JP2003516144A5 - - Google Patents
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Description
（図面の簡単な説明）
図１は、ＨＤＡＣ８と呼ばれるｃＤＮＡクローンの完全なヌクレオチド配列を示す。その配列(配列番号：１)により、ＨＤＡＣのＲＰＤ３クラス（Ｉ）との相同性を有するタンパク質（配列番号２）産物を推定する。翻訳開始因子および終結因子のコドンは、下線した。
図２は、ＨＤＡＣ１(配列番号：４)、ＨＤＡＣ２(配列番号：５)、ＨＤＡＣ３ (配列番号：６)およびＨＤＡＣ８(配列番号：７)との間のアミノ酸の類似性を示す。同一残基は暗灰色のボックスとし、保存性のある置換基は明るい灰色で示す。推定３７７アミノ酸ＨＤＡＣ８(約４２ｋＤa)産物は、ＨＤＡＣ１、２および３のＣ末端の〜１００アミノ酸に相同性のある領域を失っていることがわかる。
図１は、ＨＤＡＣ８と呼ばれるｃＤＮＡクローンの完全なヌクレオチド配列を示す。その配列(配列番号：１)により、ＨＤＡＣのＲＰＤ３クラス（Ｉ）との相同性を有するタンパク質（配列番号２）産物を推定する。翻訳開始因子および終結因子のコドンは、下線した。
図２は、ＨＤＡＣ１(配列番号：４)、ＨＤＡＣ２(配列番号：５)、ＨＤＡＣ３ (配列番号：６)およびＨＤＡＣ８(配列番号：７)との間のアミノ酸の類似性を示す。同一残基は暗灰色のボックスとし、保存性のある置換基は明るい灰色で示す。推定３７７アミノ酸ＨＤＡＣ８(約４２ｋＤa)産物は、ＨＤＡＣ１、２および３のＣ末端の〜１００アミノ酸に相同性のある領域を失っていることがわかる。
本発明で提供されるある実施態様では、ＨＤＡＣ８タンパク質は、本明細書で定義するように、１つまたはそれ以上の下記特性を有する：ヒストンのアセチル化；ＨＤＡＣ１（配列番号：４）、ＨＤＡＣ２（配列番号：５）、ＨＤＡＣ３（配列番号：６）およびＨＤＡＣ８（配列番号：７）との相同性。該相同性は、下記データベース、アルゴリズムおよびパラメーターを用いて見出される。本明細書中の「相同性」とは、配列の類似性および好ましくは同一性を意味する。
多くのサイクリン破壊ボックスが当分野において既知であり、例えば、サイクリンＡは配列ＲＴＶＬＧＶＩＧＤ（配列番号：８）を含む破壊ボックスを有する；サイクリンＢ１の破壊ボックスは配列ＲＴＡＬＧＤＩＧＮ（配列番号：９）を含む。Glotzer et al., Nature 349:132-138 (1991)参照。さらに他の破壊ボックスとして：
ＹＭＴＶＳＩＩＤＲＦＭＱＤＳＣＶＰＫＫＭＬＱＬＶＧＶＴ（配列番号：１０：ラットサイクリンＢ）；
ＫＦＲＬＬＱＥＴＭＹＭＴＶＳＩＩＤＲＦＭＱＮＳＣＶＰＫＫ（配列番号：１１：マウスサイクリンＢ）；
ＲＡＩＬＩＤＷＬＩＱＶＱＭＫＦＲＬＬＱＥＴＭＹＭＴＶＳ（配列番号：１２：マウスサイクリンＢ１）；
ＤＲＦＬＱＡＱＬＶＣＲＫＫＬＱＶＶＧＩＴＡＬＬＬＡＳＫ（配列番号：１３：マウスサイクリンＢ２）；および
ＭＳＶＬＲＧＫＬＱＬＶＧＴＡＡＭＬＬ（配列番号：１４：マウスサイクリンＡ２）
が知られている。
ＹＭＴＶＳＩＩＤＲＦＭＱＤＳＣＶＰＫＫＭＬＱＬＶＧＶＴ（配列番号：１０：ラットサイクリンＢ）；
ＫＦＲＬＬＱＥＴＭＹＭＴＶＳＩＩＤＲＦＭＱＮＳＣＶＰＫＫ（配列番号：１１：マウスサイクリンＢ）；
ＲＡＩＬＩＤＷＬＩＱＶＱＭＫＦＲＬＬＱＥＴＭＹＭＴＶＳ（配列番号：１２：マウスサイクリンＢ１）；
ＤＲＦＬＱＡＱＬＶＣＲＫＫＬＱＶＶＧＩＴＡＬＬＬＡＳＫ（配列番号：１３：マウスサイクリンＢ２）；および
ＭＳＶＬＲＧＫＬＱＬＶＧＴＡＡＭＬＬ（配列番号：１４：マウスサイクリンＡ２）
が知られている。
実施例
実施例１
Ｂasic ＢＬＡＳＴを用いて発現配列タグ(ＥＳＴ)に関するＧenＢankデータベースの探索は、デフォルトパラメーターを用いるＮＣＢＩウェブサイト(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/cgi)から利用できるが、ウテリンライブラリーからのＥＳＴ(４０９３６;受託番号ＡＡ３３３０８)がＨＤＡＣ３のアミノ末端部分に対して相同性を持つことを明らかにした。完全長のクローンを得るために、Ｍarathon- Ｒeady human Uterus cＤＮＡライブラリー(Clontech, Palo Alto, CA)を３'ＲＡＣＥの技術を用いてスクリーンし、そこでcＤＮＡの３'末端をＰＣＲで増幅した。Ｍarathon-Ｒeady cＤＮＡライブラリーを、アダプタープライマーによってフランキングした完全長ｃＤＮＡのライブラリーとして産生した。３’ＲＡＣＥを行うために、ＰＣＲ反応をアダプター領域および遺伝子特異的プライマーと相同性のあるプライマーを用いて行った。ＨＤＡＣ８特異的プライマーは：ＴＧＣＧＧＡＡＣＧＧＴＴＴＴＡＡＧＣＧＧＡＧ（配列番号：１５）であった。
実施例１
Ｂasic ＢＬＡＳＴを用いて発現配列タグ(ＥＳＴ)に関するＧenＢankデータベースの探索は、デフォルトパラメーターを用いるＮＣＢＩウェブサイト(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/cgi)から利用できるが、ウテリンライブラリーからのＥＳＴ(４０９３６;受託番号ＡＡ３３３０８)がＨＤＡＣ３のアミノ末端部分に対して相同性を持つことを明らかにした。完全長のクローンを得るために、Ｍarathon- Ｒeady human Uterus cＤＮＡライブラリー(Clontech, Palo Alto, CA)を３'ＲＡＣＥの技術を用いてスクリーンし、そこでcＤＮＡの３'末端をＰＣＲで増幅した。Ｍarathon-Ｒeady cＤＮＡライブラリーを、アダプタープライマーによってフランキングした完全長ｃＤＮＡのライブラリーとして産生した。３’ＲＡＣＥを行うために、ＰＣＲ反応をアダプター領域および遺伝子特異的プライマーと相同性のあるプライマーを用いて行った。ＨＤＡＣ８特異的プライマーは：ＴＧＣＧＧＡＡＣＧＧＴＴＴＴＡＡＧＣＧＧＡＧ（配列番号：１５）であった。
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