JP2008546048A - 統計的線形データの同定 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2005年5月13日に出願された「SYSTEMS AND METHODS FOR IDENTIFYING STATISTICALLY FLAT DATA IN A DATA SET」と表題を付された米国仮特許出願60/681,182号の利益を主張し、当該出願は「DETERMINATION OF BASELINE END CYCLE IN REAL TIME PCR USING DERIVATIVE PEAK ANALYSIS」と表題を付された米国仮特許出願第60/680,765号(出願人整理番号第002558-072200US)と同時に出願されており、関連している。これらの文献の開示は、その全てを本明細書に援用する。本出願はまた、同一出願人による「BASELINING AMPLIFICATION DATA」と表題を付された米国特許出願第_____号(出願人整理番号第002558-072210US)に関連する。これらの出願の各開示は、全ての目的のため本明細書に援用される。
である。
Claims (24)
- データセットが統計的線形挙動を示すかを決定するために当該データセットを処理する方法であって、当該方法が以下の:
シグナル成分とノイズ成分を有するデータポイントのオリジナルセットを受け取り;
上記オリジナルデータセットを線形関数に近似し;
上記オリジナルデータセットと上記近似された線形関数との間の残差を計算し;
上記オリジナルデータセットと上記近似された線形関数との間の残差の第一尺度を計算し;
上記オリジナルデータセットに存在する上記ノイズ成分を、以下の:
i)平滑化データポイントのセットを測定することにより平滑化データセットを計算し、ここで平滑化データポイントの数値は当該平滑化データポイントの近くに位置する複数のオリジナルデータポイントの数値に基づいており;そして
ii)上記平滑化データセットと上記オリジナルデータセットとの間の残差を計算する
により見積もり;
上記平滑化データセットと上記オリジナルデータセットとの間の残差の第二尺度を計算し;そして
上記第一尺度と上記第二尺度を比較して上記オリジナルデータセットが統計的線形挙動を示すかを決定する
を含む、前記方法。 - 前記オリジナルデータセットの近似が、最小二乗法近似を使用することを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記平滑化データセットの計算が、ローパスフィルターを使用することを含む、請求項1に記載の方法。
- 平滑化データポイントの数値が、当該平滑化データポイントの周辺のウインドウ内に存在する上記オリジナルデータポイントの平均である、請求項1に記載の方法。
- 前記ウインドウが5ユニットである、請求項4に記載の方法。
- 前記第一尺度と前記第二尺度が各々標準偏差である、請求項1に記載の方法。
- 前記比較が、前記第一尺度と前記第二尺度の比率を計算して、当該比率が所定の値より小さいか又は大きいかを決定することを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記所定の値が1のオーダーである、請求項7に記載の方法。
- 前記データがPCR増幅曲線を表す、請求項1に記載の方法。
- 前記方法が、プロセッサーで実行される、請求項1に記載の方法。
- 前記プロセッサーが、独立型コンピューターシステム、ネットワーク接続コンピューターシステム、又はリアルタイムPCR装置に組み込まれている、請求項10に記載の方法。
- データ処理を実行して、当該データが線形挙動を示すかを決定する命令を実行するように情報装置を指図するために適用された複数の指示を有する情報貯蔵媒体であって、当該処理が以下のステップ:
シグナル成分とノイズ成分を有するデータポイントのオリジナルセットを受け取り;
上記オリジナルデータセットを線形関数に近似し;
上記オリジナルデータセットと上記近似された線形関数との間の残差を計算し;
上記オリジナルデータセットと上記近似された線形関数との間の残差の第一尺度を計算し;
上記オリジナルデータセットに存在する上記ノイズ成分を、以下の:
i)平滑化データポイントのセットを決定することにより平滑化データセットを計算し、ここで平滑化データポイントの数値は当該平滑化データポイントの近くに位置する複数のオリジナルデータポイントの値に基づいており;そして
ii)上記平滑化データセットと上記オリジナルデータセットとの間の残差を計算する
ことにより見積もり
上記平滑化データセットと上記オリジナルデータセットとの間の残差の第二尺度を計算し;そして
上記第一尺度と上記第二尺度とを比較して当該オリジナルデータセットが統計的に線形挙動を示すかを決定する
を含む、前記媒体。 - 前記オリジナルデータセットを近似することが、最小二乗法近似を用いることを含む、請求項12に記載の情報貯蔵媒体。
- 前記平滑化データセットの計算がローパスフィルターを使用することを含む、請求項12に記載の情報貯蔵媒体。
- 平滑化データポイントの数値が、当該平滑化データポイント周辺のウインドウ内の上記オリジナルデータポイントの平均である、請求項12に記載の情報貯蔵媒体。
- 前記第一尺度と前記第二尺度が各々標準偏差である、請求項12に記載の情報貯蔵媒体。
- 前記比較が、前記第一尺度と前記第二尺度の比率を計算して、当該比率が所定の値より小さいか又は大きいかを決定することを含む、請求項12に記載の情報貯蔵媒体。
- 前記データがPCR増幅曲線を示す、請求項12に記載の情報貯蔵媒体。
- 以下の:
シグナル成分とノイズ成分を有するデータポイントのオリジナルセットを産生する検出器;並びに
当該データが線形挙動を示すかを決定するためにデータを処理するロジックであって、以下の:
上記オリジナルデータセットを線形関数に近似し;
上記オリジナルデータセットと上記近似された線形関数との間の残差を計算し;
上記オリジナルデータセットと上記近似された線形関数との間の残差の第一尺度を計算し;
上記オリジナルデータセット中に存在する上記ノイズ成分を、以下の:
i)平滑化データポイントのセットを決定することにより平滑化データセットを計算し、ここで平滑化データポイントの数値が当該平滑化データポイントの近くに位置する複数のオリジナルデータポイントの数値に基づいており;そして
ii)上記平滑化データセットと上記オリジナルデータセットとの間の残差を計算する
により見積もり;
上記平滑化データセットと上記オリジナルデータセットとの間の残差の第二尺度を計算し;そして
上記第一尺度と上記第二尺度を比較して、上記オリジナルデータセットが統計的に線形挙動を示すかを決定する
ことによるロジック
を含むPCR検出装置。 - 前記オリジナルデータセットの近似が、最小二乗法近似を用いることを含む、請求項19に記載のPCR検出装置。
- 前記平滑化データセットがローパスフィルターを使用することを含む、請求項19に記載のPCR検出装置。
- 平滑化データポイントの値が、平滑化データポイント周辺オウインドウ内の上記オリジナルデータポイントの平均である、請求項19に記載のPCR検出装置。
- 前記第一尺度と前記第二尺度が、各々標準偏差である、請求項19に記載のPCR検出装置。
- 前記比較が、前記第一尺度と前記第二尺度の比を計算して、当該比が所定の数値より小さいか又は大きいかを決定することを含む、請求項19に記載のPCR検出装置。
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