JP2011101617A - 細菌コロニ釣菌装置及びその前処理方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】釣菌対象とする細菌コロニを特定するマークの位置と細菌コロニの領域をそれぞれ別の波長成分画像から取得する。この後、撮像画像から識別されたマークに対応する細菌コロニの領域を、釣菌対象を与える位置情報として設定する。
【選択図】図1
Description
まず、実施例に係る細菌コロニ釣菌装置が作業者に要求する前処理の内容を説明する。患者から採集した血液、喀痰、尿、糞便等の検体、水、土壌、食品から採取した検体等に含まれる細菌の有無を確認する場合、作業者は培養プレートの底面に敷設した寒天その他の培地に検体を塗布した後、当該培養プレートをインキュベータ(例えば恒温槽)に収容して細菌を培養する。培養時間は、通常12時間以上である。所定の培養時間が経過すると、検査技師である作業者は、培地上に細菌コロニが生育した培養プレートを確認し、釣菌対象とする細菌コロニを選定する。この選定の際、作業者は、選択した細菌コロニを特定的に示すマークを培養プレートの裏面に付ける。なお、培養プレートの蓋にマークを付けることもできる。
図1に、実施例に係る細菌コロニ釣菌装置の概略構成例を示す。図1に示す細菌コロニ釣菌装置は、セットされた培養プレート1の縁部を底面側から支持する環状の台座と、培養プレート1を底面側から撮像する1台の撮像部2と、培養プレート1の底面を第1の波長成分の光で照明する照明部3と、培養プレート1の底面を第2の波長成分の光で照明する照明部4と、撮像部2で撮像された画像を処理する画像処理部5と、釣菌針6を上下左右に移動する釣菌機構7と、装置全体を制御する制御部8とで構成される。
実施例に係る細菌コロニ釣菌装置では、2種類の波長成分画像を撮像することにより、1台の撮像部2だけでも釣菌対象とする細菌コロニの正確な位置情報の取得を可能とする。ここで、1つの波長成分画像は、釣菌対象とする細菌コロニを特定するマークを他の領域から識別可能に撮像できる波長成分について撮像された画像であり、他の波長成分画像は、培養プレート上に培養された細菌コロニを他の領域から識別可能に撮像できる波長成分について撮像された画像である。マークと細菌コロニを個別に取得できれば、マークされた特定の細菌コロニの位置情報(領域情報)を正確に抽出することができる。
実施例に係る撮像部2には、オートフォーカス機能を搭載する。ここでのオートフォーカス機能は、釣菌対象とする細菌コロニを特定するマークを撮像対象とする波長成分画像の撮像時には、マークが描画されている培養プレート1の裏面又は蓋の表面にフォーカスを自動的に合せ、細菌コロニを撮像対象とする波長成分画像の撮像時には、細菌コロニが培養されている培地上にフォーカスを自動的に合わせることを意味する。
図5に、細菌コロニ釣菌装置に培養プレート1をセットしてから特定の細菌コロニを釣菌するまでの処理手順の概要を示す。なお、図5では、白色光源を有する照明部3と赤外光源を有する照明部4を備え、撮像部2は赤外カットフィルタの着脱機構を備えるカラーCCDカメラを備えるものとする。また、可視光の吸収度はマークの方が培地や細菌コロニよりも大きく、赤外光の吸収度は細菌コロニと培地の方がマークよりも大きいものとする。さらに、赤外光の吸収度は、培地よりも細菌コロニの方が大きいものとする。すなわち、可視領域ではマークだけを他の領域から区別して撮像することが可能であり、赤外領域では細菌コロニを培地から区別して撮像することが可能であるものとする。
以下では、透明度が異なる複数種類の培地にそれぞれ細菌コロニを培養した場合と培養しない場合における波長成分と吸光度(透過率)の関係の違いを説明する。図6−図8に、3種類の培地について照射する波長成分を変化させた場合(波長を350nm〜850nmの範囲で変化させた場合)における吸光度(透過率)の変化を示す。なお、吸光度が低いほど透過率が高いことを示す。図6はミューラーヒントン培地を用いる場合の測定例であり、図7は血液培地を用いる場合の測定例であり、図8はチョコレート培地を用いる場合の測定例である。
図9に、白色光で培養プレート1を照明し、その画像をオートフォーカス機能付きのカラーCCDカメラを用いて撮像する場合に取得される画像例を示す。図中、網掛けで示す領域が細菌コロニであり、白抜きの大円が撮像範囲の外縁(培地の外縁)である。図9は、釣菌対象とする細菌コロニ21、22、23、24、25を囲むように描画されたマーク31、32、33、34、35の画像を示す。なお、図9では実際に撮像される像を実線で表し、実際には撮像されない像を点線で囲んで示している。従って、図9において実際に撮像されているのはマーク31−35だけとなる。
2:撮像部
3:照明部
4:照明部
5:画像処理部
6:釣菌針
7:釣菌機構
8:制御部
11:照明部
21−25:細菌コロニ
31−35:マーク
Claims (15)
- 培養プレート上から細菌コロニを釣菌する装置において、
釣菌機構と、
照明部と、
設置された培養プレートの画像を撮像する撮像部と、
前記照明部及び前記撮像部を制御して複数種類の波長成分画像を撮像し、撮像された複数種類の波長成分画像を比較して釣菌対象とする細菌コロニの位置情報を取得する画像処理部と、
取得された前記位置情報に基づいて前記釣菌機構を駆動制御する制御部と
を有する細菌コロニ釣菌装置。 - 前記複数種類の波長成分画像のうちの一つは、釣菌対象とする細菌コロニを特定するマークを他の領域から識別可能に撮像できる波長成分について撮像された画像であり、
前記複数種類の波長成分画像のうちの一つは、培養プレート上に培養された細菌コロニを他の領域から識別可能に撮像できる波長成分について撮像された画像である
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 前記画像処理部は、波長成分画像に含まれる特定領域の明るさとその他の領域の明るさの違いに基づいて前記マーク、前記細菌コロニ、培地の各領域を識別し、識別された細菌コロニのうち前記マークが付された細菌コロニの位置情報だけを釣菌対象に選定された細菌コロニの位置情報として取得する
ことを特徴とする請求項2に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 前記照明部は、波長成分が異なる複数種類の光を選択的に照射できる1つの光源又はそれぞれが前記複数種類の光に対応する複数個の光源を有する
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 前記照明部は、白色光を照射できる光源と、白色光のうち前記培養プレートに照射される波長成分を選択的に切り替える機構部とを有する
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 前記撮像部は、前記複数種類の波長成分画像に対応する全ての波長域の画像を撮像できる撮像装置と、培養プレートからの光のうち前記撮像装置に入射する波長成分を選択的に切り替える機構部とを有する
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 前記撮像部は、前記複数種類の波長成分画像を、前記培養プレートの一方向のみから撮像する
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 前記複数種類の波長成分画像のうちの一つは、釣菌対象とする細菌コロニを特定するために付されるマークに吸収される波長成分について撮像された画像であり、
前記複数種類の波長成分画像のうちの一つは、培地を通過する又は培地と前記マークの両方を通過する一方で細菌コロニに吸収される波長成分について撮像された画像である
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 釣菌対象とする細菌コロニを特定するために付されるマークに吸収される波長成分を有する第1の光を前記照明部が照射するとき、前記撮像部は前記培養プレートの撮像画像を第1の波長成分画像として撮像し、
培地を通過する又は培地と前記マークの両方を通過する一方で細菌コロニに吸収される波長成分を有する第2の光を前記照明部が照射するとき、前記撮像部は前記培養プレートの撮像画像を第2の波長成分画像として撮像する
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 前記照明部が可視領域の第1の光を照射する第1の光源と長波長域の第2の光を照射する第2の光源を有し、かつ、前記撮像部が波長選択性能を有する場合において、
前記照明部が前記第1の光を照射するとき、前記撮像部は前記培養プレートの長波長域以外の波長成分について得られる画像を第1の波長成分画像として取得し、
前記照明部が前記第2の光を照射するとき、前記撮像部は前記培養プレートの長波長域成分について得られる撮像画像を第2の波長成分画像として取得する
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 前記照明部が釣菌対象とする細菌コロニを特定するマークのみに吸収される第1の光を照射する第1の光源と細菌コロニのみに吸収される第2の光を照射する第2の光源を有し、かつ、前記撮像部が波長選択性を有していない場合において、
前記照明部が前記第1の光を照射するとき、前記撮像部は前記培養プレートの画像を第1の波長成分画像として取得し、
前記照明部が前記第2の光を照射するとき、前記撮像部は前記培養プレートの画像を第2の波長成分画像として取得する
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 前記照明部が複数の波長成分を含む光を照射する光源と、複数の波長成分を含む前記光のうち釣菌対象とする細菌コロニを特定するマークのみを透過する第1の光と前記細菌コロニのみを透過する第2の光を選択的に通過する機構部とを有し、かつ、前記撮像部が波長選択性を有していない場合において、
前記照明部が前記第1の光を照射するとき、前記撮像部は前記培養プレートの画像を第1の波長成分画像として取得し、
前記照明部が前記第2の光を照射するとき、前記撮像部は前記培養プレートの画像を第2の波長成分画像として取得する
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 前記撮像部は、釣菌対象とする細菌コロニを特定するマークの取得時には、当該マークの生成面に自動的に焦点を合わせ、培地上に培養された細菌コロニの画像の取得時には、培地上に自動的に焦点を合わせるオートフォーカス機構を有する
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 釣菌対象とする細菌コロニの位置は、吸収する波長成分又は透過する波長成分が異なる複数種類のマークによって特定されている
ことを特徴とする請求項1に記載の細菌コロニ釣菌装置。 - 釣菌機構と、照明部と、設置された培養プレートの画像を撮像する撮像部と、前記撮像部で撮像された画像を処理する画像処理部と、取得された前記位置情報に基づいて前記釣菌機構を駆動制御する制御部とを有する細菌コロニ釣菌装置の前処理方法において、
前記画像処理部を通じて前記照明部及び前記撮像部を制御して、複数種類の波長成分画像を取得する処理と、
取得された複数種類の波長成分画像を比較して釣菌対象とする細菌コロニの位置情報を取得する処理と
を有する細菌コロニ釣菌装置の前処理方法。
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Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2015533508A (ja) * | 2012-10-29 | 2015-11-26 | ビオムリュ | 生物種を観察する方法 |
WO2018061951A1 (ja) * | 2016-09-30 | 2018-04-05 | オリンパス株式会社 | 培養観察システム |
US20180284146A1 (en) * | 2015-05-28 | 2018-10-04 | B.D. Kiestra B.V. | Automated method and system for obtaining and preparing microorganism sample for both identification and antibiotic susceptibility tests |
US11226476B2 (en) | 2016-09-30 | 2022-01-18 | Olympus Corporation | Specimen observation apparatus |
US11460682B2 (en) | 2017-05-29 | 2022-10-04 | Evident Corporation | Observation device |
Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS611378A (ja) * | 1984-06-14 | 1986-01-07 | Hitachi Electronics Eng Co Ltd | コロニ−自動移植装置 |
JPS62272967A (ja) * | 1986-05-22 | 1987-11-27 | Hitachi Electronics Eng Co Ltd | コロニ−自動移植装置 |
JPS6358598U (ja) * | 1986-10-06 | 1988-04-19 | ||
JPH1078434A (ja) * | 1996-07-19 | 1998-03-24 | Bayer Ag | 少なくとも一つの与えられたリガンドに対する個々の結合特性に関する分子のスクリーニングのための方法及び装置 |
JP2003116593A (ja) * | 2001-10-17 | 2003-04-22 | Hakuju Inst For Health Science Co Ltd | 微生物の判定方法およびその装置 |
JP2005257567A (ja) * | 2004-03-12 | 2005-09-22 | Microbio Corp | 3次元領域内の被写体の撮影方法および撮影装置 |
JP2011036188A (ja) * | 2009-08-12 | 2011-02-24 | Ihi Corp | 微生物検出装置 |
-
2009
- 2009-11-11 JP JP2009257829A patent/JP5552298B2/ja active Active
Patent Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS611378A (ja) * | 1984-06-14 | 1986-01-07 | Hitachi Electronics Eng Co Ltd | コロニ−自動移植装置 |
JPS62272967A (ja) * | 1986-05-22 | 1987-11-27 | Hitachi Electronics Eng Co Ltd | コロニ−自動移植装置 |
JPS6358598U (ja) * | 1986-10-06 | 1988-04-19 | ||
JPH1078434A (ja) * | 1996-07-19 | 1998-03-24 | Bayer Ag | 少なくとも一つの与えられたリガンドに対する個々の結合特性に関する分子のスクリーニングのための方法及び装置 |
JP2003116593A (ja) * | 2001-10-17 | 2003-04-22 | Hakuju Inst For Health Science Co Ltd | 微生物の判定方法およびその装置 |
JP2005257567A (ja) * | 2004-03-12 | 2005-09-22 | Microbio Corp | 3次元領域内の被写体の撮影方法および撮影装置 |
JP2011036188A (ja) * | 2009-08-12 | 2011-02-24 | Ihi Corp | 微生物検出装置 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
BIOTECHNOLOGY, vol. 8, no. 8, JPN6013057517, August 1990 (1990-08-01), pages 746 - 749, ISSN: 0002801623 * |
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2015533508A (ja) * | 2012-10-29 | 2015-11-26 | ビオムリュ | 生物種を観察する方法 |
US20180284146A1 (en) * | 2015-05-28 | 2018-10-04 | B.D. Kiestra B.V. | Automated method and system for obtaining and preparing microorganism sample for both identification and antibiotic susceptibility tests |
US10921336B2 (en) * | 2015-05-28 | 2021-02-16 | Bd Kiestra B.V. | Automated method and system for obtaining and preparing microorganism sample for both identification and antibiotic susceptibility tests |
WO2018061951A1 (ja) * | 2016-09-30 | 2018-04-05 | オリンパス株式会社 | 培養観察システム |
JPWO2018061951A1 (ja) * | 2016-09-30 | 2019-07-18 | オリンパス株式会社 | 培養観察システム |
US11226476B2 (en) | 2016-09-30 | 2022-01-18 | Olympus Corporation | Specimen observation apparatus |
US11460682B2 (en) | 2017-05-29 | 2022-10-04 | Evident Corporation | Observation device |
Also Published As
Publication number | Publication date |
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