JP2000139481A - ヌクレオシド一リン酸合成用の昆虫細胞由来のデオキシヌクレオシドキナ―ゼ - Google Patents
ヌクレオシド一リン酸合成用の昆虫細胞由来のデオキシヌクレオシドキナ―ゼInfo
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Abstract
組換えキナーゼを提供する。 【解決手段】 ヌクレオシド一リン酸の合成中に、安定
化SH試薬を加えることなく、タンパク質を安定化するこ
となく安定であり、そして4種の天然デオキシヌクレオ
シド全てを受け入れる、昆虫細胞、例えばDrosophila M
elanogasterなどから取得可能な組換えキナーゼ。DNA配
列、ベクター、形質転換細胞、前記組換えキナーゼの製
造方法ならびにヌクレオシド一リン酸の調製に対するそ
の使用。
Description
ド一リン酸の合成中に、安定化SH試薬を添加することな
く、タンパク質および界面活性剤を安定化することなく
安定であり、そして4つの天然デオキシヌクレオシド全
てを受け入れる、例えば、Drosophila Melanogasterの
ような昆虫細胞由来の組換えキナーゼである。本発明の
さらなる主題は、本発明のキナーゼをコードするDNA配
列、ならびに本発明のキナーゼの調製方法およびヌクレ
オシド一リン酸の合成中におけるその使用である。
オキシ)−ヌクレオシドキナーゼは、それぞれ、ヌクレ
オシドまたはデオキシヌクレオシドの対応するヌクレオ
チド一リン酸へのリン酸化を触媒するものであり、よっ
てヌクレオチド代謝の「再利用経路」において重要な役
割を果たす。
応用の試薬として大いに用いられているデオキシヌクレ
オシド三リン酸の出発物質である。
3つの方法: 1.魚精子の加水分解 2.デオキシヌクレオシドからの化学合成 3.デオキシヌクレオシドからの酵素合成 により得ることができる。
る。例えば、魚精子の加水分解では、4つの一リン酸エ
ステル全てがほぼ同量ずつ製造される。このため、市場
の要求を捉え損ねているのは事実である(例えば、部分
的にd-TTPの代わりに用いられるd-UTPはd-CTPから調製
される)。さらに、加水分解から得られるd-TTPは、約
2%のd-UTPが混入しており、実質的に単離することが
できない。
観点(GMP)から重大であるものと評価されなければな
らない。また、魚精子由来の一リン酸エステルの市場は
かなり限定される。
製による単離が困難ないくつかの副生物が製造される。
さらに、いくつかの塩基(例えばグアノシン)には合成
時間をかなり増大させるリン酸化の前に保護基を付与し
なければならない。
当技術分野の現状の欠点は、デオキシヌクレオシド一リ
ン酸の合成中に、安定化SH試薬を添加することなく、タ
ンパク質および界面活性剤を安定化することなく安定で
あり、4つの天然デオキシヌクレオチド:チミジン(dT
hd)、デオキシシチジン(dCyd)、デオキシアデノシン
(dAdo)およびデオキシグアノシン(dGuo)全てを受け
入れる、特にDrosophila melanogaster(Dm-dNK)など
の昆虫細胞由来の組換え多機能デオキシヌクレオシドキ
ナーゼの提供により克服された。本発明においては、安
定とは、触媒された反応の収率が37℃にて5時間以内、
好ましくは10時間以内、特に好ましくは12時間以内に減
少しないことを意味する。酵素がチオールを含む安定剤
を添加することなくそのように長時間安定であることは
驚くべきことである。今までその他のキナーゼにおいて
はこの安定性は観察されていない(1〜9)。合成にお
いて本発明のキナーゼを用いる場合、これらの安定剤を
省略することによって合成はより安価なものとなり、と
りわけ生成物の精製が非常に簡略化され得る。
基質特異性を有する。その結果、個々のヌクレオシドの
合成に対して、対応する特異的キナーゼを有することも
必要ない。ジデオキシヌクレオシドまたは塩基−もしく
は糖ー修飾ヌクレオシドのような修飾ヌクレオシド類似
体の合成に対しては特異性が低いことが特に都合がよ
い。塩基−修飾ヌクレオシドは、例えば、塩基がレポー
ター基(染料、ジゴキシゲニン、ビオチン)で標識され
た7-デアザ-ヌクレオシド、C-ヌクレオシドおよびヌク
レオチドである。糖−修飾ヌクレオシドは、例えば、ア
ザチミジン、アラビノシル−チミジンである。公知の類
似の酵素と比較したDrosophilaキナーゼの速度定数を図
1に示す。本発明のキナーゼの特異的活性kcは、従来公
知のキナーゼのものよりも数倍大きい。酵素の活性は、
参考文献:Munch-Petersonら(1991)J. Biol. Chem. 26
6, 9032-9038に記載されたようにして測定した。このこ
とにより、dNMPを合成するのに必要な酵素の量はかなり
低くなる(3.5〜14000倍、図1のKc値参照)。本発明の
キナーゼの特異性定数(kc/KM)は、いくつかの能力に
より従来公知のものを超えるものであり、拡散定数の範
囲にある。このことにより、キナーゼをd-NMP合成に加
える場合、完全な収率が得られる。それらは従来公知の
キナーゼの2〜6500倍高い(図1参照)。
都合がよい60℃でも安定である。好ましくは、本発明の
酵素は、T=37℃で、5mM MgCl2 を含むトリス緩衝液中
においてt1/2 ≧50時間、水中においてt1/2 ≧25時間の
半減期を有するものであり、全ての天然デオキシヌクレ
オシドを受け入れる(実施例6)。
動物生物、特にDrosophilaキナーゼの特性に匹敵する特
性を示す六脚類クラスのその他の動物種由来のキナーゼ
である。特に、上記の安定性および上記の基質特異性を
本質的に有するキナーゼである。好ましいキナーゼは、
有翅類のサブクラスから単離されたキナーゼであり、特
に好ましいのは双翅類クラス由来のものであり、Drosop
hilidaeファミリー由来のものが特に好ましい。
ゼをコードするDNA配列ならびにその機能的断片であ
る。本発明のDNA配列は、以下に示す配列: GGGAAGTGGCAGGAGTAGCTCCCG(配列番号2) CTCCCGTTGTAGCCGTCGCCCTTCTGG(配列番号3) GACGACTGGCTCGGGCAGCTCTTCACCGCGTTG(配列番号4) TTCGATTTTTATTACCTCGCGAGGTAA(配列番号5) AGGTAAAAATCGCGAGCGATAACGAAGCAC(配列番号6) CACCGCATGCTTGCGTAGGCCGTCGCCCGAGCAAGACTCCTC(配列番
号7) GACTACATGTTTCTAGGGTTCTTCACC(配列番号8) を有するプライマーが本発明のキナーゼのDNA配列上に
ハイブリダイズするという特徴を有する。
配列番号2、3、5、7および8または配列番号2、
4、5、7および8または配列番号2、5、6、7およ
び8を有するオリゴヌクレオチドをハイブリダイズする
そのようなキナーゼおよびDNA配列でもある。
がよい: −ハイブリダイゼーション:0.75M NaCl、0.15トリス、
10mM EDTA、0.1%リン酸ナトリウム、0.1%SLS、0.03%
BSA、0.03% Ficoll 400、0.03%PVPおよび100μd/ml
煮沸子ウシ胸腺DNA、50℃にて約12時間。 −洗浄:0.1×SET、0.1%SDS、0.1%リン酸ナトリウム
および0.1Mリン酸緩衝液で45℃にて3×30分。
に示す。本発明のDNA配列は、下記の手順によってDroso
phila Melanogasterから取得可能である:
ドする推定遺伝子を含有する1.1kbpのcDNAインサートを
含むpBluescript SK +/-ファージミドは、Berkeley Dro
sophilaゲノム配列決定プロジェクト(クローンLD1598
3)から得た。ファージミドの多重クローニング部位(M
CS)にEcoRIおよびXhoIによりクローニングされた1.1kb
pのcDNAの5'末端の最初の600塩基対は、カリフォルニア
大学(バークリー)のHarveyらによって既に配列決定さ
れている。これらの配列情報に基づいて、新規プライマ
ーを設計した(インサートの完全配列決定を可能にする
Dm-TK1およびDm-TK2/5'-TCCCAATCTCACGTGCAGATC-3'(配
列番号9)および5'-TTCATCGAAGAGTCCATTCAC-3'(配列番
号10))。Dm-TK1は、推定翻訳開始領域の上流に結合
する21bpのセンスプライマーである。Dm-TK2は、既に配
列決定されているcDNA部分の3'領域の21bpのセンスプラ
イマーとして設計した。
アミノ酸を有するタンパク質をコードするオープンリー
ディングフレームを同定することができた。DNA配列、
配列番号1を図5に示す。このタンパク質の分子量の計
算値は29kDaであり、したがって天然Dm-dNKについて分
子量は約30kDaであるとするMunch-Petersonら(1998
年)によってに示されたデータと一致する。
る構造遺伝子はpBluescript SK +/-ファージミドの1.1k
b cDNAインサートから「ポリメラーゼ連鎖反応」技法
(PCR)によって単離することができる(Mullis, K.B.
およびFaloona, F.A., Methodsin Enzymol. 155(1987)3
35-350)。このために、適切な発現プラスミドへのその
後の挿入の対応するエンドヌクレアーゼ制限部位を有す
る特異的プライマー対(5'-GCGCGAATTCATGGCGGAGGCAGCA
TCCTGTGC-3'(配列番号11)および5'-GCGCAAGCTTATTATC
TGGCGACCCTCTGGC-3'(配列番号12))を合成した。例え
ば、5'−プライマー(Dm-dNK3)はコード配列の上流にE
coRIエンドヌクレアーゼ制限部位を有するが、3'-プラ
イマー(Dm-dNK4)はコード配列の下流にHindIIIエンド
ヌクレアーゼ制限部位を含む。さらに、3'-プライマー
はコード配列の下流に翻訳を安全に終結させるための2
個の終結コドンを含む。さらに、E.coliにおける翻訳開
始のために最適化された適当なプライマーは以下の配
列: 配列番号13(Dm-dNK3) 5'-CGCGAATTCATGGCGGAAGCGGCGAGCTGCGCGCGTAAGGGGACC-
3' 配列番号14(Dm-dNK4) 5'-CGCAAGCTTATTAACGGGCGACCCTCTGGC-3' を有する。
子のクローニング PCR調製物をアガロースゲルに加えて、そのアガロース
ゲルから750bpの構造遺伝子を単離した。PCR断片をEcoR
IおよびHindIII制限エンドヌクレアーゼを用いて37℃で
1時間切断した。同時に、pUC18プラスミドをEcoRIおよ
びHindIII制限エンドヌクレアーゼを用いて37℃で1時
間切断し、次いで調製物をアガロースゲル電気泳動によ
って分離し、2635bpのベクター断片を単離した。その
後、PCR断片およびベクター断片をT4-DNA-リガーゼによ
りライゲートした。次いで、1μl(20ng)のベクター
断片および3μl(100ng)のPCR断片、1μlの10×リガ
ーゼ緩衝液(Maniatisら, 1989 Molecular cloning, a
Laboratory manual, Sambrok, Fritsch, Maniatis, Boo
k 3, Section B27; Munch-Peterson(1991) J. Biol.Che
m. 266, 9032)、1μlのT4-DNA-リガーゼ、二回蒸留し
た(bidist.)4μlの無菌H2O をピペットで加え、注意深
く混合して16℃で一晩インキュベートした。クローニン
グされた遺伝子を制限分析および配列決定によってチェ
ックした。
ての構造遺伝子のクローニング Dm-dNKの発現のために、構造遺伝子を適当なプロモータ
ー、好ましくは誘導プロモーター、特に好ましくはlac
-、lacUV5-、tac-またはT5プロモーターの調節下で右方
向に挿入するという方法で構造遺伝子を適切な発現ベク
ターにクローニングした。好ましい発現ベクターは、la
c-もしくはlacUV5プロモーターを有するpUCプラスミド
またはpKKプラスミドである。
いてのプラスミドpUC18からEcoRIおよびHindIIIによっ
て切り出し、制限調製物をアガロース電気泳動により分
離し、約750bpの断片をアガロースゲルから単離した。
同時に、発現ベクターをEcoRIおよびHindIIIで切断し、
制限調製物をアガロースゲル電気泳動により分離し、得
られたベクター断片をアガロースゲルから単離した。得
られた断片を記載されたようにしてライゲートした。遺
伝子が適切に挿入されていることは制限分析および配列
決定によって確認した。
クターである。pKKT5が特に好ましい。発現ベクターpKK
T5は、pKK177-3(Kopetzkiら, 1989, Mol. Gen. Genet.
216:149-155)から、tac-プロモーターをプラスミドpD
S(Bujardら, 1987, Methods Enzymol. 155:416-433)
から誘導されたT5-プロモーターと交換することによっ
て得られる。EcoRI-エンドヌクレアーゼ制限部位をT5-
プロモーターの配列から点突然変異により除去した。
の形質転換 種々のE.coli株のコンピテント細胞をHanahanの方法
(J. Mol. Biol. 166(1983) pp.557)にしたがって調製
した。得られた細胞200μlを単離したプラスミドDNA
(発現ベクター)20ngと混合した。30分間氷上でインキ
ュベートした後、熱ショック(42℃で90秒)を行った。
その後、細胞を1mlのLB-培地に移し、37℃にて1時間
表現型発現のためにインキュベートした。この形質転換
調製物のアリコートを選択マーカーとしてアンピシリン
を含むLBプレート上に加え、37℃で15時間インキュベー
トした。
1、JM105、NM522、UT5600、TG1、RR1ΔM15、E.coli HB1
01、E.coli Bである。
mlのLbamp 培地中でインキュベートし、37℃でシェーカ
ー内でインキュベートした。550nmにおける吸光度0.5で
細胞を1mM IPTGを用いて誘導し、37℃で4時間シェーカ
ー内でインキュベートした。続いて、個々の発現クロー
ンの吸光度を測定し、OD550 が3/mlであるアリコートを
採取し、細胞を遠心分離した(6000rpm、4℃で10分
間)。細胞を400μlのTE緩衝液(50mM TRIS/50mM EDT
A、pH8.0)に再懸濁し、超音波により解離させ、遠心分
離(14000rpm、4℃にて10分間)により可溶性タンパク
質画分を不溶性タンパク質画分から分離した。SDSおよ
びβ-メルカプトエタノールを含有する緩衝液を全ての
画分に加え、タンパク質を煮沸(100℃にて5分間)によ
り変性させた。その後、それぞれ10μlずつを15%分析S
DSゲルにより分析した(Laemmli U.K.(1970) Nature 22
7:555-557)。
ゼを用いる酵素的リン酸化によるヌクレオシド一リン酸
の合成 −リン酸基ドナーとしてのヌクレオチド三リン酸の触媒
量での使用 −再生系(CK/CP; PK/PEP;アセチルリン酸/アシルキナ
ーゼ、ピロリン酸/ピロホスホリラーゼ)によるリン酸
基ドナーのin situ再生によってより詳細に特徴付けら
れるヌクレオシド一リン酸の製造方法である。
もともとのヌクレオシド一リン酸、デオキシヌクレオシ
ド一リン酸、ジデオキシヌクレオシド一リン酸ならびに
その他の糖−および塩基−修飾ヌクレオシド一リン酸が
適用可能である。
リン酸の合成における本発明のキナーゼの使用である。
Biotec)で形質転換した。そのDmキナーゼの構造遺伝子
はCaCl2 法によってクローニングした(Sambrook, Mole
cular cloning,第二版, Cold Spring Harbor Laborator
y press)。形質転換コロニーを、50μg/mlのアンピシ
リンを含む100mlのLB培地(10mgのトリプトン、5mgの
酵母抽出物、8mgのNaCl/l)に37℃にて一晩懸濁した。
翌日、培養物をLB培地1lでOD 0.6に調節し、100μl I
PTGにより発現を誘導した。一晩25℃の培養温度に維持
し、細胞を遠心分離により集めた。細胞を100mlの緩衝
液A(20mMのリン酸カリウム(pH7.5)、5mMのMgC
l2 、1mMのDTT、10%のグリセリン、1%のトリトンX1
00および0.1mMのフェニルスルホニルフロリド)に再懸
濁した。混合物をフレンチプレスで粉砕した。ホモジナ
イズした物質を遠心分離(20000rpm/15分)し、1μmの
Whatmanガラスマイクロフィルターおよび0.45μmの酢酸
セルロースフィルターで濾過した。
5mm)にかけ、該カラムは10カラム容の緩衝液B(140mM
のNaCl、2.7mMのKCl、10mMのNa2HPO4 、1.8mMのKH2P
O4 、1mMのDTT、10%グリセロール、1%トリトンX10
0、0.1mMのフェニルスルホニルフロリド、5mMのベンズ
アミジン、50mMのアミノカプロン酸)で平衡化しておい
た。カラムを50床容の緩衝液Bおよび10容の緩衝液C
(140mM NaCl、2.7mM KCl、10mM NaH2PO4、1.8mM KH2PO
4 )で洗浄し、その後融合タンパク質を、400Uのトロン
ビンを含む1カラム容の緩衝液Cの2時間にわたる再循
環によって分離させた。次いで、Dm-ヌクレオシドキナ
ーゼを3カラム容の緩衝液Cで溶出した。
成の比較 d-Cyt 22mg トリス緩衝液pH8.0 2ml MgAc 10mg ATP 66mg d-NK 0.132U DTT 7mg/0mg
り測定する。反応は、DTTを添加しない場合の調製では
それほど遅くはなく、特に45時間後でも終結していない
(図2参照)。
は80%以上であり、チオールは加える必要はない。トリ
ス緩衝液の添加は必ずしも必要ない(図3参照)。
いにもかかわらず酵素は依然として活性である。収率は
ほんの触媒量のATPを用いたにもかかわらず80%である
(図4参照)。
ヌクレオシドに加える。次いで、50Uのクレアチンキナ
ーゼおよび0.32Uのd-NKを加える。
た。Dm-ヌクレオシドキナーゼは広範な最適温度を有
し、最高は60℃である(図6参照)。活性試験は参考文
献No.14に記載されている。
ーゼの活性を測定した。50mMトリスpH7.5+2.5mM MgCl
2 中で37℃にて種々の時間インキュベーションした後、
残留活性を測定した。
安定であるが、天然キナーゼの活性は50分以内に<20%
に減少する。2.5mg/mlのBSAを加えることにより、天然
キナーゼは同様に安定である(図7(A)および7(B))。
半減期は50時間であり、MgCl2 を加えない場合31時間で
あり、純水においては28時間である。天然Dm-キナーゼ
は同一条件下で半減期が<12分である。
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d-CMPの生成を示す。
のd-AMP、グアノシンからのd-GMPの生成を示す。
d-CMPの生成を示す。
最適温度を示す。
た組換えDm-ヌクレオシドキナーゼの安定性を示す。(A)
はBSAを添加することなく測定したものであり、(B)はBS
Aを添加して測定したものである。
Claims (14)
- 【請求項1】 ヌクレオシド一リン酸の合成中に、安定
化SH試薬を加えることなく、タンパク質を安定化するこ
となく安定であり、そして4種の天然デオキシヌクレオ
シド全てを受け入れる、非脊椎動物生物の細胞から取得
可能な組換えキナーゼ。 - 【請求項2】 昆虫細胞から取得可能な請求項1に記載
の組換えキナーゼ。 - 【請求項3】 4種の天然デオキシヌクレオシド全てに
対して少なくとも20U/mg(1U=1μmol/分)の特異的活
性を示す精製状態にある請求項1または2に記載の組換
えキナーゼ。 - 【請求項4】 全ての天然デオキシヌクレオシドに対し
て>10000M-1s-1の特異性定数kc/Km を示す、請求項1
〜3のいずれか1項に記載の組換えキナーゼ。 - 【請求項5】 キナーゼが、37℃において、5mM MgCl2
を含むトリス緩衝液中でt1/2 ≧50時間、水中でt1/2 ≧
25時間の半減期を有するものである、請求項1〜4のい
ずれか1項に記載の組換えキナーゼ。 - 【請求項6】 40〜60℃の広範な最適温度を示す、請求
項1〜5のいずれか1項に記載の組換えキナーゼ。 - 【請求項7】 Drosophila Melanogasterから取得可能
な請求項1〜6のいずれか1項に記載の組換えキナー
ゼ。 - 【請求項8】 請求項1〜7のいずれか1項に記載のDr
osophila Melanogaster由来のキナーゼをコードするDNA
配列。 - 【請求項9】 配列番号2〜8の配列がそのDNA配列上
にハイブリダイズするものである、請求項8に記載のDN
A配列。 - 【請求項10】 請求項8または9に記載のDNA配列お
よびプロモーターを含むベクター。 - 【請求項11】 請求項10に記載のベクターで形質転
換された宿主。 - 【請求項12】 請求項1〜7のいずれか1項に記載の
組換えキナーゼの製造方法であって、下記工程: 1)Dm-dNKのコード配列を単離すること、 2)誘導プロモーターを有するE.coli用の好ましい発現
ベクターに構造遺伝子をクローニングすること、 3)好ましいE.coli宿主株における発現ベクターを形質
転換すること、および 4)適切な誘導によってE.coliにおいてDm-dNK遺伝子を
発現させること を行うものである、前記製造方法。 - 【請求項13】 ヌクレオシド一リン酸の合成に対す
る、請求項1〜7のいずれか1項に記載のDrosophila M
elanogasterから取得可能な組換えキナーゼの使用。 - 【請求項14】 請求項1〜7のいずれか1項に記載の
組換えキナーゼがヌクレオシドのリン酸化に使用される
ものである、ヌクレオシド一リン酸の製造方法。
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