JP2009505633A5

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Publication number: JP2009505633A5
Application number: JP2008503299A
Authority: JP
Filing date: 2006-07-19
Publication date: 2009-09-10
Anticipated expiration: 2026-07-19

Claims

以下の段階を含む、NSCLCを治療または予防するための化合物をスクリーニングする方法：
(a)試験化合物の存在下で、KNTC2ポリペプチドまたはその機能的等価物をCDCA1ポリペプチドまたはその機能的等価物と接触させる段階；
(b)段階(a)のポリペプチド間の結合を検出する段階；および
(c)KNTC2ポリペプチドとCDCA1ポリペプチドの結合を阻害する試験化合物を選択する段階。
CDCA1ポリペプチドの機能的等価物が、KNTC2結合ドメインのアミノ酸配列を含む、請求項1記載の方法。
CDCA1ポリペプチドの機能的等価物が、SEQ ID NO：35のアミノ酸配列(IQKIKLGIQQLKDAAEREK)を含む、請求項2記載の方法。
KNTC2ポリペプチドの機能的等価物が、CDCA1結合ドメインのアミノ酸配列を含む、請求項1記載の方法。
以下の構成要素を含む、NSCLCを治療または予防するための化合物をスクリーニングするためのキット：
(a)KNTC2ポリペプチドまたはその機能的等価物、および
(b)CDCA1ポリペプチドまたはその機能的等価物。
センス鎖およびアンチセンス鎖を含む二本鎖分子であって、該センス鎖が、KNTC2標的配列に対応するリボヌクレオチド配列を含み、かつ該アンチセンス鎖が、該センス鎖に相補的であるリボヌクレオチド配列を含み、さらに該センス鎖および該アンチセンス鎖が互いにハイブリダイズして該二本鎖分子を形成し、かつ該二本鎖分子が、KNTC2遺伝子を発現する細胞中に導入された場合に該遺伝子の発現を阻害する、二本鎖分子。
KNTC2標的配列が、SEQ ID NO：31のヌクレオチド配列由来の少なくとも約10個の連続的なヌクレオチドを含む、請求項６記載の二本鎖分子。
KNTC2標的配列が、SEQ ID NO：31のヌクレオチド配列由来の約19個〜約25個の連続的なヌクレオチドを含む、請求項７記載の二本鎖分子。
KNTC2標的配列がSEQ ID NO：9を含む、請求項８記載の二本鎖分子。
一本鎖リボヌクレオチド配列を介して連結されたセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む単一のリボヌクレオチド転写物である、請求項６記載の二本鎖分子。
約100ヌクレオチド長未満のオリゴヌクレオチドである、請求項６記載の二本鎖分子。
約75ヌクレオチド長未満のオリゴヌクレオチドである、請求項１１記載の二本鎖分子。
約50ヌクレオチド長未満のオリゴヌクレオチドである、請求項１２記載の二本鎖分子。
約25ヌクレオチド長未満のオリゴヌクレオチドである、請求項１３記載の二本鎖分子。
二本鎖分子が、約19ヌクレオチド長と約25ヌクレオチド長の間のオリゴヌクレオチドである、請求項１４記載の二本鎖分子。
請求項６記載の二本鎖分子をコードするベクター。
センス鎖およびアンチセンス鎖を含む二次構造を有する転写物をコードする、請求項１６記載のベクター。
転写物が、センス鎖およびアンチセンス鎖を連結する一本鎖リボヌクレオチド配列をさらに含む、請求項１７記載のベクター。
センス鎖核酸およびアンチセンス鎖核酸の組み合わせを含むポリヌクレオチドを含むベクターであって、該センス鎖核酸がSEQ ID NO：9からなるヌクレオチド配列を含み、かつ該アンチセンス鎖核酸が、該センス鎖に相補的な配列からなる、ベクター。
ポリヌクレオチドが、一般式
5'-[A]-[B]-[A']-3'
を有し、式中[A]がSEQ ID NO：9のヌクレオチド配列であり、[B]が3個〜23個のヌクレオチドからなるヌクレオチド配列であり、かつ[A']が[A]に相補的なヌクレオチド配列である、請求項１９記載のベクター。
KNTC2遺伝子に対する薬学的有効量のsiRNAを含む、NSCLCを治療または予防するための組成物。
siRNAが、SEQ ID NO：9のヌクレオチド配列を含むセンス鎖を標的配列として含む、請求項２１記載の組成物。
以下の段階を含む、NSCLCの予後を評価する方法：
(a)NSCLCの予後が評価される対象から採取された試料におけるCDCA1およびKNTC2のいずれかまたは両方の発現レベルを検出する段階、ならびに
(b)CDCA1およびKNTC2のいずれかまたは両方の発現レベルの上昇が検出される場合、予後不良が示唆される段階。
CDCA1およびKNTC2の両方の発現レベルを検出する段階を含む、請求項２３記載の方法。
発現レベルが、以下からなる群より選択される方法のいずれか1つによって検出される、請求項２３記載の方法：
(a)SEQ ID NO：34(CDCA1)またはSEQ ID NO：32(KNTC2)のアミノ酸配列をコードするmRNAの存在を検出する段階、
(b)SEQ ID NO：34(CDCA1)またはSEQ ID NO：32(KNTC2)のアミノ酸配列を含むタンパク質の存在を検出する段階、および
(c)SEQ ID NO：34(CDCA1)またはSEQ ID NO：32(KNTC2)のアミノ酸配列を含むタンパク質の生物活性を検出する段階。
以下からなる群より選択される任意の1つの構成要素を含む、NSCLCの予後を評価するためのキット：
(a)SEQ ID NO：34(CDCA1)またはSEQ ID NO：32(KNTC2)のアミノ酸配列をコードするmRNAの存在を検出するための試薬、
(b)SEQ ID NO：34(CDCA1)またはSEQ ID NO：32(KNTC2)のアミノ酸配列を含むタンパク質の存在を検出するための試薬、および
(c)SEQ ID NO：34(CDCA1)またはSEQ ID NO：32(KNTC2)のアミノ酸配列を含むタンパク質の生物活性を検出するための試薬。