JP2005328745A5 - - Google Patents

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（４）HCV遺伝子のサブタイプ3a
HCV遺伝子のサブタイプ3a型のコア領域のタイピング可能な特異性の高い領域、（配列番号44：HCV3a型コア領域の1〜366bpに該当）の配列に基づき、表７に示されるような各種プライマーを設計した。このプライマーを組み合わせて、HCV遺伝子のサブタイプ3a型検体を鋳型に実施例１と同様の条件でNASBA法による恒温増幅を行い、電気泳動により増幅の有無、位置を確認した。さらに、増幅が確認されたプライマーペアについて、他のHCVサブタイプの検体を用いてNASBA法による増幅の有無、位置を検討し、HCV3aのジェノタイピングが可能かどうかを検討した。プライマー設定領域及び結果を表７に纏めて示す。

Claims (6)

  1. 配列番号1〜10、21、及び22から選ばれるいずれか１に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基を含む、HCV恒温増幅用プライマー。
  2. さらにT7プロモーター配列を含むことを特徴とする、請求項１記載のプライマー。
  3. 以下の（1）〜（5）から選ばれる、HCV恒温増幅用プライマーペア。
    (1)配列番号1及び配列番号2に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア
    (2)配列番号3及び配列番号4に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア、又は配列番号3及び配列番号9に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア
    (3)配列番号5及び配列番号6に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア、又は配列番号5及び配列番号10に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア
    (4)配列番号7及び配列番号8に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア
    (5)配列番号21及び配列番号22に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア
  4. 少なくとも一方のプライマーがさらにT7プロモーター配列を含むことを特徴とする、請求項３記載のプライマーペア。
  5. 以下の(1)〜(5)から選ばれる１以上のプライマーペアと、前記プライマーペアによる増幅産物に相補的な配列を含み、前記増幅産物を検出するためのプローブを含む、HCV検出用キット。
    (1)配列番号1及び配列番号2に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア
    (2)配列番号3及び配列番号4に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア、又は配列番号3及び配列番号9に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア
    (3)配列番号5及び配列番号6に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア、又は配列番号5及び配列番号10に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア
    (4)配列番号7及び配列番号8に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア
    (5)配列番号21及び配列番号22に示される塩基配列中の3’末端側の連続した少なくとも18塩基をそれぞれ含むプライマーペア
  6. 前記プライマーペアのうち少なくとも一方がT7プロモーター配列を含むことを特徴とする、請求項５に記載のHCV検出用キット。
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