JP2004524801A5 - - Google Patents
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Description
【特許請求の範囲】
【請求項1】 細胞における遺伝子発現を分析するために1セットの核酸を選択する方法であって、該方法は、以下:
a)複数の核酸配列を含むデータベースを提供する工程であって、該核酸配列の各々が、タンパク質コード配列の全長または部分長、ならびに該タンパク質コード配列の下流に隣接している3’非翻訳領域配列を含む、工程;
b)3’非翻訳領域(UTR)の上流に隣接して位置する1セットのタンパク質コード配列を同定することによって、該データベースから該タンパク質コード配列を抽出する工程であって、該3’非翻訳領域(UTR)が、以下の標的配列:
i)第一標的配列WU/T(AU/TU/TU/TA)U/TWWWであって、ここでこの括弧の外側のヌクレオチドが、異なるヌクレオチドで置換されていないか、またはそのうち1つが異なるヌクレオチドで置換されており、ここでWがA,U、もしくはTを示す、第一標的配列;または
ii)第二標的配列U/T(AU/TU/TU/T)nであって、ここでnは、該第二標的配列がこの括弧内の四量体配列のうち3〜12を含むことを示す、第二標的配列、
の1つを含む、工程、
を包含する、方法。
【請求項2】 前記データベースが、mRNA配列、cDNA配列、またはその両方を含む、請求項1に記載の方法。
【請求項3】 前記データベースがゲノム配列を含む、請求項1に記載の方法。
【請求項4】 前記データベースがゲノム配列を含む、請求項1に記載の方法であって、該方法はさらに、前記セットから、前記3’UTR以外の領域において標的配列を有する遺伝子の前記タンパク質コード配列を除外する工程、
を包含する、方法。
【請求項5】 細胞における遺伝子発現を分析するための核酸分子のライブラリーを調製する方法であって、以下:
a)2つ以上の核酸分子の群を獲得する工程であって、ここで該核酸分子のタンパク質コード配列は、請求項1に記載の方法によって選択され、該核酸分子の各々の該タンパク質コード配列は、該群における他の核酸分子のタンパク質コード配列とは異なる、工程、および
b)該核酸分子の各々を別々の核酸ベクターに組み込んで該ライブラリーを提供する工程、
を包含する、方法。
【請求項6】 前記核酸分子を配列決定する工程をさらに包含する、請求項5に記載の方法。
【請求項7】 請求項5に記載の方法によって調製された、核酸ライブラリー。
【請求項8】 細胞中のARE遺伝子の発現を分析するための、カスタマイズされたアレイを調製する方法であって、該方法は、以下:
(a)請求項1に記載の方法によって選択した複数の前記核酸分子の前記タンパク質コード配列を決定する工程;
(b)該核酸分子の各々についての遺伝子プローブを固体支持体に結合させて該アレイを提供する工程、
を包含し、
ここで該プローブの各々が、該タンパク質コード配列またはその相補体内の標的領域に対して、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、
ここで、該プローブの各々が、ヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド、cDNA分子、または合成遺伝子プローブである、方法。
【請求項9】 請求項8に記載の方法によって調製された、カスタマイズされたアレイ。
【請求項10】 3’非翻訳領域がARE配列を含む遺伝子の開始領域に標的化されたプライマーセットを同定するための方法であって、以下:
a)複数の遺伝子のタンパク質コード配列の開始コドンを位置付ける工程であって、該遺伝子の3’UTRが以下の標的配列:
i)第一標的配列WU/T(AU/TU/TU/TA)U/TWWW(配列番号1)であって、ここでこの括弧の外側の該ヌクレオチドが、異なるヌクレオチドで置換されていないか、またはそのうち1つが異なるヌクレオチドで置換されており、ここでWがA,U、もしくはTを示す、第一標的配列;または
ii)第二標的配列U/T(AU/TU/TU/T)n(配列番号2)であって、ここでnは、該第二標的配列がこの括弧内の四量体配列のうち3〜12を含むことを示す、第二標的配列、
のうち1つを含む、工程;
b)該遺伝子を以下:
i)開始コドンが3’末端に結合されたAを有するATGa遺伝子、および
ii)開始コドンが3’末端に結合されたCを有するATGc遺伝子、
iii)開始コドンが3’末端に結合されたGを有するATGg遺伝子、
iv)開始コドンが3’末端に結合されたTを有するATGt遺伝子、
からなる群より選択されるクラスにグループ分けする工程;ならびに
c)該開始コドンの直ぐ上流に位置する9ヌクレオチド、および該開始コドンの直ぐ下流に位置する該ヌクレオチドを分析することによって該クラスの各々についてのコンセンサス配列を構築する工程、
を包含し、
ここで該コンセンサス配列の各々は13ヌクレオチド長であり、
該コンセンサス配列の各々は、関連のクラスにおける遺伝子の少なくとも75%を包含し、そして
該4つのコンセンサス配列の各々によって包含される該オリゴヌクレオチドが1つのプライマーセットである、
方法。
【請求項11】 ARE遺伝子転写物を選択的に増幅する方法であって、該方法は、以下:
a)オリゴdTプライマーおよび逆転写酵素を用いて、1つ以上のARE遺伝子を発現する細胞から得たRNA分子を逆転写して、一本鎖DNA分子のプールを提供する工程;
b)ポリメラーゼ連鎖反応によって、該プール内のARE含有DNA分子の一部を増幅する工程であって、該ポリメラーゼ連鎖反応は、以下:
i)13〜50ヌクレオチド長であり、そしてTAAAT配列を有する2〜10のペンタマーを含む3’プライマーであって、該ペンタマー配列は重複しているかまたは重複していない、3’プライマー;および
ii)請求項10に記載の方法によって得られた5’プライマーセットのうち1つによって包含される1つ以上のプライマー、
を使用する、工程、
を包含する、方法。
【請求項12】 細胞における遺伝子発現を分析するための核酸分子のライブラリーを調製する方法であって、該方法は、以下:
a)2つ以上の核酸分子の群を獲得する工程であって、該核酸分子のタンパク質コード配列は、請求項11に記載の方法によって同定され、該2つ以上の核酸分子の各々の該タンパク質コード配列は、該群における他の核酸分子のタンパク質コード配列とは異なる、工程、および
b)該核酸分子の各々を別々の核酸ベクターに組み込んで該ライブラリーを提供する工程、
を包含する、方法。
【請求項13】 請求項12に記載の方法によって調製された、核酸ライブラリー。
【請求項14】 細胞中のARE遺伝子の発現を分析するためのカスタマイズされたアレイを調製する方法であって、該方法は、以下:
(a)請求項11に記載の方法によって増幅した複数のARE核酸分子の前記タンパク質コード配列を決定する工程;
(b)該核酸分子の各々についての遺伝子プローブを固体支持体に結合させて該アレイを提供する工程、
を包含し、
ここで、該プローブの各々が、ストリンジェントな条件下で、該タンパク質コード配列またはその相補体内の標的領域にハイブリダイズし、そして
該プローブの各々が、核酸塩基を含む、オリゴヌクレオチド、cDNA分子、または合成遺伝子プローブである、方法。
【請求項15】 請求項14に記載の方法によって調製された、カスタマイズされたアレイ。
【請求項16】 請求項15に記載のカスタマイズされたアレイであって、前記プローブが少なくとも10ヌクレオチド長であるオリゴヌクレオチドであり、該オリゴヌクレオチドのGC含量が少なくとも40%であり、そして該オリゴヌクレオチドがヘアピン構造を形成しない、カスタマイズされたアレイ。
【請求項17】 ARE遺伝子転写物を選択的に増幅する方法であって、該方法は、以下:
a)逆転写酵素および5’末端にNH2基を有するオリゴdTプライマーを用いて、1つ以上のARE遺伝子を発現する細胞から得たRNA分子を逆転写して、一本鎖cDNA分子のプールを提供する工程;
b)オリゴマーを該cDNA分子に連結する工程であって、該オリゴマーは、50〜70ヌクレオチド長であり、該オリゴマーは3’末端でリン酸化されかつNH2によって5’末端で保護されており、該オリゴマーは、ヒトmRNA分子に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズしない配列を有する、工程
c)ポリメラーゼ連鎖反応によって工程(b)において生成された該cDNA分子内のARE含有DNA分子をPCR増幅する工程であって、該工程は、以下:
i)13〜50ヌクレオチド長であり、そしてTAAAT配列を有する2〜10のペンタマーを含む3’プライマーであって、該ペンタマー配列は重複しているかまたは重複していない、3’プライマー;および
ii)配列が該オリゴマー内に含まれる配列に対して同一である5’プライマー、を使用する、工程、
を包含する、方法。
【請求項18】 前記3’プライマーのCG含量が少なくとも40%である、請求項17に記載の方法。
【請求項19】 工程(d)によって生成される前記ARE含有DNA分子を配列決定する工程をさらに包含する、請求項17に記載の方法。
【請求項20】 細胞における遺伝子発現を分析するための核酸分子のライブラリーを調製する方法であって、該方法は、以下:
a)2つ以上の核酸分子の群を獲得する工程であって、該核酸分子のタンパク質コード配列は、請求項19に記載の方法によって同定され、該2つ以上の核酸分子の各々の該タンパク質コード配列は、該群における他の核酸分子のタンパク質コード配列とは異なる、工程、および
b)該核酸分子の各々を別々の核酸ベクターに組み込んで該ライブラリーを提供する工程、
を包含する、方法。
【請求項21】 請求項20に記載の方法によって調製された、核酸ライブラリー。
【請求項22】 細胞中の遺伝子発現を分析するためのカスタマイズされたアレイを調製する方法であって、該方法は、以下:
(a)請求項17に記載の方法によって増幅した複数のARE核酸分子の前記タンパク質コード配列を決定する工程;
(b)該核酸分子の各々についての遺伝子プローブを固体支持体に結合させて該アレイを提供する工程、
を包含し、
ここで、該プローブが、ストリンジェントな条件下で、該タンパク質コード配列またはその相補体内の標的領域にハイブリダイズし、そして
該プローブが、核酸塩基を含む、オリゴヌクレオチド、cDNA分子、または合成遺伝子プローブである、方法。
【請求項23】 請求項22に記載の方法によって調製された、カスタマイズされたアレイ。
【請求項24】 被験体におけるARE発現プロフィールを得る方法であって、以下:
a)該被験体から得た組織サンプルからRNAを抽出する工程;
b)検出可能なタグを用いて該RNAを標識する工程;
c)請求項9に記載のマイクロアレイ、請求項15に記載のマイクロアレイ、請求項23に記載のマイクロアレイからなる群より選択されるマイクロアレイと、該標識されたRNAとを接触させる工程;および
d)該マイクロアレイ上に存在するプローブとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする標識されたRNA分子の配列またはパターンを決定する工程、を包含する、方法。
【請求項1】 細胞における遺伝子発現を分析するために1セットの核酸を選択する方法であって、該方法は、以下:
a)複数の核酸配列を含むデータベースを提供する工程であって、該核酸配列の各々が、タンパク質コード配列の全長または部分長、ならびに該タンパク質コード配列の下流に隣接している3’非翻訳領域配列を含む、工程;
b)3’非翻訳領域(UTR)の上流に隣接して位置する1セットのタンパク質コード配列を同定することによって、該データベースから該タンパク質コード配列を抽出する工程であって、該3’非翻訳領域(UTR)が、以下の標的配列:
i)第一標的配列WU/T(AU/TU/TU/TA)U/TWWWであって、ここでこの括弧の外側のヌクレオチドが、異なるヌクレオチドで置換されていないか、またはそのうち1つが異なるヌクレオチドで置換されており、ここでWがA,U、もしくはTを示す、第一標的配列;または
ii)第二標的配列U/T(AU/TU/TU/T)nであって、ここでnは、該第二標的配列がこの括弧内の四量体配列のうち3〜12を含むことを示す、第二標的配列、
の1つを含む、工程、
を包含する、方法。
【請求項2】 前記データベースが、mRNA配列、cDNA配列、またはその両方を含む、請求項1に記載の方法。
【請求項3】 前記データベースがゲノム配列を含む、請求項1に記載の方法。
【請求項4】 前記データベースがゲノム配列を含む、請求項1に記載の方法であって、該方法はさらに、前記セットから、前記3’UTR以外の領域において標的配列を有する遺伝子の前記タンパク質コード配列を除外する工程、
を包含する、方法。
【請求項5】 細胞における遺伝子発現を分析するための核酸分子のライブラリーを調製する方法であって、以下:
a)2つ以上の核酸分子の群を獲得する工程であって、ここで該核酸分子のタンパク質コード配列は、請求項1に記載の方法によって選択され、該核酸分子の各々の該タンパク質コード配列は、該群における他の核酸分子のタンパク質コード配列とは異なる、工程、および
b)該核酸分子の各々を別々の核酸ベクターに組み込んで該ライブラリーを提供する工程、
を包含する、方法。
【請求項6】 前記核酸分子を配列決定する工程をさらに包含する、請求項5に記載の方法。
【請求項7】 請求項5に記載の方法によって調製された、核酸ライブラリー。
【請求項8】 細胞中のARE遺伝子の発現を分析するための、カスタマイズされたアレイを調製する方法であって、該方法は、以下:
(a)請求項1に記載の方法によって選択した複数の前記核酸分子の前記タンパク質コード配列を決定する工程;
(b)該核酸分子の各々についての遺伝子プローブを固体支持体に結合させて該アレイを提供する工程、
を包含し、
ここで該プローブの各々が、該タンパク質コード配列またはその相補体内の標的領域に対して、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、
ここで、該プローブの各々が、ヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド、cDNA分子、または合成遺伝子プローブである、方法。
【請求項9】 請求項8に記載の方法によって調製された、カスタマイズされたアレイ。
【請求項10】 3’非翻訳領域がARE配列を含む遺伝子の開始領域に標的化されたプライマーセットを同定するための方法であって、以下:
a)複数の遺伝子のタンパク質コード配列の開始コドンを位置付ける工程であって、該遺伝子の3’UTRが以下の標的配列:
i)第一標的配列WU/T(AU/TU/TU/TA)U/TWWW(配列番号1)であって、ここでこの括弧の外側の該ヌクレオチドが、異なるヌクレオチドで置換されていないか、またはそのうち1つが異なるヌクレオチドで置換されており、ここでWがA,U、もしくはTを示す、第一標的配列;または
ii)第二標的配列U/T(AU/TU/TU/T)n(配列番号2)であって、ここでnは、該第二標的配列がこの括弧内の四量体配列のうち3〜12を含むことを示す、第二標的配列、
のうち1つを含む、工程;
b)該遺伝子を以下:
i)開始コドンが3’末端に結合されたAを有するATGa遺伝子、および
ii)開始コドンが3’末端に結合されたCを有するATGc遺伝子、
iii)開始コドンが3’末端に結合されたGを有するATGg遺伝子、
iv)開始コドンが3’末端に結合されたTを有するATGt遺伝子、
からなる群より選択されるクラスにグループ分けする工程;ならびに
c)該開始コドンの直ぐ上流に位置する9ヌクレオチド、および該開始コドンの直ぐ下流に位置する該ヌクレオチドを分析することによって該クラスの各々についてのコンセンサス配列を構築する工程、
を包含し、
ここで該コンセンサス配列の各々は13ヌクレオチド長であり、
該コンセンサス配列の各々は、関連のクラスにおける遺伝子の少なくとも75%を包含し、そして
該4つのコンセンサス配列の各々によって包含される該オリゴヌクレオチドが1つのプライマーセットである、
方法。
【請求項11】 ARE遺伝子転写物を選択的に増幅する方法であって、該方法は、以下:
a)オリゴdTプライマーおよび逆転写酵素を用いて、1つ以上のARE遺伝子を発現する細胞から得たRNA分子を逆転写して、一本鎖DNA分子のプールを提供する工程;
b)ポリメラーゼ連鎖反応によって、該プール内のARE含有DNA分子の一部を増幅する工程であって、該ポリメラーゼ連鎖反応は、以下:
i)13〜50ヌクレオチド長であり、そしてTAAAT配列を有する2〜10のペンタマーを含む3’プライマーであって、該ペンタマー配列は重複しているかまたは重複していない、3’プライマー;および
ii)請求項10に記載の方法によって得られた5’プライマーセットのうち1つによって包含される1つ以上のプライマー、
を使用する、工程、
を包含する、方法。
【請求項12】 細胞における遺伝子発現を分析するための核酸分子のライブラリーを調製する方法であって、該方法は、以下:
a)2つ以上の核酸分子の群を獲得する工程であって、該核酸分子のタンパク質コード配列は、請求項11に記載の方法によって同定され、該2つ以上の核酸分子の各々の該タンパク質コード配列は、該群における他の核酸分子のタンパク質コード配列とは異なる、工程、および
b)該核酸分子の各々を別々の核酸ベクターに組み込んで該ライブラリーを提供する工程、
を包含する、方法。
【請求項13】 請求項12に記載の方法によって調製された、核酸ライブラリー。
【請求項14】 細胞中のARE遺伝子の発現を分析するためのカスタマイズされたアレイを調製する方法であって、該方法は、以下:
(a)請求項11に記載の方法によって増幅した複数のARE核酸分子の前記タンパク質コード配列を決定する工程;
(b)該核酸分子の各々についての遺伝子プローブを固体支持体に結合させて該アレイを提供する工程、
を包含し、
ここで、該プローブの各々が、ストリンジェントな条件下で、該タンパク質コード配列またはその相補体内の標的領域にハイブリダイズし、そして
該プローブの各々が、核酸塩基を含む、オリゴヌクレオチド、cDNA分子、または合成遺伝子プローブである、方法。
【請求項15】 請求項14に記載の方法によって調製された、カスタマイズされたアレイ。
【請求項16】 請求項15に記載のカスタマイズされたアレイであって、前記プローブが少なくとも10ヌクレオチド長であるオリゴヌクレオチドであり、該オリゴヌクレオチドのGC含量が少なくとも40%であり、そして該オリゴヌクレオチドがヘアピン構造を形成しない、カスタマイズされたアレイ。
【請求項17】 ARE遺伝子転写物を選択的に増幅する方法であって、該方法は、以下:
a)逆転写酵素および5’末端にNH2基を有するオリゴdTプライマーを用いて、1つ以上のARE遺伝子を発現する細胞から得たRNA分子を逆転写して、一本鎖cDNA分子のプールを提供する工程;
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c)ポリメラーゼ連鎖反応によって工程(b)において生成された該cDNA分子内のARE含有DNA分子をPCR増幅する工程であって、該工程は、以下:
i)13〜50ヌクレオチド長であり、そしてTAAAT配列を有する2〜10のペンタマーを含む3’プライマーであって、該ペンタマー配列は重複しているかまたは重複していない、3’プライマー;および
ii)配列が該オリゴマー内に含まれる配列に対して同一である5’プライマー、を使用する、工程、
を包含する、方法。
【請求項18】 前記3’プライマーのCG含量が少なくとも40%である、請求項17に記載の方法。
【請求項19】 工程(d)によって生成される前記ARE含有DNA分子を配列決定する工程をさらに包含する、請求項17に記載の方法。
【請求項20】 細胞における遺伝子発現を分析するための核酸分子のライブラリーを調製する方法であって、該方法は、以下:
a)2つ以上の核酸分子の群を獲得する工程であって、該核酸分子のタンパク質コード配列は、請求項19に記載の方法によって同定され、該2つ以上の核酸分子の各々の該タンパク質コード配列は、該群における他の核酸分子のタンパク質コード配列とは異なる、工程、および
b)該核酸分子の各々を別々の核酸ベクターに組み込んで該ライブラリーを提供する工程、
を包含する、方法。
【請求項21】 請求項20に記載の方法によって調製された、核酸ライブラリー。
【請求項22】 細胞中の遺伝子発現を分析するためのカスタマイズされたアレイを調製する方法であって、該方法は、以下:
(a)請求項17に記載の方法によって増幅した複数のARE核酸分子の前記タンパク質コード配列を決定する工程;
(b)該核酸分子の各々についての遺伝子プローブを固体支持体に結合させて該アレイを提供する工程、
を包含し、
ここで、該プローブが、ストリンジェントな条件下で、該タンパク質コード配列またはその相補体内の標的領域にハイブリダイズし、そして
該プローブが、核酸塩基を含む、オリゴヌクレオチド、cDNA分子、または合成遺伝子プローブである、方法。
【請求項23】 請求項22に記載の方法によって調製された、カスタマイズされたアレイ。
【請求項24】 被験体におけるARE発現プロフィールを得る方法であって、以下:
a)該被験体から得た組織サンプルからRNAを抽出する工程;
b)検出可能なタグを用いて該RNAを標識する工程;
c)請求項9に記載のマイクロアレイ、請求項15に記載のマイクロアレイ、請求項23に記載のマイクロアレイからなる群より選択されるマイクロアレイと、該標識されたRNAとを接触させる工程;および
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CA2498784A1 (en) * | 2002-09-13 | 2004-03-25 | The Texas A & M University System | Bioinformatic method for identifying surface-anchored proteins from gram-positive bacteria and proteins obtained thereby |
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WO2007095007A2 (en) * | 2006-02-14 | 2007-08-23 | Albert Einstein College Of Medicine Of Yeshiva University | Systematic genomic library and uses thereof |
US20130252983A1 (en) * | 2010-09-10 | 2013-09-26 | Cornell University | Activating phosphorylation site on glutaminase c |
DK3760737T3 (en) * | 2015-05-11 | 2023-04-11 | Illumina Inc | Platform for discovery and analysis of therapeutic agents |
WO2018071055A1 (en) | 2016-10-11 | 2018-04-19 | Genomsys Sa | Method and apparatus for the compact representation of bioinformatics data |
KR102421458B1 (ko) | 2016-10-11 | 2022-07-14 | 게놈시스 에스에이 | 액세스 유닛으로 구조화된 생물정보학 데이터에 액세스하기 위한 방법 및 장치 |
Family Cites Families (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5561222A (en) * | 1989-11-15 | 1996-10-01 | Duke University | RNA-binding proteins useful for the control of cellular genetic processing and expression |
US5474796A (en) * | 1991-09-04 | 1995-12-12 | Protogene Laboratories, Inc. | Method and apparatus for conducting an array of chemical reactions on a support surface |
US5444149A (en) * | 1992-05-11 | 1995-08-22 | Duke University | Methods and compositions useful in the recognition, binding and expression of ribonucleic acids involved in cell growth, neoplasia and immunoregulation |
US5459037A (en) * | 1993-11-12 | 1995-10-17 | The Scripps Research Institute | Method for simultaneous identification of differentially expressed mRNAs and measurement of relative concentrations |
US5859227A (en) * | 1996-07-31 | 1999-01-12 | Bearsden Bio, Inc. | RNA sequences which interact with RNA-binding proteins |
US6238863B1 (en) * | 1998-02-04 | 2001-05-29 | Promega Corporation | Materials and methods for indentifying and analyzing intermediate tandem repeat DNA markers |
US20040121842A1 (en) * | 2002-12-20 | 2004-06-24 | Daniel Willis | Peering system for gaming service providers |
-
2001
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