JP2006517101A - 治療用産物を送達するための、増殖性の幹細胞および前駆細胞における候補分子の持続的発現 - Google Patents
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Abstract
候補分子を持続的に発現する増殖細胞からなる単離された前駆細胞集団または幹細胞集団を得る方法、および結果として得られた候補分子を持続的に発現する増殖細胞からなる単離された前駆細胞集団または幹細胞集団。さらに、ex vivo遺伝子産物(例えば、タンパク質)産生の新規の産物、および神経疾患または神経変性疾患の症状の治療も提供される。図15は本発明で用いられるベクターを示す。このベクターには、IRES−neo配列が、マウスPolr2a遺伝子座の(エキソン28に隣接する)3’非コード配列にクローニングされた。
Description
本発明は、概して、バイオテクノロジーに関し、詳細には、体性幹細胞を治療および使用する様々な方法、ならびに治療用産物を送達する方法に関する。さらに詳細には、本発明は、グリア前駆細胞、間葉系幹細胞、および星状細胞前駆細胞における相同組換えの使用を含み、結果として得られた細胞を含む。
本願は、米国特許法第119条(e)によって、2003年1月13日に出願された米国特許仮出願第60/440,152号の利益を主張する。
[背景]
疾患を治療するための治療用タンパク質の送達は、一般的に、遺伝子送達ビヒクルとしてウイルスベクターを使用することを含む。治療用タンパク質は、該タンパク質をコードする外来性DNAを適切な細胞に導入することによって産生することができる。しかしながら、ウイルスベクターの使用には、複製可能なウイルスがベクターの生成中に生じる可能性があるなどの制約がある。同様に、導入されたウイルスと、内在性レトロウイルスゲノムとの間で組換えが起こる場合があり、新規の細胞特異性、宿主域、または増大した病原性(ビルレンス)および細胞傷害性を有する感染因子が生じる可能性がある。ウイルスはまた単独で多数の細胞に組み込むこともでき、レトロウイルスでの限られたクローニング能は治療への応用の制約となっている。さらに、目的の(関心の対象となる)産物がin vivo発現する期間は短い。従って、ウイルスベクターとは関係の無い、新たな治療用タンパク質送達法が有用であると理解することができる。
[背景]
疾患を治療するための治療用タンパク質の送達は、一般的に、遺伝子送達ビヒクルとしてウイルスベクターを使用することを含む。治療用タンパク質は、該タンパク質をコードする外来性DNAを適切な細胞に導入することによって産生することができる。しかしながら、ウイルスベクターの使用には、複製可能なウイルスがベクターの生成中に生じる可能性があるなどの制約がある。同様に、導入されたウイルスと、内在性レトロウイルスゲノムとの間で組換えが起こる場合があり、新規の細胞特異性、宿主域、または増大した病原性(ビルレンス)および細胞傷害性を有する感染因子が生じる可能性がある。ウイルスはまた単独で多数の細胞に組み込むこともでき、レトロウイルスでの限られたクローニング能は治療への応用の制約となっている。さらに、目的の(関心の対象となる)産物がin vivo発現する期間は短い。従って、ウイルスベクターとは関係の無い、新たな治療用タンパク質送達法が有用であると理解することができる。
幹細胞は、親幹細胞と同様の自己複製能および分化能の特性を有する娘細胞を生じることができる自己複製細胞である。造血幹細胞などのある特定の幹細胞の自己複製能は長期間にわたるのに対して、他の幹細胞の自己複製能は短い。幹細胞は、由来する組織および分化能に基づいて分類されている。多能性胚性幹細胞(「ESC」)はどのタイプの組織にも分化することができる。ESCは分化するにつれて、その系列を特定のタイプの細胞に次第に制限することができる。例えば、神経幹細胞は中枢神経系の派生物を生じることができるのに対して、神経冠幹細胞は末梢神経系の派生物、肝臓幹細胞、肝細胞、および膵臓幹細胞を生じる。皮膚、血液、骨、消化管、および筋肉を含む多数の組織から幹細胞が同定されており、部分的なリストを表1に示す。
分化の間に、幹細胞は、さらに限定された前駆細胞(precursor )(「前駆」細胞(progenitor cell )とも知られる)を生じることができる。前駆細胞は、限られた自己複製を起こすことができるが、分化のレパートリーはさらに制限されている。例えば、グリア前駆細胞は多くの種類のグリア細胞(すなわち、星状細胞およびオリゴデンドロサイト)に分化することができるが、ニューロンには分化できないのに対して、ニューロン前駆細胞は多くの種類のニューロンを生じることができるが、星状細胞もオリゴデンドロサイトも生じることができない。制限された前駆細胞も多数の組織から同定されており、部分的なリストを表2に示す。
幹細胞および前駆細胞は、様々な治療パラダイム(精製または濃縮された混合物からの細胞の単離、および特定の組織または臓器への細胞の直接移植または一定期間培養した後の細胞の移植を含む)に用いられている。場合によっては、さらなる操作(例えば、細胞への遺伝子のトランスフェクションもしくは感染、色素もしくは抗体による細胞の標識、または増殖因子およびサイトカインによる細胞の前処理)の後に、細胞が移植される。
外来性遺伝子の発現は細胞の内在機構(例えば、メチル化、ヘテロクロマチン再構築、および異物として認識され安定に発現する細胞の消失)によってダウンレギュレートまたは抑制されるので、細胞において遺伝子を発現させる大部分の方法には制約がある。長期間維持される細胞において安定した発現を得る代替法の評価が、多数の研究室における進行中の研究プログラムである(非特許文献1を参照のこと)。
相同組換えを細胞への遺伝子の挿入に使用することができるという可能性は1980年代初期から断続的に議論され、試みられてきた。例えば、マリオ−カペッキ(Mario Capecchi)らは、相同組換えが生じた細胞を選択する方法を開発した。例えば、特許文献1、特許文献2、特許文献3、特許文献4、および特許文献5を参照のこと(これらの全ての内容は本明細書に参考として援用される)。しかしながら、遺伝子ターゲティングが非効率であり、in vivoでは幹細胞の天然量が少なく、低効率の相同組換え事象を選択するために必要な細胞分裂数のためにin vitroで幹細胞または前駆細胞を未分化状態で維持することが難しいという理由で、幹細胞ではあまりうまくいかなかった。さらに、幹細胞を含む体細胞の相同組換えははるかに難しいことが分かっている。
現在に至るまで、相同組換えは、3つの主な理由のために胚性幹細胞に限定されてきた。第1に、体細胞(例えば、不死化線維芽細胞)において遺伝子置換技術を使用する最初の取り組みが期待の持てるものではなかった。成功するのは容認できないほど少なく、いくつかの有力な研究室の失敗によって、カペッキ(Capecchi)法を体細胞に適合させるという重大な試みが頓挫した。このことは、相同組換え効率が非常に細胞の種類に特異的であるということを立証していると思われる。
第2に、相同組換えの最も一般的な使用の場合、体細胞には、ESCと比較してかなり多くの面倒な問題がある。ESCとは異なり、体細胞は、ある特定の遺伝子の2個の対立遺伝子が確実に置換されるために、細胞培養操作を必要とする。多くの理由が、体細胞に関する困難(細胞を長期間増殖できないこと、および適切で効率的なベクターを選択できないことを含む)に起因してきた。従って、相同組換えの最もよく認識されている使用の場合、体細胞における手順はESCより本質的に難しく、かなり複雑である。
第3に、最良の条件下で、哺乳動物ESCでの相同組換えは出発細胞集団100万個あたりおおよそ1回の頻度で生じる。相同組換え手順を任意の特定の種類の初代細胞での使用に首尾よく適合させられれば、この細胞種は培養において少なくとも24回の細胞分裂を経て、おおよそ1000万個の細胞を生じるはずである。最もよく特徴付けられている骨髄由来造血幹細胞の場合、2〜3回以下の細胞分裂が培養において達成されている。しかしながら、ESCは、政治的および倫理的な問題を提起する胚に由来するので理想的な治療候補ではない。さらに、ESCは自発的に増殖して腫瘍を形成することがあり、in
vivo分化シグナルに適切に反応しないことがある。
米国特許第5,464,764号
米国特許第5,487,992号
米国特許第5,627,059号
米国特許第5,631,153号
米国特許第6,204,061号
ヤネツ・アール・ジェイ(Yanez, RJ )およびポーター・エイ・シー(Porter, AC)、「治療遺伝子ターゲティング(Therapeutic Gene Targeting)」Gene Ther. 1998年2月5日(2)、p.149−159
vivo分化シグナルに適切に反応しないことがある。
従って、ESC以外の細胞において候補分子を持続的に発現させるストラテジーを特定することが必要であると理解することができる。
[発明の開示]
本発明は、体細胞での相同組換え法を使用して、幹細胞または前駆細胞において分子を安定に発現させる新規の方法を含む。体細胞または前駆細胞は、未分化な状態のままで、TERTを発現し、テロメラーゼ活性を維持し、自己複製能を示すように培養で増殖させることができる。1つの実施態様において、幹細胞または前駆細胞は、グリア前駆細胞、間葉系幹細胞、星状細胞前駆細胞、およびその任意の混合物を含んでもよい。
本発明は、体細胞での相同組換え法を使用して、幹細胞または前駆細胞において分子を安定に発現させる新規の方法を含む。体細胞または前駆細胞は、未分化な状態のままで、TERTを発現し、テロメラーゼ活性を維持し、自己複製能を示すように培養で増殖させることができる。1つの実施態様において、幹細胞または前駆細胞は、グリア前駆細胞、間葉系幹細胞、星状細胞前駆細胞、およびその任意の混合物を含んでもよい。
目的のタンパク質の発現が構成的に活性のある遍在性プロモーターまたは細胞種特異的プロモーターによって調節できるように、目的の遺伝子を構築物またはベクターバックボーンにクローニングすることができる。ベクターは、エレクトロポレーション、リポフェクション(Lipofection、商標)、細胞融合、レトロウイルス感染、カチオン性薬剤導入、CaPO4、トランスフェクション、およびその組み合わせを含むがそれらに限定されない様々な方法によって、培養された幹細胞または前駆細胞に挿入することができる。ベクターの設計は、ベクターがヒトゲノム、ラットゲノム、またはマウスゲノムの特定の配列と相同な領域を含むような設計でもよい。1つの実施態様において、相同な領域は100%の相同性を有してもよい。このような相同配列として、Rosa遺伝子座、RNApolII遺伝子座、およびβ−アクチン遺伝子座を挙げることができるが、これらに限定されない。これらの相同配列を使用すると、細胞が複製する時に、挿入されたDNAと染色体DNAの中の相同配列との間で組換えが可能になる。本発明はまた、この方法によって作成された体細胞または前駆細胞を含む。
本発明はまた、選択遺伝子マーカーを用いて単離および選択することができる、相同部位にDNAが挿入された幹細胞または前駆細胞も含む。次いで、該細胞は後の実験に用いられてもよい。後の実験として、遺伝子産物の置換により異常または欠損が修正されるような、被検体への幹細胞または前駆細胞の移植が挙げられるが、これに限定されない。このような異常または欠損の例として、触媒酵素の消失、増殖因子またはその受容体の濃度の低下、および、あるタンパク質が同タンパク質を通常発現しない細胞において新たに発現することが挙げられる。
本発明の別の実施態様は、少なくとも1つの配列が幹細胞または前駆細胞のゲノムの選択された部位に配置され、同じ選択部位が繰り返し標的となり得るように、少なくとも1回の相同組換え事象が首尾よく生じた幹細胞株および前駆細胞株を作成することを含む。例えば、第1の相同組換え事象によって、同じ位置での後の相同組換え事象を促す遺伝子配列が挿入されてもよい。挿入された遺伝子配列は、再現可能なやり方で第3の遺伝子または第4の遺伝子で置換されてもよい。
本発明のさらに別の実施態様は、体細胞において相同組換えを試みること、ならびにin vivoでの増殖因子の送達効力を評価し、かつ遺伝子発現を直接比較するために、様々な候補増殖因子を発現する複数の種類の細胞クローンを得ることを含む。
本発明の別の実施態様は、特定の遺伝子座において相同組換えを試み、次いで、第1の組換え事象によって導入された変化を第2の対立遺伝子において繰り返す第2の組換え事象のために、得られたクローンを再選択することを含む。このようなホモ接合性変異細胞は、高濃度の選択剤を使用して再選択するか、または同じ細胞株において第1の組換えプロセスと同様に第2の組換えプロセスを試みることによって得ることができる。別の実施態様は、目的の遺伝子の発現を制御することができるプロモーターを改変することを含む
。この改変は、プロモーターの少なくとも一部を、遺伝子産物の発現をさらに調節することができる産物で置換することを含んでもよい。
。この改変は、プロモーターの少なくとも一部を、遺伝子産物の発現をさらに調節することができる産物で置換することを含んでもよい。
被検体は、目的の遺伝子を産生できなくてもよいし、正常レベルの目的の遺伝子を発現できなくてもよい。相同組換えが生じた後に、目的の遺伝子は、体細胞または前駆細胞の精製または濃縮された集団を用いて被検体に送達されてもよい。送達は、目的の遺伝子のin vitro送達またはin vivo送達を含んでもよい。1つの実施態様において、送達は、被検体において目的の遺伝子を発現させることを含んでもよい。
本発明の別の実施態様は、相同組換えによって導入された内在性タンパク質を発現することができるグリア前駆細胞の単離された集団を含む。グリア前駆細胞にはMHC発現が無くてもよい。グリア前駆細胞は、分化、TERTの発現、テロメラーゼ活性の維持、および自己複製が可能であってもよい。
本発明の別の実施態様は、相同組換えによって導入された内在性タンパク質を発現することができる間葉系幹細胞の単離された集団を含む。間葉系幹細胞にはMHC発現が無くてもよい。間葉系幹細胞は、分化、TERTの発現、テロメラーゼ活性の維持、および自己複製が可能であってもよい。
本発明の別の実施態様は、相同組換えによって導入された内在性タンパク質を発現することができる星状細胞前駆細胞の単離された集団を含む。星状細胞前駆細胞にはMHC発現が無くてもよい。星状細胞前駆細胞は、分化、TERTの発現、テロメラーゼ活性の維持、および自己複製が可能であってもよい。本発明はまた、神経疾患または神経変性疾患を含む疾患の治療に使用するための、相同組換えされた体性幹細胞または前駆細胞も含む。
本発明はまた、ex vivo遺伝子療法のために、相同組換えによって細胞に導入された内在性タンパク質を発現するグリア前駆細胞、間葉系幹細胞、星状細胞前駆細胞、またはその混合物の単離された集団を使用することを含む、遺伝子療法の方法も含む。
本発明の相同組換えされた体性幹細胞または前駆細胞と薬学的に許容可能な賦形剤とを使用することを含む、神経疾患または神経変性疾患を治療するための医薬品を製造する方法。
[発明の最良の実施態様]
トランスジェニックマウスを作成するために、ならびに細胞株およびある体細胞の遺伝子座を標的とするために、相同組換えが用いられてきた。しかしながら、成功は一定せず、特定の細胞の種類に適した条件およびベクターの開発に左右されてきた。一般的に、細胞は、相同組換えの生存可能な候補となるために、選択可能かつ低密度で増殖可能なように、十分な数の細胞分裂を経なければならない。これらの基準を満たす細胞はほとんどなく、結果として、相同組換えの成功は、胚性幹細胞、不死化細胞株、および線維芽細胞に限られてきた。
トランスジェニックマウスを作成するために、ならびに細胞株およびある体細胞の遺伝子座を標的とするために、相同組換えが用いられてきた。しかしながら、成功は一定せず、特定の細胞の種類に適した条件およびベクターの開発に左右されてきた。一般的に、細胞は、相同組換えの生存可能な候補となるために、選択可能かつ低密度で増殖可能なように、十分な数の細胞分裂を経なければならない。これらの基準を満たす細胞はほとんどなく、結果として、相同組換えの成功は、胚性幹細胞、不死化細胞株、および線維芽細胞に限られてきた。
説明したように、ESCは、一つには分化シグナルに適切に反応しないことがあるという理由で、理想的な治療候補ではない。しかしながら、中間的な系列のグリア前駆細胞は、グリア組織の形成に限定された分化レパートリーを有し、通常、成人の脳および脊柱に存在し、そこでin vivoシグナルに反応する。さらに、オリゴデンドロサイトのサブタイプは、中枢神経系(「CNS」)の神経線維を取り囲む保護鞘であるミエリンの産生を主に担っている。オリゴデンドロサイトの細胞機能の消失は、多発性硬化症などの脱
髄疾患の発症において大きな役割を果たしている。
髄疾患の発症において大きな役割を果たしている。
グリアに限定された前駆細胞の精製集団を単離する方法が示されており、体細胞での相同組換えを阻む従来の障害を解決する可能性をもたらす。なぜなら、グリア前駆細胞はその特徴を保持しながら長期間培養で維持できることが示されているからである。さらに、グリア前駆細胞は不死化することができ、外来遺伝子を導入することができ、その細胞を外来遺伝子の発現について選択できることが最近証明された。ウー(Wu)ら、「グリアに限定された三分化能細胞株の胚脊髄培養物からの単離(Isolation of a Glial-Restricted Tripotential Cell Line from Embryonic Spinal Cord Cultures)」、GLIA 第38巻、p.65−69(2002年)を参照のこと。同文献の内容は本明細書に参考として援用される。さらに、グリア前駆細胞は高レベルのテロメラーゼを発現する。セディビイ(Sedivy)、「末端は手段を正当化できるか 哺乳動物細胞におけるテロメアならびに複製老化および不死化の機構(Can Ends Justify the Means? Telomeres and the Mechanisms of Replicative Senescence and Immortalization in Mammalian Cells )」PNAS USA 第95巻、p.9078−9081(1998年8月)を参照のこと。同文献の内容は本明細書に参考として援用される。本発明によれば、少なくとも20継代自己複製し、グリア細胞に分化することができ、テロメラーゼ陽性の前駆細胞が相同組換え事象の候補である(図8を参照のこと)。
90%をこえるCNS細胞がグリアであり、グリア細胞治療は、脱髄疾患および神経変性疾患を含む広範囲の神経疾患の治療において潜在的に重要である。グリア細胞は、ニューロンの生存および正常機能の維持、神経伝達物質代謝の調節、ならびにニューロン間の最適なシグナル伝達を維持するためのミエリンの合成に極めて重要である。グリア機能の消失は、多発性硬化症、脊髄損傷、皮質下脳卒中、脳性麻痺、および遺伝病(白質萎縮を含む)に及ぶ脱髄疾患において主な役割を果たしている。グリア機能不全はまた、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症(「ALS」)、ハンチントン舞踏病を含む神経変性疾患、ならびにリソソーム蓄積症(テイ−サックス病、ハーラー症候群、ゴーシェ病、ファブリー病、および晩期幼児型神経セロイドリポフスチノーシス(「LINCL」)を含むが、これに限定されない)における主な要因である。従って、グリア前駆細胞は理想的な治療候補である。
グリア前駆細胞はまた、並外れた増殖能、感染部位への移動能、ならびにオリゴデンドロサイトサブタイプおよび星状細胞サブタイプへの分化能のために、理想的な治療用送達ビヒクルでもある。上記の疾患が、様々なやり方(外来性タンパク質因子を発現するようにグリア前駆細胞を遺伝学的にコード化し、その細胞を損傷組織に送達すること、誘導性増殖因子を送達することによって内在性前駆幹細胞を動員すること、および/または細胞補充療法を含む)で治療できることが意図される。しかしながら、このような治療を妨げている主因は、適切な治療候補が無いことであった。本発明は、生存可能な治療候補を作成するために相同組換えを使用する方法を提供する。
幹細胞または自己複製前駆細胞(初代細胞)において相同組換えが成功する鍵の1つは、これらの細胞を培養において本質的に変えずに何世代も増殖できることを実現することである。これは、直接、培養において細胞を実際に何世代も継代することによって達成することができ、または不死細胞を特徴付ける酵素テロメラーゼの高い発現レベルから推測することができる。グリア前駆細胞は30世代を超えて培養で維持することができるうえに、高レベルのテロメラーゼ(細胞不死性の生化学マーカー)を発現することが最近示された。間葉細胞もまた培養において無限に(40世代を超えて)増殖することができ、高いテロメラーゼレベルを示す。星状細胞前駆細胞を含むがこれに限定されない他のクラスの幹細胞および前駆細胞も同様の特徴を示すと予想される。ソマー(Sommer)およびラオ(Rao )、「神経幹細胞および細胞数の調節(Neural Stem Cells and Regulation of Ce
ll Number )」、Progress in Neurobiology 第66巻、p.1−18(2002年)を参照のこと。
ll Number )」、Progress in Neurobiology 第66巻、p.1−18(2002年)を参照のこと。
体細胞における相同組換えの最初の失敗は、重要な実験パラメータの重要性についての理解が無かったことに起因するかもしれない。例えば、実験によって操作された標的配列と細胞内の標的配列は100パーセントマッチすることが必要な場合がある。(ヤネツ・アール・ジェイ(Yanez, RJ )およびポーター・エイ・シー(Porter, AC)、「治療遺伝子ターゲティング(Therapeutic Gene Targeting)」、Gene Ther. 1998年2月5日(2)、p.149−159を参照のこと)。本発明は、グリア前駆細胞、間葉系幹細胞、および星状細胞前駆細胞において、相同組換えが少なくとも1つの特定の遺伝子座において効率的に生じることを証明する。
制御された薬物送達のための導入遺伝子(トランスジーン)の組込みを対象とした相同組換えの使用は、幹細胞研究および相同組換えのほとんど重複しない分野において本質的に無視されてきた。本発明は、培養における幹細胞集団および前駆細胞集団の増殖特性の新たな特徴付け、ならびに増殖している幹細胞および前駆細胞において候補分子を持続的に発現させる従来にないストラテジーを特徴とする相同組換え法を提供する。
一般的に、相同組換えプロセスは、目的のDNAが導入される細胞から開始すると特徴付けることができる。本発明において、出発細胞は、グリア型の細胞に分化し、かつテロメラーゼ陽性である任意の自己複製体性幹細胞でよい。例示的な細胞として、グリア前駆細胞、間葉系幹細胞、および星状細胞前駆細胞が挙げられるが、これに限定されない。本明細書の実施例から得られたデータに基づいて、本発明による相同組換えは、自己複製能を有し、テロメラーゼを発現し、グリア細胞分化能を有する全ての前駆細胞において可能であると予想される。
DNAが導入された後、細胞のDNAと導入されたDNAの間で相同組換えが生じ、その結果、細胞は、挿入されたDNAにコードされる産物を発現することができる。本発明において、DNAは、細胞のDNAのある特定の遺伝子座であってその前駆細胞またはその分化した前駆細胞において発現される遺伝子座に導入可能である。このような遺伝子座の例として、Rosa遺伝子座、RNApolII、および前駆型の細胞に特異的な遺伝子(例えば、サイクリックヌクレオチドジホスファターゼ(「CNP」)、ミエリン塩基性タンパク質(「MBP」)、およびプロテオリピッドタンパク質(「PLP」)があるが、これに限定されない)が挙げられるが、これに限定されない。
本発明によれば、DNAは、エレクトロポレーション、リポフェクション(商標)、細胞融合、レトロウイルス感染、カチオン性薬剤導入、CaPO4、トランスフェクション、およびその組み合わせを含むが、これに限定されない様々な方法によって細胞に挿入することができる。細胞に導入しようとするDNAは、DNA構築物、DNAプラスミド、λファージ、BAC(細菌人工染色体)、およびYAC(酵母人工染色体)を含むが、これに限定されない様々な形で導入することができる。
相同組換えされた幹細胞または前駆細胞は、当該技術分野で周知の薬学的に許容可能な担体または賦形剤と組み合わせることができる。適切な薬学的担体として、不活性固形希釈剤または増量剤、滅菌水溶液、および様々な有機溶媒が挙げられる。相同組換えされた幹細胞または前駆細胞と薬学的に許容可能な担体を組み合わせることによって形成された薬学的組成物は、錠剤、散剤、ロゼンジ、シロップ、注射液などの様々な剤形で投与することができる。治療されている被検体の体重、年齢、および状態、疾患の重篤度、ならびに選択された特定の投与経路などの既知の注意事項を考慮に入れて、当業者は投与を行うことができる。
特定の実施態様では、組換えられた遺伝子が内在性プロモーターによって調節されるように、内部リボソーム進入部位(「IRES」)タンパク質が、相同組換えが生じる特定の遺伝子座に挿入される(図4)。
相同組換えはまた、細胞内の目的の遺伝子のプロモーターを取り替える、または改変するために使用することができる。このような相同組換え事象により、例えば、目的の遺伝子の誘導性制御が可能となる。胚性幹細胞での相同組換えにおいて従来用いられているベクターを体性幹細胞において使用することができる。目的の遺伝子の例として、血小板由来増殖因子(PDGF)、上皮増殖因子(EGF)、線維芽細胞増殖因子(FGF)、脳由来神経栄養因子(BDNF)、グリア由来神経栄養因子(GDNF)、および毛様体神経栄養因子(CNTF)が挙げられるが、これに限定されない。
以下の非限定的な実施例によって、本発明をさらに理解することができる。
[実施例I]
グリア前駆細胞が培養において増殖する能力を試験するために、テロメラーゼ活性のレベル、培養において長期間分裂する能力、ならびにエレクトロポレーション、リポフェクション(商標)、およびレトロウイルス感染を用いて細胞にDNAを送達する能力を評価した。ラオ(Rao )ら、「三分化能グリア前駆細胞は発生中の脊髄に存在する(A Tripotential Glial Precursors is Present in the Developing Spinal Cord)」PNAS USA 第95巻、p.3966−4001(1998年3月);ラオおよびメイヤー−プロスシェル(Mayer-Proschel)、「グリアに限定された前駆細胞は神経上皮多能性幹細胞に由来する(Glial-Restricted Precursors are Derived from Multipotent Neuroepithelial Stem Cells )」Developmental Biology 第188巻、p.48−63(1997年);米国特許第6,361,996号および米国特許第6,235,527号を参照のこと。これらの全ての内容は本明細書に参考として援用される。
グリア前駆細胞が培養において増殖する能力を試験するために、テロメラーゼ活性のレベル、培養において長期間分裂する能力、ならびにエレクトロポレーション、リポフェクション(商標)、およびレトロウイルス感染を用いて細胞にDNAを送達する能力を評価した。ラオ(Rao )ら、「三分化能グリア前駆細胞は発生中の脊髄に存在する(A Tripotential Glial Precursors is Present in the Developing Spinal Cord)」PNAS USA 第95巻、p.3966−4001(1998年3月);ラオおよびメイヤー−プロスシェル(Mayer-Proschel)、「グリアに限定された前駆細胞は神経上皮多能性幹細胞に由来する(Glial-Restricted Precursors are Derived from Multipotent Neuroepithelial Stem Cells )」Developmental Biology 第188巻、p.48−63(1997年);米国特許第6,361,996号および米国特許第6,235,527号を参照のこと。これらの全ての内容は本明細書に参考として援用される。
図8は、テロメラーゼ活性を発現するGRP細胞を示す。NEP細胞およびE14混合細胞は、解剖されたばかりのE10. 5胚およびE14胚から入手した。A2B5陽性GRP細胞は、フローサイトメトリーによって分取されたE14混合細胞から選択された。1000個の細胞に相当する抽出物のテロメラーゼ活性を標準的なTRAPアッセイで分析した。活性レベルを定量し、表の形式で示した(図8,パートb)。「HI」試料は熱で不活化した対照である。TERTの発現を、遺伝子特異的プライマーを用いたRT−PCRによって評価した(図8,パートc)。従って、グリア前駆細胞は相同組換え事象の候補である。
[実施例II]
相同組換えのためにベクターを設計し、この設計されたベクターを用いて、特定の部位で組換えを起こすことができることを示す。タンパク質の発現が構成的に活性のある遍在性プロモーターまたは細胞種特異的プロモーターによって調節されるように、目的の遺伝子がベクターバックボーンにクローニングされる。ベクターは、例えば、エレクトロポレーション、リポフェクション(商標)、および/または細胞融合によって、培養した前駆細胞に挿入される。ベクターの設計は、特定の被検体(例えば、ヒト、ラット、またはマウス)のゲノムの特定の配列と相同な領域を含むような設計である。このような相同配列として、Rosa遺伝子座、RNApolII遺伝子座、およびβ−アクチン遺伝子座が挙げられるが、これらに限定されない。これらの相同配列を使用すると、細胞が複製する時に、挿入されたDNAと染色体DNAの中の相同配列との組換えが可能になる。
相同組換えのためにベクターを設計し、この設計されたベクターを用いて、特定の部位で組換えを起こすことができることを示す。タンパク質の発現が構成的に活性のある遍在性プロモーターまたは細胞種特異的プロモーターによって調節されるように、目的の遺伝子がベクターバックボーンにクローニングされる。ベクターは、例えば、エレクトロポレーション、リポフェクション(商標)、および/または細胞融合によって、培養した前駆細胞に挿入される。ベクターの設計は、特定の被検体(例えば、ヒト、ラット、またはマウス)のゲノムの特定の配列と相同な領域を含むような設計である。このような相同配列として、Rosa遺伝子座、RNApolII遺伝子座、およびβ−アクチン遺伝子座が挙げられるが、これらに限定されない。これらの相同配列を使用すると、細胞が複製する時に、挿入されたDNAと染色体DNAの中の相同配列との組換えが可能になる。
部位特異的組込みには、部位特異的組換え事象が生じた細胞を首尾よく選択するために、十分な期間、培養で増殖することができる十分な数の細胞が得られることが必要とされる。本発明者らは、グリア前駆細胞、星状細胞前駆細胞、および間葉系幹細胞について、自己複製し、トランスフェクトされた遺伝子を発現することができ、ネオマイシンおよびピューロマイシンを用いて選択可能な細胞を多数得ることができることを示した。図1は、DNAを細胞に挿入するのにエレクトロポレーションを使用できることを示すプロトタイプベクターの例を図示する。試験されたDNA挿入法は、エレクトロポレーション、リポフェクション(商標)、ウイルス導入、およびリン酸カルシウムを介した導入を含む。このことは、少なくとも20%の効率を有する他の任意の市販の遺伝子送達薬剤を本発明に従って使用できることを示唆している。
任意のクローニングされた目的の遺伝子座を標的とできることを示すために、Rosa26遺伝子座、RNApolII、およびGAPDH遺伝子座を標的とする構築物が開発された。このようなプラスミドのいくつかの変形が用いられた。プロモーターを含む構築物(スプライスドナー部位もしくはスプライスアクセプターを含む、または含まない)、あるいはプロモーターを含まない構築物(スプライスドナー部位もしくはスプライスアクセプターを含む、または含まない)のいずれかを使用することができる。IRES部位またはfloxed遺伝子産物を有する構築物は、詳細に説明されていてかつ当業者によって容易に入手可能な方法を用いて作成することができる。相同組換えに用いられるベクターおよび構築物の詳細な概説はコート(Court )ら、2002年、コープランド(Copeland)ら、2001年で述べられており、ベクターのいくつかの変形物の例を本明細書で説明する(図2)。
ベクターは、内在性エンハンサー(例えば、Rosa26)の下流に組み込まれるように、エンハンサーを有さないプロモーターを含まないベクターでもよい。本発明によれば、ベクターは、プロモーターを含まないベクターのように内在性エンハンサーによってもたらされる制御に加えて、遺伝子発現を外因的に制御することができる追加のエンハンサーエレメントを有する構築物でもよい。プロモーター(CMV、PGK、プリオンタンパク質、または前駆細胞集団において発現を駆動するのに適した任意のプロモーターを含むが、これに限定されない)は、内在性遺伝子(例えば、GDNFをコードする内在性遺伝子)の上流に組み込むことができる。
ベクターは、標的遺伝子座の特定の領域への組込み後に発現を可能にするスプライスドナー部位またはスプライスアクセプター部位を有する構築物でもよい。ベクターは、内在性遺伝子の特定の領域への組込み後に所望のタンパク質の効率的な発現を可能にするIRES部位を有する構築物でもよい。さらに、本発明によれば、適切なベクターは、このような構築物の任意の変形物でもよい。このような組換えの例を図3〜6に示す。
[実施例III]
相同組換えのためにベクターを設計した。マウスPolr2a遺伝子座を標的とする配列を構築するために、IRES−neo配列を、マウスPolr2a遺伝子座の(エキソン28に隣接する)3’非コード配列にクローニングした(図15)(配列番号1)。詳細に述べると、本発明者らは、ネオマイシン耐性遺伝子(neo)に連結した内部リボソーム進入部位(IRES)エレメントを、Polr2a遺伝子の最後の3つのエキソンおよび3’非翻訳領域(3’UTR)を含むゲノムDNA断片に挿入した(図3;3’UTRは斜線のついた囲みで示され、pAはポリアデニル化シグナルである)。neo遺伝子にはプロモーター配列が無く、IRESエレメントを用いて第2シストロンから翻訳され、その発現はゲノムへの適切な(すなわち、内在性プロモーターの3’側への)組み込み
に左右される。このストラテジーは、ある特定の遺伝子座での相同組換え頻度を著しく高める(テブルディック(Tvrdik)およびカペッキ(Capecchi)、未公表の観察)。本発明者らは、RNAポリメラーゼIIの大サブユニットをコードするPolr2a遺伝子を選択した。なぜなら、Polr2a遺伝子は、十分に高発現な極めて重要な遺伝子であり十分なレベルのネオマイシン耐性を確かなものにするからである。最終的なターゲティングベクターを直線化し、エレクトロポレーション(実験4aおよび実験4b)またはリポフェクション(実験4c)を用いてGRP細胞に導入した。細胞を24時間回復させ、次いで、70μg/mlのG418を含む培地に入れた。実験1では、108個のGRPについてエレクトロポレーションを実施した。実験2aおよび2bでは、2×107個のGRPを使用した。
相同組換えのためにベクターを設計した。マウスPolr2a遺伝子座を標的とする配列を構築するために、IRES−neo配列を、マウスPolr2a遺伝子座の(エキソン28に隣接する)3’非コード配列にクローニングした(図15)(配列番号1)。詳細に述べると、本発明者らは、ネオマイシン耐性遺伝子(neo)に連結した内部リボソーム進入部位(IRES)エレメントを、Polr2a遺伝子の最後の3つのエキソンおよび3’非翻訳領域(3’UTR)を含むゲノムDNA断片に挿入した(図3;3’UTRは斜線のついた囲みで示され、pAはポリアデニル化シグナルである)。neo遺伝子にはプロモーター配列が無く、IRESエレメントを用いて第2シストロンから翻訳され、その発現はゲノムへの適切な(すなわち、内在性プロモーターの3’側への)組み込み
に左右される。このストラテジーは、ある特定の遺伝子座での相同組換え頻度を著しく高める(テブルディック(Tvrdik)およびカペッキ(Capecchi)、未公表の観察)。本発明者らは、RNAポリメラーゼIIの大サブユニットをコードするPolr2a遺伝子を選択した。なぜなら、Polr2a遺伝子は、十分に高発現な極めて重要な遺伝子であり十分なレベルのネオマイシン耐性を確かなものにするからである。最終的なターゲティングベクターを直線化し、エレクトロポレーション(実験4aおよび実験4b)またはリポフェクション(実験4c)を用いてGRP細胞に導入した。細胞を24時間回復させ、次いで、70μg/mlのG418を含む培地に入れた。実験1では、108個のGRPについてエレクトロポレーションを実施した。実験2aおよび2bでは、2×107個のGRPを使用した。
[実施例IV]
哺乳動物体性幹細胞において相同組換えによる導入遺伝子の標的化組込みを行った(実験4a、実験4b、および実験4c)。これは、マウス胚の脳から単離されたグリア前駆幹細胞(GRP)のPolr2a遺伝子の3’非翻訳配列にある特定の配列への導入遺伝子の組込みを標的とした。
哺乳動物体性幹細胞において相同組換えによる導入遺伝子の標的化組込みを行った(実験4a、実験4b、および実験4c)。これは、マウス胚の脳から単離されたグリア前駆幹細胞(GRP)のPolr2a遺伝子の3’非翻訳配列にある特定の配列への導入遺伝子の組込みを標的とした。
マウスGRPを単離および培養する手順は以前に公表されている。凍結初代細胞の融解および継代によって増殖させたGRPを、DMEM/F12、1X N2添加物、1X B27添加物、20ng/mlヒト塩基性FGF、ならびに1Xペニシリンおよびストレプトマイシンにおいて培養した。実験4bおよび4cでは、レチノイン酸を含まないB27添加物を使用した。細胞は、エレクトロポレーションによって(生存細胞の約40%がレポーター遺伝子を一過的に発現する)、またはFugen(商品名)トランスフェクション試薬を用いたリポフェクション(商標)によって(細胞の約12%がレポーターを一過的に発現した)効率的にトランスフェクトすることができた。
GRP初代培養はネオマイシン感受性であり(図13)、従って、細胞のトランスフェクション後にG−418耐性を選択すると、安定に組み込まれたネオマイシン耐性マーカーを発現する細胞クローンを単離することができる(図14)。
細胞を、エレクトロポレーションを用いて(実験4aおよび実験4b)、またはリポフェクション(商標)を用いて(実験4c)、実施例IIIのベクターでトランスフェクトし、24時間回復させ、次いで、70μg/mlのG418中に置いた。実験4aでは、10(8)GRPをエレクトロポレーションした。実験4bおよび実験4cでは、2×10(7)GRPを使用した。
ネオマイシン陽性クローンは、3つの独立したトランスフェクション実験全てにおいて観察された(図14は実験4aからの例を示す)。57個のクローンが実験4aで見られ、29個が実験4bで見られ、約100個が実験4cで見られた(実験4cの場合、細胞クローンは近接しすぎて容易に区別できないことが多かった)。単離されたクローンから細胞をつついて採取し、2つの組織培養ウェルに播種するのに使用した。一方のウェルは凍結させ、他方のウェルは、特定のクローンにおけるIRES−neo配列の組込みがどういったものであるかを分析するために使用した。
実験4aでは、9個のクローンが、図15に示したオリゴヌクレオチドを用いたPCRによる分子分析に十分なレベルまで増殖した。クローンの増殖におけるこの成功の低さは、B27添加物に含まれるレチノイン酸の存在によるものであった。レチノイン酸を含まないB27添加物を使用した実験4bおよび4cでは、つついて採取した後に、53個のクローンのうち40個が勢いよく増殖した。
図16では、Polr2a配列に対応するオリゴヌクレオチド(一方はターゲティングベクターに含まれ(QT26)、他方はPolr2aにおいて約2. 6kb離れている(QT23))を用いて、PCR反応を行った。相同組換えが生じた場合、野生型Polr2遺伝子座で見られる2. 6kbのPCR断片の間に1. 5kbのIRES−neo配列が入り、従って、約4. 1kb断片が生じると予想された。
実験4aでは、11個のクローン(A〜K)からDNAを調製し、PCR分析の成功に十分なゲノムDNAを示す対照バンドが無いことに基づいて、このうち2個(BおよびJ)を考慮の対象から外した。残った9個のクローンの全てが、2. 6kbのPCR増幅断片によって証明されるように少なくとも1つの野生型Polr2a対立遺伝子の存在を示した。しかしながら、4個(F、G、H、およびK)はさらに4. 1kbのバンドを示し、このバンドは2. 6kbのPolr2a断片へのIRES−neoの相同組換えを介した標的化組込み後に生じると予想されたものである。
実験4bおよび4cから分析された17個のクローンのうちの2個には、IRES−neoがPolr2a遺伝子座に組み込まれていた。これらの2個のうちの1個は相同組換えから生じたものであった(図17)。実験4bおよび4cにおいて、15個のクローン(4bおよび4cからのプールした結果)からDNAを調製し、PCRによって分析した。この分析では、2つの独立したPCR増幅反応を行った。最初に、実験4aと同様に、Polr2aでの推定IRES neo組込みに隣接するオリゴヌクレオチド対を使用した。オリゴヌクレオチド配列の一方(QT26)はオリジナルのターゲティングベクターに含まれ、Polr2配列に含まれる他方のオリゴヌクレオチド配列(QT23)はベクターに含まれないものとした。分析された15個全てのクローンにおいて、野生型Polr2a対立遺伝子に由来する対照の2. 6バンドが観察された(図17,パートA)。これらのクローンのうちの2個(2,13)では、さらに大きなバンドが観察された。クローン13のバンドは約4. 1kbであり、相同組換えを介した標的化組込みの後に予想されるものと全く同じであった。クローン2の場合、バンドは6kbより大きかった。従って、クローン2は、Polr2a遺伝子は破壊されているが、1回の相同組換え事象の後に生じたとは思われない。
クローン2には付加的な再編成が関与しているが、クローン13では関与しなかったことを、第2のPCR分析によってさらに証明する。第2のPCR分析(図17,パートB)では、標的化組込みが生じたクローン由来のテンプレートDNAにおいてのみPCR増幅断片が見られるようにオリゴヌクレオチド対を選択した。従って、オリゴヌクレオチドプライマーの一方はIRESそのものの中にあり、他方は、ターゲティングベクターに隣接するがベクター中には含まれないPolr2a配列に対応するものである。IRES−neoが相同組換によって正確に組み込まれた場合、2. 8kbのバンドが予想される。この2. 8kbバンドはクローン13においてはっきりと見ることができる。クローン2では、IRES−neoがPolr2aに組み込まれたことを示す断片が増幅された。しかしながら、この断片はかなり大きかった。この分析から、クローン2では、IRES−neoのPolr2aへの組込みに部分的なDNAのさらなる再編成を伴ったが、クローン13では伴わなかったという追加証拠が得られる。他の13個のどのクローンでも断片は増幅されなかった。これは図17のパートAのデータと一致し、これらのクローンにおけるIRES−neoの組込みが標的化機構ではない機構によって生じたことを示している。
クローン13からのIRES−Polr2a増幅断片(図17,パートB)を配列決定することによって、この断片がPolr2a遺伝子座に由来し、PCRデータの解釈を裏付けるものであることが確かめられた。Polr2a遺伝子座は比較的高い相同組換え頻
度を可能にする唯一のものであると思われない。というのも、胚性幹細胞における約200個の遺伝子座が、転写に関してサイレントでない大部分の遺伝子について同等の組換え率を有することが報告されているからである。
度を可能にする唯一のものであると思われない。というのも、胚性幹細胞における約200個の遺伝子座が、転写に関してサイレントでない大部分の遺伝子について同等の組換え率を有することが報告されているからである。
[実施例V]
このように、体性幹細胞(特に、マウスグリア前駆細胞)での首尾よい相同組換えが実現可能であることが証明された。この技術は、ヒト(Homo sapiens)を含む全ての哺乳動物のグリア幹細胞に容易に一般化され、同様に他のクラスの体性幹細胞にも容易に一般化される。実施例I、II、III、およびIVの結果を考慮して、幹細胞および前駆細胞が高レベルのテロメラーゼ(TERT)を発現し、TERT(染色体の先端部を修復する酵素であり、この酵素がなければ細胞が分裂するごとに先端部が短くなる)を合成し、少なくとも10世代の間、未分化な状態で維持され、他の前駆細胞集団での相同組換えが可能なように、幹細胞を維持および培養する方法が最適化される。この仮説を試験するために、間葉系幹細胞および星状細胞前駆細胞が用いられ、相同組換えがこれらの種類の細胞で可能なことが示される。
このように、体性幹細胞(特に、マウスグリア前駆細胞)での首尾よい相同組換えが実現可能であることが証明された。この技術は、ヒト(Homo sapiens)を含む全ての哺乳動物のグリア幹細胞に容易に一般化され、同様に他のクラスの体性幹細胞にも容易に一般化される。実施例I、II、III、およびIVの結果を考慮して、幹細胞および前駆細胞が高レベルのテロメラーゼ(TERT)を発現し、TERT(染色体の先端部を修復する酵素であり、この酵素がなければ細胞が分裂するごとに先端部が短くなる)を合成し、少なくとも10世代の間、未分化な状態で維持され、他の前駆細胞集団での相同組換えが可能なように、幹細胞を維持および培養する方法が最適化される。この仮説を試験するために、間葉系幹細胞および星状細胞前駆細胞が用いられ、相同組換えがこれらの種類の細胞で可能なことが示される。
[実施例VI]
外来DNAを細胞に挿入し、次いでその外来DNAに基づいて細胞を選択することができる。さらに、外来DNAの挿入は、改変された細胞の特性全体を変えはしない(図9,図10;ウー(Wu)ら「グリアに限定された三分化能細胞株の胚脊髄培養物からの単離」、GLIA 第38巻、p.65−69(2002年))。相同な部位にDNAが挿入された幹細胞または前駆細胞を単離し、選択遺伝子マーカーを用いて選択する。次いで、後の実験のために細胞を使用する。後の実験として、遺伝子産物の置換が異常または欠損を治すような、被検体への幹細胞または前駆細胞の移植が挙げられるが、これに限定されない。このような異常の例として、触媒酵素の消失、増殖因子またはその受容体の濃度の低下、および、あるタンパク質が同タンパク質を通常発現しない細胞において新たに発現することが挙げられる。本発明において、neoは、グリア前駆細胞のPolr2a遺伝子座において発現される。
外来DNAを細胞に挿入し、次いでその外来DNAに基づいて細胞を選択することができる。さらに、外来DNAの挿入は、改変された細胞の特性全体を変えはしない(図9,図10;ウー(Wu)ら「グリアに限定された三分化能細胞株の胚脊髄培養物からの単離」、GLIA 第38巻、p.65−69(2002年))。相同な部位にDNAが挿入された幹細胞または前駆細胞を単離し、選択遺伝子マーカーを用いて選択する。次いで、後の実験のために細胞を使用する。後の実験として、遺伝子産物の置換が異常または欠損を治すような、被検体への幹細胞または前駆細胞の移植が挙げられるが、これに限定されない。このような異常の例として、触媒酵素の消失、増殖因子またはその受容体の濃度の低下、および、あるタンパク質が同タンパク質を通常発現しない細胞において新たに発現することが挙げられる。本発明において、neoは、グリア前駆細胞のPolr2a遺伝子座において発現される。
[実施例VII]
関連した実験では、治療用鎮痛性ペプチドをコードするDNAが、相同組換えによってグリア前駆細胞のRosa遺伝子座に組み込まれる。グリア前駆細胞は、実施例VIのプロトコールに従ってスクリーニングされ、げっ歯類などの被検体の脊椎に移植される。グリア前駆細胞は、組み込まれたタンパク質を分泌し、げっ歯類疼痛モデルにおいて効力が試験される。
関連した実験では、治療用鎮痛性ペプチドをコードするDNAが、相同組換えによってグリア前駆細胞のRosa遺伝子座に組み込まれる。グリア前駆細胞は、実施例VIのプロトコールに従ってスクリーニングされ、げっ歯類などの被検体の脊椎に移植される。グリア前駆細胞は、組み込まれたタンパク質を分泌し、げっ歯類疼痛モデルにおいて効力が試験される。
[実施例VIII]
さらなるサブクローンを開発するために、再度、細胞を遺伝子挿入の標的とすることができる(図11;ウーら「グリアに限定された三分化能細胞株の胚脊髄培養物からの単離」GLIA 第38巻、p.65−69(2002年))。少なくとも1つの外来性配列がグリア前駆細胞ゲノムの選択された部位に配置され、同じ選択された部位が繰り返し標的化されるように、少なくとも1回の相同組換え事象が首尾よく生じた前駆細胞株が作成される。例えば、挿入された遺伝子配列は、再現可能なやり方で第3の遺伝子または第4の遺伝子で置換される。
さらなるサブクローンを開発するために、再度、細胞を遺伝子挿入の標的とすることができる(図11;ウーら「グリアに限定された三分化能細胞株の胚脊髄培養物からの単離」GLIA 第38巻、p.65−69(2002年))。少なくとも1つの外来性配列がグリア前駆細胞ゲノムの選択された部位に配置され、同じ選択された部位が繰り返し標的化されるように、少なくとも1回の相同組換え事象が首尾よく生じた前駆細胞株が作成される。例えば、挿入された遺伝子配列は、再現可能なやり方で第3の遺伝子または第4の遺伝子で置換される。
ある部位が特異的に標的化され、組換えが成功したら、同じ部位を、実質的にさらに高
い効率で再標的化することが可能である。これを実現する方法の1つは、目的の遺伝子座を含むBAC(細菌人工染色体)を(細菌内での相同組換えを用いて)標的部位に別の配列を含むように操作し、次いで、グリア前駆細胞において相同組換えを行うようにしてこれらの新たなBACを使用することによる方法である。もう1つの方法は、組換えがfloxed遺伝子座で高い効率で生じ、既存の遺伝子座を新たなDNAで置換するように、「floxed遺伝子」(Cre/lox系)、およびΦC31/AttP/AttBまたはFlγ/FRTを含む他の系を使用する方法である。標的部位での新たなDNAは、単一部位の突然変異を導入するように働いてもよく、既存のエキソンまたは遺伝子全体に取って代わるように働いてもよい。新たなDNAは既存の配列に取って代わってもよく、既存の配列に加わってもよい。このようなストラテジーの1つの図を図7に示す。数種類のやり方で反復標的化を行うことができ、Floxed部位を用いた一例を示してあることに留意のこと。反復標的化の別の例を図12に示す。ここでは、新たなDNA配列を付加するために1個のflox部位が用いられる。図7および図12に示した技法は同時にまたは別々に使用することができる。
い効率で再標的化することが可能である。これを実現する方法の1つは、目的の遺伝子座を含むBAC(細菌人工染色体)を(細菌内での相同組換えを用いて)標的部位に別の配列を含むように操作し、次いで、グリア前駆細胞において相同組換えを行うようにしてこれらの新たなBACを使用することによる方法である。もう1つの方法は、組換えがfloxed遺伝子座で高い効率で生じ、既存の遺伝子座を新たなDNAで置換するように、「floxed遺伝子」(Cre/lox系)、およびΦC31/AttP/AttBまたはFlγ/FRTを含む他の系を使用する方法である。標的部位での新たなDNAは、単一部位の突然変異を導入するように働いてもよく、既存のエキソンまたは遺伝子全体に取って代わるように働いてもよい。新たなDNAは既存の配列に取って代わってもよく、既存の配列に加わってもよい。このようなストラテジーの1つの図を図7に示す。数種類のやり方で反復標的化を行うことができ、Floxed部位を用いた一例を示してあることに留意のこと。反復標的化の別の例を図12に示す。ここでは、新たなDNA配列を付加するために1個のflox部位が用いられる。図7および図12に示した技法は同時にまたは別々に使用することができる。
図4は、内在性プロモーターから転写物を直接発現させるためにIRESを含むベクターを使用する例を示す。
[実施例IX]
相同組換えがグリア前駆細胞で行われ、in vivoでの増殖因子送達の効力を評価し、遺伝子発現を直接比較するために様々な候補増殖因子を発現する複数の細胞クローンが得られる。従って、グリア前駆細胞は、遺伝子によって発現される発現タンパク質の送達ビヒクルとして働く。このプロセスは、間葉系幹細胞および星状細胞前駆細胞でも再現される。
相同組換えがグリア前駆細胞で行われ、in vivoでの増殖因子送達の効力を評価し、遺伝子発現を直接比較するために様々な候補増殖因子を発現する複数の細胞クローンが得られる。従って、グリア前駆細胞は、遺伝子によって発現される発現タンパク質の送達ビヒクルとして働く。このプロセスは、間葉系幹細胞および星状細胞前駆細胞でも再現される。
候補因子として、グリア前駆細胞の分裂および分化を誘導し、従って、MS、ALS、および白質萎縮を含むグリア消失疾患を治療する可能性のある増殖因子であるPDGFが挙げられる。このような因子として、GDNF、グルタミン酸トランスポーター、および白質萎縮またはリソソーム蓄積症に関与する酵素も挙げられる。別のクラスの治療用候補因子は、グリア細胞によって生産される治療用因子の分泌を増大させる。このような分子として、ドミナントネガティブ型マンノース−6−リン酸受容体が挙げられる。ドミナントネガティブ型マンノース−6−リン酸受容体は、多数の様々なリソソームプロ酵素の分泌を誘導することによって、いくつかの異なるリソソーム蓄積症の治療に有用な細胞を生じることができる。
グリア前駆細胞に血小板由来増殖因子(「PDGF」)をコードする遺伝子を組み込み、この細胞を被検体の脳または脊髄に導入する。導入された細胞は、グリア前駆細胞の増殖およびオリゴデンドロサイトへの分化を促進するPDGFを発現する。例えば、米国特許第4,889,919号、米国特許第4,845,075号、米国特許第4,766,073号、米国特許第4,801,542号、米国特許第4,350,687号、米国特許第5,096,825号、米国特許第5,439,818号、米国特許第5,229,500号、米国特許第6,077,829号、米国特許第5,438,121号、米国特許第5,180,820号、米国特許第6,221,376号、米国特許第6,093,802号、米国特許第6,362,319号、および米国特許第4,997,929号を参照のこと。これらの各内容は本明細書に参考として援用される。
グリア前駆細胞に、上皮増殖因子(「EGF」)をコードする遺伝子を組み込み、この細胞を被検体の脳に導入する。導入された細胞は、神経幹細胞を増殖状態に維持するEGFを発現する。
グリア前駆細胞に、脳由来神経栄養因子(「BDNF」)をコードする遺伝子を組み込み、この細胞を被検体の脳に導入する。導入された細胞は、脳室下領域でのニューロン前駆細胞の生存および分化を促進するBDNFを発現する。これは、ハンチントン舞踏病の治療における可能性のある役割を意味している。
グリア前駆細胞に、毛様体神経栄養因子(「CNTF」)をコードする遺伝子を組み込み、この細胞を被検体の脳に導入する。導入された細胞はCNTFを発現する。
グリア前駆細胞に、トリペプチジルアミノペプチダーゼ−1(TPP−1)などのリソソーム酵素をコードするcDNAを組み込む。導入された細胞は、LINCL/バッテン病の多くの型の治療に有益なTPP−1を過剰発現および分泌する。
グリア前駆細胞に、トリペプチジルアミノペプチダーゼ−1(TPP−1)などのリソソーム酵素をコードするcDNAを組み込む。導入された細胞は、LINCL/バッテン病の多くの型の治療に有益なTPP−1を過剰発現および分泌する。
グリア前駆細胞に、可溶性細胞質外型のマンノース−6−リン酸受容体をコードするcDNAを組み込む。導入された細胞は、多数の様々なリソソームプロ酵素を高レベルで分泌し、様々なリソソーム病に関連した神経系欠陥を治療するのに有用な可能性がある。
[実施例X]
相同組換えがグリア前駆細胞の第1の遺伝子座で行われ、次いで、得られたクローンは、第1の組換え事象によって導入された変化を第2の対立遺伝子において繰り返す第2の組換え事象について再選択される。このようなホモ接合性変異細胞は、高濃度の選択剤を用いて再選択するか、または同じ細胞株において第1の組換えプロセスと同様に第2の組換えプロセスを試みることによって得ることができる。
相同組換えがグリア前駆細胞の第1の遺伝子座で行われ、次いで、得られたクローンは、第1の組換え事象によって導入された変化を第2の対立遺伝子において繰り返す第2の組換え事象について再選択される。このようなホモ接合性変異細胞は、高濃度の選択剤を用いて再選択するか、または同じ細胞株において第1の組換えプロセスと同様に第2の組換えプロセスを試みることによって得ることができる。
培養細胞での相同組換えは、一般的に、目的の遺伝子座の一方の対立遺伝子を標的とする。この遺伝子座でホモ接合性の細胞株を得るために、2つのストラテジーのうち1つを試みることができる。ホモ接合体を得るために高濃度の選択剤での増殖が用いられてもよいし、その部位が前記のように第2の組換え事象において再度標的化されてもよい。
様々な例示的な実施態様および実施例を用いて説明してきたが、本発明は必ずしもこのように限定されるとは限らない。
Claims (45)
- 体性幹細胞または前駆細胞において相同組換えを得る方法であって、
幹細胞または前駆細胞を培養において増殖させる工程;
目的の遺伝子をコードする核酸を、体性幹細胞または前駆細胞に挿入する工程;
相同組換えを起こして、相同組換えされた幹細胞または前駆細胞を得る工程;および
挿入された核酸を有する相同組換えされた体性幹細胞または前駆細胞を選択する工程
を含む方法。 - 目的の少なくとも1つの遺伝子をコードする核酸を挿入するために、未分化なままであり、TERTを発現し、テロメラーゼ活性を維持し、自己複製能を示す体性幹細胞または前駆細胞を同定する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 目的の少なくとも1つの遺伝子によりコードされる産物を産生する相同組換えされた幹細胞または前駆細胞を同定する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 相同組換えされた幹細胞または前駆細胞と、薬学的に許容可能な担体を会合する工程をさらに含む、請求項3に記載の方法。
- 前記相同組換えされた幹細胞または前駆細胞を被検体に導入する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 前記導入する工程がin vitro送達を含む、請求項5に記載の方法。
- 前記導入する工程がin vivo送達を含む、請求項5に記載の方法。
- 目的の少なくとも1つの遺伝子によりコードされる産物を産生することができない被検体を選択する工程をさらに含む、請求項5に記載の方法。
- 産物がタンパク質である、請求項8に記載の方法。
- 目的の少なくとも1つの遺伝子によりコードされる産物を正常レベルで発現することができない被検体を選択する工程をさらに含む、請求項5に記載の方法。
- 相同組換えされた幹細胞または前駆細胞と薬学的に許容可能な担体とを被検体に導入する工程をさらに含む、請求項4に記載の方法。
- 相同組換えされた体性幹細胞または前駆細胞用の選択剤含有増殖培地を含む選択培地を供給する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- グリア前駆細胞、間葉系幹細胞、星状細胞前駆細胞、およびその混合物からなる群から体性幹細胞または前駆細胞を選択する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 体性幹細胞または前駆細胞がグリア前駆細胞である、請求項1に記載の方法。
- 核酸を体性幹細胞または前駆細胞に挿入する工程が、相同組換えを可能にするベクターを使用する工程を含む、請求項1に記載の方法。
- ベクターが、幹細胞または前駆細胞のDNAと相同な領域を含む、請求項15に記載の方法。
- 相同な領域がRosa遺伝子座、RNApolII遺伝子座、およびβ−アクチン遺伝子座からなる群から選択される、請求項16に記載の方法。
- 相同な領域がRNA polr2a遺伝子座に由来する、請求項17に記載の方法。
- エレクトロポレーション、リポフェクション、細胞融合、レトロウイルス感染、カチオン性薬剤導入、CaPO4、トランスフェクション、およびその組み合わせからなる群から選択される方法によって核酸を挿入する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 方法がエレクトロポレーションである、請求項19に記載の方法。
- 体性幹細胞または前駆細胞に核酸を挿入する前に、体性幹細胞または前駆細胞の核酸の遺伝子座にIRESタンパク質を導入する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 核酸の中のプロモーターを同定し、目的の少なくとも1つの遺伝子によりコードされる産物の発現を変えるためにプロモーターを改変する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- プロモーターの少なくとも一部を、目的の少なくとも1つの遺伝子によりコードされる産物の発現をさらに調節することができる産物で置換する工程をさらに含む、請求項22に記載の方法。
- 導入する工程が、相同組換えされた幹細胞または前駆細胞を被検体の脳に導入する工程を含む、請求項5に記載の方法。
- 導入する工程が、相同組換えされた幹細胞または前駆細胞を被検体の脊髄に導入する工程を含む、請求項5に記載の方法。
- 目的の少なくとも1つの遺伝子が少なくとも1つの増殖因子をコードする、請求項1に記載の方法。
- 少なくとも1つの増殖因子が、血小板由来増殖因子、上皮増殖因子、線維芽細胞増殖因子、脳由来神経栄養増殖因子、グリア由来神経栄養因子、および毛様体神経栄養因子からなる群から選択される、請求項26に記載の方法。
- 複数の相同組換えされた幹細胞または前駆細胞を得る工程をさらに含む、請求項5に記載の方法。
- 複数の相同組換えされた幹細胞または前駆細胞を被検体に導入する工程をさらに含む、請求項28に記載の方法。
- in vivoで産物を送達する効力を評価する工程をさらに含む、請求項29に記載の方法。
- 選択された産物を発現することができる目的の遺伝子をコードする、相同組換えされた幹細胞または前駆細胞。
- 相同組換えによって体性幹細胞または前駆細胞に組み込まれた核酸によりコードされる内在性タンパク質を発現することができる、請求項31に記載の相同組換えされた幹細胞
または前駆細胞。 - 体性幹細胞または前駆細胞がグリア前駆細胞、間葉系幹細胞、または星状細胞前駆細胞からなる群から選択される、請求項31に記載の相同組換えされた幹細胞または前駆細胞。
- 体性幹細胞または前駆細胞がグリア前駆細胞である、請求項31に記載の相同組換えされた幹細胞または前駆細胞。
- MHCクラス抗原を発現することができない、請求項31に記載の相同組換えされた幹細胞または前駆細胞。
- 分化することができる、請求項31に記載の相同組換えされた幹細胞または前駆細胞。
- TERTを発現することができる、請求項31に記載の相同組換えされた幹細胞または前駆細胞。
- テロメラーゼ活性を維持することができる、請求項31に記載の相同組換えされた幹細胞または前駆細胞。
- 幹細胞または前駆細胞が自己複製することができる、請求項31に記載の相同組換えされた幹細胞または前駆細胞。
- 医学的処置のために、相同組換えされた幹細胞または前駆細胞を使用する工程を含む、治療方法。
- 相同組換えされた幹細胞または前駆細胞が、相同組換えによって幹細胞または前駆細胞に組み込まれた核酸によりコードされる内在性タンパク質を発現する、請求項40に記載の治療方法。
- 相同組換えされた体性幹細胞または前駆細胞を、相同組換えされたグリア前駆細胞、相同組換えされた星状細胞前駆細胞、および相同組換えされた間葉系幹細胞からなる群から選択する工程をさらに含む、請求項40に記載の治療方法。
- 相同組換えされた体性幹細胞または前駆細胞が相同組換えされたグリア前駆細胞である、請求項42に記載の治療方法。
- 相同組換えされた幹細胞または前駆細胞が、神経疾患または神経変性疾患の治療に用いられるように適合される、請求項40に記載の治療方法。
- 請求項1に記載の方法によって作成された、請求項31に記載の相同組換えされた体性幹細胞または前駆細胞。
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