HU228496B1 - Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof - Google Patents

Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof Download PDF

Info

Publication number
HU228496B1
HU228496B1 HU9800094A HUP9800094A HU228496B1 HU 228496 B1 HU228496 B1 HU 228496B1 HU 9800094 A HU9800094 A HU 9800094A HU P9800094 A HUP9800094 A HU P9800094A HU 228496 B1 HU228496 B1 HU 228496B1
Authority
HU
Hungary
Prior art keywords
ser
thr
lys
gly
asp
Prior art date
Application number
HU9800094A
Other languages
English (en)
Inventor
Alain Milon
Rycke Jean De
Original Assignee
Envt Toulouse
Agronomique Inst Nat Rech
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Envt Toulouse, Agronomique Inst Nat Rech filed Critical Envt Toulouse
Publication of HU9800094D0 publication Critical patent/HU9800094D0/hu
Publication of HUP9800094A2 publication Critical patent/HUP9800094A2/hu
Publication of HUP9800094A3 publication Critical patent/HUP9800094A3/hu
Publication of HU228496B1 publication Critical patent/HU228496B1/hu

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/02Bacterial antigens
    • A61K39/025Enterobacteriales, e.g. Enterobacter
    • A61K39/0258Escherichia
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20Bacteria; Culture media therefor
    • C12N1/205Bacterial isolates
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/54Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the route of administration
    • A61K2039/541Mucosal route
    • A61K2039/542Mucosal route oral/gastrointestinal
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12RINDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/01Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
    • C12R2001/185Escherichia
    • C12R2001/19Escherichia coli
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Description

A találmány tárgyát új, nem-patogén. £. coli mutánsok képezik# amelyek különösen alkalmasak fiatal nyulakban coiibacillozist megelőző vakcinák előállítására.
A találmány tárgyát képezi továbbá a találmány szerinti mutánsok alkalmazása vakcinák előállítására.# valamint a. találmány szerinti mutánsokat tartalmasó vakcinák.
A fiatal# elválasztott nyulak hasmenésének fő oka a colibacillózís. 'Ez a betegség fontos halál-okot jelent a tenyésztő egységekben és kutatásokat folytattak annak érdekében# hogy hatékony vakcinát állítsanak elő. A máig kifejlesztett fő vakcinációs stratégiák nem patogén vagy kismértékben patogén inaktiváit homológ törzseket vagy élő heterológ törzseket alkalmaznak# amely törzsek lokális inmunválas2t .indukálnak fantí iípopollszaccharid A íxaraungiobulinok indukciója) és/vagy ökológiai barrier effektust váltanak ki# amelyet a patogén 0103 törzsekkel szemben gyakorolnak.
Aktaszámunk; 87220-3568/FÁ
Eddig azonban egyetlen stratégia sem eredményezett teljesen ártalmatlan vakcinát, amely teljes védelmet nyújtana. A kutatás tehát folytatódott azon mechanizmusok azonosítására, amelyek néhány E. coli törzs patogenitásáért felelősek.
Az ember számára enteropatogén E. coli törzsek (vagyis az .EP.EC törzsek), amelyek kisgyermekek hasmenéséért felelősek, képesek specifikus foélhám léziók kiváltására, amelyet „öss zekapcsolődási-kitőrlesi láziénak („a11achment-effacement 1esiοn, azaz A/E-i ézló) neveznek,
Sgy összkapcsolódási-kitörlés.i femotipust, amely korrelál egy, a HeLa vagy Hep-2. sejt vonal epitelíális sejtjein végrehajtott in vitro vizsgálattal, vagyis a FÁS (fluoreszcens aktin festés”) teszttel, definiáltak .humán EPEC törzsekben. Ebben a vizsgálatban a sejtekhez lokalisáltan tapadó sejtek az adhéziós centrumokban polimerizált aktin tömörüléshez vezetnek, amelyet egy fiuorokrómfooz [Knutton és mtsai, Infect. Immun. 57, 1290 (1989)) kapcsolódó phalloidinnel detektálunk. Ennek az összekapcsolódásikitörlési fenotipusnak a főbb determinánsait egy LEE nevű lókusz <enterocita kitörlési lókusz) kódolja [McDaníel és mtsai, Proc. Natl.Acad. Scí,, 92, 1664 (1995)).
Megfigyelték, hogy a fiatal nyulak hasmenéséért felelős E. coli törzsek képesek arra, hogy a húsán EPEC törzsek által okozo11 összekapcsölőőási-kitör1ési léz.íöhoz hasónló lésiót váltsanak ki (Licoís és mtsai.., Infect. Immun., 59, 3796 (1991); Moon és mtsai, infect. Iwun., 41, 1340 (1.983); Peeters és mtsai.., Vet. Pathol., 22, 54 (1.985);
« « * « V
Takeuchí és mtsai., Infect. Imnn., 19, 686, (1978) ] , Eteket
ο; risztté törzseket egy es szerzők [..Robins-Srowne
mtsai, Infect . Immun., 62, 3336 <19 9 4); Rofoi ns-Browne
m t s a i, 1 n f e c t . Immun<, 62, 1584, (1994)] szokták RE'
törzseknek is nevezni (” nyűi ί·ρκ·<» í 4-» i. { Λ
A 35 kpb-s kromoszomális lókusz homológját, amelynek létét eredetileg humán eredetű. EP.SC törzs prototípusban mutatták ki, vagyis az E2348/69-et .megtalálták [Karao'lis és mtsai, in Pröceedings: of the First International Rus'hmore Conference on Mechanisms in the Pathogenesis of Enteric Diseases*', Rapid City, 5.D., (1995); McDaniel és mtsai, Proc. Natl . Acad. Sci , , 92, 1664, (1.9.95)] a referencia REREC törzsben, amelyet RDEC-l-nek neveznek (O15.:H- serovar) és amelyet eredetileg Cantey és Blake írtak le (Infect. Dia,, 135, 454, (1977)].
Egy intíminnek nevezett., 96-100 kDa-os külső memhzénprotein, amelyet humán EPEC törzsének LEE-lótuszában levő eaeA nevű. gén kódol, részt vesz az összekapcsolásikitörlés 1 lézi-ók kialakulásában (Jerse és mtsai., Infect. immun., 59, 4302 (1991)1. Donnenberg és mtsai (J. Clin. Invest., 92, 1412 <1993)1 tanulmányozták az eaeA-gén szerepét a patogenításban. E2348/69 törzset teszteltek 11 önkéntesben, akiknek orálisan 2,10-^ CFU adagot adtak. Tizenegy további önkéntesnek ugyanolyan adag izogén eaeA mutánst adtak. Ar eredmények demonstrálják. az eaeá-gén szerepét a vírulencíában, ezért indirekt módon, a korrelációt az A/Eléziók, FAS-pozitiv fenotípus és az LEE-lökusz között (amely abban az időben, nem volt ismert) , valamint a viru»e * *
X >
«Α ***· i énei a között, isivel akkoriban úgy -gondolták/ hogy egyedül az eaeA-gén játszik szerepet a.z A/E~lézió kialakulásában és a FAS-pozitiv fenotipus .megjelenésében. & mutáns maradék patogenítása azonban azt mutatja, hogy az eaeA-gén mellett más virulene.tagénak is érintve vannak.
Ezenfelül az eaeA-gén jelen van a mem-entercpatog-én coli törzsekben is [Cantey és Moseley, Infec. lmun., 59, 3924 (1991); Leory és mtsal, J, Med. Mícrobio.1., 40, 90 ( i 9 9 3 ; ] .
Az intixaint ködoró eaeA-gén egy analógiát különböző nyúl ,F. coli törzsekben kimutatták [Ágin és Wölí, In: Proceedings of the First International Rushmo-re Conference on Me-chanísms in the Fathogenesis of Enteric Diseases”, Rapid City, S.D., 43. old. (1995); Leroy és mtsai, a. bed. bicrobiol., 40, 90 (19939; Pohl és latsai., Infect-. Immun., 61, 2203 (1993)].
hyugst-berópában végzett 'epidemiológiai vizsgálatok kimutatták, hogy a nyulak elválasztása során fellépő, hasmenésért felelős törzsek számos szérumcsoporthoz tartoznak, amelyek közül a leggyakrabban előforduló szérumcsoport a 0103 {Blanco és mtsai. Vet. Microibiol., 38, 193 (1994)?
CanguiIhem és Milon, J. Clin. Microbiol.-, 27, 743 (1989) ].
Az 0103 törzsek (amelyek ezenfelül rendelkeznek azzal a megkülönböztető tulajdonsággal, hogy nem fermentálják a ramnözt) az emésztési úton való kísérleti inokuláciöt követően nagyon pató-gének nyarakban és olyan összekapcsolódási-kitörlési iéziót okoznak [lioois és mtsal, Infect. Immun., 59, 3796 (1991); Fohl és latsai, Infect. Immun.,- 61, 2203 «« ««« (1993); Bobins-Broune ss mtsal, Infect. Immun,, 62, 3329 (1994); Robins-Browne ss mtsal# Infect. Immun,, 62, 1584 (1994)], amelyek kinézetre hasonlók az emberi eredetű EPEC törzsek által okozottakhoz< A lézió létrehozásának ez a kritériuma, amely azzal a ténnyel együtt# hogy ezen törzsek kromoszomalis DNS-e hibrid!zálódik a humán EPEC referencia törzs eaeA~génjére specifikus próbákkal [Leroy és mtsal, u. Med. Microbiol., 40, 90 (1993); Pohl és mtsaí, Infect. Immun.# 61, 2203 (1993)]# mint az RDSC-1 törzs esetében# talán megengedi azt a· feltételezést# hogy ezek a törzsek emlékeztetnek az EPEC (vagy RSBEC) törzsekre. Az 0103 törzsekben azonban az eaeá-génsn kívül az LEE-iokuss egyetlen más génjével való homo légi a sem mutatható ki.
Az E. coli 0103 törzsek specifikus adhezíut állítanak elő, amelyet AE/R2-nek neveznek, amely képessé teszi a baktériumokat arra, hogy ho2zátapadjanak a nyűi enterocitákhoz és a fíe.La és Hep·-2 sejtvonala.k sejtjeihez [Miion és mtssi., Infect. Immun. 58, 2690 (1990)).
Kimutatták# hogy ez az adhezin hozzájárult a 0103 törzsek patogenitásához. fiatal nyulakban. Ezt ügy mutatták ki, hogy összehasonlították az 0103 .szérumcsoport reprezentatív törzsének (amelyet B10 törzsnek hívtak) patogenitását ennek a törzsnek egy mutánsával, amely elvesztette adhéziós tulajdonságát annak következtében# hogy az AB/R2 adhezínt kódoló operádba Tn5::phoA transzpozont inzertáltak [Piliien és mtsal, Vet, Microfoiol.. # 50, 105 (1996)]. Javasolták, hogy ezeket a mutánsokat használják, vakcinaként [Chalareng és mtsal, Communicatíon. aux. γτ·1^© journées de l.a. recherche cnnicole (VI. nyílt nyűi-kutatási találkozó közleményeij ? La Rochelle, december 6 és 7, 1994, INRA-ITAVI-ASCF Publ.}.
Annak érdekében, hogy tisztázzuk a hasonlóság mérté-
két az coli 01.03 törzsei és
között, vi zsgáltuk az 0103 tör
ennek oka az vort. hogy a FÁS
non, mint .ami ka; ocsolatban
lókuszával (McDaníe 1 és mtsai,
1664 (1995 « J *
áll az EP.EC törzsek LEEProc. háti, Acad, Sci., 92,
Valójában azt találtuk, hogy a BIO törzs negatívan reagált a FÁS tesztre, miközben a RDEC-1 REPEC törzs, valamint a humán EPEC törzsek pozitív reakciót adtak azonos kísérleti feltételek mellett,
Másrészt azonban meglepd módon azt találtuk, hogy a BIO törzs újabb citopatikus hatást (CPE) hozott létre a BeLa sejtvonal epitelíáiís sejtjein, amely a cito-szkeleton és a fokális adhéziós plakkok reorganizációjában (átrendeződésében) nyilvánult meg. Akárcsak a FÁS típusú válasz esetében, ez a CPE Is összefüggésben volt a celluláris akt in intenzív polímerizációjávai. Ellentétben azonban .azzal, amit a PÁS típusú válasz esetében megfigyelünk, a polimerizált aktín nem válik lokalizálttá a bakteriális érintkezési pontokon, .hanem kábelek formájában rendeződik, amelyek áthúzódnak a sejt egyik végétől a másikig, A citoszkeleton ilyen módosulásai határozottan és megfordíthat atlanui nőnek az idő múlásával.
Ezen felül az aktin kábelek kialakulását a vinkulin mennyiségének fokozatos növekedése kíséri, amely jelenséget «» * φφ a FÁS típusú válasz esetében nem lehet megfigyelni [Finlay és latsai.-, Infect, Immun., SO, 2541 (19-92)] . A kontroli sejtekben a vínkulin pontszerű tömegek formájában van jelen, amelyek a sejtek kontúrján jelennek meg, míg a BIO hatásának kitett sejtek esetében a vínkulin az egész sejtfe'lszln mentén oszlik el, a pontszerű eloszlásbői majdnem szálas eloszlássá alakulva, ami emlékeztet az aktin kábelekre. A cítoszkelaton ilyen módosulása. együtt jár a sejtosztódás .leállásával és a sejtméret bizonyos fokú növekedésével. Miközben a. citosztázis hosszú ideig tart, a sejtek halálához vezet egy 5-6 napos periódus végén.
Más törzsek vizsgálatakor azt találtuk, hogy ez a CBE kifejeződött (expresszálödott) minden ramnoz-negativ 0103 törzsnél éppúgy, mint a RDEC-1 törzsnél. Ugyanúgy megfigyeltük ezt kőt humán eredetű klinikai EPEC ízoiátumban. Ezzel, ellentétben a humán eredetű referencia törzs, vagyis S2348/69, azonos körülmények között vizsgálva- nem mutatott semmilyen detektálható CPE-t.
Az erre a CPE-re jellemző cit-o-szkeleton változás emlékeztet arra, amelyet a CNF és CNE2 B. coli toxinok váltanak ki föswaid és mtsai., Proc. Natl. Acad. Sói. USA, 91, 3811 (1994)1 . Nem találtunk azonban a Slö-ben semmi olyan gént, amely homológ lett volna az coli CNFÍ-gyel és
CNF2-vei> Ezenfelül, miközben a CN'F-ek aktivitása detektálható a CNF-efc termelő törzsek kultúráinak lizátumaifoan, a BIO kultúrák üzátumaiban nem lehetett semmilyen aktivitást detektálni. Az azonban lehetséges, hogy a CPE-hez vezető mechanizmus, amelyet a BIO indukál, hasonló a CNF toxincké»χ 4 ♦*#* ♦' ♦ ♦ « »*« Λ ♦ > * hoz, amely utóbbi hatásmechanizmus összefügg a Rho aktiválásával, amely a citoszkeleton és a fokális adhézió centrumai szabályozásában résztvevő kis G-pro-fcein {Elínn és Hídley, J. Cell. Sci., 1.Ö9, 113 3 (1996) j .
Párhuzamosan számos 0103 törzs (köztük a prototípus 810 törzs) kromoszomális DbS~ét híbridizáltuk a törzs 35 kb
LES vi.ru.lenc.ia egységéből származó négy próbával, és összehasonlítottuk a 0103 törzsek és az £2348/69 törzs által a kultúra-közegbe ürített (kiválasztott) proteineket oly módon, hogy analizáltuk megfelelő eiektroforetikus profiljaikat valamint kereszt immnn-precípítácíóvai. A 0103 törzsekben demonstráltuk egy iőkusz jelenlétét, amely homológ az 83348/69 LSE virulencia-egységgei, bár mutat némi szerkezeti különbségeket is az utóbbival összevetve (amely különbségeket a DNS restrikciós helyek polimorfiájával mutattunk ki, valamint a kiválasztott proteinek eiektroforetikus migrációjának kisebb különbségeivel). Szt a iőkusz az EPECtörzsekben, amely analóg az LEE-vei, a következőkben ugyancsak ”LEB~lókusznak” fogjuk nevezni.
Azt is megfigyeltük, hogy ez a CDS korrelált a 0103 törzsek in vivő patogenitásával.
Az E. coli O103~mal kezdve olyan törzseket konstruáltunk, amelyek ennek az LEE-lökusznak a mutációit hordozták és megfigyeltük, hogy egy törzs, amely ennek az LEElókusznafc az egyik génje inakfcíváiödott, már nem váltja ki a CPE-t és elveszti patogenitását, bár megtartja az AF/R2 adhezint és képes marad a bél kolonizálására. ügy tűnik tehát, hogy az 0103 törzsek LEE-lökusza olyan genetikus deχ* ♦ * ♦ *
Φ X
♦.» ♦·»·*' Φ terminánsokat hordoz, amelyek felelősek a CPE-ért és a patogenitásért.
Végül megvizsgáltak ezen LES-lókosz mutánsok immunogén tulajdonságait és azt. találtuk# hogy ezek a mutánsok nagyon hatékony védelmet ruháztak át a patogén szülő-törzzsel szemben.
Jelen találmány tárgya eljárás E, coli uem-patogén mutánsának előállítására E. coli olyan patogén mutánsából, amely képes citopatogén hatást kiváltani Héra epiteliáiis sejtekben# amely hatás részint abban nyilvánul meg# hogy polimerizált aktinból kábelek képződnek, amelyek az említett sejteken egyik végüktől a másikig áthúzódnak, részint abban, hogy nő a vínknlin mennyisége, azzal jellemezve, hogy a patogén E. coli törzs mutageni zá.l t és .hogy a citophatikus hatást kiváltani már nem képes mutánsok kerülnek kiválasztásra.
A 310 törzset, amelyet 1997. január 15,-én 1-1807' szám alatt letétbe helyeztünk a Coiiectíon Nafcionale de Cultures de Microorganísmes-néi ÍCKMC) [Mikroorganizmus kultúrák francia nemzeti gyűjteménye], 28, Rue du Docteur Roux, 75724 PARIS CSDEX 15, csak példaként említjük azokra a patogén E. coli törzsekre, .amelyek képesek kiváltani a fent említett cítopatikus hatást, és amelyeket éppen ezért kiindulási anyagként alkalmazni lehet a találmány szerinti e I j á r ás as g va .1 ó s i t á s áná 1.
A találmány ugyancsak magába foglalja az Et coli olyan nem-patogén mutáns törzseit, amelyek az említett eljárás segítségével kaphatók. Ezek a törzsek legalább egy fi * * ·< Φ»Χ mutációt hordoznak, amelyek as LEE-lókusz legalább egy génjének inaktiválását eredményezik.
A találmány szerinti megoldás egy előnyös megvalósítási módja szerint a mutáns törzset egy olyan .3. coli törzsből nyerjük, amely patogén a nyálakra nézve és amely ..az 0103 szérumcsoporthez tartozik.
A találmány szerinti megoldás egy másik előnyös megvalósítása szerint a mutáns törzs legalább egy olyan mutációt hordoz, .amely az LHE-lókusz legalább egy sep-génjének az inaktiválását eredményezi.
A találmány szerinti mutáns törzs előnyösen legalább egy olyan mutációt hordoz, amely az LEE-lókusz esph vagy espB-génjelből legalább egynek az inaktiválását eredményezi .
Egy találmány szerinti törzset, amelyet BlÖ/C&l-gyel jelöltünk, 1997 január 15.-én 1-1808 szám alatt letétbe helyeztünk a Coliection. Natiouale de Cultures de Mícroorganismes-nél (CKMC) /Mikroorganizmus kultúrák francia nemzeti gyűjteménye], 28., Rue du Docteur B.cux, 75724
PARIS CEDSX 15.
Jelen találmány tárgyát képezik vakcinák, különösen olyan vakcinák, amelyeket orális úton lehet beadni, amelyek az coli legalább egy, a találmány szerinti mutáns törzsét tartalmazzák.
Az említett mutáns törzs előnyösen rendelkezik egy funkcionális AF/R2 adhezinnel és emiatt megtartja azt a képességét, hogy kolonizálja a belet.
Például a találmány -szerinti vakcinák, amelyek tartalmazzák a B10/CA1 törzset, szájon át beadhatók és megvédik a fiatal elválasztott nyálakat a 0103 szérumcsoporthoz tartozó patogén £b coli törzsekkel szembeni fertőzéstől.
A találmányt a leírás hátralevő, most következő része segítségével jobban, meg lehet érteni, amely nem kizárólagos példákat mutat be mutáns törzsek előállítására a. találmány szerint# valamint ezen törzsek vakcinaként való alkalmazását £. coli 0183 törzsek által létrehozott ci topa ti kus hatás demonstráláss Béla sejk sítúrákon
Az ebben a kisérlatsorozatban alkalmazott bakteriális törzsek a következők:·
- a nyűi számára enteropatogén BIO és RDSC-1 coli referencia törzsek;
- a ΒΙδ./1'βΕΙ törzs, amely BIO egy mutánsa, amelyet TnphoA mutagenezissel nyertünk és amely már nem termeli az AF/R2 adhezint [Pillien és mtsai, Vet. Microlbiol., 50, (1996) 1 ;
- 13 &. coli törzs, .amelyeket különféle nyúl hasmenéses esetekből izoláltak, és amelyeket előzőleg megvizsgáltunk kísérleti patogenitás szempontjából és abból a szempontból, hogy rendelkeznek-e bizonyos virulenciajellemzőkkel, mint AF/R2 és eaeA (Canguilhem és Miion, J. Clin. Microlb.iol., 27, 743 (1939); Leroy és mtsai, dl Med. Microbioi., 40, 90 ('1.993)1;
és kontrolként FÁS. pozitív humán törzseket:
- az E234S/6.9 humán EPBC referencia törzset;
- két humán EPEC törzset, amelyeket CFU201-gyel és CF517~tel jelöltünk (amelyeket Christíane Foresfier szívességéből kaptunk meg. Clermont-Férrend Gyógyszerészeti Tanszék) ; ezeket a törzseket gyermek hasmenéses estekből nyerték; ezek híbridizálnsk az eaeA specifikus és a &fp~ specifikus próbákkal és pozitívan reagálnak a FÁS tesztre.
- Interakciós teszt Haha sejteken
Sgy nappal az interakciós teszt előtt a HeLa sejteket •felosztott mikoszköplemezeken{ Lab-Tek, Míles Scientificj csíráztatjuk, vagy sejtkultúra titráló lemezeken (NUNCj a következő koncentrációban: 4„lcH sejt/ml Eagle minimális esszenciális közegben,· amely tartalmaz Earle sókat (BMEM, G1BC0; és tartalmaz 10% borjú embrió szérumot {FCS, GIBCOj és 50 pg gentamícint ml-nként (GIBCO). Ugyancsak a teszt előtti napon a baktériumokat „PEKASSAY broth-ban {DIFCO}. 24 óra inkubálás után 37 °C-on 5¾ CGy jelenlétében a sejteket Earle sós pufferrel mostuk (EBSS, G1BC0), majd összekevertük a baktériumokkal ugyanabban az BMEK tartalmú 25 mMos HEFE3 pufferben (GISCOI, amely tartalmazott 1% D~mannózt •(SIGMA) és 5t FCS-t (borjúembrió szérum) . 4 órás inkubáció után 37 °0~οη, 5% COg jelenlétében a sejteket bőségesen
mostul ; az EBSS-se.1, máj d
amely 10·% FCS-t tarta. Imazot
annak érdekében, hogy tonkr
A v. i Ö1 il >öző inkubációs idők
♦κ* °C-on) 5% CGy jelenlétében a sejteket EBS'S-sel mostuk, majd 1% formollal PBS-ben. fixáltuk 30 percig, szobahőmérsékleten .
Ezekután a különböző inkubációs idők után megbizonyosodtunk a történt morfológiai változásokról és kvantitatív módon meghatároztuk a sejtnövekedést.
*Váltósások a cítoazke1ebonban
F aktint rhodam inhoz kapcsolt phalloi-dinnel. tettük .láthatóvá (MOLEChLAR PBÖBESj a gyártó által ajánlott körülmények között. Vínvulirt közvetett immun £ Inoreszcencia segítségévei mutattunk ki egér anti-vinvulín monokionáiis antitestet használva (V2N-11-5 klón, Sigma), 1/100 hígítás mellett, valamint £Xuoreszceinnel kapcsolt, kecske antiegér antitest felhasználásával (0819 számú, IMMÜNOTECH). A mikroszkóplemezeket ISICA DMR fluoreszcencia-mikroszkóppal vizsgáltuk (40x-es ohjektÍvvel).
Az eredményeket az 1. és 2. ábrák mutatják.
Az 1, ábra a HeLa sejtek citoszkeletonjában bekövetkezett morfológiai változást mutatja a FÁS tesztben miután azokat kitettük a BIG-es E. coli törzs hatásának (A és 3), valamint az £2348/69 hatásának. (C és D), amelyet 4 óra inkubálás követett.
Az F aktín festését phalloídin/rhodamin alkalmazásával értük el, Minden egyes törzsre ugyanazt a mikroszkopikus területet mutatjuk íáziskontrasztban (A és C), valamint fluoresscenciás körülmények között (B és D) 4Öx objektívve 1, A vonal nagysága 20 pm«.
φ ΦΦ**
ΦΦ * * y 4 Κ « φ « Φ * φ Φ * Φ Φ *«
Α 2, ábra a cítoszkeleton változásait mutatja be és a fokális adhéziós plakkokat, amelyek a HeLa sejtekben jöttek létre a BIO E, coli törzs hatásának való kitétel után,· 24 órával (8 és E) valamint 48 órával (C és F) a kölcsönhatás után, vagy a mutáns- 810/CA.l törzs (amelynek előállítását az alábbiakban/ a 2. példában Írjuk le; hatásának való kitétel után, 24 órával a kölcsönhatás után (A és D).
Baloldalt (A, S és C) : as F-aktin festése pha1lo i dinnel/rhodaminna1 Jobboldalt (D, E és F|. : a vínvulin festése indirekt immunf luoreszcenoí a módszerrel anti~vin.vul.in antitestek felhasználásával,
A vonal nagysága 20 μη.
*A sej tnövekadés kvant1tat ίv me gmérése
Metilénkékkel specifikus módon lehet megfesteni sejtfehérjéket, és ez lehetővé teszi egyrészt, hogy megvizsgáljuk a sejtek morfológiáját, másrészt, hogy megmérjük a sejtpázsifcok teljes proteintarfcaimát. A sejtfehérjéket 1% metilénkékkel festjük meg 0,0 M borát pufferben a tilson által leirt módszer szerint [Animál cell cuiture: A practical approach# R.I. Frishney (szerk.} IRL Press Oxford, (199.2) ]. A sejttenyészetek maradék proteinjét kvantitatív módon megállapítjuk a kölcsönhatás napján, és 72 órával később olyan módon, hogy a festéket 8,1 14 HCi-val extránáljuk, majd automatikus ELISA iemezleolvason (model M 5800/7000, Dynatech) megmérjük az optikai sűrűséget 630 nm15
«.♦* *< «·***
Az eredményeket a 3. és 4. ábrák mutatják.
A. 3.. ábra a HeLa sejtek morfológiáját illusztrálja négy nappal a kölcsönhatás után, mind a BIO törzs esetében
CB}· mind a B10/CA1 mutáns esetében CA) . A festés metilénkékkel történt. A vonal hossza 20 gm...
A 4. ábra a bakteriális oltvány finoculumj dózisának hatását mutatja a He la sejtek növekedésére a BIO (0), Blö/CAl <0} és a ΒΙΟΖΙβΕΙ <» £„ coli törzsekkel való kölcsönhatást követően.
Az abszcisszán van megadva, az infekció multiplicitása (sokszorosódása) a CKJ-k száma sejtenként a kölcsönhatási teszt kezdetén;
az ordinátán van megadva a sejtnövekedés koefficiense - OD (optikai sűrűség) 72 órával a kölcsönhatás után/OD a kölcsönhatás napján.
Minden pont négy minta átlaga. A sejtnövekedési koefficiens standard deviációja minden esetben kisebb, mint
0.2.
Kovetkeztetés
Amint azt az 1. ábra mutatja, a Blö törzs nem. vált ki semmilyen FÁS típusú választ, vagyis nem vezet a polimerizált aktín semmilyen szignifikáns sűrűsödéséhez a baktériumok és a sejtek érintkezési pontjánál, és ez a RAS típusú válasz-hiány annak ellenére jelentkezik, hogy erős adhézlő lép fel és ellentétében az B234S/69 törzzsel kapott eredményekkel, amely erősen pozitív FÁS választ vált ki azonos körülmények között.
ψ -* « Φ ♦ < ·
Po2it.lv FAS-tipusu választ figyeltünk ®eg a RDEC-l törzs esetében is a nagyon csekély adhézió ellenére, valamint a humán CF11201 és CF517 törzsek esetében.
A. aás vizsgáit £. coli törzsek között a raianőznegativ 0103 fenotipusből négy törzs nem vált ki FÁS típusú választ.
Mégis., a BIO törzs hatásának kitett sejtek igen. mély változást mutatnak a citoszkeletonban, amelyet a kölcsönhatás befejezése után lehet detektálni (1. ábra), és amelynek nagysága nő az idővel (2B, 2C, 2S és 2F ábrák) .. Ezek a változások, amelyeket itt a CPE névvel jelölünk, a polimerizált aktin nagyszámú kábeljának kialakulásában jutnak kifejezésre, amelyek kötegekbe rendeződve áthúzódnak a sejten, és gyakran párhuzamosak egymással (2B és 2C ábra). Az aktin kőtegek megerősödésével párhuzamosan, fokozatos növekedés figyelhető meg a vi.nvu.tin formációkban, amelyek a fókái is adhéziós plakkokkal állnak kapcsolatban. Szék a formációk, amelyek általában pontszernek és azon sejtek peremén helyezkednek el, amelyeket előzőleg kitettünk £2348/09 törzs 'hatásának, a BIO törzs hatásának kitett sejtekben az inkubálás után. 48 - 72 órával általános és pszeudofibriilárís eloszlást vesznek fel. (2E és 2F ábrák).
A BIO törzs hatásának kitett sejtek mérete érzékelhetően nő az idővel, vagyis körülbelül 2.5 szeresére 4 nap inkubáció után, összhangban a sejtmag átmérőjével (3. ábra) ; ezzel párhuzamosan a sejtnövekedés blokkolt, amint azt a reziduális (visszamaradó) sejttenyészetekben végzett tel-
♦ * X*
Jf ♦ X es protein-m-eghatározás mutatja (4. ábra). A sejtek, csak az inkubáció ö.
Ezenfelül ként számolva i col ony- .forrni ng
50%-án mutatott napján kezdenek elpusztulni.
megbecsültük, hogy a teszt kezdetén sejtena BIO egy 50-100 telepfcépző egységéből unit, CFü) álló oltvány a sejtek legalább
CPE-t.
Bár a Blö/16 IS X ÁÍVLí; <3.11 £.> törzs egyáltalán nem képez
fibrilláris adhezint (Pililén és mtsai, Vet.
Microbiol., SO, iöS (1996)), ’!· igyanazt a CPE-t hozza létre,
mint a szülő <· BIO tö rzs; amint azonban azt a 4, ábra mutat-
ja, citopatogenifása kb, SO-szer alacsonyabb.
A. vizsgált egyéb, nyúl hasmenésből származó törzsek között a Blö-zel azonos fenotipust <0103 szérumcsoport/ ramnóz fermentáció hiánya, eaeá pozitív} mutató tizenegy törzs a CPE-t definiáló minden morfológiai, változást létrehoz. Ezt a CPE-t kiváltja a másik hat vizsgált törzsből három kiváltja, éppúgy, mint a referencia R.DEC-1 törzs. A humán eredetű EPEC törzsek közül az E2348/69 törzs nem hozott létre semmilyen detektálható CPE-t, míg a két CF112Ö1 és CF51? törzs erősen pozitívak voltak CPE-re nézve,
A. CPE-t nem lehetett reprodukálni a BIO kölcsönhatási kultúra tízszeresen betöményitett felülűszöjának alkalmazásával, sem a baktérinmtestek lízátumalval (oldataival), amelyeket ugyanabból a kultúrából nyertünk és hasonlóképpen tízszeresen tömény!tettünk
2. pe.íi'.líJ
CFE-negativ mutánsok eiöállitása, soeiekciója és genetikai vicegúláta
Annak -érdekében, hogy betekintést nyerjünk ennek a C?E~nek a molekuláris meghat ár o-zotts ágába és hogy megvizsgáljuk a lehetséges korrelációt a CFE és az ehteropatogemitás között nyulakban, a CFE kiváltásának képességét elvesztett, ki ónokat izoláltunk B1Ö mutánsok bankjából, amelyeket úgy nyertünk, hogy véletlenszerűen inzertáltuk a TnSISSOjy :pho.4 transzpozont (TnphoA) (Manoíl és Beckwith, Froc. Natl. Aead. Sex., §2., 8129 (1935)].
TnphoA-t a p.R7733 öngyilkos plazmiddal való konjugáció révén juttatjuk be a BIO törzsbe, amely az SH1Q (kpi:r+) K. coli törzsben található (Taylor és mtsai·., J. Bacteriol., 171, 1.870 (1989)].
A 'transzpozont befogadott kiónokat két lépésben szelektáltuk :
1) A Luxia-Bertani agaron (LA közeg) levő konjugációskeverékeket először is feldúsítottuk a transzponált kiónokban oly módon, hogy átvittük őket egy kanamicint (20 pg/ml! tartalmazó M9 minimál tápoldatba, majd 48 éráig 37 °C-on inkubáltuk. A ssülő-törzsek nem növekednek ebben a közegben, mivel az SM1.0 auxotróf (thy thr les), a BIO pedig érzékeny a kanamicinre.
2) Második lépésben a feldúsított kultúrákat kanm.ic.int (50 pg/ml) és 5-bromo-4-fcIoro-3-in.dol.il foszfátot (X?) (40 pg/ml) tartalmazó LA közegre szélesztettük (40 p.g~ mi) . A kékre szineződött klánokat ezután fenolvörös aaarra •ί replikáitukz amely 1¾ ramnózt tartalmazott és LA közegre, amely vagy kanamicint (100 ^ig/rai} vagy ampicíllint (100 μ g/mi) tartalmazott annak érdekében, hogy elim.inálja azokat a kiónokat, amelyekben az egész pRT733 plazmád koíntegráiódott a BIO ge&oaaal·
Azokat a klánokat tartottuk meg további vizsgálat céljából, amelyek rendelkeztek a ramnőz negatív fenotípussal és a kanamícin rezisztenciával, valamint az ampicíilín érzékenységgel.
Az igy kiválasztott mutánsokat ezután egy éjszakán keresztül kanamícint (50 gg-mi) tartalmazó PENASSAY közegben tenyésztettük, majd utána glicerin hozzáadása után (végső koncentráció 20¾} -20 °C~ on tároltuk. Ezután .96 üreges sejt kultúr a lemezen. (FALCOK) meghatároztuk GPS. kiváltó képességüket HeLa sejteken a fent. leírt 1. példában megadott módszerek alkalmazásával.
A megvizsgált közel 2700 klón közül 7 független klón (vagyis azok a kiónok, amelyeket független konjugációs keverékekből különítettünk el} volt CPE-negativ és nem integrálta a teljes öngyilkos piazmidot.
A 2, ábra (A és Bl illusztrálja azt, hogy az egyik ilyen mutáns (B10/CA1} elvesztette a CPE-t. Az ábra azt mutatja, hogy az ennek a mutánsnak kitett sejtek nem mutatnak változást a oítoszkeletonban, ami a vad típusú B10 törzs által kiváltott CP'E jellemzője.
A 3A ábra azt is mutatja, hogy a B1Q/ÁC1 mutáns nem okoz semmi olyan morfológiai változást, amit a B10 törzs vált ki. A 4. ábra mutatja, hogy citopatogenitása majdnem nulla, inek a mutánsnak a
Harbor, NY ( 1983)) s
A C?E~ negatív
meghatározás a céljá
Boehringer) segí tsé<
3.4 kpb-s Hindi .11
(DIG-ÜTP). ) irt a ε
A C.PE-negatív mutánsok genetikai jellemzése
Hacsak másképp nem jelöljük, az alkalmazott technikákat a Sambrook és mtsai. által előirt standard protokolloknak (Holecular Cloning: A Laboratory Manual# Co'ld Spring :1.989) ] megfelelően valósítottuk meg.
-negatív mutánsokba inzertéit egységek számának >a céljából egy kereskedelmi kit (DIG DNA, segítségével.# a gyártó javaslatait követve TnS Hindi .11 fargsmensét csatoltuk digoxigeninhez Ezt. a próbát Southern-blottal ellenőriztük a teljes BbS Clal, BamHI és Sáli emésztési fragmen.seive.1 szemben.
A ? előzetesen kiválasztott kiónbbl kettőt kiküszöböltünk# mert kettős inzertálást tartalmaztak.
Az 5 fennmaradó mutánsban az inzert a következőképpen lokalizálható:
Megfigyeltük# hegy a BIO kromo-s tornál is DNS~e az E2348/69 törzs LSE--fókuszának.# amelyet McDaniel és mtsai írtak le (Proc. Natl. Acad. Sci., 92, 1664 (1995)) négy specifikus fragmensével (az 5. ábrán A, C és D~vel jelölve)
hibridizá it.# amint az ;t az 5a ábra mutatja. Ez a hibrid!z
cié és te bb, mint 3 5 kh-s régión t hrténik (amint azt az
ábra muté at ja) , as U2ly f ezért úgy ' tűnik, hogy az E2 3 4.8/
lókusszal analóg lök' uset képez, a restrikciós polimorf!
musban az ónban jel ént ős küiönbséoe] fe vannak.
«·*«
Próbákat készítettünk olyan módon, hogy az A, B, c és D fragxaenseket megjelöltük digoxin~DÍP-vei, A teljes DNS különböző restrikciós enzimekkel történő emésztése, majd a Southern biot végrehajtása után a CPE-negativ 31 ö mutánsokra ezekkel a próbákkal, kapott hibridizációs profilokat őszszehasonlltottuk a szülői. BIO törzsre és az S2348/63--re kapottakkal. V
Ezen próbák -alkalmazása arra. a következtetésre vezet, hogy az öt mutáns az LEE-ló-kusznak megfelelő régióba Inzertálodott a TnphoA inzert. Az 5b ábra körrel körülvett nyíllal mutatja a TnpboA inzert helyét ebben as 5 mutánsban .
E mutánsok közül háromban {BÍO/CAi, BÍ0/S2 és B10/PA12} az inzert a 8 kB-os ScoRI fragxaensben helyezkedett el, amely a 3 próbával hibrid!zált, vagyis a szekréciós {.kiválasztási} génekkel (sepá - sepD} homológ gének kö-
ében <. A BIO/Hl2
ridizáiő régiók
sban az ergo és
kedík el ób példa
Λ TAS-választ adö törzsek, a CPB-t kiváltó- törzsek és a CPE~o-s.gat.i.v mutánsok protein-profiljának Összehasonlítása
Annak érdekében, hogy azonosítsunk bármilyen lehetséges kiválasztott baktérium-proteint, amely kapcsolatba hozható a CPE-vei, analizáltuk a kultúrák íelüiúszójában levő proteinek elekfcroforetikus migrációs profilját az £2348/6:9 « * »*·* «4 ««Λ *
Λ >**♦
* * humán S.PEC törzs esetében, a BIO', RDEG-l és a S10/16E1 teresek esetében, valamint a CFE-negativ BIO mutánsok esetében .
A baktériumokat a fenti 1. példában leírt kölcsönhatási teszt körülményei között tenyésztjük, de a sejtek jelenléte nélkül, a kezdeti oltvány hozzávetőleg 107 CFU/ial. 2 órás inkubáció után a baktériumokat centrifugáljuk (4000 g, 15 min, 20 °Ci és 1 ml metíonín nélküli EMEM-ben (No.. 31900-020, GlüCO; szuszpendáijuk, amely tartalmaz még S% hozzáadott dializáit FC5-t. 20 perces inkubáció után 37 °Con annak érdekében, hogy kimerítsük az endogén metíonín készletet, -^S-nel jelzett metionint adunk hozzá 100 uCi/mi mennyiségben. További. 1 órás inkubáció után a baktériumokat két egymás utáni eemtrifugálással (12000 gy 10 min} eltávolítjuk, majd a centrifugálásí felülűszoban a proteineket 40Oö-es políetilén-glíkoilai (PSG, 200 mg/ml, MERCK} kicsapatjuk. 1 órás 0 °C-os Inkubáció után a keveréket ismét centrifugáljuk (1200Ό g, 30 min} „ A. centrifugálásí üledéket 30 μί elekt.roforézises felviteli pufferben szuszpendáijuk és a proteineket eiektroforetikus migráció segítségével szétválasztjuk 12%-os pol íakr Hantid gélben SDS jelenlétében (SDS-PAGE). A gélt vákuumban szárítjuk, majd szobahőmérsékleten 6 napra érintkezésbe hozzuk egy β-msx (AMEASBAM) filmmel, A filmet a szokásos módon hívjuk elő.
Az eredményeket a 6A ábra mutatja.
A Blö szülői törzsben (3. sáv} három főbb proteint azonosítottunk, amelyek molekulatömege rendre 39, 37 és 25 kDa volt, valamint egy kevésbé fontos csíkot 40 kDa-nál.
X* · Φ ΦΦΦ * X * φ ·*'♦
Miközben a nyúl RBBC-l és a B10/16EI mutánsok profiljai megegyeznek a Blö-ével, a humán SPEC referencia törzs, £2348769 (6. sáv) négy csíkot mutat viszonylag hasonló molekulatömeggel NO, 39, 36 és 26 kDa), valamint egy további nagyobb csíkot kb. 29 kDa értékkel, amelynek nincs meg az ekvivalense a BIO profilban (6A ábra) . Ezen csíkok egyike sem. jelenik meg a CPE-negativ B10/CA1 mutánsban. (4. sáv). A 2. sáv a molekulatömeg markereket tartalmazza.
Ezeket a proteineket immunológiai. összefüggésük szerint is megvizsgáltuk,, poliklonális nyúlszérumot használva, amelyet a PEG-gel kicsapatott BIO felülűszö proteinekkel szeriben termeltettünk.
Az Ímmunpreciptiációt a felülúszó proteinekkel szembeni antiszérummal a tenyészet felülúszóján hajtottuk végre, miután megjelöltük -^S-nel, amint az fentebb leírtuk. Az Ímmunpreciptiációt a standard módszerek felhasználásával végeztük el [Sambrook és mtsai.: Moíecuiar CIoning: A Laboratory Manuai, Cold Spring Barbor, b.Y. (1989)j,
Az eredményeket a 6B és a 7. ábra mutatja.
A 6B ábrához tartozó lábjegyzet: 1. sáv: BIO preimmun szérummal; 2: BIO; 3: BiO/CAl; 4: B1Q16E1; 5: molekulatömeg markerek; 6. BDSC-1; 7: £2348/69.
A 6B ábra mutatja, hogy az antiszérumnak a BIO {3.
S£V · és RBSü-l (6. sáv) bárom fő proteinjével (39, í ? 5 25
kDA) , valamint az £2348/69 né gy pro te injéve1 (39, 36, 29
26 í :Da) való precipitátumát. Miközben a BIO három fő prof
inje jelen van az AF/R2-negativ mutáns (B.1.0/16E1# 4. sáv) felüiűszójában, nem jelennek meg a CPE-negativ mutáns (Blü/üAI, 3. sáv) felüiúszójában, Meg kell azonban jegyezni, hogy a preímmuu szérumnak is van bizonyos fokú képessége arra, hogy a BIO 40 kDa~s kisebbségi proteinjével
immunpr ec í pi tá t-u? sót képezzen. Ezek
zik, hogy a Blö felülúszó pro teinj
ével és as E2 348 /69-ével (még ha e:
Xekuistömege érzékelhetően különböző is), és hogy a CPEnegativ mutánsban ezen proteinek képződése a feiüiűszőban megváltozik.
Annak eldöntésére, hogy a felülúszóban levő proteineknek ezt az eltűnését a. megfelelő gének expressziójának hibája, vagy a proteineknek a baktérium általi kiválasztásának hibája okozta, összehasonlítottuk a BIO törzs és a CPE-negativ mutánsok (CA1, FA12, E2, A9, és H12) felülúszó proteinjeinek ismmnprecipítáoiös profilját az azonos kultúrából vett baktériumok lizátumaínak (oldatainak) iffimunprecítpítácíós profiljával.
A lizátumokat három fagyasztásiy felengedésl ciklus révén nyertük (-20 °C és 20 °C között), amelyet centrifugalás követett (12000 g, 10 perc), majd kinyertük az lizátum felüiűszóját. Az immnnprecipítáciőt azután hajtottuk végre, hogy megjelöltük -^Ο-ηοΙ, ugyanolyan körülmények között, mint amiket a feiülússó proteinek esetében használtunk. Mielőtt azonban ezt elvégeztük volna az B. coli HBlöl laborétórium törzsének lisátumát használtuk az antiszérum depletálasára, hogy kiküszöböl jük a nem-specifikus reakciókat .
felülúszó proteinek
7B (a bakteriális
Az eredményeket a 7A (a üsmunprecipi feác.iős profilja] és lizátumok immunpreciptíciós profilja) ábra mutatja.
Lábjegyzet a 7A ábrához: sáv OK 1: BIO; 2: mólókul
meg markerek; 3; CA .1; 4: FAI2; 5: E2; 0 : AB; 7: H12,
A 7A ábra azt mt itatja, hogy a S hlG- -zel összehasonl
a ielülöszó proteinek jelentősen csökkennek minden mutánsban. Ez a csökkenés még hangsúlyosabbnak tűnik három mutánsban, nevezetesen a CA1-ben, Ε-2-ben és A9-foen. Az imaunprecipítáció kimutat egy csíkot kb. 110 kDa-nái, amelynek Intenzitása többé-kevésbé egyforma minden törzsben, és amelyet ezért nem befolyásolnak a mutációk.
Megjegyzés a 7S ábrához; sávok; 1; molekulatömeg markerek,* 2; BIO; 3: CA1; 4; FAI2; 5: 2B7 6: A9;7: H12.
A 7B ábra azt mutatja, hogy a fentebb leírt főbb proteinek többé-kevésbé azonos mennyiségben jelen vannak a BIO lizátumokban és a. mutáns lizátumokban, a CA1 mutáns kivételével, amely különösen szegénynek mutatkozik a 25 kDa-s proteinben.
4, példa
A patogenitáa elvesztése a BIO egy CFE-negativ mutánsában
Annak tanulmányozására, hogy a CPE elvesztése hatással van-e a virulencíára, összehasonlítottuk a BIO törzsnek a nyulakra vonatkozó patogén itá-s át orális adagolás esetén az egyik mutánséval, jelen esetben a B10/CA1 törzsével.
A patogenitást új-zéiandi fehér tenyészetből (INRA törzs) származó, 35 napos fiatal nyálakon vizsgáltuk.
φ φφ ί *** * » * * « · ** ♦ * * φ * * φ » ♦ * * * ί *Λ φ Κ-.φ Λ Φ » # •φφφνφ amelyeket. 28 napos korukban választóttünk el, a Pillien és mtsai által leírt módszerrel. [Vet. Microbiol. 50, 105 (1996! 'j. 51 nyalat három csoportba osztottunk, amelyek súlyuk és alom tekintetében homogének voltak, majd orálisan beoltottuk őket a teszt törzsek 2.1<P CFü egységével, név szerint a következőkkel: a Blö szülő törzzsel (18 állat), a CFB-negativ Blö/CAl mutánssal (13 állat) és egy nem-patogén KI2 laboratóriumi BM21 törzzsel (1.5 állat). A hasmenéses és haláleseteket, valamint a súlyt fej legyeztük, és az B. coli törzseket a székletben megszámoltuk és osztályoztuk, amint azt Billien és mtsai leírták (1996. id. mű].
A BIO szülő törzzsel való orális beoltás mind a 18 beoltott állat esetében súlyveszteséget okozott, közülük 17 esetben hasmenést, 16 esetben halált. Az elhullások a beoltást követő harmadik és tizenkettedik nap között következtek be. összehasonlításképpen az azonos mennyiségű Blö/CAl mutánssal beoltott állatok, hasonlóan az B. coli KI2 törzszsel beoitottakhöz, nem mutattak semmi sűlyveszteséget vagy klinikai tünetet. A két utóbbi csoport esetében felvett súly-görbék gyakorlatilag azonosak voltak.
A 8A ábra mutatja den csoportban a kísérlet során: BIO (két tólélö/18 állat Δ; K12 (kontroll; 15 túiélö/15 állat) - 0; B10/CA1 (18 túlélő/ 18 állat) - □.
A 88 ábra mutatja, a coli hacillusofc populációját a beoltás után különböző Időkkel azon állatok székletében, amelyeket a KI2 kontroll törzzsel, a Blö törzzsel és a Blö/CAl törzzsel oltottak be:
túlélő állatok átlag súlyát min· □ : Blö/'CAl törzsből állóként azonosított Collbaciilus flóra
Q: BIO törzsből állóként azonosított Colibaoillus
f. 1 o r a.
Jelentős S. coli kolonlzációt (elszaporodást) figyel tünk meg a szülői SIO törzzsel beoltott nyulak esetében, a kolonizáciő elérte a túlélőkben a .10^ CFU/g szintet a széklet tartalomban több, mint két héttel a beoltás után. Minden azonosított colibacillus flóra BIO törzset tartalmazott.
Ez a teljes E. coli populáció ICp-IO^-szer nagyobb volt, mint az, amit a kontrollcsoportban levő nyulak esetében láttunk, amelyeket a Klz-es E. coli törzzsel oltottak be, amelyet ezen felül nem. is detektáltak a megfelelő állatokban.
Azokban a nyu.la.kban, amelyeket a S1Ö/CA1 mutánssal oltottak be, ez utóbbi a beleket magas szinten kolonizálta, ami után az E, coli populáció kb, lö& CFJ/g széklettartalom szinten .stabilizálódott legalább két hétig. Ezalatt az idő alatt a teljes E. coli populáció '?0~lö0%--át a B10/CA1 alkotta .
ő. oe 3da
Egy CBE-negativ törzs által átvitt védelem viszonya a szülői B20 törzzsel valő fertőzéshez
A patogén BIO törzs 10^ CFU-s dóziséval vali raíií napo s nyutón., beoltás hatásait összehasonlítottuk 2, 13 egyébből álló 35 amelyek közül az egyik csoportnak egy héttel φ * *
X Φ* *« φ ·♦·>«* * φ
Λ * * * korábban orálisan a B18/C&1 mutáns törzset adtuk be (2xlí)·'
CFÜ!
Harminchat fiatal nyalat <a faj és a tenyésztési körülmények megegyeznek a fenti 4. példában leírtakkal) két csoportba osztottunk, .amelyek a súly és az alom szempontjából homogének voltak. 30 napos korukban az egyik csoportba tartozó állatoknak 2x10^ CFÜ B1Q/CA1 mutánst adtunk be orálisan 2 ml PBS-ben. Hét nappal később mindkét csoporthoz, tatoző állatoknak a patogén BIO eredeti szülői törzsből orálisan, egy 2x10^ CFÜ dózist adtunk (ami a halálos dózis kb. 150S~a). A hasmenése» és haláleseteket valamint a súlyt feljegyeztük és a székletben az £. coli törzseket megszámláltuk és típusba soroltuk, amint azt a fenti 4. példában leírtuk.
Az egész megfigyelési időszak alatt semmilyen klinikai tünetet vagy súlyveszteséget nem figyeltünk meg azokon a fiatal nyulakon, amelyeknek előzőleg orálisan beadtak a
B10/CA1 törzset.
Másrészt 18 nyálból 11 azok közül, amelyeket nem vakcináitünk BIO/CAl-gyel súlyveszteséget mutatott, míg a nynlak közül 9 hasmenést mutatott és 18-ből 7 elpusztult,
A bél-kolonizáoiő vizsgálata megmutatta, hogy a B1Ö/C&1 törzs hatásosan kolonizálta a beleket akkorra, mikor a patogén BIO szülői törzset beadtuk; ezután a B10/CA1 törzs a kb. 10' CFU/g stabil szinten maradt két hétig, ezáltal megakadályozta azt, hogy a B10 detektálható szinten megjelenjék.
* * * * ♦ x«i
Párhuzamosan ELISA-t használtunk a lokális anti 0103 LES XgA antitestek mérésére a székletben, A 9. ábra mutatja a székletben levő IgA antitestek .kifejlődését a CPE-nsgativ 310/CA1 törzzsel való orális beoltás (0 nap) után, majd a virulens 810 törzzsel való beoltás után (a 7, napon} (0), vagy csak a 810 virulens törzzsel való beoltás után a 7, napon . Látható, hogy az antitest válasz szignifikánsan nő körülbelül 15 nappal a B10/CA1 törzzsel való orális beoltás után.
o. példa
LEE-mutánsck izolálása helyspeclfukcs mu tagé nézessél
A B10 törzs LES-fókuszának jobboldali végét klónoztuk és szekvenáitufc, A szekvenált régié szerveződését diagramszérűén mutatja a 10. ábra, és a kapott szekvenciát a csatolt szekvencia-Iistában Írjuk le 1. szekvencia azonosító szám alatt. Ezenfelül tanulmányoztuk az LEE;-fókusz általános szerveződését a patogén 0103 törzsekben és megerősítettük, hogy ez azonos volt mindezekben a törzsekben.
Létrehoztuk az 0103 törzs LES-lókusz mutánsait az
E22-vel jelölt mutáns törzzsel kezdve, Míg ez a patogén törzs analóg a S10 törzzsel, érzékeny a streptomieínre {éppúgy mint továbbá minden megvizsgált Graa-nagativ spektrum an tibo t i Rumra}.
Ezeket a mutánsokat az ai léi-csere 'módszerével állítottuk elő.
Minden egyes választott lókuss esetében {eaeA, espA, espB és espDi a vad típusú E22 törzs alléiját kicseréltük
S22
Λ1 ♦* ί
fc- « «••Οί'ί *- +
Φ » • «·«· ♦♦ »
* φ ♦
φ *»«« egy olyan alléllel# amelyet egy expressziós kazetta [-Gálán és mtsai.# J. Bacterioi.# 174# 4338 (.1.992)1 izertálásával# amel.y tartalmazott egy kanamícinnel szembeni rezisztenciagént (aph.T-gén: amlnoglikozíd 3'-foszfotranszerás) egy erős pr omo te.r szabályozása alatt# tarnszkripciós terminátor nélkül. Ez a kazettát# amelyet a mutálandó gének szegélyeznek# és amelyet egy öngyilkos piazmid [Kaniga és mtsaí# Gene# 109, 137 (.199.1)] hordoz# bejuttatjuk a vad típusú törzsbe, majd kiválasztjuk a rekomblnáns baktériumokat.# amelyekben a vad típusú alléit a mutált alléi váltotta fel.
Az eaeá és espő-géneket a kazettának a természetes Eco-RV-be ill. a Bglll restrikciós helyre való inzertálása által inaktiváljuk. Az espB és espA esetében de .novo egy SgJJT (GACATCj helyet hoztunk létre hely-specifikus mutagenezisse.1 (PCR degenerált oligonukleotido-k alkalmazásával és a plazmidok szelekciója restrikcióval).
A kapott mutánsok által előállított proteineket immun-b-Iotto-lás segítségével analizáltuk az EaeA esetében és isaauiyp-recipítációva.! az EspA, EspB és S-s-pD esetében. Ez az analízis megerősítette# hogy ezek a mutánsok csak abban különböztek a. vad típusú törzstől., hogy nem termelték azt a proteint# amelynek génjét a mutáció inaktiválta.
A kapott mutánsok a következők voltak:
- EzzAespA# amely már nem szintetizálja az EspA proteint, ~ E22ÁespB# amely már nem szintetizálja az EspB proteint.
- E22AespG# amely már nem szintetizálja az EspB proteint.
- S22AeaeA# amely már nem szintetizálja az EaeA proteint, ezért nem építi azt be külső membránjába.
# *.<ν*.* * *'*·.
«8 <fr ♦ '*♦ * ♦ *«-«1 \ * ♦ φ 9 * ♦ » «*<· * **''*
Az egyéb proteinek szintézise lényegileg normális marad mindegyik mutánsban. Az E'2'2áespA mutáns például már nem termel SspA-t, de normálisan kiválaszt EspB-t és EspD-t éppúgy, mint ahogyan, normálisan szintetizál EaeA-t és normálisan beépíti azt külső membránjába. Ügy tűnik tehát, hogy ezen mutánsok mindegyike tartalmaz egy szigorú, nem poláris („sáriét, non-polar) mutációt, amely kizárólag a mutáció cél-génj ét érinti.
A 10. ábra a 0103 törzsek LEE-lőkuszának jobboldali végét mutatja és a különböző gének pozícióját, is jelzi és a kazetta inzertáiásának helyét mind a 4 kapott mutánsban.
Ezeket a mutánsokat in vitro vizsgálatoknak vetettük alá, a melyek célja az volt, hogy megállapítsuk CPE kiváltási képességüket HeLa sejtekben, amint azt a fenti 1. példában leírtuk.
Az esp-gen mutánsok patogenitását is ügy ellenőriztük elválasztott nyuiakban, hogy 35 napos nyulak csoportjainak orálisan beadtunk 2x10'’ CFb mutánsot nyálanként ugyanannak a protokollnak az alkalmazásával,a melyet fentebb a 4, példában leírtunk.
*♦»««*** * ♦* ♦ )ί » «. ** * * » * .*.♦* X * « A X X * κ«« « ««« >» »«*»
- 32 ~
A kapott eredményeket az 1 táblázat foglalja, össze
1, Táblázat
Törzs CPE/Keka in vivő patogentíás3
süiyveszte- ség hasmenés halandóság
£22* 4-F+ 23/34 26/34 25/34
E22ÁespA 0/16 0/16 0/16
£22AespB - 0/16 0/16' 0/16
E22Áesp£> - 3/18 2/18 2/18
E22ÁeaeA •S-4-4- NT NT NT
a: A klinikai tüneteket mutató állatok száma/beoltott állatok száma *: vad tipo.su törzsek
NT: nem vizsgáit,
Ezek az eredmények azt mutatják, hogy az Esp protein szintézis mutánsok, már nm expresszál ják a citopatogén hatást Heha sejteken, szemben az eaeA mutánssal. Ennek következtében két .Esp protein mutáns (ÁespA és ÁespS) teljesen elvesztette patogentiáeát és a ÁespD mutáns patogenitása sokkal gyengébb, mint a vad típusú törzsé.
SZEKVENCIÁLISΤΑ
Α2 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: .12620 basispár TÍPUSA: nukleotíd
HÁNY SZÁLÚ: kettős
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
JELLEMZŐK:
NÉV/KULCS: cds
E LHELYE ZKEUÉ S: 1768,..4587
EGYÉB INFORMÁCIÓK: /produkt - eaeA JELLEMZŐK:
NÉV/KULCS: cds
ELHELYEZKEDÉS: 7278. . .7856
EGYÉB INFORMÁCIÓK: /produkt = wespA!5 JELLEMZŐK:
NÉV/KULCS: cds ELHELYEZKEDÉS: 7869...3011 EGYÉB INFORMÁCIÓK: /produkt = MespD* JELLEMZŐK:.
NÉV/KULCS: cds
ELHELYEZKEDÉS: 9032...937 6
EGYÉB INFORMÁCIÓK: Zprodukt - ”espB”
AZ' 1.. AZONOSÍTÓ SZÁM.Ö SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
OATATWCCO AACCCCGTCA CWSATMTA SmWAOTOWM T&CMAffiMC SÖ &CG&WASC CASGffiS&TCC AA4TASTGÖC Ö&ÖGSÁ&A&A TOmWSAT TCATACtTCA X2Ö
ACCTOACTT CMCCTCCS TÖCAÖATCCT AAACTTW3T TSTShOT SACTATTGCT 188
8CM3OTSTO& TAGGÖATÖOC TGCGACGGGS &TTGC&C&GG OTGTTGCWT SACTCCAOAÖ 24ö
CCGG&TO&CC CAATCACTAC CÖACCCTÖAT GCTGCMCAA &C&Ö&3CTG& mOJ® 388
AAAÖATCAST TAACOWO, ASCMTSOS AACCCAGATA AŐbSAMST ΤΜΤΑΤ03ΑΤ 388
8AÖAACG0AA ATGCÓATTCC STOT$KM CTO&&3&TG ATSTTÖTTSC GCAAATAGCÁ 420
S&AC&ftSCTA AAÖCSOCÖGG TÖAACN38CC A®CO« CTATTGAAAG TMTTCTCW 488
SCGCAGOAA JWATOAWL KCAÖOmCT AAACSO3MC K«MW TCOTTCATCG 54 S
GQGGrmOCT ACOSTATTAS XWTGCGCKS ATTCTTOOS GGGCAATTGG TÖCCT3TOT? 888
Μ 9 » X XX * * **
* φ - 35 - : ...1 I ♦ ♦ ♦♦*:>
ACTGCCTCTC TTC&TCGCAA AAACCAACTS δΜΑΑΟΜ CAATt&CTAC ACGTACTGTA 888
STCG&TAATC AGCCTACGAA TAACGCACTT GCGC&CTGCA ATACTGACAC AAGTGGSCCA 728
GAAÖAGTCCC C3GCGASCAG ACTTAáTTCG AATGCCAGCC TCTCATCGA& CCTGTCTGAC 788
ACCTCCAGCA CGCTCACGGT AGAGAATCCG TACTCTGACT TCTGAATGCC CAGAAACTAT 850
TCACCTGCTC GCATTTC&GA G8AACCTATT TATGACTAW TCGCCTCAGA TCTTAATTAT 208
AGCGTCATTC AACATTTTTC A8CTAACAGC KWW GAACTTTAG? GCTAACCCCA Μ8
GSGCAAGGTA TCCAAAGT&C TTATGCTCTT CTOWa GÖSSO0S&TT GCTTTTAGGT 1823
ATCTGACTAT TAACGGGGCT GCTCGAGAOC GCMGTAAGTA CCTCCAATGC CGCACCAACG A ,»v 1888
CCSGGACCCT CACGTTTCGT TTAAATATAT CCTTGAGTAT TTAGTCTACT TTGGGAGGGG 1148
GGGACTTTTA CTAATATTAA CTTTCTAGAG AATAAAGTTG CAGCACTGÖT AACTCTTGAA 1288
CTTCTOTAAT TATAAATTCA ATTAAGMGAA ATT&TAACT? CATCAAGATC CTACCTTTTA T2CO
T7AGATAGAT TTSCACAAAA AATTCTTATT GGATCTATCT αΏΏΛ®Α AAATAGATTG 1820
worr® ctatctatga gattcattat atttcgttat ctgatgctaa ctacgaatat 12 SS
ACTATGATCT &TGSCGTCTG TGCTAAATTC CCGACAGATA ATÖCTRACTT CGCTCTTGAG 1448
ATTTCTAATG CAAACTTACT GTTTGCAGAG AATCTCTGAC CATACCTGTG TTACTAATCA >*>:·. Λ' · · · >. A í: > CTAGCACAAT CTCWTCTTT AGCTTTACTT TTTCCSCTCT ACTATGCTAC ACCTGAAAAA aSí . , X«?y «5 ·?* ' íf CTWAGAATG AAATAGAAGT CTTCSTTAAG TCAATW&AA ACCCTTATTT GGTATTACAT 2588 1558 1520
WKO» TAACATTAGA AAACÖAACAT AWAA&&TAG ACTAAATTAG TTCA&SCTAT 1888
AATAAACATT ATTACTCCT© AAGATAAAAG ATTATTTATT AATATAATTT ACTATTCATT 1740
CTAACTCATT GTGGTGGACC CCATAAC ATG ATT ACT CAT GGT TTT TAT GCC Met Tie Thr Kis Gly Lhs Tyr Aia 1 5 1721
CTG ACC CGG CAC AAG’GAT AAG CTA AAA AAA. ACA TTT’ ATT ACT CT? AGT Arg T&r Arg Kis Lye/His Lys Leó Lys Lys Thr Lhe.lle Met Leu Ser 18 l IS 28' x<X ?>VV Λ «·>·<· * ·\? ·*!*$·-.· GCT GG? TTA GG& TCT TTT TTT TAT GTT AAC CAG AAT TCA TTT GCA AAT Ale Gly Leu Gly Leu The Fhe Tyr Vei A»» Gin As» Ser The Ale A®» 25 20 25 88 1832 1887
GGT GAA AAT TAT TTT AAA TTG AGT TCA GAT TCA AAA CTG TTA ACT CAA Gly Glu Asn Tyr Phe Lys Leu Ser Ser Asp Ser Lys Leu Leu Thr Glu 45 50 55 1535
AAT GCC GCT CAG GAT CSC CTT TTT TAT ACT TTA AAA ACA GGT GAA ACT As» Alá Ale Gi» Asp Arg Leu Phe Tyr Thr Leu Lys Thr Gly Glu Thr 88 85 > 70 1283
Χ« V « ** * * « ΦΧ <44
/.4 * *
GTT GCC AAT ATT TCT AAA Lys TCA Ser CAG GGT ATC AGT TTA TCG ÓTA ATT TGG 2031
Vei Ale Asn.Tle 75 Ser Gin Gly 80 H e Ser Len Ser 85 Val lle Trp
TCA CTG AAT AAA CAT TTA TAC AGT TCC GAA ACC GAA ATÜ ATG AAG GCT 2075
Ser Lea Asn Lye SÍ® Len Tyr Ser Ser Gin Ser Gin Mét- Mer Lys Ale
PO PS 100
GGA CCT GGT CAG CAG ATC ATT TTG CCA GTC AAA AAA ere TCT GTT GAA 2127
Sly Pr© Gly Gin Gin He He Len Pre Len Lye Ly® Len Per Val Gin
105 110 22S 120
TAT AÜT GCC TTA CCT GTC TTA GGT TCG GCA CCT GTT. OTT GCT GCA GGT 2175
Tyr Ser Ale Len Pro vei Len Gly Ser Ale Pro Val. Val Alá Als Gly
12K 130 *5?>k 135
GGT GTC GCT GGT CAT ACG AAT AAA ATS ACT AAA ATG TCC CCÜ GAC CCS 2223
Gly Val Ale Gly Mis Thr Asn Lys heh Thr Lys Méh Ser Pr© Asp Alá
140 14$ 150
ACT AAA AGC AAC ACG ACC GAT GAC AAG GCT CTA AAT TAT GCG GCA CAA 2271
Thr Lye Ser Asn Thr Thr Asp Asp Lys Ale Len Asn Tyr Alá Ale Gin
155 140 185
CAG GCG GCG AGC CTT GGT AGC CAG CTG CAG TCG CGC TCA CT® AAC GGC 232.P
Gin Ale Ale Ser Len Gly Ser Gin Len Gin Ser Arg Ser Len Aon Gly
27© 17S 2P0
GAT TAC GCG AAA GAT ACC GCT CTT GGT ATG GCC AGG AGC CAG GCT TCG 2387
Asp Tyr Alá lys Asp. Thr Ale Len Gly Met Ale Ser Ser Gin Ale Ser
185 ÍS© 185 200
TCA CAG TTG CAG GCC TGG TTA CAA CAT TAT GGA ACG GCA G&G- GTT AAT 2415
Ser Gin Len Gin Alá Trp Len Gin Ki® Tyr Gly Thr Ale Gin Val Asn
205 220 215
CTG CAG AÜT GGT AAT AAC TTT GAC SÜT AGT TCA CTG GAC TTC TTA TTA · 24S3
Len Gin Ser Üly Asn Asn Phe Asp Sly Ser Ser Len Asp Phe Asn Len
220 225 230
CCG TTC TAT GAT TCC GAA AAC ATG CTG GCA TTT GGT CAG GTC ÜST GCG 2511 ?» Phe Tyr Asp Ser Sin Asn Mer Len Ale Phe Gly. Sin v&I Gly Alá
235 24© . 245
CGT TAS ATT GAC TGC CSC TTT AGG GCA AAT TTA CGT GCT GGC CAG CGT 2SS9
Arg Tyr Tle Asp Ser Arg The Thr Ale Asn Len Gly Ale Gly Sin Arg
2SÖ 255 25©
TTT TTC GTT CCT GAA AAT ATG TTG GGC TAT AAC GtC TTC ATT GAT CAG 2507
Phe Fte Len. Pro Gin Asn hét L«u Gly Tyr Asn Vei Phe lle Asp Sin
255 272 275 28©
GAT TTT TCT GGT GAT AAT ACC CGT TTA GGT ATT SÜT GGC GAA TAC TGG
Asp Phe ser Sly Asp Asn Thr Arg Len Gly Π® Gly Gly Gin Tyr Trp
255 25© 2PS
2585 * * *· » * ' ··*, 5 .* χ λ r»*s
CGA SAS TAT TTC m AGT AGC GTT AAC CGC TAT TTC CGC ATG AGC GGC 2783
Arg Asp Tyr Phe Lys Ser Sár Val Asa Gly Tyr Phe Arg Mer ser Gly
388 385 Γ 3X8
TGG CAT GAG TCA TACjAAT &%8 AAA GAT TAT GAT g|g CGC CCG GCA AAT $751
Trp His Glu Per Tyr Asa Lys Lys Asp Tyr Asp Óla Arg Pre Al® Asa
335 320 333
GGT TTT GÁT ATT CGC TTT AAT CGC TAT TTA CCA TCA TAT CCG GCA 27»
Gly Phe Asp XXe Arg Phe te Gly Tyr Leu Pre Ser Tyr Pre Alá he»
133 333 343 ®C GCC AAA CTG ATG TAT CAA CAG TAT TAT CGT CAT AAT GTT GOT TTG 2347
Gly Alá Lys he» Mer Tyr cl» Gla Tyr Tyr Gly Asp Asa v®X Al® Le»
343 358 355 . 358
TTT AAT TCC GAT AAG TTG C&G TCG AAT CCT GGC GCÖ GGG ACC GTT CCT 2885
Phe Asn Ser Asp Lys Le» Gl® Ser Asa Pre Gly A1& Al® Thr Vei Gly
355 373 ? 373 * \ .w
GTA AAC TAC AGT COS ATT CCT CTG GTG ACG ATS CSC ATC GAT TAG CGT 2 343
Val Asa Tyr Thr Pro lle Pro Leó Vei Thr Mefc Gly Ile Asp Tyr Arg
388 335 353
CAT GGT ACG GGT AAT GAA AAT GAT CTC CTT TAC TCA ATG CAG PTC CGT 2»1
His Gly Thr Gly Asa Gla Asa Asp Leu he» Tyr Ser Mer Gla Phe Arg
385 403 435
TAT CAG TTT GAT AAA CCG TGG TCT CAG CAA ATC GAG CCA CAC TAT GTT 3333
Tyr Gla Phe &sp Lys Pro Trp Ser Gla Gla lle Glg Pro Gla Tyr v&l
4X8 433 423
Λ
AAC GAG TTA AGA ACA TTA TCG GGC' AGC CGT TAC GAT CTG GTT CAG CGT 3357
Asa Glu Leu Arg Thr: Les. Ser Gly Ser Arg Tyr Agg Leu V®1 Gla Arg
425 433 435 ·' 440 ' s
AAT AAC AAT ATT ATT CTG GAG TAC AAA AAG CAG GAT ATT CTT TCT CTG 313S
Asa Asa Asa He He Leu Glu Tyr Lys Ly® Gla Asp 21® Leu Ser Leu
445 453 455
AAT ATT CCG CAT GAT ATT AAT GGT ACT GAA CAC AGT ACG CAG AAG ATT 3133
Asa lle Pro Mis Asp He Asa Gly Thr Glu His Ser Thr Gla Lys He
458 455 478
CAA TTG ATC GTT AAG AGC AAA TAC GGT CTG GAT CGT ATC GTC TGG GAT 3231
Gla Leu He Val hy® Ser Lys Tyr Gly Leu Asp Arg He Val Trp Asp
475 400 485 . ’*·
CAT AGC CCA TTA CGC AST CAG GGC W CAG ATT CS CAT GGC GGA AGC 3272
Asp Ser Al® Leu Arg Ser Gla Gly Gly Gla He Gla His Gly Gly Ser
428 425 588
CAA AGC GCA CAA GAC TAC CAG GCT ATT TTG CCT GCT TAT GTG CAA GCC 3327
Gla Ser Al® Gla Asp Tyr Gla A1& He Leu Pro Alá Tyr vei Gla Gly
585 510 515
520 » X«r ♦ X « * * ♦ fi ♦ X ♦ ♦ Λ
CTC AGC AAT ATT TAT AAA CTG ACC GCT CGG GCC TAT GAC CGA AAT GGT 3375
W Ser Asn He Tyr Lya 525 Vei Thr Alá Arg Alá 530 Tyr Asp Arg Asn 535 Giy
MT AGT TCT AAT AAT GTA C$3 CTC ACT ATT ACC GTT TTA CCT AAT CTG 3433
Aon Ser Ser Asn Asn Val Gin Len Thr lie Thr Val Len Pr© Asn GXy
540 545 550
SAS GTT GTG GAC CAG GTT CTG GTA ÁCS GAC TTT &CT GCT GAT AAA ACA . 3471
Gin Val Val Asp Gin Val Giy Vei Thr Asp The Thp Alá ASp Lya Thr
SSS 550 555
TCG GCT AAA GCG GAT GGC ATA GAA GCT ATT ACC TAT ACC GCG ACG GTT 3515
Ser Alá Lys Alá Asp GXy lle Gin Aia lle Thr Tyr Thr Alá Thr Val
§70 575 550
W AAG MT GGT GTA GCT CAG GCT AAT GTC CCT GTA ACA TTT AGT ATT 3557
Lys Lys ÁSS GXy vei Alá Gin Alá Asn Val Prn Val Thr The Ser Xle
sss 550 555 500
GTA TCT GGG AGT GCT AGT CTT GGG GCA AAT AGT GCG AGA ACG GAT CTT 3515
Val Ser GXy Thr Alá Thr Len GXy AXa Asn Ser Alá Arg Thr Asp Giy
SSS 510 3$ 5X5
AAC GGT AAG GCG ACC GTA ACG GTG AAG TCG GCT GCT CTA CAG GTC 3583
Aan Giy Lys Alá Thr Vei Thr Len Lys Ser Alá Thr Pro GXy Gin Val
520 535 530
GTC GTG TCT GCT AAA ACC GCT GAG ATG ACT TCG CCT CTT AAT GCC AGC 37X1
vei Vhl Ser Alá Lys Thr Alá Gin hhfc Thr Ser Pro Len Asn A1& Ser
OS 540 545
GCG GTT ATA TTT GTT GAT CAA ACC AAG GCC AGT ATT ACT GAG ATT AAG 3755
Alá Val Tle Phe Val Asp Gin Thr Lys Alá 5er lle: Thr Gin lle Lys
550 555 SO $
GCT GAT AAA AGA AGA GCG SAS GCA GAT CTT TCT GAT GCG ATT ACC TAT 3307
Alá Asp Ly® Thr Thr Alá Lys Alá Asp GXy Ser Alá lle Thr Tyr
sss 57® 575 ü/ 580
ACT GTC AGA GTG ATG AAG GAG GGG GCA CCC GTA GTA GAT CAG AAA GTG 3 855
Thr Val Arg Val Msr Lys Gin Giy Alá Pr© Vei Val ASp Gin Lys Val
555 550 505
AGC TTT TCT AAG GAT TXT GCG ACC CTG AAT MG ACT GAA GCA ACA ACC 3803
Thr The Ser Lys Asp Phe GXy Thr Len Asn Lys Thr Gin Alá Thr Thr
700 705 710
GAT CAG AAT GGT TAT GCT ACT GTA AAA TTA TCA TCG AAT ACT CCT GGC 3351
Asp Gin Asn Giy Tyr Alá Thr Val Lys Len Ser Ser Asn Thr Ar© Giy
7X5 728 725
AAG GCC ATT GTT AGT GCA MA GTG AGT GGA GTA GC^ ACA GAA CTT MG 3333
Lys Alá Tle Vei Ser Alá Lys Val Ser Giy val GXy Thr Gin Val Lys
730 735 700
404?
*Χ«Φ **
OCT ACT ACC OTT GAG TTT TTT ÖCS CCS TTG AGT ATT GAT GOT GAT M Ma Thr Thr Val 01« Phe Phe Alá Pro hév S®r n© Asp oly Asp Lys
755 720
GTO ACC ÓTA ATT sor ACT GGT ATC ÁCS GGS GCT dó CCA AAO AAC T00
Val Thr Val lle Oly Thr Oly lle Thr Oly Alá Leú Pro Ly® Asn Trp
705 770 775
%
TTA OAO TAT GGT CAG OTT AAO CTA CAG OCA ACA ooo GGC AAT 80A AAA
Leu öla Tyr Oly Sin vsl Lys Leu Gin Alá Thr Oly Oly Asn Oly Lys
790 725 792
TAG ACA TOO AAA TCC AST AAT ACT AAA ATT GOT TCT OTT GAT AAG TCO
Tyr Thr Trp Ly® Ser Ser Asn Thr Lys lle Alá Ser Val Asp Asn Ser
?>5 200 SOS
OOA CTG ATA ACC TTA AAT G&A AAA GGG AGT GCC AGA ATT AGT CTA ÓTA
Oly Val Xle Thr Lee Asn Glu Lys Oly Ser Alá Thr Xle Thr Val val
2X0 9X5 22,0
TCT sor GAT AAT CAO AGT GCG ACA TAG ACA ATT aa! GCA CCG GGT AST
Ser Gly Asp Asn Sin Ser Alá Thr Tyr Thr lle Asn Alá Ar® Oly Ser
225 230 835 240
ATT ÓTA ATT OTT OTS GAT AAA AAT ACT CGA OTT AGÖ TAT TTT GAT OGG
lle Vsl lle Alá Val Asp Ly® Asn Thr Arg Val Thr Tyr Phe Asp Alá
295 250 255
m AAC AAA TCT AAG ACA AAT AGG GCA AAT TTA GCA CAO CCA AAA OAA
Glu Asn Lys Cys Lys Thr Asn Ser Alá Asn Len Alá Gin Pre Lys Gin
200 9«S 870
ÓTA TTG SCO AAT ATS TAT TCA. ACA TOG GGT GGT GCA AAT AAA TAT CCT
Leu Leu Alá As» lle Tyr Ser Thr Trp Oly Alá Al| Asn Lys Tyr Pro
975 920 4 225
TAC TAT TCT SÓT TCT AAA TCA TTG ACT GOT TGO AT^ AAA CAA TCT TCT
Tyr Tyr Ser oly ser Lys ser Len Thr Alá Trp lle Lys Gin Ser Ser
290 292 900
TCT OAA CAO TCA TCA GGT ÓTA TCA AGG ACA TAT GAT TTG OTT ACG AAO
ser Glu Sin Ser Ser Oly Vei Ser Ser Thr Tyr Asp L®« Val Thr Lys
m
9X5
920
4095
4143
4X91
4039
422?
3 S
4323
4431
4479
4527
AAC CAO TTG ATS AAT OTT OOA ÓTA AAC AAT AAO AAT OCT TTT TCT OTT Asm Sin Len Ti® Áss Val Gly V®1 Asn Asn Lys Asn Alá Phe Ser val
925 520 935
4575
402?
GTCTCATTTO SOAATAAOTT TTTCGTSTAT CTTGTTTOAT AGAGACCTTG TTTACCATAT
CTACAACATC TOCACAATAA AAMCCCTCC OA&OAOOGGO MOAXAATAA TAAOTTMTA
AGA8AACGGA ATMGOTS&T
AATCGCGTCT ATOAC&T&GC
ATtAAG&SCA ATTGWOAS' «wcm mwm
STCCATCGCA TTTATAA7GG á»ASO ACATCAT2CT
GA&dCT8AT GCCAGTTC&T
Meccowc GmTTCAöTA
GTATCCCÖAT AAGAGGAAGA
ACCGTATTCC GTXAAAATAT
G7WTAATAA AMATATTTT
Λ tgattcgcaa csccmm
AAGTTTGTTT TCrnTÁGOT
VHW3GGAA AGCAAAACGT
OWCTAGCC AGGWsAGAC
ATCASACAAT GGCAASGIGT
GATSACCTTT CC8OSST&
< ·«ΐ(; ( / γ : : ' 1 1'' :( : )( ( :('<)( ( ( : : 1 : 1 : ) ) :>' mmATTCA AOT3&AÖATA ·<$?
ATTGAWCCT TSTKMO emcecsss gömstwa
AT&TOAGWt AACATTtTTA
TGG7ÖAACTT ACATCAACTA
ATGG&ATATT CATAACTAA2
TCAAAACACC GCATCTGTiT attaaöscaa wwrrm'
AOTOS&TT ACTAGTTCAT
CAAAGGCAGT GCAAGSAAAG
GC&ASAGCSG CTTACTCTGA
TGGGCTGCTS GAACAGCA7G
- 40 ATICG75TGG GCGGGAGATO
CXCTTTCAG AAT8CTACCA
TCTTCATCGT SCCGCTGATT
GOTMW? CTGAAATMT cogg&tctt ktctsotk
TTTTWmT &TTGMATA5 τοαττημτ Grmcwrm
ACASATTTIC AACTTCSCTC atccwot ^wcm
CATTAATCGC GGiVSATOATT
WTCTTÖ© GTAATTMAA
GCGO3ACATT TrmX&TSC
GCTGGTA2&C ATCAGCTCTÖ
MCTSCCQ&T GGCTCCAGAC
Gcrrrmns tcoatttttg
8S7CAATATC ACCAATGA7G
AT8&OT&TC TSCTTCATAG
AMS8AAAAC ACCTOTCA wm»c sg®em
ATTSCCGATV ACÖC&TCOC&
AATTTTTTTC ATCCT38W3
ACAATAGAG? AGAAAGGAAG
GAT7&CGTG& OTTCCAA'TG
TXAATSCTAA TTC&n&ŐAT
CTMTAGTTA ttctccatea
CbSTTTCTGA AACGATTGAA
AASAG8AAGG WSACAACG
CCGATASCGA ΤΑΜ2ΤΜΑΑ
A2CCTAATTT ©TCTATGITT * * » ♦ ♦♦ :* * »»* x * « * x· * ♦ * *· »4·» X .
'TOATACCAT CTTTAGGATC &TTCCC&3GC TKJIACCG’TT l((()(ij:(((l<<l>:((<l(:Í ))((1( ()(( (()Ö<<<(():)((
C1ÚAÖTATTT TTCCGGGSM l^O)l)í^)l)))t)8)llÍ8)l)(((((8(·
MmsAmr TAcr&rrm
TGT2GMAAA CCnXCCCOC
TTTATTAATT TATTCrmr
TT&TGTMTT CCS&TCCAGC anrWTG AAÖGGGGAAT
GT&ATGATSA TATCCTTATA
WTWmC AAATGATATT
V*
AAW3AGTTA AATCAGTGGT γ**;·*
C&T&CSAGAö TGATTGCATG
CTAÁACGCTC GGGGrfCAGC
AAOGCAATCG CAGCACXAAT scmocc TTTCTGGCAC
AAGCAACAtC CCGCT&T&TC
Ί lx·
GGGGTO3SCT CTCG&TCMT 'ol
CS7ATA2CAA CTAAAAACTG e
TOTXTGTGC CTAWGATAG
CCATTSAGAA όΤΓΠΑΤΓΠ1
-TWAAOATG Ά8ΑΑΑΑΑΑΤΑ
CTCTTGTACA ÖTACTATTTA
8CM3S® TTGAATOTAA T^AATTGÖ MTCTOAACA TTAAATTTAC AAAA'TÖAATT G^CTAAGCC TGGGATATCG GAGA&3CTGC TVAATGATAT
GAACTATCAT WUWAC&8
G8TAA7A1GC CAAAAdGGGA «8?
4537
4«?
5887
518?
5157
5227
52«?
8347
5857 e?
852?
5587
5547
5787
5757
5537
58S7
588?
5087
8857
5127
5187
5247
5387
8357
8527
8457
5557 * **** »#♦» Φ Φ* * * * * XX X ♦ » Χ«« χ
- 41 CATTGTTCCA CTTATATCTT CTTTATTASA ATCTAAGTTT GTTMCATT3 AATTAMAAA OS»?
CAAATACCCC AAATTATTAT TAG&TTT&TT ASGCGMÖAT GATTCCCAGT TGGCTCTGCT SOS?
TTCCTGCTTA GGGGTSSSTG AGT7AAATCA GG&AGCTATC CAS&AG&TCA AAAAGCTTTA 072?
TGAAAASCCC AAGGATGAgG ATTCTGAAAA CCGAGCCTCT TTpJSACT CCTTTATGCA S787
CATTAAGCAT CTTCCAGAGC GTS&CA&CCA CTTAAAGGTT .J^«86© CGGTATCGTT 0S47
CGATSTGTCT TATATGTCTT CTTTTGAAGA TAAGGTGMA ASATCTTCAA TTATTASCGA SS 07
TTTA7GCCGG GTAATCATTT THTATCGCT TGATAACTAT ACAGATATTA TTCCAATCTC 0307
TATT.AATAAA GATAAAGATG TCATTTTAAA TGA&GTATTG TCTATTATTG AACATGTATG 702?
GTTAACAGAA GACTGCCTCC TSG&AASCCC TTCTCGGGTA TCGATTGTCG AACATAAACA 7087
TGTTTATTAT TTCCACCTAT TG&AAG&CTT TTTTGCATCA TWXTCACG CTTGTTTTAT 7147
.............0
TCATAGGCAA CAGAGAGAXA ATACATTATT AATGATTGGT AM37»TO ATTATAACCA ?287 '· f‘$ gg&tgttatt tgatattggt tttttaatcs ttttlggtct tgctaagaaa gattattaag ?3«? «. . *#
AGCTATATAC ATG GAT ACA. TCA ACT GCA ACA TCA GTT. GCT AGT GCG K 7310
Bet Áss Thr Ser Thr Alá Thr Ser Vei Alá Ser ΑΧ» Asn
IS 10
GCC W ACT TCG ACA TCG ACA CTG TAT GAC TTA GGC AOT ATG TCG MA 7304
Al® Ser Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr Asp Lee Gly Ser Bet Ser Lys
28 25
GAC GAA GTA GTT CAG CTA TTT AAT AAA GTG GGT GTT TTT CAG GCT GCG 7412
Asp Glu Vei v®X Gla Lén The Asn Lys Vei Gly V&j^ Ohu Gin Alá Alá ; JS 48 <5 .?'· Sí:
CTT CTG ATG TTT GCC TAT ATG TAT CAG GCA CAA AGG)GAT CTG TCG ATT 7400
Len Leu Met Phe Alá Tyr Bet Tyr Gin Alá Gin Seri Asp Len Ser Ile
SS - «0
GGA AAG TTT GCT GAT ATG AAT SAS GGA TCT AAG GAG TCA ACC ACA CCC 750»
Ale Lys The Ale Asp Bet Asn GXe Als Ser Ly® Gla Ser Xhr Thr Al®
70 75
CAA AAA ATG GCT AAT CTT CTG GAT GCT AAA ATT GCT GAT GTT CAG AGT 755«
Cin Ly® Bet Ale Asn Leu WX Asp Alá Ly® Xlé Alá Asp Val Gin Ser «8 85 88
AGT TCT CAC AAG AAT AAG AAA GCC AAA CTT CCT CA^> CAA CTG ATT GAC 7004
Ser Ser Asp Lys Asn Lys Lys AX® Lys Leu Pro Glu Glu Val Ile Asp ' 100 XOj
TAT ATA AAT GAT CCT±GC AAT CAC ATT ACA GTA GOT ATT AGC GAT 7053
Tyr XX® Aon Asp Pre Arg Asn Asp Ile Thr V&l Ser Gly Xle Ser Asp
210 1X3 228 125 # ♦♦♦**♦*
Κ 9 * ♦ <
Φ φ
ΦΦ Φ »»*
GTA ΑΑΤ Leu Asn CT? Als CTA Glu TTA Leu 13 8 CTG GG? GGT GAT TTG CTA AGG CTG AAC GCC GCT 7700
Gly Als Gly Asp Lea 135 Gla Thr vsl Lys Als Alá 140
ATT TCG GCC AAA TGG AAT AAC TTG AGG AGG ÓTA AAT AAT AGG CAC 7748
lle Ser Als Lys 145 ser.. Asn Asn Len Thr Thr 150 Val val Asa Asa Ser Gla 155
CTT δ» ATA CAG GAAí ATS TCT AAT ACT TTA AAC C?A TTA AGG ACT GCA 7735
Leu Glu lle 1SÖ Gla Glahefc Ser Asa i«5 Thr Leu Asn Len Len 170 Thr Ser Alá
CCT TCT CAT ATT CAC TGA CTG CTA TAG AGA ACT ATT TCA GGA ATA TGG 7844
Arg Ser 175 Aap lle Gla Ser Leu XSÖ Cin Tyr Arg Thr lle 185 Ser Alá lle Ser
OT GCT Leu Gly m MA Lys TAA CCGG&GAT&A < ET ATS OT AAT GTA AAT AGG GAT ATG Mer Leu Asa Vsi Aeu ser Asp Xle X ., 5 w 7833
c&o tgt ATG AGG TGT CTG GGC AGG GGT CTT AGG GGT ACT TCA GGT ATT 7840
Gla ser lö ífet Arg Ser Gly Als 15 Ser Als Al® Thr Alá í& Thr Ser Gly 11®
AAT CAG CCT GAA CTG ACT TCC GCT CTG GAT TTA CAA CTG GTT AAA TGG W
Asn Gin IS Ere Glu Vsl Thr Ser 38 AX& Len Asp Len Gla 35 Len Val Lys Ser 4Ö
áS gcg CCA TCA CGA AC? TG? AGA CA& AC? AGG CTT TTA GGA AGG CTA 803$
The Alá Tro Ser Alá «5 Ser Trp Thr Glu Ser 50 Thr Als Leu Fre Thr Pre 55
GCG CGA GGC CAC TGA TTA CTG ACG CCT TCT GTT GCT SÁG CAT CTG CTG 8ÖS4
Fra Als Gly His Sö Ser Leu Vsl Thr Fro Ser SS Vsl Alá Gin ASp Vsl Leu 70
AG? AA& CTG TTT GG? GGT ATT AST CCT CAA CTT ACT AST CGA AGA SÁG 8137
Ser Lys Leu 75 Phe Gly Gly lle Ser 88 Gly Gin Val Ser SS Arg Thr Gin
CTA AGG GA& GCA CAG CGC AGG ACT CAG AAT GCA AGG TCT GCG TAT GCT 8188
Gly Thr Fö Glu Fre Gla Arg Ser Thr $5 Gla Asa Als Ser 188 Ser Sly Tyr Pro
TAT OT TGT CAG CTG AAT AAC GTT CAG CCT CAG CTG ATG ATG ATG ATC 8320
Tyr Len X05 Ser Gin Vsl &sa Asn 118 Vei Asp Fre Gla 115 Als Met Met Hét Hét 110
CTG AGG CTG TTA TGG CTG GAT CTT TGA GCG CAG Ahh CT? GGG ACT ATC 827«
Val Thr Leu Leu Ser 13 5 Leu Asp Alá Ser Alá 138 Gla Lys <$*. val Alá Ser Hét 13 S
AAA AAC ÓMjdAudrik TGC AAC GAC ATG TAG ACT CA? CCT CAA AAT AAG GCG CTG CAT 8324
Lys Aaa Ser Asa xes Glu lle Tyr Thr Asp Oly 145 Gla Asa Lys Alá Len Asp 150
« 9 ΦΦΦ Κ + φφ * φ
AAT Ara AAA Lys AGG Thr 155 CTG Leu GAG Gla TTT Phe AAA Lys AAG Lys 15« CAG Gla CTG Leu GAA Gla GAA Gla CAA Gin X55 CAG Gla AAA Lys GCC Ale 8372
GAA GAG AAA GGA CAA AAA AGT AAA ATT GTT GGT CAG GTC TTT GGT TGG 8420
Glu Gla Lys Ale Gin Lys Ser hys lle Lee Gly Gin Vei Phe Gly Trp
17« 175 18«
TTG GTC GCG GTA. ACT GCT ATT GGA GCT ATT TTT' AAC CCG GCA CTG 3455
Pee Gly Vei Ale Vei Thr Ale Xle Ale Als Xle Phe, Aee Pre Alá Leu
155 130 135 20«
TGG GCT GTT GTT GCC GTT ACC GGA AGA GCA ATG GCA CTG CAA AGT GCA 8515
Trp Alá val Vei Ale vei Ser Alá Thr Ale Met Ale Leu Gla Thr Alá
SOS 318 315
GTT GAT GTA ATG GGC GAT AAG GCC CCG GAG GGG TTA AAG ACA GCA GCG 8554
Vei Aep m Mse Gly Aeg Lys Ale «re Gl« Alá Lee Lys Thr Alá Ale
SSG 335 33«
GAA GTG TTT GGC GGA GTA TCT ATT GCT GCA AGT ATT:, CTG ACA GCC GGC S512
Gla %1 The Gly Gly Val Sár He Ale Ale Ser Xle Leu Thr Ale Gly
SIS < sec .345
ATT GGC GGG GTG TCT TCA GTT ATG Φ» Φν> JL. AAA GTT GGC GAT GTC GGT AAC 055«
Xle Gly Gly vei Ser Ser Lea hefc Ser Lys vei Gly Asp vei Ale Asn
250 355 350
AAA GTT GGT TGA AAC ATC GTG AAA AGA GTT ACT AAA CTG GCC GAT GTA G7«8
Lys Vei Gly Ser Aea lle Val Lys Thr Vei Thr Lys Lee Ale Aep Val
255 370 375 30«
TTT GTT GAG AAC GTT GTT TCA AAA GTT GCG GCA ACG GCA AAT GGA TTT 8755
«he Vei Gla Asn Vei Val Ser Lys Vei Alá Ale Thr Ale Aaa Gly «he
255 28« 305
ACG ACC TCT GCA CGT TCT ATT GGG ACA ACT GTG CTG AAT AAT GAT TCT 8004
Thr Thr Ser Alá Arg Ser lle Gly Thr Thr Val Lee Asn Aea Asp Ser
30« 7 305 31«
GCG GAA TAT AGG ATA TTG GCT CAG TTA TCT GCT TAC GCG GTA CA& AAC 0852
Ale Gla Tyr Ser lle Lee Ale Gla Leu Ser Ale Tyr Alá Val Gin Asn
315 330 335
TTA ACT GGA CAG AGT GAA AAC CTG GGT GAG AGT GGG AAG GTT GAG CTG 8300
Aee Thr Arg Gla Ser Glu Asn Leu Gly Gla Ser Alá Lys Vsl Gla Leu
SS® 335 w
GAT AAA GCT GCA GCC GAG TTG GGA AAC CAG GCA AGG TAT TTA CAA AAC 8540
Asp Lye Ale Ale Alá Gla leu Arg Aea Gla Alá Ser Tyr Leu Gla Aea
Ser
GCT TCT CAG ΤΤΑ ΑΤΑ TGG GAC TCA GCA CGA GXA &ΑΤ AGG CGT ATT GTT Alá Ser Gla Leu Xle Ser Asp Ser Ale Arg Val Aaa Ser Arg lle Vei 378
355 * *♦»#♦**♦
Λ* > * * ♦ * * * * *♦# » «·*♦
AGT ©GT CGA ©η TAA * TTATTAAAGA GAATTTAATT ATG AAT ACT ATT GAT Két Asa Thr Xle Asp 5045
Ser Gly Arg Vei 350
1 5
TAT ACT AAT CAA ©TA AT© AGG GTT AAT TCT GTT TCG GAG AAT ACT ACC sose
Tyr Thr Asn ©le Vei Met Thr va l Asa Ser Val Ser ©lu tos Thr Thr
10 X5 20
GGC TCT AAT GCA ATT ACC GCA TCT ©CT ATT AAT TCA TCT TT© CTT ACC 3X42
©ly Ser Aon Alá Xle Thr Alá Ser AX& Xle Asn ©er ©er Leu Leu Thr
25 30 35
GAT GGT AAG GTC GAT GTT TCT AAA CTG ATG CTG ©AA ATT CAA AAA CTC 0150
Asp GXy Lys Val Asp VAX Ser Lys Lee Mer Leu Giu Xle Gin Lys Leu
40 45 50
CTG GGC AAG ATG ©X© CGT ATA TT© CAG GAT TA© CAA. CA© CAA CA© TT© 5230
Leu ciy Lys Met Val Ar® xle Leu ©la top Tyr ©In Glu ©la Gin Leu
55 SO SS
TG© CAG AGG TAT CAG ATC CAA CTG GCC GTT TTT ©A© AGC CAG AAT AAA 3280
Ser Gin Ser Tyr ©la, Xle Gin Leu Alá Val Ph® Giu. Ser ©la tor Lys
TO 75 00 S5
GCC ATT GAT GAA AAA AAG GCC ©CT ©CA ACA GCC GCT CT© GTT ©GT GGG 3334
Alá Xle Asp Glu Lys Lys AXa Alá Alá Thr Alá Alá Leu Val ©ly Gly
00 SS 100
GCT ATT TCA TCA GTA TTG GGG ATC TTA GGC TCT TTT GCA GCA ATT AAC 3302
Alá. Xle Ser Ser Val Lee. Giy Xle Leu Gly Ser Phe Al® Aia Xle Asn
205 110 115
AGT GCT AC© AAA GGC ©CG AGT ©AT ATT GCT CAA AAA ACC ©cc TCT ACA 3430
Ser Alá Thr Lys Gly Ma Ser Asp Xle Alá ©le Lya Thr Alá Ser Thr
ISO 125 . 130 7*'·
TCT TCT AAG GCT ATT GAT GC© ©CT TCT ©AT ACT GCG ACT AAA ÁCS TTG 5470
Ser Ser Lys AXa Xle Asp Alá Aia Ser top Thr Alá Thr Lys Thr Leu
135 140 245
ACT AAG GCA ÁCS GAA AÖC ©TT GCT ©AT GCT ©TT GAA GAT ©CA TCC AGC 3525
Thr Lys Alá Thr Glu Ser Val Al® Asp Alá vai ©lu Asp Alá Ser Ser
ISO 155 150 XS5
GT© ATG CA© CAA GC© ATG ACT ACA ©CA AC© AGA ©CG GCC AGC CGT ACA 3574
Val Met ©In ©In Alá Thr Thr Aia Thr Ar® Alá Alá Ser Ar® Thr
170 175 4 ' :«· XOO
TCC GAC GTT GCT GAT GAC ATT GCC GAT TCT ©CT CA© AGA GCT TCT CA© SS22
Ser top Val Alá top Asp Xle Alá top Ser Alá Gin Arg Ma Ser ©la
105 ISO 105
CT© GCT GAA AAC ©CT GCA GAT GCC ©CT CAG AA© ©CA AGT CGG ©CA AGC 3S7©
Lee Alá Gitt &Sh Alá Alá Aep Alá Alá ©la Lys AXa Ser Ar® Ma Ser
200 205 2ΧΟ
Φ 4*,. φ W * ♦ ♦ Φ * 9 9 Μ
X φ Φ*Χ· φ * * * · φ φ
Χ.« Φ 4*Χ «V ·ΦΦ*Χ
O3C TXT ATG GCT GCA CTA GAT AAG ATT ACT GGC TCT ACA CCA TTT ATT 8?28
Arg Phe hht AXa Als Val Asp Lys He Thr Gly Ser Thr Pro Phe Xle
21S 220 225
GCC CTT ACC AGT CTT GCC GAA ©SC ATS AAG ACA TTG CCA AGA. ACG GTA 975S
AX& Val Thr Ser Leu Alá Glu Gly Thr Lys Thr to Pro Thr Thr VaX
339 235 240 245
TCT GAA TCA GTC AAA TGT AAC CAT GAG ATT AGC GAA CAG CGT TAT AAG 38X4
S®r 81« Ser Val Lys Ser Asn His Glu XX® ser Glu Glu Arg Tyr Lys
25« 255 280
TCT GTG GAG AAC TTC CAG C&íS GGT AAT TTG GAT CTG TAT AAG CAA GAA 3862
Ser Val Glu Asn Phe Gin Gin Gly Asn X»e« Asp Len Tyr Lys Gin Glu
265 279 275
GTT CGC AGA GCG CAG GAT GAT ATC GCT AGC CGT CTG CGT GAT ATG ACA 551©
Val Arg Arg Alá Gin Asp Asp 11® Alá Ser Arg heh Arg Asp hét Thr
AGA GCC GCT CGC GAT CTC ACT GAT CTT CAG AAT CÖt ATG GGT CAA TCG 835S
Thr Al® Alá Arg Asp to Thr Asp Leu Gin Asn Arg Siet Gly Gin Ser
255 30« 505
GTT CGC TTA GCT GGG TAA TTGATCATGG TCGATACGTT TAATGATGAA 10995
Val Arg Lau Alá Gly *
21« 315
GTGCTTAATC ACTATCTTGA ACAAAAAGGG TACACA&T&C AGAAGGAGTT TCTTTGTGGC 10966
A8T8GCTTTT TTATCGGATG GCGGATTGAG ACCTCTTTTT TCTCATTAGC GTACAGACTT 10125 6 ©ATGAACAAG AACTGATTTT GTGCTCTTTT GAAGCACGTA ACÖU&C&GG GCTTAACÖGC 10136 CCTGTTTTAT CACTGACTCG CTTGCTCGAA GAGTTGTACC AC^TTTTTC GGGTATTAAG 18245 AAAATCAGTG CGATGAAATŐ TAAGATTGST TCAGATTCA© AACGTCAAAA GCGCGAAGAG 10385
TTGTTTAATT ACTTCATCAG AAAGGGCGCT 62GCASCAA6 AAACAGAAGA CGGAATTTGG 18355
TTCGTAAVGA ATGTAAATAG TTACAAATTT TTATTTCTAT TAACTATTGA GGAAAATTTA 10525
ATGAATTTAT CTGAAATTAC TChACAAATG GGTGAAGTAG GTAAAACGCT GAGTGATTCT 195 8 5
TTTCTGCCAA CAAGCTACTG GTGTGGGCGG CTGTAGCTGC GGCAAATCAT AAGCTTCCCA 10726
AATAT8C&GA ATCTATCCTG GATGTATXGC CGCAAATTAT ACCCGATA&A AAAGATATCG 1078®
CACATTTAGA ATTTATTATT TTATATGGAT TAAATAGAAA AAATOATGCG GTAAASGCTC 10845
TGGAGGACTT TATGGATGAT GAGACAAGCC AGTTGTTATG CTGTCTGGTC CACGAGAATA 18506
ATAGAAGCTS GACACTAATG
GTAC0AAA2T TTCTMGTTr
TTWAKn AATOAAATT
TATGtTTAM GGAATTAGTC
AAÖCCGÖQTA ASCTCWTOG
GAATSCSAXT AÖW2TCAAT
GACTTTTMT osactagcc
GTOSACAAGT SGAOÚ3XCTT
AAAAGATCAT TTAGCTSCCT
AAGCCGCCCS GCACCGGGGS
ACXGCCCACT GCTCM^CÓC
WATACTSA SGTCTTAAOC &TCCGASGC& TCCSSS^CÁT otatgaactg tcsaaaaagg
TTTAGASAST· TA&&&OTAA
ATATCWXT2 «M2GAAAX
AÖW3GÖT3T XTCSTTAACC
AXGTTSGATl 'TGACATATCA csotatttttt ttetwra®
Aöcxsmtím WSTGGG3S.
AWCTTTTGG AAGAACTGÖT
TACTrCTCXA CTCACTfóXT
ÖATTATGASA TGGXTS&TAG
CTTTTCAATX ®ΤΠ»Μ
AGCACAATAT TTGTCAATTC
TCTOTCCAG' SCATTAAIAT
QTTCAGCGXA TTTCTSÖ&TA
ATCAGATTTC STCÜAGCAGG
- 46 ~ ttttaatctc atattgagtt
TAACAGAGAT ATTTATAATA cawww? nsw?w wwtssts romw tóswmc 1ACAC1AGGA
OGTTATCTGÜ CTTTTCACTG
CTCOTTTTt TCCCSGXAC2
OTgeSASTTC ATTTACTOSG ccsssccatc coAxcrm
AXSAAAAXXC SAAAAGTSTT
ÖGCCGACAAG CSGGTTGGTA
TAAAAGAXCA TTTGGCXGCC
CAAGCCGttt GGCACO3CCG
TACC8CSTAT TGCTCAÖ2CA
C&TAAAAAGT ΑΟΑΤΓΓΑΑΑΑ
AAACWATAT T&&STTGCAT
AAAXAXTG1A ATMAXGATÖ
ASAffiXXÚTA ATTTTTIATC acatőasöca ssssome
Í5T»» TAICTCIATT txxcatcwx TAíseteros
CTGOTWTG ATTGÖCTATT
T8CTAASC&T ATTTATTTTA
AGCTTTÖCGC XGGXATGAXA
CTCTTTGGCG XAOTCACTO
CCTWrWAT CACGCGAOAT ctthsgt&ct rmrceoGCG
ACTOATAGT OTCTWCC
ACTGTTTCTÖ ÖATA&ASCTT φ $.>·... > <**» X ** ♦ * * * *X X 0 * * *»x * * * 0 * ·* * #*0 -0 ««* i* *«*»
TAAACMTTG ATAMtTTCA
CCTTMTGAA AAAXAX^GCT
AGTTTATA3T CGtTAACTAT
ASATATAAAA AGGSATGA&T
CGÓCATA11A CTAÜTGCGGC
WCCTCWG CTSTTCGTCT
TOMATATSA ATGCGAO&AC
TCTCGTCtW CCCCACCGCC
COXCCCATTG CTCAGGCATT
ÖATACTTCAA ÖSCTTAAGCC
TCÍGGGTCAT GCCGGTCTTX
TATGAAAA&X CGAAAAGTCT C^CCCACAA GTGGACAOGC
Λ\'γ
TTAAAASATC AWWCTSC
TTATTAATTA CTGTTÜATTG
TCTGATAAAT GTSATTGGTA
AAAGAGWTA ATAGAGCAAG
CA1AAATTTA CCGC1ATXTG
TGX&TGTACA GGC1CTTATA ·*<· k.
XAWCCGATA 2dASGCT3GC „Av
AihoAC&T ertmcTAAT ACATCCACTG TCTGGTTCTT
TCACOSAA&C SACCATTXC
TTCAACTXGA GACTGXAATG
GAAATGTTTC TGOTATTTTC
GWTAA&CTO XTCGCXCATC
ACGGAGGTCA AAATTCOGTT
AWJAACATC GCW3AT&TC •'\·ν:.
xo$s«
1X22«
XXÖSS mo
XX2ÖS
1120
XX32S
ΧΧ3Ο
UUŐ nsM
XX5O
11S2S nos xxw xxs©«
XX8GS »538
XX98S
X284S
1210« mss
12228
1228«
12X4«
X24®8
124««
1252«
X2S8S
12«2« *♦ « # ♦♦ * * » y *♦« κ ♦ » * * * κι*# 9 «<Χ4Γ ί» Λ»<·Χ
- 47 A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 940 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULÁT íPVS: fehérj e
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met Ile Thr Hi® Gly Phe Tyr AI® Arg Thr Arg His Lys Hi® Lys Le»
1 5 IS
Lys Lys Thr Ph© Ile Met Leu 2® y Ser Ale Gly Leu 25 Gly Leu Phe Phe Tyr J 3®
Val Asn Gin Asn SeriPhe Alá 3S A :g< Asn Gly Glu Asn 4® Tyij Phe Lys Leu Ser L·· 45
Ser Asp ser Lys Lee Lee Thr Gin Áss Alá Ale SS SS Gin Asp Arg Leu Phe 5®
Tyr SS Thr Leu Ly® Thr Gly Glu 7® Thr Val Al® Asn 75 Ti® Ser Lys Ser Gin SS
Gly Xle Ser Leu Ser Vei He SS Trp Ser Leu Áss. 0® Ly® Hl® Leu Tyr Ser 55
Ser Glu Ser Glu hét Met Lys 10® Ale Gly Pro Gly 305 Gin.. Sin ile Ile Leu Ú 110
Pro Leu Lys Lys Leu .Ser Vei I1S í Glu Tyr Ser Aia 32® LeuPro Vei Leu Gly Á 125
Ser Al® Pro Val Val Aia Al® 136 325 Gly Gly v»X Alá Gly Mi® Thr Asn Lys 14®
m 14S Thr Lys Hét Ser Pro Asp 1SÖ Ale Thr Lys Ser 155 Asn Thr Thr Asp Asp IS®
Lys Ale Leu Asn Tyr Al» Al® 3SS Gl» Gin Al® Al® 17S Ser Leu Gly Ser Sin 175
Leu Gl» Ser Arg Ser Le» Asn is® Gly Asp Tyr Ale 1S5 Ly© Asp Thr AI® Leu IS®
Oly hét Al® Ser Ser Gin Ale 1S5 Ser ser Gin Leu 200 Glh Alá Trp Leu Gin 205
Kb Tyr Gly Thr Al® Glu Val 21® ' 235 Asn Leu Gin Ser Gly Asn Asn Phe Asp 22®
SXy 225 Ser Ser Leu Asp Phe Leu 250 Leu Pro Phe Tyr 235 Asp Ser Glu A»» Met 24®
Leu Ale Phe Gly Gin Vei Gly Ale Arg Tyr ile Asp Ser Arg Phe Thr
24S 25® 255
X fc «4 ♦ fc· ♦ ♦ ♦ 4 ♦ ♦ 4
Aln Asn leu Gly Alá Ile Gin Arg Phe Phe Phe Le® Pro Gin Asn 278 Asn Ke® Thr Len Arg
Gly Tyr Asn 258 Asp Gin 288 255 Aep 8er Gly Asp 23$
Val Phe
275
les Gly Ile 288 Gly aly Glv Tyr Trp Arg Asp Tyr 285 Phe Lys 388 Ser Ser vei
Asn 385 Gly Tyr Phe Arg heh 318 Ser Gly Trp His Gin 315 Ser Tyr Asn Lys Lys 320
Asp Tyr Asp Gin Arg 325 Pro Als Asn Gly Phe 330 Asp ile Arg Phe Asn 335 Gly
Tyr Les Pm Ser 348 Tyr Pro Alá Lee GXy 34$ Als Lys Lei Két Tyr 388 Gin Gin
Tyr Tyr Gly 35$ Asp Aen Val Alá Len 358 Phe Asn Ser ASp Lys 355 Len Gin Ser
Asn Pro Gly $78 Ale Alá Thr Val Gly 375 Vei Asn Tyr Thr Pro 388 Ile Pro Len
Vei 38$ Thr Get «X Ile Asp 388 Tyr Arg Als Gly Thr 385 Gly Asn Gin Asn Asp 488
Len Len Tyr $®r Kei 485 Gin Phe Arg Tyr Gin 418 Phe Asp Lys Pm Trp «15 Ser
Gin Gin Ile Gin 428 Pro Gin Tyr val Asn 525 Gin Len 3A Arg Thr Les «38 Ser Gly
Ser Arg Tyr 835 Asp Len Val Gin Arg «48 Asn Asn Asn Ile Ile «45 Len 81® Tyr
lys Lys Gin 558 Asp lle Len Per Leu «55 Asn Ile Pro Kis Asp 558 Ile Asn Gly
Thr 555 Gin Síé Ser Thr Gin 478 Lys lie Gin Len lie «75 Vei Lys Ser Lys Tyr 4S0
Gly lsen Asp Arg lle Val Trp Asp Asp Ser Als Les Arg Ser Sin Gly
48$ «80 «85
GXy Sin Ile óla Kis 8ly Oly Ser Sin Ser Us Gla Asp Tyr Gin Alá w sós sic
Ile Leu Pro Als Tyr Val Gin Öly Gly Ser As® Ile Tyr Lys Vél Thr SIS §2& 52S
Als Arg Als Tyr Asp Arg Áss Gly Áss Ser Ser Áss Áss v&i Gin Le® 538 $35 S«0
Thr Ile Thr Vei Len Pro Áss Gly Gin Vei vei Asp Gin val Gly Val 54$ 558 SS5 SSG φ φ
Thr Asp Phe Thr Alá Asp Lys Thr Ser Alá lys Alá Asp Gly Xle 875 Gitt
555 570
Mis Xle Thr Tyr Thr Alá Thr Val Lyg 589 585 lys Áss Gly Val Alá Gl® 559 Alá
As® val Pr© val Thr Phe Ser Xle Val 985 890 Ser Gly Thr Alá 895 Thr léé Gly
Alá As® Ser Alá. Arg Thr Asp Oly &s& Sly lys Alá Thr 810 815 820 Val Thr lett
Lys Ser Alá Thr Pro Gly Sin Val Val 825 810 Val Ser Als lys 855 Thr Alá Gitt 840
Met Thr Ser Pro leu A®» Alá Ser Ale 885 val xle Phe Val 880 Asp Gitt 855 Thr
lys Alá Ser Xle Thr Gle Xle lys Alá 889 885 Asp lys Thr Thr Alá Lys 870 Al®
Asp Gly Ser Asp Alá Xle Thr Tyr Thr 875 859 Val Arg Val' Mer 885 Lys Gitt Gly
Alá Pró Val Val Asp Gin lys Val Thr 889 SS5 Phe Ser ly® Asp 799 Phe Gly Thr
lev As® lys Thr Gle Alá Thr Thr Asp 795 719 Gitt Áss Gly Tyr 715 Alá Thr Val 720
lye les Ser Ser As® Thr Pre Gly lys 725 Alá Xle Val Ser 730 Alá lys 735 Val
Ser Oly Val Gly Thr Gitt vei lys Alá 740 745 Thr Thr Val Gitt Phe Phe 750 Alá
Pre Leu Ser Xle Asp Gly Asp lye Vei 75S 780 Thr Val Xle Gly 788 Thr Gly Xla
Thr Gly Alá lett Pro lys Asn Trp le® 770 775 01® Tyr Gl/ Gitt 750 val Lys lett
Glh Alá Thr Gly Gly Asn Gly lye Tyr 785 799 Thr Trp lys Ser 795 Ser As® Thr 990
lys lle Alá Ser val Asp As® Ser Gly 595 Val Xle Thr le» 910 As® Glu §15 Lys
Gly Ser Al® Thr lle Thr Val Val Ser 820 825 Gly Asp As® Gl® Ser Alá 950 Thr
Tyr Thr lle As® Alá Pre Gly Ser Xle 535 989 Val Xle Alá val 585 Asp Lys AStt
Thr Arg Val Thr Tyr Phe Asp Alá Gitt as® Lys Gye Lys Thr As® Ser
859 855 δ«0 *» * » * * * *» * * «** * ♦** »·*· ♦ * * ·>
♦ ♦ * X
Ma m
Trp
Thr
SÍ»
Le» Lett
As» Lys Tyr Pro Tyr Tyr 5SS 880
Lys-Sin ser Ser Ser 81« SOS
Π® Tyr Ser Thr
W
Ser Lys Ser Le»
835
Ser Oly Val Ser SIS
Ser Thr Tyr Asp Leu/v&X Thr Lys SIS 320
A®» Val Gly Val ’ $2$
Asn Asn Lys Asn AU Phe Ser V&X Cys Val Lys *
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÓ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HŐS S E A: 193 ami no s a v
TíPUS A: aaínosav
TOPOLÓGIÁJA: 1 i n-eári s .> Οώ
EKVSNCIA LEÍRÁSA:
Ne» Asp Thr Ser Thr Alá Thr Ser Val Alá Ser AXa Asn Alá Ser Thr
X 5 20 25
Ser Thr Ser Thr Val Tyr Asp le» Oly Ser Net Ser Lys Asp 82» Vei
20 25 30
vax 81» Le» Phe As» Lys val 8Iy Val Phe Gin Alá Alá Le» Lee Net
35 20 <5
Phe Alá Tyr Met Tyr 81» Alá 81» Ser Asp LStt Ser XXe Alá Lys Phe
50 55 80
Als Asp Net As» 81») Alá Ser Lys 81» Ser Thr Thr Alá 01» Lys Net
55 ' TO 75 80
Α1» Asn Leu Val Asp Alá Lys lle Alá Asp VaX Sin Ser Ser Ser Asp
SS 30 35
Lys As» Lys Lys AXa Lys La» Pro 81» 81» Val He ASp Tyr 22« Asn
200 105 120
Asp Pro Arg AS» Asp XXe Thr Vei Ser Oly Xle Ser Asp Le» Asn Alá
115 120 225
Sí». Le» Oly Alá Gly Asp Leu 81» Thr Val Lys Alá Alá lle Ser Alá
120 135 240
Lys Ser Asm As» Le» Thr Thr Val Val Un As» ser 81» Le» 81» lle
245 ISO 155 ISO
8ln 81» Met Ser AS» Thr Le» As» Le» Le» Thr Ser Alá Arg Ser Asp
1S5 170 175
y» #6 9 «· * *' » « ♦ Λ » ν * » » * ♦ *
Φ«Κ χ *·»* *♦. ♦**« * ♦·« e
Ue din Ser Leu Sin Tyr fcg Thr Ih Ser Alá Xle Ser Leu Gly Lys .„Λ t*c 190
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁNÓ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 381 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
4. AZONOSÍTÓ SZÁNÓ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Mer Le» Asn Val Aaa Ser Asp ile Gin Ser Met Arg Ser Gly Alá Ser
1 5 18 15
Alá Alá Thr Alá Thr ser Gly Ile Asn Gin pr© Glu val Thr Ser Alá
28 2$ 38
Len Asp Len Sin Len val 5yg Ser Thr Alá Pr© Ser Alá Ser Trp Thr
IS ' 48 45
Sin Ser Thr Alá leu Pr© Thr Pr© Pro Alá Gly Kis Ser Leu val Thr
58 55 88
Pro Ser Vei Alá Sin Asp Val Len Ser Lys Leu Phe Gly Gly Xle Ser
SS 70 75 88
Gly Glu Val Arg Ser Arg Thr Sin Gly Thr Glu Pr© Gin Arg Ser Thr
85 28 25
Gin Asn Alá Ser Ser Gly Tyr Pr© Tyr Leu Ser Gin Val Asn Asn Val
188 ν 18s 118
Asp Pr© Gin Alá Mer két hét Met Val Thr Leu Leu Ser Leu Asp Alá
US 138 185
Ser Ale Gin Lys Vei Alá Ser Mer Lys Asn Ser Asn Glu xle Tyr Thr
138 135 148
Asp Gly din Asn Lys Alá Len Asp Asn Lys Thr Leu Glu Phe Lys Lys
145 158 155 158
din Leu Glu Glu Gin Gin Ly® Alá Glu Glu Lys Alá Glu Lys Sár Lys
185 178 175
Ile Leu Gly Gin Val Phe Gly Trp Leu Gly Val Ali Val Thr Alá Xle
188 1S5 188
Alá Alá Xle Phe Asn Pr© Al» Leu Trp Alá Val val Alá Val Ser Alá
155 > 288 285
ΧΦ * Φ ** fc fc «« ♦ * φ «' »** $ ♦ * fc * S * «44 ♦ «♦· *fc «»νΦ ~ 52 -
Thr Alá mt Π3 AiA Les 81a Thr Al» Val Asp Val h»fe Cly A»g lya Alá
215 223
81» Alá le» lys Thr Als A) a 81» rrl Ph» Gly 8ly Vei Ser XI®
225 233 235 2» 8
Alá Ma Ser lls Lea Thr Alá Giy lle 8ly 81y val Ser Ser Ae«
áss 258 ,; 255
ssa hyg Val Giy Asp V&i Als Aa» lys Val Sly 8sh As» Xle Val lys
288 2®» s?e
Thr val Thr lys les Als Asp Val Phe Val 81» hsa Vei Val Ser lys
27$ 2S8 285
VAX Alá Alá Thr Alá Asm 8Xy Ahe Thr thr S»r Alá Arg Ser Xl< 81 y
2 SS 2 SS 388
Thr Thr Val 1®« Áss As» Asp Sár Als 81» Tyr Ser 11« 1«» Als 81»
389 319 313 328
Xísö Ssr Alá Tyr Als Val 81» As» t-eu Thr Arg 81a Ser 81» As» leu
325 338 A 335
Gly 81» Sár Als lys Val 81» le» Asp lys Als Als Alá 81» Lse Arg
3« .» 345 358
AS» 8ls Als §»r Tyr Ims 81» &»» Als Ser 81a les Xle Ser Asp Ser
355 3AV 355
Als Arg val Asn Ser Arg 11« Val Ser Cly Arg Val *
37S 37» 388
ΑΖ 5, AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 315 aminosv
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓG IÁJA: 1 i n sár í s
MOLEKULATÍPUS: fehérje
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
WV Aea Thr 11» ASp Tyr Thr As» 81» Val Hét Thr Vei As» 8er Val
1 5 18 18
Ser 81» As» Thr Thr 8ly Ser As» Als Xle Thr Al» Ser Alá Xle A»»
Ah 25 78
Ser Per ΙΑ» hee Thr Asp Sly Lys y&x Asp Val Ser lys Les fíefe Χλ«
15 48 . 88
81« xle 81» Lys les X>»« 8iy hy» M»fc Val Arg tle les 81» Asp Tyr
58 55 88
81» 81» 81» 81» A®» S»r 81a Ser Tyr 81» Xle 81» A»» Alá Val Phe
55 73 75 58
* »« Φ ν *Φ * χ t * Φ 0 ϊ. Λ * * * * « »Χ« « »·*« *Φ Ή ν«
Gitt Ser Gla A®» Lys Al® XI» Aap Glu lya Lys Al® Alá Alá Thr Al®
SS 90 55
Alá les Vei Gly Gly-Alá Xle Ser Ser 100 lóg Val Les Gly Xle Leu Gly Ser 110
Phe Ma Al® 1X5 Xle Asn Ser Alá Thr Lys GXy Al® Ser Asp Xle Al® Gle 128 125
lys Thr Al® 130 Ser Thr Ser Ser lys AX® 135 Xle Asp Alá Alá Ser Asp Thr xao
Alá Thr lys 145 Thr lett Thr Lys AX® Thr 158 Gitt Ser V®X Ale Asp Alá val 155 ISO
Gitt Asp AX® Ser Ser Vei Kel Gla Gin 155 Al® 170 Met Thr Thr Alá Thr Arg 175
Alá Al® Ser Arg Thr. Ser Asp Val Ale ISO 18S Asp Asp Xlé' Alá Asp Ser Als 190
Gin Arg Al® X95 Ser Gin Lee Al® Glu Asa 290 Alá Al® Μρ Alá Alá Gitt lys 205
Alá Ser Arg 2X0 Alá Ser Arg Phe Két AXa 215 &X& Val Asp ly® Xle Thr Gly 220
Ser Thr Pre 225 Phe Xle Alá Val Thr Ser 230 Les Ale Gle GXy Thr Ly® Thr 235 250
Les Pre Thr Thr Vsl Ser Gla Ser Val 245 lys 250 Ser Aaa His Gls lle Ser 285
Gle Gle Arg Tyr lys Ser Val Glu Aen 280 2 SS Phe Gitt Gitt Gly AStt Lett Asp 270
Les Tyr lys 275 Gin Gis Vei Arg Arg .Al® 280 Gla Aap Asp Xle Al® Ser Arg 285
les Arg Asp 2S0 Arg Met Gly Kér Thr Thr Alá Alá Arg Asp 2 SS Sin Ser Val Arg lev Alá Gly Les Thr Asp les Gla Asn 300 4
305 ' 3X8 3X5

Claims (9)

  1. SZABADALMI IGÉNYPONTOK
    1) Eljárás nem-patógán E. coll mutáns előállítására epiteliális HeLa-sejtekben citopatogén hatást kiváltani képes patogén. B. coli mutánsból - amely citopatogén hatás részint abban nyilvánul meg# hogy polimerizált .aktínból kábelek képződnek# amelyek a sejtek egyik végétől a .másikig áthúzódnak, részint pedig abban# hogy nő a vinvulin mennyisége- -# azzal jellemezve# hogy a patogén S, coli törzset mutagenízárjuk és a cítoptatikus hatást kiváltani nem képes mutánsokat kiválasztjuk.
  2. 2} Nem-patogén mutáns E. coli törzs# azzal jellemezve# hogy az az I. igénypont szerinti eljárással lett előállítva.
  3. 3j A 2. igénypont szerinti nem-patogén mutáns E. coli törzs# azzal jellemezve, hogy legalább egy olyan mutációt hordoz# amely az LEE-Iökusz legalább egy génjét inaktiválja.
  4. 4) A 2. vagy 3. igénypont szerinti nem-patogén mutáns B. coli törzs# aszal jellemezve, hogy az olyan E. coli törzsből nyerhető# amely nyulakra nézve patogén# és amely az 01.03 szérumcsoporthoz tartozik.
  5. 5) A 4, igénypont szerinti mutáns törzs, azzal jellemezve# hogy 0103 szérumcsoporthoz tartozó nyálakra nézve patogén E, coli törzsként a CNCM-nél (.Mikroorganizmus' Tenyészetek Francia nemzeti Gyűjteménye) 1997 január 15.-én 1-1807 szám alatt letétbe helyezett BIO jelű törzsből állítható elő.
    δ) A 2-5. igénypontok bármelyike szerinti nem-patogén. mutáns E. coli törzs# azzal jellemezve# hogy legalább egy **· * .*<**» ** «. » * « « 9* » ♦ »χ» az LSE-iőkusz legalább egy aep-~génj ének inaktiválását eredményező - mutációt hordoz.
  6. 7) A Blö/C&l jelű nem-patógán mutáns .5. coli törzs, amely a CNCM-nél (Mikroorganizmus Kultúrák Francia Nemzeti Gyűjteménye) 1997 január 15,-én 1-1808 szám alatt letétbe lett helyezve.
    S) Vakcina, amely legalább egy, a 2-7, igénypontok bármelyike szerinti nem patogén mutáns £. coli törzset tartalmaz .
  7. 9) A 8,- igénypont sserinti vakcina, amely orálisan, alkalma zhat ő ,
  8. 10) A 2-7. Igénypontok bármelyike szerinti mutáns £. coli törzs alkalmazása vakcina előállítására.
  9. 11) A 10. igénypont szerinti, alkalmazás, azzal jellemezve, begy nyuiaknak beadni kívánt vakcinát állítunk elő.
HU9800094A 1997-01-20 1998-01-20 Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof HU228496B1 (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9700532A FR2758568B1 (fr) 1997-01-20 1997-01-20 Souches mutantes non pathogenes d'e. coli, leur procede d'obtention et leurs utilisations

Publications (4)

Publication Number Publication Date
HU9800094D0 HU9800094D0 (en) 1998-03-30
HUP9800094A2 HUP9800094A2 (hu) 1998-09-28
HUP9800094A3 HUP9800094A3 (en) 2001-11-28
HU228496B1 true HU228496B1 (en) 2013-03-28

Family

ID=9502763

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HU9800094A HU228496B1 (en) 1997-01-20 1998-01-20 Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof

Country Status (5)

Country Link
EP (1) EP0864644B1 (hu)
DE (1) DE69831888T2 (hu)
ES (1) ES2251760T3 (hu)
FR (1) FR2758568B1 (hu)
HU (1) HU228496B1 (hu)

Also Published As

Publication number Publication date
FR2758568B1 (fr) 1999-03-26
HU9800094D0 (en) 1998-03-30
EP0864644A1 (fr) 1998-09-16
EP0864644B1 (fr) 2005-10-19
HUP9800094A3 (en) 2001-11-28
DE69831888T2 (de) 2006-07-27
DE69831888D1 (de) 2006-03-02
ES2251760T3 (es) 2006-05-01
HUP9800094A2 (hu) 1998-09-28
FR2758568A1 (fr) 1998-07-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Law Adhesion and its role in the virulence of enteropathogenic Escherichia coli
Bliska et al. Bacterial resistance to complement killing mediated by the Ail protein of Yersinia enterocolitica.
HU205262B (en) Process for producing new, nonreverting living vaccine and stock against shigella
JP2002521345A (ja) 鳥類病原体を制御するため生きた弱毒化サルモネラワクチン
KR100628657B1 (ko) AroC, OmpF 및 OmpC 유전자 각각에 비복귀돌연변이로 약독화된 백신에 유용한 박테리아
De Rycke et al. Enteropathogenic Escherichia coli O103 from rabbit elicits actin stress fibers and focal adhesions in HeLa epithelial cells, cytopathic effects that are linked to an analog of the locus of enterocyte effacement
MXPA03008296A (es) Composiciones de vacuna antibacteriana.
CN1798574B (zh) 无荚膜的多杀巴斯德氏菌hyaE缺失型突变株
JP4189031B2 (ja) グラム陰性菌からの異型o抗原の高レベルの発現に有用な生ワクチン担体株と生ワクチンとして使用するためのその誘導体
Nougayrède et al. The long‐term cytoskeletal rearrangement induced by rabbit enteropathogenic Escherichia coli is Esp dependent but intimin independent
MXPA02010407A (es) Aislamiento y caracterizacion del operante csa (etec-cs4-pili) y metodos para su uso.
EP0564689B1 (en) Recombinant live vaccines against Gram-negative enteric pathogens
HU228496B1 (en) Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof
Pillien et al. Role of adhesive factor/rabbit 2 in experimental enteropathogenic Escherichia coli O103 diarrhea of weaned rabbit
Aguilera Galaviz et al. Detection of potentially cariogenic strains of Streptococcus mutans using the polymerase chain reaction
MXPA05000467A (es) Formulacion de micoplasma gallisepticum.
WO1998002523A1 (en) Vaccine preparations
EP0209599A1 (en) A 987p fimbriae-producing microorganism, a vaccine for the immunization of pigs as well as a method for production of the vaccine
Galaviz et al. Detection of potentially cariogenic strains of Streptococcus mutans using the polymerase chain reaction
RU2140981C1 (ru) Авирулентный штамм vibrio cholerae не-01 серогруппы (варианты), способ получения штамма (варианты), вакцина
EP1181371B1 (en) Attenuated mutant enteropathogenic e. coli (epec) strains, process for their production and their use
Isberg Intracellular trafficking of Legionella pneumophila within phagocytic cells
AU2003236302B2 (en) Virulence genes and proteins, and their use
CN116782926A (zh) 高剂量志贺氏菌疫苗制剂
AU2013201267B2 (en) Anti-bacterial vaccine compositions