JP2007097476A - 生化学処理装置、これに用いる容器および検査装置 - Google Patents

生化学処理装置、これに用いる容器および検査装置 Download PDF

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Abstract

【課題】 簡便な構成で収容部間のコンタミネーションを防ぎ、且つPCR反応等の高温工程に晒した場合においても好適に使用できる容器を提供し、さらにこれを使用した生化学処理装置を提供することを目的とする。
【解決手段】 液体を収容可能な複数の収容部を有する容器を使用して生化学反応を行なうための生化学処理装置であって、前記収容部を選択的に密閉する手段を有することを特徴とする生化学処理装置。
【選択図】 図3

Description

本発明はDNA検査装置などの生化学処理装置、およびこれに用いる容器に関する。特に、検体DNAの増幅および精製用の容器の構造およびその開閉機構に関するものである。
核酸の塩基配列の解析、核酸試料中の標的核酸の検出を迅速・正確に行なうものとして、DNAマイクロアレイに代表されるプローブ担体を用いたハイブリダイゼーション反応を利用した方法が多く提案されている。DNAマイクロアレイとは、標的核酸と相補的な塩基配列を有するプローブを、ビーズ、ガラス板等の固相上に高密度で固定したものであり、これを用いた標的核酸の検出は一般に以下のような工程を有する。
第1の工程として、PCR法に代表される増幅方法によって、標的核酸を増幅する。具体的には、まず、核酸試料中に第1及び第2のプライマを加え、酵素の存在下で温度サイクルをかける。第1のプライマは標的核酸の一部と特異的に結合し、第2のプライマは標的核酸と相補的な核酸の一部と特異的に結合する。標的核酸を含む二本鎖核酸と第1及び第2のプライマが結合すると伸長反応によって標的核酸を含む二本鎖核酸が増幅される(以降、第1PCRと呼ぶ。)。
十分に標的核酸を含む二本鎖核酸が増幅された後に、未反応のプライマや核酸の断片など、増幅された二本鎖核酸以外のものを精製によって除去する。精製には磁性粒子に二本鎖核酸を吸着させる方法やカラムフィルタを利用したものなどが知られている。
精製を終了した核酸試料中に第3のプライマを加えて温度サイクルをかける。第3のプライマは、酵素、蛍光物質、発光物質等で標識されており、標的核酸と相補的な核酸の一部と特異的に結合する。標的核酸に相補的な核酸と、第3のプライマが結合すると伸長反応によって標識された標的核酸が増幅されるのである(以降、第2PCRと呼ぶ。)。
結果として、核酸試料中に標的核酸が含まれている場合は標識された標的核酸が生成され、核酸試料中に標的核酸が含まれない場合は標識された標的核酸は生成されない。
第2の工程として、この核酸試料をDNAマイクロアレイに接触させ、DNAマイクロアレイのプローブとハイブリダイゼーション反応させる。プローブと相補的な標的核酸がある場合は、プローブと標的核酸がハイブリッド体を形成する。
第3の工程として、標的核酸の検出を行なう。プローブと標的核酸がハイブリッド体を形成しているかどうかは、標的核酸の標識物質によって検出が可能であり、これにより特定の塩基配列の有無を確認できる。
この複数の工程を1つの装置で連続的に処理する装置に関して特許文献1で開示されている。移動可能な分注機により容器内に必要な液体を搬送して反応させる構成となっている。
特開7−107999号公報
複数の処理を行なう生化学処理装置においては、個別に液体が保持できる多数の空間(容器)が必要となる。例えば、多数の試薬をそれぞれの保持する容器であり、さらに生化学処理を行なうための反応場としての容器である。
それらの容器間の液体の移動に伴って生じるコンタミネーション(混液)の課題は、重要である。分注装置を用いた場合などによって生じる、液体移動に伴う液体の散乱の問題を回避するために、液体の移動距離を短縮する、すなわち容器間の距離を近接させる構成にすることが好ましい。
この構成は、温度調整すべき領域が小さくなるという利点もあるばかりか、搬送手段も小型化できる。
しかし、近接すればするほど、隣接する容器内の試薬同士のコンタミネーションの課題は大きくなっていた。
また、使用する直前まで容器の開放部をフィルムし、必要時に開封する構成が考えられるが、この場合の開封後に課題が残っている。具体的には、PCR処理工程などの加熱を行なう処理工程においては、加熱による液体の蒸発が課題となる。また、冷却を行なう処理工程においては、冷却に伴う結露なども課題となっていた。
従って、本発明は簡便な構成で収容部間のコンタミネーションを防ぎ、且つPCR反応等の高温工程に晒した場合においても好適に使用できる容器を提供し、さらにこれを使用した生化学処理装置を提供することを目的とする。
すなわち、本発明に係る生化学処理装置は、
液体を収容可能な複数の収容部を有する容器を使用して生化学反応を行なうための生化学処理装置であって、
前記収容部を選択的に密閉する手段を有する
ことを特徴とする。
本発明の生化学処理装置においては、収容部を選択的に密閉する手段を有することで、容器内への複数の液体注入を容易に実現し、且つ高温加熱に対する液体蒸発を防ぐことができる。さらに複数容器内の液体が不要にコンタミネーションを起こす心配がなく、正確な生化学処理を行うことができるので、より正確な生化学分析を可能とする。
以下に本発明を詳細に説明する。
検体DNAを増幅、ハイブリダイゼーション、検出の複数の工程を1つの装置で連続的に実施する装置の増幅部分を例に説明する。
本実施形態に使用される容器は、液体を収容可能に構成されている容器を複数備える容器と、密閉手段としての可動式の蓋部材を備えている。
容器には市販されている96ウェルのPCRマイクロプレートもしくはそれと同等の形状にウェルを形成したものを用いるとよい。この容器にはPCR工程で用いる試薬類があらかじめ充填されている。容器の一方側は第1および第2PCRを実施するウェル、中央部分は精製の際に使用するウェル、もう一方側は精製および第1、第2PCRで用いる試薬が充填されたウェルとなっている。
ウェルの開口部には密閉部材が接着もしくは溶着などにより固定されているとよい。ウェルにはあらかじめ試薬類が充填されているところと、反応の際に溶液が充填されるところがあるが、この密閉部材により装置にセットして反応が始まるまではすべてのウェル内部が外部と遮断されているため外部からの異物混入を防ぐことができる。密閉部材はウェルから溶液を吸引およびウェルに溶液を吐出する前に装置側に備えられた穴あけ手段で破られる構成となっている。穴あけはそのウェルを使う直前に行なうため外部に露出する時間は最低限におさえられる。
密閉部材の上には弾性材料で形成された可動式の蓋部材が配置される。この蓋部材は少なくとも第1および第2PCRの際に使用するウェルを密閉できる大きさとなっている。蓋部材は常にウェルを密閉する方向に付勢されており、支点を中心に開閉可能に容器に支持されている。したがって第1PCR終了後、溶液を取り出すために蓋を開けた後など必要なときには再度ウェルを密閉することができる。必要なときのみ蓋部材を開ける構成なので蒸発は極めて少なく、不用意に外部に溶液がもれる可能性も極めて低い。
蓋部材の開閉は装置側の駆動手段により行なわれる。
蓋部材の可動式は、上記のような回動方式に限定されず、スライド方式や蓋部材が開口部に向かって垂直に落下する方式でもよい。
増幅装置側は大きく分けてサーマルサイクル部、精製部、保冷部で構成されている。この3つが容器を動かさなくても各機能を果たせる近接した位置関係で配置されている。
サーマルサイクル部は容器と嵌合、密着する複数の凹部からなるアルミや銅合金などの熱伝導性の良い金属で形成したサーマルサイクルブロックとペルチェ素子やヒータなどで構成される。凹部の数は第1および第2PCRを実施するウェルと同数が形成されている。このサーマルサイクルブロックに容器を嵌合させて第1および第2PCRを実施する。一般的には約92℃、55℃、72℃の3つの設定温度を各温度について所定時間保持し、このサイクルをそれぞれ40回程度(第1PCRにおいて)および25回程度(第2PCRにおいて)繰り返すものである。
サーマルサイクル部は容器の上部、つまり蓋部材の存在する側にも加熱部を備えていることがこのましい。この加熱部はアルミや銅合金などの熱伝導性の良い金属により構成された加熱ブロックと、ペルチェ素子やヒータなどからなり、加熱ブロックに熱を与えることにより容器を蓋部材を通して上部から加熱する。加熱ブロックは第1および第2PCRの際にPCR反応を行なうウェルの上部のみを覆う大きさに構成されており、保冷ウェルを加熱しないように構成されている。これによりウェル内壁面温度が上昇するので、蒸発して上昇してきた溶液が内壁面に付着して結露するのを防止することができる。
ウェル上部の加熱部は第1および第2PCRの際に蓋部材上部に存在し、第1および第2PCRウェルへ溶液を出し入れする際もしくは密閉部材に穴をあけする際には、それらの動作を妨げない位置へ退避している。そして加熱部が退避する際に蓋部材も開けるように構成されている。
容器の中央部に対向する位置には精製部が配置されている。精製はウェルにあらかじめ充填された磁性粒子およびウェル近傍に配置した磁石を用いて行なう方法が採用できる。
このウェルに核酸溶液、洗浄液、エタノールなどを別々に供給後、攪拌し核酸を磁性粒子に吸着させる。その後、通常ウェルから離れた位置にある磁石を精製ウェルに近づけることにより核酸付き磁性粒子を1ヶ所に保持し、ウェルに核酸付き磁性粒子を残してウェル内の溶液を吸引する。次にこのウェルに溶出液を供給し磁性粒子から核酸を分離させ、磁石を精製ウェルに近づけて磁性粒子を1ヶ所に保持し磁性粒子以外の溶液を吸引する。このようなステップを経て精製された核酸溶液を得る。
容器がセットされた位置における、サーマルサイクル部と保冷部は、互いが対向する位置(サーマルサイクル部がウエルプレートの一端側であれば、その他端側)に配置されている。保冷部は容器と嵌合、密着する複数の凹部からなるアルミや銅合金などの熱伝導性の良い金属で形成した冷却ブロックとペルチェ素子などで構成される。凹部の数は少なくとも試薬類が充填されたウェルと同数が形成されている。冷却ブロックは周囲を断熱部材で覆われている。
これらサーマルサイクル部、保冷部、精製部に対向するウェル間で溶液を移動させるピペットユニットが構成されている。ピペットユニットは先端に着脱可能なピペットチップを備えており、必要に応じて交換する。
容器が装置にセットされてから実際に使用されるまでの間、保冷部は試薬を劣化させない温度で保存している。試薬の保存温度は4℃〜20℃程度の範囲であり、近接したサーマルサイクル部の温度(55〜92℃)の影響を受けないでこの温度を維持しなければならない。
保冷部とサーマルサイクル部の間に精製部を配置することにより距離をとってサーマルサイクル部と保冷部の温度が相互影響しないように構成されている。
また、このようにサーマルサイクル部、保冷部、精製部を配置することによりPCRマイクロプレートの限られたサイズを効率的に使っているので装置の小型化をはかれるとともに、溶液を供給、吸引するピペットの移動距離を短くすることもできる。
容器を増幅精製工程のみで使用する仕様の場合、増幅精製工程が終了すると使用者が容器を装置から取り外すことができる。取り外した後はこの容器を廃却すればよい。蓋部材も容器に構成されているので一緒に廃却される。装置側に蓋部材を有する場合に比べてその洗浄機構もしくは交換機構がない分、構成を簡素化できる。また、蓋部材を洗浄可能もしくは交換可能に構成したとしても次の容器の検査に前の反応残留物などが混入することを確実に防ぐことができるとはいい難く、その点でも有利である。
(第1実施例)
DNA検査装置の増幅部分の例についてさらに詳細に説明する。
図1に本実施例のDNA検査装置の概念図を示す。
DNA検査装置は生体試料からDNAを抽出する抽出部101、DNAを増幅させる増幅部102、増幅したDNAをプローブDNAと結合させるハイブリダイゼーション部103、プローブDNAと結合したかどうか検出する検出部104からなる。抽出部、増幅部、ハイブリダイゼーション部、検出部の順番に検査工程が進む。
図2は容器のウェル部分を示す斜視図である。
ウェル部分は市販されているポリプロピレン製のPCRマイクロプレート1もしくはそれと同等の形状に形成したものを用いており、8×12個のウェルが9mmピッチで構成されている。各ウェルの先端(底)部2は後述するサーマルサイクルブロック、冷却ブロックと嵌合する形状になっている。
図3はDNA検査装置の増幅部を正面から見たもので、容器の構造およびウェル配置とサーマルサイクル部、保冷部、精製部との位置関係などを説明するものである。
図3は第1および第2PCR反応中の状態を示している。
容器3は8×12個のウェルを1×12ウェルずつ12分割して利用し、同時に12検体の検査が可能となっている。
図3の右側のウェルから説明する。1番右のウェル4は第2PCRを行なうウェルであり最初は空である。ウェル5は第1PCRを行なうウェルであり酵素試薬、プライマなどの溶液101があらかじめ充填されている。ウェル6、7は精製を行なうウェルであり最初にウェル7から使う。ウェル7にはあらかじめ磁性粒子溶液102が充填されており、ウェル6は空である。ウェル8には洗浄液103、ウェル9にはエタノール104、ウェル10には溶出液105、もっとも左側のウェル11には第2PCRで使う試薬、プライマなどの溶液106があらかじめ充填されている。この配列が図面鉛直方向に12列並んでいる。
12はアルミなどで構成されたラミネートフィルムで96個のウェル開口部に接着もしくは溶着などにより固定されている。これにより外部からの異物混入を防ぐことができる。ウェルから溶液を吸引およびウェルに溶液を吐出する前に穴あけカッターでフィルム12を破る方式となっている。
フィルム12は各ウェルを使用する直前に不図示のカッター部で穴をあけるので内部の溶液および反応場が外部に露出する時間は最低限におさえられる。したがってウェルへの外部からの異物混入および外部への溶液モレの可能性を極めて低くできる。
13はシリコンゴム製の蓋、14は蓋を保持する部材、15は蓋13および蓋保持部材14を回動可能に保持する支点軸であり、支点軸15には蓋13および蓋保持部材14がウェル4、5を密閉する方向に付勢する不図示のねじりコイルバネが取り付けられている。16は支点軸15を回動可能に保持する軸受部である。ウェル部分に市販のPCRマイクロプレートを利用する場合、軸受部16は接着もしくはネジ止めなどでPCRマイクロプレートの縁部分17に固定される。またはPCRマイクロプレートに相当する部分と軸受部を一体化して作成してもよい。
蓋13はウェル4、5のみ12列計24ウェルを覆う大きさに構成されており後述する加熱ブロックと同等の大きさになっている。
18はサーマルサイクル部に配置されたサーマルサイクルブロックでアルミや銅合金などの熱伝導性の良い金属により構成され24個のウェル(穴部)が形成されている。
その下部にはサーマルサイクルブロック18を加熱するペルチェ素子19が配置されており、その接触面を完全に密着させて熱を確実に伝えるためのグリス(不図示)が塗布されている。グリス以外で同様な効果を得るものとして熱伝導性の良いシート材料もある。
ペルチェ素子19は容器3の12列のウェルをすべて均一に加熱できる個数で配置されている。
ウェル4、5がサーマルサイクルブロック18と対向しており、外周がウェル内壁と密着する寸法関係となっている。
なお、サーマルサイクルブロック18は周囲を樹脂で形成された断熱部材(不図示)で覆われており周囲に熱が逃げないように構成されている。
ウェル6、7の間には磁石20、磁石固定部材21、磁石回動支点22が配置され、磁石20、磁石固定部材21は精製工程における磁性粒子捕集のときは図3の23の位置にある。磁石20、磁石固定部材21は各列に対応し合計12個、磁石回動支点22に回動可能に保持されている。磁石回動支点22は後述する保持板32に形成された不図示の軸受手段により保持されている。磁石固定部材21は磁石20と反対側の端部が不図示のソレノイドと連結されている。磁性粒子をウェルの壁面に集中させたいときはソレノイドに電流を流して磁石固定部材21を引き込むことにより磁石20が23の位置まで上昇してくる。
24は保冷部に配置された冷却ブロックでアルミや銅合金などの熱伝導性の良い金属により構成され48個のウェル(穴部)が形成されている。
その下部には冷却ブロック24を冷却するペルチェ素子25が配置されており、その接触面を完全に密着させて熱を確実に伝えるためのグリス(不図示)が塗布されている。グリス以外で同様な効果を得るものとして熱伝導性の良いシート材料もある。
ペルチェ素子25は容器3の12列のウェルをすべて均一に保冷できる個数で配置されている。
ウェル8〜11までが冷却ブロックと対向しており、外周がウェル内壁と密着する寸法関係となっている。
なお、冷却ブロック24は周囲を樹脂で形成された断熱部材(不図示)で覆われており周囲の温度影響を受けにくくしている。
26は容器3を上部から加熱するユニットであり、27はアルミや銅合金により構成された加熱ブロックである。加熱ブロック27はウェル4、5の上部のみを覆う大きさに構成されており、ウェル6〜11を加熱しないように構成されている。加熱ブロック27の上部にはペルチェ素子28が配置されており、その接触面を完全に密着させて熱を確実に伝えるためのグリス(不図示)が塗布されている。
ペルチェ素子28の上部には金属材料で形成された冷却ブロック29が、上記と同様に接触面にグリスを介して固定されている。ペルチェ素子28の裏から放熱するときにこの冷却ブロック29によって冷却を促進させる。
冷却ブロック29は出入口を備えた中空構造になっており、その出入口に接続された不図示の配管を介して冷却水が流れる構造となっている。
30は上面に開口31を備え、加熱ブロック27、ペルチェ素子28および冷却ブロック29を保持し、かつ断熱する部材である。
加熱ブロック27、ペルチェ素子28、冷却ブロック29、保持部材30が一つのユニット(天板ユニット)として構成されており、この天板ユニット26が図中右方へ移動可能に構成されている。
この天板ユニット26は容器3の12列のウェルをすべて均一に加熱できるような幅で構成されている。
天板ユニット26は増幅時に容器3のウェル4、5と密着する位置にあって上部から加熱する。
図8および図9は天板ユニット26および蓋13の開閉方法を説明するもので要部を抜き出して示したものである。
図8は天板ユニット26が蓋13の真上の少し距離を取った位置にある状態を示すもので図5と同じ状態である。図8(a)は斜視図、図8(b)は図8(a)を右側から見た側面図で全部品の透視図となっている。
図8(a)(b)において49、50は天板ユニット26の両側に固定されたピンである。51、52は天板ユニット26の両側に配置された側板で、装置本体部分に固定されている。(固定部分は不図示)53は側板51に形成された長穴で側板52にも同様に形成されて、ピン49、50が長穴53の中をスライド可能になっている。54は一端をピン50に回動可能に支持されたリンクで、これも天板ユニット26の両側に配置されている。55は一端をリンク54に固定されたピン56に回動可能に支持されたリンクで、これも天板ユニット26の両側に配置されている。57はリンク55が固定されている天板駆動軸であり一端にギヤ58が取り付けられている。59は端部にギヤ60が取り付けられたモータでありギヤ58およびギヤ61に動力を伝達する。62はギヤ61に固定され蓋13を開閉する軸である。軸62は蓋13と重なる位置関係に配置されている。モータ59およびギヤ58、60、61の保持部は省略してある。
図9は天板ユニット26が退避し、蓋13が開けられた状態を示すもので図6と同じ状態である。図9(a)は斜視図、図9(b)は図9(a)を右側から見た側面図で全部品の透視図となっている。
図8から図9への動きを説明する。モータ59を図8(b)の反時計方向に駆動するとギヤ60を介してギヤ58、駆動軸57が時計方向に回転し、リンク55が駆動軸57を中心に時計方向に回転する。これによってリンク54が駆動され、その一端に係合しているピン50を介し、ピン49、50が長穴53に沿ってスライド、すなわち天板ユニット26が右方へ動く。
このときギヤ58と同時にギヤ61も反時計方向に回転し、軸62が蓋13の端部と接触し、そのまま回転することにより蓋13が支点軸15を中心に動いて図9の位置に到達し不図示のセンサで位置を検出してモータ59の駆動を停止する。この状態からモータ59を時計方向に駆動すると蓋13は閉じる方向に回転し、不図示のホームポジションセンサにより停止位置にあること(図8の状態に到達したこと)を検出されたらモータ59の駆動を停止する。
往路においては天板ユニット26がある程度退避してから蓋13が開き始め、復路においては天板ユニット26がホームポジション付近に到達した時点では蓋13がすでに閉じており動作が干渉しないように構成されている。
容器3とサーマルサイクルブロック18、冷却ブロック24を嵌合させ、後述する保持板32を上昇させることにより容器3を天板ユニット26に対して押圧している。これにより容器3のウェル外周とサーマルサイクルブロック18、冷却ブロック24の密着性が向上しウェルへの熱伝導性がよくなる。
ペルチェ素子19、25の下にはこれらサーマルサイクル部、保冷部、精製部全体を保持する保持板32が配置されており、装置のベース33に不図示の軸受で支持されたリードスクリュー34および不図示のモータおよび駆動伝達系により図中上下に一体で駆動される。
保持板32の下面には金属材料で形成された水冷ブロック35、36が、上記と同様に接触面にグリスを介して固定されている。水冷ブロック35、36はペルチェ素子19、25の対向する位置にそれぞれ固定されておりペルチェ素子19、25の下面からの冷却を促進させる。ペルチェ素子19の下に配置される方は磁石固定部材21と干渉しない位置関係に配置されており、図中には点線で位置を示す。
冷却ブロック35、36は出入口を備えた中空構造になっており、出入口に接続された不図示の配管を介して冷却水が流れる構造となっている。
点線37であらわされているのは容器3をセットするキャリッジ部で不図示のモータおよび駆動伝達系を介して図面鉛直方向に配置されているリードスクリュー38およびガイドシャフト39により前後にキャリッジ部37を駆動する。点線37の高さは容器3をセットする高さであり、キャリッジ37が装置前面にあるときに容器をセットする。キャリッジ37が装置後方に駆動されて容器3がサーマルサイクル部、保冷部、精製部と対向する位置に到達すると停止する。このとき保持板32は図3で示される位置より下方、容器3とぶつからない位置にある。その後、リードスクリュー34で保持板32を図3の位置まで上昇させる。
次にDNA検査装置の動作について説明する。
なお、以降は1列(1検体分)の動きを説明するが他の列も同様に動作している。
図4は図3の上面図であり天板ユニット26およびその他を除いた要部をあらわしたものである。
使用者が容器3を点線40の位置にあるキャリッジ37にセットすると不図示の駆動モータ、リードスクリュー38によって容器3を後方(図中上方)に搬送する。実線の位置まで到達するとリードスクリュー38によって支持板32が上昇し、図5の状態となる。
図5は図3よりも支持板32がわずかに下にあり加熱ブロック27と蓋13は接触していない。
すでに不図示の抽出部によって血液、尿などの生体試料から公知の手段により抽出された核酸を含む溶液をウェル5へ移動させる。
核酸溶液の移動にはピペットを用いる。
図6はピペットを用いて核酸溶液をウェル5へ吐出している様子をあらわしたものである。
41は先端に着脱可能に取り付けられたピペットチップ42を介して溶液の供給・吐出・攪拌を行なうピペット部、およびその搬送部でモータ、リードスクリューなどから構成される。ピペット部は不図示のピペット搬送部により上下前後左右に移動可能に構成されている。
この他、ピペットチップの図中右側にウェルを密閉しているフィルムに穴をあけるカッター部、周辺には未使用のピペットチップを保持しておくピペットホルダ部、および使用済みピペットチップを収容するピペット廃却部などが構成されている。カッター部はピペット搬送部で所定の位置に搬送される。(以上不図示)
あらかじめフィルム12のウェル5に対向する部分にカッター部で穴をあけておきピペットチップ42がウェル5内に進入できる状態になっている。
なお、穴をあける前に天板ユニット26および蓋13は不図示の駆動機構によりそれぞれ右方へ移動および略90回転させて、ウェル4、5の上面が開放状態にしておく。
図中右方にある抽出部から核酸溶液を吸引したピペットチップ42をウェル5の上方まで移動後、下降させてウェル5内に進入させ、所定の深さまで進入させたら核酸溶液を吐出する。
その後、ウェルにピペットチップを入れたまま吸引、吐出を所定回数繰り返し、あらかじめ充填されていた試薬類とじゅうぶんに混合(攪拌)する。
混合を終了したらピペット部41を容器3上から退避させ、天板ユニット26および蓋13を図5のようにウェル4、5を密閉する状態にしておく。
その後、リードスクリュー34により保持板32を上昇させて図3の状態にする。
このとき蓋13は保持板32を天板ユニット26に付勢することによりウェル1ヶ所あたり50〜100gf、場合によってはそれ以上の力で押圧される構造となっている。
図3の状態で第1PCRを開始する。約92〜55〜72℃の間を所定の保持時間、サイクル数で実施することにより試料管内の核酸が増幅される。第1PCRの間、保冷部は試薬類が劣化しない温度、例えば4℃程度に維持される。サーマルサイクル部(ウェル4、5)と保冷部(ウェル8〜11)は要部を不図示の断熱部材で覆われている上に、間に精製部(ウェル6、7)を配置しているためある程度の距離が確保されている。
このように配置することによってサーマルサイクル部と保冷部の温度が相互に影響を与えないようになっている。
第1PCR終了後、精製工程が始まる。
図7は増幅産物中の核酸を磁性粒子に吸着させた後、磁石20で磁性粒子を集めて核酸付き磁性粒子43以外をピペットチップ42に吸引した状態を示している。
まず図6のように天板ユニット26を退避させて、蓋13を開けた状態にしておく。
ウェル5内の溶液ピペットチップ42により吸引しウェル7に吐出する。(事前にカッター部によりウェル7に穴をあけておく)
ピペットウェル7への充填が終了したら天板ユニット26および蓋13は図5のようにウェル4、5を密閉する位置に戻しておく。
次にウェル7にあらかじめ充填されている磁性粒子溶液102とウェル5から移動した溶液をピペットチップ42で攪拌し、核酸を磁性粒子にじゅうぶん吸着させた後、磁石20を図7の位置まで上昇させて核酸付き磁性粒子43をウェル7内壁の1ヶ所に集中させる。ここで図7のようにピペットチップ42により核酸付き磁性粒子43以外を吸引し不図示の廃液処理部分に吐出する。なお第1PCRが終了したらサーマルサイクルブロックの温度は室温程度にしてよい。
次に磁石20をウェル7から遠ざけて、ウェル8に穴をあけて中の洗浄液103を吸引しウェル7へ移動させ、ピペットチップ42により攪拌し、磁石20を上昇させて核酸付き磁性粒子をウェル8内壁の1ヶ所に集中させる。ここでピペットチップ42により核酸付き磁性粒子43以外を吸引し(図7と同様の状態である)不図示の廃液処理部分に吐出する。
この流れと同様にウェル9のエタノール104をウェル7に移動させて核酸付き磁性粒子43以外を吸引して不図示の廃液処理部に吐出する。
ここで精製工程中の洗浄工程終了である。
最後に核酸付き磁性粒子43から核酸を溶出させる工程に移る。
ウェル7内の溶液およびウェル10の溶出液をウェル6へ移動し、洗浄液、エタノールのときと同様に攪拌、放置を経て磁石20により1ヶ所に磁性粒子を集める。溶出液によって磁性粒子から核酸が離れており、この溶液が精製を経て得られた核酸溶液である。これをウェル6から所定量吸引して(図7と同様の状態である)ウェル4に移動させる。移動前にあらかじめ図6のように天板ユニット26を退避させて、蓋13を開けた状態にしておき、カッター部でウェル4に穴をあけておく。
ここで精製工程終了である。
次にウェル11に穴をあけて第2PCRで使用する溶液106をウェル4に移動させ、ピペットチップ42により攪拌する。攪拌が終了したら図5のように蓋13をウェル4、5を密閉する状態とし、続けて図3のように加熱ブロック27が蓋13と密着する状態とし、第2PCRを開始する。すでに試薬類はすべて使い切っているので第2PCRの間は冷却ブロック24の冷却を停止してもよい。
第2PCRが終了したら天板ユニット26および蓋13を図6のように天板ユニット26を退避させて、蓋13を開けた状態にしておき、ピペットチップ42によりウェル5から増幅産物を不図示のハイブリダイゼーション部に移動させる。移動が終了し、再度図3の状態にしてから保持板32を下降させてキャリッジ部37を手前に搬送すると容器3をDNA検査装置から取り外し可能な状態となる。
以上のように第1PCR、精製、第2PCR工程を通じてウェル4、5上のフィルム12に穴をあけるとき、およびウェル4、5に溶液の出し入れを行なう際に蓋13を開閉させている。ウェル4、5を複数回開放、密閉するために蓋13は穴あけタイプではなく開閉する形式を採用している。
また、天板ユニット26を退避・復帰させる動きと蓋13の開閉を1つの駆動源で同時(天板ユニット26が退避を開始してある程度時間が経過してから蓋13が動き始めるので動作的には時間差あり)に行なっているので蓋13の開放・密閉を迅速に行なうことができ、ウェル4、5が外部に露出する時間を短くしている。
増幅精製工程が終了し容器3が図4の点線40の位置に戻ってくると容器3を装置から取り外すことができる。蓋13も容器3に構成されているので一緒に廃却できる。廃棄物が一つにまとまっているので取り扱いやすい。
図3で説明したように容器3にあらかじめ充填しておく溶液を使用する順番に配置し、未使用(穴をあけていない)ウェル上を溶液を吸引したピペットチップがなるべく通過しないように構成した。こうした配列にすることにより仮にピペットチップから溶液が落下しても、未使用ウェルに落下する可能性は小さいので増幅工程および精製工程に影響を与えることはない。
(第2実施例)
上記実施例では天板ユニット26と蓋13を一つのモータで同時に駆動し、動作時間の短縮化をはかっているが天板ユニット26と蓋13を駆動する機構は上記実施例に限定されるものではない。例えば図8、図9でギヤ58とギヤ61をそれぞれ別のモータで駆動し、天板ユニット26と蓋13を動作させる構成である。
また、上記実施例では、蓋13はねじりコイルバネによってウェル4、5を密閉する方向に付勢される構成となっているが他の方法であっても良い。例えば蓋13周辺に鉄製の部材を設け、その対向部に磁石を配置し、通常は磁力でウェル4、5密閉する構成である。蓋13を開放する際には磁力に逆らって蓋13を引き離す手段を装置側に配置してあれば良い。
その他、公知技術である多様な機構によって構成することは可能であり本発明は具体的な機構に限定されるものではない。
(第3実施例)
上記実施例では容器3には増幅工程に関わる試薬類のみが充填されていたが、他の工程(抽出・ハイブリ・検出)の試薬が一緒に充填されていてもよい。
本発明のDNA検査装置の概念図 本発明の容器のウェル部分を示す斜視図 本発明のDNA検査装置の増幅部正面図 本発明のDNA検査装置の増幅部上面図 本発明のDNA検査装置の増幅部正面図(増幅開始前の状態) 本発明のDNA検査装置の増幅部正面図(核酸溶液を吐出している状態) 本発明の精製工程を示す図 本発明の天板ユニット、蓋駆動機構を示す図 本発明の天板ユニット、蓋駆動機構を示す図
符号の説明
1 PCRマイクロプレート
3 容器
4 第2PCRを行なうウェル
5 第1PCRを行なうウェル
6、7 精製を行なうウェル
8 洗浄液103が充填されたウェル
9 エタノール104が充填されたウェル
10 溶出液105が充填されたウェル
11 第2PCR用溶液106が充填されたウェル
12 フィルム
13 蓋
18 サーマルサイクルブロック
19 サーマルサイクル用ペルチェ素子
20 磁石
24 冷却ブロック
25 保冷用ペルチェ素子
26 天板ユニット
32 保持板
34 リードスクリュー
35、36 水冷ブロック
37 キャリッジ部
38 リードスクリュー
40 容器3をセットする位置
42 ピペットチップ
54、55 リンク
58、60、61 ギヤ
59 モータ
62 軸
101 プライマなどの溶液101
102 磁性粒子溶液

Claims (16)

  1. 液体を収容可能な複数の収容部を有する容器を使用して生化学反応を行なうための生化学処理装置であって、
    前記収容部を選択的に密閉する手段を有する
    ことを特徴とする生化学処理装置。
  2. 前記収容部を密閉するための蓋部材が装置側に設けられていることを特徴とする請求項1に記載の生化学処理装置。
  3. 前記容器に蓋部材が設けられており、前記処理装置に前記蓋部材を可動させる可動手段を有する請求項1に記載の生化学処理装置。
  4. 生化学処理装置の使用前に前記収容部を予め密閉するため第2の密閉部材を有する請求項1に記載の生化学処理装置。
  5. 前記第2密閉手段に密閉された部分を外部に連通させる手段および前記連通手段を駆動する手段を有する請求項4に記載の生化学処理装置。
  6. 前記収容部に対して加熱反応を実施する手段を有する請求項1に記載の生化学処理装置。
  7. 前記加熱実施手段は前記容器の上部からの加熱手段を含むことを特徴とする請求項6に記載の生化学処理装置。
  8. 前記加熱手段を、前記容器の少なくとも前記反応部に対向する位置と退避した位置に駆動する手段を有する請求項7記載の生化学処理装置。
  9. 前記加熱手段と前記蓋部材は連続的に駆動され、
    前記加熱手段および前記蓋部材をそれぞれ前記退避位置および開放位置へ駆動するときは前記加熱手段が蓋部材に先行して移動を開始し、
    前記加熱手段および前記蓋部材をそれぞれ前記対向位置および密閉位置へ駆動するときは前記蓋部材が加熱手段に先行して移動を開始することを特徴とする請求項8記載の生化学処理装置。
  10. 前記加熱反応はPCR反応であることを特徴とする請求項9記載のPCR増幅処理装置。
  11. 前記生化学処理装置は、検体中のDNAを検査する装置である請求項1〜10のいずれかに記載のDNA検査装置。
  12. 請求項1〜11のいずれかに記載の装置に使用する容器であって、
    第2の密閉部材によって、密閉状態で前記収容部内に試薬が保持されていることを特徴とする試薬保持容器。
  13. 液体を収容可能な複数の収容部を備えた容器部と、
    前記収容部を選択的に密閉可能な可動式の蓋部材と、
    を備える容器。
  14. 生化学処理装置での使用前に前記収容部を予め密閉するため第2の密閉手段を有する請求項13に記載の容器。
  15. 前記容器は付勢手段を備え、蓋部材は前記付勢手段によって外部から駆動力を与えられない限りは少なくとも前記収容部を密閉する方向に付勢されていることを特徴とする請求項14に記載の容器。
  16. 前記蓋部材は弾性を有する材料で構成されていることを特徴とする請求項13に記載の容器。
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