JP2013088898A - 3dデータ解析のための装置、方法及びプログラムと、微小粒子解析システム - Google Patents
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Abstract
【解決手段】微小粒子の測定データを保存するデータ格納部130と、前記測定データから独立した3種の変数を選択する入力部141と、前記3種の変数を座標軸とする座標空間内における位置と図形を計算し、前記微小粒子の特性分布を表す3D立体画像を作成するデータ処理部120と、前記3D立体画像を表示する表示部142と、を有し、前記3D立体画像において、平面によって複数の領域に区分けされた前記座標空間の各領域内の前記図形を領域毎に異なる色で表示する3Dデータ解析装置1を提供する。
【選択図】図2
Description
この3Dデータ解析装置では、任意に選択した3種のパラメータを座標軸とした三次元分布図を立体視しながらデータ解析のための領域を設定する際、各領域内の図形が領域毎に異なる色で表示される。このため、各図形がいずれの領域に存在しているのかを直感的に確認しながら領域の設定を行うことができ、領域間の境界を明確に認識して、正確な領域設定を行うことができる。
この3Dデータ解析装置において、前記データ処理部は、前記領域毎の分布頻度を計算し、前記表示部は、各領域内の前記図形を、分布頻度に関連付けられた色で表示することが好ましい。さらに、前記データ処理部は、前記平面の位置変更に連動して前記分布頻度を計算し、各領域内の前記図形の色がリアルタイムに変化して表示されるようにすることが好ましい。
3D立体画像中において各領域内の図形を頻度分布に応じた異なる色によって表示することで、ユーザが直感的に頻度分布の解析結果を知得することができる。
この3Dデータ解析装置は、前記入力部からの入力信号に基づいて前記表示部において前記3D立体画像を回転させ、任意に選択された座標軸方向からの該画像の立体像を観察できるように構成されることが好ましい。
細胞には、動物細胞(血球系細胞など)及び植物細胞が含まれる。微生物には、大腸菌等の細菌類、タバコモザイクウイルス等のウイルス類、イースト菌等の菌類などが含まれる。生体関連粒子には、各種細胞を構成する染色体、リポソーム、ミトコンドリア、オルガネラ(細胞小器官)なども含まれる。さらに、生体関連粒子には、核酸やタンパク質、これらの複合体などの生体関連高分子も包含され得るものとする。工業用粒子は、有機もしくは無機高分子材料、金属などであってもよい。有機高分子材料には、ポリスチレン、スチレン・ジビニルベンゼン及びポリメチルメタクリレートなどが含まれる。無機高分子材料には、ガラス、シリカ及び磁性体材料などが含まれる。金属には、金コロイド及びアルミなどが含まれる。これら微小粒子の形状は、一般には球形であるが、非球形であってもよい。また、微小粒子の大きさや質量なども特に限定されない。
1.3Dデータ解析装置の構成
2.3D立体画像の表示
3.データ解析
4.データ表示
5.3D立体画像の特徴
(5−1)図形の形状
(5−2)図形のシェード処理
(5−3)座標軸
(5−4)動画像
6.3Dデータ解析プログラム
図1に、本技術に係る3Dデータ解析装置の装置構成を示す。ここでは、3Dデータ解析装置を微小粒子測定装置に連設して微小粒子解析システムとして構成した実施形態を示す。また、図2に、この微小粒子解析システムの機能的構成を示す。以下では、微小粒子測定装置としてフローサイトメータを用いる場合を例に説明する。
図3に、本技術に係る3Dデータ解析装置により表示される三次元分布図を模式的に示す。この三次元分布図は、表示部142に3D立体画像により表示され、ユーザによって立体的に視認され得るものである。
データ分析のための解析領域の設定は、ユーザが、表示部142に表示された3D立体画像を見ながら、マウス41あるいはキーボード42などの入力デバイスを用いて、三次元分布図5の座標空間6を複数の領域に区分けする平面を設定することによって行われる。図5に、設定される平面と領域の具体例を示す。ここでは、簡略のため、1つの座標軸Xに沿って平面(以下、「ガイド面」とも称する)51によって座標空間6を2つの領域61,62に区分けする例を示した。
データ処理部120は、各領域におけるパラメータの値及び/又は分布頻度を計算し、表示部142に、パラメータの値及び/又は分布頻度に関する情報(解析結果)を表示させる。
以下、本技術に係る3Dデータ解析装置により表示される3D立体画像の特徴について順に説明する。
図3中符号7で示した微小粒子に対応する図形は、所定形状のポリゴンの組み合わせからなる多面体として計算され、3D立体画像中に表示される。上記のように、データ処理部120は、ユーザが選択したパラメータの測定値に基づいて各微小粒子の座標空間内の位置と図形7を計算し、三次元分布図を作成する。この際、図形7を所定形状のポリゴンの組み合わせからなる多面体として計算することで、データ処理部120における計算負荷を軽減できる。また、図形7を所定形状のポリゴンの組み合わせからなる多面体として3D立体画像中に表示することで、立体視した際の画像の立体感を増強することができる。
3D立体画像において、図形7は、立体視した際に手前に観察される図形ほど濃く、奥に観察される図形ほど淡く表示される。このように図形7の濃淡を変化させる処理を、以下「シェード処理」と称するものとする。
3D立体画像において、座標軸は、立体視した際に手前に観察される部分ほど太く、奥に観察される分ほど細く表示される。太さを変化させた座標軸の立体像の概念図を図14に示す。このように、座標軸の太さを変化させることによって、3D立体画像の立体像に奥行きを与えて立体感を向上できる。
既に説明したように、表示部142(ディスプレイ43)への3D立体画像の表示は、入力部141(マウス41あるいはキーボード42など)からのユーザの入力信号に基づき任意に回転、拡大あるいは縮小させて行ってもよい。3D立体画像を回転する際には、図3に示したように、座標空間6を構成する立体形状(図では立方体)の各辺に座標軸が表示されていることが好ましい。これらの座標軸により座標空間6の立体形状が明確になるため、3D立体画像を回転させた際の三次元分布図の向きの変化を認識し易くなる。
本技術に係る3Dデータ解析プログラムは、微小粒子の測定データから選択される独立した3種の変数を座標軸とする座標空間内における位置と図形を計算し、前記微小粒子の特性分布を表す3D立体画像を作成するステップと、前記3D立体画像を表示するステップと、前記3D立体画像においてユーザにより設定される平面により複数の領域に区分けされた前記座標空間の各領域内の前記図形を領域毎に異なる色で表示するステップと、をコンピュータに実行させる。
(1)微小粒子の測定データを保存するデータ格納部と、前記測定データから独立した3種の変数を選択する入力部と、前記3種の変数を座標軸とする座標空間内における位置と図形を計算し、前記微小粒子の特性分布を表す3D立体画像を作成するデータ処理部と、前記3D立体画像を表示する表示部と、を有し、前記3D立体画像において、平面によって複数の領域に区分けされた前記座標空間の各領域内の前記図形を領域毎に異なる色で表示する3Dデータ解析装置。
(2)前記データ処理部は、前記領域毎の分布頻度を計算し、前記表示部は、各領域内の前記図形を、分布頻度に関連付けられた色で表示する上記(1)記載の3Dデータ解析装置。
(3)前記入力部からの入力信号に基づいて前記平面を位置変更可能に設定し、前記3D立体画像中に表示する上記(1)又は(2)記載の3Dデータ解析装置。
(4)前記データ処理部が前記平面の位置変更に連動して前記分布頻度を計算し、各領域内の前記図形の色がリアルタイムに変化して表示される上記(1)〜(3)のいずれかに記載の3Dデータ解析装置。
(5)前記入力部からの入力信号に基づいて前記表示部において前記3D立体画像を回転させ、任意に選択された座標軸方向からの該画像の立体像観察を可能とする上記(1)〜(4)のいずれかに記載の3Dデータ解析装置。
Claims (8)
- 微小粒子の測定データを保存するデータ格納部と、
前記測定データから独立した3種の変数を選択する入力部と、
前記3種の変数を座標軸とする座標空間内における位置と図形を計算し、前記微小粒子の特性分布を表す3D立体画像を作成するデータ処理部と、
前記3D立体画像を表示する表示部と、を有し、
前記3D立体画像において、平面によって複数の領域に区分けされた前記座標空間の各領域内の前記図形を領域毎に異なる色で表示する3Dデータ解析装置。 - 前記データ処理部は、前記領域毎の分布頻度を計算し、
前記表示部は、各領域内の前記図形を、分布頻度に関連付けられた色で表示する請求項1記載の3Dデータ解析装置。 - 前記入力部からの入力信号に基づいて前記平面を位置変更可能に設定し、前記3D立体画像中に表示する請求項2記載の3Dデータ解析装置。
- 前記データ処理部が前記平面の位置変更に連動して前記分布頻度を計算し、各領域内の前記図形の色がリアルタイムに変化して表示される請求項3記載の3Dデータ解析装置。
- 前記入力部からの入力信号に基づいて前記表示部において前記3D立体画像を回転させ、任意に選択された座標軸方向からの該画像の立体像観察を可能とする請求項4記載の3Dデータ解析装置。
- 微小粒子の測定データを保存するデータ格納部と、前記測定データから独立した3種の変数を選択する入力部と、前記3種の変数を座標軸とする座標空間内における位置と図形を計算し、前記微小粒子の特性分布を表す3D立体画像を作成するデータ処理部と、前記3D立体画像を表示する表示部と、を有し、前記3D立体画像において、平面によって複数の領域に区分けされた前記座標空間の各領域内の前記図形を、領域毎に異なる色で表示する3Dデータ解析装置と、
微小粒子測定装置と、を連設してなる微小粒子解析システム。 - 微小粒子の測定データから独立した3種の変数を選択する手順と、
前記3種の変数を座標軸とする座標空間内における位置と図形を計算し、前記微小粒子の特性分布を表す3D立体画像を作成する手順と、
前記3D立体画像を表示させる手順と、
前記3D立体画像において前記座標空間を複数の領域に区分けする平面を設定する手順と、
各領域内の前記図形を領域毎に異なる色で表示させる手順と、を含む3Dデータ解析方法。 - 微小粒子の測定データから選択される独立した3種の変数を座標軸とする座標空間内における位置と図形を計算し、前記微小粒子の特性分布を表す3D立体画像を作成するステップと、
前記3D立体画像を表示するステップと、
前記3D立体画像においてユーザにより設定される平面により複数の領域に区分けされた前記座標空間の各領域内の前記図形を領域毎に異なる色で表示するステップと、をコンピュータに実行させる3Dデータ解析プログラム。
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