JP2012509076A - Piv−5およびpiv−2のfタンパク質の突然変異タンパク質 - Google Patents

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Abstract

本発明は、5型PIV (PIV-5またはPIV5) および2型PIV (PIV-2またはPIV2) として現在表示されるパラインフルエンザウイルス (PIV) の融合タンパク質 (Fタンパク質) の突然変異タンパク質に関する。本発明は、それらに由来する生成物、たとえば、核酸、ベクター、細胞;抗体、アプタマー、干渉RNAの融合阻害剤;骨髄腫、ハイブリドーマ;幹細胞および前駆細胞などに関する。また本発明は、医学的および生物工学的適用において使用するための、前記突然変異タンパク質およびそれらに由来する生成物に関する。

Description

本願は、現在、5型PIV(PIV-5又はPIV5)及び2型PIV(PIV-2又はPIV2)として表示されているパラインフルエンザウイルス(PIV)の融合タンパク質(Fタンパク質)の突然変異タンパク質に関する。
本願は、それらに由来する生成物、たとえば:
・核酸、ベクター、細胞;
・抗体、アプタマー、干渉RNAタイプの融合阻害剤;
・骨髄腫、ハイブリドーマ;
・幹細胞及び前駆細胞
に関する。
本願はまた、医学的及び生物工学的な適用において使用するための、これらの突然変異タンパク質及びそれらに由来する生成物に関する。
現在、5型PIV(PIV-5又はPIV5)として表示されているパラインフルエンザウイルス(PIV)は、パラミクソウイルス科のルブラウイルス属のエンベロープに包まれたウイルスである。PIV-5は、最初にサル細胞の初代培養物から単離されたため、従来はSV5(シミアンウイルス5)という名で知られていた。しかしながら、PIV-5の自然なホストはイヌであると思われ、イヌにおいてケンネルコフとして知られる咳を引き起こす。
その後に、幾つかのPIV-5単離体が、ヒトから収集されたが動物細胞で培養されたサンプルから得られた。さらに、ヒトにおいては、何の症状又は疾病もPIV-5に付随しなかった。このように、ヒトが実際にPIV-5のホストであるかどうかという問題は今なお熱く討論されている。
何れにせよ、PIV-5ウイルスは現在、動物ウイルスであると考えられている。
2型PIV(PIV-2又はPIV2)として現在表示されているパラインフルエンザウイルス(PIV)もまた、パラミクソウイルス科のルブラウイルス属のエンベロープに包まれたウイルスである。
現在、PIV-2のヒト単離体のみが同定されており(hPIV-2)、そのため、PIV-2はヒトウイルスであると考えられている。
PIV-5及びPIV-2ウイルスは、核酸配列、タンパク質配列、組織、構造及び形態の点から互いに極めて類似している。
ヒトパラインフルエンザウイルスのなかで、PIV-2は、ヒトにおいて発見されたPIV-5に最も近いウイルスである。
PIV-2は、PIV-5のヒト同等物であると考えることができ、少なくとも本発明者らによってそのように考えられている。
PIV-5又はPIV-2による感染は、シンシチウムとして知られる多核性構造体の形成を導き、これは、感染したホスト由来の細胞が融合した結果である。
PIV-5及びPIV-2ウイルスは、ウイルスエンベロープと細胞膜との融合によってホスト細胞へ入る。
この融合は、赤血球凝集素ノイラミニダーゼ結合タンパク質(HN)及び融合タンパク質(F)の二つのウイルス糖タンパク質を関与させる。
PIV-5及びPIV-2の融合タンパク質Fは、単純な前駆体(F0)の形態で合成され、グリコシル化ホモトリマーの形態である。PIV-5及びPIV-2の融合タンパク質Fは、ジスルフィド架橋を介して連結した二つのサブユニット(大カルボキシ末端サブユニットF1及び小アミノ末端サブユニットF2)からなる「前活性化」形態を生成するために、ホストのフューリン(furines)によるタンパク分解性の切断を必要とする。
サブユニットF1は、疎水性融合ペプチド(FP)並びにコイルドコイル型のコンフォメーションを有する二つの7アミノ酸繰り返しドメイン(heptade repeat domains)(HR−1及びHR−2)で構成される。HNによる活性化の後、融合タンパク質は、一連のコンフォメーション変化を起こし、結果として、融合ペプチドの標的細胞膜への挿入を生じる。次に、HR−1及びHR−2ドメイン間の相互作用が生じ、ウイルスエンベロープを細胞膜に近づける(Russell et al, 2006)。これらのドメインは、三つのHR−1ドメインが三つのHR−2ドメインに非平行配向で連結された三量体コイルドコイル構造で構成された6らせん体の極めて安定な束を形成することが知られている。このコンフォメーションは、Fタンパク質の融合後形態を表す(Baker et al, 1999, Sergel-Germano et al, 2000, West et al, 2005)。
PIV-5及びPIV-2の融合タンパク質Fは、融合の促進のために、同じウイルス型に由来するHNタンパク質を必要とする(Yao et al, 1997)。しかしながら、FとHNの間に存在する相互作用の詳細な性質は未だに正しく知られていない。
しかし、幾つかの研究が、PIV-5及びPIV-2のある株が、融合を引き起こすためのHNの必要性において相違していることを示している。
例として、Ito et al(1997)は、そのFタンパク質が3つのアミノ酸(残基22、443及び516)によってのみ相違している「SV5」(PIV-5)の二つの株、即ち、W3A及びWRを開示している。W3A株のFタンパク質は、自律的な(autonomous)様式で、即ち、HNタンパク質の非存在下で融合を誘導することができ、一方、WR株のFタンパク質はその能力を有していない。
Ito et al(1997)は、WR株のFタンパク質の膜融合(fusogenic)活性が、このタンパク質の22位のアミノ酸をアミノ酸プロリンで置換することによって回復され得ることを示している。
Ito et al(2000)は、W3A及びWR株のFタンパク質の132位のアミノ酸E及び290位のアミノ酸Aが、これらの株のFタンパク質がHNタンパク質に自律的である能力に関与し得ることを示唆している。
Paterson et al(2000)は、W3A株のFタンパク質の22位のアミノ酸プロリンの存在、及びWR株のFタンパク質のアミノ酸443の存在が、これらのウイルス株の膜融合能力を上昇させ得ることを示している。
Russell et al(2003)は、W3A株のFタンパク質の残基L447及びI449を芳香族アミノ酸によって置換することにより、このウイルス株のFタンパク質の膜融合活性が上昇され得ることを示している。
Gardner及びDutch(2007)は、野生型「SV5」(PIV−5)ウイルスのFタンパク質の突然変異I49Aが、膜融合促進効果(pro-fusogenic effect)を有するであろうことを示している。
Gardner et al(2007)は、野生型「SV5」(PIV-5)ウイルスのFタンパク質の突然変異V402Aが、膜融合促進効果を有するであろうことを示している。
タンパク質PIV-2に関しては、このウイルスのFタンパク質の配列に突然変異を導入し、それによって自律性及び膜融合能力を上昇させるタイプの試みを記載した従来技術文献は見当たらない。
さらに、インフルエンザタンパク質HA1/HA2、ラブドウイルスGタンパク質、又はHIVのgp41/gp120タンパク質など、融合能力を有するウイルスタンパク質が他に多くある。
これらの種々のウイルスタンパク質の膜融合性能力及び自律性に関する現在の知識は、今なお極めて限られている。
いずれにせよ、ウイルス融合タンパク質に関する現在の知識は、有効な医学的及び/又は生物工学的適用を構想するのに十分な技術的ノウハウを提供しない。
本発明者らは、高い膜融合性であり、かつその融合能力における実質的な自律性を示す融合タンパク質を利用可能にすることが、幾つかの医学的及び生物工学的な状況の解決を提供し得ると考えた。
本発明者らは、従って、例えばインフルエンザのHA1/HA2タンパク質、ラブドウイルスのGタンパク質、又はHIVのgp41/gp120タンパク質などの、他の一連のウイルス融合タンパク質から、PIV-5及び/又はPIV-2のFタンパク質を精選して選択した。
次いで、本発明者らは、HNタンパク質の非存在下において膜融合能力を有する突然変異Fタンパク質を構築及び生産した。
本発明の突然変異タンパク質は、高い膜融合能力と高い自律性を有することが証明された。それらは、細胞融合を誘導するためにHNタンパク質の存在を必要とせず、また、シンシチウムの形成を必要としなかった。
また、本発明者らは、これらの突然変異タンパク質に、Fタンパク質が天然の状態で示しているものとは異なる切断サイト、より具体的には組織特異的切断サイトを導入することが可能であることを示した。
また、本発明者らは、本発明の突然変異タンパク質及び/又はそれらに由来するか又はそれらから得られる生成物の医学的適用(治療的、予防的、緩和的、また診断的)及び/又は生物工学的適用を提案する。
より具体的には、本発明者らは、癌(より具体的には転移性の癌、好ましくは転移性黒色腫)又は胎盤の発達不全などの、シンシチウムの形成を誘導または増加することが望まれる疾病又は機能障害を生体内で又は生体外で治療、予防又は緩和するための、本発明の突然変異タンパク質又はそれらをコードする核酸の使用を提案する。
本発明者らはさらに、エンベロープに包まれたウイルスの感染、アレルギー、自己免疫疾患又は移植片拒絶などの、シンシチウムの形成を阻害又はブロックすることが望まれる疾病又は機能障害を生体内で又は生体外で治療、予防又は緩和するための、抗体、組換え樹状細胞、アンチセンス、siRNA、核酸アプタマーなどの、PIV−5及び/又はPIV−2のFタンパク質をブロッキングする薬剤を提案する。
本発明者らはさらに、シンシチウムの過剰な形成、又は反対に不十分な形成を検出するための診断手段を提案する。
本発明者らはさらに、他の生物工学的手段、特に、シンシチウムの形成を減少させることができる活性成分をスクリーニングするための手段を提案する。
本発明者らはさらに、本発明の突然変異タンパク質を含む、癌細胞、より具体的には骨髄腫を提案する。本発明者らはさらに、本発明の突然変異タンパク質を含むハイブリドーマを提案する。本発明の癌細胞、より具体的には骨髄腫は、ポリエチレングリコール(PEG)も、エレクトロポレーションも、他のいずれの融合誘導手段も用いることなく、別の細胞と、より具体的にはBリンパ球と融合することができる。本発明の癌細胞、より具体的には骨髄腫は、自律的な融合能力を有する。
本発明のハイブリドーマは、ポリエチレングリコール(PEG)も、エレクトロポレーションも、他のいずれの融合誘導手段も必要とせずに、(Bリンパ球の骨髄腫への)融合によって生産され得る。本発明のハイブリドーマは、本発明の少なくとも一つの癌細胞、より具体的には少なくとも一つの骨髄腫を用いることによって実際に生産され得る。
本発明者らはさらに、本発明の突然変異タンパク質を発現する組換え幹細胞又は前駆細胞、及び、筋繊維の生産におけるそれらの適用を提案する。
本発明の他の側面は、下記の「詳細な説明」の項において説明される。
ファイルされた出願の図面セットは、カラーでファイルされた。これは、特許庁でファイルを閲覧することによりアクセスすることができる。
図1A:PIV-5のFタンパク質の基準配列 (配列番号31;WR単離体のFタンパク質の配列) および対応するCDS配列 (配列番号30;配列番号31のタンパク質をコードする核酸配列)。配列番号31の配列において、ボールドで下線付きの文字は、以下の位置のアミノ酸を示す: - 22 (L)、 - 49 (I)、 - 132 (E、この単離体に予め存在する突然変異)、 - 147 (T)、 - 158 (T)、 - 290 (A、この単離体に予め存在する突然変異)、 - 402 (V)、 - 443 (P、この単離体に理論的に予め存在する突然変異)、 - 447 (L)、 - 449 (I)、および - 463 (A)。 図1B:PIV-2のFタンパク質の基準配列 (配列番号33;Greer単離体のFタンパク質の配列) および対応するCDS配列 (配列番号32;配列番号33のタンパク質をコードする核酸配列)。配列番号33の配列において、ボールドで下線付きの文字は、以下の位置のアミノ酸を示す: - 24 (I)、 - 53 (I)、 - 133 (K)、 - 151 (T)、 - 162 (S)、 - 294 (I)、 - 406 (A)、 - 428 (S)、 - 439 (S)、 - 445 (I)、 - 474 (S)。 図2A:PIV-2のFタンパク質 (配列番号33のアミノ酸8〜533) に対するPIV-5のFタンパク質 (配列番号31のアミノ酸4〜529) のアラインメント:これら2つのタンパク質の間で、タンパク質同一性は47.7%である。このアラインメントから得られるコンセンサス配列は、配列番号34として参照される。 図2B:PIV-5のFタンパク質のアミノ酸および突然変異に対応する、PIV-2のFタンパク質のアミノ酸および突然変異。 図3:PIV-5のFタンパク質の天然の切断サイト (配列番号23) の、組織特異的切断サイト、この場合、転移性腫瘍組織により特異的に発現される酵素、すなわちマトリクス金属プロテアーゼ9 (MMP-9) のサイトによる置換の図解。 MMP-9サイトのコンセンサスサイト:配列番号27の配列 (PXXhyS/Tサイト、ここで、X = 任意のアミノ酸、およびHy = 任意の疎水性アミノ酸、すなわちF、M、V、L、Iから選択される任意のアミノ酸)。 MMP-9サイトの例示的配列:配列番号28の配列、配列番号29の配列。 図4:PIV-5のFタンパク質をコードする配列がクローニングされているプラスミドpcDNA3.1の構造。 Amp:アンピシリン耐性遺伝子 pCMV:サイトメガロウイルスプロモーター MCS:マルチプルクローニングサイト F PIV5:PIV-5のFタンパク質 BGHpolyA:ウシ成長ホルモンpolyA。 図5A、5B:PIV-5のFタンパク質において本発明者らにより作成された突然変異の視覚化。 図5C、5D:PIV-5のFタンパク質において本発明者らにより作成された突然変異の視覚化。 図6A:半定量的融合テストの間に行われた顕微鏡観察の写真 (本発明者らにより作成された突然変異体の大きな一群)。 図6B:半定量的融合テストの後に得られた融合スコアを示す図 (本発明者らにより作成された突然変異体の大きな一群)。 図7A:半定量的融合テストの間に行われた顕微鏡観察の写真 (本発明者らにより作成された突然変異体の選択物)。 図7B:半定量的融合テストの後に得られた融合スコアを示す図 (本発明者らにより作成された突然変異体の選択物)。
詳細な説明
本出願において、「タンパク質」という用語は、「糖タンパク質」という用語をその範囲に包含する。これは特に、実際に糖タンパク質であるFタンパク質及びHNタンパク質の場合である。
PIV-5及びPIV-2のFタンパク質(非突然変異タンパク質):
PIV-5のFタンパク質の配列を図1Aに示す(配列番号31のタンパク質配列;配列番号30のコーディング核酸配列)。これは、サル単離体であるWR単離体の配列である。これらの配列は、ジーンバンク(Genbank)データベースから受入れ番号AB021962により入手可能なものである。
本発明者らがATCCから入手し、下記の実施例に記載した突然変異タンパク質の構築及び生産に用いたWR単離体のサンプルは、しかしながら、Fタンパク質の443位において、(ジーンバンクから入手可能な配列の点から見て予想されるものとは対照的に)アミノ酸Pを有しておらず、アミノ酸Sを有している。従って、WR単離体のFタンパク質の代替配列は、443位のアミノ酸がSでありPではないことを除いて、配列番号31の配列と同一である。簡略化のために、ここではこの代替配列を「443にSを有する配列番号31」と記載する。
配列番号31の配列及び代替配列「443にSを有する配列番号31」、好ましくは代替配列「443にSを有する配列番号31」は、本特許出願の文脈においては、PIV-5のFタンパク質の基準配列として作用する。
しかしながら、WR単離体以外の単離体、特に、
・例えばW3A単離体などの他のサル単離体;
・他の非ヒト動物からの単離体、例えば、
○イヌ単離体、例えば、イヌ単離体CPI+、CPI−、H221、78524、Tl;
○ブタ単離体、例えば、ブタ単離体SER;
・ヒトから採取されたサンプルに由来するが、動物細胞で培養された(上記導入部分を参照)「ヒト」単離体と名付けられた単離体、例えば、MIL単離体、DEN単離体、LN単離体、MEL単離体、及びWO 02 077211において「クリプトウイルス(cryptovirus)」と記載されている単離体
が明らかに存在する。
これらの種々のPIV-5単離体のFタンパク質の配列における変異は極めてわずかである。
これらの変異の記述は、Chatziandreou et al,(2004)(その内容並びに特に表3及びこの論文中でそれに付随するコメントは、参照により本特許出願に組み込まれる)によって与えられる。
この論文の表3をここに再現する:
Figure 2012509076
Figure 2012509076
Figure 2012509076
Figure 2012509076
上記の表1において、空欄は、関係するFタンパク質が、左側のカラムに示されているW3A株のFタンパク質と同じアミノ酸を有することを示す。その位置がこの表に明記されていないアミノ酸ももちろん、W3AのFタンパク質の配列中におけるそれらに対応するものと同じである。これらのアミノ酸自体は、WR単離体のFタンパク質の配列中におけるそれらに対応するものと同じである(配列番号31の配列を参照)。
それ故、配列番号35〜46の配列は、これら配列の各々について、表1に示された配列番号31のアミノ酸の配列における置換(及び、適切な場合、示された配列番号31のアミノ酸の配列のC−末端部分における付加)により得られる配列である。
W3A単離体のFタンパク質、並びに上記の他の単離体のFタンパク質は、
・147位における、アミノ酸T;
・158位における、アミノ酸T;
・447位における、アミノ酸L;及び
・449位における、アミノ酸I
を有する。
このように、W3A及びWR単離体は、他の単離体において529位を超えて伸長する細胞質伸長(cytoplasmic extension)を有していないことが分かる。関係する単離体に依存して、この細胞質伸長は、2から7のアミノ酸を含有する。
また、これらの単離体のFタンパク質の配列は、WR株のFタンパク質の配列と比較して5%未満(より具体的には、最大3%)だけ変化していることが分かる(細胞質伸長を考慮にいれない、即ち、このパーセンテージはWRのFタンパク質の長さから算出される);Chatziandreou et al.(2004)による論文の第85頁の終わりを参照されたい。
PIV-5のFタンパク質は、従って、
・配列番号31の配列、又は前記代替配列「443にSを有する配列番号31」;又は
・配列番号31の前記配列又は前記代替配列「443にSを有する配列番号31」の変異配列であって、
○配列番号31の配列と同じサイズであるか、又は配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ小さいサイズであるか、又は配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ大きいサイズであり[前記代替配列「443にSを有する配列番号31」は、配列番号31の配列と同じサイズである]、好ましくは配列番号31の配列と同じサイズを有し、又は配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ大きいサイズを有し;及び
○配列番号31の配列又は前記代替配列「443にSを有する配列番号31」に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有する(この同一性は、配列番号31の配列の長さ又は適切な場合には前記代替配列「443にSを有する配列番号31」の配列の長さを用いて算出される)
として定義され得る変異配列
からなっていてもよい。
配列番号31のPIV-5のFタンパク質の変異配列は、特に、上記の単離体W3A、MIL、DEN、LN、MEL、クリプトウイルス、CPI+、CPI−、H221、78524、Tl及びSERのFタンパク質の配列を含む(上記表1及びChatziandreou et al,(2004)の論文を参照されたい)。
同様に、本願においてPIV-2 Fタンパク質のための基準として作用する配列は、図1Bに提示されたGreer株の配列である(配列番号33のタンパク質配列、配列番号32のコーディング核酸配列)。
例えばV98、V94 Toshiba 単離体などのGreer単離体以外のPIV-2 単離体が明らかに存在する。
これらの他のPIV-2単離体のFタンパク質の配列は、Greer単離体のものと極めて近いが、単離体間の変異である幾つかの小さい変異を有する。
それ故、PIV-2 Fタンパク質は、
・配列番号33の配列;又は
・配列番号33の前記配列の変異配列であって、
○配列番号33の配列と同じサイズであるか、又は配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ小さいサイズであるか、又は配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ大きいサイズであり、好ましくは配列番号33の配列と同じサイズを有し、好ましくは配列番号33の配列とサイズが同じであり;及び
○配列番号33の配列に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有する(この同一性は、配列番号33の配列の長さを用いて算出される)
として定義され得る変異配列
からなっていてもよい。
PIV-5のFタンパク質の配列(配列番号31)をPIV-2のもの(配列番号33)に対してアラインメントした結果のコンセンサス配列(配列番号34)は、以下の通りであり、図2Aに見出される。このコンセンサス配列は、以下のように書き換えられる。
Figure 2012509076
シンボル「-」は、PIV-5のFタンパク質とPIV-2のFタンパク質がこの位置において異なるアミノ酸を有することを示す。
このコンセンサス配列は、以下のように形式化することもできる:
Figure 2012509076
PIV-5のWR単離体のFタンパク質の配列は、N−末端においてアミノ酸MGTにより先行される配列番号34の配列である(図1A及び2Aを参照)。
PIV-2のGreer単離体のFタンパク質の配列は、N−末端においてアミノ酸MHHLHPM(配列番号86)により先行され、C−末端においてアミノ酸ENPAFFSKNNHGNIYGIS(配列番号87)が続く配列番号34の配列である(図1B及び2Aを参照)。
PIV-5及びPIV-2のFタンパク質の配列は、配列番号34の配列を含む配列であり、好ましくは配列番号34の配列を含むPIVウイルスのFタンパク質の配列であると考えられ得る。より具体的には、PIV-5及びPIV-2のFタンパク質の配列は、以下のように考えられ得る:
a) 配列番号34の配列であって、
・N−末端において3〜7のアミノ酸によって先行され、より具体的にはN−末端において3アミノ酸(例えばMGT)又は7アミノ酸(例えばMHHLHPM)によって先行され;及び
・任意に、C−末端において18アミノ酸が続き、より具体的にはC−末端においてアミノ酸ENPAFFSKNNHGNIYGISが続く
配列;又は
b) 上記a)で記載された配列の変異配列であって、
・下記の何れか:
i. 配列番号31の配列と同じサイズを有するか、又は配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ小さいサイズであるか、又は配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ大きいサイズであり;好ましくは配列番号31の配列と同じサイズを有し、又は配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ大きいサイズであり;及び
ii. 配列番号31の配列又は前記代替配列「443にSを有する配列番号31」に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有する(この同一性は、配列番号31の配列の長さ又は適切な場合には前記代替配列「443にSを有する配列番号31」の長さを用いて算出される);
・又は
i. 配列番号33の配列と同じサイズを有するか、又は配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ小さいサイズであるか、又は配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ大きいサイズであるか、好ましくは配列番号33の配列と同じサイズを有し;及び
ii. 配列番号33の配列に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有する(この同一性は、配列番号33の配列の長さを用いて算出される)
である変異配列。
本発明の突然変異タンパク質:
本願は、突然変異タンパク質であって、そのアミノ酸配列が、
・置換:
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列中の22位のアミノ酸、又は、前記PIV-2 Fタンパク質の配列中の24位のアミノ酸の、アミノ酸Pによる置換(PIV-5のFにおける突然変異22P;PIV-2のFにおける突然変異24P);及び
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列中の132位のアミノ酸、又は、前記PIV-2 Fタンパク質の配列中の133位のアミノ酸の、アミノ酸Eによる置換(PIV-5のFにおける突然変異132E;PIV-2のFにおける突然変異133E);及び
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列中の290位のアミノ酸、又は、前記PIV-2 Fタンパク質の配列中の294位のアミノ酸の、アミノ酸Aによる置換(PIV-5のFにおける突然変異290A;PIV-2のFにおける突然変異294A);及び
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列中の447位のアミノ酸、又は、前記PIV-2 Fタンパク質の配列中の445位のアミノ酸の、アミノ酸Pによる置換(PIV-5のFにおける突然変異447P;PIV-2のFにおいける突然変異445P);
・並びに、置換:
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列中の147位のアミノ酸、又は、前記PIV-2 Fタンパク質の配列中の151位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換(PIV-5のFにおける突然変異147Hy;PIV-2のFにおける突然変異151Hy);及び/又は
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列中の158位のアミノ酸、又は、前記PIV-2 Fタンパク質の配列中の162位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換(PIV-5のFにおける突然変異158Hy;PIV-2のFにおける突然変異162Hy);
・並びに、任意に:
○前記Fタンパク質の天然の(又は自然の)切断サイトの、別の酵素的切断サイトによる置換、及び/又は、前記Fタンパク質の天然の(又は自然の)切断サイト以外の酵素的切断サイトの、前記Fタンパク質への挿入;及び/又は
○前記Fタンパク質のC−末端部分であって、前記タンパク質のC−末端にある最後のアミノ酸からN−末端方向に伸張するが、前記Fタンパク質のHR2ドメインを超えては伸張しないC−末端部分の欠失
によって、PIV-5又はPIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される(derivable)配列を含む突然変異タンパク質に関する。
前記アミノ酸の位置は、前記Fタンパク質の前駆体形態(F0)の配列(即ち、切断前のFタンパク質の配列)に対して算出され、その位置はN−末端からC−末端へカウントされる。
PIV-2 Fタンパク質において示された位置は、PIV-5のFタンパク質において示されたものと対応する位置である(位置の対応の表を示す図2Bを参照されたい)。
PIV-5又はPIV-2ウイルスの前記Fタンパク質の配列は、上記で定義されたとおりである。よって、それは、特に配列番号34の配列(PIV-5及びPIV-2のFタンパク質のコンセンサス配列)を含むと定義され得る。
PIV-5 Fタンパク質の突然変異タンパク質:
本発明の一つの側面に従って、本発明の突然変異タンパク質は、下記のPIV-5ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される配列を含む:
・配列番号31の配列(図1Aに示されたPIV-5のWR単離体のFタンパク質の配列)、又は前記代替配列「443にSを有する配列番号31」の配列;又は
・配列番号31の前記配列又は前記代替配列「443にSを有する配列番号31」の変異配列であって、
○配列番号31の配列と同じサイズであるか(即ち、529アミノ酸からなる)、又は配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ大きいサイズであるか(即ち、530、531、532、533、534、535又は536アミノ酸からなる)、又は配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ小さいサイズであり(即ち、522、523、524、525、526、527又は528アミノ酸からなる);及び
○配列番号31の配列又は前記代替配列「443にSを有する配列番号31」に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有し、この同一性は、配列番号31の配列の長さ又は(適切な場合には)前記代替配列「443にSを有する配列番号31」の長さを用いて算出される、変異配列。
好ましくは、PIV-5の前記Fタンパク質の配列は、以下からなる:
・配列番号31の配列(図1Aに示されたPIV-5のWR単離体のFタンパク質の配列)、又は前記代替配列「443にSを有する配列番号31」の配列;又は
・配列番号31の前記配列又は前記代替配列「443にSを有する配列番号31」の変異配列であって、
○配列番号31の配列と同じサイズであるか(即ち、529アミノ酸からなる)、又は配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ大きいサイズである(即ち、530、531、532、533、534、535又は536アミノ酸からなる);及び
○配列番号31の配列又は前記代替配列「443にSを有する配列番号31」に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有し、この同一性は、配列番号31の配列の長さ又は適切な場合には前記代替配列「443にSを有する配列番号31」の長さを用いて算出される、変異配列。
そのような変異配列の具体的な例は、本願の表1に示されているW3A、MIL、DEN、LN、MEL、クリプトウイルス、CPI+、CPI−、H221、78524、Tl及びSERの単離体の一つのFタンパク質の配列(上記を参照)、即ち、配列番号35〜46の配列の一つを含む。
好ましくは、PIV-5の前記Fタンパク質の配列は、配列番号31の配列(図1Aに示されたPIV-5のWR単離体のFタンパク質の配列)、又は、前記代替配列「443にSを有する配列番号31」からなり、特に好ましくは、前記代替配列「443にSを有する配列番号31」からなる。
好ましくは、PIV-5の前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列は、このFタンパク質配列から、少なくとも上記の突然変異22P、132E、290A、447Pおよび158Hyによって導き出される。
好ましくは、PIV-5の前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列は、このFタンパク質配列から、少なくとも上記の突然変異22P、132E、290A、447Pおよび147Hyによって導き出される。
好ましくは、PIV-5の前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列は、このFタンパク質配列から、少なくとも上記の突然変異22P、132E、290A、447P、147Hyおよび158Hyによって導き出される。
PIV-5のFタンパク質の配列から導き出される前記配列は、PIV-5の前記Fタンパク質配列に対して、上記の突然変異22P、132E、290A、447Pおよび147Hy/158Hy以外の突然変異を含まなくてもよい。
あるいは、PIV-5のFタンパク質の配列から導き出される前記配列は、上記の突然変異22P、132E、290A、447Pおよび147Hy/158Hyによって、及び、上記の突然変異22P、132E、290A、447P以外の少なくとも一つの突然変異によって、好ましくは、
・以下から選択される少なくとも一つの融合前(pre-fusion)突然変異:
○49位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○402位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○443位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換;
○449位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換;
及び/又は
・以下から選択される少なくとも一つの融合後(post-fusion)突然変異:
○463位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
によって、このFタンパク質配列から導き出され得る。
好ましくは、PIV-5の前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列は、上記の突然変異22P、132E、290A、447Pおよび147Hy/158Hyによって、及び、
・以下から選択される少なくとも一つの融合前突然変異:
○49位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○402位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
及び/又は
・以下から選択される少なくとも一つの融合後突然変異:
○463位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
によって、このFタンパク質配列から導き出される。
好ましくは、PIV-5の前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列は、上記の突然変異22P、132E、290A、447Pおよび147Hy/158Hyによって、及び、
・以下から選択される少なくとも一つの融合後突然変異:
○463位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
によって、このFタンパク質配列から導き出される。
463位のアミノ酸を置換するために選択される前記疎水性アミノ酸は、有利にはV、I、Lから選択され、好ましくはVである。
Figure 2012509076
表4に示した突然変異は、任意のPIV-5単離体、即ち、WR単離体又は変異単離体のFタンパク質に導入され得る。より具体的には、それらは、図1Aに示された配列番号31のFタンパク質配列(ジーンバンクデータベースから受入れ番号AB021962で入手可能なWRのFタンパク質)に導入され得る。
しかしながら、上記のように、本発明者らがATCCから受領し、下記の実施例に記載した突然変異タンパク質の構築及び生産に用いたWR単離体のサンプルは、(ジーンバンクから入手可能な配列の点から見て予想されるものとは対照的に)Fタンパク質の443位にアミノ酸Pを有しておらず、アミノ酸Sを有していた。従って、表4に示した突然変異は、前記代替配列「443にSを有する配列番号31」(配列番号62、63、64)に導入され得る。
PIV-2 Fタンパク質の突然変異タンパク質:
本発明の別の側面に従って、本発明の突然変異タンパク質は、PIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される配列を含む。
前記PIV-2 Fタンパク質の配列は、上記で定義されたとおりである。特にそれは、
・配列番号33の配列(図1Bに示したPIV-2のGreer単離体のFタンパク質の配列);又は
・配列番号33の配列の変異配列であって、
○配列番号33の配列と同じサイズであるか(即ち、551アミノ酸からなる)、又は配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ大きいサイズであるか(即ち、552又は553アミノ酸からなる)、又は配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ小さいサイズであり(即ち、549又は550アミノ酸からなる);及び
○配列番号33の配列に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有し、この同一性は、配列番号33の配列の長さを用いて算出される、変異配列
からなっていてもよい。
好ましくは、PIV-2の前記Fタンパク質の配列は、
・配列番号33の配列(図1Bに示したPIV-2のGreer単離体のFタンパク質の配列);又は
・配列番号33の配列の変異配列であって、
○配列番号33の配列と同じサイズであるか(即ち、551アミノ酸からなる)、又は配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ大きいサイズであり(即ち、552又は553アミノ酸からなる);及び
○配列番号33の配列に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有し、この同一性は、配列番号33の配列の長さを用いて算出される、変異配列
からなる。
さらに好ましくは、PIV-2の前記Fタンパク質の配列は、
・配列番号33の配列(図1Bに示したPIV-2のGreer単離体のFタンパク質の配列);又は
・配列番号33の配列の変異配列であって、
○配列番号33の配列と同じサイズであり(即ち、551アミノ酸からなる);及び
○配列番号33の配列に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有し、この同一性は、配列番号33の配列の長さを用いて算出される、変異配列
からなる。
特に好ましくは、前記Fタンパク質の配列は、配列番号33の配列(図1Bに示したPIV-2のGreer単離体のFタンパク質の配列)からなる。
好ましくは、前記PIV-2のFタンパク質の配列から導き出される前記配列は、このFタンパク質配列から、少なくとも上記の突然変異24P、133E、294A、445Pおよび162Hyによって導き出される。
好ましくは、PIV-2の前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列は、このFタンパク質配列から、少なくとも上記の突然変異24P、133E、294A、445Pおよび151Hyによって導き出される。
好ましくは、PIV-2の前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列は、このFタンパク質配列から、少なくとも上記の突然変異24P、133E、294A、445P、162Hyおよび151Hyによって導き出される。
PIV-5のFタンパク質の配列から導き出される前記配列は、PIV-2の前記Fタンパク質配列に対して、上記の突然変異24P、133E、294A、445Pおよび151Hy/162Hy以外の突然変異を含まなくてもよい。
あるいは、PIV-2のFタンパク質の配列から導き出される前記配列は、上記の突然変異24P、133E、294A、445Pおよび151Hy/162Hyによって、及び上記の突然変異24P、133E、294A、445P以外の少なくとも一つの突然変異によって、好ましくは、
・以下から選択される少なくとも一つの融合前突然変異:
○53位アミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○406位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○428位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換;
○439位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換;
及び/又は
・以下から選択される少なくとも一つの融合後突然変異:
○474位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
によって、このFタンパク質配列から導き出され得る。
好ましくは、PIV-2の前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列は、上記の突然変異24P、133E、294A、445Pおよび151Hy/162Hyによって、及び、
・以下から選択される少なくとも一つの融合前突然変異:
○53位アミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○406位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
及び/又は
・以下から選択される少なくとも一つの融合後突然変異:
○474位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
によって、このFタンパク質配列から導き出される。
好ましくは、PIV-2の前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列は、上記の突然変異24P、133E、294A、445Pおよび151Hy/162Hyによって、および
・474位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
から選択される少なくとも一つの融合後突然変異によって、このFタンパク質配列から導き出される。
474位のアミノ酸置換において選択される前記疎水性アミノ酸は、有利にはV、I、Lから選択され、好ましくはVである。
Figure 2012509076
表5に示した突然変異は、任意のPIV-2単離体、即ち、Greer単離体又は変異単離体のFタンパク質に導入され得る。よって、より具体的には、それらは、図1Bに示された配列番号33のFタンパク質配列(GreerのFタンパク質;配列番号88〜90)に導入され得る。
Figure 2012509076
切断サイト:
本発明に従って、本発明の突然変異タンパク質は、
・上述の突然変異;および更に
・前記Fタンパク質の天然の切断サイトの、別の酵素的切断サイトによる置換、および/または前記Fタンパク質の天然の切断サイト以外の酵素的切断サイトの前記Fタンパク質への挿入、好ましくは、前記Fタンパク質の天然の切断サイトの、別の酵素的切断サイトによる置換
によって、PIV-5またはPIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される配列を含み得る。
PIV-5またはPIV-2のFタンパク質の切断サイトは、このFタンパク質の2つのサブユニット(F1およびF2)の切断サイトである。
PIV-5およびPIV-2のFタンパク質の天然型において、この切断サイトは、フューリン(furines)により切断されるサイトである。
PIV-5のFタンパク質の天然型において、この切断サイトは、配列RRRRR (配列番号23) からなる。これは、PIV-5のFタンパク質の天然型の98〜102位にある (図1A参照)。PIV-5のFタンパク質の天然(または自然)の切断サイトを含むPIV-5のFタンパク質配列の断片の例は、以下のとおりである:
IGENLETIRNQLIPTRRRRRFAGVVIGL (配列番号24)。
PIV-2のFタンパク質の天然型において、切断サイトは、配列KTRQKR (配列番号25) からなる。これは、PIV-2のFタンパク質の天然型の101〜106位にある (図1B参照)。PIV-2のFタンパク質の天然(または自然)の切断サイトを含むPIV-2のFタンパク質配列の断片の例は、LTPLIENLSKISTVTDTKTRQKRFAGVVVGLAALGVA (配列番号26) である。
好ましくは、天然の切断サイト以外の前記切断サイトは、組織特異的切断サイトである。
好ましくは、天然の切断サイト以外の前記切断サイトは、一または複数の腫瘍組織によって特異的に発現される酵素の切断サイトであり、更に好ましくは、一または複数の転移性組織によって酵素特異的に発現される酵素の切断サイトである。
一例として、天然の切断サイト以外の前記切断サイトは、金属プロテアーゼの切断サイト、たとえばマトリクス金属プロテアーゼ9 (MMP-9) の切断部位であり得る;下記の例2を参照。
マトリクス金属プロテアーゼ9 (MMP-9) の切断サイトは、配列PXXHy S/T (配列番号27){ここでX = 任意のアミノ酸、Hy = 任意の疎水性アミノ酸 (すなわち、F、M、V、L、Iから選択される任意のアミノ酸)}を含んでいてもよいし、この配列からなっていてもよい。
一例として、マトリクス金属プロテアーゼ9 (MMP-9) の切断サイトは、配列PRRIT (配列番号28) および/または配列
IGENLETIRNQLIPTPRRITFAGVVIGL (配列番号29)
を含んでいてもよいし、この配列からなっていてもよい。
本発明の核酸:
また本出願は、本発明による突然変異タンパク質をコードする核酸、DNAまたはRNA (普遍的な遺伝暗号に従って、この遺伝暗号の縮重を許容する)、並びにかかる核酸の相補的核酸(同じ長さの完全に相補的な核酸)に関する。
かかる核酸は、配列番号30の配列 (天然のPIV-5 Fタンパク質をコードする配列)、または前記代替配列“443にSを有する配列番号31”をコードする代替配列、または変異Fタンパク質をコードする変異配列、あるいは、配列番号32の配列 (天然のPIV-2 Fタンパク質をコードする配列)、または変異Fタンパク質をコードする変異配列から導き出される。
本発明のベクター:
また本出願は、本発明による少なくとも一つの核酸を含む核酸ベクター、より具体的には、トランスフェクション、形質導入または形質転換ベクターに関する。
有利には、かかるベクターは、発現ベクターであり得る。
好ましくは、これは、動物細胞 (非ヒト動物細胞および/またはヒト細胞) において、より好ましくは、
・ヒト細胞、有利には病的なヒト細胞、より具体的にはヒト腫瘍細胞、より好ましくは転移性黒色腫細胞において;または
・胎盤細胞において、
前記少なくとも一つの核酸の発現を許容するベクターである。
かかる発現ベクターは、有利には、アデノウイルスベクターであり得る。
前記アデノウイルスベクターは、前記核酸の発現を調節するためのエレメント、好ましくはプロモーターを含んでいてもよく、腫瘍細胞、好ましくは転移性細胞、より好ましくは転移性黒色腫細胞において前記核酸の発現を許容する。
好ましくは、この発現は特異的である。有利には、この発現は、非腫瘍 (または非転移性) 細胞において有意な発現は存在しないが、前記腫瘍細胞または転移性細胞において前記核酸の発現を許容するように十分に特異的である。
有利には、かかるアデノウイルスベクターは、腫瘍崩壊性アデノウイルスベクターである。
有利には、本発明の発現ベクターは、前記核酸の発現を調節するためのエレメント、好ましくはプロモーターを含み、胎盤細胞、好ましくは不十分な膜融合性 (fusogenicity) を有する病的な胎盤細胞において前記核酸の発現を許容する、アデノウイルスベクターであり得る。
好ましくは、この発現は特異的である。有利には、この発現は、非胎盤細胞において有意な発現は存在しないが、前記胎盤細胞において前記核酸の発現を許容するように十分に特異的である。
本発明のベクターは、択一的または補足的に、動物細胞 (非ヒト動物細胞および/またはヒト細胞)、より好ましくはヒト細胞、有利には病的なヒト細胞、より具体的にはヒト腫瘍細胞、好ましくは転移性ヒト細胞、より好ましくは転移性黒色腫細胞のゲノムへの、前記少なくとも一つの核酸の挿入を許容するベクターであり得る。かかるベクターは、より具体的には、腫瘍、具体的には転移性腫瘍、より具体的には転移性黒色腫の遺伝子治療のために向けられる。
また本出願は、本発明の少なくとも一つの核酸を含み、動物細胞 (非ヒト動物細胞および/またはヒト細胞)、より好ましくはヒト細胞、有利には胎盤細胞、好ましくはヒトの胎盤細胞のゲノムへの、前記少なくとも一つの核酸の挿入を許容する、ベクターに関する。かかるベクターは、より具体的には、不完全な胎盤の発達を伴う疾病または状態の遺伝子治療のために向けられる。
本発明の細胞:
また本出願は、本発明による少なくとも一つの突然変異タンパク質、および/または本発明による少なくとも一つの核酸、DNAまたはRNA、および/または本発明による少なくとも一つのベクターを含む細胞に関する。
かかる細胞は、ヒト細胞または非ヒト動物細胞であり得る。
好ましくは、かかる細胞は、腫瘍細胞、好ましくは転移性細胞、より好ましくは転移性黒色腫細胞である。
かかる細胞は、後述されるとおり、シンシチウムの形成を誘導することができる膜融合 (fusogenic) 能力を備えた細胞としての適用を見出す。
あるいは、本発明の細胞は、ヒトまたは非ヒト動物の免疫系の非腫瘍細胞、好ましくは非腫瘍性のヒトまたは非ヒト動物の樹状細胞であってもよく、前記細胞は、本発明による少なくとも一つの突然変異タンパク質をその表面で発現している。かかる細胞は、後述されるとおり、たとえば活性な免疫処置により、細胞融合阻害剤の産生を誘導することができる薬剤としての適用を見出す。
医学的適用 (融合促進(pro-fusion)):
本発明の突然変異タンパク質、および/または本発明の核酸、DNAまたはRNA、および/または本発明のベクター、および/または本発明の細胞は、病的な細胞および/または生物の健康に好ましくない細胞の存在および/または増殖を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和において、より具体的には、不十分な細胞の膜融合性 (cellular fusogenicity) を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和において、好ましくは疾病または腫瘍形成状態、たとえば腫瘍、転移性腫瘍、有利には転移性黒色腫の治療および/または予防および/または緩和において使用され得る。
かかる疾病または状態は、これらの病的な細胞および/または好ましくない細胞の低減または除去により、治療および/または予防および/または緩和され得る。
かかる細胞の表面で発現される本発明の突然変異タンパク質は、これら細胞の融合を誘導し、その結果、シンシチウムの形成を誘導し、これら細胞の破壊(または少なくとも数の減少)につながる。
本発明の突然変異タンパク質、および/または本発明の核酸、DNAまたはRNA、および/または本発明のベクター、および/または本発明の細胞は、胎盤の発達不全を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和において使用され得る。
かかる疾病または状態は、胎盤細胞の融合の誘導または刺激により、治療および/または予防および/または緩和され得る。
よって、本出願はまた、本発明の少なくとも一つの突然変異タンパク質、および/または本発明の少なくとも一つの核酸、DNAまたはRNA、および/または本発明の少なくとも一つのベクター、および/または本発明の細胞を含む、薬学的組成物または薬に関する。
かかる薬学的組成物またはかかる薬は、上述のような病的な細胞および/または生物の健康に好ましくない細胞の存在および/または増殖を伴う疾病または状態 (例として、腫瘍、転移性腫瘍、転移性黒色腫) の治療および/または予防および/または緩和、あるいは不十分な細胞の膜融合性 (cellular fusogenicity) を伴う疾病または状態 (例として、胎盤の発達不全) の治療および/または予防および/または緩和に向けられてもよい。
かかる薬学的組成物またはかかる薬は、少なくとも一つの薬学的および/または生理学的に許容可能な賦形剤を更に含んでもよい。
本発明の突然変異タンパク質 (または本発明の核酸、DNA、RNA、または発現ベクター) は、ヒト細胞または非ヒト動物細胞により発現されるように、好ましくはかかる細胞の表面で発現されるように使用され得る。
この細胞は、病的な細胞、好ましくは腫瘍細胞、より好ましくは転移性細胞、より好ましくは転移性黒色腫細胞であってもよいし、非腫瘍細胞、たとえば健康な細胞であってもよい。
より具体的には、ヒト患者または病気の非ヒト動物被検体から取り出された病的な細胞を、本発明の少なくとも一つの突然変異タンパク質、および/または本発明の少なくとも一つの核酸、DNAまたはRNA、および/または本発明の少なくとも一つの発現ベクターと、本発明の突然変異タンパク質を発現させるように接触させることにより、エクスビボで(ex vivo)(またはインビトロで) 処理してもよい。
択一的または補足的に、患者または被検体の病的な細胞の近くに局在するが病的でない細胞を取り出して、当該処理を行ってもよい。
このようにエクスビボで(またはインビトロで)処理された細胞は、その後、前記患者または被検体に再投与するように向けられてもよい。
かかる細胞は、前記患者または被検体が冒されている病状、たとえば腫瘍、転移性腫瘍、転移性黒色腫の治療および/または予防および/または緩和のために有用である。
あるいは、この細胞は、胎盤の細胞、より具体的には、不十分な膜融合性(fusogenicity)に罹患している胎盤の細胞であり得る。かかる細胞は、本発明の突然変異タンパク質をその表面で発現させることにより一旦処理されると、胎盤の発達不全の治療および/または予防および/または緩和に向けられてもよい。
よって本出願は、より具体的には、疾病または腫瘍形成状態、好ましくは腫瘍、より好ましくは転移性腫瘍、更に好ましくは転移性黒色腫の治療および/または予防および/または緩和において使用するための、本発明による突然変異タンパク質、本発明による核酸、DNAまたはRNA、本発明によるベクター、本発明による細胞に関する。
また本出願は、より具体的には、胎盤の発達不全の治療および/または予防および/または緩和において使用するための、本発明による突然変異タンパク質、本発明による核酸、DNAまたはRNA、本発明によるベクター、本発明による細胞に関する。
本発明による融合阻害剤:
また本出願は、細胞融合を減少させるかまたは遮断する能力を有する生成物に関する。これら生成物は、本発明の一または複数の突然変異タンパク質の阻害剤である。
かかる阻害剤は、過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和において、好ましくはエンベロープに包まれたウイルスの感染(たとえばHIV、インフルエンザ、パラインフルエンザまたはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶の治療および/または予防および/または緩和において使用され得る。
好ましくは、本発明による阻害剤は、以下のとおりである:
・本発明による突然変異タンパク質に対する抗体、またはかかる抗体のFabもしくはF(ab’)2断片;または
・本発明による少なくとも一つの突然変異タンパク質に、または本発明による核酸、DNA、RNAに、特異的に結合する核酸アプタマーまたはペプチドアプタマー;または
・本発明による少なくとも一つの突然変異タンパク質をその表面で発現する、組換え免疫系細胞、好ましくは組換え樹状細胞;または
・本発明による核酸のアンチセンス核酸;または
・19〜22のヌクレオチドを含有する二本鎖RNAを含み、かつ本発明による核酸に結合する(ハイブリダイズする)ことができる、低分子干渉(small interfering)RNA、siRNA。
よって、本出願はまた、ヒトまたは非ヒト動物の免疫系の非腫瘍細胞、好ましくはヒトまたは非ヒト動物の樹状細胞であって、本発明による少なくとも一つの突然変異タンパク質をその表面で発現する細胞に関するとともに、過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和における、好ましくはエンベロープに包まれたウイルスの感染(たとえばHIV、インフルエンザ、パラインフルエンザまたはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶の治療および/または予防および/または緩和における、この細胞の使用に関する。
また本出願は、本発明による突然変異タンパク質または本発明の幾つかの突然変異タンパク質に対する抗体に関する。好ましくは、この抗体は、本発明の前記突然変異タンパク質に特異的な抗体である。有利には、この抗体はモノクローナル抗体である。本発明の阻害剤は、かかる抗体の保存された断片、たとえばFabまたはF(ab')2断片であり得る。
かかる抗体または抗体断片は、たとえば、それを必要とする患者または被検体に前記抗体または抗体断片を投与することにより、細胞融合メカニズムを遮断または阻害するように向けられてもよい。
択一的または補足的に、本発明の突然変異タンパク質は、このタンパク質に対して活性な免疫化を誘導するために、すなわち、前記患者または被検体による抗−突然変異タンパク質抗体の産生を誘導するために、前記患者または被検体にそれ自体投与するように向けられてもよい。必要な場合または所望の場合、一または複数のワクチンアジュバントが、前記突然変異タンパク質の一または複数と一緒に、または異なる時間で投与されてもよい。
よって、本出願はまた、免疫原性剤としての本発明の少なくとも一つの突然変異タンパク質、および有利には少なくとも一つの免疫化アジュバントを含む、治療用および/または予防用および/または緩和用ワクチンに関する。かかるワクチンは、過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和のため、好ましくは、エンベロープに包まれたウイルスの感染(たとえば、HIV、インフルエンザ、パラインフルエンザまたはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶の治療および/または予防および/または緩和のために向けられてもよい。
また本出願は、以下のものに関する:
・本発明の少なくとも一つの突然変異タンパク質に、または本発明の核酸、DNA、RNAに、特異的に結合する核酸アプタマーまたはペプチドアプタマー;
・本発明の少なくとも一つの突然変異タンパク質をその表面で発現する、組換え免疫系細胞、好ましくは組換え樹状細胞;
・本発明の核酸のアンチセンス核酸;
・19〜22のヌクレオチドを含有する二本鎖RNAを含み、かつ本発明の核酸に結合する(ハイブリダイズする)ことができ、有利には前記核酸の転写を遮断または阻害することができる、低分子干渉(small interfering)RNA、siRNA。
また、かかる生成物は、本発明の阻害剤でもある。よって、これらは、上述のような過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和のために向けられてもよい。より具体的には、これらは、Fタンパク質の発現または過剰発現について少なくとも一つの遺伝子を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和のために向けられる。
よって、本出願はまた、本発明の少なくとも一つの阻害剤を含む薬学的組成物または薬に関する。
かかる薬学的組成物または薬は、とりわけ、上述のような過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和のために向けられてもよい。
かかる薬学的組成物または薬は、少なくとも一つの薬学的および/または生理学的に許容可能な賦形剤を更に含んでもよい。
本出願は、より具体的には、過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和において使用するための本発明による阻害剤であって、前記疾病または状態が、エンベロープに包まれたウイルスの感染(好ましくは、HIVおよび/またはインフルエンザおよび/またはパラインフルエンザおよび/またはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶である阻害剤に関する。
本出願は、より具体的には、過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和において免疫原性剤として使用するための本発明による突然変異タンパク質であって、前記疾病または状態が、エンベロープに包まれたウイルスの感染(好ましくは、HIVおよび/またはインフルエンザおよび/またはパラインフルエンザおよび/またはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶である突然変異タンパク質に関する。
本出願は、より具体的には、ワクチンまたはワクチン組成物、より具体的には、過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和のために向けられたワクチンまたはワクチン組成物であって、前記疾病または状態が、エンベロープに包まれたウイルスの感染(好ましくは、HIVおよび/またはインフルエンザおよび/またはパラインフルエンザおよび/またはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶であるワクチンまたはワクチン組成物に関する。かかるワクチンまたはワクチン組成物は、少なくとも本発明による突然変異タンパク質を含み、少なくとも一つの生理学的に許容可能なアジュバントを任意に含む。
診断および予後の適用:
また本出願は、
・不十分なシンシチウムの形成、たとえば、腫瘍、転移性腫瘍、転移性黒色腫または胎盤の発達不全;あるいは対照的に
・過剰なシンシチウムの形成、たとえば、エンベロープに包まれたウイルスの感染(好ましくは、HIVおよび/またはインフルエンザおよび/またはパラインフルエンザおよび/またはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶
を伴う疾病または状態の診断または予後のための方法、より具体的にはインビトロでの方法に関する。
本発明の診断または予後の方法は、たとえば、診断または予後を受ける患者または被検体から採取された生物学的サンプルなどの生物学的サンプルにおいて、本発明による少なくとも一つの突然変異タンパク質または本発明による少なくとも一つの核酸を検出することを含む。
この検出は、たとえば、前記サンプル中に含有されるタンパク質または核酸の配列を決定することにより行ってもよい。
この検出は、たとえば、前記少なくとも一つの突然変異タンパク質に結合する抗体、ペプチドアプタマーまたはオリゴヌクレオチドアプタマーを用いて、より具体的には、本発明の抗体、ペプチドアプタマーまたはオリゴヌクレオチドアプタマーを用いて、本発明の前記少なくとも一つの突然変異タンパク質を検出することにより行ってもよい。
この検出は、たとえば、前記少なくとも一つの核酸に結合する核酸、ペプチドアプタマーまたはオリゴヌクレオチドアプタマーを用いて、より具体的には、本発明の核酸に相補的な核酸、本発明のペプチドアプタマーまたはオリゴヌクレオチドアプタマーを用いて、本発明の前記少なくとも一つの核酸を検出することにより行ってもよい。
また本出願は、不十分なシンシチウムの形成または対照的に過剰なシンシチウムの形成の診断または予後のための方法で使用するための、前記抗体、ペプチドアプタマー、オリゴヌクレオチドアプタマー、相補的な核酸に関する。
生物工学的適用 (スクリーニング):
また本出願は、シンシチウムの形成を減少させるかまたは遮断することができる化合物をスクリーニングするための方法、より具体的にはインビトロでの方法に関する。本発明の方法は、(たとえば、候補化合物の存在下で達成される融合度を、その非存在下で達成される融合度と比較することにより) 候補化合物が前記細胞の融合を減少させるかまたは遮断するかどうかを決定するために、候補化合物を、本発明の少なくとも一つの突然変異タンパク質を発現する細胞と接触させることを含む。
かかる化合物は、過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態、たとえば、エンベロープに包まれたウイルスの感染、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶の治療および/または予防および/または緩和のための有効成分候補である。
生物工学的適用 (骨髄腫、ハイブリドーマ):
また本出願は、本発明による少なくとも一つの突然変異タンパク質を含む、好ましくは少なくとも一つのかかる突然変異タンパク質をその表面に含む、および/または本発明による少なくとも一つの核酸を含む、および/または本発明による少なくとも一つのベクター、より具体的には本発明による発現ベクターを含む、腫瘍細胞、より具体的には骨髄腫に関する。
かかる腫瘍細胞、より具体的にはかかる骨髄腫は、とりわけ、(この腫瘍細胞とBリンパ球との融合による)ハイブリドーマの産生、より具体的には抗体産生ハイブリドーマの産生に使用され得る。
また本出願は、本発明による少なくとも一つの突然変異タンパク質、および/または本発明による少なくとも一つの核酸、および/または本発明による少なくとも一つのベクターを含む、ハイブリドーマ、より具体的には抗体産生ハイブリドーマに関する。かかるハイブリドーマは、とりわけ、本発明による少なくとも一つの突然変異タンパク質を含む、好ましくは少なくとも一つのかかる突然変異タンパク質をその表面に含む、および/または本発明による少なくとも一つの核酸を含む、および/または本発明による少なくとも一つのベクターを含む、少なくとも一つの腫瘍細胞、より具体的には骨髄腫と、少なくとも一つのBリンパ球を接触させることにより産生され得る。かかる腫瘍細胞は、固有の膜融合 (fusogenic) 能力を有する:よって、かかる腫瘍細胞は、従来技術においてハイブリドーマの産生を目的として腫瘍細胞とBリンパ球との融合を誘導するために慣用的に使用されるポリエチレングリコール(PEG)またはエレクトロポレーション法または任意の他の方法を使用することなく、前記少なくとも一つのBリンパ球と融合することができる。
生物工学的適用 (幹細胞または前駆細胞):
また本出願は、本発明による少なくとも一つの突然変異タンパク質を含む、好ましくは少なくとも一つのかかる突然変異タンパク質をその表面に含む、および/または本発明による少なくとも一つの核酸を含む、および/または本発明による少なくとも一つのベクター、より具体的には本発明による発現ベクターを含む、幹細胞または前駆細胞に関する。
かかる幹細胞または前駆細胞は、固有の膜融合 (fusogenic) 能力を有する:よって、かかる幹細胞または前駆細胞は、融合によりシンシチウムを形成することができる。
この幹細胞または前駆細胞が、筋細胞への分化能力を有している場合、(細胞の融合およびシンシチウムの形成により) 筋繊維を形成することができる。
よって、本出願はまた、筋繊維の産生、たとえばインビトロでの産生において使用するための、かかる幹細胞または前駆細胞に関する。
この産生は、たとえば、複数の前記幹細胞または前駆細胞を、互いに接触させて、幹細胞、または適切な場合には前駆細胞の増殖を許容する培地上または培地中に置くことにより行ってもよく、その結果、前記幹細胞または前駆細胞の膜融合(fusogenic)能力が発揮され、これによりシンシチウム、より具体的には筋繊維の形成を誘導することができる。幹細胞、または適切な場合には前駆細胞の増殖を許容し、かつ筋細胞、より具体的には筋繊維への可能な分化能力の発現に適している培地の例は、当業者に公知であり;一例は、MCDB培地である。
幹細胞または前駆細胞の、筋細胞、より具体的には筋繊維への分化を観察することを許容する細胞マーカーの例は、当業者に公知であり、たとえばCD56である。
本出願において、“含む(comprising)”の用語は、“包含する(including)”または“含有する(containing)”と同義であり、明示的に指摘されない一または複数の追加のエレメント、成分または工程の存在を除外しないオープンな用語であり、一方、“からなる(consisting)”または“構成される(constituted)”の用語は、明示的に開示されない任意の他の追加のエレメント、工程または成分の存在を除外するクローズした用語である。“から本質的になる(essentially consisting of)”または“により本質的に構成される(essentially constituted by)”の用語は、追加のエレメント、成分または工程が、発明に基づいて特徴に重大な影響を及ぼさない限り、一または複数の追加のエレメント、成分または工程の存在を除外しない部分的にオープンな用語である。
その結果、“含む(comprising)”(または“comprise(s)”)の用語は、“からなる(consisting of)”、“により構成される(constituted by)”の用語、並びに“から本質的になる(essentially consisting of)”および“により本質的に構成される(essentially constituted by)”の用語を包含する。
本出願で引用される文献および参照文献の内容は、参照により組み込まれる。
以下の実施例は、例示のために純粋に記載され、本発明を何ら限定するものではない。
例1:突然変異体の構築およびそれらの膜融合性(fusogenicity)の測定
材料および方法および:
細胞およびウイルス
細胞株LLC-MK2 (Macaca mulatta腎臓細胞株) は、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション (American Type Culture Collection (ATCC)) から受入れ番号CCL-7で入手可能である。
細胞株A549 (ヒト肺癌細胞株) は、ATCCから受入れ番号CCL-185で入手可能である。
組換え株HuH7-Tat (ヒト肝癌細胞株) は、HIV-1 TatによるHuH-7株の細胞の形質導入により入手可能である。
HuH-7株は、ジャパニーズ・コレクション・オブ・リサーチ・バイオリソース(Japanese Collection of Research Bioresources)からリファレンス番号JCRB0403で入手可能である。
HIV-TatによるHuH-7株の形質導入は、レトロウイルスベクターLXSN-tatを用いて行い、Tatプラスミドを形質導入した。
細胞LLC-MK2、A549およびHuH7-Tatは、5%ウシ胎仔血清を含むEMEM (イーグル最小必須培地) またはDMEM (ダルベッコ/フォークト改変イーグル最小必須培地) で培養した。
PIV-5 WR株は、ATCC (ATCC番号VR-288) から入手し、Terrier et al, 2008に記載されるとおりLLC-MK2細胞上で培養した。
RNAの抽出、RT-PCRおよびクローニング
ウイルスRNAは、PIV-5によるLLC-MK2細胞の感染から得られた上清から、Absolutely RNA(登録商標) Microprep Kit (Stratagene, USA) を用いて、供給業者により提供される説明書に従って抽出した。逆転写は、pd(N)6ランダムヘキサマー (Amersham Biosciences, GB) および鳥類骨髄芽球症ウイルスAMVの逆転写酵素 (Reverse Transcriptase; RT) (Promega から入手可能なAMV-RT逆転写酵素) を用いて行った。
PIV-5 Fの全配列の増幅は、データベースから入手可能なPIV-5のヌクレオチド配列 (GenBank受入れ番号AB021962) から設計されたプライマー対を用いて行った。
使用されたプライマー対は、以下のとおりであった:
センスプライマー (配列番号 1):
5' TTGCGGCCGCATGGGTACTATAA 3'
アンチセンスプライマー (配列番号 2):
5' CCGCTCGAGTTATGATAAACAAAATTCTCC 3'。
増幅は、以下のプロトコールに従って行った:95℃で2 min、その後39サイクル (95℃/30s、55℃/1 min、72℃/3 min)、および72℃で10 minの最後の伸長。
PIV-5 Fの相補的DNAは、マルチプルクローニングサイトにあるNotIおよびXhoIサイトで、発現プラスミドpcDNA3.1(+) にクローニングした (図4参照)。
PCR産物およびプラスミドは、それぞれ、Nucleospin(登録商標) ExtractIIキットおよびNucleospin(登録商標) プラスミドキット (Macherey Nagel, Germany) を用いて、供給業者により提供される説明書に従って精製した。
この研究における配列決定のシリーズは、MWG Biotech (Ebersberg, Germany) により実行した。
ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を用いた指定突然変異誘発
PIV-5のFタンパク質の突然変異タンパク質は、PIV-5 F融合タンパク質をコードするプラスミドpcDNA3.1において、指定突然変異により産生した。突然変異は、供給業者により提供されるプロトコール (Stratageneから入手可能なQuickChange(登録商標) Site-Directed Mutagenesis System) に従って、相補的プライマーを用いたPCRにより作成した。使用されたプライマーのリストは、下記表2に示す。プラスミドのアセンブリは、配列決定により確認した。
Figure 2012509076
Figure 2012509076
突然変異443Pは、理論的には、WR単離体のFタンパク質に予め存在する。しかし、発明者らがATCCから受領したこの単離体のサンプルに、この突然変異は実際に存在しなかった。このため、発明者らはそれを導入しなければならなかった。
細胞のトランスフェクション
試薬ExGen500 (Fermentas) を用いて、供給業者により提供される説明書に従って、細胞をプラスミドによりトランスフェクトした。1〜3マイクログラムのプラスミドDNAを、48hの間、細胞 (70〜80% コンフルエンス) に添加した。トランスフェクションの効率は、緑色蛍光タンパク質GFPをコードするプラスミドを用いて評価した。
共焦点顕微鏡による免疫蛍光法
トランスフェクトされた細胞は、リン酸緩衝生理食塩水PBS中のパラホルムアルデヒド (1% v/v) を用いて固定し、その後、2回洗浄した。PBSで1/10に希釈された、PIV-5 Fタンパク質に対するモノクローナル抗体の存在下で、この場合、Randall et al, 1987に記載されるモノクローナル抗体F1aの存在下で、細胞マットを3hの間インキュベートした。モノクローナル抗体F1aは、PIV-5の単離体 (この場合、LN単離体) に対するマウスの免疫処置、ハイブリドーマの調製、および特異的な抗F抗体の選択により得た。
その後、細胞マットを洗浄し、PBSで1/200に希釈された抗マウスIgG-Alexa Fluor(登録商標) 633二次抗体 (Invitrogen) とともに30分間インキュベートした。細胞を、すすいだ後、1/1000のDapi (4',6'-ジアミジノ-2-フェニルインドール) とともに、リン酸緩衝生理食塩水PBS中1/200の、Alexa Fluor(登録商標) 488に結合した小麦胚凝集素 (WGA) (Invitrogenから入手可能なWGA-Alexa Fluor(登録商標)) と混合するか、または混合せずに、10分間インキュベートした。TCS SP2共焦点顕微鏡 (Leica) を用いて、画像を取得した。
フローサイトメトリー
フローサイトメトリーは、文献 (Horvat and Lamb 1992) に記載されるとおり行った。A549細胞を、種々のFusをコードするプラスミドによりトランスフェクトし、氷上に置いた。細胞マットを、1 %のアジ化ナトリウムを含むリン酸緩衝生理食塩水PBSですすいだ。その後、そのマットに、抗PIV-5 Fタンパク質モノクローナル抗体 (この場合、モノクローナル抗体F1a) を添加し (1% ウシ胎仔血清を含む1/500 PBSリン酸緩衝液)、4℃で30分間インキュベートした。その後、そのマットをすすぎ、1/1000のAlexa Fluor(登録商標) 488 に結合した抗マウス二次抗体 (Invitrogen) の存在下でインキュベートした。細胞を、すすいだ後、500μLのPBSリン酸緩衝液、EDTA (エチレンジアミンジアミン四酢酸) 中0.5mMを用いて穏やかに引き離した。細胞を、500μLの1 %パラホルムアルデヒド溶液を含有する専用のフローサイトメトリー管に移した。5000細胞の蛍光強度を、蛍光活性化細胞ソーティングFACSを用いて、この場合、Becton DickinsonからのFACSVantageTM SEフローを用いて測定した。
半定量的融合テスト (シンシチウムのサイズおよび核の数の関数として確立した融合スコア)
種々のFus発現プラスミドによりトランスフェクトし、免疫蛍光法で観察したマットに、半定量的分析を行った。この分析は、以下の基準を用いて突然変異体の各々について融合スコアを決定することから構成される:
・融合または融合なし (単純な集合)、-/+で表示;
・シンシチウムのサイズ、1〜5のスケールで表示;
・核の数、1〜5のスケールで表示。
これにより計算されるスコアを、2つの点数を足すことにより得た:このため、最大の理論的点数は、10であり、最大数の核をもつ最大サイズのシンシチウムに相当する。
定量的融合テスト (ルシフェラーゼ活性の測定)
細胞−細胞融合を定量するために、“ドナー”A549細胞 (6ウェルプレートのウェルあたり2.5百万の細胞) を、種々のFus突然変異タンパク質をコードする2μgのプラスミドpcDNA3.1、並びに長い末端反復配列LTRに依存してルシフェラーゼを発現する50 ngのプラスミドで、同時トランスフェクトした (Lavillette et al, 2007)。
ネガティブコントロールは、2μgの空のプラスミドpcDNA3.1で同時トランスフェクトした細胞により提供した。
トランスフェクションから12時間後、“ドナー”細胞を、リン酸緩衝液 (PBS)、EDTA中0.5 mMを用いて引き離し、カウントした後に、新たな6ウェルプレート(105細胞/ウェル)に置き換えた。“インジケーター”HuH7-Tat細胞 (4 × 105細胞/ウェル) を、PBS-EDTA緩衝液を用いて引き離し、その後、すすいで“ドナー”細胞に添加した。
ルシフェラーゼ活性は、共培養 (co-culture) の72時間後に、ルシフェラーゼ活性測定キットを用いて、この場合、PromegaからのLuciferase Assay System (E1500) キットを用いて、供給業者により提供される指示書に従って測定した。
結果:
本発明者らにより構築され産生された突然変異タンパク質は、上記表3に示される。
この表3において、本発明者らは、種々の突然変異を、それらが属する機能に従ってまとめた。すなわち、
・HNに対する自律性の機能への関与: PIV-5のFタンパク質の22、132および290位;
・融合前の機能への関与:PIV-5のFタンパク質の49、402、443、447および449位;
・融合後の機能への関与:PIV-5のFタンパク質の147、158および463位。
図5A、5B、5Cおよび5Dは、表3の突然変異の位置を図示する。
このように、本発明者らは、突然変異タンパク質を構築し、産生し、試験した。
Figure 2012509076
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これら突然変異タンパク質の構築および産生の間に使用されたPIV-5のFタンパク質配列は、WR単離体の代替Fタンパク質配列であった。この代替配列は、443位のアミノ酸がPでなくSであることを除いて、配列番号31の配列 (Genbank配列) と同じであった (代替配列“443にSを有する配列番号31”)。
このため、配列番号47〜79の配列は、前述の代替配列“443にSを有する配列番号31”内におけるアミノ酸の置換から得られる配列であり、このアミノ酸の置換は、上記表3に、これら配列の各々について示される。
半定量的融合テストの間に顕微鏡下で行われた観察の写真を、図6Aに示す。
半定量的融合テストの最後に得られたスコアを、図6Bに示す。
突然変異タンパク質Fus 6、Fus 6.1、Fus 6.2およびFus 6.3は、多くの細胞の凝集という結果につながったが、細胞融合という結果につながらなかった。
突然変異タンパク質Fus 3.3、Fus 3.1、Fus 2、Fus 1.1、Fus 1.2およびFus 1は、ゼロの融合スコアを得た。
突然変異タンパク質Fus 9、Fus 7、Fus 3、Fus 5およびFus 4は、低い融合スコアを得た。
Fus 4の融合スコアを超えて、有意な融合スコアを有する一連の突然変異タンパク質が分離した。すなわち、
・自律性の3つの突然変異および融合前の突然変異449Pを共通に含む突然変異タンパク質のグループ、たとえば、突然変異タンパク質Fus8、Fus10、Fus10.4、Fus10.5、Fus11、Fus8.l、Fus8.2、Fus8.4、Fus8.5、Fus8.6、Fus8.7、Fus10.l、Fus10.2、Fus10.3;および
・自律性の3つの突然変異、融合前の突然変異447P、および少なくとも一つの融合後の突然変異 (147Vまたは158V) を共通に含む突然変異タンパク質のグループ、たとえば、Fus7.1、Fus7.2またはFus7.3。
図7Aおよび7Bは、テストされた突然変異タンパク質の選択物について、顕微鏡観察の写真を示し、融合スコアを示す。すなわち、
・自律性の3つの突然変異;
・融合前の突然変異447P;および
・147および/または158位における少なくとも一つの融合後の突然変異であって、この/これらの位置に疎水性アミノ酸、たとえばV、IまたはLを提示する突然変異、たとえば融合後の突然変異147Vおよび/または融合後の突然変異158V
を共通に含む突然変異タンパク質のグループ、たとえば突然変異タンパク質Fus7.1、Fus7.2およびFus7.3。
例2:転移性腫瘍組織により特異的に発現される酵素のサイトによる天然の切断サイトの置換
本発明の突然変異タンパク質、およびとりわけ上記表1に記載されるものは、天然のFタンパク質の天然の切断サイトの置換により、たとえば、それを組織特異的な切断サイトで置換することにより、予め改変された。
例として、PIV-5のFタンパク質の天然の切断サイトは、転移性腫瘍組織により特異的に発現される酵素、すなわちマトリクス金属プロテアーゼ9 (MMP-9) のサイトにより置換された。
PIV-5のFタンパク質の天然の切断サイトは、以下のとおりである:
RRRRR (配列番号 23)。
PIV-5のFタンパク質の天然の切断サイトを含むFタンパク質配列の断片の例は、以下のとおりである:
IGENLETIRNQLIPTRRRRRFAGVVIGL (配列番号 24)。
MMP-9切断サイトのコンセンサス配列は、以下のとおりである:
PXXHyS/T (配列番号 27)
ここでX = 任意のアミノ酸、および
ここでHy = 任意の疎水性アミノ酸 (すなわち、F、M、V、L、Iから選択される任意のアミノ酸)。
MMP-9切断サイトの例は、以下のとおりである:
PRRIT (配列番号 28)。
MMP-9切断サイトを含む本発明の突然変異Fタンパク質配列の断片の例は、以下のとおりである:
IGENLETIRNQLIPTPRRITFAGVVIGL (配列番号 29)。
材料および方法:
PIV-5のFタンパク質の突然変異タンパク質は、上記例1に記載されるとおり産生した。
選択された切断サイト、この場合、配列番号28のMMP-9切断サイトによる天然の切断サイトの置換は、以下のとおり行った:
切断サイトの置換は、融合タンパク質F PIV-5をコードするプラスミドpcDNA3.1において、3つの連続的な指定突然変異誘発により行った。突然変異は、供給業者により提供されるプロトコール (Stratageneから入手可能なQuickChange(登録商標) Site-Directed Mutagenesis System) に従って、相補的プライマーを用いたPCRにより作成した。プラスミドのアセンブリは、配列決定により確認した。
1st 突然変異 R98P
センス 5' CCAGTTGATTCCAACTCCGAGGAGACGCCGGTTTGC 3' (配列番号80)
アンチセンス 5' GCAAACCGGCGTCTCCTCGGAGTTGGAATCAACTGG 3' (配列番号81)
2nd 突然変異 R101I
センス 5 ' GATTCCAACTCCGAGGAGAATCCGGTTTGCAGGAGTGGTG 3 ' (配列番号82)
アンチセンス 5 ' CACCACTCCTGCAAACCGGATTCTCCTCGGAGTTGGAATC 3' (配列番号83)
3rd 突然変異 R102T
センス 5' GATTCCAACTCCGAGGAGAATCACGTTTGCAGGAGTGGTGATTGG 3' (配列番号84)
アンチセンス 5' CCAATCACCACTCCTGCAAACGTGATTCTCCTCGGAGTTGGAATC 3' (配列番号85)。
細胞のトランスフェクション
試薬ExGen500 (Fermentas) を用いて、供給業者により提供される説明書に従って、細胞をプラスミドによりトランスフェクトした。1〜3マイクログラムのプラスミドDNAを、48hの間、細胞 (70〜80% コンフルエンス) に添加した。トランスフェクションの効率は、緑色蛍光タンパク質GFPをコードするプラスミドを用いて評価した。
共焦点顕微鏡による免疫蛍光法
トランスフェクトされた細胞は、リン酸緩衝生理食塩水PBS中のパラホルムアルデヒド (1% v/v) を用いて固定し、その後、2回洗浄した。PBSで1/10に希釈された、融合タンパク質PIV-5 Fに対するモノクローナル抗体の存在下で、この場合、Randall et al, 1987に記載されるモノクローナル抗体F1aの存在下で、細胞マットを3hの間インキュベートした。モノクローナル抗体F1aは、PIV-5の単離体 (この場合、LN単離体) に対するマウスの免疫処置、ハイブリドーマの調製、および特異的な抗F抗体の選択により得た。
その後、細胞マットを洗浄し、PBSで1/200に希釈された抗マウスIgG-Alexa Fluor(登録商標) 633二次抗体 (Invitrogen) とともに30分間インキュベートした。細胞を、すすいだ後、1/1000のDapi (4',6'-ジアミジノ-2-フェニルインドール) とともに、リン酸緩衝生理食塩水PBS中1/200の、Alexa Fluor(登録商標) 488に結合した小麦胚凝集素 (WGA) (Invitrogenから入手可能なWGA-Alexa Fluor(登録商標)) と混合するか、または混合せずに、10分間インキュベートした。TCS SP2共焦点顕微鏡 (Leica) を用いて、画像を取得した。
参照文献
Baker et al, 1999, Mol Cell. 3(3):309-19.
Chatziandreou et al, 2004, Journal of General Virology 85: 3007-3016.
Horvat and Lamb 1992, J. Virol. 66(4): 2443-2455.
Ito et al 1997, J Virol. 71(12): 9855-9858.
Ito et al, 2000, J Gen Virol. 81(Pt 3):719-727.
Gardner and Dutch 2007, J. Virol. 81(15):8303-14.
Gardner et al, 2007, Biochemistry 46(17):5094-5105.
Lavillette D. et al, 2007, J. Virol. 81(16): 8752-8765
Paterson et al, 2000, Virology 270(l):17-30.
Randall et al, 1987, J . Gen. Virol. 68(Pt 1l): 2769-2780
Russell et al, 2003, J. Cell Biol. 163(2):363-74.
Terrier et al, 2008, Journal of Clinical Virology, 2008, 43(1): 86-92.
West et al, 2005, J Virol. 79(3):1543-1551.
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Terrier et al, 2008, Journal of Clinical Virology, 2008, 43(1): 86-92.
West et al, 2005, J Virol. 79(3):1543-1551.
以下に、本願出願の当初の特許請求の範囲に記載された発明を付記する。
[1] 突然変異タンパク質であって、そのアミノ酸配列が、
・置換:
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における22位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における24位のアミノ酸の、アミノ酸Pによる置換;および
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における132位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における133位のアミノ酸の、アミノ酸Eによる置換;および
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における290位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における294位のアミノ酸の、アミノ酸Aによる置換;および
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における447位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における445位のアミノ酸の、アミノ酸Pによる置換;
・並びに、置換:
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における147位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における151位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換;および/または
○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における158位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における162位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換;
・並びに、任意に:
○前記Fタンパク質の天然の切断サイトの、別の酵素的切断サイトによる置換、および/または前記Fタンパク質の天然の切断サイト以外の酵素的切断サイトの、前記Fタンパク質への挿入;および/または
○前記Fタンパク質のC-末端部分であって、前記タンパク質のC-末端にある最後のアミノ酸からN-末端方向に伸張するが、前記Fタンパク質のHR2ドメインを超えては伸張しないC-末端部分の欠失
によって、PIV-5またはPIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される配列を含む突然変異タンパク質。
[2] PIV-5またはPIV-2ウイルスの前記Fタンパク質の配列が、配列番号34の配列を含むことを特徴とする、[1]に記載の突然変異タンパク質。
[3] 前記Fタンパク質の配列が、PIV-5のFタンパク質であることを特徴とする、[1]または[2]に記載の突然変異タンパク質。
[4] 前記Fタンパク質の配列が、
・配列番号31の配列、または443位のアミノ酸が、この代替配列では(配列番号31のPの代わりに)Sであることを除いて、配列番号31の配列と同じである代替配列;または
・配列番号31の前記配列または前記代替配列の変異配列であって、
○配列番号31の配列と同じサイズであるか、または配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ大きいサイズであるか、または配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ小さいサイズであり;
○配列番号31の配列または前記代替配列に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有し、この同一性は、配列番号31の配列の長さまたは適切な場合には前記代替配列の長さを用いて算出される、変異配列
からなることを特徴とする、[3]に記載の突然変異タンパク質。
[5] 前記Fタンパク質が、配列番号35〜46の配列の一つからなることを特徴とする、[4]に記載の突然変異タンパク質。
[6] そのアミノ酸配列が、前記PIV-5 Fタンパク質配列に対して他の突然変異を含まないことを特徴とする、[3]〜[5]の何れか一に記載の突然変異タンパク質。
[7] 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、配列番号62、63または64の配列である、[6]に記載の突然変異タンパク質。
[8] 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、
○49位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○402位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○443位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換;
○449位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換
から選択される少なくとも一つの融合前の突然変異;および/または
○463位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
から選択される少なくとも一つの融合後の突然変異
によって、前記Fタンパク質配列から更に導き出されることを特徴とする、[3]〜[5]の何れか一に記載の突然変異タンパク質。
[9] 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、
○49位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○402位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換
から選択される少なくとも一つの融合前の突然変異:および/または
○463位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
から選択される少なくとも一つの融合後の突然変異
によって、前記Fタンパク質配列から更に導き出されることを特徴とする、[3]〜[5]および[8]の何れか一に記載の突然変異タンパク質。
[10] 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、463位のアミノ酸を疎水性アミノ酸によって置換することにより前記Fタンパク質配列から更に導き出されることを特徴とする、[3]〜[5]、[8]および[9]の何れか一に記載の突然変異タンパク質。
[11] 463位のアミノ酸を置換するために選択される前記疎水性アミノ酸が、V、I、Lから選択され、好ましくはVであることを特徴とする、[8]〜[10]の何れか一に記載の突然変異タンパク質。
[12] PIV-5ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される前記配列が、前記PIV-5 Fタンパクス質の配列における158位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換を含むことを特徴とする、[3]〜[11]の何れか一に記載の突然変異タンパク質。
[13] PIV-5ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される前記配列が、前記PIV-5 Fタンパクス質の配列における147位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換を含むことを特徴とする、[3]〜[11]の何れか一に記載の突然変異タンパク質。
[14] 前記Fタンパク質の配列が、PIV-2のFタンパク質であることを特徴とする、[1]または[2]に記載の突然変異タンパク質。
[15] 前記Fタンパク質の配列が、
・配列番号33の配列;または
・配列番号33の前記配列の変異配列であって、
○配列番号33の配列と同じサイズであるか、または配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ大きいサイズであるか、または配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ小さいサイズであり;
○配列番号33の配列に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有し、この同一性は、配列番号33の配列の長さを用いて算出される、変異配列
からなることを特徴とする、[14]に記載の突然変異タンパク質。
[16] そのアミノ酸配列が、前記PIV-2 Fタンパク質配列に対して他の突然変異を含まないことを特徴とする、[14]または[15]に記載の突然変異タンパク質。
[17] 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、配列番号88、89、90の配列であることを特徴とする、[16]に記載の突然変異タンパク質。
[18] 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、
○53位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○406位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○428位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換;
○439位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換
から選択される少なくとも一つの融合前の突然変異;および/または
○474位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
から選択される少なくとも一つの融合後の突然変異
によって、前記Fタンパク質配列から更に導き出されることを特徴とする、[14]または[15]に記載の突然変異タンパク質。
[19] 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、
○53位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
○406位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換
から選択される少なくとも一つの融合前の突然変異;および/または
○474位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換;
から選択される少なくとも一つの融合後の突然変異
によって、前記Fタンパク質配列から更に導き出されることを特徴とする、[14]、[15]、[18]の何れか一に記載の突然変異タンパク質。
[20] 474位のアミノ酸を置換するために選択される前記疎水性アミノ酸が、V、I、Lから選択され、好ましくはVであることを特徴とする、[18]または[19]に記載の突然変異タンパク質。
[21] PIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される前記配列が、前記PIV-2 Fタンパクス質の配列における162位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換を含むことを特徴とする、[14]〜[20]の何れか一に記載の突然変異タンパク質。
[22] PIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される前記配列が、前記PIV-2 Fタンパクス質の配列における151位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換を含むことを特徴とする、[14]〜[20]の何れか一に記載の突然変異タンパク質。
[23] [1]〜[22]の何れか一に記載の突然変異タンパク質であって、前記Fタンパク質の天然の切断サイトの、別の酵素的切断サイトによる置換により、および/または前記Fタンパク質の天然の切断サイト以外の酵素的切断サイトの、前記Fタンパク質への挿入により、PIV-5またはPIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される配列を含むことを特徴とする、突然変異タンパク質。
[24] 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、組織特異的切断サイトであることを特徴とする、[23]に記載の突然変異タンパク質。
[25] 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、一または複数の腫瘍組織によって酵素特異的に発現される酵素の切断サイトであることを特徴とする、[23]または[24]に記載の突然変異タンパク質。
[26] 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、一または複数の転移性組織によって酵素特異的に発現される酵素の切断サイトであることを特徴とする、[23]〜[25]のいずれか一に記載の突然変異タンパク質。
[27] 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、金属プロテアーゼの切断サイトであることを特徴とする、[23]〜[26]のいずれか一に記載の突然変異タンパク質。
[28] 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、マトリクス金属プロテアーゼ9(MMP-9)の切断サイトであることを特徴とする、[23]〜[27]のいずれか一に記載の突然変異タンパク質。
[29] 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、配列PXXHyS/T(配列番号27)を含み、ここで、X=任意のアミノ酸であり、Hy=F、M、V、L、Iから選択される任意のアミノ酸であることを特徴とする、[23]〜[28]のいずれか一に記載の突然変異タンパク質。
[30] 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、配列PRRIT(配列番号28)および/または配列IGENLETIRNQLIPTPRRITFAGVVIGL(配列番号29)を含むことを特徴とする、[23]〜[29]のいずれか一に記載の突然変異タンパク質。
[31] [1]〜[30]の何れか一に記載の突然変異タンパク質をコードする核酸、DNAもしくはRNA、または該核酸の相補的核酸。
[32] [31]に記載の少なくとも一つの核酸を含む、トランスフェクション、形質導入または形質転換ベクター。
[33] 発現ベクターであることを特徴とする、[32]に記載のベクター。
[34] アデノウイルスベクターであることを特徴とする、[33]に記載の発現ベクター。
[35] 前記核酸の発現を調節するためのエレメントを含み、腫瘍細胞、好ましくは転移性細胞、より好ましくは転移性黒色腫細胞において前記核酸の発現を可能にする、アデノウイルスベクターであることを特徴とする、[33]または[34]に記載の発現ベクター。
[36] 腫瘍崩壊性のアデノウイルスベクターであることを特徴とする、[33]〜[35]の何れか一に記載の発現ベクター。
[37] 動物細胞、好ましくはヒト細胞、特にヒト腫瘍細胞、好ましくは転移性ヒト細胞のゲノムへの、より好ましくは転移性黒色腫細胞への、前記少なくとも一つの核酸の挿入を可能にするベクターであることを特徴とする、[32]に記載のベクター。
[38] [1]〜[30]の何れか一に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質、および/または[31]に記載の少なくとも一つの核酸、DNAもしくはRNA、および/または[32]〜[37]の何れか一に記載の少なくとも一つのベクターを含むことを特徴とする細胞。
[39] ヒト細胞または非ヒト動物細胞であることを特徴とする、[38]に記載の細胞。
[40] 腫瘍細胞、好ましくは転移性細胞、より好ましくは転移性黒色腫細胞であることを特徴とする、[38]または[39]に記載の細胞。
[41] 疾病または腫瘍形成状態、好ましくは転移性腫瘍、好ましくは転移性黒色腫の治療および/または予防および/または緩和において使用するための、[1]〜[30]の何れか一に記載の突然変異タンパク質、[31]に記載の核酸、DNAもしくはRNA、[32]〜[37]の何れか一に記載のベクター、[38]〜[40]の何れか一に記載の細胞。
[42] 胎盤の発達不全の治療および/または予防および/または緩和において使用するための、[1]〜[30]の何れか一に記載の突然変異タンパク質、[31]に記載の核酸、DNAもしくはRNA、[32]〜[37]の何れか一に記載のベクター、[38]〜[40]の何れか一に記載の細胞。
[43] 細胞融合阻害剤であって、
・[1]〜[30]の何れか一に記載の突然変異タンパク質に対する抗体、または該抗体のFabもしくはF(ab’)2断片;
・[1]〜[30]の何れか一に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質に、または[31]に記載の核酸、DNA、RNAに、特異的に結合する核酸アプタマーまたはペプチドアプタマー;
・[1]〜[30]の何れか一に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質をその表面で発現する、組換え免疫系細胞、好ましくは組換え樹状細胞;
・[31]に記載の核酸のアンチセンス核酸;
・19〜22のヌクレオチドを含有する二本鎖RNAを含み、かつ[31]に記載の核酸に結合できる、低分子干渉(small interfering)RNA、siRNA
であることを特徴とする細胞融合阻害剤。
[44] [43]の細胞であって、ヒトまたは非ヒト動物の免疫系細胞、好ましくはヒトまたは非ヒト動物の樹状細胞であり、[1]〜[30]の何れか一に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質をその表面で発現する細胞。
[45] 過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和において使用するための、[43]の細胞融合阻害剤であって、前記疾病または状態が、エンベロープに包まれたウイルスの感染(好ましくはHIVおよび/またはインフルエンザおよび/またはパラインフルエンザおよび/またはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶である、細胞融合阻害剤。
[46] 過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和において免疫原性剤として使用するための、[1]〜[30]の何れか一に記載の突然変異タンパク質であって、前記疾病または状態が、エンベロープに包まれたウイルスの感染(好ましくはHIVおよび/またはインフルエンザおよび/またはパラインフルエンザおよび/またはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶である、突然変異タンパク質。
[47] 過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和のためのワクチンであって、前記疾病または状態が、エンベロープに包まれたウイルスの感染(好ましくはHIVおよび/またはインフルエンザおよび/またはパラインフルエンザおよび/またはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶であり、[1]〜[30]の何れか一に記載の突然変異タンパク質を少なくとも含むことを特徴とするワクチン。
[48] 不十分な又は対照的に過剰なシンシチウムの形成を伴う疾病の診断または予後のためのインビトロでの方法であって、生物学的サンプルにおいて、[1]〜[30]の何れか一に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質または[31]に記載の少なくとも一つの核酸を検出することを含むことを特徴とするインビトロでの方法。
[49] シンシチウムの形成を減少させるかまたは遮断することができる化合物をスクリーニングするためのインビトロでの方法であって、候補化合物が前記細胞の融合を減少させるかまたは遮断するかどうかを決定するために、候補化合物を[1]〜[30]の何れか一に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質と接触させることを含むことを特徴とするインビトロでの方法。
[50] [1]〜[30]の何れか一に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質を含み、好ましくは少なくとも一つの該突然変異タンパク質をその表面に含み、および/または[31]に記載の少なくとも一つの核酸を含み、および/または[32]、[37]の何れか一に記載の少なくとも一つのベクターを含む、腫瘍細胞、特に骨髄腫。
[51] ハイブリドーマの産生において使用するための、[50]に記載の腫瘍細胞、特に骨髄腫。
[52] [1]〜[30]の何れか一に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質、および/または[31]に記載の少なくとも一つの核酸、および/または[32]、[37]の何れか一に記載の少なくとも一つのベクターを含むことを特徴とするハイブリドーマ。
[53] 筋細胞への分化の能力を有する幹細胞または前駆細胞であって、[1]〜[30]の何れか一に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質を含み、好ましくは少なくとも一つの該突然変異タンパク質をその表面に含み、および/または[31]に記載の少なくとも一つの核酸を含み、および/または[32]、[37]の何れか一に記載の少なくとも一つのベクターを含むことを特徴とし、前記細胞はヒト胚細胞ではない、幹細胞または前駆細胞。
[54] 筋繊維幹細胞または前駆細胞としての使用のための、[53]の幹細胞または前駆細胞。

Claims (54)

  1. 突然変異タンパク質であって、そのアミノ酸配列が、
    ・置換:
    ○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における22位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における24位のアミノ酸の、アミノ酸Pによる置換;および
    ○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における132位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における133位のアミノ酸の、アミノ酸Eによる置換;および
    ○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における290位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における294位のアミノ酸の、アミノ酸Aによる置換;および
    ○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における447位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における445位のアミノ酸の、アミノ酸Pによる置換;
    ・並びに、置換:
    ○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における147位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における151位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換;および/または
    ○前記PIV-5 Fタンパク質の配列における158位のアミノ酸または前記PIV-2 Fタンパク質の配列における162位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換;
    ・並びに、任意に:
    ○前記Fタンパク質の天然の切断サイトの、別の酵素的切断サイトによる置換、および/または前記Fタンパク質の天然の切断サイト以外の酵素的切断サイトの、前記Fタンパク質への挿入;および/または
    ○前記Fタンパク質のC-末端部分であって、前記タンパク質のC-末端にある最後のアミノ酸からN-末端方向に伸張するが、前記Fタンパク質のHR2ドメインを超えては伸張しないC-末端部分の欠失
    によって、PIV-5またはPIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される配列を含む突然変異タンパク質。
  2. PIV-5またはPIV-2ウイルスの前記Fタンパク質の配列が、配列番号34の配列を含むことを特徴とする、請求項1に記載の突然変異タンパク質。
  3. 前記Fタンパク質の配列が、PIV-5のFタンパク質であることを特徴とする、請求項1または2に記載の突然変異タンパク質。
  4. 前記Fタンパク質の配列が、
    ・配列番号31の配列、または443位のアミノ酸が、この代替配列では(配列番号31のPの代わりに)Sであることを除いて、配列番号31の配列と同じである代替配列;または
    ・配列番号31の前記配列または前記代替配列の変異配列であって、
    ○配列番号31の配列と同じサイズであるか、または配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ大きいサイズであるか、または配列番号31の配列より最大で7アミノ酸だけ小さいサイズであり;
    ○配列番号31の配列または前記代替配列に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有し、この同一性は、配列番号31の配列の長さまたは適切な場合には前記代替配列の長さを用いて算出される、変異配列
    からなることを特徴とする、請求項3に記載の突然変異タンパク質。
  5. 前記Fタンパク質が、配列番号35〜46の配列の一つからなることを特徴とする、請求項4に記載の突然変異タンパク質。
  6. そのアミノ酸配列が、前記PIV-5 Fタンパク質配列に対して他の突然変異を含まないことを特徴とする、請求項3〜5の何れか一項に記載の突然変異タンパク質。
  7. 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、配列番号62、63または64の配列である、請求項6に記載の突然変異タンパク質。
  8. 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、
    ○49位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
    ○402位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
    ○443位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換;
    ○449位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換
    から選択される少なくとも一つの融合前の突然変異;および/または
    ○463位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
    から選択される少なくとも一つの融合後の突然変異
    によって、前記Fタンパク質配列から更に導き出されることを特徴とする、請求項3〜5の何れか一項に記載の突然変異タンパク質。
  9. 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、
    ○49位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
    ○402位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換
    から選択される少なくとも一つの融合前の突然変異:および/または
    ○463位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
    から選択される少なくとも一つの融合後の突然変異
    によって、前記Fタンパク質配列から更に導き出されることを特徴とする、請求項3〜5および8の何れか一項に記載の突然変異タンパク質。
  10. 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、463位のアミノ酸を疎水性アミノ酸によって置換することにより前記Fタンパク質配列から更に導き出されることを特徴とする、請求項3〜5、8および9のに記載の何れか一項に記載の突然変異タンパク質。
  11. 463位のアミノ酸を置換するために選択される前記疎水性アミノ酸が、V、I、Lから選択され、好ましくはVであることを特徴とする、請求項8〜10の何れか一項に記載の突然変異タンパク質。
  12. PIV-5ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される前記配列が、前記PIV-5 Fタンパクス質の配列における158位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換を含むことを特徴とする、請求項3〜11の何れか一項に記載の突然変異タンパク質。
  13. PIV-5ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される前記配列が、前記PIV-5 Fタンパクス質の配列における147位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換を含むことを特徴とする、請求項3〜11の何れか一項に記載の突然変異タンパク質。
  14. 前記Fタンパク質の配列が、PIV-2のFタンパク質であることを特徴とする、請求項1または2に記載の突然変異タンパク質。
  15. 前記Fタンパク質の配列が、
    ・配列番号33の配列;または
    ・配列番号33の前記配列の変異配列であって、
    ○配列番号33の配列と同じサイズであるか、または配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ大きいサイズであるか、または配列番号33の配列より最大で2アミノ酸だけ小さいサイズであり;
    ○配列番号33の配列に対して、95%を超える配列同一性、好ましくは少なくとも96%、より好ましくは少なくとも97%の配列同一性を有し、この同一性は、配列番号33の配列の長さを用いて算出される、変異配列
    からなることを特徴とする、請求項14に記載の突然変異タンパク質。
  16. そのアミノ酸配列が、前記PIV-2 Fタンパク質配列に対して他の突然変異を含まないことを特徴とする、請求項14または15に記載の突然変異タンパク質。
  17. 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、配列番号88、89、90の配列であることを特徴とする、請求項16に記載の突然変異タンパク質。
  18. 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、
    ○53位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
    ○406位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
    ○428位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換;
    ○439位のアミノ酸のアミノ酸Pによる置換
    から選択される少なくとも一つの融合前の突然変異;および/または
    ○474位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換
    から選択される少なくとも一つの融合後の突然変異
    によって、前記Fタンパク質配列から更に導き出されることを特徴とする、請求項14または15に記載の突然変異タンパク質。
  19. 前記Fタンパク質の配列から導き出される前記配列が、
    ○53位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換;
    ○406位のアミノ酸のアミノ酸Aによる置換
    から選択される少なくとも一つの融合前の突然変異;および/または
    ○474位のアミノ酸の疎水性アミノ酸による置換;
    から選択される少なくとも一つの融合後の突然変異
    によって、前記Fタンパク質配列から更に導き出されることを特徴とする、請求項14、15、18の何れか一項に記載の突然変異タンパク質。
  20. 474位のアミノ酸を置換するために選択される前記疎水性アミノ酸が、V、I、Lから選択され、好ましくはVであることを特徴とする、請求項18または19に記載の突然変異タンパク質。
  21. PIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される前記配列が、前記PIV-2 Fタンパクス質の配列における162位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換を含むことを特徴とする、請求項14〜20の何れか一項に記載の突然変異タンパク質。
  22. PIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される前記配列が、前記PIV-2 Fタンパクス質の配列における151位のアミノ酸の、V、I、Lから選択される疎水性アミノ酸、好ましくはVによる置換を含むことを特徴とする、請求項14〜20の何れか一項に記載の突然変異タンパク質。
  23. 請求項1〜22の何れか一項に記載の突然変異タンパク質であって、前記Fタンパク質の天然の切断サイトの、別の酵素的切断サイトによる置換により、および/または前記Fタンパク質の天然の切断サイト以外の酵素的切断サイトの、前記Fタンパク質への挿入により、PIV-5またはPIV-2ウイルスのFタンパク質の配列から導き出される配列を含むことを特徴とする、突然変異タンパク質。
  24. 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、組織特異的切断サイトであることを特徴とする、請求項23に記載の突然変異タンパク質。
  25. 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、一または複数の腫瘍組織によって酵素特異的に発現される酵素の切断サイトであることを特徴とする、請求項23または24に記載の突然変異タンパク質。
  26. 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、一または複数の転移性組織によって酵素特異的に発現される酵素の切断サイトであることを特徴とする、請求項23〜25のいずれか一項に記載の突然変異タンパク質。
  27. 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、金属プロテアーゼの切断サイトであることを特徴とする、請求項23〜26のいずれか一項に記載の突然変異タンパク質。
  28. 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、マトリクス金属プロテアーゼ9(MMP-9)の切断サイトであることを特徴とする、請求項23〜27のいずれか一項に記載の突然変異タンパク質。
  29. 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、配列PXXHyS/T(配列番号27)を含み、ここで、X=任意のアミノ酸であり、Hy=F、M、V、L、Iから選択される任意のアミノ酸であることを特徴とする、請求項23〜28のいずれか一項に記載の突然変異タンパク質。
  30. 天然の切断サイト以外の前記切断サイトが、配列PRRIT(配列番号28)および/または配列IGENLETIRNQLIPTPRRITFAGVVIGL(配列番号29)を含むことを特徴とする、請求項23〜29のいずれか一項に記載の突然変異タンパク質。
  31. 請求項1〜30の何れか一項に記載の突然変異タンパク質をコードする核酸、DNAもしくはRNA、または該核酸の相補的核酸。
  32. 請求項31に記載の少なくとも一つの核酸を含む、トランスフェクション、形質導入または形質転換ベクター。
  33. 発現ベクターであることを特徴とする、請求項32に記載のベクター。
  34. アデノウイルスベクターであることを特徴とする、請求項33に記載の発現ベクター。
  35. 前記核酸の発現を調節するためのエレメントを含み、腫瘍細胞、好ましくは転移性細胞、より好ましくは転移性黒色腫細胞において前記核酸の発現を可能にする、アデノウイルスベクターであることを特徴とする、請求項33または34に記載の発現ベクター。
  36. 腫瘍崩壊性のアデノウイルスベクターであることを特徴とする、請求項33〜35の何れか一項に記載の発現ベクター。
  37. 動物細胞、好ましくはヒト細胞、特にヒト腫瘍細胞、好ましくは転移性ヒト細胞のゲノムへの、より好ましくは転移性黒色腫細胞への、前記少なくとも一つの核酸の挿入を可能にするベクターであることを特徴とする、請求項32に記載のベクター。
  38. 請求項1〜30の何れか一項に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質、および/または請求項31に記載の少なくとも一つの核酸、DNAもしくはRNA、および/または請求項32〜37の何れか一項に記載の少なくとも一つのベクターを含むことを特徴とする細胞。
  39. ヒト細胞または非ヒト動物細胞であることを特徴とする、請求項38に記載の細胞。
  40. 腫瘍細胞、好ましくは転移性細胞、より好ましくは転移性黒色腫細胞であることを特徴とする、請求項38または39に記載の細胞。
  41. 疾病または腫瘍形成状態、好ましくは転移性腫瘍、好ましくは転移性黒色腫の治療および/または予防および/または緩和において使用するための、請求項1〜30の何れか一項に記載の突然変異タンパク質、請求項31に記載の核酸、DNAもしくはRNA、請求項32〜37の何れか一項に記載のベクター、請求項38〜40の何れか一項に記載の細胞。
  42. 胎盤の発達不全の治療および/または予防および/または緩和において使用するための、請求項1〜30の何れか一項に記載の突然変異タンパク質、請求項31に記載の核酸、DNAもしくはRNA、請求項32〜37の何れか一項に記載のベクター、請求項38〜40の何れか一項に記載の細胞。
  43. 細胞融合阻害剤であって、
    ・請求項1〜30の何れか一項に記載の突然変異タンパク質に対する抗体、または該抗体のFabもしくはF(ab’)2断片;
    ・請求項1〜30の何れか一項に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質に、または請求項31に記載の核酸、DNA、RNAに、特異的に結合する核酸アプタマーまたはペプチドアプタマー;
    ・請求項1〜30の何れか一項に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質をその表面で発現する、組換え免疫系細胞、好ましくは組換え樹状細胞;
    ・請求項31に記載の核酸のアンチセンス核酸;
    ・19〜22のヌクレオチドを含有する二本鎖RNAを含み、かつ請求項31に記載の核酸に結合できる、低分子干渉(small interfering)RNA、siRNA
    であることを特徴とする細胞融合阻害剤。
  44. 請求項43の細胞であって、ヒトまたは非ヒト動物の免疫系細胞、好ましくはヒトまたは非ヒト動物の樹状細胞であり、請求項1〜30の何れか一項に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質をその表面で発現する細胞。
  45. 過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和において使用するための、請求項43の細胞融合阻害剤であって、前記疾病または状態が、エンベロープに包まれたウイルスの感染(好ましくはHIVおよび/またはインフルエンザおよび/またはパラインフルエンザおよび/またはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶である、細胞融合阻害剤。
  46. 過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和において免疫原性剤として使用するための、請求項1〜30の何れか一項に記載の突然変異タンパク質であって、前記疾病または状態が、エンベロープに包まれたウイルスの感染(好ましくはHIVおよび/またはインフルエンザおよび/またはパラインフルエンザおよび/またはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶である、突然変異タンパク質。
  47. 過剰な細胞の膜融合性(cellular fusogenicity)を伴う疾病または状態の治療および/または予防および/または緩和のためのワクチンであって、前記疾病または状態が、エンベロープに包まれたウイルスの感染(好ましくはHIVおよび/またはインフルエンザおよび/またはパラインフルエンザおよび/またはラブドウイルスの感染)、アレルギー、自己免疫疾患または移植片拒絶であり、請求項1〜30の何れか一項に記載の突然変異タンパク質を少なくとも含むことを特徴とするワクチン。
  48. 不十分な又は対照的に過剰なシンシチウムの形成を伴う疾病の診断または予後のためのインビトロでの方法であって、生物学的サンプルにおいて、請求項1〜30の何れか一項に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質または請求項31に記載の少なくとも一つの核酸を検出することを含むことを特徴とするインビトロでの方法。
  49. シンシチウムの形成を減少させるかまたは遮断することができる化合物をスクリーニングするためのインビトロでの方法であって、候補化合物が前記細胞の融合を減少させるかまたは遮断するかどうかを決定するために、候補化合物を請求項1〜30の何れか一項に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質と接触させることを含むことを特徴とするインビトロでの方法。
  50. 請求項1〜30の何れか一項に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質を含み、好ましくは少なくとも一つの該突然変異タンパク質をその表面に含み、および/または請求項31に記載の少なくとも一つの核酸を含み、および/または請求項32、37の何れか一項に記載の少なくとも一つのベクターを含む、腫瘍細胞、特に骨髄腫。
  51. ハイブリドーマの産生において使用するための、請求項50に記載の腫瘍細胞、特に骨髄腫。
  52. 請求項1〜30の何れか一項に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質、および/または請求項31に記載の少なくとも一つの核酸、および/または請求項32、37の何れか一項に記載の少なくとも一つのベクターを含むことを特徴とするハイブリドーマ。
  53. 筋細胞への分化の能力を有する幹細胞または前駆細胞であって、請求項1〜30の何れか一項に記載の少なくとも一つの突然変異タンパク質を含み、好ましくは少なくとも一つの該突然変異タンパク質をその表面に含み、および/または請求項31に記載の少なくとも一つの核酸を含み、および/または請求項32、37の何れか一項に記載の少なくとも一つのベクターを含むことを特徴とし、前記細胞はヒト胚細胞ではない、幹細胞または前駆細胞。
  54. 筋繊維幹細胞または前駆細胞としての使用のための、請求項53の幹細胞または前駆細胞。
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