JP2001515702A - 作物植物の大規模突然変異誘発法 - Google Patents

作物植物の大規模突然変異誘発法

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レビイ、アブラハム、エイ
マイスナー、ラファエル
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イエダ・リサーチ・アンド・デベロツプメント・カンパニー・リミテツド
イシウム リサーチ デベロップメント カンパニー オブ ザ ヘブリュー ユニバーシティー オブ イエルサレム
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、作物植物中の突然変異体の迅速かつ大規模な産生を可能にする。これは、同じ種の市販の植物と交配することができるミニ植物を使用することにより達成される。ミニ栽培品種中で突然変異を誘導し、次に得られる突然変異植物集団中で突然変異体を同定する。目的の突然変異遺伝子は、選択された突然変異ミニ植物と市販の栽培品種を交配することにより市販の栽培品種中に遺伝子移入することができる。ランダムT−DNAまたはトランスポゾン挿入事象を含有するミニ作物の植物集団を使用し、可動性DNA接種マーカー遺伝子挿入についてこの集団をスクリーニングすることにより、逆向き遺伝学を行うことができる。この作製体から得られる突然変異を、選択マーカー遺伝子の発現について迅速にスクリーニングし、これらの形質転換体中のスクリーニング可能なマーカー遺伝子に機能的に結合したプロモーターをクローン化する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 (発明の分野) 本発明は、植物遺伝学の分野に属し、作物植物の突然変異誘発、遺伝子同定、
および遺伝子機能の解析のための改良法に関する。本発明は、任意の植物種にお
いて有用であり、トマトでの使用を本明細書に例示する
【0002】 (発明の背景) 高等植物のゲノムは、30,000〜50,000個の遺伝子を有すると推定
されている。機能が割り当てられているのはわずか数百の植物遺伝子である。遺
伝子機能を確認するのに、新しい遺伝子の単離およびこれらの新たに単離された
遺伝子の突然変異がしばしば必要である。バイオテクノロジーによる作物の改良
は、新たに単離された遺伝子の詳細な性状解析に依存する。
【0003】 アラビドプシス(Arabidopsis)モデル系は、過去10年間の植物分子生物学 の顕著な進展に大きく貢献してきた。アラビドプシス(Arabidopsis)の使用が 成功した大きな理由は、その小ささ、短い生活環および比較的小さいゲノムであ
る(リュートウィラー(Leutwiler)ら、1984)。さらにアラビドプシス(A
rabidopsis)は、外来DNAで容易に形質転換可能である(ベクトールド(Bech
told)ら、1993)。これらの特徴は、目的の形質を制御する種々の遺伝子の
突然変異体の大きな集団をスクリーニングすることにより、アラビドプシス(Ar
abidopsis)で発現される任意の形質の遺伝的分析を容易にする。メタンスルホ ン酸エチル(EMS)、高速ニュートロン衝撃、T−DNA挿入、およびトラン
スポゾン標識により突然変異誘発させた植物集団は、植物成長とゲノム形質の遺
伝的制御を分析するための手段として、植物生物学者にとって非常に有用である
ことが証明された(コンクズ(Koncz)ら、1992)。遺伝的解析のためのモ デルとしてアラビドプシス(Arabidopsis)を利用が非常に大きいにもかかわら ず、この種で得られた知見は、他の農学的に重要な作物種に必ずしもいつも応用
できるわけではない。例えばアラビドプシス(Arabidopsis)は長角果タイプの 果実を有し、従ってこれはアブラナ科(Brassicaceae)のメンバーの果実成長の
良好なモデル種であるが、多肉質の液果タイプの果実を産生する植物にとっては
有用ではない。
【0004】 一方、トマト(リコペルシコン・エスクレンツム(Lycopersicon esculentum ))は、多肉質の液果タイプの果実を産生する作物種の良好なモデルである。ト
マトは遺伝的によく知られている。トマトは、数百のマッピングされた形質と分
子マーカーを含有する比較的小さな二倍体ゲノム(n=12、C=1pg)を有す
る(タンスクレイ(Tanskley)、1993)。トマトは、外来DNAで形質転換
することができる(マコーミック(McCormick)ら、1986)。さらにこれは 、新鮮野菜マーケットならびに食物加工産業の最も重要な作物の1つである(ヒ
レ(Hille)ら、1989;リック(Rick)とヨーダー(Yoder)、1988)。
【0005】 トマト遺伝学をさらに進展させるための大きな障害は、遺伝子同定に必要な大
きな突然変異体集団がないことである。トマトの有用な突然変異体集団は、各ト
マト遺伝子について少なくとも1つの突然変異体対立遺伝子を含有するであろう
。そのような集団は、この作物の飽和突然変異誘発を達成することを可能にする
であろう。突然変異トマト植物を産生するための技術は存在するが、これらの技
術を充分に大規模に応用して、ゲノムが突然変異体で飽和されている集団を得る
ことは、時間と空間の制約のために、現在は不可能である。これらの同じ制約の
ため、他の農作物の研究も限定される。
【0006】 突然変異トマト植物は、EMS(ヒルデリング(Hildering)とベルカーク(V
erkerk)、1965;シェーンメーカーズ(Shoenmakers)ら、1991;ウィ スマン(Wisman)ら、1991)、X線(ヒルデリング(Hildering)とベルカ ーク(Verkerk)、1965)、または高速ニュートロン(ベルカーク(Verkerk
)、1971)のようなDNA障害物質を使用して産生されているが、アラビド
プシス(Arabidopsis)での同様の試みと比較すると、はるかに限定されている 。トマトジェネティックリソースセンター(Tomato Genetic Resource Center)
から入手できる数百の突然変異トマト株が報告されているが、新しい遺伝子の突
然変異のスクリーニングに利用可能な、M1植物の大きい集団由来の突然変異誘
発したM2種子のストックはない。
【0007】 形質転換法はいまだに手間がかかるため、T−DNA標識による挿入突然変異
誘発は、トマトでは現実的ではない。一方トランスポゾン標識は、トマトや他の
農作物種の突然変異誘発および遺伝子同定において有望なアプローチである。A
c/Ds輸送可能成分ファミリーは、トマトにおいて活性であり(ヨーダー(Yo
der)ら、1988)、この種のAc/Ds転位のパターンは、報告されている (キャロル(Carroll)ら、1995;オズボーン(Osborne)ら、1991;ロ
メンス(Rommens)ら、1992;ヨーダー(Yoder)ら、1988)。トマトゲ
ノム中でマッピングされたDs成分を含有するトマト株が作成されている(クナ
ップ(Knapp)ら、1994;トーマス(Thomas)ら、1994)。これらの株 は、近くの部位のAc/Dsの選択的挿入の利用を可能にする(ドーナー(Doon
er)とベラチュー(Belachew)、1989;ジョーンズ(Jones)ら、1990 )。Ac/Ds標識系を使用して、クラドスポリウム(Cladosporium)耐性を担
う遺伝子座であるcf9(ジョーンズ(Jones)ら、1994);サイトクロー ムp450同族体をコードする遺伝子であるdwarf(ビショップ(Bishop)
ら、1996);および葉緑体の成長を制御するdcl(ケディー(Keddie)ら
、1996)のようないくつかの遺伝子を標識および単離した。
【0008】 逆向き遺伝学は、単離した遺伝子の機能を決定するための効率的な方策である
(ベンソン(Benson)ら、1995)。例えばトウモロコシでは、48,000
個のランダムに突然変異誘発した植物からの大きな植物集団をスクリーニングす
ることにより、目的の遺伝子の突然変異を同定することができる。原理的に、こ
の突然変異体集団の各植物は、輸送可能成分の挿入により引き起こされる異なる
突然変異を有する。目的の遺伝子中に輸送可能成分の挿入を有する植物は、ポリ
メラーゼチェイン反応(PCR)解析により同定される。トランスポゾンに対応
するヌクレオチド配列を有する第1のプライマー、および目的の遺伝子に対応す
るヌクレオチド配列を有する第2のプライマーは、推定突然変異体から単離した
DNAとともにPCR反応で使用される。原理的に、PCR産物は、目的の遺伝
子中にトランスポゾンが挿入されている場合のみ産生される。PCR反応でそこ
からPCR産物が産生されるDNAからなる突然変異植物は、植物の栽培と成長
に及ぼす突然変異の作用を調べるために解析され、こうして目的の遺伝子の機能
が確認される。
【0009】 しかし、多くの作物種で逆向き遺伝学を使用することは、目的の突然変異体を
検出するために成熟するまで栽培させる必要がある数万のT−DNAまたはトラ
ンスポゾン標識植物を産生し収容することは、多大の時間と努力が必要であり、
広大な野外施設が必要なため、非現実的である。従って多くの作物種で逆向き遺
伝学を現実的にするために別の方策が必要である。同様に、プロモーターまたは
エンハンサーのような遺伝子発現を制御するDNA成分を検出することができる
DNA作製体で形質転換される作物植物の大集団をスクリーニングするために、
現実的な方法が必要である。
【0010】 (発明の要約) 本発明の目的は、ミニ作物植物を使用して突然変異体の同定と性状解析をする
ための改良法を提供することである。
【0011】 本発明の別の目的は、クローン化されたヌクレオチド配列の性状解析のための
改良法を提供することである。
【0012】 本発明のさらに別の目的は、ヌクレオチド配列のクローニングのための改良法
を提供することである。
【0013】 これらの目的および他の目的は、所望の形質を有する突然変異ミニ植物の選択
方法であって、 (a)ミニ植物は、(i)同じ種の市販の植物に比較してサイズが小さいこと
;(ii)成熟して、同じ種の市販の植物に使用される標準的栽培条件より少なく
とも10倍高い植物密度で、生きた種子または塊茎を産生すること;および(ii
i)同じ種の市販の植物と交配させることができること、という特徴を有する、 ミニ植物集団を提供する工程; (b)ミニ植物を突然変異誘導物質で処理して突然変異ミニ植物集団を産生す
ることにより、ミニ植物集団中で突然変異ミニ植物を作成する工程;および (c)突然変異ミニ植物集団内で所望の形質を有する突然変異ミニ植物を選択
する工程、 を含んでなる方法を提供することにより達成される。
【0014】 本明細書に記載の本発明のすべての面および実施態様において、ミニ植物の集
団は、自然の突然変異または誘導した突然変異(遺伝子操作または植物成長因子
で処理することにより誘導)により作成される、本発明に従って使用されるミニ
植物の例は、特に限定されないが、「マイクロトム(Micro-Tom)」および「マ イクロピーチ(Micro-Peach)」のようなミニトマト栽培品種がある。上記工程 (b)で使用される突然変異誘導物質は、メタンスルホン酸エチル(EMS)、
メタンスルホン酸メチル(MMS)、メチル−N−ニトロソ尿素(MNU)、お
よびブレオマイシン類のような化学突然変異誘発物質でもよい。あるいは突然変
異誘導物質は、UV、γ線、X線、および高速ニュートロンのような放射線でも
よい。最後に突然変異誘導物質は、T−DNAまたは輸送可能成分(自律性トラ
ンスポゾン、非自律性トランスポゾン、およびトウモロコシAc/Ds輸送可能
成分のような自律性/非自律性トランスポゾン系よりなる群から選択される)で
ある可動性DNA配列でもよい。同じ種の市販の植物は、食物、繊維または花を
産生するのに使用される植物、液果タイプの果実(トマト、ブドウ、プルーン、
ナス、カンキツ類果実、およびリンゴ)を産生する植物、またはナス科(Solana
ceae)の植物(例えば、ジャガイモ)がある。
【0015】 別の実施態様において本発明は、突然変異ミニ集団を提供し、ここで集団のミ
ニ植物は、以下の特徴を有する:(i)同じ種の市販の植物に比較してサイズが
小さいこと;(ii)成熟して、同じ種の市販の植物に使用される標準的栽培条件
より少なくとも10倍高い密度で、生きた種子または塊茎を産生すること;(ii
i)同じ種の市販の植物と交配させることができること;および(iv)化学突然 変異誘発物質、放射線、および可動性DNA配列よりなる群から選択される物質
により誘導される突然変異を有すること。
【0016】 本発明のさらに別の実施態様は、目的の遺伝子中に挿入された可動性DNA配
列を含有するミニ植物の同定方法であって、 (a)ミニ植物は、(i)同じ種の市販の植物に比較してサイズが小さいこと
;(ii)成熟して、同じ種の市販の植物に使用される標準的栽培条件より少なく
とも10倍高い植物密度で、生きた種子または塊茎を産生すること;および(ii
i)同じ種の市販の植物と交配させることができること、という特徴を有する、 ミニ植物集団を提供する工程; (b)該植物を可動性DNA配列で処理して、ミニ植物集団中で突然変異植物
を作成する工程; (c)可動性DNA配列のヌクレオチド配列に対応する第1のプライマーと、
目的の遺伝子のヌクレオチド配列に対応する第2のプライマーとを使用して、P
CRにより、該突然変異植物から抽出されるDNAをスクリーニングする工程;
および (d)第1のプライマーと第2のプライマーの存在下でPCR産物を産生する
DNAからなるミニ植物を同定する工程、 を含んでなる方法を提供する。
【0017】 本発明のさらに別の実施態様は、ミニ植物の突然変異体集団の産生方法であっ
て、 (a)ミニ植物は、(i)同じ種の市販の植物に比較してサイズが小さいこと
;(ii)成熟して、同じ種の市販の植物に使用される標準的栽培条件より少なく
とも10倍高い植物密度で、生きた種子または塊茎を産生すること;および(ii
i)同じ種の市販の植物と交配させることができること、という特徴を有する、 ミニ植物集団を提供する工程;および (b)該植物を突然変異誘導物質で処理して突然変異作物栽培品種の突然変異
体集団を産生することにより、ミニ植物集団中で突然変異植物を作成する工程 を含んでなる方法を提供する。
【0018】 工程(b)の突然変異誘導物質がT−DNAである時、ミニ植物はアグロバク
テリウム(Agrobacterium)で感染され、こうして各形質転換体が異なるゲノム 位置にT−DNA挿入体を含有する複数の形質転換体が産生される、工程(b)
の突然変異誘導物質がトランスポゾンである時、突然変異ミニ植物集団は、活性
転位系を含有するミニ植物の子孫から得られる、この活性転位系は、植物本来の
トランスポゾン、または当業者に公知の遺伝子操作技術により植物中に導入され
るトランスポゾン(例えば、自律性トランスポゾン、または非自律性トランスポ
ゾンを含有する植物をトランスポザーゼ源または自律性トランスポゾンを含有す
る植物と交配して得られる輸送可能成分)でもよい。輸送可能成分は、例えばト
ウモロコシAc/Dsトランスポゾン系である。
【0019】 本発明のさらに別の実施態様は、植物遺伝子発現を制御するヌクレオチド配列
の同定方法であって、 (a)作物植物のミニ植物をDNA作製体で形質転換して、ランダムに突然変
異誘発した植物の集団を産生する工程(ここでDNA作製体は、プロモーターが
欠如しているかまたは最小のプロモーターを含有するスクリーニング可能なマー
カーをコードする遺伝子配列を含み、ミニ植物は、(i)同じ種の市販の植物に
比較してサイズが小さいこと;(ii)成熟して、同じ種の市販の植物に使用され
る標準的栽培条件より少なくとも10倍高い植物密度で、生きた種子または塊茎
を産生すること;および(iii)同じ種の市販の植物と交配させて、ランダムに 突然変異誘発した植物を産生することができること、という特徴を有する); (b)DNA作製体で形質転換され、スクリーニング可能なマーカーを発現す
る植物集団内でミニ植物を同定する工程;および (c)工程(b)で同定される形質転換したミニ植物から単離される総DNA
からのスクリーニング可能なマーカーをコードする遺伝子に機能的に結合したヌ
クレオチド配列をクローン化する工程、 を含んでなる方法を提供する。
【0020】 スクリーニング可能なマーカーはGUSまたはルシフェラーゼでもよく、可動
性DNA配列はT−DNAまたは輸送可能成分でもよく、そして植物遺伝子発現
を含有するヌクレオチド配列は、プロモーターまたはエンハンサーでもよい。
【0021】 さらに別の実施態様において本発明は、所望の形質を有する市販の植物の突然
変異体集団を産生する方法であって、 (a)本発明の選択方法に従って選択される所望の形質を有する突然変異ミニ
植物を、同じ種の市販の植物と交配させる工程、および (b)市販の親植物に似ており所望の形質を発現する子孫を選択する工程 を含んでなる方法を提供する。
【0022】 この実施態様に従って、本発明はまた、上記方法により得られる市販の植物の
突然変異体集団を包含する。
【0023】 (発明の詳細な説明) 本発明は、突然変異誘発した植物の大規模産生と効率的なスクリーニングを可
能にする。これは、同じ種の市販の栽培品種と交配することができるミニ作物植
物を利用して行われる。ミニ植物で突然変異が誘導され、次に突然変異は突然変
異ミニ植物集団中で同定され、これは効率的に高密度まで成熟させることができ
る。
【0024】 多くの作物種(例えば、トマト)について逆向き遺伝学を試みることの大きな
障害は、大規模な突然変異植物を産生し扱うには多大の時間、努力、およびスペ
ースが必要なことである。本発明は、例えば現状の産生法では現実的ではないよ
うなトランスポゾン突然変異誘発植物の迅速、大規模かつ効率的なスクリーニン
グを可能にする。農業的目的の多くの農作物種(例えば、トマト)の逆向き遺伝
学のために、代表的な植物集団を産生するのに、100,000もの異なるトラ
ンスポゾン突然変異誘発植物が必要であると推定される。作物植物中でのそのよ
うな突然変異体のライブラリーの産生は、本発明を用いてミニ植物を使用するこ
とにより行われる。本発明は、管理可能な植え付け領域内で成長した大きな植物
集団中で、目的の標的遺伝子中に挿入されたトランスポゾンを有する株を同定す
ることにより、ほとんどすべての所望の遺伝子の不活性化を可能にする。標的遺
伝子中のトランスポゾン挿入の同定は、標的遺伝子に対応するヌクレオチド配列
を有する1つのプライマーとトランスポゾンに対応するヌクレオチド配列を有す
る第2のプライマーを使用して、PCRによりトランスポゾン含有植物のプール
をスクリーニングすることにより行われる。PCR産物は、目的の遺伝子内にト
ランスポゾンが挿入された植物突然変異体から単離されたDNA基質からのに産
生される。
【0025】 本発明の方法は、食物、繊維または花を産生するために使用される植物を含む
農業的興味のある任意の植物に適している。これらの農作物植物は、特に限定さ
れないが、トマト、ブドウ、カンキツ類果実、プルーン、リンゴ、ナスから選択
される液果タイプの果実;ナス科(Solanaceae)の植物(例えば、ポテト)およ
びトウモロコシなら花および果実木種を含む。
【0026】 本発明の方法はまた、古典的な品種改良プログラムにおいて商業的価値のある
遺伝子の同定、新しい遺伝子の単離、新しい遺伝子の導入、および組織特異的プ
ロモーターとエンハンサーの単離を促進するであろう。商業的価値のある遺伝子
には、果実の熟成に影響を与える遺伝子、および植物の収率および/または量を
改良する遺伝子がある。単離の標的となる可能性のある新しい遺伝子には、果実
中の糖含量、ミネラル取り込みなどに関連する遺伝子がある。組織特異的プロモ
ーターは、トランスポゾン内で作成される「遺伝子捕捉」法を使用して単離して
もよい。
【0027】 植物ゲノムへの輸送可能成分のような可動性DNA配列の挿入と、標的遺伝子
中に挿入されたトランスポゾンを有する植物の同定とにより、ミニ植物中のラン
ダム突然変異誘発により、ほとんどすべての所望の遺伝子が不活性化される。目
的の挿入突然変異体の同定は、標的遺伝子に対応するヌクレオチド配列を有する
1つのプライマーとトランスポゾンに対応する第2のプライマーを使用して、P
CRによりトランスポゾン含有植物のプールをスクリーニングすることにより行
われる。ミニ作物植物集団はまた、植物プロモーターの効率的なスクリーニング
と同定に使用される。
【0028】 本明細書で使用される用語を以下のように定義する。 ミニ植物、栽培品種または作物は、対応する植物、栽培品種または植物の野生
型作物に比較して著しく小さい全体的サイズまたはバイオマスを有する。ミニ植
物、栽培品種または作物は、成熟するまで栽培させて、対応する野生型植物では
非現実的な植物密度で生存活性のある生殖器官(例えば、果実、種子、塊茎など
)を産生することができる。例えば、ミニ植物、栽培品種、または作物を、同じ
種の市販の植物で使用される標準的栽培条件より、少なくとも1倍、好ましくは
5倍、10倍、50倍、100倍、150倍、200倍、250倍、300倍、
またはそれ以上の植物密度に、成熟するまで栽培させることができる。野生型植
物を高密度で栽培させることは可能性のあるが、実生または若い植物段階までで
あり、果実、種子または塊茎は産生されない。これに対して本発明のミニ作物は
、成熟した果実、種子、塊茎などが成長するまで高植物密度で栽培し成熟させる
ことができる。
【0029】 トランスポゾン − ゲノム内の異なる位置に移動または「ジャンプ」するこ
とができる天然のDNA配列。遺伝子中に導入され、その結果遺伝子を破壊する
ことにより、トランスポゾンは遺伝子の突然変異を引き起こす。トランスポゾン
は、細菌、キイロショウジョウバエ(Drosophila)、酵母、線虫、植物、および
哺乳動物で見つかっている。
【0030】 輸送可能成分 − トランスポゾンに対応する。
【0031】 トランスポザーゼ − トランスポゾンの末端領域、およびトランスポゾンの
切除とゲノム内の他の位置への転位に介在する、自律性トランスポゾンにより発
現されるタンパク質。
【0032】 自律性トランスポゾン − トランスポザーゼをコードし、その触媒活性につ
いてトランスポザーゼに認識される末端領域を有し、従って自律性に転位する成
分。自律性トランスポゾンにより引き起こされる突然変異は不安定である。自律
性トランスポゾンの例は、トウモロコシのAc(アクチベーター)トランスポゾ
ンである。
【0033】 非自律性トランスポゾン − トランスポザーゼに認識される末端領域を有す
るがそれをコードしない成分、従って切除とゲノム内の転位のためにはトランス
ポザーゼがtransで供給されることが必要である。非自律性トランスポゾン
の例は、トウモロコシのDs(解離)トランスポゾンであり、これは自律性(例
えば、Ac)トランスポゾンとともに使用することができる。
【0034】 作物のミニ栽培品種は、自然の突然変異体または誘導された突然変異体(目的
の作物植物の遺伝子操作もしくは植物成長因子を用いる処理により誘導される)
から成長させることができる。矮小突然変異体は植物界では普遍的に存在し、多
くの種で見いだされている。
【0035】 最も顕著な矮小遺伝子集団の1つは、コムギのrht(背が低い)遺伝子であ
る(ゲール(Gale)とヨウセフィアン(Youssefian)、1985)。これらの遺
伝子は、ほとんどが緑の革命に関与している。矮小栽培品種のより短い茎に、1
つの植物当たり「負荷」をかけて高収率(より重い穂)にし、植物を背の高い栽
培品種で可能な高さより高密度にし、世界的なコムギの収率を上げることができ
る。野生型コムギの高さは、約120〜140cmであり、これは1つの矮小化遺
伝子が存在すると90〜100cm、2つの矮小化遺伝子が存在すると40〜60
cmになる。今日、標準的コムギ栽培品種は、1つまたは2つの矮小化遺伝子を有
する。これらの植物において、背が低いことは他の植物器官(例えば、葉または
穂)の小型化に関連せず、従って大規模な突然変異誘発には有用ではない。しか
し極端に矮小なコムギ植物は、この種の大規模突然変異誘発を促進するのに使用
することができた。
【0036】 同様に、矮小化遺伝子が他の穀物(例えば、トウモロコシやイネ);エンドウ
のようなマメ科植物;コショウ、ナスおよびトマトのような野菜;バラのような
装飾植物;およびオレンジのような木や他のカンキツ類で見つかっている。これ
らの遺伝子の作用様式は異なる。矮小植物、関与する遺伝子、およびその作用様
式のいくつかの例が、最近の総説で報告されている(ヘデン(Hedden)とカミヤ
(Kamiya)、1997)。例えば、ある矮小植物は、植物ホルモンの1つ(例え
ば、ジベレリン)の合成に欠陥があり、別の矮小植物はジベレリンを合成するが
これに非感受性である(例えば、GAI=ジベレリン非感受性突然変異体)。し
かし、多くの矮小植物では、作用様式は不明である。そのような矮小植物、また
は操作して植物のサイズを大幅に低下させることができるクローン化遺伝子は、
本発明で任意の作物で特許請求した、以後の大規模突然変異誘発に利用すること
ができる。
【0037】 多くの作物で、矮小植物を単離し性状解析するための一般的方法が利用できる
。植物は、全体のサイズに影響を与える単離した遺伝子で形質転換することがで
きる。例えばアラビドプシス(Arabidopsis)から単離されるアペタラ(apetala
)遺伝子を使用して、形質転換したポプラ植物のサイズを変更した。ミニ作物は
、伝統的な品種改良法を使用して作製することができる。栽培品種「マイクロト
ム(Micro-Tom)」の場合は、minatureとdwarfと呼ぶ2つの主要 な遺伝子が、ミニ表現型に関与する。
【0038】 ミニ植物のサイズは著しく小さいため、矮小またはミニ栽培品種の植物は、標
準的農場条件下より少なくとも10倍高い密度で栽培される。これは、狭い領域
での大きな植物集団の解析を促進する。以後の例に記載のようにトマトのミニ栽
培品種である「マイクロトム(Micro-Tom)」の場合は、植物は、標準的農場条 件下の市販の培養物で得られる密度より約200倍高い密度で栽培される。ミニ
栽培品種で得られた挿入突然変異体を含む新しい突然変異体は、ミニ化遺伝子ま
たはトランス遺伝子を分離することにより、作物との標準的交配により、商業的
バックグランドに移すことができる。
【0039】 本発明の方法に従ってミニ栽培品種を得るのに任意の突然変異誘発法が使用で
き、特に限定されないが、当業者に公知の方法を使用する、化学的処理、放射線
照射、または宿主植物からもしくは異種起源からのT−DNAもしくはトランス
ポゾンのDNA挿入がある。矮小化を引き起こす挿入不活性化は、大きな植物集
団をスクリーニングすることにより達成される。ミニ栽培品種の突然変異体の産
生のための化学的処理は、メタンスルホン酸エチル(EMS)、メタンスルホン
酸メチル(MMS)、メチル−N−ニトロソ尿素(MNU)、およびブレオマイ
シン類などの突然変異誘発物質を使用して公知の方法により行うことができる。
また、UV光、X線および高速ニュートロンを照射する公知の方法によっっても
突然変異を行うことができる(例えば、ペールマン(Poehlman)、1987また
はマルムベリ(Malmbery)、1993を参照)。
【0040】 可動性DNA配列を有する遺伝子の挿入不活性化を実施してもよい。可動性D
NA配列はT−DNAまたはトランスポゾンでもよい。
【0041】 T−DNA突然変異誘発は、アグロバクテリウム(Agrobacterium)を使用し て公知の方法により実施してもよい(ヘーケマ(Hoekema)ら、1983;米国 特許第5,149,645号)。トランスポゾン挿入突然変異誘発は、公知の方
法により行うことができる(フェドロフ(Fedoroff)ら、1984;米国特許第
4,732,856号および第5,013,658号)。輸送可能成分は、自律
性トランスポゾン、非自律性トランスポゾン、または自律性/非自律性トランス
ポゾン系(例えば、トウモロコシAc/Dsトランスポゾン系)でもよい。
【0042】 植物の大きい集団好ましくは少なくとも数千の植物を、突然変異体についてス
クリーニングする。突然変異体の同定は視覚的に行い、例えばミニ選択物を同定
することができる。他のタイプの突然変異体を同定するためにさらなる方策を使
用することができる。例えば特に限定されないが、ホルモン、ミネラル、病原体
、除草剤などの特定の形質について、植物生物学で使用される公知の方法により
測定する。
【0043】 目的の特定の遺伝子での挿入事象の同定は、トランスポゾンまたはT−DNA
のヌクレオチド配列に対応する第1のプライマーと、目的の遺伝子のヌクレオチ
ド配列に対応する第2のプライマーによるPCRスクリーニングを用いて行うこ
とができる。目的の遺伝子は、部分的にまたは全体が配列決定されている単離さ
れた遺伝子でもよい。あるいは目的の遺伝子は、発現された配列標識(EST)
でもよい。PCR法は当該分野で公知である。PCRの一般的な説明は、デリド
ウ(Delidow)ら、1993に記載されている。PCR法のための適当なオリゴ ヌクレオチドプライマー配列の設計は、リチリック(Rychlick)ら(1993)
に記載されている。PCR産物の検出法は、アレン(Allen)ら(1993)に 記載されている。
【0044】 第1のプライマーと第2のプライマーを用いてPCR産物を産生する、そこか
らDNAが単離された植物が、同定される。この植物を解析して、植物の表現型
上のトランスポゾン挿入の作用を調べることができる。
【0045】 本発明の方法は、成長または疾患耐性遺伝子を含む目的の遺伝子を同定し性状
解析するのに使用することができる。PCR解析用のプライマーの設計のために
、目的の遺伝子の充分なヌクレオチド配列が必要である。特定の遺伝子がいった
ん同定されると、これらは植物品種改良で好適な方法により、適当な商業的バッ
クグランドに移すことができる(例えば、ペールマン・ジェイ・エム(Poehlman
JM)、Breeding Field Crops、ニューヨーク、1987 を参照)。使用される具体的な方策は、作物植物に依存する。
【0046】 本発明は、作物植物であるトマトの突然変異体ライブラリーを開発するのに使
用した。このライブラリーは、トマト遺伝学の研究と、重要な遺伝子を単離する
能力を大幅に進展させる。この突然変異トマトライブラリーは、元々家庭ガーデ
ニングを目的として品種改良された「マイクロトム(Micro-Tom)」(マイクロ トマト)と呼ぶミニ−矮小−有限リペルシコン・エスクレツム(Lypersicon esc
ulentum)栽培品種に基づく(スコット(Scott)とハーボー(Harbaugh)、19
89)。この栽培品種は、高密度(1平方メートル当たり1357個の植物)で
栽培でき、そのような高密度でも実を結ぶため、本発明に特に有用である。さら
にこの栽培品種は生活環が短く、種を播いてから70〜90日で成熟した果実を
生成し、これが1年に最高4回のスクリーニングを容易にする。これらの性質の
ため、これは大きな突然変異誘発植物集団のスクリーニングの効率的なシステム
であり、トマトでの飽和突然変異誘発を可能にする。
【0047】 さらにこの栽培品種は、容易かつ効率的に形質転換することができる。子葉の
のアグロバクテリウム(Agrobacterium)介在形質転換により、最大80%の形 質転換頻度が得られ、子葉の接種からトランスジェニック果実の採取までに約1
00日が必要なだけである。さらにこの栽培品種は、2つの主要な遺伝子が標準
的トマト栽培品種と異なるのみである。「マイクロトム(Micro-Tom)」のサイ ズを制御する2つの遺伝子は劣性であるため、F1世代の標準的バックグランド
で優性形質を解析することができる。劣性遺伝子を標準的バックグランドに移す
ためには、さらに1世代が必要である。従って突然変異またはトランス遺伝子は
、「マイクロトム(Micro-Tom)」遺伝的バックグランドで研究することが便利 であり、必要な場合は、当業者に公知の伝統的品種改良法を使用して、標準的バ
ックグランドに移すことができる。
【0048】 我々はまた、Ac/Dsトランスポゾン標識系を、「マイクロピーチ(Micro-
Peach)」と呼ぶ別のミニトマト栽培品種で使用することができることを確認し た。「マイクロピーチ(Micro-Peach)」は、サイズが「マイクロトム(Micro-T
om)」に似ている。しかし「マイクロピーチ(Micro-Peach)」は、「マイクロ トム(Micro-Tom)」の赤い果実色ではなく、桃の果実色をしている。Ac/D sトランスポゾン系は、「マイクロピーチ(Micro-Peach)」中で非常に活性が 高く、大規模な突然変異誘発と逆向き遺伝学をすることができる。
【0049】 「マイクロトム(Micro-Tom)」を突然変異誘発と逆向き遺伝学のモデル系と して評価するために、この栽培品種の細微条件と形質転換条件を最適化した。次
に9,000個のM1個体から得られた20,000個のEMS−突然変異誘発
M2植物のスクリーニングを行なった。葉、花、および果実の色または形が変化
した突然変異体が見つかった。Ac/Ds輸送可能成分エンハンサー捕捉システ
ム(フェドロフ(Fedoroff)とスミス(Smith)、1993)と遺伝子捕捉シス テム(スナダレサン(Sunadaresan)ら、1995)を「マイクロトム(Micro-T
om)」に導入し、活性があることを確認した。すなわち「マイクロトム(Micro-
Tom)」栽培品種の利用は、トマトの飽和突然変異誘発の目標、または任意の遺 伝子の標識もしくは挿入不活性化の目標を達成するのに使用することができる。
本発明の方法は、遺伝子の迅速で効率的な性状解析を促進するために、目的の植
物種の任意のミニ選択で使用することができる。
【0050】 本発明の利点は、14,000の個体からなるEMS突然変異誘発した「マイ
クロトム(Micro-Tom)」から得られるM2植物集団が、100m2のスペースで
のみ栽培したという観察により強調される。さらに、短い6ヶ月間(M1は春に
栽培し、M2は同じ年の夏に栽培した)1人の作業を必要としただけでこの集団
が得られた。使用したEMS突然変異誘発は比較的穏やかであったが、1%未満
のアルビノ植物が見つかったという事実により証明されるように、多数の突然変
異体が回収された。得られたM2集団中にさらなる突然変異遺伝子が存在する可
能性が高く、これは他の研究者により今日まで報告された限定された数百のトマ
ト突然変異体に充分匹敵する。
【0051】 各M1植物から得られた突然変異表現型を示したすべてのM2ファミリーは、
3:1(優性:劣性)比で分離した。これは、本明細書で使用した実験条件下で
「マイクロトム(Micro-Tom)」で、配偶子が突然変異誘発の時に成熟種子の胚 中に存在する単一の細胞から得られることを示唆する。これらのデータは、以前
の報告(ヒルデリング(ヒlderingp)とベルカーク(Verkerk)、1965;ベル カーク(Verkerk)、1971)に一致し、1〜3つの細胞が、突然変異したト マト植物中で胞子母細胞を発生することを示唆している。
【0052】 トランスポゾン標識系はトマトですでに報告されている(キャロル(Carrol)
ら1995;クナップ(Knapp)ら、1994;ロメンス(Rommens)ら、199
2;ヨーダー(Yoder)ら、1988)が、この植物についてエンハンサーや遺 伝子捕捉システムの文献は無い。しかし本発明において、非連鎖転位の選択のた
めの2つのシステムがトマトに導入され、1つのシステムはNAM感受性とカナ
マイシン耐性に基づき(スンダレサン(Sundaresan)ら、1995)、第2のシ
ステムは切除−挿入選択(フェドロフ(Fedoroff)とスミス(Smith)、199 3)に基づき、これはDs内に含有されるヒグロマイシン耐性の効率的な検出を
利用する。さらに、「マイクロトム(Micro-Tom)」の他の農学的特徴と一緒に 切除マーカーとしてクロロスルフロンに対する耐性を利用して、多数の推定突然
変異体がエンハンサーやプロモーターのスクリーニングについてスクリーニング
され、遺伝子単離について使用することができる。さらに最近報告されたトマト
の体細胞組織の部位選択挿入(クーレイ(Cooley)ら、1996)はまた、安定
な胚細胞転位事象について「マイクロトム(Micro-Tom)」で応用することがで きる。この点で、「マイクロトム(Micro-Tom)」で活性があることが証明され たAc/Ds系はまた、遺伝子ノックアウトまたは挿入不活性化により、逆向き
遺伝学に寄与する。
【0053】 以下の例は例示のために提供され、決して本発明の請求の範囲を限定するもの
と考えてはならない。開示された態様には種々の変更が可能であり、そのような
変更は、本発明の請求の範囲内に含まれることは当業者には明らかであろう。本
明細書に記載したすべての文献および特許出願は、本発明が関する分野の技術レ
ベルを示すものである。本明細書に記載のすべての文献および特許出願は、各文
献または特許出願が、具体的かつ個別にその全体が取り込まれたものとして、本
明細書の一部として参照される。
【0054】 (例) 例1.栽培環境と遺伝子構成
【0055】 (a)方法:「マイクロトム(Micro-Tom)」植物種子を播き、苗床トレイま たは鉢で果実が熟すまで栽培した。植物密度の実験について、各処理は、異なる
根の容積での栽培に対応する。そのために植物を13、33、90、または20
0mlの市販の区画化した苗床トレイ中または465ml容量の鉢中で育てた。各処
理は二重測定で行い、それぞれ84個(13ml処理)、72個(33ml)、63
個(90ml)、50個(200)ml、および15個(465ml)の植物からなり
、各形質について分析した。
【0056】 (b)結果:種々のサイズの根の区画を有する苗床トレイ中で、種子から果実
が熟するまで「マイクロトム(Micro-Tom)」植物を育てて、植物の成長ならび に果実と種子の成熟に及ぼす密度の効果を測定した。100〜1357植物/m 2 (465〜13mlの範囲の根の容積に等しい)の密度を試験した。異なる栽培 条件に対する「マイクロトム(Micro-Tom)」の応答を図1に示す。試験した栽 培形質は、括弧内に示す値の範囲(最初−最大)で各四角中に示す。各形質はこ
の形質の最大値のパーセントとして示し、根の容積(下のスケール)または植物
密度(上のスケール)の関数として示す。以下の形質を測定した:開花までの日
数(播いて開花までの平均日数);熟すまでの日数(播いてから熟すまでの平均
日数);植物の高さ(土壌の表面から第1花序までの高さ(cm));葉の数(主
茎上の葉の数);植物の収率(植物当たりの総果実質量(g));果実の数(植
物当たりの果実の数);果実の質量(果実の平均質量(g));および種子の数
(植物当たりの種子の平均数)。誤差棒は、小さすぎるため記載していない。
【0057】 一部の形質は、植物密度にほとんど影響を受けなかった。例えば種子を播いて
から開花までの日数は37〜40日の範囲であり、種子を播いてから果実が熟す
るまでの日数は75〜82日の範囲であった。対照の標準的有限トマト栽培品種
(cv.UC82)を同様の条件で育てると、高密度(412〜1357植物/
2)では果実ができず、低密度(100〜226植物/m2)では一部の植物で
のみ果実ができた。他の形質(例えば、植物の収率、植物当たりの果実の数、ま
たは種子の数)は、植物密度の変化に対して直線的に応答し、実験で得られた最
小値と最大値の間には10倍以上の差があった。平均果実質量と植物の高さの形
質は、密度に対する応答が小さく、最小値と最大値では2倍の差であった。
【0058】 種々の密度レベルで育てた成熟植物を、図2Aと2Bに示す。図2Aは、根の
区画が13ml(左上)、33ml(右上)、90ml(左下)、および200ml(右
下)を有する苗床トレイで育てた「マイクロトム(Micro-Tom)」植物を示す。 図2Bは、90mlの区画で育てた野生型「マイクロトム(Micro-Tom)」の成熟 植物をスケール棒とともに示す。植物は5〜6mlの高さ(根は含まない)で、果
実の直径は1.5〜2cmである。「マイクロトム(Micro-Tom)」植物は、苗床 中で226植物/m2の密度で育てた。「マイクロトム(Micro-Tom)」では、す
べての植物器官が、釣り合ってサイズが低下している(種子は例外であり、ほぼ
正常の大きさである)。これは、植物の全体のサイズと比較すると外観がコンパ
クトで大きな葉を持つ他のトマト矮小突然変異体と対照的である。
【0059】 これらの結果は、矮小栽培品種「マイクロトム(Micro-Tom)」は、本発明に 従って1357植物/m2の密度でルーチンに育てることができることを証明し ている。
【0060】 「マイクロトム(Micro-Tom)」をUC82(有限栽培品種)およびVF86 (非有限栽培品種)と交配した。両方の交配のF1植物は、高さが「高い」親と
非常によく似ており、「マイクロトム(Micro-Tom)」型に関与する遺伝子は劣 性であることを示している。UC82との交配からのF2子孫では、広い範囲の
栽培環境表現型があった。176個のF2植物のうちの6個は明らかに「マイク
ロトム(Micro-Tom)」タイプではなく、これは変更遺伝子の可能な追加の作用 を有する2つの主要な劣性遺伝子により制御されていることを示唆している。「
マイクロトム(Micro-Tom)」の系統(スコット(Scott)とハーボー(Harbaugh
)、1989)に基づき、dwarfとminiatureは、「マイクロトム
(Micro-Tom)」表現型に関与する2つの遺伝子であるようである。
【0061】 これらの結果は、矮小栽培品種「マイクロトム(Micro-Tom)」は、市販のト マト栽培品種と容易に交配させることができることを示している。
【0062】 例2.EMS突然変異誘発 (a)方法:EMS実験について、植物を例1に記載のように栽培したが、植
物は、温室の代わりにワイズマンインスチチュートオブサイエンス(Weizmann I
nstitute of Science)(レホヴォト(Rehovot)、イスラエル)のネットハウス
で栽培した。
【0063】 15,000個の「マイクロトム(Micro-Tom)」種子についてEMS突然変 異誘発を行なった。突然変異誘発を行なった種子と突然変異誘発した種子から発
芽した植物を、M1世代と呼ぶ。種子をシャーレ中のワットマン紙上に9時間浸
し、非緩衝化0.7%EMS(シグマ(Sigma))溶液150mlを含有する三角 フラスコに移し、静かに攪拌しながら室温(22℃)で16時間インキュベート
した。突然変異誘発した種子を充分洗浄し、ファンで乾燥し、同じ日に実生トレ
イに播いた。対照群と比較して、突然変異誘発した実生は成長が遅れ、発芽の割
合は約25%低下していた。約10%のM1植物は不稔性であった。M2種子は
、9000個のM1植物から採取した。70個のM1植物から、M2種子を各植
物から1つずつ採取し、子孫の列中の各M1植物について10〜20個のM2植
物を育てた。残りのM2種子をバルクで採取し、各M1植物から1つの果実をプ
ールした。バルク採取物から約20,000個のM2種子を播き、14,000
個の果実産生M2植物が得られた。M3種子をバルクで採取した。
【0064】 (b)結果:M1集団(処理世代)では、約1%の植物が斑入り葉緑素を示し
た。
【0065】 図2Cに示すように、M2集団では、全部で14,000個の植物を苗床トレ
イ中で栽培し、突然変異表現型についてスクリーニングした。図2D〜Hは、突
然変異体表現型を有するEMS生成したM2植物を示す。この集団から111個
の葉緑素突然変異体(アルビノ、黄色(キサントフィル様)および薄緑色の葉を
含む)を見つけた。図2Gは、葉緑素突然変異体表現型(黄色の葉)を有するM
2植物を示す。葉の形、花(花弁)および果実の色素が変化した植物も観察され
た。野生型の丸い形の果実と比較して、6つの植物はすべての果実で果実の形が
変化していた(カキ型(図2d)とナシ型(図2E)のような表現型を含む)。
楕円形の果実を有する植物も、細長い葉を有した(図2F)。
【0066】 個々のM1植物から得られる70個のM2ファミリーを、突然変異体について
スクリーニングした。5個のファミリーで突然変異表現型が観察され、これらは
いつも3:1に分離した。葉のアントシアニン(紫)色素について分離したその
ようなファミリーの1つ:図2Hに示すこのファミリーは、単一のM2植物から
得られ、アントシアニンについて3:1に分離した。
【0067】 例3.「マイクロトム(Micro-Tom)」におけるトランスポゾン標識とエンハン サー捕捉
【0068】 (a)方法:「マイクロトム(Micro-Tom)」植物を、以下の作製体を用いて 前述のように形質転換した。次にトランスジェニック植物を、温室内で例1に示
すように栽培した。
【0069】 (1)作製体:エンハンサー捕捉(フェドロフ(Fedoroff)とスミス(Smith )、1993)について使用した作製体Bam35S−AcとDs378−GU
Sを、ニナ・フェドロフ(Nina Fedoroff)から得た。遺伝子捕捉とエンハンサ ー捕捉に使用した作製体DsGとDsE(スンダレサン(Sundaresan)ら、19
95)は、それぞれベンカテサン・スンダレサン(Venkatesan Sundaresan)か ら得た。これらの作製体は図3に示し、以下に説明する。
【0070】 Acに類似の配列を灰色で示し、末端反転繰り返し配列を灰色の矢印で示す。
作製体は、各T−DNAの右(RB)の境界と左(LB)の境界がある。β−グ
ルクロニダーゼ遺伝子(GUS)はDs378−GUS中のAcウィークプロモ
ーターに、DsE中の35S最小の〜1から〜46プロモーター領域(黒四角)
か、またはDsG中の3つのアクセプタースプライス部位が続くアラビドプシス
(Arabidopsis)イントロン(黒四角)に融合している(スンダレサン(Sundare
san)ら、1995)。カナマイシンに対する耐性(Kanr)またはヒグロマイ
シンに対する耐性(Hygr)は、それぞれネオマイシンホスホトランスフェラ ーゼまたはアミノシクリトールホスホトランスフェラーゼ遺伝子により与えられ
る。ナフタレンアセトアミドに対する感受性(NAMs)は、インドールヒドロ ラーゼ遺伝子により与えられる。
【0071】 Ds移動性は、Ds含有植物(DsG、DsEおよびDs378−GUS)を
Bam35S−Acで形質転換したトランスポザーゼ産生植物と交配することに
より行われる。この作製体中でAcトランスポザーゼは、5’末端領域がユニー
クなBamHI水まで欠失しているAc成分に融合した35Sプロモーターの制
御下で産生される。クロロスルフロン耐性(Chlr)は、Ds378−GUS 含有作製体からDs成分を切除し、GUS含有作製体から突然変異アセト乳酸シ
ンターゼ遺伝子を活性化し、アラビドプシス(Arabidopsis)から突然変異アセ ト乳酸シンターゼ遺伝子を活性化することにより、得られる(フェドロフ(Fedo
roff)とスミス(Smith)、1993)。Bam35S−AcとDs378−G USとの交配のF1中のDs378−GUSの切除により切除指紋(Ex1とE
x2)が得られ、プライマーpr1とpr2で増幅した。Ds378−GUSの
両側に位置する配列を上記Ex1とEx2に示す。下線を引いた配列は、Ds3
78−GUSが得られる元々のwx−m7トウモロコシ対立遺伝子中の宿主複製
フランキングAc挿入部位を示す。
【0072】 (2)形質転換:以下の最適化プロトコールを使用して、「マイクロトム(Mi
cro-Tom)」を作製体Ds378−GUS、Bam35S−Ac、DsE、およ びDsGを形質転換した。0.2μg/mlの2,4−Dとタバコフィーダー細胞層
(ホーシュ(Horsch)ら、1985)を補足したKCMS培地(フィラティ(Fi
llati)ら、1987)を含有するプレートを、弱い光の条件下で25℃で24 時間インキュベートした。7日目の実生の子葉を葉柄の近くと先端で切断し、プ
レートの上に置き、弱い光の条件下で25℃で24時間インキュベートした。同
時培養で使用したアグロバクテリウム(Agrobacterium)株LBA4404の濃 度は、5×107〜9×107cfu/mlであった(OD0.4〜0.5に相当する)
。プレインキュベーションと同じ条件下で同時培養を行い、48時間継続した。
次に子葉を、100μg/mlのカナマイシンと400μg/mlのカルベニシリンを含
有する2Z培地(フィラティ(Fillati)ら、1987)に移し、次に200μg
/mlのカルベニシリンを含有する1Z培地に再度2〜3週間移した。次に芽を子 葉から切除し、2μg/ml IBA、50μg/mlカナマイシン、および100μg/
mlカルベニシリンを補足した根付け培地(MSSV)(フィラティ(Fillati) ら、1987)に移した。1〜3週間後に根の付いた実生が現れ、次に温室に移
した。
【0073】 (3)選択マーカーとGUSレポーター。形質転換に必要なカナマイシン選択
と捕捉系で使用したGUSレポーター以外に、多くのマーカーを使用して転位事
象について選択した(フェドロフ(Fedoroff)とスミス(Smith)、1993; スンダレサン(Sunadaresan)ら、1995)。このために、以下の化合物の1 つまたは組合せを補足した0.8%寒天含有ニチュ(Nitsh)培地中で、滅菌し た種子発芽させ成長させた:20μg/mlのヒグロマイシン(カルビオケム(Calb
iochem));0.25μg/mlのナフタレンアセトアミド(NAM、シグマ(Sigm
a));および100p.p.b.または2p.m.のクロロスルフロン(ヂュポン(DuPon
t))。ジェファーソン(Jefferson)(1987)に従ってGUS染色を行い、
ベックマン(Beeckman)とイングラー(Engler)(1994)に従って組織の清
掃を行なった。
【0074】 (4)DNA解析。デラポルタ(Dellaporta)法(デラポルタ(Dellaporta)
ら、1983)に従って、フェノールクロロホルム抽出を追加して、若い葉から
DNAを抽出した。製造業者の勧める条件に従ってプロメガ(Promega)のTa qポリメラーゼを使用して、MJサーマルサイクラー中で2.5mM MgCl2 、および200μM dNTPを用いて、PCR反応を行なった。以下のプログ
ラムを使用した:94℃で変性2分、そして94℃で1分、55℃で45分、7
2℃で1分を30サイクル、最後に72℃で5分を1工程。Ds切除産物を増幅
するのに使用したプライマーは:pr2、5’GGATAGTGGGATTGT
GCGTC3’(これは、35Sプロモーター中の配列に相補的である)および
pr1、5’GGATGATTTGTTGGGGTTTA3’(これは、ALS
遺伝子中の配列に相補的である)(図3)。切除生成物の予測されたサイズ(約
322塩基対)のバンドをアガロースゲルから抽出し、製造業者の説明書に従っ
てゲンクリーン(GenClean)を使用してDNAを精製した。これらのPCR産物
をpGEM−Tベクター(プロメガ(Promega))中にクローン化し、T7また はSP6プライマーを使用して配列決定した。サザン解析のために、2μgのゲ ノムDNAをHindIIIで消化し、0.8%アガロースゲルで分画し、MSI から購入したニトロセルロース膜に移した。製造業者の説明書に従ってハイブリ
ダイゼーションを行なった。1kbの内部GUS断片をPCRで増幅し、ランダム
プライミング法(フェインバーグ(Feinberg)とフォーベルスタイン(Vogelste
rin)、1983))により放射能標識し、Ds検出のためのプローブとして使 用した。
【0075】 (b)結果:作製体Ds378−GUS、Bam35S−Ac、DsE、およ
びDsGを、前記したように「マイクロトム(Micro-Tom)」に形質転換した。
【0076】 これらの作製体は、カナマイシンに対する耐性を与えるNPTII遺伝子を含有
する。T−DNAの存在を検出し、Ds378−GUS中のドナー部位に対する
Ds成分をマッピングするために、またはDsEとDsGを用いる非連鎖転位事
象の選択のために、NPTIIを形質転換マーカーとして使用することができる。
この遺伝子の1つの利点は、全トマト植物中の非破壊レポーターとしてのその使
用である。前記したように(ウェイデ(Weide)ら、1989)連続3日間30 0μg/mlのカナマイシンで、最も成長段階で「マイクロトム(Micro-Tom)」植 物を噴霧することは、これらを破壊せずにカナマイシン感受性植物を同定するこ
とを可能にする。このような植物中で、苗条の先端近くの若い葉は、図4に示す
ように噴霧後まもなく白くなる。図4Aは、300μg/lのカナマイシンを3回 噴霧処理(1日1回)後の、3週令の「マイクロトム(Micro-Tom)」植物を示 す。Bam35S−Ac(上のパネル)で形質転換したカナマイシン耐性植物を
、同じ週令の感受性の植物である野生型(下のパネル)と比較した。感受性植物
中で苗条で白色の葉が出現する。最終的に、これらの葉は死滅するが、次に現れ
る葉は、緑色であり、植物は生き続ける。
【0077】 ヒグロマイシン耐性遺伝子は、図4Bに示すようにDs378−GUSの存在
を示す。Ds378−GUSで形質転換した植物は20μg/mlのヒグロマイシン
に耐性(図4B、左)であり、野生型「マイクロトム(Micro-Tom)」は感受性 (図4B、下左)である。
【0078】 インドール酢酸ヒドロラーゼ(iaaH)遺伝子は、NAMに対する感受性を
与える。図4Cに示すように、感受性植物は、根の基部にカルス様組織を発生し
、発芽後約3週間で死滅する。Bam35S−Acで形質転換した植物は、0.
25μg/mlナフタレンアセトアミドに感受性(図4C、左)であり、野生型は耐
性(図4C、右)である。NAM感受性は、Bam35S−Acに対して選択す
るために陰性選択マーカーとして使用することができ、従って新しい挿入体を安
定化し、DsEとDsG中のドナー部位に対して選択する。
【0079】 ALS遺伝子は、図4Dに示すように、非切除Ds成分を有する植物中の10
0ppbクロロスルフロンに対して低い耐性を与え、Dsが切除される植物中の2p
pmクロロスルフロンに対する耐性を与える。100ppbクロロスルフロンで育て た野生型植物は感受性(図4D、左)であり、Ds378−GUSで形質転換し
た植物は低い耐性(図4D、真ん中)である。
【0080】 転位選択に使用したマーカー選択の結果を図4に示す。F1(Ds×トランス
ポザーゼ)植物のX−Gluc染色は、青い部分を示す(図4E〜F)。10日
令のF1実生の根の青色(図4E)から明らかなように、DsG中のプロモータ
ーのないGUSレポーター遺伝子は活性化された、開花の2週間後で直径1cmの
若い果実は、GUS活性について染色された(図4F、上)。野生型またはBa
m35S−Ac親のような陰性対照植物中では、GUS活性は得られなかった(
図4F、上)。F1果実の一部でGUSが活性化された(図4F、下)。
【0081】 すなわち、アラビドプシス(Arabidopsis)についてすでに記載した選択特徴 (フェドロフ(Fedoroff)とスミス(Smith)、1993;スンダレサン(Sunad
aresan)ら、1995)はまた、「マイクロトム(Micro-Tom)」に応用でき、 従ってトランスポゾン標識系のために使用することができる。連鎖転位事象が最
もしばしば回収される、Dsの非連鎖および安定化転位を作成する方策、および
切除と再挿入の選択の方策は、すでに記載されており比較される(スンダレサン
(Sunadaresan)ら、1996)。
【0082】 Ds378−GUSとBam35S−Ac作製体を使用して、切除/再挿入シ
ステムの新しい特徴が、カナマイシン感受性植物を同定しレスキューする能力か
ら得られる(図4A)。Ds378−GUSとBam35S−Acを有する親の
間の交配後に、ヒグロマイシン耐性とカナマイシン感受性についてF2植物を選
択すると、図4Dに示すように非連鎖の安定化転位事象の選択を可能にする。胚
性Ds切除事象が起きたF2植物(Bam35S−Ac×Ds378−GUS)
は、クロロスルフロンに対して充分耐性である(図4D,右)。これはフェドロ
フ(Fedoroff)とスミス(Smith)(1993)により開発されたシステムをト マトに応用することを可能にする。この2重システムは、連鎖および非連鎖転位
の選択に適している。
【0083】 トマトでのこのシステムの使用は、まずHygrとKans植物の選択が関与し
、これは、非連鎖の安定な転位事象の同定を可能にする。この群の植物について
、空のドナー部位を含むT−DNAは分離するため、NAM選択は必要ではなく
、クロロスルフロンは使用すべきではない。第2にHygrとKans植物の間の
クロロスルフロンの耐性の植物の選択は、連鎖転位事象の同定を可能にする。こ
の群の植物は、Acが近くに転位する自然の傾向のために、かつ前記した非連鎖
転位事象(Hygr、Kans、およびChls植物)の一部のために、濃縮され る。
【0084】 「マイクロトム(Micro-Tom)」に導入されるAc/Ds系の活性を、Ds切 除指紋を配列決定することによりDs378−GUSとBam35S−Acで別
々に形質転換したトランスジェニック植物の間の交配のF1植物中で確認した。
図3でDs378−GUSの下に示すこれらの指紋は、Ac/Dsについて予測
されるものに典型的である。分析した4つのクローンのうちの3つは、トウモロ
コシのwx−m7対立遺伝子またはアラビドプシス(Arabidopsis)(シー・ウ ェイル(C. Weil)、私信)およびタバコ(ゴルブノバ(Gorbunova)とレビイ(
Levy)、1997;シャレブ(Shalev)とレビイ(Levy)、1997)中のAc
により生成されたものと同じ好適な指紋(GC反転)を有していた。これらの結
果は、すでにスコット(Scott)ら(1996)が記載しているように、優先的 指紋生成が種に非依存性であることを示唆する。さらにDsG×Bam35S−
Acの根(図4E)、葉(示していない)、またはDs378−GUS×Bam
35S−Acの若い果実(図4F)中に見いだされるGUS染色パターンは、植
物成長過程での遺伝子中またはその近くのDsの再組み込みを示した。弱いAc
プロモーターを有するDs378−GUS親では、若い果実の未成熟な種子中で
のみ弱いGUS活性が検出された。
【0085】 最後に、図5に示すように、Ds378−GUS×Bam35S−Acの交配
の子孫であるクロロスルフロンとヒグロマイシン耐性F2植物のサザンブロット
解析により転位を確認した。ゲノムDNAを:Ds378−GUS作製体につい
てホモ接合性のトランスジェニック植物(レーンa);Bam35S−GUS作
製体についてホモ接合性のトランスジェニック植物(レーンb);これらの2つ
の植物の間の交配のF1植物(レーンc);および2ppmクロロスルフロンとヒ グロマイシンに対して耐性である誘導したF2植物(レーンd〜l)から抽出し
た。DNAをHindIIIで消化し、0.8%アガロースゲルでかけ、ナイロン 膜に移し、内部の1kbGUSプローブにハイブリダイズさせた。矢印は、Bam
35S−GUSからの8kbのバンドを示す。
【0086】 HindIIIで消化したDs含有親Ds378−GUSからのDNAを処理す ると、Dsの5’末端とGUS遺伝子の5’の間の結合が切断され、左の境界近
くでT−DNAを切断しない(図3)。Ds内に存在するGUSプローブは、D
s親について単一の8kbのバンドを明らかにし(レーンa)、単一のT−DNA
コピーがゲノム内に挿入されることを示している。トランスポザーゼ親では予測
されたように、ハイブリダイゼーションは得られなかった(レーンb)。F2親
は変動するハイブリダイゼーションパターン(図5、レーンd〜l)を示し、新
しい位置での成分切除と再挿入を示していた。Ds378−GUSとBam35
S−Acの交配からのF2植物の解析は、クロロスルフロン耐性について試験し
た22個の植物のうち、ヒグロマイシン含有培地上でインキュベートすると激し
く根が成長することにより証明されるように、11個がヒグロマイシン耐性であ
った。これは、切除したAcの喪失の割合を約50%にし、これはトウモロコシ
(ドーナー(Dooner)とベラチュー(Belachew)、1989;グリーンブラット
(Greenblatt)、1984;マクリントック(McClintock9、1956)、タバ
コ(ジョーンズ(Jones)ら、1990)およびアラビドプシス(Arabidopsis)
(アルトマン(Altmann)ら、1992)について既に報告した数字と似ている 。
【0087】 例4.ミニ植物栽培品種における逆向き遺伝学 トランスポゾン含有植物の集団を産生するために、ミニトマト栽培品種の「マ
イクロトム(Micro-Tom)」が選択した。「マイクロトム」は、例3に記載され る形質転換方法により、図3に図示されるプラスミドBam35S−Acで形質
転換した。形質転換体は、プラスミドBam35S−Acについてホモ接合性で
あり、かつトランスポザーゼ活性を発現する初代親植物(株R2−1−1)を産
生するために自家受粉させた。図3に示したプラスミドDs378−GUS、お
よび図6に示したDs−LUCは、例3に記載されるように「マイクロトム」に
形質転換された。形質転換体は、T−DNA中にドナーDsを含有する一連の植
物を生じさせるように自家受粉させた。F1種子を産生させるために、トランス
ポザーゼとDs植物を交雑させた。F1植物は、選択なしに成長させ、F2種子
を産生させるために自家受粉させた。F2種子は、例3に記載されるように、ク
ロロスルフロン(chlorosulfuron)、ヒグロマイシンおよびNAMを含有する寒
天に基づく培地中でF2実生を成長させることにより、安定な転位事象について
選択した。独立した転位事象に対応するF2植物を成長させて、優性突然変異に
ついてスクリーニングした。F2植物を自家受粉させて、各ファミリーが、単一
のF2植物に由来する12個のF3植物からなるF3ファミリーを、劣性突然変
異についてスクリーニングした。
【0088】 既知のヌクレオチド配列(標的)中へのDs挿入を含有する突然変異ミニ植物
を同定した。DNAは、F2植物の葉から抽出した。トランスポゾンDsのヌク
レオチド配列に対応する第1のプライマー、および標的ヌクレオチド配列のヌク
レオチド配列に対応する第2のプライマーでスクリーニングすることにより、こ
れらのDNA試料をPCRに付した。第1のプライマーおよび第2のプライマー
によりPCR産物を産生する植物を同定し分析して、植物の表現型に及ぼす、目
的のヌクレオチド配列中へのトランスポゾン挿入の効果を決定した。
【0089】 例5:Ds−ルシフェラーゼ Ds−ルシフェラーゼと呼ばれる遺伝子捕捉のためのDNA作成体を、図6に
示す。Acに類似した配列は灰色で示され、末端反転繰り返しは灰色の矢印で示
す。作成体は、これらの各T−DNAの右(RB)および左(LB)境界が両側
に位置する。ルシフェラーゼ遺伝子(LUC)は、ヌクレオチド1〜252のA
c左末端に融合させる。この領域は、末端反転繰り返しを含有するが、プロモー
ターを欠いている。カナマイシン(Kanr)またはヒグロマイシンに対する耐 性は、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼまたはアミノシクリトールホスホ
トランスフェラーゼ遺伝子により与えられ、クロロスルフロン耐性(クロロスル
フロンr)は、Ds378−GUS含有作成体からのDs成分の切除、および3 5Sプロモーターによるアラビドプシス(Arabidopsis)(フェデロフ(Federof
f)とスミス(Smith)、1993)からの突然変異アセト乳酸シンターゼ遺伝子
の活性化により得られる。BAR遺伝子は、除草剤のバスタ(Basta)に対する 耐性を与える。
【0090】 プラスミドDs−ルシフェラーゼは、以下のように作成した:Ds378−G
US中のDs成分(図3)を、Ac境界の間にルシフェラーゼとカナマイシン耐
性遺伝子を両方を含有する、上述した図6に示すDs成分により置換した。次に
35Sプロモーター−Ds−ALS Asp718断片を、二元ベクターSLJ
525(英国、ノリッジのジョナサン・ジョーンズ博士(Dr. Jonathan Jones)
から得た)中にクローン化した。プラスミドDs−ルシフェラーゼを、図3に記
載したミニトマト栽培品種「マイクロトム(Micro-Tom)」に形質転換した。
【0091】 Ds−ルシフェラーゼの独立した転位を含有する全体で1,000個の植物を
栽培した。実生、花および果実のような植物器官を、ルシフェラーゼ発現につい
てスクリーニングした。スクリーニングは、1mMルシフェリンで植物組織を噴霧
し、続いて全くの暗闇でイメージングさせることにより行った。イメージングは
、超低光シグナルを検出することができる冷却CCDプリンストンインストルメ
ント(Princeton Instrument)カメラにより行った。暗闇で輝く、すなわち種々
の組織でルシフェラーゼを発現する100個の植物を、図7に図示すように検出
した。スクリーニングした1,000個の植物の中で、1個の植物が、普通条件
下で実生中でルシフェラーゼを発現したが、冷却処理により抑制された(図7、
下のパネル)。非常に特異的な型のプロモーターまたはエンハンサーを検出する
ために、変異体の大きな集団をスクリーニングする必要がある。
【0092】 (参考文献) Allen et al. (1993)「ポリメラーゼチェイン反応の使用および増幅産物の検 出」, Methods in Molecular Blology, Vol 15: PCR Protocols: Current Metho
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【図面の簡単な説明】
【図1】 図1は、異なる栽培条件に対する「マイクロトム(Micro-Tom)」の応答を示 す。
【図2】 図2は、「マイクロトム(Micro-Tom)」野生型と突然変異表現型を示す。
【図3】 図3は、「マイクロトム(Micro-Tom)」に形質転換された作製体の略図を示 す。
【図4】 図4は、転位選択に使用されるマーカーを含有する植物の選択の結果を示す。
【図5】 図5は、クロロスルフロン耐性(Chlr)およびヒグロマイシン耐性(Hy gr)植物のサザンブロットの結果を示す。
【図6】 図6は、プラスミドDs−ルシフェラーゼ(Ds−LUC)の略図を示す。
【図7】 図7は、種々の植物器官で発現される遺伝子中へのDs−ルシフェラーゼ(D
s−LUC)挿入の結果を示す。
【手続補正書】特許協力条約第34条補正の翻訳文提出書
【提出日】平成12年3月13日(2000.3.13)
【手続補正1】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】0074
【補正方法】変更
【補正内容】
【0074】 (4)DNA解析。デポルタ(Dellaporta)法(デラポルタ(Dellaporta)ら、 1983)に従って、フェノールクロロホルム抽出を追加して、若い葉からDN
Aを抽出した。製造業者の勧める条件に従ってプロメガ(Promega)のTaqポ リメラーゼを使用して、MJサーマルサイクラー中で2.5mM MgCl2、お よび200μM dNTPを用いて、PCR反応を行なった。以下のプログラム
を使用した:94℃で変性2分、そして94℃で1分、55℃で45分、72℃
で1分を30サイクル、最後に72℃で5分を1工程。Ds切除産物を増幅する
のに使用したプライマーは:pr2、5’GGATAGTGGGATTGTGC
GTC3’(配列番号1)(これは、35Sプロモーター中の配列に相補的であ
る)およびpr1、5’GGATGATTTGTTGGGGTTTA3’(配列
番号2)(これは、ALS遺伝子中の配列に相補的である)(図3)。切除生成
物の予測されたサイズ(約322塩基対)のバンドをアガロースゲルから抽出し
、製造業者の説明書に従ってゲンクリーン(GenClean)を使用してDNAを精製
した。これらのPCR産物をpGEM−Tベクター(プロメガ(Promega))中 にクローン化し、T7またはSP6プライマーを使用して配列決定した。サザン
解析のために、2μgのゲノムDNAをHindIIIで消化し、0.8%アガロー
スゲルで分画し、MSIから購入したニトロセルロース膜に移した。製造業者の
説明書に従ってハイブリダイゼーションを行なった。1kbの内部GUS断片をP
CRで増幅し、ランダムプライミング法(フェインバーグ(Feinberg)とフォー
ベルスタイン(Vogelsterin)、1983))により放射能標識し、Ds検出の ためのプローブとして使用した。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM ,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM) ,AL,AM,AT,AU,AZ,BA,BB,BG, BR,BY,CA,CH,CN,CU,CZ,DE,D K,EE,ES,FI,GB,GE,GH,GM,HR ,HU,ID,IL,IS,JP,KE,KG,KP, KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT,LU,L V,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI, SK,SL,TJ,TM,TR,TT,UA,UG,U S,UZ,VN,YU,ZW (72)発明者 レビイ、アブラハム、エイ イスラエル国 レホボト、ネベ メツ 4、 ワイツマン インスチチュート オ ブ サイエンス (72)発明者 マイスナー、ラファエル イスラエル国 レホボト、モルデイ ハゲ タオト 10 (72)発明者 エルキンド、ヨナタン イスラエル国 レホボト、シムヒ ストリ ート 7 Fターム(参考) 2B030 AA02 AA03 AD14 CA06 CA08 CA10 CB02 CD03 CD06 CD10 4B024 AA08 AA11 CA01 CA20 DA01 FA02 FA06 FA10 GA11 GA17 GA25

Claims (44)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 所望の形質を有する突然変異ミニ植物の選択方法であって、 (a)ミニ植物は、(i)同じ種の市販の植物に比較してサイズが小さいこと
    ;(ii)成熟して、同じ種の市販の植物に使用される標準的栽培条件より少なく
    とも10倍高い植物密度で、生きた種子または塊茎を産生すること;および(ii
    i)同じ種の市販の植物と交配させることができること、という特徴を有する、 ミニ植物集団を提供する工程; (b)ミニ植物を突然変異誘導物質で処理して突然変異ミニ植物集団を産生す
    ることにより、ミニ植物集団中で突然変異ミニ植物を作成する工程;および (c)突然変異ミニ植物集団内で所望の形質を有する突然変異ミニ植物を選択
    する工程、 を含んでなる上記方法。
  2. 【請求項2】 ミニ植物の集団は、自然の突然変異または誘導した突然変異
    (遺伝子操作または植物成長因子で処理することにより誘導)により作成される
    、請求項1記載の方法。
  3. 【請求項3】 ミニ植物はミニトマト栽培品種である、請求項2記載の方法
  4. 【請求項4】 食物、繊維、または花を産生するのに、同じ種の市販の植物
    が使用される、請求項1記載の方法。
  5. 【請求項5】 同じ種の市販の植物は、液果タイプの果実またはナス科(So
    lanaceae)の植物を産生する植物である、請求項4記載の方法。
  6. 【請求項6】 市販の植物は、トマト、ブドウ、プルーン、ナス、カンキツ
    類果実、リンゴから選択される液果タイプの果実を産生する、請求項5記載の方
    法。
  7. 【請求項7】 工程(b)の突然変異誘導物質は、メタンスルホン酸エチル
    (EMS)、メタンスルホン酸メチル(MMS)、メチル−N−ニトロソ尿素(
    MNU)、およびブレオマイシン類よりなる群から選択される化学突然変異誘発
    物質である、請求項1記載の方法。
  8. 【請求項8】 工程(b)の突然変異誘導物質は、UV、γ線、X線、およ
    び高速ニュートロンよりなる群から選択される放射線である、請求項1記載の方
    法。
  9. 【請求項9】 工程(b)の突然変異誘導物質は、T−DNAおよび輸送可
    能成分よりなる群から選択される可動性DNA配列である、請求項1記載の方法
  10. 【請求項10】 輸送可能成分は、自律性トランスポゾン、非自律性トラン
    スポゾン、および自律性/非自律性トランスポゾン系よりなる群から選択される
    、請求項9記載の方法。
  11. 【請求項11】 輸送可能成分は、トウモロコシAc/Ds輸送可能成分で
    ある、請求項10記載の方法。
  12. 【請求項12】 請求項1〜11までのいずれか1項に記載の方法により選
    択される、突然変異ミニ植物。
  13. 【請求項13】 ミニ植物はミニトマト栽培品種である、請求項12記載の
    突然変異ミニ植物。
  14. 【請求項14】 集団のミニ植物は、以下の特徴を有する突然変異ミニ植物
    集団:(i)同じ種の市販の植物に比較してサイズが小さいこと;(ii)成熟し
    て、同じ種の市販の植物に使用される標準的栽培条件より少なくとも10倍高い
    密度で、生きた種子または塊茎を産生すること;(iii)同じ種の市販の植物と 交配させることができること;および(iv)化学突然変異誘発物質、放射線、お
    よび可動性DNA配列よりなる群から選択される物質により誘導される突然変異
    を有すること。
  15. 【請求項15】 食物、繊維、または花を産生するのに、同じ種の市販の植
    物が使用される、請求項14記載の突然変異ミニ植物集団。
  16. 【請求項16】 同じ種の市販の植物は、液果タイプの果実またはナス科(
    Solanaceae)の植物を産生する植物である、請求項15記載の突然変異ミニ植物
    集団。
  17. 【請求項17】 市販の植物は、トマト、ブドウ、プルーン、ナス、カンキ
    ツ類果実、リンゴから選択される液果タイプの果実を産生する、請求項16記載
    の突然変異ミニ植物集団。
  18. 【請求項18】 目的の遺伝子中に挿入された可動性DNA配列を含有する
    ミニ植物の同定方法であって、 (a)ミニ植物は、(i)同じ種の市販の植物に比較してサイズが小さいこと
    ;(ii)成熟して、同じ種の市販の植物に使用される標準的栽培条件より少なく
    とも10倍高い植物密度で、生きた種子または塊茎を産生すること;および(ii
    i)同じ種の市販の植物と交配させることができること、という特徴を有する、 ミニ植物集団を提供する工程; (b)該植物を可動性DNA配列で処理して、ミニ植物集団中で突然変異植物
    を作成する工程;そして (c)可動性DNA配列のヌクレオチド配列に対応する第1のプライマーと、
    目的の遺伝子のヌクレオチド配列に対応する第2のプライマーとを使用して、P
    CRにより、突然変異植物から抽出されるDNAをスクリーニングする工程;お
    よび (d)第1のプライマーと第2のプライマーの存在下でPCR産物を産生する
    DNAからなるミニ植物を同定する工程、 を含んでなる上記方法。
  19. 【請求項19】 ミニ植物はミニトマト栽培品種である、請求項18記載の
    方法。
  20. 【請求項20】 可動性DNA配列は、T−DNAまたは輸送可能成分より
    なる群から選択される、請求項18記載の方法。
  21. 【請求項21】 輸送可能成分は、トウモロコシAc/Ds輸送可能成分で
    ある、請求項20記載の方法。
  22. 【請求項22】 ミニ植物の突然変異体集団の産生方法であって、 (a)ミニ植物は、(i)同じ種の市販の植物に比較してサイズが小さいこと
    ;(ii)成熟して、同じ種の市販の植物に使用される標準的栽培条件より少なく
    とも10倍高い植物密度で、生きた種子または塊茎を産生すること;および(ii
    i)同じ種の市販の植物と交配させることができること、という特徴を有する、 ミニ植物集団を提供する工程;および (b)該植物を突然変異誘導物質で処理して、ミニ作物栽培品種の突然変異体
    集団を産生することにより、ミニ植物集団中で突然変異植物を作成する工程 を含んでなる上記方法。
  23. 【請求項23】 ミニ植物の集団は、自然の突然変異または誘導した突然変
    異(遺伝子操作または植物成長因子で処理することにより誘導)により作成され
    る、請求項22記載の方法。
  24. 【請求項24】 工程(b)の突然変異誘導物質は、メタンスルホン酸エチ
    ル(EMS)、メタンスルホン酸メチル(MMS)、メチル−N−ニトロソ尿素
    (MNU)、およびブレオマイシン類よりなる群から選択される化学突然変異誘
    発物質である、請求項22記載の方法。
  25. 【請求項25】 工程(b)の突然変異誘導物質は、UV、γ線、X線、お
    よび高速ニュートロンよりなる群から選択される放射線である、請求項22記載
    の方法。
  26. 【請求項26】 工程(b)の突然変異誘導物質は、T−DNAまたは輸送
    可能成分よりなる群から選択される可動性DNA配列である、請求項22記載の
    方法。
  27. 【請求項27】 突然変異誘導物質はT−DNAであり、ミニ植物はアグロ
    バクテリウム(Agrobacterium)で感染され、こうして各形質転換体が異なるゲ ノム位置にT−DNA挿入体を含有する複数の形質転換体が産生される、請求項
    26記載の方法。
  28. 【請求項28】 突然変異誘導物質はトランスポゾンであり、突然変異ミニ
    植物集団は、活性転位系を含有するミニ植物の子孫から得られる、請求項26記
    載の方法。
  29. 【請求項29】 活性転位系は、植物本来のトランスポゾン、または遺伝子
    操作技術により植物中に導入されるトランスポゾンである、請求項28記載の方
    法。
  30. 【請求項30】 活性転位系は、自律性トランスポゾンと、非自律性トラン
    スポゾンを含有する植物をトランスポザーゼ源または自律性トランスポゾンを含
    有する植物と交配して得られる輸送可能成分とから選択される、請求項29記載
    の方法。
  31. 【請求項31】 輸送可能成分はトウモロコシAc/Dsトランスポゾン系
    を含む、請求項29記載の方法。
  32. 【請求項32】 ミニ植物はミニトマト栽培品種である、請求項22〜31
    に記載の方法。
  33. 【請求項33】 植物遺伝子発現を制御するヌクレオチド配列の同定方法で
    あって、 (a)ミニ植物をDNA作製体で形質転換して、ランダムに突然変異誘発した
    植物の集団を産生する工程(ここでDNA作製体は、プロモーターが欠如してい
    るかまたは最小のプロモーターを含有するスクリーニング可能なマーカーをコー
    ドする遺伝子配列を含み、該遺伝子配列は可動性DNA配列の境界内にクローン
    化され、該ミニ植物は、(i)同じ種の市販の植物に比較してサイズが小さいこ
    と;(ii)成熟して、同じ種の市販の植物に使用される標準的栽培条件より少な
    くとも10倍高い植物密度で、生きた種子または塊茎を産生すること;および(
    iii)同じ種の市販の植物と交配させて、ランダムに突然変異誘発した植物を産 生することができること、という特徴を有する); (b)該DNA作製体で形質転換され、該スクリーニング可能なマーカーを発
    現する植物集団内でミニ植物を同定する工程;および (c)工程(b)で同定されるミニ植物から単離される総DNAからのスクリ
    ーニング可能なマーカーをコードする遺伝子に機能的に結合したヌクレオチド配
    列をクローン化する工程、 を含んでなる上記方法。
  34. 【請求項34】 スクリーニング可能なマーカーはGUSとルシフェラーゼ
    から選択される、請求項33記載の方法。
  35. 【請求項35】 可動性DNA配列はT−DNAまたは輸送可能成分である
    、請求項33または34記載の方法。
  36. 【請求項36】 植物遺伝子発現を制御するヌクレオチド配列は、プロモー
    ターまたはエンハンサーである、請求項33記載の方法。
  37. 【請求項37】 所望の形質を有する市販の植物の突然変異体集団を産生す
    る方法であって、 (a)所望の形質を有する請求項1記載の方法に従って選択される突然変異ミ
    ニ植物を、同じ種の市販の植物と交配させる工程、および (b)市販の親植物に似ており所望の形質を発現する子孫を選択する工程 を含んでなる上記方法。
  38. 【請求項38】 食物、繊維、または花を産生するのに、市販の植物が使用
    される、請求項37記載の方法。
  39. 【請求項39】 市販の植物は、液果タイプの果実またはナス科(Solanace
    ae)の植物を産生する植物である、請求項38記載の方法。
  40. 【請求項40】 市販の植物は、トマト、ブドウ、プルーン、ナス、カンキ
    ツ類果実、リンゴから選択される液果タイプの果実を産生する、請求項39記載
    の方法。
  41. 【請求項41】 請求項37記載の方法により産生される所望の形質を有す
    る市販の植物。
  42. 【請求項42】 食物、繊維、または花を産生するのに使用される、請求項
    41記載の市販の植物。
  43. 【請求項43】 液果タイプの果実またはナス科(Solanaceae)の植物を産
    生する、請求項42記載の市販の植物。
  44. 【請求項44】 市販の植物は、トマト、ブドウ、プルーン、ナス、カンキ
    ツ類果実、リンゴから選択される液果タイプの果実を産生する、請求項43記載
    の方法。
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