JP2009235091A - ヒトk+イオンチャンネルおよびその治療的適用 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】核酸分子の望まれていない発現または過剰発現によって引き起こされる疾患の治療用薬物の設計方法であって、
(a)特異的かつ効力の高い薬物を同定する工程;
(b)部位特異的突然変異誘発およびキメラタンパク質研究による、前記薬物の結合部位を同定する工程;
(c)(ポリ)ペプチドの結合部位および前記薬物の構造の両方を分子モデリングする工程;ならびに
(d)(ポリ)ペプチドに対するその結合特異性を改良するために薬物を改変する工程、
を含み、該核酸分子が、
(A)配列番号:3または4のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸分子を含有してなる核酸分子;
(B)配列番号:13または14のDNA配列を有する核酸分子を含有してなる核酸分子;
(C)(A)または(B)の核酸分子の相補的な鎖にハイブリダイズする核酸分子;または
(D)(C)の核酸分子の配列に縮重した核酸分子、
である、ヒトK+ イオンeagチャンネルの機能を有する(ポリ)ペプチドをコードする核酸分子を含有してなる、治療用薬物の設計方法。
【選択図】なし
Description
核酸分子の望まれていない発現または過剰発現によって引き起こされる疾患の治療用薬物の設計方法であって、
(a)特異的かつ効力の高い薬物を同定する工程;
(b)部位特異的突然変異誘発およびキメラタンパク質研究による、前記薬物の結合部位を同定する工程;
(c)(ポリ)ペプチドの結合部位および前記薬物の構造の両方を分子モデリングする工程;ならびに
(d)(ポリ)ペプチドに対するその結合特異性を改良するために薬物を改変する工程、
を含み、該核酸分子が、
(A)配列番号:3または4のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸分子を含有してなる核酸分子;
(B)配列番号:13または14のDNA配列を有する核酸分子を含有してなる核酸分子;
(C)(A)または(B)の核酸分子の相補的な鎖にハイブリダイズする核酸分子;または
(D)(C)の核酸分子の配列に縮重した核酸分子、
である、ヒトK+ イオンeagチャンネルの機能を有する(ポリ)ペプチドをコードする核酸分子を含有してなる、治療用薬物の設計方法
に関する。
(a)配列番号:3または4のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸分子を含有してなる核酸分子;
(b)配列番号:13または14のDNA配列を有する核酸分子を含有してなる核酸分子;
(c)(a)または(b)の核酸分子の相補的な鎖にハイブリダイズする核酸分子;または
(d)(c)の核酸分子の配列に縮重した核酸分子、
である、ヒトK+ イオンeagチャンネルの機能を有する(ポリ)ペプチドをコードする核酸分子を含有してなる核酸分子に関する。
(a)前記疾患により冒された哺乳動物から細胞を得る工程ならびに前記導入工程の後に前記疾患により冒された哺乳動物から細胞を得る工程、ここで、前記導入は前記細胞に行われる、
(b)前記細胞を前記哺乳動物または同種の哺乳動物に再導入する工程、
をさらに含む。
(a)特異的かつ効力の高い薬物を同定する工程;
(b)部位特異的突然変異誘発およびキメラタンパク質研究による、前記薬物の結合部位を同定する工程;
(c)(ポリ)ペプチドの結合部位および前記薬物の構造の両方を分子モデリングする工程;ならびに
(d)(ポリ)ペプチドに対するその結合特異性を改良するために薬物を改変する工程、
を含む、治療用薬物の設計方法に関する。
(a)アンチセンスオリゴヌクレオチドおよびリボザイムから選ばれる化合物を、翻訳の阻害または低減に対して試験する工程;または
(b)本発明の(ポリ)ペプチドをコードし、かつ好ましくはその転写因子応答エレメントを有する遺伝子のプロモーター領域に結合する化合物を、転写の阻害に対して試験する工程;または
(c)本発明の(ポリ)ペプチドの増殖活性をブロックすると推測されるペプチドまたは抗体を、前記ブロック活性に対して試験する工程、
を含む、本発明の核酸分子の発現のインヒビターまたは本発明の(ポリ)ペプチドの機能のインヒビターを同定する方法に関する。
(a)ヒトeagに特異的な薬物を得るための、H1アンタゴニスト(好ましくはアステミゾール)の化学工学を共に有するチャンネルの変異誘発;
(b)診断および/または予知方法を設計するための、癌細胞でのeagの発現レベルの定量的および定性的解析。これはまた、特定の腫瘍に対する遺伝子治療の設計を可能にするであろう。
標準手法に従ってMCF−7細胞から得た全RNAよりmRNAを精製した。次いで、スーパースクリプト(Superscript)II逆転写酵素を用い逆転写によりcDNAを調製した;このcDNAを、高度に保存されたeag配列に適合するように設計された縮重オリゴヌクレオチドを使用するPCR増幅のための鋳型として用いた。増幅後、ラットeag由来のSacII/SacII断片を、結果のサザンブロット解析のためのプローブとして用いた。陽性ハイブリダイゼーションを示すそれらのバンドを、次いで、pGEM−Tベクター(Promega社)にクローニングし、配列決定した。それらの全てがHERGに対応する配列を与えた。
5'-CAGAA(T,C)AA(T,C)GTGGC(A,C,T,G,)TGGCT
5'-TCACT(G,A)AAGATCTATA(A,G)TC
eagファミリーの他の1つのメンバーであるHERG11-16 は、長鎖QT症候群(LQT)のファミリー型に関連付けられている。これにより、それらのLQT型不整脈を誘導する能力に基づいてHERGのいくつかのブロッカーの同定が可能となっている。このように、アステミゾール(astemizole)およびテルフェナジン(terfenadine)等の特定のヒスタミンH1レセプターブロッカー、ならびにIII型不整脈薬物〔ドフェチリド(dofetilide)、E−4031)〕は、HERG15,17 の強力で特異的なブロッカーである。しかしながら、eagチャンネルについての特異的なブロッカーは未だ記載されていない。HERGとeagチャンネル間の配列類似性のため、reagに対する両群の薬物を本発明に従って試験した。H1ブロッカーもreagに影響し、一方、チャンネルはIII型抗不整脈剤(ドフェチリド)に対しむしろ無感受性である。このことは、選択的にeag型チャンネルをブロックし、(MCF7細胞にも存在する)HERGチャンネルの可能な影響を排除するための有効な道具を提供する。単一の推定ヒトeagチャンネルに対する、これらの薬物の1つ(アステミゾール 5μM)の影響をFig.6に示す。
異なるヒト組織由来の全RNA500ng(または脊髄のポリA+ RNA5ng)を逆転写し、配列 5'-CGCATGAACTACCTGAAGACG(フォワード)および5'-TCTGTGGATGGGGCGATGTTC(リバース)の1組のオリゴヌクレオチドを用いて増幅した。増幅したDNAを特異的なヒトeagプローブ(チャンネルのコア由来の1.5Kb EcoRI断片)を用いてサザンブロットにより解析した。試験したRNAの内、脳全RNAのみが陽性シグナルを与えた。脊髄、副腎、骨格筋、心臓、気管、肝臓、腎臓および乳腺由来のRNAは陰性であった。RNAの正確性をトランスフェリン増幅を用いて調べた。同じアプローチを用いて、いくつかの腫瘍性ヒト細胞株におけるheagの発現を調べた:MCF−7(胸腺癌)BT−474〔胸管癌(breast ductal carcinoma)、充実性腫瘍由来〕、EFM−19〔胸癌、管型胸膜液(pleural fluid)由来〕、COLO−824(胸癌、胸膜液由来)、SHSY5Y(神経芽腫)。正常組織と比較して、試験した全ての癌細胞株はheag発現について陽性であることが見出された。さらに、異なるヒト組織および293細胞由来のRNAのRT−PCR産物のサザンブロットは、脳由来RNAにおいてのみ、heagAおよびBに相当する2つのバンドが増幅され得、同定され得るということを示す。トランスフェリンレセプター(TFR)シグナルを下部に示す(Fig.15A)。さらに、異なるヒト細胞株および乳房上皮細胞の一次培養物(Epith.cells)由来の全RNAのRT−PCR産物のサザンブロット解析。TRFシグナルを下部に示す。異なる細胞株由来のRNA(34)およびヒト組織由来の市販のRNA(Clontech社)をシングル−チューブRT−PCR(35)に供した。脊髄を除き、全RNAを用いた。その際、ポリ(A)+ RNAを用いた(プライマー配列は以下:フォワード:5'-CGCATGAACTACTGAAGACG、およびリバース:5'-TCTGTGGATGGGGCGATGTTC。5'-TCAGCCCAGCAGAAGCATTATおよびリバース:5'-CTGGCAGCGTGTGAGAGC をRNAおよびPCR性能を制御するために用いた。)。TFRの特異的プライマーをRNAおよびPCR性能を制御するために用いた。これらのODNは、エクソン11に始まり、エクソン19まで広がっている(37)公表されたTFR配列(36)に従って設計した。これは、2つのheagスプライス断片および逆転写酵素の非存在下での対照の増幅と共に、ゲノムDNA汚染による偽陽性を排除する。50μl(heag)または15μl(TFR)のPCR反応物を2%アガロースゲルで解析した。DNAをメンブレンに転写し、高度ストリンジェンシーにて、980bp heag断片および脳RNAから増幅されたTFR断片からなる〔32P〕−dCTP標識したランダムにプライミングするプローブと連続的にハイブリダイズさせた。
heagの発現はインビボで腫瘍細胞にとって有利であるか否かを決定するため、本発明者らは、雌性シッド(scid)(極度の複合免疫不全、33)マウスの脇腹へのチャンネルを発現するCHO細胞(CHOhEAG細胞)の皮下移植を行った。CHOKv細胞を対照として用いた。従って、100μlのPBS中に懸濁した2×106 CHOhEAG細胞またはCHO−Kv1.4細胞を、Bomholtgard,Ry,Denmarkから得た6〜8週齢の雌性Fox Chase scidマウス(C.B−17/Icr sicd/scid)の脇腹上で皮下に移植した。腫瘍の存在を、全てのマウスの触診により2日ごとに調べた。2または3週間後、動物を頸の脱臼により屠殺し、腫瘍を切開し、続くパラフィン包埋および染色のためにパラホルムアルデヒドにて固定した。CHOhEAG細胞の同定は、pTracerベクター(Invitrogen)にコードされるグリーン蛍光タンパク質由来の蛍光を生起する腫瘍のUVイルミネーションにより確立した。移植の1週間後、CHOhEAGを注入した全てのマウスが触診により検出可能な腫瘍を有したが、対照においては1mmを超える容量のものは観察されなかった。移植後2週間の間には、heag発現腫瘍は直径で5mmを超過するに至り、ほとんどの場合、皮膚を通して目に見える程に現れた(Fig.17A);マウスを2週間後(N=6)または3週間後(N=7)に屠殺した。使用した11匹の対照動物の内1匹のみが目に見える腫瘍を有さなかった;全13匹のCHOhEAGを注入した動物は腫瘍を示した。heag発現腫瘍の平均容量(Fig.17B,C)は、対照のそれより有意に大きく、特に移植後2週目が大きかった(Fig.17B)。肉眼観察から、腫瘍はもろく、出血性であるようであった;CHOhEAG腫瘍は対照よりも黒ずんでおり、2週目に全てのCHOhEAGを注入したマウスにおいて皮膚に癒着した(Fig.17D,E)。7匹のマウスの内6匹が3週目に同様な特徴を示した。対照的に、腫瘍は、2週間後、全ての対照マウスにおいて皮膚から容易に切開でき、3週目に6匹のマウスの内5匹においてであった。腫瘍の下の組織は全ての場合に影響を受けていないようであった。組織学により確認し(Fig.17H,I,矢頭)、黒ずんだ色は多量の腫瘍内の壊死によるためであった(Fig.17F,G,矢印)。このことは、CHOhEAG腫瘍のより早い成長を示す。EAG発現腫瘍における生命維持範囲の厚さは、有意に対照におけるより小さかった(Fig.17J)。腫瘍の急速な成長により、CHOhEAG群における多量の腫瘍内壊死を説明することができる。このことはまた、移植2週間後における腫瘍の容積に見出される差異の増大を説明する。というのは、CHOhEAG腫瘍は、大量の壊死のために成長を止めるであろうからである。これらのデータは、heag腫瘍の発現はより早く成長し、CHOKv腫瘍よりもより攻撃的であることを強力に示唆する。
ある腫瘍細胞におけるheagの発現は、それらの異常な成長の結果ではないが、このK+ チャンネルが、それらの増殖に必要であるということが想定される。それゆえ、アンチセンスオリゴデオキシヌクレオチド(ODN)によるheag発現の阻害は、これらの腫瘍細胞における増殖速度を減少させるはずである。そこで、heagの推定開始コドンに広がる19merのアンチセンスホスホロチオエート ODN(5'-CAGCCATGGTCATCCTCCC)を用いて増殖の阻害を試験した。センスODNおよびスクランブル(scrambled)配列(gtcggtaccagtaggaggg )を対照として用いた。Figure 16Aに示すデータは、EFM細胞におけるheag mRNA含量を減少させるアンチセンスODN処理の有効性を明確にする。アンチセンスODNでの処理によるSHSY−5Y細胞におけるheag媒介K+ 電流の減少をFig.16BおよびCに示す。
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[1](a)配列番号:3または4のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸分子を含有してなる核酸分子;
(b)配列番号:13または14のDNA配列を有する核酸分子を含有してなる核酸分子;
(c)(a)または(b)の核酸分子の相補的な鎖にハイブリダイズする核酸分子;または
(d)(c)の核酸分子の配列に縮重した核酸分子、
である、ヒトK+ イオンeagチャンネルの機能を有する(ポリ)ペプチドをコードする核酸分子を含有してなる核酸分子。
[2]配列5’−GGGAGGATGACCATGGCTを含有してなる[1]記載の核酸分子に特異的にハイブリダイズする核酸分子。
[3]DNAである[1]または[2]記載の核酸分子。
[4]RNAである[1]または[2]記載の核酸分子。
[5]融合タンパク質をコードする[1]〜[4]いずれか1つに記載の核酸分子。
[6][1]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子を含有してなるベクター。
[7]発現ベクターおよび/または遺伝子ターゲッティングまたは遺伝子導入ベクターである[6]記載のベクター。
[8][6]または[7]記載のベクターで形質転換された宿主。
[9]哺乳類細胞、真菌細胞、植物細胞、昆虫細胞または細菌細胞である[8]記載の宿主。
[10][8]または[9]記載の宿主を培養する工程、および産生された(ポリ)ペプチドを単離する工程を含む、[1]または[3]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子によってコードされた(ポリ)ペプチドの生産方法。
[11][1]または[3]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子によってコードされた、または[10]記載の方法によって生産された(ポリ)ペプチド。
[12][11]記載の(ポリ)ペプチドに対し特異的な抗体。
[13]モノクローナル抗体である[12]記載の抗体。
[14][2]記載の核酸分子、[6]記載のベクター、[11]記載のポリペプチドおよび/または[12]または[13]記載の抗体および薬学的に許容できる担体および/または希釈剤および/または賦形剤を含有してなる医薬組成物。
[15][1]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子、[6]記載のベクター、[11]記載のポリペプチドおよび/または[12]または[13]記載の抗体を含有してなる診断用組成物。
[16][1]または[3]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子の望まれていない発現または過剰発現によって引き起こされる疾患の予防または治療方法であって、[1]または[3]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子の発現のインヒビター、または[11]記載の(ポリ)ペプチドの機能のインヒビターを、前記疾患により影響を受けた哺乳動物または前記疾患の影響を受けやすいと推測される哺乳動物に導入する工程を含む、前記疾患の予防または治療方法。
[17][11]記載の(ポリ)ペプチドの機能不全により引き起こされる疾患の予防または治療方法であって、[1]または[3]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子の発現のインヒビター、[11]記載の(ポリ)ペプチドの機能不全のインヒビターもしくは改変剤、heagをコードする[1]または[3]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子、またはheag活性を有する[11]記載のポリペプチドを、前記疾患の影響を受けた哺乳動物または前記疾患の影響を受けやすいと推測される哺乳動物に導入する工程を含む、前記疾患の予防または治療方法。
[18]前記核酸分子の発現または過剰発現の前記インヒビターが、[2]記載の核酸分子である、[16]記載の方法。
[19]ポリペプチド機能の前記インヒビターが、[12]または[13]記載の抗体、または薬物、好ましくはアステミゾールまたはテルフェナジンである、[16]記載の方法。
[20]導入工程の前に、
(a)前記疾患により冒された哺乳動物から細胞を得る工程ならびに前記導入工程の後に前記疾患により冒された哺乳動物から細胞を得る工程、ここで、前記導入は前記細胞に行われる、
(b)前記細胞を前記哺乳動物または同種の哺乳動物に再導入する工程、
をさらに含む、[16]〜[19]いずれか1つに記載の方法。
[21]前記細胞が、生殖細胞、胚性細胞もしくは卵細胞またはそれらに由来する細胞である、[16]〜[20]いずれか1つに記載の方法。
[22][1]および[3]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子の望まれていない発現または過剰発現によって引き起こされる疾患の治療用薬物の設計方法であって、
(a)特異的かつ効力の高い薬物を同定する工程;
(b)部位特異的突然変異誘発およびキメラタンパク質研究による、前記薬物の結合部位を同定する工程;
(c)(ポリ)ペプチドの結合部位および前記薬物の構造の両方を分子モデリングする工程;ならびに
(c)(ポリ)ペプチドに対するその結合特異性を改良するために薬物を改変する工程、
を含む、治療用薬物の設計方法。
[23](a)アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび/またはリボザイムから選ばれた化合物を、翻訳の阻害または低減に対して試験する工程;または
(b)[11]記載の(ポリ)ペプチドをコードし、かつ好ましくはその転写因子応答エレメントを有する遺伝子のプロモーター領域に結合する化合物を、転写の阻害に対して試験する工程;または
(c)[11]記載の(ポリ)ペプチドの増殖活性をブロックすると推測されるペプチドまたは抗体を、前記ブロック活性に対して試験する工程、
を含む、[1]または[3]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子の発現のインヒビターまたは[11]記載の(ポリ)ペプチドの機能のインヒビターの同定方法。
[24]前記薬物またはインヒビターが、ペプチド疑似体またはファージディスプレイもしくはコンビナトリアルライブラリー技術を適用することによってさらに改良された、[22]または[23]記載の方法。
[25][1]または[3]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子または[11]記載の(ポリ)ペプチドの発現に対し、インヒビターを適用する工程を含む、細胞増殖の阻害方法。
[26][1]および[3]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子の発現を評価する工程、または哺乳動物の細胞において[11]記載のポリペプチドの定量的な存在を評価する工程を含む、癌および/または神経変性疾患(neurodegenerative diseases)および/または乾癬の予知方法。
[27]前記癌が、乳癌または神経芽腫または子宮頸癌(cervix carcinoma)である、[26]記載の方法。
[28]前記乳癌が、胸腺癌(breast adenocarcinoma)、胸癌管型(breast carcinoma ductal type)である、[27]記載の方法。
[29]前記神経変性疾患が、アルツハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症または多発性硬化症である、[26]記載の方法。
[30]前記哺乳動物が、ヒト、ラットまたはマウスである、[16]〜[21]および[26]〜[29]いずれか1つに記載の方法。
[31]遺伝子治療における[1]〜[5]いずれか1つに記載の核酸分子の使用。
[32][2]記載の核酸分子、[6]記載のベクター、[11]記載のポリペプチドおよび/または[12]または[13]記載の抗体を含有してなるキット。
Claims (1)
- 核酸分子の望まれていない発現または過剰発現によって引き起こされる疾患の治療用薬物の設計方法であって、
(a)特異的かつ効力の高い薬物を同定する工程;
(b)部位特異的突然変異誘発およびキメラタンパク質研究による、前記薬物の結合部位を同定する工程;
(c)(ポリ)ペプチドの結合部位および前記薬物の構造の両方を分子モデリングする工程;ならびに
(d)(ポリ)ペプチドに対するその結合特異性を改良するために薬物を改変する工程、
を含み、該核酸分子が、
(A)配列番号:3または4のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸分子を含有してなる核酸分子;
(B)配列番号:13または14のDNA配列を有する核酸分子を含有してなる核酸分子;
(C)(A)または(B)の核酸分子の相補的な鎖にハイブリダイズする核酸分子;または
(D)(C)の核酸分子の配列に縮重した核酸分子、
である、ヒトK+ イオンeagチャンネルの機能を有する(ポリ)ペプチドをコードする核酸分子を含有してなる、治療用薬物の設計方法。
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