JP2012502281A5 - - Google Patents

Download PDF

Info

Publication number
JP2012502281A5
JP2012502281A5 JP2011526308A JP2011526308A JP2012502281A5 JP 2012502281 A5 JP2012502281 A5 JP 2012502281A5 JP 2011526308 A JP2011526308 A JP 2011526308A JP 2011526308 A JP2011526308 A JP 2011526308A JP 2012502281 A5 JP2012502281 A5 JP 2012502281A5
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
biomarker
individual
biomarkers
lung cancer
value
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
JP2011526308A
Other languages
English (en)
Other versions
JP2012502281A (ja
JP5701212B2 (ja
Filing date
Publication date
Application filed filed Critical
Priority claimed from PCT/US2009/056399 external-priority patent/WO2010030697A1/en
Publication of JP2012502281A publication Critical patent/JP2012502281A/ja
Publication of JP2012502281A5 publication Critical patent/JP2012502281A5/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP5701212B2 publication Critical patent/JP5701212B2/ja
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Claims (22)

  1. 個体が肺癌を有するか又は有さないかを診断するためのin vitroの方法であって:
    表1に記載のバイオマーカーのN個を含むバイオマーカーパネルを提供し、
    個体からの生体試料において、パネル中の前記バイオマーカーの1つにそれぞれ対応するバイオマーカー値を検出することを含んでなり、ここで前記個体は、前記バイオマーカー値に基づいて、肺癌を有するもの又は有さないものとして分類され、そしてここでN=2〜61である、前記方法。
  2. バイオマーカーのパネルが、1.65以上の感度+特異度値を有する、請求項1の方法。
  3. バイオマーカーのパネルが1.70以上の感度+特異度値を有する、請求項1の方法。
  4. バイオマーカー値を検出することが in vitro アッセイを実施することを含む、請求項1〜3のいずれかの方法。
  5. 前記 in vitro アッセイが前記バイオマーカーのそれぞれに対応する少なくとも1つの捕捉試薬を含み、そして前記少なくとも1つの捕捉試薬をアプタマー、抗体、及び核酸プローブからなる群より選択することをさらに含んでなる、請求項4の方法。
  6. 前記 in vitro アッセイが、イムノアッセイ、アプタマーベースのアッセイ、組織学的又は細胞学的アッセイ、mRNA発現レベルアッセイからなる群より選択される、請求項4の方法。
  7. それぞれのバイオマーカー値を既定値又は既定値範囲に基づいて評価する、請求項1〜6のいずれかの方法。
  8. 生体試料が肺組織であり、そしてここでバイオマーカー値は、前記肺組織の組織学的又は細胞学的分析より導かれる、請求項1〜7のいずれかの方法。
  9. 生体試料が、全血、血漿、及び血清からなる群より選択される、請求項1〜7のいずれかの方法。
  10. 肺癌の可能性を示すためのコンピュータ実行法であって:
    表1に記載のバイオマーカーのN個を含むバイオマーカーパネルを提供し、 コンピュータバイオマーカー情報を個体のために検索すること(ここで該バイオマーカー情報は、パネル中の前記バイオマーカーの1つにそれぞれ対応するバイオマーカー値を含む);
    前記バイオマーカー値のそれぞれの分類をコンピュータで実施すること;及び
    複数の分類に基づいて、前記個体が肺癌を有する可能性を示すことを含んでなり、そしてここでN=2〜61である、前記方法。
  11. 個体が肺癌を有する可能性を示すことがその可能性をコンピュータディスプレイ上に表示することを含む、請求項10の方法。
  12. N=3〜15である、請求項1〜11のいずれかの方法。
  13. N=3〜10である、請求項1〜11のいずれかの方法。
  14. 個体がヒトである、請求項1〜13のいずれかの方法。
  15. 個体が喫煙者である、請求項1〜14のいずれかの方法。
  16. バイオマーカーが表1、カラム6より選択される、請求項15の方法。
  17. 個体が肺結節を有する、請求項1〜16のいずれかの方法。
  18. バイオマーカーが表1、カラム5より選択される、請求項17の方法。
  19. 肺癌が非小細胞肺癌である、請求項1〜18のいずれかの方法。
  20. 肺癌の可能性を示すためのコンピュータプログラム製品であって:
    計算デバイス又はシステムのプロセッサーによって実行可能なプログラムコードを具現化するコンピュータ読み取り可能媒体を含んでなり、該プログラムコードは:
    個体からの生体試料へ帰属されるデータを検索するコード(ここで、該データは、表1より選択される少なくともN個のバイオマーカーの1つにそれぞれ対応するバイオマーカー値を含み、ここで前記バイオマーカーは、生体試料において検出された);及び
    個体の肺疾患状態を前記バイオマーカー値の関数として示す分類法を実行するコードを含んでなり;そしてここでN=2〜61である、前記コンピュータプログラム製品。
  21. 前記分類法が確率密度関数を使用する、請求項20のコンピュータプログラム製品。
  22. 前記分類法が2以上のクラスを使用する、請求項21のコンピュータプログラム製品。
JP2011526308A 2008-09-09 2009-09-09 肺癌バイオマーカーとその使用 Active JP5701212B2 (ja)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US9559308P 2008-09-09 2008-09-09
US61/095,593 2008-09-09
US15283709P 2009-02-16 2009-02-16
US61/152,837 2009-02-16
PCT/US2009/056399 WO2010030697A1 (en) 2008-09-09 2009-09-09 Lung cancer biomarkers and uses thereof

Publications (3)

Publication Number Publication Date
JP2012502281A JP2012502281A (ja) 2012-01-26
JP2012502281A5 true JP2012502281A5 (ja) 2012-09-13
JP5701212B2 JP5701212B2 (ja) 2015-04-15

Family

ID=42005456

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2011526308A Active JP5701212B2 (ja) 2008-09-09 2009-09-09 肺癌バイオマーカーとその使用

Country Status (14)

Country Link
EP (1) EP2340506B1 (ja)
JP (1) JP5701212B2 (ja)
KR (1) KR101658347B1 (ja)
CN (2) CN104198709A (ja)
AU (2) AU2009291811B2 (ja)
CA (3) CA3152591C (ja)
DK (1) DK2340506T3 (ja)
ES (1) ES2559758T3 (ja)
GB (1) GB2478441B (ja)
HK (2) HK1153834A1 (ja)
HR (1) HRP20160127T1 (ja)
MX (1) MX2011002322A (ja)
SI (1) SI2340506T1 (ja)
WO (1) WO2010030697A1 (ja)

Families Citing this family (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2012006632A2 (en) * 2010-07-09 2012-01-12 Somalogic, Inc. Lung cancer biomarkers and uses thereof
US10359425B2 (en) 2008-09-09 2019-07-23 Somalogic, Inc. Lung cancer biomarkers and uses thereof
JP2012520469A (ja) 2009-03-12 2012-09-06 キャンサー・プリヴェンション・アンド・キュア,リミテッド 性別に基づく疾病の識別・評価・予防及び治療を含む、肺病の識別・評価・予防及び治療の方法並びにそのキット
BR112013003391B8 (pt) 2010-08-13 2022-10-25 Somalogic Inc Método para diagnosticar câncer pancreático em um indivíduo
JP2014510926A (ja) * 2011-04-07 2014-05-01 ザ スクリップス リサーチ インスティテュート 細胞巨大分子の発現を調節する化合物のハイスループットスクリーニング
JP2014514572A (ja) 2011-04-29 2014-06-19 キャンサー・プリヴェンション・アンド・キュア,リミテッド 分類システムおよびそのキットを使用した肺疾患の同定および診断方法
CN103890586B (zh) * 2011-10-24 2016-06-29 私募蛋白质体公司 肺癌生物标记及其用途
CA2860298A1 (en) 2011-12-21 2013-06-27 Integrated Diagnostics, Inc. Compositions, methods and kits for diagnosis of lung cancer
US9304137B2 (en) 2011-12-21 2016-04-05 Integrated Diagnostics, Inc. Compositions, methods and kits for diagnosis of lung cancer
US11913957B2 (en) 2011-12-21 2024-02-27 Biodesix, Inc. Compositions, methods and kits for diagnosis of lung cancer
CN104115150B (zh) * 2012-02-17 2018-05-04 皇家飞利浦有限公司 急性肺损伤(ali)/急性呼吸窘迫整合征(ards)评估和监测
US9103837B2 (en) 2012-11-07 2015-08-11 Somalogic, Inc. Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) biomarkers and uses thereof
CN105814571B (zh) * 2013-11-07 2020-01-07 曼迪奥研究有限公司 肺癌评估系统及计算机可读介质
KR102087373B1 (ko) * 2015-09-11 2020-03-10 주식회사 압타머사이언스 비소세포성 폐암 진단용 단백질 바이오마커 패널 및 이를 이용한 비소세포성 폐암 진단 방법
FR3050269B1 (fr) * 2016-04-15 2018-05-11 Ecole Superieure De Physique Et De Chimie Industrielles De La Ville De Paris (Espci) Procede de selection et de recuperation de produits et systeme associe
CN105823665A (zh) * 2016-05-13 2016-08-03 北京九州柏林生物科技有限公司 生物组织样本制备套液
BR112018076528A2 (pt) * 2016-06-21 2019-04-02 The Wistar Institute Of Anatomy And Biology composições e métodos para diagnosticar cânceres de pulmão usando perfis de expressão gênica
JP6280997B1 (ja) * 2016-10-31 2018-02-14 株式会社Preferred Networks 疾患の罹患判定装置、疾患の罹患判定方法、疾患の特徴抽出装置及び疾患の特徴抽出方法
CN110709936A (zh) 2017-04-04 2020-01-17 肺癌蛋白质组学有限责任公司 用于早期肺癌预后的基于血浆的蛋白质概况分析
WO2019046814A1 (en) 2017-09-01 2019-03-07 Venn Biosciences Corporation IDENTIFICATION AND USE OF GLYCOPEPTIDES AS BIOMARKERS FOR THE DIAGNOSIS AND MONITORING OF TREATMENT
US11885815B2 (en) 2017-11-22 2024-01-30 Gritstone Bio, Inc. Reducing junction epitope presentation for neoantigens
WO2019246289A1 (en) * 2018-06-22 2019-12-26 Somalogic, Inc. Improved proteomic multiplex assays
WO2020256640A1 (en) * 2019-06-21 2020-12-24 National University Of Singapore Methods for determining the likelihood of lung cancer
CN110579611B (zh) * 2019-09-18 2023-01-31 郑州大学 一种用于肺癌早期筛查和诊断的联合检测血清标志物、试剂盒及检测方法
CN111047609B (zh) * 2020-03-13 2020-07-24 北京深睿博联科技有限责任公司 肺炎病灶分割方法和装置
CN113960235B (zh) * 2020-10-10 2023-03-14 中山大学肿瘤防治中心(中山大学附属肿瘤医院、中山大学肿瘤研究所) 生物标志物在制备肺癌检测试剂中的用途和方法
CN112557514B (zh) * 2020-12-22 2021-09-21 中国海洋大学 手持式海底沉积物样品剖面声学全自动测量装置

Family Cites Families (23)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6596503B1 (en) * 2000-08-18 2003-07-22 East Carolina University Monoclonal antibody DS6, tumor-associated antigen CA6, and methods of use thereof
US6939670B2 (en) * 2001-03-12 2005-09-06 Monogen, Inc. Cell-based detection and differentiation of lung cancer
US20030190602A1 (en) * 2001-03-12 2003-10-09 Monogen, Inc. Cell-based detection and differentiation of disease states
CA2444691A1 (en) * 2001-04-18 2002-10-31 Protein Design Labs, Inc. Methods of diagnosis of lung cancer, compositions and methods of screening for modulators of lung cancer
US8014952B2 (en) * 2002-12-18 2011-09-06 Queen Elizabeth Hospital Serum biomarkers in lung cancer
CN1225477C (zh) * 2003-03-28 2005-11-02 上海市疾病预防控制中心 肺癌早期血清特异蛋白及其应用
CN1455257A (zh) * 2003-05-23 2003-11-12 北京师范大学 一种利用表面修饰蛋白芯片进行肺癌诊断方法
JP4938451B2 (ja) * 2004-03-23 2012-05-23 オンコセラピー・サイエンス株式会社 非小細胞肺癌の診断のための方法
JP2005304497A (ja) * 2004-03-25 2005-11-04 Joji Inasawa 特定の癌関連遺伝子を用いる癌の検出方法及び癌の抑制方法
WO2005113798A2 (en) * 2004-04-15 2005-12-01 University Of Florida Research Foundation, Inc. Proteolytic markers as diagnostic biomarkers for cancer, organ injury and muscle rehabilitation/exercise overtraining
US20060204951A1 (en) * 2004-04-26 2006-09-14 Judah Folkman Platelet biomarkers for the detection of disease
JP2008508538A (ja) * 2004-08-02 2008-03-21 チルドレンズ・メディカル・センター・コーポレイション 癌についての血小板生物マーカー
CN1873417A (zh) * 2005-06-02 2006-12-06 中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所 一种用于诊断肺癌的蛋白质芯片
WO2007076439A2 (en) * 2005-12-22 2007-07-05 Abbott Laboratories Methods and marker combinations for screening for predisposition to lung cancer
US7908091B2 (en) * 2006-03-17 2011-03-15 Prometheus Laboratories Inc. Methods of predicting and monitoring tyrosine kinase inhibitor therapy
CA2666584A1 (en) * 2006-10-17 2008-04-24 Synergenz Bioscience Limited Methods and compositions for assessment of pulmonary function and disorders
US20110119776A1 (en) * 2007-02-05 2011-05-19 Wong Kwok-Kin Methods of diagnosing and prognosing lung cancer
KR100846354B1 (ko) * 2007-03-21 2008-07-15 (주) 프로탄바이오 혈청 당단백질부터 분리한 폐암 진단용 마커
EP2155908A4 (en) * 2007-05-18 2010-12-01 Univ Southern California GERMINAL LINEAR POLYMORPHISMS IN THE ANGIOGENIC PATHWAY AS PREDICTORS OF A TUMOR RECIPIENT IN THE TREATMENT OF CANCER
WO2009036123A1 (en) * 2007-09-11 2009-03-19 Cancer Prevention And Cure, Ltd. Method of identifying biomarkers in human serum indicative of pathologies of human lung tissues
WO2010003772A1 (en) * 2008-06-16 2010-01-14 Siemens Medical Solutions Diagnostics Gmbh Method for predicting adverse response to erythropoietin in breast cancer treatment
US10359425B2 (en) * 2008-09-09 2019-07-23 Somalogic, Inc. Lung cancer biomarkers and uses thereof
CA2789494C (en) * 2010-02-10 2021-08-17 The Regents Of The University Of California Salivary biomarkers for lung cancer detection

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2012502281A5 (ja)
JP2013532295A5 (ja)
KR102248900B1 (ko) 심혈관 위험 사건 예측 및 그것의 용도
JP2022519897A (ja) 対象の妊娠関連状態を決定するための方法及びシステム
Liberto et al. Current and emerging methods for ovarian cancer screening and diagnostics: a comprehensive review
HRP20160127T1 (hr) Biomarkeri raka pluä†a i njihove uporabe
KR101921945B1 (ko) 폐암 바이오마커 및 그것의 용도
US9423403B2 (en) Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) biomarkers and uses thereof
CN113271849B (zh) 结合类别不平衡集降采样与生存分析的疾病风险确定方法
JP2015514227A5 (ja)
CN105143887A (zh) 非酒精性脂肪肝疾病(nafld)和非酒精性脂肪性肝炎(nash)生物标记及其用途
CN116008563A (zh) 非酒精性脂肪肝疾病(nafld)和非酒精性脂肪性肝炎(nash)生物标记及其用途
Mengual et al. Validation study of a noninvasive urine test for diagnosis and prognosis assessment of bladder cancer: evidence for improved models
Fu et al. Liquid biopsy technologies for hematological diseases
Meng et al. Applications of laboratory findings in the prevention, diagnosis, treatment, and monitoring of COVID-19
CN116287220B (zh) 用于快速诊断川崎病的分子生物标志物和分析方法
Foko et al. The spectrum of clinical biomarkers in severe malaria and new avenues for exploration
WO2015164616A1 (en) Biomarkers for detection of tuberculosis
Gomes et al. Optimizing the molecular diagnosis of Covid-19 by combining RT-PCR and a pseudo-convolutional machine learning approach to characterize virus DNA sequences
WO2016123058A1 (en) Biomarkers for detection of tuberculosis risk
KR20180036787A (ko) 비소세포성 폐암 진단용 단백질 바이오마커 패널 및 이를 이용한 비소세포성 폐암 진단 방법
CN113444796B (zh) 与肺癌相关的生物标志物及其在诊断癌症中的应用
CN115066616A (zh) 非酒精性脂肪性肝炎(nash)生物标志物及其用途
EP3295176A1 (en) Biomarkers for detection of tuberculosis risk
CN113699235B (zh) 免疫原性细胞死亡相关基因在头颈鳞癌生存预后及放疗应答性中的应用