JP2003529357A - ヒトポリヌクレオチド、ポリペプチド、および抗体 - Google Patents

ヒトポリヌクレオチド、ポリペプチド、および抗体

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パトリック ジェイ. ディロン,
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、新規なヒトポリペプチドおよびそのようなポリペプチドをコードする遺伝子のコード領域を含む単離された核酸に関する。また、本発明のヒトポリペプチドを産生するためのベクター、宿主細胞、抗体および組換え方法が提供される。本発明はさらに、これらの新規なヒトポリペプチドに関する障害を診断および処置するために有用な診断方法および治療方法に関する。本発明はさらに、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストを同定するためのスクリーニング方法に関する。本発明はさらに、本発明のポリペプチドの産生および機能を阻害する方法および/または組成物に関する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 (発明の分野) 本発明は、新規なヒトタンパク質に関する。より詳細には、新規なヒトポリペ
プチドをコードする単離された核酸分子が提供される。新規なヒトポリペプチド
およびこれらのポリペプチドに結合する抗体が提供される。本発明のヒトポリヌ
クレオチドおよび/またはポリペプチドを産生するためのベクター、宿主細胞、
ならびに組換え方法および合成方法がまた提供される。本発明はさらに、これら
の新規なヒトポリペプチドに関する障害を診断、処置、予防および/または予測
するのに有用な診断方法および治療方法に関する。本発明はさらに、本発明のポ
リヌクレオチドおよびポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストを同定す
るためのスクリーニング方法に関する。本発明はさらに、本発明のポリペプチド
の産生および機能を阻害する方法および/または組成物に関する。
【0002】 (発明の背景) タンパク質輸送は、原核生物細胞および真核生物細胞の両方にとって、典型的
なプロセスである。個々のタンパク質の輸送は、通常アミノ末端シグナル配列を
介して生じ、リボソーム体部位から特定の細胞または細胞外の位置にタンパク質
を指向、または標的化する。輸送は、以下の工程のいくつかの任意の組み合せを
含み得る:シャペロンとの接触、アンフォールディング、レセプターおよび/ま
たは間隙複合体(pore complex)との相互作用、エネルギーの添加
、ならびにリフォールディング。さらに、細胞外タンパク質は、不活性の前駆体
として産生され得る。一旦、前駆体が搬出された場合、シグナルペプチダーゼに
よるシグナル配列の除去は、タンパク質を活性化する。
【0003】 アミノ末端シグナル配列は、実質的に、異なり、多くのパターンおよび全体的
な特性を共有する。最近、隠れ(hidden)Markovモデル(HMM)
、FASTAおよびSmith Watermanアルゴリズムに対する統計変
数を用いて、共有されるパターン、特に保存配列を見出した(Pearson、
W.R.およびD.J.Lipman、PNAS、85:2444〜48(19
88);Smith、T.F.、およびM.S. Waterman、J.Mo
l.Biol.、147:195〜97(1981))。これらは、最初に言語
認識パターンを試験するために開発されたが、HMNを生物学に利用して、タン
パク質配列およびDNA配列を分析し、タンパク質構造をモデル化する(Kro
gh、A.ら、J.Mol.Biol.、235:1501〜31(1994)
;Collin、M.ら、Protein Sci.、2:305〜14(19
93))。HMNは、形式的な確率基準を有し、アミノ酸またはヌクレオチド、
ならびに最初(opening)の挿入または欠失および伸長した挿入または欠
失に対する位置特異的スコアを用いる。このアルゴリズムは、新たに同定された
配列由来の情報を取り込んで、うまくいくパターンをさらに作ることにおいて、
非常に可撓性である。他の方法は、膜結合タンパク質を同定するために存在する
。Kleinらは、ポリペプチド中における潜在的膜貫通セグメントを検出する
ための方法(「ALOM」、KKDともいう)を開発した(Klein、P.ら
、Biochem.Biophys.Acta.、815:468(1985)
)。これは、特定の範囲のアミノ酸残基にわたる平均の疎水性値から最も可能性
のある膜貫通セグメントを同定することを試みる。これは、このセグメントが膜
貫通セグメント(INTEGRAL)か否(PERIPHERAL)かを予測し
、そして膜結合ポリペプチドを示唆し得る。
【0004】 タンパク質の他のファミリーは、膜結合タンパク質として存在する。形質膜に
結合することが知られるタンパク質ファミリーのいくつかの例は、レセプター(
核、4回膜貫通、Gタンパク質共役、およびチロシンキナーゼ)、サイトカイン
(ケモカイン)、ホルモン(成長、および分化因子)、ニューロペプチド、およ
び血管調節因子、プロテインキナーゼ、ホスファターゼ、ホスホリパーゼ、ホス
ホジエステラーゼ、ヌクレオチドシクラーゼ、マトリックス分子(接着、カドヘ
リン、細胞外マトリクス分子、インテグリン、およびセレクチン)、Gタンパク
質、イオンチャネル(カルシウム、クロライド、カリウム、およびナトリウム)
、プロテアーゼ、トラスポーター/ポンプ(アミノ酸、糖、タンパク質、金属、
およびビタミン;カルシウム、リン酸、カリウム、およびナトリウム)、および
調節タンパク質である。これらのタンパク質(レセプター、ホルモン、およびマ
トリックスタンパク質)およびこれらの機能不全に関する疾患についてのいくつ
かの記載が伴う。
【0005】 さらに、いくつかのタンパク質は、細胞内で機能して、これらの構造および/
また機能によって同定され得る。コンピューターアルゴリズムは、細胞内タンパ
ク質ファミリーの新規なメンバーの同定を支援するよう適用され得る。細胞内タ
ンパク質の例は、転写因子、種々のクラスの酵素、ミトコンドリアタンパク質、
およびシグナル伝達分子を含む。
【0006】 したがって、これらの新規のタンパク質を同定および利用することについて明
確な必要性がある。これらのタンパク質は、関連はしているものの、種々の細胞
および組織型における多様かつ多面的な機能を有し得る。レセプター型分子は、
低分子および他の薬理学的価値のある因子を標的に基づいてスクリーニングする
ことにおける有用性を示す。このようなレセプターに対して惹起されるモノクロ
ーナル抗体は、抗腫瘍における治療、診断、または他の能力において有用性を示
す。精製された本発明のヒトポリペプチドは、さらなるヒトタンパク質、またシ
グナル伝達経路のタンパク質の同定、性質決定、および精製のための研究手段と
して有用であり、これは、ヒトタンパク質と相互作用し得る。さらに、ヒトタン
パク質の発現をモニターするよう設計されたアッセイは、特定の型の障害(例え
ば、免疫系障害または肥満障害)の存在または発達をモニターする診断手段とし
て有用であり得る。
【0007】 (発明の要旨) 本発明は、配列表に開示され、そして/または表1に記載されかつAmeri
can Type Culture Collection(ATCC)に寄託
されたヒトcDNAプラスミドに含まれる、ポリヌクレオチド配列を含むか、ま
たは代替的に、その配列からなる単離された核酸分子を含む。これらの核酸分子
のフラグメント、改変体、および誘導体もまた、本発明に含まれる。本発明はま
た、ヒトポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むか、または代替的に
それらのポリヌクレオチドからなる単離された核酸分子を含む。本発明は、これ
らのポリヌクレオチドによってコードされるヒトポリペプチドをさらに含む。配
列表に開示され、そして/または表1に記載されかつATCCに寄託されたヒト
cDNAプラスミドによってコードされるようなヒトポリペプチドを含むか、ま
たは代替的にそれらのポリペプチドからなるアミノ酸配列が、さらに提供される
。これらのポリペプチドに結合する抗体もまた、本発明に含まれる。これらのア
ミノ酸配列のポリペプチドのフラグメント、改変体、および誘導体もまた、これ
らのポリペプチドおよびこれらのポリペプチドを結合する抗体をコードするポリ
ヌクレオチドも同様に、本発明に含まれる。
【0008】 (詳細な説明) (表) 表1は、本願に関連してATCCで成された寄託物のATCC寄託物、寄託日
、およびATCC受託番号を要約する。表1はさらに、cDNAクローンID、
cDNAクローンIDに含まれるベクターの種類、ヌクレオチド配列ID番号、
開示される配列に含まれるヌクレオチド、開示された配列の開始コドンの5’ヌ
クレオチドの位置、アミノ酸配列ID番号、および開示された配列によってコー
ドされるORFの最後のアミノ酸を含む、以下の各「遺伝子番号」に関する情報
を要約する。
【0009】 表2は、任意の1以上の公のEST配列のうちの少なくとも1、2、3、4、
5、10以上が本発明の特定の実施形態から必要に応じて除外される、これらの
公のESTを示す。
【0010】 表3は、表1において開示されたクローンに対応するポリヌクレオチドの発現
プロフィールを要約する。第1列は、表1に開示される各コンティグ配列に関連
するcDNAクローンについて、特有のクローン識別子「クローンID番号V」
を提供する。列2の「ライブラリーコード」は、本発明のポリヌクレオチドを発
現する組織および/または細胞株ライブラリーの発現プロフィールを示す。列2
の各ライブラリーコードは、表5において提供されるライブラリーコードおよび
ライブラリーの説明に対応する組織/細胞供給源の識別子コードを表す。これら
のポリヌクレオチドの発現は、試験される他の組織および/または細胞ライブラ
リーにおいて観察されなかった。当業者は、本発明の対応するポリヌクレオチド
の顕著な発現パターンを示す組織を同定するためか、または顕著なおよび/もし
くは特異的な組織の発現を示すポリヌクレオチドを同定するためにこの情報を慣
用的に使用し得る。
【0011】 表4、列1は、ヌクレオチド識別子「配列番号X」を提供し、これは、表1、
列5に開示されたヌクレオチド配列番号Xと一致する。表4、列2は、配列番号
Xに対応するポリヌクレオチドの、染色体位置である「細胞学的バンドまたは染
色体」を提供する。染色体位置は、NCBI(National Center
for Biotechnology Information)UniGe
neデータベースに含まれる、ESTおよびcDNA配列に対する正確な一致を
見出すことにより決定された。推定的な染色体位置を考慮して、疾患遺伝子座関
連は、Online Mendelian Inheritance in M
an(Online Mendelian Inheritance in M
an,OMIMTM McKusick−Nathans Institute
for Genetic Medicine,Johns Hopkins
University(Baltimore,MD)およびNatiol Ce
nter for Biotechnology Information,N
ational Library of Medicine(Bethesda
,MD)2000.World Wide Web URL:http://w
ww.ncbi.nlm.nih.gov/omim/)由来の、Morbid
Mapとの比較により決定された。Queryの推定染色体位置がMorbi
d Mapエントリーの染色体位置と重複する場合、morbid mapエン
トリーのOMIM参照識別子番号が、表4、列3に提供され、「OMIM ID
」で標識される。OMIM参照識別子番号への手がかりが表6で提供される。
【0012】 表5、列1は、表3、列2に開示されたライブラリーコードを提供する。列2
は、対応するライブラリーが由来した組織または細胞供給源の説明を提供する。
疾患組織に対応するライブラリーコードが、用語「疾患」を用いる列3に示され
る。列3における用語「疾患」の使用は、非制限的である。ライブラリーの組織
供給源は、特異的(例えば、新生物)であり得るか、または疾患関連(例えば、
疾患起源の正常な部分に由来する組織サンプル)であり得る。さらに、「疾患」
の命名を欠くライブラリーは、なお疾患状態または障害に直接的または間接的に
関与する供給源由来であり得、従って、その疾患状態または障害においてさらな
る有用性を有し得る。
【0013】 表6は、表4、列3に開示されたOMIM参照識別番号に対する手がかりを提
供する。OMIM参照識別番号(列1)は、Online Mendelian
Inheritance in Manに由来した(Online Mend
elian Inheritance in Man,OMIM.McKusi
ck−Nathans Institute for Genetic Med
icine,John Hopkins University(Baltim
ore,MD)and National Center for Biote
chnology Information,National Librar
y of Medicine,(Bethesda,MD)2000.Worl
d Wide Web URL:http://www.ncbi.nlm.n
ih.gov/omim/)。列2は、Morbid Mapデータベースから
決定されるように、表4、列2において開示されるような細胞学的なバンドと関
連した疾患を提供する。
【0014】 (定義) 以下の定義は、本明細書全体を通して使用される特定の用語の理解を容易にす
るために提供される。
【0015】 本発明において、「単離された(単離した)」とは、その本来の環境(例えば
、それが天然に存在する場合は天然の環境)から取り出された物質をいい、した
がって、その天然の状態から「人間の手によって」変更されている。例えば、単
離されたポリヌクレオチドは、ベクターまたは組成物の一部であり得るか、ある
いは細胞中に含まれ得、そしてなお「単離されている」状態であり得る。なぜな
ら、そのベクター、組成物、または特定の細胞は、そのポリヌクレオチドの本来
の環境ではないからである。用語「単離された」は、ゲノムライブラリーまたは
cDNAライブラリー、細胞全体の総RNA調製物またはmRNA調製物、ゲノ
ムDNA調製物(電気泳動により分離され、そしてブロットへトランスファーさ
れたものを含む)、剪断された細胞全体のゲノムDNA調製物をも、本発明のポ
リヌクレオチド/配列の識別する特徴がないことが当該分野で示されている他の
組成物をもいわない。
【0016】 本明細書中で使用される場合、「ポリヌクレオチド」とは、(表1の第5列に
記載にされる)配列番号X(配列番号X)に含まれる核酸配列を有する分子、ま
たは(表1の第2列に記載され、そしてATCC受託番号ZでATCCに寄託さ
れたプラスミドのプール内に含まれる)cDNAプラスミドVをいう。例えば、
このポリヌクレオチドは、5’および3’非翻訳配列、天然または人工のシグナ
ル配列を伴うかまたは伴わないコード領域、タンパク質コード領域、ならびにこ
の核酸配列のフラグメント、エピトープ、ドメイン、および改変体を含む、全長
cDNA配列のヌクレオチド配列を含み得る。さらに、本明細書で使用される場
合、「ポリペプチド」とは、広く定義される本発明のポリヌクレオチド(cDN
Aに対応する配列のポリAテールの翻訳から生じるポリフェニルアラニンペプチ
ド配列もポリリジンペプチド配列も明らかに除く)によってコードされるアミノ
酸配列を有する分子をいう。
【0017】 本発明では、配列番号Xの配列を含む代表的プラスミドが、American Type Culture Collection(「ATCC」)に寄託さ
れ、そして/また表1に記載されている。表1に示すように、各プラスミドは、
cDNAクローンID(識別番号)およびATCC受託番号(ATCC受託番号
Z)によって同定される。単一の寄託物としてプールし、そして寄託したプラス
ミドは、同じTACC受託番号を有する。ATCCは、10801 Unive
rsity Boulevard,Manassas,Virginia 20
110−2209,USAに位置する。ATCC寄託は、特許手続上の微生物の
寄託の国際的承認に関するブダペスト条約の条項に拠って行われた。
【0018】 本発明の「ポリヌクレオチド」はまた、ストリンジェントなハイブリダイゼー
ション条件下で、配列番号Xに含まれる配列、またはその相補体(例えば、本明
細書中に記載されるポリヌクレオチドフラグメントのうちのいずれか1つ、2つ
、3つ、4つ以上の相補体)、および/またはcDNAプラスミドVに含まれる
配列(例えば、本明細書中に記載されるポリヌクレオチドフラグメントのうちの
いずれか1つ、2つ、3つ、4つ以上の相補体)にハイブリダイズし得るポリヌ
クレオチドを含む。「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」とは、
50%ホルムアミド、5×SSC(750mM NaCl、75mMクエン酸三
ナトリウム)、50mMリン酸ナトリウム(pH7.6)、5×デンハルト溶液
、10%デキストラン硫酸、および20μg/ml変性剪断サケ精子DNAを含
む溶液中での42℃での一晩のインキュベーション、続いて0.1×SSC中で
約65℃にてフィルターを洗浄することをいう。
【0019】 本発明の「ポリヌクレオチド」には、より低いストリンジェンシーのハイブリ
ダイゼーション条件で本発明のポリヌクレオチドにハイブリダイズする核酸分子
もまた含まれる。ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーおよびシグナル
検出の変更は、主として、ホルムアミド濃度(より低い百分率のホルムアミドが
、低下したストリンジェンシーを生じる);塩条件、または温度の操作を通じて
達成される。例えば、より低いストリンジェンシー条件は、6×SSPE(20
×SSPE=3M NaCl;0.2M NaHPO;0.02M EDT
A、pH7.4)、0.5% SDS、30%ホルムアミド、100μg/ml
サケ精子ブロッキングDNAを含む溶液中、37℃で一晩のインキュベーション
;次いで1×SSPE、0.1% SDSを用いた50℃での洗浄を含む。さら
に、さらにより低いストリンジェンシーを達成するために、ストリンジェントな
ハイブリダイゼーション後に行われる洗浄は、より高い塩濃度(例えば、5×S
SC)で行われ得る。
【0020】 上記の条件におけるバリエーションが、ハイブリダイゼーション実験において
バックグラウンドを抑制するために使用される代替的なブロッキング試薬の含有
および/または置換によって達成され得ることに留意のこと。代表的なブロッキ
ング試薬としては、デンハルト試薬、BLOTTO、ヘパリン、変性サケ精子D
NA、および市販の特許処方物が挙げられる。特異的ブロッキング試薬の含有は
、適合性の問題に起因して、上記のハイブリダイゼーション条件の改変を必要と
し得る。
【0021】 もちろん、ポリA+配列(例えば、配列表に示されるcDNAの任意の3’末
端ポリA+領域(tract))に、またはT(もしくはU)残基の相補的スト
レッチにのみハイブリダイズするポリヌクレオチドは、「ポリヌクレオチド」の
定義に包含されない。なぜなら、このようなポリヌクレオチドは、ポリ(A)ス
トレッチまたはその相補体を含む任意の核酸分子(例えば、プライマーとしてオ
リゴdTを用いて生成される、事実上任意の二本鎖cDNAクローン)にハイブ
リダイズするからである。
【0022】 本発明のポリヌクレオチドは、任意のポリリボヌクレオチドまたはポリデオキ
シリボヌクレオチドから構成され得、これは、非改変RNAもしくは非改変DN
Aまたは改変RNAもしくは改変DNAであり得る。例えば、ポリヌクレオチド
は、一本鎖および二本鎖のDNA、一本鎖領域と二本鎖領域との混合物であるD
NA、一本鎖および二本鎖のRNA、ならびに一本鎖領域と二本鎖領域との混合
物であるRNA、一本鎖、またはより代表的には二本鎖もしくは一本鎖領域と二
本鎖領域との混合物であり得るDNAおよびRNAを含むハイブリッド分子から
構成され得る。さらに、このポリヌクレオチドは、RNAもしくはDNAまたは
RNAおよびDNAの両方を含む、三本鎖領域から構成され得る。ポリヌクレオ
チドはまた、安定性のために、または他の理由のために改変された、1つ以上の
改変された塩基またはDNA骨格もしくはRNA骨格を含み得る。「改変された
」塩基としては、例えば、トリチル化された塩基およびイノシンのような普通で
ない塩基が挙げられる。種々の改変が、DNAおよびRNAに対して行われ得;
したがって、「ポリヌクレオチド」は、化学的、酵素的、または代謝的に改変さ
れた形態を含む。
【0023】 特定の実施形態においては、本発明のポリヌクレオチドは、少なくとも15の
、少なくとも30の、少なくとも50の、少なくとも100の、少なくとも12
5の、少なくとも500の、または少なくとも1000の連続するヌクレオチド
であるが、300kb未満、200kb未満、100kb未満、50kb未満、
15kb未満、10kb未満、7.5kb未満、5kb未満、2.5kb未満、
2.0kb未満、または1kb未満の長さである。さらなる実施形態においては
、本発明のポリヌクレオチドは、本明細書中に開示されたコード配列の一部を含
むが、任意のイントロンの全てまたは一部を含むわけではない。別の実施形態に
おいては、コード配列を含むポリヌクレオチドは、ゲノムの隣接遺伝子のコード
配列(すなわち、ゲノムにおける目的の遺伝子に対する5’または3’)を含ま
ない。他の実施形態において、本発明のポリヌクレオチドは、1000、500
、250、100、50、25、20、15、10、5、4、3、2または1以
上のゲノム隣接遺伝子のコード配列を含まない。
【0024】 「配列番号X」とは、表1の5列目に記載されるポリヌクレオチド配列をいう
が、「配列番号Y」とは、表1の10列目に記載されるポリペプチド配列をいう
。配列番号Xは、表1の6列目において特定される整数によって同定される。配
列番号Yのポリペプチド配列は、配列番号Xのポリヌクレオチドによってコード
される翻訳されたオープンリーディングフレーム(ORF)である。ポリヌクレ
オチド配列は、配列リストに示され、直ちに全てのポリペプチド配列が続く。従
って、配列番号2のポリヌクレオチド配列に対応するポリペプチド配列は、配列
リストに示される第1のポリペプチド配列である。第2のポリペプチド配列は、
配列番号3などとして示されるポリヌクレオチド配列に対応する。
【0025】 本発明のポリペプチドは、ペプチド結合または改変されたペプチド結合、すな
わち、ペプチドアイソスター(isostere)によって互いに連結したアミ
ノ酸から構成され得、そして遺伝子がコードする20個のアミノ酸以外のアミノ
酸を含み得る。ポリペプチドは、翻訳後プロセシングのような天然のプロセスに
よって、または当該技術分野で周知の化学的改変技術のいずれかによって、改変
され得る。このような改変は、基本テキスト、およびより詳細な研究論文、なら
びに多くの研究文献に十分に記載される。改変は、ペプチド骨格、アミノ酸側鎖
、およびアミノ末端またはカルボキシル末端、を含むポリペプチドのどこにでも
生じ得る。同じ型の改変が、所定のポリペプチド中のいくつかの部位で、同じま
たは種々の程度で存在し得ることが理解される。また、所定のポリペプチドは多
くの型の改変を含み得る。ポリペプチドは、例えば、ユビキチン化の結果として
分枝状であり得、そしてそのポリペプチドは、分枝を含むかまたは含まない、環
状であり得る。環状、分枝状および分枝した環状のポリペプチドは、天然の翻訳
後プロセスから生じ得るか、または合成方法によって作製され得る。改変として
は、アセチル化、アシル化、ADP−リボシル化、アミド化、フラビンの共有結
合、ヘム部分の共有結合、ヌクレオチドまたはヌクレオチド誘導体の共有結合、
脂質または脂質誘導体の共有結合、ホスファチジルイノシトール(phosph
otidylinositol)の共有結合、架橋、環化、ジスルフィド結合形
成、脱メチル化、共有結合架橋の形成、システインの形成、ピログルタミン酸の
形成、ホルミル化、γ−カルボキシル化、グリコシル化、GPIアンカー形成、
水酸化、ヨウ素化、メチル化、ミリストイル化、酸化、ペグ化(pegylat
ion)、タンパク質分解プロセシング、リン酸化、プレニル化、ラセミ化、セ
レノイル化、硫酸化、アルギニル化のようなタンパク質へのアミノ酸のトランス
ファーRNA媒介付加、およびユビキチン化が挙げられる。(例えば、PROT
EINS−STRUCTURE AND MOLECULAR PROPERT
IES、第2版、T.E.Creighton、W.H.Freeman an
d Company、New York(1993);POSTTRANSLA
TIONAL COVALENT MODIFICATION OF PROT
EINS、B.C.Johnson編、Academic Press、New
York、1−12頁(1983);Seifterら、Meth Enzy
mol.182:626−646(1990);Rattanら、Ann.N.
Y.Acad.Sci.663:48−62(1992)を参照のこと)。
【0026】 本発明のポリペプチドは、任意の適切な様式で調製され得る。そのようなポリ
ペプチドとしては、単離された天然に存在するポリペプチド、組換え的に生成さ
れたポリペプチド、合成的に生成されたポリペプチド、またはこれらの方法の組
み合わせによって生成されたポリペプチドが挙げられる。このようなポリペプチ
ドを調製するための手段は、当該分野において十分に理解されている。
【0027】 ポリペプチドは、分泌タンパク質の形態(成熟形態を含む)であり得るか、ま
たはより大きなタンパク質(例えば、融合タンパク質)の一部であり得る(下記
を参照のこと)。分泌配列またはリーダー配列、プロ配列、精製において補助す
る配列(例えば、多重のヒスチジン残基)、または組換え生成の間の安定性のた
めのさらなる配列を含むさらなるアミノ酸配列を含むことは、しばしば有利であ
る。
【0028】 本発明のポリペプチドは、好ましくは単離された形態で提供され、そして好ま
しくは実質的に精製される。ポリペプチドの組換え的に生成されたバージョン(
分泌ポリペプチドを含む)は、本明細書中で記載される技術か、または当該分野
で別の公知の技術を使用して(例えば、SmithおよびJohnson(Ge
ne 67:31−40(1988))により記載される1工程方法によって)
、実質的に精製され得る。本発明のポリペプチドはまた、本明細書中で記載され
る技術、または当該分野における他の周知の方法を使用して(例えば、当該分野
で周知の方法で本発明のポリペプチドに対して惹起された本発明の抗体を使用す
ることによって)、天然の供給源、合成的な供給源または組換え供給源から精製
され得る。
【0029】 「機能的活性」を示すポリペプチドとは、本発明の全長(完全)タンパク質と
関連した1つ以上の公知の機能的活性を示し得るポリペプチドを意味する。この
ような機能的活性としては、生物学的活性、抗原性[抗ポリペプチド抗体に結合
する(または結合することについて、ポリペプチドと競合する)能力]、免疫原
性(本発明のポリペプチドに結合する抗体を生成する能力)、本発明のポリペプ
チドと多量体を形成する能力、およびポリペプチドについてのレセプターまたは
リガンドに結合する能力が挙げられるが、これらに限定されない。
【0030】 「機能的活性を有するポリペプチド」とは、特定のアッセイ(例えば、生物学
的アッセイのような)で測定した場合、用量依存性を伴なっても伴なわなくても
、本発明のポリペプチド(成熟形態を含む)の活性と類似であるが、必ずしも同
一ではない活性を示すポリペプチドをいう。用量依存性が存在する場合、ポリペ
プチドの用量依存性と同一である必要はないが、むしろ本発明のポリペプチドと
比較した場合に、所定の活性における用量依存性に実質的に類似する(すなわち
、候補ポリペプチドは、本発明のポリペプチドと比較して、より大きな活性を示
すか、または約1/25以上、そして好ましくは約1/10以上の活性、そして
最も好ましくは約1/3以上の活性を示す)。
【0031】 ポリペプチド、ならびにそれらのフラグメント、改変体、誘導体、およびアナ
ログの機能的活性は、種々の方法によってアッセイされ得る。
【0032】 例えば、全長ポリペプチドの抗体への結合について本発明の全長ポリペプチド
に結合するか、またはそれと競合する能力についてアッセイする、1つの実施形
態では、当該分野で公知の種々の免疫アッセイが、用いられ得る。このようなア
ッセイとしては、放射免疫アッセイ、ELISA(酵素結合免疫吸着アッセイ)
、「サンドイッチ」免疫アッセイ、免疫放射分析アッセイ、ゲル拡散沈降反応、
免疫拡散アッセイ、インサイチュ免疫アッセイ(例えば、コロイド金、酵素また
は放射性同位体標識を用いる)、ウェスタンブロット、沈降反応、凝集アッセイ
(例えば、ゲル凝集アッセイ、血球凝集アッセイ)、補体結合アッセイ、免疫蛍
光アッセイ、プロテインAアッセイ、および免疫電気泳動アッセイなどのような
技術を用いる競合および非競合アッセイ系が挙げられるが、これらに限定されな
い。1つの実施形態では、抗体結合が、一次抗体上の標識を検出することによっ
て検出される。別の実施形態では、この一次抗体は、この一次抗体に対する二次
抗体または試薬の結合を検出することによって検出される。さらなる実施形態で
は、この二次抗体が標識される。多くの手段が、免疫アッセイにおける結合の検
出について当該分野で公知であり、そして本発明の範囲内である。
【0033】 別の実施形態では、同定されたリガンド、または本発明のポリペプチドフラグ
メント、改変体、または誘導体が多量体化する能力が評価される場合、結合が、
例えば、還元および非還元ゲルクロマトグラフィー、タンパク質アフィニティー
クロマトグラフィー、ならびにアフィニティーブロッティングのような当該分野
で周知の手段によって、アッセイされ得る。一般には、Phizicky、E.
ら、1995、Microbiol.Rev.59:94−123を参照のこと
。別の実施形態では、その基質への本発明のポリペプチドの結合の生理学的相関
(シグナル伝達)がアッセイされ得る。
【0034】 さらに、本明細書中に記載のアッセイ(実施例を参照のこと)および当該分野
で公知の他のアッセイは、本発明のポリペプチドならびにそれらのフラグメント
、改変体、誘導体、およびアナログが、ポリペプチドの生物学的活性に関連した
関連の生物学的活性を(インビトロまたはインビボのいずれかで)惹起する能力
を測定するために、慣用的に適用され得る。他の方法は、当業者に公知であり、
そして本発明の範囲内である。
【0035】 (本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド) (遺伝子番号1によってコードされるタンパク質の特徴) この遺伝子の翻訳産物は、マウスアンギオテンシン変換酵素(ACE)(Ge
nbank登録AAA37148を参照のこと)と配列相同性を共有し、このA
CEは、アンギオテンシンIのアンギオテンシンII(強力な血管収縮薬)への
変換に関与すると考えられる細胞外膜結合ジペプチジルカルボキシペプチダーゼ
である。この相同性に基づいて、これらのタンパク質は、少なくともいくつかの
生物学的活性を共有すると考えられる。
【0036】 開示されるcDNAをコードするこの遺伝子は、X染色体上に存在すると考え
られる。従って、本発明に関連するポリヌクレオチドは、例えば、X染色体につ
いての連鎖分析におけるマーカーとしての用途を有する。
【0037】 さらなる非限定的な実施形態において、本発明のポリペプチドは、以下のアミ
ノ酸配列のうち1つ以上を含むか、あるいはこれらからなる:1)膜貫通ドメイ
ン:LIVFGVVMGVIVVGIVI(配列番号24);および/または2
)細胞外ドメイン:
【0038】
【数1】 (配列番号25)。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた
、これらのポリペプチドのうち1つ以上に結合する抗体と同様に、本発明に含ま
れる。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体(例えば、本
明細書中に記載のフラグメント、これらのポリペプチドに対して少なくとも80
%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一なポ
リペプチド、およびストリンジェントな条件下で、これらのポリペプチドをコー
ドするポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコード
されるポリペプチド、ならびにこれらの相補体)は、本発明に含まれる。本発明
のこれらのフラグメントおよび改変体に結合する抗体もまた、本発明に含まれる
。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドもまた、本
発明に含まれる。
【0039】 機能的活性を示す本発明のACEタンパク質の細胞外部分のフラグメント(配
列番号25)を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドもまた、好ましい
。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、これらのポリペ
プチドのうち1つ以上と結合する抗体と同様に、本発明に含まれる。さらに、こ
れらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体(例えば、本明細書中に記載の
フラグメント、これらのポリペプチドに対して少なくとも80%、85%、90
%、95%、96%、97%、98%、または99%同一なポリペプチド、およ
びストリンジェントな条件下で、これらのポリペプチドをコードするポリヌクレ
オチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチ
ド、またはこれらの相補体)は、本発明に含まれる。本発明のこれらのフラグメ
ントおよび改変体と結合する抗体もまた、本発明に含まれる。これらのフラグメ
ントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドもまた、本発明に含まれる。
【0040】 機能的活性によって、全長(完全な)ACEタンパク質に関連する1つ以上の
公知の機能的活性を示し得るポリペプチドフラグメントが意味される。このよう
な機能的活性としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:生物学的活
性(例えば、アンギオテンシンIをアンギオテンシンIIに変換する能力)、抗
原性[抗ACE抗体に結合する(またはACEポリペプチドと結合について競合
する)能力]、免疫原性(ACEポリペプチドに結合する抗体を産性する能力)
、および本発明のACEポリペプチドで多重体を形成する能力。
【0041】 本発明は、本明細書中に記載されるポリヌクレオチド配列のフラグメントにさ
らに関する。例えば、寄託されたcDNAまたは配列番号2に示される、ヌクレ
オチド配列のポリヌクレオチド配列のフラグメントによって、少なくとも約15
nt、そしてより好ましくは、少なくとも約20nt、少なくとも約25nt、
なおより好ましくは、少なくとも約30nt、少なくとも約35nt、およびな
おより好ましくは、少なくとも約40n長、少なくとも約45nt長、少なくと
も約50nt長、少なくとも約60nt長、少なくとも約70nt長、少なくと
も約80nt長、少なくとも約90nt長、少なくとも約100nt長、少なく
とも約125nt長、少なくとも約150nt長、および少なくとも約175n
t長のポリヌクレオチドフラグメントが意図され、これらは本明細書中で議論さ
れる診断プローブおよびプライマーとして有用である。当然ながら、より大きな
フラグメント200〜2133nt長はまた、寄託したcDNAまたは配列番号
2に示されるヌクレオチド配列の、全てではない場合でも大部分に対応するフラ
グメントであるので、本発明に従って有用である。例えば、少なくとも20nt
長のフラグメントによって、寄託されたcDNAのヌクレオチド配列または配列
番号2に示されるヌクレオチド配列由来の20以上の連続した塩基を含むフラグ
メントが意図される。この状況において、「約」は、具体的に列挙されるサイズ
、ならびにいずれかの末端もしくは両方の末端で、いくつか(5、4、3、2、
もしくは1個)のヌクレオチドだけより大きいかまたはより小さいサイズを含む
【0042】 さらなる実施形態において、本発明のポリヌクレオチドは、対応するタンパク
質の機能的性質をコードする。本明細書中に記載されるかさもなくば当該分野で
公知のように、本発明のポリヌクレオチドは、染色体の同定、染色体のマッピン
グ、および連鎖分析におけるプローブまたはプライマーとして役立つことが挙げ
られるが、これらに限定されない用途を有する。
【0043】 本発明の好ましいポリペプチドは、残基:Ser−48〜Leu−55、Gl
u−110〜Leu−118、Glu−136〜Tyr−146、およびVal
−151〜Arg−158として配列番号13に示されるACEタンパク質の細
胞外部分の免疫原性エピトープのうち、1つ、2つ、3つまたは4つ全てを含む
か、あるいはこれらからなる。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオ
チドもまた、これらのポリペプチドの1つ以上に結合する抗体と同様に、本発明
に含まれる。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体(例え
ば、本明細書中に記載のフラグメント、これらのポリペプチドに対して少なくと
も80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%同
一なポリペプチド、およびストリンジェントな条件下で、これらのポリペプチド
をコードするポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドによって
コードされるポリペプチド、またはこれらの相補体)は、本発明に含まれる。本
発明のこれらのフラグメントおよび改変体と結合する抗体もまた、本発明に含ま
れる。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドもまた
、本発明に含まれる。
【0044】 この遺伝子は、結腸および小腸の組織で発現される。
【0045】 従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、生
物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびに血
管収縮に関連する疾患および/または傷害、ならびに胃腸系の疾患および/また
は障害を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として
有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対する抗体は
、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブの提供に有用である
。上記組織または細胞、特に胃腸系および脈管系の多くの障害に関して、標準の
遺伝子発現レベル(すなわち、障害を有さない個体由来の健常組織または体液中
の発現レベル)に対して有意に高いまたは低いレベルのこの遺伝子の発現が、こ
のような障害を有する個体から採取された特定の組織もしくは細胞型(例えば、
胃腸組織、脈管組織、癌性組織および創傷組織)または体液(例えば、リンパ、
血清、血漿、尿、滑液、および髄液)、または別の組織もしくはサンプル中で、
慣用的に検出され得る。
【0046】 胃腸組織における組織分布、およびACEに対する相同性は、この遺伝子に対
応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体が、血管収縮障害および胃腸障害
に関連する疾患および/または障害の診断、予後、予防、および/または処置に
有用であることを示す。アンギオテンシン変換酵素に対する相同性に基づいて、
本発明の翻訳産物は、同様な生物学的活性を共有すると考えられる。
【0047】 特定の実施形態において、本発明のポリペプチドのアンタゴニスト(例えば、
本発明の溶解性ポリペプチド、アンチセンス、リボザイム、抗体、リガンド、低
分子および/または本明細書中に記載される方法を使用して同定されるアンタゴ
ニスト)は、血管収縮に関連する障害の診断、予後、予防、および/または処置
において有用である。このようなアンタゴニストは、例えば、アンギオテンシン
IのアンギオテンシンIIへの変換を防止することによって、機能し得る。本発
明のアンタゴニストは、血管収縮(例えば、高血圧(hypertension
)、勃起性機能不全、高血圧(high blood pressure)、冠
状動脈不全、および冠状心疾患)に関連する疾患ならびに/あるいは節「心臓血
管障害」および/または本明細書中の他の箇所に記載される他の疾患または障害
の診断、予後、予防、および/または処置において有用であり得る。
【0048】 さらなる実施形態において、本発明のアンタゴニストは、血管収縮および/ま
たはカルシウムイオンの平滑筋細胞への流入に影響する他の分子(例えば、カル
シウムアンタゴニスト)と組み合され得る。例えば、米国特許第5,721,2
44号を参照のこと。この遺伝子の翻訳産物は、当該分野で公知の技術(例えば
、米国特許第5,723,307号に開示の技術)を使用するためにアッセイさ
れ得る。
【0049】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチドのアゴニスト(例えば、
本発明の溶解性ポリペプチド、抗体、リガンド、低分子および/または本明細書
中に記載の方法を使用して同定されるアゴニスト)は、血管収縮に関連する障害
の診断、予後、予防、および/または処置において使用される。このようなアゴ
ニストは、例えば、アンギオテンシンIのアンギオテンシンII以外のタンパク
質への変換を促進することによって、機能し得る。本発明のアゴニストは、血管
収縮(例えば、高血圧、勃起性機能不全、高血圧、冠状動脈不全、および冠状心
疾患)に関連する疾患ならびに/あるいは節「心臓血管障害」および/または本
明細書中の他の箇所に記載される他の疾患または障害の処置または予防において
有用であり得る。さらなる実施形態において、本発明のアゴニストは、血管収縮
および/またはカルシウムイオンの平滑筋細胞への流入に影響する他の分子(例
えば、カルシウムアンタゴニスト)と組み合され得る。例えば、米国特許第5,
721,244号を参照のこと。この遺伝子の翻訳産物は、当該分野で公知の技
術(例えば、米国特許第5,723,307号に開示の技術)を使用するために
アッセイされ得る。
【0050】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチドのアゴニスト(例えば、
本発明の溶解性ポリペプチド、抗体、リガンド、低分子および/または本明細書
中に記載の方法を使用して同定されるアゴニスト)は、低血圧によって特徴付け
られる障害を処置するために使用される。このようなアゴニストは、例えば、ア
ンギオテンシンIのアンギオテンシンIIへの変換を促進することによって、機
能し得る。さらなる実施形態において、本発明のアゴニストは、血管収縮および
/またはカルシウムイオンの平滑筋細胞への流入に影響する他の分子(例えば、
カルシウムアンタゴニスト)と組み合され得る。例えば、米国特許第5,721
,244号を参照のこと。この遺伝子の翻訳産物は、当該分野で公知の技術(例
えば、米国特許第5,723,307号に開示の技術)を使用するためにアッセ
イされ得る。
【0051】 特定の実施形態において、この遺伝子に対応する翻訳産物に対して指向される
抗体は、血管収縮に関連する障害の予防および/または除去に有用である。1つ
の実施形態において、本発明は、この遺伝子に対応するポリペプチドの抗体アン
タゴニストに関する。好ましい実施形態において、本発明の抗体アンタゴニスト
は、この遺伝子に対応するポリペプチドの細胞外部分(配列番号25)に特異的
に結合する。これらのアンタゴニストは、血管収縮(例えば、高血圧、勃起性機
能不全、高血圧、冠状動脈不全、および冠状心疾患)に関連する疾患ならびに/
あるいは節「心臓血管障害」および/または本明細書中の他の箇所に記載される
他の疾患または障害の処置において有用である。
【0052】 代替的な実施形態において、本発明は、この遺伝子に対応するポリペプチドの
抗体アゴニストに関する。好ましい実施形態において、本発明の抗体アゴニスト
は、この遺伝子に対応するポリペプチドの細胞外部分(配列番号25)に特異的
に結合する。これらのアゴニストは、血管収縮(例えば、高血圧、勃起性機能不
全、高血圧、冠状動脈不全、および冠状心疾患)に関連する疾患ならびに/ある
いは節「心臓血管障害」および/または本明細書中の他の箇所に記載される他の
疾患または障害の処置において有用である。
【0053】 あるいは、小腸組織および結腸組織におけるこの組織分布は、この遺伝子のポ
リヌクレオチド、翻訳産物および抗体が、小腸に関連する障害の診断、予後、予
防、および/または処置に有用であることを示唆する。これは、消化および食物
吸収に関連する疾患、ならびに小腸または身体内の他の造血細胞および造血組織
のパイアー斑に関連する造血障害を含み得る。同様に、結腸組織におけるこの遺
伝子の翻訳産物の発現は、ここでも、食物の消化、処理、および排出への関与、
ならびに診断マーカーまたは結腸癌および一般の癌の発達における原因となる因
子としての、この遺伝子についての潜在的な役割を示唆する。
【0054】 この遺伝子の翻訳産物、ならびにこの遺伝子の翻訳産物に対して指向される抗
体は、上記に列挙される組織についての腫瘍マーカーおよび/または免疫療法の
標的としての有用性を示し得る。
【0055】 (遺伝子番号2によってコードされるタンパク質の特徴) この遺伝子の翻訳産物は、ヒトキモトリプシン様膵臓プロテアーゼ(Genb
ank登録CAA50711を参照のこと)との配列相同性を共有する。この相
同性に基づいて、これらのタンパク質は、少なくともいくつかの生物学的活性を
共有すると考えられる。
【0056】 本発明の好ましいポリペプチドは、残基:Asp−120〜Ser−127、
Gly−168〜Asn−177、Thr−203〜Thr−213、Lys−
256〜Ile−264、Ser−266〜Ala−271、Thr−295〜
Ser−304、Leu−313〜Ile−320、Arg−324〜Ser−
332、Val−335〜Ser−350、およびGly−371〜Glu−3
79として配列番号14に示されるタンパク質の免疫原性エピトープのうち、1
つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、または10個全てを含
むか、あるいはこれらからなる。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレ
オチドもまた、これらのポリペプチドの1つ以上に結合する抗体と同様に、本発
明に含まれる。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体(例
えば、本明細書中に記載のフラグメント、これらのポリペプチドに対して少なく
とも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%
同一なポリペプチド、およびストリンジェントな条件下で、これらのポリペプチ
ドをコードするポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドによっ
てコードされるポリペプチド、またはこれらの相補体)は、本発明に含まれる。
本発明のこれらのフラグメントおよび改変体と結合する抗体もまた、本発明に含
まれる。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドもま
た、本発明に含まれる。
【0057】 この遺伝子は、精巣組織において特に発現される。
【0058】 従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、生
物学的サンプル中に存在する精巣組織または精巣細胞型の差示的同定のため、な
らびに生殖系の疾患および/または障害を含むがこれらに限定されない疾患およ
び状態の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれ
らのポリペプチドに対する抗体は、この組織または細胞型の差示的同定のための
免疫学的プローブの提供に有用である。上記組織または細胞、特に生殖系の多数
の障害に関して、標準の遺伝子発現レベル(すなわち、この障害を有さない個体
由来の健常組織または体液中の発現レベル)に対して有意に高いまたは低いレベ
ルのこの遺伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組
織もしくは細胞型(例えば、生殖組織、癌性組織および創傷組織)または体液(
例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液、および髄液)、または別の組織もしく
はサンプル中で、慣用的に検出され得る。
【0059】 精巣組織における分布、およびプロテアーゼに対する相同性は、この遺伝子に
対応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体が、生殖系の疾患および/また
は障害の診断、予後、予防、および/または処置に有用であることを示す。
【0060】 この相同性に基づいて、本発明の翻訳産物が、新規なプロテアーゼ分子である
ことが予想される。従って、この遺伝子の翻訳産物は、広範な生物学的活性(例
えば、細胞表面分子の切断およびタンパク分解活性を含む)に関与し得る。この
遺伝子の翻訳産物に対して指向される抗体は、このプロテアーゼ活性の予防およ
び/または排除において有用である。
【0061】 より一般には、この組織分布は、この遺伝子の翻訳産物が、適切な精巣機能(
例えば、内分泌機能、精子の成熟)ならびに癌に関する状態の診断、予後、予防
、および/または処置に有用であることを示す。従って、この遺伝子の翻訳産物
は、男性の不妊症および/またはインポテンスの処置に有用である。この遺伝子
の翻訳産物はまた、結合因子を同定するように設計されたアッセイにおいて有用
である。なぜなら、このような因子(アンタゴニスト)は、男性の避妊薬として
有用であるためである。同様に、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳
産物および抗体は、精巣癌の診断、予後、予防、および/または処置に有用であ
ると考えられる。精巣はまた、身体の他の組織において特に低いレベルで発現さ
れ得る転写物の、活性な遺伝子発現部位である。従って、この遺伝子の翻訳産物
は、これらが他のプロセス(例えば、いくつかの可能な標的表示として、造血、
炎症、骨形成、および腎機能)において関連する機能的役割を果たし得る、他の
特定の組織または器官において発現され得る。
【0062】 この遺伝子の翻訳産物、ならびにこの遺伝子の翻訳産物に対して指向される抗
体は、上記に列挙される組織のための腫瘍マーカーおよび/または免疫療法の標
的としての有用性を示し得る。
【0063】 (遺伝子番号3によってコードされるタンパク質の特徴) この遺伝子の翻訳産物は、ヒトカテプシン2ポリペプチド(国際公開番号WO
9813484を参照のこと)と配列相同性を共有し、これは、炎症、転移およ
びペプチド/前酵素プロセシングに関与すると考えられる。この相同性に基づい
て、これらのタンパク質が、少なくともいくつかの生物学的活性を共有すると考
えられる。
【0064】 本発明の好ましいポリペプチドは、残基:Met−1〜Gly−7、Pro−
10〜Ser−21、Gly−59〜Glu−65、Pro−72〜Lys−7
7、Ser−84〜Trp−89、Arg−93〜Asp−106、Arg−1
93〜Gly−200、およびArg−357〜Ser−362として配列番号
15に示されるタンパク質の免疫原性エピトープのうちの、1つ、2つ、3つ、
4つ、5つ、6つ、7つ、または8つ全てを含むか、あるいはこれらからなる。
これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、これらのポリペプ
チドの1つ以上に結合する抗体と同様に、本発明に含まれる。さらに、これらの
ポリペプチドのフラグメントおよび改変体(例えば、本明細書中に記載のフラグ
メント、これらのポリペプチドに対して少なくとも80%、85%、90%、9
5%、96%、97%、98%、または99%同一なポリペプチド、およびスト
リンジェントな条件下で、これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
にハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド、ま
たはこれらの相補体)は、本発明に含まれる。本発明のこれらのフラグメントお
よび改変体と結合する抗体もまた、本発明に含まれる。これらのフラグメントお
よび改変体をコードするポリヌクレオチドもまた、本発明に含まれる。
【0065】 この遺伝子は、成人および胎児の肺組織において特異的に発現される。
【0066】 従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、生
物学的サンプル中に存在するこの組織または細胞型の差示的同定のため、ならび
に肺系の疾患および/または障害を含むがこれらに限定されない疾患および状態
の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポ
リペプチドに対する抗体は、この組織または細胞型の差示的同定のための免疫学
的プローブの提供に有用である。上記組織または細胞、特に肺系の多くの障害に
関して、標準の遺伝子発現レベル(すなわち、この障害を有さない個体由来の健
常組織または体液中の発現レベル)に対して有意に高いまたは低いレベルのこの
遺伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織もしく
は細胞型(例えば、肺組織、癌性組織および創傷組織)または体液(例えば、リ
ンパ、血清、血漿、尿、滑液、および髄液)、または別の組織もしくはサンプル
中で、慣用的に検出され得る。
【0067】 肺系における組織分布、およびカテプシン2に対する相同性は、この遺伝子に
対応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体が、肺系の疾患および/または
障害の診断、予後、予防、および/または処置に有用であることを示す。カテプ
シン2に対する相同性は、この遺伝子の翻訳産物が、前酵素プロセシング、炎症
、および転移に関与することを示す。従って、この遺伝子の翻訳産物に対して指
向されたアンタゴニストは、これらのプロセス(特に、肺癌の転移に関連するプ
ロセス)の予防および/または排除において有用であり得る。
【0068】 この組織分布は、この遺伝子の翻訳産物が、発生中の肺(特に、発達する最後
の組織が肺である成熟前の乳児において)と関連する障害の診断、予後、予防、
および/または処置に有用であることを示唆する。この組織分布は、この遺伝子
の翻訳産物が、肺腫瘍の診断、予後、予防、および/または処置に有用であるこ
とを示唆する。なぜなら、この遺伝子は、細胞分裂の調節に関与し得るから(特
に、これが胎児の組織において発現されるから)である。
【0069】 この遺伝子の翻訳産物、ならびにこの遺伝子の翻訳産物に対して指向される抗
体は、上記に列挙される組織についての腫瘍マーカーおよび/または免疫療法の
標的としての有用性を示し得る。
【0070】 (遺伝子番号4によってコードされるタンパク質の特徴) この遺伝子の翻訳産物は、Drosophila melanogaster
由来の屈曲頚部(crooked neck)タンパク質(Genbank登録
CAA41263を参照のこと)と配列相同性を共有し、これは、神経形成にお
いて役割を果たすと考えられる。Drosophila中での屈曲頚部の発現の
減少は、脳の神経芽細胞の増殖における欠損を生じると考えられ、これは神経細
胞系統の非存在を生じる。この相同性に基づいて、これらのタンパク質は、同様
の生物学的な機能を共有し得ると考えられる。
【0071】 この開示されるcDNAをコードする遺伝子は、染色体遺伝子座20p11.
2に存在すると考えられる。この染色体遺伝子座は、Alagille症候群(
肝管の発育不全、先天性肺動脈狭窄、ならびに顔および骨格の異常によって特徴
づけられる障害)に関連する。従って、本発明に関連するポリヌクレオチドは、
例えば、染色体遺伝子座20p11.2についての連鎖分析におけるマーカーと
しての用途を有する。
【0072】 本発明の好ましいポリペプチドは、残基:Ala−7〜Ile−12、Arg
−35〜Glu−41、Pro−48〜Thr−79、Glu−92〜Arg−
99、Gln−179〜Trp−185、Phe−261〜Glu−267、I
le−282〜Ser−290、Glu−320〜Ala−332、Ile−3
63〜Arg−371、Glu−386〜Arg−394、Lys−441〜L
eu−447、Glu−460〜Leu−467、Gly−475〜Ser−4
81、Ile−526〜Tyr−538、Leu−541〜Gln−546、S
er−560〜Ala−568、Val−584〜Cys−592、Ala−6
07〜Val−613、Lys−620〜Gly−636、Asp−648〜A
sn−654、Trp−664〜Glu−675、およびPro−678〜Se
r−687として配列番号16に示されるタンパク質の免疫原性エピトープのう
ちの、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11
個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20
個、21個、または22個全てを含むか、あるいはこれらからなる。これらのポ
リペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、これらのポリペプチドの1つ
以上に結合する抗体と同様に、本発明に含まれる。さらに、これらのポリペプチ
ドのフラグメントおよび改変体(例えば、本明細書中に記載のフラグメント、こ
れらのポリペプチドに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96
%、97%、98%、または99%同一なポリペプチド、およびストリンジェン
トな条件下で、これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドにハイブリ
ダイズするポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド、またはこれら
の相補体)は、本発明に含まれる。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体
と結合する抗体もまた、本発明に含まれる。これらのフラグメントおよび改変体
をコードするポリヌクレオチドもまた、本発明に含まれる。
【0073】 この遺伝子は、乳児脳および全脳組織において発現される。さらに、ノーザン
分析は、胆嚢組織における約2.4kbの転写物の存在を示す。
【0074】 従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、生
物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに神
経発達および全身的に中枢神経系(CNS)の発達を含む疾患および/または障
害を含むが、これらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有
用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対する抗体は、
組織型または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有
用である。上記組織または細胞、特にCNSおよび胆嚢の多くの障害について、
標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織また
は体液中の発現レベルに対して、有意により高いかまたはより低いレベルのこの
遺伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取された、特定の組織型ま
たは細胞型(例えば、CNS組織、胆嚢組織、癌性組織および創傷組織)または
体液(例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄液)あるいは別の組織ま
たはサンプル中で慣用的に検出され得る。
【0075】 胎児脳組織、全脳組織および胆嚢組織における組織分布、ならびにDroso
phila melanogaster由来の屈曲頚部タンパク質に対する相同
性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体が、CNS
の発達を含む疾患および/または障害(特に、神経系統の発達を含む障害)の診
断、予後、予防、および/または処置に有用であることを示す。この遺伝子の翻
訳産物は、神経発生を刺激する際、または遠位の組織系における神経系(例えば
、胆嚢など)の増殖を刺激する場合に有用であり得る。あるいは、この遺伝子の
翻訳産物に対する抗体は、このタンパク質の活性を予防する場合に有用であり得
、従って、神経発生を予防する場合に有用で有り得る。
【0076】 より一般的に、この組織分布は、この遺伝子の翻訳産物が以下のような神経変
性疾患状態および行動障害の診断、予後、予防、および/または処置に有用であ
ることを示唆する:アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、ツレ
ット症候群、精神分裂病、躁病、痴呆、パラノイア、強迫性障害、恐慌性障害、
学習障害、ALS、精神病、自閉症、および行動変化(摂食、睡眠パターン、平
衡、および知覚における障害を含む)。さらに、この遺伝子または遺伝子産物は
また、胚発生または性関連障害と関連した発生性障害の処置および/または検出
において役割を果たし得る。
【0077】 この遺伝子の翻訳産物およびこの遺伝子の翻訳産物に対して指向される抗体は
、上記に列挙された組織の腫瘍マーカーおよび/または免疫療法の標的としての
有用性を示し得る。
【0078】 (遺伝子番号5によってコードされるタンパク質の特徴) この遺伝子の翻訳産物は、マウスおよびヒトのホスホリパーゼA2(Genb
ank登録番号AAD42773およびAF188625を参照のこと)と配列
相同性を共有する。ホスホリパーゼA2分子は、グリセロールの第2の炭素基か
らの脂肪酸の放出において機能すると考えられている。相同性に基づいて、これ
らのタンパク質が、少なくともいくらかの生物学的活性を共有し得ると考えられ
る。
【0079】 本発明の好ましいポリペプチドは、配列番号17において、残基Gly−52
〜Gln−65、His−67〜Gly−78、Arg−87〜Glu−105
、Arg−121〜Arg−129、およびPro−136〜Gln−141と
して示されるタンパク質の免疫原性エピトープの1、2、3、4、または5つ全
てを含むか、あるいはこれらからなる。これらのポリペプチドをコードするポリ
ヌクレオチドもまた、これらのポリペプチドの1つ以上に結合する抗体がそうで
あるように、本発明により包含される。さらに、これらのポリペプチドのフラグ
メントおよび改変体(例えば、本明細書に記載のフラグメント、これらのポリペ
プチドに少なくとも、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98
%または99%同一であるポリペプチド、およびこれらのポリペプチドをコード
するポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌ
クレオチドによりコードされるポリペプチド、またはその相補体)が、本発明に
より包含される。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体に結合する抗体も
また、本発明により包含される。これらのフラグメントおよび改変体をコードす
るポリヌクレオチドもまた、本発明により包含される。
【0080】 この遺伝子は、B細胞リンパ腫およびT細胞リンパ腫において発現される。
【0081】 従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、生
物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに免
疫系(特に、リンパ腫)の疾患および/または障害を含むが、これらに限定され
ない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチ
ドおよびこれらのポリペプチドに対する抗体は、組織または細胞型の示差的同定
のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記組織または細胞、
特に免疫系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害
を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により
高いかまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現が、このような障害を有する個
体から採取された、特定の組織または細胞型(例えば、免疫組織、癌性組織およ
び創傷組織)または体液(例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄液)
あるいは別の組織またはサンプル中で慣用的に検出され得る。
【0082】 B細胞リンパ腫およびT細胞リンパ腫における組織分布、ならびにホスホリパ
ーゼA2に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物
および抗体が、免疫系(特にリンパ腫)の疾患および/または障害の診断、予後
、予防、および/または処置に有用であることを示す。B細胞リンパ腫およびT
細胞リンパ腫におけるこの遺伝子の翻訳産物の発現は、これらがリンパ系細胞系
統の増殖において役割を果たし得ること、および免疫プロセスの間のT細胞また
はB細胞の正常な抗原認識および活性化に関与し得ることを示唆する。この遺伝
子の翻訳産物の異常な活性はまた、B細胞リンパ腫およびT細胞リンパ腫の増殖
に寄与し得る。従って、この遺伝子の翻訳産物に対する抗体は、この活性を予防
および/または排除する場合に有用であり得る。
【0083】 より一般的には、この遺伝子またはこの遺伝子の翻訳産物に対する抗体は、以
下において臨床的な関連性を有している:損なわれた免疫の処置において;自己
免疫の修正において;免疫調節において;アレルギーの処置において;および炎
症の調節において;ならびにリンパ腫の認識および処置において。この遺伝子の
翻訳産物はまた、特定の造血系統の分化に影響を与える際に役割を果たし得、そ
して造血幹細胞においてさえ影響を与え得る。
【0084】 この遺伝子の翻訳産物およびこの遺伝子の翻訳産物に対する抗体は、上記に列
挙された組織の腫瘍マーカーおよび/または免疫療法の標的としての有用性を示
し得る。
【0085】 (遺伝子番号6によってコードされるタンパク質の特徴) この遺伝子の翻訳産物は、ヒト供給源、マウス供給源、およびウシ供給源由来
の多数のセリンプロテアーゼ分子(それぞれ、Genbank登録番号BAA1
3322、AAD49422、AAC95151を参照のこと)と配列相同性を
共有する。これらは、全て、筋骨格系と関連する細胞および/または組織(ここ
は、おそらくこれらがその活性を発揮する領域である)において発現される。こ
の相同性に基づいて、これらのタンパク質は、少なくともいくらかの生物学的活
性を共有することが予想される。
【0086】 本発明の好ましい実施形態は、以下:
【0087】
【化1】 のアミノ酸配列を含むか、あるいはこれらからなる。これらのポリペプチドをコ
ードするポリヌクレオチドもまた、これらのポリペプチドの1つ以上に結合する
抗体がそうであるように、本発明により包含される。さらに、これらのポリペプ
チドのフラグメントおよび改変体(例えば、本明細書に記載のフラグメント、こ
れらのポリペプチドに少なくとも、80%、85%、90%、95%、96%、
97%、98%または99%同一であるポリペプチド、およびこれらのポリペプ
チドをコードするポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイ
ズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、またはその相補体)
が、本発明により包含される。本発明のこれらのフラグメントおよび改変体に結
合する抗体もまた、本発明により包含される。これらのフラグメントおよび改変
体をコードするポリヌクレオチドもまた、本発明により包含される。
【0088】 本発明の好ましいポリペプチドは、配列番号18において、残基Pro−21
〜Leu−26、Gln−31〜Tyr−36、Asp−42〜Asp−48、
Ala−98〜Arg−103、Arg−108〜Asp−113、およびPh
e−165〜Lys−171として示されるタンパク質の免疫原性エピトープの
1、2、3、4、5、または6つ全てを含むか、あるいはこれらからなる。これ
らのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、これらのポリペプチド
の1つ以上に結合する抗体がそうであるように、本発明により包含される。さら
に、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体(例えば、本明細書に記
載のフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも、80%、85%、90
%、95%、96%、97%、98%または99%同一であるポリペプチド、お
よびこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドにストリンジェントな
条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド
、またはその相補体)が、本発明により包含される。本発明のこれらのフラグメ
ントおよび改変体に結合する抗体もまた、本発明により包含される。これらのフ
ラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドもまた、本発明により包
含される。
【0089】 この遺伝子は、横紋筋肉腫および骨髄組織において発現される。ノーザン分析
は、心臓組織および腎臓組織におけるこの遺伝子の発現を明らかにする。
【0090】 従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、生
物学的サンプル中に存在する筋骨格組織または細胞型の示差的同定のため、なら
びに腎臓系、心血管系、および筋骨格系の疾患および/または障害(特に、組織
リモデリングおよび/または癌を含む疾患および/または障害)を含むが、これ
らに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に
、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対する抗体は、組織または細胞型
の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記組織
または細胞、特に腎臓系、心血管系、および筋骨格系の多くの障害について、標
準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または
体液中の発現レベルに対して、有意により高いかまたはより低いレベルのこの遺
伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取された、特定の組織または
細胞型(例えば、腎臓組織、心臓組織、筋骨格組織、癌性組織および創傷組織)
または体液(例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄液)あるいは別の
組織またはサンプル中で慣用的に検出され得る。
【0091】 横紋筋肉腫および骨髄組織における分布、ならびにいくつかのセリンプロテア
ーゼに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物およ
び抗体が、筋骨格系の疾患および/または障害の診断、予後、予防、および/ま
たは処置に有用であることを示す。セリンプロテアーゼに対する相同性に基づい
て、本発明の翻訳産物は、筋骨格系組織の組織リモデリングおよび/または再構
築において役割を果たし得る。
【0092】 あるいは、本発明の翻訳産物は、特定の癌(例えば、横紋筋肉腫)において役
割を果たし得、細胞外成分のタンパク質分解を介した癌の転移を潜在的に補助す
る。従って、本発明の翻訳産物に対する抗体は、本発明の翻訳産物のプロテアー
ゼ活性を予防および/または排除する場合に有用である。横紋筋肉腫を検出する
ためのキットもまた、提供される。このようなキットは、1つの実施形態におい
て、固体支持体に結合されるこの遺伝子の翻訳産物に特異的な抗体を備える。
【0093】 個体における横紋筋肉腫を検出する方法がまた、提供され、この方法は、その
個体由来の体液または組織サンプル(好ましくは、血清)に対して、この遺伝子
の翻訳産物に特異的な抗体を接触させる工程、および、抗体が体液または組織サ
ンプル中に見出される抗原に結合するか否かを確かめる工程を包含する。好まし
くは、この抗体は、固体支持体に結合され、そしてこの体液は、血清である。上
記実施形態、ならびに他の処置および診断試験(キットおよび方法)は、本明細
書中の他に箇所により詳細に記載される。
【0094】 より一般的には、横紋筋肉腫、心臓組織、および腎臓組織における発現は、こ
の遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体が、筋障害(例えば
、筋ジストロフィー、心筋症、フィブロイド、筋腫、および横紋筋肉腫)、心血
管障害(例えば、高血圧、アテローム性動脈硬化症、糖尿病性血管障害)、およ
び腎障害(例えば、腎機能不全、挫傷腎、および糸球体腎炎)を含む種々の障害
の診断、予後、予防および/または処置に有用であることを示唆する。
【0095】 この遺伝子の翻訳産物およびこの遺伝子の翻訳産物に対する抗体は、上記に列
挙された組織の腫瘍マーカーおよび/または免疫療法の標的としての有用性を示
し得る。
【0096】 (遺伝子番号7によってコードされるタンパク質の特徴) この遺伝子の翻訳産物は、ヒトA6タンパク質チロシンキナーゼタンパク質(
Genbank登録番号CAB38055を参照のこと)と配列相同性を共有し
、これは、リン酸化事象およびシグナル伝達に関与すると考えられる。相同性に
基づいて、これらのタンパク質が、少なくともいくらかの生物学的活性を共有す
ることが予想される。
【0097】 開示されるcDNAをコードする遺伝子は、染色体座位3p21に存在すると
考えられる。従って、本発明に関連するポリヌクレオチドは、例えば、染色体座
位3p21に関する連鎖分析におけるマーカーとしての用途を有する。
【0098】 本発明の好ましいポリペプチドは、配列番号19において、残基Ser−42
〜Asp−54、Pro−90〜Val−95、Thr−107〜Gly−11
4、Ser−148〜Gln−154、Glu−168〜Thr−173、Se
r−226〜Asp−231、Pro−325〜Gly−330、およびPro
−341〜Ser−348として示されるタンパク質の免疫原性エピトープの1
、2、3、4、5、6、7、または8つ全てを含むか、あるいはこれらからなる
。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、これらのポリペ
プチドの1つ以上に結合する抗体がそうであるように、本発明により包含される
。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体(例えば、本明細
書に記載のフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも、80%、85%
、90%、95%、96%、97%、98%または99%同一であるポリペプチ
ド、およびこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドにストリンジェ
ントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるポリペ
プチド、またはその相補体)が、本発明により包含される。本発明のこれらのフ
ラグメントおよび改変体に結合する抗体もまた、本発明により包含される。これ
らのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチドもまた、本発明に
より包含される。
【0099】 この遺伝子は、造血系の組織および細胞(例えば、活性化T細胞、初代樹状細
胞、および好酸球)において主に発現される。
【0100】 従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、生
物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに免
疫系および造血系の疾患および/または障害を含むが、これらに限定されない疾
患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよ
びこれらのポリペプチドに対する抗体は、組織または細胞型の示差的同定のため
の免疫学的プローブを提供することに有用である。上記組織または細胞、特に免
疫系および造血系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち
、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意
により高いかまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現が、このような障害を有
する個体から採取された、特定の組織または細胞型(例えば、免疫組織、造血組
織、癌性組織および創傷組織)または体液(例えば、リンパ、血清、血漿、尿、
滑液および髄液)あるいは別の組織またはサンプル中で慣用的に検出され得る。
【0101】 免疫系の組織および細胞における組織分布、ならびにチロシンキナーゼタンパ
ク質に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物およ
び抗体が、免疫系の疾患および/または障害の診断、予後、予防、および/また
は処置に有用であることを示す。例えば、この遺伝子に対応するポリヌクレオチ
ド、翻訳産物および抗体は、以下を含む免疫学的障害の診断、予後、予防、およ
び/または処置のための試薬として使用され得る:関節炎、喘息、AIDSのよ
うな免疫不全疾患、白血病、慢性関節リウマチ、炎症性腸疾患、敗血症、挫瘡、
乾癬および/または本明細書の以下の「免疫活性」に記載される障害。
【0102】 この遺伝子の翻訳産物は、シグナル伝達において機能し得るか、または特に、
免疫系に関連するリン酸化を介した分子の活性化に関与し得る。この遺伝子の翻
訳産物に対する抗体は、これらの活性の予防および/または排除に有用である。
【0103】 より一般的には、造血細胞および組織におけるこの組織分布は、潜在的に全て
の造血細胞系統(血液幹細胞を含む)の増殖;生存;分化;および/または活性
化の調節における役割を示唆する。この遺伝子の翻訳産物は、サイトカイン産生
、抗原提示、または癌の処置(例えば、免疫応答を追加免疫することによる)に
おける有用性もまた示唆し得る他のプロセスの調節に関与し得る。
【0104】 さらに、この遺伝子の翻訳産物は、様々な血液系統の幹細胞および方向付けら
れた前駆細胞の拡大において、ならびに様々な細胞型の分化および/または増殖
において商業的有用性を有し得る。
【0105】 この遺伝子の翻訳産物ならびにこの遺伝子の翻訳産物に対する抗体は、上記の
組織の腫瘍マーカーとしておよび/または免疫治療の標的として有用性を示し得
る。
【0106】 (遺伝子番号8によってコードされるタンパク質の特徴) この遺伝子の翻訳産物は、ヒトカルシウムチャネルサブユニット(例えば、国
際公開番号WO95/04822およびGenBank登録番号479664を
参照のこと)と配列相同性を共有する。この相同性に基づいて、これらのタンパ
ク質は、少なくともいくらかの生物学的活性を共有することが予想される。
【0107】 この遺伝子は、乳児および成体の脳組織において発現される。
【0108】 従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、生
物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに神
経系を含む疾患および/または障害を含むが、これらに限定されない疾患および
状態の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれら
のポリペプチドに対する抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学
的プローブを提供することに有用である。上記組織または細胞、特に神経系の多
くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体
からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いかまたはよ
り低いレベルのこの遺伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取され
た、特定の組織または細胞型(例えば、神経組織、癌性組織および創傷組織)ま
たは体液(例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄液)あるいは別の組
織またはサンプル中で慣用的に検出され得る。
【0109】 成体脳組織および乳児脳組織における分布、ならびにニューロンのカルシウム
チャネルサブユニットα1B−1タンパク質に対する相同性は、この遺伝子に対
応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体が、神経系(特に、イオンチャネ
ル分子を含むもの)の疾患および/または障害の診断、予後、予防、および/ま
たは処置に有用であることを示す。この遺伝子の翻訳産物は、カルシウムのよう
なイオンに対する膜透過性に関与し得、従って、この遺伝子の翻訳産物をブロッ
クし、かつこの活性を妨害するアンタゴニストに関する良好な標的であり得る。
従って、この遺伝子の翻訳産物の一部に特異的に結合する抗体および/または小
分子が、好ましい。
【0110】 この遺伝子の翻訳産物ならびにこの遺伝子の翻訳産物に対する抗体は、上記の
組織の腫瘍マーカーとしておよび/または免疫治療の標的として有用性を示し得
る。
【0111】 (遺伝子番号9によってコードされるタンパク質の特徴) この遺伝子の翻訳産物は、臭気物質レセプター(例えば、Genbank登録
番号AAD13325を参照のこと)と配列相同性を共有する。この相同性に基
づいて、これらのタンパク質が、少なくともいくらかの生物学的活性を共有する
と考えられる。
【0112】 開示されるcDNAをコードする遺伝子は、染色体座位1q44に存在すると
考えられる。従って、本発明に関連するポリヌクレオチドは、例えば、染色体座
位1q44に関する連鎖分析におけるマーカーとしての用途を有する。
【0113】 この遺伝子は、精巣組織ならびに肺系の組織(例えば、喉頭、口蓋、唾液腺、
および肺組織)において発現される。さらに、この遺伝子は、好中球、初代樹状
細胞およびマクロファージを含む免疫系細胞において発現される。
【0114】 従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、生
物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに臭
気物質認識、および/もしくは免疫学的障害もしくは生殖障害を含む疾患ならび
に/または障害を含むが、これらに限定されない疾患および状態の診断のための
試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対
する抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供す
ることに有用である。上記組織または細胞、特に生殖系、免疫系および肺系の多
くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体
からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いかまたはよ
り低いレベルのこの遺伝子の発現が、このような障害を有する個体から採取され
た、特定の組織または細胞型(例えば、精巣組織、肺組織、免疫組織、癌性組織
および創傷組織)または体液(例えば、リンパ、血清、血漿、尿、滑液および髄
液)あるいは別の組織またはサンプル中で慣用的に検出され得る。
【0115】 肺組織、免疫組織、および精巣組織における分布、ならびに臭気物質レセプタ
ーに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物および
抗体が、肺障害、免疫障害、および生殖障害、ならびに嗅覚障害を含む疾患およ
び/または障害の診断、予後、予防、および/または処置に有用であることを示
す。
【0116】 この遺伝子の翻訳産物に対するアンタゴニストは、本発明の翻訳産物への分子
の結合を妨害および/または阻害し、それによって特定の臭気の認識を妨害する
際に有用である。
【0117】 あるいは、肺組織および免疫系細胞におけるこの遺伝子の発現は、この遺伝子
に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体が、呼吸性感染、免疫不全、
炎症、自己免疫障害、および/または本明細書中の下記の「免疫活性」に記載さ
れるような肺障害および免疫学的障害の、診断、予後、予防、および/または処
置に有用であることを示す。
【0118】 この遺伝子の翻訳産物ならびにこの遺伝子の翻訳産物に対する抗体は、上記の
組織の腫瘍マーカーとしておよび/または免疫治療の標的として有用性を示し得
る。
【0119】 (遺伝子番号10によってコードされるタンパク質の特徴) この遺伝子の翻訳産物は、COP9複合体サブユニット3(Genbank登
録番号AAD41247を参照のこと)と配列相同性を共有し、これは、シグナ
ル伝達に関与すると考えられる。
【0120】 本発明の好ましいポリペプチドは、配列番号22において、残基Glu−94
〜Leu−99として示されるタンパク質の免疫原性エピトープを含むか、ある
いはこれからなる。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた
、これらのポリペプチドの1つ以上に結合する抗体がそうであるように、本発明
により包含される。さらに、これらのポリペプチドのフラグメントおよび改変体
(例えば、本明細書に記載のフラグメント、これらのポリペプチドに少なくとも
、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%または99%同一
であるポリペプチド、およびこれらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチ
ドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコ
ードされるポリペプチド、またはその相補体)が、本発明により包含される。本
発明のこれらのフラグメントおよび改変体に結合する抗体もまた、本発明により
包含される。これらのフラグメントおよび改変体をコードするポリヌクレオチド
もまた、本発明により包含される。
【0121】 この遺伝子は、変形性関節症および破骨細胞腫の組織および細胞、ならびに胚
中心B細胞において発現される。
【0122】 従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、生
物学的サンプル中に存在する骨格組織または骨格細胞型の示差的同定のため、な
らびに骨格系障害および免疫学的障害の疾患および/または障害を含むが、これ
らに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に
、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対する抗体は、組織または細胞型
の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記組織
または細胞、特に骨格系および免疫系の多くの障害について、標準的な遺伝子発
現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レ
ベルに対して、有意により高いかまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現が、
このような障害を有する個体から採取された、特定の組織または細胞型(例えば
、骨格組織、免疫組織、癌性組織および創傷組織)または体液(例えば、リンパ
、血清、血漿、尿、滑液および髄液)あるいは別の組織またはサンプル中で慣用
的に検出され得る。
【0123】 胎児心臓および胚中心B細胞、ならびに破骨細胞腫および変形性関節症の細胞
および組織における組織分布は、この遺伝子の翻訳産物が、骨格系の疾患および
/または障害(特に、骨組織、筋組織、および結合組織の炎症性自己免疫障害)
の診断、予後、予防、および/または処置に有用であることを示す。
【0124】 この遺伝子は、骨格系に特異的な活性のためにシグナルを伝達する際に役割を
果たし得る。この遺伝子の翻訳産物に対する抗体は、この活性を妨害および/ま
たは排除する場合に有用であり得る。
【0125】 より一般的には、B細胞、破骨細胞腫組織および変形性関節症組織における組
織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体が、骨
格系(特に、骨粗鬆症)に影響を与える障害および状態、ならびに結合組織に影
響を与える障害(例えば、関節炎、外傷、腱炎、軟骨軟化症(chrondom
alacia)および炎症)の診断、予後、予防、および/または処置において
有用であり得る。この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体
は、慢性関節リウマチ、狼瘡、強皮症、および皮膚筋炎、ならびに小人症、脊髄
変形、および特異的関節異常ならびに軟骨形成不全(すなわち、先天性脊椎骨端
形成異常、家族性関節炎、II型骨形成不全(Atelosteogenesi
s type II)、シュミット型骨幹端軟骨形成不全))のような種々の自
己免疫障害の診断、予後、予防、および/または処置において有用であり得る。
【0126】 この遺伝子の翻訳産物ならびにこの遺伝子の翻訳産物に対する抗体は、上記の
組織の腫瘍マーカーとしておよび/または免疫治療の標的として有用性を示し得
る。
【0127】
【表1】 表1は、上記の各「遺伝子番号」に対応する情報を要約する。「ヌクレオチド
配列番号X」として同定されるヌクレオチド配列は、表1において同定される「
cDNAクローンID番号V」から、およびいくつかの場合において、さらなる
関連のDNAクローンから得られる、部分的に相同な(「重複する」)配列から
構築された。重複する配列は、高い冗長性の単一の連続した配列に構築され(通
常、各ヌクレオチド位置で3〜5個の重複する配列)、配列番号Xとして同定さ
れる最終的な配列を得た。
【0128】 cDNAクローンID番号Vは、その日付に寄託され、そして「ATCC受託
番号Zおよび日付」において列挙される対応する受託番号が与えられた。寄託物
のいくつかは、同じ遺伝子に対応する複数の異なるクローンを含む。「ベクター
」は、cDNAクローンIDにおいて含まれるベクターの型をいう。
【0129】 「総ヌクレオチド配列」は、「遺伝子番号」によって同定されるコンティグに
おけるヌクレオチドの総数をいう。寄託されたプラスミドは、これらの配列の全
てを含み得、この配列は、配列番号Xの「クローン配列の5’ヌクレオチド」お
よび「クローン配列の3’ヌクレオチド」として示されるヌクレオチドの位置に
よって反映される。推定メチオニン開始コドンの配列番号Xのヌクレオチドの位
置は(存在する場合)、「開始コドンの5’ヌクレオチド」として同定される。
同様に、推定シグナル配列の配列番号Xのヌクレオチドの位置は(存在する場合
)、「シグナルペプチドの第一のアミノ酸の5’ヌクレオチド」として同定され
る。
【0130】 翻訳されたアミノ酸配列は、ポリヌクレオチド配列の第1翻訳コドンで始まり
、「アミノ酸配列番号Y」として同定されるが、他のリーディングフレームもま
た、公知の分子生物学技術を使用して容易に翻訳され得る。これらの代替的オー
プンリーディングフレームによって産生されるポリペプチドは、本発明によって
具体的に意図される。
【0131】 配列番号X(ここで、Xは、配列表に開示されたポリヌクレオチド配列のいず
れかであり得る)および翻訳される配列番号Y(ここで、Yは、配列表に開示さ
れたポリペプチド配列のいずれかであり得る)は、十分に正確であり、そしてそ
うでなければ、当該分野において周知でありかつ以下でさらに記載される種々の
使用に適切である。例えば、配列番号Xは、配列番号Xにおいて含まれる核酸配
列または寄託されたプラスミドに含まれるcDNAを検出する核酸ハイブリダイ
ゼーションプローブを設計することを含む使用を有するが、これらに限定されな
い。これらのプローブはまた、生物学的サンプル中の核酸分子にハイブリダイズ
し、それによって本発明の種々の法医学の方法、および診断の方法を可能にする
。同様に、配列番号Yから同定されるポリぺプチドは、表1において同定された
cDNAクローンによりコードされる分泌タンパク質に特異的に結合する抗体を
産生することを含むが、これらに限定されない使用を有する。
【0132】 それにもかかわらず、配列決定反応によって生じるDNA配列は、配列決定の
エラーを含み得る。エラーは、誤って同定されたヌクレオチドとして、または生
じたDNA配列におけるヌクレオチドの挿入または欠失として存在する。誤って
挿入されたか、または欠失されたヌクレオチドは、推定アミノ酸配列のリーディ
ングフレームにおいてフレームシフトを引き起こす。これらの場合において、生
じたDNA配列は、実際のDNA配列と99.9%(例えば、1000塩基を超
えるオープンリーディングフレームにおける1塩基の挿入または欠失)を超えて
同一であり得るにもかかわらず、推定アミノ酸配列は、実際のアミノ酸配列とは
異なる。
【0133】 従って、ヌクレオチド配列またはアミノ酸配列における正確さを必要とするこ
れらの適用のために、本発明は、配列番号Xとして同定された作製されたヌクレ
オチド配列、および配列番号Yとして同定された推定の翻訳されたアミノ酸配列
のみではなく、表1において記載されるような、ATCCに寄託された本発明の
ヒトcDNAを含むプラスミドDNAのサンプルもまた提供する。各々の寄託さ
れたプラスミドのヌクレオチド配列は、公知の方法に従って寄託されたプラスミ
ドの配列決定により容易に決定され得る。
【0134】 次いで、推定アミノ酸配列は、このような寄託物から証明され得る。さらに、
特定のプラスミドによりコードされるタンパク質のアミノ酸配列はまた、ペプチ
ド配列決定により、または寄託されたヒトcDNAを含む適切な宿主細胞中でタ
ンパク質を発現し、このタンパク質を収集し、そしてその配列を決定することに
より、直接的に決定され得る。
【0135】 また、cDNAプラスミドを含むベクターの名前を表1に提供する。各ベクタ
ーは、当該分野において、慣用的に使用される。以下のさらなる情報は、利便性
のために提供される。
【0136】 ベクターLambda Zap(米国特許第5,128,256号および同第
5,286,636号)、Uni−Zap XR(米国特許第5,128,25
6号および同第5,286,636号)、Zap Express(米国特許第
5,128,256号および同第5,286,636号)、pBluescri
pt(pBS)(Short,J.M.ら、Nucleic Acids Re
s.16:7583−7600(1988);Alting−Mees,M.A
.およびShort,J.M.、Nucleic Acids Res.17:
9494(1989))ならびにpBK(Alting−Mees,M.A.ら
、Strategies 5:58−61(1992))は、Stratage
ne Cloning Systems,Inc.、11011 N.Torr
ey Pines Road、La Jolla,CA,92037から市販さ
れている。pBSは、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてpBKはネオマイ
シン耐性遺伝子を含む。ファージミドpBSは、λZapベクターおよびUni
−Zap XRベクターから切り出され得、そしてファージミドpBKは、Za
p Expressベクターから切り出され得る。両方のファージミドは、E.
coli株XL−1 Blue(これもまた、Stratageneから入手可
能である)に形質転換され得る。
【0137】 ベクターpSport1、pCMVSport 1.0、pCMVSport
2.0およびpCMVSport3.0は、Life Technologi
es、Inc.、P.O.Box 6009、Gaithersburg,MD
20897から得られた。全てのSportベクターはアンピシリン耐性遺伝
子を含み、そしてE.coli株DH10B(これもまた、Life Tech
nologiesから入手可能である)に形質転換され得る。例えば、Grub
er,C.E.ら、Focus 15:59(1993)を参照のこと。ベクタ
ーlafmid BA(Bento Soares、Columbia Uni
versity、NY)は、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてE.col
i株XL−1 Blueに形質転換され得る。ベクターpCR(登録商標)2.
1(これはInvitrogen、1600 Faraday Avenue、
Carlsbad、CA 92008から入手可能である)は、アンピシリン耐
性遺伝子を含み、そしてE.coli株DH10B(Life Technol
ogiesから入手可能である)に形質転換され得る。例えば、Clark,J
.M.、Nuc.Acids Res.16:9677−9686(1988)
およびMead,D.ら、Bio/Technology 9:(1991)を
参照のこと。
【0138】 本発明はまた、配列番号X、配列番号Y、および/または寄託されたプラスミ
ド(cDNAプラスミドV)に対応する遺伝子に関する。対応する遺伝子は、本
明細書中に開示される配列情報を使用して、公知の方法に従って単離され得る。
このような方法は、開示された配列からプローブまたはプライマーを調製する工
程、およびゲノム物質の適切な供給源から対応する遺伝子を同定または増幅する
工程を包含するが、これらに限定されない。
【0139】 本発明においてまた提供されるものは、対立遺伝子改変体、オルソログ(or
tholog)、および/または種相同体である。当該分野において公知である
手順は、本明細書中で開示された配列またはATCCに寄託されたクローンから
の情報を用いて、配列番号X、配列番号Y、および/またはcDNAプラスミド
Vに対応する遺伝子の全長遺伝子、対立遺伝子改変体、スプライス改変体、全長
コード部分、オルソログ、および/または種相同体を得るために使用され得る。
例えば、対立遺伝子改変体および/または種相同体は、本明細書中に提供される
配列から適切なプローブまたはプライマーを作製し、そして対立遺伝子改変体お
よび/または所望の相同体について適切な核酸供給源をスクリーニングすること
により単離および同定され得る。
【0140】 本発明は、配列番号Xの核酸配列および/またはcDNAプラスミドVを含む
か、あるいはこれらからなるポリヌクレオチドを提供する。本発明はまた、配列
番号Yのポリペプチド配列、配列番号Xによりコードされるポリペプチド、およ
び/またはcDNAプラスミドV中のcDNAによりコードされるポリペプチド
を含むか、あるいはこれらからなるポリペプチドを提供する。配列番号Yのポリ
ペプチド配列、配列番号Xによりコードされるポリペプチド、および/またはc
DNAプラスミドV中のcDNAによりコードされるポリペプチドを含むか、あ
るいはこれらからなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドはまた、本発
明により包含される。本発明はさらに、配列番号Xの核酸配列の相補体、および
/またはcDNAプラスミドV中のcDNAのコード鎖の相補体を含むか、ある
いはこれらからなるポリヌクレオチドを包含する。
【0141】 多くのポリヌクレオチド配列(例えば、EST配列)は、公に利用可能であり
、そして配列データベースを通してアクセス可能であり、そして本発明の着想の
前に公に利用可能であったかもしれない。好ましくは、このような関連するポリ
ヌクレオチドは、本発明の範囲から特に除外される。全ての関連配列を列挙する
ことは、本出願の開示では非常に煩わしい。従って、好ましくは、配列番号Xか
ら、一般式a−bにより記載されるヌクレオチド配列(ここで、aは配列番号X
の1と配列番号Xの最終ヌクレオチド−15との間の任意の整数であり、bは1
5〜配列番号Xの最終ヌクレオチドの整数であり、ここでaおよびbの両方は配
列番号Xに示されるヌクレオチド残基の位置に対応し、そしてここでbはa+1
4以上である)を含む1つ以上のポリヌクレオチドが除外される。
【0142】 (全長遺伝子の回収のためのRACEプロトコル) 部分的cDNAクローンは、Frohman,M.Aら、Proc.Nat’
l.Acad.Sci.USA,85:8998−9002(1988)に記載
されたcDNA末端の高速増幅(RACE)手順を利用することにより全長を作
製し得る。5’末端または3’末端のいずれかが欠失しているcDNAクローン
は、翻訳の開始コドンまたは終止コドンのそれぞれに伸長する欠失塩基対を含む
ように再構築され得る。いくつかの場合において、cDNAは、そのために翻訳
の開始を欠失している。以下に、この本来の5’RACE手順の改変を簡単に記
載する。ポリA+または全RNAを、Superscript II(Gibc
o/BRL)およびcDNA配列に特異的なアンチセンスプライマーまたは相補
的プライマーを用いて逆転写する。そのプライマーを、Microcon Co
ncentrator(Amicon)を用いて反応から除去する。次いで、第
1鎖cDNAを、dATPおよび末端デオキシヌクレオチドトランスフェラーゼ
(Gibco/BRL)を用いて、添付する。このように、アンカー配列を産生
し、これは、PCR増幅のために必要である。第2鎖をdA−テイル含有PCR
緩衝液、TaqDNAポリメラーゼ(Perkin−Elmer Cetus)
、5’末端で3つの隣接制限部位(XhoI、SalIおよびClaI)を含む
オリゴdTプライマーならびにこれらの制限部位を正しく含むプライマーから合
成する。この2本鎖cDNAを同じプライマーならびにネスティッドcDNA特
異的アンチセンスプライマーを用いて40サイクルでPCR増幅する。このPC
R産物を、エチジウムブロマイドアガロースゲル上でサイズ分離し、そして欠失
しているタンパク質コードDNAの推定サイズのcDNA産物を含むゲルの領域
を取り出す。cDNAをMagic PCR Prep kit(Promeg
a)を用いてアガロースゲルから精製し、XhoIまたはSalIを用いて制限
消化し、そしてプラスミド(例えば、pBluescript SKII(St
ratagene))にXhoI部位およびEcoRV部位で連結する。このD
NAを細菌に形質転換し、そしてこのプラスミドクローンを配列決定して、正確
なタンパク質コード挿入物を同定する。正確な5’末端を、推定的に同定された
相同体を有するこの配列と部分的cDNAクローンを有する重複を比較すること
により確認する。当該分野において公知の同様の方法および/または市販のキッ
トを使用して、増幅し、そして3’末端を回収する。
【0143】 いくつかの、品質制御キットが購入のために市販されている。上記のそれらと
同様の試薬および方法は、全長遺伝子を回収をするための5’ RACEおよび
3’RACEの両方について、Gibco/BRLからキットの形態で供給され
る。第2のキットは、Clontechから入手可能である。このキットは、D
umasら、Nucleic Acids Res.,19:5227−32(
1991)により開発された、関連技術の改変(SLIC(一本鎖cDNAへの
、一本鎖の連結))である。手順における主な違いは、RNAを、逆転写後にア
ルカリ加水分解し、そしてRNAリガーゼを使用して、第1鎖cDNAに、制限
部位を含むアンカープライマーを連結することである。これは、過去に配列決定
をするのが困難なポリTの伸長を生じるdAテーリング反応における必要性を除
去する。
【0144】 RNAからの5’cDNAまたは3’cDNAを産生する代替法は、cDNA
ライブラリー二本鎖DNAを使用することである。非対称性PCR増幅アンチセ
ンスcDNA鎖を、アンチセンスcDNA特異的プライマーおよびプラスミドア
ンカープライマーを用いて合成する。これらのプライマーを除去し、そして対称
PCR反応を、ネストしたcDNA特異的アンチセンスプライマーおよびプラス
ミドアンカープライマーを用いて実施する。
【0145】 (5’末端配列または3’末端配列を産生し、全長遺伝子を得るための、RN
Aリガーゼのプロトコル) 一旦、目的の遺伝子が同定されると、本来のcDNAプラスミド中には存在し
ないかもしれない遺伝子の5’部分または3’部分の同定のためのいくつかの方
法が利用可能になる。これらの方法は、以下を含むがこれらに限定されない:フ
ィルタープローブ探索、特異的プローブを使用するクローン富化、5’ RAC
Eおよび3’RACEと類似および同一のプロトコル。全長遺伝子は、ライブラ
リー中に存在し得、そして探索によって同定され得るが、一方、5’末端または
3’末端を生成するために有用な方法は、欠けている情報を生成するために、本
来のcDNAからの既存の配列情報を、使用することである。5’RACEに類
似する方法は、所望の全長遺伝子の欠けている5’末端を生成するために利用可
能である(この方法は、Fromont−Racineら、Nucleic A
cids Res.,21(7):1683−1684(1993)によって発
表された)。簡潔には、特定のRNAオリゴヌクレオチドを、全長遺伝子RNA
転写物をおそらく含むRNAの集団の5’末端に連結し、そして連結されたRN
Aオリゴヌクレオチドに特異的なプライマーおよび目的の遺伝子の公知の配列に
特異的なプライマーを含むプライマーセットを使用して、所望の全長遺伝子の5
’部分をPCR増幅する。次いで、この増幅した産物を配列決定し得、そしてこ
れを使用して全長遺伝子を生成し得る。この方法は、所望の供給源から単離され
た総RNAを用いて開始し、この手順における必要条件ではないが、ポリA R
NAを使用し得る。次いで、RNA調製物を、必要ならばホスファターゼで処理
して、後のRNAリガーゼ工程を妨害し得る分解または損傷RNAの5’リン酸
基を排除し得る。次いで、使用された場合、ホスファターゼを不活化し、そして
RNAをメッセンジャーRNAの5’末端に存在するキャップ構造を除去するた
めに、タバコ酸性ピロホスファターゼを用いて処理する。この反応は、次いでT
4 RNAリガーゼを用いてRNAオリゴヌクレオチドに連結され得る、キャッ
プ切断RNAの5’末端に5’リン酸基を残す。次いで、この改変型RNA調製
物を、遺伝子特異的なオリゴヌクレオチドを用いる、第一鎖cDNA合成のため
のテンプレートとして使用し得る。次いで、第一鎖合成反応物を、連結されたR
NAオリゴヌクレオチドに特異的なプライマーおよび目的のヒト遺伝子の公知の
配列に特異的なプライマーを用いる、所望の5’末端のPCR増幅のためのテン
プレートとして使用し得る。次いで、得られた生成物を配列決定し、そして分析
して5’末端配列が関連遺伝子に属することを確認する。
【0146】 (ポリヌクレオチドフラグメントおよびポリペプチドフラグメント) 本発明はまた、本発明のポリヌクレオチド(核酸)の、ポリヌクレオチドフラ
グメントに関する。本発明において、「ポリヌクレオチドフラグメント」とは、
以下である核酸配列を有するポリヌクレオチドをいう:cDNAプラスミドVに
含まれるcDNAの一部か、もしくはcDNAプラスミドVに含まれるcDNA
によりコードされるポリペプチドをコードするcDNAの一部;配列番号Xもし
くはその相補鎖におけるポリヌクレオチド配列の一部;配列番号Yのポリペプチ
ドの一部をコードするポリヌクレオチド配列;あるいは配列番号Xによりコード
されるポリペプチドの一部をコードするポリヌクレオチド配列。本発明のヌクレ
オチドフラグメントは、好ましくは、少なくとも約15nt、そしてより好まし
くは少なくとも約20nt、さらにより好ましくは少なくとも約30nt、そし
てなおより好ましくは少なくとも約40nt、少なくとも約50nt、少なくと
も約75nt、少なくとも約100nt、少なくとも約125nt、または少な
くとも約150ntの長さである。例えば、「少なくとも約20ntの長さ」の
フラグメントは、cDNAプラスミドVのcDNA配列に含まれる配列または配
列番号Xもしくはその相補鎖に示されるヌクレオチド配列由来の20以上の連続
する塩基を含むことが意図される。この文脈において「約(おおよそ)」は、特
に記載された値、あるいはそれより数個(5、4、3、2、または1)のヌクレ
オチドだけ大きいかまたは小さな値を含む。これらのヌクレオチドフラグメント
は、本明細書中で議論されるように、診断プローブおよびプライマーとしての使
用を含むが、それらに限定されない使用を有する。もちろん、より大きなフラグ
メント(例えば、少なくとも150、175、200、250、500、600
、1000または2000のヌクレオチドの長さ)もまた、本発明に含まれる。
【0147】 さらに、本発明のポリヌクレオチドフラグメントの代表例としては、例えば、
配列番号X、またはその相補鎖の以下のおおよそのヌクレオチド数の配列を含む
か、あるいはそれらからなるフラグメントが挙げられる:1〜50、51〜10
0、101〜150、151〜200、201〜250、251〜300、30
1〜350、351〜400、401〜450、451〜500、501〜55
0、551〜600、601〜650、651〜700、701〜750、75
1〜800、801〜850、851〜900、901〜950、951〜10
00、1001〜1050、1051〜1100、1101〜1150、115
1〜1200、1201〜1250、1251〜1300、1301〜1350
、1351〜1400、1401〜1450、1451〜1500、1501〜
1550、1551〜1600、1601〜1650、1651〜1700、1
701〜1750、1751〜1800、1801〜1850、1851〜19
00、1901〜1950、1951〜2000、2001〜2050、205
1〜2100、2101〜2150、2151〜2200、2201〜2250
、2251〜2300、2301〜2350、2351〜2400、2401〜
2450、2451〜2500、2501〜2550、2551〜2600、2
601〜2650、2651〜2700、2701〜2750、2751〜28
00、2801〜2850、2851〜2900、および/または2901〜2
920。この文脈において、「おおよそ(約)」は、特に記載された範囲、また
はいずれかの末端もしくは両方の末端において、これより数個(5、4、3、2
、または1)のヌクレオチドだけ大きいか、または小さな範囲を含む。好ましく
は、これらのフラグメントは、その配列が一部であるポリヌクレオチドによりコ
ードされるポリペプチドの、機能的活性(例えば、生物学的活性)を有するポリ
ペプチドをコードする。より好ましくは、これらのフラグメントは、本明細書中
、上記で議論されるようにプローブまたはプライマーとして使用され得る。スト
リンジェントなハイブリダイゼーション条件下またはより低いストリンジェンシ
ー条件下でこれらのフラグメントの1つ以上にハイブリダイズするポリヌクレオ
チドもまた本発明に含まれ、これらのポリヌクレオチドまたはフラグメントによ
りコードされるポリペプチドも同様に含まれる。
【0148】 さらに、本発明のポリヌクレオチドフラグメントの代表例としては、例えば、
cDNAプラスミドVに含まれるcDNAヌクレオチド配列、またはその相補鎖
の以下のおおよそのヌクレオチド数の配列を含むか、あるいはそれらからなるフ
ラグメントが挙げられる:1〜50、51〜100、101〜150、151〜
200、201〜250、251〜300、301〜350、351〜400、
401〜450、451〜500、501〜550、551〜600、601〜
650、651〜700、701〜750、751〜800、801〜850、
851〜900、901〜950、951〜1000、1001〜1050、1
051〜1100、1101〜1150、1151〜1200、1201〜12
50、1251〜1300、1301〜1350、1351〜1400、140
1〜1450、1451〜1500、1501〜1550、1551〜1600
、1601〜1650、1651〜1700、1701〜1750、1751〜
1800、1801〜1850、1851〜1900、1901〜1950、1
951〜2000、2001〜2050、2051〜2100、2101〜21
50、2151〜2200、2201〜2250、2251〜2300、230
1〜2350、2351〜2400、2401〜2450、2451〜2500
、2501〜2550、2551〜2600、2601〜2650、2651〜
2700、2701〜2750、2751〜2800、2801〜2850、2
851〜2900、および/または2901〜2920。この文脈において、「
おおよそ(約)」は、特に記載された範囲、あるいはいずれかの末端もしくは両
方の末端において、これより数個(5、4、3、2、または1)のヌクレオチド
だけ大きいか、または小さな範囲を含む。好ましくは、これらのフラグメントは
、cDNAプラスミドVに含まれるcDNAヌクレオチド配列によってコードさ
れるポリペプチドの機能的活性(例えば、生物学的活性)を有するポリペプチド
をコードする。より好ましくは、これらのフラグメントは、本明細書中で議論さ
れるように、プローブまたはプライマーとして使用され得る。ストリンジェント
なハイブリダイゼーション条件下またはより低いストリンジェンシー条件下で1
つ以上のこれらのフラグメントにハイブリダイズするポリヌクレオチドもまた本
発明に含まれ、これらのポリヌクレオチドまたはフラグメントによりコードされ
るポリペプチドもまた、含まれる。
【0149】 本発明において、「ポリペプチドフラグメント」とは、配列番号Yに含まれる
アミノ酸配列の一部、配列番号Xのポリヌクレオチド配列によってコードされる
アミノ酸配列の一部、および/またはcDNAプラスミドV中のcDNAによっ
てコードされるアミノ酸配列の一部であるアミノ酸配列をいう。タンパク質(ポ
リペプチド)フラグメントは、「自立構造(free−standing)」で
あり得るか、あるいはより大きなポリぺプチド(このフラグメントが、部分また
は領域(最も好ましくは単一の連続した領域として)を形成する)内に含まれ得
る。本発明のポリペプチドフラグメントの代表例としては、例えば、配列番号Y
のコード領域の、以下のおおよそのアミノ酸数のアミノ酸配列を含むか、あるい
はそれらからなるフラグメントが挙げられる:1〜20、21〜40、41〜6
0、61〜80、81〜100、101〜120、121〜140、141〜1
60、161〜180、181〜200、201〜220、221〜240、2
41〜260、261〜280、281〜300、301〜320、321〜3
40、341〜360、361〜380、381〜400、401〜420、4
21〜440、441〜460、461〜480、481〜500、501〜5
20、521〜540、541〜560、561〜580、581〜600、6
01〜620、621〜640、641〜660、661〜680、681〜7
00、および/または701〜711。さらに、本発明のポリペプチドフラグメ
ントは、少なくとも約10、15、20、25、30、35、40、45、50
、55、60、65、70、75、80、85、90、100、110、120
、130、140、または150のアミノ酸の長さであり得る。この文脈におい
て、「約(おおよそ)」とは、特に記載された範囲または値、あるいはいずれか
の末端もしくは両方の末端において、これより数個(5、4、3、2、または1
)のアミノ酸だけ大きいかまたは小さな、範囲または値を含む。これらのポリペ
プチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明に含まれる。
【0150】 タンパク質のN末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失が、タンパク質の1つ以
上の生物学的機能の損失の改変を生じるとしても、他の機能的活性(例えば、生
物学的活性、多量体化する能力、リガンドに結合する能力)は、なお保持され得
る。例えば、ポリペプチドの完全な形態または成熟形態を認識する抗体を誘導す
るおよび/または抗体に結合する、短縮型ムテインの能力は、完全なポリペプチ
ド、または成熟ポリペプチドの大部分より少ない残基が、N末端から除去される
場合には、一般的に保持される。完全なポリペプチドのN末端残基を欠く特定の
ポリペプチドが、このような免疫原性活性を保持するかどうかは、本明細書中に
記載される慣用的な方法、およびそうでなければ当該分野において公知の別の方
法によって容易に決定され得る。多数の欠失したN末端アミノ酸残基を有するム
テインは、いくつかの生物学的活性または免疫原性活性を保持し得るようである
。実際に、6つと同じくらい少ないアミノ酸残基からなるペプチドは、しばしば
免疫応答を惹起し得る。
【0151】 従って、本発明のポリペプチドフラグメントとしては、分泌タンパク質および
成熟形態が挙げられる。さらに好ましいポリペプチドフラグメントとしては、ア
ミノ末端もしくはカルボキシ末端またはその両方から、連続した一連の欠失した
残基を有する分泌タンパク質、もしくは成熟形態が挙げられる。例えば、任意の
数のアミノ酸(1〜60の範囲)は、分泌ポリペプチドもしくは成熟形態のいず
れかのアミノ末端から欠失され得る。同様に、任意の数のアミノ酸(1〜30の
範囲)が、分泌タンパク質もしくは成熟形態のカルボキシ末端から欠失され得る
。さらに、上記のアミノ末端およびカルボキシ末端の欠失の任意の組み合わせは
好ましい。同様に、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレ
オチドもまた好ましい。
【0152】 本発明は、本明細書中で開示されるポリペプチド(例えば、配列番号Yのポリ
ペプチド、配列番号Xに含まれるポリヌクレオチド配列によりコードされるポリ
ペプチド、および/またはcDNAプラスミドVに含まれるcDNAによりコー
ドされるポリペプチド)のアミノ酸配列のアミノ末端から、1つ以上の欠失した
残基を有するポリペプチドを、さらに提供する。特に、N末端の欠失は、一般式
m−qによって記載され得、ここでqは、本発明のポリペプチド(例えば、配列
番号Yに開示されるポリペプチド)におけるアミノ酸残基の総数を表す全整数で
あり、そしてmは、2〜q−6の範囲の任意の整数として定義される。これらの
ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド(フラグメントおよび/または改変
体を含む)もまた、本発明に含まれる。
【0153】 また、上記のように、タンパク質のC末端からの1つ以上のアミノ酸の欠失が
、このタンパク質の1つ以上の生物学的機能の損失の改変を生じるとしても、他
の機能的活性(例えば、生物学的活性、多量体化する能力、リガンドに結合する
能力)は、なお保持され得る。例えば、ポリペプチドの完全な形態または成熟形
態を認識する抗体を誘導するおよび/またはこの抗体に結合する、短縮型ムテイ
ンの能力は、完全なポリペプチド、または成熟ポリペプチドの大部分より少ない
残基が、C末端から除去される場合には、一般的に保持される。完全なポリペプ
チドのC末端残基を欠く特定のポリペプチドが、このような免疫原性活性を保持
するか否かは、本明細書中に記載される慣用的な方法、およびそうでなければ当
該分野において公知の他の方法によって容易に決定され得る。多数の欠失したC
末端アミノ酸残基を有するムテインは、いくつかの生物学的活性または免疫原性
活性を保持し得るようである。実際に、6つと同じくらい少ないアミノ酸残基か
らなるペプチドは、しばしば免疫応答を惹起し得る。
【0154】 従って、本発明は、本明細書中で開示されるポリペプチド(例えば、配列番号
Yのポリペプチド、配列番号Xに含まれるポリヌクレオチド配列によりコードさ
れるポリペプチド、および/またはcDNAプラスミドVに含まれるcDNAに
よりコードされるポリペプチド)のアミノ酸配列のカルボキシ末端からの1つ以
上の残基を有するポリペプチドを、さらに提供する。特に、C末端の欠失は、一
般式1−nによって記載され得、ここでnは、6〜q−1の範囲の任意の全整数
であり、そしてここでnは、本発明のポリペプチドにおけるアミノ酸残基の位置
に対応する。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド(フラグメン
トおよび/または改変体を含む)もまた、本発明により含まれる。
【0155】 さらに、上記のN末端またはC末端の欠失のいずれかを組み合わせて、N末端
およびC末端欠失型ポリペプチドを産生し得る。本発明はまた、アミノ末端およ
びカルボキシ末端の両方から1つ以上の欠失したアミノ酸を有するポリペプチド
を提供する。このポリペプチドは、一般的に、配列番号X(例えば、好ましくは
配列番号Yとして開示されるポリペプチドを含むが、これに限定されない)およ
び/またはcDNAプラスミドV中のcDNA、ならびに/あるいはそれらの相
補鎖によってコードされるポリペプチドの、残基m−nを有する場合に記載され
得、ここでnおよびmは、上記のような整数である。これらのポリペプチドをコ
ードするポリヌクレオチド(フラグメントおよび/または改変体を含む)もまた
、本発明に含まれる。
【0156】 配列番号Yのポリペプチドに含まれる任意のポリペプチド配列、配列番号Xと
して記載されるポリヌクレオチド配列によってコードされる、任意のポリペプチ
ド配列、またはcDNAプラスミドV中のcDNAによってコードされる任意の
ポリペプチド配列は、そのポリペプチドの特定の好ましい領域を決定するために
、分析され得る。例えば、配列番号XまたはcDNAプラスミドV中のcDNA
のポリヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列は、
DNASTARコンピュータアルゴリズム(DNASTAR,Inc.,122
8 S.Park St.,Madison,WI 53715 USA;ht
tp://www.dnastar.com/)のデフォルトパラメーターを使
用して、分析され得る。
【0157】 DNASTARコンピューターアルゴリズムを使用して慣用的に得られ得るポ
リペプチドの領域としては、以下が挙げられるが、それらに限定されない:Ga
rnier−Robsonのα−領域、β−領域、ターン領域、およびコイル領
域、Chou−Fasmanのα−領域、β−領域、およびターン領域、Kyt
e−Doolittleの親水性領域および疎水性領域、Eisenbergの
α−両親媒性領域およびβ−両親媒性領域、Karplus−Schulzの可
撓性領域、Eminiの表面形成領域ならびに高い抗原性指標のJameson
−Wolfの領域。この点で、本発明の非常に好ましいポリヌクレオチドの中に
、いくつかの構造的特徴(例えば、上記の特徴のいくつか(例えば、1、2、3
または4))と組み合わされる領域を含むポリペプチドをコードするポリヌクレ
オチドがある。
【0158】 さらに、Kyte−Doolittle親水性領域および疎水性領域、Emi
ni表面形成領域、ならびに高い抗原性指標のJameson−Wolf領域(
すなわち、Jameson−Wolfプログラムのデフォルトパラメターを使用
して同定されるような、1.5より大きいか、または1.5に等しい抗原性指標
を有する、4つ以上の連続するアミノ酸を含む)を慣用的に使用して、抗原性に
対する高い程度の潜在性を表すポリペプチドの領域を決定し得る。高い抗原性の
領域は、免疫応答の開始プロセスにおいて、抗原認識が生じ得る環境中のポリペ
プチドの表面上に曝されるようであるポリペプチドの領域を表す値を選択するこ
とによって、DNASTAR分析によるデータから決定される。
【0159】 本発明の好ましいポリペプチドフラグメントは、そのアミノ酸配列がフラグメ
ントであるポリペプチド配列の、機能的活性(例えば、生物学的活性)を示すア
ミノ酸配列を含むか、またはあるいは、これらからなるフラグメントである。「
機能的活性」を示すポリペプチドとは、全長タンパク質と関連した1つ以上の公
知の機能的活性(例えば、前述のような、生物学的活性、抗原性、免疫原性、お
よび/または多量体化など)を示し得るポリペプチドを意味する。
【0160】 他の好ましいポリペプチドフラグメントは、生物学的に活性なフラグメントで
ある。生物学的に活性なフラグメントとは、本発明のポリペプチドの活性に対し
て、同一である必要はないが、類似する活性を示すフラグメントである。このフ
ラグメントの生物学的活性は、改善された所望の活性、または低下した望ましく
ない活性を含み得る。
【0161】 好ましい実施形態において、本発明のポリペプチドは、配列番号Yのポリペプ
チドの1、2、3、4、5以上の抗原性フラグメントか、またはその部分を含む
か、またはあるいはそれらからなる。これらのポリペプチドをコードするポリヌ
クレオチド(フラグメントおよび/または改変体を含む)もまた、本発明に含ま
れる。
【0162】 本発明は、以下のポリペプチドを含むか、またはあるいは以下からなるポリペ
プチドを含む:配列番号Yに示されるポリペプチド配列のエピトープ、またはc
DNAプラスミドV中のcDNAによりコードされるポリペプチド配列のエピト
ープ、あるいは前述で定義されるように、ストリンジェントなハイブリダイゼー
ション条件下またはより低いストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件下
で、配列番号Xのエピトープコード配列またはcDNAプラスミドVに含まれる
エピトープコード配列の相補鎖にハイブリダイズするポリヌクレオチドによって
コードされるポリペプチド配列のエピトープ。本発明はさらに、本発明のポリペ
プチド配列のエピトープをコードするポリヌクレオチド配列(例えば、配列番号
Xに開示される配列など)、本発明のエピトープをコードするポリヌクレオチド
配列の相補鎖のポリヌクレオチド配列、および前記で定義されるように、ストリ
ンジェントなハイブリダイゼーション条件下またはより低いストリンジェンシー
条ハイブリダイゼーション件下で、この相補鎖にハイブリダイズするポリヌクレ
オチド配列を含む。
【0163】 用語「エピトープ」とは、本明細書中で使用される場合、動物において、好ま
しくは哺乳動物において、そして最も好ましくはヒトにおいて抗原性活性または
免疫原性活性を有するポリペプチドの部分をいう。好ましい実施形態において、
本発明は、エピトープを含むポリペプチド、およびこのポリペプチドをコードす
るポリヌクレオチドを含む。「免疫原性エピトープ」とは、本明細書中で使用さ
れる場合、当該分野で公知の任意の方法によって決定されるような(例えば、下
記に記載される抗体を産生するための方法による)、動物における抗体応答を誘
発するタンパク質の一部として定義される(例えば、Geysenら、Proc
.Natl.Acad.Sci.USA 81:3998−4002(1983
)を参照のこと)。用語「抗原性エピトープ」とは、本明細書中で使用される場
合、当該分野で周知の任意の方法(例えば、本明細書中に記載される免疫アッセ
イによる)によって決定されるような、抗体がその抗原に免疫特異的に結合し得
るタンパク質の一部として定義される。免疫特異的結合は、非特異的結合は除外
するが、他の抗原との交差反応を除外する必要はない。抗原性エピトープは、免
疫原性である必要はない。
【0164】 エピトープとして機能するフラグメントは、任意の従来の方法によって産生さ
れ得る。(例えば、Houghten,R.A.,Proc.Natl.Aca
d.Sci.USA 82:5131−5135(1985)を参照のこと。こ
れはさらに、米国特許第4,631,211号に記載される)。
【0165】 本発明においては、抗原性エピトープは、好ましくは、少なくとも4、少なく
とも5、少なくとも6、少なくとも7アミノ酸配列を含み、より好ましくは、少
なくとも8、少なくとも9、少なくとも10、少なくとも11、少なくとも12
、少なくとも13、少なくとも14、少なくとも15、少なくとも20、少なく
とも25、少なくとも30、少なくとも40、少なくとも50アミノ酸配列を含
み、そして最も好ましくは約15アミノ酸と約30アミノ酸との間の配列を含む
。免疫原性エピトープまたは抗原性エピトープを含有する好ましいポリペプチド
は、少なくとも10、15、20、25、30、35、40、45、50、55
、60、65、70、75、80、85、90、95または100アミノ酸残基
の長さである。さらなる非排他的に好ましい抗原性エピトープは、本明細書中で
開示される抗原性エピトープおよびその一部を含む。抗原性エピトープは、有用
である(例えば、エピトープに特異的に結合する抗体(モノクローナル抗体を含
む)を惹起するため)。好ましい抗原性エピトープは、本明細書中で開示される
抗原性エピトープ、および2、3、4、5以上のこれらの抗原性エピトープの任
意の組合わせを含む。抗原性エピトープは、イムノアッセイにおいて、標的分子
として使用され得る。(例えば、Wilsonら、Cell 37:767−7
78(1984);Sutcliffeら、Science 219:660−
666(1983)を参照のこと)。
【0166】 同様に、免疫原性エピトープを使用して、例えば、当該分野で周知の方法に従
う抗体を誘導し得る。(例えば、Sutcliffeら、前出;Wilsonら
,前出;Chowら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:
910−914;およびBittleら、J.Gen.Virol.66:23
47−2354(1985)を参照のこと)。好ましい免疫原性エピトープは、
本明細書で開示される免疫原性および2、3、4、5以上のこれらの免疫原性エ
ピトープの任意の組合せを含む。1つ以上の免疫原性エピトープを含むポリペプ
チドは、キャリアタンパク質(例えば、アルブミン)とともに動物系(例えば、
ウサギまたはマウス)に対する抗体応答を誘発するために提示され得るか、また
はこのポリペプチドが十分に長い場合(少なくとも約25アミノ酸)、そのポリ
ペプチドはキャリアなしで提示され得る。しかし、8〜10個程度の少なさのア
ミノ酸を含む免疫原性エピトープは、少なくとも変性ポリペプチド中の直鎖状エ
ピトープに結合し得る抗体を惹起するには十分であることが示されている(例え
ば、ウェスタンブロッティングにおいて)。
【0167】 本発明のエピトープ保有ポリペプチドは、当該分野で周知の方法に従って抗体
を誘導するために使用され得る。これらの周知の方法としては、インビボ免疫、
インビトロ免疫、およびファージディスプレイ法が挙げられるが、それらに限定
されない。例えば、Sutcliffeら、前出;Wilsonら、前出、およ
びBittleら、J.Gen.Virol.、66:2347−2354(1
985)を参照のこと。インビボ免疫を使用する場合、動物を遊離ペプチドを用
いて免疫し得る;しかし、抗ペプチド抗体力価は、高分子キャリア(例えば、キ
ーホールリンペットヘモシアニン(KLH)または破傷風トキソイド)にペプチ
ドを結合させることによりブーストされ得る。例えば、システイン残基を含むペ
プチドは、マレイミドベンゾイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(M
BS)のようなリンカーを用いてキャリアに結合され得る。その一方、他のペプ
チドは、より一般的な結合剤(例えば、グルタルアルデヒド)を用いてキャリア
に結合され得る。ウサギ、ラット、およびマウスのような動物は、遊離のペプチ
ドまたはキャリア結合ペプチドのいずれかを用いて、例えば、約100μgのペ
プチドまたはキャリアタンパク質およびフロイントアジュバントまたは免疫応答
を刺激することが公知である他のアジュバントを含むエマルジョンを腹腔内注射
および/または皮内注射することにより免疫される。いくつかのブースター注射
が、抗ペプチド抗体の有用な力価を提供するために、例えば、約2週間の間隔で
、必要とされ得る。この力価は、例えば、固体表面に吸着した遊離のペプチドを
用いるELISAアッセイにより検出され得る。免疫した動物由来の血清中の抗
ペプチド抗体の力価は、抗ペプチド抗体の選択(例えば、当該分野で周知の方法
に従う固体支持体上のペプチドへの吸着および選択された抗体の溶出による)に
より上昇し得る。
【0168】 当業者に理解されるように、そして上記で考察されるように、本発明のポリペ
プチドおよびその免疫原性エピトープフラグメントおよび/または抗原性エピト
ープフラグメントは、他のポリペプチド配列に融合され得る。例えば、本発明の
ポリペプチドは、免疫グロブリン(IgA、IgE、IgG、IgM)の定常ド
メインまたはそれらの部分(CH1、CH2、CH3、またはそれらの任意の組
み合わせ、およびこれらの部分)と融合し得、これがキメラポリペプチドを生じ
る。このような融合タンパク質は、精製を容易にし得、そしてインビボにおける
半減期を増加し得る。このことは、ヒトCD4ポリペプチドの最初の2つのドメ
インおよび哺乳動物の免疫グロブリンの重鎖または軽鎖の定常領域の種々のドメ
インからなるキメラタンパク質について示された。例えば、EP 394,82
7;Trauneckerら、Nature,331:84−86(1988)
を参照のこと。上皮の関門を横切っての免疫系への抗原の増強された送達は、F
cRn結合パートナー(例えば、IgGフラグメントまたはFcフラグメント(
例えば、PCT公開 WO96/22024およびWO 99/04813を参
照のこと)に結合体化した抗原(例えば、インスリン)について実証されている
。ジスルフィド架橋二量体構造を有するIgG融合タンパク質はまた、そのIg
G部分ジスルフィド結合に起因して、単量体ポリペプチドまたはそれらのフラグ
メント単独よりも、他の分子の結合および中和において効果的であることが見出
された。例えば、Fountoulakisら、J.Biochem.、270
:3958−3964(1995)を参照のこと。
【0169】 同様に、EP−A−O 464 533(カナダ国対応出願2045869)
は、別のヒトタンパク質またはその一部とともに免疫グロブリン分子の定常領域
の種々の部分を含む、融合タンパク質を開示する。多くの場合、融合タンパク質
中のFc部分は、治療および診断において有利であり、従って、例えば改善され
た薬物動態学的特性を生じ得る(EP−A 0232 262)。あるいは、融
合タンパク質が発現、検出、および精製された後に、Fc部分が欠失され得るこ
とが望ましい。例えば、融合タンパク質が、免疫の抗原として使用される場合、
そのFc部分は、治療および診断を妨げ得る。薬物探索において、例えばhIL
−5のようなヒトタンパク質が、hIL−5のアンタゴニストを同定するための
高処理能力スクリーニングアッセイの目的のためにFc部分と融合されている。
(D.Bennettら、J.Molecular Recognition
8:52−58(1995);K.Johansonら、J.Biol.Che
m.270:9459−9471(1995)を参照のこと。) さらに、本発明のポリペプチドは、融合されたポリペプチドの精製を容易にす
るペプチドのような、マーカー配列と融合され得る。好ましい実施形態において
、このマーカーアミノ酸配列は、とりわけ、pQEベクター(QIAGEN,I
nc.,9259 Eton Avenue,Chatsworth,CA,9
1311)において提供されるタグのようなヘキサ−ヒスチジンペプチドであり
、それらの多くは市販されている。例えば、Gentzら、Proc.Natl
.Acad.Sci.USA 86:821−824(1989)に記載される
ように、ヘキサ−ヒスチジンは、融合タンパク質の簡便な精製を提供する。精製
に有用な他のペプチドタグである「HA」タグは、インフルエンザ赤血球凝集素
タンパク質由来のエピトープに対応する(Wilsonら、Cell 37:7
67(1984))。
【0170】 従って、これら上記の任意の融合物は、本発明のポリヌクレオチドまたはポリ
ペプチドを用いて操作され得る。
【0171】 上記のエピトープをコードする核酸はまた、エピトープタグ(例えば、血球凝
集素(「HA」)タグまたはフラッグタグ(flag tag))として目的の
遺伝子と組換えられ、発現されたポリペプチドの検出および精製を補助し得る。
例えば、Janknechtらによって記載された系は、ヒト細胞株において発
現される非変性融合タンパク質の迅速な精製を可能にする(Janknecht
ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:8972−897
(1991))。この系において、目的の遺伝子は、遺伝子の読み取り枠(リー
ディングフレーム)が、6つのヒスチジン残基からなるアミノ末端タグと翻訳で
融合されるように、ワクシニア組換えプラスミド中にサブクローンされる。この
タグは、融合タンパク質についての基質結合ドメインとしてはたらく。組換えワ
クシニアウイルスに感染した細胞由来の抽出物は、Ni2+ニトリロ三酢酸アガ
ロースカラムに充填され、そしてヒスチジンタグ化したタンパク質が、イミダゾ
ール含有緩衝液を用いて選択的に溶出され得る。
【0172】 本発明のさらなる融合タンパク質は、遺伝子シャッフリング、モチーフシャッ
フリング、エキソンシャッフリング、および/またはコドンシャッフリング(総
称して「DNAシャッフリング」といわれる)の技術を通じて生成され得る。D
NAシャッフリングを使用して、本発明のポリペプチドの活性を調節し得、この
ような方法を用いて、変化した活性を有するポリペプチド、ならびにそのポリペ
プチドのアゴニストおよびアンタゴニストを生成し得る。一般には、米国特許第
5,605,793号;同第5,811,238号;同第5,830,721号
;同第5,834,252号;および同第5,837,458号、ならびにPa
ttenら、Curr.Opinion Biotechnol.8:724−
33(1997);Harayama、Trends Biotechnol.
16(2):76−82(1998);Hanssonら、J.Mol.Bio
l.287:265−76(1999);ならびにLorenzoおよびBla
sco,Biotechniques 24(2):308−13(1998)
(これらの特許および刊行物の各々は、本明細書によってその全体が参考として
援用される)を参照のこと。1つの実施形態において、配列番号Xに対応するポ
リヌクレオチドおよびこれらのポリヌクレオチドによってコードされるポリペプ
チドの改変は、DNAシャッフリングにより達成され得る。DNAシャッフリン
グは、相同組換えまたは部位特異的組換えにより、2つ以上のDNAセグメント
をアセンブリして、ポリヌクレオチド配列における変化を産生することを含む。
別の実施形態において、本発明のポリヌクオチドまたはコードされるポリペプチ
ドは、組換え前に、エラープローンPCR、ランダムヌクレオチド挿入または他
の方法による、ランダムな変異誘発に供されることによって改変され得る。別の
実施形態において、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの1つ
以上の成分、モチーフ、セクション(section)、部分、ドメイン、フラ
グメントなどは、1つ以上の異種分子の1つ以上の成分、モチーフ、セクション
、部分、ドメイン、フラグメントなどと組み換えられ得る。
【0173】 (ポリヌクレオチド改変体およびポリペプチド改変体) 本発明はまた、改変体を含む。本発明は、配列番号Xに開示されるポリヌクレ
オチド配列の改変体またはそれらに対する相補鎖の改変体、および/またはcD
NAプラスミドV中に含まれるcDNA配列の改変体に関する。
【0174】 本発明はまた、配列番号Yに開示されるポリペプチド配列の改変体、配列番号
Xのポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド配列の改変体および/
またはcDNAプラスミドV中のcDNAによってコードされるポリペプチド配
列の改変体を含む。
【0175】 「改変体」とは、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドとは異なるが
それらの特性は保持している、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドをいう。一
般的に、改変体は全体的に非常に類似しており、そして、多くの領域において、
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドと同一である。
【0176】 従って、本発明の1つの局面は、以下からなる群から選択されるヌクレオチド
配列を有するポリヌクレオチドを含むか、あるいはそれらからなる単離された核
酸分子を提供する:(a)配列番号Xに記載のヌクレオチド配列、またはクロー
ンID番号VのcDNA配列に含まれるヌクレオチド配列;(b)配列番号Yの
完全なアミノ酸配列またはクローンID番号V中のcDNAによってコードされ
る完全なアミノ酸配列をコードする、配列番号XまたはクローンID番号Vのc
DNAにおけるヌクレオチド配列;(c)成熟ヒトポリペプチドをコードする、
配列番号XまたはクローンID番号VのcDNAにおけるヌクレオチド配列;(
d)ヒトポリペプチドの生物学的に活性なフラグメントをコードする、配列番号
XまたはクローンID番号VのcDNA配列におけるヌクレオチド配列;(e)
ヒトポリペプチドの抗原性フラグメントをコードする、配列番号Xまたはクロー
ンID番号VのcDNA配列におけるヌクレオチド配列;(f)配列番号Yの完
全なアミノ酸配列またはクローンID番号V中のcDNAによってコードされる
完全なアミノ酸配列を含む、ヒトポリペプチドをコードするヌクレオチド配列;
(g)配列番号Yのアミノ酸配列またはクローンID番号V中のcDNAによっ
てコードされるアミノ酸配列の成熟ヒトポリペプチドをコードするヌクレオチド
配列;(h)配列番号Yの完全なアミノ酸配列またはクローンID番号V中のc
DNAによってコードされる完全なアミノ酸配列を有するヒトポリペプチドの生
物学的に活性なフラグメントをコードするヌクレオチド配列;(i)配列番号Y
の完全なアミノ酸配列またはクローンID番号V中のcDNAによってコードさ
れる完全なアミノ酸配列を有するヒトポリペプチドの抗原性フラグメントをコー
ドするヌクレオチド配列;ならびに(j)上記の(a),(b),(c),(d
),(e),(f),(g),(h),または(i)のヌクレオチド配列のいず
れかに対して相補的なヌクレオチド配列。
【0177】 本発明はまた、例えば、上記の(a),(b),(c),(d),(e),(
f),(g),(h),(i)または(j)のヌクレオチド配列、配列番号Xの
ヌクレオチドコード配列またはそれに対する相補鎖、クローンID番号V中に含
まれるcDNAのヌクレオチドコード配列またはそれに対する相補鎖、配列番号
Yのポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、配列番号Xのヌクレオチド配
列によってコードされるポリペプチド配列をコードするヌクレオチド配列、配列
番号Xのポリヌクレオチド配列の相補体によってコードされるポリペプチド配列
、クローンID番号V中に含まれるcDNAによってコードされるポリペプチド
をコードするヌクレオチド配列、表1の第10欄に規定されるようなポリペプチ
ド配列をコードする配列番号Xのヌクレオチド配列またはそれに対する相補鎖、
表1の第10欄に規定されるようなポリペプチドをコードするヌクレオチド配列
またはそれに対する相補鎖、および/またはこれらの核酸分子のいずれかのポリ
ヌクレオチドフラグメント(例えば、本明細書中に記載されるようなこれらのフ
ラグメント)のいずれかに対して少なくとも80%,85%,90%,95%,
96%,97%,98%,99%または100%同一なヌクレオチド配列を含む
か、あるいはそれらからなる核酸分子に関する。ストリンジェントなハイブリダ
イゼーション条件下、またはより低いストリンジェンシーの条件下で、これらの
核酸分子の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドもまた、本発明によっ
て包含され、これらのポリヌクレオチドおよび核酸によってコードされるポリペ
プチドも同様に包含される。
【0178】 好ましい実施形態において、本発明は、上記の(a),(b),(c),(d
),(e),(f),(g),(h),または(i)のポリヌクレオチドに対し
て、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下、またはより低いストリ
ンジェンシーの条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドを含むか、あるい
はそれらからなる核酸分子を包含し、これらのポリヌクレオチドによってコード
されるポリペプチドも同様に包含する。別の好ましい実施形態において、ストリ
ンジェントなハイブリダイゼーション条件下、またはより低いストリンジェンシ
ーの条件下で、これらの核酸分子の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチ
ドもまた、本発明によって包含され、これらのポリヌクレオチドによってコード
されるポリペプチドも同様に包含される。
【0179】 別の実施形態では、本発明は、以下からなる群から選択されるアミノ酸配列を
有するポリペプチドを含むか、あるいはそれらからなる精製されたタンパク質を
提供する:(a)配列番号Yの完全なアミノ酸配列、またはクローンID番号V
中のcDNAによってコードされる完全なアミノ酸配列;(b)配列番号Yのア
ミノ酸配列、またはクローンID番号V中のcDNAによってコードされるアミ
ノ酸配列を有するヒトポリペプチドの成熟形態のアミノ酸配列;(c)配列番号
Yの完全なアミノ酸配列、またはクローンID番号V中のcDNAによってコー
ドされる完全なアミノ酸配列を有するヒトポリペプチドの生物学的に活性なフラ
グメントのアミノ酸配列;ならびに(d)配列番号Yの完全なアミノ酸配列、ま
たはクローンID番号V中のcDNAによってコードされる完全なアミノ酸配列
を有する、ヒトポリペプチドの抗原性フラグメントのアミノ酸配列。
【0180】 本発明はまた、例えば、上記の(a),(b),(c),または(d)のアミ
ノ酸配列、配列番号Yに示されるアミノ酸配列、クローンID番号V中に含まれ
るcDNAによってコードされるアミノ酸配列、表1の第10欄に規定されるよ
うなアミノ酸配列、配列番号Xのヌクレオチド配列によってコードされるアミノ
酸配列、および配列Xのポリヌクレオチド配列の相補体によってコードされるア
ミノ酸配列のいずれかに対して少なくとも80%,85%,90%,95%,9
6%,97%,98%,99%または100%同一なアミノ酸配列を含むか、あ
るいはそれらからなるタンパク質に関する。これらのポリペプチドのフラグメン
トもまた提供される(例えば、本明細書中に記載のこれらのフラグメント)。さ
らに、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下、またはより低いスト
リンジェンシーの条件下で、これらのアミノ酸配列をコードする核酸分子の相補
体にハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるタンパク質もま
た本発明によって包含され、これらのタンパク質をコードするポリヌクレオチド
も同様に包含される。
【0181】 本発明の参照ヌクレオチド配列に、例えば、少なくとも95%「同一」である
ヌクレオチド配列を有する核酸によって、その核酸のヌクレオチド配列が、その
ヌクレオチド配列がポリぺプチドをコードする参照ヌクレオチド配列の各100
ヌクレオチドあたり5つまでの点変異を含み得ることを除いて、参照配列に対し
て同一であることを意図する。換言すれば、参照ヌクレオチド配列に対して少な
くとも95%同一のヌクレオチド配列を有する核酸を得るために、参照配列のヌ
クレオチドの5%までが、欠失され得るか、または別のヌクレオチドで置換され
得るか、あるいは参照配列中の総ヌクレオチドの5%までの数のヌクレオチドが
参照配列中に挿入され得る。問い合わせ(query)配列は、表1に示される
配列全体、ORF(オープンリーディングフレーム)、または本明細書中で記載
されるように特定される任意のフラグメントであり得る。
【0182】 実際問題として、任意の特定の核酸分子またはポリぺプチドが、本発明のヌク
レオチド配列に対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、9
7%、98%、または99%同一であるか否かは、公知のコンピュータープログ
ラムを使用して従来的に決定され得る。問い合わせ配列(本発明の配列)と対象
配列との間の最も良好な全体的な適合性(全体的な配列整列とも呼ばれる)を決
定するための好ましい方法は、Brutlagら(Comp.App. Bio
sci.6:237−245(1990))のアルゴリズムに基づくFASTD
Bコンピュータープログラムを使用して決定され得る。配列整列において、問い
合わせ配列および対象配列は、両方ともにDNA配列である。RNA配列は、U
からTに変換することによって比較され得る。この全体的な配列整列の結果は、
同一性パーセントで示される。同一性パーセントを算定するためにDNA配列の
FASTDB整列において使用される好ましいパラメーターは:Matrix=
Unitary、k−tuple=4、Mismatch Penalty=1
、Joining Penalty=30、Randomization Gr
oup Length=0、Cutoff Score=1、Gap Pena
lty=5、Gap Size Penalty 0.05、Window S
ize=500または対象ヌクレオチド配列の長さ(どちらかより短い方)であ
る。
【0183】 対象配列が、5’または3’欠失のために(内部欠失のためではなく)問い合
わせ配列より短い場合、手動の補正が結果に対してなされなけらばならない。こ
れは、同一性パーセントを計算する場合に、FASTDBプログラムが対象配列
の5’および3’の短縮を考慮しないからである。5’末端または3’末端で短
縮されている対象配列について、問い合わせ配列に対して、同一性パーセントは
、問い合わせ配列の総塩基のパーセントとして一致/整列されない対象配列の5
’および3’である問い合わせ配列の塩基の数を計算することによって補正され
る。ヌクレオチドが一致/整列されるか否かは、FASTDB配列整列の結果に
よって決定される。次いで、このパーセントは、特定のパラメーターを用いて上
記のFASTDBプログラムによって算定された同一性パーセントから差し引か
れ、最終的な同一性パーセントのスコアに到達する。この補正されたスコアが、
本発明の目的に使用されるものである。FASTDB整列によって示されるよう
に、問い合わせ配列と一致/整列されない、対象配列の5’および3’の塩基の
外側の塩基のみが、同一性パーセントのスコアを手動で調整する目的で算定され
る。
【0184】 例えば、90塩基の対象配列が、同一性パーセントを決定するために100塩
基の問い合わせ配列に整列される。欠失が、対象配列の5’末端で生じ、従って
、FASTDB整列は、5’末端で最初の10塩基の一致/整列を示さない。1
0個の不対合塩基は、配列の10%(一致していない5’および3’の末端の塩
基の数/問い合わせ配列の塩基の総数)を表し、そのため10%が、FASTD
Bプログラムによって算定される同一性パーセントのスコアから差し引かれる。
残りの90塩基が完全に一致する場合は、最終的な同一性パーセントは90%で
ある。別の例では、90塩基の対象配列が、100塩基の問い合わせ配列と比較
される。この場合、欠失は、内部欠失であり、その結果、対象配列の5’または
3’に問い合わせと一致/整列しない塩基が存在しない。この場合、FASTD
Bによって算定される同一性パーセントは手動で補正されない。再び、問い合わ
せ配列と一致/整列しない対象配列の5’または3’の塩基のみが手動で補正さ
れる。他の手動の補正は、本発明の目的のためにはなされない。
【0185】 本発明の問い合わせアミノ酸配列に、例えば、少なくとも95%「同一」であ
るアミノ酸配列を有するポリぺプチドにより、対象ポリペプチドのアミノ酸配列
は、その対象ポリぺプチド配列が問い合わせアミノ酸配列の各100個のアミノ
酸あたり5つまでのアミノ酸の変更を含み得ることを除いて、問い合わせ配列に
同一であることが意図される。換言すれば、問い合わせアミノ酸配列に少なくと
も95%同一であるアミノ酸配列を有するポリぺプチドを得るために、対象配列
におけるアミノ酸残基の5%までが、挿入、欠失、(インデル(indels)
)または別のアミノ酸で置換され得る。参照配列のこれらの改変は、参照アミノ
酸配列のアミノ末端もしくはカルボキシ末端位置で生じ得るか、またはそれらの
末端位置の間のどこにでも生じ得、参照配列中の残基間で個々にかまたは参照配
列内の1個以上連続する群の状態かのいずれかで、散在する。
【0186】 実際問題として、任意の特定のポリぺプチドが、例えば、表1に示されるアミ
ノ酸配列またはそのフラグメント、配列番号Xにおけるヌクレオチド配列により
コードされるアミノ酸配列またはそのフラグメント、あるいはcDNAプラスミ
ドVにおけるcDNAによりコードされるアミノ酸配列またはそのフラグメント
に対して、少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98
%、または99%同一であるか否かは、公知のコンピュータープログラムを使用
して従来のように決定され得る。問い合わせ配列(本発明の配列)と対象配列と
の間での最良の全体的な一致(全体的配列整列とも呼ばれる)を決定するための
好ましい方法は、Brutlagら(Comp.App.Biosci.6:2
37−245(1990))のアルゴリズムに基づくFASTDBコンピュータ
ープログラムを使用して決定され得る。配列整列において、問い合わせ配列およ
び対象配列は、両方ともヌクレオチド配列であるかまたは両方ともアミノ酸配列
であるかのいずれかである。上記の全体的配列整列の結果は、同一性パーセント
で示される。FASTDBアミノ酸整列に用いられる好ましいパラメーターは:
Matrix=PAM 0、k−tuple=2、Mismatch Pena
lty=1、Joining Penalty=20、Randomizati
on Group Length=0、Cutoff Score=1、Win
dow Size=配列の長さ、Gap Penalty=5、Gap Siz
e Penalty=0.05、Window Size=500または対象ア
ミノ酸配列の長さ(どちらかより短い方)である。
【0187】 対象配列が、N末端またはC末端欠失により(内部の欠失のためではなく)問
い合わせ配列よりも短い場合、手動の補正が結果に対してなされなけらばならな
い。これは、FASTDBプログラムが、全体的な同一性パーセントを算定する
場合に、対象配列のN末端短縮およびC末端短縮を考慮しないからである。N末
端およびC末端で短縮されている対象配列について、問い合わせ配列に対して、
同一性パーセントは、問い合わせ配列の総塩基のパーセントとして、対応する対
象残基と一致/整列しない、対象配列のN末端およびC末端である問い合わせ配
列の残基の数を計算することによって補正される。残基が一致/整列されている
か否かは、FASTDB配列整列の結果によって決定される。次いで、このパー
セントは、上記のFASTDBプログラムによって特定のパラメーターを使用し
て計算された同一性パーセントから差し引かれ、最終的な同一性パーセントのス
コアに到達する。この最終的な同一性パーセントのスコアが、本発明の目的で使
用されるものである。問い合わせ配列と一致/整列していない対象配列のN末端
側およびC末端側の残基のみが、同一性パーセントのスコアを手動で調整する目
的のために考慮される。すなわち、対象配列の最も遠いN末端およびC末端残基
の外側の問い合わせ残基位置のみである。
【0188】 例えば、90アミノ酸残基の対象配列が、同一性パーセントを決定するために
100残基の問い合わせ配列と整列される。欠失が対象配列のN末端で生じ、そ
してそれゆえFASTDB整列は、N末端での最初の10残基の一致/整列を示
さない。この10個の不対合残基は、配列の10%(一致していないN末端およ
びC末端の残基の数/問い合わせ配列中の残基の総数)を表し、その結果FAS
TDBプログラムによって計算される同一性パーセントのスコアから10%が差
し引かれる。残りの90残基が完全に一致した場合、最終的な同一性パーセント
は90%である。別の例において、90残基の対象配列が、100残基の問い合
わせ配列と比較される。この場合、欠失は、内部欠失であり、そのため問い合わ
せと一致/整列しない対象配列のN末端またはC末端の残基は存在しない。この
場合、FASTDBによって算定される同一性パーセントは、手動で補正されな
い。再び、FASTDB整列において示されるように、問い合わせ配列と一致/
整列しない対象配列のN末端およびC末端の外側の残基位置のみが手動で補正さ
れる。他の手動の補正は、本発明の目的のためにはなされない。
【0189】 改変体は、コード領域、非コード領域、またはその両方における変化を含み得
る。特に好ましいものは、サイレントな置換、付加、または欠失を生成するがコ
ードされるポリぺプチドの特性または活性を変化させない変化を含む、ポリヌク
レオチド改変体である。遺伝コードの縮重に起因するサイレントな置換によって
生成されるヌクレオチド改変体が、好ましい。さらに、50アミノ酸未満、40
アミノ酸未満、30アミノ酸未満、20アミノ酸未満、10アミノ酸未満、ある
いは5〜50アミノ酸、5〜25アミノ酸、5〜10アミノ酸、1〜5アミノ酸
、または1〜2アミノ酸が、任意の組合せで置換、欠失、または付加されている
改変体もまた、好ましい。ポリヌクレオチド改変体は、種々の理由(例えば、特
定の宿主についてのコドン発現を至適化するため(ヒトmRNAにおけるコドン
を、E.coliのような細菌宿主によって好ましいコドンに変化させる))の
ために、生成され得る。
【0190】 天然に存在する改変体は、「対立遺伝子改変体」と呼ばれ、そして生物の染色
体上の所定の遺伝子座を占有する遺伝子のいくつかの代替の形態のうちの1つを
いう。(Genes II、Lewin,B.,編 John Wiley &
Sons,New York(1985))。これらの対立遺伝子改変体は、
ポリヌクレオチドレベルおよび/またはポリぺプチドレベルのいずれかで変化し
得、そして本発明に含まれる。あるいは、天然に存在しない改変体は、変異誘発
技術によってまたは直接的な合成によって生成され得る。
【0191】 タンパク質工学および組換えDNA技術の公知の方法を使用して、改変体は、
本発明のポリぺプチドの特性を改善または変化させるために作製され得る。例え
ば、本明細書中に考察されるように、1つ以上のアミノ酸が、生物学的機能の実
質的な欠損を伴わずに、本発明のポリペプチドのN末端またはC末端から欠失さ
れ得る。Ronら、J.Biol.Chem.268:2984−2988(1
993)の著者らは、3個、8個、または27個のアミノ末端アミノ酸残基を欠
失させた後でさえもヘパリン結合活性を有する改変体KGFタンパク質を報告し
た。同様に、インターフェロンγは、このタンパク質のカルボキシ末端から8〜
10個のアミノ酸残基を欠失させた後、10倍までのより高い活性を示した(D
obeliら、J.Biotechnology 7:199−216(198
8))。
【0192】 さらに、豊富な証拠は、改変体が、天然に存在するタンパク質の生物学的活性
に類似する生物学的活性をしばしば保持することを実証する。例えば、Gayl
eおよび共同研究者ら(J.Biol.Chem 268:22105−221
11(1993))は、ヒトサイトカインIL−1aの広範囲にわたる変異分析
を行った。彼らは、ランダムな変異誘発を使用して、分子の全長にわたって改変
体当たり平均2.5アミノ酸の変化になる、3,500個を超える個々のIL−
1a改変体を作製した。複数の変異が、全ての潜在的なアミノ酸の位置で試験さ
れた。この研究者らは、「分子の大部分は、[結合活性または生物学的活性]の
いずれに対してもほとんど影響を伴わないで変化され得る」ことを見出した。(
要約を参照のこと)。実際、試験された3,500個を超えるヌクレオチド配列
のうち、わずか23個の独特なアミノ酸配列が、野生型と活性が有意に異なるタ
ンパク質を生成した。
【0193】 さらに、本明細書中で考察されるように、ポリぺプチドのN末端またはC末端
からの1つ以上のアミノ酸の欠失が、1つ以上の生物学的機能の改変または欠失
を生じたとしても、他の生物学的活性はなお保持され得る。例えば、分泌される
形態を認識する抗体を誘導および/または結合する、欠失改変体の能力は、分泌
される形態の大多数より少ない残基が、N末端またはC末端から除去される場合
に保持されるようである。タンパク質のN末端またはC末端残基を欠損する特定
のポリぺプチドが、このような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に
記載される慣用的な方法、およびそうでなければ当該分野において公知の慣用的
な方法によって容易に決定され得る。
【0194】 従って、本発明はさらに、本発明のポリペプチド(それらが改変体である)の
機能的な活性(例えば、生物学的活性)を示すポリぺプチド改変体を含む。この
ような改変体としては、活性に対する影響をほとんど有さないように、当該分野
において公知の一般的な法則に従って選択される、欠失、挿入、逆位、反復、お
よび置換が挙げられる。
【0195】 本出願は、本明細書中に開示される核酸配列に対して少なくとも80%、85
%、90%、95%、96%、97、98%、99%または100%同一の核酸
分子に関し(例えば、Nおよび/またはC末端欠失のアミノ酸配列を有するポリ
ペプチドをコードする)、それらが機能的活性を有するポリペプチドをコードす
るかどうかに関わらない。これは、特定の核酸分子が機能的活性を有するポリペ
プチドをコードしない場合でも、当業者はなお、例えば、ハイブリダイゼーショ
ンプローブまたはポリメラーゼ連鎖反応(PCR)プライマーとして核酸分子を
使用する方法を知っているからである。機能的活性を有するポリペプチドをコー
ドしない本発明の核酸分子の使用は、特に、(1)cDNAライブラリー内で遺
伝子または対立遺伝子またはそれらのスプライス変異体を単離する工程;(2)
Vermaら、Human Chromosomes:A Manual of
Basic Techniques、Pergamon Press、New
York(1988)に記載されるような、遺伝子の正確な染色体位置を提供
するための、中期染色体拡散へのインサイチュハイブリダイゼーション(例えば
、「FISH」);および(3)特定の組織内でmRNA発現を検出するための
ノーザンブロット分析を含む。
【0196】 しかし、本明細書中に開示される核酸配列に対して少なくとも80%、85%
、90%、95%、96%、97%、98%、99%または100%同一の配列
を有する核酸分子が好ましく、これは、実際に本発明のポリペプチドの機能的活
性を有するポリペプチドをコードする。
【0197】 当然のことながら、遺伝子コードの縮重に起因して、例えば、cDNAプラス
ミドVのcDNAの核酸配列、表1(配列番号X)に示される核酸配列またはそ
のフラグメントに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、
97%、98%、99%、または100%同一の配列を有する多数の核酸分子が
、「機能活性を有する」ポリペプチドをコードするということを、当業者は、直
ちに理解する。実際に、これらのヌクレオチド配列のいずれかの縮重改変体すべ
てが、同じポリぺプチドをコードするので、多くの場合、このことは、上記の比
較アッセイを実行しなくても、当業者に明らかである。縮重改変体でないような
核酸分子について、合理的な数がまた、機能活性を有するポリペプチドをコード
することが、当該分野でさらに理解される。なぜならば、当業者が、さらに以下
に記載されるように、タンパク質の機能を有意にもたらす可能性が低いか、また
は有意にもたらす可能性がないかのいずれかのアミノ酸置換(例えば、1つの脂
肪族アミノ酸を第2の脂肪族アミノ酸と置換すること)を完全に知っているから
である。
【0198】 例えば、表現型的にサイレントなアミノ酸置換の作製方法に関する手引きは、
Bowieら、「Deciphering the Message in P
rotein Sequences:Tolerance to Amino
Acid Substitutions」,Science 247:1306
−1310(1990)に提供され、ここにおいてこの著者らは、アミノ酸配列
の変化に対する寛容性を研究するための2つの主なストラテジーが存在すること
を示す。
【0199】 第1のストラテジーは、進化の過程の間の自然の選択によるアミノ酸置換の寛
容を利用する。異なる種におけるアミノ酸配列を比較して、保存されるアミノ酸
が同定され得る。これらの保存されるアミノ酸は、タンパク質の機能について重
要であるようである。対照的に、置換が自然の選択によって寛容されたアミノ酸
の位置は、これらの位置がタンパク質の機能に重要ではないことを示す。従って
、アミノ酸置換を寛容する位置は改変され得るが、タンパク質の生物学的活性を
なおも維持する。
【0200】 第2のストラテジーは、タンパク質機能に重要な領域を同定するために、クロ
ーン化された遺伝子の特定の位置でアミノ酸変化を導入するための遺伝子工学を
使用する。例えば、部位特異的変異誘発またはアラニンスキャニング変異誘発(
分子中の各残基で1つのアラニン変異の導入)が、使用され得る。(Cunni
nghamおよびWells,Science 244:1081−1085(
1989))。次いで、得られた変異分子は生物学的活性について試験され得る
【0201】 著者らが言及するように、これらの2つのストラテジーは、タンパク質がアミ
ノ酸置換に驚くほど寛容であることを明らかにした。著者らはさらに、どのアミ
ノ酸変化が、タンパク質中の特定のアミノ酸位置で許容されるようであるかを示
す。例えば、(タンパク質の三次構造内に)ほとんど埋もれているアミノ酸残基
は、非極性側鎖を必要とするが、表面側鎖の特徴は、一般にほとんど保存されな
い。さらに、寛容される保存的なアミノ酸置換は、脂肪族または疎水性アミノ酸
のAla、Val、Leu、およびIleの置換;ヒドロキシル残基のSerお
よびThrの置換;酸性残基のAspおよびGluの置換;アミド残基のAsn
およびGlnの置換、塩基性残基のLys、Arg、およびHisの置換;芳香
族残基のPhe、Tyr、およびTrpの置換、ならびに小さなサイズのアミノ
酸のAla、Ser、Thr、Met、およびGlyの置換を含む。保存的なア
ミノ酸置換に加えて、本発明の改変体は、(i)1つ以上の非保存的なアミノ酸
残基との置換、ここでは置換されるアミノ酸残基は、遺伝コードによってコード
されるアミノ酸残基であってもよく、もしくはそうでなくてもよい、または(i
i)置換基を有する1つ以上のアミノ酸残基での置換、または(iii)別の化
合物(例えば、ポリぺプチドの安定性および/もしくは可溶性を増加するための
化合物(例えば、ポリエチレングリコール))との成熟ポリぺプチドの融合、ま
たは(iv)さらなるアミノ酸(例えば、IgG Fc融合領域ペプチド、また
はリーダーもしくは分泌配列、または精製を容易にする配列のような)とのポリ
ペプチドの融合、または(v)別の化合物(例えばアルブミン(組換えアルブミ
ン(例えば、1999年3月2日に発行された米国特許第5,876,969号
、EP特許0 413 622、および1998年6月16日に発行された米国
特許第5,766,883号、(本明細書中でそれら全体において参考として援
用される)を参照のこと)を含むがこれに限定されない)のような)とのポリぺ
プチドの融合を含む。このような改変体ポリぺプチドは、本明細書中の教示から
、当業者の範囲内であると考えられる。
【0202】 例えば、他の荷電されたアミノ酸または中性のアミノ酸での荷電されたアミノ
酸のアミノ酸置換を含むポリぺプチド改変体は、改善された特性(例えば、より
少ない凝集性)を有するタンパク質を生成し得る。薬学的処方物の凝集は、凝集
体の免疫原活性に起因して、活性の減少およびクリアランスの増加の両方をもた
らす。(Pinckardら、Clin.Exp.Immunol.2:331
−340(1967);Robbinsら、Diabetes 36:838−
845(1987);Clelandら、Crit.Rev.Therapeu
tic Drug Carrier Systems 10:307−377(
1993))。
【0203】 本発明のさらなる実施形態は、少なくとも1つのアミノ酸置換を含むが、50
アミノ酸置換を超えず、さらにより好ましくは、40アミノ酸置換を超えず、な
おより好ましくは、30アミノ酸置換を超えず、そしてなおさらにより好ましく
は、20アミノ酸置換を超えないアミノ酸配列を含むポリペプチドのアミノ酸配
列を含むポリペプチドに関する。もちろん、ポリペプチドが、配列番号Yのポリ
ペプチドのアミノ酸配列、配列番号Xによってコードされるアミノ酸配列、およ
び/またはcDNAプラスミドVのcDNAによってコードされるアミノ酸配列
を含むアミノ酸配列を有することが非常に好ましく、好ましさの増大する順番に
、これは、少なくとも1つのアミノ酸置換を含むが、10、9、8、7、6、5
、4、3、2、または1アミノ酸置換を超えない。特定の実施形態において、配
列番号Yのアミノ酸配列またはそのフラグメント(例えば、本明細書に記載の成
熟形態および/または他のフラグメント)、配列番号Xによってコードされるア
ミノ酸配列またはそのフラグメント、ならびに/あるいはcDNAプラスミドV
またはそのフラグメントによってコードされるアミノ酸配列における付加、置換
、および/または欠失の数は、1〜5、5〜10、5〜25、5〜50、10〜
50、または50〜150であり、保存的アミノ酸置換が好ましい。本明細書中
で議論されるように、本発明の任意のポリペプチドは、融合タンパク質を産生す
るために使用され得る。例えば、本発明のポリペプチドは、第2のタンパク質と
融合される場合、抗原性タグとして使用され得る。本発明のポリペプチドに対し
て惹起される抗体は、ポリペプチドに結合することによって、第2のタンパク質
を間接的に検出するために使用され得る。さらに、分泌されるタンパク質は、細
胞位置を輸送シグナルに基づいて標的化するので、分泌されることが示される本
発明のポリペプチドは、他のタンパク質に一旦融合されると標的化分子として使
用され得る。
【0204】 本発明のポリペプチドと融合され得るドメインの例は、異種シグナル配列のみ
ならず、他の異種機能性領域をも含む。融合は、必ずしも直接的である必要はな
いが、リンカー配列を介して起こり得る。
【0205】 特定の好ましい実施形態において、本発明のタンパク質は、ポリペプチドがN
および/またはC末端欠失変異体である融合タンパク質を含む。好ましい実施形
態において、本出願は、特定のNおよびC末端欠失変異体のアミノ酸配列を有す
るポリペプチドをコードする核酸配列に対して少なくとも80%、85%、90
%、95%、96%、97%、98%または99%同一の核酸分子に関する。こ
れらのポリペプチド(フラグメントおよび/または改変体を含む)をコードする
ポリヌクレオチドはまた、本発明によって包含される。
【0206】 さらに、融合タンパク質はまた、本発明のポリペプチドの特徴を改良するため
に操作され得る。例えば、さらなるアミノ酸、特に荷電アミノ酸の領域が、宿主
細胞からの精製または続く取り扱いおよび貯蔵の間の安定性および持続性を改良
するためにポリペプチドのN末端へ付加され得る。また、ペプチド部分は精製を
容易にするためにポリペプチドへ付加され得る。このような領域は、ポリペプチ
ドの最終調製の前に除去され得る。ポリペプチドの取り扱いを容易にするための
ペプチド部分の付加は、当該分野でよく知られる慣用の技術である。
【0207】 当業者に理解されるように、上記の本発明のポリペプチドおよびそのエピトー
プ保有フラグメントは、異種ポリペプチド配列と合わせられ得る。例えば、本発
明のポリペプチドは、異種ポリペプチド配列と融合され得、例えば、本発明のポ
リペプチドは、免疫グロブリン(IgA、IgE、IgG、IgM)の定常ドメ
インまたはそれらの部分(CH1、CH2、CH3、またはそれらの任意の組み
合わせ(完全なドメインおよびそれらの部分の両方を含む))と融合され得、キ
メラポリペプチドを生じる。このような融合タンパク質は、精製を容易にし、そ
してインビボでの半減期の増大を示す。1つの報告された例において、ヒトCD
4−ポリペプチドの最初の2つのドメインおよび哺乳動物の免疫グロブリンの重
鎖または軽鎖の定常領域の種々のドメインからなるキメラタンパク質について示
されている。(EP A 394,827;Trauneckerら、Natu
re,331:84〜86(1988))。(IgGに起因する)ジスルフィド
結合二量体構造を有する融合タンパク質はまた、単量体タンパク質またはそれら
のフラグメント単独よりも、他の分子の結合および中和においてより効果的であ
り得る(例えば、Fountoulakisら,J.Biochem.,270
:3958−3964(1995))。
【0208】 (ベクター、宿主細胞、およびタンパク質産生) 本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含むベクター、宿主細胞、および
組換え技術によるポリペプチドの産生に関連する。例えば、ベクターは、ファー
ジベクター、プラスミドベクター、ウイルスベクター、またはレトロウイルスベ
クターであり得る。レトロウイルスベクターは、複製コンピテント、または複製
欠損であり得る。後者の場合、一般的にウイルス増殖は、補完性(comple
menting)宿主細胞にのみ生じる。
【0209】 本発明のポリヌクレオチドは、宿主における増殖のために選択マーカーを含む
ベクターに連結され得る。一般に、プラスミドベクターは、リン酸カルシウム沈
澱物のような沈澱物、または荷電脂質との複合体において導入される。ベクター
がウイルスである場合、このベクターは、適切なパッケージング細胞株を使用し
てインビトロでパッケージングされ、次いで宿主細胞に形質導入され得る。
【0210】 ポリヌクレオチド挿入物は、適切なプロモーター(いくつか挙げれば、例えば
、ファージλPLプロモーター、E.coli lacプロモーター、trpプ
ロモーター、phoAプロモーターおよびtacプロモーター、SV40初期プ
ロモーターおよびSV40後期プロモーター、ならびにレトロウイルスLTRの
プロモーター)に作動可能に連結されるべきである。他の適切なプロモーターは
当業者に公知である。発現構築物はさらに、転写開始、転写終結のための部位、
および転写領域において、翻訳のためのリボソーム結合部位を含む。この構築物
によって発現される転写物のコード部分は、好ましくは、始めに翻訳開始コドン
、および翻訳されるべきポリペプチドの末端に適切に位置される終結コドン(U
AA、UGAまたはUAG)を含む。
【0211】 示されるように、発現ベクターは、好ましくは少なくとも1つの選択マーカー
を含む。このようなマーカーは、真核細胞培養のためのジヒドロ葉酸レダクター
ゼ、G418、またはネオマイシン耐性遺伝子、ならびにE.coliおよび他
の細菌において培養するためのテトラサイクリン耐性遺伝子、カナマイシン耐性
遺伝子またはアンピシリン耐性遺伝子を含む。適切な宿主の代表的な例は、細菌
細胞(例えば、E.coli、StreptomycesおよびSalmone
lla typhimurium細胞);真菌細胞(例えば、酵母細胞(例えば
、Saccharomyces cerevisiaeまたはPichia p
astoris(ATCC受託番号201178)));昆虫細胞(例えばDr
osophila S2およびSpodoptera Sf9細胞);動物細胞
(例えば、CHO細胞、COS細胞、293細胞、およびBowesメラノーマ
細胞);ならびに植物細胞を含むが、これらに限定されない。上記の宿主細胞の
ための適切な培養培地および条件は、当該分野で公知である。
【0212】 細菌における使用のために好ましいベクターの中には、pQE70、pQE6
0およびpQE−9(QIAGEN,Inc.から入手可能);pBluesc
riptベクター、Phagescriptベクター、pNH8A、pNH16
a、pNH18A、pNH46A(Stratagene Cloning S
ystems,Inc.から入手可能);およびptrc99a、pKK223
−3、pKK233−3、pDR540、pRIT5(Pharmacia B
iotech,Inc.から入手可能)を含む。好ましい真核生物ベクターの中
には、pWLNEO、pSV2CAT、pOG44、pXT1およびpSG(S
tratageneから入手可能);ならびにpSVK3、pBPV、pMSG
およびpSVL(Pharmaciaから入手可能)がある。酵母系における使
用のために好ましい発現ベクターとしては、pYES2、pYD1、pTEF1
/Zeo、pYES2/GS、pPICZ、pGAPZ、pGAPZalph、
pPIC9、pPIC3.5、pHIL−D2、pHIL−S1、pPIC3.
5K、pPIC9K、およびPAO815(全てが、Invitrogen,C
arlbad,CAから入手可能)が挙げられるがこれらに限定されない。他の
適切なベクターは、当業者に容易に明らかである。
【0213】 宿主細胞への構築物の導入は、リン酸カルシウムトランスフェクション、DE
AE−デキストラン媒介トランスフェクション、カチオン性脂質媒介トランスフ
ェクション、エレクトロポレーション、形質導入、感染、または他の方法によっ
てもたらされ得る。このような方法は、Davisら、Basic Metho
ds In Molecular Biology (1986)のような多く
の標準的研究室マニュアルに記載される。本発明のポリペプチドは、実際、組換
えベクターを欠損する宿主細胞によって発現され得ることが特に意図される。
【0214】 本発明のポリペプチドは、硫酸アンモニウム沈澱またはエタノール沈澱、酸抽
出、陰イオンまたは陽イオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマ
トグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグ
ラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィーおよびレクチンクロマト
グラフィーを含む周知の方法によって組換え細胞培養物から回収され得、そして
精製され得る。最も好ましくは、高速液体クロマトグラフィー(「HPLC」)
が精製のために使用される。
【0215】 本発明のポリペプチドはまた、以下から回収され得る:直接単離されるかまた
は培養されるかにかかわらず、体液、組織および細胞を含む天然の供給源から精
製された産物;化学的合成手順の産物;ならびに、例えば、細菌細胞、酵母細胞
、高等植物細胞、昆虫細胞、および哺乳動物細胞を含む、原核生物宿主または真
核生物宿主から組換え技術によって産生された産物。組換え産生手順に使用され
る宿主に依存して、本発明のポリペプチドは、グリコシル化されてもまたはグリ
コシル化されていなくてもよい。さらに、本発明のポリペプチドはまた、宿主媒
介プロセスの結果として、いくつかの場合において、最初の改変されたメチオニ
ン残基を含み得る。従って、一般に、翻訳開始コドンによってコードされるN末
端メチオニンが、すべての真核生物細胞における翻訳後の任意のタンパク質から
高い効率で除去されることは当該分野において周知である。ほとんどのタンパク
質においてN末端メチオニンもまた、ほとんどの原核生物において効果的に除去
されるが、いくつかのタンパク質について、この原核生物除去プロセスは、N末
端メチオニンが共有結合するアミノ酸の性質に依存しており、非効率的である。
【0216】 1つの実施形態において、酵母Pichia pastorisは、真核細胞
系において、本発明のポリペプチドを発現させるために使用される。Pichi
a pastorisは、メタノールをその唯一の炭素供給源として代謝し得る
メチル栄養性(methylotrophic)酵母である。メタノール代謝経
路における主要な工程は、Oを使用してのホルムアルデヒドへのメタノールの
酸化である。この反応は、酵素アルコールオキシダーゼによって触媒される。そ
の唯一の炭素供給源としてメタノールを代謝するために、Pichia pas
torisは、Oに対するアルコールオキシダーゼの比較的低い親和性に部分
的に一部起因して、高レベルのアルコールオキシダーゼを生成しなければならな
い。結果的に、主要な炭素供給源としてメタノールに依存する増殖培地において
、2つのアルコールオキシダーゼ遺伝子(AOX1)のうちの1つのプロモータ
ー領域は、非常に活性である。メタノールの存在下で、AOX1遺伝子から産生
されるアルコールオキシダーゼは、Pichia pastorisにおける総
可溶性タンパク質のうちのおよそ30%までを含む。Ellis,S.B.ら、
Mol.Cell.Biol.5:1111〜21(1985);Koutz,
P.J.ら、Yeast 5:167〜77(1989);Tschopp,J
.F.ら、Nucl.Acids Res.15:3859〜76(1987)
を参照のこと。従って、AOX1調節配列の全てまたは一部の転写調節下の異種
コード配列(例えば、本発明のポリヌクレオチドなど)は、メタノールの存在下
で増殖したPichia酵母において、非常に高レベルで発現される。
【0217】 1つの例において、プラスミドベクターpPIC9Kは、「Pichia P
rotocols:Methods in Molecular Biolog
y」,D.R.HigginsおよびJ.Cregg編(The Humana
Press,Totowa,NJ,1998)において本質的に記載されるよ
うに、Pichea酵母系において、本明細書中に示されるように本発明のポリ
ペプチドをコードするDNAを発現させるために使用される。この発現ベクター
は、マルチクローニング部位の上流に位置するPichia pastoris
アルカリホスファターゼ(PHO)分泌シグナルペプチド(すなわち、リーダー
)に連結された強力なAOX1プロモーターによって、本発明のポリペプチドの
発現および分泌を可能にする。
【0218】 多くの他の酵母ベクター(例えば、pYES2、pYD1、pTEF1/Ze
o、pYES2/GS、pPICZ、pGAPZ、pGAPZalpha、pP
IC9、pPIC3.5、pHIL−D2、pHIL−S1、pPIC3.5K
、およびPAO815)は、当業者が容易に理解するように、提案された発現構
築物が必要とされる場合インフレームのAUGを含む転写、翻訳、分泌(所望さ
れる場合)などのために適切に配置されたシグナルを提供する限り、pPIC9
Kの代わりに使用され得る。
【0219】 別の実施形態において、異種コード配列(例えば、本発明のポリヌクレオチド
など)の高レベルの発現は、本発明の異種ポリヌクレオチドを発現ベクター(例
えば、pGAPZまたはpGAPZalpha)中にクローニングし、そしてメ
タノールの非存在下で酵母培養物を増殖させることによって達成され得る。
【0220】 本明細書において議論されるベクター構築物を含む宿主細胞を含むことに加え
て、本発明はまた、脊椎動物起源(特に、哺乳動物起源)の一次(primar
y)宿主細胞、二次(secondary)宿主細胞、および不死化宿主細胞を
含む。これらの宿主細胞は、内因性の遺伝物質(例えば、コード配列)を欠失ま
たは置換するように操作されており、そして/または本発明のポリヌクレオチド
と作動可能に連結された遺伝物質(例えば、異種ポリヌクレオチド配列)を含む
ように操作され、そして内因性のポリヌクレオチドを活性化、変更、および/ま
たは増幅する。例えば、当該分野で公知の技術は、相同組換えを介して、異種制
御領域(例えば、プロモーターおよび/またはエンハンサー)ならびに内因性ポ
リヌクレオチド配列と作動可能に連結するために使用され得る(例えば、199
7年6月24日に発行された米国特許第5,641,670号;1996年9月
26日に公開された国際公開第WO 96/29411号;1994年8月4日
に公開された国際公開第WO 94/12650号;Kollerら,Proc
.Natl.Acad.Sci.USA 86:8932−8935(1989
);およびZijlstraら,Nature 342:435−438(19
89)を参照のこと。これらの開示の各々は、それら全体において参考として援
用される)。
【0221】 さらに、本発明のポリペプチドは、当該分野で公知の技術を用いて化学合成さ
れ得る(例えば、Creighton,1983,Proteins:Stru
ctures and Molecular Principles,W.H.
Freeman & Co.,N.Y.およびHunkapillerら,Na
ture,310:105−111(1984)を参照のこと)。例えば、ポリ
ペプチドのフラグメントに対応するポリペプチドは、ペプチド合成機の使用によ
り合成され得る。さらに、所望の場合、非古典的アミノ酸または化学的アミノ酸
アナログが、置換または付加としてこのポリペプチド配列に導入され得る。非古
典的アミノ酸としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:共通アミノ
酸のD異性体、2,4−ジアミノ酪酸、a−アミノイソ酪酸、4−アミノ酪酸、
Abu、2−アミノ酪酸、g−Abu、e−Ahx、6−アミノヘキサン酸、A
ib、2−アミノイソ酪酸、3−アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルロイシ
ン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトルリン、ホモシトルリ
ン、システイン酸、t−ブチルグリシン、t−ブチルアラニン、フェニルグリシ
ン、シクロヘキシルアラニン、b−アラニン、フルオロアミノ酸、デザイナーア
ミノ酸(例えば、b−メチルアミノ酸)、Ca−メチルアミノ酸、Na−メチル
アミノ酸、および一般のアミノ酸アナログ。さらに、アミノ酸はD(右旋性)ま
たはL(左旋性)であり得る。
【0222】 本発明は、翻訳の間または翻訳後に、例えば、グリコシル化、アセチル化、リ
ン酸化、アミド化、公知の保護基/ブロッキング基による誘導体化、タンパク質
分解切断、抗体分子または他の細胞性リガンドへの結合などによって示差的に改
変される本発明のポリペプチドを含む。任意の多数の化学的改変は、以下を含む
がこれらに限定されない公知の技術によって実施され得る:臭化シアン、トリプ
シン、キモトリプシン、パパイン、V8プロテアーゼ、NaBHによる特異的
化学的切断;アセチル化、ホルミル化、酸化、還元;ツニカマイシンの存在下で
の代謝合成;など。
【0223】 本発明によって含まれるさらなる翻訳後修飾としては、例えば、以下などが挙
げられる:N結合型もしくはO結合型の炭水化物鎖(N末端またはC末端のプロ
セシング)、アミノ酸骨格への化学部分の結合、N結合型もしくはO結合型の炭
水化物鎖の化学修飾、および原核生物宿主細胞発現の結果としてのN末端メチオ
ニン残基の付加もしくは欠失。このポリペプチドはまた、検出可能な標識(例え
ば、酵素標識、蛍光標識、同位体標識または親和性標識)を用いて改変され、こ
のタンパク質の検出および単離が可能にされ得る。
【0224】 本発明によってまた、さらなる利点(例えば、このポリペプチドの溶解度、安
定性および循環時間の増加、または免疫原性の減少)を提供し得る、本発明のポ
リペプチドの化学修飾誘導体が提供される(米国特許第4,179,337号を
参照のこと)。誘導体化のための化学部分は、水溶性ポリマー(例えば、ポリエ
チレングリコール、エチレングリコール/プロピレングリコールコポリマー、カ
ルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコールなど)から選
択され得る。このポリペプチドは、この分子内のランダムな位置で、またはこの
分子内の予定の位置で改変され得、そして1、2、3またはそれ以上の結合した
化学部分を含み得る。
【0225】 このポリマーは、任意の分子量のポリマーであり得、そして分枝状であっても
非分枝状であってもよい。ポリエチレングリコールに関しては、好ましい分子量
は、取り扱いおよび製造の容易さのために、約1kDaと約100kDaとの間
(用語「約」は、ポリエチレングリコールの調製において、いくつかの分子は示
した分子量よりも重く、いくつかは示した分子量よりも軽いことを示す)である
。所望の治療的プロフィール(例えば、所望される徐放の持続時間、ある場合に
は生物学的活性に対する効果、取り扱いの容易さ、抗原性の程度または抗原性が
ないこと、および治療タンパク質またはアナログに対するポリエチレングリコー
ルの他の公知の効果)に依存して、他のサイズが用いられ得る。
【0226】 ポリエチレングリコール分子(または他の化学的部分)は、このタンパク質の
機能的ドメインまたは抗原性ドメインに対する効果を考慮してタンパク質に結合
されるべきである。当業者に利用可能な多数の結合方法が存在する(例えば、本
明細書中に参考として援用される、EP 0 401 384(G−CSFにP
EGを結合する)、Malikら,Exp.Hematol.20:1028−
1035(1992)(塩化トレシルを用いたGM−CSFのペグ化(pegy
lation)を報告する)もまた参照のこと)。例えば、ポリエチレングリコ
ールは、反応性基(例えば、遊離のアミノ基またはカルボキシル基)によってア
ミノ酸残基を介して共有結合され得る。反応性基は、活性化ポリエチレングリコ
ール分子が結合し得る基である。遊離のアミノ基を有するアミノ酸残基としては
、リジン残基およびN末端アミノ酸残基が挙げられ得る;遊離のカルボキシル基
を有するアミノ酸残基としては、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基および
C末端アミノ酸残基が挙げられ得る。スルフヒドリル残基もまた、ポリエチレン
グリコール分子を結合するための反応性基として用いられ得る。治療目的のため
に好ましいのは、アミノ基での結合、例えば、N末端またはリジン基での結合で
ある。
【0227】 具体的にはN末端で化学修飾されたタンパク質を所望し得る。ポリエチレング
リコールを本発明の組成の例示として用いて、種々のポリエチレングリコール分
子から(分子量、分枝などによって)、反応混合物中でのポリエチレングリコー
ル分子のタンパク質(ポリペプチド)分子に対する比、行われるべきペグ化反応
の型、および選択されたN末端ペグ化タンパク質の獲得方法を選択し得る。N末
端ペグ化調製物の獲得方法(すなわち、必要な場合、この部分を他のモノペグ化
部分から分離すること)は、ペグ化タンパク質分子の集団からの、N末端ペグ化
物質の精製により行われ得る。N末端修飾で化学修飾された選択的タンパク質は
、特定のタンパク質における誘導体化に利用可能な異なる型の第1級アミノ基の
示差的反応性(リジン対N末端)を利用する還元的アルキル化によって達成され
得る。適切な反応条件下では、カルボニル基含有ポリマーを用いた、N末端での
タンパク質の実質的に選択的な誘導体化が達成される。
【0228】 本発明のポリペプチドは、単量体または多量体(すなわち、二量体、三量体、
四量体およびより高度の多量体)であり得る。従って、本発明は、本発明のポリ
ペプチドの単量体および多量体、それらの調製ならびにそれらを含む組成物(好
ましくは治療薬)に関する。特定の実施形態において、本発明のポリペプチドは
、単量体、二量体、三量体または四量体である。さらなる実施形態において、本
発明の多量体は、少なくとも二量体、少なくとも三量体、または少なくとも四量
体である。
【0229】 本発明によって含まれる多量体は、ホモマーまたはヘテロマーであり得る。本
明細書中で用いられる場合、用語ホモマーは、配列番号Yのアミノ酸配列に対応
するかまたは配列番号Xによってコードされるアミノ酸配列または配列番号Xの
相補体、および/またはcDNAプラスミドVによってコードされるアミノ酸配
列(本明細書中に記載されるこれらに対応する、フラグメント、改変体、スプラ
イス改変体および融合タンパク質を含む)のみを含む多量体をいう。これらのホ
モマーは、同一または異なるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含み得る。特
定の実施形態では、本発明のホモマーは、同一のアミノ酸配列を有するポリペプ
チドのみを含む多量体である。別の特定の実施形態では、本発明のホモマーは、
異なるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む多量体である。特定の実施形態
では、本発明の多量体は、ホモ二量体(例えば、同一または異なるアミノ酸配列
を有するポリペプチドを含む)あるいはホモ三量体(例えば、同一および/また
は異なるアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む)である。さらなる実施形態
では、本発明のホモマー性多量体は、少なくともホモ二量体、少なくともホモ三
量体または少なくともホモ四量体である。
【0230】 本明細書中で用いられる場合、用語ヘテロマーとは、本発明のポリペプチドに
加えて、1つ以上の異種ポリペプチド(すなわち、異なるタンパク質のポリペプ
チド)を含む多量体をいう。特定の実施形態では、本発明の多量体は、ヘテロ二
量体、ヘテロ三量体またはヘテロ四量体である。さらなる実施形態では、本発明
のヘテロマー性多量体は、少なくともヘテロ二量体、少なくともヘテロ三量体ま
たは少なくともヘテロ四量体である。
【0231】 本発明の多量体は、疎水性、親水性、イオン性および/もしくは共有結合性の
結合の結果であり得、ならびに/または例えば、リポソーム形成によって間接的
に連結され得る。従って、1つの実施形態では、本発明の多量体(例えば、ホモ
二量体またはホモ三量体など)は、本発明のポリペプチドが溶液中で互いに接触
する場合に形成される。別の実施形態では、本発明のへテロ多量体(例えば、ヘ
テロ三量体またはヘテロ四量体など)は、本発明のポリペプチドが、溶液中で本
発明のポリペプチドに対する抗体(本発明の融合タンパク質中の異種ポリペプチ
ド配列に対する抗体を含む)と接触する場合に、形成される。他の実施形態では
、本発明の多量体は、本発明のポリペプチドとの、および/または本発明のポリ
ペプチド間での共有結合によって形成される。このような共有結合は、ポリペプ
チド配列(例えば、配列番号Yに列挙されるか、または配列番号Xおよび/もし
くはcDNAプラスミドVによってコードされるポリペプチド中に含まれる、ポ
リペプチド配列)中に含まれる1以上のアミノ酸残基を含み得る。1例では、こ
の共有結合は、ネイティブ(すなわち、天然に存在する)ポリペプチドにおいて
相互作用するポリペプチド配列内に存在するシステイン残基間での架橋である。
別の例では、この共有結合は、化学的操作または組換え操作の結果である。ある
いは、このような共有結合は、融合タンパク質中の異種ポリペプチド配列におい
て含まれる、1以上のアミノ酸残基を含み得る。1例では、共有結合は、本発明
の融合タンパク質に含まれる異種配列間にある(例えば、米国特許番号第5,4
78,925号を参照のこと)。特定の例では、この共有結合は、(本明細書中
に記載されるような)本発明のFc融合タンパク質に含まれる異種配列間にある
。別の特定の例では、本発明の融合タンパク質の共有結合は、共有結合した多量
体を形成し得る別のタンパク質(例えば、オステオプロテゲリン(osteop
rotegerin)(例えば、国際公開第WO 98/49305号(この内
容はその全体が本明細書中で参考として援用される)を参照のこと)など)由来
の異種ポリペプチド配列間にある。別の実施形態では、2以上の本発明のポリペ
プチドは、ペプチドリンカーを介して連結される。例としては、米国特許番号第
5,073,627号(本明細書中に参考として援用される)に記載されるペプ
チドリンカーが挙げられる。ペプチドリンカーによって隔てられた本発明の複数
のポリペプチドを含むタンパク質は、従来の組換えDNA技術を用いて生成され
得る。
【0232】 本発明の多量体ポリペプチドを調製する別の方法は、ロイシンジッパーまたは
イソロイシンジッパーのポリペプチド配列に融合した本発明のポリペプチドの使
用を含む。ロイシンジッパードメインおよびイソロイシンジッパードメインは、
それらが発見されたタンパク質の多量体化を促進するポリペプチドである。ロイ
シンジッパーは、本来、いくつかのDNA結合タンパク質(Landschul
zら、Science 240:1759(1988))において同定され、そ
してそれ以来、種々の異なるタンパク質から見出されている。公知のロイシンジ
ッパーは、共通して、二量体化または三量体化する天然に存在するペプチド、お
よびそれらの誘導体である。本発明の可溶性多量体タンパク質を産生するために
適切なロイシンジッパードメインの例は、PCT出願WO94/10308(本
明細書中で参考として援用される)に記載されるロイシンジッパードメインであ
る。溶液中で二量体化または三量体化するポリペプチド配列と融合した、本発明
のポリペプチドを含む組換え融合タンパク質は、適切な宿主細胞において発現さ
れ、そして得られる可溶性多量体融合タンパク質は、当該分野で公知の技術を使
用して、培養上清から回収される。
【0233】 本発明の三量体ポリペプチドは、増大した生物学的活性の利点を提供し得る。
好ましいロイシンジッパー部分およびイソロイシン部分は、優先的に三量体を形
成するものである。1つの例は、Hoppeら(FEBS Letters 3
44:191,(1994))および米国特許出願第08/446,922号(
本明細書中で参考として援用される)に記載されるような、肺サーファクタント
タンパク質D(SPD)から誘導されるロイシンジッパーである。天然に存在す
る三量体タンパク質から誘導される他のペプチドは、本発明の三量体ポリペプチ
ドの調製において使用され得る。
【0234】 別の例において、本発明のタンパク質は、Flag(登録商標)ポリペプチド
配列を含む本発明の融合タンパク質に含まれるFlag(登録商標)ポリペプチ
ド配列間の相互作用によって結合される。さらなる実施形態において、本発明の
結合タンパク質は、本発明のFlag(登録商標)融合タンパク質に含まれる異
種ポリペプチド配列と抗Flag(登録商標)抗体との間の相互作用によって結
合される。
【0235】 本発明の多量体は、当該分野で公知の化学技術を用いて生成され得る。例えば
、本発明の多量体中に含まれることが所望されるポリペプチドは、当該分野で公
知のリンカー分子およびリンカー分子長最適化技術を用いて化学的に架橋され得
る(例えば、米国特許番号第5,478,925号を参照のこと、これは、本明
細書中でその全体が参考として援用される)。さらに、本発明の多量体は、多量
体中に含まれることが所望されるポリペプチドの配列中に位置するシステイン残
基間に1つ以上の分子間架橋を形成するために、当該分野で公知の技術を用いて
生成され得る(例えば、米国特許番号第5,478,925号を参照のこと、こ
れは、本明細書中でその全体が参考として援用される)。さらに、本発明のポリ
ペプチドは、そのポリペプチドのC末端またはN末端へのシステインまたはビオ
チンの付加によって慣用的に改変され得、そして当該分野で公知の技術が、1つ
以上のこれらの改変したポリペプチドを含む多量体を生成するために適用され得
る(例えば、米国特許番号第5,478,925号を参照のこと、これは、本明
細書中でその全体が参考として援用される)。さらに、当該分野で公知の技術は
、本発明の多量体に含まれることが所望されるポリペプチド成分を含むリポソー
ムを生成するために適用され得る(例えば、米国特許番号第5,478,925
号を参照のこと、これは、本明細書中でその全体が参考として援用される)。
【0236】 あるいは、本発明の多量体は、当該分野で公知の遺伝子工学技術を用いて生成
され得る。1つの実施形態において、本発明の多量体中に含まれるポリペプチド
は、本明細書中に記載されるかまたはさもなくば当該分野で公知の融合タンパク
質技術を用いて組換え産生される(例えば、米国特許番号第5,478,925
号を参照のこと、これは、本明細書中でその全体が参考として援用される)。特
定の実施形態において、本発明のホモ二量体をコードするポリヌクレオチドは、
本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を、リンカーポリペプ
チドをコードする配列に連結し、次いで、もともとのC末端からN末端へ逆方向
にポリペプチドの翻訳産物をコードする合成ポリヌクレオチド(リーダー配列を
欠く)に、さらに連結することによって生成される(例えば、米国特許番号第5
,478,925号を参照のこと、これは、本明細書中でその全体が参考として
援用される)。別の実施形態において、本明細書中に記載されるかまたはさもな
くば当該分野で公知の組換え技術が適用されて、膜貫通ドメイン(あるいは疎水
性ペプチドまたはシグナルペプチド)を含む本発明の組換えポリペプチドを生成
し、そしてこれは、膜再構成技術によってリポソームに取り込まれ得る(例えば
、米国特許番号第5,478,925号を参照のこと、これは、本明細書中でそ
の全体が参考として援用される)。
【0237】 (抗体) 本発明のさらなるポリペプチドは、本発明の配列番号Yのポリペプチド、ポリ
ペプチドフラグメント、もしくは改変体、および/または本発明のエピトープに
免疫特異的に結合する(特異的抗体−抗原結合をアッセイするための当該分野で
周知のイムノアッセイにより決定されるような)抗体およびT−細胞抗原レセプ
ター(TCR)に関する。本発明の抗体としては、ポリクローナル抗体、モノク
ローナル抗体、多重特異的抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、またはキメラ抗体、単
鎖抗体、Fabフラグメント、F(ab’)フラグメント、Fab発現ライブラ
リーによって産生されたフラグメント、抗イディオタイプ(抗Id)抗体(例え
ば、本発明の抗体に対する抗Id抗体が挙げられる)、および任意の上記抗体の
エピトープ結合フラグメントが挙げられるが、これらに限定されない。本明細書
中で使用される場合、用語「抗体」とは、免疫グロブリン分子および免疫グロブ
リン分子の免疫学的に活性な部分(すなわち、抗原に免疫特異的に結合する抗原
結合部位を含む分子)をいう。本発明の免疫グロブリン分子は、免疫グロブリン
分子の任意の型(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、およびI
gY)、クラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1
およびIgA2)またはサブクラスの分子であり得る。
【0238】 最も好ましくは、抗体は、本発明のヒト抗原結合抗体フラグメントであり、そ
してFab、Fab’およびF(ab’)2、Fd、単鎖Fv(scFv)、単
鎖抗体、ジスルフィド連結Fv(sdFv)およびVLドメインまたはVHドメ
インのいずれかを含むフラグメントが挙げられるが、これらに限定されない。単
鎖抗体を含む抗原結合抗体フラグメントは、可変領域を、単独であるいは以下:
ヒンジ領域、CH1ドメイン、CH2ドメインおよびCH3ドメインの全体また
は部分との組み合わせで含み得る。ヒンジ領域、CH1ドメイン、CH2ドメイ
ンおよびCH3ドメインと可変領域の任意の組み合わせをもまた含む抗原結合フ
ラグメントもまた、本発明に含まれる。本発明の抗体は、鳥類および哺乳動物を
含む任意の動物起源由来であり得る。好ましくは、この抗体は、ヒト、ネズミ(
例えば、マウスおよびラット)、ロバ、ウサギ(ship rabbit)、ヤ
ギ、モルモット、ラクダ、ウマ、またはニワトリである。本明細書中で使用され
る場合、「ヒト」抗体は、ヒト免疫グロブリンのアミノ酸配列を有する抗体を含
み、そしてヒト免疫グロブリンライブラリーから、または1つ以上のヒト免疫グ
ロブリンについてトランスジェニックでかつ内因性免疫グロブリンを発現しない
動物(以下および、例えば、Kucherlapatiらによる米国特許番号第
5,939,598号に記載されるような)から単離された抗体を含む。
【0239】 本発明の抗体は、一重特異的、二重特異的、三重特異的またはより多価の多重
特異的であり得る。多重特異的な抗体は、本発明のポリペプチドの異なるエピト
ープに対して特異的であり得るか、または本発明のポリペプチドおよび異種エピ
トープ(例えば、異種ポリペプチドまたは固体支持体物質)の両方に特異的であ
り得る。例えば、PCT公開WO 93/17715;WO92/08802;
WO 91/00360;WO 92/05793;Tuttら、J.Immu
nol.147:60−69(1991);米国特許第4,474,893号;
同第4,714,681号;同第4,925,648号;同第5,573,92
0号;同第5,601,819号;Kostelnyら、J.Immunol.
148:1547−1553(1992)を参照のこと。
【0240】 本発明の抗体は、この抗体により認識されるかまたは特異的に結合される本発
明のポリペプチドのエピトープまたは部分によって、記載され得るかまたは特定
化され得る。このエピトープまたはポリペプチド部分は、本明細書中に記載され
るように、例えば、N末端およびC末端位置により、または連続するアミノ酸残
基のサイズにより、特定化され得る。本発明の任意のエピトープまたはポリペプ
チドを特異的に結合する抗体はまた排除され得る。従って、本発明は、本発明の
ポリペプチドを特異的に結合し、そしてこのポリペプチドの排除を可能にする抗
体を含む。
【0241】 本発明の抗体はまた、その交差反応性によって記載され得るか、または特定化
され得る。本発明のポリペプチドの任意の他のアナログ、オルソログ(orth
olog)またはホモログを結合しない抗体が、含まれる。本発明のポリペプチ
ドに対して少なくとも95%、少なくとも90%、少なくとも85%、少なくと
も80%、少なくとも75%、少なくとも70%、少なくとも65%、少なくと
も60%、少なくとも55%および少なくとも50%の同一性(当該分野で公知
の方法および本明細書において記載された方法を用いて計算される場合)を有す
るポリペプチドを結合する抗体もまた、本発明に含まれる。特定の実施形態にお
いて、本発明の抗体は、ヒトタンパク質のマウスホモログ、ラットホモログおよ
び/またはウサギホモログならびにそれらの対応するエピトープと交差反応する
。本発明のポリペプチドに対して95%未満、90%未満、85%未満、80%
未満、75%未満、70%未満、65%未満、60%未満、55%未満および5
0%未満の同一性(当該分野で公知の方法および本明細書において記載された方
法を用いて計算される場合)を有するポリペプチドに結合しない抗体もまた、本
発明に含まれる。特定の実施形態において、上記の交差反応性は、任意の単一特
異的な抗原性ポリペプチドもしくは免疫原性ポリペプチド、または2、3、4、
5もしくはそれより多くの本明細書中に開示される特異的な抗原性ポリペプチド
および/または免疫原性ポリペプチドの組み合わせに関する。さらに本発明には
、(本明細書中に記載されるような)ストリンジェントなハイブリダイゼーショ
ン条件下で本発明のポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドに
よりコードされるポリペプチドを結合する抗体が含まれる。本発明の抗体はまた
、本発明のポリペプチドに対するその結合親和性によって記載または特定され得
る。好ましい結合親和性としては、5×10−2M、10−2M、5×10−3 M、10−3M、5×10−4M、10−4M、5×10−5M、10−5M、
5×10−6M、10−6M、5×10−7M、10−7M、5×10−8M、
10−8M、5×10−9M、10−9M、5×10−10M、10−10M、
5×10−11M、10−11M、5×10−12M、10−12M、5×10−13 M、10−13M、5×10−14M、10−14M、5×10−15
、または10−15M未満の解離定数すなわちKdを有する結合親和性が挙げら
れる。
【0242】 本発明はまた、競合的な結合を決定するための当該分野で公知の任意の方法(
例えば、本明細書中に記載されるイムノアッセイ)によって決定されるような、
本発明のエピトープに対する抗体の結合を競合的に阻害する抗体を提供する。好
ましい実施形態において、この抗体は、少なくとも95%、少なくとも90%、
少なくとも85%、少なくとも80%、少なくとも75%、少なくとも70%、
少なくとも60%、または少なくとも50%、エピトープに対する結合を競合的
に阻害する。
【0243】 本発明の抗体は、本発明のポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストと
して作用し得る。例えば、本発明は、レセプター/リガンドと本発明のポリペプ
チドとの相互作用を部分的または完全にのいずれかで破壊する抗体を含む。好ま
しくは、本発明の抗体は、本明細書中に開示される抗原性のエピトープまたはそ
の部分に結合する。本発明は、レセプター特異的抗体およびリガンド特異的抗体
の両方を特徴とする。本発明はまた、リガンド結合を妨げないがレセプターの活
性化を妨げるレセプター特異的抗体を特徴とする。レセプターの活性化(すなわ
ち、シグナル伝達)は、本明細書中に記載される技術、またはさもなくば当該分
野で公知の技術によって決定され得る。例えば、レセプターの活性化は、(例え
ば、上記されたような)免疫沈降、続いてウエスタンブロット分析によって、レ
セプターのリン酸化(例えば、チロシンまたはセリン/スレオニン)あるいはそ
の基質を検出することによって決定され得る。特定の実施形態において、抗体の
非存在下の活性の少なくとも95%、少なくとも90%、少なくとも85%、少
なくとも80%、少なくとも75%、少なくとも70%、少なくとも60%、ま
たは少なくとも50%でリガンド活性またはレセプター活性を阻害する抗体を提
供する。
【0244】 本発明はまた、リガンド結合およびレセプター活性化の両方を妨げるレセプタ
ー特異的抗体、ならびにレセプター−リガンド複合体を認識し、そして、好まし
くは、結合していないレセプターまたは結合していないリガンドを特異的に認識
しない抗体を特徴とする。同様に、本発明には、リガンドに結合し、そしてリガ
ンドのレセプターへの結合を妨げる中和抗体、ならびにリガンドに結合し、それ
によってレセプター活性化を妨げるが、リガンドがレセプターに結合することは
妨げない抗体が含まれる。さらに本発明に含まれるのは、レセプターを活性化す
る抗体である。これらの抗体は、レセプターアゴニストとして作用し得、すなわ
ち、リガンド媒介のレセプター活性化の生物学的活性のすべてまたはサブセット
(subset)のいずれかを増強または活性化し得る(例えば、レセプターの
二量体化を誘導することによる)。この抗体は、本明細書中に開示される本発明
のペプチドの特定の生物学的活性を含む生物学的活性に対するアゴニスト、アン
タゴニストまたはインバース(inverse)アゴニストとして特定化され得
る。上記の抗体アゴニストは、当該分野で公知の方法を用いて作製され得る。例
えば、PCT公開WO96/40281;米国特許第5,811,097号;D
engら、Blood 92(6):1981−1988(1998);Che
nら、Cancer Res.58(16):3668−3678(1998)
;Harropら、J.Immunol.161(4):1786−1794(
1998);Zhuら、Cancer Res:58(15):3209−32
14(1998);Yoonら、J.Immunol.160(7):3170
−3179(1998);Pratら、J.Cell.Sci.111(Pt2
):237−247(1998);Pitardら、J.Immunol.Me
thods 205(2):177−190(1997);Liautardら
、Cytokine 9(4):233−241(1997);Carlson
ら、J.Biol.Chem.272(17):11295−11301(19
97);Tarymanら、Neuron 14(4):755−762(19
95);Mullerら、Structure 6(9):1153−1167
(1998);Bartunekら、Cytokine 8(1):14−20
(1996)(上記の文献はすべて、その全体が本明細書において参考として援
用される)を参照のこと。
【0245】 本発明の抗体は、例えば、インビトロおよびインビボの両方における診断方法
および治療方法を含む本発明のポリペプチドを精製、検出および標的化するのた
めに使用され得るが、これに限定されない。例えば、この抗体は、生物学的サン
プルにおいて本発明のポリペプチドのレベルを定性的および定量的に測定するた
めのイムノアッセイにおいて用途を有する。例えば、Harlowら,Anti
bodies:A Laboratory Manual,(Cold Spr
ing Harbor Laboratory Press,第2版,1988
)(その全体が参考として本明細書中に援用される)を参照のこと。
【0246】 以下により詳細が議論されるように、本発明の抗体は、単独で、または他の組
成物との組み合わせのいずれかで用いられ得る。この抗体は、さらに、N末端も
しくはC末端で異種ポリペプチドに組換え的に融合され得るか、またはポリペプ
チドもしくは他の組成物に化学的に結合(共有結合および非共有結合を含む)さ
れ得る。例えば、本発明の抗体は、検出アッセイにおける標識として有用な分子
およびエフェクター分子(例えば、異種ポリペプチド、薬物、放射性核種または
毒素)に、組換え的に融合または結合され得る。例えば、PCT公開WO92/
08495;WO91/14438;WO89/12624;米国特許第5,3
14,995号;およびEP396,387号を参照のこと。
【0247】 本発明の抗体としては、改変された(すなわち、抗体が抗イディオタイプ応答
を生成するのを妨げないような、任意の型の分子の抗体への共有結合による)誘
導体が挙げられる。例えば、制限されないが、抗体誘導体としては、例えば、グ
リコシル化、アセチル化、ぺグ化(pegylation)、リン酸化(pho
sphylation)、アミド化、既知の保護基/遮断基(blocking
group)による誘導体化、タンパク質分解性切断、細胞性リガンドまたは
他のタンパク質への連結などによって改変された抗体が挙げられる。多数の任意
の化学的改変が、特異的化学切断、アセチル化、ホルミル化、ツニカマイシンの
代謝的合成などを含むが、これらに制限されない公知の技術によって実行され得
る。さらに、誘導体は、1つ以上の非古典的アミノ酸を含み得る。
【0248】 本発明の抗体は、当該分野で公知の任意の適切な方法によって産生され得る。
目的の抗原に対するポリクローナル抗体は、当該分野で周知の種々の手順によっ
て産生され得る。例えば、本発明のポリペプチドが種々の宿主動物(ウサギ、マ
ウス、ラットなどを含むがこれらに限定されない)に投与されて、抗原に対して
特異的なポリクローナル抗体を含む血清の産生を誘導し得る。種々のアジュバン
トが、宿主種に依存して、免疫学的応答を増加させるために使用され得、そして
フロイント(完全および不完全)、水酸化アルミニウムのようなミネラルゲル(
mineral gel)、リゾレシチンのような界面活性物質、プルロニック
(pluronic)ポリオール、ポリアニオン、ペプチド、オイルエマルジョ
ン、キーホールリンペットヘモシアニン、ジニトロフェノール、ならびにBCG
(カルメット−ゲラン杆菌)およびcorynebacterium parv
umのような潜在的に有用なヒトアジュバントを含むが、これらに限定されない
。このようなアジュバントはまた、当該分野で周知である。
【0249】 モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ、組換え、およびファージディスプレ
イ技術、またはそれらの組み合わせの使用を含む、当該分野で公知の広範な種々
の技術を用いて調製され得る。例えば、モノクローナル抗体は、当該分野で公知
の以下に挙げられるハイブリドーマ技術を使用して産生され得、例えば、Har
lowら、Antibodies:A Laboratory Manual,
(Cold Spring Harbor Laboratory Press
,第2版、1988);Hammerlingら、Monoclonal An
tibodies and T−Cell Hybridomas 563−6
81(Elsevier,N.Y.1981)(上記の参考文献は、その全体が
参考として援用される)に教示される。本明細書中で使用される場合、用語「モ
ノクローナル抗体」とは、ハイブリドーマ技術を通して生成された抗体に限定さ
れない。用語「モノクローナル抗体」とは、任意の真核生物、原核生物、または
ファージクローンを含む単一のクローンに由来する抗体をいい、そしてその生成
される方法ではない。
【0250】 ハイブリドーマ技術を用いて特異的抗体を産生およびスクリーニングする方法
は、当該分野で慣用的かつ周知であり、そして実施例に詳細に議論される。非限
定的な実施例において、マウスは、本発明のポリペプチドまたはそのようなペプ
チドを発現する細胞を用いて免疫され得る。一旦免疫応用が検出される(例えば
、抗原に特異的な抗体がマウスの血清中に検出される)と、マウスの脾臓を収集
しそして脾細胞を単離する。次に、その脾細胞を周知の技術によって任意の適切
な骨髄腫細胞(例えば、ATCCから入手可能な細胞株SP20由来の細胞)に
融合させる。ハイブリドーマを限界希釈によって選択およびクローン化する。次
に、ハイブリドーマクローンを、本発明のポリペプチドに結合し得る抗体を分泌
する細胞について、当該分野で公知の方法によってアッセイする。一般的に高い
レベルの抗体を含む腹水(ascites fluid)が、陽性ハイブリドー
マクローンを用いてマウスを免疫させることによって、産生され得る。
【0251】 従って、本発明は、モノクローナル抗体および本発明の抗体を分泌するハイブ
リドーマ細胞を培養する工程を包含する方法によって産生される抗体を、産生す
る方法を提供し、ここで、好ましくは、このハイブリドーマは、骨髄腫細胞と本
発明の抗原で免疫したマウスから単離された脾細胞とを融合させることによって
、次いで本発明のポリペプチドと結合し得る抗体を分泌するハイブリドーマクロ
ーンについて、融合物から生じるハイブリドーマをスクリーニングすることによ
って産生される。
【0252】 特定のエピトープを認識する抗体フラグメントは、公知の技術によって産生さ
れ得る。例えば、本発明のFabおよびF(ab’)2フラグメントは、(Fa
bフラグメントを産生するための)パパインまたは(F(ab’)2フラグメン
トを産生するための)ペプシンのような酵素を使用して、免疫グロブリン分子の
タンパク質分解切断によって産生され得る。F(ab’)2フラグメントは、可
変領域、軽鎖定常領域および重鎖のCH1ドメインを含む。例えば、本発明の抗
体はまた、当該分野で公知の種々のファージディスプレイ方法を用いて産生され
得る。ファージディスプレイ法において、機能的抗体ドメインは、それらをコー
ドするポリヌクレオチド配列を保有するファージ粒子の表面に提示される。特定
の実施形態において、そのようなファージは、レパートリーまたはコンビナトリ
アル抗体ライブラリー(例えば、ヒトまたはマウス)から発現される抗原結合ド
メインを提示するために利用され得る。目的の抗原に結合する抗原結合ドメイン
を発現するファージは、抗原を用いて選択または同定され得る(例えば、標識し
た抗体あるいは固体表面またはビーズに結合または捕捉された抗原を使用する)
。これらの方法において用いられるファージは、代表的には、ファージ遺伝子I
IIタンパク質またはファージ遺伝子VIIIタンパク質のいずれかに組換え的
に融合されたFab、Fvまたはジスルフィド安定化されたFvの抗体ドメイン
を有するファージから発現されたfdおよびM13結合ドメインを含む糸状ファ
ージ(filamentous phage)である。本発明の抗体を作製する
ために用いられ得るファージディスプレイ方法の例としては、以下に開示される
方法が挙げられる:Brinkmanら、J.Immunol.Methods
182:41−50(1995);Amesら、J.Immunol.Met
hods 184:177−186(1995);Kettleborough
ら、Eur.J.Immunol.24:952−958(1994);Per
sicら、Gene 187 9−18(1997);Burtonら、Adv
ances in Immunology 57:191−280(1994)
;PCT出願番号PCT/GB91/01134;PCT公開WO 90/02
809;WO 91/10737;WO 92/01047;WO 92/18
619;WO 93/11236;WO 95/15982;WO 95/20
401;ならびに米国特許第5,698,426号;同第5,223,409号
;同第5,403,484号;同第5,580,717号;同第5,427,9
08号;同第5,750,753号;同第5,821,047号;同第5,57
1,698号;同第5,427,908号;同第5,516,637号;同第5
,780,225号;同第5,658,727号;同第5,733,743号お
よび同第5,969,108号(これらの各々は、本明細書中でその全体が参考
として援用される)。
【0253】 上記参考文献に記載されるように、ファージ選択後、ファージ由来の抗体をコ
ードする領域は、ヒト抗体を含む抗体の全体または任意の他の所望の抗原結合フ
ラグメントを生成するために単離されかつ用いられ得、そして例えば、以下に詳
細が記載されるように、哺乳動物細胞、昆虫細胞、植物細胞、酵母および細菌を
含む任意の所望の宿主において発現され得る。例えば、Fab、Fab’および
F(ab’)2フラグメントを組換え的に産生するための技術はまた、当該分野
で公知の方法を用いて使用され得、このような方法は、以下に開示される:PC
T公開WO 92/22324;Mullinaxら、BioTechniqu
es 12(6):864−869(1992);およびSawaiら、AJR
I 34:26−34(1995);およびBetterら、Science
240:1041−1043(1998)(これらの参考文献は、その全体が参
考として援用される)。
【0254】 単鎖のFvsおよび抗体を産生するために用いられ得る技術の例としては、米
国特許第4,946,778号および同第5,258,498号;Huston
ら、Methods in Enzymology 203:46−88(19
91);Shuら、PNAS 90:7995−7999(1993);および
Skerraら、Science 240:1038−1040(1988)に
記載される技術が挙げられる。ヒトにおける抗体のインビボにおける使用および
インビトロ検出アッセイを含むいくつかの用途のために、キメラ抗体、ヒト化抗
体またはヒト抗体の使用が好ましくあり得る。キメラ抗体とは、抗体の異なる部
分が、異なる動物種に由来する分子(例えば、マウスモノクローナル抗体由来の
可変領域およびヒト免疫グロブリン定常領域を有する抗体)である。キメラ抗体
を産生するための方法は、当該分野において公知である。例えば、Morris
on,Science 229:1202(1985);Oiら、BioTec
hniques 4:214(1986);Gilliesら、(1989)J
.Immunol.Methods 125:191−202;米国特許第5,
807,715号;同第4,816,567号;および同第4,816,397
号を参照のこと(これらはそれらの全体が、参考として本明細書中に援用される
)。ヒト化抗体は、非ヒト種由来の1つ以上の相補性決定領域(CDR)および
ヒト免疫グロブリン分子由来のフレームワーク領域を有する所望された抗原に結
合する非ヒト種抗体由来の抗体分子である。しばしば、ヒトフレームワーク領域
内のフレームワーク残基(framework residue)は、抗原結合
を変化させるため(好ましくは改善させるために)CDRドナー抗体由来の対応
残基と置換される。これらフレームワークの置換は、当該分野で周知の方法によ
って同定され、例えば、抗原結合に重要なフレームワーク残基を同定するための
CDRおよびフレームワーク残基の相互作用のモデリング、ならびに特定の位置
における異常なフレームワーク残基を同定するための配列比較による。(例えば
、Queenら、米国特許第5,585,089号;Riechmannら、N
ature 332:323(1988)を参照のこと(これらはそれらの全体
が参考として本明細書中に援用される)。)抗体は、以下を含む当該分野で公知
の種々の技術を用いてヒト化され得る:例えば、CDR−移植(欧州特許第23
9,400号;PCT公開WO 91/09967;米国特許第5,225,5
39号;同第5,530,101号および同第5,585,089号)、ベニヤ
リング(veneering)またはリサーフェイシング(resurfaci
ng)(欧州特許第592,106号;同第519,596号;Padlan、
Molecular Immunology 28(4/5):489−498
(1991); Studnickaら、Protein Engineeri
ng 7(6):805−814(1994);Roguskaら、PNAS
91:969−973(1994))、およびチェーンシャッフリング(cha
in shuffling)(米国特許第5,565,332号)。
【0255】 完全なヒト抗体は、ヒト患者の治療的処置に対して特に所望される。ヒト抗体
は、ヒト免疫グロブリン配列に由来する抗体ライブラリーを用いた上記のファー
ジディスプレイ法を含む当該分野で公知の種々の方法により作製され得る。米国
特許第4,444,887号、および同第4,716,111号;およびPCT
公開WO 98/46645、WO 98/50433、WO 98/2489
3、WO 98/16654、WO 96/34096、WO 96/3373
5、およびWO 91/10741;(これらの各々はその全体が参考として本
明細書中に援用される)もまた参照のこと。
【0256】 ヒト抗体はまた、機能的内因性免疫グロブリンの発現は出来ないが、ヒト免疫
グロブリン遺伝子を発現し得るトランスジェニックマウスを用いて産生され得る
。例えば、ヒト重鎖免疫グロブリン遺伝子およびヒト軽鎖免疫グロブリン遺伝子
の複合体は、無作為にまたは相同組換えによってマウス胚性幹細胞に導入され得
る。あるいは、ヒト可変領域、定常領域および多様性領域(diversity
region)は、ヒト重鎖遺伝子およびヒト軽鎖遺伝子に加えて、マウスの
胚性幹細胞に導入され得る。マウス重鎖免疫グロブリン遺伝子およびマウス軽鎖
免疫グロブリン遺伝子は、相同組換えによるヒト免疫グロブリン座の導入と別々
にまたは同時に非機能的にされ得る。特に、JH領域のホモ接合性の欠失は、内
因性抗体の産生を妨げる。改変された胚性幹細胞を発展させ、そしてキメラマウ
スを産生するために胚盤胞中に微量注入する。次に、キメラマウスを、ヒト抗体
を発現するホモ接合性の子孫を産生するために繁殖させる。トランスジェニック
マウスを、選択された抗原(例えば、本発明のポリペプチドの全体または部分)
を用いて通常の様式で免疫する。抗原に対するモノクローナル抗体は、従来のハ
イブリドーマ技術を用いた免疫したトランスジェニックマウスから得られ得る。
トランスジェニックマウスに保持されたヒト免疫グロブリン導入遺伝子は、B細
胞分化の間に再編成し、そしてその後、クラススイッチングおよび体細胞変異を
受ける。従って、そのような技術の使用によって、治療的に有用なIgG抗体、
IgA抗体、IgM抗体およびIgE抗体の産生が可能である。ヒト抗体を産生
するためのこの技術の概要については、LonbergおよびHuszar、I
nt.Rev.Immunol.13:65−93(1995)を参照のこと。
ヒト抗体およびヒトモノクローナル抗体を産生するためのこの技術のならびにそ
のような抗体を産生するためのプロトコールの詳細な議論については、例えば、
PCT公開WO98/24893;WO92/01047;WO96/3409
6;WO96/33735;欧州特許第0 598 877;米国特許第5,4
13,923号;同第5,625,126号;同第5,633,425号;同第
5,569,825号;同第5,661,016号;同第5,545,806号
;同第5,814,318号;同第5,885,793号;同第5,916,7
71号;および同第5,939,598号を参照のこと(これらはその全体が本
明細書中に参考として援用される)。さらに、Abgenix,Inc.(Fr
eemont,CA)およびGenpharm(San Jose,CA)のよ
うな企業は、上記の技術に類似した技術を用いて選択された抗原に対するヒト抗
体を提供することに従事し得る。
【0257】 選択されたエピトープを完全に認識するヒト抗体を、「ガイドされた(gui
ded)選択」といわれる技術を用いて産生し得る。このアプローチにおいて、
選択された非ヒトモノクローナル抗体(例えば、マウス抗体)は、同じエピトー
プを完全に認識するヒト抗体の選択を導くために使用される。(Jespers
ら、Bio/technology 12:899−903(1988))。
【0258】 さらに、本発明のポリペプチドに対する抗体は、当業者に周知の技術を用いて
本発明のポリペプチドを「模倣する」抗イディオタイプ抗体を産生するために順
々に利用され得る。(例えば、GreenspanおよびBona、FASEB
J.7(5):437−444;(1989)およびNissinoff,J
.Immunol.147(8):2429−2438(1991)を参照のこ
と。)例えば、結合し、そしてポリペプチドの多量体化(multimeriz
ation)および/またはリガンドに対する本発明のポリペプチドの結合を競
合的に阻害する抗体が、ポリペプチドの多量体化ドメインおよび/または結合ド
メインを「模倣する」抗イディオタイプを産生するために使用され得、そして結
果としてポリペプチドおよび/またはそのリガンドに結合し、そして中和する。
このような抗イディオタイプまたはそのような抗イディオタイプのFabフラグ
メントの中和は、ポリペプチドリガンドを中和するための治療的レジメンに使用
され得る。例えば、そのような抗イディオタイプ抗体は、本発明のポリペプチド
に結合するためおよび/またはそのリガンド/レセプターに結合するために使用
され得、そしてそれによってその生物学的活性がブロックされる。
【0259】 (抗体をコードするポリヌクレオチド) 本発明はさらに、本発明の抗体およびそのフラグメントをコードするヌクレオ
チド配列を含むポリヌクレオチドを提供する。本発明はまた、ストリンジェント
な、またはより低いストリジェンシーなハイブリダイゼーション条件下で(例え
ば、上記に定義されるような)抗体(好ましくは、本発明のポリペプチドと特異
的に結合する、好ましくは、配列番号Yのアミノ酸配列を有するポリペプチドに
結合する抗体)をコードするポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレ
オチドを含む。
【0260】 ポリヌクレオチドは、当該分野で公知の任意の方法によって得られ得、そして
そのポリヌクレオチドのヌクレオチド配列は決定される。例えば、抗体のヌクレ
オチド配列が知られている場合、この抗体をコードするポリヌクレオチドは、化
学的に合成されたオリゴヌクレオチドから構築され得(例えば、Kutmeie
rら、BioTechniques 17:242(1994)に記載されるよ
うな)、これは、簡単にいうと、以下の工程を包含する:この抗体をコードする
配列の部分を含むオーバーラップするオリゴヌクレオチドの合成、これらのオリ
ゴヌクレオチドのアニーリングおよび連結、次いでPCRによる連結されたオリ
ゴヌクレオチドの増幅。
【0261】 あるいは、抗体をコードするポリヌクレオチドは、適切な供給源からの核酸か
ら生成され得る。特定の抗体をコードする核酸を含むクローンは入手不可能だが
、その抗体分子の配列が既知である場合、その免疫グロブリンをコードする核酸
は、化学的に合成され得るか、あるいは適切な供給源(例えば、抗体cDNAラ
イブラリー、または抗体を発現する任意の組織もしくは細胞(例えば、本発明の
抗体の発現のために選択されたハイブリドーマ細胞)から生成されたcDNAラ
イブラリー、またはそれから単離された核酸(好ましくはポリA+RNA))か
ら、例えば、その抗体をコードするcDNAライブラリーからのcDNAクロー
ンを同定するために、配列の3’末端および5’末端にハイブリダイズ可能な合
成プライマーを使用するPCR増幅によって、または特定の遺伝子配列に特異的
なオリゴヌクレオチドプローブを使用するクローニングによって得られ得る。P
CRによって生成された増幅された核酸は、次いで、当該分野で周知の任意の方
法を用いて、複製可能なクローニングベクターにクローニングされ得る。
【0262】 一旦、抗体のヌクレオチド配列および対応するアミノ酸配列が決定されると、
抗体のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列の操作について当該分野で周知の
方法(例えば、組換えDNA技術、部位特異的変異誘発、PCRなど(例えば、
Sambrookら、1990,Molecular Cloning,A L
aboratory Manual,第2版、Cold Spring Har
bor Laboratory,Cold Spring Harbor,NY
およびAusubelら編、1998,Current Protocols
in Molecular Biology,John Wiley&Sons
,NYに記載の技術を参照のこと。これらは両方がその全体において本明細書に
参考として援用される。))を用いて操作され、例えば、アミノ酸の置換、欠失
、および/または挿入を作製するように異なるアミノ酸配列を有する抗体を生成
し得る。
【0263】 特定の実施形態において、重鎖および/または軽鎖の可変ドメインのアミノ酸
配列は、相補性決定領域(CDR)の配列の同定のために、当該分野において周
知の方法によって(例えば、配列超可変性の領域を決定するために、他の重鎖、
および軽鎖の可変領域を既知のアミノ酸配列と比較することによって)調べられ
得る。慣用的な組換えDNA技術を用いて、1つ以上のCDRが、前述のように
フレームワーク領域内に(例えば、非ヒト抗体をヒト化するために、ヒトフレー
ムワーク領域中に)挿入され得る。このフレームワーク領域は天然に存在し得る
か、またはコンセンサスフレームワーク領域であり得、そして好ましくはヒトフ
レームワーク領域であり得る(例えば、列挙したヒトフレームワーク領域につい
ては、Chothiaら、J.Mol.Biol.278:457−479(1
998)を参照のこと)。好ましくは、フレームワーク領域およびCDRの組み
合わせによって生成されたポリヌクレオチドは、本発明のポリペプチドに特異的
に結合する抗体をコードする。好ましくは、上記に議論されるように、1つ以上
のアミノ酸置換は、フレームワーク領域内で作製され得、そして好ましくは、そ
のアミノ酸置換は、抗体のその抗原への結合を改善する。さらに、このような方
法は、1つ以上の鎖内ジスルフィド結合が欠如した抗体分子を生成するために、
鎖内ジスルフィド結合に関与する1つ以上の可変領域のシステイン残基のアミノ
酸置換または欠失を作製するために使用され得る。ポリヌクレオチドへの他の変
更は、本発明によって、および当該分野の技術において包含される。
【0264】 さらに、適切な抗原特異性のマウス抗体分子由来の遺伝子を、適切な生物学的
活性のヒト抗体分子由来の遺伝子と共にスプライシングさせることによって、「
キメラ抗体」を産生するために開発された技術(Morrisonら、Proc
.Natl.Acad.Sci.81:851−855(1984);Neub
ergerら、Nature 312:604−608(1984);Take
daら、Nature 314:452−454(1985))が使用され得る
。上記のように、キメラ抗体は、異なる部分が異なる動物種に由来する分子であ
り、このような分子は、マウスmAbおよびヒト免疫グロブリンの定常領域由来
の可変領域を有する(例えば、ヒト化抗体)。
【0265】 あるいは、単鎖抗体の産生に関して記載された技術(米国特許第4,946,
778号;Bird、Science 242:423−42(1988);H
ustonら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:587
9−5883(1988);およびWardら、Nature 334:544
−54(1989))が、単鎖抗体の産生に適応され得る。単鎖抗体は、Fv領
域の重鎖フラグメントおよび軽鎖フラグメントがアミノ酸架橋を介して連結され
れることによって形成され、単鎖ポリペプチドを生じる。E.coliにおける
機能性Fvフラグメントのアセンブリのための技術もまた、使用され得る(Sk
erraら、Science 242:1038−1041(1988))。
【0266】 (抗体を産生する方法) 本発明の抗体は、抗体を合成するための当該分野で公知の任意の方法によって
、特に、化学合成によって、または、好ましくは、組換え発現技術によって産生
され得る。
【0267】 本発明の抗体、またはそのフラグメント、誘導体もしくはアナログ(例えば、
本発明の抗体の重鎖もしくは軽鎖または本発明の単鎖抗体)の組換え発現は、そ
の抗体をコードするポリヌクレオチドを含有する発現ベクターの構築を必要とす
る。一旦、本発明の抗体分子または抗体の重鎖もしくは軽鎖、あるいはそれらの
部分(好ましくは、重鎖または軽鎖の可変ドメインを含有する)をコードするポ
リヌクレオチドが得られると、抗体分子の産生のためのベクターは、当該分野で
周知の技術を用いる組換えDNA技術によって生成され得る。従って、抗体をコ
ードするヌクレオチド配列を含有するポリヌクレオチドの発現によってタンパク
質を調製するための方法は、本明細書に記載される。当業者に周知の方法は、抗
体をコードする配列ならびに適切な転写制御シグナルおよび翻訳制御シグナルを
含有する発現ベクターの構築のために使用され得る。これらの方法には、例えば
、インビトロの組換えDNA技術、合成技術、およびインビボの遺伝子組換えが
挙げられる。従って、本発明は、プロモーターに作動可能に連結された、本発明
の抗体分子、あるいはその重鎖もしくは軽鎖、または重鎖もしくは軽鎖の可変ド
メインをコードするヌクレオチド配列を含む、複製可能なベクターを提供する。
このようなベクターは、抗体分子の定常領域(例えば、PCT公開 WO86/
05807;PCT公開 WO89/01036;および米国特許第5,122
,464号を参照のこと)をコードするヌクレオチド配列を含み得、そしてこの
抗体の可変ドメインは、重鎖または軽鎖の全体の発現のためにこのようなベクタ
ーにクローニングされ得る。
【0268】 この発現ベクターは、従来技術によって宿主細胞へと移入され、そしてこのト
ランスフェクトされた細胞は、次いで、本発明の抗体を産生するために、従来技
術によって培養される。従って、本発明は、異種プロモーターに作動可能に連結
された、本発明の抗体、あるいはその重鎖もしくは軽鎖、または本発明の単鎖抗
体をコードするポリヌクレオチドを含む宿主細胞を含む。二重鎖抗体の発現につ
いての好ましい実施形態において、重鎖および軽鎖の両方をコードするベクター
は、以下に詳述されるように、免疫グロブリン分子全体の発現のために宿主細胞
中に同時発現され得る。
【0269】 種々の宿主発現ベクター系は、本発明の抗体分子を発現させるために利用され
得る。このような宿主発現系は、目的のコード配列が産生され、かつ続いて精製
され得るビヒクルを表わすが、また、適切なヌクレオチドをコードする配列で形
質転換またはトランスフェクトされる場合に、インサイチュで本発明の抗体分子
を発現し得る細胞を表わす。これらには、以下が挙げられるが、これらに限定さ
れない:抗体をコードする配列を含む組換えバクテリオファージDNA、プラス
ミドDNAまたはコスミドDNA発現ベクターを用いて形質転換された細菌(例
えば、E.coli、B.subtilis)のような微生物;抗体をコードす
る配列を含む組換え酵母発現ベクターで形質転換された酵母(例えば、Sacc
haromyces、Pichia);抗体をコードする配列を含む組換えウイ
ルス発現ベクター(例えば、バキュロウイルス)に感染した昆虫細胞系;組換え
ウイルス発現ベクター(例えば、カリフラワーモザイクウイルス、CaMV;タ
バコモザイクウイルス、TMV)に感染した植物細胞系または抗体をコードする
配列を含む組換えプラスミド発現ベクター(例えば、Tiプラスミド)で形質転
換された植物細胞系;あるいは哺乳動物細胞のゲノムに由来するプロモーター(
例えば、メタロチオネインプロモーター)または哺乳動物のウイルスに由来する
プロモーター(例えば、アデノウイルス後期プロモーター;ワクシニアウイルス
7.5Kプロモーター)を含む組換え発現構築物を保有する哺乳動物細胞系(例
えば、COS、CHO、BHK、293、3T3細胞)。好ましくは、Esch
erichia coliのような細菌細胞、そしてより好ましくは、特に、組
換え抗体分子全体の発現のために真核生物細胞が、組換え抗体分子の発現のため
に使用される。例えば、ヒトサイトメガロウイルス由来の主要中間初期遺伝子プ
ロモーターエレメントのようなベクターと組み合わされた、チャイニーズハムス
ターの卵巣細胞(CHO)のような哺乳動物細胞が、抗体のための効果的な発現
系である(Foeckingら、Gene 45:101(1986);Coc
kettら、Bio/Technology 8:2(1990))。
【0270】 細菌系において、多くの発現ベクターが、抗体分子の発現を意図する使用に依
存して有利に選択され得る。例えば、多量のこのようなタンパク質が産生される
べき場合、抗体分子の薬学的組成物の生成のために、容易に精製される融合タン
パク質産物の高レベルの発現を指向するベクターが所望され得る。このようなベ
クターには、以下が挙げられるが、これらに限定されない:抗体をコードする配
列がlacZをコードする領域と共にベクターにインフレーム(in fram
e)で個別に連結され得、その結果、融合タンパク質が産生されるE.coli
発現ベクターpUR278(Rutherら、EMBO J.2:1791(1
983));pINベクター(Inouye&Inouye、Nucleic
Acids Res.13:3101−3109(1985);Van Hee
ke&Schuster、J.Biol.Chem.24:5503−5509
(1989))など。pGEXベクターもまた、グルタチオンS−トランスフェ
ラーゼ(GST)との融合タンパク質として、外来性ポリペプチドを発現させる
ために使用され得る。一般に、このような融合タンパク質は可溶性であり、そし
て溶解した細胞から、マトリックスグルタチオン−アガロースビーズへの吸着お
よび結合、それに続く遊離グルタチオン存在化での溶出によって容易に精製され
得る。このpGEXベクターは、トロンビンまたはXa因子プロテアーゼ切断部
位を含むように設計され、その結果、このクローニングされた標的遺伝子産物は
、GST部分から放出され得る。
【0271】 昆虫系においては、Autographa californica核多角体
病ウィルス(AcNPV)は、外来遺伝子を発現するためのベクターとして使用
される。このウィルスは、Spodoptera frugiperda細胞に
おいて増殖する。抗体をコードする配列は、このウィルスの非必須の領域(例え
ばポリヘドリン遺伝子)に個々にクローニングされ得、そしてAcNPVプロモ
ーター(例えばポリヘドリンプロモーター)の制御下に配置され得る。
【0272】 哺乳動物宿主細胞においては、多数のウィルスに基づく発現系が利用され得る
。アデノウィルスが発現ベクターとして使用される場合においては、目的の抗体
をコードする配列は、アデノウィルスの転写/翻訳制御複合体、例えば後期プロ
モーターおよび3つの部分に分かれるリーダー配列、に連結され得る。次いで、
このキメラ遺伝子は、インビトロまたはインビボでの組換えによって、アデノウ
ィルスゲノムに挿入され得る。ウィルスゲノムの非必須領域(例えば、E1また
はE3領域)における挿入は、生存可能で、感染した宿主において抗体分子を発
現する能力のある組換えウィルスを生じる(例えば、Logan&Shenk、
Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:355−359(19
84)を参照のこと)。特異的開始シグナルはまた、挿入された抗体をコードす
る配列の効率的な翻訳のために必要とされ得る。これらのシグナルは、ATG開
始コドンおよび隣接する配列を含む。さらに、この開始コドンは、挿入部分全体
の翻訳を確実にするために、所望されるコード配列のリーディングフレームと相
が同じでなければならない。これらの外因性翻訳制御シグナルおよび開始コドン
は、種々の起源(天然および合成の両方)であり得る。発現の効率は、適切な転
写エンハンサーエレメント、転写ターミネーター、などの含有によって高められ
得る(Bittnerら、Methods in Enzymol.153:5
1−544(1987)を参照のこと)。
【0273】 さらに、宿主細胞系統は、選択され得、これは挿入配列の発現を調節するか、
または所望される特異的な様式で遺伝子産物を改変し、そしてプロセシングする
。タンパク質産物のこのような改変(例えばグリコシル化)およびプロセシング
(例えば切断)は、タンパク質の機能のために重要であり得る。異なる宿主細胞
は、タンパク質および遺伝子産物の、翻訳後プロセシングおよび改変のための、
特徴的で特異的な機構を有する。適切な細胞株または宿主系は、発現された外来
タンパク質の正確な改変およびプロセシングを確実にするように選択され得る。
この目的のために、遺伝子産物の、第一の転写、グリコシル化、およびリン酸化
の正確なプロセシングのための細胞機構を有する、真核生物宿主細胞が、使用さ
れ得る。このような哺乳動物宿主細胞は、CHO、VERY、BHK、Hela
、COS、MDCK、293、3T3、WI38、そして特に、例えば、BT4
83、Hs578T、HTB2、BT20およびT47Dのような乳癌細胞株、
ならびに、例えば、CRL7030およびHs578Bstのような正常な乳腺
細胞株、を含むがこれらに限定されない。
【0274】 組換えタンパク質の長期間の高収率産生のために、安定発現が好ましい。例え
ば、安定に抗体分子を発現する細胞株が操作され得る。ウィルスの複製起点を含
む発現ベクターを使用するよりも、宿主細胞は、適切な発現制御要素(例えば、
プロモーター、エンハンサー、配列、転写ターミネーター、ポリアデニル化部位
、など)、および選択マーカーによって制御されるDNAで形質転換され得る。
異種DNAの導入に続いて、操作された細胞は、1〜2日間富化培地で増殖し得
、次いで、選択培地に切り替えられる。組換えプラスミドにおける選択マーカー
は、選択に対する耐性を与え、そして細胞が、プラスミドをその染色体内に安定
に組み込み、そして増殖して、細胞増殖巣を形成し、これを今度はクローニング
し得、増殖して細胞株になり得ることを可能にする。この方法は、抗体分子を発
現する細胞株を操作するために、有利に使用され得る。このような操作された細
胞株は、直接的または間接的に抗体分子と相互作用する化合物のスクリーニング
および評価において、特に有用であり得る。
【0275】 多数の選択系が使用され得、この選択系は、単純ヘルペスウィルスチミジンキ
ナーゼ(Wiglerら、Cell 11:223(1977))、ヒポキサン
チン−グアニン ホスホリボシルトランスフェラーゼ(Szybalska&S
zybalski、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 48:2
02(1992))、およびアデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(Lo
wyら、Cell 22:817(1980))の遺伝子を含むが限定されず、
これらの遺伝子は、tk−、hgprt−またはaprt−細胞においてそれぞ
れ使用され得る。また、代謝拮抗物質耐性は、以下の遺伝子の選択の根拠として
使用され得る:dhfr、これはメトトレキサートに対する耐性を与える(Wi
glerら、Natl.Acad.Sci.USA 77:357(1980)
;O’Hareら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:1
527(1981));gpt、これはミコフェノール酸にに対する耐性を与え
る(Mulligan&Berg、Proc.Natl.Acad.Sci.U
SA 78:2072(1981));neo、これはアミノグリコシドG−4
18に対する耐性を与える(Clinical Pharmacy 12:48
8−505;Wu and Wu、Biotherapy 3:87−95(1
991);Tolstoshev、Ann.Rev.Pharmacol.To
xicol.32:573−596(1993);Mulligan、Scie
nce 260:926−932(1993);およびMorgan and
Anderson、Ann.Rev.Biochem.62:191−217(
1993);1993年5月、TIB TECH 11(5):155−215
);ならびにhygro、これはハイグロマイシンにに対する耐性を与える(S
anterreら、Gene 30:147(1984))。組換えDNA技術
の分野で、一般的に周知の方法は、所望の組換えクローンを選択するために、慣
用的に適用され得、そしてこのような方法は、以下に記載されている:例えば、
Ausubelら(編)、Current Protocols in Mol
ecular Biology、John Wiley&Sons、NY(19
93);Kriegler、Gene Transfer and Expre
ssion、A Laboratory Manual、Stockton P
ress、NY(1990);ならびに12章および13章、Dracopol
iら(編)、Current Protocols in Human Gen
etics、John Wiley&Sons、NY(1994);Colbe
rre−Garapinら、J.Mol.Biol.150:1(1981)(
これらはその全体が本明細書中に参考として援用される)。
【0276】 抗体分子の発現レベルは、ベクター増幅によって増大され得る(総説として、
BebbingtonおよびHentschel、The use of ve
ctors based on gene amplification fo
r the expression of cloned genes in
mammalian cells in DNA cloning、Vol.3
.(Academic Press、New York、1987)を参照のこ
と)。抗体を発現するベクター系におけるマーカーが、増幅可能であると、宿主
細胞の培養物に存在するインヒビターのレベルにおける増加は、マーカー遺伝子
のコピーの数を増加する。増幅領域は抗体遺伝子と結合しているので、抗体の産
生もまた増加する(Crouseら、Mol.Cell.Biol.3:257
(1983))。
【0277】 宿主細胞は、本発明の二つの発現ベクター(重鎖由来のポリペプチドをコード
する第一のベクターおよび軽鎖由来のポリペプチドをコードする第二のベクター
)で、同時トランスフェクトされ得る。この二つのベクターは、重鎖および軽鎖
のポリペプチドの等しい発現を可能にする、同一の選択マーカーを含み得る。あ
るいは、単一のベクターが使用され得、これは重鎖および軽鎖両方のポリペプチ
ドをコードし、そして発現することができる。このような状況において、過剰の
毒性の遊離重鎖を避けるために、重鎖の前に軽鎖が配置されるべきである(Pr
oudfoot、Nature 322:52(1986);Kohler、P
roc.Natl.Acad.Sci.USA 77:2197(1980))
。重鎖および軽鎖のためのコード配列はcDNAまたはゲノムDNAを含み得る
【0278】 一旦、本発明の抗体分子が、動物によって産生されるか、化学的に合成される
か、または組換えにより発現されると、当該分野で公知の、免疫グロブリン分子
の精製のための任意の方法、例えば、クロマトグラフィー(例えば、イオン交換
、アフィニティー(特に、プロテインAの後に特異的抗原に対するアフィニティ
ーによる)、およびサイズカラムクロマトグラフィー)、遠心分離、溶解度差、
またはタンパク質精製のための任意の他の標準的な技術によって、精製され得る
。さらに、本発明の抗体またはそのフラグメントは、本明細書中に記載されるか
またはそうでなければ当該分野において公知の、異種ポリペプチド配列に融合さ
れ得、精製を容易にする。
【0279】 本発明は、本発明のポリペプチド(もしくはその部分、好ましくはこのポリペ
プチドの少なくとも10個、20個、30個、40個、50個、60個、70個
、80個、90個、もしくは100個のアミノ酸)に、組換えにより融合される
かまたは化学的に結合されて(共有結合および非共有結合の両方を含む)、融合
タンパク質を生成する抗体、を含む。この融合は、直接的である必要はないが、
リンカー配列を介して起こり得る。この抗体は、本発明のポリペプチド(または
その部分、好ましくはこのポリペプチドの少なくとも10個、20個、30個、
40個、50個、60個、70個、80個、90個、もしくは100個のアミノ
酸)以外の抗原に特異的であり得る。例えば、インビトロまたはインビボのいず
れにおいても、本発明のポリペプチドを特定の細胞表面のレセプターに特異的な
抗体に融合または結合させることによって、特定の細胞のタイプに対して、本発
明のポリペプチドを標的にするために、抗体が使用され得る。本発明のポリペプ
チドに融合または結合される抗体はまた、インビトロ免疫アッセイおよび当該分
野で公知の方法を使用する精製方法において使用され得る。例えば、Harbo
rら、上記、およびPCT公開WO93/21232;EP439,095;N
aramuraら、Immunol.Lett.39:91−99(1994)
;米国特許第5,474,981号;Gilliesら、PNAS 89:14
28−1432(1992);Fellら、J.Immunol.146:24
46−2452(1991)を参照のこと。これらは、その全体が参考として援
用される。
【0280】 本発明はさらに、抗体の可変領域以外のドメインに融合または結合された、本
発明のポリペプチドを含む組成物を含む。例えば、本発明のポリペプチドは、抗
体のFc領域、またはその部分に融合または結合され得る。本発明のポリペプチ
ドに融合されたこの抗体の部分は、定常領域、ヒンジ領域、CH1ドメイン、C
H2ドメイン、およびCH3ドメイン、またはそのドメイン全体もしくは部分の
任意の組合せを含み得る。これらのポリペプチドはまた、上記の抗体の部分に融
合または結合され得、マルチマーを形成する。例えば、本発明のポリペプチドに
融合されたFc部分は、このFc部分の間のジスルフィド結合を通してニ量体を
形成し得る。より高度のマルチマー形態は、ポリペプチドをIgAおよびIgM
の部分に融合させることによって作製され得る。本発明のポリペプチドを抗体部
分に融合または結合させるための方法は、当該分野において公知である。例えば
、米国特許第5,336,603号;同第5,622,929号;同第5,35
9,046号;同第5,349,053号;同第5,447,851号;同第5
,112,946号;EP 307,434;EP 367,166;PCT公
開WO96/04388;WO91/06570;Ashkenaziら、Pr
oc.Natl.Acad.Sci.USA 88:10535−10539(
1991);Zhengら、J.Immunol.154:5590−5600
(1995);およびVilら、Proc.Natl.Acad.Sci.US
A 89:11337−11341(1992)(前記の参考文献はその全体が
参考として援用される)を参照のこと。
【0281】 上で考察されたように、配列番号Yのポリペプチド、ポリペプチドフラグメン
ト、または改変体に対応するポリペプチドは、このポリペプチドのインビボ半減
期を増大させるため、または当該分野で公知の方法を使用する免疫学的アッセイ
において使用するために、上記の抗体部分に融合または結合され得る。さらに、
配列番号Yに対応するポリペプチドを、上記の抗体部分に融合または結合して、
精製を容易にし得る。1つの報告された例は、ヒトCD4ポリペプチドの最初の
2つのドメイン、および哺乳動物の免疫グロブリンの重鎖または軽鎖の定常領域
の種々のドメインからなるキメラタンパク質を記載している(EP 394,8
27;Trauneckerら、Nature 331:84−86(1988
))。ジスルフィド連結二量体構造(IgGに起因する)を有する抗体に融合ま
たは結合される、本発明のポリペプチドもまた、単量体分泌タンパク質またはタ
ンパク質フラグメント単独よりも、他の分子に結合しそして中和するのにさらに
効率的であり得る(Fountoulakisら、J.Biochem.270
:3958−3964(1995))。多くの場合、融合タンパク質のFc部分
は、治療および診断において有益であり、従って、例えば、改良された薬物動態
学的な特性を生じ得る(EP A 232,262)。あるいは、融合タンパク
質が発現され、検出され、そして精製された後に、Fc部分を欠失させることが
望ましい。例えば、融合タンパク質が免疫化のための抗原として使用される場合
、Fc部分は、治療および診断を妨害し得る。例えば、薬物の発見において、h
IL−5のようなヒトタンパク質は、hIL−5のアンタゴニストを同定するた
めのハイスループットスクリーニングアッセイの目的のためにFc部分と融合さ
れてきた(Bennettら、J.Molecular Recognitio
n 8:52−58(1995);Johansonら、J.Biol.Che
m.270:9459−9471(1995)を参照のこと)。
【0282】 さらに、本発明の抗体またはそのフラグメントは、精製を容易にするペプチド
のような、マーカー配列に融合され得る。好ましい実施形態において、マーカー
アミノ酸配列は、とりわけヘキサ−ヒスチジンペプチド(例えば、pQEベクタ
ー(QIAGEN,Inc.,9259 Eton Avenue,Chats
worth,CA,91311)において提供されるタグ)であり、これらの多
くのマーカーアミノ酸配列が市販されている。例えば、Gentzら、Proc
.Natl.Acad.Sci.USA 86:821−824(1989)に
記載されるように、ヘキサ−ヒスチジンは、融合タンパク質の都合の良い精製を
提供する。精製のために有用な別のペプチドタグは、インフルエンザ赤血球凝集
素タンパク質由来のエピトープに対応する「HA」タグ(Wilsonら、Ce
ll37:767(1984))、および「flag」タグを含むが、これに限
定されない。
【0283】 本発明は、診断剤または治療剤に結合される、抗体またはそのフラグメントを
さらに含む。抗体は、例えば、臨床上の試験手順(例えば、所定の処置レジメン
(regimen)の効力を決定するため)の一部として、腫瘍の発生または進
行をモニターするために、診断的に使用され得る。検出は、抗体を検出可能な物
質と連結させることによって容易にされ得る。検出可能な物質の例としては、種
々の酵素、補欠分子団、蛍光物質、発光物質、生物発光物質、放射性物質、種々
の陽電子放射断層撮影を使用する陽電子放射金属、および非放射性常磁性金属イ
オン、が挙げられる。この検出可能な物質は、抗体(またはそのフラグメント)
に対して、直接的または間接的のいずれかで、当該分野で公知の技術を使用する
媒介物(例えば、当該分野で公知のリンカーなど)を介して、連結または結合さ
れ得る。例えば、本発明に従う診断薬としての使用のための抗体に結合され得る
金属イオンに関しては、米国特許第4,741,900号を参照のこと。適切な
酵素の例としては、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β
−ガラクトシダーゼ、またはアセチルコリンエステラーゼが挙げられ;適切な補
欠分子団複合体の例としては、ストレプトアビジン/ビオチンおよびアビジン/
ビオチンが挙げられ;適切な蛍光物質の例としては、ウンベリフェロン、フルオ
レセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジ
ニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドまたはフィコエリトリンが挙げら
れ;発光物質の例としては、ルミノールが挙げられ;生物発光物質の例としては
、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンが挙げられ;ならびに、適切
な放射性物質の例としては、125I、131I、111Inまたは99Tcが
挙げられる。
【0284】 さらに、抗体またはそのフラグメントは、治療用部分(例えば細胞毒(例えば
細胞増殖抑制性もしくは細胞殺傷性の薬剤))、治療剤または放射性金属イオン
(例えば、α−エミッタ−(例えば213Bi)など)に結合され得る。細胞毒
または細胞毒性薬剤は、細胞に対して有害な任意の薬剤を含む。例としては、パ
クリタキセル(paclitaxol)、サイトカラシンB、グラミシジンD、
臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テニポシド(ten
oposide)、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン(colch
icin)、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオ
ン(dihydroxy anthracin dione)、ミトキサントロ
ン、ミトラマイシン、アクチノマイシンD、1−デヒドロテストステロン、グル
ココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、
およびピューロマイシン、ならびにそのアナログまたはホモログ、が挙げられる
。治療剤は、代謝拮抗物質(例えば、メトトレキサート、6−メルカプトプリン
、6−チオグアニン、シタラビン、5−フルオロウラシルデカルバジン(5−f
luorouracil decarbazine)、アルキル化剤(例えば、
メクロレタミン、チオエパ(thioepa)クロラムブシル、メルファラン、
カルムスチン(BSNU)およびロムスチン(CCNU)、シクロホスファミド
(cyclothosphamide)、ブスルファン、ジブロモマンニトール
、ストレプトゾトシン、マイトマイシンC、ならびにcis−ジクロロジアミン
白金(II)(DDP)シスプラチン)、アンスラサイクリン(例えば、ダウノ
ルビシン(以前はダウノマイシン)およびドキソルビシン)、抗生物質(例えば
、ダクチノマイシン(以前はアクチノマイシン)、ブレオマイシン、ミトラマイ
シン、およびアンスラマイシン(anthramycin)(AMC))、なら
びに抗有糸分裂剤(例えばビンクリスチンおよびビンブラスチン)、を含むが、
それらに限定されない。
【0285】 本発明の結合体は、所定の生物学的応答を改変するために使用され得、治療剤
または薬物部分は、古典的な化学的治療剤に限定されると解釈されない。例えば
、薬物部分は、所望の生物学的活性を有するタンパク質またはポリペプチドであ
り得る。このようなタンパク質としては、例えば、毒素(例えばアブリン、リシ
ンA、シュードモナス外毒素、またはジフテリア毒素);タンパク質(例えば、
腫瘍壊死因子、a−インターフェロン、β−インターフェロン、神経発育因子、
血小板由来増殖因子、組織プラスミノゲンアクチベーター、アポトーシス薬(例
えば、TNF−α、TNF−β、AIM I(国際公開第WO97/33899
号を参照のこと)、AIM II(国際公開第WO97/34911号を参照の
こと)、Fasリガンド(Takahashiら、Int.Immunol.6
:1567−1574(1994))、VEGI(国際公開第WO99/231
05号を参照のこと))、血栓症薬もしくは抗脈管形成薬(例えば、アンジオス
タチンもしくはエンドスタチン);または生物学的応答改変剤(例えばリンホカ
イン、インターロイキン−1(「IL−1」)、インターロイキン−2(「IL
−2」)、インターロイキン−6(「IL−6」)、顆粒球マクロファージコロ
ニー刺激因子(「GM−CSF」)、顆粒球コロニー刺激因子(「G−CSF」
)、または他の増殖因子など)、が挙げられ得る。
【0286】 抗体はまた、固体支持体に付着させられ得、この固体支持体は、標的抗原の免
疫アッセイまたは精製に特に有用である。このような固体支持体としては、ガラ
ス、セルロース、ポリアクリルアミド、ナイロン、ポリスチレン、ポリ塩化ビニ
ルまたはポリプロピレン、が挙げられるがそれらに限定されない。
【0287】 このような治療部分を抗体に結合する技術は周知であり、例えば、Arnon
ら、「Monoclonal Antibodies For Immunot
argeting Of Drugs In Cancer Therapy」
Monoclonal Antibodies And Cancer The
rapy、Reisfeldら(編)、243−56頁(Alan R.Lis
s,Inc.1985);Hellstromら、「Antibodies F
or Drug Delivery」Controlled Drug Del
ivery(第2版)、Robinsonら(編)、623−53頁(Marc
el Dekker,Inc.1987);Thorpe、「Antibody
Carriers Of Cytotoxic Agents In Can
cer Therapy:A Review」Monoclonal Anti
bodies’84:Biological And Clinical Ap
plications、Pincheraら(編)、475−506頁(198
5);「Analysis,Results,And Future Pros
pective Of The Therapeutic Use Of Ra
diolabeled Antibody In Cancer Therap
y」Monoclonal Antibodies For Cancer D
etection And Therapy、Baldwinら(編)、303
−16頁(Academic Press 1985)、およびThorpeら
、「The Preparation And Cytotoxic Prop
erties Of Antibody−Toxin Conjugates」
、Immunol.Rev.62:119−58(1982)を参照のこと。
【0288】 あるいは、抗体は2次抗体に結合され、米国特許第4,676,980号(こ
れは、その全体が本明細書に参考として援用される)におけるSegalによる
記載のような抗体の異種結合体(heteroconjugate)を形成し得
る。
【0289】 単独、あるいは細胞毒性因子および/またはサイトカインと組み合わせて投与
される、抗体に結合する治療部分を有するかまたは有さない抗体が、治療薬とし
て使用され得る。
【0290】 (免疫表現型分類(immunophenotyping)) 本発明の抗体は、細胞株および生物学的サンプルの免疫表現型分類のために利
用され得る。本発明の遺伝子の翻訳生成物は、細胞特異的マーカーとして、ある
いはより詳細には、特定の細胞型の分化および/または成熟の種々の段階で示差
的に発現される細胞マーカーとして有用であり得る。特異的エピトープ、または
エピトープの組み合わせに対して指向されるモノクロナール抗体は、マーカーを
発現する細胞集団のスクリーニングを可能とする。種々の技術が、マーカーを発
現する細胞集団をスクリーニングするために、モノクロナール抗体を用いて利用
され得、そしてその技術には、抗体でコーティングされた磁気ビーズを用いる磁
気分離、固体マトリクス(すなわち、プレート)に付着した抗体を用いる「パン
ニング」、ならびにフローサイトメトリー(例えば、米国特許第5,985,6
60号;およびMorrisonら、Cell,96:737−49(1999
)を参照のこと)が挙げられる。
【0291】 これらの技術は、血液学的悪性腫瘍(すなわち、急性白血病患者における微小
残存病変(minimal residual disease)(MRD))
および移植片対宿主病(GVHD)を予防するための移植術における「非自己」
細胞と共に見出され得るような、細胞の特定集団のスクリーニングを可能にする
。あるいは、これらの技術は、ヒト臍帯血において見出され得るような増殖およ
び/または分化を受け得る、造血幹細胞および前駆細胞のスクリーニングを可能
にする。
【0292】 (抗体結合アッセイ) 本発明の抗体は、免疫特異的結合について、当該分野で公知の任意の方法によ
ってアッセイされ得る。使用され得る免疫アッセイは、競合的および非競合的ア
ッセイ系を含むがこれに限定されない。このアッセイ系は以下のような技術を使
用する、少し例を挙げると、ウェスタンブロット、放射性免疫アッセイ、ELI
SA(酵素結合免疫吸着アッセイ)、「サンドイッチ」免疫アッセイ、免疫沈降
アッセイ、沈降素反応、ゲル拡散沈降素反応、免疫拡散アッセイ、凝集アッセイ
、補体結合アッセイ、免疫放射分析アッセイ、蛍光免疫アッセイ、プロテインA
免疫アッセイ。このようなアッセイは、当該分野で、慣習的および周知である(
例えば、Ausubelら(編)、1994、Current Protoco
ls in Molecular Biology、第1巻、John Wil
ey&Sons Inc.,New Yorkを参照のこと。これはその全体が
本明細書中で参考として援用される)。典型的な免疫アッセイは、以下に簡単に
記載される(しかし限定として意図されない)。
【0293】 免疫沈降プロトコルは、一般に、RIPA緩衝液(1%NP−40またはTr
iton X−100、1%デオキシコール酸ナトリウム、0.1%SDS、0
.15M NaCl、0.01Mリン酸ナトリウム(pH7.2)、1%Tra
sylol)のような、タンパク質ホスファターゼおよび/またはプロテアーゼ
インヒビター(例えば、EDTA、PMSF、アプロチニン、バナジウム酸ナト
リウム)を補充した溶解緩衝液中で、細胞の集団を溶解する工程、目的の抗体を
細胞溶解物に添加する工程、4℃である時間(例えば1〜4時間)インキュベー
トする工程、プロテインAおよび/またはプロテインGのセファロースビーズを
細胞溶解物に添加する工程、約1時間以上、4℃でインキュベートする工程、ビ
ーズを溶解緩衝液で洗浄する工程およびビーズをSDS/サンプル緩衝液中に再
懸濁する工程、を包含する。目的の抗体が特定の抗原を免疫沈降する能力は、例
えば、ウェスタンブロット分析によって評価され得る。当業者は、抗原に対する
抗体の結合を増加し、そしてバックグラウンドを減少する(例えば、セファロー
スビーズとともに細胞溶解物を予め洗浄する)ように改変され得るパラメータに
関して、よく知っている。免役沈降プロトコルに関するさらなる考察については
、Ausubelら(編)、1994、Current Protocols
in Molecular Biology、Vol.1、John Wile
y&Sons,Inc.,New York(10.16.1)を参照のこと。
【0294】 ウェスタンブロット分析は一般的に、タンパク質サンプルを調製する工程、タ
ンパク質サンプルのポリアクリルアミドゲルでの電気泳動(例えば抗原の分子量
によって8%〜20%のSDS−PAGE)、タンパク質サンプルをポリアクリ
ルアミドゲルからメンブレン(例えばニトロセルロース、PVDFまたはナイロ
ン)へ移す工程、ブロッキング溶液(例えば、3%のBSAまたは無脂肪ミルク
を含むPBS)中でメンブレンをブロッキングする工程、メンブレンを洗浄緩衝
液(例えば、PBS−Tween20)中で洗浄する工程、ブロッキング緩衝液
で希釈された1次抗体(目的の抗体)を用いてメンブレンをブロッキングする工
程、洗浄緩衝液中でメンブレンを洗浄する工程、ブロッキング緩衝液で希釈され
た、酵素基質(例えば西洋ワサビペルオキシダーゼもしくはアルカリホスファタ
ーゼ)または放射性分子(例えば32Pまたは125I)に結合した2次抗体(
これは1次抗体(例えば抗ヒト抗体)を認識する)でメンブレンをブロッキング
する工程、洗浄緩衝液中でメンブレンを洗浄する工程、および抗原の存在を検出
する工程、を包含する。当業者は、検出されるシグナルを増加し、そしてバック
グランドノイズを減少するように改変され得るパラメータをよく知っている。ウ
ェスタンブロットプロトコルに関するさらなる考察については、例えば、Aus
ubelら(編)、1994、Current Protocols in M
olecular Biology、Vol.1、John Wiley&So
ns,Inc.、New York(10.8.1)を参照のこと。
【0295】 ELISAは、抗原を調製する工程、96ウェルマイクロタイタープレートの
ウェルをその抗原でコーティングする工程、酵素基質(例えば、西洋ワサビペル
オキシダーゼまたはアルカリホスフォターゼ)のような検出可能な化合物に結合
した目的の抗体をそのウェルに添加し、そして一定時間インキュベートする工程
、および抗原の存在を検出する工程を含む。ELISAにおいて、目的の抗体は
、検出可能な化合物に結合している必要はない;その代わり、検出可能な化合物
に結合した第二の抗体(目的の抗体を認識する)がウェルに添加され得る。さら
に、ウェルを抗原でコーティングする代わりに、抗体がウェルにコーティングさ
れ得る。この場合、検出可能な化合物に結合した第二の抗体が、コーティングさ
れたウェルへの目的の抗原の添加に続いて、添加され得る。当業者は、検出され
るシグナルを増加させるように改変され得るパラメータ、および当該分野におい
て公知のELISAの他のバリエーションに関して、認め得る。ELISAに関
するさらなる考察については、例えば、Ausubelら編,1994,Cur
rent Protocols in Molecular Biology,
第1巻、John Wiley & Sons,Inc.,New York,
11.2.1を参照のこと。
【0296】 抗体の抗原に対する結合親和性および抗体−抗原相互作用のオフレート(of
f−rate)が、競合結合アッセイにより決定され得る。競合結合アッセイの
一つの例は、ラジオイムノアッセイであり、ラジオイムノアッセイは、標識した
抗原(例えば、3Hまたは125I)と、漸増量の非標識抗原の存在下での目的
の抗体とのインキュベーション、および標識した抗原に結合した抗体の検出を含
む。目的の抗体の、特定の抗原に対する親和性、および結合オフレートは、スキ
ャッチャードプロット分析によるデータから決定され得る。第二の抗体との競合
はまた、ラジオイムノアッセイを用いて決定され得る。この場合、抗原は、漸増
量の非標識第二抗体の存在下で、標識した化合物(例えば、3Hまたは125I
)に結合した目的の抗体とともにインキュベートされる。
【0297】 (治療用途) 本発明はさらに、抗体ベースの治療に関し、この治療は、1つ以上の開示され
た疾患、障害、または状態を処置するために、動物、好ましくは哺乳動物、そし
て最も好ましくはヒトの患者に、本発明の抗体を投与する工程を包含する。本発
明の治療化合物としては、本発明の抗体(本明細書中に記載されるような、それ
らのフラグメント、アナログおよび誘導体を含む)ならびに本発明の抗体をコー
ドする核酸(本明細書中に記載されるような、それらのフラグメント、アナログ
および誘導体ならびに抗イディオタイプ抗体を含む)が挙げられるが、これらに
限定されない。本発明の抗体は、本発明のポリペプチドの異常な発現および/ま
たは活性に関連した疾患、障害または状態(本明細書中に記載される任意の1つ
以上の疾患、障害、または状態を含むがこれらに限定されない)を処置、阻害ま
たは予防するために使用され得る。本発明のポリペプチドの異常な発現および/
または活性に関連した疾患、障害または状態の処置および/または予防は、それ
らの疾患、障害または状態に関連した症状を緩和する工程を含むが、これに限定
されない。本発明の抗体は、当該分野で公知であるか、または本明細書中に記載
されるように、薬学的に受容可能な組成物中に提供され得る。
【0298】 本発明の抗体が治療的に使用され得る方法の要約は、身体内で局所的にまたは
全身的に、あるいは(例えば、補体(CDC)により、またはエフェクター細胞
(ADCC)により媒介されるような)抗体の直接的細胞傷害性により、本発明
のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを結合させることを含む。これらのアプ
ローチのいくつかは、より詳細に以下に記載される。本明細書中で提供される教
示を与えられれば、当業者は、過度の実験なしに、診断上の目的、モニタリング
の目的あるいは治療上の目的のために、本発明の抗体を使用する方法がわかる。
【0299】 本発明の抗体は、例えば、抗体と相互作用するエフェクター細胞の数または活
性を増加させるために役立つ、他のモノクローナル抗体またはキメラ抗体、ある
いはリンホカインまたは造血増殖因子(例えば、IL−2、IL−3およびIL
−7のような)と組み合わせて有利に利用され得る。
【0300】 本発明の抗体は、単独で、または他の型の処置(例えば、放射線療法、化学療
法、ホルモン治療、免疫治療および抗腫瘍剤)との組み合わせで投与され得る。
一般的に、(抗体の場合には)患者の種と同じ種である種起源または種反応性の
生成物の投与が好ましい。従って、好ましい実施形態においては、ヒトの抗体、
フラグメント誘導体、アナログ、または核酸が、治療または予防のために、ヒト
の患者に投与される。
【0301】 本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド(それらのフラグメントを含む
)に対するイムノアッセイ、およびそれらに関連した障害の治療の両方のために
、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対する、高親和性および/ま
たは強力な、インビボでの阻害抗体および/または中和抗体、それらのフラグメ
ント、またはその領域を使用することが好ましい。このような抗体、フラグメン
ト、または領域は、好ましくは、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド
(それらのフラグメントを含む)に対して親和性を有する。好ましい結合親和性
としては、5×10−2M、10−2M、5×10−3M、10−3M、5×1
−4M、10−4M、5×10−5M、10−5M、5×10−6M、10 M、5×10−7M、10−7M、5×10−8M、10−8M、5×10 M、10−9M、5×10−10M、10−10M、5×10−11M、10−11 M、5×10−12M、10−12M、5×10−13M、10−13
、5×10−14M、10−14M、5×10−15M、および10−15Mよ
りも小さい解離定数すなわちKdを有する結合親和性が挙げられる。
【0302】 (遺伝子治療) 特定の実施形態において、抗体またはその機能的誘導体をコードする配列を含
む核酸は、本発明のポリペプチドの異常な発現および/または活性に関連した疾
患または障害を処置、阻害または予防するために、遺伝子治療の目的で投与され
る。遺伝子治療とは、発現したか、または発現可能な核酸の、被験体への投与に
より行われる治療をいう。本発明のこの実施形態において、核酸は、それらのコ
ードされたタンパク質を産生し、そのタンパク質は治療効果を媒介する。
【0303】 当該分野で利用可能な遺伝子治療のための任意の方法は、本発明に従って使用
され得る。例示的な方法が以下に記載される。
【0304】 遺伝子治療の方法の一般的な概説については、Goldspielら,Cli
nical Pharmacy 12:488−505(1993);Wuおよ
びWu,Biotherapy 3:87−95(1991);Tolstos
hev,Ann.Rev.Pharmacol.Toxicol.32:573
−596(1993);Mulligan,Science 260:926−
932(1993);ならびにMorganおよびAnderson,Ann.
Rev.Biochem.62:191−217(1993);May,TIB
TECH 11(5):155−215(1993)を参照のこと。使用され得
る、組換えDNA技術分野において一般的に公知である方法は、Ausubel
ら(編),Current Protocols in Molecular
Biology,John Wiley & Sons,NY(1993);お
よびKriegler,Gene Transfer and Express
ion,A Laboratory Manual,Stockton Pre
ss,NY(1990)に記載される。
【0305】 好ましい局面において、化合物は抗体をコードする核酸配列を含有し、上記核
酸配列は、適切な宿主において、抗体、あるいはそのフラグメントもしくはキメ
ラタンパク質、またはその重鎖もしくは軽鎖を発現する発現ベクターの一部であ
る。特に、このような核酸配列は、抗体コード領域に作動可能に連結したプロモ
ーターを有し、上記プロモーターは誘導性であるかまたは構成性であり、そして
必要に応じて組織特異的である。別の特定の実施形態においては、抗体をコード
する配列および任意の他の所望の配列がゲノム中の所望の部位での相同組換えを
促進する領域に隣接した核酸分子が使用され、それにより抗体をコードする核酸
の染色体内の発現を提供する(KollerおよびSmithies,Proc
.Natl.Acad.Sci.USA 86:8932−8935(1989
);Zijlstraら,Nature 342:435−438(1989)
)。
【0306】 特定の実施形態において、発現した抗体分子は単鎖抗体であるか;あるいはこ
の核酸配列は、この抗体の重鎖および軽鎖の両方をコードする配列またはそのフ
ラグメントを含む。
【0307】 核酸の患者への送達は、直接的(この場合、患者は核酸または核酸保有ベクタ
ーに直接的に曝される)か、または間接的(この場合、細胞は最初にインビトロ
で核酸で形質転換され、次いで患者に移植される)のいずれかであり得る。これ
らの2つのアプローチは、インビボ遺伝子治療として、またはエキソビボ遺伝子
治療としてそれぞれ公知である。
【0308】 特定の実施形態において、核酸配列はインビボで直接的に投与され、そこで核
酸配列は発現されて、コードされた生成物を産生する。これは、当該分野で公知
の多数の方法(例えば、それらを適切な核酸発現ベクターの一部として構築し、
そしてそれを細胞内になるように投与することにより(例えば、欠損性または弱
毒化したレトロウイルスまたは他のウイルスベクター(米国特許第4,980,
286号を参照のこと)を用いた感染により)、あるいは、裸のDNAの直接注
射により、あるいは、微粒子ボンバードメント(例えば、遺伝子銃;Bioli
stic、Dupont)の使用により、あるいは脂質または細胞表面レセプタ
ーでコーティングするか、あるいは薬剤をトランスフェクトすること、リポソー
ム、微粒子、またはマイクロカプセル中へのカプセル化により、あるいは、それ
らを核に入ることが公知であるペプチドと結合させて投与することにより、レセ
プター媒介のエンドサイトーシスを受けるリガンドと結合させて投与することに
より(例えば、WuおよびWu,J.Biol.Chem.262:4429−
4432(1987)を参照のこと)(レセプターを特異的に発現する細胞型を
標的にするために用いられ得る)など)のいずれかにより達成され得る。別の実
施形態において、核酸−リガンド複合体が形成され得、ここで、リガンドはエン
ドソームを破壊するフソジェニック(fusogenic)ウイルス性ペプチド
を含み、核酸がリソソーム分解を回避することを可能にする。さらに別の実施形
態において、核酸は、特異的なレセプターを標的化することにより、細胞特異的
な取り込みおよび発現についてインビボで標的化され得る(例えば、PCT公開
第WO92/06180号;同第WO92/22635号;同第WO92/20
316号;同第WO93/14188号、同第WO93/20221号を参照の
こと)。あるいは、核酸は、細胞内部に導入され得、そして相同組換えにより、
発現のために宿主細胞DNA中に組み込まれ得る(KollerおよびSmit
hies,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:8932−
8935(1989);Zijlstraら,Nature 342:435−
438(1989))。
【0309】 特定の実施形態において、本発明の抗体をコードする核酸配列を含むウイルス
ベクターが使用される。例えば、レトロウイルスベクターが用いられ得る(Mi
llerら,Meth.Enzymol.217:581−599(1993)
を参照のこと)。これらのレトロウイルスベクターは、ウイルス性ゲノムの正確
なパッケージングおよび宿主細胞DNAへの組込みのために必要な構成要素を含
む。遺伝子治療において使用される抗体をコードする核酸配列は、一つ以上のベ
クター中にクローン化され、これは、患者内への遺伝子の送達を容易にする。レ
トロウイルスベクターに関するさらなる詳細は、Boesenら,Biothe
rapy 6:291−302(1994)(これは、幹細胞を化学療法に対し
てより耐性にするために、mdr1遺伝子を造血性幹細胞に送達するための、レ
トロウイルスベクターの使用を記載する)に見出され得る。遺伝子治療における
レトロウイルスベクターの使用を説明する他の参考文献は、以下である:Clo
wesら,J.Clin.Invest.93:644−651(1994);
Kiemら,Blood 83:1467−1473(1994);Salmo
nsおよびGunzberg,Human Gene Therapy 4:1
29−141(1993);ならびにGrossmanおよびWilson,C
urr.Opin.in Genetics and Devel.3:110
−114(1993)。
【0310】 アデノウイルスは、遺伝子治療において使用され得る他のウイルスベクターで
ある。アデノウイルスは、特に、気道上皮へ遺伝子を送達するための魅力的なビ
ヒクルである。アデノウイルスは、自然に気道上皮に感染し、そこで軽い疾患を
起こす。アデノウイルスに基づく送達システムの他の標的は、肝臓、中枢神経系
、内皮細胞、および筋肉である。アデノウイルスは、非分裂細胞に感染すること
ができるという利点を有する。KozarskyおよびWilson,Curr
ent Opinion in Genetics and Developm
ent 3:499−503(1993)は、アデノウイルスに基づく遺伝子治
療の概説を示す。Boutら,Human Gene Therapy 5:3
−10(1994)は、アカゲザルの気道上皮に遺伝子を移入するためのアデノ
ウイルスベクターの使用を証明した。遺伝子治療におけるアデノウイルスの使用
の他の例は、Rosenfeldら,Science 252:431−434
(1991);Rosenfeldら,Cell 68:143−155(19
92);Mastrangeliら,J.Clin.Invest.91:22
5−234(1993);PCT公開第WO94/12649号;およびWan
gら,Gene Therapy 2:775−783(1995)に見出され
得る。好ましい実施形態において、アデノウイルスベクターが使用される。
【0311】 アデノ随伴ウイルス(AAV)はまた、遺伝子治療における使用について提案
されてきた(Walshら,Proc.Soc.Exp.Biol.Med.2
04:289−300(1993);米国特許第5,436,146号)。
【0312】 遺伝子治療に対する別のアプローチは、エレクトロポレーション、リポフェク
ション、リン酸カルシウム媒介トランスフェクション、またはウイルス感染のよ
うな方法により、組織培養中の細胞へ遺伝子を移入する工程を含む。通常、移入
の方法は、選択マーカーの細胞への移入を含む。次いで、細胞は、移入された遺
伝子を取り込みそして発現している細胞を単離するために選沢下に置かれる。そ
れらの細胞は次いで、患者に送達される。
【0313】 この実施形態においては、得られた組換え細胞のインビボ投与の前に、核酸が
細胞に導入される。このような導入は、当該分野において公知の任意の方法によ
り実施され得、それらの方法としては以下が挙げられるがこれらに限定されない
:トランスフェクション、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション
、核酸配列を含むウイルスベクターまたはバクテリオファージベクターでの感染
、細胞融合、染色体媒介の遺伝子移入、マイクロセル(microcell)媒
介の遺伝子移入、スフェロプラスト融合など。外来遺伝子の細胞への導入につい
ては、当該分野において多数の技術が公知であり(例えば、Loefflerお
よびBehr,Meth.Enzymol.217:599−618(1993
);Cohenら,Meth.Enzymol.217:618−644(19
93);Cline,Pharmac.Ther.29:69−92m(198
5)を参照のこと)、そしてレシピエント細胞の必要な発生的および生理学的機
能が破壊されない場合、本発明に従って使用され得る。この技術は、核酸の細胞
への安定した移入を提供するはずであり、その結果、核酸は、細胞により発現可
能であり、そして好ましくは、その細胞の子孫により遺伝性でかつ発現可能であ
る。
【0314】 得られた組換え細胞は、当該分野において公知の様々な方法により、患者へ送
達され得る。組換え血球(例えば、造血幹細胞または造血前駆細胞)は、好まし
くは、静脈内に投与される。使用が考えられる細胞の量は、所望の効果、患者の
状態などに依存し、そして当業者により決定され得る。
【0315】 遺伝子治療の目的のために核酸が導入され得る細胞は、任意の所望の入手可能
な細胞型を包含し、そして以下を含むがそれらに限定されない:上皮細胞、内皮
細胞、ケラチノサイト、線維芽細胞、筋肉細胞、肝細胞;Tリンパ球、Bリンパ
球、単球、マクロファージ、好中球、好酸球、巨核球、顆粒球のような血球;種
々の幹細胞または前駆細胞、特に、造血幹細胞または造血前駆細胞(例えば、骨
髄、臍帯血、末梢血、胎児の肝臓などから得られるような細胞)。
【0316】 好ましい実施形態において、遺伝子治療に使用される細胞は、患者に対して自
己である。
【0317】 遺伝子治療において組換え細胞が使用される実施形態において、抗体をコード
する核酸配列は、細胞またはそれらの子孫により核酸配列が発現可能であるよう
に細胞に導入され、次いで組換え細胞は、治療的効果のためにインビボで投与さ
れる。特定の実施形態において、幹細胞または前駆細胞が用いられる。インビト
ロで単離され、かつインビトロで維持され得る任意の幹細胞および/または前駆
細胞は、本発明のこの実施形態に従って潜在的に使用され得る(例えば、PCT
公開第WO94/08598号:StempleおよびAnderson,Ce
ll 71:973−985(1992);Rheinwald,Meth.C
ell Bio.21A:229(1980);ならびにPittelkowお
よびScott,Mayo Clinic Proc.61:771(1986
)を参照のこと)。
【0318】 特定の実施形態において、遺伝子治療の目的で導入される核酸は、コード領域
に作動可能に連結された誘導性プロモーターを含有し、その結果、核酸の発現は
、適切な転写誘導因子の存在または非存在を制御することにより制御可能である
【0319】 本発明の化合物または薬学的組成物は、好ましくは、ヒトでの使用の前にイン
ビトロで、次いでインビボで、所望の治療活性または予防活性について試験され
る。例えば、化合物または薬学的組成物の、治療有用性または予防有用性を証明
するためのインビトロアッセイとしては、細胞株または患者組織サンプルに対す
る化合物の効果が挙げられる。細胞株および/または組織サンプルに対する化合
物または組成物の効果は、当業者に公知である技術(ロゼット形成アッセイおよ
び細胞溶解アッセイが挙げられるがこれらに限定されない)を利用して決定され
得る。本発明に従って、特定の化合物の投与が示されるかどうかを決定するため
に用いられ得るインビトロアッセイとしては、インビトロ細胞培養アッセイが挙
げられ、このアッセイでは、患者組織サンプルが培養において増殖され、そして
化合物に曝されるか、そうでなければ化合物が投与され、そして、組織サンプル
に対するそのような化合物の効果が観察される。
【0320】 (治療的/予防的な投与および組成物) 本発明は、被験体への有効量の本発明の化合物または薬学的組成物、好ましく
は本発明のポリペプチドまたは抗体の投与による処置、阻害および予防の方法を
提供する。好ましい局面において、化合物は実質的に精製される(例えば、その
効果を制限するかまたは望ましくない副作用を生じる物質を実質的に含まない)
。被験体は好ましくは、ウシ、ブタ、ウマ、ニワトリ、ネコ、イヌなどのような
動物が挙げられるがそれらに限定されない動物であり、そして好ましくは哺乳動
物であり、そして最も好ましくはヒトである。
【0321】 化合物が核酸または免疫グロブリンを含む場合に使用され得る処方および投与
方法は、上記に記載され;さらなる適切な処方および投与経路は、本明細書中で
以下に記載されたものの中から選択され得る。
【0322】 種々の送達システムが公知であり、そして本発明の化合物を投与するために用
いられ得る(例えば、リポソーム中でのカプセル化、微粒子、マイクロカプセル
、この化合物の発現が可能な組換え細胞、レセプター媒介エンドサイトーシス(
例えば、WuおよびWu,J.Biol.Chem.262:4429−443
2(1987)を参照のこと)、レトロウイルスまたは他のベクターの一部とし
ての核酸の構築など)。導入方法としては、皮内、筋内、腹腔内、静脈内、皮下
、鼻腔内、硬膜外、および経口の経路が挙げられるがそれらに限定されない。化
合物または組成物は、任意の好都合な経路により(例えば、注入またはボーラス
注射により、上皮または粘膜内層(例えば、口腔粘膜、直腸粘膜および腸粘膜な
ど)を通しての吸収により)投与され得、そして他の生物学的に活性な薬剤と一
緒に投与され得る。投与は、全身的または局所的であり得る。さらに、本発明の
薬学的化合物または組成物を、任意の適切な経路(脳室内注射および髄腔内注射
を包含し;脳室内注射は、例えば、Ommayaリザーバのようなリザーバに取
り付けられた脳室内カテーテルにより容易にされ得る)により中枢神経系に導入
することが望まれ得る。例えば、吸入器または噴霧器の使用、およびエアゾール
化剤を用いた処方により、肺投与もまた使用され得る。
【0323】 特定の実施形態において、本発明の薬学的化合物または組成物を、処置の必要
な領域に局所的に投与することが望まれ得る;これは、制限する目的ではないが
、例えば、手術中の局部注入、局所適用(例えば、手術後の創傷包帯と組み合わ
せて)により、注射により、カテーテルにより、坐剤により、またはインプラン
ト(このインプラントは、シアラスティック(sialastic)膜のような
膜または繊維を含む、多孔性、非多孔性、または膠様材料である)により達成さ
れ得る。好ましくは、抗体を含む本発明のタンパク質を投与する場合、タンパク
質が吸収されない材料を使用するために注意が払われなければならない。
【0324】 別の実施形態において、化合物または組成物は、小胞、特に、リポソーム中へ
送達され得る(Langer,Science 249:1527−1533(
1990);Treatら,Liposomes in the Therap
y of Infectious Disease and Cancer,L
opez−BeresteinおよびFidler(編),Liss,New
York,353〜365頁(1989);Lopez−Berestein,
同書317〜327頁を参照のこと;広く同書を参照のこと)。
【0325】 さらに別の実施形態において、化合物または組成物は制御された放出システム
中で送達され得る。1つの実施形態において、ポンプが用いられ得る(Lang
er(前出);Sefton,CRC Crit.Ref.Biomed.En
g.14:201(1987);Buchwaldら,Surgery 88:
507(1980);Saudekら,N.Engl.J.Med.321:5
74(1989)を参照のこと)。別の実施形態において、ポリマー材料が用い
られ得る(Medical Applications of Control
led Release,LangerおよびWise(編),CRC Pre
s.,Boca Raton,Florida(1974);Controll
ed Drug Bioavailability,Drug Product
Design and Performance,SmolenおよびBal
l(編),Wiley,New York(1984);RangerおよびP
eppas,J.、Macromol.Sci.Rev.Macromol.C
hem.23:61(1983)を参照のこと;Levyら,Science
228:190(1985);Duringら,Ann.Neurol.25:
351(1989);Howardら,J.Neurosurg.71:105
(1989)もまた参照のこと)。さらに別の実施形態において、制御された放
出システムは、治療標的、即ち、脳の近くに置かれ得、従って、全身用量の一部
のみを必要とする(例えば、Goodson,Medical Applica
tions of Controlled Release(前出),第2巻,
115〜138頁(1984)を参照のこと)。
【0326】 他の制御された放出システムは、Langerにより総説において議論される
(Science 249:1527−1533(1990))。
【0327】 本発明の化合物がタンパク質をコードする核酸である、具体的な実施形態にお
いて、その核酸は、それを適切な核酸発現ベクターの一部として構成し、そして
それが細胞内になるように投与することにより(例えば、レトロウイルスベクタ
ーの使用により(米国特許第4,980,286号を参照のこと)、または直接
注射により、または微粒子ボンバードメント(例えば、遺伝子銃;Biolis
tic,Dupont)の使用により、または脂質もしくは細胞表面レセプター
もしくはトランスフェクト剤でコーティングすることにより、または核に入るこ
とが公知であるホメオボックス様ペプチドと結合させて投与すること(例えば、
Joliotら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:18
64−1868(1991)を参照のこと)などにより、そのコードされたタン
パク質の発現を促進するようにインビボで投与され得る。あるいは、核酸は、細
胞内に導入され得、そして、発現のために相同組換えにより宿主細胞DNA内に
組み込まれ得る。
【0328】 本発明はまた、薬学的組成物を提供する。このような組成物は、治療有効量の
化合物、および薬学的に受容可能なキャリアを含む。具体的な実施形態において
、用語「薬学的に受容可能な」とは、動物における、そしてさらに特にヒトにお
ける使用のために、連邦規制当局もしくは米国政府により認められたか、または
米国薬局方もしくは他の一般に認められた薬局方に列挙されたことを意味する。
用語「キャリア」とは、治療剤とともに投与される、希釈剤、アジュバンド、賦
形剤、またはビヒクルをいう。このような薬学的なキャリアは、水および油(石
油起源、動物起源、植物起源、または合成起源の油(例えば、ピーナッツ油、大
豆油、鉱油、ゴマ油など)を含む)のような滅菌した液体であり得る。水は、薬
学的組成物が静脈内に投与される場合に、好ましいキャリアである。生理食塩水
溶液、ならびにデキストロースおよびグリセロールの水溶液はまた、特に注射可
能な溶液のために、液体キャリアとして使用され得る。適切な薬学的賦形剤とし
ては、デンプン、グルコース、ラクトース、スクロース、ゼラチン、麦芽、イネ
、フラワー、チョーク、シリカゲル、ステアリン酸ナトリウム、モノステアリン
酸グリセロール、滑石、塩化ナトリウム、脱脂粉乳、グリセロール、プロピレン
、グリコール、水、エタノールなどが挙げられる。組成物はまた、所望されるな
らば、少量の湿潤剤もしくは乳化剤、またはpH緩衝剤を含み得る。これらの組
成物は、液剤、懸濁剤、乳剤、錠剤、丸剤、カプセル剤、散剤、徐放性処方物な
どの形態を取り得る。この組成物は、従来の結合剤およびトリグリセリドのよう
なキャリアとともに、坐剤として処方され得る。経口処方物は、薬学的等級のマ
ンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナ
トリウム、セルロース、炭酸マグネシウムなどのような標準キャリアを含み得る
。適切な薬学的キャリアの例は、E.W.Martinによる「Remingt
on’s Pharmaceutical Sciences」に記載される。
このような組成物は、治療有効量の化合物を、好ましくは精製された形態で、適
切な量のキャリアとともに含んで、患者への適切な投与のための形態を提供する
。処方物は、投与形態に適するべきである。
【0329】 好ましい実施形態において、組成物は、慣用手順に従って、ヒトへの静脈内投
与のために採用された薬学的組成物として、処方される。代表的には、静脈内投
与のための組成物は、滅菌等張水性緩衝液の溶液である。必要な場合、組成物は
また、可溶化剤および注射の部位での痛みを緩和するリグノカインのような局部
麻酔を含み得る。一般的には、成分は、別々にかまたは単一投薬形態で一緒に混
合してのどちらかで、例えば、一定量の活性薬剤を示すアンプルまたは小袋(s
achette)のような密封された容器中の凍結乾燥粉末または水を含まない
濃縮物として供給される。組成物が注入により投与されるべき場合には、組成物
は、滅菌した薬学的等級の水または生理食塩水を含む注入ボトルに分配され得る
。組成物が注射により投与される場合、成分が投与の前に混合され得るように、
注射用滅菌水または生理食塩水のアンプルが提供され得る。
【0330】 本発明の化合物は、中性のまたは塩の形態として処方され得る。薬学的に受容
可能な塩としては、塩酸、リン酸、酢酸、シュウ酸、酒石酸などに由来するもの
のようなアニオンとともに形成される塩、およびナトリウム、カリウム、アンモ
ニウム、カルシウム、水酸化第2鉄、イソプロピルアミン、トリエチルアミン、
2−エチルアミノエタノール、ヒスチジン、プロカインなどに由来するもののよ
うなカチオンとともに形成される塩が挙げられる。
【0331】 本発明のポリペプチドの異常な発現および/または活性と関連する疾患または
障害の処置、抑制および予防において効果的である本発明の化合物の量は、標準
的な臨床技術により決定され得る。さらに、インビトロアッセイは、必要に応じ
て、最適な投薬量の範囲を同定するのを助けるために使用され得る。処方におい
て使用されるべき正確な用量はまた、投与の経路、および疾患または障害の重篤
さに依存し、そして開業医の判断および各患者の状況に従って決定されるべきで
ある。有効用量は、インビトロまたは動物モデル試験系から得られた用量反応曲
線から外插され得る。
【0332】 抗体に関して、患者に投与される投薬量は、代表的に、患者の体重1kgあた
り0.1mg〜100mgである。好ましくは、患者に投与される投薬量は、患
者の体重1kgあたり0.1mgと20mgとの間であり、より好ましくは、患
者の体重1kgあたり1mg〜10mgである。一般に、ヒト抗体は、外来ポリ
ペプチドへの免疫応答に起因して、他種由来の抗体よりもヒト体内で長い半減期
を有する。従って、ヒト抗体の低い投薬量および頻度の低い投与は、しばしば可
能である。さらに、本発明の抗体の投与の投薬量および頻度は、改変(例えば、
脂溶化(lipidation)のような)による抗体の取り込みおよび組織浸
透(例えば、脳への)を増強することにより減少され得る。
【0333】 本発明はまた、本発明の薬学的組成物の一つ以上の成分で満たされている一つ
以上の容器を備える薬学的パックまたはキットを提供する。薬学的製品または生
物学的製品の製造、使用または販売を規制している政府機関により規定される形
式における通告は、このような容器に、必要に応じて伴ない得る。この通告は、
ヒトの投与のための製造、使用または販売のこの機関による認可を反映する。
【0334】 (診断および画像化) 目的のポリペプチドに特異的に結合する標識化抗体、ならびにその誘導体およ
びそのアナログは、診断目的のために使用されて、本発明のポリペプチドの異常
な発現および/または活性に関連する疾患、障害および/または状態を検出、診
断またはモニターし得る。本発明は、目的のポリペプチドの異常な発現の検出に
ついて提供し、これは、(a)目的のポリペプチドに特異的な1つ以上の抗体を
使用して、個体の細胞または体液中の目的のポリペプチドの発現をアッセイする
工程、および(b)この遺伝子発現レベルと標準的な遺伝子発現のレベルを比較
する工程、を包含し、これによって、その標準的な発現レベルと比較されるアッ
セイされたポリペプチド遺伝子発現レベルの増加または減少が、異常な発現を示
す。
【0335】 本発明は、障害を診断するための診断アッセイを提供し、このアッセイは、(
a)目的のポリペプチドに特異的な1つ以上の抗体を使用して、個体の細胞また
は体液中の目的のポリペプチドの発現をアッセイする工程、および(b)この遺
伝子発現レベルと標準的な遺伝子発現のレベルを比較する工程、を包含し、これ
によって、その標準的な発現レベルと比較されるアッセイされたポリペプチド遺
伝子発現レベルの増加または減少が、特定の障害を示す。癌に関して、個体由来
の生検組織における比較的高い量の転写物の存在は、疾患の発生のための素因を
示し得るか、または実際の臨床症状の出現前に疾患を検出するための手段を提供
し得る。この型のより決定的な診断は、保健専門家に予防手段を使用させること
、または早期の積極的な処置を可能にし得、これにより、癌の発生またはさらな
る進行を予防する。
【0336】 本発明の抗体を使用して、当業者に公知の古典的な免疫組織学的方法を使用し
て生物学的サンプル中のタンパク質レベルをアッセイし得る(例えば、Jalk
anenら、J.Cell.Biol.101:976−985(1985);
Jalkanenら、J.Cell.Biol.105:3087−3096(
1987)を参照のこと)。タンパク質遺伝子発現を検出するために有用な、抗
体に基づく他の方法としては、イムノアッセイ(例えば、酵素結合イムノソルベ
ント検定法(ELISA)および放射免疫測定法(RIA))が挙げられる。適
切な抗体アッセイ標識は、当該分野において公知であり、そして酵素標識(例え
ば、グルコースオキシダーゼ);放射性同位体(例えば、ヨウ素(125I、1
21I)、炭素(14C)、硫黄(35S)、トリチウム(3H)、インジウム
(112In)、およびテクネチウム(99Tc));発光標識(例えば、ルミ
ノール);ならびに蛍光標識(例えば、フルオレセインおよびローダミン)、な
らびにビオチンが挙げられる。
【0337】 本発明の1つの局面は、動物、好ましくは哺乳動物、そして最も好ましくはヒ
トにおける、目的のポリペプチドの異常な発現と関連する疾患または障害の検出
および診断である。1つの実施形態において、診断は、a)目的のポリペプチド
に特異的に結合する有効量の標識化分子を被験体に(例えば、非経口的に、皮下
に、または腹腔内に)投与する工程;b)このポリペプチドが発現する被験体内
の部位でこの標識化分子が優先的に濃縮することを可能にするために(および結
合していない標識化分子がバックグラウンドレベルまで除去されるために)投与
後、時間間隔を待つ工程;c)バックグラウンドレベルを決定する工程;および
d)この被験体中の標識化分子を検出する工程、を包含し、その結果、このバッ
クグラウンドレベルを越える標識化分子の検出は、この被験体が目的のポリペプ
チドの異常な発現と関連する特定の疾患または障害を有することを示す。バック
グラウンドレベルは、特定の系について以前に決定された標準的な値と、検出さ
れた標識化分子の量を比較する工程を包含する種々の方法により決定され得る。
【0338】 被験体の大きさおよび使用される画像化システムが、診断の画像を産生するた
めに必要である画像化部分の量を決定するということは、当該分野において理解
される。放射性同位体部分の場合、ヒト被験体について、注入される放射能の量
は、通常、約5〜20mキュリーの範囲の99mTcである。次いで、標識化抗
体または標識化抗体フラグメントは、特定のタンパク質を含む細胞の位置で優先
的に蓄積する。インビボでの腫瘍の画像化は、S.W.Burchielら、「
Immunopharmacokinetics of Radiolabel
ed Antibodies and Their Fragments」(T
umor Imaging、第13章:The Radiochemical
Detection of Cancer,S.W.BurchielおよびB
.A.Rhodes編、Masson Publishing Inc.(19
82)において、記載される。
【0339】 使用する標識の型および投与の様式を含む、いくつかの変動に依存して、標識
化分子が被験体中の部位に優先的に濃縮することを可能にするため、および結合
していない標識化分子がバックグラウンドレベルまで除去されるための投与後の
時間間隔は、6〜48時間もしくは6〜24時間または6〜12時間である。別
の実施形態において、投与後の時間間隔は、5〜20日間または5〜10日間で
ある。
【0340】 1つの実施形態において、疾患および障害をモニターすることは、疾患または
障害(disease)を診断するための方法を繰り返すことによって実施され
る(例えば、最初の診断から1ヶ月後、最初の診断から6ヶ月後、最初の診断か
ら1年後、など)。
【0341】 標識化分子の存在は、インビボスキャニングについての当該分野で公知の方法
を使用して患者中で検出され得る。これらの方法は、使用される標識の型に依存
する。当業者は、特定の標識を決定するための適切な方法を決定することができ
る。本発明の診断方法において使用され得る方法およびデバイスは、コンピュー
タ連動断層撮影法(CT)、体全体のスキャン(例えば、陽子(positio
n)放射断層撮影法(PET))、磁気共鳴画像法(MRI)、および超音波診
断法を含むが、これらに限定されない。
【0342】 特定の実施形態において、分子を放射性同位体で標識し、そして放射応答外科
的機器(radiation responsive surgical in
strument)(Thurstonら、米国特許第5,441,050号)
を使用して患者中で検出する。別の実施形態において、分子を蛍光化合物で標識
し、そして蛍光応答スキャニング機器を使用して患者中で検出する。別の実施形
態において、分子を陽電子射出金属で標識し、そして陽電子射出断層撮影法を使
用して患者中で検出する。さらに別の実施形態において、分子を常磁性標識で標
識し、そして磁気共鳴画像法(MRI)を使用して患者中で検出する。
【0343】 (キット) 本発明は、上記の方法において使用され得るキットを提供する。1つの実施形
態において、キットは、1つ以上の容器において、本発明の抗体、好ましくは精
製した抗体を備える。特定の実施形態において、本発明のキットは、エピトープ
を含む実質的に単離されたポリペプチドを備える。このエピトープは、キット中
に含まれる抗体と特異的に免疫反応する。好ましくは、本発明のキットは、目的
のポリペプチドと反応しないコントロール抗体をさらに備える。別の特定の実施
形態において、本発明のキットは、目的のポリペプチドへの抗体の結合を検出す
るための手段を備える(例えば、この抗体は、検出可能な基質(例えば、蛍光化
合物、酵素基質、放射性化合物もしくは発光化合物)に結合体化され得るか、ま
たは一次抗体を認識する二次抗体が、検出可能な基質と結合体化され得る)。
【0344】 本発明の別の特定の実施形態において、キットは、増殖性および/または癌性
のポリヌクレオチドおよびポリペプチドに対して特異的な抗体を含む血清のスク
リーニングに使用するための診断キットである。このようなキットは、目的のポ
リペプチドと反応しないコントロール抗体を備え得る。このようなキットは、エ
ピトープを含む実質的に単離されたポリペプチド抗原を備え得る。このエピトー
プは、少なくとも1つの抗ポリペプチド抗原抗体と特異的に免疫反応する。さら
に、このようなキットは、抗原に対する上記の抗体の結合を検出するための手段
を備える(例えば、抗体は、蛍光化合物(例えば、フローサイトメトリーにより
検出され得るフルオレセインまはたローダミン)と結合体化され得る)。特定の
実施形態において、キットは、組換え的に産生されたポリペプチド抗原または化
学的に合成されたポリペプチド抗原を備え得る。キットのポリペプチド抗原はま
た、固体支持体に付着され得る。
【0345】 より特定の実施形態において、上記のキットの検出手段は、上記のポリペプチ
ド抗原が付着する固体支持体を備える。このようなキットはまた、非付着レポー
ター標識化抗ヒト抗体を備え得る。この実施形態において、ポリペプチド抗原へ
の抗体の結合は、上記のレポーター標識化抗体の結合によって検出され得る。
【0346】 さらなる実施形態において、本発明は、本発明のポリペプチドの抗原を含む血
清のスクリーニングにおいて使用するための、診断キットを含む。この診断キッ
トは、ポリペプチド抗原またはポリヌクレオチド抗原と特異的に免疫反応する実
質的に単離された抗体、およびこの抗体へのこのポリヌクレオチド抗原またはポ
リペプチド抗原の結合を検出するための手段を備える。1つの実施形態において
、抗体は、固体支持体に付着される。特定の実施形態において、抗体は、モノク
ローナル抗体であり得る。キットのこの検出手段は、二次標識化モノクローナル
抗体を含み得る。あるいは、またはさらに、この検出手段は、標識化競合抗原を
含み得る。
【0347】 1つの診断構成において、試験血清を、本発明の方法により得られる表面結合
抗原を有する固相試薬と反応させる。特定の抗原抗体とこの試薬との結合、およ
び洗浄することによる結合していない血清成分の除去の後、この試薬をレポータ
ー標識化抗ヒト抗体と反応させて、固体支持体上に、結合した抗抗原抗体の量に
比例して、この試薬にレポーターを結合させる。この試薬を再び洗浄して、結合
していない標識化抗体を除去し、そしてこの試薬と会合するレポーターの量を決
定する。代表的に、レポーターは、酵素であり、この酵素は、適切な蛍光性基質
、発光性基質または比色用基質(Sigma,St.Louis,MO)の存在
下で固相をインキュベートすることにより検出される。
【0348】 上記のアッセイにおける固体表面試薬は、タンパク質材料を固体支持体材料(
例えば、高分子ビーズ、計深棒、96ウェルプレートまたは濾過材料)に付着さ
せるための公知の技術により調製される。これらの付着方法としては、一般的に
、支持体へのタンパク質の非特異的な吸着または固体支持体上の化学的に反応性
の基(例えば、活性化カルボキシル基、ヒドロキシル基、またはアルデヒド基)
とのタンパク質の共有結合(covalent attachment)(代表
的には、遊離アミン基を介する)が挙げられる。あるいは、ストレプトアビジン
でコートされたプレートが、ビオチン化された抗原と共に使用され得る。
【0349】 従って、本発明は、この診断方法を行うためのアッセイ系またはキットを提供
する。このキットは、一般的に、表面結合された組換え抗原を有する支持体、お
よび表面結合された抗抗原抗体を検出するための、レポーター標識された抗ヒト
抗体を備える。
【0350】 (ポリヌクレオチドの使用) 本明細書中で同定された各々のポリヌクレオチドは、試薬として多数の方法に
おいて使用され得る。以下の説明は例示的であるとみなされるべきであり、そし
て公知の技術を利用する。
【0351】 本発明のポリヌクレオチドは、染色体同定のために有用である。実際の配列デ
ータ(反復多型性)に基づく染色体マーキング試薬は現在ほとんど利用可能では
ないため、新しい染色体マーカーを同定する必要性が存在するままである。各々
の配列は、個々のヒト染色体上の特定の位置に特に標的化され、そしてこの位置
にハイブリダイズされ得る。従って、本発明の各々のポリヌクレオチドは、当該
分野で公知の技術を用いて染色体マーカーとして慣用的に使用され得る。
【0352】 簡単に言うと、配列は、配列番号Xで示される配列からPCRプライマー(好
ましくは、少なくとも15bp(例えば、15〜25bp))を調製することに
よって染色体にマッピングされ得る。プライマーが、ゲノムDNA中の1つより
多くの予測されたエキソンにまたがらないように、プライマーは、コンピュータ
ー分析を使用して必要に応じて選択され得る。次いで、これらのプライマーは、
個々のヒト染色体を含む体細胞ハイブリッドのPCRスクリーニングのために使
用される。配列番号Xに対応するヒト遺伝子を含むハイブリッドのみが、増幅さ
れたフラグメントを産生する。
【0353】 同様に、体細胞ハイブリッドは、特定の染色体に対してポリヌクレオチドをP
CRマッピングする迅速な方法を提供する。単一のサーマルサイクラーを使用し
て1日あたり3つ以上のクローンが割り当てられ得る。さらに、ポリヌクレオチ
ドの下位位置決定(sublocalization)は、特定の染色体フラグ
メントのパネルを用いて達成され得る。使用され得る他の遺伝子マッピング戦略
は、インサイチュハイブリダイゼーション、標識フローソート(labeled
flow−sorted)染色体でのプレスクリーニング、染色体特異的cD
NAライブラリーを構築するためのハイブリダイゼーションによる前選択、およ
びコンピューターマッピング技術(例えば、その全体が本明細書中に参考として
援用される、Shuler,Trends Biotechnol 16:45
6−459(1998)を参照のこと)を含む。
【0354】 ポリヌクレオチドの正確な染色体位置はまた、中期染色体スプレッド(spr
ead)の蛍光インサイチュハイブリダイゼーション(FISH)を使用して獲
得され得る。この技術は500または600塩基ほどの短さのポリヌクレオチド
を使用する;しかし2,000〜4,000bpのポリヌクレオチドが好ましい
。この技術の総説に関しては、Vermaら、「Human Chromoso
mes:a Manual of Basic Techniques」,Pe
rgamon Press,New York (1988)を参照のこと。
【0355】 染色体マッピングについては、ポリヌクレオチドは、個々に(単一染色体また
はその染色体上の単一部位をマークするために)またはパネルで(複数部位およ
び/または複数染色体をマークするために)使用され得る。
【0356】 従って、本発明はまた、染色体の位置決定のための方法も提供し、この方法は
、(a)表1におけるポリヌクレオチド配列および配列番号XからPCRプライ
マーを調製する工程、ならびに(b)個々の染色体を含む体細胞ハイブリッドを
スクリーニングする工程を包含する。
【0357】 本発明のポリヌクレオチドは、同様に、放射線ハイブリッドマッピング、HA
PPYマッピング、および長範囲制限マッピングに有用である。これらの技術お
よび当該分野で公知の他の技術の概説について、例えば、Dear「Genom
e Mapping:A Practical Approach」IRL P
ress at Oxford University Press、Lond
on(1997);Aydin、J.Mol.Med.77:691〜694(
1999);Haciaら、Mol.Psychiatry 3:483〜49
2(1998);Herrickら、Chromosome Res.7:40
9〜423(1999);Hamiltonら、Methods Cell B
iol.62:265〜280(2000);および/またはOtt、J.He
red.90:68〜70(1999)(これらの各々は、その全体が参考とし
て本明細書中に援用される)を参照のこと。
【0358】 一旦、ポリヌクレオチドが正確な染色体位置にマップされると、ポリヌクレオ
チドの物理的位置は、連鎖分析において使用され得る。連鎖分析は、染色体位置
と特定の疾患の提示との間の同時遺伝(coinheritance)を確立す
る。(疾患マッピングデータは、例えば、V.McKusick,Mendel
ian Inheritance in Man(Johns Hopkins
University Welch Medical Libraryを通し
てオンラインで利用可能である)において見い出される)。1メガベースマッピ
ング解像度および20kbあたり1遺伝子と仮定すると、疾患と関連する染色体
領域に正確に位置決定されるcDNAは、50〜500の潜在的な原因遺伝子の
うちの1つであり得る。
【0359】 従って、一旦、同時遺伝が確立されると、罹患個体と非罹患個体との間での本
発明のポリヌクレオチドおよび対応する遺伝子における差異が試験され得る。ま
ず、染色体中の可視的構造変化(例えば、欠失または転座)は染色体スプレッド
において、またはPCRによって試験される。構造的変化が存在しない場合、点
変異の存在が確認される。何人かのまたは全ての罹患個体で観察されたが、正常
な個体では観察されなかった変異は、この変異がこの疾患を引き起こし得ること
を示す。しかし、いくつかの正常な個体由来のポリペプチドおよび対応する遺伝
子の完全な配列決定は、変異を多型性と区別するために要求される。新しい多型
性が同定される場合、この多型ポリペプチドはさらなる連鎖分析のために使用さ
れ得る。
【0360】 さらに、非罹患個体と比較した、罹患個体の遺伝子の増加または減少した発現
が、本発明のポリヌクレオチドを使用して評価され得る。任意のこれらの変化(
変化した発現、染色体再配置、または変異)は、診断マーカーまたは予後マーカ
ーとして使用され得る。
【0361】 従って、本発明はまた、障害の診断の間に有用な診断方法を提供し、この方法
は、個体由来の細胞または体液中の本発明のポリヌクレオチドの発現レベルを測
定する工程、および測定された遺伝子発現レベルを標準のポリヌクレオチド発現
レベルと比較する工程を包含し、これによって、標準と比較して、遺伝子発現レ
ベルの増加または減少が、障害の指標になる。
【0362】 なお別の実施形態では、本発明は、サンプルを、試験被験体に由来する増殖性
および/またはガン性のポリヌクレオチドの存在について分析するためのキット
を含む。一般的実施形態において、このキットは、本発明のポリヌクレオチドと
特異的にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む少なくとも1つのポリヌク
レオチドプローブ、および適切な容器を備える。特定の実施形態では、このキッ
トは、本発明のポリヌクレオチドの内部領域を規定する2つのポリヌクレオチド
プローブを含み、ここで各プローブは、この領域に対して内部に31’マー末端
を含む1つの鎖を有する。さらなる実施形態では、このプローブは、ポリメラー
ゼ連鎖反応増幅のためのプライマーとして有用であり得る。
【0363】 例えば、腫瘍の診断を含む、関連障害の診断が既に従来方法によって行われて
いる場合、本発明は、予後インジケーターとして有用であり、それによって増強
または抑制された本発明のポリヌクレオチドの発現を示す患者が、標準レベルに
より近いレベルでこの遺伝子を発現する患者と比較して悪い臨床結果を経験する
【0364】 「本発明のポリヌクレオチドの発現レベルを測定する(こと)」によって、本
発明のポリペプチドのレベルまたは本発明のポリペプチドをコードするmRNA
のレベルを、第1の生物学的サンプルにおいて直接的(例えば、絶対のタンパク
質レベルまたはmRNAレベルを決定または評価することによって)または相対
的(例えば、第2の生物学的サンプル中のポリペプチドレベルまたはmRNAレ
ベルに対して比較することによって)のいずれかで定性的または定量的に測定ま
たは評価することが意図される。好ましくは、第1の生物学的サンプル中のポリ
ペプチドレベルまたはmRNAレベルが測定または評価され、そして標準のポリ
ペプチドレベルまたはmRNAレベルに対して比較され、この標準は、関連障害
を有さない個体から得られる第2の生物学的サンプルから得られるかまたは関連
障害を有さない個体の集団由来のレベルを平均することによって決定される。当
該分野で認識されるように、一旦標準的なポリペプチドレベルまたはmRNAレ
ベルが公知になれば、これを、比較のための標準として反復して用い得る。
【0365】 「生物学的サンプル」によって、本発明のポリペプチドまたは対応するmRN
Aを含む、個体、体液、細胞株、組織培養物または他の供給源から得られる任意
の生物学的サンプルが意図される。示されるように、生物学的サンプルは、本発
明のポリペプチドを含む体液(例えば、精液、リンパ、血清、血漿、尿、滑液お
よび髄液)、本発明のポリペプチドを発現することが見出された組織供給源を含
む。哺乳動物から組織生検および体液を得るための方法は、当該分野で周知であ
る。生物学的サンプルがmRNAを含む場合、組織生検が好ましい供給源である
【0366】 上記で提供された方法は好ましくは、本発明のポリヌクレオチドおよび/また
はポリペプチドが固体支持体に結合される、診断方法および/またはキットに適
用され得る。1つの例示的な方法では、この支持体は、米国特許第5,837,
832号、同第5,874,219号および同第5,856,174号に記載さ
れる、「遺伝子チップ」または「生物学的チップ」であり得る。さらに、本発明
のポリヌクレオチドが結合されたこのような遺伝子チップを用いて、本発明の単
離された本発明のポリヌクレオチド配列と、試験被験体から単離されたポリヌク
レオチドとの間の多型性を同定し得る。このような多型の知識(すなわち、その
多型の位置、およびその多型の存在)は、多くの障害(例えば、神経障害、免疫
系障害、筋肉障害、生殖障害、胃腸障害、肺障害、心血管障害、腎障害、増殖性
障害、ならびに/または癌性疾患および癌性状態)について、疾患遺伝子座を同
定する際に有益である。このような方法は、米国特許第5,858,659号お
よび同第5,856,104号に記載される。上記に参照した米国特許は、その
全体が本明細書中に参考として援用される。
【0367】 本発明は、化学的に合成された、または、ペプチド核酸(PNA)として再現
された)または当該分野で公知の他の方法に従って、本発明のポリヌクレオチド
を包含する。PNAの使用は、本発明のポリヌクレオチドが固体支持体、または
、遺伝子チップに取り込まれる場合、好ましい形態として役立つ。本発明の目的
のために、ペプチド核酸(PNA)は、ポリアミド型のDNAアナログであり、
そしてアデニン、グアニン、チミンおよびシトシンについてのモノマー単位が市
販されている(Perceptive Biosystems)。DNAの特定
の成分(例えば、リン、酸化リンまたはデオキシリボース誘導体)は、PNA中
に存在しない。P.E.Nielsen,M.Egholm,R.H.Berg
およびO.Buchardt,Science 254,1497(1991)
;ならびにM.Egholm,O.Buchardt,L.Christens
en,C.Behrens,S.M.Freier,D.A.Driver,R
.H.Berg、S.K.Kim,B.NordenおよびP.E.Niels
en,Nature 365,666(1993)によって開示されるように、
PNAは、相補的なDNA鎖に対して特異的かつ緊密に結合し、そしてヌクレア
ーゼによって分解されない。実際、PNAは、DNA自体が結合するよりも強力
にDNAに結合する。これはおそらく、2つの鎖の間に静電斥力が存在せず、そ
してまたポリアミド骨格がより可撓性が高いことによる。これによって、PNA
/DNA二重鎖は、DNA/DNA二重鎖よりも広範囲のストリンジェンシー条
件下で結合し、多重鎖ハイブリダイゼーションを行うのをより容易にする。強力
な結合に起因して、DNAを用いてよりも小さいプローブが用いられ得る。さら
に、おそらく、単一の塩基ミスマッチが、PNA/DNAハイブリダイゼーショ
ンを用いて決定され得る。なぜなら、PNA/DNAの15マーにおける単一の
ミスマッチは、DNA/DNAの15マー二重鎖については4℃〜16℃である
のに対して、融点(T.sub.m)を8〜20℃低下させるからである。また
、PNA中に電荷基が存在しないことは、ハイブリダイゼーションが、低いイオ
ン強度で行われ得、そして分析の間の塩によって可能な妨害を減少させることを
意味する。
【0368】 本発明は、哺乳動物におけるガンの検出を含むがこれらに限定されない用途を
有する。特に、本発明は、以下を含むがこれらに限定されない、病理学的細胞増
殖新形成の診断の間に有用である:急性骨髄性白血病(急性単球性白血病、急性
骨髄芽球性白血病、急性前骨髄球性白血病、急性骨髄単球性白血病、急性赤白血
病、急性巨核球性白血病、および急性未分化白血病などを含む);および慢性骨
髄性白血病(慢性骨髄単球性白血病、慢性顆粒球性白血病などを含む)。好まし
い哺乳動物としては、有尾猿(monkey)、無尾猿(ape)、ネコ、イヌ
、ウシ、ブタ、ウマ、ウサギおよびヒトが挙げられる。特に好ましいのは、ヒト
である。
【0369】 病理学的細胞増殖障害はしばしば、原癌遺伝子の不適切な活性化に関連する(
Gelmann,E.P.ら,「The Etiology of Acute
Leukemia:Molecular Genetics and Vir
al Oncology」,Neoplastic Diseases of
the Blood,第1巻,Wiernik、P.H.ら編,161−182
(1985))。新形成は現在、ウイルス配列の染色体への挿入、より活性に転
写される領域への遺伝子の染色体転座、または何らかの他の機構による、正常な
細胞遺伝子産物の定性的変化から、または遺伝子発現の定量的改変から生じると
考えられている(Gelmannら、前出)。特定の遺伝子の変異または変更さ
れた発現が、他の組織および他の細胞型の中でも、いくつかの白血病の病因と関
与するようである(Gelmannら、前出)。実際、いくつかの動物新形成に
関与する癌遺伝子のヒト対応物は、ヒトの白血病および癌のいくつかの症例にお
いて増幅または転座されている(Gelmannら、前出)。
【0370】 例えば、c−myc発現は、非リンパ球性白血病細胞株HL−60において高
度に増幅される。HL−60細胞が増幅を止めるように化学的に誘導される場合
、c−mycのレベルは、ダウンレギュレートされることが見出される(国際公
開番号WO91/15580)。しかし、c−mycまたはc−mybの5’末
端に相補的であるDNA構築物へのHL−60細胞の暴露が、c−mycタンパ
ク質またはc−mybタンパク質の発現をダウンレギュレートする対応するmR
NAの翻訳をブロックし、処理した細胞の細胞増殖および分化の停止を引き起こ
すことが示されている(国際公開番号WO91/15580;Wickstro
mら、Proc.Natl.Acad.Sci.85:1028(1988);
Anfossiら、Proc.Natl.Acad.Sci.86:3379(
1989))。しかし、当業者は、増殖表現型を示すことが公知である種々の起
源の多数の細胞および細胞型を考慮すれば、本発明の有用性が造血性の細胞およ
び組織の増殖性障害の処置に限定されないことを認識する。
【0371】 前記に加えて、本発明のポリヌクレオチドは、三重らせん形成を通して、また
はアンチセンスDNAもしくはRNAを通して遺伝子発現を制御するために使用
され得る。アンチセンス技術は、例えば、Okano,J.Neurochem
.56:560(1991),「Oligodeoxynucleotides
as Antisense Inhibitors of Gene Exp
ression」,CRC Press,Boca Raton,FL(198
8)において考察される。三重らせん形成は例えば、Leeら、Nucleic
Acids Research 6:3073(1979);Cooneyら
、Science 241:456(1988);およびDervanら、Sc
ience 251:1360(1991)において考察される。両方の方法は
、相補的DNAまたは相補的RNAへのポリヌクレオチドの結合に依存する。こ
れらの技術に関して、好ましいポリヌクレオチドは通常、20〜40塩基長のオ
リゴヌクレオチドであり、そして転写に関与する遺伝子領域(三重らせん−Le
eら,Nucl.Acids Res.6:3073(1979);Coone
yら、Science 241:456(1988);およびDervanら、
Science 251:1360(1991)を参照のこと)またはmRNA
自体(アンチセンス−Okano,J.Neurochem.56:560(1
991);Oligodeoxy−nucleotides as Antis
ense Inhibitors of Gene Expression,C
RC Press,Boca Raton,FL(1988))のいずれかに相
補的である。三重らせん形成は、最適にはDNAからのRNA転写の遮断を生じ
るが、アンチセンスRNAハイブリダイゼーションは、ポリペプチドへのmRN
A分子の翻訳を阻止する。上記に記載のオリゴヌクレオチドはまた、アンチセン
スRNAまたはDNAが、インビボで発現されて本発明の抗原のポリペプチド産
生を阻害し得るように細胞に送達され得る。両方の技術は、モデル系において効
果的であり、そして本明細書に開示される情報は、疾患を処置するための試みに
おいて、特に、増殖性疾患および/または状態の処置のために、アンチセンスま
たは三重らせんポリヌクレオチドを設計するために使用され得る。
【0372】 本発明のポリヌクレオチドはまた、遺伝子治療において有用である。遺伝子治
療の1つの目標は、遺伝欠損を修正する試みにおいて、欠損遺伝子を有する生物
へ正常遺伝子を挿入することである。本発明に開示されるポリヌクレオチドは、
高度に正確な様式でこのような遺伝欠損を標的とする手段を提供する。別の目標
は、宿主ゲノム中には存在しなかった新しい遺伝子を挿入し、それによって宿主
細胞中に新しい形質を生成することである。
【0373】 ポリヌクレオチドはまた、微小な生物学的サンプルから個体を同定するために
有用である。例えば、米国軍は、その職員を同定するために制限フラグメント長
の多型性(RFLP)の使用を考慮している。この技術において、個体のゲノム
DNAは1つ以上の制限酵素で消化され、そして職員を同定するため固有なバン
ドを生じるためのサザンブロットについてプローブされる。この方法は、「認識
票(Dog tag)」(これは、失われたり、交換されたり、または盗まれた
りすることにより、ポジティブな同定を困難にし得る)の現在の限界を受けない
。本発明のポリヌクレオチドは、RFLPのためのさらなるDNAマーカーとし
て使用され得る。
【0374】 本発明のポリヌクレオチドはまた、個体のゲノムの選択された部分の実際の塩
基ごとのDNA配列を決定することによって、RFLPに対する代替物として使
用され得る。これらの配列は、このような選択されたDNAを増幅しそして単離
するためにPCRプライマーを調製するために使用され得、次いで、この選択さ
れたDNAは、配列決定され得る。各個体が固有のセットのDNA配列を有する
ので、この技術を使用して、個体が同定され得る。一旦、固有のIDデータベー
スが個体について確立されると、その個体が生存していようとまたは死亡してい
ようと、その個体のポジティブ同定が、極めて小さな組織サンプルからなされ得
る。
【0375】 法医学生物学もまた、本明細書に開示されるようなDNAに基づく同定技術を
使用して利益を得る。組織(例えば、髪または皮膚)、または体液(例えば、血
液、唾液、精液、滑液、羊水、乳汁、リンパ、肺痰(pulmonary sp
utum)またはサーファクタント、尿、糞便物質など)のような非常に小さな
生物学的サンプルから得られたDNA配列は、PCRを使用して増幅され得る。
ある先行技術において、DQaクラスII HLA遺伝子のような多型性遺伝子
座から増幅された遺伝子配列は、個体を同定するための法医学生物学において使
用される。(Erlich,H.,PCR Technology,Freem
an and Co.(1992))。一旦、これらの特異的多型性遺伝子座が
増幅されると、これらは1つ以上の制限酵素で消化される。これは、DQaクラ
スII HLA遺伝子に対応するDNAでプローブされたサザンブロットについ
てのバンドの同定セットを生じる。同様に、本発明のポリヌクレオチドは、法医
学的目的のための多型性マーカーとして使用され得る。
【0376】 また、特定の組織の供給源を同定し得る試薬についての必要性が存在する。例
えば、未知の起源の組織が提供される場合、法医学においてこのような必要性が
生じる。適切な試薬は、例えば、本発明の配列から調製される、DNAプローブ
またはプライマーを含み得る。このような試薬のパネルは、種および/または器
官型によって組織を同定し得る。同様の様式で、これらの試薬は、夾雑物につい
て組織培養物をスクリーニングするために使用され得る。
【0377】 本発明のポリヌクレオチドはまた、生物学的サンプル中に存在する組織または
細胞型の示差的同定のためのハイブリダイゼーションプローブとして有用である
。同様に、本発明のポリペプチドに関するポリペプチドおよび抗体は、組織(例
えば、免疫組織化学アッセイ)または細胞型(例えば、免疫細胞学アッセイ)の
示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。さらに、「標
準」遺伝子発現レベル(すなわち、障害を有しない個体由来の健康組織の発現レ
ベル)と比較して、上記の組織または細胞の多くの障害に対して、本発明のポリ
ヌクレオチド/ポリペプチドの有意に高いかまたは低いレベルの遺伝子発現が、
このような障害を有する個体から採取された特定の組織(例えば、本発明のポリ
ペプチドおよび/またはポリヌクレオチドを発現する組織、および/または癌性
組織および/または創傷組織)または体液(例えば、血清、血漿、尿、滑液また
は髄液)において検出され得る。
【0378】 従って、本発明は、以下の工程を含む障害の診断方法を提供する:(a)個体
の細胞または体液中の遺伝子発現レベルをアッセイする工程;(b)標準的な遺
伝子発現レベルと、この遺伝子発現レベルを比較し、それにより、標準の発現レ
ベルと比較して、アッセイされた遺伝子発現レベルの増加または減少が障害を示
す、工程。
【0379】 少なくとも、本発明のポリヌクレオドは、サザンブロットのゲル上の分子量マ
ーカーとして、特定の細胞型における特異的mRNAの存在についての診断プロ
ーブとして、新規のポリヌクレオドを発見するプロセスにおける「減算した(s
ubtract−out)」公知の配列に対するプローブとして、「遺伝子チッ
プ」または他の支持体に付着するためのオリゴマーを選択および作製するために
、DNA免疫技術を用いて抗DNA抗体を惹起するために、および免疫応答を惹
起する抗原として使用され得る。
【0380】 (ポリペプチドの使用) 本明細書中で同定される各々のポリペプチドは、多くの方法において使用され
得る。以下の記述は、例示として考慮されるべきであり、そして公知の技術を利
用する。
【0381】 本発明のポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織(
例えば、ABC免疫ペルオキシダーゼのような免疫組織化学アッセイ(Hsuら
、J.Histochem.cytochem.29:577−580(198
1))または細胞型(例えば、免疫細胞化学アッセイ)の示差的同定のための免
疫学的プローブを提供するために有用である。
【0382】 抗体を使用して、当業者に公知の古典的な免疫組織学的な方法を用いて、生物
学的サンプル中の本発明のポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドの
レベルをアッセイし得る。(例えば、Jalkanenら、J.Cell.Bi
ol.101:976−985(1985);Jalkanenら、J.Cel
l.Biol.105:3087−3096(1987)を参照のこと)。タン
パク質の遺伝子発現を検出するのに有用な、他の抗体に基づく方法には、免疫学
的検定(例えば、酵素結合イムノソルベント検定(ELISA)およびラジオイ
ムノアッセイ(RIA))が含まれる。適切な抗体アッセイの標識は、当該分野
で公知であり、そして酵素標識(例えば、グルコースオキシダーゼ);放射性同
位体(例えば、ヨウ素(131I、125I、123I、121I)、炭素( C)、硫黄(35S)、トリチウム(H)、インジウム(115mIn、 13m In、112In、111In)、およびテクネチウム(99Tc、99 Tc)、タリウム(201Tl)、ガリウム(68Ga、67Ga)、パラジ
ウム(103Pd)、モリブデン(99Mo)、キセノン(133Xe)、フッ
素(18F)、153Sm、177Lu、159Gd、149Pm、140La
175Yb、166Ho、90Y、47Sc、186Re、188Re、14 Pr、105Rh、97Ru;発光標識(例えば、ルミノール);ならびに蛍
光標識(例えば、フルオレセインおよびローダミン)ならびにビオチンが挙げら
れる。
【0383】 生物学的サンプル中の本発明のポリペプチドのレベルをアッセイすることに加
えて、タンパク質はまた、画像化によりインビボで検出され得る。タンパク質の
インビボ画像化のための抗体の標識またはマーカーは、X線撮影法、NMR、ま
たはESRにより検出可能なものを含む。X線撮影法のために適切な標識は、放
射性同位体(例えば、バリウムまたはセシウム)を含み、これは検出可能な放射
線を放射するが、被験体に対して明らかに有害ではない。NMRおよびESRの
ための適切なマーカーは、検出可能な特徴的なスピンを有するマーカー(例えば
、重水素)を含み、これは、関連するハイブリドーマのための栄養分を標識する
ことにより抗体中に取り込まれ得る。
【0384】 放射性同位体(例えば、131I、112In、99mTc、(131I、 25 I、123I、121I)、炭素(14C)、硫黄(35S)、トリチウム
H)、インジウム(115mIn、113mIn、112In、111In
)、およびテクネチウム(99Tc、99mTc)、タリウム(201Ti)、
ガリウム(68Ga、67Ga)、パラジウム(103Pd)、モリブデン( Mo)、キセノン(133Xe)、フッ素(18F)、153Sm、177
u、159Gd、149Pm、140La、175Yb、166Ho、90Y、47 Sc、186Re、188Re、142Pr、105Rh、97Ru)、放
射線不透過性物質、または核磁気共鳴により検出可能な材料のような適切な検出
可能な画像化部分で標識された、タンパク質特異的抗体または抗体フラグメント
は、免疫系の障害について検査されるべき哺乳動物に(例えば、非経口的、皮下
、または腹腔内に)導入される。被験体のサイズおよび用いられる画像化システ
ムは、診断画像を生成するために必要な画像化部分の量を決定することが当該分
野で理解される。放射性同位体部分の場合には、ヒト被験体について、注射され
る放射能の量は、通常、99mTcの約5〜20ミリキュリーの範囲である。次
いで、標識された抗体または抗体フラグメントは、本発明のポリヌクレオチドに
よりコードされるポリペプチドを発現する細胞の位置に優先的に蓄積される。イ
ンビボ腫瘍画像化は、S.W.Burchielら、「Immunopharm
acokinetics of Radiolabeled Antibodi
es and Their Fragments」(Tumor Imagin
gの第13章:The Radiochemical Detection o
f Cancer、S.W.BurchielおよびB.A.Rhodes編、
Masson Publishing Inc.(1982))に記載される。
【0385】 1つの実施形態において、本発明は、異種ポリペプチドまたは核酸と会合する
本発明のポリペプチド(例えば、本発明のポリヌクレオチドによりコードされる
ポリペプチドおよび/または抗体)を投与することによる、本発明の組成物の細
胞への特異的な送達のための方法を提供する。1つの例において、本発明は、治
療タンパク質を標的化細胞中へ送達するための方法を提供する。別の例において
、本発明は、一本鎖核酸(例えば、アンチセンスまたはリボザイム)または二本
鎖核酸(例えば、細胞のゲノムに組み込み得るか、またはエピソームにて複製し
得、そして転写され得るDNA)を、標的化細胞に送達するための方法を提供す
る。
【0386】 別の実施形態において、本発明は、毒素または細胞傷害性プロドラッグに関連
する本発明のポリペプチドを投与することによる細胞の特異的な破壊(例えば、
腫瘍細胞の破壊)のための方法を提供する。
【0387】 「毒素」とは、内因性の細胞傷害性エフェクタ系、放射性同位体、ホロ毒素(
holotoxin)、改変型毒素、毒素の触媒サブユニット、または規定の条
件下で細胞死を引き起こす細胞中もしくは細胞表面には通常存在しない任意の分
子もしくは酵素を結合および活性化する1つ以上の化合物を意味する。本発明の
方法に従って使用され得る毒素としては、以下が挙げられるが、これらに限定さ
れない:当該分野で公知の放射性同位体、固有のまたは誘導された内因性の細胞
傷害性エフェクタ系に結合する化合物(例えば、抗体(またはその補体固定含有
部分))、チミジンキナーゼ、エンドヌクレアーゼ、RNAse、α毒素、リシ
ン、アブリン、Pseudomonas外毒素A、ジフテリア毒素、サポリン、
モモルジン(momordin)、ゲロニン(gelonin)、ヤマゴボウ抗
ウイルスタンパク質、αサルシン(sarcin)およびコレラ毒素。「毒素」
はまた、細胞分裂停止剤もしくは細胞破壊剤、治療薬または放射活性金属イオン
(例えば、α−放射体(例えば、213Bi))もしくは他の放射性同位体(例
えば、103Pd、133Xe、131I、68Ge、57Co、65Zn、 Sr、32P、35S、90Y、153Sm、153Gd、169Yb、51 Cr、54Mn、75Se、113Sn、90イットリウム、117スズ、18 レニウム、166ホルミウム、および188レニウム);発光標識(例えば、
ルミノール);および蛍光標識(例えば、フルオレセインおよびローダミン)、
ならびにビオチンを含む。
【0388】 当該分野において公知の技術は、本発明のポリペプチド(抗体を含む)を標識
化するために適用され得る。このような技術としては、二官能性結合剤の使用(
例えば、米国特許第5,756,065号;同第5,714,631号;同第5
,696,239号;同第5,652,361号;同第5,505,931号;
同第5,489,425号;同第5,435,990号;同第5,428,13
9号;同第5,342,604号;同第5,274,119号;同第4,994
,560号;および同第5,808,003号を参照のこと;これら各々の内容
は、本明細書中に参考としてその全体を援用する)が挙げられるが、これに限定
されない。
【0389】 従って、本発明は、障害の診断方法を提供し、これは以下を含む:(a)個体
の細胞または体液における本発明のポリペプチドの発現レベルをアッセイする工
程;および(b)アッセイされたポリペプチドの発現レベルを標準のポリペプチ
ドの発現レベルと比較し、それによって標準の発現レベルと比較してアッセイさ
れたポリペプチドの発現レベルにおける増加または減少が障害を示す工程。癌に
関しては、個体由来の生検された組織中の相対的に高い量の転写物の存在は、疾
患の発症の素因を示し得るか、または実際の臨床的な症状が明らかとなる前に疾
患を検出するための手段を提供し得る。より決定的なこのタイプの診断は、保健
専門家がより早く予防策または積極的な処置を使用し、それによって癌の発症ま
たはさらなる進行を防ぐことを可能にし得る。
【0390】 さらに、本発明のポリペプチドを用いて疾患または状態(例えば、神経障害、
免疫系障害、筋肉障害、生殖障害、胃腸障害、肺障害、心血管障害、腎臓障害、
増殖障害ならびに/または癌性疾患および状態)を処置または予防し得る。例え
ば、患者は、ポリペプチドの非存在またはレベルの減少を元に戻すこと(例えば
、インスリン)、異なるポリペプチドの非存在またはレベルの減少を補充するこ
と(例えば、ヘモグロビンBに対するヘモグロビンS、SOD、カタラーゼ、D
NA修復タンパク質)、ポリペプチドの活性を阻害すること(例えば、癌遺伝子
または腫瘍抑制因子)、ポリペプチドの活性を活性化すること(例えば、レセプ
ターに結合することによって)、遊離リガンドについて膜結合レセプターと競合
させることによって膜結合レセプターの活性を減少させること(例えば、炎症を
低減させる際に用いられる可溶性TNFレセプター)、または所望の応答をもた
らすこと(例えば、血管の成長の阻害、増殖細胞または組織に対する免疫応答の
増強)の試みにおいて、本発明のポリペプチドが投与され得る。
【0391】 同様に、本発明のポリペプチドに対して指向される抗体もまた用いられ、疾患
(上記、および本明細書中のどこかに記載されるような)を処置し得る。例えば
、本発明のポリペプチドに対して指向される抗体の投与には、ポリペプチドを結
合して、そして/またはポリペプチドを中和し、そして/またはポリペプチドの
過剰産生を低減し得る。同様に、抗体の投与は、例えば、膜に結合したポリペプ
チド(レセプター)へ結合することにより、ポリペプチドを活性化し得る。
【0392】 少なくとも、本発明のポリペプチドは、当業者に周知の方法を用いるSDS−
PAGEゲルまたは分子ふるいゲル濾過カラムの分子量マーカーとして使用され
得る。宿主細胞の形質転換を評価する方法として、ポリペプチドがまた用いられ
、抗体を惹起し得、次いで、この抗体が使用され、組換え細胞からのタンパク質
発現を測定する。さらに、本発明のポリペプチドが使用され、以下の生物学的活
性を試験し得る。
【0393】 (診断アッセイ) 本発明の化合物は、哺乳動物(好ましくはヒト)における種々の障害の診断、
処置、予防および/または予測のために有用である。このような障害としては、
神経障害(例えば、以下の「神経活性および神経学的疾患」に記載される)、免
疫系の障害(例えば、以下の「免疫活性」に記載される)、筋肉障害(例えば、
以下の「神経活性および神経学的疾患」に記載される)、生殖障害(例えば、以
下の「抗新脈管形成活性」に記載される)、肺障害(例えば、以下の「免疫活性
」に記載される)、心血管障害(例えば、以下の「心臓血管障害」に記載される
)、感染性疾患(例えば、以下の「感染性疾患」に記載される)、増殖性障害(
例えば、以下の「過剰増殖性障害」、「抗新脈管形成活性」および「細胞レベル
での疾患」に記載される)、ならびに/または、癌性の疾患および障害(例えば
、以下の「過剰増殖性障害」、「抗新脈管形成活性」および「細胞レベルでの疾
患」に記載される)が挙げられるが、これらに限定されない。
【0394】 好ましい実施形態において、本発明の組成物(本発明のポリヌクレオチド、ポ
リペプチドおよび抗体、ならびにそのフラグメントおよび改変体を含む)は、心
臓血管傷害(例えば、高血圧症、心臓病、冠状動脈不全、勃起不全、高い血圧、
および/または以下の「心臓血管傷害」に記載されるような)、異常なプロテア
ーゼ活性、神経学的障害(例えば、不適切な神経発達、および/または以下の「
神経活性および神経学的疾患」に記載されるような)、過剰増殖性障害(例えば
、癌の転移、および/または以下の「過剰増殖性障害」に記載されるような)、
ならびに免疫系障害(例えば、炎症、および/または以下の「免疫活性」に記載
されるような)に関連する疾患および/または障害の診断、予後、予防、および
/または処置において、使用され得る。
【0395】 別の実施形態において、本発明のポリペプチド、またはこのポリペプチドに対
応するポリヌクレオチド、抗体、アゴニスト、またはアンタゴニストは、本発明
のポリペプチドが発現される組織に関連する障害を診断、予後、予防、および/
または処置するために、使用され得、このような組織としては、「本発明のポリ
ヌクレオチドおよびポリペプチド」に開示される組織、および/または表3、列
2(ライブラリーコード)に開示される、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もし
くはそれより多くの組織が挙げられる。多数の障害について、本発明のポリヌク
レオチドの発現の実質的に変更した(増大または減少した)レベルが、このよう
な障害を有する個体から得た細胞または体液(例えば、血清、血漿、尿、滑液ま
たは髄液)で、「標準」の遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体由
来の組織または体液中のCR発現レベルに比較して、検出され得る。従って、本
発明は、障害の診断中に有用な診断方法を提供し、この方法は、個体由来の組織
、細胞または体液での本発明のヒトポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベ
ルを測定する工程、および測定した遺伝子発現レベルを標準遺伝子発現レベルと
比較する工程を包含し、そのことにより、標準と比較される遺伝子発現レベルの
増加または減少が、障害の指標となる。これらの診断アッセイは、例えば、血液
サンプル、生検組織、または剖検組織などにおいて、インビボまたはインビトロ
で実施され得る。
【0396】 本発明はまた、予想指標として有用であり、これにより本発明の遺伝子発現の
上昇または低下を示す患者は、標準レベルに近いレベルで遺伝子を発現する患者
に対して悪い臨床結果を被る。
【0397】 「ポリペプチドをコードする遺伝子の発現レベルをアッセイする」とは、本発
明のヒトポリペプチドのレベル、または本発明のヒトポリペプチドをコードする
mRNAレベルを、第一の生物学的サンプルで、直接的(例えば、絶対タンパク
質レベルまたはmRNAレベルの決定または評価によって)または相対的(例え
ば、第二の生物学的サンプルのポリペプチドレベルまたはmRNAレベルに対す
る比較によって)に、定性または定量的に測定または評価することを意図する。
好ましくは、第一の生物学的サンプル中のポリペプチド発現レベルまたはmRN
Aレベルは、測定または評価され、そして標準ポリペプチドレベルまたはmRN
Aレベルと比較され、この標準は、障害を有さない個体から得た第二の生物学的
サンプルから得られるか、または免疫系の障害を有さない個体集団からのレベル
を平均して決定される。当該分野で理解されるように、一旦、標準ポリペプチド
レベルまたはmRNAレベルが判明すると、比較のための標準として繰り返し使
用され得る。
【0398】 「生物学的サンプル」とは、本発明のヒトポリペプチド(その一部を含む)ま
たはmRNAを含有する、個体、細胞株、組織培養物、またはその他の供給源か
ら得られた、任意の生物学的サンプルを意図する。示されるように、生物学的サ
ンプルとしては、本発明のポリペプチドの全長またはそのフラグメントを発現す
ることが見出された体液(例えば、血清、血漿、尿、滑液、および髄液)および
組織供給源が挙げられる。哺乳動物から組織生検および体液を得る方法は、当該
分野で周知である。生物学的サンプルが、mRNAを含む場合、組織生検が好ま
しい供給源である。
【0399】 全細胞RNAは、ChomczynskiおよびSacchi(Anal.B
iochem.162:156−159(1987))により記載される一段階
グアニジウム−チオシアネート−フェノール−クロロホルム方法のような任意の
適切な技術を用いて生物学的サンプルから単離され得る。次いで、本発明のヒト
ポリペプチドをコードするmRNAのレベルが、任意の適切な方法を用いてアッ
セイされる。これらは、ノーザンブロット分析、S1ヌクレアーゼマッピング、
ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、ポリメラーゼ連鎖反応と組み合わせた逆転写
(RT−RCR)、およびリガーゼ連鎖反応と組み合わせた逆転写(RT−LC
R)を包含する。
【0400】 本発明はまた、ポリペプチドの正常なレベルおよび異常なレベルの決定を含む
、生物学的サンプル(例えば、細胞および組織)中の本発明のポリペプチドのレ
ベルを検出する定量アッセイおよび診断アッセイのような診断アッセイに関する
。従って、例えば、正常なコントロール組織サンプルと比較した、本発明のポリ
ペプチドの過剰発現を検出するための本発明に従う診断アッセイは、腫瘍の存在
を検出するために使用され得る。宿主由来のサンプルにおいて、本発明のヒトポ
リペプチドのようなポリペプチドのレベルを決定するために使用され得るアッセ
イ技術は、当業者に周知である。このようなアッセイ方法としては、放射性免疫
アッセイ、競合結合アッセイ、ウエスタンブロット分析、およびELISAアッ
セイが挙げられる。生物学的サンプルにおける本発明のポリペプチドレベルのア
ッセイは、任意の当該分野に公知の方法を用いて可能である。
【0401】 生物学的サンプル中のポリペプチドレベルをアッセイすることは、抗体に基づ
く技術を用いて可能である。例えば、組織における本発明のポリペプチドの発現
は、古典的な免疫組織学的方法(Jalkanenら、J.Cell.Biol
.101:976−985(1985);Jalkanen、M.ら、J.Ce
ll.Biol.105:3087−3096(1987))を用いて研究され
得る。ポリペプチド遺伝子発現を検出するために有用な他の抗体に基づく方法は
、免疫アッセイ(例えば、酵素結合免疫吸着法(ELISA)および放射性免疫
アッセイ(RIA))を包含する。適切な抗体アッセイ標識は、当該分野で公知
であり、そして酵素標識(例えば、グルコースオキシダーゼ)および放射性同位
元素(例えば、ヨウ素(125I、121I)、炭素(14C)、硫黄(35
)、トリチウム(H)、インジウム(112In)、およびテクネチウム( 9m Tc)および蛍光標識(例えば、フルオレセインおよびローダミン)、なら
びにビオチンを包含する。
【0402】 分析されるべき組織または細胞型としては、一般的には、遺伝子を発現するこ
とが公知であるか、またはそのことが予測される組織または細胞型(例えば、癌
など)が挙げられる。本明細書中で使用されるタンパク質単離方法は、例えば、
HarlowおよびLane(Harlow,E.およびLane,D.,19
88「Antibodies:A Laboratory Manual」、C
old Spring Harbor Laboratory Press,C
old Spring Harbor,New York(これは、その全体が
本明細書中で参考として援用される))に記載される方法であり得る。単離され
た細胞は、細胞培養物または患者由来であり得る。培養物から採取された細胞の
分析は、細胞ベースの遺伝子治療技術の一部として、あるいは遺伝子の発現に対
する化合物の効果を試験するために使用され得る細胞の評価において必須の工程
であり得る。
【0403】 例えば、抗体または抗体のフラグメント(例えば、本明細書中に記載される)
を使用して、本発明の遺伝子産物あるいは保存された改変体もしくはそのペプチ
ドフラグメントの存在を定量的にまたは定性的に検出し得る。これは、例えば、
光学顕微鏡検出、フローサイトメトリー検出、または蛍光比色検出と一緒に蛍光
的に標識された抗体を使用する免疫蛍光技術によって達成され得る。
【0404】 好ましい実施形態において、本発明のポリペプチドの推定エピトープドメイン
の全てまたはいずれか1つに対する抗体、または抗体のフラグメントは、本発明
の遺伝子産物、またはその保存された改変体もしくはペプチドフラグメントの存
在を定量的にまたは定性的に検出するために用いられ得る。これは、例えば、光
学顕微鏡、フローサイトメトリー、または蛍光定量検出と組み合わせた、蛍光標
識した抗体を使用する免疫蛍光技術によって達成され得る。
【0405】 さらに好ましい実施形態において、本発明のポリペプチドの立体配置エピトー
プに対する抗体、または抗体のフラグメントは、本発明の遺伝子産物、またはそ
の保存された改変体もしくはペプチドフラグメントの存在を定量的にまたは定性
的に検出するために用いられ得る。これは、例えば、光学顕微鏡、フローサイト
メトリー、または蛍光定量検出と組み合わせた、蛍光標識した抗体を使用する免
疫蛍光技術によって達成され得る。
【0406】 本発明の抗体(またはそのフラグメント)、および/または本発明のポリペプ
チドは、本発明の遺伝子産物またはその保存された改変体もしくはそのペプチド
フラグメントのインサイチュ検出のために、免疫蛍光、免疫電子顕微鏡または非
免疫学的アッセイとしてさらに組織学的に使用され得る。インサイチュ検出は、
患者由来の組織学的標本を除去すること、およびそれに本発明の標識した抗体ま
たは本発明のポリペプチドを適用することによって達成され得る。抗体(または
フラグメント)またはポリペプチドは、好ましくは、生物学的サンプル上に標識
した抗体(またはフラグメント)を覆うことによって適用される。このような手
順の使用を通して、遺伝子産物、または保存された改変体もしくはペプチドフラ
グメント、あるいはポリペプチド結合の存在だけでなく、試験した組織における
その分布も決定することが可能である。本発明を使用して、当業者は、広範種々
の組織学的方法のいずれか(例えば、染色手順)が、例えば、インサイチュ検出
を達成するために変更され得ることを容易に理解する。
【0407】 本発明の遺伝子産物または保存された改変体もしくはそのペプチドフラグメン
トについての免疫アッセイおよび非免疫アッセイは、代表的に、本発明の遺伝子
産物または保存された改変体もしくはそのペプチドフラグメントを結合し得る検
出可能に標識された抗体の存在下で、サンプル(例えば、生物学的液体、組織抽
出物、新鮮な収集された細胞、または細胞培養においてインキュベートされた細
胞の溶解物)をインキュベートする工程、ならびに当該分野で周知の多数の技術
のいずれかによって結合した抗体を検出する工程を包含する。
【0408】 生物学的サンプルは、固相支持体またはキャリア(例えば、ニトロセルロース
)あるいは細胞、細胞粒子もしくは可溶性タンパク質を固定し得る他の固体支持
体と接触させられ得る。次いで、この支持体を、適切な緩衝液で洗浄し、続いて
、検出可能に標識された抗ポリペプチド抗体または検出可能なポリペプチドで処
理し得る。この固相支持体を、次いで、緩衝液で2回洗浄し、非結合の抗体また
はポリペプチドを除去し得る。必要に応じて、この抗体は、その後標識される。
次いで、固体支持体上の固定された標識の量は、従来の方法によって検出され得
る。
【0409】 「固相支持体またはキャリア」とは、抗原または抗体を結合し得る任意の支持
体を意図する。周知の支持体またはキャリアとしては、ガラス、ポリスチレン、
ポリプロピレン、ポリエチレン、デキストラン、ナイロン、アミラーゼ、天然の
および改変したセルロース、ポリアクリルアミド、斑糲岩、および磁鉄鉱が挙げ
られる。キャリアの性質は、本発明の目的のためにある程度可溶性であるかまた
は不溶性のいずれかであり得る。支持体材料は、結合した分子が、抗原または抗
体に結合し得る限り、実質的に任意の可能な構造配置を有し得る。従って、支持
体の構造は、ビーズの場合は球状、あるいは試験管の内表面またはロッドの外表
面の場合は円筒形であり得る。あるいは、表面は、平面(例えば、シート、試験
ストリップなど)であり得る。好ましい支持体は、ポリスチレンビーズを含む。
当業者には、抗体または抗原を結合し得る多くの他の適切なキャリアが公知であ
るか、または慣用的な実験の使用によって同一か確認することができる。
【0410】 本発明のポリペプチドに対する抗体または本発明の抗原ポリペプチドの所定の
ロットの結合活性は、周知の方法に従って決定され得る。当業者は、慣用的な実
験を使用することによって各々の決定のための有効でかつ最適のアッセイ条件を
決定し得る。
【0411】 個体から得られた生物学的サンプルにおいて本発明のポリペプチドレベルまた
はポリヌクレオチドレベルをアッセイすることに加えて、ポリペプチドまたはポ
リヌクレオチドは、画像化によってインビボでも検出され得る。例えば、本発明
の1つの実施形態において、本発明のポリペプチドおよび/または本発明の抗体
は、疾患の細胞(例えば、新生物)を画像化するために使用される。別の実施形
態において、本発明のポリヌクレオチド(例えば、特定のmRNA転写物の、全
体または部分に相補的なポリヌクレオチド)ならびに/あるいは抗体(例えば、
本発明のポリペプチドのエピトープのいずれか1つまたは組み合わせに対する抗
体、本発明のポリペプチドの構成的エピトープに対する抗体、または哺乳動物細
胞の細胞表面上で発現された全長ポリペプチドに対する抗体)は、疾患細胞また
は新生物細胞を画像化するために使用される。
【0412】 本発明のポリペプチドをインビボで画像化するための抗体標識またはマーカー
は、X線撮影、NMR、MRI、CATスキャンもしくはESRにより検出可能
なものが挙げられる。X線撮影のために、適切な標識としては、検出可能な放射
線を放射するが被験体に対して明らかに有害でない、放射線同位元素(例えば、
バリウムまたはセシウム)が挙げられる。NMRおよびESRのための適切なマ
ーカーとしては、検出可能な特徴的なスピンを有するマーカー(例えば、重水素
)が挙げられ、これらは、関連のハイブリドーマのための栄養素の標識化により
抗体に取り込まれ得る。インビボ画像化がヒトにおける診断のために本発明のポ
リペプチドの増強されたレベルを検出するために使用される場合、ヒト抗体また
は「ヒト化」キメラモノクローナル抗体を使用することが好ましくあり得る。そ
のような抗体は、本明細書中に記載されるかさもなくば当該分野で公知の技術を
用いて産生され得る。例えば、キメラ抗体を作製するための方法は、当該分野で
公知である。総説については、Morrison,Science 229:1
202(1985);Oiら、BioTechniques 4:214(19
86);Cabillyら、米国特許第4,816,567号;Taniguc
hiら、EP 171496;Morrisonら、EP 173494;Ne
ubergerら、WO 8601533;Robinsonら、WO 870
2671;Boulianneら、Nature 312:643(1984)
;Neubergerら、Nature 314:268(1985)を参照の
こと。
【0413】 さらに、存在が検出され得る本発明の任意のポリペプチドが、投与され得る。
例えば、放射性不透過性(radio−opaque)化合物または他の適切な
化合物で標識された本発明のポリペプチドは、投与され、標識抗体に関して上記
に記載されるようにインビボで画像化され得る。さらにこのようなポリペプチド
は、インビトロ診断手順のために使用され得る。
【0414】 適切な検出可能な画像化部分(例えば、放射性同位元素(例えば、131I、112 In、99mTc)、放射線不透過性物質、または核磁気共鳴により検出
可能な材料)で標識された、本発明のポリペプチド特異的抗体または抗体フラグ
メントが、免疫系障害について試験される哺乳動物に(例えば、非経口で、皮下
で、もしくは腹腔内で)導入される。被験体および使用される画像化システムの
大きさが、診断画像を生じるのに必要とされる画像化部分の量を決定することは
、当該分野で理解される。放射線同位元素部分の場合、ヒト被験体については、
注入される放射能の量は、通常、約5〜20ミリキュリーの99mTcの範囲で
ある。標識された抗体または抗体フラグメントは、次いで、標的タンパク質を含
む細胞の位置に優先的に蓄積する。インビボ腫瘍イメージングは、S.W.Bu
rchielら、「Immunopharmacokinetics of R
adiolabeled Antibodies and Their Fra
gment」により記載される(Tumor Imaging:The Rad
iochemical Detection of Cancer、S.W.B
urchielおよびB.A.Rhodes編、Masson Publish
ing Inc.(1982)の13章)。
【0415】 抗体に関して、ポリペプチド特異的抗体が検出可能に標識され得る1つの方法
は、これらを酵素へ連結し、そしてこの連結された産物を酵素免疫アッセイ(E
IA)に用いることによる(Voller,A.「The Enzyme Li
nked Immunosorbent Assay(ELISA)」1978
、Diagnostic Horizons 2:1−7、Microbiol
ogical Associates Quarterly Publicat
ion、Walkersville、MD);Vollerら、J.Clin.
Pathol.31:507−520(1978);Butler,J.E.、
Meth.Enzymol.73:482−523(1981);Maggio
,E.(編)1980、Enzyme Immunoassay、CRC Pr
ess、Boca Raton、FL;Ishikawa,E.ら(編)198
1、Enzyme Immunoassay、Kgaku Shoin、Tok
yo)。抗体に結合する酵素は、適切な基質(好ましくは色素基質)と、例えば
、分光光度法、蛍光法または可視手段によって検出され得る化学部分を生成する
ような様式で反応する。抗体を検出可能に標識するために使用される酵素として
は、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ、ブドウ球菌ヌクレアーゼ、δ−5−ステロイド
イソメラーゼ、酵母アルコールデヒドロゲナーゼ、α−グリセロホスフェート、
デヒドロゲナーゼ、トリオースホスフェートイソメラーゼ、西洋ワサビペルオキ
シダーゼ、アルカリホスファターゼ、アスパラギナーゼ、グルコースオキシダー
ゼ、β−ガラクトシダーゼ、リボヌクレアーゼ、ウレアーゼ、カタラーゼ、グル
コース−6−リン酸デヒドロゲナーゼ、グルコアミラーゼおよびアセチルコリン
エステラーゼが挙げられるが、これらに限定されない。さらに、この検出は、こ
の酵素に対する色素基質を用いる比色方法によって達成され得る。検出はまた、
同様に調製された標準物質と比較して、基質の酵素反応の程度を視覚的に比較す
ることによって達成され得る。
【0416】 検出はまた、種々の他の免疫アッセイのいずれかを用いて達成され得る。例え
ば、抗体または抗体フラグメントを放射性標識することによって、ラジオイムノ
アッセイ(RIA)の使用を介して本発明のポリペプチドを検出することが可能
である(例えば、Weintraub,B.,Principles of R
adioimmunoassays,Seventh Training Co
urse on Radioligand Assay Techniques
,The Endocrine Society,March,1986を参照
のこと(これは、本明細書中に参考として援用される))。放射性同位元素は、
γカウンター、シンチレーションカウンター、またはオードラジオグラフィーを
含む手段によって検出され得るが、これらに限定されない。
【0417】 抗体を蛍光化合物で標識することもまた可能である。蛍光標識された抗体が適
切な波長の光に曝露される場合、次いでその存在は、蛍光に起因して検出され得
る。最も一般的に使用される蛍光標識化合物の間では、フルオレセインイソチオ
シアネート、ローダミン、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシア
ニン、o−フタルアルデヒド(ophthaldehyde)およびフルオレサ
ミンがある。
【0418】 抗体はまた、152Euまたは他のランタニド系列のような蛍光発光金属を用
いて検出可能に標識され得る。これらの金属は、ジエチレントリアミンペンタ酢
酸(DTPA)またはエチレンジアミンテトラ酢酸(ETDA)のような金属キ
レート群を用いて抗体に結合され得る。
【0419】 抗体はまた、化学発光化合物に結合することによって検出可能に標識され得る
。次いで、化学発光タグ化抗体の存在は、化学反応の経過の間に生じる発光の存
在を検出することによって決定される。特に有用な化学発光標識化合物の例は、
ルミノール、イソルミノール、セロマティックアクリジニウムエステル(the
romatic acridinium ester)、イミダゾール、アクリ
ジニウム塩およびオキサレートエステルである。
【0420】 同様に、生物発光化合物を使用して、本発明の抗体を標識し得る。生物発光は
、触媒タンパク質が化学発光反応の効率を増加する生物系において見出される化
学発光の型である。生物発光タンパク質の存在は、発光の存在を検出することに
よって決定される。標識目的のための重要な生物発光化合物は、ルシフェリン、
ルシフェラーゼおよびエクオリンである。
【0421】 (疾患を検出するための方法) 概して、疾患は、患者から得られた生物学的サンプル(例えば、血液、血清、
尿、および/または腫瘍生検)中の本発明のタンパク質および/またはこのよう
なタンパク質をコードするポリヌクレオチドの1つ以上の存在に基づき患者にお
いて検出され得る。言い換えれば、このようなタンパク質は、疾患または障害(
癌および/または本明細書のいずれかに記載のものを含む)の存在または非存在
を示すマーカーとして用いられ得る。さらに、このようなタンパク質は、他の疾
患および癌の検出に有用であり得る。本明細書に提供される結合剤は、概して生
物学的サンプル中でこの薬剤に結合する抗原のレベルの検出を可能にする。ポリ
ヌクレオチドプライマーおよびプローブは、本発明のポリペプチドをコードする
mRNA(これは、また癌を含む疾患または障害の存在または非存在の指標であ
る)のレベルを検出するために用いられ得る。一般に、本発明のポリペプチドは
、正常組織よりも疾患組織で少なくとも3倍高いレベルで存在するはずである。
【0422】 サンプル中でポリペプチドマーカーを検出するための結合剤を用いるための当
業者に公知の種々のアッセイ形式が存在する。例えば、HarlowおよびLa
ne(前出)を参照のこと。概して、患者における疾患の存在または非存在は、
以下(a)患者から得た生物学的サンプルを結合剤と接触させる工程;(b)こ
の結合剤に結合するポリペプチドのレベルをサンプル中で検出する工程;および
(c)ポリペプチドのレベルを事前に決定したカットオフ値と比較する工程、に
より検出され得る。
【0423】 好ましい実施形態において、このアッセイは、本発明のポリペプチドに結合し
そしてそのサンプル中の残余物からこのポリペプチドを取り出すために、固体支
持体に固定した結合因子の使用を含む。次いで、この結合したポリペプチドは、
レポーター基を含みそして結合因子/ポリペプチド複合体に特異的に結合する検
出試薬を使用して、検出され得る。このような検出試薬は、例えば、このポリペ
プチドに特異的に結合する結合因子あるいはこの結合因子に特異的に結合する抗
体または他の因子(例えば、抗免疫グロブリン、プロテインG、プロテインAま
たはレクチン)を含み得る。あるいは、競合アッセイを使用し、ここで、ポリペ
プチドは、レポーター基で標識され、そしてサンプルとのその固定された結合因
子のインキュベーション後にその結合因子に結合させる。サンプルの成分がその
結合因子への標識ポリペプチドの結合を阻害する程度は、その固定された結合因
子とのサンプルの反応性を示す。このようなアッセイにおける使用に適切なポリ
ペプチドとしては、本発明のポリペプチドおよびそれらの部分、あるいは抗体が
挙げられ、上記のように、これらに対して結合因子が結合する。
【0424】 固体支持体は、本発明のポリペプチドが付着され得る、当業者に公知の任意の
材料であり得る。例えば、固体支持体は、マイクロタイタープレート中の試験ウ
ェルあるいはニトロセルロースまたは他の適切な膜であり得る。あるいは、この
支持体は、ビーズまたはディスク(例えば、ガラスファイバーガラス、ラテック
スまたはプラスチック材料(例えば、ポリスチレンまたはポリ塩化ビニル))で
あり得る。支持体はまた、磁気粒子または光ファイバーセンサー(例えば、米国
特許第5,359,681号に開示されるような)であり得る。結合因子は、当
業者に公知の種々の技術(これらは、特許および科学文献に十分記載される)を
使用して固体支持体に固定され得る。本発明の状況下で、用語「固定」とは、非
共有結合会合(例えば、吸着)および共有結合会合(これは、因子と支持体上の
官能基との間の直接連結であり得るか、または架橋剤による連結であり得る)の
両方をいう。マイクロタイタープレート中のウェルまたは膜への吸着による固定
化が、好ましい。このような場合において、吸着は、結合因子を、適切な緩衝液
中で、固体支持体に適切な時間で接触させることによって達成され得る。接触時
間は、温度と共に変化するが、代表的には、約1時間〜約1日である。一般に、
約10ng〜約10μg(好ましくは、約100ng〜約1μg)の範囲の量の
結合因子をプラスチックマイクロタイタープレートのウェル(例えば、ポリスチ
レンまたはポリ塩化ビニル)に接触させることが、十分な量の結合因子を固定す
るのに十分である。
【0425】 固体支持体への結合因子の共有結合付着は、一般に、支持体を二官能性試薬と
最初に反応させることにより達成され得る。この試薬は、支持体および結合因子
上の官能基(例えば、ヒドロキシル基またはアミノ基)の両方と反応する。例え
ば、結合因子は、ベンゾキノンを使用してか、またはこの結合パートナー上のア
ミンおよび活性水素との支持体上のアルデヒド基の縮合によって、適切なポリマ
ーコーティングを有する支持体に共有結合的に付着され得る(例えば、Pier
ce Immunotechnology Catalog and Hand
book、1991、A12−A13)。
【0426】 (遺伝子治療方法) 本発明の別の局面は、障害、疾患および状態を処置または予防するための遺伝
子治療方法である。この遺伝子治療方法は、本発明のポリペプチドの発現を達成
するための、核酸(DNA、RNAおよびアンチセンスDNAまたはRNA)配
列の動物への導入に関する。この方法は、標的組織によるこのポリペプチドの発
現のために必要なプロモーターおよび他の任意の遺伝因子と、作動可能に連結し
た本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを必要とする。このよう
な遺伝子治療および送達技術は当該分野において公知である(例えば、本明細書
中に参考として援用される、WO90/11092を参照のこと)。
【0427】 従って、例えば、患者由来の細胞は、エキソビボで本発明のポリヌクレオチド
と作動可能に連結したプロモーターを含むポリヌクレオチド(DNAまたはRN
A)を用いて操作され得、次いで、操作された細胞は、本発明のポリペプチドを
用いて処置される患者に提供される。このような方法は、当該分野において周知
である。例えば、Belldegrun,A.ら、J.Natl.Cancer
Inst.85:207−216(1993);Ferrantini,M.
ら、Cancer Research 53:1107−1112(1993)
;Ferrantini,M.ら、J.Immunology 153:460
4−4615(1994);Kaido,T.ら、Int.J.Cancer
60:221−229(1995);Ogura,H.ら、Cancer Re
search 50:5102−5106(1990);Santodonat
o,L.ら、Human Gene Therapy 7:1−10(1996
);Santodonato,L.ら、Gene Therapy 4:124
6−1255(1997);およびZhang,J.−F.ら、Cancer
Gene Therapy 3:31−38(1996)を参照のこと。これら
は、本明細書中に参考として援用される。1つの実施形態においては、操作され
る細胞は、動脈細胞である。この動脈細胞は、動脈、動脈の周囲の組織への直接
的な注射を介して、またはカテーテル注入を介して患者に再導入され得る。
【0428】 以下により詳細に考察されるように、このポリヌクレオチド構築物は、注射可
能な物質を動物の細胞に送達する任意の方法(例えば、組織(心臓、筋肉、皮膚
、肺、肝臓など)の間質空間への注射)により送達され得る。このポリヌクレオ
チド構築物は、薬学的に受容可能な液体または水性のキャリア中で送達され得る
【0429】 1つの実施形態においては、本発明のポリヌクレオチドは、裸のポリヌクレオ
チドとして送達される。用語「裸の」ポリヌクレオチド、DNAまたはRNAと
は、細胞への侵入を補助し、促進し、または容易にするために作用するいかなる
送達ビヒクル(ウイルス配列、ウイルス粒子、リポソーム処方物、リポフェクチ
ンまたは沈殿剤などを含む)も含まない配列をいう。しかし、本発明のポリヌク
レオチドはまた、当業者に周知の方法により調製され得るリポソーム処方物中お
よびリポフェクチン処方物中などで送達され得る。このような方法は、例えば、
米国特許第5,593,972号、同第5,589,466号および同第5,5
80,859号(これらは、本明細書中に参考として援用される)に記載される
【0430】 遺伝子治療方法において使用されるポリヌクレオチドベクター構築物は、好ま
しくは、宿主ゲノム中に組み込まれないかまたは複製を可能にする配列を含まな
い構築物である。適切なベクターとしては、Stratageneから入手可能
なpWLNEO、pSV2CAT、pOG44、pXT1およびpSG;Pha
rmaciaから入手可能なpSVK3、pBPV、pMSGおよびpSVL;
ならびにInvitrogenから入手可能なpEF1/V5、pcDNA3.
1、およびpRc/CMV2が挙げられる。他の適切なベクターは、当業者に容
易に明らかである。
【0431】 当業者に公知の任意の強力なプロモーターは、ポリヌクレオチド配列の発現を
駆動するために用いられ得る。適切なプロモーターとしては、アデノウイルスプ
ロモーター(例えば、アデノウイルス主要後期プロモーター);または異種プロ
モーター(例えば、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター);RSウイ
ルス(RSV)プロモーター;誘導性プロモーター(例えば、MMTプロモータ
ー、メタロチオネインプロモーター);熱ショックプロモーター;アルブミンプ
ロモーター;ApoAIプロモーター;ヒトグロビンプロモーター;ウイルスチ
ミジンキナーゼプロモーター(例えば、単純ヘルペスチミジンキナーゼプロモー
ター);レトロウイルスLTR;b−アクチンプロモーター;およびヒト成長ホ
ルモンプロモーターが挙げられる。このプロモーターはまた、本発明のポリヌク
レオチドについてネイティブなプロモーターであり得る。
【0432】 他の遺伝子治療技術とは異なり、裸の核酸配列を標的細胞に導入する1つの主
要な利点は、その細胞におけるポリヌクレオチド合成の一過性の性質である。研
究によって、非複製DNA配列が細胞に導入されて、6ヶ月までの期間の間、所
望のポリペプチドの産生を提供し得ることが示された。
【0433】 ポリヌクレオチド構築物は、動物内の組織(筋肉、皮膚、脳、肺、肝臓、脾臓
、骨髄、胸腺、心臓、リンパ、血液、骨、軟骨、膵臓、腎臓、胆嚢、胃、腸、精
巣、卵巣、子宮、直腸、神経系、眼、腺、および結合組織を包含する)の間隙空
間に送達され得る。この組織の間隙空間は、器官組織の細網線維間の、細胞間の
液体ムコ多糖類基質、血管または室の壁における弾性線維、線維性組織のコラー
ゲン線維、あるいは結合組織鞘性筋肉細胞(connective tissu
e ensheathing muscle cell)内または骨の裂孔中の
同じ基質を包含する。これは、同様に、循環の血漿およびリンパチャンネルのリ
ンパ液により占められた空間である。筋肉組織の間隙空間への送達は、以下で議
論される理由のために好ましい。それらは、これらの細胞を含む組織への注射に
よって、好都合に送達され得る。それらは、好ましくは、分化した持続性の非分
裂細胞に送達され、そしてその細胞において発現されるが、送達および発現は、
非分化細胞または完全には分化していない細胞(例えば、血液の幹細胞または皮
膚線維芽細胞)において達成され得る。インビボでの筋肉細胞は、ポリヌクレオ
チドを取り込み、そして発現する能力において、特に適格である。
【0434】 裸の核酸配列注射のために、DNAまたはRNAの有効投薬量は、約0.05
mg/kg体重から約50mg/kg体重の範囲にある。好ましくは、この投薬
量は、約0.005mg/kgから約20mg/kgであり、そしてより好まし
くは約0.05mg/kgから約5mg/kgである。もちろん、当業者が認識
するように、この投薬量は、注射の組織部位に応じて変化する。核酸配列の適切
かつ有効な投薬量は、当業者によって容易に決定され得、そして処置される状態
および投与経路に依存し得る。
【0435】 好ましい投与経路は、組織の間隙空間への非経口注射経路による。しかし、他
の非経口経路もまた用いられ得、これには、例えば、特に、肺または気管支の組
織、咽喉または鼻の粘膜への送達のためのエアロゾル処方物の吸入が挙げられる
。さらに、裸のDNA構築物が、血管形成術の間にこの手順において用いられる
カテーテルによって動脈に送達され得る。
【0436】 裸のポリヌクレオチドは、送達部位での直接の針注射、静脈内注射、局所投与
、カテーテル注入、およびいわゆる「遺伝子銃」を含むがこれらに限定されない
、当該分野で公知の任意の方法によって送達される。これらの送達方法は、当該
分野で公知である。
【0437】 この構築物はまた、ウイルス配列、ウイルス粒子、リポソーム処方物、リポフ
ェクチン、沈殿剤などのような送達ビヒクルを用いて送達され得る。このような
送達方法は、当該分野で公知である。
【0438】 特定の実施形態において、ポリヌクレオチド構築物は、リポソーム調製物中で
複合体化している。本発明にて使用するためのリポソーム調製物は、カチオン性
(正に荷電した)、アニオン性(負に荷電した)および中性の調製物を包含する
。しかしながら、カチオン性リポソームとポリアニオン性核酸との間で強固な荷
電複合体を形成し得るので、カチオン性リポソームが特に好ましい。カチオン性
リポソームは、機能的形態において、プラスミドDNA(本明細書中で参考とし
て援用される、Felgnerら、Proc.Natl.Acad.Sci.U
SA(1987)84:7413〜7416);mRNA(本明細書中で参考と
して援用される、Maloneら、Proc.Natl.Acad.Sci.U
SA(1989)86:6077〜6081);および精製された転写因子(本
明細書中で参考として援用される、Debsら、J.Biol.Chem.(1
990)265:10189〜10192)の細胞内送達を媒介することが示さ
れている。
【0439】 カチオン性リポソームは容易に入手可能である。例えば、N[1−2,3−ジ
オレイルオキシ)プロピル]−N,N,N−トリエチルアンモニウム(DOTM
A)リポソームは特に有用であり、そして商標LipofectinのもとにG
IBCO BRL,Grand Island,N.Y.(本明細書中で参考と
して援用される、Felgnerら、Proc.Natl.Acad.Sci.
USA(1987)84:7413〜7416もまた参照のこと)より入手可能
である。他の市販のリポソームとしては、トランスフェクテース(transf
ectace)(DDAB/DOPE)およびDOTAP/DOPE(Boeh
ringer)が挙げられる。
【0440】 当該分野で周知の技術を使用して、他のカチオン性リポソームを、容易に入手
可能な物質より調製し得る。DOTAP(1,2−ビス(オレオイルオキシ)−
3−(トリメチルアンモニオ)プロパン)リポソームの合成の記述に関して、例
えばPCT公開番号WO90/11092(本明細書中で参考として援用される
)を参照のこと。DOTMAリポソームの調製は文献にて説明されており、例え
ば、本明細書中で参考として援用される、P.Felgnerら、Proc.N
atl.Acad.Sci.USA、84:7413〜7417を参照のこと。
類似した方法を使用して、他のカチオン性脂質物質よりリポソームを調製し得る
【0441】 同様に、アニオン性リポソームおよび中性リポソームは、例えば、Avant
i Polar Lipids(Birmingham,Ala.)から容易に
入手可能であり、または容易に入手可能な物質を使用して簡単に調製され得る。
そのような物質としてはとりわけ、ホスファチジルコリン、コレステロール、ホ
スファチジルエタノールアミン、ジオレオイルホスファチジルコリン(DOPC
)、ジオレオイルホスファチジルグリセロール(DOPG)、ジオレオイルホス
ファチジルエタノールアミン(DOPE)が挙げられる。これらの物質はまた、
DOTMA出発物資およびDOTAP出発物質と適切な割合において混合され得
る。これらの物質を使用してリポソームを生成する方法は、当該分野で周知であ
る。
【0442】 例えば、商業的に、ジオレオイルホスファチジルコリン(DOPC)、ジオレ
オイルホスファチジルグリセロール(DOPG)、およびジオレオイルホスファ
チジルエタノールアミン(DOPE)を種々の組み合わせにおいて使用し、コレ
ステロールを添加してもしなくても、従来のリポソームを生成し得る。従って、
例えば、超音波処理バイアル中への窒素ガス流下で、各50mgのDOPGおよ
びDOPCを乾燥することにより、DOPG/DOPC小胞を調製し得る。この
サンプルを一晩真空ポンプ下に置き、そして次の日、脱イオン水で水和する。次
いで、浴を、15ECで循環させながら、最大設定にて、逆位カップ(浴タイプ
)プローブを装備したHeat Systems モデル350超音波処理器を
使用して、このサンプルを栓をしたバイアル中にて2時間超音波処理する。ある
いは、負に荷電した小胞を、超音波処理なしで調製して多重膜小胞を生成し得る
か、または核孔膜(nucleopore membrane)を通して押し出
すことにより別々の大きさの単膜小胞を生成し得る。他の方法は、当業者に公知
でありそして利用可能である。
【0443】 このリポソームとしては、多重膜小胞(MLV)、小さな単膜小胞(SUV)
または大きな単膜小胞(LUV)が挙げられ得、SUVが好ましい。当該分野で
周知の方法を使用して、種々のリポソーム−核酸複合体が調製される。例えば、
本明細書中で参考として援用される、Straubingerら、Method
s of Immunology(1983)、101:512〜527を参照
のこと。例えば、核酸を含有するMLVは、ガラスチューブの壁面にリン脂質の
薄膜を堆積させ、そしてその後、カプセル化されるべき物質の溶液で水和するこ
とによって調製され得る。SUVは、MLVの長期超音波処理により調製され、
単膜リポソームの均質集団を生成する。封入されるべき物質を、予め形成された
MLVの懸濁液に添加し、次いで、超音波処理する。カチオン性脂質を含むリポ
ソームを使用する場合、乾燥した脂質膜を、滅菌水または10mM Tris/
NaClのような等張性緩衝溶液のような適切な溶液中に再懸濁し、超音波処理
し、次いで、予め形成されたリポソームをDNAと直接混合する。正に荷電した
リポソームのカチオン性DNAへの結合に起因して、リポソームおよびDNAは
非常に安定な複合体を形成する。SUVは、小核酸フラグメントを用いての用途
を見出す。LUVは、当該分野で周知の多くの方法により調製される。一般に使
用される方法としては、Ca2+−EDTAキレート化(Papahadjop
oulosら、Biochim.Biophys.Acta(1975)394
:483;Wilsonら、Cell(1979))17:77);エーテル注
入(Deamer,D.およびBangham,A.、Biochim.Bio
phys.Acta(1976)443:629;Ostroら、Bioche
m.Biophys.Res.Commum.(1977)76:836;Fr
aleyら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1979)76
:3348);界面活性剤透析(Enoch,H.およびStrittmatt
er,P.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1979)76
:145);および逆相エバポレーション(REV)(Fraleyら、J.B
iol.Chem.(1980)255:10431;Szoka、F.および
Papahadjopuolos,D.、Proc.Natl.Acad.Sc
i.USA(1978)75:145;Schaefer−Ridderら、S
cience(1982)215:166)が挙げられ、これらの文献は本明細
書中で参考として援用される。
【0444】 一般に、DNAのリポソームに対する割合は、約10:1から約1:10まで
である。好ましくは、その割合(ration)は、約5:1から約1:5まで
である。より好ましくは、その割合は、約3:1から約1:3までである。さら
により好ましくは、その割合は、約1:1である。
【0445】 米国特許第5,676,954号(本明細書中で参考として援用される)は、
カチオン性リポソームキャリアと複合体化された遺伝物質のマウスへの注入につ
いて報告する。米国特許第4,897,355号、同第4,946,787号、
同第5,049,386号、同第5,459,127号、同第5,589,46
6号、同第5,693,622号、同第5,580,859号、同第5,703
,055号および国際公開第WO94/9469号(これらは本明細書中で参考
として援用される)は、DNAを細胞および哺乳動物にトランスフェクトする際
に使用するためのカチオン性脂質を提供する。米国特許第5,589,466号
、同第5,693,622号、同第5,580,859号、同第5,703,0
55号および国際公開第WO94/9469号(これらは本明細書中で参考とし
て援用される)は、DNA−カチオン性脂質複合体を哺乳動物に送達する方法を
提供する。
【0446】 特定の実施形態において、本発明のポリペプチドをコードする配列を含むRN
Aを含むレトロウイルス粒子を使用して、エキソビボまたはインビボで細胞を操
作する。レトロウイルスプラスミドベクターが由来し得るレトロウイルスとして
は、モロニーマウス白血病ウイルス、脾臓壊死ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、
ハーベイ肉腫ウイルス、ニワトリ白血病ウイルス、テナガザル白血病ウイルス、
ヒト免疫不全ウイルス、骨髄増殖性肉腫ウイルス、および乳癌ウイルスが挙げら
れるが、これらに限定されない。
【0447】 このレトロウイルスプラスミドベクターを使用して、パッケージング細胞株を
形質導入し、プロデューサー細胞株を形成する。トランスフェクトされ得るパッ
ケージング細胞株の例としては、その全体が本明細書中で参考として援用される
、Miller、Human Gene Theapy、1:5〜14(199
0)にて記載されるようなPE501、PA317、R−2、R−AM、PA1
2、T19−14X、VT−19−17−H2、RCRE、RCRIP、GP+
E−86、GP+envAm12およびDAN細胞株が挙げられるが、これらに
限定されない。このベクターは、当該分野で公知の任意の手段により、パッケー
ジング細胞を形質導入し得る。そのような手段としては、エレクトロポレーショ
ン、リポソームの使用、およびCaPO沈殿が挙げられるが、それらに限定さ
れない。1つの代替法において、このレトロウイルスプラスミドベクターをリポ
ソームにカプセル化し得るか、または脂質に結合し得て、次いで宿主に投与し得
る。
【0448】 このプロデューサー細胞株は、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレ
オチドを含む感染性レトロウイルスベクター粒子を産生する。次いで、そのよう
なレトロウイルスベクター粒子を使用して、インビトロまたはインビボのどちら
かで、真核生物細胞を形質導入し得る。この形質導入された真核生物細胞は、本
発明のポリペプチドを発現する。
【0449】 特定の他の実施形態において、アデノウイルスベクター中に含まれるポリヌク
レオチドを用いて、エキソビボまたはインビボで細胞を操作する。アデノウイル
スは、それが本発明のポリペプチドをコードし、そして発現し、それと同時に通
常の溶菌性ウイルス生活環にて複製するその能力に関して不活性化されるように
操作され得る。アデノウイルス発現は、そのウイルスDNAの宿主細胞染色体へ
の組み込み無しに達成され、その結果、挿入性変異誘発についての心配が軽減さ
れる。さらに、アデノウイルスは、何年もの間、腸の生ワクチンとして優れた安
全側面を伴って使用されている(Schwartz,A.R.ら(1974)、
Am.Rev.Respir.Dis.109:233−238)。最終的に、
アデノウイルス媒介性遺伝子移入が、コトンラットの肺へのα−1−アンチトリ
プシンおよびCFTRの移入を含む多くの例において実証されている(Rose
nfeld,M.A.ら(1991)、Science、252:431〜43
4;Rosenfeldら(1992)、Cell、68:143〜155)。
さらに、ヒト癌における原因物質としてアデノウイルスを確立しようとする広範
な研究は、一様に否定的であった(Green,M.ら(1979)Proc.
Natl.Acad.Sci.USA,76:6606)。
【0450】 本発明において有用である適切なアデノウイルスベクターは、例えば、Koz
arskyおよびWilson,Curr.Opin.Genet.Devel
. 3:499〜503(1993);Rosenfeldら、Cell 68
:143〜155(1992);Engelhardtら、Human Gen
et.Ther.4:759〜769(1993);Yangら、Nature
Genet.7:362〜369(1994);Wilsonら、Natur
e 365:691〜692(1993);および米国特許第5,652,22
4号に記載されており、これらの文献および特許は本明細書中で参考として援用
される。例えば、アデノウイルスベクターAd2が有用であり、そしてヒト29
3細胞にて増殖され得る。これらの細胞は、アデノウイルスのE1領域を含み、
そして構成的にElaおよびElbを発現し、このことは、このベクターから欠
失している遺伝子の産物を提供することによって欠損アデノウイルスを補完する
。Ad2に加えて、他の多様なアデノウイルス(例えば、Ad3、Ad5、およ
びAd7)もまた、本発明において有用である。
【0451】 好ましくは、本発明において使用されるアデノウイルスは、複製欠損性である
。複製欠損アデノウイルスは、感染性粒子を形成するために、ヘルパーウイルス
および/またはパッケージング細胞株の助けを必要とする。得られたウイルスは
、細胞に感染する能力があり、そしてプロモーターに作動可能に連結された目的
のポリヌクレオチドを発現し得るが、ほとんどの細胞にて複製し得ない。複製欠
損アデノウイルスは、次の遺伝子のすべてまたは一部のうちの1つ以上にて欠失
され得る:E1a、E1b、E3、E4、E2aまたはL1〜L5。
【0452】 特定の他の実施形態において、アデノ随伴ウイルス(AAV)を使用して、エ
キソビボまたはインビボでこの細胞を操作する。AAVは、感染性粒子を生成す
るためにヘルパーウイルスを必要とする、天然に存在する欠損ウイルスである(
Muzyczka,N.,Curr.Topics in Microbiol
.Immunol.158:97(1992))。AAVはまた、非分裂細胞の
中にそのDNAを組み込み得る数少ないウイルスの中の1つである。300塩基
対程度の小さいAAVを含むベクターがパッケージされ得、そして組み込み得る
が、外来性DNAのためのスペースは約4.5kbに限られる。そのようなAA
Vの生成および使用の方法は当該分野で公知である。例えば、米国特許第5,1
39,941号、同第5,173,414号、同第5,354,678号、同第
5,436,146号、同第5,474,935号、同第5,478,745号
および同第5,589,377号を参照のこと。
【0453】 例えば、本発明において使用するために適切なAAVベクターは、DNA複製
、キャプシド形成、および宿主細胞組み込みに必要な配列すべてを含む。Sam
brookら、Molecular Cloning:A Laborator
y Manual、Cold Spring Harbor Press(19
89)において見出される方法のような、標準的クローニング方法を使用して、
ポリヌクレオチド構築物を、このAAVベクターに挿入する。次いで、リポフェ
クション、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム沈殿などを含む、任意の
標準的技術を使用して、この組換えAAVベクターを、ヘルパーウイルスに感染
しているパッケージング細胞にトランスフェクトする。適切なヘルパーウイルス
としては、アデノウイルス、サイトメガロウイルス、ワクシニアウイルス、また
はヘルペスウイルスが挙げられる。一旦パッケージング細胞がトランスフェクト
および感染されると、それらはそのポリヌクレオチド構築物を含む感染性AAV
ウイルス粒子を生成する。次いで、エキソビボまたはインビボのいずれかで、こ
れらのウイルス粒子を使用して真核生物細胞を形質導入する。この形質導入細胞
は、そのゲノムに組み込まれたポリヌクレオチド構築物を含み、そして本発明の
ポリペプチドを発現する。
【0454】 遺伝子治療の別の方法は、相同組換え(例えば、米国特許第5,641,67
0号、1997年6月24日発行;国際公開第WO96/29411号、199
6年9月26日公開;国際公開第WO94/12650号、1994年8月4日
公開;Kollerら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86
:8932〜8935(1989);およびZijlstraら、Nature
342:435〜438(1989)を参照のこと)を介して、異種制御領域
および内在性ポリヌクレオチド配列(例えば、本発明のポリペプチドをコードし
ている配列)を作動可能に連結する工程を含む。この方法は、標的細胞中に存在
しているが、通常はその細胞中で発現しないかまたは所望するよりも低いレベル
で発現する、遺伝子の活性化を含む。
【0455】 当該分野で既知の標準的技術を使用して、ポリヌクレオチド構築物を作製する
。この構築物は、プロモーターを、そのプロモーターに隣接した標的化配列とと
もに含む。適切なプロモーターが、本明細書中に記載されている。標的化配列は
、プロモーター−標的化配列と内在性配列との相同組換えを可能にするに十分に
その内在性配列に対して相補的である。標的化配列は、所望される内在性ポリヌ
クレオチド配列の5’末端の十分近くに存在し、それゆえ、相同組換えに際して
、そのプロモーターは、その内在性配列に作動可能に連結される。
【0456】 このプロモーターおよび標的化配列は、PCRを使用して増幅され得る。好ま
しくは、この増幅されたプロモーターは、5’末端および3’末端に別の制限酵
素部位を含む。好ましくは、第1の標的化配列の3’末端は、増幅されたプロモ
ーターの5’末端と同じ制限酵素部位を含み、そして第2の標的化配列の5’末
端は、増幅されたプロモーターの3’末端と同じ制限部位を含む。増幅されたプ
ロモーターおよび標的化配列を消化し、そしてともに連結する。
【0457】 裸のポリヌクレオチドとしてか、もしくは上記により詳細に記載されるような
リポソーム、ウイルス配列、ウイルス粒子、ウイルス全体、リポフェクション、
沈殿剤などのようなトランスフェクション促進剤と一緒にかのいずれかで、この
プロモーター−標的化配列構築物を細胞に送達する。直接針注射、静脈内注射、
局所投与、カテーテル注入、粒子加速器などを含む任意の方法により、Pプロモ
ーター−標的化配列を送達し得る。この方法を、下記により詳細に記載する。
【0458】 プロモーター−標的化配列構築物は、細胞により取り込まれる。この構築物と
内在性配列との間に相同組換えが起こり、その結果、内在性配列は、このプロモ
ーターの制御下に配置される。次いで、このプロモーターは、内在性配列の発現
を駆動する。
【0459】 好ましくは、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、そのタ
ンパク質の分泌を促進する分泌シグナル配列を含む。代表的に、このシグナル配
列は、コード領域の5’末端に向かってかまたは5’末端で発現される、そのポ
リヌクレオチドのコード領域に位置する。このシグナル配列は、目的のポリヌク
レオチドに対して同種であってもよいしまたは異種であってもよく、そしてトラ
ンスフェクトされる細胞に対して同種であってもよいしまたは異種であってもよ
い。さらに、当該分野で公知の方法を使用して、このシグナル配列は化学合成さ
れ得る。
【0460】 その投与形態によって、治療効果を提供するのに十分な量にて1つ以上の分子
が発現される限り、上記のポリヌクレオチド構築物のうちのいずれかの任意の投
与形態が使用され得る。これは、直接針注射、全身性注射、カテーテル注入、バ
イオリスティック(biolistic)注射器、粒子加速器(すなわち、「遺
伝子銃」)、ゲルフォームスポンジデポー(depot)、他の市販デポー物質
、浸透圧ポンプ(例えば、Alzaミニポンプ)、経口用または坐剤用の固形(
錠剤または丸剤)薬学的処方物、および手術中のデカンティング(decant
ing)または局所適用を含む。例えば、ラット肝臓およびラット脾臓へのリン
酸カルシウム沈澱した裸のプラスミドの直接注射、または門脈へのタンパク質被
覆プラスミドの直接注射は、ラット肝臓における外来遺伝子の遺伝子発現をもた
らした(Kanedaら、Science、243:375(1989))。
【0461】 局所投与の好ましい方法は、直接注射によるものである。好ましくは、送達ビ
ヒクルと複合体を形成した本発明の組換え分子は、動脈領域内部に直接注射によ
り投与されるか、または動脈領域内部に局所投与される。動脈領域内部での組成
物の局所投与とは、その組成物を動脈内に数センチメートル、好ましくは数ミリ
メートルで注射することを言う。
【0462】 局所投与の別の方法は、本発明のポリヌクレオチド構築物を外科的創傷中また
は外科的創傷の周囲に接触させることである。例えば、患者は手術を経験し得、
そしてこのポリヌクレオチド構築物がその創傷の内側の組織の表面上にコーティ
ングされ得るか、またはこの構築物が、その創傷の内側の組織の領域に注入され
得る。
【0463】 全身投与に有用な治療組成物は、本発明の標的化された送達ビヒクルと複合体
を形成した本発明の組換え分子を含む。全身投与で使用するために適切な送達ビ
ヒクルは、特定部位に対してそのビヒクルを標的化するリガンドを含むリポソー
ムを含む。
【0464】 全身投与の好ましい方法としては、静脈内注射、エアロゾル、経口および経皮
(局所的)送達が挙げられる。当該分野で標準的な方法を使用して、静脈内注射
が実行され得る。当該分野で標準的な方法を使用して、エアロゾル送達もまた実
行され得る(例えば、本明細書中で参考として援用される、Stribling
ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 189:11277〜1
1281(1992)を参照のこと)。動物の腸内の消化酵素による分解に耐え
る能力をもつキャリアに対して本発明のポリヌクレオチド構築物を複合体形成す
ることにより、経口送達は実行され得る。そのようなキャリアの例としては、当
該分野で公知であるもののような、プラスチックカプセルまたは錠剤が挙げられ
る。皮膚内へ通過可能な親油性試薬(例えば、DMSO)と本発明のポリヌクレ
オチド構築物を混合することによって、局所的送達は実行され得る。
【0465】 送達される物質の有効量を決定することは、例えば、その物質の化学構造およ
び生物学的活性、動物の年齢および体重、処置を必要とする正確な状態およびそ
の重症度、ならびに投与経路を含む、多数の因子に依存し得る。処置の頻度は、
1用量あたりの投与されるポリヌクレオチド構築物の量ならびに被験体の健康お
よび病歴のような、多くの因子に依存する。正確な量、投薬回数および投薬のタ
イミングは、主治医または主治獣医により決定される。
【0466】 本発明の治療的組成物は、任意の動物に、好ましくは哺乳動物および鳥類に投
与され得る。好ましい哺乳動物としては、ヒト、イヌ、ネコ、マウス、ラット、
ウサギ、ヒツジ、ウシ、ウマおよびブタが挙げられ、特にヒトが好ましい。
【0467】 (生物学的活性) 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチドまたはアゴニストもしくはア
ンタゴニストをアッセイに使用し、1つ以上の生物学的活性について試験し得る
。本発明のこれらのポリヌクレオチドもしくはポリペプチドまたはアゴニストも
しくはアンタゴニストが、特定のアッセイにおいて活性を示す場合、これらの分
子はその生物学的活性に関連した疾患に関与し得るようである。従って、このポ
リヌクレオチドもしくはポリペプチドまたはアゴニストもしくはアンタゴニスト
は、関連した疾患を処置するために使用され得る。
【0468】 これらのタンパク質は、心臓血管障害、免疫系障害、タンパク質分解活性、炎
症、癌の転移、および神経学的障害、に関連する生物学的活性に関与すると考え
られる。従って、本発明の組成物(本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドお
よび抗体、ならびにそれらのフラグメントおよび改変体を含む)は、これらのタ
ンパク質の異常な活性に関する疾患および/または障害を診断、検出および/ま
たは処置する際に使用され得る。
【0469】 好ましい実施形態において、本発明の組成物(本発明のポリヌクレオチド、ポ
リペプチドおよび抗体、ならびにそのフラグメントおよび改変体を含む)は、心
臓血管障害(例えば、高血圧症(hypertension)、心臓病、冠状動
脈不全、勃起不全、高血圧症(high blood pressure)、お
よび/または以下の「心臓血管障害」に記載されるような)、異常なプロテアー
ゼ活性、神経学的障害(例えば、不適切な神経発達、および/または以下の「神
経活性および神経学的疾患」に記載されるような)、過剰増殖性障害(例えば、
癌の転移、および/または以下の「過剰増殖性障害」に記載されるような)、な
らびに免疫系障害(例えば、炎症、および/または以下の「免疫活性」に記載さ
れるような)に関連する疾患および/または障害の診断、予後、予防および/ま
たは処置において、使用され得る。
【0470】 別の実施形態において、本発明のポリペプチド、またはこのポリペプチドに対
応するポリヌクレオチド、抗体、アゴニスト、またはアンタゴニストは、本発明
のポリペプチドが発現される組織に関連する障害を診断、予後、予防および/ま
たは処置するために使用され得、このような組織としては、「本発明のポリヌク
レオチドおよびポリペプチド」に開示される組織、および/または表3の2列(
ライブラリーコード)に開示される、1つ、2つ、3つ、4つ、5つもしくはそ
れより多くの組織が挙げられる。
【0471】 従って、本発明のポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体は、心臓血管障害、
免疫系障害、タンパク質分解活性、炎症、癌の転移、および神経学的障害、を含
むがそれらに限定されない活性に関連する疾患および/または障害を診断、予後
、予防および/または処置する際に有用である。
【0472】 より一般に、この遺伝子に対応するポリヌクレオチド、翻訳産物および抗体は
、以下の系に関連する疾患および/または障害の診断、検出および/または処置
に有用であり得る。
【0473】 (免疫活性) 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および/またはアゴニストも
しくはアンタゴニストは、例えば、免疫細胞の増殖、分化もしくは動員(走化性
)を活性化または阻害することによる、免疫系の疾患、障害および/または状態
の処置、予防、診断および/または予後診断において有用であり得る。免疫細胞
は、造血と呼ばれるプロセスを介して発生し、多能性幹細胞から骨髄性細胞(血
小板、赤血球、好中球およびマクロファージ)およびリンパ系細胞(Bリンパ球
およびTリンパ球)を生成する。これらの免疫疾患、障害および/または状態の
病因は、遺伝的、身体的(somatic)(例えば、癌またはいくつかの自己
免疫性障害)、後天的(例えば、化学療法もしくは毒素による)または感染的で
あり得る。さらに、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および/ま
たはアゴニストもしくはアンタゴニストは、特定の免疫系の疾患または障害のマ
ーカーまたは検出物質(detector)として使用され得る。
【0474】 別の実施形態において、本発明のポリペプチド、あるいはそのポリペプチドに
対応するポリヌクレオチド、抗体、アゴニストまたはアンタゴニストは、免疫系
の疾患および障害を処置するためおよび/または本発明のポリペプチドが発現さ
れる組織(「本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド」と表題を付けられ
た節に開示される組織を含む)に関連する細胞によって生じた免疫応答を阻害ま
たは増強するために使用され得る。
【0475】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および/またはアゴニストも
しくはアンタゴニストは、免疫不全症(先天性または後天性の免疫不全症の両方
を含む)の処置、予防および/または診断に有用であり得る。免疫グロブリンレ
ベル、B細胞機能および/またはB細胞数が減少するB細胞免疫不全症の例とし
ては、以下が挙げられる:X連鎖無ガンマグロブリン血症(ブルートン病)、X
連鎖小児性無ガンマグロブリン血症、過剰IgMを伴うX連鎖免疫不全症、過剰
IgMを伴う非X連鎖免疫不全症、X連鎖リンパ球増殖症候群(XLP)、無ガ
ンマグロブリン血症(先天性および後天性無ガンマグロブリン血症を含む)、成
体発症無ガンマグロブリン血症、後期発症無ガンマグロブリン血症、異常ガンマ
グロブリン血症、低ガンマグロブリン血症、不特定(unspecifed)低
ガンマグロブリン血症、劣性無ガンマグロブリン血症(スイス型)、選択的Ig
M欠損症、選択的IgA欠損症、選択的IgGサブクラス欠損症、IgGサブク
ラス欠損症(IgA欠損症を伴うかまたは伴わない)、Ig欠損症(IgMの増
加を伴う)、IgGおよびIgA欠損症(IgMの増加を伴う)、正常なIgま
たはIgの上昇を伴う抗体欠損症、Ig重鎖欠乏、κ鎖欠損症、B細胞リンパ球
増殖障害(BLPD)、分類不能型免疫不全(CVID)、分類不能型免疫不全
(CVI)(後天性)、および一過性乳児低ガンマグロブリン血症。
【0476】 特定の実施形態において、毛細血管拡張性運動失調または毛細血管拡張性運動
失調に関連する状態が、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチド、および
/またはそのアゴニストを投与することにより、回復および/または処置され得
る。
【0477】 T細胞および/またはB細胞の機能および/または数が減少される先天性の免
疫不全症の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:ディ・ジ
ョージ異常、重症複合型免疫不全(SCID)(X連鎖SCID、常染色体劣性
SCID、アデノシンデアミナーゼ欠損症、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ
(PNP)欠損症、クラスII MHC欠損症(不全リンパ球症候群)、ヴィス
コット−オールドリッチ症候群、および毛細血管拡張性運動失調を含むが、これ
らに限定されない)、胸腺発育不全、3次および4次咽頭嚢症候群、22q11
.2欠損、慢性粘膜皮膚カンジダ症、ナチュラルキラー細胞欠損症(NK)、特
発性CD4+Tリンパ球減少症、優性T細胞欠損(不特定)を伴う免疫不全症、
および細胞媒介免疫の不特定免疫不全症。
【0478】 特定の実施形態において、ディ・ジョージ異常またはディ・ジョージ異常に関
連する状態が、例えば、本発明のポリペプチドもしくはポリヌクレオチド、また
はそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与することにより、回復および/
または処置される。
【0479】 本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドおよび/またはそのアゴニスト
を投与することにより回復および/または処置され得る、他の免疫不全症として
は、以下が挙げられるが、これらに限定されない:慢性肉芽腫症、チェディアッ
ク−東病、ミエロペルオキシダーゼ欠損症、リンパ球グルコース−6−リン酸デ
ヒドロゲナーゼ欠損症、X連鎖リンパ球増殖症候群(XLP)、リンパ球接着欠
損症、補体成分欠損症(C1、C2、C3、C4、C5、C6、C7、C8およ
び/またはC9欠損症を含む)、網様発育不全、胸腺リンパ形成不全、胸腺腫を
伴う発育不全、重篤な先天性リンパ球減少症、免疫不全症を伴う形成異常、新生
児好中球減少症、短肢小人症、およびIgによる免疫不全症を共存するネゼロフ
症候群。
【0480】 好ましい実施形態において、これらの免疫不全症および/または上記の免疫不
全症に関連する状態は、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および
/またはアゴニストもしくはアンタゴニストを使用して処置、予防および/また
は診断され得る。
【0481】 好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体
および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、免疫不全個体間で免疫応
答性をブーストするための薬剤として使用され得る。特定の実施形態において、
本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および/またはアゴニストもし
くはアンタゴニストは、B細胞および/またはT細胞免疫不全個体間で免疫応答
性をブーストするための薬剤として使用され得る。
【0482】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および/またはアゴニストも
しくはアンタゴニストは、自己免疫障害の処置、予防および/または診断におい
て有用であり得る。多くの自己免疫障害は、免疫細胞によって自己物質を外来物
質として不適切に認識されることによって生じる。この不適切な認識は、宿主組
織の破壊を導く免疫応答を生じる。従って、免疫応答(特に、T細胞の増殖、分
化または走化性)を阻害し得る本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドの
投与は、自己免疫障害の予防における効果的な治療であり得る。
【0483】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および/またはアゴニストも
しくはアンタゴニストによって処置、予防および/または診断され得る自己免疫
疾患または障害としては、以下の1以上が挙げられるが、これらに限定されない
:全身性エリテマトーデス、慢性関節リウマチ、強直性脊椎炎、多発性硬化症、
自己免疫性甲状腺炎、橋本甲状腺病、自己免疫溶血性貧血、溶血性貧血、血小板
減少症、自己免疫血小板減少症紫斑病、自己免疫新生児血小板減少症、特発性血
小板減少症紫斑病、紫斑病(例えば、ヘーノホ−シェーンライン紫斑病)、自己
免疫性血球減少症、グッドパスチャー症候群、尋常性天疱瘡、重症筋無力症、グ
レーブス病(甲状腺機能亢進症)、およびインスリン耐性糖尿病。
【0484】 本発明の組成物で処置、予防および/または診断され得る自己免疫成分を有す
るであろうさらなる障害としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない
:II型コラーゲン誘導性関節炎、抗リン脂質症候群、皮膚炎、アレルギー性脳
脊髄炎、心筋炎、再発性多発性軟骨炎、リウマチ性心疾患、神経炎、ブドウ膜炎
眼炎、多発性内分泌腺症、ライター病、スティッフマン症候群、自己免疫肺炎、
自閉症、ギヤン−バレー症候群、インスリン依存性糖尿病、および自己免疫炎症
性眼障害。
【0485】 本発明の組成物で処置、予防および/または診断され得る自己免疫成分を有す
るであろうさらなる障害としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない
:抗コラーゲン抗体を伴う強皮症(例えば、核小体および他の核抗体によってし
ばしば特徴付けられる)、混合結合組織病(例えば、可溶性核抗原(例えば、リ
ボ核タンパク質)に対する抗体によってしばしば特徴付けられる)、多発性筋炎
(例えば、非ヒストンANAによってしばしば特徴付けられる)、悪性貧血(例
えば、抗壁細胞、ミクロソーム、および内因子抗体によってしばしば特徴付けら
れる)、特発性アジソン病(例えば、体液性および細胞媒介性の副腎細胞傷害性
によってしばしば特徴付けられる)、不妊症(例えば、抗精子抗体によってしば
しば特徴付けられる)、糸球体腎炎(例えば、糸球体基底膜抗体または免疫複合
体によってしばしば特徴付けられる)、水疱性類天疱瘡(例えば、基底膜におけ
るIgGおよび補体によってしばしば特徴付けられる)、シューグレン症候群(
例えば、多組織抗体および/または特定の非ヒストンANA(SS−B)によっ
てしばしば特徴付けられる)、糖尿病(例えば、細胞媒介性および体液性島細胞
抗体によってしばしば特徴付けられる)、およびアドレナリン作用性薬物耐性(
ぜん息および嚢胞性線維症を伴うアドレナリン作用性薬物耐性を含む)(例えば
、β−アドレナリン作用性レセプター抗体によって特徴付けられる)。
【0486】 本発明の組成物で処置、予防および/または診断され得る自己免疫成分を有し
得るさらなる障害としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:慢性
活動性肝炎(例えば、平滑筋抗体によってしばしば特徴付けられる)、原発性胆
汁性肝硬変(例えば、ミトコンドリア抗体によってしばしば特徴付けられる)、
他の内分泌腺不全(例えば、いくつかの場合における特異的組織抗体によってし
ばしば特徴付けられる)、白斑(例えば、メラノサイト抗体によってしばしば特
徴付けられる)、脈管炎(例えば、血管壁におけるIgおよび補体ならびに/ま
たは低い血清補体によってしばしば特徴付けられる)、MI後(例えば、心筋抗
体によってしばしば特徴付けられる)、心臓切開症候群(例えば、心筋抗体によ
ってしばしば特徴付けられる)、じんま疹(例えば、IgEに対するIgGおよ
びIgM抗体によってしばしば特徴付けられる)、アトピー性皮膚炎(IgEに
対するIgGおよびIgM抗体によってしばしば特徴付けられる)、ぜん息(例
えば、IgEに対するIgGおよびIgM抗体によってしばしば特徴付けられる
)、ならびに多くの他の炎症性、肉芽腫性、変性および萎縮性障害。
【0487】 好ましい実施形態において、これらの自己免疫疾患および障害ならびに/また
は上記のこれらの疾患および障害に関連する状態は、例えば、本発明のアンタゴ
ニストもしくはアゴニスト、ポリペプチドもしくはポリヌクレオチドまたは抗体
を使用して、処置、予防および/または診断される。特定の好ましい実施形態に
おいて、慢性関節リウマチは、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体
および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストを使用して、処置、予防およ
び/または診断される。別の特定の実施形態において、全身性エリテマトーデス
が、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および/またはアゴニスト
もしくはアンタゴニストを用いて処置、予防および/または診断される。別の特
定の好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗
体および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、特発性血小板減
少性紫斑病が処置、予防および/または診断される。別の特定の好ましい実施形
態において、IgAネフロパシーは、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド
、抗体、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、処置、予
防および/または診断される。
【0488】 好ましい実施形態において、自己免疫疾患および自己免疫障害ならびに/また
は上記の疾患および障害と関連する状態は、本発明のポリヌクレオチド、ポリペ
プチド、抗体および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、処置
、予防および/または診断される。
【0489】 好ましい実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド
および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、免疫抑制剤として使用さ
れる。
【0490】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および/またはアゴニスト
もしくはアンタゴニストは、造血細胞の疾患、障害および/または状態の処置、
予防および/または診断において有用であり得る。本発明のポリヌクレオチド、
ポリペプチド、抗体、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、白
血病、好中球減少症、貧血、および血小板病床が挙げられるが、それらに限定さ
れない、特定の(または多くの)型の造血細胞の減少に関連した疾患、障害およ
び/または状態を処置または予防する試みにおいて、多能性幹細胞を含む造血細
胞の分化および増殖を増加させるために用いられ得る。あるいは、本発明のポリ
ヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および/またはアゴニストもしくはアンタ
ゴニストは、組織球増殖症が挙げられるが、それらに限定されない、特定の(ま
たは多くの)型の造血細胞の減少に関連した疾患、障害および/または状態を処
置または予防する試みにおいて、多能性幹細胞を含む造血細胞の分化および増殖
を増加させるために用いられ得る。
【0491】 アレルギー反応および状態(例えば、喘息(特にアレルギー性喘息)または他
の呼吸障害)はまた、本発明のポリペプチド、抗体もしくはポリヌクレオチド、
および/またはそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、処置、予
防および/または診断され得る。さらに、これらの分子は、アナフィラキシー、
抗原性分子に対する過敏性、または血液型不適合を処置、予防および/または診
断するために用いられ得る。
【0492】 さらに、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチド、および/またはその
アゴニストは、IgE媒介アレルギー応答を処置または予防するために使用され
得る。このようなアレルギー反応としては、喘息、鼻炎および湿疹が挙げられる
が、これらに限定されない。特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチ
ド、ポリペプチド、抗体および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、
インビトロまたはインビボにおいてIgE濃度の調節のために使用され得る。
【0493】 さらに、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および/またはア
ゴニストもしくはアンタゴニストは、炎症状態の診断、予後、予防、および/ま
たは処置に用途を有する。例えば、本発明のポリペプチド、抗体、もしくはポリ
ヌクレオチド、および/または本発明のアゴニストもしくはアンタゴニストは、
炎症応答に関与する細胞の活性、増殖および/または分化を阻害し得るので、こ
れらの分子を使用して、慢性および急性の両方の状態の炎症状態を診断、予後診
断、予防および/または処置し得る。このような炎症状態には、例えば以下が挙
げられるがそれらに限定されない:例えば、感染に関連する炎症(例えば、敗血
症性ショック、敗血症、または全身炎症応答症候群)、虚血再灌流傷害に関連す
る炎症、内毒素致死に関連する炎症、補体媒介性超急性拒絶に関連する炎症、腎
炎に関連する炎症、サイトカインまたはケモカインが誘導する肺傷害に関連する
炎症、炎症性腸疾患に関連する炎症、クローン病に関連する炎症、サイトカイン
(例えば、TNFまたはIL−1)の過剰生成から生じる炎症、呼吸障害に関連
する炎症(例えば、ぜん息およびアレルギー);胃腸障害(例えば、炎症性腸障
害);癌(例えば、胃癌、卵巣癌、肺癌、膀胱癌、肝臓癌、および乳癌など);
CNS障害(例えば、多発性硬化症、虚血性脳損傷、および/または発作、外傷
性脳損傷、神経変性性障害(例えば、パーキンソン病およびアルツハイマー病な
ど)、AIDS関連痴呆、およびプリオン病);心血管障害(例えば、アテロー
ム性動脈硬化症、心筋炎、心血管疾患、および心肺バイパス合併症など);なら
びに炎症によって特徴付けられる多くのさらなる疾患、状態、および障害(例え
ば、慢性肝炎、慢性関節リウマチ、痛風、外傷、膵炎、サルコイドーシス、皮膚
炎、腎虚血再還流障害、グレーヴス病、全身性エリテマトーデス、真性糖尿病、
および同種異系移植拒絶)。
【0494】 炎症は、基本的な防御機構なので、炎症は実質的に身体の任意の組織で影響し
得る。従って、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、および抗体、ならび
にそれらのアゴニストまたはアンタゴニストは、以下を含むがそれらに限定され
ない組織特異的な炎症疾患の処置に用途を有する:副腎炎、肺胞炎、胆管胆嚢炎
、虫垂炎、亀頭炎、眼瞼炎、気管支炎、滑液包炎、心臓炎、蜂巣炎、子宮頸管炎
、胆嚢炎、声帯炎、蝸牛炎(cochlitis)、大腸炎、結膜炎、膀胱炎、
皮膚炎、憩室炎、脳炎、心内膜炎、食道炎、耳管炎、結合組織炎、毛包炎、胃炎
、胃腸炎、歯肉炎、舌炎、肝脾炎、角膜炎、迷路炎、喉頭炎、リンパ管炎、乳腺
炎、中耳炎(media otitis)、髄膜炎、子宮炎、粘膜炎、心筋炎、
筋炎、鼓膜炎、腎炎、神経炎、精巣炎、骨軟骨炎、耳炎、心膜炎、腱周囲炎、腹
膜炎、喉頭炎、静脈炎、灰白髄炎、前立腺炎、歯髄炎、網膜炎、鼻炎、卵管炎、
強膜炎、強膜脈絡膜炎、陰嚢炎、静脈洞炎、脊椎炎(sponylitis)、
脂肪組織炎、口内炎、滑膜炎、耳管炎、腱炎、扁桃炎、尿道炎、および膣炎。
【0495】 特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、またはポリヌクレオ
チドおよび/またそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストは、器官移植拒絶
または対宿主性移植片病を処置、診断および/または予防に有用である。器官拒
絶は、免疫応答を介して宿主免疫細胞による移植組織の破壊によって起こる。同
様に、免疫応答はGVHDにもまた関与しているが、この場合、外来性の移植免
疫細胞が宿主組織を破壊する。免疫応答、特にT細胞の活性、増殖、分化または
走化性を阻害する、本発明のポリペプチド、抗体、またはポリヌクレオチド、お
よび/またそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストは、器官拒絶またはGV
HDの予防において効果的な治療であり得る。特定の実施形態において、免疫応
答、特にT細胞の活性、増殖、分化または走化性を阻害する、本発明のポリペプ
チド、抗体、またはポリヌクレオチドおよび/またそれらのアゴニストもしくは
アンタゴニストは、実験的アレルギーおよび超急性異種移植拒絶の予防において
効果的な治療であり得る。
【0496】 他の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、またはポリヌクレオチ
ドおよび/またそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストは、免疫複合体病(
血清病、後期連鎖球菌性(post steptococcal)糸球体腎炎お
よび結節性多発性動脈炎、免疫複合体誘導脈管炎を含むがそれらに限定されない
)処置、診断および/または予防に有用である。
【0497】 本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および/またはアゴニスト
もしくはアンタゴニストを使用して、感染因子を処置、検出、および/または予
防し得る。例えば、免疫応答を上昇させることによって、特にB細胞および/ま
たはT細胞の増殖活性および/または分化を増加させることによって、感染性疾
患が処置、検出および/または予防され得る。免疫応答は、既存の免疫応答を上
昇させるか、または新たな免疫応答を開始させるかのいずれかにより上昇され得
る。あるいは、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および/または
アゴニストもしくはアンタゴニストはまた、必ずしも免疫応答を誘発することな
く、感染因子(感染因子を列挙する応用の節などで引用される)を直接阻害し得
る。
【0498】 別の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、お
よび/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、特異的な免疫応答を上昇す
るワクチンアジュバントとして使用される。特定の実施形態において、本発明の
ポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および/またはアゴニストもしくはア
ンタゴニストは、癌特異的免疫応答を増強するアジュバントとして使用される。
【0499】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、抗ウイルス免疫応答
を増強するアジュバントとして使用される。アジュバントとして本発明の組成物
を用いて増強され得る抗ウイルス免疫応答としては、ウイルスおよび本明細書に
おいて記載されるかさもなければ当該分野で公知のウイルス関連疾患および症状
が挙げられる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、以下:AIDS、
髄膜炎、デング熱、EBV、および肝炎(例えば、B型肝炎)からなる群より選
択される、ウイルス、疾患または症状に対する免疫応答を増強するためのアジュ
バントとして用いられる。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、以
下:HIV/AIDS、RSウイルス、デング熱、ロタウイルス、日本脳炎、イ
ンフルエンザAおよびB、パラインフルエンザ、麻疹、サイトメガロウイルス、
狂犬病、Juninウイルス、チクングニヤウイルス、リフトバレー熱、単純疱
疹、および黄熱病からなる群より選択されるウイルス、疾患または症状に対する
免疫応答を増強するアジュバントとして用いられる。
【0500】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、抗細菌免疫応答また
は抗真菌免疫応答を増大し得るアジュバントとして使用される。アジュバントと
して本発明の組成物を使用して増大され得る抗細菌免疫応答または抗真菌免疫応
答としては、細菌または真菌、および本明細書中に記載されるか、またはさもな
くば当該分野で公知の疾患または症状に関連する細菌または真菌が挙げられる。
特定の実施形態において、本発明の組成物は、細菌または真菌、疾患、または症
状(これは、破傷風、ジフテリア、ボツリスム、およびB型髄膜炎からなる群か
ら選択される)に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして使用され
る。
【0501】 別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、細菌または真菌、疾患、ま
たは症状(これは、Vibrio cholerae、Mycobacteri
um leprae、Salmonella typhi、Salmonell
a paratyphi、Meisseria meningitidis、S
treptococcus pneumoniae、Group B stre
ptococcus、Shigella spp.、Enterotoxige
nic Escherichia coli、Enterohemorrhag
ic E.coli、およびBorrelia burgdorferiからな
る群から選択される)に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして使
用される。
【0502】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、抗寄生生物免疫応答
を増大するためのアジュバントとして使用される。アジュバントとして本発明の
組成物を使用して増大され得る抗寄生生物免疫応答としては、寄生生物、および
本明細書中に記載されるかまたはさもなくば当該分野で公知の疾患または症状に
関連する寄生生物が挙げられる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、
寄生生物に対する免疫応答を増大するためのアジュバントとして使用される。別
の特定の実施形態において、本発明の組成物は、Plasmodium(マラリ
ア)またはLeishmaniaに対する免疫応答を増大するためのアジュバン
トとして使用される。
【0503】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストはまた、例えば、単核食
細胞の補充および活性化を妨げることによって、珪肺症、サルコイドーシス、特
発性肺線維症を含む、感染性疾患を処置するために使用され得る。
【0504】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、本発明のポリペプチ
ドに対する免疫媒介応答を阻害または増強するための抗体を生成するための抗原
として使用される。
【0505】 1つの実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、
および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、免疫系をブーストし、1
つ以上の抗体(例えば、IgG、IgA、IgM、およびIgE)の量の増大を
生じ、より高い親和性抗体の産生を誘導し、そして免疫グロブリンのクラススイ
ッチ(例えば、IgG、IgA、IgMおよびIgE)を誘導し、および/また
は免疫応答を増大するための動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、ハムスタ
ー、モルモット、ブタ、ミニブタ、ニワトリ、ラクダ、ヤギ、ウマ、ウシ、ヒツ
ジ、イヌ、ネコ、非ヒト霊長類、およびヒト、最も好ましくはヒト)に投与され
る。
【0506】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、病原に対するB細胞
応答性の刺激物質として使用される。
【0507】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、T細胞のアクチベー
ターとして使用される。
【0508】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、免疫抑制性治療を受
ける前の、個体の免疫状態を増大させる薬剤として使用される。
【0509】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、より高い親和性抗体
を誘導するための薬剤として使用される。
【0510】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、血清免疫グロブリン
濃度を増加するための薬剤として使用される。
【0511】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、免疫無防備状態の個
体の回復を促進するための薬剤として使用される。
【0512】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、高齢の集団の間の免
疫応答性をブーストするための薬剤として使用される。
【0513】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、骨髄移植および/ま
たは他の移植(例えば、同種異系または外因性の器官移植)の前、間、または後
の免疫系エンハンサーとしてとして使用される。移植に関して、本発明の組成物
は、移植の前、同時、および/または後に投与され得る。特定の実施形態におい
て、本発明の組成物は、移植の後、T細胞集団の回復の開始前に投与される。別
の特定の実施形態において、本発明の組成物は、移植の後、T細胞集団の回復の
開始後であるが、B細胞集団の完全な回復の前にまず投与される。
【0514】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、B細胞機能の後天的
欠損を有する個体間で免疫応答性をブーストするための薬剤としてとして使用さ
れる。ポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチドおよび/またはそれらのアゴニス
トもしくはアンタゴニストを投与することによって寛解または処置され得る、B
細胞機能の後天的欠損を生じる状態としては、HIV感染、AIDS、骨髄移植
、およびB細胞慢性リンパ球性白血病(CLL)が挙げられるが、これらに限定
されない。
【0515】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、一時的な免疫不全を
有する個体間で免疫応答性をブーストするための薬剤としてとして使用される。
ポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチドおよび/またはそれらのアゴニストもし
くはアンタゴニストを投与することによって寛解または処置され得る、一時的な
免疫不全を生じる状態としては、ウイルス感染(例えば、インフルエンザ)から
の回復、栄養失調に関連する状態、感染性単核細胞症からの回復、またはストレ
スに関連する状態、麻疹からの回復、輸血からの回復、手術からの回復が挙げら
れるが、これらに限定されない。
【0516】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、単球、樹状細胞およ
び/またはB細胞による抗原提示のレギュレーターとして使用される。1つの実
施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体、および/ま
たはアゴニストもしくはアンタゴニストは、インビトロまたはインビボで抗原提
示を増強するかまたは抗原提示をアンタゴナイズする。さらに、関連する実施形
態において、この抗原提示の増強またはアンタゴナイズは、抗腫瘍処置としてか
または免疫系を調節するために有用であり得る。
【0517】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、個体の免疫系を、T
H1細胞性応答とは反対に、体液性応答(すなわち、TH2)の発生に指向する
ための薬剤として使用される。
【0518】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、腫瘍増殖を誘導し、
従って、腫瘍を抗腫瘍性薬剤に対してより感受性にするための手段として使用さ
れる。例えば、多発性骨髄腫は、緩慢な細胞分裂(dividing)の疾患で
あり、従って、実質的に全ての抗腫瘍性レジメンに対して不応性である。これら
の細胞は、より迅速に増殖させた場合、これらの感受性プロフィールは、おそら
く変化するようである。
【0519】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、AIDS、慢性リン
パ球障害および/または分類不能性免疫不全症(Common Variabl
e Immunodificiency)のような病理におけるB細胞の産生の
刺激因子として使用される。
【0520】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、手術、外傷または遺
伝的欠陥後のリンパ組織の生成および/または再生のための治療としてとして使
用される。別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌ
クレオチド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、移植前の骨
髄サンプルの前処理として使用される。
【0521】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、SCID患者の間で
観察されるような免疫不全(immuno−incompetence/imm
unodeficicency)を生じる遺伝性の障害のための遺伝子ベースの
治療として使用される。
【0522】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、単球に影響を及ぼす
寄生生物疾患(リーシュマニア属(Leshmania))に対して防御するた
めに単球/マクロファージを活性化する手段として使用される。
【0523】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、本発明のポリペプチ
ドによって惹起される分泌サイトカインを調節する手段として用いられる。
【0524】 上記の適用の全ては、獣医学的医療に適用され得る。
【0525】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、外来性因子または自
己に対する種々の局面の免疫応答をブロックする手段として用いられる。免疫応
答の特定の局面が所望され得る疾患または条件の例としては、狼瘡および関節炎
のような自己免疫障害、ならびに皮膚アレルギー、炎症、腸疾患、損傷および病
原体に関連する疾患/障害に対する免疫応答が挙げられる。
【0526】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、自己免疫疾患(例え
ば、特発性血小板減少性紫斑病、全身性エリテマトーデスおよび多発性硬化症)
に関連するB細胞増殖およびIg分泌を妨げるための治療として用いられる。
【0527】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、内皮細胞におけるB
細胞および/またはT細胞の遊走のインヒビターとして用いられる。この活性は
、組織構造または同属の応答を破壊し、そして例えば、免疫応答の破壊および敗
血症のブロックにおいて有用である。
【0528】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、未定量有意性の単一
クローン性高ガンマグロブリン血症(monoclonalgammopath
y of undetermined significance)(MGUS
)、ヴァルデンストレーム疾患、関連する特発性単一クローン性高ガンマグロブ
リン血症、およびプラスマ細胞腫のような疾患における、慢性の高ガンマグロブ
リン血症事象のための治療として用いられる。
【0529】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、例えば、特定の自己
免疫疾患および慢性炎症疾患および感染性疾患における、マクロファージおよび
その前駆体、ならびに好中球、好塩基球、Bリンパ球およびいくつかのT細胞サ
ブセット(例えば、活性化T細胞およびCD8細胞傷害性T細胞ならびにナチュ
ラルキラー細胞)の、ポリペプチド走化性および活性化を阻害するために使用さ
れ得る。自己免疫疾患の例は、本明細書中に記載され、これらには、多発性硬化
症およびインスリン依存性糖尿病が挙げられる。
【0530】 本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および/またはアゴニスト
もしくはアンタゴニストはまた、好酸球の産生および遊走を妨げることによって
、特発性好酸球増多症候群を処置するために使用され得る。
【0531】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、補体媒介性細胞溶解
を増強または阻害するために用いられる。
【0532】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、抗体依存性細胞傷害
性を増強または阻害するために用いられる。
【0533】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストはまた、例えば、動脈壁
における単球浸潤を妨げることによって、アテローム性動脈硬化症を処置するた
めに使用され得る。
【0534】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、成人呼吸窮迫症候群
(ARDS)を処置するために使用され得る。
【0535】 別の特定の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、創傷および組織の修
復の刺激、新脈管形成の刺激、血管またはリンパの疾患または障害の修復の刺激
に有用であり得る。さらに、本発明のアゴニストおよびアンタゴニストは、粘膜
表面の再生を刺激するために使用され得る。
【0536】 特定の実施形態において、ポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、および/
またはそれらのアゴニストは、原発性または後天性の免疫不全症、欠損性の血清
免疫グロブリン産生、再発性の感染および/または免疫機能不全によって特徴付
けられる障害を処置または予防するために使用される。さらに、ポリヌクレオチ
ドまたはポリペプチド、ならびに/あるいはそれらのアゴニストは、関節、骨、
皮膚および/または耳下腺の感染、血液由来の感染(例えば、敗血症、髄膜炎、
敗血症性関節炎および/または骨髄炎)、自己免疫疾患(例えば、本明細書中に
開示されるような自己免疫疾患)、炎症性障害、および悪性疾患、ならびに/あ
るいはこれらの感染、疾患および/または悪性疾患に関連する任意の疾患または
障害または状態(CVID、他の原発性免疫不全、HIV疾患、CLL、再発性
気管支炎、静脈洞炎、中耳炎、結膜炎、肺炎、肝炎、髄膜炎、帯状ヘルペス(例
えば、重篤な帯状ヘルペス)および/またはニューモシスティスを含むが、これ
らに限定されない)を処置または予防するために使用され得る。本発明のポリペ
プチド、抗体、ポリヌクレオチド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴ
ニストを用いて、予防、診断または処置され得る他の疾患および障害としては、
HIV感染、HTLV−BLV感染、リンパ球減少症、食細胞殺菌性機能不全貧
血、血小板減少症、およびヘモグロビン尿が挙げられるがこれらに限定されない
【0537】 別の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、お
よび/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、分類不能性免疫不全症(c
ommon variable Immunodeficiency dise
ase)(「CVID」;「後天性無ガンマグロブリン血症」および「後天性低
ガンマグロブリン血症」としても公知である)またはこの疾患のサブセットを有
する個体を、処置および/または診断するために使用される。
【0538】 特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体な
らびに/あるいはアゴニストまたはアンタゴニストは、自己免疫細胞または組織
関連癌もしくは新生物を含む癌または新生物を処置、診断、および/または予防
するために用いられ得る。本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体なら
びに/あるいはアゴニストまたはアンタゴニストによって予防、診断、または処
置され得る癌または新生物の例は、本明細書に記載されており、そして急性骨髄
性白血病、慢性骨髄性白血病、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、急性リンパ球
性貧血(ALL)、慢性リンパ球性白血病、プラスマ細胞腫、多発性骨髄腫、バ
ーキットリンパ腫、およびEBV変態疾患が挙げられる。好ましい実施形態にお
いて、毒素または放射性同位体に結合体化された本発明のポリヌクレオチド、ポ
リペプチド、抗体ならびに/あるいはアゴニストまたはアンタゴニストは、本明
細書中に記載のように、癌および新生物を処置、診断、および/または予防する
ために用いられ得る。さらに好ましい実施形態において、毒素または放射性同位
体に結合体化された本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体ならびに/
あるいはアゴニストまたはアンタゴニストは、本明細書に記載のように、急性骨
髄性白血病を処置、診断、および/または予防するために用いられ得る。
【0539】 別の特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗
体ならびに/あるいはアゴニストまたはアンタゴニストは、ラージB細胞リンパ
腫の細胞増殖を減少するための治療として用いられる。
【0540】 別の特定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチ
ド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、慢性骨髄性白血病に
関連するB細胞およびIgの関与を減少する手段として用いられる。
【0541】 特定の実施形態において、本発明の組成物は、例えば、部分的または完全な脾
臓切除を蒙った個体のような、B細胞免疫不全個体の間で免疫反応性をブースト
するための薬剤として用いられる。
【0542】 本発明のアンタゴニストとしては、例えば、本発明のポリペプチドの結合抗体
および/または阻害性抗体、アンチセンス核酸、リボザイムまたは可溶性形態(
例えば、Fc融合タンパク質)が挙げられる(例えば、実施例9を参照のこと)
。本発明のアゴニストとしては、例えば、このポリペプチドの結合抗体および/
または刺激性抗体、および可溶性形態(例えば、Fc融合タンパク質)が挙げら
れる(例えば、実施例9を参照のこと)。本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌ
クレオチド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、例えば、本
明細書に記載されるような、薬学的に受容可能なキャリアと組み合わせて使用さ
れ得る。
【0543】 別の実施形態において、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、お
よび/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、機能的な内因性抗体分子を
産生し得ないか、またはさもなければ内因性免疫系不全を有するが、別の動物由
来の再構成されたかまたは部分的に再構成された免疫系によってヒト免疫グロブ
リン分子を産生し得る、動物(上記した動物を含むがこれに限定されず、また、
トランスジェニック動物も含む)に投与される(例えば、公開PCT出願番号W
O98/24893、WO/9634096、WO/9633735、およびW
O/9110741を参照のこと)。本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレ
オチド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストをこのような動物へ
投与することは、本発明のポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、および/ま
たはアゴニストもしくはアンタゴニストに対するモノクローナル抗体を生成する
ために有用である。
【0544】 さらに、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドおよび/またはアンタゴニ
ストは、アポトーシスに影響し得、従って、細胞生存の増大あるいはアポトーシ
スの阻害に関連する多くの疾患の処置において有用である。例えば、本発明のポ
リヌクレオチド、ポリペプチドおよび/またはアンタゴニストによって処置また
は検出され得る、細胞生存の増大あるいはアポトーシスの阻害に関連する疾患と
しては、癌(例えば、濾胞性リンパ腫、p53変異を有する癌腫、およびホルモ
ン依存性腫瘍、これらは以下:結腸癌、心臓腫瘍、膵臓癌、黒色腫、網膜芽細胞
腫、神経膠芽細胞腫、肺癌、腸の癌、精巣癌、胃癌、神経芽細胞腫、粘液腫、筋
腫、リンパ腫、内皮腫、骨芽細胞腫、骨巨細胞腫、骨肉腫、軟骨肉腫、腺腫、乳
癌、前立腺癌、カポージ肉腫および卵巣癌を含むが、これらに限定されない);
自己免疫障害(例えば、多発性硬化症、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、胆
汁性肝硬変、ベーチェット病(Behcet’s disease)、クローン
病、多発性筋炎、全身性エリテマトーデスおよび免疫関連糸球体腎炎ならびに慢
性関節リウマチ)およびウイルス感染(例えば、ヘルペスウイルス、ポックスウ
イルスおよびアデノウイルス)、炎症、対宿主性移植片病、急性移植片拒絶、な
らびに慢性移植片拒絶、が挙げられる。
【0545】 好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドおよび
/またはアンタゴニストは、特に上記に列挙される癌の増殖、進行、および/ま
たは転移を阻害するために使用される。
【0546】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドおよび/またはアンタゴニストによ
って処置または検出され得る、細胞生存の増大に関連するさらなる疾患または状
態としては、悪性疾患ならびに以下のような関連する障害の進行および/または
転移が挙げられるが、これらに限定されない:白血病(急性白血病(例えば、急
性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病(骨髄芽球性、前骨髄球性、骨髄単球性、
単球性および赤白血病を含む)を含む)ならびに慢性白血病(例えば、慢性骨髄
性(顆粒球性)白血病および慢性リンパ球性白血病))、真性赤血球増加症、リ
ンパ腫(例えば、ホジキン病および非ホジキン病)、多発性骨髄腫、ヴァルデン
ストレームマクログロブリン血症、H鎖病、ならびに固形腫瘍(肉腫および癌腫
(例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、脊索腫、血
管肉腫、内皮肉腫(endotheliosarcoma)、リンパ管肉腫、リ
ンパ管内皮腫、骨膜腫、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結
腸癌腫、膵臓癌、乳癌、卵巣癌、前立腺癌、扁平上皮癌、基底細胞癌、腺癌、汗
腺癌、皮脂腺癌、乳頭状癌、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原生癌、腎
細胞癌、肝細胞癌、胆管癌、絨毛癌、セミノーマ、胎生期癌、ウィルムス腫瘍、
頸部癌、精巣腫瘍、肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠腫、神経膠星状
細胞腫、髄芽細胞腫、頭蓋咽頭腫、脳室上衣細胞腫、松果体腫、血管芽細胞腫、
聴神経腫、乏突起神経膠腫、髄膜腫(menangioma)、黒色腫、神経芽
細胞腫、および網膜芽細胞腫)を含むが、これらに限定されない)。
【0547】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドおよび/またはアンタゴニストによ
って処置または検出され得る、アポトーシスの増大に関連するさらなる疾患とし
ては、以下が挙げられる:AIDS;神経変性障害(例えば、アルツハイマー病
、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症、色素性網膜炎、小脳変性および脳腫瘍
または以前に関連した疾患);自己免疫障害(例えば、多発性硬化症、シェーグ
レン症候群、橋本甲状腺炎、胆汁性肝硬変、ベーチェット病(Behcet’s
disease)、クローン病、多発性筋炎、全身性エリテマトーデスおよび
免疫関連糸球体腎炎ならびに慢性関節リウマチ)、脊髄形成異常症候群(例えば
、再生不良性貧血)、対宿主性移植片病、虚血性傷害(心筋梗塞、発作および再
灌流傷害によって生じるようなもの)、肝臓傷害(例えば、肝炎関連肝臓傷害、
虚血/再灌流傷害、胆汁うっ滞(cholestosis)(胆管傷害)および
肝臓癌);毒物誘導性肝臓疾患(アルコールによって引き起こされるようなもの
)、敗血症性ショック、悪液質ならびに食欲不振。
【0548】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、ならびに/あるいはアンタゴニス
トによって検出および/または処置され得る過剰増殖の疾患および/または障害
の例としては、肝臓、腹部、骨、乳房、消化器系、膵臓、腹膜、内分泌腺(副腎
、上皮小体、下垂体、精巣、卵巣、胸腺、甲状腺)、眼、頭部および頸部、神経
(中枢および末梢)、リンパ系、骨盤、皮膚、軟組織、脾臓、胸部、ならびに泌
尿生殖器に位置する新生物が挙げられるが、これらに限定されない。
【0549】 同様に、他の過剰増殖障害もまた、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド
、ならびに/あるいはアンタゴニストにより処置または検出され得る。このよう
な過剰増殖性障害の例としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:高
ガンマグロブリン血症、リンパ球増殖性障害、パラプロテイン血症、紫斑、サル
コイドーシス、セザリー症候群、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症、
ゴシェ病、組織球増殖症、および任意の他の過剰増殖性疾患、加えて上記に列挙
した器官系に見出される新生物。
【0550】 (過剰増殖障害) 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくは
アンタゴニストを使用し、新生物を含む過剰増殖障害を処置または検出し得る。
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはア
ンタゴニストは、直接的または間接的な相互作用を介してこの障害の増殖を阻害
し得る。あるいは、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはア
ゴニストもしくはアンタゴニストは、過剰増殖障害を阻害し得る他の細胞を増殖
し得る。
【0551】 例えば、免疫応答を増大させること、特に過剰増殖障害の抗原性の質を増大さ
せることによって、またはT細胞を増殖、分化、もしくは動員することによって
、過剰増殖障害を処置し得る。既存の免疫応答を増強するか、または新たな免疫
応答を開始するかのいずれかによって、この免疫応答を増大させ得る。あるいは
、免疫応答を減少させることもまた、化学療法剤のような、過剰増殖障害を処置
する方法であり得る。
【0552】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくは
アンタゴニストによって処置または検出され得る過剰増殖障害の例としては、結
腸、腹部、骨、乳房、消化器系、肝臓、膵臓、腹膜、内分泌腺(副腎、上皮小体
、下垂体、精巣、卵巣、胸腺、甲状腺)、眼、頭部および頸部、神経(中枢およ
び末梢)、リンパ系、骨盤、皮膚、軟組織、脾臓、胸部、ならびに泌尿生殖器に
位置する新生物が挙げられるが、これらに限定されない。
【0553】 同様に、他の過剰増殖障害もまた、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペ
プチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストにより処置または検出され得
る。このような過剰増殖性障害の例としては、以下が挙げられるがこれらに限定
されない:高ガンマグロブリン血症、リンパ球増殖性障害、パラプロテイン血症
、紫斑、サルコイドーシス、セザリー症候群、ヴァルデンストレームマクログロ
ブリン血症、ゴシェ病、組織球増殖症、および任意の他の過剰増殖性疾患、加え
て上記に列挙した器官系に見出される新生物。
【0554】 本発明のポリヌクレオチドを利用する1つの好ましい実施形態は、本発明およ
び/または融合タンパク質もしくはそのフラグメントを用いる遺伝子治療によっ
て、異常な細胞分裂を阻害することである。
【0555】 従って、本発明は、本発明のポリヌクレオチドを異常に増殖している細胞に挿
入することによって、細胞増殖性障害を処置するための方法を提供し、ここでこ
のポリヌクレオチドはこの発現を示す。
【0556】 本発明の別の実施形態は、個体における細胞増殖性障害を処置する方法を提供
し、この方法は、本発明の1以上の活性遺伝子コピーを異常に増殖している1つ
の細胞または複数の細胞に投与することを包含する。好ましい実施形態において
は、本発明のポリヌクレオチドは、このポリヌクレオチドをコードするDNA配
列の発現において有効な組換え発現ベクターを含むDNA構築物である。本発明
の別の好ましい実施形態においては、本発明のポリヌクレオチドをコードするD
NA構築物は、レトロウイルスベクター、またはより好ましくは、アデノウイル
スベクターを用いて、処理されるべき細胞に挿入される(G J.Nabelら
、PNAS 1999 96:324−326(これは、本明細書中に参考とし
て援用される)を参照のこと)。最も好ましい実施形態においては、ウイルスベ
クターは不完全であり、非増殖性細胞ではなく増殖性細胞のみを形質転換する。
さらに、好ましい実施形態においては、単独、または他のポリヌクレオチドと組
み合わされたかもしくは融合されたかのいずれかで増殖性細胞に挿入される本発
明のポリヌクレオチドは、次いで外部刺激(すなわち、磁気、特異的小分子、化
学的、または薬物投与など)を介して調節され得、これはこのポリヌクレオチド
の上流のプロモーターに作用し、コードされたタンパク質産物の発現を誘導する
。このように、本発明の有益な治療効果は、この外部刺激に基づいて明確に調節
され得る(すなわち、本発明の発現を増加、減少、または阻害する)。
【0557】 本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、他の脈管形成タンパ
ク質をコードする他のポリヌクレオチドと一緒に投与され得る。脈管形成タンパ
ク質としては、酸性および塩基性の線維芽細胞増殖因子、VEGF−1、VEG
F−2、VEGF−3、上皮増殖因子αおよびβ、血小板由来の内皮細胞増殖因
子、血小板由来増殖因子、腫瘍壊死因子α、肝細胞増殖因子、インスリン様増殖
因子、コロニー刺激因子、マクロファージコロニー刺激因子、顆粒球/マクロフ
ァージコロニー刺激因子、および一酸化窒素シンターゼが挙げられるが、これら
に限定されない。
【0558】 本発明のポリヌクレオチドは、発癌遺伝子または抗原の発現の抑制において有
用であり得る。「発癌遺伝子の発現の抑制」によって、遺伝子の転写の抑制、遺
伝子転写物の分解(プレメッセージ(pre−message)RNA)、スプ
ライシングの阻害、メッセンジャーRNAの破壊、タンパク質の翻訳後修飾の阻
止、タンパク質の破壊、またはタンパク質の正常な機能の阻害が意図される。
【0559】 異常に増殖している細胞への局所的投与のために、本発明のポリヌクレオチド
は当業者に公知の任意の方法によって投与され得、この方法としては、トランス
フェクション、エレクトロポレーション、細胞の微量注入、またはビヒクル(例
えば、リポソーム、リポフェクチン)中で、または裸のポリヌクレオチドとして
、あるいは本明細書を通して記載される任意の他の方法が挙げられるが、これら
に限定されない。本発明のポリヌクレオチドは、公知の遺伝子送達系(例えば、
レトロウイルスベクター(Gilboa,J.Virology 44:845
(1982);Hocke,Nature 320:275(1986);Wi
lsonら、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.85:30
14)、ワクシニアウイルス系(Chakrabartyら、Mol.Cell
Biol.5:3403(1985))または当業者に公知の他の有効なDN
A送達系(Yatesら、Nature 313:812(1985))がある
が、これらに限定されない)によって送達され得る。これらの参考文献は、例示
のみであり、本明細書中に参考として援用される。異常に増殖している細胞を特
異的に送達またはトランスフェクトし、そして非分裂細胞を避けるために、当業
者に公知のレトロウイルス、またはアデノウイルス(当該分野および本明細書中
の他のいずれかに記載のような)送達系を使用することが好ましい。宿主DNA
複製は、組み込みのためにレトロウイルスDNAを必要とし、レトロウイルスは
そのライフサイクルに必要なレトロウイルス遺伝子を欠くために自己複製できな
いからである。このようなレトロウイルス送達系を本発明のポリヌクレオチドの
ために用いることによって、この遺伝子および構築物は異常に増殖している細胞
を標的とし、そして非分裂正常細胞を避ける。
【0560】 本発明のポリヌクレオチドは、注射針を疾患部位に直接導くために使用される
画像化デバイスの使用によって、内部器管、体腔などにおける細胞増殖性障害/
疾患部位へ直接送達され得る。本発明のポリヌクレオチドはまた、外科的処置の
ときに疾患部位へ投与され得る。
【0561】 「細胞増殖性疾患」によって、器管、腔、または身体の部分の任意の1つまた
は任意の組み合わせに影響を与える、任意のヒトまたは動物の疾患もしくは障害
が意味され、これは良性であるか悪性であるかに関わらず、細胞、細胞の群、ま
たは組織の単一または複数の局所的異常増殖によって特徴付けられる。
【0562】 本発明のポリヌクレオチドが処置される細胞の増殖に対して生物学的に阻害す
る効果を有する限り、本発明のポリヌクレオチドの任意の量が投与され得る。さ
らに、本発明のポリヌクレオチドの1つより多くを、同じ部位へ同時に投与する
ことが可能である。「生物学的に阻害する」によって、細胞の部分的または全体
的な増殖阻害および細胞の増殖(proliferation)または成長(g
rowth)の速度における減少が意味される。生物学的阻害用量は、組織培養
物における標的悪性細胞増殖もしくは異常増殖細胞増殖、動物および細胞培養物
における腫瘍増殖に対する本発明のポリヌクレオチドの効果を評価することによ
って、または当業者に公知の任意の他の方法によって決定され得る。
【0563】 本発明はさらに、抗体に基づく治療に関し、この治療は、1以上の記載された
障害を処置するために、抗ポリペプチド抗体および抗ポリヌクレオチド抗体を哺
乳動物(好ましくは、ヒト)患者に投与する工程を包含する。抗ポリペプチド抗
体および抗ポリヌクレオチド抗体のポリクロナール抗体およびモノクロナール抗
体を生成するための方法は、本明細書中のいずれかに詳細に記載される。このよ
うな抗体は、当該分野において公知であるかまたは本明細書中に記載されるよう
な薬学的に受容可能な組成物中に提供され得る。
【0564】 本発明の抗体が治療的に使用され得る方法の要旨は、本発明のポリヌクレオチ
ドまたはポリペプチドを、身体中で局所的もしくは全体的に、または抗体の直接
的な細胞傷害性によって(例えば、相補細胞(CDC)またはエフェクター細胞
(ADCC)によって媒介されるように)結合させる工程を包含する。これらの
アプローチのいくつかは、以下により詳細に記載される。本明細書中に提供され
る教示によって、当業者は過度の実験なしで、本発明の抗体を診断目的、モニタ
リング目的または治療目的のために使用する方法を理解する。
【0565】 特に、本発明の抗体、フラグメントおよび誘導体は、本明細書中に記載される
ような細胞増殖性障害および/または細胞分化障害を有しているかまたは発症し
ている被験体を処置するために有用である。このような処置は、抗体もしくはフ
ラグメント、誘導体またはそれらの結合体の単一または複数の用量を投与する工
程を包含する。
【0566】 本発明の抗体は、例えば、他のモノクロナール抗体もしくはキメラ抗体と組み
合わせて、またはリンホカインもしくは造血成長因子と組み合わせて有利に使用
され得、例えば、これは抗体と相互作用するエフェクター細胞の数または活性を
増加させるために役立つ。
【0567】 本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対して高親和性抗体および/
または強力なインビボ阻害抗体および/または中和抗体、それらのフラグメント
もしくは領域を、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド(それらのフラ
グメントを含む)を指向するイムノアッセイおよびそれらに関連する障害の治療
の両方のために使用することが好ましい。このような抗体、フラグメントまたは
領域は、好ましくは、ポリヌクレオチドまたはポリペプチド(それらのフラグメ
ントを含む)に対する親和性を有する。好ましい結合親和性としては、5×10−6 M、10−6M、5×10−7M、10−7M、5×10−8M、10−8 M、5×10−9M、10−9M、5×10−10M、10−10M、5×10−11 M、10−11M、5×10−12M、10−12M、5×10−13
、10−13M、5×10−14M、10−14M、5×10−15Mおよび1
−15M未満の解離定数すなわちKdを伴う結合親和性が挙げられる。
【0568】 さらに、本明細書中のいずれかに記載されるように、本発明のポリペプチドは
、単独で、融合タンパク質として、または他のポリペプチドと組み合わせて、直
接的または間接的のいずれかで、増殖性細胞または組織の新脈管形成の阻害にお
いて有用である。最も好ましい実施形態においては、この抗新脈管形成効果は、
例えば造血性細胞、腫瘍特異的細胞(例えば、腫瘍関連マクロファージ)の阻害
を通して、間接的に達成され得る(Joseph IBら、J Natl Ca
ncer Inst,90(21):1648−53(1998)(これは本明
細書中に参考として援用される)を参照のこと)。本発明のポリペプチドまたは
ポリヌクレオチドを指向する抗体はまた、直接的または間接的に新脈管形成の阻
害を生じ得る(Witte Lら、Cancer Metastasis Re
v.17(2):155−61(1998)(これは本明細書中に参考として援
用される)を参照のこと)。
【0569】 本発明のポリペプチド(融合タンパク質を含む)またはそのフラグメントは、
アポトーシスの誘導を介した増殖性細胞または組織の阻害において有用であり得
る。このポリペプチドは、例えば、デスドメインレセプター(例えば、腫瘍壊死
因子(TNF)レセプター1、CD95(Fas/APO−1)、TNFレセプ
ター関連アポトーシス媒介タンパク質(TRAMP)およびTNF関連アポトー
シス誘導リガンド(TRAIL)レセプター1およびレセプター2)の活性化に
おいて、直接的または間接的のいずれかで、増殖性細胞および組織のアポトーシ
スを誘導するために作用し得る(Schulze−Osthoff Kら、Eu
r J Biochem 254(3):439−59(1998)(これは本
明細書中に参考として援用される)を参照のこと)。さらに、本発明の別の好ま
しい実施形態においては、このポリペプチドは、他の機構を介して(例えば、ア
ポトーシスを活性化する他のタンパク質の活性化において)、あるいは単独また
は小分子薬物もしくはアジュバント(例えば、アポプトニン(apoptoni
n)、ガレクチン、チオレドキシン、抗炎症タンパク質)との組み合わせのいず
れかで、このタンパク質の発現の刺激を介して、アポトーシスを誘導し得る(例
えば、Mutat Res 400(1−2):447−55(1998)、M
ed Hypotheses.50(5):423−33(1998)、Che
m Biol Interact.Apr 24;111−112:23−34
(1998)、J Mol Med.76(6):402−12(1998)、
Int J Tissue React;20(1):3−15(1998)(
これらはすべて本明細書中に参考として援用される)を参照のこと)。
【0570】 本発明のポリペプチド(それとの融合タンパク質もしくはそのフラグメントを
含む)は、増殖性細胞または組織の転移の阻害において有用である。阻害は、ポ
リペプチド、または本明細書中のいずれかに記載されるようなこのポリペプチド
を指向する抗体の投与の直接的な結果として、あるいは間接的に(例えば、転移
を阻害することが知られているタンパク質(例えば、α4インテグリン)の発現
の活性化)生じ得る(例えば、Curr Top Microbiol Imm
unol 1998;231:125−41(これは本明細書中に参考として援
用される)を参照のこと)。本発明のこのような治療的効果は、単独、または小
分子薬物もしくはアジュバントとの組み合わせのいずれかで達成され得る。
【0571】 別の実施形態においては、本発明は、本発明のポリペプチドを含有する組成物
(例えば、異種ポリペプチド、異種核酸、毒素、またはプロドラッグに会合する
ポリペプチドまたはポリペプチド抗体を含有する組成物)を、本発明のポリペプ
チドを発現する標的細胞に送達する方法を提供する。本発明のポリペプチドまた
はポリペプチド抗体は、疎水性、親水性、イオン性および/または共有結合性相
互作用を介して、異種ポリペプチド、異種核酸、毒素、またはプロドラッグに会
合し得る。
【0572】 本発明のポリペプチド、それらとの融合タンパク質またはそれらのフラグメン
トは、直接的(例えば、本発明のポリペプチドが増殖性抗原および免疫原に応答
するために、免疫応答を「ワクチン接種した」場合に起こるように)、または間
接的(例えば、この抗原および免疫原に対する免疫応答を増強することが知られ
ているタンパク質(例えば、ケモカイン)の発現の活性化におけるように)のい
ずれかで、増殖細胞または組織の免疫原性および/または抗原性の増強において
有用である。
【0573】 (心臓血管障害) 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくは
アンタゴニストを使用して、四肢虚血のような末梢動脈疾患を含む、心臓血管障
害を処置し得る。
【0574】 心臓血管障害としては、動動脈瘻(arterio−arterial fi
stula)、動静脈瘻、大脳動静脈先天異常、先天性心欠陥(congeni
tal heart defects)、肺動脈弁閉鎖症、およびシミター症候
群のような心臓血管異常が挙げられる。先天性心欠陥としては、大動脈縮窄、三
房心、冠状脈管奇形(coronary vessel anomalies)
、交差心、右胸心、開存性動脈管(patent ductus arteri
osus)、エブスタイン奇形、アイゼンメンガー複合体、左心室発育不全症候
群、左胸心、ファロー四徴症、大血管転位症、両大血管右室起始症、三尖弁閉鎖
症、動脈管遺残、および心中隔欠損症(heart septal defec
ts)(例えば、大動脈肺動脈中隔欠損症(aortopulmonary s
eptal defect)、心内膜床欠損症、リュタンバッシェ症候群、ファ
ロー三徴症、心室心中隔欠損症(ventricular heart sep
tal defects))が挙げられる。
【0575】 心臓血管障害としてはまた、不整脈、カルチノイド心臓病、高心拍出量(hi
gh cardiac output)、低心拍出量(low cardiac
output)、心タンポナーデ、心内膜炎(細菌性を含む)、心臓動脈瘤、
心停止、うっ血性心不全、うっ血性心筋症、発作性呼吸困難、心臓水腫、心肥大
、うっ血性心筋症、左心室肥大、右心室肥大、梗塞後心破裂(post−inf
arction heart rupture)、心室中隔破裂、心臓弁疾患、
心筋疾患、心筋虚血、心内膜液浸出、心外膜炎(梗塞性および結核性を含む)、
気心膜症、心膜切開後症候群、右心疾患、リウマチ性心疾患、心室機能不全、充
血、心臓血管妊娠合併症(cardiovascular pregnancy
complications)、シミター症候群、心血管梅毒、および心血管
結核(cardiovascular tuberculosis)のような心
臓病が挙げられる。
【0576】 不整脈としては、洞性不整脈、心房性細動、心房粗動、徐脈、期外収縮、アダ
ムズ−ストークス症候群、脚ブロック、洞房ブロック、長QT症候群(long
QT syndrome)、副収縮、ローン−ギャノング−レヴァイン症候群
、マヘーム型早期興奮症候群(Mahaim−type pre−excita
tion syndrome)、ウルフ−パーキンソン−ホワイト症候群、洞不
全症候群、頻拍、および心室性細動が挙げられる。頻拍としては、発作性頻拍、
上室性頻拍、心室固有調律促進、房室結節性再入頻拍(atrioventri
cular nodal reentry tachycardia)、異所心
房性頻拍、異所接合部頻拍、洞房結節性再入頻拍(sinoatrial no
dal reentry tachycardia)、洞性頻拍、トルサード・
ド・ポワント、および心室性頻拍が挙げられる。
【0577】 心臓弁疾患としては、大動脈弁機能不全症、大動脈弁狭窄症、心雑音(hea
r murmurs)、大動脈弁逸脱症、僧帽弁逸脱症、三尖弁逸脱症、僧帽弁
機能不全、僧帽弁狭窄症、肺動脈弁閉鎖症、肺動脈弁機能不全、肺動脈弁狭窄症
、三尖閉鎖症、三尖弁機能不全、および三尖弁狭窄症が挙げられる。
【0578】 心筋疾患としては、アルコール性心筋症、うっ血性心筋症、肥大型心筋症、弁
下部性大動脈狭搾症、弁下部性肺動脈狭搾症、拘束型心筋症、シャーガス心筋症
、心内膜線維弾性症、心内膜心筋線維症、キーンズ症候群、心筋再灌流障害、お
よび心筋炎が挙げられる。
【0579】 心筋性虚血としては、狭心症、冠動脈瘤、冠動脈硬化、冠動脈血栓症、冠動脈
血管痙攣、心筋梗塞、および心筋気絶(myocardial stunnin
g)のような冠動脈疾患が挙げられる。
【0580】 心臓血管疾患としてはまた、動脈瘤、血管形成異常、血管腫症、細菌性血管腫
症状、ヒッペル−リンダラ疾患(Hippel−Lindau Disease
)、クリペル−トルノネー−ウェーバー症候群、スタージ−ウェーバー症候群、
血管運動神経性水腫、大動脈疾患、高安動脈炎、大動脈炎、ルリーシュ症候群、
動脈閉塞疾患、動脈炎、動脈内膜炎(enarteritis)、結節性多発性
動脈炎、脳血管障害、糖尿病性血管障害、糖尿病性網膜症、塞栓症、血栓症、先
端紅痛症、痔、肝静脈閉塞障害、高血圧、低血圧、虚血、末梢血管障害、静脈炎
、肺静脈閉塞疾患、高血圧、低血圧、虚血、末梢血管疾患、静脈炎、肺静脈閉塞
疾患、レーノー病、CREST症候群、網膜静脈閉塞、シミター症候群、上大静
脈症候群、毛細血管拡張症、毛細血管拡張性運動失調(atacia tela
ngiectasia)、遺伝性出血性毛細管拡張症、精索静脈瘤、拡張蛇行静
脈、静脈瘤性潰瘍、脈管炎、および静脈機能不全のような血管疾患が挙げられる
【0581】 動脈瘤としては、解離性動脈瘤、偽動脈瘤、感染した動脈瘤、破裂した動脈瘤
、大動脈性動脈瘤、大脳性動脈瘤、冠動脈瘤、心動脈瘤、および腸骨性動脈瘤が
挙げられる。
【0582】 動脈閉塞疾患としては、動脈硬化症、間欠性跛行、頸動脈狭窄症、線維筋性形
成異常、腸間膜性血管閉塞、モヤモヤ病、腎動脈閉塞、網膜動脈閉塞、および閉
塞性血栓性血管炎が挙げられる。
【0583】 脳血管障害としては、頸動脈疾患、脳のアミロイドアンギオパチー、大脳動脈
瘤、大脳無酸素症、大脳動脈硬化、大脳動静脈先天異常、大脳動脈疾患、大脳の
塞栓症および血栓症、頸動脈血栓症、洞血栓症、ヴァレンベルク症候群、大脳出
血、硬膜上血腫、硬膜下血腫、クモ膜下出血(subaraxhnoid he
morrhage)、大脳梗塞、大脳虚血(一過性を含む)、鎖骨下動脈盗血症
候群、室周白軟化症(periventricular leukomalac
ia)、血管性頭痛、群発性頭痛、片頭痛、および椎骨基部(vertebro
basilar)機能不全が挙げられる。
【0584】 塞栓症としては、空気塞栓症、羊水塞栓症、コレステロール塞栓症、爪先チア
ノーゼ症候群、脂肪塞栓症、肺動脈塞栓症、および血栓塞栓症が挙げられる。血
栓症としては、冠状動脈血栓症、肝静脈血栓症、網膜静脈閉塞、頸動脈血栓症、
洞血栓症、ヴァレンベルク症候群、および血栓性静脈炎が挙げられる。
【0585】 虚血としては、大脳虚血、虚血性大腸炎、仕切り症候群(compartme
nt syndrome)、前仕切り症候群(anterior compar
tment syndrome)、心筋虚血、再灌流傷害、および末梢四肢虚血
が挙げられる。脈管炎としては、大動脈炎、動脈炎、ベーチェット(Behce
t)症候群、チャーグ−ストラウス症候群、粘膜皮膚リンパ節症候群、閉塞性血
栓性血管炎、過敏性血管炎、シェーンライン−ヘーノホ紫斑病(Schoenl
ein−Henoch purpura)、アレルギー性皮膚血管炎およびヴェ
ーゲナー肉芽腫症が挙げられる。
【0586】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくは
アンタゴニストは、危険な四肢虚血および冠状動脈疾患の処置に対して特に有効
である。
【0587】 ポリペプチドは、当該分野で公知である任意の方法を使用して投与され得、こ
れらの方法としては、送達部位における直接的針注射、静脈内注射、局所投与、
カテーテル注入、微粒子銃(biolistic)注射、粒子加速器、ゲルフォ
ームスポンジデポー、他の市販デポー物質、浸透圧ポンプ、経口または坐剤の固
形薬学的処方物、手術中のデカンティングまたは局所適用、エアロゾル送達が挙
げられるが、これらに限定されない。そのような方法は当該分野で公知である。
本発明のポリペプチドは、下記でより詳細に記載される、治療剤(Therap
eutic)の一部として投与され得る。本発明のポリヌクレオチドを送達する
方法は本明細書中でより詳細に記載される。
【0588】 (抗新脈管形成活性) 新脈管形成の内因性の、刺激因子とインヒビターとの間の天然に存在する平衡
は、阻害影響が優勢である平衡である。Rastinejadら、Cell 5
6:345〜355(1989)。新生血管形成が正常な生理学的条件下におい
て生じるまれな場合(例えば、創傷治癒、器官再生、胚発生、および雌性生殖プ
ロセス)において、新脈管形成は、厳密に調節され、そして空間的および時間的
に定められる。病的な新脈管形成の条件(例えば、固形腫瘍増殖を特徴付ける)
の下において、これらの調節の制御はできない。調節されていない新脈管形成は
病的になり、そして多くの新生物性疾患および非新生物性疾患の進行を維持する
。多くの重篤な疾患は、固形腫瘍の増殖および転移、関節炎、いくつかの型の眼
の疾患、障害および/または状態ならびに乾癬を含む、異常な新生血管形成によ
り支配される。例えば、Mosesら、Biotech.9:630〜634(
1991);Folkmanら、N.Engl.J.Med.、333:175
7〜1763(1995);Auerbachら、J.Microvasc.R
es.29:401〜411(1985);Folkman、Advances
in Cancer Research(編)、KleinおよびWeinh
ouse編、Academic Press、New York、175〜20
3頁(1985);Patz、Am.J.Opthalmol.94:715〜
743(1982);およびFolkmanら、Science 221:71
9〜725(1983)による概説を参照のこと。多くの病的状態において、新
脈管形成のプロセスは、その疾患状態に寄与する。例えば、固形腫瘍の増殖が新
脈管形成に依存することを示唆する有意なデータが蓄積されている。Folkm
anおよびKlagsbrun、Science 235:442〜447(1
987)。
【0589】 本発明は、本発明のポリヌクレオチドおよび/またはポリペプチド、ならびに
本発明のアゴニストまたはアンタゴニストの投与による新生血管形成に関連する
疾患、障害および/または状態の処置を提供する。本発明のポリヌクレオチドお
よびポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストを用いて処置し得
る悪性状態および転移性状態には、本明細書に記載の悪性疾患、固形腫瘍、およ
び癌、ならびに当該分野で公知の他のもの(このような障害の総説については、
Fishmanら、Medicine、第2版、J.B.Lippincott
Co.,Philadelphia(1985)を参照のこと)が挙げられる
が、これらに限定されない。従って、本発明は、新脈管形成関連疾患および/ま
たは障害の処置の方法を提供し、この方法は、治療有効量の、本発明のポリヌク
レオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび/またはアゴニストを、その処
置の必要な個体に投与する工程を包含する。例えば、ポリヌクレオチド、ポリペ
プチド、アンタゴニストおよび/またはアゴニストは、癌または腫瘍を治療的に
処置するために、種々のさらなる方法で利用され得る。ポリヌクレオチド、ポリ
ペプチド、アンタゴニストおよび/またはアゴニストで処置され得る癌としては
、前立腺癌、肺癌、乳癌、卵巣癌、胃癌、膵臓癌、喉頭癌、食道癌、精巣癌、肝
臓癌、耳下腺癌、胆管癌、結腸癌、直腸癌、頸部癌、子宮癌、子宮内膜癌、腎臓
癌、膀胱癌、甲状腺癌を含む固形腫瘍;原発性腫瘍および転移;黒色腫;膠芽腫
;カポージ肉腫;平滑筋肉腫;非小細胞肺癌;結腸直腸癌;進行性(advan
ced)悪性疾患;および血液から生じる腫瘍(例えば、白血病)が挙げられる
が、これらに限定されない。例えば、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタ
ゴニストおよび/またはアゴニストは、皮膚癌、頭頸部腫瘍、乳房腫瘍およびカ
ポージ肉腫のような癌を処置するために、局所送達され得る。
【0590】 なお他の局面において、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストお
よび/またはアゴニストは、例えば膀胱内投与によって膀胱癌の表面形態を処置
するために利用され得る。ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストお
よび/またはアゴニストは、腫瘍に直接的に、または注射もしくはカテーテルを
介して腫瘍部位付近に送達され得る。当然のことながら、当業者が理解するよう
に、適切な投与様式は、処置されるべき癌によって変化する。他の送達様式は本
明細書中において議論される。
【0591】 ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび/またはアゴニスト
は、癌に加えて、新脈管形成に関与する他の障害を処置する際に有用であり得る
。これらの障害としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:良性腫
瘍(例えば、血管腫、聴神経腫、神経線維腫、トラコーマ、および化膿性肉芽腫
);動脈硬化プラーク;眼の脈管形成疾患(例えば、糖尿病性網膜症、未熟網膜
症、黄斑変性、角膜移植拒絶、血管新生緑内障、水晶体後線維増殖、ルベオーシ
ス、網膜芽細胞腫、ブドウ膜炎(uvietis)および眼の翼状片(Pter
ygia)(異常な血管増殖));慢性関節リウマチ;乾癬;遅延型創傷治癒;
子宮内膜症;脈管形成;顆粒化;過形成性瘢痕(ケロイド);偽関節骨折;強皮
症;トラコーマ;血管接着;心筋の新脈管形成;冠状側副枝(coronary
collaterals);大脳側副枝;動静脈奇形;虚血性四肢新脈管形成
;オースラー−ウェーバー(Osler−Webber)症候群;プラーク新生
血管形成;毛細血管拡張症;血友病性関節;血管線維腫;線維筋性形成異常;創
傷顆粒化;クローン病;およびアテローム性動脈硬化症。
【0592】 例えば、本発明の1つの局面において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプ
チド、アンタゴニストおよび/またはアゴニストを過形成性瘢痕またはケロイド
に投与する工程を包含する、過形成性瘢痕およびケロイドを処置するための方法
が提供される。
【0593】 本発明の1つの実施形態において、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタ
ゴニストおよび/またはアゴニストは、過形成性瘢痕またはケロイドに、これら
の病変の進行を妨げるために直接注射される。この治療は、過形成性瘢痕および
ケロイド(例えば、やけど)の発生を生じることが知られている状態の予防処置
において特に価値があり、そして好ましくは、増殖期が進行する時間(最初の傷
害の約14日後)を有した後であるが、過形成性瘢痕またはケロイドの発生の前
に開始される。上述のように、本発明はまた、眼の新生血管形成疾患(例えば、
角膜新生血管形成、血管新生緑内障、増殖性糖尿病網膜症、水晶体後線維増殖お
よび黄斑変性を含む)を処置するための方法を提供する。
【0594】 さらに、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(アゴニストおよび/
またはアンタゴニストを含む)を用いて処置され得る新生血管形成に関連する眼
の障害としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:血管新生緑内障
、糖尿病網膜症、網膜芽細胞腫、水晶体後線維増殖症、ブドウ膜炎、未熟網膜症
、黄斑変性、角膜移植新生血管形成、ならびに他の眼の炎症性疾患、眼の腫瘍、
および脈絡膜または虹彩の新生血管形成に関連する疾患。例えば、Waltma
nら、Am.J.Ophthal.85:704〜710(1978)およびG
artnerら、Surv.Ophthal.22:291〜312(1978
)による総説を参照のこと。
【0595】 従って、本発明の1つの局面において、治療有効量の化合物(上記)を患者に
対して、血管の形成が阻害されるように角膜に投与する工程を包含する、角膜新
生血管形成(角膜移植新生血管形成を含む)のような眼の新生血管形成疾患を処
置するための方法が、提供される。簡潔には、角膜は、通常には血管を欠く組織
である。しかし、特定の病的状態において、毛細血管は、縁の角膜周囲脈管叢か
ら角膜に伸長し得る。角膜が血管化されるようになる場合、角膜はまた混濁され
るようになり、患者の視力の衰えを生じる。角膜が完全に不透明になる(opa
citate)場合に、視力喪失が完全になり得る。広範な種々の障害は、例え
ば、以下を含む角膜新生血管形成を生じ得る:角膜感染(例えば、トラコーマ、
単純ヘルペス角膜炎、リーシュマニア症およびオンコセルカ症)、免疫学的プロ
セス(例えば、移植片拒絶およびスティーヴンズ−ジョンソン症候群)、アルカ
リやけど、外傷、炎症(任意の原因による)、毒性および栄養欠乏状態、ならび
にコンタクトレンズを装着することの合併症として。
【0596】 特に好ましい実施形態において、本発明は、生理食塩水(眼に用いる調製物に
おいて一般に使用される任意の保存剤および抗菌剤と組合せて)中で局所投与の
ために調製され得、そして点眼剤形態で投与され得る。溶液または懸濁液は、そ
の純粋な形態で調製され得、そして1日に数回投与され得る。あるいは、上記の
ように調製される抗脈管形成組成物はまた、角膜に直接投与され得る。好ましい
実施形態において、抗脈管形成組成物は、角膜に結合する粘膜接着性ポリマーと
ともに調製される。さらなる実施形態において、抗脈管形成因子または抗脈管形
成組成物は、従来のステロイド治療に対する補助剤として利用され得る。局所治
療はまた、脈管形成応答(例えば、化学的やけど)を誘導する高い可能性を有す
ることが公知である角膜病変において予防的に有用であり得る。これらの場合に
おいて、処置(おそらくステロイドと組み合わせられる)は、その後の合併症を
予防するのを補助するために直ちに開始され得る。
【0597】 他の実施形態において、上記の化合物は、角膜支質に直接、顕微鏡の案内の下
で眼科医によって注入され得る。好ましい注射部位は、個々の病巣の形態で変化
し得るが、投与の目標は、脈管構造の前進している面に組成物を置くこと(すな
わち、血管と正常な角膜との間に分散される)である。ほとんどの場合において
、これは、前進している血管から角膜を「防御」するための縁周囲(peril
imbic)角膜注射を含む。この方法はまた、角膜新生血管形成を予防的に防
ぐために、角膜傷害の直後に利用され得る。この状況において、この物質は、角
膜病巣とその所望されない潜在的な血液供給の縁との間に分散して縁周囲角膜に
注射され得る。このような方法はまた、類似の様式で、移植された角膜の毛細血
管浸潤を予防するために利用され得る。徐放形態において、注入は、1年に2〜
3回のみ必要とされ得る。ステロイドもまた、注入溶液に添加され、その注射自
体から生じる炎症を低減し得る。
【0598】 本発明の別の局面において、患者に、血管の形成を阻害するように、治療有効
量のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび/またはアゴニス
トを眼に投与する工程を包含する、血管新生緑内障を処置するための方法が提供
される。1つの実施形態において、化合物は、初期の形態の血管新生緑内障を処
置するために、眼に局所投与され得る。他の実施形態において、化合物は、前方
角(anterior chamber angle)の領域に注入によって移
植され得る。他の実施形態において、化合物はまた、化合物が眼房水に連続的に
放出されるように、任意の位置に置かれ得る。本発明の別の局面において、患者
に、血管の形成が阻害されるように、治療有効量のポリヌクレオチド、ポリペプ
チド、アンタゴニストおよび/またはアゴニストを眼に投与する工程を包含する
、増殖性糖尿病性網膜症を処置するための方法が提供される。
【0599】 本発明の特に好ましい実施形態において、増殖性糖尿病性網膜症は、網膜にお
けるポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび/またはアゴニス
トの局所濃度を増加させるために、眼房水または硝子体への注入によって処置さ
れ得る。好ましくは、この処置は、光凝固を必要とする重篤な疾患の獲得の前に
開始されるべきである。
【0600】 本発明の別の局面において、血管の形成が阻害されるように、患者に、治療有
効量のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アンタゴニストおよび/またはアゴニ
ストを眼に投与する工程を包含する、水晶体後線維増殖症を処置するための方法
が、提供される。化合物は、硝子体内注射を介して、および/または眼内移植を
介して局所投与され得る。
【0601】 さらに、このポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび/またはア
ゴニストで処置され得る障害としては、以下が挙げられるが、それらに限定され
ない:血管腫、関節炎、乾癬、血管線維腫、アテローム性プラーク、遅延型創傷
治癒、顆粒化、血友病性関節、過形成性瘢痕、偽関節骨折、オースラー−ウェー
バー(Osler−Weber)症候群、化膿性肉芽腫、強皮症、トラコーマ、
および血管接着。
【0602】 さらに、このポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび/またはア
ゴニストで処置され得る障害および/または状態としては、以下が挙げられるが
、それらに限定されない:固形腫瘍、血液由来の(blood born)腫瘍
(例えば、白血病)、腫瘍転移、カポージ肉腫、良性腫瘍(例えば、血管腫、聴
神経腫、神経線維腫、トラコーマ、および化膿性肉芽腫)、慢性関節リウマチ、
乾癬、眼の脈管形成疾患(例えば、糖尿病性網膜症、未熟網膜症、黄斑変性、角
膜移植拒絶、血管新生緑内障、水晶体後線維増殖症、ルベオーシス、網膜芽細胞
腫、およびブドウ膜炎(uvictis))、遅延型創傷治癒、子宮内膜症、脈
管形成、顆粒化、過形成性瘢痕(ケロイド)、偽関節骨折、強皮症、トラコーマ
、血管接着、心筋の新脈管形成、冠状側副枝(coronary collat
erals)、大脳側副枝、動静脈奇形、虚血性四肢新脈管形成、オースラー−
ウェーバー症候群、プラーク新生血管形成、毛細血管拡張症、血友病性関節、血
管線維腫、線維筋性形成異常、創傷顆粒化、クローン病、アテローム性動脈硬化
症、産児制限薬剤(月経を制御する、胎芽着床のために必要な血管新生を予防す
ることによる)、病原性の結果(例えば、ネコ引っかき病(Rochele m
inalia quintosa)、潰瘍(Helicobacter pyl
ori)、バルトネラ症および細菌性血管腫症状)のような新脈管形成を有する
疾患。
【0603】 出産を制御する方法の1つの局面において、胎芽着床をブロックするに十分な
化合物の量は、性交および受精が起こる前またはその後に投与され、従って産児
制限の有効な方法、おそらく「事後用(morning after)」方法を
提供する。ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび/またはアゴニ
ストはまた、月経を制御することにおいて使用され得るか、または子宮内膜症の
処置における腹膜洗浄液として、もしくは腹膜移植のためのいずれかで投与され
得る。
【0604】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび/またはアゴニ
ストは、縫合(stitch)肉芽腫を予防するために、外科縫合に組み込まれ
得る。
【0605】 ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび/またはアゴニストは、
広範な種々の外科手順において利用され得る。例えば、本発明の1つの局面にお
いて、組成物(例えば、スプレーまたはフィルムの形態において)は、悪性組織
から正常な周囲の組織を分離するため、そして/または周囲の組織への疾患の広
がりを予防するために、腫瘍の除去の前に、領域をコートまたはスプレーするた
めに利用され得る。本発明の他の局面において、組成物(例えば、スプレーの形
態において)は、腫瘍をコートするため、または所望の場所において新脈管形成
を阻害するために、内視鏡手順を介して送達され得る。本発明のなお他の局面に
おいて、本発明の抗脈管形成組成物でコートされている外科メッシュが、外科メ
ッシュが利用され得る任意の手順において利用され得る。例えば、本発明の1つ
の実施形態において、抗脈管形成組成物を有した外科メッシュレーデン(lad
en)は、構造に対する支持を提供するため、そして一定の量の抗脈管形成因子
を放出するために、腹部癌切除手術の間(例えば、結腸切除の後)に利用され得
る。
【0606】 本発明のさらなる局面において、癌の局所的再発およびその部位での新しい血
管の形成が阻害されるように、切除後にポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴ
ニストおよび/またはアゴニストを腫瘍の切除縁に投与する工程を包含する、腫
瘍切除部位を処置するための方法が提供される。本発明の1つの実施形態におい
て、抗脈管形成化合物は、腫瘍切除部位に直接投与される(例えば、塗布、ブラ
ッシング(brushing)、または他の方法で抗脈管形成化合物で腫瘍の切
除縁をコートすることによって適用される)。あるいは、抗脈管形成化合物は、
投与前に公知の外科ペーストに組み込まれ得る。本発明の特に好ましい実施形態
において、抗脈管形成化合物は、悪性疾患についての肝切除後および神経外科手
術後に適用される。
【0607】 本発明の1つの局面において、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト
および/またはアゴニストは、広範な種々の腫瘍(例えば、乳房腫瘍、結腸腫瘍
、脳腫瘍および肝腫瘍を含む)の切除縁に投与され得る。例えば、本発明の1つ
の実施形態において、抗脈管形成化合物は、切除後に、神経学的腫瘍の部位に、
その部位での新しい血管の形成が阻害されるように投与され得る。
【0608】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび/またはアゴニ
ストはまた、他の抗脈管形成因子とともに投与され得る。他の抗脈管形成因子の
代表的な例としては以下が挙げられる:抗侵襲性因子、レチノイン酸およびその
誘導体、パクリタキセル、スラミン、メタロプロテイナーゼ−1の組織インヒビ
ター、メタロプロテイナーゼ−2の組織インヒビター、プラスミノーゲン活性化
インヒビター−1、プラスミノーゲン活性化インヒビター−2および種々の形態
のより軽い「d群」遷移金属。
【0609】 より軽い「d群」遷移金属には、例えばバナジウム、モリブデン、タングステ
ン、チタン、ニオブおよびタンタル種が挙げられる。そのような遷移金属種は、
遷移金属錯体を形成し得る。上記の遷移金属種の適切な錯体としては、オキソ遷
移金属錯体が挙げられる。
【0610】 バナジウム錯体の代表的な例としては、バナデート錯体およびバナジル錯体の
ようなオキソバナジウム錯体が挙げられる。適切なバナデート錯体としては、例
えばメタバナジン酸アンモニウム、メタバナジン酸ナトリウムおよびオルトバナ
ジン酸ナトリウムのようなメタバナデート錯体およびオルトバナデート錯体が挙
げられる。適切なバナジル錯体としては、例えばバナジルアセチルアセトネート
および硫酸バナジル(硫酸バナジル一水和物および硫酸バナジル三水和物のよう
な硫酸バナジル水和物を含む)が挙げられる。
【0611】 タングステン錯体およびモリブデン錯体の代表的な例としてはまた、オキソ錯
体が挙げられる。適切なオキソタングステン錯体としては、タングステート錯体
およびタングステンオキシド錯体が挙げられる。適切なタングステート錯体とし
ては、タングステン酸アンモニウム、タングステン酸カルシウム、タングステン
酸ナトリウム二水和物およびタングステン酸が挙げられる。適切なタングステン
オキシドとしては、タングステン(IV)オキシドおよびタングステン(VI)
オキシドが挙げられる。適切なオキソモリブデン錯体としては、モリブデート、
モリブデンオキシドおよびモリブデニル錯体が挙げられる。適切なモリブデート
錯体としては、モリブデン酸アンモニウムおよびその水和物、モリブデン酸ナト
リウムおよびその水和物、ならびにモリブデン酸カリウムおよびその水和物が挙
げられる。適切なモリブデンオキシドとしては、モリブデン(VI)オキシド、
モリブデン(VI)オキシドおよびモリブデン酸が挙げられる。適切なモリブデ
ニル錯体としては、例えばモリブデニルアセチルアセトネートが挙げられる。他
の適切なタングステン錯体およびモリブデン錯体としては、例えばグリセロール
、酒石酸および糖由来のヒドロキソ誘導体が挙げられる。
【0612】 広範な種々の他の抗脈管形成因子もまた、本発明の状況において利用され得る
。代表的な例としては、以下が挙げられる:血小板因子4;硫酸プロタミン;硫
酸化キチン誘導体(クイーンクラブ(queen crab)の殻から調製され
る)(Murataら、Cancer Res.51:22〜26、1991)
;硫酸化多糖ペプチドグリカン複合体(SP−PG)(この化合物の機能は、ス
テロイド(例えば、エストロゲン)およびクエン酸タモキシフェンの存在によっ
て、増強され得る);スタウロスポリン;基質代謝の調節因子(例えば、プロリ
ンアナログ、シスヒドロキシプロリン、d,L−3,4−デヒドロプロリン、チ
アプロリン、α,α−ジピリジル,アミノプロピオニトリルフマレートを含む)
;4−プロピル−5−(4−ピリジニル)−2(3H)−オキサゾロン;メトト
レキサート;ミトザントロン;ヘパリン;インターフェロン;2マクログロブリ
ン−血清;ChIMP−3(Pavloffら、J.Bio.Chem.267
:17321〜17326、1992);キモスタチン(Tomkinsonら
、Biochem J.286:475〜480、1992);シクロデキスト
リンテトラデカサルフェート;エポネマイシン;カンプトテシン;フマギリン(
Ingberら、Nature 348:555〜557、1990);チオリ
ンゴ酸金ナトリウム(「GST」;MatsubaraおよびZiff、J.C
lin.Invest.79:1440〜1446、1987);アンチコラゲ
ナーゼ−血清;α2−抗プラスミン(Holmesら、J.Biol.Chem
.262(4):1659〜1664、1987);ビサントレン(Natio
nal Cancer Institute);ロベンザリット二ナトリウム(
N−(2)−カルボキシフェニル−4−クロロアントロニル酸(chloroa
nthronilic acid)二ナトリウム、すなわち「CCA」;Tak
euchiら、Agents Actions 36:312〜316、199
2);サリドマイド;Angostaticステロイド;AGM−1470;カ
ルボキシアミノイミダゾール(carboxynaminolmidazole
);およびメタロプロテイナーゼインヒビター(例えば、BB94)。
【0613】 (細胞レベルでの疾患) 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアンタゴニストもし
くはアゴニストによって処置または検出され得る細胞生存の増大あるいはアポト
ーシスの阻害に関連する疾患には、癌(例えば、濾胞性リンパ腫、p53変異を
有する癌腫、およびホルモン依存性腫瘍、これらは以下:結腸癌、心臓腫瘍、膵
臓癌、黒色腫、網膜芽細胞腫、神経膠芽細胞腫、肺癌、腸の癌、精巣癌、胃癌、
神経芽細胞腫、粘液腫、筋腫、リンパ腫、内皮腫、骨芽細胞腫、骨巨細胞腫、骨
肉腫、軟骨肉腫、腺腫、乳癌、前立腺癌、カポージ肉腫および卵巣癌を含むが、
これらに限定されない);自己免疫性の障害(例えば、多発性硬化症、シェーグ
レン症候群、橋本甲状腺炎、胆汁性肝硬変、ベーチェット病(Behcet’s
disease)、クローン病、多発性筋炎、全身性エリテマトーデスおよび
免疫関連糸球体腎炎ならびに慢性関節リウマチ)およびウイルス感染(例えば、
ヘルペスウイルス、ポックスウイルスおよびアデノウイルス)、炎症、対宿主性
移植片病、急性移植片拒絶、ならびに慢性移植片拒絶、が挙げられる。好ましい
実施形態において、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、および/
またはアンタゴニストは、特に上記に列挙される、癌の増殖、進行、および/ま
たは転移(metasis)を阻害するために使用される。
【0614】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくは
アンタゴニストによって処置または検出され得る細胞生存の増大に関連するさら
なる疾患または状態には、悪性疾患の進行および/または転移ならびに以下のよ
うな関連する障害が挙げられるが、これらに限定されない:白血病(急性白血病
(例えば、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病(骨髄芽球性、前骨髄球性、
骨髄単球性、単球性および赤白血病を含む)を含む)ならびに慢性白血病(例え
ば、慢性骨髄性(顆粒球性)白血病および慢性リンパ球性白血病))、真性赤血
球増加症、リンパ腫(例えば、ホジキン病および非ホジキン病)、多発性骨髄腫
、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症、H鎖病、ならびに固形腫瘍(肉
腫および癌腫(例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫
、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫(endotheliosarcoma)、リン
パ管肉腫、リンパ管内皮腫、骨膜腫、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横
紋筋肉腫、結腸癌腫、膵臓癌、乳癌、卵巣癌、前立腺癌、扁平上皮癌、基底細胞
癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳頭状癌、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管
支原生癌、腎細胞癌、肝細胞癌腫、胆管癌、絨毛癌、セミノーマ、胎生期癌、ウ
ィルムス腫瘍、頸部癌、精巣腫瘍、肺癌、小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠
腫、神経膠星状細胞腫、髄芽細胞腫、頭蓋咽頭腫、脳室上衣細胞腫、松果体腫、
血管芽細胞腫、聴神経腫、乏突起神経膠腫、髄膜腫(menangioma)、
黒色腫、神経芽細胞腫、および網膜芽細胞腫)を含むが、これらに限定されない
)。
【0615】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニストもしくは
アンタゴニストによって処置または検出され得るアポトーシスの増大に関連する
疾患には、以下が挙げられる:AIDS;神経変性疾患、障害(例えば、アルツ
ハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症、色素性網膜炎、小脳変性お
よび脳腫瘍または以前に関連した疾患);自己免疫性の障害(例えば、多発性硬
化症、シェーグレン症候群、橋本甲状腺炎、胆汁性肝硬変、ベーチェット病(B
ehcet’s disease)、クローン病、多発性筋炎、全身性エリテマ
トーデスおよび免疫関連糸球体腎炎ならびに慢性関節リウマチ)、脊髄形成異常
症候群(例えば、再生不良性貧血)、対宿主性移植片病、虚血性傷害(心筋梗塞
、発作および再灌流傷害によって生じるようなもの)、肝臓傷害(例えば、肝炎
関連肝臓傷害、虚血/再灌流傷害、胆汁うっ滞(cholestosis)(胆
管傷害)および肝臓癌);毒物誘導性肝臓疾患(アルコールによって引き起こさ
れるようなもの)、敗血症性ショック、悪液質ならびに食欲不振。
【0616】 (創傷治癒および上皮細胞増殖) 本発明のなおさらなる局面に従って、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリ
ペプチド、およびアゴニストもしくはアンタゴニストを、治療目的のため、例え
ば、創傷治癒の目的のために上皮細胞増殖および基底ケラチノサイトを刺激する
ため、ならびに毛包産生および皮膚創傷の治癒を刺激するために、利用するため
のプロセスが提供される。本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、お
よびアゴニストもしくはアンタゴニストは、以下を含む創傷治癒を刺激すること
において臨床的に有用であり得る:外科的創傷、切除の創傷、深い創傷(真皮お
よび表皮の損傷を含む)、眼組織の創傷、歯の組織の創傷、口腔の創傷、糖尿病
性潰瘍、皮膚の潰瘍、肘の潰瘍、動脈性の潰瘍、静脈うっ滞潰瘍、熱への曝露ま
たは化学物質による熱傷、および他の異常な創傷治癒状態(例えば、尿毒症、栄
養失調、ビタミン欠乏、ならびにステロイド、放射能療法および抗腫瘍性薬物お
よび代謝拮抗物質を用いる全身性処置に関連する合併症)。本発明のポリヌクレ
オチドもしくはポリペプチド、およびアゴニストもしくはアンタゴニストは、皮
膚の欠失後の皮膚の回復を促進するために使用され得る。
【0617】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニストもしくは
アンタゴニストは、創傷床(wound bed)への皮膚移植片の付着を増大
するため、および創傷床からの再上皮形成を刺激するために使用され得る。以下
は、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、アゴニストまたはアンタゴ
ニストが創傷床への付着を増大するために使用され得る、移植片の型である:自
家移植片、人工皮膚、同種移植片(allograft)、自己植皮片、自己表
皮移植片(autoepdermic graft)、無血管性(avacul
ar)移植片、ブレア−ブラウン移植片、骨移植片、胚胎組織移植片、真皮移植
片、遅延移植片、皮膚移植片、表皮移植片、筋膜移植片、全層皮膚移植片、異種
移植片(heterologous graft)、異種移植片(xenogr
aft)、同種移植片(homologous graft)、増殖性移植片、
層板状の移植片、網状移植片、粘膜移植片、オリエ−ティールシュ移植片、大網
移植片(omenpal graft)、パッチの移植片、茎状移植片、全層移
植片(penetrating graft)、分層植皮片、分層皮膚移植片。
本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニストもしくはア
ンタゴニストは、皮膚の強度を助長するため、および高齢の皮膚の外見を改善す
るために使用され得る。
【0618】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニストもしくは
アンタゴニストはまた、肝細胞増殖、および肺、乳房、膵臓、胃、小腸(sma
ll intesting)、および大腸における上皮細胞増殖における変化を
生じると考えられる。本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、および
アゴニストもしくはアンタゴニストは、上皮細胞(例えば、皮脂細胞(sebo
cyte)、毛包、肝実質細胞、肺胞上皮細胞II型(type II pne
umocyte)、ムチン産生杯細胞、および他の上皮細胞、ならびに皮膚、肺
、肝臓、および胃腸管内に含まれるそれらの先祖)の増殖を促進し得る。本発明
のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、アゴニストもしくはアンタゴニスト
は、内皮細胞、ケラチノサイト、および基底ケラチノサイトの増殖を促進し得る
【0619】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニストもしくは
アンタゴニストはまた、照射、化学療法処置またはウイルス感染から生じる腸の
毒性の副作用を低減するために使用され得る。本発明のポリヌクレオチドもしく
はポリペプチド、およびアゴニストもしくはアンタゴニストは、小腸粘膜上で細
胞保護的な効果を有し得る。本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、
およびアゴニストもしくはアンタゴニストはまた、化学療法およびウイルス感染
から生じる粘膜炎(mucositis)(口粘膜)の治癒を刺激し得る。
【0620】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニストもしくは
アンタゴニストは、熱傷を含む、完全なおよび部分的な厚さの皮膚欠損における
皮膚の十分な再生(すなわち、毛包、汗腺、および皮脂腺の再増殖)、乾癬のよ
うな他の皮膚欠損の処置においてさらに使用され得る。本発明のポリヌクレオチ
ドもしくはポリペプチド、およびアゴニストもしくはアンタゴニストは、表皮水
疱症、これらの損傷の再上皮形成を促進することによる頻繁な開放性かつ疼痛性
の水疱を生じる内在的な真皮への表皮の接着における欠損を処置するために使用
され得る。本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニスト
もしくはアンタゴニストはまた、胃潰瘍および十二指腸潰瘍を処置し、そして粘
膜の内層の瘢痕形成ならびにより迅速な腺の粘膜および十二指腸の粘膜の内層の
再生による治癒を助けるために使用され得る。炎症性腸疾患(例えば、クーロン
病および潰瘍性大腸結腸炎)は、それぞれ、小腸または大腸の粘膜表面の崩壊を
生じる疾患である。従って、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、
およびアゴニストもしくはアンタゴニストは、粘膜表面の再表面化(resul
facing)を促進して、より迅速な治癒を助けるため、および炎症性腸疾患
の進行を予防するために、使用され得る。本発明のポリヌクレオチドもしくはポ
リペプチド、アゴニストもしくはアンタゴニストを用いる処置は、胃腸管全体の
粘膜の産生に対して有意な効果を有することが予測され、そして腸粘膜を、摂取
されたかまたは外科手術後の有害な物質から保護するために使用され得る。本発
明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニストもしくはアンタ
ゴニストは、本発明のポリヌクレオチドの発現下に関連する疾患を処置するため
に使用され得る。
【0621】 さらに、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニスト
もしくはアンタゴニストは、種々の病的状態に起因する肺への損傷を予防および
治癒するために使用され得る。本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド
、およびアゴニストもしくはアンタゴニストは、急性または慢性の肺損傷を予防
または処置するために、増殖および分化を刺激し得、そして肺胞および気管支(
brochiolar)上皮の修復を促進し得る。例えば、気管支上皮および肺
胞(aveoli)の壊死を生じる、気腫(これは、肺胞の進行性の損失を生じ
る)および吸入損傷(すなわち、煙の吸入および熱傷から生じる)は、本発明の
ポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、アゴニストまたはアンタゴニストを使
用して効果的に処置され得る。また、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペ
プチド、およびアゴニストもしくはアンタゴニストは、肺胞上皮細胞II型の増
殖および分化を刺激するために使用され得、これは、未熟な乳児における硝子膜
疾患(例えば、乳児呼吸窮迫症候群および気管支肺異形成症)のような疾患を処
置または予防することを助け得る。
【0622】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニストもしくは
アンタゴニストは、肝実質細胞の増殖および分化を刺激し得、そして従って、肝
臓疾患および病状(例えば、肝硬変により生じる劇症肝不全、肝炎ウイルスおよ
び毒性物質(すなわち、アセトアミノフェン、四塩化炭素(carbon te
traholoride)、および他の当該分野で公知の肝臓毒素)により生じ
る肝臓損傷)を緩和または処置するために使用され得る。
【0623】 さらに、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、およびアゴニスト
もしくはアンタゴニストは、真性糖尿病の発症を処置または予防するために使用
され得る。新たにI型糖尿病およびII型糖尿病と診断された患者において、い
くつかの島細胞機能が残っている場合、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリ
ペプチド、およびアゴニストもしくはアンタゴニストは、その疾患の持続性の発
現を緩和、遅延または予防するように、その島機能を維持するために使用され得
る。また、本発明のポリヌクレオチドもしくポリペプチド、およびアゴニストま
たはアンタゴニストは、島細胞機能を改善または促進するための島細胞移植にお
ける補助として使用され得る。
【0624】 (内分泌障害) 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくは
アンタゴニストを使用して、ホルモンバランスに関連する障害および/または疾
患、ならびに/あるいは内分泌系の障害または疾患を処置、予防、診断、および
/または予後し得る。
【0625】 内分泌系の腺により分泌されるホルモンは、身体発育、性的機能、代謝、およ
び他の機能を制御する。障害は、2つの方法で分類される:ホルモンの産生にお
ける障害、およびホルモンに応答する組織の不全。これらのホルモンアンバラン
スおよび内分泌系疾患、障害または状態の病因は、遺伝的、体細胞性(例えば、
癌およびいくつかの自己免疫疾患)、後天性(例えば、化学治療、損傷または毒
素によって)、または感染性であり得る。さらに、本発明のポリヌクレオチド、
ポリペプチド、抗体、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、内
分泌系および/またはホルモンアンバランスに関連する特定の疾患または障害の
マーカーまたはディテクターとして使用され得る。
【0626】 内分泌系および/またはホルモンアンバランスおよび/または疾患は、子宮運
動の障害を含み、これには以下が挙げられるが、これらに限定されない:妊娠お
よび分娩時の合併症(例えば、早期分娩、過期妊娠、自然流産、ならびに遅延分
娩およびとめられた分娩);ならびに月経周期の障害および/または疾患(例え
ば、月経困難症および子宮内膜症)。
【0627】 内分泌系および/またはホルモンアンバランス障害および/または疾患として
は、膵臓の障害および/または疾患(例えば、真性糖尿病、尿崩症、先天性白内
障欠損、褐色細胞腫−島細胞腫症候群);副腎の障害および/または疾患(例え
ば、アディソン病、コルチコステロイド欠損、男性化作用疾患、多毛症、クッシ
ング症候群、高アルドステロン症、褐色細胞腫);下垂体の障害および/または
疾患(例えば、下垂体機能亢進症、下垂体機能低下症、下垂体性小人症、下垂体
腺腫、汎下垂体機能低下症、先端巨大症、巨人症);甲状腺の障害および/また
は疾患(甲状腺機能亢進症、甲状腺機能低下症、プラマー病、グレーヴズ病(毒
性散在甲状腺腫)、毒性小結節甲状腺種、甲状腺炎(橋本甲状腺炎、亜急性肉芽
腫性甲状腺炎、およびサイレントリンパ球性甲状腺炎)、ペンドレッド症候群、
粘液水腫、クレチン病、甲状腺中毒症、甲状腺ホルモン縮合障害、チミン形成不
全症、甲状腺のヒュルトレ細胞腫瘍、甲状腺癌、甲状腺悪性腫瘍、髄様甲状腺癌
が挙げられるが、これらに限定されない);副甲状腺の障害および/または疾患
(例えば、上皮小体機能亢進症、上皮小体機能低下症);視床下部の障害および
/または疾患。
【0628】 特定の実施形態において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび/ま
たはポリペプチドおよび/またはこれらのポリペプチドのアゴニストもしくはア
ンタゴニスト(抗体を含む)、ならびにこれらのポリヌクレオチド、ポリペプチ
ド、アゴニストおよびアンタゴニストのフラグメントおよび改変体は、異常なグ
ルコース代謝もしくは細胞中へのグルコースの取り込みに関連する疾患および障
害を診断、予後、処置、予防または寛解するために使用され得る。
【0629】 特定の実施形態において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび/ま
たはポリペプチドおよび/またはそれらのアゴニストもしくはアンタゴニストは
、I型糖尿病(インスリン依存性糖尿病、IDDM)を診断、予後、処置、予防
および/または寛解するために使用され得る。
【0630】 別の実施形態において、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよび/また
はポリペプチドおよび/またはそれらのアゴニストおよび/またはアンタゴニス
トは、II型糖尿病(インスリン耐性糖尿病)を診断、予後、処置、予防および
/または寛解するために使用され得る。
【0631】 さらに、他の実施形態において、この遺伝子および/またはそれらのアンタゴ
ニストに対応するポリヌクレオチドおよび/またはポリペプチド(特に、中和抗
体または拮抗抗体)は、(I型もしくはII型)糖尿病(糖尿病ケトアシドーシ
ス、糖尿病昏睡、高血糖性非ケトン性昏睡、てんかん発作、精神錯乱、嗜眠状態
、心血管疾患(例えば、心臓疾患、アテローム性動脈硬化症、微小血管疾患、高
血圧、発作、および「心血管障害」の節に記載された他の疾患および障害)、異
脂肪血症、腎臓疾患(例えば、腎不全、ネフロパシー、「腎障害」の節に記載さ
れる他の疾患および障害)、神経損傷、ニューロパシー、視覚障害(例えば、糖
尿病網膜症および失明)、潰瘍および障害性損傷治癒、感染(例えば、「感染性
疾患」の節に記載された感染性障害および疾患、特に尿路および皮膚の障害およ
び疾患)、手根管症候群およびデュプュイトラン拘縮に関連する状態を診断、予
後、処置、予防または寛解するために使用され得るが、これらに限定されない。
【0632】 他の実施形態において、この遺伝子および/またはそれらのアゴニストもしく
はアンタゴニストに対応するポリヌクレオチドならびに/またはポリペプチドは
、動物の体重を調節するために、動物、好ましくは哺乳動物、最も好ましくはヒ
トに投与され得る。特定の実施形態において、この遺伝子および/またはそれら
のアゴニストもしくはアンタゴニストに対応するポリヌクレオチドならびに/ま
たはポリペプチドは、動物の体重を、インスリンに関する生物学的経路を調節す
ることによって制御するために、動物、好ましくは哺乳動物、最も好ましくはヒ
トに投与され得る。さらに他の実施形態において、この遺伝子および/またはそ
れらのアゴニストもしくはアンタゴニストに対応するポリヌクレオチドならびに
/またはポリペプチドは、動物の体重を、インスリン様増殖因子に関する生物学
的経路を調節することによって制御するために、動物、好ましくは哺乳動物、最
も好ましくはヒトに投与され得る。
【0633】 さらに、内分泌系および/またはホルモンアンバランス障害および/または疾
患はまた、癌を含む精巣または卵巣の障害および/または疾患を含み得得る。他
の精巣または卵巣の障害および/または疾患としては、例えば、卵巣癌、多嚢胞
性卵巣症候群、クラインフェルター症候群、バニシング精巣症候群(両側性無精
巣)、ライディヒ細胞先天性欠損、潜伏精巣症、ヌーナン症候群、筋緊張性ジス
トロフィー、精巣の毛細血管種(良性)、精巣の新形成および新精巣。
【0634】 さらに、内分泌系およびまたはホルモンアンバランス障害および/または疾患
はまた、例えば、多内分泌腺機能低下症候群、褐色細胞腫、神経芽細胞腫、多発
性内分泌腺腫症、ならびに内分泌組織の障害および/または癌のような障害およ
び/または疾患を含み得る。
【0635】 (神経活性および神経学的疾患) 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドおよびアゴニストもしくはアンタゴ
ニストは、脳および/または神経系の疾患、障害、傷害または損傷の診断および
/または処置のために使用され得る。本発明の組成物(例えば、ポリペプチド、
ポリヌクレオチドおよび/またはアゴニストもしくはアンタゴニスト)を用いて
処置され得る神経系の障害には、軸索の切断、ニューロンの減少もしくは変性、
または脱髄のいずれかを引き起こす、神経系損傷および、疾患または障害が挙げ
られるが、これらに限定されない。本発明の方法に従って、患者(ヒト患者およ
び非ヒト哺乳動物患者を含む)において処置され得る神経系病変には、以下、ま
たは中枢神経系(脊髄、脳を含む)もしくは末梢神経系のいずれかの病変が挙げ
られるが、これらに限定されない:(1)虚血病変(ここで、神経系の一部にお
ける酸素不足により、ニューロンの損傷または死が生じ、これには大脳梗塞もし
くは虚血、または脊髄梗塞もしくは虚血が挙げられる);(2)外傷病変(身体
的損傷により生じるかまたは手術に関連する病変、例えば、神経系の一部分を切
断する病変、または圧縮損傷を含む);(3)悪性病変(ここで、神経系の一部
分は、神経系関連悪性疾患もしくは非神経系組織由来の悪性疾患のいずれかであ
る悪性組織により破壊または損傷される);(4)感染性病変(ここで、神経系
の一部分は、例えば、膿瘍による感染の結果として、破壊または損傷されるか、
あるいはヒト免疫不全ウイルス、帯状ヘルペスもしくは単純ヘルペスウイルスに
よる感染と関連するか、ライム病、結核、梅毒に関連する);(5)変性病変(
ここで、神経系の一部分は、変性プロセスの結果として破壊または損傷され、こ
れには、パーキンソン病、アルツハイマー病、ハンティングトン病または筋萎縮
性側索硬化症(ALS)に関連する変性が挙げられるが、これらに限定されない
);(6)栄養性の疾患または障害に関連する病変(ここで、神経系の一部分は
、栄養障害または代謝障害によって破壊または損傷され、これには、ビタミンB
12欠乏症、葉酸欠乏症、ヴェルニッケ病、タバコ−アルコール弱視、マルキア
ファーヴァ−ビニャーミ病(脳梁の一次変性)およびアルコール小脳変性が挙げ
られるが、これらに限定されない);(7)全身性疾患に関連する神経性病変(
糖尿病(糖尿病性ニューロパシー、ベル麻痺)、全身性エリテマトーデス、癌ま
たは類肉腫症が挙げられるが、これらに限定されない);(8)毒性物質(アル
コール、鉛または特定の神経毒を含む)により生じる病変;ならびに(9)脱髄
性病変(ここで、神経系の一部分は、脱髄性疾患によって破壊または損傷され、
これには、多発性硬化症、ヒト免疫不全ウイルス関連脊髄障害、横断脊髄障害ま
たは種々の病因、進行性多病巣性白質脳障害、および橋中央ミエリン溶解が挙げ
られるが、これらに限定されない)。
【0636】 1つの実施形態において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、または
アゴニストもしくはアンタゴニストは、低酸素症の損傷効果から神経細胞を保護
するために用いられる。さらに好ましい実施形態では、本発明のポリペプチド、
ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、大脳低酸素症
の損傷効果から神経細胞を防御するために用いられる。この実施形態によると、
本発明の組成物は、大脳低酸素症に関連する神経細胞損傷を処置または予防する
ために用いられる。この実施形態の1つの非限定的局面において、本発明のポリ
ペプチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、大
脳虚血と関連する神経細胞損傷を処置、または予防するために用いられる。この
実施形態の非限定的な別の局面において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオ
チド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、大脳梗塞症に関連する神経
細胞損傷を処置または予防するために用いられる。
【0637】 別の好ましい実施形態において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、
またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、発作に関連する神経細胞損傷を処
置または予防するために用いられる。特定の実施形態において、本発明のポリペ
プチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、発作
に関連する大脳神経細胞損傷を処置または予防するために用いられる。
【0638】 別の好ましい実施形態において、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、
またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、心臓発作に関連する神経細胞損傷
を処置または予防するために使用される。特定の実施形態において、本発明のポ
リペプチド、ポリヌクレオチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、
心臓発作に関連する大脳神経細胞損傷を処置または予防するために使用される。
【0639】 神経系障害を処置または予防するために有用な本発明の組成物は、ニューロン
の生存または分化の促進における生物学的活性について試験することによって選
択され得る。(限定の目的ではないが)例えば、以下の効果のいずれかを誘発す
る本発明の組成物は、本発明に従って有用であり得る:(1)培養物中のニュー
ロンの増加した生存時間(低酸素症または低酸素状態の存在下または非存在下の
いずれかにおいて);(2)培養物中またはインビボにおけるニューロンの増加
した出芽;(3)培養物中またはインビボにおけるニューロン関連分子(例えば
、運動ニューロンに関しては、コリンアセチルトランスフェラーゼまたはアセチ
ルコリンエステラーゼ)の増加した生成;あるいは(4)インビボにおけるニュ
ーロン機能不全減少した症状。このような効果は、当該分野において公知の任意
の方法によって測定され得る。好ましい、非限定的な実施形態においては、ニュ
ーロンの増加した生存は、本明細書中に記載されるか、そうでなければ当該分野
において公知の方法(例えば、Zhangら、Proc Natl Acad
Sci USA 97:3637−42(2000)またはArakawaら(
J.Neurosci.10:3507−3515(1990))に記載される
方法)を用いて慣習的に測定され得;ニューロンの増加した出芽は、当該分野に
おいて公知の方法(例えば、Pestronkら(Exp.Neurol.70
:65−82(1980))またはBrownら(Ann.Rev.Neuro
sci.4:17−42(1981))に記載される方法)によって検出され得
;ニューロン関連分子の増加した生成は、当該分野で公知であり、測定されるべ
き分子に依存した技術を用いて、バイオアッセイ、酵素アッセイ、抗体結合、ノ
ーザンブロットアッセイなどによって測定され得;そして運動ニューロン機能不
全は、運動ニューロン障害の物理的症状(例えば、弱さ、運動ニューロン伝導速
度または機能的障害)を評価することによって測定され得る。
【0640】 特定の実施形態において、本願発明に従って処置され得る運動ニューロン障害
としては、以下のような障害が挙げられるが、それらに限定されない:梗塞形成
、感染、毒素への曝露、外傷、外科的損傷、変性疾患または運動ニューロンなら
びに神経系の他の構成要素に影響し得る悪性疾患のような障害、ならびに筋萎縮
性側索硬化症および、これらに限定されないが、進行性脊髄性筋萎縮症、進行性
球麻痺、原発性側索硬化症、乳児性および若年性筋萎縮、小児の進行性球麻痺(
ファチオ・ロンデ症候群)、ポリオおよびポリオ後症候群、ならびに遺伝性運動
感覚性ニューロパシー(シャルコー−マリー−ツース病)を含む、ニューロンに
選択的に影響する障害。
【0641】 さらに、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、ニューロン生存、
シナプス形成;伝達;神経分化などにおいて役割を果たし得る。従って、本発明
の組成物(ポリヌクレオチド、ポリペプチド、およびアゴニストまたはアンタゴ
ニストを含む)は、学習および/または認識の障害を含むがこれに限定されない
、これらの役割に関連する疾患または障害を、診断、および/または処置または
予防するのに用いられ得る。本発明の組成物は、神経変性性疾患状態および/ま
たは行動障害の処置または予防において有用であり得る。このような神経変性性
疾患状態および/または行動障害としては以下が挙げられるがこれらに限定され
ない:アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、ツレット症候群、
精神分裂病、躁病、痴呆、偏執症、強迫性障害、恐慌性障害、学習障害、ALS
、精神病、自閉、および行動変化(栄養補給、睡眠パターン、平衡、および知覚
の障害を含む)。さらに、本発明の組成物は、発生中の胚、または伴性障害に関
連する発生の障害の処置、予防および/または検出において役割を果たし得る。
【0642】 さらに、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、および/またはアゴニス
トまたはアンタゴニストは、以下を含むが挙げられるがこれらに限定されない脳
血管障害に関連する、疾患、傷害、障害または、損傷から、神経細胞を防御する
のに有用であり得る:脳血管障害(例えば、頸動脈血栓症、頸動脈狭窄およびモ
ヤモヤ病を含む頸動脈疾患)、脳のアミロイドアンギオパチー、大脳動脈瘤、脳
低酸素症、大脳動脈硬化症、大脳動静脈奇形、大脳動脈疾患、脳塞栓症および血
栓(例えば、頸動脈血栓症、洞血栓症およびヴァレンベルク症候群)、脳出血(
例えば、硬膜外血腫または硬膜下血腫およびクモ膜下出血)、脳亀裂骨折、脳虚
血(例えば、一過性脳虚血、鎖骨下動脈盗血症候群、または椎骨脳底不全(ve
rtebrobasilar insufficiency))、血管性痴呆(
たとえば、多発脳梗塞性痴呆)、白質軟化症(leukomalacia)、室
周(periventicular)ならびに血管性頭痛(例えば、群発性頭痛
または片頭痛)。
【0643】 本発明のなおさらなる局面によれば、治療目的で、神経学的細胞増殖および/
または分化を刺激するために、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、
ならびにアゴニストまたはアンタゴニストを利用するためのプロセスが提供され
る。従って、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストおよび/ま
たはアンタゴニストは、神経学的疾患を処置、および/または検出するために用
いられ得る。さらに、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、または
アゴニストもしくはアンタゴニストは、特定の神経系疾患または障害のマーカー
または検出因子として用いられ得る。
【0644】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および/またはアン
タゴニストを用いて処置または検出され得る神経性疾患のさらなる例としては、
以下が挙げられる:脳疾患(例えば、代謝脳疾患(母体性フェニルケトン尿症の
ようなフェニルケトン尿症、ピルビン酸カルボキシラーゼ欠損、ピルビン酸デヒ
ドロゲナーゼ複合体欠損、ヴェルニッケ脳障害、脳水腫を含む)、小脳新生物の
ような脳新生物(テント下新生物、脈絡叢新生物のような脳室新生物、視床下部
新生物、テント上新生物、キャナヴァン病を含む)、小脳性運動失調のような小
脳疾患(脊髄小脳変性(例えば、毛細血管拡張性運動失調)、脳性共同運動障害
、フリートライヒ運動失調、マチャド−ジョセフ病、オリーブ橋小脳萎縮を含む
)、テント下新生物のような小脳新生物、広汎性脳硬化症(例えば、軸周囲性脳
炎、球様細胞白質萎縮症、異染性白質萎縮症および亜急性硬化性汎脳炎)。
【0645】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および/またはアン
タゴニストを用いて処置または検出され得る神経性疾患のさらなる例としては、
以下が挙げられる:脳血管障害(例えば、頸動脈疾患(頸動脈血栓症、頸動脈狭
窄症およびモヤモヤ病を含む)、脳のアミロイドアンギオパチー、大脳動脈瘤、
脳酸素欠乏症、大脳動脈硬化症、大脳動静脈先天異常、大脳動脈疾患、脳塞栓症
および血栓症(例えば、頸動脈血栓症、洞血栓症およびヴァレンベルク症候群)
、脳出血(例えば、硬膜上血腫、硬膜下血腫およびクモ膜下出血)、脳梗塞、脳
虚血(例えば、一過性脳虚血、鎖骨下動脈盗血症候群および椎骨基部不全)、血
管性痴呆(例えば、多発脳梗塞性痴呆)、室周白斑、および血管性頭痛(例えば
、群発性頭痛、片頭痛)。
【0646】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および/またはアン
タゴニストを用いて処置または検出され得る神経性疾患のさらなる例としては、
以下が挙げられる:痴呆(例えば、AIDS痴呆複合症、初老期痴呆(例えば、
アルツハイマー病およびクロイツフェルト−ヤーコプ病)、老年痴呆(例えば、
アルツハイマー病および進行性核上性麻痺)、血管性痴呆(例えば、多発脳梗塞
性痴呆))、脳炎(軸周囲性脳炎、ウイルス性脳炎(例えば、流行性脳炎、日本
脳炎、セントルイス脳炎、ダニ媒介脳炎および西ナイル熱)を含む)、急性播種
性脳脊髄炎、髄膜脳炎(例えば、ブドウ膜脳炎症候群、脳炎後のパーキンソン病
および亜急性硬化性汎脳炎)、脳軟化症(例えば、室周白斑)、てんかん(例え
ば、全身てんかん(点頭痙攣を含む)、アプサンスてんかん、ミオクローヌスて
んかん(MERRF症候群、強直性間代性てんかんを含む)、部分てんかん(例
えば、複雑部分てんかん、前頭葉てんかんおよび側頭葉てんかん)、外傷後てん
かん、てんかん重積持続状態(例えば、持続性部分てんかん)を含む)、および
ハレルフォルデン−シュパッツ症候群。
【0647】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および/またはアン
タゴニストを用いて処置または検出され得る神経性疾患のさらなる例としては、
以下が挙げられる:水頭症(例えば、ダンディ−ウォーカー症候群および正常圧
水頭症)、視床下部疾患(例えば、視床下部新生物)、大脳マラリア、ナルコレ
プシー(脱力発作を含む)、延髄ポリオ、大脳偽腫瘍、レット症候群、ライ症候
群、視床疾患、トキソプラスマ症、頭蓋内結核腫およびツェルヴェーガー症候群
、中枢神経系感染(例えば、AIDS痴呆複合症、ブレーン膿瘍、硬膜下蓄膿、
脳脊髄炎(例えば、ウマ脳脊髄炎、ベネズエラウマ脳脊髄炎、壊死性出血性脳脊
髄炎)、ビスナ、および大脳マラリア。
【0648】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および/またはアン
タゴニストを用いて処置または検出され得る神経性疾患のさらなる例としては、
以下が挙げられる:髄膜炎(例えば、クモ膜炎、無菌性髄膜炎(例えば、ウイル
ス性髄膜炎(リンパ球性脈絡髄膜炎を含む)、細菌性髄膜炎(ヘモフィルス髄膜
炎、リステリア髄膜炎を含む)、髄膜炎菌性髄膜炎(例えば、ウォーターハウス
−フリーデリックセン症候群、肺炎球菌髄膜炎および髄膜結核)、真菌類髄膜炎
(例えば、クリプトコックス髄膜炎)、硬膜下滲出、髄膜脳炎(例えば、ブドウ
膜髄膜脳炎症候群)、脊髄炎(例えば、横断脊髄炎)、神経梅毒(例えば、脊髄
ろう)、ポリオ(延髄ポリオおよびポリオ後症候群を含む)、プリオン疾患およ
び(例えば、クロイツフェルト−ヤーコプ症候群、ウシ海綿状脳症、ゲルストマ
ン−シュトロイスラー症候群、クールー、スクラピー)。
【0649】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および/またはアン
タゴニストを用いて処置または検出され得るさらなる神経性疾患としては、以下
が挙げられる:大脳トキソプラスマ症、中枢神経系新生物(例えば、脳新生物(
小脳新生物(例えば、テント下新生物)、脳室新生物(例えば、脈絡叢新生物)
、視床下部新生物およびテント上新生物を含む)、髄膜新生物、脊髄新生物(硬
膜外新生物を含む)、脱髄疾患(例えば、キャナヴァン病)、広汎性脳硬化症(
副腎脳白質ジストロフィー、軸周囲性脳炎、球様細胞白質萎縮症、異染性白質萎
縮症のような広汎性脳硬化症を含む)、アレルギー性脳脊髄炎、壊死性出血性脳
脊髄炎、進行性多病巣性白質脳障害、多発性硬化症、橋中央ミエリン溶解、横断
脊髄炎、視神経脊髄炎、スクラピー、脊柱前弯症、慢性疲労症候群、ビスナ、高
圧神経症候群、髄膜症、脊髄疾患(例えば、先天性筋無緊張症、筋萎縮性側索硬
化症)、棘筋萎縮症(例えば、ヴェルドニッヒ−ホフマン病)、脊髄圧迫、脊髄
新生物(例えば、硬膜外新生物)、脊髄空洞症、脊髄ろう、スティッフマン症候
群、精神遅滞(例えば、Angelman症候群、ネコ鳴き症候群、ド・ランゲ
症候群、ダウン症候群)、ガングリオシドーシス(例えば、ガングリオシドーシ
スG(M1)、ザントホフ病、テイ−サックス病)、ハートナップ病、ホモシス
チン尿症、ローレンス−ムーン−ビードル症候群、レッシュ−ナイハン症候群、
カエデシロップ病、ムコリピドーシス(例えば、フコース蓄積症)、セロイド脂
褐素沈着症、眼脳腎症候群、フェニルケトン尿症(例えば、母体フェニルケトン
尿症)、プラーダー−ヴィリ症候群、レット症候群、ルービンスタイン−テービ
症候群、結節硬化症、WAGR症候群、神経系異常(例えば、全前脳症、神経管
欠損(例えば、無脳症(水無脳症(hydrangencephaly)を含む
)))、アルノルト−キアーリ奇形、脳ヘルニア、髄膜瘤、髄膜脊髄瘤、および
脊椎癒合不全(例えば、嚢胞性二分脊椎および潜在性二分脊椎)。
【0650】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および/またはアン
タゴニストを用いて処置または検出され得るさらなる神経性疾患としては、以下
が挙げられる:遺伝性感覚ニューロン障害および運動ニューロン障害(シャルコ
ー−マリー病を含む)、遺伝性眼萎縮症、レフサム病、遺伝性痙性対麻痺、ヴェ
ルドニッヒ−ホフマン病、遺伝性運動ニューロン障害および感覚ニューロン障害
(例えば、先天性痛覚脱失症および家族性自律神経障害)、神経症的発現(例え
ば、認知不能症(ゲルストマン症候群を含む)、健忘症(例えば、逆向性健忘症
)、失行症、神経因性膀胱障害、脱力発作、伝達障害(例えば、聴覚障害(難聴
、部分的聴力欠損、大声(loudness)レクルートメントおよび耳鳴を含
む)、言語障害(例えば、失語症(失書症、名称失語症、ブロカ失語症およびヴ
ェルニッケ失語症を含む)、失読症(例えば、後天性失読症)、言語発達障害、
発語障害(例えば、失語症(名称失語症、ブロカ失語症およびヴェルニッケ失語
症を含む))、構音障害、伝達障害(例えば、発語障害(構語障害、反響言語、
無言症およびどもりを含む)、発声障害(例えば、失声症および嗄声))、除脳
硬直状態、せん妄、束形成、幻覚、髄膜症、運動障害(例えば、Angelma
n症候群、運動失調、アテトーシス、舞踏病、失調症、運動低下症、筋緊張低下
、ミオクロヌス、チック、斜頸および振せん)、筋緊張亢進(例えば、筋硬直(
例えば、スティッフマン症候群)、筋痙性、麻痺(例えば、顔面神経麻痺(耳帯
状疱疹を含む)、胃不全麻痺、片麻痺、眼筋麻痺(例えば、複視、デュエーン症
候群、ホルナー症候群、慢性進行性外眼筋麻痺症(例えば、キーンズ症候群))
、延髄麻痺、熱帯性痙性不全対麻痺、対麻痺(例えば、ブラウン−セカール症候
群、四肢麻痺)、呼吸性麻痺および声帯麻痺、不全麻痺)、幻影肢、味覚障害(
例えば、無味覚症および味覚不全)、視覚障害(例えば、弱視、失明、色覚障害
、複視、半盲、暗点および正常以下の視覚)、睡眠障害(例えば、睡眠過剰(ク
ライネ−レヴィン症候群を含む)、不眠症、および夢遊症)、痙縮(例えば、開
口障害)、意識消失(例えば、昏睡、持続性植物状態および失神)および眩暈、
神経筋障害(例えば、先天性筋無緊張症、筋萎縮性側索硬化症、ランバート−イ
ートン筋無力症症候群、運動ニューロン疾患、筋萎縮(例えば、棘筋萎縮、シャ
ルコー−マリー病およびヴェルドニッヒ−ホフマン病)、ポリオ後症候群、筋ジ
ストロフィー、重症筋無力症、萎縮性ミオトニー、先天性ミオトニー、ネマリン
ミオパシー、家族性周期性四肢麻痺、多発性パラミオクロヌス(paramyl
oclonus)、熱帯性痙性不全対麻痺およびスティッフマン症候群)、末梢
神経系障害(例えば、先端疼痛症)、アミロイドニューロパシー、自律神経系疾
患(例えば、アーディー症候群、Barre−Lieou症候群、家族性自律神
経障害、ホルナー症候群、反射性交感神経性ジストロフィーおよびシャイ−ドレ
ーガー症候群)、脳神経疾患(例えば、聴神経疾患(例えば、聴神経腫(2型神
経線維腫症を含む))、顔面神経疾患(例えば、顔面神経痛、メルカーソン−ロ
ーゼンタール症候群、眼球運動障害(弱視、眼振、動眼神経麻痺を含む)、眼筋
麻痺(例えば、デュエーン症候群、ホルナー症候群、慢性進行性外眼筋麻痺症(
キーンズ症候群を含む))、斜視(例えば、内斜視および外斜視)、視神経麻痺
、視神経疾患(例えば、眼萎縮症(遺伝性眼萎縮症を含む)、視神経円板結晶腔
、視神経炎(例えば、視神経脊髄炎、乳頭水腫))、三叉神経痛、声帯麻痺、脱
髄疾患(例えば、視神経脊髄炎および脊柱前弯症)、および糖尿病性ニューロパ
シー(例えば、糖尿病足)。
【0651】 本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニスト、および/またはアン
タゴニストを用いて処置または検出され得るさらなる神経性疾患としては、以下
が挙げられる:神経圧挫症候群(例えば、手根管症候群、足根管症候群)、胸郭
出口症候群(例えば、頸肋症候群)、尺骨神経圧挫症候群、神経痛(例えば、カ
ウザルギー、頸腕神経痛、顔面神経痛および三叉神経痛)、神経炎(例えば、実
験的アレルギー性神経炎、眼神経炎、多発性神経炎、多発神経根神経炎および神
経根炎(例えば、多発性神経根炎))、遺伝性運動ニューロン障害および感覚ニ
ューロン障害(例えば、シャルコー−マリー病)、遺伝性眼萎縮症、レフサム病
、遺伝性痙性対麻痺およびヴェルドニッヒ−ホフマン病、遺伝性感覚ニューロン
障害および自律神経ニューロン障害(先天性痛覚脱失症および家族性自律神経障
害を含む)、POEMS症候群、坐骨神経痛、味覚性発汗症およびテタニー)。
【0652】 (感染性疾患) 本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチド、ならびにアゴニストまたはア
ンタゴニストは、感染因子を処置または検出するために用いられ得る。例えば、
免疫応答を上昇させることによって、特にB細胞および/またはT細胞の増殖お
よび分化を増加させることによって、感染性疾患が処置され得る。免疫応答は、
既存の免疫応答を上昇させるか、または新たな免疫応答を開始させるかのいずれ
かにより上昇され得る。あるいは、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチ
ド、ならびにアゴニストまたはアンタゴニストはまた、必ずしも免疫応答を誘発
することなく、感染因子を直接阻害し得る。
【0653】 ウイルスは、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、および/また
はアゴニストもしくはアンタゴニストにより処置または検出され得る疾患または
症状を引き起こし得る感染因子の一例である。ウイルスの例としては、以下のD
NAおよびRNAのウイルスおよびウイルス科が挙げられるがこれらに限定され
ない:アルボウイルス、アデノウイルス科、アレナウイルス科、アルテリウイル
ス、ビルナウイルス科、ブンヤウイルス科、カルシウイルス科、サルコウイルス
科(Circoviridae)、コロナウイルス科、デング熱、EBV、HI
V、フラビウイルス科、ヘパドナウイルス科(肝炎)、ヘルペスウイルス科(例
えば、サイトメガロウイルス、単純ヘルペス、ヘルペス帯状疱疹)、モノネガウ
イルス(Mononegavirus)(例えば、パラミクソウイルス科、麻疹
ウイルス、ラブドウイルス科)、オルソミクソウイルス科(例えば、インフルエ
ンザA、インフルエンザB、およびパラインフルエンザ)、パピローマウイルス
、パポバウイルス科、パルボウイルス科、ピコルナウイルス科、ポックスウイル
ス科(例えば、痘瘡またはワクシニア)、レオウイルス科(例えば、ロタウイル
ス)、レトロウイルス科(HTLV−I、HTLV−II、レンチウイルス)、
およびトガウイルス科(例えば、ルビウイルス属)。これらの科内に入るウイル
スは、以下を含むがこれらに限定されない種々の疾患または症状を引き起こし得
る:関節炎、細気管支炎(bronchiollitis)、呼吸性シンシチウ
ムウイルス、脳炎、眼性感染症(例えば、結膜炎、角膜炎)、慢性疲労症候群、
肝炎(A型、B型、C型、E型、慢性活動性、デルタ)、日本脳炎B型、アルゼ
ンチン出血熱、チングニア、リフトバレー熱、黄熱病、髄膜炎、日和見感染症(
例えば、AIDS)、肺炎、バーキットリンパ腫、水痘、出血熱、麻疹、流行性
耳下腺炎、パラインフルエンザ、狂犬病、感冒、ポリオ、白血病、風疹、性感染
症、皮膚病(例えば、カポージ、いぼ)、およびウイルス血症。本発明のポリヌ
クレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストを
用いて、任意のこれらの症状または疾患が処置または検出され得る。特定の実施
形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、またはアゴニストも
しくはアンタゴニストは、以下の処置に使用される:髄膜炎、デング熱、EBV
、および/または肝炎(例えば、B型肝炎)。さらなる具体的な実施形態におい
て、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、またはアゴニストもしくはアン
タゴニストは、1以上の他の市販の肝炎ワクチンに非応答性の患者を処置するた
めに使用される。さらに具体的な実施形態において、本発明のポリヌクレオチド
、ポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニストは、AIDSを処置
するために使用される。
【0654】 同様に、疾患または症状を引き起こし得、かつ本発明のポリヌクレオチドもし
くはポリペプチド、および/またはアゴニストもしくはアンタゴニストによって
処置または検出され得る細菌性因子あるいは真菌性因子は、以下のグラム陰性お
よびグラム陽性細菌および細菌科ならびに真菌を含むがこれらに限定されない:
Actinomycetales(例えば、Corynebacterium、
Mycobacterium、Norcardia)、Cryptococcu
s neoformans、Aspergillosis、Bacillace
ae(例えば、Anthrax、Clostridium)、Bacteroi
daceae、Blastomycosis、Bordetella、Borr
elia(例えば、Borrelia burgdorferi)、Bruce
llosis、Candidiasis、Campylobacter、Coc
cidioidomycosis、Cryptococcosis、Derma
tocycoses、E.coli(例えば、Enterotoxigenic
E.coliおよびEnterohemorrhagic E.coli)、
Enterobacteriaceae(Klebsiella、Salmon
ella(例えば、Salmonella typhi、およびSalmone
lla paratyphi)、Serratia、Yersinia)、Er
ysipelothrix、Helicobacter、Legionello
sis、Leptospirosis、Listeria、Mycoplasm
atales、Mycobacterium leprae、Vibrio c
holerae、Neisseriaceae(例えば、Acinetobac
ter、Gonorrhea、Menigococcal)、Meisseri
a meningitidis、Pasteurellaceaの感染症(例え
ば、Actinobacillus、Heamophilus(例えば、Hea
mophilusインフルエンザB型)、Pasteurella)、Pseu
domonas、Rickettsiaceae、Chlamydiaceae
、Syphilis、Shigella spp.、Staphylococc
al、Meningiococcal、PneumococcalならびにSt
reptococcal(例えば、Streptococcus pneumo
niaeおよびB群Streptococcus)。これらの細菌または真菌の
科は、以下を含むがこれらに限定されない疾患または症状を引き起こし得る:菌
血症、心内膜炎、眼感染症(結膜炎、結核、ブドウ膜炎)、歯肉炎、日和見感染
症(例えば、AIDSに関連した感染症)、爪周囲炎、プロテーゼ関連感染症、
ライター病、気道感染症(例えば、百日咳または蓄膿症)、敗血症、ライム病、
ネコ引っ掻き病、赤痢、パラチフス熱、食中毒、腸チフス、肺炎、淋病、髄膜炎
(例えば、髄膜炎A型およびB型)、クラミジア、梅毒、ジフテリア、ライ病、
パラ結核、結核、狼瘡、ボツリヌス中毒、壊疽、破傷風、膿痂疹、リウマチ熱、
猩紅熱、性感染病、皮膚病(例えば、蜂巣炎、皮膚真菌症(dermatocy
coses))、毒血症、尿路感染症、創傷感染症。本発明のポリペプチドもし
くはポリヌクレオチド、アゴニストもしくはアンタゴニストを用いて、これらの
症状もしくは疾患のいずれかを処置または検出し得る。具体的な実施形態におい
て、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、アゴニストまたはアンタゴニス
トは、以下を処置するために使用される:破傷風、ジフテリア、ボツリヅム、お
よび/またはB型髄膜炎。
【0655】 さらに、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、および/またはア
ゴニストもしくはアンタゴニストにより処置または検出され得る、寄生生物性因
子が引き起こす疾患または症状としては以下のファミリーまたはクラスが挙げら
れるがこれらに限定されない:アメーバ症、バベシア症、コクシジウム症、クリ
プトスポリジウム症、二核アメーバ症(Dientamoebiasis)、交
疫、外部寄生生物性、ジアルジア鞭毛虫症、蠕虫症、リーシュマニア症、タイレ
リア症、トキソプラスマ症、トリパノソーマ症、およびトリコモナス(Tric
homonas)症、ならびに胞子虫症(Sporozoan)(例えば、Pl
asmodium virax、Plasmodium falcipariu
m、Plasmodium malariaeおよびPlasmodium o
vale)。これらの寄生生物は、以下を含むがこれらに限定されない種々の疾
患または症状を引き起こし得る:疥癬、ツツガムシ病、眼性感染症、腸疾患(例
えば、赤痢、ジアルジア鞭毛虫症)、肝臓疾患、肺疾患、日和見感染症(例えば
、AIDS関連)、マラリア、妊娠合併症、およびトキソプラスマ症。本発明の
ポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、またはアゴニストもしくはアンタゴニ
ストを用いて、これらの症状または疾患のいずれかを処置または検出し得る。特
定の実施形態において、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、またはアゴ
ニストもしくはアンタゴニストは、マラリアを処置するために使用される。
【0656】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしく
はアンタゴニストは、患者に有効量のポリペプチドを投与するか、または患者か
ら細胞を取り出して、本発明のポリヌクレオチドをこの細胞に供給し、そして操
作した細胞を患者に戻す(エキソビボ治療)かのいずれかによるものであり得る
。さらに、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドはワクチン中の抗原と
して用いられて、感染性疾患に対する免疫応答を惹起し得る。
【0657】 (再生) 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしく
はアンタゴニストを用いて、細胞を分化させ、増殖させ、そして誘引して、組織
の再生を導き得る(Science 276:59−87(1997)を参照の
こと)。組織の再生を用いて、先天性欠損、外傷(創傷、熱傷、切開、または潰
瘍)、加齢、疾患(例えば、骨粗鬆症、変形性関節炎(osteocarthr
itis)、歯周病、肝不全)、美容形成手術を含む手術、線維症、再灌流傷害
、もしくは全身性サイトカイン損傷により損傷を受けた組織を修復、置換、また
は保護し得る。
【0658】 本発明を用いて再生し得る組織としては、以下が挙げられる:器官(例えば、
膵臓、肝臓、腸、腎臓、皮膚、内皮)、筋肉(平滑筋、骨格筋、または心筋)、
血管系(血管およびリンパ管を含む)、神経、造血、および骨格(骨、軟骨、腱
、および靭帯)の組織。好ましくは、再生は、瘢痕なく、または瘢痕が低減され
て生じる。再生はまた、新脈管形成を含み得る。
【0659】 さらに、本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニス
トもしくはアンタゴニストは、治癒するのが困難な組織の再生を増加させ得る。
例えば、腱/靭帯の再生を増大させることによって、損傷後の回復時間が早まる
。本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチド、ならびにアゴニストもしく
はアンタゴニストはまた、損傷を回避する試みにおいて予防的に使用され得る。
処置され得る特定の疾患は、腱炎、手根管症候群、および他の腱欠損または靭帯
欠損を含む。非治癒創傷の組織再生のさらなる例としては、褥瘡性潰瘍、脈管不
全、外科的創傷、および外傷性創傷に関連する潰瘍が挙げられる。
【0660】 同様に、神経および脳組織はまた、神経細胞を増殖および分化させるために本
発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチドならびにアゴニストもしくはアン
タゴニストを使用することによって再生され得る。本方法を用いて処置され得る
疾患としては、中枢神経系疾患および末梢神経系疾患、神経障害、または機械的
および外傷性障害(例えば、脊髄障害、頭部外傷、脳血管疾患、および発作(s
toke))が挙げられる。詳細には、末梢神経傷害と関連する疾患、末梢神経
障害(例えば、化学療法または他の医学的療法から生じる)、局在神経障害、お
よび中枢神経系疾患(例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチント
ン病、筋萎縮性側索硬化症、およびシャイ−ドレーガー症候群)はすべて、本発
明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチドならびにアゴニストもしくはアンタ
ゴニストを用いて処置され得る。
【0661】 (走化性) 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチドならびにアゴニストもしくは
アンタゴニストは、走化性活性を有し得る。走化性分子は、細胞(例えば、単球
、線維芽細胞、好中球、T細胞、肥満細胞、好酸球、上皮細胞および/または内
皮細胞)を、身体中の特定の部位(例えば、炎症、感染、または過剰増殖の部位
)に誘引または動員する。次いで、動員された細胞は、特定の外傷または異常性
を撃退および/または治癒し得る。
【0662】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチドならびにアゴニストもしくは
アンタゴニストは、特定の細胞の走化性活性を増大し得る。次いで、これらの走
化性分子を使用して、身体中の特定の位置に標的化した細胞の数を増加させるこ
とによって、炎症、感染、過剰増殖性障害、または任意の免疫系障害を処置し得
る。例えば、走化性分子を使用して、傷害を受けた位置に免疫細胞を誘引するこ
とによって、組織に対する創傷および他の外傷を処置し得る。本発明の走化性分
子はまた、線維芽細胞を誘引し得、これは創傷を処置するために使用され得る。
【0663】 本発明のポリヌクレオチドもしくはポリペプチドならびにアゴニストもしくは
アンタゴニストが走化性活性を阻害し得ることもまた意図される。これらの分子
はまた、障害を処置するために使用され得る。従って、本発明のポリヌクレオチ
ドもしくはポリペプチドならびにアゴニストもしくはアンタゴニストは、走化性
のインヒビターとして使用され得る。
【0664】 (結合活性) 本発明のポリペプチドは、このポリペプチドに結合する分子、またはこのポリ
ペプチドが結合する分子についてスクリーニングするために使用され得る。この
ポリペプチドとこの分子との結合は、結合したポリペプチドまたは分子の活性を
活性化(アゴニスト)、増大、阻害(アンタゴニスト)、または減少させ得る。
そのような分子の例としては、抗体、オリゴヌクレオチド、タンパク質(例えば
、レセプター)、または低分子が挙げられる。
【0665】 好ましくは、この分子は、このポリペプチドの天然のリガンド(例えば、リガ
ンドのフラグメント)、または天然の基質、リガンド、構造的模倣物、もしくは
機能的模倣物に密接に関連する(Coliganら、Current Prot
ocols in Immunology 1(2):第5章(1991)を参
照のこと)。同様に、この分子は、このポリペプチドが結合する天然のレセプタ
ー、または少なくとも、このポリペプチドによって結合され得るレセプターのフ
ラグメント(例えば、活性部位)に密接に関連し得る。いずれの場合においても
、この分子は、公知の技術を用いて合理的に設計され得る。
【0666】 好ましくは、これらの分子についてのスクリーニングは、ポリペプチドを発現
する適切な細胞を産生する工程を包含する。好ましい細胞としては、哺乳動物、
酵母、Drosophila、またはE.coli由来の細胞が挙げられる。次
いで、このポリペプチドを発現する細胞(または、発現されたポリペプチドを含
む細胞膜)を、好ましくは、このポリペプチドまたはこの分子のいずれかの結合
、活性の刺激、または活性の阻害を観察するための分子を潜在的に含む試験化合
物と接触させる。
【0667】 アッセイは、このポリペプチドへの候補化合物の結合を単純に試験し得、ここ
で結合は、標識によって、または標識された競合物との競合に関するアッセイに
おいて検出される。さらに、アッセイは、候補化合物がこのポリペプチドへの結
合によって生成されるシグナルを生じるか否かを試験し得る。
【0668】 あるいは、アッセイは、無細胞調製物、固体支持体に接着されたポリペプチド
/分子、化学ライブラリー、または天然産物の混合物を用いて実施され得る。ア
ッセイはまた、候補化合物を、ポリペプチドを含む溶液と混合する工程、ポリペ
プチド/分子の活性または結合を測定する工程、およびポリペプチド/分子の活
性または結合を、標準と比較する工程を単純に包含し得る。
【0669】 好ましくは、ELISAアッセイは、モノクローナル抗体またはポリクローナ
ル抗体を用いて、サンプル(例えば、生物学的サンプル)におけるポリペプチド
のレベルまたは活性を測定し得る。この抗体は、ポリペプチドへの直接的もしく
は間接的のいずれかの結合、または基質についてのポリペプチドとの競合によっ
て、ポリペプチドのレベルまたは活性を測定し得る。
【0670】 さらに、本発明のポリペプチドが結合するレセプターは、当業者に公知の多く
の方法(例えば、リガンドパニングおよびFACSソーティング(Coliga
nら、Current Protocols in Immun.,1(2)、
第5章(1991))によって同定され得る。例えば、発現クローニングを用い
、ここで、ポリアデニル化RNAがこのポリペプチドに応答する細胞(例えば、
NIH3T3細胞(これは、FGFファミリータンパク質に対する複数のレセプ
ターを含むことが公知である)、およびSC−3細胞)から調製される、そして
このRNAから作製されたcDNAライブラリーは、プールに分けられ、そして
このポリペプチドに応答性でないCOS細胞または他の細胞をトランスフェクト
するために使用される。ガラススライド上で増殖しているトランスフェクトされ
た細胞は、それらを標識化した後に、本発明のポリペプチドに曝露される。この
ポリペプチドは、種々の手段(部位特異的プロテインキナーゼに対する認識部位
のヨウ素化または封入を含む)によって標識化され得る。
【0671】 固定化およびインキュベーション後、このスライドは、オートラジオグラフィ
ー分析に供される。陽性プールを同定し、そしてサブプールを、反復性のサブプ
ール化および再スクリーニングプロセスを使用して調製および再びトランスフェ
クトして、最終的に推定レセプターをコードする単一のクローンを生じる。
【0672】 レセプター同定のための代替のアプローチとして、この標識ポリペプチドは、
レセプター分子を発現する細胞膜および抽出調製物と光親和性に連結し得る。架
橋された材料は、PAGE分析によって分離され、そしてX線フィルムに曝露さ
れる。このポリペプチドのレセプターを含む標識複合体が切り出され得、ペプチ
ドフラグメントへと分離され得、そしてタンパク質微小配列決定に供され得る。
微小配列決定から得られるアミノ酸配列を使用して、1組の縮重オリゴヌクレオ
チドプローブを設計してcDNAライブラリーをスクリーニングし、推定レセプ
ターをコードする遺伝子を同定する。
【0673】 さらに、遺伝子シャッフリング、モチーフシャッフリング、エキソンシャッフ
リング、および/またはコドンシャッフリングの技術(集合的に「DNAシャッ
フリング」という)を利用して、本発明のポリペプチドの活性を調節し得、それ
によって本発明のポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストを効果的に生
成する。一般に、米国特許第5,605,793号、同第5,811,238号
、同第5,830,721号、同第5,834,252号、および同第5,83
7,458号、ならびにPatten,P.A.ら、Curr.Opinion
Biotechnol.8:724〜33(1997);Harayama,
S.Trends Biotechnol.16(2):76〜82(1998
);Hansson,L.O.ら、J.Mol.Biol.287:265〜7
6(1999);ならびにLorenzo,M.M.およびBlasco,R.
Biotechniques 24(2):308〜13(1998)(これら
の特許および刊行物の各々は、本明細書において参考として援用される)を参照
のこと。1つの実施形態において、ポリヌクレオチドの変更および対応するポリ
ペプチドの変更は、DNAシャッフリングによって達成され得る。DNAシャッ
フリングは、相同組換えまたは部位特異的な組換えによる、2つ以上のDNAセ
グメントの、所望の分子への構築に関連する。別の実施形態において、ポリヌク
レオチドおよび対応するポリペプチドは、組換えの前に、誤りがちな(erro
r−prone)PCR、ランダムヌクレオチド挿入または他の方法によるラン
ダム変異誘発に供することによって、変更され得る。別の実施形態において、本
発明のポリペプチドの1つ以上の成分、モチーフ、切片、部分、ドメイン、フラ
グメントなどは、1つ以上の異種分子の1つ以上の成分、モチーフ、切片、部分
、ドメイン、フラグメントなどと組換えられ得る。好ましい実施形態において、
この異種分子は、ファミリーのメンバーである。さらに好ましい実施形態におい
て、この異種分子は、例えば、血小板由来増殖因子(PDGF)、インスリン様
増殖因子(IGF−I)、トランスホーミング増殖因子(TGF)−α、表皮増
殖因子(EGF)、線維芽細胞増殖因子(FGF)、TGF−β、骨形成タンパ
ク質(BMP)−2、BMP−4、BMP−5、BMP−6、BMP−7、アク
チビンAおよびアクチビンB、デカペンタプレジック(decapentapl
egic)(dpp)、60A、OP−2、ドーサリン(dorsalin)、
増殖分化因子(GDF)、結節(nodal)、MIS、インヒビン−α、TG
F−β1、TGF−β2、TGF−β3、TGF−β5、および神経膠由来神経
栄養因子(GDNF)のような増殖因子である。
【0674】 他の好ましいフラグメントは、本発明のポリペプチドの生物学的に活性なフラ
グメントである。生物学的に活性なフラグメントは、本発明のポリぺプチドの活
性に類似の活性を示すが、必ずしも同一である必要はないフラグメントである。
このフラグメントの生物学的活性は、改善された所望の活性、または減少した所
望されない活性を含み得る。
【0675】 さらに、本発明は、本発明のポリペプチドの作用を調節する化合物を同定する
ために化合物をスクリーニングする方法を提供する。このようなアッセイの例は
、哺乳動物線維芽細胞、本発明のポリペプチド、スクリーニングされるべき化合
物および[H]チミジンを、線維芽細胞が通常増殖する細胞培養条件下で合わ
せる工程を包含する。コントロールアッセイは、スクリーニングされるべき化合
物の非存在下で実施され得、そしてこの化合物の存在下での線維芽細胞の増殖の
量と比較して、各々の場合における[H]チミジンの取り込みの決定によって
、この化合物が増殖を刺激するか否かを決定し得る。線維芽細胞の増殖の量は、 [H]チミジンの取り込みを測定する液体シンチレーションクロマトグラフィ
ーによって測定される。アゴニスト化合物およびアンタゴニスト化合物の両方が
、この手順により同定され得る。
【0676】 別の方法において、本発明のポリペプチドに対するレセプターを発現する哺乳
動物細胞または膜調製物は、この化合物の存在下において標識化した本発明のポ
リペプチドとともにインキュベートされる。次いで、この化合物がこの相互作用
を増強またはブロックする能力が、測定され得る。あるいは、スクリーニングさ
れるべき化合物の相互作用に従う既知のセカンドメッセンジャー系の応答および
レセプターが測定され、そしてこの化合物がこのレセプターに結合し、そしてセ
カンドメッセンジャー応答を誘発する能力を測定して、この化合物が潜在的なア
ゴニストまたはアンタゴニストであるか否かを決定する。このようなセカンドメ
ッセンジャー系には、cAMPグアニル酸シクラーゼ、イオンチャネルまたはホ
スホイノシチド加水分解が挙げられるが、これらに限定されない。
【0677】 これらの上記のアッセイの全ては、診断マーカーまたは予後マーカーとして使
用され得る。これらのアッセイを用いて発見される分子は、ポリペプチド/分子
を活性化または阻害することによって、疾患を処置するか、または患者における
特定の結果(例えば、血管増殖)をもたらすために使用され得る。さらに、この
アッセイは、適切に操作された細胞または組織からの本発明のポリペプチドの産
生を阻害または増強し得る因子を発見し得る。
【0678】 従って、本発明は、以下の工程を含む本発明のポリペプチドに結合する化合物
を同定する方法を包含する:(a)候補結合化合物を本発明のポリペプチドとと
もにインキュベートする工程;および(b)結合が生じたか否かを決定する工程
。さらに、本発明は、以下の工程を含むアゴニスト/アンタゴニストを同定する
方法を包含する:(a)候補化合物を本発明のポリペプチドとともにインキュベ
ートする工程、(b)生物学的活性をアッセイする工程、および(b)ポリペプ
チドの生物学的活性が変更されているか否かを決定する工程。
【0679】 (標的化された送達) 別の実施形態において、本発明は、組成物を、本発明のポリペプチドについて
のレセプターを発現する標的化細胞、または本発明のポリペプチドの細胞結合形
態を発現する細胞に送達する方法を提供する。
【0680】 本明細書中で議論される場合、本発明のポリペプチドまたは抗体は、異種ポリ
ペプチド、異種核酸、毒素またはプロドラッグと、疎水性、親水性、イオン性お
よび/または共有結合性の相互作用を介して会合し得る。1つの実施形態におい
て、本発明は、異種ポリペプチドまたは核酸と会合した本発明のポリペプチド(
抗体を含む)を投与することによる、本発明の組成物の細胞への特異的な送達の
ための方法を提供する。1つの例において、本発明は、治療タンパク質を標的化
細胞中へ送達するための方法を提供する。別の例において、本発明は、一本鎖核
酸(例えば、アンチセンスまたはリボザイム)あるいは二本鎖核酸(例えば、細
胞のゲノムに組み込まれ得るか、またはエピソームにて複製し得、そして転写さ
れ得る、DNA)を、標的化細胞に送達するための方法を提供する。
【0681】 別の実施形態において、本発明は、毒素または細胞傷害性プロドラッグと会合
した本発明のポリペプチド(例えば、本発明のポリペプチドまたは本発明の抗体
)を投与することによる細胞の特異的破壊(例えば、腫瘍細胞の破壊)のための
方法を提供する。
【0682】 「毒素」とは、内因性の細胞傷害性エフェクター系、放射性同位体、ホロ毒素
(holotoxin)、改変型毒素、毒素の触媒サブユニット、または規定の
条件下で細胞死を引き起こす細胞中もしくは細胞表面には通常存在しない任意の
分子もしくは酵素を、結合および活性化する化合物を意味する。本発明の方法に
従って使用され得る毒素としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない
:当該分野で公知の放射性同位体、固有のまたは誘導された内因性の細胞傷害性
エフェクター系を結合する化合物(例えば、抗体(またはその補体固定を含む部
分))、チミジンキナーゼ、エンドヌクレアーゼ、RNAse、α毒素、リシン
、アブリン、Pseudomonas外毒素A、ジフテリア毒素、サポリン、モ
モルジン(momordin)、ゲロニン(gelonin)、ヨウシュヤマゴ
ボウ抗ウイルスタンパク質、α−サルシン(sarcin)およびコレラ毒素。
「細胞傷害性プロドラッグ」とは、通常細胞内に存在する酵素によって、細胞傷
害性化合物へと変換される非毒性の化合物を意味する。本発明の方法に従って使
用され得る細胞傷害性プロドラッグとしては、安息香酸マスタードアルキル化剤
のグルタミル誘導体、エトポシドまたはマイトマイシンCのリン酸誘導体、シト
シンアラビノシド、ダウノルビシン、およびドキソルビシンのフェノキシアセト
アミド誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。
【0683】 (薬物スクリーニング) 本発明のポリペプチドの活性を改変する分子についてスクリーニングするため
の、本発明のポリペプチド、またはこれらのポリペプチドをコードするポリヌク
レオチドの使用が、さらに意図される。このような方法は、本発明のポリペプチ
ドを、アンタゴニスト活性またはアゴニスト活性を有することが疑われる選択さ
れた化合物と接触させる工程、および結合に続いてこれらのポリペプチドの活性
をアッセイする工程を包含する。
【0684】 本発明は、種々の薬物スクリーニング技術のいずれかにおいて、本発明のポリ
ペプチド、またはそれらの結合フラグメントを使用することによって治療用化合
物をスクリーニングするために特に有用である。このような試験に用いられるポ
リペプチドまたはフラグメントは、固体支持体に固定化され得、細胞表面上に発
現され得、溶液中で遊離であり得、または細胞内に局在化され得る。薬物スクリ
ーニングの1つの方法は、ポリペプチドまたはフラグメントを発現する組換え核
酸を用いて安定に形質転換される真核生物宿主細胞または原核生物宿主細胞を利
用する。薬物は、競合結合アッセイにおいて、このような形質転換細胞に対して
スクリーニングされる。例えば、試験されている薬剤と本発明のポリペプチドと
の間の複合体の形成(formulaton)を測定し得る。
【0685】 従って、本発明は、本発明のポリペプチドによって媒介される活性に影響を及
ぼす薬物または任意の他の薬剤についてのスクリーニング方法を提供する。これ
らの方法は、当該分野で周知の方法によって、このような薬剤を本発明のポリペ
プチドもしくはそのフラグメントと接触させる工程、およびこの薬剤とこのポリ
ペプチドもしくはそのフラグメントとの間の複合体の存在についてアッセイする
工程を包含する。このような競合結合アッセイにおいて、スクリーニングされる
薬剤は、代表的に、標識化される。インキュベーション後に、遊離の薬剤は、結
合形態で存在する薬剤から分離され、そして遊離または複合体化されていない標
識の量は、特定の薬剤が本発明のポリペプチドに結合する能力の尺度である。
【0686】 薬物スクリーニングについての別の技術は、本発明のポリペプチドに対する適
切な結合親和性を有する化合物に対するハイスループットスクリーニングを提供
し、そして欧州特許出願84/03564(1984年9月13日公開)(これ
は、本明細書中で参考として援用される)に非常に詳細に記載される。簡潔にい
うと、大量の異なる小さなペプチド試験化合物は、固体基材(例えば、プラスチ
ックピンまたは何らかの他の表面)上で合成される。ペプチド試験化合物を、本
発明のポリペプチドと反応させ、そして洗浄する。次いで、結合したポリペプチ
ドは、当該分野で周知の方法によって検出される。精製されたポリペプチドは、
前述の薬物スクリーニング技術での使用のためにプレート上に直接コーディング
される。さらに、非中和抗体を使用して、このペプチドを捕捉し得、そして固体
支持体上にそれを固定し得る。
【0687】 本発明はまた、競合薬物スクリーニングアッセイの使用を意図し、ここで、本
発明のポリペプチドを結合し得る中和抗体は、ポリペプチドまたはそのフラグメ
ントに対する結合について試験化合物と特異的に競合する。この様式において、
抗体を使用して、本発明のポリペプチドと1つ以上の抗原性エピトープを共有す
る任意のペプチドの存在を検出する。
【0688】 (アンチセンスおよびリボザイム(アンタゴニスト)) 特定の実施形態において、本発明に従うアンタゴニストは、配列番号Xに含ま
れる配列またはその相補鎖に対応する核酸、および/あるいは表1で同定するc
DNAプラスミドVに含まれるヌクレオチド配列に対応する核酸である。1つの
実施形態において、アンチセンス配列は、生物体により内部で生成され、別の実
施形態において、アンチセンス配列は別々に投与される(例えば、O’Conn
or,J.,Neurochem.56:560(1991)。Oligode
oxynucleotides as Antisense Inhibito
rs of Gene Expression,CRC Press,Boca
Raton,FL(1988)を参照のこと)。アンチセンス技術を使用して
、アンチセンスDNAもしくはRNAを通してか、または3重らせんの形成を通
して遺伝子発現を制御し得る。アンチセンス技術は、例えば、Okano,J.
,Neurochem.56:560(1991);Oligodeoxynu
cleotides as Antisense Inhibitors of
Gene Expression,CRC Press,Boca Rato
n,FL(1988)に考察される。3重らせん形成は、例えば、Leeら、N
ucleic Acids Research 6:3073(1979);C
ooneyら、Science、241:456(1988);およびDerv
anら、Science、251:1300(1991)において考察される。
これらの方法は、相補的なDNAまたはRNAへのポリヌクレオチドの結合に基
づく。
【0689】 例えば、非リンパ性白血病細胞株HL−60および他の細胞株の増殖を阻害す
るためのc−mycおよびc−mybアンチセンスRNA構築物の使用は、以前
に記載された(Wickstromら(1988);Anfossiら(198
9))。これらの実験は、細胞をオリゴリボヌクレオチドとインキュベーション
することによってインビトロで行われた。インビボ用途のための類似の手順は、
WO91/15580に記載される。簡単には、所定のアンチセンスRNAにつ
いてのオリゴヌクレオチドの対は、以下のように生成される:オープンリーディ
ングフレームの最初の15塩基に相補的な配列を、5末端のEcoRI部位およ
び3末端のHindIII部位に隣接させる。次に、オリゴヌクレオチドの対は
、90℃で1分間加熱され、次いで2×連結緩衝液(20mM TRIS HC
l pH7.5、10mM MgCl、10mM ジチオスレイトール(DT
T)および0.2mM ATP)中でアニーリングされ、次いで、レトロウイル
スベクターPMV7のEcoR1/HindIII部位に連結される(WO91
/15580)。
【0690】 例えば、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの5’コード部
分を使用して、約10〜40塩基対長のアンチセンスRNAオリゴヌクレオチド
を設計し得る。DNAオリゴヌクレオチドは、転写に関与する遺伝子の領域に相
補的であるように設計され、それにより転写およびレセプターの産生を阻害する
。アンチセンスRNAオリゴヌクレオチドは、インビボでmRNAにハイブリダ
イズし、そしてmRNA分子のレセプターポリペプチドへの翻訳をブロックする
【0691】 1つの実施形態において、本発明のアンチセンス核酸は、外来の配列からの転
写により細胞内で産生される。例えば、ベクターまたはその一部が転写され、本
発明のアンチセンス核酸(RNA)を産生する。このようなベクターは、このア
ンチセンス核酸をコードする配列を含む。このようなベクターは、それが転写さ
れて所望のアンチセンスRNAを産生し得る限り、エピソームを保持し得るか、
または染色体に組込まれ得る。このようなベクターは、当該分野において標準的
な組換えDNA技術方法により構築され得る。ベクターは、脊椎動物細胞におい
て複製および発現のために使用される、当該分野で公知のプラスミド、ウイルス
などであり得る。本発明のポリペプチドをコードする配列またはそのフラグメン
トの発現は、脊椎動物、好ましくはヒト細胞において作用することが当該分野で
公知の任意のプロモーターにより得る。そのようなプロモーターは、誘導性また
は構成性であり得る。このようなプロモーターとしては、SV40初期プロモー
ター領域(BernoistおよびChambon、Nature、29:30
4−310(1981))、ラウス肉腫ウイルスの3’長末端反復に含まれるプ
ロモーター(Yamamotoら、Cell、22:787−797(1980
))、ヘルペスチミジンプロモーター(Wagnerら、Proc.Natl.
Acad.Sci.U.S.A.78:1441−1445(1981))、メ
タロチオネイン遺伝子の調節配列(Brinsterら、Nature、296
:39−42(1982))などが挙げられるが、これらに限定されない。
【0692】 本発明のアンチセンス核酸は、少なくとも本発明の遺伝子のRNA転写物の一
部に相補的な配列を含む。しかし、完全に相補的であることは好ましいが、必要
ではない。本明細書中で言及される「少なくともRNAの一部に相補的な」配列
は、RNAとハイブリダイズし得るに十分な相補性を有し、安定な二重鎖を形成
する配列を意味し;従って、本発明の二本鎖アンチセンス核酸の場合において、
二重鎖DNAの一本鎖が試験され得るか、または三重鎖形成がアッセイされ得る
。ハイブリダイズする能力は、相補性の程度およびアンチセンス核酸の長さの両
方に依存する。一般的に、ハイブリダイズする核酸が長いほど、RNAとのより
多くの塩基ミスマッチを含み得、これは、安定な二重鎖(または三重鎖の場合も
あり得る)を含み得、そしてなお形成し得る。当業者は、ハイブリダイズ複合体
の融点を決定するために標準的な手順を使用することによりミスマッチの許容の
程度を確認し得る。
【0693】 メッセージの5’末端に相補的であるオリゴヌクレオチド(例えば、AUG開
始コドンまででかつAUG開始コドンを含む5’非翻訳配列)は、翻訳の阻害の
際に最も効率的に働くべきである。しかし、mRNAの3’非翻訳配列に相補的
な配列は、同様にmRNAの翻訳を阻害する際に有効であることが示された。一
般的に、Wagner,R.、Nature 372:333−335(199
4)を参照のこと。従って、本明細書中に記載されるポリヌクレオチド配列の5
’−または3’−の非翻訳非コード領域のいずれかに相補的なオリゴヌクレオチ
ドは、内因性mRNAの翻訳を阻害するアンチセンスアプローチに使用され得る
。mRNAの5’非翻訳領域に相補的なオリゴヌクレオチドは、AUG開始コド
ンの相補物を含むべきである。mRNAコード領域に相補的なアンチセンスオリ
ゴヌクレオチドは、翻訳のあまり効率的でないインヒビターであるが、本発明に
従って使用され得る。本発明のmRNAの5’領域、3’領域またはコード領域
にハイブリダイズするように設計されるか否かにかかわらず、アンチセンス核酸
は、少なくとも6ヌクレオチド長であるべきであり、そして好ましくは6〜約5
0ヌクレオチド長にわたるオリゴヌクレオチドである。特定の局面において、こ
のオリゴヌクレオチドは、少なくとも10ヌクレオチド、少なくとも17ヌクレ
オチド、少なくとも25ヌクレオチドまたは少なくとも50ヌクレオチドである
【0694】 本発明のポリヌクレオチドは、DNA、もしくはRNA、またはキメラ混合物
、あるいはそれらの誘導体もしくは改変バージョン、一本鎖、または二本鎖であ
り得る。このオリゴヌクレオチドは、塩基部分、糖部分、またはリン酸骨格で改
変されて、例えば、分子の安定性、ハイブリダーゼーションなどを改善し得る。
このオリゴヌクレオチドは、ペプチドのような他の付加基(例えば、インビボに
おいて宿主細胞レセプターを標的化するために)、または細胞膜を通した輸送を
促進する因子(例えば、Letsingerら、Proc.Natl.Acad
.Sci.U.S.A.86:6553−6556(1989);Lemait
reら、Proc.Natl.Acad.Sci.84:648−652(19
87);PCT公開番号WO88/09810(1988年12月15日公開)
を参照のこと)、または血液脳関門(例えば、PCT公開番号WO89/101
34(1988年4月25日公開)を参照のこと)、ハイブリダイゼーション誘
引切断剤(hybridization−triggered cleavag
e agent)(例えば、Krolら、BioTechniques、6:9
58−976(1988)を参照のこと)、またはインターカレート剤(例えば
、Zon,Pharm.Res.5:539−549(1988)を参照のこと
)を含み得る。この目的のために、オリゴヌクレオチドは、別の分子(例えば、
ペプチド、ハイブリダーゼーション誘引架橋剤、輸送剤、ハイブリダイゼーショ
ン誘引切断剤など)に結合体化され得る。
【0695】 アンチセンスオリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの改変された塩基部分を
含み得、この塩基部分は、以下を含むがそれらに限定されない群から選択される
:5−フルオロウラシル、5−ブロモウラシル、5−クロロウラシル、5−ヨー
ドウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、4−アセチルシトシン、5−(カル
ボキシヒドロキシルメチル)ウラシル、5−カルボキシメチルアミノメチル−2
−チオウリジン、5−カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシ
ル、β−D−ガラクトシルキューオシン、イノシン、N6−イソペンテニルアデ
ニン、1−メチルグアニン、1−メチルイノシン、2,2−ジメチルグアニン、
2−メチルアデニン、2−メチルグアニン、3−メチルシトシン、5−メチルシ
トシン、N6−アデニン、7−メチルグアニン、5−メチルアミノメチルウラシ
ル、5−メトキシアミノメチル−2−チオウラシル、β−D−マンノシルキュー
オシン、5’−メトキシカルボキシメチルウラシル、5−メトキシウラシル、2
−メチルチオ−N6−イソペンテニルアデニン、ウラシル−5−オキシ酢酸(v
)、ワイブトキソシン(wybutoxosine)、プソイドウラシル、キュ
ーオシン、2−チオシトシン、5−メチル−2−チオウラシル、2−チオウラシ
ル、4−チオウラシル、5−メチルウラシル、ウラシル−5−オキシ酢酸メチル
エステル、ウラシル−5−オキシ酢酸(v)、5−メチル−2−チオウラシル、
3−(3−アミノ−3−N−2−カルボキシプロピル)ウラシル、(acp3)
w、および2,6−ジアミノプリン。
【0696】 アンチセンスオリゴヌクレオチドはまた、以下を含むがそれらに限定されない
群から選択される少なくとも1つの改変された糖部分を含み得る:アラビノース
、2−フルオロアラビノース、キシルロース、およびヘキソース。
【0697】 なお別の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下を含む
がそれらに限定されない群から選択される少なくとも1つの改変されたリン酸骨
格を含む:ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロアミドチオエ
ート、ホスホロアミデート(phosphoramidate)、ホスホロジア
ミデート、メチルホスホネート、アルキルホスホトリエステル、およびホルムア
セタール(formacetal)またはそれらのアナログ。
【0698】 なお別の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、a−アノマ
ーオリゴヌクレオチドである。a−アノマーオリゴヌクレオチドは、相補的なR
NAと特異的な二本鎖ハイブリッドを形成し、通常のb−ユニットとは反対に、
その鎖は互いに平行にする(Gautierら、Nucl.Acids Res
.、15:6625−6641(1987))。このオリゴヌクレオチドは、2
’−0−メチルリボヌクレオチドであるか(Inoueら、Nucl.Acid
s Res.、15:6131−6148(1987))、またはキメラRNA
−DNAアナログである(Inoueら、FEBS Lett.215:327
−330(1987))。
【0699】 本発明のポリヌクレオチドは当該分野で公知の標準的な方法(例えば、自動D
NA合成機(このような装置はBiosearch,Applied Bios
ystemsなどから市販されている)の使用により)合成され得る。例えば、
ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドは、Steinらの方法(Nucl.A
cids Res.、16:3209(1988))により合成され得、メチル
ホスホネートオリゴヌクレオチドは、コントロールドポアガラス(contro
lled pore glass)ポリマー支持体(Sarinら、Proc.
Natl.Acad.Sci.U.S.A.、85:7448−7451(19
88))などの使用により調製され得る。
【0700】 コード領域配列に相補的なアンチセンスヌクレオチドが使用され得るが、転写
された非翻訳領域に相補的なアンチセンスヌクレオチドが最も好ましい。
【0701】 本発明による潜在的なアンタゴニストはまた、触媒RNA、すなわちリボザイ
ムを含む(例えば、PCT国際公開WO90/11364、1990年10月4
日公開;Sarverら、Science、247:1222−1225(19
90)を参照のこと)。一方、部位特異的認識配列でmRNAを切断するリボザ
イムを使用して、mRNAを破壊し得るが、ハンマーヘッド型リボザイムの使用
が好ましい。ハンマーヘッド型リボザイムは、標的mRNAと相補的な塩基対を
形成する隣接領域により決定される位置で、mRNAを切断する。たった1つの
必要条件は、標的mRNAが以下の2つの塩基配列を有することである:5’−
UG−3’。ハンマーヘッド型リボザイムの構築および生成は当該分野で周知で
あり、そしてHaseloffおよびGerlach、Nature、334:
585−591(1988)により十分に記載される。配列番号Xのヌクレオチ
ド配列内に多くの潜在的なハンマーヘッド型リボザイム切断部位が存在する。好
ましくは、このリボザイムは、切断認識部位がmRNAの5’末端付近に位置す
るように;すなわち、効率を増大し、そして非機能的mRNA転写物の細胞内蓄
積を最小化するように、操作される。
【0702】 アンチセンスアプローチの場合、本発明のリボザイムは、改変されたオリゴヌ
クレオチド(例えば、安定性、標的化などを改良するために)から構成され得、
そしてインビボにおいて本発明のポリペプチドを発現する細胞に送達されるべき
である。リボザイムをコードするDNA構築物は、DNAをコードするアンチセ
ンスの導入のための上記と同じ様式において細胞中に導入され得る。送達の好ま
しい方法は、強力な構成性プロモーター(例えば、pol IIIまたはpol
IIプロモーターのような)の制御下で、リボザイムを「コードする」DNA
構築物を使用することを含み、その結果トランスフェクトした細胞が、十分な量
のリボザイムを生成し、そして内因性メッセージを破壊し、翻訳を阻害する。リ
ボザイムはアンチセンス分子と異なり触媒性であるので、より低い細胞内濃度が
効率のために必要とされる。
【0703】 アンタゴニスト/アゴニスト化合物を利用して、腫瘍性の細胞および組織に対
する本発明のポリペプチドの細胞増殖(growth)および増殖(proli
feration)効果を阻害し得る。すなわち、腫瘍の新脈管形成を刺激し、
それにより異常な細胞成長および増殖を(例えば、腫瘍形成または増殖において
)遅延または防止する。
【0704】 このアンタゴニスト/アゴニストをまた利用して、血管過多の疾患を予防し得
、そして水晶体嚢外白内障(extracapsular cataract)
手術後の上皮レンズ細胞の増殖を防止し得る。本発明のポリペプチドのマイトジ
ェン活性の防止はまた、例えば、バルーン血管形成術後の再狭窄のような場合に
要求され得る。
【0705】 アンタゴニスト/アゴニストをまた利用して、創傷治癒の間の瘢痕組織の増殖
を防止し得る。
【0706】 アンタゴニスト/アゴニストをまた利用して、本明細書中に記載される疾患を
処置し得る。
【0707】 従って、本発明は、障害または疾患(本発明のポリヌクレオチドの過剰発現に
関連する、本願の全体に渡って列挙される障害または疾患が含まれるが、これら
に限定されない)を、(a)本発明のポリヌクレオチドに関するアンチセンス分
子、および/または(b)本発明のポリヌクレオチドに関するリボザイムを患者
に投与することによって、処置する方法を提供する。
【0708】 (結合ペプチドおよび他の分子) 本発明はまた、本発明のポリペプチドに結合するポリペプチドおよび非ポリペ
プチドを同定するためのスクリーニング方法、およびそれによって同定された結
合分子を含む。これらの結合分子は、例えば、本発明のポリペプチドのアゴニス
トおよびアンタゴニストとして有用である。そのようなアゴニストおよびアンタ
ゴニストは、本発明に従って、以下に詳細に記載される治療実施形態において使
用され得る。
【0709】 この方法は、以下の工程を包含する: a.本発明のポリペプチドを多数の分子と接触させる工程;および b.この本発明のポリペプチドに結合する分子を同定する工程。
【0710】 本発明のポリペプチドを多数の分子と接触させる工程は、多数の方法によって
もたらされ得る。例えば、当業者は、本発明のポリペプチドを固体支持体上に固
定化させ、そして多数の分子の溶液を固定化した本発明のポリペプチドと接触さ
せることを考え得る。このような手順は、固定化ポリペプチドから構成される親
和性マトリックスを用いるアフィニティークロマトグラフィープロセスに類似し
ている。次いで、本発明のポリペプチドに対して選択的な親和性を有する分子が
、親和性選択によって精製され得る。固体支持体の性質、このポリペプチドのこ
の固体支持体への付着に関するプロセス、溶媒、および親和性単離または親和性
選択の条件は、大部分が慣用的であり、そして当業者に周知である。
【0711】 あるいは、当業者はまた、多数のポリペプチドを、ポリペプチドのサブセット
または個々のポリペプチドを含む実質的に別々の分画へ分離し得る。例えば、多
数のポリペプチドは、ゲル電気泳動、カラムクロマトグラフィーなどポリペプチ
ドの分離に関して当業者に公知の方法によって、分離され得る。個々のポリペプ
チドはまた、宿主細胞の外部表面上またはほぼ外部表面に発現されるような様式
で、形質転換された宿主細胞(例えば、組換えファージ)によって産生され得る
。次いで、個々の単離物は、本発明のポリペプチドによって「プローブ化」され
得、必要に応じて発現に必要とされるであろうインデューサーの存在下で、本発
明のポリペプチドと個々のクローンとの間で任意の選択的親和性相互作用が起こ
ったか否かが決定される。本発明のポリペプチドを個々のポリペプチドを含む各
分画と接触させる前に、これらのポリペプチドはまず、さらなる簡便性のために
固体支持体に移され得る。そのような固体支持体は、単に、例えばニトロセルロ
ースまたはナイロンでできたフィルター膜の断片であり得る。この様式において
、陽性クローンは、形質転換宿主細胞の発現ライブラリーの集団(これらは、本
発明のポリペプチドに対して選択的親和性を有するポリペプチドをコードするD
NA構築物を持つ)から同定され得る。さらに、本発明のポリペプチドに対して
選択的親和性を有するポリペプチドのアミノ酸配列が、従来の手段によって直接
決定され得るか、またはこのポリペプチドをコードするDNAのコード配列が、
頻繁により簡便に決定され得る。次いで、一次配列が、対応するDNA配列から
推定され得る。アミノ酸配列がポリペプチド自身から決定されるものである場合
、微小配列決定技術を使用し得る。この配列決定技術は、質量分析法を含み得る
【0712】 特定の状況において、選択的親和性相互作用の存在を決定または検出しようと
試みる前に、いずれの未結合ポリペプチドを、本発明のポリペプチドおよび多数
のポリペプチドの混合物から洗浄除去することが望ましくあり得る。このような
洗浄工程は、本発明のポリペプチドまたは多数のポリペプチドが固体支持体に結
合している場合に、特に望ましくあり得る。
【0713】 本方法に従って提供される多数の分子は、多様性ライブラリー(例えば、本発
明のポリペプチドへ特異的に結合する分子をスクリーニングし得る無作為または
コンビナトリアルの、ペプチドライブラリーまたは非ペプチドライブラリー)と
して提供され得る。使用され得る多くのライブラリー(例えば、化学合成ライブ
ラリー、組換えライブラリー(例えば、ファージディスプレイライブラリー)、
およびインビトロ翻訳ベースのライブラリー)が、当該分野で公知である。化学
合成ライブラリーの例は、以下に記載される:Fodorら、1991、Sci
ence 251:767−773;Houghtenら、1991、Natu
re 354:84−86;Lamら、1991、Nature 354:82
−84;Medynski、1994、Bio/Technology 12:
709−710;Gallopら、1994、J.Medicinal Che
mistry 37(9):1233−1251;Ohlmeyerら、199
3、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:10922−10
926;Erbら、1994,Proc.Natl.Acad.Sci.USA
91:11422−11426;Houghtenら、1992,Biote
chniques 13:412;Jayawickremeら、1994、P
roc.Natl.Acad.Sci.USA 91:1614−1618;S
almonら、1993,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 9
0:11708−11712;PCT公開WO93/20242;ならびにBr
ennerおよびLerner、1992、Proc.Natl.Acad.S
ci.USA 89:5381−5383。
【0714】 ファージディスプレイライブラリーの例は、以下に記載される:Scottお
よびSmith、1990、Science 249:386−390;Dev
linら、1990、Science、249:404−406;Christ
ian,R.B.ら、1992、J.Mol.Biol.227:711−71
8);Lenstra、1992、J.Immunol.Meth.152:1
49−157;Kayら、1993、Gene 128:59−65;ならびに
PCT公開番号WO94/18318(1994年8月18日)。
【0715】 インビトロ転移ベースのライブラリーは、以下に記載されるライブラリーを含
むが、これらに限定されない:PCT出願公開第WO 91/05058(19
91年4月18日);およびMattheakisら,1994,Proc.N
atl.Acad.Sci.USA 91:9022−9026。
【0716】 非ペプチドライブラリーの例示の目的で、ベンゾジアゼピンライブラリー(例
えば、Buninら,1994,Proc.Natl.Acad.Sci.US
A 91:4708−4712を参照のこと)が、使用のために適合され得る。
ペプトイドライブラリー(Simonら,1992,Proc.Natl.Ac
ad.Sci.USA 89:9367−9371)もまた、使用される。使用
され得るライブラリー(ここで、ペプチドにおけるアミド官能基が、ペルメチル
化されて(permethylate)、化学的に変換されたコンビナトリアル
ライブラリーを生成する)の別の例は、Ostreshら(1994,Proc
.Natl.Acad.Sci.USA 91:11138−11142)によ
って記述される。
【0717】 本発明において有用な非ペプチドライブラリーのバラエティーは、広い。例え
ば、EckerおよびCrooke,1995,Bio/Technology
13:351−360は、種々のライブラリーの基礎を形成する化学種の中で
、ベンゾジアゼピン、ヒダントイン、ピペラジンジオン(piperazine
dione)、ビフェニル、糖アナログ、β−メルカプトケトン、アリール酢酸
、アシルピペリジン、ベンゾピラン、クバン、キサンチン、アミンイミド、およ
びオキサゾロンを列挙する。
【0718】 非ペプチドライブラリーは、2つの型に広く分類され得る:修飾された(de
corated)モノマーおよびオリゴマー。修飾されたモノマーライブラリー
は、種々の官能基が付加される際に、比較的単純な骨格構造を使用する。しばし
ば、この骨格は、既知の有用な薬理学活性を有する分子である。例えば、この骨
格は、ベンゾジアゼピン構造であり得る。
【0719】 非ペプチドオリゴマーライブラリーは、モノマーの順序に依存して新規な形状
に生成する様式で、一緒に組み立てられる非常に多数のモノマーを使用する。使
用されているモノマー単位中では、カルバメート、ピロリノン、およびモルホリ
ノである。ペプトイド(側鎖が、α−炭素よりもむしろα−アミノ基に付着され
るペプチド様オリゴマー)は、非ペプチドオリゴマーライブラリーの別のバージ
ョンの基礎を形成する。第一の非ペプチドオリゴマーライブラリーは、1つの型
のモノマーを利用し、従って、繰返し骨格を含んだ。最近のライブラリーは、1
より多いモノマーを利用し、ライブラリーに多様性(flexibility)
を与える。
【0720】 ライブラリーをスクリーニングすることは、種々の一般に公知の方法のいずれ
かによって達成され得る。例えば、ペプチドライブラリーのスクリーニングを開
示する、以下の参考文献を参照のこと:ParmleyおよびSmith,19
89,Adv.Exp.Med.Biol.251:215−218;Scot
tおよびSmith,1990,Science 249:386−390;F
owlkesら,1992;BioTechniques 13:422−42
7;Oldenburgら,1992,Proc.Natl.Acad.Sci
.USA 89:5393−5397;Yuら,1994,Cell 76:9
33−945;Staudtら,1988,Science 241:577−
580;Bockら,1992,Nature 355:564−566;Tu
erkら,1992,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:
6988−6992;Ellingtonら,1992,Nature 355
:850−852;米国特許第5,096,815号、米国特許第5,223,
409号、および米国特許第5,198,346号(全てLadnerら);R
ebarおよびPabo,1993,Science 263:671−673
;およびPCT出願公開第WO 94/18318。
【0721】 特定の実施形態において、本発明のポリペプチドに結合する分子を同定するた
めのスクリーニングは、ライブラリーメンバーを、固体相上に結合された本発明
のポリペプチドと接触させ、そして本発明のポリペプチドに結合するこれらのラ
イブラリーメンバーを収集することによって、実施され得る。このようなスクリ
ーニング方法(「パニング」技術と名付けられた)の例は、例として、Parm
leyおよびSmith,1988,Gene 73:305−318;Fow
lkesら,1992,BioTechniques 13:422−427;
PCT出願公開第WO 94/18318;ならびに本明細書中に記載される参
考文献に記載される。
【0722】 別の実施形態において、酵母において、相互作用するタンパク質を選択するた
めのツーハイブリッド系(FieldsおよびSong,1989,Natur
e 340:245−246;Chienら,1991,Proc.Natl.
Acad.Sci.USA 88:9578−9582)が、本発明のポリペプ
チドに特異的に結合する分子を同定するために使用され得る。
【0723】 この結合分子がポリペプチドである場合、このポリペプチドは、任意のペプチ
ドライブラリー(ランダムペプチドライブラリー、組合せペプチドライブラリー
、または偏った(biased)ペプチドライブラリーを含む)から好都合に選
択され得る。用語「偏った」は、この場合のペプチドにおいて、ライブラリーを
生成する方法が、分子の得られた収集の多様性を支配する1つ以上のパラメータ
を制限するように操作されることを意味するために、本明細書中で使用される。
【0724】 従って、真にランダムペプチドライブラリーは、ペプチドの所定の位置におい
て特定のアミノ酸を見出す確率が20の全てのアミノ酸について同じである、ペ
プチドの収集を生成する。しかし、偏りは、例えば、リジンが、5番目のアミノ
酸ごとに存在すること、またはデカペプチドライブラリーの位置4、8、および
9が、アルギニンのみを含むように固定されることを、特定することによってラ
イブラリーに導入され得る。明らかに、偏りの多くの型が意図され得、そして本
発明が、任意の特定の偏りに制限されない。さらに、本発明は、特定の型のペプ
チドライブラリー(例えば、ファージ提示ペプチドライブラリーおよびDNA挿
入物を有するλファージベクターを含むDNA構築物を利用するもの)を意図す
る。
【0725】 上記のように、ポリペプチドである結合分子の場合において、このポリペプチ
ドは、約6〜約60未満のアミノ酸残基、好ましくは、約6〜約10のアミノ酸
残基、および最も好ましくは、約6〜約22のアミノ酸残基を有し得る。別の実
施形態において、結合ポリペプチドは、15〜100アミノ酸、または20〜5
0アミノ酸の範囲を有する。
【0726】 選択された結合ポリペプチドは、化学合成または組換え発現によって得られ得
る。
【0727】 (他の活性) 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トは、血管内皮細胞増殖を刺激する能力の結果として、種々の疾患状態(例えば
、血栓症、動脈硬化、および他の心臓血管の状態)に起因する虚血組織の血管再
生を刺激するための処置において利用され得る。本発明のポリペプチド、ポリヌ
クレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニストはまた、上記で議論されたよう
に新脈管形成および四肢の再生を刺激するために利用され得る。
【0728】 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トを、傷害、火傷、手術後の組織修復、および潰瘍に起因する創傷の処置にもま
た利用し得る。なぜなら、それらは異なる起源の種々の細胞(例えば、線維芽細
胞および骨格筋細胞)に対してマイトジェン性であり、それゆえ損傷組織または
疾患組織の修復または置換を促進するからである。
【0729】 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トをまた、ニューロンの成長を刺激し、そして特定のニューロンの障害または神
経変性状態(例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、およびエイズ関連複
合体)において生じるニューロンの損傷を処置および予防するために利用し得る
。本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トは、軟骨細胞増殖を刺激する能力を有し得、それゆえ、骨および歯周の再生を
増強し、そして組織移植片または骨の移植片を補助するために利用され得る。
【0730】 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トをまた利用して、ケラチノサイト増殖を刺激することにより、日焼けに起因す
る皮膚の老化を予防し得る。
【0731】 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トをまた、抜け毛を予防するために利用し得る。なぜなら、FGFファミリーの
メンバーは、髪形成細胞を活性化し、そしてメラノサイト増殖を促進するからで
ある。同じ方針にそって、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニス
ト、またはアンタゴニストを利用して、他のサイトカインと組み合わせて使用し
た場合、造血細胞および骨髄細胞の増殖および分化を刺激し得る。
【0732】 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トをまた利用して、移植前の器官を維持し得るか、または初代組織の細胞培養を
支持し得る。本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはア
ンタゴニストはまた、初期胚における分化のための中胚葉起源の組織を誘導する
ために利用され得る。
【0733】 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トはまた、先に議論されたような造血系統に加えて、胚性幹細胞の分化または増
殖を増加または減少し得る。
【0734】 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トはまた、哺乳動物の特徴(例えば、身長、体重、毛の色、眼の色、皮膚、脂肪
組織の割合、色素沈着、大きさ、および形)を調節するために使用され得る(例
えば、美容外科)。同様に、本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニ
スト、またはアンタゴニストは、異化作用、同化作用、プロセシング、利用、お
よびエネルギーの貯蔵に影響を及ぼす哺乳動物の代謝を調節するために使用され
得る。
【0735】 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トは、重量障害(肥満、悪液質、消耗病、食欲不振および過食症が挙げられるが
これらに限定されない)を処置するために使用され得る。
【0736】 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トは、バイオリズム、カリカディック(caricadic)リズム、うつ病(
抑うつ性の障害を含む)、暴力の傾向、痛みへの耐性、生殖能力(好ましくは、
アクチビンまたはインヒビン様活性によって)、ホルモンレベルもしくは内分泌
物レベル、食欲、性欲、記憶、ストレス、または他の認知の質に影響を及ぼすこ
とによって、哺乳動物の精神状態または身体状態を変更するために使用され得る
【0737】 本発明のポリペプチド、ポリヌクレオチド、アゴニスト、またはアンタゴニス
トはまた、例えば、貯蔵能力、脂肪含有量、脂質、タンパク質、炭水化物、ビタ
ミン、ミネラル、補因子、または他の栄養成分を増加または減少させるための、
食品添加物または保存剤として使用され得る。
【0738】 上記の適用は、広範な種々の宿主における使用を有する。このような宿主とし
ては、ヒト、マウス、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ウマ、マウス、ラッ
ト、ハムスター、ブタ、ミニブタ、ニワトリ、ヤギ、ウシ、ヒツジ、イヌ、ネコ
、非ヒト霊長類、およびヒトが挙げられるが、これらに限定されない。特定の実
施形態において、宿主は、マウス、ウサギ、ヤギ、モルモット、ニワトリ、ラッ
ト、ハムスター、ブタ、ヒツジ、イヌまたはネコである。好ましい実施形態にお
いて、宿主は哺乳動物である。最も好ましい実施形態において、宿主は、ヒトで
ある。 (他の好ましい実施形態) 本願発明の他の好ましい実施形態は、配列番号Xまたはその相補鎖、および/
またはcDNAプラスミドVのヌクレオチド配列中の少なくとも約50の連続し
たヌクレオチドの配列に、少なくとも95%同一であるヌクレオチド配列を含む
、単離された核酸分子を含む。
【0739】 連続するヌクレオチドの上記配列が、表1の配列番号Xに対して同定された位
置の範囲の配列番号Xのヌクレオチド配列に含まれる、核酸分子もまた好ましい
【0740】 配列番号Xまたはその相補鎖、および/またはcDNAプラスミドVのヌクレ
オチド配列中の少なくとも約150の連続したヌクレオチドの配列に、少なくと
も95%同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子もまた好まし
い。
【0741】 配列番号Xまたはその相補鎖、および/またはcDNAプラスミドVのヌクレ
オチド配列中の少なくとも約500の連続したヌクレオチドの配列に、少なくと
も95%同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子がさらに好ま
しい。
【0742】 さらに好ましい実施得形態は、表1の配列番号Xに対して同定された位置の範
囲において配列番号Xのヌクレオチド配列に少なくとも95%同一であるヌクレ
オチド配列を含む核酸分子である。
【0743】 さらに好ましい実施形態は、配列番号Xまたはその相補鎖、および/またはc
DNAプラスミドVの完全なヌクレオチド配列に、少なくとも95%同一である
ヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子である。
【0744】 配列番号Xまたはその相補鎖および/またはcDNAプラスミドVのヌクレオ
チド配列を含む核酸分子に、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下
で、ハイブリダイズする、単離された核酸分子もまた、好ましく、ここで、この
核酸分子は、A残基のみまたはT残基のみからなるヌクレオチド配列を有する核
酸分子に、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリザイズ
しない。
【0745】 cDNAプラスミドVを含むDNA分子を含む組成物もまた好ましい。
【0746】 cDNAプラスミドVのヌクレオチド配列において少なくとも50の連続する
ヌクレオチドの配列に、少なくとも95%同一であるヌクレオチド配列を含む単
離された核酸分子もまた好ましい。
【0747】 上記の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列が、cDNAプラスミド
Vによってコードされるオープンリーディングフレーム配列のヌクレオチド配列
中に含まれる、単離された核酸分子もまた好ましい。
【0748】 cDNAプラスミドVによってコードされるヌクレオチド配列中の少なくとも
150の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95%同一であるヌクレオチ
ド配列を含む、単離された核酸分子もまた好ましい。
【0749】 さらに好ましい実施形態は、cDNAプラスミドVによってコードされるヌク
レオチド配列中の少なくとも500の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも
95%同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子である。
【0750】 さらに好ましい実施形態は、cDNAプラスミドVによってコードされる完全
なヌクレオチド配列に少なくとも95%同一であるヌクレオチド配列を含む、単
離された核酸分子である。
【0751】 さらに好ましい実施形態は、以下からなる群から選択される配列中の少なくと
も50の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95%同一であるヌクレオチ
ド配列を含む核酸分子を、生物学的サンプルにおいて検出するための方法である
:配列番号Xのヌクレオチド配列またはそれに相補的な鎖、およびcDNAプラ
スミドVによってコードされるヌクレオチド配列;この方法は、上記サンプル中
の少なくとも1つの核酸分子のヌクレオチド配列を、上記の群から選択された配
列と比較する工程および上記サンプル中の上記核酸分子の配列が、上記選択され
た配列に少なくとも95%同一であるか否かを決定する工程を包含する。
【0752】 上記の配列を比較する工程が、上記サンプル中の核酸分子と、上記の群から選
択される上記の配列を含む核酸分子との間の核酸ハイブリダイゼーションの程度
を決定する工程を包含する、上記方法もまた好ましい。同様に、上記の配列を比
較する工程が、上記サンプル中の核酸分子から決定されるヌクレオチド配列と、
上記の群から選択される上記配列とを比較する工程によって実施される、上記方
法もまた好ましい。核酸分子は、DNA分子またはRNA分子を含み得る。
【0753】 さらに好ましい実施形態は、生物学的サンプルの種、組織、または細胞型を同
定するための方法であって、この方法は、以下からなる群から選択される配列中
の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95%同一である
ヌクレオチド配列を含む上記サンプル中の核酸分子を(もしあれば)検出する工
程を包含する:配列番号Xのヌクレオチド配列またはその相補鎖およびcDNA
プラスミドVによってコードされるヌクレオチド配列。
【0754】 生物学的サンプルの種、組織、または細胞型を同定するための方法は、少なく
とも2つのヌクレオチド配列のパネル中のヌクレオチド配列を含む核酸分子を検
出する工程を包含し得、ここで上記パネル中の少なくとも1つの配列は、上記の
群から選択される配列中の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列に少な
くとも95%同一である。
【0755】 タンパク質をコードする配列番号Xまたはその相補鎖またはcDNAプラスミ
ドVのヌクレオチド配列の異常な構造または発現と関連する病理学的状態を、被
験体において診断するための方法もまた好ましく、この方法は、以下からなる群
から選択される配列中の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列に少なく
とも95%同一であるヌクレオチド配列を含む、核酸分子(もしあれば)を、上
記被験体から得られる生物学的サンプルにおいて検出する工程を包含する:配列
番号Xのヌクレオチド配列またはその相補鎖およびcDNAのプラスミドVのヌ
クレオチド配列。
【0756】 病理学的状態を診断するための方法は、少なくとも2つのヌクレオチド配列の
パネル中のヌクレオチド配列を含む核酸分子を検出する工程を包含し得、ここで
、上記パネル中の少なくとも1つの配列は、上記群から選択される配列中の少な
くとも50の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95%同一である。
【0757】 上記の核酸分子のヌクレオチド配列が、少なくとも2つのヌクレオチド配列の
パネルを含む、単離された核酸分子を含む組成物もまた好ましく、ここで上記の
パネル中の少なくとも1つの配列は、以下からなる群から選択される配列中の少
なくとも50個連続したヌクレオチドの配列と少なくとも95%同一である:配
列番号Xのヌクレオチド配列またはその相補鎖およびcDNAプラスミドVによ
りコードされるヌクレオチド配列。この核酸分子は、DNA分子またはRNA分
子を含み得る。
【0758】 配列番号Yのポリペプチド配列;配列番号Xもしくはその相補鎖によりコード
されるポリペプチドおよび/またはcDNAプラスミドVによりコードされるポ
リペプチド中の少なくとも約10個連続したアミノ酸の配列と少なくとも90%
同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた好ましい。
【0759】 配列番号Yのアミノ酸配列;配列番号Xもしくはその相補鎖によりコードされ
るポリペプチドのアミノ酸配列および/またはcDNAプラスミドVによりコー
ドされるポリペプチドのアミノ酸配列中の少なくとも約30個連続したアミノ酸
の配列と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド
もまた好ましい。
【0760】 配列番号Yのアミノ酸配列;配列番号Xもしくはその相補鎖によりコードされ
るポリペプチドのアミノ酸配列および/またはcDNAプラスミドVによりコー
ドされるポリペプチドのアミノ酸配列中の少なくとも約100個連続したアミノ
酸の配列と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチ
ドはさらに好ましい。
【0761】 配列番号Yの完全アミノ酸配列;配列番号Xもしくはその相補鎖によりコード
されるポリペプチドの完全アミノ酸配列および/またはcDNAプラスミドVに
よりコードされるポリペプチドの完全アミノ酸配列と少なくとも95%同一のア
ミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドはさらに好ましい。
【0762】 cDNAプラスミドVによりコードされるポリペプチドの完全アミノ酸配列中
の少なくとも約10個連続したアミノ酸の配列と少なくとも90%同一のアミノ
酸配列を含む、単離されたポリペプチドはさらに好ましい。
【0763】 上記の連続したアミノ酸の配列が、cDNAプラスミドVによってコードされ
るポリペプチド;配列番号Xもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチ
ドおよび/または配列番号Yのポリペプチド配列の一部のアミノ酸配列に含まれ
る、ポリペプチドもまた好ましい。
【0764】 cDNAプラスミドVによってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列中の
少なくとも約30個連続したアミノ酸の配列と少なくとも95%同一であるアミ
ノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた、好ましい。
【0765】 cDNAプラスミドVによってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列中の
少なくとも約100個連続したアミノ酸の配列と少なくとも95%同一であるア
ミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた、好ましい。
【0766】 cDNAプラスミドVによってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列と少
なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた
、好ましい。
【0767】 以下からなる群から選択される配列中の、少なくとも10個連続したアミノ酸
の配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドに対して
特異的に結合する単離された抗体は、さらに好ましい:配列番号Yのポリペプチ
ド;配列番号Xもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチド配列および
cDNAプラスミドVによりコードされるポリペプチド。
【0768】 以下:配列番号Yのポリペプチド配列;配列番号Xもしくはその相補鎖により
コードされるポリペプチドおよびcDNAプラスミドVによりコードされるポリ
ペプチドからなる群から選択された配列中の、少なくとも10個連続したアミノ
酸の配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドを、生
物学的サンプルにおいて検出する方法はさらに好ましく;この方法は、このサン
プル中における少なくとも1つのポリペプチド分子のアミノ酸配列をこの群から
選択された配列と比較する工程およびこのサンプル中におけるこのポリペプチド
分子の配列が、少なくとも10個連続したアミノ酸のこの配列と少なくとも90
%同一であるかどうかを決定する工程を含む。
【0769】 このサンプル中における少なくとも1つのポリペプチド分子のアミノ酸配列を
、この群から選択された配列と比較するこの工程が、このサンプル中のポリペプ
チドの、以下:配列番号Yのポリペプチド配列;配列番号Xもしくはその相補鎖
によりコードされるポリペプチドおよびcDNAプラスミドVによりコードされ
るポリペプチドからなる群から選択された配列中の少なくとも10個連続したア
ミノ酸の配列に対して、少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含むポリペ
プチドと特異的に結合する抗体に対する特異的な結合の程度を決定することを含
む、上記の方法もまた、好ましい。
【0770】 配列を比較する工程が、このサンプル中のポリペプチド分子から決定されたア
ミノ酸配列を、この群から選択されたこの配列と比較することによって行われる
、上記の方法もまた好ましい。
【0771】 生物学的サンプルの種、組織または細胞型を同定する方法もまた好ましく、こ
こでこの方法は、もし存在するならば、以下からなる群から選択される配列にお
ける少なくとも10個連続したアミノ酸の配列と少なくとも90%同一であるア
ミノ酸配列を含むポリペプチド分子をこのサンプル中で検出する工程を含む:配
列番号Yのポリペプチド配列;配列番号Xもしくはその相補鎖によりコードされ
るポリペプチドおよびcDNAプラスミドVによりコードされるポリペプチド。
【0772】 生物学的サンプルの種、組織または細胞型を同定する上記の方法もまた好まし
く、ここでこの方法は、少なくとも2つのアミノ酸配列のパネルにおけるアミノ
酸配列を含むポリペプチド分子を検出する工程を含み、ここでこのパネル中の少
なくとも1つの配列は、上記の群から選択された配列における少なくとも10個
連続したアミノ酸の配列と少なくとも90%同一である。
【0773】 被験体において、表1において同定された、ポリペプチドをコードする核酸配
列の異常な構造または発現に関連する病的状態を診断する方法もまた、好ましく
、ここで、この方法は、この被験体から得られた生物学的サンプルにおいて、少
なくとも2つのアミノ酸配列のパネルにおけるアミノ酸配列を含むポリペプチド
分子を検出する工程を含み、ここでこのパネル中の少なくとも1つの配列は、以
下からなる群から選択される配列における少なくとも10個連続したアミノ酸の
配列と少なくとも90%同一である:配列番号Yのポリペプチド配列;配列番号
Xもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドおよびcDNAプラスミ
ドVによりコードされるポリペプチド。
【0774】 これらの方法のいずれかにおいて、上記ポリペプチド分子を検出する工程は、
抗体を使用することを包含する。
【0775】 以下からなる群から選択された配列中の、少なくとも10個連続したアミノ酸
の配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコード
するヌクレオチド配列と、少なくとも95%同一であるヌクレオチド配列を含む
、単離された核酸分子もまた、好ましい:配列番号Yのポリペプチド配列;配列
番号Xもしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドおよびcDNAプラ
スミドVによりコードされるポリペプチド。
【0776】 上記ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、原核生物宿主でのこのポ
リペプチドの発現について最適化されている、単離された核酸分子もまた、好ま
しい。
【0777】 上記ポリペプチドが以下からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、単離
された核酸分子もまた、好ましい:配列番号Yのポリペプチド配列;配列番号X
もしくはその相補鎖によりコードされるポリペプチドおよびcDNAプラスミド
Vによりコードされるポリペプチド。
【0778】 上記の単離された核酸分子のいずれかをベクター中に挿入する工程を含む、組
換えベクターの作製方法はさらに好ましい。この方法によって生成された組換え
ベクターも、好ましい。宿主細胞中にベクターを導入する工程を含む、組換え宿
主細胞を作製する方法、ならびにこの方法によって生成された組換え宿主細胞も
また、好ましい。
【0779】 単離されたポリペプチドを作製する方法であって、このポリペプチドが発現さ
れるような条件下でこの組換え宿主細胞を培養する工程、およびこのポリペプチ
ドを回収する工程を包含する、方法もまた好ましい。この組換え宿主細胞が真核
生物細胞であり、そしてこのポリペプチドが以下からなる群から選択されたアミ
ノ酸配列を含むヒトタンパク質である、単離されたポリペプチドを作製するこの
方法もまた好ましい:配列番号Yのポリペプチド配列;配列番号Xもしくはその
相補鎖によりコードされるポリペプチドおよびcDNAプラスミドVによりコー
ドされるポリペプチド。この方法によって生成された単離されたポリペプチドも
また、好ましい。
【0780】 増加したレベルのタンパク質活性を必要とする個体を処置する方法もまた、好
ましく、ここで、この方法は、このような個体に、この個体においてこのタンパ
ク質の活性のレベルを増加させるのに有効な量の、本願発明の単離されたポリペ
プチド、ポリヌクレオチド、その免疫原性フラグメントもしくはアナログ、結合
因子、抗体、あるいは抗原フラグメントを含む治療剤を投与する工程を包含する
【0781】 減少したレベルのタンパク質活性を必要とする個体を処置する方法もまた、好
ましく、ここで、この方法は、このような個体に、この個体においてこのタンパ
ク質の活性のレベルを減少させるのに有効な量の、本願発明の単離されたポリペ
プチド、ポリヌクレオチド、その免疫原性フラグメントもしくはアナログ、結合
因子、抗体、あるいは抗原結合フラグメントを含む治療剤を投与する工程を包含
する。
【0782】 本発明の特定の実施形態では、表2の4番目の列に列挙される各「コンティグ
ID」について、好ましくは、表2の5番目の列で参照されるヌクレオチド配列
、および一般式a−bにより記載されるヌクレオチド配列(ここでaおよびbは
、表2の列3で参照される対応する配列番号Xについて独自に決定される)を含
むか、またはそのようなヌクレオチド配列からなる、1つ以上のポリヌクレオチ
ドが除外される。さらに特定の実施形態は、表2の5番目の列において参照され
る特定のポリヌクレオチド配列の1、2、3、4個、またはそれ以上を除外する
ポリヌクレオチド配列に関する。
【0783】 c−dの一般式によって記載されるヌクレオチド配列を含む1つ以上のポリヌ
クレオチドは、好ましくは本発明から排除される。ここでcとdの両方は、配列
番号Xに示されるヌクレオチド残基の位置に対応し、そしてここでdは、c+1
4より大きいかまたは同等である。
【0784】 一般式によって排除され得る全ての配列を含むことを意味することは決してな
く、これは、ただ代表的な例である。これらの登録番号を通して利用可能である
全ての参照は、その全体が、参照として本明細書中に援用される。
【0785】
【表2】
【0786】
【表3】
【0787】
【表4】
【0788】
【表5】
【0789】
【表6】 概して、本発明を記載してきたが、例示の目的のために提供されかつ限定する
ことを意図しない、以下の実施例を参照することによって、本発明はより容易に
理解される。
【0790】 (実施例) (実施例1:選択されたcDNAクローンの寄託されたサンプルからの単離) 引用されるATCC寄託物中の各cDNAクローンは、プラスミドベクター中
に含まれる。表1は、各クローンが単離されたcDNAライブラリーを構築する
ために用いられたベクターを示す。多くの場合において、ライブラリーを構築す
るために使用されたベクターは、プラスミドが切り出されたファージベクターで
ある。直下の表は、cDNAライブラリーを構築する際に使用される各ファージ
ベクターについて関連するプラスミドを相関づける。例えば、特定のクローンが
ベクター「Lambda Zap」中に単離されていると表1に示される場合、
対応する寄託クローンは、「pBluescript」である。
【0791】
【表7】 ベクターLambda Zap(米国特許第5,128,256号および同第
5,286,636号)、Uni−Zap XR(米国特許第5,128,25
6号および同第5,286,636号)、Zap Express(米国特許第
5,128,256号および同第5,286,636号)、pBluescri
pt(pBS)(Shortら、Nucleic Acids Res. 16
:7583−7600(1988);Alting−Meesら、Nuclei
c Acids Res.、17:9494(1989))ならびにpBK(A
lting−Meesら、Strategies 5:58−61(1992)
)は、Stratagene Cloning Systems,Inc.、1
1011 N.Torrey Pines Road、La Jolla,CA
,92037から市販されている。pBSは、アンピシリン耐性遺伝子を含み、
そしてpBKはネオマイシン耐性遺伝子を含む。両方とも、E.coli株XL
−1 Blue(これもまた、Stratageneから入手可能である)に形
質転換され得る。pBSは、SK+、SK−、KS+およびKSの4形態で入荷
する。SおよびKとは、ポリリンカー領域(「S」とはSacIであり、そして
「K」とは、KpnIのことであり、これらは、それぞれのリンカーの各末端で
の最初の部位である)に隣接するT7およびT3プライマー配列に対するポリリ
ンカーの配向をいう。「+」または「−」とは 、ある方向においてf1 or
iから開始される一本鎖レスキューがセンス鎖DNAを生成し、そして他方にお
いてアンチセンスであるようなf1複製起点(「ori」)の配向をいう。
【0792】 ベクターpSport1、pCMVSport 2.0およびpCMVSpo
rt3.0をLife Technologies、Inc.、P.O.Box
6009、Gaithersburg,MD 20897から入手した。全ての
Sportベクターはアンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてE.coli株D
H10B(これもまた、Life Technologiesから入手可能であ
る)に形質転換され得る。(例えば、Gruber,C.E.ら、Focus
15:59(1993)を参照のこと)。ベクターlafmid BA(Ben
to Soares、Columbia University、NY)は、ア
ンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてE.coli株XL−1 Blueに形質
転換され得る。ベクターpCR(登録商標)2.1(これはInvitroge
n、1600 Faraday Avenue、Carlsbad、CA 92
008から入手可能である)は、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてE.c
oli株DH10B(Life Technologiesから入手可能である
)に形質転換され得る(例えば、Clark、Nuc.Acids Res.1
6:9677−9686(1988)およびMeadら、Bio/Techno
logy 9:(1991)を参照のこと)。好ましくは、本発明のポリヌクレ
オチドは、表1における特定のクローンについて同定されたファージベクター配
列、ならびに上記に示された対応するプラスミドベクター配列を含まない。
【0793】 表1に引用される、任意の所定のcDNAクローンについてATCC受託番号
を与えられたサンプルにおける寄託された物質はまた、1つ以上のさらなるプラ
スミド(これは各々、その所定のクローンとは異なるcDNAクローンを含む)
を含み得る。従って、同じATCC受託番号を共有する寄託物は、表1に示され
る各cDNAクローンのためのプラスミドを少なくとも含む。代表的には、表1
に引用される各ATCC寄託物のサンプルは、ほぼ等量(重量で)の約50個の
プラスミドDNA(これは各々、異なるcDNAクローンを含む)の混合物を含
む;しかし、このような寄託サンプルは、50個よりも多いかまたは少ないcD
NAクローン(約500個までのcDNAクローン)のためのプラスミドを含み
得る。
【0794】 表1における特定のクローンについて引用されるプラスミドDNAの寄託サン
プルからそのクローンを単離するために2つのアプローチが使用され得る。第一
に、プラスミドを、配列番号Xに対応するポリヌクレオチドプローブを使用して
、クローンをスクリーニングすることによって直接単離する。
【0795】 特に、30〜40ヌクレオチドを有する特定のポリヌクレオチドを、報告され
ている配列に従って、Applied BiosystemsのDNA合成装置
を使用して合成する。オリゴヌクレオチドを、例えば、32P−γ−ATPで、
T4ポリヌクレオチドキナーゼを用いて標識し、そして慣用の方法に従って精製
する。(例えば、Maniatisら、Molecular Cloning:
A Laboratory Manual、Cold Spring Harb
or Press、Cold Spring、NY(1982))。プラスミド
混合物を、当業者に公知の技術(例えば、ベクター供給者によって提供される技
術または上記で引用された関連の刊行物もしくは特許において提供される技術)
を用いて、上記のような適切な宿主(例えば、XL−1 Blue(Strat
agene))に形質転換する。形質転換体を1.5%寒天プレート(適切な選
択薬剤、例えば、アンピシリンを含む)に、1プレートあたり約150の形質転
換体(コロニー)の密度にプレーティングする。これらのプレートを、細菌コロ
ニースクリーニングについての慣用の方法(例えば、Sambrookら、Mo
lecular Cloning:A Laboratory Manual、
第2版、(1989)、Cold Spring Harbor Labora
tory Press、1.93〜1.104頁)または当業者に公知の他の技
術に従って、ナイロンメンブレンを使用してスクリーニングする。
【0796】 あるいは、配列番号Xの両端(すなわち、表1に規定されるクローンの5’N
Tおよび3’NTによって囲まれる配列番号Xの領域内)に由来する、17〜2
0ヌクレオチドの2つのプライマーを合成し、そしてこれらを使用して、寄託さ
れたcDNAプラスミドをテンプレートとして使用して、所望のcDNAを増幅
する。ポリメラーゼ連鎖反応を、慣用の条件下で、例えば、0.5μgの上記c
DNAテンプレートを有する反応混合物の25μl中で実施する。便利な反応混
合物は、1.5〜5mM MgCl、0.01%(w/v)ゼラチン、それぞ
れ20μMのdATP、dCTP、dGTP、dTTP、25pmolの各プラ
イマーおよび0.25ユニットのTaqポリメラーゼである。35サイクルのP
CR(94℃での変性を1分間;55℃でのアニールを1分間;72℃での伸長
を1分間)を、Perkin−Elmer Cetus自動化サーマルサイクラ
ーを用いて実施する。増幅産物をアガロースゲル電気泳動により分析し、そして
予想される分子量のDNAバンドを切り出し、そして精製する。PCR産物を、
DNA産物をサブクローニングおよび配列決定することによって選択された配列
であることを確認する。
【0797】 寄託されたクローンに存在しないかもしれない遺伝子の5’非コード部分また
は3’非コード部分の同定のために、いくつかの方法が利用可能である。これら
の方法は、以下を含むがこれらに限定されない:フィルタープローブ探索、特異
的プローブを使用するクローン富化、および当該分野で周知である5’および3
’「RACE」プロトコルと類似するかまたは同一のプロトコル。例えば、5’
RACEに類似する方法は、所望の全長転写物の失われた5’末端を生成するた
めに利用可能である(Fromont−Racineら、Nucleic Ac
ids Res.21(7):1683−1684(1993))。
【0798】 簡潔には、特定のRNAオリゴヌクレオチドを、全長遺伝子RNA転写物をお
そらく含むRNAの集団の5’末端に連結する。連結されたRNAオリゴヌクレ
オチドに特異的なプライマーおよび目的の遺伝子の公知の配列に特異的なプライ
マーを含むプライマーセットを使用して、所望の全長遺伝子の5’部分をPCR
増幅する。次いで、この増幅した産物を配列決定し得、そしてこれを使用して全
長遺伝子を生成し得る。
【0799】 この上記の方法は、所望の供給源から単離された総RNAを用いて開始するが
、ポリA+RNAをも使用し得る。次いで、RNA調製物を、必要ならばホスフ
ァターゼで処理して、後のRNAリガーゼ工程を妨害し得る分解または損傷RN
Aの5’リン酸基を排除し得る。次いで、ホスファターゼを不活化するべきであ
り、そしてRNAをメッセンジャーRNAの5’末端に存在するキャップ構造を
除去するために、タバコ酸性ピロホスファターゼを用いて処理するべきである。
この反応は、次いでT4 RNAリガーゼを用いてRNAオリゴヌクレオチドに
連結され得る、キャップ切断RNAの5’末端に5’リン酸基を残す。
【0800】 この改変型RNA調製物を、遺伝子特異的なオリゴヌクレオチドを用いる、第
一鎖cDNA合成のためのテンプレートとして使用する。第一鎖合成反応物を連
結されたRNAオリゴヌクレオチドに特異的なプライマーおよび目的の遺伝子の
公知の配列に特異的なプライマーを用いる、所望の5’末端のPCR増幅のため
のテンプレートとして使用する。次いで、得られた生成物を配列決定し、そして
分析して5’末端配列が所望の遺伝子に属することを確認する。
【0801】 (実施例2:ポリヌクレオチドに対応するゲノムクローンの単離) ヒトゲノムP1ライブラリー(Genomic Systems、Inc.)
を、実施例1に記載される方法に従って、配列番号Xに対応するcDNA配列に
ついて選択されたプライマーを用いるPCRによってスクリーニングする(Sa
mbrookもまた参照のこと)。
【0802】 (実施例3:ポリペプチドの組織分布) 本発明のポリヌクレオチドのmRNA発現の組織分布を、とりわけ、Samb
rookらによって記載されるノーザンブロット分析についてのプロトコルを用
いて決定する。例えば、実施例1に記載される方法によって生成されるcDNA
プローブを、rediprimeTM DNA labeling syste
m(Amersham Life Science)を用いて、製造者の指示に
従って、P32で標識する。標識後、プローブを、CHROMA SPIN−1
00TMカラム(Clontech Laboratories、Inc.)を
使用して、製造者のプロトコル番号PT1200−1に従って精製する。次いで
、精製した標識プローブを使用して、種々のヒト組織をmRNA発現について試
験する。
【0803】 種々のヒト組織(H)またはヒト免疫系組織(IM)を含む多重組織ノーザン
(MTN)ブロット(Clontech)を、ExpressHybTMハイブ
リダイゼーション溶液(Clontech)を用いて、製造者のプロトコル番号
PT1190−1に従って、標識プローブで試験する。ハイブリダイゼーション
および洗浄後、ブロットをマウントして、そして−70℃で一晩フィルムに露出
し、そしてフィルムを標準的な手順に従って現像する。
【0804】 (実施例4:ポリヌクレオチドの染色体マッピング) オリゴヌクレオチドプライマーのセットを、配列番号Xの5’末端の配列に従
って設計する。このプライマーは、好ましくは約100ヌクレオチドにわたる。
次いで、このプライマーセットを、以下のセットの条件下でポリメラーゼ連鎖反
応に使用する:95℃で30秒;56℃で1分;70℃で1分。このサイクルを
32回反復し、次いで1回、70℃で5分間のサイクルを行う。個々の染色体ま
たは染色体フラグメントを含む体細胞ハイブリッドパネル(Bios,Inc)
に加えて、ヒト、マウス、およびハムスターのDNAを鋳型として使用する。反
応物を、8%ポリアクリルアミドゲルまたは3.5%アガロースゲルのいずれか
で分析する。染色体マッピングを、特定の体細胞ハイブリッドにおける約100
bpのPCRフラグメントの存在によって決定する。
【0805】 (実施例5:ポリペプチドの細菌性発現) 本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、実施例1に概説する
ように、DNA配列の5’および3’末端に対応するPCRオリゴヌクレオチド
プライマーを使用して増幅して挿入フラグメントを合成する。cDNA挿入物を
増幅するために使用されるプライマーは、発現ベクターに増幅産物をクローニン
グするために、必要な場合は、制限部位(例えば、BamHIおよびXbaI)
および開始コドン/終止コドンを好ましくは含むべきである。例えば、BamH
IおよびXbaIは、細菌性発現ベクターpQE−9(Qiagen,Inc.
,Chatsworth,CA)の制限酵素部位に対応する。このプラスミドベ
クターは、抗生物質耐性(Amp)、細菌の複製起点(ori)、IPTGで
調節可能なプロモーター/オペレーター(P/O)、リボソーム結合部位(RB
S)、6−ヒスチジンタグ(6−His)、および制限酵素クローニング部位を
コードする。
【0806】 pQE−9ベクターをBamHIおよびXbaIで消化し、そして、増幅され
たフラグメントを細菌性RBSにおいて開始されるリーディングフレームを維持
しながらpQE−9ベクターに連結する。次いで連結混合物を、lacIリプレ
ッサーを発現し、そしてまたカナマイシン耐性(Kan)を与えるプラスミド
pREP4の多重コピーを含む、E.coli株M15/rep4(Qiage
n,Inc.)を形質転換するために使用する。形質転換体を、それらのLBプ
レート上で生育する能力によって同定し、そしてアンピシリン/カナマイシン耐
性コロニーを選択する。プラスミドDNAを単離し、そして制限分析によって確
認する。
【0807】 所望の構築物を含むクローンを、Amp(100μg/ml)およびKan(
25μg/ml)の両方を補充したLB培地における液体培養で一晩(O/N)
増殖させる。O/N培養物を、1:100〜1:250の比で大量培養物に接種
するために使用する。細胞を、0.4と0.6との間の光学密度600(O.D
600)まで増殖させる。次いで、IPTG(イソプロピル−B−D−チオガ
ラクトピラノシド)を最終濃度1mMになるように加える。IPTGは、lac
Iリプレッサーの不活化により誘導し、P/Oの障害物を除去し、遺伝子発現の
増加を導く。
【0808】 細胞を、さらに3〜4時間増殖させる。次いで、細胞を遠心分離(6000×
gで20分間)によって収集する。細胞ペレットを、カオトロピック剤である6
MグアニジンHCl中に、4℃で3〜4時間攪拌することによって可溶化させる
。細胞細片を遠心分離によって取り除き、そしてポリペプチドを含む上清を、ニ
ッケル−ニトリロ三酢酸(「Ni−NTA」)アフィニティー樹脂カラム(QI
AGEN,Inc.前出より入手可能)にロードする。6×Hisタグを有する
タンパク質は、Ni−NTA樹脂に高い親和性で結合し、そして単純な1工程手
順で精製され得る(詳細には、The QIAexpressionist(1
995)QIAGEN,Inc.,前出を参照のこと)。
【0809】 手短に言えば、上清を、6Mグアニジン−HCl、pH8のカラムにロードし
、このカラムを、最初に10容量の6Mグアニジン−HCl、pH8で洗浄し、
次いで10容量の6Mグアニジン−HCl、pH6で洗浄し、最後にポリペプチ
ドを、6Mグアニジン−HCl、pH5で溶出する。
【0810】 次いで、精製したタンパク質を、リン酸緩衝化生理食塩水(PBS)または5
0mM 酢酸ナトリウム、pH6の緩衝液および200mM NaClに対して
透析することにより再生させる。あるいは、タンパク質はNi−NTAカラムに
固定化している間に、首尾よく再折畳みされ得る。推奨条件は以下の通りである
:プロテアーゼインヒビターを含む、500mM NaCl、20%グリセロー
ル、20mM Tris/HCl pH7.4中の6M〜1M尿素の直線勾配を
使用する再生。再生は1.5時間以上の時間をかけて行うべきである。再生後、
これらのタンパク質を250mMイミダゾールの添加によって溶出させる。イミ
ダゾールを、PBSまたは50mM酢酸ナトリウム pH6の緩衝液および20
0mM NaClに対する最終の透析工程によって除去する。精製したタンパク
質を、4℃で保存するか、または−80℃で冷凍する。
【0811】 上記の発現ベクターに加えて、本発明はさらに、本発明のポリヌクレオチドに
作動可能に連結されたファージオペレーターおよびプロモーターエレメントを含
み、pHE4aと呼ばれる発現ベクターを含む(ATCC受託番号209645
、1998年2月25日に寄託)。このベクターは以下を含む:1)選択マーカ
ーとしてのネオマイシンホスホトランスフェラーゼ遺伝子、2)E.coli複
製起点、3)T5ファージプロモーター配列、4)2つのlacオペレーター配
列、5)シャイン−ダルガーノ配列、および6)ラクトースオペロンリプレッサ
ー遺伝子(laqIq)。複製起点(oriC)は、pUC19(LTI,Ga
ithersburg,MD)に由来する。プロモーター配列およびオペレータ
ー配列を合成的に作製する。
【0812】 NdeIおよびXbaI、BamHI、XhoI、またはAsp718によっ
てベクターを制限処理し、制限生成物をゲルで泳動し、そしてより大きな方のフ
ラグメント(スタッファー(stuffer)フラグメントは約310塩基対で
あるべきである)を単離することによって、DNAをpHEaに挿入し得る。D
NA挿入物を、NdeI(5’プライマー)およびXbaI、BamHI、Xh
oI、またはAsp718(3’プライマー)に対する制限部位を有するPCR
プライマーを使用して、実施例1に記載のPCRプロトコルに従って生成する。
PCR挿入物を、ゲル精製し、そして適合する酵素で制限処理する。挿入物およ
びベクターを標準的なプロトコルに従って連結する。
【0813】 操作されたベクターは、上記のプロトコルにおいて、細菌系でタンパク質を発
現させるために容易に置換され得る。
【0814】 (実施例6:封入体からのポリペプチドの精製) 以下の代替の方法は、ポリペプチドが封入体の形態で存在する場合に、E.c
oli中で発現されたポリペプチドを精製するために使用され得る。他に指定さ
れない場合には、以下のすべての工程は4〜10℃で行われる。
【0815】 E.coli発酵の生産期の完了に際し、細胞培養物を4〜10℃に冷却し、
そして15,000rpmの連続遠心分離(Heraeus Sepatech
)によって細胞を採集する。細胞ペーストの単位重量あたりのタンパク質の予想
される収量および必要とされる精製タンパク質の量に基づいて、細胞ペーストの
適切な量(重量による)を、100mM Tris、50mM EDTA、pH
7.4を含む緩衝溶液に懸濁させる。細胞を、高剪断ミキサーを使用して均質な
懸濁液に分散させる。
【0816】 次いで、細胞をマイクロフルイダイザー(microfluidizer)(
Microfluidics,Corp.またはAPV Gaulin,Inc
.)に2回、4000〜6000psiで溶液を通すことによって溶解させる。
次いでホモジネートを、最終濃度0.5M NaClになるようにNaCl溶液
と混合し、続いて7000×gで15分間遠心分離を行う。得られたペレットを
、0.5M NaCl、100mM Tris、50mM EDTA、pH7.
4を使用して再度洗浄する。
【0817】 得られた洗浄した封入体を、1.5M 塩酸グアニジン(GuHCl)で2〜
4時間可溶化する。7000×gで15分間の遠心分離の後、ペレットを廃棄し
、そしてポリペプチドを含む上清を4℃で一晩インキュベートしてさらなるGu
HCl抽出を可能にする。
【0818】 不溶性粒子を除去するための高速遠心分離(30,000×g)に続き、Gu
HCl可溶化タンパク質を、GuHCl抽出物と、50mM ナトリウム、pH
4.5、150mM NaCl、2mM EDTAを含む20容量の緩衝液とを
、激しい攪拌で迅速に混合することによって、再折畳みさせる。再折畳みした希
釈タンパク質溶液を、さらなる精製工程の前の12時間、混合しないで4℃で保
つ。
【0819】 再折畳みされたポリペプチド溶液を清澄にするために、40mM酢酸ナトリウ
ム、pH6.0で平衡化した、適切な表面積を有する0.16μmメンブレンフ
ィルターを備えるあらかじめ準備した接線濾過ユニット(例えば、Filtro
n)を使用する。濾過したサンプルを、カチオン交換樹脂(例えば、Poros
HS−50,Perseptive Biosystems)上にロードする
。カラムを40mM 酢酸ナトリウム、pH6.0で洗浄し、そして同じ緩衝液
中の250mM、500mM、1000mM、および1500mM NaClで
、段階的な様式で溶出する。溶出液の280nmにおける吸光度を連続的にモニ
ターする。画分を収集し、そしてSDS−PAGEによってさらに分析する。
【0820】 次いでポリペプチドを含む画分をプールし、そして4容量の水と混合する。次
いで希釈されたサンプルを、あらかじめ準備した強アニオン(Poros HQ
−50,Perseptive Biosystems)交換樹脂および弱アニ
オン(Poros CM−20,Perseptive Biosystems
)交換樹脂の直列カラムのセットにロードする。カラムを40mM 酢酸ナトリ
ウム、pH6.0で平衡化する。両方のカラムを、40mM 酢酸ナトリウム、
pH6.0、200mM NaClで洗浄する。次いでCM−20カラムを10
カラム容量の直線勾配(0.2M NaCl、50mM 酢酸ナトリウム、pH
6.0から1.0M NaCl、50mM 酢酸ナトリウム、pH6.5の範囲
)を用いて溶出させる。画分を、溶出液の定常A280モニタリング下で収集す
る。次いで、(例えば、16% SDS−PAGEによって判明した)ポリペプ
チドを含む画分をプールする。
【0821】 得られたポリペプチドは、上記の再折畳みおよび精製工程の後で95%より高
い純度を示すはずである。5μgの精製タンパク質がロードされる場合、いかな
る主たる混在バンドも、クマシーブルー染色した16% SDS−PAGEゲル
から観察されないはずである。精製タンパク質はまた、エンドトキシン/LPS
混在について試験され得、そして代表的には、LPS含量はLALアッセイに従
って、0.1ng/ml未満である。
【0822】 (実施例7:バキュロウイルス発現系におけるポリペプチドのクローニングお
よび発現) この実施例では、ポリペプチドを発現するために、プラスミドシャトルベクタ
ーpA2を使用してポリヌクレオチドをバキュロウイルスに挿入する。この発現
ベクターは、Autographa californica核多核体ウイルス
(AcMNPV)の強力なポリヘドリンプロモーター、続いてBamHI、Xb
a I、およびAsp718のような便利な制限部位を含む。シミアンウイルス
40(「SV40」)のポリアデニル化部位を、効率的なポリアデニル化のため
に使用する。組換えウイルスの容易な選択のために、プラスミドは、同方向にあ
る弱いDrosophilaプロモーターの制御下でE.coli由来のβ−ガ
ラクトシダーゼ遺伝子、続いてポリヘドリン遺伝子のポリアデニル化シグナルを
含む。挿入された遺伝子は両方の側で、クローン化したポリヌクレオチドを発現
する生存可能なウイルスを生成するために、野生型ウイルスDNAとの細胞媒介
性の相同組換えのためのウイルス配列と隣接する。
【0823】 他の多くのバキュロウイルスベクター(例えば、pAc373、pVL941
、およびpAcIM1)は、当業者が容易に理解するように、必要とされる場合
、構築物が転写、翻訳、分泌などのために適切に配置されたシグナル(シグナル
ペプチドおよびインフレームなAUGを含む)を提供する限りにおいて、上記の
ベクターの代わりに使用され得る。このようなベクターは、例えば、Lucko
wら、Virology 170:31−39(1989)に記載される。
【0824】 具体的には、適切な制限部位および開始コドン/終止コドンを有するプライマ
ーを用い、実施例1に記載されるPCRプロトコルを使用して、寄託されたクロ
ーンに含まれるcDNA配列を、増幅させる。天然に存在するシグナル配列を使
用して分泌タンパク質を産生する場合、pA2ベクターは第2のシグナルペプチ
ドを必要としない。あるいは、ベクターは、Summersら(「A Manu
al of Methods for Baculovirus Vector
s and Insect Cell Culture Procedures
」、Texas Agricultural Experimental St
ation Bulletin No.1555(1987))に記載される標
準的な方法を用いて改変して、バキュロウイルスリーダー配列を含ませ得る(p
A2 GP)。
【0825】 増幅されたフラグメントを、市販のキット(「Geneclean」,BIO
101 Inc.,La Jolla,Ca)を使用して、1%アガロースゲ
ルから単離する。次いでフラグメントを適切な制限酵素で消化し、そして再び1
%アガロースゲルで精製する。
【0826】 プラスミドを対応する制限酵素で消化し、そして必要に応じて、当該分野で公
知の慣用の手順を用いて、仔ウシ腸ホスファターゼを用いて脱リン酸化し得る。
次いでDNAを、市販のキット(「Geneclean」BIO 101 In
c.,La Jolla,Ca)を使用して、1%アガロースゲルから単離する
【0827】 フラグメントおよび脱リン酸化したプラスミドを、T4 DNAリガーゼを用
いて互いに連結する。E.coli HB101またはXL−1 Blue(S
tratagene Cloning Systems,La Jolla,C
a)細胞のような他の適切なE.coli宿主を、連結混合液で形質転換し、そ
して培養プレート上に拡げる。プラスミドを含む細菌を、個々のコロニー由来の
DNAを消化し、そして消化産物をゲル電気泳動によって分析することにより同
定する。クローニングしたフラグメントの配列をDNA配列決定によって確認す
る。
【0828】 このポリヌクレオチドを含む5μgのプラスミドを、Felgnerら、Pr
oc.Natl.Acad.Sci.USA 84:7413−7417(19
87)によって記載されたリポフェクション法を使用して、1.0μgの市販の
線状化バキュロウイルスDNA(「BaculoGoldTM baculov
irus DNA」,Pharmingen,San Diego,CA)とと
もに同時トランスフェクトする。1μgのBaculoGoldTMウイルスD
NAおよび5μgのプラスミドを、50μlの無血清グレース培地(Life
Technologies Inc.,Gaithersburg,MD)を含
む、マイクロタイタープレートの滅菌したウェル中で混合する。その後、10μ
lのリポフェクチンおよび90μlグレース培地を加え、混合し、そして室温で
15分間インキュベートする。次いで、トランスフェクション混合液を、無血清
グレース培地1mlを加えた35mm組織培養プレートに播種したSf9昆虫細
胞(ATCC CRL 1711)に滴下して加える。次いでプレートを27℃
で5時間インキュベートする。次いで、トランスフェクション溶液をプレートか
ら除去し、そして10%ウシ胎仔血清を補充した1mlのグレース昆虫培地を添
加する。次いで培養を27℃で4日間継続する。
【0829】 4日後上清を収集し、SummersおよびSmith、前出によって記載さ
れたようにプラークアッセイを行う。「Blue Gal」(Life Tec
hnologies Inc.,Gaithersburg)を含むアガロース
ゲルを、galが発現しているクローン(青色に着色したプラークを生ずる)の
容易な同定および単離を可能にするために使用する。(この型の「プラークアッ
セイ」の詳細な説明はまた、Life Technologies Inc.,
Gaithersburgによって配布される、昆虫細胞培養およびバキュロ
ウイルス学のための使用者ガイドの中の9−10頁に見出され得る)。適切なイ
ンキュベーションの後、青色に着色したプラークをマイクロピペッター(例えば
、Eppendorf)のチップで拾う。次いで、組換えウイルスを含む寒天を
、200μlのグレース培地を含む微小遠心分離チューブ中で再懸濁させ、そし
て組換えバキュロウイルスを含む懸濁液を、35mmディッシュに播種したSf
9細胞に感染させるために使用する。4日後、これらの培養ディッシュの上清を
採集し、次いで4℃に貯蔵する。
【0830】 ポリペプチドの発現を確認するために、10%熱不活化FBSを補充したグレ
ース培地中でSf9細胞を増殖させる。細胞を、約2の感染多重度(「MOI」
)でポリヌクレオチドを含む組換えバキュロウイルスで感染させる。放射性標識
したタンパク質を所望する場合には、6時間後に培地を除去し、そしてメチオニ
ンおよびシステインを含まないSF900 II培地(Life Techno
logies Inc.,Rockville,MDから入手可能)に置き換え
る。42時間後、5μCiの35S−メチオニンおよび5μCiの35S−シス
テイン(Amershamから入手可能)を添加する。細胞をさらに16時間イ
ンキュベートし、次いで遠心分離によって採集する。上清中のタンパク質および
細胞内タンパク質を、SDS−PAGE、次いで(放射性標識した場合)オート
ラジオグラフィーによって分析する。
【0831】 精製タンパク質のアミノ末端のアミノ酸配列の微量配列決定法を使用して、産
生されたタンパク質のアミノ末端配列を決定し得る。
【0832】 (実施例8:哺乳動物細胞におけるポリペプチドの発現) 本発明のポリペプチドを、哺乳動物細胞中で発現させ得る。代表的な哺乳動物
発現ベクターは、mRNAの転写の開始を媒介するプロモーターエレメント、タ
ンパク質コード配列、ならびに転写の終結および転写物のポリアデニル化に必要
なシグナルを含む。さらなるエレメントは、エンハンサー、コザック配列、およ
び、RNAスプライシングのドナー部位およびアクセプター部位に隣接する介在
配列を含む。非常に効率的な転写は、SV40由来の初期および後期プロモータ
ー、レトロウイルス(例えばRSV、HTLVI、HIVI)由来の長末端反復
(LTR)、およびサイトメガロウイルス(CMV)の初期プロモーターを用い
て達成される。しかし、細胞エレメント(例えば、ヒトアクチンプロモーター)
もまた、使用され得る。
【0833】 本発明を実施する際の使用に適切な発現ベクターは、例えば、pSVLおよび
pMSG(Pharmacia,Uppsala,Sweden)、pRSVc
at(ATCC 37152)、pSV2dhfr(ATCC 37146)、
pBC12MI(ATCC 67109)、pCMVSport2.0、ならび
にpCMVSport3.0のようなベクターを含む。使用され得る哺乳動物宿
主細胞は、ヒトHela細胞、293細胞、H9細胞およびJurkat細胞、
マウスNIH3T3細胞およびC127細胞、Cos 1細胞、Cos 7細胞
およびCV1細胞、ウズラQC1−3細胞、マウスL細胞、ならびにチャイニー
ズハムスター卵巣(CHO)細胞を含む。
【0834】 あるいは、ポリペプチドは、染色体に組み込まれたポリヌクレオチドを含む、
安定な細胞株中で発現され得る。dhfr、gpt、ネオマイシン、ハイグロマ
イシンのような選択可能なマーカーを用いる同時トランスフェクションは、トラ
ンスフェクトされた細胞の同定および単離を可能にする。
【0835】 トランスフェクトされた遺伝子はまた、大量のコードされたタンパク質を発現
するために増幅され得る。DHFR(ジヒドロ葉酸還元酵素)マーカーは、目的
の遺伝子の数百または数千さえものコピーを有する細胞株の開発に有用である。
(例えば、Altら、J.Biol.Chem.253:1357−1370(
1978);Hamlin、Biochem.et Biophys.Acta
、1097:107−143(1990):Pageら、Biotechnol
ogy 9:64−68(1991)を参照のこと)。別の有用な選択マーカー
は、酵素グルタミンシンターゼ(GS)である(Murphyら、Bioche
m J.227:277−279(1991);Bebbingtonら、Bi
o/Technology 10:169−175(1992))。これらのマ
ーカーを使用して、哺乳動物細胞を選択培地中で増殖させ、そしてもっとも高い
耐性を有する細胞を選択する。これらの細胞株は、染色体に組み込まれた、増幅
された遺伝子を含む。チャイニーズハムスター卵巣(CHO)およびNSO細胞
は、タンパク質の産生のためにしばしば使用される。
【0836】 プラスミドpSV2−dhfr(ATCC受託番号37146)の誘導体であ
る、発現ベクターpC4(ATCC受託番号209646)およびpC6(AT
CC受託番号209647)は、ラウス肉腫ウイルス(Cullenら、Mol
ecular and Cellular Biology,438−447(
1985年3月))の強力なプロモーター(LTR)、およびCMVエンハンサ
ー(Boshartら、Cell 41:521−530(1985))のフラ
グメントを含む。例えば、BamHI、XbaI、およびAsp718の制限酵
素切断部位を有するマルチプルクローニングサイトは、目的の遺伝子のクローニ
ングを容易にする。ベクターはまた、ラットプレプロインスリン遺伝子の3’イ
ントロン、ポリアデニル化および終結シグナル、ならびに、SV40初期プロモ
ーターの制御下にあるマウスDHFR遺伝子を含む。
【0837】 具体的には、例えば、プラスミドpC6を、適切な制限酵素によって消化し、
次いで当該分野で公知の手順によって、仔ウシ腸ホスファターゼ(phosph
ate)を使用して脱リン酸化する。次いで、このベクターを1%アガロースゲ
ルから単離する。
【0838】 本発明のポリヌクレオチドは、必要な場合、適切な制限部位および開始/停止
コドンを有するプライマーを用いて実施例1に概説するプロトコルに従って増幅
される。このベクターは分泌のために必要な場合、異種シグナル配列を含むよう
に改変され得る(例えば、WO96/34891を参照のこと)。
【0839】 増幅フラグメントを、市販のキット(「Geneclean」、BIO 10
1 Inc.、La Jolla,Ca.)を使用して、1%アガロースゲルか
ら単離する。次いで、このフラグメントを、適切な制限酵素で消化し、そして再
び1%アガロースゲルで精製する。
【0840】 次いで、増幅フラグメントを同じ制限酵素で消化し、そして1%アガロースゲ
ルで精製する。次いで、単離されたフラグメントおよび脱リン酸したベクターを
、T4 DNAリガーゼで連結する。次いで、E.coli HB101細胞ま
たはXL−1 Blue細胞を形質転換し、そしてプラスミドpC6に挿入され
たフラグメントを含む細菌を、例えば、制限酵素分析を用いて同定する。
【0841】 活性なDHFR遺伝子を欠損するチャイニーズハムスター卵巣細胞を、トラン
スフェクションに使用する。5μgの発現プラスミドpC6を、リポフェクチン
(Felgnerら、前出)を用いて、0.5μgのプラスミドpSVneoと
同時トランスフェクトする。プラスミドpSV2−neoは、優性で選択可能な
マーカーであるところの、G418を含む抗生物質の群に対する耐性を付与する
酵素をコードするTn5由来のneo遺伝子を含む。この細胞を、1mg/ml
のG418を補充したαマイナスMEMに播種する。2日後、この細胞をトリプ
シン処理し、そして10、25、または50ng/mlのメトトレキサートおよ
び1mg/mlのG418を補充したαマイナスMEM中のハイブリドーマクロ
ーニングプレート(Greiner,Germany)中に播種する。約10〜
14日後、単一のクローンをトリプシン処理し、次いで異なる濃度のメトトレキ
サート(50nM、100nM、200nM、400nM、800nM)を使用
して、6ウェルのペトリ皿または10mlのフラスコに播種する。次いで、最高
濃度のメトトレキサートで増殖するクローンを、さらに高い濃度のメトトレキサ
ート(1μM、2μM、5μM、10mM、20mM)を含む新たな6ウェルプ
レートに移す。同じ手順を、100〜200μMの濃度で増殖するクローンが得
られるまで繰り返す。所望の遺伝子産物の発現を、例えば、SDS−PAGEお
よびウエスタンブロットによって、または逆相HPLC分析によって分析する。
【0842】 (実施例9:タンパク質融合物) 本発明のポリぺプチドは、好ましくは、他のタンパク質に融合される。これら
の融合タンパク質は、種々の適用に使用され得る。例えば、本発明のポリぺプチ
ドの、Hisタグ、HAタグ、プロテインA、IgGドメイン、およびマルトー
ス結合タンパク質への融合は、精製を容易にする(実施例5を参照のこと;EP
A 394,827もまた参照のこと;Trauneckerら、Natur
e、331:84−86(1988))。このポリペプチドはまた、異種ポリペ
プチド配列(例えば、KDEL)に融合して分泌および細胞内輸送を促進し得る
。さらに、IgG−1、IgG−3、およびアルブミンへの融合は、インビボで
の半減期を増大させる。本発明のポリぺプチドに融合した核局在化シグナルは、
タンパク質を特定の細胞内局在に標的化し得る。一方、共有結合ヘテロ二量体ま
たはホモ二量体は、融合タンパク質の活性を増大または減少させ得る。融合タン
パク質はまた、1つより多い機能を有するキメラ分子を作製し得る。最後に、融
合タンパク質は、非融合タンパク質と比較して、融合タンパク質の可溶性および
/または安定性を増大させ得る。上記の融合タンパク質の全ての型は、IgG分
子へのポリぺプチドの融合を概説する以下のプロトコル、または実施例5に記載
されるプロトコルを改変することによって作製され得る。
【0843】 簡単には、IgG分子のヒトFc部分は、以下に記載の配列の5’末端および
3’末端にわたるプライマーを使用してPCR増幅され得る。これらのプライマ
ーはまた、発現ベクター(好ましくは、哺乳動物発現ベクター)へのクローニン
グを容易にする都合の良い制限酵素部位、および必要な場合、開始/停止コドン
を有するべきである。
【0844】 例えば、pC4(受託番号209646)が使用される場合、ヒトFc部分は
、BamHIクローニング部位に連結され得る。3’BamHI部位が破壊され
るべきであることに注意のこと。次に、ヒトFc部分を含有するベクターが、B
amHIを用いて再び制限され、ベクターを線状化し、そして実施例1に記載さ
れるPCRプロトコルによって単離された本発明のポリヌクレオチドが、このB
amHI部位に連結される。ポリヌクレオチドは、終止コドンなしにクローニン
グされ、そうでなければ、融合タンパク質は産生されないことに注意すること。
【0845】 天然に存在するシグナル配列が分泌タンパク質を産生するために使用される場
合、pC4は、第2のシグナルペプチドを必要としない。あるいは、天然に存在
するシグナル配列が使用されない場合、ベクターは、異種シグナル配列を含むよ
うに改変され得る(例えば、WO 96/34891を参照のこと)。
【0846】
【化2】 (実施例10:ポリペプチドの処方) 本発明はまた、被験体に有効量の治療剤を投与することにより疾患または障害
(例えば、本明細書中に開示される疾患または障害の任意の1つ以上のような)
を処置および/または予防する方法を提供する。治療剤により、薬学的に受容可
能なキャリア型(例えば、滅菌キャリア)と組み合わせた、本発明のポリヌクレ
オチドまたはポリペプチド(フラグメントおよび改変体を含む)、そのアゴニス
トまたはアンタゴニスト、および/あるいはそれらに対する抗体を意味する。
【0847】 ポリペプチド組成物は、個々の患者の臨床状態(特に、分泌ポリペプチド単独
を用いた処置の副作用)、送達部位、投与の方法、投与の計画、ならびに開業医
に公知の他の因子を考慮に入れて、良好な医療行為と一致した様式において、処
方および投薬される。従って、本明細書中での目的のための「有効量」は、この
ような考慮によって、決定される。
【0848】 一般的な提案として、一用量あたりに非経口的に投与されるポリペプチドの薬
学的に有効な総量は、患者の体重の約1μg/kg/日〜10mg/kg/日の
範囲であるが、上記で注意したように、これは治療上の裁量を受ける。より好ま
しくは、この用量は、少なくとも0.01mg/kg/日であり、そしてヒトに
関して最も好ましくは、ホルモンについて、約0.01mg/kg/日と1mg
/kg/日との間である。連続して投与される場合、ポリペプチドは、代表的に
、1日あたり1〜4回の注射によるか、または、例えば、ミニポンプを使用する
連続皮下注入のいずれかにより、約1μg/kg/時間〜約50μg/kg/時
間の投薬速度で投与される。静脈内バッグ溶液もまた、使用され得る。変化を観
察するために必要である処置の長さ、および応答が生じるための処置後の間隔は
、所望の効果に依存して変動するようである。
【0849】 本発明のポリペプチドを含む薬学的組成物は、経口的に、直腸に、非経口的に
、槽内に(intracistemally)、膣内に、腹腔内に、局所的に(
粉末、軟膏、ゲル、ドロップまたは経皮性パッチによるように)、頬側に(bu
cally)、または経口スプレーもしくは鼻内スプレーとして投与される。「
薬学的に受容可能なキャリア」とは、非毒性の固体、半固体または液状充填剤、
希釈剤、カプセル化材料または任意の型の処方補助物をいう。本明細書中で使用
される場合、用語「非経口的(な)」とは、静脈内、筋肉内、腹腔内、胸骨内(
intrasternal)、皮下および関節内の注射および注入を含む投与の
様式をいう。
【0850】 ポリペプチドはまた、徐放系によって適切に投与される。徐放性組成物の適切
な例としては、成形品の形態(例えば、フィルム、またはマイクロカプセル)の
半透性のポリマーマトリクスが挙げられる。徐放性マトリクスとしては、ポリラ
クチド(米国特許第3,773,919号、EP 58,481)、L−グルタ
ミン酸とγ−エチル−L−グルタメートとの共重合体(Sidmanら、Bio
polymers,22:547−556(1983))、ポリ(2−ヒドロキ
シエチルメタクリレート)(Langerら、J.Biomed.Mater.
Res.15:167−277(1981)およびLanger,Chem.T
ech.12:98−105(1982))、エチレンビニルアセテート(R.
Langerら)またはポリ−D−(−)−3−ヒドロキシ酪酸(EP 133
,988)が挙げられる。徐放性組成物としてはまた、リポソームに封入された
(liposomally entrapped)ポリペプチドが挙げられる。
分泌ポリペプチドを含むリポソームは、それ自体、公知の方法により調製される
:DE3,218,121;Epsteinら、Proc.Natl.Acad
.Sci.USA,82:3688−3692(1985);Hwangら、P
roc.Natl.Acad.Sci.USA,77:4030−4034(1
980);EP 52,322;EP 36,676;EP 88,046;E
P 143,949;EP 142,641;日本国特許出願83−11800
8;米国特許第4,485,045号および同第4,544,545号;および
EP 102,324。通常、リポソームは、脂質含有量が約30molパーセ
ントコレステロールより多い、小さな(約200〜800Å)単層型であり、選
択された割合は、最適な分泌ポリペプチド療法について調整される。
【0851】 非経口的な投与に関して、1つの実施形態において、ポリペプチドは、一般に
、薬学的に受容可能なキャリア(すなわち、使用される投薬量および濃度でレシ
ピエントに非毒性であり、そしてこの処方の他の成分と適合性であるもの)と共
に単位投薬量注入可能形態(溶液、懸濁液または乳濁液)において、所望の程度
の純度でそれを混合することによって処方される。例えば、処方物は、好ましく
は、酸化剤およびポリペプチドに対して有害であることが公知である他の化合物
を含まない。
【0852】 一般に、処方物は、ポリペプチドを、液体キャリアもしくは細かく粉砕した固
体キャリアまたは両方と、均一およびじかに接触させることにより調製される。
次いで、必要である場合、産物は、所望の処方物へと成形される。好ましくは、
このキャリアは、非経口的なキャリアであり、より好ましくは、レシピエントの
血液と等張である溶液である。このようなキャリアビヒクルの例としては、水、
生理食塩水、リンガー溶液、およびデキストロース溶液が挙げられる。非水溶性
ビヒクル(例えば、不揮発性油およびオレイン酸エチル)はまた、リポソームと
同様に、本明細書中で有用である。
【0853】 キャリアは、微量の添加物(例えば、等張性および化学的安定性を増強する物
質)を適宜含む。このような物質は、使用される投薬量および濃度において、レ
シピエントに非毒性であり、そして緩衝液(例えば、リン酸塩、クエン酸塩、コ
ハク酸塩、酢酸、および他の有機酸またはそれらの塩類);抗酸化剤(例えば、
アスコルビン酸);低分子量(約10残基よりも小さい)のポリペプチド(例え
ば、ポリアルギニンまたはトリペプチド);タンパク質(例えば、血清アルブミ
ン、ゼラチン、または免疫グロブリン);親水性ポリマー(例えば、ポリビニル
ピロリドン);アミノ酸(例えば、グリシン、グルタミン酸、アスパラギン酸、
またはアルギニン);単糖、二糖、および他の糖質(セルロースもしくはその誘
導体、グルコース、マンノース、またはデキストリンを含む);キレート剤(例
えば、EDTA);糖アルコール(例えば、マンニトールまたはソルビトール)
;対イオン(例えば、ナトリウム);ならびに/あるいは非イオン性界面活性剤
(例えば、ポリソルベート、ポロキサマー(poloxamer)、またはPE
G)を含む。
【0854】 ポリペプチドは、このようなビヒクル中で、代表的に、約3〜8のpHで、約
0.1mg/ml〜100mg/mlの濃度、好ましくは1〜10mg/mlの
濃度で処方される。上記の賦形剤、キャリア、または安定化剤の特定のものの使
用は、ポリペプチド塩の形成をもたらすことが理解される。
【0855】 治療的な投与のために使用される任意のポリペプチドは、無菌であり得る。無
菌性は、滅菌濾過膜(例えば、0.2ミクロン膜)による濾過により容易に達成
される。治療ポリペプチド組成物は、一般に、無菌アクセスポートを有する容器
(例えば、皮下注射針によって貫通可能なストッパーを有する静脈内溶液バッグ
またはバイアル)に配置される。
【0856】 ポリペプチドは、通常、単位用量容器または多用量容器(例えば、密封アンプ
ルまたは密封バイアル)中に水溶液としてか、または再構成のための凍結乾燥し
た処方物として保存される。凍結乾燥した処方物の例として、10mlバイアル
を、5mlの滅菌濾過した1%(w/v)水性ポリペプチド溶液で満たし、そし
て得られる混合物を凍結乾燥する。その注入溶液は、静菌注射用水を使用して、
凍結乾燥したポリペプチドを再構成することにより調製される。
【0857】 本発明はまた、本発明の薬学的組成物の1つ以上の成分で満たされた1つ以上
の容器を含む薬学的パックまたはキットを提供する。薬品または生物学的製品の
製造、使用または販売を規制している政府機関により規定される形式における通
告は、このような容器に伴い得る。この通告は、ヒトの投与のための製造、使用
または販売の、この機関による認可を反映する。さらに、本発明のポリペプチド
は、他の治療的化合物とともに使用され得る。
【0858】 本発明の治療剤は、単独で、またはアジュバントと組み合わせて投与され得る
。本発明の治療剤とともに投与され得るアジュバントとしては、以下が挙げられ
るが、それらに限定されない:ミョウバン、ミョウバン+デオキシコール酸(I
mmunoAg)、MTP−PE(Biocine Corp.)、QS21(
Genentech,Inc.)、BCG(例えば、THERACYS(登録商
標))、MPLおよびCorynebacterium parvumの生存不
能な調製物。特定の実施形態において、本発明の治療剤は、ミョウバンと組み合
わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、QS−2
1と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得るさらなるア
ジュバントとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:モノホスホ
リル脂質免疫調節剤、AdjuVax 100a、QS−21、QS−18、C
RL1005、アルミニウム塩、MF−59、およびVirosomalアジュ
バント技術。本発明の治療剤とともに投与され得るワクチンとしては、以下が挙
げられるが、これらに限定されない:MMR(麻疹、流行性耳下腺炎,風疹)、
ポリオ(polio)、水痘、破傷風/ジフテリア、A型肝炎、B型肝炎、B型
インフルエンザ、百日咳(whooping cough)、肺炎、インフルエ
ンザ、ライム病、ロタウイルス、コレラ、黄熱病、日本脳炎、ポリオ(poli
omyelitis)、狂犬病、腸チフス、および百日咳(pertusis)
に対する防御に指向するワクチン。組み合わせは、例えば、混合物として同時に
、別々であるが同時にもしくは並行して;または逐次的にかのいずれかで投与さ
れ得る。これは、組み合わされた薬剤が治療混合物としてともに投与される提示
を含み、そして組み合わせた薬剤が、別々であるが同時に(例えば、同じ個体へ
別々の静脈内ラインを通じてのように)投与される手順もまた含む。「組み合わ
せ」投与は、第1に、続いて第2に与えられる化合物または薬剤のうちの1つを
別々に投与することをさらに含む。
【0859】 本発明の治療剤は、単独で、または他の治療的薬剤と組み合わせて投与され得
る。本発明の治療剤とともに投与され得る治療的薬剤としては、以下が挙げられ
るが、それらに限定されない:化学療法剤、抗生物質、ステロイド性および非ス
テロイド性の抗炎症剤、従来の免疫療法剤、および/または以下に記載される治
療的処置。組み合わせは、例えば、混合物として同時に、別々であるが同時にも
しくは並行して;または逐次的にかのいずれかで投与され得る。これは、組み合
わされた薬剤が、治療混合物としてともに投与される提示を含み、そして組み合
わせた薬剤が、別々であるが同時に(例えば、同じ個体へ別々の静脈内ラインを
通じてのように)投与される手順もまた含む。「組み合わせ」投与は、第1に、
続いて第2に与えられる化合物または薬剤のうちの1つを別々に投与することを
さらに含む。
【0860】 1つの実施形態において、本発明の治療剤は、抗凝血剤と組み合わせて投与さ
れる。本発明の組成物と共に投与され得る抗凝血剤としては以下が挙げられるが
これらに限定されない:ヘパリン、低分子量ヘパリン、ワルファリンナトリウム
(例えば、COUMADIN(登録商標))、ジクマロール、4−ヒドロキシク
マリン、アニシンジオン(例えば、MIRADONTM)、アセノクマロール(
例えば、ニクマロン、SINTHROMETM)、インダン−1,3−ジオン、
フェンプロクーモン(例えば、MARCUMARTM)、エチルビスクマセテー
ト(ethyl biscoumacetate)(例えば、TROMEXANTM )、およびアスピリン。特定の実施形態において、本発明の組成物は、ヘパ
リンおよび/またはワルファリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形
態において、本発明の組成物は、ワルファリンと組み合わせて投与される。別の
特定の実施形態において、本発明の組成物は、ワルファリンおよびアスピリンと
組み合わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、ヘ
パリンと組み合わせて投与される。別の特定の実施形態において、本発明の組成
物は、ヘパリンおよびアスピリンと組み合わせて投与される。
【0861】 別の実施形態において、本発明の治療剤は、血栓溶解薬物と組み合わせて投与
される。本発明の組成物と共に投与され得る血栓溶解薬物としては以下が挙げら
れるがこれらに限定されない:プラスミノゲン、ライスプラスミノゲン(lys
plasminogen)、α2−抗プラスミン、ストレプトキナーゼ(例えば
、KABIKINASETM)、抗レスプレイス(antiresplace)
(例えば、EMINASETM)、組織プラスミノゲンアクチベーター(t−P
A、アルテベイス(altevase)、ACTIVASETM)、ウロキナー
ゼ(例えば、ABBOKINASETM)、サウルプレイス(saurupla
se)(プロウロキナーゼ、単鎖ウロキナーゼ)およびアミノカプロン酸(例え
ば、AMICARTM)。特定の実施形態において、本発明の組成物は、組織プ
レスミノゲンアクチベーターおよびアスピリンと組み合わせて投与される。
【0862】 別の実施形態において、本発明の治療剤は、抗血小板薬物と組み合わせて投与
される。本発明の組成物と共に投与され得る抗血小板薬物としては以下が挙げら
れるがこれらに限定されない:アスピリン、ジピリダモール(例えば、PERS
ANTINETM)、およびチクロピジン(例えば、TICLIDTM)。
【0863】 特定の実施形態において、本発明の治療剤との組み合わせにおいて抗凝血剤、
血栓溶解薬物および/または抗血小板薬物の使用は、血栓症、動脈血栓症、静脈
血栓症、血栓塞栓症、肺塞栓症、アテローム性動脈硬化症、心筋梗塞、一過性脳
虚血発作、不安定狭心症の予防、診断および/または処置のために意図される。
特定の実施形態において、本発明の治療剤との組み合わせにおける抗凝血剤、血
栓溶解薬物および/または抗血小板薬物の使用は、血管形成手順に伴い得るよう
な手術周辺の血栓症の危険を軽減するために、非リウマチ性心房細動を含む心房
細動を有する患者における発作の危険を軽減するために、人工心臓弁および/ま
たは僧帽弁疾患に関連する塞栓症の危険を軽減するために、伏在性の移植片の閉
塞の予防のために意図される。単独または抗血小板薬剤、抗凝固薬剤および/も
しくは血栓溶解薬物との組み合わせにおける本発明の治療剤の他の使用としては
、体外装置(例えば、脈管内カニューレ、血液透析の患者における脈管アクセス
シャント、血液透析機、および心肺バイパス機)における閉塞の予防が挙げられ
るが、それらに限定されない。
【0864】 特定の実施形態において、本発明の治療剤は、抗レトロウイルス薬剤、ヌクレ
オシド/ヌクレオチド逆転写酵素インヒビター(NRTI)、非ヌクレオシド逆
転写酵素インヒビター(NNRTI)、および/またはプロテアーゼインヒビタ
ー(PI)と組み合わせて投与される。本発明の治療剤と組み合わせて投与され
得るNRTIとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:RETR
OVIRTM(ジドブジン/AZT)、VIDEXTM(ジダノシン/ddI)
、HIVIDTM(ザルシタビン/ddC)、ZERITTM(スタブジン/d
4T)、EPIVIRTM(ラミブジン/3TC)、およびCOMBIVIR (ジドブジン/ラミブジン)。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得るN
NRTIとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:VIRAMU
NETM(ネビラピン)、RESCRIPTORTM(デラビルジン)、および
SUSTIVATM(エファビレンズ)。本発明の治療剤と組み合わせて投与さ
れ得るプロテアーゼインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定
されない:CRIXIVANTM(インディナビル(indinavir))、
NORVIRTM(リトナビル(ritonavir))、INVIRASE (サキナビル(saquinavir))、およびVIRACEPTTM(ネ
ルフィナビル(nelfinavir))。特定の実施形態において、抗レトロ
ウイルス薬剤、ヌクレオシド逆転写酵素インヒビター、非ヌクレオシド逆転写酵
素インヒビター、および/またはプロテアーゼインヒビターは、AIDSを処置
するため、および/またはHIV感染を予防もしくは処置するために、本発明の
治療剤との任意の組み合わせで使用され得る。
【0865】 さらなるNRTIとしては、以下が挙げられる:LODENOSINETM
F−ddA;酸安定性アデノシンNRTI;Triangle/Abbott;
COVIRACILTM(エムトリシタビン(emtricitabine)/
FTC;ラミブジン(lamivudine)(3TC)と構造的に関連するが
、インビトロにおいて3〜10倍強い活性を有する;Triangle/Abb
ott);dOTC(BCH−10652,同様に、ラミブジンと構造的に関連
するが、ラミブジン耐性単離体のかなりの部分に対する活性を有する;Bioc
hem Pharma);Adefovir(FDAによって、抗HIV治療に
ついての認可を拒絶された;Gilead Sciences);PREVEO
N(登録商標)(Adefovir Dipivoxil,アデノフォビル(a
defovir)の活性なプロドラッグ;その活性形態はPMEA−ppである
);TENOFOVIRTM(ビス−POC PMPA,PMPAプロドラッグ
;Gilead);DAPD/DXG(DAPDの活性な代謝産物;Trian
gle/Abbott);D−D4FC(3TCと関連,AZT/3TC−耐性
ウイルスに対する活性を有する);GW420867X(Glaxo Well
come);ZIAGENTM(アバカビル(abacavir)/159U8
9;Glaxo Wellcome Inc.);CS−87(3’アジド−2
’,3’−ジデオキシウリジン;WO 99/66936);ならびに、β−L
−FD4Cおよびβ−L−FddCのS−アシル−2−チオエチル(SATE)
−保有プロドラッグ形態(WO 98/17281)。
【0866】 さらなるNNRTIとしては、以下が挙げられる:COACTINONTM
Emivirine/MKC−442,HEPTクラスの強力なNNRTI;T
riangle/Abbott);CAPRAVIRINETM(AG−154
9/S−1153,K103N変異を含むウイルスに対して活性を有する、次世
代のNNRTI;Agouron);PNU−142721(その前駆体デラビ
ルジン(delavirdine)よりも20〜50倍高い活性を有し、そして
K103N変異体に対して活性である;Pharmacia & Upjohn
);DPC−961およびDPC−963(エファビレンツ(efaviren
z)の第二世代誘導体,K103N変異を有するウイルスに対して活性であるよ
うに設計された;DuPont);GW−420867X(HBY097よりも
25倍高い活性を有し、そしてK103N変異体に対して活性である;Glax
o Wellcome);CALANOLIDE A(ラテックス樹木由来の天
然に存在する因子;Y181CおよびK103N変異のいずれかまたは両方を含
むウイルスに対して活性);ならびに、Propolis(WO 99/498
30)。
【0867】 さらなるプロテアーゼインヒビターとしては以下が挙げられる:LOPINA
VIRTM(ABT378/r;Abbott Laboratories);
BMS−232632(アザペプチド;Bristol−Myres Squi
bb);TIPRANAVIRTM(PNU−140690,非ペプチド性(n
on−peptic)ジヒドロピロン;Pharmacia & Upjohn
);PD−178390(非ペプチド性ジヒドロピロン;Parke−Davi
s);BMS 232632(アザペプチド;Bristol−Myers S
quibb);L−756,423(インディナビル(indinavir)の
アナログ;Merck);DMP−450(環状尿素化合物;Avid & D
uPont);AG−1776(プロテアーゼインヒビター耐性ウイルスに対し
てインビトロで活性を有するペプチド模倣物;Agouron);VX−175
/GW−433908(アンプレナビル(amprenavir)のホスフェー
トプロドラッグ;Vertex & Glaxo Welcome);CGP6
1755(Ciba);およびAGENERASETM(アンプレナビル(am
prenavir);Glaxo Wellcome Inc.)。
【0868】 さらなる抗レトロウイルス薬剤としては、融合インヒビター/gp41結合剤
が挙げられる。融合インヒビター/gp41結合剤としては、T−20(その休
止状態においてgp41に結合し、そしてフソジェニック(fusogenic
)状態への形質転換を妨げるHIV gp41膜貫通タンパク質の外部ドメイン
の残基643〜678由来のペプチド;Trimeris)およびT−1249
(第二世代の融合インヒビター;Trimeris)が挙げられる。
【0869】 さらなる抗レトロウイルス薬剤としては、融合インヒビター/ケモカインレセ
プターアンタゴニストが挙げられる。融合インヒビター/ケモカインレセプター
アンタゴニストとしては、以下が挙げられる:CXCR4アンタゴニスト(例え
ば、AMD 3100(バイサイクラム(bicyclam)),SDF−1お
よびそのアナログ,ならびにALX40−4C(カチオン性ペプチド),T22
(18アミノ酸のペプチド;Trimeris)ならびにT22アナログである
T134およびT140);CCR5アンタゴニスト(例えば、RANTES(
9−68),AOP−RANTES,NNY−RANTES,およびTAK−7
79);ならびにCCR5/CXCR4アンタゴニスト(例えば、NSC 65
1016(ジスタマイシンアナログ)。CCR2B,CCR3,およびCCR6
アンタゴニストもまた含まれる。ケモカインレセプターアゴニスト(例えば、R
ANTES,SDF−1,MIP−1α,MIP−1βなど)もまた融合を阻害
し得る。
【0870】 さらなる抗レトロウイルス薬剤は、インテグラーゼインヒビターを含む。イン
テグラーゼインヒビターとしては、以下が挙げられる:ジカフェオイルキナ(D
FQA)酸(dicaffeoylquinic(DFQA)acids);L
−チコリ酸(L−chicoric acid)(ジカフェオイル酒石(DCT
A)酸);キナリザリン(quinalizarin;QLC)および関連のア
ントラキノン;ZINTEVIRTM(AR177、真のインテグラーゼインヒ
ビターではなく、細胞表面で恐らく作用するオリゴヌクレオチド;Aronde
x);ならびにWO 98/50347に開示されるようなナフトール。
【0871】 さらなる抗レトロウイルス薬剤としては、以下が挙げられる:ヒドロキシ尿素
様化合物(例えば、BCX−34(プリンヌクレオシドホスホリラーゼインヒビ
ター;Biocryst));リボヌクレオチドレダクターゼインヒビター(例
えば、DIDOXTM(Molecules for Health));イノ
シンモノホスフェートデヒドロゲナーゼ(IMPDH)インヒビター(例えば、
VX−497(Vertex));ならびにマイコフォリック酸(mycoph
olic acid)(例えば、CellCept(マイコフェノラートモフェ
チル(mycophenolate mofetil);Roche)。
【0872】 さらなる抗レトロウイルス薬剤としては、以下が挙げられる:ウイルスインテ
グラーゼのインヒビター、ウイルスゲノム核転座のインヒビター(例えば、アリ
ーレンビス(メチルケトン)化合物);HIV侵入のインヒビター(例えば、A
OP−RANTES,NNY−RANTES,RANTES−IgG融合タンパ
ク質,RANTESおよびグリコサミノグリカン(GAG)の可溶性複合体,お
よびAMD−3100);ヌクレオカプシドジンクフィンガーインヒビター(例
えば、ジチアン(dithiane)化合物);HIV TatおよびRevの
標的;ならびに薬剤エンハンサー(pharmacoenhancer)(例え
ば、ABT−378)。
【0873】 他の抗レトロウイルス治療剤および補助治療剤としては、以下が挙げられる:
サイトカインおよびリンホカイン(例えば、MIP−1α,MIP−1β,SD
F−1α,IL−2,PROLEUKINTM(アルデスロイキン(aldes
leukin)/L2−7001;Chiron),IL−4,IL−10,I
L−12,およびIL−13);インターフェロン(例えば、IFN−α2a)
;TNFs,NFκB,GM−CSF,M−CSF,およびIL−10のアンタ
ゴニスト;免疫活性を調節する薬剤(例えば、シクロスポリンおよびプレドニゾ
ン);ワクチン、例えば、RemuneTM(HIV免疫原),APL 400
−003(Apollon),組換えgp120およびフラグメント,二価(B
/E)組換えエンベロープ糖タンパク質,rgp120CM235,MN rg
p120,SF−2 rgp120,gp120/可溶性CD4複合体,Del
ta JR−FLタンパク質,不連続gp120 C3/C4ドメイン由来の分
枝合成ペプチド,融合能を有する免疫原,ならびにGag,Pol,Nef,お
よびTatワクチン;遺伝子に基づく治療、例えば、遺伝的抑制エレメント(G
SE;WO 98/54366),およびイントラカイン(intrakine
)(遺伝子改変されたCCケモカイン(ERへと標的化されて、新たに合成され
たCCR5の表面発現をブロックする(Yangら,PNAS 94:1156
7−72(1997);Chenら,Nat.Med.3:1110−16(1
997));抗体、例えば、抗CXCR4抗体12G5,抗CCR5抗体2D7
,5C7,PA8,PA9,PA10,PA11,PA12,およびPA14,
抗CD4抗体Q4120およびRPA−T4,抗CCR3抗体7B11,抗gp
120抗体17b,48d,447−52D,257−D,268−Dおよび5
0.1,抗Tat抗体,抗TNF−α抗体,およびモノクローナル抗体33A;
アリール炭化水素(AH)レセプターアゴニストおよびアンタゴニスト、例えば
、TCDD,3,3’,4,4’,5−ペンタクロロビフェニル,3,3’,4
,4’−テトラクロロビフェニル,およびα−ナフトフラボン(WO 98/3
0213);ならびに、抗酸化剤、例えば、γ−L−グルタミル−L−システイ
ンエチルエステル(γ−GCE;WO 99/56764)。
【0874】 さらなる実施形態では、本発明の治療剤は、抗ウイルス薬剤と組み合わせて投
与される。本発明の治療剤と共に投与され得る抗ウイルス薬剤としては、アシク
ロビル、リバビリン、アマンタジン、およびレマンチジン(remantidi
ne)が挙げられるが、これらに限定されない。
【0875】 他の実施形態では、本発明の治療剤は、抗日和見感染症薬剤と組み合わせて投
与され得る。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得る抗日和見感染症薬剤と
しては、以下が挙げられるが、これらに限定されないTRIMETHOPRIM
−SULFAMETHOXAZOLETM,DAPSONETM,PENTAM
IDINETM,ATOVAQUONETM,ISONIAZIDTM,RIF
AMPINTM,PYRAZINAMIDETM,ETHAMBUTOLTM
RIFABUTINTM,CLARITHROMYCINTM,AZITHRO
MYCINTM,GANCICLOVIRTM,FOSCARNETTM,CI
DOFOVIRTM,FLUCONAZOLETM,ITRACONAZOLETM ,KETOCONAZOLETM,ACYCLOVIRTM,FAMCIC
OLVIRTM,PYRIMETHAMINETM,LEUCOVORINTM ,NEUPOGENTM(フィルグラスチム(filgrastim)/G−C
SF),およびLEUKINETM(サルグラモスチン(sargramost
im)/GM−CSF)。特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見
Pneumocystis carinii肺炎感染を予防的に処置または予防
するために、TRIMETHOPRIM−SULFAMETHOXAZOLE 、DAPSONETM、PENTAMIDINETM、および/またはATO
VAQUONETMとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態に
おいて、本発明の治療剤は、日和見Mycobacterium avium複
合感染を予防的に処置または予防するために、ISONIAZIDTM、RIF
AMPINTM、PYRAZINAMIDETM、および/またはETHAMB
UTOLTMとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において
、本発明の治療剤は、日和見Mycobacterium tuberculo
sis感染を予防的に処置または予防するために、RIFABUTINTM、C
LARITHROMYCINTM、および/またはAZITHROMYCIN との任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の
治療剤は、日和見サイトメガロウイルス感染を予防的に処置または予防するため
に、GANCICLOVIRTM、FOSCARNETTM、および/またはC
IDOFOVIRTMとの任意の組み合わせで使用される。別の特定の実施形態
において、本発明の治療剤は、日和見真菌感染を予防的に処置または予防するた
めに、FLUCONAZOLETM、ITRACONAZOLETM、および/
またはKETOCONAZOLETMとの任意の組み合わせで使用される。別の
特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見単純ヘルペスウイルスI型
および/またはII型感染を予防的に処置または予防するために、ACYCLO
VIRTMおよび/またはFAMCICOLVIRTMとの任意の組み合わせで
使用される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日和見Toxo
plasma gondii感染を予防的に処置または予防するために、PYR
IMETHAMINETMおよび/またはLEUCOVORINTMとの任意の
組み合わせで使用される。別の特定の実施形態において、本発明の治療剤は、日
和見細菌感染を予防的に処置または予防するために、LEUCOVORINTM および/またはNEUPOGENTMとの任意の組み合わせで使用される。
【0876】 さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、抗生物質薬剤と組合わせて投
与される。本発明の治療剤とともに投与され得る抗生物質としては、アモキシシ
リン、β−ラクタマーゼ、アミノ配糖体、β−ラクタム(糖ペプチド)、β−ラ
クタマーゼ、クリンダマイシン、クロラムフェニコール、セファロスポリン、シ
プロフロキサシン、シプロフロキサシン、エリスロマイシン、フルオロキノロン
類、マクロライド系抗生物質、メトロニダゾル、ペニシリン、キノロン類、ラパ
マイシン、リファンピン、ストレプトマイシン、スルホンアミド、テトラサイク
リン、トリメトプリム、トリメトプリム−スルファメトキサゾール、およびバン
コマイシンが挙げられるが、これらに限定されない。
【0877】 他の実施形態において、本発明の治療剤は、免疫刺激剤と組み合わせて投与さ
れる。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得る免疫刺激剤としては、以下が
挙げられるが、これらに限定されない:レバミゾール(例えば、ERGAMIS
OLTM、イソプリノシン(isopprinosine)(例えば、INOS
IPLEXTM)、インターフェロン(例えば、インターフェロンα)、および
インターロイキン(例えば、IL−2)。
【0878】 他の実施形態では、本発明の治療剤は、免疫抑制剤と組み合わせて投与される
。本発明の治療剤と組合わせて投与され得る従来の非特異的免疫抑制剤としては
、ステロイド類、シクロスポリン、シクロスポリンアナログ、シクロホスファミ
ドメチルプレドニゾン、プレドニゾン、アザチオプリン、FK−506、15−
デオキシスペルグアリン(15−deoxyspergualin)、および応
答T細胞の機能を抑制することによって作用する他の免疫抑制剤が挙げられるが
、これらに限定されない。本発明の治療剤と組み合わせて投与され得る他の免疫
抑制剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:プレドニゾロン
、メトトレキサート、サリドマイド、メトキサレン、ラパマイシン、レフルノミ
ド、ミゾリビン(BREDININTM)、ブレキナル、デオキシスペルグアリ
ン(deoxyspergualin)、およびアザスピラン(azaspir
ane)(SKF 105685),ORTHOCLONE OKT(登録商標
)3(マウスモノクローナル抗CD3抗体),SANDIMMUNETM,NE
ORALTM,SANGDYATM(シクロスポリン),PROGRAF(登録
商標)(FK506,タクロリムス),CELLCEPT(登録商標)(マイコ
フェノラートモフェチル(mycophenolate motefil),そ
の活性な代謝産物は、ミコフェノール酸である),IMURANTM(アザチオ
プリン),グルココルチコステロイド,副腎皮質ステロイド(例えば、DELT
ASONETM(プレドニゾロン)およびHYDELTRASOLTM(プレド
ニゾロン),FOLEXTMおよびMEXATETM(メトトレキサート),O
XSORALEN−ULTRATM(メトキサレン)ならびにRAPAMUNETM (シロリムス(sirolimus))。特定の実施形態では、免疫抑制剤
は、器官または骨髄移植の拒絶を予防するために使用され得る。
【0879】 さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、単独でかまたは1以上の静脈
内免疫グロブリン調製物と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投
与され得る静脈内免疫グロブリン調製物としては、GAMMARTM、IVEE
GAMTM、SANDOGLOBULINTM、GAMMAGARD S/D 、ATGAMTM(抗胸腺細胞グロブリン)およびGAMIMUNETMが挙
げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、本発明の治療剤
は、移植治療(例えば、骨髄移植)において静脈内免疫グロブリン調製物と組み
合わせて投与される。
【0880】 特定の実施形態では、本発明の治療剤は、単独または抗炎症性薬剤と組み合わ
せて投与される。本発明の治療剤と共に投与され得る抗炎症性薬剤としては、以
下が挙げられるが、これらに限定されない:コルチコステロイド(例えば、ベタ
メタゾン、ブデソニド、コルチゾン、デキサメタゾン、ヒドロコルチゾン、メチ
ルプレドニゾロン、プレドニゾロン、プレドニゾン、およびトリアムシノロン)
、非ステロイド性抗炎症薬物(例えば、ジクロフェナク、ジフルニサル、エトド
ラク、フェノプロフェン、フロクタフェニン、フルルビプロフェン、イブプロフ
ェン、インドメタシン、ケトプロフェン、メクロフェナム酸塩、メフェナム酸、
メロキシカム、ナブメトン、ナプロキセン、オキサプロジン、フェニルブタゾン
、ピロキシカム、スリンダク、テノキシカム、チアプロフェン酸、およびトルメ
チン)、ならびに抗ヒスタミン薬、アミノアリールカルボン酸誘導体、アリール
酢酸誘導体、アリール酪酸誘導体、アリールカルボン酸、アリールプロピオン酸
誘導体、ピラゾール類、ピラゾロン類、サリチル酸誘導体、チアジンカルボキサ
ミド類、e−アセトアミドカプロン酸、S−アデノシルメチオニン、3−アミノ
−4−ヒドロキシ酪酸、アミキセトリン(amixetrine)、ベンダザッ
ク、ベンジダミン、ブコローム、ジフェンピラミド、ジタゾール、エモルファゾ
ン、グアイアズレン、ナブメトン、ニメスリド、オルゴテイン、オキサセプロー
ル、パラニリン(paranyline)、ペリソキサール、ピフオキシム、プ
ロカゾン、プロキサゾール、およびテニダプ。
【0881】 さらなる実施形態において、本発明の組成物は、単独でかまたは抗脈管形成薬
剤と組合わせて投与される。本発明の組成物とともに投与され得る抗脈管形成薬
剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:アンジオスタチン(
Entremed,Rockville,MD)、トロポニン−1(Bosto
n Life Sciences,Boston,MA)、抗侵襲性因子、レチ
ノイン酸およびその誘導体、パクリタキセル(タキソール)、スラミン、メタロ
プロテイナーゼ−1の組織インヒビター、メタロプロテイナーゼ−2の組織イン
ヒビター、VEGI、プラスミノーゲンアクチベーターインヒビター−1、プラ
スミノーゲンアクチベーターインヒビター−2および種々の形態のより軽い「d
群」遷移金属。
【0882】 より軽い「d群」遷移金属としては、例えばバナジウム、モリブデン、タング
ステン、チタン、ニオブおよびタンタル種が挙げられる。そのような遷移金属種
は、遷移金属錯体を形成し得る。上記の遷移金属種の適切な錯体としては、オキ
ソ遷移金属錯体が挙げられる。
【0883】 バナジウム錯体の代表的な例としては、バナデート錯体およびバナジル錯体の
ようなオキソバナジウム錯体が挙げられる。適切なバナデート錯体としては、例
えばメタバナジン酸アンモニウム、メタバナジン酸ナトリウムおよびオルトバナ
ジン酸ナトリウムのようなメタバナデート錯体およびオルトバナデート錯体が挙
げられる。適切なバナジル錯体としては、例えばバナジルアセチルアセトネート
および硫酸バナジル(硫酸バナジル一水和物および硫酸バナジル三水和物のよう
な硫酸バナジル水和物を含む)が挙げられる。
【0884】 タングステン錯体およびモリブデン錯体の代表的な例としてはまた、オキソ錯
体が挙げられる。適切なオキソタングステン錯体としては、タングステート錯体
およびタングステンオキシド錯体が挙げられる。適切なタングステート錯体とし
ては、タングステン酸アンモニウム、タングステン酸カルシウム、タングステン
酸ナトリウム二水和物およびタングステン酸が挙げられる。適切なタングステン
オキシドとしては、タングステン(IV)オキシドおよびタングステン(VI)
オキシドが挙げられる。適切なオキソモリブデン錯体としては、モリブデート、
モリブデンオキシドおよびモリブデニル錯体が挙げられる。適切なモリブデート
錯体としては、モリブデン酸アンモニウムおよびその水和物、モリブデン酸ナト
リウムおよびその水和物、ならびにモリブデン酸カリウムおよびその水和物が挙
げられる。適切なモリブデンオキシドとしては、モリブデン(VI)オキシド、
モリブデン(VI)オキシドおよびモリブデン酸が挙げられる。適切なモリブデ
ニル錯体としては、例えばモリブデニルアセチルアセトネートが挙げられる。他
の適切なタングステン錯体およびモリブデン錯体としては、例えばグリセロール
、酒石酸および糖由来のヒドロキソ誘導体が挙げられる。
【0885】 広範な種々の他の抗脈管形成因子もまた、本発明の状況において利用され得る
。代表的な例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:血小板第
4因子4;硫酸プロタミン;硫酸化キチン誘導体(クイーンクラブ(queen
crab)の殻から調製される)(Murataら、Cancer Res.
51:22〜26、1991);硫酸化多糖ペプチドグリカン複合体(SP−P
G)(この化合物の機能は、ステロイド(例えば、エストロゲン)およびクエン
酸タモキシフェンの存在によって、増強され得る);スタウロスポリン;基質代
謝の調節因子(例えば、プロリンアナログ、シスヒドロキシプロリン、d,L−
3,4−デヒドロプロリン、チアプロリン、α,α−ジピリジル,アミノプロピ
オニトリルフマレートを含む);4−プロピル−5−(4−ピリジニル)−2(
3H)−オキサゾロン;メトトレキサート;ミトザントロン;ヘパリン;インタ
ーフェロン;2マクログロブリン−血清;ChIMP−3(Pavloffら、
J.Bio.Chem.267:17321〜17326、1992);キモス
タチン(Tomkinsonら、Biochem J.286:475〜480
、1992);シクロデキストリンテトラデカサルフェート;エポネマイシン;
カンプトテシン;フマギリン(Ingberら、Nature 348:555
〜557、1990);チオリンゴ酸金ナトリウム(「GST」;Matsub
araおよびZiff、J.Clin.Invest.79:1440〜144
6、1987);アンチコラゲナーゼ−血清;α2−抗プラスミン(Holme
sら、J.Biol.Chem.262(4):1659〜1664、1987
);ビサントレン(National Cancer Institute);
ロベンザリット二ナトリウム(N−(2)−カルボキシフェニル−4−クロロア
ントロニル酸(chloroanthronilic acid)二ナトリウム
、すなわち「CCA」;Takeuchiら、Agents Actions
36:312〜316、1992);およびメタロプロテイナーゼインヒビター
(例えば、BB94)。
【0886】 本発明の状況において同様に利用され得るさらなる抗脈管形成因子としては、
サリドマイド(Celgene,Warren,NJ);血管拡張性ステロイド
;AGM−1470(H.BremおよびJ.Folkman J Pedia
tr.Surg.28:445−51(1993));インテグリンαvβ3ア
ンタゴニスト(C.Storgardら,J Clin.Invest.103
:47−54(1999));カルボキシアミノイミダゾール(carboxy
naminolmidazole);カルボキシアミドトリアゾール(CAI)
(National Cancer Institute,Bethesda,
MD);Conbretastatin A−4(CA4P)(OXiGENE
,Boston,MA);Squalamine(Magainin Phar
maceuticals,Plymouth Meeting,PA);TNP
−470,(Tap Pharmaceuticals,Deerfield,
IL);ZD−0101 AstraZeneca(London,UK);A
PRA(CT2584);Benefin,Byrostatin−1(SC3
39555);CGP−41251(PKC 412);CM101;Dexr
azoxane(ICRF187);DMXAA;エンドスタチン;Flavo
pridiol;Genestein;GTE;ImmTher;Iressa
(ZD1839);Octreotide(ソマトスタチン);Panreti
n;Penacillamine;Photopoint;PI−88;Pri
nomastat(AG−3340)Purlytin;Suradista(
FCE26644);タモキシフェン(Nolvadex);Tazarote
ne;テトラチオモリブデート;Xeloda(Capecitabine);
および5−フルオロウラシルが挙げられる。
【0887】 本発明の組成物と組合わせて投与され得る抗脈管形成薬剤は、種々の機構を通
じて作用し得、これらの機構としては、以下が挙げられるが、これらに限定され
ない:細胞外マトリックスのタンパク質分解の阻害、内皮細胞−細胞外マトリッ
クス接着分子の機能のブロック、増殖因子のような脈管形成誘導因子の機能と拮
抗すること、および増殖している内皮細胞において発現されるインテグリンレセ
プタ−の阻害。細胞外マトリックスタンパク質分解を妨害し、そして本発明の組
成物と組合わせて投与され得る抗脈管形成インヒビタ−の例としては、以下が挙
げられるが、これらに限定されない:AG−3340(Agouron,La
Jolla,CA)、BAY−12−9566(Bayer,West Hav
en,CT)、BMS−275291(Bristol Myers Squi
bb,Princeton,NJ)、CGS−27032A(Novartis
,East Hanover,NJ)、Marimastat(British
Biotech,Oxford,UK)およびMetastat(Aeter
na,St−Foy,Quebec)。内皮細胞−細胞外マトリックス接着分子
の機能をブロックすることにより作用し、そして本発明の組成物と組合わせて投
与され得る抗脈管形成インヒビタ−の例としては、以下が挙げられるが、これら
に限定されない:EMD−121974(Merck KcgaA Darms
tadt,Germany)およびVitaxin(Ixsys,La Jol
la,CA/Medimmune,Gaithersburg,MD)。脈管形
成誘導因子と直接拮抗するかまたはこの誘導因子を阻害することにより作用し、
そして本発明の組成物と組合わせて投与され得る抗脈管形成薬剤の例としては、
以下が挙げられるが、これらに限定されない:Angiozyme(Riboz
yme,Boulder,CO)、抗VEGF抗体(Genentech,S.
San Francisco,CA)、PTK−787/ZK−225846(
Novartis,Basel,Switzerland)、SU−101(S
ugen,S.San Francisco,CA)、SU−5416(Sug
en/Pharmacia Upjohn,Bridgewater,NJ)、
およびSU−6668(Sugen)。他の抗脈管形成薬剤は、脈管形成を間接
的に阻害するように作用する。本発明の組成物と組合わせて投与され得る脈管形
成の間接的インヒビタ−の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定され
ない:IM−862(Cytran,Kirkland,WA)、インタ−フェ
ロン−α、IL−12(Roche,Nutley,NJ)、およびペントサン
ポリスルフェ−ト(Georgetown University,Washi
ngton,DC)。
【0888】 特定の実施形態において、抗脈管形成薬剤と組合わせた本発明の組成物の使用
は、自己免疫疾患(例えば、本明細書中に記載の自己免疫疾患)の処置、予防、
および/または回復のために企図される。
【0889】 特定の実施形態において、抗脈管形成薬剤と組合わせた本発明の組成物の使用
は、関節炎の処置、予防、および/または回復のために企図される。さらに特定
の実施形態において、抗脈管形成薬剤と組合わせた本発明の組成物の使用は、慢
性関節リウマチの処置、予防、および/または回復のために企図される。
【0890】 別の実施形態において、本発明のポリペプチドをコ−ドするポリヌクレオチド
は、脈管形成タンパク質または脈管形成タンパク質をコ−ドする他のポリヌクレ
オチドと一緒に投与され得る。本発明の組成物とともに投与され得る脈管形成タ
ンパク質としては、酸性および塩基性の線維芽細胞増殖因子、VEGF−1、V
EGF−2、VEGF−3、上皮増殖因子αおよびβ、血小板由来内皮細胞増殖
因子、血小板由来増殖因子、腫瘍壊死因子α、肝細胞増殖因子、インスリン様増
殖因子、コロニ−刺激因子、マクロファ−ジコロニ−刺激因子、顆粒球/マクロ
ファ−ジコロニ−刺激因子、および一酸化窒素シンタ−ゼが挙げられるが、これ
らに限定されない。
【0891】 さらなる実施形態において、本発明の組成物は、化学療法剤と組み合わせて投
与される。本発明の治療剤とともに投与され得る化学療法剤としては、アルキル
化剤(例えば、ナイトロジェンマスタ−ド(例えば、メクロレタミン、シクロホ
スファミド、シクロホスファミドイホスファミド(Cyclophospham
ide Ifosfamide)、メルファラン(L−サルコリジン)、および
クロラムブシル)、エチレンイミン、およびメチルメルアミン(例えば、ヘキサ
メチルメラミンおよびチオテパ)、硫酸アルキル(例えば、ブスルファン)、ニ
トロソ尿素類(例えば、カルムスチン(BCNU)、ロムスチン(CCNU)、
セムスチン(メチルCCNU)、およびストレプトゾシン(ストレプトゾトシン
)、トリアゼン(triazene)(例えば、ダカルバジン、(DTIC;ジ
メチルトリアゼノイミダゾ−ルカルボキシアミド(dimethyltriaz
enoimidazolecarboxamide))、葉酸アナログ(例えば
、メトトレキセート(アメトプテリン)、ピリミジンアナログ(例えば、フルオ
ロウラシル(5−フルオロウラシル;5−FU)、フロクスリジン(フルオロデ
オキシウリジン;FudR)、およびシタラビン(シトシンアラビノシド))、
プリンアナログおよびプリン関連阻害剤(例えば、メルカプトプリン(6−メル
カプトプリン;6−MP)、チオグアニン(6−チオグアニン;TG)、および
ペントスタチン(2’−デオキシコフォルマイシン)、ビンカアルカロイド(例
えば、ビンブラスチン(VLB、硫酸ビンブラスチン))およびビンクリスチン
(硫酸ビンクリスチン))、エピポドフィルロトキシン(epipodophy
llotoxin)(例えば、エトポシドおよびテニポシド)、抗生物質(例え
ば、ダクチノマイシン(アクチノマイシンD)、ダウノルビシン(ダウノマイシ
ン;ルビドマイシン)、ドキソルビシン、ブレオマイシン、プリカマイシン(P
licamycin)(ミトラマイシン)、およびマイトマシン(マイトマイシ
ンC)、酵素(例えば、L−アスパラギナ−ゼ)、生物学的応答変更因子(例え
ば、インタ−フェロンαおよびインタ−フェロンα−2b)、白金錯体組成物(
例えば、シスプラチン(cis−DDP)およびカルボプラチン)、アントラシ
ンジオン(anthracenedione)(ミトキサントロン)、置換尿素
(例えば、ヒドロキシ尿素)、メチルヒドラジン誘導体(例えば、プロカルバジ
ン(N−メチルヒドラジン;MIH)、アドレノコルチコステロイド(例えば、
プレドニゾロン)、プロゲスチン(例えば、ヒドロキシプロゲステロンカプロエ
−ト(Hydroxyprogesterone caproate)、メドロ
キシプロゲステロン、酢酸メドロキシプロゲステロン、および酢酸メゲストロ−
ル)、エストロゲン(例えば、ジエチルスチルベストロ−ル(DES)、ジエチ
ルスチルベストロ−ルジホスフェ−ト、エストラジオ−ル、およびエチニルエス
トラジオ−ル)、抗エストロゲン(例えば、タモキシフェン)、アンドロゲン(
プロピオン酸テストステロン、およびフルオキシメステロン)、抗アンドロゲン
(例えば、フルタミド)、ゴナドトロピン放出ホルモンアナログ(例えば、ロイ
プロリド)、他のホルモンおよびホルモンアナログ(例えば、メチルテストステ
ロン、エストラムスチン、エストラムスチンリン酸ナトリウム、クロロトリアニ
セン、およびテストラクトン)、および他のもの(例えば、ジカルバジン(di
carbazine)、グルタミン酸、およびミトタン)が挙げられるが、これ
らに限定されない。
【0892】 1つの実施形態において、本発明の組成物は、1つ以上の以下の薬物との組み
合わせて投与される:インフリキシマブ(infliximab)(これはまた
、RemicadeTMCentocor,Inc.として公知である)、トロ
ケイド(Trocade)(Roche,RO−32−3555)、レフルノミ
ド(Leflunomide)(これはまた、Hoechst Marion
Roussel製のAravaTMとして公知である)、KineretTM
これは、Amgen,Inc製のアナキンラ(Anakinra)としても公知
である、IL−1レセプタ−アンタゴニスト)。
【0893】 特定の実施形態において、本発明の組成物は、CHOP(シクロフォスファミ
ド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、およびプレドニゾン)と組み合わせて投
与されるか、またはCHOPの成分の1以上の組み合わせで投与される。ある実
施形態において、本発明の組成物は、抗CD20抗体(ヒトモノクロ−ナル抗C
D20抗体)と組み合わせて投与される。別の実施形態において、本発明の組成
物は、抗CD20抗体およびCHOPと共に、または抗CD20抗体およびCH
OPの1以上の成分(特に、シクロホスファミドおよび/またはプレドニゾロン
)の任意の組み合わせと共に投与される。特定の実施形態において、本発明の組
成物は、リツキシマブ(Rituximab)と組み合わせて投与される。さら
なる実施形態において、本発明の組成物は、リツキシマブおよびCHOPと共に
、またはリツキシマブおよびCHOPの1以上の成分(特に、シクロホスファミ
ドおよび/またはプレドニゾロン)の任意の組み合わせと共に投与される。特定
の実施形態において、本発明の組成物は、トシツモマブ(tositumoma
b)と組み合わせて投与される。さらなる実施形態において、本発明の組成物は
、トシツモマブおよびCHOPと共に、またはトシツモマブおよびCHOPの1
以上の成分(特に、シクロホスファミドおよび/またはプレドニゾロン)の任意
の組み合わせと共に投与される。抗CD20抗体を、放射性同位元素、毒素、ま
たは細胞毒性プロドラッグと任意に結合させえる。
【0894】 別の特定の実施形態において、本発明の組成物は、ZevalinTMと組み
合わせて投与される。さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、Zeva
linTMおよびCHOPと共に、またはZevalinTMおよびCHOPの
1以上の成分(特に、シクロホスファミドおよび/またはプレドニゾロン)の任
意の組み合わせと共に投与される。ZevalinTMを、1以上の放射性同位
元素と結合させ得る。特に好ましい同位元素は、90Yおよび111Inである
【0895】 さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、サイトカインと組み合わせて
投与される。本発明の治療剤とともに投与され得るサイトカインとしては、IL
2、IL3、IL4、IL5、IL6、IL7、IL10、IL12、IL13
、IL15、抗CD40、CD40L、IFN−γおよびTNF−αが挙げられ
るが、これらに限定されない。別の実施形態において、本発明の治療剤は、任意
のインタ−ロイキン(IL−1α、IL−1β、IL−2、IL−3、IL−4
、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−9、IL−10、IL−1
1、IL−12、IL−13、IL−14、IL−15、IL−16、IL−1
7、IL−18、IL−19、IL−20およびIL−21を含むが、これらに
限定されない)と共に投与され得る。
【0896】 1つの実施形態において、本発明の治療剤は、TNFファミリ−のメンバ−と
組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得るTNF分子、T
NF関連分子、またはTNF様分子としては、以下が挙げられるが、これらに限
定されない:可溶性形態のTNF−α、リンホトキシン−α(LT−α、TNF
−βとしても公知)、LT−β(複合ヘテロトリマ−LT−α2−β中に見出さ
れる)、OPGL、FasL、CD27L、CD30L、CD40L、4−1B
BL、DcR3、OX40L、TNF−γ(国際公開番号WO96/14328
)、AIM−I(国際公開番号WO97/33899)、エンドカイン−α(国
際公開番号WO98/07880)、OPG、およびニュ−トロカイン−α(国
際公開番号WO98/18921)、OX40、および神経成長因子(NGF)
、ならびに可溶性形態のFas、CD30、CD27、CD40および4−IB
B、TR2(国際公開番号WO96/34095)、DR3(国際公開番号WO
97/33904)、DR4(国際公開番号WO98/32856)、TR5(
国際公開番号WO98/30693)、TRANK、TR9(国際公開番号WO
98/56892)、TR10(国際公開番号WO98/54202)、312
C2(国際公開番号WO98/06842)、およびTR12、ならびに可溶性
形態のCD154、CD70、およびCD153。
【0897】 さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、脈管形成タンパク質と組み合
わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る脈管形成タンパク質と
しては、欧州特許番号EP−399816に開示されるようなグリオ−ム由来増
殖因子(GDGF);欧州特許番号EP−682110に開示されるような血小
板由来増殖因子A(PDGF−A);欧州特許番号EP−282317に開示さ
れるような血小板由来増殖因子B(PDGF−B);国際公開番号WO92/0
6194号に開示されるような胎盤増殖因子(PlGF);Hauserら、G
orwth Factors、4:259−268(1993)に開示されるよ
うな胎盤増殖因子2(PlGF−2);国際公開番号WO90/13649号に
開示されるような血管内皮増殖因子(VEGF);欧州特許番号EP−5064
77に開示されるような血管内皮増殖因子A(VEGF−A);国際公開番号W
O96/39515号に開示されるような血管内皮増殖因子2(VEGF−2)
;血管内皮増殖因子B(VEGF−3);国際公開番号WO96/26736号
に開示されるような血管内皮増殖因子B−186(VEGF−B186);国際
公開番号WO98/02543号に開示されるような血管内皮増殖因子D(VE
GF−D);国際公開番号WO98/07832号に開示されるような血管内皮
増殖因子D(VEGF−D);およびドイツ国特許番号DE19639601に
開示されるような血管内皮増殖因子E(VEGF−E)が挙げられるが、これら
に限定されない。上記の参考文献は、本明細書で参考として援用される。
【0898】 さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、線維芽細胞増殖因子と組み合
わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る線維芽細胞増殖因子と
しては、FGF−1、FGF−2、FGF−3、FGF−4、FGF−5、FG
F−6、FGF−7、FGF−8、FGF−9、FGF−10、FGF−11、
FGF−12、FGF−13、FGF−14、およびFGF−15が挙げられる
が、これらに限定されない。
【0899】 さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、造血系成長因子と組み合わせ
て投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る造血系成長因子としては、
顆粒球マクロファ−ジコロニ−刺激因子(GM−CSF)(サルグラモスチム(
sargramostim)、LEUKINETM、PROKINETM)、顆
粒球コロニ−刺激因子(G−CSF)(フィルグラスチム、NEUPOGEN )、マクロファ−ジコロニ−刺激因子(M−CSF、CSF−1)、エリスロ
ポエチン(エポエチンα、EPOGENTM、PROCRITTM)、幹細胞因
子(SCF、c−kitリガンド、鉄剤(steel factor))、巨核
球コロニ−刺激因子、PIXY321(GMCSF/IL−3融合タンパク質)
、インタ−ロイキン、特にIL−1からIL−12までのいずれか1つ以上、イ
ンタ−フェロンγまたはトロンボポエチンが挙げられるが、これらに限定されな
い。
【0900】 特定の実施形態において、本発明の治療剤は、アドレナリン遮断薬(例えば、
アセブトロ−ル、アテノロ−ル、ベタキソロール、ビソプロ−ル(bisopr
olol)、カルテロ−ル(carteolol)、ラベタロ−ル、メトプロロ
ール、ナドロ−ル、オクスプレノロール、ペンブトロ−ル(penbutolo
l)、ピンドロ−ル、プロプラノロ−ル、ソタロール、およびチモロ−ル)と組
み合わせて投与される。
【0901】 別の実施形態において、本発明の治療剤は、抗不整脈薬(例えば、アデノシン
、アミドアロン、ブレチリウム、ジキタリス、ジゴキシン、ジギトキシン、ジリ
アゼム(diliazem)、ジソピラミド、エスモロール、フレカイニド、リ
ドカイン、メキシレチン、モリシジン(moricizine)、フェニトイン
、ナロカインアミド、N−アセチルプロカインアミド、プロパフェノン、プロプ
ラノロ−ル、キニジン、ソタロ−ル、トカイニド、およびベラパミル)と組み合
わせて投与される。
【0902】 別の実施形態において、本発明の治療剤は、利尿薬(例えば、炭酸脱水酵素阻
害薬(例えば、アセタゾラミド、ジクロルフェナミド、およびメタゾルアミド)
、浸透圧性利尿薬(例えば、グリセリン、イソソルビド、マンニト−ル、および
尿素)、Na−K−2Cl共輸送阻害利尿薬(例えば、フロセミド、ブメ
タニド、アゾセミド(azosemide)、ピレタニド、トリパミド、エタク
リン酸、ムゾリミン(muzolimine)、およびトルセミド(torse
mide))、チアジドおよびチアジド様利尿薬(例えば、ベンドロフルメサイ
アザイド、ベンズサイアザイド、クロロチアジド、ヒドロクロロチアジド、ヒド
ロフルメチアジド、メチルクロチアジド、ポリチアジド、トリクロメチアジド(
trichormethiazide)、クロルタリドン、インダパミド、メト
ラゾン、およびキネサゾン)、カリウム保持性利尿薬(例えば、アミロライドお
よびトリアムテレン)、および鉱質コルチコイドレセプタ−アンタゴニスト(例
えば、スピロノラクトン、カンレノン(canrenone)、およびカンレノ
エ−トカリウム(potassium canrenoate))と組み合わせ
て投与される。
【0903】 1つの実施形態において、本発明の治療剤は、内分泌物および/またはホルモ
ンの不均衡障害のための処置剤と組み合わせて投与される。内分泌物および/ま
たはホルモンの不均衡障害のための処置剤としては、以下が挙げられるが、これ
らに限定されない:127I、ヨウ素の放射性同位元素(例えば、131Iおよ
123I);組換え成長ホルモン(例えば、HUMATROPETM(組換え
ソマトロピン);成長因子アナログ(例えば、PROTROPINTM(ソマト
レム);ド−パミンアゴニスト(例えば、PARLODELTM(ブロモクリプ
チン);ソマトスタチンアナログ(例えば、SANDOSTATINTM(オク
トレオチド);ゴナドトロピン調製物(例えば、PREGNYLTM、A.P.
L.TM およびPROFASITM(絨毛性ゴナドトロピン(CG))、PE
RGONALTM(メノトロピン)、およびMETRODINTM(尿性卵胞性
刺激ホルモン(uFSH));合成ヒトゴナドトロピン放出ホルモン調製物(例
えば、FACTRELTMおよびLUTREPULSETM(塩酸ゴナドレリン
);合成ゴナドトロピンアゴニスト(例えば、LUPRONTM(酢酸ロイプロ
リド)、SUPPRELINTM(酢酸ヒストレリン(histrelin a
cetate))、SYNARELTM(酢酸ナファレリン(nafareli
n acetate))、およびZOLADEXTM(酢酸ゴセレリン(gos
erelin acetate));甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン合成調製
物(例えば、RELEFACT TRHTMおよびTHYPINONETM(プ
ロチレリン);組換えヒトTSH(例えば、THYROGENTM);甲状腺ホ
ルモンの天然異性体のナトリウム塩の合成調製物(例えば、L−T TM、SY
NTHROIDTMおよびLEVOTHROIDTM(レボチロキシンナトリウ
ム(levothyroxine sodium))、L−T TM、CYTO
MELTMおよびTRIOSTATTM(リオチロインナトリウム(lioth
yroine sodium))、およびTHYROLARTM(リオトリック
ス);抗甲状腺組成物(例えば、6−n−プロピルチオウラシル(プロピルチオ
ウラシル)、1−メチル−2−メルカプトイミダゾ−ルおよびTAPAZOLETM (メチマゾ−ル)、NEO−MERCAZOLETM(カルビマゾ−ル);
βアドレナリン作用性レセプタ−アンタゴニスト(例えば、プロプラノロ−ルお
よびエスモロ−ル;Ca2+チャネル阻害剤;デキサメタゾンおよびヨウ素の放
射線医学的造影剤(例えば、TELEPAQUETM(ヨ−パン酸)およびOR
AGRAFINTM(イポダ−トナトリウム)。
【0904】 さらなる内分泌物および/またはホルモンの不均衡障害のための処置剤として
は、以下が挙げられるが、これらに限定されない:ESTRACETM(エスト
ラジオ−ル)、ESTINYLTM(エチニルエストラジオ−ル)、PREMA
RINTM、ESTRATABTM、ORTHO−ESTTM、OGENTM
よびエストロピペイト(estropipate)(エストロン)、ESTRO
VISTM(キネストロ−ル)、ESTRADERMTM(エストラジオ−ル)
、DELESTROGENTMおよびVALERGENTM(吉草酸エストラジ
オ−ル)、DEPO−ESTRADIOL CYPIONATETMおよびES
TROJECT LATM(エストラジオ−ルシピオネ−ト);抗エストロゲン
(例えば、NOLVADEXTM(タモキシフェン)、SEROPHENETM およびCLOMIDTM(クロミフェン);プロゲスチン(例えば、DURAL
UTINTM(カプロン酸ヒドロキシプロゲステロン)(hydroxypro
gesterone caproate))、MPATMおよびDEPO−PR
OVERATM(酢酸メドロキシプロゲステロン)、PROVERATMおよび
CYCRINTM(MPA)、MEGACETM(酢酸メゲストロ−ル)、NO
RLUTINTM(ノルエチンドロン),ならびにNORLUTATETMおよ
びAYGESTINTM(酢酸ノルエチンドロン);プロゲステロンインプラン
ト(例えば、NORPLANT SYSTEMTM(ノルゲストレルの皮下移植
);抗黄体ホルモン(例えば、RU 486TM(ミフェプリストン);ホルモ
ン避妊薬(例えば、ENOVIDTM(ノルエチノドレル+メストラノ−ル)、
PROGESTASERTTM(プロゲステロンを放出する子宮内器具)、LO
ESTRINTM、BREVICONTM、MODICONTM、GENORATM 、NELONATM、NORINYLTM、OVACON−35TMおよび
OVACON−50TM(エチニルエストラジオ−ル/ノルエチンドロン)、L
EVLENTM、NORDETTETM、TRI−LEVLENTMおよびTR
IPHASIL−21TM(エチニルエストラジオ−ル/レボノルゲストレル(
levonorgestrel)) LO/OVRALTMおよびOVRAL (エチニルエストラジオ−ル/ノルゲストレル)、DEMULENTM(エチ
ニルエストラジオ−ル/二酢酸エチノジオ−ル)、NORINYLTM、ORT
HO−NOVUMTM、NORETHINTM、GENORATM、およびNE
LOVATM(ノルエチンドロン/メストラノ−ル)、DESOGENTMおよ
びORTHO−CEPTTM(エチニルエストラジオ−ル/デソゲステレル(d
esogestrel))、ORTHO−CYCLENTMおよびORTHO−
TRICYCLENTM(エチニルエストラジオ−ル/ノルゲスチメ−ト(no
rgestimate))、MICRONORTMおよびNOR−QDTM(ノ
ルエチンドロン),およびOVRETTETM(ノルゲストレル)。
【0905】 さらなる内分泌物および/またはホルモンの不均衡障害のための処置剤として
は、以下が挙げられるが、これらに限定されない:テストステロンエステル(例
えば、酢酸メテノロン(methenolone acetate)およびテス
トステロンアンデカノエ−ト(undecanoate);非経口および経口ア
ンドロゲン(例えば、TESTOJECT−50TM(テストステロン)、TE
STEXTM(プロピオン酸テストステロン)、DELATESTRYLTM
エナンタ−トテストステロン)、DEPO−TESTOSTERONETM(シ
ピオネ−トテストステロン)、DANOCRINETM(ダナゾ−ル)、HAL
OTESTINTM(フルオキシメステロン)、ORETON METHYL 、TESTREDTMおよびVIRILONTM(メチルテストステロン)、
およびOXANDRINTM(オキサンドロロン);テストステロン経皮的シス
テム(例えば、TESTODERMTM;アンドロゲンレセプタ−アンタゴニス
トおよび5−α−レダクタ−ゼ阻害剤(例えば、ANDROCURTM(酢酸シ
プロテロン)、EULEXINTM(フルタミド)、およびPROSCARTM (フィナステリド(finasteride));副腎皮質刺激ホルモン調製物
(例えば、CORTROSYNTM(コシントロピン);副腎皮質ステロイドお
よびこれらの合成アナログ(例えば、ACLOVATETM(ジプロピオン酸ア
ルクロメタゾン)、CYCLOCORTTM(アムシノニド)、BECLOVE
NTTMおよびVANCERILTM(ジプロピオン酸ベクロメタゾン)、CE
LESTONETM(ベタメタゾン)、BENISONETMおよびUTICO
RTTM(安息香酸ベタメタゾン)、DIPROSONETM(ジプロピオン酸
ベタメタゾン)、CELESTONE PHOSPHATETM(ベタメタゾン
リン酸ナトリウム塩)、CELESTONE SOLUSPANTM(ベタメタ
ゾンリン酸ナトリウムおよび酢酸ベタメタゾン)、BETA−VALTMおよび
VALISONETM(吉草酸塩ベタメタゾン)、TEMOVATETM(プロ
ピオン酸クロベタゾ−ル)、CLODERMTM(クロコルトロンピバレ−ト)
、CORTEFTM およびHYDROCORTONETM(コルチソル(ヒド
ロコルチゾン))、HYDROCORTONE ACETATETM(酢酸コル
チソル(ヒドロコルチゾン))、LOCOIDTM(酪酸コルチソル(ヒドロコ
ルチゾン))、HYDROCORTONE PHOSPHATETM(コルチソ
ル(ヒドロコルチゾン)リン酸ナトリウム塩)、A−HYDROCORTTM
よびSOLU CORTEFTM(コルチソル(ヒドロコルチゾン)コハク酸ナ
トリウム塩)、WESTCORTTM(吉草酸コルチソル(ヒドロコルチゾン)
)、CORTISONE ACETATETM(酢酸コルチゾン)、DESOW
ENTMおよびTRIDESILONTM(デソニド)、TOPICORTTM (デスオキシメタゾン)、DECADRONTM(デキサメタゾン)、DECA
DRON LATM(酢酸デキサメタゾン)、DECADRON PHOSPH
ATETMおよびHEXADROL PHOSPHATETM(デキサメタゾン
リン酸ナトリウム塩)、FLORONETMおよびMAXIFLORTM(酢酸
ジフロラゾン)、FLORINEF ACETATETM(酢酸フルドロコルチ
ゾン)、AEROBIDTMおよびNASALIDETM(フルニソリド)、F
LUONIDTMおよびSYNALARTM(フルオシノロンアセトニド)、L
IDEXTM(フルオシノニド)、FLUOR−OPTMおよびFMLTM(フ
ルオロメトロン)、CORDRANTM(フルランドレノリド)、HALOG (ハルシノニド)、HMS LIZUIFILMTM(メドリゾン)、MED
ROLTM(メチルプレドニゾロン)、DEPO−MEDROLTMおよびME
DROL ACETATETM(酢酸メチルプレドニゾロン)、A−METHA
PREDTMおよびSOLUMEDROLTM(メチルプレドニゾロンコハク酸
ナトリウム塩)、ELOCONTM(モメタゾン(mometasone)フロ
エ−ト)、HALDRONETM(酢酸パラメタゾン)、DELTA−CORT
EFTM(プレドニゾロン)、ECONOPREDTM(酢酸プレドニゾロン)
、HYDELTRASOLTM(プレドニゾロンリン酸ナトリウム塩)、HYD
ELTRA−T.B.ATM(プレドニゾロンテブテ−ト)、DELTASON
TM(プレドニゾン)、ARISTOCORTTMおよびKENACORT (triamcinolone)、KENALOGTM(triamcino
lone acetonide)、ARISTOCORTTMおよびKENAC
ORT DIACETATETM(トリアムシノロンジアセテ−ト)、およびA
RISTOSPANTM(ヘキサアセトニド(hexacetonide)トリ
アムシノロン);副腎皮質ステロイドの生合成阻害剤および作用阻害剤(例えば
、CYTADRENTM(アミノグルテチミド)、NIZORALTM(ケトコ
ナゾ−ル)、MODRASTANETM(トリロスタン)、およびMETOPI
RONETM(メチラポン)。
【0906】 内分泌および/またはホルモン不均衡障害のためのさらなる処置剤としては、
以下が挙げられるが、これらに限定されない:ウシインスリン、ブタインスリン
またはヒトインスリン、あるいはこれらの混合物;インスリンアナログ;組換え
ヒトインスリン(例えば、HUMULINTMおよびNOVOLINTM;経口
低血糖症薬物(例えば、ORAMIDETMおよびORINASETM(トルブ
タミド)、DIABINESETM(クロルプロパミド)、TOLAMIDE およびTOLINASETM(トラザミド)、DYMELORTM(アセトヘ
キサミド)、グリベンクラミド(glibenclamide)、MICRON
ASETM、DIBETATMおよびGLYNASETM(グリブリド)、GL
UCOTROLTM(グリピジド)、ならびにDIAMICRONTM(グリク
ラジド)、GLUCOPHAGETM(メトホルミン)、PRECOSETM
アカルボース)、AMARYLTM(グリメピリド(glimepiride)
)およびシグリタゾン(ciglitazone);チアゾリジンジオン(th
iazolidinedione)(TZD)(例えば、ロシグリタゾン(ro
siglitazone)、AVANDIATM(マレイン酸ロシグリタゾン)
、ACTOSTM(ピオグリタゾン(piogliatazone))およびト
ログリタゾン(troglitazone);α−グルコシダ−ゼ阻害剤;ウシ
もしくはブタのグルカゴン;ソマトスタチン(例えば、SANDOSTATINTM (オクテオチド(octreotide));およびジアゾキシド(例えば
、PROGLYCEMTM(ジアゾキシド))。なお別の実施形態において、本
発明の治療剤は、以下の1つ以上と組み合わせて投与され得る:ビグアナイド抗
糖尿病剤、グリタゾン(glitazone)抗糖尿病剤およびスルホニル尿素
抗糖尿病剤。
【0907】 1つの実施形態において、本発明の治療剤は、子宮運動性障害のための処置剤
と組み合わせて投与される。子宮運動性障害のための処置剤としては、以下が挙
げられるが、これらに限定されない:エストロゲン薬物(例えば、結合体化エス
トロゲン(例えば、PREMARIN(登録商標)およびESTRATAB(登
録商標))、エストラジオ−ル(例えば、CLIMARA(登録商標)およびA
LORA(登録商標))、エストロピペイト(estropipate)、およ
びクロロトリアニセン;プロゲスチン薬物(例えば、AMEN(登録商標)(メ
ドロキシプロゲステロン)、MICRONOR(登録商標)(酢酸ノルエチドロ
ン(norethidrone))、PROMETRIUM(登録商標)プロゲ
ステロン、および酢酸メゲストロ−ル);およびエストロゲン/プロゲステロン
併用治療(例えば、結合体化エストロゲン/メドロキシプロゲステロン(例えば
、PREMPROTMおよびPREMPHASE(登録商標))および酢酸ノル
エチドロン/エチニルエストラジオ−ル(例えば、FEMHRTTM)。
【0908】 さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、鉄欠乏性貧血および低色性貧
血のための処置に有用な薬物とともに投与され、これらの薬物としては、以下が
挙げられるが、これらに限定されない:硫酸第一鉄(硫酸鉄、FEOSOLTM )、フマル酸第一鉄(例えば、FEOSTATTM)、グルコン酸第一鉄(例え
ば、FERGONTM)、多糖類−鉄複合体(例えば、NIFEREXTM)、
鉄デキストラン注入(例えば、INFEDTM)、硫酸銅、ピロキシジン(py
roxidine)、リボフラビン、ビタミンB12、シアノコバラミン(cy
ancobalamin)注入(例えば、REDISOLTM、RUBRAMI
N PCTM)、ヒドロキソコバラミン、葉酸(例えば、FOLVITETM
、ロイコボリン(フォリン酸、5−CHOH4PteGlu、シトロボラム因子
)またはWELLCOVORIN(ロイコボリンのカルシウム塩)、トランスフ
ェリンまたはフェリチン。
【0909】 特定の実施形態において、本発明の治療剤は、精神障害のための処置剤と組み
合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る精神障害のための処
置剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:抗精神病薬(例え
ば、クロルプロマジン、クロルプロチキセン、クロザピン、フルフェナジン、ハ
ロペリド−ル、ロクサピン、メソリダジンベシレ−ト、モリンドン、オランザピ
ン(olanzapine)、パ−フェナジン、ピモジド、クエチアピン(qu
etiapine)、リスペリドン(risperidone)、チオリダジン
、チオチキセン、トリフルオペラジン、およびトリフルプロマジン)、抗躁病薬
(例えば、カルバマゼピン、ジバルプロックスナトリウム、炭酸リチウム、およ
びクエン酸リチウム)、抗うつ薬(例えば、アミトリプチリン、アモキサピン、
ビュ−プロピオン、シタロプラム(citalopram)、クロミプラミン、
デシプラミン、ドキセピン、フルボキサミン(fluvoxamine)、フル
オキセチン、イミプラミン、イソカルボキサジド、マプロチリン、ミルタザピン
(mirtazapine)、ネフォゾドン(nefazodone)、ノルト
リプチリン、パロキセチン(paroxetine)、フェネルジン、プロトリ
プチリン、セルトラリン、トラニルシプロミン、トラゾドン、トリミプラミン、
および ベンラファキシン(venlafaxine))、抗不安薬(例えば、
アルプラゾラム、ブスピロン、クロルジアゼポキシド、クロラゼペ−ト、ジアゼ
パム、ハラゼパム、ロラゼパム、オキサゼパム、およびプラゼパム)、ならびに
興奮薬(例えば、d−アンフェタミン、メチルフェニデ−ト、およびペモリン)
【0910】 他の実施形態において、本発明の治療剤は、神経性疾患を処置するための薬剤
と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与され得る神経性疾患の
ための処置剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:鎮痙薬(
例えば、カルバマゼピン、クロナゼパム、エトスクシミド、フェノバルビタ−ル
、フェニトイン、プリミドン、バルプロ酸、ジバルプロックスナトリウム、フェ
ルバメ−ト、ガバペンチン(gabapentin)、ラモトリジン、レベチラ
セタム(levetiracetam)、オキシカルバゼピン(oxcarba
zepine)、チアガビン(tiagabine)、トピラメイト(topi
ramate)、ゾニサミド(zonisamide)、ジアゼパム、ロラゼパ
ム、およびクロナゼパム)、抗パ−キンソン症候群薬(例えば、レボドパ/カル
ビドパ、セレジリン、アマンチジン(amantidine)、ブロモクリプチ
ン、ペルゴリド(pergolide)、ロピニロ−ル(ropinirole
)、プラミペキソ−ル(pramipexole)、ベンズトロピン;ビペリデ
ン;エトプロパジン;プロシクリジン;トリヘキシフェニジル、トルカポン(t
olcapone))、およびALS治療剤(例えば、リルゾ−ル(riluz
ole))。
【0911】 別の実施形態において、本発明の治療剤は、血管弛緩薬および/またはカルシ
ウムチャネル阻害剤と組み合わせて投与される。本発明の治療剤とともに投与さ
れ得る血管弛緩薬としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:アン
ギオテンシン変換酵素(ACE)インヒビター(例えば、パパベリン、イソクス
プリン、ベナゼプリル(benazepril)、カプトプリル、シラザプリル
(cilazapril)、エナラプリル、エナラプリラ−ト、ホシノプリル(
fosinopril)、リジノプリル、モエキシプリル(moexipril
)、ペリインドプリル(perindopril)、キナプリル(quinap
ril)、ラミプリル(ramipril)、スピラプリル(spirapri
l)、トランドラプリル(trandolapril),およびナイリドリン)
、ならびに硝酸塩(例えば、イソソルビドジニトレ−ト、イソソルビドモノニト
レ−ト,およびニトログリセリン)。本発明の治療剤とともに投与され得るカル
シウムチャネル阻害剤の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されな
い:アムロジピン、ベプリジル(bepridil)、ジルチアゼム、フェロジ
ピン、フルナリジン、イスラジピン(isradipine)、ニカルジピン、
ニフェジピン、ニモジピン、およびベラパミル。
【0912】 特定の実施形態において、本発明の治療剤は、胃腸疾患のための処置と組み合
わせて投与され得る。本発明の治療剤と共に投与され得る胃腸障害のための処置
には、以下が挙げられるがこれらに限定されない:H2ヒスタミンアンタゴニス
ト(例えば、TAGAMETTM(シメチジン)、ZANTACTM(ラニチジ
ン)、PEPCIDTM(ファモチジン)およびAXIDTM(ニザチジン))
;H、KATPaseのインヒビター(例えば、PREVACIDTM(ラ
ンソプラゾール(lansoprazole))およびPRILOSECTM
オメプラゾール));ビスマス化合物(例えば、PEPTO−BISMOLTM (サリチル酸ビスマス(塩基性塩))およびDE−NOLTM(クエン酸ビスマ
ス(塩基性塩));種々の制酸剤;スクラルファート;プロスタグランジンアナ
ログ(例えば、CYTOTECTM(ミソプロストール));ムスカリン様コリ
ン作用性亜アンタゴニスト;緩下薬(例えば、界面活性剤緩下薬、興奮性緩下薬
、生理食塩水および浸透性緩下薬);下痢止め薬(例えば、LOMOTILTM (ジフェノキシラート)、MOTOFENTM(ジフェノキシン)およびIMO
DIUMTM(塩酸ロペラミド))、ソマトスタチンの合成アナログ(例えば、
SANDOSTATINTM(オクトレオチド))、制吐薬(例えば、ZOFR
ANTM(オンダンセトロン)、KYTRILTM(塩酸グラニセトロン)、ト
ロピセトロン(tropisetron)、ドラセトロン(dolasetro
n)、メトクロプラミド、クロルプロマジン、パーフェナジン、プロクロルペラ
ジン、プロメタジン、チエチルペラジン、トリフルプロマジン、ドンペリドン、
ハロペリドール、ドロペリドール、トリメトベンズアミド、デキサメタゾン、メ
チルプレドニゾロン、ドロナビノールおよびナビロン);D2アンタゴニスト(
例えば、メトクロプラミドおよびトリメトベンズアミドおよびクロルプロマジン
);胆汁酸塩;ケノデオキシコール酸;ウルソデオキシコール酸;ならびに膵臓
酵素(例えば、パンクレアチンおよびパンクレリパーゼ)。
【0913】 さらなる実施形態において、本発明の治療剤は、他の治療剤または予防(例え
ば、放射線療法)と組み合わせて投与される。
【0914】 (実施例11:ポリペプチドのレベル低下を処置する方法) 個体におけるポリペプチドの標準の発現レベルまたは正常発現レベルの低下に
より引き起こされる状態は、本発明のポリペプチドを好ましくは分泌形態および
/または可溶性形態で投与することにより処置し得ることが理解される。従って
、本発明はまた、このポリペプチドのレベルの増加が必要な個体の処置方法を提
供する。この方法は、このような個体に、このような個体でこのポリペプチドの
活性レベルを増加させる量のポリペプチドを含む治療的組成物を投与する工程を
包含する。
【0915】 例えば、ポリペプチドのレベルが低下した患者は、そのポリペプチドを、1日
用量0.1〜100μg/kgで6日間続けて服用する。好ましくは、このポリ
ペプチドは分泌形態である。投与および処方物に基づく投薬計画の正確な詳細は
、実施例10に提供されている。
【0916】 (実施例12:ポリペプチドのレベル上昇を処置する方法) アンチセンス技術を使用して本発明のポリペプチドの産生を阻害する。この技
術は、ガンのような様々な病因に起因する、好ましくは分泌形態のポリペプチド
のレベルを低下させる方法の1つの例である。
【0917】 例えば、ポリペプチドのレベルが異常に上昇したと診断された患者に、アンチ
センスポリヌクレオチドを、0.5、1.0、1.5、2.0および3.0mg
/kg/日で21日間、静脈内投与する。この処置に対して十分に寛容化された
場合は、7日間の休薬期間後に、この処置を繰り返す。本発明のアンチセンスポ
リヌクレオチドは、本明細書中に記載されているか(例えば、実施例10を参照
のこと)、または当該分野で公知の技術および処方物を使用して処方され得る。
【0918】 (実施例13:遺伝子治療を使用する処置方法−エキソビボ) 遺伝子治療の1つの方法は、ポリペプチドを発現し得る線維芽細胞を患者に移
植する。一般に、線維芽細胞は、皮膚生検により被験者から得られる。得られた
組織を組織培養培地中に配置し、小片に分割する。組織の小塊を組織培養フラス
コの湿潤表面に置き、約10片を各フラスコに置く。このフラスコを倒置し、し
っかりと閉めた後、室温で一晩放置する。室温で24時間後、フラスコを反転さ
せ、組織塊をフラスコの底に固定させたままにし、そして新鮮な培地(例えば、
10%FBS、ペニシリンおよびストレプトマイシンを含有するHamのF12
培地)を添加する。次に、フラスコを37℃で約1週間インキュベートする。
【0919】 この時点で、新鮮な培地を添加し、次いで数日ごとに取り換える。さらに二週
間培養した後に、単層の線維芽細胞が出現する。この単層をトリプシン処理し、
さらに大きなフラスコにスケールアップする。
【0920】 モロニーマウス肉腫ウイルスの長末端反復が隣接するpMV−7(Kirsc
hmeier,P.T.ら、DNA,7:219−25(1988))をEco
RIおよびHindIIIで消化した後、仔ウシ腸ホスファターゼで処理する。
線状ベクターをアガロースゲル上で分画し、そしてガラスビーズを使用して精製
する。
【0921】 本発明のポリペプチドをコードするcDNAを、プライマーを用い、そして必
要な場合、適切な制限部位および開始/終止コドンを有する、実施例1に記載の
それぞれ5’末端配列および3’末端配列に対応するPCRプライマーを使用し
て増幅し得る。好ましくは、この5’プライマーはEcoRI部位を含み、そし
てこの3’プライマーはHindIII部位を含む。等量の、モロニーマウス肉
腫ウイルスの線状骨格および増幅したEcoRIおよびHindIIIフラグメ
ントを、T4 DNAリガーゼの存在下で一緒に加える。得られた混合物を、こ
の2つのフラグメントを連結するのに適した条件下で維持する。次に、連結混合
物を使用し、細菌HB101を形質転換する。次に、それを、カナマイシンを含
む寒天上にプレーティングし、ベクターが正確に挿入された目的の遺伝子を有す
ることを確認する。
【0922】 両種指向性(アンホトロピックな)pA317またはGP+am12パッケー
ジング細胞を、10%仔ウシ血清(CS)、ペニシリンおよびストレプトマイシ
ンを含むダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中、組織培養でコンフルエン
トな密度まで増殖させる。次に、その遺伝子を含むMSVベクターを培地に加え
、そしてパッケージング細胞をこのベクターで形質導入する。このとき、このパ
ッケージング細胞は、その遺伝子を含む感染性ウイルス粒子を産生する(ここで
、このパッケージング細胞をプロデューサー細胞という)。
【0923】 形質導入されたプロデューサー細胞に新鮮な培地を添加し、次いでこの培地を
10cmプレートのコンフルエントなプロデューサー細胞から採取する。感染性
ウイルス粒子を含む使用済み培地を、ミリポアフィルターを通して濾過し、はが
れたプロデューサー細胞を除去した後、この培地を使用して、線維芽細胞を感染
させる。線維芽細胞のサブコンフルエントなプレートから培地を除去し、そして
プロデューサー細胞からの培地で速やかに置き換える。この培地を除去し、そし
て新鮮な培地と置き換える。ウイルスの力価が高ければ、実質的にすべての線維
芽細胞が感染され、選択は必要ではない。力価が非常に低ければ、neoまたは
hisのような選択マーカーを有するレトロウイルスベクターを使用することが
必要である。一旦、線維芽細胞が効率的に感染したなら、その線維芽細胞を分析
し、タンパク質が産生されているか否かを決定する。
【0924】 次に、操作された線維芽細胞を、単独で、またはサイトデックス3マイクロキ
ャリアビーズ上でコンフルエントに増殖させた後のいずれかで、宿主に移植する
【0925】 (実施例14:内因性遺伝子を使用する遺伝子治療) 本発明に従う遺伝子治療の別の方法は、本発明のポリヌクレオチドに対応する
内因性遺伝子配列を、例えば、米国特許番号5,641,670(1997年6
月24日発行);国際公開番号WO 96/29411(1996年9月26日
公開);国際公開番号WO 94/12650(1994年8月4日公開);K
ollerら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA,86:893
2〜8935(1989);およびZijlstraら、Nature,342
:435〜438(1989)に記載されるように、相同組換えを介してプロモ
ーターに作動可能に結合する工程を包含する。この方法は、その標的細胞中に存
在するが、その細胞中では発現されないかまたは所望されるよりも低いレベルで
発現される、遺伝子の活性化を包含する。
【0926】 プロモーターおよび標的化配列を含むポリヌクレオチド構築物を作製する。こ
の標的化配列は、プロモーターに隣接する、内因性遺伝子の5’非コード配列に
相同である。この標的化配列は、この遺伝子の5’末端に十分に近く、その結果
、このプロモーターは、相同組換えの際にこの内因性配列に作動可能に連結され
る。このプロモーターおよび標的化配列を、PCRを使用して増幅し得る。好ま
しくは、この増幅したプロモーターは、5’末端および3’末端上に異なる制限
酵素部位を含む。好ましくは、第1の標的化配列の3’末端は、増幅したプロモ
ーターの5’末端と同じ制限酵素部位を含み、そして第2の標的化配列の5’末
端は、増幅したプロモーターの3’末端と同じ制限部位を含む。
【0927】 この増幅したプロモーターおよび増幅した標的化配列を、適切な制限酵素で消
化し、続いて仔ウシ腸ホスファターゼで処理する。消化したプロモーターおよび
消化した標的化配列を、T4 DNAリガーゼの存在下でともに加える。得られ
た生じた混合物を、これら2つのフラグメントの連結に適切な条件下で維持する
。この構築物をアガロースゲルでサイズ分画し、次いでフェノール抽出およびエ
タノール沈殿により精製する。
【0928】 この実施例において、このポリヌクレオチド構築物を、エレクトロポレーショ
ンを介して裸のポリヌクレオチドとして投与する。しかし、このポリヌクレオチ
ド構築物はまた、トランスフェクション促進剤(例えば、リポソーム、ウイルス
配列、ウイルス粒子、沈殿剤など)とともに投与され得る。送達のこのような方
法は、当該分野で公知である。
【0929】 一旦、細胞をトランスフェクトすると、相同組換えが生じて、このプロモータ
ーがこの内因性遺伝子配列に作動可能に連結される。これは、この細胞中におけ
る本発明のポリペプチドの発現を生じる。発現は、免疫学的染色または当該分野
で公知の他の任意の方法により、検出され得る。
【0930】 線維芽細胞を、皮膚生検により被験体から得る。得られた組織を、DMEM+
10%ウシ胎仔血清中に配置する。対数増殖期または定常期初期の線維芽細胞を
、トリプシン処理し、そしてプラスチックの表面から栄養培地でリンスする。細
胞懸濁液のアリコートを、計数のために取り出し、そして残りの細胞を遠心分離
に供する。上清を吸引し、そしてペレットを5mlのエレクトロポレーション緩
衝液(20mM HEPES pH7.3、137mM NaCl、5mM K
Cl、0.7mM NaHPO、6mMデキストロース)に再懸濁する。こ
の細胞を再遠心分離し、上清を吸引し、そして細胞を1mg/mlのアセチル化
ウシ血清アルブミンを含むエレクトロポレーション緩衝液に再懸濁する。この最
終細胞懸濁物は、約3×10細胞/mlを含む。エレクトロポレーションを、
再懸濁直後に実施すべきである。
【0931】 プラスミドDNAを、標準的技術に従って調製する。例えば、本発明のポリヌ
クレオチドの遺伝子座に標的化するためのプラスミドを構築するために、プラス
ミドpUC18(MBI Fermentas、Amherst、NY)をHi
ndIIIで消化する。CMVプロモーターを、5’末端にXbaI部位および
3’末端にBamHI部位を備えてPCRにより増幅する。2つの配列番号Xの
非コード遺伝子配列をPCRを介して増幅する:一方の非コード配列(フラグメ
ント1)を、5’末端にHindIII部位および3’末端にXbaI部位を備
えて増幅する;他方の非コード配列(フラグメント2)を、5’末端にBamH
I部位および3’末端にHindIII部位を備えて増幅する。このCMVプロ
モーターおよび配列フラグメントを、適切な酵素(CMVプロモーター−Xba
IおよびBamHI;フラグメント1−XbaI;フラグメント2−BamHI
)で消化し、そしてともに連結する。得られた連結生成物をHindIIIで消
化し、そしてHindIIIで消化したpUC18プラスミドと連結する。
【0932】 プラスミドDNAを、0.4cmの電極ギャップを備える滅菌キュベット(B
io−Rad)に添加する。最終DNA濃度は、一般的に、少なくとも120μ
g/mlである。次いで、この細胞懸濁液の0.5ml(約1.5×10細胞
を含む)をこのキュベットに添加し、そしてこの細胞懸濁液およびDNA溶液を
、穏やかに混合する。エレクトロポレーションを、Gene−Pulser装置
(Bio−Rad)を用いて実施する。キャパシタンスおよび電圧を、それぞれ
、960μFおよび250〜300Vに設定する。電圧が増加すると、細胞の生
存が減少するが、導入されたDNAをそのゲノム中に安定に組込む生存細胞の割
合が劇的に増加する。これらのパラメーターを考慮すると、パルス時間約14〜
20mSecが観察されるはずである。
【0933】 エレクトロポレーションした細胞を、室温で約5分間維持し、次いで、このキ
ュベットの中身を、滅菌した移動ピペットを用いて穏やかに取り出す。この細胞
を、10cmのディッシュ中の、予め温めた栄養培地(15%仔ウシ血清を含む
DMEM)10mlに直接加え、そして37℃でインキュベートする。翌日、こ
の培地を吸引し、そして10mlの新鮮な培地と交換し、そしてさらに16〜2
4時間インキュベートする。
【0934】 次いで、操作された線維芽細胞を、宿主中に、単独か、またはサイトデックス
(cytodex)3マイクロキャリア(microcarrier)ビーズ上
でコンフルエントになるまで増殖させた後かのいずれかで、注入する。ここで、
この線維芽細胞は、タンパク質産物を生成する。次いで、この線維芽細胞を、上
記のような患者に導入し得る。
【0935】 (実施例15:遺伝子治療を使用する処置方法−インビボ) 本発明の別の局面は、障害、疾患、および状態を処置するためにインビボ遺伝
子治療方法を使用することである。この遺伝子治療法は、本発明のポリペプチド
の発現を増大または減少させるための、動物への本発明のポリヌクレオチドに対
応する裸の核酸(DNA、RNA、およびアンチセンスDNAまたはRNA)配
列の導入に関する。このポリヌクレオチドは、プロモーター、または標的組織に
よる本発明のポリペプチドの発現に必要な任意の他の遺伝子エレメントに、作動
可能に連結され得る。このような遺伝子治療および送達の技術および方法は、当
該分野で公知であり、例えば、WO90/11092、WO98/11779;
米国特許第5693622号、同第5705151号、同第5580859号;
Tabataら、Cardiovasc.Res.35(3):470−479
(1997);Chao Jら、Pharmacol.Res.35(6):5
17−522(1997);Wolff、Neuromuscul.Disor
d.7(5):314−318(1997)、Schwartzら、Gene
Ther.,3(5):405−411(1996);Tsurumi Y.ら
、Circulation 94(12):3281−3290(1996)(
本明細書中に参考として援用される)を参照のこと。
【0936】 このポリヌクレオチド構築物は、注入可能な物質を動物の細胞に送達する任意
の方法(例えば、組織(心臓、筋肉、皮膚、肺、肝臓、腸など)の間隙空間への
注入)によって送達され得る。このポリヌクレオチド構築物は、薬学的に受容可
能な液体または水性キャリア中で送達され得る。
【0937】 用語「裸の」ポリヌクレオチド、DNAまたはRNAは、細胞への侵入を補助
、促進、または容易にするように作用するいかなる送達ビヒクル(ウイルス配列
、ウイルス粒子、リポソーム処方物、リポフェクチン、または沈澱剤などを含む
)も含まない配列をいう。しかし、本発明のポリヌクレオチドはまた、当業者に
周知の方法によって調製され得るリポソーム処方物(例えば、Felgnerら
Ann.NY Acad.Sci.,772:126−139(1995)お
よびAbdallahら Biol.Cell 85(1):1−7(1995
)で教示されたもの)中で送達され得る。
【0938】 この遺伝子治療方法において使用されるポリヌクレオチドベクター構築物は、
好ましくは、宿主ゲノムに組み込まれず、複製を可能にする配列も含まない構築
物である。当業者に公知の任意の強力なプロモーターが、DNAの発現を駆動す
るために用いられ得る。他の遺伝子治療技術とは異なり、裸の核酸配列を標的細
胞に導入する1つの主要な利点は、その細胞におけるポリヌクレオチド合成の一
過性の性質である。研究によって、非複製DNA配列が細胞に導入されて、6ヶ
月までの間の期間、所望のポリペプチドの産生を提供し得ることが示された。
【0939】 ポリヌクレオチド構築物を、動物内の組織(筋肉、皮膚、脳、肺、肝臓、脾臓
、骨髄、胸腺、心臓、リンパ、血液、骨、軟骨、膵臓、腎臓、胆嚢、胃、腸、精
巣、卵巣、子宮、直腸、神経系、眼、腺、および結合組織を含む)の間隙空間に
送達され得る。組織の間隙空間は、細胞間液、器官組織の細網線維間のムコ多糖
マトリクス、血管または室の壁における弾性線維、線維性組織のコラーゲン線維
、あるいは筋肉細胞を囲む結合組織内の同じマトリクス(that same
matrix)または骨の裂孔中の結合組織内の同じマトリクス(that s
ame matrix)を含む。これは、同様に、循環の血漿およびリンパチャ
ンネルのリンパ液により占められた空間である。筋肉組織の間隙空間への送達は
、以下に記載の理由のために好ましい。このポリヌクレオチド構築物を、これら
の細胞を含む組織への注射によって、好都合に送達し得る。このポリヌクレオチ
ド構築物は、好ましくは、持続性の分化した非分裂細胞に送達され、その細胞に
おいて発現されるが、送達および発現は、非分化細胞または完全には分化してい
ない細胞(例えば、血液の幹細胞または皮膚線維芽細胞)において達成され得る
。インビボ筋肉細胞は、ポリヌクレオチドを取り込み、そしてこのポリヌクレオ
チドを発現する能力において、特に適格である。
【0940】 裸のポリヌクレオチド注射のために、DNAまたはRNAの有効投薬量は、約
0.05g/kg体重〜約50mg/kg体重の範囲にある。好ましくは、投薬
量は、約0.005mg/kg〜約20mg/kgであり、そしてより好ましく
は、約0.05mg/kg〜約5mg/kgである。もちろん、当業者が認識す
るように、この投薬量は、注射の組織部位に従って変動する。核酸配列の適切か
つ有効な投薬量は、当業者によって容易に決定され得、そして処置される状態お
よび投与経路に依存し得る。好ましい投与経路は、組織の間隙空間への非経口注
射経路によってである。しかし、他の非経口経路もまた用いられ得、これには、
例えば、特に肺または気管支組織、咽喉または鼻の粘膜への送達のためのエアロ
ゾル処方物の吸入が挙げられる。さらに、裸のポリヌクレオチド構築物を、血管
形成術の間にこの手順において用いられるカテーテルによって動脈に送達し得る
【0941】 インビボでの筋肉における注射された本発明のポリヌクレオチドの用量応答効
果を、以下のようにして決定する。本発明のポリペプチドをコードするmRNA
の生成のために適切な鋳型DNAを、標準的な組換えDNA方法論に従って調製
する。鋳型DNA(これは環状または直鎖状のいずれかであり得る)は裸のDN
Aとして、またはリポソームと複合体化されるかのいずれかで使用される。次い
で、マウスの四頭筋に、種々の量のこの鋳型DNAを注射する。
【0942】 5〜6週齢の雌性および雄性のBalb/Cマウスに、0.3mlの2.5%
Avertinを腹腔内注射することにより麻酔する。1.5cmの切開を大腿
前部で行い、そして四頭筋を直接可視化する。鋳型DNAを、0.1mlのキャ
リアに入れて、1cc注射器で27ゲージ針を通して1分間にわたって、この筋
肉の遠位挿入部位から約0.5cmの位置で膝に、約0.2cmの深さで注射す
る。縫合を、将来の位置確認のために注射部位の上で行い、そして皮膚をステン
レス鋼クリップで閉じる。
【0943】 適切なインキュベーション時間(例えば、7日)後、筋肉抽出物を、四頭全体
を切り出すことによって調製する。個々の四頭筋の5枚目毎の15μm切片を、
本発明のタンパク質発現について組織化学的に染色する。タンパク質発現につい
ての時間経過は、異なるマウスから四頭筋を異なる時間に採取すること以外は、
同様な様式で行い得る。注射後の筋肉中の本発明のDNAの持続性を、注射した
マウスおよびコントロールマウスから総細胞性DNAおよびHIRT上清を調製
した後、サザンブロット分析によって決定し得る。マウスにおける上記実験の結
果は、本発明の裸のDNAを用いて、ヒトおよび他の動物において適切な投薬量
および他の処置パラメーターを推定するために使用し得る。
【0944】 (実施例16:抗体の産生) a)ハイブリドーマ技術 本発明の抗体を、種々の方法によって調製し得る。(Current Pro
tocols、第2章を参照のこと)。このような方法の1つの例として、本発
明のポリペプチドを発現する細胞を、ポリクローナル抗体を含む血清の産生を誘
導するために、動物に投与する。好ましい方法において、本発明のポリペプチド
の調製物を調製し、そしてその調製物が、天然の夾雑物を実質的に含まないよう
にするために精製する。次いで、このような調製物を、より大きな比活性のポリ
クローナル抗血清を産生するために、動物に導入する。
【0945】 本発明のポリペプチドに特異的なモノクローナル抗体を、ハイブリドーマ技術
を使用して調製する(Kohlerら、Nature 256:495(197
5);Kohlerら、Eur.J.Immunol.6:511(1976)
;Kohlerら、Eur.J.Immunol.6:292(1976);H
ammerlingら:Monoclonal Antibodies and
T−Cell Hybridomas、Elsevier、N.Y.、563
〜681頁(1981))。一般的に、動物(好ましくは、マウス)を、本発明
のポリペプチドまたはより好ましくは本発明の分泌ポリペプチド発現細胞で、免
疫する。このようなポリペプチド発現細胞を、適切な任意の組織培養培地(好ま
しくは、10%ウシ胎仔血清(約56℃にて不活化)を補充し、そして約10g
/lの非必須アミノ酸、約1,000U/mlのペニシリン、および約100μ
g/mlのストレプトマイシンを補充した、イーグル(Earle’s)改変イ
ーグル(Eagle’s)培地)にて培養する。
【0946】 このようなマウスの脾細胞を抽出し、そして適切な骨髄腫細胞株と融合させる
。適切な任意の骨髄腫細胞株を、本発明に従って使用し得るが、しかし、親骨髄
腫細胞株(SP2O)(ATCCから入手可能)を使用することが好ましい。融
合後、生じたハイブリドーマ細胞を、HAT培地にて選択的に維持し、ついで、
Wandsら(Gastroenterology 80:225〜232(1
981))により記載されるように、限界希釈によってクローン化する。ついで
、このような選択を介して得たハイブリドーマ細胞をアッセイして、本発明のポ
リペプチドを結合し得る抗体を分泌するクローンを同定する。
【0947】 あるいは、本発明のポリペプチドに結合し得るさらなる抗体を、抗イディオタ
イプ抗体を使用して2段階工程の手順において生成し得る。このような方法は、
抗体それ自体が抗原であり、それゆえ第二の抗体に結合する抗体を得ることが可
能であるという事実を利用する。この方法に従って、タンパク質特異的抗体を使
用して、動物(好ましくは、マウス)を免疫する。次いで、このような動物の脾
細胞を使用して、ハイブリドーマ細胞を産生する。そして、このハイブリドーマ
細胞は、タンパク質特異的抗体に結合する能力が本発明のポリペプチドによって
ブロックされ得る抗体を産生するクローンを同定するためにスクリーニングされ
る。このような抗体は、タンパク質特異的抗体に対する抗イディオタイプ抗体を
含み、そして動物を免疫してさらなるタンパク質特異的抗体の形成を誘導するた
めに使用される。
【0948】 ヒトにおける抗体のインビボ使用のために、抗体は、「ヒト化」される。この
ような抗体は、上記のモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞に由来
する遺伝的構築物を使用することによって産生され得る。キメラ抗体およびヒト
化抗体を産生するための方法は当該分野で公知であり、そして本明細書に議論さ
れる(総説については、Morrison,Science 229:1202
(1985);Oiら、BioTechniques 4:214(1986)
;Cabillyら、米国特許第4,816,567号;Taniguchiら
、EP 171496;Morrisonら、EP 173494;Neube
rgerら、WO 8601533;Robinsonら、WO 870267
1;Boulianneら、Nature 312:643(1984);Ne
ubergerら、Nature 314:268(1985)を参照のこと)
【0949】 (b)scFvのライブラリーからの本発明のポリペプチドに対して指向され
る抗体フラグメントの単離) ヒトPBLから単離した天然に存在するV遺伝子を、本発明のポリペプチド(
ドナーは、これらに対して曝露されていても曝露されていなくともよい)に対す
る反応性を含む抗体フラグメントのライブラリーに構築する(例えば、米国特許
第5,885,793号(その全体が参考として本明細書に援用される)を参照
のこと)。
【0950】 (ライブラリーのレスキュー(rescue)) PCT公開WO 92/01047に記載のように、ヒトPBLのRNAから
scFvのライブラリーを構築する。抗体フラグメントを提示するファージをレ
スキューするため、ファージミドを保有する約10個のE.coliを用いて
、50mlの2×TY(1%グルコースおよび100μg/mlのアンピシリン
を含有する)(2×TY−AMP−GLU)を接種し、そして振盪しながら0.
8のO.D.まで増殖させる。この培養物の5mlを用いて50mlの2×TY
−AMP−GLUに接種し、2×10TUのΔ遺伝子3ヘルパー(M13Δ遺
伝子III、PCT公開WO92/01047を参照のこと)を添加し、そして
培養物を振盪なしで37℃で45分間インキュベートし、次いで振盪しながら3
7℃で45分間インキュベートする。この培養物を10分間4000r.p.m
.で遠心分離し、そしてペレットを2リットルの2×TY(100μg/mlア
ンピシリンおよび50μg/mlカナマイシンを含有する)中に再懸濁し、そし
て一晩増殖させる。ファージをPCT公開WO92/01047に記載のように
調製する。
【0951】 M13Δ遺伝子IIIを以下のように調製する:M13Δ遺伝子IIIヘルパ
ーファージは、遺伝子IIIタンパク質をコードしない。それゆえ、抗体フラグ
メントを提示するファージ(ファージミド)は、抗原に対するより大きい結合ア
ビディティーを有する。ファージ形態形成の間、野生型遺伝子IIIタンパク質
を供給するpUC19誘導体を保有する細胞においてヘルパーファージを増殖さ
せることにより、感染性M13Δ遺伝子III粒子を作製する。培養物を振盪な
しで37℃で1時間インキュベートし、次いで振盪しながら37℃でさらに1時
間インキュベートする。細胞を遠心沈殿(IEC−Centra 8,400r
.p.m.で10分間)し、100μg/mlのアンピシリンおよび25μg/
mlのカナマイシンを含有する2×TYブロス(2×TY−AMP−KAN)3
00ml中で再懸濁し、そして37℃で振盪しながら一晩増殖させた。ファージ
粒子を、2回のPEG沈殿(Sambrookら、1990)により培養培地か
ら精製および濃縮し、2ml PBSに再懸濁し、そして0.45μmのフィル
ター(Minisart NML;Sartorius)を通過させ、約10 形質導入単位/ml(アンピシリン耐性クローン)の最終濃度を得る。
【0952】 (ライブラリーのパニング) Immunotube(Nunc)を、100μg/mlまたは10μg/m
lのいずれかの本発明のポリペプチドの4mlを用いてPBS中で一晩コーティ
ングする。チューブを2%Marvel−PBSを用いて37℃で2時間ブロッ
クし、次いでPBS中で3回洗浄する。約1013TUのファージをチューブに
適用し、そして、回転盤上で上下にタンブリングしながら室温で30分間インキ
ュベートし、次いでさらに1.5時間静置しておく。チューブをPBS 0.1
%Tween−20で10回、そしてPBSで10回洗浄する。1mlの100
mMトリエチルアミンを添加し、そして回転盤上で15分間上下に回転させるこ
とによりファージを溶出し、その後この溶液を0.5mlの1.0M Tris
−HCl,pH7.4で直ちに中和する。次いで、溶出したファージを細菌とと
もに37℃で30分間インキュベートすることにより、ファージを用いて、10
mlの対数増殖中期のE.coli TG1に感染させる。次いで、E.col
iを1%グルコースおよび100μg/mlアンピシリンを含有するTYEプレ
ート上にプレーティングする。次いで、得られる細菌ライブラリーを、上記のよ
うにΔ遺伝子3ヘルパーファージでレスキューし、次の回の選択のためのファー
ジを調製する。次いで、このプロセスを、全4回のアフィニティー精製について
反復し、3回目および4回目にはチューブ洗浄をPBS、0.1%Tween−
20で20回、そしてPBSで20回に増加する。
【0953】 (結合剤(バインダー)の特徴付け) 第3回目および4回目の選択から溶出したファージを用いて、E.coli
HB 2151を感染させ、そして可溶性scFvをアッセイのために単一コロ
ニーから生成する(Marksら、1991)。50mM炭酸水素塩、pH9.
6中の本発明のポリペプチドの10pg/mlのいずれかでコーティングしたマ
イクロタイタープレートを用いてELISAを実施する。ELISAにおける陽
性クローンをPCRフィンガープリンティング(例えば、PCT公開WO92/
01047を参照のこと)、次に配列決定することによりさらに特徴付ける。こ
れらのELISA陽性クローンはまた、当業者に公知の技術によってさらに特徴
付けされ得る(例えば、エピトープマッピング、結合アフィニティー、レセプタ
ーシグナル変換、抗体/抗原結合をブロックするか、または競合的に阻害する能
力、および競合的なアゴニスト活性またはアンタゴニスト活性)。
【0954】 本発明を、前述の説明および実施例に詳細に記載された以外の方法で実施し得
ることは、明らかである。本発明の多数の改変およびバリエーションが、上記の
教示を考慮して可能であり、従って、それは、添付の特許請求の範囲の範囲内に
ある。
【0955】 発明の背景、詳細な説明および実施例において引用された各文書の全開示(特
許、特許出願、学術文献、要約、実験マニュアル、書籍または他の開示を含む)
は、本明細書中に参考として援用される。さらに、本明細書にとともに提出され
た配列表のハードコピーおよび対応するコンピューター読み出し取り可能な形態
は、両方とも本明細書中にその全体が参考として援用される。
【0956】 本発明の特定のポリヌクレオチドおよびポリペプチド(抗体を含む)は、本明
細書においてその全体が参考として援用されている、2000年4月3日出願の
米国仮出願番号60/194,118号、および2000年9月29日出願の同
第60/236,384号に開示されている。さらに、米国仮出願番号第60/
194,118号、および同第60/236,384号の配列表のハードコピー
およびコンピュ−ター読み取り可能な形態はまた、本明細書中にその全体が参考
として援用されている。
【0957】
【表8】 (カナダ) 出願人は、出願に基づきカナダ国特許が発行されるか、あるいは同出願が拒絶
または放棄されて回復され得なくなるかもしくは取り下げられるまでは、特許庁
長官(Commissioner of Patents)が、長官により指名
された独立の専門家に対してのみ出願中で言及された寄託済みの生物学的材料の
サンプルの供与を許可する旨を請求し、出願人は、国際出願の公表のための規則
上の準備が完了する前に、書面によりその旨を国際事務局に告知しなければなら
ない。
【0958】 (ノルウェー) 出願人はここにおいて、出願が(ノルウェー特許庁により)公開に付されるか
あるいは公開を経ずにノルウェー特許庁による決定を受けるまでは、サンプルの
供与は当該技術の専門家に対してのみ行われる旨を、請求する。この旨の請求は
、ノルウェー特許法第22条および第33条(3)に基づき出願が公に利用可能
にされる時点以前に、出願人によりノルウェー特許庁に対してなされるものとす
る。そのような請求が出願人によりなされた場合は、第三者によるサンプルの供
与のいかなる請求においても、利用される専門家を表示するものとする。専門家
は、ノルウェー特許庁により作成された公認専門家のリスト(list of
recognized experts)に記載された任意の者か、あるいは、
個々の場合において出願人により承認された任意の者であり得る。
【0959】 (オーストラリア) 出願人はここにおいて、微生物のサンプルの供与は、特許の付与前において、
あるいは出願の放棄(lapsing)、拒絶あるいは取り下げ前において、発
明に対し利害関係を有さない当業者である対象者(skilled addre
ssee)に対してのみ行われる旨を、告知するものである(オーストラリア国
特許法第3.25(3)号規定)。
【0960】 (フィンランド) 出願人はここにおいて、出願が(特許および統制委員会(National
Board of Patents and Regulations)により
)公開に付されるかあるいは公開を経ずに国立特許および法規委員会による決定
を受けるまでは、サンプルの供与は当該技術の専門家に対してのみ行われる旨を
、請求する。
【0961】 (英国) 出願人はここにおいて、微生物のサンプルの供与は専門家に対してのみ利用可
能にされる旨を、請求する。この旨の請求は、出願の国際公表のための規則上の
準備が完了する前に、出願人により国際事務局に対してなされなければならない
。 ATCC受託番号PTA−621 (デンマーク) 出願人はここにおいて、出願が(デンマーク特許庁により)公開に付されるか
あるいは公開を経ずにデンマーク特許庁による決定を受けるまでは、サンプルの
供与は当該技術の専門家に対してのみ行われる旨を、請求する。この旨の請求は
、デンマーク特許法第22条および第33条(3)に基づき出願が公に利用可能
にされる時点以前に、出願人によりデンマーク特許庁に対してなされるものとす
る。そのような請求が出願人によりなされた場合は、第三者によるサンプルの供
与のいかなる請求においても、利用される専門家を表示するものとする。専門家
は、デンマーク特許庁により作成された公認専門家のリスト(list of
recognized experts)に記載された任意の者か、あるいは、
個々の場合において出願人により承認された任意の者であり得る。
【0962】 (スウェーデン) 出願人はここにおいて、出願が(スウェーデン特許庁により)公開に付される
かあるいは公開を経ずにスウェーデン特許庁による決定を受けるまでは、サンプ
ルの供与は当該技術の専門家に対してのみ行われる旨を、請求する。この旨の請
求は、優先日から16ヶ月が経過するよりも前に、出願人により国際事務局に対
してなされるものとする(好ましくはPCT Applicant’s Gui
deのVolume Iのannex Zに記載された書式PCT/RO/13
4による)。そのような請求が出願人によりなされた場合は、第三者によるサン
プルの供与のいかなる請求においても、利用される専門家を表示するものとする
。専門家は、スウェーデン特許庁により作成された公認専門家のリスト(lis
t of recognized experts)に記載された任意の者か、
あるいは、個々の場合において出願人により承認された任意の者であり得る。
【0963】 (オランダ) 出願人はここにおいて、オランダ特許の発行日まで、あるいは出願が拒絶、取
り下げあるいは放棄(lapsed)される日までは、特許法31F(1)の規
定に基づき、微生物は専門家へのサンプル供与の形でのみ行われる旨を、請求す
る。この旨の請求は、オランダ王国特許法の第22C条または第25条に基づき
出願が公に利用可能にされる日のうちいずれか早い方の日付よりも前に、出願人
によりオランダ工業所有権局に対して提出されるものとする。
【配列表】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61P 5/16 A61P 9/00 4C084 7/00 9/10 4H045 9/00 11/00 9/10 11/06 11/00 13/12 11/06 15/00 13/12 17/00 15/00 19/02 17/00 21/04 19/02 25/00 21/04 25/16 25/00 27/02 25/16 29/00 27/02 101 29/00 31/04 101 35/00 31/04 37/06 35/00 C07K 16/40 37/06 C12N 1/15 C07K 16/40 1/19 C12N 1/15 1/21 1/19 9/50 1/21 C12Q 1/37 5/10 1/68 A 9/50 G01N 33/15 Z C12Q 1/37 33/50 Z 1/68 C12N 15/00 ZNAA G01N 33/15 5/00 A 33/50 A61K 37/02 (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE,TR),OA(BF ,BJ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW, ML,MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,G M,KE,LS,MW,MZ,SD,SL,SZ,TZ ,UG,ZW),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ, MD,RU,TJ,TM),AE,AG,AL,AM, AT,AU,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,B Z,CA,CH,CN,CO,CR,CU,CZ,DE ,DK,DM,DZ,EE,ES,FI,GB,GD, GE,GH,GM,HR,HU,ID,IL,IN,I S,JP,KE,KG,KP,KR,KZ,LC,LK ,LR,LS,LT,LU,LV,MA,MD,MG, MK,MN,MW,MX,MZ,NO,NZ,PL,P T,RO,RU,SD,SE,SG,SI,SK,SL ,TJ,TM,TR,TT,TZ,UA,UG,US, UZ,VN,YU,ZA,ZW (72)発明者 ムーア, ポール エイ. アメリカ合衆国 メリーランド 20874, ジャーマンタウン, レザーバーク ド ライブ 19005 (72)発明者 ニ, ジアン アメリカ合衆国 メリーランド 20853, ロックビル, マナーフィールド ロー ド 5502 (72)発明者 ソペット, ダニエル アール. アメリカ合衆国 メリーランド 22020, センタービル, スティルフィールド プレイス 15050 (72)発明者 コールマン, ティモシー エイ. アメリカ合衆国 メリーランド 20850, ゲイザーズバーグ、 ボックスベリー テラス 7512 (72)発明者 ゲンツ, ライナー エル. アメリカ合衆国 メリーランド 20850, ロックビル, マウント プロスペクト ドライブ 13608 (72)発明者 エンドレス, グレゴリー エイ. アメリカ合衆国 マサチューセッツ 01062, フローレンス, ブリッジ ロ ード 408 (72)発明者 リ, イ アメリカ合衆国 カリフォルニア 94086, サニーベイル, レイクサイド ドライ ブ 1247, アパートメント 3034 (72)発明者 ディロン, パトリック ジェイ. アメリカ合衆国 カリフォルニア 92009, カールズバッド, スナイプ コート 1055 Fターム(参考) 2G045 AA34 AA35 BB10 BB14 BB20 BB46 BB51 DA13 DA36 FB02 FB05 FB06 FB08 4B024 AA01 AA11 BA14 CA04 CA09 CA11 DA02 DA05 DA11 EA02 EA03 EA04 FA02 GA01 GA11 HA01 HA12 4B050 CC01 CC03 DD11 FF14 LL01 LL03 4B063 QA01 QA18 QA19 QQ36 QQ42 QQ52 QR08 QR16 QR33 QR42 QR55 QR57 QR59 QR62 QR80 QR82 QS05 QS25 QS34 QS36 QX02 4B065 AA01X AA57X AA90X AA93Y AB01 BA01 CA25 CA33 CA44 CA46 4C084 AA01 DC50 NA14 ZA012 ZA152 ZA162 ZA182 ZA332 ZA342 ZA362 ZA452 ZA662 ZA672 ZA682 ZA752 ZA812 ZA892 ZA942 ZA962 ZB082 ZB112 ZB132 ZB152 ZB262 ZB352 ZC352 4H045 AA11 AA30 BA10 CA40 DA76 EA50 FA72 FA74

Claims (22)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 単離された核酸分子であって、以下: (a)配列番号Xに示されるポリヌクレオチド、またはATCC受託番号Zに
    含まれるcDNAによってコードされるポリヌクレオチド; (b)配列番号Yの生物学的に活性なポリペプチドフラグメント、またはAT
    CC受託番号Zに含まれるcDNA配列によってコードされる生物学的に活性な
    ポリペプチドフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド; (c)配列番号Yのポリペプチドエピトープ、またはATCC受託番号Zに含
    まれるcDNA配列によってコードされるポリペプチドエピトープをコードする
    、ポリヌクレオチド; (d)(a)〜(c)において特定されるポリヌクレオチドのいずれか1つに
    ストリンジェント条件下でハイブリダイズし得るポリヌクレオチドであって、こ
    こで、該ポリヌクレオチドは、A残基のみまたはT残基のみのヌクレオチド配列
    を有する核酸分子に、ストリンジェント条件下でハイブリダイズしない、ポリヌ
    クレオチド、 からなる群より選択されるポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子。
  2. 【請求項2】 前記ポリヌクレオチドが、可溶性ポリペプチドをコードする
    ヌクレオチド配列を含む、請求項1に記載の単離された核酸分子。
  3. 【請求項3】 前記ポリヌクレオチドが、配列番号Yとして同定される配列
    をコードするヌクレオチド配列、またはATCC受託番号Zに含まれるcDNA
    配列によってコードされるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、
    請求項1に記載の単離された核酸分子。
  4. 【請求項4】 前記ポリヌクレオチドが、配列番号Xの全体のヌクレオチド
    配列、またはATCC受託番号Zに含まれるcDNAを含む、請求項1に記載の
    単離された核酸分子。
  5. 【請求項5】 前記ポリヌクレオチドがDNAである、請求項2に記載の単
    離された核酸分子。
  6. 【請求項6】 前記ポリヌクレオチドがRNAである、請求項3に記載の単
    離された核酸分子。
  7. 【請求項7】 請求項1に記載の単離された核酸分子を含む、ベクター。
  8. 【請求項8】 請求項7に記載のベクターを含む、宿主細胞。
  9. 【請求項9】 遺伝子発現を制御する異種調節エレメントに作動可能に連結
    されている請求項1に記載の核酸分子を含む、組換え宿主細胞。
  10. 【請求項10】 請求項9に記載の宿主細胞からコードされたポリペプチド
    を発現する工程、および該ポリペプチドを回収する工程を包含する、ポリペプチ
    ドの産生方法。
  11. 【請求項11】 単離されたポリペプチドであって、以下: (a)配列番号Yに示されるポリペプチド、またはcDNAによってコードさ
    れるポリペプチド; (b)配列番号Yのポリペプチドフラグメント、またはcDNAによってコー
    ドされるポリペプチド; (c)配列番号Yのポリペプチドエピトープ、またはcDNAによってコード
    されるポリペプチド;および (d)配列番号Yの改変体、 からなる群より選択される配列に少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む、
    単離されたポリペプチド。
  12. 【請求項12】 配列番号Yを有するポリペプチドを含む、請求項11に記
    載の単離されたポリペプチド。
  13. 【請求項13】 請求項11に記載の単離されたポリペプチドに特異的に結
    合する、単離された抗体。
  14. 【請求項14】 請求項11に記載の単離されたポリペプチドを発現する、
    組換え宿主細胞。
  15. 【請求項15】 単離されたポリペプチドを作製する方法であって、以下: (a)該ポリペプチドが発現されるような条件下で、請求項14に記載の組換
    え宿主細胞を培養する工程;および (b)該ポリペプチドを回収する工程、 を包含する、方法。
  16. 【請求項16】 請求項15に記載の方法によって産生される、ポリペプチ
    ド。
  17. 【請求項17】 医学的状態を予防、処置、または緩和する方法であって、
    請求項1に記載のポリヌクレオチドの治療有効量を、哺乳動物被験体に投与する
    工程を包含する、方法。
  18. 【請求項18】 被験体における病理学的状態、または病理学的状態に対す
    る感受性を診断する方法であって、以下: (a)請求項1に記載のポリヌクレオチドにおける変異の存在または非存在を
    決定する工程;および (b)該変異の存在または非存在に基づいて病理学的状態、または病理学的状
    態に対する感受性を診断する工程、 を包含する、方法。
  19. 【請求項19】 被験体において病理学的状態、または病理学的状態に対す
    る感受性を診断する方法であって、以下: (a)生物学的サンプルにおける請求項11に記載のポリペプチドの発現の存
    在または量を決定する工程;および (b)該ポリペプチドの発現の存在または量に基づいて病理学的状態、または
    病理学的状態に対する感受性を診断する工程、 を包含する、方法。
  20. 【請求項20】 請求項11に記載のポリペプチドに対する結合パートナー
    を同定する方法であって、以下: (a)請求項11に記載のポリペプチドを結合パートナーと接触させる工程;
    および (b)該結合パートナーが該ポリペプチドの活性をもたらすか否かを決定する
    工程、 を包含する、方法。
  21. 【請求項21】 請求項11に記載のポリペプチドの活性を改変する分子を
    スクリーニングする方法であって、以下: (a)該ポリペプチドを、アゴニスト活性またはアンタゴニスト活性を有する
    と疑われる化合物と接触させる工程;および (b)該ポリペプチドの活性をアッセイする工程; を包含する、方法。
  22. 【請求項22】 医学的状態を予防、処置、または緩和する方法であって、
    請求項11に記載のポリペプチドの治療有効量を、哺乳動物被験体に投与する工
    程を包含する、方法。
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