JP2005501840A5

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Publication number: JP2005501840A5
Application number: JP2003518546A
Authority: JP
Filing date: 2002-07-23
Publication date: 2006-01-05

Claims

癌を有する対象におけるイリノテカンに対する感受性を予測する方法であって、その対象がＭＤＲ１遺伝子、ＭＲＰ１遺伝子、ＣＹＰ３Ａ５遺伝子およびＵＧＴ１Ａ１遺伝子よりなる群から選択される遺伝子を含む２以上の遺伝子それぞれに１以上の変異対立遺伝子を有するかを判定することを含み、これらの対立遺伝子は癌細胞がこれら２以上の遺伝子のタンパク質を低い量または高い量で発現することの指標であり、これにより低発現はイリノテカンに対する感受性が高いことの指標となり、高発現はイリノテカンに対する耐性または耐性素質の指標となる方法。
ＭＤＲ１遺伝子における変異対立遺伝子が、下記のものよりなる群から選択されるポリヌクレオチドを含む、請求項１に記載の方法：
（ａ）下記のいずれか１つの核酸配列を有するポリヌクレオチド：

（ｂ）ＳＥＱＩＤＮＯ：６０６、６０８、６１０、６１２、６１８、６２０、６２２、６２４および／または６２８のいずれか１つのアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）多剤耐性１（ＭＤＲ１）遺伝子にハイブリダイズしうるポリヌクレオチドであって、下記の位置に対応する位置において少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失を有するポリヌクレオチド：
ＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００２４５７）の

および／またはＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００５０６８）の

および／またはＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：Ｍ２９４３２）の位置１０１、３０８、
および／またはＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：Ｍ２９４４５）の位置１３７、１７６；
（ｄ）ＭＤＲ１遺伝子にハイブリダイズしうるポリヌクレオチドであって、ＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００５０６８）の位置８３９４６、７０２００、７０２３７、６５２４１、および／またはＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：Ｍ２９４３２）の位置１０１および／または、ＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００２４５７）の位置１４１５２９、１７４９０１、１３９１７７、１４０１１８、１４０５６８、１４０７２７、１３９４７９に対応する位置にＡを；ＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：Ｍ２９４３２）の位置３０８および／または、ＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００５０６８）の位置８４７０１、８３９７３、８４０７４、８４１１９、７８１７０、７０２０４、７０２５３、７０３７１、５０５３７、４３１６２、および／またはＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：Ｍ２９４４５）の位置１３７または１７６、および／またはＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００２４５７）の位置１４５９８４、１７１４６６、１７５０６８、１７５０７４、１３９０６４、１３９２７６、１４０５７６に対応する位置にＴを；ＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００２４５７）の位置１４０８３７、１７１４０４、１７１４５６、１７１５１１、１７１５１２、１３９１１９、１４０４９０、１３９６１９、および／またはＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００５０６８）の位置４３２６３に対応する位置にＣを；ＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００５０６８）の位置８４０３２、７７８１１、７３２５２、および／またはＭＤＲ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００２４５７）の位置１４１５９０、１７５１４２、１７５１８０、１３９０１５、１４０２１６、１４０５９５に対応する位置にＧを有するポリヌクレオチド；
（ｅ）ＭＤＲ１ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド：該ポリペプチドはＭＤＲ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２５０６１１８）の位置２１、１０３、１６８、４００、８９３、９９９、１００１、１１０７および／または１１４１に対応する位置においてアミノ酸置換を含む；
（ｆ）ＭＤＲ１ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド：該ポリペプチドは下記のアミノ酸置換を含む：ＭＤＲ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２５０６１１８）の位置２１に対応する位置におけるＡｓｎからＡｓｐへの置換；または／およびＭＤＲ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２５０６１１８）の位置１０３に対応する位置におけるＰｈｅからＬｅｕへの置換；または／およびＭＤＲ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２５０６１１８）の位置１６８に対応する位置におけるＶａｌからＩｌｅへの置換；または／およびＭＤＲ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２５０６１１８）の位置４００に対応する位置におけるＳｅｒからＡｓｎへの置換；または／およびＭＤＲ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２５０６１１８）の位置８９３に対応する位置におけるＡｌａからＳｅｒへの置換；または／およびＭＤＲ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２５０６１１８）の位置９９９に対応する位置におけるＡｌａからＴｈｒへの置換；または／およびＭＤＲ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２５０６１１８）の位置１００１に対応する位置におけるＡｌａからＴｈｒへの置換；または／およびＭＤＲ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２５０６１１８）の位置１１０７に対応する位置におけるＧｌｎからＰｒｏへの置換；または／およびＭＤＲ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２５０６１１８）の位置１１４１に対応する位置におけるＳｅｒからＴｈｒへの置換。
ＭＲＰ１遺伝子における変異対立遺伝子が、下記のものよりなる群から選択されるポリヌクレオチドを含む、請求項１に記載の方法：
（ａ）下記のいずれか１つの核酸配列を有するポリヌクレオチド：

（ｂ）ＳＥＱＩＤＮＯ：６００、６０２および／または６０４のいずれか１つのアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド；
（ｃ）多剤耐性タンパク質１（ＭＲＰ１）遺伝子にハイブリダイズしうるポリヌクレオチドであって、ＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：７２０９４５１）の位置５７９９８、５７８５３、５３２８２および／または３９５０８に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ０２６４５２）の位置１３７６６７、１３７６４７、１３７７１０、１２４６６７および／または３８６４６に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００３０２６）の位置２７２５８、２７１５９、３４２１８、３４２１５、５５４７２および／または３４２０６−３４２０７に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ９１３１８）の位置２１１３３、１４００８、１８０６７、１７９７０および／または１７９００に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８３０）の位置７９、８８および／または２４９に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８３１）の位置９５および／または２５９に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ０２５２７７）の位置１５０７２７および／または３３５５１に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８２８）の位置１７４に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８２９）の位置２４８および／または２５８に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ０７０５０）の位置１８８４、１６２５、１１６３、３８１、２３３、１８９、４４０および／または１７２０−１７２３に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ０７０５０）の位置９２６／９２７および／または４３７／４３８に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの挿入；あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００３０２６）の位置５５１５６／５５１５７に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの挿入を有するポリヌクレオチド；
（ｄ）ＭＲＰ１遺伝子にハイブリダイズしうるポリヌクレオチドであって、ＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ９１３１８）の位置２１１３３、１４００８および／または１８１９５に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００３０２６）の位置２７２５８および／または３４２１８に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８３０）の位置７９に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：７２０９４５１）の位置５７９９８および／または５７８５３に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ０２６４５２）の位置１３７６６７および／または１３７６４７に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ０２５２７７）の位置１５０７２７および／または３３５５１に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８２９）の位置２４８に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ０７０５０）の位置１８８４、１６２５、２３３および／または１８９に対応する位置にＡを；ＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：７２０９４５１）の位置３９５０８に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ９１３１８）の位置１７９００、１８０６７および／または１８１９５に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８２８）の位置１７４に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ０７０５０）の位置４４０および／または１１６３に対応する位置にＴを；ＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８３０）の位置８８に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８３１）の位置９５に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００３０２６）の位置２７１５９、５５４７２および／または３４２１５に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ０２６４５２）の位置１２４６６７および／または３８６４６に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：７２０９４５１）の位置５３２８２に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ０２６４５２）の位置１３７７１０に対応する位置にＣを；ＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８３０）の位置２４９に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８２９）の位置２５８に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＦ０２２８３１）の位置２５９に対応する位置、あるいはＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ０７０５０）の位置３８１に対応する位置にＧを；ＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ９１３１８）の位置１７９７０に対応する位置におけるＴの欠失を；あるいは、ＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００３０２６）の位置３４２０６−３４２０７に対応する位置におけるＡＴの欠失を；あるいは、ＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ０７０５０）の位置１７２０−１７２３に対応する位置においてＧＧＴＡの欠失を；ＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：Ｕ０７０５０）の位置９２６／９２７に対応する位置におけるＴの挿入および／またはその位置４３７／４３８に対応する位置におけるＴＣＣＴＴＣＣの挿入を；ＭＲＰ１遺伝子（寄託番号：ＡＣ００３０２６）の位置５５１５６／５５１５７に対応する位置におけるＴＧＧＧＧＣの挿入を有するポリヌクレオチド；
（ｅ）ＭＲＰ１ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド：該ポリペプチドは下記のアミノ酸置換を含む：ＭＲＰ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２８２８２０６）の位置２３９に対応する位置におけるＰｈｅからＣｙｓへの置換；または／およびＭＲＰ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２８２８２０６）の位置４３３に対応する位置におけるＡｒｇからＳｅｒへの置換；または／およびＭＲＰ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ２８２８２０６）の位置７２３に対応する位置におけるＡｒｇからＧｌｎへの置換。
ＣＹＰ３Ａ５遺伝子における変異対立遺伝子が、下記のものよりなる群から選択されるポリヌクレオチドを含む、請求項１に記載の方法：
（ｂ）シトクロムＰ４５０サブファミリーＩＩＩＡ（ニフェジピンオキシダーゼ）ポリペプチド５（ＣＹＰ３Ａ５）遺伝子にハイブリダイズしうるポリヌクレオチドであって、ＣＹＰ３Ａ５遺伝子（寄託番号：ＧＩ：１０２８１４５１）の位置４７５１８および／または９７３６に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換、あるいはＣＹＰ３Ａ５遺伝子（寄託番号：ＧＩ：１１１７７４５２）の位置１４５６０１および／または１４５９２９に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換を有するポリヌクレオチド；
（ｃ）ＣＹＰ３Ａ５遺伝子にハイブリダイズしうるポリヌクレオチドであって、ＣＹＰ３Ａ５遺伝子（寄託番号：ＧＩ：１０２８１４５１）の位置４７５１８に対応する位置にＣを；ＣＹＰ３Ａ５遺伝子（寄託番号：ＧＩ：１１１７７４５２）の位置１４５６０１および／または１４５９２９に対応する位置にＧを；あるいはＣＹＰ３Ａ５遺伝子（寄託番号：ＧＩ：１０２８１４５１）の位置９７３６に対応する位置にＧを有するポリヌクレオチド。
ＵＧＴ１Ａ１遺伝子における変異対立遺伝子が、下記のものよりなる群から選択されるポリヌクレオチドを含む、請求項１に記載の方法：
（ａ）下記のいずれか１つの核酸配列を有するポリヌクレオチド：

（ｂ）下記のいずれか１つのアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド：

（ｃ）ウリジン二リン酸グリコシルトランスフェラーゼ１メンバーＡ１（ＵＧＴ１Ａ１）遺伝子にハイブリダイズしうるポリヌクレオチドであって、ＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置５９、１６０、２２６、５３９、５４４、６４０、７０１、８４１、８５５、８９０、９３８、１００６、１００７、１０２０、１０８４、１０８５、１１１４、１１１７、１１３９、１１５８、１１７５−１１７６、１２１６、１２９７、１３２４、１４７１、１４７８、３７２−３７３、５２３−５２５および／または８９２−９０５に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの置換または欠失、あるいは、ＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置４７０／４７１および／または１２２２／１２２３に対応する位置における少なくとも１個のヌクレオチドの挿入を有するポリヌクレオチド；
（ｄ）ＵＧＴ１Ａ１遺伝子にハイブリダイズしうるポリヌクレオチドであって、ＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置２２６、５３９、７０１、８５５、９３８、１０２０および／または１１１７に対応する位置にＡを；ＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置１６０、６４０、８９０、１００６、１０８４、１１３９、１１７６、１３２４および／または１４７８に対応する位置にＴを；ＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置５４４、８４１および／または１２１６に対応する位置にＣを；ＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：１８１３０３）の位置５９、１００７、１０８５、１１１４、１１５８、１１７５、１２９７および／または１４７１に対応する位置にＧを；ならびに／あるいはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置３７２−３７３に対応する位置におけるＣＴの欠失を；ＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置５２３−５２５に対応する位置におけるＴＴＣの欠失を；ＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置８９２−９０５に対応する位置におけるＴＡＣＡＴＴＡＡＴＧＣＴＴＣの欠失を；ＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置４７０／４７１に対応する位置におけるＴの挿入を；ならびに／あるいはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置１２２２／１２２３に対応する位置におけるＧの挿入を有するポリヌクレオチド；
（ｅ）ＵＧＴ１Ａ１ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド：該ポリペプチドは下記のアミノ酸置換を含む：ＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置１５に対応する位置におけるＬｅｕからＡｒｇへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置７１に対応する位置におけるＧｌｙからＡｒｇへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置１７５に対応する位置におけるＬｅｕからＧｌｎへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置１７７に対応する位置におけるＣｙｓからＡｒｇへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置２０９に対応する位置におけるＡｒｇからＴｒｐへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置２２９に対応する位置におけるＰｒｏからＧｌｎへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置２７６に対応する位置におけるＧｌｙからＡｒｇへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置２９２に対応する位置におけるＡｌａからＶａｌへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置２９３に対応する位置におけるＴｙｒからＴｒｐへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３０８に対応する位置におけるＧｌｙからＧｌｕへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３３１に対応する位置におけるＧｌｎからＡｒｇへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３５７に対応する位置におけるＧｌｎからＡｒｇへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３６７に対応する位置におけるＡｒｇからＧｌｙへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３６８に対応する位置におけるＡｌａからＴｈｒへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３８７に対応する位置におけるＰｒｏからＡｒｇへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３７５に対応する位置におけるＳｅｒからＰｈｅへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３８１に対応する位置におけるＳｅｒからＡｒｇへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置４０１に対応する位置におけるＡｌａからＰｒｏへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置４２８に対応する位置におけるＬｙｓからＧｌｕへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置４８６に対応する位置におけるＴｙｒからＡｓｐへの置換；または／およびＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置４８８に対応する位置におけるＳｅｒからＰｈｅへの置換；
（ｆ）ＵＧＴ１Ａ１ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチドであって、ＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３５）の位置３７２−３７３に対応する位置におけるＣＴの欠失を有し、これにより該ポリペプチドにおいてＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置１１９に対応する位置におけるアミノ酸Ａｓｐに続く１個以上のアミノ酸が置換、付加および／または欠失し；ならびに／あるいはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３６）の位置４７０／４７１に対応する位置にＴの挿入を有し、これにより該ポリペプチドにおいてＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置１５２に対応する位置におけるアミノ酸Ｐｒｏに続く１個以上のアミノ酸が置換、付加および／または欠失し；ならびに／あるいはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３６）の位置５２３−５２５に対応する位置におけるＴＴＣの欠失を有し、これにより該ポリペプチドにおいてＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置１６８に対応する位置におけるアミノ酸Ｔｈｒに続く１個以上のアミノ酸が置換、付加および／または欠失し；ならびに／あるいはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３６）の位置８９２−９０５に対応する位置におけるＴＡＣＡＴＴＡＡＴＧＣＴＴＣの欠失を有し、これにより該ポリペプチドにおいてＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置２９２に対応する位置におけるアミノ酸Ａｌａに続く１個以上のアミノ酸が置換、付加および／または欠失し；ならびに／あるいはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：ＧＩ：８８５０２３６）の位置１２２２／１２２３に対応する位置におけるＧの挿入を有し、これにより該ポリペプチドにおいてＵＧＴ１Ａ１ポリペプチド（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置４０２に対応する位置におけるアミノ酸Ｌｙｓに続く１個以上のアミノ酸が置換、付加および／または欠失するポリヌクレオチド；および
（ｇ）ＵＧＴ１Ａ１ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド：該ポリヌクレオチドはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置４９に対応する位置におけるＧｌｎから終止コドンへのアミノ酸置換；および／またはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置２８０に対応する位置におけるＣｙｓから終止コドンへのアミノ酸置換；および／またはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３３１に対応する位置におけるＧｌｎから終止コドンへのアミノ酸置換；および／またはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３３５に対応する位置におけるＴｒｐから終止コドンへのアミノ酸置換；および／またはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置３５７に対応する位置におけるＧｌｎから終止コドンへのアミノ酸置換；および／またはＵＧＴ１Ａ１遺伝子（寄託番号：Ｇ８８５０２３６）の位置４３７に対応する位置におけるＬｙｓから終止コドンへのアミノ酸置換を含む。
癌が、結腸直腸癌、子宮頚癌、胃癌、肺癌、悪性神経膠腫、卵巣癌および膵癌よりなる群から選択される、請求項１ないし５のいずれか１項に記載の方法
対象が動物である、請求項１ないし６のいずれか１項に記載の方法。
対象がマウスである、請求項１ないし６のいずれか１項に記載の方法。
対象がヒトである、請求項１ないし６のいずれか１項に記載の方法。
ヒトがアフリカ人種またはアジア人種である、請求項９に記載の方法。
患者がイリノテカンによる治療に対する中毒反応のリスクを有するかを判定する方法であって、ＭＤＲ１遺伝子、ＭＲＰ１遺伝子、ＣＹＰ３Ａ５遺伝子およびＵＧＴ１Ａ１遺伝子を含む２以上の遺伝子に１以上の変異対立遺伝子を患者が有するかを判定することを含む方法。
癌を患う患者にイリノテカンを投与するのに最適な治療方式を判定するための方法であって、以下：
（ａ）その患者が、ＭＤＲ１遺伝子、ＭＲＰ１遺伝子、ＣＹＰ３Ａ５遺伝子およびＵＧＴ１Ａ１遺伝子よりなる群から選択される遺伝子を含む２以上の遺伝子それぞれの１以上の変異対立遺伝子を有するかを判定し；
（ｂ）前記２以上の遺伝子それぞれに１以上のそのような変異対立遺伝子を有する患者において、これら２以上の遺伝子の遺伝子生成物の発現レベルが一般集団のものより低いためイリノテカンに対する高い感受性を示す場合は、前記２以上の遺伝子における患者の対立遺伝子を考慮せずにイリノテカンを投与する場合の患者におけるピーク量と比較して、その患者におけるイリノテカンのピーク量を低下させるように変更した治療方式が適すると判定する；
ことを含む、前記方法。
癌を患う患者にイリノテカンを投与するのに最適な治療方式を判定するための方法であって、以下：
（ａ）その患者が、ＭＤＲ１遺伝子、ＭＲＰ１遺伝子、ＣＹＰ３Ａ５遺伝子およびＵＧＴ１Ａ１遺伝子よりなる群から選択される遺伝子を含む２以上の遺伝子それぞれの１以上の変異対立遺伝子を有するかを判定し；
（ｂ）前記２以上の遺伝子それぞれに１以上のそのような変異対立遺伝子を有する患者において、これら２以上の遺伝子の遺伝子生成物の発現レベルが一般集団のものより高いためイリノテカンに対する耐性または耐性素質を示す場合は、前記２以上の遺伝子における患者の対立遺伝子を考慮せずにイリノテカンを投与する場合の患者におけるピーク量と比較して、その患者におけるイリノテカンのピーク量を増大させるように変更した治療方式が適すると判定する；
ことを含む、前記方法。
ＭＤＲ１遺伝子、ＭＲＰ１遺伝子、ＣＹＰ３Ａ５遺伝子およびＵＧＴ１Ａ１遺伝子よりなる群から選択される遺伝子を含む２以上の遺伝子それぞれに１以上の変異対立遺伝子を有する対象における結腸直腸癌、子宮頚癌、胃癌、肺癌、悪性神経膠腫、卵巣癌および膵癌の治療に用いる医薬組成物を調製するための、イリノテカンまたはその誘導体の使用。
癌を治療するためのイリノテカンを含む医薬組成物であって、以下：
（ａ）患者の遺伝子型をアッセイして、その患者がＭＤＲ１遺伝子、ＭＲＰ１遺伝子、ＣＹＰ３Ａ５遺伝子およびＵＧＴ１Ａ１遺伝子よりなる群から選択される遺伝子を含む２以上の遺伝子それぞれに１以上の変異対立遺伝子を有するかを判定し；そして
（ｂ）前記２以上の遺伝子のそのような変異対立遺伝子を有する患者において、そのような変異対立遺伝子を有する患者の治療に十分な量のイリノテカンをその患者に投与するが、この量は、前記２以上の遺伝子における患者の対立遺伝子を考慮せずに投与する量と比較して増大または減少される；
ことを特徴とする、前記医薬組成物。