HU228496B1 - Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof - Google Patents
Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof Download PDFInfo
- Publication number
- HU228496B1 HU228496B1 HU9800094A HUP9800094A HU228496B1 HU 228496 B1 HU228496 B1 HU 228496B1 HU 9800094 A HU9800094 A HU 9800094A HU P9800094 A HUP9800094 A HU P9800094A HU 228496 B1 HU228496 B1 HU 228496B1
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- ser
- thr
- lys
- gly
- asp
- Prior art date
Links
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 title claims description 27
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 9
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 54
- 230000000120 cytopathologic effect Effects 0.000 claims description 29
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 26
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 claims description 22
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 claims description 14
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 claims description 14
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims description 14
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 10
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims description 10
- 244000052769 pathogen Species 0.000 claims description 8
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 claims description 5
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 5
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 38
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 35
- 241000208202 Linaceae Species 0.000 description 19
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 18
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 14
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 14
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 13
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 13
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 12
- YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N Thr-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 11
- 235000011389 fruit/vegetable juice Nutrition 0.000 description 11
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 11
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 11
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 10
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 9
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 9
- 101100500479 Hafnia alvei eaeA gene Proteins 0.000 description 8
- 101150107911 eae gene Proteins 0.000 description 8
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 8
- 230000004044 response Effects 0.000 description 8
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 7
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 7
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 7
- 210000004292 cytoskeleton Anatomy 0.000 description 7
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 7
- 238000007096 Glaser coupling reaction Methods 0.000 description 6
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 6
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 6
- SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 6
- LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N 0.000 description 6
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 6
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 6
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 6
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 6
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 6
- 108010037896 heparin-binding hemagglutinin Proteins 0.000 description 6
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 6
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 6
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 6
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 6
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 6
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 6
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 6
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 6
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 6
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 6
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 6
- WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N 0.000 description 5
- STTYIMSDIYISRG-UHFFFAOYSA-N Valyl-Serine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NC(CO)C(O)=O STTYIMSDIYISRG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 5
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 5
- 230000034994 death Effects 0.000 description 5
- 231100000517 death Toxicity 0.000 description 5
- 101150099846 eaeA gene Proteins 0.000 description 5
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 5
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 5
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 5
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 5
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 5
- OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N Asp-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 4
- SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N L-rhamnopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N 0.000 description 4
- PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N L-rhamnose Natural products CC(O)C(O)C(O)C(O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N Lys-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- KPKZJLCSROULON-QKGLWVMZSA-N Phalloidin Chemical compound N1C(=O)[C@@H]([C@@H](O)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C[C@@](C)(O)CO)NC(=O)[C@H](C2)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]3C[C@H](O)CN3C(=O)[C@@H]1CSC1=C2C2=CC=CC=C2N1 KPKZJLCSROULON-QKGLWVMZSA-N 0.000 description 4
- RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N Ser-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N Sulfisoxazole Chemical compound CC1=NOC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=C1C NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- LVRFMARKDGGZMX-IZPVPAKOSA-N Thr-Tyr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 LVRFMARKDGGZMX-IZPVPAKOSA-N 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N acetic acid Substances CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 4
- 230000008859 change Effects 0.000 description 4
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 4
- 101150117399 espB gene Proteins 0.000 description 4
- 210000001650 focal adhesion Anatomy 0.000 description 4
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 4
- 230000004660 morphological change Effects 0.000 description 4
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 4
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 4
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 230000001018 virulence Effects 0.000 description 4
- 230000004580 weight loss Effects 0.000 description 4
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 3
- IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 3
- 101100500480 Escherichia coli O127:H6 (strain E2348/69 / EPEC) eaeB gene Proteins 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 3
- VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- MMAPOBOTRUVNKJ-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asp-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O MMAPOBOTRUVNKJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- FPCGZYMRFFIYIH-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FPCGZYMRFFIYIH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- SNXUIBACCONSOH-BWBBJGPYSA-N Ser-Thr-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNXUIBACCONSOH-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 3
- HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N Thr-Arg Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 3
- IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 3
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 3
- LECUEEHKUFYOOV-ZJDVBMNYSA-N Thr-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O LECUEEHKUFYOOV-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 3
- CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 3
- ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N Tin Chemical compound [Sn] ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N Val-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 3
- 102000003970 Vinculin Human genes 0.000 description 3
- 108090000384 Vinculin Proteins 0.000 description 3
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 3
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 3
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 3
- 101150055155 espA gene Proteins 0.000 description 3
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 3
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 3
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 3
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 3
- CXKWCBBOMKCUKX-UHFFFAOYSA-M methylene blue Chemical compound [Cl-].C1=CC(N(C)C)=CC2=[S+]C3=CC(N(C)C)=CC=C3N=C21 CXKWCBBOMKCUKX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 229960000907 methylthioninium chloride Drugs 0.000 description 3
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 3
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 108010048397 seryl-lysyl-leucine Proteins 0.000 description 3
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 3
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 3
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical group C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- FBLMOFHNVQBKRR-IHRRRGAJSA-N Arg-Asp-Tyr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FBLMOFHNVQBKRR-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- LRPZJPMQGKGHSG-XGEHTFHBSA-N Arg-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O LRPZJPMQGKGHSG-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N Arg-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- WCZXPVPHUMYLMS-VEVYYDQMSA-N Arg-Thr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WCZXPVPHUMYLMS-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 2
- APHUDFFMXFYRKP-CIUDSAMLSA-N Asn-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N APHUDFFMXFYRKP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- QJMCHPGWFZZRID-BQBZGAKWSA-N Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O QJMCHPGWFZZRID-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- DONWIPDSZZJHHK-HJGDQZAQSA-N Asp-Lys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O DONWIPDSZZJHHK-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- ZBYLEBZCVKLPCY-FXQIFTODSA-N Asp-Ser-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ZBYLEBZCVKLPCY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- CPMKYMGGYUFOHS-FSPLSTOPSA-N Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CPMKYMGGYUFOHS-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 239000006145 Eagle's minimal essential medium Substances 0.000 description 2
- 239000012594 Earle’s Balanced Salt Solution Substances 0.000 description 2
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 2
- DBUNZBWUWCIELX-JHEQGTHGSA-N Gly-Thr-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DBUNZBWUWCIELX-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 2
- XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- OCRQUYDOYKCOQG-IRXDYDNUSA-N Gly-Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 OCRQUYDOYKCOQG-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 2
- DGTOKVBDZXJHNZ-WZLNRYEVSA-N Ile-Thr-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N DGTOKVBDZXJHNZ-WZLNRYEVSA-N 0.000 description 2
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- VGPCJSXPPOQPBK-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VGPCJSXPPOQPBK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N Leu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- PLDJDCJLRCYPJB-VOAKCMCISA-N Lys-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PLDJDCJLRCYPJB-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- 108010009711 Phalloidine Proteins 0.000 description 2
- CDNPIRSCAFMMBE-SRVKXCTJSA-N Phe-Asn-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CDNPIRSCAFMMBE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- NAXPHWZXEXNDIW-JTQLQIEISA-N Phe-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NAXPHWZXEXNDIW-JTQLQIEISA-N 0.000 description 2
- GKZIWHRNKRBEOH-HOTGVXAUSA-N Phe-Phe Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 GKZIWHRNKRBEOH-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 2
- ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- QVOGDCQNGLBNCR-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QVOGDCQNGLBNCR-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N Ser-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- PPNPDKGQRFSCAC-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PPNPDKGQRFSCAC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N Ser-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CO XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- OZPDGESCTGGNAD-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CO OZPDGESCTGGNAD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- NERYDXBVARJIQS-JYBASQMISA-N Ser-Trp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CO)N)O NERYDXBVARJIQS-JYBASQMISA-N 0.000 description 2
- BEBVVQPDSHHWQL-NRPADANISA-N Ser-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BEBVVQPDSHHWQL-NRPADANISA-N 0.000 description 2
- JTEICXDKGWKRRV-HJGDQZAQSA-N Thr-Asn-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O JTEICXDKGWKRRV-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- SGAOHNPSEPVAFP-ZDLURKLDSA-N Thr-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SGAOHNPSEPVAFP-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 2
- RVMNUBQWPVOUKH-HEIBUPTGSA-N Thr-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O RVMNUBQWPVOUKH-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 2
- XVHAUVJXBFGUPC-RPTUDFQQSA-N Thr-Tyr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O XVHAUVJXBFGUPC-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 2
- BARBHMSSVWPKPZ-IHRRRGAJSA-N Tyr-Asp-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O BARBHMSSVWPKPZ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- QAYSODICXVZUIA-WLTAIBSBSA-N Tyr-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QAYSODICXVZUIA-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 2
- AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N Tyr-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- WYOBRXPIZVKNMF-IRXDYDNUSA-N Tyr-Tyr-Gly Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)NCC(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 WYOBRXPIZVKNMF-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 2
- XXROXFHCMVXETG-UWVGGRQHSA-N Val-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O XXROXFHCMVXETG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- OFTXTCGQJXTNQS-XGEHTFHBSA-N Val-Thr-Ser Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O OFTXTCGQJXTNQS-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 2
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 2
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 2
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 2
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 2
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N dipeptide phenylalanyl-tyrosine Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000001842 enterocyte Anatomy 0.000 description 2
- 230000000369 enteropathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 208000002854 epidermolysis bullosa simplex superficialis Diseases 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 2
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 2
- 208000028774 intestinal disease Diseases 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 2
- 108010070409 phenylalanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010073025 phenylalanylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010069117 seryl-lysyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 2
- 239000004575 stone Substances 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 2
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 2
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 2
- ALBODLTZUXKBGZ-JUUVMNCLSA-N (2s)-2-amino-3-phenylpropanoic acid;(2s)-2,6-diaminohexanoic acid Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O.OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ALBODLTZUXKBGZ-JUUVMNCLSA-N 0.000 description 1
- CXLUIRPQSBYREP-WDSKDSINSA-N (3s)-3-[[(2s)-2-amino-4,4-dicarboxybutanoyl]amino]propane-1,1,3-tricarboxylic acid Chemical compound OC(=O)C(C(O)=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C(O)=O)C(O)=O)C(O)=O CXLUIRPQSBYREP-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JKMPXGJJRMOELF-UHFFFAOYSA-N 1,3-thiazole-2,4,5-tricarboxylic acid Chemical compound OC(=O)C1=NC(C(O)=O)=C(C(O)=O)S1 JKMPXGJJRMOELF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PFFIDZXUXFLSSR-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-N-[2-(4-methylpentan-2-yl)-3-thienyl]-3-(trifluoromethyl)pyrazole-4-carboxamide Chemical compound S1C=CC(NC(=O)C=2C(=NN(C)C=2)C(F)(F)F)=C1C(C)CC(C)C PFFIDZXUXFLSSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- WESHVRNMNFMVBE-FXQIFTODSA-N Arg-Asn-Asp Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N)CN=C(N)N WESHVRNMNFMVBE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ZZZWQALDSQQBEW-STQMWFEESA-N Arg-Gly-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ZZZWQALDSQQBEW-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- IIAXFBUTKIDDIP-ULQDDVLXSA-N Arg-Leu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O IIAXFBUTKIDDIP-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- VVJTWSRNMJNDPN-IUCAKERBSA-N Arg-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O VVJTWSRNMJNDPN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- MNBHKGYCLBUIBC-UFYCRDLUSA-N Arg-Phe-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 MNBHKGYCLBUIBC-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- VENMDXUVHSKEIN-GUBZILKMSA-N Arg-Ser-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VENMDXUVHSKEIN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ADPACBMPYWJJCE-FXQIFTODSA-N Arg-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ADPACBMPYWJJCE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DNLQVHBBMPZUGJ-BQBZGAKWSA-N Arg-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O DNLQVHBBMPZUGJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- URAUIUGLHBRPMF-NAKRPEOUSA-N Arg-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O URAUIUGLHBRPMF-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- AIFHRTPABBBHKU-RCWTZXSCSA-N Arg-Thr-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O AIFHRTPABBBHKU-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N Arg-Tyr Natural products NC(CCNC(=N)N)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QJWLLRZTJFPCHA-STECZYCISA-N Arg-Tyr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O QJWLLRZTJFPCHA-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- NMTANZXPDAHUKU-ULQDDVLXSA-N Arg-Tyr-Lys Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NMTANZXPDAHUKU-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- QQEWINYJRFBLNN-DLOVCJGASA-N Asn-Ala-Phe Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QQEWINYJRFBLNN-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- NPDLYUOYAGBHFB-WDSKDSINSA-N Asn-Arg Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N NPDLYUOYAGBHFB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N Asn-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- ACRYGQFHAQHDSF-ZLUOBGJFSA-N Asn-Asn-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ACRYGQFHAQHDSF-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- NVGWESORMHFISY-SRVKXCTJSA-N Asn-Asn-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O NVGWESORMHFISY-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- HZYFHQOWCFUSOV-IMJSIDKUSA-N Asn-Asp Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HZYFHQOWCFUSOV-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- OLGCWMNDJTWQAG-GUBZILKMSA-N Asn-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O OLGCWMNDJTWQAG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OPEPUCYIGFEGSW-WDSKDSINSA-N Asn-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OPEPUCYIGFEGSW-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JQSWHKKUZMTOIH-QWRGUYRKSA-N Asn-Gly-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(=O)N)N JQSWHKKUZMTOIH-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- UDSVWSUXKYXSTR-QWRGUYRKSA-N Asn-Gly-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O UDSVWSUXKYXSTR-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- LTZIRYMWOJHRCH-GUDRVLHUSA-N Asn-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LTZIRYMWOJHRCH-GUDRVLHUSA-N 0.000 description 1
- WIDVAWAQBRAKTI-YUMQZZPRSA-N Asn-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O WIDVAWAQBRAKTI-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- AYOAHKWVQLNPDM-HJGDQZAQSA-N Asn-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O AYOAHKWVQLNPDM-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- NTWOPSIUJBMNRI-KKUMJFAQSA-N Asn-Lys-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NTWOPSIUJBMNRI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- LSJQOMAZIKQMTJ-SRVKXCTJSA-N Asn-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O LSJQOMAZIKQMTJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SONUFGRSSMFHFN-IMJSIDKUSA-N Asn-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SONUFGRSSMFHFN-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- OOXUBGLNDRGOKT-FXQIFTODSA-N Asn-Ser-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O OOXUBGLNDRGOKT-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- REQUGIWGOGSOEZ-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ser-Asn Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)C(=O)N REQUGIWGOGSOEZ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- JXMREEPBRANWBY-VEVYYDQMSA-N Asn-Thr-Arg Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O JXMREEPBRANWBY-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N Asn-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 1
- RGGVDKVXLBOLNS-JQWIXIFHSA-N Asn-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CC(N)=O)N)C(O)=O)=CNC2=C1 RGGVDKVXLBOLNS-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 1
- FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N Asn-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- XEGZSHSPQNDNRH-JRQIVUDYSA-N Asn-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XEGZSHSPQNDNRH-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- KWBQPGIYEZKDEG-FSPLSTOPSA-N Asn-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O KWBQPGIYEZKDEG-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- HMQDRBKQMLRCCG-GMOBBJLQSA-N Asp-Arg-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HMQDRBKQMLRCCG-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- IXIWEFWRKIUMQX-DCAQKATOSA-N Asp-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O IXIWEFWRKIUMQX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- JDHOJQJMWBKHDB-CIUDSAMLSA-N Asp-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N JDHOJQJMWBKHDB-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KNMRXHIAVXHCLW-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asn-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)C(=O)O KNMRXHIAVXHCLW-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- XACXDSRQIXRMNS-OLHMAJIHSA-N Asp-Asn-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O XACXDSRQIXRMNS-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- KHBLRHKVXICFMY-GUBZILKMSA-N Asp-Glu-Lys Chemical compound N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O KHBLRHKVXICFMY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N Asp-Ile Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GBSUGIXJAAKZOW-GMOBBJLQSA-N Asp-Ile-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O GBSUGIXJAAKZOW-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- IDDMGSKZQDEDGA-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 IDDMGSKZQDEDGA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LTCKTLYKRMCFOC-KKUMJFAQSA-N Asp-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LTCKTLYKRMCFOC-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- RPUYTJJZXQBWDT-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N RPUYTJJZXQBWDT-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ZKAOJVJQGVUIIU-GUBZILKMSA-N Asp-Pro-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ZKAOJVJQGVUIIU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- BRRPVTUFESPTCP-ACZMJKKPSA-N Asp-Ser-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O BRRPVTUFESPTCP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- VNXQRBXEQXLERQ-CIUDSAMLSA-N Asp-Ser-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N VNXQRBXEQXLERQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N Asp-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 1
- GCACQYDBDHRVGE-LKXGYXEUSA-N Asp-Thr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O GCACQYDBDHRVGE-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- USENATHVGFXRNO-SRVKXCTJSA-N Asp-Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 USENATHVGFXRNO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BPAUXFVCSYQDQX-JRQIVUDYSA-N Asp-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O BPAUXFVCSYQDQX-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- SFJUYBCDQBAYAJ-YDHLFZDLSA-N Asp-Val-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 SFJUYBCDQBAYAJ-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- 108010077805 Bacterial Proteins Proteins 0.000 description 1
- 101000609447 Beet necrotic yellow vein virus (isolate Japan/S) Protein P25 Proteins 0.000 description 1
- 102100021257 Beta-secretase 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710150192 Beta-secretase 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100021277 Beta-secretase 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710150190 Beta-secretase 2 Proteins 0.000 description 1
- BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N Borate Chemical compound [O-]B([O-])[O-] BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 101100439298 Caenorhabditis elegans cgt-2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100015199 Caenorhabditis elegans gly-11 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 241001492658 Cyanea koolauensis Species 0.000 description 1
- MXZYQNJCBVJHSR-KATARQTJSA-N Cys-Lys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CS)N)O MXZYQNJCBVJHSR-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- YQEHNIKPAOPBNH-DCAQKATOSA-N Cys-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N YQEHNIKPAOPBNH-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 1
- 230000007023 DNA restriction-modification system Effects 0.000 description 1
- 235000003385 Diospyros ebenum Nutrition 0.000 description 1
- 241000792913 Ebenaceae Species 0.000 description 1
- 241000028463 Escherichia coli O103 Species 0.000 description 1
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001123946 Gaga Species 0.000 description 1
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 1
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 1
- RJONUNZIMUXUOI-GUBZILKMSA-N Glu-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N RJONUNZIMUXUOI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- LGYZYFFDELZWRS-DCAQKATOSA-N Glu-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O LGYZYFFDELZWRS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N Glu-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- HPJLZFTUUJKWAJ-JHEQGTHGSA-N Glu-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HPJLZFTUUJKWAJ-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N Glu-Leu-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- VXEFAWJTFAUDJK-AVGNSLFASA-N Glu-Tyr-Ser Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O VXEFAWJTFAUDJK-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- WGYHAAXZWPEBDQ-IFFSRLJSSA-N Glu-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WGYHAAXZWPEBDQ-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- FZQLXNIMCPJVJE-YUMQZZPRSA-N Gly-Asp-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FZQLXNIMCPJVJE-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- QGZSAHIZRQHCEQ-QWRGUYRKSA-N Gly-Asp-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 QGZSAHIZRQHCEQ-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- HDNXXTBKOJKWNN-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HDNXXTBKOJKWNN-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JSNNHGHYGYMVCK-XVKPBYJWSA-N Gly-Glu-Val Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JSNNHGHYGYMVCK-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- OLPPXYMMIARYAL-QMMMGPOBSA-N Gly-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN OLPPXYMMIARYAL-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- YIWFXZNIBQBFHR-LURJTMIESA-N Gly-His Chemical class [NH3+]CC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CN=CN1 YIWFXZNIBQBFHR-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- UTYGDAHJBBDPBA-BYULHYEWSA-N Gly-Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)CN UTYGDAHJBBDPBA-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- TVUWMSBGMVAHSJ-KBPBESRZSA-N Gly-Leu-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 TVUWMSBGMVAHSJ-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- PFMUCCYYAAFKTH-YFKPBYRVSA-N Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN PFMUCCYYAAFKTH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- GAFKBWKVXNERFA-QWRGUYRKSA-N Gly-Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 GAFKBWKVXNERFA-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- QAMMIGULQSIRCD-IRXDYDNUSA-N Gly-Phe-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)C[NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 QAMMIGULQSIRCD-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N Gly-Pro-Gly Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N Gly-Thr-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N 0.000 description 1
- YJDALMUYJIENAG-QWRGUYRKSA-N Gly-Tyr-Asn Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)CN)O YJDALMUYJIENAG-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- JYGYNWYVKXENNE-OALUTQOASA-N Gly-Tyr-Trp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O JYGYNWYVKXENNE-OALUTQOASA-N 0.000 description 1
- 241000160777 Hipparchia semele Species 0.000 description 1
- FDQYIRHBVVUTJF-ZETCQYMHSA-N His-Gly-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CN=CN1 FDQYIRHBVVUTJF-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- BDFCIKANUNMFGB-PMVVWTBXSA-N His-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 BDFCIKANUNMFGB-PMVVWTBXSA-N 0.000 description 1
- CZVQSYNVUHAILZ-UWVGGRQHSA-N His-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 CZVQSYNVUHAILZ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ILUVWFTXAUYOBW-CUJWVEQBSA-N His-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O ILUVWFTXAUYOBW-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- UAVQIQOOBXFKRC-BYULHYEWSA-N Ile-Asn-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O UAVQIQOOBXFKRC-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- WKXVAXOSIPTXEC-HAFWLYHUSA-N Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O WKXVAXOSIPTXEC-HAFWLYHUSA-N 0.000 description 1
- TWPSALMCEHCIOY-YTFOTSKYSA-N Ile-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N TWPSALMCEHCIOY-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 1
- FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N Ile-Leu-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)O)N FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- PMMMQRVUMVURGJ-XUXIUFHCSA-N Ile-Leu-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O PMMMQRVUMVURGJ-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- UWBDLNOCIDGPQE-GUBZILKMSA-N Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN UWBDLNOCIDGPQE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WSSGUVAKYCQSCT-XUXIUFHCSA-N Ile-Met-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N WSSGUVAKYCQSCT-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N Ile-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 1
- BVRPESWOSNFUCJ-LKTVYLICSA-N Ile-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)CC)C(O)=O)=CNC2=C1 BVRPESWOSNFUCJ-LKTVYLICSA-N 0.000 description 1
- ZUWSVOYKBCHLRR-MGHWNKPDSA-N Ile-Tyr-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N ZUWSVOYKBCHLRR-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 1
- ZGKVPOSSTGHJAF-HJPIBITLSA-N Ile-Tyr-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N ZGKVPOSSTGHJAF-HJPIBITLSA-N 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003440 L-leucyl group Chemical group O=C([*])[C@](N([H])[H])([H])C([H])([H])C(C([H])([H])[H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- UCOCBWDBHCUPQP-DCAQKATOSA-N Leu-Arg-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UCOCBWDBHCUPQP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- WXHFZJFZWNCDNB-KKUMJFAQSA-N Leu-Asn-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WXHFZJFZWNCDNB-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N Leu-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- HPBCTWSUJOGJSH-MNXVOIDGSA-N Leu-Glu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HPBCTWSUJOGJSH-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- LLBQJYDYOLIQAI-JYJNAYRXSA-N Leu-Glu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O LLBQJYDYOLIQAI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- LCPYQJIKPJDLLB-UWVGGRQHSA-N Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C LCPYQJIKPJDLLB-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XXXXOVFBXRERQL-ULQDDVLXSA-N Leu-Pro-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XXXXOVFBXRERQL-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- BQVUABVGYYSDCJ-ZFWWWQNUSA-N Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- VUBIPAHVHMZHCM-KKUMJFAQSA-N Leu-Tyr-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 VUBIPAHVHMZHCM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 240000007472 Leucaena leucocephala Species 0.000 description 1
- 235000010643 Leucaena leucocephala Nutrition 0.000 description 1
- 101001090725 Leuconostoc gelidum Bacteriocin leucocin-A Proteins 0.000 description 1
- ZQCVMVCVPFYXHZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZQCVMVCVPFYXHZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YPLVCBKEPJPBDQ-MELADBBJSA-N Lys-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N YPLVCBKEPJPBDQ-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- ALGGDNMLQNFVIZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Asp Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N ALGGDNMLQNFVIZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XBZOQGHZGQLEQO-IUCAKERBSA-N Lys-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN XBZOQGHZGQLEQO-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N Lys-Phe Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- XFANQCRHTMOEAP-WDSOQIARSA-N Lys-Pro-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O XFANQCRHTMOEAP-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- ZUGVARDEGWMMLK-SRVKXCTJSA-N Lys-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZUGVARDEGWMMLK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JHNOXVASMSXSNB-WEDXCCLWSA-N Lys-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O JHNOXVASMSXSNB-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- IEIHKHYMBIYQTH-YESZJQIVSA-N Lys-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)O IEIHKHYMBIYQTH-YESZJQIVSA-N 0.000 description 1
- YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N Lys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- RIPJMCFGQHGHNP-RHYQMDGZSA-N Lys-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O RIPJMCFGQHGHNP-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- HWROAFGWPQUPTE-OSUNSFLBSA-N Met-Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N HWROAFGWPQUPTE-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- DBXMFHGGHMXYHY-DCAQKATOSA-N Met-Leu-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DBXMFHGGHMXYHY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N Met-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- ZYTPOUNUXRBYGW-YUMQZZPRSA-N Met-Met Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCSC ZYTPOUNUXRBYGW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N Met-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N Met-Thr Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C([O-])=O KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- GWADARYJIJDYRC-XGEHTFHBSA-N Met-Thr-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GWADARYJIJDYRC-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- QYIGOFGUOVTAHK-ZJDVBMNYSA-N Met-Thr-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QYIGOFGUOVTAHK-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- IIHMNTBFPMRJCN-RCWTZXSCSA-N Met-Val-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IIHMNTBFPMRJCN-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N Nalpha-L-Leucyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000002853 Nelumbo nucifera Species 0.000 description 1
- 235000006508 Nelumbo nucifera Nutrition 0.000 description 1
- 235000006510 Nelumbo pentapetala Nutrition 0.000 description 1
- 101100216047 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) gla-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010029719 Nonspecific reaction Diseases 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 241001024099 Olla Species 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- IWRZUGHCHFZYQZ-UFYCRDLUSA-N Phe-Arg-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 IWRZUGHCHFZYQZ-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- BXNGIHFNNNSEOS-UWVGGRQHSA-N Phe-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 BXNGIHFNNNSEOS-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- WIVCOAKLPICYGY-KKUMJFAQSA-N Phe-Asp-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N WIVCOAKLPICYGY-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- QPVFUAUFEBPIPT-CDMKHQONSA-N Phe-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QPVFUAUFEBPIPT-CDMKHQONSA-N 0.000 description 1
- OVJMCXAPGFDGMG-HKUYNNGSSA-N Phe-Gly-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O OVJMCXAPGFDGMG-HKUYNNGSSA-N 0.000 description 1
- DOXQMJCSSYZSNM-BZSNNMDCSA-N Phe-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DOXQMJCSSYZSNM-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- PEFJUUYFEGBXFA-BZSNNMDCSA-N Phe-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 PEFJUUYFEGBXFA-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- SCKXGHWQPPURGT-KKUMJFAQSA-N Phe-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SCKXGHWQPPURGT-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- BAONJAHBAUDJKA-BZSNNMDCSA-N Phe-Tyr-Asp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 BAONJAHBAUDJKA-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- BELBBZDIHDAJOR-UHFFFAOYSA-N Phenolsulfonephthalein Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1C1(C=2C=CC(O)=CC=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 BELBBZDIHDAJOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N Pro-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- SXMSEHDMNIUTSP-DCAQKATOSA-N Pro-Lys-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SXMSEHDMNIUTSP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- GZNYIXWOIUFLGO-ZJDVBMNYSA-N Pro-Thr-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GZNYIXWOIUFLGO-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- FHJQROWZEJFZPO-SRVKXCTJSA-N Pro-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 FHJQROWZEJFZPO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 101100084022 Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) lapA gene Proteins 0.000 description 1
- 101100074339 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) LEE1 gene Proteins 0.000 description 1
- SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CO SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- QGMLKFGTGXWAHF-IHRRRGAJSA-N Ser-Arg-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O QGMLKFGTGXWAHF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- OYEDZGNMSBZCIM-XGEHTFHBSA-N Ser-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OYEDZGNMSBZCIM-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N Ser-Asn Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- WXWDPFVKQRVJBJ-CIUDSAMLSA-N Ser-Asn-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CO)N WXWDPFVKQRVJBJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- DKKGAAJTDKHWOD-BIIVOSGPSA-N Ser-Asn-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O DKKGAAJTDKHWOD-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 1
- UGJRQLURDVGULT-LKXGYXEUSA-N Ser-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UGJRQLURDVGULT-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N Ser-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- BTPAWKABYQMKKN-LKXGYXEUSA-N Ser-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O BTPAWKABYQMKKN-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- SWSRFJZZMNLMLY-ZKWXMUAHSA-N Ser-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SWSRFJZZMNLMLY-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SQBLRDDJTUJDMV-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SQBLRDDJTUJDMV-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N Ser-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- VQBCMLMPEWPUTB-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VQBCMLMPEWPUTB-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- AEGUWTFAQQWVLC-BQBZGAKWSA-N Ser-Gly-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AEGUWTFAQQWVLC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- BPMRXBZYPGYPJN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BPMRXBZYPGYPJN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- MUARUIBTKQJKFY-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MUARUIBTKQJKFY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SFTZWNJFZYOLBD-ZDLURKLDSA-N Ser-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO SFTZWNJFZYOLBD-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- CXBFHZLODKPIJY-AAEUAGOBSA-N Ser-Gly-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)N CXBFHZLODKPIJY-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 1
- YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- QJKPECIAWNNKIT-KKUMJFAQSA-N Ser-Lys-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O QJKPECIAWNNKIT-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- PBUXMVYWOSKHMF-WDSKDSINSA-N Ser-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO PBUXMVYWOSKHMF-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- PJIQEIFXZPCWOJ-FXQIFTODSA-N Ser-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PJIQEIFXZPCWOJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- PPCZVWHJWJFTFN-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PPCZVWHJWJFTFN-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N Ser-Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- BMKNXTJLHFIAAH-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BMKNXTJLHFIAAH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N Ser-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- VLMIUSLQONKLDV-HEIBUPTGSA-N Ser-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VLMIUSLQONKLDV-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 1
- ZKOKTQPHFMRSJP-YJRXYDGGSA-N Ser-Thr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ZKOKTQPHFMRSJP-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- PQEQXWRVHQAAKS-SRVKXCTJSA-N Ser-Tyr-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CO)N)CC1=CC=C(O)C=C1 PQEQXWRVHQAAKS-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ILVGMCVCQBJPSH-WDSKDSINSA-N Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO ILVGMCVCQBJPSH-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- IAOHCSQDQDWRQU-GUBZILKMSA-N Ser-Val-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O IAOHCSQDQDWRQU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- UKKROEYWYIHWBD-ZKWXMUAHSA-N Ser-Val-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O UKKROEYWYIHWBD-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N Ser-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 101150050863 T gene Proteins 0.000 description 1
- JNQZPAWOPBZGIX-RCWTZXSCSA-N Thr-Arg-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O)CCCN=C(N)N JNQZPAWOPBZGIX-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- NLSNVZAREYQMGR-HJGDQZAQSA-N Thr-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NLSNVZAREYQMGR-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- KRPKYGOFYUNIGM-XVSYOHENSA-N Thr-Asp-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N)O KRPKYGOFYUNIGM-XVSYOHENSA-N 0.000 description 1
- ONNSECRQFSTMCC-XKBZYTNZSA-N Thr-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ONNSECRQFSTMCC-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N Thr-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- XPNSAQMEAVSQRD-FBCQKBJTSA-N Thr-Gly-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XPNSAQMEAVSQRD-FBCQKBJTSA-N 0.000 description 1
- DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N Thr-Gly-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- GXUWHVZYDAHFSV-FLBSBUHZSA-N Thr-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GXUWHVZYDAHFSV-FLBSBUHZSA-N 0.000 description 1
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N Thr-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N Thr-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- JLNMFGCJODTXDH-WEDXCCLWSA-N Thr-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O JLNMFGCJODTXDH-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- XSEPSRUDSPHMPX-KATARQTJSA-N Thr-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XSEPSRUDSPHMPX-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- JWQNAFHCXKVZKZ-UVOCVTCTSA-N Thr-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JWQNAFHCXKVZKZ-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 1
- QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N Thr-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N Thr-Pro-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- OLFOOYQTTQSSRK-UNQGMJICSA-N Thr-Pro-Phe Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OLFOOYQTTQSSRK-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N Thr-Ser-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N 0.000 description 1
- YRJOLUDFVAUXLI-GSSVUCPTSA-N Thr-Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O YRJOLUDFVAUXLI-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 1
- MYNYCUXMIIWUNW-IEGACIPQSA-N Thr-Trp-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MYNYCUXMIIWUNW-IEGACIPQSA-N 0.000 description 1
- AKHDFZHUPGVFEJ-YEPSODPASA-N Thr-Val-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O AKHDFZHUPGVFEJ-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N Thr-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- VYVBSMCZNHOZGD-RCWTZXSCSA-N Thr-Val-Val Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O VYVBSMCZNHOZGD-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- VEYXZZGMIBKXCN-UBHSHLNASA-N Trp-Asp-Asp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N VEYXZZGMIBKXCN-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- PGPCENKYTLDIFM-SZMVWBNQSA-N Trp-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PGPCENKYTLDIFM-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- LYMVXFSTACVOLP-ZFWWWQNUSA-N Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)=CNC2=C1 LYMVXFSTACVOLP-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- UJRIVCPPPMYCNA-HOCLYGCPSA-N Trp-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N UJRIVCPPPMYCNA-HOCLYGCPSA-N 0.000 description 1
- BOBZBMOTRORUPT-XIRDDKMYSA-N Trp-Ser-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BOBZBMOTRORUPT-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- SGFIXFAHVWJKTD-KJEVXHAQSA-N Tyr-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SGFIXFAHVWJKTD-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- NSGZILIDHCIZAM-KKUMJFAQSA-N Tyr-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N NSGZILIDHCIZAM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ZOBLBMGJKVJVEV-BZSNNMDCSA-N Tyr-Lys-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O ZOBLBMGJKVJVEV-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- KZOZXAYPVKKDIO-UFYCRDLUSA-N Tyr-Met-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 KZOZXAYPVKKDIO-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- PSALWJCUIAQKFW-ACRUOGEOSA-N Tyr-Phe-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N PSALWJCUIAQKFW-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- QPOUERMDWKKZEG-HJPIBITLSA-N Tyr-Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QPOUERMDWKKZEG-HJPIBITLSA-N 0.000 description 1
- UMSZZGTXGKHTFJ-SRVKXCTJSA-N Tyr-Ser-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 UMSZZGTXGKHTFJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LUMQYLVYUIRHHU-YJRXYDGGSA-N Tyr-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LUMQYLVYUIRHHU-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N Tyr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 1
- BIVIUZRBCAUNPW-JRQIVUDYSA-N Tyr-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BIVIUZRBCAUNPW-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- UUBKSZNKJUJQEJ-JRQIVUDYSA-N Tyr-Thr-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N)O UUBKSZNKJUJQEJ-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N Tyr-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- AOIZTZRWMSPPAY-KAOXEZKKSA-N Tyr-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)O AOIZTZRWMSPPAY-KAOXEZKKSA-N 0.000 description 1
- AKKYBQGHUAWPJR-MNSWYVGCSA-N Tyr-Thr-Trp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N)O AKKYBQGHUAWPJR-MNSWYVGCSA-N 0.000 description 1
- BMPPMAOOKQJYIP-WMZOPIPTSA-N Tyr-Trp Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C([O-])=O)C1=CC=C(O)C=C1 BMPPMAOOKQJYIP-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 1
- AGDDLOQMXUQPDY-BZSNNMDCSA-N Tyr-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AGDDLOQMXUQPDY-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- OYOQKMOWUDVWCR-RYUDHWBXSA-N Tyr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OYOQKMOWUDVWCR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- BYOHPUZJVXWHAE-BYULHYEWSA-N Val-Asn-Asn Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N BYOHPUZJVXWHAE-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- BMGOFDMKDVVGJG-NHCYSSNCSA-N Val-Asp-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N BMGOFDMKDVVGJG-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- SCBITHMBEJNRHC-LSJOCFKGSA-N Val-Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N SCBITHMBEJNRHC-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- KZKMBGXCNLPYKD-YEPSODPASA-N Val-Gly-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KZKMBGXCNLPYKD-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- JAKHAONCJJZVHT-DCAQKATOSA-N Val-Lys-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N JAKHAONCJJZVHT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CKTMJBPRVQWPHU-JSGCOSHPSA-N Val-Phe-Gly Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)O)N CKTMJBPRVQWPHU-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- QTPQHINADBYBNA-DCAQKATOSA-N Val-Ser-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN QTPQHINADBYBNA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- PZTZYZUTCPZWJH-FXQIFTODSA-N Val-Ser-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N PZTZYZUTCPZWJH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- LCHZBEUVGAVMKS-RHYQMDGZSA-N Val-Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)[C@@H](C)O)C(O)=O LCHZBEUVGAVMKS-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- PDDJTOSAVNRJRH-UNQGMJICSA-N Val-Thr-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O PDDJTOSAVNRJRH-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- SUGRIIAOLCDLBD-ZOBUZTSGSA-N Val-Trp-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N SUGRIIAOLCDLBD-ZOBUZTSGSA-N 0.000 description 1
- VTIAEOKFUJJBTC-YDHLFZDLSA-N Val-Tyr-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N VTIAEOKFUJJBTC-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- ZLNYBMWGPOKSLW-LSJOCFKGSA-N Val-Val-Asp Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ZLNYBMWGPOKSLW-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N Valylglycine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NCC(O)=O IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 239000000853 adhesive Substances 0.000 description 1
- 230000001070 adhesive effect Effects 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 1
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 108010018691 arginyl-threonyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 230000000386 athletic effect Effects 0.000 description 1
- 108700017365 bacteria SspA Proteins 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 244000309466 calf Species 0.000 description 1
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- WOWHHFRSBJGXCM-UHFFFAOYSA-M cetyltrimethylammonium chloride Chemical compound [Cl-].CCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)C WOWHHFRSBJGXCM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000001332 colony forming effect Effects 0.000 description 1
- 239000013256 coordination polymer Substances 0.000 description 1
- 101150047356 dec-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 230000008034 disappearance Effects 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L disodium;(2',7'-dibromo-3',6'-dioxido-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-4'-yl)mercury;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Na+].O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(Br)=C([O-])C([Hg])=C1OC1=C2C=C(Br)C([O-])=C1 BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 208000007150 epidermolysis bullosa simplex Diseases 0.000 description 1
- 101150093735 espD gene Proteins 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 206010016256 fatigue Diseases 0.000 description 1
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 1
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 1
- 235000019634 flavors Nutrition 0.000 description 1
- 229960004279 formaldehyde Drugs 0.000 description 1
- 235000019256 formaldehyde Nutrition 0.000 description 1
- 108010004609 gamma-carboxyglutamyl-gamma-carboxyglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 1
- 108010019832 glycyl-asparaginyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010078326 glycyl-glycyl-valine Proteins 0.000 description 1
- 108010066198 glycyl-leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N glycylvaline Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 230000000366 juvenile effect Effects 0.000 description 1
- 231100000636 lethal dose Toxicity 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010091798 leucylleucine Proteins 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 239000012160 loading buffer Substances 0.000 description 1
- 230000007108 local immune response Effects 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 1
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- 108010085203 methionylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 231100000219 mutagenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 210000000287 oocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 229960003531 phenolsulfonphthalein Drugs 0.000 description 1
- 108010065135 phenylalanyl-phenylalanyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010018625 phenylalanylarginine Proteins 0.000 description 1
- 101150009573 phoA gene Proteins 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 230000008521 reorganization Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- BZQWDGWNCKYCHR-DYNCTKRQSA-M sodium;(6r,7r)-3-[[[5-(dimethylamino)naphthalen-1-yl]sulfonylamino]methyl]-8-oxo-7-[(2-thiophen-2-ylacetyl)amino]-5-thia-1-azabicyclo[4.2.0]oct-2-ene-2-carboxylate Chemical compound [Na+].N([C@H]1[C@@H]2N(C1=O)C(=C(CS2)CNS(=O)(=O)C1=C2C=CC=C(C2=CC=C1)N(C)C)C([O-])=O)C(=O)CC1=CC=CS1 BZQWDGWNCKYCHR-DYNCTKRQSA-M 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 238000005728 strengthening Methods 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000008719 thickening Effects 0.000 description 1
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 108010080629 tryptophan-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010003137 tyrosyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 1
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 1
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 description 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/02—Bacterial antigens
- A61K39/025—Enterobacteriales, e.g. Enterobacter
- A61K39/0258—Escherichia
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
- C12N1/205—Bacterial isolates
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/54—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the route of administration
- A61K2039/541—Mucosal route
- A61K2039/542—Mucosal route oral/gastrointestinal
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
- C12R2001/185—Escherichia
- C12R2001/19—Escherichia coli
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Virology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Description
A találmány tárgyát új, nem-patogén. £. coli mutánsok képezik# amelyek különösen alkalmasak fiatal nyulakban coiibacillozist megelőző vakcinák előállítására.
A találmány tárgyát képezi továbbá a találmány szerinti mutánsok alkalmazása vakcinák előállítására.# valamint a. találmány szerinti mutánsokat tartalmasó vakcinák.
A fiatal# elválasztott nyulak hasmenésének fő oka a colibacillózís. 'Ez a betegség fontos halál-okot jelent a tenyésztő egységekben és kutatásokat folytattak annak érdekében# hogy hatékony vakcinát állítsanak elő. A máig kifejlesztett fő vakcinációs stratégiák nem patogén vagy kismértékben patogén inaktiváit homológ törzseket vagy élő heterológ törzseket alkalmaznak# amely törzsek lokális inmunválas2t .indukálnak fantí iípopollszaccharid A íxaraungiobulinok indukciója) és/vagy ökológiai barrier effektust váltanak ki# amelyet a patogén 0103 törzsekkel szemben gyakorolnak.
Aktaszámunk; 87220-3568/FÁ
Eddig azonban egyetlen stratégia sem eredményezett teljesen ártalmatlan vakcinát, amely teljes védelmet nyújtana. A kutatás tehát folytatódott azon mechanizmusok azonosítására, amelyek néhány E. coli törzs patogenitásáért felelősek.
Az ember számára enteropatogén E. coli törzsek (vagyis az .EP.EC törzsek), amelyek kisgyermekek hasmenéséért felelősek, képesek specifikus foélhám léziók kiváltására, amelyet „öss zekapcsolődási-kitőrlesi láziénak („a11achment-effacement 1esiοn, azaz A/E-i ézló) neveznek,
Sgy összkapcsolódási-kitörlés.i femotipust, amely korrelál egy, a HeLa vagy Hep-2. sejt vonal epitelíális sejtjein végrehajtott in vitro vizsgálattal, vagyis a FÁS (fluoreszcens aktin festés”) teszttel, definiáltak .humán EPEC törzsekben. Ebben a vizsgálatban a sejtekhez lokalisáltan tapadó sejtek az adhéziós centrumokban polimerizált aktin tömörüléshez vezetnek, amelyet egy fiuorokrómfooz [Knutton és mtsai, Infect. Immun. 57, 1290 (1989)) kapcsolódó phalloidinnel detektálunk. Ennek az összekapcsolódásikitörlési fenotipusnak a főbb determinánsait egy LEE nevű lókusz <enterocita kitörlési lókusz) kódolja [McDaníel és mtsai, Proc. Natl.Acad. Scí,, 92, 1664 (1995)).
Megfigyelték, hogy a fiatal nyulak hasmenéséért felelős E. coli törzsek képesek arra, hogy a húsán EPEC törzsek által okozo11 összekapcsölőőási-kitör1ési léz.íöhoz hasónló lésiót váltsanak ki (Licoís és mtsai.., Infect. Immun., 59, 3796 (1991); Moon és mtsai, infect. Iwun., 41, 1340 (1.983); Peeters és mtsai.., Vet. Pathol., 22, 54 (1.985);
« « * « V
Takeuchí és mtsai., Infect. Imnn., 19, 686, (1978) ] , Eteket
ο; risztté | törzseket | egy | es szerzők [..Robins-Srowne |
mtsai, Infect | . Immun., | 62, | 3336 <19 9 4); Rofoi ns-Browne |
m t s a i, 1 n f e c t | . Immun<, | 62, | 1584, (1994)] szokták RE' |
törzseknek is | nevezni (” | nyűi | ί·ρκ·<» í 4-» i. { Λ |
A 35 kpb-s kromoszomális lókusz homológját, amelynek létét eredetileg humán eredetű. EP.SC törzs prototípusban mutatták ki, vagyis az E2348/69-et .megtalálták [Karao'lis és mtsai, in Pröceedings: of the First International Rus'hmore Conference on Mechanisms in the Pathogenesis of Enteric Diseases*', Rapid City, 5.D., (1995); McDaniel és mtsai, Proc. Natl . Acad. Sci , , 92, 1664, (1.9.95)] a referencia REREC törzsben, amelyet RDEC-l-nek neveznek (O15.:H- serovar) és amelyet eredetileg Cantey és Blake írtak le (Infect. Dia,, 135, 454, (1977)].
Egy intíminnek nevezett., 96-100 kDa-os külső memhzénprotein, amelyet humán EPEC törzsének LEE-lótuszában levő eaeA nevű. gén kódol, részt vesz az összekapcsolásikitörlés 1 lézi-ók kialakulásában (Jerse és mtsai., Infect. immun., 59, 4302 (1991)1. Donnenberg és mtsai (J. Clin. Invest., 92, 1412 <1993)1 tanulmányozták az eaeA-gén szerepét a patogenításban. E2348/69 törzset teszteltek 11 önkéntesben, akiknek orálisan 2,10-^ CFU adagot adtak. Tizenegy további önkéntesnek ugyanolyan adag izogén eaeA mutánst adtak. Ar eredmények demonstrálják. az eaeá-gén szerepét a vírulencíában, ezért indirekt módon, a korrelációt az A/Eléziók, FAS-pozitiv fenotípus és az LEE-lökusz között (amely abban az időben, nem volt ismert) , valamint a viru»e * *
X >
«Α ***· i énei a között, isivel akkoriban úgy -gondolták/ hogy egyedül az eaeA-gén játszik szerepet a.z A/E~lézió kialakulásában és a FAS-pozitiv fenotipus .megjelenésében. & mutáns maradék patogenítása azonban azt mutatja, hogy az eaeA-gén mellett más virulene.tagénak is érintve vannak.
Ezenfelül az eaeA-gén jelen van a mem-entercpatog-én coli törzsekben is [Cantey és Moseley, Infec. lmun., 59, 3924 (1991); Leory és mtsal, J, Med. Mícrobio.1., 40, 90 ( i 9 9 3 ; ] .
Az intixaint ködoró eaeA-gén egy analógiát különböző nyúl ,F. coli törzsekben kimutatták [Ágin és Wölí, In: Proceedings of the First International Rushmo-re Conference on Me-chanísms in the Fathogenesis of Enteric Diseases”, Rapid City, S.D., 43. old. (1995); Leroy és mtsai, a. bed. bicrobiol., 40, 90 (19939; Pohl és latsai., Infect-. Immun., 61, 2203 (1993)].
hyugst-berópában végzett 'epidemiológiai vizsgálatok kimutatták, hogy a nyulak elválasztása során fellépő, hasmenésért felelős törzsek számos szérumcsoporthoz tartoznak, amelyek közül a leggyakrabban előforduló szérumcsoport a 0103 {Blanco és mtsai. Vet. Microibiol., 38, 193 (1994)?
CanguiIhem és Milon, J. Clin. Microbiol.-, 27, 743 (1989) ].
Az 0103 törzsek (amelyek ezenfelül rendelkeznek azzal a megkülönböztető tulajdonsággal, hogy nem fermentálják a ramnözt) az emésztési úton való kísérleti inokuláciöt követően nagyon pató-gének nyarakban és olyan összekapcsolódási-kitörlési iéziót okoznak [lioois és mtsal, Infect. Immun., 59, 3796 (1991); Fohl és latsai, Infect. Immun.,- 61, 2203 «« ««« (1993); Bobins-Broune ss mtsal, Infect. Immun,, 62, 3329 (1994); Robins-Browne ss mtsal# Infect. Immun,, 62, 1584 (1994)], amelyek kinézetre hasonlók az emberi eredetű EPEC törzsek által okozottakhoz< A lézió létrehozásának ez a kritériuma, amely azzal a ténnyel együtt# hogy ezen törzsek kromoszomalis DNS-e hibrid!zálódik a humán EPEC referencia törzs eaeA~génjére specifikus próbákkal [Leroy és mtsal, u. Med. Microbiol., 40, 90 (1993); Pohl és mtsaí, Infect. Immun.# 61, 2203 (1993)]# mint az RDSC-1 törzs esetében# talán megengedi azt a· feltételezést# hogy ezek a törzsek emlékeztetnek az EPEC (vagy RSBEC) törzsekre. Az 0103 törzsekben azonban az eaeá-génsn kívül az LEE-iokuss egyetlen más génjével való homo légi a sem mutatható ki.
Az E. coli 0103 törzsek specifikus adhezíut állítanak elő, amelyet AE/R2-nek neveznek, amely képessé teszi a baktériumokat arra, hogy ho2zátapadjanak a nyűi enterocitákhoz és a fíe.La és Hep·-2 sejtvonala.k sejtjeihez [Miion és mtssi., Infect. Immun. 58, 2690 (1990)).
Kimutatták# hogy ez az adhezin hozzájárult a 0103 törzsek patogenitásához. fiatal nyulakban. Ezt ügy mutatták ki, hogy összehasonlították az 0103 .szérumcsoport reprezentatív törzsének (amelyet B10 törzsnek hívtak) patogenitását ennek a törzsnek egy mutánsával, amely elvesztette adhéziós tulajdonságát annak következtében# hogy az AB/R2 adhezínt kódoló operádba Tn5::phoA transzpozont inzertáltak [Piliien és mtsal, Vet, Microfoiol.. # 50, 105 (1996)]. Javasolták, hogy ezeket a mutánsokat használják, vakcinaként [Chalareng és mtsal, Communicatíon. aux. γτ·1^© journées de l.a. recherche cnnicole (VI. nyílt nyűi-kutatási találkozó közleményeij ? La Rochelle, december 6 és 7, 1994, INRA-ITAVI-ASCF Publ.}.
Annak érdekében, hogy tisztázzuk a hasonlóság mérté-
két az | coli 01.03 | törzsei és |
között, vi | zsgáltuk | az 0103 tör |
ennek oka | az vort. | hogy a FÁS |
non, mint | .ami ka; | ocsolatban |
lókuszával | (McDaníe | 1 és mtsai, |
1664 (1995 | « J * |
áll az EP.EC törzsek LEEProc. háti, Acad, Sci., 92,
Valójában azt találtuk, hogy a BIO törzs negatívan reagált a FÁS tesztre, miközben a RDEC-1 REPEC törzs, valamint a humán EPEC törzsek pozitív reakciót adtak azonos kísérleti feltételek mellett,
Másrészt azonban meglepd módon azt találtuk, hogy a BIO törzs újabb citopatikus hatást (CPE) hozott létre a BeLa sejtvonal epitelíáiís sejtjein, amely a cito-szkeleton és a fokális adhéziós plakkok reorganizációjában (átrendeződésében) nyilvánult meg. Akárcsak a FÁS típusú válasz esetében, ez a CPE Is összefüggésben volt a celluláris akt in intenzív polímerizációjávai. Ellentétben azonban .azzal, amit a PÁS típusú válasz esetében megfigyelünk, a polimerizált aktín nem válik lokalizálttá a bakteriális érintkezési pontokon, .hanem kábelek formájában rendeződik, amelyek áthúzódnak a sejt egyik végétől a másikig, A citoszkeleton ilyen módosulásai határozottan és megfordíthat atlanui nőnek az idő múlásával.
Ezen felül az aktin kábelek kialakulását a vinkulin mennyiségének fokozatos növekedése kíséri, amely jelenséget «» * φφ a FÁS típusú válasz esetében nem lehet megfigyelni [Finlay és latsai.-, Infect, Immun., SO, 2541 (19-92)] . A kontroli sejtekben a vínkulin pontszerű tömegek formájában van jelen, amelyek a sejtek kontúrján jelennek meg, míg a BIO hatásának kitett sejtek esetében a vínkulin az egész sejtfe'lszln mentén oszlik el, a pontszerű eloszlásbői majdnem szálas eloszlássá alakulva, ami emlékeztet az aktin kábelekre. A cítoszkelaton ilyen módosulása. együtt jár a sejtosztódás .leállásával és a sejtméret bizonyos fokú növekedésével. Miközben a. citosztázis hosszú ideig tart, a sejtek halálához vezet egy 5-6 napos periódus végén.
Más törzsek vizsgálatakor azt találtuk, hogy ez a CBE kifejeződött (expresszálödott) minden ramnoz-negativ 0103 törzsnél éppúgy, mint a RDEC-1 törzsnél. Ugyanúgy megfigyeltük ezt kőt humán eredetű klinikai EPEC ízoiátumban. Ezzel, ellentétben a humán eredetű referencia törzs, vagyis S2348/69, azonos körülmények között vizsgálva- nem mutatott semmilyen detektálható CPE-t.
Az erre a CPE-re jellemző cit-o-szkeleton változás emlékeztet arra, amelyet a CNF és CNE2 B. coli toxinok váltanak ki föswaid és mtsai., Proc. Natl. Acad. Sói. USA, 91, 3811 (1994)1 . Nem találtunk azonban a Slö-ben semmi olyan gént, amely homológ lett volna az coli CNFÍ-gyel és
CNF2-vei> Ezenfelül, miközben a CN'F-ek aktivitása detektálható a CNF-efc termelő törzsek kultúráinak lizátumaifoan, a BIO kultúrák üzátumaiban nem lehetett semmilyen aktivitást detektálni. Az azonban lehetséges, hogy a CPE-hez vezető mechanizmus, amelyet a BIO indukál, hasonló a CNF toxincké»χ 4 ♦*#* ♦' ♦ ♦ « »*« Λ ♦ > * hoz, amely utóbbi hatásmechanizmus összefügg a Rho aktiválásával, amely a citoszkeleton és a fokális adhézió centrumai szabályozásában résztvevő kis G-pro-fcein {Elínn és Hídley, J. Cell. Sci., 1.Ö9, 113 3 (1996) j .
Párhuzamosan számos 0103 törzs (köztük a prototípus 810 törzs) kromoszomális DbS~ét híbridizáltuk a törzs 35 kb
LES vi.ru.lenc.ia egységéből származó négy próbával, és összehasonlítottuk a 0103 törzsek és az £2348/69 törzs által a kultúra-közegbe ürített (kiválasztott) proteineket oly módon, hogy analizáltuk megfelelő eiektroforetikus profiljaikat valamint kereszt immnn-precípítácíóvai. A 0103 törzsekben demonstráltuk egy iőkusz jelenlétét, amely homológ az 83348/69 LSE virulencia-egységgei, bár mutat némi szerkezeti különbségeket is az utóbbival összevetve (amely különbségeket a DNS restrikciós helyek polimorfiájával mutattunk ki, valamint a kiválasztott proteinek eiektroforetikus migrációjának kisebb különbségeivel). Szt a iőkusz az EPECtörzsekben, amely analóg az LEE-vei, a következőkben ugyancsak ”LEB~lókusznak” fogjuk nevezni.
Azt is megfigyeltük, hogy ez a CDS korrelált a 0103 törzsek in vivő patogenitásával.
Az E. coli O103~mal kezdve olyan törzseket konstruáltunk, amelyek ennek az LEE-lökusznak a mutációit hordozták és megfigyeltük, hogy egy törzs, amely ennek az LEElókusznafc az egyik génje inakfcíváiödott, már nem váltja ki a CPE-t és elveszti patogenitását, bár megtartja az AF/R2 adhezint és képes marad a bél kolonizálására. ügy tűnik tehát, hogy az 0103 törzsek LEE-lökusza olyan genetikus deχ* ♦ * ♦ *
Φ X
♦.» ♦·»·*' Φ terminánsokat hordoz, amelyek felelősek a CPE-ért és a patogenitásért.
Végül megvizsgáltak ezen LES-lókosz mutánsok immunogén tulajdonságait és azt. találtuk# hogy ezek a mutánsok nagyon hatékony védelmet ruháztak át a patogén szülő-törzzsel szemben.
Jelen találmány tárgya eljárás E, coli uem-patogén mutánsának előállítására E. coli olyan patogén mutánsából, amely képes citopatogén hatást kiváltani Héra epiteliáiis sejtekben# amely hatás részint abban nyilvánul meg# hogy polimerizált aktinból kábelek képződnek, amelyek az említett sejteken egyik végüktől a másikig áthúzódnak, részint abban, hogy nő a vínknlin mennyisége, azzal jellemezve, hogy a patogén E. coli törzs mutageni zá.l t és .hogy a citophatikus hatást kiváltani már nem képes mutánsok kerülnek kiválasztásra.
A 310 törzset, amelyet 1997. január 15,-én 1-1807' szám alatt letétbe helyeztünk a Coiiectíon Nafcionale de Cultures de Microorganísmes-néi ÍCKMC) [Mikroorganizmus kultúrák francia nemzeti gyűjteménye], 28, Rue du Docteur Roux, 75724 PARIS CSDEX 15, csak példaként említjük azokra a patogén E. coli törzsekre, .amelyek képesek kiváltani a fent említett cítopatikus hatást, és amelyeket éppen ezért kiindulási anyagként alkalmazni lehet a találmány szerinti e I j á r ás as g va .1 ó s i t á s áná 1.
A találmány ugyancsak magába foglalja az Et coli olyan nem-patogén mutáns törzseit, amelyek az említett eljárás segítségével kaphatók. Ezek a törzsek legalább egy fi * * ·< Φ»Χ mutációt hordoznak, amelyek as LEE-lókusz legalább egy génjének inaktiválását eredményezik.
A találmány szerinti megoldás egy előnyös megvalósítási módja szerint a mutáns törzset egy olyan .3. coli törzsből nyerjük, amely patogén a nyálakra nézve és amely ..az 0103 szérumcsoporthez tartozik.
A találmány szerinti megoldás egy másik előnyös megvalósítása szerint a mutáns törzs legalább egy olyan mutációt hordoz, .amely az LHE-lókusz legalább egy sep-génjének az inaktiválását eredményezi.
A találmány szerinti mutáns törzs előnyösen legalább egy olyan mutációt hordoz, amely az LEE-lókusz esph vagy espB-génjelből legalább egynek az inaktiválását eredményezi .
Egy találmány szerinti törzset, amelyet BlÖ/C&l-gyel jelöltünk, 1997 január 15.-én 1-1808 szám alatt letétbe helyeztünk a Coliection. Natiouale de Cultures de Mícroorganismes-nél (CKMC) /Mikroorganizmus kultúrák francia nemzeti gyűjteménye], 28., Rue du Docteur B.cux, 75724
PARIS CEDSX 15.
Jelen találmány tárgyát képezik vakcinák, különösen olyan vakcinák, amelyeket orális úton lehet beadni, amelyek az coli legalább egy, a találmány szerinti mutáns törzsét tartalmazzák.
Az említett mutáns törzs előnyösen rendelkezik egy funkcionális AF/R2 adhezinnel és emiatt megtartja azt a képességét, hogy kolonizálja a belet.
Például a találmány -szerinti vakcinák, amelyek tartalmazzák a B10/CA1 törzset, szájon át beadhatók és megvédik a fiatal elválasztott nyálakat a 0103 szérumcsoporthoz tartozó patogén £b coli törzsekkel szembeni fertőzéstől.
A találmányt a leírás hátralevő, most következő része segítségével jobban, meg lehet érteni, amely nem kizárólagos példákat mutat be mutáns törzsek előállítására a. találmány szerint# valamint ezen törzsek vakcinaként való alkalmazását £. coli 0183 törzsek által létrehozott ci topa ti kus hatás demonstráláss Béla sejk sítúrákon
Az ebben a kisérlatsorozatban alkalmazott bakteriális törzsek a következők:·
- a nyűi számára enteropatogén BIO és RDSC-1 coli referencia törzsek;
- a ΒΙδ./1'βΕΙ törzs, amely BIO egy mutánsa, amelyet TnphoA mutagenezissel nyertünk és amely már nem termeli az AF/R2 adhezint [Pillien és mtsai, Vet. Microlbiol., 50, (1996) 1 ;
- 13 &. coli törzs, .amelyeket különféle nyúl hasmenéses esetekből izoláltak, és amelyeket előzőleg megvizsgáltunk kísérleti patogenitás szempontjából és abból a szempontból, hogy rendelkeznek-e bizonyos virulenciajellemzőkkel, mint AF/R2 és eaeA (Canguilhem és Miion, J. Clin. Microlb.iol., 27, 743 (1939); Leroy és mtsai, dl Med. Microbioi., 40, 90 ('1.993)1;
és kontrolként FÁS. pozitív humán törzseket:
- az E234S/6.9 humán EPBC referencia törzset;
- két humán EPEC törzset, amelyeket CFU201-gyel és CF517~tel jelöltünk (amelyeket Christíane Foresfier szívességéből kaptunk meg. Clermont-Férrend Gyógyszerészeti Tanszék) ; ezeket a törzseket gyermek hasmenéses estekből nyerték; ezek híbridizálnsk az eaeA specifikus és a &fp~ specifikus próbákkal és pozitívan reagálnak a FÁS tesztre.
- Interakciós teszt Haha sejteken
Sgy nappal az interakciós teszt előtt a HeLa sejteket •felosztott mikoszköplemezeken{ Lab-Tek, Míles Scientificj csíráztatjuk, vagy sejtkultúra titráló lemezeken (NUNCj a következő koncentrációban: 4„lcH sejt/ml Eagle minimális esszenciális közegben,· amely tartalmaz Earle sókat (BMEM, G1BC0; és tartalmaz 10% borjú embrió szérumot {FCS, GIBCOj és 50 pg gentamícint ml-nként (GIBCO). Ugyancsak a teszt előtti napon a baktériumokat „PEKASSAY broth-ban {DIFCO}. 24 óra inkubálás után 37 °C-on 5¾ CGy jelenlétében a sejteket Earle sós pufferrel mostuk (EBSS, G1BC0), majd összekevertük a baktériumokkal ugyanabban az BMEK tartalmú 25 mMos HEFE3 pufferben (GISCOI, amely tartalmazott 1% D~mannózt •(SIGMA) és 5t FCS-t (borjúembrió szérum) . 4 órás inkubáció után 37 °0~οη, 5% COg jelenlétében a sejteket bőségesen
mostul | ; az EBSS-se.1, | máj d |
amely | 10·% FCS-t tarta. | Imazot |
annak | érdekében, hogy | tonkr |
A v. i Ö1 il | >öző inkubációs | idők |
♦κ* °C-on) 5% CGy jelenlétében a sejteket EBS'S-sel mostuk, majd 1% formollal PBS-ben. fixáltuk 30 percig, szobahőmérsékleten .
Ezekután a különböző inkubációs idők után megbizonyosodtunk a történt morfológiai változásokról és kvantitatív módon meghatároztuk a sejtnövekedést.
*Váltósások a cítoazke1ebonban
F aktint rhodam inhoz kapcsolt phalloi-dinnel. tettük .láthatóvá (MOLEChLAR PBÖBESj a gyártó által ajánlott körülmények között. Vínvulirt közvetett immun £ Inoreszcencia segítségévei mutattunk ki egér anti-vinvulín monokionáiis antitestet használva (V2N-11-5 klón, Sigma), 1/100 hígítás mellett, valamint £Xuoreszceinnel kapcsolt, kecske antiegér antitest felhasználásával (0819 számú, IMMÜNOTECH). A mikroszkóplemezeket ISICA DMR fluoreszcencia-mikroszkóppal vizsgáltuk (40x-es ohjektÍvvel).
Az eredményeket az 1. és 2. ábrák mutatják.
Az 1, ábra a HeLa sejtek citoszkeletonjában bekövetkezett morfológiai változást mutatja a FÁS tesztben miután azokat kitettük a BIG-es E. coli törzs hatásának (A és 3), valamint az £2348/69 hatásának. (C és D), amelyet 4 óra inkubálás követett.
Az F aktín festését phalloídin/rhodamin alkalmazásával értük el, Minden egyes törzsre ugyanazt a mikroszkopikus területet mutatjuk íáziskontrasztban (A és C), valamint fluoresscenciás körülmények között (B és D) 4Öx objektívve 1, A vonal nagysága 20 pm«.
φ ΦΦ**
ΦΦ * * y 4 Κ « φ « Φ * φ Φ * Φ Φ *«
Α 2, ábra a cítoszkeleton változásait mutatja be és a fokális adhéziós plakkokat, amelyek a HeLa sejtekben jöttek létre a BIO E, coli törzs hatásának való kitétel után,· 24 órával (8 és E) valamint 48 órával (C és F) a kölcsönhatás után, vagy a mutáns- 810/CA.l törzs (amelynek előállítását az alábbiakban/ a 2. példában Írjuk le; hatásának való kitétel után, 24 órával a kölcsönhatás után (A és D).
Baloldalt (A, S és C) : as F-aktin festése pha1lo i dinnel/rhodaminna1 Jobboldalt (D, E és F|. : a vínvulin festése indirekt immunf luoreszcenoí a módszerrel anti~vin.vul.in antitestek felhasználásával,
A vonal nagysága 20 μη.
*A sej tnövekadés kvant1tat ίv me gmérése
Metilénkékkel specifikus módon lehet megfesteni sejtfehérjéket, és ez lehetővé teszi egyrészt, hogy megvizsgáljuk a sejtek morfológiáját, másrészt, hogy megmérjük a sejtpázsifcok teljes proteintarfcaimát. A sejtfehérjéket 1% metilénkékkel festjük meg 0,0 M borát pufferben a tilson által leirt módszer szerint [Animál cell cuiture: A practical approach# R.I. Frishney (szerk.} IRL Press Oxford, (199.2) ]. A sejttenyészetek maradék proteinjét kvantitatív módon megállapítjuk a kölcsönhatás napján, és 72 órával később olyan módon, hogy a festéket 8,1 14 HCi-val extránáljuk, majd automatikus ELISA iemezleolvason (model M 5800/7000, Dynatech) megmérjük az optikai sűrűséget 630 nm15
«.♦* *< «·***
Az eredményeket a 3. és 4. ábrák mutatják.
A. 3.. ábra a HeLa sejtek morfológiáját illusztrálja négy nappal a kölcsönhatás után, mind a BIO törzs esetében
CB}· mind a B10/CA1 mutáns esetében CA) . A festés metilénkékkel történt. A vonal hossza 20 gm...
A 4. ábra a bakteriális oltvány finoculumj dózisának hatását mutatja a He la sejtek növekedésére a BIO (0), Blö/CAl <0} és a ΒΙΟΖΙβΕΙ <» £„ coli törzsekkel való kölcsönhatást követően.
Az abszcisszán van megadva, az infekció multiplicitása (sokszorosódása) a CKJ-k száma sejtenként a kölcsönhatási teszt kezdetén;
az ordinátán van megadva a sejtnövekedés koefficiense - OD (optikai sűrűség) 72 órával a kölcsönhatás után/OD a kölcsönhatás napján.
Minden pont négy minta átlaga. A sejtnövekedési koefficiens standard deviációja minden esetben kisebb, mint
0.2.
Kovetkeztetés
Amint azt az 1. ábra mutatja, a Blö törzs nem. vált ki semmilyen FÁS típusú választ, vagyis nem vezet a polimerizált aktín semmilyen szignifikáns sűrűsödéséhez a baktériumok és a sejtek érintkezési pontjánál, és ez a RAS típusú válasz-hiány annak ellenére jelentkezik, hogy erős adhézlő lép fel és ellentétében az B234S/69 törzzsel kapott eredményekkel, amely erősen pozitív FÁS választ vált ki azonos körülmények között.
ψ -* « Φ ♦ < ·
Po2it.lv FAS-tipusu választ figyeltünk ®eg a RDEC-l törzs esetében is a nagyon csekély adhézió ellenére, valamint a humán CF11201 és CF517 törzsek esetében.
A. aás vizsgáit £. coli törzsek között a raianőznegativ 0103 fenotipusből négy törzs nem vált ki FÁS típusú választ.
Mégis., a BIO törzs hatásának kitett sejtek igen. mély változást mutatnak a citoszkeletonban, amelyet a kölcsönhatás befejezése után lehet detektálni (1. ábra), és amelynek nagysága nő az idővel (2B, 2C, 2S és 2F ábrák) .. Ezek a változások, amelyeket itt a CPE névvel jelölünk, a polimerizált aktin nagyszámú kábeljának kialakulásában jutnak kifejezésre, amelyek kötegekbe rendeződve áthúzódnak a sejten, és gyakran párhuzamosak egymással (2B és 2C ábra). Az aktin kőtegek megerősödésével párhuzamosan, fokozatos növekedés figyelhető meg a vi.nvu.tin formációkban, amelyek a fókái is adhéziós plakkokkal állnak kapcsolatban. Szék a formációk, amelyek általában pontszernek és azon sejtek peremén helyezkednek el, amelyeket előzőleg kitettünk £2348/09 törzs 'hatásának, a BIO törzs hatásának kitett sejtekben az inkubálás után. 48 - 72 órával általános és pszeudofibriilárís eloszlást vesznek fel. (2E és 2F ábrák).
A BIO törzs hatásának kitett sejtek mérete érzékelhetően nő az idővel, vagyis körülbelül 2.5 szeresére 4 nap inkubáció után, összhangban a sejtmag átmérőjével (3. ábra) ; ezzel párhuzamosan a sejtnövekedés blokkolt, amint azt a reziduális (visszamaradó) sejttenyészetekben végzett tel-
♦ * X*
Jf ♦ X es protein-m-eghatározás mutatja (4. ábra). A sejtek, csak az inkubáció ö.
Ezenfelül ként számolva i col ony- .forrni ng
50%-án mutatott napján kezdenek elpusztulni.
megbecsültük, hogy a teszt kezdetén sejtena BIO egy 50-100 telepfcépző egységéből unit, CFü) álló oltvány a sejtek legalább
CPE-t.
Bár a | Blö/16 | IS X ÁÍVLí; <3.11 £.> | törzs egyáltalán nem | képez |
fibrilláris | adhezint | (Pililén és mtsai, | Vet. | |
Microbiol., | SO, iöS | (1996)), ’!· | igyanazt a CPE-t hozza | létre, |
mint a szülő | <· BIO tö | rzs; amint | azonban azt a 4, ábra | mutat- |
ja, citopatogenifása kb, SO-szer alacsonyabb.
A. vizsgált egyéb, nyúl hasmenésből származó törzsek között a Blö-zel azonos fenotipust <0103 szérumcsoport/ ramnóz fermentáció hiánya, eaeá pozitív} mutató tizenegy törzs a CPE-t definiáló minden morfológiai, változást létrehoz. Ezt a CPE-t kiváltja a másik hat vizsgált törzsből három kiváltja, éppúgy, mint a referencia R.DEC-1 törzs. A humán eredetű EPEC törzsek közül az E2348/69 törzs nem hozott létre semmilyen detektálható CPE-t, míg a két CF112Ö1 és CF51? törzs erősen pozitívak voltak CPE-re nézve,
A. CPE-t nem lehetett reprodukálni a BIO kölcsönhatási kultúra tízszeresen betöményitett felülűszöjának alkalmazásával, sem a baktérinmtestek lízátumalval (oldataival), amelyeket ugyanabból a kultúrából nyertünk és hasonlóképpen tízszeresen tömény!tettünk
2. pe.íi'.líJ
CFE-negativ mutánsok eiöállitása, soeiekciója és genetikai vicegúláta
Annak -érdekében, hogy betekintést nyerjünk ennek a C?E~nek a molekuláris meghat ár o-zotts ágába és hogy megvizsgáljuk a lehetséges korrelációt a CFE és az ehteropatogemitás között nyulakban, a CFE kiváltásának képességét elvesztett, ki ónokat izoláltunk B1Ö mutánsok bankjából, amelyeket úgy nyertünk, hogy véletlenszerűen inzertáltuk a TnSISSOjy :pho.4 transzpozont (TnphoA) (Manoíl és Beckwith, Froc. Natl. Aead. Sex., §2., 8129 (1935)].
TnphoA-t a p.R7733 öngyilkos plazmiddal való konjugáció révén juttatjuk be a BIO törzsbe, amely az SH1Q (kpi:r+) K. coli törzsben található (Taylor és mtsai·., J. Bacteriol., 171, 1.870 (1989)].
A 'transzpozont befogadott kiónokat két lépésben szelektáltuk :
1) A Luxia-Bertani agaron (LA közeg) levő konjugációskeverékeket először is feldúsítottuk a transzponált kiónokban oly módon, hogy átvittük őket egy kanamicint (20 pg/ml! tartalmazó M9 minimál tápoldatba, majd 48 éráig 37 °C-on inkubáltuk. A ssülő-törzsek nem növekednek ebben a közegben, mivel az SM1.0 auxotróf (thy thr les), a BIO pedig érzékeny a kanamicinre.
2) Második lépésben a feldúsított kultúrákat kanm.ic.int (50 pg/ml) és 5-bromo-4-fcIoro-3-in.dol.il foszfátot (X?) (40 pg/ml) tartalmazó LA közegre szélesztettük (40 p.g~ mi) . A kékre szineződött klánokat ezután fenolvörös aaarra •ί replikáitukz amely 1¾ ramnózt tartalmazott és LA közegre, amely vagy kanamicint (100 ^ig/rai} vagy ampicíllint (100 μ g/mi) tartalmazott annak érdekében, hogy elim.inálja azokat a kiónokat, amelyekben az egész pRT733 plazmád koíntegráiódott a BIO ge&oaaal·
Azokat a klánokat tartottuk meg további vizsgálat céljából, amelyek rendelkeztek a ramnőz negatív fenotípussal és a kanamícin rezisztenciával, valamint az ampicíilín érzékenységgel.
Az igy kiválasztott mutánsokat ezután egy éjszakán keresztül kanamícint (50 gg-mi) tartalmazó PENASSAY közegben tenyésztettük, majd utána glicerin hozzáadása után (végső koncentráció 20¾} -20 °C~ on tároltuk. Ezután .96 üreges sejt kultúr a lemezen. (FALCOK) meghatároztuk GPS. kiváltó képességüket HeLa sejteken a fent. leírt 1. példában megadott módszerek alkalmazásával.
A megvizsgált közel 2700 klón közül 7 független klón (vagyis azok a kiónok, amelyeket független konjugációs keverékekből különítettünk el} volt CPE-negativ és nem integrálta a teljes öngyilkos piazmidot.
A 2, ábra (A és Bl illusztrálja azt, hogy az egyik ilyen mutáns (B10/CA1} elvesztette a CPE-t. Az ábra azt mutatja, hogy az ennek a mutánsnak kitett sejtek nem mutatnak változást a oítoszkeletonban, ami a vad típusú B10 törzs által kiváltott CP'E jellemzője.
A 3A ábra azt is mutatja, hogy a B1Q/ÁC1 mutáns nem okoz semmi olyan morfológiai változást, amit a B10 törzs vált ki. A 4. ábra mutatja, hogy citopatogenitása majdnem nulla, inek a mutánsnak a
Harbor, NY ( | 1983)) s |
A C?E~ | negatív |
meghatározás | a céljá |
Boehringer) | segí tsé< |
3.4 kpb-s | Hindi .11 |
(DIG-ÜTP). ) | irt a ε |
A C.PE-negatív mutánsok genetikai jellemzése
Hacsak másképp nem jelöljük, az alkalmazott technikákat a Sambrook és mtsai. által előirt standard protokolloknak (Holecular Cloning: A Laboratory Manual# Co'ld Spring :1.989) ] megfelelően valósítottuk meg.
-negatív mutánsokba inzertéit egységek számának >a céljából egy kereskedelmi kit (DIG DNA, segítségével.# a gyártó javaslatait követve TnS Hindi .11 fargsmensét csatoltuk digoxigeninhez Ezt. a próbát Southern-blottal ellenőriztük a teljes BbS Clal, BamHI és Sáli emésztési fragmen.seive.1 szemben.
A ? előzetesen kiválasztott kiónbbl kettőt kiküszöböltünk# mert kettős inzertálást tartalmaztak.
Az 5 fennmaradó mutánsban az inzert a következőképpen lokalizálható:
Megfigyeltük# hegy a BIO kromo-s tornál is DNS~e az E2348/69 törzs LSE--fókuszának.# amelyet McDaniel és mtsai írtak le (Proc. Natl. Acad. Sci., 92, 1664 (1995)) négy specifikus fragmensével (az 5. ábrán A, C és D~vel jelölve)
hibridizá | it.# amint | az | ;t az 5a ábra | mutatja. Ez a hibrid!z |
cié és te | bb, mint | 3 5 | kh-s régión t | hrténik (amint azt az |
ábra muté | at ja) , as | U2ly | f ezért úgy ' | tűnik, hogy az E2 3 4.8/ |
lókusszal | analóg | lök' | uset képez, a | restrikciós polimorf! |
musban az | ónban jel | ént | ős küiönbséoe] | fe vannak. |
«·*«
Próbákat készítettünk olyan módon, hogy az A, B, c és D fragxaenseket megjelöltük digoxin~DÍP-vei, A teljes DNS különböző restrikciós enzimekkel történő emésztése, majd a Southern biot végrehajtása után a CPE-negativ 31 ö mutánsokra ezekkel a próbákkal, kapott hibridizációs profilokat őszszehasonlltottuk a szülői. BIO törzsre és az S2348/63--re kapottakkal. V
Ezen próbák -alkalmazása arra. a következtetésre vezet, hogy az öt mutáns az LEE-ló-kusznak megfelelő régióba Inzertálodott a TnphoA inzert. Az 5b ábra körrel körülvett nyíllal mutatja a TnpboA inzert helyét ebben as 5 mutánsban .
E mutánsok közül háromban {BÍO/CAi, BÍ0/S2 és B10/PA12} az inzert a 8 kB-os ScoRI fragxaensben helyezkedett el, amely a 3 próbával hibrid!zált, vagyis a szekréciós {.kiválasztási} génekkel (sepá - sepD} homológ gének kö-
ében <. A | BIO/Hl2 |
ridizáiő | régiók |
sban az | ergo és |
kedík el ób példa
Λ TAS-választ adö törzsek, a CPB-t kiváltó- törzsek és a CPE~o-s.gat.i.v mutánsok protein-profiljának Összehasonlítása
Annak érdekében, hogy azonosítsunk bármilyen lehetséges kiválasztott baktérium-proteint, amely kapcsolatba hozható a CPE-vei, analizáltuk a kultúrák íelüiúszójában levő proteinek elekfcroforetikus migrációs profilját az £2348/6:9 « * »*·* «4 ««Λ *
Λ >**♦
* * humán S.PEC törzs esetében, a BIO', RDEG-l és a S10/16E1 teresek esetében, valamint a CFE-negativ BIO mutánsok esetében .
A baktériumokat a fenti 1. példában leírt kölcsönhatási teszt körülményei között tenyésztjük, de a sejtek jelenléte nélkül, a kezdeti oltvány hozzávetőleg 107 CFU/ial. 2 órás inkubáció után a baktériumokat centrifugáljuk (4000 g, 15 min, 20 °Ci és 1 ml metíonín nélküli EMEM-ben (No.. 31900-020, GlüCO; szuszpendáijuk, amely tartalmaz még S% hozzáadott dializáit FC5-t. 20 perces inkubáció után 37 °Con annak érdekében, hogy kimerítsük az endogén metíonín készletet, -^S-nel jelzett metionint adunk hozzá 100 uCi/mi mennyiségben. További. 1 órás inkubáció után a baktériumokat két egymás utáni eemtrifugálással (12000 gy 10 min} eltávolítjuk, majd a centrifugálásí felülűszoban a proteineket 40Oö-es políetilén-glíkoilai (PSG, 200 mg/ml, MERCK} kicsapatjuk. 1 órás 0 °C-os Inkubáció után a keveréket ismét centrifugáljuk (1200Ό g, 30 min} „ A. centrifugálásí üledéket 30 μί elekt.roforézises felviteli pufferben szuszpendáijuk és a proteineket eiektroforetikus migráció segítségével szétválasztjuk 12%-os pol íakr Hantid gélben SDS jelenlétében (SDS-PAGE). A gélt vákuumban szárítjuk, majd szobahőmérsékleten 6 napra érintkezésbe hozzuk egy β-msx (AMEASBAM) filmmel, A filmet a szokásos módon hívjuk elő.
Az eredményeket a 6A ábra mutatja.
A Blö szülői törzsben (3. sáv} három főbb proteint azonosítottunk, amelyek molekulatömege rendre 39, 37 és 25 kDa volt, valamint egy kevésbé fontos csíkot 40 kDa-nál.
X* · Φ ΦΦΦ * X * φ ·*'♦
Miközben a nyúl RBBC-l és a B10/16EI mutánsok profiljai megegyeznek a Blö-ével, a humán SPEC referencia törzs, £2348769 (6. sáv) négy csíkot mutat viszonylag hasonló molekulatömeggel NO, 39, 36 és 26 kDa), valamint egy további nagyobb csíkot kb. 29 kDa értékkel, amelynek nincs meg az ekvivalense a BIO profilban (6A ábra) . Ezen csíkok egyike sem. jelenik meg a CPE-negativ B10/CA1 mutánsban. (4. sáv). A 2. sáv a molekulatömeg markereket tartalmazza.
Ezeket a proteineket immunológiai. összefüggésük szerint is megvizsgáltuk,, poliklonális nyúlszérumot használva, amelyet a PEG-gel kicsapatott BIO felülűszö proteinekkel szeriben termeltettünk.
Az Ímmunpreciptiációt a felülúszó proteinekkel szembeni antiszérummal a tenyészet felülúszóján hajtottuk végre, miután megjelöltük -^S-nel, amint az fentebb leírtuk. Az Ímmunpreciptiációt a standard módszerek felhasználásával végeztük el [Sambrook és mtsai.: Moíecuiar CIoning: A Laboratory Manuai, Cold Spring Barbor, b.Y. (1989)j,
Az eredményeket a 6B és a 7. ábra mutatja.
A 6B ábrához tartozó lábjegyzet: 1. sáv: BIO preimmun szérummal; 2: BIO; 3: BiO/CAl; 4: B1Q16E1; 5: molekulatömeg markerek; 6. BDSC-1; 7: £2348/69.
A 6B ábra mutatja, hogy az antiszérumnak a BIO {3.
S£V · | és RBSü-l (6. sáv) bárom | fő proteinjével (39, | í ? 5 | 25 |
kDA) | , valamint az £2348/69 né | gy pro te injéve1 (39, | 36, 29 | |
26 í | :Da) való precipitátumát. | Miközben a BIO három | fő prof |
inje jelen van az AF/R2-negativ mutáns (B.1.0/16E1# 4. sáv) felüiűszójában, nem jelennek meg a CPE-negativ mutáns (Blü/üAI, 3. sáv) felüiúszójában, Meg kell azonban jegyezni, hogy a preímmuu szérumnak is van bizonyos fokú képessége arra, hogy a BIO 40 kDa~s kisebbségi proteinjével
immunpr ec í pi tá t-u? | sót képezzen. | Ezek | |
zik, | hogy a Blö | felülúszó pro | teinj |
ével | és as E2 348 | /69-ével (még | ha e: |
Xekuistömege érzékelhetően különböző is), és hogy a CPEnegativ mutánsban ezen proteinek képződése a feiüiűszőban megváltozik.
Annak eldöntésére, hogy a felülúszóban levő proteineknek ezt az eltűnését a. megfelelő gének expressziójának hibája, vagy a proteineknek a baktérium általi kiválasztásának hibája okozta, összehasonlítottuk a BIO törzs és a CPE-negativ mutánsok (CA1, FA12, E2, A9, és H12) felülúszó proteinjeinek ismmnprecipítáoiös profilját az azonos kultúrából vett baktériumok lizátumaínak (oldatainak) iffimunprecítpítácíós profiljával.
A lizátumokat három fagyasztásiy felengedésl ciklus révén nyertük (-20 °C és 20 °C között), amelyet centrifugalás követett (12000 g, 10 perc), majd kinyertük az lizátum felüiűszóját. Az immnnprecipítáciőt azután hajtottuk végre, hogy megjelöltük -^Ο-ηοΙ, ugyanolyan körülmények között, mint amiket a feiülússó proteinek esetében használtunk. Mielőtt azonban ezt elvégeztük volna az B. coli HBlöl laborétórium törzsének lisátumát használtuk az antiszérum depletálasára, hogy kiküszöböl jük a nem-specifikus reakciókat .
felülúszó proteinek
7B (a bakteriális
Az eredményeket a 7A (a üsmunprecipi feác.iős profilja] és lizátumok immunpreciptíciós profilja) ábra mutatja.
Lábjegyzet a | 7A | ábrához: sáv | OK | 1: | BIO; | 2: mólókul |
meg markerek; 3; CA | .1; | 4: FAI2; 5: | E2; | 0 | : AB; | 7: H12, |
A 7A ábra azt | mt | itatja, hogy | a S | hlG- | -zel | összehasonl |
a ielülöszó proteinek jelentősen csökkennek minden mutánsban. Ez a csökkenés még hangsúlyosabbnak tűnik három mutánsban, nevezetesen a CA1-ben, Ε-2-ben és A9-foen. Az imaunprecipítáció kimutat egy csíkot kb. 110 kDa-nái, amelynek Intenzitása többé-kevésbé egyforma minden törzsben, és amelyet ezért nem befolyásolnak a mutációk.
Megjegyzés a 7S ábrához; sávok; 1; molekulatömeg markerek,* 2; BIO; 3: CA1; 4; FAI2; 5: 2B7 6: A9;7: H12.
A 7B ábra azt mutatja, hogy a fentebb leírt főbb proteinek többé-kevésbé azonos mennyiségben jelen vannak a BIO lizátumokban és a. mutáns lizátumokban, a CA1 mutáns kivételével, amely különösen szegénynek mutatkozik a 25 kDa-s proteinben.
4, példa
A patogenitáa elvesztése a BIO egy CFE-negativ mutánsában
Annak tanulmányozására, hogy a CPE elvesztése hatással van-e a virulencíára, összehasonlítottuk a BIO törzsnek a nyulakra vonatkozó patogén itá-s át orális adagolás esetén az egyik mutánséval, jelen esetben a B10/CA1 törzsével.
A patogenitást új-zéiandi fehér tenyészetből (INRA törzs) származó, 35 napos fiatal nyálakon vizsgáltuk.
φ φφ ί *** * » * * « · ** ♦ * * φ * * φ » ♦ * * * ί *Λ φ Κ-.φ Λ Φ » # •φφφνφ amelyeket. 28 napos korukban választóttünk el, a Pillien és mtsai által leírt módszerrel. [Vet. Microbiol. 50, 105 (1996! 'j. 51 nyalat három csoportba osztottunk, amelyek súlyuk és alom tekintetében homogének voltak, majd orálisan beoltottuk őket a teszt törzsek 2.1<P CFü egységével, név szerint a következőkkel: a Blö szülő törzzsel (18 állat), a CFB-negativ Blö/CAl mutánssal (13 állat) és egy nem-patogén KI2 laboratóriumi BM21 törzzsel (1.5 állat). A hasmenéses és haláleseteket, valamint a súlyt fej legyeztük, és az B. coli törzseket a székletben megszámoltuk és osztályoztuk, amint azt Billien és mtsai leírták (1996. id. mű].
A BIO szülő törzzsel való orális beoltás mind a 18 beoltott állat esetében súlyveszteséget okozott, közülük 17 esetben hasmenést, 16 esetben halált. Az elhullások a beoltást követő harmadik és tizenkettedik nap között következtek be. összehasonlításképpen az azonos mennyiségű Blö/CAl mutánssal beoltott állatok, hasonlóan az B. coli KI2 törzszsel beoitottakhöz, nem mutattak semmi sűlyveszteséget vagy klinikai tünetet. A két utóbbi csoport esetében felvett súly-görbék gyakorlatilag azonosak voltak.
A 8A ábra mutatja den csoportban a kísérlet során: BIO (két tólélö/18 állat Δ; K12 (kontroll; 15 túiélö/15 állat) - 0; B10/CA1 (18 túlélő/ 18 állat) - □.
A 88 ábra mutatja, a coli hacillusofc populációját a beoltás után különböző Időkkel azon állatok székletében, amelyeket a KI2 kontroll törzzsel, a Blö törzzsel és a Blö/CAl törzzsel oltottak be:
túlélő állatok átlag súlyát min· □ : Blö/'CAl törzsből állóként azonosított Collbaciilus flóra
Q: BIO törzsből állóként azonosított Colibaoillus
f. 1 o r a.
Jelentős S. coli kolonlzációt (elszaporodást) figyel tünk meg a szülői SIO törzzsel beoltott nyulak esetében, a kolonizáciő elérte a túlélőkben a .10^ CFU/g szintet a széklet tartalomban több, mint két héttel a beoltás után. Minden azonosított colibacillus flóra BIO törzset tartalmazott.
Ez a teljes E. coli populáció ICp-IO^-szer nagyobb volt, mint az, amit a kontrollcsoportban levő nyulak esetében láttunk, amelyeket a Klz-es E. coli törzzsel oltottak be, amelyet ezen felül nem. is detektáltak a megfelelő állatokban.
Azokban a nyu.la.kban, amelyeket a S1Ö/CA1 mutánssal oltottak be, ez utóbbi a beleket magas szinten kolonizálta, ami után az E, coli populáció kb, lö& CFJ/g széklettartalom szinten .stabilizálódott legalább két hétig. Ezalatt az idő alatt a teljes E. coli populáció '?0~lö0%--át a B10/CA1 alkotta .
ő. oe 3da
Egy CBE-negativ törzs által átvitt védelem viszonya a szülői B20 törzzsel valő fertőzéshez
A patogén BIO törzs 10^ CFU-s dóziséval vali raíií napo s nyutón., beoltás hatásait összehasonlítottuk 2, 13 egyébből álló 35 amelyek közül az egyik csoportnak egy héttel φ * *
X Φ* *« φ ·♦·>«* * φ
Λ * * * korábban orálisan a B18/C&1 mutáns törzset adtuk be (2xlí)·'
CFÜ!
Harminchat fiatal nyalat <a faj és a tenyésztési körülmények megegyeznek a fenti 4. példában leírtakkal) két csoportba osztottunk, .amelyek a súly és az alom szempontjából homogének voltak. 30 napos korukban az egyik csoportba tartozó állatoknak 2x10^ CFÜ B1Q/CA1 mutánst adtunk be orálisan 2 ml PBS-ben. Hét nappal később mindkét csoporthoz, tatoző állatoknak a patogén BIO eredeti szülői törzsből orálisan, egy 2x10^ CFÜ dózist adtunk (ami a halálos dózis kb. 150S~a). A hasmenése» és haláleseteket valamint a súlyt feljegyeztük és a székletben az £. coli törzseket megszámláltuk és típusba soroltuk, amint azt a fenti 4. példában leírtuk.
Az egész megfigyelési időszak alatt semmilyen klinikai tünetet vagy súlyveszteséget nem figyeltünk meg azokon a fiatal nyulakon, amelyeknek előzőleg orálisan beadtak a
B10/CA1 törzset.
Másrészt 18 nyálból 11 azok közül, amelyeket nem vakcináitünk BIO/CAl-gyel súlyveszteséget mutatott, míg a nynlak közül 9 hasmenést mutatott és 18-ből 7 elpusztult,
A bél-kolonizáoiő vizsgálata megmutatta, hogy a B1Ö/C&1 törzs hatásosan kolonizálta a beleket akkorra, mikor a patogén BIO szülői törzset beadtuk; ezután a B10/CA1 törzs a kb. 10' CFU/g stabil szinten maradt két hétig, ezáltal megakadályozta azt, hogy a B10 detektálható szinten megjelenjék.
* * * * ♦ x«i
Párhuzamosan ELISA-t használtunk a lokális anti 0103 LES XgA antitestek mérésére a székletben, A 9. ábra mutatja a székletben levő IgA antitestek .kifejlődését a CPE-nsgativ 310/CA1 törzzsel való orális beoltás (0 nap) után, majd a virulens 810 törzzsel való beoltás után (a 7, napon} (0), vagy csak a 810 virulens törzzsel való beoltás után a 7, napon . Látható, hogy az antitest válasz szignifikánsan nő körülbelül 15 nappal a B10/CA1 törzzsel való orális beoltás után.
o. példa
LEE-mutánsck izolálása helyspeclfukcs mu tagé nézessél
A B10 törzs LES-fókuszának jobboldali végét klónoztuk és szekvenáitufc, A szekvenált régié szerveződését diagramszérűén mutatja a 10. ábra, és a kapott szekvenciát a csatolt szekvencia-Iistában Írjuk le 1. szekvencia azonosító szám alatt. Ezenfelül tanulmányoztuk az LEE;-fókusz általános szerveződését a patogén 0103 törzsekben és megerősítettük, hogy ez azonos volt mindezekben a törzsekben.
Létrehoztuk az 0103 törzs LES-lókusz mutánsait az
E22-vel jelölt mutáns törzzsel kezdve, Míg ez a patogén törzs analóg a S10 törzzsel, érzékeny a streptomieínre {éppúgy mint továbbá minden megvizsgált Graa-nagativ spektrum an tibo t i Rumra}.
Ezeket a mutánsokat az ai léi-csere 'módszerével állítottuk elő.
Minden egyes választott lókuss esetében {eaeA, espA, espB és espDi a vad típusú E22 törzs alléiját kicseréltük
S22
Λ1 ♦* ί
fc- « «••Οί'ί *- +
Φ » • «·«· ♦♦ »
* φ ♦
φ *»«« egy olyan alléllel# amelyet egy expressziós kazetta [-Gálán és mtsai.# J. Bacterioi.# 174# 4338 (.1.992)1 izertálásával# amel.y tartalmazott egy kanamícinnel szembeni rezisztenciagént (aph.T-gén: amlnoglikozíd 3'-foszfotranszerás) egy erős pr omo te.r szabályozása alatt# tarnszkripciós terminátor nélkül. Ez a kazettát# amelyet a mutálandó gének szegélyeznek# és amelyet egy öngyilkos piazmid [Kaniga és mtsaí# Gene# 109, 137 (.199.1)] hordoz# bejuttatjuk a vad típusú törzsbe, majd kiválasztjuk a rekomblnáns baktériumokat.# amelyekben a vad típusú alléit a mutált alléi váltotta fel.
Az eaeá és espő-géneket a kazettának a természetes Eco-RV-be ill. a Bglll restrikciós helyre való inzertálása által inaktiváljuk. Az espB és espA esetében de .novo egy SgJJT (GACATCj helyet hoztunk létre hely-specifikus mutagenezisse.1 (PCR degenerált oligonukleotido-k alkalmazásával és a plazmidok szelekciója restrikcióval).
A kapott mutánsok által előállított proteineket immun-b-Iotto-lás segítségével analizáltuk az EaeA esetében és isaauiyp-recipítációva.! az EspA, EspB és S-s-pD esetében. Ez az analízis megerősítette# hogy ezek a mutánsok csak abban különböztek a. vad típusú törzstől., hogy nem termelték azt a proteint# amelynek génjét a mutáció inaktiválta.
A kapott mutánsok a következők voltak:
- EzzAespA# amely már nem szintetizálja az EspA proteint, ~ E22ÁespB# amely már nem szintetizálja az EspB proteint.
- E22AespG# amely már nem szintetizálja az EspB proteint.
- S22AeaeA# amely már nem szintetizálja az EaeA proteint, ezért nem építi azt be külső membránjába.
# *.<ν*.* * *'*·.
«8 <fr ♦ '*♦ * ♦ *«-«1 \ * ♦ φ 9 * ♦ » «*<· * **''*
Az egyéb proteinek szintézise lényegileg normális marad mindegyik mutánsban. Az E'2'2áespA mutáns például már nem termel SspA-t, de normálisan kiválaszt EspB-t és EspD-t éppúgy, mint ahogyan, normálisan szintetizál EaeA-t és normálisan beépíti azt külső membránjába. Ügy tűnik tehát, hogy ezen mutánsok mindegyike tartalmaz egy szigorú, nem poláris („sáriét, non-polar) mutációt, amely kizárólag a mutáció cél-génj ét érinti.
A 10. ábra a 0103 törzsek LEE-lőkuszának jobboldali végét mutatja és a különböző gének pozícióját, is jelzi és a kazetta inzertáiásának helyét mind a 4 kapott mutánsban.
Ezeket a mutánsokat in vitro vizsgálatoknak vetettük alá, a melyek célja az volt, hogy megállapítsuk CPE kiváltási képességüket HeLa sejtekben, amint azt a fenti 1. példában leírtuk.
Az esp-gen mutánsok patogenitását is ügy ellenőriztük elválasztott nyuiakban, hogy 35 napos nyulak csoportjainak orálisan beadtunk 2x10'’ CFb mutánsot nyálanként ugyanannak a protokollnak az alkalmazásával,a melyet fentebb a 4, példában leírtunk.
*♦»««*** * ♦* ♦ )ί » «. ** * * » * .*.♦* X * « A X X * κ«« « ««« >» »«*»
- 32 ~
A kapott eredményeket az 1 táblázat foglalja, össze
1, Táblázat
Törzs | CPE/Keka | in vivő patogentíás3 | ||
süiyveszte- ség | hasmenés | halandóság | ||
£22* | 4-F+ | 23/34 | 26/34 | 25/34 |
E22ÁespA | 0/16 | 0/16 | 0/16 | |
£22AespB | - | 0/16 | 0/16' | 0/16 |
E22Áesp£> | - | 3/18 | 2/18 | 2/18 |
E22ÁeaeA | •S-4-4- | NT | NT | NT |
a: A klinikai tüneteket mutató állatok száma/beoltott állatok száma *: vad tipo.su törzsek
NT: nem vizsgáit,
Ezek az eredmények azt mutatják, hogy az Esp protein szintézis mutánsok, már nm expresszál ják a citopatogén hatást Heha sejteken, szemben az eaeA mutánssal. Ennek következtében két .Esp protein mutáns (ÁespA és ÁespS) teljesen elvesztette patogentiáeát és a ÁespD mutáns patogenitása sokkal gyengébb, mint a vad típusú törzsé.
SZEKVENCIÁLISΤΑ
Α2 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: .12620 basispár TÍPUSA: nukleotíd
HÁNY SZÁLÚ: kettős
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
JELLEMZŐK:
NÉV/KULCS: cds
E LHELYE ZKEUÉ S: 1768,..4587
EGYÉB INFORMÁCIÓK: /produkt - eaeA JELLEMZŐK:
NÉV/KULCS: cds
ELHELYEZKEDÉS: 7278. . .7856
EGYÉB INFORMÁCIÓK: /produkt = wespA!5 JELLEMZŐK:
NÉV/KULCS: cds ELHELYEZKEDÉS: 7869...3011 EGYÉB INFORMÁCIÓK: /produkt = MespD* JELLEMZŐK:.
NÉV/KULCS: cds
ELHELYEZKEDÉS: 9032...937 6
EGYÉB INFORMÁCIÓK: Zprodukt - ”espB”
AZ' 1.. AZONOSÍTÓ SZÁM.Ö SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
OATATWCCO AACCCCGTCA CWSATMTA SmWAOTOWM T&CMAffiMC SÖ &CG&WASC CASGffiS&TCC AA4TASTGÖC Ö&ÖGSÁ&A&A TOmWSAT TCATACtTCA X2Ö
ACCTOACTT CMCCTCCS TÖCAÖATCCT AAACTTW3T TSTShOT SACTATTGCT 188
8CM3OTSTO& TAGGÖATÖOC TGCGACGGGS &TTGC&C&GG OTGTTGCWT SACTCCAOAÖ 24ö
CCGG&TO&CC CAATCACTAC CÖACCCTÖAT GCTGCMCAA &C&Ö&3CTG& mOJ® 388
AAAÖATCAST TAACOWO, ASCMTSOS AACCCAGATA AŐbSAMST ΤΜΤΑΤ03ΑΤ 388
8AÖAACG0AA ATGCÓATTCC STOT$KM CTO&&3&TG ATSTTÖTTSC GCAAATAGCÁ 420
S&AC&ftSCTA AAÖCSOCÖGG TÖAACN38CC A®CO« CTATTGAAAG TMTTCTCW 488
SCGCAGOAA JWATOAWL KCAÖOmCT AAACSO3MC K«MW TCOTTCATCG 54 S
GQGGrmOCT ACOSTATTAS XWTGCGCKS ATTCTTOOS GGGCAATTGG TÖCCT3TOT? 888
Μ 9 » X XX * * **
* φ - 35 - : ...1 | I ♦ ♦ ♦♦*:> |
ACTGCCTCTC TTC&TCGCAA AAACCAACTS δΜΑΑΟΜ CAATt&CTAC ACGTACTGTA | 888 |
STCG&TAATC AGCCTACGAA TAACGCACTT GCGC&CTGCA ATACTGACAC AAGTGGSCCA | 728 |
GAAÖAGTCCC C3GCGASCAG ACTTAáTTCG AATGCCAGCC TCTCATCGA& CCTGTCTGAC | 788 |
ACCTCCAGCA CGCTCACGGT AGAGAATCCG TACTCTGACT TCTGAATGCC CAGAAACTAT | 850 |
TCACCTGCTC GCATTTC&GA G8AACCTATT TATGACTAW TCGCCTCAGA TCTTAATTAT | 208 |
AGCGTCATTC AACATTTTTC A8CTAACAGC KWW GAACTTTAG? GCTAACCCCA | Μ8 |
GSGCAAGGTA TCCAAAGT&C TTATGCTCTT CTOWa GÖSSO0S&TT GCTTTTAGGT | 1823 |
ATCTGACTAT TAACGGGGCT GCTCGAGAOC GCMGTAAGTA CCTCCAATGC CGCACCAACG A ,»v | 1888 |
CCSGGACCCT CACGTTTCGT TTAAATATAT CCTTGAGTAT TTAGTCTACT TTGGGAGGGG | 1148 |
GGGACTTTTA CTAATATTAA CTTTCTAGAG AATAAAGTTG CAGCACTGÖT AACTCTTGAA | 1288 |
CTTCTOTAAT TATAAATTCA ATTAAGMGAA ATT&TAACT? CATCAAGATC CTACCTTTTA | T2CO |
T7AGATAGAT TTSCACAAAA AATTCTTATT GGATCTATCT αΏΏΛ®Α AAATAGATTG | 1820 |
worr® ctatctatga gattcattat atttcgttat ctgatgctaa ctacgaatat | 12 SS |
ACTATGATCT &TGSCGTCTG TGCTAAATTC CCGACAGATA ATÖCTRACTT CGCTCTTGAG | 1448 |
ATTTCTAATG CAAACTTACT GTTTGCAGAG AATCTCTGAC CATACCTGTG TTACTAATCA >*>:·. Λ' · · · >. A í: > CTAGCACAAT CTCWTCTTT AGCTTTACTT TTTCCSCTCT ACTATGCTAC ACCTGAAAAA aSí . , X«?y «5 ·?* ' íf CTWAGAATG AAATAGAAGT CTTCSTTAAG TCAATW&AA ACCCTTATTT GGTATTACAT | 2588 1558 1520 |
WKO» TAACATTAGA AAACÖAACAT AWAA&&TAG ACTAAATTAG TTCA&SCTAT | 1888 |
AATAAACATT ATTACTCCT© AAGATAAAAG ATTATTTATT AATATAATTT ACTATTCATT | 1740 |
CTAACTCATT GTGGTGGACC CCATAAC ATG ATT ACT CAT GGT TTT TAT GCC Met Tie Thr Kis Gly Lhs Tyr Aia 1 5 | 1721 |
CTG ACC CGG CAC AAG’GAT AAG CTA AAA AAA. ACA TTT’ ATT ACT CT? AGT Arg T&r Arg Kis Lye/His Lys Leó Lys Lys Thr Lhe.lle Met Leu Ser 18 l IS 28' x<X ?>VV Λ «·>·<· * ·\? ·*!*$·-.· GCT GG? TTA GG& TCT TTT TTT TAT GTT AAC CAG AAT TCA TTT GCA AAT Ale Gly Leu Gly Leu The Fhe Tyr Vei A»» Gin As» Ser The Ale A®» 25 20 25 88 | 1832 1887 |
GGT GAA AAT TAT TTT AAA TTG AGT TCA GAT TCA AAA CTG TTA ACT CAA Gly Glu Asn Tyr Phe Lys Leu Ser Ser Asp Ser Lys Leu Leu Thr Glu 45 50 55 | 1535 |
AAT GCC GCT CAG GAT CSC CTT TTT TAT ACT TTA AAA ACA GGT GAA ACT As» Alá Ale Gi» Asp Arg Leu Phe Tyr Thr Leu Lys Thr Gly Glu Thr 88 85 > 70 | 1283 |
Χ« V « ** * * « ΦΧ <44
/.4 * *
GTT GCC AAT ATT TCT | AAA Lys | TCA Ser | CAG GGT ATC AGT TTA TCG ÓTA ATT TGG | 2031 | |||||||||
Vei | Ale | Asn.Tle 75 | Ser | Gin Gly 80 | H e Ser | Len | Ser 85 | Val | lle | Trp | |||
TCA | CTG | AAT AAA | CAT | TTA | TAC | AGT TCC | GAA ACC | GAA | ATÜ | ATG | AAG | GCT | 2075 |
Ser | Lea | Asn Lye | SÍ® | Len | Tyr | Ser Ser | Gin Ser | Gin | Mét- | Mer | Lys | Ale | |
PO | PS | 100 | |||||||||||
GGA | CCT | GGT CAG | CAG | ATC | ATT | TTG CCA | GTC AAA | AAA | ere | TCT | GTT | GAA | 2127 |
Sly | Pr© | Gly Gin Gin | He | He | Len Pre | Len Lye | Ly® | Len | Per | Val | Gin | ||
105 | 110 | 22S | 120 | ||||||||||
TAT | AÜT | GCC TTA | CCT GTC | TTA GGT TCG | GCA CCT | GTT. | OTT | GCT | GCA | GGT | 2175 | ||
Tyr | Ser | Ale Len | Pro | vei | Len | Gly Ser | Ale Pro | Val. | Val | Alá | Als | Gly | |
12K | 130 | *5?>k | 135 | ||||||||||
GGT | GTC | GCT GGT | CAT | ACG | AAT | AAA ATS | ACT AAA | ATG | TCC | CCÜ | GAC | CCS | 2223 |
Gly | Val | Ale Gly | Mis | Thr | Asn | Lys heh | Thr Lys | Méh | Ser | Pr© | Asp | Alá | |
140 | 14$ | 150 | |||||||||||
ACT | AAA | AGC AAC | ACG | ACC | GAT | GAC AAG | GCT CTA AAT | TAT | GCG | GCA | CAA | 2271 | |
Thr | Lye | Ser Asn | Thr | Thr | Asp | Asp Lys | Ale Len | Asn | Tyr | Alá Ale | Gin | ||
155 | 140 | 185 | |||||||||||
CAG | GCG | GCG AGC | CTT | GGT | AGC | CAG CTG | CAG TCG | CGC | TCA | CT® | AAC | GGC | 232.P |
Gin | Ale | Ale Ser | Len | Gly | Ser | Gin Len | Gin Ser | Arg | Ser | Len | Aon | Gly | |
27© | 17S | 2P0 | |||||||||||
GAT | TAC | GCG AAA | GAT | ACC | GCT | CTT GGT | ATG GCC | AGG | AGC | CAG | GCT | TCG | 2387 |
Asp | Tyr | Alá lys | Asp. | Thr | Ale | Len Gly | Met Ale | Ser | Ser | Gin | Ale | Ser | |
185 | ÍS© | 185 | 200 | ||||||||||
TCA | CAG | TTG CAG | GCC TGG | TTA | CAA CAT | TAT GGA | ACG | GCA | G&G- | GTT | AAT | 2415 | |
Ser | Gin | Len Gin | Alá | Trp Len | Gin Ki® | Tyr Gly | Thr | Ale | Gin | Val | Asn |
205 220 215
CTG CAG AÜT GGT AAT AAC TTT GAC SÜT AGT TCA CTG GAC TTC TTA TTA · 24S3
Len Gin Ser Üly Asn Asn Phe Asp Sly Ser Ser Len Asp Phe Asn Len
220 225 230
CCG TTC TAT GAT TCC GAA AAC ATG CTG GCA TTT GGT CAG GTC ÜST GCG 2511 ?» Phe Tyr Asp Ser Sin Asn Mer Len Ale Phe Gly. Sin v&I Gly Alá
235 24© . 245
CGT TAS ATT GAC TGC CSC TTT AGG GCA AAT TTA CGT GCT GGC CAG CGT 2SS9
Arg Tyr Tle Asp Ser Arg The Thr Ale Asn Len Gly Ale Gly Sin Arg
2SÖ 255 25©
TTT TTC GTT CCT GAA AAT ATG TTG GGC TAT AAC GtC TTC ATT GAT CAG 2507
Phe Fte Len. Pro Gin Asn hét L«u Gly Tyr Asn Vei Phe lle Asp Sin
255 272 275 28©
GAT TTT TCT GGT GAT AAT ACC CGT TTA GGT ATT SÜT GGC GAA TAC TGG
Asp Phe ser Sly Asp Asn Thr Arg Len Gly Π® Gly Gly Gin Tyr Trp
255 25© 2PS
2585 * * *· » * ' ··*, 5 .* χ λ r»*s
CGA SAS TAT TTC m AGT AGC GTT AAC CGC TAT TTC CGC ATG AGC GGC 2783
Arg Asp Tyr Phe Lys Ser Sár Val Asa Gly Tyr Phe Arg Mer ser Gly
388 385 Γ 3X8
TGG CAT GAG TCA TACjAAT &%8 AAA GAT TAT GAT g|g CGC CCG GCA AAT $751
Trp His Glu Per Tyr Asa Lys Lys Asp Tyr Asp Óla Arg Pre Al® Asa
335 320 333
GGT TTT GÁT ATT CGC TTT AAT CGC TAT TTA CCA TCA TAT CCG GCA 27»
Gly Phe Asp XXe Arg Phe te Gly Tyr Leu Pre Ser Tyr Pre Alá he»
133 333 343 ®C GCC AAA CTG ATG TAT CAA CAG TAT TAT CGT CAT AAT GTT GOT TTG 2347
Gly Alá Lys he» Mer Tyr cl» Gla Tyr Tyr Gly Asp Asa v®X Al® Le»
343 358 355 . 358
TTT AAT TCC GAT AAG TTG C&G TCG AAT CCT GGC GCÖ GGG ACC GTT CCT 2885
Phe Asn Ser Asp Lys Le» Gl® Ser Asa Pre Gly A1& Al® Thr Vei Gly
355 373 ? 373 * \ .w
GTA AAC TAC AGT COS ATT CCT CTG GTG ACG ATS CSC ATC GAT TAG CGT 2 343
Val Asa Tyr Thr Pro lle Pro Leó Vei Thr Mefc Gly Ile Asp Tyr Arg
388 335 353
CAT GGT ACG GGT AAT GAA AAT GAT CTC CTT TAC TCA ATG CAG PTC CGT 2»1
His Gly Thr Gly Asa Gla Asa Asp Leu he» Tyr Ser Mer Gla Phe Arg
385 403 435
TAT CAG TTT GAT AAA CCG TGG TCT CAG CAA ATC GAG CCA CAC TAT GTT 3333
Tyr Gla Phe &sp Lys Pro Trp Ser Gla Gla lle Glg Pro Gla Tyr v&l
4X8 433 423
Λ
AAC GAG TTA AGA ACA TTA TCG GGC' AGC CGT TAC GAT CTG GTT CAG CGT 3357
Asa Glu Leu Arg Thr: Les. Ser Gly Ser Arg Tyr Agg Leu V®1 Gla Arg
425 433 435 ·' 440 ' s
AAT AAC AAT ATT ATT CTG GAG TAC AAA AAG CAG GAT ATT CTT TCT CTG 313S
Asa Asa Asa He He Leu Glu Tyr Lys Ly® Gla Asp 21® Leu Ser Leu
445 453 455
AAT ATT CCG CAT GAT ATT AAT GGT ACT GAA CAC AGT ACG CAG AAG ATT 3133
Asa lle Pro Mis Asp He Asa Gly Thr Glu His Ser Thr Gla Lys He
458 455 478
CAA TTG ATC GTT AAG AGC AAA TAC GGT CTG GAT CGT ATC GTC TGG GAT 3231
Gla Leu He Val hy® Ser Lys Tyr Gly Leu Asp Arg He Val Trp Asp
475 400 485 . ’*·
CAT AGC CCA TTA CGC AST CAG GGC W CAG ATT CS CAT GGC GGA AGC 3272
Asp Ser Al® Leu Arg Ser Gla Gly Gly Gla He Gla His Gly Gly Ser
428 425 588
CAA AGC GCA CAA GAC TAC CAG GCT ATT TTG CCT GCT TAT GTG CAA GCC 3327
Gla Ser Al® Gla Asp Tyr Gla A1& He Leu Pro Alá Tyr vei Gla Gly
585 510 515
520 » X«r ♦ X « * * ♦ fi ♦ X ♦ ♦ Λ
CTC AGC AAT ATT TAT AAA | CTG ACC GCT CGG GCC TAT GAC CGA AAT GGT | 3375 | ||||||||||||||
W | Ser | Asn He | Tyr Lya 525 | Vei Thr | Alá | Arg Alá 530 | Tyr | Asp | Arg | Asn 535 | Giy | |||||
MT | AGT | TCT | AAT | AAT | GTA | C$3 | CTC ACT ATT | ACC | GTT | TTA | CCT | AAT | CTG | 3433 | ||
Aon | Ser | Ser | Asn | Asn | Val | Gin | Len | Thr | lie | Thr | Val | Len | Pr© | Asn | GXy | |
540 | 545 | 550 | ||||||||||||||
SAS | GTT | GTG | GAC | CAG | GTT | CTG | GTA | ÁCS | GAC | TTT | &CT GCT | GAT | AAA | ACA . | 3471 | |
Gin | Val | Val | Asp | Gin | Val | Giy | Vei | Thr | Asp | The | Thp | Alá | ASp | Lya | Thr | |
SSS | 550 | 555 | ||||||||||||||
TCG | GCT | AAA | GCG | GAT | GGC | ATA | GAA | GCT | ATT | ACC | TAT | ACC | GCG | ACG | GTT | 3515 |
Ser | Alá | Lys | Alá | Asp | GXy | lle | Gin | Aia | lle | Thr | Tyr | Thr | Alá | Thr | Val | |
§70 | 575 | 550 | ||||||||||||||
W | AAG | MT | GGT | GTA | GCT | CAG | GCT AAT | GTC | CCT | GTA | ACA | TTT | AGT | ATT | 3557 | |
Lys | Lys | ÁSS | GXy | vei | Alá | Gin | Alá | Asn | Val | Prn | Val Thr | The | Ser | Xle | ||
sss | 550 | 555 | 500 | |||||||||||||
GTA | TCT | GGG | AGT | GCT | AGT | CTT | GGG | GCA | AAT | AGT | GCG AGA | ACG | GAT | CTT | 3515 | |
Val | Ser | GXy | Thr | Alá | Thr | Len | GXy | AXa | Asn | Ser | Alá | Arg | Thr | Asp | Giy | |
SSS | 510 | 3$ | 5X5 | |||||||||||||
AAC | GGT | AAG | GCG | ACC | GTA | ACG | GTG | AAG | TCG | GCT | GCT | CTA CAG | GTC | 3583 | ||
Aan | Giy | Lys | Alá | Thr | Vei | Thr | Len | Lys | Ser | Alá | Thr | Pro | GXy | Gin | Val | |
520 | 535 | 530 | ||||||||||||||
GTC | GTG | TCT | GCT | AAA | ACC | GCT | GAG | ATG | ACT | TCG | CCT | CTT | AAT | GCC | AGC | 37X1 |
vei | Vhl | Ser | Alá | Lys | Thr | Alá | Gin | hhfc | Thr | Ser | Pro | Len | Asn | A1& | Ser | |
OS | 540 | 545 | ||||||||||||||
GCG | GTT | ATA | TTT | GTT | GAT | CAA | ACC | AAG | GCC | AGT | ATT | ACT | GAG | ATT | AAG | 3755 |
Alá | Val | Tle | Phe | Val | Asp | Gin | Thr | Lys | Alá | 5er | lle: | Thr | Gin | lle | Lys | |
550 | 555 | SO $ | ||||||||||||||
GCT | GAT | AAA | AGA | AGA | GCG | SAS | GCA | GAT | CTT | TCT | GAT | GCG | ATT | ACC | TAT | 3307 |
Alá | Asp | Ly® | Thr | Thr | Alá | Lys | Alá | Asp | GXy | Ser | Alá | lle | Thr | Tyr | ||
sss | 57® | 575 | ü/ | 580 | ||||||||||||
ACT | GTC | AGA | GTG | ATG | AAG | GAG | GGG | GCA | CCC | GTA | GTA | GAT | CAG | AAA | GTG | 3 855 |
Thr | Val | Arg | Val | Msr | Lys | Gin | Giy | Alá | Pr© | Vei | Val | ASp | Gin | Lys | Val | |
555 | 550 | 505 | ||||||||||||||
AGC | TTT | TCT | AAG | GAT | TXT | GCG | ACC | CTG | AAT | MG | ACT | GAA | GCA | ACA ACC | 3803 | |
Thr | The | Ser | Lys | Asp | Phe | GXy | Thr | Len | Asn | Lys | Thr | Gin | Alá | Thr | Thr | |
700 | 705 | 710 | ||||||||||||||
GAT | CAG | AAT | GGT | TAT | GCT | ACT | GTA | AAA TTA TCA | TCG | AAT | ACT | CCT | GGC | 3351 | ||
Asp | Gin | Asn | Giy | Tyr | Alá | Thr | Val | Lys Len Ser | Ser | Asn | Thr | Ar© | Giy | |||
7X5 | 728 | 725 | ||||||||||||||
AAG | GCC | ATT | GTT AGT | GCA | MA | GTG | AGT | GGA | GTA | GC^ | ACA | GAA | CTT | MG | 3333 | |
Lys | Alá | Tle | Vei | Ser | Alá | Lys | Val | Ser | Giy | val | GXy | Thr | Gin | Val | Lys | |
730 | 735 | 700 |
404?
*Χ«Φ **
OCT ACT ACC OTT GAG TTT TTT ÖCS CCS TTG AGT ATT GAT GOT GAT M Ma Thr Thr Val 01« Phe Phe Alá Pro hév S®r n© Asp oly Asp Lys
755 720
GTO | ACC | ÓTA | ATT | sor | ACT | GGT | ATC | ÁCS GGS | GCT | dó CCA | AAO | AAC | T00 | |
Val | Thr | Val | lle | Oly | Thr | Oly | lle | Thr Oly | Alá | Leú | Pro | Ly® | Asn | Trp |
705 | 770 | 775 | ||||||||||||
% | ||||||||||||||
TTA | OAO | TAT | GGT | CAG | OTT | AAO | CTA | CAG OCA | ACA | ooo | GGC | AAT | 80A | AAA |
Leu | öla | Tyr Oly | Sin | vsl | Lys | Leu | Gin Alá | Thr | Oly | Oly | Asn | Oly Lys | ||
790 | 725 | 792 | ||||||||||||
TAG | ACA | TOO | AAA | TCC | AST | AAT | ACT | AAA ATT | GOT | TCT OTT | GAT | AAG | TCO | |
Tyr | Thr | Trp | Ly® | Ser | Ser | Asn | Thr | Lys lle | Alá | Ser | Val | Asp | Asn | Ser |
?>5 | 200 | SOS | ||||||||||||
OOA | CTG | ATA | ACC | TTA | AAT | G&A | AAA | GGG AGT | GCC | AGA | ATT | AGT | CTA | ÓTA |
Oly | Val | Xle | Thr | Lee | Asn | Glu | Lys | Oly Ser | Alá | Thr | Xle | Thr | Val | val |
2X0 | 9X5 | 22,0 | ||||||||||||
TCT | sor | GAT | AAT | CAO | AGT | GCG | ACA | TAG ACA | ATT | aa! | GCA | CCG | GGT | AST |
Ser | Gly | Asp | Asn | Sin | Ser | Alá | Thr | Tyr Thr | lle | Asn | Alá | Ar® | Oly | Ser |
225 | 230 | 835 | 240 | |||||||||||
ATT | ÓTA | ATT | OTT | OTS | GAT | AAA | AAT | ACT CGA | OTT | AGÖ | TAT | TTT | GAT | OGG |
lle | Vsl | lle | Alá | Val | Asp | Ly® | Asn | Thr Arg | Val | Thr | Tyr | Phe | Asp | Alá |
295 | 250 | 255 | ||||||||||||
m | AAC | AAA | TCT | AAG | ACA | AAT | AGG | GCA AAT | TTA GCA | CAO | CCA | AAA | OAA | |
Glu | Asn | Lys | Cys | Lys | Thr | Asn | Ser | Alá Asn | Len Alá | Gin | Pre Lys | Gin | ||
200 | 9«S | 870 | ||||||||||||
ÓTA | TTG | SCO | AAT | ATS | TAT | TCA. | ACA | TOG GGT | GGT | GCA | AAT | AAA | TAT | CCT |
Leu | Leu | Alá | As» | lle | Tyr | Ser | Thr | Trp Oly Alá | Al| | Asn | Lys Tyr | Pro | ||
975 | 920 | 4 | 225 | |||||||||||
TAC | TAT | TCT | SÓT | TCT | AAA | TCA | TTG | ACT GOT | TGO | AT^ | AAA | CAA | TCT | TCT |
Tyr | Tyr | Ser | oly | ser Lys | ser | Len | Thr Alá | Trp | lle Lys | Gin | Ser | Ser | ||
290 | 292 | 900 | ||||||||||||
TCT | OAA | CAO | TCA | TCA | GGT | ÓTA | TCA | AGG ACA | TAT | GAT | TTG | OTT | ACG | AAO |
ser | Glu | Sin | Ser | Ser | Oly | Vei | Ser | Ser Thr | Tyr Asp | L®« | Val | Thr | Lys |
m
9X5
920
4095
4143
4X91
4039
422?
3 S
4323
4431
4479
4527
AAC CAO TTG ATS AAT OTT OOA ÓTA AAC AAT AAO AAT OCT TTT TCT OTT Asm Sin Len Ti® Áss Val Gly V®1 Asn Asn Lys Asn Alá Phe Ser val
925 520 935
4575
402?
GTCTCATTTO SOAATAAOTT TTTCGTSTAT CTTGTTTOAT AGAGACCTTG TTTACCATAT
CTACAACATC TOCACAATAA AAMCCCTCC OA&OAOOGGO MOAXAATAA TAAOTTMTA
AGA8AACGGA ATMGOTS&T
AATCGCGTCT ATOAC&T&GC
ATtAAG&SCA ATTGWOAS' «wcm mwm
STCCATCGCA TTTATAA7GG á»ASO ACATCAT2CT
GA&dCT8AT GCCAGTTC&T
Meccowc GmTTCAöTA
GTATCCCÖAT AAGAGGAAGA
ACCGTATTCC GTXAAAATAT
G7WTAATAA AMATATTTT
Λ tgattcgcaa csccmm
AAGTTTGTTT TCrnTÁGOT
VHW3GGAA AGCAAAACGT
OWCTAGCC AGGWsAGAC
ATCASACAAT GGCAASGIGT
GATSACCTTT CC8OSST&
< ·«ΐ(; ( / γ : : ' 1 1'' :( : )( ( :('<)( ( ( : : 1 : 1 : ) ) :>' mmATTCA AOT3&AÖATA ·<$?
ATTGAWCCT TSTKMO emcecsss gömstwa
AT&TOAGWt AACATTtTTA
TGG7ÖAACTT ACATCAACTA
ATGG&ATATT CATAACTAA2
TCAAAACACC GCATCTGTiT attaaöscaa wwrrm'
AOTOS&TT ACTAGTTCAT
CAAAGGCAGT GCAAGSAAAG
GC&ASAGCSG CTTACTCTGA
TGGGCTGCTS GAACAGCA7G
- 40 ATICG75TGG GCGGGAGATO
CXCTTTCAG AAT8CTACCA
TCTTCATCGT SCCGCTGATT
GOTMW? CTGAAATMT cogg&tctt ktctsotk
TTTTWmT &TTGMATA5 τοαττημτ Grmcwrm
ACASATTTIC AACTTCSCTC atccwot ^wcm
CATTAATCGC GGiVSATOATT
WTCTTÖ© GTAATTMAA
GCGO3ACATT TrmX&TSC
GCTGGTA2&C ATCAGCTCTÖ
MCTSCCQ&T GGCTCCAGAC
Gcrrrmns tcoatttttg
8S7CAATATC ACCAATGA7G
AT8&OT&TC TSCTTCATAG
AMS8AAAAC ACCTOTCA wm»c sg®em
ATTSCCGATV ACÖC&TCOC&
AATTTTTTTC ATCCT38W3
ACAATAGAG? AGAAAGGAAG
GAT7&CGTG& OTTCCAA'TG
TXAATSCTAA TTC&n&ŐAT
CTMTAGTTA ttctccatea
CbSTTTCTGA AACGATTGAA
AASAG8AAGG WSACAACG
CCGATASCGA ΤΑΜ2ΤΜΑΑ
A2CCTAATTT ©TCTATGITT * * » ♦ ♦♦ :* * »»* x * « * x· * ♦ * *· »4·» X .
'TOATACCAT CTTTAGGATC &TTCCC&3GC TKJIACCG’TT l((()(ij:(((l<<l>:((<l(:Í ))((1( ()(( (()Ö<<<(():)((
C1ÚAÖTATTT TTCCGGGSM l^O)l)í^)l)))t)8)llÍ8)l)(((((8(·
MmsAmr TAcr&rrm
TGT2GMAAA CCnXCCCOC
TTTATTAATT TATTCrmr
TT&TGTMTT CCS&TCCAGC anrWTG AAÖGGGGAAT
GT&ATGATSA TATCCTTATA
WTWmC AAATGATATT
V*
AAW3AGTTA AATCAGTGGT γ**;·*
C&T&CSAGAö TGATTGCATG
CTAÁACGCTC GGGGrfCAGC
AAOGCAATCG CAGCACXAAT scmocc TTTCTGGCAC
AAGCAACAtC CCGCT&T&TC
Ί lx·
GGGGTO3SCT CTCG&TCMT 'ol
CS7ATA2CAA CTAAAAACTG e
TOTXTGTGC CTAWGATAG
CCATTSAGAA όΤΓΠΑΤΓΠ1
-TWAAOATG Ά8ΑΑΑΑΑΑΤΑ
CTCTTGTACA ÖTACTATTTA
8CM3S® TTGAATOTAA T^AATTGÖ MTCTOAACA TTAAATTTAC AAAA'TÖAATT G^CTAAGCC TGGGATATCG GAGA&3CTGC TVAATGATAT
GAACTATCAT WUWAC&8
G8TAA7A1GC CAAAAdGGGA «8?
4537
4«?
5887
518?
5157
5227
52«?
8347
5857 e?
852?
5587
5547
5787
5757
5537
58S7
588?
5087
8857
5127
5187
5247
5387
8357
8527
8457
5557 * **** »#♦» Φ Φ* * * * * XX X ♦ » Χ«« χ
- 41 CATTGTTCCA CTTATATCTT CTTTATTASA ATCTAAGTTT GTTMCATT3 AATTAMAAA OS»?
CAAATACCCC AAATTATTAT TAG&TTT&TT ASGCGMÖAT GATTCCCAGT TGGCTCTGCT SOS?
TTCCTGCTTA GGGGTSSSTG AGT7AAATCA GG&AGCTATC CAS&AG&TCA AAAAGCTTTA 072?
TGAAAASCCC AAGGATGAgG ATTCTGAAAA CCGAGCCTCT TTpJSACT CCTTTATGCA S787
CATTAAGCAT CTTCCAGAGC GTS&CA&CCA CTTAAAGGTT .J^«86© CGGTATCGTT 0S47
CGATSTGTCT TATATGTCTT CTTTTGAAGA TAAGGTGMA ASATCTTCAA TTATTASCGA SS 07
TTTA7GCCGG GTAATCATTT THTATCGCT TGATAACTAT ACAGATATTA TTCCAATCTC 0307
TATT.AATAAA GATAAAGATG TCATTTTAAA TGA>ATTG TCTATTATTG AACATGTATG 702?
GTTAACAGAA GACTGCCTCC TSG&AASCCC TTCTCGGGTA TCGATTGTCG AACATAAACA 7087
TGTTTATTAT TTCCACCTAT TG&AAG&CTT TTTTGCATCA TWXTCACG CTTGTTTTAT 7147
.............0
TCATAGGCAA CAGAGAGAXA ATACATTATT AATGATTGGT AM37»TO ATTATAACCA ?287 '· f‘$ gg&tgttatt tgatattggt tttttaatcs ttttlggtct tgctaagaaa gattattaag ?3«? «. . *#
AGCTATATAC ATG GAT ACA. TCA ACT GCA ACA TCA GTT. GCT AGT GCG K 7310
Bet Áss Thr Ser Thr Alá Thr Ser Vei Alá Ser ΑΧ» Asn
IS 10
GCC W ACT TCG ACA TCG ACA CTG TAT GAC TTA GGC AOT ATG TCG MA 7304
Al® Ser Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr Asp Lee Gly Ser Bet Ser Lys
28 25
GAC GAA GTA GTT CAG CTA TTT AAT AAA GTG GGT GTT TTT CAG GCT GCG 7412
Asp Glu Vei v®X Gla Lén The Asn Lys Vei Gly V&j^ Ohu Gin Alá Alá ; JS 48 <5 .?'· Sí:
CTT CTG ATG TTT GCC TAT ATG TAT CAG GCA CAA AGG)GAT CTG TCG ATT 7400
Len Leu Met Phe Alá Tyr Bet Tyr Gin Alá Gin Seri Asp Len Ser Ile
SS - «0
GGA AAG TTT GCT GAT ATG AAT SAS GGA TCT AAG GAG TCA ACC ACA CCC 750»
Ale Lys The Ale Asp Bet Asn GXe Als Ser Ly® Gla Ser Xhr Thr Al®
70 75
CAA AAA ATG GCT AAT CTT CTG GAT GCT AAA ATT GCT GAT GTT CAG AGT 755«
Cin Ly® Bet Ale Asn Leu WX Asp Alá Ly® Xlé Alá Asp Val Gin Ser «8 85 88
AGT TCT CAC AAG AAT AAG AAA GCC AAA CTT CCT CA^> CAA CTG ATT GAC 7004
Ser Ser Asp Lys Asn Lys Lys AX® Lys Leu Pro Glu Glu Val Ile Asp ' 100 XOj
TAT ATA AAT GAT CCT±GC AAT CAC ATT ACA GTA GOT ATT AGC GAT 7053
Tyr XX® Aon Asp Pre Arg Asn Asp Ile Thr V&l Ser Gly Xle Ser Asp
210 1X3 228 125 # ♦♦♦**♦*
Κ 9 * ♦ <
Φ φ
ΦΦ Φ »»*
GTA ΑΑΤ Leu Asn | CT? Als | CTA Glu | TTA Leu 13 8 | CTG GG? GGT GAT TTG CTA AGG CTG AAC GCC GCT | 7700 | ||||||
Gly Als | Gly | Asp Lea 135 | Gla | Thr | vsl | Lys Als Alá 140 | |||||
ATT TCG | GCC | AAA | TGG | AAT AAC | TTG | AGG AGG | ÓTA | AAT | AAT AGG CAC | 7748 | |
lle Ser | Als | Lys 145 | ser.. | Asn Asn | Len | Thr Thr 150 | Val | val | Asa | Asa Ser Gla 155 | |
CTT δ» | ATA | CAG | GAAí | ATS TCT | AAT | ACT TTA | AAC | C?A | TTA | AGG ACT GCA | 7735 |
Leu Glu | lle 1SÖ | Gla Glahefc Ser | Asa i«5 | Thr Leu | Asn | Len | Len 170 | Thr Ser Alá | |||
CCT TCT | CAT | ATT | CAC | TGA CTG | CTA | TAG AGA | ACT | ATT | TCA | GGA ATA TGG | 7844 |
Arg Ser 175 | Aap | lle | Gla | Ser Leu XSÖ | Cin | Tyr Arg | Thr | lle 185 | Ser | Alá lle Ser | |
OT GCT Leu Gly m | MA Lys | TAA | CCGG&GAT&A < | ET ATS OT AAT GTA AAT AGG GAT ATG Mer Leu Asa Vsi Aeu ser Asp Xle X ., 5 w | 7833 | ||||||
c&o tgt | ATG | AGG | TGT CTG GGC | AGG | GGT CTT | AGG | GGT | ACT | TCA GGT ATT | 7840 | |
Gla ser lö | ífet | Arg | Ser | Gly Als 15 | Ser | Als Al® | Thr | Alá í& | Thr | Ser Gly 11® | |
AAT CAG | CCT | GAA | CTG | ACT TCC | GCT | CTG GAT | TTA CAA | CTG | GTT AAA TGG | W | |
Asn Gin IS | Ere | Glu Vsl | Thr Ser 38 | AX& | Len Asp | Len Gla 35 | Len | Val Lys Ser 4Ö | |||
áS gcg | CCA | TCA CGA | AC? TG? | AGA | CA& AC? | AGG | CTT | TTA | GGA AGG CTA | 803$ | |
The Alá | Tro | Ser | Alá «5 | Ser Trp | Thr | Glu Ser 50 | Thr | Als | Leu | Fre Thr Pre 55 | |
GCG CGA | GGC | CAC | TGA | TTA CTG | ACG | CCT TCT | GTT | GCT | SÁG | CAT CTG CTG | 8ÖS4 |
Fra Als | Gly | His Sö | Ser | Leu Vsl | Thr | Fro Ser SS | Vsl | Alá | Gin | ASp Vsl Leu 70 | |
AG? AA& | CTG | TTT | GG? | GGT ATT | AST | CCT CAA | CTT | ACT | AST | CGA AGA SÁG | 8137 |
Ser Lys | Leu 75 | Phe | Gly | Gly lle | Ser 88 | Gly Gin | Val | Ser SS | Arg Thr Gin | ||
CTA AGG | GA& | GCA | CAG | CGC AGG | ACT | CAG AAT | GCA | AGG | TCT | GCG TAT GCT | 8188 |
Gly Thr Fö | Glu | Fre | Gla | Arg Ser Thr $5 | Gla Asa | Als | Ser 188 | Ser | Sly Tyr Pro | ||
TAT OT | TGT | CAG | CTG | AAT AAC | GTT | CAG CCT | CAG | CTG | ATG | ATG ATG ATC | 8320 |
Tyr Len X05 | Ser | Gin | Vsl | &sa Asn 118 | Vei | Asp Fre | Gla 115 | Als | Met | Met Hét Hét 110 | |
CTG AGG | CTG | TTA | TGG | CTG GAT | CTT | TGA GCG | CAG | Ahh | CT? | GGG ACT ATC | 827« |
Val Thr | Leu | Leu | Ser 13 5 | Leu Asp | Alá | Ser Alá 138 | Gla | Lys <$*. | val | Alá Ser Hét 13 S | |
AAA AAC | ÓMjdAudrik TGC | AAC | GAC | ATG TAG | ACT | CA? CCT | CAA | AAT | AAG | GCG CTG CAT | 8324 |
Lys Aaa | Ser | Asa xes | Glu | lle Tyr | Thr | Asp Oly 145 | Gla | Asa | Lys | Alá Len Asp 150 |
« 9 ΦΦΦ Κ + φφ * φ
AAT Ara | AAA Lys | AGG Thr 155 | CTG Leu | GAG Gla | TTT Phe | AAA Lys | AAG Lys 15« | CAG Gla | CTG Leu | GAA Gla | GAA Gla | CAA Gin X55 | CAG Gla | AAA Lys | GCC Ale | 8372 |
GAA | GAG | AAA | GGA | CAA | AAA | AGT | AAA | ATT | GTT | GGT | CAG | GTC | TTT | GGT | TGG | 8420 |
Glu | Gla | Lys | Ale | Gin | Lys | Ser | hys | lle | Lee | Gly | Gin | Vei | Phe | Gly | Trp | |
17« | 175 | 18« | ||||||||||||||
TTG | GTC | GCG | GTA. | ACT | GCT | ATT | GGA | GCT | ATT | TTT' | AAC | CCG | GCA | CTG | 3455 | |
Pee | Gly | Vei | Ale | Vei | Thr | Ale | Xle | Ale | Als | Xle | Phe, | Aee | Pre | Alá | Leu | |
155 | 130 | 135 | 20« | |||||||||||||
TGG | GCT | GTT | GTT | GCC | GTT | ACC | GGA | AGA | GCA | ATG | GCA | CTG | CAA | AGT | GCA | 8515 |
Trp | Alá | val | Vei | Ale | vei | Ser | Alá | Thr | Ale | Met | Ale | Leu | Gla | Thr | Alá | |
SOS | 318 | 315 | ||||||||||||||
GTT | GAT | GTA ATG | GGC | GAT | AAG | GCC | CCG | GAG | GGG | TTA AAG | ACA | GCA | GCG | 8554 | ||
Vei | Aep | m | Mse | Gly | Aeg | Lys | Ale | «re | Gl« | Alá | Lee | Lys | Thr | Alá | Ale | |
SSG | 335 | 33« | ||||||||||||||
GAA | GTG | TTT | GGC | GGA | GTA | TCT | ATT | GCT | GCA | AGT | ATT:, | CTG | ACA | GCC | GGC | S512 |
Gla | %1 | The | Gly Gly Val | Sár | He | Ale | Ale | Ser | Xle | Leu | Thr | Ale | Gly | |||
SIS | < | sec | .345 | |||||||||||||
ATT | GGC | GGG | GTG | TCT | TCA | GTT | ATG | Φ» Φν> JL. | AAA | GTT | GGC | GAT | GTC | GGT | AAC | 055« |
Xle | Gly | Gly | vei | Ser | Ser | Lea | hefc | Ser | Lys | vei | Gly | Asp | vei | Ale | Asn | |
250 | 355 | 350 | ||||||||||||||
AAA | GTT | GGT | TGA AAC | ATC | GTG | AAA | AGA | GTT | ACT | AAA | CTG | GCC | GAT | GTA | G7«8 | |
Lys | Vei | Gly | Ser | Aea | lle | Val | Lys | Thr | Vei | Thr | Lys | Lee | Ale | Aep | Val | |
255 | 370 | 375 | 30« | |||||||||||||
TTT | GTT | GAG | AAC | GTT | GTT | TCA | AAA | GTT | GCG | GCA | ACG | GCA | AAT | GGA | TTT | 8755 |
«he | Vei | Gla | Asn | Vei | Val | Ser | Lys | Vei | Alá | Ale | Thr | Ale | Aaa | Gly | «he | |
255 | 28« | 305 | ||||||||||||||
ACG | ACC | TCT | GCA | CGT | TCT | ATT | GGG | ACA | ACT | GTG | CTG | AAT | AAT | GAT | TCT | 8004 |
Thr | Thr | Ser | Alá | Arg | Ser | lle | Gly | Thr | Thr | Val | Lee | Asn | Aea | Asp | Ser | |
30« | 7 | 305 | 31« | |||||||||||||
GCG | GAA | TAT | AGG | ATA | TTG | GCT | CAG | TTA | TCT | GCT | TAC | GCG | GTA | CA& | AAC | 0852 |
Ale | Gla | Tyr | Ser | lle | Lee | Ale | Gla | Leu | Ser | Ale | Tyr | Alá | Val | Gin | Asn | |
315 | 330 | 335 | ||||||||||||||
TTA | ACT | GGA | CAG | AGT | GAA | AAC | CTG | GGT | GAG | AGT | GGG AAG | GTT | GAG | CTG | 8300 | |
Aee | Thr | Arg | Gla | Ser | Glu | Asn | Leu | Gly Gla | Ser | Alá | Lys | Vsl | Gla | Leu | ||
SS® | 335 | w | ||||||||||||||
GAT | AAA | GCT | GCA | GCC | GAG | TTG | GGA | AAC | CAG | GCA | AGG | TAT | TTA | CAA | AAC | 8540 |
Asp | Lye | Ale | Ale | Alá | Gla | leu | Arg | Aea | Gla | Alá | Ser | Tyr | Leu | Gla | Aea |
Ser
GCT TCT CAG ΤΤΑ ΑΤΑ TGG GAC TCA GCA CGA GXA &ΑΤ AGG CGT ATT GTT Alá Ser Gla Leu Xle Ser Asp Ser Ale Arg Val Aaa Ser Arg lle Vei 378
355 * *♦»#♦**♦
Λ* > * * ♦ * * * * *♦# » «·*♦
AGT ©GT CGA ©η | TAA * | TTATTAAAGA GAATTTAATT ATG AAT ACT ATT GAT Két Asa Thr Xle Asp | 5045 | |||||||||||
Ser Gly | Arg Vei 350 | |||||||||||||
1 | 5 | |||||||||||||
TAT | ACT | AAT CAA | ©TA AT© AGG GTT AAT TCT | GTT | TCG GAG | AAT | ACT | ACC | sose | |||||
Tyr | Thr | Asn ©le | Vei | Met | Thr va l | Asa | Ser | Val | Ser ©lu | tos | Thr | Thr | ||
10 | X5 | 20 | ||||||||||||
GGC | TCT | AAT GCA | ATT | ACC GCA TCT | ©CT ATT AAT | TCA TCT | TT© | CTT | ACC | 3X42 | ||||
©ly | Ser | Aon Alá | Xle | Thr | Alá Ser | AX& | Xle | Asn | ©er ©er | Leu | Leu | Thr | ||
25 | 30 | 35 | ||||||||||||
GAT | GGT | AAG | GTC | GAT | GTT | TCT AAA | CTG | ATG | CTG | ©AA ATT | CAA | AAA | CTC | 0150 |
Asp | GXy Lys | Val | Asp | VAX | Ser Lys | Lee | Mer | Leu | Giu Xle | Gin | Lys | Leu | ||
40 | 45 | 50 | ||||||||||||
CTG | GGC | AAG | ATG | ©X© | CGT | ATA TT© | CAG | GAT | TA© | CAA. CA© | CAA | CA© | TT© | 5230 |
Leu | ciy | Lys | Met | Val | Ar® | xle Leu | ©la | top Tyr | ©In Glu | ©la Gin | Leu | |||
55 | SO | SS | ||||||||||||
TG© | CAG | AGG | TAT | CAG ATC | CAA CTG | GCC | GTT | TTT | ©A© AGC | CAG | AAT AAA | 3280 | ||
Ser Gin | Ser | Tyr | ©la, Xle | Gin Leu Alá | Val | Ph® | Giu. Ser | ©la | tor Lys | |||||
TO | 75 | 00 | S5 | |||||||||||
GCC ATT | GAT | GAA | AAA AAG | GCC ©CT | ©CA | ACA | GCC | GCT CT© | GTT | ©GT | GGG | 3334 | ||
Alá | Xle | Asp | Glu | Lys | Lys | AXa Alá | Alá | Thr Alá | Alá Leu | Val | ©ly Gly | |||
00 | SS | 100 | ||||||||||||
GCT | ATT | TCA | TCA | GTA | TTG | GGG ATC | TTA GGC | TCT | TTT GCA GCA | ATT | AAC | 3302 | ||
Alá. | Xle | Ser | Ser | Val | Lee. | Giy Xle | Leu | Gly | Ser | Phe Al® | Aia | Xle | Asn | |
205 | 110 | 115 | ||||||||||||
AGT | GCT | AC© | AAA | GGC | ©CG | AGT ©AT | ATT | GCT | CAA | AAA ACC | ©cc | TCT ACA | 3430 | |
Ser | Alá | Thr | Lys | Gly | Ma | Ser Asp | Xle | Alá | ©le | Lya Thr | Alá | Ser | Thr | |
ISO | 125 | . 130 7*'· | ||||||||||||
TCT | TCT | AAG | GCT | ATT | GAT | GC© ©CT | TCT | ©AT | ACT | GCG ACT | AAA | ÁCS | TTG | 5470 |
Ser | Ser | Lys | AXa | Xle | Asp | Alá Aia | Ser | top | Thr Alá Thr | Lys | Thr | Leu | ||
135 | 140 | 245 | ||||||||||||
ACT | AAG | GCA | ÁCS | GAA AÖC | ©TT GCT | ©AT | GCT ©TT | GAA GAT | ©CA | TCC | AGC | 3525 | ||
Thr | Lys | Alá | Thr | Glu | Ser Val Al® | Asp | Alá | vai | ©lu Asp | Alá | Ser | Ser | ||
ISO | 155 | 150 | XS5 | |||||||||||
GT© | ATG | CA© | CAA GC© ATG ACT ACA | ©CA AC© | AGA | ©CG GCC | AGC | CGT | ACA | 3574 | ||||
Val | Met | ©In | ©In Alá | Thr Thr Aia | Thr | Ar® | Alá Alá | Ser | Ar® | Thr | ||||
170 | 175 | 4 ' :«· | XOO | |||||||||||
TCC | GAC | GTT | GCT | GAT | GAC | ATT GCC | GAT | TCT | ©CT | CA© AGA GCT | TCT | CA© | SS22 | |
Ser | top | Val | Alá | top | Asp | Xle Alá | top | Ser | Alá | Gin Arg Ma | Ser | ©la | ||
105 | ISO | 105 | ||||||||||||
CT© | GCT | GAA | AAC | ©CT | GCA GAT GCC | ©CT | CAG | AA© | ©CA AGT | CGG | ©CA | AGC | 3S7© | |
Lee | Alá | Gitt | &Sh | Alá Alá Aep Alá | Alá | ©la | Lys | AXa Ser | Ar® | Ma | Ser |
200 205 2ΧΟ
Φ 4*,. φ W * ♦ ♦ Φ * 9 9 Μ
X φ Φ*Χ· φ * * * · φ φ
Χ.« Φ 4*Χ «V ·ΦΦ*Χ
O3C TXT ATG GCT GCA CTA GAT AAG ATT ACT GGC TCT ACA CCA TTT ATT 8?28
Arg Phe hht AXa Als Val Asp Lys He Thr Gly Ser Thr Pro Phe Xle
21S 220 225
GCC CTT ACC AGT CTT GCC GAA ©SC ATS AAG ACA TTG CCA AGA. ACG GTA 975S
AX& Val Thr Ser Leu Alá Glu Gly Thr Lys Thr to Pro Thr Thr VaX
339 235 240 245
TCT GAA TCA GTC AAA TGT AAC CAT GAG ATT AGC GAA CAG CGT TAT AAG 38X4
S®r 81« Ser Val Lys Ser Asn His Glu XX® ser Glu Glu Arg Tyr Lys
25« 255 280
TCT GTG GAG AAC TTC CAG C&íS GGT AAT TTG GAT CTG TAT AAG CAA GAA 3862
Ser Val Glu Asn Phe Gin Gin Gly Asn X»e« Asp Len Tyr Lys Gin Glu
265 279 275
GTT CGC AGA GCG CAG GAT GAT ATC GCT AGC CGT CTG CGT GAT ATG ACA 551©
Val Arg Arg Alá Gin Asp Asp 11® Alá Ser Arg heh Arg Asp hét Thr
AGA GCC GCT CGC GAT CTC ACT GAT CTT CAG AAT CÖt ATG GGT CAA TCG 835S
Thr Al® Alá Arg Asp to Thr Asp Leu Gin Asn Arg Siet Gly Gin Ser
255 30« 505
GTT CGC TTA GCT GGG TAA TTGATCATGG TCGATACGTT TAATGATGAA 10995
Val Arg Lau Alá Gly *
21« 315
GTGCTTAATC ACTATCTTGA ACAAAAAGGG TACACA&T&C AGAAGGAGTT TCTTTGTGGC 10966
A8T8GCTTTT TTATCGGATG GCGGATTGAG ACCTCTTTTT TCTCATTAGC GTACAGACTT 10125 6 ©ATGAACAAG AACTGATTTT GTGCTCTTTT GAAGCACGTA ACÖU&C&GG GCTTAACÖGC 10136 CCTGTTTTAT CACTGACTCG CTTGCTCGAA GAGTTGTACC AC^TTTTTC GGGTATTAAG 18245 AAAATCAGTG CGATGAAATŐ TAAGATTGST TCAGATTCA© AACGTCAAAA GCGCGAAGAG 10385
TTGTTTAATT ACTTCATCAG AAAGGGCGCT 62GCASCAA6 AAACAGAAGA CGGAATTTGG 18355
TTCGTAAVGA ATGTAAATAG TTACAAATTT TTATTTCTAT TAACTATTGA GGAAAATTTA 10525
ATGAATTTAT CTGAAATTAC TChACAAATG GGTGAAGTAG GTAAAACGCT GAGTGATTCT 195 8 5
TTTCTGCCAA CAAGCTACTG GTGTGGGCGG CTGTAGCTGC GGCAAATCAT AAGCTTCCCA 10726
AATAT8C&GA ATCTATCCTG GATGTATXGC CGCAAATTAT ACCCGATA&A AAAGATATCG 1078®
CACATTTAGA ATTTATTATT TTATATGGAT TAAATAGAAA AAATOATGCG GTAAASGCTC 10845
TGGAGGACTT TATGGATGAT GAGACAAGCC AGTTGTTATG CTGTCTGGTC CACGAGAATA 18506
ATAGAAGCTS GACACTAATG
GTAC0AAA2T TTCTMGTTr
TTWAKn AATOAAATT
TATGtTTAM GGAATTAGTC
AAÖCCGÖQTA ASCTCWTOG
GAATSCSAXT AÖW2TCAAT
GACTTTTMT osactagcc
GTOSACAAGT SGAOÚ3XCTT
AAAAGATCAT TTAGCTSCCT
AAGCCGCCCS GCACCGGGGS
ACXGCCCACT GCTCM^CÓC
WATACTSA SGTCTTAAOC &TCCGASGC& TCCSSS^CÁT otatgaactg tcsaaaaagg
TTTAGASAST· TA&&&OTAA
ATATCWXT2 «M2GAAAX
AÖW3GÖT3T XTCSTTAACC
AXGTTSGATl 'TGACATATCA csotatttttt ttetwra®
Aöcxsmtím WSTGGG3S.
AWCTTTTGG AAGAACTGÖT
TACTrCTCXA CTCACTfóXT
ÖATTATGASA TGGXTS&TAG
CTTTTCAATX ®ΤΠ»Μ
AGCACAATAT TTGTCAATTC
TCTOTCCAG' SCATTAAIAT
QTTCAGCGXA TTTCTSÖ&TA
ATCAGATTTC STCÜAGCAGG
- 46 ~ ttttaatctc atattgagtt
TAACAGAGAT ATTTATAATA cawww? nsw?w wwtssts romw tóswmc 1ACAC1AGGA
OGTTATCTGÜ CTTTTCACTG
CTCOTTTTt TCCCSGXAC2
OTgeSASTTC ATTTACTOSG ccsssccatc coAxcrm
AXSAAAAXXC SAAAAGTSTT
ÖGCCGACAAG CSGGTTGGTA
TAAAAGAXCA TTTGGCXGCC
CAAGCCGttt GGCACO3CCG
TACC8CSTAT TGCTCAÖ2CA
C&TAAAAAGT ΑΟΑΤΓΓΑΑΑΑ
AAACWATAT T&&STTGCAT
AAAXAXTG1A ATMAXGATÖ
ASAffiXXÚTA ATTTTTIATC acatőasöca ssssome
Í5T»» TAICTCIATT txxcatcwx TAíseteros
CTGOTWTG ATTGÖCTATT
T8CTAASC&T ATTTATTTTA
AGCTTTÖCGC XGGXATGAXA
CTCTTTGGCG XAOTCACTO
CCTWrWAT CACGCGAOAT ctthsgt&ct rmrceoGCG
ACTOATAGT OTCTWCC
ACTGTTTCTÖ ÖATA&ASCTT φ $.>·... > <**» X ** ♦ * * * *X X 0 * * *»x * * * 0 * ·* * #*0 -0 ««* i* *«*»
TAAACMTTG ATAMtTTCA
CCTTMTGAA AAAXAX^GCT
AGTTTATA3T CGtTAACTAT
ASATATAAAA AGGSATGA&T
CGÓCATA11A CTAÜTGCGGC
WCCTCWG CTSTTCGTCT
TOMATATSA ATGCGAO&AC
TCTCGTCtW CCCCACCGCC
COXCCCATTG CTCAGGCATT
ÖATACTTCAA ÖSCTTAAGCC
TCÍGGGTCAT GCCGGTCTTX
TATGAAAA&X CGAAAAGTCT C^CCCACAA GTGGACAOGC
Λ\'γ
TTAAAASATC AWWCTSC
TTATTAATTA CTGTTÜATTG
TCTGATAAAT GTSATTGGTA
AAAGAGWTA ATAGAGCAAG
CA1AAATTTA CCGC1ATXTG
TGX&TGTACA GGC1CTTATA ·*<· k.
XAWCCGATA 2dASGCT3GC „Av
AihoAC&T ertmcTAAT ACATCCACTG TCTGGTTCTT
TCACOSAA&C SACCATTXC
TTCAACTXGA GACTGXAATG
GAAATGTTTC TGOTATTTTC
GWTAA&CTO XTCGCXCATC
ACGGAGGTCA AAATTCOGTT
AWJAACATC GCW3AT&TC •'\·ν:.
xo$s«
1X22«
XXÖSS mo
XX2ÖS
1120
XX32S
ΧΧ3Ο
UUŐ nsM
XX5O
11S2S nos xxw xxs©«
XX8GS »538
XX98S
X284S
1210« mss
12228
1228«
12X4«
X24®8
124««
1252«
X2S8S
12«2« *♦ « # ♦♦ * * » y *♦« κ ♦ » * * * κι*# 9 «<Χ4Γ ί» Λ»<·Χ
- 47 A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 940 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULÁT íPVS: fehérj e
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met Ile Thr Hi® Gly Phe Tyr AI® Arg Thr Arg His Lys Hi® Lys Le» | |||
1 | 5 | lö | IS |
Lys | Lys Thr Ph© Ile Met Leu 2® y | Ser Ale Gly Leu 25 | Gly Leu Phe Phe Tyr J 3® |
Val | Asn Gin Asn SeriPhe Alá 3S A :g< | Asn Gly Glu Asn 4® | Tyij Phe Lys Leu Ser L·· 45 |
Ser | Asp ser Lys Lee Lee Thr Gin Áss Alá Ale SS SS | Gin Asp Arg Leu Phe 5® | |
Tyr SS | Thr Leu Ly® Thr Gly Glu 7® | Thr Val Al® Asn 75 | Ti® Ser Lys Ser Gin SS |
Gly | Xle Ser Leu Ser Vei He SS | Trp Ser Leu Áss. 0® | Ly® Hl® Leu Tyr Ser 55 |
Ser | Glu Ser Glu hét Met Lys 10® | Ale Gly Pro Gly 305 | Gin.. Sin ile Ile Leu Ú 110 |
Pro | Leu Lys Lys Leu .Ser Vei I1S í | Glu Tyr Ser Aia 32® | LeuPro Vei Leu Gly Á 125 |
Ser | Al® Pro Val Val Aia Al® 136 325 | Gly Gly v»X Alá | Gly Mi® Thr Asn Lys 14® |
m 14S | Thr Lys Hét Ser Pro Asp 1SÖ | Ale Thr Lys Ser 155 | Asn Thr Thr Asp Asp IS® |
Lys | Ale Leu Asn Tyr Al» Al® 3SS | Gl» Gin Al® Al® 17S | Ser Leu Gly Ser Sin 175 |
Leu | Gl» Ser Arg Ser Le» Asn is® | Gly Asp Tyr Ale 1S5 | Ly© Asp Thr AI® Leu IS® |
Oly | hét Al® Ser Ser Gin Ale 1S5 | Ser ser Gin Leu 200 | Glh Alá Trp Leu Gin 205 |
Kb | Tyr Gly Thr Al® Glu Val 21® ' 235 | Asn Leu Gin Ser | Gly Asn Asn Phe Asp 22® |
SXy 225 | Ser Ser Leu Asp Phe Leu 250 | Leu Pro Phe Tyr 235 | Asp Ser Glu A»» Met 24® |
Leu | Ale Phe Gly Gin Vei Gly | Ale Arg Tyr ile Asp Ser Arg Phe Thr |
24S 25® 255
X fc «4 ♦ fc· ♦ ♦ ♦ 4 ♦ ♦ 4
Aln Asn leu Gly Alá | Ile | Gin Arg Phe | Phe Phe | Le® Pro Gin | Asn 278 Asn | Ke® Thr | Len Arg | |||||
Gly Tyr Asn | 258 | Asp Gin 288 | 255 Aep | 8er | Gly Asp 23$ | |||||||
Val | Phe | |||||||||||
275 | ||||||||||||
les | Gly Ile 288 | Gly | aly | Glv | Tyr Trp Arg Asp Tyr 285 | Phe Lys 388 | Ser | Ser | vei | |||
Asn 385 | Gly Tyr | Phe | Arg heh 318 | Ser Gly | Trp | His | Gin 315 | Ser Tyr | Asn | Lys | Lys 320 | |
Asp | Tyr Asp | Gin | Arg 325 | Pro | Als Asn | Gly | Phe 330 | Asp | ile Arg | Phe | Asn 335 | Gly |
Tyr | Les Pm | Ser 348 | Tyr | Pro | Alá Lee | GXy 34$ | Als | Lys | Lei Két | Tyr 388 | Gin | Gin |
Tyr Tyr Gly 35$ | Asp | Aen | Val | Alá Len 358 | Phe | Asn | Ser | ASp Lys 355 | Len | Gin | Ser | |
Asn | Pro Gly $78 | Ale | Alá | Thr | Val Gly 375 | Vei | Asn | Tyr | Thr Pro 388 | Ile | Pro | Len |
Vei 38$ | Thr Get | «X | Ile | Asp 388 | Tyr Arg | Als | Gly | Thr 385 | Gly Asn | Gin | Asn | Asp 488 |
Len | Len Tyr | $®r | Kei 485 | Gin | Phe Arg Tyr | Gin 418 | Phe | Asp Lys | Pm | Trp «15 | Ser | |
Gin | Gin Ile | Gin 428 | Pro Gin | Tyr val | Asn 525 | Gin | Len | 3A Arg Thr | Les «38 | Ser | Gly | |
Ser | Arg Tyr 835 | Asp | Len | Val | Gin Arg «48 | Asn | Asn | Asn | Ile Ile «45 | Len | 81® | Tyr |
lys | Lys Gin 558 | Asp | lle | Len | Per Leu «55 | Asn | Ile | Pro | Kis Asp 558 | Ile | Asn | Gly |
Thr 555 | Gin Síé | Ser | Thr | Gin 478 | Lys lie | Gin | Len | lie «75 | Vei Lys | Ser | Lys | Tyr 4S0 |
Gly | lsen Asp Arg | lle | Val | Trp Asp Asp | Ser | Als | Les Arg | Ser | Sin | Gly |
48$ «80 «85
GXy Sin Ile óla Kis 8ly Oly Ser Sin Ser Us Gla Asp Tyr Gin Alá w sós sic
Ile Leu Pro Als Tyr Val Gin Öly Gly Ser As® Ile Tyr Lys Vél Thr SIS §2& 52S
Als Arg Als Tyr Asp Arg Áss Gly Áss Ser Ser Áss Áss v&i Gin Le® 538 $35 S«0
Thr Ile Thr Vei Len Pro Áss Gly Gin Vei vei Asp Gin val Gly Val 54$ 558 SS5 SSG φ φ
Thr Asp Phe Thr Alá Asp Lys Thr Ser Alá lys Alá Asp | Gly Xle 875 | Gitt | |
555 | 570 | ||
Mis Xle Thr Tyr Thr Alá Thr Val Lyg 589 585 | lys Áss Gly Val | Alá Gl® 559 | Alá |
As® val Pr© val Thr Phe Ser Xle Val 985 890 | Ser Gly Thr Alá 895 | Thr léé | Gly |
Alá As® Ser Alá. Arg Thr Asp Oly &s& Sly lys Alá Thr 810 815 820 | Val Thr | lett | |
Lys Ser Alá Thr Pro Gly Sin Val Val 825 810 | Val Ser Als lys 855 | Thr Alá | Gitt 840 |
Met Thr Ser Pro leu A®» Alá Ser Ale 885 | val xle Phe Val 880 | Asp Gitt 855 | Thr |
lys Alá Ser Xle Thr Gle Xle lys Alá 889 885 | Asp lys Thr Thr | Alá Lys 870 | Al® |
Asp Gly Ser Asp Alá Xle Thr Tyr Thr 875 859 | Val Arg Val' Mer 885 | Lys Gitt | Gly |
Alá Pró Val Val Asp Gin lys Val Thr 889 SS5 | Phe Ser ly® Asp 799 | Phe Gly | Thr |
lev As® lys Thr Gle Alá Thr Thr Asp 795 719 | Gitt Áss Gly Tyr 715 | Alá Thr | Val 720 |
lye les Ser Ser As® Thr Pre Gly lys 725 | Alá Xle Val Ser 730 | Alá lys 735 | Val |
Ser Oly Val Gly Thr Gitt vei lys Alá 740 745 | Thr Thr Val Gitt | Phe Phe 750 | Alá |
Pre Leu Ser Xle Asp Gly Asp lye Vei 75S 780 | Thr Val Xle Gly 788 | Thr Gly | Xla |
Thr Gly Alá lett Pro lys Asn Trp le® 770 775 | 01® Tyr Gl/ Gitt 750 | val Lys | lett |
Glh Alá Thr Gly Gly Asn Gly lye Tyr 785 799 | Thr Trp lys Ser 795 | Ser As® | Thr 990 |
lys lle Alá Ser val Asp As® Ser Gly 595 | Val Xle Thr le» 910 | As® Glu §15 | Lys |
Gly Ser Al® Thr lle Thr Val Val Ser 820 825 | Gly Asp As® Gl® | Ser Alá 950 | Thr |
Tyr Thr lle As® Alá Pre Gly Ser Xle 535 989 | Val Xle Alá val 585 | Asp Lys | AStt |
Thr Arg Val Thr Tyr Phe Asp Alá Gitt | as® Lys Gye Lys | Thr As® | Ser |
859 855 δ«0 *» * » * * * *» * * «** * ♦** »·*· ♦ * * ·>
♦ ♦ * X
Ma m
Trp
Thr
SÍ»
Le» Lett
As» Lys Tyr Pro Tyr Tyr 5SS 880
Lys-Sin ser Ser Ser 81« SOS
Π® Tyr Ser Thr
W
Ser Lys Ser Le»
835
Ser Oly Val Ser SIS
Ser Thr Tyr Asp Leu/v&X Thr Lys SIS 320
A®» Val Gly Val ’ $2$
Asn Asn Lys Asn AU Phe Ser V&X Cys Val Lys *
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÓ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HŐS S E A: 193 ami no s a v
TíPUS A: aaínosav
TOPOLÓGIÁJA: 1 i n-eári s .> Οώ
EKVSNCIA LEÍRÁSA:
Ne» | Asp | Thr | Ser | Thr | Alá | Thr | Ser | Val | Alá | Ser | AXa | Asn | Alá | Ser | Thr |
X | 5 | 20 | 25 | ||||||||||||
Ser | Thr | Ser | Thr | Val | Tyr | Asp | le» | Oly | Ser | Net | Ser | Lys | Asp | 82» | Vei |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
vax | 81» | Le» | Phe | As» | Lys | val | 8Iy | Val | Phe | Gin | Alá | Alá | Le» | Lee | Net |
35 | 20 | <5 | |||||||||||||
Phe | Alá | Tyr | Met | Tyr | 81» | Alá | 81» | Ser | Asp | LStt | Ser | XXe | Alá | Lys | Phe |
50 | 55 | 80 | |||||||||||||
Als | Asp | Net | As» | 81») | Alá | Ser | Lys | 81» | Ser | Thr | Thr | Alá | 01» | Lys | Net |
55 | ' TO | 75 | 80 | ||||||||||||
Α1» | Asn | Leu | Val | Asp | Alá | Lys | lle | Alá | Asp | VaX | Sin | Ser | Ser | Ser | Asp |
SS | 30 | 35 | |||||||||||||
Lys | As» | Lys | Lys | AXa | Lys | La» | Pro | 81» | 81» | Val | He | ASp | Tyr | 22« | Asn |
200 | 105 | 120 | |||||||||||||
Asp | Pro | Arg | AS» | Asp | XXe | Thr | Vei | Ser | Oly | Xle | Ser | Asp | Le» | Asn | Alá |
115 | 120 | 225 | |||||||||||||
Sí». | Le» | Oly | Alá | Gly | Asp | Leu | 81» | Thr | Val | Lys | Alá | Alá | lle | Ser | Alá |
120 | 135 | 240 | |||||||||||||
Lys | Ser | Asm | As» | Le» | Thr | Thr | Val | Val | Un | As» | ser | 81» | Le» | 81» | lle |
245 | ISO | 155 | ISO | ||||||||||||
8ln | 81» | Met | Ser | AS» | Thr | Le» | As» | Le» | Le» | Thr | Ser | Alá | Arg | Ser | Asp |
1S5 | 170 | 175 |
y» #6 9 «· * *' » « ♦ Λ » ν * » » * ♦ *
Φ«Κ χ *·»* *♦. ♦**« * ♦·« e
Ue din Ser Leu Sin Tyr fcg Thr Ih Ser Alá Xle Ser Leu Gly Lys .„Λ t*c 190
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁNÓ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 381 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
4. AZONOSÍTÓ SZÁNÓ SZEKVENCIA | LEÍRÁSA: |
Mer Le» Asn Val Aaa Ser Asp ile Gin | Ser Met Arg Ser Gly Alá Ser |
1 5 | 18 15 |
Alá Alá Thr Alá Thr ser Gly Ile Asn | Gin pr© Glu val Thr Ser Alá |
28 2$ | 38 |
Len Asp Len Sin Len val 5yg Ser Thr | Alá Pr© Ser Alá Ser Trp Thr |
IS ' 48 | 45 |
Sin Ser Thr Alá leu Pr© Thr Pr© Pro | Alá Gly Kis Ser Leu val Thr |
58 55 | 88 |
Pro Ser Vei Alá Sin Asp Val Len Ser | Lys Leu Phe Gly Gly Xle Ser |
SS 70 | 75 88 |
Gly Glu Val Arg Ser Arg Thr Sin Gly Thr Glu Pr© Gin Arg Ser Thr | |
85 | 28 25 |
Gin Asn Alá Ser Ser Gly Tyr Pr© Tyr | Leu Ser Gin Val Asn Asn Val |
188 ν 18s | 118 |
Asp Pr© Gin Alá Mer két hét Met Val | Thr Leu Leu Ser Leu Asp Alá |
US 138 | 185 |
Ser Ale Gin Lys Vei Alá Ser Mer Lys | Asn Ser Asn Glu xle Tyr Thr |
138 135 | 148 |
Asp Gly din Asn Lys Alá Len Asp Asn | Lys Thr Leu Glu Phe Lys Lys |
145 158 | 155 158 |
din Leu Glu Glu Gin Gin Ly® Alá Glu | Glu Lys Alá Glu Lys Sár Lys |
185 | 178 175 |
Ile Leu Gly Gin Val Phe Gly Trp Leu | Gly Val Ali Val Thr Alá Xle |
188 1S5 | 188 |
Alá Alá Xle Phe Asn Pr© Al» Leu Trp | Alá Val val Alá Val Ser Alá |
155 > 288 | 285 |
ΧΦ * Φ ** fc fc «« ♦ * φ «' »** $ ♦ * fc * S * «44 ♦ «♦· *fc «»νΦ ~ 52 -
Thr Alá mt Π3 | AiA Les | 81a | Thr Al» Val Asp Val h»fe Cly A»g | lya | Alá | |
215 | 223 | |||||
81» Alá | le» lys | Thr Als | A) a 81» rrl Ph» Gly 8ly Vei | Ser | XI® | |
225 | 233 | 235 | 2» 8 | |||
Alá Ma Ser | lls Lea | Thr | Alá | Giy lle 8ly 81y val Ser Ser | Ae« | |
áss | 258 ,; | 255 | ||||
ssa hyg Val | Giy Asp | V&i | Als | Aa» lys Val Sly 8sh As» Xle | Val | lys |
288 | 2®» s?e | |||||
Thr val Thr | lys les Als | Asp | Val Phe Val 81» hsa Vei Val | Ser | lys | |
27$ | 2S8 285 | |||||
VAX Alá Alá | Thr Alá | Asm | 8Xy | Ahe Thr thr S»r Alá Arg Ser | Xl< | 81 y |
2 SS | 2 SS | 388 | ||||
Thr Thr Val | 1®« Áss | As» | Asp | Sár Als 81» Tyr Ser 11« 1«» | Als | 81» |
389 | 319 | 313 | 328 | |||
Xísö Ssr Alá | Tyr Als | Val | 81» | As» t-eu Thr Arg 81a Ser 81» | As» | leu |
325 | 338 A | 335 | ||||
Gly 81» Sár | Als lys | Val | 81» | le» Asp lys Als Als Alá 81» | Lse | Arg |
3« .» | 345 358 | |||||
AS» 8ls Als | §»r Tyr | Ims | 81» | &»» Als Ser 81a les Xle Ser | Asp | Ser |
355 | 3AV 355 | |||||
Als Arg val | Asn Ser | Arg | 11« | Val Ser Cly Arg Val * | ||
37S | 37» | 388 |
ΑΖ 5, AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 315 aminosv
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓG IÁJA: 1 i n sár í s
MOLEKULATÍPUS: fehérje
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
WV | Aea | Thr | 11» | ASp | Tyr | Thr | As» | 81» | Val | Hét | Thr Vei | As» | 8er | Val |
1 | 5 | 18 | 18 | |||||||||||
Ser | 81» | As» | Thr | Thr | 8ly | Ser | As» | Als | Xle | Thr | Al» Ser | Alá | Xle | A»» |
Ah | 25 | 78 | ||||||||||||
Ser | Per | ΙΑ» | hee | Thr | Asp | Sly | Lys | y&x | Asp | Val | Ser lys | Les | fíefe | Χλ« |
15 | 48 | . 88 | ||||||||||||
81« | xle | 81» | Lys | les | X>»« | 8iy | hy» | M»fc | Val | Arg | tle les | 81» | Asp | Tyr |
58 | 55 | 88 | ||||||||||||
81» | 81» | 81» | 81» | A®» | S»r | 81a | Ser | Tyr | 81» | Xle | 81» A»» | Alá | Val | Phe |
55 | 73 | 75 | 58 |
* »« Φ ν *Φ * χ t * Φ 0 ϊ. Λ * * * * « »Χ« « »·*« *Φ Ή ν«
Gitt Ser Gla A®» Lys Al® XI» Aap Glu | lya Lys Al® Alá Alá Thr Al® | ||
SS | 90 | 55 | |
Alá les Vei | Gly Gly-Alá Xle Ser Ser 100 lóg | Val | Les Gly Xle Leu Gly Ser 110 |
Phe Ma Al® 1X5 | Xle Asn Ser Alá Thr Lys GXy Al® Ser Asp Xle Al® Gle 128 125 | ||
lys Thr Al® 130 | Ser Thr Ser Ser lys AX® 135 | Xle | Asp Alá Alá Ser Asp Thr xao |
Alá Thr lys 145 | Thr lett Thr Lys AX® Thr 158 | Gitt | Ser V®X Ale Asp Alá val 155 ISO |
Gitt Asp AX® | Ser Ser Vei Kel Gla Gin 155 | Al® 170 | Met Thr Thr Alá Thr Arg 175 |
Alá Al® Ser | Arg Thr. Ser Asp Val Ale ISO 18S | Asp | Asp Xlé' Alá Asp Ser Als 190 |
Gin Arg Al® X95 | Ser Gin Lee Al® Glu Asa 290 | Alá | Al® Μρ Alá Alá Gitt lys 205 |
Alá Ser Arg 2X0 | Alá Ser Arg Phe Két AXa 215 | &X& | Val Asp ly® Xle Thr Gly 220 |
Ser Thr Pre 225 | Phe Xle Alá Val Thr Ser 230 | Les | Ale Gle GXy Thr Ly® Thr 235 250 |
Les Pre Thr | Thr Vsl Ser Gla Ser Val 245 | lys 250 | Ser Aaa His Gls lle Ser 285 |
Gle Gle Arg | Tyr lys Ser Val Glu Aen 280 2 SS | Phe | Gitt Gitt Gly AStt Lett Asp 270 |
Les Tyr lys 275 | Gin Gis Vei Arg Arg .Al® 280 | Gla | Aap Asp Xle Al® Ser Arg 285 |
les Arg Asp 2S0 Arg Met Gly | Kér Thr Thr Alá Alá Arg Asp 2 SS Sin Ser Val Arg lev Alá Gly | Les Thr Asp les Gla Asn 300 4 |
305 ' 3X8 3X5
Claims (9)
- SZABADALMI IGÉNYPONTOK1) Eljárás nem-patógán E. coll mutáns előállítására epiteliális HeLa-sejtekben citopatogén hatást kiváltani képes patogén. B. coli mutánsból - amely citopatogén hatás részint abban nyilvánul meg# hogy polimerizált .aktínból kábelek képződnek# amelyek a sejtek egyik végétől a .másikig áthúzódnak, részint pedig abban# hogy nő a vinvulin mennyisége- -# azzal jellemezve# hogy a patogén S, coli törzset mutagenízárjuk és a cítoptatikus hatást kiváltani nem képes mutánsokat kiválasztjuk.
- 2} Nem-patogén mutáns E. coli törzs# azzal jellemezve# hogy az az I. igénypont szerinti eljárással lett előállítva.
- 3j A 2. igénypont szerinti nem-patogén mutáns E. coli törzs# azzal jellemezve, hogy legalább egy olyan mutációt hordoz# amely az LEE-Iökusz legalább egy génjét inaktiválja.
- 4) A 2. vagy 3. igénypont szerinti nem-patogén mutáns B. coli törzs# aszal jellemezve, hogy az olyan E. coli törzsből nyerhető# amely nyulakra nézve patogén# és amely az 01.03 szérumcsoporthoz tartozik.
- 5) A 4, igénypont szerinti mutáns törzs, azzal jellemezve# hogy 0103 szérumcsoporthoz tartozó nyálakra nézve patogén E, coli törzsként a CNCM-nél (.Mikroorganizmus' Tenyészetek Francia nemzeti Gyűjteménye) 1997 január 15.-én 1-1807 szám alatt letétbe helyezett BIO jelű törzsből állítható elő.δ) A 2-5. igénypontok bármelyike szerinti nem-patogén. mutáns E. coli törzs# azzal jellemezve# hogy legalább egy **· * .*<**» ** «. » * « « 9* » ♦ »χ» az LSE-iőkusz legalább egy aep-~génj ének inaktiválását eredményező - mutációt hordoz.
- 7) A Blö/C&l jelű nem-patógán mutáns .5. coli törzs, amely a CNCM-nél (Mikroorganizmus Kultúrák Francia Nemzeti Gyűjteménye) 1997 január 15,-én 1-1808 szám alatt letétbe lett helyezve.S) Vakcina, amely legalább egy, a 2-7, igénypontok bármelyike szerinti nem patogén mutáns £. coli törzset tartalmaz .
- 9) A 8,- igénypont sserinti vakcina, amely orálisan, alkalma zhat ő ,
- 10) A 2-7. Igénypontok bármelyike szerinti mutáns £. coli törzs alkalmazása vakcina előállítására.
- 11) A 10. igénypont szerinti, alkalmazás, azzal jellemezve, begy nyuiaknak beadni kívánt vakcinát állítunk elő.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
FR9700532A FR2758568B1 (fr) | 1997-01-20 | 1997-01-20 | Souches mutantes non pathogenes d'e. coli, leur procede d'obtention et leurs utilisations |
Publications (4)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HU9800094D0 HU9800094D0 (en) | 1998-03-30 |
HUP9800094A2 HUP9800094A2 (hu) | 1998-09-28 |
HUP9800094A3 HUP9800094A3 (en) | 2001-11-28 |
HU228496B1 true HU228496B1 (en) | 2013-03-28 |
Family
ID=9502763
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9800094A HU228496B1 (en) | 1997-01-20 | 1998-01-20 | Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0864644B1 (hu) |
DE (1) | DE69831888T2 (hu) |
ES (1) | ES2251760T3 (hu) |
FR (1) | FR2758568B1 (hu) |
HU (1) | HU228496B1 (hu) |
-
1997
- 1997-01-20 FR FR9700532A patent/FR2758568B1/fr not_active Expired - Lifetime
-
1998
- 1998-01-20 DE DE69831888T patent/DE69831888T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-01-20 HU HU9800094A patent/HU228496B1/hu unknown
- 1998-01-20 EP EP98400093A patent/EP0864644B1/fr not_active Expired - Lifetime
- 1998-01-20 ES ES98400093T patent/ES2251760T3/es not_active Expired - Lifetime
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
FR2758568B1 (fr) | 1999-03-26 |
HU9800094D0 (en) | 1998-03-30 |
EP0864644A1 (fr) | 1998-09-16 |
EP0864644B1 (fr) | 2005-10-19 |
HUP9800094A3 (en) | 2001-11-28 |
DE69831888T2 (de) | 2006-07-27 |
DE69831888D1 (de) | 2006-03-02 |
ES2251760T3 (es) | 2006-05-01 |
HUP9800094A2 (hu) | 1998-09-28 |
FR2758568A1 (fr) | 1998-07-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Law | Adhesion and its role in the virulence of enteropathogenic Escherichia coli | |
Bliska et al. | Bacterial resistance to complement killing mediated by the Ail protein of Yersinia enterocolitica. | |
HU205262B (en) | Process for producing new, nonreverting living vaccine and stock against shigella | |
JP2002521345A (ja) | 鳥類病原体を制御するため生きた弱毒化サルモネラワクチン | |
KR100628657B1 (ko) | AroC, OmpF 및 OmpC 유전자 각각에 비복귀돌연변이로 약독화된 백신에 유용한 박테리아 | |
De Rycke et al. | Enteropathogenic Escherichia coli O103 from rabbit elicits actin stress fibers and focal adhesions in HeLa epithelial cells, cytopathic effects that are linked to an analog of the locus of enterocyte effacement | |
MXPA03008296A (es) | Composiciones de vacuna antibacteriana. | |
CN1798574B (zh) | 无荚膜的多杀巴斯德氏菌hyaE缺失型突变株 | |
JP4189031B2 (ja) | グラム陰性菌からの異型o抗原の高レベルの発現に有用な生ワクチン担体株と生ワクチンとして使用するためのその誘導体 | |
Nougayrède et al. | The long‐term cytoskeletal rearrangement induced by rabbit enteropathogenic Escherichia coli is Esp dependent but intimin independent | |
MXPA02010407A (es) | Aislamiento y caracterizacion del operante csa (etec-cs4-pili) y metodos para su uso. | |
EP0564689B1 (en) | Recombinant live vaccines against Gram-negative enteric pathogens | |
HU228496B1 (en) | Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof | |
Pillien et al. | Role of adhesive factor/rabbit 2 in experimental enteropathogenic Escherichia coli O103 diarrhea of weaned rabbit | |
Aguilera Galaviz et al. | Detection of potentially cariogenic strains of Streptococcus mutans using the polymerase chain reaction | |
MXPA05000467A (es) | Formulacion de micoplasma gallisepticum. | |
WO1998002523A1 (en) | Vaccine preparations | |
EP0209599A1 (en) | A 987p fimbriae-producing microorganism, a vaccine for the immunization of pigs as well as a method for production of the vaccine | |
Galaviz et al. | Detection of potentially cariogenic strains of Streptococcus mutans using the polymerase chain reaction | |
RU2140981C1 (ru) | Авирулентный штамм vibrio cholerae не-01 серогруппы (варианты), способ получения штамма (варианты), вакцина | |
EP1181371B1 (en) | Attenuated mutant enteropathogenic e. coli (epec) strains, process for their production and their use | |
Isberg | Intracellular trafficking of Legionella pneumophila within phagocytic cells | |
AU2003236302B2 (en) | Virulence genes and proteins, and their use | |
CN116782926A (zh) | 高剂量志贺氏菌疫苗制剂 | |
AU2013201267B2 (en) | Anti-bacterial vaccine compositions |