JP2006087442A - 質の保証された生物学的サンプルおよびこのサンプルを含む組成物を生成するための方法 - Google Patents

Abstract

【課題】微生物の充填に関して、質が保証された核酸増幅方法を使用する生物学的サンプルのプールを生成する方法、他方で、混入した個々のサンプルの信頼できる同定、ならびに、プールにおけるそのような混入についての特定の限界値への固執を可能とする方法を利用可能とする方法であり、他方、費用の低減および先行技術から公知のプール試験方法より単純な方法を提供すること。
【解決手段】核酸増幅法（ここで、スクリーニングプールは、高感度の核酸増幅法を使用して試験され、そして、スクリーニングサブプール（これは、より感受性でない核酸増幅法（ここで、個々のサンプルは抽出され、そして除去される）を使用して試験される）に分けられ得る）を使用して、微生物の充填に関して質の保証された個々の血液提供物、血漿、血清および細胞培養バッチからなる群より選択される生物学的サンプルのプールを生成する方法。
【選択図】なし

Description

本発明は、核酸増幅法を使用する、微生物の充填に関して保証された質を有する生物学的サンプルのプールを生成する方法に関する。

生物学的サンプル（例えば、血漿の提供物または細胞培養物の上清のバッチ）は、所望でない微生物（特に、ウイルスまたは外来ＤＮＡ）が、混入し得る。これらの混入は、このような生物学的調製物から生成され、そして、ヒトに投与される調製物において、所望でない反応を導き得る。

とりわけ、ヒト血漿は、血漿誘導剤を生成するため（特に、血漿成分の遺伝的欠失または後天性欠失における補充療法のため）の開始物質として、臨床的に非常に重要である。この種の薬学的調製物は、一般に、単一の提供物（ｄｏｎａｔｉｏｎ）から生産されるのではなく、大多数の個体の提供物からなる血漿のプールから生産される。

しかし、ヒト血漿を使用する場合、薬学的調製物または血漿誘導剤に移され得るいずれの感染病原体も含まないように注意しなければならない。血液中におそらく存在し得る感染病原体は、とりわけ、血液（血行性ウイルス）（例えば、ＨＩウイルスまたは肝炎ウイルス（Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、ＥまたはＧ）およびパルボウイルス）を介して移され得るウイルスである。

血漿誘導剤を含む薬物の大きな要求のために、これらの薬物の経済的な生産は、工業的規模に基づいてのみ可能である。

血漿は、ドナーから獲得され、そして、薬学的調製物の生成のためにプールされる。通常のプールは約２０００〜６０００の個体の血漿の提供物からなる。従って、全血漿プールが、単一のウイルスが混入した血漿提供物によって汚染される危険が存在する。２０世紀の前半の終わりまでに加熱することによって、ヒトアルブミンをウイルスに安全な調製物に処理する際、すでに成功を収めたが、これは、血漿から獲得可能な全ての他の薬物と一緒の場合、それらの熱に対する感受性のために、最初は可能ではなかった。今日までに、適切に調製されたアルブミン調製物の使用が何百万回も存在したが、ヒトの血液で発生するウイルスの感染は全くなかった。

対照的に、いくつかのウイルス感染（特に、肝炎ウイルスの感染）は、血漿由来の多数の他の薬物と共に報告されており、そして、１９８０年代以降、ＡＩＤＳウイルスの感染の報告が増加している。

１９８０年頃、熱処理によってウイルス混入物の不活化を達成する目的で、熱処理が、適切に安定した第ＶＩＩＩ因子の濃縮物で、初めて実行された。しかし、まず第ＶＩＩＩ因子の活性の多大な喪失を受け入れなければならず、そして、実際の不活化能力は、不明のままであった。

最後に、熱不活化方法の改良および他の新しい不活化方法の使用を介して、ほとんどの場合に受容体におけるウイルス感染を生じない血漿由来の薬物を生成することは可能である。この開発はまた、ウイルス血症の可能性および従ってウイルス混入血漿が存在する全てのドナーおよび提供物を除外する目的で、ドナーおよび提供物の選択の改善と協力していた。

長い間、陽性の結果を生じる提供物を除外すること、および、血液産物の生成のための開始物質として機能することが意図されたより大きい血漿プールにウイルスを導入しないようにすることは、血液中の特定のウイルスへの抗原またはそれに対する抗体のどちらかの検出を介して、試みられてきた。個々のドナーが、全ての試験において、疾患のいずれの症状または病理学的試験結果を有さない場合でも、特定のウイルスは、長期間高濃度でさえ血中に存在し得る。現在、そのような特定のウイルスによるウイルス血症の発生は、増幅方法の補助を使用して、明白に検出され得る。

ウイルスの混入した単一の血漿提供物はもちろん、血漿単位のプール化を介して希釈され得るが、増幅反応の補助を使用するウイルスゲノム配列の検出は、非常に敏感であるため、これらの希釈液におけるウイルスゲノムまたはこれらの配列はそれぞれ、明白に決定され得、そして、上記のように、それらが特定の検出限界以下の場合、感染の可能性に関する限り、これらはいずれの臨床的関連性も有さない。

「ＥＥＣ Ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ Ｄｏｃｕｍｅｎｔ Ｎｏｔｅ ｆｏｒ Ｇｕｉｄａｎｃｅ，Ｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓ ｆｏｒ Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ Ｐｒｏｃｕｃｔｓ Ｄｅｒｉｖｅｄ ｆｒｏｍ Ｈｕｍａｎ Ｂｌｏｏｄ ａｎｄ Ｐｌａｓｍａ」（Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ １９９２，２０：１５９−１６４）に従うＥＣガイドラインは、血漿ドナーまたは血漿提供物の制御のための質保証システムを提案する。従って、全ての血漿提供物は、Ｂ型肝炎抗原、ＨＩＶ−１抗体およびＨＩＶ−２抗体などのウイルスマーカーの不在について有効な試験で試験されなければならない。なぜなら、これらは、血漿ドナーのウイルス感染に対応する指標であるためである。Ｃ型肝炎感染を除外するための試験もまた、行なわれる。

ヨーロッパの薬局方（Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｐｈａｒｍａｃｏｐｏｅｉａ、第２版、第２部、１９９４年、８５３−４頁）によると、全ての提供物におけるＣ型肝炎ウイルス抗体およびＨＩＶ抗体について、Ｂ型肝炎表面抗原を決定するために、特別な試験が行なわれることが必要とされる。

１９９５年３月１４日のＦＤＡガイドラインは、さらなる安全要素として目的産物（免疫グロブリン産物）のＰＣＲ（ポリメラーゼ連鎖反応）試験を提供する。

提案された試験にも関わらず、ＥＣガイドラインでは、これら全てのウイルスマーカーのみのコントロールによる個々の血漿提供物の安全は十分ではないことが強調されている。血漿サンプルにおけるこのマーカーの不在が確認される場合でも、ドナーのウイルス血症は、除外され得ない。ウイルス抗原および対応する抗体は、必ずしも感染後、直ぐに検出可能というわけではない。ウイルス感染の最初のマーカーは、感染性物質との接触後、何週間または何か月後まで、惹起されない。感染の後および抗体の発生の前の重要な期間は、一般的に「潜伏期間」（ｗｉｎｄｏｗ ｐｅｒｉｏｄ）と特徴付けられる。しかし、最初のウイルスマーカーが検出可能な感染後の時間は、ウイルスによって変化する。

さらに、血漿から生成される多数の薬物について、生成プロセスの一部として、欠失および不活化が発生し、そして、そのような産物自身は、ウイルスに非常に安全であることもまた、公知である。

けれども、血漿誘導剤のウイルス不活化が、工業規模で、極めて首尾良く行なわれてきた。それにもかかわらず、まれな場合に、ＡＩＤＳ、Ａ型、Ｂ型およびＣ型肝炎のような血行性ウイルスの伝達が存在してきた。従って、定常的生産方法（Ｌａｎｃｅｔ ３４０，３０５−３０６（１９９２）；ＭＭＷＲ ４３（２８），５０５−５０９（１９９４）；Ｔｈｒｏｍｂ．Ｈａｅｍｏｓｔ．６８，７８１（１９９２））にも関わらず、少数の生産バッチにおける生産者によって、ウイルスが混入した産物が生産されてきたと想定しなければならない。このことの原因は、おそらく、特定の開始バッチの極めて高度な混入に求められるべきである。間接的な方法のみが、血漿の生産におけるウイルスの混入した血漿提供物を除外するのに利用可能であるので、開始物質は非常に高度に混入しているため別の成功したウイルス不活化方法およびウイルス欠失化方法は、ウイルスに安定な目的産物を生成するのにもはや十分ではない可能性がある。

大部分のヒト病原性ウイルスについてのヒト感染用量は未知であり、そして、現在のところ、血漿プールを試験する際に検出可能でさえないので、混入した個々のサンプルを同定することによって、全ての単一の混入を見つけることが所望である。従って、使用される核酸増幅試験は、確かに極めて感受性であるが、非常に費用がかかる。それで、それらの使用は、既知のヒト病原性ウイルスで、正当化されるが、ヒトの病原性効果が、全く知られていないかまたは記載されていない他の微生物について、または、非常に高い病原体用量のみで感染性である他の微生物について、この費用は必要でない。

特に、ＷＯ９６／３５４３７および米国特許第５ ５９１ ５７３号−Ａは、核酸増幅方法および／または抗体試験を使用する血漿プールについての試験系を記載する。米国特許第５ ５９１ ５７３号は、血漿プールを試験するための方法を開示する。この方法を使用して、第１のプールを調製し、そして、ＰＣＲ法によって試験する。このＰＣＲ試験が陽性の場合、第２のより小さいサブプールが調製され、そしてＰＣＲ法によって再び試験される。このプロセスは、混入した個々の提供物が同定されるまで、繰り返される。スクリーニング方法の一部として開示される、抗体試験または前もってセットされた規定限界値の維持はまた、ＷＯ９６／３５４３７に従って想定される。

しかし、記載された核酸増幅方法は、当業者が、最も優れた感受性を可能とする増幅方法を常に使用しようと試みる事実を共有する。しかし、記載されるように、これらの高い感受性のＰＣＲ試験は、非常に費用がかかる（特に、個々の生物学的サンプルのプールの一連の試験において）。しかし、より低い感受性を有するＰＣＲ試験（それは、はるかに費用において好ましい）は、一般的にそのような試験において避けられる。なぜなら、（低い）検出限界下の混入の危険が、付随して高くなるためである。

同様に、組換え細胞培養由来の上清を使用してでさえ、微生物または宿主細胞由来の核酸によって、混入が、発生し続け得る。このような混入は、もちろん、存在すべきでないか、または、その上清より精製されるべき薬学的調製物において特定の最大値（限界値）においてのみ存在すべきである。

本発明の課題は、従って、微生物（特にウイルス）の充填に関して、質が保証された核酸増幅方法を使用する生物学的サンプルのプールを生成する方法、他方で、混入した個々のサンプル（特に高度に混入した個々のサンプル）の信頼できる同定、ならびに、プールにおけるそのような混入についての特定の限界値への固執を可能とする方法を利用可能とする方法であり、他方、費用の低減および先行技術から公知のプール試験方法より単純な方法をもたらすことである。

本発明に従って、この課題は、以下の工程によって特徴付けられる核酸増幅法を使用する微生物の充填に関して質が保証された生物学的サンプルのプールを生成する方法によって解決され、この工程は以下を含む：
−生物学的サンプルからアリコートを取る工程、
−そのアリコートをスクリーニングプールと組み合わせる工程、
−第１の核酸増幅プロセス（それは、試験される微生物に関して、特定の選択された検出限界ＤＬ−１を有する）によって、微生物のゲノム等価物の存在または含有量について、スクリーニングプールを試験する工程、
−スクリーニングプールを試験する際、ゲノム等価物の現在の限界値を超えた場合、より小さいプールに取られるアリコートを組換えることによって、スクリーニングプールをスクリーニングサブプールに分ける工程、
−さらなる核酸増幅プロセス（試験される微生物について特定の選択検出限界ＤＬ−２を有し、ここで、ＤＬ−１＜ＤＬ−２である）によって試験される微生物のゲノム等価物の存在または含有量について、スクリーニングサブプールを再試験する工程、
−ＤＬ−２を超えるこれらのサンプルを同定および除去する工程、ならびに
−非除去サンプルを、質が保証されたプールに組み合わせる工程。

本発明に従って、それらの感受性に関して異なる少なくとも２つの核酸増幅プロセスを提供することによって、効率的な（プール試験の高い感受性のために）およびそれにもかかわらず費用のかからない方法が、利用可能であり得る。なぜなら、サブプールの試験は、前もっての核酸のさらなる抽出なしで、より感受性でない核酸増幅法（従って、それは、決定的により費用がかからずそしてより高価でない）によって、個々のサンプルについて実行されるためである。

従って、本発明の方法を使用して、第１の工程において、スクリーニングプールは、非常に感受性および定量的な方法を使用して、核酸混入について試験された。非常に費用のかかる混入した個々のサンプルまたは提供物の決定（それは、はるかに多数のさらなる試験を含む）は、より感受性でない核酸増幅法を使用して決定される。そうする際、関連した混入が見過ごされる危険は全くない。なぜなら、スクリーニングプール試験は、できるだけ感受性な方法を使用して、行なっているためである。しかし、他方、混入した個々のサンプルまたは群についての除去方法の費用および時間の消費は、決定的に減少する。そのような混入した個々の提供物が、これらの理由のために、現在までに実行されていない、これらの場合では、本発明の方法は、初めて、価値のある原材料（それは、個々の提供物を表す）を使用する可能性を、低費用で提供し、そして、これらのサンプルが廃棄されることを防ぐ。

核酸増幅法の感度は、本発明に従って、関連した核酸増幅法を使用してさらに検出可能であるゲノム等価物の量として、設定される。正確に確立された限界値を使用してこの種の方法を提供することは、当業者にとって容易に可能であり、通常の知識の一部である。

本発明は従って、以下を提供する。
（１） 質の保証された生物学的サンプルのプールを生成するための方法であって、この方法は、以下の工程：
−上記生物学的サンプルからアリコートを取る工程；
−上記収集されたアリコートを、スクリーニングプールに組み合わせる工程；
−上記試験される微生物についての検出限界（ＤＬ−１）を有する第１の核酸増幅プロセスによって、微生物のゲノム等価物の存在または含有量について、スクリーニングプールを試験する工程；
−上記スクリーニングプールを試験する際、ゲノム等価物の現在の限界値を超える場合、上記収集されたアリコートを、より小さいプールに組み換えることによって、上記スクリーニングプールを、スクリーニングサブプールに分ける工程；
−第２の核酸増幅プロセス（上記プロセスは、上記試験される微生物についての選択された検出限界値（ＤＬ−２）を有し、ここで、ＤＬ−１＜ＤＬ−２）によって試験される上記微生物のゲノム等価物の存在または含有量について、上記スクリーニングサブプールを再試験する工程；
−ＤＬ−２を超えるサンプルを除去する工程；ならびに
−上記質の保証された生物学的サンプルのプールを生成するために残りのサンプルを組み合わせる工程；
を包含する、方法。
（２） 上記核酸増幅法がＰＣＲである、項目１に記載の方法。
（３） 上記試験される微生物がウイルスである、項目１に記載の方法。
（４） 上記試験される微生物が肝炎ウイルス、レトロウイルス、およびパルボウイルスからなる群より選択される、項目１に記載の方法。
（５） 上記スクリーニングプールを試験する際の上記限界値が、ＤＬ−１と１０^５ゲノム等価物／ｍＬとの間に設定される、項目１に記載の方法。
（６） 上記生物学的サンプルが、個々の血液提供物、血漿、血清および細胞培養バッチからなる群より選択される、項目１に記載の方法。
（７） 上記スクリーニングプールが５１２の生物学的サンプルから形成され、そして、２４のサブプールに分けられる、項目１に記載の方法。
（８） 上記さらなる核酸増幅法が、上記第１の核酸増幅法の後すぐに行われる、項目１に記載の方法。
（９） 項目１に記載の方法によって獲得された、質の保証された生物学的サンプルのプール。
（１０） 項目９に記載のプールおよび薬学的に受容可能なキャリアを含む薬学的組成物。
（１１） 血漿タンパク質、および組換え的に産生されたタンパク質からなる群より選択される少なくとも１つの成分を含む、項目１０に記載の薬学的組成物。
（１２） 上記肝炎ウイルスが、ＨＡＶ、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＨＤＶ、ＨＥＶおよびＨＧＶからなる群より選択される、項目４に記載の方法。
（１３） 上記レトロウイルスが、ＨＩＶ−１およびＨＩＶ−２からなる群より選択される、項目４に記載の方法。
（１４） 上記パルボウイルスがパルボＢ−１９である、項目４に記載の方法。
（１５） 上記限界値が約１０^４ゲノム等価物／ｍｌに設定される、項目５に記載の方法。
（１６） 上記血漿タンパク質または組換えタンパク質が酵素である、項目１１に記載の組成物。

本発明の方法は、とりわけ、微生物の充填に関するプールの質の保証について適しており、その微生物は、病原性または毒性が低いか、または、確立された限界値以下に存在する充填は、それぞれの場合において、薬学的調製物の調製まで続く精製プロセスの経路において、除去されると想定され得るか、または、この種の薬学的調製物におけるこの限界値に対応する混入の量が無毒であり、そして、副作用がないと想定され得る。この特定の例は、パルボウイルスの混入からなり、特にパルボＢ１９からなる。

パルボウイルスＢ１９は、脂質膜を有さず、従って、ウイルス不活化法に対して比較的抵抗性である３２ｎｍの直径を有する一本鎖ＤＮＡウイルスである。従って、多数の不活化法は、例えば、低温殺菌（６０℃、１２時間）のような物理的方法または有機性溶媒（ＴＮＢＰおよび／または界面活性剤）のような科学的処理は、満足する結果を有さない。感熱処理のみが、効果的であると証明されたようである。

パルボウイルスＢ１９は、無毒な感染性紅斑（ｅｒｙｔｈｍａ ｉｎｖｅｃｔｉｏｓｕｍ）の原因病原体であり、関節痛および関節炎がときどき観察される。これらは、しばしば、致死に至るので、子宮内の感染は恐れられている。Ｂ１９の限られた循環に脅かされる患者としては、慢性的な溶血性貧血を有する患者、骨髄移植を伴う患者、先天性／後天性免疫不全を有する患者ならびに妊娠した女性が挙げられる（Ｓｉｂｒｏｗｓｋｉら、Ｂｅｉｔｒ Ｉｎｆｕｓｉｏｎｓｔｈｅｒ．Ｂａｓｅｌ，Ｋａｒｇｅｒ，１９９０，２６，２２−２６）。

産業国における血清有病率は、５歳以下の子供では、２〜１０％、そして、２０歳以上の成人では、４０〜６０％であり、そして、７０歳以上の成人では、８５％である。従って、この高い血清有病率は、血漿プール試験において、大多数の陽性結果を生じ、従って、高度に混入した個々のサンプルを決定するために、大多数のさらなる試験の必要性を生じる。

ＥＰ−Ａ−０ ９２２ ７７１は、パルボウイルスＤＮＡが、ＤＮＡ含量が１０^６〜１０^７ゲノム等価物／ｍＬを上回るサンプル中だけでのみ検出され得るように、抽出、増幅または検出における準最適条件の使用を介して、ＰＣＲの感度が減少する、血液血漿における高いウイルス濃度を検出するための方法を記載する。しかし、この方法は、これがプールの試験に適していないという不利益を有する。

それにもかかわらず、細菌またはウイルスのように発生する全ての微生物は、本発明に従って、分析され得、ここで、とりわけ、ウイルスに関する質の保証が、血液および血漿提供物の試験において、特に重要である。

好ましくは、肝炎ウイルス（特に、ＨＡＶ、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＨＤＶ、ＨＥＶおよびＨＧＶ）、レトロウイルス（特に、ＨＩＶ−１およびＨＩＶ−２）ならびにパルボウイルス（特に、パルボＢ１９）は、本発明に従う方法を使用して試験されるか、または、血漿プールは、これらの種類のウイルスに関して、質が保証されている。

種々のバッチの組換えタンパク質の産生を試験する際、宿主細胞核酸（本明細書中では、真核生物細胞もしくは原核生物細胞またはＤＮＡもしくはＲＮＡは、本明細書中では微生物として検出される）の混入あるいは特定の細菌もしくはウイルス混入を有する混入の特定の（規定の）限界値の維持が試験される。

本発明に従う、特に好ましい方法の変形型は、第１の核酸増幅法の検出限界ＤＬ−１と１０^５ゲノム等価物／ｍＬとの間のスクリーニングプールを試験する際に、限界値を設定することからなり、ここで、例えば、特に約１０^４ゲノム等価物／ｍＬの値が、パルボＢ１９について特に効率的であると証明されてきた。好ましくは、相対限界はまた、相対検出値と一致し得る。

第１の核酸増幅法についての検出限界ＤＬ−１は、好ましくは、１０^２〜１０^４ゲノム等価物／ｍＬの範囲に位置するが（しかし、１０〜５０ＧＥ／ｍＬまでなり得るか、または、例外の場合では、より低くなりえる）、一方、検出限界ＤＬ−２は、通常１０^４〜１０^７ゲノム等価物／ｍＬとなるように選択される。ＤＬ−１およびＤＬ−２は、好ましくは、少なくとも１０のうち１の能力だけ異なるが、１０のうち約２の能力の相違が、本発明に従って、特に効率的である。なぜなら、この方法において、混入した個々の提供物はなお、信頼して同定され（これは、本発明に従って、必要である）、他方、スクリーニングプロセスについてのコストおよび費用は、既知の方法と比較してかなり減少され得る。

核酸の増幅は、本発明に従って、文献中に記載される一連の増幅プロセスによって、行なわれ得る；ＰＣＲ法は、本明細書中で、特に効果的であることが証明され、そして、広範な用法および産業的有効性ならびにこのコストのために、ＰＣＲ法はまた、好ましい。ＰＣＲ増幅法は、Ｍｕｌｌｉｓらによって、１９８３年に最初に記載された（米国特許第４，６８３，１９５号および米国特許第４，６８３，２０２号）。ウイルスゲノム配列はまた、「ネスト化ＰＣＲ」によって増幅され得る（Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ．１５５（１９８７），３３５−３５０）。ＲＮＡの増幅および検出のために、ＲＮＡは、最初に、ＤＮＡに転写されなければならない。この方法は、逆転写酵素を使用して行なわれ、そして、ＲＴ−ＰＣＲと呼ばれる（Ｃｅｌｌ ５０（１９８７），８３１−８４０）。

増幅産物の分析は、伸長プロセスおよびその後続くハイブリダイゼーションまたは産物のゲル電気泳動分離における標識されたヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドプライマーの使用を介して行なわれ得る。

増幅ＤＮＡフラグメントの検出は、例えば、２つの蛍光色素を有するプローブの方法によって、行なわれ得る。この方法は、例えば、Ｌｉｖａｋらによって記載される（ＰＣＲ Ｍｅｔｈｏｄ ａｎｄ Ａｐｐｌ．１９９５；４：３５７−３６２）。このプローブの特別な性質は、プローブの５’末端に付着された色素（ＦＡＭ）の蛍光（レポーター）が、第２の蛍光色素（ＴＡＭＲＡ）（消光剤）の存在によって減少され、これが、プライマーの３’末端に配置されるという事実に依存する。

増幅中には、新しいＤＮＡ鎖が、熱安定性のＤＮＡポリメラーゼ、好ましくは、Ｔａｑポリメラーゼの効果の元で、すぐに合成される。そうする際に、ＤＮＡポリメラーゼは、個々の鎖からプローブを置換するだけではなく、そのヌクレオチド鎖切断活性によって分解し、従って、２つの蛍光色素を放出する。レポーター染色の蛍光は、消光剤によってもはや抑制されず、増加する。この蛍光の増加は、ＰＣＲ中にＡＢＩ ｐｒｉｓｍ ７７００において連続的に記録される。閾値（蛍光の増加が陽性シグナルとして評価されて開始する）は、いくつかの陰性コントロールと比較して測定される。

未知のサンプルにおける微生物（例えば、パルボＢ１９）を使用する充填の定量化は、外部の検量線を介して行なわれる。キャリアプラスミド（これは、増幅される配列を含む）におけるパルボＢ１９ ＤＮＡのクローニングされた断片は、さらに１０^６コピー／反応物から１０コピー／反応物までの濃度で、直鎖状形態で同時増幅される。閾値（レポーター色素の蛍光シグナルがまず、ベースラインを超えて上昇する、１回のＰＣＲサイクルに対応する）を確立することによって、検量線は、この閾値を超える未知のサンプルのパルボＢ１９ ＤＮＡの含有量が定量されるプログラムにおいて確立される。

ＰＣＲについての代替的な方法としては、ＥＰ ０ ３２０ ３０８ ＡおよびＥＰ ０ ３３６ ７３１ Ａと関連するリガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、ならびに核酸配列ベース増幅（ＮＡＳＢＡ）、ＥＰ ０ ３１０ ２２９に関連した自立配列複製（ＳＳＲ）、または、ＥＰ ０ ３７３ ９６０ Ａに関連した転写ベース増幅系（ＴＡＳ）が挙げられる。ＤＮＡポリメラーゼまたはＲＮＡポリメラーゼのような増幅において同時にかまたは段階的に使用され得る多数の酵素は、これらの方法において使用され得る。

好ましくは、本発明に従って、内部標準（これを使用して、増幅の基本的機能が保証される）は、核酸増幅において加えられ得る。慣例的な試験において、本発明の方法に従って得られる結果の理解は、通常、以下のように調べられる：
ａ）内部標準が全く検出されない（すなわち、可視バンドが全くない）：例えば、増幅反応の結果として（例えば、ＰＣＲ）、決定が機能しなかった；この方法では、誤った陰性結果が、除外され得る。

ｂ）内部標準のみが検出可能である（例えば、標準バンドのみが可視である）：決定（増幅反応（例えば、ＰＣＲ）を含む）が機能し、サンプルは陰性である；
ｃ）標準およびサンプル核酸は、検出可能である（例えば、両方のバンドが、可視である）：陽性サンプル。

本発明に従って、試験について優先である生物学的サンプルは、個々の血液提供物、血漿、血清または細胞培養バッチの群より選択される。予想される混入は、特に、これらの生物学的サンプルで発生し、そして、これらはまた、生体の供給源由来の薬物の工業的製造において優先して使用される。

本発明に従う方法は、ロボット制御を使用する自動化バージョンで実行され得、従来の基本骨格は、これに特に適している。当業者は、このようなスクリーニングプールの生成について多数の異なった可能性について気付いている。例えば、Ｍｏｒｔｉｍｅｒ（Ｖｏｘ Ｓａｎｇ．１９９７，７３：９３−９６）は、二次元（２Ｄ）、三次元（３Ｄ）および四次元（４Ｄ）プールでさえ記載する。例えば、５１２（８×８×８）の個々のサンプルから生成された３Ｄプールを溶解するために、当業者は、明白に混入した個々のサンプルを同定し得るために、例えば、２４のサブプールを使用する。

本発明に従って、第２の核酸増幅プロセスは、好ましくは、第１の核酸増幅後に、サブプールから直接実行される。このことは、さらなる核酸の抽出は、全く起こらず、むしろ、サブプール中で、直接決定される。

別の局面に従って、本発明はまた、生物学的サンプルの質が保証されたプール（これは、本発明に従う方法を介して獲得され得る）および本発明に従う質の保証された調製物に基づいて産生されるかまたは産生され得る薬学的調製物に関する。これらの薬学的調製物は、好ましくは、タンパク質（特に、血漿タンパク質および組換え産生タンパク質、ならびに酵素）の群から選択される少なくとも１つの構成成分を含む。

本発明は、以下の実施例の方法によって、以下により詳細に例示されるが、これは、制限されることを意図しない。

（プール化）
５１２の血漿提供物のアリコートは、スクリーニングプールおよび２４のサブプールに対する３次元スキームの方法によってプールされる。

（抽出）
スクリーニングプールからの核酸抽出は、ＱＩＡＧＥＮからのＱＩＡｍｐバイアルキットの改変プロトコールの方法によって実行する。このために、１ｍＬのスクリーニングプールを、超遠心分離に供し、上清を１４０μＬに減少させた。ＱＩＡＧＥＮキットに従って、５６０μＬ ＡＶＬ溶解緩衝液を加えた後、混合物を、熱振盪器中で５６℃で１０分間インキュベートした。この溶解物を、シリカカラムに適用し、これを８０００ｒｐｍで遠心分離することによって、強制的に通過させた。０．５ｍＬ洗浄緩衝液ＡＷＩおよびＡＷ２を使用して、それぞれ洗浄した後、カラムに吸着した核酸を、５０μＬ Ｈ_２Ｏを使用して溶解した。

（増幅）
２０μＬ抽出物を、３０μＬ Ｍａｓｔｅｒｍｉｘに添加することによって、パルボＢ１９ ＤＮＡの小フラグメントを増幅した。

（５μＬ １０×ＴａｑＭａｎ緩衝液、１４μＬ ２５ｍＭ ＭｇＣｌ_２、４μＬ ２．５ｍＭ ｄＮＴＰ、１．５μＬ １０μＭ ＰＴ１．ｆ（５’ＧＡＣＡＧＴＴＡＴＣＴＧＡＣＣＡＣＣＣＣＣＡ３’）（配列番号Ｎｒ．１）、１．５μＬ １０μＭ ＰＴ１．ｒ（５’ＧＣＴＡＡＣＴＴＧＣＣＣＡＧＧＣＴＴＧＴ３’）（配列番号Ｎｒ．２）、１μＬ ５μＭ ＰＴ１．ｐ（５’６−ＦＡＭ−ＣＣＡＧＴＡＧＣＡＧＴＣＡＴＧＣＡＧＡＡＣＣＴＡＧＡＧＧＡＧＡ−ＴＡＭＲＡ３’）（配列番号Ｎｒ．３）、１μＬ Ｔｗｅｅｎ２０（１％）、１．２５μＬ ゼラチン（２％）、０．５μＬ ＡｍｐＥｒａｓｅ ＵＮＧ（１Ｕ／μＬ）、０．２５μＬ ＡｍｐｌｉＴａｑ Ｇｏｌｄ（５Ｕ／μＬ）を使用するＴａｑＭａｎ ＰＣＲ Ｃｏｒｅ Ｒｅａｇｅｎｔ Ｋｉｔ、Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ）。

増幅は、ＡＢＩ ｐｒｉｓｍ ７７００で、以下の条件下で、行なった：
１．ＡｍｐＥｒａｓｅ ＵＮＧ反応、５０℃、２分間
２．最初の変性、９５℃、１０分間
３．９５℃、１５秒間および５８℃、１分間のサイクル。

ＰＣＲは、ＰＣＲ間の蛍光の増加によって評価する。閾値（すなわち、基底ノイズを超えてシグナルが増加するサイクル）は、定量化のために役立つ。この場合のパルボＢ１９ゲノムのクローニングされたフラグメントを有する一連の標準直鎖状プラスミドの閾値は、スクリーニングプールの抽出におけるパルボＢ１９濃度を測定するためのベースラインとして役立つ。

サンプル中で測定されるゲノム等価物の数が、スクリーニングプール中における１０^４ＧＥ／ｍＬの限界値より低い場合、このプールに含まれるサンプルは、使用のためにクリアーしている。他方、閾値が限界値を超える場合、スクリーニングプールは溶解される。

（溶解）
スクリーニングプールの２４サブプールを、自動の方法によっていくつかの工程で、Ｈ_２Ｏ中で、１：２００に希釈し、そして、ＴａｑＭａｎ ＰＣＲにおける抽出なしで使用する。

（溶解物の増幅）
パルボＢ１９ ＤＮＡの小フラグメントを、２０μＬサブプール希釈液（サブプールの０．１μＬに対応する）を３０μＬマスターミックスに添加することによって、増幅する。

（５μＬ １０×ＴａｑＭａｎ緩衝液、１４μＬ ２５ｍＭ ＭｇＣｌ_２、４μＬ ２．５ｍＭ ｄＮＴＰ、１．５μＬ １０μＭ ＰＴ１．ｆ（５’ＧＡＣＡＧＴＴＡＴＣＴＧＡＣＣＡＣＣＣＣＣＡ３’）、１．５μＬ １０μＭ ＰＴ１．ｒ（５’ＧＣＴＡＡＣＴＴＧＣＣＣＡＧＧＣＴＴＧＴ３’）、１μＬ ５μＭ ＰＴ１．ｐ（５’６−ＦＡＭ−ＣＣＡＧＴＡＧＣＡＧＴＣＡＴＧＣＡＧＡＡＣＣＴＡＧＡＧＧＡＧＡ−ＴＡＭＲＡ３’）、１μＬ Ｔｗｅｅｎ２０（１％）、１．２５μＬ ゼラチン（２％）、０．５μＬ ＡｍｐＥｒａｓｅ ＵＮＧ（１Ｕ／μＬ）、０．２５μＬ ＡｍｐｌｉＴａｑ Ｇｏｌｄ（５Ｕ／μＬ）を使用するＴａｑＭａｎ Ｇｏｌｄ Ｋｉｔ、Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ）。

増幅は、ＡＢＩ ｐｒｉｓｍ ７７００で、以下の条件下で、行なう：
１．ＡｍｐＥｒａｓｅ ＵＮＧ反応、５０℃、２分間
２．最初の変性、９５℃、１０分間
３．９５℃、１５秒間および５８℃、１分間のサイクル。

（評価）
ＰＣＲは、ＰＣＲ間の蛍光の増加によって評価する。同時に増幅された既知の
シリーズの値と比較して、閾値（すなわち、基底ノイズを超えてシグナルが増加するサイクル）を決定することによって、スクリーニングサンプルの抽出物中のゲノム等価物の数を決定する。

供給物が０．１μＬ物質である場合、少なくとも１０^４ＧＥ／ｍＬの含有量を有するサンプルのみが、シグナルを生成し得るので、溶解物中で陽性として認識される個々の提供物は廃棄され、そして、残渣は、使用のために放出される。

Claims (1)

1. 質の保証された生物学的サンプルのプールを生成するための方法であって、この方法は、以下の工程：
   −該生物学的サンプルからアリコートを取る工程；
   −該収集されたアリコートを、スクリーニングプールに組み合わせる工程；
   −該試験される微生物についての検出限界（ＤＬ−１）を有する第１の核酸増幅プロセスによって、微生物のゲノム等価物の存在または含有量について、スクリーニングプールを試験する工程；
   −該スクリーニングプールを試験する際、ゲノム等価物の現在の限界値を超える場合、該収集されたアリコートを、より小さいプールに組み換えることによって、該スクリーニングプールを、スクリーニングサブプールに分ける工程；
   −第２の核酸増幅プロセス（該プロセスは、該試験される微生物についての選択された検出限界値（ＤＬ−２）を有し、ここで、ＤＬ−１＜ＤＬ−２）によって試験される該微生物のゲノム等価物の存在または含有量について、該スクリーニングサブプールを再試験する工程；
   −ＤＬ−２を超えるサンプルを除去する工程；ならびに
   −該質の保証された生物学的サンプルのプールを生成するために残りのサンプルを組み合わせる工程；
   を包含する、方法。