FR2539758A1 - Nouveaux vecteurs d'expression et leur application a la preparation d'une proteine ayant l'activite de l'antitrypsine-a1 humaine - Google Patents
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Abstract
LA PRESENTE INVENTION CONCERNE UN VECTEUR DE CLONAGE ET D'EXPRESSION D'UN GENE DETERMINE DANS UNE BACTERIE, CARACTERISE EN CE QU'IL COMPORTE AU MOINS: A.L'ORIGINE DE REPLICATION D'UN PLASMIDE BACTERIEN, B.UN PROMOTEUR DU BACTERIOPHAGE L, P, P OU P, C.UNE REGION D'INITIATION DE LA TRADUCTION, D.UNE ZONE DE CLONAGE COMPORTANT DES SITES DE RESTRICTION UNIQUES. CE VECTEUR EST UTILE NOTAMMENT POUR LA PREPARATION D'UNE PROTEINE AYANT L'ACTIVITE DE L'ANTITRYPSINE-A.
Description
La présente invention concerne notamment de nouveaux vecteurs de clonage et d'expression, des bactéries transformées @ ide de ces vecteurs et leurs applications, , en particulier pour Ba préparation d'une protéine ayant l'activité de l'antitrypsine-@1 humaine.
L'antitrypsine-α1 est une glycoprotéine sérique représentant 90 % des globulines dans 9e sérum humain. Elle est présente à une concentration de 130 à 150 mg/dl dans le sérum normal. Il s'agit d'une channe polypeptidique simple ayant un poids moléculaire de 47-52 000 daltons, 10 à 15 % du poids étant des channes latérales d'hydrates de carbone. .De nombreuses variantes humaines de l'antitrypsine-α1 sont connues et la plupart de ces polymorphismes semblent résulter chaque fois dUun seul
substituant aminoacide L antitrypsine-α1 est synthétisée essentiellement dans le foie.
substituant aminoacide L antitrypsine-α1 est synthétisée essentiellement dans le foie.
La fonction de l'antitrypsine-α1 est celle d'une antiprotéase ; elle se combine avec une grande variété de protéases et les rend inactives, notamment la trypsine, la thrombine, la chimotrypsine et la plasmide.
Toutefois, sa fonction essentielle est d'inhiber l'élastase neutrophile, une protéase à large spectre capable de dégrader la plupart des protéines de structure, en particulier les composants du tissu conjonctif.
Bien qu'il s'agisse d'une protéine sérique circulante, l'antitrypsine-α1 présente une importance essentielle comme inhibiteur de l'élastase extravasculaire. Ceci est dd essentiellement à sa petite taille qui lui permet, à la différence de l'antiélastase sérique plus grosse, la macroglobuline-α2, de diffuser à travers la plupart des tissus.
Ainsi, approximativement 44 de l'antitrypsine-α1 est extravasculaire et les organes les plus importants protégés par l'antitrypsine-α1 sont les poumons.
Une déficience en antitrypsine-α1 peut provoquer un déséquilibre protéase/antiprotéase et, pour les raisons indiquées précédemment, les conséquences cliniques les plus significatives se produisent au niveau des poumons. Dans ces organes, en effet, un excès d'activité élastasique conduit avec une fréquence élevée à des maladies endommageant le poumon tel que l'emphysème.
Le cas le plus connu de déficience en anti trypsine-C1 est du a un désordre génétique au cours duquel certains phénotypes antitrypsine-a1 variants sont associés a une déficience marquée en antitrypsine-a1 sérique. Le variant le mieux étudié, le type Z, est une substitution d'aminoacide (la lysine remplace l'acide glutamique en position 53 à partir de l'extrémité C terminale de la protéine). Ce changement affecte l'importance de la glycosilation de la molécule d'antitrypsine-a1, ce qui conduit à un défaut de sécrétion de la molécule, une accumulation dans les hépatocytes et un taux sérique en antitrypsine-a1 qui représente de 10 à 15 % de celui des contrôles.Cette déficience est associée à un développement de l'emphysème chez les individus âgés de 40 à 50 ans et moins fréquemment avec des troubles du foie. L'allèle
Z a une fréquence située entre 1/3 000 et 1/4 000 dans la population caucasolde des Etats-Unis d'Amdrique, ainsi qu'en Europe. Ceci correspond approximativement à 50 000 homozygotes ZZ aux Etats-Unis d'Amérique,. De plus, environ une personne sur 800 aux
E.U.A. présente le phénotype SZ qui est associé à un taux d'antitrypsine-a1 dans le sérum qui est seulement de 35 % de la normale. Ce taux est probablement le seuil correspondant au développement de destruction au niveau des poumons par un déséquilibre protéase/antiprotéase et le nombre de personnes affectées aux E.U.A. est de l'ordre de 250 000.Les fréquences européennes sont approximativement du même ordre (références 1 à 3).
Z a une fréquence située entre 1/3 000 et 1/4 000 dans la population caucasolde des Etats-Unis d'Amdrique, ainsi qu'en Europe. Ceci correspond approximativement à 50 000 homozygotes ZZ aux Etats-Unis d'Amérique,. De plus, environ une personne sur 800 aux
E.U.A. présente le phénotype SZ qui est associé à un taux d'antitrypsine-a1 dans le sérum qui est seulement de 35 % de la normale. Ce taux est probablement le seuil correspondant au développement de destruction au niveau des poumons par un déséquilibre protéase/antiprotéase et le nombre de personnes affectées aux E.U.A. est de l'ordre de 250 000.Les fréquences européennes sont approximativement du même ordre (références 1 à 3).
Il est clair que tout facteur qui réduit le taux de l'antitrypsine-a1 fonctionnelle conduit à un déséquilibre protéase/antiprotéase et prédispose par là même à des atteintes pulmonaires. Il est maintenant clairement établi que de tels désordres apparaissent chez les fumeurs de cigarettes, la fumée de cigarettes constituant l'un des facteurs majeurs qui sont mis en cause dans l'emphysème non-héréditaire.
Il a été démontré à la fois que les composants de la fumée de cigarettes peuvent inhiber fonctionnellement l'antitrypsine-a1 en oxydant un .rdsidu méthionine près du site d'inhibition de l'élastase (référence 4) et que l'activité fonctionnelle de l'antitrypsine-a1 est au moins réduite de deux fois dans les poumons des fumeurs (référence 5).
Il est intéressant de noter que les fumeurs ne présentent pas de baisse de l'antitrypsine-a1 sérique, mais que cette déficience est localisée dans les poumons et est due a l'action directe de la fumée de cigarette. Il est très probable que la fumée de cigarette peut également induire un taux élevé d'élastase neutrophile dans les poumons, en accroissant ainsi la charge protdo- lytique sur les poumons qui sont moins protégés compte tenu de l'inactivation de l'antitrypsine-a1.
Divers autres états pathologiques peuvent être associés avec la réduction du taux sérique de l'antitrypsine-a11 les plus significatifs sont, notamment, les syndromes de difficultés respiratoires aiguës chez les nouveau-nés et les adultes, les rhumatismes, l'arthrite, l'asthme stéroidodépendant et probablement les fibroses cystiques(référence 1).
I1 est clair que tout déséquilibre protéase/ antiprotéase, qui peut avoir une manifestation sur le plan clinique (référence 6), doit pouvoir être traité par une thérapie de remplacement.
Les premières approches de cette technique ont consisté à effectuer des injections intraveineuses d'antitrypsine-α1 humaine préparée à partir de sérum normal aux individus présentant une déficience génétique (homozygotes ZZ). Le résultat de ces études préliminai- res montre que le taux sérique d'antitrypsine-α1 peut être maintenu à une valeur supérieure à 70 70 mg/dl, c'est-à-dire un niveau suffisant pour assurer une protection anti-élastase efficace des poumons Il est évident que toute déficience en antitrypsine-α peut être approchée thérapeutiquement de cette façon.
Pour un tel type de théraple, il est nécessaire de disposer de grandes quantités d'ATol humaine très pure
Mais l'extraction de l'ATol à partir du sérum se beurta aux problèmes de purification des protéines extraites de milieu naturel et également aux problèmes liés à l'utilisation de sérum comm matière de base qui sont essentiellement des problèmes de coutaminants.
Mais l'extraction de l'ATol à partir du sérum se beurta aux problèmes de purification des protéines extraites de milieu naturel et également aux problèmes liés à l'utilisation de sérum comm matière de base qui sont essentiellement des problèmes de coutaminants.
Ces différents problèmes peuvent être résolus en utilisant un produit obtenu par fermentation bactérienne - comme cela sera démontré ci-après
En effet, il est connu de purifier des-poly- peptides tels qu'enzymes, antigènes et hormones, à partir de culture de bactéries incorporant un vecteur d'expression, tel qu'on plasmide, dans lequel se trouve cloné le gène codant pour lesdits polypeptides
Afin de préciser certains éléments de terminologie qui seront utilisés dans le cadre de la description, il convient de rappeler brièvement les éléments principaux régissant l'expression d'un gène.
En effet, il est connu de purifier des-poly- peptides tels qu'enzymes, antigènes et hormones, à partir de culture de bactéries incorporant un vecteur d'expression, tel qu'on plasmide, dans lequel se trouve cloné le gène codant pour lesdits polypeptides
Afin de préciser certains éléments de terminologie qui seront utilisés dans le cadre de la description, il convient de rappeler brièvement les éléments principaux régissant l'expression d'un gène.
Pour que le gène cloné puisse "s'exprimer", c'est-à-dire que le produit désiré codé par ledit gène sot synthétisé par la bactérie, il convient que le vecteur utilisé présente certaines caractéristiques qui sont es à l'expression des gènes.
L'expression d'un gène cloné comporte deux grandes étapes
- tout d D abord la transcription de l'information codée par 1 l'ADN du vecteur en ARN messager (mARN)
- puis la traduction de cet mARN en poly peptides au niveau des ribosomes.
- tout d D abord la transcription de l'information codée par 1 l'ADN du vecteur en ARN messager (mARN)
- puis la traduction de cet mARN en poly peptides au niveau des ribosomes.
L'étape de transcription commence par la fixation d'une enzyme, l'ARN polymérase qui assure la "lecture" de l'information, sur une partie de l'ADN du vecteur appelée "promoteur" qui initie la transcription.
Cette fixation est soumise à différents types de régulation, en particulier la transcription par l'ARN polymérasepeut être réprimée par la fixation d'une protéine dénommée "répresseur" qui se fixe sur une sequence dénommée "opérateur", au voisinage du promoteur (contrôle négatif).
C'est seulement lorsque le répresseur est désactivé que l'ARN polymérase peut commencer la transcription.
La désactivation du répresseur ou induction est effectuée soit par action d'une substance agissant sur le rdpresseur, soit par d'autres moyens tels que la chaleur.
L'ADN une fois transcrit en mARN par l'tinter médiaire de 1'ARN polymérase, le mARN va être traduit au niveau des ribosomes en une thaine poly- peptide.
Pour que cette traduction puisse s'effectuer, il est nécessaire que le mARN comprenne une région de fixation des ribosomes et le site d'initiation de la traduction : l'ADN du vecteur doit présenter les séquences correspondantes appelées ci-après "région d'initiation de la traduction".
Si les éléments mentionnés précédemment sont nécessaires pour l'expression du gène cloné, le vecteur d'expression possède également une autre propriété intéressante. En effet, il est-capable de se répliquer et de se multiplier dans certaines cellules bactériennes dites "cellules hôtes" et, par là même, d'augmenter le nombre de "copies" du gène cloné. Ceci conduit, dans la plupart des cas où le gène est exprimé, à une production accrue de la protéine.
Enfin, le vecteur d'expression, en particulier lorsqu'il s'agit d'un plasmide, présente en général des gènes codant pour la résistance à différents antibiotiques, ce type de résistance est utilisé comme "marqueur" permettant de sélectionner les souches bactériennes transformées.
D'autres éléments intéressants des vecteurs d'expression seront explioités ci-après dans le cours de la description.
La présente invention concerne un nouveau vecteur de clonage et d'expression permettant une production améliorée de protéines et/ou de peptides dans une souche de bactérie gram négative et en particulier
Escherichia coli.
Escherichia coli.
Plus particulièrement, il s'agit d'un vecteur de clonage et d'expression d'un gène déterminé dans une bactérie gram négative, caractérisé en ce qu il comporte
l'origine de réplication d'un plasmide hantérien,
- un promoteur du bactériophage A : PL, PR ou P'
- une région codant pour l'initiation de la traduction,
- und région de clonage comportant des sites de restriction uniques.
l'origine de réplication d'un plasmide hantérien,
- un promoteur du bactériophage A : PL, PR ou P'
- une région codant pour l'initiation de la traduction,
- und région de clonage comportant des sites de restriction uniques.
Comme cela a été indiqué précédemment, la présence d'une origine de réplication pour un plasmide est essentielle pour permettre la réplication du vecteur dans les cellules bactériennes correspondantes, -en particulier dans le cas de E. coli on utilisera, de préférence, l'origine de réplication du plasmide pBR322.
Le plasmide pBR322 présente, en effet l'avantage de donner un grand nombre de copies et ainsi d'augmenter la quantité de plasmides produisant la protéine désirée
Il est, bien entendu, possible d'utiliser d'autres origines de réplication, en particulier celle d'un plasmide codant pour les facteurs de résistances quelconques ou d'un épisome colicinogénique [c'est-à-dire conférant à une bactérie la faculté de synthétiser une colicine).
Il est, bien entendu, possible d'utiliser d'autres origines de réplication, en particulier celle d'un plasmide codant pour les facteurs de résistances quelconques ou d'un épisome colicinogénique [c'est-à-dire conférant à une bactérie la faculté de synthétiser une colicine).
Toutefois, il convient de choisir des plasmides dont la réplication n'est pas contrôlée de façon trop sévère et qui ne présente pas de site de restriction indésirable, en dehors de la région de clonage.
Parmi les promoteurs du bactériophage #. on utilisera, de préférence, le promoteur principal de gauche noté #PL. PL est un promoteur puissant responsable de la transcription précoce de #. Des publications antérieures font déjà état de l'expression à un haut niveau des gènes clonés sous le contrôle de PL
(références 8 et 9).
(références 8 et 9).
Il est également possible d'utiliser d'autres promoteurs du bactériophage notamment le promoteur de droite, FR, ou le second promoteur de droits, P'R
Bien qu'il soit possible d'utiliser des séquences d'initiation de la traduction très variées, on préfère utiliser celle de la protéine cII du bactériophage A qui sera nommée ci-après #cIIxbs.
Bien qu'il soit possible d'utiliser des séquences d'initiation de la traduction très variées, on préfère utiliser celle de la protéine cII du bactériophage A qui sera nommée ci-après #cIIxbs.
Si l'utilisation de la région AcIIrbs est plus
particulièrement intéressante, pour des raisons qui
seront explicitées ci-après, il est néanmoins possible
d'utiliser d'autres séquences d'initiation de la
traduction, notamment celle du gène #E qui est limitée par des
sites de restriction intéressants, mais également celles de
. ~ ~~~ ~~
R17 COAT CCTCAACCGGGGTTTGAAGCATGGCTTCTAACTTT
~ ~~~
QB COAT GAAACTTTGGGTCAATTTGATCATGCAAAATTAGAGACTAGACTGA
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F2 COAT CCTCAACCGAGGTTTGAAGCATGGCTTCCAACTTACTCAG
~ ~~~ ~~
MS2 COAT GAGCCCTCAACCGGAGTTTGAAGCATGGCTTCTAACTTTACTCAGTT
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PHIX D TTCAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTTACTGAACAAIC
Saug96I ~ ~~~ ~~ Nari
*PHIX F TTCGGCCCCTTACTTGAGGATAAATTATGTCTAATATTCAAACTGGCGCCG
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G4 D TGACACAAACCACAAAGGAAGCTGAAATGTCTAAATCAAACGAATCTGCTG
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G4 F GTCCCACTCTATTTAAGGATACAAAAATGTCTAACGTTCAAACATCTGCGG
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L 11 TTATTACCCAACTTGAGGAATTTATAATGGCTAAGAAAGTACAAAGCCTATG
~~~ ~
L 1 TGGGCCTGGTAGTGGAGGACTAAGAAATGGCTAAACTGACCAAGCGCATGCG
~~~ ~~
L7 CTGGCAAACATCCAGGAGCAAAGCTAATGGCTTTAAATCTTCAAGACAAACA
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L 12 TATTCTGATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCAT
~~~ ~
RPO B GACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAA
~ ~~~~
SPC AGTAGTTGACATTAGCGGAGCCTAAAATGATCCAAGAACAGACTATGCTGAA
~~~ ~
STR CAAAAGCTAAAACCAGGAGCTATTTAATGGCAACAGTTAACCAGCTGGTACG
~~~ ~
*CII ATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACGCAACGA
~~~ ~
TUF B CGATTTACCGTGTCTTAGAGGGACAATCGATGTGTAAAGAAAAGTTTGAACGTAC
~~~
OMP A ATACAGTAACTCACAGGGGCTGGATTGATTATGTACACTTCAGGCTATGCACAT
~ ~~~ ~ ~
LAM-D TGAACACACCAGTGTAAGGGATGTTTATGACGAGCAAAGAAACCTTTACCCATT
~ ~ ~~~ ~ ~
LAM-E TGTGCGGGCTTTTTTACGGGATTTTTTTATGTCGATGTACACAACCGCCCAACTGC
La région codant pour l'initiation de la traduction AcIIrbs est plus particulièrement intdressante car
10) il a été démontrd que la protéine cli est synthétisée en grande quantité sous le contrôle du promoteur PL
2 1 1 la région en cause est limitée par des sites de restriction qui permettent un isolement facile de ladite région ;
30) une enzyme de restriction (NdeI) recouvre le codon d'initiation de la traduction.
particulièrement intéressante, pour des raisons qui
seront explicitées ci-après, il est néanmoins possible
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traduction, notamment celle du gène #E qui est limitée par des
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La région codant pour l'initiation de la traduction AcIIrbs est plus particulièrement intdressante car
10) il a été démontrd que la protéine cli est synthétisée en grande quantité sous le contrôle du promoteur PL
2 1 1 la région en cause est limitée par des sites de restriction qui permettent un isolement facile de ladite région ;
30) une enzyme de restriction (NdeI) recouvre le codon d'initiation de la traduction.
Dans ces conditions, l'insertion de gènes étrangers sur ce site avec reconstruction du codon d'initiation ATG permet l'expression de protéines non-fusionnées, c'est-à-dire ne contenant pas d'amino acide étranger z la protéine que l'on devra préparer a l'exception de la méthionine initiale.
Par contre, le olonage d'un gène étranger dans l'un des sites de restriction uniques en aval de AcIIrbs conduit à l'expression d'une protéine fusionnée comme cela sera décrit ci-dessous.
Il est intéressant de pouvoir obtenir selon les besoins des protéines fasionnées ou non-fusionnées.
Une protéine fusionnée comporte en général, outre la protéine intéressante, une partie provenant de l'expression de gènes du vecteur ou de certains éléments de jonction des différents éléments du vecteur.
Ceci nécessite donc par la suite un clivage de la protéine exprimée pour libérer la partie protéique inbéressante,
Toutefois, dans certains cas il est possible de faire excréter la protéine fusionnée.
Toutefois, dans certains cas il est possible de faire excréter la protéine fusionnée.
Au contraire, dans le cas de protéine non fusionnée, il n'est pas nécessaire de prévoir un clivage mais la protéine n'est, en général, pas excrétée et doit donc être isolée d'un lysat bactérien.
Enfin5 dans certains cas5 une protéine non fu- sionnée ne sera pas stable dans la cellule alors que la protéine fusionnée le sera Il faut donc5 dans chaque ca$ étudier les avantages et les inconvénients, et il est important de disposer d'un vecteur polyvalent pouvant permettre l'expression des deux types de protéines.
La zone de clonage comportant des sites de restriction uniques permet l'insertion de gènes étrangers pour la production de protéines fusionnées (ou non fusionnées). Ces sites de restriction uniques sont situés en aval du promoteur PL et de la région d'initiation de traduction de cil
Parmi les sites d'insertion uniques qui figurent de préférence dans cette zone5 on peut citer ECORI.Sali,
AccI, BamHI, HindIII, HindII et PstI correspondant à des enzymes de restriction couramment utilisées L'insertion des gènes codant pour une protéine particulière dans de tels sites placés à 40-50 bp en aval du codon d'initiation de la traduction conduit è la synthèse de protéines étrangères fusionnées à l'extrémité N terminale des aminoacides bactériens dérivant de
Le vecteur en cause comporte5 en outre5 de préférence une fonction d'antiterminaison de transcription codée par exémple par le gène N de # noté AN. En présence du produit de transcription du gène N la transcription à partir de PL se poursuit au delà de la plupart des signaux stop.
Parmi les sites d'insertion uniques qui figurent de préférence dans cette zone5 on peut citer ECORI.Sali,
AccI, BamHI, HindIII, HindII et PstI correspondant à des enzymes de restriction couramment utilisées L'insertion des gènes codant pour une protéine particulière dans de tels sites placés à 40-50 bp en aval du codon d'initiation de la traduction conduit è la synthèse de protéines étrangères fusionnées à l'extrémité N terminale des aminoacides bactériens dérivant de
Le vecteur en cause comporte5 en outre5 de préférence une fonction d'antiterminaison de transcription codée par exémple par le gène N de # noté AN. En présence du produit de transcription du gène N la transcription à partir de PL se poursuit au delà de la plupart des signaux stop.
Ceci écarte les problèmes posés par un arrêt prématuré de la transcription qui peuvent se produire lorsque les gènes étrangers clonés présentent de tels signaux stop Bu outre5 il a eté démontré que 1 expression à partir de PL est améliorés dans un environnement N
Lorsque le promoteur n'est pas PL ou PR mais P'R par exemple, la fonction d'antiterminaison peut être différente. PwR est responsable de la transcription des gènes tardifs du bactériophage #. L'expression du gène tardif est régulée positivement par le produit du gène Q (référence 10) dont il a été démontré qu'il agit comme antiterminateur de transcription analogue à la protéine N (référence 11). Q agit à la terminaison pour l'ARN 6S de # constitutif initié a P'R en permettant ainsi la transcriptiqn de la région du gène tardif distal.
Lorsque le promoteur n'est pas PL ou PR mais P'R par exemple, la fonction d'antiterminaison peut être différente. PwR est responsable de la transcription des gènes tardifs du bactériophage #. L'expression du gène tardif est régulée positivement par le produit du gène Q (référence 10) dont il a été démontré qu'il agit comme antiterminateur de transcription analogue à la protéine N (référence 11). Q agit à la terminaison pour l'ARN 6S de # constitutif initié a P'R en permettant ainsi la transcriptiqn de la région du gène tardif distal.
L'expression de Q est elle-même contrôlée par PR qui, comme PL, est régulé par le répresseur cI. Cette cascade d'interactions peut être reconstruite sur un plasmide d'expression et utilisée de la meme façon pour PL.
Afin d'écarter les problèmes de toxicité et d'instabilité du système hôte-vecteur en cas de production en continu de grandes quantités d'une protéine étrangère, il est nécessaire de prévoir le contrôle de l'activité du promoteur en lui adjoignant tout ou partie d'un système d'expression inductible, en particulier thermoinductible.
De préférence, le contrôle par la température de la synthèse de la protéine étrangère est effectué au niveau de la transcription au moyen d'un répresseur thermosensible codé dans la bactérie hôte, par exemple cI857, qui réprime l'activité de PL à 280C mais qui est inactivé à 420C. Le répresseur agit sur l'opérateur
OL qui est adjacent au promoteur PL. Bien que dans le cas précédent une partie du système d'expression thermoinductible soit partie intégrante de la bactdrie hôte, il est possible de prévoir que ce système fasse partie du vecteur lui-même.
OL qui est adjacent au promoteur PL. Bien que dans le cas précédent une partie du système d'expression thermoinductible soit partie intégrante de la bactdrie hôte, il est possible de prévoir que ce système fasse partie du vecteur lui-même.
Le vecteur en cause peut également comporter un gène de résistance à un antibiotique, par exemple l'ampicilline dans le cas de pBR322, mais d'autres gènes de résistance peuvent être utilisés, résistance à la tétracycline (Tetr) ou au chloramphénicol (Cmr).
L'incorporation d'un tel marqueur est nécessaire pour la sélection des bactéries contenant les transformants porteurs du plasmide selon l'invention pendant les expériences de clonage.
L'incorporation d'un gène de résistance permet d'augmenter la stabilité du plasmide en imposant une pression de sélection lors de la fermentation, et en outre facilite-l'isolement des transformants.
Pour le clonage il est intéressant de disposer d'un système permettant de détecter l'insertion dans un plasmide d'un ADN étranger.
A titre d'exemple, il est possible de prévoir dans la zone de clonage le fragment N-terminal de la ss-galactosidase de E. coli (lacZ') en le-fusionnant avec la région d'initiation de traduction dérivée de AcII, ce qui met la traduction du fragment a sous le contrôle des séquences de cII.
Le fragment a est complémenté par l'expression du fragment w C-terminal codé dans l'hôte, ceci conduit à une activité ss-galactosidase dans les cellules.
Cette activité ss-galactosidase produit des colonies bleues en présence d'un substrat chromophorique, le 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-ss-D-galacosidase.
A 28 C, le promoteur PL est inactivé, le fragment α n'est pas synthétisé et les colonies demeurent blanches. Lorsque la température est amenée à 420C, le promoteur PL est activé le fragment a est synthétisé et les colonies virent au bleu.
L'insertion d'ADNétrangers dans les sites de clonage situés dans ce système de détection empêche la synthèse de la ss-galactosidase et conduit donc à des colonies blanches aussi bien à 280C qu'à 420C.
il est également possible. de remplacer le gène lacZ'par d'autres gènes permettant une détection.
La présente invention concerne également des procédés permettant le clonage et l'expression de gènes codant pour des protéines particulières, notamment pour l'antitrypsine-a1 humaine préparée à l'étant fusionné ou non fusionné, ainsi que les plasmides correspondants
Ainsi, la présente invention concerne un procédé de clonage et d'expression dVun gène codant pour une protéine déterminée permettant de préparer ladite protéine sous forme non fusionnée, caractérisé en ce que l'on clone le gène dans un site de restriction recouvrant le codon d'initiation de la traduction d'un vecteur tel que décrit précédemment et dans lequel on reconstitue le codon d'initiation de la traduction.
Ainsi, la présente invention concerne un procédé de clonage et d'expression dVun gène codant pour une protéine déterminée permettant de préparer ladite protéine sous forme non fusionnée, caractérisé en ce que l'on clone le gène dans un site de restriction recouvrant le codon d'initiation de la traduction d'un vecteur tel que décrit précédemment et dans lequel on reconstitue le codon d'initiation de la traduction.
L1invention concerne, en outre, un procédé de clonage d'un gène codant pour une protéine déterminée permettant de préparer ladite protéine sous forme fuzionnée, caractérisé eu ce que on clone le gène dans la one de clonage d'un vecteur tel que décrit précédemment en aval de la séquence d'initiation de la traduction.
L'invention concerne également les vecteurs obtenus par la mise en oeuvre de ces procédés ainsi que les bactéries transformées par les différents vecteurs décrit, en particulier des bactéries gram négatives et plus particulièrement Escherichia coli.
L'invention concerne enfin les produits préparés par fermentation des souches ainsi transformées.
Enfin, la présente invention concerne un vecteur, notamment un plasmide, comportant tout ou partie de la séquence codant pour l'antitrypsine-α1 humaine et notamment un vecteur tel que décrit précédemment, ainsi que les bactéries transformées et le produit obtenu par fermentation de ces bactéries qui sera dénommé ci-après antitrypsine-a1 humaine d'origine bactérienne
Il doit etre entendu que ce produit peut présenter des différences structurales avec l'antitrypsine-α;1 humaine sérique mais présente néanmoins la même activité n vivo, notamment la même activité anti-élastase ou une activité équivalente par rapport à l'antitrypsine-α1 sérique.
Il doit etre entendu que ce produit peut présenter des différences structurales avec l'antitrypsine-α;1 humaine sérique mais présente néanmoins la même activité n vivo, notamment la même activité anti-élastase ou une activité équivalente par rapport à l'antitrypsine-α1 sérique.
Par antitrypsine-aX humaine d'origine bactérienne, on entend définir également un produit d'origino bactérienne obtenu par fermentation mais syant ensuite été modifié chimiquement ou biologiquement.
La présente invention concernez enfin utilisé sation de l'antitrypsine-α1 humaine d'origine bactérienne à titre de médicament pour le traitement et/ou la préven- tion des maladies humaines induites par un déficit en antitrypsine-α1. Parmi les maladies qui peuvent être traitées ou prévenues par l'antitrypsine-α1 selon l'inventions il faut citer les déficits en antitrypsine-α;1 hériditaires dus à un désordre génétique et qui se traduisent notamment par des emphysèmes Il est également possible de traiter certains syndromes de difficultés respiratoires aiguës en particulier chez les nouveau-nés et les adultes, ainsi que l'arthrite rhumatoïde, l'asthme stéroido-dépendant et les fibroses cystiques.
Ce médicament peut également être utilisé pour remédier à certains déficits en antitrypsine-α1 chez les fumeurs de cigarettes.
L'antitrypsine-α1 humaine d'origine bactérienne peut être administrée par une voie quelconque, mais la voie parentérale est semble-t-il la plus satisfaisante.
Toutefois, dans le cas des déficiences dues à la fumée de cigarette, l'introduction directe dans les poumons par inhalation est également très efficace.
Les dosages journaliers de l'antitrypsine-a1 à utiliser dépendent de la nature du traitement, préventif ou curatif, ainsi que de l'importance de la -déficience à traiter. Ces dosages. pourront être adaptés afin de maintenir un taux déterminé d'-antitrypsine-a1 dans le sérum ou au niveau des poumons par exemple.
Les compositions pharmaceutiques correspondantes seront également adaptées à la voie d'administration et pourront être à libération contrôlée, notamment sous forme d'implant libérant lentement le principe actif dans le système circulatoire.
La présente invention comporte, bien entendu, d'autres aspects, notamment certains plasmides qui seront décrits dans les exemples ainsi que leurs mutants et dérivés et de façon générale les procédés de fermentation des bactéries transformées ainsi que les produits de ces fermentations.
D'autres caractéristiques et avantages de l?invention seront mieux compris à la lepture des exemples ci-après et des dessins ci-annexés sur lesquels - la figure 1 représente la stratégie permettant de
préparer le plasmide pTG907, - la figure 2 représente la stratégie permettant de
préparer le phage M13tg910, - la figure 3 représente la structure du phage M13ig910, - la figure 4 représente la stratégie permettant de
préparer le plasmide pTG908, - la figure 5 représente les immunoprécipités correspondant
aux produits de traduction de l'ARN total de foie humain, - la figure 6 représente une sonde isolée d'un clone de
cADN humain total codant pour l'antitrypsine-a1, - la figure 7 représente la séquence partielle d'un
clone de cADN de l'antitrypsine-a1 en comparaison
avec la séquence publiée.
préparer le plasmide pTG907, - la figure 2 représente la stratégie permettant de
préparer le phage M13tg910, - la figure 3 représente la structure du phage M13ig910, - la figure 4 représente la stratégie permettant de
préparer le plasmide pTG908, - la figure 5 représente les immunoprécipités correspondant
aux produits de traduction de l'ARN total de foie humain, - la figure 6 représente une sonde isolée d'un clone de
cADN humain total codant pour l'antitrypsine-a1, - la figure 7 représente la séquence partielle d'un
clone de cADN de l'antitrypsine-a1 en comparaison
avec la séquence publiée.
- la figure 8 représente la stratégie pour préparer le plasmide pTG920,
- la figure 9 représente l'analyse sur gel des protéines synthétisées par E. coli transformé par un plasmide portant le gène humain de l'antitrypsine-a ainsi que les immunoprécipités correspondants,
- la figure 10 représente l'activité biologique de l'antitrypsine-a1 préparée à partir de E. coli.
- la figure 9 représente l'analyse sur gel des protéines synthétisées par E. coli transformé par un plasmide portant le gène humain de l'antitrypsine-a ainsi que les immunoprécipités correspondants,
- la figure 10 représente l'activité biologique de l'antitrypsine-a1 préparée à partir de E. coli.
1) Procédés généraux
a) Souches bactériennes
Les souches bactériennes utilisées dans le cadre de la présente invention sont les suivantes
. TGE900 qui est une souche de E. coli ayant les caractéristiques suivantes : su F his ilv bio (#c1857#Bam#HI)
N6437, souche de E. coli ayant les caractéristiques suivantes : F his ilv gal + #8proC+ : tn10 lac#m15 (#c1857#B am#HI).
a) Souches bactériennes
Les souches bactériennes utilisées dans le cadre de la présente invention sont les suivantes
. TGE900 qui est une souche de E. coli ayant les caractéristiques suivantes : su F his ilv bio (#c1857#Bam#HI)
N6437, souche de E. coli ayant les caractéristiques suivantes : F his ilv gal + #8proC+ : tn10 lac#m15 (#c1857#B am#HI).
. Jm103 qui est une souche de E. coli ayant E les caractéristiques suivantes : A(lac-pro) sup thi endA sbcB1S sttA rK nK+ / F1 traD36 proAB+ lacia lacZAm15.
Les souches mentionnées précédemment ont été utilisées parce qu'elles étaient disponibles, mais il est bien entendu qu'il est possible d'utiliser d'autres souches dans la mesure où elles présentent certaines caractéristiques essentielles qui sont rappelées dans le cours de la description détaillée.
b) Préparation des ADN
Des mini-préparations d'ADN de plasmides ou de phages M13 sont effectuées comme cela est décrit par
Ish-Horowitz (référence 12) à la seule différence que l'ADN est précipité une seconde fois avec de l'éthanol avant d'être utilisé.
Des mini-préparations d'ADN de plasmides ou de phages M13 sont effectuées comme cela est décrit par
Ish-Horowitz (référence 12) à la seule différence que l'ADN est précipité une seconde fois avec de l'éthanol avant d'être utilisé.
Les maxi-préparations sont effectuées comme cela est décrit dans la publication précédente, avec une purification complémentaire par un gradient de densité CsCl/bromure d'éthidium.
ci Technigues de clonaque
Le traitement des ADN avec des enzymes de restriction est effectué, sauf indications contraires, en utilisant les conditions indiquées par le fabricant (New England Biolabs, Bethesda Research Laboratories et Boehringer Mannheim)
Lorsque cela est nécessaire, les phosphates des extrémités 5' sont éliminés en utilisant, soit une phosphatase alcaline bactérienne, soit une phosphatase d'intestin de veau, pendant 30 minutes à 37 C dans le tampon d'enzyme de restriction.
Le traitement des ADN avec des enzymes de restriction est effectué, sauf indications contraires, en utilisant les conditions indiquées par le fabricant (New England Biolabs, Bethesda Research Laboratories et Boehringer Mannheim)
Lorsque cela est nécessaire, les phosphates des extrémités 5' sont éliminés en utilisant, soit une phosphatase alcaline bactérienne, soit une phosphatase d'intestin de veau, pendant 30 minutes à 37 C dans le tampon d'enzyme de restriction.
La réparation des extrémités cohézives utilisant la polymérase de Klonow (Boehringer Mannheim) est effectuée à 25 C pendant 15 minutes dans un mélange de 50 m/bl. Tris BCl, pH 7,8, 5 mHol. MgCl2, 10 mMol. de ss-mercaptoéthanol, 0,4 mMol. de dNTPs avec l'enzyme et 10 à 200 g/ml d'ADN.
La nucléase S1 (Miles) est utilisée à 2 u/ g d'AND à 25 C pendant 30 minutes dans un milieu 0,3 Mol.
NaCl, 0,03 Mol. NaOAc, pH 4,0, 0,003 Mol. ZnCl2.
Bal31 est utilisée selon la procédé de Panayotatos et al. (référence 13). Les ligotions sont effectuées à 15 C (sauf lorsque cela est indiqué différemment) pendant 4 à 24 heures en utilisant de l'ADN ligase T4 (Boehringer Mannheim) avec 100 mMol de NaCl, 66 mMol de Tris HCl, pH 7,5, 10 mMol. de MgCl21 0,5 mMol. de spermidine, 0,2 mMol. de EDTA, 2 mMol. de DTT, 1 mMol.
d'ATP, 0,1 mg/ml de BSA et 5 à 50 g/ml d'ADN
Pour la ligation d'extrémités cohésives, on utilise environ 30 unités/ml de ligase. Pour la ligation des extrémités franches on utilise environ 100 unités/ml de ligase
Entre les différentes réactions enzymatiques, des échantillons d'ADN sont extraits avec un mélange phénol/chloroforme puis précipités à l'éthanol.Lorsque cela est nécessaire, du tARN de E coli ou de levures est utilisé comme entraîneur. les adaptateuxs moléculaires (Collaborative Research, Bethesda Research Laboratories,
New England Biolabs) sont préhybridés et utilisés en excès molaire de 10 à 50 fois pour les extrémités franches d'AND utilisant les conditions de tampon décrites précédemment avec 100 unités/ml de ligase TA à 4 C pendant 15 heures Lorsque l'on utilise des adaptateurs non phosphorylés, les adaptateurs qui n'ont pas réagi sont éliminés directement après ligation par précipitation avec le tétrachlorhydrate de spermine (Hoopes et al. - référence 14)
Lorsque l'on utilise des adaptateurs phosphorylés, le mélange de ligation est tout d'abord extrait avec un mélange phénol/chloroforme puis précipité avec de l'éthanol avant coupure spécifique avec les enzymes de restriction appropriées puis précipitation avec le tétrachlorhydrate de spermine
Les cellules bactériennes compétentes sont préparées puis transformées avec les plasmides ou transfectées par l'ADN de M13 selon les procédés décrits par Dagert et Ehrlich (référence 15).
Pour la ligation d'extrémités cohésives, on utilise environ 30 unités/ml de ligase. Pour la ligation des extrémités franches on utilise environ 100 unités/ml de ligase
Entre les différentes réactions enzymatiques, des échantillons d'ADN sont extraits avec un mélange phénol/chloroforme puis précipités à l'éthanol.Lorsque cela est nécessaire, du tARN de E coli ou de levures est utilisé comme entraîneur. les adaptateuxs moléculaires (Collaborative Research, Bethesda Research Laboratories,
New England Biolabs) sont préhybridés et utilisés en excès molaire de 10 à 50 fois pour les extrémités franches d'AND utilisant les conditions de tampon décrites précédemment avec 100 unités/ml de ligase TA à 4 C pendant 15 heures Lorsque l'on utilise des adaptateurs non phosphorylés, les adaptateurs qui n'ont pas réagi sont éliminés directement après ligation par précipitation avec le tétrachlorhydrate de spermine (Hoopes et al. - référence 14)
Lorsque l'on utilise des adaptateurs phosphorylés, le mélange de ligation est tout d'abord extrait avec un mélange phénol/chloroforme puis précipité avec de l'éthanol avant coupure spécifique avec les enzymes de restriction appropriées puis précipitation avec le tétrachlorhydrate de spermine
Les cellules bactériennes compétentes sont préparées puis transformées avec les plasmides ou transfectées par l'ADN de M13 selon les procédés décrits par Dagert et Ehrlich (référence 15).
EXEMPLE 1
L'exemple de synthèse de vecteurs selon la présente invention qui sera décrit ci-aprds n'est bien entendu nullement limitatif et il est possible d'obtenir des vecteurs entrant dans le cadre de la présente invention en procédant de façon distincte.
L'exemple de synthèse de vecteurs selon la présente invention qui sera décrit ci-aprds n'est bien entendu nullement limitatif et il est possible d'obtenir des vecteurs entrant dans le cadre de la présente invention en procédant de façon distincte.
La préparation d'un vecteur selon l'invention implique tout d'abord la préparation d'un plasmide comportant
- l'origine de réplication de pBR322,
- le gène de résistance à l'amplicilline de ce même plasmide ampR,
- le promoteur PL et le gène AN, et, en outre, au cours de cette synthèse on doit s'efforcer de faire disparattre les sites de restriction gênants afin de pouvoir obtenir plus tard dans le cours de la synthèse des sites uniques de restriction.
- l'origine de réplication de pBR322,
- le gène de résistance à l'amplicilline de ce même plasmide ampR,
- le promoteur PL et le gène AN, et, en outre, au cours de cette synthèse on doit s'efforcer de faire disparattre les sites de restriction gênants afin de pouvoir obtenir plus tard dans le cours de la synthèse des sites uniques de restriction.
1) Suppression du site PstI dans pBR322
Le plasmide de base utilisé est le plasmide pBR322 ;'toutefois, celui-ci présente l'inconvénient R d'avoir à l'intérieur du gène amp un site de restric- tion PstI, car un site de même nature sera utilisé par la suite dans la zone de clonage comme site unique de restriction. Il convient donc de faire disparattre ce site de restriction PstI.en utilisant un mutant du plasmide pBR322, le plasmide pUC8,-dans lequel le gène de résistance à l'ampicilline neprésente pas de site de restriction PstI (ce site a été éliminé par mutation in vitro). pBR322 est commercialisé notamment. par Bethesda
Research Laboratories et pUC8 est décrit dans l'article référencé 16.
Le plasmide de base utilisé est le plasmide pBR322 ;'toutefois, celui-ci présente l'inconvénient R d'avoir à l'intérieur du gène amp un site de restric- tion PstI, car un site de même nature sera utilisé par la suite dans la zone de clonage comme site unique de restriction. Il convient donc de faire disparattre ce site de restriction PstI.en utilisant un mutant du plasmide pBR322, le plasmide pUC8,-dans lequel le gène de résistance à l'ampicilline neprésente pas de site de restriction PstI (ce site a été éliminé par mutation in vitro). pBR322 est commercialisé notamment. par Bethesda
Research Laboratories et pUC8 est décrit dans l'article référencé 16.
Pour ce faire, on échange le fragment PvuI/PvuII de 1 669 bp de pBR322 avec le fragment analogue PvuI/PvuII du plasmide pUC8. Afin de réaliser cet échange les plasmides pBR322 et pUC8 sont traités successivement par PvuI, PvuII, puis circularisés par section d'une ligase.
On obtient ainsi le plasmide pTG902 qui ne présente plus de site de restriction PstI et qui a également perdu le site de restriction NdeI présent à l'origine sur pBR322 (non représenté sur la fig. 1).
En outre, le plasmide pTG902 porte un fragment de 50 bp correspondant à la séquence laci' dans lequel se trouve.
le site PvuII.
2) Insertion du promoteur PL et du gène au
et préparation du plasmide de pTG907
Le promoteur PL et le gène AN sont isolés
du plasmide pKC30 pour être insérés dans pTG902, le segment prélevé contient également l'opérateur OL sur lequel agira le répresseur thermosensible cI850, comme cela sera décrit dans les essais. En outre, le procédé permet de supprimer les sites EcoRI et HindIII tout en conservant un site unique BamHI en aval du gène N pour pouvoir ensuite insérer AcIIrbs. Le plasmide de pKC30 est décrit dans la référence 17.
et préparation du plasmide de pTG907
Le promoteur PL et le gène AN sont isolés
du plasmide pKC30 pour être insérés dans pTG902, le segment prélevé contient également l'opérateur OL sur lequel agira le répresseur thermosensible cI850, comme cela sera décrit dans les essais. En outre, le procédé permet de supprimer les sites EcoRI et HindIII tout en conservant un site unique BamHI en aval du gène N pour pouvoir ensuite insérer AcIIrbs. Le plasmide de pKC30 est décrit dans la référence 17.
pTG902 est coupé en son site de restriction unique EcoRI et les extrémités 5' sortantes sont éliminées par traitement à la nucléase S1. Après une digestion avec BamHI, le fragment le plus important est purifié sur gel.
Le fragment portant le promoteur PL et le gène #N est préparé de la même façon à partir de pKC30 en traitant successivement le plasmide par pvuI, la nucléase S1 et BamHI. Les fragments, après purification sur gel, sont soumis à l'action de la ligase, ce qui conduit à la. fusion EcoRI/PvuI et à la reconstitution du site BamHI.
Le mélange de ligation est utilisé pour transformer des cellules hôtes compétentes, TGE9OO, à 30 C. Cette souche contient le prophage # délété, #cI857#bam#BI, qui fournit le répresseur de # thermosensible, c1857, qui est nécessaire pour bloquer la transcription A partir de
Ceci est important car l'activité de PI, dans un milieu N+ est léthale compte tenu de la fonction d'antiterminaison de R.
Ceci est important car l'activité de PI, dans un milieu N+ est léthale compte tenu de la fonction d'antiterminaison de R.
Apres analyse par enzymes de restriction, les clones contiennent des plasmides de structure correcte, et sont ensuite testés pour leur manque de viabilité à 42 C.
L'un des plasmides obtenus, pTG906, est traité de façon à éliminer le segment PvuII-SalI de manière à supprimer les sites de restriction compris sur ce segment et afin de faire disparaître également les deux sites de restriction extrêmes. Pour ce faire, pTG906 est traité successivement avec SalI, la nucléase
PvuII et la ligase
On obtient ainsi le plasmide pTG907 qui comporte l'ensemble des éléments évoqués au début de cette étape et, en outre, qui est Pst Eco Hind Sal 'Ava Nde
PvuII-. La synthèse de ce plasmide est représentée sur la figure 1.
PvuII et la ligase
On obtient ainsi le plasmide pTG907 qui comporte l'ensemble des éléments évoqués au début de cette étape et, en outre, qui est Pst Eco Hind Sal 'Ava Nde
PvuII-. La synthèse de ce plasmide est représentée sur la figure 1.
3) Clonaqe de la région #cIIrbs
La seconde phase importante de la synthèse consiste à insérer la région #cIIrbs sous forme dsun fragment Aval/TaqI dans le début du gène lacZ' (fragment a de la ss-galactosidaso) lequel a été cloné dans le phage M13 nommé M13tg110.Cette stratégie permet un test fonctionnel simple pour rbs, à savoir la production. de la protéine lacZ' et, par conséquent, d'obtenir des plaques bleues en présence d'IPTG et de Xgal ; ceci permet également un séquençage rapide de la construction en utilisant la méthode dite du didéoxy
Dans le cours des expériences, différents dérivés du phage M13 seront mentionnés précédemment on a mentionné le phage M13tg110 et dans la suite de la description on utilisera d'autres phages du même type dont la construction va etre rappelée ci-après.
La seconde phase importante de la synthèse consiste à insérer la région #cIIrbs sous forme dsun fragment Aval/TaqI dans le début du gène lacZ' (fragment a de la ss-galactosidaso) lequel a été cloné dans le phage M13 nommé M13tg110.Cette stratégie permet un test fonctionnel simple pour rbs, à savoir la production. de la protéine lacZ' et, par conséquent, d'obtenir des plaques bleues en présence d'IPTG et de Xgal ; ceci permet également un séquençage rapide de la construction en utilisant la méthode dite du didéoxy
Dans le cours des expériences, différents dérivés du phage M13 seront mentionnés précédemment on a mentionné le phage M13tg110 et dans la suite de la description on utilisera d'autres phages du même type dont la construction va etre rappelée ci-après.
La construction de. ces vecteurs est indiquée dans le tableau I ci-après sur lequel figurent les références du phage de départ, la nature de enzyme de restriction avec laquelle il a été découpé, le traitement particulier qu'ont subi les fragments ainsi obtenus et la nature de l'insert qui a été fixé dans les sites ainsi révélés
Le phage M13mp7 est commercialisé notamment par 9a société Bethesda Research Laboratories
M13mp701 est obtenu à partir de M13mp7 par remplacement du fragment PstIJEcoRI à droite (CTG CAG ... GAA TTC) par la séquence : CTG CAG CAA TTC.
Le phage M13mp7 est commercialisé notamment par 9a société Bethesda Research Laboratories
M13mp701 est obtenu à partir de M13mp7 par remplacement du fragment PstIJEcoRI à droite (CTG CAG ... GAA TTC) par la séquence : CTG CAG CAA TTC.
<tb> ATG <SEP> ACC <SEP> ATG <SEP> ATT <SEP> ACG <SEP> AAT <SEP> TCC <SEP> CCG <SEP> GAT <SEP> CCG <SEP> TCG <SEP> ACC <SEP> TGC <SEP> AGC <SEP> AAT <SEP> TCA <SEP> CTG <SEP> GCC <SEP> 13au701
<tb> <SEP> Bai <SEP> HI <SEP> 1
<tb> ATGACCÁTGATTACGAATTCCCCG <SEP> GATCCGTCGACCTGCAGCAATTCACTGGCC
<tb> TACTGGTACTAATGCTTAAGGGGCCTAG <SEP> GCAGCTGGACGTCGTTAAGTGACCGG
<tb> <SEP> I
<tb> <SEP> DNA <SEP> polymerase
<tb> ATGACCATGATTACGAATTCCCCGGATC <SEP> GATCCGTC6ACCTGCAGCAATTCACTGGCC
<tb> TACTGGTACTAATGCTTAAGGGGCCTAG <SEP> CTAGGCAGCTGGACGTCGTTAAGTGACCSG
<tb> <SEP> I
<tb> <SEP> Linker <SEP> HindIII
<tb> <SEP> t
<tb> ATGACCATGATTACGAATTCCCCGGATCCCAAGCTTGG <SEP> CCRAGCTT66GATCGGTCGACCTGCAGCA TTCACTGGCC
<tb> TACTGGTACTAATGCTTAAGGGGCCTAGGSTTCGAACC <SEP> GGTTCGAACCCTAGGCAGCTGGACGTCGT <SEP> TAAGTGACCGG
<tb> <SEP> HindII
<tb> <SEP> t
<tb> ATGACCATGATTACGAATTCCCCGGATCCCA <SEP> AGCTTGGGATCCGïCSACCTGCAGCAATTCACTGGCC
<tb> TACTGGTACTAATGCTTAAGGGGCCTAGGGTTCGA <SEP> ACCCTAGGCAGCTGGACGTCGTTAAGTGACCGG
<tb> <SEP> T4DNA <SEP> ligase
<tb> <SEP> 'P
<tb> ATG <SEP> ACC <SEP> ATG <SEP> ATT <SEP> ACG <SEP> AAT <SEP> TCC <SEP> CCG <SEP> GAT <SEP> CCC <SEP> AAG <SEP> CTT <SEP> GGG <SEP> ATC <SEP> CGT <SEP> CGA <SEP> CCT <SEP> SCA <SEP> SCA <SEP> AIT <SEP> CAS <SEP> TUT <SEP> CL
<tb>
Eco RI BAM HI Hind III Bac HI Sal I PstI TABLEAU I
Phase Phase Phase Complémen
Nom Phage Site de Traitement Insert de de de tation de
parental olivage HindIII BamHI PstI lacα +/
M13mp701 M13mp7 Construction D.R.Bentley O I I +
M13tg102 M13mp701 AccI ADN séquence I I I +
polymérase HindIII(a)
M13tg110 M13mp701 AccI S1 nucléase séquence III I II
HindIII(a)z
M13tg115 M13tg110 EcoRI S1 nucléase séquence II III I +
BglII (b) (a) Adaptateur de séquence HindIII phosphorylé CCAAGCTTGG (b) Adaptateur de séquence BglII non phosphorylé CAGATCTG
Les protocoles d'utilisation des enzymes (restriction, ADN polymérase, T4ÂDN ligase) sont ceux indiqués dans les notices des fournisseurs Le "linker"
HindIII est un oligonucléotide synthétique de séquence 5' CCAAGCTTGG 3' (Collaborative Research Inc., Waltham,
Mass 02154, E.U.A.).
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Eco RI BAM HI Hind III Bac HI Sal I PstI TABLEAU I
Phase Phase Phase Complémen
Nom Phage Site de Traitement Insert de de de tation de
parental olivage HindIII BamHI PstI lacα +/
M13mp701 M13mp7 Construction D.R.Bentley O I I +
M13tg102 M13mp701 AccI ADN séquence I I I +
polymérase HindIII(a)
M13tg110 M13mp701 AccI S1 nucléase séquence III I II
HindIII(a)z
M13tg115 M13tg110 EcoRI S1 nucléase séquence II III I +
BglII (b) (a) Adaptateur de séquence HindIII phosphorylé CCAAGCTTGG (b) Adaptateur de séquence BglII non phosphorylé CAGATCTG
Les protocoles d'utilisation des enzymes (restriction, ADN polymérase, T4ÂDN ligase) sont ceux indiqués dans les notices des fournisseurs Le "linker"
HindIII est un oligonucléotide synthétique de séquence 5' CCAAGCTTGG 3' (Collaborative Research Inc., Waltham,
Mass 02154, E.U.A.).
La région cIIrbs est isolés à partir d'un plaamide pOS11 (réf 18) qui contient un fragment de #HaeIII/Sau3A qui s'étend
du milieu du gène cro jusqu'au milieu de la région
codant pour cII (cro et cI étant impliqués notamment dans la régulation de la lysogénie du bacté riophage #).
du milieu du gène cro jusqu'au milieu de la région
codant pour cII (cro et cI étant impliqués notamment dans la régulation de la lysogénie du bacté riophage #).
On prélève dans pOG11 le fragment AvaI/Taq1 de 186 bp contenant la région cIIrbs et on le traite avec la polymérase Klenow. D'autre part, on traite le phage M13tg110 par BamHI puis par la polymérase de Kienow zuivi d'un traitement à la phosphatase intestinale de veau
Les fragments obtenus zont soumis à l'action de la ligase T4.
Les fragments obtenus zont soumis à l'action de la ligase T4.
Un examen des séquences du fragment de pOG11 comportant la région cIIrbs et du phage M13tg110 permet de prévoir que l'insertion du fragment portant cIIrbs
dans le site BamHI de M13tg110 doit conduire â lobten-
tion de plaques bleues après fermentation des bactéries
transfectées compte tenu du fait que le gène lacZ' est
en phase pour la traduction, à partir de AUG du gène de
cII, tandis que les plaques correspondant à la souche
parentale M13tg110 sont blanches
Les plaques bleues sont préléves puis les colonies sont sélection- nées par analyse de restriction enzymatique des minipréparations et l'on vérifie ensuite par séquencage que la construction obtenue est correcte
On obtient ainsi un clone résultant M13tg910 dont la structure globale est représentée à la partie inférieure de la Figure 2 et la structure détaillée est représentée a la figure 3
On constate que l'insertion du fragment cIIrbs reconstruit en amont les sites BamHI et Aval et en aval le site BamHI.
dans le site BamHI de M13tg110 doit conduire â lobten-
tion de plaques bleues après fermentation des bactéries
transfectées compte tenu du fait que le gène lacZ' est
en phase pour la traduction, à partir de AUG du gène de
cII, tandis que les plaques correspondant à la souche
parentale M13tg110 sont blanches
Les plaques bleues sont préléves puis les colonies sont sélection- nées par analyse de restriction enzymatique des minipréparations et l'on vérifie ensuite par séquencage que la construction obtenue est correcte
On obtient ainsi un clone résultant M13tg910 dont la structure globale est représentée à la partie inférieure de la Figure 2 et la structure détaillée est représentée a la figure 3
On constate que l'insertion du fragment cIIrbs reconstruit en amont les sites BamHI et Aval et en aval le site BamHI.
Ea traduction à partir de AUG de cli conduit à la fusion des 13 aminoacides terminaux de cil aux 8 aminoacides du NH2 terminal de la protéine lacZ".
4) Insertion du fragment #cIIxbs dans le plasmide pTG907
La troisième étape de cette synthèse consiste à transférex le fragment cIIrbs/lacZ' du phage M13tg910 sur le plasmide vecteur pTG907 préparé précédemment...
La troisième étape de cette synthèse consiste à transférex le fragment cIIrbs/lacZ' du phage M13tg910 sur le plasmide vecteur pTG907 préparé précédemment...
Pour ce faire, il convient tout d'abord d'éliminer les sites EcoRi, BamHI et AvaI en amont de cIIrbs puis d'insérer un site BglII
Dans ces conditions, cIIrbs peut etre prélevé sous forme d'un fragment BgIII-BglII et placé dans le site BamHI en aval du promoteur PL et du gène AN de pTG907.
Dans ces conditions, cIIrbs peut etre prélevé sous forme d'un fragment BgIII-BglII et placé dans le site BamHI en aval du promoteur PL et du gène AN de pTG907.
Le phage M13tg910 est digéré avec EcoRI puis traité avec Ba131 puis ensuite par la polymérase de
Klenow. Les fragments obtenus sont alors soumis à l'action de la ligase en présence d'adaptateurs BglII non phosphorylés. Le mélange de ligation obtenu est utilisé pour transformer des cellules compétentes JM103.
Klenow. Les fragments obtenus sont alors soumis à l'action de la ligase en présence d'adaptateurs BglII non phosphorylés. Le mélange de ligation obtenu est utilisé pour transformer des cellules compétentes JM103.
On sélectionne alors les plages bleues.Ces clones sont ensuite analysés afin de vérifier qu'ils contiennent le site
BglII et qu'ils ne présentent plus de site EcoRI ou BamHI en amont. On obtient ainsi des clones tels que M13tg912 dont la structure est représentée sur la Figure 4.
BglII et qu'ils ne présentent plus de site EcoRI ou BamHI en amont. On obtient ainsi des clones tels que M13tg912 dont la structure est représentée sur la Figure 4.
Le traitement par Ba131 a produit une délétion de 101 bp éliminant les sites EcoRI, BamHI et AvaI ainsi que les séquences de lac ATG et lac Shine/Dalgarno.
Le site BglII introduit se trouve placé environ 100 bp en amont de 1'ATG de cli et 10 bp en aval de Flac.
Comme cela a été dit précédemment, il était envisagé de transférer le fragment BglII-BglII comportant cIIrbs et lacZ' de M13tg912 dans le site BamHI de pTG907 préparé à l'origine. Toutefois cette construction n'a pas été possible car elle se révèle Iéthale pour les souches hôtes, c'est pourquoi il a fallu mettre au point une stratégie différente mettant en oeuvre un adaptateur
HgaI/SphI qui permet l'insertion d'un fragment
BglII/HgaI portant cIIrbs et lac2' entre les sites
BamHI et SphI de pTG907.
HgaI/SphI qui permet l'insertion d'un fragment
BglII/HgaI portant cIIrbs et lac2' entre les sites
BamHI et SphI de pTG907.
Le fragment BamHI/SphI de pTG907, le fragment
BglII/HpaI portant cIIrbs et làcZ' et l'adaptateur phosphorylé ont été préhybridés dans un rapport molaire de 1:2:1 puis traités avec la ligase T4. Des aliquots sont util-isés pour transformer les cellules compétentes de la souche 6150 à 300C.
BglII/HpaI portant cIIrbs et làcZ' et l'adaptateur phosphorylé ont été préhybridés dans un rapport molaire de 1:2:1 puis traités avec la ligase T4. Des aliquots sont util-isés pour transformer les cellules compétentes de la souche 6150 à 300C.
Les cellules intéressantes sont identifiées en sélectionnant les transformants avec un fragment cIIrbs/lacZ' marqué au P32 et la construction obtenue est confirmée par une étude de restriction enzymatique.
Afin d'avoir une première indication montrant que les différents éléments du système d'expression se conduisent comme cela est désiré, le plasmide obtenu, pTG908, est transféré dans une souche hôte N6437 qui possède à la fois c1857 et le fragment. de la ss-galactosidase complémentant le fragment a qui est codé par le plasmide.
Les transformants obtenus placés sur une boite contenant IPTG + Xgal sont blancs à 280C puis virent au bleu environ 30 minutes après lorsqu'on les transfère à 420C.
EXEMPLE 2
De la même façon que précédemment, il est possible d'utiliser un autre promoteur que PL.
De la même façon que précédemment, il est possible d'utiliser un autre promoteur que PL.
pBAH3 construit par V. pirotta comporte le gène cI857, PR et une partie du gène cro cloné dans pBR322.
Ce clone contient un site BglII dans le gène cro' en aval du promoteur PR (promoteur de droite) qui est sous le contrôle du cI857 codé par le plasmide.
Le gène Q, P'R' le gène 6S ARN et une partie du gène S tardif sont contenus dans un fragment BBclI (réf6- rence 19 .). Ce fragment peut être inséré dans le site
BglII de pBAH3 en mettant.ainsi le gène Q sous le contrôle de PR du plasmide. P'R plus l'ensemble de système de contrôle en cascade sera alors contenu dans un fragment
EcoRI qui peut être utilisé pour remplacer PL et N qui se trouvent placés dans un fragment BglII/AvaIII dans pTG908.
BglII de pBAH3 en mettant.ainsi le gène Q sous le contrôle de PR du plasmide. P'R plus l'ensemble de système de contrôle en cascade sera alors contenu dans un fragment
EcoRI qui peut être utilisé pour remplacer PL et N qui se trouvent placés dans un fragment BglII/AvaIII dans pTG908.
Ceci conduit à une construction analogue de pTG908 mais dans lequel la transcription est contrôlée par P'R.
Les exemples suivants concernent le clonage du gène codant pour l'antitrypsine-a1.
Pour ce faire, on a isolé un clone de cADN codant pour la séquence complète du mARN codant l'antitrypsine-a1 humaine. On a inséré cette séquence dans un vecteur d'expression plasmidique bactérien préparé. précédemment et démontré la synthèse dans E. coli d'une grande quantité de polypeptides qui présentent une réaction avec un anticorps correspondant à l'antitrypsine-a1 humaine naturelle et qui présentent, in vitro, l'activité biologique de l'antitrypsine-a et sa capacité à inhiber l'activité de l'élastase. Cette antitrypsine-a1 produite à partir de bactéries constitue la base d'un produit qui peut etre utilisé dans une thérapie de remplacement pour le traitement des désordres qui comportent une déficience en antitrypsine-a1.
EXEMPLE 3
Clonage et isolement d'un cADN complet condant nour l'antitryp- sine-α1 humaine et son expression dans E. col
1) Clonage du cADN de l'antitrypsine-α a) Isolement du polyA+ mARN de foie humain et
détection de I'activité de mARN anitrvPsine-a,
Les foies humains sont obtenus post mortem et rapidement congelés dans l'azote liquide. L'ARN est'prdparé à partir de 5 g de foie en utilisant le procédé au chlorhydrate de guanidine tel que décrit dans la référence 20.
Clonage et isolement d'un cADN complet condant nour l'antitryp- sine-α1 humaine et son expression dans E. col
1) Clonage du cADN de l'antitrypsine-α a) Isolement du polyA+ mARN de foie humain et
détection de I'activité de mARN anitrvPsine-a,
Les foies humains sont obtenus post mortem et rapidement congelés dans l'azote liquide. L'ARN est'prdparé à partir de 5 g de foie en utilisant le procédé au chlorhydrate de guanidine tel que décrit dans la référence 20.
L'ARN est chromatographié sur une colonne poly U-Sépharose (Pharmacia) pour enrichir en polyA+ mARN.
L'ARN total et le polyA+ mARN sont traduits dans un lysat de réticulpcytes.de lapin traité par la nucléase (BRL) en utilisant les conditions décrites précédemment dans la référence 20. De façon à étudier les modifications post-traductionnelles, des membranes de pancréas de chien (réf. 21j sont ajoutées au système de traduction.
Les immunoprécipitations, en utilisant un antisérum anti antitrypsine-a1 commercial (Nordic Immunology),-sont décrites dans la référence 22.
La figure 5 représente les immunoprécipités correspondant aux produits de traduction de 1'ARN total de foie humain. Ces ARN ont été traduits dans des lysats de réticulocytes de lapin traités par la nucléase à 300 g/ml, en présence ou en l'absence de membranes microsomales de pancréas de chien.
La méthionine S35 a été utilisée comme traceur radioactif.
Les aliquots contenant environ 106 cpm de radioactivité insoluble au TCA sont soumis à une électrophorèse sur un gel à 10 ode polyacrylamide SDS, puis fluorographiés et autoradiographiés.
La ligne 1 représente les protéines marqueurs radioactives, la taille étant indiquée en 103 daltons
La ligne 2 représente les immunoprécipités avec l'antisérum antitrypsine-a1 en présence de membranes
La ligne 3 est identique à la ligne 2 mais les produits obtenus ayant été préparés en l'absence de membranes
la ligne 4, comme pour la ligne 3 mais en utilisant un antisérum non immune.
La ligne 2 représente les immunoprécipités avec l'antisérum antitrypsine-a1 en présence de membranes
La ligne 3 est identique à la ligne 2 mais les produits obtenus ayant été préparés en l'absence de membranes
la ligne 4, comme pour la ligne 3 mais en utilisant un antisérum non immune.
L'immunoprécipitation du produit de traduction d'ARN-total de foie humain avec l'antisérum antiantitrypsine-a1 indique qu'un polypeptide spécifique de poids moléculaire de 45 000 daltons est précipité lorsque la traduction est effectuée en l'absence de membranes microsomales. L'addition de membranes microsomales à la traduction conduit à un polypeptide immunoprécipité légèrement plus grand (48 000 daltons).
Cette augmentation de la la taille du produit de traduction du mARN de l'antitrypsine-al en présence de membranes microsomales est probablement due à une modification post-traductionnelle telle que la glycosylation. Les polypeptides immunoprécipités de petite et de grande taille sont mis en compétition par l'addition d'antitrypsine-α1 humaine native non marqude et confirme l'identité des produits de traduction. Ainsi, un ARN messager de l'antitrypsine-a1 biologiquement actif peut être facilement détecté à la fois dans 1'ARN total et dans le mARN poly A+ préparé, à partir de foie humain ; la quantité de mARN a-AT est de l'ordre de 1 à 5 % dans le foie.
b) Synthèse de cADN et préparation d'une banque de
clones de cADN de foie humain
Le poly A+ mARN est utilisé comme matrice pour une transcription reverse en utilisant comme amorce un oligomère (dT) 12-18 L'ADN complémentaire est synthétisé dans 100 l de milieu réactionnel contenant 100 mMol.
clones de cADN de foie humain
Le poly A+ mARN est utilisé comme matrice pour une transcription reverse en utilisant comme amorce un oligomère (dT) 12-18 L'ADN complémentaire est synthétisé dans 100 l de milieu réactionnel contenant 100 mMol.
Tris HC1, pH 8,3, 50 mMol. de KC1, 8 mMol. MgCl, 30 mMol. ss-mercaptoéthanol, 1, g d'oligo (dT) 12-18' 5 gg de poly A mARN, 500 Mol. dATP, dCTP, dGTP, dTTP, et 80- unités de transcriptase reverse de virus de myeloblastose aviaire (Life Sciences Inc., St Petersberg,
Floride).
Floride).
Après incubation à 420C pendant 45 minutes, la réaction est terminée et le complexe cADN est dénaturé en chauffant à 1000C pendant 3 minutes et transfert rapide sur bain de glace.
Pour la synthèse du second brin d'ADN, le mélange réactionnel du premier brin est dilué 5 fois et ajusté à une concentration finale de 100 mMol. Hepes-KOH, pH 6,9, 100 mMol. KCl, 200 Mol. dATP, dGTP, dTTP, 200 ssMol. de dCTP P32 l'activité spécifique étant de 0,5 Ci/mmol., 10 unités du fragment Klenow de 1'ADN polymérase de
E. coli (Boehringer Mannheim).
E. coli (Boehringer Mannheim).
L'incubation est effectuée à 250C pendant 2 heures. Le rendement en cADN bicatenaire (dscADN) tel que cela est mesuré par la radioactivité est de 970 ng. Le mélange réactionnel est extrait avec un volume égal de phénol:chloroforme (50:50) saturé avec 10 mMol. Tris HC1, pH 7,5, 1 mEol. EDTA et le cADN est précipité par l'éthanol.
Le dscADN est rendu à extrémité franche par une digestion avec 5 unités de nucléase S1 dans un volume de réaction de 100 l contenant 30 mMol. d'acétate de sodium, pH 4,8, 300 mMol. de NaCl, 3 mMol. ZnCl2.
Après 1 heure à 370C, on ajoute de 1'EDTA et du SDS jusqu'à une concentration finale 10 mmol. et 0,1 % respectivement puis le mélange réactionnel est chauffé à 650C pendant 10 minutes. Le dscADN traité par S1 est ensuite appliqué sur un gradient de sucrose linéaire 5-20 % dans un tampon 100 mMol. Tris HCl, pH 7,5, 100 mMol. NaCl, 5 Mol. EDTA puis centrifugé à 30 000 rpm à 150C pendant 15 heures avec un rotor
Beckman Sw60 Ti. Des fractions de 0,5 mi sont collectées et la quantité de cADN dans chacune des fractions est déterminée en mesurant la radioactivité insoluble-TCA dans les aliquots de chacune des fractions. La taille du dscADN dans chacune des fractions est mesurée en analysant des aliquots sur un gel d'agarose neutre suivi par une autoradiographie.Les fractions contenant le dscADN d'un poids moyen de 1 kb et plus sont rassemblées, 5 g de tARN de E. coli sont ajoutés comme entraineur et les acides nucléiques sont récupérés par précipitation à l'éthanol, suivie par une centrifugation.
Beckman Sw60 Ti. Des fractions de 0,5 mi sont collectées et la quantité de cADN dans chacune des fractions est déterminée en mesurant la radioactivité insoluble-TCA dans les aliquots de chacune des fractions. La taille du dscADN dans chacune des fractions est mesurée en analysant des aliquots sur un gel d'agarose neutre suivi par une autoradiographie.Les fractions contenant le dscADN d'un poids moyen de 1 kb et plus sont rassemblées, 5 g de tARN de E. coli sont ajoutés comme entraineur et les acides nucléiques sont récupérés par précipitation à l'éthanol, suivie par une centrifugation.
Le dscADN est dissous dans un petit volume de 1/10 x SSC (15 mMol. NaCi, 1,5 mMol. de citrate de sodium, pH 7,0).
100 ng de cADN bicatenaire sont allongés à l'extrémité 3' avec une extension dC hompolymère par incubation dans un milieu réactionnel de: 30 l contenant 140 mMol. de cacodylate de sodium, pH 6,8, 1 mMol. de chlorure de cobalt, 0,1 mMol. de dithioérithritol, 100 Mol. dCTP H , activité spécifique 6,7 Ci/mmol. et 5 unités de transférase ddoxynucléotide terminale (BRL) pendant 15 minutes à 370C.
Des petits morceaux dG hompolymères (approximativement 13 éléments par extrémité 3') sont ajoutés dans le même milieu réactionnel au plasmide pBR322 ,digéré au préalable avec l'enzyme PstI. Le plasmide pBR322 ainsi obtenu, est ensuite purifié à partir du mélange réactionnel par extraction au.phénol suivie par une électrophorèse préparative et une électro-élution sur un gel d'agarose à 1 %.
Le dscADN obtenu directement du milieu réactionnel est mélangé avec pBR322-dG dans un rapport de 15 ng', de cADN.pour 500 ng de vecteur dans 150 l de 10 mMol. Tris HC1, pH 7,5, 100 mMol. NaCl, 1 mMol.
EDTA, chauffé à 65 C pendant 10 minutes puis incubé à 420C pendant 2 heures. Le mélange de réaction est ensuite utilisé pour transformer (référence 23) une souche de E. coli 1106, les transformants sont sélectionnés sur plaque d'agar LB contenant 15 g/ml de tétracycline. Un total de 15 000 recombinants sont obtenus à partir de 30 ng de dscADN qui, approximativement pour 50 % d'entre eux, contiennent des insertions de cADN supérieures à 1 kb. Fous les transformants sont prélevés des plaques, suspendus dans un milieu LB contenant 15 y/ml de tétracycline et la banque est stockée à - 200C après addition de glycérol jusqu'à 50 %.
c) Stratégie pour isoler les clones de cADN de l'antitrypsine-α1
La séquence de 306 pb du clone de cADN d'antitrypsine-a1 humaine incomplète codant les 69 aminoacides terminaux et incluant 66 nucléotides de la séquence non codante en 3' (référence 24) est analysée par ordinateur de façon à déterminer la séquence d'oligonucléotides qui doit être utilisée comme sonde pour un clone de cADN d'antitrypsine-a1. Ceci est effectué en divisant les 306 paires de base en tous les groupements possibles de 21 bases (21mers) qui sont ensuite analysés séparément pour leur possibilité de former une structure double brin intramoléculaire (épingle à cheveux). Le 2lmer choisi, 5'-TGAAGCTCTCCAAGGCCTGTG-3' (qui est représenté à la fig. 6) ne contient aucune épingle à cheveux plus longue que 2 pb.Le complément de cette séquence, c 'est-à-dire 5' -GCACGGCCTTGGAG'AGCTTCA-3', est synthétisé sur un support de gel de silice comme cela a été décrit ,précédemment '(référence 25) q Après avoir marqué l'extrémité 5', la taille de l'oligonucléotide est testée par électrophorèse sur gel de polyacrylamide et la séquence est déterminée par la méthode de Maxam et Gilbert.
La séquence de 306 pb du clone de cADN d'antitrypsine-a1 humaine incomplète codant les 69 aminoacides terminaux et incluant 66 nucléotides de la séquence non codante en 3' (référence 24) est analysée par ordinateur de façon à déterminer la séquence d'oligonucléotides qui doit être utilisée comme sonde pour un clone de cADN d'antitrypsine-a1. Ceci est effectué en divisant les 306 paires de base en tous les groupements possibles de 21 bases (21mers) qui sont ensuite analysés séparément pour leur possibilité de former une structure double brin intramoléculaire (épingle à cheveux). Le 2lmer choisi, 5'-TGAAGCTCTCCAAGGCCTGTG-3' (qui est représenté à la fig. 6) ne contient aucune épingle à cheveux plus longue que 2 pb.Le complément de cette séquence, c 'est-à-dire 5' -GCACGGCCTTGGAG'AGCTTCA-3', est synthétisé sur un support de gel de silice comme cela a été décrit ,précédemment '(référence 25) q Après avoir marqué l'extrémité 5', la taille de l'oligonucléotide est testée par électrophorèse sur gel de polyacrylamide et la séquence est déterminée par la méthode de Maxam et Gilbert.
d) Analyse de la banque cADN de foie humain
Environ 15 000 colonies sont mises en croissance pendant une nuit sur des boîtes d'agar LB contenant 15 g/ml de tétracycline. Le jour suivant, les colonies bactériennes sont transférées sur papier Whatman 540 (référence 26). Les bactéries demeurant sur les boites d'origine contenant la tétracycline sont remises en croissance pendant quelques heures à 370C.
Environ 15 000 colonies sont mises en croissance pendant une nuit sur des boîtes d'agar LB contenant 15 g/ml de tétracycline. Le jour suivant, les colonies bactériennes sont transférées sur papier Whatman 540 (référence 26). Les bactéries demeurant sur les boites d'origine contenant la tétracycline sont remises en croissance pendant quelques heures à 370C.
Afin de prdparer 1'ADN plasmidique bactérien pour l'hybridation, les filtres sont lavés pendant 5 minutes avec NaOH0,5 Mol. Après séchage à l'air les filtres sont neutralisés par un lavage séquentiel dans un tampon 0,5 Mol. Tris HCl, pH 7,5, 2 x SSC. Les filtres sont alors rincés avec de l'alcool et séchés à l'air.
Les débris bactériens restants sont éliminés par digestion pendant 2 heures à 370C avec 25 ssg/ml de protéinase K dans 50 raMol. Tris HC1, pH 7,5, 5 mMol. EDTA, 0,5 % SDS.
La sonde d'hybridation est préparée par marquage de l'extrémité 5' avec la polynucléotide kinase (PL Biochemicals) sur 80 ng du 21mer avec 50 uCi de P32-y-ATP. L'hybridation est effectuée à 370C pendant une nuit dans 40 ml de 6 x SSC, 1 x solution de Denhardt, 10 mMol. de phosphate de sodium, pH 7,5, 50 % de formamide. Les filtres sont alors lavés à la température de la pièce plusieurs fois avec 6 x SSC, 0,1 % SDS. Les filtres sont séchés et autoradiographi4s pendant une nuit. Des signaux positifs très forts sont clairement détectables au delà du bruit de fond -de l'hybridation.
e) Identification des Elasmides recombinants contenant
le cADA de l'antitrypsine-α1
Les colonies bactériennes correspondant aux signaux positifs importants sont déterminées en orientant l'autoradiographe avec les boîtes d'origine contenant la tétracycline. Les ADN plasmidiques sont préparés à partir de petites cultures de chacune des colonies bactériennes (référence 27) et la taille de l'insert de cADN de chaque plasmide est déterminde par digestion avec PstI. Un plasmide appelé pTG603 se trouve contenir un insert d'environ 1,6 kb possédant deux sites AvaI et un site unique BamHI.
le cADA de l'antitrypsine-α1
Les colonies bactériennes correspondant aux signaux positifs importants sont déterminées en orientant l'autoradiographe avec les boîtes d'origine contenant la tétracycline. Les ADN plasmidiques sont préparés à partir de petites cultures de chacune des colonies bactériennes (référence 27) et la taille de l'insert de cADN de chaque plasmide est déterminde par digestion avec PstI. Un plasmide appelé pTG603 se trouve contenir un insert d'environ 1,6 kb possédant deux sites AvaI et un site unique BamHI.
La taille des fragments produits par double digestion avec AvaI + PstI (250 paires de base) est en accord avec ce qui était prévu pour un clone de l'antitrypsine-a1 ayant une longueur complète (références 24 28). Pour confirmer que ce plasmide contient bien en fait l'insert de cADN de l'antitrypsine-α1, l'insert est transféré sous forme de fragment PstI sur le phage M13mp8 après découpage avec PstI puis séquence en utilisant des didéoxynucléotides comme terminateurs de chaîne. La séquence obtenue (fig. 7) confirme l'identité du cADN avec celui de l'antitrypsine-a. La séquence obtenue est comparée à la région correspondante connue pour 1'ADN humain codant pour l'antitrypsine-a1.A la partie supérieure de la figure 7 figure la séquence partielle du clone de cADN de l'antitrypsine-a1 complète et à la partie inférieure figure la séquence partielle de pTG603 telle quelle a été déterminée. L'homologie entre les deux séquences de nucléotides est représentée par des astérisques. X représente des nucléotides qui n'ont pas été déterminés.
2) Expression du cADN de l'antitrypsine-α1
humaine dans E. coli
Le clone de cADN de l'antitrypsine-α1 humaine pTG603 contient un site de restriction unique BamHI immddiatement après le codon pour le premier aminoacide de la protéine mature.La capacité de codage pour le polypeptide mature entier, à 1-' exception de l'acide glutamique initial, est ainsi contenu dans un fragment
BamHI/PstI qui a été cloné sur le vecteur d'expression pTG920 ;' 'dans cette. construction, la transcription est effectuée à partir du promoteur de A à gauche, PL, , et la traduction est initiée à 1'ATG de #cIIrbs qui, accompagné par le site de fixation des ribosomes et les 39 premiers pb, du gène AcII, sont fusionnés au début du gène lacZ' comme cela est indiqué.
humaine dans E. coli
Le clone de cADN de l'antitrypsine-α1 humaine pTG603 contient un site de restriction unique BamHI immddiatement après le codon pour le premier aminoacide de la protéine mature.La capacité de codage pour le polypeptide mature entier, à 1-' exception de l'acide glutamique initial, est ainsi contenu dans un fragment
BamHI/PstI qui a été cloné sur le vecteur d'expression pTG920 ;' 'dans cette. construction, la transcription est effectuée à partir du promoteur de A à gauche, PL, , et la traduction est initiée à 1'ATG de #cIIrbs qui, accompagné par le site de fixation des ribosomes et les 39 premiers pb, du gène AcII, sont fusionnés au début du gène lacZ' comme cela est indiqué.
Une région de liaison comportant des sites de restriction uniques est située à la jonction de cII et de la séquence lacZ'. Le plasmide pTG920 est un dérivé de pTG908 préparé dans l'exemple 3,dans lequel le fragment original BamHI/PstI situé à 40 bp en aval de 1'ATG du cII dans pTG908, est remplacé par un fragment
BglII/PstI de Mi3tgll5, comme cela est décrit dans la figure 8.
BglII/PstI de Mi3tgll5, comme cela est décrit dans la figure 8.
Grâce à ce processus, on obtient un site BamHI qui est placé dans la même phase de traduction que le site BamHI du gène de l'antitrypsine-α1.
La figure 8 représente la stratégie de clonage permettant de préparer le plasmide pTG920 à partir du plasmide pTG908 -et du phage M13tg115 et indication du fragment à cloner de de pTG603 Les traits pleins reprdsentent les séquences codant pour une protéine et dans le cas de pTG603 représentent la séquence codant pour le polypeptide mature. de l'antitrypsine-α1 Les régions hachurées représentent les -régions codant pour les 13 aminoacides N-terminaux de cII qui seront finalement fusionnés avec l'antitrypsine-α1.
Ainsi, l'insertion d'.un fragment BamHI/PstI de pTG603 entre BamHI et le site PstI de pTG920 conduira à l'expression d'un polypeptide fusionné contenant (à partir du NH2 terminal) 13 aminoacides de la protéine cII, 4 aminoacides dérivant de la séquence de l'adaptateur et le polypeptide mature de l'antitrypsine-α1.
excepté l'acide glutamique du NH2 terminal.
pTG920, traité par BamHI/PstI et de la phosphatase alcaline, est lié avec pTG603, digéré- avec BamHI et
PstI . Les cellules TGe900 transformantes portant le fragment antitrypsine-a1 sont isolées après
étude de restriction enzymatique. L'un de ces clon, pTG922, est choisi-pour être étudié plus complètement.
PstI . Les cellules TGe900 transformantes portant le fragment antitrypsine-a1 sont isolées après
étude de restriction enzymatique. L'un de ces clon, pTG922, est choisi-pour être étudié plus complètement.
Comme cela a déjà été mentionné, les vecteurs selon l'invention peuvent permettre de préparer, à titre de variante du procédé précédent, la protéine non fusionnée. Pour ce faire, on digère pTG920 avec
NdeI et,pTG603 avec BamHI-comme précédemment, puis on effectue la ligation des fragments obtenus par l'inter- médiaire d'un adaptateur oligomère, comme cela est décrit ci-dessous, ou bien.on effectue les memes opérations sur le vecteur pTG922
NdeI et,pTG603 avec BamHI-comme précédemment, puis on effectue la ligation des fragments obtenus par l'inter- médiaire d'un adaptateur oligomère, comme cela est décrit ci-dessous, ou bien.on effectue les memes opérations sur le vecteur pTG922
<tb> <SEP> NdeI <SEP> BamHI
<tb> <SEP> 1 <SEP> cII <SEP> 1
<tb> 5'-CATATG------- <SEP> -------GGATCC <SEP> 3'
<tb> 3'-GTATAC------- <SEP> -------CCTAGG <SEP> 5'
<tb> <SEP> t <SEP> t
<tb> <SEP> NdeI <SEP> BamHI
<tb> <SEP> TATGGAG <SEP> 7mer
<tb> <SEP> Adaptateur <SEP> ACCTCCTAG <SEP> 9mer
<tb> <SEP> 1
<tb> <SEP> ------CA <SEP> CA <SEP> TATGGAG <SEP> GAT <SEP>
<tb> <SEP> ------GT <SEP> -CT <SEP> ATACCTC <SEP> CITA <SEP>
<tb>
Cette jonction reconstitue le codon de départ
ATG auquel est fusionné le gène codant pour l'antitrypsine-α;1
Les cellules de la souche E. coli TGE900 contenant, soit le plasmide d'expression pTG922 qui contient le gène de l'antitrypsine-a1 humaine, soit le plasmide seul sans insert, pTG920, les protéines sont marques avec de la méthionine S35 pendant 1 heure aux températures indiquées ci-dessus.
<tb> <SEP> 1 <SEP> cII <SEP> 1
<tb> 5'-CATATG------- <SEP> -------GGATCC <SEP> 3'
<tb> 3'-GTATAC------- <SEP> -------CCTAGG <SEP> 5'
<tb> <SEP> t <SEP> t
<tb> <SEP> NdeI <SEP> BamHI
<tb> <SEP> TATGGAG <SEP> 7mer
<tb> <SEP> Adaptateur <SEP> ACCTCCTAG <SEP> 9mer
<tb> <SEP> 1
<tb> <SEP> ------CA <SEP> CA <SEP> TATGGAG <SEP> GAT <SEP>
<tb> <SEP> ------GT <SEP> -CT <SEP> ATACCTC <SEP> CITA <SEP>
<tb>
Cette jonction reconstitue le codon de départ
ATG auquel est fusionné le gène codant pour l'antitrypsine-α;1
Les cellules de la souche E. coli TGE900 contenant, soit le plasmide d'expression pTG922 qui contient le gène de l'antitrypsine-a1 humaine, soit le plasmide seul sans insert, pTG920, les protéines sont marques avec de la méthionine S35 pendant 1 heure aux températures indiquées ci-dessus.
Les extraits sont préparés comme cela est décrit dans la référence 7 et les aliquot,s analysés sur un gel de polyacrylamide 10 % SDS, suivi par une fluorographie et autoradiographie.
Les résultats sont représentés sur la figure 9A
Ligne 1 : marqueur de poids moléculaire radioactif,
Ligne 2 : extrait cellulaire avec pTG922, croissance à 280C (sans induction),
Ligne 3 : comme pour la ligne 2, mais croissance à 420C (induction)
Ligne 4 : extrait de cellules contenant le plasmide pTG920, croissance à 28 C,
Ligne 5 : comme pour la ligne 4, mais croissance à 420C.
Ligne 1 : marqueur de poids moléculaire radioactif,
Ligne 2 : extrait cellulaire avec pTG922, croissance à 280C (sans induction),
Ligne 3 : comme pour la ligne 2, mais croissance à 420C (induction)
Ligne 4 : extrait de cellules contenant le plasmide pTG920, croissance à 28 C,
Ligne 5 : comme pour la ligne 4, mais croissance à 420C.
Les résultats observés démontrent l'induction d'une
bande forte ayant un poids moléculaire d'environ
45 000 daltons (figure 9A). La densitométrie de l'auto
radiogramme indique que la quantité d'antitrypsine-a1
produire représente entre 7,5 et 15 % des protéines totales
de E. coli (I1 n'a été fait aucun ajustement pour les
différences potentielles entre le contenu en méthionine de
l'antitrypsine-a1 et celui des protéines de E. coli
totales).
bande forte ayant un poids moléculaire d'environ
45 000 daltons (figure 9A). La densitométrie de l'auto
radiogramme indique que la quantité d'antitrypsine-a1
produire représente entre 7,5 et 15 % des protéines totales
de E. coli (I1 n'a été fait aucun ajustement pour les
différences potentielles entre le contenu en méthionine de
l'antitrypsine-a1 et celui des protéines de E. coli
totales).
Les extraits marqués de cellules de E. coli portant les plasmides pTG920 et pTG922 sont préparés comme mentionné ci-dessus Des aliquots sont soumis à une immunoprécipitation avec un antisérum antiantitrypsine-a1, comme cela est décrit pour la figure 5, et sont analysés sur un gel de polyacrylamide 10 % SDS, suivi par une fluorographie.Les résultats sont représentés sur la figure 9B1
la ligne 1 correspond aux extraits de E. coli TGE900 contenant pTG922 (présentant la séquence de I'antitrypsine-a1) marqués à 420C et immunoprécipités avec l'antisérum de l'antitrypsine-a1, 100 jil d'extraits,
ligne 2, comme pour la ligne 1, mais avec 2 l d'extraits,
Ligne 3, néant,
Ligne 4, comme pour la ligne 1, avec une croissance cellulaire à une température non permise (28 0C), 100 ml d'extraits,
ligne 5, extraits de cellules contenant le plasmide parent pTG9.20,marqués à la température de l'induction, 420C, 100 1 d'extraits.
la ligne 1 correspond aux extraits de E. coli TGE900 contenant pTG922 (présentant la séquence de I'antitrypsine-a1) marqués à 420C et immunoprécipités avec l'antisérum de l'antitrypsine-a1, 100 jil d'extraits,
ligne 2, comme pour la ligne 1, mais avec 2 l d'extraits,
Ligne 3, néant,
Ligne 4, comme pour la ligne 1, avec une croissance cellulaire à une température non permise (28 0C), 100 ml d'extraits,
ligne 5, extraits de cellules contenant le plasmide parent pTG9.20,marqués à la température de l'induction, 420C, 100 1 d'extraits.
Enfin, sur la figure 9B2 figurent les résultats d'immunocompétition de l'antitrypsine-a1 synthétisée par
E. coli. Les extraits cellulaires de E. coli contenant pTG922 sont marqués à 420C comme cela a été décrit précédemment. Des aliquots sont utilisés pour les immunoprécipitations suivantes
ligne 1 : immunoprécipitation avec l'antisérum anti-antitrypsine-al,
ligne 2 : comme pour la ligne 1, mais en présence de 10 g d'antitrypsine-a1 humaine native non marqude,
ligne 3, comme pour la ligne 2, mais 20 g de compétiteur antitrypsine-a1
ligne 4, comme pour la ligne 3, mais avec 50 g de compétiteur.
E. coli. Les extraits cellulaires de E. coli contenant pTG922 sont marqués à 420C comme cela a été décrit précédemment. Des aliquots sont utilisés pour les immunoprécipitations suivantes
ligne 1 : immunoprécipitation avec l'antisérum anti-antitrypsine-al,
ligne 2 : comme pour la ligne 1, mais en présence de 10 g d'antitrypsine-a1 humaine native non marqude,
ligne 3, comme pour la ligne 2, mais 20 g de compétiteur antitrypsine-a1
ligne 4, comme pour la ligne 3, mais avec 50 g de compétiteur.
Ces essais démontrent que le produit d'immunoprécipitation-a le même poids moléculaire que celui qui est précipité à partir, du produit de traduction exempt de cellule provenant du mARN de foie humain en l'absence de membrane.
3) Activité biologique de l'antitrypsine-α1
produite dans E. coli
Les extraits bruts de pTG922 sont préparés et des aliquots sont testés pour..leur activité anti-élastase dé pancréas de porcs.
produite dans E. coli
Les extraits bruts de pTG922 sont préparés et des aliquots sont testés pour..leur activité anti-élastase dé pancréas de porcs.
Pour tester l'activité biologique de l'anti- trypsine-a1 préparée par E. coli on prépare des extraits bruts de culture comme cela est décrit précédemment en l'absence d'inhibiteur de protéase, sauf un inhibiteur de la trypsine de soja. Les essais à l'élastase sont effectués selon la méthode de. sera (référence 29) modifiée.
Les extraits bruts. d'échantillons d'antitrypsine-α1 sont préincubés avec 0,25 g d'élastase pancréatique de porcs pendant 30 minutes à la. température ambiante avant d'y ajouter un substrat d'élastine H3 'et incubation à 370C. pendant 15 heures. Les échantillons de 300 l sont ensuite centrifugés et le pourcentage d'inhibition est déterminé par comptage des surnageants.
Les échantillons sont les suivants
1) - élastase
2) - élastase + 50 l d'extraits de pTG920
induits,
3-4) - élastase + 20 iii d'extraits de pTG920
induits + 5 g et 10 g d'anti
trypsine-a1 humaine (Sigma)
5-6-7) - élastase + 5 ttl + 20 l + 50 iil d'extraits
de pTG9-22 induits,
8) - élastase + 50 l d'extraits de pTG922
non induits.
1) - élastase
2) - élastase + 50 l d'extraits de pTG920
induits,
3-4) - élastase + 20 iii d'extraits de pTG920
induits + 5 g et 10 g d'anti
trypsine-a1 humaine (Sigma)
5-6-7) - élastase + 5 ttl + 20 l + 50 iil d'extraits
de pTG9-22 induits,
8) - élastase + 50 l d'extraits de pTG922
non induits.
Les résultats montrent (figure 1Q) qu'une inhibition complète de l'élastase est obtenue seulement avec des extraits induits par pTG922 et non pas dans les extraits non induits de pTG922 ou de pTG920, ce qui indique la présence de l'antitrypsine-α1 active biologiquement dans' les extraits induits.
4) Estimation de la quantité d'antitrypsine-α1
produite par les bactéries
A partir des gels de polyacrylamide des extraits induits marqués, on estime qu'environ 15 % des protéines cellulaires totales sont constituées par de l'antitrypsine-a1.
produite par les bactéries
A partir des gels de polyacrylamide des extraits induits marqués, on estime qu'environ 15 % des protéines cellulaires totales sont constituées par de l'antitrypsine-a1.
En admettant pg de protéines par cellule,, ceci donne 0,15 pg d'antitrypsine-α1 par cellule.
Après traitement aux ultrasons et centrifugation, environ 50 % de l'antitrypsine-al est perdue dans le culbt : le pourcentage d'antitrypsine-α1 par rapport au total des protéines cellulaires dans le surnageant est donc de 7,5 %.
Une estimation de la quantité d'antitrypsine-a1 produite peut également être faite à partir des mesures de l'activité anti-dlastase. Il a été trouvé que 100 % d'inhibition pour 0,25 g d'élastase pancréatique porcine sont obtenus avec 10 g d'antitrypsine-α1 humaine préparée à partir de sérum (en présence des extraits bactériens de contrôle).Un niveau équivalent d'inhibition est observé avec 50 l d'extraits bactériens induits contenant de l'antitrypsine-a1, c'est-à-dire
50 l d'extraits = 10 g antitrypsine-α1
1,5 l de culture = 10 gg antitrypsine-a 1,5 x 108 cellules = 10 g antitrypsine-a 150 cellules = 10 g antitrypsine-a1 1 cellule = - 0,05 pg (i.e. 6 % protéines
cellulaires totales)
'Ceci est en bon accord avec le taux de 7,5 % estimé à partir des gels après traitement sonore et centrifugation, Ce calcul indique que l'antitrypsine-α;1 produite par des bactéries présente un taux d'activité anti-élastase comparabie à l'antitrypsine-a1 préparée à partir de sérum et que l'antitrypsine-a1 est produite avec un taux d'environ 15 mg/l de cultures.
50 l d'extraits = 10 g antitrypsine-α1
1,5 l de culture = 10 gg antitrypsine-a 1,5 x 108 cellules = 10 g antitrypsine-a 150 cellules = 10 g antitrypsine-a1 1 cellule = - 0,05 pg (i.e. 6 % protéines
cellulaires totales)
'Ceci est en bon accord avec le taux de 7,5 % estimé à partir des gels après traitement sonore et centrifugation, Ce calcul indique que l'antitrypsine-α;1 produite par des bactéries présente un taux d'activité anti-élastase comparabie à l'antitrypsine-a1 préparée à partir de sérum et que l'antitrypsine-a1 est produite avec un taux d'environ 15 mg/l de cultures.
5) Modification post-synthétique de l'antitrypsine-α1
L'antitrypsine-a1 humaine est une glycoprotéine qui contient trois chaines latérales d'hydrates de carbone. Ces chaines sont de type N-glucoside contenant de l'acide N-acétyl neuraminîque, du galactose, du mannose et de la N-acétyl glycosamine, et sont liées à la protéine par l'intermédiaire d'un radical asparginyl.
L'antitrypsine-a1 humaine est une glycoprotéine qui contient trois chaines latérales d'hydrates de carbone. Ces chaines sont de type N-glucoside contenant de l'acide N-acétyl neuraminîque, du galactose, du mannose et de la N-acétyl glycosamine, et sont liées à la protéine par l'intermédiaire d'un radical asparginyl.
Les oligosaccharides existent, soit sous forme A (ou à 2 points de branchement), soit sous forme B (un seul point de branchement).
La glycosylation n'est probablement pas nécessaire pour l'activité biologique de la protéine,car le produit obtenu à partir des bactéries est actif.
I1 peut être nécessaire de glycosyler le produit obtenu par la bactérie de façon à assurer une meilleure stabilité. Ceci est possible in vitro car le produit de traduction exempt de cellules, obtenu à partir du mARN de l'antitrypsine-a1 en présence de membrane, voit sa taille augmenter compte tenu de la glycosylation.
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5th edition, eds Stanbury Wyngaarden, Fredrickson,
Goldstein et Brown. Mc Graw Hill.
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Genetic, Biochemical and Clinical Aspects of Human
α1-Antitrypsin in Advances in Human Genetics 11, 1-62.
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Deficiency. Reversal of Protease-Antiprotease
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Claims (31)
1) Vecteur de clonage et d'expression d'un gène déterminé dans une bactérie,' caractérisé en ce qu'il comporte au moins
a) l'origine de ,réplication d'un plasmide bactérien,
b) un promoteur du bactériophage A, PLt PR ou
c) une région d'initiation de la traduction,
d) une zone de clonage comportant des sites de restriction uniques.
2) Vecteur de clonage et d'expression d'un gène déterminé dans une bactérie, caractérisé en ce qu'il comporte au moins
a) l'origine de réplication d'un plasmide bactérien,
b) un promoteur du bactériophage A, PL, PR ou
c) une région d'initiation de la traduction choisie parmi AcIIrbs et AErbs zou une séquence synthétique, placée sous le contrôle du promoteur du bactériophage #.
d) une zone de clonage comportant des sites de restriction uniques.
3) Vecteur selon la revendication 2, caractérisé en ce que la région d'initiation de la traduction est AcIIrbs.
4) Vecteur selon la revendication 3, caractérisé en ce que la région est constituée par tout ou partie de la séquence
ATTGTTATCTAAGGAAATACTTACATATGGTTCGTGCAAACAAACATAACGAG
5) Vecteur selon la revendication 2, caractérisé en ce que la région d'initiation de la traduction est constituée par tout ou partie de la région d'initiation de la traduction du gène #E. -
6) Vecteur selon l'une des revendications 2 à 5, caractérisé en ce qu'il comporte un site de restriction unique qui est situé dans la région d'initiation de la traduction.
7) Vecteur selon la revendication 6, caractérisé en ce que dans le cas-de #cIIrbs le site de restriction unique est le site NdeI.
8) Vecteur selon l'une des revendications 1 à 7, caractérisé en ce que le promoteur utilisé est le promoteur PL.
9) Vecteur selon l'une des revendications 1 à 8, caractérisé en ce qu'il comporte, en outre, une fonction d'antiterminaison de transorption
10) Vecteur selon la revendication 9, caractérisé en ce que la fonction d'antiterminaison de transcription est le gène AN pour le promoteur PL ou PR ou le gène #Q pour le promoteur P'R
11) Vecteur selon l'une"des-'rèvendications 9 à 10, caractérisé en ce qu'il comporte l'origine de réplication de pBR322.
12) Vecteur selon l'une des revendications 1 à 11, caractérisé en ce qu'il comporte un gène codant pour la résistance à un antibiotique.
13) Vecteur selon la revendication 12, caractérisé en ce qu'il comporte un gène de résistance à l'ampicilline.
14) Vecteur selon la revendication 13, caractérisé en ce qu'il comporte le gène de résistance à l'ampicilline de pBR322 muté pour supprimer-le site de restriction PstI.
15) Vecteur selon l'une des revendications 1 à 14, caractérisé en ce que la zone de clonage est située dans un gène indicateur.
16) Vecteur selon la revendication 15, caractérisé en ce que le gène indicateur est constitué par tout ou partie du gène lacZ.
17) Vecteur selon l'une des revendications 7 à 15, caractérisé en ce que le promoteur est contrôlé par un rEpresseur.
18) Vecteur selon la revendication 17, caractérisé en ce que--la séquence de répression peut être induite par une élévation de température.
19) Vecteur selon l'une des revendications 1 à 18, caractérisé en ce qu'il comporte un gène codant pour une protéine déterminée.
20) Le plasmide vecteur pTG922 ainsi que ses mutants et dérivés.
21) Vecteur selon l'une des revendications 19 et 20, caractérisé en ce qu'il comporte tout ou partie du gène codant pour l'antitrypsine-a1 humaine.
22) Le plasmide vecteur pTG908 et pTG920 ainsi que leurs mutants et dérivés.
23) Procédé de clonage d'un gène codant pour une protéine déterminée' permettant de préparer ladite protéine non fusionnée, caractérisé en ce que l'on clone le gène dans un site de restriction recouvrant le codon d'initiation de la traduction d'un vecteur selon l'une des revendications 1 à 22 et on reconstitue le codon d'initiation de la traduction.
24) Procédé de clonage d'un gène codant pour une protéine déterminée permettant de préparer ladite protéine fusionnée, caractérisé en ce que l'on clone le gène dans la zone de clonage d'un vecteur selon l'une des revendications 1 à 22 en aval de la séquence d'initiation de la traduction.
25) Vecteur obtenu par la mise en oeuvre du procédé selon l'une des revendications 23 et 24.
26) Vecteur de clonage et d'expression de l'antitrypsine-a1 caractdris,6 en ce qu'il comporte au moins tout ou partie de la séquence codant pour 1' antitrypsine-a1 humaine.
27) Bactérie transformée par un vecteur selon l'une des revendications 1 à 22 et 25 et 26.
28) Bactérie selon la revendication 27, caractérisée en ce qu'il s'agit d'une souche de E. coli.
29) Procédé de prdparation d'antitrypsine-a1 humaine d'origine bactérienne, caractérisé en ce qu'on cultive sur un milieu de culture une bactérie trans formée selon l'une des revendications 24 et 25,, ladite bactérie ayant. été transformée par un vecteur comportant tout ou partie de la séquence d'AND codant pour l'antitrypsine-a1 humaine.
30) Antitrypsine-a humaine d'origine bactérienne.
31) A titre de médicament l'antitrypsine-a humaine d'origine bactérienne'.
Priority Applications (8)
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Citations (3)
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FR1431678A (fr) * | 1963-06-12 | 1966-03-18 | Behringwerke Ag | Procédé pour l'isolement de l'alpha1-antitrypsine |
EP0038182A2 (fr) * | 1980-04-11 | 1981-10-21 | The President And Fellows Of Harvard College | Méthode pour synthétiser dans un hôte bactérien une protéine ou un polypeptide parachevé au choix |
EP0041767A2 (fr) * | 1980-06-06 | 1981-12-16 | Biogen, Inc. | Vecteurs améliorés, méthodes de construction de tels vecteurs et d'expression de gènes clonés |
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- 1983-01-21 FR FR8300909A patent/FR2539758B1/fr not_active Expired
-
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- 1984-01-20 JP JP50058484A patent/JPS60500648A/ja active Pending
Patent Citations (3)
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Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
GENE, vol. 13, 1981, pages 289-298, Elsevier/North-Holland Biomedical Press, NL * |
PROC. NATL. ACAD. SCI., vol. 78, no. 11, novembre 1981, pages 6826-6830, US * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
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JPS60500648A (ja) | 1985-05-09 |
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