ES2724730T3 - Reactivos de diagnóstico - Google Patents

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Hans Vordermeier
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Abstract

Un reactivo de diagnóstico que comprende: (i) un polipéptido que consiste en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:8; o (ii) un polipéptido que consiste entre 15-65 aminoácidos y que comprende la SEQ ID NO:8; estando el reactivo caracterizado por que desencadena un resultado de ensayo de diagnóstico negativo cuando se realiza un ensayo de infección por tuberculosis en una muestra de un animal que ha sido vacunado contra una infección por un agente de la tuberculosis.

Description

DESCRIPCIÓN
Reactivos de diagnóstico
Campo de la invención
La presente invención se refiere a reactivos para su uso en la detección de infecciones por tuberculosis, particularmente tuberculosis en mamíferos tales como seres humanos y ganado, más particularmente infección por Mycobacteria, tales como M. Tuberculosis y M. bovis. Los reactivos son útiles para diferenciar entre animales con una infección por tuberculosis y aquellos que han sido vacunados contra una infección, ya que únicamente se obtiene un resultado positivo a partir de animales infectados (o animales expuestos a un agente infeccioso).
Antecedentes
M. tuberculosis y M. bovis son patógenos importantes del hombre y animales. Se cree que M. tuberculosis infecta hasta a un tercio de la población humana mundial, permaneciendo sin detectar durante la fase latente de la infección y reactivándose causando 10 millones de casos de tuberculosis y otras enfermedades al año, que dan como resultado 2 millones de muertes (Corbett y col., (2003) Arch. Intern. Med. vol. 163 págs. 1009-1021). M bovis, que tiene más de un 99,9% de identidad de secuencia con M. tuberculosis, es el agente causante predominante de la tuberculosis bovina (TBB) y causa también la enfermedad en seres humanos. Se han notificado casos de tuberculosis bovina en ganado causada por M. tuberculosis, particularmente en países en desarrollo con altos índices de incidencia de TB humana (véase, por ejemplo, Berg y col. (2009) PLoS ONE vol. 4 e5068). La TBB representa una carga económica significativa para la industria agrícola de diversos países incluyendo Reino Unido (Krebs (1997) "Bovine Tuberculosis in Cattle & Badgers" HMSO, Londres, Reino Unido).
La principal prueba de diagnóstico utilizada en el control y vigilancia de la TB bovina es la prueba cutánea de tuberculina, una prueba que ha permanecido en la vanguardia del diagnóstico de la TB tanto en el hombre como en el ganado durante más de 100 años. El desarrollo de la prueba surgió después de la preparación de la primera "tuberculina" por Robert Koch en 1890. Mientras que la tuberculina de Koch no pudo vivir hasta sus pretensiones iniciales de tener propiedades curativas, se reconoció rápidamente su potencial diagnóstico. Los formatos más comunes de la prueba usados en el ganado son la prueba del pliegue caudal (CFT), la prueba de tuberculina cervical intradérmica simple (SIT) y la prueba de tuberculina cervical comparativa intradérmica simple (SICCT) (Monaghan y col. (1994) Vet. Microbiol. vol. 40 págs. 111-24). Ambos formados de prueba usan una tuberculina de derivado proteico purificado (PPD) preparada de un cultivo de M. bovis (PPD-B) como el antígeno de diagnóstico principal. Adicionalmente, la prueba SICCT incluye el uso de un PPD obtenido a partir de M. avium (PPD-A) para proporcionar una medida de sensibilización ambiental. Es la más específica de las dos pruebas (Plum (1931) Cornell Vet. vol. 21 págs. 68-76; Stenius (1938) Veterinary Record vol. 50 págs. 633-7) y, por lo tanto, el formato de prueba adoptado en Reino Unido.
Además de los ensayos cutáneos, están también bajo consideración ensayos de diagnóstico basados en sangre que miden la producción de linfocinas inducidas por antígeno tales como el interferón (IFN-y). La citocina IFN-y parece ser crítica en el desarrollo de inmunidad a M. tuberculosis. Por ejemplo, tanto ratones con un gen de IFN-y interrumpido como seres humanos con un receptor de IFN-y mutado son altamente susceptibles a infecciones micobacterianas. Sin embargo, están asociadas limitaciones de especificidad al uso de PPD en dichos ensayos. Estas surgen debido a la mezcla en bruto de las proteínas de M. bovis que contiene el PPD, muchas de las cuales son reactivas cruzadas con la cepa de vacuna de BCG y especies micobacterianas ambientales, tales como M. avium y M. intracellulare.
La expresión "ensayo de infección por tuberculosis" usada en la presente memoria descriptiva puede referirse a cualquiera de estas pruebas de diagnóstico a las que se ha hecho referencia anteriormente.
La tuberculosis bovina es un problema importante y constante en Reino Unido (http://www.defra.gov.uk/foodfarm/animals/diseases/tb, consultado el 14 de julio de 2011). La vacunación de ganado bovino ha sido identificada como una de las estrategias de control a largo plazo de Reino Unido más prometedoras (Krebs (1997) "Bovine Tuberculosis in Cattle & Badgers" HMSO) y el desarrollo de una vacuna eficaz sigue siendo una prioridad de investigación. Actualmente, las vacunas prometedoras contra la tuberculosis bovina se basan en combinaciones de sensibilización-recuerdo heterólogas que incluyen la cepa de la vacuna de M. bovis atenuada viva Bacilo Calmette-Guerin (BCG) como uno de sus componentes (Hogarth y col. (2006) J. Pharm. Pharmacol. vol. 58 págs. 749-57). Sin embargo, como en los seres humanos, la vacunación de ganado con BCG compromete la especificidad de la prueba cutánea de tuberculina, ya que el PPD contiene antígenos reactivos cruzados compartidos tanto por las cepas patógenas como de vacuna (Berggren (1981) Br. Vet. J. vol. 137 págs. 88-94; Buddle y col. (1999) Clin. Diagn. Lab. Immunol. vol. 6 págs. 1-5; Waddington & Ellwood (1972) Br. Vet. J. vol. 128 págs. 541-52). Por lo tanto, el desarrollo de pruebas de diagnóstico que puedan diferenciar los animales vacunados de los infectados, denominados pruebas DIVA, es un requisito previo esencial para permitir la inclusión de la vacunación basada en BCG como parte de las estrategias de control de la tuberculosis bovina.
Estudios anteriores han demostrado que los reactivos de diagnóstico que distinguen entre ganado vacunado e infectado se pueden desarrollar usando antígenos definidos y específicos que están presentes en M. bovis virulento pero ausente del BCG. El análisis genético del BCG ha revelado que varias regiones genómicas grandes se han eliminado durante la atenuación y posterior propagación prolongada en el cultivo. Estas regiones se han caracterizado y los antígenos de una de estas regiones, RD1, se han estudiado extensamente en varias especies, incluyendo seres humanos y ganado. Por ejemplo, se ha demostrado que pueden usarse cócteles de proteínas o péptidos compuestos por dos antígenos de la región RD1, ESAT-6 y CFP-10, para distinguir entre ganado infectado por M. bovis y ganado vacunado con BCG. En los seres humanos, se usan los péptidos ESAT-6 y CFP-10 sintéticos en la prueba QuantiFERON®-TB Gold para el diagnóstico de la tuberculosis.
La aplicación práctica de dichos reactivos DIVA se ha realizado hasta ahora en gran medida a través del uso en ensayos de liberación de interferón y (IFN-y) (IGRA) basados en sangre. Por ejemplo, el documento WO2009/060184 y Sidders et al. (2008; Am. J. Microbiol. vol. 76 pág. 3932-3939) desveló varios polipéptidos que incluían epítopos de Rv3615c que se descubrió que eran útiles para detectar una infección por M. bovis o M. tuberculosis, usando tal ensayo. Este polipéptido también se ha confirmado como útil para detectar una infección por M. tuberculosis en seres humanos (Millington y col. (2011) Proc. Natl. Acad. Sci. USA vol. 108 págs. 5730-5735). Se hace referencia a Rv3615c en el presente documento usando la anotación del genoma de M. tuberculosis (http://genolist.pasteur.fr/TubercuList/, consultado el 14 de julio de 2011). En el genoma de M. bovis, se anota como Mb3645c (http://genolist.pasteur.fr/BoviList/, consultado el 14 de julio de 2011).
Dado el alto nivel de familiaridad y la extensa aplicación de la prueba cutánea de tuberculina por veterinarios y médicos, un formato de prueba cutánea de DIVA proporcionaría una valiosa plataforma de prueba adicional. Éste podría ser especialmente el caso en el que la logística de acceso a los recursos de laboratorio es problemática. Es también notable que en los últimos años ha habido también un renovado interés en una prueba de DIVA basada en una prueba cutánea para la tuberculosis humana, demostrando varios informes el potencial de prueba cutánea de ESAT-6 (Aggerbeck & Madsen (2006) Tuberculosis (Edinb.) vol. 86 págs. 363-73; Arend y col. (2000) J. Infect. Dis. vol. 181 págs. 1850-4; Wu et al. (2008) Clin. Exp. Immunol. vol. 152 págs. 81-7). Whelan et al. (2010; J. Clin. Microbiol. vol. 48 p3176-3181) analizan el uso de ESAT-6, CFP-10, m P b 70, MPB83 y Rv3615c en combinación como una prueba cutánea. El documento WO98/53075 divulga secuencias de aminoácidos contenidas en las proteínas de M. tuberculosis.
Por consiguiente, la presente invención aborda el problema de proporcionar reactivos de diagnóstico discriminatorios para la detección de infecciones por micobacterias, especialmente en un formato de prueba cutánea DIVA.
Resumen de la invención
De acuerdo con un primer aspecto de la invención, se proporciona un reactivo de diagnóstico que comprende:
(i) un polipéptido que consiste en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:8; o
(ii) un polipéptido que consiste entre 15-65 aminoácidos y que comprende la SEQ ID NO:8;
estando el reactivo caracterizado por que desencadena un resultado de ensayo de diagnóstico negativo cuando se realiza un ensayo de infección por tuberculosis en una muestra de un animal que ha sido vacunado contra una infección por un agente de la tuberculosis.
Este reactivo desencadena un resultado positivo al usarse en un ensayo para determinar si un animal tiene una infección por tuberculosis o ha estado expuesto a un agente de la tuberculosis. Ventajosamente, el reactivo de diagnóstico puede permitir a un usuario diferenciar entre un animal que tiene una infección por tuberculosis y uno que ha sido vacunado contra una infección de este tipo, como se desvela en el presente documento por primera vez y como se explicará en más detalle a continuación. También se obtiene un resultado negativo cuando el animal no está vacunado o no está infectado (o no ha estado expuesto a un agente de la tuberculosis). El animal puede ser un mamífero, por ejemplo, una vaca, tejón o un ser humano.
El reactivo de diagnóstico puede comprender además la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:7 o una secuencia que tenga al menos un 85% de identidad de secuencia con la misma.
Ninguno de los polipéptidos Rv2346c, Rv1793 o Rv3020c se ha identificado previamente como útil para diferenciar entre animales infectados por tuberculosis y animales vacunados.
Opcional o adicionalmente, el reactivo de diagnóstico puede comprender, como alternativa, o además, al menos un polipéptido que comprenda cada uno al menos una de las secuencias de aminoácidos de SEQ ID NO:1, 2, 3, 4, 5, 6 o 9, o una secuencia que tenga al menos un 85% de identidad de secuencia con una de las SEQ ID NO:1, 2, 3, 4, 5, 6 o 9.
En una forma de realización, el reactivo de diagnóstico puede comprender todas las secuencias aminoacídicas SEQ ID NO: 1-9. Puede estar en forma de polipéptidos individuales, teniendo cada uno una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre las SEQ ID NO: 1-9, puede ser una o más proteínas de fusión, comprendiendo cada una dos o más de las SEQ ID NO: 1-9. Estas secuencias se incluyeron en el agrupamiento peptídico Sec#1 descrito en el presente documento y mostrado en la Tabla 3 a continuación.
La expresión "infección por tuberculosis", como se usa a lo largo de esta memoria descriptiva, indica una infección en la que el agente causante es una Mycobacterium, por ejemplo, M. tuberculosis, M. bovis, y/o M. africanum. En algunos casos, la infección puede ser el resultado de una exposición a una combinación de estas especies bacterianas. Asimismo, la expresión "agente de la tuberculosis" indica un organismo capaz de causar síntomas tuberculosos, típicamente una Mycobacterium, por ejemplo, M. tuberculosis, M. bovis, y/o M. africanum.
Una vacuna que puede administrarse a un animal para vacunarlo contra una infección por tuberculosis incluye la vacuna con bCg .
El reactivo de diagnóstico puede comprender, como alternativa o adicionalmente, un polipéptido que comprenda al menos una de las secuencias de aminoácidos de SEQ ID NOs:10-69, o una secuencia que tenga al menos un 85% de identidad de secuencia con una de las SEQ ID NOs:10-69. Las SEQ ID Nos: 50-69 se incluyeron en las agrupaciones peptídicas #11 y #14 descritas en el presente documento y mostradas en la Tabla 2 a continuación. Por ejemplo, el reactivo de diagnóstico puede comprender las SEQ ID NOs:8 y 60-69.
A modo de ejemplo no limitante, el reactivo de diagnóstico puede comprender los polipéptidos que tienen las secuencias aminoacídicas SEQ ID NO: 11, 18, 22, 30 y 45, o puede comprender los polipéptidos que tienen las secuencias aminoacídicas SEQ ID NO: 13, 15, 24, 46; en otras palabras, el reactivo de diagnóstico puede comprender cualquier combinación de polipéptidos que tienen cada uno una secuencia de aminoácidos seleccionada libremente de entre las indicadas por las SEQ ID NO: 11-49.
Las secuencias SEQ ID NO: 11-21 son péptidos que son fragmentos de ESAT-6. Las secuencias SEQ ID NO: 22-31 son péptidos que son fragmentos de c FP-10. Las secuencias SEQ ID NO: 32-43 son péptidos que son fragmentos de Rv3615c. Estas secuencias se analizan en la solicitud pendiente junto con la presente, n.° PCT/GB2011/050843. Las SEQ ID NO: 44, 45 y 46 son ESAT-6, CFP-10 y Rv3615c de longitud completa, respectivamente. La SEQ ID NO: 47 es la proteína MPB83, SEQ ID NO: 48 es un fragmento de MPB83 y la SEQ ID NO: 49 es la proteína MPB70.
En una forma de realización, el reactivo de diagnóstico puede comprender las SEQ ID NOs:8, 11-42 y 60-69.
El reactivo de diagnóstico puede comprender secuencias peptídicas individuales, o puede comprender una o más proteínas de fusión, comprendiendo cada una al menos dos secuencias aminoacídicas seleccionadas de entre las SEQ ID NO: 1-69, preferiblemente, comprendiendo al menos una de las SEQ ID NO: 7 u 8.
El reactivo de diagnóstico puede ser para su uso en un método de detección de una infección por tuberculosis en un mamífero, o para detectar la exposición de un animal a un agente de la tuberculosis. Ventajosamente, el método se capaz de confirmar tal infección o exposición, como diferenciada de la vacunación. El método puede ser una prueba cutánea tal como una prueba del pliegue caudal (CFT), una prueba intradérmica simple (SIT) o una prueba cervical comparativa intradérmica simple (SICCT). Se obtiene un resultado positivo cuando el animal está infectado con (o ha estado expuesto a) un agente de la tuberculosis, y se obtiene un resultado negativo si el animal no está ni infectado ni expuesto, incluso si el animal ha sido vacunado contra infección por un agente de la tuberculosis.
En algunas formas de realización, por ejemplo, para su uso en una prueba cutánea, el reactivo de diagnóstico puede estar en forma de una preparación inyectable estéril que puede ser una suspensión acuosa u oleaginosa, o una suspensión en un diluyente o disolvente parenteralmente aceptable no tóxico. La suspensión acuosa puede prepararse, por ejemplo, en manitol, agua, solución de Ringer o una solución de cloruro sódico isotónica. Como alternativa, puede prepararse en una solución salina tamponada con fosfato. La suspensión oleaginosa puede prepararse en un monoglicérido sintético, un diglicérido sintético, un ácido graso o un aceite farmacéuticamente aceptable natural. El ácido graso puede ser un ácido oleico o un derivado de glicérido de ácido oleico. El aceite farmacéuticamente aceptable natural puede ser un aceite de oliva, un aceite de ricino, o un aceite de oliva polioxietilado o aceite de ricino polioxietilado. La suspensión oleaginosa puede contener un diluyente o dispersante de alcohol de cadena larga, por ejemplo, Ph. Helv. De acuerdo con un aspecto adicional de la invención, se proporciona un reactivo de diagnóstico para su uso en un método para detectar una infección de tuberculosis en un mamífero o para detectar la exposición de un animal a un agente de tuberculosis, y diferencial de la vacunación del animal, comprendiendo el reactivo de diagnóstico una secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:8, en el que el método es una prueba cutánea que desencadena un resultado positivo cuando el mamífero está infectado con un agente para la tuberculosis y que desencadena un resultado negativo cuando el mamífero se ha vacunado contra una infección con un agente de la tuberculosis, o cuando el mamífero no está vacunado y/o no está infectado.
Un aspecto adicional de la invención, proporciona un método para detectar una infección por tuberculosis en un animal, o la exposición de un animal a un agente de la tuberculosis, que comprende las etapas de
(i) poner en contacto in vitro una población de células del animal con al menos un reactivo de diagnóstico como se define en el primer aspecto de la invención; y
(ii) determinar si las células de dicha población reconocen el reactivo de diagnóstico.
Tal método es un "ensayo de infección por tuberculosis", como se ha hecho referencia anteriormente y se describe en el presente documento. La población de células puede incluir linfocitos T. El reconocimiento del reactivo de diagnóstico por dichas células puede ser, por ejemplo, por medio de la unión de un receptor de linfocitos T al reactivo de diagnóstico, por ejemplo, la unión del receptor de linfocitos T al menos a un polipéptido incluido en el reactivo de diagnóstico. El método puede comprender un ensayo de inmunidad mediada por células (CMI), que puede detectar interferón gamma (IFN-y) como se describe en el presente documento.
Un aspecto adicional de la invención proporciona un reactivo de diagnóstico como se define en el primer aspecto de la invención, para su uso en un método para detectar una infección por tuberculosis en un animal, o la exposición de un animal a un agente de la tuberculosis, que comprende las etapas de
(i) poner en contacto in vivo una población de células del animal con el reactivo de diagnóstico; y
(ii) determinar si las células de dicha población reconocen el reactivo de diagnóstico.
"Usando" y el "uso" de polipéptidos y reactivos de diagnóstico en la prueba cutánea típicamente implican una infección intradérmica del uno o más polipéptidos y/o el reactivo de diagnóstico en el animal. La prueba cutánea puede ser una prueba CFT, SIT o SICCT, como se describe en la Office International des Epizooties (OIE) Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals (ISBN-10:92-9044-718-4; http://www.oie.int/eng/normes/ mmanual/a_summry.htm, consultada el 14 de julio de 2011). El manual proporciona información, definiciones y directrices sobre los criterios de pruebas positivas.
Los métodos divulgados en el presente documento pueden servir para detectar una infección por M. bovis o M. tuberculosis en un animal, por ejemplo (pero sin limitación), un mamífero, tal como una vaca, tejón o ser humano. Ventajosamente, puesto que los reactivos de diagnóstico son capaces de diferenciar entre un animal infectado y un animal vacunado, el usuario puede estar seguro de que un resultado positivo del método es un positivo verdadero que indica infección, en lugar de un falso positivo resultante de la previa vacunación del animal. Por lo tanto, los métodos es este aspecto de la invención proporcionan un método para detectar una infección por tuberculosis en un animal, o una exposición de un animal a un agente de la tuberculosis, que comprende llevar a cabo una prueba cutánea en el animal usando al menos un reactivo de diagnóstico de acuerdo con el primer aspecto de la invención, donde el uso del método en un animal que se ha vacunado contra una infección por un agente de la tuberculosis da como resultado la obtención de una prueba cutánea negativa, y el uso del método en un animal infectado con un agente de la tuberculosis da como resultado la obtención de una prueba cutánea positiva.
De acuerdo con un aspecto adicional de la invención, se proporciona un kit de diagnóstico que comprende un reactivo de diagnóstico de acuerdo con el primer aspecto de la invención. El kit de diagnóstico puede servir para su uso en uno o más métodos divulgados en el presente documento. Particularmente, cuando el kit es para su uso en un método de prueba cutánea, el reactivo de diagnóstico puede estar en forma líquida, como se ha escrito anteriormente, o puede estar en forma sólida (por ejemplo, liofilizado). Puede incluirse en el kit en forma de al menos una alícuota de 0,05-0,15 ml que contiene 1-15 pg de cada polipéptido contenido en el reactivo de diagnóstico. Por ejemplo, el kit puede comprender alícuotas de aproximadamente 0,05 ml, aproximadamente 0,06 ml, aproximadamente 0,07 ml, aproximadamente 0,08 ml, aproximadamente 0,09 ml, aproximadamente 0,1 ml, aproximadamente 0,11 ml, aproximadamente 0,12 ml, aproximadamente 0,13 ml, aproximadamente 0,14 ml o aproximadamente 0,15 ml, que contenían 1-15 pg, 3-12 pg, 5-10 pg de cada proteína, por ejemplo, aproximadamente 5 pg, aproximadamente 6 pg, aproximadamente 7 pg, aproximadamente 8 pg, aproximadamente 9 pg o aproximadamente 10 pg de cada polipéptido. Cada alícuota puede contenerse en un dispositivo de inyección desechable. El kit puede comprender adicionalmente al menos una muestra de PPD. El reactivo de diagnóstico es capaz de detectar una infección por tuberculosis en un animal, o una exposición de un animal a un agente de la tuberculosis, por ejemplo, puede ser capaz de detectar una infección por o una exposición a M. bovis o M. tuberculosis. Particularmente, cuando el reactivo de diagnóstico comprende una o más de las SEQ ID NO: 1-9 y/o 50-69, permite a un usuario diferenciar entre un animal infectado con tuberculosis y un animal que ha sido vacunado contra una infección por tuberculosis, mediante métodos tales como se describe en el presente documento. Como se ha mencionado anteriormente, esto permite al usuario basarse en resultados de pruebas positivas al usar el reactivo de diagnóstico como una indicación de infección por tuberculosis en lugar de vacunación.
De acuerdo con un aspecto adicional de la invención, se proporciona un polipéptido (que puede aislarse) que consiste en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO:8, o que consiste entre 15-65 aminoácidos y que comprende la SEQ ID NO:8. La expresión "variante funcional" indica un polipéptido en el que la secuencia de aminoácidos difiere de la secuencia base a partir de la cual se deriva en que uno o más aminoácidos en la secuencia están sustituidos por otros aminoácidos. La variante es una variante funcional porque las características funcionales del polipéptido del que se obtiene la variante se mantienen. Por ejemplo, se desencadena una respuesta inmunitaria similar por la exposición de un animal, o una muestra de un animal, al polipéptido variante en comparación con la no variante. En particular, cualquier sustitución, adición o eliminación aminoacídica no debe alterar o alterar significativamente la estructura terciaria del uno o más epítopos contenidos en el péptido del que deriva la variante. El experto en la técnica es capaz de determinar fácilmente variantes funcionales apropiadas sin la aplicación de habilidades inventivas.
Las sustituciones aminoacídicas pueden considerarse como "conservativas" cuando se reemplaza un aminoácido por un aminoácido diferente con propiedades ampliamente similares. Las sustituciones no conservativas son cuando los aminoácidos se reemplazan por aminoácidos de tipo diferente.
Se entiende por "sustitución conservativa" la sustitución de un aminoácido por otro aminoácido de la misma clase, en el que las clases se definen como se indica a continuación:
_____ Clase___________ Ejemplos de aminoácidos_____
No polar: Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Phe, Trp
Polar no cargado: Gly, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asn, Gln
Ácido: Asp, Glu
Básico: Lys, Arg, His.
Como se conoce bien conocido por los expertos en la técnica, alterar la estructura primaria de un péptido con una sustitución conservativa puede no alterar significativamente la actividad de ese péptido debido a que la cadena lateral del aminoácido que se inserta en la secuencia puede ser capaz de formar enlaces y contactos similares a la cadena lateral del aminoácido que se ha sustituido. Esto es así incluso cuando la sustitución es en una región que es crítica para la determinación de la conformación del péptido
Como se ha mencionado anteriormente, las sustituciones no conservativas son posibles a condición de que estas no desestabilicen la estructura terciaria de un epítopo del péptido, por ejemplo, que no interrumpan la inmunogenicidad (por ejemplo, la antigenicidad) del péptido. En particular, la adición o eliminación de un pequeño número (por ejemplo, hasta aproximadamente 10, o hasta aproximadamente 5, por ejemplo, aproximadamente 1, 2, 3, 4 o 5) de aminoácidos en el extremo N o C de un polipéptido puede no afectar adversamente a la inmunogenicidad del péptido y dichas variantes para una secuencia de aminoácidos se contemplan particularmente como incluidas dentro del término "variante funcional" de un polipéptido.
En términos generales, serán posibles menos sustituciones no conservativas sin alterar la actividad biológica del polipéptido. De forma adecuada, las variantes pueden ser al menos aproximadamente un 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% o aproximadamente un 99% idénticas a la secuencia base, que se determina como un porcentaje de la longitud completa del más largo de los polipéptidos que se comparan.
La identidad de secuencia entre secuencias aminoacídicas puede determinarse mediante comparación de un alineamiento de las secuencias. Cuando está ocupada una posición equivalente en las secuencias comparadas por el mismo aminoácido, entonces las moléculas son idénticas en esa posición. Puntuar un alineamiento como porcentaje de identidad va en función del número de aminoácidos idénticos en posiciones compartidas por las secuencias comparadas. Cuando se comparan secuencias, los alineamientos óptimos pueden requerir introducir huecos en una o más de las secuencias para tener en cuenta posibles inserciones y deleciones en las secuencias. Los métodos de comparación de secuencias pueden emplear penalizaciones de hueco de manera que, para el mismo número de moléculas idénticas en las secuencias que se están comparando, un alineamiento de secuencias con los menores huecos posibles, reflejando la alta relación entre las dos secuencias comparadas, consiga una mayor puntuación que aquel con muchos huecos. El cálculo de la identidad porcentual máxima implica la producción de un alineamiento óptimo teniendo en cuenta las penalizaciones de hueco. El porcentaje de la identidad de secuencia puede determinarse usando el software BLASTP, disponible públicamente en http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (consultado el 14 de julio de 2011), usando una configuración de parámetros por defecto. La comparación debe determinarse para la secuencia de longitud completa del polipéptido, para evitar una alta identidad de secuencia sobre un fragmento corto del polipéptido.
La invención también abarca proteínas de fusión que comprenden más de una de las SEQ ID NOs:1-10 y/o 50-69. Las proteínas antigénicas de longitud completa enumeradas en la Tabla 3 pueden excluirse (por ejemplo, Rv1038c, Rv1197, Rv1792, etc.).
De acuerdo con un aspecto adicional de la invención, se proporciona un ácido nucleico que codifica un polipéptido que consiste en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:8, o que consiste entre 15-65 aminoácidos y que comprende la SEQ ID NO:8.
A lo largo de toda la descripción y las reivindicaciones de esta memoria descriptiva, las palabras "comprender" y "contener" y variaciones de las palabras, por ejemplo, "que comprende" y "comprende", significan "incluyendo, pero sin limitación", y no excluyen otros restos, actividades, componentes, números enteros o etapas. A lo largo de toda la descripción y las reivindicaciones de esta memoria descriptiva, el singular incluye el plural a menos que el contexto requiera otra cosa. En particular, cuando se usa el artículo indefinido, se entenderá que la memoria descriptiva contempla la pluralidad, así como la singularidad, a menos que el contexto requiera otra cosa.
Las características de cada aspecto de la invención pueden ser como se describe en relación con cualquiera de los demás aspectos.
Otras características de la presente invención se harán evidentes a partir de los siguientes ejemplos. En términos generales, la invención se extiende a cualquier característica novedosa, o cualquier combinación novedosa, de las características desveladas en esta memoria descriptiva (incluyendo las reivindicaciones y dibujos adjuntos). Por lo tanto, las funciones, números enteros, características, compuestos o restos químicos que se describen junto con un aspecto particular, forma de realización o ejemplo de la invención se entenderán como aplicables a cualquier otro aspecto, forma de realización o ejemplo descrito en el presente documento, a menos que sea incompatible con el mismo.
Además, a menos que se indique otra cosa, cualquiera característica desvelada en el presente documento puede reemplazarse por una característica alternativa que sirva para el mismo fin o similar.
Breve descripción de las figuras
Ahora se describirán los ejemplos no limitantes particulares de la presente invención con referencia a las siguientes figuras, en las que:
La figura 1 muestra la frecuencia de respuesta de 23 animales reactores a TB (TB) y 8 animales vacunados con BCG (BCG) a los agrupamientos peptídicos de secretoma reconocidos con más frecuencia;
la figura 2 muestra las frecuencias de respuesta de 22 animales reactores a TAMBIÉN (barras de color blanco) y 23 animales vacunados con BCG (barras de color negro) a péptidos de secretoma individuales (*indica los péptidos seleccionados para inclusión en el agrupamiento peptídico Sec#1);
la figura 3 (A) muestra la frecuencia de respuesta de 22 animales reactores a TB y 21 animales vacunados con BCG al agrupamiento peptídico Sec#1 (p<0,05, prueba exacta de Fisher) y la figura 3 (B) muestra respuestas IFN-y (ADO450) de 8 animales reactores a TB y 3 animales vacunados con BCG tanto a los agolpamientos peptídicos Sec#1 y Sec#2, representando la línea horizontal discontinua el corte para una respuesta positiva;
la figura 4 muestra respuestas de prueba cutánea a cócteles peptídicos en ganado expuesto de forma natural a infección por M. bovis; y
la figura 5 muestra respuestas de prueba cutánea de un cóctel peptídico de referencia que contiene péptidos de ESAT6, CFP10 y Rv3615c en solitario o en combinación con un cóctel peptídico de Rv2346c (agrupamiento peptídico n.° 11) o Rv3020c (agrupamiento peptídico n.° 14) (significación entre los grupos determinada por ANOVA con medidas repetidas, * p<0,05), en ganado expuesto de forma natural a infección por M. bovis.
Ejemplos
Materiales y métodos
Ganado
Todos los animales se mantuvieron en la Veterinary Laboratories Agency en el momento de la toma de muestras sanguíneas y los procedimientos se llevaron a cabo dentro de los límites de una Licencia del Ministerio del Interior de Reino Unido en virtud de la Ley sobre procedimientos científicos en los que se utilizan animales de 1986, que se aprobó por el comité de revisión de ética local. Se usaron los siguientes grupos de animales en este estudio:
(i) Reactores a tuberculosis (reactores a TB)
Se obtuvieron muestras de sangre heparinizada de reactores positivos a SICCT infectados de forma natural de rebaños que se sabía que tenían tuberculosis bovina (TBB) de acuerdo como se determinó por la Animal Health Agency. También se obtuvieron muestras de sangre heparinizada de 4 animales que se infectaron experimentalmente aprox. 6 meses con una cepa de campo de M. bovis de Gran Bretaña (AF 2122/97) por instilación intratraqueal de 1 x 103 UFC como se ha descrito previamente (Dean y col. (2005) Infect. Immun. vol. 73 págs. 6467-6471). Un examen post mortem detallado de 36 animales reactores a TB reveló lesiones por TB visibles en todos menos cuatro animales, confirmando la presencia de enfermedad activa.
(ii) Vacunados con BCG
Se obtuvieron muestras de sangre heparinizada de animales vacunados con BCG como se ha descrito previamente (Vordermeier y col. (1999) Clin. Diagn. Lab. Immunol. vol. 6 págs. 675-682). En resumen, los terneros (aprox.
6 meses de edad) de rebaños sin TBB se vacunaron con BCG Pasteur por inyección subcutánea de 1 x 106 UFC en el lateral del cuello.
Producción y preparación de péptidos y antígenos
Se seleccionaron 119 proteínas secretadas, o potencialmente secretadas, de Mycobacterium bovis para el cribado de antígenos como se ha descrito previamente (Jones y col. (2010) Infect. Immun. vol. 78 págs. 1326-1332). Los péptidos se sintetizaron (JPT Peptide Technologies GmbH, Berlín, Alemania) en agrupamientos de 20-mers solapando 12 aminoácidos para cada uno de los genes de interés. En total, se evaluaron 379 agrupamientos peptídicos que contenían un total de 4129 péptidos. Estos agrupamientos peptídicos se disolvieron en RPMI 1640 (Gibco, Reino Unido) que contenía sulfóxido de dimetilo al 20% (DMSO) para obtener una concentración de 1 mg/ml/péptido, y los agrupamientos peptídicos se usaron para estimular sangre entera a una concentración final de 5 pg/ml/péptido. Los péptidos que comprendían los agrupamientos para algunos antígenos se sintetizaron individualmente (Mimotopes Pty Ltd, Clayton, Australia), se disolvieron en RPMI 1640 que contenía DMSO al 20% para obtener una concentración de 5 mg/ml y se usaron individualmente para estimular sangre entera a una concentración final de 10 pg/ml, o se formularon en agrupamientos peptídicos adicionales a una concentración de 10 pg/ml/péptido. Los péptidos de ESAT-6 y CFP-10 se formularon para obtener un cóctel peptídico como se ha descrito previamente (Vordermeier y col. (2001) Clin. Diagn. Lab. Immunol. vol. 8 págs. 571-578) y se usaron a una concentración final de 5 pg/ml/péptido. Este cóctel peptídico se usó como un "estándar de oro" con el que comparar las inmunogenicidades de los demás antígenos.
Se suministró tuberculina bovina (PPD-B) por la Tuberculin Production Unit en la Veterinary Laboratories Agency, Weybridge, Surrey, Reino Unido, y se usó a una concentración final de 10 pg/ml. Se incluyó una enterotoxina B estafilocócica (SEB; Sigma-Aldritch, Reino Unido) como un control positivo a una concentración final de 1 pg/ml, mientras que la sangre entera se incubó con RPMI 1640 en solitario como un control negativo.
Ensayo inmunoabsorbente ligando a enzimas (ELISA) de IFN-y
Se añadieron alícuotas de sangre entera (250 pl) por duplicado a antígeno en placas de 96 pocillos y se incubaron a 37 °C en presencia de CO2 al 5% durante 24 horas, después de lo cual se recogieron los sobrenadantes plasmáticos y se almacenaron a -80 °C hasta que se necesitaron. La cuantificación de IFN-y en los sobrenadantes plasmáticos se determinó usando el kit Bovigam ELISA (Prionics AG, Suiza). Un resultado se consideró positivo si la densidad óptica a 450 nm (DO450) con el antígeno menos la DO450 sin el antígeno (ADO450) era >0,1 en ambos de los pocillos duplicados.
Evaluación de prueba cutánea de Rv2346c (agrupamiento peptídico n.° 11) o Rv3020c (agrupamiento peptídico n.° 14)
La evaluación de prueba cutánea de los antígenos proteicos y peptídicos definidos se realizó en ganado expuesto de forma natural a infección por M. bovis (n = 17). Este ganado se incluyó como resultado de proporcionar repuestas positivas a la prueba cutánea de tuberculina comparativa cervical intradérmica simple (SICCT) durante operaciones de vigilancia en el terreno habituales.
Los antígenos se administraron en 8 sitios por animal (4 en cada lado del cuello). Los antígenos se administraron en un volumen de 100 pl. Todos los cócteles de antígenos proteicos o peptídicos definidos se administraron a una concentración de 5 ug/ml por componente de cóctel. El espesor de la piel se midió en el sitio de inyección inmediatamente antes de la administración intradérmica del antígeno. El espesor de la piel en el sitio de inyección se midió de nuevo 72 horas después de la administración del antígeno, y se determinó el aumento del espesor de la piel en este tiempo. Este método también es adecuado para determinar la reacción en ganado no infectado con M. bovis, ya esté vacunado o sin vacunar contra tal infección.
Los antígenos proteicos recombinantes purificados se suministraron por Lionex GmbH. La composición del cóctel de ESAT-6, CFP-10 y Rv3615c era SEQ ID NO: 11-43. Se usó una combinación de 11 péptidos que proporcionaban un solapamiento de la secuencia completa para cada uno de los antígenos Rv3020c y Rv2346c, como se enumera en la Tabla 2 a continuación (las SEQ ID NO: 7 y 50-59 proporcionan un solapamiento de la secuencia completa para Rv2346c y las SEQ ID NO: 8 y 60-69 proporcionan un solapamiento de la secuencia completa para Rv3020c). Los cócteles Rv3020c y Rv2346c (es decir, los agrupamientos peptídicos n.° 14 y n.° 11, respectivamente, como se muestra en la Tabla 2) se ensayaron individualmente y en combinación con un cóctel que contenía los péptidos solapantes de ESAT-6, CFP-10 y Rv3615c (es decir, las SEQ ID NO: 11-43), que por su parte es el objeto de la solicitud de patente pendiente junto con la presente PCT/GB2011/050843.
Resultados
Para probar la hipótesis de que las proteínas secretadas por M. bovis es probable que contengan antígenos inmunógenos que pueden usarse para aumentar la especificidad de las pruebas diagnósticas, se cribaron 379 agrupamientos de péptidos solapantes (4129 péptidos en total que representaban 119 antígenos) para comprobar su capacidad para estimular una respuesta a IFN-y in vitro usando sangre entera tanto de animales reactores a TB (n = 23) como animales vacunados con BCG (n = 8). Como se esperaba, todos los animales reactores a TB y los animales vacunados con BCG respondieron a PPD-B y al antígeno de control positivo SEB, mientras que 22 animales reactores de TB (96%) y 2 animales vacunados con BCG (25%) respondieron al cóctel peptídico ESAT-6/CFP-10 (datos no mostrados). De los 379 agrupamientos peptídicos, aproximadamente la mitad (n = 184) no indujeron IFN-y en ninguno de los animales reactores a TB ni vacunados con BCG. Para los 195 agrupamientos peptídicos restantes, se reconocieron 163 y 77 por los animales reactores a TB y los animales vacunados con BCG respectivamente, reconociéndose 45 por ambos grupos de animales (Tabla 1). De forma alentadora, con respecto a los reactores de diagnóstico diferenciales, se reconocieron 118 agrupamientos peptídicos diferentes por los animales reactores a TB pero no se indujo ninguna respuesta a IFN-y en ninguno de los animales vacunados con BCG estudiados.
Se apreció una jerarquía de respuestas a diferentes agrupamientos peptídicos, con frecuencias de respuesta que variaban del 4% al 65% en los animales reactores a TB, y del 13% al 38% den los animales vacunados con bCg (Tabla 1).
T l 1 R n imi n l r mi n í i ní n r
Figure imgf000010_0001
La Figura 1 detalla las frecuencias de respuesta para los 8 agrupamientos peptídicos reconocidos con más frecuencia, es decir, aquellos que indujeron una respuesta a IFN-y en más de la mitad de los animales reactores a TB estudiados. Sorprendentemente, todos menos un agrupamiento peptídico (n.° 30-2) representaron antígenos que pertenecían a la familia de proteínas ESAT-6. De manera interesante, los agrupamientos peptídicos n.° 11 y n.° 14 no se reconocieron por ninguno de los animales vacunados con BCG, lo que sugería que contenían péptidos con aplicación potencial como reactivos DIVA. Los péptidos incluidos en estos agrupamientos se indican en la Tabla 2.
° °
Figure imgf000010_0002
Aunque 6 de los 8 agrupamientos peptídicos reconocidos con más frecuencia indujeron una respuesta a IFN-y en algunos animales vacunados con BCG, los inventores razonaron a continuación que una investigación al mínimo detalle de la inmunogenicidad de los componentes de estos agrupamientos puede revelar péptidos individuales adicionales con uso potencial como reactivos DIVA. Para este fin, los péptidos solapantes contenidos en estos agrupamientos peptídicos se cribaron individualmente para determinar su capacidad para inducir la producción de IFN-y tanto en animales reactores a TB (n = 22) como vacunados con BCG (n = 23). En estos experimentos, 19 animales reactores a TB (86%) pero ningún animal vacunado con BCG (0%) respondieron al cóctel peptídico (datos no mostrados). Se identificaron cincuenta y tres péptidos individuales como inmunógenos en animales reactores a TB, con frecuencias de respuesta que variaban del 5% al 50% (figura 2). De estos péptidos, seis (péptidos n.° 17, n.° 32, n.° 48, n.° 58, n.° 67 y n.° 69) también indujeron respuestas a IFN-y en animales vacunados con BCG con frecuencias de respuesta que variaban del 4% al 17% (figura 2).
Con el fin de evaluar si una combinación de péptidos individuales de diferentes antígenos de secretoma es suficiente para inducir diferencialmente una respuesta a IFN-y en animales reactores a TB, se construyó un agrupamiento peptídico (Sec#1) que consistía en 10 péptidos. En primer lugar, se seleccionaron los péptidos n.° 42 y n.° 55 (SEQ ID NO: 7 y 8, respectivamente) ya que eran los dos péptidos reconocidos con más frecuencia (frecuencias de respuesta del 50% y del 36% respectivamente) y también porque pertenecían a agrupamientos peptídicos no reconocidos por los animales vacunados con BCG (agrupamientos n.° 11 y n.° 14 respectivamente, Figura 1). A continuación, se seleccionaron cuatro péptidos adicionales (péptidos n.° 20, n.° 29, n.° 33 y n.° 64) ya que se reconoció en los animales reactores a TAMBIÉN que no pudieron responder a los péptidos n.° 42 o n.° 55 (datos no mostrados). Por último, se incluyeron cuatro péptidos más (péptidos n.° 16, n.° 19, n.° 25 y n.° 57) debido a su ubicación en regiones de homología entre múltiples proteínas ESAT-6 (véase la Tabla 3).
T l I nifi i n i n l r mi n 1 2
Figure imgf000011_0001
Como se muestra en la figura 3A, la frecuencia de respuesta al agrupamiento peptídico Sec#1 fue significativamente mayor en animales reactores a TB (p<0,05, prueba exacta de Fisher), reconociendo 14 de 22 (64%) animales reactores a TB el agrupamiento peptídico en comparación con 6 de 21 (29%) animales vacunados con BCG. Para optimizar el agrupamiento peptídico para su uso como reactivo DIVA, los componentes peptídicos individuales del agrupamiento peptídico Sec#1 se cribaron de nuevo para determinar su capacidad para inducir una repuesta a IFN-y en los animales vacunados con BCG. Estos experimentos identificaron únicamente un único péptido (péptido n.° 64) como inmunógeno en algunos animales vacunados con BCG (datos no mostrados). Por lo tanto, se construyó un segundo agrupamiento peptídico (Sec#2) que carecía de este péptido, y la capacidad de tanto Sec#1 como Sec#2 para inducir IFN-y se comparó tanto en los animales reactores a TB (n = 8) como en los animales vacunados con BCG (n = 3) que habían demostrado previamente reconocer el anterior agrupamiento peptídico. La omisión del péptido #64 del agrupamiento apenas tuvo efecto sobre la frecuencia de respuesta para los animales reactores a TB, produciendo aún 7 de los 8 animales IFN-y por encima del corte (figura 3B). En total, 7 de 13 (54%) animales reactores a TB produjeron IFN-y en respuesta a Sec#2 (datos no mostrados). Por el contrario, la eliminación del péptido #64 anuló completamente la respuesta en todos los animales vacunados con BCG ensayados (figura 3B).
Los datos de la prueba cutánea se muestran en la figura 4. Un animal no pudo inducir una reacción cutánea en la prueba cutánea de tuberculina comparativa y, de forma similar, este mismo animal no proporcionó ninguna respuesta de la prueba cutánea a ninguna de las combinaciones de antígeno definidas. La adición del cóctel de péptidos de Rv3020c (SEQ ID NO: 8 y 60-69) al cóctel de referencia que contenía péptidos de ESAT-6, CFP-10 y Rv3615c (SEQ ID NOs: 11-43) demostró respuestas significativamente más fuerzas que el cóctel de referencia en solitario, véase la figura 5.
Análisis
Los resultados presentados en el presente documento tenían una importancia significativa con respecto al desarrollo de reactivos DIVA. El cribado de 119 proteínas secretadas, o potencialmente secretadas, por M. bovis reveló tres agrupamientos peptídicos únicos que se reconocieron con frecuencia por ganado infectado por M. bovis pero no se pudo inducir una respuesta a IFN-y en ninguno de los animales vacunados con BCG estudiados. Dos de estos agrupamientos peptídicos consistían en péptidos solapantes que representaban la secuencia de aminoácidos completa para dos antígenos individuales, Rv2346c y Rv3020c, mientras que el tercero (Sec#2) consistía en un cóctel de 9 péptidos obtenidos de múltiples antígenos.
El mecanismo subyacente para el reconocimiento diferencial de Rv2346c y Rv3020c sigue sin estar claro. En primer lugar, ambos genes se localizan en los genomas de M. bovis (cepa AF2122/97) y, de forma más importante, en el BCG Pasteur (cepa 1173P2), que se usó para inmunizar el ganado. En segundo lugar, el análisis del genoma reveló secuencias aminoacídicas idénticas de las dos proteínas entre las dos cepas. Por lo tanto, la falta de respuestas inmunitarias a Rv2346c y Rv3020c observada en los animales vacunados con BCG es improbable que se explique por las deleciones o alteraciones de las secuencias aminoacídicas en estas dos proteínas en la cepa BCG Pasteur usada para la vacuna.

Claims (15)

REIVINDICACIONES
1. Un reactivo de diagnóstico que comprende:
(i) un polipéptido que consiste en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:8; o
(ii) un polipéptido que consiste entre 15-65 aminoácidos y que comprende la SEQ ID NO:8;
estando el reactivo caracterizado por que desencadena un resultado de ensayo de diagnóstico negativo cuando se realiza un ensayo de infección por tuberculosis en una muestra de un animal que ha sido vacunado contra una infección por un agente de la tuberculosis.
2. Un reactivo de diagnóstico de acuerdo con la reivindicación 1, que comprende, además:
(i) una secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:7, o una secuencia que tiene al menos un 85% de identidad de secuencia con la misma; y/o
(ii) que comprende además al menos una de las secuencias de aminoácidos de SEQ ID NO:1, 2, 3, 4, 5, 6 o 9, o una secuencia que tiene al menos un 85% de identidad de secuencia con una de la SEQ ID NO:1, 2, 3, 4, 5, 6 o 9; y/o
(iii) que comprende todas las SEQ ID NOs:1-9.
3. Un reactivo de diagnóstico de acuerdo con la reivindicación 1 o 2, que comprende además al menos una de las secuencias de aminoácidos de SEQ ID NOs:10-69 o una secuencia que tiene al menos un 85% de identidad de secuencia con una de las SEQ ID NOs:10-69.
4. Un reactivo de diagnóstico de acuerdo con la reivindicación 1, que comprende además secuencias de aminoácidos de SEQ ID NOs:60-69, que comprende opcionalmente secuencias de aminoácidos de SEQ ID NOs:7, 11-42 y 50-69.
5. Un reactivo de diagnóstico para su uso en un método para detectar una infección de tuberculosis en un mamífero o para detectar la exposición de un animal a un agente de tuberculosis, y diferencial de la vacunación del animal, comprendiendo el reactivo de diagnóstico una secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:8, en el que el método es una prueba cutánea que desencadena un resultado positivo cuando el mamífero está infectado con un agente para la tuberculosis y que desencadena un resultado negativo cuando el mamífero se ha vacunado contra una infección con un agente de la tuberculosis, o cuando el mamífero no está vacunado y/o no está infectado.
6. Un método para detectar una infección por tuberculosis en un animal, o la exposición de un animal a un agente de la tuberculosis, que comprende las etapas de
(i) poner en contacto in vitro una población de células del animal con al menos un reactivo de diagnóstico de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1-4; y
(ii) determinar si las células de dicha población reconocen el reactivo de diagnóstico;
opcionalmente, en el que la población de células incluye linfocitos T.
7. El método de acuerdo con la reivindicación 6, que comprende un ensayo de inmunidad mediada por células (CMI), opcionalmente, en el que el ensayo CMI detecta interferón gamma (IFN-y).
8. Un reactivo de diagnóstico de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1-4, para su uso en un método para detectar una infección por tuberculosis en un animal, o la exposición de un animal a un agente de la tuberculosis, que comprende las etapas de
(i) poner en contacto in vivo una población de células del animal con el reactivo de diagnóstico; y
(ii) determinar si las células de dicha población reconocen el reactivo de diagnóstico.
9. Un kit de diagnóstico que comprende un reactivo de diagnóstico de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1-4.
10. Un kit de acuerdo con la reivindicación 9, en el que el reactivo de diagnóstico es capaz de detectar una infección por tuberculosis en un animal, o la exposición de un animal a un agente de la tuberculosis.
11. Un kit de acuerdo con la reivindicación 10, en el que el reactivo de diagnóstico es de acuerdo con la reivindicación 1 o 2, y es adecuado para su uso para diferenciar entre un animal que tiene una infección por tuberculosis y un animal vacunado contra la infección por tuberculosis.
12. Un polipéptido que consiste en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:8, o que consiste entre 15-65 aminoácidos y que comprende la SEQ ID NO:8.
13. Un ácido nucleico que codifica un polipéptido que consiste en al menos un polipéptido de acuerdo con la reivindicación 12.
14. Un vector que comprende al menos un ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 13.
15. Una célula transformada con el vector de acuerdo con la reivindicación 14.
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