JP2014196914A - 電気泳動用分離媒体の製造装置および電気泳動用分離媒体の製造方法 - Google Patents
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Abstract
Description
また、pH勾配ゲルに関しては前駆体溶液状態のpHと重合後のゲルpHは異なるが、送液中の2種の前駆体混合溶液のpHを測定できないため、フィードバック制御によって所望のpH勾配を有するpH勾配ゲルを作製できないことも困難な理由として挙げることができる。
以下、図を参照しながら、本実施形態に係る電気泳動用分離媒体の製造装置および電気泳動用分離媒体の製造方法について説明する。なお、以下の全ての図面においては、図面を見やすくするため、各構成要素の寸法や比率などは適宜異ならせてある。
本実施形態に係る電気泳動用分離媒体の製造装置および電気泳動用分離媒体の製造方法は、目的物として、水と、水を担持する高分子量の担体分子と、を含むゲル状の分離媒体を製造する。製造される分離媒体においては、pHや担体分子の濃度に勾配を有する。
pHに勾配を有する分離媒体、例えば、通常知られた固定化pH勾配ゲル(IPGゲル:Immobilized pH gradient gel)は、(i)置換基を有していてもよいアクリルアミド(以下、アクリルアミド系モノマーと称することがある)と、(ii)アクリルアミド系モノマーと共重合可能な架橋剤と、(iii)アクリルアミド系モノマーと共重合可能であり、且つ水中で酸性を示す解離基(酸性基)または塩基性を示す解離基(塩基性基)を有するアクリルアミド誘導体と、を重合させて製造する。
その後、分離媒体の製造装置内で、前駆体を重合させることで、酸性基と塩基性基の存在比に勾配を形成し、pH勾配を有する担体分子が得られる。担体分子は水を保持するため、全体としてゲル状となり、目的物である分離媒体が得られる。
担体分子の濃度に勾配を有する分離媒体については、(i)アクリルアミド系モノマーと、(ii)架橋剤と、の合計の濃度が異なる2種の前駆体溶液を用意し、さらに、一方にグリセロール(グリセリン)を加え高比重溶液とする。ここで、2種の前駆体溶液は、一方が本発明における第1溶液に該当し、他方が本発明における第2溶液に該当する。
図1は、本実施形態に係る電気泳動用分離媒体の製造装置を有する製造システム100の概略図である。図に示すように製造システム100は、分離媒体の製造装置10Aと、前駆体溶液を貯留する貯留部20と、前駆体溶液を送液する送液装置30とを有する。
本実施形態の製造装置は、以上のような構成となっている。
次に、製造装置10Aを用いた、濃度勾配を有する分離媒体の製造方法について説明する。以下の説明においては、泳動方向にpH勾配が変化するIPGゲルを製造する方法について説明する。本実施形態の製造方法においては、上記製造システム100を用いるものとし、適宜図1、2に示した符号を用いて説明する。
以上のようにして、電気泳動用分離媒体を製造することができる。
図7は、第2実施形態の製造装置に係る製造装置10Bを示す模式図であり、図5(a)に対応する図である。第1実施形態の製造装置10Aにおいては、充填部材13として直方体の部材を1つ有することとして示したが、本実施形態の製造装置10Bは、充填部材14として、複数の小片14aを用いることとしている。
図8は、第3実施形態の製造装置に係る製造装置10Cを示す模式図であり、図5(a)に対応する図である。第1実施形態の製造装置10Aにおいては、充填部材13としてブロック状の部材を1つ有することとして示したが、本実施形態の製造装置10Cは、充填部材15として、複数の板材15aを用いることとしている。
図9,10は、第4実施形態の製造装置に係る製造装置10Dを示す模式図であり、図5に対応する図である。第1実施形態の製造装置10Aにおいては、充填部材13として直方体状の部材であることとしたが、充填部材の機能としては、注入容器10aの内部空間の容積を制御することができれば、形状は限定されない。
図11は、第5実施形態の製造装置に係る製造装置10Fを示す模式図であり、図11(a)は概略斜視図、図11(b)は断面図である。
以下に本発明を実施例により説明するが、本発明はこれらの実施例に限定されるものではない。
(実施例1)
アクリルアミド、メチレンビスアクリルアミド、複数種のアクリルアミドバッファー(Acrylamido buffer、Sigma−Aldrich社)、蒸留水を混ぜ合わせ、酸性の前駆体溶液(酸性溶液)および塩基性の前駆体溶液(塩基性溶液)を調整した。この際、酸性溶液は、pHが3.5となるように複数種のアクリルアミドバッファーを適宜混合し、塩基性溶液は、pHが10.2となるように複数種のアクリルアミドバッファーを適宜混合した。さらに、塩基性溶液にグリセロールを混ぜ合わせた。
製造装置が、充填部材を有さないこと以外は、実施例1と同様にして、比較例1の分離媒体2を製造した。充填部材を有さない製造装置に、酸性溶液及び塩基性溶液をそれぞれ2050μLずつ注入すると、製造装置の底部から約70mm程度の長さを有する分離媒体が得られる。
分離媒体1および分離媒体2を、それぞれ、尿素、チオ尿素、3-(3-cholamidepropyl)dimethylammonio-1-propanesulphonate(CHAPS)、ジチオトレイトール(DTT)、両性電解質(Ampholyte)および等電点が既知であるペプチド9種類を混ぜ合わせた溶液に浸漬し、16時間放置した。
表1に示した9種の等電点は、等電点電気泳動を行った9種のペプチドの等電点である。
図13は、表1の結果をグラフ化したものであり、横軸は酸性端からの距離(単位:mm)、縦軸はpHを示している。図13のグラフから、実測値に基づいた分離媒体1,2のpH勾配を算出することができる。
以下、当該充填部材なしで作製したIPGゲルと充填部材ありで作製したIPGゲルを比較の為50mmに切り出して2次元電気泳動を行った結果を述べる。
浸漬後、分離媒体1,2を取り出し、一次元目の等電点電気泳動を行った。一次元目の電気泳動終了後、SDSを含む平衡化バッファーに分離媒体1,2を浸漬し、10分程度振とうさせ、平衡化を行った。平衡化後、分離媒体1,2をそれぞれPAGEゲルに接続し、定法に従って二次元目の電気泳動であるSDS−PAGEを行った。
Claims (5)
- 電気泳動用分離媒体の製造装置であって、
前記電気泳動用分離媒体の前駆体を含む第1溶液と、前記第1溶液とは前記前駆体の濃度が異なる第2溶液とが、混合比を線形に変化させながら混合され、得られた混合液が注入される注入容器と、
前記注入容器の内部空間に配置されることで前記内部空間の容積を低減させ、前記内部空間に前記混合液を注入したときの前記混合液の液面高さの変化量に対する前記混合比の変化量を低減させる充填部材と、を有する電気泳動用分離媒体の製造装置。 - 前記充填部材は、複数の小片を有し、前記小片が集積されて前記充填部材を形成している請求項1に記載の電気泳動用分離媒体の製造装置。
- 前記充填部材は、前記内部空間を仕切り、前記混合液が注入されない空間を形成する板材である請求項1に記載の電気泳動用分離媒体の製造装置。
- 前記充填部材には、前記内部空間に前記充填部材を配置したときの、前記内部空間に注入した前記混合液の液面高さの変化量に対する前記混合比の変化量に関する情報が付されている請求項1から3のいずれか1項に記載の電気泳動用分離媒体の製造装置。
- 電気泳動用分離媒体の製造方法であって、
前記電気泳動用分離媒体の前駆体を含む第1溶液と、前記第1溶液とは前記前駆体の濃度が異なる第2溶液とが、混合比を線形に変化させながら混合し、得られた混合液を注入容器に注入する工程と、
前記混合液に含まれる前記前駆体を重合させる工程と、を有し、
前記注入する工程においては、前記注入容器の内部空間の容積を局所的に低減させておくことで、前記内部空間に前記混合液を注入したときの前記混合液の液面高さの変化量に対する前記混合比の変化量を低減させる電気泳動用分離媒体の製造方法。
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