JP2013524792A5

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Publication number: JP2013524792A5
Application number: JP2013505367A
Authority: JP
Filing date: 2011-04-21
Publication date: 2014-06-05
Anticipated expiration: 2031-04-21

Claims

スフィンゴシン１−リン酸に結合することができるＬ−核酸分子であって、前記核酸分子は５’→３’の方向にヌクレオチドの第１の末端ストレッチと、ヌクレオチドの中心ストレッチと、ヌクレオチドの第２の末端ストレッチを含むか、または、５’→３’の方向にヌクレオチドの第２の末端ストレッチと、ヌクレオチドの中心ストレッチと、ヌクレオチドの第１の末端ストレッチを含み、
前記ヌクレオチドの第１の末端ストレッチが３〜６のヌクレオチドを含み、
前記ヌクレオチドの第２の末端ストレッチが３〜６のヌクレオチドを含み、
前記ヌクレオチドの中心ストレッチが、
５’ ＡＡＵＡＧＣＣＧＵＵＧＡＡＡＣＧＣＣＵＵＵＡＧＡＧＡＡＧＣＡＣＵＡＧ３’、５’ ＡＡＵＡＧＣＣＧＡＵＧＡＡＡＣＧＣＣＵＵＵＡＧＡＧＡＡＧＣＡＣＵＡＧ３’、および、
５’ ＡＡＵＡＧＣＣＧＡＡＵＧＡＡＡＣＧＣＣＵＵＡＡＧＡＧＡＡＧＣＡＣＵＡＧ３’．
からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、Ｌ−核酸分子。
前記核酸がスフィンゴシン１−リン酸によって媒介される活性のアンタゴニストである、請求項１に記載の核酸分子。
前記ヌクレオチドの第１の末端ストレッチが、５’Ｘ_１Ｘ_２Ｘ_３ＳＵＧ３’のヌクレオチド配列を含み、および前記ヌクレオチドの第２の末端ストレッチが５’ＣＡＳＸ_４Ｘ_５Ｘ_６３’のヌクレオチド配列を含み、
ここで、
Ｘ_１はＡまたは不在であり、Ｘ_２はＧまたは不在であり、Ｘ_３はＳまたは不在であり、Ｘ_４はＳまたは不在であり、Ｘ_５はＣまたは不在であり、およびＸ_６はＵまたは不在である、請求項１または２に記載の核酸分子。
前記ヌクレオチドの第１の末端ストレッチが、５’Ｘ_１Ｘ_２Ｘ_３ＳＵＧ３’のヌクレオチド配列を含み、および前記ヌクレオチドの第２の末端ストレッチが５’ＣＡＳＸ_４Ｘ_５Ｘ_６３’のヌクレオチド配列を含み、
ここで、
ａ）Ｘ_１はＡであり、Ｘ_２はＧであり、Ｘ_３はＳであり、Ｘ_４はＳであり、Ｘ_５はＣであり、およびＸ_６はＵであり、または
ｂ）Ｘ_１は不在であり、Ｘ_２はＧであり、Ｘ_３はＳであり、Ｘ_４はＳであり、Ｘ_５はＣであり、およびＸ_６はＵであり、または
ｃ）Ｘ_１はＡであり、Ｘ_２はＧであり、Ｘ_３はＳであり、Ｘ_４はＳであり、Ｘ_５はＣであり、およびＸ_６は不在であり、または
ｄ）Ｘ_１は不在であり、Ｘ_２はＧであり、Ｘ_３はＳであり、Ｘ_４はＳであり、Ｘ_５はＣであり、およびＸ_６は不在である、請求項１〜３のいずれか１項に記載の核酸分子。
前記ヌクレオチドの第１の末端ストレッチが、５’Ｘ_１Ｘ_２Ｘ_３ＳＵＧ３’ヌクレオチド配列を含み、および前記ヌクレオチドの第２の末端ストレッチが５’ＣＡＳＸ_４Ｘ_５Ｘ_６３’のヌクレオチド配列を含み、
ここで、
ａ）Ｘ_１は不在であり、Ｘ_２は不在であり、Ｘ_３はＳであり、Ｘ_４はＳであり、Ｘ_５はＣであり、およびＸ_６は不在であり、または
ｂ）Ｘ_１は不存であり、Ｘ_２はＧであり、Ｘ_３はＳであり、Ｘ_４はＳであり、Ｘ_５は不在であり、およびＸ_６は不在であり、または
ｃ）Ｘ_１は不在であり、Ｘ_２は不在であり、Ｘ_３はＳであり、Ｘ_４はＳであり、Ｘ_５は不在であり、およびＸ_６は不在である、請求項１〜３のいずれか１項に記載の核酸分子。
前記ヌクレオチドの第１の末端ストレッチが５’Ｘ_１Ｘ_２Ｘ_３ＳＵＧ３’のヌクレオチド配列を含み、および前記ヌクレオチドの第２の末端ストレッチが５’ＣＡＳＸ_４Ｘ_５Ｘ_６３’のヌクレオチド配列を含み、
ここで、
Ｘ_１は不在であり、Ｘ_２は不在であり、Ｘ_３はＳまたは不在であり、Ｘ_４はＳまたは不在であり、Ｘ^５は不在であり、およびＸ_６は不在である、請求項１〜３のいずれか１項に記載の核酸分子。
前記核酸分子が、配列番号１２〜２６のいずれか１つに記載のヌクレオチド配列、好ましくは、配列番号１２、１３、１５、１８、１９および２３〜２６のいずれか１つに記載のヌクレオチド配列、より好ましくは、配列番号１２、１８、２３および２４のいずれか１つに記載のヌクレオチド配列を含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の核酸分子。
前記核酸分子が、配列番号１８に記載の核酸配列またはそれと相同である核酸分子を含み、その相同性が少なくとも８５％である、請求項１〜７のいずれか１項に記載の核酸分子。
スフィンゴシン１−リン酸に結合することができるＬ−核酸分子であって、参照核酸分子と比較して、前記核酸分子の親和性が増加し、前記参照核酸分子が配列番号１８に記載のヌクレオチド配列を含み、および前記参照核酸分子がリボヌクレオチドからなり、前記核酸分子が配列番号１８に記載のヌクレオチド配列を含み、および配列番号１８に記載のヌクレオチド配列の１つまたは複数のヌクレオチドがリボヌクレオチドよりはむしろデオキシリボヌクレオチドである、Ｌ−核酸分子。
前記核酸分子が、配列番号２７〜３７、３９および４０のいずれか１つに記載のヌクレオチド配列、好ましくは、配列番号３０、３４〜３７、３９および４０のいずれか１つに記載のヌクレオチド配列、より好ましくは、配列番号３６、３７、３９および４０のいずれか１つに記載のヌクレオチド配列を含む、請求項９に記載の核酸分子。
前記核酸分子が、配列番号３６に記載の核酸配列またはそれと相同である核酸分子を含み、その相同性が少なくとも８５％であり、前記相同核酸がリボヌクレオチドおよび少なくとも１つのデオキシリボヌクレオチドを含む、請求項１０に記載の核酸分子。
前記核酸分子が修飾基を含み、生物体由来の前記修飾基を含む前記核酸分子の排泄速度が、前記修飾基を含まない核酸と比較して低下する、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の核酸分子。
前記核酸分子が修飾基を含み、前記修飾基を含む前記核酸分子が、前記修飾基を含まない核酸分子と比較して、生物体における滞留時間が増加する、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の核酸分子。
疾患の治療および／または予防のための方法で用いる、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の核酸分子。
請求項１〜１３のいずれか１項に定義される核酸分子と、任意にさらなる成分とを含む医薬組成物であって、前記さらなる成分が、医薬的に許容される賦形剤、医薬的に許容される担体、および医薬的に活性な薬剤を含む群から選択される、医薬組成物。
薬物の製造のための、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の核酸分子の使用。
診断手段の製造のための、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の核酸分子の使用。
請求項１〜１３のいずれか１項に記載の核酸分子と、スフィンゴシン１−リン酸とを含む複合体であって、好ましくは、前記複合体が結晶性複合体である複合体。
スフィンゴシン１−リン酸の検出のための請求項１〜１３のいずれか１項に記載の核酸分子の使用。
スフィンゴシン１−リン酸またはスフィンゴシン１−リン酸の類似体によって媒介される活性のアンタゴニストをスクリーニングする方法であって、
前記スフィンゴシン１−リン酸および／または前記スフィンゴシン１−リン酸の類似体によって媒介される活性の候補アンタゴニストを提供するステップと、
請求項１〜１３のいずれか１項に定義される核酸を提供するステップと、
前記スフィンゴシン１−リン酸および／または前記スフィンゴシン１−リン酸の類似体によって媒介される活性のアンタゴニストの存在下でシグナルを供給する試験系を提供するステップと、
前記スフィンゴシン１−リン酸によって媒介される活性の前記候補アンタゴニストが、前記スフィンゴシン１−リン酸および／または前記スフィンゴシン１−リン酸の類似体によって媒介される活性のアンタゴニストであるかどうかを決定するステップとを含む、方法。
請求項１〜１３のいずれか１項に記載の核酸分子を含むスフィンゴシン１−リン酸を検出するためのキット。
請求項１〜１３のいずれか１項に定義される核酸を試料において検出する方法であって、前記方法が、
ａ）捕捉プローブが請求項１〜１３のいずれか１項に定義される核酸分子の第１の部分と少なくとも部分的に相補的である捕捉プローブと、請求項１〜１３のいずれか１項に定義される核酸分子の第２の部分と少なくとも部分的に相補的である検出プローブとを、またはその代わりに、請求項１〜１３のいずれか１項に定義される核酸分子の第２の部分と少なくとも部分的に相補的である捕捉プローブと、請求項１〜１３いずれか１項に定義される核酸分子の第１の部分と少なくとも相補的である検出プローブとを提供するステップと；
ｂ）請求項１〜１３のいずれか１項に定義される核酸分子を含有する、または請求項１〜１３のいずれか１項に定義される核酸分子を含有すると推定される試料に、前記捕捉プローブおよび前記検出プローブを別々に、または組み合わせて添加するステップと；
ｃ）前記捕捉プローブおよび前記検出プローブが、請求項１〜１３のいずれか１項に定義される核酸分子またはその一部と、同時にまたは任意の順番のいずれかで反応できるようにするステップと；
ｄ）前記捕捉プローブが、ステップａ)で提供される請求項１〜１３のいずれか１項に定義される核酸分子とハイブリッド形成するかどうかを任意に検出するステップと；
ｅ）請求項１〜１３のいずれか１項に定義される前記核酸分子と、前記捕捉プローブと、前記検出プローブとからなる、ステップｃ）で形成される複合体を検出するステップとを含む方法。