JP2013509861A5

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Publication number: JP2013509861A5
Application number: JP2012536757A
Authority: JP
Filing date: 2010-10-27
Publication date: 2013-12-05
Anticipated expiration: 2030-10-27

Claims

ＨＥＲ３結合モチーフ（ＢＭ）を含むＨＥＲ３結合ポリペプチドであって、該モチーフは、
ｉ）ＥＸ₂Ｘ₃Ｘ₄ＡＹＸ₇ＥＩＷＸ₁₁ＬＰＮＬＸ₁₆Ｘ₁₇Ｘ₁₈ＱＸ₂₀ Ｘ₂₁ＡＦＩＸ₂₅ Ｘ₂₆ＬＸ₂₈Ｄ、
［ここで、互いに独立して、
Ｘ₂はＫ、Ｒ及びＷから選択され；
Ｘ₃はＫ、Ｒ、及びＹから選択され；
Ｘ₄は、Ａ、Ｄ、Ｅ、Ｇ、Ｈ、Ｉ、Ｋ、Ｌ、Ｍ、Ｎ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ｖ及びＷから選
択され；
Ｘ₇はＡ、Ｅ、Ｆ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｓ、Ｔ、Ｖ、Ｗ及びＹから選択され；
Ｘ₁₁はＥ及びＱから選択され；
Ｘ₁₆はＮ及びＴから選択され；
Ｘ₁₇はＲ、Ｔ及びＶから選択され；
Ｘ₁₈はＲ、Ｔ及びＶから選択され；
Ｘ₂₀はＫ及びＲから選択され；
Ｘ₂₁はＡ及びＧから選択され；
Ｘ₂₅はＡ、Ｇ、Ｋ、Ｒ及びＳから選択され；
Ｘ₂₆はＳ及びＫから選択され；
Ｘ₂₈はＡ、Ｄ、Ｅ、Ｆ、Ｐ、Ｑ、Ｓ、Ｔ、Ｗ及びＹから選択される］；
及び
ii）ｉ）において定義された配列に対して少なくとも９３％の同一性を有するアミノ酸配列［ここで該ポリペプチドは、ＨＥＲ３の細胞外ドメインに結合する］、
から選択されるアミノ酸配列からなる、上記ＨＥＲ３結合ポリペプチド。
アミノ酸配列が配列番号ｉ）１〜３３４のいずれか１つから選択される、請求項１に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド。
アミノ酸配列ｉ）が、配列番号２３〜２５、配列番号２７〜２８、配列番号３２、配列番号３５〜３６、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４〜４５、配列番号５３〜５
４及び配列番号５６のいずれか１つから選択される、請求項２に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド。
前記ＨＥＲ３結合モチーフが、３ヘリックスバンドルタンパク質ドメインの一部を形成する、請求項１〜３のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド。
ｉ）Ｋ−［ＢＭ］−ＤＰＳＱＳＸ_aＸ_bＬＬＸ_c ＥＡＫＫＬＮＤＸ_dＱ；
［ここで、
［ＢＭ］は、請求項１〜３のいずれか１項において定義されるＨＥＲ３結合モチーフであり；
Ｘ_aはＡ及びＳから選択され；
Ｘ_bはＮ及びＥから選択され；
Ｘ_cはＡ、Ｓ及びＣから選択され；
Ｘ_dはＡ及びＳから選択される］
及び
ii）上で定義された配列のいずれか１つに対して少なくとも９４％の同一性を有するアミノ酸配列、
から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド。
アミノ酸配列ｉ）が配列番号３３５〜６６８のいずれか１つから選択される、請求項５に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド。
アミノ酸配列ｉ）が、配列番号３５７〜３５９、配列番号３６１〜３６２、配列番号３６６、配列番号３６９〜３７０、配列番号３７４、配列番号３７６、配列番号３７８〜３７９、配列番号３８７〜３８８及び配列番号３９０のいずか１つから選択される、請求項６に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド。
アミノ酸配列が配列番号６６９〜１００２から選択される、請求項１〜４のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド。
アミノ酸配列が、配列番号６９１〜６９３、配列番号６９５〜６９６、配列番号７００、配列番号７０３〜７０４、配列番号７０８、配列番号７１０、配列番号７１２〜７１３、配列番号７２１、配列番号７２２及び配列番号７２４から選択される、請求項８に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド。
相互作用のＫ_D値が多くとも１×１０^-6Ｍ、例えば多くとも１×１０^-7Ｍ、例えば多く
とも１×１０^-8ＭであるようにＨＥＲ３結合ポリペプチドがＨＥＲ３に結合する、請求項１〜９のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド。
さらなるＣ末端アミノ酸及び／又はＮ末端アミノ酸を含む、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチドであって、ここでさらなるＣ末端アミノ酸及び／又はＮ末端アミノ酸の各々が、例えば、ポリペプチドの生産、精製、インビボ若しくはインビトロでの安定化、カップリング又は検出を改善する、ＨＥＲ３結合ポリペプチド。
アミノ酸配列が同じであっても異なっていてもよい、少なくとも２つのＨＥＲ３結合ポリペプチド単量体単位を含む、多量体形態である、請求項１〜１１のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド。
請求項１〜１２のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
請求項１〜１２のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド；ＨＥＲ２結合ポリペプチド；及びＨＥＲ３結合ポリペプチドとＨＥＲ２結合ポリペプチドとを連結するための連結部分を含む、ＨＥＲ３及びＨＥＲ２に対する結合親和性を有するリガンド。
ＨＥＲ２結合ポリペプチドが、相互作用のＫ_D値が多くとも１×１０^-6Ｍ、例えば多く
とも１×１０^-7Ｍ、例えば多くとも１×１０^-8ＭであるようにＨＥＲ２に結合する、請求項１４に記載のリガンド。
請求項１〜１２のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド；ＥＧＦＲ結合ポリペプチド；及びＨＥＲ３結合ポリペプチドをＥＧＦＲ結合ポリペプチドと連結するための連結部分を含む、ＨＥＲ３及びＥＧＦＲに対する結合親和性を有するリガンド。
インビボでリガンド半減期を延長させるための半減期延長部分をさらに含む、請求項１〜１２のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド、又は請求項１４〜１６のいずれか１項に記載のリガンド。
請求項１〜１２のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド又は請求項１４〜１７のいずれか１項に記載のリガンドと治療剤との組み合わせ。
治療における使用のための、請求項１〜１２のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド、請求項１４〜１７のいずれか１項に記載のリガンド又は請求項１８に記載の組み合わせ。
例えば結腸がん、子宮内膜がん、胃がん、神経膠腫、乳がん、膵臓がん、頭頸部扁平上皮がん、肺がん、黒色種、髄芽腫、神経上皮腫、卵巣がん、パジェット病、乳頭様甲状腺がん、前立腺がん、皮膚扁平上皮がん、移行上皮がん及び前庭神経鞘腫から選択されるＨＥＲ３関連状態の処置のための、請求項１〜１２のいずれか１項に記載のＨＥＲ３結合ポリペプチド、請求項１４〜１７のいずれか１項に記載のリガンド又は請求項１８に記載の組み合わせ。