JP2002516069A - Tnf関連死リガンド - Google Patents

Tnf関連死リガンド

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JP2002516069A
JP2002516069A JP2000541304A JP2000541304A JP2002516069A JP 2002516069 A JP2002516069 A JP 2002516069A JP 2000541304 A JP2000541304 A JP 2000541304A JP 2000541304 A JP2000541304 A JP 2000541304A JP 2002516069 A JP2002516069 A JP 2002516069A
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trdl
polypeptide
cells
apoptosis
culture
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シンシア・ジェイ・ミルズ
デイビッド・エイ・ジョーンズ
マイケル・ジェイ・ビーンコウスキー
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Pharmacia and Upjohn Co
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    • C07ORGANIC CHEMISTRY
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    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/52Cytokines; Lymphokines; Interferons
    • C07K14/525Tumour necrosis factor [TNF]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2799/00Uses of viruses
    • C12N2799/02Uses of viruses as vector
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、TNF関連死リガンド(TRDL)とここに命名された新規な腫瘍壊死因子(TNF)同族体に関する。TRDLをコードする単離核酸分子が提供される。また、TRDL活性の作動薬および拮抗薬を同定する方法のようにTRDLポリペプチドも提供される。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 (発明の分野) 本発明は、TNF関連死リガンド(TNF-related death lig
and)(TRDL)とここに命名された新規な腫瘍壊死因子(TNF)同族体に関
する。
【0002】 (発明の背景) 腫瘍を収縮させるその能力から命名された腫瘍壊死因子(TNF)は、免疫系細
胞によって作られ、免疫調節、炎症および癌において重要な役割を有するサイト
カインの新たな族のメンバーである。その族は、TNFに加えて、分子のC末端
部分に制限される限定された配列相同性を共有する7つのメンバーを含む。TN
F-βを除いて、これらの各リガンドの各々は、対応する標的細胞から効果を誘
導するには細胞表面提示を必要とするタイプIIの膜に関連した蛋白質である。(
Wiley、S.R.、Schooley、K.、Smolak、P.J.、Din
、W.S.、Huang、C-P.、Nicholl、J.K.、Sutherlan
d、G.R.、Davis Smith、T.、Rauch、C.、Smith、C.
A.およびGoodwin、R.G.(1995) Identification
and characterization of a new member of
the TNF family that induces apoptosis.
Immunity. 3、673-682)。このサイトカイン族は、複雑なシグナ
リング戦略およびしばしば矛盾した生物学的効果のある、増大するリストの標的
膜貫通受容体と相互作用する(Wiley、S.R.、Schooley、K.、S
molak、P.J.、Din、W.S.、Huang、C-P.、Nicholl、
J.K.、Sutherland、G.R.、Davis Smith、T.、Rau
ch、C.、Smith、C.A.およびGoodwin、R.G.(1995) Id
entification and characterization of a
new member of the TNF family that induc
es apoptosis.Immunity. 3、673-682)。
【0003】 TNF-αとTNFR-1受容体との相互作用は、TNFリガンド受容体族の生
物学的多様性を類型化する。TNFR-1の連結は、NF-κBを活性化し、種々
の細胞型において炎症応答を誘導する(Beg、A.A.およびBaltimor
e、D.(1996) An essential role for NF−κB i
n preventing TNF-α-induced cell death. S
cience. 274、782-784. Wang、C-Y.、Mayo、M.W.
およびBaldwin、A.S. Jr.(1996) TNF-and cancer
therapy-induced apoptosis:potentiatio
n by inhibition of NF−κB. Science. 274、7
84-787. VanAntwerp、D.J.、Martin、S.J.、Kaf
ri、T.、Green、D.R.およびVerma、I.M.(1996) Supp
ression of TNF-α-induced apoptosis by N
F−κB. Science. 274、787-789)。
【0004】 あるいは、TNFR-1活性化はアポトーシスも誘導できる(Pan、G.,O'
Rourke、K.、Chinnaiyan、A.M.、Gentz、R.、Ebn
er、R.、Ni、J.およびDixit、V.(1997) The recept
or for the cytotoxic ligand TRAIL. Scie
nce. 276、111-113)。これらの2つの経路および最終的な細胞内の
結末を調節するメカニズムは不明のままであるが、治療介入について注目すべき
見通しを提供する。ヒト疾患におけるこの生死バランスの重要性は、TNFが多
くの型の癌細胞を効果的に殺せないという観察に見ることができる(Wang、
C-Y.、Mayo、M.W.およびBaldwin、A.S. Jr.(1996) T
NF-and cancer therapy-induced apoptosi
s:potentiation by inhibition of NF−κB.
Science. 274、784-787. Baichwal、V.R.およびB
aeuerle、P.A.(1997) Apoptosis:Activate N
F−κB or die? Current Biology. 7、R94-R96)
。最近の証拠は、TNFが、アポトーシス経路を遮断できるキー分子であるNF
-κBを活性化することによってそれ自体を蝕むことを示唆する(Beg、A.A.
およびBaltimore、D.(1996) An essential role
for NF−κB in preventing TNF−α-induced
cell death. Science. 274、782-784. Wang、C
-Y.、Mayo、M.W.およびBaldwin、A.S. Jr.(1996) TN
F-and cancer therapy-induced apoptosis
:potentiation by inhibition of NF−κB. S
cience. 274、784-787. VanAntwerp、D.J.、Ma
rtin、S.J.、Kafri、T.、Green、D.R.およびVerma、
I.M.(1996) Suppression of TNF-α-induced a
poptosis by NF−κB. Science. 274、787-789.
Liu、Z-G.、Hsu、H.、Goeddel、D.およびKarin、M.(
1996) Dissection of the TNF receptor 1 e
ffector functions:JNK activation is no
t linked to apoptosis while NF−κB activ
ation prevents cell death. Cell. 87、565-
576. Wu、M.、Lee、H.、Bellas、R.E.、Schauer、S
.L.、Arsura、M.、Katz、D.、FitzGerald、M.J.、R
othstein、T.L.、Sherr、D.H.およびSonenshein、
G.E.(1996) Inhibition of NF−κB/Rel induc
es apoptosis of murine B cells. EMBO J. 1
5、4682-4690)。この遮断は、腫瘍細胞を免疫監視に対して抵抗性にで
き、腫瘍細胞のアポトーシスにたよる化学療法的アプローチを混乱できる。従っ
て、この保護メカニズムの崩壊は、TNF媒介殺傷に細胞を感作できる(Beg
、A.A.およびBaltimore、D.(1996) An essential
role for NF-κB in preventing TNF-α-induc
ed cell death. Science. 274、782-784. Wan
g、C-Y.、Mayo、M.W.およびBaldwin、A.S. Jr.(1996)
TNF-and cancer therapy-induced apoptos
is:potentiation by inhibition of NF−κB
. Science. 274、784-787. VanAntwerp、D.J.、
Martin、S.J.、Kafri、T.、Green、D.R.およびVerm
a、I.M.(1996) Suppression of TNF-α-induce
d apoptosis by NF−κB. Science. 274、787-7
89)。
【0005】 TNFシグナリングの理解における最近の進歩は、TNFに応答する細胞内で
、NF-κB活性化およびアポトーシスの潜在的な遮断に対する、別々の分子標
的を解明した。(Beg、A.A.およびBaltimore、D.(1996) A
n essential role for NF−κB in preventin
g TNF−α-induced cell death. Science. 274
、782-784. Wang、C-Y.、Mayo、M.W.およびBaldwin
、A.S. Jr.(1996) TNF-and cancer therapy-in
duced apoptosis:potentiation by inhib
ition of NF−κB. Science. 274、784-787. Va
nAntwerp、D.J.、Martin、S.J.、Kafri、T.、Gre
en、D.R.およびVerma、I.M.(1996) Suppression o
f TNF-α-induced apoptosis by NF−κB. Scie
nce. 274、787-789.Wu、M.、Lee、H.、Bellas、R.
E.、Schauer、S.L.、Arsura、M.、Katz、D.、Fitz
Gerald、M.J.、Rothstein、T.L.、Sherr、D.H.およ
びSonenshein、G.E.(1996) Inhibition of NF
−κB/Rel induces apoptosis of murine B c
ells. EMBO J. 15、4682-4690)。これらの応答は、活性化
TNF受容体へのシグナリング蛋白質の補充によって促進される。TRADD(
TNFR1関連死ドメイン蛋白質)、TRAF2(TNFR関連蛋白質-2)および
RIP(受容体相互作用プロテインキナーゼ)を含めたこれらシグナリング蛋白質
のいくつかは、NF-κBの活性化を開始するようである。Chinnaiya
n、A.M.、O'Rourke、K.、Yu、G-L.、Lyons、R.H.、Ga
rg、M.、Duan、D.R.、Xing、L.、Gentz、R.、Ni、J.お
よびDixit、V.M.(1996) Signal transduction
by DR3、a death domain-containing recep
tor related to TNFR-1 and CD95. Science.
274、990-992。FADD(Fas関連死ドメイン蛋白質)およびFLI
CK(FADD様インターロイキン変換酵素)を含めた他の蛋白質の補充は、アポ
トーシスを誘導する(Boldin、M.P.、Goncharov、T.M.、G
oltsev、Y.V.および Wallach、D.(1996) Involve
ment of MACH、a novel MORT1/FADD-interac
ting protease、in Fas/APO-1-and TNF rece
ptor-induced cell death. Cell. 85、803-81
5. Muzio、M.、Chinnaiyan、A.M.、Kischkel、F.
C.、O'Rourke、K.、Shevchenko、A.、Ni、J.、Sca
ffidi、C.、Bretz、J.D.、Zhang、M.、Gentz、R.、
Mann、M.、Krammer、P.H.、Peter、M.E.およびDixi
t、V.(1996) FLICE、a novel FADD-homologou
s ICE/CED-3-like protease、is recruited
to the CD95(Fas/APO-1) death-inducing si
gnaling complex. Cell. 85、817-827)。
【0006】 この新たな生物学は、とりわけ癌、炎症疾患および神経変性疾患における潜在
的な治療介入について、研究者間にかなりの注目を創造して来た。かくして、当
業者ならば、アポトーシスおよびNF-κBの活性化に包含される炎症性サイト
カインのTNF族の新規なメンバーの継続的な要求が存在することは明らかであ
ろう。
【0007】 (情報の開示) Wileyら、Immunity 3、673-682(1995)。 Beg、A.A.およびD. Baltimore、Science 274、7
82-784(1996)。 Wangら、Science 274、784-787(1996)。 VanAntwerpら、Science 274、787-789(1996)
。 Panら、Science 276、111-113(1997)。 Baichwalら、Current Biology 7、R94-R96(1
997)。 Liuら、Cell 87、565-576(1996)。 Wuら、EMBO J 15、4682-4690(1996)。 Chinnaiyanら、Science 274、990-992(1996)
。 Boldinら、Cell 85、803-815(1996)。 Muzioら、Cell 85、817-827(1996)。 Altschulら、J. Mol. Bio. 215、403-410(1990
). Idziorekら、J. Immuno. Meth. 185:249-25
8(1995)。 X.M. Wangら、 Human Immunol 37:264(1993)。
【0008】 (発明の概要) 本発明は、本明細書中でTRDLと命名された新規なTNF同族体をコードす
るポリヌクレオチドを含む単離核酸分子またはその断片を提供する。本発明のT
RDLポリペプチドは、図3および4に示されるアミノ酸配列(各々、配列番号
:2および配列番号:4)を有する、本明細書中でTRDL-11およびTRDL
-14と命名されたTRDLの2つの別々なスプライス変異体を含む。TRDL
の好ましい断片は、TRDL-11およびTRDL-14の細胞外部分を含む。 好ましい具体例において、該核酸分子は、配列番号:1または配列番号:3の
ヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む。他の態様において、本発明
は、ストリンジェント条件下、TRDL-11またはTRDL-14をコードする
ポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドを含む単離核酸分子ま
たはその断片を提供する。
【0009】 また、本発明は、本発明の単離核酸分子を含むベクター、かかるベクターが導
入された宿主細胞、および上記の宿主細胞を培養し、TRDLポリペプチドを単
離することを特徴とするTRDLポリペプチドを得る組換え方法を提供する。 他の態様において、本発明は、単離TRDLポリペプチドならびにその断片を
提供する。好ましい具体例において、TRDLポリペプチドは、配列番号:2ま
たは配列番号:4のアミノ酸配列を有する。また、TRDLポリペプチドに特異
的に結合するポリクローナルおよびモノクローナルの双方の単離抗体が提供され
る。
【0010】 また、本発明は、TRDLに高親和性受容体を有する細胞の同定法であって、 (a)単離TRDLポリペプチドを標識し; (b)工程(a)で得られた標識TRDLポリペプチドと、哺乳動物細胞系の 細胞とを接触させ; (c)工程(b)で得られた細胞を洗浄して未結合のTRDLを除去し;次いで (d)工程(c)で得られた洗浄された細胞中の標識TRDLポリペプチドの 存在を測定し; それによって、工程(c)で得られた洗浄された細胞中の標識TRDLポリペプチ
ドの存在が細胞上のTRDLについての高親和性受容体の存在を示すことを特徴
とする該方法を提供する。
【0011】 他の具体例において、本発明はTRDLのその受容体への結合を阻害する薬剤
の同定法であって、 (a)単離TRDLポリペプチドを標識し; (b)(i)試験薬剤の存在下;および (ii)試験薬剤の不存在下; 工程(a)で得られた標識TRDLポリペプチドと、哺乳動物細胞系の 細胞とを接触させ、 (c)(i)工程(b)(i)で得られた;および (ii)工程(b)(ii)で得られた; 細胞を洗浄して、未結合TRDLを除去し、 (d)(i)工程(c)(i)で得られた洗浄された細胞;および (ii)工程(c)(ii)で得られた洗浄された細胞; 中の標識TRDLポリペプチドの量を測定し、次いで (e)工程(d)(i)において測定された標識TRDLポリペプチドの量と、(d)
(ii)において測定されたものを比較し; それによって、試料(d)(ii)中より、試料(d)(i)中の標識TRDLポリペプチ
ドのより低量は、該薬剤がTRDLのその受容体への結合を阻害したことを示す
ことを特徴とする該方法に関する。
【0012】 他の具体例において、本発明はTRDLのその受容体への結合を増強する薬剤
の同定法であって、 (a)単離TRDLポリペプチドを標識し; (b)(i)試験薬剤の存在下;および (ii)試験薬剤の不存在下; 工程(a)で得られた標識TRDLポリペプチドと、哺乳動物細胞系の細胞 とを接触させ、 (c)(i)工程(b)(i)で得られた;および (ii)工程(b)(ii)で得られた; 細胞を洗浄し、 (d)(i)工程(c)(i)で得られた洗浄された細胞;および (ii)工程(c)(ii)で得られた洗浄された細胞; 中の標識TRDLポリペプチドの量を測定し、次いで (e)工程(d)(i)において測定された標識TRDLポリペプチドの量と、 (d)(ii)において測定されたものを比較し; それによって、試料(d)(ii)中より、試料(d)(i)中の標識TRDLポリペプチ
ドのより高量は、該薬剤がTRDLのその受容体への結合を増強することを示す
ことを特徴とする該方法に関する。
【0013】 他の具体例において、本発明はTRDLとの相互作用に際して、アポトーシス
を受ける細胞系の同定法であって、 (a)哺乳動物細胞系の培養細胞を試験培養物および対照培養物とに分け; (b)TRDLポリペプチドと工程(a)の試験培養物とを接触させ; (c)アポトーシスを受けた、 (i)工程(b)で得られた試験培養物;および (ii)工程(a)の対照培養物; の細胞の量を測定し;次いで (d)工程(c)(i)の試験培養物中のアポトーシスを受けたと判断された細胞の 量と、工程(c)(ii)の対照培養物中のアポトーシスを受けたと判断された 細胞の量とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が該対照培養物
よりも高いという決定は、TRDLとの相互作用に際して、該哺乳動物細胞系が
アポトーシスを受けることを示すことを特徴とする該方法を提供する。
【0014】 さらに他の具体例において、本発明は、アポトーシスのTRDL媒介誘導を阻
害できる薬剤の同定法であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受けることがで きる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際して、アポト ーシスを受けることができる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
物中より低いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介誘導を阻
害することを示すことを特徴とする該方法を提供する。
【0015】 さらに他の具体例において、本発明は、アポトーシスのTRDL媒介誘導を増
強できる薬剤の同定法であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受けることがで きる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際して、アポト
ーシスを受けることができる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
物中より高いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介誘導を増
強することを示すことを特徴とする該方法を提供する。
【0016】 さらに他の具体例において、本発明は、アポトーシスのTRDL媒介防止を阻
害できる薬剤の同定法であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際してアポトーシスを受けるのが妨げら れる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際してアポトー シスを受けるのが妨げられる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
物中より高いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介防止を阻
害することを示すことを特徴とする該方法を提供する。
【0017】 さらに他の具体例において、本発明は、アポトーシスのTRDL媒介防止を増
強できる薬剤の同定法であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際してアポトーシスを受けるのが妨げら れる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際してアポトー シスを受けるのが妨げられる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
物中より低いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介防止を増
強することを示すことを特徴とする該方法を提供する。
【0018】 (詳細な記載) 本発明は、本明細書中でTRDL-11およびTRDL-14と命名され、図4
および5に示されたアミノ酸配列(各々、配列番号:2および配列番号:4)を有
するTRDLペプチドの2つの別々なスプライス変異体をコードすることを特徴
とする単離核酸分子を提供する。特に断りのない限りは、TRDLに対する全て
の言及は、TRDL-11またはTRDL-14のいずれかに言及するものと理解
されるべきである。
【0019】 本発明のTRDLポリペプチドは、TNF−α、FasLおよびTRAILを
含むサイトカイン族と配列相同性を持つ。TNF、TRAILおよびFasLの
ような分子との配列保存は、カルボキシ末端から100アミノ酸以内の2つの短
いストレッチに第一義的には制限される。TNF−α、FasLおよびTRAI
Lに対するTRDLのC末端ドメインの全パーセント同一性は、各々、17%、
17%および12%である。顕著ではないが、このレベルの相同性は、TNFサ
イトカイン族には典型的である。比較すると、TRAILは、FasLに対して
わずかに28%の相同性、TNFαに対して23%の相同性およびリンホトキシ
ンβに対して22%の相同性である。これらの族のメンバーと同様に、TRDL
は、細胞表面上のこの分子の適当な存在が必要であるらしいN末端近くの推定膜
貫通セグメントを含む。Wiley、S.R.、Schooley、K.、Smo
lak、P.J.、Din、W.S.、Huang、C−P.、Nicholl、J.
K.、Sutherland、G.R.、Davis Smith、T.、Rauc
h、C.、Smith、C.A.およびGoodwin、R.G.(1995) Ide
ntification and characterization of a
new member of the TNF family that induc
es apoptosis. Immunity. 3、 673−682。
【0020】 本発明のTRDLポリペプチドの構造ドメインは、Transmemプログラ
ム(Pharmacia & Upjohn、Kalamazoo、MI)を介して
予測された。かくして、そのアミノ酸配列が 配列番号:2で与えられるTRD
L-11の構造ドメインは、約アミノ酸残基1ないし約アミノ酸残基23に対応
するN末端細胞質ドメイン、約アミノ酸残基24ないし約アミノ酸残基52に対
応する膜貫通領域、および約アミノ酸残基53ないし約アミノ酸残基234に対
応するC末端細胞外ドメインを含むと予測される。そのアミノ酸配列が 配列番
号:4で与えられるTRDL-14の構造ドメインは、約アミノ酸残基1ないし
約アミノ酸残基23に対応するN末端細胞質ドメイン、約アミノ酸残基24ない
し約アミノ酸残基52に対応する膜貫通領域、および約アミノ酸残基53ないし
約アミノ酸残基247に対応するC末端細胞外ドメインを含むと予測される。か
くして、本発明は、TRDL-11またはTRDL-14のいずれかの細胞内、膜
貫通領域または細胞外領域をコードする核酸分子も提供する。
【0021】 当業者に理解されるであろうように、上記の各TRDLポリペプチドの膜貫通
領域は、疎水性ドメインの型を同定するための慣用的基準により同定される。も
ちろん、膜貫通領域の正確な境界線は、上記のものからわずかに変更できる。か
くして、TRDLの膜貫通ドメインのN末端境界線は、示された境界線に対して
5アミノ酸残基N末端側またはC末端側で始まることができ、TRDLの膜貫通
ドメインのC末端は、示された境界線に対して5アミノ酸残基N末端側またはC
末端側で始まることができる。もちろん、膜貫通領域の現実の境界線が上記のご
とくシフトする場合、細胞内ドメインのC末端境界線および細胞外ドメインのN
末端境界線における対応するシフトにも見出されるであろう。
【0022】 配列番号:1および配列番号:3で与えられたヌクレオチド配列は、各々、T
RDL-11およびTRDL-14をコードするヌクレオチド配列に対応する。T
RDLをコードするDNAの単離および配列決定は以下の実施例1で記載する。
(TRDL-14をコードする)配列番号:3のDNAと比較して、(TRDL-1
1をコードする)配列番号:1のDNAは、配列番号:3(TRDL-14)のDN
Aからの約16アミノ酸(TRDL-14の約残基111ないし約残基127)を
コードする約48塩基対のインフレーム欠失を含む。(TRDL-11をコードす
る)配列番号:1のDNAと比較して、(TRDL-14をコードする)配列番号:
3のDNAは、配列番号:1(TRDL-11)のDNAからの末端コドン付近の
約183塩基対を欠く(図5参照)。
【0023】 実施例1に記載のごとく、自動配列決定法を用いて、TRDLのヌクレオチド
配列を得た。本発明のTRDLヌクレオチド配列を両DNA鎖について得、正確
に100%であると考えられる。しかしながら、当該技術分野において知られて
いるように、かかる自動方法によって得られたヌクレオチド配列は、いくつかの
誤りを含むかも知れない。自動化によって決定されたヌクレオチド配列は、典型
的には、所与の核酸分子の実際のヌクレオチド配列に対して少なくとも約90%
同一、より典型的には、少なくとも約95%同一ないし少なくとも約99.9%
同一である。実際の配列は、当該技術分野でよく知られるマニュアル配列決定法
を用いてより正確に決定できる。当該技術分野で知られるように、1以上のヌク
レオチドの挿入または欠失をもたらす配列の誤りの結果、予測アミノ酸配列が変
異点で開始する核酸分子の実際のヌクレオチド配列から予測されるものとは異な
るであろうように翻訳においてフレームシフトを生じさせるであろう。
【0024】 本発明のTRDLのDNAは、cDNA、化学合成されたDNA、PCRによ
って単離されたDNA、ゲノムDNAおよびその組合せを含む。ゲノムTRDL
のDNAは、本明細書中に記載されたTRDL cDNAでゲノムライブラリー
をスクリーニングすることによって得ることができる(実施例3、セクション(e
) 参照)。また、TRDL DNAから転写されたRNAも、本発明に包まれる。
【0025】 遺伝暗号の縮重のために、2つのDNA配列は異なるが同一のアミノ酸配列を
依然としてコードできる。かくして、本発明は、本発明のいずれかのTRDLポ
リペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を有する単離核酸分子を提供し、
ここに、該ポリヌクレオチド配列は、配列番号:2または配列番号:4の完全な
アミノ酸配列またはその断片を有するTRDLポリペプチドをコードする。
【0026】 また、組換え体および非組換え体の精製TRDLポリペプチドも本明細書中で
提供される。TRDLのいずれかの生物学的活性を保持する天然のTRDL蛋白
質の変異体および誘導体も本発明の範囲内にある。TRDLの一つの生物学的活
性は、アポトーシスを誘導する能力である。標的細胞のアポトーシスを検出する
ためのアッセイ手順はよく知られている。これらは、Wileyら(WO 97/
01633)によって記載されたDNAラダーリング・アポトーシスアッセイお
よび細胞溶解アッセイを含む。
【0027】 TRDL変異体は、例えば、天然のTRDLをコードするヌクレオチド配列の
変異によって得ることができる。本明細書で言及するTRDL変異体は、アミノ
酸配列中の1以上の欠失、挿入または置換のために、天然のTRDLのものとは
異なるアミノ酸配列を有する以外は天然のTRDLと実質的に相同性のあるポリ
ペプチドである。変異体のアミノ酸またはヌクレオチド配列は、天然のTRDL
配列に対して、好ましくは、少なくとも約80%の同一性があり、より好ましく
は、少なくとも約90%の同一性があり、最も好ましくは、少なくとも約95%
の同一性がある。天然および変異体TRDL配列間の、相同性とも呼ばれる配列
同一性のパーセンテージは、例えば、この目的に通常用いられる、Bestfi
tプログラムのごときいずれかのコンピュータープログラムを用いて、2つの配
列を比較することによって決定できる(Wisconsin Sequence
Analysis Package、version 8 for Unix、Ge
netics Computer Group、University Rese
arch Park、Madison Wisconsin)、それは、Smit
hおよびWatermanのアルゴリズム(Adv. Appl. Math. 2:
482-489(1981))を用いる。
【0028】 天然のアミノ酸配列の改変は、多数の公知技術のいずれかによって達成できる
。例えば、突然変異は、Walderら(Gene 42:133(1986));
Bauerら(Gene 37:73(1985));Craik(BioTechn
iques、January 1985、pp. 12-19);Smithら(Ge
netic Engineering:Principles and Meth
ods、Plenum Press(1981));および米国特許第4,518,5
84号および第4,737,462号によって記載される、オリゴヌクレオチド指
向された突然変異のごとき、当業者によく知られた手順によって特定の位置に導
入できる。
【0029】 本発明の範囲内のTRDL変異体は、TRDLポリペプチドの1以上のアミノ
酸残基が、TRDLポリペプチドの二次および/または三次構造を変更しない異
なる残基によって置換されることを意味する保存的置換した配列を含むことがで
きる。かかる置換は、1つの脂肪族残基(Ile、Val、LeuまたはAla)
をもう一つの代わりに置換すること、または塩基性残基LysおよびArg、酸
性残基GluおよびAsp、アミド残基GlnおよびAsn、ヒドロキシル残基
SerおよびTyr、または芳香族残基PheおよびTyr間の置換ごとく、類
似の物理化学的性質を有する残基によるアミノ酸の置換を含むことができる。
【0030】 表現型的にサイレントなアミノ酸交換の作成に関するさらなる情報は、Bow
ieら、Science 247:1306-1310(1990)に見出すことが
できる。TRDLの生物学的活性を実質的に保持できた他のTRDL変異体は、
アミノ酸置換が蛋白質の機能領域外のエリア、例えば、受容体結合部位の外にあ
る領域においてなされるものである。
【0031】 他の態様において、本発明は、上記の核酸分子の一部、例えば、前記の核酸分
子のうちの1つの、少なくとも約15ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約2
0ヌクレオチド、より好ましくは少なくとも約30ヌクレオチド、およびさらに
より好ましくは少なくとも約30ないし少なくとも約100ヌクレオチドに、ス
トリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドを含む単離核酸
分子を提供する。記載された長さを有する核酸分子のかかる一部とは、例えば、
参照核酸分子の少なくとも約15隣接ヌクレオチドをいう。ストリンジェントな
ハイブリダイゼーション条件とは、6×SSC/0.1% SDS中での約2.5時
間約42℃にての一晩のインキュベーション、続いての0.1% SDS、65℃
にて1.0×SSCでのフィルター洗浄を示す。
【0032】 本明細書中のTRDLをコードする核酸分子ならびに(TRDL-1、TRDL
-11およびTRDL-14のいずれかの細胞内、膜貫通領域または細胞外領域を
コードする断片を含めた)かかる核酸分子にハイブリダイズできるポリヌクレオ
チドの断片をポリメラーゼ鎖反応(PCR)におけるプローブまたはプライマーと
して用いることができる。かかるプローブを用いて、例えば、in vitro
アッセイならびにサザーンおよびノーザンブロットにてTRDL核酸の存在を検
出できる。TRDLを発現する細胞型も、かかるプローブの使用によって同定で
きる。かかる手順は、よく知れれ、当業者ならば、特定の適用に適当な長さのプ
ローブを選択できるであろう。PCRでは、所望のTRDL核酸分子の末端に対
応する5'および3'プライマーを使用して通常の技術を用いてその配列を単離し
、増幅する。
【0033】 TRDL核酸分子の他の有用な断片は、(センス鎖を用いて)標的TRDL m
RNA配列または(アンチセンス鎖を用いて)TRDL DNA配列に結合できる
一本鎖核酸配列を含むアンチセンスおよびセンスヌクレオチドである。
【0034】 他の態様において、本発明は、関連した天然パターンのグリコシル化が有り無
しのTRDLポリペプチドを含む。酵母または哺乳動物の発現系(以下に記載)に
おいて発現したTRDLは、分子量およびグリコシル化パターンにおいて天然の
TRDLポリペプチドと同様か、またはかなり異なる。細菌発現系におけるTR
DLの発現は、非グリコシル化TRDLを供するであろう。
【0035】 本発明のポリペプチドは、好ましくは単離形態において供され、好ましくは実
質的に精製される。TRDLポリペプチドは、硫酸アンモニウムまたはエタノー
ル沈澱、アニオンまたはカチオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースク
ロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマ
トグラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィーおよびレクチンクロ
マトグラフィーを含めたよく知られた方法によって組換え細胞培養物から回収で
き、精製できる。好ましい具体例において、高速液体クロマトグラフィー(HP
LC)を精製のために使用する。
【0036】 また、本発明は、本発明のポリヌクレオチド分子を含むベクター、ならびにか
かるベクターで形質転換した宿主細胞に関する。本発明のいずれかのポリヌクレ
オチド分子は、宿主における増殖のために、選択マーカーおよび複製起点を一般
的に含むベクターと結合できる。また、本発明は、上記のポリヌクレオチド分子
から発現したTRDLポリペプチドを供するため、TRDLの発現用ベクターが
好ましい。該ベクターは、哺乳動物、微生物、ウイルスまたは昆虫遺伝子から誘
導されるもののごとき適当な転写または翻訳調節配列に作動可能に連結した、上
記または下記のいずれかのTRDLポリペプチドをコードするDNAを含む。調
節配列の例は、転写プロモーター、オペレーターまたはエンハンサー、mRNA
リボソーム結合部位、および転写および翻訳を制御する適当な配列を含む。ヌク
レオチド配列は、調節配列がTRDLをコードするDNAに機能的に関係する場
合に作動可能に結合する。かくして、プロモーターのヌクレオチド配列は、もし
プロモーターヌクレオチド配列がTRDL配列の転写を指示するならば、TRD
LのDNA配列に作動可能に結合する。
【0037】 TRDLをコードするポリヌクレオチド分子のクローニングに用いられるべき
、またはTRDLポリペプチドの発現用の適当なベクターの選択は、該ベクター
がその中で形質転換されるであろう宿主細胞、および適用可能な場合、TRDL
ポリペプチドがそれから発現されるべき宿主細胞にもちろん依存するであろう。
TRDLポリペプチド発現用の適当な宿主細胞は、原核細胞、酵母細胞およびよ
り高級な真核細胞を含み、それらの各々は以下に記載される。
【0038】 また、かかる宿主細胞において発現されるべきTRDLポリペプチドは、異種
蛋白質からの領域を含む融合蛋白質である。かかる領域は、例えば、ポリペプチ
ドの分泌、改良された安定性または精製促進を可能とするために含ませる。例え
ば、適当なシグナルペプチドをコードする配列を発現ベクターに取り込むことが
できる。シグナルペプチド用DNA配列(分泌型リーダー(secretory
leader))は、TRDLがシグナルペプチドを含む融合蛋白質として翻訳さ
れるようにTRDL配列にインフレームで融合できる。意図した宿主細胞で機能
するシグナルペプチドは、TRDLポリペプチドの細胞外分泌を増進する。好ま
しくは、該シグナル配列は、細胞からのTRDLの分泌に際してTRDLポリペ
プチドから切断されるであろう。本発明を実施するのに用いることができるシグ
ナル配列の非限定的例は、酵母α因子およびsf9昆虫細胞のミツバチメラチン
リーダー(melatin leader)を含む。
【0039】 好ましい具体例において、該TRDLポリペプチドは、ポリペプチドの精製を
促進するのに用いられる異種領域を含む融合蛋白質であろう。かかる機能に用い
られた多くの利用可能なペプチドは、結合パートナーに対する融合蛋白質の選択
的結合を可能とする。例えば、該TRDLポリペプチドは、結合パートナーまた
はペプチドタグに特異的に結合する融合蛋白質を形成するためのペプチドを含む
ように修飾することができる。かかるペプチドタグの非限定的例は、6−His
タグ、チオレドキシンタグ、赤血球凝集素タグ、GSTタグおよびOmpAシグ
ナル配列タグを含む。当業者によって理解されるであろうように、ペプチドを認
識し、ペプチドに結合する結合パートナーは、金属イオン(例えば、金属アフィ
ニティーカラム)、抗体またはその断片を含むいずれの分子または化合物、およ
びFLAGタグのごときペプチドを結合するいずれの蛋白質またはペプチドでも
あり得る。
【0040】 TRDLポリペプチドの発現用の適当な宿主細胞は、原核細胞、酵母細胞およ
びより高度な真核細胞を含む。TRDLの発現に用いるべき適当な原核生物宿主
は、Escherichia属、Bacillus属およびSalmonell
a属の細菌、ならびにPseudomonas属、Streptomyces属
およびStaphylococcus属のメンバーを含む。例えば、E.col
iにおける発現では、TRDLポリペプチドは、原核生物宿主において、N末端
メチオニン残基を含んで組換えポリペプチドの発現を促進できる。次いで、N末
端のMetは、発現したTRDLポリペプチドから所望により切断できる。 原核生物宿主で用いる発現ベクターは、一般的に1以上の表現型の選択マーカ
ー遺伝子を含む。かかる遺伝子は、例えば、抗生物質抵抗性を与えるか、または
栄養要求性を供する蛋白質をコードする。非常に様々なかかるベクターは、商業
的入手源から容易に入手できる。例は、pSPORTベクター、pGEMベクタ
ー(Promega)、pPROEXベクター(LTI、Bethesda、MD
NA)、Bluescriptベクター(Stratagene)およびpQEベ
クター(Qiagen)を含む。
【0041】 また、TRDLは、Saccharomyces、PichiaおよびKlu
veromycesを含めた属からの酵母宿主細胞において発現できる。好まし
い酵母宿主は、S. cerevisiaeおよびP. pastorisである。
酵母ベクターは、2μ酵母プラスミドからの複製起点配列、自律複製の配列(AR
S)、プロモーター領域、ポリアデニル化用配列、転写終止用配列、および選択
マーカー遺伝子をしばしば含むであろう。酵母およびE. coli双方において
複製可能なベクター(シャトルベクターという)も用いることができる。上記の特
徴の酵母ベクターに加えて、シャトルベクターは、E. coliにおける複製お
よび選択のための配列も含む。酵母宿主において発現したTRDLポリペプチド
の直接的分泌は、TRDLをコードするヌクレオチド配列の5'端にて酵母α因
子リーダー配列をコードするヌクレオチド配列を含ませることによって達成でき
る。
【0042】 また、昆虫宿主細胞培養系は、TRDLポリペプチドの発現に用いることがで
きる。バキュロウイルスにおけるTRDLポリペプチドの発現は、以下の実施例
4に記載される。昆虫細胞における異種蛋白質の発現についてのバキュロウイル
ス系の使用に関してのさらなる情報は、LuckowおよびSummers、B
iolTechnology 6:47(1988)に概説されている。
【0043】 好ましい具体例において、TRDLポリペプチドを哺乳動物宿主細胞において
発現させる。適当な哺乳動物細胞系の非限定的例は、サル腎臓細胞のCOS-7
系(Gluzmanら、Cell 23:175(1981))およびチャイニーズ
ハムスター卵巣(CHO)細胞を含む。CHO細胞におけるTRDLポリペプチド
発現は、以下の実施例4に記載される。
【0044】 TRDLポリペプチドの発現用の適当な発現ベクターの選択は、用いられるべ
き具体的な哺乳動物宿主細胞にもちろん依存し、当業者の技量内であろう。適当
な発現ベクターの例は、pcDNA3(Invitrogen)およびpSVL(
Pharmacia Biotech)を含む。哺乳動物宿主細胞で用いられる発
現ベクターは、ウイルスゲノム由来の転写および翻訳制御配列を含む。本発明に
おいて用いることができる、通常に使用されるプロモーター配列およびエンハン
サー配列は、限定されるものではないが、ヒト・サイトメガロウイルス(CMV)
、アデノウイルス2、ポリオーマウイルスおよびシミアンウイルス40(SV4
0)由来のものを含む。哺乳動物発現ベクターの構築方法は、例えば、Okay
amaおよびBerg(Mol. Cell. Biol. 3:280(1983));
Cosmanら(Mol. Immunol. 23:935(1986));Cosm
anら(Nature 312:768(1984));EP-A-0367566;
およびWO 91/18982に開示されている。
【0045】 また、本発明のポリペプチドを用いて、ポリクローナルおよびモノクローナル
抗体を生起させることができ、それはTRDLポリペプチド発現を検出するため
の診断的アッセイに有用である。かかる抗体は慣用的技術によって調製できる。
例えば、Antibodies:A Laboratory Manual、Ha
rlowおよびLand(編)、Cold Spring Harbor Labo
ratory Press、Cold Spring Harbor、N.Y.、(1
988);Monoclonal Antibodies、Hybridomas
:A New Dimension in Biological Analyse
s、Kennetら(eds.)、Plenum Press、New York(1
980)参照。
【0046】 また、本発明のTRDL核酸分子は、ヒト染色体上の特定の位置とハイブリダ
イズできる(実施例4に記載)ので、染色体同定について価値が有る。実際の配列
データ(繰り返し多型)に基づく染色体マーキング試薬は染色体位置をマーキング
するのに現在ほとんど入手できないので、染色体上の特定の部位を同定する必要
が現在ある。一旦配列が正確な染色体位置にマップされたならば、染色体上の該
配列の物理的位置は、遺伝子地図データと相関させることができる。次いで、同
一の染色体領域にマップされている遺伝子と疾患との間の関係は、連鎖解析を通
して同定でき、ここに、物理的に隣接する遺伝子の共遺伝が測定される。次いで
、特定の疾患に関連するらしい遺伝子が事実疾患の原因であるか否かは、罹患し
たおよび罹患していない個人間の核酸配列を比較することにより決定できる。
【0047】 TRDLは、FasリガンドおよびTRAILのごとき、TDRLおよびTN
F族のメンバー間の配列相同性によって示されるごとき炎症性サイトカインのT
NF族の新しいメンバーであるので、TRDLは、同様な生物学的応答を誘導す
るらしい。これらは、細胞のアポトーシスの活性化およびNF-κBの活性化を
含む。ある種の疾患状態は、該疾患に罹っていない個人に起こるアポトーシスの
レベルと比較して低いアポトーシスのレベルを示す。かかる疾患は、例えば、p
53突然変異を持つ癌、ホルモン依存性腫瘍、自己免疫疾患およびウイルス感染
を含む。さらにまた、以下の実施例2において記載されるごとく、ある種の組織
型は、腫瘍組織より正常組織において高レベルのTRDL発現を示す。かくして
、TRDLについての1つの用途は、個人に対してTRDLを投与するまたは該
個人に対してTRDL活性を減少させる薬剤(すなわち、TRDL作動薬)を投与
することを特徴とするTRDL活性の増加を必要とする個人を治療する方法に関
する。TRDLまたはTRDL作動薬の投与は、所望のプログラムされた細胞死
に導くことができる。
【0048】 さらに、ある種の疾患は、該疾患に罹っていない個人に生じるアポトーシスの
レベルと比較して増加したレベルのアポトーシスを含む。TRDLまたはTRD
L活性を減少させる薬剤(すなわち、TRDL拮抗薬)の投与は、従って、かかる
個人においてアポトーシスのレベルを低下できる。かかる疾患は、例えば、AI
DS、神経変性疾患、脊髄異形成疾患および虚血性損傷を含む。かくして、TR
DLの一つの用途は、個人に対してTRDL活性を減少できる薬剤(すなわち、
TRDL拮抗薬)を該個人に投与することを特徴とする、TRDLの減少を必要
とする個人を治療する方法に関する。TRDL拮抗薬の投与は、所望のプログラ
ムされた細胞死に導くことができる。
【0049】 かくして、他の具体例において、本発明は、TRDL作動薬および拮抗薬の同
定におけるTRDLポリペプチドの使用に関する。TRDLポリペプチドの一つ
のかかる用途は、後記の実施例5に記載される。この実施例において、高親和性
のTRDL受容体を担う細胞は、標識したTRDLと異なる細胞系とを組合せる
ことによって同定される。次いで、高レベルのTRDL結合を発現する細胞系は
、後記されるごとくTRDL作動薬および拮抗薬について高処理量のスクリーニ
ングアッセイにおいて用いられる。かくして、該細胞系に結合するTRDLを増
加させる薬剤はTRDL作動薬であり、一方、TRDL結合を減少させる薬剤は
TRDL拮抗剤でる。TRDL用の適当な標識は、ビオチン、125I、14C、35
Sおよび3Hのごとき放射性同位体、フルオロセインおよびローダミンのごとき
蛍光標識、および酵素標識を含む。
【0050】 かくして、本発明は、TRDLに対して高親和性受容体を有する細胞の同定法
であって、 (a)単離TRDLポリペプチドを標識し; (b)工程(a)で得られた標識TRDLポリペプチドと、哺乳動物細胞系の 細胞とを接触させ; (c)工程(b)で得られた細胞を洗浄して未結合のTRDLを除去し;次いで (d)工程(c)で得られた洗浄された細胞中の標識TRDLポリペプチドの 存在を測定し; それによって、工程(c)で得られた洗浄された細胞中の標識TRDLポリペプチ
ドの存在が細胞上のTRDLに対する高親和性受容体の存在を示すことを特徴と
する該方法を提供する。
【0051】 他の具体例において、本発明はTRDLのその受容体への結合を阻害する薬剤
の同定法であって、 (a)単離TRDLポリペプチドを標識し; (b)(i)試験薬剤の存在下;および (ii)試験薬剤の不存在下; 工程(a)で得られた標識TRDLポリペプチドと、哺乳動物細胞系の 細胞とを接触させ、 (c)(i)工程(b)(i)で得られた;および (ii)工程(b)(ii)で得られた; 細胞を洗浄して未結合TRDLを除去し; (d)(i)工程(c)(i)で得られた洗浄された細胞;および (ii)工程(c)(ii)で得られた洗浄された細胞; 中の標識TRDLポリペプチドの量を測定し、次いで (e)工程(d)(i)において測定された標識TRDLポリペプチドの量と、(d)
(ii)において測定されたものを比較し; それによって、試料(d)(ii)中より、試料(d)(i)中の標識TRDLポリペプチ
ドのより低量は、該薬剤がTRDLのその受容体への結合を阻害することを示す
ことを特徴とする該方法に関する。
【0052】 他の具体例において、本発明はTRDLのその受容体への結合を増強する薬剤
の同定法であって、 (a)単離TRDLポリペプチドを標識し; (b)(i)試験薬剤の存在下;および (ii)試験薬剤の不存在下; 工程(a)で得られた標識TRDLポリペプチドと、哺乳動物細胞系の細胞
と を接触させ、 (c)(i)工程(b)(i)で得られた;および (ii)工程(b)(ii)で得られた; 細胞を洗浄して未結合TRDLを除去し; (d)(i)工程(c)(i)で得られた洗浄された細胞;および (ii)工程(c)(ii)で得られた洗浄された細胞; 中の標識TRDLポリペプチドの量を測定し、次いで (e)工程(d)(i)において測定された標識TRDLポリペプチドの量と、(d)
(ii)において測定されたものを比較し; それによって、試料(d)(ii)中より、試料(d)(i)中の標識TRDLポリペプチ
ドのより高量は、該薬剤がTRDLのその受容体への結合を増強することを示す
ことを特徴とする該方法に関する。
【0053】 さらにまた、上記のごとく、TRDLは、アポトーシスの誘導またはアポトー
シスの予防のごとき、サイトカインのTNF族に共通する活性を示すであろう。
アポトーシスを受けた細胞の定量で用いるべきアッセイ法は、当該技術分野にお
いてよく知られている(例えば、Wileyら、Immunity 3:673-
682(1995);Idziorekら、J. Immuno. Meth. 185
:249-258(1995);X.M. Wangら、Human Immunol
37:264(1993)参照)。かくして、Wileyらが記載したDNAラダ
ーリングアポトーシスアッセイまたはパーセント生存率アッセイ、またはIdz
iorekらの細胞死アッセイ(実施例6参照)のごときアッセイを用いることに
よって、様々な細胞型におけるアポトーシス誘導または予防に対するTRDLの
効果を試験し、TRDLとの相互作用に際してプログラムされた細胞死を受ける
細胞型、およびTRDLとの相互作用に際してプログラムされた細胞死を受ける
ことが妨げられる細胞型の同定を可能とすることができるであろう。
【0054】 従って、本発明はTRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受ける細胞
系の同定法であって、 (a)哺乳動物細胞系の培養細胞を試験培養物および対照培養物とに分け; (b)TRDLポリペプチドと工程(a)の試験培養物とを接触させ; (c)アポトーシスを受けた、 (i)工程(b)で得られた試験培養物;および (ii)工程(a)の対照培養物; の細胞の量を測定し;次いで (d)工程(c)(i)の試験培養物中のアポトーシスを受けたと判断された細胞の 量と、工程(c)(ii)の対照培養物中のアポトーシスを受けたと判断された 細胞の量とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が該対照培養物
よりも高いという決定は、TRDLとの相互作用に際して、該哺乳動物細胞系が
アポトーシスを受けたことを示すことを特徴とする該方法を提供する。
【0055】 次いで、TRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受けた上記の方法に
よって同定された哺乳動物細胞系は、アポトーシスのTRDL媒介誘導を阻害ま
たは増強できる薬剤を同定するのに用いることができる。従って、本発明は、ア
ポトーシスのTRDL媒介誘導を阻害できる薬剤の同定法であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受けることがで きる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際して、アポト ーシスを受けることができる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
物中より低いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介誘導を阻
害することを示すことを特徴とする該方法を提供する。
【0056】 また、本発明は、アポトーシスのTRDL媒介誘導を増強できる薬剤の同定法
であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受けることがで きる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際して、アポト ーシスを受けることができる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
物中より高いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介誘導を増
強することを示すことを特徴とする該方法を提供する。
【0057】 サイトカインのTNF族のある種のメンバーによって示される他の活性は、ア
ポトーシスの防止である。一つの例は、腫瘍壊死因子とTNF受容体2(TNF
R2)との相互作用において見出すことができる。その相互作用の結果、活性化
されると、アポトーシスから細胞を保護する転写因子であるNFκBの阻害が取
り除かれる。
【0058】 従って、本発明はTRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受けること
を防止する細胞系の同定法であって、 (a)哺乳動物細胞系の培養細胞を試験培養物および対照培養物とに分け; (b)TRDLポリペプチドと工程(a)の試験培養物とを接触させ; (c)アポトーシスを受けた、 (i)工程(b)で得られた試験培養物;および (ii)工程(a)の対照培養物; の細胞の量を測定し;次いで (d)工程(c)(i)の試験培養物中のアポトーシスを受けたと判断された細胞の 量と、工程(c)(ii)の対照培養物中のアポトーシスを受けたと判断された 細胞の量とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が該対照培養物
よりも低いという決定は、TRDLとの相互作用に際して、該哺乳動物細胞系が
アポトーシスを受けることから妨げられることを示すことを特徴とする該方法を
提供する。
【0059】 次いで、TRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受けることを防止す
べき上記の方法によって同定された哺乳動物細胞系は、アポトーシスのTRDL
媒介防止を阻害または増強できる薬剤の同定において用いることができる。従っ
て、本発明は、アポトーシスのTRDL媒介防止を阻害できる薬剤の同定法であ
って、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際してアポトーシスを受けるのが妨げら れる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際してアポトー シスを受けるのが妨げられる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
物中より高いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介防止を阻
害することを示すことを特徴とする該方法を提供する。
【0060】 また、本発明は、アポトーシスのTRDL媒介防止を増強できる薬剤の同定法
であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際してアポトーシスを受けるのが妨げら れる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際してアポトー シスを受けるのが妨げられる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
物中より低いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介防止を増
強することを示すことを特徴とする該方法を提供する。
【0061】 本発明を一般的に記載してきたが、本発明は以下の実施例を参照することによ
ってより容易に理解され、これは例示のために供するもので、限定を意図するも
のではない。
【0062】 (実施例) 実施例1:TRDLをコードする遺伝子の単離および配列決定 材料および方法 (a)IncyteデータベースのBLAST検索:Incyte LifeS
eqデータベースを基本的局所的整列検索ツール(BLAST)および質問として
完全ヒトTNF−α cDNA配列(受入れ番号M10988)を用いて検索した(
Altschul、S.F.、Gish、W.、Miller、W.、Myers、
E.W.およびLipman、D.J.(1990) Basic local ali
gnment search tool. J. Mol. Bio. 215、403-
410)。Altschul、S.F.、Gish、W.、Miller、W.、M
yers、E.W.およびLipman、D.J.(1990)Basic loca
l alignment search tool. J. Mol. Bio. 215
、403-410。
【0063】 (b)配列解析:全ヌクレオチド配列は、ABI373Aフルオセインベースの
配列決定器を用い (Perkin Elmer/Applied Biosyst
ems Division、PE/ABD、Foster City、CA)および
TaqFSTM ポリメラーゼでのABI PRISMTM Ready Dye−De
oxy Terminator kitを用いて直接的に得られた。各ABIサイ
クル配列決定反応は、約0.5μgのプラスミドDNAを含んだ。サイクル配列
決定は、最初の98℃における1分間の変性、続いての96℃における15秒間
の35サイクル、50℃における10秒間のアニーリングおよび60℃における
4分間の伸長を用いて行った。温度サイクルおよび時間は、Perkin−El
mer 9600 thermocyclerによって制御された。伸長産物は、
Centrisepゲル濾過カートリッジ(Princeton Separat
ion Systems、Adelphia、NJ)を用いて精製した。各反応産
物をピペットによってカラム中に負荷し、次いで、それをスイングバケット遠心
(Sorvall model RT6000B table Top centri
fuge)で室温にて4分間1500×gで遠心した。カラム精製試料を真空下
、約40分間乾燥させ、次いで、3μlのDNA負荷溶液(83%脱イオン化ホ
ルムアミド、8.3mM EDTAおよび1.6mg/mlのBlue Dextr
an)に溶解した。次いで、試料を90℃まで3分間で加熱し、ABI373A
シークエンサー(ストレッチ修飾)によって配列解析のためにゲル試料ウェルに負
荷した。配列解析は、シークエンサープログラム(Gene Codes、Ann
Arbor、MI)にABI373Aファイルを取込むことによって行った。一
般的に、700bpの配列の読みが得られた。潜在的な配列決定の誤りは、両D
NA鎖からの配列情報を得ることによって、および全配列決定のあいまいさを取
り去るまで、異なる位置においてプライマーを用い、異なる領域を再配列決定す
ることによって最小化した。クローン78258を含めたクラスター99092
のクローンについてのLifeSeq Assembly機能に沿った上記方法
は、隣接する709bpのcDNA配列が得られるのを可能とする(図2)。該配
列に含まれるのは、該隣接物中の最もはるか上流にあるクローン798247で
ある。
【0064】 結果および考察 質問としてヒトTNFαの全蛋白質コード領域(受入れ番号M10988)を用
いたIncyte LifeSeqロングリードデータベースのBLAST検索
は、統計的関連30の7個のマッチを同定した(p<1.0)(12)。Altsc
hul、S.F.、Gish、W.、Miller、W.、Myers、E.W.およ
びLipman、D.J.(1990)Basic local alignment
search tool. J. Mol. Bio. 215、403-410。これ
らのマッチのうち78258R1は、TNFαがFasL(Fasリガンド)およ
びTRAIL(TNF関連アポトーシス誘導リガンド)とも相同性である領域にお
いてTNFαと相同性を示した(図1Aおよび1B)。クローン78258R1を
用いた全Incyte LifeSeqデータベースのBLAST検索は、統計
的関連の23個のマッチを同定し (p<1.0)(Altschul、S.F.、G
ish、W.、Miller、W.、Myers、E.W.およびLipman、D
NA.J.(1990)Basic local alignment search
tool. J. Mol. Bio. 215、403-410)、それのうち8個は、
ヒトCpGアイランドDNAゲノムMsel断片と同定された。23個のマッチ
の解析は、16個がクローン78258と同一クラスターに属することを明らか
にした。78258を含むクラスター99092のアセンブリーは、隣接する7
09塩基対のcDNA配列を生じた。この隣接物は、(cDNAライブラリーO
VARNOT03、非腫瘍卵巣組織からの)798247を含めたいくつかの重
複クローンよりなり、それは最も遠い上流に出現し(図2)、TNFα、FasL
およびTRAILとの相同性を保持した。入手可能な798247 EST配列
は、285bpに限定され、3'端にて停止コドンを含むが、推定の開始メチオ
ニンを欠いた。TNFα同族体として798247を確認するために、該クロー
ンを完全配列解析用にIncyteから得た。
【0065】 pSPORT(Bethesda Research Laboratorie
s、Bethesda、MDNA)における798247の配列解析は、172
個のアミノ酸の部分的オープンリーデングフレームを含む828bpの挿入を同
定した。このクローンは、TNFαとの相同性の領域を保持するが、79824
7についての配列は、5'端にて推定開始メチオニンを欠いた。この観察は全長
クローンおよび完全な特徴付けを得るにはさらなるクローニング実験を必要とし
た。
【0066】 798247についての2つの全長クローンは、白血球cDNAライブラリー
から5×105プラークをスクリーニングすることによって得た。一次スクリー
ニングは、二連リフトにハイブリダイズする5個のプラークを同定した。5個の
うち4個は、続いてプラーク精製され、挿入サイズは、PCRによって決定した
。挿入サイズは、1.5および1.8kb間の範囲であった。pDR2(Clon
tech、Palo Alto、CA)における2個の該クローン、TRDL-1
4およびTRDL-11の配列解析は、248個のアミノ酸の推定オープンリー
ディングフレームを含む1408bpの一つの挿入および235個のアミノ酸の
推定オープンリーディングフレームを含む1537bpのもう一つの挿入を同定
した。クローン14および11は、クローン11には欠けるクローン14に存在
する16個のアミノ酸(残基111-127)をコードする48塩基対のインフレ
ーム挿入を除いてほぼ同一であった。クローン#11および#14の配列解析は
、TRDL遺伝子の代替スプライシングから生起するらしい798247配列と
の様々な差を明らかにした。さらに、183塩基対のエクソンは、クローン11
の3'端に存在し、それはクローン14に存在しなかった。両クローンは、起源
クローン798247ならびにIncyteクラスター99092および517
48からの隣接アセンブリーとほとんど同一であった。図6は、クローンTRD
L-14およびTRDL-11とTNF族メンバーとの蛋白質整列を示す。
【0067】 クローンTRDL-14の全長配列に対するもう一つのBLAST検索は、起
源隣接の5'端と重複するクローンの第2クラスターを示す。組み立てると、こ
のクラスター(51748)は、39クローンよりなる670bp隣接を産生した
。2つのクラスターを単一の組立体に入れると、クラスター51748の隣接の
3'端はクラスター99092の隣接の5'端と重複し、1136塩基対の新しい
隣接(881955)を形成し、オリジナル隣接にはないN末端を供した。
【0068】 TRDLは、他のTNF関連リガンドとの限定された配列相同性を保有した。
TNF、TRAILおよびFasLのような分子との配列保存は、カルボキシ末
端から100アミノ酸以内の2つの短いストレッチまでにまず制限された。同一
性のこれらの短いC末端ストレッチの同定は、貧弱な統計的スコアにも拘らず可
能な候補物としてオリジナルBLASTマッチの選択を可能とした。TNFα、
FasL およびTRAILに対する全パーセント同一性は、各々、17%、1
7%および12%である。著しくはないけれども、このレベルの相同性は、TN
Fサイトカイン族に典型的である。比較によって、TRAILは、FasLとわ
ずか28%の相同性、TNFαと23%の相同性、リンフォトキシンβと22%
の相同性である。これらの族のメンバーのように、TRDLは、細胞表面上にこ
の分子を適切に提示するのに必要であるらしいN末端近くの推定膜貫通セグメン
トを含む(Wiley、S.R.、Schooley、K.、Smolak、P.J.
、Din、W.S.、Huang、C−P.、Nicholl、J.K.、Suth
erland、G.R.、Davis Smith、T.、Rauch、C.、Sm
ith、C.A.および Goodwin、R.G.(1995)Identific
ation and characterization of a new mem
ber of the TNF family that induces apop
tosis. Immunity. 3、673-682)。
【0069】 実施例2:TRDL発現の組織分布 材料および方法 (a)pDR2/TRDLの調製:λDR2から5pDR2プラスミドへの変換
は、Clontechプロトコル#PT1011−1に記載のごとくAM1細胞
において行った。プラスミドDNAはQiagen mini−またはmaxi
−prep(Qiagen、Chatsworth、CA)によって精製した。
【0070】 (b)ノーザン分析:Incyte Electronic Northernを
(クラスター99092からの)クローン798247および(クラスター517
48からの)177393に対して行った。この機能は、Electronic
Northernを示し、所与の遺伝子が発現されるライブラリーおよび各々に
おけるその豊富さレベルを測定するという2つの目的を有する。LifeSeq
データベースにおいて、この分析は、マスタークラスターメンバーシップに基づ
いている。クローン177393はその配列がpDR2/TRDL−14の5'端
を表すので選択した。
【0071】 複数のヒト組織mRNAブロットは、Clontech Laborator
ies(Palo Alto、CA)から購入した。プラスミドDNA(pSPOR
T/798247)をNotI+SalIで消化し、QIAquick Gel E
xtraction Kit(Qiagen、Chatsworth、CA)によ
って精製し、マルチプライム標識キット(multiprime labelin
g kit)(Ready−to−go DNA labeling kit、Pha
rmacia Biotech)を用いてoc32PdCTPで標識した。ブロッ
トをExpress Hyb緩衝液中で(Clontech、Palo Alto
、CA)中で68℃にて2.5時間ハイブリダイズさせた。未結合プローブは、室
温にて2×SSC、0.05%SDS中で3回すばやくすすぎ、次いで2回、2
0分間洗浄し、続いて50℃にて0.1×SSC、0.1%SDS中で2回、30
分間洗浄することによって除去した。Hyperfilm MP(Amersha
m)を−80℃にて一晩感光させた。
【0072】 ヒト癌細胞系複数組織mRNAブロットはClontech(Palo Alt
o、CA)から購入した。pDR2/TRDL-14のコード領域の最初の約70
0bpを、5'-ATATGGATCCCAGCTCATGCCAGCCTCA-
3'(配列番号:12)および5'-AGTAAAGCTTGGAATTATGAC
ACTCAGAATATCCC-3'(配列番号:13)であるプライマーを用いて
PCR増幅した。ゲル精製したPCR産物をプローブとして用いるために標識し
、該ブロットを上記のごとくハイブリダイズさせた。
【0073】 (c)ドットブロット分析:腫瘍遺伝子スクリーニング用96ドット全RNAド
ットブロットはBiochain Institute、Inc(San Lea
ndro、CA)から購入した。該ブロットは、癌細胞系ノーザンブロットを併
用してハイブリダイズさせた。
【0074】 (d)白血球ライブラリーのスクリーニング:Clontechヒト白血球ライ
ブラリーHL1169X(λDR2)のスクリーニングはClontech La
mbda Library Protocol Handbook(PR92192
)に記載のごとく行った。標識798247プローブはReady-to-go B
eads(Pharmacia Biotech)およびα32PdCTP(Amer
sham)を用いて生成させた。5ラ105プラークの一次スクリーニングは、二
連リフトでハイブリダイズした5個のプラークを同定した。5個のうち4個は、
2°および3°スクリーンにてプラーク精製し、挿入サイズはPCRによって決
定した。
【0075】 結果および考察 クローン798247および177393についてのIncyte Life
Seq電子ノーザンの結果を図7に示す。これらの結果は、これらの2つのクロ
ーンによって表されるDNA配列が、炎症組織、腫瘍および豊富な末梢血液供給
を有する組織において主に発現されることを示す。
【0076】 798247の組織分布は、複数の組織から単離されたmRNAのノーザン分
析によって決定された。(pSPORT w/SalI & NotIから切り出し
た)全長798247挿入とのハイブリダイゼーションは、約1.6および1.8
kbにおいて2つのRNA種を同定した。最高レベルの発現は、肺および末梢血
中白血球において見られ、膵臓、結腸、小腸、前立腺および卵巣においては中間
レベルの発現であった。骨格筋、胸腺および精巣においては、ほとんどまたは検
出不可の発現であった(図8Aおよび8B)。
【0077】 ヒト癌細胞系のノーザンブロットをクローンTRDL-14のコード領域の最
初の約700bpを用いてハイブリダイズさせた。高度に発現されたRNA種は
、HeLaおよびSW480細胞において1.7kb、2.5kbにて同定した。
4.4kbにおける第三の種は、HeLa、SW480、HL-60およびK-5
62細胞において中程度に発現された(図9Aおよび9B)。
【0078】 また、腫瘍遺伝子スクリーニングRNAドットブロットは、TRDL-14 プ
ローブを用いてハイブリダイズさせた。最高レベルの発現は、十二指腸、結腸お
よび膵臓の正常試料と比較して腫瘍試料に見られた。対照的に、発現は、膀胱、
甲状腺、小腸、胸腺、副腎および乳房のごとき組織の腫瘍試料より正常試料にお
いてより高かった(図10Aおよび10B)。
【0079】 代替スプライシングについての証拠は、複数のヒト組織から単離されたRNA
を用いたノーザン分析を介して見られた。肺および末梢血中白血球は、1.6k
bの転写体にのみの高レベルの発現を示した。対照的に、低レベルの1.8kb
転写体は、腎臓、膵臓および前立腺のような組織において出現した。このサイズ
差は、クローンpDR2/TRDL-14から抜け落ちた183bpのエクソンと
合致し、組織に見られた2つの転写体サイズに対応し得る。また、2つの転写体
は、腫瘍細胞系のノーザン分析においても見られた。この場合、両転写体は、同
一細胞系に存在した。かくして、高発現レベルを有する組織(肺および末梢血中
白血球)は、選択的に1.6kbの転写体を産生するらしい。対照的に、低レベル
のTRDL発現を有する組織は、1.8kbメッセージを生じさせる。この異な
る発現は、組織特異的発現および機能的調節についてのメカニズムとしての代替
スプライシングを示唆する。
【0080】 TRDLの発現プロフィールは、他のTNF関連サイトカインの発現プロフィ
ールと同様であるが同一ではない。例えば、最近記載されたTRAILリガンド
は、他の組織において見られたものと同様である肺および末梢血中白血球におけ
る発現レベルを示した (Wiley、S.R.、Schooley、K.、Smo
lak;P.J.、Din、W.S.、Huang、C−P.、Nicholl、J.
K.、Sutherland、G.R.、Davis Smith、T.、Rauc
h、C.、Smith、C.A.およびGoodwin、R.G.(1995)Ide
ntification and characterization of a
new member of the TNF family that induc
es apoptosis. Immunity. 3、673-682)。癌細胞系
において、TRDLの発現は、HeLa(子宮癌)およびSW480(結腸直腸癌)
細胞系にまず限定され、再度、この遺伝子の細胞特異的発現の能力を示した。I
ncyteデータベースを用いたTRDLの電子ノーザン分析は、炎症メディエ
ーターとしてこの分子を注目させる発現パターンを明らかにした。TRDLに対
応する少なくとも一つのESTは、42個の異なるライブラリーにおいて同定さ
れた。これらのうち24個のESTは、炎症組織または腫瘍において出現した。
これは、標的疾患状態においてTRDLの存在を確認する。
【0081】 実施例3:TRDLの異種発現 材料および方法 (a)E. coliにおけるpcDNA3/TRDL-14の発現:ポリメラーゼ
鎖反応を利用して、BamHIおよびEcoRI修飾プライマーを用いてpDR
2/TRDL-14からTRDL−14の全長コード領域を増幅した。用いたプラ
イマーは、Genosys Biotechnologies、Inc.(The
Woodlands、TX)から購入した5'-CAGCTCATGCCAGCC
TCA-3'(配列番号:14)および5'-TATCCGTAAAATCAAAGT
CCCAG-3'(配列番号:15)であった。10ngのプラスミドは、以下のP
CR条件下で鋳型として供した:30サイクル(94℃にて30秒間;55℃に
て1分間;72℃にて1分間)。該産物は、SureCloneキット(Phar
macia Biotech)を用いてサブクローニングした。DH5αコンピテ
ント細胞(GIBCO-BRL)を形質転換させ、プラスミドDNAを精製した(Q
iagen、Chatsworth CA)。BamHIおよびEcoRI消化に
よって挿入を取出し、pcDNA3(Invitrogen、Carlsbad
CA)に移した。DH5αコンピテント細胞を形質転換させ、陽性コロニーをP
CR分析によって決定した。陽性コロニーからのプラスミドDNAを精製(Qi
agen)し、上記のごとくABI373A蛍光をベースとしたシーケンサーを
用いて挿入配列を確認した。
【0082】 (b)CHO細胞におけるヒトTRDLの発現:ヒトTRDLの完全オープンリ
ーディングフレームをCMV即時型プロモーターの制御下、チャイニーズハムス
ター卵巣(CHO)細胞中で発現させた。プラスミドpDR2/TRDL14をX
baIおよびBamHIで2重消化し、得られたcDNA断片をXbaIおよび
BamHI消化したpUC18に連結させて、pUC18-TRDL14を得た
。pUC18/TRDL14をEcoRIおよびBamHIで2重消化し、得ら
れたDNA断片をEcoRIおよびBamHI消化したpcDNA3に連結させ
て、pcDNA3/TRDL14を得た。次いで、pcDNA3/TRDL14を
用いて、リポフェクタミン(Lipofectamine)を使用してCHO K
1細胞にトランスフェクトし、安定なトランスフェクタントをネオマイシン選択
(G418 0.8μg/ml)により単離した。クローン細胞系は限界希釈により
調製した。
【0083】 ヒトTRDL-11およびヒトTRDL-14の予測細胞外ドメインを、バキュ
ロウイルス導入ベクターpAcHLT-Aにおいて、6つのHis-タグを持つN
2末端融合としての発現のためにPCRによって作成した。NdeI制限部位
を含む共通5'センスオリゴヌクレオチド・プライマー(5'-CATATGCAC
AGAGCTGCAGAGCCTCAGGAG-3'(配列番号:16)、TRDL
-14における塩基対217-239およびTRDL-11における塩基対226-
248)を、PCRにおいて、TRDL-11またはTRDL-14のいずれかに
ついて特異的で、KpnI部位を含む3'アンチセンスプライマー(各々、TRD
L-14およびTRDL-11における781-804および750-774の塩基
対に対応する5'-TCACAGTTTCACAAACCCCAGGAAG-3'(
配列番号:17)および5'-GTAAAATCAAAGTCCCAGGAAGG
T-3'(配列番号:18))と対合させた。pDR2/TRDL14プラスミドDN
AまたはpDR2/TRDL11プラスミドDNA(0.1μg)をセンスおよびア
ンチセンスプライマー(1μM)およびPwo耐熱性のポリメラーゼを用いて、次
のサイクル条件下で増幅させた;20サイクルにわたって、94℃にて1分間の
変性、65℃にて2分間のアニーリングおよび72℃にて3分間の伸長。得られ
た産物は、NdeIおよびKpnIで完全消化し、NdeIおよびKpnI消化
されたバキュロウイルス導入ベクターpAcHLT-Aに連結させて、pAcH
LT-A/TRDL14およびpAcHLT-A/TRDL11を得た。両発現プラ
スミドを両鎖に対して完全に配列決定して、オープンリーディングフレームの完
全さを確認した。
【0084】 (c)バキュロウイルスにおけるヒトTRDLの発現:ヒトTRDL-11(pA
cHLT-A/TRDL11)またはヒトTRDL-14(pAcHLT-A/TRD
L14)のいずれかを含むバキュロウイルス導入ベクターを標準的トランスフェ
クション手法を用いて、Sf9細胞にBaculoGoldTM DNAと共にト
ランスフェクトした。細胞内発現は感染中の細胞の代謝的標識、続いてのSDS
-PAGE分析によって確認した。5個の区別されるウイルスプラークをクロー
ニングし、TRDL発現を分析して、単一の高産生ウイルス単離体を得た。次い
で、増幅されたウイルスストックを用いて、5PFU/細胞にてSf9細胞また
はHi5細胞のいずれかのグレース(Grace)の無血清培地/リットルにおい
て約1ラ109個の細胞を感染させた。振盪フラスコ中の65時間に続いて、感染
細胞を遠心によって得、細胞溶解物をNiアガロースを用いた精製用の出発物質
として供した。
【0085】 (d)Sf9細胞からの分泌用の細胞外ドメインの作成:ヒトTRDL11 お
よびヒトTRDL14の予測細胞外ドメインは、バキュロウイルス導入ベクター
pVT-Bacにおけるミツバチメラチン(melatin)リーダー配列とのイ
ンフレーム融合を調製することによって、Sf9細胞からの分泌のために作成さ
れた(Tessier、D.C.、Thomas、D.Y.、Khouri、H.E.
、Laliberte、F.およびVernet、T.、Gene 98:177-
183(1991))。pVT-Bacへの指向性クローニング用の制限部位を取込
んだセンスおよびアンチセンスPCRプライマーを用いて、上記のごとく細胞外
ドメインに対応するTRDL11またはTRDL14のコード配列の領域を増幅
させた。次いで、増幅産物を適当な制限エンドヌクレアーセで完全消化し、pV
T-Bacにサブクローニングした。BaculoGold DNAでの共トラン
スフェクションによってpVT-Bac/TRDL11およびpVT-Bac/TR
DL14の発現を上記のごとく行った。
【0086】 (e)ヒトTRDLのゲノムクローンの単離:ヒトTRDLの部分的cDNAク
ローンを用いて、コロニーハイブリダイゼーションによって、細菌性人工染色体
(BAC)ゲノムクローンを単離した。cDNA挿入は、α-32P-dATPでラン
ダムプライム標識して、それを用いてヒトBACゲノムライブラリーをスクリー
ニングした。個々のクローンを希釈プレーティングおよび再スクリーニングによ
って単離し、2つのクローン14814および14815を得た。共有エクソン
またはTRDL-14/TRDL-11エクソンのいずれかに特異的なオリゴヌク
レオチドプライマーを用いたPCR分析は、両BACクローンがヒトTRDLの
全オープンリーディングフレームを含むことを確認した。
【0087】 実施例4:in situハイブリダイゼーションにおける蛍光によるヒトTR
DLのヒト染色体マッピング クローン14815からのDNAをニックトランスレーションによってジゴキ
シゲニンdUTPで標識した。標識プローブを剪断されたヒトDNAと組合せ、
50%ホルムアミド、10%硫酸デキストランおよび2×SSCを含んだ溶液中
の植物凝集素(PHA)刺激の末梢血中リンパ球から誘導された正常な中期染色体
にハイブリダイズさせた。特異的ハイブリダイゼーションシグナルを、フルオレ
セイン化抗ジゴキシゲニン抗体とのインキュベーション、続いての一つの色試験
についての4',6-ジアミジン-2'-フェニルインドール二塩酸塩(DAPI)で対
比染色した。2つの色試験におけるプローブ検出は、フルオレセイン化抗ジゴキ
シゲニン抗体およびTexas radアビジンとのインキュベーションし、続
いてのDAPIでの対比染色によって達成した。最初の試験の結果、サイズ、形
態学および結合パターンに基づき、染色体17であると考えられるグループE染
色体の短腕を特異的に標識した。第2の試験を行い、そこでは染色体17の動原
体領域に特異的なビオチン標識プローブをクローン14815と共にハイブリダ
イズさせた。この試験の結果、赤色で動原体を、緑色で染色体17の短腕を特異
的に標識した。該14815を示した10個の特異的に標識された染色体17の
測定値は、バンド17p13.3に対応する領域において動原体から染色体アー
ム17pのテロメアへの距離の77%である位置にある。合計80個の中期細胞
は、特異的標識を示す72個で分析した。
【0088】 脊椎動物遺伝子の上流配列内に位置するCpGアイランドの過メチル化は、潜
在的な遺伝子サイレンシング結果を有する。いくつかの研究は、両結腸、乳房お
よび前立腺中の正常DNAに比較して、腫瘍DNAにおいてヒト染色体17pl
3.3に対してCpGアイランドの過メチル化を示した(Ribierasら、J
. of Cellular Biochemistry 56:86-96(199
4);Morton、R.A.ら、J. Urology 156:512-516(1
996))。An essential role for NF−κB in pre
venting cell death. Science. 274:782-78
4)。さらに、TRDL遺伝子内のCpGアイランドは、CpGアイランドとし
ていくつかのTRDL ESTの注釈に導く。かくして、TRDL遺伝子の過メ
チル化および結果として生じた不活性化は、癌を生じる可能性がある。
【0089】 実施例5:TRDL作動薬および拮抗薬の高処理量スクリーニング 材料および方法 (a)放射性標識ヒトTRDLの調製:ヒトTRDLの可溶性細胞外ドメインを
上記のごとくバキュロウイルスを用いてアミノ末端6-His-タグ融合として発
現させる。感染細胞によって産生された物質は、低張溶解/均質化、続いてNi-
NTAアガロース上のアフィニティークロマトグラフィーによって細胞から回収
する。次いで、精製蛋白質をイミダゾール含有緩衝液を用いてアフィニティー樹
脂から溶出させ、使用に先立ってアリコートにて凍結貯蔵する。 精製TRDL蛋白質の試料は、ヨードゲンを用い125Iで放射性標識した。ヨ
ードゲン(CHCl3中の1.0mg/ml溶液の1.0μl)を窒素下で蒸発させ、
30μlの1.0M KPO4(pH7.0)/10μl(1.0mCi)のNal 25Iと
混合し、氷上で10分間インキュベートする。この混合物を20μl中10μg
のヒトTRDLを含む試験管に移し、氷上で5分間反応させる。非取込みNal 2 5 IをPBS/0.1%ゼラチンで平衡化したPD10カラムを用いて除去する。
【0090】 (b)受容体結合アッセイおよび高処理量スクリーニングの開発:l 25I-TRD
Lを用いて高アフィニティー受容体の存在についてヒト細胞系を調査する[U9
37、THP-1、Jurkat、HeLaおよびSW480]。1.0ラ106
胞を含む三連の試験管を全容量0.5mlのRPMI 1640培地/2% FCS
中の0-10nMの範囲にわたって量を増加させる未標識TRDLの存在または
不存在において、2.0ラ105dpmのl 25I-TRDLと共にインキュベートす
る。氷上で2時間後、該細胞を10mlの新鮮な培地で3回洗浄し、細胞関連T
RDLをγカウントによって定量する。
【0091】 高処理量スクリーニングは、シンチレーション近接アッセイ(SPA)を用いて
行う。高レベルのTRDL受容体を発現する細胞系から調製された膜を、氷上で
の1時間のインキュベーションによってSPAビーズ上にコートする。膜コート
したSPAビーズをl 25I-TRDLと混合し、室温にて30分間インキュベート
する。次いで、該SPAビーズをPBSで洗浄し、シンチレーションをシンチレ
ーション分光光度計を用いて検出する。スクリーニングでは、SPA結合アッセ
イを試験化合物(10μM)の存在下または不存在下で行い、これらの条件下で>
50%までSPAシグナルを低下させる薬剤を陽性として評点付けした。
【0092】 実施例6:細胞死の定量用のアッセイ 細胞死アッセイ:細胞死をDNA結合染料YOPRO-1(Molecular Probes、Junction City、OR.)を用いて定量する(Idz
iorek、T.ら.、J. Immuno. Meth. 185:249-258(1
995)。24ウェルプレート中の密集した、血清枯渇のMCF7細胞をUVま
たはエトポシドのいずれかで16時間処理する。次いで、1μMのYOPRO-
1を細胞と共に37℃にて60分間インキュベートする。YOPRO-1取込み
を460nm励起および585nm放射にての蛍光プレートリーダーにおいてプ
レートを読み取ることによって評価する。
【0093】 本発明は、これまでの記載および実施例において特に記載されたごときとは他
の方法で実施できることは明らかであろう。 本発明の多数の修飾および変形は、上記の教示に徴すると可能であり、従って
、本発明の範囲内にある。 本明細書中に引用した全刊行物の全ての開示を、ここに出典明示して本明細書
の一部とみなす。
【0094】 (配列表) (1)一般的情報: (i)出願人:ビーンコウスキー、マイケル・ジェイ ミルズ、シンシア・ジェイ ジョーンズ、デイビッド・エイ (ii)発明の名称:TNF関連死リガンド (iii)配列数:18 (iv)通信宛先: (A)宛先:ファルマシア・アップジョン、知的所有権法律部門 (B)街:ヘンリエッタ・ストリート301番 (C)市:カラマズー (D)州:ミシガン (E)国:アメリカ合衆国 (F)郵便番号:49001 (v)コンピューター判読形式: (A)媒体型:フロッピーディスク (B)コンピューター:IBM PC互換性 (C)オペレーティングシステム:PC-DOS/MS-DOS (D)ソフトウェア:PatentIn Release #1.0,Version #1.25 (vi)現時の出願データ: (A)出願番号: (B)出願日: (C)分類: (Viii)代理人/代行者情報 (A)氏名:カーバー、ローリー・エル (B)登録番号:第41,113号 (C)参照/明細書番号:6111.P CN1 (ix)電気通信情報 (A)電話:616/833-0974 (B)ファックス:616/833-8897 (c)テレックス:224401
【0095】 (2)配列番号:1 に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:1550塩基対 (B)型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:1: TTTCAGGTCC CGGATCCGCG CTTGCTACCC CACTCTTGAA ACCACAGCTG TTGGCAGGGT 60 CCCCAGCTCA TGCCAGCCTC ATCTCCTTTC TTGCTAGCCC CCAAAGGGCC TCCAGGCAAC 120 ATGGGGGGCC CAGTCAGAGA GCCGGCACTC TCAGTTGCCC TCTGGTTGAG TTGGGGGGCA 180 GCTCTGGGGG CCGTGGCTTG TGCCATGGCT CTGCTGACCC AACAAACAGA GCTGCAGAGC 240 CTCAGGAGAG AGGTGAGCCG GCTGCAGGGG ACAGGAGGCC CCTCCCAGAA TGGGGAAGGG 300 TATCCCTGGC AGAGTCTCCC GGAGCAGAGT TCCGATGCCC TGGAAGCCTG GGAGAGTGGG 360 GAGAGATCCC GGAAAAGGAG AGCAGTGCTC ACCCAAAAAC AGAAGAATGA CTCCGATGTG 420 ACAGAGGTGA TGTGGCAACC AGCTCTTAGG CGTGGGAGAG GCCTACAGGC CCAAGGATAT 480 GGTGTCCGAA TCCAGGATGC TGGAGTTTAT CTGCTGTATA GCCAGGTCCT GTTTCAAGAC 540 GTGACTTTCA CCATGGGTCA GGTGGTGTCT CGAGAAGGCC AAGGAAGGCA GGAGACTCTA 600 TTCCGATGTA TAAGAAGTAT GCCCTCCCAC CCGGACCGGG CCTACAACAG CTGCTATAGC 660 GCAGGTGTCT TCCATTTACA CCAAGGGGAT ATTCTGAGTG TCATAATTCC CCGGGCAAGG 720 GCGAAACTTA ACCTCTCTCC ACATGGAACC TTCCTGGGGT TTGTGAAACT GTGATTGTGT 780 TATAAAAAGT GGCTCCCAGC TTGGAAGACC AGGGTGGGTA CATACTGGAG ACAGCCAAGA 840 GCTGAGTATA TAAAGGAGAG GGAATGTGCA GGAACAGAGG CGTCTTCCTG GGTTTGGCTC 900 CCCGTTCCTC ACTTTTCCCT TTTCATTCCC ACCCCCTAGA CTTTGATTTT ACGGATATCT 960 TGCTTCTGTT CCCCATGGAG CTCCGAATTC TTGCGTGTGT GTAGATGAGG GGCGGGGACG 1020 GGCGCCAGGC ATTGTCCAGA CCTGGTCGGG CCCACTGGAA GCATCCAGAA CAGCACCACC 1080 ATCTAGCGGC CGCTCGAGGG AAGCACCCGC CGGTTGGCCG AAGTCCACGA AGCCGCCCTC 1140 TGCTAGGGAA AACCCCTGGT TCTCCATGCC ACACCTCTCT CCAGGTGCCC TCTGCCTCTT 1200 CACCCCACAA GAAGCCTTAT CCTACGTCCT TCTCTCCATC TATCGGACCC CAGTTTCCAT 1260 CACTATCTCC AGAGATGTAG CTATTATGCG CCCGTCTACA GGGGGTGCCC GACGATGACG 1320 GTGCCTTCGC AGTCAAATTA CTCTTCGGGT CCCAAGGTTT GGCTTTCACG CGCTCCATTG 1380 CCCCGGCGTG GCAGGCCATT CCAAGCCCTT CCGGGCTGGA ACTGGTGTCG GAGGAGCCTC 1440 GGGTGTATCG TACGCCCTGG TGTTGGTGTT GCCTCACTCC TCTGAGCTCT TCTTTCTGAT 1500 CAAGCCCTGC TTAAAGTTAA ATAAAATAGA ATGAATGATA AAAAAAAAAA 1550
【0096】 (2)配列番号:2 に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:234アミノ酸 (B)型:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:蛋白質 (xi)配列:配列番号:2: Met Pro Ala Ser Ser Pro Phe Leu Leu Ala Pro Lys Gly Pro Pro Gly 1 5 10 15 Asn Met Gly Gly Pro Val Arg Glu Pro Ala Leu Ser Val Ala Leu Trp 20 25 30 Leu Ser Trp Gly Ala Ala Leu Gly Ala Val Ala Cys Ala Met Ala Leu 35 40 45 Leu Thr Gln Gln Thr Glu Leu Gln Ser Leu Arg Arg Glu Val Ser Arg 50 55 60 Leu Gln Gly Thr Gly Gly Pro Ser Gln Asn Gly Glu Gly Tyr Pro Trp 65 70 75 80 Gln Ser Leu Pro Glu Gln Ser Ser Asp Ala Leu Glu Ala Trp Glu Ser 85 90 95 Gly Glu Arg Ser Arg Lys Arg Arg Ala Val Leu Thr Gln Lys Gln Lys 100 105 110 Asn Asp Ser Asp Val Thr Glu Val Met Trp Gln Pro Ala Leu Arg Arg 115 120 125 Gly Arg Gly Leu Gln Ala Gln Gly Tyr Gly Val Arg Ile Gln Asp Ala 130 135 140 Gly Val Tyr Leu Leu Tyr Ser Gln Val Leu Phe Gln Asp Val Thr Phe 145 150 155 160 Thr Met Gly Gln Val Val Ser Arg Glu Gly Gln Gly Arg Gln Glu Thr 165 170 175 Leu Phe Arg Cys Ile Arg Ser Met Pro Ser His Pro Asp Arg Ala Tyr 180 185 190 Asn Ser Cys Tyr Ser Ala Gly Val Phe His Leu His Gln Gly Asp Ile 195 200 205 Leu Ser Val Ile Ile Pro Arg Ala Arg Ala Lys Leu Asn Leu Ser Pro 210 215 220 His Gly Thr Phe Leu Gly Phe Val Lys Leu 225 230
【0097】 (2)配列番号:3 に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:1430塩基対 (B)型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:3: TTTTATTTCA GGTCCCGGAT CCGCGCTTGA AACCACAGCT GTTGGCAGGG TCCCCAGCTC 60 ATGCCAGCCT CATCTCCTTT CTTGCTAGCC CCCAAAGGGC CTCCAGGCAA CATGGGGGGC 120 CCAGTCAGAG AGCCGGCACT CTCAGTTGCC CTCTGGTTGA GTTGGGGGGC AGCTCTGGGG 180 GCCGTGGCTT GTGCCATGGC TCTGCTGACC CAACAAACAG AGCTGCAGAG CCTCAGGAGA 240 GAGGTGAGCC GGCTGCAGGG GACAGGAGGC CCCTCCCAGA ATGGGGAAGG GTATCCCTGG 300 CAGAGTCTCC CGGAGCAGAG TTCCGATGCC CTGGAAGCCT GGGAGAATGG GGAGAGATCC 360 CGGAAAAGGA GAGCAGTGCT CACCCAAAAA CAGAAGAAGC AGCACTCTGT CCTGCACCTG 420 GTTCCCATTA ACGCCACCTC CAAGGATGAC TCCGATGTGA CAGAGGTGAT GTGGCAACCA 480 GCTCTTAGGC GTGGGAGAGG CCTACAGGCC CAAGGATATG GTGTCCGAAT CCAGGATGCT 540 GGAGTTTATC TGCTGTATAG CCAGGTCCTG TTTCAAGACG TGACTTTCAC CATGGGTCAG 600 GTGGTGTCTC GAGAAGGCCA AGGAAGGCAG GAGACTCTAT TCCGATGTAT AAGAAGTATG 660 CCCTCCCACC CGGACCGGGC CTACAACAGC TGCTATAGCG CAGGTGTCTT CCATTTACAC 720 CAAGGGGATA TTCTGAGTGT CATAATTCCC CGGGCAAGGG CGAAACTTAA CCTCTCTCCA 780 CATGGAACCT TCCTGGGACT TTGATTTTAC GGATATCTTG CTTCTGTTCC CCATGGAGCT 840 CCGAATTCTT GCGTGTGTGT AGATGAGGGG CGGGGGACGG GCGCCAGGCA TTGTTCAGAC 900 CTGGTCGGGG CCCACTGGAA GCATCCAGAA CAGCACCACC ATCTAGCGGC CGCTCGAGGG 960 AAGCACCCGC CGGTTGGCCG AAGTCCACGA AGCCGCCCTC TGCTAGGGAA AACCCCTGGT 1020 TCTCCATGCC ACACCTCTCT CCAGGTGCCC TCTGCCTCTT CACCCCACAA GAAGCCTTAT 1080 CCTACGTCCT TCTCTCCATC TATCGGACCC CAGTTTCCAT CACTATCTCC AGAGATGTAG 1140 CTATTATGCG CCCGTCTACA GGGGGTGCCC GACGATGACG GTGCCTTCGC AGTCAAATTA 1200 CTCTTCGGGT CCCAAGGTTT GGCTTTCACG CGCTCCATTG CCCCGGCGTG GCAGGCCATT 1260 CCAAGCCCTT CCGGGCTGGA ACTGGTGTCG GAGGAGCCTC GGGTGTATCG TACGCCCTGG 1320 TGTTGGTGTT GCCTCACTCC TCTGAGCTCT TCTTTCTGAT CAAGCCCTGC TTAAAGTTAA 1380 ATAAAATAGA ATGAATGATA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA 1430
【0098】 (2)配列番号:4 に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:247アミノ酸 (B)型:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:蛋白質 (xi)配列:配列番号:4: Met Pro Ala Ser Ser Pro Phe Leu Leu Ala Pro Lys Gly Pro Pro Gly 1 5 10 15 Asn Met Gly Gly Pro Val Arg Glu Pro Ala Leu Ser Val Ala Leu Trp 20 25 30 Leu Ser Trp Gly Ala Ala Leu Gly Ala Val Ala Cys Ala Met Ala Leu 35 40 45 Leu Thr Gln Gln Thr Glu Leu Gln Ser Leu Arg Arg Glu Val Ser Arg 50 55 60 Leu Gln Gly Thr Gly Gly Pro Ser Gln Asn Gly Glu Gly Tyr Pro Trp 65 70 75 80 Gln Ser Leu Pro Glu Gln Ser Ser Asp Ala Leu Glu Ala Trp Glu Asn 85 90 95 Gly Glu Arg Ser Arg Lys Arg Arg Ala Val Leu Thr Gln Lys Gln Lys 100 105 110 Lys Gln His Ser Val Leu His Leu Val Pro Ile Asn Ala Thr Ser Lys 115 120 125 Asp Asp Ser Asp Val Thr Glu Val Met Trp Gln Pro Ala Leu Arg Arg 130 135 140 Gly Arg Gly Leu Gln Ala Gln Gly Tyr Gly Val Arg Ile Gln Asp Ala 145 150 155 160 Gly Val Tyr Leu Leu Tyr Ser Gln Val Leu Phe Gln Asp Val Thr Phe 165 170 175 Thr Met Gly Gln Val Val Ser Arg Glu Gly Gln Gly Arg Gln Glu Thr 180 185 190 Leu Phe Arg Cys Ile Arg Ser Met Pro Ser His Pro Asp Arg Ala Tyr 195 200 205 Asn Ser Cys Tyr Ser Ala Gly Val Phe His Leu His Gln Gly Asp Ile 210 215 220 Leu Ser Val Ile Ile Pro Arg Ala Arg Ala Lys Leu Asn Leu Ser Pro 225 230 235 240 His Gly Thr Phe Leu Gly Leu 245
【0099】 (2)配列番号:5 に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:24アミノ酸 (B)型:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:5: Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys Gly Asp 1 5 10 15 Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg 20
【0100】 (2)配列番号:6 に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:24アミノ酸 (B)型:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:6: Tyr Asn Xaa Cys Tyr Xaa Ala Gly Val Phe His Leu His Gln Gly Asp 1 5 10 15 Ile Leu Ser Val Ile Ile Pro Arg 20
【0101】 (2)配列番号:7 に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:16アミノ酸 (B)型:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:7: Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe Lys 1 5 10 15
【0102】 (2)配列番号:8 に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:16アミノ酸 (B)型:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:8: Ile Gln Asp Ala Gly Val Tyr Leu Leu Tyr Arg Gln Val Leu Phe Gln 1 5 10 15
【0103】 (2)配列番号:9 に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:233アミノ酸 (B)型:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:蛋白質 (xi)配列:配列番号:9: Met Ser Thr Glu Ser Met Ile Arg Asp Val Glu Leu Ala Glu Glu Ala 1 5 10 15 Leu Pro Lys Lys Thr Gly Gly Pro Gln Gly Ser Arg Arg Cys Leu Phe 20 25 30 Leu Ser Leu Phe Ser Phe Leu Ile Val Ala Gly Ala Thr Thr Leu Phe 35 40 45 Cys Leu Leu His Phe Gly Val Ile Gly Pro Gln Arg Glu Glu Phe Pro 50 55 60 Arg Asp Leu Ser Leu Ile Ser Pro Leu Ala Gln Ala Val Arg Ser Ser 65 70 75 80 Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val Val Ala Asn Pro 85 90 95 Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg Ala Asn Ala Leu 100 105 110 Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu Val Val Pro Ser 115 120 125 Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe Lys Gly Gln Gly 130 135 140 Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile Ser Arg Ile Ala 145 150 155 160 Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala Ile Lys Ser Pro 165 170 175 Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys Pro Trp Tyr Glu 180 185 190 Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys Gly Asp Arg Leu 195 200 205 Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe Ala Glu Ser Gly 210 215 220 Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu 225 230
【0104】 (2)配列番号:10に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:281アミノ酸 (B)型:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:蛋白質 (xi)配列:配列番号:10: Met Gln Gln Pro Phe Asn Tyr Pro Tyr Pro Gln Ile Tyr Trp Val Asp 1 5 10 15 Ser Ser Ala Ser Ser Pro Trp Ala Pro Pro Gly Thr Val Leu Pro Cys 20 25 30 Pro Thr Ser Val Pro Arg Arg Pro Gly Gln Arg Arg Pro Pro Pro Pro 35 40 45 Pro Pro Pro Pro Pro Leu Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Leu Pro 50 55 60 Pro Leu Pro Leu Pro Pro Leu Lys Lys Arg Gly Asn His Ser Thr Gly 65 70 75 80 Leu Cys Leu Leu Val Met Phe Phe Met Val Leu Val Ala Leu Val Gly 85 90 95 Leu Gly Leu Gly Met Phe Gln Leu Phe His Leu Gln Lys Glu Leu Ala 100 105 110 Glu Leu Arg Glu Ser Thr Ser Gln Met His Thr Ala Ser Ser Leu Glu 115 120 125 Lys Gln Ile Gly His Pro Ser Pro Pro Pro Glu Lys Lys Glu Leu Arg 130 135 140 Lys Val Ala His Leu Thr Gly Lys Ser Asn Ser Arg Ser Met Pro Leu 145 150 155 160 Glu Trp Glu Asp Thr Tyr Gly Ile Val Leu Leu Ser Gly Val Lys Tyr 165 170 175 Lys Lys Gly Gly Leu Val Ile Asn Glu Thr Gly Leu Tyr Phe Val Tyr 180 185 190 Ser Lys Val Tyr Phe Arg Gly Gln Ser Cys Asn Asn Leu Pro Leu Ser 195 200 205 His Lys Val Tyr Met Arg Asn Ser Lys Tyr Pro Gln Asp Leu Val Met 210 215 220 Met Glu Gly Lys Met Met Ser Tyr Cys Thr Thr Gly Gln Met Trp Ala 225 230 235 240 Arg Ser Ser Tyr Leu Gly Ala Val Phe Asn Leu Thr Ser Ala Asp His 245 250 255 Leu Tyr Val Asn Val Ser Glu Leu Ser Leu Val Asn Phe Glu Glu Ser 260 265 270 Gln Thr Phe Phe Gly Leu Tyr Lys Leu 275 280
【0105】 (2)配列番号:11に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:281アミノ酸 (B)型:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:蛋白質 (xi)配列:配列番号:11: Met Ala Met Met Glu Val Gln Gly Gly Pro Ser Leu Gly Gln Thr Cys 1 5 10 15 Val Leu Ile Val Ile Phe Thr Val Leu Leu Gln Ser Leu Cys Val Ala 20 25 30 Val Thr Tyr Val Tyr Phe Thr Asn Glu Leu Lys Gln Met Gln Asp Lys 35 40 45 Tyr Ser Lys Ser Gly Ile Ala Cys Phe Leu Lys Glu Asp Asp Ser Tyr 50 55 60 Trp Asp Pro Asn Asp Glu Glu Ser Met Asn Ser Pro Cys Trp Gln Val 65 70 75 80 Lys Trp Gln Leu Arg Gln Leu Val Arg Lys Met Ile Leu Arg Thr Ser 85 90 95 Glu Glu Thr Ile Ser Thr Val Gln Glu Lys Gln Gln Asn Ile Ser Pro 100 105 110 Leu Val Arg Glu Arg Gly Pro Gln Arg Val Ala Ala His Ile Thr Gly 115 120 125 Thr Arg Gly Arg Ser Asn Thr Leu Ser Ser Pro Asn Ser Lys Asn Glu 130 135 140 Lys Ala Leu Gly Arg Lys Ile Asn Ser Trp Glu Ser Ser Arg Ser Gly 145 150 155 160 His Ser Phe Leu Ser Asn Leu His Leu Arg Asn Gly Glu Leu Val Ile 165 170 175 His Glu Lys Gly Phe Tyr Tyr Ile Tyr Ser Gln Thr Tyr Phe Arg Phe 180 185 190 Gln Glu Glu Ile Lys Glu Asn Thr Lys Asn Asp Lys Gln Met Val Gln 195 200 205 Tyr Ile Tyr Lys Tyr Thr Ser Tyr Pro Asp Pro Ile Leu Leu Met Lys 210 215 220 Ser Ala Arg Asn Ser Cys Trp Ser Lys Asp Ala Glu Tyr Gly Leu Tyr 225 230 235 240 Ser Ile Tyr Gln Gly Gly Ile Phe Glu Leu Lys Glu Asn Asp Arg Ile 245 250 255 Phe Val Ser Val Thr Asn Glu His Leu Ile Asp Met Asp His Glu Ala 260 265 270 Ser Phe Phe Gly Ala Phe Leu Val Gly 275 280
【0106】 (2)配列番号:12に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:28塩基対 (B)型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:12: ATATGGATCC CAGCTCATGC CAGCCTCA 28
【0107】 (2)配列番号:13に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:35塩基対 (B)型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:13: AGTAAAGCTT GGAATTATGA CACTCAGAAT ATCCC 35
【0108】 (2)配列番号:14に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:18塩基対 (B)型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:14: CAGCTCATGC CAGCCTCA 18
【0109】 (2)配列番号:15に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:23塩基対 (B)型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:15: TATCCGTAAA ATCAAAGTCC CAG 23
【0110】 (2)配列番号:16に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:30塩基対 (B)型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:16: CATATGCACA GAGCTGCAGA GCCTCAGGAG 30
【0111】 (2)配列番号:17に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:25塩基対 (B)型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:17: TCACAGTTTC ACAAACCCCA GGAAG 25
【0112】 (2)配列番号:18に関する情報: (i)配列の特性: (A)長さ:24塩基対 (B)型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:18: GTAAAATCAA AGTCCCAGGA AGGT 24
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1Aおよび1B】 図1Aおよび1Bは、TNF同族体についてのIncyte LifeSeq
データ調査の結果を示す配列比較である。そのデータベースを基本的局在配置ツ
ール(BLAST)およびTNF-α(受入#M10988)についての配列を用い
て調査した。クローン78258のコード領域における2つの領域は、TNF-
αとの相同性の注目領域を有する。図1Aは、1つのかかる相同性領域を示す:
クローン78258(配列番号:5)の領域をTNF-α(配列番号:6)の領域と
比較する。図1Bは、もう一つの相同性領域を示す:クローン78258(配列
番号:7)の第二領域をTNF-α(配列番号:8)の第二領域と比較する。
【図2】 図2は、709bpcDNA配列内のクローンのクラスターアセンブリおよび
コンセンサスを示す。隣接する709bpのcDNA配列は、クローン7825
8を含めたクラスター99092のクローンについてLifeSeqアセンブリ
ー機能を用いて得た。配列にはクローン79247が含まれ、それは該隣接にお
いて最も遠方の上流にある。
【図3】 図3は、TRDL-11のヌクレオチド配列(配列番号:1)および予測アミノ
酸配列(配列番号:2)を示す。
【図4】 図4は、TRDL-14のヌクレオチド配列(配列番号:3)および予測アミノ
酸配列(配列番号:4)を示す。
【図5】 図5は、クローンTRDL-11(配列番号:1)およびTRDL-14(配列番
号:3)のヌクレオチド配列のDNA配列整列を示す。クローン11および14
は、クローン11にないクローン14に存在する48塩基対ストレッチおよびク
ローン14に欠けたクローン11の3'末端に存在する183塩基対5を除外し
てほぼ同一である。
【図6】 図6は、TNF族メンバーのTNF−α(配列番号:9)、FasL(配列番号
:10)およびTRAIL(配列番号:11)のアミノ酸配列に対するクローンT
RDL-11(配列番号:2)およびTRDL-14(配列番号:4)によってコード
される予測アミノ酸配列の整列を示す。相同性領域は、灰色で強調されている。
【図7】 図7は、クローン177393および798247についての電子ノーザンブ
ロットの結果を示す。これらの2つのクローンは、TRDL-11(配列番号:1
)およびTRDL-14(配列番号:3)についての配列を含む該クラスターの代表
的メンバーである。それらは、炎症組織および豊富な末梢血供給を持つ組織にお
いて主に発現される。
【図8Aおよび8B】 図8Aは、クローン798247の発現の組織分布を示すノーザンブロットで
ある。複数組織のノーザン分析を、プローブとして全長の79824を用いて行
った。示された組織(1=心臓、2=脳、3=胎盤、4=肺 5=肝臓、6=骨格筋、7
=腎臓、8=膵臓、9=脾臓、10=胸腺、11=前立腺、12=精巣、13=卵巣、
14=小腸、15=結腸、16=末梢血中白血球)を表す2つの別々のブロットを平
行して解析した。該プローブは、約1.6および1.8kbにおいてメッセージに
ハイブリダイズした。シグナルをホスホイメージャー(Phosphoimag
er)を用いて定量し、相対的燐光としてプロットで示した。図8Bは、示され
た組織の型からのノーザンブロットにおける標識798247プローブの相対的
燐光を示すグラフである。
【図9Aおよび9B】 図9Aは、ヒト癌細胞系におけるTRDL-14発現の分布を示すノーザンブ
ロットである。複数の癌細胞系ノーザン分析(1=HL-60、2=HeLaS3、
3=K-562、4=MOLT-4、5=BL Raji、6=SW480、7=A54
9および8=G361)は、プローブとしてTRDL-14のコード領域を用いて
行った。HeLaおよびSW480細胞において、該プローブは、約1.7kb(
バー1および2)および2.5kb(バー3および4)においてメッセージにハイブ
リダイズした。4.4kbでの第三mRNA種は、HeLa、SW480、HL
−60およびK−562細胞において適度に発現し、MOLT−4、BL Ra
ji、A549およびG351細胞(バー5−12)において低レベルで発現した
。図9Bは、示された癌細胞系からのノーザンブロットにおいて標識79824
7の相対的燐光を示すグラフである。
【図10Aおよび10B】 図10Aは、通常の腫瘍組織試料においてTRDL-14発現の分布を示すグ
ラフである。高レベルの発現は、十二脂腸および結腸からの腫瘍試料において見
られた。肺における発現は、正常および腫瘍試料において共に高かった。図10
Bは、正常および腫瘍組織試料におけるTRDL-14発現の分布を示すグラフ
である。高レベルの発現は、膵臓からの腫瘍試料において見られた。発現は、胆
嚢、胸腺、副腎、乳房および甲状腺からの腫瘍試料より正常において高かった。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C12N 1/19 C12N 7/00 4H045 5/10 C12P 21/02 C 7/00 C12Q 1/02 C12P 21/02 G01N 33/15 Z C12Q 1/02 33/50 Z G01N 33/15 33/68 33/50 C12N 15/00 ZNAA 33/68 5/00 A (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM ,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM) ,AL,AM,AT,AU,AZ,BA,BB,BG, BR,BY,CA,CH,CN,CU,CZ,DE,D K,EE,ES,FI,GB,GE,GH,GM,HR ,HU,ID,IL,IS,JP,KE,KG,KP, KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT,LU,L V,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI, SK,SL,TJ,TM,TR,TT,UA,UG,U S,UZ,VN,YU,ZW (72)発明者 デイビッド・エイ・ジョーンズ アメリカ合衆国84108ユタ州ソルト・レイ ク・シティ、イースト・ローガン・アベニ ュー1780番 (72)発明者 マイケル・ジェイ・ビーンコウスキー アメリカ合衆国49024ミシガン州ポーテイ ジ、ハロー・ウッド3431番 Fターム(参考) 2G045 AA34 AA35 AA40 BB20 CB01 DA36 DA78 FB07 4B024 AA01 AA12 BA28 DA02 DA06 DA20 EA02 GA11 HA01 HA12 HA15 4B063 QA01 QA18 QQ02 QQ20 QQ79 QR48 QR54 QR66 QR72 QR80 QS03 QS15 4B064 AG07 CA02 CA10 CA19 CC24 DA05 DA14 4B065 AA26X AA90X AA91X AA93Y AA95X AB01 AC14 BA02 CA24 CA44 CA46 4H045 AA11 AA20 AA30 BA10 CA42 DA14 EA28 EA51 FA74

Claims (23)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 (a)配列番号:2または配列番号:4の完全なアミノ酸配列
    を有するTRDLポリペプチドをコードするヌクレオチド配列; (b)配列番号:2の約53位ないし約235位、または配列番号:4の約53
    位ないし約248位にアミノ酸配列を有するTRDLポリペプチドの細胞外領域
    をコードするヌクレオチド配列;および (c)(a)または(b)のヌクレオチド配列に相補性のヌクレオチド配列よりなる
    群から選択される配列に対して少なくとも95%同一の配列を有するポリヌクレ
    オチドを含む単離核酸分子。
  2. 【請求項2】 請求項1(a)記載の該ポリヌクレオチド分子が、配列番号:
    1または配列番号:3で与えられるヌクレオチド配列を有する請求項1記載の核
    酸分子。
  3. 【請求項3】 請求項1(b)記載の該ポリヌクレオチド分子が、約226ヌ
    クレオチドないし約771ヌクレオチドの配列番号:1で与えられるヌクレオチ
    ド配列、または約217ヌクレオチドないし約801ヌクレオチドの配列番号:
    3で与えられるヌクレオチド配列を有する請求項1記載の核酸分子。
  4. 【請求項4】 請求項1の(a)、(b)または(c)記載のヌクレオチド配列を
    有するポリヌクレオチドに、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポ
    リヌクレオチドを含む単離核酸分子。
  5. 【請求項5】 請求項1記載の核酸分子を含むベクター。
  6. 【請求項6】 請求項1記載の該核酸分子が、TRDLポリペプチド発現用
    のプロモーターに作動可能に連結した請求項5記載のベクター。
  7. 【請求項7】 請求項5記載のベクターを含む宿主細胞。
  8. 【請求項8】 請求項7記載のベクターを含む宿主細胞。
  9. 【請求項9】 該宿主が、真核生物の宿主である請求項8記載の宿主細胞。
  10. 【請求項10】 該宿主細胞が、バキュロウイルス細胞である請求項9記載
    の宿主細胞。
  11. 【請求項11】 該宿主細胞が、CHO細胞である請求項9記載の宿主細胞
  12. 【請求項12】 請求項8記載の宿主細胞を培養し、TRDLポリペプチド
    を単離することを特徴とするTRDLポリペプチドを得る方法。
  13. 【請求項13】 請求項12記載の方法によって生成されるTRDLポリペ
    プチド。
  14. 【請求項14】 (a)配列番号:2または配列番号:4の完全なアミノ酸配
    列; (b)配列番号:2の約53位ないし約235位のアミノ酸配列;および (c)配列番号:4の約53位ないし約248位のアミノ酸配列よりなる群から
    選択される配列に、少なくとも95%同一のアミノ酸配列を有する単離TRDL
    ポリペプチド。
  15. 【請求項15】 請求項14記載のTRDLポリペプチドに特異的に結合す
    る単離抗体。
  16. 【請求項16】 TRDLに対する高親和性受容体を有する細胞の同定法で
    あって、 (a)請求項14記載の単離TRDLポリペプチドを標識し; (b)工程(a)で得られた該標識TRDLポリペプチドと哺乳動物細胞系の細胞
    とを接触させ; (c)工程(b)で得られた細胞を洗浄して、未結合のTRDLを除去し;次いで (d)工程(c)で得られた洗浄した細胞中の該標識TRDLポリペプチドの存在
    を測定し、それによって、工程(c)で得られた洗浄した細胞中の該標識TRDL
    ポリペプチドの存在が、該細胞上にTRDLに対する高親和性受容体の存在を示
    すことを特徴とする該方法。
  17. 【請求項17】 TRDLのその受容体への結合を阻害する薬剤の同定法で
    あって、 (a)請求項14記載の単離TRDLポリペプチドを標識し; (b)(i)試験薬剤の存在下;および (ii)試験薬剤の不存在下; 工程(a)で得られた該標識TRDLポリペプチドと哺乳動物細胞系の細胞とを
    接触させ; (c)(i)工程(b)(i)で得られた;および (ii)工程(b)(ii)で得られた; 細胞を洗浄して、未結合のTRDLを除去し; (d)(i)工程(c)(i)で得られた洗浄した細胞;および (ii)工程(c)(ii)で得られた洗浄した細胞; 中の標識TRDLポリペプチドの量を測定し、次いで (e)工程(d)(i)において測定された標識TRDLポリペプチドの量と工程(
    d)(ii)において測定されたものを比較し; それによって、試料(d)(ii)中より低量の、試料(d)(i)中の標識TRDLポリ
    ペプチドは、該薬剤がTRDLのその受容体への結合を阻害したことを示すこと
    を特徴とする該方法。
  18. 【請求項18】 TRDLのその受容体への結合を増強する薬剤の同定法で
    あって、 (a)請求項14記載の単離TRDLポリペプチドを標識し; (b)(i)試験薬剤の存在下;および (ii)試験薬剤の不存在下; 工程(a)で得られた該標識TRDLポリペプチドと哺乳動物細胞系の細胞とを
    接触させ; (c)(i)工程(b)(i)で得られた;および (ii)工程(b)(ii)で得られた; 細胞を洗浄して、未結合のTRDLを除去し; (d)(i)工程(c)(i)で得られた洗浄した細胞;および (ii)工程(c)(ii)で得られた洗浄した細胞; 中の標識TRDLポリペプチドの量を測定し、次いで (e)工程(d)(i)において測定された標識TRDLポリペプチドの量と工程(
    d)(ii)において測定されたものを比較し; それによって、試料(d)(ii)中より高量の、試料(d)(i)中の標識TRDLポリ
    ペプチドは、該薬剤がTRDLのその受容体への結合を増強したことを示すこと
    を特徴とする該方法。
  19. 【請求項19】 TRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受ける細
    胞系の同定法であって、 (a)哺乳動物細胞系の培養細胞を試験培養物および対照培養物とに分け; (b)TRDLポリペプチドと工程(a)の試験培養物とを接触させ; (c)アポトーシスを受けた、 (i)工程(b)で得られた試験培養物;および (ii)工程(a)の対照培養物; の細胞の量を測定し;次いで (d)工程(c)(i)の試験培養物中のアポトーシスを受けたと判断された細胞の 量と、工程(c)(ii)の対照培養物中のアポトーシスを受けたと判断された 細胞の量とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が該対照培養物
    よりも高いという決定は、TRDLとの相互作用に際して、該哺乳動物細胞系が
    アポトーシスを受けることを示すことを特徴とする該方法。
  20. 【請求項20】 アポトーシスのTRDL媒介誘導を阻害できる薬剤の同定
    法であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受けることがで きる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際して、アポト ーシスを受けることができる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
    物中より低いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介誘導を阻
    害することを示すことを特徴とする該方法。
  21. 【請求項21】 アポトーシスのTRDL媒介誘導を増強できる薬剤の同定
    法であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際して、アポトーシスを受けることがで きる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際して、アポト ーシスを受けることができる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
    物中より高いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介誘導を増
    強することを示すことを特徴とする該方法。
  22. 【請求項22】 アポトーシスのTRDL媒介防止を阻害できる薬剤の同定
    法であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際してアポトーシスを受けるのが妨げら れる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際してアポトー シスを受けるのが妨げられる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
    物中より高いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介防止を阻
    害することを示すことを特徴とする該方法。
  23. 【請求項23】 アポトーシスのTRDL媒介防止を増強できる薬剤の同定
    法であって、 (a)試験培養物および対照培養物中でアポトーシスを受けた細胞の量を測定し 、ここに、該試験培養物は、試験薬剤の存在下でTRDLポリペプチドと 接触したTRDLとの相互作用に際してアポトーシスを受けるのが妨げら れる哺乳動物細胞を含み、かつ、該対照培養物は、試験薬剤の不存在下で TRDLポリペプチドと接触したTRDLとの相互作用に際してアポトー シスを受けるのが妨げられる哺乳動物細胞を含み;次いで (b)工程(a)の試験培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量と 、工程(a)の対照培養物中でアポトーシスを受けたと判断された細胞の量 とを比較し; それによって、該試験培養物中のアポトーシスを受けた細胞の量が、該対照培養
    物中より低いという決定は、該試験薬剤がアポトーシスのTRDL媒介防止を増
    強することを示すことを特徴とする該方法。
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