JP2009519001A5

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Publication number: JP2009519001A5
Application number: JP2005510048A
Authority: JP
Filing date: 2003-12-22
Publication date: 2009-06-25

Claims

狭窄を発生させる変化した危険性を有する個体を同定することを補助するための方法であって、該方法は、
該個体の核酸において、配列番号７６０５、８０５８、１１０９３、１１５０７、１７４７３、１７１１７、１１７３２、５８２２、１９４５８、および１３７８４のヌクレオチド配列のうちのいずれか一つにおいて一塩基多型（ＳＮＰ）を検出する工程
を包含し、ここで、該ＳＮＰの存在は、該個体における狭窄の変化した危険性と相関する、方法。
前記変化した危険性が、増加した危険性である、請求項１に記載の方法。
前記個体が、狭窄を有する、請求項２に記載の方法。
前記変化した危険性が、減少した危険性である、請求項１に記載の方法。
請求項１に記載の方法であって、対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的増幅、配列決定、５’ヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、サイズ分析、および一本鎖立体配座多型からなる群より選択されるプロセスにより検出が実施される、方法。
少なくとも８個連続したヌクレオチドを含む単離された核酸分子であって、ここで、該ヌクレオチドのうちの一つが、配列番号７６０５、８０５８、１１０９３、１１５０７、１７４７３、１７１１７、１１７３２、５８２２、１９４５８、および１３７８４のヌクレオチド配列のうちのいずれか一つより選択される一塩基多型（ＳＮＰ）またはそれらの相補体である、核酸分子。
配列番号２８５〜５６８のアミノ酸配列のうちのいずれか一つをコードする、単離された核酸分子。
配列番号２８５〜５６８からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
請求項８に記載のポリペプチドに特異的に結合する抗体、もしくはその抗原結合フラグメント。
前記抗体が、モノクローナル抗体である、請求項９に記載の抗体。
増幅されたポリヌクレオチドであって、該増幅されたポリヌクレオチドは、配列番号７６０５、８０５８、１１０９３、１１５０７、１７４７３、１７１１７、１１７３２、５８２２、１９４５８、および１３７８４のヌクレオチド配列のうちのいずれか一つより選択される一塩基多型（ＳＮＰ）またはそれらの相補体を含み、ここで、該増幅されたポリヌクレオチドは、約１６ヌクレオチドと約１，０００ヌクレオチドとの間の長さである、ポリヌクレオチド。
請求項１１に記載の増幅されたポリヌクレオチドであって、ここで、前記ヌクレオチド配列が、配列番号７６０５、８０５８、１１０９３、１１５０７、１７４７３、１７１１７、１１７３２、５８２２、１９４５８、および１３７８４のヌクレオチド配列のうちのいずれか一つを含む、ポリヌクレオチド。
配列番号７６０５、８０５８、１１０９３、１１５０７、１７４７３、１７１１７、１１７３２、５８２２、１９４５８、および１３７８４のヌクレオチド配列のうちのいずれか一つの一塩基多型（ＳＮＰ）を含む核酸分子に特異的にハイブリダイズする、単離されたポリヌクレオチド。
８〜７０ヌクレオチドの長さである、請求項１３に記載のポリヌクレオチド。
対立遺伝子特異的プローブである、請求項１３に記載のポリヌクレオチド。
対立遺伝子特異的プライマーである、請求項１３に記載のポリヌクレオチド。
請求項１３に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、表５（配列番号２６，１３１〜２６，４１５）に記載のプライマー配列からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、ポリヌクレオチド。
核酸中の一塩基多型（ＳＮＰ）を検出するためのキットであって、該キットは、請求項１３のポリヌクレオチド、緩衝剤、および酵素を備える、キット。
核酸分子中の一塩基多型（ＳＮＰ）を検出するための方法であって、該方法は、
ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号７６０５、８０５８、１１０９３、１１５０７、１７４７３、１７１１７、１１７３２、５８２２、１９４５８、および１３７８４のヌクレオチド配列のうちのいずれか一つにおけるＳＮＰに特異的にハイブリダイズする試薬と、試験サンプルとを接触させる工程；ならびに
ハイブリダイズした二重鎖の形成を検出する工程
を包含する、方法。
請求項１９に記載の方法であって、対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的増幅、配列決定、５’ヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、サイズ分析、および一本鎖立体配座多型からなる群より選択されるプロセスにより検出が実施される、方法。
改変ポリペプチドを検出するための方法であって、該方法は、
試験サンプル中の配列番号７６０５、８０５８、１１０９３、１１５０７、１７４７３、１７１１７、１１７３２、５８２２、１９４５８、および１３７８４のヌクレオチド配列のうちのいずれか一つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）によりコードされる改変ポリペプチドと、試薬とを接触させる工程、および
該試薬の該ポリペプチドへの結合を検出する工程
を包含する、方法。
狭窄を治療的もしくは予防的に処置するのに有用な薬剤を同定するための方法であって、該方法は、
候補薬剤と、請求項８に記載のポリペプチドとを、該ポリペプチドと該候補薬剤との間に結合複合体を形成させるために適切な条件下で接触させる工程、ならびに
該結合複合体の形成を検出する工程
を包含し、ここで、該複合体の存在は、該薬剤を同定する、方法。