JP2011505826A - 合成ポリマーを用いた遺伝子サイレンシングに活性な核酸を送達する手段 - Google Patents
合成ポリマーを用いた遺伝子サイレンシングに活性な核酸を送達する手段 Download PDFInfo
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Abstract
Description
本発明また、遺伝子による遺伝病(genetic herediary disease)または複雑な遺伝子疾患の原因となるか、またはそれに関与する1種以上の標的タンパク質の発現に対し調節作用を誘導する医薬組成物として使用される組成物を提供する。
(化学薬品およびオリゴヌクレオチド)
オリゴヌクレオチドを化学的に合成し、Eurogentec(ベルギー)によってPAGE精製した。オリゴヌクレオチドは、1xアニーリング緩衝液(50mMの酢酸カリウム、50mMの酢酸マグネシウム)(Eurogentec)中、2分間にわたり95℃でアニーリングされ、次いで、室温で2〜4時間インキュベートされた。GAPDH SMARTプール(登録商標)試薬はDharmaconから入手した。
LPEIは2−エチル−2−オキサゾリンモノマーのリビングカチオン開環重合後に生成させられた中間体ポリ−2−エチル−2−オキサゾリンから得られる。
L-PEIの合成:0.35molのポリ−2−エチル−2−オキサゾリンを水100mLに溶解させ、次いで、200mLの37%塩酸を添加し、混合物を120℃に加熱した。24時間後、反応混合物を蒸発させ、次いで、水を添加した後に凍結乾燥させた。収率は90%であった。
(N,O−Boc−チロシンの合成)
L−チロシン(Sigma)5gをNa2CO3(0.1mg/mL)125mLおよびTHF50mLに溶解させた。次いで、THF75mLに溶解したBoC2O17.2gをチロシン溶液に添加し、その混合物を室温で3日間にわたり攪拌した。水(40ml)を加え、N,O−Boc−チロシンをエーテルで抽出した。水相をHClで酸性化し、酢酸エチルで新たに2回抽出した。蒸発させた後、この粗製産物をシリカゲルクロマトグラフィー(5%MeOH/CH2Cl2中)によって精製する。5.2gのN,O−BOC−チロシンを得た。
(N−Boc−トリプトファンの合成)
N−Noc−トリプトファンの合成は、N,O−Boc−チロシンの合成のために用いられたのと同一の手順により実現されたが、トリプトファン2gおよびBoc2O6.5gにより出発し、白色固体2.79gを得た。
(ポリエチレンイミン−チロシン接合体(L-PEI-Tyr)の合成)
(L-PEI10KD-Tyr33%の合成)
手順1:100mgのL-PEI10K・HCl(1.26mmol)を5mLの200mMホウ酸塩緩衝液(pH=8.2)に溶解させた。次いで、pHを10N NaOHを用いて8に調節した。THF15mLに溶解したN,O−Boc−チロシン(0.632mmol)240mgを添加し、混合物を10分間にわたり攪拌した。DMTMM(500mg)を混合物に添加し、48時間にわたって攪拌した。蒸発させた後、固体を水で洗浄した。乾燥後、239mgの黄色固体を得た(L-PEI10K-TyrBoc2)。185mgのLPEI-TyrBoc2をトリフルオロ酢酸(TFA)5mLに溶解させた。3時間後、反応混合物を蒸発させ、水中で透析した。凍結乾燥後、111mgの白色固体(L-PEI10K-Tyr)を得た。
(ポリエチレンイミン−トリプトファン接合体(L-PEI-Trp)の合成)
(L-PEI10KD-Trp33%の合成)
L-PEI-Trpの合成は、L-PEI-Tyrの合成のために用いられたのと同じ手順により実現されたが、0.1gのLPEIおよび0.193gのN−Boc−トリプトファンにより出発した。
(細胞培養)
ヒーラ(ヒト子宮頚部上皮腺癌、CCl-2)細胞の成育がMEM(Eurobio)中においてなされ、このMEMには、2mMのグルタマックス(Eurobio)、Earle’s BSS(Eurobio)、1.5g/Lの重炭酸ナトリウム(Eurobio)、0.1mMの非必須アミノ酸(Eurobio)、1.0mMのピルビン酸ナトリウム(Eurobio)、100単位/mlのペニシリン(Eurobio)、100μg/mlのストレプトマイシン(Eurobio)および10%のFBS(Perbio)が補充されていた。
トランスフェクションの1日前、2.5×104個の細胞を、24ウェル織培養プレートにおいて10%FBSを含む1mlの新鮮な完全培地中に播いた。トランスフェクションの前に、siRNA/ポリマーの複合体を調製した。所望量のsiRNAを50μlの50mMリン酸緩衝液(pH6または8)に希釈した。次いで、所望量のポリマー溶液(7.5mM窒素)をsiRNA溶液に添加した。得られた溶液を10秒間にわたりボルテックスにより混合し、室温にて10〜15分間にわたり放置した。トランスフェクション溶液を細胞に加える前に、完全培地を除去し、10%のFBSを含む新鮮な完全培地0.55mlと置き換えた。次いで、複合体溶液50μlをウェル毎に加え、プレートを37℃でインキュベートした。
トランスフェクションの1日前、5×104個の細胞を、24ウェル組織培養プレートにおいて10%FBSを含む1mlの新鮮な完全培地中に播いた。トランスフェクションの前に、ポリマー、プラスミドおよびsiRNAとの複合体を調製した。100ngのpCMVLuc(GL2Luc二本鎖配列)および所望量のsiRNAを50μlの50mMリン酸緩衝液(pH7)に希釈した。次いで、2μlのL-PEI10K-Tyr19%溶液(7.5mM窒素)をプラスミドおよびsiRNA溶液に添加した。得られた溶液を10秒間にわたりボルテックスにより混合し、室温にて10〜15分間にわたり放置した。細胞にトランスフェクション溶液を加える前に、完全培地を除去し、10%FBSを含んだ新鮮な完全培地0.55mlと置き換えた。次いで、複合体溶液50μlをウェル毎に添加し、プレートを37℃でインキュベートした。ルシフェラーゼ遺伝子発現を24時間のインキュベート期間後に測定した。実験は三重測定で行い、ルシフェラーゼ活性は、細胞溶解液中のタンパク質含量(タンパク質重量(mg))によって規格化された相対光単位(Relative Light Unit:RLU)として表された。次いで、サイレンシング効率をGL2Luc siRNAトランスフェクト細胞およびGL3Luc siRNAトランスフェクト細胞からのルシフェラーゼ活性の比からから算出した。
トランスフェクションの1日前、5×104個の細胞を、24ウェル組織培養プレートにおいて10%のFBSを含む1mlの新鮮な完全培地中に播種した。トランスフェクションの前に、ポリマーと、RNAi(siRNA、shRNA、microRNA適合低分子ヘアピン型RNA)を媒介する短鎖RNAを発現するDNAベクターとの複合体を調製した。プラスミドRNAiベクター(1μg)を50μlの50mMリン酸緩衝液(pH7)に希釈した。次いで、2〜4μlのL-PEI10K-Tyr19%溶液(7.5mM窒素)をプラスミドRNAiベクター溶液に添加した。得られた溶液を10秒間にわたりボルテックスで混合し、室温にて10〜15分間にわたり放置した。細胞にトランスフェクション溶液を加える前に、完全培地を除去し、10%FBSを含んだ新鮮な完全培地0.55mlと置き換えた。次いで、1〜50μlの複合体溶液をウェル毎に添加し、プレートを37℃でインキュベートした。インキュベーション1日後、新鮮な完全培地0.4mlを加えた。標的遺伝子の発現のレベル(mRNAレベル)またはタンパク質産生阻害のレベル(タンパク質レベル)を24日以上後に決定した。コントロールとして、標的遺伝子発現に対する(ミスマッチ配列を含む)非特異的活性RNAを発現するプラスミドRNAiベクターを用いた。
ルシフェラーゼ遺伝子発現は、市販のキット(Promega、フランス)を用いて測定された。完全培地を除去した後、1mlのPBS溶液で3回洗浄した。次いで、1×溶解バッファー100μlをウェル毎に加え、プレートを室温で30分間にわたりインキュベートした。溶解液を集め、14,000gで5分間にわたり遠心分離した。ルシフェリン溶液100μl注入後、ルシフェラーゼアッセイ法により溶解液2.5μlを評価した。発光(RLU)をルミノメーター(LB960、Berthold、フランス)により5秒間積算してモニタリングした。結果はBCAアッセイ法(Pierce、フランス)を用いて、細胞タンパク質の重量(mg)当たりの10秒間にわたり積算された光単位(RLU)として表される。
メッセンジャーRNAレベルは、QuantiGene(登録商標)BRANCHED DNAアッセイ(GenoSpectra)(全細胞溶解液を用い、標的増幅なしに実施される)により決定された。
トランスフェクションの1日前、2.5×104個のA549細胞を、24ウェル組織培養プレートにおいて10%FBSを含む1mlの新鮮な完全培地中に播種した。トランスフェクションの前に、siRNA/ポリマーの複合体を調製した。所望量のsiRNA−ローダミン(Rho)を50μlの50mMリン酸緩衝液(pH6または8)に希釈した。次いで、所望容積のL-PEI10K-Tyr33%溶液(7.5mM窒素)をsiRNA溶液に添加した。得られた溶液を10秒間にわたりボルテックスで混合し、室温にて10〜15分間にわたり放置した。細胞にトランスフェクション溶液を加える前に、完全培地を除去し、10%FBSを含んだ新鮮な完全培地0.55mlと置き換えた。次いで、複合体溶液50μlをウェル毎に加え、プレートを37℃で24または48時間にわたりインキュベートした。
2−エチル−2−オキサゾリンモノマーのカチオン開環重合を用いて、平均分子量が10kDaである線状ポリエチレンイミン(linear polyethylenimine:L-PEI)を生じさせた。次いで、「材料と方法」に記載の手順1または2に従って、L-PEI10Kを種々の程度でチロシン残基により修飾した。L-PEI-Tyr誘導体はすべて、図1に例示されるように1H-NMRによって特徴付けられる。
線状ポリエチレンイミンおよびチロシン修飾線状ポリエチレンイミン(L-PEI10KTyr33%)による培養細胞への比較siRNA送達能力を蛍光siRNA(ローダミン標識siRNA、siRNA-FluoR)を用いて試験した。少量のsiRNA-FluoR(最終濃度25および50nM)を、50μlの50mMリン酸緩衝液(pH6.0)中で2μlのL-PEI10KまたはL-PEI10KTyr33%(両者とも7.5mM窒素の保存溶液)と複合体形成させた。得られたトランスフェクション物を、10%FBSを含む完全培地で培養されたA549細胞に加えた。細胞を24ウェル組織培養プレートフォーマットで24時間にわたりインキュベートした後に、蛍光顕微鏡によって観察した。結果を図2に示す(10%FBSを含む1mlの完全細胞培養培地でインキュベートし、50μlの50mMリン酸緩衝液(pH6.0)中で25nM(A)または50nM(B)のsiRNA−ローダミン(Rho)を2μlのL-PEI10KまたはL-PEI10KTyr33%(7.5mM窒素)と複合体形成させた)。観察前、細胞を1mlのPBS-BSA 1%で洗浄し、次いで、蛍光顕微鏡法(ECLIPSE TE2000-S、Nikon)(倍率200)によって観察した。
GL3ルシフェラーゼ(SV40要素の制御下のホタル(Photinus pyralis)ルシフェラーゼ)を安定して発現するA549細胞を用いて、ポリマー媒介性siRNA送達後の選択的サイレンシングを評価した。10%FBSを含む0.55mlの完全培地において(24ウェル組織培養プレートフォーマット中)、50μlの50mMリン酸緩衝液(pH6.0)中で2μlのL-PEI10KまたはL-PEI10KTyr33%(7.5mM窒素)と複合体形成したGL3Luc siRNA(1〜100nM)を細胞にトランスフェクトした。ルシフェラーゼ遺伝子発現を48時間のインキュベート期間後に測定した。実験は三重測定で行い、ルシフェラーゼ活性は細胞溶解液中のタンパク質含量(タンパク質の重量(mg))によって規格化された相対光単位(Relative Light Unit:RLU)として表された。次いで、サイレンシング効率を非トランスフェクト細胞から算出した。
L-PEI10KTyr33%による同じトランスフェクション条件において、GL2Luc遺伝子(Elbashirら(2001)によって検証済みのsiRNA)を標的にする非特異的siRNAを用いてルシフェラーゼサイレンシングの選択性を試験した。10%FBSを含む0.55mlの完全培地(24ウェル組織培養プレートフォーマット中)において、ルシフェラーゼ遺伝子を安定して発現するA549-GL3Luc細胞に、50μlの50mMリン酸緩衝液(pH8.0)中で2μlのL-PEI10K-Tyr33%(7.5mM窒素)と複合体形成したGL3Luc siRNA(1〜20nM)をトランスフェクトした。ルシフェラーゼ遺伝子発現を48時間のインキュベート期間後に測定した。実験は三重測定で行い、ルシフェラーゼ活性は細胞溶解液中のタンパク質含量(タンパク質重量(mg))によって規格化された相対光単位(RLU)として表された。次いで、サイレンシング効率を非トランスフェクト細胞から算出した。結果を図5に示す。
50μlの50mMリン酸緩衝液(pH8.0)中で、2μlのL-PEI10K-Tyr33%(7.5mM窒素)と複合体形成したGAPDH siRNA(1〜25nM)をヒーラ細胞にトランスフェクトした。48時間のインキュベーション期間後に分枝DNAアッセイによりGAPDH mRNAレベルが測定され、1〜25nMのsiRNA濃度を用いたところ、GAPDH mRNAレベルは90%超阻害された。結果を図6に示す。非特異的コントロールとして、無関係の配列(ラミンA/C)と一致するsiRNAを同じ条件でトランスフェクトした。非特異的コントロールはGAPDH mRNAレベルへの阻害作用を示さなかった。
チロシン残基により修飾されたポリマーによる培養細胞へのsiRNA送達後の遺伝子サイレンシングの改善について、分子量17kDaを有するポリアリルアミン(polyallylamine:PAA)を用いて例証する。PAAに40%の窒素修飾程度でチロシン残基をグラフトした。50μlの50mMリン酸緩衝液(pH6.0)中、siRNAGL3Lucおよび1μlのPAA17K-Tyr40%でトランスフェクション複合体を調製した。10%FBSを含む0.55mlの完全培地において、50μlの50mMリン酸緩衝液(pH8.0)中で2μlのL-PEI10KTyr33%(7.5mM窒素)と複合体形成したGAPDH siRNA(1〜25nM)をA549-GL3Luc細胞にトランスフェクトした。48時間のインキュベーション期間後に分枝DNAアッセイによりGAPDH mRNAレベルを測定した。非特異的コントロールとして、無関係の配列(ラミンA/C)と一致するsiRNAを同じ条件でトランスフェクトした。実験は三重測定で行い、GAPDHサイレンシング効率は非トランスフェクト細胞の内在性GAPDHレベルから算出された。結果を図7に示す。PAA17K-Tyr40%により90%のサイレンシングが得られたが、未修飾のPAAはサイレンシングが低く、サイレンシングは約10%と有意ではなかった。また、siRNAGL2Lucは全体的にルシフェラーゼ遺伝子をサイレンシングすることができなかったことから、PAA17K-Tyr40%により得られたサイレンシングは選択的であることが裏付けられた。
ヒーラ細胞(50000細胞/ウェル)に、10%FBSを含んだ0.55mlの完全培地(24ウェル組織培養プレートフォーマット中)において、pCMVLucプラスミド(100ng、GL2Luc配列)と、50μlの50mMリン酸緩衝液(pH7.0)中で2μlのPEI10K-Tyr19%と複合体形成した、特異的GL2Luc siRNAまたはミスマッチGL3Luc siRNA(0〜50nM)のいずれかとを共トランスフェクトした。ルシフェラーゼ遺伝子発現を24時間のインキュベーションの期間後に測定した。結果を図8に示す。実験は三重測定で行い、ルシフェラーゼ活性(A)は細胞溶解液中のタンパク質含量(タンパク質重量(mg))によって規格化された相対光単位(RLU)として表された。次いで、サイレンシング効率(B)はGL2Luc siRNAトランスフェクト細胞およびGL3Luc siRNAトランスフェクト細胞からのルシフェラーゼ活性の割合から算出された。
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Claims (22)
- 芳香族アミノ酸によって修飾されたポリアミンと、およびRNA干渉に活性のある小さな二本鎖または一本鎖RNAとを含む、トランスフェクション剤として有用な組成物。
- 前記ポリアミンは、分枝または線状のポリエチレンイミン、ポリアリルアミン、デンドリマー,ポリアミノエステル、ポリリジン、ポリヒスチジン、ポリアルギニン、ポリオルニチンまたはキトサンを含む、請求項1に記載の組成物。
- 前記ポリアミンは、線状のポリエチレンイミン(LPEI)、ポリアリルアミン(PAA)およびポリリジン(PLL)を含む群から選択される、請求項2に記載の組成物。
- 前記ポリアミンの分子量は400Da超である、請求項1〜3のいずれか1つに記載の組成物。
- ポリアミンは、線状の、2〜220KDの線状ポリエチレンイミン、10〜70KDのポリアリルアミンおよび1〜300KDのポリリジンを含む群から選択される、請求項3に記載の組成物。
- ポリアミンを修飾するのに用いられる芳香族アミノ酸は、チロシン、トリプトファンおよびフェニルアラニンあるいはそれらの誘導体を含む群から選択される、請求項1〜5のいずれか1つに記載の組成物。
- 前記芳香族アミノ酸は、トリプトファンおよび/またはチロシンである、請求項6に記載の組成物。
- RNAは、通常のものであるか修飾されており、該修飾基は、例えば2’−フルオ、2’−メトキシ、ホスホロチオアート、LNAまたはモルホリノである、請求項1〜7のいずれか1つに記載の組成物。
- RNAは、二本鎖または一本鎖アンチセンスsiRNAまたは一本鎖センス/アンチセンスsiRNAの混合物である、請求項1〜8のいずれか1つに記載の組成物。
- siRNAは、15〜30merを有する、請求項8または9に記載の組成物。
- 上記のような芳香族アミノ酸によって修飾されたポリアミンと、二本鎖または一本鎖siRNAとを等張培地、例えば、NaCl、グルコース、緩衝液において含む、請求項1〜10のいずれか1つに記載の組成物。
- siRNAの濃度は、ピコモルからマイクロモルまで変動する、請求項8〜11のいずれか1つに記載の組成物。
- 1種以上の添加剤、例えば、PEG、PVA、単糖類、多糖類、ペプチド、タンパク質、ビタミン類を更に含む、請求項1〜12のいずれか1つに記載の組成物。
- RNAiに活性なRNAを発現するかまたは導入遺伝子をコードするプラスミドDNAを更に含む、請求項1〜13のいずれか1つに記載の組成物。
- 導入遺伝子は、前記小RNAによって標的化される、請求項14に記載の組成物。
- 前記プラスミドは、siRNA、shRNAまたはmicro-RNA適合低分子ヘアピン型RNAを発現し、該各RNAは、芳香族アミノ酸、特に、チロシンおよびその誘導体によって修飾されたポリアミン、特に、チロシンおよびその誘導体を有する線状のポリエリレンイミンを含み、DNAベクターのトランスフェクション剤として有用であり、前記プラスミドは、siRNA、shRNAまたはmicroRNA適合低分子ヘアピン型RNAを発現する、請求項14に記載の組成物。
- 請求項1〜16のいずれか1つに記載の組成物の芳香族アミノ酸によって修飾されたポリアミンを合成する方法であって、該ポリアミンの存在下でジメトキシトリアジン−N−メチルモルホリウム(DMTMM)によって活性化された芳香族アミノ酸のスーパーエステルを使用する工程を含む、方法。
- ポリアミンの合成は、塩基性緩衝液、例えば、ホウ酸塩緩衝液200mM(pH=7.5〜9)中で、あるいは塩基存在下の水性培地または水/アルコール混合物中で行われる、請求項17に記載の方法。
- 前記組成物中の芳香族アミノ酸によるポリアミンの修飾の割合(百分率)は、0.01〜100%、特には15〜50%である、請求項17または18に記載の方法。
- 請求項1〜16のいずれか1つに記載の組成物の使用を含む、siRNAまたはsiRNAおよびプラスミドDNAをin vitro、ex-vivo転移する方法。
- siRNAの前記in vitro転移は、懸濁液中の1以上の接着細胞を含む培地で実行される、請求項20に記載の方法。
- 前記培地が、通常培地または合成培地である、請求項21に記載の方法。
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