JP2011502484A - Hla−dr結合性ペプチドおよびそれらの使用 - Google Patents
Hla−dr結合性ペプチドおよびそれらの使用 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2011502484A JP2011502484A JP2010532242A JP2010532242A JP2011502484A JP 2011502484 A JP2011502484 A JP 2011502484A JP 2010532242 A JP2010532242 A JP 2010532242A JP 2010532242 A JP2010532242 A JP 2010532242A JP 2011502484 A JP2011502484 A JP 2011502484A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- peptide
- peptides
- htl
- epitope
- cyclin
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/71—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for growth factors; for growth regulators
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4738—Cell cycle regulated proteins, e.g. cyclin, CDC, INK-CCR
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4743—Insulin-like growth factor binding protein
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4748—Tumour specific antigens; Tumour rejection antigen precursors [TRAP], e.g. MAGE
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/08—Linear peptides containing only normal peptide links having 12 to 20 amino acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/57—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2
- A61K2039/572—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2 cytotoxic response
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Abstract
Description
本出願は、2007年11月1日に提出された米国仮出願第60/984,646号による優先権の恩典を主張する。
本発明は、癌などのさまざまな病的状態を予防するため、治療するため、または診断するための組成物および方法に関する。特に、本発明は、選択された主要組織適合遺伝子複合体(MHC)分子と結合して、免疫応答を誘導することのできる、新規ペプチドを提供する。
以下の定義は、当業者が、本明細書に開示された本発明の好ましい態様のいくつかを理解することを可能にするために提供される。しかし、当然ながら、これらの定義は例示に過ぎず、特許請求の範囲に示された本発明の範囲を限定するために用いられるべきではない。当業者は、以下の定義に軽微な改変を加えて、そのような改変された定義を、本明細書に開示された本発明を理解して実施するために利用することができるであろう。当業者に明らかであると考えられる、そのような改変は、以下に示された特許請求の範囲に対して適用可能であることから、本発明の範囲内にあると判断される。この項に示された定義が、参照により本明細書に組み入れられる特許、公開特許出願および他の刊行物ならびにGenBankおよび他のデータベース中の配列に示された定義に反するか、または他の様式で一致しない場合には、この項に示された定義が、参照により本明細書に組み入れられる定義に優先する。
本発明のある態様は、一部には、ワクチン設計のためのエピトープベースのアプローチに関する。そのようなアプローチは、HTL免疫応答を誘導するための機序は、HTLエピトープを、抗原提示細胞上に提示されたHLA分子と結合した約6〜25アミノ酸のペプチドとして提示する段階を含むという十分に確立された知見に基づく。
HLAクラスIIスーパーモチーフおよびモチーフの一次アンカー残基について、以下に描写する。
3つの一般的HLAクラスIIアレル特異的HLA分子:HLA DRB1*0401、DRB1*0101およびDRB1*0701と結合するペプチドに関してもモチーフが同定されている(例えば、Southwood et al. J. Immunology 160:3363-3373, 1998を参照)。一括して、これらのモチーフからの共通の残基がHLA DR-1-4-7スーパーモチーフを描写する。これらのDR分子と結合するペプチドは、大型の芳香族残基または疎水性残基(Y、F、W、L、I、VまたはM)によって特徴づけられるスーパーモチーフを、9-merコア領域の位置1における一次アンカー残基として、および小型の非荷電残基(S、T、C、A、P、V、I、LまたはM)を位置6における一次アンカー残基として保持する。これらのHLA型のそれぞれに関するアレル特異的な二次的効果および二次アンカーも同定されている(Southwood et al., 前記)。HLA-DRB1*0401、DRB1*0101および/またはDRB1*0701に対するペプチド結合は、一次および/または二次アンカー位置での置換によってモジュレートすることができ、好ましくは各々の残基をスーパーモチーフに関して特定されているように選択する。
熱帯熱マラリア原虫(Plasmodium falcparum)サーカムスポロゾイト(CS)タンパク質の位置378〜398
および連鎖球菌18kDタンパク質の位置1〜16
などの抗原由来の配列が含まれる。
材料および方法
以下の材料および方法は、本明細書で開示される実施例のすべてに一般に該当する。具体的な材料および方法は、各実施例の中で必要に応じて開示される。
抗IFN-γおよびビオチン化抗IFN-γは、Mabtech(Sweden)から入手した。ホルボールミリステートアセテート(PMA)、ヒト血清アルブミン(HSA)、ポリクローナルヒトIgG、破傷風毒素(TT)およびイオノマイシンは、Sigma(St. Louis, MO, USA)からのものとした。ヤギ抗ヒト西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)結合抗体は、Santa Cruz Biotechnology(Santa Cruz, CA)から入手した。ハンクス平衡塩類溶液(HBSS)、RPMI-1640およびリン酸緩衝食塩水は、Cellgro(Hernden, VA, USA)からのものとした。Ficoll-Paqueは、Amersham Biosciences(Uppsala, Sweden)からのものとした。ペプチドはすべて、Mayo Clinic Protein Chemistry and Proteomic CoreまたはEpimmune, Inc.(San Diego, CA)のいずれかによって合成され、以前に記載された通りに逆相HPLCによって均質性95%超に精製した(Dzuris JL, Sidney J, Appella E, Chesnut RW, Watkins DI, Sette A. Conserved MHC class I peptide binding motif between humans and rhesus macaques. J Immunol 2000;164: 283-91)。ペプチドの純度は、逆相HPLCおよびアミノ酸分析、シークエンシング、ならびに/または質量分析によって決定した。凍結乾燥ペプチドを20mg/mlで100% DMSO中に再懸濁させ、続いてPBS中に必要な濃度となるまで希釈した。
用いた予測プログラム、PlC(Predicted IC50)は、HLA-DR結合能を有するペプチドを予測するための、改変型の線形係数またはマトリックスベースの方法である。PlCは、ペプチド分子に沿った各残基が、結合親和性に独立に寄与しうるという仮定の上で予測される(Sette A, et al. Proc Natl Acad Sci U S A 1989;86: 3296-300;Sette A, et al. J Immunol 1989;142: 35-40)。本アルゴリズムは、対応する入力配列に対して予測IC50値(PlCと命名)を生成する。より低いPlC値は、HLAに対する結合の確率がより高いことを指し示す。本プログラムは、タンパク質全体を包含する、3残基ずつずれている15アミノ酸長の配列を分析する。
PBMCは、記載された通りに血液から単離し(Disis ML, et al. Clin Cancer Res 1999;5: 1289-97)、凍結用培地(12.5% HSA、ペニシリン、ストレプトマイシンおよび2mMグルタミンを含むRPMI)中にある状態で液体窒素中(20×106個/ml)で凍結保存した(Disis ML et al. J Immunol Methods 2005.)。
15種の異なるHLA-DR分子を、可溶化したHLA-DR分子に対するペプチドの結合を測定するための定量的アッセイに用いた。これらのHLA-DR分子は、均衡のとれた集団対象範囲が可能となるように選択した:DRB1*0101、DRB1*1501、DRB1*0301、DRB1*0401、DRB1*0404、DRB1*1101、DRB5*0101、DRB4*0101、DRB3*0101、DRB1*0701、DRB1*0405、DRB1*0802、DRB1*0901、DRB1*1201およびDRB1*1302(24)。利用するMHC分子は、EBVで形質転換させたホモ接合型細胞系、または単一のMHCがアレルトランスフェクトされた721.221、C1Rまたは線維芽細胞系から精製した。これらの細胞系を、2mM L-グルタミン、100 U(100μg/ml)ペニシリン-ストレプトマイシン溶液および10%熱非働化FCSを補充したRPMI-1640培地中での培養によって維持した。HLA-DR分子は、1%(v/v)NP-40、150 mM NaCl、5mM EDTAおよび2mM PMSFを含む50mM Tris-HCL、pH 8.5中で調製した細胞溶解物から、抗体を利用するアフィニティークロマトグラフィーを用いて精製した。手短に述べると、不活性化Sepharose CL4BおよびプロテインA Sepharoseのカラムをプレカラム(pre-column)として用いた。HLA-DR分子は、溶解物をLB3.1モノクローナル抗体(抗HLA-DRA)カラムに通過させることによって捕捉した。抗体カラムを、1%(v/v)NP-40を含む10mM Tris-HCL、pH8.0中で洗浄し、続いて0.4%(w/v)n-オクチルグルコシドを含むPBS中で洗浄した。続いてMHC分子を、0.4%(w/v)n-オクチルグルコシドを含む0.15 M NaCl、pH 11.5中にある50mMジエチルアニリンで溶出させた。pHを8.0に低下させ、溶出液を、Centriprep 30濃縮器(Amicon, Beverly, MA)における2000rpmでの遠心によって濃縮した。
以前の記載の通りに、可溶性HLA-DR分子に対するペプチドの結合を、放射標識した標準ペプチドの結合の阻害に基づいて測定するために、放射性リガンド結合阻害アッセイを用いた(Sidney J, Southwood S, Oseroff C, del Guercio MF, Grey HM, Sette A. Measurement of MHC/peptide interactions by gel filtration. Cuff Protocols Immunol 1998;18: 18.3.2-.3.9.)。手短に述べると、1〜10nMの放射標識ペプチドを、プロテアーゼ阻害薬のカクテルの存在下で、1μM〜1nMの精製HLA-DR分子とともに室温または37℃で2日間コインキュベートした。アッセイは、pH 4からpH 7までのさまざまなpH条件で行った。アッセイ混合物の最終的なpHは、以前の記載の通りにクエン酸緩衝液を用いて調整する(Sidney J, Curr Protocols Immunol 1998)。インキュベーション後に、HLA-DRに結合した放射能のパーセンテージを、LB3.1抗体をコーティングしたOptiplate(Packard Instruments, Meriden, CT)上にHLA-DR/ペプチド複合体を捕捉して、1分当たりの結合カウント数をTopCountミクロシンチレーションカウンター(Packard Instruments)を用いて決定することによって決定する。10〜20%の結合放射能が得られるHLA-DRを、放射標識ペプチドの結合の50%阻害が得られるペプチドの濃度を算出する阻害アッセイに用いる。用いた条件下で、測定されたIC50値は、真のKd値の妥当な近似値となる。競合ペプチドを、30μg/mL〜300pg/mLの範囲の濃度で、2〜4回の完全な独立した実験において検査する。以前の研究と同じく、特定のHLA-DR分子に対して1000nMまたはそれよりも良好な親和性を有するペプチドは、各々の抗原に対する結合剤として定義される。
低頻度T細胞を検出するための10-day ELIspotを、腫瘍抗原ペプチド(表1)に対する反応性を記載された通りに決定するために用いた(Knutson KL et al. J Clin Onc 2006;24: 4254-61)。ペプチドに対する陽性応答は、対照非抗原ウェルの平均を有意に上回り(p<0.05、両側t検定)、かつ検出可能(すなわち、>1:100,000)である頻度と定義した。PMA/イオノマイシンおよびCEFプールを、以前の記載の通りに、陽性非腫瘍関連対照として用いた(Knutson, 2006)。
ELISAは以前の記載の通りに行った(Knutson, 2006)。手短に述べると、96ウェルプレートに1μg/ml IGFBP-2タンパク質、200ng/ml破傷風毒素または1μg/ml BSAをコーティングした。標準曲線の作成のために、いくつかのウェルにヒトIgGを200〜0.2ng/mlの濃度範囲で添加した。洗浄およびブロッキングの後に、ヒト血清をプレートに1:40の希釈度で3通りずつ添加し、プレートを室温で2時間インキュベートした。洗浄後に、100μL/ウェルのHRP(Santa Cruz Biotechnology)を1:2000に希釈し、室温で1時間インキュベートした。最終洗浄の後に、各ウェルを100μL(テトラメチルベンザジン(tetramethylbenzadine))TMB基質(BD Bioscience)とともにインキュベートした。呈色を希HCLで停止させ、プレートリーダーで450nMの吸光度を読み取った。
確立されたモチーフ検索アルゴリズムを用いた、腫瘍関連抗原由来の保存されたHLAクラスII拘束性ペプチドの同定
ワクチン設計のために有用なエピトープを同定するために、可能性のあるHLAクラスIIモチーフを同定するための腫瘍関連抗原配列のアミノ酸モチーフ検索にまず基づく、学際的アプローチを用いた(表I参照)。これに続いて、エピトープペプチド結合の親和性および幅広さを決定するために、精製されたHLA分子を用いるハイスループット合成ペプチド結合アッセイを行った。
事実上100%の集団対象範囲を達成するために、モチーフ検索アルゴリズムを最も一般的なHLAクラスIIアレルに関して検証し、HLA DRB1*0101、DRB1*1501、DRB1*0301、DRB1*0401、DRB1*0404、DRB1*1101、DRB5*0101、DRB4*0101、DRB3*0101、DRB1*0701、DRB1*0405、DRB1*0802、DRB1*0901、DRB1*1201およびDRB1*1302スーパータイプに的を絞った。選択された腫瘍関連抗原配列を、モチーフの定義を用いてモチーフ陽性アミノ酸配列に関してスキャニングした。
腫瘍ワクチンに含めるためのHTLエピトープの同定
表Iに列記されたペプチドのうち、少なくとも4種の異なるHLAと1000nM未満のIC50で結合したペプチドを同定し、表IIに示している。表IIのペプチド配列を、精製MHC分子に対するそれらの結合能に関してさらに評価した。図1から4までは、免疫原性であった表IIのペプチドを示している(丸の中に示されている)。これらのHTLペプチドは、腫瘍ワクチンの中に含めるための候補である。
マルチエピトープワクチンの設計および開発
上記の通りの少なくとも4種の異なるHLAサブタイプと結合し、かつ図1〜4に示すように免疫原性であることが示されたペプチドを、マルチエピトープワクチンに含めるために選択した。表IIIは、陽性応答を示した患者のパーセント、および8種のワクチン候補の特定のHLAサブタイプに対する結合パターンを示している。
(登場順にそれぞれSEQ ID NO:6〜10、13〜15、20、25、20、29、32、40〜42、46、51〜52、56〜57、59、67〜70、73〜77、86〜90、102〜103、109、111、114、126、136、145〜146、156、165〜168、171、179、186および188〜190)
Claims (37)
- 表Iに列記されたペプチドからなる群より選択される、単離されたHLA-DR結合性ペプチド。
- 請求項1記載のペプチドを含む組成物。
- 第2のHTL誘導性ペプチドをさらに含む、請求項2記載の組成物。
- CTLペプチドをさらに含む、請求項2記載の組成物。
- 脂質をさらに含む、請求項2〜4のいずれか一項記載の組成物。
- リポソームをさらに含む、請求項2〜4のいずれか一項記載の組成物。
- ペプチドがスペーサー分子と結び付いている、請求項2記載の組成物。
- 担体をさらに含む、請求項2〜4のいずれか一項記載の組成物。
- 抗原提示細胞をさらに含む、請求項2〜4のいずれか一項記載の組成物。
- 請求項1記載のペプチドをコードする、単離された核酸。
- 請求項1記載のペプチドおよび少なくとも1つの追加のペプチドまたはシグナル配列をコードする、単離された核酸。
- 少なくとも1つの追加のペプチドまたはシグナル配列が第2のHTL誘導性ペプチドである、請求項11記載の単離された核酸。
- 少なくとも1つの追加のペプチドまたはシグナル配列がCTLペプチドである、請求項11記載の単離された核酸。
- 請求項1記載のペプチド、および免疫原性を強化または低下させるために含められる少なくとも1つのタンパク質またはポリペプチドをコードする、単離された核酸。
- 請求項10〜14のいずれか一項記載の核酸を含む組成物。
- 脂質をさらに含む、請求項15記載の組成物。
- リポソームをさらに含む、請求項15記載の組成物。
- 担体をさらに含む、請求項15記載の組成物。
- 請求項1記載のペプチドを患者に投与する段階を含む、癌を予防または治療する方法。
- 請求項10〜14のいずれか一項記載の核酸を患者に投与する段階を含む、癌を予防または治療する方法。
- 患者における癌の治療、予後予測またはリスクを決定するための診断試薬としての、請求項1記載のペプチドの使用。
- 表IIに列記されたペプチドの群から選択される、請求項1記載のペプチド。
- HER-2/neu p59、HER-2/neu p83、HER-2/neu p88、HER-2/neu p422、HER-2/neu p885、CEA p24、CEA p75、CEA p176、CEA p423、CEA p488、CEA p650、CEA p663、IGFBP-2 p17、IGFBP-2 p22、IGFBP-2 p249、IGFBP-2 p293、サイクリンD1 p3、サイクリンD1 p49、サイクリンD1 p53、サイクリンD1 p98、サイクリンD1 p137、サイクリンD1 p145、サイクリンD1 p174およびサイクリンD1 p199からなるペプチドの群より選択される、請求項1記載のペプチド。
- 表Iに列記されたものからなる群より選択されるエピトープを含む、30アミノ酸未満の長さの、単離されたHLA-DR結合性ペプチド。
- 表IIに列記されたものからなる群より選択されるエピトープを含む、30アミノ酸未満の長さの、単離されたHLA-DR結合性ペプチド。
- 表Iに列記されたものからなる群より選択されるエピトープに対応する、請求項24記載の単離されたHLA-DR結合性ペプチド。
- 表IIに列記されたものからなる群より選択されるエピトープに対応する、請求項24記載の単離されたHLA-DR結合性ペプチド。
- 30残基またはそれ未満の長さの少なくとも1つのHLA-DR結合性ペプチドを含む組成物であって、前記ペプチドが、表1に列記されたHTLエピトープのうちのいずれか1つから選択されるHTLエピトープ、およびそれらの混合物を含む、組成物。
- 30残基またはそれ未満の長さの少なくとも1つのHLA-DR結合性ペプチドを含む組成物であって、前記ペプチドが、表2に列記されたHTLエピトープのうちのいずれか1つから選択されるHTLエピトープ、およびそれらの混合物を含む、組成物。
- 少なくとも2、3、4、5、6、7、8、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54または55種のペプチドを含む、請求項28または29記載の組成物。
- 少なくとも2つの癌胎児性抗原(CEA)HTLペプチド、少なくとも2つのサイクリンD1 HTLペプチド、少なくとも2つのヒト上皮増殖因子受容体2(HER-2/neu)HTLペプチド、および少なくとも2つのインスリン増殖因子結合タンパク質2(IGFBP-2)HTLペプチドを含む組成物であって、前記ペプチドが表1に列記されたペプチドから選択される、請求項29または30記載の組成物。
- ペプチドが表2に列記されたペプチドから選択される、請求項31記載の組成物。
- 2つの癌胎児性抗原(CEA)HTLペプチド、少なくとも2つのサイクリンD1 HTLペプチド、少なくとも2つのヒト上皮増殖因子受容体2(HER-2/neu)HTLペプチドおよび少なくとも2つのインスリン増殖因子結合タンパク質2(IGFBP-2)HTLペプチドからなる組成物であって、前記ペプチドが表2に列記されたペプチドから選択される、請求項31記載の組成物。
- HER-2/neu p59、HER-2/neu p83、HER-2/neu p88、HER-2/neu p422、HER-2/neu p885、CEA p24、CEA p75、CEA p176、CEA p423、CEA p488、CEA p650、CEA p663、IGFBP-2 p17、IGFBP-2 p22、IGFBP-2 p249、IGFBP-2 p293、サイクリンD1 p3、サイクリンD1 p49、サイクリンD1 p53、サイクリンD1 p98、サイクリンD1 p137、サイクリンD1 p145、サイクリンD1 p174およびサイクリンD1 p199からなる群より選択される少なくとも2つのペプチドを含む、請求項29または30記載の組成物。
- 少なくとも2つの癌胎児性抗原(CEA)HTLペプチド、少なくとも2つのサイクリンD1 HTLペプチド、少なくとも2つのヒト上皮増殖因子受容体2(HER-2/neu)HTLペプチドおよび少なくとも2つのインスリン増殖因子結合タンパク質2(IGFBP-2)HTLペプチドを含む、請求項34記載の組成物。
- それぞれが腫瘍関連抗原(HTL)エピトープをコードする5〜55種の核酸を含むマルチエピトープ構築物からなる群より選択される、単離されたポリヌクレオチドであって、前記HTLエピトープが、HER-2/neu p59、HER-2/neu p83、HER-2/neu p88、HER-2/neu p422、HER-2/neu p885、CEA p24、CEA p75、CEA p176、CEA p423、CEA p488、CEA p650、CEA p663、IGFBP-2 p17、IGFBP-2 p22、IGFBP-2 p249、IGFBP-2 p293、サイクリンD1 p3、サイクリンD1 p49、サイクリンD1 p53、サイクリンD1 p98、サイクリンD1 p137、サイクリンD1 p145、サイクリンD1 p174およびサイクリンD1 p199からなる群より選択され、前記核酸が同じリーディングフレーム中で互いに直接的または間接的に連結されている、単離されたポリヌクレオチド。
- 以下からなる群より選択される、単離されたポリヌクレオチド:
(a)それぞれが腫瘍関連抗原(HTL)エピトープをコードする5〜55種の核酸を含むマルチエピトープ構築物であって、前記HTLエピトープが表1に列記されたエピトープのうちのいずれか1つであり、前記核酸が同じリーディングフレーム中で互いに直接的または間接的に連結されている、マルチエピトープ構築物;
(b)それぞれが腫瘍関連抗原(HTL)エピトープをコードする5〜55種の核酸を含むマルチエピトープ構築物であって、前記HTLエピトープが表2に列記されたエピトープのうちのいずれか1つであり、前記核酸が同じリーディングフレーム中で互いに直接的または間接的に連結されている、マルチエピトープ構築物;
(c)それぞれが腫瘍関連抗原(HTL)エピトープをコードする5種および8種の核酸を含むマルチエピトープ構築物であって、前記HTLエピトープが表3に列記されたエピトープのうちのいずれか1つであり、前記核酸が同じリーディングフレーム中で互いに直接的または間接的に連結されている、マルチエピトープ構築物;
(d)1つまたは複数のスペーサー核酸が、(a)または(b)または(c)または(d)のHTLエピトープ核酸の間に配置されている、(a)〜(d)のマルチエピトープ構築物;
(e)前記1つまたは複数のスペーサー核酸がそれぞれ1〜8アミノ酸をコードする、(d)のマルチエピトープ構築物;
(f)前記スペーサー核酸の1つまたは複数が、GPGPG(SEQ ID NO:193)を含むかまたはそれからなるアミノ酸配列、PGPGP(SEQ ID NO:194)を含むかまたはそれからなるアミノ酸配列、(GP)n(SEQ ID NO:195)を含むかまたはそれからなるアミノ酸配列、(PG)n(SEQ ID NO:196)を含むかまたはそれからなるアミノ酸配列、(GP)nG(SEQ ID NO:197)を含むかまたはそれからなるアミノ酸配列、および(PG)nP(SEQ ID NO:198)を含むかまたはそれからなるアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードする、(d)または(e)のマルチエピトープ構築物であって、式中、nはゼロから11までの間の整数である、マルチエピトープ構築物;
(g)1つまたは複数のMHCクラスII標的指向性核酸をさらに含む、(a)〜(f)のうちのいずれか1つののマルチエピトープ構築物;
(h)前記1つまたは複数の標的指向性核酸が、Igκシグナル配列、組織プラスミノーゲンアクチベーターシグナル配列、インスリンシグナル配列、小胞体シグナル配列、LAMP-1リソソーム標的指向性配列、LAMP-2リソソーム標的指向性配列、HLA-DMリソソーム標的指向性配列、HLA-DOのHLA-DM会合配列、Ig-a細胞質ドメイン、Ig-ss細胞質ドメイン、Iiタンパク質、インフルエンザマトリックスタンパク質、HCV抗原、および酵母Tyタンパク質からなる群より選択される1つまたは複数の標的指向性配列をコードする、(g)のマルチエピトープ構築物;
(i)HTLエピトーププロセシングのために最適化されている、(a)〜(h)のうちのいずれか1つのマルチエピトープ構築物;
(j)HTL核酸が、それによりコードされるHTL接合エピトープの数を最小限にするように並び替えられている、(a)〜(i)のうちのいずれか1つのマルチエピトープ構築物;
(k)少なくとも2つの癌胎児性抗原(CEA)HTLエピトープ、少なくとも2つのサイクリンD1 HTLエピトープ、少なくとも2つのヒト上皮増殖因子受容体2(HER-2/neu)HTLエピトープおよび少なくとも2つのインスリン増殖因子結合タンパク質2(IGFBP-2)HTLエピトープを含む、(a)〜(j)のうちのいずれか1つのマルチエピトープ構築物;
(l)少なくとも2つの癌胎児性抗原(CEA)HTLエピトープ、少なくとも2つのサイクリンD1 HTLエピトープ、少なくとも2つのヒト上皮増殖因子受容体2(HER-2/neu)HTLエピトープおよび少なくとも2つのインスリン増殖因子結合タンパク質2(IGFBP-2)HTLエピトープが、表2に列記されたエピトープから選択される、(k)のマルチエピトープ構築物;
(k)表3に列記されたエピトープからなる、(a)〜(j)のうちのいずれか1つのマルチエピトープ構築物。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US98464607P | 2007-11-01 | 2007-11-01 | |
PCT/US2008/081799 WO2009059011A2 (en) | 2007-11-01 | 2008-10-30 | Hla-dr binding peptides and their uses |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2014152923A Division JP6006265B2 (ja) | 2007-11-01 | 2014-07-28 | Hla−dr結合性ペプチドおよびそれらの使用 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2011502484A true JP2011502484A (ja) | 2011-01-27 |
Family
ID=40591749
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2010532242A Pending JP2011502484A (ja) | 2007-11-01 | 2008-10-30 | Hla−dr結合性ペプチドおよびそれらの使用 |
JP2014152923A Active JP6006265B2 (ja) | 2007-11-01 | 2014-07-28 | Hla−dr結合性ペプチドおよびそれらの使用 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2014152923A Active JP6006265B2 (ja) | 2007-11-01 | 2014-07-28 | Hla−dr結合性ペプチドおよびそれらの使用 |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US20100310640A1 (ja) |
EP (2) | EP3085707B1 (ja) |
JP (2) | JP2011502484A (ja) |
CN (1) | CN102066410B (ja) |
CA (2) | CA2991175A1 (ja) |
WO (1) | WO2009059011A2 (ja) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPWO2013089252A1 (ja) * | 2011-12-14 | 2015-04-27 | 国立大学法人高知大学 | ヘルパーt細胞誘導性ポリペプチドの改変 |
JP2018038388A (ja) * | 2013-08-05 | 2018-03-15 | イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハー | Nsclcをはじめとする肺がんなどの数種の腫瘍に対する新規免疫療法 |
JP2022058349A (ja) * | 2015-12-10 | 2022-04-12 | イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハー | Cllおよびその他のがんに対する免疫療法において使用するための新規ペプチドおよびペプチドの組み合わせ |
Families Citing this family (18)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US9220746B2 (en) | 2009-06-04 | 2015-12-29 | The University Of North Carolina At Chapel Hill | Compounds and methods for treating bone disorders and controlling weight |
GB201009222D0 (en) * | 2010-06-02 | 2010-07-21 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Improved cancer therapy based on tumour associated antigens derived from cyclin D1 |
GB201121308D0 (en) | 2011-12-12 | 2012-01-25 | Cell Medica Ltd | Process |
CN102590511B (zh) * | 2012-02-14 | 2014-07-23 | 北京市肿瘤防治研究所 | 基于igfbp-2自身抗体或其与igfbp-2联合的检测的肿瘤诊断试剂或试剂盒及应用 |
US9814767B2 (en) | 2012-02-17 | 2017-11-14 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Methods and materials for generating CD8+ T cells having the ability to recognize cancer cells expressing a HER2/neu polypeptide |
BR112016021345A8 (pt) | 2014-03-17 | 2022-07-05 | Tapimmune Inc | Composições de vacina de molécula de ácido nucleico e usos das mesmas |
CN113403338A (zh) | 2014-03-28 | 2021-09-17 | 华盛顿大学商业中心 | 乳腺癌和卵巢癌疫苗 |
WO2016007499A1 (en) * | 2014-07-07 | 2016-01-14 | Duke University | Vaccines against an oncogenic isoform of her2 (erbb2) and methods of using the same |
CA2971408C (en) | 2014-12-17 | 2019-12-10 | Sri International | Targeted stealth liposomes loaded with an immunogenic human leukocyte antigen class i restricted peptide |
SG10202112047TA (en) | 2015-09-18 | 2021-12-30 | Baylor College Medicine | Immunogenic antigen identification from a pathogen and correlation to clinical efficacy |
EP3383427A4 (en) | 2015-12-04 | 2019-11-27 | Mayo Foundation for Medical Education and Research | METHODS AND VACCINES FOR INDUCING IMMUNE RESPONSES OF MULTIPLE DIFFERENT CMH MOLECULES |
CN105949303B (zh) * | 2016-06-24 | 2020-02-07 | 安徽未名细胞治疗有限公司 | 一种特异性肿瘤抗原cea的ctl识别表位肽及其应用 |
BR112019016250A2 (pt) | 2017-02-06 | 2020-04-14 | Alize Pharma Iii Sas | peptídeos isolados, uso do peptídeo isolado, método para prevenção ou tratamento de um distúrbio ósseo, método para melhorar a formação óssea, método para inibir a reabsorção óssea, método para induzir a deposição óssea, método para induzir a maturação óssea, método de expandir células tronco ex vivo e composição farmacêutica |
JP2021525261A (ja) | 2018-05-24 | 2021-09-24 | アモライト・ファルマ | 代謝疾患の治療におけるigfbp−2のヘパリン結合ドメイン |
US11058751B1 (en) | 2020-11-20 | 2021-07-13 | Think Therapeutics, Inc. | Compositions for optimized RAS peptide vaccines |
US11421015B2 (en) | 2020-12-07 | 2022-08-23 | Think Therapeutics, Inc. | Method of compact peptide vaccines using residue optimization |
US11161892B1 (en) | 2020-12-07 | 2021-11-02 | Think Therapeutics, Inc. | Method of compact peptide vaccines using residue optimization |
US11464842B1 (en) | 2021-04-28 | 2022-10-11 | Think Therapeutics, Inc. | Compositions and method for optimized peptide vaccines using residue optimization |
Family Cites Families (32)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4235871A (en) | 1978-02-24 | 1980-11-25 | Papahadjopoulos Demetrios P | Method of encapsulating biologically active materials in lipid vesicles |
US4722848A (en) | 1982-12-08 | 1988-02-02 | Health Research, Incorporated | Method for immunizing animals with synthetically modified vaccinia virus |
US4501728A (en) * | 1983-01-06 | 1985-02-26 | Technology Unlimited, Inc. | Masking of liposomes from RES recognition |
US5019369A (en) * | 1984-10-22 | 1991-05-28 | Vestar, Inc. | Method of targeting tumors in humans |
US4837028A (en) | 1986-12-24 | 1989-06-06 | Liposome Technology, Inc. | Liposomes with enhanced circulation time |
US5703055A (en) | 1989-03-21 | 1997-12-30 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery |
AU625013B2 (en) | 1989-11-03 | 1992-06-25 | Vanderbilt University | Method of in vivo delivery of functioning foreign genes |
US5279833A (en) | 1990-04-04 | 1994-01-18 | Yale University | Liposomal transfection of nucleic acids into animal cells |
US5204253A (en) | 1990-05-29 | 1993-04-20 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Method and apparatus for introducing biological substances into living cells |
IL105914A0 (en) | 1992-06-04 | 1993-10-20 | Univ California | Methods and compositions for in vivo gene therapy |
AU4998993A (en) | 1992-08-07 | 1994-03-03 | Epimmune, Inc. | Hla binding peptides and their uses |
DE69435292D1 (de) | 1993-03-05 | 2010-06-17 | Epimmune Inc | Verfahren zur herstellung von immunogenen hla-a2.1-bindenden peptiden |
US5679647A (en) * | 1993-08-26 | 1997-10-21 | The Regents Of The University Of California | Methods and devices for immunizing a host against tumor-associated antigens through administration of naked polynucleotides which encode tumor-associated antigenic peptides |
US5804566A (en) | 1993-08-26 | 1998-09-08 | The Regents Of The University Of California | Methods and devices for immunizing a host through administration of naked polynucleotides with encode allergenic peptides |
DK0735893T3 (da) * | 1993-09-14 | 2009-03-09 | Pharmexa Inc | PAN DR-bindende peptider til styrkelse af immunsvaret |
US5739118A (en) | 1994-04-01 | 1998-04-14 | Apollon, Inc. | Compositions and methods for delivery of genetic material |
US5736524A (en) | 1994-11-14 | 1998-04-07 | Merck & Co.,. Inc. | Polynucleotide tuberculosis vaccine |
US6071890A (en) | 1994-12-09 | 2000-06-06 | Genzyme Corporation | Organ-specific targeting of cationic amphiphile/DNA complexes for gene therapy |
US5922687A (en) | 1995-05-04 | 1999-07-13 | Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Intracellular delivery of nucleic acids using pressure |
EP0914142B9 (en) | 1996-03-11 | 2012-01-04 | Epimmune Inc. | Peptides with increased binding affinity for at least three hla-a3-like molecules |
US6294378B1 (en) | 1996-07-26 | 2001-09-25 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Method and reagents for genetic immunization |
CA2685270C (en) | 1998-05-13 | 2014-07-29 | Pharmexa Inc. | Expression vectors for stimulating an immune response and methods of using the same |
JP2002516824A (ja) * | 1998-05-29 | 2002-06-11 | エピミューン, インコーポレイテッド | 広範に反応性のdr拘束エピトープの同定 |
EP1239866A4 (en) * | 1999-12-10 | 2005-02-09 | Epimmune Inc | INDUCTION OF HER2 / NEU CELLULAR IMMUNE RESPONSES USING PEPTIDE AND NUCLEIC ACID-CONTAINING COMPOSITIONS |
US20070098776A1 (en) * | 1999-12-13 | 2007-05-03 | Fikes John D | HLA class I A2 tumor associated antigen peptides and vaccine compositions |
CA2393730A1 (en) * | 1999-12-13 | 2001-06-14 | Epimmune Inc. | Hla class i a2 tumor associated antigen peptides and vaccine compositions |
US20030224036A1 (en) * | 1999-12-13 | 2003-12-04 | Fikes John D | Hla class I a2 tumor associated antigen peptides and vaccine compositions |
US7462354B2 (en) * | 1999-12-28 | 2008-12-09 | Pharmexa Inc. | Method and system for optimizing minigenes and peptides encoded thereby |
US20040121946A9 (en) * | 2000-12-11 | 2004-06-24 | John Fikes | Inducing cellular immune responses to her2/neu using peptide and nucleic acid compositions |
WO2005012502A2 (en) * | 2003-03-28 | 2005-02-10 | Idm Pharma, Inc. | Methods of identifying optimal variants of peptide epitopes |
WO2004094454A2 (en) * | 2003-04-18 | 2004-11-04 | Idm Pharma, Inc. | Hla-a2 tumor associated antigen peptides and compositions |
PT1806358E (pt) * | 2005-09-05 | 2010-05-28 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Peptídeos associados a tumor ligando promiscuamente às moléculas do antigénio de leucócitos humanos (hla) da classe ii |
-
2008
- 2008-10-30 WO PCT/US2008/081799 patent/WO2009059011A2/en active Application Filing
- 2008-10-30 US US12/740,562 patent/US20100310640A1/en not_active Abandoned
- 2008-10-30 JP JP2010532242A patent/JP2011502484A/ja active Pending
- 2008-10-30 CA CA2991175A patent/CA2991175A1/en not_active Abandoned
- 2008-10-30 EP EP16160535.7A patent/EP3085707B1/en active Active
- 2008-10-30 CN CN200880124030.6A patent/CN102066410B/zh active Active
- 2008-10-30 CA CA2704397A patent/CA2704397C/en active Active
- 2008-10-30 EP EP08843542.5A patent/EP2215111B1/en active Active
-
2014
- 2014-07-28 JP JP2014152923A patent/JP6006265B2/ja active Active
- 2014-09-08 US US14/480,365 patent/US20140377340A1/en not_active Abandoned
-
2016
- 2016-12-16 US US15/381,454 patent/US10556943B2/en active Active
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
JPN6013026765; Cancer Immunol. Immunother. Vol.50, No.11, 2002, p.615-624 * |
JPN6013026767; Clinnical Cancer Research Vol.9, No.15, 2003, p.5559-5565 * |
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPWO2013089252A1 (ja) * | 2011-12-14 | 2015-04-27 | 国立大学法人高知大学 | ヘルパーt細胞誘導性ポリペプチドの改変 |
JP2018038388A (ja) * | 2013-08-05 | 2018-03-15 | イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハー | Nsclcをはじめとする肺がんなどの数種の腫瘍に対する新規免疫療法 |
JP2020010686A (ja) * | 2013-08-05 | 2020-01-23 | イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハー | Nsclcをはじめとする肺がんなどの数種の腫瘍に対する新規免疫療法 |
JP7039044B2 (ja) | 2013-08-05 | 2022-03-22 | イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハー | Nsclcをはじめとする肺がんなどの数種の腫瘍に対する新規免疫療法 |
JP2022058349A (ja) * | 2015-12-10 | 2022-04-12 | イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハー | Cllおよびその他のがんに対する免疫療法において使用するための新規ペプチドおよびペプチドの組み合わせ |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP2215111A2 (en) | 2010-08-11 |
JP2015007061A (ja) | 2015-01-15 |
EP3085707B1 (en) | 2019-02-27 |
CA2704397A1 (en) | 2009-05-07 |
US20140377340A1 (en) | 2014-12-25 |
CA2704397C (en) | 2018-01-23 |
CN102066410A (zh) | 2011-05-18 |
US20100310640A1 (en) | 2010-12-09 |
CA2991175A1 (en) | 2009-05-07 |
EP2215111A4 (en) | 2011-08-03 |
EP3085707A1 (en) | 2016-10-26 |
JP6006265B2 (ja) | 2016-10-12 |
US10556943B2 (en) | 2020-02-11 |
US20170342126A1 (en) | 2017-11-30 |
WO2009059011A9 (en) | 2009-12-30 |
WO2009059011A3 (en) | 2009-11-05 |
EP2215111B1 (en) | 2016-03-16 |
WO2009059011A2 (en) | 2009-05-07 |
CN102066410B (zh) | 2017-01-18 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6006265B2 (ja) | Hla−dr結合性ペプチドおよびそれらの使用 | |
EP1917970B1 (en) | Hla binding peptides and their uses | |
EP1230268B1 (en) | Heteroclitic analogs of class i epitopes | |
EP1911461A2 (en) | HLA class I and II binding peptides and their uses | |
EP0907370B1 (en) | Hla-a2.1 binding peptides and their uses | |
JP2002507397A (ja) | Hla結合ペプチド及びその使用 | |
JP2003521245A (ja) | ペプチドおよび核酸組成物を使用する、前立腺癌抗原に対する細胞性免疫応答の誘導 | |
EP1263775A1 (en) | Hla binding peptides and their uses | |
JP2004500059A (ja) | ペプチドおよび核酸組成物を使用する、癌胎児性抗原に対する細胞性免疫応答の誘導 | |
CA2432995C (en) | Immunogenic hla-a2 supermotif-restricted peptides | |
US20040157273A1 (en) | Subunit vaccines with a2 supermotifs | |
JP2004517609A (ja) | Hla−a2.1結合ペプチドおよびそれらの用途 | |
WO1999065522A1 (en) | Hla binding peptides and their uses | |
JP2004522415A (ja) | Hla結合ペプチドおよびその使用方法 | |
JP2004508340A (ja) | Hla結合ペプチドおよびその使用方法 | |
JP2011139706A (ja) | Hla結合ペプチドおよびその使用方法 | |
JP2010001303A (ja) | Hla結合ペプチド及びその使用 | |
KR20030036139A (ko) | Hla 결합 펩티드 및 이의 용도 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20111027 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20121010 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20130605 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20130903 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20130910 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20131203 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20140326 |