HU228496B1 - Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof - Google Patents
Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof Download PDFInfo
- Publication number
- HU228496B1 HU228496B1 HU9800094A HUP9800094A HU228496B1 HU 228496 B1 HU228496 B1 HU 228496B1 HU 9800094 A HU9800094 A HU 9800094A HU P9800094 A HUP9800094 A HU P9800094A HU 228496 B1 HU228496 B1 HU 228496B1
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- ser
- thr
- lys
- gly
- asp
- Prior art date
Links
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 title claims description 27
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 9
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 54
- 230000000120 cytopathologic effect Effects 0.000 claims description 29
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 26
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 claims description 22
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 claims description 14
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 claims description 14
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims description 14
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 10
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims description 10
- 244000052769 pathogen Species 0.000 claims description 8
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 claims description 5
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 5
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 38
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 35
- 241000208202 Linaceae Species 0.000 description 19
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 18
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 14
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 14
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 13
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 13
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 12
- YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N Thr-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 11
- 235000011389 fruit/vegetable juice Nutrition 0.000 description 11
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 11
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 11
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 10
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 9
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 9
- 101100500479 Hafnia alvei eaeA gene Proteins 0.000 description 8
- 101150107911 eae gene Proteins 0.000 description 8
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 8
- 230000004044 response Effects 0.000 description 8
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 7
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 7
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 7
- 210000004292 cytoskeleton Anatomy 0.000 description 7
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 7
- 238000007096 Glaser coupling reaction Methods 0.000 description 6
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 6
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 6
- SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 6
- LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N 0.000 description 6
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 6
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 6
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 6
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 6
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 6
- 108010037896 heparin-binding hemagglutinin Proteins 0.000 description 6
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 6
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 6
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 6
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 6
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 6
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 6
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 6
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 6
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 6
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 6
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 6
- WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N 0.000 description 5
- STTYIMSDIYISRG-UHFFFAOYSA-N Valyl-Serine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NC(CO)C(O)=O STTYIMSDIYISRG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 5
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 5
- 230000034994 death Effects 0.000 description 5
- 231100000517 death Toxicity 0.000 description 5
- 101150099846 eaeA gene Proteins 0.000 description 5
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 5
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 5
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 5
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 5
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 5
- OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N Asp-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 4
- SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N L-rhamnopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N 0.000 description 4
- PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N L-rhamnose Natural products CC(O)C(O)C(O)C(O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N Lys-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- KPKZJLCSROULON-QKGLWVMZSA-N Phalloidin Chemical compound N1C(=O)[C@@H]([C@@H](O)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C[C@@](C)(O)CO)NC(=O)[C@H](C2)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]3C[C@H](O)CN3C(=O)[C@@H]1CSC1=C2C2=CC=CC=C2N1 KPKZJLCSROULON-QKGLWVMZSA-N 0.000 description 4
- RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N Ser-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N Sulfisoxazole Chemical compound CC1=NOC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=C1C NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- LVRFMARKDGGZMX-IZPVPAKOSA-N Thr-Tyr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 LVRFMARKDGGZMX-IZPVPAKOSA-N 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N acetic acid Substances CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 4
- 230000008859 change Effects 0.000 description 4
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 4
- 101150117399 espB gene Proteins 0.000 description 4
- 210000001650 focal adhesion Anatomy 0.000 description 4
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 4
- 230000004660 morphological change Effects 0.000 description 4
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 4
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 4
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 230000001018 virulence Effects 0.000 description 4
- 230000004580 weight loss Effects 0.000 description 4
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 3
- IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 3
- 101100500480 Escherichia coli O127:H6 (strain E2348/69 / EPEC) eaeB gene Proteins 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 3
- VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- MMAPOBOTRUVNKJ-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asp-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O MMAPOBOTRUVNKJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- FPCGZYMRFFIYIH-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FPCGZYMRFFIYIH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- SNXUIBACCONSOH-BWBBJGPYSA-N Ser-Thr-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNXUIBACCONSOH-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 3
- HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N Thr-Arg Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 3
- IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 3
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 3
- LECUEEHKUFYOOV-ZJDVBMNYSA-N Thr-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O LECUEEHKUFYOOV-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 3
- CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 3
- ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N Tin Chemical compound [Sn] ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N Val-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 3
- 102000003970 Vinculin Human genes 0.000 description 3
- 108090000384 Vinculin Proteins 0.000 description 3
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 3
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 3
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 3
- 101150055155 espA gene Proteins 0.000 description 3
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 3
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 3
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 3
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 3
- CXKWCBBOMKCUKX-UHFFFAOYSA-M methylene blue Chemical compound [Cl-].C1=CC(N(C)C)=CC2=[S+]C3=CC(N(C)C)=CC=C3N=C21 CXKWCBBOMKCUKX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 229960000907 methylthioninium chloride Drugs 0.000 description 3
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 3
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 108010048397 seryl-lysyl-leucine Proteins 0.000 description 3
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 3
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 3
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical group C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- FBLMOFHNVQBKRR-IHRRRGAJSA-N Arg-Asp-Tyr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FBLMOFHNVQBKRR-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- LRPZJPMQGKGHSG-XGEHTFHBSA-N Arg-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O LRPZJPMQGKGHSG-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N Arg-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- WCZXPVPHUMYLMS-VEVYYDQMSA-N Arg-Thr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WCZXPVPHUMYLMS-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 2
- APHUDFFMXFYRKP-CIUDSAMLSA-N Asn-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N APHUDFFMXFYRKP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- QJMCHPGWFZZRID-BQBZGAKWSA-N Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O QJMCHPGWFZZRID-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- DONWIPDSZZJHHK-HJGDQZAQSA-N Asp-Lys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O DONWIPDSZZJHHK-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- ZBYLEBZCVKLPCY-FXQIFTODSA-N Asp-Ser-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ZBYLEBZCVKLPCY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- CPMKYMGGYUFOHS-FSPLSTOPSA-N Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CPMKYMGGYUFOHS-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 239000006145 Eagle's minimal essential medium Substances 0.000 description 2
- 239000012594 Earle’s Balanced Salt Solution Substances 0.000 description 2
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 2
- DBUNZBWUWCIELX-JHEQGTHGSA-N Gly-Thr-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DBUNZBWUWCIELX-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 2
- XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- OCRQUYDOYKCOQG-IRXDYDNUSA-N Gly-Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 OCRQUYDOYKCOQG-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 2
- DGTOKVBDZXJHNZ-WZLNRYEVSA-N Ile-Thr-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N DGTOKVBDZXJHNZ-WZLNRYEVSA-N 0.000 description 2
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- VGPCJSXPPOQPBK-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VGPCJSXPPOQPBK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N Leu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- PLDJDCJLRCYPJB-VOAKCMCISA-N Lys-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PLDJDCJLRCYPJB-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- 108010009711 Phalloidine Proteins 0.000 description 2
- CDNPIRSCAFMMBE-SRVKXCTJSA-N Phe-Asn-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CDNPIRSCAFMMBE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- NAXPHWZXEXNDIW-JTQLQIEISA-N Phe-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NAXPHWZXEXNDIW-JTQLQIEISA-N 0.000 description 2
- GKZIWHRNKRBEOH-HOTGVXAUSA-N Phe-Phe Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 GKZIWHRNKRBEOH-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 2
- ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- QVOGDCQNGLBNCR-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QVOGDCQNGLBNCR-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N Ser-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- PPNPDKGQRFSCAC-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PPNPDKGQRFSCAC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N Ser-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CO XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- OZPDGESCTGGNAD-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CO OZPDGESCTGGNAD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- NERYDXBVARJIQS-JYBASQMISA-N Ser-Trp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CO)N)O NERYDXBVARJIQS-JYBASQMISA-N 0.000 description 2
- BEBVVQPDSHHWQL-NRPADANISA-N Ser-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BEBVVQPDSHHWQL-NRPADANISA-N 0.000 description 2
- JTEICXDKGWKRRV-HJGDQZAQSA-N Thr-Asn-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O JTEICXDKGWKRRV-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- SGAOHNPSEPVAFP-ZDLURKLDSA-N Thr-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SGAOHNPSEPVAFP-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 2
- RVMNUBQWPVOUKH-HEIBUPTGSA-N Thr-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O RVMNUBQWPVOUKH-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 2
- XVHAUVJXBFGUPC-RPTUDFQQSA-N Thr-Tyr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O XVHAUVJXBFGUPC-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 2
- BARBHMSSVWPKPZ-IHRRRGAJSA-N Tyr-Asp-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O BARBHMSSVWPKPZ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- QAYSODICXVZUIA-WLTAIBSBSA-N Tyr-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QAYSODICXVZUIA-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 2
- AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N Tyr-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- WYOBRXPIZVKNMF-IRXDYDNUSA-N Tyr-Tyr-Gly Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)NCC(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 WYOBRXPIZVKNMF-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 2
- XXROXFHCMVXETG-UWVGGRQHSA-N Val-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O XXROXFHCMVXETG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- OFTXTCGQJXTNQS-XGEHTFHBSA-N Val-Thr-Ser Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O OFTXTCGQJXTNQS-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 2
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 2
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 2
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 2
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 2
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N dipeptide phenylalanyl-tyrosine Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000001842 enterocyte Anatomy 0.000 description 2
- 230000000369 enteropathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 208000002854 epidermolysis bullosa simplex superficialis Diseases 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 2
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 2
- 208000028774 intestinal disease Diseases 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 2
- 108010070409 phenylalanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010073025 phenylalanylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010069117 seryl-lysyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 2
- 239000004575 stone Substances 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 2
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 2
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 2
- ALBODLTZUXKBGZ-JUUVMNCLSA-N (2s)-2-amino-3-phenylpropanoic acid;(2s)-2,6-diaminohexanoic acid Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O.OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ALBODLTZUXKBGZ-JUUVMNCLSA-N 0.000 description 1
- CXLUIRPQSBYREP-WDSKDSINSA-N (3s)-3-[[(2s)-2-amino-4,4-dicarboxybutanoyl]amino]propane-1,1,3-tricarboxylic acid Chemical compound OC(=O)C(C(O)=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C(O)=O)C(O)=O)C(O)=O CXLUIRPQSBYREP-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JKMPXGJJRMOELF-UHFFFAOYSA-N 1,3-thiazole-2,4,5-tricarboxylic acid Chemical compound OC(=O)C1=NC(C(O)=O)=C(C(O)=O)S1 JKMPXGJJRMOELF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PFFIDZXUXFLSSR-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-N-[2-(4-methylpentan-2-yl)-3-thienyl]-3-(trifluoromethyl)pyrazole-4-carboxamide Chemical compound S1C=CC(NC(=O)C=2C(=NN(C)C=2)C(F)(F)F)=C1C(C)CC(C)C PFFIDZXUXFLSSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- WESHVRNMNFMVBE-FXQIFTODSA-N Arg-Asn-Asp Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N)CN=C(N)N WESHVRNMNFMVBE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ZZZWQALDSQQBEW-STQMWFEESA-N Arg-Gly-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ZZZWQALDSQQBEW-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- IIAXFBUTKIDDIP-ULQDDVLXSA-N Arg-Leu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O IIAXFBUTKIDDIP-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- VVJTWSRNMJNDPN-IUCAKERBSA-N Arg-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O VVJTWSRNMJNDPN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- MNBHKGYCLBUIBC-UFYCRDLUSA-N Arg-Phe-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 MNBHKGYCLBUIBC-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- VENMDXUVHSKEIN-GUBZILKMSA-N Arg-Ser-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VENMDXUVHSKEIN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ADPACBMPYWJJCE-FXQIFTODSA-N Arg-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ADPACBMPYWJJCE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DNLQVHBBMPZUGJ-BQBZGAKWSA-N Arg-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O DNLQVHBBMPZUGJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- URAUIUGLHBRPMF-NAKRPEOUSA-N Arg-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O URAUIUGLHBRPMF-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- AIFHRTPABBBHKU-RCWTZXSCSA-N Arg-Thr-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O AIFHRTPABBBHKU-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N Arg-Tyr Natural products NC(CCNC(=N)N)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QJWLLRZTJFPCHA-STECZYCISA-N Arg-Tyr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O QJWLLRZTJFPCHA-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- NMTANZXPDAHUKU-ULQDDVLXSA-N Arg-Tyr-Lys Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NMTANZXPDAHUKU-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- QQEWINYJRFBLNN-DLOVCJGASA-N Asn-Ala-Phe Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QQEWINYJRFBLNN-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- NPDLYUOYAGBHFB-WDSKDSINSA-N Asn-Arg Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N NPDLYUOYAGBHFB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N Asn-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- ACRYGQFHAQHDSF-ZLUOBGJFSA-N Asn-Asn-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ACRYGQFHAQHDSF-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- NVGWESORMHFISY-SRVKXCTJSA-N Asn-Asn-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O NVGWESORMHFISY-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- HZYFHQOWCFUSOV-IMJSIDKUSA-N Asn-Asp Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HZYFHQOWCFUSOV-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- OLGCWMNDJTWQAG-GUBZILKMSA-N Asn-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O OLGCWMNDJTWQAG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OPEPUCYIGFEGSW-WDSKDSINSA-N Asn-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OPEPUCYIGFEGSW-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JQSWHKKUZMTOIH-QWRGUYRKSA-N Asn-Gly-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(=O)N)N JQSWHKKUZMTOIH-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- UDSVWSUXKYXSTR-QWRGUYRKSA-N Asn-Gly-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O UDSVWSUXKYXSTR-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- LTZIRYMWOJHRCH-GUDRVLHUSA-N Asn-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LTZIRYMWOJHRCH-GUDRVLHUSA-N 0.000 description 1
- WIDVAWAQBRAKTI-YUMQZZPRSA-N Asn-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O WIDVAWAQBRAKTI-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- AYOAHKWVQLNPDM-HJGDQZAQSA-N Asn-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O AYOAHKWVQLNPDM-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- NTWOPSIUJBMNRI-KKUMJFAQSA-N Asn-Lys-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NTWOPSIUJBMNRI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- LSJQOMAZIKQMTJ-SRVKXCTJSA-N Asn-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O LSJQOMAZIKQMTJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SONUFGRSSMFHFN-IMJSIDKUSA-N Asn-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SONUFGRSSMFHFN-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- OOXUBGLNDRGOKT-FXQIFTODSA-N Asn-Ser-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O OOXUBGLNDRGOKT-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- REQUGIWGOGSOEZ-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ser-Asn Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)C(=O)N REQUGIWGOGSOEZ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- JXMREEPBRANWBY-VEVYYDQMSA-N Asn-Thr-Arg Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O JXMREEPBRANWBY-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N Asn-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 1
- RGGVDKVXLBOLNS-JQWIXIFHSA-N Asn-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CC(N)=O)N)C(O)=O)=CNC2=C1 RGGVDKVXLBOLNS-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 1
- FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N Asn-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- XEGZSHSPQNDNRH-JRQIVUDYSA-N Asn-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XEGZSHSPQNDNRH-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- KWBQPGIYEZKDEG-FSPLSTOPSA-N Asn-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O KWBQPGIYEZKDEG-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- HMQDRBKQMLRCCG-GMOBBJLQSA-N Asp-Arg-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HMQDRBKQMLRCCG-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- IXIWEFWRKIUMQX-DCAQKATOSA-N Asp-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O IXIWEFWRKIUMQX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- JDHOJQJMWBKHDB-CIUDSAMLSA-N Asp-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N JDHOJQJMWBKHDB-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KNMRXHIAVXHCLW-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asn-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)C(=O)O KNMRXHIAVXHCLW-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- XACXDSRQIXRMNS-OLHMAJIHSA-N Asp-Asn-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O XACXDSRQIXRMNS-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- KHBLRHKVXICFMY-GUBZILKMSA-N Asp-Glu-Lys Chemical compound N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O KHBLRHKVXICFMY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N Asp-Ile Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GBSUGIXJAAKZOW-GMOBBJLQSA-N Asp-Ile-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O GBSUGIXJAAKZOW-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- IDDMGSKZQDEDGA-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 IDDMGSKZQDEDGA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LTCKTLYKRMCFOC-KKUMJFAQSA-N Asp-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LTCKTLYKRMCFOC-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- RPUYTJJZXQBWDT-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N RPUYTJJZXQBWDT-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ZKAOJVJQGVUIIU-GUBZILKMSA-N Asp-Pro-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ZKAOJVJQGVUIIU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- BRRPVTUFESPTCP-ACZMJKKPSA-N Asp-Ser-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O BRRPVTUFESPTCP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- VNXQRBXEQXLERQ-CIUDSAMLSA-N Asp-Ser-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N VNXQRBXEQXLERQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N Asp-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 1
- GCACQYDBDHRVGE-LKXGYXEUSA-N Asp-Thr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O GCACQYDBDHRVGE-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- USENATHVGFXRNO-SRVKXCTJSA-N Asp-Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 USENATHVGFXRNO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BPAUXFVCSYQDQX-JRQIVUDYSA-N Asp-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O BPAUXFVCSYQDQX-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- SFJUYBCDQBAYAJ-YDHLFZDLSA-N Asp-Val-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 SFJUYBCDQBAYAJ-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- 108010077805 Bacterial Proteins Proteins 0.000 description 1
- 101000609447 Beet necrotic yellow vein virus (isolate Japan/S) Protein P25 Proteins 0.000 description 1
- 102100021257 Beta-secretase 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710150192 Beta-secretase 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100021277 Beta-secretase 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710150190 Beta-secretase 2 Proteins 0.000 description 1
- BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N Borate Chemical compound [O-]B([O-])[O-] BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 101100439298 Caenorhabditis elegans cgt-2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100015199 Caenorhabditis elegans gly-11 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 241001492658 Cyanea koolauensis Species 0.000 description 1
- MXZYQNJCBVJHSR-KATARQTJSA-N Cys-Lys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CS)N)O MXZYQNJCBVJHSR-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- YQEHNIKPAOPBNH-DCAQKATOSA-N Cys-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N YQEHNIKPAOPBNH-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 1
- 230000007023 DNA restriction-modification system Effects 0.000 description 1
- 235000003385 Diospyros ebenum Nutrition 0.000 description 1
- 241000792913 Ebenaceae Species 0.000 description 1
- 241000028463 Escherichia coli O103 Species 0.000 description 1
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001123946 Gaga Species 0.000 description 1
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 1
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 1
- RJONUNZIMUXUOI-GUBZILKMSA-N Glu-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N RJONUNZIMUXUOI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- LGYZYFFDELZWRS-DCAQKATOSA-N Glu-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O LGYZYFFDELZWRS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N Glu-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- HPJLZFTUUJKWAJ-JHEQGTHGSA-N Glu-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HPJLZFTUUJKWAJ-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N Glu-Leu-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- VXEFAWJTFAUDJK-AVGNSLFASA-N Glu-Tyr-Ser Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O VXEFAWJTFAUDJK-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- WGYHAAXZWPEBDQ-IFFSRLJSSA-N Glu-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WGYHAAXZWPEBDQ-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- FZQLXNIMCPJVJE-YUMQZZPRSA-N Gly-Asp-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FZQLXNIMCPJVJE-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- QGZSAHIZRQHCEQ-QWRGUYRKSA-N Gly-Asp-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 QGZSAHIZRQHCEQ-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- HDNXXTBKOJKWNN-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HDNXXTBKOJKWNN-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JSNNHGHYGYMVCK-XVKPBYJWSA-N Gly-Glu-Val Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JSNNHGHYGYMVCK-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- OLPPXYMMIARYAL-QMMMGPOBSA-N Gly-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN OLPPXYMMIARYAL-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- YIWFXZNIBQBFHR-LURJTMIESA-N Gly-His Chemical class [NH3+]CC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CN=CN1 YIWFXZNIBQBFHR-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- UTYGDAHJBBDPBA-BYULHYEWSA-N Gly-Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)CN UTYGDAHJBBDPBA-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- TVUWMSBGMVAHSJ-KBPBESRZSA-N Gly-Leu-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 TVUWMSBGMVAHSJ-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- PFMUCCYYAAFKTH-YFKPBYRVSA-N Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN PFMUCCYYAAFKTH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- GAFKBWKVXNERFA-QWRGUYRKSA-N Gly-Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 GAFKBWKVXNERFA-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- QAMMIGULQSIRCD-IRXDYDNUSA-N Gly-Phe-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)C[NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 QAMMIGULQSIRCD-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N Gly-Pro-Gly Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N Gly-Thr-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N 0.000 description 1
- YJDALMUYJIENAG-QWRGUYRKSA-N Gly-Tyr-Asn Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)CN)O YJDALMUYJIENAG-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- JYGYNWYVKXENNE-OALUTQOASA-N Gly-Tyr-Trp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O JYGYNWYVKXENNE-OALUTQOASA-N 0.000 description 1
- 241000160777 Hipparchia semele Species 0.000 description 1
- FDQYIRHBVVUTJF-ZETCQYMHSA-N His-Gly-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CN=CN1 FDQYIRHBVVUTJF-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- BDFCIKANUNMFGB-PMVVWTBXSA-N His-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 BDFCIKANUNMFGB-PMVVWTBXSA-N 0.000 description 1
- CZVQSYNVUHAILZ-UWVGGRQHSA-N His-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 CZVQSYNVUHAILZ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ILUVWFTXAUYOBW-CUJWVEQBSA-N His-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O ILUVWFTXAUYOBW-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- UAVQIQOOBXFKRC-BYULHYEWSA-N Ile-Asn-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O UAVQIQOOBXFKRC-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- WKXVAXOSIPTXEC-HAFWLYHUSA-N Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O WKXVAXOSIPTXEC-HAFWLYHUSA-N 0.000 description 1
- TWPSALMCEHCIOY-YTFOTSKYSA-N Ile-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N TWPSALMCEHCIOY-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 1
- FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N Ile-Leu-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)O)N FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- PMMMQRVUMVURGJ-XUXIUFHCSA-N Ile-Leu-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O PMMMQRVUMVURGJ-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- UWBDLNOCIDGPQE-GUBZILKMSA-N Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN UWBDLNOCIDGPQE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WSSGUVAKYCQSCT-XUXIUFHCSA-N Ile-Met-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N WSSGUVAKYCQSCT-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N Ile-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 1
- BVRPESWOSNFUCJ-LKTVYLICSA-N Ile-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)CC)C(O)=O)=CNC2=C1 BVRPESWOSNFUCJ-LKTVYLICSA-N 0.000 description 1
- ZUWSVOYKBCHLRR-MGHWNKPDSA-N Ile-Tyr-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N ZUWSVOYKBCHLRR-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 1
- ZGKVPOSSTGHJAF-HJPIBITLSA-N Ile-Tyr-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N ZGKVPOSSTGHJAF-HJPIBITLSA-N 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003440 L-leucyl group Chemical group O=C([*])[C@](N([H])[H])([H])C([H])([H])C(C([H])([H])[H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- UCOCBWDBHCUPQP-DCAQKATOSA-N Leu-Arg-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UCOCBWDBHCUPQP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- WXHFZJFZWNCDNB-KKUMJFAQSA-N Leu-Asn-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WXHFZJFZWNCDNB-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N Leu-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- HPBCTWSUJOGJSH-MNXVOIDGSA-N Leu-Glu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HPBCTWSUJOGJSH-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- LLBQJYDYOLIQAI-JYJNAYRXSA-N Leu-Glu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O LLBQJYDYOLIQAI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- LCPYQJIKPJDLLB-UWVGGRQHSA-N Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C LCPYQJIKPJDLLB-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XXXXOVFBXRERQL-ULQDDVLXSA-N Leu-Pro-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XXXXOVFBXRERQL-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- BQVUABVGYYSDCJ-ZFWWWQNUSA-N Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- VUBIPAHVHMZHCM-KKUMJFAQSA-N Leu-Tyr-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 VUBIPAHVHMZHCM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 240000007472 Leucaena leucocephala Species 0.000 description 1
- 235000010643 Leucaena leucocephala Nutrition 0.000 description 1
- 101001090725 Leuconostoc gelidum Bacteriocin leucocin-A Proteins 0.000 description 1
- ZQCVMVCVPFYXHZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZQCVMVCVPFYXHZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YPLVCBKEPJPBDQ-MELADBBJSA-N Lys-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N YPLVCBKEPJPBDQ-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- ALGGDNMLQNFVIZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Asp Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N ALGGDNMLQNFVIZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XBZOQGHZGQLEQO-IUCAKERBSA-N Lys-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN XBZOQGHZGQLEQO-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N Lys-Phe Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- XFANQCRHTMOEAP-WDSOQIARSA-N Lys-Pro-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O XFANQCRHTMOEAP-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- ZUGVARDEGWMMLK-SRVKXCTJSA-N Lys-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZUGVARDEGWMMLK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JHNOXVASMSXSNB-WEDXCCLWSA-N Lys-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O JHNOXVASMSXSNB-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- IEIHKHYMBIYQTH-YESZJQIVSA-N Lys-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)O IEIHKHYMBIYQTH-YESZJQIVSA-N 0.000 description 1
- YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N Lys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- RIPJMCFGQHGHNP-RHYQMDGZSA-N Lys-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O RIPJMCFGQHGHNP-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- HWROAFGWPQUPTE-OSUNSFLBSA-N Met-Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N HWROAFGWPQUPTE-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- DBXMFHGGHMXYHY-DCAQKATOSA-N Met-Leu-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DBXMFHGGHMXYHY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N Met-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- ZYTPOUNUXRBYGW-YUMQZZPRSA-N Met-Met Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCSC ZYTPOUNUXRBYGW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N Met-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N Met-Thr Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C([O-])=O KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- GWADARYJIJDYRC-XGEHTFHBSA-N Met-Thr-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GWADARYJIJDYRC-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- QYIGOFGUOVTAHK-ZJDVBMNYSA-N Met-Thr-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QYIGOFGUOVTAHK-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- IIHMNTBFPMRJCN-RCWTZXSCSA-N Met-Val-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IIHMNTBFPMRJCN-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N Nalpha-L-Leucyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000002853 Nelumbo nucifera Species 0.000 description 1
- 235000006508 Nelumbo nucifera Nutrition 0.000 description 1
- 235000006510 Nelumbo pentapetala Nutrition 0.000 description 1
- 101100216047 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) gla-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010029719 Nonspecific reaction Diseases 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 241001024099 Olla Species 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- IWRZUGHCHFZYQZ-UFYCRDLUSA-N Phe-Arg-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 IWRZUGHCHFZYQZ-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- BXNGIHFNNNSEOS-UWVGGRQHSA-N Phe-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 BXNGIHFNNNSEOS-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- WIVCOAKLPICYGY-KKUMJFAQSA-N Phe-Asp-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N WIVCOAKLPICYGY-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- QPVFUAUFEBPIPT-CDMKHQONSA-N Phe-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QPVFUAUFEBPIPT-CDMKHQONSA-N 0.000 description 1
- OVJMCXAPGFDGMG-HKUYNNGSSA-N Phe-Gly-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O OVJMCXAPGFDGMG-HKUYNNGSSA-N 0.000 description 1
- DOXQMJCSSYZSNM-BZSNNMDCSA-N Phe-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DOXQMJCSSYZSNM-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- PEFJUUYFEGBXFA-BZSNNMDCSA-N Phe-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 PEFJUUYFEGBXFA-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- SCKXGHWQPPURGT-KKUMJFAQSA-N Phe-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SCKXGHWQPPURGT-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- BAONJAHBAUDJKA-BZSNNMDCSA-N Phe-Tyr-Asp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 BAONJAHBAUDJKA-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- BELBBZDIHDAJOR-UHFFFAOYSA-N Phenolsulfonephthalein Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1C1(C=2C=CC(O)=CC=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 BELBBZDIHDAJOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N Pro-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- SXMSEHDMNIUTSP-DCAQKATOSA-N Pro-Lys-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SXMSEHDMNIUTSP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- GZNYIXWOIUFLGO-ZJDVBMNYSA-N Pro-Thr-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GZNYIXWOIUFLGO-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- FHJQROWZEJFZPO-SRVKXCTJSA-N Pro-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 FHJQROWZEJFZPO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 101100084022 Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) lapA gene Proteins 0.000 description 1
- 101100074339 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) LEE1 gene Proteins 0.000 description 1
- SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CO SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- QGMLKFGTGXWAHF-IHRRRGAJSA-N Ser-Arg-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O QGMLKFGTGXWAHF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- OYEDZGNMSBZCIM-XGEHTFHBSA-N Ser-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OYEDZGNMSBZCIM-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N Ser-Asn Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- WXWDPFVKQRVJBJ-CIUDSAMLSA-N Ser-Asn-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CO)N WXWDPFVKQRVJBJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- DKKGAAJTDKHWOD-BIIVOSGPSA-N Ser-Asn-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O DKKGAAJTDKHWOD-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 1
- UGJRQLURDVGULT-LKXGYXEUSA-N Ser-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UGJRQLURDVGULT-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N Ser-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- BTPAWKABYQMKKN-LKXGYXEUSA-N Ser-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O BTPAWKABYQMKKN-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- SWSRFJZZMNLMLY-ZKWXMUAHSA-N Ser-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SWSRFJZZMNLMLY-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SQBLRDDJTUJDMV-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SQBLRDDJTUJDMV-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N Ser-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- VQBCMLMPEWPUTB-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VQBCMLMPEWPUTB-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- AEGUWTFAQQWVLC-BQBZGAKWSA-N Ser-Gly-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AEGUWTFAQQWVLC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- BPMRXBZYPGYPJN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BPMRXBZYPGYPJN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- MUARUIBTKQJKFY-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MUARUIBTKQJKFY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SFTZWNJFZYOLBD-ZDLURKLDSA-N Ser-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO SFTZWNJFZYOLBD-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- CXBFHZLODKPIJY-AAEUAGOBSA-N Ser-Gly-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)N CXBFHZLODKPIJY-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 1
- YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- QJKPECIAWNNKIT-KKUMJFAQSA-N Ser-Lys-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O QJKPECIAWNNKIT-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- PBUXMVYWOSKHMF-WDSKDSINSA-N Ser-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO PBUXMVYWOSKHMF-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- PJIQEIFXZPCWOJ-FXQIFTODSA-N Ser-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PJIQEIFXZPCWOJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- PPCZVWHJWJFTFN-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PPCZVWHJWJFTFN-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N Ser-Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- BMKNXTJLHFIAAH-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BMKNXTJLHFIAAH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N Ser-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- VLMIUSLQONKLDV-HEIBUPTGSA-N Ser-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VLMIUSLQONKLDV-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 1
- ZKOKTQPHFMRSJP-YJRXYDGGSA-N Ser-Thr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ZKOKTQPHFMRSJP-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- PQEQXWRVHQAAKS-SRVKXCTJSA-N Ser-Tyr-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CO)N)CC1=CC=C(O)C=C1 PQEQXWRVHQAAKS-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ILVGMCVCQBJPSH-WDSKDSINSA-N Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO ILVGMCVCQBJPSH-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- IAOHCSQDQDWRQU-GUBZILKMSA-N Ser-Val-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O IAOHCSQDQDWRQU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- UKKROEYWYIHWBD-ZKWXMUAHSA-N Ser-Val-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O UKKROEYWYIHWBD-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N Ser-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 101150050863 T gene Proteins 0.000 description 1
- JNQZPAWOPBZGIX-RCWTZXSCSA-N Thr-Arg-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O)CCCN=C(N)N JNQZPAWOPBZGIX-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- NLSNVZAREYQMGR-HJGDQZAQSA-N Thr-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NLSNVZAREYQMGR-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- KRPKYGOFYUNIGM-XVSYOHENSA-N Thr-Asp-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N)O KRPKYGOFYUNIGM-XVSYOHENSA-N 0.000 description 1
- ONNSECRQFSTMCC-XKBZYTNZSA-N Thr-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ONNSECRQFSTMCC-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N Thr-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- XPNSAQMEAVSQRD-FBCQKBJTSA-N Thr-Gly-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XPNSAQMEAVSQRD-FBCQKBJTSA-N 0.000 description 1
- DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N Thr-Gly-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- GXUWHVZYDAHFSV-FLBSBUHZSA-N Thr-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GXUWHVZYDAHFSV-FLBSBUHZSA-N 0.000 description 1
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N Thr-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N Thr-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- JLNMFGCJODTXDH-WEDXCCLWSA-N Thr-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O JLNMFGCJODTXDH-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- XSEPSRUDSPHMPX-KATARQTJSA-N Thr-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XSEPSRUDSPHMPX-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- JWQNAFHCXKVZKZ-UVOCVTCTSA-N Thr-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JWQNAFHCXKVZKZ-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 1
- QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N Thr-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N Thr-Pro-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- OLFOOYQTTQSSRK-UNQGMJICSA-N Thr-Pro-Phe Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OLFOOYQTTQSSRK-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N Thr-Ser-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N 0.000 description 1
- YRJOLUDFVAUXLI-GSSVUCPTSA-N Thr-Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O YRJOLUDFVAUXLI-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 1
- MYNYCUXMIIWUNW-IEGACIPQSA-N Thr-Trp-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MYNYCUXMIIWUNW-IEGACIPQSA-N 0.000 description 1
- AKHDFZHUPGVFEJ-YEPSODPASA-N Thr-Val-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O AKHDFZHUPGVFEJ-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N Thr-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- VYVBSMCZNHOZGD-RCWTZXSCSA-N Thr-Val-Val Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O VYVBSMCZNHOZGD-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- VEYXZZGMIBKXCN-UBHSHLNASA-N Trp-Asp-Asp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N VEYXZZGMIBKXCN-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- PGPCENKYTLDIFM-SZMVWBNQSA-N Trp-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PGPCENKYTLDIFM-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- LYMVXFSTACVOLP-ZFWWWQNUSA-N Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)=CNC2=C1 LYMVXFSTACVOLP-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- UJRIVCPPPMYCNA-HOCLYGCPSA-N Trp-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N UJRIVCPPPMYCNA-HOCLYGCPSA-N 0.000 description 1
- BOBZBMOTRORUPT-XIRDDKMYSA-N Trp-Ser-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BOBZBMOTRORUPT-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- SGFIXFAHVWJKTD-KJEVXHAQSA-N Tyr-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SGFIXFAHVWJKTD-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- NSGZILIDHCIZAM-KKUMJFAQSA-N Tyr-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N NSGZILIDHCIZAM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ZOBLBMGJKVJVEV-BZSNNMDCSA-N Tyr-Lys-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O ZOBLBMGJKVJVEV-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- KZOZXAYPVKKDIO-UFYCRDLUSA-N Tyr-Met-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 KZOZXAYPVKKDIO-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- PSALWJCUIAQKFW-ACRUOGEOSA-N Tyr-Phe-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N PSALWJCUIAQKFW-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- QPOUERMDWKKZEG-HJPIBITLSA-N Tyr-Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QPOUERMDWKKZEG-HJPIBITLSA-N 0.000 description 1
- UMSZZGTXGKHTFJ-SRVKXCTJSA-N Tyr-Ser-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 UMSZZGTXGKHTFJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LUMQYLVYUIRHHU-YJRXYDGGSA-N Tyr-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LUMQYLVYUIRHHU-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N Tyr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 1
- BIVIUZRBCAUNPW-JRQIVUDYSA-N Tyr-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BIVIUZRBCAUNPW-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- UUBKSZNKJUJQEJ-JRQIVUDYSA-N Tyr-Thr-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N)O UUBKSZNKJUJQEJ-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N Tyr-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- AOIZTZRWMSPPAY-KAOXEZKKSA-N Tyr-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)O AOIZTZRWMSPPAY-KAOXEZKKSA-N 0.000 description 1
- AKKYBQGHUAWPJR-MNSWYVGCSA-N Tyr-Thr-Trp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N)O AKKYBQGHUAWPJR-MNSWYVGCSA-N 0.000 description 1
- BMPPMAOOKQJYIP-WMZOPIPTSA-N Tyr-Trp Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C([O-])=O)C1=CC=C(O)C=C1 BMPPMAOOKQJYIP-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 1
- AGDDLOQMXUQPDY-BZSNNMDCSA-N Tyr-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AGDDLOQMXUQPDY-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- OYOQKMOWUDVWCR-RYUDHWBXSA-N Tyr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OYOQKMOWUDVWCR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- BYOHPUZJVXWHAE-BYULHYEWSA-N Val-Asn-Asn Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N BYOHPUZJVXWHAE-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- BMGOFDMKDVVGJG-NHCYSSNCSA-N Val-Asp-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N BMGOFDMKDVVGJG-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- SCBITHMBEJNRHC-LSJOCFKGSA-N Val-Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N SCBITHMBEJNRHC-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- KZKMBGXCNLPYKD-YEPSODPASA-N Val-Gly-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KZKMBGXCNLPYKD-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- JAKHAONCJJZVHT-DCAQKATOSA-N Val-Lys-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N JAKHAONCJJZVHT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CKTMJBPRVQWPHU-JSGCOSHPSA-N Val-Phe-Gly Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)O)N CKTMJBPRVQWPHU-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- QTPQHINADBYBNA-DCAQKATOSA-N Val-Ser-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN QTPQHINADBYBNA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- PZTZYZUTCPZWJH-FXQIFTODSA-N Val-Ser-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N PZTZYZUTCPZWJH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- LCHZBEUVGAVMKS-RHYQMDGZSA-N Val-Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)[C@@H](C)O)C(O)=O LCHZBEUVGAVMKS-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- PDDJTOSAVNRJRH-UNQGMJICSA-N Val-Thr-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O PDDJTOSAVNRJRH-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- SUGRIIAOLCDLBD-ZOBUZTSGSA-N Val-Trp-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N SUGRIIAOLCDLBD-ZOBUZTSGSA-N 0.000 description 1
- VTIAEOKFUJJBTC-YDHLFZDLSA-N Val-Tyr-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N VTIAEOKFUJJBTC-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- ZLNYBMWGPOKSLW-LSJOCFKGSA-N Val-Val-Asp Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ZLNYBMWGPOKSLW-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N Valylglycine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NCC(O)=O IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 239000000853 adhesive Substances 0.000 description 1
- 230000001070 adhesive effect Effects 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 1
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 108010018691 arginyl-threonyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 230000000386 athletic effect Effects 0.000 description 1
- 108700017365 bacteria SspA Proteins 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 244000309466 calf Species 0.000 description 1
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- WOWHHFRSBJGXCM-UHFFFAOYSA-M cetyltrimethylammonium chloride Chemical compound [Cl-].CCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)C WOWHHFRSBJGXCM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000001332 colony forming effect Effects 0.000 description 1
- 239000013256 coordination polymer Substances 0.000 description 1
- 101150047356 dec-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 230000008034 disappearance Effects 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L disodium;(2',7'-dibromo-3',6'-dioxido-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-4'-yl)mercury;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Na+].O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(Br)=C([O-])C([Hg])=C1OC1=C2C=C(Br)C([O-])=C1 BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 208000007150 epidermolysis bullosa simplex Diseases 0.000 description 1
- 101150093735 espD gene Proteins 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 206010016256 fatigue Diseases 0.000 description 1
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 1
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 1
- 235000019634 flavors Nutrition 0.000 description 1
- 229960004279 formaldehyde Drugs 0.000 description 1
- 235000019256 formaldehyde Nutrition 0.000 description 1
- 108010004609 gamma-carboxyglutamyl-gamma-carboxyglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 1
- 108010019832 glycyl-asparaginyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010078326 glycyl-glycyl-valine Proteins 0.000 description 1
- 108010066198 glycyl-leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N glycylvaline Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 230000000366 juvenile effect Effects 0.000 description 1
- 231100000636 lethal dose Toxicity 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010091798 leucylleucine Proteins 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 239000012160 loading buffer Substances 0.000 description 1
- 230000007108 local immune response Effects 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 1
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- 108010085203 methionylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 231100000219 mutagenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 210000000287 oocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 229960003531 phenolsulfonphthalein Drugs 0.000 description 1
- 108010065135 phenylalanyl-phenylalanyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010018625 phenylalanylarginine Proteins 0.000 description 1
- 101150009573 phoA gene Proteins 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 230000008521 reorganization Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- BZQWDGWNCKYCHR-DYNCTKRQSA-M sodium;(6r,7r)-3-[[[5-(dimethylamino)naphthalen-1-yl]sulfonylamino]methyl]-8-oxo-7-[(2-thiophen-2-ylacetyl)amino]-5-thia-1-azabicyclo[4.2.0]oct-2-ene-2-carboxylate Chemical compound [Na+].N([C@H]1[C@@H]2N(C1=O)C(=C(CS2)CNS(=O)(=O)C1=C2C=CC=C(C2=CC=C1)N(C)C)C([O-])=O)C(=O)CC1=CC=CS1 BZQWDGWNCKYCHR-DYNCTKRQSA-M 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 238000005728 strengthening Methods 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000008719 thickening Effects 0.000 description 1
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 108010080629 tryptophan-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010003137 tyrosyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 1
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 1
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 description 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/02—Bacterial antigens
- A61K39/025—Enterobacteriales, e.g. Enterobacter
- A61K39/0258—Escherichia
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
- C12N1/205—Bacterial isolates
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/54—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the route of administration
- A61K2039/541—Mucosal route
- A61K2039/542—Mucosal route oral/gastrointestinal
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
- C12R2001/185—Escherichia
- C12R2001/19—Escherichia coli
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Mycology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Description
A találmány tárgyát új, nem-patogén. £. coli mutánsok képezik# amelyek különösen alkalmasak fiatal nyulakban coiibacillozist megelőző vakcinák előállítására.The present invention relates to a novel non-pathogen. £. coli mutants which are particularly suitable for the preparation of vaccines against colibacillosis in young rabbits.
A találmány tárgyát képezi továbbá a találmány szerinti mutánsok alkalmazása vakcinák előállítására.# valamint a. találmány szerinti mutánsokat tartalmasó vakcinák.The invention also relates to the use of the mutants of the invention in the preparation of vaccines. vaccines containing mutants of the invention.
A fiatal# elválasztott nyulak hasmenésének fő oka a colibacillózís. 'Ez a betegség fontos halál-okot jelent a tenyésztő egységekben és kutatásokat folytattak annak érdekében# hogy hatékony vakcinát állítsanak elő. A máig kifejlesztett fő vakcinációs stratégiák nem patogén vagy kismértékben patogén inaktiváit homológ törzseket vagy élő heterológ törzseket alkalmaznak# amely törzsek lokális inmunválas2t .indukálnak fantí iípopollszaccharid A íxaraungiobulinok indukciója) és/vagy ökológiai barrier effektust váltanak ki# amelyet a patogén 0103 törzsekkel szemben gyakorolnak.The major cause of diarrhea in young # weaned rabbits is colibacillosis. 'This disease is an important cause of death in breeding units and research has been done to produce an effective vaccine. The main vaccination strategies developed to date utilize non-pathogenic or mildly pathogenic inactivated homologous strains or live heterologous strains which induce a local immune response (induction of phylloopolyaccharide A) and / or an ecological barrier effect.
Aktaszámunk; 87220-3568/FÁDocket; 87220-3568 / WM
Eddig azonban egyetlen stratégia sem eredményezett teljesen ártalmatlan vakcinát, amely teljes védelmet nyújtana. A kutatás tehát folytatódott azon mechanizmusok azonosítására, amelyek néhány E. coli törzs patogenitásáért felelősek.So far, however, no strategy has resulted in a completely harmless vaccine that offers complete protection. Thus, research has continued to identify the mechanisms responsible for the pathogenesis of some E. coli strains.
Az ember számára enteropatogén E. coli törzsek (vagyis az .EP.EC törzsek), amelyek kisgyermekek hasmenéséért felelősek, képesek specifikus foélhám léziók kiváltására, amelyet „öss zekapcsolődási-kitőrlesi láziénak („a11achment-effacement 1esiοn, azaz A/E-i ézló) neveznek,In humans, enteropathogenic E. coli strains (i.e., .EP.EC strains), which are responsible for diarrhea in infants, are capable of inducing specific cephalic lesions called "a11achment-effacement 1esiοn", i.e., A / E. .
Sgy összkapcsolódási-kitörlés.i femotipust, amely korrelál egy, a HeLa vagy Hep-2. sejt vonal epitelíális sejtjein végrehajtott in vitro vizsgálattal, vagyis a FÁS (fluoreszcens aktin festés”) teszttel, definiáltak .humán EPEC törzsekben. Ebben a vizsgálatban a sejtekhez lokalisáltan tapadó sejtek az adhéziós centrumokban polimerizált aktin tömörüléshez vezetnek, amelyet egy fiuorokrómfooz [Knutton és mtsai, Infect. Immun. 57, 1290 (1989)) kapcsolódó phalloidinnel detektálunk. Ennek az összekapcsolódásikitörlési fenotipusnak a főbb determinánsait egy LEE nevű lókusz <enterocita kitörlési lókusz) kódolja [McDaníel és mtsai, Proc. Natl.Acad. Scí,, 92, 1664 (1995)).So fusion-deletion.i femotype, which correlates with a HeLa or Hep-2. cell line epithelial cells, defined by the FÁS (fluorescent actin staining) assay, in human EPEC strains. In this assay, cells locally adhering to the cells lead to polymerization of actin aggregation at adhesion centers, which is a fluorochrome phosphor (Knutton et al., Infect. Immun. 57, 1290 (1989)). The major determinants of this association deletion phenotype are encoded by a locus named LEE (enterocyte deletion locus) [McDaniel et al., Proc. Natl. Sci., 92, 1664 (1995)).
Megfigyelték, hogy a fiatal nyulak hasmenéséért felelős E. coli törzsek képesek arra, hogy a húsán EPEC törzsek által okozo11 összekapcsölőőási-kitör1ési léz.íöhoz hasónló lésiót váltsanak ki (Licoís és mtsai.., Infect. Immun., 59, 3796 (1991); Moon és mtsai, infect. Iwun., 41, 1340 (1.983); Peeters és mtsai.., Vet. Pathol., 22, 54 (1.985);It has been observed that E. coli strains responsible for diarrhea in juvenile rabbits are able to induce a lesion similar to the junctional-eruption laser caused by EPEC strains in their flesh (Licoís et al., Infect. Immun., 59, 3796 (1991)). Moon et al., Infect. Iwun. 41, 1340 (1983); Peeters et al., Vet. Pathol., 22, 54 (1.985);
« « * « V«« * «V
Takeuchí és mtsai., Infect. Imnn., 19, 686, (1978) ] , EteketTakeuchí et al., Infect. Imnn., 19, 686 (1978)], Eteket
A 35 kpb-s kromoszomális lókusz homológját, amelynek létét eredetileg humán eredetű. EP.SC törzs prototípusban mutatták ki, vagyis az E2348/69-et .megtalálták [Karao'lis és mtsai, in Pröceedings: of the First International Rus'hmore Conference on Mechanisms in the Pathogenesis of Enteric Diseases*', Rapid City, 5.D., (1995); McDaniel és mtsai, Proc. Natl . Acad. Sci , , 92, 1664, (1.9.95)] a referencia REREC törzsben, amelyet RDEC-l-nek neveznek (O15.:H- serovar) és amelyet eredetileg Cantey és Blake írtak le (Infect. Dia,, 135, 454, (1977)].The homologue of the 35 kpb chromosomal locus, originally of human origin. EP.SC strain was detected in the prototype, i.e., E2348 / 69 was found. [Karao'lis et al., In Prolongings: First International Conference on Mechanisms in Enteric Diseases *, Rapid City, 5 .D. (1995); McDaniel et al., Proc. Natl. Acad. Sci, 92, 1664, (1.9.95)] in the reference REREC strain, termed RDEC-1 (O15.H-serovar), originally described by Cantey and Blake (Infect. Dia ,, 135, 454). , 1977].
Egy intíminnek nevezett., 96-100 kDa-os külső memhzénprotein, amelyet humán EPEC törzsének LEE-lótuszában levő eaeA nevű. gén kódol, részt vesz az összekapcsolásikitörlés 1 lézi-ók kialakulásában (Jerse és mtsai., Infect. immun., 59, 4302 (1991)1. Donnenberg és mtsai (J. Clin. Invest., 92, 1412 <1993)1 tanulmányozták az eaeA-gén szerepét a patogenításban. E2348/69 törzset teszteltek 11 önkéntesben, akiknek orálisan 2,10-^ CFU adagot adtak. Tizenegy további önkéntesnek ugyanolyan adag izogén eaeA mutánst adtak. Ar eredmények demonstrálják. az eaeá-gén szerepét a vírulencíában, ezért indirekt módon, a korrelációt az A/Eléziók, FAS-pozitiv fenotípus és az LEE-lökusz között (amely abban az időben, nem volt ismert) , valamint a viru»e * *It was called an intimate., A 96-100 kDa outer memhene protein, named eaeA in the LEE lotus of the human EPEC strain. gene (Jerse et al., 1991, Infect. Immun., 59, 4302 (1991)). Donnenberg et al. (J. Clin. Invest., 92, 1412 <1993). The role of the eaeA gene in pathogenicity E2348 / 69 strains were tested in 11 volunteers given orally doses of 2.10-4 CFU. Eleven other volunteers were given the same dose of the isogenic eaeA mutant. The results demonstrate the role of the eaeA gene in virulence, indirectly, the correlation between A / Lesions, the FAS-positive phenotype, and the LEE-locus (not known at the time), as well as viru »e * *
X >X>
«Α ***· i énei a között, isivel akkoriban úgy -gondolták/ hogy egyedül az eaeA-gén játszik szerepet a.z A/E~lézió kialakulásában és a FAS-pozitiv fenotipus .megjelenésében. & mutáns maradék patogenítása azonban azt mutatja, hogy az eaeA-gén mellett más virulene.tagénak is érintve vannak.«Α *** · i years ago, at that time, it was thought / that the eaeA gene alone plays a role in the development of a.z A / E ~ lesion and the appearance of the FAS-positive phenotype. however, the pathogenization of the " mutant residue shows that other virulene.tags are involved in addition to the eaeA gene.
Ezenfelül az eaeA-gén jelen van a mem-entercpatog-én coli törzsekben is [Cantey és Moseley, Infec. lmun., 59, 3924 (1991); Leory és mtsal, J, Med. Mícrobio.1., 40, 90 ( i 9 9 3 ; ] .In addition, the eaeA gene is also present on mem-entercathogens in coli strains [Cantey and Moseley, Infec. Immun., 59, 3924 (1991); Leory et al., J. Med. Microbio. 1, 40, 90 (9 9 3;].
Az intixaint ködoró eaeA-gén egy analógiát különböző nyúl ,F. coli törzsekben kimutatták [Ágin és Wölí, In: Proceedings of the First International Rushmo-re Conference on Me-chanísms in the Fathogenesis of Enteric Diseases”, Rapid City, S.D., 43. old. (1995); Leroy és mtsai, a. bed. bicrobiol., 40, 90 (19939; Pohl és latsai., Infect-. Immun., 61, 2203 (1993)].The eatiA gene that smokes intixaine is an analogy to various rabbits, F. coli strains [Ágin and Wölí, In: Proceedings of the First International Rushmo Conference on the Mechanism of the Fathogenesis of Enteric Diseases ”, Rapid City, S.D., 43. (1995); Leroy et al., A. bed. bicrobiol., 40, 90 (19939; Pohl et al., Infect. Immun., 61, 2203 (1993)).
hyugst-berópában végzett 'epidemiológiai vizsgálatok kimutatták, hogy a nyulak elválasztása során fellépő, hasmenésért felelős törzsek számos szérumcsoporthoz tartoznak, amelyek közül a leggyakrabban előforduló szérumcsoport a 0103 {Blanco és mtsai. Vet. Microibiol., 38, 193 (1994)?epidemiological studies in hyugst-bopa revealed that strains responsible for diarrhea during weaning of rabbits belong to a number of serum groups, the most common of which is 0103 {Blanco et al. Vet. Microibiol., 38, 193 (1994)?
CanguiIhem és Milon, J. Clin. Microbiol.-, 27, 743 (1989) ].CanguiIhem and Milon, J. Clin. Microbiol., 27, 743 (1989)].
Az 0103 törzsek (amelyek ezenfelül rendelkeznek azzal a megkülönböztető tulajdonsággal, hogy nem fermentálják a ramnözt) az emésztési úton való kísérleti inokuláciöt követően nagyon pató-gének nyarakban és olyan összekapcsolódási-kitörlési iéziót okoznak [lioois és mtsal, Infect. Immun., 59, 3796 (1991); Fohl és latsai, Infect. Immun.,- 61, 2203 «« ««« (1993); Bobins-Broune ss mtsal, Infect. Immun,, 62, 3329 (1994); Robins-Browne ss mtsal# Infect. Immun,, 62, 1584 (1994)], amelyek kinézetre hasonlók az emberi eredetű EPEC törzsek által okozottakhoz< A lézió létrehozásának ez a kritériuma, amely azzal a ténnyel együtt# hogy ezen törzsek kromoszomalis DNS-e hibrid!zálódik a humán EPEC referencia törzs eaeA~génjére specifikus próbákkal [Leroy és mtsal, u. Med. Microbiol., 40, 90 (1993); Pohl és mtsaí, Infect. Immun.# 61, 2203 (1993)]# mint az RDSC-1 törzs esetében# talán megengedi azt a· feltételezést# hogy ezek a törzsek emlékeztetnek az EPEC (vagy RSBEC) törzsekre. Az 0103 törzsekben azonban az eaeá-génsn kívül az LEE-iokuss egyetlen más génjével való homo légi a sem mutatható ki.The 0103 strains (which, moreover, have the distinctive property of not fermenting rhamnose), are highly pathogens in the summer following experimental inoculation by digestion and cause an attachment-deletion lesion [lioois et al., Infect. Immun., 59, 3796 (1991); Fohl and Latsai, Infect. Immun., - 61, 2203 «« «« «(1993); Bobins-Broune ss mtsal, Infect. Immun., 62, 3329 (1994); Robins-Browne ss mtsal # Infect. Immun., 62, 1584 (1994)], which are similar in appearance to those produced by human EPEC strains. This is the criterion for the generation of the lesion which, together with the fact that the chromosomal DNA of these strains hybridizes to the human EPEC reference strain. probes specific for the eaeA ~ gene [Leroy et al., u. Med. Microbiol., 40, 90 (1993); Pohl et al., Infect. Immun. # 61, 2203 (1993)] # as in RDSC-1 strain # may allow the assumption # that these strains resemble EPEC (or RSBEC) strains. However, in strain 0103, no homo aerial with any other gene of the LEE locus is detected besides the eaea gene.
Az E. coli 0103 törzsek specifikus adhezíut állítanak elő, amelyet AE/R2-nek neveznek, amely képessé teszi a baktériumokat arra, hogy ho2zátapadjanak a nyűi enterocitákhoz és a fíe.La és Hep·-2 sejtvonala.k sejtjeihez [Miion és mtssi., Infect. Immun. 58, 2690 (1990)).E. coli 0103 strains produce a specific adhesive, termed AE / R2, which enables bacteria to adhere to rabbit enterocytes and cells of the phaLa and Hep2-2 cell line [Miion et al. , Infect. Immun. 58: 2690 (1990)).
Kimutatták# hogy ez az adhezin hozzájárult a 0103 törzsek patogenitásához. fiatal nyulakban. Ezt ügy mutatták ki, hogy összehasonlították az 0103 .szérumcsoport reprezentatív törzsének (amelyet B10 törzsnek hívtak) patogenitását ennek a törzsnek egy mutánsával, amely elvesztette adhéziós tulajdonságát annak következtében# hogy az AB/R2 adhezínt kódoló operádba Tn5::phoA transzpozont inzertáltak [Piliien és mtsal, Vet, Microfoiol.. # 50, 105 (1996)]. Javasolták, hogy ezeket a mutánsokat használják, vakcinaként [Chalareng és mtsal, Communicatíon. aux. γτ·1^© journées de l.a. recherche cnnicole (VI. nyílt nyűi-kutatási találkozó közleményeij ? La Rochelle, december 6 és 7, 1994, INRA-ITAVI-ASCF Publ.}.This adhesin has been shown to contribute to the pathogenicity of strain 0103. in young rabbits. This case was demonstrated by comparing the pathogenicity of a representative strain of serum group 0103 (called strain B10) with a mutant of this strain that lost its adhesion property due to the insertion of the transposon Tn5 :: phoA into the AB / R2 adhesin coding operative. Mtsal, Vet, Microfoiol. # 50, 105 (1996)]. It has been suggested that these mutants be used as vaccines [Chalareng et al., Communicat. aux. γτ · 1 ^ © journées de la recherche cnnicole (Proceedings of the 6th Open Rabbit Research Meeting? La Rochelle, December 6 and 7, 1994, INRA-ITAVI-ASCF Publ.}.
Annak érdekében, hogy tisztázzuk a hasonlóság mérté-In order to clarify the extent of similarity-
áll az EP.EC törzsek LEEProc. háti, Acad, Sci., 92,consists of EP.EC strains LEEProc. dorsal, Acad, Sci., 92,
Valójában azt találtuk, hogy a BIO törzs negatívan reagált a FÁS tesztre, miközben a RDEC-1 REPEC törzs, valamint a humán EPEC törzsek pozitív reakciót adtak azonos kísérleti feltételek mellett,In fact, we found that the BIO strain reacted negatively to the FÁS test, while the RDEC-1 REPEC strain and the human EPEC strain gave a positive reaction under the same experimental conditions,
Másrészt azonban meglepd módon azt találtuk, hogy a BIO törzs újabb citopatikus hatást (CPE) hozott létre a BeLa sejtvonal epitelíáiís sejtjein, amely a cito-szkeleton és a fokális adhéziós plakkok reorganizációjában (átrendeződésében) nyilvánult meg. Akárcsak a FÁS típusú válasz esetében, ez a CPE Is összefüggésben volt a celluláris akt in intenzív polímerizációjávai. Ellentétben azonban .azzal, amit a PÁS típusú válasz esetében megfigyelünk, a polimerizált aktín nem válik lokalizálttá a bakteriális érintkezési pontokon, .hanem kábelek formájában rendeződik, amelyek áthúzódnak a sejt egyik végétől a másikig, A citoszkeleton ilyen módosulásai határozottan és megfordíthat atlanui nőnek az idő múlásával.On the other hand, however, it was surprisingly found that the BIO strain produced a new cytopathic effect (CPE) on epithelial cells of the BeLa cell line, which was manifested in the reorganization of the cytoskeleton and focal adhesion plaques. As with the FÁS type response, this CPE Is also correlated with the intense polymerization of cellular actin. However, in contrast to what is observed with the PÁS type response, the polymerized actin does not become localized at the bacterial contact points, but rather in the form of cables that extend from one end of the cell to the other. Such modifications of the cytoskeleton strongly and inversely increase the time. over.
Ezen felül az aktin kábelek kialakulását a vinkulin mennyiségének fokozatos növekedése kíséri, amely jelenséget «» * φφ a FÁS típusú válasz esetében nem lehet megfigyelni [Finlay és latsai.-, Infect, Immun., SO, 2541 (19-92)] . A kontroli sejtekben a vínkulin pontszerű tömegek formájában van jelen, amelyek a sejtek kontúrján jelennek meg, míg a BIO hatásának kitett sejtek esetében a vínkulin az egész sejtfe'lszln mentén oszlik el, a pontszerű eloszlásbői majdnem szálas eloszlássá alakulva, ami emlékeztet az aktin kábelekre. A cítoszkelaton ilyen módosulása. együtt jár a sejtosztódás .leállásával és a sejtméret bizonyos fokú növekedésével. Miközben a. citosztázis hosszú ideig tart, a sejtek halálához vezet egy 5-6 napos periódus végén.In addition, the formation of actin cables is accompanied by a gradual increase in vinculin levels, a phenomenon which is not observed in the FÁS type response (Finlay et al., Infect, Immun., SO, 2541 (19-92)). In control cells, vinculin is present in the form of point masses which appear on the contours of the cells, whereas in cells exposed to BIO, vinculin is distributed throughout the cell surface, converting from a point distribution to an almost fibrous distribution reminiscent of actin cables. Such a change in the cytoskeleton. it is accompanied by a cessation of cell division and a certain increase in cell size. While the. cytostasis lasts for a long time, leading to cell death at the end of a 5-6 day period.
Más törzsek vizsgálatakor azt találtuk, hogy ez a CBE kifejeződött (expresszálödott) minden ramnoz-negativ 0103 törzsnél éppúgy, mint a RDEC-1 törzsnél. Ugyanúgy megfigyeltük ezt kőt humán eredetű klinikai EPEC ízoiátumban. Ezzel, ellentétben a humán eredetű referencia törzs, vagyis S2348/69, azonos körülmények között vizsgálva- nem mutatott semmilyen detektálható CPE-t.Examination of other strains showed that this CBE was expressed (expressed) in all rhamnose-negative 0103 strains as well as in RDEC-1. Similarly, this stone was observed in the human clinical EPEC flavor. In contrast, the human reference strain, S2348 / 69, did not show any detectable CPE under the same conditions.
Az erre a CPE-re jellemző cit-o-szkeleton változás emlékeztet arra, amelyet a CNF és CNE2 B. coli toxinok váltanak ki föswaid és mtsai., Proc. Natl. Acad. Sói. USA, 91, 3811 (1994)1 . Nem találtunk azonban a Slö-ben semmi olyan gént, amely homológ lett volna az coli CNFÍ-gyel ésThe change in cyt-o-skeleton characteristic of this CPE is reminiscent of that induced by B. coli toxins CNF and CNE2 in Föswaid et al., Proc. Natl. Acad. Salts. USA, 91, 3811 (1994) 1. However, we did not find any genes in Slo that were homologous to coli CNF1 and
CNF2-vei> Ezenfelül, miközben a CN'F-ek aktivitása detektálható a CNF-efc termelő törzsek kultúráinak lizátumaifoan, a BIO kultúrák üzátumaiban nem lehetett semmilyen aktivitást detektálni. Az azonban lehetséges, hogy a CPE-hez vezető mechanizmus, amelyet a BIO indukál, hasonló a CNF toxincké»χ 4 ♦*#* ♦' ♦ ♦ « »*« Λ ♦ > * hoz, amely utóbbi hatásmechanizmus összefügg a Rho aktiválásával, amely a citoszkeleton és a fokális adhézió centrumai szabályozásában résztvevő kis G-pro-fcein {Elínn és Hídley, J. Cell. Sci., 1.Ö9, 113 3 (1996) j .CNF2> In addition, while the activity of CN'Fs could be detected in lysates of cultures of CNF-efc producing strains, no activity could be detected in the messages of BIO cultures. However, it is possible that the mechanism leading to CPE induced by BIO is similar to that of CNF toxin, the latter mechanism of action associated with Rho activation, which is a small G-propcene involved in the regulation of the cytoskeleton and focal adhesion centers {Elínn and Bridley, J. Cell. Sci., 1.9, 113, 3 (1996).
Párhuzamosan számos 0103 törzs (köztük a prototípus 810 törzs) kromoszomális DbS~ét híbridizáltuk a törzs 35 kbIn parallel, the chromosomal DbS of several 0103 strains (including prototype 810) were hybridized to 35 kb
LES vi.ru.lenc.ia egységéből származó négy próbával, és összehasonlítottuk a 0103 törzsek és az £2348/69 törzs által a kultúra-közegbe ürített (kiválasztott) proteineket oly módon, hogy analizáltuk megfelelő eiektroforetikus profiljaikat valamint kereszt immnn-precípítácíóvai. A 0103 törzsekben demonstráltuk egy iőkusz jelenlétét, amely homológ az 83348/69 LSE virulencia-egységgei, bár mutat némi szerkezeti különbségeket is az utóbbival összevetve (amely különbségeket a DNS restrikciós helyek polimorfiájával mutattunk ki, valamint a kiválasztott proteinek eiektroforetikus migrációjának kisebb különbségeivel). Szt a iőkusz az EPECtörzsekben, amely analóg az LEE-vei, a következőkben ugyancsak ”LEB~lókusznak” fogjuk nevezni.Four samples from the LES vi.ru.lenc.ia unit were compared and the proteins secreted (selected) by strain 0103 and strain 2348/69 were analyzed by their respective electrophoretic profiles as well as by cross-immuno-precision. Strain 0103 demonstrated the presence of a locus homologous to the LSE virulence unit of 83348/69, although it exhibits some structural differences compared to the latter (which were detected by polymorphism of DNA restriction sites and less by electrophoretic migration of selected proteins). That is, the genus in the EPEC strains, which is analogous to LEE, will be hereinafter referred to as the "LEB ~ locus".
Azt is megfigyeltük, hogy ez a CDS korrelált a 0103 törzsek in vivő patogenitásával.It was also observed that this CDS correlated with the in vivo pathogenicity of the 0103 strains.
Az E. coli O103~mal kezdve olyan törzseket konstruáltunk, amelyek ennek az LEE-lökusznak a mutációit hordozták és megfigyeltük, hogy egy törzs, amely ennek az LEElókusznafc az egyik génje inakfcíváiödott, már nem váltja ki a CPE-t és elveszti patogenitását, bár megtartja az AF/R2 adhezint és képes marad a bél kolonizálására. ügy tűnik tehát, hogy az 0103 törzsek LEE-lökusza olyan genetikus deχ* ♦ * ♦ *Starting with E. coli O103, strains carrying mutations of this LEE locus were constructed and it was observed that a strain that is inactivated by one of its LEE locus genes no longer induces CPE and loses its pathogenicity, retains the AF / R2 adhesin and is able to colonize the gut. so the LEE locus of strain 0103 seems to be a genetic deχ * ♦ * ♦ *
Φ XΦ X
♦.» ♦·»·*' Φ terminánsokat hordoz, amelyek felelősek a CPE-ért és a patogenitásért.Contains terminology responsible for CPE and pathogenicity.
Végül megvizsgáltak ezen LES-lókosz mutánsok immunogén tulajdonságait és azt. találtuk# hogy ezek a mutánsok nagyon hatékony védelmet ruháztak át a patogén szülő-törzzsel szemben.Finally, the immunogenic properties of these LES-locus mutants and its properties have been investigated. We found that these mutants confer a very effective protection against the pathogenic parent strain.
Jelen találmány tárgya eljárás E, coli uem-patogén mutánsának előállítására E. coli olyan patogén mutánsából, amely képes citopatogén hatást kiváltani Héra epiteliáiis sejtekben# amely hatás részint abban nyilvánul meg# hogy polimerizált aktinból kábelek képződnek, amelyek az említett sejteken egyik végüktől a másikig áthúzódnak, részint abban, hogy nő a vínknlin mennyisége, azzal jellemezve, hogy a patogén E. coli törzs mutageni zá.l t és .hogy a citophatikus hatást kiváltani már nem képes mutánsok kerülnek kiválasztásra.The present invention relates to a method for producing a mutant of E. coli, a pathogen of E. coli, from a pathogen mutant of E. coli which is capable of inducing cytopathogenic effects in epithelial cells of Hera, which results in the formation of polymerized actin cables extending from one end to another. , in part due to the increase in vincinline, characterized in that the pathogenic strain of E. coli is mutagenic and that mutants that are no longer capable of inducing cytopathic effects are selected.
A 310 törzset, amelyet 1997. január 15,-én 1-1807' szám alatt letétbe helyeztünk a Coiiectíon Nafcionale de Cultures de Microorganísmes-néi ÍCKMC) [Mikroorganizmus kultúrák francia nemzeti gyűjteménye], 28, Rue du Docteur Roux, 75724 PARIS CSDEX 15, csak példaként említjük azokra a patogén E. coli törzsekre, .amelyek képesek kiváltani a fent említett cítopatikus hatást, és amelyeket éppen ezért kiindulási anyagként alkalmazni lehet a találmány szerinti e I j á r ás as g va .1 ó s i t á s áná 1.The 310 strains, deposited on January 15, 1997, under the number 1-1807 'of the French National Collection of Microorganism Cultures, 28, Rue du Docteur Roux, 75724 PARIS CSDEX 15 , by way of example only, those pathogenic strains of E. coli which are capable of inducing the aforementioned cytopathic activity and which can therefore be used as starting materials for the preparation of the present invention. .
A találmány ugyancsak magába foglalja az Et coli olyan nem-patogén mutáns törzseit, amelyek az említett eljárás segítségével kaphatók. Ezek a törzsek legalább egy fi * * ·< Φ»Χ mutációt hordoznak, amelyek as LEE-lókusz legalább egy génjének inaktiválását eredményezik.The invention also encompasses non-pathogenic mutant strains of Et coli obtainable by said method. These strains carry at least one fi * * · <Φ »Χ mutation that results in inactivation of at least one gene of the s LEE locus.
A találmány szerinti megoldás egy előnyös megvalósítási módja szerint a mutáns törzset egy olyan .3. coli törzsből nyerjük, amely patogén a nyálakra nézve és amely ..az 0103 szérumcsoporthez tartozik.In a preferred embodiment of the present invention, the mutant strain is a .3. coli strain which is pathogenic to saliva and belongs to serum group 0103.
A találmány szerinti megoldás egy másik előnyös megvalósítása szerint a mutáns törzs legalább egy olyan mutációt hordoz, .amely az LHE-lókusz legalább egy sep-génjének az inaktiválását eredményezi.In another preferred embodiment of the present invention, the mutant strain carries at least one mutation that results in inactivation of at least one sep gene of the LHE locus.
A találmány szerinti mutáns törzs előnyösen legalább egy olyan mutációt hordoz, amely az LEE-lókusz esph vagy espB-génjelből legalább egynek az inaktiválását eredményezi .Preferably, the mutant strain of the invention carries at least one mutation that results in inactivation of at least one of the LEE locus esph or espB gene signal.
Egy találmány szerinti törzset, amelyet BlÖ/C&l-gyel jelöltünk, 1997 január 15.-én 1-1808 szám alatt letétbe helyeztünk a Coliection. Natiouale de Cultures de Mícroorganismes-nél (CKMC) /Mikroorganizmus kultúrák francia nemzeti gyűjteménye], 28., Rue du Docteur B.cux, 75724A strain according to the invention, designated B1 / C & l, was deposited on January 15, 1997, under number 1-1808 with Coliection. Natiouale de Cultures de Microorganismes (CKMC) / French National Collection of Microorganism Cultures], 28, Rue du Docteur B.cux, 75724
PARIS CEDSX 15.PARIS CEDSX 15.
Jelen találmány tárgyát képezik vakcinák, különösen olyan vakcinák, amelyeket orális úton lehet beadni, amelyek az coli legalább egy, a találmány szerinti mutáns törzsét tartalmazzák.The present invention relates to vaccines, in particular vaccines which can be administered orally, containing at least one strain of the mutant of the invention.
Az említett mutáns törzs előnyösen rendelkezik egy funkcionális AF/R2 adhezinnel és emiatt megtartja azt a képességét, hogy kolonizálja a belet.Preferably, said mutant strain has a functional AF / R2 adhesin and therefore retains its ability to colonize the intestine.
Például a találmány -szerinti vakcinák, amelyek tartalmazzák a B10/CA1 törzset, szájon át beadhatók és megvédik a fiatal elválasztott nyálakat a 0103 szérumcsoporthoz tartozó patogén £b coli törzsekkel szembeni fertőzéstől.For example, vaccines of the invention containing the strain B10 / CA1 can be administered orally and protect young weaned saliva from infection with pathogen E. coli strains belonging to serum group 0103.
A találmányt a leírás hátralevő, most következő része segítségével jobban, meg lehet érteni, amely nem kizárólagos példákat mutat be mutáns törzsek előállítására a. találmány szerint# valamint ezen törzsek vakcinaként való alkalmazását £. coli 0183 törzsek által létrehozott ci topa ti kus hatás demonstráláss Béla sejk sítúrákonThe present invention will be better understood by reference to the following description, which provides non-exclusive examples of mutant strains. and the use of these strains as vaccines. demonstration of the ci topa ti effect created by coli 0183 strains on Béla sheikh ski tours
Az ebben a kisérlatsorozatban alkalmazott bakteriális törzsek a következők:·The bacterial strains used in this series of experiments are as follows: ·
- a nyűi számára enteropatogén BIO és RDSC-1 coli referencia törzsek;enteropathogenic BIO and RDSC-1 coli reference strains for rabbits;
- a ΒΙδ./1'βΕΙ törzs, amely BIO egy mutánsa, amelyet TnphoA mutagenezissel nyertünk és amely már nem termeli az AF/R2 adhezint [Pillien és mtsai, Vet. Microlbiol., 50, (1996) 1 ;strain ΒΙδ. / 1'βΕΙ, a mutant of BIO obtained by TnphoA mutagenesis, which no longer produces the AF / R2 adhesin [Pillien et al., Vet. Microlbiol. 50 (1996) 1;
- 13 &. coli törzs, .amelyeket különféle nyúl hasmenéses esetekből izoláltak, és amelyeket előzőleg megvizsgáltunk kísérleti patogenitás szempontjából és abból a szempontból, hogy rendelkeznek-e bizonyos virulenciajellemzőkkel, mint AF/R2 és eaeA (Canguilhem és Miion, J. Clin. Microlb.iol., 27, 743 (1939); Leroy és mtsai, dl Med. Microbioi., 40, 90 ('1.993)1;- 13 &. coli strain isolated from various cases of rabbit diarrhea and previously examined for experimental pathogenicity and for certain virulence characteristics such as AF / R2 and eaeA (Canguilhem and Miion, J. Clin. Microlb.iol., 27, 743 (1939); Leroy et al., Med. Microbiol. 40, 90 (1993) 1;
és kontrolként FÁS. pozitív humán törzseket:and FÁS as a control. positive human strains:
- az E234S/6.9 humán EPBC referencia törzset;- human strain E234S / 6.9 EPBC;
- két humán EPEC törzset, amelyeket CFU201-gyel és CF517~tel jelöltünk (amelyeket Christíane Foresfier szívességéből kaptunk meg. Clermont-Férrend Gyógyszerészeti Tanszék) ; ezeket a törzseket gyermek hasmenéses estekből nyerték; ezek híbridizálnsk az eaeA specifikus és a &fp~ specifikus próbákkal és pozitívan reagálnak a FÁS tesztre.two human EPEC strains labeled with CFU201 and CF517 (courtesy of Christian Foresfier, Department of Pharmacy, Clermont-Male); these strains were obtained from childhood diarrhea; they hybridize with eaeA specific and & fp ~ specific probes and respond positively to the FÁS test.
- Interakciós teszt Haha sejteken- Interaction test on Haha cells
Sgy nappal az interakciós teszt előtt a HeLa sejteket •felosztott mikoszköplemezeken{ Lab-Tek, Míles Scientificj csíráztatjuk, vagy sejtkultúra titráló lemezeken (NUNCj a következő koncentrációban: 4„lcH sejt/ml Eagle minimális esszenciális közegben,· amely tartalmaz Earle sókat (BMEM, G1BC0; és tartalmaz 10% borjú embrió szérumot {FCS, GIBCOj és 50 pg gentamícint ml-nként (GIBCO). Ugyancsak a teszt előtti napon a baktériumokat „PEKASSAY broth-ban {DIFCO}. 24 óra inkubálás után 37 °C-on 5¾ CGy jelenlétében a sejteket Earle sós pufferrel mostuk (EBSS, G1BC0), majd összekevertük a baktériumokkal ugyanabban az BMEK tartalmú 25 mMos HEFE3 pufferben (GISCOI, amely tartalmazott 1% D~mannózt •(SIGMA) és 5t FCS-t (borjúembrió szérum) . 4 órás inkubáció után 37 °0~οη, 5% COg jelenlétében a sejteket bőségesenThus, the day before the interaction assay, HeLa cells are • germinated on split microplates {Lab-Tek, Miles Scientificj, or cell culture titration plates (NUNCj at 4 µg / ml in Eagle's Minimum Essential Medium · containing Earle salts (BMEM, G1BC0; and contains 10% fetal calf serum {FCS, GIBCO3 and 50 pg gentamicin per ml (GIBCO). On the day before the test, bacteria were cultured in "PEKASSAY broth {DIFCO}. After 24 hours incubation at 37 ° C, 5¾ In the presence of CGy, cells were washed with Earle saline buffer (EBSS, G1BC0) and mixed with bacteria in the same BMEK containing 25 mM HEFE3 buffer (GISCOI containing 1% D-mannose (SIGMA) and 5t FCS (calf embryo serum)). After incubation for 4 hours at 37 ° 0 ~ οη in the presence of 5% COg,
♦κ* °C-on) 5% CGy jelenlétében a sejteket EBS'S-sel mostuk, majd 1% formollal PBS-ben. fixáltuk 30 percig, szobahőmérsékleten .♦ at κ * ° C) in the presence of 5% CGy, cells were washed with EBS'S and then with 1% formol in PBS. fixed for 30 minutes at room temperature.
Ezekután a különböző inkubációs idők után megbizonyosodtunk a történt morfológiai változásokról és kvantitatív módon meghatároztuk a sejtnövekedést.After these different incubation times, we confirmed the morphological changes and quantified cell growth.
*Váltósások a cítoazke1ebonban* Shifters at cítoazke1ebon
F aktint rhodam inhoz kapcsolt phalloi-dinnel. tettük .láthatóvá (MOLEChLAR PBÖBESj a gyártó által ajánlott körülmények között. Vínvulirt közvetett immun £ Inoreszcencia segítségévei mutattunk ki egér anti-vinvulín monokionáiis antitestet használva (V2N-11-5 klón, Sigma), 1/100 hígítás mellett, valamint £Xuoreszceinnel kapcsolt, kecske antiegér antitest felhasználásával (0819 számú, IMMÜNOTECH). A mikroszkóplemezeket ISICA DMR fluoreszcencia-mikroszkóppal vizsgáltuk (40x-es ohjektÍvvel).F actin with phalloidin linked to rhodamine. was made visible (MOLEChLAR PBBCsj under the conditions recommended by the manufacturer). Vinvirulent was detected by indirect immune £ Inesorescence using murine anti-vinvulin monoclonal antibody (V2N-11-5 clone, Sigma) at 1/100 dilution with using goat anti-mouse antibody (IMMUNOTECH 0819) The microplates were examined with an ISICA DMR fluorescence microscope (40x guideline).
Az eredményeket az 1. és 2. ábrák mutatják.The results are shown in Figures 1 and 2.
Az 1, ábra a HeLa sejtek citoszkeletonjában bekövetkezett morfológiai változást mutatja a FÁS tesztben miután azokat kitettük a BIG-es E. coli törzs hatásának (A és 3), valamint az £2348/69 hatásának. (C és D), amelyet 4 óra inkubálás követett.Figure 1 shows the morphological change in the cytoskeleton of HeLa cells in the FÁS assay after exposure to E. coli strain B (A and 3) and £ 2348/69. (C and D) followed by 4 hours incubation.
Az F aktín festését phalloídin/rhodamin alkalmazásával értük el, Minden egyes törzsre ugyanazt a mikroszkopikus területet mutatjuk íáziskontrasztban (A és C), valamint fluoresscenciás körülmények között (B és D) 4Öx objektívve 1, A vonal nagysága 20 pm«.Staining for actin F was achieved using phalloidin / rhodamine. The same microscopic area was shown for each strain in fascial contrast (A and C) and under fluorescence conditions (B and D) at 4x × 1, line size 20 µm.
φ ΦΦ**φ ΦΦ **
ΦΦ * * y 4 Κ « φ « Φ * φ Φ * Φ Φ *«ΦΦ * * y 4 Κ «φ« Φ * φ Φ * Φ Φ * «
Α 2, ábra a cítoszkeleton változásait mutatja be és a fokális adhéziós plakkokat, amelyek a HeLa sejtekben jöttek létre a BIO E, coli törzs hatásának való kitétel után,· 24 órával (8 és E) valamint 48 órával (C és F) a kölcsönhatás után, vagy a mutáns- 810/CA.l törzs (amelynek előállítását az alábbiakban/ a 2. példában Írjuk le; hatásának való kitétel után, 24 órával a kölcsönhatás után (A és D).Α Figure 2 shows changes in the cytoskeleton and focal adhesion plaques produced in HeLa cells after exposure to BIO strain E, coli · 24 hours (8 and E) and 48 hours (C and F) for interaction or the mutant strain 810 / CA.l (the preparation of which is described below / in Example 2; 24 hours after the interaction (A and D)).
Baloldalt (A, S és C) : as F-aktin festése pha1lo i dinnel/rhodaminna1 Jobboldalt (D, E és F|. : a vínvulin festése indirekt immunf luoreszcenoí a módszerrel anti~vin.vul.in antitestek felhasználásával,Left (A, S, and C): staining of as-F actin with pha11loin din / rhodaminna1 Right (D, E, and F: staining of vulin vinyl by indirect immunofluorescence using anti-vin.vul.in antibodies,
A vonal nagysága 20 μη.The line size is 20 μη.
*A sej tnövekadés kvant1tat ίv me gmérése* Quantification of cell growth rate quantitatively
Metilénkékkel specifikus módon lehet megfesteni sejtfehérjéket, és ez lehetővé teszi egyrészt, hogy megvizsgáljuk a sejtek morfológiáját, másrészt, hogy megmérjük a sejtpázsifcok teljes proteintarfcaimát. A sejtfehérjéket 1% metilénkékkel festjük meg 0,0 M borát pufferben a tilson által leirt módszer szerint [Animál cell cuiture: A practical approach# R.I. Frishney (szerk.} IRL Press Oxford, (199.2) ]. A sejttenyészetek maradék proteinjét kvantitatív módon megállapítjuk a kölcsönhatás napján, és 72 órával később olyan módon, hogy a festéket 8,1 14 HCi-val extránáljuk, majd automatikus ELISA iemezleolvason (model M 5800/7000, Dynatech) megmérjük az optikai sűrűséget 630 nm15Methylene blue is a specific method for staining cellular proteins, which allows us to examine the morphology of the cells on the one hand and to measure the total protein spectrum of the cell lawns, on the other. Cellular proteins were stained with 1% methylene blue in 0.0 M borate buffer according to the method described by tilson [Animated cell cuiture: A practical approach # R.I. Frishney (Eds.) IRL Press Oxford (199.2)] The residual protein of cell cultures was quantitated on the day of interaction and 72 hours later by extraction of the dye with 8.14 HCl and automatic ELISA plate reader (model M 5800/7000, Dynatech) measure optical density at 630 nm15
«.♦* *< «·***«. ♦ * * <« · ***
Az eredményeket a 3. és 4. ábrák mutatják.The results are shown in Figures 3 and 4.
A. 3.. ábra a HeLa sejtek morfológiáját illusztrálja négy nappal a kölcsönhatás után, mind a BIO törzs esetébenA. Figure 3 illustrates the morphology of HeLa cells four days after the interaction for both the BIO strain
CB}· mind a B10/CA1 mutáns esetében CA) . A festés metilénkékkel történt. A vonal hossza 20 gm...CB} · CA for both B10 / CA1 mutant). The staining was done with methylene blue. The line length is 20 gm ...
A 4. ábra a bakteriális oltvány finoculumj dózisának hatását mutatja a He la sejtek növekedésére a BIO (0), Blö/CAl <0} és a ΒΙΟΖΙβΕΙ <» £„ coli törzsekkel való kölcsönhatást követően.Figure 4 shows the effect of bacterial inoculum finoculum dose on growth of He la cells after interaction with BIO (0), Blo / CAl <0} and ΒΙΟΖΙβΕΙ »£„ coli.
Az abszcisszán van megadva, az infekció multiplicitása (sokszorosódása) a CKJ-k száma sejtenként a kölcsönhatási teszt kezdetén;In the abscissa, the multiplicity of infection is the number of CKJs per cell at the start of the interaction test;
az ordinátán van megadva a sejtnövekedés koefficiense - OD (optikai sűrűség) 72 órával a kölcsönhatás után/OD a kölcsönhatás napján.cell ordinate coefficient of cell growth - OD (Optical Density) 72 hours after interaction / OD on day of interaction.
Minden pont négy minta átlaga. A sejtnövekedési koefficiens standard deviációja minden esetben kisebb, mintEach point is the average of four samples. The standard deviation of the cell growth coefficient is in all cases less than
0.2.0.2.
KovetkeztetésConclusion
Amint azt az 1. ábra mutatja, a Blö törzs nem. vált ki semmilyen FÁS típusú választ, vagyis nem vezet a polimerizált aktín semmilyen szignifikáns sűrűsödéséhez a baktériumok és a sejtek érintkezési pontjánál, és ez a RAS típusú válasz-hiány annak ellenére jelentkezik, hogy erős adhézlő lép fel és ellentétében az B234S/69 törzzsel kapott eredményekkel, amely erősen pozitív FÁS választ vált ki azonos körülmények között.As shown in Figure 1, the Blö strain does not. does not induce any FÁS type response, ie it does not lead to any significant thickening of the polymerized actin at the point of contact between bacteria and cells, and this RAS-type response occurs despite strong adhesion and in contrast to the results obtained with strain B234S / 69. , which elicits a strongly positive FÁS response under the same conditions.
ψ -* « Φ ♦ < ·ψ - * «Φ ♦ <·
Po2it.lv FAS-tipusu választ figyeltünk ®eg a RDEC-l törzs esetében is a nagyon csekély adhézió ellenére, valamint a humán CF11201 és CF517 törzsek esetében.A Po2it.lv FAS-type response was observed even in the case of RDEC-1 strain, despite very low adhesion, and in human CF11201 and CF517 strains.
A. aás vizsgáit £. coli törzsek között a raianőznegativ 0103 fenotipusből négy törzs nem vált ki FÁS típusú választ.A. aas exams £. Among the coli strains, four strains of the raianznegegative 0103 phenotype did not elicit a FÁS type response.
Mégis., a BIO törzs hatásának kitett sejtek igen. mély változást mutatnak a citoszkeletonban, amelyet a kölcsönhatás befejezése után lehet detektálni (1. ábra), és amelynek nagysága nő az idővel (2B, 2C, 2S és 2F ábrák) .. Ezek a változások, amelyeket itt a CPE névvel jelölünk, a polimerizált aktin nagyszámú kábeljának kialakulásában jutnak kifejezésre, amelyek kötegekbe rendeződve áthúzódnak a sejten, és gyakran párhuzamosak egymással (2B és 2C ábra). Az aktin kőtegek megerősödésével párhuzamosan, fokozatos növekedés figyelhető meg a vi.nvu.tin formációkban, amelyek a fókái is adhéziós plakkokkal állnak kapcsolatban. Szék a formációk, amelyek általában pontszernek és azon sejtek peremén helyezkednek el, amelyeket előzőleg kitettünk £2348/09 törzs 'hatásának, a BIO törzs hatásának kitett sejtekben az inkubálás után. 48 - 72 órával általános és pszeudofibriilárís eloszlást vesznek fel. (2E és 2F ábrák).Still, cells exposed to the BIO strain do. show a profound change in the cytoskeleton that can be detected upon completion of the interaction (Figure 1) and increase in size over time (Figures 2B, 2C, 2S and 2F). These changes, designated herein as CPE, are they are expressed in the formation of a large number of actin cables, which are arranged in bundles across the cell and are often parallel (Figures 2B and 2C). Along with the strengthening of actin stone bundles, a gradual increase is observed in the vi.nvu.tin formations, whose foci are also associated with adhesion plaques. The chair is the formations that are usually located on the perimeter and on the periphery of cells previously exposed to the strain <RTI ID = 0.0> 2348/09, </RTI> after incubation with the BIO strain. From 48 to 72 hours, a general and pseudofibrillar distribution is observed. (Figures 2E and 2F).
A BIO törzs hatásának kitett sejtek mérete érzékelhetően nő az idővel, vagyis körülbelül 2.5 szeresére 4 nap inkubáció után, összhangban a sejtmag átmérőjével (3. ábra) ; ezzel párhuzamosan a sejtnövekedés blokkolt, amint azt a reziduális (visszamaradó) sejttenyészetekben végzett tel-The size of the cells exposed to the BIO strain is appreciably increased with time, i.e., about 2.5-fold after 4 days of incubation, consistent with the diameter of the nucleus (Figure 3); in parallel, cell growth was blocked, as was the case with residual (residual) cell cultures.
♦ * X*♦ * X *
Jf ♦ X es protein-m-eghatározás mutatja (4. ábra). A sejtek, csak az inkubáció ö.Jf ♦ is determined by protein m definition X (Figure 4). The cells, only the incubation.
Ezenfelül ként számolva i col ony- .forrni ngIn addition, calculated as i, i col ony- .forrni ng
50%-án mutatott napján kezdenek elpusztulni.50% of the day shown to begin to die.
megbecsültük, hogy a teszt kezdetén sejtena BIO egy 50-100 telepfcépző egységéből unit, CFü) álló oltvány a sejtek legalábbit was estimated that at the start of the test, the cell BIO is a graft of 50-100 colony forming units (CFU) at least
CPE-t.CPE.
ja, citopatogenifása kb, SO-szer alacsonyabb.ya, cytopathogenicity kb, SO fold lower.
A. vizsgált egyéb, nyúl hasmenésből származó törzsek között a Blö-zel azonos fenotipust <0103 szérumcsoport/ ramnóz fermentáció hiánya, eaeá pozitív} mutató tizenegy törzs a CPE-t definiáló minden morfológiai, változást létrehoz. Ezt a CPE-t kiváltja a másik hat vizsgált törzsből három kiváltja, éppúgy, mint a referencia R.DEC-1 törzs. A humán eredetű EPEC törzsek közül az E2348/69 törzs nem hozott létre semmilyen detektálható CPE-t, míg a két CF112Ö1 és CF51? törzs erősen pozitívak voltak CPE-re nézve,A. Among the other strains from rabbit diarrhea examined, eleven strains with the same phenotype as Blö <0103 serum / rhamnose fermentation, eaeaa positive}, produced all morphological changes defining CPE. This CPE is induced by three of the other six strains examined, as well as the reference R.DEC-1 strain. Of the human EPEC strains, E2348 / 69 did not produce any detectable CPE, whereas the two CF112O1 and CF51? strain were very positive for CPE,
A. CPE-t nem lehetett reprodukálni a BIO kölcsönhatási kultúra tízszeresen betöményitett felülűszöjának alkalmazásával, sem a baktérinmtestek lízátumalval (oldataival), amelyeket ugyanabból a kultúrából nyertünk és hasonlóképpen tízszeresen tömény!tettünkA. CPE could not be reproduced using the 10-fold concentrated supernatant of the BIO interaction culture, nor the lysate (solutions) of the bacterial bodies obtained from the same culture and similarly ten-fold concentrated.
2. pe.íi'.líJ2. pe.íi'.líJ
CFE-negativ mutánsok eiöállitása, soeiekciója és genetikai vicegúlátaProduction, selection and genetic vice versa of CFE-negative mutants
Annak -érdekében, hogy betekintést nyerjünk ennek a C?E~nek a molekuláris meghat ár o-zotts ágába és hogy megvizsgáljuk a lehetséges korrelációt a CFE és az ehteropatogemitás között nyulakban, a CFE kiváltásának képességét elvesztett, ki ónokat izoláltunk B1Ö mutánsok bankjából, amelyeket úgy nyertünk, hogy véletlenszerűen inzertáltuk a TnSISSOjy :pho.4 transzpozont (TnphoA) (Manoíl és Beckwith, Froc. Natl. Aead. Sex., §2., 8129 (1935)].In order to gain insight into the molecular target region of this C? E and to investigate the possible correlation between CFE and ectopic pathogenesis in rabbits, we have isolated tin from the bank of B1? Mutants that have lost their ability to induce CFE. it was obtained by randomly inserting the transposon TnSISSOjy: pho.4 (TnphoA) (Manoil and Beckwith, Froc. Natl. Aead. Sex., §2, 8129 (1935)).
TnphoA-t a p.R7733 öngyilkos plazmiddal való konjugáció révén juttatjuk be a BIO törzsbe, amely az SH1Q (kpi:r+) K. coli törzsben található (Taylor és mtsai·., J. Bacteriol., 171, 1.870 (1989)].TnphoA is introduced by conjugation with the suicide plasmid p.R7733 into the BIO strain of K. coli strain SH1Q (kpi: r +) (Taylor et al., J. Bacteriol., 171, 1.870 (1989)). .
A 'transzpozont befogadott kiónokat két lépésben szelektáltuk :The transposon 'received clones were selected in two steps:
1) A Luxia-Bertani agaron (LA közeg) levő konjugációskeverékeket először is feldúsítottuk a transzponált kiónokban oly módon, hogy átvittük őket egy kanamicint (20 pg/ml! tartalmazó M9 minimál tápoldatba, majd 48 éráig 37 °C-on inkubáltuk. A ssülő-törzsek nem növekednek ebben a közegben, mivel az SM1.0 auxotróf (thy thr les), a BIO pedig érzékeny a kanamicinre.1) The conjugation mixtures on Luxia-Bertani agar (LA medium) were first enriched in the transposed clones by transferring them to a M9 minimal medium containing kanamycin (20 pg / ml) and incubating for 48 hours at 37 ° C. strains do not grow in this medium because SM1.0 is auxotrophic (thy thr les) and BIO is sensitive to kanamycin.
2) Második lépésben a feldúsított kultúrákat kanm.ic.int (50 pg/ml) és 5-bromo-4-fcIoro-3-in.dol.il foszfátot (X?) (40 pg/ml) tartalmazó LA közegre szélesztettük (40 p.g~ mi) . A kékre szineződött klánokat ezután fenolvörös aaarra •ί replikáitukz amely 1¾ ramnózt tartalmazott és LA közegre, amely vagy kanamicint (100 ^ig/rai} vagy ampicíllint (100 μ g/mi) tartalmazott annak érdekében, hogy elim.inálja azokat a kiónokat, amelyekben az egész pRT733 plazmád koíntegráiódott a BIO ge&oaaal·2) In a second step, the enriched cultures were plated on LA medium containing kanm.ic.int (50 pg / ml) and 5-bromo-4-chloro-3-in.dol.yl phosphate (X?) (40 pg / ml). 40 pg ~ mi). Colored in blue clans then phenol red aaarra • ί replikáituk z containing 1¾ rhamnose and LA medium containing either kanamycin (100 .mu.g / rai} or ampicillin (100 μ g / ml) contained, in order to elim.inálja Clones in which your entire pRT733 plasmid is co-integrated with BIO ge & oaaal ·
Azokat a klánokat tartottuk meg további vizsgálat céljából, amelyek rendelkeztek a ramnőz negatív fenotípussal és a kanamícin rezisztenciával, valamint az ampicíilín érzékenységgel.Clans that had the rhamnose negative phenotype and kanamycin resistance as well as ampicillin sensitivity were retained for further study.
Az igy kiválasztott mutánsokat ezután egy éjszakán keresztül kanamícint (50 gg-mi) tartalmazó PENASSAY közegben tenyésztettük, majd utána glicerin hozzáadása után (végső koncentráció 20¾} -20 °C~ on tároltuk. Ezután .96 üreges sejt kultúr a lemezen. (FALCOK) meghatároztuk GPS. kiváltó képességüket HeLa sejteken a fent. leírt 1. példában megadott módszerek alkalmazásával.The mutants thus selected were then cultured overnight in PENASSAY medium containing kanamycin (50 µg / ml) and then added to glycerol (final concentration 20¾} -20 ° C.) .96 hollow cell culture on plate (FALCOK) their GPS-triggering ability on HeLa cells was determined using the methods described in Example 1 above.
A megvizsgált közel 2700 klón közül 7 független klón (vagyis azok a kiónok, amelyeket független konjugációs keverékekből különítettünk el} volt CPE-negativ és nem integrálta a teljes öngyilkos piazmidot.Of the nearly 2,700 clones examined, 7 were independent clones (i.e., clones isolated from independent conjugation mixtures) which were CPE negative and did not integrate the entire suicide plasmid.
A 2, ábra (A és Bl illusztrálja azt, hogy az egyik ilyen mutáns (B10/CA1} elvesztette a CPE-t. Az ábra azt mutatja, hogy az ennek a mutánsnak kitett sejtek nem mutatnak változást a oítoszkeletonban, ami a vad típusú B10 törzs által kiváltott CP'E jellemzője.Figure 2 (A and B1 illustrates that one of these mutants (B10 / CA1}) has lost CPE. The figure shows that cells exposed to this mutant show no change in the oocyte skeleton, which is wild type B10). strain-induced CP'E trait.
A 3A ábra azt is mutatja, hogy a B1Q/ÁC1 mutáns nem okoz semmi olyan morfológiai változást, amit a B10 törzs vált ki. A 4. ábra mutatja, hogy citopatogenitása majdnem nulla, inek a mutánsnak aFigure 3A also shows that the B1Q / ÁC1 mutant does not cause any morphological change induced by strain B10. Figure 4 shows that the cytopathogenicity is almost zero, the mutant a
A C.PE-negatív mutánsok genetikai jellemzéseGenetic characterization of C.PE-negative mutants
Hacsak másképp nem jelöljük, az alkalmazott technikákat a Sambrook és mtsai. által előirt standard protokolloknak (Holecular Cloning: A Laboratory Manual# Co'ld Spring :1.989) ] megfelelően valósítottuk meg.Unless otherwise noted, the techniques used are described in Sambrook et al. (Holecular Cloning: The Laboratory Manual # Co'ld Spring: 1989)].
-negatív mutánsokba inzertéit egységek számának >a céljából egy kereskedelmi kit (DIG DNA, segítségével.# a gyártó javaslatait követve TnS Hindi .11 fargsmensét csatoltuk digoxigeninhez Ezt. a próbát Southern-blottal ellenőriztük a teljes BbS Clal, BamHI és Sáli emésztési fragmen.seive.1 szemben.-in order to count the number of units inserted in negative mutants using a commercial kit (DIG DNA). .1 opposite.
A ? előzetesen kiválasztott kiónbbl kettőt kiküszöböltünk# mert kettős inzertálást tartalmaztak.THE ? we removed two of the pre-selected clones # because they contained double inserts.
Az 5 fennmaradó mutánsban az inzert a következőképpen lokalizálható:The insertion in the remaining 5 mutants can be localized as follows:
Megfigyeltük# hegy a BIO kromo-s tornál is DNS~e az E2348/69 törzs LSE--fókuszának.# amelyet McDaniel és mtsai írtak le (Proc. Natl. Acad. Sci., 92, 1664 (1995)) négy specifikus fragmensével (az 5. ábrán A, C és D~vel jelölve)We also observed # tips on the BIO chromosome tower with DNA for the LSE focus of strain E2348 / 69 described by McDaniel et al., (1995) Proc. Natl. Acad. Sci., 92, 1664. (marked A, C and D in Figure 5)
«·*««· *"
Próbákat készítettünk olyan módon, hogy az A, B, c és D fragxaenseket megjelöltük digoxin~DÍP-vei, A teljes DNS különböző restrikciós enzimekkel történő emésztése, majd a Southern biot végrehajtása után a CPE-negativ 31 ö mutánsokra ezekkel a próbákkal, kapott hibridizációs profilokat őszszehasonlltottuk a szülői. BIO törzsre és az S2348/63--re kapottakkal. VThe probes were prepared by labeling fragments A, B, c and D with digoxin-DIP, digesting the complete DNA with various restriction enzymes, and then carrying out the Southern biot on the CPE-negative mutants with these probes. profiles were compared to parenting in autumn. BIO strain and S2348 / 63. V
Ezen próbák -alkalmazása arra. a következtetésre vezet, hogy az öt mutáns az LEE-ló-kusznak megfelelő régióba Inzertálodott a TnphoA inzert. Az 5b ábra körrel körülvett nyíllal mutatja a TnpboA inzert helyét ebben as 5 mutánsban .Apply these probes to it. concludes that the five mutants have inserted the TnphoA insert into the region corresponding to the LEE-horse. Figure 5b shows the position of the TnpboA insert in this mutant with a circled arrow.
E mutánsok közül háromban {BÍO/CAi, BÍ0/S2 és B10/PA12} az inzert a 8 kB-os ScoRI fragxaensben helyezkedett el, amely a 3 próbával hibrid!zált, vagyis a szekréciós {.kiválasztási} génekkel (sepá - sepD} homológ gének kö-In three of these mutants, {BIO / CA1, BIO / S2, and B10 / PA12}, the insert was located in the 8 kB ScoRI fragment which hybridized to the 3 probes, i.e., the secretory {.sub.2} genes (sepas - sepD} homologous genes
kedík el ób példakind of elk example
Λ TAS-választ adö törzsek, a CPB-t kiváltó- törzsek és a CPE~o-s.gat.i.v mutánsok protein-profiljának ÖsszehasonlításaProtein Comparison of the protein profiles of TAS responding strains, CPB inducing strains and CPE ~ o-s.gat.i.v mutants
Annak érdekében, hogy azonosítsunk bármilyen lehetséges kiválasztott baktérium-proteint, amely kapcsolatba hozható a CPE-vei, analizáltuk a kultúrák íelüiúszójában levő proteinek elekfcroforetikus migrációs profilját az £2348/6:9 « * »*·* «4 ««Λ *In order to identify any potential bacterial protein selected that may be associated with CPE, we analyzed the electrophoretic migration profile of proteins in the culture supernatant at <RTIgt; £ 2348/6: 9 "*" * · * "4" "Λ *
Λ >**♦Λ> ** ♦
* * humán S.PEC törzs esetében, a BIO', RDEG-l és a S10/16E1 teresek esetében, valamint a CFE-negativ BIO mutánsok esetében .* * for human S.PEC strain, BIO ', RDEG-1 and S10 / 16E1 strains, and CFE-negative BIO mutants.
A baktériumokat a fenti 1. példában leírt kölcsönhatási teszt körülményei között tenyésztjük, de a sejtek jelenléte nélkül, a kezdeti oltvány hozzávetőleg 107 CFU/ial. 2 órás inkubáció után a baktériumokat centrifugáljuk (4000 g, 15 min, 20 °Ci és 1 ml metíonín nélküli EMEM-ben (No.. 31900-020, GlüCO; szuszpendáijuk, amely tartalmaz még S% hozzáadott dializáit FC5-t. 20 perces inkubáció után 37 °Con annak érdekében, hogy kimerítsük az endogén metíonín készletet, -^S-nel jelzett metionint adunk hozzá 100 uCi/mi mennyiségben. További. 1 órás inkubáció után a baktériumokat két egymás utáni eemtrifugálással (12000 gy 10 min} eltávolítjuk, majd a centrifugálásí felülűszoban a proteineket 40Oö-es políetilén-glíkoilai (PSG, 200 mg/ml, MERCK} kicsapatjuk. 1 órás 0 °C-os Inkubáció után a keveréket ismét centrifugáljuk (1200Ό g, 30 min} „ A. centrifugálásí üledéket 30 μί elekt.roforézises felviteli pufferben szuszpendáijuk és a proteineket eiektroforetikus migráció segítségével szétválasztjuk 12%-os pol íakr Hantid gélben SDS jelenlétében (SDS-PAGE). A gélt vákuumban szárítjuk, majd szobahőmérsékleten 6 napra érintkezésbe hozzuk egy β-msx (AMEASBAM) filmmel, A filmet a szokásos módon hívjuk elő.The bacteria were cultured under the conditions of the interaction test described in Example 1 above, but in the absence of cells, the initial inoculum was approximately 10 7 CFU / µl. After incubation for 2 hours, the bacteria were centrifuged (4000 g, 15 min, at 20 ° C and 1 mL of methionine-free EMEM (No. 31900-020, GlüCO; suspended in containing 5% additional dialyzed FC5) for 20 minutes. after incubation at 37 ° C to deplete the endogenous methionine pool, 100 µCi / ml of methionine labeled with - 5 S. After another 1 hour incubation, the bacteria were removed by two successive eemrifugations (12000 g for 10 min). followed by centrifugation in the supernatant, the proteins were precipitated with 40,000 polyethylene glycol (PSG, 200 mg / ml, MERCK). μß was suspended in electrophoresis loading buffer and the proteins were separated by electrophoretic migration on a 12% polyacrylic Hantid gel in the presence of SDS (SDS-PAGE). and contacted with a β-msx (AMEASBAM) film at room temperature for 6 days. The film is developed as usual.
Az eredményeket a 6A ábra mutatja.The results are shown in Figure 6A.
A Blö szülői törzsben (3. sáv} három főbb proteint azonosítottunk, amelyek molekulatömege rendre 39, 37 és 25 kDa volt, valamint egy kevésbé fontos csíkot 40 kDa-nál.Three major proteins with molecular weights of 39, 37 and 25 kDa and a minor band at 40 kDa, respectively, were identified in the Blö parent strain (lane 3).
X* · Φ ΦΦΦ * X * φ ·*'♦X * · Φ ΦΦΦ * X * φ · * '♦
Miközben a nyúl RBBC-l és a B10/16EI mutánsok profiljai megegyeznek a Blö-ével, a humán SPEC referencia törzs, £2348769 (6. sáv) négy csíkot mutat viszonylag hasonló molekulatömeggel NO, 39, 36 és 26 kDa), valamint egy további nagyobb csíkot kb. 29 kDa értékkel, amelynek nincs meg az ekvivalense a BIO profilban (6A ábra) . Ezen csíkok egyike sem. jelenik meg a CPE-negativ B10/CA1 mutánsban. (4. sáv). A 2. sáv a molekulatömeg markereket tartalmazza.While the profiles of rabbit RBBC-1 and B10 / 16EI mutants are identical to those of Blö, the human SPEC reference strain, £ 2348769 (lane 6), shows four bands with relatively similar molecular weights of NO, 39, 36, and 26 kDa) and one. another larger band approx. 29 kDa, which has no equivalent in the BIO profile (Figure 6A). None of these stripes. appears in the CPE-negative B10 / CA1 mutant. (Lane 4). Lane 2 contains molecular weight markers.
Ezeket a proteineket immunológiai. összefüggésük szerint is megvizsgáltuk,, poliklonális nyúlszérumot használva, amelyet a PEG-gel kicsapatott BIO felülűszö proteinekkel szeriben termeltettünk.These proteins are immunological. and polyclonal rabbit serum produced in serine with PEG precipitated BIO supernatant proteins.
Az Ímmunpreciptiációt a felülúszó proteinekkel szembeni antiszérummal a tenyészet felülúszóján hajtottuk végre, miután megjelöltük -^S-nel, amint az fentebb leírtuk. Az Ímmunpreciptiációt a standard módszerek felhasználásával végeztük el [Sambrook és mtsai.: Moíecuiar CIoning: A Laboratory Manuai, Cold Spring Barbor, b.Y. (1989)j,Immunoprecipitation with antiserum to the supernatant proteins was performed on the culture supernatant after being labeled with - S as described above. Immunoprecipitation was performed using standard methods [Sambrook et al., Moecuiar Cloning: Laboratory Manuai, Cold Spring Barbor, b.Y. (1989) J.
Az eredményeket a 6B és a 7. ábra mutatja.The results are shown in Figures 6B and 7.
A 6B ábrához tartozó lábjegyzet: 1. sáv: BIO preimmun szérummal; 2: BIO; 3: BiO/CAl; 4: B1Q16E1; 5: molekulatömeg markerek; 6. BDSC-1; 7: £2348/69.Footnote to Figure 6B: Lane 1: BIO with preimmune serum; 2: BIO; 3: BiO / CA1; 4: B1Q16E1; 5: molecular weight markers; 6. BDSC-1; 7: £ 2348/69.
A 6B ábra mutatja, hogy az antiszérumnak a BIO {3.Figure 6B shows that the antiserum has BIO {3.
inje jelen van az AF/R2-negativ mutáns (B.1.0/16E1# 4. sáv) felüiűszójában, nem jelennek meg a CPE-negativ mutáns (Blü/üAI, 3. sáv) felüiúszójában, Meg kell azonban jegyezni, hogy a preímmuu szérumnak is van bizonyos fokú képessége arra, hogy a BIO 40 kDa~s kisebbségi proteinjéveline is present in the AF / R2-negative mutant (B.1.0 / 16E1 # lane 4), does not appear in the CPE-negative mutant (Blu / µAI lane 3), but it should be noted that serum also has a degree of ability to bind the BIO with the 40 kDa minority protein
Xekuistömege érzékelhetően különböző is), és hogy a CPEnegativ mutánsban ezen proteinek képződése a feiüiűszőban megváltozik.It is also perceptibly different) and that the formation of these proteins in the CPEnegative mutant changes in the supernatant.
Annak eldöntésére, hogy a felülúszóban levő proteineknek ezt az eltűnését a. megfelelő gének expressziójának hibája, vagy a proteineknek a baktérium általi kiválasztásának hibája okozta, összehasonlítottuk a BIO törzs és a CPE-negativ mutánsok (CA1, FA12, E2, A9, és H12) felülúszó proteinjeinek ismmnprecipítáoiös profilját az azonos kultúrából vett baktériumok lizátumaínak (oldatainak) iffimunprecítpítácíós profiljával.To decide that this disappearance of protein in the supernatant a. we compared the ismmnprecipitating profile of the supernatant proteins of the BIO strain and CPE-negative mutants (CA1, FA12, E2, A9, and H12) to lysates of bacteria from the same culture, or due to a defect in bacterial secretion with an iffimmune prediction profile.
A lizátumokat három fagyasztásiy felengedésl ciklus révén nyertük (-20 °C és 20 °C között), amelyet centrifugalás követett (12000 g, 10 perc), majd kinyertük az lizátum felüiűszóját. Az immnnprecipítáciőt azután hajtottuk végre, hogy megjelöltük -^Ο-ηοΙ, ugyanolyan körülmények között, mint amiket a feiülússó proteinek esetében használtunk. Mielőtt azonban ezt elvégeztük volna az B. coli HBlöl laborétórium törzsének lisátumát használtuk az antiszérum depletálasára, hogy kiküszöböl jük a nem-specifikus reakciókat .The lysates were obtained by three freeze-thaw cycles (-20 ° C to 20 ° C) followed by centrifugation (12000 g, 10 minutes) and the supernatant of the lysate was recovered. Immunoprecipitation was performed after labeling - ^ ^-ηοΙ under the same conditions as used for the supernatant proteins. However, before this was done, an additive from the B. coli HBlöl laboratory strain was used to deplete the antiserum to eliminate non-specific reactions.
felülúszó proteineksupernatant proteins
7B (a bakteriális7B (bacterial
Az eredményeket a 7A (a üsmunprecipi feác.iős profilja] és lizátumok immunpreciptíciós profilja) ábra mutatja.The results are shown in Figure 7A (immunoprecipitation profile of lysmunoprecipes) and lysates.
a ielülöszó proteinek jelentősen csökkennek minden mutánsban. Ez a csökkenés még hangsúlyosabbnak tűnik három mutánsban, nevezetesen a CA1-ben, Ε-2-ben és A9-foen. Az imaunprecipítáció kimutat egy csíkot kb. 110 kDa-nái, amelynek Intenzitása többé-kevésbé egyforma minden törzsben, és amelyet ezért nem befolyásolnak a mutációk.bypass proteins are significantly reduced in all mutants. This decrease seems to be even more pronounced in three mutants, namely CA1, Ε-2 and A9-foen. Immunoprecipitation shows a band of approx. 110 kDa, the intensity of which is more or less the same in all strains and is therefore unaffected by mutations.
Megjegyzés a 7S ábrához; sávok; 1; molekulatömeg markerek,* 2; BIO; 3: CA1; 4; FAI2; 5: 2B7 6: A9;7: H12.Note to Figure 7S; bands; 1; molecular weight markers, * 2; BIO; 3: CA1; 4; FAI2; 5: 2B7 6: A9; 7: H12.
A 7B ábra azt mutatja, hogy a fentebb leírt főbb proteinek többé-kevésbé azonos mennyiségben jelen vannak a BIO lizátumokban és a. mutáns lizátumokban, a CA1 mutáns kivételével, amely különösen szegénynek mutatkozik a 25 kDa-s proteinben.Figure 7B shows that the major proteins described above are present in more or less equal amounts in the BIO lysates and in the. mutant lysates except for the CA1 mutant, which appears to be particularly poor in the 25 kDa protein.
4, példaExample 4
A patogenitáa elvesztése a BIO egy CFE-negativ mutánsábanLoss of pathogenicity in a CFE-negative mutant of BIO
Annak tanulmányozására, hogy a CPE elvesztése hatással van-e a virulencíára, összehasonlítottuk a BIO törzsnek a nyulakra vonatkozó patogén itá-s át orális adagolás esetén az egyik mutánséval, jelen esetben a B10/CA1 törzsével.To study whether the loss of CPE has an effect on virulence, we compared the rabbit pathogenicity of the BIO strain for oral administration with one of the mutants, in this case the B10 / CA1 strain.
A patogenitást új-zéiandi fehér tenyészetből (INRA törzs) származó, 35 napos fiatal nyálakon vizsgáltuk.Pathogenicity was examined on 35-day-old young saliva from New Zealand white culture (INRA strain).
φ φφ ί *** * » * * « · ** ♦ * * φ * * φ » ♦ * * * ί *Λ φ Κ-.φ Λ Φ » # •φφφνφ amelyeket. 28 napos korukban választóttünk el, a Pillien és mtsai által leírt módszerrel. [Vet. Microbiol. 50, 105 (1996! 'j. 51 nyalat három csoportba osztottunk, amelyek súlyuk és alom tekintetében homogének voltak, majd orálisan beoltottuk őket a teszt törzsek 2.1<P CFü egységével, név szerint a következőkkel: a Blö szülő törzzsel (18 állat), a CFB-negativ Blö/CAl mutánssal (13 állat) és egy nem-patogén KI2 laboratóriumi BM21 törzzsel (1.5 állat). A hasmenéses és haláleseteket, valamint a súlyt fej legyeztük, és az B. coli törzseket a székletben megszámoltuk és osztályoztuk, amint azt Billien és mtsai leírták (1996. id. mű].φ φφ ί *** * »* *« · ** ♦ * * φ * * φ »♦ * * * ί * Λ φ Κ-.φ Λ Φ» # • φφφνφ which. At 28 days of age, they were separated by the method described by Pillien et al. [Vet. Microbiol. 50, 105 (1996-1991) 51 livers were divided into three groups which were homogeneous in weight and litter and then inoculated orally with the 2.1 <P CFU unit of the test strains, namely: the Blö parent strain (18 animals), with the CFB-negative B1 / CA1 mutant (13 animals) and a non-pathogenic KI2 laboratory strain BM21 (1.5 animals). Diarrhea and death, as well as weight, were scored and B. coli strains were counted and classified as it is described by Billien et al. (1996, ed.).
A BIO szülő törzzsel való orális beoltás mind a 18 beoltott állat esetében súlyveszteséget okozott, közülük 17 esetben hasmenést, 16 esetben halált. Az elhullások a beoltást követő harmadik és tizenkettedik nap között következtek be. összehasonlításképpen az azonos mennyiségű Blö/CAl mutánssal beoltott állatok, hasonlóan az B. coli KI2 törzszsel beoitottakhöz, nem mutattak semmi sűlyveszteséget vagy klinikai tünetet. A két utóbbi csoport esetében felvett súly-görbék gyakorlatilag azonosak voltak.Oral inoculation with the BIO parent strain caused weight loss in all 18 vaccinated animals, including 17 cases of diarrhea and 16 deaths. The deaths occurred between the third and the twelfth day after vaccination. for comparison, animals vaccinated with the same amount of B1 / CA1 mutant, similar to those vaccinated with B. coli K2 strain, showed no weight loss or clinical signs. The weight curves of the latter two groups were practically identical.
A 8A ábra mutatja den csoportban a kísérlet során: BIO (két tólélö/18 állat Δ; K12 (kontroll; 15 túiélö/15 állat) - 0; B10/CA1 (18 túlélő/ 18 állat) - □.Figure 8A shows den group in the experiment: BIO (two living / 18 animals Δ; K12 (control; 15 surviving / 15 animals) - 0; B10 / CA1 (18 surviving / 18 animals) - □.
A 88 ábra mutatja, a coli hacillusofc populációját a beoltás után különböző Időkkel azon állatok székletében, amelyeket a KI2 kontroll törzzsel, a Blö törzzsel és a Blö/CAl törzzsel oltottak be:Figure 88 shows the population of coli hacillusofc at different times after inoculation in the faeces of animals that were vaccinated with the K2 control strain, the Blö strain and the Blö / CAl strain:
túlélő állatok átlag súlyát min· □ : Blö/'CAl törzsből állóként azonosított Collbaciilus flóraaverage weight of surviving animals min · □: Collbaciilus flora identified as Blö / 'CAl
Q: BIO törzsből állóként azonosított ColibaoillusQ: Colibaoillus identified as a BIO strain
f. 1 o r a.f. 1 hour.
Jelentős S. coli kolonlzációt (elszaporodást) figyel tünk meg a szülői SIO törzzsel beoltott nyulak esetében, a kolonizáciő elérte a túlélőkben a .10^ CFU/g szintet a széklet tartalomban több, mint két héttel a beoltás után. Minden azonosított colibacillus flóra BIO törzset tartalmazott.Significant colonization (proliferation) of S. coli was observed in rabbits vaccinated with the parental SIO strain, and colonization reached a level of .10 CFU / g in survivors more than two weeks after inoculation. All identified colibacillus flora contained BIO strains.
Ez a teljes E. coli populáció ICp-IO^-szer nagyobb volt, mint az, amit a kontrollcsoportban levő nyulak esetében láttunk, amelyeket a Klz-es E. coli törzzsel oltottak be, amelyet ezen felül nem. is detektáltak a megfelelő állatokban.This total E. coli population was ICp-10x-fold greater than that seen in the rabbits in the control group, which were inoculated with the Klz strain of E. coli, which was not. have also been detected in appropriate animals.
Azokban a nyu.la.kban, amelyeket a S1Ö/CA1 mutánssal oltottak be, ez utóbbi a beleket magas szinten kolonizálta, ami után az E, coli populáció kb, lö& CFJ/g széklettartalom szinten .stabilizálódott legalább két hétig. Ezalatt az idő alatt a teljes E. coli populáció '?0~lö0%--át a B10/CA1 alkotta .In lymphocytes vaccinated with the S1 / CA1 mutant, the latter colonized the intestines at high levels, after which the E, coli population stabilized at about 1.5 µg / CFU / g for at least two weeks. During this time, '? 0 ~ 0%' of the total E. coli population was B10 / CA1.
ő. oe 3daShe. oe 3da
Egy CBE-negativ törzs által átvitt védelem viszonya a szülői B20 törzzsel valő fertőzéshezRelationship of protection conferred by a CBE-negative strain to infection with parental strain B20
A patogén BIO törzs 10^ CFU-s dóziséval vali raíií napo s nyutón., beoltás hatásait összehasonlítottuk 2, 13 egyébből álló 35 amelyek közül az egyik csoportnak egy héttel φ * *The effects of inoculation of the pathogenic BIO strain with a dose of 10 <RTIgt; CFU </RTI> on a daily basis were compared with 2, 13 of 35 subjects, one of which had a week φ * *.
X Φ* *« φ ·♦·>«* * φX Φ * * «φ · ♦ ·>« * * φ
Λ * * * korábban orálisan a B18/C&1 mutáns törzset adtuk be (2xlí)·'Λ * * * Previously orally administered mutant strain B18 / C & 1 (2xl1) · '
CFÜ!CFU!
Harminchat fiatal nyalat <a faj és a tenyésztési körülmények megegyeznek a fenti 4. példában leírtakkal) két csoportba osztottunk, .amelyek a súly és az alom szempontjából homogének voltak. 30 napos korukban az egyik csoportba tartozó állatoknak 2x10^ CFÜ B1Q/CA1 mutánst adtunk be orálisan 2 ml PBS-ben. Hét nappal később mindkét csoporthoz, tatoző állatoknak a patogén BIO eredeti szülői törzsből orálisan, egy 2x10^ CFÜ dózist adtunk (ami a halálos dózis kb. 150S~a). A hasmenése» és haláleseteket valamint a súlyt feljegyeztük és a székletben az £. coli törzseket megszámláltuk és típusba soroltuk, amint azt a fenti 4. példában leírtuk.Thirty-six young bunnies (species and breeding conditions identical to those described in Example 4 above) were divided into two groups which were homogeneous in weight and litter. At 30 days of age, animals in one of the groups were dosed with 2 x 10 4 CFU B1Q / CA1 mutants orally in 2 ml PBS. Seven days later, a dose of 2x10 4 CFU (corresponding to a lethal dose of about 150 S) was added to both groups, orally, from the parent pathogenic parent BIO strain. Diarrhea »and deaths as well as weight were recorded and £. coli strains were counted and sorted as described in Example 4 above.
Az egész megfigyelési időszak alatt semmilyen klinikai tünetet vagy súlyveszteséget nem figyeltünk meg azokon a fiatal nyulakon, amelyeknek előzőleg orálisan beadtak aThroughout the observation period, no clinical symptoms or weight loss were observed in young rabbits previously dosed orally.
B10/CA1 törzset.Strain B10 / CA1.
Másrészt 18 nyálból 11 azok közül, amelyeket nem vakcináitünk BIO/CAl-gyel súlyveszteséget mutatott, míg a nynlak közül 9 hasmenést mutatott és 18-ből 7 elpusztult,On the other hand, out of 18 saliva, 11 of those unvaccinated with BIO / CA1 showed weight loss, while 9 of the nynlak showed diarrhea and 7 of 18 died,
A bél-kolonizáoiő vizsgálata megmutatta, hogy a B1Ö/C&1 törzs hatásosan kolonizálta a beleket akkorra, mikor a patogén BIO szülői törzset beadtuk; ezután a B10/CA1 törzs a kb. 10' CFU/g stabil szinten maradt két hétig, ezáltal megakadályozta azt, hogy a B10 detektálható szinten megjelenjék.The intestinal colonization assay showed that the B10 / C & 1 strain effectively colonized the intestines when the pathogenic BIO parental strain was administered; then strain B10 / CA1 at ca. 10 'CFU / g remained stable for two weeks, thereby preventing B10 from being detected at a detectable level.
* * * * ♦ x«i* * * * ♦ x «i
Párhuzamosan ELISA-t használtunk a lokális anti 0103 LES XgA antitestek mérésére a székletben, A 9. ábra mutatja a székletben levő IgA antitestek .kifejlődését a CPE-nsgativ 310/CA1 törzzsel való orális beoltás (0 nap) után, majd a virulens 810 törzzsel való beoltás után (a 7, napon} (0), vagy csak a 810 virulens törzzsel való beoltás után a 7, napon . Látható, hogy az antitest válasz szignifikánsan nő körülbelül 15 nappal a B10/CA1 törzzsel való orális beoltás után.Parallel ELISA was used to measure local anti-0103 LES XgA antibodies in stool. Figure 9 shows the development of IgA antibodies in stool after oral inoculation with CPE-nsgativ 310 / CA1 strain (day 0) followed by virulent strain 810. after vaccination (day 7) (0) or only after vaccination with virulent strain 810 on day 7. It can be seen that the antibody response is significantly increased approximately 15 days after oral vaccination with strain B10 / CA1.
o. példaShe. example
LEE-mutánsck izolálása helyspeclfukcs mu tagé nézessélIsolation of a LEE mutant to look at a site specific mu tag
A B10 törzs LES-fókuszának jobboldali végét klónoztuk és szekvenáitufc, A szekvenált régié szerveződését diagramszérűén mutatja a 10. ábra, és a kapott szekvenciát a csatolt szekvencia-Iistában Írjuk le 1. szekvencia azonosító szám alatt. Ezenfelül tanulmányoztuk az LEE;-fókusz általános szerveződését a patogén 0103 törzsekben és megerősítettük, hogy ez azonos volt mindezekben a törzsekben.The right end of the LES focus of strain B10 was cloned and sequenced. The sequence of the sequenced antigen is shown diagrammatically in Figure 10 and the resulting sequence is depicted in SEQ ID NO: 1. In addition, we examined the general organization of the LEE1 focus in the pathogen 0103 strains and confirmed that it was identical in all of these strains.
Létrehoztuk az 0103 törzs LES-lókusz mutánsait azThe LES locus mutants of strain 0103 were generated
E22-vel jelölt mutáns törzzsel kezdve, Míg ez a patogén törzs analóg a S10 törzzsel, érzékeny a streptomieínre {éppúgy mint továbbá minden megvizsgált Graa-nagativ spektrum an tibo t i Rumra}.Starting with the E22-labeled mutant strain, While this pathogenic strain is analogous to the S10 strain, it is sensitive to streptomycin {as well as all Graa-nagativ spectra examined tibo t i Rumra}.
Ezeket a mutánsokat az ai léi-csere 'módszerével állítottuk elő.These mutants were produced by the ai exchange method.
Minden egyes választott lókuss esetében {eaeA, espA, espB és espDi a vad típusú E22 törzs alléiját kicseréltükFor each selected locus, the allele of {eaeA, espA, espB, and espDi in the wild-type strain E22 was replaced.
S22S22
Λ1 ♦* ίΛ 1 ♦ * ί
fc- « «••Οί'ί *- +fc- «« •• Οί'ί * - +
Φ » • «·«· ♦♦ »Φ »•« · «· ♦♦»
* φ ♦* φ ♦
φ *»«« egy olyan alléllel# amelyet egy expressziós kazetta [-Gálán és mtsai.# J. Bacterioi.# 174# 4338 (.1.992)1 izertálásával# amel.y tartalmazott egy kanamícinnel szembeni rezisztenciagént (aph.T-gén: amlnoglikozíd 3'-foszfotranszerás) egy erős pr omo te.r szabályozása alatt# tarnszkripciós terminátor nélkül. Ez a kazettát# amelyet a mutálandó gének szegélyeznek# és amelyet egy öngyilkos piazmid [Kaniga és mtsaí# Gene# 109, 137 (.199.1)] hordoz# bejuttatjuk a vad típusú törzsbe, majd kiválasztjuk a rekomblnáns baktériumokat.# amelyekben a vad típusú alléit a mutált alléi váltotta fel.φ * »« «with an allele # contained in an expression cassette [-Galan et al. # 174 # 4338 (.1992) 1] contained an expression gene for kanamycin (aph.T gene: amlnoglycoside 3'-phosphotransfer) under the control of a strong pr omo te.r # without a transcription terminator. This cassette #, flanked by the genes to be mutated #, carrying a suicide plasmid [Kaniga et al. # Gene # 109, 137 (.199.1)] is introduced into a wild-type strain and selected into recombinant bacteria. the mutated allele replaced it.
Az eaeá és espő-géneket a kazettának a természetes Eco-RV-be ill. a Bglll restrikciós helyre való inzertálása által inaktiváljuk. Az espB és espA esetében de .novo egy SgJJT (GACATCj helyet hoztunk létre hely-specifikus mutagenezisse.1 (PCR degenerált oligonukleotido-k alkalmazásával és a plazmidok szelekciója restrikcióval).The eaea and espoo genes were inserted into the natural Eco-RV or cassette. by inactivation of BglII at the restriction site. For espB and espA, de. Novo is a SgJJT (GACATCj site was created for site-specific mutagenesis.1 (using PCR degenerate oligonucleotides and restriction plasmid selection).
A kapott mutánsok által előállított proteineket immun-b-Iotto-lás segítségével analizáltuk az EaeA esetében és isaauiyp-recipítációva.! az EspA, EspB és S-s-pD esetében. Ez az analízis megerősítette# hogy ezek a mutánsok csak abban különböztek a. vad típusú törzstől., hogy nem termelték azt a proteint# amelynek génjét a mutáció inaktiválta.Proteins produced by the resulting mutants were analyzed by immuno-b-Lotto for EaeA and for isaolypi recipients. for EspA, EspB and S-s-pD. This analysis confirmed that these mutants differed only in. wild-type strain that did not produce the protein # whose gene was inactivated by the mutation.
A kapott mutánsok a következők voltak:The resulting mutants were:
- EzzAespA# amely már nem szintetizálja az EspA proteint, ~ E22ÁespB# amely már nem szintetizálja az EspB proteint.- EzzAespA # which no longer synthesizes EspA protein, ~ E22AespB # which no longer synthesizes EspB protein.
- E22AespG# amely már nem szintetizálja az EspB proteint.- E22AespG #, which no longer synthesizes EspB protein.
- S22AeaeA# amely már nem szintetizálja az EaeA proteint, ezért nem építi azt be külső membránjába.- S22AeaeA #, which no longer synthesizes EaeA and therefore does not incorporate it into its outer membrane.
# *.<ν*.* * *'*·.# *. <ν *. * * * '* ·.
«8 <fr ♦ '*♦ * ♦ *«-«1 \ * ♦ φ 9 * ♦ » «*<· * **''*«8 <fr ♦ '* ♦ * ♦ *« - «1 \ * ♦ φ 9 * ♦» «* <· * **' '*
Az egyéb proteinek szintézise lényegileg normális marad mindegyik mutánsban. Az E'2'2áespA mutáns például már nem termel SspA-t, de normálisan kiválaszt EspB-t és EspD-t éppúgy, mint ahogyan, normálisan szintetizál EaeA-t és normálisan beépíti azt külső membránjába. Ügy tűnik tehát, hogy ezen mutánsok mindegyike tartalmaz egy szigorú, nem poláris („sáriét, non-polar) mutációt, amely kizárólag a mutáció cél-génj ét érinti.Synthesis of other proteins remains essentially normal in each mutant. For example, the E'2'2αespA mutant no longer produces SspA, but normally secretes EspB and EspD just as it normally synthesizes and integrates EaeA into its outer membrane. Thus, each of these mutants appears to carry a strict non-polar ("saris, non-polar") mutation that affects only the target gene of the mutation.
A 10. ábra a 0103 törzsek LEE-lőkuszának jobboldali végét mutatja és a különböző gének pozícióját, is jelzi és a kazetta inzertáiásának helyét mind a 4 kapott mutánsban.Figure 10 shows the right end of the LEE locus of strain 0103 and the position of the various genes, as well as the location of cassette insertion in each of the 4 mutants obtained.
Ezeket a mutánsokat in vitro vizsgálatoknak vetettük alá, a melyek célja az volt, hogy megállapítsuk CPE kiváltási képességüket HeLa sejtekben, amint azt a fenti 1. példában leírtuk.These mutants were subjected to in vitro assays to determine their ability to induce CPE in HeLa cells as described in Example 1 above.
Az esp-gen mutánsok patogenitását is ügy ellenőriztük elválasztott nyuiakban, hogy 35 napos nyulak csoportjainak orálisan beadtunk 2x10'’ CFb mutánsot nyálanként ugyanannak a protokollnak az alkalmazásával,a melyet fentebb a 4, példában leírtunk.The pathogenicity of the esp-gen mutants was also checked in isolated rabbits by administering 2x10 '' CFb mutants per group of 35-day-old rabbits orally using the same protocol as described in Example 4 above.
*♦»««*** * ♦* ♦ )ί » «. ** * * » * .*.♦* X * « A X X * κ«« « ««« >» »«*»* ♦ »« «*** * ♦ * ♦) ί» «. ** * * »*. *. ♦ * X *« A X X * κ «« «« ««> »» «*»
- 32 ~- 32 ~
A kapott eredményeket az 1 táblázat foglalja, összeThe results obtained are summarized in Table 1
1, Táblázat1, Table
a: A klinikai tüneteket mutató állatok száma/beoltott állatok száma *: vad tipo.su törzseka: Number of animals showing clinical signs / number of vaccinated animals *: wild typ.su strains
NT: nem vizsgáit,DK: not exams,
Ezek az eredmények azt mutatják, hogy az Esp protein szintézis mutánsok, már nm expresszál ják a citopatogén hatást Heha sejteken, szemben az eaeA mutánssal. Ennek következtében két .Esp protein mutáns (ÁespA és ÁespS) teljesen elvesztette patogentiáeát és a ÁespD mutáns patogenitása sokkal gyengébb, mint a vad típusú törzsé.These results indicate that Esp protein synthesis mutants already express the cytopathogenic effect on Heha cells as opposed to the eaeA mutant. As a result, two .Esp protein mutants (ÁespA and ÁespS) have completely lost their pathogenicity and the pathogenicity of the ÁespD mutant is much lower than that of the wild-type strain.
SZEKVENCIÁLISΤΑSZEKVENCIÁLISΤΑ
Α2 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:1.2 1. SEQ ID NO: 1 SEQUENCE CHARACTERISTICS:
HOSSZA: .12620 basispár TÍPUSA: nukleotídLENGTH: .12620 base pair TYPE: nucleotide
HÁNY SZÁLÚ: kettősTHREE FIBER: Double
TOPOLÓGIÁJA: lineárisTOPOLOGY: linear
MOLEKULATÍPUS: genomi DNSMOLECULATING TYPE: genomic DNA
JELLEMZŐK:FEATURES:
NÉV/KULCS: cdsNAME / KEY: cds
E LHELYE ZKEUÉ S: 1768,..4587E LHELYE ZKEUÉ S: 1768, .. 4587
EGYÉB INFORMÁCIÓK: /produkt - eaeA JELLEMZŐK:OTHER INFORMATION: / produk - eaeA FEATURES:
NÉV/KULCS: cdsNAME / KEY: cds
ELHELYEZKEDÉS: 7278. . .7856LOCATION: 7278.. .7856
EGYÉB INFORMÁCIÓK: /produkt = wespA!5 JELLEMZŐK:OTHER INFORMATION: / product = w espA ! 5 FEATURES:
NÉV/KULCS: cds ELHELYEZKEDÉS: 7869...3011 EGYÉB INFORMÁCIÓK: /produkt = MespD* JELLEMZŐK:.NAME / KEY: cds LOCATION: 7869 ... 3011 OTHER INFORMATION: / product = M espD * FEATURES :.
NÉV/KULCS: cdsNAME / KEY: cds
ELHELYEZKEDÉS: 9032...937 6LOCATION: 9032 ... 937 6
EGYÉB INFORMÁCIÓK: Zprodukt - ”espB”OTHER INFORMATION: Zprodukt - ”espB”
AZ' 1.. AZONOSÍTÓ SZÁM.Ö SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 1 SEQ.
OATATWCCO AACCCCGTCA CWSATMTA SmWAOTOWM T&CMAffiMC SÖ &CG&WASC CASGffiS&TCC AA4TASTGÖC Ö&ÖGSÁ&A&A TOmWSAT TCATACtTCA X2ÖOATATWCCO AACCCCGTCA CWSATMTA SmWAOTOWM T & CMAffiMC SÖ & CG & WASC CASGffiS & TCC AA4TASTGÖC Ö & OSA & A & TOmWSAT TCATACtTCA X2Ö
ACCTOACTT CMCCTCCS TÖCAÖATCCT AAACTTW3T TSTShOT SACTATTGCT 188ACCTOACTT CMCCTCCS TÖCAÖATCCT AAACTTW3T TSTShOT SACTATTGCT 188
8CM3OTSTO& TAGGÖATÖOC TGCGACGGGS &TTGC&C&GG OTGTTGCWT SACTCCAOAÖ 24ö8CM3OTSTO & TAGGÖATÖOC TGCGACGGGS & TTGC & C & GG OTGTTGCWT SACTCCAOAÖ 24ö
CCGG&TO&CC CAATCACTAC CÖACCCTÖAT GCTGCMCAA &C&Ö&3CTG& mOJ® 388CCGG & TO & CC CAATCACTAC CÖACCCTÖAT GCTGCMCAA & C & Ö & 3CTG & mOJ® 388
AAAÖATCAST TAACOWO, ASCMTSOS AACCCAGATA AŐbSAMST ΤΜΤΑΤ03ΑΤ 388AAAÖATCAST TAACOWO, ASCMTSOS AACCCAGATA AŐbSAMST ΤΜΤΑΤ03ΑΤ 388
8AÖAACG0AA ATGCÓATTCC STOT$KM CTO&&3&TG ATSTTÖTTSC GCAAATAGCÁ 4208AÖAACG0AA ATGCÓATTCC STOT $ KM CTO && 3 & TG ATSTTÖTTSC GCAAATAGCÁ 420
S&AC&ftSCTA AAÖCSOCÖGG TÖAACN38CC A®CO« CTATTGAAAG TMTTCTCW 488S & AC & ftSCTA AAÖCSOCÖGG TÖAACN38CC A®CO «CTATTGAAAG TMTTCTCW 488
SCGCAGOAA JWATOAWL KCAÖOmCT AAACSO3MC K«MW TCOTTCATCG 54 SSCGCAGOAA JWATOAWL KCAÖOmCT AAACSO3MC K «MW TCOTTCATCG 54 S
GQGGrmOCT ACOSTATTAS XWTGCGCKS ATTCTTOOS GGGCAATTGG TÖCCT3TOT? 888GQGGrmOCT ACOSTATTAS XWTGCGCKS ATTCTTOOS GGGCAATTGG TÖCCT3TOT? 888
Μ 9 » X XX * * **Μ 9 »X XX * * **
Χ« V « ** * * « ΦΧ <44Χ «V« ** * * «ΦΧ <44
/.4 * */.4 * *
205 220 215205 220 215
CTG CAG AÜT GGT AAT AAC TTT GAC SÜT AGT TCA CTG GAC TTC TTA TTA · 24S3CTG CAG AÜT GGT AAT AAC TTT GAC SÜT AGT TCA CTG GAC TTC TTA TTA · 24S3
Len Gin Ser Üly Asn Asn Phe Asp Sly Ser Ser Len Asp Phe Asn LenLen Gin Ser Üly Asn Asn Phe Asp Sly Ser Ser Len Asp Phe Asn Len
220 225 230220 225 230
CCG TTC TAT GAT TCC GAA AAC ATG CTG GCA TTT GGT CAG GTC ÜST GCG 2511 ?» Phe Tyr Asp Ser Sin Asn Mer Len Ale Phe Gly. Sin v&I Gly AláCCG TTC TAT GAT TCC GAA AAC ATG CTG GCA TTT GGT CAG GTC CST GCG 2511? »Phe Tyr Asp Ser Sin Asn Mer Len Ale Phe Gly. Sin v & I Gly Alá
235 24© . 245235 24 ©. 245
CGT TAS ATT GAC TGC CSC TTT AGG GCA AAT TTA CGT GCT GGC CAG CGT 2SS9CGT TAS ATT GAC TGC CSC TTT AGG GCA AAT TTA CGT GCT GGC CAG CGT 2SS9
Arg Tyr Tle Asp Ser Arg The Thr Ale Asn Len Gly Ale Gly Sin ArgArg Tyr Tle Asp Ser Arg The Thr Ale Asn Len Gly Ale Gly Sin Arg
2SÖ 255 25©2SÖ 255 25 ©
TTT TTC GTT CCT GAA AAT ATG TTG GGC TAT AAC GtC TTC ATT GAT CAG 2507TTT TTC GTT CCT GAA AAT ATG TTG GGC TAT AAC GtC TTC ATT GAT CAG 2507
Phe Fte Len. Pro Gin Asn hét L«u Gly Tyr Asn Vei Phe lle Asp SinPhe Fte Len. Pro Gin Asn Week L «u Gly Tyr Asn Vei Phe lle Asp Sin
255 272 275 28©255 272 275 28 ©
GAT TTT TCT GGT GAT AAT ACC CGT TTA GGT ATT SÜT GGC GAA TAC TGGGAT TTT TCT GGT GAT AAT ACC CGT TTA GGT ATT SÜT GGC GAA TAC TGG
Asp Phe ser Sly Asp Asn Thr Arg Len Gly Π® Gly Gly Gin Tyr TrpAsp Phe ser Sly Asp Asn Thr Arg Len Gly Π® Gly Gly Gin Tyr Trp
255 25© 2PS255 25 © 2PS
2585 * * *· » * ' ··*, 5 .* χ λ r»*s2585 * * * · »* '·· *, 5. * Χ λ r» * s
CGA SAS TAT TTC m AGT AGC GTT AAC CGC TAT TTC CGC ATG AGC GGC 2783CGA SAS TAT TTC m AGT AGC GTT AAC CGC TAT TTC CGC ATG AGC GGC 2783
Arg Asp Tyr Phe Lys Ser Sár Val Asa Gly Tyr Phe Arg Mer ser GlyArg Asp Tyr Phe Lys Ser Mud Val Asa Gly Tyr Phe Arg Mer ser Gly
388 385 Γ 3X8388 385 Γ 3X8
TGG CAT GAG TCA TACjAAT &%8 AAA GAT TAT GAT g|g CGC CCG GCA AAT $751TGG CAT GAG TCA TACjAAT &% 8 AAA GAT TAT GAT g | g CGC CCG GCA AAT $ 751
Trp His Glu Per Tyr Asa Lys Lys Asp Tyr Asp Óla Arg Pre Al® AsaTrp His Glu Per Tyr Asa Lys Lys Asp Tyr Asp Óla Arg Pre Al® Asa
335 320 333335 320 333
GGT TTT GÁT ATT CGC TTT AAT CGC TAT TTA CCA TCA TAT CCG GCA 27»GGT TTT GAT ATT CGC TTT AAT CGC TAT TTA CCA TCA TAT CCG GCA 27 »
Gly Phe Asp XXe Arg Phe te Gly Tyr Leu Pre Ser Tyr Pre Alá he»Gly Phe Asp XXe Arg Phe te Gly Tyr Leu Pre Ser Tyr Pre Alá he »
133 333 343 ®C GCC AAA CTG ATG TAT CAA CAG TAT TAT CGT CAT AAT GTT GOT TTG 2347133 333 343 ®C GCC AAA CTG ATG TAT CAA CAG TAT TAT CGT CAT AAT GTT GOT TTG 2347
Gly Alá Lys he» Mer Tyr cl» Gla Tyr Tyr Gly Asp Asa v®X Al® Le»Gly Alá Lys he »Mer Tyr cl» Gla Tyr Tyr Gly Asp Asa v®X Al® Le »
343 358 355 . 358343 358 355. 358
TTT AAT TCC GAT AAG TTG C&G TCG AAT CCT GGC GCÖ GGG ACC GTT CCT 2885TTT AAT TCC GAT AAG TTG C&G TCG AAT CCT GGC GCÖ GGG ACC GTT CCT 2885
Phe Asn Ser Asp Lys Le» Gl® Ser Asa Pre Gly A1& Al® Thr Vei GlyPhe Asn Ser Asp Lys Le »Gl® Ser Asa Pre Gly A1 & Al® Thr Vei Gly
355 373 ? 373 * \ .w 355 373? 373 * \. w
GTA AAC TAC AGT COS ATT CCT CTG GTG ACG ATS CSC ATC GAT TAG CGT 2 343GTA AAC TAC AGT COS ATT CCT CTG GTG ACG ATS CSC ATC GAT TAG CGT 2,343
Val Asa Tyr Thr Pro lle Pro Leó Vei Thr Mefc Gly Ile Asp Tyr ArgVal Asa Tyr Thr Pro lle Pro Leo Vei Thr Mefc Gly Ile Asp Tyr Arg
388 335 353388,335,353
CAT GGT ACG GGT AAT GAA AAT GAT CTC CTT TAC TCA ATG CAG PTC CGT 2»1CAT GGT ACG GGT AAT GAA AAT GAT CTC CTT TAC TCA ATG CAG PTC CGT 2 »1
His Gly Thr Gly Asa Gla Asa Asp Leu he» Tyr Ser Mer Gla Phe ArgHis Gly Thr Gly Asa Gla Asa Asp Leu he »Tyr Ser Mer Gla Phe Arg
385 403 435385 403 435
TAT CAG TTT GAT AAA CCG TGG TCT CAG CAA ATC GAG CCA CAC TAT GTT 3333TAT CAG TTT GAT AAA CCG TGG TCT CAG CAA ATC GAG CCA CAC TAT GTT 3333
Tyr Gla Phe &sp Lys Pro Trp Ser Gla Gla lle Glg Pro Gla Tyr v&lTyr Gla Phe & sp Lys Pro Trp Ser Gla Gla lle Glg Pro Gla Tyr v & l
4X8 433 4234X8 433 423
ΛΛ
AAC GAG TTA AGA ACA TTA TCG GGC' AGC CGT TAC GAT CTG GTT CAG CGT 3357AAC GAG TTA AGA ACA TTA TCG GGC 'AGC CGT TAC GAT CTG GTT CAG CGT 3357
Asa Glu Leu Arg Thr: Les. Ser Gly Ser Arg Tyr Agg Leu V®1 Gla ArgAsa Glu Leu Arg Thr: Les. Ser Gly Ser Arg Tyr Agg Leu V®1 Gla Arg
425 433 435 ·' 440 ' s425 433 435 · '440' s
AAT AAC AAT ATT ATT CTG GAG TAC AAA AAG CAG GAT ATT CTT TCT CTG 313SAAT AAC AAT ATT ATT CTG GAG TAC AAA AAG CAG GAT ATT CTT TCT CTG 313S
Asa Asa Asa He He Leu Glu Tyr Lys Ly® Gla Asp 21® Leu Ser LeuAsa Asa Asa He He Leu Glu Tyr Lys Ly® Gla Asp 21® Leu Ser Leu
445 453 455445 453 455
AAT ATT CCG CAT GAT ATT AAT GGT ACT GAA CAC AGT ACG CAG AAG ATT 3133AAT ATT CCG CAT GAT ATT AAT GGT ACT GAA CAC AGT ACG CAG AAG ATT 3133
Asa lle Pro Mis Asp He Asa Gly Thr Glu His Ser Thr Gla Lys HeAsa lle Pro Mis Asp He Asa Gly Thr Glu His Ser Thr Gla Lys He
458 455 478458 455 478
CAA TTG ATC GTT AAG AGC AAA TAC GGT CTG GAT CGT ATC GTC TGG GAT 3231CAA TTG ATC GTT AAG AGC AAA TAC GGT CTG GAT CGT ATC GTC TGG GAT 3231
Gla Leu He Val hy® Ser Lys Tyr Gly Leu Asp Arg He Val Trp AspGla Leu He Val hy® Ser Lys Tyr Gly Leu Asp Arg He Val Trp Asp
475 400 485 . ’*·475,400,485. '* ·
CAT AGC CCA TTA CGC AST CAG GGC W CAG ATT CS CAT GGC GGA AGC 3272CAT AGC CCA TTA CGC AST CAG GGC W CAG ATT CS CAT GGC GGA AGC 3272
Asp Ser Al® Leu Arg Ser Gla Gly Gly Gla He Gla His Gly Gly SerAsp Ser Al® Leu Arg Ser Gla Gly Gly Gla He Gla His Gly Gly Ser
428 425 588428,425,588
CAA AGC GCA CAA GAC TAC CAG GCT ATT TTG CCT GCT TAT GTG CAA GCC 3327CAA AGC GCA CAA GAC TAC CAG GCT ATT TTG CCT GCT TAT GTG CAA GCC 3327
Gla Ser Al® Gla Asp Tyr Gla A1& He Leu Pro Alá Tyr vei Gla GlyGla Ser Al® Gla Asp Tyr Gla A1 & He Leu Pro Alá Tyr v Gla Gly
585 510 515585 510 515
520 » X«r ♦ X « * * ♦ fi ♦ X ♦ ♦ Λ 520 »X« r ♦ X «* * ♦ fi ♦ X ♦ ♦ Λ
404?404?
*Χ«Φ *** Χ «Φ **
OCT ACT ACC OTT GAG TTT TTT ÖCS CCS TTG AGT ATT GAT GOT GAT M Ma Thr Thr Val 01« Phe Phe Alá Pro hév S®r n© Asp oly Asp LysOCT ACT ACC OTT GAG TTT TTT ÖCS CCS TTG AGT ATT GAT GOT GAT M Ma Thr Thr Val 01 «Phe Phe Alá Pro Hév S®r n © Asp oly Asp Lys
755 720755,720
mm
9X59x5
920920
40954095
41434143
4X914X91
40394039
422?422?
3 S3 S
43234323
44314431
44794479
45274527
AAC CAO TTG ATS AAT OTT OOA ÓTA AAC AAT AAO AAT OCT TTT TCT OTT Asm Sin Len Ti® Áss Val Gly V®1 Asn Asn Lys Asn Alá Phe Ser valAAC CAO TTG ATS AAT OTT OOA OA AAC AAT AAO AAT OCT TTT TCT OTT Asm Sin Len Ti® Dig Val Gly V®1 Asn Asn Lys Asn Ala Phe Ser val
925 520 935925,520,935
45754575
402?402?
GTCTCATTTO SOAATAAOTT TTTCGTSTAT CTTGTTTOAT AGAGACCTTG TTTACCATATGTCTCATTTO SOAATAAOTT TTTCGTSTAT CTTGTTTOAT AGAGACCTTG TTTACCATAT
CTACAACATC TOCACAATAA AAMCCCTCC OA&OAOOGGO MOAXAATAA TAAOTTMTACTACAACATC TOCACAATAA AAMCCCTCC OA & OAOOGGO MOAXAATAA
AGA8AACGGA ATMGOTS&TAGA8AACGGA ATMGOTS & T
AATCGCGTCT ATOAC&T&GCAATCGCGTCT ATOAC & T & GC
ATtAAG&SCA ATTGWOAS' «wcm mwmATtAAG & SCA ATTGWOAS '«wcm mwm
STCCATCGCA TTTATAA7GG á»ASO ACATCAT2CTSTCCATCGCA TTTATAA7GG á »ASO ACATCAT2CT
GA&dCT8AT GCCAGTTC&TGA & dCT8AT GCCAGTTC & T
Meccowc GmTTCAöTAMeccowc GmTTCAöTA
GTATCCCÖAT AAGAGGAAGAGTATCCCÖAT AAGAGGAAGA
ACCGTATTCC GTXAAAATATACCGTATTCC GTXAAAATAT
G7WTAATAA AMATATTTTG7WTAATTA CRAFTS
Λ tgattcgcaa csccmmΛ tgattcgcaa csccmm
AAGTTTGTTT TCrnTÁGOTAAGTTTGTTT TCrnTAG
VHW3GGAA AGCAAAACGTVHW3GGAA AGCAAAACGT
OWCTAGCC AGGWsAGACOWCTAGCC AGGWsAGAC
ATCASACAAT GGCAASGIGTATCASACAAT GGCAASGIGT
GATSACCTTT CC8OSST&GATSACCTTT CC8OSST &
< ·«ΐ(; ( / γ : : ' 1 1'' :( : )( ( :('<)( ( ( : : 1 : 1 : ) ) :>' mmATTCA AOT3&AÖATA ·<$?<· «Ϊ́ (; (/ γ:: '1 1'':(:) {(: ('<) ((( :: 1: 1:)):>'mmATTCA AOT3 & AÖATA · <$?
ATTGAWCCT TSTKMO emcecsss gömstwaATTGAWCCT TSTKMO emcecsss gömstwa
AT&TOAGWt AACATTtTTAAT & TOAGWt AACATTtTTA
TGG7ÖAACTT ACATCAACTATGG7ÖAACTT ACATCAACTA
ATGG&ATATT CATAACTAA2ATGG & ATATT CATAACTAA2
TCAAAACACC GCATCTGTiT attaaöscaa wwrrm'TCAAAACACC GCATCTGTiT attaöscaa wwrrm '
AOTOS&TT ACTAGTTCATAOTOS & TT ACTAGTTCAT
CAAAGGCAGT GCAAGSAAAGCAAAGGCAGT GCAAGSAAAG
GC&ASAGCSG CTTACTCTGAGC & ASAGCSG CTTACTCTGA
TGGGCTGCTS GAACAGCA7GTGGGCTGCTS GAACAGCA7G
- 40 ATICG75TGG GCGGGAGATO- 40 ATICG75TGG GCGGGAGATO
CXCTTTCAG AAT8CTACCACXCTTTCAG AAT8CTACCA
TCTTCATCGT SCCGCTGATTTCTTCATCGT SCCGCTGATT
GOTMW? CTGAAATMT cogg&tctt ktctsotkGOTMW? CTGAAATMT cogg & tctt ktctsotk
TTTTWmT &TTGMATA5 τοαττημτ GrmcwrmTTTTWmT & TTGMATA5 τοαττημτ Grmcwrm
ACASATTTIC AACTTCSCTC atccwot ^wcmACASATTTIC AACTTCSCTC atccwot ^ wcm
CATTAATCGC GGiVSATOATTCATTAATCGC GGiVSATOATT
WTCTTÖ© GTAATTMAAWTCTTÖ © GTAATTMAA
GCGO3ACATT TrmX&TSCGCGO3ACATT TrmX & TSC
GCTGGTA2&C ATCAGCTCTÖGCTGGTA2 & C ATCAGCTCTÖ
MCTSCCQ&T GGCTCCAGACMCTSCCQ & T GGCTCCAGAC
Gcrrrmns tcoatttttgGcrrrmns tcoatttttg
8S7CAATATC ACCAATGA7G8S7CAATATC ACCAATGA7G
AT8&OT&TC TSCTTCATAGAT8 & OT & TC TSCTTCATAG
AMS8AAAAC ACCTOTCA wm»c sg®emAMS8AAAAC ACCTOTCA wm »c sg®em
ATTSCCGATV ACÖC&TCOC&ATTSCCGATV ACÖC & TCOC &
AATTTTTTTC ATCCT38W3AATTTTTTTC ATCCT38W3
ACAATAGAG? AGAAAGGAAGACAATAGAG? AGAAAGGAAG
GAT7&CGTG& OTTCCAA'TGGAT7 & CGTG & OTTCCAA'TG
TXAATSCTAA TTC&n&ŐATTXAATSCTAA TTC & n & HER
CTMTAGTTA ttctccateaCTMTAGTTA ttctccatea
CbSTTTCTGA AACGATTGAACbSTTTCTGA AACGATTGAA
AASAG8AAGG WSACAACGAASAG8AAGG WSACAACG
CCGATASCGA ΤΑΜ2ΤΜΑΑCCGATASCGA ΤΑΜ2ΤΜΑΑ
A2CCTAATTT ©TCTATGITT * * » ♦ ♦♦ :* * »»* x * « * x· * ♦ * *· »4·» X .A2CCTAATTT © TCTATGITT * * »♦ ♦♦: * *» »* x *« * x · * ♦ * * »» 4 · »X.
'TOATACCAT CTTTAGGATC &TTCCC&3GC TKJIACCG’TT l((()(ij:(((l<<l>:((<l(:Í ))((1( ()(( (()Ö<<<(():)(('TOATACCAT CTTTAGGATC & TTCCC & 3GC TKJIACCG'TT l ((() {ij : (((l <<l>: ((<l ( : Í))) {(1 (() {((() Ö <<< (( )) ((
C1ÚAÖTATTT TTCCGGGSM l^O)l)í^)l)))t)8)llÍ8)l)(((((8(·C1UVERATED TTCCGGGSM l ^ O) l) l ^) l))) t) 8) ll8) l) ((((((8 (·)
MmsAmr TAcr&rrmMmsAmr TAcr & rrm
TGT2GMAAA CCnXCCCOCTGT2GMAAA CCnXCCCOC
TTTATTAATT TATTCrmrTTTATATTAT TATTCrmr
TT&TGTMTT CCS&TCCAGC anrWTG AAÖGGGGAATTT & TGTMTT CCS & TCCAGC anrWTG AAÖGGGGAAT
GT&ATGATSA TATCCTTATAGT & ATGATSA TATCCTTATA
WTWmC AAATGATATTWTWmC AAATGATATT
V*V *
AAW3AGTTA AATCAGTGGT γ**;·*AAW3AGTTA AATCAGTGGT γ **; · *
C&T&CSAGAö TGATTGCATGC&T & CSAGAö TGATTGCATG
CTAÁACGCTC GGGGrfCAGCCTAÁACGCTC GGGGrfCAGC
AAOGCAATCG CAGCACXAAT scmocc TTTCTGGCACAAOGCAATCG CAGCACXAAT scmocc TTTCTGGCAC
AAGCAACAtC CCGCT&T&TCAAGCAACAtC CCGCT & T & TC
Ί lx·Ί lx ·
GGGGTO3SCT CTCG&TCMT 'olGGGGTO3SCT CTCG & TCMT 'ol
CS7ATA2CAA CTAAAAACTG eCS7ATA2CAA CTAAAAACTG e
TOTXTGTGC CTAWGATAGTOTXTGTGC CTAWGATAG
CCATTSAGAA όΤΓΠΑΤΓΠ1 CCATTSAGAA όΤΓΠΑΤΓΠ 1
-TWAAOATG Ά8ΑΑΑΑΑΑΤΑ-TWAAOATG Ά8ΑΑΑΑΑΑΤΑ
CTCTTGTACA ÖTACTATTTACTCTTGTACA FIVE TACTATS
8CM3S® TTGAATOTAA T^AATTGÖ MTCTOAACA TTAAATTTAC AAAA'TÖAATT G^CTAAGCC TGGGATATCG GAGA&3CTGC TVAATGATAT8CM3S® TTGAATOTAA T ^ AATTGÖ MTCTOAACA TTAAATTTAC AAAA'TÖAATT G ^ CTAAGCC TGGGATATCG GAGA & 3CTGC TVAATGATAT
GAACTATCAT WUWAC&8GAACTATCAT WUWAC & 8
G8TAA7A1GC CAAAAdGGGA «8?G8TAA7A1GC CAAAAdGGGA «8?
45374537
4«?4 '?
58875887
518?518?
51575157
52275227
52«?52 '?
83478347
5857 e?5857 e?
852?852?
55875587
55475547
57875787
57575757
55375537
58S758S7
588?588?
50875087
88578857
51275127
51875187
52475247
53875387
83578357
85278527
84578457
5557 * **** »#♦» Φ Φ* * * * * XX X ♦ » Χ«« χ5557 * **** »# ♦» Φ Φ * * * * * XX X ♦ »Χ« «χ
- 41 CATTGTTCCA CTTATATCTT CTTTATTASA ATCTAAGTTT GTTMCATT3 AATTAMAAA OS»?- 41 CATTGTTCCA CTTATATCTT CTTTATTASA ATCTAAGTTT GTTMCATT3 AATTAMAA OS »?
CAAATACCCC AAATTATTAT TAG&TTT&TT ASGCGMÖAT GATTCCCAGT TGGCTCTGCT SOS?CAAATACCCC AAATTATTAT TAG & TTT & TT ASGCGMÖAT GATTCCCAGT TGGCTCTGCT SOS?
TTCCTGCTTA GGGGTSSSTG AGT7AAATCA GG&AGCTATC CAS&AG&TCA AAAAGCTTTA 072?TTCCTGCTTA GGGGTSSSTG AGT7AAATCA GG & AGCTATC CAS & AG & TCA AAAAGCTTTA 072?
TGAAAASCCC AAGGATGAgG ATTCTGAAAA CCGAGCCTCT TTpJSACT CCTTTATGCA S787TGAAAASCCC AAGGATGAgG ATTCTGAAAA CCGAGCCTCT TTpJSACT CCTTTATGCA S787
CATTAAGCAT CTTCCAGAGC GTS&CA&CCA CTTAAAGGTT .J^«86© CGGTATCGTT 0S47CATTAAGCAT CTTCCAGAGC GTS & CA & CCA CTTAAAGGTT .J ^ «86 © CGGTATCGTT 0S47
CGATSTGTCT TATATGTCTT CTTTTGAAGA TAAGGTGMA ASATCTTCAA TTATTASCGA SS 07CGATSTGTCT TATATGTCTT CTTTTGAAGA TAAGGTGMA ASATCTTCAA TTATTASCGA SS 07
TTTA7GCCGG GTAATCATTT THTATCGCT TGATAACTAT ACAGATATTA TTCCAATCTC 0307TTTA7GCCGG GTAATCATTT THTATCGCT TGATAACTAT ACAGATATTA TTCCAATCTC 0307
TATT.AATAAA GATAAAGATG TCATTTTAAA TGA>ATTG TCTATTATTG AACATGTATG 702?TATT.AATAAA GATAAAGATG TCATTTTAAA TGA & GTATTG TCTATTATTG AACATGTATG 702?
GTTAACAGAA GACTGCCTCC TSG&AASCCC TTCTCGGGTA TCGATTGTCG AACATAAACA 7087GTTAACAGAA GACTGCCTCC TSG & AASCCC TTCTCGGGTA TCGATTGTCG AACATAAACA 7087
TGTTTATTAT TTCCACCTAT TG&AAG&CTT TTTTGCATCA TWXTCACG CTTGTTTTAT 7147TGTTTATTAT TTCCACCTAT TG & AAG & CTT TTTTGCATCA TWXTCACG CTTGTTTTAT 7147
.............0............. 0
TCATAGGCAA CAGAGAGAXA ATACATTATT AATGATTGGT AM37»TO ATTATAACCA ?287 '· f‘$ gg&tgttatt tgatattggt tttttaatcs ttttlggtct tgctaagaaa gattattaag ?3«? «. . *#TCATAGGCAA CAGAGAGAXA ATACATTATT AATGATTGGT AM37 »TO ATTATAACCA? 287 '· f' $ gg & tgttatt tgatattggt tttttaatcs ttttlggtct tgctaagaaa gattattaag? 3«? «. . * #
AGCTATATAC ATG GAT ACA. TCA ACT GCA ACA TCA GTT. GCT AGT GCG K 7310AGCTATATAC ATG GAT ACA. TCA ACT GCA ACA TCA GTT. GCT AGT GCG K 7310
Bet Áss Thr Ser Thr Alá Thr Ser Vei Alá Ser ΑΧ» AsnBet Dig Thr Ser Thr Alá Thr Ser Vei Alá Ser ΑΧ »Asn
IS 10IS 10
GCC W ACT TCG ACA TCG ACA CTG TAT GAC TTA GGC AOT ATG TCG MA 7304GCC W ACT TCG ACA TCG ACA CTG TAT GAC TTA GGC AOT ATG TCG MA 7304
Al® Ser Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr Asp Lee Gly Ser Bet Ser LysAl® Ser Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr Asp Lee Gly Ser Bet Ser Lys
28 2528 25
GAC GAA GTA GTT CAG CTA TTT AAT AAA GTG GGT GTT TTT CAG GCT GCG 7412GAC GAA GTA GTA GTT CAG CTA TTT AAT AAA GTG GGT GTT TTT CAG GCT GCG 7412
Asp Glu Vei v®X Gla Lén The Asn Lys Vei Gly V&j^ Ohu Gin Alá Alá ; JS 48 <5 .?'· Sí:Asp Glu Vei v®X Gla Lén The Asn Lys Vei Gly V & j ^ Ohu Gin Alá Alá ; JS 48 <5.? '· Ski:
CTT CTG ATG TTT GCC TAT ATG TAT CAG GCA CAA AGG)GAT CTG TCG ATT 7400CTT CTG ATG TTT GCC TAT ATG TAT CAG GCA CAA AG) GAT CTG TCG ATT 7400
Len Leu Met Phe Alá Tyr Bet Tyr Gin Alá Gin Seri Asp Len Ser IleLen Leu Met Phe Alá Tyr Bet Tyr Gin Alá Gin Seri Asp Len Ser Ile
SS - «0SS - «0
GGA AAG TTT GCT GAT ATG AAT SAS GGA TCT AAG GAG TCA ACC ACA CCC 750»GGA AAG TTT GCT GAT ATG AAT SAS GGA TCT AAG GAG TCA ACC ACA CCC 750 »
Ale Lys The Ale Asp Bet Asn GXe Als Ser Ly® Gla Ser Xhr Thr Al®Ale Lys The Ale Asp Bet Asn GXe Als Ser Ly® Gla Ser Xhr Thr Al®
70 7570 75
CAA AAA ATG GCT AAT CTT CTG GAT GCT AAA ATT GCT GAT GTT CAG AGT 755«CAA AAA ATG GCT AAT CTT CTG GAT GCT AAA ATT GCT GAT GTT CAG AGT 755 «
Cin Ly® Bet Ale Asn Leu WX Asp Alá Ly® Xlé Alá Asp Val Gin Ser «8 85 88Cin Ly® Bet Ale Asn Leu WX Asp Under Ly® Xlé Under Asp Val Gin Ser «8 85 88
AGT TCT CAC AAG AAT AAG AAA GCC AAA CTT CCT CA^> CAA CTG ATT GAC 7004AGT TCT CAC AAG AAT AAG AAA GCC AAA CTT CCT CA ^> CAA CTG ATT GAC 7004
Ser Ser Asp Lys Asn Lys Lys AX® Lys Leu Pro Glu Glu Val Ile Asp ' 100 XOjSer Ser Asp Lys Asn Lys Lys AX® Lys Leu Pro Glu Glu Val Ile Asp '100 XOj
TAT ATA AAT GAT CCT±GC AAT CAC ATT ACA GTA GOT ATT AGC GAT 7053TAT ATA AAT GAT CCT ± GC AAT CAC ATT ACA GTA GOT ATT AGC GAT 7053
Tyr XX® Aon Asp Pre Arg Asn Asp Ile Thr V&l Ser Gly Xle Ser AspTyr XX® Aon Asp Pre Arg Asn Asp Ile Thr V & l Ser Gly Xle Ser Asp
210 1X3 228 125 # ♦♦♦**♦*210 1X3 228 125 # ♦♦♦ ** ♦ *
Κ 9 * ♦ <Κ 9 * ♦ <
Φ φΦ φ
ΦΦ Φ »»* ΦΦ Φ »» *
« 9 ΦΦΦ Κ + φφ * φ«9 ΦΦΦ Κ + φφ * φ
SerSer
GCT TCT CAG ΤΤΑ ΑΤΑ TGG GAC TCA GCA CGA GXA &ΑΤ AGG CGT ATT GTT Alá Ser Gla Leu Xle Ser Asp Ser Ale Arg Val Aaa Ser Arg lle Vei 378GCT TCT CAG ΤΤΑ ΑΤΑ TGG GAC TCA GCA CGA GXA & ΑΤ AGG CGT ATT GTT Ala Ser Gla Leu Xle Ser Asp Ser Ale Arg Val Aaa Ser Arg lle Vei 378
355 * *♦»#♦**♦355 * * ♦ »# ♦ ** ♦
Λ* > * * ♦ * * * * *♦# » «·*♦Λ *> * * ♦ * * * * * ♦ # »« · * ♦
200 205 2ΧΟ200 205 2ΧΟ
Φ 4*,. φ W * ♦ ♦ Φ * 9 9 ΜΦ 4 *,. φ W * ♦ ♦ Φ * 9 9 Μ
X φ Φ*Χ· φ * * * · φ φX φ Φ * Χ · φ * * * · φ φ
Χ.« Φ 4*Χ «V ·ΦΦ*ΧΧ. «Φ 4 * Χ« V · ΦΦ * Χ
O3C TXT ATG GCT GCA CTA GAT AAG ATT ACT GGC TCT ACA CCA TTT ATT 8?28O3C TXT ATG GCT GCA CTA GAT AAG ATT ACT GGC TCT ACA CCA TTT ATT 8? 28
Arg Phe hht AXa Als Val Asp Lys He Thr Gly Ser Thr Pro Phe XleArg Phe hht AXa Als Val Asp Lys He Thr Gly Ser Thr Pro Phe Xle
21S 220 22521S 220 225
GCC CTT ACC AGT CTT GCC GAA ©SC ATS AAG ACA TTG CCA AGA. ACG GTA 975SGCC CTT ACC AGT CTT GCC GAA © SC ATS AAG ACA TTG CCA AGA. ACG GTA 975S
AX& Val Thr Ser Leu Alá Glu Gly Thr Lys Thr to Pro Thr Thr VaXAX & Val Thr Ser Leu Alá Glu Gly Thr Lys Thr to Pro Thr Thr VaX
339 235 240 245339 235 240 245
TCT GAA TCA GTC AAA TGT AAC CAT GAG ATT AGC GAA CAG CGT TAT AAG 38X4TCT GAA TCA GTC AAA TGT AAC CAT GAG ATT AGC GAA CAG CGT TAT AAG 38X4
S®r 81« Ser Val Lys Ser Asn His Glu XX® ser Glu Glu Arg Tyr LysS®r 81 «Ser Val Lys Ser Asn His Glu XX® ser Glu Glu Arg Tyr Lys
25« 255 28025 «255 280
TCT GTG GAG AAC TTC CAG C&íS GGT AAT TTG GAT CTG TAT AAG CAA GAA 3862TCT GTG GAG AAC TTC CAG C&S GGT AAT TTG GAT CTG TAT AAG CAA GAA 3862
Ser Val Glu Asn Phe Gin Gin Gly Asn X»e« Asp Len Tyr Lys Gin GluSer Val Glu Asn Phe Gin Gin Gly Asn X »e« Asp Len Tyr Lys Gin Glu
265 279 275265,279,275
GTT CGC AGA GCG CAG GAT GAT ATC GCT AGC CGT CTG CGT GAT ATG ACA 551©GTT CGC AGA GCG CAG GAT GAT ATC GCT AGC CGT CTG CGT GAT ATG ACA 551 ©
Val Arg Arg Alá Gin Asp Asp 11® Alá Ser Arg heh Arg Asp hét ThrVal Arg Arg Alá Gin Asp Asp 11® Alá Ser Arg heh Arg Asp Week Thr
AGA GCC GCT CGC GAT CTC ACT GAT CTT CAG AAT CÖt ATG GGT CAA TCG 835SAGA GCC GCT CGC GAT CTC ACT GAT CTT CAG AAT CÖt ATG GGT CAA TCG 835S
Thr Al® Alá Arg Asp to Thr Asp Leu Gin Asn Arg Siet Gly Gin SerThr Al® Alá Arg Asp To Thr Asp Leu Gin Asn Arg Giet Gly Gin Ser
255 30« 505255 30 «505
GTT CGC TTA GCT GGG TAA TTGATCATGG TCGATACGTT TAATGATGAA 10995GTT CGC TTA GCT GGG TAA TTGATCATGG TCGATACGTT TAATGATGAA 10995
Val Arg Lau Alá Gly *Val Arg Lau Alá Gly *
21« 31521 «315
GTGCTTAATC ACTATCTTGA ACAAAAAGGG TACACA&T&C AGAAGGAGTT TCTTTGTGGC 10966GTGCTTAATC ACTATCTTGA ACAAAAAGGG TACACA & T & C AGAAGGAGTT TCTTTGTGGC 10966
A8T8GCTTTT TTATCGGATG GCGGATTGAG ACCTCTTTTT TCTCATTAGC GTACAGACTT 10125 6 ©ATGAACAAG AACTGATTTT GTGCTCTTTT GAAGCACGTA ACÖU&C&GG GCTTAACÖGC 10136 CCTGTTTTAT CACTGACTCG CTTGCTCGAA GAGTTGTACC AC^TTTTTC GGGTATTAAG 18245 AAAATCAGTG CGATGAAATŐ TAAGATTGST TCAGATTCA© AACGTCAAAA GCGCGAAGAG 10385A8T8GCTTTT TTATCGGATG GCGGATTGAG ACCTCTTTTT TCTCATTAGC GTACAGACTT 10125 6 © ATGAACAAG AACTGATTTT GTGCTCTTTT GAAGCACGTA ACÖU & C & GCTTAACÖGC GG 10136 CCTGTTTTAT CACTGACTCG CTTGCTCGAA GAGTTGTACC C ^ TTTTTC GGGTATTAAG 18245 AAAATCAGTG CGATGAAATŐ TAAGATTGST TCAGATTCA © AACGTCAAAA GCGCGAAGAG 10385
TTGTTTAATT ACTTCATCAG AAAGGGCGCT 62GCASCAA6 AAACAGAAGA CGGAATTTGG 18355TTGTTTAATT ACTTCATCAG AAAGGGCGCT 62GCASCAA6 AAACAGAAGA CGGAATTTGG 18355
TTCGTAAVGA ATGTAAATAG TTACAAATTT TTATTTCTAT TAACTATTGA GGAAAATTTA 10525TTCGTAAVGA ATGTAAATAG TTACAAATTT TTATTTCTAT TAACTATTGA GGAAAATTTA 10525
ATGAATTTAT CTGAAATTAC TChACAAATG GGTGAAGTAG GTAAAACGCT GAGTGATTCT 195 8 5ATGAATTTAT CTGAAATTAC TChACAAATG GGTGAAGTAG GTAAAACGCT GAGTGATTCT 195 8 5
TTTCTGCCAA CAAGCTACTG GTGTGGGCGG CTGTAGCTGC GGCAAATCAT AAGCTTCCCA 10726TTTCTGCCAA CAAGCTACTG GTGTGGGCGG CTGTAGCTGC GGCAAATCAT AAGCTTCCCA 10726
AATAT8C&GA ATCTATCCTG GATGTATXGC CGCAAATTAT ACCCGATA&A AAAGATATCG 1078®AATAT8C & GA ATCTATCCTG GATGTATXGC CGCAAATTAT ACCCGATA & A AAAGATATCG 1078®
CACATTTAGA ATTTATTATT TTATATGGAT TAAATAGAAA AAATOATGCG GTAAASGCTC 10845CACATTTAGA ATTTATTATT TTATATGGAT TAAATAGAAA AAATOATGCG GTAAASGCTC 10845
TGGAGGACTT TATGGATGAT GAGACAAGCC AGTTGTTATG CTGTCTGGTC CACGAGAATA 18506TGGAGGACTT TATGGATGAT GAGACAAGCC AGTTGTTATG CTGTCTGGTC CACGAGAATA 18506
ATAGAAGCTS GACACTAATGATAGAAGCTS GACACTAATG
GTAC0AAA2T TTCTMGTTrGTAC0AAA2T TTCTMGTTr
TTWAKn AATOAAATTTTWAK ATHLETIC
TATGtTTAM GGAATTAGTCTATGtTTAM GGAATTAGTC
AAÖCCGÖQTA ASCTCWTOGAAÖCCGÖQTA ASCTCWTOG
GAATSCSAXT AÖW2TCAATGAATSCSAXT AÖW2TCAAT
GACTTTTMT osactagccGACTTTTMT osactagcc
GTOSACAAGT SGAOÚ3XCTTGTOSACAAGT SGAOÚ3XCTT
AAAAGATCAT TTAGCTSCCTAAAAGATCAT TTAGCTSCCT
AAGCCGCCCS GCACCGGGGSAAGCCGCCCS GCACCGGGGS
ACXGCCCACT GCTCM^CÓCACXGCCCACT GCTCM ^ CÓC
WATACTSA SGTCTTAAOC &TCCGASGC& TCCSSS^CÁT otatgaactg tcsaaaaaggWATACTSA SGTCTTAAOC & TCCGASGC & TCCSSS ^ CÁT otatgaactg tcsaaaaagg
TTTAGASAST· TA&&&OTAATTTAGASTA · TA&&& TAKE IT
ATATCWXT2 «M2GAAAXATATCWXT2 «M2GAAAX
AÖW3GÖT3T XTCSTTAACCAÖW3GÖT3T XTCSTTAACC
AXGTTSGATl 'TGACATATCA csotatttttt ttetwra®AXGTTSGATl 'TGACATATCA cstatttttt ttetwra®
Aöcxsmtím WSTGGG3S.Aöcxsmtím WSTGGG3S.
AWCTTTTGG AAGAACTGÖTAWCTTTTGG AAGAACTGÖT
TACTrCTCXA CTCACTfóXTTACTrCTCXA CTCACTfóXT
ÖATTATGASA TGGXTS&TAGÖATTATGASA TGGXTS & TAG
CTTTTCAATX ®ΤΠ»ΜCTTTTCAATX ®ΤΠ »Μ
AGCACAATAT TTGTCAATTCAGCACAATAT TTGTCAATTC
TCTOTCCAG' SCATTAAIATTCTOTCCAG 'SCATTAAIAT
QTTCAGCGXA TTTCTSÖ&TAQTTCAGCGXA TTTCTSÖ & TA
ATCAGATTTC STCÜAGCAGGATCAGATTTC STCÜAGCAGG
- 46 ~ ttttaatctc atattgagtt- 46 ~ ttttaatctc atattgagtt
TAACAGAGAT ATTTATAATA cawww? nsw?w wwtssts romw tóswmc 1ACAC1AGGATAACAGAGAT ATTTATAATA cawww? nsw? w wwtssts romw tóswmc 1ACAC1AGGA
OGTTATCTGÜ CTTTTCACTGOGTTATCTGÜ CTTTTCACTG
CTCOTTTTt TCCCSGXAC2CTCOTTTTt TCCCSGXAC2
OTgeSASTTC ATTTACTOSG ccsssccatc coAxcrmOTgeSASTTC ATTTACTOSG ccsssccatc coAxcrm
AXSAAAAXXC SAAAAGTSTTAXSAAAAXXC SAAAAGTSTT
ÖGCCGACAAG CSGGTTGGTAÖGCCGACAAG CSGGTTGGTA
TAAAAGAXCA TTTGGCXGCCTAAAAGAXCA TTTGGCXGCC
CAAGCCGttt GGCACO3CCGCAAGCCGttt GGCACO3CCG
TACC8CSTAT TGCTCAÖ2CATACC8CSTAT TGCTCAÖ2CA
C&TAAAAAGT ΑΟΑΤΓΓΑΑΑΑC & TAAAAAGT ΑΟΑΤΓΓΑΑΑΑ
AAACWATAT T&&STTGCATAAACWATAT T && STTGCAT
AAAXAXTG1A ATMAXGATÖAAAXAXTG1A ATMAXGATE WORK
ASAffiXXÚTA ATTTTTIATC acatőasöca ssssomeASAffiXXÚTA ATTTTTIATC acacia ssssome
Í5T»» TAICTCIATT txxcatcwx TAíseterosÍ5T »» TAICTCIATT txxcatcwx TAíseteros
CTGOTWTG ATTGÖCTATTCTGOTWTG ATTGÖCTATT
T8CTAASC&T ATTTATTTTAT8CTAASC & T ATTTATTTTA
AGCTTTÖCGC XGGXATGAXAAGCTTTÖCGC XGGXATGAXA
CTCTTTGGCG XAOTCACTOCTCTTTGGCG XAOTCACTO
CCTWrWAT CACGCGAOAT ctthsgt&ct rmrceoGCGCCTWrWAT CACGCGAOAT ctthsgt & ct rmrceoGCG
ACTOATAGT OTCTWCCACTOATAGT OTCTWCC
ACTGTTTCTÖ ÖATA&ASCTT φ $.>·... > <**» X ** ♦ * * * *X X 0 * * *»x * * * 0 * ·* * #*0 -0 ««* i* *«*»ACTGTTTCTÖ ÖATA & ASCTT φ $.> · ...> <** »X ** ♦ * * * * XX 0 * * *» x * * * 0 * · * * # * 0 -0 «« * i * * « * »
TAAACMTTG ATAMtTTCATAAACMTTG ATAMtTTCA
CCTTMTGAA AAAXAX^GCTCCTTMTGAA AAAXAX ^ GCT
AGTTTATA3T CGtTAACTATAGTTTATA3T CGtTAACTAT
ASATATAAAA AGGSATGA&TASATATAAAA AGGSATGA & T
CGÓCATA11A CTAÜTGCGGCCGÓCATA11A CTAÜTGCGGC
WCCTCWG CTSTTCGTCTWCCTCWG CTSTTCGTCT
TOMATATSA ATGCGAO&ACTOMATATSA ATGCGAO & AC
TCTCGTCtW CCCCACCGCCTCTCGTCtW CCCCACCGCC
COXCCCATTG CTCAGGCATTCOXCCCATTG CTCAGGCATT
ÖATACTTCAA ÖSCTTAAGCCÖATACTTCAA ÖSCTTAAGCC
TCÍGGGTCAT GCCGGTCTTXTCÍGGGTCAT GCCGGTCTTX
TATGAAAA&X CGAAAAGTCT C^CCCACAA GTGGACAOGCTATGAAAA & X CGAAAAGTCT C ^ CCCACAA GTGGACAOGC
Λ\'γΛ \ 'γ
TTAAAASATC AWWCTSCTTAAAASATC AWWCTSC
TTATTAATTA CTGTTÜATTGTTATTAATTA CTGTTÜATTG
TCTGATAAAT GTSATTGGTATCTGATAAAT GTSATTGGTA
AAAGAGWTA ATAGAGCAAGAAAGAGWTA ATAGAGCAAG
CA1AAATTTA CCGC1ATXTGCA1AAATTTA CCGC1ATXTG
TGX&TGTACA GGC1CTTATA ·*<· k.TGX & TGTACA GGC1CTTATA · * <· k.
XAWCCGATA 2dASGCT3GC „AvXAWCCGATA 2dASGCT3GC Av
AihoAC&T ertmcTAAT ACATCCACTG TCTGGTTCTTAihoAC & T ertmcTAAT ACATCCACTG TCTGGTTCTT
TCACOSAA&C SACCATTXCTCACOSAA & C SACCATTXC
TTCAACTXGA GACTGXAATGTTCAACTXGA GACTGXAATG
GAAATGTTTC TGOTATTTTCGAAATGTTTC TGOTATTTTC
GWTAA&CTO XTCGCXCATCGWTAA & CTO XTCGCXCATC
ACGGAGGTCA AAATTCOGTTACGGAGGTCA AAATTCOGTT
AWJAACATC GCW3AT&TC •'\·ν:.AWJAACATC GCW3AT & TC • '\ · ν:.
xo$s«xo $ s "
1X22«1X22 "
XXÖSS moXXÖSS mo
XX2ÖSXX2ÖS
11201120
XX32SXX32S
ΧΧ3ΟΧΧ3Ο
UUŐ nsMNEW nsM
XX5OXX5O
11S2S nos xxw xxs©«11S2S nos xxw xxs © «
XX8GS »538XX8GS »538
XX98SXX98S
X284SX284S
1210« mss1210 «mss
1222812228
1228«1228 «
12X4«12x4 "
X24®8X24®8
124««124 ««
1252«1252 «
X2S8SX2S8S
12«2« *♦ « # ♦♦ * * » y *♦« κ ♦ » * * * κι*# 9 «<Χ4Γ ί» Λ»<·Χ12 «2« * ♦ «# ♦♦ * *» y * ♦ «κ ♦» * * * κι * # 9 «<Χ4Γ ί» Λ »<· Χ
- 47 A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:- 47 SEQ ID NO: 2 SEQUENCE FEATURES:
HOSSZA: 940 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULÁT íPVS: fehérj eLENGTH: 940 amino acids TYPE: amino acid TOPOLOGY: linear MOLECULATE IPVS: protein e
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 2:
24S 25® 25524S 25® 255
X fc «4 ♦ fc· ♦ ♦ ♦ 4 ♦ ♦ 4X fc «4 ♦ fc · ♦ ♦ ♦ 4 ♦ ♦ 4
48$ «80 «85$ 48 «80« 85
GXy Sin Ile óla Kis 8ly Oly Ser Sin Ser Us Gla Asp Tyr Gin Alá w sós sicGXy Sin Ile olla Small 8ly Oly Ser Sin Ser Us Gla Asp Tyr Gin Alá w salty sic
Ile Leu Pro Als Tyr Val Gin Öly Gly Ser As® Ile Tyr Lys Vél Thr SIS §2& 52SIle Leu Pro Als Tyr Val Gin Oly Gly Ser As® Ile Tyr Lys Re Thr SIS §2 & 52S
Als Arg Als Tyr Asp Arg Áss Gly Áss Ser Ser Áss Áss v&i Gin Le® 538 $35 S«0Als Arg Als Tyr Asp Arg Dig Gly Dig Ser Ser Dig Dig & Gin Le® $ 538 35 S «0
Thr Ile Thr Vei Len Pro Áss Gly Gin Vei vei Asp Gin val Gly Val 54$ 558 SS5 SSG φ φThr Ile Thr Vei Len Pro Dig Gly Gin Vei Asp Gin val Gly Val 54 $ 558 SS5 SSG φ φ
859 855 δ«0 *» * » * * * *» * * «** * ♦** »·*· ♦ * * ·>859 855 δ «0 *» * »* * * *» * * «** * ♦ **» · * · ♦ * * ·>
♦ ♦ * X♦ ♦ * X
Ma mI m
TrpTrp
ThrThr
SͻSKI"
Le» LettLe »Lett
As» Lys Tyr Pro Tyr Tyr 5SS 880As »Lys Tyr Pro Tyr Tyr 5SS 880
Lys-Sin ser Ser Ser 81« SOSLys-Sin ser Ser Ser 81 «SOS
Π® Tyr Ser ThrΠ® Tyr Ser Thr
WW
Ser Lys Ser Le»Ser Lys Ser Le »
835835
Ser Oly Val Ser SISSer Oly Val Ser SIS
Ser Thr Tyr Asp Leu/v&X Thr Lys SIS 320Ser Thr Tyr Asp Leu / v & X Thr Lys SIS 320
A®» Val Gly Val ’ $2$A® »Val Gly Val '$ 2 $
Asn Asn Lys Asn AU Phe Ser V&X Cys Val Lys *Asn Asn Lys Asn AU Phe Ser V&X Cys Val Lys *
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÓ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:SEQ ID NO: 3 SEQUENCE DATA: SEQUENCE FEATURES:
HŐS S E A: 193 ami no s a vHero S E A: 193 am no s a v
TíPUS A: aaínosavTYPE A: acetic acid
TOPOLÓGIÁJA: 1 i n-eári s .> ΟώTOPOLOGY: 1 i n-eári s.> Οώ
EKVSNCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF EXVNCIA:
y» #6 9 «· * *' » « ♦ Λ » ν * » » * ♦ *y »# 6 9« · * * '»« ♦ Λ »ν *» »* ♦ *
Φ«Κ χ *·»* *♦. ♦**« * ♦·« eΦ «Κ χ * ·» * * ♦. ♦ ** «* ♦ ·« e
Ue din Ser Leu Sin Tyr fcg Thr Ih Ser Alá Xle Ser Leu Gly Lys .„Λ t*c 190Ue din Ser Leu Sin Tyr fcg Thr Ih Ser Alá Xle Ser Leu Gly Lys. Λ t * c 190
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁNÓ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:IDENTIFICATION 4 IDENTIFIC SEQUENCE DATA: SEQUENCE CHARACTERISTICS:
HOSSZA: 381 aminosavLENGTH: 381 amino acids
TÍPUSA: aminosavTYPE: amino acid
TOPOLÓGIÁJA: lineárisTOPOLOGY: linear
ΧΦ * Φ ** fc fc «« ♦ * φ «' »** $ ♦ * fc * S * «44 ♦ «♦· *fc «»νΦ ~ 52 -ΧΦ * Φ ** fc fc «« ♦ * φ «'» ** $ ♦ * fc * S * «44 ♦« ♦ · * fc «» νΦ ~ 52 -
ΑΖ 5, AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:ΑΖ 5 SEQ ID NO: SEQUENCE CHARACTERISTICS:
HOSSZA: 315 aminosvLENGTH: 315 amino acids
TÍPUSA: aminosavTYPE: amino acid
TOPOLÓG IÁJA: 1 i n sár í sTOP OF THEOLOGY: 1 i n mud
MOLEKULATÍPUS: fehérjeMOLECULAR TYPE: protein
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:DESCRIPTION OF SEQ ID NO: 5:
* »« Φ ν *Φ * χ t * Φ 0 ϊ. Λ * * * * « »Χ« « »·*« *Φ Ή ν«* »« Φ ν * Φ * χ t * Φ 0 ϊ. Λ * * * * «» Χ «« »· *« * Φ Ή ν «
305 ' 3X8 3X5305 '3X8 3X5
Claims (9)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
FR9700532A FR2758568B1 (en) | 1997-01-20 | 1997-01-20 | NON PATHOGENIC MUTANT STRAINS OF E. COLI, THEIR PROCESS FOR OBTAINING AND THEIR USES |
Publications (4)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HU9800094D0 HU9800094D0 (en) | 1998-03-30 |
HUP9800094A2 HUP9800094A2 (en) | 1998-09-28 |
HUP9800094A3 HUP9800094A3 (en) | 2001-11-28 |
HU228496B1 true HU228496B1 (en) | 2013-03-28 |
Family
ID=9502763
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9800094A HU228496B1 (en) | 1997-01-20 | 1998-01-20 | Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0864644B1 (en) |
DE (1) | DE69831888T2 (en) |
ES (1) | ES2251760T3 (en) |
FR (1) | FR2758568B1 (en) |
HU (1) | HU228496B1 (en) |
-
1997
- 1997-01-20 FR FR9700532A patent/FR2758568B1/en not_active Expired - Lifetime
-
1998
- 1998-01-20 HU HU9800094A patent/HU228496B1/en unknown
- 1998-01-20 DE DE69831888T patent/DE69831888T2/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-01-20 ES ES98400093T patent/ES2251760T3/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-01-20 EP EP98400093A patent/EP0864644B1/en not_active Expired - Lifetime
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
HUP9800094A3 (en) | 2001-11-28 |
ES2251760T3 (en) | 2006-05-01 |
EP0864644B1 (en) | 2005-10-19 |
FR2758568B1 (en) | 1999-03-26 |
HUP9800094A2 (en) | 1998-09-28 |
DE69831888D1 (en) | 2006-03-02 |
HU9800094D0 (en) | 1998-03-30 |
FR2758568A1 (en) | 1998-07-24 |
DE69831888T2 (en) | 2006-07-27 |
EP0864644A1 (en) | 1998-09-16 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Law | Adhesion and its role in the virulence of enteropathogenic Escherichia coli | |
Bliska et al. | Bacterial resistance to complement killing mediated by the Ail protein of Yersinia enterocolitica. | |
JP2002521345A (en) | Live attenuated Salmonella vaccine to control avian pathogens | |
KR100628657B1 (en) | Bacteria attenuated by a non-reverting mutation in each of the AroC, OmpF and OmpC genes, useful as vaccines | |
De Rycke et al. | Enteropathogenic Escherichia coli O103 from rabbit elicits actin stress fibers and focal adhesions in HeLa epithelial cells, cytopathic effects that are linked to an analog of the locus of enterocyte effacement | |
MXPA03008296A (en) | Methods and products useful in recovering and recycling tannins. | |
JP4189031B2 (en) | Live vaccine carrier strain useful for high level expression of variant O antigen from gram negative bacteria and its derivatives for use as live vaccine | |
Nougayrède et al. | The long‐term cytoskeletal rearrangement induced by rabbit enteropathogenic Escherichia coli is Esp dependent but intimin independent | |
MXPA02010407A (en) | Isolation and characterization of the csa operon (etec cs4 pili) and methods of using same. | |
EP0564689B1 (en) | Recombinant live vaccines against Gram-negative enteric pathogens | |
HU228496B1 (en) | Non-pathogenic mutant e.coli strains, process for production and use thereof | |
Pillien et al. | Role of adhesive factor/rabbit 2 in experimental enteropathogenic Escherichia coli O103 diarrhea of weaned rabbit | |
MXPA05000467A (en) | Mycoplasma gallisepticum. | |
WO1998002523A1 (en) | Vaccine preparations | |
Alexander et al. | Construction and characterization of virG (icsA)-deleted Escherichia coli K12-Shigella flexneri hybrid vaccine strains | |
EP0209599A1 (en) | A 987p fimbriae-producing microorganism, a vaccine for the immunization of pigs as well as a method for production of the vaccine | |
Galaviz et al. | Detection of potentially cariogenic strains of Streptococcus mutans using the polymerase chain reaction | |
RU2140981C1 (en) | Avirulent strain vibrio cholerae of non 01-serogroup (variants), method of strain preparing (variants), vaccine | |
EP1181371B1 (en) | Attenuated mutant enteropathogenic e. coli (epec) strains, process for their production and their use | |
KR102674702B1 (en) | Attenuation of bacterial virulence by attenuation of bacterial folate transport | |
Isberg | Intracellular trafficking of Legionella pneumophila within phagocytic cells | |
AU2003236302B2 (en) | Virulence genes and proteins, and their use | |
AU2013201267B2 (en) | Anti-bacterial vaccine compositions | |
Koomey | GENETIC AND BIOCHEMICAL STUDIES OF GONOCOCCAL IMMUNOGLOBULIN-A1 PROTEASE | |
Tuanyok | A Study of the Molecular Epidemiology and Genetic Basis of Virulence Mechanisms in Shigella Spp. |