FI119190B - Modifierad beta-laktamas och förfarande för dess framställning - Google Patents

Modifierad beta-laktamas och förfarande för dess framställning Download PDF

Info

Publication number
FI119190B
FI119190B FI20065431A FI20065431A FI119190B FI 119190 B FI119190 B FI 119190B FI 20065431 A FI20065431 A FI 20065431A FI 20065431 A FI20065431 A FI 20065431A FI 119190 B FI119190 B FI 119190B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
beta
lactamase
metallo
protein
sequence
Prior art date
Application number
FI20065431A
Other languages
English (en)
Finnish (fi)
Other versions
FI20065431A0 (sv
FI20065431A (sv
Inventor
Pertti Koski
Nina Wickstrand
Susanna Kaeaeriaeinen
Original Assignee
Ipsat Therapies Oy
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ipsat Therapies Oy filed Critical Ipsat Therapies Oy
Publication of FI20065431A0 publication Critical patent/FI20065431A0/sv
Priority to FI20065431A priority Critical patent/FI119190B/sv
Priority to CNA200780023477XA priority patent/CN101484577A/zh
Priority to ES07765926.6T priority patent/ES2452321T3/es
Priority to US12/304,874 priority patent/US7989192B2/en
Priority to NZ573696A priority patent/NZ573696A/en
Priority to PCT/FI2007/050372 priority patent/WO2007147945A1/en
Priority to AU2007262916A priority patent/AU2007262916B2/en
Priority to EP07765926.6A priority patent/EP2038411B1/en
Priority to CA2659691A priority patent/CA2659691C/en
Priority to RU2009101795/10A priority patent/RU2009101795A/ru
Priority to KR1020097001283A priority patent/KR101609243B1/ko
Priority to JP2009515904A priority patent/JP5306191B2/ja
Priority to BRPI0713726-5A priority patent/BRPI0713726B1/pt
Publication of FI20065431A publication Critical patent/FI20065431A/sv
Application granted granted Critical
Publication of FI119190B publication Critical patent/FI119190B/sv
Priority to ZA200810460A priority patent/ZA200810460B/xx
Priority to NO20090297A priority patent/NO342006B1/no

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/78—Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5)
    • C12N9/86—Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5) acting on amide bonds in cyclic amides, e.g. penicillinase (3.5.2)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/46—Hydrolases (3)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P39/00—General protective or antinoxious agents
    • A61P39/02—Antidotes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/32—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Bacillus (G)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Claims (19)

1. Modifierat metallo-beta-iaktamasprotein, kännetecknat av att det har den allmänna formeln: 5 NH2-K-T-E-ABL-COOH där K är lysin,
2. Isolerad nukleotidmolekyl, kännetecknad av att den innehäller en nukleotidsekvens, som förmär uttrycka ett metallo-beta-laktamas-protein enligt patentkrav 1.
3. Nukleotidmolekyl enligt patentkrav 2, kännetecknad av att 20 den innehäller de pävarandra följande nukleotidema 94 - 756 av sekvens nr 2.
| * 4. Ekpressionsvektor, kännetecknad av att den innehäller en : nukleotidmolekyl enligt patentkrav 2.
5. Värdcell, kännetecknad av att den förmar uttrycka ett me- tallo-beta-laktamasprotein, som kodas av vektom enligt patentkrav 4. : ·*: 25
6. Värdcell enligt patentkrav 5, kännetecknad av att den är *** . * * ’. Bacillus spp., speciellt B. licheniformis eller B. subtilis.
7. Modifierat metallo-beta-laktamasprotein, kännetecknat av att det har den allmänna formeln: • · * • · ··· S·;·8 30 NH2-E-ABL-COOH Ä ·· E är glutaminsyra, och ABL är ett i aminoändan stympat metallo-beta*laktamasenzym, som φ · *··* 35 stympats sä, att aminoändan av E - ABL motsvarar aminosyroma 12 -15 i se- 119190 kvens nr 1, med tillägget att aminosyran i position +13 i sekvens nr 1 kan vara antingen T (treonin) eller A (alanin).
8. Metallo-beta-laktamasprotein enligt patentkrav 7, kanne-t e c k n a t av att det tillhör undergruppen B1 av metallo-beta-laktamaser.
9. Metallo-beta-laktamasprotein enligt patentkrav 8, känne- t e c k n a t av att den stympade beta-laktamasen härstammar frän Bacillus spp, och speciellt frän B. cereus.
10. Metallo-beta-laktamasprotein enligt patentkrav 9, känne-tecknat av att E - ABL har erhallits genom att avlägsna de första elva ami- 10 nosyroma fran aminoändan av moget metallo-beta-laktamas.
10 Tärtreonin, E är glutaminsyra, och ΔΒΙ_ är ett i aminoändan stympat metallo-beta-laktamasenzym, som stympats sä, att aminoändan av E - ABL motsvarar aminosyroma 12 -15 i se-kvens nr 1, med tillägget att aminosyran i position +13 i sekvens nr 1 kan vara 15 antingen T (treonin) eller A (alanin).
11. Metallo-beta-laktamasprotein enligt patentkrav 8, kanne-t e c k n a t av att sekvensen E - ABL är minst 80 % identisk eller minst 90 % identisk med de pävarandra följande aminosyroma 6 - 221 i sekvens nr 3.
12. Metallo-beta-laktamasprotein enligt patentkrav 8, känne-15 tecknatavattE -ABL är en stympad form av en metallo-beta-laktamas med sekvensen nr 1 eller en variant eller ett fragment därav med beta-lakta-masaktivitet.
13. Förfarande för framställning av modifierat metallo-beta-laktamasprotein, kännetecknat av att man odlar en värdcell enligt patentkrav 20. under betingelser som tilläter expression av en beta-laktamas som har den allmänna formeln: • * ·· · *y NH2 - K - T - E - ABL - COOH ·♦· »Ml * · i 25 där K är lysin, T är treonin, E är glutaminsyra, och ABL är ett I aminoändan stympat metallo-beta-laktamasenzym, som · .***. 30 stympats sä, att aminoändan av E - ABL motsvarar aminosyroma 12 -15 i se- *. kvens nr 1, med tillägget att aminosyran i position +13 i sekvens nr 1 kan vara »»« *·“* antingen T (treonin) eller A (alanin), och utför en modifikation efter translationen, vilket resulterar i en • ··· modifierad metallo-beta-laktamas med den allmänna formeln: • Ml ; —; 35 NH2 - E - ABL - COOH 119190 där E och ABL är ovan definierade, och valbart isolerar och renar proteinet som modifierats efter translatio- nen. 5
14. Förfarande enligt patentkrav 13, kännetecknat avatt me- tallo-beta-laktamasproteinet uttrycks i en form som innehäller en signalse-kvens, varvid proteinet utsöndras ur värdcellen.
15. Förfarande enligt patentkrav 13 eller 14, kännetecknat av att proteinet produceras i Bacillus spp. och speciellt i B. licheniformis- eller βίο subtilis.
16. Farmaceutisk komposition, kännetecknad av att den innehäller ett modifierat metallo-beta-laktamasprotein enligt patentkrav 7.
17. Modifierat metallo-beta-laktamasprotein enligt patentkrav 7 att användas som läkemedel.
18. Användning av modifierat metallo-beta-laktamasprotein enligt patentkrav 7 vid framställning av ett läkemedel för att eliminera biverkningar som förorsakas av beta-laktamantibiotika i taimen.
19. Användning enligt patentkrav 18, kännetecknad av att beta-laktamantibiotikan väljs ur gruppen som bestär av kefalosporiner, karba-20 penemer och penicilliner. 9 9 9 tt · • · · • · • · **« * ··♦· • · • · · * · ··· · • · « • · · 999 999 9 9 9 9 99 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 · • * • * • 9 • · · » · · • · * 999 999 • · • · ··· * ···· * · • · • 9 999
FI20065431A 2006-06-21 2006-06-21 Modifierad beta-laktamas och förfarande för dess framställning FI119190B (sv)

Priority Applications (15)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI20065431A FI119190B (sv) 2006-06-21 2006-06-21 Modifierad beta-laktamas och förfarande för dess framställning
CA2659691A CA2659691C (en) 2006-06-21 2007-06-19 Modified beta-lactamase and method for its preparation
KR1020097001283A KR101609243B1 (ko) 2006-06-21 2007-06-19 변형 베타-락타마제 및 이의 제조 방법
US12/304,874 US7989192B2 (en) 2006-06-21 2007-06-19 Modified beta-lactamase and method for its preparation
NZ573696A NZ573696A (en) 2006-06-21 2007-06-19 Modified beta-lactamase and method for its preparation
PCT/FI2007/050372 WO2007147945A1 (en) 2006-06-21 2007-06-19 Modified beta-lactamase and method for its preparation
AU2007262916A AU2007262916B2 (en) 2006-06-21 2007-06-19 Modified beta-lactamase and method for its preparation
EP07765926.6A EP2038411B1 (en) 2006-06-21 2007-06-19 Modified beta-lactamase and method for its preparation
CNA200780023477XA CN101484577A (zh) 2006-06-21 2007-06-19 经修饰的β-内酰胺酶及其制备方法
RU2009101795/10A RU2009101795A (ru) 2006-06-21 2007-06-19 Модифицированная бета-лактамаза и способ ее получения
ES07765926.6T ES2452321T3 (es) 2006-06-21 2007-06-19 Beta-lactamasa modificada y método para su preparación
JP2009515904A JP5306191B2 (ja) 2006-06-21 2007-06-19 β‐ラクタマーゼ修飾体およびその調製方法
BRPI0713726-5A BRPI0713726B1 (pt) 2006-06-21 2007-06-19 Proteínas metalo-beta-lactamase modificadas, seu uso, métodos para preparação das referidas proteínas e para a produção de uma preparação homogênea de enzima metalo-beta- lactamase, molécula de nucleotídeo, vetor de expressão e microrganismo transgênico
ZA200810460A ZA200810460B (en) 2006-06-21 2008-12-10 Modified beta-lactamase and method for its preparation
NO20090297A NO342006B1 (no) 2006-06-21 2009-01-19 Modifisert beta-laktamase og fremgangsmåte for fremstilling derav

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI20065431 2006-06-21
FI20065431A FI119190B (sv) 2006-06-21 2006-06-21 Modifierad beta-laktamas och förfarande för dess framställning

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI20065431A0 FI20065431A0 (sv) 2006-06-21
FI20065431A FI20065431A (sv) 2007-12-22
FI119190B true FI119190B (sv) 2008-08-29

Family

ID=36651526

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI20065431A FI119190B (sv) 2006-06-21 2006-06-21 Modifierad beta-laktamas och förfarande för dess framställning

Country Status (15)

Country Link
US (1) US7989192B2 (sv)
EP (1) EP2038411B1 (sv)
JP (1) JP5306191B2 (sv)
KR (1) KR101609243B1 (sv)
CN (1) CN101484577A (sv)
AU (1) AU2007262916B2 (sv)
BR (1) BRPI0713726B1 (sv)
CA (1) CA2659691C (sv)
ES (1) ES2452321T3 (sv)
FI (1) FI119190B (sv)
NO (1) NO342006B1 (sv)
NZ (1) NZ573696A (sv)
RU (1) RU2009101795A (sv)
WO (1) WO2007147945A1 (sv)
ZA (1) ZA200810460B (sv)

Families Citing this family (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FI20105572A0 (sv) 2010-05-24 2010-05-24 Prevab R Lcc Modifierad beta-laktamas och förfaranden och användningar relaterade därtill
SG186302A1 (en) * 2010-06-16 2013-02-28 Abbott Lab Comparison of protein samples
WO2012128810A1 (en) 2011-03-23 2012-09-27 Abbott Laboratories Methods and systems for the analysis of protein samples
CA2833454C (en) * 2011-04-21 2020-03-10 Biomerieux Inc. Method of detecting at least one mechanism of resistance to cephalosporins by mass spectrometry
WO2015161243A2 (en) 2014-04-17 2015-10-22 Synthetic Biologics, Inc. Beta-lactamases with improved properties for therapy
CN106574273B (zh) * 2014-08-28 2021-07-02 合成生物制品有限公司 β-内酰胺酶的基于大肠杆菌的生产
CN107148473B (zh) 2014-10-08 2021-08-06 合成生物制品有限公司 β-内酰胺酶制剂及其用途
FR3027307B1 (fr) 2014-10-16 2016-11-04 Azurrx Sas Molecule proteique hybride apte a inhiber au moins un antibiotique et composition pharmaceutique la comportant
EP3236993B1 (en) 2014-12-23 2023-09-13 Theriva Biologics, Inc. Methods and compositions for inhibiting or preventing adverse effects of oral antibiotics
JP6810697B2 (ja) * 2015-02-23 2021-01-13 シンセティック・バイオロジクス・インコーポレイテッド 腸内マイクロバイオームの保護のために抗生物質と共に使用するカルバペネマーゼ
AU2016229976B2 (en) 2015-03-06 2021-11-11 Theriva Biologics, Inc. Safe and effective beta-lactamase dosing for microbiome protection
US10988749B2 (en) 2016-02-23 2021-04-27 Da Volterra Beta-lactamase variants
EP3420078B1 (en) 2016-02-23 2022-05-25 Da Volterra Beta-lactamase variants
US20210290741A1 (en) 2018-08-05 2021-09-23 Da Volterra Compositions for the treatment of graft versus host disease
CA3106429A1 (en) 2018-08-05 2020-02-13 Da Volterra Method for improving anticancer agent efficacy
US20220154156A1 (en) * 2019-03-11 2022-05-19 Regents Of The University Of Minnesota Proteins and methods for disrupting bacterial communication
CN115104030A (zh) * 2019-12-30 2022-09-23 希真医疗财团 碳青霉烯类抗生素耐药病原菌株的直接检测方法
EP4148136A1 (en) 2021-09-08 2023-03-15 Da Volterra An engineered yeast cell for the delivery of antibiotic-inactivating enzymes

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FI920206A0 (fi) 1992-01-17 1992-01-17 Pekka Untamo Heino Medicinsk anvaendning, medicinskt foerfarande och preparat.
FI112666B (sv) 2001-11-06 2003-12-31 Ipsat Therapies Oy Icke-sporbildande Bacillus subtilis, dess framställning och användning
FR2843302B1 (fr) 2002-08-09 2004-10-22 Centre Nat Rech Scient Forme galenique pour la delivrance colique de principes actifs

Also Published As

Publication number Publication date
CA2659691A1 (en) 2007-12-27
NO20090297L (no) 2009-01-19
NZ573696A (en) 2011-09-30
CN101484577A (zh) 2009-07-15
EP2038411B1 (en) 2014-02-26
FI20065431A0 (sv) 2006-06-21
FI20065431A (sv) 2007-12-22
WO2007147945A8 (en) 2009-07-30
NO342006B1 (no) 2018-03-12
ZA200810460B (en) 2009-12-30
ES2452321T3 (es) 2014-03-31
JP5306191B2 (ja) 2013-10-02
EP2038411A4 (en) 2010-04-07
BRPI0713726A2 (pt) 2012-10-30
EP2038411A1 (en) 2009-03-25
US7989192B2 (en) 2011-08-02
WO2007147945A1 (en) 2007-12-27
RU2009101795A (ru) 2010-07-27
AU2007262916A1 (en) 2007-12-27
KR101609243B1 (ko) 2016-04-05
CA2659691C (en) 2015-05-19
KR20090046787A (ko) 2009-05-11
US20090181004A1 (en) 2009-07-16
JP2009540814A (ja) 2009-11-26
AU2007262916B2 (en) 2013-12-05
BRPI0713726B1 (pt) 2023-01-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
FI119190B (sv) Modifierad beta-laktamas och förfarande för dess framställning
Poirel et al. Emergence of oxacillinase-mediated resistance to imipenem in Klebsiella pneumoniae
Poirel et al. OXA-28, an extended-spectrum variant of OXA-10 β-lactamase from Pseudomonas aeruginosa and its plasmid-and integron-located gene
Danel et al. OXA-17, a further extended-spectrum variant of OXA-10 β-lactamase, isolated from Pseudomonas aeruginosa
JP5827681B2 (ja) 改変型β−ラクタマーゼ並びにそれに関する方法及び使用
Osano et al. Molecular characterization of an enterobacterial metallo beta-lactamase found in a clinical isolate of Serratia marcescens that shows imipenem resistance
Bou et al. OXA-24, a novel class D β-lactamase with carbapenemase activity in an Acinetobacter baumannii clinical strain
Mugnier et al. A TEM-derived extended-spectrum beta-lactamase in Pseudomonas aeruginosa
Danel et al. OXA-14, another extended-spectrum variant of OXA-10 (PSE-2) beta-lactamase from Pseudomonas aeruginosa
Barnaud et al. Extension of resistance to cefepime and cefpirome associated to a six amino acid deletion in the H-10 helix of the cephalosporinase of an Enterobacter cloacae clinical isolate
Péduzzi et al. Characterization and amino acid sequence analysis of a new oxyimino cephalosporin-hydrolyzing class A β-lactamase from Serratia fonticola CUV
Poirel et al. Identification of the novel narrow-spectrum β-lactamase SCO-1 in Acinetobacter spp. from Argentina
Dubois et al. Decreased susceptibility to cefepime in a clinical strain of Escherichia coli related to plasmid-and integron-encoded OXA-30 β-lactamase
Dabos et al. LMB-1 producing Citrobacter freundii from Argentina, a novel player in the field of MBLs
Xiong et al. A Klebsiella pneumoniae producing three kinds of class A β-lactamases encoded by one single plasmid isolated from a patient in Huashan Hospital, Shanghai, China
Prinarakis et al. Characterization of a novel SHV α-lactamase variant that resembles the SHV-5 enzyme
Chen et al. Detection of plasmid-mediated IMP-1 metallo-β-lactamase and quinolone resistance determinants in an ertapenem-resistant Enterobacter cloacae isolate
Mammeri et al. Extended-spectrum cephalosporinases in Enterobacteriaceae
Arlet et al. Novel, plasmid-encoded, TEM-derived extended-spectrum beta-lactamase in Klebsiella pneumoniae conferring higher resistance to aztreonam than to extended-spectrum cephalosporins
CN106574273B (zh) β-内酰胺酶的基于大肠杆菌的生产
Cheng Structural and functional studies of antibiotic resistance enzymes
Claverie et al. Characterization of the Naturally Occurring
Courvalin et al. Genetic and Biochemical Characterization
Azibi et al. Characterization and Nucleotide Sequence
Cephalosporins Clinical Isolate Confers Resistance to

Legal Events

Date Code Title Description
FG Patent granted

Ref document number: 119190

Country of ref document: FI

MM Patent lapsed