JP2002272500A - 有用ウシの評価方法 - Google Patents
有用ウシの評価方法Info
- Publication number
- JP2002272500A JP2002272500A JP2001084254A JP2001084254A JP2002272500A JP 2002272500 A JP2002272500 A JP 2002272500A JP 2001084254 A JP2001084254 A JP 2001084254A JP 2001084254 A JP2001084254 A JP 2001084254A JP 2002272500 A JP2002272500 A JP 2002272500A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- type
- amino acid
- codon
- ability
- homo
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 title claims abstract description 51
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 24
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims abstract description 37
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 34
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract description 8
- 235000019197 fats Nutrition 0.000 claims description 20
- 108010006025 bovine growth hormone Proteins 0.000 claims description 18
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 18
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 claims description 15
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 claims description 12
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 9
- 235000021051 daily weight gain Nutrition 0.000 claims description 8
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 claims description 7
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 6
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 6
- 235000019784 crude fat Nutrition 0.000 claims description 5
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 claims description 4
- 239000000122 growth hormone Substances 0.000 abstract description 5
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 abstract 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 23
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 9
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 9
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 8
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000037429 base substitution Effects 0.000 description 6
- 235000015278 beef Nutrition 0.000 description 6
- 244000309464 bull Species 0.000 description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 6
- 239000000047 product Substances 0.000 description 6
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 6
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 5
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 5
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 5
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 5
- 108010051696 Growth Hormone Proteins 0.000 description 4
- 102000018997 Growth Hormone Human genes 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 125000003580 L-valyl group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[H] 0.000 description 3
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 3
- 238000003505 heat denaturation Methods 0.000 description 3
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 3
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 3
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 2
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 2
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 2
- 239000008049 TAE buffer Substances 0.000 description 2
- HGEVZDLYZYVYHD-UHFFFAOYSA-N acetic acid;2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;2-[2-[bis(carboxymethyl)amino]ethyl-(carboxymethyl)amino]acetic acid Chemical compound CC(O)=O.OCC(N)(CO)CO.OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O HGEVZDLYZYVYHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 235000019786 weight gain Nutrition 0.000 description 2
- BTYTYHBSJKQBQA-GCJQMDKQSA-N Ala-Asp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N)O BTYTYHBSJKQBQA-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 1
- AWNAEZICPNGAJK-FXQIFTODSA-N Ala-Met-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AWNAEZICPNGAJK-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- OSRZOHXQCUFIQG-FPMFFAJLSA-N Ala-Phe-Pro Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@@H]([NH3+])C)C(=O)N1[C@H](CCC1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 OSRZOHXQCUFIQG-FPMFFAJLSA-N 0.000 description 1
- AUFACLFHBAGZEN-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ser-Cys Chemical compound N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O AUFACLFHBAGZEN-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- GXCSUJQOECMKPV-CIUDSAMLSA-N Arg-Ala-Gln Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O GXCSUJQOECMKPV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GXXWTNKNFFKTJB-NAKRPEOUSA-N Arg-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXXWTNKNFFKTJB-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- QHUOOCKNNURZSL-IHRRRGAJSA-N Arg-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QHUOOCKNNURZSL-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- QEYJFBMTSMLPKZ-ZKWXMUAHSA-N Asn-Ala-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QEYJFBMTSMLPKZ-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- ULRPXVNMIIYDDJ-ACZMJKKPSA-N Asn-Glu-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N ULRPXVNMIIYDDJ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- ICDDSTLEMLGSTB-GUBZILKMSA-N Asn-Met-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ICDDSTLEMLGSTB-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YSYTWUMRHSFODC-QWRGUYRKSA-N Asn-Tyr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(O)=O YSYTWUMRHSFODC-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- SVABRQFIHCSNCI-FOHZUACHSA-N Asp-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SVABRQFIHCSNCI-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- 235000005956 Cosmos caudatus Nutrition 0.000 description 1
- UKVGHFORADMBEN-GUBZILKMSA-N Cys-Arg-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O UKVGHFORADMBEN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- UDDITVWSXPEAIQ-IHRRRGAJSA-N Cys-Phe-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O UDDITVWSXPEAIQ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- MADFVRSKEIEZHZ-DCAQKATOSA-N Gln-Gln-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N MADFVRSKEIEZHZ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- HYPVLWGNBIYTNA-GUBZILKMSA-N Gln-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HYPVLWGNBIYTNA-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- XZUUUKNKNWVPHQ-JYJNAYRXSA-N Gln-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O XZUUUKNKNWVPHQ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- ZZLDMBMFKZFQMU-NRPADANISA-N Gln-Val-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZZLDMBMFKZFQMU-NRPADANISA-N 0.000 description 1
- SRZLHYPAOXBBSB-HJGDQZAQSA-N Glu-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SRZLHYPAOXBBSB-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- WRNAXCVRSBBKGS-BQBZGAKWSA-N Glu-Gly-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O WRNAXCVRSBBKGS-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N Glu-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N Glu-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- VHPVBPCCWVDGJL-IRIUXVKKSA-N Glu-Thr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O VHPVBPCCWVDGJL-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 1
- BPQYBFAXRGMGGY-LAEOZQHASA-N Gly-Gln-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)CN BPQYBFAXRGMGGY-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- UESJMAMHDLEHGM-NHCYSSNCSA-N Gly-Ile-Leu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O UESJMAMHDLEHGM-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- HFPVRZWORNJRRC-UWVGGRQHSA-N Gly-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN HFPVRZWORNJRRC-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- BPOHQCZZSFBSON-KKUMJFAQSA-N His-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1cnc[nH]1)C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(O)=O BPOHQCZZSFBSON-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- BKOVCRUIXDIWFV-IXOXFDKPSA-N His-Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 BKOVCRUIXDIWFV-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- KMBPQYKVZBMRMH-PEFMBERDSA-N Ile-Gln-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O KMBPQYKVZBMRMH-PEFMBERDSA-N 0.000 description 1
- IITVUURPOYGCTD-NAKRPEOUSA-N Ile-Pro-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IITVUURPOYGCTD-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- 125000003440 L-leucyl group Chemical group O=C([*])[C@](N([H])[H])([H])C([H])([H])C(C([H])([H])[H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 125000000769 L-threonyl group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])[C@](O[H])(C([H])([H])[H])[H] 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N Leu-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- AUBMZAMQCOYSIC-MNXVOIDGSA-N Leu-Ile-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O AUBMZAMQCOYSIC-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- LXKNSJLSGPNHSK-KKUMJFAQSA-N Leu-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N LXKNSJLSGPNHSK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- RZXLZBIUTDQHJQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RZXLZBIUTDQHJQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ZGUMORRUBUCXEH-AVGNSLFASA-N Leu-Lys-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O ZGUMORRUBUCXEH-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- PKKMDPNFGULLNQ-AVGNSLFASA-N Leu-Met-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O PKKMDPNFGULLNQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N Leu-Phe-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- RGUXWMDNCPMQFB-YUMQZZPRSA-N Leu-Ser-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O RGUXWMDNCPMQFB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N Lys-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100342977 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-1 gene Proteins 0.000 description 1
- SWZKMTDPQXLQRD-XVSYOHENSA-N Phe-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SWZKMTDPQXLQRD-XVSYOHENSA-N 0.000 description 1
- HPECNYCQLSVCHH-BZSNNMDCSA-N Phe-Cys-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)C(=O)O)N HPECNYCQLSVCHH-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- ZLGQEBCCANLYRA-RYUDHWBXSA-N Phe-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZLGQEBCCANLYRA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- QPVFUAUFEBPIPT-CDMKHQONSA-N Phe-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QPVFUAUFEBPIPT-CDMKHQONSA-N 0.000 description 1
- WLYPRKLMRIYGPP-JYJNAYRXSA-N Phe-Lys-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 WLYPRKLMRIYGPP-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- JHSRGEODDALISP-XVSYOHENSA-N Phe-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O JHSRGEODDALISP-XVSYOHENSA-N 0.000 description 1
- NHDVNAKDACFHPX-GUBZILKMSA-N Pro-Arg-Ala Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O NHDVNAKDACFHPX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N Pro-Thr-Gly Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- 108010003201 RGH 0205 Proteins 0.000 description 1
- HBOABDXGTMMDSE-GUBZILKMSA-N Ser-Arg-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HBOABDXGTMMDSE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- CNIIKZQXBBQHCX-FXQIFTODSA-N Ser-Asp-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O CNIIKZQXBBQHCX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- MESDJCNHLZBMEP-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MESDJCNHLZBMEP-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- BGOWRLSWJCVYAQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BGOWRLSWJCVYAQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GZBKRJVCRMZAST-XKBZYTNZSA-N Ser-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GZBKRJVCRMZAST-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- IXZHZUGGKLRHJD-DCAQKATOSA-N Ser-Leu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O IXZHZUGGKLRHJD-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- FVFUOQIYDPAIJR-XIRDDKMYSA-N Ser-Trp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CO)N FVFUOQIYDPAIJR-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- BZTSQFWJNJYZSX-JRQIVUDYSA-N Thr-Tyr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BZTSQFWJNJYZSX-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- OHOVFPKXPZODHS-SJWGOKEGSA-N Tyr-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N OHOVFPKXPZODHS-SJWGOKEGSA-N 0.000 description 1
- UEPLNXPLHJUYPT-AVGNSLFASA-N Val-Met-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O UEPLNXPLHJUYPT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- PFMSJVIPEZMKSC-DZKIICNBSA-N Val-Tyr-Glu Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N PFMSJVIPEZMKSC-DZKIICNBSA-N 0.000 description 1
- 210000000577 adipose tissue Anatomy 0.000 description 1
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 1
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 1
- 244000309466 calf Species 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 108010066198 glycyl-leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 235000020997 lean meat Nutrition 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 230000035764 nutrition Effects 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 238000002205 phenol-chloroform extraction Methods 0.000 description 1
- 108010024654 phenylalanyl-prolyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 1
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000009394 selective breeding Methods 0.000 description 1
- 210000000582 semen Anatomy 0.000 description 1
- 238000003307 slaughter Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/575—Hormones
- C07K14/61—Growth hormone [GH], i.e. somatotropin
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/575—Hormones
- G01N2333/61—Growth hormones [GH] (Somatotropin)
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
定する方法の提供。 【解決手段】 ウシ成長ホルモンのアミノ酸配列のうち
第127番目及び/又は第172番目のアミノ酸をコードする
コドン型を解析し、得られる解析結果からウシの成長能
力及び/又は筋肉中脂肪蓄積能力を評価する方法。
Description
伝子多型並びにウシの成長能力及び筋肉中脂肪蓄積能力
を利用したウシの評価方法に関する。
と期間を用いて行われてきた。すなわち、血統情報と能
力推定値を用いて雄ウシと雌ウシを選抜し、これを交配
して候補種雄ウシを生産し、候補種雄ウシの精子を用い
て7頭から16頭の雌ウシに種付けをし、この子ウシを21
か月齢から24か月齢まで肥育し、屠殺し、候補種雄ウシ
の遺伝的能力評価を行ってきた(間接検定)。 しかしな
がら、このように費用と期間をかけた割には、候補種雄
ウシが利用に価するだけの遺伝的能力を保持していなか
った例が多く認められる。
は、血統情報をもとに良質なウシ肉を生産すると期待さ
れる肥育素ウシを購入したにもかかわらず、期待した良
質の肉が生産されず、得るべき差益が得られない例が多
く認められる。以上のようなことから、種雄ウシの予備
選抜や肥育素ウシ選定の現場において利用可能な、血統
情報以外の有用な情報が求められている。一方、肉用ウ
シの成長及び肉質と血液中の成長ホルモン量との間には
有意な関係を有することが示されている。また、血液中
の成長ホルモン量は、脂肪組織からの蓄積脂肪の放出促
進効果を持つと考えられる。
翻訳部分(エキソン)から構成されており、第5エキソン
には3カ所の塩基置換が見出されている。このうち、2
ヶ所の塩基置換はアミノ酸の変化を伴う非同義置換であ
ることが明らかになっている。非同義置換とは、もとの
アミノ酸とは別のアミノ酸をコードする塩基に置換され
ることを意味する。これら2ヶ所の塩基置換のうち、遺
伝子の3'側近傍の置換には、現在のところ黒毛和種と褐
毛和種にしか存在していない遺伝子型が存在することが
報告されている(千国幸一ら,日畜会報,65,340-346,
1994)。また、前記ウシの成長ホルモンの塩基変異に起
因する遺伝子型を判定する方法も知られている(特開平
10-136985号公報)。しかしながら、ウシ成長ホルモン
の遺伝子型とウシ食肉形質との関係を判定するウシ育種
選抜に有効な判定方法は未だ報告されていない。
選抜に有用なウシの評価方法を提供することを目的とす
る。
を解決するため鋭意研究を行った結果、ウシ成長ホルモ
ン遺伝子のエキソン5に存在する第127番目及び/又は
第172番目のアミノ酸における対立遺伝子のコドン型
と、ウシの成長能力及び筋肉中脂肪蓄積能力との間に統
計的有意性が認められ、本遺伝情報に基づいて優良な肉
用ウシを選抜、選定し得ることを見出し、本発明を完成
するに至った。
アミノ酸配列のうち第127番目及び/又は第172番目のア
ミノ酸をコードするコドン型を解析し、得られる解析結
果からウシの成長能力及び/又は筋肉中脂肪蓄積能力を
評価することを特徴とするウシの評価方法である。第12
7番目のアミノ酸をコードするコドン型としてはGTGホモ
型、GTG/CTGヘテロ型及びCTGホモ型が挙げられ、第172
番目のアミノ酸をコードするコドン型としてはACGホモ
型、ACG/ATGヘテロ型及びATGホモ型が挙げられる。ま
た、本発明において、ウシの成長能力は日増体重により
測定され、筋肉中脂肪蓄積能力は脂肪交雑評価又は粗脂
肪含量により測定されることを特徴とする。さらに、上
記コドンの解析は、上記第127番目及び/又は第172番目
のアミノ酸をコードするDNAを含む遺伝子を増幅させ、
得られる増幅産物についての多型分析により達成するこ
とができる。以下、本発明を詳細に説明する。
選抜のため、牛成長ホルモン遺伝子の第5エキソンの多
型をそのDNAマーカーとして提供することを特徴とする
ものである。本発明における評価の対象となるウシとし
ては、肉用ウシとして飼育されているものであれば特に
品種は限定されるものではなく、ホルスタイン種、ヘレ
フォード種、アンガス種、褐毛和種、黒毛和種、シンメ
ンタール種、ジャージー種、エアーシャー種、ブラウン
スイス種、ガーンジー種などを例示することができる。
本発明においては、黒毛和種と褐毛和種における評価
(例えば黒毛和種及び褐毛和種の判定)に特に有用であ
る。
シ成長ホルモン遺伝子(配列番号5)を用いる。遺伝子
の採取源としては、特に限定されるものではなく、例え
ば、筋肉、各種臓器、精液等から採取することができ
る。遺伝子を調製する方法としては、当業者に利用可能
なものであればいずれの方法(例えばフェノール・クロ
ロフォルム法)をも利用できる。
構成されており(配列番号6)、2ヶ所の非同義塩基置
換は、コドン(アミノ酸変換単位)で示した場合、第127
番目と第172番目に存在する。このうち、第172番目のア
ミノ酸置換(メチオニン)に相当する塩基置換(ATG)
は、現在のところ黒毛和種と褐毛和種のみに認められて
いる。また、第172番目のアミノ酸のメチオニン型は、
第127番目のアミノ酸置換(ロイシン又はバリン)(塩基型
は各々CTG、GTG)のうちのバリン型にしか認められてい
ない。従って、前記2カ所の塩基置換によってウシ成長
ホルモンペプチドには3つの遺伝子型が存在しているこ
とになり、A型(Leu127−Thr172)、B型(Val 127−Thr
172)、C型(Val127−Met172)のいずれかの型となる。こ
れらの各遺伝子型と塩基置換との関係を表1に示した。
遺伝子のエキソン5に存在する第127番目、第172番目又
はこれらの両者のアミノ酸におけるコドン型の相違(遺
伝子多型)とウシの成長能力及び筋肉中脂肪蓄積能力と
の関係に基づき、優良遺伝子型のウシを評価し得る。評
価の基準として、第127番目アミノ酸のコドン型として
は、GTGホモ型、GTG/CTGヘテロ型、CTGホモ型の3種類
又はその一部、第172番目アミノ酸のコドン型として
は、ACGホモ型、ACG/ATGヘテロ型、及びATGホモ型の3
種類又はその一部を用いる。
アミノ酸配列のうち第127番目、第172番目又はこれらの
両者のアミノ酸配列をコードするDNA領域(ウシ成長ホ
ルモン遺伝子のエキソン5に存在する)を、プライマー
を用いたPCR法により増幅させ、得られた反応産物を電
気泳動法によって行うことができ、その結果、第127番
目及び/又は第172番目の遺伝子型を判定することがで
きる。
シ成長ホルモン遺伝子のエキソン5に存在する第127番
目及び第172番目のアミノ酸コドンを含むDNA領域の全遺
伝子型から増幅できる1組のプライマー、エキソン5に
おける第127番目アミノ酸のコドン多型を検出し得るプ
ライマー、エキソン5における第172番目アミノ酸のコ
ドン多型を検出し得るプライマーであれば任意に設計す
ることが可能である。これらプライマーは、通常の化学
合成により得ることができ、そのサイズは、20〜30mer
程度が好ましく、特に、25〜30merのものが好ましい。
0〜60秒、アニーリング:50〜65℃で10〜60秒、伸長反
応:65〜76℃で10〜240秒で行う。好ましくは、熱変
性:94℃で30秒、アニーリング:60℃で45秒、伸長反
応:72℃で45秒を1サイクルとし、これを30〜40回、好
ましくは35〜40回行う。
電気泳動分析する。ここで、電気泳動分析は常法によっ
て行えばよい。例えば4%アガロースを含むTAE緩衝液
ゲル中で100Vの電圧をかけて電気泳動し、分離したDNA
バンドパターンを分析する。これにより、遺伝子型を判
定することができる。
が存在する部分ごとに、コドン127番目の遺伝子型、172
番目の遺伝子型に分けて、それぞれの遺伝子型を有する
ときにそれぞれどのような成長能力又は脂肪蓄積能力が
得られるかを検討すると、ウシ成長ホルモンの遺伝子型
の相違に起因するウシの成長能力及び筋肉中脂肪蓄積能
力を評価することが可能となる。この場合、ウシの成長
能力(増体能力ともいう)の指標として日増体重(DG:
1日あたりの体重増加量(kg/日))を、筋肉中脂肪蓄積
能力の指標として脂肪交雑評価(BMS: beef marbling s
core)又は粗脂肪含量を用いることができ、これらの値
は優良ウシを評価するための基礎となる。例えば、コド
ン127番目型の場合は、GTGホモ型と、GTG/CTGヘテロ型
及び/又はCTGホモ型との間でBMS等及びDGを比較する。
また、コドン172番目型の場合は、ACGホモ型と、ACG/AT
Gヘテロ型及び/又はATGホモ型との間でBMS等及びDGを比
較する。比較したいずれかの群間において平均値の統計
学的有意差があれば、当該有意差のあるコドン型を有す
るウシは優良であると評価することができる。その結
果、上記評価に基づいて肉質に優れた有用な肉用ウシが
選抜される。
「肉が霜降り(marbling)になる遺伝的能力」を意味す
る。「霜降り」とは、脂肪の白色が筋肉、特に背最長筋
肉の赤肉内に霜を降ったように蓄積されることを意味
し、主として「脂肪交雑」により判定される。本発明に
おいては、通常、日本食肉格付協会の基準が利用され
る。
載されている次の公定法(Officialmethod of analysis
(14th edition), P159-169, Association of Officia
l Method of Analytical Chemists, Inc., Arlington,
Virginia 2209 USA, 1984)によって求められる脂肪重
量を意味する。粗脂肪含量は以下のようにして求めるこ
とができる。すなわち、食肉を3mm目のひき肉器を用い
てひき肉とし、混和した後に数グラムを秤量し、48時間
程度凍結乾燥して水分を除去する。その後、脂肪抽出器
(通常はソックスレー抽出器)を用いて、ジエチルエー
テルにより秤量の済んでいるフラスコ内に抽出する。抽
出後、ジエチルエーテルを揮発させ、脂肪のみが残るフ
ラスコを秤量し、フラスコ重量を差し引くことにより脂
肪重量を求める。
説明する。ただし、本発明はこれら実施例にその技術的
範囲が限定されるものではない。
存在する遺伝子型の解析 遺伝子型が生産形質と有意な関係にあるか否かを明らか
にするには、栄養及び飼養等環境条件を一定とした解析
を行うことが必要である。そこで、解析対象ウシには、
同一飼養条件、同一屠殺月齢からなる集団、黒毛和種間
接検定ウシ約180頭(家畜改良事業団)を用い、以下のP
CR法によって遺伝子型を解析した。
プライマーを合成し、全遺伝子型を増幅できる1組のプ
ライマーをGH4F及びGH5Rとした。
-3'(配列番号1) GH5R: 5'-ccagaatagaatgacacctactcagacaat-3'(配列番
号2)
56bpの増幅産物が得られる。また、変異特異的なプライ
マーとして、エキソン5における第127番目アミノ酸の
コドンの変異部位を3'末端にもつプライマーをGHARとし
た。このプライマーによって、347bpの増幅産物が得ら
れる。さらに、変異特異的なプライマーとして、エキソ
ン5における第172番目アミノ酸のコドンの変異部位を
3'末端にもつプライマーをGHABRとした。このプライマ
ーによって、483bpの増幅産物が得られる。
マー(GH4F、GH5R)及び0.1μM プライマー(GHAR、GHA
BR)に、0.5ユニットのTaqポリメラーゼ(PERKIN ELMER
社製)を加えて20μlの反応液とした。PCR機(PERKIN ELM
ER社製)を用い、熱変性:94℃で30秒、アニーリング:6
0℃で45秒、伸長反応:72℃で45秒を1サイクルとし、
これを40回行った。
分析した。電気泳動装置としては、コスモ・バイオ社製
のミューピッドを用いた。ゲルトレーに泳動ゲル(4%
アガロース,TAE緩衝液)を作製し、PCRによって増幅し
たDNAを添加した。次いで、100Vの電圧をかけて電気泳
動し、分離したDNAバンドパターンを常法により染色
し、分析した。DNA分子量マーカーとして、φx174 DNA/
HincII digestを用いた。
47bpの位置に、BB型は483bpの位置に、そしてCC型は656
bpの位置に、それぞれ1本のバンドとして検出された。
得られた結果から、対象ウシを、第127番目アミノ酸の
コドン型については、1)GTGホモ型、2)GTG/CTGヘテロ
型及びCTGホモ型の2群に分け、第172番目アミノ酸のコ
ドン型については、1)ACGホモ型、2)ACG/ATGヘテロ型
及びATGホモ型の2群に分けた。
の測定及び脂肪交雑の評価 次に、実施例1で設定した各コドン型の群におけるウシ
について、ウシの成長能力指標として日増体重の測定
を、そして筋肉中脂肪蓄積能力の指標として脂肪交雑の
評価を行った。その結果を表2及び表3に示す。
遺伝子のコドン型をGTGホモ型(Val/Val)である場合
とGTG/CTGヘテロ型(Val/Leu)及びCTGホモ型(Leu/
Leu)である場合とに分けて脂肪交雑評価及び日増体重
を比較したところ、脂肪交雑評価では両型の値に有意差
が認められ、日増体重では両型の値に有意差は認められ
なかった。従って、第127番目アミノ酸のコドン型の相
違により、脂肪交雑の違いが明確になるとともに、コド
ン型の相違によるウシ個体の体重上の問題は生じないこ
とが明らかになった。この結果から、第127番目アミノ
酸のコドン型がGTGホモ型(Val/Val)であり、そのコ
ドン型に対応する遺伝子型BB、BC、CCのウシが、筋肉中
脂肪蓄積能力において優れ、かつ成長能力も劣らないこ
とが判明した。
のコドン型をACGホモ型(Thr/Thr)である場合とACG/
ATGヘテロ型(Thr/Met)及びATGホモ型(Met/Met)で
ある場合に分けて脂肪交雑評価及び日増体重を比較した
ところ、脂肪交雑評価では両型の値に差が認められる傾
向がある(P<0.10)とともに、日増体重においては両型
の値に有意差(P<0.05)が認められた。従って、第172
番目アミノ酸のコドン型の相違により、成長能力の違い
が明確になるが、成長能力に優れたウシ個体の脂肪交雑
評価が低い傾向にあることが明らかになった。この結果
から、第172番目アミノ酸のコドン型がACGホモ型であ
り、そのコドン型に対応する遺伝子型AA、AB、BBのウシ
が成長能力において優れていることが判明した。
子の第127番目及び/又は第172番目アミノ酸のコドン型
を解析することにより、ウシの成長能力及び筋肉中脂肪
蓄積能力を評価することが可能である。
測定結果を示す電気泳動の図である。
Claims (6)
- 【請求項1】 ウシ成長ホルモンのアミノ酸配列のうち
第127番目及び/又は第172番目のアミノ酸をコードする
コドン型を解析し、得られる解析結果からウシの成長能
力及び/又は筋肉中脂肪蓄積能力を評価することを特徴
とするウシの評価方法。 - 【請求項2】 第127番目のアミノ酸をコードするコド
ン型がGTGホモ型、GTG/CTGヘテロ型及びCTGホモ型から
選ばれる少なくとも1つである請求項1記載の方法。 - 【請求項3】 第172番目のアミノ酸をコードするコド
ン型がACGホモ型、ACG/ATGヘテロ型及びATGホモ型から
選ばれる少なくとも1つである請求項1記載の方法。 - 【請求項4】 ウシの成長能力が、日増体重により測定
されるものである請求項1記載の方法。 - 【請求項5】 筋肉中脂肪蓄積能力が、脂肪交雑評価又
は粗脂肪含量により測定されるものである請求項1記載
の方法。 - 【請求項6】 コドンの解析が、ウシ成長ホルモンのア
ミノ酸配列のうち第127番目及び/又は第172番目のアミ
ノ酸をコードするDNAを含む遺伝子を増幅させ、得られ
る増幅産物について多型分析を行うものである、請求項
1記載の方法。
Priority Applications (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2001084254A JP2002272500A (ja) | 2001-03-23 | 2001-03-23 | 有用ウシの評価方法 |
CA002441938A CA2441938A1 (en) | 2001-03-23 | 2001-06-27 | Method of evaluating useful cattle |
AU2001267834A AU2001267834B2 (en) | 2001-03-23 | 2001-06-27 | Method of evaluating useful cattle |
PCT/JP2001/005502 WO2002077279A1 (fr) | 2001-03-23 | 2001-06-27 | Procede d'evaluation de betail utile |
US10/471,599 US7157231B2 (en) | 2001-03-23 | 2001-06-27 | Method of evaluating useful cattle |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2001084254A JP2002272500A (ja) | 2001-03-23 | 2001-03-23 | 有用ウシの評価方法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2002272500A true JP2002272500A (ja) | 2002-09-24 |
Family
ID=18939948
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2001084254A Pending JP2002272500A (ja) | 2001-03-23 | 2001-03-23 | 有用ウシの評価方法 |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US7157231B2 (ja) |
JP (1) | JP2002272500A (ja) |
AU (1) | AU2001267834B2 (ja) |
CA (1) | CA2441938A1 (ja) |
WO (1) | WO2002077279A1 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2013505003A (ja) * | 2009-09-17 | 2013-02-14 | シーワイ オコーナー イレイド ヴィレッジ ファウンデーション | 家畜のジェノタイピング方法 |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
BRPI0706589A2 (pt) * | 2006-01-13 | 2011-04-05 | Univ Alberta | polimorfismos nos genes do receptor do hormÈnio de crescimento, grelina, leptina, neuropeptìdeo y e na proteìna desacopladora 2 e suas associações com medições de desempenho e capacidade de carcaça em gado bovino |
WO2023196818A1 (en) | 2022-04-04 | 2023-10-12 | The Regents Of The University Of California | Genetic complementation compositions and methods |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP3005668B2 (ja) * | 1996-11-11 | 2000-01-31 | 農林水産省畜産試験場長 | 遺伝子型の判定方法 |
-
2001
- 2001-03-23 JP JP2001084254A patent/JP2002272500A/ja active Pending
- 2001-06-27 CA CA002441938A patent/CA2441938A1/en not_active Abandoned
- 2001-06-27 WO PCT/JP2001/005502 patent/WO2002077279A1/ja active Application Filing
- 2001-06-27 AU AU2001267834A patent/AU2001267834B2/en not_active Ceased
- 2001-06-27 US US10/471,599 patent/US7157231B2/en not_active Expired - Lifetime
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2013505003A (ja) * | 2009-09-17 | 2013-02-14 | シーワイ オコーナー イレイド ヴィレッジ ファウンデーション | 家畜のジェノタイピング方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20050138679A1 (en) | 2005-06-23 |
AU2001267834B2 (en) | 2006-09-07 |
US7157231B2 (en) | 2007-01-02 |
WO2002077279A1 (fr) | 2002-10-03 |
CA2441938A1 (en) | 2002-10-03 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Fitzsimmons et al. | A potential association between the BM 1500 microsatellite and fat deposition in beef cattle | |
Ciobanu et al. | Genetic variation in two conserved local Romanian pig breeds using type 1 DNA markers | |
JP2007525217A (ja) | レプチンプロモーター多型及びその使用 | |
KR100467874B1 (ko) | 돼지의 증가된 한배새끼수에 대한 유전 마아커로서의 프로락틴 수용체 유전자 | |
KR101595011B1 (ko) | 돼지의 유두 수 판단용 snp 마커 및 이의 용도 | |
Niu et al. | Porcine insulin-like growth factor 1 (IGF1) gene polymorphisms are associated with body size variation | |
US10626459B2 (en) | Methods and kits for the identification of animals having a greater potential for desirable characteristics, and for the early identification of fat deposits in bovines | |
US20040241723A1 (en) | Systems and methods for improving protein and milk production of dairy herds | |
WO2011118549A1 (ja) | ブタの椎骨数を支配するVertnin遺伝子、およびその利用 | |
KR100804310B1 (ko) | 소 근내지방도 관련 fabp4 유전자를 이용한 dna마커 | |
Kong et al. | Association of sequence variations in DGAT 1 gene with economic traits in Hanwoo (Korea cattle) | |
JP2008537674A (ja) | 商業的肥育場の去勢ウシ及び若雌ウシにおけるレプチン遺伝子中のマーカーと屠体特性との間の連関 | |
JP4893893B2 (ja) | 牛肉の風味や食感の良さ等に関する遺伝子判定法 | |
JP2002272500A (ja) | 有用ウシの評価方法 | |
KR20160048316A (ko) | 한우 마블링 예측을 위한 마커 및 그 진단방법 | |
CN110982908B (zh) | 一种瘦肉型定远猪品系脂肪沉积及肉质性状分子标记方法 | |
JP3619833B2 (ja) | ステアロイル−CoAデサチュラーゼの遺伝子型に基づき、牛肉の風味や食感の良さ等を判定する方法 | |
US20050136440A1 (en) | Method for identifying animals for milk production qualities by analysing the polymorphism of the Pit-1 and kappa-casein genes | |
Saygili et al. | Determinatıon of the MSTN/HaeIII gene polymorphism in indigenous Morkaraman sheep | |
CN109897904B (zh) | 基于prlr基因鉴定大白猪繁殖性状的分子标记及应用 | |
JP5736655B2 (ja) | ブタの椎骨数遺伝子診断キット | |
Ardıçlı et al. | Genetic variability of FABP4 c. 328 G> A (rs110652478) polmorphism and its association with slaugter weight and carcass traits in aberdeen angus and hereford bulls imported into Turkey | |
CN109897903B (zh) | 基于FSHβ基因鉴定大白猪繁殖性状的分子标记及应用 | |
Ardıçlı et al. | Genetic variability of FABP4 c. 328 G> A (rs110652478) polymorphism and its association with slaughter weight and carcass traits in Aberdeen Angus and Hereford bulls imported into Turkey | |
Looft et al. | A high-density linkage map of the RN region in pigs |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20031215 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20040127 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20040329 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20040512 |
|
A912 | Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912 Effective date: 20040625 |