JP2000245487A

JP2000245487A - 遺伝子組成物および方法

Info

Publication number: JP2000245487A
Application number: JP2000019392A
Authority: JP
Inventors: Nila Shah; シャーニラ; Janet Warrington; ワーリントンジャネット; Nila Patil; パティルニラ
Original assignee: Affymetrix Inc
Current assignee: Affymetrix Inc
Priority date: 1999-01-27
Filing date: 2000-01-27
Publication date: 2000-09-12
Also published as: EP1024200A2; CA2294572A1

Abstract

(57)【要約】【課題】法医学、父子確定検査、医学、および遺伝分
析を含む適用に有用な、多型部位を含むヒトゲノム由来
の核酸セグメント、これらの部位およびこれらの部位に
隣接する領域にハイブリダイズする対立遺伝子特異的プ
ライマーおよびプローブ、ならびに個体または個体の群
からの核酸を分析する方法を提供すること。【解決手段】表１において示されるフラグメントから
選択される１０〜１００の連続する塩基の核酸セグメン
トであって、多型部位もしくは直接隣接する塩基、また
は該セグメントの相補体を含む、セグメント。

Description

【発明の詳細な説明】

【０００１】

【発明の属する技術分野】全ての生物のゲノムは、その
生物の継続する進化の過程において、自然発生的な変異
を受け、前駆配列（ｐｒｏｇｅｎｉｔｏｒｓｅｑｕｅ
ｎｃｅｓ）の改変体形態を生成する（例えば、Ｇｕｓｅ
ｌｌａ、Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．５
５：８３１−８５４（１９８６）を参照のこと）。改変
体形態は、前駆配列と比較して、進化的な利益または不
利益を付与し得るか、または中立（ｎｅｕｔｒａｌ）で
あり得る。いくつかの場合において、改変体形態は、致
死的な不利益を付与する。他の場合においては、改変体
形態は、その種に進化的な利益を付与し、そしてその種
の多くまたは大部分のメンバーのデオキシリボ核酸（Ｄ
ＮＡ）に最終的に取り込まれ、そして事実上、前駆配列
になる。多くの場合においては、前駆形態および改変体
形態の両方は生存し、そして種の集団中で同時に存在す
る。配列の複数の形態が同時に存在することによって、
多型性が生じる。

【０００２】多型性のいくつかの異なる型が報告されて
いる。制限フラグメント長多型（ＲＦＬＰ）とは、制限
フラグメントの長さを改変するＤＮＡ配列における変化
である（例えば、Ｂｏｔｓｔｅｉｎら、Ａｍ．Ｊ．
Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．３２，３１４−３３１（１
９８０）を参照のこと）。ＲＦＬＰは、制限部位を作製
するかまたは欠失させ得、従って、制限フラグメント長
を変化させる。ＲＦＬＰは、ヒトおよび動物の遺伝的分
析において広範に用いられている（例えば、ＷＯ９０／
１３６６８；ＷＯ９０／１１３６９；Ｄｏｎｉｓ−Ｋｅ
ｌｌｅｒ、Ｃｅｌｌ５１，３１９−３３７（１９８
７）；およびＬａｎｄｅｒら、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ１２
１，８５−９９（１９８９）を参照のこと）。遺伝的形
質が特定のＲＦＬＰに関連され得る場合、ヒトにおける
そのようなＲＦＬＰの存在は、個体がまた、その形質を
示す可能性を予測するために用いられ得る。

【０００３】他の多型性は、短タンデム反復（ＳＴＲ）
の形態（例えば、タンデムジヌクレオチド反復モチー
フ、タンデムトリヌクレオチド反復モチーフ、およびタ
ンデムテトラヌクレオチド反復モチーフ）をとる。これ
らのタンデム反復はまた、可変数タンデム反復（ｖａｒ
ｉａｂｌｅｎｕｍｂｅｒｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａ
ｔ）（ＶＮＴＲ）多型性ともいわれる。ＶＮＴＲは、同
一性分析および父性分析、ならびに大多数の遺伝子マッ
ピング研究において用いられてきた（例えば、米国特許
第５，０７５，２１７号；Ａｒｍｏｕｒら、ＦＥＢＳ
Ｌｅｔｔ．３０７，１１３−１１５（１９９２）；Ｈ
ｏｒｎら、ＷＯ９１／１４００３；Ｊｅｆｆｒｅｙｓ、
ＥＰ３７０，７１９を参照のこと）。

【０００４】他の多型性は、同じ種の個体の間で単一の
ヌクレオチド変動の形態を取る。このような多型性は、
ＲＦＬＰ、ＳＴＲ、およびＶＮＴＲよりはるかにより頻
繁である。いくつかの単一ヌクレオチド多型性（ＳＮ
Ｐ）が、タンパク質コード配列に生じ、この場合には、
多型性形態のうちのあるものは、欠損または他の改変体
タンパク質の発現、および潜在的には遺伝的疾患を引き
起こし得る。コード配列内の多型性が遺伝的疾患を増加
する遺伝子の例には、β−グロビン（鎌状赤血球貧血）
およびＣＦＴＲ（嚢胞性線維症）が含まれる。ＳＮＰは
また、非コード領域に生じ、そしてこれらのＳＮＰは、
（例えば、欠損スプライシングの結果として）欠損タン
パク質発現を生じ得る。さらにいくつかのＳＮＰは、表
現型効果を有さない。

【０００５】ＳＮＰは、ＲＦＬＰおよびＶＮＴＲと同じ
様式で使用され得るが、いくつかの利点を提供する。Ｓ
ＮＰは、他の多型より高い頻度で起こり、そしてゲノム
全体を通してより均一に間隔を開けて配置される。より
高頻度かつ均一のＳＮＰとは、このようなＳＮＰが、他
の多型性についての場合よりも目的の遺伝子座に対して
近位で見出される可能性がより高いことを意味する。ま
た、特徴づけられたＳＮＰの異なる形態は、しばしば他
の型の多型性と区別する（例えば、対立遺伝子特異的ハ
イブリダイゼーションプローブまたはプライマーを用い
るアッセイの使用による）ことがより容易である。

【０００６】

【従来の技術】近年において作製されたヌクレオチド配
列データの量の増加にもかかわらず、ヒトおよび他の生
物における多型性の蓄積全体のわずかな割合のみが同定
されている。これまでに同定された多型性の不足は、多
量の研究が、従来の方法によるそれらの検出のために必
要であったことにかなりの部分が起因する。例えば、多
型性を同定するための従来のアプローチによって、ジデ
オキシ配列決定により個体集団におけるオリゴヌクレオ
チドの同じストレッチを配列決定する。このタイプのア
プローチでは、仕事量は、配列の長さおよび集団におけ
る個体数の両方に比例して増加し、そして当業者が理解
するように、ＤＮＡの大きなストレッチまたは多数の被
験体について非実用的になる。

【０００７】上記のものを含む本開示において引用され
るすべての文献（すなわち、刊行物および特許出願）
は、個々の文献のそれぞれが、本明細書中においてその
全体が参考として援用されることが特別かつ個々に示さ
れるのと同じ程度まで、全ての目的のためにその全体が
本明細書中において参考として援用される。

【０００８】

【発明が解決しようとする課題】本発明の目的は、法医
学、父子確定検査、医学、および遺伝分析を含む適用に
有用な、多型部位を含むヒトゲノム由来の核酸セグメン
ト、これらの部位およびこれらの部位に隣接する領域に
ハイブリダイズする対立遺伝子特異的プライマーおよび
プローブ、ならびに個体または個体の群からの核酸を分
析する方法を提供することである。

【０００９】

【課題を解決するための手段】本発明は、多型性部位ま
たは直接隣接する塩基を含む表１の第１列に示されるフ
ラグメントからの１０〜１００の連続する塩基の核酸セ
グメントを提供する。これらのセグメントの相補体もま
た本発明において提供される。これらのセグメントは、
ＤＮＡまたはリボ核酸（ＲＮＡ）であり得、そして二本
鎖または一本鎖であり得る。いくつかのセグメントは、
１０〜２０塩基長または１０〜５０塩基長である。好ま
しいセグメントには、二重対立遺伝子（ｄｉａｌｌｅｌ
ｉｃ）多型性部位が含まれる。セグメントにおける多型
性部位を占有するこの塩基は、参照塩基（表１、第３
列）または別の塩基（表１、第５列）であり得る。

【００１０】本発明はさらに、表１、第８列に示される
フラグメントのセグメントまたはその相補体にハイブリ
ダイズする対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドを提供
する。これらのオリゴヌクレオチドは、プローブまたは
プライマーであり得る。表１、第８列に示される配列ま
たはその相補体を含む単離された核酸もまた提供され
る。ここで、配列内の多型性部位は、表１、第３列に示
される参照塩基以外の塩基によって占有される。

【００１１】本発明はさらに、被験体（ヒトであり得る
が、ヒトに限定されない）からの核酸を分析する方法を
提供する。この新規な方法は、どの塩基が表１に示され
る多型性部位のうちのいずれか１つに存在するかを決定
する。必要に応じて、表１に示される１セットの多型性
部位を占有する１セットの塩基が決定される。この型の
分析は、疾患表現型の存在について試験される複数の被
験体に対して実施され得る。次いで、疾患表現型の存在
または非存在は、試験された被験体における多型性部位
に存在する塩基または塩基のセットと相関付けされ得
る。

【００１２】本発明のセグメントは、表１において示さ
れるフラグメントから選択される１０〜１００の連続す
る塩基の核酸セグメントであって、多型部位もしくは直
接隣接する塩基、または該セグメントの相補体を含む。

【００１３】１つの実施態様では、上記セグメントはＤ
ＮＡである。

【００１４】１つの実施態様では、上記セグメントはＲ
ＮＡである。

【００１５】１つの実施態様では、上記セグメントは５
０塩基未満である。

【００１６】１つの実施態様では、上記セグメントは２
０塩基未満である。

【００１７】１つの実施態様では、上記フラグメントは
Ｄ４２０４３であり、多型部位は１４７０位である。

【００１８】１つの実施態様では、上記多型部位は二重
対立遺伝子である。

【００１９】１つの実施態様では、上記多型部位を占め
る多型形態は、表１の第３列に列挙されるフラグメント
についての参照塩基である。

【００２０】１つの実施態様では、上記多型部位を占め
る多型形態は、表１の第５列において列挙されるフラグ
メントの代替の形態である。

【００２１】本発明の別の局面は、表１の第８列におい
て示されるフラグメントのセグメントまたはその相補体
にハイブリダイズする、対立遺伝子特異的オリゴヌクレ
オチドに関する。

【００２２】１つの実施態様では、上記対立遺伝子特異
的オリゴヌクレオチドはプローブである。

【００２３】１つの実施態様では、上記プローブの中心
位置は、上記フラグメントの多型部位と整列する。

【００２４】１つの実施態様では、上記対立遺伝子特異
的オリゴヌクレオチドはプライマーである。

【００２５】１つの好ましい実施態様では、上記プライ
マーの３’末端は、上記フラグメントの多型部位または
直接隣接する塩基と整列する。

【００２６】本発明の別の局面は、表１の第８列の配列
またはその相補体を含む、単離された核酸であって、該
配列または相補体内の多型部位が、表１の第３列におい
て示される参照塩基とは異なる塩基で占められる、核酸
に関する。

【００２７】１つの実施態様では、上記核酸はＤＮＡで
ある。

【００２８】１つの実施態様では、上記核酸はＲＮＡで
ある。

【００２９】１つの実施態様では、上記核酸は５０塩基
未満である。

【００３０】１つの実施態様では、上記核酸は２０塩基
未満である。

【００３１】１つの実施態様では、上記フラグメントは
ＡＦ００５０５８であり、上記多型部位は３５８３位で
ある。

【００３２】１つの実施態様では、上記多型部位は二重
対立遺伝子である。

【００３３】１つの実施態様では、上記多型部位を占め
る塩基は、表１の第３列において列挙されるフラグメン
トについて相関する塩基である。

【００３４】１つの実施態様では、上記多型部位を占め
る塩基は、表１の第５列において列挙されるフラグメン
トについて相関する塩基である。

【００３５】本発明の別の局面は、核酸を分析する方法
であって：個体から該核酸を得る工程；および表１にお
いて示される多型部位のいずれか１つを占める塩基を決
定する工程、を包含する、方法に関する。

【００３６】１つの実施態様では、上記決定する工程
は、表１において示される多型部位のセットを占める塩
基のセットを決定する工程を包含する。

【００３７】１つの実施態様では、上記核酸は多数の個
体から得られ、そして多型位置のうちの１つを占める塩
基は該個体のそれぞれにおいて決定され、そして上記方
法は、疾患表現型の存在について各個体を試験する工
程、および該疾患表現型の存在と該塩基との相関付けを
する工程をさらに包含する。

【００３８】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号１〜１０から選択される。

【００３９】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号１１〜２０から選択される。

【００４０】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号２１〜３０から選択される。

【００４１】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号３１〜４０から選択される。

【００４２】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号４１〜５０から選択される。

【００４３】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号５１〜６０から選択される。

【００４４】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号６１〜７０から選択される。

【００４５】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号７１〜８０から選択される。

【００４６】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号８１〜９０から選択される。

【００４７】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号９１〜１００から選択される。

【００４８】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号１０１〜１１０から選択される。

【００４９】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号１１１〜１２０から選択される。

【００５０】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号１２１〜１３０から選択される。

【００５１】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号１３１〜１４０から選択される。

【００５２】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号１４１〜１５０から選択される。

【００５３】１つの実施態様では，本発明のセグメント
および核酸において、上記フラグメントは、表１の配列
番号１５１〜１５８から選択される。

【００５４】

【発明の実施の形態】本発明は、多型部位を含む、ヒト
ゲノム由来の核酸セグメントを提供する。これらの部位
およびこれらの部位に隣接する領域にハイブリダイズす
る対立遺伝子特異的プライマーおよびプローブもまた提
供される。本発明はさらに、個体または個体の群からの
核酸を分析する方法を提供する。核酸、プライマー、プ
ローブは、法医学、父子確定検査、医学（例えば、多型
と表現型形質との相関付け）、および遺伝分析（例え
ば、そのような表現型形質の遺伝マッピング）を含む適
用に有用な手段である。

【００５５】（関連出願の引用）本出願は、１９９９年
１月２７日に出願した米国特許出願第０９／２３８，４
０２号の優先権を主張する。この開示は、参考として援
用される。

【００５６】（定義）オリゴヌクレオチドは、状況に応
じてＤＮＡまたはＲＮＡ、そして一本鎖または二本鎖で
あり得る。オリゴヌクレオチドは、天然に存在する塩基
または合成塩基から構成され得るが、いずれの場合にお
いても一般に合成手段によって調製される。本発明の好
ましいオリゴヌクレオチドは、表１に示される多型性部
位のいずれか１つを含むＤＮＡセグメント、またはその
相補体を含む。このセグメントは、通常、５〜１００塩
基長であり、そしてしばしば、５〜１０塩基、５〜２０
塩基、１０〜２０塩基、１０〜５０塩基、２０〜５０塩
基、または２０〜１００塩基長である。多型性部位は、
セグメントの任意の位置内で生じ得る。このセグメント
は、表１に示されるＤＮＡの対立遺伝子形態のいずれか
に由来し得る。

【００５７】ハイブリダイゼーションプローブは、塩基
特異的様式で核酸の相補鎖に結合し得るオリゴヌクレオ
チドである。このようなプローブとしては、ペプチド核
酸が挙げられる（例えば、Ｎｉｅｌｓｅｎら、Ｓｃｉｅ
ｎｃｅ２５４，１４９７−１５００（１９９１）を参
照のこと）。

【００５８】プライマーとは、適切な条件下（例えば、
緩衝液および温度）で、４つの異なるヌクレオシド三リ
ン酸および重合試薬（例えば、ＤＮＡポリメラーゼもし
くはＲＮＡポリメラーゼまたは逆転写酵素）の存在下
で、テンプレート特異的ＤＮＡ合成の開始点として作用
し得る、一本鎖オリゴヌクレオチドである。プライマー
の長さは、任意の所定の場合において、例えばプライマ
ーの意図される使用に依存し、そして一般に、１５〜３
０ヌクレオチドの範囲である。短いプライマー分子は、
一般に、テンプレートと十分に安定なハイブリッド複合
体を形成するために、より低い温度を必要とする。プラ
イマーは、テンプレートの正確な配列を反映しなくても
良いが、そのようなテンプレートとハイブリダイズする
に十分なほど相補的でなければならない。プライマー部
位は、プライマーがハイブリダイズするテンプレートの
領域をいう。プライマー対とは、増幅される配列の５’
末端とハイブリダイズする５’上流プライマー、および
増幅される配列の３’末端の相補体とハイブリダイズす
る３’下流プライマーを含むプライマーのセットであ
る。

【００５９】連鎖は、遺伝子、対立遺伝子、遺伝子座、
または遺伝子マーカーの、同じ染色体におけるそれらの
位置の結果として共に遺伝される傾向を説明し、そして
２つの遺伝子、２つの対立遺伝子、２つの遺伝子座、ま
たは２つの遺伝子マーカーの間の組換え率（％）によっ
て測定され得る。

【００６０】多型性は、１つの集団における、２つ以上
の遺伝的に決定された別の配列または対立遺伝子の存在
をいう。多型マーカーまたは部位は、多様性が生じる遺
伝子座である。好ましいマーカーは、少なくとも２つの
対立遺伝子を有し、各々が、選択された集団の約１パー
セント（％）より大きな頻度、そしてより好ましくは１
０％または２０％より大きな頻度で生じる。多型遺伝子
座は、１塩基対ほど小さくあり得る。多型マーカーとし
ては、ＲＦＬＰ、可変数タンデム反復（ＶＮＴＲ）、超
可変領域、ミニサテライト、ジヌクレオチド反復、トリ
ヌクレオチド反復、テトラヌクレオチド反復、単純配列
反復、および例えばＡｌｕのような挿入エレメントが挙
げられる。最初に同定された対立遺伝子形態を、任意に
参照形態と命名し、一方、後に同定される対立遺伝子形
態を、別の対立遺伝子または改変体対立遺伝子と命名す
る。選択された集団において最も頻繁に生じる対立遺伝
子形態は、時々、野生型形態といわれる。二倍体生物
は、対立遺伝子形態についてホモ接合性またはヘテロ接
合性であり得る。二重対立遺伝子多型性は、２つの形態
を有する。三重対立遺伝子（ｔｒｉａｌｌｅｌｉｃ）多
型性は、３つの形態を有する。

【００６１】ＳＮＰは、単一のヌクレオチドによって占
められる多型部位で生じ、これは、対立遺伝子配列の間
の変動の部位である。この変動の部位は、通常、高度に
保存された配列（例えば、所定の対立遺伝子の集団のメ
ンバーの１／１００または１／１０００未満において変
動する配列）の前および後ろに生じる。

【００６２】ＳＮＰは、通常、多型部位での、あるヌク
レオチドから別のヌクレオチドへの置換に起因して生じ
る。これらの置換は、トランジション（あるプリンの別
のプリンによる置換、またはあるピリミジンの別のピリ
ミジンによる置換）、およびトランスバージョン（すな
わち、ピリミジンによるプリンの置換またはその逆）の
両方を含む。ＳＮＰはまた、参照対立遺伝子に対する１
つのヌクレオチドの欠失または１つのヌクレオチドの挿
入から生じ得る。

【００６３】ハイブリダイゼーション（例えば、対立遺
伝子特異的プローブのハイブリダイゼーション）は、一
般に、ストリンジェントな条件下で実施される。例え
ば、約１モラー（Ｍ）以下の塩濃度および少なくとも２
５摂氏温度（℃）の条件、例えば７５０ｍＭＮａＣ
ｌ、５０ｍＭリン酸Ｎａ、５ｍＭＥＤＴＡ（ｐＨ
７．４）（５×ＳＳＰＥ）、および約２５〜約３０℃の
温度。

【００６４】単離された核酸とは、存在する優性種であ
る本発明の種である（すなわち、モルベースで、その組
成物中で任意の他の個々の種より豊富である）。好まし
くは、単離された核酸は、存在する全ての高分子種の
（モルベースで）少なくとも約５０、８０、または９０
％で含む。最も好ましくは、本発明の種は、本質的に均
一（夾雑種が、組成物中に、従来の検出方法によって検
出され得ない）まで精製される。

【００６５】（発明の説明）（１．本発明の新規の多型性）本発明の新規の多型性
は、表１に列挙される。表１の第２列は、多型性が生じ
るフラグメントに割り当てられた名称を列挙する。「Ｈ
Ｔ」で始まるフラグメントの配列は、以下でアクセス可
能であるＴＩＧＲから入手可能である：ｈｔｔｐ：／／
ｗｗｗ．ｔｉｇｒ．ｏｒｇ／ｔｄｂ／ｈｇｉ／ｓｅａｒ
ｃｈｉｎｇ／ｈｇｉ＿ｒｅｐｏｒｔｓ．ｈｔｍｌ。そし
て「ＳＴＳＧ」で始まるフラグメントの配列は、ｈｔｔ
ｐ：／／ｃａｒｂｏｎ．ｗｉ．ｍｉｔ．ｅｄｕ：８００
０／ｃｇｉ−ｂｉｎ／ｃｏｎｔｉｇ／ｓｔｓ＿ｉｎｆｏ
？ｄａｔａｂａｓｅ＝ｒｅｌｅａｓｅでアクセス可能な
Ｗｈｉｔｃｈｅａｄデータベースから入手可能である。
配列はまた、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌ
ｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ＢＬＡＳＴでアクセス可能なＢＬ
ＡＳＴプログラムを使用することによって入手され得る
ＧｅｎＢａｎｋデータベース登録番号から入手され得
る。フラグメントは、すべてヒトゲノムフラグメントで
ある。表１のそのようなヒトゲノムフラグメントに類似
の他の種のフラグメントのすべてもまた、本発明の範囲
内に含まれる。

【００６６】表１の第２列は、フラグメント内の多型性
部位の位置を列挙する。これらの位置は、番号１と割り
当てられるフラグメント配列の第１の塩基と連続して、
番号付けされる。表１の第３列は、データベースの配列
において多型性部位を占有する塩基を列挙する。この塩
基は、参照形態または原型形態と任意に称されるが、こ
の参照または原型形態は、必ずしも最も頻繁に生じる形
態でなくともよい。表１の第５列は、多型性部位の別の
塩基を列挙する。表１の第８列は、各フラグメントの多
型性部位のいずれもの側の配列の約１５塩基を列挙す
る。これらの配列は、配列番号１で始まる連続する配列
番号で命名される。配列は、ＤＮＡまたはＲＮＡのいず
れかであり得る。後者においては、表１に示されるＴ
が、Ｕに置き換えられる。多型性部位を占有する塩基
は、ＩＵＰＡＣ−ＩＵＢ命名法を用いて示される。

【００６７】

【表１】

【００６８】（Ｉ．多型性の分析）（Ａ．サンプルの調製）多型性を、分析される被験体か
らの標的核酸において検出する。任意の適切な生物学的
サンプルが、ゲノムＤＮＡのアッセイのために使用され
得る。都合の良い適切な組織サンプルとしては、全血、
精液、唾液、涙液、尿、糞便、汗、口腔粘膜（ｂｕｃｃ
ａｌ）、皮膚、および頭髪が挙げられる。純粋な赤血球
のみでは適切ではない。当業者が理解するように、ｃＤ
ＮＡまたはｍＲＮＡのアッセイのためには、組織サンプ
ルは、標的核酸が発現される器官（例えば、チトクロー
ムＰ４５０の標的核酸については肝臓）から得られなけ
ればならない。

【００６９】例えば以下に記載される多くの公知方法
は、標的サンプルからのＤＮＡの増幅を必要とする。こ
れは、例えば、ＰＣＲによって達成され得る。例えば、
ＰＣＲＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ
ａｎｄＡｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓｆｏｒＤＮＡ
Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ（Ｈ．Ａ．Ｅｒｌｉｃｈ
編、ＦｒｅｅｍａｎＰｒｅｓｓ，ＮＹ，ＮＹ，１９９
２）；ＰＣＲＰｒｏｔｏｃｏｌｓ：ＡＧｕｉｄｅ
ｔｏＭｅｔｈｏｄｓａｎｄＡｐｐｌｉｃａｔｉｏ
ｎｓ（Ｉｎｎｉｓら編、ＡｃａｄｅｍｉｃＰｒｅｓ
ｓ，ＳａｎＤｉｅｇｏ，ＣＡ，１９９０）；Ｍａｔｔ
ｉｌａら、ＮｕｃｌｅｉｃＡｃｉｄｓＲｅｓ．１
９，４９６７（１９９１）；Ｅｃｋｅｒｔら、ＰＣＲ
ＭｅｔｈｏｄｓａｎｄＡｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ
１，１７（１９９１）；ＰＣＲ（ＭｃＰｈｅｒｓｏｎら
編、ＩＲＬＰｒｅｓｓ，Ｏｘｆｏｒｄ）；および米国
特許第４，６８３，２０２号を参照のこと。

【００７０】他の適切な増幅方法としては、リガーゼ連
鎖反応（ＬＣＲ）（例えば、ＷｕおよびＷａｌｌａｃ
ｅ，Ｇｅｎｏｍｉｃｓ４，５６０（１９８９）、なら
びにＬａｎｄｅｇｒｅｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ２４１，
１０７７（１９８８））、転写増幅（Ｋｗｏｈら、Ｐｒ
ｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ８６，１
１７３（１９８９））、および自己維持型（ｓｅｌｆ−
ｓｕｓｔａｉｎｅｄ）配列複製（Ｇｕａｔｅｌｌｉら、
Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８７，
１８７４（１９９０））、および核酸に基づく配列増幅
（ＮＡＢＳＡ）が挙げられる。後者の２つの増幅方法
は、等温転写に基づく等温反応を含み、これらは、一本
鎖ＲＮＡ（ｓｓＲＮＡ）および二本鎖ＤＮＡ（ｄｓＤＮ
Ａ）の両方を、それぞれ約３０対１または約１００対１
の比の増幅産物として産生する。

【００７１】（Ｂ．標的ＤＮＡにおける新規な多型性の
検出）所定の多型性がすでに特徴づけられているか否か
に依存して、２つの異なる分析タイプがある。分析の第
１のタイプは、時にデノボ（ｄｅｎｏｖｏ）特徴付け
として言及される。この分析は、異なる被験体において
標的配列を比較して、改変の点、すなわち多型性部位を
同定する。ヒト間で最も大きな人種多様性ならびに植物
および動物において最も多い品種および種の変種を代表
する被験体のグループを分析することによって、所定の
遺伝子座のうち最も一般的な対立遺伝子／ハプロタイプ
に特徴的なパターンを同定し得、そして、集団における
このようなパターンの頻度が決定され得る。さらなる対
立遺伝子頻度は、例えば地理、人種（ｒａｃｅ）、また
は性別のような判定基準によって特徴づけられた亜集団
について決定され得る。本発明のこの多型性のデノボ特
徴付けは、本明細書中の実施例の節において記載され
る。分析の第２のタイプは、特徴付けされた多型性のど
の形態が、試験されている被験体に存在するかを決定す
る。適切な手順は種々あり、それらを次に議論する。

【００７２】（１．対立遺伝子特異的プローブ）多型性
を分析するための対立遺伝子特異的プローブの設計およ
び使用は、当該分野において公知である（例えば、Ｓａ
ｉｋｉら、Ｎａｔｕｒｅ３２４，１６３−１６６（１
９８６）；Ｄａｔｔａｇｕｐｔａ、ＥＰ２３５，７２
６、およびＳａｉｋｉ、ＷＯ８９／１１５４８）。そ
のそれぞれのセグメントにおける異なる多型形態の存在
に起因して、ある被験体からの標的ＤＮＡのセグメント
にハイブリダイズするが、別の被験体からの対応セグメ
ントにはハイブリダイズしない対立遺伝子特異的プロー
ブを設計し得る。ハイブリダイゼーション条件は、対立
遺伝子間のハイブリダイゼーション強度において有意な
差（好ましくは本質的に二成分性（ｂｉｎａｒｙ）の応
答）が存在し、このことにより選択されたプローブが、
対立遺伝子の１つのみにハイブリダイズするよう適切に
ストリンジェントであるべきである。いくつかのプロー
ブを、標的ＤＮＡのセグメントにハイブリダイズし、そ
の結果、多型性部位が、プローブの中心位置（例えば、
１５マーでは７位；１６マーでは８または９位のいずれ
か）と整列されるように設計する。プローブのこの特定
の設計は、異なる対立遺伝子形態間のハイブリダイゼー
ションにおいて有用な判別を達成する。

【００７３】対立遺伝子特異的プローブは、しばしば、
対で使用される。対の一方のメンバーは標的配列の参照
形態への完全なマッチを示し、そして他方のメンバー
は、改変体形態への完全なマッチを示す。次いで、プロ
ーブのいくつかの対を、同じ標的配列内の複数の多型性
の同時分析のために、同じ支持体に固定化し得る。

【００７４】（２．タイル状のアレイ）多型性はまた、
核酸アレイへのハイブリダイゼーションによって同定さ
れ得る（例えば、ＷＯ９５／１１９９５を参照のこ
と）。このようなアレイの１つの形態は、多型性のデノ
ボ同定に関連して、本明細書の実施例の節に記載され
る。同じアレイまたは異なるアレイは、特徴付けられた
多型性の分析のために使用され得る。上述のＷＯ９５
／１１９９５はまた、予め特徴付けられた多型性の改変
体形態の検出に至適化されているサブアレイを開示す
る。このようなサブアレイは、第２の参照配列（これ
は、第１の参照配列の対立遺伝子改変体である）に相補
的であるように設計されたプローブを含む。プローブの
第２の群を、プローブが第２の参照配列に相補性を示す
ことを除いて、本明細書の実施例の節に記載するのと同
じ原理で設計する。第２の群（または、さらなる群）を
含むことは、複数の変異が、プローブの長さと等しい短
い距離内で生じること（すなわち、９〜２１塩基内で２
以上の変異）が予測される一次参照配列の短いサブ配列
を分析するのに特に有用であり得る。

【００７５】（３．対立遺伝子特異的プライマー）対立
遺伝子特異的プライマーは、多型性に重複する標的ＤＮ
Ａの部位にハイブリダイズし、そして対立遺伝子形態
（これに対してプライマーは完全な相補性を示す）の増
幅をプライムするのみである。（例えば、Ｇｉｂｂｓ、
ＮｕｃｌｅｉｃＡｃｉｄＲｅｓ．１７，２４２７−
２４４８（１９８９）を参照のこと。）このプライマー
を、遠位部位にハイブリダイズする第２プライマーと組
み合わせて使用する。増幅は、特定の対立遺伝子形態が
存在することを意味する検出可能な産物を導く、２つの
プライマーから始まる。コントロールを、一般的には、
第２の対のプライマーを用いて行う。この対の一方は、
多型性部位での１塩基のミスマッチを示し、そして他方
は、遠位部位との完全な相補性を示す。この１塩基のミ
スマッチは増幅を妨げ、そしてこのため検出可能な産物
が形成されない。最も好ましくは、ミスマッチは、この
多型と整列されたオリゴヌクレオチドの最も３’側の位
置に含まれる。すなわち、最も３’側の位置は、プライ
マーからの伸長に対して最も不安定化している位置であ
る。（例えば、ＷＯ９３／２２４５６を参照のこ
と。）。

【００７６】（４．直接配列決定）本発明の多型性の配
列の直接分析を、ジデオキシ−チェーンターミネーショ
ン法またはＭａｘａｍ−Ｇｉｌｂｅｒｔ法のいずれかを
用いて達成し得る（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｍｏ
ｌｅｃｕｌａｒＣｌｏｎｉｎｇ，ＡＬａｂｏｒａｔ
ｏｒｙＭａｎｕａｌ（第２版、ＣＳＨＰ，ＮｅｗＹ
ｏｒｋ１９８９）、およびＺｙｓｋｉｎｄら、Ｒｅｃ
ｏｍｂｉｎａｎｔＤＮＡＬａｂｏｒａｔｏｒｙＭ
ａｎｕａｌ，（Ａｃａｄ．Ｐｒｅｓｓ，１９８８）を参
照のこと）。

【００７７】（５．変性勾配ゲル電気泳動）ＰＣＲを用
いて作製される増幅産物を、変性勾配ゲル電気泳動の使
用によって分析し得る。異なる対立遺伝子を、溶液にお
けるＤＮＡの異なる配列依存性溶融特性および電気泳動
移動度に基づいて同定し得る。（例えば、Ｅｒｌｉｃｈ
編、ＰＣＲＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｐｒｉｎｃｉｐｌ
ｅｓａｎｄＡｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓｆｏｒＤ
ＮＡＡｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ、（Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅ
ｅｍａｎａｎｄＣｏ，ＮｅｗＹｏｒｋ，１９９
２）、第７章を参照のこと。）。

【００７８】（６．一本鎖コンホメーション多型性分
析）標的配列の対立遺伝子を、一本鎖コンホメーション
多型性分析を用いて区分し得る。この方法は、一本鎖Ｐ
ＣＲ産物の電気泳動移動度における変化によって塩基差
異を同定する（例えば、Ｏｒｉｔａら、Ｐｒｏｃ．Ｎａ
ｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８６，２７６６−２７７０（１
９８９）を参照のこと）。増幅したＰＣＲ産物を、上記
のように生成し得、そして、加熱するか、またはそうで
なければ変性させて、一本鎖増幅産物を形成させ得る。
一本鎖核酸は、再折り畳みし得るか、または塩基配列に
部分的に依存する二次構造を形成し得る。一本鎖増幅産
物の異なる電気泳動移動度は、標的配列の対立遺伝子間
の塩基配列の差に関連し得る。

【００７９】（７．１塩基伸長方法）１塩基伸長方法
は、米国特許第５，８４６，７１０号、米国特許第６，
００４，７４４号、米国特許第５，８８８，８１９号、
および米国特許第５，８５６，０９２号に記載されてい
る。手短には、本方法は、標的鎖に相補的であるプライ
マーの３’末端が、標的鎖における改変部位の直ぐの
３’側の塩基と整列するが、このプライマーは、その改
変の部位と整列する塩基を含まないように、このプライ
マーをハイブリダイズさせることによって作用する。換
言すれば、プライマーが標的鎖に対する相補鎖から形成
される場合、このプライマーは、その相補鎖上の改変部
位の直ぐ５’側の塩基までの配列を含む。ハイブリダイ
ゼーションを、改変の可能性のある部位を占め得る塩基
に相補的な、１つ以上の標識ヌクレオチドの存在下で行
う。例えば、二重対立遺伝子多型性については、異なっ
て標識された２つのヌクレオチドを使用し得る。いくつ
かの方法（特に、異なって標識された複数のヌクレオチ
ドを使用する方法）において、そのヌクレオチドはジデ
オキシヌクレオチドである。標的配列における改変部位
を占める塩基に相補的なヌクレオチドが存在する場合、
ハイブリダイゼーションをプライマー伸長を可能にする
条件下で行う。伸長は、標識されたヌクレオチドを組み
込み、それによって標識された伸長したプライマーを生
成する。異なって標識された複数のヌクレオチドが使用
され、標的がヘテロ接合性である場合、異なって標識さ
れた伸長した複数のプライマーが入手され得る。どの塩
基が標的ポリヌクレオチドにおける改変部位を占めるか
の指示を提供する、伸長したプライマーが検出される。

【００８０】（ＩＩＩ．使用の方法）１つ以上の多型性
部位での、被験体における多型形態の存在は、例えば、
法医学、父子確定検査、多型性と表現型形質との相関関
係、および表現型形質の遺伝子マッピングに有用であ
る。

【００８１】（Ａ．法医学）個体における１セットの多
型性部位を占める多型形態の決定によって、個体を区別
する１セットの多型形態を同定する。（例えば、Ｎａｔ
ｉｏｎａｌＲｅｓｅａｒｃｈＣｏｕｎｃｉｌ，Ｔｈ
ｅＥｖａｌｕａｔｉｏｎｏｆＦｏｒｅｎｓｉｃ
ＤＮＡＥｖｉｄｅｎｃｅ（Ｐｏｌｌａｒｄら編、Ｎａ
ｔｉｏｎａｌＡｃａｄｅｍｙＰｒｅｓｓ，ＤＣ，１９
９６）を参照のこと。）部位の数を増加することによっ
て、ある個体における多型形態セットが、関連のない個
体におけるものと同じである確率が分析された。好まし
くは、複数の部位を分析する場合、その部位は連鎖して
いない。従って、本発明の多型性を、しばしば、遠位遺
伝子における多型性と組み合わせて使用する。法医学に
使用するための好ましい多型性は、二重対立遺伝子であ
る。なぜなら、２つの多型形態の集団頻度を、通常、複
数の対立遺伝子座での複数の多型形態のものよりも高い
正確さで決定し得るからである。

【００８２】先に議論するように、個体における法医学
用マーカーの特徴的または独特なセットを同定する能力
は、法医学分析に有用である。例えば、容疑者からの血
液サンプルが、犯罪現場からの血液または他の組織サン
プルと一致するかどうかを、選択された多型性部位を占
める多型形態のセットが、容疑者由来のサンプルと犯罪
現場から採取されたサンプルとにおいて同じであるかど
うかを決定することによって、決定し得る。犯罪現場か
ら採取された多型マーカーのセットが、容疑者由来のサ
ンプルのものと一致しない場合、容疑者は犯罪現場から
採取されたサンプルの供給源ではないと結論付けられ得
る（実験的誤差がない場合）。このマーカーのセットが
一致する場合、容疑者からのＤＮＡが、犯罪現場で見い
出されたものと一致すると結論付けられ得る。試験した
遺伝子座での多型形態の頻度が、決定されている場合
（例えば、個体の適切な集団の分析によって）、統計学
的分析を行って、容疑者と犯罪現場のマーカーの一致が
単なる偶然で生じる確率を決定し得る。

【００８３】ｐ（ＩＤ）は、ランダムに選ばれた２つの
個体が、同じ多型性または所定の多型性部位での対立遺
伝子形態を有する確率である。二重対立遺伝子座におい
て、４つの遺伝子型が可能である：ＡＡ、ＡＢ、ＢＡ、
およびＢＢ。対立遺伝子ＡおよびＢが頻度ｘおよびｙを
有する生物の一倍体ゲノムに生じる場合、二倍体生物に
おける各遺伝子型の確率は、ＷＯ９５／１２６０７に
おいて開示されるように以下の通りである：ホモ接合体：ｐ（ＡＡ）＝ｘ² ホモ接合体：ｐ（ＢＢ）＝ｙ²＝（１−ｘ）² 単一ヘテロ接合体：ｐ（ＡＢ）＝ｐ（ＢＡ）＝ｘｙ＝ｘ
（１−ｘ）両ヘテロ接合体：ｐ（ＡＢ＋ＢＡ）＝２ｘｙ＝２ｘ（１
−ｘ）。

【００８４】１つの遺伝子座での同一性の確率（すなわ
ち、一つの集団からランダムに選ばれる２つの個体が、
所定の遺伝子座で同一の多型形態を有する確率）は、以
下の式によって与えられる：ｐ（ＩＤ）＝（ｘ²）²＋（２ｘｙ）²＋（ｙ²）²。

【００８５】これらの計算を、所定の遺伝子座での任意
の数の多型形態に拡張し得る。例えば、対立遺伝子が、
その集団において、それぞれｘ、ｙおよびｚの頻度を有
する３対立遺伝子系の同一性の確率ｐ（ＩＤ）は、遺伝
子型頻度の二乗の総和に等しい：ｐ（ＩＤ）＝ｘ⁴＋（２ｘｙ）²＋（２ｙｚ）²＋（２ｘ
ｚ）²＋ｚ⁴＋ｙ⁴。

【００８６】ｎ個の対立遺伝子の遺伝子座において、適
切な二項級数を使用して、ｐ（ＩＤ）およびｐ（ｅｘ
ｃ）を計算する。

【００８７】複数の非連鎖遺伝子座の各々についての同
一性の累積確率（ｃｕｍｐ（ＩＤ））を、各遺伝子座
によって提供される確率を乗じることによって決定す
る：ｃｕｍｐ（ＩＤ）＝ｐ（ＩＤ１）ｐ（ＩＤ２）ｐ（Ｉ
Ｄ３）．．．．．ｐ（ＩＤｎ）。

【００８８】ｗ個の遺伝子座について非同一性の累積確
率（すなわち、ランダムに選ばれた２つの個体が１つ以
上の遺伝子座で異なる確率）は、以下の式によって与え
られる：ｃｕｍｐ（ｎｏｎＩＤ）＝１−ｃｕｍｐ（ＩＤ）。

【００８９】いくつかの多型遺伝子座を試験する場合、
ランダムに選ばれた個体についての非同一性の累積確率
は、非常に高くなる（例えば、１０億分の１）。このよ
うな確率が、容疑者の有罪または無罪を決定する際に、
他の証拠とともに考慮され得る。

【００９０】（Ｂ．父子確定検査）父子確定検査の目的
は、通常、特定の男性が所定の子供の父親であるかどう
かを決定することである。ほとんどの場合、子供の母親
は既知であり、従って、子供の遺伝子型への母親の寄与
を追跡し得る。従って、父子確定検査は、母親に起因し
ない子供の遺伝子型の部分が、推定の父親の遺伝子型と
一致するかどうかを調査する。父子確定検査は、推定の
父親およびその推定の子供における多型性のセットを分
析することによって実施され得る。

【００９１】母親に起因しない、子供における多型性の
セットが、推定の父親のセットに一致しない場合、（実
験的誤差がなければ）推定の父親が、その子供の父親で
はないと結論付けられ得る。母親に起因しない、子供に
おける多型性のセットが推定の父親の多型性のセットに
一致する場合、統計学的計算を行って、偶然一致の確率
を決定し得る。

【００９２】親子排除の確率（ランダムに選ばれた男性
が、その男性を父親として矛盾にさせる所定の多型性部
位での多型形態を有する確率を示す）は、ＷＯ９５／
１２６０７に開示される以下の式によって与えられる：ｐ（ｅｘｃ）＝ｘｙ（１−ｘｙ）ここでｘおよびｙは、二重対立遺伝子多型性部位の対立
遺伝子ＡおよびＢの集団頻度である。

【００９３】三重対立遺伝子部位では、ｐ（ｅｘｃ）＝
ｘｙ（１−ｘｙ）＋ｙｚ（１−ｙｚ）＋ｘｚ（１−ｘ
ｚ）＋３ｘｙｚ（１−ｘｙｚ）、ここでｘ、ｙ、および
ｚは、対立遺伝子Ａ、Ｂ、およびＣのそれぞれの集団頻
度である。

【００９４】非排除確率はｐ（非ｅｘｃ）＝１−ｐ（ｅ
ｘｃ）であり非排除の累積確率（ｎ個の遺伝子座を使用
する場合に得られる値を示す）は、従って以下である：ｃｕｍｐ（非ｅｘｃ）＝ｐ（非ｅｘｃ１）ｐ（非ｅｘ
ｃ２）ｐ（非ｅｘｃ３）．．．．ｐ（非ｅｘｃｎ）。

【００９５】ｚ個の遺伝子座についての排除の累積確率
（ランダムに選ばれた男性が排除される確率を示す）：ｃｕｍｐ（ｅｘｃ）＝１−ｃｕｍｐ（非ｅｘｃ）。

【００９６】いくつかの多型遺伝子座が分析に含まれる
場合、ランダムに選ばれた男性の排除の累積確率は非常
に高い。この確率が、子供の父親に起因し得る子供の多
型マーカーセットに多型マーカーセットが一致する推定
の父親の責任を評価することにおいて考慮され得る。

【００９７】（Ｃ．多型と表現型形質との相関）本発明
の多型は、異なる方法で生物体の表現型に寄与し得る。
先に議論されるように、いくつかの多型は、タンパク質
コード配列内に生じ、そしてタンパク質構造に影響を与
えることにより表現型に寄与する。タンパク質の構造へ
のそのような変化の効果は、中立、有益、または有害、
あるいは有益および有害の両方であり得る。例えば、ヘ
テロ接合性鎌状赤血球変異はマラリア耐性を与えるが、
ホモ接合性鎌状赤血球変異は通常致死的である。他の多
型は、非コード領域に生じ、例えば複製、転写および翻
訳への影響を介して間接的に表現型効果を働かし得る。
さらに、１つの多型は、１つより多い表現型形質に影響
を及ぼし得る。同様に、１つの表現型形質は、異なる遺
伝子における多型により影響を受け得る。さらに、いく
つかの多型は、個体に対して、特定の表現型の原因とし
て関係する異なる変異を受けやすくする。

【００９８】表現型形質は、公知の（しかし、今までに
マッピングされていない）遺伝的構成成分を有する疾患
を含む（例えば、無ガンマグロブリン血症、尿崩症、レ
ッシュ−ナイハン症候群、筋ジストロフィー、ヴィスコ
ット−オールドリッチ症候群、ファブリー病、家族性高
コレステロール血症、多発性嚢胞腎病、遺伝性球状赤血
球症、フォン−ヴィレブランド病、結節硬化症、遺伝性
出血性毛細管拡張症、家族性結腸ポリープ症、エーレル
ス−ダンロー症候群、骨形成不全症、および急性間欠性
ポルフィリン症など）。表現型形質はまた、構成成分が
遺伝的であるか、または遺伝的であり得る多因子性疾患
（例えば、自己免疫疾患、炎症、ガン、神経系疾患、お
よび病原性微生物の感染）の症状または感受性を含む。
自己免疫疾患のいくつかの例としては、慢性関節リウマ
チ、多発性硬化症、糖尿病（インシュリン依存性および
インシュリン非依存性）、全身性エリテマトーデス、お
よびグレーヴズ病が挙げられる。ガンのいくつかの例と
しては、膀胱ガン、脳ガン、乳ガン、大腸ガン、食道ガ
ン、腎臓ガン、白血病、肝ガン、肺ガン、口腔ガン、卵
巣ガン、膵臓ガン、前立腺ガン、皮膚ガン、胃ガン、お
よび子宮ガンが挙げられる。表現型形質としてはまた、
長寿、外観（例えば、ハゲ、肥満）、強さ、スピード、
持久力、受胎能、および特定の薬物または治療処置に対
する感受性または受容性のような特徴が挙げられる。

【００９９】多型と表現型形質との相関は、目的の表現
型形質の存在または非存在、および多型マーカーセット
について試験を受けた被験体の集団について行われる。
そのような分析をするために、多型のセット（すなわ
ち、多型セット）の存在または非存在は、被験体のセッ
ト（被験体のうちのいくつかは特定の形質を示し、そし
て被験体のうちのいくつかは特定の形質を示さない）に
ついて決定される。次に、セットの各多型の対立遺伝子
は、特定の対立遺伝子の存在または非存在が目的の表現
型形質と関連するか否かを決定するために考察される。
相関付けは、κ二乗検定のような標準的な統計学的方法
により行われ、そして多型形態と表現型特徴との間の何
らかの統計学的に有意な相関を留意することによって実
施され得る。例えば、多型Ａでの対立遺伝子Ａ１の存在
が心臓疾患と相関することが見出され得る。さらなる例
として、多型Ａでの対立遺伝子Ａ１および多型Ｂでの対
立遺伝子Ｂ１の組合せの存在が、家畜の乳産生の増加と
相関することが見出され得る。

【０１００】そのような相関関係は、いくつかの方法で
有用である。例えば、１つ以上の多型形態のセットと、
処置が利用可能な疾患との間に強い相関が存在する場
合、被験体（すなわち、ヒトまたは動物）における多型
形態セットの検出は、即時の処置の施行、または少なく
とも被験体の規則的なモニタリングの設定の理由づけと
なり得る。重篤な疾患と関連する多型形態の検出は、種
々の型の決定、例えば生殖の決定において有用であり得
る。例えば、女性パートナーは、彼女の男性パートナー
から彼女の子孫にそのような多型が伝達する可能性を避
けるために、インビトロ受精を行うことを選択し得る。

【０１０１】より弱いがなお統計的に有意な相関関係
が、多型セットとヒト疾患との間に存在する場合、即時
の治療的介入またはモニタリングの理由づけとはならな
いかもしれない。それにもかかわらず、患者は、患者に
とってほとんどコストをかけずに達成され得るが、改変
体対立遺伝子により患者の感受性が増加し得るという状
態の危険度を減少させる潜在的な利点を与え得る、単純
なライフスタイルの変更（例えば、ダイエット、運動）
を始める動機を与えられ得る。疾患についてのいくつか
の処置養生法のうちの１つに対する増強された受容性と
相関する患者の多型セットの同定は、この処置養生法が
続けられるべきであることを示す。

【０１０２】動物および植物について、特徴と表現型と
の相関は、例えば所望の特徴を育種するために有用であ
る。例えば、Ｂｅｉｔｚら（米国特許第５，２９２，６
３９号）は、ウシにおける牛乳産生の改善のための育種
計画における、ウシミトコンドリア多型の使用を開示す
る。ミトコンドリアＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）置換ループ
（Ｄループ）配列多型の牛乳産生への効果を評価するた
めに、各ウシは、考慮された１７各々の位置の原型のｍ
ｔＤＮＡ配列に関し、改変体であれば１を、野生型であ
れば０を割り当てられた。各産生の形質は、以下の動物
モデルを用いて個別に分析された：Ｙ_ijkpn＝μ＋ＹＳ_i＋Ｐ_j＋Ｘ_k＋β₁＋．．．β₁₇＋Ｐ
Ｅ_n＋ａ_n＋ｅ_p ここでＹ_ijknpは、牛乳、脂肪、脂肪パーセンテージ、
無脂固形分（ｓｏｌｉｄｓ−ｎｏｔ−ｆａｔ；ＳＮ
Ｆ）、ＳＮＦパーセンテージ、エネルギー濃度、または
乳汁分泌エネルギーの記録であり；μは、全体の平均値
であり；ＹＳ_iは、年−季節において仔ウシを産む全て
の牛への共通する影響であり；Ｘ_kは、高選択線または
平均選択線のいずれかのウシへの共通する影響であり；
β₁〜β₁₇は、ｍｔＤＮＡＤループ配列多型における
産生記録の二項回帰であり；ＰＥ_nは、ウシｎの全ての
記録に共通する永続性環境効果であり；ａ_nは、動物ｎ
の効果であり、そして父畜および母畜の育種価値の加算
性の遺伝的寄与およびメンデルのサンプリング効果より
構成され；そしてｅ_pは、無作為な残余である。１７の
うちの試験した多型１１は、少なくとも１つの産生形質
に影響を与えることが見出された。これら１１の遺伝子
座で牛乳産生のための最も良好な多型形態を有するウシ
は、家畜の次世代の育種するために選択される。

【０１０３】（Ｄ．表現型形質の遺伝子マッピング）前
節は、表現型形質とこれらの形質に直接的または間接的
に寄与する多型との間の相関の同定を記載した。本節
は、目的の形質と関係する遺伝子座と、その形質と無関
係だがその形質を担う遺伝子座と物理的に近く、その遺
伝子座と共分離する多型マーカーとの間の物理的連鎖の
同定を述べる。このような分析は、例えば表現形形質と
関連する遺伝子座を染色体位置にマッピングし、それに
より、その形質を担う遺伝子をクローニングするのに有
用である。（例えば、Ｌａｎｄｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａ
ｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．（ＵＳＡ）８３，７３５３−
７３５７（１９８６）；Ｌａｎｄｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎ
ａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．（ＵＳＡ）８４，２３６３
−２３６７（１９８７）；Ｄｏｎｉｓ−Ｋｅｌｌｅｒ
ら、Ｃｅｌｌ５１，３１９−３３７（１９８７）；Ｌ
ａｎｄｅｒら、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ１２１，１８５−１
９９（１９８９）を参照のこと。）連鎖によって位置決
めされた遺伝子を、指向性クローニング（ｄｉｒｅｃｔ
ｉｏｎａｌｃｌｏｎｉｎｇ）として公知であるプロセ
スによってクローン化し得る。（例えば、Ｗａｉｎｗｒ
ｉｇｈｔ，Ｍｅｄ．Ｊ．Ａｕｓｔｒａｌｉａ１５９，
１７０−１７４（１９９３）；およびＣｏｌｌｉｎｓ，
ＮａｔｕｒｅＧｅｎｅｔｉｃｓ１，３−６（１９９
２）を参照のこと。）。

【０１０４】連鎖研究を、一般に、家族の構成員に関し
て行う。家族の利用可能な構成員を、表現型形質の存在
または非存在について、そして多型マーカーのセットに
ついて特徴づける。次いで、情報を与える減数分裂にお
ける多型マーカーの分布を分析して、どの多型マーカー
が、表現型形質と共分離するかを決定する。（例えば、
Ｋｅｒｅｍら、Ｓｃｉｅｎｃｅ２４５，１０７３−１
０８０（１９８９）；Ｍｏｎａｃｏら、Ｎａｔｕｒｅ
３１６，８４２（１９８５）；Ｙａｍｏｋａら、Ｎｅｕ
ｒｏｌｏｇｙ４０，２２２−２２６（１９９０）；お
よびＲｏｓｓｉｔｅｒら、ＦＡＳＥＢＪｏｕｒｎａｌ
５，２１−２７（１９９１）を参照のこと。）。

【０１０５】連鎖を、ロッド（ＬＯＤ：オッズの対数）
値の計算によって分析する。ロッド値は、マーカーおよ
び遺伝子座の２つが連鎖せず、従って独立して分離する
状況に対して、この２つが組換え比θで位置する場合
に、これらマーカーおよび遺伝子座について観察される
分離データを得る相対尤度である（例えば、Ｔｈｏｍｐ
ｓｏｎおよびＴｈｏｍｐｓｏｎ，Ｇｅｎｅｔｉｃｓｉ
ｎＭｅｄｉｃｉｎｅ（第５版、Ｗ．Ｂ．Ｓａｕｎｄｅ
ｒｓＣｏｍｐａｎｙ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，１
９９１）；およびＳｔｒａｃｈａｎ，「Ｍａｐｐｉｎｇ
ｔｈｅｈｕｍａｎｇｅｎｏｍｅ」、ＴｈｅＨｕ
ｍａｎＧｅｎｏｍｅ（ＢＩＯＳＳｃｉｅｎｔｉｆｉ
ｃＰｕｂｌｉｓｈｅｒｓＬｔｄ，Ｏｘｆｏｒｄ）、
第４章）。一連の尤度比を、種々のθ（θ＝０．０（一
致遺伝子座）からθ＝０．５０（連鎖なし）の範囲）で
計算する。従って、θの所定値での尤度は、遺伝子座が
連鎖しなかった場合のデータの確率に対する、遺伝子座
がθで連鎖した場合のデータの確率である。計算した尤
度は、通常、この比のｌｏｇ₁₀（すなわち、ロッド値）
として示される。例えば、３のロッド値は、見かけの観
察連鎖に対する１０００：１のオッズが一致することを
示す。対数の使用は、異なる家族から収集したデータ
が、単純な加算により合わされることを可能にする。コ
ンピュータープログラムは、θの異なる値についてのロ
ッドスコアの計算に利用可能である（例えば、ＬＩＰＥ
Ｄ、ＭＬＩＮＫ（例えば、Ｌａｔｈｒｏｐ，Ｐｒｏｃ．
Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．（ＵＳＡ）８１，３４４３
−３４４６（１９８４）を参照のこと））。任意の特定
のロッドスコアについて、組換え比を、数表から決定し
得る。（例えば、Ｓｍｉｔｈら、Ｍａｔｈｅｍａｔｉｃ
ａｌｔａｂｌｅｓｆｏｒｒｅｓｅａｒｃｈｗｏｒ
ｋｅｒｓｉｎｈｕｍａｎｇｅｎｅｔｉｃｓ（Ｃｈ
ｕｒｃｈｉｌｌ，Ｌｏｎｄｏｎ，１９６１）；およびＳ
ｍｉｔｈ，Ａｎｎ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．３２，１２
７−１５０（１９６８）を参照のこと。）ロッドスコア
が最大であるθ値を、組換え比の最良の推定値であると
考える。正のロッドスコア値は、２つの遺伝子座が連鎖
することを示唆し、一方、負の値は、２つの遺伝子座が
連鎖していない確率よりも連鎖の可能性が（そのθの値
で）低いことを示唆する。慣習的に、＋３以上の合わせ
たロッド値（連鎖の傾向が１０００：１のオッズより大
きいことに等しい）は、２つの遺伝子座が連鎖するとい
う決定的な証拠であると考えられる。同様に、慣習的
に、−２以下の負のロッド値は、比較される２つの遺伝
子座の連鎖に対する決定的な証拠と解釈される。負の連
鎖データは、染色体またはそのセグメントを考察から除
外するのに有用である。次いで、探索は、残りの除外さ
れない染色体位置に集中する。

【０１０６】（ＩＶ．改変したポリペプチドおよび遺伝
子配列）本発明はさらに、核酸および対応するタンパク
質の改変体形態を提供する。この核酸は、表１の第８列
に記載される配列の１つを含み、ここで多型位置は、そ
の位置について別の塩基の１つによって占められる。い
くつかの核酸は、タンパク質の全長改変体形態をコード
する。同様に、改変体タンパク質は、表１に示される多
型位置のうちの１つを含むコドンによってコードされる
アミノ酸を除いて（それが成分である全長コード配列と
インフレームであるように読む）、表１の第８列に示さ
れる核酸配列によってコードされる、原型アミノ酸配列
を有する。その位置は、表１に示される任意の別の形態
の対応するコドンによってコードされるアミノ酸によっ
て占められる。

【０１０７】改変体遺伝子を、改変体遺伝子が、天然ま
たは他のプロモーターに作動可能に接続される発現ベク
ターにおいて発現させ得る。通常、このプロモーター
は、哺乳動物細胞における発現のための真核生物プロモ
ーターである。転写調節配列は、代表的には、異種プロ
モーター、および必要に応じて、宿主によって認識され
るエンハンサーを含む。プロモーター（例えば、ｔｒ
ｐ、ｌａｃ、ファージプロモーター、解糖酵素プロモー
ター、およびｔＲＮＡプロモーター）の選択は、一部に
は選択した宿主に依存する。市販の発現ベクターを本発
明に使用し得る。ベクターは、宿主に認識される複製
系、増幅可能な遺伝子、選択マーカー、宿主ゲノムへの
挿入に有用な宿主配列などを含み得る。

【０１０８】発現構築物を宿主細胞に導入する手段は、
例えば特定の構築および標的宿主に依存して変化する。
適切な手段としては、例えばＳａｍｂｒｏｏｋ（前出）
に記載されるような、融合、結合（ｃｏｎｊｕｇａｔｉ
ｏｎ）、トランスフェクション、形質導入、エレクトロ
ポレーション、またはインジェクションが挙げられる。
広範な種々の原核生物宿主細胞および真核生物宿主細胞
を、改変体遺伝子の発現のために使用し得る。適切な宿
主細胞としては、Ｅ．ｃｏｌｉのような細菌、酵母、糸
状菌、昆虫細胞、哺乳動物細胞（代表的には、不死化さ
れた、例えば、マウス、ＣＨＯ、ヒトおよびサルの細胞
株）、ならびにそれらの誘導体が挙げられる。好ましい
宿主細胞は、改変体遺伝子産物をプロセシングして、成
熟ポリペプチドを産生し得る。プロセシングとしては、
グリコシル化、ユビキチン化、ジスルフィド結合形成、
一般的な翻訳後修飾などが挙げられる。

【０１０９】タンパク質を、タンパク質生化学および精
製の従来の手段によって単離し、実質的に純粋な産物
（すなわち、細胞成分夾雑物を８０、９５、または９９
％含まない）を入手し得る（例えば、Ｊａｃｏｂｙ，Ｍ
ｅｔｈｏｄｓｉｎＥｎｚｙｍｏｌｏｇｙ第１０４
巻，ＡｃａｄｅｍｉｃＰｒｅｓｓ，ＮｅｗＹｏｒｋ
（１９８４）；Ｓｃｏｐｅｓ，ＰｒｏｔｅｉｎＰｕｒ
ｉｆｉｃａｔｉｏｎ，Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓａｎｄ
Ｐｒａｃｔｉｃｅ，第２版、Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒ
ｌａｇ，ＮｅｗＹｏｒｋ（１９８７）；およびＤｅｕ
ｔｓｃｈｅｒ（編）、ＧｕｉｄｅｔｏＰｒｏｔｅｉ
ｎＰｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ，Ｍｅｔｈｏｄｓｉｎ
Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，第１８２巻（１９９０）を参
照のこと）。タンパク質を分泌させる場合、宿主細胞が
増殖する上清からタンパク質を単離し得る。タンパク質
が分泌されない場合、タンパク質を、宿主細胞の溶解物
から単離し得る。

【０１１０】本発明はさらに、外因性改変体遺伝子を発
現し得、そして／または不活化された内因性改変体遺伝
子の対立遺伝子の一方または両方を有し得る、トランス
ジェニック非ヒト動物を提供する。外因性改変体遺伝子
の発現は、通常、遺伝子をプロモーター、および必要に
応じてエンハンサーに作動可能に接続し、そして構築物
を接合体にマイクロインジェクションすることによって
達成され得る。（例えば、Ｈｏｇａｎら、「Ｍａｎｉｐ
ｕｌａｔｉｎｇｔｈｅＭｏｕｓｅＥｍｂｒｙｏ，
ＡＬａｂｏｒａｔｏｒｙＭａｎｕａｌ」Ｃｏｌｄ
ＳｐｒｉｎｇＨａｒｂｏｒＬａｂｏｒａｔｏｒｙを参
照のこと。）内因性改変体遺伝子の不活化を、クローン
化改変体遺伝子が、陽性選択マーカーの挿入によって不
活化される導入遺伝子を形成することによって達成し得
る。（例えば、Ｃａｐｅｃｃｈｉ，Ｓｃｉｅｎｃｅ２
４４，１２８８−１２９２（１９８９）を参照のこ
と。）次いで、導入遺伝子を、胚幹細胞に導入し、ここ
で、導入遺伝子は、内因性改変体遺伝子との相同組換え
を受ける。マウスおよび他の齧歯類が、好ましい動物で
ある。このような動物は、有用な薬物スクリーニング系
を提供する。

【０１１１】改変体遺伝子によって発現される実質的に
全長のポリペプチドに加えて、本発明はまた、ポリペプ
チドの生物学的に活性なフラグメント、またはそのアナ
ログを含み、これは、ペプチドの相互作用を刺激する有
機分子を含む。生物学的に活性なフラグメントは、改変
体遺伝子産物に生物学的機能を付与する全長ポリペプチ
ドの任意の部分を含み、生物学的機能は、リガンド結合
および抗体結合を含む。リガンド結合としては、核酸、
タンパク質もしくはポリペプチド、生物学的に活性な低
分子、または大きな細胞構造による結合が挙げられる。

【０１１２】改変体遺伝子産物に特異的に結合するが、
対応する原型遺伝子産物には結合しない、ポリクローナ
ルおよび／またはモノクローナル抗体もまた、本発明に
よって提供される。抗体を、マウスまたは他の動物に改
変体遺伝子産物またはその合成ペプチドフラグメントを
インジェクトすることによって産生し得る。モノクロー
ナル抗体を、例えば、ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ，Ａ
ｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，ＡＬａｂｏｒａｔｏｒｙＭａ
ｎｕａｌ，ＣｏｌｄＳｐｒｉｎｇＨａｒｂｏｒＰ
ｒｅｓｓ，ＮｅｗＹｏｒｋ（１９８８）；およびＧｏ
ｄｉｎｇ，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌａｎｔｉｂｏｄｉｅ
ｓ，ＰｒｉｎｃｉｐｌｅｓａｎｄＰｒａｃｔｉｃｅ
（第２版）ＡｃａｄｅｍｉｃＰｒｅｓｓ，ＮｅｗＹ
ｏｒｋ（１９８６）に記載されるように、スクリーニン
グする。モノクローナル抗体を、改変体遺伝子産物との
特異的免疫反応性、および対応する原型遺伝子産物への
免疫反応性の欠如について試験する。これらの抗体は、
改変体形態の検出のための診断アッセイにおいて、また
は薬学的組成物における活性成分として有用である。

【０１１３】（Ｖ．キット）本発明はさらに、上記のよ
うな少なくとも１つの対立遺伝子特異的オリゴヌクレオ
チドを含むキットを提供する。好ましくは、キットは、
多型性の異なる形態にハイブリダイズする、対立遺伝子
特異的オリゴヌクレオチドの１つ以上の対を含む。いく
つかのキットにおいて、対立遺伝子特異的オリゴヌクレ
オチドは、基板に固定化されて提供される。例えば、同
じ基材は、表１に示される少なくとも１０、１００、ま
たは全ての多型性を検出するための対立遺伝子特異的オ
リゴヌクレオチドプローブを含み得る。キットの随意の
さらなる成分としては、例えば、制限酵素、逆転写酵素
またはポリメラーゼ、基質ヌクレオシド三リン酸、標識
するために使用される手段（例えば、アビジン−酵素結
合体および酵素基質、ならびに標識がビオチンである場
合の色素体）、および逆転写、ＰＣＲ、またはハイブリ
ダイゼーション反応に適切な緩衝液が挙げられる。一般
に、キットはまた、この方法を行うための指示書を含
む。

【０１１４】（ＶＩ．多型性データを格納するためのコ
ンピューターシステム）図１Ａは、本発明を実施するた
めに適切なコンピューターシステムのブロック図を示
す。コンピューターシステム１０は、中央処理装置１
４、システムメモリ１６（代表的には、ＲＡＭ）、入力
／出力（Ｉ／Ｏ）コントローラー１８、ディスプレイア
ダプター２６を介するディスプレイスクリーン２４のよ
うな外部デバイス、シリアルポート２８および３０、キ
ーボード３２、格納インターフェイス３５を介する固定
ディスクドライブ３４、ならびにフロッピーディスク３
８を受け取るように作動するプロッピーディスクドライ
ブ３６、ならびにＣＤ−ＲＯＭ４２を受け取るように作
動するＣＤ−ＲＯＭ（またはＤＶＤ−ＲＯＭ）デバイス
４０のような主要なサブシステムを相互接続するバス１
２を備える。ユーザー指示デバイス（例えば、シリアル
ポート２８を介して接続されたマウス４４、およびシリ
アルポート３０を介して接続されたネットワークインタ
ーフェイス４６）のような多くの他のデバイスが接続さ
れ得る。

【０１１５】多くの他のデバイスまたはサブシステム
（示さず）は、類似の様式で接続され得る。また、以下
に議論されるように、図１Ａにおいて示されるデバイス
のすべてのデバイスが、本発明を実施するために存在す
る必要はない。デバイスおよびサブシステムは、図１Ａ
において示されるものとは異なる方法で相互接続され得
る。図１Ａにおいて示されるようなコンピューターシス
テムの操作は周知である。本発明による多型情報を格納
するデータベースは、例えばシステムメモリ１６中、ま
たは固定ディスク３４、フロッピーディスク３８、もし
くはＣＤ−ＲＯＭ４２のような記憶媒体上に格納され得
る。そのようなデータベースにアクセスするためのアプ
リケーションプログラムは、システムメモリ１６におい
て操作可能に配置され得るか、または固定ディスク３
４、フロッピーディスク３８、もしくはＣＤ−ＲＯＭ４
２のような記憶媒体上に格納され得る。

【０１１６】図１Ｂは、コンピューターシステム１０
の、遠隔コンピューター４８、５０、および５２への相
互接続を示す。図１Ｂは、遠隔サーバー４８、５０、お
よび５２を相互接続するネットワーク５４を示す。ネッ
トワークインターフェイス４６は、クライアントコンピ
ューターシステム１０からネットワーク５４への接続を
提供する。ネットワーク５４は、例えばインターネット
であり得る。インターネットおよび他のネットワークを
介する、データを交換するためのプロトコルは周知であ
る。ネットワーク５４によって使用される物理的媒体を
移動し得るシグナル中に埋め込まれた、本明細書中に記
載の多型を同定する情報は、ネットワーク５４を通して
伝送され得る。

【０１１７】表１において示される多型を同定する情報
は、レコード（必要に応じて、フィールドに再分割され
る）に示される。各レコードは、表１における異なる多
型に関する情報を格納する。集約すると、レコードは、
表１における多型のすべて、またはその任意のサブセッ
ト（例えば、表１の５、１０、５０または１００の多
型）に関する情報を格納し得る。いくつかのデータベー
スにおいて、その情報は、多型位置を占める塩基、およ
び多型位置の場所を同定する。参照対立遺伝子における
形態以外の多型形態で存在する塩基は、単一文字か一文
字コード（すなわち、Ａ、Ｃ、Ｇ、またはＴ／Ｕ）とし
て示され得る。あるいは、多型部位を占める塩基は、表
１において示されるようなＩＵＰＡＣ多義コードで示さ
れ得る。多型部位の場所は、表１において示される配列
のうちの１つの配列内の位置として同定され得る。例え
ば、表１において示される１番目の配列において、多型
部位は、Ａ塩基またはＣ塩基を占める。位置はまた、例
えば、染色体、および染色体内の公知のマーカーからの
距離を参照することによって同定され得る。他のデータ
ベースにおいて、多型を同定する情報は、多型部位を含
む、表１において示される１０〜１００塩基の配列、ま
たはその相補体を含む。好ましくは、そのような情報
は、多型部位を含む配列の、少なくとも１０、１５、２
０、または３０の連続する塩基を記録する。

【０１１８】

【実施例】表１に示す多型性を、微細に作製されたアレ
イに固定化したプローブへのハイブリダイゼーションに
よって、多様な人種的および地域的背景の８つの関連し
ていない個体からの標的配列を再配列決定することによ
って同定した。このようなアレイの設計および使用のた
めのストラテジーおよび原理は、ＷＯ９５／１１９９５
に一般的に記載されている。このストラテジーは、表１
の第１列に示すフラグメントの参照配列に対して高度の
配列同一性を示す標的配列の分析のためのプローブのア
レイを提供する。参照配列は、ヒトゲノムプロジェクト
の経過において開発された配列タグ化部位（ＳＴＳ）で
あった（例えば、Ｓｃｉｅｎｃｅ２７０，１９４５
−１９５４（１９９５）；Ｎａｔｕｒｅ３８０，
１５２−１５４（１９９６）を参照のこと）。ほと
んどのＳＴＳは、サイズが１００塩基対（ｂｐ）から３
００ｂｐまでの範囲にあった。

【０１１９】この分析において使用される代表的なプロ
ーブアレイは、参照配列の両鎖をそれぞれタイル状にし
たプローブの４セットの２つの群を有する。第１のプロ
ーブセットは、参照配列の１つとの完全な相補性を示す
複数のプローブを含む。第１のプローブセットにおける
各プローブは、参照配列におけるヌクレオチドに対応す
るインターロゲーション位置を有する。すなわち、プロ
ーブおよび参照配列がその２つの間の相補性を最大にす
るように整列される場合、インターロゲーション位置
は、参照配列において対応するヌクレオチドと整列され
る。第１のセットにおける各プローブについて、３つの
さらなるプローブセット由来の３つの対応するプローブ
が存在する。従って、参照配列において、各ヌクレオチ
ドに対応する４つのプローブが存在する。これら３つの
さらなるプローブセット由来のプローブは、インターロ
ゲーション位置（これは、４つのプローブセット由来の
４つの対応するプローブの各々において同じ位置に生
じ、そして４つのプローブセットにおいて、異なるヌク
レオチドで占められる）を除いて、第１のプローブセッ
ト由来の対応するプローブに同一である。本分析におい
て、プローブは、２５ヌクレオチド長であった。複数の
異なる参照配列についてタイル状にしたアレイを、同じ
基材に含ませた。

【０１２０】個体からの複数の標的配列を、そのフラグ
メントについてのプライマーを使用して、ヒトゲノムＤ
ＮＡから増幅した。増幅した標的配列をＰＣＲの間また
はその後に蛍光標識した。標識した標的配列を、プロー
ブの固定化したアレイを保有する基材とハイブリダイズ
させた。プローブに結合した標識の量を測定した。標識
のパターンの分析は、標的と参照配列との間の差異の性
質および位置を明らかにした。例えば、４つの対応する
プローブの強度の比較により、プローブのインターロゲ
ーション位置と整列した標的配列における対応するヌク
レオチドの同一性が明らかになる。対応するヌクレオチ
ドは、最も高い強度を示すプローブのインターロゲーシ
ョン位置を占有する、そのヌクレオチドの相補体である
（例えば、ＷＯ９５／１１９９５を参照のこと）。多型
性の存在はまた、プローブを異なる個体からの対応する
標的にハイブリダイズさせた場合、多型性に隣接するプ
ローブの規格化したハイブリダイゼーション強度におけ
る差異によって明らかになる。例えば、多型性に隣接す
るプローブの「フットプリント」におけるハイブリダイ
ゼーション強度の相対的な損失は、その標的と参照配列
との間の差異（すなわち、多型性）を示す（例えば、Ｅ
Ｐ７１７，１１３を参照のこと）。さらに、異なる個
体からの対応する標的のハイブリダイゼーション強度
は、所定のクラスターにおける単離体が類似である傾向
にあり、そして異なるクラスターにおける単離体が非類
似である傾向にあるように、データによって示唆される
（アプリオリには規定されない）グループまたはクラス
ターに分類され得る。１９９７年２月７日に出願された
米国特許出願第０８／７９７，８１２号を参照のこと。
異なる個体由来のサンプルに対するハイブリダイゼーシ
ョンを、別々に行った。表１は、８個の試験された個体
についての参照配列との比較において、標的配列につい
て得られたデータを要約する。

【０１２１】前述から、本発明は、以下のように簡潔に
表現され得る多くの一般的な使用を包含することが明ら
かである。本発明は、疾患（例えば、ガン、炎症、心疾
患、ＣＮＳの疾患、および微生物による感染に対する感
受性）の診断またはモニタリングにおける上記の任意の
核酸セグメントの使用を提供する。本発明はさらに、こ
のような疾患の処置（とりわけ、防止処置（例えば、予
防処置）、待期療法、および治療的処置）のための医薬
の製造における任意の核酸セグメントの使用を提供す
る。本発明はさらに、任意の適切な投与形態での医薬と
しての任意のＤＮＡセグメントの使用を提供する。

【０１２２】本発明は、当業者が本発明を作製および使
用し得るように、十分な、明確な、正確な、簡潔な、正
確な用語で記載されている。さらに、なおさらなる明瞭
性および理解の目的のみではあるが、実施例および例示
が提供され、それ自体では、特許請求の範囲によって規
定される本発明を限定しない。実行され得る特定の変更
および改変が、特許請求の範囲の範囲内にあることもま
た理解される。

【０１２３】

【発明の効果】本発明によれば、法医学、父子確定検
査、医学、および遺伝分析を含む適用に有用な、多型部
位を含むヒトゲノム由来の核酸セグメント、これらの部
位およびこれらの部位に隣接する領域にハイブリダイズ
する対立遺伝子特異的プライマーおよびプローブ、なら
びに個体または個体の群からの核酸を分析する方法が提
供される。

【０１２４】

【配列表】

SEQUENCE LISTING <110> Warrington et al. <120> Genetic Compositions and Methods <130> 3229 <150> US 09/238,402 <160> 632 <170> Chipping 1.1 (c) <210> 1 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D42043 <400> 1 ACCAGCGAGG GGAGTRTATC CACCAAGCAG A <210> 2 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D42043 <400> 2 GGGAAACTGT GTTTCRGGAC AGCAGCAGGA G <210> 3 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D42043 <400> 3 GAGCATTCGG GTCAAWTCCA TGGACACCCT G <210> 4 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D45248 <400> 4 GAGGGTGAAT GCCGTSAAGA CCAAAGTGGA A <210> 5 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M69066 <400> 5 ATGGTGCCTT CAAGASCTTC ACCAAACATA C <210> 6 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M69066 <400> 6 CTCCACAGCC ATCCCRGCCT TGGCATCTAG A <210> 7 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M69066 <400> 7 GATTTTGGCC TCATTMCTTT ACCACCCCCA C <210> 8 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U56637 <400> 8 AGCAAGTTTG TTCCARGTGA CCCATTGAGC T <210> 9 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X12671 <400> 9 AGGGCGAAGG TAGGCWGGCA GATACGTTCG T <210> 10 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X12671 <400> 10 CAGGTTCTAT TTGGAWTTTA TATACAACCT G <210> 11 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> AB006782 <400> 11 GAGATGGCCT TCAGCRGTTC CCAGGCTCCC T <210> 12 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> AB006782 <400> 12 AGCAGGCCTG ATGGCWTCCC ACTGGCCTCC A <210> 13 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> AB006782 <400> 13 CACTGGCCTC CACCAMCTGA CCAGAGTGTT C <210> 14 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> AB006782 <400> 14 TGACCAGAGT GTTCTYTTCA GAGGACTGGC T <210> 15 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> AB006782 <400> 15 GAGTGTTCTC TTCAGRGGAC TGGCTCCTTT C <210> 16 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3708 <400> 16 GGAAACCTCA TTGTTSTGTA CAAAGTACTA G <210> 17 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3708 <400> 17 TGAAACTCAT CTCATYACCC TTTTCTGGGT T <210> 18 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 18 AGAAACTAAA GAAGAYTTAC CTGCGGAAAA C <210> 19 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 19 AGAAGACTTA CCTGCRGAAA ACGGGGAAAC G <210> 20 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 20 GAGGAATATT TTTATSAACT ATTTTGTAAT G <210> 21 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 21 TTTTTATCAA CTATTYTGTA ATGCAAGTTT T <210> 22 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 22 TTGTTTATTT TTTGGYACAA CCAGAAAATA G <210> 23 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 23 TTTGGTACAA CCAGARAATA GTGTGGGATA T <210> 24 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 24 TACAACCAGA AAATASTGTG GGATATTGAA T <210> 25 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 25 GTGGGATATT GAATTRTGGG AGGCTCTGAC T <210> 26 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 26 GAATTATGGG AGGCTYTGAC TGTCTCGGGT G <210> 27 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 27 AATACAAAGC ATATTMAATG GCAATATGGA G <210> 28 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 28 TAAATTACTT CTATTMCCAT GTTGTTTTTT A <210> 29 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 29 TTACTTCTAT TACCAYGTTG TTTTTTAGTA G <210> 30 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 30 TTACCATGTT GTTTTKTAGT AGAATTGTTT C <210> 31 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 31 GAATTGTGTG CACTCKGTAA CATCTTTGGT T <210> 32 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J02621 <400> 32 TGTAGTGTAC GTGCTRTTGA GTTGTGAACT G <210> 33 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 33 GATGCTGGGG GCCCTYGCCC TGACCACCGT G <210> 34 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 34 CCCTGACCAC CGTGAYGAGC CCCTGTGGAG G <210> 35 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 35 CACCGTGATG AGCCCYTGTG GAGGTGAAGA C <210> 36 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 36 CATTGTGGCT GACCAYGTCG CCTCTTATGG T <210> 37 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 37 TGTGGCTGAC CACGTYGCCT CTTATGGTGT A <210> 38 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 38 CCACGTCGCC TCTTAYGGTG TAAACTTGTA C <210> 39 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 39 CTTGTACCAG TCTTAYGGTC CCTCTGGCCA G <210> 40 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 40 CCTCTGGCCA GTACASCCAT GAATTTGATG G <210> 41 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 41 GACAAACATC GCTGTSCTAA AACATAACTT G <210> 42 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 42 CGCTGTCCTA AAACAYAACT TGAACAGTCT G <210> 43 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 43 ACGCTCCAAC TCTACYGCTG CTACCAATGA G <210> 44 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 44 CAAGTCTCCC GTGACRCTGG GTCAGCCCAA C <210> 45 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 45 TGGGTCAGCC CAACAYCCTC ATCTGTCTTG T <210> 46 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 46 TGTGGTCAAC ATCACMTGGC TGAGCAATGG G <210> 47 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 47 CTTCTGCTGA GGAGAKTTAT GACTGCAAGG T <210> 48 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 48 GGTGGAGCAC TGGGGMCTGG ACAAGCCTCT T <210> 49 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 49 CACTGGGGCC TGGACRAGCC TCTTCTGAAA C <210> 50 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 50 GCCTGAGATT CCAGCMCCTA TGTCAGAGCT C <210> 51 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 51 AGAGACTGTG GTCTGYGCCC TGGGATTGTC T <210> 52 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 52 GGTCTGCGCC CTGGGRTTGT CTGTGGGCCT C <210> 53 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 53 CTGTCTTCAT CATCCRAGGC CTGCGTTCAG T <210> 54 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 54 CAGACACCAA GGGCCMTTGT GAATCCCATC C <210> 55 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 55 AATCCCATCC TGGAAKGGAA GGTGCATCGC C <210> 56 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 56 AGAGTGGACT TGCTAMATGA CCTAGCATTA T <210> 57 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 57 TATCTGCTCA GAGCTYACAA ATGCCTTTGA A <210> 58 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 58 TGATTTTTTT CTTCTYAAGT GTTACCTACT A <210> 59 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 59 GTTACCTACT AAGAGWTGCC TGGAGTAAGC C <210> 60 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 60 CTAAGAGTTG CCTGGRGTAA GCCACCCAGC T <210> 61 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 61 TGCCTGGAGT AAGCCRCCCA GCTACCTAAT T <210> 62 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 62 AACAAATTCC CTTTAWGAGA TATATGTCAA A <210> 63 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 63 TTCCCTTTAT GAGATMTATG TCAAATTTTT C <210> 64 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 64 TGAAACCGTG GCTAASAATT GGGAGACTCT C <210> 65 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 65 CGTGGCTAAG AATTGKGAGA CTCTCTTGTT T <210> 66 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> K01160 <400> 66 TTTACCAGAT CATTTKTCAT GTCCAGTAAC A <210> 67 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L12168 <400> 67 CATTACAGTA GATAAYTGTA AGAAACTTGG C <210> 68 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L12168 <400> 68 AGATAATCAA CAGTARGGAT GTCAAAGTTC A <210> 69 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L12168 <400> 69 TTCCCTGGAT TGTGARATAG TCAGTGCCAA A <210> 70 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L12168 <400> 70 GCTTCTCTGC TCTGARAAGC ACAGCTACCT G <210> 71 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L12168 <400> 71 GAGCATGAAG GTAGCRGAAG CTGGTGTGTT T <210> 72 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M15661 <400> 72 TGTATGCCCA GGGAARGAGG CGCTATGATC G <210> 73 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M29064 <400> 73 TAATGCAGAA GTAAGRAAGG CTTTGTCTAG A <210> 74 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M37766 <400> 74 GCTCTGGAAT TGCTAYTGCT GCCTCTGTCA C <210> 75 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M37766 <400> 75 AGCATTCAAG GTCACYTGGT ACATATGACC G <210> 76 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M37766 <400> 76 TCTAAGGTCC AGAAASAGGA CAACAGCACC T <210> 77 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M37766 <400> 77 CCCTTATGCC ACATAWTTAC TCCAGGTGTT A <210> 78 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M37766 <400> 78 AAACTTCAAG GCCAGMAGAT CTTGCCTGTT G <210> 79 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 79 TGCGCCAGAG GGTTAYCAGA ACAGACTGAA A <210> 80 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 80 CCAGAGGGTT ATCAGRACAG ACTGAAAGTA C <210> 81 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 81 CTCCTGGCTC CAGCCSGAAG ACCTGCCGTT A <210> 82 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 82 TGTCCAGTGG TTCACRTTCT GGCCACATCC A <210> 83 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 83 GGTAGCAGAA CACCAYGTGG CCACACTGAG T <210> 84 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 84 GTGGGCTGCG CTGGGYCCCA GATGGACGAC A <210> 85 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 85 TTTGGCCAGT GGTGGYAATG ATAACTTGGT C <210> 86 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 86 TGATAACTTG GTCAAWGTGT GGCCTAGTGC T <210> 87 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 87 GGCAGTCCAA TGTCCYGGCA ACAGGAGGGG G <210> 88 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 88 AGTGATCGAC ACATTYGCAT CTGGAATGTG T <210> 89 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 89 CATTCGCATC TGGAAYGTGT GCTCTGGGGC C <210> 90 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 90 GTGCCGTGGA TGCCCWTTCC CAGGTGTGCT C <210> 91 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 91 CCTCTGGTCT CCCCAYTACA AGGAGCTCAT C <210> 92 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 92 CATCCCGGGT CCTGASTCTG ACCATGAGCC C <210> 93 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 93 CAGCAGATGA GACCCYGAGG CTATGGCGCT G <210> 94 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05340 <400> 94 GCAGCCAAAA GCAGCYTCAT CCACCAAGGC A <210> 95 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 95 GACTGCAATG TGCCGRTCTT AGCTGCTGCC T <210> 96 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 96 GTCCGAGCCC CTGAGYCGAG TAAAGTTGGG C <210> 97 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 97 AGTAAAGTTG GGCACRTTAC GCCGGCCTGA A <210> 98 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 98 CTTCAATCCT GGGAARAACT TCAAACTGGT C <210> 99 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 99 ACTGGCTGCA CCCACMGATG ACAGTGGGTG A <210> 100 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 100 GCACCCACAG ATGACRGTGG GTGAGGTGCA G <210> 101 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 101 AACCCTGCGA AGGCCYGGAG GTCCACAGTA T <210> 102 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 102 TGTCTACACA AATCAYAAAG GGGAGAAAAT C <210> 103 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 103 TTTATATGAA TGATAMGTCC CCATTGACGC C <210> 104 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 104 TAACCTGGAC CGGACYGATG ACCTGGTGTA C <210> 105 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 105 CAAGATGCGG CTGGCRCAGC AGAACGCCGT G <210> 106 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U43522 <400> 106 CGCCGTGACC TCCCTRAGTG AGGAGTGCAA G <210> 107＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ４３５２２＜４００＞１０７ＧＡＴＧＣＴＧＡＣＧＧＣＴＴＣＲＣＡＣＡＣＣＣ
ＴＧＧＣＴＧＴＧ＜２１０＞１０８＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ４３５２２＜４００＞１０８ＧＴＧＧＧＴＣＴＴＣＣＡＧＧＧＲＧＡＡＧＧＣＣ
ＡＡＧＧＧＧＡＧ＜２１０＞１０９＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ４３５２２＜４００＞１０９ＣＣＣＣＴＡＧＣＴＴＴＡＴＡＴＲＴＧＧＡＣＡＴ
ＧＧＣＡＧＧＣＣ＜２１０＞１１０＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ４６６９２＜４００＞１１０ CAGAGCGTGC ACTTGYGATC CTAAAATAAG C <210> 111 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U66711 <400> 111 CAAGTCCCAT GGACAKGCTG ACAGGGTCCC C <210> 112 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U66711 <400> 112 CTGTGTACGT GGGTGKGCAG TGCACGTGAG A <210> 113 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X05276 <400> 113 AACTTGCCCA GGCCARAGAA GAGAACGTGG G <210> 114 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X05276 <400> 114 TTCGCTTTGC TGGAARTGTC AAGCAAATTA T <210> 115 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X05276 <400> 115 CCCCACACTT TGAAGMATAC AGACCCCAGT A <210> 116 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X05276 <400> 116 TGCAGGACAA ACATCYTCTC AAGCAGTCAA C <210> 117 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X05276 <400> 117 TCTCAAGCAG TCAACSTAGA ATGCTTGGGA A <210> 118 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X05276 <400> 118 TTCGAGACCA GCCCARCCAA CATGGCGAAA C <210> 119 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X60221 <400> 119 AAGAATGCAG CCTTCYTAGG TCCAGGGGTA T <210> 120 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X60221 <400> 120 TTTCTTTATC CTAAARCTGG TGTAACAGGA C <210> 121 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X60221 <400> 121 AACAGGACCC TATGTRCTCG GAACTGGGCT T <210> 122 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X60221 <400> 122 CCTTTTTGAT GTGCARAGGA ATAACATTGC T <210> 123 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X60221 <400> 123 GGACTATCAT ATATCYGTGC AGAACATGAT G <210> 124 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Y00097 <400> 124 ACTCTGCTGA AGCTGKCTGG GGGAGATGAT G <210> 125 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Y00097 <400> 125 AATAGCAGAC ACACCYAGTG GAGACAAAAC T <210> 126 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Y00097 <400> 126 ATTCATTGAG AAATAYGACA AGTCTCTCCA C <210> 127 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Y00097 <400> 127 AATATGACAA GTCTCYCCAC CAAGCCATTG A <210> 128 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Z48950 <400> 128 AAGCGCTCCC TCTACYGGCG GGGTGAAGAA G <210> 129 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Z48950 <400> 129 CTCTAGCTGA TAATGSAAAC ACTAACTGGG G <210> 130 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Z48950 <400> 130 CTCTGCTGAG GAAACRGTAC CGAAGTTCTT T <210> 131 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Z49107 <400> 131 CTGGGAGGGC TGTACYCATC CAAGTCCATC C <210> 132 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D11086 <400> 132 CCTCACTCTG CATTAWTGGT ACAAGAACTC G <210> 133 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D11086 <400> 133 GCTAGAACTG AACTGSAACA ACAGATTCTT G <210> 134 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D11086 <400> 134 GATTGATTAT CAGCCWTCTC TGTGTGTATT T <210> 135 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D11086 <400> 135 TGTGCCCCCA TGTAASCACC CCTTCATTTG G <210> 136 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 136 CCGCCAAGGA CACTCRTGAG GACCATGATA C <210> 137 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 137 AGAATACAGA CGAGTMCAAC CATGACCCTC A <210> 138 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 138 AACTTTTTAA AATGCRGGCA AAACTGTTCC G <210> 139 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 139 CGGGCAAAAC TGTTCYGATT TGCCTCTGAG A <210> 140 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 140 GTTCCGATTT GCCTCWGAGA ACGATCTCCC A <210> 141 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 141 TCCGCCTCCT CATGCRGAGG GACAAGACCC T <210> 142 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 142 GGACAAGACC CTGAAKATCT GTGCCAACCA C <210> 143 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 143 GGAGCTGAAG CCCAAMGCAG GTAGCGACCG T <210> 144 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 144 GCCCAACGCA GGTAGYGACC GTGCCTGGGT C <210> 145 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 145 GGTCTGGAAC ACCCAYGCTG ACTTCGCCGA C <210> 146 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 146 GCTGACTTCG CCGACSAGTG CCCCAAGCCA G <210> 147 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 147 GAGCTGCTGG CCATCYGCTT CCTGAATGCT G <210> 148 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 148 GTTTGAAGAA TGCAGRAAAG AGATCGAAGA G <210> 149 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 149 AAAAATGATC ATGCCRAAAA AGTGGCGGAA A <210> 150 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D38076 <400> 150 CCTCTTTTTC GGTTTRTTTT TATTCTTTCA T <210> 151 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D87017 <400> 151 GAAGCTACAG CTGCCRGGTC ACGCATGAAG G <210> 152 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 152 TACAGAGAAA TGGAAYACCG ACAATACACT A <210> 153 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 153 CGAGGGCTGG CTGGCYGGCT ACCAGATGAA T <210> 154 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 154 CTATTTTGCA GCATASCTAC CTTCAGAATT T <210> 155 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 155 GGTACAGAAG AAACCYATTT CCAAAAAAGG T <210> 156 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 156 TCTAGAAATG GCTGCRAGTG GAAGCGGATA A <210> 157 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 157 AATGGCTGCA AGTGGWAGCG GATAATATGT A <210> 158 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 158 AATCGAACCT TGGTTYCCTA ACCCTAATTG A <210> 159 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 159 ACCTTGGTTC CCTAAYCCTA ATTGATGAGA G <210> 160 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 160 TGGTTCCCTA ACCCTRATTG ATGAGAGGCT C <210> 161 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 161 GGTTCCCTAA CCCTAMTTGA TGAGAGGCTC G <210> 162 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 162 GTTCCCTAAC CCTAAYTGAT GAGAGGCTCG C <210> 163 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L06132 <400> 163 TTTTTAGACA GATCTYCATG ACCTGTTCCC A <210> 164＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｌ０６１３２＜４００＞１６４ＣＡＧＣＴＡＴＡＡＧＣＴＴＧＧＲＡＧＴＧＴＣＴ
ＧＴＧＴＧＡＴＴ＜２１０＞１６５＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｌ０６１３２＜４００＞１６５ＡＡＴＣＡＣＡＴＧＧＴＧＡＣＡＲＣＡＣＴＣＡＧ
ＡＡＴＣＴＡＡＡ＜２１０＞１６６＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｌ０６１３２＜４００＞１６６ＡＣＴＣＡＡＴＴＴＧＴＴＴＴＴＹＡＧＣＡＧＴＴ
ＴＡＡＴＧＧＧＴ＜２１０＞１６７＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｍ１９３１１＜４００＞１６７ ACTTCGCCAT GTGATKACAA ACCTTGGAGA G <210> 168 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M19311 <400> 168 GCATGTGGCT TACTCYGGCT ATATCTAAGC C <210> 169 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M19311 <400> 169 CACATCTAAA CTTAGRTGGA GTTGGTCAAA T <210> 170 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22760 <400> 170 TTCGAATCCT AGAGGYTGTT AAGGACAAAG C <210> 171 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22760 <400> 171 TGTCATCCAG GAACTYAGAC CAACTTTAAA T <210> 172 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M58028 <400> 172 TACCTTTAGC ATCTGYGACA CCTCCAACTT C <210> 173 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M58028 <400> 173 TTGGTGGCCT CACTGSCAGA ACCTGACTTT G <210> 174 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M58028 <400> 174 TTCTCGCCCT GCCCASCTGC ACATTGGCTT C <210> 175 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M58028 <400> 175 ACAAGTGCCT CCAGCRCCAG AACCGTTATG A <210> 176 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M58028 <400> 176 CTGACTGCGT GACCTSGGCC TGCCACCACT G <210> 177 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M58028 <400> 177 AAGCTCAGGA GCGCCRTTCT GGTCTGGGCC C <210> 178 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M58028 <400> 178 CCGAGCTGCT GTGGCYACAT TCCTGCAGTC T <210> 179 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M58028 <400> 179 ACCAGGAGCT GCAGASCGCC AATGCCTCTG T <210> 180 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M60784 <400> 180 CCCTTTCTAT GACAARCCTA TGCGTATCCA G <210> 181 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U23852 <400> 181 TTGACTACCT GCGCASTGTG CTGGAGGACT T <210> 182 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U23852 <400> 182 CTGCACATGT CTTGTRCATG TGTAGCCTGT G <210> 183 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U23852 <400> 183 ATGTATGTCT TGGACRCTGT ACAAGGTACC C <210> 184 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U30825 <400> 184 GACCGACGTG CGCGARAAGG ACTTGGAGGA C <210> 185 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U30825 <400> 185 TGGAGGACCT GTTCTWCAAG TACGGCCGCA T <210> 186 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U30825 <400> 186 ACCTGAAGGA TCACAYGCGA GAAGCTGGGG A <210> 187 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 187 GCCACAGTAA CAACCRCACC AATTTATACA T <210> 188 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 188 TGGCTCAGCG CCTCASTCAG CTCCTCAACC T <210> 189 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 189 TCTAGCAGTG CTGGARCCAG GTGGCGAGAG G <210> 190 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 190 CATGGGGAGA CCACGRCGGA ATCATCACGG C <210> 191 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 191 TTCTGGCCTG GAGACWGTAG AAGCTTTGGC T <210> 192 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 192 AATACCTGTG TCAAASAAGA GAACACCTGT C <210> 193 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 193 CTGCAGGGAC TGGTCKGATG AAGCCAACTG T <210> 194 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 194 GTGTGACGGG GATACRGACT GCCAGGATGG T <210> 195 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 195 ACTGCCAGGA TGGTTSCGAT GAGGATCCAG T <210> 196＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ６０９７５＜４００＞１９６ＴＣＡＡＣＴＧＴＧＡＧＡＡＧＡＲＧＴＧＣＡＡＴ
ＧＧＡＴＴＣＣＧ＜２１０＞１９７＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ６０９７５＜４００＞１９７ＡＴＴＣＣＧＣＴＧＣＣＣＡＡＡＹＧＧＣＡＣＴＴ
ＧＣＡＴＣＣＣＡ＜２１０＞１９８＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ６０９７５＜４００＞１９８ＴＧＡＴＧＡＡＧＣＣＡＡＣＴＧＭＧＡＡＡＡＣＣ
ＣＣＡＣＡＧＡＡ＜２１０＞１９９＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ６０９７５＜４００＞１９９ ACCGAGATTG TGCAGRTGGC TCTGACGAGG A <210> 200 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 200 AAAAATGCCC TCTGCWTCTT GTGTATATAA T <210> 201 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 201 CAATCTGACA GCTCAWACAT CCTATGAGAT T <210> 202 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 202 CCTCTATCGC AACCCRAAGA GCTTGACTAC T <210> 203 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 203 GACTTGTTGT ATGCARTTGC AGTCAAAGAT C <210> 204 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U60975 <400> 204 CACCGGAGGC TGCAGRGCAG CTTCACCGCC T <210> 205 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 205 AGCATGGAAC CAAAGYGGAT CAGAGAGGGC T <210> 206 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 206 GGTTCGGGAT ATCAAKAAGG CCATTAAATG C <210> 207 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 207 CATGATTGCT TCATCRCTGC TCAATGAGGG G <210> 208 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 208 CTGAAAACCC TTTCCKGGAC AACCCTGATG C <210> 209 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 209 GCACAGAGTG GATCARAGCC ATCCAGATGG C <210> 210 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 210 ACTGGGAAGT AAAGASACTC CTGCATTCCT C <210> 211 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 211 CCTGAGGGAA GCCCAYGGAC AAGCTCAGTC C <210> 212 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 212 TTCCTGAGGT CCCCCYAGCT TAAAAAAAAA A <210> 213 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 213 AAAAAAATCT GCCCCRTGAT TCTAACACTC G <210> 214 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 214 ATCTTCTACT TGCTCYTGGC CTTGAGATCG T <210> 215 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 215 CTGGTGAATG TGTCTYGCGG CAGCTGCAGC A <210> 216 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 216 GGTGAATGTG TCTTGYGGCA GCTGCAGCAA G <210> 217 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 217 ACAGCACCCA TTGAARCAGA TATGTGTGTG A <210> 218 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07743 <400> 218 CCCATTGAAA CAGATRTGTG TGTGAAAGTA T <210> 219 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X51521 <400> 219 CCTGAAGATG TGGCTSAGGA GCTCATCCAG G <210> 220 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X51521 <400> 220 CCCCCCTGAG ACTGCYGTGC TCTTGGGGTC C <210> 221 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X51521 <400> 221 GCAGGCCTGA TTCTCRCGAT TATTCTCGAA T <210> 222 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X51521 <400> 222 GGAGGACACT TGGATWTTTT TTTAGTTCTT T <210> 223 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X51521 <400> 223 ATTAATGATC AGCTAYATAC TATTTATATA C <210> 224 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X51521 <400> 224 CTATGCACAC TTTTAWTTTT GTCAGATTCA C <210> 225 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X51521 <400> 225 GGTGGATTCC ATGCCRCAGA CATGAAATAA A <210> 226 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X52882 <400> 226 ATTAAATACA CAGACRTAAG AGGCCAGCCA C <210> 227 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X52882 <400> 227 GGTGGGATCC CAGGGYATGC CCAAGAGAAT C <210> 228 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X52882 <400> 228 ATGATTTCAT GTGTGRTGAG ATGGAGCGCT C <210> 229 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X52882 <400> 229 TTCTTGTTAT TCCCARTACA CTAGCAGTTA A <210> 230 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X52882 <400> 230 GAATTGATGA TCTTAYTAAA TTACATCCAG A <210> 231 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> AC002115 <400> 231 CAAGAACTAC AAGACYGCCC CTTTTGACAG C <210> 232 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> AC002115 <400> 232 TAATAAAAAC TCATTKGAAA AGTGAGACTA T <210> 233 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13118 <400> 233 CACAGCAGCC AAGTTKATTG GTGCTGGGGC A <210> 234 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13118 <400> 234 CATTGGCTAT GCCAGRAACC CGTCTCTCAA G <210> 235 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13118 <400> 235 TTTGATGGTC GCCTTYCTCA TCCTCTTCGC C <210> 236 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13118 <400> 236 TACTGCAACT CCACAYCATT CTTGGTGCTG G <210> 237 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13118 <400> 237 AACTCCACAC CATTCYTGGT GCTGGGGTGT G <210> 238 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13118 <400> 238 TGGTGCTGGG GTGTGYTAAG CTTTACCATT A <210> 239 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D26068 <400> 239 ACGGCTAGTC AGAGAMAAAG ACACAGATAA A <210> 240 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D26068 <400> 240 TAAATTTAAA GGATTYTGCT ATGTAGAATT C <210> 241 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D26068 <400> 241 AAGTCCCAGT CTGTCSTATG GGGAGCAGTT T <210> 242 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D26068 <400> 242 AGTTTGGGGG CGGCCRGCAG CAGGAGCCTG G <210> 243 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D31890 <400> 243 CTGCTGCTGC CACCARCCAC ACCACTGATA A <210> 244 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D31890 <400> 244 GGGATCACCT GACTGMCATC ACCTTAAAGG T <210> 245 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D31890 <400> 245 ACCAAGAAGG GTGAGSTGAG CATCATTCCG T <210> 246 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D31890 <400> 246 CTTTGTGAGG CAGAAMTTTA TCATCCGCTC T <210> 247 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D31890 <400> 247 GGTTGGTGGC ATCGASCGGG TTTATGAAAT T <210> 248 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D31890 <400> 248 GCACAACAGT TGGCASTTCT GTCTAGAAAA T <210> 249 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3238 <400> 249 CAGAACGCTT CAGTTSTGCT CTGCAAGGAT A <210> 250 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3238 <400> 250 CTCTGCAAGG ATATAWAATA ACTGATTGGT G <210> 251 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3238 <400> 251 GCATTCTGCT TCAGASCAAG AATGCTGGGG C <210> 252 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3238 <400> 252 ACCAGCCAGC TCCCGYTCGA ATCTGATGCT G <210> 253＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞ＨＴ３２３８＜４００＞２５３ＴＧＣＴＧＴＧＧＡＡＴＧＣＴＴＷＡＡＴＴＡＣＣ
ＡＡＣＡＣＴＡＴ＜２１０＞２５４＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞ＨＴ３２３８＜４００＞２５４ＧＧＡＡＴＴＡＴＴＧＧＧＧＴＣＲＡＡＧＧＴＧＣ
ＴＡＡＡＡＴＣＡ＜２１０＞２５５＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞ＨＴ３２３８＜４００＞２５５ＧＧＧＴＴＧＴＡＧＡＧＴＧＣＡＷＡＡＡＧＡＴＣ
ＡＴＣＣＴＴＧＡ＜２１０＞２５６＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞ＨＴ３２３８＜４００＞２５６ AGAGCTCGGA ATCTTYCTCT TCCTCCACCA C <210> 257 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3238 <400> 257 GTGATCTTGG TGGACYTATT ATTACTACAC A <210> 258 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3238 <400> 258 TTCTGGAAAG TTTTTYTAAG ACTAGTGAAG A <210> 259 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3238 <400> 259 CCCATGTAAT TATTGYGAAC ACCTTGCTTT G <210> 260 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3238 <400> 260 ATAGGCAAAA TAACTYGGCA AACTTAGTTC T <210> 261 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3238 <400> 261 ATGGTTTGGA AGTCTRTTGC TGGGAAGAAA T <210> 262 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M20471 <400> 262 AGTGGATCGA TTGCASTCAG AGCCTGAAAG T <210> 263 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M20471 <400> 263 GTCTCCCGCA TGCGCYCAGT CCTCATCTCC C <210> 264 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M20471 <400> 264 TCTTTTGGAC CAAACYTTTT TGTCTTTAGA G <210> 265 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22538 <400> 265 ATTTGCATAA GACAGYTATG CAAAATGGAG C <210> 266 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22538 <400> 266 CTTTTTATAC AATGTWTAAT CGAAAGCCAG T <210> 267 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22538 <400> 267 GTGTACAAGC AGGCCKTTAA TTTATATTGA A <210> 268 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 268 GTGCTAATTG ACATGRAAAG GCAGGGGGAT G <210> 269 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 269 CAATCCCTGA GACCARAAGA AACGCAGAGT T <210> 270 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 270 AAGCCAAGGA CAGTGRAAAA TCAGAAGAAT C <210> 271 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 271 AGGGAATCGC TGTGTRAAAG GAGATTCTCT C <210> 272 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 272 CACCAAGGTG GAGAAYGGAG AAGGCACAAT C <210> 273 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 273 AACGTGCTGG GCCTGMAAGG GGCACTGTTG A <210> 274 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 274 TGGCTGATGG CTATGRCCTG GAGATCCTGG A <210> 275 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 275 AAAAAGAACA TTTTTYTTCT ATTTAAGAAG C <210> 276 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 276 TTCTTTCCTT GTGATYTGAA TGTCTCCTTT T <210> 277 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 277 CCCTCAGAGG GCAAARAGGT GAACATAAAG G <210> 278 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 278 GCCTGCAGAT AATGCYCAGC CATCCTCCCA T <210> 279 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 279 TCTCTGCTCA GATAAYCATG ACTTAGCAAG A <210> 280 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 280 CGTCACTGTT CCACCYGGTG TAATATCTCT C <210> 281 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 281 GCAGACCTGA TCTTTMTAGG GTTGACATAG A <210> 282 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 282 CTGTCAGTGC TTGAARCTGT TTCCTTTACT C <210> 283 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 283 TTGGTGCCGT GGTGAWGGCT GCAGTCCAGT T <210> 284 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 284 CTTTGCTTTT ATTCTRTGCT CTCTGTACTT T <210> 285 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 285 TTGTCAGTGC TTGAARCTGT TTCCTTTACT C <210> 286 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U10439 <400> 286 CTGCAGTCCA GTTTTRTGAT TCTGCTTTTA T <210> 287 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57342 <400> 287 CACGTTCCGG GCCGCSACCC TGACCCTGCA G <210> 288 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57342 <400> 288 AGGGCCCCGG GCCCTYAGCC TCTCTTGTAC A <210> 289 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57342 <400> 289 TTTCCTCTCG ATTCCYATCC CCAATTTAAT A <210> 290 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57342 <400> 290 TACCATTGAT GACTTYGCCT CTGCATCTAC T <210> 291 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57342 <400> 291 GCCCCCTCCA TCCCTYAGCT ACCCTGGATC T <210> 292 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57342 <400> 292 GGAGCAGACT GGTTCYTAAC TCTCTCCCTC C <210> 293 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U62962 <400> 293 AATTGGGATG CAGCCRTGGA AGACCTTACA C <210> 294 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U62962 <400> 294 GGGCAACTCA AGATTYTGGC TTCTACTGAA G <210> 295 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X13238 <400> 295 TTTCTACAGA AACTAYGATG TCATGAAAGA T <210> 296 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X14046 <400> 296 CATCTGGATC CTCATYGACA AGACCAGCTT C <210> 297 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X14046 <400> 297 ACAGATCACC CTGGGMATCC TCATCTCCAC T <210> 298 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X14046 <400> 298 TGGCACTACC CGCAGSACTG GTTCCAAGTC C <210> 299 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X14046 <400> 299 CCCGCAGGAC TGGTTYCAAG TCCTCATCCT G <210> 300 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X14046 <400> 300 TCACGTGCGC TGGGCWCTTC CCTGCTGCCT G <210> 301 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57346 <400> 301 AGGAAGGAAG AGGTCMTCTC GCTCGGAGCT T <210> 302 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57346 <400> 302 TGCAGCCCTC CCACGSCAGA GTCTCCAGAG A <210> 303 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57346 <400> 303 TGAGCAGGCT GAGCGMTATG ATGATATGGC T <210> 304 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57346 <400> 304 GCATGAACTC TCCAASGAAG AGAGAAATCT G <210> 305 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57346 <400> 305 TCGTGCTTTG TGATCYGTCC AGTGTCACTC T <210> 306 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X74008 <400> 306 CTCCAAGGGG TATGAYCACA AAGCAAGCAA A <210> 307 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X74008 <400> 307 AGGTGGTATG GTTGTRTACA CATGCTGCCT T <210> 308 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Z29505 <400> 308 ACAGCTCCAT GACCAWCAGT ACCGCGGCCA G <210> 309 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Z29505 <400> 309 ATCAAAGAGA TCCGCSAGAG TACGGGGGCG C <210> 310＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｚ３７１６６＜４００＞３１０ＴＧＧＧＣＡＧＧＴＧＴＣＴＧＴＲＣＴＧＧＴＧＡ
ＴＧＴＧＴＣＡＣ＜２１０＞３１１＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｚ３７１６６＜４００＞３１１ＴＴＴＣＡＧＡＴＣＡＧＣＡＡＧＲＡＡＴＡＴＧＡ
ＧＣＧＣＴＴＣＴ＜２１０＞３１２＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞ＡＣ００２０４５＜４００＞３１２ＴＣＴＣＣＣＴＣＴＧＣＡＣＡＡＳＴＴＡＣＣＴＴ
ＴＧＴＧＴＧＴＣ＜２１０＞３１３＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞ＡＣ００２０４５＜４００＞３１３ GGTGGAAACC AAAGTWCGAG CTAAAATCTG T <210> 314 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> AC002045 <400> 314 GTGGAAACCA AAGTTMGAGC TAAAATCTGT A <210> 315 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D26599 <400> 315 CACGTGAGAG GGCAGWGGAA CTCCTTAGGA A <210> 316 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D30655 <400> 316 GTTCTCTATC ATTTARTAAT ATACTTGTGG A <210> 317 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08096 <400> 317 CCATTGGTCG CGGGCYTGGT GATCTGCCTC G <210> 318 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08096 <400> 318 AGCTGAATCA CACAGSACCT CAGCAGGACC C <210> 319 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08096 <400> 319 CCTGCATGGA CCAGARCTGG ACAAGGGGCA G <210> 320 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <08> L08096 <400> 320 CTGCATGGAC CAGAGMTGGA CAAGGGGCAG C <210> 321 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08096 <400> 321 TGCATGGACC AGAGCWGGAC AAGGGGCAGC T <210> 322 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08096 <400> 322 TCTACATGGT ACACAKCCAG GTGACGCTGG C <210> 323 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08096 <400> 323 CACATCCAGG TGACGYTGGC CATCTGCTCC T <210> 324 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08096 <400> 324 GACGCTGGCC ATCTGYTCCT CCACGACGGC C <210> 325 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08096 <400> 325 CCCCACCACC CTGGCYGTGG GAATCTGCTC T <210> 326 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08096 <400> 326 CCGTAGCATC AGCCTSCTGC GTCTCAGCTT C <210> 327 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08096 <400> 327 TAGCATCAGC CTGCTSCGTC TCAGCTTCCA C <210> 328 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 328 GAATGCCGGC CAAGCRACAG GCTGTCACCA A <210> 329 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 329 TCATTGGCCG GCGATRTGAT GATCCTGAAG T <210> 330 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 330 GCATTTGTGT TGATGRAGAT GAAAGAGACT G <210> 331 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 331 TCAATGACTC GCAGASACAG GCCACTAAAG A <210> 332 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 332 TATCCTGGAA ATTCARAAAG GAGTATTTGA G <210> 333 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 333 TGCTGAAAAG GCTAARTGTG AACTCTCCTC A <210> 334 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 334 TTGTCACTGA TCTAAYCAGA AGGACTATCG C <210> 335 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 335 TGTGTTGGCC GGCGAKGTCA CGGATGTGCT G <210> 336 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 336 ACTTATTAAT AGGAAYACCA CTATTCCAAC C <210> 337 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 337 GGTATTCTCT ACTGCYGCTG ATGGTCAAAC G <210> 338 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 338 CTTCAGCAGG CATCAYTGAA GCTGTTCGAA A <210> 339 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 339 TATAAAGATT TAACTRTTTT ATGCTGAAGT G <210> 340 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L11066 <400> 340 GCTACCTTCT GCCCTSTGTC TGGCACCTAC A <210> 341 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05259 <400> 341 GAAACGATGG CAGAASGAGA AGCTCGGGTT G <210> 342 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05259 <400> 342 ACCTGGACGA CTGCTYCATG TATGAGGACA T <210> 343 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U05259 <400> 343 CCTCAACATA GGAGAWGTCC AGCTGGAGAA G <210> 344 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U44839 <400> 344 GGGCCCAGCT CTGGARTCAC GAACAGGTGC C <210> 345 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U44839 <400> 345 GAAGCATGAC TGCGTYGGGT ACGTGATGAA G <210> 346 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U44839 <400> 346 TGATGACAAC AGCGTMTCCC CTGTCAATGA G <210> 347 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U44839 <400> 347 ACGCCAGGAC GTGGCRCGAC GCCTGCTGTC C <210> 348 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U46025 <400> 348 AATAATGCAA AATACKGACC CTCACTCCCA A <210> 349 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U46025 <400> 349 AGGTCTGCCG CATCTWCCTG CTGCGCATCC T <210> 350 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U46025 <400> 350 TGAGGGCTCC TCAAASTCTG AGCAAGACCA G <210> 351 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U46025 <400> 351 AGGGCGAGGA CTCGGYTGTG TTGATGGAGA G <210> 352 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U46025 <400> 352 GAGGACTCGG CTGTGWTGAT GGAGAGACTG T <210> 353 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U46025 <400> 353 CCTCTGCCAC ATCTAYCACC ATGCTCTGCA C <210> 354 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U46025 <400> 354 TATCATCAAT GAGAARATGA ATGGGAAAGT G <210> 355 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U46025 <400> 355 ACTGCCCAGC AGAACMTGGC TCTGCAGCTG G <210> 356 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U70439 <400> 356 GCTAGCAAAC CCTTCYGACG GCCCTCGCTG C <210> 357 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U70439 <400> 357 CTGGAGCTGA GGAACYGGAC CCCGGCAGCT G <210> 358 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U70439 <400> 358 GAACTTAGAG TTCCTYAGTT TAATAAATGT A <210> 359 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U70439 <400> 359 CTCAGTTTCA AATCTYCCCA AGCTGCCTAA A <210> 360 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U70439 <400> 360 CATGTTAGCT GAAAARCTTC CAAATCTCAC A <210> 361 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U70439 <400> 361 TTCCAAATCT CACACRTCTA AACTTAAGTG G <210> 362 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U70439 <400> 362 GGAACCTTTG AAAAARTTAG AATGTCTGAA A <210> 363 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U70439 <400> 363 CCCCAGCTTA CCTACWTGGA TGGCTATGAC C <210> 364 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U70439 <400> 364 TGGATGGCTA TGACCRAGAG GACCAGGAAG C <210> 365 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07203 <400> 365 GGGTCTTCTG ATGATYCCAG CAGGGATCTA T <210> 366 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X07203 <400> 366 TCATTTTCTC CATCARCAAC CAGGGAGACT G <210> 367＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ１５８２２＜４００＞３６７ＧＣＡＧＧＡＧＴＧＡＣＴＴＣＡＲＴＣＡＴＣＣＣ
ＡＧＣＡＡＴＣＧ＜２１０＞３６８＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ１６６６３＜４００＞３６８ＧＴＡＣＧＧＡＧＴＴＧＡＧＡＧＲＧＡＣＡＧＧＧ
ＣＡＧＡＣＡＡＧ＜２１０＞３６９＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ１６６６３＜４００＞３６９ＡＧＡＡＧＴＧＧＡＧＡＡＧＣＡＹＡＣＡＴＣＴＣ
ＡＧＡＡＡＧＡＴ＜２１０＞３７０＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ１６６６３＜４００＞３７０ GACGCCCATA GAAGCYGCTT CTAGTGGTGC C <210> 371 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X16663 <400> 371 GCCGCTTCTA GTGGTRCCCG TGGGCTGAAG G <210> 372 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X16663 <400> 372 GAAGAGCCAG TGTACRAAGC AGAGCCTGAG C <210> 373 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X16663 <400> 373 GAGATGGACA GGCATRAGCA GGAGGATGAA C <210> 374 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X16663 <400> 374 GATCATCAGG CTGCCYGGCT GGGGCTGGGG C <210> 375 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X16663 <400> 375 ATCTCAGCTG TGGCTSTATA TGATTACCAA G <210> 376 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X16663 <400> 376 CTTCCCTGCA AATTAYGTCA AGCTTCTGGA G <210> 377 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X16663 <400> 377 ACTGTGATTT CCCATKTCCA AAGTGGCTCT G <210> 378 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X16663 <400> 378 CCCTCCCTAT TCCTGMTGCA AATGTCTAAC C <210> 379 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X16663 <400> 379 GTCTAACCAG ATGAGKTTCT GGACAGACTT C <210> 380 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X16663 <400> 380 CTCCTTCCCA ATGAAYACCT CTCTGCCACC C <210> 381 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 381 GAAGACTGAG CTGATSCAGA AGGCCAAGCT G <210> 382 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 382 AGACTGAGCT GATCCWGAAG GCCAAGCTGG C <210> 383 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 383 GGCCGAGCGC TACGAYGACA TGGCCACCTG C <210> 384 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 384 GGTCATCTCT AGCATYGAGC AGAAGACCGA C <210> 385 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 385 CATCGAGCAG AAGACYGACA CCTCCGACAA G <210> 386 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 386 GGCTTTTGAT GAGGCSATTG CTGAACTTGA T <210> 387 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 387 CTGAATGAAG ACTCAKACAA AGACAGCACC C <210> 388 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 388 CACCCTCATC ATGCARTTGC TTAGAGACAA C <210> 389 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 389 GGCTGAAAAC TAAATMCATA CAGGGTGTCA T <210> 390 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 390 TCCATACAGG GTGTCMTCCT TCTTTCCTTC A <210> 391 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 391 TTTAAGTAAT CTGAAMCAGT TCTGCAAGTG A <210> 392 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56468 <400> 392 AAATTAAAGT ACACARGTCC AAGTCTAAAA C <210> 393 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57351 <400> 393 AGGACCTCCA CACCAYTAAC AAGATGAGCC T <210> 394 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57351 <400> 394 TGCATTTGAC AAATGSCAGG AAGAGGAAAC T <210> 395 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57351 <400> 395 TCTCCTGTCA ACAGCRGCCA GCCTCCCAAC T <210> 396 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57351 <400> 396 CTTCATAGCA TTCGCSTACT CCGTGAAGTC T <210> 397 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57351 <400> 397 CTTCATGACC ATTCTSCTCG TCATCATCCC A <210> 398 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X57351 <400> 398 ATGACCATTC TGCTCRTCAT CATCCCAGTG T <210> 399＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ５９８９２＜４００＞３９９ＡＧＴＧＡＧＣＣＣＧＣＡＴＣＴＹＴＧＣＴＧＧＡ
ＧＣＴＧＴＴＣＡ＜２１０＞４００＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ５９８９２＜４００＞４００ＡＧＣＴＡＣＡＡＡＧＣＴＧＣＣＫＣＧＧＧＧＧＡ
ＧＧＡＴＴＡＣＡ＜２１０＞４０１＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ５９８９２＜４００＞４０１ＣＣＴＡＡＡＣＣＡＧＣＣＣＴＧＹＴＧＣＡＣＴＣ
ＣＡＣＣＴＴＣＴ＜２１０＞４０２＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ５９８９２＜４００＞４０２ AATTGATAAG TAAAAKCTTC GTTATACATT T <210> 403 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59892 <400> 403 AGACTTGGGG GTGAARCTTT CCAGTTTACT G <210> 404 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59932 <400> 404 TCCGGTACAG AATGTWTTGC CAAGTACAAC T <210> 405 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59932 <400> 405 CTTCCACGGC ACTGCYGAGC AGGACCTGCC C <210> 406 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59932 <400> 406 GGTGCAGCTC CTGGGYGTGA TCGTGGAGGA G <210> 407 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59932 <400> 407 GACTACCTGC GGTCTMGGGG TCGGTCAGTG C <210> 408 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59932 <400> 408 TGCTGGCACC TGGACRCCGC CATGCGGCCC T <210> 409 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59932 <400> 409 TGCCCCTGCT CACTGRGCCC GAGCCTGAAC T <210> 410 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59932 <400> 410 GAGGAAGGAG GCCACRGAGC GGGAGGCAGC G <210> 411 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59932 <400> 411 ATTCCTTTCC TTTTTKGAGA TTTTTTTTCC G <210> 412 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59932 <400> 412 CTTGTGAGAT GGAATYGTAA TAAACCACGC C <210> 413 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> Z47055 <400> 413 TGGAGTACAA TGCCAYTGGA GGCAAGTATA A <210> 414 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> STSG-13126 <400> 414 TCCGGCCCTA TCGTCYTTCC TGTGGGCCAT T <210> 415 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> STSG-13353 <400> 415 GAAATAGGAC CAATCYGAGG CTTTCGTGAG A <210> 416 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> STSG-13369 <400> 416 GTGCTTTGGT ATATASAGGT AACAATGTAC T <210> 417 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> STSG-13448 <400> 417 ATGACAGATT CAAGAYGATG TCGCCTCCTG T <210> 418 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D00761 <400> 418 GCCATGTATT CGGCTSCTGG CAGAGACTTG G <210> 419 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D00761 <400> 419 TCAAGGCTGG AGGCTSAGCA AGTGCCATGC T <210> 420 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28137 <400> 420 GGCCCAGAAG GGCTTYCAGG ATGTGGAGGC C <210> 421 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D43950 <400> 421 TTGCCAAGCT GATGGYGGAA CTGTCCAAGT C <210> 422 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D43950 <400> 422 CTCGTGTTGC TATTGWACAC CTGGACAAGA T <210> 423 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D43950 <400> 423 TCTTGTACAG GAGATSTCAT TTGGGACAAC T <210> 424 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D43950 <400> 424 TAATCGTGGG GGTACYATCT CAACTGCTTT T <210> 425 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> HT3200 <400> 425 ACGCCATCCG CGAGGYCCTG GAGCTGGACT C <210> 426 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J03077 <400> 426 TGCGGAGTCA GACGGYGCTA TGTACGCCCT C <210> 427 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J03077 <400> 427 ATAAATATGG ATGGCRAGCT CCTAGGCCTC T <210> 428 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08666 <400> 428 AAAGTTACTG GGACCYTGGA GACCAAATAC A <210> 429 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08666 <400> 429 AGGCTTTTTT CCCCCMAGAA GATGATCAAA A <210> 430 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L08666 <400> 430 TGCAGTCACC TATACRTTAT TTAAATGTAT T <210> 431 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L22009 <400> 431 AACTCATTAT GATCCRCCAC GAAAGCTTAT G <210> 432 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L22009 <400> 432 TGATTTATGC TTACTYTAAG TGGAAATCAG G <210> 433 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L22009 <400> 433 CTCAAGTTAG TTATAKGATG TACTTAAGCA G <210> 434 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L22009 <400> 434 TTAGTTATAG GATGTWCTTA AGCAGTAAGC G <210> 435 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L22009 <400> 435 CTTTTTTTTT TTTTAMGTTA ATGGGAAAAA T <210> 436 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L22009 <400> 436 TTGGTGTTTG TATGARATTC TGAGGCCTTG A <210> 437 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L28010 <400> 437 TTCTCATGCA AAATTYTCTT CTAGCATGTG A <210> 438 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 438 TGCCAAGGAT TGTTAYCCTG CTGTCCAGAA A <210> 439 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 439 TTCTGTCTTT TGGCCRGTGC CGAGTGGAAT G <210> 440 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 440 GTAAAAGGCA GCCTGRCCTT TGCTACTGAG G <210> 441 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 441 TGTACCTTTG CCACAYGGTA CTGTATGCTT G <210> 442 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 442 CATGGTACTG TATGCYTGCC AGCTAGAAGG A <210> 443 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 443 TACTGTATGC TTGCCRGCTA GAAGGAGGGT C <210> 444 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 444 TATCCACATT CTCAASTTCA AGTCATTGCT G <210> 445 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 445 AAGTTCTGTC TACTGRTGCA GCACAAGAGA T <210> 446 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 446 CAATTGTTAC AAATARCGCA GACTTCAAAA A <210> 447 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 447 AAACAAACCA AAATTKAAAT GATCAGAATT G <210> 448 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 448 CCAGAAAATT GTGCCRAAGA GTTTAGAAAA A <210> 449 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L38951 <400> 449 AAGAGTTTAG AAAAAYAAAT ATACAATAAA A <210> 450 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22490 <400> 450 CCAACACCGT GAGGASCTTC CACCACGAAG A <210> 451 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22632 <400> 451 GGGAGTTGGT GCCTAYCGGG ATGATAATGG A <210> 452 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22632 <400> 452 CTACCGGGAT GATAAYGGAA AGCCTTACGT T <210> 453 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22632 <400> 453 TGGAAAGCCT TACGTKCTGC CTAGCGTCCG C <210> 454 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22632 <400> 454 CGGGAGTGGA CCCGCRTCCG GAACAGTGGA A <210> 455 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22632 <400> 455 GGGCATTAAT GTTTGYCTCT GCCAATCATA T <210> 456＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｍ２２６３２＜４００＞４５６ＴＧＣＡＡＧＡＡＧＴＧＡＡＡＧＫＣＡＴＧＧＣＴ
ＧＡＣＣＧＣＡＴ＜２１０＞４５７＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｍ２２６３２＜４００＞４５７ＴＣＡＧＣＣＡＣＡＧＴＧＴＧＴＲＡＣＡＣＴＣＡ
ＧＣＡＴＴＴＧＡ＜２１０＞４５８＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｍ２２６３２＜４００＞４５８ＣＣＴＴＡＴＣＡＡＣＡＧＧＣＣＲＣＡＣＴＧＣＡ
ＧＡＡＡＴＧＡＴ＜２１０＞４５９＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｍ２２６３２＜４００＞４５９ TTTTTCTGCT GATGCYGTAC CCTCACCCTT T <210> 460 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22632 <400> 460 ATGTGGTGTG CAGCCWCTCA TCTCACACTG T <210> 461 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M22632 <400> 461 CGGCGCAGGG TGGTASCAGG AAAGAGGATA T <210> 462 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M57567 <400> 462 GCTGGGGCTA CAGCAYTTAC GCAGCCGCAC G <210> 463 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M57567 <400> 463 TGATGCCCGG AAGCTSCTGC GTGCATCCCC G <210> 464 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M63483 <400> 464 GAATCTGAAG ATGAGYTACT TGTAGATGAA G <210> 465 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M63483 <400> 465 CCAACAAAGA TACAASTGAA AACGCAGATG G <210> 466 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M63483 <400> 466 AGATACAAGT GAAAAYGCAG ATGGTCAAAG T <210> 467 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M87503 <400> 467 TGATACAGCT AAGACYATGT TCCGGATTCC C <210> 468 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M95627 <400> 468 AGCGAGGTCA CCTTTRCATT GCACTCAGCA T <210> 469 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M95627 <400> 469 CTGCTTACTG ACTACYGGGG CCACACGGCT G <210> 470 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M95627 <400> 470 GCCCTCCCAC CCTTGYCCAG ACCTGGTGGG C <210> 471 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U12595 <400> 471 CCAGGCGAAA CCCAGYCTGG AGCTTGCAGG C <210> 472 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U12595 <400> 472 CTGCCAGAAA TGGAGRTTCA CTTGCAGACC A <210> 473 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U12595 <400> 473 AGAACCGGGA CAAAARTCAT CATCCACCTG A <210> 474 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U12595 <400> 474 GACCCCAAGG ATGTCSGTGA GTGGCAACAT G <210> 475 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U12595 <400> 475 CCGCAGCATC TTCTAYGTGC CCGACATGAA A <210> 476 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U12595 <400> 476 GGTGGACAGT GAGGASATTC CCCTGAACCT C <210> 477 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U12595 <400> 477 TGCTGGACTT GTTGAYGACC CTAGGGCCAT G <210> 478 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U12595 <400> 478 GGGCCATGGT GGGCCRCTTG AATGAGCTGC T <210> 479 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 479 CTAGGGGCTG GGTATYCCCA CATCACTCAT T <210> 480 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 480 GCCCATGTGG AAAGCRCCTG TCTGTTGGAT G <210> 481 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 481 TGGAAAGCAC CTGTCKGTTG GATGATGCTG G <210> 482 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 482 TCTCCTTCAA CAAGGWTCTG CTGACCTGCT G <210> 483 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 483 TTGGGGTGCT GAATARCTTG GCGAATGTCC T <210> 484 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 484 TGCCTCACAG CAGTGMGCAC AAGACTGCCC A <210> 485 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 485 GTGTGGTAGA GCACAYTGGG GCTCCTGAGC C <210> 486 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 486 TCTTCTCTCT TGGTGYGATC AGCTGGCGGA G <210> 487 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 487 ATTCAAACTC AATGAYGCTA CCATGCCTCT C <210> 488 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 488 TGTAAAACTT AGCAAYTTGG GGGACCTCAT T <210> 489 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U15085 <400> 489 TCAGTGTGCC ATAGARGACA GCAACTGGTG A <210> 490 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U28386 <400> 490 ACAGAAATGA GGCGTYGCAG AATAGAGGTC A <210> 491 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U28386 <400> 491 ATGGAGGTGC CATCCSAGCA TTCATTTCTC T <210> 492 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U28386 <400> 492 CAGTTCCTGA TATGTMATCT TTAGCATGTG G <210> 493 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U28386 <400> 493 TGATGATCCA GAAGTRTTAG CAGATACCTG C <210> 494 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U28386 <400> 494 CCCATTCCTT GTCAGYGTTC TCTCTAAGGC A <210> 495 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U28386 <400> 495 GGCTGCTGAG AAACTRGGTG AAACTGAGAA A <210> 496 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U28386 <400> 496 GAGGCTTAGA CAAAAWTGAA GCTCTACAAA A <210> 497 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U30255 <400> 497 AACATGAATG ACCACSGCTT TGTGGTCTGT G <210> 498 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U30255 <400> 498 TGTCTCCAAA GTTGAYGATT TCTTGGCCAA T <210> 499 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U30255 <400> 499 TCTCAAGTTC CAAGAYACCG ATGGCAAACA C <210> 500 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U30255 <400> 500 AAGTTCCAAG ACACCRATGG CAAACACCTG C <210> 501 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U30255 <400> 501 CACCGTGTCA TCCTCRTCAT ACAATGCCTG A <210> 502 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U45328 <400> 502 GGAGTGCGCC ATTCCRGGAA AGAAAGGGAC T <210> 503 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U45328 <400> 503 CTTGTGGCAT CGTCARAAGG AAGGGATTGG T <210> 504 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U45328 <400> 504 GCGGGTGTGC GGTCTSGATT CGCTGAATTG C <210> 505 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U45328 <400> 505 TGTGCGGTCT CGATTSGCTG AATTGCCCGT T <210> 506 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U51127 <400> 506 GGATGAAGCC GATCCRGCCA AGTGGAAGGC C <210> 507 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U51127 <400> 507 ACAGCCCCGA TGAGCWCCTG GCTGGCTGCA G <210> 508 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U51127 <400> 508 TTCCTGGAAG TGGATYTGGG CCAAGAAGGA G <210> 509 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U88964 <400> 509 GAGGGTCCCC AAGGARCATG GCTGGGAGCC G <210> 510 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U88964 <400> 510 GAGTGAGCGC CTCCTRCACA AGAGCATCCA G <210> 511 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X15729 <400> 511 TTTCCCTGCA AATGTSATGG ATGTTATTGC A <210> 512 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X15729 <400> 512 GACAGAATTT CACTGMACCC ACTGCTATTC A <210> 513＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ１５７２９＜４００＞５１３ＣＴＣＡＧＧＧＡＴＧＧＣＣＡＧＫＴＧＣＴＣＴＡ
ＡＧＴＧＧＡＴＴ＜２１０＞５１４＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ１５７２９＜４００＞５１４ＡＴＴＴＧＣＴＴＣＣＴＧＣＣＡＹＴＧＴＣＣＡＣ
ＡＴＣＡＡＴＣＡ＜２１０＞５１５＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ１５７２９＜４００＞５１５ＡＴＴＧＴＧＧＡＴＧＴＧＴＧＴＳＡＴＧＡＣＧＴ
ＡＧＡＡＡＡＧＧ＜２１０＞５１６＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｘ１５７２９＜４００＞５１６ GTCGAAGACA GAGGTKCAGG TCGTTCCAGG G <210> 517 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X56253 <400> 517 GCAGTGAGAG AATCCWGGCA GACAGAAGAA A <210> 518 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X75861 <400> 518 TGCTTTCATG GGCACRGCAA TGATCTTTAC C <210> 519 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X75861 <400> 519 CCTTGTTGAT ACTCARCTCA TTATTGAAAA G <210> 520 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X75861 <400> 520 CTCCCTTTTT TGTCARCCCC ATCTGTAGCC T <210> 521 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X75861 <400> 521 CCCTTCCTTC CTCATYGTTG TTTGGTATGC G <210> 522 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X75861 <400> 522 CCATTGGAAA GAAGTKCAGT GGTCCCATTG T <210> 523 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13900 <400> 523 GAGAGCCATG GCCGCYCTGC GTGTCCTGCT G <210> 524 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13900 <400> 524 TCCTGCTGTC CTGCGYCCGC GGCCCGCTGA G <210> 525 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13900 <400> 525 ACCAGGCCCT GAAGAYCTTC GAGGAGGACC C <210> 526 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13900 <400> 526 CTTCGAGGAG GACCCRGCCG TTGGGGGCAT T <210> 527 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13900 <400> 527 GGAGATGGTC CTCACYGGTG ACGCGATCTC A <210> 528 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13900 <400> 528 CCGTGGTGTG CAGTTYCTCT CCAATTGCTG C <210> 529 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D13900 <400> 529 GGAAAGCGGG GCCTGYGGGT CCTTGTGTCC C <210> 530 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D14812 <400> 530 TGTTTCAGTT TGTTTYCCGT TCTGTTTTAA A <210> 531 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D14812 <400> 531 GTTCCTATCC CTTTGMCACT ACACAATTTT C <210> 532 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D14812 <400> 532 AGGCATTCTA TCTTTSCTCA AATTGTTGAA G <210> 533 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 533 GCTGGCCCGC GGGGCWGTCC AGGCACGCGA G <210> 534 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 534 AAGATTTGGA TGGGAKTGCC ATGGCTTACC T <210> 535 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 535 GGACGATTAC TCATTKTAAT GGAAGCCAGA T <210> 536 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 536 AGAACTGTCA GGAGCRAAGA TCTCAGATCT C <210> 537 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 537 TCTACAATGA GAACAYGGTT AGAGAAAGCC C <210> 538 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 538 AGATAAAAAC AAGTAYGGCA TTCGGCTAAG G <210> 539 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 539 AGATGAAGGA ATGGCKCGGG AAGTCATCAA T <210> 540 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 540 AAGCAAAGTC TGAAGKAACA TATCTGAATA G <210> 541 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 541 TTGAAACCAT ATCCARTTTC TCCATCGGAT A <210> 542 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 542 CAGCTCCTGA ATGCARAGCC ACAAGAGTGT T <210> 543 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 543 GGTGTGTGTA AAATAYGCTG CTTGGATTGA A <210> 544 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D28473 <400> 544 GTCAAGTAAC TTGAGWCCTC ACAGTAATCT T <210> 545 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D32050 <400> 545 TTCAGAAGGG CACAGRTGCC CGACCATACA C <210> 546 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D32050 <400> 546 GGTGCTGGCT GACCAYGCTC GGACCATCAC T <210> 547 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D32050 <400> 547 TCCCGGAGAC ACTGCYTGGC TCCTCTATGA C <210> 548 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D32050 <400> 548 CCAAACAAGG ATGTGSAGAG GGAGATCGCT G <210> 549 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D32050 <400> 549 GTGCCTGTGT CAAGTYCCCC AGAATGCAGC C <210> 550 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D32050 <400> 550 TCGCATCTAT AGATAMCGGC TCTCCAGACC T <210> 551 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 551 GGGAGGCCGG GACAARGCGC CGGTGCAGCC C <210> 552 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 552 CCACAATGCA GAGCAKGAGG CTTGCGACCT G <210> 553 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 553 TGAAGATGTC GAGGAKTATG AGGACCTGAC A <210> 554 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 554 CCTCCTCTTT TGTGARTGGC TTTGTGAATG C <210> 555 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 555 TCCGGAATGA GTGTGWCCCT GCTCTGGCAC T <210> 556 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 556 TGCTCTCAGA CTATGWTCTC CACAACAGCA A <210> 557 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 557 CAGTTTTGCC AACACRCTGG TGGATGTGTG T <210> 558 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 558 AGATATGGGG AGCCTRCACT CCGGAGGGCT G <210> 559 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 559 CGTCTGGCTG CAATGYTGCG CCAGTTAGCT C <210> 560 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 560 ATACAACCCC AGTGTYGTTG GCCCACGGGG A <210> 561 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 561 AGGGGCTCTG AACTGYAGCT GATGTTATCA G <210> 562 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> D78151 <400> 562 GATGTTATCA GCAGGMCATG CATCCTGCTG C <210> 563 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J04611 <400> 563 TGGTTGATGC CTCCARGGCT ATGTTTGAAT C <210> 564 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J04611 <400> 564 GTGATCTCTG TGGGCRTTTA TAATCTGGTC C <210> 565 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J04611 <400> 565 CCTAGCGATA CCAAGMGGTC TCAGATCTAT G <210> 566 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J04611 <400> 566 TACTGCTGAA GAAACRCCAT TACCTGAGGC C <210> 567 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J04611 <400> 567 AAAAGACTGG GCTCCYTGGT GGATGAGTTT A <210> 568 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J04611 <400> 568 TTTAAGGAGC TTGTTYACCC ACCAGATTAC A <210> 569 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> J04611 <400> 569 CGGGCTGAAG AGTGGKCTGA AGAAGCAGGA G <210> 570＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｌ１５１８９＜４００＞５７０ＧＡＧＧＣＴＣＡＴＧＧＧＡＡＡＹＴＧＴＡＴＴＣ
ＴＣＣＧＡＧＴＣ＜２１０＞５７１＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｌ１５１８９＜４００＞５７１ＴＴＧＧＡＧＣＡＴＴＴＧＴＧＴＹＧＡＴＧＡＡＧ
ＡＴＧＡＡＡＧＡ＜２１０＞５７２＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｌ１５１８９＜４００＞５７２ＡＧＧＧＧＴＴＧＡＴＴＴＧＡＣＹＡＡＡＧＡＣＡ
ＡＣＡＴＧＧＣＡ＜２１０＞５７３＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｌ１５１８９＜４００＞５７３ TGCTGAAAAG GCTAARTGTG AACTCTCCTC A <210> 574 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L15189 <400> 574 CCAGTCTTCT GGTGGRTTAA GCAAAGATGA T <210> 575 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L15189 <400> 575 GAAGAGATTT CCAAARTGAG GGAGCTCCTG G <210> 576 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> L15189 <400> 576 CTTCAGCAGG CATCAYTGAA GCTGTTCGAA A <210> 577 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M29877 <400> 577 GGATGAGGTC GCGGCSGGCG GGTCCCGCGC T <210> 578 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M29877 <400> 578 CGACTTCGGA CCGCARTTCA CTGCGCGCTT C <210> 579 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M29877 <400> 579 CAAGTATGTA GTTTTSACGA CAAAGCATCA C <210> 580 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M29877 <400> 580 GCTTCACAAA CTGGCYGAGT CCTGTGTCTT G <210> 581 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M29877 <400> 581 ATAAATTCAA GCCACRGAGC TTGCCAGATC A <210> 582 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M97935 <400> 582 AAGCTTCTTG GTCCTMACGC CAGCCCCGAT G <210> 583 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M97935 <400> 583 AGTCTATTAG CCACARAATT GGGAAAGGAG T <210> 584 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> M97935 <400> 584 TGTATTGCAT TAAATRTAAT ATCGACACAG T <210> 585 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U09587 <400> 585 CCAGCTTGAT AACTAYGGAC AGCAAGAACT T <210> 586 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U09587 <400> 586 AGAAATTGAG CACTTYGTAG ATCCCAGTGA G <210> 587 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U09587 <400> 587 GAAATGGAGA TGCTGSTGAA TGAGAAAGGG G <210> 588 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U09587 <400> 588 CTGCTGAATG AGAAARGGGA ATTCACAATT G <210> 589 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U09587 <400> 589 TTTCCCTGCT GTAGTYGCTC CATTCAAATG T <210> 590 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U09587 <400> 590 CATTCAAATG TTCCGYCCTC CCACTGAGCC A <210> 591 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U09587 <400> 591 CAATGGCAAC ATCACRTGGG CTGATGTGGA G <210> 592 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U41371 <400> 592 GAGCTTCAGG CCAAGKTGGC AGAGATCGGA G <210> 593 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U41371 <400> 593 AGGATCTTTG AGGCTKTTAA GCTCACTGAT G <210> 594 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U54778 <400> 594 TGAGACTGAG CTAAARTTAA TCTGTTGTGA C <210> 595 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U54778 <400> 595 TTTTTCAGCA TTACTRTGTC GTCTCCGTGC C <210> 596 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U54778 <400> 596 AAGCCATTAG ACTTAYAGGT GATGCAAGCA T <210> 597 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U54778 <400> 597 ACACTATAGA GGCATRAGTG GTATCAGTTT T <210> 598 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U54778 <400> 598 TAATTGGGTG TTAGCYTGAG ATGGTTAAAG G <210> 599 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U54778 <400> 599 ACAGATACAG AATCTKTATT GTTCTTACTG A <210> 600 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57650 <400> 600 GAGCCTCTCC GAGACRTTGT TCCAGCGACT G <210> 601 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57650 <400> 601 GACAAGCCTG TTGTCRTCCA TTGAAGACAA G <210> 602＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ５７６５０＜４００＞６０２ＧＡＡＡＡＴＣＣＴＧＣＡＧＣＴＳＡＴＴＡＡＧＴ
ＣＡＣＡＧＡＡＡ＜２１０＞６０３＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ５７６５０＜４００＞６０３ＴＣＣＣＡＧＧＡＣＡＣＡＧＧＡＲＴＣＡＡＧＧＣ
ＣＣＡＧＴＧＡＣ＜２１０＞６０４＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ５７６５０＜４００＞６０４ＡＡＣＡＣＣＧＡＧＣＴＣＣＣＧＹＡＴＣＡＣＧＧ
ＣＡＡＧＣＡＣＣ＜２１０＞６０５＜２１１＞３１＜２１２＞ＤＮＡ＜２１３＞ｕｎｋｎｏｗｎ＜３０８＞Ｕ５７６５０＜４００＞６０５ CCATGCAGTG AAGCCYTCAG TGAGCTGCCA C <210> 606 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57650 <400> 606 TCTGGGTCCC CAGCTYGCTC TTGGTACTTG G <210> 607 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57650 <400> 607 GGGACCCCAG TGCCTYGTTG AGGGCGCCAT T <210> 608 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57650 <400> 608 GATCGAACAC TCATGRTGTG CCAAGTGCTG T <210> 609 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U57650 <400> 609 GCTTTAGCTA AAGTCYCGCG GGTTCCGGCA T <210> 610 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U80040 <400> 610 GAACCGGCCG CTGACMCTCT CGGAGAAGAT T <210> 611 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U80040 <400> 611 GGGATCCCCT GGGAGYTGAA GTGCCCCAAG G <210> 612 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U80040 <400> 612 AATCTGCAAC ATGGGYGCAG AAATTGGGGC C <210> 613 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U80040 <400> 613 CCAACAACCT GCTCAYTGGT GCCATCAACA T <210> 614 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U80040 <400> 614 GATTCTAGAG AACCTKTTGT TCTTGCAAGG A <210> 615 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U83843 <400> 615 ATTCTGAAAC TTCTTSATGT TGTCCATCCT G <210> 616 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U83843 <400> 616 TGAGGATTAT CAGGCRATTG TTGATGCTGA G <210> 617 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U83843 <400> 617 GGCAATTGTT GATGCYGAGT GGAACATTCT C <210> 618 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U83843 <400> 618 GGATCTGAAG AGGACRATGA TGGCCTGTGG A <210> 619 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U83843 <400> 619 GGAGACAGAG CGGTCYCTGC ATGATGCCAT C <210> 620 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> U91932 <400> 620 AGTGCCCACC CGGTCSGCCC GGCACAGCCA T <210> 621 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X54942 <400> 621 TGAGAAATGT ACAAAYCTTT CATCCATACC T <210> 622 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X54942 <400> 622 AGAAATGTAC AAATCYTTCA TCCATACCTG T <210> 623 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59417 <400> 623 TTTAAAGTAG TGCTTSTACC AACATGTCCC G <210> 624 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59417 <400> 624 AAGGCCCTCA GGTATRTAAG TGTGATCCTG C <210> 625 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59417 <400> 625 TGATTGGACA TTTGARCAGA CAGTGGAAAC T <210> 626 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X59417 <400> 626 AGTTGAAAAT CCTAARTTCA GGATTCTTAC A <210> 627 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X64364 <400> 627 AGCCTCCGGG GCTGCYGGCA CAGTCTTCAC T <210> 628 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X64364 <400> 628 GTTCAAGGTG GACTCSGACG ACCAGTGGGG A <210> 629 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X64364 <400> 629 TCCCAGAGTG AAGGCYGTGA AGTCGTCAGA A <210> 630 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X64364 <400> 630 GACGCTCCCT GCTCCRCGTC TGCGCCGCCG C <210> 631 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X64364 <400> 631 ACCGAGGGCG ACCCCRTCAC AGCCTCAAGT C <210> 632 <211> 31 <212> DNA <213> unknown <308> X64364 <400> 632 GGACGGCCGG CTCTCYATAG CACCAGGGCT C

【図面の簡単な説明】

【図１Ａ】本発明を実施するために適切なコンピュータ
ーシステムのブロック図である。

【図１Ｂ】コンピューターシステム１０の、遠隔コンピ
ューター４８、５０、および５２への相互接続、ならび
に遠隔サーバー４８、５０、および５２を相互接続する
ネットワーク５４を示す図である。

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者ジャネットワーリントンアメリカ合衆国カリフォルニア 94024, ロスアルトス，クリスティーナドライブ 1656 (72)発明者ニラパティルアメリカ合衆国カリフォルニア 94062, ウッドサイド，ダブリュー．カリフォルニアウェイ 780

Claims

【特許請求の範囲】

【請求項１】表１において示されるフラグメントから
選択される１０〜１００の連続する塩基の核酸セグメン
トであって、多型部位もしくは直接隣接する塩基、また
は該セグメントの相補体を含む、セグメント。
【請求項２】ＤＮＡである、請求項１に記載のセグメ
ント。
【請求項３】ＲＮＡである、請求項１に記載のセグメ
ント。
【請求項４】５０塩基未満である、請求項１に記載の
セグメント。
【請求項５】２０塩基未満である、請求項１に記載の
セグメント。
【請求項６】前記フラグメントがＤ４２０４３であ
り、多型部位が１４７０位である、請求項１に記載のセ
グメント。
【請求項７】前記多型部位が二重対立遺伝子である、
請求項１に記載のセグメント。
【請求項８】前記多型部位を占める多型形態が、表１
の第３列に列挙されるフラグメントについての参照塩基
である、請求項１に記載のセグメント。
【請求項９】前記多型部位を占める多型形態が、表１
の第５列において列挙されるフラグメントの代替の形態
である、請求項１に記載のセグメント。
【請求項１０】表１の第８列において示されるフラグ
メントのセグメントまたはその相補体にハイブリダイズ
する、対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチド。
【請求項１１】プローブである、請求項１０に記載の
対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチド。
【請求項１２】請求項１０に記載の対立遺伝子特異的
オリゴヌクレオチドであって、該プローブの中心位置
が、前記フラグメントの多型部位と整列する、オリゴヌ
クレオチド。
【請求項１３】プライマーである、請求項１０に記載
の対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチド。
【請求項１４】請求項１３に記載の対立遺伝子特異的
オリゴヌクレオチドであって、前記プライマーの３’末
端が、前記フラグメントの多型部位または直接隣接する
塩基と整列する、オリゴヌクレオチド。
【請求項１５】表１の第８列の配列またはその相補体
を含む、単離された核酸であって、該配列または相補体
内の多型部位が、表１の第３列において示される参照塩
基とは異なる塩基で占められる、核酸。
【請求項１６】核酸を分析する方法であって：個体か
ら該核酸を得る工程；および表１において示される多型
部位のいずれか１つを占める塩基を決定する工程、を包
含する、方法。
【請求項１７】前記決定する工程が、表１において示
される多型部位のセットを占める塩基のセットを決定す
る工程を包含する、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】請求項１６に記載の方法であって、こ
こで前記核酸は多数の個体から得られ、そして多型位置
のうちの１つを占める塩基は該個体のそれぞれにおいて
決定され、そして該方法は、疾患表現型の存在について
各個体を試験する工程、および該疾患表現型の存在と該
塩基との相関付けをする工程をさらに包含する、方法。
【請求項１９】ＤＮＡである、請求項１５に記載の核
酸。
【請求項２０】ＲＮＡである、請求項１５に記載の核
酸。
【請求項２１】５０塩基未満である、請求項１５に記
載の核酸。
【請求項２２】２０塩基未満である、請求項１５に記
載の核酸。
【請求項２３】前記フラグメントがＡＦ００５０５８
であり、前記多型部位が３５８３位である、請求項１５
に記載の核酸。
【請求項２４】前記多型部位が二重対立遺伝子であ
る、請求項１５に記載の核酸。
【請求項２５】前記多型部位を占める塩基が、表１の
第３列において列挙されるフラグメントについて相関す
る塩基である、請求項１５に記載の核酸。
【請求項２６】前記多型部位を占める塩基が、表１の
第５列において列挙されるフラグメントについて相関す
る塩基である、請求項１５に記載の核酸。
【請求項２７】前記フラグメントが、表１の配列番号
１〜１０から選択される、請求項１に記載のセグメン
ト。
【請求項２８】前記フラグメントが、表１の配列番号
１１〜２０から選択される、請求項１に記載のセグメン
ト。
【請求項２９】前記フラグメントが、表１の配列番号
２１〜３０から選択される、請求項１に記載のセグメン
ト。
【請求項３０】前記フラグメントが、表１の配列番号
３１〜４０から選択される、請求項１に記載のセグメン
ト。
【請求項３１】前記フラグメントが、表１の配列番号
４１〜５０から選択される、請求項１に記載のセグメン
ト。
【請求項３２】前記フラグメントが、表１の配列番号
５１〜６０から選択される、請求項１に記載のセグメン
ト。
【請求項３３】前記フラグメントが、表１の配列番号
６１〜７０から選択される、請求項１に記載のセグメン
ト。
【請求項３４】前記フラグメントが、表１の配列番号
７１〜８０から選択される、請求項１に記載のセグメン
ト。
【請求項３５】前記フラグメントが、表１の配列番号
８１〜９０から選択される、請求項１に記載のセグメン
ト。
【請求項３６】前記フラグメントが、表１の配列番号
９１〜１００から選択される、請求項１に記載のセグメ
ント。
【請求項３７】前記フラグメントが、表１の配列番号
１０１〜１１０から選択される、請求項１に記載のセグ
メント。
【請求項３８】前記フラグメントが、表１の配列番号
１１１〜１２０から選択される、請求項１に記載のセグ
メント。
【請求項３９】前記フラグメントが、表１の配列番号
１２１〜１３０から選択される、請求項１に記載のセグ
メント。
【請求項４０】前記フラグメントが、表１の配列番号
１３１〜１４０から選択される、請求項１に記載のセグ
メント。
【請求項４１】前記フラグメントが、表１の配列番号
１４１〜１５０から選択される、請求項１に記載のセグ
メント。
【請求項４２】前記フラグメントが、表１の配列番号
１５１〜１５８から選択される、請求項１に記載のセグ
メント。
【請求項４３】前記フラグメントが、表１の配列番号
１〜１０から選択される、請求項１５に記載の核酸。
【請求項４４】前記フラグメントが、表１の配列番号
１１〜２０から選択される、請求項１５に記載の核酸。
【請求項４５】前記フラグメントが、表１の配列番号
２１〜３０から選択される、請求項１５に記載の核酸。
【請求項４６】前記フラグメントが、表１の配列番号
３１〜４０から選択される、請求項１５に記載の核酸。
【請求項４７】前記フラグメントが、表１の配列番号
４１〜５０から選択される、請求項１５に記載の核酸。
【請求項４８】前記フラグメントが、表１の配列番号
５１〜６０から選択される、請求項１５に記載の核酸。
【請求項４９】前記フラグメントが、表１の配列番号
６１〜７０から選択される、請求項１５に記載の核酸。
【請求項５０】前記フラグメントが、表１の配列番号
７１〜８０から選択される、請求項１５に記載の核酸。
【請求項５１】前記フラグメントが、表１の配列番号
８１〜９０から選択される、請求項１５に記載の核酸。
【請求項５２】前記フラグメントが、表１の配列番号
９１〜１００から選択される、請求項１５に記載の核
酸。
【請求項５３】前記フラグメントが、表１の配列番号
１０１〜１１０から選択される、請求項１５に記載の核
酸。
【請求項５４】前記フラグメントが、表１の配列番号
１１１〜１２０から選択される、請求項１５に記載の核
酸。
【請求項５５】前記フラグメントが、表１の配列番号
１２１〜１３０から選択される、請求項１５に記載の核
酸。
【請求項５６】前記フラグメントが、表１の配列番号
１３１〜１４０から選択される、請求項１５に記載の核
酸。
【請求項５７】前記フラグメントが、表１の配列番号
１４１〜１５０から選択される、請求項１５に記載の核
酸。
【請求項５８】前記フラグメントが、表１の配列番号
１５１〜１５８から選択される、請求項１５に記載の核
酸。