FR2782734A1 - Procede pour remodeler le genome d'un animal par transfert zygotique d'une recombinase specifique de site - Google Patents

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Abstract

La présente invention concerne un procédé pour transférer dans un oocyte d'un mammifère une protéine d'intérêt, notamment une recombinase spécifique de site, sous sa forme active. Ladite recombinase est exprimée dans les cellules germinales mâles sous le contrôle d'un promoteur spécifique et reste associées à la chromatine des spermatozoïdes. Ce procédé est particulièrement utile pour remodeler le génome d'un animal, par exemple pour insérer une séquence étrangère dans le génome d'un animal, et pour remplacer une séquence par une autre. Dans le cas où ledit promoteur est le promoteur Sycpl, un mode d'application permet de réaliser des recombinaisons entre chromosomes paternels et maternels. La présente invention porte également sur les animaux susceptibles d'être obtenus par ce procédé, et sur l'utilisation de ces animaux transgéniques dans les industries pharmaceutiques, cosmétiques, et agro-alimentaire.

Description

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La présente invention concerne un procédé pour transférer dans un oocyte d'un mammifère une protéine d'intérêt, notamment une recombinase spécifique de site, sous sa forme active. Ladite recombinase est exprimée dans les cellules germinales mâles sous le contrôle d'un promoteur spécifique et reste associées à la chromatine des spermatozoïdes. Ce procédé est particulièrement utile pour remodeler le génome d'un animal, par exemple pour insérer une séquence étrangère dans le génome d'un animal, et pour remplacer une séquence par une autre. Dans le cas où ledit promoteur est le promoteur Sycpl, un mode d'application permet de réaliser des recombinaisons entre chromosomes paternels et maternels. La présente invention porte également sur les animaux susceptibles d'être obtenus par ce procédé, et sur l'utilisation de ces animaux transgéniques dans les industries pharmaceutiques, cosmétiques, et agroalimentaire.
Le procédé de recombinaison site spécifique représente un outil puissant pour effectuer des modifications prédéterminées dans le génome des animaux. Plusieurs enzymes de recombinaison, dont la recombinase Cre du bactériophage P1 (Sauer & Henderson, 1989,1990 et Porter, 1998) catalysent un événement de recombinaison entre deux séquences désoxyribonucléotidiques double brin définies (séquence cible LoxP pour l'enzyme Cre).
Ces opérations de recombinaison par Cre ont été réalisées dans des cellules en culture (Sauer et Henderson, 1990) et dans les cellules des plantes (Albert et al. 1995), mais pas sur la lignée germinale d'un animal.
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La réaction de recombinaison a été le plus souvent utilisée pour la délétion ciblée "knock-out" de régions génomiques spécifiques dites floxées par recombinaison intramoléculaire entre deux sites LoxP d'une même molécule. En particulier, des délétions dans des types cellulaires déterminés ont été réalisées à partir de diverses constructions génétiques permettant de faire exprimer spécifiquement la recombinase Cre (Brocard et al. 1997). L'intégration ciblée "knock-in" pourrait représenter une possible application de la recombinaison spécifique de site et serait d'un grand intérêt, mais certaines limitations n'ont pas permis un tel développement. De manière générale, une recombinase pourrait catalyser une recombinaison intermoléculaire entre deux molécules d'ADN portant chacune un site spécifique (ou site de recombinaison) et servirait à l'intégration d'un ADN hétérologue (introduit dans la cellule) en un site défini (une région du génome de la cellule).
L'application à la lignée germinale d'un mammifère pourrait être envisagée chez les mammifères par les méthodes actuellement disponibles, mais l'opération exigerait une suite de longues étapes techniquement difficiles, impliquant la sélection de clones recombinants dans des cellules ES en culture, l'obtention de chimères germinales, et une série de croisements avant l'obtention d'une lignée recombinante stable. D'une part, le temps requis pour l'ensemble de ces opérations se chiffrerait en mois, sinon en années et le rendement serait faible. D'autre part, la sélection des clones recombinants exigerait l'introduction de gènes de résistance à des antibiotiques. Ces sélections pourraient introduire des distorsions imprévisibles de l'expression génétique.
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En l'état actuel de la technique, les mutations introduites par recombinaison homologue ou excision sont fréquemment létales pour les animaux. De ce fait, l'effet de ces mutations dans la lignée germinale mâle ne peut être évalué puisque le processus cyclique de la spermatogenèse implique un nombre de gènes de régulation qui exercent des fonctions critiques dans d'autres organes. Un exemple de cette situation a été décrit pour le gène Brcal (Gowen et al. 1996, Zabludoff et al. 1996).Cette limitation peut être surmontée en établissant un contrôle spatial et temporel de l'expression de la recombinase. L'utilisation de promoteurs de tissus spécifiques et de promoteurs inductibles, l'utilisation de vecteurs adénoviraux et de formes de la recombinase activées par des hormones ont été considérées pour palier ce problème (Akagi et al. 1997, Brocard et al. 1997, Gu et al. 1994, Kûhn et al. 1995, Porter, 1998 , Wagner et al. 1997).
Ces problèmes sont résolus par la présente invention puisque la recombinase, n'est exprimée que dans les cellules germinales mâles. De manière inattendue, elle reste associée à la chromatine des spermatozoïdes et est transférée par les spermatozoïdes dans les oocytes sous forme active après la fécondation. Ceci permet in fine de remodeler le génome.
Une application supplémentaire pourrait être la recombinaison méiotique homologue spécifique de site entre chromosomes paternels et maternels. Ceci exigerait la présence de l'enzyme pendant la première division de méiose (essentiellement au stade pachytène), ce qui est précisément le cas dans les expériences menant à la présente invention.
La méiose réduit la taille du génome et génère une diversité génétique par recombinaison homologue, tout en
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maintenant l'intégrité génétique par un processus de réparation. Il existe peu de connaissances concernant les processus de régulation transcriptionnelle lors des premiers stades de la méiose. Cependant, des études avec des souris transgéniques ont conduit récemment à l'identification de promoteurs spécifiques des cellules mâles, par exemple HSP70-2 (Dix et al. 1996), Pdha-2 (Iannello et al. 1997), Pgk2 (Robinson et al. 1989), Tcp-lObt (Ewulonu et al. 1993) et Hox-a. 4 (Berhinger, 1993). L'adressage de l'expression de Cre vers la lignée germinale, publié dans O'Gorman et al. 1997, utilise le promoteur de la protamine Prml, qui est actif seulement après la méiose.
Le gène Sycpl a été identifié, cloné et localisé sur le chromosome 3 de la souris (Sage et al. 1997) . La protéine est un composant majeur de l'élément central du complexe synaptonemal (Meuwissen et al. 1992). Elle est présente exclusivement pendant la méiose du mâle et de la femelle du début du stade zygotène jusqu'au stade diplotène (Meuwissen et al. 1992, Heyting et al. 1989, Offenberg et al. 1991, Dietrich et al. 1992, Moens et al. 1992, Dobson et al. 1994).
L'expression concomitante de l'ARNm et de la protéine montre que la régulation de l'expression se situe au niveau transcriptionnel (Meuwissen et al. 1992).
Contrairement aux promoteurs ci-dessus mentionnés, qui sont exprimés à des stades relativement tardifs de la différenciation germinale, Sycpl présente l'intérêt d'être exprimé lors de la phase précoce de la méiose des spermatocytes. Il a été nécessaire d'identifier et de sélectionner les éléments responsables de l'expression spécifique de Sycpl. Vu qu'il n'a pas été possible d'établir une lignée cellulaire qui exprime le gène endogène, des
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expériences à partir de souris transgéniques ont été effectuées. Ainsi, on a trouvé qu'une région du promoteur de Sycpl de souris, localisée jusqu'à 260 pb en amont du site d'initiation de la transcription du gène Sycpl, est non seulement suffisante pour diriger l'expression d'un transgène pendant la période initiale de la méiose chez le mâle, mais est aussi est la plus efficace chez les mâles sans pour autant être active dans l'ovaire. Cette région de Sycpl se trouve donc utile pour la recombinaison méiotique entre des sites LoxP soit portés sur le même chromosome, soit à des localisations distinctes des chromosomes paternels et maternels.
L'ensemble des opérations nécessaires à la mise en oeuvre de la présente invention n'exige qu'une série de microinjections et réimplantations, technique aujourd'hui de routine, sur un nombre limité d'oeufs fécondés (une portée est le plus souvent suffisante). Contrairement à une opération menée à partir de cellules ES, la procédure présentée n'implique pas l'utilisation de systèmes de sélection, et le temps nécessaire à l'obtention de la souris recombinante est de quelques semaines, ce qui est considérablement plus rapide que pour la sélection de recombinants. En outre, les animaux transgéniques obtenus et leurs descendances sont totalement stables.
Ainsi, aucun des documents de la technique antérieure ne décrit, ni ne suggère la présente invention telle que définie ci-dessous.
Description La présente invention concerne un procédé pour transférer dans un oocyte une protéine d'intérêt, qui possède une forte
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affinité pour l'ADN, sous sa forme active. Ce procédé consiste à faire exprimer dans les cellules germinales mâles une protéine possédant une forte affinité pour L'ADN, ladite protéine restant associée à la chromatine des spermatozoïdes, à fertiliser des oocytes et à transférer la protéine par lesdits spermatozoïdes. La protéine est ensuite libérée sous sa forme active lors de la décondensation de la chromatine après la fécondation.
Un mode d'application avantageux de ce procédé réside dans le transfert d'une recombinase spécifique de site, notamment Cre.
Ainsi, la présente invention concerne un procédé d'insertion d'une séquence étrangère dans le génome d'un animal comprenant les étapes suivantes : a) expression d'une recombinase spécifique de site dans les spermatocytes d'un màle portant au moins un site spécifique dans son génome, ladite recombinase restant associée à la chromatine des spermatozoïdes. b) Fertilisation des oocytes et transfert de la recombinase par lesdits spermatozoïdes. c) Microinjection d'un ADN recombinant possédant la structure site spécifique-séquence étrangère dans le pronucleus mâle après fécondation. d) Insertion du transgène d'intérêt au site spécifique dans le génome de l'embryon au stade 1 cellule, catalysée par la recombinase libérée lors de la décondensation de la chromatine du spermatozoïde.
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Dans ce procédé, ladite séquence étrangère comporte un gène d'intérêt, à exprimer sous le contrôle d'un promoteur éventuellement tissu(s) spécifique. Le gène d'intérêt peut posséder en outre un élément accepteur d'épissage (SA), une séquence IRES (Internal Ribosome Entry Site) et/ou un signal de polyadénylation (par exemple AATAAA) et le gène d'intérêt peut coder pour une protéine d'intérêt ou être un gène rapporteur permettant d'identifier des promoteurs tissus spécifiques.
Dans un autre aspect, l'invention a pour objet un procédé de remplacement d'une séquence X par une séquence Y dans le génome d'un animal qui consiste à croiser un mâle de génotype site spécifique-séquence X- site spécifique dont les spermatocytes expriment une recombinase spécifique de site, ladite recombinase restant associée à la chromatine des spermatozoïdes, avec une femelle possédant la structure site spécifique-séquence Y- site spécifique dans son génome, ladite recombinase catalysant l'excision de la séquence X pendant la méiose des spermatocytes et l'intégration de la séquence Y dans le site spécifique juste après fécondation des oocytes. Bien évidemment, ce procédé peut être aussi réalisé in vitro en microinjectant une séquence comprenant la structure site spécifique-séquence Y- site spécifique dans l'oocyte fertilisé. On entend par séquence X ou séquence Y, n'importe quelle séquence codante ou non codante.
Selon les procédés évoqués supra et pour la suite de la description de l'invention, ladite recombinase peut être Cre et ledit site spécifique un site LoxP et être exprimée sous le contrôle d'un promoteur permettant une expression efficace dans les cellules germinales d'un mammifère. N'importe quelle protéine Cre, ses mutants, et variants, et n'importe quel mutant et variant de la séquence LoxP, peuvent être utilisés dans le cadre de la présente invention. Cre, bien connue de
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l'homme du métier, a été décrite notamment dans EP 300 422 (page 4 lignes 5-33) et EP 220 009 (page 3 lignes 31-39), incorporés dans la description par référence. De nombreux plasmides contenant la séquence de Cre y sont divulgués et ont été déposés à l'American Tissue Culture Collection tels que BSY90 (n d'accession ATCC 53255) et pBS39 (n d'accession ATCC 20772). La séquence de Cre peut être isolée de pBS39 par les enzymes de restriction XhoI et Sali. D'autres systèmes Recombinase/site spécifique peuvent être utilisés dans le cadre de la présente invention. On peut citer notamment le système FLP/FRT dérivé de Saccharomyces cerevisiae, le système S/RS de Zygosaccharomyces rouxii et le système Gin/gix dérivé du bactériophage Mu qui sont décrits dans EP 814 165, incorporé dans la description par référence.
Parmi les promoteurs qui permettent une expression efficace dans les cellules germinales d'un mammifère, on retient notamment les promoteurs Sycpl (N d'accession dans les banques de données U 35665), TcplO (M 84175), Pgk-2, HSP-70-2, Pdha-2 ou Prml (X 07626), ou au moins une région de ces promoteurs.
Par exemple, ledit promoteur peut comporter au moins une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la région-260/+5 (SEQ ID n 1) du promoteur Sycpl de souris. Cette région est suffisante pour induire efficacement l'expression d'un gène d'intérêt spécifiquement lors de la méiose précoce des spermatocytes d'un mammifère.
Des exemples de promoteurs pouvant servir pour l'accomplissement de la présente invention sont illustrés au tableau 1 ci-dessous. Les références du tableau sont incorporées par référence dans la description.
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Tableau 1 : Promoteurs actifs à différents stades de la spermatogenèse.
Figure img00090001
Promoteur "-.-~~~.~..~.-..~... bzz~ ~s~~~ ~ .. ~ Gène Minimal défini Spécificité d'expression Références EF-i alpha (-1200 ;-IJ Spcrmatogonics (Furuchi, 1996) IAP LTR Spcrmatogonics (Duprcssoir, 1996) FRMI/ [-2800 , '-1] Spcrmatogonics (Hcrgcrsbcrg, t995)
Figure img00090002
<tb>
<tb> Pdha-2 <SEP> [-187,-1] <SEP> Spermatocytes <SEP> précoces <SEP> (Iannello, <SEP> 1997)
<tb> Hsp70-2 <SEP> [-640 <SEP> ;+287] <SEP> Leptotèncs <SEP> à <SEP> spermatides <SEP> rondes <SEP> (Dix <SEP> , <SEP> 1996)
<tb>
Figure img00090003

Sycpt [-54, +5] Lcptotene/zygoteneapachytene présente invention Camll n # f-294 +61 Spcrmatocytcs (lkeshima, 1994) f-1000 -)1 Spcrmatocytcs c .... primaires (Bartcll, 1996)
Figure img00090004
<tb>
<tb> Hlt <SEP> et <SEP> spermatides
<tb> p4-Gtasc <SEP> [-543 <SEP> ;+253] <SEP> @ <SEP> (Shaper, <SEP> 1994)
<tb> Spcrmatocytcs <SEP> pachytcncs
<tb> et <SEP> spermatides <SEP> rondes
<tb>
Figure img00090005

Zfy 1/ [-4300 -1] . rf, 1 (Zan1browicz 1994)
Figure img00090006
<tb>
<tb> Spermatocytes <SEP> pachytènes
<tb> et <SEP> spermatides <SEP> rondes
<tb>
Figure img00090007

Tcp-lObt f-973 ' -11 S permatocytes pachytcncs a (Ewu1onu 1993) '
Figure img00090008
<tb>
<tb> spermatides <SEP> allongées
<tb> Pgk-2 <SEP> [-515 <SEP> ;-1] <SEP> Spcrmatocytes <SEP> pachytènes <SEP> à <SEP> (Robinson <SEP> 1989)
<tb> spermatides <SEP> allongées
<tb> Hst70 <SEP> [-800 <SEP> ;-1] <SEP> Spcrmatocytcs <SEP> pachytencs <SEP> et <SEP> cellules <SEP> (Widlak, <SEP> 1995)
<tb> post-méiotiques
<tb> Hox-a.4/ <SEP> [-4000 <SEP> ;+1000] <SEP> Spermatocytes <SEP> pachytenes <SEP> et <SEP> cellules <SEP> (Berhinger, <SEP> 1993)
<tb> post-méiotiques
<tb> Proacrosin <SEP> [ <SEP> -2300 <SEP> ;-1] <SEP> Spermatides <SEP> rondes <SEP> à <SEP> allongées <SEP> Nayemia, <SEP> 1994)
<tb> c-Kit <SEP> [-6232 <SEP> ;+526]
<tb> (16ème <SEP> intron) <SEP> Spermatides <SEP> rondes <SEP> à <SEP> spermatozoïdes <SEP> (Albancsi, <SEP> 1996)
<tb>
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Figure img00100001
<tb>
<tb> (protéine <SEP> tronquée) <SEP> ---î=
<tb>
Figure img00100002

ACE [-698.-;] Spcrmatidcs allongées (Langford, 1991)
Figure img00100003
<tb>
<tb> Prm-1 <SEP> [-2400 <SEP> ;-1] <SEP> et <SEP> spermatozoïdes <SEP> (Peschon, <SEP> 1987)
<tb> Spcrmatidcs <SEP> allongées <SEP> et
<tb> ~~~~~~~ <SEP> ~~~~~~~~~~ <SEP> spermatozoïdes <SEP> ~~~~~~~~~~~~
<tb>
La présente invention vise également les animaux transgéniques susceptibles d'être obtenus par les procédés décrits ci-dessus.
Un autre objet de la présente invention est une séquence nucléotidique permettant de promouvoir efficacement l'expression d'un gène d'intérêt pendant la première phase méiotique des spermatocytes d'un mammifère caractérisée en ce qu'elle comporte au moins une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID n 1. De préférence ladite séquence nucléotidique comporte au moins la séquence SEQ ID n 1 ou SEQ ID n 2.
La région -54/+5 du promoteur Sycpl (SEQ ID n 3) est la séquence minimale pour l'adressage de l'expression dans les spermatocytes. La région -260/+5 est toutefois requise pour une expression à un taux maximal.
Ainsi on définit la séquence nucléotidique du promoteur Sycpl minimale pour promouvoir une expression efficace et adressée dans les spermatocytes comme comportant au moins une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID n 1.
Les SEQ ID n 1 et SEQ ID n 2 sont les séquences-260/+5 chez la souris et-316/+5 chez le rat respectivement. De préférence, cette séquence nucléotidique est caractérisée en ce qu'elle comporte au moins la séquence SEQ ID n 1 ou SEQ ID n 2. Il va
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de soi que toute séquence équivalente aux séquences SEQ ID n 1 et SEQ ID n 2, sont visées par la présente invention. On entend par séquence équivalente toute séquence d'un promoteur de Sycpl de mammifère suffisante pour induire efficacement l'expression d'un gène d'intérêt spécifiquement dans les spermatocytes des mammifères, tel que par exemple les porcins, les ovins, les bovins, et les rongeurs.
Dans un aspect supplémentaire, l'invention concerne une séquence nucléotidique comprenant au moins une desdites séquence fusionnée à une séquence codante pour un gène d'intérêt. Le gène d'intérêt est de préférence un gène codant pour une recombinase spécifique de site, notamment Cre. Elle porte aussi sur une molécule d'ADN comportant au moins cette séquence sous la forme d'un plasmide, d'un vecteur viral, d'un pseudo-vecteur, ou d'un ADN nu linéaire ou circulaire.
La présente invention vise également un animal transgénique possédant dans son génome ladite séquence nucléotidique permettant l'expression d'un gène d'intérêt spécifiquement dans les spermatocytes, de préférence une recombinase spécifique de site, notamment Cre. La recombinase demeure associée à la chromatine des spermatozoïdes.
Cet animal est utile pour les procédés précédemment mentionnés.
La présente invention vise également un procédé de recombinaison entre chromosomes paternels et maternels qui consiste à croiser un animal mâle portant dans son génome un ou plusieurs site(s) spécifique(s), avec un animal femelle portant dans son génome un ou plusieurs site(s) spécifique(s) caractérisé en ce que la recombinase, exprimée lors de la première phase de la méiose, catalyse la recombinaison entre sites spécifiques.
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Dans un autre aspect, l'invention porte sur un animal susceptible d'être obtenu par ce procédé et un animal multi transgénique obtenu en croisant les animaux susceptibles d'être obtenus par les procédés décrits supra. L'animal transgénique selon l'invention est un mammifère, notamment sélectionné parmi les ovins, les porcins, les bovins, et les rongeurs.
Un aspect avantageux de la présente invention concerne l'utilisation dudit animal transgénique pour la préparation de substances utiles en médecine, en cosmétique, et/ou en agroalimentaire, notamment de substances actives, de préférence des peptides ou polypeptides, des anticorps, des antigènes, des hormones, ou des facteurs de croissance, et/ou pour la fabrication de suppléments alimentaires. Par exemple, on peut faire produire une protéine d'intérêt dans le lait de mammifères sous le contrôle d'un promoteur tissu spécifique ; par exemple WAP lapin ou WAP souris (demande de brevet Européen n 92401635.5-2105).
On peut aussi utiliser ledit animal comme modèle expérimental pour l'identification de gènes, de promoteurs, de protéines, notamment de gènes impliqués dans les maladies génétiques, et/ou pour tester l'action de substances actives, pour la préparation d'organes ou de cellules présentant une meilleur immuno-compatibilité avec les humains que les organes ou cellules de type sauvage ou susceptibles d'avoir un faible taux de rejet par les défenses immunitaires des humains, et pour l'élevage.
La présente invention concerne également l'ensemble des éléments tels que décrits dans les revendications, lesdits éléments étant incorporés dans la description par référence.
Pour la suite de la description, on se référera aux légendes des figures présentées ci-dessous.
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LEGENDES DES FIGURES Figure 1 : la recombinaison spécifique de sites.
A- Représentation schématique de la délétion de région génomique spécifique par recombinaison intramoléculaire entre des région dites "floxées" situées entre deux sites LoxP.
B- Intégration ciblée d'une séquence étrangère catalysée par une recombinaison intermoléculaire entre deux ADN portant chacun un site LoxP.
Figure 2 : Recombinaison méiotique homologue entre chromosomes paternel et maternel en un site spécifique LoxP.
Figure 3 : activation du transgène loxP-Pgeo sans promoteur après microinjection de la construction Pgkl-loxP.
A. Le plasmide pGK-lox comprend un fragment BamHl-HindIII, de PGKpgeobpA (Friedrich and Soriano, 1991) contenant le promoteur du gène Pgkl, inséré entre les sites BamHI (B) et HindIII (H) de pBS112 (Sauer and Henderson, 1990). L'ADN plasmidique a été clivé avec HindIII et PvuI (P) avant microinjection, ce qui a pour conséquence de supprimer le site loxP en 5'. La microinjection a été effectuée selon les techniques standards (Hogan, 1986) dans les #ufs fertilisés provenant du croisement entre une femelle de type sauvage et un mâle double transgénique portant les transgènes Tcp-lObt-cre et loxP-Pgeo.
B, C et D. Les #ufs microinjectés ont été maintenus en milieu de culture pendant 24 heures et ont été colorés avec X-Gal pour détecter l'activité P-galactosidase. B est le contrôle (pas de
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microinjection). Aucune activité P-galactosidase endogène n'est détectée. C et D sont deux séries d'#ufs dans lesquels on a microinjecté la construction décrite en A. L'activité ssgalactosidase est détectée (coloration et flèches).
Figure 4 : Insertion site spécifique de GFP au locus Rxra.
A. Représentation schématique du génome de la souris mâle parente Sycpl-Cre Rxr[alpha]#AF2 (LNL) dans les cellules somatiques et dans les gamètes.
B. Carte du vecteur d'insertion de LoxP-GFP. Le plasmide a été construit par insertions successives à l'intérieur du plasmide pBS112 (pBR322 contenant un site LoxP, Sauer and Henderson, 1990) des fragments suivants : - BamHI-NcoI provenant de pGTl.8 IRES (3geo (Mountford, 1994) avec une partie de l'intron En-2 du gène "engrailed" de la
Drosophile, un accepteur d'épissage (Sa), et un Ires (Internal Ribozomal entry site).
- HindIII-EcoRI provenant de pEGFP (Clontech) contenant la région codante pour GFP.
- SacI-XhoI provenant de psAssgeo avec le signal de polyadenylation (pA).
C. Schémas représentant la recombinaison effectuée par Cre conduisant à l'intégration dans Rxr[alpha]#AF2 (L) et le locus modifié résultant de la recombinaison spécifique de site.
D. Résultats de l'amplification PCR de l'ADN génomique de 13 bébés obtenus à partir des #ufs microinjectés en utilisant les amorces GFP1 et GFP2, et les amorces RXR1 et int2 (montre la
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jonction RXR-int. La présence ou l'absence de Sycpl-Cre est vérifiée par southern blot.
Figure 5 : Structure et séquence de la région 5' du gène Sycpl de la souris
A- Carte schématique de la région 5' de Sycpl
Les exons 1 et 2 sont numérotés, la présence du premier ATG et du site d'initiation de la transcription (+1) sont indiqués. Les limites des fragments utilisés pour la construction des différentes lignées transgéniques sont représentées. Les sites de restriction sont : B pour BamHI, P pour Pstl, S pour SacII, et A pour ApaI.
B- Comparaison de la séquence de Sycpl de la souris (M) et du rat (R).
Les sites de liaison putatifs pour les facteurs de transcription sont indiqués (encadrés dans des rectangles). La séquence transcrite (exon 1) est soulignée.
Figure 6 : Expression des diverses constructions Sycpl/luc dans une lignée cellulaire somatique
Chaque bar représente la moyenne de trois expériences, chacune réalisée trois fois. Les bars d'erreur indiquent l'erreur standard à la moyenne. Les valeurs statistiques ont été calculées en utilisant le test de Student pour cette figure et les autres. Tous les résultats sont relatifs au contrôle interne CMV/lacZ. Le vecteur contrôle (pXPl) contient le gène rapporteur de la luciférase sans promoteur. L'activité du plasmide SV40-luc a été fixé arbitrairement à 100.
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Figure 7 : L'expression spécifique dans les testicules des gènes rapporteurs dans les lignées transgéniques [- 722/+102] lacZ, [-260/+102]lacZ, [-260/+102]luc et[-54/+102]luc.
Chaque bar représente la moyenne de l'activité d'au moins cinq mâles transgéniques provenant de lots différents. Les bars d'erreur indiquent l'erreur standard à la moyenne. Cette activité est normalisée à la quantité de protéines et au bruit de fond des souris non transgéniques appartenant au même lot. Le faible niveau de l'activité lacZ est due à un niveau endogène élevé de type P galactosidase dans les cellules testiculaires. Pour chacun des chimères, deux lignées ont été étudiées en détail (1 et 2). Te représente les testicules, Li le foie, Sp la rate, Ki les reins, He le coeur et Lu les poumons.
Figure 8 : Expression du gène rapporteur luciférase dans les testicules de souris transgéniques [-54/+102] luc et [- 260/+102] luc lors de leur développement.
Des extraits de foie ont été utilisés comme contrôle négatif. Chaque bar représente la moyenne d'au moins quatre mâles transgéniques provenant de lots différents. Les bars d'erreur indiquent l'erreur standard à la moyenne. P8 à P14 sur l'axe des abscisses représentent les stades de développement du huitième jour au quatorzième jour.
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Figure 9 : Expression du gène rapporteur luc dans la souris transgénique [-260/+5] dans différents organes.
L'expression spécifique dans les testicules du gène rapporteur luciférase dans les souris transgéniques [- 260/+5]luc est représentée. Trois lignées indépendantes ont été testées pour l'expression du gène rapporteur. Chaque bar représente l'activité moyenne pour au moins cinq mâles transgéniques. Les bars d'erreurs indiquent l'erreur standard à la moyenne parmi des expériences.
La légende des divers organes testés est identique à la légende de la figure 7.
Figure 10 : Expression du gène rapporteur luciférase dans les testicules et le foie de souris appartenant à la lignée transgénique [-260/+5] au cours du développement.
Les barres rayée horizontalement représentent l'expression dans les testicules et les barres rayées en diagonale représentent l'expression dans le foie.
P8 jusqu'à P15 représentent les stades de développement du huitième jour au quinzième jour respectivement.
Les bars d'erreurs indiquent l'erreur standard à la moyenne parmi des expériences.
Figure 11 : Les transgènes Sycpl/lacZ ne sont pas exprimés pendant la méiose chez la femelle.
Des tests PCR ont été réalisés sur l'ARN provenant des testicules du foie de l'ovaire foetal E17 de souris transgéniques [-260/+102]lacZ et sur l'ARN de l'ovaire foetal
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E16 de souris transgéniques [-1848/+102]lacZ. L'ARN a été prétraité avec la DnaseI et a été soumis ou pas à la digestion par la RnaseA (+ et-) avant la réverse transcription. Les transcripts Sycpl sont détectés dans l'ARN des testicules adultes et l'ARN provenant des ovaires au stade embryonique du seizième jour (E16) et du dix-septième jour (E17), mais dans l'ARN du foie. L'ARNm de lacZ est seulement détecté dans les testicules adultes transgéniques.
Figure 12 : Excision des séquences floxées dans la descendance d'un mâle Sycpl-Cre/Rxr[alpha]#AF2 (LNL).
Les séquences Cre identifiées par amplification PCR avec une paire d'amorces Crel et Cre2 (Rxra allèle sauvage), Rxr[alpha]#AF2 (L) (allèle délétée) , et Rxr[alpha]#AF2 (LNL) (allèle cible), avec RXR1 et RXRII et tk-neo, avec tkneol et tkneo2 (Feil et al.
1996). La colonne 1 correspond à la souris progénitrice, et les colonnes 2 à 10 représentes des bébés appartenant à la même portée.
Figures 13 et 14 : délétion ciblée de gènes floxés multicopies dans des cellules germinales.
L'ADN a été préparé à partir de diverses tissus provenant de mâles double transgénique progéniteur et extrait de la queue de leur descendance, digéré avec l'enzyme de restriction HindIII et en utilisant l'ADN plasmidique de pSApgeo (colonne 1 à 7) ou par pPGKAssgeobpA (colonne 8 à 13) comme sonde, qui révèle les séquences floxées et les séquences pBR322 du transgène Cre. Les colonnes 1 à 3 ont été chargées avec l' ADN d'un progéniteur double transgénique Sycpl-Cre/pgeo floxé (1 représente le foie, 2 les reins et 3 les testicules). Les
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colonnes 4 à 6 correspondent à l'ADN extrait des queues de trois bébés obtenu avec une souris normale. La colonne 7 correspond à l'ADN d'une souris portant le trangène Sycpl-Cre (contrôle). La colonne 8 représente l'ADN et la colonne 9 l'ADN des testicules d'un progéniteur double transgénique Sucpl/Cre Pgkl floxé. Les colonnes 10 à 13 correspondent à l'ADN des queues de quatres bébés obtenus. Les fragments de restriction sont indiqués par "c" qui est le fragment du transgène Cre ; "in" qui représente les fragments internes des transgènes prédits à partir de leur séquences nucléotidiques (les tailles respectives sont 3,9et 2,4 kb pour ssgéo et 3 pour Pgkl) ; "j" correspond aux fragments de jonction avec les séquences cellulaires avoisinantes. Le transgène est représenté par une ligne simple, la séquence chromosomique par une double ligne, et les sites LoxP par un triangle.
Description détaillée.
Le procédé original de la présente invention permet donc de transférer une recombinase dans les oocytes afin d'effectuer rapidement et avec une efficacité élevée toutes les opérations de recombinaison spécifique de site dans le génome des mammifères, en particulier l'insertion d'une séquence étrangère (knock in), le remplacement de séquences ou l'inactivation de gènes, et la recombinaison méiotique entre chromosomes parentaux (Voir figures 1 et 2). Cette méthode est fondée sur la surprenante démonstration que la recombinase, exprimée pendant la méiose, est transmise en association avec la chromatine du spermatozoïde et est donc capable de catalyser une recombinaison de site prédéfini dans l'embryon avant la première division. Il est à noter que le transgène Cre est présent chez le père à l'état hémizygote. Ceci a pour conséquence que seulement 50% des descendants le reçoivent. En
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revanche, tous reçoivent l'enzyme associée à la chromatine du gamète, et la recombinaison a lieu efficacement et uniquement dans les embryons au stade 1 cellule, ce qui assure la stabilité ultérieure des sites LoxP recombinés.
De plus, si le transgène est transmis, l'activité du promoteur s'éteint dans les cellules somatiques durant toute la vie de l'organisme, du développement embryonnaire jusqu'à sa sénescence. Ainsi, les modifications génétiques réalisées sont reproduites au cours du développement dans toutes les cellules de l'organisme, sans chimérisme décelable, lesdites modifications demeurant stables et immédiatement héréditaires.
La méthode présentée est applicable aux organismes pour lesquels les techniques de transgenèse ont été jusqu'ici difficiles à développer (absence de lignées de cellules ES).
Transfert de la recombinase Cre par la chromatine du spermatozoïde. @
Dans le cas du transgène Tcp-10-bt-Cre d'abord, puis dans celui du transgène Sycpl-Cre, on a montré que des molécules d'enzyme Cre synthétisées pendant la spermatogenèse restent associées à la chromatine compactée du spermatozoïde. Inactives dans ce contexte, elles peuvent néanmoins effectuer la recombinaison entre sites LoxP lors du retour à une structure nucléaire décompactée. Cette opération, qui peut être effectuée sur le sperme dans des conditions expérimentales, a lieu naturellement après la fécondation dans le pronucleus mâle du zygote.
L'activité de la recombinase a été testée dans les expériences suivantes :
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Lors d'une première série d'expériences, des #ufs fertilisés ont été obtenus à partir de femelles de type sauvage croisées avec des mâles hemizygotes pour le transgène Tcp-lObt-cre et pour une insertion multicopie de la région codante "floxée" du gène Pgeo sans promoteur. Une construction avec un site LoxP localisée en 3' du promoteur Pgkl a été microinjectée (figure 3A). selon les techniques standards (Hogan, 1986). Après 24 heures de culture, environ un embryon sur quatre révèle une coloration positive avec X-Gal (figure 3B, C, et D). L'expression du gène pgeo est due à l'intégration efficace du promoteur microinjecté en amont de la région codante.
Une plus simple configuration génétique telle que la structure Rxr[alpha]#AF2 (L) a été utilisée afin de mettre en évidence l'intégration site spécifique de l'ADN microinjecté.
Cette deuxième série d'expériences a démontré la présence d'une activité Cre latente dans les spermatozoïdes des souris trangéniques Sycpl-Cre, dans lesquelles l'excision des séquences floxées a lieu pendant la gamétogenèse laissant seulement un seul site LoxP au moment de la fertilisation. De surcroît, ces expériences ont permis de savoir si la recombinase est toujours active dans le pronucleus mâle et pourrait permettre l'intégration d'un transgène floxé dans un site LoxP prédéterminé. Des mâles qui possèdent le transgène Sycp-1-Cre et le locus Rxr[alpha]#AF2 (LNL) floxé ont été obtenus (Figure 4A). Dans le sperme de ces mâles, les séquences tkneo ont été abondamment excisées pour générer l' allèle recombiné Rxr[alpha]#AF2 (L).
Cet allèle est transmis à l'ensemble de la descendance qui ne conserve qu'un seul site LoxP restant. Les souris double transgéniques ont été croisées avec des femelles de type sauvage ; les embryons fertilisés ont été isolés ; et un ADN
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recombinant comportant la séquence codante pour la protéine pour la protéine GFP (Green Fluroescent Protein) en amont d'un accepteur d'épissage et d'un IRES (Internai Ribosomal Entry Séquence) (figure 4B) a été microinjecté. L'analyse PCR de la structure génomique, présentée à la figure 4D, montre que la séquence codante pour GFP a été insérée à l'intérieur du locus Rxr[alpha]#AF2 (L) (figure 4C)pour de nombreux bébés et qu'aucun animal conserve le locus LoxP intact. Les animaux du type Rxra+/+ sont sous-représentés.
Le locus Rxra-LoxP-GFP-LoxP résultant de la recombinaison est transmis et retrouvé dans les tissus somatiques de la descendance des femelles et des mâles Cre-. L'expression de GFP a été mise en évidence par microscopie par fluorescence dans la peau et les testicules de ces souris. Parmi les multiples applications offertes par le transfert efficace d'une recombinase par la chromatine du sperme, des souris rapporteuses, chacune possédant un locus génomique portant une insertion avec un site LoxP et une région codante pour une protéine rapporteur (GFP, luciferase, P-galactosidase) peuvent être obtenues. L'introduction d'un transgène en une seule étape de microinjection peut servir à identifier un promoteur, ou analyser un promoteur mutant dans un contexte génomique connu et dans tous les organes de la souris. De même, il est possible d'insérer diverses séquences rapporteurs, des régions codantes mutées, des gènes codants pour des toxines, et n'importe quelle région codante d'intérêt sous le contrôle d'un promoteur donné.
La méthode pour l'insertion ciblée d'une séquence portant un site LoxP microinjectée dans l'oeuf fécondé produit du croisement d'un mâle double transgénique Sycpl-Cre / LoxP est présentée à la figure 4 et est résumée ci-après :
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1) La constitution par croisement d'une souris double transgénique portant le transgène Sycpl-Cre et une structure dans laquelle deux sites LoxP entourent une séquence étrangère (gène tkneo) ; 2) les deux transgènes sont maintenus intacts dans les tissus somatiques de la souris; la synthèse de Cre dans la lignée germinale résulte en l'excision de la séquence floxée (tkneo) dans le sperme des mâles ; 3) un mâle est croisé avec une souris de type sauvage pour le locus Rxra et Cre ; Cre reste associé au site LoxP de l'allèle Rxra muté dans la chromatine (50% des embryons); indépendamment 50% des embryons reçoivent le transgène Cre ; 4) la recombinase est libérée après décondensation de la chromatine ; 5) un ADN recombinant LoxP-SA-IRES-GFP-polyA est microinjecté dans le pronucleus mâle 15 heures après fécondation par les techniques classiques (Hogan et al
1986) ; 6) tous les embryons, Cre+ ou Cre+, ayant reçu le gène comportant un site LoxP, y ont inséré la région codant pour la protéine GFP grâce à l'action de la recombinase; 7) expression : le site LoxP avait été inséré dans un intron du gène Rxra. La présence d'un accepteur d'épissage (SA) permet l'inclusion de la séquence IRES-
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GFP dans un messager fonctionnel, celle d'un site IRES (Intemal Ribosome Entry Site) permet la traduction de l'ARN dont l'extrémité 3' est définie par le signal de poly-adénylation ("polyA") ajouté en aval de la région codante. La fluorescence verte caractéristique de l'expression du nouveau rapporteur est mise en évidence dans les organes connus pour exprimer le récepteur
Rxra.
Dans les expériences menées lors de l'accomplissement de la présente invention, l'efficacité de recombinaison a été comprise entre 50 et 80% (recombinants rapportés au nombre de souriceaux nés après microinjection).
Il va de soi que le procédé de la présente invention, notamment illustré ci-dessus, n'est aucunement limité à une région particulière pour l'insertion du transgène, à un transgène particulier, à un promoteur particulier contrôlant l'expression d'une recombinase spécifique de site, ou encore à une recombinase spécifique de site particulière.
L'étendue des applications rendues possibles grâce aux transfert d'une recombinase par la chromatine des spermatozoïdes est notamment illustrée par les différents cas de figures suivants : Identification d'un promoteur spécifique d'un tissu.
Une "souris rapporteuse" est réalisée qui porte un transgène comportant les séquences LoxP-IRES-GFP-polyA intégrées en un site chromosomique, soit par transgénèse et recombinaison illégitime, soit par recombinaison homologue.
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L'insertion en amont de fragments génomiques clonés dans un vecteur comportant également un site LoxP permet, dès la première génération de souris, d'identifier les animaux, donc le fragment qui expriment la GFP dans le tissu d'intérêt.
Plusieurs "souris rapporteuses" peuvent être utilisées en parallèle, avec des gènes rapporteurs différents (notamment P galactosidase ou luciférase), à différentes localisations chromosomiques. On peut également insérer un gène d'intérêt codant pour une protéine d'intérêt exprimé par exemple dans le lait de mammifère.
Analyse du patron d'expression d'un promoteur.
L'insertion d'un rapporteur en aval d'un promoteur (GFP en aval de Rxra) permet d'établir avec précision le patron d'expression du promoteur intact dans sa localisation génomique naturelle.
Expression de gènes hétérologues ("knock in").
Selon le patron d'expression après l'insertion d'un gène rapporteur, on pourra réaliser l'expression de tout gène biologiquement actif sous le contrôle transcriptionnel du promoteur d'intérêt. Par exemple, on peut insérer un gène codant pour une toxine, notamment la toxine diphtérique, sous le contrôle d'un promoteur tissu spécifique, et provoquer ainsi la destruction de cellules données éventuellement à un stade donné du développement.
Analyse de mutants.
L'insertion de cassettes comportant différents mutants d'une même séquence permet de comparer leurs propriétés dans un
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contexte chromosomique constant, et dans des conditions physiologiques constantes ou variables.
Le promoteur Scypl peut-être utilisé dans le procédé selon l'invention.
Le gène Sycpl est exprimé uniquement pendant la prophase de la première division méiotique dans les cellules germinales mâles et femelles (Meuwissen et al, 1992 ; et al. 1989 ; Offenberg et al. 1991 ; et al. 1992 ; et al.
1992 ; Dobson et al. 1994 et Dietrich et al. 1983). La séquence nucléotidique de la région 5' du gène Sycpl de la souris a été décrite par Sage et al. 1997 (figure 5A). La région en amont du gène ne contient pas de TATA box, mais le site de transcription comprend l'élément initiateur CCA+1GTCC (Smale et al. 1989) . Le criblage d'une librairie génomique avec un fragment Pst1 de l'ADNc de rat (692 bp) qui couvre les 585 bp de l'extrémité 5' de la région codante de Sycpl et un morceau de la séquence leader non traduite (Meuwissen et al. 1992 ; et al. 1995), a conduit à l'identification de cinq clones génomiques, dont l'un d'entre eux comprend la région 5' en amont du site d'initiation de la transcription.
Le fragment BamHl s'étendant le plus loin du côté 5', qui hybride avec la sonde ADNc 692 bp, a été sous-cloné et sa séquence nucléotidique a été établie. La séquence nucléotidique dans la région analysée, s'étendant des positions-324 à +268 montre une identité globale de 80 % entre les deux espèces (figure 5b) .
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Le haut degré de conservation entre les deux espèces est une indication claire que cette région contient d'importants éléments régulateurs.
L'analyse transgénique et plusieurs séries de délétions à l'intérieur du promoteur Sycpl ont permis de définir deux régions fonctionnelles différentes. Un enhancer fort est présent entre les position-260 et -54. Un élément proximal de 59 bp de long (-54 à +5), est suffisant pour diriger l'expression de gènes rapporteurs hétérologues (lacZ et luc) dans les cellules germinales mâles appropriées (figure 5).
Puisque l'enhancer présent dans le promoteur Sycpl est actif dans des lignées cellulaires de diverses origines, il est clair que ce promoteur dépend de l'action de facteurs de transcription ubiquitaires. Le fragment entre les positions-54 et +5 est suffisant pour diriger l'expression de la luciférase dans les spermatocytes primaires. Les comparaisons de séquences entre les quatre gènes méiotiques précoces de la souris (Sycpl, Hsp70-2, Pdha-2, et Xmr), n'ont révélé aucune conservation d'un site de liaison pour des facteurs de transcription. Il existe cependant, un haut degré de similarité (80%) entre les séquences du promoteur Sycpl chez la souris et le rat. Par exemple, une E-box et un site potentiel pour des facteurs de transcription du type Myb sont conservés.
Dans les ovaires, où la méiose est initiée lors des phases précoces de développement, aucune expression des gènes rapporteurs n'est observée dans les oocytes. Ainsi le promoteur Sycpl est très avantageux comme outil pour diriger l'expression de la recombinase Cre, car son profil d'activité permet la stabilité génétique des organismes et de leurs descendances.
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La recombinaison induite par Cre au site LoxP a été programmée pour avoir lieu pendant la méiose dans les cellules germinales mâles. Le gène Cre, a été exprimé sous le contrôle transcriptionnel d'une région du promoteur du gène Sycpl, qui est active au stade leptotène-zygotène de la méiose chez les mâles. Malgré le fait que le gène est exprimé chez les gonades mâles et femelles, la région sélectionnée du promoteur qui a été utilisée dans la construction Sycpl-Cre a conduit à l'expression du transgène exclusivement dans les testicules.
En conséquence, les sites "floxés" n'ont jamais été altérés dans la descendance des femelles. Les séquences "floxées" ont été maintenues de manière stable dans les tissus somatiques (sauf dans les testicules. Aucune expression n'a été détectée lors des stades embryonnaires postérieurs à l'implantation et dans les tissus adultes même en utilisant la technique très sensible RT-PCR (Meuwissen et al. 1992).
La recombinaison induite par Cre dans les testicules représente un procédé avantageux comparé à celui décrit lors de précédentes études sur l'activité de la recombinase dans d'autres tissus de la souris (Akagi et al. 1997 ; Gu et al.
1994 ; Wagner et al. 1997). En effet, lorsque l'on teste la descendance obtenue par le procédé de la présente invention, on s'aperçoit que tous les allèles "floxés" transmis par les mâles ont subi une recombinaison. Une telle fréquence de recombinaison est particulièrement adaptée pour le système de recombinaison Cre/lox.
La recombinase Cre peut être exprimée au stade précoce de la spermatogénèse.
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On a isolé le promoteur du gène Sycpl (Synaptonemal Complex Protein 1), actif exclusivement pendant les premiers stades de la méiose et obtenu l'expression ciblée lors des stades zygotène à pachytène de gènes rapporteurs dans des souris transgéniques. On a utilisé ce promoteur, ainsi que celui d'un promoteur méiotique plus tardif (Tcp-10-bt, Ewunolu et al. 1993) pour faire exprimer l'enzyme CRE au cours de la spermatogenèse chez des souris transgéniques. Dans le cas de Sycpl, on constate chez les mâles qui portent également un transgène "floxé", l'excision de ces séquences pendant la spermatogenèse. Cette excision n'a pas lieu chez les mâles porteurs du transgène TcplO-bt-Cre. La recombinase est bien synthétisée, mais à une période où débutent la restructuration et le compactage de la chromatine, ce qui est très probablement la cause de l'absence de recombinaison avant la formation du spermatozoïde.
Recombinaison des sites LoxP pendant la méiose.
On a montré que l'expression à partir du transgène SycplCre pendant le stade pachytène de la première division de méiose permet la recombinaison entre des sites LoxP à des positions non identiques sur les chromosomes d'origine paternelle et maternelle, selon le schéma de la figure 2. Les marqueurs moléculaires disponibles sur les chromosomes paternels et maternels permettent de montrer un échange entre chromatides appariées aux sites LoxP. La fréquence de l'événement de recombinaison dans la descendance des mâles Sycpl-Cre portant les deux chromosomes "loxés" est de l'ordre de 30%. A partir de cet exemple, toute construction de chromosomes recombinés est possible à partir de sites LoxP introduits par les méthodes classiques de recombinaison homologue dans la cellule ES, de sites insérés par transgenèse
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et recombinaison illégitime, ou de sites introduits par les méthodes d'addition ciblée.
Activité du promoteur Sycpl dans diverses lignées cellulaires.
On a construit une série d'ADN recombinants avec différentes parties de la séquence 5' en amont de la région transcrite de Sycpl (figure 5a) liée soit au gène codant pour la p-galactosidase ou pour la luciférase. On a d'abord effectué une recherche des lignées cellulaires qui exprime le gène Sycpl afin d'obtenir une base expérimentale pour l'identification des éléments génétiques importants pour l'expression pendant la méiose.
On a ensuite utilisé une série de lignées cellulaires d'origine non germinale pour mesurer l'expression des gènes rapporteurs après transfection des ADN recombinants, dans l'espoir qu'au moins une faible activité pourrait révéler la présence du promoteur. De manière inattendue, toutes ces lignées cellulaires ont montré à un haut niveau d'activité luciférase après transfection des divers ADN recombinants (figure 6). Ces résultats démontrent que même le plus petit fragment Sycpl s'étendant seulement jusqu'au nucléotide-54 permet l'expression de la luciférase (à un niveau faible mais détectable).
Une activité distincte du promoteur, bien que non apparentée à une activité spécifique de la méiose, est donc contrôlée par les séquences de la région 5' proche du gène Sycpl. On peut donc conclure que soit des éléments silencer non compris dans le fragment le plus long testé (1950 bp) empêche l'expression de Sycpl dans les cellules somatiques in vivo,
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soit la spécificité germinale dépend d'un système de signal perdu dans les cellules somatiques en culture.
Expression spécifique dans les testicules des souris transgéniques
Quatre fragments différents du promoteur de Sycpl ont été testés pour leur capacité à diriger l'expression de gène reporteur dans des souris transgéniques ([-1848/+102), (- 722/+102], [-260/+102] et [-54/+102]).
Les trois plus longs fragments du promoteur ont été testés sur la base de l'expression du gène lacZ. Sachant que le faible niveau d'expression par le fragment [-54/+102] et que le bruit de fond de l'activité P-galactosidase dans les extraits de testicules est relativement élevé (Shaper et al. 1994) la luciférase a été utilisée dans ce cas comme rapporteur. Par comparaison, l'expression de la luciférase a été testée en parallèle pour le fragment [260/+102]. Les résultats, présentés au tableau 2 ci-dessous, démontrent que, dans chaque cas, au moins deux familles expriment le transgène exclusivement dans les testicules. Ceci a été constaté même pour la souris qui porte la plus courte séquence Sycpl [-54/+102].
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TABLEAU 2 LIGNEES TRANSGENIQUES COMPORTANT DES FRAGMENTS DU PROMOTEUR Sycpl.
Figure img00320001
<tb>
Nom <SEP> transgénique <SEP> et <SEP> Longueur <SEP> du <SEP> Nombre <SEP> de <SEP> lignées <SEP> Nombre <SEP> de <SEP> souris <SEP> adultes <SEP> Profil <SEP> de <SEP> l'expression
<tb> gène <SEP> rapporteur <SEP> fragment <SEP> transgéniques <SEP> testées
<tb> indépendantes
<tb> [-1848/+102]lacZ <SEP> 1950 <SEP> 2 <SEP> >10 <SEP> Spécifiquespermatocyte
<tb> [-722/+102]lacZ <SEP> 824 <SEP> 5 <SEP> >50
<tb> [-260/+102]lacZ <SEP> 362 <SEP> 2 <SEP> (+3 <SEP> +) <SEP> >10
<tb> [-260/+102]luc <SEP> 362 <SEP> 2 <SEP> (+1 <SEP> +) <SEP> >20
<tb> [-54/+102]luc <SEP> 156 <SEP> 2 <SEP> (+1 <SEP> ++) <SEP> >20
<tb> [-260/+5]luc <SEP> 265 <SEP> 3 <SEP> (+3 <SEP> +) <SEP> >10
<tb> ' <SEP> lignées <SEP> sans <SEP> expression <SEP> " <SEP> lignées <SEP> avec <SEP> expression
<tb>
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Cependant, le niveau d'expression est plus faible dans les familles [ - 54 / +102], ce qui implique que la séquence s'étendant jusqu'au nucléotide-54 exerce un effet enhancer in vivo, comme cela est le cas dans les lignées cellulaires somatiques transfectées.
Cet effet quantitatif a été évalué en comparant les activités enzymatiques dans les testicules de souris portant le reporteur luciférase contrôlé soit par le promoteur [-54/+102], soit par le promoteur [-260/+102] de Sycpl. Ce dernier a montré de manière constante un niveau d'activité 10 à 100 fois supérieures (figure 7).
Expression lors de la méiose dans les testicules adultes.
L'expression spécifique de la p-galactosidase dans les testicules a été confirmée par coloration X-gal de plusieurs organes. Afin d'identifier les types cellulaires exprimant les transgènes, on a ensuite analysé l'activité P-galactosidase in situ dans des sections de testicules.
Les cellules X-gal positives des animaux [-260/+102]lacZ correspondent à la seconde couche des cellules germinales situées à la périphérie des tubules. Une sur-coloration avec l'hématoxyline a confirmé que les cellules lacZ positives font partie des spermatocytes au stade III-IV à pachytène du cycle de l'épithélium séminifère (Clermont et al. 1972). Au stade zygotène et pachytène précoce, une plus faible expression P- galactosidase a pu être détectée dans certaines sections.
Aucune coloration des cellules n'a été observée dans le compartiment postméiotique des tubules ni pour les spermatocytes zygotènes précoces et diplotènes.
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L'expression endogène du gène Sycpl est absente ou très faible pendant ces stades (figure 8). Ces résultats indiquent que les séquences impliquées dans l'induction ou la suppression de l'expression de Sycpl sont localisées parmi les fragments du promoteur analysés.
Afin de déterminer si la partie du promoteur de Sycpl (+1 à +102) présent dans ces fragments joue un rôle dans l'établissement du profil d'expression des gènes rapporteurs, deux familles transgéniques supplémentaires ont été générées par microinjection d'ADN recombinant délétés de ces fragments, mais conservant l'initiateur de la transcription de Sycpl avec les séquences en amont jusqu'au nucléotide-260. Les expériences enzymatiques démontrent que la spécificité et le niveau d'expression du promoteur [-260/+5] sont comparables à ceux du promoteur [-260/+102] dans les cellules transfectées (figure 6) et dans les animaux transgéniques (figures 9 et 10, comparées à la figure 5).
Régulation lors du développement chez les souris prépubères.
L'expression des gènes reporteur chez les animaux immatures a été mesurée afin de démontrer que l'expression d'un transgène est identique à celle du gène Sycpl endogène. La première vague de méiose dans les testicules juvéniles est synchrone avec l'apparence des premières cellules méiotiques, les spermatocytes leptotènes, environ 10 jours après la naissance.
Les premières cellules pachytènes sont apparues au 14ème jour et les premières cellules haploïdes après trois semaine (Bellvé et al. 1977). Nous avons analysé les familles
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transgéniques [-260/+102]lacZ, [-260/+102]luc, [-260/+5]luc, et [-54/+102]luc.
L'analyse in situ (figure 8) ci permis de détecter l'expression de la p-galactosidase dans les spermatocytes primaires pour la souris [-260/+102]lacZ au 13ème et 15ème jour après la naissance, mais pas au 8ème jour. Au 10ème jour, l'expression a été détectée seulement sur certaines souris, et dans les cas où le résultat est positif, elle n'a été observée que dans certains tubules . Ces résultats ont été confirmés par les mesures réalisées sur les souris transgéniques [- 260/+102]luc. Aucune expression de la luciférase n'a été détectée avant le 10ème jour après la naissance.
Dans les souris [-54/+102]luc et [-260/+5]luc, le profil temporel de l'activité de la luciférase est le même, est identique que celui du gène endogène (Sage et al. 1997).
L'ensemble de ces résultats a permis de conclure qu'un fragment de 59 bp (-54/+5) du promoteur Sycpl, couvre une séquence initiatrice de 7 bp et un fragment immédiatement en amont de 52 bp qui est suffisant pour diriger l'expression d'un transgène au début de la première division méiotique dans les gonades mâles.
Aucun des transgènes qui sont exprimés dans les testicules sont transcrits dans l'ovaire.
Chez les mammifères, la gamétogénèse femelle a lieu pendant le développement embryonnaire et est arrêtée avant la naissance au stade dictyotène. Lors de la prophase de la première division méiotique, le complexe synaptonémal est morphologiquement identique que celui des cellules
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spermatogéniques (Dietrich et al. 1983 , Scherthan et al. 1996) ; et est plus visible au stade pachytène (Dietrich et al. 1992) . On observe ce phénomène dans l'ovaire f#tal pendant les 15ème et 17ème jours embryonnaires (E15 et E17) . Les expériences d'immunolocalisation réalisées sur des cryosections avec un anticorps dirigé contre la protéine SCP1 du rat (Meuwissen et al. 1992 ; Dietrich et al. 1992) ont permis de détecter la protéine SCP1 (codée par Sycpl) dans les ovaires de la souris E16 et E17. On a ensuite analysé l'expression dans les ovaires des gènes rapporteurs exprimés par diverses familles transgéniques pendant la méiose mâle. Ni la détection in situ de la p-galactosidase, ni le test à la luciférase plus sensible n'ont permis de détecter une expression du transgène.
Des expériences RT-PCR réalisées avec l'ARN des ovaires E16 de[-1848/+102]lacZ et des ovaires E17 de [261/+102]lacZ souris transgéniques n'ont pas permis de détecter les transcrits fusionnés entre le premier exon de Sycpl et la séquence lacZ, alors que l'expression du gène endogène a été détectée dans les mêmes échantillons (figure 11).
Une possible explication de l'absence de l'expression est l'utilisation d'un promoteur Sycpl alternatif dans la lignée germinal femelle, comme cela était montré pour le cas du gène de l'ADN méthyltransférase (Mertineit et al. 1998).
Pour confirmer cette hypothèse, on a utilisé la technique 5' RACE pour déterminer le site d'initiation de la transcription de Sycpl dans les cellules méiotiques provenant des ovaires E16. Douze clones contenant les plus longs fragments d'ADNc parmi 48 clones analysés, ont été séquences.
Ces séquences indiquent clairement que la transcription du site d'initiation de la transcription chez les cellules germinales de la femelle est identique à celle précédemment définie chez
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les cellules germinales mâles. Il apparaît ainsi que les signaux qui assurent l'expression temporelle et spatiale du gène Sycpl lors de la méiose mâle ne sont pas suffisants pour son expression chez la femelle.
Maintenance somatique des séquences "floxées" dans les tissus de mâles transgéniques Sycpl-Cre/LoxP.
On a établi quatre familles transgéniques indépendantes portant le transgène Sycpl-Cre. Aucune différence au niveau des propriétés de ces familles ayant été notée, on a choisi aléatoirement une famille pour la suite des études. Les résultats obtenus ont démontré que le transgène, maintenu de manière stable, n'a été transcrit que dans les testicules.
Des lignées doubles transgéniques, qui maintiennent SycplCre avec un transgène "floxé" ont été obtenues en croisant une souris Sycpl-Cre avec une souris dont son génome porte un transgène "floxé". Les techniques d'intégration d'un transgène "floxé" dans le génome d'un mammifère sont notamment décrites dans Kuhn and Schwenk, 1997, Galli-Taliadoros et al. 1995, et Feil et al. 1996. En l'espèce, deux sites cibles ont été créés par microinjection à l'intérieur des #ufs fertilisés d'un ADN clone : une répétition en tandem d'une séquence Pgeo flanquée de site LoxP (Friedrich et Soriano, 1991) et une insertion en tandem à faible nombre de copies (moins de deux copies) d'un promoteur actif (LoxP-Pgkl). Un troisième site cible correspond à l'allèle Rxr[alpha]#AF2 (LNL) (Feil et al. 1996), dans lequel une cassette LoxP-tk-neo-LoxP a été insérée par recombinaison homologue dans le 8ème intron de Rxra. Chez les mâles portant des transgènes LoxP-Pgeo et LoxP-Pkgl, l'hybridation "Southern blot" indique une stabilité totale de ces loci dans les organes somatiques.
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Une analyse plus détaillée réalisée sur des animaux Sycpl- Rxr[alpha]#AF2 (LNL) a montré que une partie des mâles (2 sur 8 testés) maintiennent dans leur ADN somatique à la fois des séquences "floxées" recombinées et intactes. Cette observation est en accord avec les résultats des études sur le promoteur Sycpl mentionnées ci-dessus. Ainsi, la structure des transgènes "floxés" établie à la naissance demeure stable dans tous les organes somatiques, même en ce qui concerne les mâles sénescents. Les animaux chimères ont été écartés et de plus amples études ont été conduites avec les mâles dans lesquels le test PCR sensible n'a pas permis de détecter une recombinaison somatique. Les séquences "floxées" modifiées ont été dans chaque cas seulement détectées dans les testicules et dans l'ADN du sperme.
Délétion du loci "floxé" lors de la transmission par les mâles Sycpl-Cre/LoxP.
Dans la descendance des croisements entre des animaux doubles transgéniques avec des partenaires non transgéniques, l'excision des séquences intervenantes ont toujours été observées lorsque le locus "floxé" a été transmis par les mâles Sycpl-Cre/LoxP, alors que les mêmes loci ont été totalement stables lorsqu'ils ont été transmis maternellement. Ces résultats sont montrés à la figure 12 pour la descendance d'une femelle de type sauvage avec un mâle hétérozygote pour l'allèle "floxé" Rxr[alpha]#AF2 (LNL) et hémizygote pour le transgène Sycpl-Cre.
L'amplification PCR de l'ADN extrait de la queue du père (colonne 1) n'a pas détecté la présence de séquences "floxées" (fragment appelé "tkneo"). Aucun des neufs bébés (colonnes 2 à 10) ne possède ce fragment. Ce résultat correspond en fait à deux situations distinctes :
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Deux bébés (colonnes 4 et 10) ont reçu l'allèle sauvage
Rxra du père (identifié par l'amplification caractéristique du produit ("RXRa").
Les autres bébés ont hérité de l'allèle Rxr[alpha]#AF2 (LNL) pour lesquels les séquences tk-neo ont été excisées.
L'amplification avec les deux amorces RXR1 et RXR2 ont généré un plus large fragment caractéristique du locus recombiné ("RXR[alpha]#AF2 (L)). L'excision a été constatée indépendamment de la présence (colonnes 2,6, 8, 9) ou l'absence (colonnes 3,4, 5,7, 10) du transgène Sycpl-Cre.
Des résultats similaires ont été obtenus pour le transgène multimérique P-geo-LoxP et le transgène Pgkl-LoxP (figure 13).
L'excision dans ce cas est mise en évidence par la disparition des bandes qui correspondent sur les "Southern blots'= aux fragments internes prédits à partir de la séquence du transgène ("in"), alors que les fragments des jonctions avec les séquences endogènes ("j") ont été, dans tous les cas, maintenues. Chez les parents mâles, les séquences "floxées" n'ont pas été modifiées (colonnes 1, 2,8, figure 14), à l'exception de l'ADN des testicules (colonnes 3 et 9).
Exemple 1 : Culture cellulaire et expériences de transfection.
La lignée cellulaire BALB/3T3 (clone A31 American Type Culture Collection n CCL-163) et a été transfectées avec 2 g du promoteur chimère avec 0,1 g d'une construction CMV-lacZ Contrôle, en utilisant la méthode de la co-précipitation au phosphate de calcium (Sambrook et al. 1989). 2 x 10@ cellules ont été inoculées par boîte de 35 mm. Les tests enzymatiques ont été réalisés deux jours après la transfection.
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Exemple 2 : Microinjection et analyse des souris transgéniques.
Les souris transgéniques ont été générées par microinjection d'un ADN plasmidique à l'intérieur des oeufs fertilisés selon les techniques couramment utilisées par l'homme du métier (Hogan et al. 1986). La vérification des animaux trangéniques a été réalisée par Southern et/ou Analyse dot blot de l'extrémité de l'ADN (Sambrook et al. 1989). Toutes les familles transgéniques ont été générées et maintenues dans un arrière-plan génétique C57BL/6xDBA/2 F1.
Exemple 3 : Isolation des clones génomiques de rats
Les clones génomiques de rats ont été isolés par criblage d'une banque génomique (Sambrook et al. 1989) dans un vecteur lambda DASH (stratagène) avec une amorce d'ADNc de rat (Meuwissen et al. 1992).
Exemple 4 : Analyse de la séquence
Le séquençage de l'ADN a été réalisé en utilisant le kit Sequenase II (Amersham). Le programme informatique FASTA du Genetic Computer Group a été utilisé pour les comparaisons de séquences dans des banques de données. Les numéros d'accession dans les bases de données Genbank et EMBL pour les séquences du promoteur chez le rat et la souris sont respectivement AF020295 et AF020296.
Exemple 5 : Construction plasmidique
Tous les fragments du promoteur Sycpl proviennent d'un clone génomique contenant 12Kb de séquences en amont du site d'initiation de la transcription de Sycpl (figure 5) (Sage et
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al. 1997). A leur extrémité 3', tous les fragments testés du promoteur (à l'exception d'un fragment, voir infra) s'étendent au site SacII qui se situe dans le premier exon à la position +102 (Sage et al. 1995). La coupure du clone génomique avec BamHI et SacII a conduit à un fragment de 2Kb qui a ensuite été traité avec le fragment Klenow de l'ADN polymèrase (Biolabs) et inséré au site EcoRV dans le vecteur pBluscript KS (-) (stratagène). Un fragment EcoRl-Xhol de 1950 pb a ensuite été subcloné dans le plasmique pnassp (clontech, numéro d'accession U02433) portant le gène rapporteur lacZ ([-1848/+102] lacZ plasmide). Afin d'obtenir des chimères comprenant de plus courtes séquences génomiques, des amplifications PCR ont été réalisées en utilisant des oligonucléotides internes de 18 bp amorce 5' en conjonction avec l'amorce T3 sur le même fragment BamHI-SacII subscloné dans pBluescript. Les fragments PCR ont été clonés dans le vecteur pBluescript KS (-), vérifié par séquençage et transféré dans les sites EcoRI-Xhoi du plasmide pnassp. Les mêmes fragments du promoteur ont ensuite été transférés devant le gène rapporteur luciférase dans le plasmide pXPl (Lee et al. 1994) (ces plasmides portent les mêmes noms que précédemment avec "luc" à la place de "lacZ". Un plasmide supplémentaire a été construit avec les séquences 5' en amont entre les positions-260 et +5. Un fragment PCR a été amplifié avec la même amorce 5' utilisée pour le chimère [- 260/+102) lacZ, l'autre amorce couvre le site d'initiation de transcription de Sycpl (position +5/-15). Ce fragment de 275 bp a été subcloné dans pXPl pour former le plasmide [-260/+5]luc.
Exemple 6 : Isolation de l'ARN et analyse
L'ARN total a été préparé selon la méthode isothiocyanate (Chomezynski et al. 1987). Des échantillons d'ARN du contrôle et de souris Myb-/-A ont été utilisés (Toscani et al. 1997). Des
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ovaires foetaux provenant d'une femelle enceinte ont été rassemblés, et afin de s'assurer que les préparations ARN sont comparables, la même quantité de testicule et de foie a été utilisée. L'ARN totale a été traitée avec DNaseI (Boehringer), puis extrait au phénol et précipité à l'éthanol. 2 g d'ARN a été reverse transcrit et amplifié en utilisant le kit Titan de Boringer. En ce qui concerne les réactions de contrôle, l'ARN a été prétraité avec la RnaseA. Les séquences des amorces utilisées pour détecter les transcrits Sycpl correspondent aux positions 115-135 et 495-475 dans l'ADNc (Sage et al. 1995), conduisant à un produit de 380 pb de long. Les oligonucléotides utilisés pour détecter les transcripts de fusion entre eux Sycpl et lacZ se trouve à la position 50-68 dans l'ADNc de Sycpl et à position 444-425 dans le rapporteur lacZ du plasmide pnassp. Les conditions des cycles PCR ont été 30 secondes à 94 C, une minute à 55 C et 30 secondes à 72 C pendant 32 cycles.
Les produits de cette réaction ont été hybridés avec une sonde interne (position 245-265 dans l'ADNc Sycpl et 358-378 dans le plasmide pnassp. Les fragments d'ADNc Sycpl-lacZ ont été subclonés dans pBluescript et séquences afin de confirmer le correct épissage de l'intron SV40, La détermination de l'extrémité 5' du gène Sycpl dans les oocytes a été réalisée en utilisant le kit 5' RACE de Boehringer en suivant la procédure précédemment décrite dans Sage et al. 1997.
Exemple 7 : Test de l'activité des gènes rapporteurs
L'activité ss galactosidase a été testée sur des extraits de tissus en utilisant le substrat Galacton tel que décrit dans Shaper et al. 1994. La détermination in situ a été effectuée en utilisant une procédure alternative à la cryosection, ce qui a permis une meilleure conservation de la structure de
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l'épithélium seminifère. L'albuginea a été enlevée et le tissu a été soigneusement étendu avec l'aide de forceps afin de faciliter la pénétration de X-gal. Une fixation dans 2% de paraformaldéhyde pendant une heure à 4 C précède une incubation pendant 16 heures à température ambiante dans 0,2% de X-gal. Après la coloration, les testicules ont été post-fixés pendant 24 heures dans 10% de paraformaldéhyde et l'inclusion a été réalisée dans la Leica Historesin en suivant les instructions du fabricant (Leica Instruments). Des sections de 5 m d'épaisseur ont été sur-colorées avec l'hématoxyline Harris. L'activité luciférase a été mesurée à l'aide du "Luciferase Asay System" (Promega) selon les instructions du fabricant.
Exemple 8 : Immunolocalisation de la protéine SCP1 de la souris
La cryosection de 8 m d'épaisseur de testicules embryonnaires âgées de 15 ou 16 jours (E15 ou E16) ont été incubés avec des anticorps polyclonals dirigés contre la protéine du rat comme précédemment décrit dans Meuwissen et al.
Exemples 9 : Constructions des plasmides et production des souris transgéniques.
Le plasmide Sycpl-Cre a été construit en deux étapes. Un fragment du promoteur [-722/+102] du gène Sycpl s'étendant de - 722 à +102 relativement au site d'initiation de la transcription (Sage et al. 199'7, voir supra) a été transféré dans le plasmide pBluescript KS (Stratagène) entre les sites EcoRI et Xhol. La séquence codante pour la recombinase Cre (Numéro d'accession Genebank X03453) et un signal de polyadénylation a été ensuite inséré dans le premier plasmide digéré avec les enzymes de restriction SalI et KpnI, Dans le
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plasmide ppgeo-LoxP (Friedrich et Soriano 1991), le gène de fusion Pgeo a été intégré entre deux sites sites LoxP. Ce plasmide a été construit en insérant un fragment HindIII-BamHI correspondant à la séquence codante provenant du plasmide ppgeo à l'intérieur des sites HindII-BamHI d'un plasmide pBS112 contenant deux sites LoxP (Friedrich et Soriano 1991) . Dans le plasmide pPGK-LoxP, le promoteur du gène Pgkl de la souris (Numéro d'accession Genebank M18735) est inséré entre deux sites LoxP. Ce plasmide a été construit en insérant le promoteur de Pgkl à l'intérieur des sites HindIII-BamHI de pBS112.
Exemples 10 : Les souris transgéniques
Les souris transgéniques ont été obtenues par microinjection des chimères linéarisés par PvuI à l'intérieur des oeufs fertilisés selon les techniques bien connues de l'homme du métier (Hogan et al. 1986). L'ADN a été purifié sur des colonnes Qiagen en respectant les instructions du fabriquant puis linéarisé, et suspendu à une concentration de 5 ng/p.1 dans de l'eau stérile avant microinjection. La vérification des animaux transgéniques a été réalisée par Southern et/ou analyse dot blot de l'ADN extrait de la queue des souris. Toutes les familles transgéniques ont été générées et maintenues dans un arrière fond génétique C57BL/6 x DBA/2 Fl. Le mutant Rxr[alpha]#AF2 (LNL) possède une cassette LoxP-tk-neo-LoxP, inséré par recombinaison homologue a l' intérieur du 8ème intron du gène Rxra (Feil et al. 1996).
Exemple 11 : Expression des transgènes Cre
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Le niveau des ARNm de Cre a été estimé par analyse reverse transcriptase (RT-PCR). L'isolation de l'ARN à partir du cerveau du foie du rein et des testicules a été réalisée en utilisant une extraction par phénol acidique. Les préparations d'ARN total ont été traitées par la DNaseI (purifiées de toute RNase résiduelle) et l'ADNc a été synthétisé pendant 30 minutes à 50 C en utilisant 50 UI de la reverse transcriptase du virus murin de Moloney de la leucémie (Boehringer Mannheim) en utilisant 1 g d'ARN comme matrice. Il a ensuite été amplifié pendant 35 cycles de PCR en utilisant les amorces Crel (5'-TGA TGG ACA TGT TCA GGG ATC-3') (SEQ ID n 4) et Cre2 (5'- CAG CCA CCA GCT TGC ATG A-3' ) (SEQ ID n 5) constituant un fragment de l'ADNc de Cre de 865 pb.
Exemple 12 : Génotypage de la souris
L'extrémité de l'ADN de la souris a été préparée comme décrit dans Hogan et al. 1986 et analysée par hybridation slot blot en utilisant une série de sonde. La sonde Cre peut être obtenue par amplification PCR de tout plasmide qui contient la phase ouverte de lecture complète pour la protéine Cre en utilisant les amorces Crel et Cre2. Tous ces fragments ont été purifiés deux fois sur gel d'agarose. Des sondes peuvent également être préparés à partir des séquences du transgène floxé .
Exemple 13 : Détection de l'excision induite par Cre
L'analyse Southern blot a été réalisée selon les techniques bien connues de l'homme de l'art (Sambrook et al, 1989) . L'ADN a été digéré pendant la nuit avec les enzymes de restriction indiqués supra (dix fois en excès). Les fragments d'ADN ont été ensuite soumis à électrophorèse et transférés sur
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nitrocellulose. Les hybridation ont été réalisées en utilisant les plasmides pSApgeo ou pPKpgeobpa radiomarqués (Soriano et al, 1991). En plus des "transgènes floxés'', les séquences du plasmide pBr322 présentes dans ces chimères permettent la détection du transgène Cre.
L'analyse des souris double transgéniques portant le vecteur d'expression Cre et l' allèle Rxr[alpha]#AF2 (LNL) a été réalisée par amplification PCR telle que décrite dans Feil et al. 1996. En ce qui concerne la détection de l' allèle Rxr[alpha]#AF2 (LNL), les séquences tkneo "floxées" ont été amplifiées en utilisant les amorces 5' et 3', 5'- GGT TCT CCG GCC GCT TGG GT-3' (SEQ ID n 6) et 5'- GGA GGC GAT GCG CTG CGA AT-3' (SEQ ID n 7), respectivement. Pour ce qui est de la détection du transgène Cre, les amorces Crel et Cre2 ont été utilisées. La visualisation de l'excision du marqueur tkneo floxé de l'allèle cible Rxr[alpha]#AF2 (LNL) a été utilisée en utilisant les amorces RXR1 (5' - CCA GGA GCC TCC TTT CTC CA-3' ) (SEQ ID n 8) et RXR2 (5'CCT GCT CTA CCT GGT GAC TT-3') (SEQ ID n 9). Ces amorces ont amplifié un fragment de 156 bp à partir de l'allèle Rxra de type sauvage et un fragment de 190 bp à partir de l'allèle recombiné Rxr[alpha]#AF2 (L). Les produits amplifiés ont été analysés par électrophorèse sur gel d'agarose à 2%.
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<Desc/Clms Page number 55>
LISTE DE SEQUENCES (1) INFORMATIONS GENERALES: (i) DEPOSANT: (A) NOM: INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA
RECHERCHE MEDICALE (INSERM) (Il) RUE: 101, RUE DE TOLBIAC (C) VILLE : PARIS(E) PAYS: FRANCE (F) CODE POSTAL: 75654 CEDEX 13 (ii) TITRE DE L' INVENTION: PROCEDE FOUR REMODELER LE GENOME D'UN ANIMAL
PAR TRANSFERT ZYGOTIQUE D'UNE RECOMBINASE DE SITE
SPECIFIQUE (iii) NOMBRE DE SEQUENCES : (iv) FORME DECHIFFRABLE PAR ORDINATEUR: (A) TYPE DE SUPPORT: Floppy disk (B) ORDINATEUR : IBM PC compatible (C) SYSTEME D' EXPLOITATION : PC-DOS/MS-DOS (D) LOGICIEL: PatentIn Release #1.0, Version #1.30 (OEB) (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 1 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (ix) CARACTERISTIQUE:
NOM/CLE : -260/+5 souris (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 1 : CATCCACATG AAACACTCTA TAACACGCAC CAGAACA7AA TAAATACAGC CTTGAAAAGG 60 AAAGCACTGA GACGCCTTTA AATGGCTATA CACCAACGAG GGGGTTGGGG GGGGGCTTTC 120 CCAGCATCCT CCGACAATTT TGAGCGCAGA CTTGGTAGAG AACCCGGCAC GTGGAAGGAA 180 ATCTCGCGAG AAGTCGTGCG CGCAGAGATC CCGGCCAC-CT GGACCAACCG TTAAATTGAG 240 CCGGTCGCGG CCAGCCTCCC AGTCC 265
<Desc/Clms Page number 56>
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 2 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 392 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (ix) CARACTERISTIQUE:
NOM/CLE : -316/+5 rat (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 2 : CATTCACACG AAATACTCAA TAACACAAAC CAGAAAGTAA TAAATCATTA AAAAAAGAAA GO GAAGGAAAGA AATGAGACTC CTTTAAATGG CTATAAGCCA ATGTGATAGT TGGACGTTAA 120 GGTTGTGAGC GCCTCAGCTC TTTTGTCTGA GCACCAGCCA GGAAAGCTTT CCCAGAGTCC 180 TCTGACAATT CTGACTGCAG AGTTGGTGGA GAATCAGAAC TCGGCCCCGT GGGAAGGGAA 240 ATCCCGCGAG AAGTGTGCAC GAGATCCCGG CCAGCTGGAT CAACGGTTAA ATTTAGCCAG 300 TACAGCCCAG CTGCCCAGTC C 321 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 3 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : (C) NOMBRE DE BRINS : (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (ix) CARACTERISTIQUE:
NOM/CLE : -54/+5 souris
<Desc/Clms Page number 57>
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 3 : GATCCCGGCC AGCTGGACCA ACCGTTAAAT TGAGCCGGTC GCGGCCAGCC TCCCAGTCC 59 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 4: (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : 21paires de bases (B) TYPE : nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION : linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (ix) CARACTERISTIQUE:
NOM/CLE : amorce Crel (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 4 : TGATGGACAT GTTCAGGGAT C 21 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 5 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS : simple(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (ix) CARACTERISTIQUE:
NOM/CLE: amorce Cre2 (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 5 : CAGCCACCAG CTTGCATGA 19
<Desc/Clms Page number 58>
(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 6 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR: 20 paires do bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (ix) CARACTERISTIQUE:
NOM/CLE : amorce 5' (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 6 : GGTTCTCCGG CCGCTTGGGT 20 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 7 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : 20paires de bases (B) TYPE : nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS : simple(D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (ix) CARACTERISTIQUE:
NOM/CLE : amorce 3' (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 7 : GGAGGCGATG CGCTGCGAAT 20 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 8: (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases
<Desc/Clms Page number 59>
(B) TYPE : nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (il) TYPE DE MOLECULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 8 : CCAGGAGCCT CCTTTCTCCA 20 (@x) CARACTERISTIQUE:
NOM/CLE : amorce RXR1 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 9 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : paires de bases (B) TYPE : nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (ix) CARACTERISTIQUE: NOM/CLE: amorce RXR2 (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 9 : CCTGCTCTAC CTGGTGACTT 20

Claims (33)

  1. REVENDICATIONS 1. Procédé pour transférer dans un oocyte une protéine d'intérêt, qui possède une forte affinité pour L'ADN, sous sa forme active, caractérisé en ce qu'il comporte les étapes suivantes : a) Expression dans les cellules germinales mâles d'une protéine possédant une forte affinité pour L'ADN, ladite protéine restant associée à la chromatine des spermatozoïdes. b) Fertilisation des oocytes et transfère de la protéine par lesdits spermatozoïdes. a) Libération de la protéine sous sa forme active lors de la décondensation de la chromatine après la fécondation.
  2. 2. Procédé selon la revendication 1 caractérisé en ce que ledit gène d'intérêt est un gène codant pour une recombinase spécifique de site.
  3. 3. Procédé selon la revendication 2 caractérisé en ce que la recombinase est Cre.
  4. 4. Procédé d'insertion d'une séquence étrangère dans le génome d'un animal comprenant les étapes suivantes : a) Expression d'une recombinase spécifique de site dans les cellules germinales d'un mâle portant au moins un site spécifique dans son génome, ladite recombinase restant associée à la chromatine des spermatozoïdes. b) Fertilisation des oocytes et transfert de la recombinase par lesdits spermatozoïdes.
    <Desc/Clms Page number 61>
    c) Microinjection d'un ADN recombinant possédant la structure site spécifique-séquence étrangère dans le pronucleus mâle après fécondation. d) Insertion de ladite séquence étrangère au site spécifique dans le génome de l'embryon au stade 1 cellule, catalysée par la recombinase libérée lors de la décondensation de la chromatine du spermatozoïde.
  5. 5. Procédé selon la revendication 4 caractérisé en ce que ladite séquence étrangère comporte un gène d'intérêt, à exprimer sous le contrôle d'un promoteur éventuellement tissu (s) spécifique (s) .
  6. 6. Procédé selon la revendication 5 caractérisé en ce que ladite séquence étrangère comporte un gène rapporteur fusionné à un promoteur d'intérêt.
  7. 7. Procédé selon l'une des revendications 6 caractérisé en ce que ladite séquence étrangère comporte en outre un élément accepteur d'épissage (SA), une séquence IRES et/ou un signal de polyadénylation.
  8. 8. Procédé de remplacement d'une séquence X par une séquence Y dans le génome d'un animal caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes : a) Expression d'une recombinase spécifique de site dans les cellules germinales d'un mâle portant une structure site spécifique-séquence X-site spécifique dans son génome, ladite recombinase restant associée à la chromatine des spermatozoïdes.
    <Desc/Clms Page number 62>
    b) Excision de la séquence X lors de la spermatogénèse par la recombinase. c) Fertilisation des oocytes et transfert de la recombinase par lesdits spermatozoïdes. d) Microinjection d'un ADN recombinant possédant la structure site spécifique- séquence Y-site spécifique dans le pronucleus mâle après fécondation. e) Insertion de la séquence Y au site spécifique dans le génome de l'embryon au stade 1 cellule, catalysée par la recombinase libérée lors ,de la décondensation de la chromatine du spermatozoïde.
  9. 9. Procédé de remplacement d'une séquence X par une séquence Y dans le génome d'un animal caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes : a) Expression d'une recombinase spécifique de site dans les cellules germinales d'un mâle portant une structure site spécifique-séquence X-site spécifique dans son génome, ladite recombinase restant associée à la chromatine des spermatozoïdes. b) croisement dudit mâle avec une femelle possédant la structure site spécifique- séquence Y-site spécifique dans son génome, ladite recombinase catalysant la recombinaison entre sites spécifiques.
  10. 10. Procédé selon l'une des revendications 4 à 9 caractérisé en ce que ladite recombinase est Cre et ledit site spécifique est un site LoxP, ou un variant ou un mutant de la séquence LoxP.
  11. 11. Procédé selon l'une des revendications 4 à 10 caractérisé en ce que ladite recombinase est exprimée sous le contrôle d'un promoteur permettant une expression efficace dans les spermatocytes d'un mammifère.
    <Desc/Clms Page number 63>
  12. 12. Procédé selon la revendication 11 caractérisé en ce que ledit promoteur comporte au moins une région du promoteur Sycpl, EF-lalpha, IAP, FRM1f, Pdha-2, Hsp70-2, Camll, Hlt, P4- Gtase, Zfy1f, Tcp-lObt, Pgk-2, Hst70, Hox-a.4, Proacrosin, cKit, ACE ou Prm-1.
  13. 13. Procédé selon la revendication 12 caractérisé en ce que ledit promoteur comporte au moins une séquence ayant au moins 80 % d'identité la région du promoteur Sycpl de séquence SEQ ID n 1.
  14. 14. Animal transgénique susceptible d'être obtenu par le procédé selon l'une des revendications 4 à 13.
  15. 15. Séquence nucléotidique permettant de promouvoir efficacement l'expression d'un gène d'intérêt pendant la première phase méiotique des spermatocytes d'un mammifère caractérisée en ce qu'elle comporte au moins une séquence ayant au moins 80 % d'identité avec la séquence SEQ ID n 1.
  16. 16. Séquence nucléotidique selon la revendication 15 caractérisée en ce qu'elle comporte au moins la séquence SEQ ID n 1 ou SEQ ID n 2.
  17. 17. Séquence nucléotidique comprenant au moins une séquence selon l'une des revendications 15 à 16 fusionnée à une séquence codante pour un gène d'intérêt.
  18. 18. Séquence nucléotidique selon la revendication 17 caractérisée en ce que ledit gène d'intérêt est un gène codant pour une recombinase spécifique de site.
    <Desc/Clms Page number 64>
  19. 19. Séquence nucléotidique selon la revendication 18 caractérisée en ce que ladite recombinase est Cre.
  20. 20. Molécule d'ADN comportant au moins une séquence selon l' une des revendications 17 à 19 caractérisée en ce qu' elle se trouve sous la forme d'un plasmide, d'un vecteur viral, d'un pseudo-vecteur, ou d'un ADN nu linéaire ou circulaire.
  21. 21. Animal transgénique contenant dans son génome une séquence nucléotidique selon l'une -des revendications 17 à 19 permettant l'expression d'un gène d'intérêt spécifiquement dans les spermatocytes.
  22. 22. Animal selon la revendication 21 caractérisé en ce que le gène d'intérêt est une recombinase spécifique de site.
  23. 23. Animal selon la revendication 22 caractérisé en ce que la recombinase est Cre.
  24. 24. Animal selon l'une des revendications 22 et 23 caractérisé en ce que la recombinase demeure associée à la chromatine des spermatozoïdes.
  25. 25. Utilisation d'un animal selon la revendication 24 dans le procédé des revendications 4,8, et 9.
  26. 26. Procédé de recombinaison entre chromosomes paternels et maternels caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes : a) Expression d'une recombinase spécifique de site dans les cellules germinales d'un mâle portant dans son génome un ou plusieurs site (s) spécifique (s), b) on croise un ledit mâle avec un animal femelle portant dans son génome un ou plusieurs site(s) spécifique(s), ladite recombinase catalysant la recombinaison entre sites spécifiques lors de la première phase de la méiose.
    <Desc/Clms Page number 65>
  27. 27. Animal susceptible d'être obtenu par le procédé selon la revendication 26.
  28. 28. Animal multi transgénique obtenu en croisant entre eux les animaux selon l'une des revendications 14 et 27.
  29. 29. Animal transgénique selon l'une des revendications 14, 27 et 28 caractérisé en ce qu'il s'agit d'un mammifère, notamment sélectionné parmi les ovins, les porcins, les bovins, les rongeurs.
  30. 30. Utilisation d'un animal selon la revendication 29 pour la préparation de substances utiles en médecine, en cosmétique, et/ou en agro-alimentaire, notamment de substances actives, de préférence des peptides ou polypeptides, des anticorps, des antigènes, des hormones, ou des facteurs de croissance, et/ou pour la fabrication de suppléments alimentaires.
  31. 31. Utilisation d'un animal selon la revendication 29 comme modèle expérimental pour l'identification de gènes, de promoteur, de protéines, notamment de gènes impliqués dans les maladies génétiques, et/ou pour tester l'action de substances actives.
  32. 32. Utilisation d'un animal selon la revendication 29 pour la préparation d'organes ou de cellules présentant une meilleur immunocompatibilité avec les humains que les organes ou cellules de type sauvage ou susceptibles d'avoir un faible taux de rejet par les défenses immunitaires des humains.
  33. 33. Utilisation d'un animal selon la revendication 29 pour l'élevage.
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