JP2006516120A - ペプチドデホルミラーゼ阻害剤 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、新規な抗菌化合物の使用、およびこれらの化合物をペプチドデホルミラーゼ阻害剤として含有する医薬組成物に関する。
細菌のイニシエーターであるメチオニルtRNAは、メチオニルtRNAホルミルトランスフェラーゼ(FMT)により修飾されてホルミル−メチオニルtRNAを生成する。ついで、ホルミルメチオニン(f−Met)が新たに合成されたポリペプチドのN−末端に組み込まれる。ついで、ポリペプチドデホルミラーゼ(PDFまたはDef)が一次翻訳産物を脱ホルミル化してN−メチオニルポリペプチドを生成する。大部分の細胞内蛋白はメチオニンアミノペプチダーゼ(MAP)によりさらに処理されて、成熟ペプチドおよび遊離メチオニンを生じ、遊離メチオニンは再利用される。PDFおよびMAPは共に細菌の増殖に不可欠であり、MAP活性にはPDFが必要である。この一連の反応はメチオニンサイクルと称される(図1)。
Rは
C2−6アルキル(アルコキシ、ハロゲンまたはC1−3アルキルスルファニルにより置換されていてもよい);C2−6アルケニル(アルコキシ、ハロゲンまたはC1−3アルキルスルファニルにより置換されていてもよい);C2−6アルキニル(アルコキシ、ハロゲンまたはC1−3アルキルスルファニルにより置換されていてもよい);(CH2)nC3−6炭素環(アルコキシ、ハロゲンまたはC1−3アルキルスルファニルにより置換されていてもよい);および(CH2)n−R2からなる群より選択される;ここでR2はフェニル、フラン、ベンゾフラン、チオフェン、ベンゾチオフェン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ジオキサン、1,4−ベンゾジオキサンまたはベンゾ[1,3]ジオキソールからなる群より選択され、R2はCl、Br、I、C1−3アルキル(1個ないし3個のFで置換されていてもよい)およびC1−2アルコキシ(1個ないし3個のFで置換されていてもよい)より選択される1個またはそれ以上の置換基で置換されていてもよく;
R1はアリールおよびヘテロアリールからなる群より選択され;
YはO、CH2または共有結合であり;および
nは0ないし2の整数である]
で示される化合物あるいはその塩、溶媒和物または生理学的に機能的な誘導体が提供される。
本明細書で用いられる場合、「置換アルケニル」なる語は、所望により、C1−3アルキル(1個ないし3個のFで置換されていてもよい)、アミノ、アリール、シアノおよびハロゲンからなる群より選択される置換基で置換されていてもよい(複数の置換も可能である)少なくとも一つの炭素−炭素二重結合を有する直鎖または分岐鎖の炭化水素基をいう。
本明細書中で使用される「置換アルキニル」なる語は、所望により、C1−3アルキル(1個ないし3個のFで置換されていてもよい)、アミノ、アリールおよびハロゲンからなる群より選択される置換基で置換されていてもよい(複数の置換も可能である)少なくとも一つの炭素−炭素三重結合を有する直鎖または分岐鎖の炭化水素基をいう。
本明細書中で使用される「炭素環」なる語は、3ないし7個の炭素原子を有する非芳香族環状炭化水素基をいう。5−ないし7−員環を有する炭素環の場合、一つの環二重結合が許容される。代表的な「炭素環」基は、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシルおよびシクロヘプチルを包含するが、これに限定されない。
本明細書中で使用される「置換炭素環」なる語は、3ないし7個の炭素原子を有する非芳香族環状炭化水素基をいい、かかる基は、所望により、C1−3アルキル(1個ないし3個のFで所望により置換されていてもよい)、C2−3アルケニル、C2−3アルキニル、C1−2アルコキシ(1個ないし3個のFで所望により置換されていてもよい)、スルファニル、スルフィニル、スルホニル、オキソ、ヒドロキシ、メルカプト、アミノ、グアニジノ、カルボキシ、アミノカルボニル、アリール、アリールオキシ、ヘテロアリール、ヘテロサイクリック、アミノスルホニル、スルホニルアミノ、カルボキシアミド、ニトロ、ウレイド、シアノおよびハロゲンからなる群より選択される置換基で置換されていてもよい(複数の置換も可能である)。5−ないし7−員環を有する炭素環の場合、一つの環二重結合が許容される。
本明細書中で使用される「アラルコキシ」なる語は基−ORaRbをいい、ここでRaは上記したアルキルであり、Rbはアリールである。
本明細書中で使用される「アリールオキシ」なる語は基−ORaをいい、ここでRaは上記したアリールである。
本明細書中で使用される「メルカプト」なる語は基−SHをいう。
本明細書中で使用される「スルファニル」なる語は基−SRaをいい、ここでRaは上記した置換アルキル、置換炭素環、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロサイクリックである。
本明細書中で使用される「スルホニル」なる語は基−S(O)2Raをいい、ここでRaは上記した置換アルキル、置換炭素環、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロサイクリックである。
本明細書中で使用される「オキソ」なる語は基=Oをいう。
本明細書中で使用される「ヒドロキシ」なる語は基−OHをいう。
本明細書中で使用される「アミノ」なる語は基−NH2をいう。アミノ基は、所望により、上記した置換アルキル、置換炭素環、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロサイクリックで置換されていてもよい。
本明細書中で使用される「シアノ」なる語は基−CNをいう。
本明細書中で使用される「スルホニルアミノ」なる語は基−NHS(O)2Raをいい、ここでRaは上記した置換アルキル、置換炭素環、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロサイクリックである。
本明細書中で使用される「カルボキシアミド」なる語は基−NHC(O)Raをいい、ここでRaは上記した置換アルキル、置換炭素環、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロサイクリックである。
本明細書中で使用される「カルボキシ」なる語は基−C(O)OHをいう。カルボキシ基は、所望により、上記した置換アルキル、置換炭素環、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロサイクリックで置換されていてもよい。
本明細書中で使用される「アミノカルボニル」なる語は基−C(O)NH2をいう。アミノカルボニル基は、所望により、上記した置換アルキル、置換炭素環、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロサイクリックで置換されていてもよい。
本明細書中で使用される「グアニジノ」なる語は基−NHC(=NH)NH2をいう。
本明細書中で使用される「アシル」なる語は基−C(O)Raをいい、ここでRaは上記したアルキル、炭素環またはヘテロサイクリックである。
本明細書中で使用される「アロイル」なる語は基−C(O)Raをいい、ここでRaは上記したアリールである。
本明細書中で使用される「ヘテロアロイル」なる語は基−C(O)Raをいい、ここでRaは上記したヘテロアリールである。
本明細書中で使用される「アシルオキシ」なる語は基−OC(O)Raをいい、ここでRaは上記したアルキル、炭素環またはヘテロサイクリックである。
本明細書中で使用される「アロイルオキシ」なる語は基−OC(O)Raをいい、ここでRaは上記したアリールである。
本明細書中で使用される「ヘテロアロイルオキシ」なる語は基−OC(O)Raをいい、ここでRaは上記したヘテロアリールである。
キノリン−8−カルボン酸((R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
1,2,3,4−テトラヒドロ−キノリン−8−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
キノリン−6−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
1,2,3,4−テトラヒドロ−キノリン−6−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイル]アミノ}−メチル)−アミド、
5−メトキシ−ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
3,4−ジヒドロ−2H−ベンゾ[b][1,4]ジオキセピン−7−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
5−トリフルオロメチル−フラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
3,4−ジフルオロ−N−({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−ベンズアミド、
[1,8]ナフチリジン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
3−メチル−ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
ベンゾ[1,3]ジオキソール−5−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド、
ベンゾフラン−2−カルボン酸{[(R)−2−シクロペンチルメチル−3−(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−プロパノイルアミノ]−メチル}−アミド、
ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−7,7,7−トリフルオロ−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
からなる群より選択される。
本発明の化合物およびその製法は以下の合成スキームとの関連でより理解されるであろう。この合成スキームは本発明の化合物を調製することのできる単なる例示であり、添付した特許請求の範囲を限定することを意図とするものではない。
また、スキーム2の(17)またはスキーム3の(25)などの中間体(8)のエナンチオマーは、適当な酸塩化物(9)を、キラル剤、例えばエバンス(Evans)キラルオキサゾリジノンと、塩基、例えばn−ブチルリチウムの存在下で反応させてスキーム2のキラル中間体(10)またはスキーム3の(18)を得ることにより調製することができる。化合物(10)または(18)を、塩基、例えばジイソプロピルエチルアミンと、キレート化剤、例えば四塩化チタンの存在下、テトラヒドロフランなどの溶媒中にて反応させ、つづいてベンジルオキシメチルクロリドなどの求電子物質を添加し、キラル補助基の選択に応じて、2つのキラル化合物(11)または(19)のいずれかを得る。
以下の実施例を用いて本発明を説明する。かかる実施例は単なる例示であり、本発明の範囲を限定するものとして解釈されるものではない。
これらの工程、スキームおよび実施例にて使用される符号および取り決めは、最新の科学文献、例えば、the Journal of the American Chemical Society またはthe Journal of Biological Chemistryに使用されるものと矛盾するものではない。標準的な一文字または三文字標記は一般にアミノ酸残基を指定するのに用いられ、特記しない限り、L−配置であると仮定される。特記しない限り、すべての出発物質は市販源より入手可能であり、さらに精製することなく用いた。
MeOH(メタノール);i−PrOH(イソプロパノール);EtOH(エタノール);
TEA(トリエチルアミン);TFA(トリフルオロ酢酸);THF(テトラヒドロフラン);DMSO(ジメチルスルホキシド);AcOEtまたはEtOAc(酢酸エチル);
DCM(ジクロロメタン);DMF(N,N−ジメチルホルムアミド);CDI(1,1−カルボニルジイミダゾール);HOAc(酢酸);HOSu(N−ヒドロキシスクシンイミド);Ac(アセチル);HOBT(1−ヒドロキシベンゾトリアゾール);BOC(tert−ブチルオキシカルボニル);mCPBA(メタ−クロロ過安息香酸);FMOC(9−フルオレニルメトキシカルボニル);DCC(ジシクロヘキシルカルボジイミド);CBZ(ベンジルオキシカルボニル);NMM(N−メチルモルホリン);HOAt(1−ヒドロキシ−7−アザベンゾトリアゾール);DMAP(4−ジメチルアミノピリジン);Bn(ベンジル);TBAF(テトラ−n−ブチルアンモニウムフルオリド);HPLC(高圧液体クロマトグラフィー);BOP(ビス(2−オキソ−3−オキサゾリジニル)ホスフィニッククロリド);EDCI(1−エチル−3−[3−ジメチルアミノプロピル]カルボジイミド塩酸塩);
HBTU(O−ベンゾトリアゾール−1−イル−N,N,N',N'−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート);PIFA([ビス(トリフルオロアセトキシ)ヨード]−ベンゼン)
1H NMR(以下、「NMR」ともいう)スペクトルは、Varian VXR-300、Varian Unity-300、Varian Unity-400装置、Brucker AVANCE-400、General Electric QE-300またはBruker AM400スペクトロメーターに記録した。化学シフトは百万分の部分で表す(ppm、δユニット)。カップリング定数はヘルツの単位(Hz)である。スプリッティングパターンは見かけの多重度を記載し、s(一重線)、d(二重線)、t(三重線)、q(四重線)、quint(五重線)、m(多重線)、br(ブロード)として表される。
分取性(prep)HPLC;約50mgの最終生成物を50x20mmのI.D.のYMC CombiPrepODS−Aカラム上の500μLのDMSOに、20mL/分で、10%CH3CN(0.1%TFA)/H2O(0.1%TFA)から90%CH3CN(0.1%TFA)/H2O(0.1%TFA)の10分間の勾配で注入し、2分間保留した。フラッシュクロマトグラフィーをメルクシリカゲル60(230−400メッシュ)で行った。
赤外線(IR)スペクトルを1mmNaClセルを用いるニコレット510FT−IRスペクトロメーターで得た。反応の大部分を0.25mmのイー・メルクシリカゲルプレート(60F−254)の薄層クロマトグラフィーでモノターし、UV光、5%エタノール性リンモリブデン酸またはp−アニスアルデヒド溶液で可視化させた。
実施例2ないし32に開示されている化合物は実施例1に記載の一般的操作に従って調製された。実施例34ないし47に開示の化合物は実施例33に記載されている一般的操作に従って調製された。
(4S)−ベンジル−3−ヘプタノイル−オキサゾリジン−2−オン
(S)−(−)−4−ベンジル−2−オキサゾリジノン(3.3g、18.6ミリモル)の−78℃でのTHF(50mL)中溶液に、n−BuLi(7.4mL、ヘキサン中2.5M溶液、18.6ミリモル)を滴下した。同温度で30分間攪拌した後、反応混合物を塩化ヘプタノイル(2.76g、18.6ミリモル)で処理した。その反応混合物を攪拌し、放置して5時間にわたって10℃にまで加温し、ついで飽和水性NH4Cl溶液(100mL)でクエンチした。水層をEtOAc(100mLx2)で抽出した。合した有機層をブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥させた。減圧下で溶媒を除去し、標記化合物を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.37−7.22(m,5H)、4.69(m,1H)、4.19(m,2H)、3.31(dd,J=13.4、3.3Hz,1H)、2.95(m,2H)、2.79(dd,J=13.4、9.7Hz,1H)、1.71(m,2H)、1.42−1.32(m,6H)、0.92(t,J=6.8Hz,3H)。MH+ 290。
(4S)−ベンジル−3−[(2R)−ベンジルオキシメチルヘプタノイル]オキサゾリジン−2−オン
(S)−4−ベンジル−3−ヘプタノイルオキサゾリジン−2−オン(4.63g、16.02ミリモル)および塩化チタン(IV)(1.9mL、16.82ミリモル)の0℃でのジクロロメタン(55mL)中溶液に、ジイソプロピルエチルアミン(3.1mL、17.62ミリモル)を滴下した。0℃で1時間攪拌した後、得られたチタンエノラートをベンジルクロロメチルエーテル(TCI−アメリカ、4.9mL、32.04ミリモル)と0℃にて6時間反応させた。ついで、反応混合物を水(100mL)でクエンチした。水層をジクロロメタン(100mLx2)で抽出した。有機抽出液をブラインで洗浄してMgSO4上で乾燥させた。減圧下で溶媒を除去した後、ヘキサン/EtOAc(5:1)の溶出系を用いるフラッシュクロマトグラフィーに付して精製して標記化合物を得た。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.38−7.21(m,10H)、4.74(m,1H)、4.57(m,2H)、4.28−4.13(m,3H)、3.82(t,J=8.7Hz,1H)、3.68(dd,J=9.0、4.9Hz,1H)、3.25(dd,J=13.5、3.1Hz,1H)、2.71(dd,J=13.5、9.3Hz,1H)、1.74(m,1H)、1.54(m,1H)、1.31−1.28(m,6H)、0.89(t,J=6.7Hz,3H)。MH+ 410。
(3R)−ベンジルオキシ−2−ペンチルプロピオン酸
(S)−4−ベンジル−3−[(R)−2−ベンジルオキシメチルヘプタノイル]オキサゾリジン−2−オン(2.0g、4.89ミリモル)のTHFおよびH2Oの3:1混合液中0.05M溶液を0℃にて30%H2O2(4.5mL、39.12ミリモル)で、つづいてLiOH(0.48g、9.78ミリモル)で処理した。得られた混合物を攪拌し、放置して一夜室温にまで加温した。ついで、減圧下にてTHFを除去した。残渣をジクロロメタン(50mLx2)で洗浄し、(S)−4−ベンジルオキサゾリジン−2−オンを除去した。所望の生成物を酸性化された(pH1〜2)水層をEtOAcで抽出することで単離した。さらなる精製は不要であった。高真空下で放置して標記化合物を得た。1H NMR(400MHz、CHCl3)δ11.1(brs,1H)、7.36(m,5H)、4.57(s,2H)、3.69(m,1H)、3.58(dd,J=9.2、5.2Hz,1H)、2.74(m,1H)、1.66(m,1H)、1.54(m,1H)、1.34−1.30(m,6H)、0.90(t,J=6.7Hz,3H)。MH+ 251。
3−ヒドロキシ−(2R)−ペンチルプロピオン酸
(R)−3−ベンジルオキシ−2−ペンチル−プロピオン酸(1.54g、6.16ミリモル)のEtOH(100mL)中溶液に、10%Pd/C(310mg)を添加した。反応混合物を室温にて一夜にわたって水素添加に付した。反応完了後、反応混合物をセライト床を介して濾過し、EtOH(50mLx3)で洗浄した。溶媒を除去して標記化合物を得た。さらに精製する必要はなかった。1H NMR(400MHz、CHCl3)δ6.30(brs,1H)、3.81(d,J=5.4Hz,2H)、2.64(m,1H)、1.69(m,1H)、1.56(m,1H)、1.41−1.27(m,6H)、0.91(t,J=7.7Hz,3H)。MH+ 161。
N−ベンジルオキシ−3−ヒドロキシ−(2R)−ペンチルプロピオンアミド
(R)−3−ヒドロキシ−2−ペンチルプロピオン酸(0.92g、5.75ミリモル)、O−ベンジルヒドロキシルアミン塩酸塩(0.92g、5.75ミリモル)および4−(ジメチルアミノ)ピリジン(1.41g、11.50ミリモル)の0℃でのジクロロメタン(25mL)中混合物に、1−[3−(ジメチルアミノ)プロピル]−3−エチルカルボジイミド塩酸塩(1.11g、5.75ミリモル)を添加した。室温で一夜攪拌した後、該反応物を1N水性HCl溶液(25mL)でクエンチし、ジクロロメタン(25mLx2)を用いて抽出した。有機抽出液を水、ブラインで洗浄し、MgSO4上で乾燥させた。減圧下で溶媒を除去して標記化合物を得た。1H NMR(400MHz、CHCl3)δ9.22(brs,1H)、7.41−7.28(m,5H)、4.89(q,J=10.6Hz,2H)、3.70−3.37(m,3H)、2.17(m,1H)、 1.54(brs,1H)、1.27(m,6H)、0.88(t,J=6.9Hz,3H)。MH+ 266。
1−ベンジルオキシ−(3R)−ペンチル−アゼチジン−2−オン
(R)−N−ベンジルオキシ−3−ヒドロキシ−2−ペンチルプロピオンアミド(1.41g、5.32ミリモル)およびトリフェニルホスフィン(1.68g、6.39ミリモル)のTHF(53mL)中混合物に、0℃にてジエチルアゾジカルボキシレート(1.1mL、6.39ミリモル)を滴下した。反応混合物を攪拌し、放置して一夜にて室温にまで加温した。ついで、該反応物を水(50mL)でクエンチした。水層をEtOAc(50mLx2)で抽出した。合した有機層をブラインで洗浄してMgSO4上で乾燥させた。減圧下で溶媒を除去した後、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィー(ヘキサン:EtOAc 5/1)に付して精製し、標記化合物を得た。1H NMR(400MHz、CHCl3)δ 7.35−7.25(m,5H)、4.87(s,2H)、3.28(t,J=4.85Hx、1H)、2.84(q,J=2.35Hz,1H)、2.77(m,1H)、1.62(m,1H)、1.36(m,1H)、1.25−1.16(m,6H)、0.88(t,J=6.9Hz,3H)。MH+ 248。
3−ベンジルオキシアミノ−(2R)−ペンチルプロピオン酸
(R)−1−ベンジルオキシ−3−ペンチルアゼチジン−2−オン(0.96g、3.89ミリモル)のTHF−H2O−MeOH(50mL、3:1:1 v/v)中混合物に、水酸化リチウム・一水和物(1.91g、38.9ミリモル)を添加した。室温で一夜攪拌した後、水(25mL)を該混合物に添加した。3NHCl溶液で該混合物をpH5〜6の酸性にした。それをEtOAc(50mLx2)で抽出した。合した有機層をMgSO4上で乾燥させた。減圧下で溶媒を除去し、標記化合物を得た。1H NMR(400MHz、CHCl3)δ 9.80(brs,1H)、7.37(m,5H)、4.75(m,2H)、3.14(m,2H)、2.74(m,1H)、1.70(m,1H)、1.53(m,1H)、1.38−1.25(m,6H)、0.91(t,J=6.8Hz,3H)。MH+ 266。
(2R)−[(ベンジルオキシホルミルアミノ)メチル]ヘプタン酸
(R)−3−ベンジルオキシアミノ−2−ペンチルプロピオン酸(1.03g、3.89ミリモル)の0℃でのHCO2H(19mL)およびジクロロメタン(19mL)中混合物に、無水酢酸(3.9mL、41.2ミリモル)を添加した。該混合物を0℃で3時間攪拌した。減圧下で蒸発させることで揮発成分を除去した。ジクロロメタン(50mL)を該混合物に添加した。ブライン(50mLx2)で洗浄してMgSO4上で乾燥させた。減圧下で濾過し、蒸発させて標記化合物を得た。1H NMR(400MHz、CHCl3)δ 8.07(brs,1H)、7.29(m,5H)、4.91−4.71(m,2H)、3.76(m,2H)、2.67(m,1H)、 1.54(m,1H)、1.41(m,1H)、1.20(m,6H)、0.80(t,J=7.0Hz,3H)。MH+ 294。
N−カルバモイルメチル−キノリン−8−カルボキシアミド
キノリン−8−カルボン酸(3.45ミリモル)、グリシンアミド塩酸塩(3.45ミリモル)、NMM(41.43ミリモル)およびHOAt(4.14ミリモル)の室温でのDMF(17mL)中混合物に、1−[3−(ジメチルアミノ)プロピル]−3−エチルカルボジイミド塩酸塩(4.14ミリモル)を添加した。室温で一夜攪拌した後、反応混合物をHPLCで精製し、標記化合物を白色固体として得た。MH+ 230。
N−アミノメチル−キノリン−8−カルボキシアミド塩酸塩
PIFA(0.60ミリモル)をアセトニトリル(1.5mL)に溶かした。この溶液に、脱イオン水(1.5mL)を添加した。最後に、N−カルバモイルメチル−キノリン−8−カルボキシアミド(0.60ミリモル)を添加し、反応混合物を室温で一夜攪拌した。その反応混合物を1N HCl(15mL)で希釈し、エーテル(20mLx2)で2回洗浄した。水層を減圧下で濃縮した。得られた残渣(白色固体)を次工程に直接使用した。
キノリン−8−カルボン酸((R)−2−[(ホルミル−ベンジルオキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
(R)−2−[(ベンジルオキシホルミル−アミノ)メチル]ヘプタン酸(0.535ミリモル)、N−アミノメチル−キノリン−8−カルボキシアミド塩酸塩(0.535ミリモル)、NMM(5.35ミリモル)およびHOAt(0.642ミリモル)の室温でのDMF(6mL)中混合物に、1−[3−(ジメチルアミノ)−プロピル]−3−エチルカルボジイミド塩酸塩(0.642ミリモル)を添加した。室温で一夜攪拌した後、該反応混合物をHPLCで精製して標記化合物を白色固体として得た。MH+ 477。
キノリン−8−カルボン酸((R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
キノリン−8−カルボン酸((R)−2−[(ホルミル−ベンジルオキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド(0.260ミリモル)のEtOH(10mL)中溶液に、10%Pd/C(22mg)を加えた。反応混合物を室温にて一夜水素添加に付した。ついで反応混合物をセライト床を介して濾過し、EtOH(10mLx2)で洗浄した。溶媒を除去して粗生成物を得、それをさらにHPLCにより精製し、標記化合物を得た。1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 9.03(d,1H,J=4.2Hz)、8.70(d,1H,J=7.3Hz)、8.48(d,1H,J=8.2Hz)、8.16(d,1H,J=8.2Hz)、7.88(s,1H)、7.74(t,1H,J=7.7Hz)、7.64(dd,1H,J=8.2、4.2Hz)、4.99(ab quart,2H)、3.80−3.33(m,2H)、2.85(m,1H)、1.55(m,1H)、1.45(m,1H)、1.30−1.10(m,6H)、0.64(t,3H,J=7.2Hz)。MH+ 387。
1,2,3,4−テトラヒドロ−キノリン−8−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
分取HPLCでの精製に付して標記化合物を得た。1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.89(s,1H)、7.26(d,1H,J=8.0Hz)、6.98(d,1H,J=7.1Hz)、6.44(t,1H,J=7.44Hz)、4.70(ab quart,2H)、3.80−3.35(m,2H)、3.35(m,2H)、2.82(m,1H)、2.77(t,2H,J=6.33Hz)、1.88(m,2H)、1.60−1.21(m,8H)、0.85(t,3H)。MH+ 391。
ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
分取HPLCでの精製に付して標記化合物を得た。1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.89(s,1H)、7.74(d,1H,J=7.8Hz)、7.60(d,1H,J=8.4Hz)、7.54(s,1H)、7.48(t,1H)、7.34(t,1H)、4.79(ab quart,2H)、3.89−3.40(m,2H)、2.86(m,1H)、1.50(m,1H)、1.35(m,1H)、1.30(m,6H)、0.78(t,3H)。MH+ 376。
キノリン−6−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 8.95(d,1H,J=2.9Hz)、8.50(m,1H)、8.19(dd,1H,J=8.9、2.0Hz)、8.11(d,1H,J=8.9Hz)、7.91(s,1H)、7.64(dd,1H,J=8.3、4.2Hz)、4.83(ab quart,2H)、3.87−3.30(m,2H)、2.89(m,1H)、1.57(m,1H)、1.45(m,1H)、1.31−1.23(m,6H)、0.80(t,3H,J=6.8Hz)。MH+ 387。
1,2,3,4−テトラヒドロ−キノリン−6−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
MH+ 391。
2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイル]アミノ}−メチル)−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.88(s,1H)、7.36(m,2H)、6.89(d,1H,J=8.4Hz)、4.73(ab quart,2H,J=10.8、3.7Hz)、4.28(m,4H)、3.80−3.41(m,2H)、2.82(m,1H)、1.54(m,1H)、1.44(m,1H)、1.24(m,6H)、0.85(brt,3H)。MH+ 394。
7−メトキシ−ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.89(s,1H)、7.51(s,1H)、7.27(m,2H)、7.03(d,1H,J=7.5Hz)、4.78(ab quart,2H)、4.01(s,3H)、3.75(m,2H)、2.85(m,1H)、1.55(m,1H)、1.44(m,1H)、1.27(m,6H)、0.77(t,3H,J=6.2Hz). MH+ 406。
5−メトキシ−ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.89(s,1H)、7.49(d,1H,J=2.2Hz)、7.48(s,1H)、7.22(d,1H,J=2.5Hz)、7.07(dd,1H,J=9.2、2.6Hz)、4.81(ab quart,2H)、3.85(s,3H)、3.71(m,2H)、2.84(m,1H)、1.55(m,1H)、1.44(m,1H)、1.28(m,6H)、0.79(t,3H,J=7.0Hz)。MH+ 406。
3,4−ジヒドロ−2H−ベンゾ[b][1,4]ジオキセピン−7−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.88(s,1H)、7.46(s,1H)、7.43(d,1H,J=8.3Hz)、7.00(d,1H,J=8.3Hz)、4.73(ab quart,2H)、4.24(m,4H)、3.75(m,2H)、2.83(m,1H)、2.21(t,2H)、1.55(m,1H)、1.45(m,1H)、1.27(m,6H)、0.84(brt,3H)。MH+ 408。
5−トリフルオロメチル−フラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.87(s,1H)、7.26(d,1H,J=3.8Hz)、7.16(d,1H,J=3.8Hz)、4.75(m,2H)、3.76(m,2H)、2.84(m,1H)、1.55(m,1H)、1.44(m,1H)、1.27(m,6H)、0.84(t,3H,J=6.5Hz)。MH+ 394。
3,4−ジフルオロ−N−({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−ベンズアミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.87(s,1H)、7.81(m,1H)、7.79(m,1H)、7.41(m,1H)、4.74(ab quart,2H)、3.77(m,2H)、2.85(m,1H)、1.55(m,1H)、1.44(m,1H)、1.28(m,6H)、0.84(t,3H,J=6.8Hz)。MH+ 372。
2,3−ジフルオロ−N−({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−ベンズアミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.88(s,1H)、7.48(m,2H)、7.27(m,1H)、4.75(ab quart,2H)、3.75(m,2H)、2.86(m,1H)、1.55(m,1H)、1.44(m,1H)、1.26(m,6H)、0.87(t,3H,J=6.5Hz)。MH+ 372。
[1,8]ナフチリジン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 9.18(brs,1H)、8.64(d,1H,J=8.3Hz)、8.57(d,1H,J=8.0Hz)、8.37(d,1H、J= 8.3Hz)、7.77(m,1H)、4.85(ab quart,2H)、3.76(m,2H)、2.84(m,1H)、1.55(m,1H)、1.45(m,1H)、1.25(m,6H)、0.73(t,3H,J=6.9Hz)。MH+ 388。
3−メチル−ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.89(s,1H)、7.67(t,1H,J=7.5Hz)、7.52(d,1H,J=7.8Hz)、7.46(brs,1H,J=7.2Hz)、7.32(brs,1H,J=7.2Hz)、4.78(ab quart,2H)、3.70(m,2H)、2.85(m,1H)、2.59(s,3H)、1.55(m,1H)、1.46(m,1H)、1.26(m,6H)、0.76(brt,3H)。MH+ 390。
ベンゾ[1,3]ジオキソール−5−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.88(s,1H)、7.44(d,1H,J=8.2Hz)、7.32(s,1H)、6.89(d,1H,J=8.2Hz)、6.05(s,2H)、4.73(ab quart,2H)、3.76(m,2H)、2.85(m,1H)、1.55(m,1H)、1.46(m,1H)、1.27(m,6H)、0.86(t,3H,J=6.4Hz)。MH+ 380。
ベンゾフラン−2−カルボン酸{[(R)−2−シクロペンチルメチル−3−(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−プロパノイルアミノ]−メチル}−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.88(s,1H)、7.74(d,1H,J=7.8Hz)、7.60(d,1H,J=8.4Hz)、7.54(s,1H)、7.48(t,1H,J=7.5Hz)、7.34(t,1H,J=7.5Hz)、4.79(ab quart,2H)、3.89(m,2H)、2.86(m,1H)、1.85−1.37(m,11H)、0.78(m,3H)。MH+ 388。
ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−7,7,7−トリフルオロ−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1H NMR(400MHz、CD3OD)δ 7.88(s,1H)、7.74(d,1H,J=7.8Hz)、7.60(d,1H,J=8.4Hz)、7.54(s,1H)、7.48(t,1H,J=7.5Hz)、7.34(t,1H,J=7.5Hz)、4.79(ab quart,2H)、3.88(m,2H)、2.78(m,1H)、1.95(m,2H)、1.50−1.21(m,6H)。MH+ 430。
式(1)で示される化合物およびその医薬上許容される塩は、抗生物質に関する標準的な方法で、例えば、経口投与、非経口投与、舌下投与、皮膚から、経皮的に、直腸から、吸入によりあるいは頬側から投与することができる。
経口投与された場合に活性である、式(1)で示される化合物およびその医薬上許容される塩は、シロップ、錠剤、カプセル、クリームおよびロゼンジとして処方することができる。一般には、シロップ処方は、フレーバーまたは着色剤を含有する、液体担体、例えば、エタノール、ピーナッツ油、オリーブ油、グリセリンまたは水中の化合物または塩の溶液からなるであろう。組成物が錠剤形態である場合、固体処方の調製に常用されるいずれの医薬担体を用いてもよい。かかる担体の例としては、ステアリン酸マグネシウム、白土、タルク、ゼラチン、アカシア、ステアリン酸、デンプン、ラクトースおよびシュークロースが挙げられる。組成物がカプセル形態である場合、いずれの慣用的なカプセル化法も適しており、例えば、上記担体をハードゼラチンカプセル殻中に用いる。組成物がソフトゼラチン殻カプセル形態である場合、分散液または懸濁液を調製するために常用されるいずれの医薬担体、例えば、水性ガム、セルロース、シリケートまたは油が考えられ、ソフトゼラチンカプセル殻中に含まれる。
典型的な吸入用組成物は、慣用的な噴射剤、例えば、ジクロロジフルオロメタンまたはトリクロロフルオロメタンを用いて、乾燥粉末として、またはエアロゾルの形態にて投与することができる溶液、懸濁液またはエマルジョンの形態である。
典型的な坐薬処方は、結合剤および/または滑沢剤、例えば、高分子グリコール、ゼラチン、カカオ脂または他の低融点植物性ワックスあるいは油脂またはその合成アナログと一緒に、このようにして投与された場合に活性である、式(1)で示される化合物またはその医薬上許容される塩を含む。
好ましくは、組成物は、患者が単回用量にて投与することができるように、単位投与形態、例えば、錠剤、カプセルまたは計量エアロゾルである。
経口投与用の各々の単位投与量は、適当には、0.1mg〜500mg/kg、好ましくは1mg〜100mg/kgを含有し、非経口投与用の各々の単位投与量は、適当には、0.1mg〜100mg/kgの式(1)で示される化合物または遊離酸として計算したその医薬上許容される塩を含有する。鼻腔内投与用の各々の単位投与量は、適当には、1人あたり1〜400mg、好ましくは10〜200mgを含有する。局所処方は、適当には、0.01〜5.0%の式(1)で示される化合物を含有する。
本発明の化合物を本発明に従って投与する場合、許容されない毒物学的効果は予想されない。
生物学的アッセイ:
Lazennec&Meinnelにより開発された連続酵素結合アッセイ(「Formate dehydrogenase-coupled spectrophotometric assay of peptide deformylase」、Anal. Biochem. 1997、244、pp.180-182)を少し変形して用いてエス・アウレウス(S. aureus)またはイー・コリ(E. coli)のPDF活性を25℃で測定する。反応混合物は50μl中に50mMのリン酸カリウムバッファー(pH7.6)、15mMのNAD、0.25Uのギ酸デヒドロゲナーゼを含む。基質ペプチド、f−Met−Ala−SerがKM濃度にて含まれる。10nMのDef1酵素を添加して反応を作動させ、340nmの吸光度を20分間モニターする。
National Committee for Clinical Laboratory Standards(NCCLS)が推奨する方法、Document M7-A4, 「Methods for Dilution Susceptibility Tests for Bacteria that Grow Aerobically」(出典明示により本明細書の一部とする)を用いるブロスのマイクロダイリューション(microdilution)により全−細胞抗微生物活性を測定した。化合物を0.06から64mcg/mlの範囲で2倍連続希釈して試験した。アッセイにおいて12株のパネルを評価した。このパネルは下記の研究室株からなっていた:Staphylococcus aureus Oxford、Staphylococcus aureus WCUH29、Enterococcus faecalis I、Enterococcus faecalis 7、Haemophilus influenzae Q1、Haemophilus influenzae NEMC1、Moraxella catarrhalis 1502、Streptococcus pneumoniae 1629、Streptococcus pneumoniae N1387、Streptococcus pneumoniae N1387、E. coli 7623(AcrABEFD+)およびE. coli 120(AcrAB-)。肉眼で見た場合に増殖を抑制した化合物の最小濃度として最小阻害濃度(MIC)を決定した。ミラーリーダー(mirror reader)を用いてMIC終点の決定をアシストした。
上記記載は、その好ましい実施形態を含め、本発明を完全に開示する。本明細書に特記される実施形態の修飾および改善は、特許請求の範囲内に含まれる。当業者は、さらに工夫することなく、上記記載を用いて、本発明を最大限利用することができる。したがって、本明細書の実施例は、単なる説明として解釈されるべきであり、いかなる点においても本発明の範囲を限定するものではない。排他的権利または特権を請求する本発明の実施態様を以下に限定する。
Claims (4)
- 式(1):
[式中:
Rは
C2−6アルキル(アルコキシ、ハロゲンまたはC1−3アルキルスルファニルにより置換されていてもよい);C2−6アルケニル(アルコキシ、ハロゲンまたはC1−3アルキルスルファニルにより置換されていてもよい);C2−6アルキニル(アルコキシ、ハロゲンまたはC1−3アルキルスルファニルにより置換されていてもよい);(CH2)nC3−6炭素環(アルコキシ、ハロゲンまたはC1−3アルキルスルファニルにより置換されていてもよい);および(CH2)n−R2からなる群より選択される;ここでR2はフェニル、フラン、ベンゾフラン、チオフェン、ベンゾチオフェン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ジオキサン、1,4−ベンゾジオキサンまたはベンゾ[1,3]ジオキソールからなる群より選択され、R2はCl、Br、I、C1−3アルキル(1個ないし3個のFで置換されていてもよい)およびC1−2アルコキシ(1個ないし3個のFで置換されていてもよい)より選択される1個またはそれ以上の置換基で置換されていてもよく;
R1はアリールおよびヘテロアリールからなる群より選択され;
YはO、CH2または共有結合であり;および
nは0ないし2の整数である]
で示される化合物あるいはその塩、溶媒和物または生理学的に機能的な誘導体。 - キノリン−8−カルボン酸((R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1,2,3,4−テトラヒドロ−キノリン−8−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
キノリン−6−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
1,2,3,4−テトラヒドロ−キノリン−6−カルボン酸 ({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
2,3−ジヒドロ−ベンゾ[1,4]ジオキシン−6−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイル]アミノ}−メチル)−アミド
7−メトキシ−ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
5−メトキシ−ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
3,4−ジヒドロ−2H−ベンゾ[b][1,4]ジオキセピン−7−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
5−トリフルオロメチル−フラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
3,4−ジフルオロ−N−({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−ベンズアミド
2,3−ジフルオロ−N−({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−ベンズアミド
[1,8]ナフチリジン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
3−メチル−ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
ベンゾ[1,3]ジオキソール−5−カルボン酸({(R)−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
ベンゾフラン−2−カルボン酸{[(R)−2−シクロペンチルメチル−3−(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−プロパノイルアミノ]−メチル}−アミド
ベンゾフラン−2−カルボン酸({(R)−7,7,7−トリフルオロ−2−[(ホルミル−ヒドロキシ−アミノ)−メチル]−ヘプタノイルアミノ}−メチル)−アミド
からなる群より選択される請求項3記載の化合物。 - 細菌感染の治療法であって、その治療を必要とする対象に請求項1に記載の化合物を投与することを含む方法。
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