JP2007217423A - 転移および転移がもたらす骨格関連現象を調節する方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】本発明は、とりわけ、骨転移のモデル、骨格関連現象および転移を制御する因子を同定する方法、ならびに骨格関連現象および転移を検出する方法に関する。上記方法およびモデルは、概ね、ガン細胞と宿主細胞とを共培養し、そのような共培養細胞に由来する生物学的マーカーをコントロール細胞と比較することを含む。本発明は、転移を示す生物学的マーカーの検出を可能にするのに十分な時間をかけて、1つ以上の宿主細胞を1つ以上の癌細胞と共培養することを含む、原発腫瘍から転移への患者の癌進行をシミュレーションする方法も提供する。
【選択図】なし
Description
本発明は、概ね腫瘍学の分野に関する。より詳しくは、本発明は骨格関連現象および転移を制御する方法、骨格関連現象および転移を制御する因子を同定する方法、骨格関連現象および転移のモデル、ならびに骨格関連現象および転移を画像化および/または検出するために上記因子を用いることに関する。
癌は、米国の第2の主要な死因である。「癌(cancer)」は、多くの異なる種類の癌(すなわち胸部癌、前立腺癌、肺癌、結腸癌、および脾臓癌)を記述するために用いられ、各々の種類の癌が表現型レベルおよび遺伝子レベルの両方で異なる。癌の無秩序な増殖特性は、一種類以上の遺伝子が突然変異を獲得し、細胞増殖がもはや制御不能となった場合に、生ずる。
C.Mundy,Nature(2002),Vol.2,584−593 H.Fleisch,Bisphosphonates In Bone Disease,From The Laboratory To The Patient,2nd Edition,Parthenon Publishing (1995) G.Mundy,Nature(2002),Vol.2,584−593 Saarto et al.,J.Clin.Oncol.(2001),19:10−17
(項目1)
一種類以上の骨格関連現象の阻害を必要としている患者において、一種類以上の骨格関連現象を阻害する方法であって、
その患者に、治療上有効な量の一種類以上のEphA2インヒビターを投与する工程を包含する、方法。
(項目2)
上記EphA2インヒビターが、オリゴヌクレオチド、低分子、ミメティック、デコイ、または抗体である、項目1の方法。
(項目3)
上記癌が、前立腺癌、乳癌、または結腸癌である、項目1の方法。
(項目4)
EphA2治療の候補に対する従来の癌治療の投与をさらに含む、項目1の方法。
(項目5)
上記EphA2インヒビターが、約15ないし約30ヌクレオチドの長さのオリゴヌクレオチドである、項目1の方法。
(項目6)
上記患者が癌患者である、項目1の方法。
(項目7)
上記インヒビターが、コントロールと比較して少なくとも50%までEphA2を減少させる、項目1の方法。
(項目8)
上記インヒビターが、コントロールと比較して少なくとも90%までEphA2を減少させる、項目1の方法。
(項目9)
化学治療および/または放射線治療による上記患者の治療をさらに含む、項目1の方法。
(項目10)
治療上有効な量のビスホスホネートによる上記患者の治療をさらに含む、項目1の方法。
(項目11)
上記オリゴヌクレオチドの長さが約8〜約80ヌクレオチドであり、EphA2(配列番号1または5)をコードする核酸分子に対して少なくとも80%配列相補性を含み、さらに、そのオリゴヌクレオチドが少なくとも50%までEphA2発現を阻害する、項目1の方法。
(項目12)
上記オリゴヌクレオチドが、EphA2をコードする核酸に対して少なくとも90%配列相同性を有し、少なくとも75%までEphA2発現を阻害する、項目11の方法。
(項目13)
上記オリゴヌクレオチドが、配列番号3のヌクレオチド配列を有する、項目12の方法。
(項目14)
上記オリゴヌクレオチドが、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号1または配列番号5のヌクレオチド配列に結合して少なくとも50%までEphA2の発現を阻害する、項目11の方法。
(項目15)
上記オリゴヌクレオチドが、配列番号12〜71の配列を有するペプチドをコードする核酸に対して相補的である、項目11の方法。
(項目16)
上記低分子インヒビターが、分子量が5キロダルトン以下の有機分子である、項目2の方法。
(項目17)
上記抗体が、少なくとも1×10 8 Kaの親和性でEphA2に対して結合する、項目2の方法。
(項目18)
上記抗体が、EphA2配列の少なくとも1つの領域に結合し、その領域が配列番号12〜71によって規定される複数の領域から選択される、項目2の方法。
(項目19)
上記抗体がモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、単鎖抗体、またはFabフラグメントである、項目2の方法。
(項目20)
上記抗体が標識されている、項目2の方法。
(項目21)
上記抗体がEphA2以外のポリペプチドに対して約1×10 5 K a 未満の結合親和性を有する、項目2の方法。
(項目22)
骨への転移の阻害を必要としている患者での骨への転移を阻害する方法であって、治療上有効な量の一種類以上のEphA2インヒビターを上記患者に投与する工程を包含する、方法。
(項目23)
EphA2治療の候補に対する従来の癌治療の投与をさらに含む、項目22の方法。
(項目24)
上記EphA2インヒビターが、オリゴヌクレオチド、低分子、ミメティック、デコイ、または抗体である、項目22の方法。
(項目25)
原発腫瘍から骨転移への癌の進行をシミュレーションする方法であって、
転移を示す生物学的マーカーの検出を可能にするのに十分な時間をかけて、1つ以上の宿主細胞を1つ以上の癌細胞と共培養する工程を包含する、方法。
(項目26)
上記宿主細胞および上記癌細胞がインビトロで共培養される、項目25の方法。
(項目27)
上記宿主細胞および上記癌細胞が動物モデルにおいて共培養される、項目25の方法。
(項目28)
上記動物モデルがSCIDマウスである、項目27の方法。
(項目29)
上記癌が乳癌、前立腺癌、または結腸癌である、項目25の方法。
(項目30)
上記原発腫瘍が乳腫瘍、前立腺腫瘍、または結腸腫瘍である、項目25の方法。
(項目31)
上記宿主細胞がヒト細胞である、項目25の方法。
(項目32)
上記癌細胞および上記宿主細胞が患者から単離される、項目25の方法。
(項目33)
上記宿主細胞と共培養された場合に発現が調節される上記細胞において、1つ以上の遺伝子を同定する工程をさらに包含する、項目25の方法。
(項目34)
インビトロモデルでの原発腫瘍から骨転移への進行をシミュレーションする方法であって、共培養中での遺伝子発現の証拠を検出するのに十分な時間にわたって癌細胞と宿主細胞とを共培養する工程を包含する、方法。
(項目35)
上記原発腫瘍が乳房腫瘍、前立腺腫瘍、または大腸腫瘍である、項目34の方法。
(項目36)
上記癌細胞が乳腺細胞、前立腺細胞、大腸細胞、およびメラノーマ細胞からなる群から選択される、項目34の方法。
(項目37)
上記癌細胞がPC3、LNCaP、MDA231、MDA435、HT−29、SW620、HEPG2、およびDU145からなる群から選択される、項目34の方法。
(項目38)
上記宿主細胞を患者から単離する、項目34の方法。
(項目39)
上記共培養がインビトロ培養である、項目34の方法。
(項目40)
骨転移に対する処置の効果を決定するための方法であって、
(a)宿主細胞と癌細胞との共培養に調節因子を投与する工程、および
(b)推定調節因子の非存在下で共培養された宿主細胞および癌細胞の生物学的マーカーと、(a)の共培養細胞上の生物学的マーカーとを比較する工程、
包含する、方法。
(項目41)
上記調節因子が骨への転移を阻害する、項目40の方法。
(項目42)
上記宿主細胞がヒト細胞である、項目40の方法。
(項目43)
上記癌細胞および上記宿主細胞が患者から単離される、項目40の方法。
(項目44)
骨への転移に対する患者の罹患性を決定する方法であって、
第1の試料に生物学的マーカーがあるかどうかを決定する工程を包含し、その第1の試料が、宿主細胞と共培養した転移することが公知の癌細胞を含む第1のコントロール試料と相関させて、その生物学的マーカーを決定するのに十分な期間にわたって宿主細胞と共培養されたその患者から得た癌細胞を含み、その第1の試料に含まれる生物学的マーカーとそのコントロール試料に含まれる生物学的マーカーとの相関が骨の転移に対するその患者の罹患性を示す、方法。
(項目45)
転移することが公知の上記癌細胞が、PC3、LNCaP、MDA231、MDA435、HT−29、SW620、HEPG2、およびDU145からなる群から選択される、項目44の方法。
(項目46)
上記宿主細胞が患者から単離される、項目44の方法。
(項目47)
上記共培養がインビトロ培養である、項目44の方法。
(項目48)
1つ以上の骨格関連現象に対する癌患者の罹患性を決定するための方法であって、
患者の試料中のEphA2発現の証拠を検出する工程を包含し、そのEphA2発現の証拠が一種類以上の骨格関連現象に対する患者の罹患性を示す、方法。
(項目49)
転移することが知られている癌細胞と共培養された宿主細胞を含む第2のコントロール試料中の生物学的マーカーに、上記第1の試料中の生物学的マーカーが相関するかどうかを決定する工程をさらに包含し、その第1の試料の生物学的マーカーとその第2のコントロール試料の生物学的マーカーとの相関は、転移に対する罹患性の減少を示す、項目48の方法。
(項目50)
上記骨格関連現象が、骨折、骨痛のための放射線、骨折予防もしくは骨折処置、脊髄圧迫、骨の手術、骨転移、または悪性病変の過カルシウム血症からなる群から選択される、項目48の方法。
(項目51)
上記試料が癌細胞を含む、項目48に記載の方法。
(項目52)
上記試料が癌細胞および宿主細胞を含む、項目48に記載の方法。
(項目53)
EphA2治療に感受性のある患者を同定する方法であって、
(a)造影剤に結合したEphA2調節因子を含む組成物を患者に投与する工程、および
(b)その患者におけるEphA2発現の証拠の有無を検出する工程、
を包含し、ここで、その患者におけるEphA2発現の証拠が存在することは、EphA2治療の候補である患者を示し、上記患者でEphA2発現の証拠が存在しないことは、EphA2治療の候補ではない患者を示す、方法。
(項目54)
EphA2治療に感受性のある患者を同定する方法であって、
(a)造影剤に結合したEphA2調節因子を含む組成物を患者に投与する工程、および
(b)その患者における骨への転移またはSREを示す臨床指標の有無を検出する工程、
を包含し、ここで、その骨への転移またはSREを示す臨床指標が存在することは、EphA2治療の候補である患者を示し、上記骨への転移またはSREを示す臨床指標が存在しないことは、EphA2治療の候補ではない患者を示す、方法。
(項目55)
上記臨床指標が骨折、脊髄圧迫、および過カルシウム血症からなる群から選択される、項目54の方法。
(項目56)
上記臨床指標が放射線学的に検出される、項目54の方法。
(項目57)
架橋結合したアミノ酸の度合いを検出することによって、上記臨床指標が測定される、項目54の方法。
(項目58)
EphA2インヒビターをEphA2治療の候補に投与する工程をさらに包含する、項目54の方法。
(項目59)
骨への転移の阻害を必要としている患者において、骨への転移を阻害する方法であって、
(a)項目53または項目54にもとづいてその患者がEphA2治療の候補であるかどうかを決定する工程、
(b)その患者がEphA2治療の候補であるならば、その患者に治療上有効な量の一種類以上のEphA2インヒビターを投与する工程、ならびに
(c)その患者がEphA2治療の候補でなければ、その患者を従来の癌治療で処置する工程、
を包含する、方法。
(項目60)
上記患者に、慣習的な癌治療薬を投与する工程をさらに含む、項目59の方法。
(項目61)
上記EphA2インヒビターがオリゴヌクレオチド、低分子、ミメティック、デコイ、または抗体である、項目59の方法。
(項目62)
EphA2配列の少なくとも1つの領域に結合する抗体を産生する単離細胞であって、
その領域が配列番号12〜71によって規定される複数の領域から選択される、単離細胞。
(項目63)
上記細胞がハイブリドーマである、項目62の細胞。
(項目64)
骨への転移に感受性である患者を同定する方法であって、
その患者由来の癌細胞であり、1つ以上の宿主細胞と共培養したその癌細胞の生物学的マーカーを、1つ以上の宿主細胞と共培養したコントロール癌細胞の生物学的マーカーと比較する工程を包含する、方法。
(項目65)
上記コントロール癌細胞が非転移癌細胞を示す、項目64の方法。
(項目66)
上記コントロール癌細胞が転移癌細胞を示す、項目64の方法。
(項目67)
上記患者由来の癌細胞の生物学的マーカーが、正のコントロールまたは負のコントロールに相関するかどうかを決定する工程をさらに包含する、項目64の方法。
(項目68)
上記癌細胞および上記宿主細胞が上記患者から単離される、項目64の方法。
(項目69)
骨への転移に対する癌患者の罹患性を決定する方法であって、
患者の癌試料でのEphA2発現の証拠を検出する工程を包含し、EphA2発現の証拠が骨への転移に対するその患者の罹患性を示す、方法。
(項目70)
上記癌試料は、上記患者由来の宿主細胞と共培養される、項目69の方法。
(項目71)
EphA2RNAを測定することによってEphA2発現の証拠を検出する、項目69の方法。
(項目72)
EphA2発現の証拠をEphA2発現産物を決定することによって検出する、項目69の方法。
(項目73)
骨転移中に調節された1つ以上の遺伝子を同定する方法であって、共培養された癌細胞および宿主細胞の発現プロフィールと癌細胞のコントロール発現プロフィールとを比較する工程を包含する、方法。
(項目74)
上記調節された遺伝子がEphA2である、項目73に記載の方法。
(項目75)
上記癌細胞および上記宿主細胞が上記患者から単離される、項目73の方法。
(項目76)
項目73にもとづいて同定された骨に対する癌の転移に関与する遺伝子。
(項目77)
骨関連現象中に調節された遺伝子を同定する方法であって、
共培養された癌細胞および宿主細胞の発現プロフィールと癌細胞のコントロール発現プロフィールとを比較する工程を包含する、方法。
(項目78)
上記調節された遺伝子がEphA2である、項目77の方法。
(項目79)
上記癌細胞および上記宿主細胞が上記患者から単離される、項目77の方法。
(項目80)
癌細胞の表面にある分子を同定する方法であって、
(a)癌細胞と宿主細胞とを共培養する工程、
(b)scfvを発現するファージを、そのscfvがその癌細胞と結合させる条件下で、その共培養に添加する工程、
(c)scfvに対して結合したその癌細胞を単離する工程、および
(d)scfvの特性を明らかにすることで、その癌細胞の表面にある分子を同定する工程、
を包含する、方法。
(項目81)
上記癌細胞および上記宿主細胞が1人の患者から単離される、項目80の方法。
(項目82)
骨への転移のインヒビターを同定する方法であって、
癌細胞および宿主細胞の共培養を推定インヒビターと接触させる工程、ならびに
転移を示す生物学的マーカーの有無を決定する工程、
を包含し、コントロールと比較して転移を示す生物学的マーカーがその共培養に存在しないことは、転移のインヒビターを示す、方法。
(項目83)
上記転移がEphA2−関連骨転移である、項目82の方法。
(項目84)
上記宿主細胞および/または上記癌細胞が、EphA2を発現する少なくとも1つの細胞を含む、項目82の方法。
(項目85)
上記生物学的マーカーが、カルシウム沈着、オステオカルシンレベル、アルカリホスファターゼレベル、酒石酸耐性ホフファターゼ活性、発現プロフィール、細胞間相互作用の証拠、破骨細胞活性、骨芽細胞活性、成長ホルモン、プロラクチン、コラーゲン、プロコラーゲン、オステオポンチン、オステオネクチン、骨シアロタンパク質、酒石酸耐性ホスファターゼ、α2−HS糖タンパク質、ヒドロキシプロリン、ヒドロキシリジングリコシド、ピリジニウム架橋、オステオカルシン、あるいは鉱化細胞外マトリックスの形成、細胞間膜交換からなる群から選択される、項目82の方法。
(項目86)
上記癌細胞および上記宿主細胞が上記患者から単離される、項目82の方法。
(項目87)
項目82の方法にもとづいて同定されたインヒビター。
(項目88)
上記調節因子が、オリゴヌクレオチド、抗体、ミメティック、デコイレセプター、または低分子からなる群から選択される、項目82の方法。
(項目89)
上記癌細胞および上記宿主細胞をマウス異種移植で共培養する、項目82の方法。
(項目90)
患者における転移を検出する方法であって、
造影剤に結合したEphA2調節因子を含む組成物を患者に投与する工程、ならびに
その患者におけるその造影剤の局在を検出する工程、
を包含する、方法。
(項目91)
上記組成物が、造影剤に結合した抗EphA2抗体を含む、項目90の方法。
(項目92)
上記造影剤が、 18 F、 43 K、 52 Fe、 57 Co、 67 Cu、 67 Ga、 77 Br、 87 MSr、 86 Y、 90 Y、 99 Mtc、 111 In、 123 I、 125 I、 127 Cs、 129 Cs、 131 I、 132 I、 197 Hg、 203 Pb、または 206 Biである、項目90の方法。
(項目93)
試料に存在するEphA2の量を定量する方法であって、
その試料と造影剤に結合したEphA2調節因子を含む組成物とを接触させる工程、ならびに
その造影剤を定量する工程、
を包含する、方法。
(項目94)
骨への転移の症状を改善することを必要としている癌患者において骨への転移の症状を改善する方法であって、
その患者に対して、治療上有効な量のEphA2インヒビターを投与する工程を包含する、方法。
(項目95)
上記骨への転移の症状が、疼痛および骨折からなる群から選択される、項目94の方法。
(項目96)
患者における癌細胞と宿主細胞との相互作用を阻害する方法であって、
上記患者に対して、治療上有効な量のEphA2インヒビターを投与する工程を包含する、方法。
(項目97)
上記宿主細胞が、幹細胞、骨芽細胞、破骨細胞、間質細胞、および骨髄細胞から選択される、項目96の方法。
(項目98)
上記EphA2インヒビターが、低分子、オリゴヌクレオチド、ミメティック、デコイレセプター、または抗体からなる群から選択される、項目82または94の方法。
(項目99)
組成物であって、ヒト宿主細胞と、ヒト癌細胞および約10 −7 Mのデキサメタゾン、約0.05mMのリン酸アスコルビン酸塩、および約10mMのβグリセロリン酸塩を含む骨形成培地とを含む、組成物。
(項目100)
上記宿主細胞が、幹細胞、骨芽細胞、破骨細胞、間質細胞、骨髄細胞、またはそれらの組み合わせの1つ以上からなる群から選択される、項目99の組成物。
(項目101)
組成物であって、EphA2インヒビターと、1種類以上の薬学的に受容可能なキャリアとを含む、組成物。
(項目102)
上記組成物が、滅菌された注入可能物質である、項目101の組成物。
(項目103)
患者での1つ以上のSREを調節する方法であって、
その患者に対して項目101の組成物を治療上有効な量投与する工程を包含する、方法。
(項目104)
患者における足場非依存性細胞増殖を阻害する方法であって、
その患者に対してEphA2インヒビターを治療上有効な量投与する工程を包含する、方法。
(項目105)
患者における癌細胞の移動を阻害する方法であって、
その患者に対してEphA2インヒビターを治療上有効な量投与する工程を包含する、方法。
(項目106)
慣習的な癌治療薬を投与する工程をさらに包含する、項目105の方法。
(項目107)
癌細胞接着の阻害を必要としている患者において癌細胞接着を阻害する方法であって、
その患者に対してEphA2インヒビターを治療上有効な量投与する工程を包含する、方法。
(項目108)
上記癌細胞が、乳部細胞、前立腺細胞、大腸細胞、およびメラノーマ細胞からなる群から選択される、項目48、64、77、または80のいずれかの方法。
(項目109)
上記癌細胞が、PC3、LNCaP、MDA231、MDA435、HT−29、SW620、HEPG2、およびDU145からなる群から選択される、項目48、64、77、または80のいずれかの方法。
(項目110)
上記患者に、慣習的な癌治療薬を投与する工程をさらに包含する、項目107の方法。
(項目111)
上記癌細胞および上記宿主細胞が上記患者から単離される、項目107の方法。
(項目112)
上記患者が癌患者である、項目22、59、94、96、103、104、105、または107のいずれかの方法。
(項目113)
上記インヒビターが、コントロールと比べて少なくとも50%までEphA2発現を減少させる、項目22、59、94、96、103、104、105、または107のいずれかの方法。
(項目114)
上記インヒビターが、コントロールと比べて少なくとも90%までEphA2発現を減少させる、項目22、59、94、96、103、104、105、または107のいずれかの方法。
(項目115)
化学治療および/または放射線治療による患者の処置をさらに含む、項目22、59、94、96、103、104、105、または107のいずれかの方法。
(項目116)
治療上有効な量のビスホスホネートによる患者の処置をさらに含む、項目22、59、94、96、103、104、105、または107のいずれかの方法。
(項目117)
上記インヒビターが、約8〜約80核酸塩基長を有するオリゴヌクレオチドであり、EphA2(配列番号1または5)をコードする核酸分子に対して少なくとも80%の配列相補性を含み、そのオリゴヌクレオチドが少なくとも約50%までEphA2発現を阻害する、項目22、59、94、96、103、104、105、または107のいずれかの方法。
(項目118)
上記オリゴヌクレオチドが、EphA2をコードする核酸に対して少なくとも90%配列相同性を有し、少なくとも75%までEphA2発現を阻害する、項目117の方法。
(項目119)
上記オリゴヌクレオチドが配列番号3のヌクレオチド配列を有する、項目118の方法。
(項目120)
上記オリゴヌクレオチドが、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号1または配列番号5のヌクレオチド配列と結合し、少なくとも50%までEphA2の発現を阻害する、項目117に記載の方法。
(項目121)
上記オリゴヌクレオチドが、配列番号12〜71の配列を有するペプチドをコードする核酸分子に対して相補的である、項目117の方法。
(項目122)
上記オリゴヌクレオチドが、約15〜約30ヌクレオチド長である、項目117の方法。
(項目123)
上記インヒビターが、分子量が5キロダルトン以下である低分子インヒビターである、項目22、59、94、96、103、104、105、または107のいずれかの方法。
(項目124)
上記インヒビターが、少なくとも1×10 8 Kaの親和性で、EphA2に対して結合する抗体である、項目22、59、94、96、103、104、105、または107のいずれかの方法。
(項目125)
上記インヒビターが、EphA2配列の少なくとも1つの領域に結合する抗体であり、その領域が配列番号12〜71によって規定される領域から選択される、項目22、59、94、96、103、104、105、または107のいずれかの方法。
(項目126)
上記インヒビターが、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、単鎖抗体、またはFabフラグメントである、項目22、59、94、96、103、104、105、または107のいずれかの方法。
(項目127)
上記抗体が標識される、項目124〜126のいずれかの方法。
(項目128)
上記標識は酵素、放射性同位元素、またはフルオロフォアである、項目127の方法。
(項目129)
上記抗体が、EphA2以外のポリペプチドに対して、約1×10 5 Ka未満の結合親和性を持つ、項目124〜126のいずれかの方法。
(項目130)
CHOまたはミエローマ細胞で抗EphA2抗体を発現する方法であって、その抗EphA2抗体が、骨転移を有する患者での骨格関連減少を阻害する、方法。
(項目131)
上記抗EphA2抗体が配列番号7を含む、項目130の方法。
(項目132)
EphA2に結合する抗体を含む薬学的組成物であって、上記抗EphA2抗体が、骨転移を有する患者での骨格関連現象を阻害する、薬学的組成物。
(項目133)
項目40または82のいずれかにあるように、骨転移の処置に対する有効性を試験することによって、上記抗体が同定される、薬学的組成物。
(項目134)
項目130にもとづくCHOまたはミエローマ細胞で抗EphA2抗体を発現する方法であって、項目40または82のいずれかにあるように、骨転移の処置に対する有効性を試験することによって、その抗EphA2抗体が同定された、方法。
(発明の要旨)
本発明は、とりわけ、骨転移のモデル、骨格関連現象および転移の役割を果たす分子を同定する方法、骨格関連現象および転移の調節因子を同定する方法、骨格関連現象および転移を画像化/検出する方法、ならびに骨格関連現象および転移を制御する方法を提供することで、上記に確認された必要性に取り組む。
態では、上記転移が骨転移である。いくつかの実施形態では、上記癌が前立腺癌、乳癌、または結腸癌である。
この文献全体を通して種々の定義が用いられている。ほとんどの語が当業者によって当業者によってそれらの語のものであると考えられる意味を持つ。以下に、またはこの文献のどこかで具体的に定義される語は、全体として本発明の文脈に与えられ、また当業者によって一般に理解される意味を持つ。
;Banchereau et al.(1991)Clin.Immunol.Spectrum 3:8;およびBanchereau et al.(1991)Science 251:70、これらの文献全てを本明細書で援用する。
al Antibodies for Immunotargeting of Drugs in Cancer Therapy,”in Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,ed.Reisfeld et
al.(Alan R.Liss,Inc.),pp.243−256;ed.Hellstrom et al.(1987)”Antibodies for Drug Delivery,”in Controlled Drug Delivery, ed.Robinson et al(2d ed;Marcel Dekker,Inc.),pp.623−653;”Analysis,Results,and Future Prospective of the Therapeutic Use of
Radiolabeled Antibodies in Cancer Therapy,”in Monoclonal Antibodies for Cancer Detection and Therapy,ed.Baldwin et al.(Academic Press, New York,1985),pp.303−316を参照せよ。
いくつかの実施形態では、本発明はSREまたは転移のモデルを提供する。いくつかの実施形態では、転移は骨への転移である。モデルは、宿主細胞と癌細胞との共培養を含む。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、骨髄、骨、血液、胎盤、および臍帯に由来する。いくつかの好ましい実施形態では、宿主細胞は間充織幹細胞である。
本発明はまた、SREに対する、または癌細胞の骨への転移に対する種々の遺伝子の機能または効果を決定する方法を提供する。いくつかの実施形態では、上記方法は、1つ以上の癌細胞を1つ以上の宿主細胞と共培養し、上記癌細胞および/または宿主細胞上の1つ以上の生物学的マーカーを、共培養していない癌細胞および/または宿主細胞の同様の生物学的マーカーと比較することを含む。いくつかの実施形態では、コントロール癌細胞は、共培養で使われた癌細胞のものと同一の初期癌細胞培養から単離される。
本発明はまた、SREおよび/または転移の生物学的マーカーを同定する方法を提供する。いくつかの実施形態では、同定される生物学的マーカーとして、限定されるものではないが、例えば遺伝子、遺伝子産物、RNA、mRNA、およびDNAが挙げられる。上記方法は、宿主細胞および癌細胞を共培養し、調節の証拠を検出する。
本発明は、SREまたは転移の調節因子を同定するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、上記方法は、推定調節因子を細胞の共培養と接触させることを含む。
本発明はさらに、SREまたは転移の発現に関して異なる変数の効果を試験するための方法を提供する。試験される変数は、1種類以上のホルモン類、増殖因子、および栄養分の有無の効果を含むことが可能である。上記方法は、癌細胞と宿主細胞との共培養に生体分子を接触させることを含む。生物学的マーカーは、異なる量の変数で、コントロール細胞で共培養した癌細胞および宿主細胞上に生物学的マーカーと比較される。いくつかの実施形態では、変数がない状態でコントロール細胞を培養する。したがって、SREおよび/または転移を示す生物学的マーカーの質または量を減少させる変数は、SREおよび/または転移のインヒビターとして同定される。
本発明はさらに、患者がSREまたは転移を受けやすいかどうか、また特定の処置法が妥当なものであるかどうかを判断する方法を提供する。この方法は、患者または患者試料に由来する癌細胞を宿主細胞と共培養し、上記共培養した宿主細胞および癌細胞の生物学
的マーカーを共培養されていないコントロール癌細胞および/または宿主細胞と比較することを含む。
本発明はまた、骨への転移の過程で癌細胞上に現れる分子、または転移性またはSREに導く運命にある癌細胞上に現れる分子を同定する方法を提供する。いくつかの実施形態では、上記分子が癌細胞の表面にある。いくつかの実施形態では、上記方法は癌細胞と宿主細胞とを共培養することを含む。次に、上記共培養をscfv発現ファージで処置する。上記ファージを、scfvが共培養された細胞に結合し得る条件下で培地に添加する。ファージを結合可能とさせた後、ファージに結合した細胞を単離する。ファージ単離技術は当業者に周知であり、限定されるものではないが、フローサイトメトリ、免疫精製、勾配精製、遠沈殿法等がある。共培養された細胞に結合したscfvを単離した後に、scfvをシークエンシングして特徴付けをおこなう。次に、scfvを用いて、細胞上に存在した抗原結合相手を同定する。結合scfvにもとづく抗原結合相手の同定方法は、当業者に周知である。
いくつかの実施形態では、本発明は患者のSREまたは転移を抑制する方法を提供するもので、この方法は、上述または後述される本発明の調節因子を治療上有効な量を投与することを含む。いくつかの実施形態では、上記調節因子は、本発明の方法にもとづいて同定される。
2×107Ka、少なくとも1×108Kaである、またはそれ以上である。本発明の抗体は、本発明のポリペプチドに対する結合親和性に基づいて、説明または特定することも可能である。いくつかの実施形態では、結合親和性として、5x10−2M、10−2M、5x10−3M、10−3M、5x10−4M、10−4M、5x10−5M、10−5M、5x10−6M、10−6M、5x10−7M、10−7M、5x10−8M、10−8M、5x10−9M、10−9M、5x10−10M、10−10M、5x10−11M、10−11M、5x10−12M、10−12M、5x10−13M、10−13M、5x10−14M、10−14M、5x10−15M、または10−15M、あるいはそれ以下よりも低いKdを持つものが挙げられる。
AAI−AA25; AAI−AA50; AA1−AA84; AA9−AA177;
AA1−AA10; AA5−AA20; AA20−AA25; AA35−AA45; AA48−AA52; AA50−AA100; AA40−AA90; AA45−AA65; AA65−AA75; AA80−AA90; AA88−AA92; AA99−AA120; AA95−AA110; AA105−AA120; AA100−AA150; AA132−AA137; AA150−AA200; AA155−AA170, AA190−AA2I0; AA198−AA202; AA200−AA250; AA220−AA240; AA238−AA234; AA245−AA265; AA250−AA300; AA290−AA330; AA290−305; AA300−AA350; AA310−AA330; AA317−AA322; AA348−AA352; AA350−AA400; AA380−AA395; AA382−AA387; AA405−AA495; AA400−AA450; AA405−AA415; AA415−AA425; AA425−AA435; AA437−AA582; AA450−AA500; AA440−AA460; AA446−AA440; AA460−AA470; AA460−AA464; AA472−AA478; AA475−AA495; AA500−AA550; AA511−AA690; AA515−AA550; AA550−AA600; AA550−AA625; AA575−AA605; AA585−AA600; AA600−AA650; AA600−AA625; AA635−AA665; AA650−AA700; AA645−AA680; AA700−AA750; AA700−AA725; AA700−AA750; AA725−AA775; AA770−AA790; AA750−AA800; AA800−AA815; AA825−AA850; AA850−AA875; AA800−AA850; AA920−AA990; AA850−AA900; AA920−AA945; AA940−AA965; AA970−終了(C’末端)。
いくつかの実施形態では、本発明は癌細胞移動または接着を阻害する方法を提供する、または、上述および後述の本発明の調節因子の治療上有効な量を投与することを含む。いくつかの実施形態では、調節因子を、本発明の方法に従って同定した。
本発明は、本明細書中に記載される調節因子と薬学的に受容可能なキャリアとを一つ以上を含んでいる薬学的組成物も提供する。用語「薬学的に受容可能なキャリア」は、治療薬、例えば、抗体またはポリペプチド、遺伝子、および他の治療薬のためのキャリアに言及している。この用語は、組成物を受けている個体に有害な抗体の生産をそれ自身で誘発せず、また過度の毒性なしで投与可能な薬学的キャリアのことをいう。適当なキャリアは、大きくて、ゆっくりと代謝される高分子(例えばタンパク質、多糖類、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、重合アミノ酸、アミノ酸コポリマー、脂質凝集体、および不活性ウィルス粒子)とすることができる。そのようなキャリアは、当業者に周知である。治療用組成物中の薬学的に受容可能なキャリアは、液体(例えば水、生理食塩水、グリセロール、およびエタノール)を含むことができる。補助物質(例えば湿潤剤または乳化剤、pH緩衝物質等)もまた、そのようなビヒクル内に入れることができる。
本発明は、患者での転移を検出するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、この方法は、造影剤に連結させられる抗体、プローブ、および低分子を含んでいる組成物に投与して、上記患者での前記造影剤の局在を検出することを含む。いくつかの実施形態では、造影剤に結合した抗EphA2抗体は1種類以上の転移を検出するために、患者に投与される。標識抗体は細胞上で高密度のレセプターに結合し、それによって腫瘍細胞上で蓄積する。標準の撮像技術を使用して、腫瘍の部位を検出することができる。
本発明はまた、患者でSREおよび/または臨床指標を検出するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、この方法は、造影剤に連結させられる抗体、プローブ、および低分子を含む組成物を患者に投与し、上記患者での造影剤の局在を検出することを含む。いくつかの実施形態では、造影剤に結合した抗EphA2抗体は1種類以上の転移を検出するために、患者に投与される。標識抗体は細胞上で高密度のレセプターに結合して腫瘍細胞上に蓄積する。標準の映像技術を用いることで、SREおよび臨床指標に関するパラメータを検出したり、および/または評価したりすることができる。
いくつかの実施形態では、本発明は、転移またはSREを調整する方法を提供するもので、EphA2治療に感受性のある患者を最初に同定することを含み、この方法は、造影剤に連結させられる抗体、プローブ、プライマーまたはオリゴヌクレオチドを含んでいる組成物を、それを必要としている患者に投与する工程と、患者で遺伝子または遺伝子産物の証拠の有無を検出することが挙げられる。いくつかの実施形態では、上記遺伝子がEphA2である。患者でEphA2発現の証拠が存在することは、EphA2治療の候補である患者であることを示す。また、患者のEphA2発現の証拠が示されなければ、EphA2治療の候補ではない患者であることを示す。この方法は、患者に組成物を投与する工程と、造影剤に連結したEphA2オリゴヌクレオチドまたは抗体を比較し、患者のSREまたは転移を示す臨床指標の有無を検出する工程とを有する。臨床指標が存在することは、SREまたは転移がEphA2治療の候補である患者であることを示し、患者の臨床指標の証拠が示されなければ、EphA2治療の候補ではない患者を示す。
いくつかの実施形態では、本発明は、SREおよび/または転移に関連する遺伝子または遺伝子産物を撮像および/または検出するためのキットを提供する。いくつかの実施形態では、遺伝子はEphA2である。本発明のキットは、本発明の方法を実行するために、指示書と同様に、検出可能な抗体、低分子、オリゴヌクレオチド、デコイレセプター、ミメティック、またはプローブを含む。任意に、キットは以下の一つ以上を含むものであってもよい。すなわち、コントロール(正および/または負)、コントロールのための容器、写真、または正および/負の結果の典型的な例の記述。
正常ヒト間充織幹細胞(MSC, BioWhittaker(登録商標)からのカタログ#PT−2501)の1バイアル(750,000細胞/バイアル)を、10−7Mのデキサメタゾン、0.05mMのリン酸アスコルビン酸塩、10mMのβグリセロリン酸塩を有する完全なMSCGMを含む骨形成培地に播種し、一晩、細胞培養皿に付着させた。幹細胞は、10,000細胞/cm2の密度で播種した。翌日、サブコンフルエントな癌細胞をトリプシン処理し、計数するために、骨形成培地中に再懸濁した。癌細胞を、骨形成培地で40,000細胞/mlに希釈した。間充織幹細胞からの培地を除去し、幹細胞が前日有したのと同じ密度(10,000細胞/cm2)で癌細胞を加えた。
(アルカリホスファターゼ染色)
培地は、培養細胞から除去した。この細胞を、10%の中性緩衝ホルマリンで3〜5分間固定した。3〜5分後に、ホルマリンを除去し、リン酸緩衝食塩水(PBS)で置換した。次いで、このPBSを、アルカリホスファターゼ染色液で置換した。アルカリホスファターゼ染色液は、Fast Blue RR(Sigma(登録商標)、カタログ#FBS−25)の1カプセル(12mg)を48mlの水に加えることによって調製した。この溶液を混合した後に、溶液を濾過した。AS−MXリン酸ナフトール(Sigma(登録商標)、カタログ#85−5)の2mlを、この濾過済み溶液に加えた。この染色液を、37℃で約30分間インキュベート可能にし、次いで、PBSですすぎ洗いした。次いで、アルカリホスファターゼ染色液を、顕微鏡の下で視覚化した。
この細胞層を、PBS(Mg及びCa無しの)で洗った。100μlの細胞消化緩衝液(アッセイ緩衝液[PH9.0で1.5Mのトリス、1mMのZnC12、1mM のMgC12]の1:10希釈液+1%のトリトンX−100(登録商標))を、96穴のプレートの各々の穴に加えた。次いで、この消化緩衝液を、37℃で約30分間インキュベートした。次いで、溶解物を新しい96穴のプレートまで移送した。50μlの基質(10mlのH2O中に1カプセルのSigma(登録商標) 104)、50μlのアルカリホスファターゼ緩衝液(PH9.0で1.5Mのトリス、1mMのZnC12、1mMのMgC12)、及び10μlの細胞溶解物を、新しい96穴のプレートに加えた。混合物を37℃で15分間インキュベートした。反応を100μlのNaOHの追加により停止させた。次いで、O.D.を、410ナノメートルで読み込んだ。
細胞を10%の中性緩衝ホルマリンで5分間固定した。5分後に、固定液を除去し、細胞を脱イオン水ですすぎ洗いした。細胞に、5%の水性の硝酸銀溶液を加えた。次いで、この細胞を、細胞培養皿の蓋を除去して、1時間紫外線光に曝露した。反応は、室温で2〜3分間5%の水性のチオ硫酸ナトリウムを追加して停止させた。次いで、細胞を洗って、室温で保存した。
間充織幹細胞を、骨形成培地中、10,000細胞/cm2の密度で96穴の皿中に播種し、37℃で一晩付着させた。同時に、癌細胞(PC3、LNCaP、またはMDA231)をサブコンフルエントに播種した。翌日、癌細胞をトリプシン処理し、40,000細胞/mlの濃度で、骨形成培地中に再懸濁した。次いで、培地を、宿主細胞を含む96穴のプレートから除去した。次いで、癌細胞を10,000細胞/cm2の密度で、宿主細胞培養に加えた。アルカリホスファターゼ活性を、4日目に測定した。カルシウム沈着は、2〜3日ごと培地を変えて11〜14日間細胞をインキュベートすることにより分析した。カルシウム沈着は、11〜14日目に、フォン・コッサ染色液を用いて視覚化した。
間充織幹細胞(MSC)を、単独、或いはPC3(前立腺癌細胞)またはMDA231(胸部癌細胞)の存在下、骨形成培地中で4日間、培養した。4日目に、細胞を固定し、アルカリホスファターゼ活性のために染色した(図1、及び図2)。図1で分かるように、PC3の存在下でのみ、宿主細胞が刺激されて骨芽細胞になった。それは暗い汚れの存在によって示されている。アルカリホスファターゼ活性も、細胞溶解物を生成して測定した。図2で分かるように、アルカリホスファターゼ活性は、PC3細胞の存在下で、細胞が存在しない時よりかなり大きい。
骨転移の際、その発現が調整される遺伝子を同定するために、以下の処置を実行した。間充織幹細胞を、単独、またはPC3細胞の存在下、骨形成培地中で、4乃至11日間培養した。妥当な時間に、全RNAが、細胞から単離した。RNAを逆転写にかけ、ロシュ・ライト・サイクラー(登録商標)に特異的な遺伝子の発現について解析した。図4で分かるように、アルカリホスファターゼ遺伝子、オステオカルシン、及びCBFA2 RNAの発現は、骨転移の際、増加した。負のコントロール(NC1及びNC2)の発現は、骨転移の際、増加しなかった。
共培養でのバクテリオファージ選択のために、TG1大腸菌宿主株の新しい培養を1%のブドウ糖を有するL培地中、600ナノメートル(OD600)で0.8の光学濃度まで増殖させた。
骨移植および/またはSREの調節因子を同定するために、候補化合物を宿主細胞と癌細胞との共培養と接触させる。候補化合物を細胞の共培養に、約1ピコモルないし約5Mの濃度で添加する。同時に、コントロール共培養を、候補化合物が無い状態でインキュベートする。日毎に、骨移植またはSREの生物学的マーカーを測定して、候補化合物が骨移植および/またはSREの調節因子であるかどうかを判断する。細胞のRNA、DNA、およびタンパク質を単離して細胞の遺伝的プロフィールを同定する。遺伝的プロフィールをコントロールプロフィールと比較する。骨移植および/またはSREを示す変化が、骨移植および/またはSREの調節因子を示す。
1日目、PC3細胞を、10%胎仔ウシ血清(FCS)および1xPen/Strepを含むRPMIに16,000細胞/cm2の密度で播種した。2日目、細胞を未処理またはEphA2に対するアンチセンス・オリゴヌクレオチドによる形質移入もしくは逆コントロールオリゴヌクレオチドによる形質移入をおこなった。3日目、培地を骨形成培地に変えて、10,000細胞/cm2の濃度で間充織幹細胞を培養物に添加した。培養物をさらに3日間、37℃、5%CO2条件下でインキュベートした。3日目に、細胞をアルカリホスファターゼに対して固定および染色あるいは定量的アルカリホスファターゼ分析のために溶解した。図9に示すように、結果は、アンチセンス・オリゴヌクレオチドの存在下ではアルカリホスファターゼ接触および定量的分析の減少が見られた。
PC3細胞を、EphA2に対するアンチセンスまたは逆コントロールオリゴヌクレオチドで処理し、次に3%Matrigel(登録商標)オーバーレイを有するMatrigel(登録商標)に置いた。図13に示すように、アンチセンス・オリゴヌクレオチドは、PC3細胞の増殖を阻害した。その一方で、コントロールオリゴヌクレオチドは阻害しなかった。
PC3細胞は、EphA2に対するアンチセンスもしくは逆コントロールオリゴヌクレオチドで処理した。この細胞を0.35%軟寒天に播種し、培養7日後にアラマーブルーを用いて定量した。
CHIR−221−4RC(逆コントロール)TGTAGTTCTCCTAACCCCACGCCG (配列番号4)
PC3細胞コロニー形成阻害の結果生ずるこれらのアンチセンス・オリゴヌクレオチドは、EphA2が、転移性表現型の生成または維持に役割を果たし、または、SREに関与することを示す。
複数個体の正常組織の全RNAを貯蔵し、逆転写し、EphA2に対するプライマーを用いて定量的PCRにかけた。6つの癌および腫瘍周辺正常組織から得たLCM組織由来の増幅RNAを逆転写し、EphA2に対するプライマーを用いた定量的PCRにかけた。図12に示すように、癌のmRNAレベルが、腫瘍周辺レベルよりも約2倍高いことがわかった。大腸癌試料のEphA2レベルは、正常試料の約2倍高く現れた。
癌性細胞のポリヌクレオチドによって示される差動的発現遺伝子の発現は、転移性表現型の促進等腫瘍形成における遺伝子生成の役割と機能とを確かめるために、アンチセンス・ノックアウト技術を用いて分析が可能である。
細胞増殖の阻害に対する遺伝子発現の効果は、転移性乳癌細胞系統(MDA−MB−231またはMDA231(「231」))、SW620大腸結腸直腸癌細胞、SKOV3細胞(ヒト卵巣悪性腫瘍細胞系統)、またはまたはLNCaP、PC3、22Rvl、MDA−PCA−2bまたはDU145前立腺癌細胞で、評価することができる。
抗体認識および調製のためのEphA2の線形エピトープは、当技術分野で知られている数多くの方法のいずれかによって同定し得る。いくつかの例の方法は、抗原のアミノ酸配列に由来するペプチドの抗体結合能を調べることを含む。結合の評価は、BIACOREまたは酵素免疫測定法方法を用いておこなうことができる。他の技術として、平面固体キャリア(「チップ」)上で、抗体に対してペプチド・ライブラリーを露出させること、ならびに固相スクリーニングで用いられる多数の方法のいずれかを介して結合を検出することが挙げれられる。さらに、ファージ提示を用いて、いくつかのバイオ・パニングのラウンド後、エピトープの選択によるペプチドのライブラリーをスクリーニングすることに用いることができる。
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- 一種類以上の骨格関連現象の阻害を必要としている患者において、一種類以上の骨格関連現象を阻害するための組成物。
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