JP2005058149A - 核酸抽出装置 - Google Patents

Abstract

【課題】 短時間で効率よく試料液の核酸を自動的に抽出でき、抽出カートリッジへ作用する加圧エアに起因するコンタミネーションの発生を防止し信頼性を高める。
【解決手段】 フィルター部材を備えた抽出カートリッジ11を用い、試料液を加圧し核酸を吸着させた後、洗浄液により不純物を除去し、回収液により核酸を回収する抽出動作を行うもので搭載機構３と加圧エア供給機構４と分注機構５を備え、加圧エア供給機構４は１台のエアポンプ43と、抽出カートリッジ11への通路を開閉する開閉バルブ45と、カートリッジ内圧を検出する圧力センサ46と、開閉バルブ45上流の圧力を大気開放するリリーフバルブ44を備え、液排出が完了した加圧終了の時点で開閉バルブ45を開作動しリリーフバルブ44を開放作動し、抽出カートリッジ11内に残存する加圧エアを大気開放し液の飛散噴出を阻止する。
【選択図】 図５

Description

本発明は、フィルター部材を備えた抽出カートリッジを用いて試料液の核酸を自動抽出する核酸抽出装置に関し、特に抽出カートリッジへ加圧エアを導入する機構に関するものである。

従来の核酸抽出法としては、遠心法によるもの、磁気ビーズを用いるもの、フィルターを用いるものなどがある。

例えば、フィルターを用いた核酸抽出装置としては、フィルターを収容したフィルターチューブをラックに多数セットし、これに試料液を分注し、上記ラックの底部の周囲をシール材を介してエアチャンバーで密閉して内部を減圧し、全フィルターチューブを同時に排出側より吸引して試料液を通過させて核酸をフィルターに吸着し、その後、洗浄液および溶出液を分注して、同様に減圧吸引して洗浄・溶出するようにした機構が提案されている（例えば、特許文献１参照）。
特許第２８３２５８６号公報

上記のような従来の自動抽出装置では、装置が大型で多量の検体を分析するのに適したもので、検体数が少なく分析頻度の少ない場合には、高価で不向きであるとともに、処理効率が低くなる問題を有する。

また、このような装置においては、短時間で効率よくコンタミネーションが発生しないように処理し、かつ、装置を小型化するなどの点が要望されるが、特許文献１では次のような問題がある。

採取全血のように各試料液の特性が異なる場合に、特許文献１のように全体を同時に吸引するものでは、一部のフィルターチューブの吸引が終了してその抵抗がなくなると、他のフィルターチューブに作用する減圧が小さくなって粘度の高い試料液の処理が終了しない場合が生じる。その減圧容量を増大することは装置の小型化を図る際の障害となり、減圧容積が大きいために減圧を作用させるまでの時間が掛かり、また、液が全部排出されたことの検出が困難で、時間設定が長く、処理効率の向上の障害となる。一方、粘度の低い試料液では、フィルターチューブより勢いよく液が排出されて、泡状の飛沫が隣接するフィルターチューブおよびラックに付着してコンタミネーションを生じ、精度低下を招く問題がある。

特に、全体の真空吸引では、１つの抽出カートリッジへの試料液注入不良、抽出カートリッジの装填ミス等によってエア抵抗がないものがあると、正常な作動を確保することができず、また、多数の抽出カートリッジを個別に吸引する機構を構成することも困難である。

上記のような点より、本発明では、フィルター部材を備え核酸の吸着・洗浄・回収を行う抽出カートリッジ内に加圧エアを供給し、加圧した各液をフィルター部材を通過させて廃液容器または回収容器に排出するように構成して、処理効率の向上、小型化を図るようにしたものである。その際、加圧された液の全量がフィルター部材を通過した際に、残留加圧エアが抽出カートリッジの排出部より液とともに噴出されてミスト状の排出液が飛散して周囲を汚染し、コンタミネーションの原因となる恐れがある。

また、抽出カートリッジへ供給する加圧エアを発生するエアポンプが、全ての抽出カートリッジに対する開閉弁が閉状態にある際にも連続駆動される場合に、この状態ではエアポンプの連続駆動によってエア通路には過剰な加圧エアが作用しており、その加圧エアが次に開閉弁が開作動した際に、一度に容積の小さな抽出カートリッジ内に導入されて設定された圧力より多くの加圧エアが供給される可能性があり、内圧が高くなりすぎると、排出液の噴出速度が速くなりすぎて液が飛散してコンタミネーションの原因となるなどの問題が生じる。

本発明はこのような点に鑑みなされたもので、短時間で効率よく試料液の核酸を自動的に抽出できるとともに、抽出カートリッジへ作用する加圧エアに起因するコンタミネーションの発生を防止するようにした核酸抽出装置を提供することを目的とするものである。

本発明の核酸抽出装置は、フィルター部材を備えた抽出カートリッジを用い、該抽出カートリッジに核酸を含む試料液を注入し加圧して該試料液中の核酸を前記フィルター部材に吸着させた後、前記抽出カートリッジに洗浄液を分注し加圧して不純物を除去した後、前記抽出カートリッジに回収液を分注し加圧して前記フィルター部材に吸着した核酸を分離して回収液とともに回収する抽出動作を自動的に行う核酸抽出装置であって、
前記抽出カートリッジ、前記試料液および洗浄液の排出液を収容する廃液容器および前記核酸を含む回収液を収容する回収容器を保持する搭載機構と、前記抽出カートリッジに加圧エアを導入する加圧エア供給機構と、前記抽出カートリッジに洗浄液および回収液を分注する分注機構とを備え、
前記加圧エア供給機構は、１台のエアポンプと、抽出カートリッジへの加圧エアの導入を開閉する開閉バルブと、抽出カートリッジの内圧を検出する圧力センサと、前記エアポンプと前記開閉バルブとの間のエア通路の圧力を大気開放作動するリリーフバルブとを備え、前記抽出カートリッジ内へ加圧エアを導入して密閉し、前記圧力センサの検出により該抽出カートリッジより液排出が完了した時点で、前記開閉バルブを開作動するとともに前記リリーフバルブを大気開放作動し、前記抽出カートリッジ内に残存する加圧エアを前記開閉バルブおよび前記リリーフバルブを経て大気開放することを特徴とするものである。

また、本発明の他の核酸抽出装置は、フィルター部材を備えた抽出カートリッジを用い、該抽出カートリッジに核酸を含む試料液を注入し加圧して該試料液中の核酸を前記フィルター部材に吸着させた後、前記抽出カートリッジに洗浄液を分注し加圧して不純物を除去した後、前記抽出カートリッジに回収液を分注し加圧して前記フィルター部材に吸着した核酸を分離して回収液とともに回収する抽出動作を自動的に行う核酸抽出装置であって、
複数の前記抽出カートリッジ、前記試料液および洗浄液の排出液を収容する廃液容器および前記核酸を含む回収液を収容する回収容器を保持する搭載機構と、前記抽出カートリッジに加圧エアを導入する加圧エア供給機構と、前記抽出カートリッジに洗浄液および回収液を分注する分注機構とを備え、
前記加圧エア供給機構は、１台のエアポンプと、各抽出カートリッジへの加圧エアの導入を個別に開閉する開閉バルブと、各抽出カートリッジの内圧を個別に検出する圧力センサと、前記エアポンプと前記開閉バルブとの間のエア通路の圧力を大気開放作動するリリーフバルブとを備え、１つの前記開閉バルブを開作動して対応する抽出カートリッジへ加圧エアを供給してから該開閉バルブを閉作動し、全ての前記開閉バルブが閉状態にあるときに前記リリーフバルブを大気開放作動し、前記エアポンプの駆動継続に伴う過剰加圧エアを前記リリーフバルブを経て大気開放することを特徴とするものである。

上記のような本発明によれば、抽出カートリッジ、廃液容器および回収容器を保持する搭載機構と、抽出カートリッジに加圧エアを導入する加圧エア供給機構と、抽出カートリッジに洗浄液および回収液を分注する分注機構とを備え、フィルター部材を備えた抽出カートリッジに核酸を含む試料液を注入し加圧して核酸をフィルター部材に吸着させた後、洗浄液を分注して不純物を洗浄排出した後、回収液を分注してフィルター部材に吸着した核酸を分離して回収する抽出動作を自動的に行って短時間で効率よく試料液の核酸を自動的に抽出できる機構をコンパクトに構成することができる。

さらに、加圧エア供給機構は、エアポンプと加圧エアの導入を開閉する開閉バルブとの間のエア通路の圧力を大気開放作動するリリーフバルブを備え、抽出カートリッジからの液の排出が終了した時点で開閉バルブを開作動するとともにリリーフバルブを大気開放作動して抽出カートリッジ内に残存する加圧エアを大気開放することにより、抽出カートリッジの排出部より液と共に残存エアが噴出されてミスト状に飛散するのを防止でき、これに起因するコンタミネーションの発生が防止できる。

また、他の発明では、個別に開閉する開閉バルブを順次開閉作動して抽出カートリッジに加圧エアを導入する際に、１つの開閉バルブを開作動して対応する抽出カートリッジへ加圧エアを供給してからその開閉バルブを閉作動し、次の開閉バルブを開作動するまでの全ての開閉バルブが閉状態にあるときに、リリーフバルブを大気開放作動してエアポンプの駆動継続に伴う過剰加圧エアを大気開放することにより、抽出カートリッジに導入される加圧エアが常に適正状態となり、内圧上昇による排出液の異常噴射などが発生することなく、これに起因するコンタミネーションの発生が防止できる。

以下、本発明の実施の形態を図面に沿って説明する。図１は一つの実施の形態における核酸抽出装置のカバーを除去した状態を示す斜視図、図２は核酸抽出装置の概略機構図、図３は搭載機構におけるラックの斜視図、図４はラックの使用状態を示す斜視図、図５は加圧エア供給機構のエア系統図、図６は抽出カートリッジ内圧力の変動を示す図、図７は抽出動作の工程図、図８は抽出カートリッジの斜視図である。

一実施形態の核酸抽出装置１の機構を説明する前に、この核酸抽出装置１は、図８に示すような抽出カートリッジ１１（フィルターカートリッジ）を用いて試料液中の核酸を抽出するものである。この抽出カートリッジ１１は、上端が開口した筒状本体１１ａの底部にフィルター部材１１ｂが保持され、筒状本体１１ａのフィルター部材１１ｂより下方部位はロート状に形成され、下端中心部に細管ノズル状の排出部１１ｃが所定長さに突出形成され、筒状本体１１ａの側部両側に縦方向の突起１１ｄが形成されてなる。上部開口より後述の試料液、洗浄液、回収液が分注され、上部開口より加圧エアが導入され、各液をフィルター部材１１ｂを通して排出部１１ｃより後述の廃液容器１２または回収容器１３に流下排出する。なお、図示の場合、筒状本体１１ａは上部と下部に分割され嵌着する構造となっている。

そして、核酸抽出装置１は基本的に図７(ａ)〜(ｇ)に示すような抽出工程によって核酸の抽出精製を行う。まず図７(ａ)工程で、廃液容器１２上に位置する抽出カートリッジ１１に溶解処理された核酸を含む試料液Ｓを注入する。次に図７(ｂ)工程で、抽出カートリッジ１１に加圧エアを導入して加圧し、フィルター部材１１ｂを通して試料液Ｓを通過させ、このフィルター部材１１ｂに核酸を吸着させ、通過した液状成分は廃液容器１２に排出する。

次に図７(ｃ)工程で抽出カートリッジ１１に洗浄液Ｗを自動分注し、(ｄ)工程で抽出カートリッジ１１に加圧エアを導入して加圧し、フィルター部材１１ｂに核酸を保持したままその他の不純物の洗浄除去を行い、通過した洗浄液Ｗは廃液容器１２に排出される。この(ｃ)工程および(ｄ)工程を複数回繰り返してもよい。

その後、(ｅ)工程で抽出カートリッジ１１の下方の廃液容器１２を回収容器１３に交換してから、(ｆ)工程で抽出カートリッジ１１に回収液Ｒを自動分注し、(ｇ)工程で抽出カートリッジ１１に加圧エアを導入して加圧し、フィルター部材１１ｂと核酸の結合力を弱め、吸着されている核酸を離脱させて、核酸を含む回収液Ｒを回収容器１３に排出し回収する。

上記抽出カートリッジ１１におけるフィルター部材１１ｂは、基本的には核酸が通過可能な多孔性であり、その表面は試料液中の核酸を化学的結合力で吸着する特性を有し、洗浄液による洗浄時にはその吸着を保持し、回収液による回収時に核酸の吸着力を弱めて離すように構成されてなる。その一例の具体的構成は、特開２００３−１２８６９１号の核酸の分離精製方法に詳述されているように、例えば、上記フィルター部材１１ｂは表面に水酸基を有する有機高分子で構成されている。表面に水酸基を有する有機高分子としては、アセチルセルロースの表面鹸化物が好ましい。アセチルセルロースとしては、モノアセチルセルロース、ジアセチルセルロース、トリアセチルセルロースのいずれでもよいが、特にはトリアセチルセルロースが好ましい。その表面が鹸化処理液（例えば、ＮａＯＨ）との接触により鹸化され、その構造体はアセチルセルロースのままである。表面鹸化処理の程度（表面鹸化度）で表面の水酸基の量（密度）がコントロールでき、水酸基の数が多い方が核酸の吸着効果が高くなる。例えば、トリアセチルセルロースなどのアセチルセルロースの場合には、表面鹸化率が約５％以上であることが好ましく、１０％以上であることがさらに好ましい。アセチルセルロースは多孔性膜が好適である。

前記「核酸を含む試料液Ｓ」は、細胞またはウィルスを含む検体を溶解処理することにより核酸を液中に分散させた溶液に水溶性有機溶媒を添加したものである。例えば診断分野においては、検体として採取された全血、血漿、血清、尿、便、精液、唾液等の体液、あるいは植物（またはその一部）、動物（またはその一部）など、あるいはそれらの溶解物およびホモジネートなどの生物材料から調製された溶液が対象となる。「溶解処理」は、細胞膜および核膜を溶解して核酸を可溶化する試薬（例えば、グアニジン塩、界面活性剤およびタンパク質分解酵素を含む溶液）を含む水溶液で処理するもので、例えば、対象となる試料が全血の場合、フィルター部材１１ｂへの非特異吸着および目詰まりを防ぐために赤血球および各種タンパク質を分解、低分子化し、抽出の対象である核酸を可溶化させるために白血球および核膜の溶解を行う。「水溶性有機溶媒」としてはエタノール、イソプロパノールまたはプロパノールなどが挙げられ、中でもエタノールが好ましい。水溶性有機溶媒の濃度は好ましくは５〜９０重量％であり、さらに好ましくは２０〜６０重量％である。エタノールの添加濃度は、凝集物を生じない程度でできるだけ高くすることが特に好ましい。

「洗浄液Ｗ」は、核酸と一緒にフィルター部材１１ｂに付着した試料液中の不純物を洗い流す機能を有し、核酸の吸着はそのままで不純物を離脱させる組成を有する。主剤と緩衝剤、および必要に応じて界面活性剤を含む水溶液からなる。主剤としてはメタノール、エタノール、イソプロパノール、ｎ−イソプロパノール、ブタノール、アセトン等の約１０〜１００重量％（好ましくは２０〜１００重量％、さらに好ましくは４０〜８０重量％）の水溶液が挙げられる。

「回収液Ｒ」は、塩濃度が低いことが好ましく、特には０．５Ｍ以下の塩濃度の溶液、例えば、精製蒸留水、ＴＥバッファ等が使用される。

前記核酸抽出装置１は、図１および図２に示すように、装置本体２に、複数の抽出カートリッジ１１、廃液容器１２および回収容器１３を保持する搭載機構３と、抽出カートリッジ１１に加圧エアを導入する加圧エア供給機構４と、抽出カートリッジ１１に洗浄液Ｗおよび回収液Ｒを分注する分注機構５などを備えてなる。次に各機構３〜５を具体的に説明する。

＜搭載機構＞
搭載機構３は、装置本体２の前方下部に搭載台２１を備え、この搭載台２１上に複数の抽出カートリッジ１１、廃液容器１２および回収容器１３を保持したラック６が載置される。ラック６は、図３にも示すように、スタンド６１とカートリッジホルダー６２と容器ホルダー６３とを備える。

スタンド６１は両側の柱状部６１ａに上下移動可能にカートリッジホルダー６２を保持し、柱状部６１ａの間の下部の底板６１ｂ上に前後移動可能に容器ホルダー６３を保持している。

カートリッジホルダー６２は、前後のプレート材の接合による２分割構造に構成され、横方向に延びる保持部６２ａの両端に上下方向に延びる支持脚６２ｂを備える。その支持脚６２ｂがスタンド６１の柱状部６１ａの上下方向の摺動溝６１ｃに上下移動可能に挿入され、この支持脚６２ｂがスタンド６１に内蔵された付勢部材（不図示）によって上方に付勢されている。保持部６２ａには複数の保持孔６２ｃが並設され、上方より抽出カートリッジ１１が挿入され、抽出カートリッジ１１の筒状本体１１ａの側部両側に形成された突起１１ｄ（図８参照）の下端がカートリッジホルダー６２内の係合部材（不図示）に係合保持される。係合部材は移動可能で、移動時には突起１１ｄとの係合を解除して抽出カートリッジ１１を全部同時に下方に落下廃棄するようになっている。

このカートリッジホルダー６２は上面の両側にピン孔６２ｄを備え、使用状態では後述の押えピン４９（図１参照）の先端４９ａが係合して下方に押し下げられる。図３のようにカートリッジホルダー６２が上昇した位置では、カートリッジホルダー６２に保持された抽出カートリッジ１１の排出部１１ｃの下端は容器ホルダー６３にセットされた廃液容器１２および回収容器１３より上方に位置しているが、図４に示すように、カートリッジホルダー６２が下降した際には抽出カートリッジ１１の排出部１１ｃが廃液容器１２または回収容器１３の内部に所定量挿入されるように設定されている。

容器ホルダー６３は、横方向に延びる廃液容器保持孔６３ａと回収容器保持孔６３ｂとを平行２列に備え、後側の廃液容器保持孔６３ａに複数の廃液容器１２が、前側の回収容器保持孔６３ｂに複数の回収容器１３がそれぞれ列状に保持される。廃液容器保持孔６３ａおよび回収容器保持孔６３ｂはカートリッジホルダー６２の保持孔６２ｃと等ピッチで等位置に配設され、複数保持された各抽出カートリッジ１１の下方にそれぞれ廃液容器１２および回収容器１３が位置するように設定されている。この廃液容器１２と回収容器１３とは混同防止のためにサイズ、形状等が異なったものを使用するのが好ましい。

上記容器ホルダー６３はスタンド６１に内蔵された不図示の付勢部材によって前方に付勢されている。容器ホルダー６３の容器交換移動（前後動）は、搭載台２１に設置された作動部材３１（図２参照）が、スタンド６１の底板６１ｂに形成された開口を通して、容器ホルダー６３の底部の係合孔（不図示）に係合されて行われる。容器交換モータ３２（ＤＣモータ）の駆動に応じた作動部材３１の移動動作に応じて容器ホルダー６３が後退移動され、カートリッジホルダー６２の下方に回収容器１３が位置するように作動する。非作動時には廃液容器１２がカートリッジホルダー６２の下方に位置するように不図示の付勢部材で付勢されている。上記容器交換モータ３２の作動は位置センサ３３ａ，３３ｂの検出に応じて制御される。

なお、廃液容器保持孔６３ａおよび回収容器保持孔６３ｂは有底に設けられ、廃液容器１２または回収容器１３がセットされていない状態で誤って液が滴下しても外部に流出して汚染が発生しないようになっている。

＜加圧エア供給機構＞
加圧エア供給機構４は、前記搭載機構３のラック６に対して昇降移動する加圧ヘッド４０に１列に並んで設置された複数（図の場合８個）のエアノズル４１と、図５のエア系統図にも示すように、加圧エアを発生するエアポンプ４３と、エア通路を大気開放するリリーフバルブ４４と、各エアノズル４１に対し設置されエアポンプ４３による加圧エアの供給を個別に開閉する開閉バルブ４５と、各エアノズル４１に設置され抽出カートリッジ１１の内圧を検出する圧力センサ４６とを備え、順次抽出カートリッジ１１に加圧エアを送給する。

前記加圧ヘッド４０は、装置本体２の中間フレーム２２と上フレーム２３との間に上下方向に設置されたガイドロッド２４に上下移動可能に保持されている。同様に上下方向に設置されたボールネジ２５に加圧ヘッド４０に設置されたボールナット４０ａが螺合し、昇降モータ４７（パルスモータ）の駆動に伴うタイミングベルト、プーリを介したボールネジ２５の回転により加圧ヘッド４０が、フォトセンサ４８ａ〜４８ｃの検出に伴う制御により昇降移動される。加圧ヘッド４０の両側には押えピン４９を有し、この押えピン４９はスプリング４９ｂで下方に付勢されて上下移動可能で、先端４９ａがカートリッジホルダー６２の上面のピン孔６２ｄに係合して位置を規制して押えるようになっている。

上記押えピン４９は、カートリッジホルダー６２を押圧作動している状態で、後述の洗浄液分注ノズル５１ｗおよび回収液分注ノズル５１ｒの横方向移動と干渉しないように、カートリッジホルダー６２の前側位置を押えるように配設されている。

エアノズル４１は加圧ヘッド４０にそれぞれ上下移動可能にかつ下方に付勢されて設置され、その下方にはエアノズル４１に対応した連通孔４２ａ（図２参照）が開口されたシート状のシール材４２が配設され、加圧ヘッド４０が下降移動した際に、カートリッジホルダー６２にセットされた抽出カートリッジ１１の上端開口を、エアノズル４１先端でシール材４２を介して押圧して密閉し、連通孔４２ａを通して抽出カートリッジ１１内へ加圧エアが送給可能となる。

リリーフバルブ４４（図５）は通常は閉状態にあり、エアポンプ４３から開閉バルブ４５への通路のエアを排出する際に大気開放作動される。開閉バルブ４５は選択的に開作動されて、エアポンプ４３からの加圧エアを対応するエアノズル４１を経て抽出カートリッジ１１内に導入するようにエア回路が構成されている。圧力センサ４６は各エアノズル４１に設置され、抽出カートリッジ１１の内圧を個別に検出するものであり、検出圧力が加圧上限用の指定圧力（例えば９０ｋＰａ）となったときに対応する開閉バルブ４５を閉作動して加圧エアの送給を停止したり、また、抽出カートリッジ１１よりの液排出の完了に伴う圧力低下の検出により加圧終了を判定し次の工程に移行するなどの制御が行われる。

また、前記圧力センサ４６による抽出カートリッジ１１内の圧力変動より、カートリッジホルダー６２への抽出カートリッジ１１のセットの有無検出、液の有無検出、液量不足の検出、フィルター詰まりの検出を行うようになっている。詳細は図６により後述する。

図５に示したリリーフバルブ４４の大気開放作動は、抽出カートリッジ１１からの液が排出された加圧終了の判定に応じて対応する開閉バルブ４５の開作動と同時に行い、抽出カートリッジ１１内に残留する加圧エアを抜いて先端排出部１１ｃからのエア噴出による液飛散を阻止する。なお、このリリーフバルブ４４の作動の場合には、本実施の形態では抽出カートリッジ１１が複数であるが、１本としても適用が可能である。

また、上記リリーフバルブ４４の大気開放作動の他の形態としては、全部の開閉バルブ４５が閉じているときに大気開放作動し、連続駆動されるエアポンプ４３による過剰加圧エアを逃がし、連続運転している間に圧力が上昇した加圧エアが開閉バルブ４５の開作動に伴って急激に抽出カートリッジ１１内に供給されるのを防止するようにしている。

さらに、上記両方の機能を得るようにリリーフバルブ４４の大気開放作動を行うようにしてもよい。

＜分注機構＞
分注機構５は、ラック６上を横方向に移動可能なノズル移動台５０に設置された洗浄液分注ノズル５１ｗおよび回収液分注ノズル５１ｒと、洗浄液ボトル５６ｗに収容された洗浄液Ｗを洗浄液分注ノズル５１ｗに給送する洗浄液供給ポンプ５２ｗと、回収液ボトル５６ｒに収容された回収液Ｒを回収液分注ノズル５１ｒに給送する回収液供給ポンプ５２ｒと、搭載台２１に載置された廃液ボトル５７などを備える。

ノズル移動台５０は、装置本体２の縦壁２６に水平方向に設置されたガイドレール２７に保持されて横方向に移動可能であり、その移動が不図示のノズル移動モータ（パルスモータ）によって各抽出カートリッジ１１上で順次停止し、復帰状態では廃液ボトル５７上に停止するように駆動制御される。洗浄液分注ノズル５１ｗおよび回収液分注ノズル５１ｒは先端が下方に向けて屈曲され、洗浄液分注ノズル５１ｗは切替弁５５ｗを介して洗浄液供給ポンプ５２ｗに接続され、洗浄液供給ポンプ５２ｗは切替弁５５ｗを介して洗浄液ボトル５６ｗに接続され、回収液分注ノズル５１ｒは切替弁５５ｒを介して回収液供給ポンプ５２ｒに接続され、回収液供給ポンプ５２ｒは切替弁５５ｒを介して回収液ボトル５６ｒに接続されている。洗浄液ボトル５６ｗおよび回収液ボトル５６ｒはそれぞれ装置本体２の側部に装着される。洗浄液供給ポンプ５２ｗおよび回収液供給ポンプ５２ｒはシリンジポンプで構成され、そのピストン部材がそれぞれポンプモータ５３ｗ，５３ｒ（パルスモータ）によってセンサ５４ｗ，５４ｒの位置検出に基づいて所定量の洗浄液Ｗおよび回収液Ｒを分注するように駆動制御される。

すなわち、洗浄液Ｗまたは回収液Ｒを分注する場合には、切替弁５５ｗまたは５５ｒを洗浄液ボトル５６ｗまたは回収液ボトル５６ｒ側に切り替え、ポンプモータ５３ｗまたは５３ｒを駆動して洗浄液供給ポンプ５２ｗまたは回収液供給ポンプ５２ｒのピストン部材を後退作動させ、洗浄液Ｗまたは回収液Ｒを洗浄液供給ポンプ５２ｗまたは回収液供給ポンプ５２ｒの内部に吸引収容し、続いて切替弁５５ｗまたは５５ｒを洗浄液分注ノズル５１ｗまたは回収液分注ノズル５１ｒ側へ切り替え、ポンプモータ５３ｗまたは５３ｒを駆動して洗浄液供給ポンプ５２ｗまたは回収液供給ポンプ５２ｒのピストン部材を押込作動させ、廃液ボトル５７に対して通路内のエアを排出するまで洗浄液または回収液を洗浄液分注ノズル５１ｗまたは回収液分注ノズル５１ｒより吐出させた後、洗浄液供給ポンプ５２ｗまたは回収液供給ポンプ５２ｒの駆動を停止させる。その後、洗浄液分注ノズル５１ｗまたは回収液分注ノズル５１ｒを抽出カートリッジ１１上に移動させてから、洗浄液供給ポンプ５２ｗまたは回収液供給ポンプ５２ｒの駆動量を制御して所定量の洗浄液Ｗまたは回収液Ｒを抽出カートリッジ１１へ分注するものである。

そして、上記のような各機構３〜５は、装置本体２の上部に設置された操作パネル７の入力操作に対応し、連係された不図示の制御ユニットにより内蔵されたプログラムに基づいて駆動制御される。

上記核酸抽出装置１による抽出動作を具体的に説明する。まず搭載機構３のラック６におけるカートリッジホルダー６２に抽出カートリッジ１１をセットし、容器ホルダー６３に廃液容器１２および回収容器１３をそれぞれセットし、このラック６を装置本体２の搭載台２１に載置して準備を行う。次に、溶解処理された試料液Ｓをピペット等によって各抽出カートリッジ１１に順次注入する。なお、装置１に搭載する前のラック６にセットした後またはセットする前の抽出カートリッジ１１に試料液Ｓを先に注入するようにしてもよい。

その後、操作パネル７の操作によって装置を作動させると、加圧エア供給機構４の昇降モータ４７の駆動によって加圧ヘッド４０が下降移動し、押えピン４９の先端４９ａがカートリッジホルダー６２のピン孔６２ｄに係合して押さえつけて、このカートリッジホルダー６２を下降させて位置を規制すると共に、抽出カートリッジ１１の下端排出部１１ｃを図４のように廃液容器１２内に所定量挿入させて、排出液が飛散等によって外部に漏れてコンタミネーションの原因とならないようにする。さらに加圧ヘッド４０が下降移動してシール材４２を介して各エアノズル４１の下端部が抽出カートリッジ１１の上端開口に圧接して密閉する。前記押えピン４９がカートリッジホルダー６２の位置を規制していることで、各抽出カートリッジ１１に対し各エアノズル４１が正確に圧接して確実な密閉が確保できる。

その後、加圧エアの供給が行われるもので、まず１番目の開閉バルブ４５が開作動され、残りの開閉バルブ４５が閉状態でエアポンプ４３が駆動される。そして、１番目のエアノズル４１を通して１番目の抽出カートリッジ１１にエアポンプ４３からの加圧エアが供給され、その圧力センサ４６の検出によって加圧上限用の指定圧力に上昇すると１番目の開閉バルブ４５を閉作動し、加圧状態で抽出カートリッジ１１への圧力を密閉すると共にリリーフバルブ４４が開放作動され、続いて、２番目の開閉バルブ４５が開作動されると共にリリーフバルブ４４が閉作動されて２番目のエアノズル４１を通して２番目の抽出カートリッジ１１に加圧エアが供給される。この動作を順に繰り返して全ての抽出カートリッジ１１に圧力を加える。そして、全部の抽出カートリッジ１１への加圧エアの供給が終了して全開閉バルブ４５が閉状態となるとエアポンプ４３の駆動を停止し、リリーフバルブ４４を大気開放作動する。

そして、加圧エアが導入された抽出カートリッジ１１では、試料液Ｓは圧力の作用によりフィルター部材１１ｂを通って核酸が吸着保持され、その他の液状成分は下端部の排出部１１ｃより廃液容器１２に排出される。試料液Ｓが全てフィルター部材１１ｂを通過すると内圧が液排出完了時点で急激に低下し、これが圧力センサ４６によって検出された加圧終了の時点で、対応する開閉バルブ４５を開作動して、抽出カートリッジ１１内に残留している加圧エアをリリーフバルブ４４を介して大気開放し、抽出カートリッジ１１の排出部１１ｃから液と共に噴出されるのを阻止する。各圧力センサ４６によって全部の抽出カートリッジ１１で加圧終了が検出されると、加圧ヘッド４０が上昇作動される。

上記抽出カートリッジ１１内への加圧エアの導入に伴う内圧は、正常動作状態においては図６に曲線Ａで示す特性で変動し、曲線Ｂはその変化量を示す微分波形である。まず、開閉バルブ４５が開作動されて加圧エアが導入開始された時間０点より圧力が直線的に上昇し、加圧上限用の指定圧力（例えば９０ｋＰａ）に到達したａ点で開閉バルブ４５が閉作動されて、抽出カートリッジ１１の内部空間は加圧状態で密閉される。その圧力が液に作用してフィルター部材１１ｂを通過させるように加圧し、液が徐々に減少するのに伴って圧力が低下し、ｂ点で液の全量がフィルター部材１１ｂを通過して液排出が完了すると、フィルター部材１１ｂでのエア抵抗が低減して圧力は急激に低下する。その圧力変動は微分波形曲線Ｂでは顕著に発生することからそれを検出し、加圧終了を判定する。

また、上記加圧終了の判定は、単位時間あたりの圧力低下変化量が所定値以上であることにより行うか、検出圧力が加圧終了判定用の指定圧力以下であることより行うようにしてもよく、これらを併用して時間短縮を図るのが好ましい。

試料液Ｓの加圧の場合には、その粘度等に応じて圧力変動が異なり、粘度が低い液では、ａ点後のｂ点に至る圧力低下度合いが大きくなり、ｂ点までの時間が短くなる。また、液の粘度が大きい場合で、フィルター部材１１ｂに軽度の詰まりが生じているときには、ａ点後のｂ点に至る圧力低下度合いが小さくなり、ｂ点までの時間が長くなる。

そして、前記圧力センサ４６により検出された内圧の変動特性から加圧不良状態の検出、例えば、抽出カートリッジ１１のセットの有無検出、液の有無検出、密閉不良の検出、また、液量不足の検出、フィルター詰まりの判定検出を行うようになっている。

まず加圧不良状態の検出は、開閉バルブ４５を開作動してエアノズル４１より加圧エアを噴出してから所定時間経過後にも圧力センサ４６による検出圧力が、例えば１０ｋＰａと低く設定された加圧不良判定用の指定圧力に到達しない場合に行うもので、この場合には、エア抵抗が少ない異常状態であって、抽出カートリッジ１１がセットされてない状態、または、試料液が注入されていない状態、または、エアノズル４１と抽出カートリッジ１１との間が密閉不良状態であると判定できる。

また、抽出カートリッジ１１への試料液Ｓの注入が規定量でなく微量である場合には、初期圧力は上記加圧不良判定用の指定圧力以上に上昇するが、開閉バルブ４５を閉作動する加圧上限用の指定圧力までは上昇せず、その途中で液の排出が完了して圧力が急激に低下することにより液量不足であったと判定する。

一方、フィルター詰まりの検出は、液排出に伴って検出圧力は徐々に低下するが、この圧力低下が少なく、所定時間経過しても前述の液排出完了時の加圧終了判定が行えず、加圧終了判定用の指定圧力より低下しない場合に、フィルター詰まりが発生していると判定する。また、圧力低下変化量が所定値以上とならない時間が所定時間以上継続したことによりフィルター詰まりを検出するようにしてもよい。

この加圧時の圧力上昇不足時の加圧不良検出、液排出完了に伴う加圧終了検出、およびフィルター詰まり検出は、後述の洗浄処理および回収処理においても同様に行われる。

次に、洗浄処理に移行するが、上記加圧エア供給後の加圧ヘッド４０の上昇は、エアノズル４１が抽出カートリッジ１１より離れ、ノズル移動台５０の移動が許容できる高さまで上昇した位置で停止し、押えピン４９がカートリッジホルダー６２を押さえつけ、抽出カートリッジ１１の下端が廃液容器１２内に挿入されている図４の状態を保持して行う。そして、ノズル移動台５０を移動させて洗浄液分注ノズル５１ｗを１番目の抽出カートリッジ１１上に停止させて洗浄液Ｗを所定量分注し、ノズル移動台５０を次の抽出カートリッジ１１に移動させて順次洗浄液Ｗを分注する。全部の抽出カートリッジ１１への洗浄液Ｗの分注が終了すると、加圧ヘッド４０が下降移動し、各エアノズル４１の下端部がシール材４２を介して抽出カートリッジ１１の上端開口に圧接して密閉してから、前述と同様に開閉バルブ４５が順次開作動されて各抽出カートリッジ１１に加圧エアが供給される。圧力が作用した洗浄液Ｗは、フィルター部材１１ｂを通って核酸以外の不純物の洗浄除去を行い、洗浄液Ｗは下端部の排出部１１ｃより廃液容器１２に排出される。全部の抽出カートリッジ１１における洗浄液Ｗが全てフィルター部材１１ｂを通過して排出されると、加圧ヘッド４０が初期の位置まで上昇作動される。洗浄処理を複数回行う場合には上記動作を繰り返す。

なお、前述の加圧不良状態と判定された箇所またはフィルター詰まりが発生した箇所の抽出カートリッジ１１へは洗浄液の分注は行わないと共に、加圧エアの供給も行わないように制御する。また、これらの箇所を除いた正常作動部位の複数の開閉バルブ４５を同時に開作動して抽出カートリッジ１１に対する加圧エアの供給を複数同時に行うようにしてもよい。

次に、回収処理に移行する。まず洗浄処理後の前記加圧ヘッド４０の上昇により、押えピン４９が上昇してラック６のカートリッジホルダー６２も上昇移動し、抽出カートリッジ１１の下端排出部１１ｃが廃液容器１２より上方へ移動した後、搭載機構３の作動部材３１を作動させて容器ホルダー６３を後退移動させ、抽出カートリッジ１１の下方に回収容器１３を位置させる容器交換を行う。

続いて、加圧ヘッド４０が下降移動し、押えピン４９の先端がカートリッジホルダー６２のピン孔６２ｄに係合して押さえつける。そして、ノズル移動台５０を移動させて回収液分注ノズル５１ｒを１番目の抽出カートリッジ１１上に停止させて回収液Ｒを所定量分注し、ノズル移動台５０を次の抽出カートリッジ１１に移動させて順次回収液Ｒの分注を行う。全部の抽出カートリッジ１１への回収液Ｒの分注が終了すると、前述と同様にさらに加圧ヘッド４０が下降し、各エアノズル４１の下端部をシール材４２を介して抽出カートリッジ１１の上端開口に圧接させて密閉してから、開閉バルブ４５が順次開作動されて各抽出カートリッジ１１に加圧エアが供給される。複数の開閉バルブ４５を同時に開作動して加圧エアの供給を同時に行うようにしてもよい。圧力が作用した回収液Ｒは、フィルター部材１１ｂを通ってそれに吸着されている核酸を離脱させて、回収液Ｒとともに核酸が下端部の排出部１１ｃより回収容器１３に排出される。全部の抽出カートリッジ１１における回収液Ｒが全て回収容器１３に排出されると、加圧ヘッド４０が上昇作動され、一連の動作が終了する。

抽出動作が終了したラック６は搭載台２１より下ろされ、抽出カートリッジ１１および廃液容器１２はカートリッジホルダー６２および容器ホルダー６３より取り出されて廃棄され、一方、回収容器１３は容器ホルダー６３より取り出され、必要に応じて蓋がされて、次の核酸分析処理等が施される。

本発明の一つの実施の形態における核酸抽出装置のカバーを除去した状態を示す斜視図 核酸抽出装置の概略機構図 搭載機構におけるラックの斜視図 ラックの使用状態を示す斜視図 加圧エア供給機構のエア系統図 抽出カートリッジの内圧変動を示す図 抽出動作の工程図 抽出カートリッジの斜視図

符号の説明

１ 核酸抽出装置
２ 装置本体
３ 搭載機構
４ 加圧エア供給機構
５ 分注機構
６ ラック
11 抽出カートリッジ
11b フィルター部材
12 廃液容器
13 回収容器
40 加圧ヘッド
41 エアノズル
43 エアポンプ
44 リリーフバルブ
45 開閉バルブ
46 圧力センサ
49 押えピン
50 ノズル移動台
51w,51r 分注ノズル
52w,52r 供給ポンプ
56w,56r ボトル
61 スタンド
62 カートリッジホルダー
63 容器ホルダー
Ｓ 試料液
Ｗ 洗浄液
Ｒ 回収液

Claims (2)

1. フィルター部材を備えた抽出カートリッジを用い、該抽出カートリッジに核酸を含む試料液を注入し加圧して該試料液中の核酸を前記フィルター部材に吸着させた後、前記抽出カートリッジに洗浄液を分注し加圧して不純物を除去した後、前記抽出カートリッジに回収液を分注し加圧して前記フィルター部材に吸着した核酸を分離して回収液とともに回収する抽出動作を自動的に行う核酸抽出装置であって、
   前記抽出カートリッジ、前記試料液および洗浄液の排出液を収容する廃液容器および前記核酸を含む回収液を収容する回収容器を保持する搭載機構と、前記抽出カートリッジに加圧エアを導入する加圧エア供給機構と、前記抽出カートリッジに洗浄液および回収液を分注する分注機構とを備え、
   前記加圧エア供給機構は、１台のエアポンプと、抽出カートリッジへの加圧エアの導入を開閉する開閉バルブと、抽出カートリッジの内圧を検出する圧力センサと、前記エアポンプと前記開閉バルブとの間のエア通路の圧力を大気開放作動するリリーフバルブとを備え、前記抽出カートリッジ内へ加圧エアを導入して密閉し、前記圧力センサの検出により該抽出カートリッジより液排出が完了した時点で、前記開閉バルブを開作動するとともに前記リリーフバルブを大気開放作動し、前記抽出カートリッジ内に残存する加圧エアを前記開閉バルブおよび前記リリーフバルブを経て大気開放することを特徴とする核酸抽出装置。
2. フィルター部材を備えた抽出カートリッジを用い、該抽出カートリッジに核酸を含む試料液を注入し加圧して該試料液中の核酸を前記フィルター部材に吸着させた後、前記抽出カートリッジに洗浄液を分注し加圧して不純物を除去した後、前記抽出カートリッジに回収液を分注し加圧して前記フィルター部材に吸着した核酸を分離して回収液とともに回収する抽出動作を自動的に行う核酸抽出装置であって、
   複数の前記抽出カートリッジ、前記試料液および洗浄液の排出液を収容する廃液容器および前記核酸を含む回収液を収容する回収容器を保持する搭載機構と、前記抽出カートリッジに加圧エアを導入する加圧エア供給機構と、前記抽出カートリッジに洗浄液および回収液を分注する分注機構とを備え、
   前記加圧エア供給機構は、１台のエアポンプと、各抽出カートリッジへの加圧エアの導入を個別に開閉する開閉バルブと、各抽出カートリッジの内圧を個別に検出する圧力センサと、前記エアポンプと前記開閉バルブとの間のエア通路の圧力を大気開放作動するリリーフバルブとを備え、１つの前記開閉バルブを開作動して対応する抽出カートリッジへ加圧エアを供給してから該開閉バルブを閉作動し、全ての前記開閉バルブが閉状態にあるときに前記リリーフバルブを大気開放作動し、前記エアポンプの駆動継続に伴う過剰加圧エアを前記リリーフバルブを経て大気開放することを特徴とする核酸抽出装置。

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