FI120199B - Substituoituja N-etyyliglysiinijohdannaisia, menetelmä niiden valmistamiseksi ja niiden käyttö PNA- ja PNA-/DNA-hybridien valmistamiseksi - Google Patents
Substituoituja N-etyyliglysiinijohdannaisia, menetelmä niiden valmistamiseksi ja niiden käyttö PNA- ja PNA-/DNA-hybridien valmistamiseksi Download PDFInfo
- Publication number
- FI120199B FI120199B FI951128A FI951128A FI120199B FI 120199 B FI120199 B FI 120199B FI 951128 A FI951128 A FI 951128A FI 951128 A FI951128 A FI 951128A FI 120199 B FI120199 B FI 120199B
- Authority
- FI
- Finland
- Prior art keywords
- compound
- formula
- mixture
- evaporated
- protecting group
- Prior art date
Links
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title claims description 23
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 13
- YPIGGYHFMKJNKV-UHFFFAOYSA-N N-ethylglycine Chemical class CC[NH2+]CC([O-])=O YPIGGYHFMKJNKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 title description 2
- -1 1- (3,5-di-tert-butylphenyl) -1-methylethoxycarbonyl Chemical group 0.000 claims description 142
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 93
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 81
- 239000002904 solvent Substances 0.000 claims description 59
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 50
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 claims description 29
- 150000002148 esters Chemical group 0.000 claims description 29
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 28
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 22
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 17
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 claims description 16
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 claims description 16
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 15
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 14
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 14
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims description 14
- LMBFAGIMSUYTBN-MPZNNTNKSA-N teixobactin Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H]1C(N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C[C@@H]2NC(=N)NC2)C(=O)N[C@H](C(=O)O[C@H]1C)[C@@H](C)CC)=O)NC)C1=CC=CC=C1 LMBFAGIMSUYTBN-MPZNNTNKSA-N 0.000 claims description 14
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 13
- 239000002585 base Substances 0.000 claims description 10
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 claims description 10
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims description 10
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 10
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims description 10
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 9
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 claims description 9
- 108090000371 Esterases Proteins 0.000 claims description 8
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 claims description 8
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 claims description 8
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 claims description 8
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 claims description 8
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 8
- 239000003513 alkali Substances 0.000 claims description 7
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 7
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 claims description 6
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 claims description 6
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 claims description 5
- PEHVGBZKEYRQSX-UHFFFAOYSA-N 7-deaza-adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1C=CN2 PEHVGBZKEYRQSX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 claims description 4
- 230000008878 coupling Effects 0.000 claims description 4
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 claims description 4
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 claims description 4
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 4
- 238000006884 silylation reaction Methods 0.000 claims description 4
- YZEUHQHUFTYLPH-UHFFFAOYSA-N 2-nitroimidazole Chemical compound [O-][N+](=O)C1=NC=CN1 YZEUHQHUFTYLPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 5-methylcytosine Chemical compound CC1=CNC(=O)N=C1N LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- LOSIULRWFAEMFL-UHFFFAOYSA-N 7-deazaguanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1CC=N2 LOSIULRWFAEMFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- MSSXOMSJDRHRMC-UHFFFAOYSA-N 9H-purine-2,6-diamine Chemical compound NC1=NC(N)=C2NC=NC2=N1 MSSXOMSJDRHRMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 claims description 3
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 125000001181 organosilyl group Chemical group [SiH3]* 0.000 claims description 3
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 150000003852 triazoles Chemical class 0.000 claims description 3
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 claims description 3
- 125000001834 xanthenyl group Chemical group C1=CC=CC=2OC3=CC=CC=C3C(C12)* 0.000 claims description 3
- 229910052727 yttrium Inorganic materials 0.000 claims description 3
- JOYRKODLDBILNP-UHFFFAOYSA-N Ethyl urethane Chemical compound CCOC(N)=O JOYRKODLDBILNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N Fluorouracil Chemical compound FC1=CNC(=O)NC1=O GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 125000000319 biphenyl-4-yl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C1=C([H])C([H])=C([*])C([H])=C1[H] 0.000 claims description 2
- 229960002949 fluorouracil Drugs 0.000 claims description 2
- 125000000590 4-methylphenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1*)C([H])([H])[H] 0.000 claims 1
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims 1
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 311
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 256
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 216
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 176
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 110
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 98
- 239000000047 product Substances 0.000 description 66
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 63
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 58
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 45
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 43
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 39
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 38
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 37
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 32
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 31
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 30
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 26
- RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxane Chemical compound C1COCCO1 RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 25
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 23
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 23
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 23
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 22
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 21
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 20
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 19
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 19
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 19
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 19
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- KQSSATDQUYCRGS-UHFFFAOYSA-N methyl glycinate Chemical group COC(=O)CN KQSSATDQUYCRGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 17
- 229940087646 methanolamine Drugs 0.000 description 17
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 16
- KWGKDLIKAYFUFQ-UHFFFAOYSA-M lithium chloride Chemical compound [Li+].[Cl-] KWGKDLIKAYFUFQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 16
- BWHMMNNQKKPAPP-UHFFFAOYSA-L potassium carbonate Chemical compound [K+].[K+].[O-]C([O-])=O BWHMMNNQKKPAPP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 16
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 15
- 239000006260 foam Substances 0.000 description 15
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N N-Butanol Chemical compound CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 12
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 11
- CHKVPAROMQMJNQ-UHFFFAOYSA-M potassium bisulfate Chemical compound [K+].OS([O-])(=O)=O CHKVPAROMQMJNQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- 229910000343 potassium bisulfate Inorganic materials 0.000 description 10
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 10
- 125000001999 4-Methoxybenzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1OC([H])([H])[H])C(*)=O 0.000 description 9
- FOUZISDNESEYLX-UHFFFAOYSA-N N-hydroxyethyl glycine Natural products OCCNCC(O)=O FOUZISDNESEYLX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 9
- 238000010265 fast atom bombardment Methods 0.000 description 9
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 9
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 9
- 125000000022 2-aminoethyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])N([H])[H] 0.000 description 8
- WMFOQBRAJBCJND-UHFFFAOYSA-M Lithium hydroxide Chemical compound [Li+].[OH-] WMFOQBRAJBCJND-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 8
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 8
- 125000002668 chloroacetyl group Chemical group ClCC(=O)* 0.000 description 8
- 229910000027 potassium carbonate Inorganic materials 0.000 description 8
- FYSNRJHAOHDILO-UHFFFAOYSA-N thionyl chloride Chemical compound ClS(Cl)=O FYSNRJHAOHDILO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- PIINGYXNCHTJTF-UHFFFAOYSA-N 2-(2-azaniumylethylamino)acetate Chemical compound NCCNCC(O)=O PIINGYXNCHTJTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- HVCNXQOWACZAFN-UHFFFAOYSA-N 4-ethylmorpholine Chemical compound CCN1CCOCC1 HVCNXQOWACZAFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- VGCXGMAHQTYDJK-UHFFFAOYSA-N Chloroacetyl chloride Chemical compound ClCC(Cl)=O VGCXGMAHQTYDJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- KEAYESYHFKHZAL-UHFFFAOYSA-N Sodium Chemical compound [Na] KEAYESYHFKHZAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 239000002274 desiccant Substances 0.000 description 7
- 125000001601 guanosyl group Chemical group 0.000 description 7
- 239000002198 insoluble material Substances 0.000 description 7
- YDCHPLOFQATIDS-UHFFFAOYSA-N methyl 2-bromoacetate Chemical compound COC(=O)CBr YDCHPLOFQATIDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 150000004702 methyl esters Chemical class 0.000 description 7
- 239000012312 sodium hydride Substances 0.000 description 7
- 229910000104 sodium hydride Inorganic materials 0.000 description 7
- TZDMCKHDYUDRMB-UHFFFAOYSA-N 2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetic acid Chemical compound CC1=CN(CC(O)=O)C(=O)NC1=O TZDMCKHDYUDRMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- FPQVGDGSRVMNMR-JCTPKUEWSA-N [[(z)-(1-cyano-2-ethoxy-2-oxoethylidene)amino]oxy-(dimethylamino)methylidene]-dimethylazanium;tetrafluoroborate Chemical compound F[B-](F)(F)F.CCOC(=O)C(\C#N)=N/OC(N(C)C)=[N+](C)C FPQVGDGSRVMNMR-JCTPKUEWSA-N 0.000 description 6
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 description 6
- ILWRPSCZWQJDMK-UHFFFAOYSA-N triethylazanium;chloride Chemical compound Cl.CCN(CC)CC ILWRPSCZWQJDMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- BDNKZNFMNDZQMI-UHFFFAOYSA-N 1,3-diisopropylcarbodiimide Chemical compound CC(C)N=C=NC(C)C BDNKZNFMNDZQMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 125000004172 4-methoxyphenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(OC([H])([H])[H])=C([H])C([H])=C1* 0.000 description 5
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 5
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 5
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 5
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 5
- HHLFWLYXYJOTON-UHFFFAOYSA-N glyoxylic acid Chemical compound OC(=O)C=O HHLFWLYXYJOTON-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- GQHTUMJGOHRCHB-UHFFFAOYSA-N 2,3,4,6,7,8,9,10-octahydropyrimido[1,2-a]azepine Chemical compound C1CCCCN2CCCN=C21 GQHTUMJGOHRCHB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- IAICFWDJMWEXAO-UHFFFAOYSA-N 2-(2-sulfanylethylamino)acetic acid Chemical compound OC(=O)CNCCS IAICFWDJMWEXAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- HJBLUNHMOKFZQX-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxy-1,2,3-benzotriazin-4-one Chemical compound C1=CC=C2C(=O)N(O)N=NC2=C1 HJBLUNHMOKFZQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 4
- ZAFNJMIOTHYJRJ-UHFFFAOYSA-N Diisopropyl ether Chemical compound CC(C)OC(C)C ZAFNJMIOTHYJRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- IMNFDUFMRHMDMM-UHFFFAOYSA-N N-Heptane Chemical compound CCCCCCC IMNFDUFMRHMDMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N N-Methylpyrrolidone Chemical compound CN1CCCC1=O SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- AHVYPIQETPWLSZ-UHFFFAOYSA-N N-methyl-pyrrolidine Natural products CN1CC=CC1 AHVYPIQETPWLSZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical class [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical class [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 4
- HQABUPZFAYXKJW-UHFFFAOYSA-N butan-1-amine Chemical compound CCCCN HQABUPZFAYXKJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 4
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 4
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 4
- 125000005500 uronium group Chemical group 0.000 description 4
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 3
- ADFXKUOMJKEIND-UHFFFAOYSA-N 1,3-dicyclohexylurea Chemical compound C1CCCCC1NC(=O)NC1CCCCC1 ADFXKUOMJKEIND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OMPJBNCRMGITSC-UHFFFAOYSA-N Benzoylperoxide Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(=O)OOC(=O)C1=CC=CC=C1 OMPJBNCRMGITSC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- GSNUFIFRDBKVIE-UHFFFAOYSA-N DMF Natural products CC1=CC=C(C)O1 GSNUFIFRDBKVIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N Palladium Chemical compound [Pd] KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000012317 TBTU Substances 0.000 description 3
- CLZISMQKJZCZDN-UHFFFAOYSA-N [benzotriazol-1-yloxy(dimethylamino)methylidene]-dimethylazanium Chemical compound C1=CC=C2N(OC(N(C)C)=[N+](C)C)N=NC2=C1 CLZISMQKJZCZDN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 3
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 3
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 3
- UFULAYFCSOUIOV-UHFFFAOYSA-N cysteamine Chemical compound NCCS UFULAYFCSOUIOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 3
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 3
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 3
- 229960003151 mercaptamine Drugs 0.000 description 3
- SBFFIDNPQKRRPS-UHFFFAOYSA-N methyl 2-[2-aminoethyl-[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethyl]amino]acetate Chemical compound COC(CN(C(C1=CC=CC=C1)(C1=CC=CC=C1)C1=CC=C(C=C1)OC)CCN)=O SBFFIDNPQKRRPS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 3
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 3
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 3
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 125000005931 tert-butyloxycarbonyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(OC(*)=O)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 3
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229940055764 triaz Drugs 0.000 description 3
- OBOHMJWDFPBPKD-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro(diphenyl)methyl]-4-methoxybenzene Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 OBOHMJWDFPBPKD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NDVMCQUOSYOQMZ-UHFFFAOYSA-N 2,2-bis(trimethylsilyl)acetamide Chemical compound C[Si](C)(C)C(C(N)=O)[Si](C)(C)C NDVMCQUOSYOQMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZWEHNKRNPOVVGH-UHFFFAOYSA-N 2-Butanone Chemical compound CCC(C)=O ZWEHNKRNPOVVGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CFIBTBBTJWHPQV-UHFFFAOYSA-N 2-methyl-n-(6-oxo-3,7-dihydropurin-2-yl)propanamide Chemical compound N1C(NC(=O)C(C)C)=NC(=O)C2=C1N=CN2 CFIBTBBTJWHPQV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XXCCCRWKXQMOOQ-UHFFFAOYSA-N 3-acetyl-2-hydroxy-5-methyl-1,2-dihydropyrimidin-6-one Chemical compound CC(=O)N1C=C(C)C(O)=NC1O XXCCCRWKXQMOOQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AZTVOTGDHWTJNR-UHFFFAOYSA-N 3-chloro-3-(2,4-dioxo-1H-pyrimidin-5-yl)propanoic acid Chemical compound ClC(C=1C(NC(NC=1)=O)=O)CC(=O)O AZTVOTGDHWTJNR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 4-Dimethylaminopyridine Chemical compound CN(C)C1=CC=NC=C1 VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UIVWXNPUCAHAJX-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxy-1,1-dioxo-2,5-diphenylthiophen-3-one Chemical compound O=S1(=O)C(C=2C=CC=CC=2)C(=O)C(O)=C1C1=CC=CC=C1 UIVWXNPUCAHAJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WNLMYNASWOULQY-UHFFFAOYSA-N 4-tert-butylbenzoyl chloride Chemical compound CC(C)(C)C1=CC=C(C(Cl)=O)C=C1 WNLMYNASWOULQY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-N Fluorane Chemical compound F KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PNKUSGQVOMIXLU-UHFFFAOYSA-N Formamidine Chemical group NC=N PNKUSGQVOMIXLU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XSISQURPIRTMAY-UHFFFAOYSA-N Hydroxyethyl glycine Chemical compound NCC(=O)OCCO XSISQURPIRTMAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-N Methylamine Chemical compound NC BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AMQJEAYHLZJPGS-UHFFFAOYSA-N N-Pentanol Chemical compound CCCCCO AMQJEAYHLZJPGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RITINAODYALYMN-UHFFFAOYSA-N OC1N=CC(C)=C(O)N1COCC1=CC=CC=C1 Chemical compound OC1N=CC(C)=C(O)N1COCC1=CC=CC=C1 RITINAODYALYMN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UGJJZVWTUBNETA-UHFFFAOYSA-N acetic acid;5-methyl-1h-pyrimidine-2,4-dione Chemical compound CC(O)=O.CC1=CNC(=O)NC1=O UGJJZVWTUBNETA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 2
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 2
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 2
- 150000001540 azides Chemical class 0.000 description 2
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 description 2
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 2
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 2
- 150000001805 chlorine compounds Chemical class 0.000 description 2
- NEHMKBQYUWJMIP-UHFFFAOYSA-N chloromethane Chemical compound ClC NEHMKBQYUWJMIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000010549 co-Evaporation Methods 0.000 description 2
- 125000005982 diphenylmethyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])(*)C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 2
- PQJJJMRNHATNKG-UHFFFAOYSA-N ethyl bromoacetate Chemical compound CCOC(=O)CBr PQJJJMRNHATNKG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WBJINCZRORDGAQ-UHFFFAOYSA-N ethyl formate Chemical compound CCOC=O WBJINCZRORDGAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 2
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 2
- 238000004992 fast atom bombardment mass spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 150000002222 fluorine compounds Chemical class 0.000 description 2
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 2
- 150000004820 halides Chemical class 0.000 description 2
- 229910000040 hydrogen fluoride Inorganic materials 0.000 description 2
- JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N iodoacetic acid Chemical compound OC(=O)CI JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 2
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 2
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 2
- KXKVLQRXCPHEJC-UHFFFAOYSA-N methyl acetate Chemical compound COC(C)=O KXKVLQRXCPHEJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 2
- 239000012452 mother liquor Substances 0.000 description 2
- XBDUZBHKKUFFRH-UHFFFAOYSA-N n-(2-oxo-1h-pyrimidin-6-yl)benzamide Chemical compound OC1=NC=CC(NC(=O)C=2C=CC=CC=2)=N1 XBDUZBHKKUFFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 125000000636 p-nitrophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1*)[N+]([O-])=O 0.000 description 2
- XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-O phosphonium Chemical compound [PH4+] XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 2
- 238000007127 saponification reaction Methods 0.000 description 2
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 2
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 2
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- DYHSDKLCOJIUFX-UHFFFAOYSA-N tert-butoxycarbonyl anhydride Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)OC(=O)OC(C)(C)C DYHSDKLCOJIUFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000026 trimethylsilyl group Chemical group [H]C([H])([H])[Si]([*])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 238000001665 trituration Methods 0.000 description 2
- WMSUFWLPZLCIHP-UHFFFAOYSA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 9h-fluoren-9-ylmethyl carbonate Chemical compound C12=CC=CC=C2C2=CC=CC=C2C1COC(=O)ON1C(=O)CCC1=O WMSUFWLPZLCIHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YGMHIBLUWGDWKP-UHFFFAOYSA-N (4-methoxybenzoyl) 4-methoxybenzoate Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(=O)OC(=O)C1=CC=C(OC)C=C1 YGMHIBLUWGDWKP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LOTWILSQQDEVJL-UHFFFAOYSA-N (6-amino-7h-purin-2-yl)-(4-methoxyphenyl)methanone Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(=O)C1=NC(N)=C(NC=N2)C2=N1 LOTWILSQQDEVJL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YJTKZCDBKVTVBY-UHFFFAOYSA-N 1,3-Diphenylbenzene Chemical group C1=CC=CC=C1C1=CC=CC(C=2C=CC=CC=2)=C1 YJTKZCDBKVTVBY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VUTZFAOGDXUYEJ-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro(diphenyl)methyl]-4-methylbenzene Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 VUTZFAOGDXUYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro-(4-methoxyphenyl)-phenylmethyl]-4-methoxybenzene Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC(OC)=CC=1)C1=CC=CC=C1 JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DFPYXQYWILNVAU-UHFFFAOYSA-N 1-hydroxybenzotriazole Chemical compound C1=CC=C2N(O)N=NC2=C1.C1=CC=C2N(O)N=NC2=C1 DFPYXQYWILNVAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AVFZOVWCLRSYKC-UHFFFAOYSA-N 1-methylpyrrolidine Chemical compound CN1CCCC1 AVFZOVWCLRSYKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YKBGVTZYEHREMT-KVQBGUIXSA-N 2'-deoxyguanosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](CO)O1 YKBGVTZYEHREMT-KVQBGUIXSA-N 0.000 description 1
- YKBGVTZYEHREMT-UHFFFAOYSA-N 2'-deoxyguanosine Natural products C1=2NC(N)=NC(=O)C=2N=CN1C1CC(O)C(CO)O1 YKBGVTZYEHREMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HIXDQWDOVZUNNA-UHFFFAOYSA-N 2-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-hydroxy-7-methoxychromen-4-one Chemical compound C=1C(OC)=CC(O)=C(C(C=2)=O)C=1OC=2C1=CC=C(OC)C(OC)=C1 HIXDQWDOVZUNNA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZEGIDEYRSJSRFJ-UHFFFAOYSA-N 2-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)acetic acid Chemical compound O=C1N(CC(=O)O)C=CC(NC(=O)C=2C=CC=CC=2)=N1 ZEGIDEYRSJSRFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HHVNWGFYTKKIJO-UHFFFAOYSA-N 2-(6-aminopurin-9-yl)acetic acid Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2CC(O)=O HHVNWGFYTKKIJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CDBGTBHNSXGLIT-UHFFFAOYSA-N 2-[4-[(4-methoxybenzoyl)amino]-2-oxopyrimidin-1-yl]acetic acid Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(=O)NC1=NC(=O)N(CC(O)=O)C=C1 CDBGTBHNSXGLIT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NPHULPIAPWNOOH-UHFFFAOYSA-N 2-[4-[2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylamino)pyrimidin-5-yl]-3-(2,3-dihydroindol-1-ylmethyl)pyrazol-1-yl]-1-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)ethanone Chemical compound C1C(CC2=CC=CC=C12)NC1=NC=C(C=N1)C=1C(=NN(C=1)CC(=O)N1CC2=C(CC1)NN=N2)CN1CCC2=CC=CC=C12 NPHULPIAPWNOOH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KQLFMOSEFPONRF-UHFFFAOYSA-N 2-[6-[(4-methoxybenzoyl)amino]purin-9-yl]acetic acid Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(=O)NC1=NC=NC2=C1N=CN2CC(O)=O KQLFMOSEFPONRF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GELROPCNISLSJX-UHFFFAOYSA-N 2-[benzoyl-(2-oxo-1H-pyrimidin-6-yl)amino]acetic acid Chemical compound C=1C=NC(=O)NC=1N(CC(=O)O)C(=O)C1=CC=CC=C1 GELROPCNISLSJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4,6-dichloropyrimidine-5-carbaldehyde Chemical group NC1=NC(Cl)=C(C=O)C(Cl)=N1 GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OGMADIBCHLQMIP-UHFFFAOYSA-N 2-aminoethanethiol;hydron;chloride Chemical compound Cl.NCCS OGMADIBCHLQMIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LSTRKXWIZZZYAS-UHFFFAOYSA-N 2-bromoacetyl bromide Chemical compound BrCC(Br)=O LSTRKXWIZZZYAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SYZRZLUNWVNNNV-UHFFFAOYSA-N 2-bromoacetyl chloride Chemical compound ClC(=O)CBr SYZRZLUNWVNNNV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RZNHSEZOLFEFGB-UHFFFAOYSA-N 2-methoxybenzoyl chloride Chemical compound COC1=CC=CC=C1C(Cl)=O RZNHSEZOLFEFGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DGMOBVGABMBZSB-UHFFFAOYSA-N 2-methylpropanoyl chloride Chemical compound CC(C)C(Cl)=O DGMOBVGABMBZSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DUTHCRCFTOLMQG-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxy-2,3a-dihydro-1h-benzotriazol-4-one Chemical compound C1=CC(=O)C2N(O)NNC2=C1 DUTHCRCFTOLMQG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SFYDWLYPIXHPML-UHFFFAOYSA-N 3-nitro-1-(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl-1,2,4-triazole Chemical compound CC1=CC(C)=CC(C)=C1S(=O)(=O)N1N=C([N+]([O-])=O)N=C1 SFYDWLYPIXHPML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QSABPJKFCDBSJP-UHFFFAOYSA-N 4-methoxy-n-(7h-purin-6-yl)benzamide Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(=O)NC1=NC=NC2=C1NC=N2 QSABPJKFCDBSJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NSPMIYGKQJPBQR-UHFFFAOYSA-N 4H-1,2,4-triazole Chemical compound C=1N=CNN=1 NSPMIYGKQJPBQR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VYDWQPKRHOGLPA-UHFFFAOYSA-N 5-nitroimidazole Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CN=CN1 VYDWQPKRHOGLPA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M Bicarbonate Chemical compound OC([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MGTOIZRACBWBMM-UHFFFAOYSA-N C(C1=CC=CC=C1)OCN1C(N(C=C(C1=O)C)CC(=O)OCC)=O.C(C1=CC=CC=C1)OCN1C(N=CC(=C1O)C)(CC(=O)OCC)O Chemical compound C(C1=CC=CC=C1)OCN1C(N(C=C(C1=O)C)CC(=O)OCC)=O.C(C1=CC=CC=C1)OCN1C(N=CC(=C1O)C)(CC(=O)OCC)O MGTOIZRACBWBMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZCZQXEBWZLWYAT-UHFFFAOYSA-N COC(=O)CNC1(C=CNC(=O)N1)C(=O)C2=CC=CC=C2 Chemical compound COC(=O)CNC1(C=CNC(=O)N1)C(=O)C2=CC=CC=C2 ZCZQXEBWZLWYAT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YFWSJRPQMBBCMH-UHFFFAOYSA-N COC(=O)CNC1=NC2=C(C(=O)N1)NC=N2 Chemical compound COC(=O)CNC1=NC2=C(C(=O)N1)NC=N2 YFWSJRPQMBBCMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MUYMVSQXCWBEGG-UHFFFAOYSA-N COC1=CC=C(C=C1)C(ON(CC(=O)O)CC)(C1=CC=CC=C1)C1=CC=CC=C1 Chemical compound COC1=CC=C(C=C1)C(ON(CC(=O)O)CC)(C1=CC=CC=C1)C1=CC=CC=C1 MUYMVSQXCWBEGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N Dicylcohexylcarbodiimide Chemical compound C1CCCCC1N=C=NC1CCCCC1 QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N Ethylenediamine Chemical compound NCCN PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-M Fluoride anion Chemical compound [F-] KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N Fluorine Chemical compound FF PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007821 HATU Substances 0.000 description 1
- 240000000950 Hippophae rhamnoides Species 0.000 description 1
- 235000003145 Hippophae rhamnoides Nutrition 0.000 description 1
- 125000003047 N-acetyl group Chemical group 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- YGYAWVDWMABLBF-UHFFFAOYSA-N Phosgene Chemical compound ClC(Cl)=O YGYAWVDWMABLBF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- GLYOPNLBKCBTMI-UHFFFAOYSA-N [2-chloro-2-(1-chloro-2-phenylethoxy)ethyl]benzene Chemical compound C=1C=CC=CC=1CC(Cl)OC(Cl)CC1=CC=CC=C1 GLYOPNLBKCBTMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- MXMOTZIXVICDSD-UHFFFAOYSA-N anisoyl chloride Chemical compound COC1=CC=C(C(Cl)=O)C=C1 MXMOTZIXVICDSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000037429 base substitution Effects 0.000 description 1
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 description 1
- 239000004305 biphenyl Substances 0.000 description 1
- 235000010290 biphenyl Nutrition 0.000 description 1
- 125000006267 biphenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000012267 brine Substances 0.000 description 1
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KDPAWGWELVVRCH-UHFFFAOYSA-N bromoacetic acid Chemical class OC(=O)CBr KDPAWGWELVVRCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004657 carbamic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000004649 carbonic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000000170 chemical ionisation mass spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N chloroacetic acid Chemical compound OC(=O)CCl FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940106681 chloroacetic acid Drugs 0.000 description 1
- AOGYCOYQMAVAFD-UHFFFAOYSA-N chlorocarbonic acid Chemical class OC(Cl)=O AOGYCOYQMAVAFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 239000005289 controlled pore glass Substances 0.000 description 1
- DEZRYPDIMOWBDS-UHFFFAOYSA-N dcm dichloromethane Chemical compound ClCCl.ClCCl DEZRYPDIMOWBDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010908 decantation Methods 0.000 description 1
- 238000003795 desorption Methods 0.000 description 1
- BGRWYRAHAFMIBJ-UHFFFAOYSA-N diisopropylcarbodiimide Natural products CC(C)NC(=O)NC(C)C BGRWYRAHAFMIBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002147 dimethylamino group Chemical group [H]C([H])([H])N(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- BVOLAVZJNSGBSQ-UHFFFAOYSA-N ethyl acetate;5-methyl-1h-pyrimidine-2,4-dione Chemical compound CCOC(C)=O.CC1=CNC(=O)NC1=O BVOLAVZJNSGBSQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 238000002143 fast-atom bombardment mass spectrum Methods 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical group O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 150000002332 glycine derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- UTOUVTVKVWBZMU-UHFFFAOYSA-N methyl 2-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)acetate Chemical compound O=C1N(CC(=O)OC)C=CC(NC(=O)C=2C=CC=CC=2)=N1 UTOUVTVKVWBZMU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HXRSDRWLDRWPMF-UHFFFAOYSA-N methyl 2-[6-[(4-methoxybenzoyl)amino]purin-9-yl]acetate Chemical compound N1=CN=C2N(CC(=O)OC)C=NC2=C1NC(=O)C1=CC=C(OC)C=C1 HXRSDRWLDRWPMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000250 methylamino group Chemical group [H]N(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000004570 mortar (masonry) Substances 0.000 description 1
- XUZLXCQFXTZASF-UHFFFAOYSA-N nitro(phenyl)methanol Chemical compound [O-][N+](=O)C(O)C1=CC=CC=C1 XUZLXCQFXTZASF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940073020 nitrol Drugs 0.000 description 1
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- MOOYVEVEDVVKGD-UHFFFAOYSA-N oxaldehydic acid;hydrate Chemical compound O.OC(=O)C=O MOOYVEVEDVVKGD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052763 palladium Inorganic materials 0.000 description 1
- RGSFGYAAUTVSQA-UHFFFAOYSA-N pentamethylene Natural products C1CCCC1 RGSFGYAAUTVSQA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004817 pentamethylene group Chemical group [H]C([H])([*:2])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[*:1] 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- QIIPQYDSKRYMFG-UHFFFAOYSA-N phenyl hydrogen carbonate Chemical compound OC(=O)OC1=CC=CC=C1 QIIPQYDSKRYMFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZUOUZKKEUPVFJK-UHFFFAOYSA-N phenylbenzene Natural products C1=CC=CC=C1C1=CC=CC=C1 ZUOUZKKEUPVFJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N phenylmethyl ester of formic acid Natural products O=COCC1=CC=CC=C1 UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001467 poly(styrenesulfonates) Polymers 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 239000002213 purine nucleotide Substances 0.000 description 1
- 150000003212 purines Chemical class 0.000 description 1
- 238000001953 recrystallisation Methods 0.000 description 1
- 238000006268 reductive amination reaction Methods 0.000 description 1
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N sodium cyanoborohydride Chemical compound [Na+].[B-]C#N BEOOHQFXGBMRKU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012321 sodium triacetoxyborohydride Substances 0.000 description 1
- HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M sodium;chloride;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Cl-] HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- WHRNULOCNSKMGB-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran thf Chemical compound C1CCOC1.C1CCOC1 WHRNULOCNSKMGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000383 tetramethylene group Chemical group [H]C([H])([*:1])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[*:2] 0.000 description 1
- SIOVKLKJSOKLIF-HJWRWDBZSA-N trimethylsilyl (1z)-n-trimethylsilylethanimidate Chemical compound C[Si](C)(C)OC(/C)=N\[Si](C)(C)C SIOVKLKJSOKLIF-HJWRWDBZSA-N 0.000 description 1
- JBWKIWSBJXDJDT-UHFFFAOYSA-N triphenylmethyl chloride Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(C=1C=CC=CC=1)(Cl)C1=CC=CC=C1 JBWKIWSBJXDJDT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D233/00—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings
- C07D233/54—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings having two double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
- C07D233/66—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings having two double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
- C07D233/91—Nitro radicals
- C07D233/92—Nitro radicals attached in position 4 or 5
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D231/00—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings
- C07D231/02—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings not condensed with other rings
- C07D231/10—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings not condensed with other rings having two or three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
- C07D231/12—Heterocyclic compounds containing 1,2-diazole or hydrogenated 1,2-diazole rings not condensed with other rings having two or three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with only hydrogen atoms, hydrocarbon or substituted hydrocarbon radicals, directly attached to ring carbon atoms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D233/00—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings
- C07D233/54—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings having two double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
- C07D233/56—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazole or hydrogenated 1,3-diazole rings, not condensed with other rings having two double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with only hydrogen atoms or radicals containing only hydrogen and carbon atoms, attached to ring carbon atoms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D239/00—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings
- C07D239/02—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings not condensed with other rings
- C07D239/24—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings not condensed with other rings having three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
- C07D239/28—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings not condensed with other rings having three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, directly attached to ring carbon atoms
- C07D239/46—Two or more oxygen, sulphur or nitrogen atoms
- C07D239/52—Two oxygen atoms
- C07D239/54—Two oxygen atoms as doubly bound oxygen atoms or as unsubstituted hydroxy radicals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D249/00—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having three nitrogen atoms as the only ring hetero atoms
- C07D249/02—Heterocyclic compounds containing five-membered rings having three nitrogen atoms as the only ring hetero atoms not condensed with other rings
- C07D249/08—1,2,4-Triazoles; Hydrogenated 1,2,4-triazoles
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D473/00—Heterocyclic compounds containing purine ring systems
- C07D473/02—Heterocyclic compounds containing purine ring systems with oxygen, sulphur, or nitrogen atoms directly attached in positions 2 and 6
- C07D473/18—Heterocyclic compounds containing purine ring systems with oxygen, sulphur, or nitrogen atoms directly attached in positions 2 and 6 one oxygen and one nitrogen atom, e.g. guanine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D473/00—Heterocyclic compounds containing purine ring systems
- C07D473/26—Heterocyclic compounds containing purine ring systems with an oxygen, sulphur, or nitrogen atom directly attached in position 2 or 6, but not in both
- C07D473/32—Nitrogen atom
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
Description
Substituoituja N-etyyliglysiinijohdannaisia, menetelmä niiden valmistamiseksi ja niiden käyttö PNA- ja PNA-/ DNA-hybridien valmistamiseksi 5 Esillä oleva keksintö koskee uusia substituoituja N-etyyliglysiinijohdannaisia, menetelmää niiden valmistamiseksi sekä niiden käyttöä PNA- ja PNA-/DNA-hybridien valmistamiseksi.
Peptidi- tai polyamidinukleiinihapot (PNA) ovat 10 DNA-analogiyhdisteitä, joissa deoksiriboosifosfaattirunko on korvattu peptidioligomeerillä. Tähän mennessä kirjallisuudessa [esim. Michael Egholm, Peter E. Nielsen, Rolf H. Berg ja Ole Buchardt, Science 254 (1991) 1497 - 1500;
Ole Buchardt, Michael Egholm, Peter E. Nielsen ja Rolf 15 H. Berg, W0 92/20702] kuvatuissa synteeseissä käytetään monomeerin aminoryhmän tilapäiseksi suojaamiseksi happola-biilia tert-butoksikarbonyyli- (Boc-) suojaryhmää, joka lohkotaan pois keskivahvoilla hapoilla, kuten esim. trif-luorietikkahappo. Oligomeerien kiinteäfaasisynteesi nou-20 dattaa tällöin tavanomaista peptidisynteesimenetelmää esim. Merrifieldin [B. Merrifield, J. Am. Chem. Soc. 85 (1963) 2149] kuvaaman mukaisesti. PNA-oligomeerin lohkai seminen tapahtuu tällöin voimakkaalla hapolla, tavallisesti nestemäisellä fluorivedyllä.
25 Toistuva käsittely trifluorxetikkahapolla ja sitä seuraava pilkkominen fluorivedyllä ei sovi seka-PNA/DNA-sekvenssien synteesiin, sillä näissä olosuhteissa nuk-leosidisidos ei ole stabiili. Erityisesti puriininukleoti-dit desoksiguanosiini ja desoksiadenosiini tulevat voimak-30 käillä hapoilla nopeasti pilkotuiksi N-glykosidisidok-sesta. Lisäksi olisi tämän tapaisten molekyylien synteesiin tavallisten DNA-syntetisaattorien käyttäminen ja pitkälle menevä näissä laitteissa käytetyn kemian säilyttäminen erityisen toivottavaa. Tämä koskee myös PNA-35 sekvenssien valmistusta tällaisten laitteiden avulla.
2
Keksinnön päämäärä on tämän vuoksi antaa käyttöön glysiinijohdannaisia, jotka tekevät mahdolliseksi yksinkertaisen PNA- ja PNA-/DNA-hybridien rakentamisen sekä automaattisten syntetisaattorien käytön.
5 Tähän tarkoitukseen sopivia aineita ja siten kek sinnön kohteena ovat yhdisteet, joiden kaava on 1: B ’ V° o (l)'
PG—X-v N
Ό H
10 jossa PG on heikkojen happojen suhteen labiili aminon-suojaryhmä, joka on uretaanityyppiä, kuten esim. l-(l-ada-mantyyli)-1-metyylietoksikarbonyyli (Adpoc), l-(3,5-di-tert-butyylifenyyli)-1-metyylietoksikarbonyyli (t-Bumeoc) 15 ja l-metyyli-l-(4-bifenyyli)etyylioksikarbonyyli (Bpoc), 3,5-dimetoksifenyyli-2“propyyli-2-oksikarbonyyli (Ddz), tai joka on trityylityyppiä, kuten trifenyylimetyyli (Trt), {4-metoksifenyyli)difenyylimetyyli (Mmt), (4- metyylifenyyli)difenyylimetyyli (Mtt), di-(4-metoksifenyy-20 li)fenyylimetyyli (Dmt) ja 9-(9-fenyyli)ksantenyyli (Pi — xyl} , X on NH, 0 tai S, edullisesti NH tai 0, Y on CHZ, NH tai 0, edullisesti CH2, ja B’ on nukleotidikemiassa tavallinen emäs, esimer-25 kiksi luonnollinen emäs, kuten adeniini, sytosiini, gua-niini, tyrniini ja urasiili, tai ei-luonnollinen emäs, kuten puriini, 2,6-diaminopuriini, 7-deatsa-adeniini, 7-deatsaguaniini, N4N4-etanosytosiini, N6N6-etano-2, 6-diaminopuriini, 5-metyylisytosiini, 5-C3~6-alkynyyliurasiili, 30 5-C3-6™alkynyylisytosiini, 5-fluoriurasiili ja pseudoisosy-tosiini, joiden eksosykliset amino- tai hydroksiryhmät on 3 suojattu sopivilla tutuilla suojaryhmillä, kuten bentsoyy-li-, isobutanoyyli-, asetyyli-, fenoksiasetyyli-, 4 —(t— butyyli)bentsoyyli-, 4-(t-butyyli)fenoksiasetyyli-, 4~(me-toksi)bentsoyyli-f 2-(4-nitrofenyyli)etyyIloksikarbonyy-5 li-, 2-(2,4-dinitrofenyyli)etyylioksikarbonyyli-, 9-fluo-renyylimetoksikarbonyyli-, difenyylikarbamoyyli- tai for-mamidiiniryhmä, edullisesti bentsoyyli-, isobutanoyyli-, asetyyli-, fenoksiasetyyli-, 4-(t-butyyli)bentsoyyli-, 4-(metoksi)bentsoyyliryhmä, tai myös guaniini suojattuna 2-10 N-asetyylin ja β-Ο-defenyylikarbamoyylin yhdistelmällä, tai emäskorvausyhdiste, kuten esim. imidatsoli, triatsoli tai nitroimidatsoli, sekä niiden suolat, edullisesti niiden suolat orgaanisten tertiaaristen emästen, kuten esim. trietyyli-15 amiini tai pyridiini, kanssa.
Keksintö koskee myös menetelmää kaavan I mukaisten yhdisteiden valmistamiseksi, jolloin a) yhdiste, jonka kaava on II: H 0 nn ρβ-χ-χ/ΗΝ/\/ί' 20 jossa PG ja X määritellään kuten patenttivaatimuksessa l, R1 on vety tai esterinsuojaryhmä, saatetaan reagoimaan yhdisteen kanssa, jonka kaava on III: B ’ iyo (ui)
OH
j ossa B’ määritellään kuten edellä ja Y on CH2, 25 4 0-45 °C:ssa sopivassa liuottimessa tax näiden liuottimien seoksessa käyttäen peptidikemiassa tavallista kytkentäreagenssia, jolloin saadaan yhdiste, jonka kaava on IV: B ' I Λ <IV} o 5 jossa PG, X, B' ja R1 määritellään kuten edellä, minkä jälkeen tämä yhdiste muutetaan pilkkomalla esterinsuojaryhmä R1 heikosti aikalisissä olosuhteissa al-10 kalilipeällä tai tertiaarisilla amiiniyhdisteillä vedessä tai myös entsymaattisesti esteraasien tai lipaasien avulla 0-50 °C:ssa sopivassa liuottimessa tai näiden liuottimien seoksessa kaavan I mukaiseksi yhdisteeksi, tai b) yhdiste, jonka kaava on II: 15 jossa PG ja X määritellään kuten edellä, ja R1 on vety tai tilapäinen silyylisuojaryhmä, saatetaan reagoimaan yhdisteen kanssa, jonka kaava 20 on V: B’ ~ CH2 - CO - R2 (V) jossa B1 määritellään kuten edellä ja 25 R2 on halogeeni tai aktiiviesteritähde, 0-40 °C:ssa sopivassa liuottimessa tai näiden liuottimien seoksessa, jolloin mahdollisesti voidaan suorittaa happofunktion kaavan II mukaisessa yhdisteessä ti- 5 lapäinen suojaaminen saattamalla reagoimaan tavallisten silylointireagenssien kanssa ja tämän tilapäisen suojaryh-män pilkkominen - sen jälkeen kun on saatettu reagoimaan kaavan V mukaisen yhdisteen kanssa - lisäämällä vettä tai 5 alkoholeja reaktioseokseen, tai c) yhdiste, jonka kaava on II: ϋ S Rt (li)' jossa PG ja X määritellään kuten edellä ja 10 R1 on esterinsuojaryhmä, saatetaan reagoimaan halogeenietikkahappojohdan-naisen kanssa sopivassa liuottimessa apuemästä käyttäen, jolloin saadaan yhdiste, jonka kaava on VI:
Να I
r <j , (vi), 15 jossa
Hai on Cl, Br tai I, ja PG, X ja R1 määritellään kuten edellä, tämä välituoteyhdiste, jonka kaava on VI, muutetaan mahdollisesti suojatulla nukleoemäksellä B’ ja apuemäksel-20 la sopivassa liuottimessa yhdisteeksi, jonka kaava on IV: B ’ (lv) minkä jälkeen tämä yhdiste muutetaan pilkkomalla esterinsuojaryhmä R1 alkalilipeällä tai myös entsymaattisesti es-teraasien tai lipaasien avulla 0-50 °C:ssa sopivassa 6 liuottimessa tai näiden liuottimien seoksessa kaavan I mukaiseksi yhdisteeksi.
Kaavan I mukaiset yhdisteet, joissa Y on CH2, voidaan siten saada esimerkiksi siten, että 5 yhdiste, jonka kaava on II; H 0 ΜΠ PG-X“\/V/\KR' jossa PG ja X määritellään kuten edellä, ja R1 on vety tai esterinsuojaryhmä, kuten esim. melo tyyli, etyyli, butyyli tai 2-(metoksietoksi)etyyli, saatetaan reagoimaan yhdisteen kanssa, jonka kaava on III: B ' ΥγΟ (1 1 1 )
OH
j ossa 15 B' määritellään kuten edellä ja Y on CH2, 0 - 45 °C:ssa, edullisesti huoneenlämpötilassa, sopivassa liuottimessa, kuten esim. DMF, asetonitriili, dikloorimetaani tai näiden liuottimien seokset, käyttäen 20 peptidikemiassa tavallista kytkentäreagenssia, kuten esim. karbodi-imidit, fosfoniumreagenss.it, uroniumreagenssit, happohalogenidit, aktivoidut esterit, jolloin saadaan yhdiste, jonka kaava on IV: B ’ ,e_x V 1"v> 25 Nr 7 jossa PG, X, B' ja R1 määritellään kuten edellä, minkä jälkeen tämä yhdiste muutetaan lohkaisemalla esterinsuojaryhmä R1 heikosti aikalisissä olosuhteissa al-5 kalilipeällä, kuten esim. NaOH, LiOH, KOH, tai tertiaari-silla amiiniyhdisteillä vedessä, kuten esim. trietyyli-amiinilla, tai myös entsymaattisesti esteraasien tai li-paasien avulla 0-50 °C:ssa, edullisesti huoneenlämpötilassa sopivassa liuottimessa, kuten dioksaani, vesi, tet-10 rahydrofuraani, metanoli, vesi tai näiden liuottimien seoksissa, kaavan I mukaiseksi yhdisteeksi.
Peptidisynteesissä tavanomaisia aktivointimenetel-miä kuvaavat esim, Houben-Weyl, "Methoden der Organischen Chemie", osa 15/2, Georg Thieme Verlag Stuttgart 1974, tai 15 muita reagensseja kuten esim. BOP [B. Castro, J.R. Dormoy, G. Evin ja C. Selve, Tetrahedron Lett. 1975 1219 - 1222), PyBOP [J. Coste, D. Le-Nguyen ja B. Castro, Tetrahedron Lett. 1990 205 - 208], BroP [J. Coste, M.-N. Dufour, A. Pantaloni ja B. Castro, Tetrahedron Lett. 1990 669 - 672], 20 PyBroP [J. Coste, E. Frerot, P. Jouin ja B. Castro, Tetrahedron Lett. 1991 1967 - 1970] ja uroniumregenssit kuten esim. HBTU [V. Dourtoglou, B. Gross, V. Lamb- ropoulou, C. Zioudrou, Synthesis 1984 572 - 574], TBTU, TPTU, TSTU, TNTU [R. Knorr, A. Trzeciak, W. Bannwarth ja 25 D. Gillesen, Tetrahedron Lett. 1989 1927 - 1930], TOTU (EP-A-0 460 446), HATU [L. A. Carpino, J. Am. Chem. Soc. 115 (1993) 4397 - 4398], HAPyU, TAPipU [A. Ehrlich, S.
Rothemund, M. Brudel, M. Beyermann, L.A. Carpino ja M. Bi-enert, Tetrahedron Lett. 1993 4781 - 4784], BOI [K. Akaji, 30 N. Kuriyama, T. Kirtmra, Y. Fujiwara ja Y. Kiso, Tetrahedron Lett. 1992 3177 - 3180] tai happokloridit tai hap- pofluoridit [L.A. Carpino, H.G. Chao, M. Beyermann ja hi. Bienert, J. Org. Chem. 56 (1991) 2635; J.-N. Bertho, A. Loffet, C. Pinel, F. Reuther ja G. Sennyey kirjassa 35 E. Giralt ja D. Andreu (toim.), "Peptides 1990", Escom 8
Science Publishers B.V. , 1991, ss. 53 - 54; J. Green ja K. Bradley, Tetrahedron 1993 4141 - 4146], 2,4,6-mesi- tyleenisulfonyyli~3-nitro-l,2,4-triatsolidi (MSNT) [B. Blankemeyer-Menge, M. Nimitz ja R. Frank, Tetrahedron 5 Lett. 1990 1701 - 1704], 2,5-difenyyli-2,3-dihydro-3-okso- 4-hydroksitiofendioksidi (TDO) [R. Kirstgen, R,C. Sheppard, W. Steglich, J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1987 1870 -1871] tai aktivoidut esterit (D. Hudson, Peptide Res. 1990 51 - 55) kuvataan kulloisessakin kirjallisuuskohdassa.
10 Edullisesti käytetään karbodi-imidejä, esim. di- sykloheksyylikarbodi-imidiä tai di-isopropyylikarbo-di-imidiä. Edullisesti käytetään myös fosfoniumreagensse-ja, kuten esim. PyBOP tai PyBroP, uroniumreagensseja, kuten esim. HBTU, TBTU, TPTU, TSTU, TNTU, TOTU, KATU tai 15 BOI, tai happoklorideja tai happofluorideja.
Kaavan II mukaisten yhdisteiden synteesiä varten aminoetyyliglysiini, hydroksietyyliglysiini, merkaptoetyy-liglysiini tai niitä vastaava esteri varustetaan vastaavalla heikkojen happojen suhteen labiililla suojaryhmällä. 20 Heikkojen happojen suhteen labiilin suojaryhmän liittäminen tapahtuu tällöin sinänsä kirjallisuudesta tunnetuilla, osittain modifioiduilla menetelmillä. Sopivia reagensseja ovat esim. t-Bumeoc-fluoridi, Adpoc-atsidi, Bpoc-atsidi, Ddz-(fenyyli)karbonaatti, Trt-Cl, Mtt-Cl, Mmt-Cl, Dmt-Cl, 25 Pixyl-Cl. Tässä reaktiossa voidaan aminoetyyliglysiinin liukoisuutta parantaa samanaikaisesti suojaten happofunk-tio suorittamalla reaktio tavallisten silylointireagenssi-en, kuten esim. bis-trimetyylisilyyliasetamidin, kanssa. Tämän tilapäisen suojaryhmän lohkaiseminen pois tapahtuu 30 sen jälkeen, kun on saatettu reagoimaan suojaryhmäreagens-sien kanssa, lisäämällä vettä tai alkoholeja reaktioseok-seen. Lähtömateriaalina käytetty aminoetyyliglysiini tai vastaava aminoetyyliglysiiniesteri valmistetaan kirjallisuudesta tutuilla menetelmillä [E.P. Helmer, H.E. Gallo-35 Torres, A.M. Felix, M. Ahmad, T.J. Lambros, F. Scheidl ja 9 J. Meienhofer, Int. J. Peptide Protein Res. 23 (1984) 203 - 211] .
Toinen menetelmä aminoetyyliglysiinin valmistamiseksi käsittää glyoksyylihapon pelkistävän aminoinnin ety-5 leenidiamiinilla ja sitä kuvataan patenttihakemuksessa, jonka otsikko on "Menetelmä aminoetyyliglysiinin valmistamiseksi" (HOE 94/F 061, DE-P 44 08 530.3).
2-hydroksietyyliglysiinin tai 2-merkaptoetyyligly-siinin synteesi tapahtuu esim. pelkistäväsi! aminoimalla 10 glyoksyylihappoa tai glyoksyylihappoestereitä aminoetano-lilla tai kysteamiinilla vedyllä käyttäen palladiumia hiilellä tai 2-merkaptoetyyliglysiinin kyseessä ollen edullisesti natriumsyanoboorihydridiä tai natriumtriasetoksiboo-rihydridiä pelkistimenä.
15 2-merkaptoetyyliglysiinistä johdettu kaavan I mu kainen yhdiste voidaan saada myös siten, että ensin saatetaan reagoimaan 2-merkaptoetyyliamiini tai sen hydroklori-di etikkahapossa tai etikkahappo/vesi-seoksissa vastaavan trifenyylijohdannaisen kanssa, kuten esim. niiden haloge-20 nidit tai alkoholit. Reaktio suoritetaan happamissa olosuhteissa vastaavan trityylikationin välityksellä edullisesti 2-merkaptoetyyliamiinin rikissä. Edullisesti käytetään (4-metoksifenyyli)difenyylimetyylikloridia Mmt-ryhmän liittämiseksi tai di-(4-metoksifenyyli)fenyylimetyyli-25 kloridia Dmt-ryhmän liittämiseksi. Sitten aminoryhmä alky-loidaan reaktiolla halogeenietikkahappoesterien kanssa, edullisesti bromietikkahappoesterien kanssa, käyttäen orgaanista apuemästä kuten esim. di-isopropyylietyyliamiinia sopivassa liuottimessa, kuten esim. DMF. Tällöin syntyvä 30 kaavan II mukainen yhdiste, jossa PG on trityylityyppiä oleva suojaryhmä, X on S ja R1 on esterinsuojaryhmä, voidaan sitten muuttaa edellä kuvatulla tavalla vastaaviksi kaavan I mukaisiksi yhdisteiksi.
Kaavan III mukaiset nukleoemäsetikkahappojohdan-35 naiset voidaan saada alkyloimalla vastaavia nukleoemäksiä 10 tai eksosyklisessä hydroksi- tai aminofunktiossa suojattuja nukleoemäksiä kloorietikkahapolla, bromietikkahapolla, jodietikkahapolla tai niiden estereillä. Mahdollisesti tällöin nukleoemäkseen liitetään selektiivisen alkyloinnin 5 suorittamiseksi lisäksi tilapäisiä suojaryhmiä. Nuk-leoemästen suojaryhmänä voidaan käyttää kaikkia heikkojen happojen suhteen labiilin suojaryhmän PG kanssa yhteensopivia suojaryhmiä. Eksosykliselle aminofunktiolle käytetään edullisesti suojaryhmiä, kuten bentsoyyli-, isobu-10 tanoyyli-, asetyyli-, fenoksiasetyyli-, 4-(t-butyyli)bentsoyyli-, 4-(t-butyyli)fenoksiasetyyli-, 4-(metoksi)bentsoyyli-, 2-(4-nitrofenyyli)etyylioksikarbonyyli-, 2-(2,4-dinitrofenyyli)etyylioksikarbonyyli-, 9-fluorenyylimetok-sikarbonyyli-, difenyylikarbamoyyli- tai formamidiiniryh-15 mää. Erityisen edullisia ovat bentsoyyli-, isobutanoyy-li-, 4-(t-butyylibentsoyyli-, 2-(4-nitrofenyyli)etyylioksikarbonyyli-, 2~ (2,4-dinitrofenyyli)etyylioksikarbonyyli, 9-fluorenyylimetoksikarbonyyli-, 4-(metoksi)bentsoyyli-tai para-(t-butyyli)fenoksiasetyyli-, para-nitrofenyyli-2-20 etyylioksikarbonyyliryhmät ja guaniinille 2-N-asetyylin yhdistelmä 6-O-difenyylikarbamoyyliryhmän kanssa.
Vaihtoehtoinen menetelmä kaavan I mukaisten yhdisteiden valmistamiseksi, joissa Y on CHb, on, että yhdiste, jonka kaava on II: H § tm, 25 jossa PG ja X määritellään kuten edellä, ja R1 on vety tai tilapäinen silyylisuojaryhmä, kuten esim. trimetyylisilyyli, 30 saatetaan reagoimaan yhdisteen kanssa, jonka kaava on V: 11 B' - CH2 - CO - R2 (V) jossa B' määritellään kuten edellä, ja 5 R2 on halogeeni, kuten esim. fluori, kloori tai bromi, tai aktiiviesteritähde, kuten esim. OBt, OObt, OPfp, ONSu, 0-40 °C:ssa, edullisesti 20 - 30 °C:ssa, sopivassa liuottimessa kuten esimerkiksi DMF, NMP, asetonitriili, 10 dikloorimetaani tai näiden liuottimien seokset, jolloin mahdollisesti happofunktion kaavan II mukaisessa yhdisteessä tilapäinen suojaaminen voidaan suorittaa suorittamalla reaktio tavallisten silylointireagenssien, kuten esim. bis-trimetyylisilyyliasetamidin, kanssa, ja tämä ti-15 lapäinen suojaryhmä lohkaistaan pois - sen jälkeen kun on saatettu reagoimaan kaavan V mukaisen yhdisteen kanssa -lisäämällä vettä tai alkoholeja reaktioseokseen.
Toinen vaihtoehtoinen menetelmä kaavan I mukaisten yhdisteiden valmistamiseksi, joissa Y on CH2/ on, että 20 yhdiste, jonka kaava on II: H II o s (ID, pg-x"^^n'^A.0/r j ossa PG ja X määritellään kuten edellä ja R1 on esterinsuojaryhmä, kuten esim. metyyli, 25 etyyli, butyyli, 2-(metoksietoksi)etyyli, saatetaan reagoimaan halogeenietikkahappojohdannaisen, kuten esim. kloorietikkahappokloridi, bromietikka-happobromidi, bromietikkahappokloridi tai jodietikkahappo-kloridi, kanssa sopivassa liuottimessa, kuten esim. tetra-30 hydrofuraani, dikloorimetaani tai DMF, käyttäen apuemästä, kuten esim. trietyyliamiini, N-etyylimorfoliini tai di- 12 isopropyylietyyliamiini, jolloin saadaan yhdiste, jonka kaava on VI:
Ha I
0 (VI), jossa 5 Hal on Cl, Br, I, edullisesti Br tai Cl, aivan erityisen edullisesti Cl, ja PG, X ja R1 määritellään kuten edellä, tämä kaavan VI mukainen välituoteyhdiste muutetaan reaktiolla mahdollisesti suojatun nukleoemäksen B' ja apu-10 emäksen, esim. kaliumkarbonaatin, kanssa sopivassa liuot-timessa, esim. DMF tai NMP, yhdisteeksi, jonka kaava on IV: 8 ' *—JCv·· 15 minkä jälkeen tämä yhdiste muutetaan lohkaisemalla este-rinsuojaryhmä R1 pois alkalilipeällä, kuten esim. NaOH, LiOH, KOH, tai myös entsymaattisesti esteraasien tai li-paasien avulla 0-50 °C:ssa, edullisesti huoneenlämpötilassa sopivassa liuottimessa kuten dioksaani, vesi, tetra-20 hydrofuraani, metanoli, vesi tai näiden liuottimien seokset kaavan I mukaiseksi yhdisteeksi.
Kaavan I mukaiset yhdisteet, joissa Y on O tai N H, saadaan siten, että yhdiste, jonka kaava on II: 13 H 0 /R' ' jossa PG ja X määritellään kuten edellä, ja R1 on esterinsuojaryhmä, kuten esim. metyyli, 5 etyyli, butyyli, 2-(metoksietoksi)etyyli, tai tilapäinen esterinsuojaryhmä, kuten esim. trimetyylisilyyli, saatetaan reagoimaan yhdisteen kanssa, jonka kaava on VII: 10 B’ - Y - CO - R3 (VII) jossa B’ määritellään kuten edellä, Y on O tai NH, ja 15 R3 on Cl, ONp, ONSu, 0-40 °C:ssa, edullisesti 20 - 30 °C:ssa, sopivassa liuottimessa, kuten DMF, asetonitriili tai dikloorime-taani tai näiden liuottimien seokset, minkä jälkeen esterinsuojaryhmä R1 lohkaistaan pois alkalilipeällä, kuten 20 esim. NaOH, LiOH, KOH, tai myös entsymaattisesti este-raasien tai lipaasien avulla 0-50 °C:ssa, edullisesti huoneenlämpötilassa, sopivassa liuottimessa kuten dioksaa-ni, vesi, tetrahydrofuraani, metanoli, vesi tai näiden liuottimien seokset.
25 Lähtömateriaaliksi viimemainittuun reaktioon tar vittavat N-amino- tai N-hydroksinukleoemäkset saadaan tutuilla menetelmillä, kuten kuvaavat esim. K. Kohda, I. Ko-bayashi, K. Itano, S. Asano, Y. Kawazoe [Tetrahedron 4 9 (1993) 3947 - 3958], minkä jälkeen ne muutetaan fosgeenil- 30 la tai kloorimuurahaishappoestereillä kaavan VII mukaisiksi karbamaateiksi tai karbonaateiksi.
14
Aminohapoista käytetyt lyhenteet vastaavat pepti-dikemiassa tavallista kolmikirjainkoodia kuten kuvataan julkaisussa Europ. J. Biochem. 138 (1984) 9. Muut käytetyt lyhenteet luetellaan alla.
5 Aeg N-(2-aminoetyyli)glysyyli, “NH-CH2-CH2-NH- CH2-C0-
Aeg (AMe0B^) N- (2-aminoetyyli) -N- ( (9- (N6-4-rnetoksibent- soyyli)adenosyyli)asetyyli)glysyyli Aeg (CBi) N- (2-aminoetyyli) -N- ( (1- (N4- 10 bentsoyyli)sytosyyli)asetyyli)glysyyli
Aeg (CMe0B*) N™ (2-aminoetyyli) -N- ( (1- (N^-4-metoksi- bentsoyyli)sytosyyli)asetyyli)glysyyli Aeg (ctBuB2) N- (2-aminoetyyli) -N- ( (1- (N4-4-tert~butyy- libentsoyyli)sytosyyli)asetyyli)glysyyli 15 Aeg(GlBu) N-(2-aminoetyyli)-N-{(9-(N2- isobutanoyyli)guanosyyli)asetyyli)glysyyli
Aeg- (G2 Ac'4 Dpc N-(2-aminoetyyli)-N-( (9-(N2-asetyyli-04- difenyylikarbamoyyli)guanosyyli)glysyyli 20 Aeg(Im) N-(2-amino)etyyli-N-({1-imidatsolyyli)- asetyyli)glysyyli
Aeg (Im4_nxtro) N- (2-amino) etyyli-N- ( (1- (4-nitro) imidat- solyyli)asetyyliglysyyli
Aeg(T) N-(2-aminoetyyli)-N-({1-tyminyyli)asetyy- 25 li)glysyyli
Aeg(Triaz) N-(2-amino)etyyli-N-((1-(1r 2,4)triatso- lyyli)asetyyli)glysyyli
Bnpeoc 2,2-[bis(4-nitrofenyyli)]etoksikarbonyy- 11) 30 Boc tert-butoksikarbonyyli BOI 2-(bentsotriatsol-l-yyli)oksi-l,3-dime- tyyli-imidatsolidiniumheksafluorifosfaatti BOP bentsotriatsolyyli-l-oksi-tris(dimetyyli- amino)fosfoniumheksafluorifosfaatti 15
BroP bromi-tris (dimetyyliami.no) fosfoniumheksa- fluorifosfaatti BSA N,O-bis(trimetyylisilyyli) asetamidi
But tert-butyyli 5 Bz bentsoyyli
Bzl bentsyyli
Cl-Z 4-klooribentsyylioksikarbonyyli CPG Controlled Pore Glass (kontrolloitu huokoslasi) 10 DBU 1,8-diatsabisyklo[5.4.0]undek-7-eeni DCM dikloorimetaani
Ddz 3,5-dimetoksifenyyli-2-propyyli-2-oksikar- bonyyli DMF dimetyyliformamidi 15 Dmt di(4-metoksifenyyli)fenyylimetyyli
Dnpeoc 2-(2,4-dinitrofenyyli)etoksikarbonyyli
Dpc difenyylikarbamoyyli PAM fluoreseiinitähde
Fm 9-fluorenyylimetyyli 20 Fmoc 9-fluorenyylimetyylioksikarbonyyli H-Aeg-OH N-(2-aminoetyyli)glysiini HAPyU O-(7-atsabentsotriatsol-l-yyli)-1,1,3,3- bis(tetrametyleeni)uroniumheksafluorifosfa atti 25 BATU 0-(7-atsabentsotriatsol-l-yyli)-1,1,3,3- tetrametyyliuroniumheksafluorifosfaatti HBTU 0-(bentsotriatsol-1-yyli)-1,1,3,3-tetra- metyyliuroniumheksafluorifosfaatti HOBt 1-hydroksibentsotriatsoli 30 HONSu N-hydroksisukkinimidi HOObt 3-hydroksi-4-okso-3,4-dihydrobentsotriat- siini iBu isobutanoyyli
MeOBz 4-metoksibentsoyyli 35 Mmt 4-metoksitrifenyylimetyyli 16
Moz 4-metoksibentsyylioksikarbonyyli MSNT 2, 4, 6-mesityleenisulfonyyli-3- nitrol,2,4-triatsolidi
Mtt 4-(metyylifenyyli)difenyylimetyyli 5 NBA nitrobentsyylialkoholi NMP N-metyylipyrrolidiini
Oeg N- (2-oksietyyli) glysyyli, -O-CH2-CH2- NH-CH2CO-
Pixyl 9-(9-fenyyli)ksantenyyli 10 PyBOP bentsotriatsolyyli-1- oksitripyrrolidlnofosfoniumheksafluorifosfaatti
PyBroP bromitripyrrolidinofosfoniumheksafluori- fosfaatti 15 TAPipU 0-(7-atsabentsotriatsol-1-yyli}-1,1,3,3- bis(pentametyleeni)uroniumtetrafluoriboraa tti TBTU 0-(bentsotriatsol-1-yyli)-1,1,3,3- tetrametyyliuroniumtetrafluoriboraatti 20 tBu tert-butyyli tBuBz 4-tert-butyylibentsoyyli TDBTU 0-(3,4-dihydro-4-okso-1,2,3-bentso- triatsin-3-yyli)-1,1,3,3-tetrametyyli-uroniumtetrafluoriboraatti 25 TOO 2,5-difenyyli-2,3-dihydro-3-okso-4- hydroksitiofendioksidi
Teg N-(2-tioetyyli) glysyyli, -S-CH2-CH2-NH-CH2- C0- TFA trifluorietikkahappo 30 THF tetrahydrofuraani TNTU 0-[(5-norborneeni~2,3-dikarboksimido]- 1,1,3,3-tetrametyyliuroniumtetra-fluoriboraatti 17 TOTU O-[(syano(etoksikarbonyyli)metyleeni)- amino]-1,1,3,3-tetrametyyliuroniumtetra-fluoriboraatti TPTU 0-(1,2-dihydro-2-okso-l-pyridyyli)- 5 1,1,3,31-tetrametyyliuroniumtetrafluo riboraatti
Trt trityyli TSTU 0-(N-sukkinimidyyli)-1,1,3,3- tetrametyyliuroniumtetrafluoriboraatt i 10 Z bentsyylioksikarbonyyli MS(ES+) elektronisuihkumassaspektri (positiivinen ioni) MS(ES") elektronisuihkumassaspektri (negatiivinen ioni) 15 MS(DCI) desorptio-kemiallinen ionisaatiomassa- spektri MS(FAB) nopea atomipommitusmassaspektri
Esimerkkejä Esimerkki 1 20 N-(hydroksietyyli)glysiinin valmistus (H-Oeg-OH) 46 g glyoksyylihappo-monohydraattia liuotetaan 1 000 ml:aan vettä, minkä jälkeen samalla jäähdyttäen ja sekoittaen liuokseen lisätään 30,2 ml 2-aminoetanolia. Seokseen lisätään 10 g katalyyttiä (10 % Pd/C) ja hydra-25 taan autoklaavissa 10 baarin vetypaineessa ja huoneenlämpötilassa. Jatkotyöstämiseksi katalyytti suodatetaan imulla eroon ja suodos haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Jäännös tislataan kahdesti pienen määrän tolueenia kanssa. Tätä raakatuotetta käsitellään 250 ml:11a kuumaa metanolia, se 30 suodatetaan lämpimänä imulla eroon, pestään pienellä määrällä metanolia ja kuivataan sitten eksikaattorissa.
18
Saanto: 49,56 g
Sp.: 178 - 180 °C, haj.
Rf: 0,36 (n-butanoli/etikkahappo/vesi/etyyliase- taatti, 1:1:1:1) 5 MS (DCI) : 120 (M + H)'1'.
Esimerkki 2 N-(9-fluorenyylimetoksikarbonyyli)-N-(hydroksietyyli)glysiinin synteesi (H-Oeg(Fmoc)-OH) 10,08 g natriumvetykarbonaattia liuotetaan 150 10 ml:aan vettä, minkä jälkeen lisätään 7,15 g N-(hydroksietyyli)glysiiniä samalla sekoittaen. Noin 5 minuutin kuluttua saadaan kirkas liuos, johon lisätään ti-poittain 20,22 g Fmoc-ONSu:ta 300 ml:ssa dioksaania samalla hyvin sekoittaen. Seosta sekoitetaan vielä 3 tunnin 15 ajan huoneenlämpötilassa ja se jätetään yöksi 4 °C:seen seisomaan. Liuos suodatetaan ja suodos haihdutetaan pyörö-haihduttimessa tyhjössä kuiviin. Jäännös lietetään 100 ml:aan vettä ja pH säädetään 2:een lisäämällä pieninä erinä kaliumvetysulfaattiliuosta. Sitten seosta uutetaan kol-20 masti 150 ml:11a etyyliasetaattia, orgaaninen faasi pestään neljästi 50 ml:lla vettä ja kuivataan natriumsulfaa-tilla. Kuivausaine suodatetaan eroon ja suodos haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin. Jäännökseen lisätään 200 ml di-isopropyylieetteriä ja trituroidaan, joi-25 loin tapahtuu kiteytyminen. Seos jätetään yöksi seisomaan, sakka suodatetaan eroon ja uudelleenkiteytetään etyyliase-taatti/di-isopropyylieetteristä. Näin saatu tuote suodatetaan imulla eroon ja kuivataan eksikaattorissa.
Saanto: 15,8 g 30 Sp.: 114 - 116 °C, haj.
Rf = 0,62 (n-butanoli/etikkahappo/vesi, 3:1:1) MS (ESHj : 342 (M + H)\
Esimerkki 3 N-(9-fluorenyylimetoksikarbonyyli)-N-(4-35 metoksifenyylidifenyylimetoksietyyli)glysiinin synteesi (Mmt-Oeg(Fmoc)-OH) 19 14,74 g N-(fluorenyylimetoksikarbonyyli)-N-(hyd-roksietyyli)glysiiniä liuotetaan 160 ml:aan pyridiiniä ja lisätään 13,31 g 4-metoksifenyylidifenyylimetyylikloridia. Seosta sekoitetaan 2 tunnin ajan huoneenlämpötilassa ja se 5 jätetään yöksi 4 °C:seen seisomaan. Sitten liuotin haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa eroon ja jäännös lie-tetään 300 ml:aan etyyliasetaattia ja uutetaan kolmasti 30 ml:lla kyllästettyä bikarbonaattivesiliuosta. Sitten pestään vielä kolmasti 30 ml:11a vettä ja orgaaninen faasi 10 kuivataan natriumsulfaatilla. Kuivausaine suodatetaan eroon, suodos haihdutetaan noin 70 ml: n tilavuudeksi ja samalla sekoittaen lisätään tipoittain 700 ml di-isopropyylieetteriä. Saostunut tuote suodatetaan imulla eroon ja kuivataan eksikaattorissa.
15 Saanto: 19,95 g
Rt: 0,45 (etyyliasetaatti/metanoli/trietyyliamii- ni, 60:40:1) MS (FAB/MeOH/NBA): 658,3 (M + 2Na}\
Esimerkki 4 20 N4-(4-metoksibentsoyyli)sytosiini
Esimerkki 4a
Sytosiinia (11,1 g) suspendoidaan kuivaan pyridii-niin (250 ml) . Sitten lisätään tipoittain ruiskulla 4-metoksibentsoyylikloridia (17,06 g). Muodostuu lähes kir~ 25 kas liuos, josta saostuu noin 10 minuutissa sakka. Seosta sekoitetaan vielä noin 1,5 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen sakka suodatetaan eroon. Sakka on haluttu tuote.
Saanto: 20,5 g 30 MS (ES+) : 246 (M + H) +
Rf*. 0,77 (dikloorimetaani/isopropanoli, 8:2).
Esimerkki 4b
Sytosiinia (2,8 g) suspendoidaan kuivaan DMF:ään (100 ml) ja lisätään trietyyliamiinia (2 ml). Sitten lisä-35 tään ruiskulla tipoittain 4-metoksibentsoehappoanhydridiä (7,2 g). Muodostuu lähes kirkas liuos, josta saostuu jon- 20 kin ajan kuluttua sakka. Sekoitetaan vielä noin 2 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen sakka suodatetaan eroon. Sakka on haluttu tuote.
Saanto: 5,9 g 5 MS (ES+) : 246 (M + H) 1
Rf: 0,77 (dikloorimetaani/isopropanoli, 8:2).
Esimerkki 5 N4- (4-metoksibentsoyyli) -Nx-inetoksikarbonyylimetyy-lisytosiini 10 N4-(4-metoksibentsoyyli)sytosiinia (12,25 g) sus- pendoidaan kuivaan DMF:ään (250 ml) ja lisätään natrium-hydridiä (1,25 g) pieninä erinä. Seosta kuumennetaan vähän aikaa 60 °C:ssa, kunnes vedyn kehitys on päättynyt. Sitten lisätään huoneenlämpötilassa ruiskulla tipoittain bro-15 mietikkahappometyyliesteriä (4,75 ml). Seosta sekoitetaan vielä 1 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen lisätään pieni määrä hiilidioksidia metanolissa. Liuotin haihdutetaan tyhjössä pois ja jäljelle jääneeseen jäännökseen lisätään dikloorimetaania, minkä jälkeen se suodate-20 taan eroon. Suodatusjäännös pestään vielä pienellä määrällä vettä ja kuivataan sitten tyhjössä.
Saanto: 12,86 g
Sp. : 219 °C
MS (ES4) : 318 (M + H) + 25 Rj: 0,71 (n-butanoli/etikkahappo/vesi, 3:1:1).
Esimerkki 6 N4- (4-metoksibentsoyyli) -N1-karboksimetyylisytosii-ni N4- (4-metoksibentsoyyli) -N1-metoksikarbonyylirr\etyy-30 lisytosiinia (12,5 g) suspendoidaan veteen (100 ml) ja 0 °C:ssa lisätään tipoittain natronlipeän 2 Kl vesiliuosta kontrolloiden pH:ta (pH 12), kunnes metyyliesteri on saip-puoitunut. Reaktion edistymistä seurataan TLC:llä. Sitten reaktioliuos suodatetaan ja suodoksen pH säädetään 3:ksi 35 lisäämällä 2 M kaliumvetysulfaattiliuosta, jolloin tuote 21 saostuu. Sakka suodatetaan eroon, se pestään pienellä määrällä kylmää vettä ja kuivataan tyhjössä.
Saanto: 11,5 g
Sp.: 270 - 275 °C, haj.
5 MS (ES+) : 304 (M + H)+
Rf: 0,53 (n-butanoli/etikkahappo/vesi, 3:1:1).
Esimerkki 7 N4-(4-tert-butyylibentsoyyli)sytosiini
Sytosiinia (11,1 g) suspendoidaan kuivaan DMF:ään 10 (250 ml) ja lisätään trietyyliamiinia (15,4 ml). Sitten lisätään ruiskulla tipoittain 4-tert-butyylibentsoyyli-kloridia (18,6 ml). Seosta sekoitetaan vielä noin 4 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen lisätään lisää 4-tert-butyylibentsoyylikloridia (3,7 ml). Edelleen 2 tun-15 nin kuluttua reaktio keskeytetään lisäämällä pieni määrä metanolia. Liuotin poistetaan tyhjössä ja jäännökseen lisätään dikloorimetaania ja vettä. Tällöin saostuva kiinteä aine on haluttu aine. Sakka suodatetaan eroon ja kuivataan tyhj össä.
20 Saanto: 15,7 g MS (DCI): 272 (M + H)+
Rf: 0,55 (dikloorimetaani/metanoli, 9:1).
Esimerkki 8 N4- (4-tert-butyylibentsoyyli) -^-metoksikarbonyyli-25 metyylisytosiini N4-(4-tert-butyylibentsoyyli)sytosiinia (14,96 g) suspendoidaan kuivaan DMF:ään (250 ml), lisätään natrium-hydridiä (1,32 g) pieninä erinä ja sekoitetaan seosta 1 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, kunnes vedyn kehittyminen 30 on päättynyt. Sitten lisätään huoneenlämpötilassa ruiskulla tipoittain bromietikkahappometyyliesteriä (5,2 ml). Sekoitetaan vielä 1 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen lisätään metanolia (10 ml). Liuotin haihdutetaan tyhjössä pois ja jäljelle jäänyt jäännös ositetaan dikloo-35 rimetaaniin ja veteen. Orgaaninen faasi pestään vedellä, se kuivataan natriumsulfaatilla ja haihdutetaan suodatuk- 22 sen jälkeen tyhjössä kuiviin. Näin saatu raakatuote uudel-leenkiteytetään isopropanolista ja kuivataan sitten tyh-j össä.
Saanto: 8,0 g 5 Sp.: 189 - 193 °C, haj.
MS (DCI): 344 {M + H)+
Rf: 0,72 (dikloorimetaani/metanoli, 9:1).
Esimerkki 9 N4- (4-tert~butyylibenfcsoyyli) -N^-karboksimetyylisy- 10 tosiini N4-(4-tert-butyylibentsoyyli)-N1-metoksikarbonyyli-metyylisytosiinia (8,0 g) liuotetaan dioksaanin (50 ml) ja veden (10 ml) seokseen ja samalla sekoittaen huoneenlämpö-tilassa lisätään tipoittain natronlipeän 2 N vesiliuosta 15 (pH 11 - 12) . Kun metyyliesterin saippuoituminen on päättynyt TLC-kontrollin perusteella reaktioliuoksen pH säädetään 3:ksi 2 M kaliumvetysulfaattiliuoksella. Saostunut sakka suodatetaan eroon imulla. Raakatuote liuotetaan nat-riumkarbonaattiliuokseen ja saostetaan toistamiseen lisää-20 mällä 2 M kaliumvetysulfaattiliuosta. Tuote suodatetaan eroon imulla, se pestään pienellä määrällä vettä ja kuivataan tyhjössä.
Saanto: 6,62 g
Sp.. 285 »e, haj.
25 MS (DCI): 330 (M + H)+
Rf: 0,2 (dikloorimetaani/metanoli, 9:1).
Esimerkki 10 N4-(bentsoyyli)-sytosiini
Sytosiinia (5,55 g) suspendoidaan kuivaan pyridii-30 niin (100 ml). Sitten lisätään ruiskulla tipoittain bent-soyylikloridia (6,4 ml). Muodostuu lähes kirkas liuos, josta noin 5 minuutissa saostuu sakka. Sekoitetaan vielä noin 2 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, lisätään sitten metanolia (100 ml) ja haihdutetaan seos tyhjössä kuiviin. 35 Jäännöstä sekoitetaan isopropanolissa, se suodatetaan 23 eroon, pestään pienellä määrällä metanolia ja dietyylieet-teriä ja kuivataan tyhjössä.
Saanto: 10,1 g
Sp.: < 305 °C
5 MS (DCI): 216 (M + H)\
Esimerkki 11 N4- (bentsoyyli) -N^-metoksikarbonyylimetyylisytosiini N4-(bentsoyyli)sytosiinia (4,3 g) suspendoidaan 10 kuivaan DMF:ään (60 ml) ja lisätään natriumhydridiä (0,48 g) pieninä erinä. Seosta lämmitetään vähän aikaa 40 °C:ssa, kunnes vetykehitys on päättynyt. Sitten lisätään huoneenlämpötilassa tipoittain ruiskulla bromietikka-happometyyliesteriä (2,1 ml). Sekoitetaan vielä 2,5 tunnin 15 ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen lisätään metanolia (10 ml) . Liuotin haihdutetaan tyhjössä pois ja jäljelle jääneeseen jäännökseen lisätään dikloorimetaania ja suodatetaan sitten. Suodatusjäännös pestään vielä pienellä määrällä vettä ja kuivataan sitten tyhjössä.
20 Saanto: 6,45 g
Sp.: 234 °c MS (DCI): 288 (M + H)+
Rf: 0,85 (etyyliasetaatti/metanoli, 8:2).
Esimerkki 12 4 1 25 N -(bentsoyyli)-N -karboksimetyylisytosiini N4-(bentsoyyli)-N1-metoksikarbonyylimetyylisytosii-nia (5,85 g) liuotetaan seokseen, jossa on dioksaania (80 ml) ja vettä (40 ml), ja samalla sekoittaen huoneenlämpö-tilassa lisätään tipoittain natronlipeän 2 N vesiliuosta 30 (11,25 ml) (pH 11 - 12). Kun metyyliesterin saippuoitumi- nen on päättynyt TLC-kontrollin perusteella, reaktioliuok-sen pH säädetään 3:ksi lisäämällä 2 M kaliumvetysulfaatti-liuosta. Saostunut sakka suodatetaan imulla eroon. Tämä raakatuote liuotetaan natriumkarbonaattiliuokseen ja saos-35 tetaan sitten toistamiseen lisäämällä 2 M kaliumvetysul- 24 faattiliuosta. Tuote suodatetaan imulla eroon, se pestään pienellä määrällä vettä ja kuivataan tyhjössä.
Saanto: 5,84 g
Sp.: 283 - 286 °C, haj.
5 MS (ES+) : 274 (M + H) +
Rf! 0,15 (etyyliasetaatti/metanoli, 8:2).
Esimerkki 13 N4-{tert-butyylioksikarbonyyli)sytosiini
Sytosiinia (11,1 g) suspendoidaan kuivaan pyridii-10 niin (250 ml) . Sitten lisätään di-tert-butyyli-dikarbonaattia (21,8 g) ja 1 spaatelinkärjellinen 4-dime-tyyliaminopyridiiniä. Seosta sekoitetaan 6 tunnin ajan 60 °C:ssa, jolloin muodostuu paksu sakka. Reaktioliuos jäähdytetään ja sakka suodatetaan imulla eroon. Sakkaa se-15 koitetaan lämpimässä vedessä, se suodatetaan imulla eroon ja kuivataan tyhjössä.
Saanto: 10,26 g MS (DCI): 212 (M + H)+
Rf: 0,6 (dikloorimetaani/metanoli, 6:4).
20 Esimerkki 14 N4- (tert-butyylioksikarbonyyli) -N^metoksikarbonyy-limetyylisytosiini N4-(tert-butyylioksikarbonyyli)sytosiinia (1,6 g) suspendoidaan kuivaan DMF:ään (30 ml), natriumhydridiä 25 (0,19 g) lisätään pieninä erinä ja seosta sekoitetaan 1,5 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, kunnes vetykehitys on päättynyt. Sitten lisätään huoneenlämpötilassa ruiskulla tipoittain bromietikkahappometyyliesteriä (0,84 ml). Seosta sekoitetaan vielä 5 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, 30 minkä jälkeen lisätään metanolia (1 ml). Liuotin haihdutetaan tyhjössä eroon ja jäljelle jäänyttä jäännöstä puhdistetaan pylväskromatografisesti silikageelissä käyttäen di-kloorimetaania eluenttina. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin.
35 Saanto: 1,1 g MS (DCI): 284 (M + H)* 25
Rf: 0,5 (dikloorimetaani/metanoli, 95:5).
Esimerkki 15 N4- (tert-butyylioksikarbonyyli) -N^karboksimetyyli-sytosiini ^ NS4- (tert-butyylioksikarbonyyli) -N1-metoksikarbonyy- limetyylisytosiinia (4,2 g) suspendoidaan veteen {30 ml), ja 0 °C:ssa lisätään tipoittain natronlipeän 2 N vesiliuosta pH:ta kontrolloiden (pH 12), kunnes metyyliesteri on saippuoitunut. Reaktion etenemistä seurataan TLC:n avulla. 10 Sitten reaktioliuoksen pH säädetään 3:ksi lisäämällä etik-kahappoa ja liuotin tislataan tyhjössä eroon, Raakatuot-teen puhdistaminen tapahtuu pylväskromatografisesti sili-kageelissä käyttäen eluenttina dikloorimetaani/ metano-11/trietyyliamiinia, 8:1:1. Tuotetta sisältävät fraktiot 15 yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin.
Saanto: 3,5 g
Sp.: 95 - 98 °C, haj.
MS (FAB/NBA): 270,2 (M + H) +
Rf·: 0,35 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii- 20 ni, 8:1:1).
Esimerkki 16 N6™{4-metoksibentsoyyli)adeniini
Adeniinia (13,5 g) suspendoidaan kuivaan pyridii-niin (250 ml) . Sitten lisätään tipoittain ruiskulla 4-25 metoksibentsoyylikloridia (17,06 g). Seosta sekoitetaan 3 tunnin ajan 100 °C:ssa, minkä jälkeen se jätetään yöksi huoneenlämpötilaan seisomaan. Sitten reaktioliuokseen lisätään metanolia, minkä jälkeen liuotin tislataan eroon tyhjössä. Jäännös haihdutetaan vielä kahdesti kuiviin yh-30 dessä pienen määrän tolueenia kanssa, minkä jälkeen sitä sekoitetaan kuumassa isopropanolissa. Seoksen annetaan jäähtyä hitaasti, saostunut tuote suodatetaan imulla eroon ja kuivataan tyhjössä.
Saanto: 22,2 g
35 Sp. : 212 - 214 °C
MS (ES+) : 270 (M + H) + 26
Rf: 0,67 (dikloorimetaani/isopropanoli, 8:2).
Esimerkki 17 N6- (4-metoksibentsoyyli) -N9-metyylioksikarbonyyli- ro®tyyliadeniini 5 N6-(4-metoksibentsoyyli)adeniinia (8,01 g) suspen- doidaan kuivaan DMF:ään (150 ml), lisätään natriumhydridiä (0,75 g) pieninä erinä ja sekoitetaan seosta 0,5 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, kunnes vetykehitys on päättynyt. Sitten lisätään huoneenlämpötilassa ruiskulla tipoittain 10 bromietikkahappometyyliesteriä (2,85 ml). Seosta sekoitetaan vielä 2 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen lisätään pieni määrä hiilidioksidia metanolissa. Liuotin haihdutetaan tyhjössä eroon ja jäljelle jääneeseen jäännökseen lisätään dikloorimetaani/vettä, minkä jälkeen 15 se suodatetaan eroon. Suodatusjäännös pestään vielä pienellä määrällä vettä ja kuivataan sitten tyhjössä.
Saanto: 4,03 g MS (ES+) : 342 (M + H}'1'
Rf·: 0,76 (etyyliasetaatti/metanoli, 8:2).
20 Esimerkki 18 N6- (4-metoksibentsoyyli) -N9-karboksimetyyliadeniini N6-(4-metoksibentsoyyli)-N9-metyylioksikarbonyyli-metyyliadeniinia (1,71 g) suspendoidaan veteen (40 ml) ja 0 °C:ssa lisätään tipoittain natronlipeän 2 N liuosta 25 pH:ta kontrolloiden (pH 11,2), kunnes metyyliesteri on saippuoitunut. Reaktion etenemistä seurataan TLCtn avulla. Sitten reaktioliuos suodatetaan ja suodoksen pH säädetään 3:ksi lisäämällä 2 M kaliumvetysulfaattiliuosta, jolloin tuote saostuu. Sakka suodatetaan eroon, se pestään pienel-30 lä määrällä kylmää vettä ja kuivataan tyhjössä.
Saanto: 1,52 g
Sp.: 222 - 223 °C; haj.
MS (ESH) : 328 (M + H)+
Rt: 0,2 (n-butanoli/etikkahappo/vesi, 3:1:1).
35 Esimerkki 19 N2-(isobutanoyyli)guaniini 27
Guaniinia (3,02 g) suspendoidaan kuivaan DMFrään {40 ml) ja lisätään trietyyliamiinia (1,45 ml). Sitten lisätään ruiskulla tipoittain isovoihappokloridia (2,12 g). Seosta sekoitetaan 3 tunnin ajan 100 °C:ssa, minkä jälkeen 5 reaktioliuokseen lisätään metanolia ja sitten liuotin tislataan tyhjössä eroon. Jäännöstä sekoitetaan kuumassa iso-propanolissa, saostunut tuote suodatetaan eroon ja kuivataan tyhjössä.
Saanto: 2,67 g 10 Rf: 0,45 (n-butanoli/etikkahappo/vesi, 3:1:1).
Esimerkki 20 N2- (isobutanoyyli) -N9-metyylioksikarbonyylimetyyli-guaniini N2-(isobutanoyyli)guaniinia (4,42 g) suspendoidaan 15 kuivaan DMF:ään (50 ml), lisätään natriumhydridiä (0,5 g) pieninä erinä ja sekoitetaan seosta 1 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, kunnes vetykehitys on päättynyt. Sitten lisätään huoneenlämpötilassa ruiskulla tipoittain bromietik-kahappometyyliesteriä (1,9 ml). Seosta sekoitetaan vielä 20 1 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen lisätään pieni määrä hiilidioksidia metanolissa. Liuotin haihdutetaan tyhjössä eroon ja jäljelle jäänyttä jäännöstä puhdistetaan pylväskromatografisesti silikageelissä käyttäen eluenttina dikloorimetaani/metanolia, 95:5. Tuotetta si-25 sältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin.
Saanto: 2,35 g MS (DCI) : 294 (M + H)'1'
Rf: 0,58 (dikloorimetaani/metanoli, 9:1).
30 Esimerkki 21 N2- (isobutanoyyli) -N9-karboksimetyyliguaniini N2-(isobutanoyyli)-N9-metyylioksikarbonyylimetyy-liguaniinia (9,68 g) suspendoidaan veteen (100 ml) ja 0 °C:ssa lisätään tipoittain natronlipeän 2 N vesiliuos-35 ta pH:ta kontrolloiden (pH 11), kunnes metyyliesteri on saippuoitunut. Reaktion etenemistä seurataan TLC:llä. Sit- 28 ten reaktioliuos suodatetaan, suodoksen pH säädetään 3:een lisäämällä 2 M kaliumvetysulfaattiliuosta ja uutetaan etyyliasetaatilla. Orgaaninen faasi heitetään pois. Vesi-faasi haihdutetaan tyhjössä noin 20 ml:n tilavuuteen ja 5 sille asetetaan kerrokseksi etyyliasetaattia. Hitaasti erottuva sakka suodatetaan imulla eroon ja kuivataan.
Saanto: 1,35 g MS (ES+) : 342 (M + H) +
Rt: 0,34 (n-butanoli/etikkahappo/vesi, 3:1:1).
10 Esimerkki 22 N-(4-metoksifenyylidifenyylimetyyliaminoetyyli)-glysiinin metyyliesterin valmistus (Mmt-Aeg-OMe) 14,76 g N-(aminoetyyli)glysiinimetyyliesteri-di™ hydrokloridia (H-Aeg-0Me.2HCl) suspendoidaan 300 ml:aan 15 DMF:ää ja samalla sekoittaen lisätään 30,2 ml trietyyli-amiinia. Seos jäähdytetään noin 4 °C:seen ja samalla hyvin sekoittaen lisätään hitaasti tiputtamalla 22,23 g Mmt-Cl:ää liuotettuna 100 ml:aan dikloorimetaania. Seosta sekoitetaan vielä 2,5 tunnin ajan huoneenlämpötilassa. 20 Sitten saostunut trietyyliamiinihydrokloridi suodatetaan eroon, lisätään liuokseen 10 ml metanolia ja haihdutetaan suodos tyhjössä kuiviin. Jäännöksellä suoritetaan kromato-grafia-ajo silikageelissä käyttäen seosta dietyylieette-ri/petrolieetteri/trietyyliamiini, 200:100:3. Tuotetta si-25 sältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin.
Saanto: 18,82 g öljyä, joka seisomaan jätettynä kiteytyy hitaasti
Rf: 0,16 (dietyylieetteri/petrolieetteri, 2:1, 30 jossa on 1 % trietyyliamiinia) MS (FAB/MeOH/NBA/LiCl): 411,2 (M + Lx)+.
29
Esimerkki 23
Synteesiohje N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyy-liamino)etyyli-N-((1-tyminyyli)asetyyli)glysiinin valmistamiseksi (Mmt-Aeg(T)-OH) 5 1,21 g {3 mmol) Mmt-Aeg-OMe:tä liuotetaan 20 ml:aan THF:ää, minkä jälkeen samalla jäähdyttäen ja hyvin sekoittaen lisätään hitaasti tipoittain 0,24 ml kloo-riasetyylikloridia liuotettuna 10 ml:aan THF:ää samanaikaisesti 0,42 ml:n trietyyliamiinia liuotettuna 10 ml:aan 10 THF:ää kanssa. Sitten seoksen annetaan vielä reagoida 30 minuutin ajan, saostunut trietyyliamiinihydrokloridi suodatetaan imulla eroon ja lisätään liuokseen 30 ml kuivaa DMF:ää. Sitten THF haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihdutti-messa pois ja liuokseen lisätään Mmt-Aeg(klooriasetyyli)-15 0Me:tä DMF:ssä sekä sitten peräkkäin 0,756 g (6 mmol) ty-miiniä ja 1,66 g (12 mmol) hienoksi jauhettua kaliumkarbonaattia. Tätä seosta sekoitetaan 48 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen liukenematon aines suodatetaan imulla eroon. Liuotin poistetaan ja jäännös ositetaan ve-20 teen ja etyyliasetaattiin. Etyyliasetaattifaasiin jäänyt raakatuote saippuoidaan liuottimen poistamisen jälkeen seoksessa dioksaani/metanoli/vesi lisäämällä 35 ml 0,2 N NaOH:ta. Liuotin poistamalla saatua jäännöstä puhdistetaan sitten kromatografisesti silikageelissä käyttäen dikloori-25 metaani/MeOH/trietyyliamiinia (100:10:1). Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan kuiviin. Jäljelle jää 0,81 g väritöntä vaahtoa.
Rf: 0,29 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyli- amiini, 100:10:1) 30 MS (ES"): 1112,0 <2M - H)"; 553, 3 (M - H)".
Esimerkki 24 N-({4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-N-((1-tyminyyli)asetyyli)glysiinimetyyliesteri (Mmt-
Aeg (T)-OMe) 35 1,00 g (2,48 mmol) N-((4-metoksifenyyli)- difenyylimetyyli)aminoetyyli-glysiinimetyyliesteriä liuo- 30 tetaan 5 ml: aan DMF:ää. Tähän liuokseen lisätään 0,404 g (2,48 mmol) 3,4-dihydro-3-hydroksi-4-okso-l, 2,3-bentso-triatsiinia ja 0,632 ml (4,96 mmol) 4-etyylimorfoliinia. Sitten lisätään tipoittain liuos, jossa on 0,456 g (2,48 5 mmol) N-l-karboksimetyylitymiiniä 5 ml:ssa DMF:äa, ja sitten 0,46 ml (3,0 mmol) N,N'-di-isopropyylikarbodi~imidiä. Reaktioseosta sekoitetaan 20 tunnin ajan huoneenlämpötilassa. Sitten liuotin poistetaan tyhjössä ja jäännös liuotetaan etyyliasetaattiin. Tämä liuos pestään kahdesti ve-10 della ja kyllästetyllä kaliumkloridiliuoksella. Orgaaninen faasi kuivataan natriumsulfaatilla, suodatetaan ja haihdutetaan sitten kuiviin. Näin saatua raakatuotetta puhdistetaan kromatografisesti silikageelissä, jota on tasapainoi-tettu seoksella dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamiini 15 (100:1:1), käyttäen gradienttia 1 - 5 % metanolia dikloo- rimetaanissa. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin, jolloin saadaan 1,28 g tuotetta värittömänä vaahtona.
MS (FAB): 571,2 (M + H)+ 20 Rf: 0,28 (CH2Cl2/MeOH, 95:5).
Esimerkki 25 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)efcyyli-N-((1-tyminyyli)asetyyli)glysiini (Mmt-Aeg(T)-OH)
Tuote edellisestä reaktiosta liuotetaan seokseen, 25 jossa on 10 ml dioksaania ja 2 ml vettä. Liuos jäähdytetään 0 °C:seen ja lisätään tipoittain 1 N natronlipeäliu-osta, kunnes saavutetaan pH-arvo 11. 2 tunnin reaktioajan jälkeen reaktio on päättynyt ja liuoksen pH säädetään 5:ksi lisäämällä varovaisesti 2 N KHSO^-liuosta. Liuosta 30 uutetaan kolmasti etyyliasetaatilla, yhdistetyt orgaaniset faasit kuivataan natriumsulfaatilla ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Näin saatua raakatuotetta puhdistetaan kromatograf isesti silikageelissä käyttäen gradienttia 5 10 % metanolia ja 1 % trietyyliamiinia dikloorimetaanissa. 35 Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Haihduttamalla ensin yhdessä pyridiinin 31 ja sitten tolueenin kanssa poistetaan vielä läsnä oleva ylimääräinen trietyyliamiini. Saadaan 1,065 g tuotetta värittömänä vaahtona.
MS (ES"): 1112,0 (2M - H)"; 555,3 (M - H)" 5 Rf: 0,28 <CH2Cl2/MeOH, 8:2).
Esimerkki 26 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-N- ({1- (N4“bentsoyyli) sytosyyli) asetyyli) gly s iin ime tyyli-esteri (Mmt-Aeg (CBz) -OMe) 10 1,10 g N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyli)ami- noetyyliglysiini-metyyliesteriä (2,72 mmol) liuotetaan 5 ml:aan DMF:ää ja 0,444 g (2,72 mmol) 3,4-dihydro-3-hydroksi-4-okso-l,2,3-bentsotriatsiinia sekä 0,94 ml 4-etyylimorfoliinia (5,45 mmol) lisätään. Lisätään suspen-15 sio, jossa on 0,744 g (2,72 mmol) N4-bentsoyyli-N1-karboksimetyylisytosiinia 20 ml:ssa DMF;ää ja sitten 0,51 ml (3,27 mmol) N, N'-di-isopropyylikarbodi-imidiä. Reak-tioseosta sekoitetaan 20 tunnin ajan huoneenlämpötilassa. Sitten liuotin haihdutetaan tyhjössä pois ja jäännös liuo-20 tetaan etyyliasetaattiin. Tämä liuos pestään kahdesti vedellä ja kerran kyllästetyllä keittosuolaliuoksella. Orgaaninen faasi kuivataan natriumsulfaatilla, suodatetaan ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Näin saatua raakatuotet-ta puhdistetaan kromatografisesti silikageelissä, jota on 25 tasapainoitettu seoksella dikloorimetaani/metanoli/-trietyyliamiini (100:1:1), käyttäen gradienttia 1 - 2 % metanolia dikloorimetaanissa. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Saadaan 0,96 g tuotetta kellanvalkoisena vaahtona.
30 MS (ES") : 658,6 (M - H)"
Rf: 0,37 (CH2Cl2/MeOH, 95:5).
32
Esimerkki 27 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-N- ((1- (N4-bentsoyyli) sytosyyli) asetyyli) glysiini (Mmt-Aeg-(CBz-OH) 5 2,26 g (3,43 mmol) N~((4-metoksifenyyli)difenyyli
metyyliamino) etyyli-N- ( (1- (N4~bentsoyyli) sytosyyli) asetyyli) glysiinimetyyliesteriä liuotetaan 50 ml:aan dioksaania. Liuos jäähdytetään 0 °C:seen ja siihen lisätään tipoittain 34,4 ml 1 N natronlipeäliuosta. 10 minuutin kuluttua pH
10 säädetään 5 teen lisäämällä tipoittain 1 N KHSCh-liuosta, saostuneet suolat suodatetaan eroon ja pestään pienellä määrällä dioksaania. Yhdistetyt suodokset haihdutetaan tyhjössä kuiviin ja jäännös haihdutetaan kahdesti me-tanolin ja dikloorimetaanin kanssa. Näin saatua raaka-15 tuotetta puhdistetaan kromatografisesti silikageelissä käyttäen gradienttia 5 - 10 % metanolia ja 1 % trietyyli-amiinia dikloorimetaanissa. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Haihduttamalla yhdessä pyridiinin ja sitten tolueenin kanssa pois-20 tetaan vielä läsnä oleva ylimääräinen trietyyliamiini. Saadaan 1,306 g tuotetta lähes valkoisena vaahtona.
MS (ES'} : 644,3 (M - H) “
Rt: 0,68 (CH2Cl2/MeOH, 8:2).
Esimerkki 28 25 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli- N- ((1- (N4-(4-tert-butyylibentsoyyli)sytosyyli)asetyyli)-glysiinimetyyliesteri (Mmt-Aeg (e13013*) -OMe) 1,00 g (2,48 mmol) N-((4-metoksifenyyli)difenyyli-metyyli)aminoetyyliglysiini-metyyliesteriä liuotetaan 5 30 raitaan DMFtää. Tähän liuokseen lisätään peräkkäin 0,403 g (2,48 mmol) 3,4-dihydro-3~hydroksi-4-okso-l, 2,3-bentso-triatsiinia ja 0,63 ml (4,96 mmol) 4-etyylimorfoliinia. Sitten lisätään suspensio, jossa on 0,740 g (2,48 mmol) N4- (4-tert-butyylibentsoyyli) -N]-karboksimetyylisytosiinia 35 5 mltssa DMFtssä, ja sen jälkeen 0,47 ml Ν,Ν'-di- isopropyylikarbodi-imidiä. Seosta sekoitetaan 20 tunnin 33 ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen se haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Jäännös liuotetaan etyyliasetaattiin, liuos pestään vedellä, kyllästetyllä natriumkloridiliuok-sella, se kuivataan natriumsulfaatilla, suodatetaan ja 5 haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Raakatuotetta puhdistetaan silikageelikolonnissa, jota on tasapainoitettu seoksella dikloorimetaani/etyyliasetaatti/trietyyliamiini (50:50:1), käyttäen eluenttina dikloorimetaani/etyyliasetaattia (1:1). Yhdistetyt, tuotetta sisältävät fraktiot haihdute-10 taan tyhjössä kuiviin. Tuote saadaan kellanvalkoisena vaahtona saannon ollessa 1,635 g.
MS (FAB/MeOH, NBA, LiCl): 722,5 (M + Li)+
Rf: 0,31 (CH2Cl2/etyyliasetaatti, 1:1).
Esimerkki 29 15 N-{(4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli- N- ( (1- (N4-(4-tert-butyylibentsoyyli)sytosyyli)asetyyli)-glysiini (Mmt-Aeg(CtBuBz) -OH) 1,63 g (2,28 mmol) N-((4-metoksifenyyli)difenyyli-metyyliamino)etyyli-N-( (1-(N4-(4-tert-butyylibentsoyyli)-20 sytosyyli)asetyyli)-glysiinimetyyliesteriä liuotetaan seokseen, jossa on 10 ml dioksaania ja 1 ml vettä, minkä jälkeen 0 °C:ssa samalla sekoittaen lisätään tipoittain 4,56 ml 1 N NaOH-liuosta. 2 tunnin kuluttua pH säädetään 5:ksi lisäämällä tipoittain 1 N KHS04-liuosta, saostuneet 25 suolat suodatetaan eroon ja pestään pienellä määrällä dioksaania. Yhdistetyt suodokset haihdutetaan tyhjössä kuiviin ja jäännös haihdutetaan kahdesti kuiviin yhdessä metanolin ja dikloorimetaanin kanssa. Näin saatua raaka-tuotetta puhdistetaan kromatografisesti silikageelissä 30 käyttäen gradienttia 2 - 10 % metanolia ja 1 % trietyyli-amiinia dikloorimetaanissa. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Vielä läsnä oleva ylimääräinen trietyyliamiini poistetaan haihduttamalla kuiviin yhdessä ensin pyridiinin ja sitten tolueenin 35 kanssa. Saadaan 0,831 g tuotetta lähes valkoisena vaahtona .
34 MS (ES') : 700,7 (M - H) "
Rf: 0,28 (CH2Cl2/MeOH, 9:1); 0,63 (CH2Cl2/MeOH, 7:3) .
Esimerkki 30 5 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyylioksi)etyyli - N-((1-tyminyyli)asetyyli)glysiini (Mmt-Oeg(T)-OH) 0,5 g (1,28 mmol) N~((4-metoksifenyyli)difenyyli-metyylioksi)etyyliglysiiniä suspendoidaan 10 ml:aan DMF:ää ja lisätään tipoittain 0,47 ml (1,92 mmol) BSA:ta. Sitten 10 lisätään peräkkäin 0,7 ml (5,1 mmol) trietyyliamiinia ja 0,26 g (1,28 mmol) kloorikarboksimetyylitymiiniä. Reak-tioliuosta sekoitetaan 4 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen lisätään vielä 65 mg (0,32 mmol) kloorikarboksimetyylitymiiniä ja sekoitetaan vielä 16 tunnin ajan. 15 Sen jälkeen liuotin haihdutetaan tyhjössä eroon ja raaka-tuotetta puhdistetaan silikageelikolonnissa käyttäen gra-dienttia 5 - 15 % metanolia ja 1 % trietyyliamiinia di- kloorimetaanissa. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Saatu ruskehtava öljy 20 liuotetaan pieneen määrään dikloorimetaania, minkä jälkeen tuote saostetaan lisäämällä dietyylieetteriä. Tuote saadaan lähes valkoisena jauheena.
Saanto: 0,219 g MS (ES') : 556,3 (M - H) ' 25 Rf: 0,54 (CH2Cl2/MeOH, 8:2).
Esimerkki 31 N- ((4-metoksifenyyli) difenyylimetyyliairu.no) etyyli-N- ( (1- (N4- (4-metoksibentsoyyli)sytosyyli)asetyyli)glysii-nimetyyliesteri (Mmt-Aeg (CMe0Bz) -OMe) 30 N-{(4-metoksifenyyli)difenyylimetyyli)aminoetyyli- glysiinimetyy-liesteriä (4,00 g, 9,9 mmol) liuotetaan DMF:ään (50 ml) . Tähän liuokseen lisätään peräkkäin 4-etyylimorfoliinia (3,44 ml), 3,4-dihydroksi-3-hydroksi- 4-okso-l,2,3-bentsotriatsiinia (1,62 g), N4-(4-metoksi- 35 bentsoyyli) -t^-karboksimetyylisytosiinia (3,00 g, 9,9 mmol) ja N,N'-di-isopropyylikarbodi-imidiä (1,87 ml). Re- 35 aktioseosta sekoitetaan 48 tunnin ajan huoneenlämpötilassa. Sitten liuotin haihdutetaan tyhjössä eroon ja jäännös lietetään etyyliasetaattiin. Tätä liuosta uutetaan kahdesti vedellä ja kerran kyllästetyllä kaliumkloridiliuoksel-5 la. Orgaaninen faasi kuivataan natriumsulfaatilla, suodatetaan ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Puhdistaminen tapahtuu pylväskromatografisesti silikageelissä, jota on ta-sapainoitettu edeltäpäin 1 % trietyyliamiinia sisältävällä dikloorimetaanilla. Eluointi suoritetaan käyttäen gra-10 dienttia 0 - 2 % metanolia 1 %:n trietyyliamiinia sisältävässä dikloorimetaanissa. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä pieneen tilavuuteen. Tällöin saostuva disykloheksyyliurea suodatetaan eroon ja suodos haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Haluttu yhdiste saa-15 daan vaaleankeltaisena vaahtona.
Saanto: 6,72 g MS {FAB/MeOH, NBA, LiCl): 696,3 (M + Li)+
Rf: 0,59 (dikloorimetaani/metanoli, 9:1).
Esimerkki 32 20 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli in- ( (1- (N4- (4-metoksibentsoyyli) sytosyyli) asetyyli) glysiini (Miat-Aeg (CMe0Bz) -OH) N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyli)aminoetyyli-N-( (1- (N4-(4-metoksibentsoyyli))sytosyyli)asetyyli)glysii-25 ni-metyyliesteriä (6,60 g, 9,6 mmol) liuotetaan seokseen, jossa on dioksaania (50 ml) ja vettä (50 ml), ja lisätään 0 °C:ssa tipoittain natronlipeän 1 M vesiliuosta (15 ml) kahdessa erässä. 2 tunnin reaktioajan jälkeen liuos neutraloidaan lisäämällä ioninvaihtajaa (Dowex AG 50WX4, pyri-30 diniummuoto). Ioninvaihtaja suodatetaan eroon ja pestään dioksaanin vesiliuoksella ja metanolilla. Yhdistetyt suo-dokset haihdutetaan tyhjössä kuiviin ja jäännöstä puhdistetaan pylväskromatografisesti silikageelissä eluoiden 10 % metanoli/dikloorimetaanilla (1 % trietyyliamiinia).
35 Tuote saadaan kellanvalkoisena vaahtona. Etyyliasetaatista uudelleenkiteyttämällä sadaan väritön jauhe.
36
Saanto: 4,00 g MS (ES") : 674,1 (M - H)"
Rf: 0,39 (dikloorimetaani/metanoli, 9:1).
Esimerkki 33 5 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli- N-{9-(N -(isobutanoyyli)guanosyyli)asetyyli)glysiinimetyy-liesteri (Mmt-Aeg (G1011) -OMe) N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyli)aminoetyyli-glysiinimetyyliesteriä (1,45 g, 3,59 mmol) liuotetaan 10 DMF:ään (7 ml). Tähän liuokseen lisätään peräkkäin 4-etyy-limorfoliinia (1,24 ml, 7,17 mmol), 3,4~dihydro-3-hydrok-si-4-okso-l,2,3-bentsotriatsiinia (0,585 g, 3,59 mmol), N2-(isobutanoyyli)-N9-karboksimetyyliguaniinia (1,00 g, 3,59 mmol) ja N,N'-di-isopropyylikarbodi-imidiä (0,67 ml, 15 4,31 mmol). Reaktioseosta sekoitetaan 48 tunnin ajan 4 °C:ssa. Sitten liuotin haihdutetaan tyhjössä eroon ja jäännös lietetään etyyliasetaattiin. Tätä liuosta uutetaan kahdesti vedellä ja kerran kyllästetyllä kaliumkloridiliu-oksella. Orgaaninen faasi kuivataan natriumsulfaatilla, 20 suodatetaan ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Jäljelle jäänyt keltainen vaahto liuotetaan pieneen määrään etyyliasetaattia ja jäähdytetään jäillä vielä läsnä olevan di-sykloheksyyliurean saostamiseksi. Suodatuksen jälkeen suo-dos haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Puhdistaminen suorite-25 taan pylväskromatografisesti silikageelissä, jota on tasa-painoitettu edeltäpäin dikloorimetaani/etyyliasetaatilla, 1:1, joka sisältää 1 %:n trietyyliamiinia. Eluointi suoritetaan dikloorimetaani/etyyliasetaatilla, 1:1. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä 30 kuiviin. Haluttu yhdiste saadaan vaaleankeltaisena vaahtona .
Saanto: 1,181 g MS (FAB/MeOH, NBA, LiCl) : 678,3 (M + 2Li-H)+; 672,3 (M + Li)+ 35 Ri?: 0,13 (dikloorimetaani/metanoli, 95:5).
37
Esimerkki 34 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-N- (9- (N2-(isobutanoyyli)guanosyyli)asetyyli)glysiini (Mmt-Aeg(GiBu) -OH) 5 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli isi- (9- (K2~(isobutanoyyli)guanosyyli)asetyyli)glysiinimetyy-liesteriä (1,15 g, 1,72 mmol) liuotetaan dioksaaniin (10 ml) ja lisätään 2,5 tunnin aikana 0 °C:ssa tipoittain nat-ronlipeän 1 N vesiliuosta (10,32 ml) 5 eränä. Edelleen 2 10 tunnin reaktioajan huoneenlämpötilassa jälkeen liuoksen pH säädetään lisäämällä tipoittain kaliumvetysulfaatin 2 M vesiliuosta 5:ksi. Saostuneet suolat suodatetaan eroon ja pestään pienellä määrällä dioksaania. Yhdistetyt suodokset haihdutetaan tyhjössä kuiviin ja jäännös haihdutetaan kah-15 desti yhdessä sekä etanolin että dikloori/metanolin, 1:1, kanssa kuiviin. Puhdistaminen suoritetaan pylväskromato-grafisesti silikageelissä eluoiden käyttäen gradienttia 10 - 20 % metanolia dikloorimetaanissa (jossa on 1 % tri-etyyliamiinia). Tuote saadaan valkoisena vaahtona.
20 Saanto: 1,229 g MS (ES') : 650,3 (M - H)"
Rf: 0,25 (dikloorimetaani/metanoli, 8:2).
Esimerkki 35 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-25 N- (9- (N6- (4-metoksibentsoyyli) adenosyyli) asetyyli) glysiini -metyyliesteri (Mmt-Aeg <AMe0Bz) -OMe) N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyli)aminoetyyli-glysiini-metyyliesteriä (1,24 g, 3,06 mmol) liuotetaan DMF:ään (7 ml). Tähän liuokseen lisätään peräkkäin 30 4-etyylimorfoliinia (1,06 ml, 6,12 mmol), 3,4-dihydro-3-hydroksi-4-okso-l,2,3-bentsotriatsiinia (0,498 g, 3,06 mmol), N6”(4-metoksibentsoyyli)-N9-karboksimetyyli-adeniinia (1,00 g, 3,06 mmol) ja N,N’-di-isopropyy-likarbodi-imidiä (0,58 ml, 3,67 mmol).
35 Reaktioseosta sekoitetaan 48 tunnin ajan 4 °C:ssa.
Sitten liuotin haihdutetaan tyhjössä eroon ja jäännös lie- 38 tetään etyyliasetaattiin. Tätä liuosta uutetaan kahdesti vedellä ja kerran kyllästetyllä kaliumkloridiliuoksella. Orgaaninen faasi kuivataan natriumsulfaatilla, suodatetaan ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Jäljelle jäänyt keltai-5 nen vaahto liuotetaan pieneen määrään etyyliasetaattia ja jäähdytetään jäillä vielä läsnä olevan disykloheksyyliure-an saostamiseksi. Tämä suodatetaan eroon ja suodos haihdu-tetaan tyhjössä kuiviin. Puhdistaminen suoritetaan pylväs-kromatografisesti silikageelissä, jota on edeltäpäin tasa-10 painoitettu dikloorimetaani/etyyliasetaatilla, 1:1, joka sisältää 1 %:n trietyyliamiinia. Eluointi suoritetaan di-kloorimetaani/etyyliasetaatilla, 1:1. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä kuiviin. Haluttu yhdiste saadaan vaaleankeltaisena vaahtona.
15 Saanto: 1,752 g MS (FAB/MeOH, NBA, LiCl): 720,3 (M + Li)+
Rf: 0,21 (dikloorimetaani/metanoli, 95:5).
Esimerkki 36 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-20 N- (9- {N6-(4-metoksibentsoyyli)adenosyyli)asetyyli)glysii-ni (Mmt-Aeg (AMe0Bz) -OH) N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-N- (9- (N6-(4-metoksibentsoyyli)adenosyyli)asetyyli)glysii-ni-metyyliesteriä (1,70 g, 2,38 mmol) liuotetaan dioksaa-25 niin (10 ml) ja liuokseen lisätään 2,5 tunnin aikana 0 °C:ssa tipoittaan natronlipeän 1 M vesiliuosta (10,32 ml) 5 eränä. Edelleen 2 tunnin reaktioajan huoneenlämpötilassa jälkeen liuoksen pH säädetään 5:ksi lisäämällä tipoittaan kaliumvetysulfaatin 2 M vesiliuosta. Saostuneet 30 suolat suodatetaan eroon ja pestään pienellä määrällä dioksaania. Yhdistetyt suodokset haihdutetaan tyhjössä kuiviin ja jäännös haihdutetaan kahdesti kuiviin sekä etanolin että dikloorimetaani/metanolin, 1:1, kanssa. Puhdistaminen tapahtuu pylväskromatografisesti silikageelissä 35 eluoiden käyttäen gradienttia 10 - 20 % metanolia dikloo- 39 rimetaanissa (jossa on 1 % trietyyliamiinia) . Tuote saadaan valkoisena vaahtona.
Saanto: 1,619 g MS (ES") : 698,3 (M - H) “ 5 Rf: 0,10 (dikloorimetaani/metanoli, 8:2).
Esimerkki 37
Tyminyylietikkahappo {valmistusmenetelmä kuten kuvaavat L. Kosynkina, W. Wang ja T. Chyau Liang, Tetrahedron Lett. 1994 5173 - 5176) 10 37,8 g tymiiniä liuotetaan liuokseen, jossa on 64,5 g kaliumhydroksidia 200 ml:ssa vettä. Sitten
40 °C:ssa samalla hyvin sekoittaen lisätään tipoittain liuos, jossa on 62,5 g bromietikkahappoa 100 ml:ssa vettä, 70 minuutissa. Seosta sekoitetaan vielä tunnin ajan 15 40 °C:ssa, sen annetaan jäähtyä 20 °C:seen ja liuoksen pH
säädetään 5,5:ksi lisäämällä kons. kloorivetyhappoa. Seoksen annetaan seistä 1,5 tunnin ajan 0 °C:ssa, saostunut reagoimatta jäänyt tyrniini suodatetaan imulla eroon, minkä jälkeen suodoksen pH säädetään 2,0:ksi lisäämällä kons. 20 kloorivetyhappoa, jolloin tuote saostuu. Seoksen annetaan seistä vielä 1 tunnin ajan 0 °C:ssa, minkä jälkeen sakka suodatetaan imulla eroon ja kuivataan eksikaattorissa.
Saanto: 52,19 g
Rf: 0,23 (etyyliasetaatti/metanoli/jääetikka, 25 75:20:5} MS (DCI) : 185 (M + H)'\
Esimerkki 38
Tyrni nyylie tikkahappometyy1ies teri 31,5 g tymiiniä suspendoidaan 800 ml:aan kuivaa 30 DMF:ää ja lisätään 69,4 g hienoksi jauhettua kaliumkarbonaattia. Seosta ravistellaan 3 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen siihen lisätään 23,1 ml bromietikka-happometyyliesteriä. Seosta ravistellaan argon-suojakaa-sussa yön yli, minkä jälkeen sakka suodatetaan eroon, se 35 pestään DMFrllä ja haihdutetaan suodos tyhjössä pyöröhaih-duttimessa kuiviin. Jäännöstä trituroidaan perusteellises- 40 ti seoksessa, jossa on 240 ml vettä ja 19 ml 2 N HCl:ää, huhmaressa, minkä jälkeen sakka suodatetaan imulla eroon ja pestään vedellä. Näin saatu, vielä kostea raakatuote uudelleenkiteytetään 450 ml:sta metanolia.
5 Saanto: 25,5 g
Rf: 0,78 (etyyliasetaatti/metanoli/jääetikka, 80:10:5) MS (DCI) : 199,1 (M + H)'1'.
Esimerkki 39 10 N- ( (4-metoksifenyyli) difenyylimetyyliamino) etyyli- N-((1-tyminyyli)asetyyli)glysiinimetyyliesteri {Mmt-
Aeg(T)-OMe) 19,84 g Mmt-Aeg-OMe:tä liuotetaan 450 ml:aan THF:ää, minkä jälkeen samalla hyvin jäähdyttäen ja hyvin 15 sekoittaen lisätään ensin 6,82 ml trietyyliamiinia ja sitten 3,92 ml klooriasetyylikloridia liuotettuna 60 ml:aan THF:ää hitaasti tipoittain. Noin 2/3:n klooriasetyyliklo-ridiliuoksen tiputettavsta määrästä jälkeen lisätään vielä 3,41 ml trietyyliamiinia. Kun klooriasetyylikloridin li-20 saaminen on päättynyt, seoksen anetaan reagoida vielä 1 tunnin ajan, saostunut trietyyliamiinihydrokloridi suodatetaan imulla eroon ja liuokseen lisätään 400 ml kuivaa DMF:ää. Sitten THF haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihdutti-messa eroon ja tämä Mmt-Aeg(klooriasetyyli)-OMe:n liuos 25 DMF:ssä lisätään jo yön yli esireagoineeseen seokseen, jossa on 12,36 g tymiiniä ja 27,16 g hienoksi jauhettua kaliumkarbonaattia 200 ml:ssa kuivaa DMF:ää. Tämän seoksen annetaan reagoida vielä 16 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen liukenematon aines suodatetaan imulla 30 eroon. Suodos haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin ja jäännös ositetaan veteen ja etyyliasetaattiin. Orgaaninen faasi kuivataan natriumsulfaatilla, minkä jälkeen kuivausaine suodatetaan eroon ja suodos haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa noin 80 ml:n tilavuuteen. Tä-35 mä seos sekoitetaan sitten seokseen, jossa on 600 ml pet- 41 rolieetteriä ja 200 ml dietyylieetteriä, jolloin tuote saostuu.
Saanto: 25 g
Rf: 0,34 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii- 5 ni, 100:5:1).
Esimerkki 40 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-N-{(1-tyminyyli)asetyyli)glysiini (Mmt-Aeg(T)-OH) 5.7 g Mmt-Aeg(T)-OMe:tä suspendoidaan 25 ml:aan 10 vettä ja lisätään peräkkäin 13,9 ml trietyyliamiinia ja 12,5 ml dioksaania. Syntyneen kirkkaan liuoksen annetaan seistä 72 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen liuotin tislataan pyöröhaihduttimessa tyhjössä pois. Jäännös tislataan vielä kolmasti pienen määrän tolueenia kans~ 15 sa. Jäännös lietetään seokseen, jossa on 20 ml sekä dioksaania että etyyliasetaattia, pieni määrä liukenematonta ainesta suodatetaan eroon ja suodos sekoitetaan 500 ml:aan eetteriä, jossa on 1 % trietyyliamiinia. Saostunut tuote suodatetaan imulla eroon ja kuivataan eksikaattorissa.
20 Saanto: 4,1 g
Rf. 0,28 (dikloorircietaani/metanoli/trietyyliamii-ni, 100:10:1).
Esimerkki 41 N-({4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-25 N-((1-tyminyyli)asetyyli)glysiini (Mmt-Aeg(T)-OH) 5.7 g Mmt-Aeg(T)-OMe:tä liuotetaan seokseen, jossa on 80 ml vettä, 20 ml metanolia ja 13,9 ml trietyyliamiinia. Syntyneen kirkkaan liuoksen annetaan reagoida 24 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen liuotin tisla- 30 taan eroon tyhjössä pyöröhaihduttimessa. Jäännös tislataan vielä kolmasti pienen määrän tolueenia kanssa. Jäännös lietetään seokseen, jossa on sekä 20 ml dioksaania että etyyliasetaattia, pieni määrä liukenematonta ainesta suo-dateaan eroon ja suodos sekoitetaan 500 ml:aan eetteriä, 35 jossa on 1 % trietyyliamiinia. Saostunut tuote suodatetaan imulla eroon ja kuivataan eksikaattorissa.
42
Saanto: 4,8 g
Rf: 0,28 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii- ni, 100:10:1).
Esimerkki 42 5 N-{(2-hydroksi)etyyli-N-((1-tyminyyli)asetyyli)- glysiini (H-Oeg(T)-OH) 2,76 g tyminyylietikkahappoa liuotetaan 15 ml:aan kuivaa DMF:ää ja 4,92 g TOTU:a ja 2,08 ml trietyyliamiinia lisätään. Seosta sekoitetaan 30 minuutin ajan huoneenläm-10 pötilassa, minkä jälkeen se lisätään hitaasti tiputtamalla liuokseen, jossa on 3,57 g (2-hydroksietyyli)glysiiniä, 10 ml vettä, 10 ml DMF:ää ja 4,16 ml trietyyliamiinia. Seosta sekoitetaan vielä 1 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen siihen lisätään 20 ml asetonitriiliä, jolloin hyd-15 roksietyyliglysiiniylimäärä saostuu. Sakka suodatetaan eroon imulla ja suodos haihdutetaan pyöröhaihduttimessa tyhjössä kuiviin. Jäännös lietetään veteen, pH säädetään l,5:ksi 1 N kloorivetyhapolla ja uutetaan etyyliasetaatilla. Vesifaasin pH säädetään 5:ksi lisäämällä kyllästettyä 20 natriumvetykarbonaattiliuosta ja haihdutetaan pyöröhaihduttimessa kuiviin. Jäännökseen lisätään 250 ml etanolia ja tällöin saostunut natriumkloridi suodatetaan imulla eroon. Suodos haihdutetaan kuiviin ja raakatuotetta puhdistetaan kromatografisesti silikageelissä eluoiden di-25 kloorimetaani/metanoli/etyyliasetaatilla, 10:2:1, jossa on 1 % trietyyliamiinia. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan pyöröhaihduttimessa tyhjössä kuiviin .
Saanto: 2,39 g 30 Rr: 0,17 (dikloorimetaani/metanoli/etyyliasetaat- ti, 10:2:1, jossa on 1 % trietyyliamiinia) MS (DCI) : 286 (M + H)\ 43
Esimerkki 43 N-(2-(di-(4-metoksifenyyli)fenyyli)metyylioksi)-etyyli-N-((1-tyminyyli)asetyyli)glysiini (Dmt-Oeg(T)-OH) 1,76 g H-Oeg(T)-OH:ta liuotetaan 30 ml:aan DMF:ää, 5 3,41 trietyyliamiinia lisätään ja 0 °C:ssa .lisätään ti poittaan liuos, jossa on 4,16 g Dmt-Cl: äa 30 ml:ssa di-kloorimetaania, 20 minuutin kuluessa. Seosta sekoitetaan vielä 3 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen saostunut trietyyliamiinihydrokloridi suodatetaan eroon ja 10 suodos haihdutetaan pyöröhaihduttimessa tyhjössä kuiviin. Raakatuotetta puhdistetaan silikageelissä eluoiden dikloo-rimetaani/metanoli/etyyliasetaatilla, 10:2:1, jossa on 1 % trietyyliamiinia. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan pyöröhaihduttimessa tyhjössä kuiviin.
15 Saanto: 3,2 g
Rf: 0,29 (dikloorimetaani/metanoli/etyyliasetaat- ti, 10:2:1, jossa on 1 % trietyyliamiinia) MS (ES+ + LiCl) : 594,3 {M + Li)'1'; 600, 4 (M + 2Li - H)+.
20 Esimerkki 44 N-(2-(di-(4-metoksifenyyli)fenyyli)metyylitio)-etyyli-N-( (1-tyminyyli) asetyyli) glysiinin valmistus (Dmt-Teg(T)-OH)
Esimerkki 44a 2 5 Dmt-S-CH2-CH2-NH2 10,17 g Dmt-Cl:ää liuotetaan 100 ml:aan etikkahap-poa ja 4,43 g 2-merkaptoetyyliamiinihydrokloridia liuotettuna 70 ml:aan vettä lisätään. Seosta sekoitetaan vielä 2 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen seos haih-30 dutetaan pyöröhaihduttimessa noin 50 ml: n tilavuuteen. Sitten lisätään 200 ml vettä ja liuoksen pH säädetään 2 N NaOH-liuoksella 10:ksi, jolloin aine saostuu. Seosta uutetaan kolmasti 100 ml:11a etyyliasetaattia, yhdistetyt orgaaniset faasit pestään kyllästetyllä NaCl-liuoksella ja 35 kuivataan natriumsulfaatilla. Kuivausaine suodatetaan eroon ja suodos haihdutetaan pyöröhaihduttimessa tyhjössä 44 kuiviin. Näin saatua raakatuotetta käytetään sitä enempää puhdistamatta seuraavassa reaktiossa.
Saanto: 14,75 g.
Esimerkki 44b 5 Dmt-S-CH2-CH2-NH~CH2-C02C2H5 12,56 g Dmt-S“-CH2-CH2-NH2: ta (raakatuote kohdasta 44a) liuotetaan 100 ml:aan kuivaa DMF:ää ja samalla sekoittaen huoneenlämpötilassa lisätään peräkkäin 4,6 ml trietyyliamiinia ja 3,66 ml bromietikkahappoetyyliesteriä. 10 Seosta sekoitetaan vielä 3 tunnin ajan, pieni määrä sakkaa suodatetaan eroon ja suodos haihdutetaan tyhjössä pyörö-haihduttimessa kuiviin. Jäännös lietetään 150 ml:aan etyyliasetaattia, pestään 4 kertaan kulloinkin 40 ml :11a vettä, kuivataan orgaaninen faasi natriumsulfaatilla ja haih-15 dutetaan suodos kuivausalneen eroon suodatuksen jälkeen tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin. Näin saatua raaka-tuotetta käytetään sitä enempää puhdistamatta seuraavassa reaktiossa.
Saanto: 12,92 g.
20 Esimerkki 44c
Dmt-Teg(T)-OEt 5,95 g Dmt-S-CH2-CH2-NH-CH2-C02C2H5:tä liuotetaan 50 ml:aan kuivaa DMF:ää ja liuokseen lisätään peräkkäin 2,36 g tyminyylietikkahappoa, 4,45 ml trietyyliamiinia ja 25 4,2 g TOTU:ta. Seosta sekoitetaan 2 tunnin ajan huoneen lämpötilassa ja se jätetään yöksi seisomaan. Sitten reak-tioseos haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin, jäännös lietetään 150 ml:aan etyyliasetaattia, pestään 5 kertaan kulloinkin 10 ml:11a kyllästettyä natriumvetykar-30 bonaattiliuosta ja kahdesti 10 ml:11a vettä ja kuivataan orgaaninen faasi natriumsulfaatilla. Kuivausaine suodatetaan eroon ja suodos haihdutetaan kuiviin tyhjössä pyöröhaihduttimessa. Saadaan öljyinen raakatuote, jota käytetään sitä enempää puhdistamatta seuraavassa reaktiossa.
45
Saanto: 8,06 g.
Esimerkki 44d
Dmt-Teg(T)-OH
8,06 g Dmt-Teg(T)-OEt:tä liuotetaan seokseen, jos-5 sa on 80 ml dioksaania ja 40 ml vettä, ja saippuoidaan lisäämällä pieninä erinä kaikkiaan 13 ml 2 N natronlipeäliu-osta. Sitten liuos haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihdutti-messa noin 50 ml:ksi ja uutetaan neljästi 50 ml:11a etyyliasetaattia. Sitten vesifaasin pH säädetään 5:ksi lisää-10 mällä 2 N kloorivetyhappoa ja uutetaan 4 kertaan 50 ml :11a etyyliasetaattia. Yhdistetyt orgaaniset faasit pestään kahdesti 30 ml:11a vettä ja kuivataan natriumsulfaatilla. Kuivausaine suodatetaan eroon ja suodos haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa noin 30 ml:n tilavuuteen. Lisä-15 tään vähän trietyyliamiinia ja sekoitetaan liuosta 300 ml:ssa di-isopropyylieetteriä, jolloin tuote saostuu. Li-säpuhdistukseksi suoritetaan kromatografia-ajo silikagee-lissä käyttäen vaihegradienttia 0 - 5 % metanolia dikloo-rimetaanissa (1 % trietyyliamiinia kaikissa eluenteissa). 20 Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan pyöröhaihduttimessa tyhjössä kuiviin.
Saanto: 2,38 g
Rf*. 0,38 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii-ni, 100:10:1) 25 MS (FAB/NBA + LiCl) : 610,2 {M + Li)+; 616,2 (M + 2Li - H)+ .
Esimerkki 45 2-N-asetyyli-4-0-difenyylikarbamoyyli-9-metoksi- karbonyylimetyyliguaniini 30 15,52 g 2-N-asetyyli-4-0-difenyylikarbamoyyligua- niinia [valmistetaan kuten kuvaavat R. Zou ja M.J. Robins, Can. J. Chem. 65 (1987) 1436 - 1437] suspendoidaan 200 ml:aan kuivaa DMF:ää ja lisätään 13,6 ml di- isopropyylietyyliamiinia, minkä jälkeen seosta lämmitetään 35 vähän aikaan, kunnes on muodostunut kirkas liuos. Sitten lisätään 4,04 ml bromietikkahappometyyliesteriä ja liuosta 46 sekoitetaan yön yli. Sitten liuotin poistetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa ja jäännös liuotetaan 200 ml:aan me-tanolia. Tämä liuos lisätään tipoittain samalla voimakkaasti sekoittaen 600 ml:aan vettä, jolloin tuote saostuu.
5 Näin saatu raakatuote suodatetaan imulla eroon, se pestään vedellä, liuotetaan jälleen metanoliin ja haihdutetaan kuiviin, minkä jälkeen jäännöstä trituroidaan etyyliasetaatissa. Saatu tuote suodatetaan imulla eroon, se pestään etyyliasetaatilla ja eetterillä ja kuivataan sitten tyh-10 jössä. Emänesteesta saadaan haihduttamalla ja jäännöstä jälleen etyyliasetaatissa trituroimalla lisää tuotetta.
Saanto: 13,2 g MS (ES+) : 461,3 (M + H) +
Re: 0,79 (2-butanoni/pyridiini/vesi/etikkahappo, 15 70:15:15:2).
Esimerkki 46 2-N-asetyyli-4-0”difenyylikarbamoyyli-9-karboksi- metyyliguaniini 7,54 g 2-N-asetyyli-4~0-difenyylikarbamoyyli-9-20 metoksikarbonyylimetyyliguaniinia liuotetaan seokseen, jossa on 20 ml metanolia, 80 ml dioksaania ja 40 ml vettä, ja saippuoidaan pH:ssa 13 kaikkiaan 18 ml :11a 1 N NaOH-liuosta. Sitten liuoksen pH säädetään 6:ksi lisäämällä 1 N kloorivetyhappoa ja haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihdutti-25 messa noin 50 ml:n tilavuuteen. 400 ml:n vettä lisäämisen jälkeen seoksen pH säädetään 3:ksi lisäämällä 1 N kloorivetyhappoa, jolloin tuote saostuu. Tuote suodatetaan imulla eroon, se pestään vedellä ja kuivataan eksikaatto-rissa.
30 Saanto: 5,92 g MS (ESfj : 447,2 (M + H)+
Rf: 0,48 (2-butanoni/pyridiinx/vesi/etikkahappo, 70:15:15:2) .
47
Esimerkki 47 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyli amino)etyyli-N- ((9- (N2-asetyyli-Oa-difenyylikarbamoyyli) guanosyyli) ase-tyyli) glysiinimetyyliesteri (Mmt-Arg (G2~Ac,4~Dpc) -OMe) 5 3,57 g 2-N-asetyyli-4-0-difenyylikarbamoyyli-9- karboksimetyyliguaniinia liuotetaan 120 ml:aan kuivaa DMF:ää ja liuokseen lisätään peräkkäin 3,23 g Mmt-Aeg-OMe:tä, 2,62 g TOTU:ta ja pieninä erinä 4,08 ml di-isopropyylietyyliamiinia. Seosta sekoitetaan 4 tunnin ajan 10 huoneenlämpötilassa ja se jätetään yöksi seisomaan. Sitten liuotin tislataan tyhjössä pyöröhaihduttimessa eroon ja jäännös ositetaan 160 ml:aan etyyliasetaattia ja 20 ml:aan vettä. Orgaanista faasia uutetaan kolmasti kulloinkin 20 ml:lla vettä, se kuivataan natriumsulfaatilla, kuivausaine 15 suodatetaan eroon ja suodos haihdutetaan kuiviin. Jäljelle jäänyttä jäännöstä trituroidaan useaan kertaan dietyyli-eetterissä, tällöin sakkana saostunut tuote suodatetaan eroon imulla ja kuivataan eksikaattorissa.
Saanto: 5,53 g 20 Rf: 0,63 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii- ni, 100:5:1) .
Esimerkki 48 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-N-((9- (N^asetyyli-C^-difenyylikarbamoyyli) guanosyyli) ase-2 5 tyyli) glysiini (Mmt-Aeg (G2"te'4_Ppo) -OH) 4,99 g Mmt-Aeg (G2-Ac'4“Dpc)-OMe: tä liuotetaan seokseen, jossa on 50 ml dioksaania ja 10 ml vettä, ja saippuoidaan lisäämällä pieninä erinä kaikkiaan 15 ml 0,5 N NaOH-liuosta. Sitten liuoksen pH säädetään 9:ksi lisäämäl-30 lä 0,5 N HCl-liuosta ja liuotin haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa eroon. Jäännös tislataan vielä kerran pienen määrän tolueenia kanssa, minkä jälkeen jäännös liuotetaan 30 ml:aan metanolia. Tätä liuosta sekoitetaan 300 ml:ssa dietyylieetteriä (johon on lisätty 1 % trietyyli-35 amiinia), jolloin tuote saostuu. Edelleen jonkin verran keltaista sakkaa trituroidaan dietyylieetterissä, se suo- 48 datetaan imulla eroon ja kuivataan eksikaattorissa. Jatko-puhdistus suoritetaan kromatografisesti silikageelissä käyttäen vaihegradienttia (4 - 16 %} metanoli/etyyli- asetaatti (1:1) dikloorimetaanissa, jolloin kaikki liuot-5 timet sisältävät 1 %:n trietyyliamiinia. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä pyörö-haihduttimessa kuiviin.
Saanto: 2,68 g
Rf: 0,18 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyli- 10 amiini, 100:7,5:1) MS (ES1 + LiCl) : 819,4 (M + H)+; 825, 3 (M + Li)+.
Esimerkki 49 l-asetyyli-2,4-dihydroksi“5-metyylipyrimidiini 1-asetyylityrniini 15 75 g tymiiniä suspendoidaan 375 ml:aan asetanhyd- ridiä ja suspensiota keitetään palautusjäähdyttäen 45 minuutin ajan. Sitten seos jäähdytetään 0 °C:seen, jolloin tuote saostuu. Sakka suodatetaan eroon imulla ja sitä sekoitetaan 375 ml:ssa etyyliasetaattia. Sakka suodatetaan 20 imulla eroon, se pestään pienellä määrällä dietyylieette-riä ja kuivataan.
Saanto: 89,1 g
Sulamispiste: 187 - 189 °C
Rf: 0,67 (dikloorimetaani/metanoli, 95:5).
25 Esimerkki 50 3-bentsyylioksimetyyli-2,4-dihydroksi-5-metyylipy-rimidiini 3-bentsyy1ioksimetyy1ityrniini 52,0 g l-asetyyli-2,4-dihydroksi-5-metyylipyrimi-30 diinia suspendoidaan 300 ml:aan DMF:ää, lisätään 47,5 ml trietyyliamiinia ja jäähdytetään sitten 0 °C:seen. Hyvin sekoitettuun liuokseen lisätään hitaasti tipoittain 100 ml bentsyylikloorimetyylieetteriä 50 ml:ssa DMF:ää tässä lämpötilassa. Seosta sekoitetaan vielä 1 tunnin ajan, ja se 35 jätetään yöksi seisomaan huoneenlämpötilaan. Sitten reak-tioseos haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin, 49 jäännös lietetään 450 ml:aan metanolia ja 300 ml:aan me-tyyliamiinin 40-%:ista vesiliuosta ja keitetään 1,5 tunnin ajan palautusjäähdyttäen. Sitten liuos haihdutetaan kuiviin ja jäännöstä sekoitetaan liuoksessa, jossa on 10,8 g 5 natriumvetykarbonaattia 600 ml:ssa vettä. Saostunut tuote suodatetaan imulla eroon, se pestään vedellä ja etanolilla ja uudelleenkiteytetäan etanolista.
Saanto: 46,66 g
Sulamispiste: 119 - 120 °C
10 Rf: 0,38 (dikloorimetaani/metanoli, 95:5).
Esimerkki 51 3-bentsyylioksimetyyli-2,4-dihydroksi“5-metyylipy-rimidiinietikkahappoetyyliesteri 3-bentsyylioksimetyyli-l-etoksikarbonyylimet.yyli- 15 tyrniini 4,97 g natriumhydridiä lisätään 150 ml:aan THF:ää, minkä jälkeen lisätään tipoittain 45,04 g 3- bentsyylioksimetyyli-2,4-dihydroksi-5-metyylipyrimidiiniä liuotettuna 550 ml:aan THF:ää N2-suojakaasussa 0 °C:ssa ja 20 sitten 21,42 ml bromietikkahappoetyyliesteriä 700 ml:ssa THF:ää tässä lämpötilassa. Sitten seoksen annetaan reagoida vielä 5 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen lisätään varovaisesti vettä. Orgaaninen faasi erotetaan ja vesifaasia uutetaan vielä 4 kertaan dikloorimetaanilla.
25 Yhdistetyt orgaaniset faasit kuivataan magnesiumsulfaatilla, haihdutetaan kuiviin ja sekoitetaan jäännöstä hep-taanissa.
Saanto: 52,4 g
Rf: 0,15 (dikloorimetaani/metanoli, 95:5) 30 MS (FAB, NBA): 319,1 (M + H) \
Esimerkki 52 2,4-dihydroksi-5-metyylipyrimidiinietikkahappo-etyyliesteri
Tyminyylietikkahappoetyyliesteri 35 25 g 3-bentsyylioksimetyyli"2,4-dihydroksi-5-me- tyylipyrimidiinietikkahappoetyyliesteriä liuotetaan 1 000 50 ml:aan dikloorimetaania, seos jäähdytetään -70 °C:seen ja tässä lämpötilassa lisätään tipoittain samalla hyvin sekoittaen 375 ml booritrikloridin 1 M liuosta dikloorime-taanissa. Seoksen annetaan reagoida vielä 3 tunnin ajan 5 tässä lämpötilassa, minkä jälkeen -70 - -60 °C:ssa lisätään tipoittain 320 ml metanolia. 1 tunnin kuluttua lisätään 197,05 ml trietyyliamiinia ja seoksen annetaan lämmetä huoneenlämpötilaan. Sitten lisätään vielä vähän vettä ja seos haihdutetaan pyöröhaihduttimessa kuiviin. Jäännös 10 lietetään etyyliasetaattiin ja pestään vedellä. Orgaaninen faasi kuivataan magnesiumsulfaatilla ja haihdutetaan sitten kuiviin.
Saanto: 12 g
Rf: 0,45 (dikloorimetaani/rnetanoli, 9:1) 15 MS (DCI): 199 (M + H)\
Esimerkki 53 2,4-dihydroksi-5-metyylipyrimidiinietikkahappo
Tyminyylietikkahappo 10 g 2,4-dihydroksi-5-metyylipyrimidiinietikkahap~ 20 poetyyliesteriä liuotetaan 130 ml:aan dioksaani/vettä (1:1), minkä jälkeen lisätään 60 ml 1 N LiOH-liuosta ja sekoitetaan yön yli huoneenlämpötilassa. Sitten seos haihdutetaan pieneen tilavuuteen, vesifaasi pestään eetterillä, minkä jälkeen sen pH säädetään 2:ksi, jolloin tuote 25 saostuu. Tuote suodatetaan eroon ja saadaan 4,9 g tuotetta. Emänesteestä saadaan pentanolilla uuttamalla ja hep-taani/eetteristä saostamalla vielä 1,5 g tuotetta.
Saanto: 6,4 g
Rr: 0,30 (dikloorimetaani/rnetanoli, 3:2) 30 MS (DCI): 185 (M + H)+.
Esimerkki 54 N-l-kloorikarboksimetyylityrniini
Tyminyylietikkahappokloridi
Esimerkki 54a 35 2 g 2,4-dihydroksi-5-metyylipyrimidiinietikkahap- poa sekoitetaan 3 tunnin ajan 15 ml:ssa tionyylikloridia 51 60 °C:ssa, kunnes kaasunkehitystä ei enää tapahdu. Sitten ylimääräinen tionyylikloridi haihdutetaan pois tyhjössä pyöröhaihduttimessa ja jäännös tislataan vielä kolmasti pienen määrän tolueenia kanssa. Näin saatua tuotetta käy-5 tetään sellaisenaan seuraavassa reaktiossa.
Saanto: 2,4 g MS (DCI) : 203 (M + H)'1'.
Esimerkki 54b N-l-karboksimetyylitymiiniä (3,0 g, 16,3 mmol) 10 suspendoidaan tionyylikloridiin (90 ml) . Suspensiota kuumennetaan 1,5 tunnin ajan 70 °C:ssa, minkä jälkeen se jätetään 16 tunniksi huoneenlämpötilaan seisomaan. Ylimääräinen tionyylikloridi poistetaan tyhjössä ja jäännös haihdutetaan kolmeen kertaan yhdessä tolueenin kanssa. 15 Saatua tuotetta trituroidaan kahdesti n-heksaanissa ja se kuivataan tyhjössä, jolloin yhdiste saadaan vaaleanorans-sina jauheena.
Saanto: 3,30 g MS (DCI; dikloorimetaani): 203 (M - H)+ 20 Rf: 0,10 (dikloorimetaani/metanoli, 7:3).
Esimerkki 55 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)efcyyli-N-((1-imidatsolyyli)asetyyli)glysiinimetyyliesterin valmistus (Mmt-Aeg(Im)-OMe) 25 4,68 g Mmt-Aeg-Ome:tä liuotetaan 150 ml:aan THF;ää, minkä jälkeen lisätään hitaasti tipoittain ja samalla jäähdyttäen ja hyvin sekoittaen 0,95 ml kloo-riasetyylikloridia liuotettuna 15 ml:aan THF:ää samanaikaisesti 3,3 ml:n trietyyliamiinia 10 ml:aan THF:ää liuo-30 tettuna kanssa. Sitten seoksen annetaan reagoida vielä 45 minuutin ajan, saostunut trietyyliamiinihydrokloridi suodatetaan imulla eroon ja liuokseen lisätään 150 ml kuivaa DMF:ää. Sitten THF haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa eroon ja Mmt-Aeg(klooriasetyyli)~OMe:n liuokseen 35 DMF:ssä lisätään peräkkäin 1,62 g imidatsolia ja 6,55 g hienoksi jauhettua kaliumkarbonaattia. 16 tunnin kuluttua 52 ei-liukoinen suola suodatetaan imulla eroon ja suodokseen lisätään toistamiseen 1,62 g imidatsolia ja 6,55 g hienoksi jauhettua kaliumkarbonaattia. Tämän seoksen annetaan reagoida edelleen 16 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, min-5 kä jälkeen liukenematon aines suodatetaan imulla eroon. Suodos haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin ja jäännös ositetaan veteen ja etyyliasetaattiin. Orgaaninen faasi kuivataan natriumsulfaatilla ja haihdutetaan sitten kuivausaineen eroon suodatuksen jälkeen kuiviin. 10 Jäännös lietetään dikloorimetaaniin ja seostetaan sekoittamalla seoksessa dietyylieetteri/petrolieetteri, 4:1. Edelleen jonkin verran kellertävä sakka kiinteytyy liuottimen pois dekantoinnin ja trituroinnin eetterissä jälkeen.
15 Saanto: 3,96 g
Rf: 0,39 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii- ni, 100:5:1).
Esimerkki 56 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyy-20 li-N-<(1-imidatsolyyli)asetyyli)glysiinin valmistus (Mmt-Aeg(Im)-OH) 1,79 g N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino) etyyli-N-((1-imidatsolyyli)asetyyli)glysiinimetyylies-teriä liuotetaan seokseen, jossa on 50 ml dioksaania ja 25 25 ml vettä, ja saippuoidaan lisäämällä 5,25 ml 1 N NaOH-liuosta. Sitten liuoksen pH säädetään 8:ksi lisäämällä 1 N HCl-liuosta ja se haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin. Jäännös tislataan vielä kahdesti pienen määrän tolueenia kanssa, minkä jälkeen sitä puhdistetaan kromato-30 grafisesti silikageelissä eluoiden seoksella dikloorime-taani/metanoli/etyyliasetaatti, 100:10:5, jossa on 1 % trietyyliamiinia. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin.
Saanto: 1,70 g 35 Rf: 0,27 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii- ni, 100:20:1) 53 MS (ES+) : 499, 3 (M + H) \
Seuraavaksi kuvataan muita synteesejä, joissa on klooriasetyylivälivaihe:
Esimerkki 57 5 N- {(4-metoksifenyyli) difenyylimetyyliamino) etyyli- N-(klooriasetyyli)glysiinimetyyliesterin DMF-liuoksen valmistus (Mmt-Aeg(klooriasetyyli)-OMe) 34,85 g Mmt-Aeg-OMe:tä liuotetaan 900 mitään THFtää, minkä jälkeen lisätään hitaasti tipoittain samalla 10 jäähdyttäen ja hyvin sekoittaen 6,9 ml klooriasetyyliklo-ridia liuotettuna 110 mitään THFtää ja samanaikaisesti 24 ml trietyyliamiinia liuotettuna 110 mitään THFtää. Sitten seoksen annetaan reagoida vielä 1 tunnin ajan, saostunut trietyyliamiinihydrokloridi suodatetaan imulla eroon ja 15 liuokseen lisätään 600 ml kuivaa DMFtää. Sitten THF haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa pois. Saatu Mmt-Aeg (klooriasetyyli)-OMe-liuos DMFtssä jaetaan.
Esimerkki 58 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-20 N-((1-(4-nitro)imidatsolyyli)asetyyli)glysiinimetyyliesterin valmistus (Mmt-Aeg (Im4_nitro) -OMe)
Yhteen puolikkaaseen edellä valmistettua Mmt-Aeg ( klooriasetyyli ) -OMe : n liuosta DMF:ssä lisätään 9,75 g hienoksi jauhettua 4-nitroimidatsolia ja 23,85 g hienoksi 25 jauhettua kaliumkarbonaattia. Seoksen annetaan reagoida edelleen 16 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen liukenematon aines suodatetaan imulla eroon. Suodos haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin ja jäännös ositetaan veteen ja etyyliasetaattiin. Orgaaninen faasi 30 pestään kolmasti kulloinkin 50 ml :11a vettä, se kuivataan natriumsulfaatilla ja haihdutetaan sitten kuivausaineen eroon suodatuksen jälkeen tyhjössä pyöröhaihduttimessa noin 60 ml:an tilavuudeksi. Tämä liuos sekoitetaan sitten seokseen, jossa on 400 ml petrolieetteriä ja 200 ml di-35 etyylieetteriä, jolloin tuote saostuu. Tuote suodatetaan imulla eroon ja kuivataan eksikaattorissa.
54
Saanto: 19,8 g
Rf: 0,40 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii- ni, 100:5:1) MS (ES'1') : 558,3 (M + H}\ 5 Esimerkki 59 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-N-((1-(4-nitro)imidatsolyyli)asetyyli)glysiinin valmistus (Mmt-Aeg (Im4~nit£°) -OH) 5,37 g N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliami-10 no)etyyli-N-{(1-(4-nitro)imidatsolyyli)asetyyli)glysiini-metyyliesteriä liuotetaan seokseen, jossa on 20 ml me-tanolia, 80 ml vettä ja 13,9 ml trietyyliamiinia. Kirkkaan liuoksen annetaan seistä 48 tunnin ajan huoneenlämpötilassa. Tällöin lähtömateriaali on saippuoitunut ja liuos 15 haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin. Jäännös tislataan vielä kahdesti pienen määrän tolueenia kanssa. Jäännös lietekään seokseen, jossa on 20 ml sekä dioksaania että etyyliasetaattia, pieni määrä ei-liukoista ainesta suodatetaan eroon ja suodos sekoitetaan 500 ml:aan eette-20 riä, jossa on 1 % trietyyliamiinia. Saostunut tuote suodatetaan eroon, se pestään pienellä määrällä eetteriä ja kuivataan eksikaattorissa.
Saanto: 4,21 g
Rf: 0,24 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii- 25 ni, 100:10:1) MS (ES+) : 543,2 (M+) .
Esimerkki 60 N-{(4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyyli-N-{(1-(1,2,4)-triatsolyyli)asetyyli)glysiinimetyyliesterin 30 valmistus (Mmt-Aeg (Triaz) -OMe)
Toiseen puolikkaaseen edellä valmistettua Mmt-Aeg (klooriasetyyli) -OMe: n liuosta DMF:ssä lisätään 5,96 g hienoksi jauhettua 1,2,4-triatsolia ja 23,85 g hienoksi jauhettua kaliumkarbonaattia. Tämän seoksen annetaan rea-35 goida vielä 16 tunnin ajan huoneenlämpötilassa, minkä jälkeen ei-liukoinen aines suodatetaan imulla eroon. Suodos 55 haihdutetaan pyöröhaihduttimessa tyhjössä kuiviin ja jäännös ositetaan veteen ja etyyliasetaattiin. Orgaaninen faasi pestään kolmasti kulloinkin 50 ml :11a vettä, se kuivataan natriumsulfaatilla ja haihdutetaan sitten kuivausai-5 neen eroon suodatuksen jälkeen tyhjössä pyöröhaihduttimessa noin 60 ml:n tilavuuteen. Tämä liuos sekoitetaan sitten 400 ml:n petrolieetteriä ja 200 ml: n dietyylieetteriä seokseen, jolloin tuote saostuu. Tuote suodatetaan imulla eroon ja kuivataan eksikaattorissa.
10 Saanto: 17,4 g
Rf: 0,63 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii- ni, 100:5:1).
Esimerkki 61 N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino)etyy-15 li-N-((1-{1,2,4-triatsolyyli)asetyyli)glysiinin valmistus (Mmt-Aeg(Triaz)-OH) 5,13 g N-((4-metoksifenyyli)difenyylimetyyliamino} etyyli-N-{(1-(1,2,4)-triatsolyyli)asetyyli)glysiinime-tyyliesteriä liuotetaan seokseen, jossa on 10 ml dioksaa-20 nia, 10 ml metanolia, 80 ml vettä ja 13,9 ml trietyyli-amiinia. Kirkkaan liuoksen annetaan seistä huoneenlämpötilassa 48 tunnin ajan. Tällöin lähtömateriaali on saippuoi-tunut ja liuos haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin. Jäännös tislataan vielä kahdesti pienen määrän 25 tolueenia kanssa. Jäännös lietetään seokseen, jossa on 20 ml sekä dioksaania että etyyliasetaattia, pieni määrä ei-liukoista ainesta suodatetaan eroon ja suodos sekoitetaan 500 ml:aan eetteriä, jossa on 1 % trietyyliamiinia. Saostunutta tuotetta (4,02 g) puhdistetaan kromatografisesti 30 silikageelissä käyttäen vaihegradienttia (2 - 15 %) meta-noli/etyyliasetaatti (1:1) dikloorimetaanissa, jolloin kaikissa liuottimissa on 1 % trietyyliamiinia. Tuotetta sisältävät fraktiot yhdistetään ja haihdutetaan tyhjössä pyöröhaihduttimessa kuiviin.
35 56
Saanto: 3,25 g
Rf: 0,27 (dikloorimetaani/metanoli/trietyyliamii- ni, 100:10:1) MS (ES+) : 500,2 (M + H)'\ 5
Claims (5)
1. Yhdiste, tunnettu siitä, että sen kaava on I: B ' V° o (l)' PG—X-—v .N il X0H 5 j ossa PG on heikkojen happojen suhteen labiili aminon-suojaryhmä, joka on uretaanityyppiä ryhmästä l-(l-adaman-10 tyyli)-1-metyylietoksikarbonyyli (Adpoc), 1-(3,5-di-tert- butyylifenyyli)-1-metyylietoksikarbonyyli (t-Bumeoc) ja 1-metyyli-l-(4-bifenyyli)etyylioksikarbonyyli (Bpoc), tai trityylityyppiä ryhmästä trifenyylimetyyli (Trt), {4-me- toksifenyyli)difenyylimetyyli {Mmt), (4-metyylifenyyli)- 15 difenyylimetyyli (Mtt), di-(4-metoksifenyyli)fenyylime tyyli (Dmt) ja 9-(9-fenyyli)ksantenyyli (Pixyl), ja X on NH, O tai S, Y on CH2, NH tai O, ja B1 on luonnollinen nukleoemäs kuten adeniini, sy-20 tosiini, guaniini, tyrniini ja urasiili, tai ei-luonnolli-nen nukleoemäs kuten puriini, 2,6-diaminopuriini, 7-deat-sa-adeniini, 7-deatsaguaniini, N4N4~etanosytosiini, N6N6- etano-2,6-diaminopuriini, 5-metyylisytosiini, 5-C2-6-alky- nyyliurasiili, 5-C2-6-alkynyylisytosiini, 5-fluoriurasiili 25 ja pseudoisosytosiini, joiden eksosykliset amino- tai hyd-roksiryhmät on suojattu sopivilla tutuilla suojaryhmillä, tai imidatsoli, triatsoli tai nitroimidatsoli. mukaan lukien sen suolat.
2-N-asetyylin ja 6-O-difenyylikarbamoyylin yhdistelmällä, tai imidatsoli, triatsoli tai nitroimidatsoli.
2. Patenttivaatimuksen 1 mukainen yhdiste, jonka 30 kaava onl, tunnettu siitä, että X on NH tai O, Y on CH2i ja B' on luonnollinen nukleoemäs ryhmästä adeniini, sytosiini, guaniini, tyrniini ja urasiili, tai ei-luonnol-linen nukleoemäs ryhmästä puriini, 2,6-diaminopuriini, 5 7-deatsa-adeniini, 7-deatsaguaniini, N4N4-etanosytosiini, NsN6-etano-2,6~diaminopuriini, 5-metyylisytosiini, 5-C3.6- alkynyyliurasiili, 5-C3.6~alkynyylisytosiini, 5-fluoriura-siili ja pseudoisosytosiini, joiden eksosykliset amino-tai hydroksiryhmät on suojattu bentsoyyli-, isobutanoyy-10 li-, asetyyli-, fenoksiasetyyli-, 4-(t-hutyyli)bentsoyy li-, 4 -(t-butyyli)fenoksiasetyyli-, 4-(metoksi)bentsoyyli-, 2 -{4-nitrotenyyli}etyylioksikarbonyyli-, 2-{2,4-di-nitrofenyyli)etyylioksikarbonyyli- , 9-fluorenyylimetoksi-karbonyyli-, difenyylikarbamoyyli- tai formamidiinisuoja-15 ryhmällä, ja myös guaniinin kyseessä ollen on suojattu
3. Menetelmä patenttivaatimuksen 1 tai 2 mukaisen yhdisteen valmistamiseksi, jonka kaava on I, jossa Y on 20 CH2, tunnettu siitä, että a) yhdiste, jonka kaava on II: H 0 ΠΠ pg-x-^n-^A0/r' jossa PG ja X määritellään kuten patenttivaatimuksessa 1, 25 R1 on vety tai esterinsuojaryhmä, saatetaan reagoimaan yhdisteen kanssa, jonka kaava on III: B · Υγ0 (III) OH jossa B' määritellään kuten edellä ja Y on CH2, 0-45 °C:ssa sopivassa liuottimessa tai näiden 5 liuottimien seoksessa käyttäen peptidikemiassa tavallista kytkentäreagenssia, jolloin saadaan yhdiste, jonka kaava on IV: B ' i λ (IV) 0 P G— 1 jossa
10 PG, X, B1 ja R1 määritellään kuten edellä, minkä jälkeen tämä yhdiste muutetaan pilkkomalla esterinsuojaryhmä R1 heikosti aikalisissä olosuhteissa al-kalilipeällä tai tertiaarisilla amiiniyhdisteillä vedessä tai myös entsymaattisesti esteraasien tai lipaasien avulla 15 0-50 °C:ssa sopivassa liuottimessa tai näiden liuottimi en seoksessa kaavan I mukaiseksi yhdisteeksi, tai b) yhdiste, jonka kaava on II: H 0 /m PG—X—/R' ' j ossa
20 PG ja X määritellään kuten edellä, ja R1 on vety tai tilapäinen silyylisuojaryhmä, saatetaan reagoimaan yhdisteen kanssa, jonka kaava on V: B1 - CH2 - CO - R2 (V) j ossa B' määritellään kuten edellä ja R2 on halogeeni tai aktiiviesteritähde, 25 0-40 °C:ssa sopivassa liuottimessa tai näiden liuottimien seoksessa, jolloin mahdollisesti voidaan suorittaa happofunktion kaavan II mukaisessa yhdisteessä tilapäinen suojaaminen saattamalla reagoimaan tavallisten 5 silylointireagenssien kanssa ja tämän tilapäisen suojaryh-män pilkkominen - sen jälkeen kun on saatettu reagoimaan kaavan V mukaisen yhdisteen kanssa - lisäämällä vettä tai alkoholeja reaktioseokseen, tai c) yhdiste, jonka kaava on II: H 0 /111 10 j ossa PG ja X määritellään kuten edellä ja R1 on esterinsuojaryhmä, saatetaan reagoimaan halogeenietikkahappojohdan- 15 naisen kanssa sopivassa liuottimessa apuemästä käyttäen, jolloin saadaan yhdiste, jonka kaava on VI: Ηα I r o , (vii, j ossa Hal on Cl, Br tai I, ja
20 PG, X ja R1 määritellään kuten edellä, tämä välituoteyhdiste, jonka kaava on VI, muutetaan mahdollisesti suojatulla nukleoemäksellä B' ja apuemäksel-lä sopivassa liuottimessa yhdisteeksi, jonka kaava on IV: e ’ Li-0 o pe-*-0\A/' "v> minkä jälkeen tämä yhdiste muutetaan pilkkomalla esterin-suojaryhmä R1 alkalilipeällä tai myös entsymaattisesti es-teraasien tai lipaasien avulla 0 - 50 °C:ssa sopivassa liuottimessa tai näiden liuottimien seoksessa kaavan I mu-5 kaiseksi yhdisteeksi.
4. Menetelmä patenttivaatimuksen 1 tai 2 mukaisen yhdisteen valmistamiseksi, jonka kaava on I, jossa Y on 0 tai NH, tunnettu siitä, että yhdiste, jonka kaava on II: H 0 P6—X—/«’ Hl), 10 jossa PG ja X määritellään kuten edellä, ja R1 on esterinsuojaryhmä tai tilapäinen esterin- suoj aryhmä, 15 saatetaan reagoimaan yhdisteen kanssa, jonka kaava on VII: B1 - Y - CO - R3 (VII) jossa
20 B1 määritellään kuten edellä, Y on O tai NH, ja R3 on Cl, ONp tai ONSu, 0 - 40 °C:ssa sopivassa liuottimessa tai näiden liuottimien seoksessa, minkä jälkeen esterinsuojaryhmä R1 25 lohkaistaan alkalilipeällä tai myös entsymaattisesti este-raasien tai lipaasien avulla 0-50 °C:ssa sopivassa liuottimessa tai näiden liuottimien seoksessa.
5. Patenttivaatimuksen 1 tai 2 mukaisten kaavan I yhdisteiden käyttö PNA- ja PNA-/DNA-hybridien valmistami- 30 seksi.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE4408534A DE4408534A1 (de) | 1994-03-14 | 1994-03-14 | Substituierte N-Ethyl-Glycinderivate zur Herstellung von PNA und PNA-/DNA-Hybriden |
| DE4408534 | 1994-03-14 |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| FI951128A0 FI951128A0 (fi) | 1995-03-10 |
| FI951128A FI951128A (fi) | 1995-09-15 |
| FI120199B true FI120199B (fi) | 2009-07-31 |
Family
ID=6512698
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| FI951128A FI120199B (fi) | 1994-03-14 | 1995-03-10 | Substituoituja N-etyyliglysiinijohdannaisia, menetelmä niiden valmistamiseksi ja niiden käyttö PNA- ja PNA-/DNA-hybridien valmistamiseksi |
Country Status (8)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US6075143A (fi) |
| EP (1) | EP0672661A1 (fi) |
| JP (1) | JPH07258222A (fi) |
| AU (1) | AU686729B2 (fi) |
| CA (1) | CA2144474C (fi) |
| DE (1) | DE4408534A1 (fi) |
| FI (1) | FI120199B (fi) |
| NO (1) | NO307705B1 (fi) |
Families Citing this family (11)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6133444A (en) * | 1993-12-22 | 2000-10-17 | Perseptive Biosystems, Inc. | Synthons for the synthesis and deprotection of peptide nucleic acids under mild conditions |
| US6919441B2 (en) * | 1994-03-14 | 2005-07-19 | Aventis Pharma Deutschland Gmbh | Polyamide-oligonucleotide derivatives, their preparation and use |
| JP2001518054A (ja) | 1995-06-07 | 2001-10-09 | パーセプティブ バイオシステムズ，インコーポレーテッド | Ｐｎａ−ｄｎａキメラと、このキメラ合成用のｐｎａシントン |
| DE19532553A1 (de) * | 1995-09-04 | 1997-03-06 | Hoechst Ag | Verfahren zur Herstellung substituierter N-Ethyl-Glycinderivate |
| US6191165B1 (en) | 1996-05-31 | 2001-02-20 | Allelix Neuroscience Inc. | Pharmaceutical for treatment of neurological and neuropsychiatric disorders |
| DE19640974A1 (de) * | 1996-10-04 | 1998-04-16 | Bayer Ag | Bausteine für DNA/PNA-Cooligomere |
| IL132518A (en) * | 1997-05-14 | 2007-05-15 | Morphochem Ag | Isonitrile derivatives and processes for the preparation thereof |
| CN104271772A (zh) * | 2012-03-29 | 2015-01-07 | 科罗拉多州立大学董事会,公司实体 | 点击核酸 |
| CA2938875A1 (en) | 2014-02-06 | 2015-08-13 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | Thiol-x click foldamers for polymer affinity and catalysis libraries |
| CN105541728B (zh) * | 2015-07-27 | 2018-07-24 | 宁夏联森生物科技有限公司 | 一种n-4苯甲酰基胞嘧啶的制备方法 |
| US10508116B2 (en) | 2016-10-07 | 2019-12-17 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body | Click nucleic acid polymers and methods of use |
Family Cites Families (17)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DE2627988A1 (de) * | 1976-06-23 | 1978-01-05 | Max Planck Gesellschaft | Sekretinbestimmung |
| US4213968A (en) * | 1978-06-05 | 1980-07-22 | Coy David Howard | Enkephalin derivatives |
| US4213893A (en) * | 1978-10-12 | 1980-07-22 | Miles Laboratories, Inc. | Flavin adenine dinucleotide-labeled conjugates for use in specific binding assays |
| JPS55135595A (en) * | 1979-04-03 | 1980-10-22 | Toyo Soda Mfg Co Ltd | Preparation of dipeptide |
| US5470974A (en) * | 1985-03-15 | 1995-11-28 | Neu-Gene Development Group | Uncharged polynucleotide-binding polymers |
| CS263951B1 (en) * | 1985-04-25 | 1989-05-12 | Antonin Holy | 9-(phosponylmethoxyalkyl)adenines and method of their preparation |
| US5227497A (en) * | 1988-04-04 | 1993-07-13 | Kanegafuchi Kagaku Kogyo Kabushiki Kaisha | Process for preparing N2 -(1-carboxy-3-phenylpropyl)-L-lysine derivative |
| EP0350145A3 (en) * | 1988-04-28 | 1990-07-04 | Yamanouchi Pharmaceutical Co. Ltd. | Pyridylthiazolidine carboxamide derivatives and their intermediates and production of both |
| DE4016596A1 (de) * | 1990-05-23 | 1991-11-28 | Hoechst Ag | Ein neues kupplungsreagenz fuer die peptidsynthese |
| US5614498A (en) * | 1990-06-07 | 1997-03-25 | Banyu Pharmaceutical Co., Ltd. | Endothelin antagonistic substance |
| US5539082A (en) * | 1993-04-26 | 1996-07-23 | Nielsen; Peter E. | Peptide nucleic acids |
| DK51092D0 (da) * | 1991-05-24 | 1992-04-15 | Ole Buchardt | Oligonucleotid-analoge betegnet pna, monomere synthoner og fremgangsmaade til fremstilling deraf samt anvendelser deraf |
| MX9207334A (es) * | 1991-12-18 | 1993-08-01 | Glaxo Inc | Acidos nucleicos peptidicos y formulacion farma- ceutica que los contiene |
| AU653896B2 (en) * | 1992-04-30 | 1994-10-13 | Taiho Pharmaceutical Co., Ltd. | Oxazolidine derivative and pharmaceutically acceptable salt thereof |
| DE4331012A1 (de) * | 1993-09-13 | 1995-03-16 | Bayer Ag | Nukleinsäuren-bindende Oligomere mit N-Verzweigung für Therapie und Diagnostik |
| WO1995017403A1 (en) * | 1993-12-22 | 1995-06-29 | Perseptive Biosystems, Inc. | Guanine synthons for peptide nucleic acid synthesis and method for production |
| MY119161A (en) * | 1994-04-18 | 2005-04-30 | Novartis Ag | Delta-amino-gamma-hydroxy-omega-aryl-alkanoic acid amides with enzyme especially renin inhibiting activities |
-
1994
- 1994-03-14 DE DE4408534A patent/DE4408534A1/de not_active Withdrawn
-
1995
- 1995-03-08 EP EP95103333A patent/EP0672661A1/de not_active Ceased
- 1995-03-10 AU AU14799/95A patent/AU686729B2/en not_active Ceased
- 1995-03-10 FI FI951128A patent/FI120199B/fi not_active IP Right Cessation
- 1995-03-13 US US08/402,840 patent/US6075143A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-03-13 NO NO950959A patent/NO307705B1/no not_active IP Right Cessation
- 1995-03-13 CA CA2144474A patent/CA2144474C/en not_active Expired - Fee Related
- 1995-03-14 JP JP7054643A patent/JPH07258222A/ja active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AU686729B2 (en) | 1998-02-12 |
| DE4408534A1 (de) | 1995-09-28 |
| NO950959D0 (no) | 1995-03-13 |
| JPH07258222A (ja) | 1995-10-09 |
| CA2144474C (en) | 2010-11-30 |
| AU1479995A (en) | 1995-09-21 |
| US6075143A (en) | 2000-06-13 |
| NO307705B1 (no) | 2000-05-15 |
| EP0672661A1 (de) | 1995-09-20 |
| FI951128A (fi) | 1995-09-15 |
| NO950959L (no) | 1995-09-15 |
| FI951128A0 (fi) | 1995-03-10 |
| CA2144474A1 (en) | 1995-09-15 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CA2144477C (en) | Pna synthesis using an amino protecting group which is labile to weak acids | |
| AU708034B2 (en) | Process for preparing substituted N-ethylglycine derivatives | |
| FI120199B (fi) | Substituoituja N-etyyliglysiinijohdannaisia, menetelmä niiden valmistamiseksi ja niiden käyttö PNA- ja PNA-/DNA-hybridien valmistamiseksi | |
| US6713603B2 (en) | Chiral peptide nucleic acids | |
| US5977302A (en) | Liquid phase process for the preparation of GnRH peptides | |
| CA2942143A1 (en) | Pharmaceutically relevant aromatic-cationic peptides and methods of generating the same | |
| US11976094B2 (en) | Method for preparing peptides | |
| CA2144473C (en) | Pna synthesis using a base-labile amino protecting group | |
| Kuwahara et al. | Synthesis of δ-amino acids with an ether linkage in the main chain and nucleobases on the side chain as monomer units for oxy-peptide nucleic acids | |
| US6465650B1 (en) | Substituted N-ethylglycine derivatives for preparing PNA and PNA/DNA hybrids | |
| Komori et al. | Structure activity relationships of synthetic antibiotic analogues of chryscandin | |
| CA2412787A1 (en) | Process for the preparation of 5-phenylpentanoyl-ala-argl-{2-[3-amino-2-oxopyrrolidin-1-yl]propionyl}-ala-arg-ala-4-aminophenylacetamide | |
| KR100543980B1 (ko) | 2-(4-니트로페닐)설포닐에톡시카르보닐 치환된 아미노산유도체와 이의 제조방법 | |
| KR20230109301A (ko) | 신규한 pna 단량체 및 이를 포함하는 pna 올리고머 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FG | Patent granted |
Ref document number: 120199 Country of ref document: FI |
|
| MM | Patent lapsed |