ES2629890T3 - miARN como biomarcadores para distinguir entre neoplasias de tiroides benignas y malignas - Google Patents

Abstract

Un método para un diagnóstico o pronóstico del cáncer de tiroides o de un tipo de cáncer de tiroides en un sujeto que comprende medir los niveles de expresión de al menos miR-375 en una muestra de tiroides de un sujeto, en donde una expresión diferencial en el nivel de expresión de miR-375 en la muestra en relación a un nivel de referencia es indicativa de cáncer de tiroides o del tipo de cáncer de tiroides.

Description

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Descripción detallada de la invención

Las realizaciones de la divulgación se refieren a composiciones y métodos que se refieren a la preparación y caracterización de miARN, así como al uso de los miARN para aplicaciones pronósticas y/o diagnósticas, en particular, aquellos métodos y composiciones relacionados con la evaluación y/o identificación de enfermedades de tiroides. La presente invención introduce un avance en la técnica actual para el diagnóstico del cáncer de tiroides mediante la descripción del uso de nuevos marcadores de miARN para el diagnóstico del cáncer de tiroides y para distinguir entre diferentes tipos de cánceres de tiroides.

I. AFECCIONES DE TIROIDES

El carcinoma tiroideo representa el 1% de todas las enfermedades malignas, pero el 90% de las neoplasias malignas neuroendocrinas. Se estima que el 5-10% de la población desarrollará un nódulo tiroideo clínicamente significativo a lo largo de su vida. La mejor prueba disponible para la evaluación de un paciente con un nódulo de tiroides es la biopsia de aspiración con aguja fina (FNA). De las FNA malignas, la mayoría son de cánceres papilares de tiroides (PTC) o de su variante folicular (FVPTC). Estos pueden diagnosticarse fácilmente si tienen las características citológicas clásicas, incluyendo una celularidad abundante y núcleos alargados que contienen surcos e inclusiones intranucleares. De hecho, en uno de cada tres casos, estos diagnósticos son claros para FNA. La biopsia de aspiración con aguja fina de los nódulos de tiroides ha reducido en gran medida la necesidad de cirugía tiroidea y ha aumentado la detección de tumores malignos entre los nódulos extirpados. Además, el diagnóstico de tumores tiroideos malignos, combinado con una terapia eficaz, ha dado lugar a una reducción destacada en la morbilidad causada por el cáncer de tiroides. Desafortunadamente, muchas FNA de tiroides no son benignas o malignas de manera concluyente, proporcionando un diagnóstico "intermedio" o "sospechoso". La prevalencia de las FNA intermedias varía, pero típicamente oscila entre el 10-25% de las FNA. En general, las FNA de tiroides son intermedias debido a los criterios morfológicos solapantes o indefinidos para las lesiones benignas frente a malignas

o a la atipia nuclear focal entre especímenes por lo demás benignos. Cabe destacar que más del doble de los pacientes son remitidos a cirugía para una lesión sospechosa (10%) que para una lesión maligna (5%), una aparición que no se aprecia ampliamente, ya que la mayoría de las FNA son benignas. Por lo tanto, cuando el diagnóstico es poco claro en la FNA, se clasifica a estos pacientes como poseedores únicamente de una lesión sospechosa o indeterminada. Es de sobra conocido que el análisis de secciones congeladas con frecuencia no ofrece información adicional.

El cirujano decide cuándo efectuar una lobectomía de tiroides, que es adecuada para lesiones benignas o una tiroidectomía total, que es adecuada para lesiones malignas cuando el diagnóstico es incierto tanto en el preoperatorio como durante la operación. La lobectomía de tiroides como procedimiento inicial para cada paciente con una FNA sospechosa podría ocasionar que el paciente con cáncer se tuviese que someter a una segunda operación para completar la tiroidectomía. Por el contrario, una tiroidectomía total para todos los pacientes con una FNA sospechosa podría dar como resultado que la mayoría de pacientes se sometiesen a un procedimiento quirúrgico innecesario, que requiere un reemplazo de hormonas tiroideas de por vida y la exposición a los riesgos inherentes de la cirugía.

Varios intentos de formular un consenso acerca de la clasificación y tratamiento del carcinoma de tiroides basándose en análisis histopatológico convencional han dado como resultado guías publicadas para el diagnóstico y gestión inicial de la enfermedad. En las últimas décadas, no se han hecho mejoras en el diagnóstico diferencial de los tumores de tiroides mediante FNA, específicamente de lesiones de tiroides sospechosas o indeterminadas, lo que sugiere que debería explorarse una nueva estrategia para esto. Por tanto, existe una urgente necesidad de desarrollar pruebas diagnósticas iniciales más precisas para evaluar un nódulo de tiroides.

El cáncer de tiroides derivado de las células epiteliales foliculares es el cáncer endocrino más común. El carcinoma papilar de tiroides (PTC) y el carcinoma folicular de tiroides (FTC) suponen la gran mayoría de todas las neoplasias malignas de tiroides. Se estima que el 7% de la población adulta (275.000 en 1999 solo en los Estados Unidos) desarrolla nódulos de tiroides clínicamente significativos a lo largo de su vida. La llegada de la ecografía de tiroides permite en la actualidad el diagnóstico de un mayor número de nódulos de tiroides y en la actualidad se estima que en aproximadamente el 50% de la población general hay presentes nódulos y estos se detectan a nivel subclínico.

II. EVALUACIÓN DE LOS NIVELES DE miARN

Se contempla el uso de una serie de ensayos para analizar los miARN en muestras de tiroides. Dichos ensayos incluyen, pero sin limitación, hibridación de matriz, hibridación en solución, amplificación de ácidos nucleicos, reacción en cadena de la polimerasa, PCR cuantitativa, RT-PCR, hibridación in situ, hibridación de Northern, ensayo de protección de hibridación (HPA) (GenProbe), ensayo de ADN ramificado (ADNr) (Chiron), amplificación por círculo rodante (RCA), detección de hibridación de una sola molécula (US Genomics), ensayo Invader (ThirdWave Technologies) y/o ensayo de ligamiento de oligos (OLA), hibridación y análisis de matriz.

A. Preparación de la muestra

Aunque se contempla miARN endógeno en las composiciones y métodos de la divulgación, también pueden manipularse y/o analizarse miARN recombinantes, incluyendo ácidos nucleicos que son complementarios o idénticos

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PCR típicas incluyen 20 o más ciclos de desnaturalización, hibridación y elongación. En muchos casos, las etapas de hibridación y elongación puede efectuarse de manera concurrente, en cuyo caso el ciclo solo contiene dos etapas. Ya que los miARN maduros son monocatenarios, se efectúa una reacción de retrotranscripción (que incluye una secuencia de ADNc complementaria) antes de las reacciones PCR. Las reacciones de retrotranscripción incluyen el uso de, por ejemplo, una ADN polimerasa a base de ARN (retrotranscriptasa) y un cebador.

En los métodos de PCR y q-PCR, por ejemplo, se usa un conjunto de cebadores para cada secuencia diana. En determinadas realizaciones, la longitud de los cebadores depende de varios factores, incluyendo, pero sin limitación, la temperatura de hibridación deseada entre los cebadores, la secuencia de ácido nucleico diana y la complejidad de las diferentes secuencias de ácido nucleico diana que se vayan a amplificar. En determinadas realizaciones, un cebador tiene de aproximadamente 15 a aproximadamente 35 nucleótidos de longitud. En otras realizaciones, un cebador tiene una longitud igual o menor de 15, 20, 25, 30 o 35 nucleótidos. En realizaciones adicionales, un cebador tiene al menos 35 nucleótidos de longitud.

En un aspecto adicional, un cebador directo puede comprender al menos una secuencia que se hibrida con un miARN diana y como alternativa puede comprender una región 5' no complementaria adicional. En otro aspecto, puede diseñarse un cebador inverso para que se hibride con el complemento de un miARN retrotranscrito. El cebador inverso puede ser independiente de la secuencia de miARN y pueden amplificarse múltiples miARN usando el mismo cebador inverso. Como alternativa, un cebador inverso puede ser específico para un miARN.

En algunas realizaciones, se amplifican dos o más miARN o ácidos nucleicos en un solo volumen de reacción o en múltiples volúmenes de reacción. En determinados aspectos, pueden usarse uno o más miARN o ácidos nucleicos como control de normalización o un ácido nucleico de referencia para normalización. La normalización puede efectuarse en los mismos volúmenes de reacción u otros distintos que las demás reacciones de amplificación. Otro aspecto incluye q-PCR multiplexada, tal como qRT-PCR, que posibilita la amplificación y cuantificación simultánea de al menos un miARN de interés y al menos un ácido nucleico de referencia en un volumen de reacción usando más de un par de cebador y/o más de una sonda. Los pares de cebador comprenden al menos un cebador de amplificación que se une de manera única a cada ácido nucleico y las sondas se marcan de tal forma que pueden distinguirse entre sí, permitiendo de este modo la cuantificación simultánea de múltiples miARN. La qRT-PCR multiplexada tiene usos de investigación y diagnósticos, incluyendo, pero sin limitación, la detección de miARN para aplicaciones diagnósticas, pronósticas y terapéuticas.

Una sola reacción q-PCR combinada puede usarse para: (1) reducir el riesgo de error experimental, (2) reducir la variabilidad entre ensayos, (3) reducir el riesgo de contaminación de la diana o producto y (4) aumentar la velocidad del ensayo. La reacción qRT-PCR puede combinarse adicionalmente con reacción de retrotranscripción incluyendo tanto una retrotranscriptasa y una ADN polimerasa termoestable a base de ADN. Cuando se usan dos polimerasas, puede usarse una estrategia de "arranque en caliente" para maximizar el rendimiento del ensayo (Patentes de los Estados Unidos 5.411.876 y 5.985.619). Por ejemplo, pueden secuestrarse los componentes para una reacción de retrotranscriptasa y puede secuestrarse una reacción PCR usando uno o más métodos de termoactivación o alteración química para mejorar la eficacia de polimerización (Patentes de los Estados Unidos 5.550.044, 5.413.924 y 6.403.341).

Para evaluar la expresión de microARN, puede usarse detección por RT-PCR en tiempo real para explorar ácidos nucleicos o ARN aislados a partir de muestras de interés y una referencia relacionada tal como, pero sin limitación, muestras de un tejido adyacente normal (NAT).

Se selecciona un panel de dianas de amplificación para la cuantificación por RT-PCR en tiempo real. La selección del panel o las dianas puede estar basada en los resultados de análisis de expresión de micromatrices, tal como con la biomatriz de miARN mirVana™ V1 (Ambion), micromatrices de miARN humano (V3) (Agilent), matrices miRLink™ (Asuragen) o cualquier otra micromatriz. En un aspecto, el panel de dianas incluye uno o más miARN descritos en la presente memoria. Un ejemplo de una diana de normalización es ARNr 5S y otros que pueden incluirse. Los componentes de la reacción de retrotranscripción (RT) se ensamblan típicamente sobre hielo antes de la adición de molde de ARN. Se añade y mezcla el molde de ARN total. Las reacciones de RT se incuban en un sistema PCR adecuado a una temperatura adecuada (15-30 °C, incluyendo todos los valores e intervalos intermedios) durante un tiempo adecuado, 15 a 30 minutos o mayor, después a una temperatura de 35 a 42 a 50°C durante 10 a 30 a 60 minutos y después a 80 a 85 a 95°C durante 5 minutos, y después se coloca sobre hielo húmedo. Los componentes de la reacción de retrotranscripción incluye típicamente agua libre de nucleasas, tampón de retrotranscripción, mezcla de dNTP, cebador de RT, inhibidor de RNasa, retrotranscriptasa y ARN.

Los componentes de la reacción PCR se ensamblan típicamente sobre hielo antes de la adición del ADNc de las reacciones de RT. Después del ensamblaje de la los componentes de la reacción PCR, se transfiere una porción de la reacción RT a la mezcla de PCR. Después, la reacción PCR se incuba típicamente en un sistema PCR a una temperatura elevada (por ejemplo, 95°C) durante aproximadamente 1 minuto, después durante una serie de ciclos de desnaturalización, hibridación y extensión (por ejemplo, 40 ciclos de 95°C durante 5 segundos y 60°C durante 30 segundos). Los resultados pueden analizarse, por ejemplo, con SDS V2.3 (Applied Biosystems). Los componentes de la PCR en tiempo real incluyen típicamente agua libre de nucleasas, MgCl2, tampón para la PCR, mezcla de dNTP, uno o más cebadores, ADN polimerasa, ADNc de la reacción RT y uno o más marcadores detectables.

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Se usan herramientas informáticas, tales como NormFinder (Andersen et al., 2004) para determinar dianas para la normalización con las dianas de interés y el conjunto de muestras de tejido. Para la normalización de los resultados de la RT-PCR en tiempo real, se resta el valor de ciclo umbral (Ct) (un valor logarítmico) para el microARN de interés de la media geométrica del valor de Ct de dianas de normalización. Puede determinarse el múltiplo de cambio restando la referencia normal de dCt (N) de la muestra de dCt correspondiente que se esté evaluando (T), produciendo un valor de ddCt (T-N) para cada muestra. El valor medio de ddCt(T-N) entre todas las muestras se convierte a múltiplo de cambio por 2ddCt. Los valores de p representativos se determinan mediante una prueba de la t de Student apareada de dos colas a partir de los valores de dCt de la muestra y la referencia normal.

D. Matrices de ácido nucleico

Determinados aspectos se refieren a la preparación y uso de matrices de miARN o matrices de sondas de miARN, que son macromatrices ordenadas de micromatrices de moléculas de ácido nucleico (sondas) que son totalmente o prácticamente complementarias o idénticas a una serie de moléculas de miARN o moléculas precursoras de miARN y se ubican sobre un soporte o material de soporte en una organización espacialmente separada. Las macromatrices son típicamente láminas de nitrocelulosa o nylon sobre la cual se puntean las sondas. Las micromatrices colocan las sondas de ácido nucleico más densamente, de tal forma que pueden caber hasta 10.000 moléculas de ácido nucleico en una región típicamente de 1 a 4 centímetros cuadrados.

Los métodos y aparatos representativos para preparar una micromatriz se han descrito, por ejemplo, en las patentes de los Estados Unidos 5.143.854; 5.202.231; 5.242.974; 5.288.644; 5.324.633; 5.384.261; 5.405.783; 5.412.087; 5.424.186; 5.429.807; 5.432.049; 5.436.327; 5.445.934; 5.468.613; 5.470.710; 5.472.672; 5.492.806; 5.503.980; 5.510.270; 5.525.464; 5.527.681; 5.529.756; 5.532.128; 5.545.531; 5.547.839; 5.554.501; 5.556.752; 5.561.071; 5.571.639; 5.580.726; 5.580.732; 5.593.839; 5.599.695; 5.599.672; 5.610.287; 5.624.711; 5.631.134; 5.639.603; 5.654.413; 5.658.734; 5.661.028; 5.665.547; 5.667.972; 5.695.940; 5.700.637; 5.744.305; 5.800.992; 5.807.522; 5.830.645; 5.837.196; 5.871.928; 5.847.219; 5.876.932; 5.919.626; 6.004.755; 6.087.102; 6.368.799; 6.383.749; 6.617.112; 6.638.717; 6.720.138, así como los documentos WO 93/17126; WO 95/11995; WO 95/21265; WO 95/21944; WO 95/35505; WO 96/31622; WO 97/10365; WO 97/27317; WO 99/35505; WO 09923256; WO 09936760; WO 0138580; WO 0168255; WO 03020898; WO 03040410; WO 03053586; WO 03087297; WO 03091426; WO 03100012; WO 04020085; WO 04027093; EP 373 203; EP 785 280; EP 799 897 y UK 8 803 000. Además, una persona normalmente versada en la materia podría analizar fácilmente datos generados usando una matriz. Dichos protocolos se han divulgado anteriormente e incluyen información hallada en los documentos WO 9743450; WO 03023058; WO 03022421; WO 03029485; WO 03067217; WO 03066906; WO 03076928; WO 03093810; WO 03100448A1.

E. Hibridación

Después de preparar una matriz o un conjunto de sondas de miARN y marcar el miARN en la muestra, se pone en contacto la población de ácidos nucleicos diana con la matriz o sondas en condiciones de hibridación, donde dichas condiciones pueden ajustarse, según se desee, para proporcionar un nivel óptimo de especificidad a la vista del ensayo particular que se esté efectuando. Las condiciones de hibridación adecuadas son bien conocidas para los expertos en la materia y se revisan en Sambrook et al. (2001) y el documento WO 95/21944. En muchas realizaciones, es particularmente interesante el uso de condiciones rigurosas durante la hibridación. Las condiciones rigurosas se conocen por los expertos en la materia.

III. ÁCIDOS NUCLEICOS

En determinados aspectos, los ácidos nucleicos, por ejemplo, miARN, incluyen típicamente segmentos de secuencia

o secuencias complementarias a moléculas de microARN ("miARN" o "miR"), que generalmente tienen de 21 a 22 nucleótidos de longitud, aunque se han comunicado longitudes de 16 y hasta 35 nucleótidos. Cada uno de los miARN se procesan a partir de una molécula precursora de ARN ("miARN precursor"). Los miARN precursores se transcriben a partir de genes que no codifican proteínas. Los miARN precursores tiene dos regiones de complementariedad que les permiten formar una estructura similar a tallo-bucle o de repliegue, que se escinde en animales por una enzima nucleasa similar a ribonucleasa III denominada Dicer. El miARN procesado es típicamente una porción del tallo.

El miARN procesado (también citado como "miARN maduro") se convierte en parte de un gran complejo para regular negativamente un gen diana particular. Los ejemplos de miARN animales incluyen aquellos que se emparejan por bases de manera imperfecta con la diana, lo que detiene la traducción (Olsen et al., 1999; Seggerson et al., 2002). Las moléculas de ARNpi también se procesan por Dicer, pero forman una larga molécula de ARN bicatenario. Los ARNpi no se encuentran naturalmente en células animales, pero pueden dirigir la escisión específica de secuencia de una diana de ARNm a través de un complejo de silenciamiento inducido por ARN (RISC) (Denli et al., 2003). En determinados aspectos, los ácidos nucleicos en algunas realizaciones son ARN o análogos de ARN.

En algunas realizaciones, hay un miARN sintético o aislado que tiene una longitud de entre 17 y 130 restos. Las realizaciones de la divulgación se refieren a moléculas de miARN sintéticas o no sintéticas que tienen, tienen como mínimo o como máximo 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38,

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En determinadas realizaciones, los ácidos nucleicos tienen (a) una "región de miARN" cuya secuencia de 5' a 3' es idéntica a la totalidad o un segmento de una secuencia de miARN madura y/o (b) una "región complementaria" cuya secuencia de 5' a 3' tiene una complementariedad entre el 60% y el 100% con la secuencia de miARN. En determinadas realizaciones, estos miARN sintéticos también están aislados, tal como se ha definido anteriormente. La expresión "región de miARN" se refiere a una región sobre el miARN sintético que es al menos un 75, 80, 85, 90, 95 o 100% idéntica, incluyendo todos los números enteros intermedios, a la secuencia completa de una secuencia madura de miARN de origen natural. En determinadas realizaciones, la región de miARN es o es al menos un 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 99,1, 99,2, 99,3, 99,4, 99,5, 99,6, 99,7, 99,8, 99,9 o 100% idéntica a la secuencia de un miARN de origen natural. Como alternativa, la región de miARN puede comprender 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27 o más posiciones de nucleótidos en común con un miARN de origen natural comparada por algoritmos de alineamiento de secuencia y métodos bien conocidos en la técnica.

La expresión "región complementaria" se refiere a una región de un miARN sintético que es o es al menos un 60% complementaria a la secuencia madura de miARN de origen natural a la que es idéntica la región de miARN. La región complementaria es o es al menos un 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 99,1, 99,2, 99,3, 99,4, 99,5, 99,6, 99,7, 99,8, 99,9 o 100% complementaria, o cualquier intervalo derivable del mismo. Con secuencias de polinucleótidos individuales, puede haber una estructura de bucle de horquilla como resultado de la unión química entre la región de miARN y la región complementaria. En otras realizaciones, la región complementaria se encuentra en una molécula de ácido nucleico diferente a la región de miARN, en cuyo caso la región complementaria se encuentra en la hebra complementaria y la región de miARN se encuentra en la hebra activa.

Se contempla que el miARN sintético pueda tener uno o más de los diseños de reemplazo, de modificación de azúcar o de no complementariedad. En determinados casos, las moléculas de ARN sintético tienen dos de estas, mientras que en otras, estas moléculas tienen los tres diseños en su sitio.

Cuando la molécula de ARN es un polinucleótido individual, existe una región enlazadora entre la región de miARN y la región complementaria. En algunas realizaciones, el polinucleótido individual es capaz de formar una estructura de bucle de horquilla como resultado de la unión entre la región de miARN y la región complementaria. El enlazador constituye el bucle de horquilla. Se contempla que en algunas realizaciones, la región enlazadora es, es de al menos

o es como máximo de 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39 o 40 restos de longitud o cualquier intervalo derivable del mismo. En determinadas realizaciones, el enlazador tiene entre 3 y 30 restos (inclusive) de longitud.

Además de tener una región de miARN y una región complementaria, también puede haber secuencias flanqueantes en el extremo 5' o 3' de la región. En algunas realizaciones, hay o hay al menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 nucleótidos o más o cualquier intervalo derivable del mismo, flanqueando a uno o ambos lados de estas regiones.

En algunas realizaciones de la divulgación, los métodos y las composiciones que implican miARN pueden implicar miARN y/u otros ácidos nucleicos. Los ácidos nucleicos pueden tener, tener al menos o tener como máximo 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300, 310, 320, 330, 340, 350, 360, 370, 380, 390, 400, 410, 420, 430, 440, 441, 450, 460, 470, 480, 490, 500, 510, 520, 530, 540, 550, 560, 570, 580, 590, 600, 610, 620, 630, 640, 650, 660, 670, 680, 690, 700, 710, 720, 730, 740, 750, 760, 770, 780, 790, 800, 810, 820, 830, 840, 850, 860, 870, 880, 890, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990 o 1000 nucleótidos o cualquier intervalo derivable del mismo, de longitud. Dichas longitudes abarcan las longitudes de miARN procesado, sondas de miARN, miARN precursor, vectores que contienen miARN, ácidos nucleicos de control y otras sondas y cebadores. En muchas realizaciones, los miARN tienen 19-24 nucleótidos de longitud, mientras que las sondas de miARN tienen 5, 10, 15, 19, 20, 25, 30, hasta 35 nucleótidos de longitud, incluyendo todos los valores e intervalos intermedios, dependiendo de la longitud del miARN procesado y de las regiones flanqueantes añadidas. Los precursores de miARN tienen generalmente entre 62 y 110 nucleótidos en seres humanos.

Los ácidos nucleicos usados en las realizaciones de la divulgación pueden tener regiones de identidad o complementariedad con otro ácido nucleico. Se contempla que la región de complementariedad o identidad pueda ser de al menos 5 restos contiguos, aunque se contempla específicamente que la región sea, sea de al menos o sea como máximo de 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94,

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aproximadamente el 70%; d) aplicar la mezcla de lisado/alcohol a un soporte sólido; e) eluir las moléculas de miARN del soporte sólido con una solución iónica; y f) capturar las moléculas de miARN. Típicamente, la muestra se seca y resuspende en un líquido y un volumen adecuado para su posterior manipulación.

B. Preparación de ácidos nucleicos

Como alternativa, la síntesis de ácidos nucleicos se efectúa según métodos estándar. Véase, por ejemplo, Itakura y Riggs (1980). Además, las patentes de los Estados Unidos 4.704.362, 5.221.619 y 5.583.013 describen cada una diversos métodos para preparar ácidos nucleicos sintéticos. Los ejemplos no limitantes de un ácido nucleico sintético (por ejemplo, un oligonucleótido sintético), incluyen un ácido nucleico producido mediante síntesis química in vitro usando química de fosfotriéster, fosfito o fosforamidita y técnicas de fase sólida, tales como las descritas en el documento EP 266.032 o mediante intermedios de desoxinucleósido H-fosfonato, tal como se describe por Froehler et al., 1986 y la Patente de los Estados Unidos 5.705.629. En algunos métodos, pueden usarse uno o más oligonucleótidos. Se han divulgado varios mecanismos diferentes para la síntesis de oligonucleótidos en, por ejemplo, las patentes de los Estados Unidos 4.659.774, 4.816.571, 5.141.813, 5.264.566, 4.959.463, 5.428.148, 5.554.744, 5.574.146, 5.602.244.

Un ejemplo no limitante de un ácido nucleico producido enzimáticamente incluye uno producido por enzimas en reacciones de amplificación tales como PCR™ (véanse, por ejemplo, las Patentes de los Estados Unidos 4.683.202 y 4.682.195) o la síntesis de un oligonucleótido descrito en la Patente de los Estados Unidos 5.645.897. Un ejemplo no limitante de un ácido nucleico producido biológicamente incluye un ácido nucleico recombinante producido (es decir, replicado) en una célula viva, tal como un vector de ADN recombinante replicado en bacterias (véase, por ejemplo, Sambrook et al., 2001.

La síntesis de oligonucleótidos es bien conocida por los expertos en la materia. Se han divulgado varios mecanismos diferentes para la síntesis de oligonucleótidos en, por ejemplo, las patentes de los Estados Unidos 4.659.774, 4.816.571, 5.141.813, 5.264.566, 4.959.463, 5.428.148, 5.554.744, 5.574.146, 5.602.244.

Los métodos recombinantes para producir ácidos nucleicos en una célula son bien conocidos por los expertos en la materia. Estos incluyen el uso de vectores (víricos y no víricos), plásmidos, cósmidos y otros vehículos para suministrar un ácido nucleico a una célula, que pueden ser la célula diana (por ejemplo, una célula cancerosa) o simplemente una célula hospedadora (para producir grandes cantidades de la molécula de ARN deseada). Como alternativa, dichas vesículas pueden usarse en el contexto de un sistema libre de células en tanto que estén presentes los reactivos para generar la molécula de ARN. Dichos métodos incluyen aquellos descritos en Sambrook, 2003, Sambrook, 2001 y Sambrook, 1989.

En determinadas realizaciones, la presente invención se refiere a moléculas de ácido nucleico que no son sintéticas. En algunas realizaciones, la molécula de ácido nucleico tiene una estructura química de un ácido nucleico de origen natural y una secuencia de un ácido nucleico de origen natural, tal como la secuencia exacta y completa de un miARN primario monocatenario (véase Lee, 2002), un miARN precursor monocatenario o un miARN maduro monocatenario. Aparte del uso de tecnología recombinante, dichos ácidos nucleicos no sintéticos pueden generarse químicamente, tal como empleando tecnología usada para crear oligonucleótidos.

C. Marcadores y técnicas de marcaje

En algunas realizaciones, los métodos de la divulgación se refieren a miARN que están marcados directa o indirectamente. Se contempla que el miARN puede aislarse y/o purificarse en primer lugar antes del marcaje. Esto puede proporcionar una reacción que marque el miARN de manera más eficaz, en contraposición a otro ARN en una muestra en la que el miARN no se aísla o purifica antes del marcaje. En muchas realizaciones, el marcaje es no radiactivo. En general, los ácidos nucleicos pueden marcarse añadiendo nucleótidos marcados (proceso en una etapa) o añadiendo nucleótidos y marcando los nucleótidos añadidos (proceso en dos etapas).

En algunas realizaciones, los ácidos nucleicos se marcan añadiendo catalíticamente al ácido nucleico un nucleótido

o nucleótidos ya marcados. Pueden añadirse uno o más nucleótidos marcados a las moléculas de miARN. Véase la Patente de los Estados Unidos 6.723.509.

En otras realizaciones, se añaden catalíticamente un nucleótido o nucleótidos no marcados a un miARN y el nucleótido no marcado se modifica con un resto químico que le permite ser marcado posteriormente. En algunas realizaciones, el resto químico es una amina reactiva, de tal forma que el nucleótido es un nucleótido modificado con amina. Los ejemplos de nucleótidos modificados con amina son bien conocidos por los expertos en la materia, habiendo muchos disponibles comercialmente, tal como de Ambion, Sigma, Jena Bioscience y TriLink.

A diferencia del marcaje de ADNc durante su síntesis, el problema para marcar el miARN es cómo marcar la molécula ya existente. En algunos métodos, las realizaciones se refieren al uso de una enzima capaz de usar un ribonucleótido o desoxirribonucleótido di o trifosfato como sustrato para su adición a un miARN. Además, en realizaciones específicas, implica usar un ribonucleótido di o trifosfato modificado, que se añade al extremo 3' de un miARN. La fuente de la enzima no es limitante. Los ejemplos de fuentes para las enzimas incluyen levadura, bacterias gramnegativas, tales como E. coli, Lactococcus lactis y virus de la viruela ovina.

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Las enzimas capaces de añadir dichos nucleótidos incluyen, pero sin limitación, poli(A) polimerasa, transferasa terminal y polinucleótido fosforilasa. En realizaciones específicas, se contempla que una ligasa no sea la enzima usada para añadir el marcador y que en su lugar, se emplee una enzima no ligasa.

La transferasa terminal cataliza la adición de nucleótidos al extremo 3' de un ácido nucleico.

La polinucleótido fosforilasa puede polimerizar nucleótido difosfatos sin necesidad de un cebador.

Los marcadores sobre el miARN o las sondas de miARN pueden ser colorimétricos (que incluyen el espectro visible y UV, incluyendo fluorescentes), luminiscentes, enzimáticos o emisores de positrones (incluyendo radiactivos). El marcador puede detectarse directa o indirectamente. Los marcadores radiactivos incluyen 125I, 32P, 33P y 35S. Los ejemplos de marcadores enzimáticos incluyen fosfatasa alcalina, luciferasa, peroxidasa de rábano picante y βgalactosidasa. Los marcadores también pueden ser proteínas con propiedades luminiscentes, por ejemplo, proteína fluorescente verde y ficoeritrina.

Los marcadores colorimétricos y fluorescentes contemplados para su uso como conjugados incluyen, pero sin limitación, colorantes Alexa Fluor, colorantes BODIPY, tales como BODIPY FL; Azul Cascade; Amarillo Cascade; coumarina y sus derivados, tales como 7-amino-4-metilcoumarina, aminocoumarina e hidroxicoumarina; colorantes de cianina, tales como Cy3 y Cy5; eosinas y eritrosinas; fluoresceína y sus derivados, tales como isotiocianato de fluoresceína; quelatos macrocíclicos de iones de lantánidos, tales como Quantum Dye™; Azul Marina; Verde Oregon; colorantes de rodamina, tales como rojo de rodamina, tetrametilrodamina y rodamina 6G; Rojo Texas; colorantes de transferencia de energía fluorescente, tales como heterodímero de naranja de tiazol-etidio; y, TOTAB.

Los ejemplos específicos de colorantes incluyen, pero sin limitación, aquellos identificados anteriormente y los siguientes: Alexa Fluor 350, Alexa Fluor 405, Alexa Fluor 430, Alexa Fluor 488, Alexa Fluor 500, Alexa Fluor 514, Alexa Fluor 532, Alexa Fluor 546, Alexa Fluor 555, Alexa Fluor 568, Alexa Fluor 594, Alexa Fluor 610, Alexa Fluor 633, Alexa Fluor 647, Alexa Fluor 660, Alexa Fluor 680, Alexa Fluor 700, y, Alexa Fluor 750; colorantes BODIPY reactivos con amina, tales como BODIPY 493/503, BODIPY 530/550, BODIPY 558/568, BODIPY 564/570, BODIPY 576/589, BODIPY 581/591, BODIPY 630/650, BODIPY 650/655, BODIPY FL, BODIPY R6G, BODIPY TMR y, BODIPY-TR; Cy3, Cy5, 6-FAM, isotiocianato de fluoresceína, HEX, 6-JOE, Verde Oregón 488, Verde Oregón 500, Verde Oregón 514, Azul Pacífico, REG, verde rodamina, rojo rodamina, renografina, ROX, SYPRO, TAMRA, 2',4',5',7'-tetrabromosulfonafluoresceína y TET.

Los ejemplos específicos de ribonucleótidos marcados fluorescentemente están disponibles de Molecular Probes y estos incluyen, Alexa Fluor 488-5-UTP, fluoresceína-12-UTP, BODIPY FL-14-UTP, BODIPY TMR-14-UTP, tetrametilrodamina-6-UTP, Alexa Fluor 546-14-UTP, rojo Texas-5-UTP y BODIPY TR-14-UTP. Hay disponibles otros ribonucleótidos fluorescentes de Amersham Biosciences, tales como Cy3-UTP y Cy5-UTP.

Los ejemplos de desoxirribonucleótidos marcados fluorescentemente incluyen dinitrofenilo (DNP)-11-dUTP, azul Cascade-7-dUTP, Alexa Fluor 488-5-dUTP, fluoresceína-12-dUTP, verde Oregón 488-5-dUTP, BODIPY FL-14dUTP, verde rodamina-5-dUTP, Alexa Fluor 532-5-dUTP, BODIPY TMR-14-dUTP, tetrametilrodamina-6-dUTP, Alexa Fluor 546-14-dUTP, Alexa Fluor 568-5-dUTP, rojo Texas-12-dUTP, rojo Texas-5-dUTP, BODIPY TR-14-dUTP, Alexa Fluor 594-5-dUTP, BODIPY 630/650-14-dUTP, BODIPY 650/665-14-dUTP; Alexa Fluor 488-7-OBEA-dCTP, Alexa Fluor 546-16-OBEA-dCTP, Alexa Fluor 594-7-OBEA-dCTP, Alexa Fluor 647-12-OBEA-dCTP.

Se contempla que los ácidos nucleicos pueden marcarse con dos marcadores diferentes. Además, puede emplearse transferencia de energía de resonancia de fluorescencia (FRET) (por ejemplo, Klostermeier et al., 2002; Emptage, 2001; Didenko, 2001).

Como alternativa, el marcador puede no ser detectable per se, pero detectable de manera indirecta o permitiendo el aislamiento o la separación del ácido nucleico diana. Por ejemplo, el marcador puede ser biotina, digoxigenina, cationes polivalentes, grupos quelantes y otros ligandos, incluyendo ligandos para un anticuerpo.

Hay fácilmente disponible una serie de técnicas para visualizar o detectar ácidos nucleicos marcados. Dichas técnicas incluyen, microscopía, matrices, fluorimetría, cicladores lumínicos u otras máquinas de PCR en tiempo real, análisis FACS, contadores de centelleo, Phosphoimagers, contadores Geiger, IRM, TAC, métodos de detección a base de anticuerpos (transferencias de Western, inmunofluorescencia, inmunohistoquímica), técnicas histoquímicas, HPLC (Griffey et al., 1997), espectroscopía, electroforesis capilar en gel (Cummins et al., 1996), espectroscopía; espectroscopía de masas; técnicas radiológicas; y técnicas de equilibrio de masas.

Cuando se emplean dos o más marcadores coloreados de manera diferencial, pueden emplearse técnicas de transferencia de energía de resonancia de fluorescencia (FRET) para caracterizar la asociación de uno o más ácidos nucleicos. Además, un experto habitual en la materia será conocedor de los modos de visualización, identificación y caracterización de ácidos nucleicos y por consiguiente, pueden usarse dichos protocolos como parte de algunas realizaciones. Los ejemplos de herramientas que pueden usarse incluyen también microscopía de fluorescencia, un Bioanalizador, un lector de placas, Storm (Molecular Dynamics), escáner de matriz, FACS (clasificador celular activado por fluorescencia) o cualquier instrumento que tenga la capacidad de excitar y detectar una molécula fluorescente.

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IV. KITS

Cualquiera de las composiciones o componentes de la divulgación descrita en la presente memoria puede estar comprendida en un kit. En un ejemplo no limitante, los reactivos para aislar miARN, marcar miARN y/o evaluar una población de miARN usando una matriz, amplificación y/o hibridación de ácidos nucleicos pueden incluirse en un kit, así como los reactivos para la preparación de muestras de muestras de colon. El kit puede incluir además reactivos para crear o sintetizar sondas de miARN. Los kits comprenderán, por lo tanto, en medios contenedores adecuados, una enzima para marcar el miARN incorporando nucleótidos marcados o nucleótidos no marcados que posteriormente se marcan. En determinados aspectos, el kit puede incluir reactivos de amplificación. En otros aspectos, el kit puede incluir diversos soportes, tales como vidrio, nylon, perlas poliméricas, perlas magnéticas y similares y/o reactivos para acoplar cualquier sonda y/o ácidos nucleicos diana. También puede incluir uno o más tampones, tales como tampón de reacción, tampón de marcaje, tampón de lavado o un tampón de hibridación, compuestos para preparar las sondas de miARN y componentes para aislar miARN. Otros kits de la divulgación pueden incluir componentes para producir una matriz de ácido nucleico que comprenda miARN y por lo tanto, pueden incluir, por ejemplo, un soporte sólido.

Se contemplan específicamente kits para implementar los métodos de la invención descrita en la presente memoria. En algunas realizaciones, hay kits para preparar miARN para su marcaje múltiple y kits para preparar sondas de miARN y/o matrices de miARN. En estas realizaciones, el kit comprende, en medios contenedores adecuados, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 o más de los siguientes: (1) poli(A) polimerasa; (2) nucleótidos no modificados (G, A, T, C y/o U); (3) un nucleótido modificado (marcado o no marcado); (4) tampón de poli(A) polimerasa; y, (5) al menos un microfiltro; (6) marcador que pueda unirse a un nucleótido; (7) al menos una sonda de miARN; (8) tampón de reacción; (9) una matriz de miARN o componentes para producir dicha matriz; (10) ácido acético; (11) alcohol; (12) soluciones para preparar, aislar, enriquecer y purificar miARN o sondas o matrices de miARN. Otros reactivos incluyen aquellos usados generalmente para manipular ARN, tales como formamida, colorante de carga, inhibidores de ribonucleasa y DNasa.

En realizaciones específicas, los kits de la divulgación incluyen una matriz que contiene sondas de miARN, tal como se describe en la solicitud. Una matriz puede tener sondas correspondientes a todos los miARN conocidos de un organismo o un tejido u órgano particular en condiciones particulares o a un subconjunto de dichas sondas. El subconjunto de sondas sobre las matrices de la invención puede ser o incluir aquellas identificadas como relevantes para una aplicación diagnóstica, terapéutica o pronóstica particular. Por ejemplo, la matriz puede contener una o más sondas que indiquen o sugieran (1) una enfermedad o afección (cáncer de tiroides), (2) susceptibilidad o resistencia a un fármaco o tratamiento particular; (3) susceptibilidad a la toxicidad de un fármaco o sustancia; (4) el estadio de desarrollo o la gravedad de una enfermedad o afección (pronóstico); y (5) predisposición genética a una enfermedad o afección.

Para cualquier realización de un kit, que incluye una matriz, puede haber moléculas de ácido nucleico que contengan

o que puedan usarse para amplificar una secuencia que sea una variante de, idéntica a o complementaria a la totalidad o parte de cualquiera de las secuencias descritas en la presente memoria. Puede implementarse cualquier ácido nucleico descrito en el presente documento como parte de un kit.

Los componentes de los kits pueden estar envasados en medio acuoso o en forma liofilizada. Los medios contenedores de los kits incluirán generalmente al menos un vial, tubo de ensayo, matraz, botella, jeringuilla u otros medios contenedores, en los que puede colocarse un componente y preferentemente, separarse en alícuotas de manera adecuada. En los casos donde haya más de un componente en el kit (el reactivo de marcaje y el marcador pueden envasarse juntos), el kit también contendrá generalmente un segundo, tercero u otro contenedor adicional en el que pueden colocarse por separado componentes adicionales. Sin embargo, varias combinaciones de componentes pueden estar comprendidas en un vial. Los kits de la presente invención también incluirán típicamente un medio para contener los ácidos nucleicos y otros contenedores de reactivo en confinamiento cerrado para su venta comercial. Dichos contenedores pueden incluir contenedores moldeados por inyección o sopado en los que se retienen los viales deseados.

Cuando los componentes del kit se proporcionan en una y/o más soluciones líquidas, la solución líquida es una solución acuosa, prefiriéndose particularmente una solución acuosa estéril.

Sin embargo, los componentes del kit pueden proporcionarse en forma de polvo seco. Cuando los reactivos y/o componentes se proporcionan en forma de polvo seco, el polvo puede reconstituirse mediante la adición de un disolvente adecuado. Se prevé que el disolvente también puede proporcionarse en otros medios contenedores. En algunas realizaciones, se proporcionan los colorantes de marcado en forma de polvo seco. Se contempla que se proporcionen 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 120, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000 µg o al menos o como máximo aquellas cantidades de colorante seco en los kits de la invención. El colorante puede resuspenderse posteriormente en cualquier disolvente adecuado, tal como DMSO.

Los medios contenedores incluirán generalmente al menos un vial, tubo de ensayo, matraz, botella, jeringuilla y/u otros medios contenedores, en los que se colocan las formulaciones de ácido nucleico, preferentemente, ubicadas de manera adecuada. Los kits también pueden comprender un segundo medio contenedor para contener un tampón

estéril farmacéuticamente aceptable y/u otro diluyente.

Los kits de la presente divulgación también incluirán típicamente un medio para contener los viales en confinamiento cerrado para su venta comercial, tal como, por ejemplo, contenedores moldeados por inyección y/o sopado en los que se retienen los viales deseados.

5 Dichos kits también pueden incluir componentes que facilitan el aislamiento del miARN marcado. También puede incluir componentes que preservan o mantienen el miARN o que lo protegen frente a su degradación. Dichos componentes pueden estar libres de RNasa o protegidos frente a RNasas. Dichos kits comprenderán generalmente, en medios adecuados, distintos contenedores para cada reactivo o solución individual.

Un kit también incluirá instrucciones para emplear los componentes del kit, así como el uso de cualquier otro reactivo 10 no incluido en el kit. Las instrucciones pueden incluir variaciones que pueden implementarse.

Los kits de la divulgación también pueden incluir uno o más de los siguientes: ARN de control; agua libre de nucleasas; contenedores libres de RNasa, tales como tubos de 1,5 ml; tubos de elución libres de RNasa; PEG o dextrano; etanol; ácido acético; acetato de sodio; acetato de amonio; guanidinio; detergente; marcador de tamaño de ácido nucleico; puntas para tubos libres de RNasa; e inhibidores de RNasa o DNasa.

15 Se contempla que dichos reactivos sean realizaciones de los kits de la divulgación. Dichos kits, sin embargo, no están limitados a los artículos particulares identificados anteriormente y pueden incluir cualquier reactivo usado para la manipulación o caracterización de miARN.

Tabla 1. Números de referencia de microARN. Los números de referencia corresponden a aquellos lisados en la base de datos Sanger miRBase, versión 12.0 de microARN (Griffiths-Jones et al., 2006) y se incorporan a la

20 presente memoria por referencia en su totalidad a efectos del 16 de noviembre de 2010, así como las secuencias representadas en cada entrada de base de datos.

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-let-7a

MIMAT0000062 MI0000062

hsa-let-7a*

MIMAT0004481 MI0000062

hsa-let-7b

MIMAT0000063 MI0000063

hsa-let-7b*

MIMAT0004482 MI0000063

hsa-let-7c

MIMAT0000064 MI0000064

hsa-let-7c*

MIMAT0004483 MI0000064

hsa-let-7d

MIMAT0000065 MI0000065

hsa-let-7d*

MIMAT0004484 MI0000065

hsa-let-7e

MIMAT0000066 MI0000066

hsa-let-7e*

MIMAT0004485 MI0000066

hsa-let-7f

MIMAT0000067 MI0000068

hsa-let-7f-1*

MIMAT0004486 MI0000067

hsa-let-7g

MIMAT0000414 MI0000433

hsa-let-7g*

MIMAT0004584 MI0000433

hsa-let-7i

MIMAT0000415 MI0000434

hsa-let-7i*

MIMAT0004585 MI0000434

hsa-miR-1

MIMAT0000416 MI0000437

hsa-miR-100

MIMAT0000098 MI0000102

hsa-miR-100*

MIMAT0004512 MI0000102

hsa-miR-101

MIMAT0000099 MI0000739

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-101*

MIMAT0004513 MI0000103

hsa-miR-103

MIMAT0000101 MI0000108

hsa-miR-105

MIMAT0000102 MI0000112

hsa-miR-105*

MIMAT0004516 MI0000112

hsa-miR-106b

MIMAT0000680 MI0000734

hsa-miR-107

MIMAT0000104 MI0000114

hsa-miR-10a

MIMAT0000253 MI0000266

hsa-miR-10a*

MIMAT0004555 MI0000266

hsa-miR-10b

MIMAT0000254 MI0000267

hsa-miR-10b*

MIMAT0004556 MI0000267

hsa-miR-1180

MIMAT0005825 MI0006273

hsa-miR-1181

MIMAT0005826 MI0006274

hsa-miR-1182

MIMAT0005827 MI0006275

hsa-miR-1183

MIMAT0005828 MI0006276

hsa-miR-1185

MIMAT0005798 MI0003844

hsa-miR-1201

MIMAT0005864 MI0006333

hsa-miR-1202

MIMAT0005865 MI0006334

hsa-miR-1203

MIMAT0005866 MI0006335

hsa-miR-1207-5p

MIMAT0005871 MI0006340

hsa-miR-1208

MIMAT0005873 MI0006341

hsa-miR-122

MIMAT0000421 MI0000442

hsa-miR-122*

MIMAT0004590 MI0000442

hsa-miR-1224-5p

MIMAT0005458 MI0003764

hsa-miR-1225-3p

MIMAT0005573 MI0006311

hsa-miR-1225-Sp

MIMAT0005572 MI0006311

hsa-miR-1226*

MIMAT0005576 MI0006313

hsa-miR-1227

MIMAT0005580 MI0006316

hsa-miR-1228

MIMAT0005583 MI0006318

hsa-miR-1228*

MIMAT0005582 MI0006318

hsa-miR-1229

MIMAT0005584 MI0006319

hsa-miR-1234

MIMAT0005589 MI0006324

hsa-miR-1237

MIMAT0005592 MI0006327

hsa-miR-1238

MIMAT0005593 MI0006328

hsa-miR-124

MIMAT0000422 MI0000445

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-124*

MIMAT0004591 MI0000445

hsa-miR-1244

MIMAT0005896 MI0006379

hsa-miR-1246

MIMAT0005898 MI0006381

hsa-miR-1249

MIMAT0005901 MI0006384

hsa-miR-1250

MIMAT0005902 MI0006385

hsa-miR-1251

MIMAT0005903 MI0006386

hsa-miR-125a-3p

MIMAT0004602 MI0000469

hsa-miR-125a-5p

MIMAT0000443 MI0000469

hsa-miR-125b

MIMAT0000423 MI0000446

hsa-miR-125b-1*

MIMAT0004592 MI0000446

hsa-miR-125b-2*

MIMAT0004603 MI0000470

hsa-miR-126

MIMAT0000445 MI0000471

hsa-miR-126*

MIMAT0000444 MI0000471

hsa-miR-1260

MIMAT0005911 MI0006394

hsa-miR-1268

MIMAT0005922 MI0006405

hsa-miR-127-3p

MIMAT0000446 MI0000472

hsa-miR-127-5p

MIMAT0004604 MI0000472

hsa-miR-1270

MIMAT0005924 MI0006407

hsa-miR-1271

MIMAT0005796 MI0003814

hsa-miR-1274a

MIMAT0005927 MI0006410

hsa-miR-1274b

MIMAT0005938 MI0006427

hsa-miR-1275

MIMAT0005929 MI0006415

hsa-miR-1276

MIMAT0005930 MI0006416

hsa-miR-128

MIMAT0000424 MI0000727

hsa-miR-1280

MIMAT0005946 MI0006437

hsa-miR-1281

MIMAT0005939 MI0006428

hsa-miR-1285

MIMAT0005876 MI0006347

hsa-miR-1287

MIMAT0005878 MI0006349

hsa-miR-1288

MIMAT0005942 MI0006432

hsa-miR-129*

MIMAT0004548 MI0000252

hsa-miR-129-3p

MIMAT0004605 MI0000473

hsa-miR-129-5p

MIMAT0000242 MI0000473

hsa-miR-1290

MIMAT0005880 MI0006352

hsa-miR-1291

MIMAT0005881 MI0006353

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-1295

MIMAT0005885 MI0006357

hsa-miR-1296

MIMAT0005794 MI0003780

hsa-miR-1299

MIMAT0005887 MI0006359

hsa-miR-1300

MIMAT0005888 MI0006360

hsa-miR-1301

MIMAT0005797 MI0003815

hsa-miR-1303

MIMAT0005891 MI0006370

hsa-miR-1305

MIMAT0005893 MI0006372

hsa-miR-1306

MIMAT0005950 MI0006443

hsa-miR-1307

MIMAT0005951 MI0006444

hsa-miR-1308

MIMAT0005947 MI0006441

hsa-miR-130a

MIMAT0000425 MI0000448

hsa-miR-130b

MIMAT0000691 MI0000748

hsa-miR-130b*

MIMAT0004680 MI0000748

hsa-miR-132

MIMAT0000426 MI0000449

hsa-miR-132*

MIMAT0004594 MI0000449

hsa-miR-1321

MIMAT0005952 MI0006652

hsa-miR-1323

MIMAT0005795 MI0003786

hsa-miR-133a

MIMAT0000427 MI0000451

hsa-miR-133b

MIMAT0000770 MI0000822

hsa-miR-134

MIMAT0000447 MI0000474

hsa-miR-135a

MIMAT0000428 MI0000452

hsa-miR-135a*

MIMAT0004595 MI0000452

hsa-miR-135b

MIMAT0000758 MI0000810

hsa-miR-136

MIMAT0000448 MI0000475

hsa-miR-136*

MIMAT0004606 MI0000475

hsa-miR-137

MIMAT0000429 MI0000454

hsa-miR-138

MIMAT0000430 MI0000455

hsa-miR-138-1*

MIMAT0004607 MI0000476

hsa-miR-138-2*

MIMAT0004596 MI0000455

hsa-miR-139-3p

MIMAT0004552 MI0000261

hsa-miR-139-5p

MIMAT0000250 MI0000261

hsa-miR-140-3p

MIMAT0004597 MI0000456

hsa-miR-140-5p

MIMAT0000431 MI0000456

hsa-miR-141

MIMAT0000432 MI0000457

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-141*

MIMAT0004598 MI0000457

hsa-miR-142-3p

MIMAT0000434 MI0000458

hsa-miR-142-5p

MIMAT0000433 MI0000458

hsa-miR-143

MIMAT0000435 MI0000459

hsa-miR-143*

MIMAT0004599 MI0000459

hsa-miR-144

MIMAT0000436 MI0000460

hsa-miR-144*

MIMAT0004600 MI0000460

hsa-miR-145

MIMAT0000437 MI0000461

hsa-miR-145*

MIMAT0004601 MI0000461

hsa-miR-1469

MIMAT0007347 MI0007074

hsa-miR-146a

MIMAT0000449 MI0000477

hsa-miR-146b-3p

MIMAT0004766 MI0003129

hsa-miR-146b-5p

MIMAT0002809 MI0003129

hsa-miR-1471

MIMAT0007349 MI0007076

hsa-miR-148a

MIMAT0000243 MI0000253

hsa-miR-148a*

MIMAT0004549 MI0000253

hsa-miR-148b

MIMAT0000759 MI0000811

hsa-miR-148b*

MIMAT0004699 MI0000811

hsa-miR-149

MIMAT0000450 MI0000478

hsa-miR-149*

MIMAT0004609 MI0000478

hsa-miR-150

MIMAT0000451 MI0000479

hsa-miR-150*

MIMAT0004610 MI0000479

hsa-miR-151-3p

MIMAT0000757 MI0000809

hsa-miR-151-5p

MIMAT0004697 MI0000809

hsa-miR-152

MIMAT0000438 MI0000462

hsa-miR-153

MIMAT0000439 MI0000463

hsa-miR-1539

MIMAT0007401 MI0007260

hsa-miR-154

MIMAT0000452 MI0000480

hsa-miR-154*

MIMAT0000453 MI0000480

hsa-miR-155

MIMAT0000646 MI0000681

hsa-miR-155*

MIMAT0004658 MI0000681

hsa-miR-15a

MIMAT0000068 MI0000069

hsa-miR-15a*

MIMAT0004488 MI0000069

hsa-miR-15b

MIMAT0000417 MI0000438

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-15b*

MIMAT0004586 MI0000438

hsa-miR-16

MIMAT0000069 MI0000115

hsa-miR-16-2*

MIMAT0004518 MI0000115

hsa-miR-17

MIMAT0000070 MI0000071

hsa-miR-17*

MIMAT0000071 MI0000071

hsa-miR-181a

MIMAT0000256 MI0000289

hsa-miR-181a*

MIMAT0000270 MI0000289

hsa-miR-181a-2*

MIMAT0004558 MI0000269

hsa-miR-181b

MIMAT0000257 MI0000683

hsa-miR-181c

MIMAT0000258 MI0000271

hsa-miR-181c*

MIMAT0004559 MI0000271

hsa-miR-181d

MIMAT0002821 MI0003139

hsa-miR-182

MIMAT0000259 MI0000272

hsa-miR-182*

MIMAT0000260 MI0000272

hsa-miR-1825

MIMAT0006765 MI0008193

hsa-miR-1826

MIMAT0006766 MI0008194

hsa-miR-1827

MIMAT0006767 MI0008195

hsa-miR-183

MIMAT0000261 MI0000273

hsa-miR-183*

MIMAT0004560 MI0000273

hsa-miR-184

MIMAT0000454 MI0000481

hsa-miR-185

MIMAT0000455 MI0000482

hsa-miR-186

MIMAT0000456 MI0000483

hsa-miR-187*

MIMAT0004561 MI0000274

hsa-miR-188-3p

MIMAT0004613 MI0000484

hsa-miR-188-5p

MIMAT0000457 MI0000484

hsa-miR-18a

MIMAT0000072 MI0000072

hsa-miR-18b

MIMAT0001412 MI0001518

hsa-miR-18b*

MIMAT0004751 MI0001518

hsa-miR-190

MIMAT0000458 MI0000486

hsa-miR-1909*

MIMAT0007882 MI0008330

hsa-miR-191

MIMAT0000440 MI0000465

hsa-miR-191*

MIMAT0001618 MI0000465

hsa-miR-1910

MIMAT0007884 MI0008331

hsa-miR-1914

MIMAT0007889 MI0008335

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-1914*

MIMAT0007890 MI0008335

hsa-miR-1915

MIMAT0007892 MI0008336

hsa-miR-1915*

MIMAT0007891 MI0008336

hsa-miR-192

MIMAT0000222 MI0000234

hsa-miR-192*

MIMAT0004543 MI0000234

hsa-miR-193a-3p

MIMAT0000459 MI0000487

hsa-miR-193a-Sp

MIMAT0004614 MI0000487

hsa-miR-193b

MIMAT0002819 MI0003137

hsa-miR-193b*

MIMAT0004767 MI0003137

hsa-miR-194

MIMAT0000460 MI0000732

hsa-miR-194*

MIMAT0004671 MI0000732

hsa-miR-195

MIMAT0000461 MI0000489

hsa-miR-195*

MIMAT0004615 MI0000489

hsa-miR-196a

MIMAT0000226 MI0000279

hsa-miR-196b

MIMAT0001080 MI0001150

hsa-miR-197

MIMAT0000227 MI0000239

hsa-miR-198

MIMAT0000228 MI0000240

hsa-miR-199a-3p

MIMAT0000232 MI0000242

hsa-miR-199a-5p

MIMAT0000231 MI0000242

hsa-miR-199b-5p

MIMAT0000263 MI0000282

hsa-miR-19a

MIMAT0000073 MI0000073

hsa-miR-19b

MIMAT0000074 MI0000074

hsa-miR-19b-1*

MIMAT0004491 MI0000074

hsa-miR-200a

MIMAT0000682 MI0000737

hsa-miR-200a*

MIMAT0001620 MI0000737

hsa-miR-200b

MIMAT0000318 MI0000342

hsa-miR-200b*

MIMAT0004571 MI0000342

hsa-miR-200c

MIMAT0000617 MI0000650

hsa-miR-200c*

MIMAT0004657 MI0000650

hsa-miR-202

MIMAT0002811 MI0003130

hsa-miR-203

MIMAT0000264 MI0000283

hsa-miR-204

MIMAT0000265 MI0000284

hsa-miR-205

MIMAT0000266 MI0000285

hsa-miR-206

MIMAT0000462 MI0000490

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-208b

MIMAT0004960 MI0005570

hsa-miR-20a

MIMAT0000075 MI0000076

hsa-miR-20a*

MIMAT0004493 MI0000076

hsa-miR-20b

MIMAT0001413 MI0001519

hsa-miR-21

MIMAT0000076 MI0000077

hsa-miR-21*

MIMAT0004494 MI0000077

hsa-miR-210

MIMAT0000267 MI0000286

hsa-miR-211

MIMAT0000268 MI0000287

hsa-miR-212

MIMAT0000269 MI0000288

hsa-miR-214

MIMAT0000271 MI0000290

hsa-miR-214*

MIMAT0004564 MI0000290

hsa-miR-215

MIMAT0000272 MI0000291

hsa-miR-216a

MIMAT0000273 MI0000292

hsa-miR-216b

MIMAT0004959 MI0005569

hsa-miR-218

MIMAT0000275 MI0000294

hsa-miR-219-5p

MIMAT0000276 MI0000296

hsa-miR-22

MIMAT0000077 MI0000078

hsa-miR-22*

MIMAT0004495 MI0000078

hsa-miR-221

MIMAT0000278 MI0000298

hsa-miR-221*

MIMAT0004568 MI0000298

hsa-miR-222

MIMAT0000279 MI0000299

hsa-miR-222*

MIMAT0004569 MI0000299

hsa-miR-223

MIMAT0000280 MI0000300

hsa-miR-223*

MIMAT0004570 MI0000300

hsa-miR-224

MIMAT0000281 MI0000301

hsa-miR-23a

MIMAT0000078 MI0000079

hsa-miR-23a*

MIMAT0004496 MI0000079

hsa-miR-23b

MIMAT0000418 MI0000439

hsa-miR-23b*

MIMAT0004587 MI0000439

hsa-miR-24

MIMAT0000080 MI0000081

hsa-miR-24-1*

MIMAT0000079 MI0000080

hsa-miR-25

MIMAT0000081 MI0000082

hsa-miR-26a

MIMAT0000082 MI0000083

hsa-miR-26a-1*

MIMAT0004499 MI0000083

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-26b

MIMAT0000083 MI0000084

hsa-miR-26b*

MIMAT0004500 MI0000084

hsa-miR-27a

MIMAT0000084 MI0000085

hsa-miR-27a*

MIMAT0004501 MI0000085

hsa-miR-27b

MIMAT0000419 MI0000440

hsa-miR-28-3p

MIMAT0004502 MI0000086

hsa-miR-28-5p

MIMAT0000085 MI0000086

hsa-miR-296-5p

MIMAT0000690 MI0000747

hsa-miR-298

MIMAT0004901 MI0005523

hsa-miR-299-3p

MIMAT0000687 MI0000744

hsa-miR-299-5p

MIMAT0002890 MI0000744

hsa-miR-29a

MIMAT0000086 MI0000087

hsa-miR-29a*

MIMAT0004503 MI0000087

hsa-miR-29b

MIMAT0000100 MI0000107

hsa-miR-29b-1*

MIMAT0004514 MI0000105

hsa-miR-29b-2*

MIMAT0004515 MI0000107

hsa-miR-29c

MIMAT0000681 MI0000735

hsa-miR-29c*

MIMAT0004673 MI0000735

hsa-miR-300

MIMAT0004903 MI0005525

hsa-miR-301a

MIMAT0000688 MI0000745

hsa-miR-301b

MIMAT0004958 MI0005568

hsa-miR-302c*

MIMAT0000716 MI0000773

hsa-miR-30a

MIMAT0000087 MI0000088

hsa-miR-30a*

MIMAT0000088 MI0000088

hsa-miR-30b

MIMAT0000420 MI0000441

hsa-miR-30b*

MIMAT0004589 MI0000441

hsa-miR-30c

MIMAT0000244 MI0000254

hsa-miR-30c-1*

MIMAT0004674 MI0000736

hsa-miR-30c-2*

MIMAT0004550 MI0000254

hsa-miR-30d

MIMAT0000245 MI0000255

hsa-miR-30d*

MIMAT0004551 MI0000255

hsa-miR-30e

MIMAT0000692 MI0000749

hsa-miR-30e*

MIMAT0000693 MI0000749

hsa-miR-31

MIMAT0000089 MI0000089

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-31 *

MIMAT0004504 MI0000089

hsa-miR-32

MIMAT0000090 MI0000090

hsa-miR-320a

MIMAT0000510 MI0000542

hsa-miR-320b

MIMAT0005792 MI0003839

hsa-miR-320c

MIMAT0005793 MI0003778

hsa-miR-320d

MIMAT0006764 MI0008192

hsa-miR-323-3p

MIMAT0000755 MI0000807

hsa-miR-324-3p

MIMAT0000762 MI0000813

hsa-miR-324-5p

MIMAT0000761 MI0000813

hsa-miR-326

MIMAT0000756 MI0000808

hsa-miR-328

MIMAT0000752 MI0000804

hsa-miR-329

MIMAT0001629 MI0001726

hsa-miR-330-3p

MIMAT0000751 MI0000803

hsa-miR-331-3p

MIMAT0000760 MI0000812

hsa-miR-335

MIMAT0000765 MI0000816

hsa-miR-335*

MIMAT0004703 MI0000816

hsa-miR-337-3p

MIMAT0000754 MI0000806

hsa-miR-337-Sp

MIMAT0004695 MI0000806

hsa-miR-338-3p

MIMAT0000763 MI0000814

hsa-miR-338-Sp

MIMAT0004701 MI0000814

hsa-miR-339-3p

MIMAT0004702 MI0000815

hsa-miR-339-5p

MIMAT0000764 MI0000815

hsa-miR-33a

MIMAT0000091 MI0000091

hsa-miR-33b

MIMAT0003301 MI0003646

hsa-miR-33b*

MIMAT0004811 MI0003646

hsa-miR-340

MIMAT0004692 MI0000802

hsa-miR-340*

MIMAT0000750 MI0000802

hsa-miR-342-3p

MIMAT0000753 MI0000805

hsa-miR-342-5p

MIMAT0004694 MI0000805

hsa-miR-345

MIMAT0000772 MI0000825

hsa-miR-346

MIMAT0000773 MI0000826

hsa-miR-34a

MIMAT0000255 MI0000268

hsa-miR-34a*

MIMAT0004557 MI0000268

hsa-miR-34b

MIMAT0004676 MI0000742

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-34b*

MIMAT0000685 MI0000742

hsa-miR-34c-3p

MIMAT0004677 MI0000743

hsa-miR-34c-5p

MIMAT0000686 MI0000743

hsa-miR-361-3p

MIMAT0004682 MI0000760

hsa-miR-361-5p

MIMAT0000703 MI0000760

hsa-miR-362-3p

MIMAT0004683 MI0000762

hsa-miR-362-5p

MIMAT0000705 MI0000762

hsa-miR-363

MIMAT0000707 MI0000764

hsa-miR-365

MIMAT0000710 MI0000769

hsa-miR-369-3p

MIMAT0000721 MI0000777

hsa-miR-369-5p

MIMAT0001621 MI0000777

hsa-miR-370

MIMAT0000722 MI0000778

hsa-miR-371-5p

MIMAT0004687 MI0000779

hsa-miR-373*

MIMAT0000725 MI0000781

hsa-miR-374a

MIMAT0000727 MI0000782

hsa-miR-374b

MIMAT0004955 MI0005566

hsa-miR-374b*

MIMAT0004956 MI0005566

hsa-miR-375

MIMAT0000728 MI0000783

hsa-miR-376a

MIMAT0000729 MI0000784

hsa-miR-376a*

MIMAT0003386 MI0000784

hsa-miR-376b

MIMAT0002172 MI0002466

hsa-miR-376c

MIMAT0000720 MI0000776

hsa-miR-377

MIMAT0000730 MI0000785

hsa-miR-377*

MIMAT0004689 MI0000785

hsa-miR-378

MIMAT0000732 MI0000786

hsa-miR-378*

MIMAT0000731 MI0000786

hsa-miR-379

MIMAT0000733 MI0000787

hsa-miR-381

MIMAT0000736 MI0000789

hsa-miR-382

MIMAT0000737 MI0000790

hsa-miR-409-3p

MIMAT0001639 MI0001735

hsa-miR-409-5p

MIMAT0001638 MI0001735

hsa-miR-410

MIMAT0002171 MI0002465

hsa-miR-411

MIMAT0003329 MI0003675

hsa-miR-421

MIMAT0003339 MI0003685

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-422a

MIMAT0001339 MI0001444

hsa-miR-423-3p

MIMAT0001340 MI0001445

hsa-miR-423-5p

MIMAT0004748 MI0001445

hsa-miR-424

MIMAT0001341 MI0001446

hsa-miR-424*

MIMAT0004749 MI0001446

hsa-miR-425

MIMAT0003393 MI0001448

hsa-miR-425*

MIMAT0001343 MI0001448

hsa-miR-429

MIMAT0001536 MI0001641

hsa-miR-431

MIMAT0001625 MI0001721

hsa-miR-431*

MIMAT0004757 MI0001721

hsa-miR-432

MIMAT0002814 MI0003133

hsa-miR-433

MIMAT0001627 MI0001723

hsa-miR-449a

MIMAT0001541 MI0001648

hsa-miR-449b

MIMAT0003327 MI0003673

hsa-miR-450a

MIMAT0001545 MI0003187

hsa-miR-450b-5p

MIMAT0004909 MI0005531

hsa-miR-451

MIMAT0001631 MI0001729

hsa-miR-452

MIMAT0001635 MI0001733

hsa-miR-454

MIMAT0003885 MI0003820

hsa-miR-454*

MIMAT0003884 MI0003820

hsa-miR-455-3p

MIMAT0004784 MI0003513

hsa-miR-455-5p

MIMAT0003150 MI0003513

hsa-miR-483-3p

MIMAT0002173 MI0002467

hsa-miR-483-5p

MIMAT0004761 MI0002467

hsa-miR-484

MIMAT0002174 MI0002468

hsa-miR-485-3p

MIMAT0002176 MI0002469

hsa-miR-485-5p

MIMAT0002175 MI0002469

hsa-miR-486-3p

MIMAT0004762 MI0002470

hsa-miR-486-5p

MIMAT0002177 MI0002470

hsa-miR-487a

MIMAT0002178 MI0002471

hsa-miR-487b

MIMAT0003180 MI0003530

hsa-miR-488

MIMAT0004763 MI0003123

hsa-miR-488*

MIMAT0002804 MI0003123

hsa-miR-489

MIMAT0002805 MI0003124

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-490-3p

MIMAT0002806 MI0003125

hsa-miR-490-5p

MIMAT0004764 MI0003125

hsa-miR-491-5p

MIMAT0002807 MI0003126

hsa-miR-493

MIMAT0003161 MI0003132

hsa-miR-493*

MIMAT0002813 MI0003132

hsa-miR-494

MIMAT0002816 MI0003134

hsa-miR-495

MIMAT0002817 MI0003135

hsa-miR-497

MIMAT0002820 MI0003138

hsa-miR-498

MIMAT0002824 MI0003142

hsa-miR-499-5p

MIMAT0002870 MI0003183

hsa-miR-500

MIMAT0004773 MI0003184

hsa-miR-500*

MIMAT0002871 MI0003184

hsa-miR-501-3p

MIMAT0004774 MI0003185

hsa-miR-501-5p

MIMAT0002872 MI0003185

hsa-miR-502-3p

MIMAT0004775 MI0003186

hsa-miR-502-5p

MIMAT0002873 MI0003186

hsa-miR-503

MIMAT0002874 MI0003188

hsa-miR-505

MIMAT0002876 MI0003190

hsa-miR-505*

MIMAT0004776 MI0003190

hsa-miR-506

MIMAT0002878 MI0003193

hsa-miR-508-5p

MIMAT0004778 MI0003195

hsa-miR-509-3-5p

MIMAT0004975 MI0005717

hsa-miR-509-3p

MIMAT0002881 MI0005717

hsa-miR-509-5p

MIMAT0004779 MI0003196

hsa-miR-512-3p

MIMAT0002823 MI0003140

hsa-miR-513a-Sp

MIMAT0002877 MI0003191

hsa-miR-513b

MIMAT0005788 MI0006648

hsa-miR-513c

MIMAT0005789 MI0006649

hsa-miR-514

MIMAT0002883 MI0003200

hsa-miR-516a-5p

MIMAT0004770 MI0003181

hsa-miR-516b

MIMAT0002859 MI0003167

hsa-miR-517a

MIMAT0002852 MI0003161

hsa-miR-517b

MIMAT0002857 MI0003165

hsa-miR-518a-5p

MIMAT0005457 MI0003173

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-518c*

MIMAT0002847 MI0003159

hsa-miR-518e*

MIMAT0005450 MI0003169

hsa-miR-519d

MIMAT0002853 MI0003162

hsa-miR-519e*

MIMAT0002828 MI0003145

hsa-miR-520h

MIMAT0002867 MI0003175

hsa-miR-525-5p

MIMAT0002838 MI0003152

hsa-miR-526b

MIMAT0002835 MI0003150

hsa-miR-532-3p

MIMAT0004780 MI0003205

hsa-miR-532-5p

MIMAT0002888 MI0003205

hsa-miR-539

MIMAT0003163 MI0003514

hsa-miR-542-3p

MIMAT0003389 MI0003686

hsa-miR-542-5p

MIMAT0003340 MI0003686

hsa-miR-543

MIMAT0004954 MI0005565

hsa-miR-545

MIMAT0003165 MI0003516

hsa-miR-548c-5p

MIMAT0004806 MI0003630

hsa-miR-550

MIMAT0004800 MI0003601

hsa-miR-550*

MIMAT0003257 MI0003601

hsa-miR-551b

MIMAT0003233 MI0003575

hsa-miR-551b*

MIMAT0004794 MI0003575

hsa-miR-552

MIMAT0003215 MI0003557

hsa-miR-556-3p

MIMAT0004793 MI0003562

hsa-miR-557

MIMAT0003221 MI0003563

hsa-miR-564

MIMAT0003228 MI0003570

hsa-miR-566

MIMAT0003230 MI0003572

hsa-miR-572

MIMAT0003237 MI0003579

hsa-miR-574-3p

MIMAT0003239 MI0003581

hsa-miR-574-5p

MIMAT0004795 MI0003581

hsa-miR-575

MIMAT0003240 MI0003582

hsa-miR-576-5p

MIMAT0003241 MI0003583

hsa-miR-582-3p

MIMAT0004797 MI0003589

hsa-miR-582-5p

MIMAT0003247 MI0003589

hsa-miR-583

MIMAT0003248 MI0003590

hsa-miR-584

MIMAT0003249 MI0003591

hsa-miR-585

MIMAT0003250 MI0003592

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-590-5p

MIMAT0003258 MI0003602

hsa-miR-592

MIMAT0003260 MI0003604

hsa-miR-595

MIMAT0003263 MI0003607

hsa-miR-598

MIMAT0003266 MI0003610

hsa-miR-601

MIMAT0003269 MI0003614

hsa-miR-602

MIMAT0003270 MI0003615

hsa-miR-605

MIMAT0003273 MI0003618

hsa-miR-610

MIMAT0003278 MI0003623

hsa-miR-612

MIMAT0003280 MI0003625

hsa-miR-614

MIMAT0003282 MI0003627

hsa-miR-615-3p

MIMAT0003283 MI0003628

hsa-miR-616

MIMAT0004805 MI0003629

hsa-miR-617

MIMAT0003286 MI0003631

hsa-miR-622

MIMAT0003291 MI0003636

hsa-miR-623

MIMAT0003292 MI0003637

hsa-miR-624*

MIMAT0003293 MI0003638

hsa-miR-625

MIMAT0003294 MI0003639

hsa-miR-625*

MIMAT0004808 MI0003639

hsa-miR-627

MIMAT0003296 MI0003641

hsa-miR-628-3p

MIMAT0003297 MI0003642

hsa-miR-628-5p

MIMAT0004809 MI0003642

hsa-miR-629

MIMAT0004810 MI0003643

hsa-miR-629*

MIMAT0003298 MI0003643

hsa-miR-630

MIMAT0003299 MI0003644

hsa-miR-631

MIMAT0003300 MI0003645

hsa-miR-633

MIMAT0003303 MI0003648

hsa-miR-634

MIMAT0003304 MI0003649

hsa-miR-636

MIMAT0003306 MI0003651

hsa-miR-638

MIMAT0003308 MI0003653

hsa-miR-639

MIMAT0003309 MI0003654

hsa-miR-640

MIMAT0003310 MI0003655

hsa-miR-641

MIMAT0003311 MI0003656

hsa-miR-642

MIMAT0003312 MI0003657

hsa-miR-648

MIMAT0003318 MI0003663

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-650

MIMAT0003320 MI0003665

hsa-miR-652

MIMAT0003322 MI0003667

hsa-miR-654-3p

MIMAT0004814 MI0003676

hsa-miR-654-5p

MIMAT0003330 MI0003676

hsa-miR-656

MIMAT0003332 MI0003678

hsa-miR-658

MIMAT0003336 MI0003682

hsa-miR-659

MIMAT0003337 MI0003683

hsa-miR-660

MIMAT0003338 MI0003684

hsa-miR-662

MIMAT0003325 MI0003670

hsa-miR-663

MIMAT0003326 MI0003672

hsa-miR-663b

MIMAT0005867 MI0006336

hsa-miR-664

MIMAT0005949 MI0006442

hsa-miR-664*

MIMAT0005948 MI0006442

hsa-miR-665

MIMAT0004952 MI0005563

hsa-miR-668

MIMAT0003881 MI0003761

hsa-miR-671-5p

MIMAT0003880 MI0003760

hsa-miR-7

MIMAT0000252 MI0000263

hsa-miR-7-1*

MIMAT0004553 MI0000263

hsa-miR-7-2*

MIMAT0004554 MI0000264

hsa-miR-708

MIMAT0004926 MI0005543

hsa-miR-720

MIMAT0005954 MI0006654

hsa-miR-744

MIMAT0004945 MI0005559

hsa-miR-744*

MIMAT0004946 MI0005559

hsa-miR-758

MIMAT0003879 MI0003757

hsa-miR-760

MIMAT0004957 MI0005567

hsa-miR-765

MIMAT0003945 MI0005116

hsa-miR-766

MIMAT0003888 MI0003836

hsa-miR-767-5p

MIMAT0003882 MI0003763

hsa-miR-769-3p

MIMAT0003887 MI0003834

hsa-miR-769-5p

MIMAT0003886 MI0003834

hsa-miR-770-5p

MIMAT0003948 MI0005118

hsa-miR-873

MIMAT0004953 MI0005564

hsa-miR-874

MIMAT0004911 MI0005532

hsa-miR-876-3p

MIMAT0004925 MI0005542

ID_ de la sonda

Número de referencia de microARN Número de referencia de precursor

hsa-miR-876-5p

MIMAT0004924 MI0005542

hsa-miR-877

MIMAT0004949 MI0005561

hsa-miR-877*

MIMAT0004950 MI0005561

hsa-miR-885-5p

MIMAT0004947 MI0005560

hsa-miR-886-3p

MIMAT0004906 MI0005527

hsa-miR-886-5p

MIMAT0004905 MI0005527

hsa-miR-887

MIMAT0004951 MI0005562

hsa-miR-888

MIMAT0004916 MI0005537

hsa-miR-889

MIMAT0004921 MI0005540

hsa-miR-890

MIMAT0004912 MI0005533

hsa-miR-891a

MIMAT0004902 MI0005524

hsa-miR-891b

MIMAT0004913 MI0005534

hsa-miR-892a

MIMAT0004907 MI0005528

hsa-miR-892b

MIMAT0004918 MI0005538

hsa-miR-9

MIMAT0000441 MI0000468

hsa-miR-9*

MIMAT0000442 MI0000468

hsa-miR-921

MIMAT0004971 MI0005713

hsa-miR-923

MIMAT0004973 MI0005715

hsa-miR-92a

MIMAT0000092 MI0000094

hsa-miR-92a-1*

MIMAT0004507 MI0000093

hsa-miR-92b

MIMAT0003218 MI0003560

hsa-miR-92b*

MIMAT0004792 MI0003560

hsa-miR-93

MIMAT0000093 MI0000095

hsa-miR-93*

MIMAT0004509 MI0000095

hsa-miR-933

MIMAT0004976 MI0005755

hsa-miR-934

MIMAT0004977 MI0005756

hsa-miR-936

MIMAT0004979 MI0005758

hsa-miR-939

MIMAT0004982 MI0005761

hsa-miR-940

MIMAT0004983 MI0005762

hsa-miR-944

MIMAT0004987 MI0005769

hsa-miR-95

MIMAT0000094 MI0000097

hsa-miR-96

MIMAT0000095 MI0000098

hsa-miR-98

MIMAT0000096 MI0000100

hsa-miR-99a

MIMAT0000097 MI0000101

imagen9

Para contrastar la hipótesis estadística, se usó una prueba de t de dos muestras, asumiendo una varianza igual. Esta prueba se usó para definir qué sondas se consideran expresadas significativamente de manera diferencial o "significantes", basándose en la tasa de descubrimiento ajustada a 0,05. Además, también se evaluó la expresión diferencial usando una prueba de t de Student y se consideró estadísticamente significativa cuando el valor de p 5 ≤0,05.

Se adquirieron treinta y una muestras frescas congeladas de tiroides normal y diversas neoplasias de tiroides adquiridas de Asterand (Asterand, plc., Detroit, MI, EE.UU.). Las muestras fueron de cinco tejidos de tiroides normales (NOR), cuatro nódulos hiperplásicos (NOD), cinco adenomas foliculares (FA), cinco carcinomas foliculares de tiroides (FTC), cinco carcinomas papilares de tiroides (PTC), cuatro variantes foliculares de carcinomas papilares

10 de tiroides (FVPTC), un carcinoma anaplásico de tiroides (ATC) y tres carcinomas medulares de tiroides (MTC) (tabla 2).

Tabla 2. Datos histopatológicos e información de pacientes para muestras de tejido tiroideo. Tejidos tiroideos normales (NOR), nódulos hiperplásicos (NOD), adenomas foliculares (FA), carcinomas foliculares de tiroides (FTC), carcinomas papilares de tiroides (PTC), variantes foliculares de carcinomas papilares de tiroides (FVPTC),

15 carcinoma anaplásico de tiroides (ATC), carcinomas medulares de tiroides (MTC).

Muestra

Sexo Edad al extirpar Etnia Tipo de muestra Diagnósticohistológico Puntuación de tinción TNM (Name et al., 1900) Grupo deestadio AJCC/UICC Greene (2002) % de tumor en la muestra

26

Femenino 53 Caucásica Tumor ATC T3NXM0 III 97

4

Femenino 41 Caucásica Tumor FA T3NXM0 I 100

13

Masculino 47 Caucásica Tumor FA T2NXMX II 100

15

Femenino 68 Caucásica Tumor FA T3NXM0 III 95

17

Femenino 50 Caucásica Tumor FA T2N0M0 II 100

22

Femenino 52 Caucásica Tumor FA T2NXM0 II 100

18

Masculino 58 Caucásica Tumor FTC T3NXm0 III 100

27

Femenino 52 Caucásica Tumor FTC T4aNXM0 IVA 90

30

Femenino 79 Caucásica Tumor FTC T1N1M0 III 95

31

Femenino 75 Caucásica Tumor FTC T2NXMX I 100

34

Femenino 57 Caucásica Tumor FTC T1NXMX I 95

16

Femenino 32 Caucásica Tumor FVPTC T4AN1M0 I 95

25

Femenino 59 Caucásica Tumor FVPTC TXNXM0 80

32

Femenino 24 Caucásica Tumor FVPTC T2NXM0 I 90

33

Masculino 41 Hispana Tumor FVPTC T4aNlbMX I 70

19

Femenino 48 Caucásica Tumor MTC T2N1M0 90

28

Femenino 54 Caucásica Tumor MTC T2N0MX II 96

29

Masculino 59 Caucásica Tumor MTC T1N1MX III 85

6

Masculino 54 Caucásica Enfermo NOD 0

7

Masculino 83 Caucásica Enfermo NOD 0

12

Femenino 88 Caucásica Enfermo NOD 0

21

Masculino 45 Caucásica Enfermo NOD 0

1

Femenino 85 Caucásica Normal NOR 0

3

Femenino 71 Caucásica Normal NOR T2NXM0 II 0

5

Femenino 52 Caucásica Normal NOR T3N1 aMO III 0

14

Femenino 38 Caucásica Normal NOR TXNlbMO I 0

8

Femenino 42 Caucásica Tumor PTC T3NXM0 I 90

Muestra

Sexo Edad al extirpar Etnia Tipo de muestra Diagnósticohistológico Puntuación de tinción TNM (Name et al., 1900) Grupo deestadio AJCC/UICC Greene (2002) % de tumor en la muestra

10

Femenino 24 Caucásica Tumor PTC T2N0M0 II 90

11

Femenino 41 Caucásica Tumor PTC TXNXM0 95

23

Masculino 24 Caucásica Tumor PTC T3N1MX I 100

24

Masculino 29 Caucásica Tumor PTC T3NlbM0 I 90

Los niveles de expresión medios de miARN en cada grupo, determinados a partir de análisis de micromatriz, se muestran en la tabla 3.

Tabla 3. Datos de matriz normalizados para la expresión de miARN en grupos de muestra de tejido de tiroides. Med, nivel medio de expresión en el conjunto de muestras; DE, desviación estándar; %, porcentaje de muestras con nivel de expresión por encima del fondo.

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-let7a

14,3 100 14,6 0,5 100 14,6 0,3 100 14,8 0,4 100 14,8 0,1. 100 14,6 0,4 1,00 15,2 0,2 100 14,9 0,3 100

hsa-let7a*

1,6 0 1,4 0,3 20 1,5 0,5 40 1,3 0,2 25 1,1. 0,3 0 1,2 0,2 50 1,3 0,4 50 1,3 0,3 20

hsa-let7b

13,9 100 13,6 0,6 100 13,2. 0,6 100 13,9 0,2 100 13,3. 0,4 100 14,0 0,4 1,00 14,0 0,2 100 13,8 0,4 100

hsa-let7b*

2,4 0 2,1. 1,1 20 1,7 0,4 0 1,9 0,4 0 1,3. 0,1. 0 1,6 0,5 0 1,3 0,1. 0 1,6 0,4 0

hsa-let7c

10,7 100 12,1. 0,7 100 12,1. 0,7 100 12,5 0,3 100 12,8 0,4 100 12,7 0,1. 1,00 13,0 0,2 100 12,4 0,4 100

hsa-let7c*

0,1 0 0,5 0,9 0 0,1 0,6 0 0,0 0,9 0 0,1 0,1. 0 1,0 0,2 0 0,6 0,3 0 1,1 1,3 20

hsa-let7d

11,1 100 11,7 0,6 100 11,7 0,5 100 12,1 0,3 100 11,3. 0,7 100 11,8 0,3 1,00 12,3 0,2 100 12,0 0,4 100

hsa-let7d*

1,3 0 2,2. 1,1 100 1,3. 0,9 60 1,6 0,5 50 0,6 0,8 33 1,5 0,3 1,00 1,7 0,3 75 1,1 0,3 40

hsa-let7e

12,2 100 11,4 0,6 100 11,6 0,7 100 12,1 0,5 100 12,8 0,2 100 11,3 0,4 1,00 11,7 0,2 100 12,2 0,2 100

hsa-let7e*

2,4 100 2,5 1,2 80 2,4 0,6 80 2,7 0,5 75 3,1. 0,3 100 1,7 0,5 1,00 2,2 0,3 100 2,2 0,3 100

hsa-let7f

13,6 100 14,1. 0,6 100 14,3. 0,4 100 14,2 0,5 100 13,9 0,1. 100 14,0 0,6 1,00 14,7 0,2 100 14,4 0,5 100

hsa-let7f-l*

2,5 0 2,1. 0,5 0 1,8 0,4 0 2,1 0,5 0 1,4 0,6 33 1,8 0,5 0 1,4 0,1. 0 1,7 0,4 0

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-let7s

11,8 100 12,7 0,5 100 12,7 0,3 100 13,0 0,3 100 12,3. 0,4 100 12,8 0,3 1,00 13,4 0,2 100 13,0 0,3 100

hsa-let7s*

2,1 0 0,5 1,5 20 1,1. 0,5 0 0,2 0,1. 0 0,3 1,3 0 0,0 0,6 0 0,1 0,5 0 0,9 0,6 0

hsa-let7i

12,0 100 13,6 0,6 100 13,5 0,4 100 14,6 0,4 100 12,6 0,9 100 13,5 0,2 1,00 14,0 0,3 100 14,5 0,2 100

hsa-let7i*

0,1 0 2,8 1,0. 80 3,1. 0,4 100 3,7 0,7 100 1,9 1,0. 33 2,9 1,0. 1,00 3,6 0,4 100 3,8 0,4 100

hsa-miR1

3,1 100 5,9 1,4 100 5,9 1,3 100 7,5 1,2 100 50,2 1,0. 100 8,7 34 1,00 9,6 34 100 5,4 1,4 100

hsa-miR100

9,2 100 11,3. 1,4 100 10,6 0,8 100 11,1 0,6 100 10,6 0,7 100 11,7 0,2 1,00 12,1 0,4 100 11,1 0,2 100

hsa-miR100*

1,3 0 1,9 0,9 20 1,3. 0,4 0 1,5 0,2 0 1,3. 0,4 0 1,2 0,1. 0 1,7 0,4 50 1,3 0,4 20

hsa-miR101

7,5 100 8,3. 1,1 100 8,8 0,3 100 8,8 0,5 100 8,8 0,3 100 8,9 0,6 1,00 9,5 0,2 100 9,1 0,7 100

hsa-miR101*

1,4 0 1,9 0,8 40 2,2. 0,2 60 2,5 0,5 75 20,2 0,2 100 2,4 0,5 75 2,8 0,2 100 2,6 0,4 80

hsa-miR103

11,6 100 11,4 0,7 100 11,6 0,5 100 11,7 0,2 100 12,02 0,2 100 11,4 0,2 1,00 11,7 0,2 100 11,6 0,3 100

hsa-miR105

0,7 0 0,8 1,6 0 1,4 0,6 0 1,2 0,9 0 2,0 25 67 1,3 0,4 0 1,0 0,3 0 1,1 0,5 0

hsa-miR105*

0,2 0 0,7 0,6 0 0,4 0,4 0 0,1 0,8 0 0,0 0,1. 0 0,2 0,5 0 0,1 0,3 0 0,1 10. 20

hsa-miR106b

9,9 100 9,4 0,8 100 9,8 0,3 100 9,9 0,3 100 10,3 0,3 100 9,5 0,1. 1,00 9,7 0,3 100 10,2 0,1. 100

hsa-miR107

11,1 100 10,9 0,8 100 11,3. 0,5 100 10,9 0,3 100 11,5 0,1. 100 10,9 0,3 1,00 11,3 0,2 100 11,0 0,3 100

hsa-miR10a

10,4 100 8,5 1,9 100 6,7 1,0. 100 7,6 0,8 100 11,7 0,5 100 7,6 0,1. 1,00 8,7 0,4 100 7,4 0,6 100

hsa-miR10a*

2,4 0 1,4 1,7 20 0,5 0,4 0 0,8 0,5 0 3,8 0,6 100 1,1 0,4 0 1,6 0,1. 25 1,5 0,3 0

hsa-miR10b

7,7 100 8,5 0,5 100 8,2. 0,4 100 8,5 0,6 100 8,6 0,2 100 8,6 0,5 1,00 9,1 0,2 100 8,5 0,4 100

hsa-miR10b*

1,8 0 2,0 0,5 0 2,4 0,2 20 2,8 0,5 50 2,1. 1,4 67 3,3 0,6 1,00 3,3 0,6 100 2,3 0,3 60

hsa-miR1180

0,4 0 1,4 1,7 20 1,7 0,9 20 1,5 0,7 0 3,1. 1,0. 67 3,5 0,4 1,00 2,4 0,1. 50 0,8 1,0. 0

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR1181

4,0 100 3,4 0,2 100 4,3. 1,1 100 3,7 0,4 100 30,2 0,6 67 4,0 0,5 1,00 3,5 0,4 100 3,3 0,4 100

hsa-miR1182

2,2 0 0,9 0,9 0 1,6 1,1 20 2,2 1,1 25 2,5 1,5 67 4,8 0,8 1,00 2,9 0,4 75 0,7 0,7 0

hsa-miR1183

4,0 100 3,0 1,3 60 3,7 0,9 80 3,8 0,9 100 4,3. 1,4 100 6,2 0,7 1,00 4,6 0,5 100 2,6 0,6 40

hsa-miR1185

0,9 0 0,9 0,6 0 1,1. 0,4 0 0,4 0,4 0 3,0 0,5 100 0,7 0,3 0 0,9 0,2 0 1,1 0,6 0

hsa-miR1201

2,5 0 1,6 0,9 20 2,0 0,8 20 1,0 0,3 0 0,7 0,5 0 1,1 0,5 0 1,4 0,2 0 1,0 1,0. 0

hsa-miR1202

11,2 100 9,4 0,7 100 10,5 1,4 100 10,6 1,6 100 10,1 21. 100 13,7 0,8 1,00 11,0 0,9 100 9,0 0,9 100

hsa-miR1203

0,4 0 0,4 1,2 0 0,2 1,1 0 0,0 1,0. 0 0,3 1,5 0 2,4 0,5 50 0,4 1,0. 0 1,1 0,5 0

hsa-miR1207-5p

9,5 100 8,7 0,8 100 9,4 0,9 100 9,5 1,0 100 9,3. 1,6 100 11,8 1,0 1,00 9,8 0,5 100 8,2 0,7 100

hsa-miR1208

0,9 0 1,2. 0,8 0 2,2. 0,6 0 1,8 0,9 25 2,3. 1,0. 67 3,7 0,3 1,00 2,8 0,4 75 2,0 1,0. 20

hsa-miR122

0,5 0 0,6 0,3 0 0,5 0,6 0 0,7 1,3 0 4,0 31. 33 2,2 1,3 50 0,7 0,6 0 0,7 0,2 0

hsa-miR122*

0,7 0 0,3 1,0. 0 0,1 0,7 0 0,1 1,1 0 1,1. 1,5 33 0,3 0,5 0 0,2 0,5 0 0,0 0,3 0

hsa-miR1224-5p

5,6 100 5,0 1,5 100 5,4 0,8 100 5,3 0,7 100 5,7 1,1 100 7,6 0,7 1,00 5,9 0,5 100 4,3 0,5 100

hsa-miR1225-3p

4,3 100 3,5 0,4 80 3,8 0,3 100 3,7 0,4 100 3,4 0,2 100 4,1 0,3 1,00 3,4 0,2 100 3,6 0,2 100

hsa-miR1225-5p

9,8 100 8,7 0,6 100 9,2. 0,9 100 9,5 1,0. 100 90,2 1,5 100 11,8 1,0. 1,00 9,8 0,4 100 8,3 0,5 100

hsa-miR1226*

3,8 100 3,7 0,5 80 4,2. 0,6 100 3,9 0,3 100 4,0 0,9 100 5,7 0,5 1,00 4,4 0,4 100 3,8 0,5 100

hsa-miR1227

1,4 0 1,8 1,1 20 0,5 0,5 0 0,9 0,8 0 0,1 0,4 0 0,1 0,6 0 0,3 0,4 0 0,0 0,7 0

hsa-miR1228

5,6 100 4,6 0,7 100 5,1. 0,3 100 5,0 0,5 100 4,7 0,2 100 5,8 0,6 1,00 4,8 0,2 100 4,8 0,2 100

hsa-miR1228*

1,2 0 0,7 1,3 0 0,4 1,0. 0 0,3 1,2 0 0,0 1,5 0 1,9 0,7 50 0,5 0,9 25 1,4 0,6 0

hsa-miR1229

1,9 0 2,0 0,6 0 1,8 0,5 0 1,9 0,4 25 1,8 0,1. 0 2,3 0,3 75 1,8 0,5 75 1,7 0,2 40

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR1234

5,0 100 3,9 1,0. 80 4,6 0,2 100 4,5 0,5 100 3,9 0,5 100 4,7 0,6 1,00 4,1 0,4 100 4,4 0,3 100

hsa-miR1237

3,8 100 2,7 0,4 20 3,0 0,3 40 2,9 0,6 50 2,7 0,2 33 3,3 0,5 1,00 2,6 0,4 75 2,9 0,3 60

hsa-miR1238

4,7 100 3,7 0,6 80 4,1. 0,2 100 4,1 0,4 100 3,7 0,3 100 4,1 0,4 1,00 3,6 0,2 100 4,0 0,3 100

hsa-miR124

4,2 100 0,7 0,3 0 0,4 1,1 0 0,1 0,4 0 7,9 31. 100 1,5 1,1 2,5 0,6 0,5 0 0,4 0,3 0

hsa-miR124*

1,9 0 0,7 1,0. 0 1,0 1,0. 0 1,1 0,4 0 00,2 1,7 33 0,9 0,5 0 1,4 0,4 0 1,5 0,2 0

hsa-miR1244

1,0 0 0,4 0,8 0 0,9 0,6 0 1,0 0,8 0 0,9 0,7 0 2,1 0,9 2,5 1,3 1,5 50 0,5 0,5 0

hsa-miR1246

7,4 100 7,1. 1,2 100 7,7 1,0. 100 7,8 1,0. 100 7,9 1,9 100 9,6 1,2 1,00 9,2 0,9 100 6,9 1,4 100

hsa-miR1249

5,2 100 4,0 0,6 100 4,5 0,5 100 4,5 0,8 100 40,2 0,7 100 5,9 0,7 1,00 4,5 0,5 100 3,9 0,4 100

hsa-miR1250

1,2 0 0,5 1,3 0 0,2 0,5 0 0,2 0,8 0 0,9 0,3 0 1,9 0,5 2,5 0,1 0,9 0 0,3 0,7 0

hsa-miR1251

2,3 0 0,5 1,4 0 0,3 1,4 40 0,7 0,9 0 1,5 0,4 33 0,4 1,2 0 1,0 0,3 25 0,1 1,5 20

hsa-miR125a-3p

6,2 100 5,6 0,8 100 6,1. 0,7 100 6,1 0,1. 100 60,2 0,7 100 7,3 0,4 1,00 5,9 0,3 100 5,7 0,5 100

hsa-miR125a-5p

9,3 100 8,8 0,7 100 8,8 0,9 100 9,0 0,3 100 90,2 0,1. 100 8,6 0,2 1,00 8,8 0,2 100 9,2 0,2 100

hsa-miR125b

10,4 100 13,2. 1,0. 100 13,8 0,6 100 14,1 0,4 100 14,0 0,7 100 13,9 0,2 1,00 14,2 0,2 100 14,4 0,3 100

hsa-miR125b-l*

2,5 100 0,9 1,7 20 2,2. 1,1 60 2,1 0,6 75 2,3. 11. 67 3,1 1,3 1,00 1,9 0,9 75 0,8 0,8 20

hsa-miR125b-2*

2,7 0 4,6 0,9 100 4,9 1,1 100 5,3 0,3 100 5,8 0,6 100 5,6 0,2 1,00 5,6 0,2 100 5,3 0,3 100

hsa-miR126

10,0 100 12,7 0,7 100 12,1. 0,5 100 12,0 0,9 100 11,7 0,3 100 12,4 0,3 1,00 12,9 0,2 100 11,9 0,4 100

hsa-miR126*

3,4 100 6,5 1,0. 100 6,2. 0,4 100 5,5 1,2 100 5,5 0,2 100 6,2 0,8 1,00 6,9 0,3 100 5,6 0,6 100

hsa-miR1260

9,8 100 8,6 0,7 100 9,5 0,6 100 8,5 0,6 100 8,9 0,4 100 6,5 0,9 1,00 8,1 0,8 100 8,8 0,5 100

hsa-miR1268

7,6 100 7,4 0,4 100 7,8 0,5 100 7,5 0,9 100 7,9 0,7 100 10,2 1,3 1,00 8,3 0,7 100 6,6 0,5 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR127-3p

5,4 100 3,4 1,0. 80 3,9 1,3 100 4,2 0,8 100 8,9 0,4 100 4,5 1,0. 1,00 5,2 0,6 100 4,1 1,4 100

hsa-miR127-5p

0,2 0 1,3. 0,9 0 1,2. 0,6 0 0,4 0,4 0 0,1 1,3 0 1,3 0,3 2,5 0,3 1,0. 0 0,9 0,6 0

hsa-miR1270

0,0 0 1,4 0,5 0 1,2. 1,2 0 1,4 0,6 0 0,8 0,8 0 2,5 0,5 50 2,1 0,2 25 1,3 0,4 0

hsa-miR1271

3,3 100 3,6 0,5 100 3,6 0,2 100 3,9 0,2 100 40,2 1,1 100 4,3 0,4 1,00 4,4 0,2 100 4,0 0,2 100

hsa-miR1274a

9,6 100 7,3. 0,8 100 8,2. 0,7 100 7,4 0,7 100 7,5 0,9 100 4,7 1,0. 1,00 6,6 1,3 100 7,7 0,5 100

hsa-miR1274b

12,6 100 10,9 0,8 100 11,8 0,7 100 11,1 0,6 100 11,0 0,8 100 8,5 0,9 1,00 10,2 1,2 100 11,3 0,4 100

hsa-miR1275

6,9 100 6,6 0,9 100 7,0 1,3 100 7,2 0,3 100 7,7 0,3 100 8,1 0,5 1,00 7,4 0,4 100 6,5 0,5 100

hsa-miR1276

1,0 0 0,2 1,6 0 0,4 0,8 0 0,4 0,8 0 00,2 1,3 0 2,0 0,6 2,5 0,1 0,6 0 0,2 1,3 0

hsa-miR128

6,8 100 6,5 0,6 100 6,8 0,2 100 6,6 0,4 100 8,3. 0,9 100 7,1 0,5 1,00 7,5 0,4 100 6,7 0,3 100

hsa-miR1280

7,7 100 6,9 1,4 100 7,2. 0,7 100 6,4 0,5 100 6,9 0,2 100 7,6 0,9 1,00 7,0 1,3 100 6,7 1,0. 100

hsa-miR1281

4,2 100 3,5 0,5 80 3,6 0,2 100 3,8 0,5 100 3,3. 0,4 100 3,9 0,3 1,00 3,3 0,4 100 3,5 0,3 100

hsa-miR1285

2,3 0 1,9 1,0. 20 2,2. 0,5 80 1,7 0,7 25 2,9 0,3 100 3,4 0,6 1,00 2,5 0,4 100 1,7 0,4 20

hsa-miR1287

1,7 0 2,1. 0,9 40 2,0 0,8 20 1,5 0,9 0 1,9 0,3 0 1,7 0,9 0 2,3 0,8 75 1,7 0,8 0

hsa-miR1288

5,9 100 5,4 0,5 100 5,6 0,4 100 5,6 0,3 100 5,1. 0,3 100 5,3 0,4 1,00 5,4 0,2 100 6,3 0,7 100

hsa-miR129*

2,8 100 2,7 0,3 40 2,7 0,9 40 2,2 0,4 0 5,4 34 67 2,1 0,4 50 2,2 0,1. 100 2,0 0,2 20

hsa-miR129-3p

4,1 100 3,1. 0,8 60 3,1. 1,4 60 2,7 0,5 75 90,2 55 100 3,7 20. 75 4,0 1,1 100 3,3 0,6 100

hsa-miR129-5p

1,8 0 0,7 1,3 0 0,7 1,4 20 0,8 1,0. 0 5,9 50. 67 2,5 0,8 50 1,5 0,6 0 0,1 0,6 0

hsa-miR1290

4,9 100 4,0 1,2 100 4,9 0,8 100 4,2 0,7 100 4,7 1,1 100 5,5 1,0. 1,00 5,9 1,6 100 4,7 1,4 100

hsa-miR1291

0,6 0 0,8 1,1 20 1,1. 1,4 20 0,9 0,9 0 1,3. 1,3 0 3,0 0,7 1,00 1,6 0,7 25 0,2 0,5 0

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR1295

2,0 0 1,9 0,7 20 3,0 0,8 60 1,6 0,9 0 2,4 0,2 33 2,6 0,1. 2,5 2,4 0,2 50 2,8 1,1 80

hsa-miR1296

0,8 0 0,7 1,7 20 0,3 0,5 0 0,2 0,3 0 0,1 0,3 0 0,3 0,4 0 0,5 0,6 0 0,6 0,5 0

hsa-miR1299

1,7 0 2,3. 1,3 20 2,7 0,5 40 3,2 1,2 75 3,3. 1,6 67 4,4 0,4 1,00 3,4 1,6 50 2,4 0,9 40

hsa-miR1300

5,5 100 3,7 1,1 80 4,3. 0,8 100 4,6 1,2 100 4,6 1,1 100 7,8 0,8 1,00 5,7 1,4 100 3,5 0,8 100

hsa-miR1301

0,9 0 0,8 0,4 0 0,8 0,8 20 0,5 0,8 0 3,5 0,6 100 1,6 0,3 0 1,0 0,4 0 0,7 0,4 0

hsa-miR1303

1,1 0 0,3 1,5 0 0,3 0,6 0 0,3 1,0. 0 0,3 0,5 0 1,7 0,6 2,5 0,2 0,6 0 0,7 0,3 0

hsa-miR1305

7,7 100 7,7 0,7 100 7,5 0,3 100 7,4 0,4 100 7,0 0,3 100 7,1 0,5 1,00 7. 0. 100 8,3 0,5 100

hsa-miR1306

1,5 0 1,2. 0,8 0 1,7 0,6 0 1,7 0,1. 0 1,4 0,7 0 3,0 0,3 75 1,7 0,4 0 0,9 0,5 0

hsa-miR1307

1,6 0 1,8 1,1 40 2,1. 0,5 80 1,8 0,5 25 2,6 0,6 100 3,4 0,4 1,00 2,5 0,4 100 1,7 0,6 40

hsa-miR1308

9,7 100 8,4 1,7 100 8,0 0,6 100 8,3 1,0. 100 9,4 1,2 100 10,0 0,9 1,00 9,0 0,7 100 7,4 0,8 100

hsa-miR130a

10,2 100 10,3 0,9 100 10,4 1,2 100 11,3 0,2 100 9,8 1,4 100 11,5 0,4 1,00 11,6 0,3 100 11,5 0,5 100

hsa-miR130b

7,8 100 6,6 1,1 100 7,3. 0,4 100 6,6 0,0. 100 7,4 0,6 100 7,1 0,4 1,00 7,6 0,4 100 6,5 0,2 100

hsa-miR130b*

0,1 0 1,0 1,1 0 0,6 1,1 20 0,2 0,5 0 0,3 0,5 0 0,2 0,6 0 0,7 0,3 50 0,1 0,9 0

hsa-miR132

7,2 100 5,7 0,8 100 6,1. 0,4 100 6,3 0,2 100 9,0 1,2 100 6,3 0,3 1,00 6,0 0,1. 100 6,6 0,6 100

hsa-miR132*

3,5 100 3,1. 0,5 80 3,5 0,4 100 3,3 0,4 100 5,6 1,1 100 2,7 0,6 75 3,3 0,5 100 3,4 1,0. 80

hsa-miR1321

1,3 0 0,5 0,6 0 1,2. 0,5 0 1,3 0,7 0 1,6 1,2 33 3,7 0,8 1,00 2,1 10. 50 0,2 0,4 0

hsa-miR1323

1,6 0 2,0 0,3 0 1,9 0,6 0 1,7 0,5 0 1,8 0,7 0 2,7 0,3 50 1,8 0,4 25 1,2 0,4 0

hsa-miR133a

2,7 0 3,5 0,6 100 3,3. 0,7 80 5,0 1,5 100 2,8 0,6 67 6,1 3,0 1,00 6,4 34 100 3,3 1,1 100

hsa-miR133b

3,7 100 6,2. 1,1 100 5,8 1,3 100 8,2 1,7 100 50,2 1,3 100 9,4 3,0 1,00 9,6 34 100 5,7 1,6 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR134

5,8 100 5,1. 0,9 100 5,8 0,9 100 5,8 1,0. 100 5,8 1,1 100 8,0 0,9 1,00 6,1 0,5 100 4,6 0,6 100

hsa-miR135a

1,2 0 8,0 1,2 100 9,0 0,3 100 8,3 1,4 100 7,8 0,7 100 8,1 1,0. 1,00 8,8 0,5 100 8,5 0,8 100

hsa-miR135a*

4,7 100 3,7 0,5 100 4,7 0,9 100 4,8 0,5 100 40,2 1,3 100 5,6 0,8 1,00 5,1 0,4 100 3,6 0,3 100

hsa-miR135b

2,2 0 9,6 1,2 100 10,0 1,7 100 10,3 0,9 100 9,7 0,7 100 9,0 0,6 1,00 10,0 0,4 100 10,7 0,7 100

hsa-miR136

3,3 100 2,3. 0,5 40 2,8 1,0. 60 2,5 0,4 50 6,6 0,5 100 2,8 0,7 75 3,6 0,5 100 2,7 0,7 60

hsa-miR136*

1,8 0 0,9 1,1 0 1,9 1,2 40 1,4 0,4 0 6,4 0,5 100 2,2 0,8 2,5 3,1 0,5 100 1,7 1,2 40

hsa-miR137

0,9 0 0,1 0,6 0 0,4 0,8 0 0,5 1,4 0 5,0 31. 100 0,5 0,6 0 1,0 0,8 0 1,7 0,9 20

hsa-miR138

0,1 0 5,4 1,3 100 4,8 1,2 80 4,9 0,8 100 3,4 22 67 6,6 0,7 1,00 6,6 0,5 100 4,6 1,1 100

hsa-miR138-1*

1,9 0 1,0 0,8 0 1,3. 1,2 0 1,5 0,6 0 0,5 0,7 0 1,3 0,5 0 0,1 1,2 25 1,5 0,6 0

hsa-miR138-2*

1,0 0 2,2. 0,7 40 2,5 0,6 80 1,3 1,1 25 2,1. 0,4 67 2,4 0,3 50 2,4 0,3 100 2,6 0,9 80

hsa-miR139-3p

4,0 100 4,4 0,4 100 4,1. 0,7 100 4,9 0,3 100 4,6 0,5 100 5,0 0,4 1,00 5,0 0,3 100 4,9 0,4 100

hsamiR1395p

2,8 100 6,3. 0,7 100 5,3. 1,1 100 5,6 0,7 100 50,2 0,9 100 6,9 0,3 1,00 6,8 0,3 100 5,5 0,5 100

hsa-miR140-3p

8,6 100 8,4 0,5 100 8,2. 0,6 100 8,4 0,4 100 8,4 0,1 100 8,7 0,2 1,00 8,7 0,1 100 8,1 0,2 100

hsa-miR140-5p

9,0 100 8,6 0,6 100 8,3. 0,5 100 8,5 0,5 100 8,6 0,3 100 8,4 0,3 1,00 8,6 0,1 100 8,5 0,2 100

hsa-miR141

2,5 100 11,1. 0,8 100 11,9 1,0. 100 11,4 0,7 100 11,7 0,5 100 10,7 0,6 1,00 11,2 0,4 100 11,7 0,3 100

hsa-miR141*

1,7 0 3,4 0,9 80 4,2. 0,5 100 3,6 0,5 75 3,9 0,4 100 2,7 0,6 1,00 3,6 0,4 100 4,1 0,4 100

hsa-miR142-3p

10,1 100 8,3. 1,9 100 9,7 1,3 100 9,3 1,2 100 7,8 1,1 100 7,2 1,1 1,00 8,9 1,1 100 10,0 1,4 100

hsa-miR142-5p

6,6 100 4,8 1,7 80 5,9 1,6 100 6,1 1,3 100 40,2 1,2 100 4,2 1,0. 1,00 5,7 1,1 100 6,3 1,3 100

hsa-miR143

5,3 100 8,1. 0,6 100 7,8 0,8 100 7,6 0,8 100 8,1. 0,5 100 8,3 0,4 1,00 8,8 0,4 100 7,3 0,3 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR143*

1,4 0 4,1. 0,4 100 3,6 0,6 80 3,3 0,4 75 4,0 0,6 100 4,0 0,5 1,00 4,1 0,4 100 3,3 0,4 100

hsa-miR144

4,4 100 6,2. 25 100 7,1. 1,0. 100 6,9 0,5 100 60,2 0,8 100 7,2 1,3 1,00 8,2 0,3 100 5,5 1,2 100

hsa-miR144*

3,0 100 4,4 22 60 5,3. 1,1 100 5,2 1,1 100 5,1. 1,4 100 5,7 1,0. 1,00 6,6 0,3 100 4,1 0,9 100

hsa-miR145

6,8 100 10,6 0,5 100 9,8 0,9 100 9,8 0,8 100 1.00.2 0,5 100 10,7 0,2 1,00 11,1 0,4 100 9,4 0,3 100

hsa-miR145*

2,4 0 5,6 0,7 100 5,1. 0,8 100 4,8 1,1 100 5,5 0,5 100 5,4 0,4 1,00 6,2 0,4 100 4,6 0,4 100

hsa-miR1469

0,8 0 0,7 1,6 20 1,6 0,9 20 1,3 0,7 25 1,4 21. 67 3,4 0,4 1,00 2,2 0,7 75 0,3 1,3 20

hsa-miR146a

8,7 100 7,7 0,8 100 8,1. 0,7 100 8,6 1,0. 100 7,4 0,3 100 7,0 0,2 1,00 7,9 0,8 100 8,7 1,3 100

hsa-miR146b-3p

2,1 0 0,5 1,4 0 1,1. 0,6 0 2,5 1,3 75 1,1. 0,2 0 1,1 0,4 0 0,9 0,2 0 3,7 1,1 100

hsa-miR146b-5p

9,0 100 8,5 20. 100 7,9 1,6 100 13,2 1,1 100 70,2 1,2 100 7,6 0,8 1,00 7,5 0,5 100 14,4 0,9 100

hsa-miR1471

3,2 100 2,6 1,3 40 3,3. 1,0. 60 3,8 0,9 100 3,6 1,7 67 5,5 0,4 1,00 4,5 0,3 100 2,3 0,5 20

hsa-miR148a

10,4 100 10,6 1,4 100 11,8 0,7 100 10,0 0,3 100 10,7 1,4 100 10,2 0,5 1,00 11,3 0,3 100 10,1 0,8 100

hsa-miR148a*

0,6 0 1,8 1,2 40 2,3. 0,7 100 0,5 0,5 0 0,9 0,8 67 0,4 0,6 2,5 1,8 0,4 100 0,2 0,9 20

hsa-miR148b

6,7 100 8,2. 1,3 100 8,8 0,9 100 7,9 0,9 100 9,6 0,6 100 8,3 0,6 1,00 9,0 0,4 100 7,8 0,7 100

hsa-miR148b*

1,1 0 1,3. 0,4 20 1,3. 0,6 40 1,2 0,7 50 1,6 0,2 33 1,1 0,5 0 1,4 0,1 75 1,2 0,5 40

hsa-miR149

5,3 100 4,3. 1,0. 100 4,7 0,8 100 4,0 0,2 100 4,8 0,9 100 3,8 0,4 1,00 4,0 0,2 100 3,9 0,7 100

hsa-miR149*

1,7 0 0,8 1,6 20 1,5 1,1 20 1,6 1,1 25 1,9 1,7 67 4,7 0,6 1,00 2,8 0,6 100 0,3 0,6 0

hsa-miR150

9,6 100 8,9 1,7 100 8,9 24 100 9,9 1,5 100 7,7 1,9 100 8,7 0,3 1,00 9,6 1,4 100 10,3 1,2 100

hsa-miR150*

5,1 100 4,1. 0,6 100 5,0 1,0. 100 5,0 0,8 100 4,9 16 100 7,5 0,7 1,00 5,6 0,6 100 3,9 0,6 100

hsa-miR151-3p

6,5 100 7,1. 0,6 100 7,1. 0,6 100 7,7 0,5 100 7,7 0,3 100 7,5 0,3 1,00 7,6 0,2 100 7,7 0,3 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR151-5p

9,2 100 10,0 0,6 100 10,2 0,8 100 10,9 0,6 100 11,0 0,2 100 10,5 0,3 1,00 11,1 0,2 100 10,9 0,3 100

hsa-miR152

6,7 100 7,2. 1,1 100 7,6 0,8 100 6,4 0,2 100 6,6 0,5 100 7,8 0,5 1,00 7,9 0,2 100 6,2 0,5 100

hsa-miR153

3,9 100 0,6 1,6 40 0,8 1,5 20 1,5 0,9 25 8,1. 1,1 100 1,4 0,8 2,5 2,3 0,3 100 1,6 0,5 20

hsa-miR1539

2,8 0 2,4 0,7 20 2,1. 0,4 0 2,2 0,3 0 1,8 0,2 0 2,9 0,5 50 1,9 0,4 0 2,1 0,1 0

hsa-miR154

3,4 100 2,3. 0,9 40 2,5 1,0. 40 2,5 0,4 50 6,9 0,2 100 2,7 1,6 75 3,9 0,4 100 2,3 1,4 80

hsa-miR154*

2,4 0 1,2. 0,7 0 1,3. 1,6 20 1,5 0,4 0 4,8 0,6 100 1,0 0,8 0 2,5 0,9 25 1,6 1,0. 20

hsa-miR155

10,2 100 6,8 1,5 100 7,2. 1,5 100 7,5 0,7 100 6,3. 1,2 100 5,9 0,2 1,00 6,6 1,2 100 8,1 0,9 100

hsa-miR155*

1,9 100 0,7 0,3 0 0,4 1,0. 20 0,5 0,3 0 0,3 0,2 0 0,1 0,1 0 0,2 0,5 0 0,6 0,6 20

hsa-miR15a

11,1 100 10,9 0,6 100 11,7 0,4 100 11,7 0,6 100 11,6 0,6 100 10,5 0,5 1,00 10,9 0,2 100 12,0 0,3 100

hsa-miR15a*

1,4 0 1,8 0,6 60 1,9 0,5 80 2,1 0,5 75 1,9 0,7 67 0,9 0,3 0 1,2 0,1 50 2,2 0,4 100

hsa-miR15b

11,2 100 11,1. 0,8 100 11,7 0,2 100 11,7 0,5 100 11,6 0,2 100 11,4 0,2 1,00 12,0 0,3 100 12,0 0,4 100

hsa-miR15b*

1,5 0 1,4 0,5 20 1,7 0,5 60 1,1 0,4 0 10,2 0,3 0 1,2 0,2 0 1,5 0,2 50 1,7 0,3 60

hsa-miR16

12,6 100 12,6 0,6 100 13,1. 0,2 100 13,3 0,4 100 13.0.2 0,5 100 12,7 0,2 1,00 13,1 0,3 100 13,5 0,2 100

hsa-miR 16-2*

2,5 100 2,8 0,5 80 3,1. 0,4 100 2,8 0,4 100 2,8 0,3 100 2,8 0,4 1,00 3,5 0,1 100 3,0 0,6 100

hsa-miR17

8,4 100 8,6 0,6 100 9,5 0,4 100 9,3 0,2 100 8,6 0,7 100 9,3 0,2 1,00 9,4 0,2 100 9,5 0,1 100

hsa-miR17*

3,6 100 4,5 0,7 100 5,6 0,4 100 5,0 0,4 100 4,9 0,3 100 5,1 0,5 1,00 5,4 0,4 100 5,4 0,3 100

hsa-miR181a

8,8 100 10,6 1,6 100 10,5 0,7 100 11,2 0,8 100 10,7 0,9 100 10,1 0,5 1,00 10,1 0,5 100 11,3 0,3 100

hsa-miR181a*

3,2 100 4,4 1,3 100 4,8 0,7 100 4,2 0,7 100 4,7 0,8 100 3,3 0,4 1,00 3,5 0,5 100 4,4 0,2 100

hsa-miR181a-2*

3,0 100 4,8 18 100 4,3. 0,7 100 5,9 11. 100 3,3. 0,7 100 3,9 0,5 1,00 4,5 0,6 100 6,2 0,7 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR181b

7,0 100 8,5 1,5 100 8,3. 0,9 100 9,5 0,8 100 8,3. 0,8 100 8,2 0,4 1,00 8,1 0,6 100 9,6 0,5 100

hsa-miR181c

6,3 100 6,6 0,6 100 6,4 0,7 100 7,5 0,4 100 8,4 0,3 100 7,1 0,6 1,00 7,1 0,4 100 7,6 0,3 100

hsa-miR181c*

3,8 100 3,9 0,6 100 3,4 0,8 100 4,5 0,5 100 5,3. 0,2 100 4,0 0,4 1,00 3,9 0,5 100 4,6 0,4 100

hsa-miR181d

5,3 100 5,7 0,6 100 5,4 0,7 100 6,6 0,6 100 6,9 0,1 100 5,9 0,5 1,00 5,8 0,4 100 6,7 0,3 100

hsa-miR182

1,3 0 3,8 1,1 100 4,5 1,4 100 3,0 1,6 75 5,9 0,3 100 1,8 0,8 75 2,3 0,6 100 2,6 1,1 100

hsa-miR182*

0,4 0 1,1. 0,5 20 1,1. 0,7 20 0,6 1,0. 25 2,0 0,2 100 0,3 0,5 0 0,0 0,2 0 0,4 0,9 0

hsa-miR1825

4,2 100 3,5 0,4 80 3,6 0,1 100 3,7 0,5 100 3,4 0,2 100 3,4 0,3 1,00 3,2 0,2 100 3,4 0,3 80

hsa-miR1826

4,4 100 5,4 1,0. 100 5,7 0,4 100 5,5 0,7 100 5,5 0,1 100 6,3 0,4 1,00 5,9 0,3 100 5,3 0,7 100

hsa-miR1827

1,6 0 1,3. 1,0. 0 1,8 0,3 20 2,1 0,6 25 1,3. 0,6 0 1,7 0,7 2,5 2,2 0,7 75 1,9 0,8 60

hsa-miR183

6,0 100 7,6 1,2 100 7,7 1,2 100 6,8 1,4 100 10,5 0,7 100 6,1 0,4 1,00 6,1 0,5 100 6,3 0,2 100

hsa-miR183*

0,5 0 1,6 1,1 20 2,1. 1,2 80 1,4 1,2 50 4,4 0,4 100 1,4 0,7 2,5 0,4 0,4 0 0,0 1,0. 20

hsa-miR184

2,0 0 0,8 0,6 0 1,7 1,2 20 2,1 1,6 25 2,1. 0,7 0 2,8 0,4 75 1,7 0,4 0 1,3 0,5 0

hsa-miR185

7,8 100 8,1. 1,0. 100 8,3. 0,4 100 8,2 0,3 100 8,1. 0,3 100 8,4 0,4 1,00 8,7 0,3 100 8,2 0,3 100

hsa-miR186

5,6 100 6,1. 0,9 100 6,4 0,7 100 6,3 0,5 100 6,5 0,4 100 6,9 0,5 1,00 7,2 0,3 100 6,3 0,4 100

hsa-miR187*

2,6 0 0,8 1,4 0 1,6 1,2 0 1,8 0,7 0 2,0 1,6 67 4,7 0,7 1,00 2,8 0,4 100 0,8 0,9 0

hsa-miR188-3p

0,6 0 0,2 1,2 20 0,3 1,1 0 0,2 0,4 0 0,4 0,4 0 0,3 0,5 0 0,4 0,2 0 0,4 0,6 0

hsa-miR188-5p

5,7 100 4,7 0,3 100 5,4 0,9 100 5,5 0,8 100 5,6 0,9 100 7,5 0,6 1,00 5,8 0,4 100 4,7 0,4 100

hsa-miR18a

4,6 100 4,3. 1,0. 80 5,2. 0,4 100 4,8 0,5 100 4,6 0,5 100 4,5 0,4 1,00 4,9 0,3 100 4,9 0,4 100

hsa-miR18b

3,6 100 3,1. 1,0. 80 3,8 0,4 100 3,4 0,5 100 30,2 0,5 100 3,3 0,5 1,00 3,7 0,2 100 3,5 0,4 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR18b*

2,4 0 2,1. 0,5 0 1,9 0,2 0 2,1 0,2 0 1,5 0,3 0 1,9 0,4 0 1,7 0,3 25 1,9 0,4 0

hsa-miR190

2,0 0 1,5 1,2 0 2,4 0,5 20 1,7 0,2 0 1,5 0,3 0 1,8 0,3 0 2,2 0,2 75 1,6 0,3 0

hsa-miR1909*

0,1 0 0,0 24 20 0,6 1,2 0 0,2 0,4 0 0,0 1,6 0 2,6 0,8 75 0,6 0,3 0 1,2 0,4 0

hsa-miR191

0,9 0 0,7 1,7 40 1,3. 0,7 0 1,2 0,6 25 1,3. 0,2 33 0,7 0,7 0 1,5 0,4 50 1,7 0,4 60

hsa-miR191*

4,6 100 3,5 0,9 80 4,0 0,2 100 3,9 0,4 100 3,5 0,3 100 3,9 0,4 1,00 3,4 0,3 100 3,9 0,3 100

hsa-miR1910

1,5 0 0,2 21. 20 1,7 0,2 0 1,0 0,7 0 1,4 0,4 0 0,7 0,6 0 0,9 0,5 0 1,9 0,2 0

hsa-miR1914

1,9 0 0,3 20. 20 1,7 0,6 0 1,2 0,7 0 10,2 0,3 0 1,6 0,3 0 1,4 0,2 0 1,5 0,7 0

hsa-miR1914*

8,0 100 7,2. 0,7 100 7,5 0,3 100 7,7 0,3 100 7,3. 0,4 100 7,8 0,4 1,00 7,4 0,1 100 8,2 0,7 100

hsa-miR1915

7,9 100 7,4 0,6 100 8,1. 0,6 100 8,0 0,5 100 7,9 1,0. 100 10,1 0,5 1,00 8,4 0,5 100 7,1 0,3 100

hsa-miR1915*

0,4 0 0,8 1,1 0 0,1 0,9 0 0,9 0,8 0 00,2 1,4 0 2,3 0,5 2,5 0,7 0,4 0 1,4 0,8 0

hsa-miR192

6,8 100 7,0 1,2 100 7,5 1,0. 100 7,3 0,1 100 7,7 1,7 100 7,4 0,4 1,00 7,9 0,2 100 7,6 0,3 100

hsa-miR192*

0,6 0 1,4 1,2 20 1,7 0,9 40 1,8 0,3 0 2,0 1,4 33 1,7 0,2 0 2,2 0,3 100 1,9 0,3 20

hsa-miR193a-3p

7,9 100 7,3. 1,0. 100 7,1. 0,5 100 7,3 0,7 100 6,5 1,1 100 7,3 0,3 1,00 7,9 0,2 100 7,4 0,4 100

hsa-miR193a-5p

5,4 100 5,7 0,8 100 4,9 0,5 100 5,4 1,0. 100 4,8 1,4 100 6,1 0,5 1,00 6,0 0,2 100 5,1 0,4 100

hsa-miR193b

7,3 100 6,5 1,0. 100 7,1. 1,5 100 6,8 0,6 100 8,0 0,5 100 7,6 1,0. 1,00 8,3 0,8 100 7,0 0,8 100

hsa-miR193b*

2,8 100 3,2. 1,1 60 3,5 0,4 100 3,4 0,5 100 3,7 0,7 100 4,7 0,6 1,00 4,4 0,4 100 3,1 0,3 100

hsa-miR194

5,2 100 5,7 1,2 100 6,3. 0,9 100 6,0 0,4 100 6,5 1,8 100 6,3 0,4 1,00 6,7 0,2 100 6,3 0,3 100

hsa-miR194*

0,5 0 0,4 1,2 0 0,0 0,6 0 0,3 0,1 0 00,2 1,2 33 1,5 0,6 75 0,5 0,2 0 0,2 0,5 0

hsa-miR195

11,1 100 11,0 0,8 100 11,4 1,1 100 10,6 0,6 100 10,7 0,7 100 11,2 0,3 1,00 11,6 0,3 100 10,6 0,4 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR195*

1,3 0 1,6 1,4 60 1,1. 0,9 20 1,3 0,5 0 1,3. 0,2 33 2,0 0,3 75 1,7 0,3 100 0,2 0,9 0

hsa-miR196a

3,6 100 3,4 14 80 1,8 0,3 0 3,3 18 50 2,7 15 33 1,8 0,4 0 2,2 16 25 2,0 0,8 40

hsa-miR196b

1,5 0 2,6 0,4 20 2,6 1,5 20 2,5 0,6 25 2,0 0,2 0 1,9 0,4 0 1,9 0,7 25 2,1 0,2 40

hsa-miR197

6,1 100 5,8 0,4 100 5,7 0,3 100 5,7 0,1 100 5,8 0,6 100 5,8 0,2 1,00 5,7 0,2 100 5,6 0,2 100

hsa-miR198

2,8 100 1,0 0,7 0 1,6 1,4 20 2,4 1,3 50 20,2 21. 67 4,9 0,6 1,00 3,0 0,6 100 0,8 0,8 0

hsa-miR199a-3p

11,3 100 10,0 0,8 100 10,4 1,3 100 10,8 0,4 100 1.10.2 1,2 100 11,6 0,2 1,00 12,0 0,2 100 11,0 0,7 100

hsa-miR199a-5p

8,8 100 8,5 0,8 100 9,0 1,3 100 9,3 0,3 100 9,7 1,2 100 9,9 0,6 1,00 10,4 0,3 100 9,3 0,8 100

hsa-miR199b-5p

8,0 100 5,9 1,7 100 7,2. 1,9 100 7,3 0,6 100 7,9 1,9 100 9,3 0,2 1,00 9,7 0,2 100 7,8 1,3 100

hsa-miR19a

7,1 100 7,5 0,9 100 8,6 0,4 100 8,2 0,5 100 7,5 0,2 100 7,9 0,5 1,00 8,3 0,1 100 8,5 0,6 100

hsa-miR19b

9,9 100 10,2 0,7 100 11,2. 0,5 100 10,9 0,5 100 10,3 0,3 100 10,7 0,3 1,00 10,8 0,2 100 11,3 0,3 100

hsa-miR19b-l*

1,3 100 2,2. 0,6 60 3,0 0,4 100 2,8 0,3 100 2,1. 0,3 100 2,0 0,4 1,00 2,5 0,5 100 2,9 0,3 100

hsa-miR200a

1,4 0 5,6 31. 100 7,1. 20. 100 10,2 0,6 100 11,3. 0,3 100 8,9 0,3 1,00 9,9 0,1 100 10,2 0,5 100

hsa-miR200a*

0,5 0 2,1. 1,8 40 2,2. 1,3 60 5,4 0,6 100 5,7 0,3 100 4,3 0,3 1,00 4,6 0,2 100 5,3 0,6 100

hsa-miR200b

2,9 100 7,2. 32 100 8,3. 1,8 100 11,8 0,7 100 12.0.2 0,1 100 10,2 0,1 1,00 11,1 0,2 100 11,8 0,5 100

hsa-miR200b*

0,5 0 2,5 22 40 2,6 1,4 60 5,8 0,5 100 6,0 0,1 100 4,9 0,3 1,00 5,2 0,3 100 5,6 0,6 100

hsa-miR200c

3,0 100 11,4 0,7 100 12,1. 0,7 100 11,7 0,3 100 12.0.2 0,3 100 11,4 0,3 1,00 11,7 0,3 100 11,9 0,2 100

hsa-miR200c*

0,8 0 2,4 0,9 80 2,6 0,4 100 2,1 0,5 75 2,6 0,3 100 1,0 0,5 0 1,9 0,8 75 2,1 0,3 100

hsa-miR202

4,7 100 4,4 0,7 100 4,9 0,8 100 4,9 0,8 100 5,1. 0,7 100 7,1 0,6 1,00 5,1 0,8 100 4,3 0,5 100

hsa-miR203

3,9 100 5,6 0,9 100 6,9 1,5 100 5,4 0,8 100 3,5 20. 67 6,1 0,8 1,00 5,9 0,6 100 6,6 1,1 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR204

8,7 100 7,4 27 100 7,3. 1,6 100 5,4 21. 100 6,0 1,3 100 8,2 0,5 1,00 8,7 0,8 100 5,3 0,8 100

hsa-miR205

1,9 0 4,8 34 80 3,2. 22 60 4,9 1,6 100 3,9 0,7 100 4,5 0,4 1,00 5,1 0,1 100 5,2 34 80

hsa-miR206

1,4 0 0,3 1,2 0 0,3 0,6 0 2,4 30. 25 0,8 10. 0 5,3 32 1,00 3,9 37 50 0,1 0,4 0

hsa-miR208b

0,6 0 0,3 0,9 0 0,6 0,4 0 0,9 1,2 0 00,2 0,2 0 1,5 31. 2,5 1,7 24 25 0,7 0,4 0

hsa-miR20a

9,7 100 9,9 0,6 100 10,9 0,4 100 10,7 0,2 100 9,8 0,8 100 10,5 0,2 1,00 10,7 0,3 100 11,0 0,1 100

hsa-miR20a*

2,5 0 3,6 0,6 100 4,7 0,2 100 4,2 0,5 100 4,1. 0,2 100 4,3 0,5 1,00 5,0 0,4 100 4,6 0,6 100

hsa-miR20b

7,4 100 7,2. 0,8 100 8,2. 0,4 100 7,7 0,4 100 7,0 0,7 100 7,8 0,4 1,00 8,2 0,3 100 8,0 0,4 100

hsa-miR21

16,0 100 13,9 1,0. 100 14,5 0,6 100 14,9 0,6 100 14,8 1,0. 100 13,3 0,4 1,00 13,5 0,5 100 15,8 0,5 100

hsa-miR21*

7,1 100 5,3. 0,6 100 5,9 0,7 100 6,7 0,3 100 5,9 0,7 100 4,4 0,2 1,00 5,6 20. 100 6,8 0,6 100

hsa-miR210

8,7 100 4,6 1,0. 100 5,5 1,7 100 5,3 0,4 100 8,7 29 100 6,4 0,2 1,00 6,3 0,4 100 5,8 0,4 100

hsa-miR211

1,3 0 1,6 1,2 20 0,5 0,4 0 1,4 0,4 0 0,3 1,0. 0 0,3 0,5 0 0,9 0,6 0 0,4 0,7 0

hsa-miR212

5,4 100 4,6 0,5 100 4,8 0,5 100 4,6 0,4 100 5,9 0,8 100 5,0 0,5 1,00 4,4 0,2 100 4,9 0,6 100

hsa-miR214

8,3 100 7,5 0,8 100 7,8 1,3 100 8,5 0,5 100 8,9 1,3 100 9,4 0,4 1,00 9,6 0,2 100 8,2 0,8 100

hsa-miR214*

3,2 100 2,9 0,8 40 3,1. 1,4 80 3,3 0,3 100 3,8 1,2 100 4,0 0,6 1,00 4,5 0,2 100 3,5 0,9 100

hsa-miR215

4,6 100 5,1. 1,3 100 5,8 1,0. 100 5,3 0,3 100 5,9 1,6 100 5,5 0,5 1,00 6,2 0,3 100 5,7 0,5 100

hsa-miR216a

0,8 0 0,7 1,4 20 0,5 1,3 20 0,4 1,6 0 1,9 0,8 67 0,4 0,1 0 0,2 0,4 0 0,7 1,1 0

hsa-miR216b

2,1 0 1,7 0,7 0 1,9 0,4 0 1,0 0,9 0 0,0 1,4 33 1,0 0,4 0 1,6 0,2 0 1,3 0,6 0

hsa-miR218

5,0 100 7,2. 1,0. 100 7,8 0,6 100 7,8 0,8 100 8,3. 0,4 100 8,2 0,3 1,00 8,9 0,3 100 7,9 0,7 100

hsa-miR219-5p

2,1 0 3,3. 1,0. 60 3,4 0,6 60 3,4 0,6 75 3,7 0,6 100 3,3 0,8 75 3,8 0,3 100 3,4 0,5 80

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR22

12,8 100 12,4 0,7 100 12,7 0,8 100 12,1 0,2 100 12,4 0,4 100 12,2 0,3 1,00 12,3 0,2 100 12,1 0,1 100

hsa-miR22*

4,8 100 5,3. 1,0. 100 5,8 0,8 100 4,3 0,5 100 4,5 0,3 100 4,9 0,8 1,00 5,6 0,7 100 4,9 0,5 100

hsa-miR221

6,9 100 8,9 20. 100 9,0 21. 100 10,2 1,0. 100 9,7 0,8 100 6,9 0,4 1,00 6,8 0,3 100 10,6 0,7 100

hsa-miR221*

4,8 100 6,6 19 100 6,6 19 100 8,1 0,9 100 6,9 0,3 100 5,1 0,2 1,00 5,0 0,4 100 8,7 0,9 100

hsa-miR222

6,0 100 7,5 1,3 100 7,6 1,7 100 9,7 0,8 100 8,1. 0,7 100 6,6 0,8 1,00 5,9 0,1 100 10,2 0,6 100

hsa-miR222*

2,1 0 0,0 1,0. 0 0,0 0,7 0 0,9 0,4 0 0,4 0,8 0 0,8 0,3 0 1,1 0,3 0 0,5 0,7 40

hsa-miR223

11,3 100 9,3. 1,0. 100 9,6 0,9 100 10,7 1,3 100 90,2 1,2 100 9,9 0,7 1,00 10,9 0,9 100 10,3 0,7 100

hsa-miR223*

2,1 0 0,7 0,5 0 0,9 0,6 0 1,4 1,0. 50 0,8 0,4 0 0,8 0,3 0 1,4 0,7 50 1,3 0,4 20

hsa-miR224

2,5 0 5,3. 0,9 100 4,7 0,7 100 5,2 0,8 100 6,6 25 100 5,7 0,2 1,00 6,0 0,1 100 5,7 0,5 100

hsa-miR23a

13,4 100 12,3. 0,5 100 12,6 0,6 100 12,5 0,4 100 13,0 0,1 100 12,7 0,3 1,00 13,1 0,2 100 12,6 0,4 100

hsa-miR23a*

3,1 100 2,7 0,9 80 3,5 0,3 100 3,6 0,4 100 30,2 0,7 100 4,5 0,5 1,00 3,5 0,3 100 3,5 0,6 100

hsa-miR23b

12,2 100 12,1. 1,0. 100 11,5 1,0. 100 12,6 0,4 100 13,4 0,1 100 12,0 0,1 1,00 12,6 0,2 100 12,3 0,5 100

hsa-miR23b*

3,5 100 3,6 0,8 100 2,9 0,8 100 4,3 0,2 100 4,6 0,3 100 3,4 0,3 1,00 4,0 0,2 100 4,0 0,6 100

hsa-miR24

12,5 100 12,2. 0,4 100 12,0 0,4 100 12,6 0,4 100 13,0 0,2 100 12,2 0,2 1,00 12,5 0,2 100 12,6 0,3 100

hsa-miR24-1*

5,6 100 5,3. 0,8 100 4,8 0,8 100 5,7 0,4 100 6,6 0,2 100 4,9 0,1 1,00 5,4 0,1 100 5,7 0,5 100

hsa-miR25

9,4 100 9,4 0,7 100 9,7 0,2 100 9,9 0,2 100 10,1 0,1 100 9,8 0,3 1,00 10,0 0,3 100 9,9 0,2 100

hsa-miR26a

10,4 100 11,7 1,0. 100 11,8 0,4 100 12,3 0,4 100 12.0.2 0,4 100 12,5 0,3 1,00 12,8 0,2 100 12,2 0,3 100

hsa-miR26a-l*

0,6 0 1,4 0,3 0 1,3. 0,2 0 1,3 0,2 0 1,3. 0,2 0 1,1 0,7 0 1,4 0,2 50 1,3 0,3 0

hsa-miR26b

10,5 100 11,3. 0,5 100 11,7 0,6 100 11,8 0,6 100 12.0.2 0,1 100 12,0 0,4 1,00 12,6 0,3 100 12,0 0,3 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR26b*

1,0 0 2,0 0,4 20 1,7 0,4 40 1,3 0,5 25 1,7 0,2 100 1,3 0,4 0 1,7 0,1 100 1,5 0,3 40

hsa-miR27a

13,0 100 11,6 0,6 100 12,0 0,6 100 12,0 0,4 100 12,3. 0,1 100 11,7 0,3 1,00 12,2 0,2 100 12,2 0,3 100

hsa-miR27a*

1,5 0 0,8 0,7 0 1,0 0,5 0 1,3 0,9 0 1,3. 0,2 0 1,5 0,6 0 0,9 0,6 0 0,0 1,6 20

hsa-miR27b

11,7 100 11,8 1,0. 100 11,3. 0,9 100 12,3 0,5 100 12,9 0,3 100 11,8 0,3 1,00 12,3 0,2 100 12,1 0,6 100

hsa-miR28-3p

1,2 0 0,9 0,6 0 0,7 0,9 0 1,0 0,2 0 1,0 0,3 33 2,1 0,2 1,00 1,4 0,2 100 0,5 0,9 20

hsa-miR28-5p

7,7 100 7,2. 0,5 100 7,4 0,4 100 7,3 0,6 100 7,9 0,4 100 7,6 0,2 1,00 8,0 0,1 100 7,4 0,1 100

hsa-miR296-5p

3,7 100 3,2. 0,3 100 3,4 0,4 100 3,4 0,5 100 30,2 0,2 100 4,5 0,7 1,00 3,4 0,2 100 3,1 0,2 100

hsa-miR298

1,5 0 0,6 1,2 0 0,1 0,9 0 0,5 0,9 0 0,6 1,1 0 1,9 0,4 50 0,8 0,8 0 0,8 0,7 0

hsa-miR299-3p

2,0 0 0,3 0,7 0 1,2. 0,9 0 1,0 0,7 0 3,1. 0,5 100 1,7 0,6 0 1,6 0,3 0 1,0 0,5 0

hsa-miR299-5p

3,1 100 2,1. 1,0. 40 2,3. 1,3 40 2,3 0,5 25 50,2 0,5 100 2,9 1,5 50 3,8 0,4 100 2,4 0,9 60

hsa-miR29a

13,6 100 13,3. 0,6 100 13,7 0,2 100 14,0 0,3 100 14,0 0,1 100 13,7 0,3 1,00 14,0 0,3 100 14,3 0,4 100

hsa-miR29a*

1,8 0 2,0 0,4 40 2,2. 0,2 100 2,1 0,1 75 2,1. 0,3 100 1,7 0,8 75 2,1 0,2 100 2,4 0,6 80

hsa-miR29b

11,6 100 11,4 0,4 100 12,3. 0,6 100 12,2 0,6 100 12,8 0,8 100 11,6 0,7 1,00 12,1 0,3 100 12,6 0,8 100

hsa-miR29b-l*

5,0 100 4,8 0,5 100 5,0 0,4 100 5,3 0,4 100 5,4 0,5 100 3,4 0,3 1,00 5,3 0,7 100 5,5 0,4 100

hsa-miR29b-2*

0,2 0 0,9 1,7 60 1,6 0,7 60 1,2 0,3 25 2,7 0,9 100 1,7 0,5 1,00 2,0 0,3 100 1,0 0,4 40

hsa-miR29c

11,9 100 12,8 0,7 100 13,1. 0,9 100 12,9 0,3 100 13,5 0,9 100 13,0 0,4 1,00 13,3 0,2 100 13,1 0,4 100

hsa-miR29c*

6,2 100 7,4 1,0. 100 7,5 1,0. 100 6,9 0,3 100 8,3. 0,9 100 7,5 0,3 1,00 7,9 0,3 100 7,0 0,4 100

hsa-miR300

1,2 0 0,4 1,0. 0 1,1. 1,0. 0 0,7 0,8 0 0,3 1,3 0 0,2 0,5 0 0,4 0,8 25 1,1 0,3 0

hsa-miR301a

5,9 100 5,6 1,1 100 6,3. 0,6 100 5,9 0,6 100 7,6 0,3 100 5,6 0,5 1,00 5,8 0,2 100 6,0 0,5 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR301b

2,3 100 1,6 1,2 60 2,5 0,9 60 1,7 0,3 75 3,1. 0,7 100 1,7 0,3 75 2,5 0,5 100 1,6 0,2 60

hsa-miR302c*

0,8 0 0,3 0,5 0 0,3 0,9 0 0,8 0,4 0 00,2 1,3 0 1,6 0,7 2,5 0,1 0,5 0 0,8 0,6 0

hsa-miR30a

13,4 100 11,2. 0,5 100 12,3. 1,1 100 11,3 0,3 100 9,8 1,5 100 12,0 0,4 1,00 12,1 0,3 100 11,4 0,7 100

hsa-miR30a*

10,3 100 8,0 0,5 100 9,0 1,1 100 8,2 0,5 100 6,6 1,6 100 8,6 0,3 1,00 9,0 0,4 100 8,3 0,8 100

hsa-miR30b

9,7 100 11,1. 0,6 100 11,5 0,6 100 11,7 0,7 100 12,0 0,2 100 11,7 0,5 1,00 12,2 0,3 100 11,9 0,5 100

hsa-miR30b*

3,1 100 4,0 0,7 100 4,1. 0,5 100 4,4 0,3 100 4,4 0,4 100 4,3 0,3 1,00 4,5 0,1 100 4,3 0,4 100

hsa-miR30c

11,1 100 10,7 0,8 100 11,4 0,6 100 10,5 0,5 100 1.00.2 0,6 100 11,1 0,4 1,00 11,5 0,2 100 10,4 0,6 100

hsa-miR30c-l*

2,4 100 3,1. 0,7 100 3,2. 0,5 100 2,8 0,3 100 2,7 0,5 100 3,2 0,3 1,00 3,4 0,1 100 2,8 0,2 100

hsa-miR30c-2*

6,7 100 5,0 0,5 100 5,9 0,9 100 5,3 0,6 100 3,8 1,7 100 6,0 0,3 1,00 6,1 0,3 100 5,2 0,7 100

hsa-miR30d

8,9 100 9,9 0,7 100 10,1 0,6 100 10,4 0,8 100 10,6 0,2 100 10,4 0,2 1,00 10,4 0,2 100 10,2 0,4 100

hsa-miR30d*

1,1 0 2,7 0,5 80 3,0 0,4 100 3,1 0,6 75 3,1. 0,3 100 2,2 0,3 1,00 2,9 0,2 100 2,9 0,5 100

hsa-miR30e

8,4 100 9,5 0,9 100 10,0 0,5 100 9,4 0,4 100 8,9 0,3 100 9,6 0,4 1,00 9,8 0,3 100 9,5 0,3 100

hsa-miR30e*

7,0 100 7,4 0,8 100 8,0 0,5 100 7,1 0,5 100 6,7 0,5 100 7,2 0,5 1,00 8,0 0,3 100 7,3 0,5 100

hsa-miR31

5,6 100 4,9 35 80 6,7 1,7 100 10,1 1,1 100 3,6 27 67 6,8 1,8 1,00 7,7 0,6 100 10,1 0,6 100

hsa-miR31*

5,0 100 3,7 34 60 5,4 1,6 100 8,5 1,1 100 2,4 22 67 5,2 1,6 1,00 6,0 0,6 100 8,6 0,6 100

hsa-miR32

2,6 100 3,8 1,0. 80 5,1. 0,5 100 3,8 0,8 100 3,7 0,7 100 3,6 0,9 1,00 4,4 0,3 100 4,5 0,8 100

hsa-miR320a

8,2 100 7,9 0,7 100 8,4 0,2 100 8,4 0,0. 100 8,9 0,1 100 9,2 0,3 1,00 8,6 0,1 100 8,3 0,3 100

hsa-miR320b

9,7 100 9,0 0,7 100 9,5 0,2 100 9,6 0,2 100 10,1 0,3 100 10,2 0,4 1,00 9,8 0,1 100 9,4 0,3 100

hsa-miR320c

9,8 100 9,0 0,7 100 9,5 0,1 100 9,5 0,1 100 10,0 0,4 100 10,2 0,2 1,00 9,9 0,1 100 9,3 0,4 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR320d

10,4 100 9,6 0,7 100 10,0 0,2 100 10,1 0,1 100 10,5 0,4 100 10,7 0,3 1,00 10,4 0,0. 100 9,9 0,4 100

hsa-miR323-3p

0,3 0 -0,2 1,0 0 -0,2 0,7 0 -0,3 0,5 0 6,9 0,1 100 0,4 0,8 0 1,3 1,5 25 0,0 0,7 0

hsa-miR324-3p

8,7 100 9,1. 0,7 100 9,3. 0,2 100 9,1 0,4 100 9,1. 0,2 100 9,1 0,3 1,00 9,2 0,2 100 9,3 0,4 100

hsa-miR324-5p

7,2 100 8,0 0,9 100 8,2. 0,8 100 7,9 0,3 100 90,2 0,0. 100 7,9 0,2 1,00 8,0 0,2 100 8,0 0,4 100

hsa-miR326

2,4 100 2,3. 0,5 80 1,5 0,2 40 1,6 0,2 25 3,6 0,1 100 1,7 0,1 1,00 1,9 0,2 100 1,7 0,3 80

hsa-miR328

3,9 100 4,0 0,6 100 2,9 0,9 80 3,7 0,4 100 3,9 0,5 100 3,6 0,3 1,00 3,9 0,2 100 3,2 0,5 100

hsa-miR329

0,6 0 0,8 11. 0 0,5 0,5 0 0,3 0,3 0 4,1. 0,1 100 0,5 0,5 0 1,5 0,4 0 0,1 0,6 0

hsa-miR330-3p

5,2 100 3,7 0,4 100 3,8 0,4 100 3,9 0,3 100 6,3. 0,5 100 4,4 0,2 1,00 4,0 0,0. 100 4,0 0,3 100

hsa-miR331-3p

10,2 100 10,0 0,7 100 10,6 0,8 100 10,2 0,4 100 10,8 0,1 100 10,1 0,2 1,00 10,5 0,2 100 10,3 0,2 100

hsa-miR335

5,8 100 5,9 1,2 100 6,6 0,7 100 5,5 0,6 100 9,1. 1,6 100 5,8 0,7 1,00 6,5 0,3 100 5,8 0,9 100

hsa-miR335*

2,6 0 2,5 0,3 20 2,5 0,2 60 1,9 0,4 25 3,8 0,9 100 2,0 0,3 0 2,0 0,2 25 2,0 0,2 40

hsa-miR337-3p

1,5 0 1,9 0,9 20 1,5 0,3 0 1,4 0,4 0 30,2 0,4 100 1,6 0,6 0 2,0 0,3 50 1,4 0,6 0

hsa-miR337-5p

3,3 100 1,5 0,8 20 2,0 1,5 40 2,0 0,5 0 5,3. 0,3 100 2,5 0,9 75 3,3 0,4 100 2,2 1,3 40

hsa-miR338-3p

6,0 100 6,2. 0,6 100 6,7 0,9 100 6,5 0,4 100 9,3. 0,3 100 6,9 0,8 1,00 7,4 0,5 100 7,0 0,6 100

hsa-miR338-5p

1,0 0 1,9 0,6 80 2,3. 0,3 100 2,0 0,4 50 2,1. 0,4 100 2,5 0,3 1,00 2,1 0,2 100 2,4 0,9 80

hsa-miR339-3p

3,6 100 3,4 0,8 100 3,6 0,6 100 3,4 0,6 100 4,0 0,2 100 3,6 0,3 1,00 3,7 0,2 100 3,5 0,5 100

hsa-miR339-5p

1,5 100 1,1. 1,6 40 1,9 1,3 40 0,8 1,1 50 0,9 0,9 0 1,5 0,1 2,5 1,7 0,3 100 1,4 0,8 60

hsa-miR33a

3,2 100 2,3. 1,2 60 3,0 0,4 100 3,0 0,5 75 30,2 0,7 100 2,3 0,4 75 2,9 0,1 100 3,1 0,6 80

hsa-miR33b

0,6 0 0,8 0,9 20 0,8 0,6 0 0,4 0,5 0 0,7 0,4 0 0,0 0,4 0 0,3 0,4 0 0,5 0,2 0

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR33b*

2,9 100 2,7 0,5 40 2,7 0,5 60 2,8 0,4 25 2,7 0,6 100 4,3 0,5 1,00 3,0 0,3 100 2,5 0,2 60

hsa-miR340

5,5 100 5,2. 1,1 100 5,8 0,4 100 5,2 0,5 100 60,2 0,6 100 4,7 0,5 1,00 5,3 0,2 100 5,4 0,6 100

hsa-miR340*

4,4 100 4,2. 0,9 100 4,6 0,3 100 3,9 0,7 100 50,2 0,5 100 3,3 0,5 1,00 4,3 0,2 100 4,2 0,4 100

hsa-miR342-3p

9,7 100 9,4 0,8 100 9,3. 0,6 100 9,4 0,5 100 10,1 0,7 100 9,2 0,3 1,00 9,4 0,4 100 9,8 0,2 100

hsa-miR342-5p

5,9 100 5,0 0,9 100 5,0 0,9 100 5,5 0,6 100 5,8 0,4 100 4,9 0,2 1,00 5,3 0,6 100 5,8 0,2 100

hsa-miR345

1,6 0 3,9 1,8 100 4,1. 1,9 80 3,1 0,7 100 2,9 1,0. 100 4,3 0,2 1,00 4,5 0,6 100 2,9 0,5 100

hsa-miR346

1,4 0 1,4 1,6 40 0,3 0,3 0 1,2 0,2 0 0,1 1,2 0 0,3 1,0. 0 1,0 0,2 0 0,5 0,6 0

hsa-miR34a

11,3 100 11,9 0,5 100 12,0 0,6 100 12,3 0,3 100 10,6 0,7 100 10,9 0,2 1,00 10,9 0,1 100 12,6 0,2 100

hsa-miR34a*

3,8 100 4,5 0,3 100 4,6 0,4 100 4,8 0,3 100 3,1. 0,6 100 3,7 0,1 1,00 3,7 0,2 100 5,1 0,2 100

hsa-miR34b

4,6 100 1,6 1,1 0 1,4 0,7 20 1,5 0,8 0 10,2 1,6 33 2,1 1,0. 2,5 1,9 0,5 50 1,3 0,6 0

hsa-miR34b*

8,4 100 6,8 0,5 100 7,2. 0,4 100 7,3 0,4 100 6,0 0,8 100 6,6 0,4 1,00 6,5 0,1 100 7,6 0,5 100

hsa-miR34c-3p

2,0 100 1,4 0,8 0 0,7 0,6 0 1,1 0,5 0 00,2 1,6 0 1,7 0,3 75 0,3 0,7 0 1,4 0,2 0

hsa-miR34c-5p

7,4 100 3,1. 0,6 100 3,9 0,7 100 3,3 1,1 100 3,4 1,6 67 4,1 0,8 1,00 3,8 0,4 100 3,4 0,8 100

hsa-miR361-3p

6,3 100 6,8 0,5 100 6,6 0,3 100 6,8 0,5 100 6,8 0,2 100 6,9 0,4 1,00 7,4 0,1 100 7,3 0,2 100

hsa-miR361-5p

9,0 100 8,7 0,5 100 8,5 0,4 100 8,7 0,4 100 90,2 0,5 100 8,7 0,2 1,00 8,8 0,1 100 8,7 0,2 100

hsa-miR362-3p

6,3 100 5,6 0,9 100 6,1. 0,4 100 5,2 0,4 100 5,9 0,6 100 5,8 0,5 1,00 6,3 0,3 100 5,8 0,6 100

hsa-miR362-5p

6,6 100 5,6 1,0. 100 6,0 0,7 100 5,3 0,3 100 5,9 0,5 100 5,7 0,3 1,00 5,8 0,2 100 5,6 0,0. 100

hsa-miR363

7,3 100 5,9 0,9 100 5,8 0,6 100 5,9 0,9 100 5,5 0,9 100 6,4 0,5 1,00 6,9 0,3 100 4,7 0,9 100

hsa-miR365

7,7 100 8,6 1,2 100 8,8 0,5 100 7,9 0,4 100 9,0 0,3 100 8,7 0,6 1,00 9,8 0,5 100 8,2 0,6 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR369-3p

0,8 0 0,7 1,1 0 0,9 0,5 0 0,7 0,2 0 2,9 0,7 67 0,5 0,5 0 0,4 0,4 0 0,9 0,4 0

hsa-miR369-5p

1,3 0 1,2. 1,1 0 1,6 0,7 20 0,9 0,5 0 5,3. 0,7 100 1,5 0,6 2,5 2,1 0,3 75 1,5 0,8 20

hsa-miR370

1,8 0 0,4 1,7 0 1,8 0,7 0 2,1 1,1 25 4,8 0,4 100 3,8 0,5 1,00 2,4 0,5 100 1,1 0,8 0

hsa-miR371-5p

4,6 100 3,6 0,8 80 4,2. 0,7 100 3,8 0,8 100 4,1. 0,9 100 6,1 0,5 1,00 4,5 0,5 100 2,8 0,4 60

hsa-miR373*

2,2 100 0,9 1,7 20 1,9 0,7 60 1,1 0,5 0 1,3. 1,6 67 3,2 1,0. 75 1,9 0,3 75 0,2 0,7 0

hsa-miR374a

7,5 100 8,3. 0,9 100 8,7 0,5 100 8,6 0,8 100 8,7 0,4 100 8,4 0,6 1,00 9,2 0,2 100 9,1 0,4 100

hsa-miR374b

7,0 100 7,6 0,7 100 7,8 0,5 100 8,1 0,5 100 8,1. 0,5 100 8,0 0,5 1,00 8,5 0,2 100 8,4 0,2 100

hsa-miR374b*

1,0 0 1,5 0,4 0 1,5 0,4 0 1,0 0,8 25 1,6 0,3 0 1,2 0,5 0 1,8 0,2 75 1,7 0,3 20

hsa-miR375

1,3 0 2,1. 26 60 1,9 21. 40 6,3 13 100 13,9 0,4 100 4,0 21. 75 4,9 11. 100 6,7 1,2 100

hsa-miR376a

5,1 100 3,2. 1,1 60 4,2. 1,5 100 4,1 0,4 100 8,5 0,7 100 4,8 0,9 1,00 5,8 0,4 100 4,2 1,3 100

hsa-miR376a*

1,5 0 0,8 0,7 0 1,5 0,5 0 0,9 0,2 0 4,6 0,4 100 1,2 0,3 0 1,5 0,3 0 1,1 0,4 0

hsa-miR376b

2,4 0 0,6 0,9 0 0,9 1,2 20 0,6 0,2 0 3,4 1,4 100 0,8 0,7 0 1,5 0,4 25 1,2 0,6 20

hsa-miR376c

5,9 100 3,9 1,1 100 4,6 1,4 100 4,8 0,5 100 90,2 0,8 100 5,4 0,9 1,00 6,3 0,4 100 4,9 1,1 100

hsa-miR377

4,0 100 2,5 1,2 40 3,5 1,4 80 3,3 0,3 100 7,5 0,5 100 3,5 0,8 1,00 4,5 0,6 100 3,5 1,4 80

hsa-miR377*

0,9 0 0,5 0,9 0 0,3 0,4 0 0,0 1,0. 0 2,9 0,2 100 0,2 0,4 0 0,2 0,4 0 0,1 0,3 0

hsa-miR378

5,2 100 4,5 0,8 100 4,6 0,5 100 5,0 0,4 100 4,8 0,7 100 6,2 1,5 1,00 6,0 1,9 100 4,8 0,2 100

hsa-miR378*

3,7 100 2,9 0,6 60 2,5 0,2 40 3,3 0,3 75 3,0 0,8 67 3,9 1,7 1,00 4,1 20. 100 2,9 0,4 80

hsa-miR379

2,8 100 1,0 0,9 20 1,5 1,7 40 1,7 0,9 25 60,2 0,1 100 2,7 0,9 75 3,1 0,5 100 1,9 1,2 40

hsa-miR381

3,7 100 2,0 1,1 20 2,4 1,6 60 2,8 0,7 75 7,3. 0,3 100 4,1 1,2 1,00 4,3 0,5 100 2,7 1,1 60

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR382

2,3 0 1,2. 1,1 20 1,7 0,9 20 1,8 0,4 0 6,5 0,2 100 2,2 0,4 75 2,6 0,6 100 1,5 1,2 40

hsa-miR409-3p

4,2 100 2,3. 0,5 20 2,3. 1,3 20 2,8 0,6 50 70,2 0,3 100 2,6 1,0. 75 2,3 1,6 75 2,6 1,1 60

hsa-miR409-5p

1,2 0 0,6 0,8 0 0,5 0,7 0 0,4 0,6 0 4,9 0,1 100 0,3 1,1 0 0,4 0,5 0 0,4 0,6 0

hsa-miR410

3,0 0 1,6 0,4 0 1,8 0,7 0 1,7 0,6 0 80,2 0,1 100 2,2 1,0. 50 2,9 1,2 25 1,9 1,0. 0

hsa-miR411

1,3 0 0,4 1,2 0 1,2. 0,9 0 1,0 0,9 0 4,8 0,2 100 1,3 1,1 2,5 2,2 0,4 75 0,9 0,7 0

hsa-miR421

2,5 0 2,4 1,3 40 2,8 0,4 80 2,2 0,7 50 3,5 0,5 100 2,3 0,5 75 2,7 0,1 100 2,5 0,5 60

hsa-miR422a

0,2 0 1,4 1,2 20 2,0 0,8 20 1,3 1,2 25 2,0 1,4 67 3,6 0,4 1,00 2,8 0,3 100 0,8 1,1 0

hsa-miR423-3p

2,6 100 3,4 0,3 100 3,6 0,2 100 3,5 0,4 100 3,6 0,1 100 3,6 0,1 1,00 3,5 0,1 100 3,4 0,2 100

hsa-miR423-5p

5,6 100 6,6 0,7 100 6,8 0,2 100 6,9 0,3 100 6,9 0,1 100 7,2 0,3 1,00 7,1 0,1 100 6,8 0,2 100

hsa-miR424

7,6 100 9,1. 13 100 10,0 14 100 10,8 14 100 8,4 1,2 100 8,8 0,4 1,00 10,0 0,5 100 10,5 0,7 100

hsa-miR424*

2,2 100 2,9 1,1 60 2,9 1,1 80 3,8 0,9 100 3,1. 1,9 67 5,3 0,7 1,00 3,8 0,3 100 3,0 0,5 100

hsa-miR425

7,7 100 7,3. 0,9 100 7,5 0,3 100 7,5 0,2 100 7,8 0,1 100 7,0 0,4 1,00 7,4 0,2 100 7,7 0,3 100

hsa-miR425*

4,1 100 3,2. 0,6 80 3,5 0,2 100 3,4 0,3 75 3,1. 0,2 100 3,3 0,3 1,00 3,1 0,3 100 3,4 0,3 100

hsa-miR429

0,1 0 4,7 30. 60 5,9 22 80 9,2 0,8 100 10,3 0,3 100 7,6 0,2 1,00 8,6 0,1 100 9,0 0,5 100

hsa-miR431

2,3 0 1,0 1,2 0 1,2. 0,2 0 1,0 0,8 0 5,0 1,1 100 1,1 0,5 0 1,8 1,5 25 1,0 0,6 0

hsa-miR431*

2,5 0 2,1. 0,5 0 1,6 1,1 0 1,5 1,4 25 2,9 0,1 100 1,9 0,7 2,5 1,4 0,2 0 1,6 0,8 0

hsa-miR432

2,8 100 1,8 0,7 0 2,1. 0,6 20 2,0 0,6 0 7,6 0,4 100 3,3 0,6 75 3,0 0,7 100 2,0 0,8 20

hsa-miR433

1,5 0 0,7 1,3 0 1,5 0,6 0 1,2 0,6 0 4,1. 0,6 100 0,4 0,9 0 0,6 0,6 0 1,2 0,5 0

hsa-miR449a

4,5 100 2,3. 0,6 40 3,5 1,2 80 4,1 0,8 100 3,4 0,8 100 3,4 1,3 75 3,2 0,2 100 3,4 0,5 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR449b

1,2 0 0,6 0,3 0 1,1. 0,9 20 1,2 0,3 0 0,6 0,6 0 1,2 0,4 0 1,0 0,1 0 1,1 0,3 0

hsa-miR450a

2,0 0 4,8 1,3 100 5,5 1,6 80 6,0 1,8 100 3,5 0,8 100 4,1 0,7 1,00 5,4 0,4 100 5,5 0,7 100

hsa-miR450b-5p

0,9 0 1,3. 0,4 0 1,3. 0,5 0 1,6 0,8 25 0,4 0,7 0 0,5 0,3 0 0,8 0,5 0 1,2 0,4 0

hsa-miR451

12,0 100 13,4 20. 100 14,0 1,1 100 14,4 0,9 100 13,9 1,4 100 14,9 0,6 1,00 15,5 0,2 100 12,9 0,8 100

hsa-miR452

1,6 0 4,2. 0,8 100 3,9 0,8 100 4,3 0,5 100 5,1. 23 100 4,6 0,4 1,00 5,0 0,3 100 4,5 0,4 100

HasmiR-254

5,5 100 5,5 0,9 100 6,3. 0,2 100 5,8 0,6 100 6,7 0,2 100 6,0 0,5 1,00 6,5 0,3 100 6,1 0,2 100

hsa-miR454*

1,2 0 1,8 0,7 20 1,5 0,2 0 1,1 0,9 0 1,4 0,5 0 1,0 0,5 0 1,1 0,2 0 1,2 0,3 0

hsa-miR455-3p

5,7 100 5,7 0,9 100 6,7 1,0. 100 6,1 0,8 100 5,4 1,2 100 6,4 0,4 1,00 6,9 0,1 100 6,4 0,2 100

hsa-miR455-5p

2,3 0 3,3. 1,1 80 4,0 1,0. 100 3,6 0,6 100 2,7 1,6 67 4,2 0,2 1,00 4,7 0,1 100 3,8 0,4 100

hsa-miR483-3p

2,6 0 2,0 1,0. 20 0,8 0,6 0 1,7 0,4 0 1,3. 0,8 0 1,4 0,3 0 1,3 0,5 0 0,4 0,3 0

hsa-miR483-5p

6,2 100 5,0 0,8 100 5,7 1,2 100 6,2 1,2 100 6,4 19 100 8,5 0,8 1,00 6,9 0,2 100 4,5 0,8 100

hsa-miR484

5,0 100 4,7 0,8 100 5,1. 0,4 100 4,3 0,5 100 5,4 0,6 100 4,5 0,4 1,00 4,9 0,2 100 4,6 0,3 100

hsa-miR485-3p

1,1 0 0,3 1,9 0 0,1 0,7 0 0,1 0,9 0 4,3. 0,4 100 0,1 0,5 0 0,9 0,9 25 0,2 0,5 0

hsa-miR485-5p

0,5 0 0,3 1,1 0 0,6 0,4 0 0,1 1,0. 0 4,0 0,4 100 0,0 0,9 0 0,2 0,4 0 0,5 0,5 0

hsa-miR486-3p

1,8 0 0,1 1,8 40 0,6 0,8 40 1,2 0,9 50 3,4 0,4 100 2,2 1,0. 1,00 2,6 1,1 100 0,1 1,0. 20

hsa-miR486-5p

5,4 100 7,0 1,9 100 7,2. 1,0. 100 7,8 1,0. 100 7,8 1,2 100 8,6 0,7 1,00 8,8 0,5 100 6,0 0,9 100

hsa-miR487a

1,1 0 0,5 1,1 0 0,5 0,6 0 0,3 0,9 0 4,8 0,3 100 0,2 0,6 0 0,9 0,9 25 0,8 1,2 0

hsa-miR487b

4,9 100 4,1. 0,5 100 4,7 0,6 100 4,1 0,4 100 9,7 0,2 100 3,6 1,2 75 4,7 0,6 100 4,6 0,7 100

hsa-miR488

1,3 0 2,3. 1,8 40 2,0 22 40 1,2 0,2 0 0,4 1,0. 0 0,3 0,8 0 0,2 0,4 0 0,5 0,6 0

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR488*

0,2 0 0,6 1,2 20 0,3 1,1 0 0,1 0,5 0 0,9 0,4 0 0,7 0,4 0 0,4 0,4 0 0,7 0,3 0

hsa-miR489

2,5 0 2,8 1,6 60 2,9 1,2 60 2,9 0,4 75 2,1. 0,8 33 2,4 0,5 50 2,8 0,6 100 3,1 0,4 100

hsa-miR490-3p

0,1 0 0,7 0,9 0 0,4 0,9 0 0,4 0,8 0 1,5 1,6 33 1,7 0,4 0 0,2 0,6 0 1,1 0,7 0

hsa-miR490-5p

0,7 0 1,3. 0,9 0 0,9 0,8 0 1,4 0,7 0 2,0 0,9 67 3,4 0,3 1,00 2,3 0,8 50 1,1 0,5 0

hsa-miR491-5p

1,3 0 1,6 1,0. 60 0,9 0,7 60 1,7 0,5 75 1,6 0,4 100 1,7 0,4 1,00 1,9 0,2 100 1,5 0,3 100

hsa-miR493

1,0 0 0,1 1,1 0 0,1 1,3 0 0,2 1,3 0 1,0 1,4 0 2,9 0,7 75 1,2 0,7 0 0,7 0,8 0

hsa-miR493*

3,2 100 1,7 0,7 20 2,2. 1,2 40 2,0 0,4 25 5,4 0,4 100 1,7 1,3 50 3,0 0,5 100 2,2 0,9 40

hsa-miR494

8,7 100 7,5 0,8 100 8,1. 0,6 100 8,4 1,0. 100 7,9 0,2 100 8,6 1,1 1,00 7,5 0,3 100 7,9 0,5 100

hsa-miR495

3,1 100 1,9 0,9 20 2,4 1,2 40 2,5 0,5 25 6,9 0,3 100 2,6 1,0. 75 3,6 0,8 100 2,5 1,0. 60

hsa-miR497

9,2 100 9,4 1,0. 100 9,6 1,1 100 8,8 0,3 100 8,9 0,7 100 9,6 0,1 1,00 9,8 0,3 100 8,7 0,5 100

hsa-miR498

2,0 0 1,3. 1,1 0 1,4 0,6 0 1,7 0,6 0 1,9 0,8 33 3,8 0,5 1,00 2,3 0,5 25 1,0 0,6 0

hsa-miR499-5p

2,1 0 3,6 0,9 60 4,3. 11. 80 3,8 0,6 75 4,5 0,6 100 5,3 18 1,00 5,8 16 100 3,7 0,5 100

hsa-miR500

5,0 100 4,6 0,7 100 5,0 0,3 100 4,6 0,3 100 4,5 0,3 100 4,9 0,1 1,00 4,8 0,2 100 5,3 0,6 100

hsa-miR500*

5,9 100 4,9 0,8 100 4,9 0,4 100 4,4 0,2 100 50,2 0,5 100 5,4 0,0. 1,00 5,3 0,3 100 4,5 0,3 100

hsa-miR501-3p

4,5 100 3,4 0,8 100 3,5 0,5 100 3,0 0,2 100 3,8 0,4 100 4,6 0,2 1,00 3,9 0,7 100 2,8 0,3 100

hsa-miR501-5p

4,6 100 4,3. 0,5 100 4,4 0,1 100 4,1 0,1 100 4,6 0,3 100 4,6 0,1 1,00 4,5 0,1 100 4,7 0,7 100

hsa-miR502-3p

6,2 100 5,4 0,8 100 5,3. 0,5 100 4,9 0,2 100 5,5 0,3 100 5,9 0,1 1,00 5,8 0,2 100 4,9 0,2 100

hsa-miR502-5p

4,6 100 3,9 0,6 100 3,9 0,6 100 3,3 0,3 100 4,0 0,5 100 4,0 0,1 1,00 4,1 0,2 100 3,7 0,2 100

hsa-miR503

4,0 100 4,6 0,7 100 4,9 1,0. 100 6,1 1,0. 100 3,5 1,6 67 3,7 0,7 1,00 4,5 0,2 100 5,7 0,8 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR505

5,5 100 5,1. 0,7 100 4,9 0,3 100 4,8 0,3 100 6,0 0,7 100 5,1 0,2 1,00 5,4 0,2 100 4,8 0,3 100

hsa-miR505*

4,7 100 4,1. 0,8 100 3,8 0,2 100 3,9 0,4 100 5,1. 0,9 100 4,1 0,3 1,00 4,2 0,3 100 4,0 0,2 100

hsa-miR506

0,3 0 0,5 1,7 0 0,4 0,5 0 0,4 1,0. 0 0,5 0,7 0 0,6 0,8 0 0,6 0,5 0 1,0 1,5 20

hsa-miR508-5p

2,2 0 0,3 0,6 0 1,1. 0,5 0 0,9 0,2 0 0,3 0,8 0 0,2 1,0. 2,5 0,4 0,6 0 0,7 0,5 0

hsa-miR509-3-5p

0,0 0 0,2 0,9 0 0,8 0,5 0 0,5 0,6 0 00,2 0,4 0 0,6 0,3 0 0,0 0,4 0 0,7 1,3 20

hsa-miR509-3p

0,1 0 0,3 1,7 0 0,5 0,6 0 0,9 1,2 25 0,1 1,1 0 0,0 0,5 0 0,4 0,5 0 1,2 1,4 20

hsa-miR509-5p

0,6 0 0,6 1,2 0 0,0 0,9 0 1,0 0,8 0 0,1 0,7 0 1,2 0,4 0 0,7 0,5 0 0,7 0,9 20

hsa-miR512-3p

0,4 0 3,6 1,7 60 3,1. 1,7 60 4,3 0,5 100 4,5 0,2 100 5,1 0,0. 1,00 4,8 0,5 100 4,0 0,4 100

hsa-miR513a-5p

3,9 100 3,4 0,5 60 3,7 0,4 100 4,4 0,2 100 4,1. 0,7 100 5,5 0,4 1,00 4,3 0,3 100 3,9 0,7 100

hsa-miR513b

3,3 100 2,8 0,6 60 3,2. 0,2 100 3,7 0,3 100 30,2 0,4 100 4,1 0,7 1,00 3,2 0,4 100 3,1 0,2 100

hsa-miR513c

2,3 100 2,2. 0,5 60 2,3. 0,1 60 3,0 0,1 75 2,5 0,3 100 3,2 0,7 75 2,3 0,3 75 2,7 0,6 80

hsa-miR514

0,9 0 1,7 1,1 20 0,5 0,2 0 1,9 1,2 50 1,0 1,1 33 0,7 0,5 0 0,9 0,3 0 2,9 0,9 80

hsa-miR516a-5p

2,2 0 2,0 0,5 60 2,4 0,9 80 2,8 0,6 75 20,2 23 67 3,6 10. 75 3,4 11. 75 1,4 0,7 20

hsa-miR516b

0,7 0 0,1 0,8 0 0,7 0,8 0 0,8 0,7 0 0,8 1,4 0 2,8 0,3 75 1,1 0,8 0 0,0 0,3 0

hsa-miR517a

1,2 0 0,9 1,2 0 0,0 0,8 0 0,2 0,3 0 1,1. 1,3 33 0,0 0,6 0 0,2 0,6 0 0,5 0,5 0

hsa-miR517b

1,3 0 1,0 1,3 0 0,7 0,3 0 0,1 0,6 0 1,5 0,9 33 0,7 0,5 0 0,9 0,4 0 0,6 0,6 0

hsa-miR518a-5p

0,5 0 0,2 0,5 0 0,3 1,0. 0 0,4 0,9 0 00,2 1,2 0 2,1 0,7 2,5 0,9 0,8 0 0,5 0,4 0

hsa-miR518c*

0,3 0 0,1 0,8 0 0,1 0,5 0 0,5 0,7 0 0,8 0,8 0 2,2 0,5 2,5 0,6 0,7 0 0,5 0,6 0

hsa-miR518e*

0,5 0 0,3 1,2 0 0,2 0,7 0 0,8 1,0. 0 0,4 0,7 0 2,0 0,3 2,5 1,0 0,4 0 0,7 0,4 0

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR519d

1,7 0 1,1. 1,3 20 0,3 0,6 0 0,4 1,0. 0 1,0 0,5 0 0,8 0,2 0 0,7 0,2 0 0,7 0,4 0

hsa-miR519e*

1,6 0 1,5 0,8 0 2,1. 0,7 20 1,6 0,5 0 1,6 0,5 0 2,4 0,4 2,5 1,8 0,5 25 1,6 0,4 0

hsa-miR520h

0,6 0 0,6 1,1 0 0,4 0,5 0 1,9 25 25 0,3 0,4 0 0,2 0,3 0 0,1 0,4 0 0,2 0,5 0

hsa-miR525-5p

1,2 0 0,5 0,7 0 0,5 0,6 0 0,3 0,6 0 0,9 0,6 0 2,2 0,5 2,5 0,8 0,6 0 0,1 0,4 0

hsa-miR526b

1,2 0 1,1. 0,5 0 1,2. 1,0. 0 1,3 1,1 25 2,0 0,9 67 3,5 0,5 1,00 1,9 0,4 50 0,3 0,7 0

hsa-miR532-3p

6,0 100 5,7 0,9 100 5,9 0,6 100 5,1 0,1 100 6,0 0,5 100 5,9 0,2 1,00 6,2 0,2 100 5,3 0,2 100

hsa-miR532-5p

7,6 100 6,7 0,8 100 6,8 0,7 100 6,3 0,2 100 70,2 0,5 100 7,1 0,2 1,00 7,1 0,2 100 6,5 0,2 100

hsa-miR539

2,1 0 1,5 0,2 0 1,2. 0,4 0 1,3 0,2 0 6,5 0,3 100 1,7 0,3 2,5 1,7 0,5 25 1,3 0,4 0

hsa-miR542-3p

3,3 100 5,4 1,5 100 6,0 1,8 100 7,0 1,3 100 40,2 1,1 100 4,9 0,4 1,00 5,8 0,3 100 6,4 0,8 100

hsa-miR542-5p

3,9 100 5,9 1,4 100 6,3. 1,5 100 7,3 1,1 100 4,6 1,3 100 5,6 0,4 1,00 6,3 0,3 100 6,8 0,9 100

hsa-miR543

2,0 0 1,1. 0,5 0 1,5 0,8 0 0,9 0,4 0 5,3. 0,1 100 1,2 0,9 0 2,1 0,9 50 1,3 0,6 0

hsa-miR545

1,6 0 1,7 0,7 40 1,8 0,3 40 2,5 1,0. 50 2,0 0,4 67 1,5 0,3 0 1,7 0,2 50 1,9 0,3 40

hsa-miR548c-5p

2,4 0 1,9 0,3 20 2,0 0,3 40 2,2 0,0. 50 1,7 0,3 0 1,9 0,2 0 2,3 0,2 100 2,2 0,4 40

hsa-miR550

2,9 100 2,0 0,6 0 2,4 0,5 40 2,5 0,5 50 2,3. 0,5 67 3,7 0,3 1,00 2,4 0,3 100 2,0 0,3 20

hsa-miR550*

4,1 100 3,1. 0,2 80 2,9 0,7 60 2,8 0,4 75 3,6 0,6 100 2,8 0,2 1,00 2,8 0,2 100 3,2 0,4 80

hsa-miR551b

2,6 100 6,0 26 100 4,9 0,7 100 9,0 0,8 100 3,4 1,3 100 5,3 0,1 1,00 5,2 0,5 100 10,0 0,6 100

hsa-miR551b*

0,3 0 0,6 1,3 0 0,0 0,6 0 0,8 0,7 0 0,1 21. 0 2,7 0,7 1,00 0,9 1,0. 50 0,3 1,3 0

hsa-miR552

0,2 0 0,0 0,3 0 0,3 0,8 0 0,3 0,8 0 2,1. 1,8 67 0,1 0,5 0 0,2 0,5 0 0,0 0,2 0

hsa-miR556-3p

1,6 0 1,3. 0,3 0 0,5 0,4 0 0,9 0,4 0 0,6 1,0. 33 0,4 0,3 0 0,6 0,5 0 0,7 0,2 0

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR557

4,5 100 4,7 0,3 100 4,7 0,5 100 4,7 0,6 100 5,6 0,4 100 6,2 0,8 1,00 5,0 0,5 100 4,0 0,6 100

hsa-miR564

4,5 100 5,2. 0,7 100 5,3. 0,5 100 5,7 0,5 100 5,3. 0,4 100 5,9 0,3 1,00 5,6 0,4 100 5,7 0,4 100

hsa-miR566

0,9 0 0,4 1,5 0 0,3 1,0. 0 1,1 0,7 0 1,0 1,6 0 3,2 0,9 75 1,3 0,5 0 0,2 0,6 0

hsa-miR572

4,9 100 5,0 0,6 100 5,2. 0,6 100 5,2 0,8 100 4,9 0,9 100 7,9 1,0. 1,00 5,6 0,9 100 4,1 0,5 100

hsa-miR574-3p

5,7 100 6,1. 0,7 100 6,0 0,4 100 6,2 0,1 100 6,6 0,0. 100 6,8 0,6 1,00 6,8 0,1 100 6,2 0,4 100

hsa-miR574-5p

6,1 100 5,8 0,7 100 5,8 0,6 100 6,7 0,2 100 6,3. 0,2 100 7,5 0,6 1,00 6,7 0,3 100 6,4 0,3 100

hsa-miR575

8,3 100 7,7 0,7 100 8,4 0,8 100 8,3 0,4 100 8,3. 1,4 100 10,2 0,7 1,00 8,5 0,6 100 7,8 0,4 100

hsa-miR576-5p

0,6 0 1,1. 0,7 0 1,5 1,1 20 0,7 0,5 0 0,1 0,4 0 0,8 0,3 0 0,4 0,5 0 1,0 0,3 0

hsa-miR582-3p

4,0 100 1,0 1,1 0 0,9 0,7 0 0,8 0,5 0 00,2 0,3 0 1,4 0,3 0 1,2 0,3 0 1,4 0,4 0

hsa-miR582-5p

8,4 100 3,5 0,4 80 4,0 1,6 80 3,5 0,8 75 6,1. 0,2 100 3,2 0,6 1,00 4,3 0,4 100 3,7 0,5 100

hsa-miR583

1,2 0 0,5 0,8 0 0,5 1,4 20 0,9 1,0. 0 1,3. 1,1 33 2,6 0,7 75 1,3 0,4 0 0,6 0,5 0

hsa-miR584

2,4 0 2,8 0,4 60 3,5 1,3 60 2,8 0,9 25 3,1. 0,4 100 4,4 0,5 1,00 3,4 0,3 100 2,0 0,4 40

hsa-miR585

0,4 0 2,4 1,0. 40 2,1. 1,1 40 2,1 0,4 25 1,4 0,1 0 2,7 0,6 75 2,2 0,6 75 1,5 1,8 40

hsa-miR590-5p

6,4 100 6,2. 0,9 100 6,9 0,4 100 6,8 0,6 100 6,8 0,4 100 6,0 0,4 1,00 6,3 0,1 100 6,9 0,4 100

hsa-miR592

4,7 100 2,0 0,7 0 2,4 11. 40 2,4 0,9 50 7,5 1,2 100 1,7 0,3 0 2,5 0,3 100 2,0 0,6 40

hsa-miR595

0,4 0 1,6 1,1 20 0,2 0,2 0 1,3 0,7 0 1,1. 0,6 0 1,8 0,4 0 1,2 0,4 0 0,5 0,3 0

hsa-miR598

5,1 100 5,4 1,0. 100 5,7 0,8 100 6,1 0,6 100 8,0 0,3 100 5,6 0,5 1,00 6,2 0,4 100 5,8 0,7 100

hsa-miR601

3,2 100 2,6 0,5 20 3,6 0,8 100 3,5 0,9 75 3,3. 1,3 67 5,6 0,5 1,00 3,9 0,5 100 2,6 0,7 80

hsa-miR602

2,8 0 2,4 0,5 20 3,2. 0,7 60 2,3 0,5 25 20,2 0,9 33 3,9 0,5 1,00 2,7 0,4 100 1,9 0,4 0

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR605

3,8 100 2,0 1,2 40 2,3. 1,2 40 1,7 1,1 25 1,5 0,6 0 3,7 1,0. 75 2,2 0,9 50 1,1 0,6 0

hsa-miR610

3,5 100 1,7 0,7 20 2,3. 0,9 20 2,4 0,9 25 2,6 1,0. 67 4,5 0,6 1,00 2,8 0,7 100 1,8 0,6 0

hsa-miR612

1,8 0 0,6 0,8 0 0,5 0,5 0 0,8 0,4 0 0,7 0,4 0 0,4 0,9 50 0,7 0,4 0 1,2 0,5 0

hsa-miR614

0,1 0 0,1 0,9 0 0,0 0,7 0 0,2 0,4 0 0,7 0,8 0 2,1 0,7 2,5 0,9 0,4 0 0,1 0,8 0

hsa-miR615-3p

1,0 0 0,8 1,6 20 0,1 0,3 0 0,1 1,1 0 00,2 0,7 0 0,3 0,3 0 0,0 0,2 0 0,4 0,4 0

hsa-miR616

0,4 0 1,1. 1,0. 0 0,2 0,8 0 0,8 1,0. 0 0,0 1,1 0 1,7 0,5 1,00 0,1 0,6 0 1,2 0,6 0

hsa-miR617

1,3 0 0,8 0,9 0 1,3. 0,7 0 0,9 0,8 0 10,2 0,6 0 3,3 0,3 1,00 1,6 0,7 25 0,5 0,5 0

hsa-miR622

4,4 100 2,6 0,9 40 2,9 1,0. 40 3,0 0,8 50 3,5 1,4 67 5,2 0,4 1,00 3,9 0,8 100 2,4 0,7 40

hsa-miR623

3,5 100 2,1. 0,9 40 2,1. 0,7 40 2,2 1,1 25 2,3. 1,6 67 5,0 0,5 1,00 3,1 0,8 100 1,0 1,1 0

hsa-miR624*

1,3 0 2,0 0,2 40 2,0 0,5 60 1,8 0,4 50 1,9 0,3 100 1,6 0,6 75 2,3 0,2 100 2,0 0,2 80

hsa-miR625

6,1 100 4,8 0,8 100 5,0 0,9 100 5,7 0,3 100 4,3. 0,6 100 5,0 0,2 1,00 5,5 0,3 100 6,2 0,3 100

hsa-miR625*

2,6 0 2,2. 0,5 20 2,1. 0,3 0 2,2 0,1 25 1,9 0,5 33 2,4 0,4 2,5 1,9 0,1 25 2,1 0,2 40

hsa-miR627

2,7 100 2,3. 0,9 60 2,9 0,4 80 3,1 0,5 75 2,7 0,3 100 3,0 0,3 1,00 3,1 0,1 100 3,1 0,4 100

hsa-miR628-3p

2,3 100 3,1. 1,1 80 3,4 0,4 100 3,6 0,6 75 3,6 0,6 100 3,3 0,4 1,00 3,7 0,2 100 3,8 0,6 100

hsa-miR628-5p

3,3 100 3,7 0,7 100 3,7 0,5 100 3,6 0,5 100 4,7 0,3 100 3,8 0,3 1,00 4,4 0,1 100 3,8 0,4 100

hsa-miR629

2,3 100 2,0 0,6 60 2,3. 0,6 80 2,7 0,2 100 2,7 0,3 100 2,4 0,5 1,00 2,5 0,1 100 2,9 0,5 100

hsa-miR629*

2,4 100 2,4 0,4 100 3,1. 0,8 80 2,3 0,5 50 2,3. 0,7 100 2,7 0,9 1,00 2,3 0,4 100 2,3 0,4 100

hsa-miR630

5,5 100 4,4 0,9 80 5,4 1,2 100 5,5 1,1 100 5,3. 1,2 100 6,8 0,6 1,00 6,0 0,4 100 4,0 1,1 80

hsa-miR631

0,2 0 1,2. 1,7 20 0,8 0,9 0 0,3 1,7 0 1,1. 22 33 4,0 0,6 1,00 2,1 0,9 25 0,9 0,8 0

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR633

0,3 0 0,6 0,8 0 0,5 0,9 0 0,4 0,3 0 00,2 0,4 0 0,1 0,5 0 0,2 0,5 0 0,6 1,3 20

hsa-miR634

2,6 0 2,8 0,6 40 2,5 0,4 40 2,2 0,4 0 1,7 0,1 0 2,1 0,5 2,5 1,9 0,1 25 2,3 0,4 60

hsa-miR636

2,8 0 2,3. 0,4 0 2,3. 0,3 0 2,2 0,4 0 1,8 0,3 0 2,3 0,3 50 1,9 0,3 50 2,0 0,1 0

hsa-miR638

8,4 100 8,3. 0,5 100 8,4 0,6 100 8,5 0,7 100 8,1. 1,0. 100 11,0 1,0. 1,00 8,9 0,6 100 7,3 0,5 100

hsa-miR639

0,0 0 1,1. 0,7 0 0,6 0,7 0 1,3 0,7 0 00,2 0,6 0 1,0 0,5 50 0,5 1,0. 25 0,5 0,7 0

hsa-miR640

1,1 0 0,2 1,6 20 0,5 1,0. 0 0,1 0,8 0 0,1 0,6 0 1,5 0,5 0 0,0 0,5 0 1,2 0,1 0

hsa-miR641

0,1 0 0,4 0,9 20 0,5 0,4 0 0,6 0,2 0 0,9 0,4 0 0,7 0,2 0 0,8 0,5 50 0,3 0,5 0

hsa-miR642

1,9 0 0,6 1,3 0 0,9 0,4 0 1,3 0,9 0 0,7 0,4 33 0,9 0,5 0 0,9 0,3 0 0,7 0,6 0

hsa-miR648

1,6 0 0,4 1,4 0 1,1. 1,2 20 1,2 1,3 25 1,8 1,3 33 4,1 0,5 1,00 2,3 1,2 50 0,0 0,7 0

hsa-miR650

2,2 100 2,1. 0,8 40 2,6 0,8 80 1,6 0,7 50 1,9 0,2 67 2,8 1,0. 75 2,6 0,6 100 2,2 1,2 80

hsa-miR652

5,3 100 5,9 1,2 100 6,2. 0,8 100 5,4 0,4 100 7,5 0,3 100 6,4 0,3 1,00 6,6 0,2 100 5,2 0,3 100

hsa-miR654-3p

3,6 100 2,3. 1,1 40 2,3. 1,5 60 2,5 0,4 75 6,3. 0,5 100 3,1 1,0. 75 4,0 0,2 100 2,7 1,1 80

hsa-miR654-5p

2,7 100 2,0 1,3 60 2,4 0,8 40 2,2 0,4 25 4,3. 0,3 100 4,1 0,4 1,00 3,0 0,4 100 2,0 0,5 60

hsa-miR656

1,6 0 0,8 0,2 0 0,8 0,4 0 0,5 0,3 0 2,1. 0,6 33 0,4 0,4 0 0,5 0,3 0 0,6 0,3 0

hsa-miR658

0,1 0 0,1 0,9 0 0,1 0,7 0 0,0 0,3 0 00,2 0,9 0 1,2 0,6 2,5 0,2 0,8 0 0,7 0,3 0

hsa-miR659

3,7 100 2,4 0,9 40 3,0 1,2 60 3,3 0,9 100 3,5 1,5 67 5,5 0,6 1,00 3,8 0,7 100 1,4 0,9 0

hsa-miR660

8,2 100 7,4 10. 100 7,7 0,7 100 6,8 0,2 100 7,9 0,6 100 7,6 0,2 1,00 7,8 0,2 100 7,2 0,3 100

hsa-miR662

1,2 0 1,5 0,7 0 1,6 0,4 0 1,7 0,4 0 1,9 0,8 0 3,6 0,2 1,00 2,3 0,3 25 1,0 0,2 0

hsa-miR663

6,5 100 4,4 1,1 100 5,6 1,2 100 5,8 1,1 100 5,5 1,9 100 8,6 0,8 1,00 6,2 0,8 100 4,1 0,8 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR663b

0,4 0 1,8 21. 60 1,2. 0,7 0 1,8 1,8 50 3,9 1,0. 100 1,8 1,1 50 2,0 0,5 75 1,0 26 40

hsa-miR664

5,6 100 6,3. 0,8 100 6,1. 0,9 100 5,8 0,5 100 6,3. 0,4 100 5,8 0,5 1,00 6,2 0,2 100 5,9 0,4 100

hsa-miR664*

5,0 100 5,1. 1,0. 100 5,0 1,1 100 5,2 0,4 100 5,6 0,2 100 6,4 0,8 1,00 5,5 0,3 100 4,8 0,4 100

hsa-miR665

1,9 0 3,9 1,5 80 2,8 0,9 60 4,0 1,0. 100 3,9 0,6 100 4,5 0,2 1,00 3,6 0,5 100 3,6 0,4 100

hsa-miR668

2,1 0 0,5 1,7 20 1,0 0,5 0 0,9 0,8 0 1,3. 0,4 0 0,5 0,3 0 0,6 0,3 0 1,4 0,8 0

hsa-miR671-5p

5,0 100 4,2. 0,6 100 4,9 1,0. 100 5,1 1,0. 100 5,1. 1,8 100 7,2 0,6 1,00 5,8 0,2 100 3,7 0,7 100

hsa-miR7

9,4 100 8,7 43 100 8,8 26 100 7,2 26 100 13,9 1,0. 100 11,0 1,8 1,00 11,4 0,5 100 7,3 1,7 100

hsa-miR7-1*

3,8 100 4,2. 0,9 100 4,8 0,2 100 4,6 0,7 100 6,9 0,4 100 4,1 0,4 1,00 4,9 0,2 100 4,9 0,5 100

hsa-miR7-2*

1,0 0 3,6 24 80 2,9 1,8 80 1,8 1,6 50 1,6 20. 33 3,8 1,2 1,00 4,7 0,6 100 1,1 1,3 20

hsa-miR708

0,9 0 2,1. 0,9 20 1,2. 1,0. 0 1,3 1,0. 0 1,1. 20. 33 2,6 0,4 1,00 2,2 0,4 75 1,5 0,4 0

hsa-miR720

14,5 100 12,8 0,9 100 13,2. 0,6 100 12,8 0,5 100 12,5 0,7 100 10,2 0,8 1,00 11,8 1,0. 100 12,9 0,3 100

hsa-miR744

2,8 0 4,2. 1,1 100 4,5 0,8 100 5,1 0,3 100 50,2 0,4 100 4,5 0,5 1,00 5,1 0,1 100 4,8 0,4 100

hsa-miR744*

-1,0 0 1,7 1,1 40 1,0 1,1 0 0,8 1,1 0 1,1. 0,2 0 0,6 0,4 0 0,7 0,5 0 0,7 0,4 20

hsa-miR758

1,7 0 0,5 1,6 0 0,5 0,9 0 0,4 0,9 0 5,0 0,1 100 0,3 1,1 2,5 1,0 0,6 25 0,6 0,6 0

hsa-miR760

2,9 100 2,5 0,8 60 3,5 0,9 80 2,8 0,3 50 2,6 0,8 67 4,3 0,4 1,00 3,1 0,4 100 2,8 1,0. 80

hsa-miR765

4,2 100 3,0 1,0. 40 3,7 1,1 100 4,0 1,1 100 4,5 1,7 100 6,6 0,7 1,00 4,9 0,6 100 2,3 0,7 40

hsa-miR766

4,5 100 4,0 0,3 100 3,8 0,6 100 4,0 0,4 100 40,2 0,3 100 4,4 0,3 1,00 3,9 0,5 100 3,8 0,4 100

hsa-miR767-5p

1,1 0 0,1 1,2 0 0,6 0,3 0 0,2 11. 0 1,1. 0,6 33 0,2 0,4 0 0,6 0,2 0 0,6 11. 0

hsa-miR769-3p

3,1 100 1,7 0,6 0 1,7 0,6 20 1,8 0,4 25 2,3. 0,1 100 3,3 0,6 1,00 2,0 0,2 100 1,1 0,5 0

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR769-5p

6,4 100 4,7 0,6 100 4,9 0,3 100 5,0 0,3 100 5,7 0,3 100 4,6 0,2 1,00 4,9 0,2 100 5,0 0,2 100

hsa-miR770-5p

3,0 100 2,9 0,5 60 3,3. 0,6 100 2,6 0,3 50 30,2 0,2 100 3,2 0,4 1,00 2,9 0,6 100 3,0 0,6 100

hsa-miR873

5,5 100 2,8 1,6 60 1,6 1,4 60 0,9 1,5 0 3,4 31. 67 3,3 0,8 1,00 4,3 0,3 100 0,8 0,8 20

hsa-miR874

4,8 100 7,1. 1,6 100 7,2. 1,0. 100 6,3 0,6 100 6,4 0,3 100 7,0 0,1 1,00 7,0 0,2 100 6,3 0,3 100

hsa-miR876-3p

2,4 100 1,8 20. 60 1,3. 0,5 0 0,8 0,9 0 2,6 22 67 1,7 0,5 2,5 2,9 0,4 100 0,4 0,5 0

hsa-miR876-5p

1,8 0 1,2. 0,4 0 0,9 0,4 0 1,1 0,4 0 1,1. 1,0. 33 0,8 0,4 0 1,3 0,4 25 0,8 0,7 0

hsa-miR877

2,3 0 1,6 1,1 20 2,7 0,7 80 2,3 0,9 25 3,1. 1,3 100 4,5 0,6 1,00 3,2 0,4 100 1,4 1,2 20

hsa-miR877*

3,1 100 2,9 0,5 60 3,0 0,6 100 3,0 0,3 75 2,9 0,4 100 4,7 0,4 1,00 3,2 0,7 100 2,7 0,3 60

hsa-miR885-5p

0,7 0 2,7 25 60 0,9 1,4 0 0,6 0,8 0 1,1. 1,0. 0 0,9 24 2,5 1,5 24 25 0,1 0,2 0

hsa-miR886-3p

7,3 100 8,7 0,7 100 7,7 1,3 100 9,2 0,5 100 7,5 1,0. 100 8,2 0,5 1,00 8,3 1,0. 100 8,4 0,8 100

hsa-miR886-5p

2,2 0 1,3. 1,2 0 1,2. 0,5 0 1,1 1,0. 0 0,9 0,5 0 0,2 1,0. 0 0,3 1,1 25 1,7 0,3 0

hsa-miR887

3,1 100 3,2. 0,7 100 3,3. 0,6 100 3,2 0,3 100 30,2 0,9 100 4,0 0,3 1,00 3,9 0,5 100 2,8 0,5 100

hsa-miR888

0,2 0 0,2 0,4 0 0,4 1,9 20 0,0 0,9 0 2,3. 34 33 0,2 0,9 0 0,7 0,5 0 0,4 1,0. 0

hsa-miR889

0,5 0 -0,6 1,0 0 0,0 0,3 0 -0,2 0,8 0 3,8 0,5 100 -0,3 0,1 0 0,0 0,2 0 0,1 0,4 0

hsa-miR890

0,3 0 1,1. 0,8 0 0,4 1,1 0 0,2 0,6 0 2,6 20. 67 0,1 0,7 0 0,7 0,5 0 0,8 0,7 0

hsa-miR891a

1,7 0 1,0 20. 0 1,6 0,9 0 1,1 0,4 0 0,0 27 33 0,6 0,4 0 1,6 0,5 0 1,5 0,7 0

hsa-miR891b

0,2 0 0,6 0,9 0 0,6 1,2 20 0,5 0,3 0 2,5 32 33 0,1 0,8 0 0,0 0,3 0 0,0 1,3 0

hsa-miR892a

0,7 0 0,9 1,2 0 0,7 0,5 0 0,4 0,3 0 1,5 1,1 33 0,3 0,4 0 0,5 0,9 25 0,4 0,4 0

hsa-miR892b

5,0 100 4,7 0,5 100 5,0 0,3 100 4,8 0,4 100 4,6 0,1 100 4,7 0,1 1,00 4,7 0,2 100 5,8 0,8 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR9

5,1 100 0,6 1,2 0 1,2. 0,3 0 0,4 0,7 0 4,7 1,6 100 1,1 0,4 0 1,9 0,3 50 1,0 0,7 20

hsa-miR9*

7,1 100 0,9 1,7 20 1,8 1,0. 0 1,0 0,9 0 5,3. 1,8 100 1,6 0,2 0 2,1 0,7 50 2,1 1,1 20

hsa-miR921

1,3 0 0,9 0,9 0 0,8 1,2 0 0,6 1,2 0 0,1 0,9 0 1,7 0,5 50 0,4 0,9 0 0,6 0,4 0

hsa-miR923

13,3 100 12,4 0,7 100 12,7 1,1 100 14,3 1,5 100 12,9 0,2 100 14,0 1,8 1,00 13,3 0,9 100 12,6 0,7 100

hsa-miR92a

7,8 100 8,6 0,7 100 9,3. 0,3 100 9,2 0,1 100 8,8 0,4 100 9,4 0,3 1,00 9,4 0,1 100 9,3 0,2 100

hsa-miR92a-l*

0,3 0 0,2 0,8 0 0,5 0,5 0 0,9 0,8 0 0,6 0,4 0 0,1 0,3 0 0,9 1,1 25 0,8 0,3 0

hsa-miR92b

0,8 0 1,4 0,9 0 1,0 0,6 20 0,9 0,8 0 0,5 0,2 0 1,2 0,3 0 0,7 0,1 0 0,9 0,6 20

hsa-miR92b*

2,1 0 0,9 1,2 0 0,8 0,9 0 1,3 1,3 0 0,9 0,7 0 3,0 0,6 1,00 1,0 22 50 1,9 0,7 0

hsa-miR93

7,6 100 8,0 0,7 100 8,5 0,3 100 8,7 0,3 100 8,8 0,3 100 8,5 0,3 1,00 8,8 0,2 100 8,7 0,2 100

hsa-miR93*

0,6 0 1,2. 0,5 60 1,2. 0,2 60 0,8 0,6 75 1,5 0,5 100 0,7 0,5 75 1,1 0,5 75 0,6 0,4 40

hsa-miR933

3,1 100 2,2. 0,7 60 2,3. 0,4 100 2,4 0,6 50 1,9 0,4 67 2,7 0,5 1,00 2,1 0,4 75 2,4 0,3 80

hsa-miR934

2,4 0 1,3. 1,5 0 1,1. 1,3 0 1,4 1,1 0 0,4 1,0. 0 2,1 0,7 75 0,5 1,0. 0 1,8 0,7 0

hsa-miR936

2,1 0 0,9 1,1 20 1,7 1,0. 0 1,3 1,7 25 3,1. 1,6 67 4,5 0,6 1,00 2,6 0,5 50 0,3 0,5 0

hsa-miR939

7,3 100 6,1. 0,6 100 6,8 0,7 100 6,7 0,5 100 6,6 0,9 100 8,9 0,4 1,00 7,4 0,8 100 5,8 0,4 100

hsa-miR940

1,0 100 6,0 0,8 100 7,0 0,7 100 6,6 0,4 100 6,5 1,1 100 8,9 0,7 1,00 6,9 0,7 100 6,1 0,1 100

hsa-miR944

0,7 0 0,6 0,8 0 0,2 0,4 0 0,7 0,2 0 0,0 0,1 0 0,5 0,5 0 0,5 0,3 0 0,8 0,8 20

hsa-miR95

6,4 100 7,3. 0,7 100 7,8 0,4 100 7,5 0,8 100 9,4 0,7 100 7,9 0,6 1,00 8,4 0,5 100 7,5 0,3 100

hsa-miR96

7,4 100 8,9 0,9 100 9,5 11. 100 8,4 17 100 11,0 0,5 100 7,1 0,4 1,00 7,5 0,4 100 8,2 0,5 100

hsa-miR98

7,2 100 8,4 0,9 100 8,7 0,6 100 8,2 0,7 100 8,4 0,2 100 8,2 0,5 1,00 8,9 0,3 100 8,2 0,7 100

ATC

FA FTC FVPTC MTC NOD NOR PTC

miARN

Med % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE % Med DE %

hsa-miR99a

8,0 100 10,8 1,0. 100 11,0 0,8 100 11,4 0,3 100 11,6 0,6 100 11,5 0,2 1,00 11,9 0,2 100 11,2 0,4 100

hsa-miR99a*

1,8 0 1,7 0,6 60 1,8 1,3 60 1,0 1,1 50 1,8 0,9 67 1,3 0,7 50 2,0 0,1 100 1,5 0,5 60

hsa-miR99b

8,8 100 8,6 0,7 100 8,3. 0,6 100 8,9 0,5 100 9,5 0,1 100 8,5 0,3 1,00 8,8 0,1 100 8,9 0,7 100

hsa-miR99b*

1,2 0 2,1. 0,7 0 1,7 0,5 20 2,0 0,6 25 2,0 0,4 33 2,9 0,3 1,00 2,2 0,4 50 2,3 0,4 40

EJEMPLO 2

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL TEJIDO TIROIDEO NORMAL Y LOS NÓDULOS TIROIDEOS HIPERPLÁSICOS

Se expresó un total de 415 miARN humanos por encima del nivel de fondo en las muestras de tejido tiroideo normal,

5 representando un 48% de los miARN humanos presentes en las matrices. Se expresó un total de 409 miARN por encima del nivel de fondo en las muestras de nódulos tiroideos hiperplásicos, representando un 47% de los miARN presentes en las matrices.

Un total de 173 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de tejido normales y los especímenes de nódulos hiperplásicos (p<0,05) (tabla 4). Entre estos, 89 miARN estaban

10 sobreexpresados (dif. Log2 (NOD frente a NOR) ≥ 1) y 14 estaban subexpresados (dif Log2 (NOD frente a NOR) ≤1) en al menos 2 veces en NOD en comparación con NOR. De estos, hsa-miR-1202, -934 y -663 estaban sobreexpresados en más de cinco veces en NOD frente a NOR.

Tabla 4. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de NOD y de NOR. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

15

miARN

NOD NOR NOD frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1202

13,75 0,81 11,03 0,86 3,65E-03 2,71 6,6

hsa-miR-934

2,09 0,71 -0,51 1,01 5,57E-03 2,60 6,1

hsa-miR-663

8,63 0,75 6,18 0,82 4,50E-03 2,45 5,5

hsa-miR-572

7,90 1,01 5,63 0,90 1,52E-02 2,28 4,9

hsa-miR-1300

7,80 0,79 5,66 1,41 3,82E-02 2,14 4,4

hsa-miR-12075p

11,83 1,05 9,76 0,49 1,17E-02 2,07 4,2

hsa-miR-34c-3p

1,72 0,30 -0,35 0,70 1,66E-03 2,07 4,2

hsa-miR-940

8,91 0,72 6,86 0,69 6,45E-03 2,05 4,1

hsa-miR-1203

2,45 0,50 0,42 0,97 9,81E-03 2,03 4,1

hsa-miR-638

10,95 1,00 8,93 0,61 1,35E-02 2,02 4,1

hsa-miR-1909*

2,64 0,78 0,62 0,25 2,69E-03 2,02 4,0

hsa-miR-936

4,55 0,65 2,56 0,47 2,46E-03 1,99 4,0

miARN

NOD NOR NOD frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-12255p

11,79 0,95 9,85 0,45 1,00E-02 1,95 3,9

hsa-miR-149*

4,68 0,59 2,76 0,59 3,67E-03 1,92 3,8

hsa-miR-187*

4,73 0,70 2,81 0,38 3,02E-03 1,92 3,8

hsa-miR-198

4,90 0,65 2,98 0,64 5,61E-03 1,92 3,8

hsa-miR-150*

7,49 0,70 5,58 0,63 6,61E-03 1,92 3,8

hsa-miR-202

7,06 0,56 5,14 0,80 7,72E-03 1,92 3,8

hsa-miR-648

4,14 0,46 2,26 1,24 3,00E-02 1,87 3,7

hsa-miR-134

8,00 0,93 6,13 0,47 1,16E-02 1,86 3,6

hsa-miR-631

3,97 0,56 2,11 0,89 1,20E-02 1,86 3,6

hsa-miR-623

4,95 0,55 3,09 0,84 1,00E-02 1,86 3,6

hsa-miR-1276

2,01 0,65 0,15 0,60 5,63E-03 1,86 3,6

hsa-miR-1268

10,19 1,33 8,34 0,66 4,65E-02 1,86 3,6

hsa-miR-551b*

2,72 0,65 0,88 1,01 2,22E-02 1,84 3,6

hsa-miR-566

3,15 0,92 1,31 0,55 1,40E-02 1,84 3,6

hsa-miR-1182

4,76 0,77 2,94 0,45 6,33E-03 1,82 3,5

hsa-miR-1250

1,91 0,52 0,10 0,88 1,22E-02 1,81 3,5

hsa-miR-616

1,69 0,53 -0,08 0,59 4,27E-03 1,77 3,4

hsa-miR-493

2,93 0,73 1,16 0,73 1,42E-02 1,76 3,4

hsa-miR-659

5,53 0,63 3,79 0,65 8,34E-03 1,74 3,3

hsa-miR-302c*

1,62 0,71 -0,10 0,48 6,98E-03 1,72 3,3

hsa-miR-601

5,60 0,53 3,90 0,46 2,84E-03 1,69 3,2

hsa-miR-371-5p

6,14 0,47 4,45 0,52 2,97E-03 1,69 3,2

hsa-miR-765

6,63 0,70 4,95 0,59 1,01E-02 1,69 3,2

hsa-miR-188-5p

7,46 0,63 5,77 0,44 4,60E-03 1,68 3,2

hsa-miR-575

10,16 0,66 8,50 0,60 9,92E-03 1,66 3,2

hsa-miR-610

4,46 0,57 2,80 0,72 1,13E-02 1,66 3,2

hsa-miR-12245p

7,60 0,65 5,95 0,48 6,56E-03 1,65 3,1

hsa-miR-1915

10,06 0,49 8,41 0,52 3,72E-03 1,65 3,1

hsa-miR-516b

2,78 0,32 1,14 0,79 8,69E-03 1,63 3,1

hsa-miR-526b

3,54 0,53 1,91 0,43 3,12E-03 1,63 3,1

hsa-miR-617

3,26 0,35 1,64 0,66 4,92E-03 1,62 3,1

hsa-miR-1321

3,74 0,75 2,13 1,05 4,68E-02 1,61 3,1

miARN

NOD NOR NOD frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-518c*

2,24 0,52 0,63 0,75 1,20E-02 1,61 3,1

hsa-miR-483-5p

8,47 0,79 6,87 0,23 8,35E-03 1,60 3,0

hsa-miR-127-5p

8,12 0,52 7,36 0,45 2,53E-02 1,59 3,0

hsa-miR-1183

6,22 0,69 4,64 0,50 9,83E-03 1,58 3,0

hsa-miR-939

8,91 0,42 7,35 0,82 1,50E-02 1,56 3,0

hsa-miR-490-3p

1,74 0,41 0,19 0,61 5,55E-03 1,55 2,9

hsa-miR-877*

4,73 0,40 3,20 0,72 9,85E-03 1,54 2,9

hsa-miR-1303

1,71 0,56 0,18 0,58 8,93E-03 1,53 2,9

hsa-miR-640

1,49 0,46 -0,04 0,54 4,90E-03 1,53 2,9

hsa-miR-424*

5,34 0,66 3,82 0,28 5,36E-03 1,52 2,9

hsa-miR-1915*

2,26 0,54 0,74 0,45 4,94E-03 1,52 2,9

hsa-miR-498

3,77 0,49 2,26 0,47 4,41E-03 1,50 2,8

hsa-miR-671-5p

7,24 0,57 5,77 0,20 2,82E-03 1,47 2,8

hsa-miR-1249

5,93 0,74 4,49 0,51 1,85E-02 1,44 2,7

hsa-miR-1291

2,48 0,82 1,45 0,57 2,45E-02 1,43 2,7

hsa-miR-1228*

1,90 0,73 0,49 0,88 4,82E-02 1,41 2,7

hsa-miR-370

3,80 0,49 2,41 0,50 7,31E-03 1,39 2,6

hsa-miR-525-5p

2,15 0,49 0,77 0,60 1,16E-02 1,39 2,6

hsa-miR-125a3p

7,33 0,40 5,95 0,29 1,36E-03 1,39 2,6

hsa-miR-622

5,23 0,37 3,86 0,82 2,20E-02 1,38 2,6

hsa-miR-662

3,58 0,21 2,26 0,34 5,85E-04 1,33 2,5

hsa-miR-1226*

5,72 0,46 4,41 0,38 4,72E-03 1,31 2,5

hsa-miR-550

3,70 0,30 2,40 0,27 6,78E-04 1,31 2,5

hsa-miR-769-3p

3,34 0,64 2,04 0,20 8,01E-03 1,30 2,5

hsa-miR-583

2,59 0,74 1,29 0,37 2,02E-02 1,30 2,5

hsa-miR-1306

2,97 0,34 1,68 0,44 3,68E-03 1,29 2,4

hsa-miR-921

1,67 0,51 0,39 0,89 4,67E-02 1,29 2,4

hsa-miR-33b*

4,27 0,51 3,00 0,35 5,89E-03 1,28 2,4

hsa-miR-373*

3,17 0,97 1,91 0,35 4,98E-02 1,26 2,4

hsa-miR-877

4,47 0,65 3,24 0,44 2,00E-02 1,23 2,3

hsa-miR-557

6,23 0,77 5,01 0,53 4,06E-02 1,22 2,3

hsa-miR-760

4,31 0,36 3,09 0,41 4,29E-03 1,21 2,3

hsa-miR-1469

3,39 0,42 2,18 0,70 2,54E-02 1,21 2,3

miARN

NOD NOR NOD frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-614

2,05 0,67 0,86 0,38 2,09E-02 1,19 2,3

hsa-miR-602

3,88 0,51 2,69 0,44 1,22E-02 1,19 2,3

hsa-miR-513a5p

5,52 0,43 4,33 0,26 3,25E-03 1,19 2,3

hsa-miR-184

2,83 0,43 1,66 0,43 7,87E-03 1,18 2,3

hsa-miR-298

1,93 0,38 0,75 0,85 4,40E-02 1,18 2,3

hsa-miR-1180

3,54 0,41 2,38 0,14 1,69E-03 1,16 2,2

hsa-miR-490-5p

3,39 0,29 2,28 0,77 3,62E-02 1,11 2,2

hsa-miR-296-5p

4,51 0,68 3,44 0,22 2,50E-02 1,07 2,1

hsa-miR-518e*

2,03 0,27 0,96 0,41 4,61E-03 1,07 2,1

hsa-miR-654-5p

4,06 0,36 2,99 0,39 6,73E-03 1,06 2,1

hsa-miR-1539

2,93 0,48 1,88 0,41 1,51E-02 1,05 2,1

hsa-miR-194*

1,50 0,63 0,45 0,25 2,09E-02 1,05 2,1

hsa-miR-340*

3,30 0,54 4,31 0,21 1,29E-02 -1,01 2,0

hsa-miR-10a

7,62 0,10 8,66 0,40 2,48E-03 -1,04 2,1

hsa-miR-429

7,59 0,20 8,64 0,10 9,14E-05 -1,05 2,1

hsa-miR-582-5p

3,22 0,58 4,27 0,39 2,28E-02 -1,06 2,1

hsa-miR-365

8,74 0,64 9,80 0,45 3,53E-02 -1,06 2,1

hsa-miR-200a

8,86 0,32 9,93 0,13 7,60E-04 -1,07 2,1

hsa-miR-148a

10,18 0,47 11,27 0,26 6,55E-03 -1,08 2,1

hsa-miR-876-3p

1,74 0,54 2,91 0,40 1,29E-02 -1,18 2,3

hsa-miR-424

8,84 0,42 10,03 0,50 1,09E-02 -1,19 2,3

hsa-miR-450a

4,07 0,66 5,36 0,44 1,73E-02 -1,29 2,4

hsa-miR-148a*

0,37 0,58 1,75 0,37 6,80E-03 -1,39 2,6

hsa-miR-720

10,25 0,79 11,85 0,99 4,50E-02 -1,60 3,0

hsa-miR-1260

6,50 0,87 8,14 0,77 3,13E-02 -1,63 3,1

hsa-miR-29b-1*

3,36 0,34 5,26 0,67 2,23E-03 -1,90 3,7

EJEMPLO 3 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL TEJIDO TIROIDEO NORMAL Y ADENOMA

FOLICULAR

Se expresó un total de 415 miARN humanos por encima del nivel de fondo en las muestras de tejido tiroideo normal, representando un 48% de los miARN humanos presentes en las matrices. Se expresó un total de 334 miARN por encima del nivel de fondo en las muestras de adenoma folicular, representando un 39% de los miARN presentes en las matrices.

Un total de 114 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras normales y los especímenes de FA (p<0,05) (tabla 5). Entre estos, seis miARN estaban sobreexpresados (dif. Log2 (FA frente a NOR) ≥ 1) y 79 estaban subexpresados (dif Log2 (FA frente a NOR) ≤1) en al menos dos veces en FA en comparación con NOR. De estos, cinco miARN, (hsa-miR-200a, -206, -200b, -429 y -199b-5p, estaban subexpresados de 10 a 20 veces en FA frente a NOR y seis miARN (hsa-miR-200b*, -486-3p, -376a, -200a*, -376c y -381) estaban subexpresados de 5 a 10 veces en las muestras de FA en comparación con las muestras NOR (tabla 5).

Tabla 5. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FA y de NOR. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

NOR FA FA frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-222

5,87 0,13 7,51 1,30 4,27E-02 1,63 3,10

hsa-miR-182

2,28 0,58 3,85 1,11 3,85E-02 1,57 2,97

hsa-miR-96

7,46 0,37 8,94 0,88 1,71E-02 1,48 2,79

hsa-miR-1227

0,32 0,43 1,77 1,08 4,10E-02 1,45 2,73

hsa-miR-182*

0,03 0,20 1,08 0,53 7,55E-03 1,06 2,08

hsa-miR-34a

10,87 0,11 11,88 0,50 5,60E-03 1,01 2,01

hsa-miR-1915

8,41 0,52 7,41 0,57 3,07E-02 -1,00 2,00

hsa-miR-30a*

8,99 0,37 7,99 0,47 1,00E-02 -1,00 2,00

hsa-miR-128

7,50 0,42 6,49 0,63 2,97E-02 -1,01 2,02

hsa-miR-151-5p

11,05 0,25 10,03 0,57 1,31E-02 -1,02 2,03

hsa-miR-20b

8,20 0,29 7,17 0,76 3,85E-02 -1,04 2,05

hsa-miR-188-5p

5,77 0,44 4,71 0,32 3,83E-03 -1,06 2,09

hsa-miR-95

8,36 0,53 7,29 0,74 4,68E-02 -1,07 2,10

hsa-miR-1207-5p

9,76 0,49 8,69 0,76 4,59E-02 -1,07 2,10

hsa-miR-1225-5p

9,85 0,45 8,71 0,57 1,40E-02 -1,14 2,20

hsa-miR-30b

12,22 0,28 11,09 0,62 1,17E-02 -1,14 2,20

hsa-miR-137

1,01 0,78 -0,13 0,61 4,26E-02 -1,14 2,21

hsa-miR-30c-2*

6,15 0,27 5,00 0,53 6,12E-03 -1,15 2,21

hsa-miR-610

2,80 0,72 1,65 0,67 4,30E-02 -1,15 2,22

hsa-miR-455-3p

6,91 0,12 5,74 0,95 4,64E-02 -1,17 2,25

hsa-miR-338-3p

7,41 0,48 6,20 0,59 1,31E-02 -1,21 2,32

hsa-miR-432

2,98 0,71 1,76 0,66 3,21E-02 -1,22 2,34

hsa-miR-10b*

3,27 0,63 2,05 0,49 1,35E-02 -1,23 2,34

hsa-miR-136

3,60 0,47 2,33 0,52 6,55E-03 -1,27 2,41

hsa-miR-26b

12,58 0,26 11,30 0,54 3,67E-03 -1,28 2,42

hsa-miR-516b

1,14 0,79 -0,14 0,79 4,63E-02 -1,28 2,43

hsa-miR-601

3,90 0,46 2,62 0,55 7,22E-03 -1,28 2,43

hsa-miR-130a

11,60 0,31 10,32 0,86 2,59E-02 -1,29 2,44

miARN

NOR FA FA frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-939

7,35 0,82 6,06 0,56 2,66E-02 -1,29 2,44

hsa-miR-154*

2,47 0,92 1,17 0,72 4,83E-02 -1,30 2,46

hsa-miR-493*

2,96 0,54 1,66 0,68 1,76E-02 -1,30 2,46

hsa-miR-299-3p

1,65 0,31 0,33 0,73 1,23E-02 -1,32 2,49

hsa-miR-20a*

4,96 0,36 3,60 0,59 5,18E-03 -1,35 2,56

hsa-miR-516a-5p

3,37 1,12 2,00 0,46 3,93E-02 -1,37 2,59

hsa-miR-135a*

5,11 0,38 3,73 0,52 3,00E-03 -1,39 2,61

hsa-miR-455-5p

4,70 0,09 3,31 1,14 4,77E-02 -1,39 2,62

hsa-miR-659

3,79 0,65 2,36 0,93 3,69E-02 -1,42 2,68

hsa-miR-150*

5,58 0,63 4,08 0,64 9,64E-03 -1,50 2,83

hsa-miR-671-5p

5,77 0,20 4,25 0,59 1,75E-03 -1,52 2,87

hsa-miR-1915*

0,74 0,45 -0,82 1,08 3,14E-02 -1,56 2,95

hsa-miR-223

10,86 0,87 9,28 0,97 3,90E-02 -1,58 2,98

hsa-miR-877

3,24 0,44 1,65 1,12 3,34E-02 -1,59 3,01

hsa-miR-154

3,92 0,39 2,33 0,87 1,21E-02 -1,59 3,01

hsa-miR-1208

2,84 0,36 1,22 0,79 7,05E-03 -1,62 3,07

hsa-miR-639

0,53 1,01 -1,10 0,71 2,51E-02 -1,63 3,09

hsa-miR-630

6,04 0,36 4,40 0,94 1,33E-02 -1,64 3,13

hsa-miR-214*

4,54 0,23 2,90 0,79 5,39E-03 -1,64 3,13

hsa-miR-1321

2,13 1,05 0,48 0,58 1,97E-02 -1,65 3,13

hsa-miR-218

8,86 0,27 7,21 0,99 1,52E-02 -1,65 3,15

hsa-miR-1202

11,03 0,86 9,38 0,66 1,30E-02 -1,66 3,16

hsa-miR-299-5p

3,80 0,43 2,13 1,01 1,89E-02 -1,66 3,17

hsa-miR-936

2,56 0,47 0,89 1,06 2,28E-02 -1,67 3,18

hsa-miR-654-3p

3,97 0,25 2,28 1,11 2,18E-02 -1,68 3,21

hsa-miR-210

6,28 0,41 4,60 1,04 1,93E-02 -1,69 3,22

hsa-miR-663

6,18 0,82 4,45 1,10 3,52E-02 -1,73 3,31

hsa-miR-127-3p

5,22 0,57 3,44 1,00 1,62E-02 -1,78 3,43

hsa-miR-495

3,64 0,76 1,86 0,95 1,87E-02 -1,78 3,43

hsa-miR-411

2,19 0,44 0,40 1,22 2,83E-02 -1,79 3,45

hsa-miR-337-5p

3,33 0,35 1,52 0,79 3,90E-03 -1,82 3,52

hsa-miR-483-5p

6,87 0,23 5,02 0,82 3,40E-03 -1,86 3,62

hsa-miR-193b

8,34 0,80 6,47 1,01 2,02E-02 -1,86 3,64

miARN

NOR FA FA frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1471

4,55 0,27 2,62 1,29 2,29E-02 -1,93 3,80

hsa-miR-765

4,95 0,59 3,01 1,05 1,37E-02 -1,93 3,82

hsa-miR-198

2,98 0,64 1,05 0,66 3,00E-03 -1,94 3,83

hsa-miR-199a-5p

10,41 0,25 8,46 0,81 2,53E-03 -1,95 3,86

hsa-miR-187*

2,81 0,38 0,84 1,40 3,15E-02 -1,96 3,90

hsa-miR-377

4,48 0,60 2,50 1,15 1,73E-02 -1,98 3,96

hsa-miR-199a-3p

12,04 0,17 10,02 0,83 2,12E-03 -2,01 4,04

hsa-miR-1182

2,94 0,45 0,89 0,88 3,83E-03 -2,06 4,16

hsa-miR-1246

9,20 0,88 7,09 1,23 2,40E-02 -2,11 4,30

hsa-miR-379

3,13 0,51 1,02 0,89 4,16E-03 -2,11 4,31

hsa-miR-214

9,59 0,15 7,46 0,79 1,22E-03 -2,13 4,39

hsa-miR-499-5p

5,78 1,61 3,65 0,86 3,72E-02 -2,13 4,39

hsa-miR-136*

3,09 0,50 0,94 1,05 7,30E-03 -2,16 4,46

hsa-miR-381

4,34 0,54 1,97 1,13 6,47E-03 -2,37 5,18

hsa-miR-376c

6,27 0,41 3,88 1,05 3,81E-03 -2,39 5,24

hsa-miR-200a*

4,59 0,21 2,10 1,76 2,75E-02 -2,49 5,61

hsa-miR-376a

5,80 0,39 3,25 1,14 3,94E-03 -2,55 5,87

hsa-miR-486-3p

2,60 1,12 -0,11 1,75 3,23E-02 -2,70 6,51

hsa-miR-200b*

5,18 0,30 2,47 2,18 4,45E-02 -2,72 6,57

hsa-miR-199b-5p

9,67 0,16 5,87 1,73 3,51E-03 -3,79 13,87

hsa-miR-429

8,64 0,10 4,75 3,02 3,90E-02 -3,89 14,80

hsa-miR-200b

11,06 0,20 7,16 3,18 4,65E-02 -3,89 14,87

hsa-miR-206

3,86 3,71 -0,30 1,16 4,71E-02 -4,17 17,96

hsa-miR-200a

9,93 0,13 5,59 3,11 2,85E-02 -4,34 20,18

EJEMPLO 4 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL TEJIDO TIROIDEO NORMAL Y EL CARCINOMA

FOLICULAR DE TIROIDES

Se expresó un total de 415 miARN humanos por encima del nivel de fondo en las muestras de tejido tiroideo normal, 5 representando un 48% de los miARN humanos presentes en las matrices. Se expresó un total de 353 miARN por encima del nivel de fondo en las muestras de carcinoma folicular de tiroides, representando un 41 % de los miARN presentes en las matrices.

Un total de 100 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras normales y los especímenes de carcinoma folicular (p<0,05) (tabla 6). Entre estos, 13 miARN estaban

10 sobreexpresados (dif. Log2 (FTC frente a NOR) ≥ 1) y 36 estaban subexpresados (dif Log2 (FTC frente a NOR) ≤1) en al menos 2 veces en FTC en comparación con NOR. De estos, ocho miARN (hsa-miR-375, -200a, -200b, -429, 873, -200b*, -199b-5p y -200a*) estaban subexpresados de 5 a 10 veces en las muestras FTC en comparación con las muestras NOR (tabla 6).

Tabla 6. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FTC y de NOR. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

NOR FTC FTC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-182

2,28 0,58 4,50 1,38 2,02E-02 2,23 4,7

hsa-miR-96

7,46 0,37 9,53 1,14 1,06E-02 2,07 4,2

hsa-miR-183*

0,43 0,40 2,14 1,17 2,78E-02 1,71 3,3

hsa-miR-1274a

6,64 1,28 8,23 0,72 4,99E-02 1,59 3,0

hsa-miR-183

6,09 0,54 7,67 1,17 4,18E-02 1,58 3,0

hsa-miR-1274b

10,21 1,23 11,77 0,70 4,80E-02 1,55 2,9

hsa-miR-720

11,85 0,99 13,21 0,64 4,07E-02 1,36 2,6

hsa-miR-1260

8,14 0,77 9,49 0,60 2,05E-02 1,35 2,6

hsa-miR-181a*

3,51 0,54 4,80 0,73 2,23E-02 1,29 2,4

hsa-miR-34a

10,87 0,11 12,03 0,62 8,67E-03 1,15 2,2

hsa-miR-222*

-1,15 0,34 -0,04 0,74 2,86E-02 1,11 2,2

hsa-miR-182*

0,03 0,20 1,12 0,70 1,95E-02 1,10 2,1

hsa-miR-21

13,52 0,47 14,52 0,58 2,74E-02 1,00 2,0

hsa-let-7g*

-0,08 0,50 -1,09 0,50 1,98E-02 -1,01 2,0

hsa-miR-595

1,19 0,38 0,18 0,21 1,35E-03 -1,01 2,0

hsa-miR-1308

8,98 0,67 7,97 0,57 4,49E-02 -1,01 2,0

hsa-miR-452

4,97 0,26 3,94 0,77 3,95E-02 -1,03 2,0

hsa-miR-143

8,85 0,35 7,81 0,76 4,12E-02 -1,04 2,1

hsa-miR-365

9,80 0,45 8,76 0,49 1,34E-02 -1,04 2,1

hsa-miR-363

6,85 0,30 5,78 0,59 1,31E-02 -1,07 2,1

hsa-miR-218

8,86 0,27 7,78 0,57 1,03E-02 -1,08 2,1

hsa-miR-145*

6,15 0,36 5,06 0,76 3,38E-02 -1,09 2,1

hsa-miR-10a*

1,64 0,08 0,55 0,39 9,90E-04 -1,10 2,1

hsa-miR-23b*

3,98 0,18 2,87 0,81 3,37E-02 -1,11 2,2

hsa-miR-193a-5p

6,04 0,25 4,90 0,52 5,20E-03 -1,14 2,2

hsa-miR-224

5,97 0,07 4,74 0,67 8,56E-03 -1,23 2,4

hsa-miR-487a

0,85 0,93 -0,49 0,56 3,13E-02 -1,34 2,5

hsa-miR-145

11,11 0,39 9,75 0,89 2,61E-02 -1,35 2,6

hsa-miR-490-5p

2,28 0,77 0,89 0,77 3,23E-02 -1,38 2,6

hsa-miR-154

3,92 0,39 2,45 1,01 3,00E-02 -1,47 2,8

hsa-miR-451

15,49 0,22 14,03 1,07 3,22E-02 -1,47 2,8

hsa-miR-100

12,09 0,35 10,62 0,75 8,97E-03 -1,48 2,8

miARN

NOR FTC FTC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1246

9,20 0,88 7,69 0,96 4,51E-02 -1,51 2,9

hsa-miR-139-5p

6,80 0,26 5,29 1,11 3,35E-02 -1,52 2,9

hsa-miR-199a-3p

12,04 0,17 10,44 1,29 4,63E-02 -1,59 3,0

hsa-miR-486-5p

8,85 0,51 7,25 0,96 2,05E-02 -1,60 3,0

hsa-miR-876-3p

2,91 0,40 1,27 0,55 1,60E-03 -1,64 3,1

hsa-miR-138

6,63 0,55 4,85 1,20 3,00E-02 -1,78 3,4

hsa-miR-214

9,59 0,15 7,78 1,27 2,68E-02 -1,81 3,5

hsa-miR-486-3p

2,60 1,12 0,61 0,84 1,82E-02 -1,99 4,0

hsa-miR-10a

8,66 0,40 6,67 1,02 8,21E-03 -1,99 4,0

hsa-miR-200a*

4,59 0,21 2,23 1,29 9,07E-03 -2,37 5,2

hsa-miR-199b-5p

9,67 0,16 7,23 1,94 4,28E-02 -2,43 5,4

hsa-miR-200b*

5,18 0,30 2,61 1,38 8,66E-03 -2,58 6,0

hsa-miR-873

4,26 0,29 1,64 1,40 8,29E-03 -2,62 6,2

hsa-miR-429

8,64 0,10 5,86 2,18 4,08E-02 -2,77 6,8

hsa-miR-200b

11,06 0,20 8,28 1,82 1,99E-02 -2,78 6,9

hsa-miR-200a

9,93 0,13 7,09 2,00 2,70E-02 -2,84 7,2

hsa-miR-375

4,86 1,12 1,85 2,10 3,74E-02 -3,01 8,0

EJEMPLO 5 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL TEJIDO TIROIDEO NORMAL Y EL CARCINOMA

PAPILAR DE TIROIDES

5 Se expresó un total de 415 miARN humanos por encima del nivel de fondo en las muestras de tejido tiroideo normal, representando un 48% de los miARN humanos presentes en las matrices. Se expresó un total de 354 miARN por encima del nivel de fondo en las muestras de carcinoma papilar de tiroides, representando un 41 % de los miARN presentes en las matrices.

Un total de 219 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras

10 normales y los especímenes de carcinoma papilar (p<0,05) (tabla 7). Entre estos, 22 miARN estaban sobreexpresados (dif. Log2 (PTC frente a NOR) ≥ 1) y 121 estaban subexpresados (dif Log2 (PTC frente a NOR) ≤1) en al menos 2 veces en PTC en comparación con NOR. De estos, hsa-miR-146b-5p estaba sobreexpresado en más de 110 veces en las muestras de PTC; cinco miARN (hsa-miR-551b, -146b-3p, -222, -221 y -221*) estaban sobreexpresados de 10 a 30 veces en las muestras de PTC y tres miARN (hsa-miR-31*, -31 y -21) estaban

15 sobreexpresados de 5 a 10 veces en las muestras de PTC. Entre los miARN que se expresaron a niveles medios menores en las muestras de PTC, seis miARN (hsa-miR-1, -7, -206, -7, -2*, -873 y -204) estaban subexpresados de 10 a 20 veces y trece miARN estaban subexpresados en 5 y 10 veces en las muestras de PTC.

Tabla 7. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de PTC y de NOR. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

NOR PTC NOR frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1

9,59 3,43 5,41 1,45 4,14E-02 4,18 18,2

miARN

NOR PTC NOR frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-7

11,38 0,51 7,30 1,72 2,70E-03 4,08 16,9

hsa-miR-206

3,86 3,71 -0,07 0,40 4,79E-02 3,93 15,2

hsa-miR-7-2*

4,72 0,59 1,08 1,28 1,21E-03 3,65 12,5

hsa-miR-873

4,26 0,29 0,81 0,78 7,17E-05 3,45 10,9

hsa-miR-204

8,70 0,83 5,26 0,80 4,03E-04 3,45 10,9

hsa-miR-631

2,11 0,89 -0,92 0,83 1,12E-03 3,03 8,2

hsa-miR-92b*

1,01 2,20 -1,87 0,74 2,71E-02 2,88 7,4

hsa-miR-486-5p

8,85 0,51 6,05 0,90 9,11E-04 2,80 7,0

hsa-miR-144

8,24 0,32 5,48 1,15 2,51E-03 2,76 6,8

hsa-miR-765

4,95 0,59 2,28 0,68 4,49E-04 2,67 6,4

hsa-miR-451

15,49 0,22 12,86 0,80 4,10E-04 2,63 6,2

hsa-miR-144*

6,62 0,32 4,08 0,88 9,59E-04 2,54 5,8

hsa-miR-876-3p

2,91 0,40 0,41 0,55 1,24E-04 2,51 5,7

hsa-miR-486-3p

2,60 1,12 0,10 1,00 9,44E-03 2,50 5,7

hsa-miR-149*

2,76 0,59 0,27 0,56 3,42E-04 2,49 5,6

hsa-miR-659

3,79 0,65 1,42 0,91 3,34E-03 2,37 5,2

hsa-miR-483-5p

6,87 0,23 4,52 0,79 7,40E-04 2,35 5,1

hsa-miR-1246

9,20 0,88 6,87 1,37 2,19E-02 2,33 5,0

hsa-miR-648

2,26 1,24 -0,03 0,72 1,00E-02 2,29 4,9

hsa-miR-1182

2,94 0,45 0,68 0,68 7,17E-04 2,26 4,8

hsa-miR-1471

4,55 0,27 2,31 0,52 1,15E-04 2,24 4,7

hsa-miR-936

2,56 0,47 0,34 0,48 2,16E-04 2,22 4,7

hsa-miR-1915*

0,74 0,45 -1,44 0,82 2,19E-03 2,18 4,5

hsa-miR-1300

5,66 1,41 3,48 0,76 2,05E-02 2,18 4,5

hsa-miR-363

6,85 0,30 4,69 0,85 2,01E-03 2,16 4,5

hsa-miR-198

2,98 0,64 0,85 0,77 2,99E-03 2,14 4,4

hsa-miR-663

6,18 0,82 4,09 0,76 5,54E-03 2,08 4,2

hsa-miR-499-5p

5,78 1,61 3,72 0,45 2,79E-02 2,06 4,2

hsa-miR-623

3,09 0,84 1,05 1,06 1,64E-02 2,04 4,1

hsa-miR-630

6,04 0,36 4,01 1,11 1,01E-02 2,03 4,1

hsa-miR-1183

4,64 0,50 2,62 0,61 1,04E-03 2,03 4,1

hsa-miR-671-5p

5,77 0,20 3,74 0,72 1,04E-03 2,03 4,1

hsa-miR-1202

11,03 0,86 9,02 0,95 1,31E-02 2,01 4,0

miARN

NOR PTC NOR frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-138

6,63 0,55 4,62 1,08 1,19E-02 2,01 4,0

hsa-miR-187*

2,81 0,38 0,80 0,86 3,72E-03 2,00 4,0

hsa-miR-422a

2,78 0,27 0,82 1,09 1,04E-02 1,96 3,9

hsa-miR-1321

2,13 1,05 0,17 0,39 5,88E-03 1,96 3,9

hsa-miR-516a-5p

3,37 1,12 1,43 0,65 1,34E-02 1,94 3,8

hsa-miR-1228*

0,49 0,88 -1,42 0,60 5,86E-03 1,91 3,8

hsa-miR-1469

2,18 0,70 0,27 1,30 3,42E-02 1,91 3,8

hsa-miR-493

1,16 0,73 -0,73 0,79 7,59E-03 1,90 3,7

hsa-miR-199b-5p

9,67 0,16 7,78 1,31 2,61E-02 1,88 3,7

hsa-miR-1909*

0,62 0,25 -1,25 0,45 1,54E-04 1,87 3,7

hsa-miR-583

1,29 0,37 -0,56 0,48 4,00E-04 1,85 3,6

hsa-miR-1291

1,56 0,68 -0,24 0,49 2,41E-03 1,80 3,5

hsa-miR-877

3,24 0,44 1,45 1,15 2,28E-02 1,79 3,5

hsa-miR-1268

8,34 0,66 6,57 0,52 2,81E-03 1,77 3,4

hsa-miR-145

11,11 0,39 9,37 0,28 1,05E-04 1,73 3,3

hsa-miR-152

7,88 0,23 6,19 0,48 3,69E-04 1,69 3,2

hsa-miR-1224-5p

5,95 0,48 4,26 0,47 1,11E-03 1,69 3,2

hsa-miR-150*

5,58 0,63 3,89 0,62 5,16E-03 1,68 3,2

hsa-miR-373*

1,91 0,35 0,24 0,68 3,14E-03 1,67 3,2

hsa-miR-371-5p

4,45 0,52 2,81 0,43 1,24E-03 1,64 3,1

hsa-miR-365

9,80 0,45 8,16 0,64 3,40E-03 1,64 3,1

hsa-miR-345

4,50 0,63 2,86 0,49 3,03E-03 1,64 3,1

hsa-miR-638

8,93 0,61 7,32 0,50 3,27E-03 1,61 3,1

hsa-miR-1180

2,38 0,14 0,78 0,98 1,52E-02 1,60 3,0

hsa-miR-939

7,35 0,82 5,75 0,45 7,25E-03 1,60 3,0

hsa-miR-381

4,34 0,54 2,75 1,08 3,15E-02 1,59 3,0

hsa-miR-526b

1,91 0,43 0,32 0,75 7,06E-03 1,59 3,0

hsa-miR-145*

6,15 0,36 4,58 0,41 4,99E-04 1,58 3,0

hsa-miR-1225-5p

9,85 0,45 8,28 0,48 1,56E-03 1,57 3,0

hsa-miR-134

6,13 0,47 4,56 0,60 3,81E-03 1,57 3,0

hsa-miR-1207-5p

9,76 0,49 8,19 0,66 5,75E-03 1,57 3,0

hsa-miR-1308

8,98 0,67 7,42 0,76 1,50E-02 1,56 2,9

hsa-miR-148a*

1,75 0,37 0,21 0,94 1,80E-02 1,55 2,9

miARN

NOR PTC NOR frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-572

5,63 0,90 4,08 0,45 1,20E-02 1,54 2,9

hsa-miR-298

0,75 0,85 -0,78 0,66 1,81E-02 1,53 2,9

hsa-miR-143

8,85 0,35 7,32 0,28 1,67E-04 1,53 2,9

hsa-miR-566

1,31 0,55 -0,20 0,64 6,95E-03 1,52 2,9

hsa-miR-135a*

5,11 0,38 3,61 0,32 3,36E-04 1,50 2,8

hsa-miR-1203

0,42 0,97 -1,06 0,52 2,10E-02 1,48 2,8

hsa-miR-138-1*

-0,09 1,17 -1,55 0,61 4,52E-02 1,46 2,7

hsa-miR-622

3,86 0,82 2,40 0,69 2,31E-02 1,45 2,7

hsa-miR-195*

1,65 0,33 0,21 0,87 1,73E-02 1,44 2,7

hsa-miR-214

9,59 0,15 8,16 0,85 1,33E-02 1,43 2,7

hsa-miR-652

6,64 0,19 5,22 0,29 6,92E-05 1,43 2,7

hsa-miR-886-5p

-0,28 1,12 -1,68 0,30 2,98E-02 1,40 2,6

hsa-miR-584

3,41 0,30 2,03 0,45 1,15E-03 1,38 2,6

hsa-miR-329

1,45 0,43 0,08 0,64 8,19E-03 1,37 2,6

hsa-miR-299-5p

3,80 0,43 2,45 0,92 3,16E-02 1,35 2,5

hsa-miR-518a-5p

0,89 0,75 -0,45 0,45 1,23E-02 1,34 2,5

hsa-miR-934

-0,51 1,01 -1,85 0,68 4,92E-02 1,34 2,5

hsa-miR-490-3p

0,19 0,61 -1,13 0,67 1,82E-02 1,32 2,5

hsa-miR-1915

8,41 0,52 7,09 0,28 1,76E-03 1,32 2,5

hsa-miR-193b

8,34 0,80 7,03 0,79 4,44E-02 1,31 2,5

hsa-miR-129-5p

1,45 0,57 0,15 0,60 1,27E-02 1,31 2,5

hsa-miR-10a

8,66 0,40 7,36 0,58 6,93E-03 1,30 2,5

hsa-miR-370

2,41 0,50 1,11 0,79 2,49E-02 1,30 2,5

hsa-miR-411

2,19 0,44 0,89 0,65 1,16E-02 1,30 2,5

hsa-miR-193b*

4,44 0,44 3,15 0,31 1,24E-03 1,29 2,5

hsa-miR-139-5p

6,80 0,26 5,51 0,53 3,02E-03 1,29 2,4

hsa-miR-126*

6,87 0,34 5,58 0,62 7,53E-03 1,29 2,4

hsa-miR-601

3,90 0,46 2,62 0,73 1,87E-02 1,28 2,4

hsa-miR-662

2,26 0,34 0,98 0,16 1,47E-04 1,27 2,4

hsa-miR-148b

9,01 0,40 7,77 0,67 1,46E-02 1,24 2,4

hsa-miR-498

2,26 0,47 1,03 0,60 1,18E-02 1,23 2,3

hsa-miR-148a

11,27 0,26 10,07 0,84 2,97E-02 1,20 2,3

hsa-miR-516b

1,14 0,79 -0,04 0,28 1,67E-02 1,18 2,3

miARN

NOR PTC NOR frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-617

1,64 0,66 0,47 0,50 1,86E-02 1,17 2,3

hsa-miR-490-5p

2,28 0,77 1,10 0,47 2,58E-02 1,17 2,3

hsa-miR-485-3p

0,94 0,89 -0,23 0,51 4,11E-02 1,17 2,2

hsa-miR-518c*

0,63 0,75 -0,49 0,55 3,58E-02 1,12 2,2

hsa-miR-199a-5p

10,41 0,25 9,29 0,76 2,80E-02 1,11 2,2

hsa-miR-616

-0,08 0,59 -1,19 0,58 2,53E-02 1,11 2,2

hsa-miR-640

-0,04 0,54 -1,15 0,15 2,86E-03 1,11 2,2

hsa-miR-188-5p

5,77 0,44 4,66 0,39 4,83E-03 1,11 2,2

hsa-miR-30c

11,51 0,24 10,41 0,58 1,01E-02 1,10 2,1

hsa-miR-501-3p

3,91 0,68 2,83 0,27 1,34E-02 1,08 2,1

hsa-miR-34c-3p

-0,35 0,70 -1,42 0,20 1,32E-02 1,07 2,1

hsa-miR-887

3,89 0,46 2,82 0,46 1,02E-02 1,07 2,1

hsa-miR-199a-3p

12,04 0,17 10,98 0,71 2,31E-02 1,06 2,1

hsa-miR-557

5,01 0,53 3,95 0,56 2,36E-02 1,06 2,1

hsa-miR-29b-2*

2,05 0,28 0,99 0,44 4,23E-03 1,06 2,1

hsa-miR-497

9,77 0,27 8,74 0,47 6,23E-03 1,03 2,0

hsa-miR-1910

-0,88 0,50 -1,90 0,24 4,81E-03 1,02 2,0

hsa-miR-124

0,64 0,46 -0,38 0,31 5,68E-03 1,02 2,0

hsa-miR-654-5p

2,99 0,39 1,98 0,52 1,46E-02 1,01 2,0

hsa-miR-130b

7,56 0,39 6,55 0,21 1,54E-03 1,01 2,0

hsa-miR-195

11,57 0,26 10,57 0,40 3,44E-03 1,00 2,0

hsa-miR-892b

4,74 0,18 5,77 0,82 4,49E-02 -1,04 2,0

hsa-miR-34b*

6,54 0,12 7,62 0,54 6,35E-03 -1,08 2,1

hsa-miR-1305

7,19 0,23 8,28 0,53 6,82E-03 -1,09 2,1

hsa-miR-15a

10,87 0,25 12,01 0,32 6,19E-04 -1,14 2,2

hsa-miR-181a

10,09 0,53 11,28 0,33 4,32E-03 -1,19 2,3

hsa-miR-503

4,49 0,24 5,74 0,81 2,20E-02 -1,24 2,4

hsa-miR-34a*

3,71 0,15 5,07 0,21 1,22E-05 -1,36 2,6

hsa-miR-181b

8,08 0,58 9,59 0,52 4,57E-03 -1,51 2,8

hsa-miR-222*

-1,15 0,34 0,46 0,73 4,92E-03 -1,61 3,0

hsa-miR-181a-2*

4,53 0,63 6,23 0,66 5,62E-03 -1,70 3,3

hsa-miR-34a

10,87 0,11 12,59 0,24 3,29E-06 -1,72 3,3

hsa-miR-375

4,86 1,12 6,74 1,20 4,70E-02 -1,88 3,7

miARN

NOR PTC NOR frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-514

0,86 0,32 2,93 0,86 2,70E-03 -2,07 4,2

hsa-miR-21

13,52 0,47 15,85 0,45 1,36E-04 -2,32 5,0

hsa-miR-31

7,66 0,63 10,14 0,64 6,61E-04 -2,49 5,6

hsa-miR-31*

6,00 0,62 8,58 0,56 3,21E-04 -2,57 6,0

hsa-miR-221*

5,03 0,35 8,71 0,86 9,54E-05 -3,68 12,9

hsa-miR-221

6,75 0,27 10,60 0,73 2,24E-05 -3,85 14,4

hsa-miR-222

5,87 0,13 10,25 0,58 1,75E-06 -4,37 20,7

hsa-miR-146b-3p

-0,93 0,25 3,73 1,12 8,80E-05 -4,65 25,2

hsa-miR-551b

5,24 0,48 9,98 0,58 3,63E-06 -4,74 26,7

hsa-miR-146b-5p

7,54 0,54 14,41 0,92 3,58E-06 -6,87 116,6

EJEMPLO 6

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL TEJIDO TIROIDEO NORMAL Y LA VARIANTE

FOLICULAR DEL CARCINOMA PAPILAR DE TIROIDES

Se expresó un total de 415 miARN humanos por encima del nivel de fondo en las muestras de tejido tiroideo normal,

5 representando un 48% de los miARN humanos presentes en las matrices. Se expresó un total de 346 miARN por encima del nivel de fondo en las muestras de variante folicular del carcinoma papilar de tiroides, representando un 40% de los miARN presentes en las matrices.

Un total de 126 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras normales y los especímenes de la variante folicular de carcinoma papilar (p<0,05). Entre estos, 14 miARN estaban 10 sobreexpresados (dif. Log2 (FVPTC frente a NOR) ≥ 1) y 50 estaban subexpresados (dif Log2 (FVPTC frente a NOR) ≤1) en al menos 2 veces en FVPTC en comparación con NOR (tabla 8). De estos, hsa-miR-146b-5p estaba sobreexpresado en más de 50 veces en las muestras de FVPTC, hsa-miR-222, -551b, -221 y -146b-3p estaban sobreexpresados de 10 a 14 veces en las muestras de FVPTC y hsa-miR-221*, -31* y -31) estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces en las muestras de FVPTC. Entre los miARN que se expresaron a niveles medios

15 menores en las muestras de FVPTC, hsa-miR-7 y -873 estaban subexpresados de 10 a 20 veces en las muestras de FVPTC y hsa-miR-204, -7-2* y -199b-5p estaban subexpresados de 5 a 10 veces en las muestras FVPTC.

Tabla 8. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FVPTC y de NOR. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

NOR FVPTC FVPTC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR146b-5p

7,54 0,54 13,20 1,09 8,62E-05 5,66 50,5

hsa-miR-222

5,87 0,13 9,66 0,79 7,99E-05 3,79 13,8

hsa-miR-551b

5,24 0,48 8,99 0,76 1,64E-04 3,75 13,4

hsa-miR-221

6,75 0,27 10,19 0,98 5,17E-04 3,44 10,9

hsa-miR146b-3p

-0,93 0,25 2,46 1,30 2,17E-03 3,39 10,5

hsa-miR-221*

5,03 0,35 8,06 0,85 5,98E-04 3,03 8,2

hsa-miR-31*

6,00 0,62 8,47 1,06 6,94E-03 2,46 5,5

hsa-miR-31

7,66 0,63 10,06 1,12 9,65E-03 2,40 5,3

miARN

NOR FVPTC FVPTC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-222*

-1,15 0,34 0,85 0,42 3,21E-04 2,00 4,0

hsa-miR-503

4,49 0,24 6,07 1,04 2,58E-02 1,57 3,0

hsa-miR-34a

10,87 0,11 12,33 0,27 5,15E-05 1,46 2,7

hsa-miR-21

13,52 0,47 14,94 0,64 1,18E-02 1,42 2,7

hsa-miR-181b

8,08 0,58 9,48 0,84 3,36E-02 1,40 2,6

hsa-miR-34a*

3,71 0,15 4,76 0,31 8,68E-04 1,05 2,1

hsa-miR-29c*

7,86 0,25 6,86 0,34 3,09E-03 -1,00 2,0

hsa-miR-30c

11,51 0,24 10,51 0,51 1,21E-02 -1,01 2,0

hsa-miR-210

6,28 0,41 5,26 0,39 1,12E-02 -1,02 2,0

hsa-miR-3623p

6,25 0,35 5,23 0,41 8,68E-03 -1,03 2,0

hsa-miR193b*

4,44 0,44 3,41 0,46 1,75E-02 -1,03 2,0

hsa-miR-5323p

6,16 0,20 5,10 0,09 5,91E-05 -1,06 2,1

hsa-miR-136

3,60 0,47 2,50 0,44 1,41E-02 -1,10 2,1

hsa-miR199a-5p

10,41 0,25 9,31 0,27 1,03E-03 -1,10 2,1

hsa-miR-4555p

4,70 0,09 3,57 0,63 1,21E-02 -1,13 2,2

hsa-miR-214

9,59 0,15 8,46 0,48 3,98E-03 -1,14 2,2

hsa-miR-377

4,48 0,60 3,32 0,35 1,54E-02 -1,16 2,2

hsa-miR-329

1,45 0,43 0,28 0,26 3,62E-03 -1,17 2,2

hsa-miR-495

3,64 0,76 2,45 0,45 3,56E-02 -1,19 2,3

hsa-miR199a-3p

12,04 0,17 10,82 0,41 1,50E-03 -1,21 2,3

hsa-miR-3695p

2,10 0,30 0,89 0,48 5,32E-03 -1,21 2,3

hsa-miR-652

6,64 0,19 5,43 0,43 2,14E-03 -1,21 2,3

hsa-miR-1395p

6,80 0,26 5,57 0,68 1,51E-02 -1,23 2,3

hsa-miR-214*

4,54 0,23 3,31 0,30 5,87E-04 -1,23 2,3

hsa-miR-148a

11,27 0,26 10,02 0,33 9,76E-04 -1,24 2,4

hsa-miR148a*

1,75 0,37 0,48 0,48 5,82E-03 -1,28 2,4

hsa-miR-22*

5,56 0,65 4,29 0,52 2,22E-02 -1,28 2,4

hsa-miR-143

8,85 0,35 7,56 0,83 2,92E-02 -1,28 2,4

miARN

NOR FVPTC FVPTC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-3375p

3,33 0,35 2,04 0,52 6,37E-03 -1,29 2,4

hsa-miR-145

11,11 0,39 9,81 0,83 3,00E-02 -1,29 2,5

hsa-miR-144

8,24 0,32 6,93 0,46 3,39E-03 -1,31 2,5

hsa-miR-144*

6,62 0,32 5,25 1,07 4,89E-02 -1,38 2,6

hsa-miR-154

3,92 0,39 2,54 0,38 2,26E-03 -1,38 2,6

hsa-miR-379

3,13 0,51 1,74 0,86 3,16E-02 -1,39 2,6

hsa-miR-345

4,50 0,63 3,11 0,68 2,39E-02 -1,39 2,6

hsa-miR-376c

6,27 0,41 4,84 0,47 3,70E-03 -1,43 2,7

hsa-miR-6543p

3,97 0,25 2,50 0,40 7,43E-04 -1,47 2,8

hsa-miR-152

7,88 0,23 6,38 0,23 8,99E-05 -1,50 2,8

hsa-miR-2995p

3,80 0,43 2,29 0,48 3,53E-03 -1,51 2,8

hsa-miR-9

1,92 0,34 0,41 0,75 1,04E-02 -1,51 2,8

hsa-miR-381

4,34 0,54 2,81 0,74 1,53E-02 -1,54 2,9

hsa-miR-193b

8,34 0,80 6,75 0,59 1,90E-02 -1,58 3,0

hsa-miR1915*

0,74 0,45 -0,87 0,78 1,17E-02 -1,60 3,0

hsa-miR551b*

0,88 1,01 -0,79 0,69 3,42E-02 -1,67 3,2

hsa-miR-136*

3,09 0,50 1,39 0,40 1,87E-03 -1,70 3,2

hsa-miR-376a

5,80 0,39 4,10 0,40 9,12E-04 -1,71 3,3

hsa-miR-138

6,63 0,55 4,85 0,81 1,07E-02 -1,78 3,4

hsa-miR-639

0,53 1,01 -1,31 0,68 2,38E-02 -1,83 3,6

hsa-miR-365

9,80 0,45 7,90 0,40 7,41E-04 -1,90 3,7

hsa-miR-8763p

2,91 0,40 0,79 0,91 5,28E-03 -2,12 4,4

hsa-miR-1295p

1,45 0,57 -0,79 1,02 8,52E-03 -2,24 4,7

hsa-miR199b-5p

9,67 0,16 7,31 0,64 3,76E-04 -2,36 5,1

hsa-miR-7-2*

4,72 0,59 1,75 1,62 1,38E-02 -2,97 7,8

hsa-miR-204

8,70 0,83 5,44 2,07 2,63E-02 -3,27 9,6

hsa-miR-873

4,26 0,29 0,89 1,45 3,88E-03 -3,37 10,3

hsa-miR-7

11,38 0,51 7,22 2,56 1,90E-02 -4,16 17,9

EJEMPLO 7

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL TEJIDO TIROIDEO NORMAL Y EL CARCINOMA ANAPLÁSICO DE TIROIDES

Se expresó un total de 415 miARN humanos por encima del nivel de fondo en las muestras de tejido tiroideo normal,

5 representando un 48% de los miARN humanos presentes en las matrices. Se expresó un total de 330 miARN por encima del nivel de fondo en la muestra de cáncer anaplásico de tiroides, representando un 38% de los miARN presentes en las matrices.

Un total de 178 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras normales y el espécimen de carcinoma anaplásico de tiroides (p<0,05). Entre estos, 32 miARN estaban 10 sobreexpresados (dif. Log2 (ATC frente a NOR) ≥ 1) y 124 estaban subexpresados (dif Log2 (ATC frente a NOR) ≤1) en al menos 2 veces en ATC en comparación con NOR. De estos, hsa-miR-582-3p y hsa-miR-9* estaban sobreexpresados de 30 a 40 veces en la muestra de ATC, hsa-miR-582-5p, -34c-5p, 124 estaban sobreexpresados de 10 a 20 veces en la muestra de ATC y hsa-miR-9, -34b, -21 y -210 estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces en la muestra de ATC (tabla 9). Entre los miARN que se expresaron a niveles medios menores en la muestra de ATC,

15 ocho (miR-429, -141, -200c, 200a, -200b, -135b, -135a y -205) estaban subexpresados de 100 a 420 veces, hsamiR-138 y hsa-miR-7-2* estaban subexpresados de 50 a 100 veces y veintidós miARN se expresaron a niveles entre 10 y 40 veces menores en el espécimen de ATC en comparación con las muestras NOR (tabla 9).

Tabla 9. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de ATC y de NOR. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

NOR ATC ATC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-582-3p

-1,21 0,32 3,97 6,88E-04 5,18 36,3

hsa-miR-9*

2,09 0,66 7,14 6,51E-03 5,05 33,2

hsa-miR-582-5p

4,27 0,39 8,42 2,40E-03 4,15 17,7

hsa-miR-34c-5p

3,81 0,36 7,37 3,18E-03 3,55 11,7

hsa-miR-124

0,64 0,46 4,16 6,56E-03 3,52 11,5

hsa-miR-9

1,92 0,34 5,05 3,66E-03 3,13 8,7

hsa-miR-34b

1,95 0,51 4,65 1,81E-02 2,70 6,5

hsa-miR-21

13,52 0,47 16,00 1,84E-02 2,48 5,6

hsa-miR-210

6,28 0,41 8,74 1,25E-02 2,45 5,5

hsa-miR-592

2,46 0,28 4,74 5,25E-03 2,28 4,9

hsa-miR-34b*

6,54 0,12 8,43 7,36E-04 1,89 3,7

hsa-miR-10a

8,66 0,40 10,38 3,16E-02 1,72 3,3

hsa-miR-153

2,34 0,28 3,92 1,50E-02 1,58 3,0

hsa-miR-769-5p

4,90 0,24 6,42 1,08E-02 1,52 2,9

hsa-miR-550*

2,80 0,18 4,14 7,27E-03 1,34 2,5

hsa-miR-30a*

8,99 0,37 10,32 4,79E-02 1,33 2,5

hsa-miR-149

3,96 0,22 5,28 1,25E-02 1,32 2,5

hsa-miR-449a

3,23 0,21 4,52 1,17E-02 1,29 2,4

hsa-miR-30a

12,09 0,31 13,36 3,57E-02 1,27 2,4

hsa-miR-873

4,26 0,29 5,52 3,14E-02 1,26 2,4

hsa-miR-132

6,00 0,15 7,21 5,18E-03 1,21 2,3

miARN

NOR ATC ATC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-191*

3,42 0,27 4,58 3,01E-02 1,16 2,2

hsa-miR-656

0,48 0,26 1,64 2,72E-02 1,16 2,2

hsa-miR-330-3p

4,00 0,04 5,15 1,78E-04 1,15 2,2

hsa-miR-1201

1,35 0,21 2,48 1,69E-02 1,13 2,2

hsa-miR-769-3p

2,04 0,20 3,15 1,57E-02 1,11 2,2

hsa-let-7b*

1,31 0,14 2,41 5,36E-03 1,10 2,1

hsa-miR-431*

1,38 0,23 2,46 2,45E-02 1,09 2,1

hsa-miR-1238

3,64 0,23 4,72 2,45E-02 1,08 2,1

hsa-let-7f-1*

1,41 0,12 2,48 3,84E-03 1,07 2,1

hsa-miR-425*

3,06 0,27 4,08 4,45E-02 1,02 2,0

hsa-miR-519d

0,74 0,21 1,74 2,42E-02 1,00 2,0

hsa-miR-30e*

8,03 0,28 7,03 4,75E-02 -1,00 2,0

hsa-miR-7-1*

4,85 0,15 3,84 9,18E-03 -1,01 2,0

hsa-miR-16-2*

3,48 0,10 2,46 2,96E-03 -1,02 2,0

hsa-miR-361-3p

7,35 0,12 6,33 5,16E-03 -1,03 2,0

hsa-miR-1271

4,37 0,19 3,33 1,60E-02 -1,03 2,0

hsa-miR-338-5p

2,10 0,17 1,05 1,07E-02 -1,06 2,1

hsa-miR-574-3p

6,79 0,11 5,72 3,21E-03 -1,07 2,1

hsa-miR-30c-1*

3,43 0,11 2,37 3,00E-03 -1,07 2,1

hsa-miR-624*

2,34 0,17 1,27 1,05E-02 -1,07 2,1

hsa-miR-151-3p

7,63 0,21 6,52 1,73E-02 -1,10 2,1

hsa-let-7d

12,26 0,22 11,15 1,99E-02 -1,12 2,2

hsa-miR-192

7,92 0,21 6,79 1,62E-02 -1,13 2,2

hsa-let-7f

14,71 0,25 13,56 2,54E-02 -1,15 2,2

hsa-miR-152

7,88 0,23 6,73 2,11E-02 -1,15 2,2

hsa-miR-628-5p

4,41 0,12 3,25 2,99E-03 -1,16 2,2

hsa-miR-146b-3p

-0,93 0,25 -2,10 2,34E-02 -1,18 2,3

hsa-miR-19a

8,30 0,13 7,12 4,24E-03 -1,18 2,3

hsa-miR-455-3p

6,91 0,12 5,69 2,94E-03 -1,22 2,3

hsa-miR-93

8,83 0,24 7,61 1,87E-02 -1,23 2,3

hsa-miR-652

6,64 0,19 5,34 9,13E-03 -1,30 2,5

hsa-miR-1471

4,55 0,27 3,24 2,35E-02 -1,30 2,5

hsa-miR-214

9,59 0,15 8,28 4,62E-03 -1,31 2,5

miARN

NOR ATC ATC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-214*

4,54 0,23 3,23 1,42E-02 -1,31 2,5

hsa-miR-628-3p

3,68 0,24 2,32 1,43E-02 -1,36 2,6

hsa-miR-10b

9,05 0,24 7,70 1,55E-02 -1,36 2,6

hsa-miR-101*

2,81 0,23 1,44 1,32E-02 -1,37 2,6

hsa-miR-130a

11,60 0,31 10,22 2,80E-02 -1,38 2,6

hsa-miR-30b*

4,51 0,11 3,11 1,50E-03 -1,39 2,6

hsa-miR-30e

9,84 0,26 8,44 1,64E-02 -1,40 2,6

hsa-miR-29c

13,27 0,21 11,87 9,34E-03 -1,40 2,6

hsa-miR-138-2*

2,44 0,25 1,03 1,54E-02 -1,42 2,7

hsa-miR-374b

8,47 0,18 7,05 6,07E-03 -1,42 2,7

hsa-miR-30d

10,39 0,18 8,94 5,49E-03 -1,45 2,7

hsa-miR-194

6,65 0,22 5,17 9,14E-03 -1,48 2,8

hsa-miR-668

-0,59 0,34 -2,09 2,96E-02 -1,51 2,8

hsa-miR-192*

2,15 0,28 0,63 1,67E-02 -1,52 2,9

hsa-miR-423-5p

7,13 0,09 5,61 6,53E-04 -1,52 2,9

hsa-miR-1826

5,89 0,33 4,37 2,59E-02 -1,53 2,9

hsa-miR-215

6,16 0,28 4,58 1,47E-02 -1,57 3,0

hsa-miR-186

7,19 0,27 5,62 1,40E-02 -1,58 3,0

hsa-miR-424*

3,82 0,28 2,24 1,49E-02 -1,58 3,0

hsa-let-7g

13,44 0,18 11,83 3,81E-03 -1,60 3,0

hsa-miR-193b*

4,44 0,44 2,81 4,42E-02 -1,63 3,1

hsa-miR-199a-5p

10,41 0,25 8,77 1,02E-02 -1,64 3,1

hsa-miR-92a

9,43 0,12 7,77 1,13E-03 -1,66 3,2

hsa-miR-767-5p

0,57 0,17 -1,10 3,23E-03 -1,67 3,2

hsa-miR-374a

9,21 0,22 7,52 6,08E-03 -1,69 3,2

hsa-miR-199b-5p

9,67 0,16 7,97 2,44E-03 -1,70 3,2

hsa-miR-29c*

7,86 0,25 6,15 8,89E-03 -1,71 3,3

hsa-miR-219-5p

3,84 0,31 2,13 1,67E-02 -1,71 3,3

hsa-miR-665

3,57 0,46 1,87 4,48E-02 -1,71 3,3

hsa-miR-98

8,93 0,29 7,22 1,35E-02 -1,71 3,3

hsa-miR-32

4,42 0,32 2,63 1,60E-02 -1,79 3,5

hsa-miR-29b-2*

2,05 0,28 0,24 1,01E-02 -1,81 3,5

hsa-miR-30d*

2,94 0,23 1,12 5,64E-03 -1,82 3,5

miARN

NOR ATC ATC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-151-5p

11,05 0,25 9,21 6,98E-03 -1,84 3,6

hsa-miR-17*

5,45 0,45 3,60 3,44E-02 -1,84 3,6

hsa-miR-1301

0,99 0,35 -0,92 1,66E-02 -1,92 3,8

hsa-miR-95

8,36 0,53 6,41 4,68E-02 -1,95 3,9

hsa-miR-1208

2,84 0,36 0,87 1,64E-02 -1,96 3,9

hsa-miR-101

9,47 0,24 7,49 4,90E-03 -1,97 3,9

hsa-miR-7

11,38 0,51 9,39 3,99E-02 -1,98 4,0

hsa-miR-1180

2,38 0,14 0,37 9,38E-04 -2,01 4,0

hsa-let-7i

14,01 0,31 11,99 9,81E-03 -2,02 4,1

hsa-miR-1270

2,09 0,22 0,05 3,75E-03 -2,04 4,1

hsa-let-7g*

-0,08 0,50 -2,14 3,50E-02 -2,06 4,2

hsa-miR-26b

12,58 0,26 10,52 5,54E-03 -2,06 4,2

hsa-miR-365

9,80 0,45 7,72 2,56E-02 -2,08 4,2

hsa-miR-203

5,95 0,57 3,85 4,60E-02 -2,09 4,3

hsa-miR-744

5,09 0,12 2,84 4,85E-04 -2,25 4,7

hsa-miR-874

7,04 0,24 4,78 3,53E-03 -2,26 4,8

hsa-miR-148a*

1,75 0,37 -0,55 1,17E-02 -2,31 4,9

hsa-let-7c

12,99 0,19 10,68 1,75E-03 -2,31 5,0

hsa-miR-148b

9,01 0,40 6,69 1,35E-02 -2,32 5,0

hsa-miR-346

0,98 0,17 -1,38 1,06E-03 -2,36 5,1

hsa-miR-542-5p

6,26 0,30 3,91 5,96E-03 -2,36 5,1

hsa-miR-455-5p

4,70 0,09 2,32 1,83E-04 -2,37 5,2

hsa-miR-26a

12,78 0,23 10,36 2,56E-03 -2,42 5,3

hsa-miR-20a*

4,96 0,36 2,51 8,79E-03 -2,44 5,4

hsa-miR-542-3p

5,78 0,29 3,33 4,84E-03 -2,45 5,5

hsa-miR-424

10,03 0,50 7,56 2,18E-02 -2,46 5,5

hsa-miR-30b

12,22 0,28 9,75 4,09E-03 -2,48 5,6

hsa-miR-551b

5,24 0,48 2,61 1,65E-02 -2,63 6,2

hsa-miR-143*

4,15 0,36 1,36 6,18E-03 -2,79 6,9

hsa-miR-345

4,50 0,63 1,63 2,61E-02 -2,88 7,3

hsa-miR-126

12,90 0,21 10,01 1,13E-03 -2,89 7,4

hsa-miR-100

12,09 0,35 9,15 5,03E-03 -2,94 7,7

hsa-miR-125b-2*

5,60 0,17 2,65 5,45E-04 -2,95 7,7

miARN

NOR ATC ATC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1469

2,18 0,70 -0,80 3,20E-02 -2,98 7,9

hsa-miR-422a

2,78 0,27 -0,25 2,09E-03 -3,03 8,1

hsa-miR-491-5p

1,89 0,17 -1,33 4,87E-04 -3,22 9,3

hsa-miR-1251

0,97 0,29 -2,26 2,08E-03 -3,23 9,4

hsa-miR-450a

5,36 0,44 1,98 6,34E-03 -3,38 10,4

hsa-miR-452

4,97 0,26 1,57 1,41E-03 -3,40 10,6

hsa-miR-126*

6,87 0,34 3,44 2,81E-03 -3,43 10,8

hsa-miR-486-5p

8,85 0,51 5,35 8,93E-03 -3,50 11,3

hsa-miR-224

5,97 0,07 2,46 2,48E-05 -3,51 11,4

hsa-let-7i*

3,60 0,44 0,07 5,56E-03 -3,53 11,5

hsa-miR-451

15,49 0,22 11,96 7,29E-04 -3,53 11,6

hsa-miR-143

8,85 0,35 5,31 2,93E-03 -3,54 11,7

hsa-miR-144*

6,62 0,32 3,04 2,06E-03 -3,59 12,0

hsa-miR-99a*

1,97 0,14 -1,76 1,50E-04 -3,72 13,2

hsa-miR-145*

6,15 0,36 2,37 2,53E-03 -3,78 13,8

hsa-miR-125b

14,25 0,19 10,44 3,62E-04 -3,81 14,0

hsa-miR-144

8,24 0,32 4,43 1,80E-03 -3,81 14,0

hsa-miR-218

8,86 0,27 5,04 1,10E-03 -3,82 14,1

hsa-miR-99a

11,86 0,17 8,00 2,39E-04 -3,87 14,6

hsa-miR-139-5p

6,80 0,26 2,79 7,91E-04 -4,01 16,1

hsa-miR-200a*

4,59 0,21 0,46 3,96E-04 -4,13 17,5

hsa-miR-145

11,11 0,39 6,78 2,14E-03 -4,32 20,0

hsa-miR-512-3p

4,77 0,48 0,39 3,76E-03 -4,38 20,8

hsa-miR-486-3p

2,60 1,12 -1,82 3,85E-02 -4,41 21,3

hsa-miR-200b*

5,18 0,30 0,48 7,91E-04 -4,70 26,0

hsa-miR-141*

3,63 0,39 -1,68 1,16E-03 -5,31 39,6

hsa-miR-7-2*

4,72 0,59 -1,00 3,21E-03 -5,72 52,9

hsa-miR-138

6,63 0,55 0,09 1,73E-03 -6,53 92,7

hsa-miR-205

5,13 0,14 -1,95 2,14E-05 -7,08 135,0

hsa-miR-135a

8,83 0,52 1,19 9,30E-04 -7,64 198,8

hsa-miR-135b

10,03 0,43 2,20 5,09E-04 -7,83 227,4

hsa-miR-200b

11,06 0,20 2,93 4,36E-05 -8,13 279,8

hsa-miR-200a

9,93 0,13 1,45 1,16E-05 -8,48 357,2

miARN

NOR ATC ATC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-200c

11,68 0,25 3,00 7,51E-05 -8,67 408,7

hsa-miR-141

11,19 0,42 2,51 3,35E-04 -8,68 411,2

hsa-miR-429

8,64 0,10 -0,05 5,15E-06 -8,69 413,4

EJEMPLO 8 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL TEJIDO TIROIDEO NORMAL Y EL CARCINOMA

MEDULAR DE TIROIDES

Se expresó un total de 415 miARN humanos por encima del nivel de fondo en las muestras de tiroides normal,

5 representando un 48% de los miARN humanos presentes en las matrices. Se expresó un total de 418 miARN por encima del nivel de fondo en las muestras de carcinoma medular de tiroides, representando un 48% de los miARN presentes en las matrices.

Un total de 165 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras normales y los carcinomas medulares de tiroides (p<0,05) (tabla 10). Entre estos, 91 miARN estaban 10 sobreexpresados (dif. Log2 (MTC frente a NOR) ≥ 1) y 30 estaban subexpresados (dif Log2 (MTC frente a NOR) ≤1) en al menos 2 veces en MTC en comparación con NOR. De estos, hsa-miR-375 y hsa-miR-124 estaban sobreexpresados entre 100 y 520 veces en las muestras de MTC, veintiún miARN estaban sobreexpresados de 10 a 54 veces en las muestras de MTC y treinta y un miARN estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces en las muestras de MTC en comparación con las muestras NOR. Entre los miARN que se expresaron a niveles medios menores en

15 las muestras de MTC, hsa-miR-31 y hsa-miR-31* estaban subexpresados en más de 10 veces en las muestras de MTC y seis miARN (hsa-miR-138, -7-2*, -204, -30a*, -30c-2* y -30a) estaban subexpresados de 5 a 10 veces en los especímenes de MTC (tabla 10).

Tabla 10. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de MTC y de NOR. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

NOR MTC MTC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-375

4,86 1,12 13,86 0,40 4,71E-05 9,01 515,1

hsa-miR-124

0,64 0,46 7,86 3,11 5,21E-03 7,22 149,4

hsa-miR-153

2,34 0,28 8,11 1,07 1,26E-04 5,77 54,5

hsa-miR-323-3p

1,27 1,48 6,93 0,13 1,33E-03 5,66 50,6

hsa-miR-410

2,89 1,19 8,20 0,14 6,54E-04 5,31 39,7

hsa-miR-592

2,46 0,28 7,50 1,19 3,85E-04 5,04 32,9

hsa-miR-487b

4,75 0,63 9,75 0,19 4,62E-05 5,00 32,0

hsa-miR-409-3p

2,35 1,61 7,21 0,31 3,96E-03 4,87 29,2

hsa-miR-539

1,69 0,51 6,53 0,34 3,23E-05 4,83 28,5

hsa-miR-433

-0,64 0,60 4,13 0,61 1,46E-04 4,77 27,3

hsa-miR-432

2,98 0,71 7,61 0,36 1,58E-04 4,63 24,7

hsa-miR-409-5p

0,42 0,53 4,92 0,15 3,23E-05 4,50 22,6

hsa-miR-183

6,09 0,54 10,49 0,69 2,13E-04 4,40 21,2

hsa-miR-758

1,00 0,63 5,04 0,13 1,22E-04 4,03 16,4

hsa-miR-382

2,57 0,59 6,53 0,24 1,16E-04 3,96 15,6

miARN

NOR MTC MTC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-487a

0,85 0,93 4,79 0,32 1,00E-03 3,94 15,3

hsa-miR-183*

0,43 0,40 4,36 0,40 5,10E-05 3,93 15,2

hsa-miR-485-5p

0,22 0,44 4,03 0,40 7,66E-05 3,81 14,0

hsa-miR-889

0,00 0,19 3,79 0,54 4,36E-05 3,79 13,9

hsa-miR-127-3p

5,22 0,57 8,88 0,37 2,12E-04 3,66 12,7

hsa-miR-182

2,28 0,58 5,90 0,30 1,93E-04 3,63 12,3

hsa-miR-96

7,46 0,37 11,01 0,48 1,07E-04 3,55 11,7

hsa-miR-485-3p

0,94 0,89 4,27 0,37 1,83E-03 3,33 10,1

hsa-miR-136*

3,09 0,50 6,41 0,51 3,53E-04 3,32 10,0

hsa-miR-890

-0,66 0,49 2,63 1,99 2,22E-02 3,29 9,8

hsa-miR-495

3,64 0,76 6,93 0,28 8,90E-04 3,29 9,8

hsa-miR-543

2,07 0,93 5,30 0,05 2,10E-03 3,23 9,4

hsa-miR-9*

2,09 0,66 5,31 1,78 1,93E-02 3,21 9,3

hsa-miR-431

1,78 1,51 5,00 1,06 2,65E-02 3,21 9,3

hsa-miR-369-5p

2,10 0,30 5,27 0,72 4,65E-04 3,17 9,0

hsa-miR-376a*

1,53 0,33 4,63 0,44 1,18E-04 3,10 8,6

hsa-miR-379

3,13 0,51 6,20 0,14 1,73E-04 3,07 8,4

hsa-miR-377

4,48 0,60 7,51 0,55 1,02E-03 3,03 8,2

hsa-miR-10a

8,66 0,40 11,69 0,52 3,28E-04 3,03 8,2

hsa-miR-136

3,60 0,47 6,61 0,51 4,48E-04 3,01 8,0

hsa-miR-381

4,34 0,54 7,34 0,33 3,96E-04 2,99 8,0

hsa-miR-132

6,00 0,15 8,97 1,15 3,28E-03 2,97 7,8

hsa-miR-376c

6,27 0,41 9,21 0,81 1,39E-03 2,94 7,7

hsa-miR-154

3,92 0,39 6,86 0,17 6,85E-05 2,94 7,7

hsa-miR-221

6,75 0,27 9,68 0,79 8,60E-04 2,93 7,6

hsa-miR-377*

0,16 0,39 2,94 0,16 9,44E-05 2,78 6,9

hsa-miR-9

1,92 0,34 4,69 1,56 1,66E-02 2,77 6,8

hsa-miR-376a

5,80 0,39 8,51 0,67 1,05E-03 2,70 6,5

hsa-miR-329

1,45 0,43 4,13 0,15 1,67E-04 2,68 6,4

hsa-miR-411

2,19 0,44 4,80 0,24 2,66E-04 2,61 6,1

hsa-miR-335

6,48 0,33 9,06 1,56 2,08E-02 2,58 6,0

hsa-miR-7

11,38 0,51 13,88 0,95 6,11E-03 2,50 5,7

hsa-miR-1301

0,99 0,35 3,45 0,62 1,09E-03 2,46 5,5

miARN

NOR MTC MTC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-369-3p

0,42 0,36 2,85 0,71 1,82E-03 2,43 5,4

hsa-miR-493*

2,96 0,54 5,39 0,45 1,52E-03 2,43 5,4

hsa-miR-154*

2,47 0,92 4,83 0,62 1,25E-02 2,36 5,1

hsa-miR-370

2,41 0,50 4,77 0,36 1,02E-03 2,35 5,1

hsa-miR-330-3p

4,00 0,04 6,34 0,46 1,34E-04 2,34 5,1

hsa-miR-654-3p

3,97 0,25 6,30 0,51 4,55E-04 2,33 5,0

hsa-miR-132*

3,33 0,54 5,58 1,13 1,61E-02 2,25 4,8

hsa-miR-222

5,87 0,13 8,06 0,71 1,53E-03 2,18 4,5

hsa-miR-10a*

1,64 0,08 3,82 0,57 5,66E-04 2,18 4,5

hsa-miR-1185

0,91 0,24 3,03 0,54 8,66E-04 2,11 4,3

hsa-miR-216a

-0,17 0,41 1,88 0,79 6,21E-03 2,06 4,2

hsa-miR-7-1*

4,85 0,15 6,88 0,44 3,26E-04 2,03 4,1

hsa-miR-337-5p

3,33 0,35 5,33 0,33 6,01E-04 2,00 4,0

hsa-miR-182*

0,03 0,20 2,00 0,20 4,96E-05 1,97 3,9

hsa-miR-376b

1,52 0,42 3,45 1,39 4,32E-02 1,93 3,8

hsa-miR-338-3p

7,41 0,48 9,34 0,35 2,08E-03 1,93 3,8

hsa-miR-221*

5,03 0,35 6,93 0,33 7,96E-04 1,90 3,7

hsa-miR-668

-0,59 0,34 1,30 0,42 1,20E-03 1,89 3,7

hsa-miR-582-5p

4,27 0,39 6,13 0,18 6,29E-04 1,86 3,6

hsa-miR-663b

2,05 0,54 3,88 1,00 2,54E-02 1,83 3,6

hsa-miR-598

6,22 0,44 7,98 0,33 2,27E-03 1,76 3,4

hsa-miR-301a

5,82 0,22 7,56 0,34 4,35E-04 1,74 3,3

hsa-miR-335*

2,05 0,24 3,78 0,88 1,19E-02 1,73 3,3

hsa-miR-326

1,90 0,22 3,61 0,14 7,52E-05 1,71 3,3

hsa-miR-429

8,64 0,10 10,32 0,28 9,10E-05 1,68 3,2

hsa-miR-656

0,48 0,26 2,09 0,62 4,97E-03 1,61 3,0

hsa-miR-642

-0,92 0,34 0,65 0,41 2,47E-03 1,57 3,0

hsa-miR-431*

1,38 0,23 2,93 0,05 9,91E-05 1,55 2,9

hsa-miR-212

4,43 0,21 5,93 0,76 1,18E-02 1,50 2,8

hsa-miR-299-3p

1,65 0,31 3,11 0,45 3,83E-03 1,46 2,7

hsa-miR-299-5p

3,80 0,43 5,22 0,48 9,19E-03 1,42 2,7

hsa-miR-582-3p

-1,21 0,32 0,19 0,32 2,17E-03 1,41 2,7

hsa-miR-181c*

3,92 0,47 5,32 0,15 4,54E-03 1,40 2,6

miARN

NOR MTC MTC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-181c

7,07 0,37 8,44 0,26 2,93E-03 1,37 2,6

hsa-miR-200a

9,93 0,13 11,26 0,29 3,98E-04 1,33 2,5

hsa-miR-654-5p

2,99 0,39 4,30 0,31 4,98E-03 1,31 2,5

hsa-miR-324-5p

7,97 0,19 9,24 0,04 9,68E-05 1,27 2,4

hsa-miR-24-1*

5,38 0,10 6,56 0,18 9,92E-05 1,18 2,3

hsa-miR-337-3p

2,03 0,33 3,15 0,43 1,12E-02 1,12 2,2

hsa-miR-200a*

4,59 0,21 5,71 0,26 1,44E-03 1,12 2,2

hsa-miR-200b

11,06 0,20 12,17 0,08 2,78E-04 1,11 2,2

hsa-let-7e

11,75 0,21 12,78 0,21 1,44E-03 1,03 2,0

hsa-miR-181d

5,85 0,44 6,86 0,09 1,19E-02 1,01 2,0

hsa-let-7d*

1,66 0,34 0,59 0,75 4,86E-02 -1,08 2,1

hsa-let-7g

13,44 0,18 12,32 0,43 4,98E-03 -1,12 2,2

hsa-miR-126

12,90 0,21 11,72 0,25 1,04E-03 -1,18 2,3

hsa-miR-20b

8,20 0,29 7,02 0,70 2,62E-02 -1,19 2,3

hsa-miR-205

5,13 0,14 3,92 0,71 1,82E-02 -1,21 2,3

hsa-miR-625

5,52 0,34 4,29 0,64 2,02E-02 -1,23 2,3

hsa-miR-152

7,88 0,23 6,62 0,52 7,12E-03 -1,26 2,4

hsa-miR-1270

2,09 0,22 0,79 0,81 2,61E-02 -1,30 2,5

hsa-miR-30c

11,51 0,24 10,16 0,57 7,44E-03 -1,35 2,6

hsa-miR-30e*

8,03 0,28 6,67 0,55 7,04E-03 -1,36 2,6

hsa-miR-363

6,85 0,30 5,49 0,86 2,99E-02 -1,36 2,6

hsa-let-7i

14,01 0,31 12,62 0,95 3,66E-02 -1,39 2,6

hsa-miR-126*

6,87 0,34 5,45 0,16 1,22E-03 -1,41 2,7

hsa-miR-100

12,09 0,35 10,63 0,66 1,19E-02 -1,46 2,8

hsa-miR-455-3p

6,91 0,12 5,44 1,18 4,95E-02 -1,48 2,8

hsa-miR-542-3p

5,78 0,29 4,19 1,06 3,18E-02 -1,59 3,0

hsa-miR-139-5p

6,80 0,26 5,21 0,90 1,83E-02 -1,59 3,0

hsa-miR-345

4,50 0,63 2,88 0,99 4,31E-02 -1,62 3,1

hsa-let-7i*

3,60 0,44 1,85 0,98 2,29E-02 -1,75 3,4

hsa-miR-450a

5,36 0,44 3,51 0,77 9,42E-03 -1,85 3,6

hsa-miR-551b

5,24 0,48 3,35 1,29 3,99E-02 -1,88 3,7

hsa-miR-144

8,24 0,32 6,21 0,85 6,40E-03 -2,03 4,1

hsa-miR-30a

12,09 0,31 9,76 1,51 2,66E-02 -2,33 5,0

miARN

NOR MTC MTC frente a NOR Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-30c-2*

6,15 0,27 3,81 1,75 4,18E-02 -2,33 5,0

hsa-miR-30a*

8,99 0,37 6,59 1,57 2,88E-02 -2,40 5,3

hsa-miR-204

8,70 0,83 6,03 1,35 2,21E-02 -2,68 6,4

hsa-miR-7-2*

4,72 0,59 1,55 2,02 2,83E-02 -3,17 9,0

hsa-miR-138

6,63 0,55 3,44 2,17 3,36E-02 -3,18 9,1

hsa-miR-31*

6,00 0,62 2,44 2,19 2,44E-02 -3,57 11,9

hsa-miR-31

7,66 0,63 3,63 2,73 3,23E-02 -4,03 16,3

EJEMPLO 9 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE LOS NÓDULOS TIROIDEOS HIPERPLÁSICOS Y

5 ADENOMA FOLICULAR

Un total de 160 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de nódulo hiperplásico y los adenomas foliculares (p<0,05) (tabla 11). Entre estos, 11 miARN estaban sobreexpresados (dif. Log2 (FA frente a NOD) ≥ 1) y 128 estaban subexpresados (dif Log2 (FA frente a NOD) ≤1) en al menos 2 veces en muestras de FA en comparación con NOD. De estos, hsa-miR-1274a, -720 y -1274b estaban sobreexpresados

10 de 5 a 6 veces en el FA en comparación con las muestras de NOD. Entre los miARN que se expresaron a niveles medios menores en las muestras de FA, hsa-miR-206 y hsa-miR-1202 estaban subexpresados de 20 a 50 veces en las muestras de FA, dieciséis miARN estaban subexpresados de 10 a 20 veces y cuarenta y siete miARN estaban subexpresados de 5 a 10 veces en los especímenes de FA en comparación con las muestras de NOD.

Tabla 11. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FA y de NOD. MED, 15 expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

NOD FA FA frente a NOD

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-1274a

4,74 1,03 7,33 0,79 3,72E-03 2,59 6,0

hsa-miR-720

10,25 0,79 12,76 0,87 2,80E-03 2,51 5,7

hsa-miR-1274b

8,53 0,95 10,86 0,82 5,49E-03 2,33 5,0

hsa-miR-1260

6,50 0,87 8,62 0,71 5,13E-03 2,12 4,3

hsa-miR-182

1,79 0,79 3,85 1,11 1,69E-02 2,06 4,2

hsa-miR-96

7,09 0,38 8,94 0,88 6,06E-03 1,85 3,6

hsa-miR-1227

0,13 0,61 1,77 1,08 3,12E-02 1,64 3,1

hsa-miR-183

6,08 0,43 7,62 1,20 4,65E-02 1,54 2,9

hsa-miR-29b-1*

3,36 0,34 4,78 0,51 2,08E-03 1,42 2,7

hsa-miR-200c*

1,03 0,53 2,41 0,94 3,54E-02 1,38 2,6

hsa-miR-182*

-0,26 0,47 1,08 0,53 5,57E-03 1,34 2,5

hsa-miR-30c-2*

6,01 0,27 5,00 0,53 1,13E-02 -1,01 2,0

hsa-miR-513c

3,19 0,70 2,19 0,55 4,58E-02 -1,01 2,0

miARN

NOD FA FA frente a NOD

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-1270

2,47 0,46 1,35 0,54 1,30E-02 -1,12 2,2

hsa-miR-320d

10,69 0,29 9,56 0,73 2,34E-02 -1,13 2,2

hsa-miR-1228

5,75 0,58 4,59 0,67 3,00E-02 -1,16 2,2

hsa-miR-28-3p

2,09 0,21 0,93 0,64 1,11E-02 -1,16 2,2

hsa-miR-320b

10,20 0,36 9,03 0,72 2,16E-02 -1,17 2,2

hsa-miR-320c

10,20 0,21 9,02 0,68 1,29E-02 -1,19 2,3

hsa-miR-130a

11,54 0,35 10,32 0,86 3,36E-02 -1,22 2,3

hsa-miR-513b

4,08 0,67 2,85 0,56 1,96E-02 -1,23 2,3

hsa-miR-501-3p

4,63 0,23 3,36 0,76 1,50E-02 -1,27 2,4

hsa-miR-10b*

3,33 0,58 2,05 0,49 8,73E-03 -1,28 2,4

hsa-miR-320a

9,16 0,27 7,87 0,70 1,09E-02 -1,29 2,4

hsa-miR-296-5p

4,51 0,68 3,19 0,33 6,47E-03 -1,31 2,5

hsa-miR-299-3p

1,73 0,56 0,33 0,73 1,64E-02 -1,40 2,6

hsa-miR-199a-5p

9,93 0,57 8,46 0,81 1,85E-02 -1,47 2,8

hsa-miR-557

6,23 0,77 4,74 0,33 5,73E-03 -1,49 2,8

hsa-miR-432

3,26 0,58 1,76 0,66 9,17E-03 -1,50 2,8

hsa-miR-1285

3,38 0,58 1,86 0,97 2,91E-02 -1,52 2,9

hsa-miR-602

3,88 0,51 2,36 0,50 2,87E-03 -1,52 2,9

hsa-miR-33b*

4,27 0,51 2,73 0,50 2,53E-03 -1,55 2,9

hsa-miR-1275

8,12 0,52 6,56 0,86 1,53E-02 -1,56 3,0

hsa-miR-199a-3p

11,61 0,24 10,02 0,83 8,00E-03 -1,59 3,0

hsa-miR-1307

3,37 0,39 1,77 1,06 2,50E-02 -1,60 3,0

hsa-miR-584

4,38 0,49 2,76 0,44 1,22E-03 -1,61 3,1

hsa-miR-516a-5p

3,63 0,99 2,00 0,46 1,34E-02 -1,63 3,1

hsa-miR-122

2,20 1,35 0,56 0,32 3,16E-02 -1,64 3,1

hsa-miR-525-5p

2,15 0,49 0,50 0,66 4,32E-03 -1,66 3,2

hsa-miR-769-3p

3,34 0,64 1,68 0,57 4,48E-03 -1,66 3,2

hsa-miR-379

2,70 0,88 1,02 0,89 2,51E-02 -1,68 3,2

hsa-miR-1244

2,06 0,85 0,37 0,82 1,89E-02 -1,69 3,2

hsa-miR-1306

2,97 0,34 1,23 0,76 4,09E-03 -1,74 3,3

hsa-miR-574-5p

7,52 0,63 5,79 0,68 5,47E-03 -1,74 3,3

hsa-miR-550

3,70 0,30 1,95 0,59 1,07E-03 -1,75 3,4

hsa-miR-125a-3p

7,33 0,40 5,56 0,75 3,92E-03 -1,77 3,4

miARN

NOD FA FA frente a NOD

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-760

4,31 0,36 2,54 0,81 5,08E-03 -1,77 3,4

hsa-miR-877*

4,73 0,40 2,93 0,51 6,85E-04 -1,81 3,5

hsa-miR-210

6,41 0,24 4,60 1,04 1,19E-02 -1,82 3,5

hsa-miR-23a*

4,50 0,50 2,67 0,90 8,55E-03 -1,82 3,5

hsa-miR-1249

5,93 0,74 4,05 0,56 3,22E-03 -1,88 3,7

hsa-miR-135a*

5,61 0,85 3,73 0,52 4,43E-03 -1,88 3,7

hsa-miR-518a-5p

2,05 0,65 0,15 0,53 1,90E-03 -1,90 3,7

hsa-miR-302c*

1,62 0,71 -0,29 0,50 2,04E-03 -1,91 3,8

hsa-miR-214

9,42 0,44 7,46 0,79 3,20E-03 -1,96 3,9

hsa-miR-614

2,05 0,67 0,08 0,94 9,60E-03 -1,97 3,9

hsa-miR-184

2,83 0,43 0,85 0,59 7,74E-04 -1,99 4,0

hsa-miR-1226*

5,72 0,46 3,70 0,47 3,51E-04 -2,03 4,1

hsa-miR-583

2,59 0,74 0,54 0,77 5,12E-03 -2,04 4,1

hsa-miR-654-5p

4,06 0,36 2,01 1,28 1,81E-02 -2,05 4,1

hsa-miR-1299

4,40 0,44 2,34 1,29 1,96E-02 -2,06 4,2

hsa-miR-639

0,97 0,48 -1,10 0,71 1,64E-03 -2,07 4,2

hsa-miR-513a-5p

5,52 0,43 3,44 0,48 2,74E-04 -2,08 4,2

hsa-miR-490-5p

3,39 0,29 1,30 0,94 3,97E-03 -2,09 4,3

hsa-miR-662

3,58 0,21 1,46 0,73 8,47E-04 -2,13 4,4

hsa-miR-1180

3,54 0,41 1,41 1,66 4,20E-02 -2,13 4,4

hsa-miR-1276

2,01 0,65 -0,15 1,61 4,10E-02 -2,16 4,5

hsa-miR-381

4,14 1,16 1,97 1,13 2,54E-02 -2,17 4,5

hsa-miR-1291

2,99 0,68 0,79 1,08 9,41E-03 -2,21 4,6

hsa-miR-422a

3,64 0,36 1,41 1,24 1,07E-02 -2,23 4,7

hsa-miR-200a*

4,34 0,33 2,10 1,76 4,24E-02 -2,24 4,7

hsa-miR-373*

3,17 0,97 0,91 1,67 4,86E-02 -2,26 4,8

hsa-miR-518e*

2,03 0,27 -0,25 1,15 6,49E-03 -2,28 4,8

hsa-miR-138-1*

1,32 0,49 -0,97 0,85 2,04E-03 -2,29 4,9

hsa-miR-518c*

2,24 0,52 -0,12 0,81 1,55E-03 -2,36 5,1

hsa-miR-1250

1,91 0,52 -0,48 1,27 9,84E-03 -2,39 5,3

hsa-miR-498

3,77 0,49 1,35 1,11 5,11E-03 -2,42 5,3

hsa-miR-526b

3,54 0,53 1,11 0,45 1,53E-04 -2,42 5,4

hsa-miR-424*

5,34 0,66 2,91 1,14 7,17E-03 -2,43 5,4

miARN

NOD FA FA frente a NOD

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-630

6,83 0,59 4,40 0,94 2,81E-03 -2,43 5,4

hsa-miR-490-3p

1,74 0,41 -0,70 0,93 1,87E-03 -2,44 5,4

hsa-miR-1208

3,69 0,27 1,22 0,79 5,97E-04 -2,46 5,5

hsa-miR-617

3,26 0,35 0,77 0,94 1,59E-03 -2,49 5,6

hsa-miR-575

10,16 0,66 7,66 0,68 8,67E-04 -2,49 5,6

hsa-miR-1246

9,63 1,16 7,09 1,23 1,63E-02 -2,53 5,8

hsa-miR-1224-5p

7,60 0,65 5,05 1,45 1,45E-02 -2,55 5,9

hsa-miR-298

1,93 0,38 -0,62 1,18 4,51E-03 -2,55 5,9

hsa-miR-371-5p

6,14 0,47 3,57 0,78 6,86E-04 -2,57 5,9

hsa-miR-127-5p

1,28 0,35 -1,31 0,88 9,54E-04 -2,58 6,0

hsa-miR-1228*

1,90 0,73 -0,70 1,35 1,07E-02 -2,60 6,1

hsa-miR-921

1,67 0,51 -0,94 0,88 1,19E-03 -2,61 6,1

hsa-miR-1915

10,06 0,49 7,41 0,57 1,59E-04 -2,65 6,3

hsa-miR-622

5,23 0,37 2,58 0,92 1,06E-03 -2,65 6,3

hsa-miR-202

7,06 0,56 4,38 0,70 4,36E-04 -2,68 6,4

hsa-miR-638

10,95 1,00 8,26 0,52 1,16E-03 -2,70 6,5

hsa-miR-1469

3,39 0,42 0,68 1,64 1,55E-02 -2,71 6,6

hsa-miR-188-5p

7,46 0,63 4,71 0,32 5,89E-05 -2,74 6,7

hsa-miR-631

3,97 0,56 1,22 1,73 1,91E-02 -2,75 6,7

hsa-miR-566

3,15 0,92 0,39 1,49 1,45E-02 -2,77 6,8

hsa-miR-1268

10,19 1,33 7,39 0,37 2,58E-03 -2,80 7,0

hsa-miR-1203

2,45 0,50 -0,36 1,20 3,47E-03 -2,80 7,0

hsa-miR-610

4,46 0,57 1,65 0,67 3,02E-04 -2,80 7,0

hsa-miR-623

4,95 0,55 2,14 0,90 9,42E-04 -2,81 7,0

hsa-miR-877

4,47 0,65 1,65 1,12 3,09E-03 -2,82 7,1

hsa-miR-616

1,69 0,53 -1,14 1,00 1,44E-03 -2,82 7,1

hsa-miR-939

8,91 0,42 6,06 0,56 6,59E-05 -2,85 7,2

hsa-miR-572

7,90 1,01 5,04 0,65 1,29E-03 -2,86 7,3

hsa-miR-940

8,91 0,72 6,05 0,76 7,02E-04 -2,86 7,3

hsa-miR-134

8,00 0,93 5,08 0,86 1,80E-03 -2,91 7,5

hsa-miR-516b

2,78 0,32 -0,14 0,79 2,30E-04 -2,91 7,5

hsa-miR-1471

5,53 0,37 2,62 1,29 3,42E-03 -2,92 7,5

hsa-miR-601

5,60 0,53 2,62 0,55 7,49E-05 -2,97 7,9

miARN

NOD FA FA frente a NOD

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-671-5p

7,24 0,57 4,25 0,59 1,16E-04 -2,99 7,9

hsa-miR-493

2,93 0,73 -0,12 1,07 1,91E-03 -3,05 8,3

hsa-miR-1915*

2,26 0,54 -0,82 1,08 1,30E-03 -3,08 8,5

hsa-miR-1225-5p

11,79 0,95 8,71 0,57 5,05E-04 -3,08 8,5

hsa-miR-34c-3p

1,72 0,30 -1,38 0,78 1,53E-04 -3,09 8,5

hsa-miR-1207-5p

11,83 1,05 8,69 0,76 1,20E-03 -3,14 8,8

hsa-miR-659

5,53 0,63 2,36 0,93 6,76E-04 -3,17 9,0

hsa-miR-1183

6,22 0,69 3,04 1,31 3,35E-03 -3,18 9,1

hsa-miR-1321

3,74 0,75 0,48 0,58 1,56E-04 -3,26 9,6

hsa-miR-551b*

2,72 0,65 -0,64 1,29 2,18E-03 -3,36 10,2

hsa-miR-199b-5p

9,26 0,23 5,87 1,73 6,41E-03 -3,38 10,4

hsa-miR-370

3,80 0,49 0,41 1,72 6,93E-03 -3,40 10,5

hsa-miR-934

2,09 0,71 -1,31 1,49 4,19E-03 -3,40 10,5

hsa-miR-150*

7,49 0,70 4,08 0,64 1,19E-04 -3,42 10,7

hsa-miR-483-5p

8,47 0,79 5,02 0,82 3,79E-04 -3,45 11,0

hsa-miR-765

6,63 0,70 3,01 1,05 6,05E-04 -3,62 12,3

hsa-miR-936

4,55 0,65 0,89 1,06 5,29E-04 -3,66 12,6

hsa-miR-648

4,14 0,46 0,45 1,38 1,44E-03 -3,69 12,9

hsa-miR-149*

4,68 0,59 0,84 1,62 2,93E-03 -3,85 14,4

hsa-miR-198

4,90 0,65 1,05 0,66 4,97E-05 -3,85 14,5

hsa-miR-92b*

2,96 0,56 -0,89 1,18 5,65E-04 -3,86 14,5

hsa-miR-1182

4,76 0,77 0,89 0,88 2,20E-04 -3,88 14,7

hsa-miR-187*

4,73 0,70 0,84 1,40 1,56E-03 -3,88 14,8

hsa-miR-1300

7,80 0,79 3,75 1,14 5,35E-04 -4,05 16,6

hsa-miR-663

8,63 0,75 4,45 1,10 3,47E-04 -4,18 18,1

hsa-miR-1202

13,75 0,81 9,38 0,66 4,28E-05 -4,37 20,7

hsa-miR-206

5,33 3,16 -0,30 1,16 7,27E-03 -5,63 49,6

EJEMPLO 10 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE LOS NÓDULOS TIROIDEOS HIPERPLÁSICOS Y EL

CARCINOMA FOLICULAR DE TIROIDES

Un total de 150 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de nódulo hiperplásico y los especímenes de carcinoma folicular de tiroides (p<0,05). Entre estos, 24 miARN estaban sobreexpresados (dif. Log2 (FTC frente a NOD) ≥ 1) y 126 estaban subexpresados (dif Log2 (FTC frente a NOD) ≤1) en al menos 2 veces en muestras de FTC en comparación con NOD (tabla 12). De estos, hsa-miR-1274a estaba sobreexpresado más de 10 veces en las muestras de FTC y seis miARN (hsa-miR-1274b, -1260, -720, -182, -142-3p y -96) estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces.

Tabla 12. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FTC y de NOD. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

NOD FTC FTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1274a

4,74 1,03 8,23 0,72 5,48E-04 3,49 11,2

hsa-miR-1274b

8,53 0,95 11,77 0,70 6,03E-04 3,24 9,4

hsa-miR-1260

6,50 0,87 9,49 0,60 4,85E-04 2,99 7,9

hsa-miR-720

10,25 0,79 13,21 0,64 4,31E-04 2,96 7,8

hsa-miR-182

1,79 0,79 4,50 1,38 1,03E-02 2,72 6,6

hsa-miR-142-3p

7,20 1,09 9,73 1,31 1,77E-02 2,53 5,8

hsa-miR-96

7,09 0,38 9,53 1,14 4,75E-03 2,44 5,4

hsa-miR-148a*

0,37 0,58 2,35 0,67 2,32E-03 1,98 3,9

hsa-miR-29b-1*

3,36 0,34 4,98 0,44 5,07E-04 1,62 3,1

hsa-miR-148a

10,18 0,47 11,79 0,72 6,39E-03 1,60 3,0

hsa-miR-183

6,08 0,43 7,67 1,17 3,69E-02 1,60 3,0

hsa-miR-181a*

3,26 0,41 4,80 0,73 7,38E-03 1,54 2,9

hsa-miR-141*

2,70 0,63 4,23 0,52 5,04E-03 1,54 2,9

hsa-miR-200c*

1,03 0,53 2,57 0,40 1,63E-03 1,53 2,9

hsa-miR-32

3,64 0,87 5,08 0,46 1,49E-02 1,44 2,7

hsa-miR-21*

4,43 0,17 5,87 0,74 7,26E-03 1,43 2,7

hsa-miR-182*

-0,26 0,47 1,12 0,70 1,17E-02 1,38 2,6

hsa-miR-340*

3,30 0,54 4,62 0,31 2,36E-03 1,32 2,5

hsa-miR-21

13,28 0,37 14,52 0,58 7,55E-03 1,24 2,4

hsa-miR-15a

10,48 0,47 11,65 0,39 4,37E-03 1,18 2,3

hsa-miR-34a

10,89 0,21 12,03 0,62 1,08E-02 1,13 2,2

hsa-miR-146a

6,97 0,24 8,10 0,68 1,64E-02 1,13 2,2

hsa-miR-340

4,68 0,47 5,80 0,41 6,46E-03 1,12 2,2

hsa-miR-15a*

0,91 0,35 1,93 0,52 1,22E-02 1,02 2,0

hsa-miR-23a*

4,50 0,50 3,50 0,33 8,30E-03 -1,00 2,0

hsa-miR-1910

-0,66 0,59 -1,67 0,19 7,75E-03 -1,01 2,0

hsa-let-7c*

0,97 0,24 -0,07 0,63 1,74E-02 -1,04 2,1

hsa-miR-100

11,66 0,24 10,62 0,75 3,38E-02 -1,04 2,1

hsa-miR-658

1,16 0,56 0,11 0,71 4,59E-02 -1,06 2,1

hsa-let-7g*

-0,02 0,56 -1,09 0,50 1,93E-02 -1,07 2,1

miARN

NOD FTC FTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-296-5p

4,51 0,68 3,43 0,39 2,04E-02 -1,08 2,1

hsa-miR-432

3,26 0,58 2,12 0,63 2,78E-02 -1,14 2,2

hsa-miR-1285

3,38 0,58 2,24 0,49 1,46E-02 -1,14 2,2

hsa-miR-501-3p

4,63 0,23 3,45 0,46 2,21E-03 -1,18 2,3

hsa-miR-1244

2,06 0,85 0,87 0,64 4,67E-02 -1,20 2,3

hsa-miR-99b*

2,95 0,29 1,74 0,46 2,55E-03 -1,21 2,3

hsa-miR-193b*

4,70 0,59 3,48 0,44 9,34E-03 -1,22 2,3

hsa-miR-509-5p

1,19 0,42 -0,04 0,93 4,58E-02 -1,23 2,4

hsa-miR-193a-5p

6,14 0,51 4,90 0,52 9,03E-03 -1,24 2,4

hsa-miR-1307

3,37 0,39 2,12 0,51 5,20E-03 -1,25 2,4

hsa-miR-125a-3p

7,33 0,40 6,09 0,69 1,54E-02 -1,25 2,4

hsa-miR-1306

2,97 0,34 1,71 0,64 9,63E-03 -1,26 2,4

hsa-miR-886-5p

0,16 0,98 -1,17 0,54 3,51E-02 -1,33 2,5

hsa-miR-550

3,70 0,30 2,37 0,52 2,71E-03 -1,33 2,5

hsa-miR-508-5p

0,24 1,03 -1,13 0,51 3,41E-02 -1,37 2,6

hsa-miR-708

2,61 0,40 1,22 1,04 4,23E-02 -1,38 2,6

hsa-miR-28-3p

2,09 0,21 0,68 0,93 2,21E-02 -1,41 2,7

hsa-miR-1249

5,93 0,74 4,52 0,53 1,22E-02 -1,42 2,7

hsa-miR-1208

3,69 0,27 2,25 0,60 3,20E-03 -1,44 2,7

hsa-miR-194*

1,50 0,63 -0,04 0,61 7,56E-03 -1,54 2,9

hsa-miR-486-3p

2,16 1,04 0,61 0,84 4,16E-02 -1,55 2,9

hsa-miR-1226*

5,72 0,46 4,16 0,57 3,03E-03 -1,56 3,0

hsa-miR-557

6,23 0,77 4,66 0,55 9,08E-03 -1,57 3,0

hsa-miR-639

0,97 0,48 -0,61 0,73 7,36E-03 -1,59 3,0

hsa-miR-33b*

4,27 0,51 2,68 0,47 1,80E-03 -1,60 3,0

hsa-miR-139-5p

6,89 0,32 5,29 1,11 2,82E-02 -1,60 3,0

hsa-miR-595

1,81 0,36 0,18 0,21 5,53E-05 -1,63 3,1

hsa-miR-422a

3,64 0,36 2,01 0,84 8,83E-03 -1,63 3,1

hsa-miR-769-3p

3,34 0,64 1,71 0,57 4,78E-03 -1,63 3,1

hsa-miR-214

9,42 0,44 7,78 1,27 4,54E-02 -1,63 3,1

hsa-miR-525-5p

2,15 0,49 0,52 0,56 2,60E-03 -1,64 3,1

hsa-miR-665

4,46 0,24 2,81 0,86 7,90E-03 -1,65 3,1

hsa-miR-654-5p

4,06 0,36 2,39 0,76 5,17E-03 -1,67 3,2

miARN

NOD FTC FTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1299

4,40 0,44 2,69 0,52 1,25E-03 -1,71 3,3

hsa-miR-122

2,20 1,35 0,49 0,58 3,58E-02 -1,71 3,3

hsa-miR-574-5p

7,52 0,63 5,80 0,57 3,45E-03 -1,73 3,3

hsa-miR-877

4,47 0,65 2,71 0,70 6,47E-03 -1,75 3,4

hsa-miR-877*

4,73 0,40 2,97 0,64 2,12E-03 -1,76 3,4

hsa-miR-138

6,61 0,71 4,85 1,20 3,68E-02 -1,76 3,4

hsa-miR-575

10,16 0,66 8,39 0,84 1,10E-02 -1,76 3,4

hsa-miR-513a-5p

5,52 0,43 3,73 0,42 3,91E-04 -1,80 3,5

hsa-miR-1469

3,39 0,42 1,59 0,92 9,05E-03 -1,80 3,5

hsa-miR-1180

3,54 0,41 1,72 0,88 6,77E-03 -1,82 3,5

hsa-miR-518e*

2,03 0,27 0,19 0,73 2,09E-03 -1,84 3,6

hsa-miR-1291

2,99 0,68 1,11 1,41 4,57E-02 -1,88 3,7

hsa-miR-1915

10,06 0,49 8,15 0,61 1,49E-03 -1,91 3,8

hsa-miR-124

1,52 1,06 -0,40 1,08 3,18E-02 -1,92 3,8

hsa-miR-617

3,26 0,35 1,34 0,73 1,94E-03 -1,92 3,8

hsa-miR-940

8,91 0,72 6,98 0,73 5,62E-03 -1,93 3,8

hsa-miR-616

1,69 0,53 -0,25 0,82 4,91E-03 -1,93 3,8

hsa-miR-662

3,58 0,21 1,65 0,44 9,39E-05 -1,94 3,8

hsa-miR-1246

9,63 1,16 7,69 0,96 2,84E-02 -1,94 3,8

hsa-miR-302c*

1,62 0,71 -0,34 0,94 1,08E-02 -1,95 3,9

hsa-miR-371-5p

6,14 0,47 4,16 0,71 2,00E-03 -1,99 4,0

hsa-miR-298

1,93 0,38 -0,08 0,87 3,78E-03 -2,01 4,0

hsa-miR-614

2,05 0,67 0,04 0,66 2,78E-03 -2,01 4,0

hsa-miR-640

1,49 0,46 -0,53 0,96 6,28E-03 -2,02 4,1

hsa-miR-601

5,60 0,53 3,56 0,85 4,14E-03 -2,04 4,1

hsa-miR-516b

2,78 0,32 0,74 0,84 2,68E-03 -2,04 4,1

hsa-miR-1303

1,71 0,56 -0,33 0,55 9,28E-04 -2,04 4,1

hsa-miR-188-5p

7,46 0,63 5,41 0,89 6,21E-03 -2,04 4,1

hsa-miR-370

3,80 0,49 1,75 0,74 2,09E-03 -2,05 4,1

hsa-miR-1308

10,04 0,87 7,97 0,57 3,51E-03 -2,07 4,2

hsa-miR-583

2,59 0,74 0,52 1,41 3,34E-02 -2,07 4,2

hsa-miR-200a*

4,34 0,33 2,23 1,29 1,61E-02 -2,12 4,3

hsa-miR-202

7,06 0,56 4,93 0,81 3,08E-03 -2,13 4,4

miARN

NOD FTC FTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1250

1,91 0,52 -0,21 0,49 3,94E-04 -2,13 4,4

hsa-miR-939

8,91 0,42 6,76 0,73 1,25E-03 -2,15 4,4

hsa-miR-610

4,46 0,57 2,28 0,91 4,36E-03 -2,18 4,5

hsa-miR-490-3p

1,74 0,41 -0,44 0,85 2,29E-03 -2,18 4,5

hsa-miR-1224-5p

7,60 0,65 5,41 0,82 3,46E-03 -2,19 4,6

hsa-miR-134

8,00 0,93 5,80 0,88 8,16E-03 -2,20 4,6

hsa-miR-1471

5,53 0,37 3,32 1,04 5,17E-03 -2,21 4,6

hsa-miR-200b*

4,90 0,29 2,61 1,38 1,47E-02 -2,29 4,9

hsa-miR-671-5p

7,24 0,57 4,95 1,00 4,84E-03 -2,29 4,9

hsa-miR-498

3,77 0,49 1,44 0,61 4,65E-04 -2,33 5,0

hsa-miR-518a-5p

2,05 0,65 -0,28 1,02 5,64E-03 -2,33 5,0

hsa-miR-526b

3,54 0,53 1,20 0,98 3,80E-03 -2,34 5,1

hsa-miR-1228*

1,90 0,73 -0,44 1,02 6,18E-03 -2,34 5,1

hsa-miR-622

5,23 0,37 2,89 0,99 2,95E-03 -2,35 5,1

hsa-miR-518c*

2,24 0,52 -0,12 0,50 2,22E-04 -2,36 5,1

hsa-miR-1268

10,19 1,33 7,82 0,51 7,46E-03 -2,37 5,2

hsa-miR-1915*

2,26 0,54 -0,14 0,90 2,30E-03 -2,40 5,3

hsa-miR-1276

2,01 0,65 -0,39 0,80 1,89E-03 -2,40 5,3

hsa-miR-1207-5p

11,83 1,05 9,42 0,95 8,58E-03 -2,41 5,3

hsa-miR-424*

5,34 0,66 2,93 1,11 6,68E-03 -2,41 5,3

hsa-miR-34c-3p

1,72 0,30 -0,70 0,62 1,92E-04 -2,42 5,4

hsa-miR-127-5p

1,28 0,35 -1,15 0,64 2,55E-04 -2,43 5,4

hsa-miR-921

1,67 0,51 -0,76 1,15 6,04E-03 -2,43 5,4

hsa-miR-150*

7,49 0,70 5,02 0,98 3,87E-03 -2,48 5,6

hsa-miR-1321

3,74 0,75 1,25 0,46 4,63E-04 -2,49 5,6

hsa-miR-1183

6,22 0,69 3,73 0,90 2,57E-03 -2,49 5,6

hsa-miR-490-5p

3,39 0,29 0,89 0,77 5,25E-04 -2,50 5,6

hsa-miR-659

5,53 0,63 3,03 1,18 6,73E-03 -2,50 5,6

hsa-miR-1225-5p

11,79 0,95 9,24 0,94 5,06E-03 -2,55 5,9

hsa-miR-638

10,95 1,00 8,39 0,59 1,91E-03 -2,56 5,9

hsa-miR-138-1*

1,32 0,49 -1,25 1,24 6,14E-03 -2,58 6,0

hsa-miR-1203

2,45 0,50 -0,22 1,05 2,43E-03 -2,67 6,3

hsa-miR-572

7,90 1,01 5,22 0,61 1,64E-03 -2,68 6,4

miARN

NOD FTC FTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-551b*

2,72 0,65 0,02 0,64 4,32E-04 -2,70 6,5

hsa-miR-483-5p

8,47 0,79 5,75 1,18 5,68E-03 -2,72 6,6

hsa-miR-566

3,15 0,92 0,32 0,98 3,15E-03 -2,83 7,1

hsa-miR-936

4,55 0,65 1,69 0,95 1,40E-03 -2,86 7,2

hsa-miR-623

4,95 0,55 2,08 0,72 3,08E-04 -2,88 7,3

hsa-miR-765

6,63 0,70 3,72 1,08 2,33E-03 -2,91 7,5

hsa-miR-493

2,93 0,73 -0,08 1,31 4,78E-03 -3,00 8,0

hsa-miR-648

4,14 0,46 1,11 1,21 2,26E-03 -3,02 8,1

hsa-miR-663

8,63 0,75 5,58 1,19 3,01E-03 -3,05 8,3

hsa-miR-187*

4,73 0,70 1,60 1,16 2,23E-03 -3,13 8,7

hsa-miR-631

3,97 0,56 0,83 0,94 6,30E-04 -3,15 8,9

hsa-miR-149*

4,68 0,59 1,51 1,12 1,43E-03 -3,18 9,0

hsa-miR-1202

13,75 0,81 10,55 1,39 4,92E-03 -3,20 9,2

hsa-miR-1182

4,76 0,77 1,56 1,12 1,84E-03 -3,21 9,2

hsa-miR-934

2,09 0,71 -1,12 1,32 3,38E-03 -3,21 9,3

hsa-miR-198

4,90 0,65 1,65 1,36 3,35E-03 -3,25 9,5

hsa-miR-1909*

2,64 0,78 -0,64 1,16 1,93E-03 -3,28 9,7

hsa-miR-1300

7,80 0,79 4,28 0,85 3,76E-04 -3,53 11,5

hsa-miR-133b

9,40 3,03 5,78 1,31 4,51E-02 -3,62 12,3

hsa-miR-92b*

2,96 0,56 -0,83 0,95 2,07E-04 -3,80 13,9

hsa-miR-206

5,33 3,16 0,29 0,60 9,35E-03 -5,04 32,9

EJEMPLO 11 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE LOS NÓDULOS TIROIDEOS HIPERPLÁSICOS Y EL

CARCINOMA PAPILAR DE TIROIDES

Un total de 262 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre muestras de nódulo 5 hiperplásico y los especímenes de carcinoma papilar de tiroides (p<0,05) (tabla 13). Entre estos, 48 miARN estaban sobreexpresados (dif. Log2 (NOD frente a PTC) ≤ 1) y 152 estaban subexpresados (dif Log2 (NOD frente a PTC) ≥1) en al menos 2 veces en muestras de PTC en comparación con NOD. De estos, hsa-miR-146b-5p estaba sobreexpresado en más de 100 veces, siete miARN (hsa-miR-146b-3p, -551b, -221, -222, -221*, -31* y -31) estaban sobreexpresados de 10 a 30 veces y ocho miARN (hsa-miR-1274a, -1274b, -142-3p, -375, -720, -21, -21*, -181a-2*) 10 estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces en los especímenes de PTC en comparación con las muestras de NOD. Entre los miARN que se expresaron a niveles medios menores en las muestras de PTC, hsa-miR-206 estaba subexpresado en al menos 40 veces, treinta y cuatro miARN estaban subexpresados de 10 a 20 veces y cuarenta y siete miARN estaban subexpresados de 5 a 10 veces en los especímenes de PCT en comparación con las muestras de NOD.

15 Tabla 13. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de PTC y de NOD. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

NOD PTC NOD frente a PTC

MED

DE MED DE prueba de t dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-206

5,33 3,16 -0,07 0,40 6,31E-03 -5,39 42,1

hsa-miR-631

3,97 0,56 -0,92 0,83 2,03E-05 -4,90 29,8

hsa-miR-92b*

2,96 0,56 -1,87 0,74 1,25E-05 -4,84 28,6

hsa-miR-1202

13,75 0,81 9,02 0,95 9,73E-05 -4,73 26,5

hsa-miR-663

8,63 0,75 4,09 0,76 4,46E-05 -4,54 23,2

hsa-miR-149*

4,68 0,59 0,27 0,56 8,50E-06 -4,42 21,3

hsa-miR-765

6,63 0,70 2,28 0,68 3,16E-05 -4,35 20,4

hsa-miR-1300

7,80 0,79 3,48 0,76 7,05E-05 -4,32 20,0

hsa-miR-936

4,55 0,65 0,34 0,48 9,70E-06 -4,21 18,5

hsa-miR-648

4,14 0,46 -0,03 0,72 2,15E-05 -4,17 18,0

hsa-miR-659

5,53 0,63 1,42 0,91 1,22E-04 -4,11 17,3

hsa-miR-1182

4,76 0,77 0,68 0,68 6,26E-05 -4,08 17,0

hsa-miR-198

4,90 0,65 0,85 0,77 6,69E-05 -4,05 16,6

hsa-miR-483-5p

8,47 0,79 4,52 0,79 1,45E-04 -3,95 15,5

hsa-miR-934

2,09 0,71 -1,85 0,68 6,15E-05 -3,94 15,3

hsa-miR-187*

4,73 0,70 0,80 0,86 1,61E-04 -3,93 15,2

hsa-miR-623

4,95 0,55 1,05 1,06 2,88E-04 -3,91 15,0

hsa-miR-1909*

2,64 0,78 -1,25 0,45 3,14E-05 -3,89 14,8

hsa-miR-572

7,90 1,01 4,08 0,45 1,23E-04 -3,82 14,1

hsa-miR-1915*

2,26 0,54 -1,44 0,82 1,18E-04 -3,70 13,0

hsa-miR-7

10,99 1,81 7,30 1,72 1,65E-02 -3,70 13,0

hsa-miR-493

2,93 0,73 -0,73 0,79 1,87E-04 -3,66 12,6

hsa-miR-1207-5p

11,83 1,05 8,19 0,66 3,73E-04 -3,64 12,5

hsa-miR-638

10,95 1,00 7,32 0,50 1,80E-04 -3,63 12,4

hsa-miR-1268

10,19 1,33 6,57 0,52 7,63E-04 -3,62 12,3

hsa-miR-1183

6,22 0,69 2,62 0,61 6,91E-05 -3,60 12,2

hsa-miR-150*

7,49 0,70 3,89 0,62 7,96E-05 -3,60 12,1

hsa-miR-1321

3,74 0,75 0,17 0,39 3,55E-05 -3,57 11,9

hsa-miR-1225-5p

11,79 0,95 8,28 0,48 1,67E-04 -3,52 11,4

hsa-miR-1203

2,45 0,50 -1,06 0,52 1,79E-05 -3,50 11,3

hsa-miR-671-5p

7,24 0,57 3,74 0,72 1,00E-04 -3,50 11,3

miARN

NOD PTC NOD frente a PTC

MED

DE MED DE prueba de t dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-134

8,00 0,93 4,56 0,60 2,65E-04 -3,43 10,8

hsa-miR-566

3,15 0,92 -0,20 0,64 3,36E-04 -3,36 10,3

hsa-miR-1224-5p

7,60 0,65 4,26 0,47 4,40E-05 -3,34 10,1

hsa-miR-371-5p

6,14 0,47 2,81 0,43 1,08E-05 -3,34 10,1

hsa-miR-1228*

1,90 0,73 -1,42 0,60 1,33E-04 -3,32 10,0

hsa-miR-1291

2,99 0,68 -0,24 0,49 7,16E-05 -3,23 9,4

hsa-miR-1471

5,53 0,37 2,31 0,52 1,61E-05 -3,22 9,3

hsa-miR-526b

3,54 0,53 0,32 0,75 1,76E-04 -3,22 9,3

hsa-miR-939

8,91 0,42 5,75 0,45 1,28E-05 -3,16 8,9

hsa-miR-583

2,59 0,74 -0,56 0,48 1,13E-04 -3,15 8,9

hsa-miR-34c-3p

1,72 0,30 -1,42 0,20 3,03E-07 -3,14 8,8

hsa-miR-1469

3,39 0,42 0,27 1,30 2,61E-03 -3,12 8,7

hsa-miR-877

4,47 0,65 1,45 1,15 2,38E-03 -3,02 8,1

hsa-miR-551b*

2,72 0,65 -0,28 1,25 3,56E-03 -3,00 8,0

hsa-miR-601

5,60 0,53 2,62 0,73 2,51E-04 -2,98 7,9

hsa-miR-1915

10,06 0,49 7,09 0,28 8,39E-06 -2,97 7,8

hsa-miR-204

8,22 0,45 5,26 0,80 3,17E-04 -2,96 7,8

hsa-miR-373*

3,17 0,97 0,24 0,68 1,08E-03 -2,93 7,6

hsa-miR-616

1,69 0,53 -1,19 0,58 1,22E-04 -2,88 7,4

hsa-miR-490-3p

1,74 0,41 -1,13 0,67 1,37E-04 -2,87 7,3

hsa-miR-138-1*

1,32 0,49 -1,55 0,61 1,22E-04 -2,87 7,3

hsa-miR-940

8,91 0,72 6,07 0,15 5,24E-05 -2,84 7,1

hsa-miR-622

5,23 0,37 2,40 0,69 1,54E-04 -2,83 7,1

hsa-miR-422a

3,64 0,36 0,82 1,09 1,71E-03 -2,82 7,1

hsa-miR-630

6,83 0,59 4,01 1,11 2,59E-03 -2,82 7,1

hsa-miR-516b

2,78 0,32 -0,04 0,28 2,15E-06 -2,81 7,0

hsa-miR-188-5p

7,46 0,63 4,66 0,39 7,57E-05 -2,79 6,9

hsa-miR-617

3,26 0,35 0,47 0,50 3,11E-05 -2,79 6,9

hsa-miR-1180

3,54 0,41 0,78 0,98 1,22E-03 -2,76 6,8

hsa-miR-1246

9,63 1,16 6,87 1,37 1,50E-02 -2,76 6,8

hsa-miR-498

3,77 0,49 1,03 0,60 1,55E-04 -2,73 6,7

hsa-miR-518c*

2,24 0,52 -0,49 0,55 1,29E-04 -2,73 6,6

hsa-miR-202

7,06 0,56 4,34 0,45 8,61E-05 -2,72 6,6

miARN

NOD PTC NOD frente a PTC

MED

DE MED DE prueba de t dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-298

1,93 0,38 -0,78 0,66 1,68E-04 -2,71 6,5

hsa-miR-370

3,80 0,49 1,11 0,79 5,86E-04 -2,69 6,5

hsa-miR-7-2*

3,76 1,18 1,08 1,28 1,43E-02 -2,69 6,4

hsa-miR-610

4,46 0,57 1,81 0,58 2,45E-04 -2,65 6,3

hsa-miR-640

1,49 0,46 -1,15 0,15 5,34E-06 -2,64 6,3

hsa-miR-1308

10,04 0,87 7,42 0,76 1,93E-03 -2,62 6,2

hsa-miR-662

3,58 0,21 0,98 0,16 1,37E-07 -2,60 6,1

hsa-miR-605

3,72 1,03 1,15 0,60 2,24E-03 -2,57 5,9

hsa-miR-486-5p

8,61 0,71 6,05 0,90 2,38E-03 -2,56 5,9

hsa-miR-518a-5p

2,05 0,65 -0,45 0,45 2,43E-04 -2,51 5,7

hsa-miR-873

3,30 0,83 0,81 0,78 2,40E-03 -2,49 5,6

hsa-miR-302c*

1,62 0,71 -0,80 0,61 8,95E-04 -2,41 5,3

hsa-miR-575

10,16 0,66 7,75 0,45 3,29E-04 -2,41 5,3

hsa-miR-1303

1,71 0,56 -0,67 0,28 6,79E-05 -2,38 5,2

hsa-miR-584

4,38 0,49 2,03 0,45 1,33E-04 -2,35 5,1

hsa-miR-424*

5,34 0,66 2,99 0,48 4,54E-04 -2,34 5,1

hsa-miR-125b-1*

3,14 1,31 0,81 0,78 1,26E-02 -2,33 5,0

hsa-miR-129-5p

2,48 0,82 0,15 0,60 1,69E-03 -2,33 5,0

hsa-miR-490-5p

3,39 0,29 1,10 0,47 6,65E-05 -2,28 4,9

hsa-miR-557

6,23 0,77 3,95 0,56 1,33E-03 -2,28 4,9

hsa-miR-769-3p

3,34 0,64 1,08 0,49 5,04E-04 -2,27 4,8

hsa-miR-1250

1,91 0,52 -0,34 0,68 9,37E-04 -2,26 4,8

hsa-miR-921

1,67 0,51 -0,58 0,37 1,15E-04 -2,25 4,8

hsa-miR-1276

2,01 0,65 -0,24 1,27 1,55E-02 -2,24 4,7

hsa-miR-127-5p

1,28 0,35 -0,95 0,60 3,29E-04 -2,22 4,7

hsa-miR-516a-5p

3,63 0,99 1,43 0,65 5,13E-03 -2,20 4,6

hsa-miR-614

2,05 0,67 -0,10 0,84 4,18E-03 -2,15 4,4

hsa-miR-451

14,94 0,59 12,86 0,80 3,55E-03 -2,08 4,2

hsa-miR-525-5p

2,15 0,49 0,07 0,40 2,05E-04 -2,08 4,2

hsa-miR-654-5p

4,06 0,36 1,98 0,52 2,61E-04 -2,08 4,2

hsa-miR-1249

5,93 0,74 3,86 0,43 1,14E-03 -2,07 4,2

hsa-miR-486-3p

2,16 1,04 0,10 1,00 1,93E-02 -2,07 4,2

hsa-miR-877*

4,73 0,40 2,68 0,34 7,08E-05 -2,06 4,2

miARN

NOD PTC NOD frente a PTC

MED

DE MED DE prueba de t dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-1306

2,97 0,34 0,92 0,46 1,56E-04 -2,05 4,1

hsa-miR-602

3,88 0,51 1,86 0,42 3,32E-04 -2,02 4,0

hsa-miR-135a*

5,61 0,85 3,61 0,32 1,70E-03 -2,00 4,0

hsa-miR-1299

4,40 0,44 2,40 0,90 4,94E-03 -2,00 4,0

hsa-miR-138

6,61 0,71 4,62 1,08 1,57E-02 -1,99 4,0

hsa-miR-124

1,52 1,06 -0,38 0,31 6,07E-03 -1,90 3,7

hsa-miR-1226*

5,72 0,46 3,85 0,48 6,04E-04 -1,87 3,7

hsa-miR-886-5p

0,16 0,98 -1,68 0,30 4,95E-03 -1,84 3,6

hsa-miR-195*

2,04 0,32 0,21 0,87 5,51E-03 -1,83 3,6

hsa-miR-658

1,16 0,56 -0,65 0,32 4,55E-04 -1,82 3,5

hsa-miR-501-3p

4,63 0,23 2,83 0,27 1,35E-05 -1,81 3,5

hsa-miR-33b*

4,27 0,51 2,52 0,25 2,42E-04 -1,75 3,4

hsa-miR-363

6,43 0,54 4,69 0,85 9,80E-03 -1,74 3,3

hsa-miR-194*

1,50 0,63 -0,19 0,55 3,54E-03 -1,69 3,2

hsa-miR-1307

3,37 0,39 1,68 0,58 1,63E-03 -1,69 3,2

hsa-miR-550

3,70 0,30 2,03 0,27 4,86E-05 -1,67 3,2

hsa-miR-1285

3,38 0,58 1,71 0,43 1,58E-03 -1,67 3,2

hsa-miR-1208

3,69 0,27 2,02 1,01 1,56E-02 -1,66 3,2

hsa-miR-125a-3p

7,33 0,40 5,67 0,46 7,04E-04 -1,66 3,2

hsa-miR-144*

5,70 1,02 4,08 0,88 3,79E-02 -1,62 3,1

hsa-miR-612

0,44 0,95 -1,16 0,49 1,29E-02 -1,60 3,0

hsa-miR-664*

6,43 0,81 4,83 0,37 5,40E-03 -1,60 3,0

hsa-miR-513a-5p

5,52 0,43 3,94 0,67 4,62E-03 -1,58 3,0

hsa-miR-1275

8,12 0,52 6,55 0,47 2,04E-03 -1,57 3,0

hsa-miR-184

2,83 0,43 1,27 0,48 1,41E-03 -1,57 3,0

hsa-miR-152

7,76 0,51 6,19 0,48 2,09E-03 -1,57 3,0

hsa-miR-1244

2,06 0,85 0,50 0,47 9,53E-03 -1,57 3,0

hsa-miR-193b*

4,70 0,59 3,15 0,31 1,39E-03 -1,55 2,9

hsa-miR-760

4,31 0,36 2,76 1,00 2,33E-02 -1,54 2,9

hsa-miR-28-3p

2,09 0,21 0,55 0,88 1,16E-02 -1,54 2,9

hsa-miR-639

0,97 0,48 -0,51 0,72 9,83E-03 -1,48 2,8

hsa-miR-345

4,32 0,16 2,86 0,49 7,72E-04 -1,45 2,7

hsa-miR-122

2,20 1,35 0,75 0,22 4,67E-02 -1,45 2,7

miARN

NOD PTC NOD frente a PTC

MED

DE MED DE prueba de t dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-1323

2,66 0,34 1,22 0,35 4,51E-04 -1,44 2,7

hsa-miR-183*

1,38 0,66 -0,03 1,02 4,96E-02 -1,40 2,6

hsa-miR-296-5p

4,51 0,68 3,13 0,22 3,49E-03 -1,38 2,6

hsa-miR-139-5p

6,89 0,32 5,51 0,53 2,63E-03 -1,37 2,6

hsa-miR-518e*

2,03 0,27 0,67 0,38 5,35E-04 -1,36 2,6

hsa-miR-145

10,71 0,24 9,37 0,28 1,30E-04 -1,33 2,5

hsa-miR-876-3p

1,74 0,54 0,41 0,55 8,23E-03 -1,33 2,5

hsa-miR-595

1,81 0,36 0,49 0,32 5,96E-04 -1,33 2,5

hsa-miR-300

0,19 0,55 -1,13 0,26 1,86E-03 -1,32 2,5

hsa-miR-214

9,42 0,44 8,16 0,85 3,21E-02 -1,26 2,4

hsa-miR-1910

-0,66 0,59 -1,90 0,24 3,33E-03 -1,25 2,4

hsa-miR-432

3,26 0,58 2,03 0,77 3,41E-02 -1,23 2,3

hsa-miR-1270

2,47 0,46 1,27 0,39 3,85E-03 -1,21 2,3

hsa-miR-887

4,02 0,29 2,82 0,46 2,74E-03 -1,20 2,3

hsa-miR-652

6,41 0,29 5,22 0,29 5,18E-04 -1,19 2,3

hsa-miR-574-5p

7,52 0,63 6,36 0,28 7,18E-03 -1,16 2,2

hsa-miR-708

2,61 0,40 1,48 0,42 4,83E-03 -1,13 2,2

hsa-miR-512-3p

5,11 0,05 4,04 0,37 7,45E-04 -1,07 2,1

hsa-miR-1826

6,34 0,42 5,33 0,70 3,97E-02 -1,01 2,0

hsa-miR-483-3p

1,44 0,33 0,43 0,35 3,11E-03 -1,01 2,0

hsa-miR-23a*

4,50 0,50 3,49 0,59 2,96E-02 -1,01 2,0

hsa-miR-143

8,32 0,44 7,32 0,28 4,28E-03 -1,00 2,0

hsa-let-7i

13,53 0,24 14,53 0,18 1,77E-04 1,00 2,0

hsa-miR-200c*

1,03 0,53 2,06 0,34 9,62E-03 1,02 2,0

hsa-miR-34b*

6,55 0,45 7,62 0,54 1,60E-02 1,07 2,1

hsa-miR-181a*

3,26 0,41 4,36 0,24 1,51E-03 1,10 2,1

hsa-miR-892b

4,67 0,11 5,77 0,82 3,44E-02 1,10 2,1

hsa-miR-625

5,03 0,21 6,17 0,25 1,78E-04 1,14 2,2

hsa-miR-96

7,09 0,38 8,25 0,45 4,71E-03 1,16 2,2

hsa-miR-181a

10,11 0,48 11,28 0,33 3,28E-03 1,17 2,3

hsa-miR-542-5p

5,62 0,41 6,80 0,87 4,20E-02 1,19 2,3

hsa-miR-1305

7,07 0,50 8,28 0,53 1,03E-02 1,20 2,3

hsa-miR-222*

-0,77 0,35 0,46 0,73 1,78E-02 1,23 2,3

miARN

NOD PTC NOD frente a PTC

MED

DE MED DE prueba de t dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-15a*

0,91 0,35 2,18 0,39 1,47E-03 1,27 2,4

hsa-miR-200a

8,86 0,32 10,22 0,52 2,60E-03 1,36 2,6

hsa-miR-34a*

3,70 0,12 5,07 0,21 8,59E-06 1,37 2,6

hsa-miR-429

7,59 0,20 8,97 0,55 2,10E-03 1,38 2,6

hsa-miR-141*

2,70 0,63 4,09 0,36 4,16E-03 1,39 2,6

hsa-miR-181b

8,16 0,41 9,59 0,52 2,89E-03 1,43 2,7

hsa-miR-542-3p

4,93 0,37 6,39 0,81 1,27E-02 1,46 2,8

hsa-miR-450a

4,07 0,66 5,54 0,74 1,71E-02 1,47 2,8

hsa-miR-15a

10,48 0,47 12,01 0,32 6,22E-04 1,54 2,9

hsa-miR-200b

10,22 0,06 11,78 0,50 5,00E-04 1,55 2,9

hsa-miR-150

8,70 0,28 10,28 1,21 3,99E-02 1,58 3,0

hsa-miR-135b

9,05 0,63 10,66 0,71 9,24E-03 1,61 3,1

hsa-miR-424

8,84 0,42 10,51 0,68 3,60E-03 1,67 3,2

hsa-miR-34a

10,89 0,21 12,59 0,24 1,02E-05 1,70 3,2

hsa-miR-146a

6,97 0,24 8,74 1,29 3,18E-02 1,77 3,4

hsa-miR-503

3,72 0,73 5,74 0,81 6,05E-03 2,02 4,1

hsa-miR-29b-1*

3,36 0,34 5,53 0,38 4,45E-05 2,17 4,5

hsa-miR-142-5p

4,15 0,97 6,34 1,33 2,84E-02 2,19 4,6

hsa-miR-514

0,68 0,46 2,93 0,86 2,21E-03 2,26 4,8

hsa-miR-155

5,86 0,20 8,15 0,89 1,55E-03 2,29 4,9

hsa-miR-1260

6,50 0,87 8,82 0,47 1,35E-03 2,32 5,0

hsa-miR-181a-2*

3,90 0,52 6,23 0,66 6,88E-04 2,33 5,0

hsa-miR-21*

4,43 0,17 6,77 0,63 1,87E-04 2,34 5,1

hsa-miR-21

13,28 0,37 15,85 0,45 3,80E-05 2,57 5,9

hsa-miR-720

10,25 0,79 12,95 0,34 2,14E-04 2,70 6,5

hsa-miR-375

4,00 2,15 6,74 1,20 4,45E-02 2,74 6,7

hsa-miR-142-3p

7,20 1,09 9,95 1,39 1,45E-02 2,75 6,7

hsa-miR-1274b

8,53 0,95 11,33 0,39 5,04E-04 2,80 7,0

hsa-miR-1274a

4,74 1,03 7,71 0,50 7,32E-04 2,97 7,8

hsa-miR-31

6,80 1,81 10,14 0,64 5,96E-03 3,34 10,1

hsa-miR-31*

5,23 1,63 8,58 0,56 3,42E-03 3,35 10,2

hsa-miR-221*

5,14 0,24 8,71 0,86 9,54E-05 3,57 11,9

hsa-miR-222

6,60 0,81 10,25 0,58 1,01E-04 3,65 12,6

miARN

NOD PTC NOD frente a PTC

MED

DE MED DE prueba de t dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-221

6,94 0,35 10,60 0,73 3,82E-05 3,66 12,7

hsa-miR-551b

5,32 0,11 9,98 0,58 1,09E-06 4,65 25,2

hsa-miR-146b-3p

-1,13 0,41 3,73 1,12 8,22E-05 4,85 28,9

hsa-miR-146b-5p

7,65 0,79 14,41 0,92 8,03E-06 6,76 108,5

EJEMPLO 12 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE LOS NÓDULOS TIROIDEOS HIPERPLÁSICOS Y LA

VARIANTE FOLICULAR DEL CARCINOMA PAPILAR DE TIROIDES

5 Un total de 195 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre muestras de nódulo hiperplásico y los especímenes de la variante folicular del carcinoma papilar de tiroides (p<0,05) (tabla 14). Entre estos, 40 miARN estaban sobreexpresados (dif. Log2 (FVPTC frente a NOD) ≥ 1) y 117 estaban subexpresados (dif Log2 (FVPTC frente a NOD) ≤1) en al menos 2 veces en muestras de FVPTC en comparación con NOD. De estos, hsa-miR-146b-5p estaba sobreexpresado en más de 40 veces y once miARN (hsa-miR--51b, -146b-3p, -31, -221,

10 31*, -222, -221*, -1274a, -1274b, -720 y -503) estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces en los especímenes de FVPTC. Entre los miARN que se expresaron a niveles medios menores en las muestras de PTC, cuatro (hsa-miR92b, -631, -551b* y -934) estaban subexpresados de 10 a 20 veces y treinta y tres miARN estaban subexpresados de 5 a 10 veces en los especímenes de FVPTC en comparación con las muestras de NOD.

Tabla 14. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FVPTC y de NOD. MED, 15 expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

NOD FVPTC FVPTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-146b-5p

7,65 0,79 13,20 1,09 1,70E-04 5,56 47,0

hsa-miR-551b

5,32 0,11 8,99 0,76 7,57E-05 3,66 12,7

hsa-miR-146b-3p

-1,13 0,41 2,46 1,30 1,90E-03 3,59 12,0

hsa-miR-31

6,80 1,81 10,06 1,12 2,21E-02 3,26 9,6

hsa-miR-221

6,94 0,35 10,19 0,98 7,90E-04 3,26 9,6

hsa-miR-31*

5,23 1,63 8,47 1,06 1,59E-02 3,23 9,4

hsa-miR-222

6,60 0,81 9,66 0,79 1,66E-03 3,06 8,4

hsa-miR-221*

5,14 0,24 8,06 0,85 5,89E-04 2,92 7,6

hsa-miR-1274a

4,74 1,03 7,40 0,66 5,01E-03 2,65 6,3

hsa-miR-1274b

8,53 0,95 11,10 0,59 3,72E-03 2,57 5,9

hsa-miR-720

10,25 0,79 12,82 0,50 1,49E-03 2,57 5,9

hsa-miR-503

3,72 0,73 6,07 1,04 1,01E-02 2,35 5,1

hsa-miR-21*

4,43 0,17 6,73 0,32 1,49E-05 2,30 4,9

hsa-miR-142-3p

7,20 1,09 9,30 1,25 4,44E-02 2,10 4,3

hsa-miR-542-3p

4,93 0,37 7,01 1,32 2,26E-02 2,08 4,2

hsa-miR-1260

6,50 0,87 8,51 0,59 8,78E-03 2,01 4,0

miARN

NOD FVPTC FVPTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-181a-2*

3,90 0,52 5,91 1,15 1,89E-02 2,00 4,0

hsa-miR-29b-1*

3,36 0,34 5,34 0,41 2,89E-04 1,98 3,9

hsa-miR-424

8,84 0,42 10,75 1,38 3,82E-02 1,91 3,8

hsa-miR-542-5p

5,62 0,41 7,34 1,07 2,37E-02 1,72 3,3

hsa-miR-21

13,28 0,37 14,94 0,64 4,05E-03 1,66 3,2

hsa-miR-146a

6,97 0,24 8,61 1,03 2,11E-02 1,64 3,1

hsa-miR-222*

-0,77 0,35 0,85 0,42 1,01E-03 1,62 3,1

hsa-miR-155

5,86 0,20 7,48 0,68 3,79E-03 1,62 3,1

hsa-miR-200b

10,22 0,06 11,82 0,67 3,26E-03 1,60 3,0

hsa-miR-429

7,59 0,20 9,17 0,77 7,30E-03 1,59 3,0

hsa-miR-34a

10,89 0,21 12,33 0,27 1,42E-04 1,44 2,7

hsa-miR-200a

8,86 0,32 10,20 0,62 8,20E-03 1,34 2,5

hsa-miR-181b

8,16 0,41 9,48 0,84 2,97E-02 1,33 2,5

hsa-miR-15a

10,48 0,47 11,73 0,60 1,67E-02 1,25 2,4

hsa-miR-15a*

0,91 0,35 2,07 0,52 1,03E-02 1,16 2,2

hsa-miR-509-3-5p

-0,64 0,34 0,49 0,65 2,10E-02 1,14 2,2

hsa-let-7i

13,53 0,24 14,62 0,43 4,69E-03 1,09 2,1

hsa-miR-450b-5p

0,53 0,33 1,61 0,81 4,99E-02 1,07 2,1

hsa-miR-886-3p

8,15 0,52 9,21 0,51 2,81E-02 1,06 2,1

hsa-miR-34a*

3,70 0,12 4,76 0,31 7,14E-04 1,05 2,1

hsa-miR-211

0,30 0,50 1,36 0,41 1,77E-02 1,05 2,1

hsa-miR-200a*

4,34 0,33 5,38 0,59 2,16E-02 1,04 2,1

hsa-miR-200c*

1,03 0,53 2,07 0,45 2,51E-02 1,03 2,0

hsa-let-7e*

1,65 0,54 2,67 0,53 3,61E-02 1,02 2,0

hsa-miR-1270

2,47 0,46 1,45 0,61 3,66E-02 -1,03 2,0

hsa-miR-1301

1,60 0,30 0,53 0,77 4,02E-02 -1,07 2,1

hsa-miR-28-3p

2,09 0,21 1,00 0,24 5,11E-04 -1,09 2,1

hsa-miR-296-5p

4,51 0,68 3,36 0,54 3,93E-02 -1,15 2,2

hsa-miR-210

6,41 0,24 5,26 0,39 2,47E-03 -1,15 2,2

hsa-miR-513a-5p

5,52 0,43 4,37 0,17 2,54E-03 -1,15 2,2

hsa-miR-658

1,16 0,56 -0,02 0,28 9,21E-03 -1,18 2,3

hsa-miR-194*

1,50 0,63 0,30 0,10 9,44E-03 -1,19 2,3

hsa-miR-345

4,32 0,16 3,11 0,68 1,39E-02 -1,20 2,3

miARN

NOD FVPTC FVPTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-550

3,70 0,30 2,49 0,55 8,02E-03 -1,21 2,3

hsa-miR-432

3,26 0,58 2,04 0,63 2,92E-02 -1,22 2,3

hsa-miR-125a-3p

7,33 0,40 6,11 0,06 9,03E-04 -1,22 2,3

hsa-miR-664*

6,43 0,81 5,17 0,37 3,05E-02 -1,25 2,4

hsa-miR-1280

7,64 0,87 6,37 0,55 4,89E-02 -1,27 2,4

hsa-miR-1306

2,97 0,34 1,68 0,13 4,01E-04 -1,28 2,4

hsa-miR-193b*

4,70 0,59 3,41 0,46 1,38E-02 -1,29 2,4

hsa-miR-139-5p

6,89 0,32 5,57 0,68 1,31E-02 -1,31 2,5

hsa-miR-152

7,76 0,51 6,38 0,23 2,53E-03 -1,38 2,6

hsa-miR-298

1,93 0,38 0,52 0,93 3,11E-02 -1,40 2,6

hsa-miR-33b*

4,27 0,51 2,82 0,44 4,91E-03 -1,46 2,7

hsa-miR-1249

5,93 0,74 4,46 0,77 3,28E-02 -1,47 2,8

hsa-miR-424*

5,34 0,66 3,83 0,91 3,61E-02 -1,51 2,9

hsa-miR-760

4,31 0,36 2,76 0,33 7,18E-04 -1,55 2,9

hsa-miR-557

6,23 0,77 4,68 0,65 2,18E-02 -1,55 2,9

hsa-miR-602

3,88 0,51 2,32 0,47 4,09E-03 -1,56 3,0

hsa-miR-640

1,49 0,46 -0,07 0,79 1,41E-02 -1,57 3,0

hsa-miR-769-3p

3,34 0,64 1,76 0,44 6,54E-03 -1,58 3,0

hsa-miR-1307

3,37 0,39 1,77 0,52 2,76E-03 -1,60 3,0

hsa-miR-584

4,38 0,49 2,77 0,95 2,31E-02 -1,61 3,1

hsa-miR-124

1,52 1,06 -0,10 0,41 2,86E-02 -1,62 3,1

hsa-miR-501-3p

4,63 0,23 3,01 0,18 3,06E-05 -1,62 3,1

hsa-miR-518a-5p

2,05 0,65 0,40 0,87 2,26E-02 -1,65 3,1

hsa-miR-1250

1,91 0,52 0,22 0,81 1,27E-02 -1,69 3,2

hsa-miR-1285

3,38 0,58 1,68 0,67 8,49E-03 -1,70 3,3

hsa-miR-1308

10,04 0,87 8,34 0,99 4,15E-02 -1,70 3,3

hsa-miR-877*

4,73 0,40 3,03 0,31 5,35E-04 -1,71 3,3

hsa-miR-1471

5,53 0,37 3,83 0,89 1,22E-02 -1,71 3,3

hsa-miR-583

2,59 0,74 0,88 0,95 2,94E-02 -1,71 3,3

hsa-miR-127-5p

1,28 0,35 -0,44 0,41 6,91E-04 -1,72 3,3

hsa-miR-518c*

2,24 0,52 0,52 0,72 8,11E-03 -1,72 3,3

hsa-miR-370

3,80 0,49 2,08 1,06 2,52E-02 -1,73 3,3

hsa-miR-138

6,61 0,71 4,85 0,81 1,69E-02 -1,76 3,4

miARN

NOD FVPTC FVPTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1226*

5,72 0,46 3,94 0,25 5,17E-04 -1,78 3,4

hsa-miR-575

10,16 0,66 8,34 0,42 3,54E-03 -1,82 3,5

hsa-miR-1208

3,69 0,27 1,83 0,93 8,66E-03 -1,86 3,6

hsa-miR-525-5p

2,15 0,49 0,27 0,60 2,85E-03 -1,88 3,7

hsa-miR-662

3,58 0,21 1,69 0,36 9,68E-05 -1,89 3,7

hsa-miR-614

2,05 0,67 0,15 0,41 2,83E-03 -1,90 3,7

hsa-miR-654-5p

4,06 0,36 2,15 0,43 4,75E-04 -1,90 3,7

hsa-miR-188-5p

7,46 0,63 5,53 0,82 9,83E-03 -1,93 3,8

hsa-miR-516b

2,78 0,32 0,84 0,74 3,05E-03 -1,93 3,8

hsa-miR-490-5p

3,39 0,29 1,44 0,66 1,66E-03 -1,95 3,9

hsa-miR-199b-5p

9,26 0,23 7,31 0,64 1,21E-03 -1,95 3,9

hsa-miR-605

3,72 1,03 1,74 1,12 4,08E-02 -1,98 3,9

hsa-miR-1180

3,54 0,41 1,53 0,70 2,58E-03 -2,01 4,0

hsa-miR-566

3,15 0,92 1,14 0,67 1,23E-02 -2,01 4,0

hsa-miR-1303

1,71 0,56 -0,30 1,02 1,36E-02 -2,01 4,0

hsa-miR-498

3,77 0,49 1,75 0,56 1,67E-03 -2,02 4,1

hsa-miR-610

4,46 0,57 2,43 0,93 9,99E-03 -2,03 4,1

hsa-miR-373*

3,17 0,97 1,09 0,50 8,77E-03 -2,09 4,2

hsa-miR-1915

10,06 0,49 7,97 0,48 8,78E-04 -2,09 4,3

hsa-miR-1469

3,39 0,42 1,27 0,67 1,78E-03 -2,12 4,4

hsa-miR-490-3p

1,74 0,41 -0,38 0,84 3,95E-03 -2,12 4,4

hsa-miR-877

4,47 0,65 2,34 0,85 7,32E-03 -2,13 4,4

hsa-miR-601

5,60 0,53 3,46 0,87 5,55E-03 -2,14 4,4

hsa-miR-1291

2,99 0,68 0,85 0,93 9,84E-03 -2,14 4,4

hsa-miR-134

8,00 0,93 5,83 1,03 2,01E-02 -2,17 4,5

hsa-miR-202

7,06 0,56 4,89 0,85 5,26E-03 -2,17 4,5

hsa-miR-939

8,91 0,42 6,74 0,52 6,38E-04 -2,17 4,5

hsa-miR-1228*

1,90 0,73 -0,27 1,16 1,90E-02 -2,18 4,5

hsa-miR-671-5p

7,24 0,57 5,06 0,98 8,44E-03 -2,18 4,5

hsa-miR-526b

3,54 0,53 1,34 1,11 1,18E-02 -2,20 4,6

hsa-miR-622

5,23 0,37 3,01 0,81 2,42E-03 -2,23 4,7

hsa-miR-483-5p

8,47 0,79 6,22 1,20 2,05E-02 -2,25 4,8

hsa-miR-659

5,53 0,63 3,28 0,92 6,76E-03 -2,25 4,8

miARN

NOD FVPTC FVPTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-639

0,97 0,48 -1,31 0,68 1,53E-03 -2,28 4,9

hsa-miR-921

1,67 0,51 -0,63 1,15 1,08E-02 -2,30 4,9

hsa-miR-1224-5p

7,60 0,65 5,30 0,72 3,22E-03 -2,30 4,9

hsa-miR-422a

3,64 0,36 1,34 1,23 1,15E-02 -2,30 4,9

hsa-miR-371-5p

6,14 0,47 3,83 0,78 2,29E-03 -2,31 5,0

hsa-miR-940

8,91 0,72 6,58 0,36 1,21E-03 -2,32 5,0

hsa-miR-1225-5p

11,79 0,95 9,47 1,01 1,54E-02 -2,32 5,0

hsa-miR-1276

2,01 0,65 -0,35 0,81 3,85E-03 -2,36 5,1

hsa-miR-1207-5p

11,83 1,05 9,46 1,03 1,79E-02 -2,37 5,2

hsa-miR-617

3,26 0,35 0,87 0,83 1,80E-03 -2,39 5,2

hsa-miR-302c*

1,62 0,71 -0,79 0,40 1,05E-03 -2,41 5,3

hsa-miR-873

3,30 0,83 0,89 1,45 2,81E-02 -2,41 5,3

hsa-miR-1203

2,45 0,50 0,04 0,98 4,72E-03 -2,41 5,3

hsa-miR-1321

3,74 0,75 1,29 0,74 3,54E-03 -2,45 5,5

hsa-miR-1183

6,22 0,69 3,77 0,86 4,36E-03 -2,45 5,5

hsa-miR-198

4,90 0,65 2,44 1,28 1,42E-02 -2,46 5,5

hsa-miR-150*

7,49 0,70 5,00 0,77 2,97E-03 -2,50 5,6

hsa-miR-638

10,95 1,00 8,45 0,73 6,77E-03 -2,50 5,6

hsa-miR-616

1,69 0,53 -0,82 0,98 4,07E-03 -2,50 5,7

hsa-miR-1182

4,76 0,77 2,24 1,06 8,27E-03 -2,53 5,8

hsa-miR-765

6,63 0,70 4,00 1,15 7,77E-03 -2,63 6,2

hsa-miR-572

7,90 1,01 5,22 0,76 5,47E-03 -2,69 6,4

hsa-miR-623

4,95 0,55 2,25 1,11 4,71E-03 -2,71 6,5

hsa-miR-1268

10,19 1,33 7,45 0,90 1,42E-02 -2,74 6,7

hsa-miR-34c-3p

1,72 0,30 -1,06 0,54 1,05E-04 -2,78 6,9

hsa-miR-204

8,22 0,45 5,44 2,07 3,92E-02 -2,78 6,9

hsa-miR-1909*

2,64 0,78 -0,17 0,40 6,76E-04 -2,81 7,0

hsa-miR-138-1*

1,32 0,49 -1,51 0,57 2,83E-04 -2,83 7,1

hsa-miR-663

8,63 0,75 5,77 1,09 4,93E-03 -2,87 7,3

hsa-miR-187*

4,73 0,70 1,85 0,71 1,18E-03 -2,88 7,4

hsa-miR-648

4,14 0,46 1,22 1,33 6,09E-03 -2,92 7,6

hsa-miR-149*

4,68 0,59 1,62 1,06 2,37E-03 -3,06 8,4

hsa-miR-493

2,93 0,73 -0,16 1,28 5,71E-03 -3,09 8,5

miARN

NOD FVPTC FVPTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1915*

2,26 0,54 -0,87 0,78 5,83E-04 -3,13 8,7

hsa-miR-1202

13,75 0,81 10,61 1,63 1,36E-02 -3,13 8,8

hsa-miR-1300

7,80 0,79 4,60 1,19 4,21E-03 -3,20 9,2

hsa-miR-936

4,55 0,65 1,33 1,65 1,10E-02 -3,22 9,3

hsa-miR-129-5p

2,48 0,82 -0,79 1,02 2,49E-03 -3,26 9,6

hsa-miR-934

2,09 0,71 -1,42 1,12 1,83E-03 -3,51 11,4

hsa-miR-551b*

2,72 0,65 -0,79 0,69 3,15E-04 -3,51 11,4

hsa-miR-631

3,97 0,56 0,26 1,72 6,31E-03 -3,71 13,1

hsa-miR-92b*

2,96 0,56 -1,31 1,31 9,66E-04 -4,27 19,3

EJEMPLO 13

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE LOS NÓDULOS TIROIDEOS HIPERPLÁSICOS Y EL CARCINOMA ANAPLÁSICO DE TIROIDES

5 Un total de 166 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de nódulo hiperplásico y los carcinomas anaplásicos de tiroides (p<0,05). Entre estos, 29 miARN estaban sobreexpresados (dif. Log2 (ATC frente a NOD) ≥ 1) y 121 estaban subexpresados (dif Log2 (ATC frente a NOD) ≤1) en al menos 2 veces en muestras de ATC en comparación con NOD (tabla 15). De estos, hsa-miR-9*, -582-3p y 582-5p estaban sobreexpresados de 30 a 50 veces, seis miARN (hsa-miR-1274a, -155, -720, -1274b, -9 y -1260)

10 estaban sobreexpresados de 10 a 30 veces y seis miARN (hsa-miR-34c-5p, -592, -10a, -21, -21* y -210) estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces en el espécimen de ATC en comparación con las muestras de NOD. Entre los miARN que se expresaron a niveles medios menores en la muestra de ATC, nueve (hsa-miR-200c, -141, -429, 200a, -200b, -135a, -135b, -138 y -205) estaban subexpresados de 80 a 300 veces, seis miARN (hsa-miR-92b, -7-2*, -512-3p, -934, -200b* y -141*) estaban subexpresados de 20 a 35 veces, diez miARN estaban subexpresados de 10

15 a 20 veces y cuarenta miARN estaban subexpresados de 5 a 10 veces en el espécimen de ATC en comparación con las muestras de NOD.

Tabla 15. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de ATC y de NOD. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

NOD ATC ATC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-9*

1,57 0,18 7,14 1,01E-04 5,57 47,6

hsa-miR-582-3p

-1,38 0,31 3,97 5,78E-04 5,35 40,9

hsa-miR-582-5p

3,22 0,58 8,42 3,98E-03 5,21 36,9

hsa-miR-1274a

4,74 1,03 9,62 2,44E-02 4,88 29,5

hsa-miR-155

5,86 0,20 10,25 2,90E-04 4,39 20,9

hsa-miR-720

10,25 0,79 14,50 1,69E-02 4,25 19,0

hsa-miR-1274b

8,53 0,95 12,63 3,07E-02 4,10 17,1

hsa-miR-9

1,10 0,38 5,05 2,54E-03 3,95 15,5

hsa-miR-1260

6,50 0,87 9,84 4,22E-02 3,33 10,1

hsa-miR-34c-5p

4,07 0,83 7,37 3,76E-02 3,29 9,8

miARN

NOD ATC ATC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-592

1,71 0,29 4,74 2,61E-03 3,03 8,2

hsa-miR-10a

7,62 0,10 10,38 1,63E-04 2,76 6,8

hsa-miR-21

13,28 0,37 16,00 6,96E-03 2,72 6,6

hsa-miR-21*

4,43 0,17 7,10 7,59E-04 2,67 6,4

hsa-miR-210

6,41 0,24 8,74 3,30E-03 2,32 5,0

hsa-miR-155*

-0,06 0,15 1,88 1,28E-03 1,94 3,8

hsa-miR-34b*

6,55 0,45 8,43 3,29E-02 1,88 3,7

hsa-miR-769-5p

4,63 0,21 6,42 4,76E-03 1,80 3,5

hsa-miR-196a

1,79 0,40 3,56 2,87E-02 1,77 3,4

hsa-miR-30a*

8,56 0,34 10,32 1,95E-02 1,77 3,4

hsa-miR-146a

6,97 0,24 8,68 7,38E-03 1,71 3,3

hsa-miR-29b-1*

3,36 0,34 5,05 2,05E-02 1,69 3,2

hsa-miR-550*

2,77 0,24 4,14 1,47E-02 1,36 2,6

hsa-miR-10a*

1,13 0,36 2,44 4,83E-02 1,31 2,5

hsa-miR-223*

0,82 0,32 2,11 3,55E-02 1,29 2,4

hsa-miR-27a

11,74 0,32 12,98 4,06E-02 1,24 2,4

hsa-miR-556-3p

0,36 0,32 1,55 4,38E-02 1,19 2,3

hsa-miR-625

5,03 0,21 6,12 1,88E-02 1,09 2,1

hsa-miR-342-5p

4,85 0,25 5,91 3,13E-02 1,06 2,1

hsa-miR-423-3p

3,59 0,14 2,56 7,23E-03 -1,02 2,0

hsa-miR-30d*

2,17 0,28 1,12 4,46E-02 -1,05 2,1

hsa-miR-192*

1,68 0,23 0,63 2,68E-02 -1,06 2,1

hsa-miR-652

6,41 0,29 5,34 4,82E-02 -1,06 2,1

hsa-miR-30b*

4,30 0,31 3,11 4,21E-02 -1,19 2,3

hsa-miR-216a

0,39 0,07 -0,81 6,49E-04 -1,20 2,3

hsa-miR-199b-5p

9,26 0,23 7,97 1,48E-02 -1,29 2,4

hsa-miR-222*

-0,77 0,35 -2,06 4,47E-02 -1,29 2,4

hsa-miR-130a

11,54 0,35 10,22 4,37E-02 -1,32 2,5

hsa-miR-151-5p

10,54 0,29 9,21 2,62E-02 -1,33 2,5

hsa-miR-615-3p

0,33 0,29 -1,03 2,54E-02 -1,35 2,6

hsa-miR-564

5,89 0,30 4,52 2,60E-02 1,37 2,6

hsa-miR-29c*

7,53 0,34 6,15 3,62E-02 -1,38 2,6

hsa-miR-138-2*

2,41 0,31 1,03 2,79E-02 -1,38 2,6

miARN

NOD ATC ATC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-654-5p

4,06 0,36 2,67 3,99E-02 -1,39 2,6

hsa-miR-595

1,81 0,36 0,42 4,01E-02 -1,39 2,6

hsa-miR-760

4,31 0,36 2,89 3,97E-02 -1,41 2,7

hsa-miR-338-5p

2,47 0,30 1,05 2,31E-02 -1,42 2,7

hsa-miR-1306

2,97 0,34 1,49 3,01E-02 -1,48 2,8

hsa-miR-518e*

2,03 0,27 0,53 1,53E-02 -1,49 2,8

hsa-miR-127-5p

1,28 0,35 -0,22 3,15E-02 -1,50 2,8

hsa-miR-30d

10,43 0,25 8,94 1,24E-02 -1,50 2,8

hsa-let-7i

13,53 0,24 11,99 1,06E-02 -1,54 2,9

hsa-miR-668

-0,54 0,32 -2,09 2,35E-02 -1,55 2,9

hsa-miR-423-5p

7,16 0,31 5,61 2,03E-02 -1,55 2,9

hsa-miR-877*

4,73 0,40 3,14 3,81E-02 -1,59 3,0

hsa-miR-542-3p

4,93 0,37 3,33 3,07E-02 -1,60 3,0

hsa-miR-744*

0,59 0,36 -1,03 2,71E-02 -1,62 3,1

hsa-miR-490-3p

1,74 0,41 0,11 3,76E-02 -1,63 3,1

hsa-miR-92a

9,41 0,35 7,77 2,48E-02 -1,64 3,1

hsa-miR-939

8,91 0,42 7,27 3,95E-02 -1,64 3,1

hsa-miR-513a-5p

5,52 0,43 3,86 4,11E-02 -1,66 3,2

hsa-miR-542-5p

5,62 0,41 3,91 3,43E-02 -1,71 3,3

hsa-miR-708

2,61 0,40 0,87 3,12E-02 -1,73 3,3

hsa-miR-99b*

2,95 0,29 1,20 1,23E-02 -1,75 3,4

hsa-miR-509-5p

1,19 0,42 -0,56 3,45E-02 -1,75 3,4

hsa-miR-498

3,77 0,49 2,00 4,93E-02 -1,76 3,4

hsa-miR-1307

3,37 0,39 1,57 2,63E-02 -1,80 3,5

hsa-miR-455-5p

4,20 0,25 2,32 6,39E-03 -1,88 3,7

hsa-miR-30b

11,67 0,45 9,75 3,16E-02 -1,93 3,8

hsa-miR-518c*

2,24 0,52 0,28 4,27E-02 -1,96 3,9

hsa-miR-370

3,80 0,49 1,84 3,68E-02 -1,96 3,9

hsa-miR-1226*

5,72 0,46 3,75 3,18E-02 -1,97 3,9

hsa-miR-1826

6,34 0,42 4,37 2,44E-02 -1,97 3,9

hsa-miR-617

3,26 0,35 1,28 1,48E-02 -1,98 3,9

hsa-miR-584

4,38 0,49 2,38 3,46E-02 -2,00 4,0

hsa-let-7c

12,72 0,15 10,68 1,18E-03 -2,04 4,1

miARN

NOD ATC ATC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-616

1,69 0,53 -0,36 4,10E-02 -2,05 4,1

hsa-miR-516b

2,78 0,32 0,72 1,01E-02 -2,06 4,2

hsa-let-7g*

-0,02 0,56 -2,14 4,34E-02 -2,12 4,4

hsa-miR-26a

12,50 0,35 10,36 1,18E-02 -2,14 4,4

hsa-miR-1915

10,06 0,49 7,91 2,98E-02 -2,15 4,4

hsa-miR-874

6,97 0,13 4,78 5,77E-04 -2,19 4,6

hsa-miR-671-5p

7,24 0,57 5,05 4,09E-02 -2,19 4,6

hsa-miR-585

2,68 0,61 0,44 4,74E-02 -2,24 4,7

hsa-miR-1471

5,53 0,37 3,24 1,13E-02 -2,29 4,9

hsa-miR-526b

3,54 0,53 1,18 2,90E-02 -2,36 5,1

hsa-miR-202

7,06 0,56 4,70 3,31E-02 -2,36 5,1

hsa-miR-662

3,58 0,21 1,17 1,94E-03 -2,42 5,3

hsa-miR-126

12,43 0,25 10,01 3,28E-03 -2,42 5,3

hsa-miR-1270

2,47 0,46 0,05 1,84E-02 -2,43 5,4

hsa-miR-601

5,60 0,53 3,16 2,57E-02 -2,43 5,4

hsa-miR-648

4,14 0,46 1,64 1,67E-02 -2,49 5,6

hsa-miR-936

4,55 0,65 2,05 4,06E-02 -2,50 5,6

hsa-miR-100

11,66 0,24 9,15 2,54E-03 -2,50 5,7

hsa-miR-1301

1,60 0,30 -0,92 4,69E-03 -2,52 5,7

hsa-miR-640

1,49 0,46 -1,06 1,54E-02 -2,56 5,9

hsa-miR-665

4,46 0,24 1,87 2,25E-03 -2,59 6,0

hsa-miR-1915*

2,26 0,54 -0,36 2,29E-02 -2,62 6,1

hsa-miR-143*

3,99 0,50 1,36 1,84E-02 -2,64 6,2

hsa-miR-345

4,32 0,16 1,63 6,01E-04 -2,69 6,4

hsa-miR-490-5p

3,39 0,29 0,69 3,77E-03 -2,70 6,5

hsa-miR-551b

5,32 0,11 2,61 1,78E-04 -2,71 6,5

hsa-miR-1299

4,40 0,44 1,68 1,17E-02 -2,72 6,6

hsa-miR-1208

3,69 0,27 0,87 2,76E-03 -2,81 7,0

hsa-miR-1203

2,45 0,50 -0,39 1,45E-02 -2,84 7,2

hsa-miR-1303

1,71 0,56 -1,15 1,96E-02 -2,86 7,3

hsa-miR-921

1,67 0,51 -1,27 1,44E-02 -2,94 7,7

hsa-miR-125b-2*

5,61 0,18 2,65 7,20E-04 -2,95 7,7

hsa-miR-1276

2,01 0,65 -0,95 2,64E-02 -2,96 7,8

miARN

NOD ATC ATC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-451

14,94 0,59 11,96 2,05E-02 -2,98 7,9

hsa-miR-149*

4,68 0,59 1,68 1,98E-02 -3,00 8,0

hsa-miR-145*

5,38 0,42 2,37 7,79E-03 -3,01 8,0

hsa-miR-143

8,32 0,44 5,31 8,87E-03 -3,01 8,1

hsa-miR-99a*

1,28 0,70 -1,76 3,01E-02 -3,04 8,2

hsa-miR-491-5p

1,71 0,41 -1,33 6,81E-03 -3,04 8,3

hsa-miR-551b*

2,72 0,65 -0,34 2,47E-02 -3,07 8,4

hsa-miR-452

4,64 0,41 1,57 6,66E-03 -3,07 8,4

hsa-miR-424*

5,34 0,66 2,24 2,46E-02 -3,10 8,6

hsa-miR-1228*

1,90 0,73 -1,22 3,15E-02 -3,12 8,7

hsa-miR-1250

1,91 0,52 -1,24 1,22E-02 -3,16 8,9

hsa-miR-1180

3,54 0,41 0,37 6,15E-03 -3,17 9,0

hsa-miR-138-1*

1,32 0,49 -1,86 1,04E-02 -3,19 9,1

hsa-miR-218

8,23 0,27 5,04 1,89E-03 -3,19 9,1

hsa-miR-224

5,70 0,20 2,46 7,12E-04 -3,24 9,4

hsa-miR-486-5p

8,61 0,71 5,35 2,59E-02 -3,26 9,6

hsa-miR-125b

13,93 0,24 10,44 9,63E-04 -3,48 11,2

hsa-miR-99a

11,53 0,24 8,00 9,00E-04 -3,53 11,6

hsa-miR-631

3,97 0,56 0,20 9,12E-03 -3,78 13,7

hsa-miR-200a*

4,34 0,33 0,46 1,79E-03 -3,88 14,7

hsa-miR-422a

3,64 0,36 -0,25 2,30E-03 -3,89 14,8

hsa-miR-493

2,93 0,73 -0,99 1,73E-02 -3,92 15,1

hsa-miR-145

10,71 0,24 6,78 6,83E-04 -3,93 15,2

hsa-miR-486-3p

2,16 1,04 -1,82 4,19E-02 -3,98 15,8

hsa-miR-139-5p

6,89 0,32 2,79 1,40E-03 -4,09 17,0

hsa-miR-1469

3,39 0,42 -0,80 3,04E-03 -4,19 18,3

hsa-miR-141*

2,70 0,63 -1,68 8,48E-03 -4,38 20,8

hsa-miR-200b*

4,90 0,29 0,48 8,18E-04 -4,42 21,4

hsa-miR-934

2,09 0,71 -2,40 1,07E-02 -4,49 22,5

hsa-miR-512-3p

5,11 0,05 0,39 3,03E-06 -4,72 26,3

hsa-miR-7-2*

3,76 1,18 -1,00 3,65E-02 -4,76 27,2

hsa-miR-92b*

2,96 0,56 -2,10 3,91E-03 -5,06 33,4

hsa-miR-205

4,49 0,38 -1,95 6,21E-04 -6,44 86,5

miARN

NOD ATC ATC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-138

6,61 0,71 0,09 3,77E-03 -6,52 91,7

hsa-miR-135b

9,05 0,63 2,20 2,30E-03 -6,85 115,3

hsa-miR-135a

8,06 0,99 1,19 8,34E-03 -6,87 117,0

hsa-miR-200b

10,22 0,06 2,93 1,68E-06 -7,29 156,7

hsa-miR-200a

8,86 0,32 1,45 2,36E-04 -7,41 169,8

hsa-miR-429

7,59 0,20 -0,05 5,74E-05 -7,64 199,7

hsa-miR-141

10,73 0,55 2,51 9,18E-04 -8,21 297,0

hsa-miR-200c

11,37 0,32 3,00 1,79E-04 -8,36 329,5

EJEMPLO 14

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE LOS NÓDULOS TIROIDEOS HIPERPLÁSICOS Y EL

CARCINOMA MEDULAR DE TIROIDES

Un total de 222 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de

5 nódulo hiperplásico y los carcinomas medulares de tiroides (p<0,05). Entre estos, 108 miARN estaban sobreexpresados (dif. Log2 (MTC frente a NOD) ≥ 1) y 79 estaban subexpresados (dif Log2 (MTC frente a NOD) ≤1) en al menos 2 veces en muestras de MTC en comparación con NOD (tabla 16). De estos, hsa-miR-375 estaba sobreexpresado en más de 900 veces, seis miARN (hsa-miR-153, -323-3p, -124, -487b, -410 y -592) estaban sobreexpresados de 50 a 110 veces, treinta y cinco miARN estaban sobreexpresados de 10 a 30 veces y veintitrés

10 miARN estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces en los especímenes de MTC en comparación con las muestras de NOD. Entre los miARN que se expresaron a niveles medios menores en las muestras de MTC, hsa-miR-92b* y hsamiR-1202 estaban subexpresados de 10 a 15 veces y diecinueve miARN estaban subexpresados de 5 a 10 veces en los especímenes de MTC.

Tabla 16. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de MTC y de NOD. MED, 15 expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

MTC NOD MTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-375

13,86 0,40 4,00 2,15 5,95E-04 9,87 933,7

hsa-miR-153

8,11 1,07 1,40 0,85 2,38E-04 6,71 104,7

hsa-miR-323-3p

6,93 0,13 0,37 0,78 3,24E-05 6,56 94,2

hsa-miR-124

7,86 3,11 1,52 1,06 1,15E-02 6,34 80,9

hsa-miR-487b

9,75 0,19 3,63 1,15 3,01E-04 6,11 69,3

hsa-miR-410

8,20 0,14 2,16 1,00 1,61E-04 6,03 65,6

hsa-miR-592

7,50 1,19 1,71 0,29 2,02E-04 5,79 55,4

hsa-miR-539

6,53 0,34 1,75 0,35 9,38E-06 4,78 27,4

hsa-miR-758

5,04 0,13 0,34 1,07 7,33E-04 4,69 25,8

hsa-miR-409-5p

4,92 0,15 0,31 1,08 8,22E-04 4,62 24,5

hsa-miR-487a

4,79 0,32 0,19 0,60 7,31E-05 4,60 24,2

hsa-miR-409-3p

7,21 0,31 2,64 1,02 7,34E-04 4,58 23,9

miARN

MTC NOD MTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-137

5,03 3,11 0,46 0,60 3,16E-02 4,57 23,7

hsa-miR-433

4,13 0,61 -0,44 0,89 6,41E-04 4,56 23,7

hsa-miR-127-3p

8,88 0,37 4,47 0,97 7,24E-04 4,42 21,4

hsa-miR-183

10,49 0,69 6,08 0,43 1,33E-04 4,42 21,4

hsa-miR-485-3p

4,27 0,37 -0,10 0,54 7,49E-05 4,37 20,7

hsa-miR-382

6,53 0,24 2,18 0,36 9,57E-06 4,35 20,4

hsa-miR-432

7,61 0,36 3,26 0,58 9,50E-05 4,35 20,4

hsa-miR-495

6,93 0,28 2,62 1,04 1,03E-03 4,31 19,8

hsa-miR-136*

6,41 0,51 2,21 0,78 4,91E-04 4,20 18,4

hsa-miR-154

6,86 0,17 2,66 1,58 6,51E-03 4,20 18,4

hsa-miR-889

3,79 0,54 -0,33 0,12 2,22E-05 4,12 17,4

hsa-miR-182

5,90 0,30 1,79 0,79 3,91E-04 4,12 17,3

hsa-miR-543

5,30 0,05 1,20 0,93 7,04E-04 4,09 17,1

hsa-miR-10a

11,69 0,52 7,62 0,10 1,94E-05 4,06 16,7

hsa-miR-485-5p

4,03 0,40 -0,01 0,88 7,69E-04 4,04 16,5

hsa-miR-377

7,51 0,55 3,54 0,80 7,58E-04 3,98 15,8

hsa-miR-96

11,01 0,48 7,09 0,38 6,96E-05 3,92 15,1

hsa-miR-431

5,00 1,06 1,13 0,48 1,20E-03 3,86 14,6

hsa-miR-376c

9,21 0,81 5,35 0,89 2,00E-03 3,86 14,5

hsa-miR-136

6,61 0,51 2,79 0,73 5,87E-04 3,81 14,1

hsa-miR-154*

4,83 0,62 1,04 0,80 1,06E-03 3,79 13,8

hsa-miR-369-5p

5,27 0,72 1,50 0,64 7,48E-04 3,77 13,6

hsa-miR-9*

5,31 1,78 1,57 0,18 7,66E-03 3,73 13,3

hsa-miR-493*

5,39 0,45 1,70 1,26 5,06E-03 3,69 12,9

hsa-miR-376a

8,51 0,67 4,83 0,87 1,75E-03 3,68 12,8

hsa-miR-329

4,13 0,15 0,51 0,46 5,07E-05 3,61 12,2

hsa-miR-9

4,69 1,56 1,10 0,38 6,08E-03 3,59 12,0

hsa-miR-411

4,80 0,24 1,27 1,11 3,20E-03 3,53 11,6

hsa-miR-379

6,20 0,14 2,70 0,88 1,13E-03 3,49 11,2

hsa-miR-376a*

4,63 0,44 1,19 0,34 7,67E-05 3,44 10,9

hsa-miR-105

2,03 2,55 -1,25 0,39 4,68E-02 3,29 9,7

hsa-miR-335

9,06 1,56 5,79 0,67 1,20E-02 3,27 9,7

hsa-miR-381

7,34 0,33 4,14 1,16 6,18E-03 3,20 9,2

miARN

MTC NOD MTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-654-3p

6,30 0,51 3,13 1,00 4,39E-03 3,17 9,0

hsa-miR-377*

2,94 0,16 -0,19 0,38 4,51E-05 3,14 8,8

hsa-miR-183*

4,36 0,40 1,38 0,66 1,03E-03 2,98 7,9

hsa-miR-582-5p

6,13 0,18 3,22 0,58 4,23E-04 2,91 7,5

hsa-miR-132*

5,58 1,13 2,70 0,58 6,60E-03 2,88 7,3

hsa-miR-337-5p

5,33 0,33 2,51 0,94 4,61E-03 2,82 7,0

hsa-miR-7-1*

6,88 0,44 4,08 0,43 3,90E-04 2,80 7,0

hsa-miR-1274a

7,49 0,88 4,74 1,03 1,41E-02 2,75 6,7

hsa-miR-221

9,68 0,79 6,94 0,35 1,46E-03 2,74 6,7

hsa-miR-429

10,32 0,28 7,59 0,20 2,26E-05 2,73 6,6

hsa-miR-10a*

3,82 0,57 1,13 0,36 5,94E-04 2,69 6,4

hsa-miR-132

8,97 1,15 6,28 0,33 6,08E-03 2,68 6,4

hsa-miR-376b

3,45 1,39 0,79 0,67 1,92E-02 2,66 6,3

hsa-miR-1274b

11,05 0,81 8,53 0,95 1,43E-02 2,52 5,7

hsa-miR-338-3p

9,34 0,35 6,85 0,82 4,74E-03 2,49 5,6

hsa-miR-598

7,98 0,33 5,56 0,54 1,04E-03 2,42 5,4

hsa-miR-200a

11,26 0,29 8,86 0,32 1,45E-04 2,40 5,3

hsa-miR-369-3p

2,85 0,71 0,47 0,55 3,93E-03 2,38 5,2

hsa-miR-1260

8,86 0,42 6,50 0,87 8,18E-03 2,35 5,1

hsa-miR-1185

3,03 0,54 0,69 0,26 5,87E-04 2,34 5,1

hsa-miR-182*

2,00 0,20 -0,26 0,47 5,90E-04 2,26 4,8

hsa-miR-720

12,50 0,70 10,25 0,79 1,13E-02 2,26 4,8

hsa-miR-663b

3,88 1,00 1,76 1,12 4,96E-02 2,12 4,3

hsa-miR-29b-1*

5,39 0,51 3,36 0,34 1,36E-03 2,03 4,1

hsa-miR-301a

7,56 0,34 5,60 0,52 2,39E-03 1,97 3,9

hsa-miR-200b

12,17 0,08 10,22 0,06 3,03E-07 1,95 3,9

hsa-miR-330-3p

6,34 0,46 4,40 0,20 5,80E-04 1,94 3,8

hsa-miR-326

3,61 0,14 1,69 0,14 8,38E-06 1,92 3,8

hsa-miR-340*

5,17 0,53 3,30 0,54 6,01E-03 1,87 3,6

hsa-miR-1301

3,45 0,62 1,60 0,30 3,09E-03 1,85 3,6

hsa-miR-668

1,30 0,42 -0,54 0,32 1,18E-03 1,85 3,6

hsa-miR-335*

3,78 0,88 1,95 0,33 1,14E-02 1,83 3,6

hsa-miR-221*

6,93 0,33 5,14 0,24 4,13E-04 1,79 3,4

miARN

MTC NOD MTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-656

2,09 0,62 0,40 0,38 6,24E-03 1,69 3,2

hsa-miR-24-1*

6,56 0,18 4,91 0,13 3,15E-05 1,65 3,1

hsa-miR-582-3p

0,19 0,32 -1,38 0,31 1,21E-03 1,58 3,0

hsa-miR-340

6,25 0,61 4,68 0,47 1,15E-02 1,57 3,0

hsa-miR-200c*

2,59 0,25 1,03 0,53 5,74E-03 1,55 2,9

hsa-miR-337-3p

3,15 0,43 1,62 0,62 1,53E-02 1,53 2,9

hsa-miR-642

0,65 0,41 -0,88 0,50 7,49E-03 1,53 2,9

hsa-miR-95

9,43 0,66 7,93 0,64 2,87E-02 1,50 2,8

hsa-miR-21

14,78 0,98 13,28 0,37 3,44E-02 1,50 2,8

hsa-miR-216a

1,88 0,79 0,39 0,07 1,16E-02 1,49 2,8

hsa-miR-21*

5,89 0,75 4,43 0,17 1,14E-02 1,46 2,7

hsa-let-7e

12,78 0,21 11,33 0,40 2,33E-03 1,45 2,7

hsa-miR-301b

3,14 0,72 1,72 0,31 1,51E-02 1,42 2,7

hsa-let-7e*

3,07 0,28 1,65 0,54 9,38E-03 1,42 2,7

hsa-miR-181a*

4,68 0,78 3,26 0,41 2,46E-02 1,42 2,7

hsa-miR-299-3p

3,11 0,45 1,73 0,56 1,82E-02 1,38 2,6

hsa-miR-23b

13,42 0,15 12,04 0,09 2,24E-05 1,37 2,6

hsa-miR-148b

9,64 0,55 8,27 0,62 2,97E-02 1,37 2,6

hsa-miR-200a*

5,71 0,26 4,34 0,33 1,94E-03 1,37 2,6

hsa-miR-181c

8,44 0,26 7,10 0,60 1,67E-02 1,33 2,5

hsa-miR-324-5p

9,24 0,04 7,92 0,20 1,16E-04 1,32 2,5

hsa-miR-181c*

5,32 0,15 4,03 0,39 3,02E-03 1,29 2,5

hsa-miR-23b*

4,61 0,28 3,36 0,32 3,13E-03 1,25 2,4

hsa-miR-141*

3,92 0,38 2,70 0,63 3,17E-02 1,23 2,3

hsa-miR-27b

12,95 0,25 11,75 0,26 1,69E-03 1,19 2,3

hsa-miR-15a

11,64 0,56 10,48 0,47 2,96E-02 1,17 2,2

hsa-miR-421

3,49 0,48 2,35 0,48 2,64E-02 1,15 2,2

hsa-miR-652

7,51 0,29 6,41 0,29 4,23E-03 1,10 2,1

hsa-miR-769-5p

5,73 0,25 4,63 0,21 1,47E-03 1,10 2,1

hsa-miR-200b*

5,99 0,11 4,90 0,29 1,64E-03 1,09 2,1

hsa-miR-100

10,63 0,66 11,66 0,24 3,12E-02 -1,03 2,0

hsa-miR-769-3p

2,27 0,15 3,34 0,64 3,81E-02 -1,08 2,1

hsa-miR-1228

4,67 0,23 5,75 0,58 3,06E-02 -1,08 2,1

miARN

MTC NOD MTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1539

1,85 0,22 2,93 0,48 1,56E-02 -1,08 2,1

hsa-miR-28-3p

0,98 0,32 2,09 0,21 2,52E-03 -1,11 2,2

hsa-miR-152

6,62 0,52 7,76 0,51 3,40E-02 -1,13 2,2

hsa-miR-509-5p

0,06 0,66 1,19 0,42 3,77E-02 -1,14 2,2

hsa-miR-125a-3p

6,16 0,72 7,33 0,40 3,89E-02 -1,17 2,2

hsa-miR-639

-0,25 0,59 0,97 0,48 2,99E-02 -1,22 2,3

hsa-miR-585

1,44 0,15 2,68 0,61 2,07E-02 -1,23 2,4

hsa-miR-525-5p

0,91 0,60 2,15 0,49 2,91E-02 -1,25 2,4

hsa-miR-584

3,13 0,35 4,38 0,49 1,33E-02 -1,25 2,4

hsa-miR-574-5p

6,26 0,22 7,52 0,63 2,22E-02 -1,26 2,4

hsa-miR-23a*

3,22 0,65 4,50 0,50 3,13E-02 -1,28 2,4

hsa-miR-296-5p

3,21 0,17 4,51 0,68 2,58E-02 -1,29 2,5

hsa-miR-490-5p

2,00 0,91 3,39 0,29 3,26E-02 -1,38 2,6

hsa-miR-1208

2,29 0,97 3,69 0,27 3,83E-02 -1,39 2,6

hsa-miR-1303

0,31 0,54 1,71 0,56 2,12E-02 -1,40 2,6

hsa-miR-640

0,08 0,59 1,49 0,46 1,53E-02 -1,42 2,7

hsa-miR-345

2,88 0,99 4,32 0,16 3,13E-02 -1,44 2,7

hsa-miR-550

2,26 0,55 3,70 0,30 6,21E-03 -1,44 2,7

hsa-miR-518c*

0,79 0,80 2,24 0,52 3,24E-02 -1,45 2,7

hsa-miR-513a-5p

4,06 0,74 5,52 0,43 2,04E-02 -1,46 2,8

hsa-miR-33b*

2,75 0,62 4,27 0,51 1,55E-02 -1,52 2,9

hsa-miR-526b

2,01 0,89 3,54 0,53 3,54E-02 -1,52 2,9

hsa-miR-1306

1,39 0,66 2,97 0,34 8,44E-03 -1,58 3,0

hsa-miR-518e*

0,42 0,71 2,03 0,27 7,96E-03 -1,60 3,0

hsa-miR-921

0,06 0,95 1,67 0,51 3,29E-02 -1,61 3,0

hsa-miR-139-5p

5,21 0,90 6,89 0,32 1,67E-02 -1,67 3,2

hsa-miR-1226*

4,04 0,87 5,72 0,46 2,03E-02 -1,68 3,2

hsa-miR-1270

0,79 0,81 2,47 0,46 1,71E-02 -1,68 3,2

hsa-miR-760

2,62 0,85 4,31 0,36 1,46E-02 -1,69 3,2

hsa-miR-616

-0,02 1,08 1,69 0,53 3,84E-02 -1,70 3,3

hsa-miR-662

1,87 0,84 3,58 0,21 9,89E-03 -1,71 3,3

hsa-miR-602

2,16 0,86 3,88 0,51 2,02E-02 -1,71 3,3

hsa-miR-1249

4,17 0,68 5,93 0,74 2,34E-02 -1,77 3,4

miARN

MTC NOD MTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-138-1*

-0,48 0,71 1,32 0,49 1,04E-02 -1,80 3,5

hsa-miR-518a-5p

0,21 1,23 2,05 0,65 4,81E-02 -1,84 3,6

hsa-miR-188-5p

5,61 0,88 7,46 0,63 2,23E-02 -1,85 3,6

hsa-miR-877*

2,86 0,40 4,73 0,40 1,73E-03 -1,87 3,7

hsa-miR-610

2,56 1,05 4,46 0,57 2,65E-02 -1,89 3,7

hsa-miR-498

1,86 0,85 3,77 0,49 1,28E-02 -1,90 3,7

hsa-miR-516b

0,84 1,36 2,78 0,32 3,64E-02 -1,94 3,8

hsa-miR-202

5,12 0,65 7,06 0,56 8,22E-03 -1,94 3,8

hsa-miR-1224-5p

5,65 1,15 7,60 0,65 3,47E-02 -1,94 3,8

hsa-miR-551b

3,35 1,29 5,32 0,11 2,53E-02 -1,97 3,9

hsa-miR-371-5p

4,11 0,92 6,14 0,47 1,17E-02 -2,03 4,1

hsa-miR-659

3,47 1,46 5,53 0,63 4,91E-02 -2,06 4,2

hsa-miR-617

1,20 0,64 3,26 0,35 2,57E-03 -2,06 4,2

hsa-miR-1203

0,29 1,50 2,45 0,50 3,95E-02 -2,16 4,5

hsa-miR-1321

1,56 1,15 3,74 0,75 2,85E-02 -2,18 4,5

hsa-miR-1915

7,88 1,03 10,06 0,49 1,28E-02 -2,18 4,5

hsa-miR-1276

-0,18 1,32 2,01 0,65 3,22E-02 -2,18 4,5

hsa-miR-204

6,03 1,35 8,22 0,45 2,65E-02 -2,19 4,6

hsa-miR-134

5,80 1,10 8,00 0,93 3,46E-02 -2,19 4,6

hsa-miR-30a

9,76 1,51 11,96 0,40 3,47E-02 -2,20 4,6

hsa-miR-1182

2,54 1,51 4,76 0,77 4,94E-02 -2,22 4,7

hsa-miR-605

1,49 0,55 3,72 1,03 2,05E-02 -2,23 4,7

hsa-miR-1268

7,86 0,70 10,19 1,33 4,16E-02 -2,33 5,0

hsa-miR-601

3,26 1,32 5,60 0,53 2,14E-02 -2,34 5,1

hsa-miR-939

6,56 0,92 8,91 0,42 5,75E-03 -2,36 5,1

hsa-miR-648

1,76 1,29 4,14 0,46 1,75E-02 -2,37 5,2

hsa-miR-940

6,45 1,12 8,91 0,72 1,61E-02 -2,45 5,5

hsa-miR-1915*

-0,22 1,39 2,26 0,54 2,05E-02 -2,48 5,6

hsa-miR-934

-0,44 1,00 2,09 0,71 1,07E-02 -2,53 5,8

hsa-miR-623

2,34 1,63 4,95 0,55 2,77E-02 -2,61 6,1

hsa-miR-150*

4,87 1,63 7,49 0,70 3,22E-02 -2,62 6,2

hsa-miR-1225-5p

9,17 1,49 11,79 0,95 3,52E-02 -2,62 6,2

hsa-miR-1909*

-0,02 1,58 2,64 0,78 3,08E-02 -2,66 6,3

miARN

MTC NOD MTC frente a NOD Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-187*

1,99 1,55 4,73 0,70 2,43E-02 -2,74 6,7

hsa-miR-149*

1,87 1,75 4,68 0,59 2,74E-02 -2,82 7,0

hsa-miR-638

8,14 0,98 10,95 1,00 1,36E-02 -2,82 7,0

hsa-miR-631

1,11 2,20 3,97 0,56 4,97E-02 -2,86 7,3

hsa-miR-572

4,86 0,86 7,90 1,01 8,63E-03 -3,05 8,3

hsa-miR-663

5,54 1,91 8,63 0,75 2,96E-02 -3,09 8,5

hsa-miR-138

3,44 2,17 6,61 0,71 3,77E-02 -3,17 9,0

hsa-miR-1300

4,62 1,07 7,80 0,79 6,04E-03 -3,19 9,1

hsa-miR-1202

10,07 2,09 13,75 0,81 2,18E-02 -3,67 12,8

hsa-miR-92b*

-0,87 0,66 2,96 0,56 4,05E-04 -3,83 14,3

EJEMPLO 15

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL ADENOMA FOLICULAR Y EL CARCINOMA

FOLICULAR DE TIROIDES

5 Un total de 19 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre los adenomas foliculares y los carcinomas foliculares de tiroides (p<0,05) (tabla 17). Entre estos, cuatro (hsa-let-7g* y hsa-miR196a, -595 y -1227) se expresaron a niveles que eran al menos 2 veces mayores (dif. Log2 (FA frente a FTC) ≥ 1) en FA que en FTC, mientras que siete miARN (hsa-miR-32, -19a, -105*, -20a*, -20b, -17* y -1208) estaban subexpresados (dif. Log2 (FA frente a FTC) ≤1) en al menos 2 veces en muestra de FA en comparación con FTC.

10 Tabla 17. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FA y de FTC. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

FA FTC FA frente a FTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-let-7g*

0,54 1,49 -1,09 0,50 4,90E-02 1,63 3,1

hsa-miR-196a

3,38 1,42 1,82 0,34 4,34E-02 1,56 3,0

hsa-miR-595

1,61 1,13 0,18 0,21 2,35E-02 1,43 2,7

hsa-miR-1227

1,77 1,08 0,48 0,52 4,21E-02 1,30 2,5

hsa-miR-556-3p

1,32 0,33 0,50 0,43 9,26E-03 0,83 1,8

hsa-miR-326

2,27 0,49 1,53 0,24 1,62E-02 0,75 1,7

hsa-miR-1321

0,48 0,58 1,25 0,46 4,85E-02 -0,77 1,7

hsa-miR-15a

10,87 0,60 11,65 0,39 4,05E-02 -0,78 1,7

hsa-miR-29b

11,43 0,44 12,31 0,59 2,81E-02 -0,88 1,8

hsa-miR-17

8,55 0,59 9,48 0,41 2,00E-02 -0,93 1,9

hsa-miR-20a

9,91 0,59 10,88 0,43 1,76E-02 -0,98 2,0

hsa-miR-19b

10,20 0,69 11,18 0,50 3,20E-02 -0,98 2,0

hsa-miR-1208

1,22 0,79 2,25 0,60 4,98E-02 -1,02 2,0

miARN

FA FTC FA frente a FTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-17*

4,52 0,69 5,55 0,41 2,08E-02 -1,03 2,0

hsa-miR-20b

7,17 0,76 8,22 0,43 2,77E-02 -1,05 2,1

hsa-miR-20a*

3,60 0,59 4,73 0,24 4,27E-03 -1,12 2,2

hsa-miR-105*

-0,75 0,57 0,39 0,42 7,15E-03 -1,14 2,2

hsa-miR-19a

7,45 0,87 8,60 0,40 2,84E-02 -1,14 2,2

hsa-miR-32

3,80 1,01 5,08 0,46 3,22E-02 -1,28 2,4

EJEMPLO 16

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL ADENOMA FOLICULAR Y EL CARCINOMA

PAPILAR DE TIROIDES

5 Un total de 76 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de adenoma folicular y los especímenes de carcinoma papilar (p<0,05) (tabla 18). Entre estos, 34 miARN estaban sobreexpresados (dif. Log2 (FA frente a PTC) ≤ 1) y quince miARN estaban subexpresados en al menos 2 veces en muestras de PTC en comparación con muestras de FA (tabla 18). Entre los miARN expresados a un mayor nivel en las muestras de PTC, un miARN (hsa-miR-146b-5p) estaba sobreexpresado en más de 50 veces; cinco miARN (hsa

10 miR-31, -31*, -375, -200a, -200b) estaban sobreexpresados de 20 a 40 veces; tres miARN (hsa-miR-146b-3p, -429 y -551b) estaban sobreexpresados de 15 a 20 veces, tres miARN (hsa-miR-200a*, -200b* y -222) estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces y 22 miARN estaban sobreexpresados de 2 a 5 veces en los especímenes de PTC en comparación con las muestras de FA. Entre los miARN expresados a un menor nivel en PTC en comparación con muestras de FA, hsa-mir-885-5p estaba subexpresado en más de 5 veces y catorce miARN

15 estaban subexpresados de 2 a 5 veces.

Tabla 18. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FA y de PTC. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

FA PTC FA frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-885-5p

2,75 2,48 -0,10 0,21 3,39E-02 2,85 7,2

hsa-miR-631

1,22 1,73 -0,92 0,83 3,67E-02 2,14 4,4

hsa-miR-873

2,78 1,55 0,81 0,78 3,47E-02 1,97 3,9

hsa-miR-1227

1,77 1,08 0,03 0,66 1,52E-02 1,74 3,3

hsa-miR-148a*

1,83 1,23 0,21 0,94 4,73E-02 1,62 3,1

hsa-miR-183*

1,57 1,10 -0,03 1,02 4,48E-02 1,60 3,0

hsa-miR-483-3p

1,95 0,98 0,43 0,35 1,14E-02 1,52 2,9

hsa-miR-182*

1,08 0,53 -0,41 0,86 1,12E-02 1,49 2,8

hsa-miR-517a

0,93 1,16 -0,45 0,52 4,12E-02 1,38 2,6

hsa-miR-488*

0,64 1,24 -0,71 0,25 4,39E-02 1,35 2,5

hsa-miR-183

7,62 1,20 6,34 0,19 4,68E-02 1,28 2,4

hsa-miR-145

10,55 0,52 9,37 0,28 2,19E-03 1,18 2,3

hsa-miR-583

0,54 0,77 -0,56 0,48 2,68E-02 1,10 2,1

miARN

FA PTC FA frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-124

0,68 0,28 -0,38 0,31 4,83E-04 1,06 2,1

hsa-miR-145*

5,63 0,67 4,58 0,41 1,72E-02 1,05 2,1

hsa-miR-572

5,04 0,65 4,08 0,45 2,63E-02 0,96 1,9

hsa-miR-638

8,26 0,52 7,32 0,50 2,00E-02 0,94 1,9

hsa-miR-1268

7,39 0,37 6,57 0,52 2,03E-02 0,82 1,8

hsa-miR-557

4,74 0,33 3,95 0,56 2,56E-02 0,79 1,7

hsa-miR-143*

4,11 0,42 3,34 0,37 1,42E-02 0,78 1,7

hsa-miR-1323

1,99 0,30 1,22 0,35 6,17E-03 0,76 1,7

hsa-miR-143

8,07 0,61 7,32 0,28 3,91E-02 0,74 1,7

hsa-miR-584

2,76 0,44 2,03 0,45 3,08E-02 0,74 1,7

hsa-miR-129*

2,66 0,32 1,95 0,21 3,11E-03 0,71 1,6

hsa-miR-556-3p

1,32 0,33 0,67 0,22 5,88E-03 0,66 1,6

hsa-miR-326

2,27 0,49 1,66 0,29 4,35E-02 0,61 1,5

hsa-miR-196b

2,63 0,43 2,13 0,22 4,94E-02 0,50 1,4

hsa-miR-335*

2,48 0,31 1,99 0,18 1,44E-02 0,49 1,4

hsa-miR-449b

0,58 0,28 1,08 0,28 2,27E-02 -0,50 1,4

hsa-miR-34a*

4,48 0,35 5,07 0,21 1,18E-02 -0,59 1,5

hsa-miR-26b

11,30 0,54 11,96 0,28 4,45E-02 -0,65 1,6

hsa-miR-34a

11,88 0,50 12,59 0,24 2,06E-02 -0,71 1,6

hsa-let-7e

11,41 0,64 12,15 0,24 3,95E-02 -0,75 1,7

hsa-miR-29b-1*

4,78 0,51 5,53 0,38 2,94E-02 -0,75 1,7

hsa-miR-34b*

6,83 0,48 7,62 0,54 4,04E-02 -0,79 1,7

hsa-miR-374b

7,56 0,69 8,38 0,22 3,56E-02 -0,82 1,8

hsa-miR-151-5p

10,03 0,57 10,90 0,35 1,95E-02 -0,87 1,8

hsa-miR-15b

11,08 0,77 11,96 0,35 4,80E-02 -0,88 1,8

hsa-miR-17*

4,52 0,69 5,43 0,32 2,86E-02 -0,91 1,9

hsa-miR-16

12,60 0,59 13,53 0,18 1,02E-02 -0,92 1,9

hsa-miR-17

8,55 0,59 9,48 0,14 8,75E-03 -0,93 1,9

hsa-let-7i

13,58 0,59 14,53 0,18 8,33E-03 -0,95 1,9

hsa-miR-181c

6,62 0,63 7,59 0,35 1,68E-02 -0,97 2,0

hsa-miR-629

1,96 0,63 2,94 0,51 2,60E-02 -0,98 2,0

hsa-miR-1914*

7,19 0,66 8,19 0,68 4,53E-02 -1,00 2,0

hsa-miR-29a

13,29 0,55 14,31 0,37 9,50E-03 -1,01 2,0

miARN

FA PTC FA frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-20a*

3,60 0,59 4,63 0,57 2,37E-02 -1,03 2,0

hsa-miR-208b

-0,31 0,90 0,73 0,41 4,82E-02 -1,03 2,0

hsa-miR-181d

5,70 0,62 6,74 0,28 9,24E-03 -1,04 2,1

hsa-miR-892b

4,73 0,51 5,77 0,82 4,34E-02 -1,04 2,1

hsa-miR-19b

10,20 0,69 11,28 0,31 1,27E-02 -1,08 2,1

hsa-miR-449a

2,32 0,64 3,40 0,45 1,43E-02 -1,09 2,1

hsa-miR-1305

7,17 0,74 8,28 0,53 2,66E-02 -1,11 2,2

hsa-miR-20a

9,91 0,59 11,03 0,12 3,19E-03 -1,12 2,2

hsa-miR-15a

10,87 0,60 12,01 0,32 5,66E-03 -1,14 2,2

hsa-miR-125b

13,22 0,97 14,38 0,32 3,45E-02 -1,17 2,2

hsa-miR-29b

11,43 0,44 12,61 0,75 1,65E-02 -1,18 2,3

hsa-miR-210

4,60 1,04 5,79 0,37 4,28E-02 -1,19 2,3

hsa-miR-130a

10,32 0,86 11,54 0,45 2,29E-02 -1,22 2,3

hsa-miR-625

4,79 0,82 6,17 0,25 7,32E-03 -1,37 2,6

hsa-miR-21*

5,28 0,63 6,77 0,63 5,49E-03 -1,50 2,8

hsa-miR-137

-0,13 0,61 1,65 0,86 5,38E-03 -1,79 3,4

hsa-miR-21

13,93 0,96 15,85 0,45 3,79E-03 -1,92 3,8

hsa-miR-221*

6,55 1,87 8,71 0,86 4,70E-02 -2,16 4,5

hsa-miR-222

7,51 1,30 10,25 0,58 2,61E-03 -2,74 6,7

hsa-miR-200b*

2,47 2,18 5,62 0,59 1,41E-02 -3,15 8,9

hsa-miR-200a*

2,10 1,76 5,30 0,62 5,05E-03 -3,19 9,1

hsa-miR-551b

6,03 2,55 9,98 0,58 9,86E-03 -3,94 15,4

hsa-miR-429

4,75 3,02 8,97 0,55 1,53E-02 -4,22 18,6

hsa-miR-146b3p

-0,55 1,45 3,73 1,12 7,98E-04 -4,28 19,4

hsa-miR-200b

7,16 3,18 11,78 0,50 1,25E-02 -4,61 24,5

hsa-miR-200a

5,59 3,11 10,22 0,52 1,12E-02 -4,62 24,6

hsa-miR-375

2,08 2,60 6,74 1,20 6,59E-03 -4,66 25,3

hsa-miR-31*

3,69 3,42 8,58 0,56 1,35E-02 -4,89 29,6

hsa-miR-31

4,88 3,49 10,14 0,64 1,06E-02 -5,26 38,3

hsa-miR-146b5p

8,50 2,02 14,41 0,92 3,45E-04 -5,90 59,8

EJEMPLO 17

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL ADENOMA FOLICULAR Y LA VARIANTE

FOLICULAR DEL CARCINOMA PAPILAR DE TIROIDES

Un total de 32 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre muestras de adenoma 5 folicular y los especímenes de la variante folicular del carcinoma papilar de tiroides (p<0,05) (tabla 19). Entre estos, 17 miARN se expresaron a niveles al menos 2 veces mayores en las muestras de FVPTC en comparación con las muestras de FA (dif. Log2 (FA frente a FVPTC) ≤ 1). De estos, hsa-miR-31 estaba sobreexpresado en 30 veces, cinco miARN (hsa-miR-31*, -146b-5p, -200b, -200a y -429) estaban sobreexpresados de 20 a 30 veces, dos miARN (hsa-miR-375 y -200b*) estaban sobreexpresados de 10 a 20 veces y nueve miARN (hsa-miR-200a*, -146b-3p, -222, 10 -923, -449a, -21*, -503, -135a* y hsa-let-7i) estaban sobreexpresados de 2 a 10 veces en los especímenes de FVPTC en comparación con las muestras de FA.

Tabla 19. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FA y de FVPTC. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

FA FVPTC FA frente a FVPTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-124

0,68 0,28 -0,10 0,41 0,01 0,78 1,7

hsa-miR-143*

4,11 0,42 3,34 0,45 0,03 0,78 1,7

hsa-miR-26b*

2,01 0,44 1,27 0,48 0,04 0,75 1,7

hsa-miR-326

2,27 0,49 1,60 0,21 0,04 0,67 1,6

hsa-miR-335*

2,48 0,31 1,94 0,38 0,05 0,54 1,5

hsa-miR-548c-5p

1,91 0,25 2,23 0,05 0,04 -0,33 1,3

hsa-miR-449b

0,58 0,28 1,24 0,28 0,01 -0,66 1,6

hsa-miR-10b*

2,05 0,49 2,81 0,46 0,05 -0,77 1,7

hsa-miR-20a

9,91 0,59 10,68 0,25 0,05 -0,78 1,7

hsa-miR-513c

2,19 0,55 2,98 0,11 0,03 -0,79 1,7

hsa-miR-516a-5p

2,00 0,46 2,82 0,56 0,05 -0,82 1,8

hsa-miR-574-5p

5,79 0,68 6,65 0,20 0,04 -0,87 1,8

hsa-miR-513b

2,85 0,56 3,72 0,26 0,02 -0,88 1,8

hsa-miR-181c

6,62 0,63 7,54 0,43 0,04 -0,92 1,9

hsa-miR-513a-5p

3,44 0,48 4,37 0,17 0,01 -0,93 1,9

hsa-let-7i

13,58 0,59 14,62 0,43 0,02 -1,04 2,1

hsa-miR-135a*

3,73 0,52 4,84 0,47 0,01 -1,11 2,2

hsa-miR-503

4,62 0,74 6,07 1,04 0,04 -1,45 2,7

hsa-miR-21*

5,28 0,63 6,73 0,32 0,00 -1,46 2,7

hsa-miR-449a

2,32 0,64 4,13 0,82 0,01 -1,81 3,5

hsa-miR-923

12,37 0,71 14,31 1,49 0,04 -1,94 3,8

hsa-miR-222

7,51 1,30 9,66 0,79 0,02 -2,15 4,4

hsa-miR-146b-3p

-0,55 1,45 2,46 1,30 0,01 -3,01 8,1

hsa-miR-200a*

2,10 1,76 5,38 0,59 0,01 -3,28 9,7

miARN

FA FVPTC FA frente a FVPTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-200b*

2,47 2,18 5,82 0,47 0,02 -3,36 10,2

hsa-miR-375

2,08 2,60 6,25 1,32 0,02 -4,18 18,1

hsa-miR-429

4,75 3,02 9,17 0,77 0,03 -4,42 21,5

hsa-miR-200a

5,59 3,11 10,20 0,62 0,02 -4,60 24,3

hsa-miR-200b

7,16 3,18 11,82 0,67 0,02 -4,66 25,2

hsa-miR-146b-5p

8,50 2,02 13,20 1,09 0,00 -4,70 25,9

hsa-miR-31*

3,69 3,42 8,47 1,06 0,03 -4,77 27,4

hsa-miR-31

4,88 3,49 10,06 1,12 0,03 -5,18 36,2

EJEMPLO 18

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL ADENOMA FOLICULAR Y EL CARCINOMA ANAPLÁSICO DE TIROIDES

5 Un total de 43 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de adenoma folicular y los especímenes de carcinoma anaplásico de tiroides (p<0,05) (tabla 20). Entre estos, veintiún miARN se expresaron a niveles al menos 2 veces mayores (dif. Log2 (ATC frente a FA ≥ 1) en la muestra de ATC en comparación con las muestras de FA. De estos, hsa-miR-9* estaba sobreexpresado en 75 veces, tres miARN (hsamiR-582-3p, -582-5p y -9) estaban sobreexpresados de 20 a 30 veces, cuatro miARN (hsa-miR-34c-5p, -210, -124 y

10 -34c-3p) estaban sobreexpresados de 10 a 20 veces y trece miARN estaban sobreexpresados de 2 a 10 veces en el espécimen de ATC en comparación con las muestras de FA.

Tabla 20. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FA y de ATC. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

ATC FA ATC frente a FA Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-9*

7,14 0,91 1,70 2,85E-02 6,23 75,2

hsa-miR-582-3p

3,97 -1,04 1,10 1,40E-02 5,00 32,1

hsa-miR-582-5p

8,42 3,51 0,40 3,64E-04 4,91 30,1

hsa-miR-9

5,05 0,57 1,18 2,53E-02 4,48 22,4

hsa-miR-34c-5p

7,37 3,10 0,57 2,42E-03 4,27 19,2

hsa-miR-210

8,74 4,60 1,04 2,23E-02 4,14 17,7

hsa-miR-124

4,16 0,68 0,28 3,36E-04 3,48 11,1

hsa-miR-34c-3p

1,95 -1,38 0,78 1,79E-02 3,33 10,1

hsa-miR-592

4,74 1,97 0,74 2,69E-02 2,77 6,8

hsa-miR-30a*

10,32 7,99 0,47 1,05E-02 2,33 5,0

hsa-miR-449a

4,52 2,32 0,64 3,44E-02 2,20 4,6

hsa-miR-30a

13,36 11,17 0,45 1,16E-02 2,19 4,6

hsa-miR-409-3p

4,20 2,34 0,54 3,40E-02 1,86 3,6

miARN

ATC FA ATC frente a FA Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-769-5p

6,42 4,67 0,57 4,84E-02 1,76 3,4

hsa-miR-30c-2*

6,74 5,00 0,53 4,11E-02 1,74 3,3

hsa-miR-34b*

8,43 6,83 0,48 3,80E-02 1,60 3,0

hsa-miR-330-3p

5,15 3,65 0,39 2,53E-02 1,50 2,8

hsa-miR-410

2,97 1,58 0,41 3,56E-02 1,39 2,6

hsa-miR-155*

1,88 0,72 0,31 2,79E-02 1,16 2,2

hsa-miR-550*

4,14 3,05 0,20 7,64E-03 1,09 2,1

hsa-miR-188-5p

5,69 4,71 0,32 4,88E-02 0,97 2,0

hsa-miR-656

1,64 0,82 0,23 3,12E-02 0,82 1,8

hsa-miR-1181

4,01 3,40 0,20 4,88E-02 0,61 1,5

hsa-miR-30d*

1,12 2,67 0,50 4,55E-02 -1,56 2,9

hsa-miR-1301

-0,92 0,78 0,44 2,40E-02 -1,70 3,3

hsa-miR-93*

-0,59 1,23 0,54 3,74E-02 -1,82 3,5

hsa-miR-508-5p

-2,20 -0,35 0,58 4,27E-02 -1,85 3,6

hsa-miR-452

1,57 4,17 0,76 3,52E-02 -2,60 6,0

hsa-miR-126

10,01 12,69 0,69 2,34E-02 -2,68 6,4

hsa-miR-143*

1,36 4,11 0,42 3,82E-03 -2,76 6,8

hsa-miR-143

5,31 8,07 0,61 1,48E-02 -2,76 6,8

hsa-miR-224

2,46 5,32 0,92 4,74E-02 -2,86 7,3

hsa-miR-200c*

-0,83 2,41 0,94 3,45E-02 -3,25 9,5

hsa-miR-145*

2,37 5,63 0,67 1,16E-02 -3,26 9,6

hsa-miR-99a*

-1,76 1,66 0,58 5,85E-03 -3,42 10,7

hsa-miR-139-5p

2,79 6,34 0,73 1,13E-02 -3,54 11,6

hsa-miR-145

6,78 10,55 0,52 2,77E-03 -3,77 13,6

hsa-miR-141*

-1,68 3,42 0,92 7,06E-03 -5,10 34,3

hsa-miR-138

0,09 5,41 1,34 2,25E-02 -5,32 39,9

hsa-miR-135a

1,19 8,04 1,20 6,42E-03 -6,84 114,8

hsa-miR-135b

2,20 9,59 1,18 4,66E-03 -7,40 168,7

hsa-miR-200c

3,00 11,45 0,68 3,45E-04 -8,44 348,0

hsa-miR-141

2,51 11,09 0,84 7,22E-04 -8,58 383,5

EJEMPLO 19

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL CARCINOMA ANAPLÁSICO DE TIROIDES Y EL

CARCINOMA MEDULAR DE TIROIDES

Un total de 114 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre la muestra de

5 carcinoma anaplásico de tiroides y los especímenes de carcinoma medular de tiroides (p<0,05) (tabla 21). Entre estos, 4 miARN (hsa-miR-582-3p, -582-5p, -155* y -7b*) se expresaron a niveles entre 2 y 15 veces mayores en la muestra de ATC en comparación con las muestras de MTC (dif. Log2 (ATC frente a MTC≥ 1). Además, 99 miARN estaban subexpresados en al menos 2 veces en las muestras de ATC en comparación con las de MTC. Entre estos, hsa-miR-375 estaba subexpresado en más de 6.000 veces, cinco miARN (hsa-miR-429, -200a, -200b, -200c y -141)

10 estaban subexpresados de 500 a 1.000 veces, cuatro miARN (hsa-miR-135b, -135a, -323-3p y -205) estaban subexpresados de 50 a 200 veces, treinta y nueve miARN estaban subexpresados de 10 a 50 veces y cincuenta miARN estaban subexpresados de 2 a 50 veces en la muestra de ATC en comparación con los especímenes de MTC.

Tabla 21. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de MTC y de ATC. MED, 15 expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

ATC MTC ATC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-582-3p

3,97 0,19 0,32 9,51E-03 3,78 13,7

hsa-miR-582-5p

8,42 6,13 0,18 8,09E-03 2,29 4,9

hsa-miR-155*

1,88 0,33 0,16 1,34E-02 1,55 2,9

hsa-let-7b*

2,41 1,29 0,08 6,92E-03 1,12 2,2

hsa-miR-634

2,61 1,68 0,13 2,70E-02 0,92 1,9

hsa-miR-769-3p

3,15 2,27 0,15 3,61E-02 0,88 1,8

hsa-miR-944

0,74 -0,02 0,10 2,05E-02 0,76 1,7

hsa-miR-27a

12,98 12,27 0,07 1,16E-02 0,71 1,6

hsa-let-7a

14,35 14,77 0,07 3,12E-02 -0,42 1,3

hsa-miR-431*

2,46 2,93 0,05 1,54E-02 -0,47 1,4

hsa-miR-331-3p

10,17 10,80 0,08 1,89E-02 -0,64 1,6

hsa-miR-99b

8,83 9,49 0,13 4,93E-02 -0,66 1,6

hsa-miR-25

9,41 10,13 0,14 4,41E-02 -0,73 1,7

hsa-miR-320a

8,16 8,92 0,11 2,91E-02 -0,76 1,7

hsa-miR-574-3p

5,72 6,59 0,05 4,14E-03 -0,87 1,8

hsa-miR-24-1*

5,59 6,56 0,18 4,39E-02 -0,97 2,0

hsa-miR-585

0,44 1,44 0,15 2,76E-02 -1,00 2,0

hsa-miR-146b-3p

-2,10 -1,08 0,19 4,53E-02 -1,02 2,0

hsa-miR-423-3p

2,56 3,59 0,10 1,30E-02 -1,02 2,0

hsa-miR-1826

4,37 5,46 0,15 2,37E-02 -1,09 2,1

hsa-miR-326

2,42 3,61 0,14 1,68E-02 -1,20 2,3

hsa-miR-98

7,22 8,44 0,17 2,44E-02 -1,22 2,3

hsa-miR-454

5,50 6,74 0,18 2,69E-02 -1,24 2,4

miARN

ATC MTC ATC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-23b

12,17 13,42 0,15 1,84E-02 -1,24 2,4

hsa-miR-27b

11,68 12,95 0,25 4,96E-02 -1,27 2,4

hsa-miR-423-5p

5,61 6,91 0,07 4,07E-03 -1,31 2,5

hsa-miR-181c*

3,75 5,32 0,15 1,26E-02 -1,57 3,0

hsa-miR-182*

0,43 2,00 0,20 2,10E-02 -1,57 3,0

hsa-miR-20a*

2,51 4,10 0,23 2,67E-02 -1,59 3,0

hsa-miR-181d

5,25 6,86 0,09 4,48E-03 -1,61 3,0

hsa-miR-654-5p

2,67 4,30 0,31 4,50E-02 -1,63 3,1

hsa-miR-30d

8,94 10,62 0,25 2,78E-02 -1,68 3,2

hsa-miR-26b

10,52 12,22 0,12 6,91E-03 -1,70 3,3

hsa-miR-126

10,01 11,72 0,25 2,75E-02 -1,71 3,3

hsa-miR-151-5p

9,21 11,02 0,15 9,20E-03 -1,80 3,5

hsa-miR-30d*

1,12 3,11 0,30 2,94E-02 -2,00 4,0

hsa-miR-126*

3,44 5,45 0,16 8,72E-03 -2,02 4,0

hsa-miR-377*

0,92 2,94 0,16 8,50E-03 -2,03 4,1

hsa-miR-324-5p

7,21 9,24 0,04 4,23E-04 -2,03 4,1

hsa-miR-337-5p

3,29 5,33 0,33 3,26E-02 -2,04 4,1

hsa-let-7c

10,68 12,76 0,42 4,99E-02 -2,08 4,2

hsa-miR-181c

6,32 8,44 0,26 1,89E-02 -2,11 4,3

hsa-miR-744*

-1,03 1,10 0,21 1,28E-02 -2,13 4,4

hsa-miR-221*

4,78 6,93 0,33 3,06E-02 -2,15 4,4

hsa-miR-652

5,34 7,51 0,29 2,25E-02 -2,16 4,5

hsa-miR-1250

-1,24 0,92 0,27 1,96E-02 -2,17 4,5

hsa-miR-493*

3,16 5,39 0,45 4,99E-02 -2,23 4,7

hsa-miR-30b

9,75 12,03 0,20 1,00E-02 -2,29 4,9

hsa-miR-744

2,84 5,17 0,35 2,89E-02 -2,33 5,0

hsa-miR-642

-1,95 0,65 0,41 3,11E-02 -2,60 6,1

hsa-miR-654-3p

3,59 6,30 0,51 4,43E-02 -2,71 6,5

hsa-miR-143

5,31 8,13 0,51 4,03E-02 -2,83 7,1

hsa-miR-598

5,11 7,98 0,33 1,71E-02 -2,86 7,3

hsa-miR-370

1,84 4,77 0,36 1,97E-02 -2,93 7,6

hsa-miR-491-5p

-1,33 1,62 0,37 2,02E-02 -2,95 7,7

hsa-miR-148b

6,69 9,64 0,55 4,32E-02 -2,96 7,8

miARN

ATC MTC ATC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-409-3p

4,20 7,21 0,31 1,42E-02 -3,02 8,1

hsa-miR-7-1*

3,84 6,88 0,44 2,73E-02 -3,05 8,3

hsa-miR-145*

2,37 5,48 0,47 2,88E-02 -3,10 8,6

hsa-miR-376a*

1,52 4,63 0,44 2,55E-02 -3,11 8,6

hsa-miR-125b-2*

2,65 5,76 0,59 4,50E-02 -3,11 8,6

hsa-miR-485-3p

1,15 4,27 0,37 1,83E-02 -3,13 8,7

hsa-miR-543

2,04 5,30 0,05 3,40E-04 -3,25 9,5

hsa-miR-218

5,04 8,29 0,43 2,21E-02 -3,25 9,5

hsa-miR-889

0,51 3,79 0,54 3,45E-02 -3,28 9,7

hsa-miR-136

3,27 6,61 0,51 2,94E-02 -3,34 10,1

hsa-miR-758

1,69 5,04 0,13 1,87E-03 -3,35 10,2

hsa-miR-338-3p

5,98 9,34 0,35 1,40E-02 -3,36 10,3

hsa-miR-668

-2,09 1,30 0,42 1,95E-02 -3,40 10,5

hsa-miR-376a

5,10 8,51 0,67 4,76E-02 -3,40 10,6

hsa-miR-200c*

-0,83 2,59 0,25 7,31E-03 -3,42 10,7

hsa-miR-379

2,77 6,20 0,14 2,26E-03 -3,42 10,7

hsa-miR-145

6,78 10,23 0,51 2,77E-02 -3,45 10,9

hsa-miR-154

3,41 6,86 0,17 3,09E-03 -3,45 10,9

hsa-miR-329

0,64 4,13 0,15 2,44E-03 -3,48 11,2

hsa-miR-411

1,30 4,80 0,24 6,16E-03 -3,50 11,3

hsa-miR-485-5p

0,52 4,03 0,40 1,66E-02 -3,51 11,4

hsa-miR-127-3p

5,36 8,88 0,37 1,42E-02 -3,52 11,5

hsa-miR-377

3,95 7,51 0,55 3,03E-02 -3,56 11,8

hsa-miR-125b

10,44 14,04 0,66 4,22E-02 -3,60 12,1

hsa-miR-99a

8,00 11,61 0,62 3,65E-02 -3,62 12,3

hsa-miR-96

7,36 11,01 0,48 2,26E-02 -3,65 12,5

hsa-miR-381

3,69 7,34 0,33 1,10E-02 -3,65 12,5

hsa-miR-487a

1,13 4,79 0,32 9,89E-03 -3,66 12,6

hsa-miR-409-5p

1,23 4,92 0,15 2,18E-03 -3,69 12,9

hsa-miR-1251

-2,26 1,48 0,36 1,20E-02 -3,74 13,3

hsa-miR-495

3,07 6,93 0,28 6,80E-03 -3,86 14,5

hsa-miR-369-5p

1,32 5,27 0,72 4,19E-02 -3,94 15,4

hsa-miR-512-3p

0,39 4,53 0,17 2,19E-03 -4,14 17,7

miARN

ATC MTC ATC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-382

2,34 6,53 0,24 4,24E-03 -4,19 18,3

hsa-miR-1301

-0,92 3,45 0,62 2,58E-02 -4,38 20,8

hsa-miR-539

2,09 6,53 0,34 7,81E-03 -4,43 21,6

hsa-miR-183

6,00 10,49 0,69 3,02E-02 -4,49 22,5

hsa-miR-182

1,33 5,90 0,30 5,51E-03 -4,58 23,8

hsa-miR-136*

1,78 6,41 0,51 1,57E-02 -4,63 24,8

hsa-miR-432

2,85 7,61 0,36 7,50E-03 -4,76 27,1

hsa-miR-487b

4,94 9,75 0,19 2,15E-03 -4,81 28,1

hsa-miR-183*

-0,51 4,36 0,40 9,08E-03 -4,87 29,2

hsa-miR-410

2,97 8,20 0,14 9,35E-04 -5,22 37,3

hsa-miR-486-3p

-1,82 3,41 0,41 7,96E-03 -5,23 37,5

hsa-miR-200a*

0,46 5,71 0,26 3,23E-03 -5,25 38,0

hsa-miR-200b*

0,48 5,99 0,11 5,45E-04 -5,51 45,5

hsa-miR-141*

-1,68 3,92 0,38 6,01E-03 -5,60 48,6

hsa-miR-433

-1,51 4,13 0,61 1,54E-02 -5,63 49,6

hsa-miR-205

-1,95 3,92 0,71 1,88E-02 -5,87 58,4

hsa-miR-323-3p

0,30 6,93 0,13 4,76E-04 -6,63 98,9

hsa-miR-135a

1,19 7,85 0,66 1,28E-02 -6,66 100,8

hsa-miR-135b

2,20 9,73 0,72 1,20E-02 -7,53 184,7

hsa-miR-141

2,51 11,67 0,50 3,94E-03 -9,16 570,9

hsa-miR-200c

3,00 12,22 0,28 1,20E-03 -9,22 596,9

hsa-miR-200b

2,93 12,17 0,08 1,11E-04 -9,24 605,5

hsa-miR-200a

1,45 11,26 0,29 1,13E-03 -9,81 898,5

hsa-miR-429

-0,05 10,32 0,28 9,54E-04 -10,37 1323,6

hsa-miR-375

1,27 13,86 0,40 1,35E-03 -12,60 6201,2

EJEMPLO 20

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL CARCINOMA FOLICULAR DE TIROIDES Y EL

CARCINOMA PAPILAR DE TIROIDES

5 Un total de 79 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de carcinoma folicular de tiroides y los especímenes de carcinoma papilar de tiroides (p<0,05) (tabla 22). Entre estos, 27 miARN estaban subexpresados en al menos 2 veces en las muestras de FTC en comparación con las muestras de PTC (dif. Log2 (FTC frente a PTC) ≤ 1). De estos, hsa-miR-146b-5p se expresó a un nivel más de 80 veces menor en muestras de FTC, cinco miARN (hsa-miR-551b, -375, -146b-3p, -200b y -31) se expresaron a niveles de 10 10 a 33 veces menores en FTC; siete miARN (hsa-miR-31*, -200a, -429, -200a*, -200b*, -222 y -514) estaban subexpresados a niveles de 5 a 10 veces menores en muestras de FTC y catorce miARN estaban subexpresados de 2 a 5 veces en muestras de FTC en comparación con especímenes de PTC. Además, se expresó un total de 33 miARN a niveles de 2 a 5 veces mayores en muestras de FTC en comparación con PTC.

Tabla 22. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FTC y de PTC. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

FTC PTC FTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-183*

2,14 1,17 -0,03 1,02 1,41E-02 2,16 4,5

hsa-miR-148a*

2,35 0,67 0,21 0,94 3,25E-03 2,14 4,4

hsa-miR-204

7,33 1,59 5,26 0,80 3,21E-02 2,07 4,2

hsa-miR-182

4,50 1,38 2,59 1,06 3,92E-02 1,91 3,8

hsa-miR-631

0,83 0,94 -0,92 0,83 1,42E-02 1,75 3,4

hsa-miR-148a

11,79 0,72 10,07 0,84 8,36E-03 1,72 3,3

hsa-miR-144

7,14 0,99 5,48 1,15 4,01E-02 1,66 3,2

hsa-miR-659

3,03 1,18 1,42 0,91 4,15E-02 1,61 3,1

hsa-miR-373*

1,85 0,72 0,24 0,68 6,77E-03 1,61 3,0

hsa-miR-182*

1,12 0,70 -0,41 0,86 1,50E-02 1,53 2,9

hsa-miR-663

5,58 1,19 4,09 0,76 4,64E-02 1,49 2,8

hsa-miR-765

3,72 1,08 2,28 0,68 3,52E-02 1,44 2,7

hsa-miR-584

3,47 1,28 2,03 0,45 4,53E-02 1,44 2,7

hsa-miR-152

7,58 0,80 6,19 0,48 1,04E-02 1,39 2,6

hsa-miR-936

1,69 0,95 0,34 0,48 2,21E-02 1,35 2,5

hsa-miR-371-5p

4,16 0,71 2,81 0,43 6,54E-03 1,35 2,5

hsa-miR-183

7,67 1,17 6,34 0,19 3,55E-02 1,33 2,5

hsa-miR-602

3,17 0,70 1,86 0,42 7,13E-03 1,31 2,5

hsa-miR-1915*

-0,14 0,90 -1,44 0,82 4,48E-02 1,30 2,5

hsa-miR-96

9,53 1,14 8,25 0,45 4,69E-02 1,28 2,4

hsa-miR-1268

7,82 0,51 6,57 0,52 4,97E-03 1,25 2,4

hsa-miR-12075p

9,42 0,95 8,19 0,66 4,43E-02 1,23 2,4

hsa-miR-134

5,80 0,88 4,56 0,60 3,21E-02 1,23 2,4

hsa-miR-12245p

5,41 0,82 4,26 0,47 2,64E-02 1,15 2,2

hsa-miR-572

5,22 0,61 4,08 0,45 9,89E-03 1,14 2,2

hsa-miR-135a*

4,75 0,88 3,61 0,32 2,63E-02 1,14 2,2

hsa-miR-363

5,78 0,59 4,69 0,85 4,68E-02 1,09 2,1

hsa-miR-1321

1,25 0,46 0,17 0,39 3,84E-03 1,08 2,1

hsa-miR-638

8,39 0,59 7,32 0,50 1,51E-02 1,07 2,1

hsa-miR-1915

8,15 0,61 7,09 0,28 8,14E-03 1,05 2,1

hsa-miR-939

6,76 0,73 5,75 0,45 2,98E-02 1,01 2,0

miARN

FTC PTC FTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-652

6,19 0,81 5,22 0,29 3,47E-02 0,98 2,0

hsa-miR-30c

11,38 0,57 10,41 0,58 2,89E-02 0,97 2,0

hsa-miR-940

6,98 0,73 6,07 0,15 2,63E-02 0,91 1,9

hsa-miR-876-3p

1,27 0,55 0,41 0,55 3,70E-02 0,87 1,8

hsa-miR-130b

7,34 0,42 6,55 0,21 5,40E-03 0,79 1,7

hsa-miR-30e*

8,01 0,50 7,25 0,46 3,87E-02 0,75 1,7

hsa-miR-190

2,39 0,50 1,64 0,29 2,04E-02 0,75 1,7

hsa-miR-34c-3p

-0,70 0,62 -1,42 0,20 3,90E-02 0,72 1,6

hsa-miR-662

1,65 0,44 0,98 0,16 1,37E-02 0,67 1,6

hsa-miR-501-3p

3,45 0,46 2,83 0,27 2,95E-02 0,63 1,5

hsa-miR-93*

1,18 0,23 0,58 0,36 1,45E-02 0,60 1,5

hsa-miR-335*

2,54 0,25 1,99 0,18 3,97E-03 0,55 1,5

hsa-miR-1271

3,63 0,23 3,98 0,16 2,57E-02 -0,35 1,3

hsa-miR-16

13,11 0,21 13,53 0,18 1,07E-02 -0,41 1,3

hsa-miR-34a*

4,59 0,38 5,07 0,21 3,87E-02 -0,48 1,4

hsa-miR-374b

7,79 0,45 8,38 0,22 3,08E-02 -0,59 1,5

hsa-miR-24

11,99 0,37 12,58 0,31 2,64E-02 -0,59 1,5

hsa-miR-29a

13,71 0,18 14,31 0,37 1,27E-02 -0,60 1,5

hsa-let-7i*

3,09 0,42 3,76 0,40 3,21E-02 -0,67 1,6

hsa-miR-361-3p

6,60 0,33 7,27 0,20 4,77E-03 -0,67 1,6

hsa-miR-1305

7,48 0,33 8,28 0,53 2,12E-02 -0,80 1,7

hsa-miR-10a*

0,55 0,39 1,51 0,31 2,47E-03 -0,97 2,0

hsa-miR-224

4,74 0,67 5,75 0,50 2,76E-02 -1,01 2,0

hsa-let-7i

13,46 0,42 14,53 0,18 7,61E-04 -1,07 2,1

hsa-miR-23b*

2,87 0,81 4,00 0,58 3,59E-02 -1,13 2,2

hsa-miR-625

5,02 0,94 6,17 0,25 2,99E-02 -1,15 2,2

hsa-miR-181c

6,41 0,72 7,59 0,35 1,08E-02 -1,18 2,3

hsa-miR-181c*

3,42 0,81 4,63 0,41 1,77E-02 -1,21 2,3

hsa-miR-137

0,41 0,80 1,65 0,86 4,54E-02 -1,25 2,4

hsa-miR-181b

8,27 0,94 9,59 0,52 2,60E-02 -1,32 2,5

hsa-miR-21

14,52 0,58 15,85 0,45 3,76E-03 -1,32 2,5

hsa-miR-181d

5,41 0,66 6,74 0,28 3,20E-03 -1,33 2,5

hsa-miR-509-35p

-0,83 0,51 0,73 1,31 3,84E-02 -1,56 2,9

miARN

FTC PTC FTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-509-3p

-0,52 0,58 1,16 1,39 3,77E-02 -1,67 3,2

hsa-miR-181a-2*

4,29 0,66 6,23 0,66 1,62E-03 -1,94 3,8

hsa-miR-514

0,50 0,21 2,93 0,86 2,70E-04 -2,43 5,4

hsa-miR-222

7,63 1,65 10,25 0,58 1,03E-02 -2,61 6,1

hsa-miR-200b*

2,61 1,38 5,62 0,59 2,07E-03 -3,01 8,1

hsa-miR-200a*

2,23 1,29 5,30 0,62 1,39E-03 -3,07 8,4

hsa-miR-429

5,86 2,18 8,97 0,55 1,50E-02 -3,10 8,6

hsa-miR-200a

7,09 2,00 10,22 0,52 9,70E-03 -3,13 8,7

hsa-miR-31*

5,39 1,63 8,58 0,56 3,21E-03 -3,19 9,1

hsa-miR-31

6,66 1,68 10,14 0,64 2,51E-03 -3,49 11,2

hsa-miR-200b

8,28 1,82 11,78 0,50 3,22E-03 -3,49 11,3

hsa-miR-146b3p

-1,06 0,61 3,73 1,12 3,12E-05 -4,79 27,6

hsa-miR-375

1,85 2,10 6,74 1,20 1,95E-03 -4,89 29,6

hsa-miR-551b

4,93 0,73 9,98 0,58 2,03E-06 -5,05 33,0

hsa-miR-146b5p

7,93 1,61 14,41 0,92 5,20E-05 -6,47 88,9

EJEMPLO 21 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL CARCINOMA FOLICULAR DE TIROIDES Y LA

VARIANTE FOLICULAR DEL CARCINOMA PAPILAR DE TIROIDES

5 Un total de 47 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre muestras de carcinoma folicular de tiroides y los especímenes de la variante folicular del carcinoma papilar de tiroides (p<0,05) (tabla 23). Entre estos, siete miARN (hsa-miR-148a*, -148a, -22*, -1295, -32, -152 y -1260) se expresaron a niveles al menos 2 veces mayores en muestras de FTC en comparación con muestras de FVPTC (dif. Log2 (FTC frente a FVPTC) ≥1). Entre los miARN expresados a un menor nivel en FTC en comparación con muestras de FVPTC, dos

10 miARN (hsa-miR-146b-5p y hsa-miR-375) estaban subexpresados de 20 a 40 veces, cuatro miARN (hsa-miR-551b, 200b, -146b-3p y -31) estaban subexpresados de 10 a 20 veces, seis miARN (has-miR-429, -200b*, -200a*, -200a, 31* y -133b) estaban subexpresados de 5 a 10 veces y nueve miARN estaban subexpresados de 2 a 5 veces en muestras de FTC en comparación con especímenes de FVPTC.

Tabla 23. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FTC y de FVPTC. MED, 15 expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

FTC FVPTC FTC frente a FVPTC

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-148a*

2,35 0,67 0,48 0,48 2,35E-03 1,87 3,6

hsa-miR-148a

11,79 0,72 10,02 0,33 2,78E-03 1,76 3,4

hsa-miR-22*

5,80 0,79 4,29 0,52 1,35E-02 1,52 2,9

hsa-miR-1295

3,03 0,84 1,59 0,89 4,10E-02 1,44 2,7

miARN

FTC FVPTC FTC frente a FVPTC

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-32

5,08 0,46 3,82 0,79 1,94E-02 1,27 2,4

hsa-miR-152

7,58 0,80 6,38 0,23 2,39E-02 1,20 2,3

hsa-miR-1260

9,49 0,60 8,51 0,59 4,33E-02 0,98 2,0

hsa-miR-30e*

8,01 0,50 7,09 0,46 2,51E-02 0,92 1,9

hsa-miR-362-3p

6,13 0,39 5,23 0,41 1,17E-02 0,90 1,9

hsa-miR-30c

11,38 0,57 10,51 0,51 4,79E-02 0,88 1,8

hsa-miR-365

8,76 0,49 7,90 0,40 2,47E-02 0,86 1,8

hsa-miR-660

7,68 0,68 6,82 0,24 4,90E-02 0,86 1,8

hsa-miR-532-3p

5,86 0,60 5,10 0,09 4,13E-02 0,76 1,7

hsa-miR-130b

7,34 0,42 6,61 0,04 1,09E-02 0,73 1,7

hsa-miR-190

2,39 0,50 1,73 0,22 4,49E-02 0,66 1,6

hsa-miR-335*

2,54 0,25 1,94 0,38 2,39E-02 0,60 1,5

hsa-miR-501-5p

4,39 0,12 4,15 0,14 2,92E-02 0,24 1,2

hsa-miR-513b

3,17 0,22 3,72 0,26 1,09E-02 -0,55 1,5

hsa-miR-513a-5p

3,73 0,42 4,37 0,17 2,39E-02 -0,64 1,6

hsa-miR-513c

2,27 0,12 2,98 0,11 3,48E-05 -0,71 1,6

hsa-miR-378*

2,49 0,25 3,32 0,25 1,78E-03 -0,82 1,8

hsa-let-7g*

-1,09 0,50 -0,24 0,12 1,39E-02 -0,84 1,8

hsa-miR-211

0,50 0,36 1,36 0,41 1,30E-02 -0,85 1,8

hsa-miR-574-5p

5,80 0,57 6,65 0,20 2,56E-02 -0,85 1,8

hsa-miR-483-3p

0,84 0,56 1,71 0,42 3,86E-02 -0,86 1,8

hsa-miR-346

0,27 0,31 1,18 0,24 1,75E-03 -0,91 1,9

hsa-miR-181c*

3,42 0,81 4,55 0,48 4,51E-02 -1,13 2,2

hsa-miR-181c

6,41 0,72 7,54 0,43 2,87E-02 -1,13 2,2

hsa-let-7i

13,46 0,42 14,62 0,43 4,79E-03 -1,16 2,2

hsa-miR-595

0,18 0,21 1,35 0,71 9,19E-03 -1,17 2,2

hsa-miR-181d

5,41 0,66 6,61 0,55 2,32E-02 -1,20 2,3

hsa-miR-509-3-5p

-0,83 0,51 0,49 0,65 1,07E-02 -1,32 2,5

hsa-miR-514

0,50 0,21 1,87 1,16 3,47E-02 -1,36 2,6

hsa-miR-23b*

2,87 0,81 4,28 0,15 1,17E-02 -1,41 2,7

hsa-miR-181a-2*

4,29 0,66 5,91 1,15 3,16E-02 -1,62 3,1

hsa-miR-133b

5,78 1,31 8,20 1,72 4,66E-02 -2,42 5,4

hsa-miR-31*

5,39 1,63 8,47 1,06 1,39E-02 -3,08 8,5

miARN

FTC FVPTC FTC frente a FVPTC

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-200a

7,09 2,00 10,20 0,62 2,13E-02 -3,11 8,6

hsa-miR-200a*

2,23 1,29 5,38 0,59 2,88E-03 -3,16 8,9

hsa-miR-200b*

2,61 1,38 5,82 0,47 3,17E-03 -3,22 9,3

hsa-miR-429

5,86 2,18 9,17 0,77 2,44E-02 -3,31 9,9

hsa-miR-31

6,66 1,68 10,06 1,12 1,06E-02 -3,41 10,6

hsa-miR-146b-3p

-1,06 0,61 2,46 1,30 9,87E-04 -3,52 11,5

hsa-miR-200b

8,28 1,82 11,82 0,67 8,09E-03 -3,54 11,6

hsa-miR-551b

4,93 0,73 8,99 0,76 8,21E-05 -4,06 16,6

hsa-miR-375

1,85 2,10 6,25 1,32 8,35E-03 -4,40 21,2

hsa-miR-146b-5p

7,93 1,61 13,20 1,09 8,37E-04 -5,27 38,5

EJEMPLO 22

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL CARCINOMA FOLICULAR DE TIROIDES Y EL CARCINOMA ANAPLÁSICO DE TIROIDES

5 Un total de 73 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de carcinoma folicular de tiroides y la muestra de carcinoma anaplásico de tiroides (p<0,05) (tabla 24). Entre estos, 45 miARN se expresaron al menos 2 veces más en muestras de FTC en comparación con la muestra de ATC (dif. Log2 (FTC frente a ATC) ≥ 1). Entre estos, cuatro miARN (hsa-miR-141, -200c, -135b y 135a) estaban regulados positivamente de 200 a 600 veces en FTC, tres miARN (hsa-miR-141*, -138, y -200c*) estaban regulados

10 positivamente de 10 a 60 veces en FTC, doce miARN (hsa-miR-125b, -7i*, -99a, -145, -148*, -126*, -218, -145*, 143, -32, -452 y 551b) estaban regulados positivamente de 5 a 10 veces en FTC y veintiséis miARN estaban regulados positivamente de 2 a 5 veces en especímenes de FTC en comparación con la muestra de ATC. Además, quince miARN estaban expresados a un nivel menor en FTC en comparación con la muestra de ATC. Entre estos, seis miARN (hsa-miR-9*, -582-3p, -124, -9, -10a y 34c-5p) estaban subexpresados de 10 a 40 veces en muestras de

15 FTC y nueve miARN estaban subexpresados de 2 a 10 veces en muestras de FTC en comparación con el espécimen de ATC.

Tabla 24. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FTC y de ATC. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

ATC FTC ATC frente a FTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-9*

7,14 1,84 1,04 9,49E-03 5,30 39,4

hsa-miR-582-3p

3,97 -0,87 0,67 2,70E-03 4,84 28,6

hsa-miR-124

4,16 -0,40 1,08 1,83E-02 4,55 23,4

hsa-miR-9

5,05 1,18 0,28 2,13E-04 3,87 14,7

hsa-miR-10a

10,38 6,67 1,02 2,93E-02 3,71 13,1

hsa-miR-34c-5p

7,37 3,90 0,69 1,04E-02 3,47 11,1

hsa-miR-34b

4,65 1,45 0,70 1,41E-02 3,20 9,2

hsa-miR-34c-3p

1,95 -0,70 0,62 1,71E-02 2,66 6,3

hsa-miR-10a*

2,44 0,55 0,39 1,16E-02 1,90 3,7

miARN

ATC FTC ATC frente a FTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-483-3p

2,61 0,84 0,56 4,53E-02 1,77 3,4

hsa-miR-196a

3,56 1,82 0,34 9,34E-03 1,74 3,3

hsa-miR-769-5p

6,42 4,87 0,33 1,25E-02 1,55 2,9

hsa-miR-330-3p

5,15 3,76 0,43 4,04E-02 1,39 2,6

hsa-miR-378*

3,68 2,49 0,25 1,22E-02 1,18 2,3

hsa-miR-431

2,26 1,24 0,24 1,78E-02 1,02 2,0

hsa-miR-505*

4,69 3,79 0,17 8,14E-03 0,90 1,9

hsa-miR-326

2,42 1,53 0,24 2,90E-02 0,89 1,9

hsa-miR-1237

3,83 3,00 0,26 4,43E-02 0,83 1,8

hsa-miR-1238

4,72 4,11 0,20 4,79E-02 0,61 1,5

hsa-miR-1825

4,20 3,62 0,15 2,16E-02 0,59 1,5

hsa-miR-425*

4,08 3,49 0,17 3,16E-02 0,59 1,5

hsa-miR-191*

4,58 4,01 0,16 2,86E-02 0,57 1,5

hsa-miR-10b*

1,78 2,42 0,15 1,94E-02 -0,64 1,6

hsa-miR-101*

1,44 2,16 0,23 4,81E-02 -0,72 1,6

hsa-miR-26a-1*

0,60 1,33 0,18 1,93E-02 -0,73 1,7

hsa-miR-454

5,50 6,31 0,22 3,07E-02 -0,81 1,7

hsa-miR-93

7,61 8,50 0,27 3,78E-02 -0,90 1,9

hsa-miR-615-3p

-1,03 -0,12 0,29 4,42E-02 -0,91 1,9

hsa-miR-7-1*

3,84 4,81 0,22 1,62E-02 -0,98 2,0

hsa-miR-423-3p

2,56 3,62 0,17 5,27E-03 -1,06 2,1

hsa-miR-642

-1,95 -0,85 0,35 4,75E-02 -1,10 2,1

hsa-miR-338-5p

1,05 2,26 0,28 1,64E-02 -1,21 2,3

hsa-miR-423-5p

5,61 6,84 0,17 2,93E-03 -1,23 2,3

hsa-miR-101

7,49 8,83 0,34 2,38E-02 -1,33 2,5

hsa-miR-1826

4,37 5,72 0,40 3,53E-02 -1,36 2,6

hsa-miR-95

6,41 7,84 0,35 2,06E-02 -1,42 2,7

hsa-miR-892a

-0,72 0,73 0,47 4,71E-02 -1,45 2,7

hsa-let-7i

11,99 13,46 0,42 3,34E-02 -1,47 2,8

hsa-miR-19a

7,12 8,60 0,40 2,88E-02 -1,48 2,8

hsa-miR-92a

7,77 9,25 0,33 1,51E-02 -1,48 2,8

hsa-miR-26a

10,36 11,85 0,41 2,99E-02 -1,48 2,8

hsa-miR-30e

8,44 9,98 0,49 4,45E-02 -1,54 2,9

miARN

ATC FTC ATC frente a FTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-346

-1,38 0,27 0,31 7,94E-03 -1,65 3,1

hsa-miR-19b-1*

1,32 2,96 0,45 2,83E-02 -1,65 3,1

hsa-miR-767-5p

-1,10 0,56 0,26 4,42E-03 -1,65 3,1

hsa-miR-93*

-0,59 1,18 0,23 2,21E-03 -1,76 3,4

hsa-miR-30b

9,75 11,54 0,57 4,45E-02 -1,80 3,5

hsa-miR-30d*

1,12 3,02 0,36 8,57E-03 -1,91 3,8

hsa-miR-17*

3,60 5,55 0,41 1,18E-02 -1,95 3,9

hsa-miR-126

10,01 12,06 0,55 2,72E-02 -2,05 4,1

hsa-miR-143*

1,36 3,56 0,60 2,91E-02 -2,20 4,6

hsa-miR-20a*

2,51 4,73 0,24 1,07E-03 -2,22 4,6

hsa-miR-491-5p

-1,33 0,93 0,67 3,76E-02 -2,26 4,8

hsa-miR-224

2,46 4,74 0,67 3,62E-02 -2,28 4,9

hsa-miR-551b

2,61 4,93 0,73 4,41E-02 -2,32 5,0

hsa-miR-452

1,57 3,94 0,77 4,84E-02 -2,37 5,2

hsa-miR-32

2,63 5,08 0,46 8,20E-03 -2,46 5,5

hsa-miR-143

5,31 7,81 0,76 3,93E-02 -2,51 5,7

hsa-miR-145*

2,37 5,06 0,76 3,14E-02 -2,69 6,5

hsa-miR-218

5,04 7,78 0,57 1,17E-02 -2,74 6,7

hsa-miR-126*

3,44 6,22 0,37 2,45E-03 -2,78 6,9

hsa-miR-148a*

-0,55 2,35 0,67 1,71E-02 -2,90 7,5

hsa-miR-145

6,78 9,75 0,89 3,79E-02 -2,97 7,8

hsa-miR-99a

8,00 10,99 0,82 2,96E-02 -2,99 8,0

hsa-let-7i*

0,07 3,09 0,42 2,69E-03 -3,02 8,1

hsa-miR-125b

10,44 13,75 0,57 6,10E-03 -3,31 9,9

hsa-miR-200c*

-0,83 2,57 0,40 1,51E-03 -3,40 10,6

hsa-miR-138

0,09 4,85 1,20 2,26E-02 -4,76 27,0

hsa-miR-141*

-1,68 4,23 0,52 4,74E-04 -5,91 60,1

hsa-miR-135a

1,19 8,96 0,34 2,99E-05 -7,76 217,4

hsa-miR-135b

2,20 10,03 1,65 1,24E-02 -7,83 228,3

hsa-miR-200c

3,00 12,10 0,69 2,66E-04 -9,09 546,5

hsa-miR-141

2,51 11,85 0,96 8,85E-04 -9,34 649,3

EJEMPLO 23 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL CARCINOMA FOLICULAR DE TIROIDES Y EL

CARCINOMA MEDULAR DE TIROIDES

Un total de 136 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de

5 carcinoma folicular de tiroides y los especímenes de carcinoma medular de tiroides (MTC) (p<0,05) (tabla 25). Entre estos, 17 se expresaron (dif. Log2 (FTC frente a MTC) ≥ 1) de 2 a 10 veces más en muestras de FTC en comparación con las muestras de MTC. Además, se expresaron cien miARN a un nivel menor en FTC en comparación con las muestras de MTC. Entre estos, hsa-miR-375 estaba subexpresado en más de 1000 veces en muestras de FTC, tres miARN estaban subexpresados de 100 a 300 veces en muestras de FTC, cuarenta y cuatro

10 miARN estaban subexpresados de 10 a 100 veces y cincuenta y dos miARN estaban subexpresados entre 2 y 10 veces en las muestras de FTC en comparación con los especímenes de MTC.

Tabla 25. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FTC y de MTC. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

FTC MTC FTC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-203

6,93 1,47 3,46 2,00 2,95E-02 3,46 11,0

hsa-miR-30a

12,28 1,12 9,76 1,51 3,42E-02 2,52 5,7

hsa-miR-30a*

9,03 1,12 6,59 1,57 4,10E-02 2,44 5,4

hsa-miR-34a*

4,59 0,38 3,09 0,61 4,80E-03 1,50 2,8

hsa-miR-148a*

2,35 0,67 0,88 0,82 3,23E-02 1,47 2,8

hsa-miR-34a

12,03 0,62 10,62 0,71 2,60E-02 1,40 2,6

hsa-miR-32

5,08 0,46 3,71 0,68 1,33E-02 1,38 2,6

hsa-miR-30e*

8,01 0,50 6,67 0,55 1,22E-02 1,34 2,5

hsa-miR-22*

5,80 0,79 4,54 0,31 4,25E-02 1,26 2,4

hsa-let-7i*

3,09 0,42 1,85 0,98 4,20E-02 1,24 2,4

hsa-miR-30c

11,38 0,57 10,16 0,57 2,62E-02 1,22 2,3

hsa-miR-34b*

7,22 0,41 6,00 0,79 2,56E-02 1,22 2,3

hsa-miR-20b

8,22 0,43 7,02 0,70 2,20E-02 1,20 2,3

hsa-miR-20a

10,88 0,43 9,76 0,82 4,07E-02 1,12 2,2

hsa-miR-30e

9,98 0,49 8,87 0,25 1,15E-02 1,11 2,2

hsa-miR-135a

8,96 0,34 7,85 0,66 1,78E-02 1,11 2,2

hsa-miR-19a

8,60 0,40 7,51 0,18 5,06E-03 1,09 2,1

hsa-miR-19b

11,18 0,50 10,25 0,32 2,92E-02 0,93 1,9

hsa-miR-19b-1*

2,96 0,45 2,09 0,30 2,52E-02 0,88 1,8

hsa-miR-190

2,39 0,50 1,53 0,26 3,51E-02 0,86 1,8

hsa-miR-634

2,53 0,36 1,68 0,13 8,89E-03 0,84 1,8

hsa-miR-126*

6,22 0,37 5,45 0,16 1,68E-02 0,77 1,7

hsa-miR-1234

4,56 0,24 3,90 0,47 3,76E-02 0,65 1,6

hsa-miR-20a*

4,73 0,24 4,10 0,23 1,06E-02 0,63 1,5

miARN

FTC MTC FTC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-191*

4,01 0,16 3,52 0,30 2,13E-02 0,49 1,4

hsa-miR-425*

3,49 0,17 3,11 0,24 3,66E-02 0,38 1,3

hsa-miR-29a

13,71 0,18 14,04 0,15 3,97E-02 -0,33 1,3

hsa-miR-25

9,72 0,22 10,13 0,14 2,84E-02 -0,41 1,3

hsa-miR-454

6,31 0,22 6,74 0,18 3,02E-02 -0,44 1,4

hsa-miR-320c

9,49 0,11 10,00 0,42 3,65E-02 -0,51 1,4

hsa-miR-320d

10,00 0,17 10,53 0,43 4,41E-02 -0,53 1,4

hsa-miR-320a

8,36 0,16 8,92 0,11 1,99E-03 -0,56 1,5

hsa-miR-320b

9,46 0,18 10,06 0,28 9,54E-03 -0,60 1,5

hsa-miR-769-5p

4,87 0,33 5,73 0,25 8,46E-03 -0,86 1,8

hsa-miR-595

0,18 0,21 1,11 0,62 1,78E-02 -0,93 1,9

hsa-miR-557

4,66 0,55 5,61 0,40 4,13E-02 -0,95 1,9

hsa-miR-628-5p

3,69 0,52 4,66 0,34 2,93E-02 -0,96 2,0

hsa-miR-24

11,99 0,37 13,02 0,16 4,47E-03 -1,03 2,0

hsa-miR-582-3p

-0,87 0,67 0,19 0,32 4,49E-02 -1,06 2,1

hsa-miR-505

4,94 0,33 6,04 0,67 1,95E-02 -1,10 2,1

hsa-miR-212

4,82 0,49 5,93 0,76 4,29E-02 -1,11 2,2

hsa-miR-1250

-0,21 0,49 0,92 0,27 1,07E-02 -1,14 2,2

hsa-miR-99b

8,31 0,61 9,49 0,13 1,89E-02 -1,18 2,3

hsa-let-7e

11,56 0,69 12,78 0,21 2,70E-02 -1,22 2,3

hsa-miR-335*

2,54 0,25 3,78 0,88 2,12E-02 -1,24 2,4

hsa-miR-301a

6,31 0,64 7,56 0,34 2,21E-02 -1,25 2,4

hsa-miR-505*

3,79 0,17 5,07 0,90 1,72E-02 -1,28 2,4

hsa-miR-652

6,19 0,81 7,51 0,29 3,87E-02 -1,31 2,5

hsa-miR-656

0,78 0,40 2,09 0,62 1,02E-02 -1,31 2,5

hsa-miR-181d

5,41 0,66 6,86 0,09 1,06E-02 -1,46 2,7

hsa-miR-642

-0,85 0,35 0,65 0,41 1,49E-03 -1,50 2,8

hsa-miR-128

6,78 0,22 8,29 0,89 8,83E-03 -1,51 2,9

hsa-miR-95

7,84 0,35 9,43 0,66 3,65E-03 -1,60 3,0

hsa-miR-337-3p

1,54 0,34 3,15 0,43 9,77E-04 -1,62 3,1

hsa-miR-27b

11,31 0,86 12,95 0,25 2,08E-02 -1,64 3,1

hsa-miR-23b*

2,87 0,81 4,61 0,28 1,31E-02 -1,74 3,3

hsa-miR-24-1*

4,76 0,85 6,56 0,18 1,23E-02 -1,81 3,5

miARN

FTC MTC FTC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-216b

-1,86 0,39 0,04 1,44 2,70E-02 -1,90 3,7

hsa-miR-181c*

3,42 0,81 5,32 0,15 8,10E-03 -1,90 3,7

hsa-miR-23b

11,51 0,97 13,42 0,15 1,68E-02 -1,91 3,7

hsa-miR-654-5p

2,39 0,76 4,30 0,31 6,80E-03 -1,91 3,8

hsa-miR-299-3p

1,16 0,86 3,11 0,45 1,18E-02 -1,94 3,8

hsa-miR-1185

1,08 0,45 3,03 0,54 1,43E-03 -1,95 3,9

hsa-miR-369-3p

0,89 0,48 2,85 0,71 3,23E-03 -1,96 3,9

hsa-miR-181c

6,41 0,72 8,44 0,26 3,80E-03 -2,03 4,1

hsa-miR-7-1*

4,81 0,22 6,88 0,44 1,06E-04 -2,07 4,2

hsa-miR-326

1,53 0,24 3,61 0,14 1,09E-05 -2,08 4,2

hsa-miR-132*

3,47 0,44 5,58 1,13 8,30E-03 -2,11 4,3

hsa-miR-183*

2,14 1,17 4,36 0,40 2,12E-02 -2,22 4,7

hsa-miR-668

-0,97 0,46 1,30 0,42 4,31E-04 -2,27 4,8

hsa-miR-598

5,66 0,84 7,98 0,33 4,34E-03 -2,32 5,0

hsa-miR-552

-0,34 0,81 2,05 1,77 3,60E-02 -2,40 5,3

hsa-miR-335

6,55 0,74 9,06 1,56 1,92E-02 -2,51 5,7

hsa-miR-376b

0,88 1,24 3,45 1,39 3,45E-02 -2,57 5,9

hsa-miR-330-3p

3,76 0,43 6,34 0,46 1,90E-04 -2,58 6,0

hsa-miR-338-3p

6,72 0,87 9,34 0,35 2,80E-03 -2,62 6,1

hsa-miR-377*

0,32 0,43 2,94 0,16 5,92E-05 -2,62 6,1

hsa-miR-1301

0,82 0,78 3,45 0,62 2,63E-03 -2,63 6,2

hsa-miR-663b

1,24 0,71 3,88 1,00 4,56E-03 -2,64 6,2

hsa-miR-486-3p

0,61 0,84 3,41 0,41 1,81E-03 -2,80 7,0

hsa-miR-183

7,67 1,17 10,49 0,69 9,61E-03 -2,82 7,1

hsa-miR-299-5p

2,33 1,25 5,22 0,48 9,71E-03 -2,89 7,4

hsa-miR-132

6,06 0,44 8,97 1,15 1,89E-03 -2,90 7,5

hsa-miR-370

1,75 0,74 4,77 0,36 6,54E-04 -3,01 8,1

hsa-miR-890

-0,43 1,06 2,63 1,99 2,73E-02 -3,06 8,3

hsa-miR-493*

2,22 1,19 5,39 0,45 4,96E-03 -3,17 9,0

hsa-miR-376a*

1,45 0,46 4,63 0,44 7,49E-05 -3,18 9,1

hsa-miR-10a*

0,55 0,39 3,82 0,57 6,68E-05 -3,28 9,7

hsa-miR-337-5p

2,00 1,50 5,33 0,33 1,03E-02 -3,33 10,1

hsa-miR-200b*

2,61 1,38 5,99 0,11 6,39E-03 -3,39 10,4

miARN

FTC MTC FTC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-105

-1,37 0,57 2,03 2,55 2,34E-02 -3,40 10,6

hsa-miR-9*

1,84 1,04 5,31 1,78 1,19E-02 -3,46 11,0

hsa-miR-200a*

2,23 1,29 5,71 0,26 4,24E-03 -3,48 11,2

hsa-miR-9

1,18 0,28 4,69 1,56 2,09E-03 -3,51 11,4

hsa-miR-122

0,49 0,58 4,01 3,14 4,24E-02 -3,52 11,5

hsa-miR-154*

1,30 1,62 4,83 0,62 1,23E-02 -3,53 11,6

hsa-miR-329

0,53 0,46 4,13 0,15 1,38E-05 -3,60 12,1

hsa-miR-411

1,20 0,91 4,80 0,24 6,04E-04 -3,60 12,1

hsa-miR-369-5p

1,55 0,73 5,27 0,72 4,19E-04 -3,71 13,1

hsa-miR-431

1,24 0,24 5,00 1,06 2,06E-04 -3,75 13,5

hsa-miR-136

2,84 0,99 6,61 0,51 9,79E-04 -3,77 13,6

hsa-miR-543

1,52 0,78 5,30 0,05 1,92E-04 -3,78 13,7

hsa-miR-889

-0,01 0,31 3,79 0,54 1,30E-05 -3,80 13,9

hsa-miR-200b

8,28 1,82 12,17 0,08 1,15E-02 -3,89 14,8

hsa-miR-654-3p

2,33 1,51 6,30 0,51 5,21E-03 -3,97 15,6

hsa-miR-377

3,50 1,40 7,51 0,55 3,55E-03 -4,01 16,2

hsa-miR-200a

7,09 2,00 11,26 0,29 1,33E-02 -4,17 18,0

hsa-miR-376a

4,21 1,52 8,51 0,67 4,00E-03 -4,30 19,7

hsa-miR-485-3p

-0,08 0,71 4,27 0,37 7,28E-05 -4,35 20,4

hsa-miR-154

2,45 1,01 6,86 0,17 3,48E-04 -4,41 21,2

hsa-miR-409-5p

0,50 0,73 4,92 0,15 5,49E-05 -4,42 21,4

hsa-miR-429

5,86 2,18 10,32 0,28 1,44E-02 -4,45 21,9

hsa-miR-758

0,53 0,92 5,04 0,13 1,82E-04 -4,50 22,7

hsa-miR-495

2,43 1,15 6,93 0,28 6,54E-04 -4,50 22,7

hsa-miR-136*

1,87 1,17 6,41 0,51 8,12E-04 -4,54 23,2

hsa-miR-485-5p

-0,57 0,44 4,03 0,40 6,27E-06 -4,60 24,2

hsa-miR-137

0,41 0,80 5,03 3,11 1,62E-02 -4,62 24,6

hsa-miR-376c

4,56 1,42 9,21 0,81 2,23E-03 -4,65 25,1

hsa-miR-379

1,51 1,69 6,20 0,14 3,58E-03 -4,68 25,7

hsa-miR-382

1,70 0,95 6,53 0,24 1,52E-04 -4,83 28,5

hsa-miR-381

2,42 1,55 7,34 0,33 1,93E-03 -4,92 30,2

hsa-miR-409-3p

2,27 1,27 7,21 0,31 6,57E-04 -4,94 30,7

hsa-miR-127-3p

3,94 1,28 8,88 0,37 7,24E-04 -4,95 30,9

miARN

FTC MTC FTC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-10a

6,67 1,02 11,69 0,52 2,40E-04 -5,02 32,4

hsa-miR-487b

4,72 0,62 9,75 0,19 1,08E-05 -5,03 32,7

hsa-miR-7

8,81 2,62 13,88 0,95 2,00E-02 -5,06 33,4

hsa-miR-592

2,37 1,05 7,50 1,19 6,87E-04 -5,13 35,1

hsa-miR-487a

-0,49 0,56 4,79 0,32 6,17E-06 -5,27 38,7

hsa-miR-539

1,16 0,38 6,53 0,34 9,86E-07 -5,37 41,4

hsa-miR-432

2,12 0,63 7,61 0,36 1,04E-05 -5,48 44,7

hsa-miR-433

-1,53 0,62 4,13 0,61 1,55E-05 -5,66 50,5

hsa-miR-410

1,83 0,71 8,20 0,14 5,78E-06 -6,36 82,3

hsa-miR-323-3p

-0,16 0,72 6,93 0,13 3,36E-06 -7,09 135,9

hsa-miR-153

0,84 1,52 8,11 1,07 3,66E-04 -7,27 154,0

hsa-miR-124

-0,40 1,08 7,86 3,11 1,32E-03 -8,26 305,6

hsa-miR-375

1,85 2,10 13,86 0,40 7,72E-05 -12,01 4137,9

EJEMPLO 24 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL CARCINOMA PAPILAR DE TIROIDES Y LA

VARIANTE FOLICULAR DEL CARCINOMA PAPILAR DE TIROIDES

5 Un total de 48 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre muestras de carcinoma papilar de tiroides y los especímenes de la variante folicular del carcinoma papilar de tiroides (p<0,05) (tabla 26). Entre estos, 28 miARN estaban sobreexpresados de 2 a 5 veces (dif. Log2 (FVPTC frente a PTC) ≥ 1) en las muestras de FVPTC en comparación con las muestras de PTC (tabla 26).

Tabla 26. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FVPTC y de PTC. MED, 10 expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

FVPTC PTC FVPTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-659

3,28 0,92 1,42 0,91 1,92E-02 1,86 3,6

hsa-miR-486-5p

7,79 0,98 6,05 0,90 2,74E-02 1,74 3,3

hsa-miR-765

4,00 1,15 2,28 0,68 2,58E-02 1,72 3,3

hsa-miR-483-5p

6,22 1,20 4,52 0,79 3,69E-02 1,70 3,3

hsa-miR-663

5,77 1,09 4,09 0,76 2,98E-02 1,67 3,2

hsa-miR-1182

2,24 1,06 0,68 0,68 3,09E-02 1,56 2,9

hsa-miR-451

14,40 0,88 12,86 0,80 2,94E-02 1,53 2,9

hsa-miR-1471

3,83 0,89 2,31 0,52 1,48E-02 1,52 2,9

hsa-miR-583

0,88 0,95 -0,56 0,48 2,10E-02 1,43 2,7

hsa-miR-516a-5p

2,82 0,56 1,43 0,65 1,18E-02 1,39 2,6

hsa-miR-149*

1,62 1,06 0,27 0,56 4,27E-02 1,35 2,6

miARN

FVPTC PTC FVPTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-566

1,14 0,67 -0,20 0,64 1,76E-02 1,35 2,5

hsa-miR-298

0,52 0,93 -0,78 0,66 4,24E-02 1,31 2,5

hsa-miR-483-3p

1,71 0,42 0,43 0,35 1,55E-03 1,28 2,4

hsa-miR-125b-1*

2,05 0,58 0,81 0,78 3,34E-02 1,24 2,4

hsa-miR-135a*

4,84 0,47 3,61 0,32 2,32E-03 1,23 2,3

hsa-miR-1183

3,77 0,86 2,62 0,61 4,95E-02 1,16 2,2

hsa-miR-638

8,45 0,73 7,32 0,50 2,72E-02 1,14 2,2

hsa-miR-572

5,22 0,76 4,08 0,45 2,70E-02 1,14 2,2

hsa-miR-1321

1,29 0,74 0,17 0,39 2,11E-02 1,12 2,2

hsa-miR-150*

5,00 0,77 3,89 0,62 4,80E-02 1,10 2,1

hsa-miR-640

-0,07 0,79 -1,15 0,15 1,93E-02 1,08 2,1

hsa-miR-1909*

-0,17 0,40 -1,25 0,45 7,16E-03 1,07 2,1

hsa-miR-1224-5p

5,30 0,72 4,26 0,47 3,38E-02 1,04 2,1

hsa-miR-371-5p

3,83 0,78 2,81 0,43 3,89E-02 1,03 2,0

hsa-miR-518c*

0,52 0,72 -0,49 0,55 4,92E-02 1,01 2,0

hsa-miR-939

6,74 0,52 5,75 0,45 1,85E-02 0,99 2,0

hsa-miR-211

1,36 0,41 0,39 0,66 3,87E-02 0,97 2,0

hsa-miR-1910

-0,98 0,72 -1,90 0,24 2,97E-02 0,92 1,9

hsa-miR-1296

0,24 0,31 -0,65 0,51 1,87E-02 0,89 1,9

hsa-miR-516b

0,84 0,74 -0,04 0,28 4,27E-02 0,88 1,8

hsa-miR-1915

7,97 0,48 7,09 0,28 1,03E-02 0,87 1,8

hsa-miR-595

1,35 0,71 0,49 0,32 4,33E-02 0,86 1,8

hsa-miR-1306

1,68 0,13 0,92 0,46 1,60E-02 0,76 1,7

hsa-miR-346

1,18 0,24 0,46 0,56 4,87E-02 0,72 1,6

hsa-miR-662

1,69 0,36 0,98 0,16 5,13E-03 0,71 1,6

hsa-miR-1275

7,19 0,26 6,55 0,47 4,50E-02 0,64 1,6

hsa-miR-658

-0,02 0,28 -0,65 0,32 1,61E-02 0,64 1,6

hsa-miR-488*

-0,09 0,51 -0,71 0,25 4,71E-02 0,62 1,5

hsa-miR-513b

3,72 0,26 3,14 0,24 1,08E-02 0,58 1,5

hsa-miR-940

6,58 0,36 6,07 0,15 2,20E-02 0,51 1,4

hsa-miR-20a

10,68 0,25 11,03 0,12 2,62E-02 -0,35 1,3

hsa-miR-502-5p

3,33 0,25 3,74 0,16 2,07E-02 -0,41 1,3

hsa-miR-625

5,66 0,26 6,17 0,25 2,24E-02 -0,50 1,4

miARN

FVPTC PTC FVPTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-15b*

1,13 0,41 1,71 0,29 4,44E-02 -0,58 1,5

hsa-miR-10a*

0,79 0,52 1,51 0,31 3,30E-02 -0,73 1,7

hsa-miR-1305

7,43 0,36 8,28 0,53 3,03E-02 -0,85 1,8

hsa-miR-21

14,94 0,64 15,85 0,45 4,13E-02 -0,90 1,9

EJEMPLO 25

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL CARCINOMA PAPILAR DE TIROIDES Y EL CARCINOMA ANAPLÁSICO DE TIROIDES

5 Un total de 154 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de carcinoma papilar de tiroides y el espécimen de carcinoma anaplásico de tiroides (p<0,05) (tabla 27). De estos, 89 se expresaron al menos 2 veces más en muestras de PTC en comparación con la muestra de ATC (dif. Log2 (PTC frente a ATC) ≥ 1). Entre estos, ocho miARN (hsa-miR-141, -429, -200c, -20, -200a, -135b, -551b y -135a) estaban sobreexpresados de 100 a 500 veces en las muestras de FTC, ocho miARN (hsa-miR-146b-3p, -141*, -375, -146b

10 5p, -200b*, -200a*, -138, y -31) estaban sobreexpresados entre 20 y 60 veces en las muestras de PTC y setenta y tres miARN estaban sobreexpresados de 2 a 20 veces en muestras de PTC en comparación con el espécimen de ATC. Además, cuarenta y dos miARN estaban subexpresados en los especímenes de PTC frente a la muestra de ATC. Entre estos, dos miARN (hsa-miR-582-3p y -9*) estaban subexpresados de 30 a 50 veces en las muestras de PTC, ocho miARN (hsa-miR-582-5p, -873, -124, -9, -34c-5p, -204, -34c-3p y -34b) estaban subexpresados en las

15 muestras de PTC de 10 a 30 veces y treinta y dos miARN estaban subexpresados de 2 a 10 veces en muestras de PTC en comparación con el espécimen de ATC. El agrupamiento no supervisado, así como el análisis de componente principal (PCA) (FIG. 1) en todas las sondas detectadas demostró una clara segregación entre tiroides normal (Norm) y nódulos hiperplásicos (Nod) y entre muestras de cáncer medular de tiroides (MED) y todas las neoplasias derivadas de células foliculares (FA, FTC, PTC y FVPTC), lo que se correlaciona con los diferentes

20 orígenes de los tumores (células C frente a células foliculares). La comparación por pares entre los diferentes grupos de muestras permitió la identificación de miARN expresados de manera diferencial, tal como se describe en los ejemplos más adelante.

Tabla 27. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de PTC y de ATC. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

ATC PTC ATC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-582-3p

3,97 -1,38 0,37 1,91E-04 5,35 40,9

hsa-miR-9*

7,14 2,08 1,06 1,22E-02 5,07 33,5

hsa-miR-582-5p

8,42 3,66 0,51 1,02E-03 4,76 27,1

hsa-miR-873

5,52 0,81 0,78 5,26E-03 4,71 26,2

hsa-miR-124

4,16 -0,38 0,31 1,89E-04 4,53 23,2

hsa-miR-9

5,05 0,99 0,68 5,37E-03 4,06 16,7

hsa-miR-34c-5p

7,37 3,41 0,79 1,05E-02 3,96 15,5

hsa-miR-204

8,74 5,26 0,80 1,64E-02 3,49 11,2

hsa-miR-34c-3p

1,95 -1,42 0,20 1,04E-04 3,38 10,4

hsa-miR-34b

4,65 1,29 0,56 5,27E-03 3,36 10,2

hsa-miR-10a

10,38 7,36 0,58 9,14E-03 3,02 8,1

hsa-miR-210

8,74 5,79 0,37 1,97E-03 2,95 7,7

miARN

ATC PTC ATC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-592

4,74 2,04 0,61 1,57E-02 2,70 6,5

hsa-miR-605

3,82 1,15 0,60 1,58E-02 2,67 6,4

hsa-miR-363

7,31 4,69 0,85 4,85E-02 2,63 6,2

hsa-miR-663

6,54 4,09 0,76 4,26E-02 2,45 5,5

hsa-miR-153

3,92 1,59 0,51 1,42E-02 2,33 5,0

hsa-miR-298

1,49 -0,78 0,66 3,47E-02 2,27 4,8

hsa-miR-483-3p

2,61 0,43 0,35 4,52E-03 2,19 4,5

hsa-miR-769-3p

3,15 1,08 0,49 1,76E-02 2,07 4,2

hsa-miR-876-3p

2,38 0,41 0,55 3,00E-02 1,98 3,9

hsa-miR-1274a

9,62 7,71 0,50 2,49E-02 1,91 3,8

hsa-miR-371-5p

4,62 2,81 0,43 1,84E-02 1,81 3,5

hsa-miR-583

1,23 -0,56 0,48 2,73E-02 1,79 3,5

hsa-miR-936

2,05 0,34 0,48 3,12E-02 1,71 3,3

hsa-miR-501-3p

4,53 2,83 0,27 4,34E-03 1,71 3,3

hsa-miR-517a

1,20 -0,45 0,52 4,45E-02 1,65 3,1

hsa-miR-720

14,50 12,95 0,34 1,42E-02 1,55 2,9

hsa-miR-939

7,27 5,75 0,45 3,64E-02 1,52 2,9

hsa-miR-1225-5p

9,76 8,28 0,48 4,84E-02 1,48 2,8

hsa-miR-769-5p

6,42 5,00 0,21 3,69E-03 1,42 2,7

hsa-miR-500*

5,90 4,53 0,27 9,30E-03 1,37 2,6

hsa-miR-502-3p

6,19 4,88 0,23 6,23E-03 1,31 2,5

hsa-miR-1274b

12,63 11,33 0,39 3,71E-02 1,30 2,5

hsa-miR-130b

7,77 6,55 0,21 6,44E-03 1,23 2,3

hsa-miR-330-3p

5,15 4,02 0,28 2,01E-02 1,13 2,2

hsa-miR-532-5p

7,58 6,51 0,17 5,08E-03 1,06 2,1

hsa-miR-656

1,64 0,58 0,26 2,08E-02 1,06 2,1

hsa-miR-135a*

4,66 3,61 0,32 3,89E-02 1,05 2,1

hsa-miR-660

8,23 7,17 0,27 2,49E-02 1,05 2,1

hsa-miR-377*

0,92 -0,13 0,26 2,05E-02 1,05 2,1

hsa-miR-362-5p

6,59 5,62 0,05 4,62E-05 0,98 2,0

hsa-miR-10a*

2,44 1,51 0,31 4,97E-02 0,93 1,9

hsa-miR-940

7,00 6,07 0,15 4,43E-03 0,93 1,9

hsa-miR-1237

3,83 2,93 0,28 4,47E-02 0,90 1,9

miARN

ATC PTC ATC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-556-3p

1,55 0,67 0,22 2,16E-02 0,89 1,8

hsa-miR-636

2,84 1,98 0,12 2,59E-03 0,85 1,8

hsa-miR-1228

5,64 4,79 0,23 2,98E-02 0,85 1,8

hsa-miR-550

2,88 2,03 0,27 4,55E-02 0,84 1,8

hsa-miR-129*

2,78 1,95 0,21 2,35E-02 0,83 1,8

hsa-miR-502-5p

4,57 3,74 0,16 8,43E-03 0,83 1,8

hsa-miR-885-5p

0,68 -0,10 0,21 2,91E-02 0,78 1,7

hsa-miR-1539

2,79 2,07 0,08 1,04E-03 0,72 1,6

hsa-miR-301b

2,28 1,59 0,20 3,28E-02 0,69 1,6

hsa-miR-22

12,78 12,12 0,11 4,98E-03 0,66 1,6

hsa-miR-335*

2,61 1,99 0,18 3,64E-02 0,62 1,5

hsa-miR-140-5p

9,04 8,48 0,15 2,69E-02 0,56 1,5

hsa-miR-25

9,41 9,92 0,16 4,50E-02 -0,51 1,4

hsa-miR-1271

3,33 3,98 0,16 2,14E-02 -0,64 1,6

hsa-miR-455-3p

5,69 6,39 0,19 2,73E-02 -0,70 1,6

hsa-miR-624*

1,27 1,98 0,17 1,85E-02 -0,71 1,6

hsa-miR-192

6,79 7,63 0,27 4,62E-02 -0,84 1,8

hsa-miR-423-3p

2,56 3,45 0,22 2,03E-02 -0,88 1,8

hsa-miR-361-3p

6,33 7,27 0,20 1,29E-02 -0,94 1,9

hsa-miR-16

12,57 13,53 0,18 7,74E-03 -0,95 1,9

hsa-miR-30e

8,44 9,46 0,25 2,11E-02 -1,02 2,0

hsa-miR-93

7,61 8,67 0,23 1,36E-02 -1,07 2,1

hsa-miR-17

8,41 9,48 0,14 2,19E-03 -1,07 2,1

hsa-miR-194

5,17 6,25 0,34 4,43E-02 -1,08 2,1

hsa-miR-95

6,41 7,54 0,31 2,98E-02 -1,13 2,2

hsa-miR-151-3p

6,52 7,67 0,26 1,57E-02 -1,15 2,2

hsa-miR-93*

-0,59 0,58 0,36 4,34E-02 -1,16 2,2

hsa-miR-181a*

3,19 4,36 0,24 1,17E-02 -1,17 2,2

hsa-let-7g

11,83 13,03 0,30 2,29E-02 -1,20 2,3

hsa-miR-1270

0,05 1,27 0,39 4,66E-02 -1,22 2,3

hsa-miR-192*

0,63 1,86 0,29 1,72E-02 -1,23 2,3

hsa-miR-423-5p

5,61 6,84 0,25 1,03E-02 -1,23 2,3

hsa-miR-29c

11,87 13,10 0,40 4,63E-02 -1,23 2,4

miARN

ATC PTC ATC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-30d

8,94 10,20 0,41 4,79E-02 -1,27 2,4

hsa-miR-181c

6,32 7,59 0,35 2,91E-02 -1,27 2,4

hsa-miR-34a*

3,79 5,07 0,21 5,13E-03 -1,28 2,4

hsa-miR-206

-1,36 -0,07 0,40 4,24E-02 -1,29 2,4

hsa-miR-34a

11,30 12,59 0,24 7,79E-03 -1,29 2,5

hsa-miR-20a

9,71 11,03 0,12 6,10E-04 -1,32 2,5

hsa-miR-374b

7,05 8,38 0,22 5,18E-03 -1,33 2,5

hsa-miR-19b

9,89 11,28 0,31 1,54E-02 -1,38 2,6

hsa-miR-26b

10,52 11,96 0,28 9,48E-03 -1,44 2,7

hsa-miR-455-5p

2,32 3,78 0,44 3,86E-02 -1,46 2,8

hsa-miR-874

4,78 6,26 0,25 5,97E-03 -1,48 2,8

hsa-miR-181d

5,25 6,74 0,28 7,95E-03 -1,49 2,8

hsa-miR-19b-1*

1,32 2,85 0,25 4,93E-03 -1,54 2,9

hsa-miR-374a

7,52 9,09 0,41 2,50E-02 -1,57 3,0

hsa-miR-92a

7,77 9,35 0,16 8,31E-04 -1,58 3,0

hsa-miR-499-5p

2,14 3,72 0,45 3,38E-02 -1,58 3,0

hsa-miR-1301

-0,92 0,69 0,39 1,97E-02 -1,61 3,1

hsa-miR-151-5p

9,21 10,90 0,35 1,16E-02 -1,69 3,2

hsa-miR-665

1,87 3,57 0,41 1,89E-02 -1,70 3,3

hsa-let-7c

10,68 12,41 0,38 1,48E-02 -1,73 3,3

hsa-miR-744*

-1,03 0,75 0,36 1,07E-02 -1,78 3,4

hsa-miR-30d*

1,12 2,93 0,50 3,00E-02 -1,82 3,5

hsa-miR-17*

3,60 5,43 0,32 6,44E-03 -1,83 3,6

hsa-miR-26a

10,36 12,20 0,35 8,50E-03 -1,84 3,6

hsa-miR-346

-1,38 0,46 0,56 3,93E-02 -1,84 3,6

hsa-miR-126

10,01 11,92 0,43 1,49E-02 -1,92 3,8

hsa-miR-100

9,15 11,12 0,21 1,03E-03 -1,97 3,9

hsa-miR-143*

1,36 3,34 0,37 8,09E-03 -1,98 3,9

hsa-miR-744

2,84 4,82 0,38 9,21E-03 -1,98 4,0

hsa-miR-143

5,31 7,32 0,28 2,73E-03 -2,02 4,0

hsa-miR-30b

9,75 11,85 0,45 1,29E-02 -2,11 4,3

hsa-miR-20a*

2,51 4,63 0,57 2,81E-02 -2,12 4,3

hsa-miR-126*

3,44 5,58 0,62 3,42E-02 -2,14 4,4

miARN

ATC PTC ATC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-145*

2,37 4,58 0,41 7,75E-03 -2,20 4,6

hsa-miR-181a

8,77 11,28 0,33 2,31E-03 -2,51 5,7

hsa-miR-222*

-2,06 0,46 0,73 3,39E-02 -2,52 5,7

hsa-let-7i

11,99 14,53 0,18 1,92E-04 -2,54 5,8

hsa-miR-145

6,78 9,37 0,28 1,07E-03 -2,59 6,0

hsa-miR-181b

6,96 9,59 0,52 1,00E-02 -2,63 6,2

hsa-miR-125b-2*

2,65 5,32 0,29 1,18E-03 -2,66 6,3

hsa-miR-139-5p

2,79 5,51 0,53 9,33E-03 -2,72 6,6

hsa-miR-491-5p

-1,33 1,51 0,34 1,54E-03 -2,84 7,2

hsa-miR-200c*

-0,83 2,06 0,34 1,48E-03 -2,89 7,4

hsa-miR-218

5,04 7,94 0,71 2,00E-02 -2,90 7,4

hsa-miR-542-5p

3,91 6,80 0,87 3,86E-02 -2,90 7,4

hsa-miR-424

7,56 10,51 0,68 1,65E-02 -2,95 7,7

hsa-miR-452

1,57 4,54 0,40 2,51E-03 -2,96 7,8

hsa-miR-542-3p

3,33 6,39 0,81 2,57E-02 -3,06 8,4

hsa-miR-99a

8,00 11,21 0,37 1,38E-03 -3,21 9,3

hsa-miR-181a-2*

3,00 6,23 0,66 1,09E-02 -3,23 9,4

hsa-miR-224

2,46 5,75 0,50 3,98E-03 -3,29 9,8

hsa-miR-99a*

-1,76 1,53 0,53 4,70E-03 -3,29 9,8

hsa-miR-450a

1,98 5,54 0,74 1,16E-02 -3,56 11,8

hsa-miR-31*

4,96 8,58 0,56 4,14E-03 -3,62 12,3

hsa-miR-512-3p

0,39 4,04 0,37 8,13E-04 -3,65 12,6

hsa-let-7i*

0,07 3,76 0,40 1,10E-03 -3,69 12,9

hsa-miR-221

6,87 10,60 0,73 9,46E-03 -3,73 13,3

hsa-miR-221*

4,78 8,71 0,86 1,41E-02 -3,94 15,3

hsa-miR-125b

10,44 14,38 0,32 3,64E-04 -3,94 15,4

hsa-miR-222

6,04 10,25 0,58 2,76E-03 -4,21 18,5

hsa-miR-31

5,65 10,14 0,64 3,07E-03 -4,50 22,6

hsa-miR-138

0,09 4,62 1,08 1,86E-02 -4,52 23,0

hsa-miR-200a*

0,46 5,30 0,62 2,10E-03 -4,84 28,6

hsa-miR-200b*

0,48 5,62 0,59 1,34E-03 -5,13 35,1

hsa-miR-146b-5p

9,04 14,41 0,92 6,08E-03 -5,37 41,3

hsa-miR-375

1,27 6,74 1,20 1,41E-02 -5,47 44,4

imagen10

miARN

MTC PTC MTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-487a

4,79 0,32 -0,76 1,16 2,23E-04 5,55 46,9

hsa-miR-592

7,50 1,19 2,04 0,61 1,19E-04 5,45 43,9

hsa-miR-433

4,13 0,61 -1,22 0,52 1,14E-05 5,35 40,8

hsa-miR-539

6,53 0,34 1,30 0,37 1,10E-06 5,22 37,4

hsa-miR-487b

9,75 0,19 4,61 0,74 2,57E-05 5,14 35,2

hsa-miR-382

6,53 0,24 1,48 1,24 5,11E-04 5,05 33,0

hsa-miR-127-3p

8,88 0,37 4,10 1,39 1,29E-03 4,79 27,6

hsa-miR-136*

6,41 0,51 1,67 1,19 7,01E-04 4,74 26,7

hsa-miR-381

7,34 0,33 2,75 1,08 4,31E-04 4,59 24,0

hsa-miR-409-3p

7,21 0,31 2,64 1,15 6,04E-04 4,57 23,8

hsa-miR-154

6,86 0,17 2,35 1,36 1,47E-03 4,51 22,8

hsa-miR-485-3p

4,27 0,37 -0,23 0,51 1,21E-05 4,50 22,6

hsa-miR-485-5p

4,03 0,40 -0,47 0,52 1,37E-05 4,50 22,6

hsa-miR-409-5p

4,92 0,15 0,43 0,61 1,81E-05 4,49 22,5

hsa-miR-495

6,93 0,28 2,48 1,01 3,57E-04 4,45 21,9

hsa-miR-758

5,04 0,13 0,65 0,61 2,06E-05 4,39 20,9

hsa-miR-183*

4,36 0,40 -0,03 1,02 4,36E-04 4,39 20,9

hsa-miR-10a

11,69 0,52 7,36 0,58 4,37E-05 4,33 20,1

hsa-miR-376c

9,21 0,81 4,93 1,14 1,36E-03 4,28 19,5

hsa-miR-379

6,20 0,14 1,93 1,19 9,64E-04 4,27 19,2

hsa-miR-376a

8,51 0,67 4,25 1,32 2,23E-03 4,26 19,1

hsa-miR-183

10,49 0,69 6,34 0,19 1,14E-05 4,16 17,8

hsa-miR-329

4,13 0,15 0,08 0,64 4,42E-05 4,05 16,5

hsa-miR-377

7,51 0,55 3,49 1,41 3,61E-03 4,03 16,3

hsa-miR-543

5,30 0,05 1,29 0,60 3,10E-05 4,00 16,0

hsa-miR-431

5,00 1,06 1,01 0,65 5,24E-04 3,98 15,8

hsa-miR-136

6,61 0,51 2,65 0,74 1,95E-04 3,95 15,5

hsa-miR-411

4,80 0,24 0,89 0,65 6,69E-05 3,91 15,1

hsa-miR-369-5p

5,27 0,72 1,47 0,77 4,50E-04 3,80 13,9

hsa-miR-889

3,79 0,54 0,08 0,40 2,99E-05 3,71 13,1

hsa-miR-9

4,69 1,56 0,99 0,68 3,04E-03 3,70 13,0

hsa-miR-370

4,77 0,36 1,11 0,79 3,17E-04 3,65 12,6

hsa-miR-654-3p

6,30 0,51 2,68 1,10 1,92E-03 3,62 12,3

miARN

MTC PTC MTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-376a*

4,63 0,44 1,13 0,40 2,52E-05 3,50 11,3

hsa-miR-890

2,63 1,99 -0,83 0,68 1,00E-02 3,46 11,0

hsa-miR-182

5,90 0,30 2,59 1,06 2,12E-03 3,31 9,9

hsa-miR-486-3p

3,41 0,41 0,10 1,00 1,77E-03 3,31 9,9

hsa-miR-335

9,06 1,56 5,76 0,92 8,37E-03 3,31 9,9

hsa-miR-122

4,01 3,14 0,75 0,22 4,99E-02 3,26 9,6

hsa-miR-9*

5,31 1,78 2,08 1,06 1,68E-02 3,23 9,4

hsa-miR-154*

4,83 0,62 1,61 0,96 2,20E-03 3,21 9,3

hsa-miR-493*

5,39 0,45 2,22 0,95 1,79E-03 3,17 9,0

hsa-miR-337-5p

5,33 0,33 2,17 1,25 5,85E-03 3,16 9,0

hsa-miR-105

2,03 2,55 -1,09 0,54 3,15E-02 3,13 8,7

hsa-miR-377*

2,94 0,16 -0,13 0,26 1,71E-06 3,07 8,4

hsa-miR-299-5p

5,22 0,48 2,45 0,92 3,20E-03 2,77 6,8

hsa-miR-1301

3,45 0,62 0,69 0,39 2,19E-04 2,77 6,8

hsa-miR-96

11,01 0,48 8,25 0,45 1,82E-04 2,76 6,8

hsa-miR-668

1,30 0,42 -1,42 0,77 1,48E-03 2,73 6,6

hsa-miR-936

3,06 1,62 0,34 0,48 1,04E-02 2,71 6,6

hsa-miR-490-3p

1,48 1,56 -1,13 0,67 1,45E-02 2,61 6,1

hsa-miR-216a

1,88 0,79 -0,69 1,07 1,16E-02 2,58 6,0

hsa-miR-582-5p

6,13 0,18 3,66 0,51 2,17E-04 2,47 5,5

hsa-miR-182*

2,00 0,20 -0,41 0,86 3,64E-03 2,41 5,3

hsa-miR-132

8,97 1,15 6,57 0,65 8,37E-03 2,39 5,3

hsa-miR-1180

3,10 1,01 0,78 0,98 1,84E-02 2,32 5,0

hsa-miR-330-3p

6,34 0,46 4,02 0,28 9,61E-05 2,32 5,0

hsa-miR-654-5p

4,30 0,31 1,98 0,52 4,65E-04 2,32 5,0

hsa-miR-10a*

3,82 0,57 1,51 0,31 2,61E-04 2,31 5,0

hsa-miR-338-3p

9,34 0,35 7,04 0,63 1,26E-03 2,30 4,9

hsa-miR-652

7,51 0,29 5,22 0,29 3,71E-05 2,29 4,9

hsa-miR-598

7,98 0,33 5,76 0,74 3,02E-03 2,22 4,7

hsa-miR-376b

3,45 1,39 1,23 0,61 1,84E-02 2,22 4,7

hsa-miR-765

4,47 1,66 2,28 0,68 3,50E-02 2,19 4,6

hsa-miR-132*

5,58 1,13 3,43 0,97 2,87E-02 2,15 4,4

hsa-miR-552

2,05 1,77 -0,04 0,24 3,30E-02 2,10 4,3

miARN

MTC PTC MTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-299-3p

3,11 0,45 1,01 0,50 1,06E-03 2,09 4,3

hsa-miR-659

3,47 1,46 1,42 0,91 4,66E-02 2,05 4,1

hsa-miR-7-1*

6,88 0,44 4,87 0,48 1,10E-03 2,01 4,0

hsa-miR-1308

9,41 1,22 7,42 0,76 2,70E-02 1,99 4,0

hsa-miR-1185

3,03 0,54 1,06 0,64 4,44E-03 1,97 3,9

hsa-miR-326

3,61 0,14 1,66 0,29 4,02E-05 1,95 3,9

hsa-miR-369-3p

2,85 0,71 0,91 0,39 2,24E-03 1,94 3,8

hsa-miR-95

9,43 0,66 7,54 0,31 1,27E-03 1,89 3,7

hsa-miR-148b

9,64 0,55 7,77 0,67 6,84E-03 1,87 3,7

hsa-miR-1182

2,54 1,51 0,68 0,68 4,85E-02 1,86 3,6

hsa-miR-583

1,28 1,13 -0,56 0,48 1,60E-02 1,84 3,6

hsa-miR-648

1,76 1,29 -0,03 0,72 4,16E-02 1,79 3,5

hsa-miR-335*

3,78 0,88 1,99 0,18 3,57E-03 1,79 3,5

hsa-miR-337-3p

3,15 0,43 1,41 0,59 4,44E-03 1,74 3,3

hsa-miR-29b-2*

2,70 0,90 0,99 0,44 1,01E-02 1,71 3,3

hsa-miR-526b

2,01 0,89 0,32 0,75 2,70E-02 1,70 3,2

hsa-miR-557

5,61 0,40 3,95 0,56 4,33E-03 1,66 3,2

hsa-miR-128

8,29 0,89 6,69 0,27 7,67E-03 1,61 3,0

hsa-miR-301a

7,56 0,34 5,96 0,52 3,25E-03 1,61 3,0

hsa-miR-582-3p

0,19 0,32 -1,38 0,37 8,97E-04 1,58 3,0

hsa-miR-301b

3,14 0,72 1,59 0,20 3,01E-03 1,55 2,9

hsa-miR-1291

1,29 1,30 -0,24 0,49 4,92E-02 1,53 2,9

hsa-miR-656

2,09 0,62 0,58 0,26 2,59E-03 1,51 2,8

hsa-miR-1224-5p

5,65 1,15 4,26 0,47 4,66E-02 1,40 2,6

hsa-miR-1321

1,56 1,15 0,17 0,39 4,17E-02 1,39 2,6

hsa-miR-431*

2,93 0,05 1,56 0,84 3,39E-02 1,37 2,6

hsa-miR-642

0,65 0,41 -0,71 0,63 1,64E-02 1,36 2,6

hsa-miR-429

10,32 0,28 8,97 0,55 8,14E-03 1,35 2,5

hsa-miR-29c*

8,32 0,89 7,00 0,39 2,47E-02 1,32 2,5

hsa-miR-371-5p

4,11 0,92 2,81 0,43 3,12E-02 1,30 2,5

hsa-miR-1268

7,86 0,70 6,57 0,52 2,35E-02 1,29 2,4

hsa-miR-518c*

0,79 0,80 -0,49 0,55 3,48E-02 1,28 2,4

hsa-miR-1250

0,92 0,27 -0,34 0,68 2,34E-02 1,27 2,4

miARN

MTC PTC MTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-324-5p

9,24 0,04 7,98 0,41 2,22E-03 1,26 2,4

hsa-miR-640

0,08 0,59 -1,15 0,15 3,43E-03 1,23 2,3

hsa-miR-885-5p

1,10 1,01 -0,10 0,21 3,60E-02 1,20 2,3

hsa-miR-505

6,04 0,67 4,84 0,28 1,10E-02 1,19 2,3

hsa-miR-769-3p

2,27 0,15 1,08 0,49 6,98E-03 1,19 2,3

hsa-miR-1285

2,87 0,34 1,71 0,43 7,47E-03 1,16 2,2

hsa-miR-1275

7,69 0,34 6,55 0,47 1,13E-02 1,14 2,2

hsa-miR-584

3,13 0,35 2,03 0,45 1,15E-02 1,10 2,1

hsa-miR-23b

13,42 0,15 12,34 0,52 1,42E-02 1,08 2,1

hsa-miR-505*

5,07 0,90 4,00 0,23 3,85E-02 1,07 2,1

hsa-miR-200a

11,26 0,29 10,22 0,52 2,03E-02 1,04 2,1

hsa-miR-421

3,49 0,48 2,47 0,49 2,75E-02 1,03 2,0

hsa-miR-501-3p

3,85 0,36 2,83 0,27 3,66E-03 1,02 2,0

hsa-miR-340*

5,17 0,53 4,16 0,42 2,39E-02 1,01 2,0

hsa-miR-1303

0,31 0,54 -0,67 0,28 1,37E-02 0,98 2,0

hsa-miR-93*

1,54 0,46 0,58 0,36 1,61E-02 0,96 2,0

hsa-let-7e*

3,07 0,28 2,15 0,31 6,14E-03 0,92 1,9

hsa-miR-130b

7,45 0,55 6,55 0,21 1,47E-02 0,90 1,9

hsa-miR-145*

5,48 0,47 4,58 0,41 2,80E-02 0,90 1,9

hsa-miR-24-1*

6,56 0,18 5,68 0,52 3,36E-02 0,88 1,8

hsa-miR-145

10,23 0,51 9,37 0,28 1,99E-02 0,85 1,8

hsa-miR-484

5,42 0,61 4,57 0,29 3,43E-02 0,85 1,8

hsa-miR-181c

8,44 0,26 7,59 0,35 1,12E-02 0,84 1,8

hsa-miR-628-5p

4,66 0,34 3,84 0,40 2,63E-02 0,82 1,8

hsa-miR-143

8,13 0,51 7,32 0,28 2,44E-02 0,81 1,8

hsa-miR-664*

5,63 0,23 4,83 0,37 1,62E-02 0,80 1,7

hsa-miR-886-5p

-0,90 0,48 -1,68 0,30 2,88E-02 0,78 1,7

hsa-miR-660

7,94 0,55 7,17 0,27 3,66E-02 0,76 1,7

hsa-miR-769-5p

5,73 0,25 5,00 0,21 4,68E-03 0,72 1,7

hsa-miR-181c*

5,32 0,15 4,63 0,41 3,31E-02 0,69 1,6

hsa-miR-532-5p

7,19 0,46 6,51 0,17 2,10E-02 0,68 1,6

hsa-miR-454

6,74 0,18 6,07 0,19 2,79E-03 0,67 1,6

hsa-miR-500*

5,20 0,47 4,53 0,27 3,91E-02 0,67 1,6

miARN

MTC PTC MTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-320b

10,06 0,28 9,39 0,34 2,94E-02 0,67 1,6

hsa-miR-532-3p

5,99 0,45 5,33 0,24 3,14E-02 0,67 1,6

hsa-miR-99b

9,49 0,13 8,86 0,20 2,88E-03 0,63 1,5

hsa-let-7e

12,78 0,21 12,15 0,24 9,41E-03 0,63 1,5

hsa-miR-502-3p

5,50 0,33 4,88 0,23 1,78E-02 0,62 1,5

hsa-miR-320a

8,92 0,11 8,30 0,30 1,49E-02 0,62 1,5

hsa-miR-28-5p

7,95 0,37 7,38 0,10 1,41E-02 0,57 1,5

hsa-miR-103

12,16 0,15 11,61 0,32 3,19E-02 0,55 1,5

hsa-miR-107

11,50 0,11 10,98 0,31 3,26E-02 0,52 1,4

hsa-miR-331-3p

10,80 0,08 10,30 0,23 1,10E-02 0,50 1,4

hsa-miR-361-3p

6,76 0,17 7,27 0,20 1,08E-02 -0,51 1,4

hsa-miR-92a

8,81 0,44 9,35 0,16 4,07E-02 -0,54 1,5

hsa-miR-30e

8,87 0,25 9,46 0,25 1,85E-02 -0,59 1,5

hsa-let-7g

12,32 0,43 13,03 0,30 3,28E-02 -0,71 1,6

hsa-miR-19b-1*

2,09 0,30 2,85 0,25 7,79E-03 -0,77 1,7

hsa-miR-576-5p

0,08 0,45 0,95 0,27 1,32E-02 -0,87 1,8

hsa-miR-17

8,57 0,68 9,48 0,14 2,27E-02 -0,91 1,9

hsa-miR-19a

7,51 0,18 8,46 0,55 3,10E-02 -0,95 1,9

hsa-miR-489

2,06 0,80 3,05 0,37 4,84E-02 -0,99 2,0

hsa-miR-19b

10,25 0,32 11,28 0,31 4,33E-03 -1,02 2,0

hsa-miR-1288

5,08 0,30 6,26 0,70 3,53E-02 -1,18 2,3

hsa-miR-181b

8,33 0,79 9,59 0,52 3,24E-02 -1,26 2,4

hsa-miR-20a

9,76 0,82 11,03 0,12 1,15E-02 -1,27 2,4

hsa-miR-1305

6,95 0,26 8,28 0,53 7,51E-03 -1,32 2,5

hsa-miR-34b*

6,00 0,79 7,62 0,54 1,30E-02 -1,62 3,1

hsa-miR-130a

9,83 1,43 11,54 0,45 4,15E-02 -1,70 3,3

hsa-miR-221*

6,93 0,33 8,71 0,86 1,54E-02 -1,79 3,5

hsa-miR-625

4,29 0,64 6,17 0,25 8,95E-04 -1,87 3,7

hsa-miR-155

6,25 1,18 8,15 0,89 3,99E-02 -1,90 3,7

hsa-miR-514

1,03 1,14 2,93 0,86 3,54E-02 -1,90 3,7

hsa-let-7i

12,62 0,95 14,53 0,18 3,56E-03 -1,91 3,8

hsa-let-7i*

1,85 0,98 3,76 0,40 7,11E-03 -1,91 3,8

hsa-miR-34a

10,62 0,71 12,59 0,24 1,02E-03 -1,97 3,9

miARN

MTC PTC MTC frente a PTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-34a*

3,09 0,61 5,07 0,21 4,58E-04 -1,98 3,9

hsa-miR-450a

3,51 0,77 5,54 0,74 9,78E-03 -2,03 4,1

hsa-miR-424

8,41 1,24 10,51 0,68 1,91E-02 -2,11 4,3

hsa-miR-222

8,06 0,71 10,25 0,58 3,06E-03 -2,19 4,6

hsa-miR-542-3p

4,19 1,06 6,39 0,81 1,53E-02 -2,20 4,6

hsa-miR-542-5p

4,60 1,34 6,80 0,87 2,82E-02 -2,20 4,6

hsa-miR-503

3,46 1,63 5,74 0,81 3,53E-02 -2,27 4,8

hsa-miR-181a-2*

3,33 0,74 6,23 0,66 1,16E-03 -2,90 7,5

hsa-miR-203

3,46 2,00 6,60 1,11 2,66E-02 -3,14 8,8

hsa-miR-146b-3p

-1,08 0,19 3,73 1,12 3,79E-04 -4,81 28,1

hsa-miR-31*

2,44 2,19 8,58 0,56 7,76E-04 -6,14 70,6

hsa-miR-31

3,63 2,73 10,14 0,64 1,71E-03 -6,51 91,3

hsa-miR-551b

3,35 1,29 9,98 0,58 4,92E-05 -6,62 98,5

hsa-miR-146b-5p

7,19 1,17 14,41 0,92 6,71E-05 -7,21 148,4

EJEMPLO 27 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE EL CARCINOMA ANAPLÁSICO DE TIROIDES Y LA

VARIANTE FOLICULAR DEL CARCINOMA PAPILAR DE TIROIDES

5 Un total de 93 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre la muestra de carcinoma anaplásico de tiroides (ATC) y los especímenes de la variante folicular del carcinoma papilar de tiroides (p<0,05) (tabla 29). De estos, veintisiete miARN estaban expresados al menos 2 veces más en la muestra de ATC en comparación con las muestras de FVPTC (dif. Log2 (ATC frente a FVPTC) ≥ 1). Entre estos, un miARN (hsa-miR9*) estaba expresado en 70 veces en ATC, seis miARN (hsa-miR-582-5p, -582-3p, -9, -124, -34c-3p, y -210)

10 estaban sobreexpresados en ATC de 10 a 30 veces y veinte miARN estaban sobreexpresados en 2 a 10 veces en ATC en comparación con los especímenes de FVPTC. Además, cincuenta y tres miARN estaban subexpresados en al menos dos veces en ATC en comparación con los especímenes de FVPTC. Entre estos, ocho miARN (hsa-miR429, -200b, -141, -200a, -200c, -135b, -135a y -205) estaban subexpresados en 100 a 600 veces en ATC, ocho miARN (hsa-miR-551b, -200b*, -141*, -375, -200a*, -138, -31 y -1) estaban subexpresados de 20 a 80 veces en

15 ATC, seis miARN (hsa-miR-146b-5p, -512-3p, -125b, -222, -7i* y -99a) estaban subexpresados de 10 a 20 veces en ATC y 31 miARN estaban subexpresados de 2 a 10 veces en la muestra de ATC en comparación con los especímenes de FVPTC.

Tabla 29. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FVPTC y de ATC. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

ATC FVPTC ATC frente a FVPTC

ATC

MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-9*

7,14 1,01 0,85 7,60E-03 6,14 70,3

hsa-miR-582-5p

8,42 3,55 0,77 1,10E-02 4,87 29,3

hsa-miR-582-3p

3,97 -0,81 0,52 3,81E-03 4,78 27,4

hsa-miR-9

5,05 0,41 0,75 1,16E-02 4,64 24,9

miARN

ATC FVPTC ATC frente a FVPTC

ATC

MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-124

4,16 -0,10 0,41 2,60E-03 4,26 19,1

hsa-miR-34c-5p

7,37 3,31 1,06 4,14E-02 4,05 16,6

hsa-miR-210

8,74 5,26 0,39 4,22E-03 3,48 11,1

hsa-miR-34b

4,65 1,52 0,79 3,85E-02 3,13 8,7

hsa-miR-34c-3p

1,95 -1,06 0,54 1,52E-02 3,02 8,1

hsa-miR-155

10,25 7,48 0,68 3,56E-02 2,77 6,8

hsa-miR-30a*

10,32 8,17 0,45 2,34E-02 2,16 4,5

hsa-miR-30a

13,36 11,32 0,28 7,06E-03 2,04 4,1

hsa-miR-376b

2,37 0,60 0,24 7,44E-03 1,77 3,4

hsa-miR-501-3p

4,53 3,01 0,18 4,74E-03 1,52 2,9

hsa-miR-500*

5,90 4,40 0,17 4,10E-03 1,50 2,8

hsa-miR-1201

2,48 1,00 0,35 3,19E-02 1,48 2,8

hsa-miR-769-5p

6,42 4,96 0,33 2,79E-02 1,47 2,8

hsa-miR-660

8,23 6,82 0,24 1,36E-02 1,41 2,7

hsa-miR-155*

1,88 0,50 0,26 1,75E-02 1,38 2,6

hsa-miR-502-3p

6,19 4,88 0,20 9,56E-03 1,31 2,5

hsa-miR-330-3p

5,15 3,87 0,31 3,48E-02 1,28 2,4

hsa-miR-362-5p

6,59 5,32 0,34 4,30E-02 1,28 2,4

hsa-miR-532-5p

7,58 6,30 0,18 7,61E-03 1,28 2,4

hsa-miR-149

5,28 4,01 0,23 1,58E-02 1,26 2,4

hsa-miR-502-5p

4,57 3,33 0,25 2,21E-02 1,23 2,4

hsa-miR-130b

7,77 6,61 0,04 1,16E-04 1,16 2,2

hsa-miR-656

1,64 0,50 0,26 2,93E-02 1,14 2,2

hsa-miR-132

7,21 6,25 0,18 1,71E-02 0,96 1,9

hsa-miR-532-3p

6,00 5,10 0,09 2,51E-03 0,90 1,9

hsa-miR-326

2,42 1,60 0,21 4,27E-02 0,81 1,8

hsa-miR-376a*

1,52 0,94 0,15 4,22E-02 0,58 1,5

hsa-miR-197

6,10 5,66 0,07 8,74E-03 0,45 1,4

hsa-miR-625*

2,59 2,18 0,08 1,69E-02 0,41 1,3

hsa-miR-320a

8,16 8,38 0,03 7,87E-03 -0,22 1,2

hsa-miR-192

6,79 7,32 0,09 1,51E-02 -0,54 1,4

hsa-miR-513c

2,33 2,98 0,11 1,19E-02 -0,65 1,6

hsa-miR-26a-1*

0,60 1,29 0,18 3,93E-02 -0,69 1,6

miARN

ATC FVPTC ATC frente a FVPTC

ATC

MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-23b*

3,49 4,28 0,15 1,90E-02 -0,79 1,7

hsa-miR-194*

-0,53 0,30 0,10 4,75E-03 -0,84 1,8

hsa-miR-17

8,41 9,27 0,20 2,97E-02 -0,86 1,8

hsa-miR-20a

9,71 10,68 0,25 3,89E-02 -0,97 2,0

hsa-miR-34a

11,30 12,33 0,27 3,98E-02 -1,04 2,0

hsa-miR-93

7,61 8,66 0,25 3,43E-02 -1,05 2,1

hsa-miR-130a

10,22 11,34 0,23 2,17E-02 -1,12 2,2

hsa-miR-892a

-0,72 0,43 0,31 4,69E-02 -1,15 2,2

hsa-miR-192*

0,63 1,80 0,31 4,47E-02 -1,17 2,3

hsa-miR-423-5p

5,61 6,89 0,29 3,01E-02 -1,28 2,4

hsa-miR-30b*

3,11 4,41 0,30 3,01E-02 -1,30 2,5

hsa-miR-508-5p

-2,20 -0,86 0,25 1,68E-02 -1,34 2,5

hsa-miR-17*

3,60 4,99 0,39 4,83E-02 -1,39 2,6

hsa-miR-92a

7,77 9,23 0,13 2,09E-03 -1,46 2,7

hsa-miR-19b-1*

1,32 2,79 0,34 3,16E-02 -1,47 2,8

hsa-miR-585

0,44 2,14 0,40 3,27E-02 -1,70 3,2

hsa-miR-20a*

2,51 4,23 0,45 4,25E-02 -1,71 3,3

hsa-let-7c

10,68 12,54 0,33 1,56E-02 -1,86 3,6

hsa-let-7g*

-2,14 -0,24 0,12 6,89E-04 -1,89 3,7

hsa-miR-886-3p

7,26 9,21 0,51 4,26E-02 -1,95 3,9

hsa-miR-26a

10,36 12,32 0,41 2,36E-02 -1,96 3,9

hsa-miR-143*

1,36 3,34 0,45 2,87E-02 -1,98 3,9

hsa-miR-744

2,84 5,11 0,34 9,14E-03 -2,27 4,8

hsa-miR-144

4,43 6,93 0,46 1,66E-02 -2,50 5,6

hsa-miR-346

-1,38 1,18 0,24 2,31E-03 -2,56 5,9

hsa-miR-125b-2*

2,65 5,28 0,34 5,97E-03 -2,63 6,2

hsa-let-7i

11,99 14,62 0,43 1,24E-02 -2,63 6,2

hsa-miR-452

1,57 4,32 0,51 1,71E-02 -2,75 6,7

hsa-miR-139-5p

2,79 5,57 0,68 3,57E-02 -2,78 6,9

hsa-miR-200c*

-0,83 2,07 0,45 1,06E-02 -2,90 7,5

hsa-miR-222*

-2,06 0,85 0,42 8,46E-03 -2,91 7,5

hsa-miR-491-5p

-1,33 1,65 0,46 1,03E-02 -2,99 7,9

hsa-miR-145

6,78 9,81 0,83 4,68E-02 -3,03 8,2

miARN

ATC FVPTC ATC frente a FVPTC

ATC

MED DE prueba de t Dif. Log2 Múltiplo de cambio

hsa-miR-221*

4,78 8,06 0,85 4,13E-02 -3,29 9,8

hsa-miR-99a

8,00 11,35 0,30 2,09E-03 -3,36 10,3

hsa-let-7i*

0,07 3,66 0,74 2,29E-02 -3,58 12,0

hsa-miR-222

6,04 9,66 0,79 2,64E-02 -3,62 12,3

hsa-miR-125b

10,44 14,14 0,44 5,03E-03 -3,69 13,0

hsa-miR-512-3p

0,39 4,27 0,48 5,45E-03 -3,89 14,8

hsa-miR-146b-5p

9,04 13,20 1,09 4,17E-02 -4,16 17,9

hsa-miR-1

3,13 7,49 1,20 4,82E-02 -4,35 20,4

hsa-miR-31

5,65 10,06 1,12 3,87E-02 -4,41 21,3

hsa-miR-138

0,09 4,85 0,81 1,33E-02 -4,76 27,1

hsa-miR-200a*

0,46 5,38 0,59 5,00E-03 -4,92 30,3

hsa-miR-375

1,27 6,25 1,32 4,28E-02 -4,99 31,7

hsa-miR-141*

-1,68 3,56 0,53 3,04E-03 -5,23 37,7

hsa-miR-200b*

0,48 5,82 0,47 2,01E-03 -5,34 40,5

hsa-miR-551b

2,61 8,99 0,76 4,92E-03 -6,37 83,0

hsa-miR-205

-1,95 4,92 1,61 3,15E-02 -6,87 116,9

hsa-miR-135a

1,19 8,34 1,41 2,02E-02 -7,15 142,1

hsa-miR-135b

2,20 10,27 0,91 4,23E-03 -8,08 269,9

hsa-miR-200c

3,00 11,67 0,33 1,72E-04 -8,67 407,2

hsa-miR-200a

1,45 10,20 0,62 1,05E-03 -8,75 430,1

hsa-miR-141

2,51 11,36 0,71 1,58E-03 -8,85 461,2

hsa-miR-200b

2,93 11,82 0,67 1,31E-03 -8,89 474,4

hsa-miR-429

-0,05 9,17 0,77 1,74E-03 -9,23 599,6

EJEMPLO 28 LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE LA VARIANTE FOLICULAR DEL CARCINOMA

PAPILAR DE TIROIDES Y EL CARCINOMA MEDULAR DE TIROIDES

5 Un total de 142 miARN humanos se expresaron significativamente de manera diferencial entre las muestras de la variante folicular del carcinoma papilar de tiroides y los especímenes de carcinoma medular de tiroides (p<0,05) (tabla 30). De estos, diecinueve miARN se expresaron a niveles al menos 2 veces mayores en las muestras de FVPTC en comparación con los especímenes de MTC (dif. Log2 (FVPTC frente a MTC) ≥ 1). Entre estos, cuatro miARN (hsa-miR-31, -31*, 146b-5p y -55b) estaban expresados de 40 a 90 veces más en FVPTC, hsa-miR-146b-3p

10 estaba expresado al menos 10 veces más en FVPTC y catorce miARN estaban expresados de 2 a 10 veces más en las muestras de FVPTC en comparación con los especímenes de MTC. Además, noventa y seis miARN estaban subexpresados en al menos dos veces en las muestras de FVPTC en comparación con los especímenes de MTC. Entre estos, cuatro miARN (hsa-miR-124, -375, -323-3p t -7) estaban subexpresados de 100 a 250 veces en FVPTC, seis miARN (hsa-miR-129-5p, -153, -410, -487b, -432 y -433) estaban subexpresados de 400 a 100 veces en

15 FVPTC, diecisiete miARN estaban subexpresados de 20 a 40 veces en FVPTC, diecisiete miARN estaban subexpresados de 10 a 20 veces en FVPTC y 52 miARN estaban subexpresados de 2 a 10 veces en muestras de FVPTC en comparación con los especímenes de MTC.

Tabla 30. MicroARN expresados de manera diferencial significativa entre muestras de FVPTC y de MTC. MED, expresión media entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar

miARN

FVPTC MTC FVPTC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-31

10,06 1,12 3,63 2,73 7,28E-03 6,43 86,3

hsa-miR-31*

8,47 1,06 2,44 2,19 4,45E-03 6,03 65,3

hsa-miR-146b-5p

13,20 1,09 7,19 1,17 9,10E-04 6,01 64,3

hsa-miR-551b

8,99 0,76 3,35 1,29 7,34E-04 5,63 49,6

hsa-miR-146b-3p

2,46 1,30 -1,08 0,19 5,96E-03 3,55 11,7

hsa-miR-542-3p

7,01 1,32 4,19 1,06 2,91E-02 2,82 7,1

hsa-miR-542-5p

7,34 1,07 4,60 1,34 2,90E-02 2,74 6,7

hsa-miR-503

6,07 1,04 3,46 1,63 4,80E-02 2,60 6,1

hsa-miR-181a-2*

5,91 1,15 3,33 0,74 2,01E-02 2,58 6,0

hsa-miR-1

7,49 1,20 5,17 1,04 4,47E-02 2,32 5,0

hsa-let-7i

14,62 0,43 12,62 0,95 1,24E-02 2,00 4,0

hsa-let-7i*

3,66 0,74 1,85 0,98 3,82E-02 1,81 3,5

hsa-miR-886-3p

9,21 0,51 7,47 1,00 2,83E-02 1,74 3,3

hsa-miR-34a

12,33 0,27 10,62 0,71 6,22E-03 1,71 3,3

hsa-miR-34a*

4,76 0,31 3,09 0,61 4,90E-03 1,67 3,2

hsa-miR-222

9,66 0,79 8,06 0,71 3,95E-02 1,60 3,0

hsa-miR-625

5,66 0,26 4,29 0,64 1,07E-02 1,37 2,6

hsa-miR-34b*

7,29 0,41 6,00 0,79 3,54E-02 1,29 2,4

hsa-miR-222*

0,85 0,42 -0,37 0,76 3,93E-02 1,22 2,3

hsa-miR-944

0,72 0,21 -0,02 0,10 2,56E-03 0,74 1,7

hsa-miR-19b-1*

2,79 0,34 2,09 0,30 3,82E-02 0,70 1,6

hsa-miR-585

2,14 0,40 1,44 0,15 3,80E-02 0,70 1,6

hsa-let-7b*

1,95 0,36 1,29 0,08 2,99E-02 0,65 1,6

hsa-let-7b

13,90 0,18 13,28 0,41 4,09E-02 0,62 1,5

hsa-miR-18b*

2,07 0,24 1,52 0,31 4,35E-02 0,55 1,5

hsa-miR-548c-5p

2,23 0,05 1,70 0,27 1,02E-02 0,53 1,4

hsa-miR-513c

2,98 0,11 2,52 0,29 3,00E-02 0,46 1,4

hsa-miR-574-3p

6,16 0,14 6,59 0,05 3,72E-03 -0,44 1,4

hsa-miR-320b

9,63 0,15 10,06 0,28 4,28E-02 -0,44 1,4

hsa-miR-103

11,67 0,18 12,16 0,15 1,30E-02 -0,49 1,4

miARN

FVPTC MTC FVPTC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-501-5p

4,15 0,14 4,64 0,32 3,84E-02 -0,49 1,4

hsa-miR-320a

8,38 0,03 8,92 0,11 2,46E-04 -0,54 1,5

hsa-miR-107

10,95 0,26 11,50 0,11 1,91E-02 -0,56 1,5

hsa-miR-770-5p

2,61 0,27 3,18 0,21 3,07E-02 -0,57 1,5

hsa-miR-502-3p

4,88 0,20 5,50 0,33 2,47E-02 -0,62 1,5

hsa-miR-769-5p

4,96 0,33 5,73 0,25 1,99E-02 -0,77 1,7

hsa-miR-181c*

4,55 0,48 5,32 0,15 4,59E-02 -0,78 1,7

hsa-miR-500*

4,40 0,17 5,20 0,47 2,44E-02 -0,79 1,7

hsa-miR-23b

12,59 0,41 13,42 0,15 2,31E-02 -0,82 1,8

hsa-miR-501-3p

3,01 0,18 3,85 0,36 9,70E-03 -0,83 1,8

hsa-miR-130b

6,61 0,04 7,45 0,55 2,61E-02 -0,84 1,8

hsa-miR-24-1*

5,70 0,42 6,56 0,18 2,19E-02 -0,86 1,8

hsa-miR-532-5p

6,30 0,18 7,19 0,46 1,49E-02 -0,89 1,9

hsa-miR-532-3p

5,10 0,09 5,99 0,45 1,02E-02 -0,90 1,9

hsa-miR-181c

7,54 0,43 8,44 0,26 2,45E-02 -0,90 1,9

hsa-miR-454

5,79 0,59 6,74 0,18 4,46E-02 -0,96 1,9

hsa-miR-582-3p

-0,81 0,52 0,19 0,32 3,39E-02 -1,00 2,0

hsa-miR-628-5p

3,62 0,46 4,66 0,34 2,19E-02 -1,04 2,1

hsa-miR-365

7,90 0,40 8,96 0,32 1,34E-02 -1,06 2,1

hsa-miR-200a

10,20 0,62 11,26 0,29 4,14E-02 -1,06 2,1

hsa-miR-484

4,30 0,53 5,42 0,61 4,86E-02 -1,12 2,2

hsa-miR-660

6,82 0,24 7,94 0,55 1,40E-02 -1,12 2,2

hsa-miR-1285

1,68 0,67 2,87 0,34 3,89E-02 -1,19 2,3

hsa-miR-340*

3,95 0,67 5,17 0,53 4,94E-02 -1,22 2,3

hsa-miR-193b

6,75 0,59 7,99 0,51 3,39E-02 -1,24 2,4

hsa-miR-505

4,79 0,33 6,04 0,67 2,16E-02 -1,25 2,4

hsa-miR-421

2,20 0,69 3,49 0,48 4,07E-02 -1,29 2,4

hsa-miR-324-5p

7,92 0,33 9,24 0,04 1,12E-03 -1,32 2,5

hsa-miR-212

4,55 0,44 5,93 0,76 2,82E-02 -1,38 2,6

hsa-miR-517b

0,08 0,58 1,50 0,86 4,56E-02 -1,42 2,7

hsa-miR-301b

1,69 0,31 3,14 0,72 1,38E-02 -1,45 2,7

hsa-miR-29c*

6,86 0,34 8,32 0,89 2,77E-02 -1,46 2,8

hsa-miR-29b-2*

1,18 0,35 2,70 0,90 2,53E-02 -1,52 2,9

miARN

FVPTC MTC FVPTC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-656

0,50 0,26 2,09 0,62 5,28E-03 -1,59 3,0

hsa-miR-301a

5,93 0,56 7,56 0,34 6,97E-03 -1,63 3,1

hsa-miR-128

6,57 0,42 8,29 0,89 1,80E-02 -1,72 3,3

hsa-miR-148b

7,91 0,86 9,64 0,55 2,91E-02 -1,73 3,3

hsa-miR-337-3p

1,37 0,42 3,15 0,43 2,79E-03 -1,78 3,4

hsa-miR-335*

1,94 0,38 3,78 0,88 1,23E-02 -1,84 3,6

hsa-miR-95

7,55 0,84 9,43 0,66 2,40E-02 -1,89 3,7

hsa-miR-598

6,08 0,57 7,98 0,33 3,78E-03 -1,90 3,7

hsa-miR-642

-1,29 0,91 0,65 0,41 1,99E-02 -1,94 3,8

hsa-miR-326

1,60 0,21 3,61 0,14 3,27E-05 -2,01 4,0

hsa-miR-652

5,43 0,43 7,51 0,29 8,23E-04 -2,08 4,2

hsa-miR-369-3p

0,75 0,18 2,85 0,71 2,04E-03 -2,10 4,3

hsa-miR-299-3p

0,98 0,74 3,11 0,45 7,29E-03 -2,13 4,4

hsa-miR-654-5p

2,15 0,43 4,30 0,31 7,49E-04 -2,14 4,4

hsa-miR-486-3p

1,20 0,92 3,41 0,41 1,27E-02 -2,20 4,6

hsa-miR-668

-0,93 0,84 1,30 0,42 8,78E-03 -2,24 4,7

hsa-miR-132*

3,28 0,43 5,58 1,13 1,22E-02 -2,30 4,9

hsa-miR-7-1*

4,57 0,67 6,88 0,44 3,64E-03 -2,31 5,0

hsa-miR-330-3p

3,87 0,31 6,34 0,46 3,55E-04 -2,47 5,5

hsa-miR-582-5p

3,55 0,77 6,13 0,18 2,62E-03 -2,58 6,0

hsa-miR-1185

0,44 0,42 3,03 0,54 8,29E-04 -2,58 6,0

hsa-miR-96

8,40 1,66 11,01 0,48 4,92E-02 -2,61 6,1

hsa-miR-370

2,08 1,06 4,77 0,36 9,02E-03 -2,69 6,5

hsa-miR-132

6,25 0,18 8,97 1,15 4,92E-03 -2,71 6,6

hsa-miR-338-3p

6,51 0,41 9,34 0,35 2,04E-04 -2,83 7,1

hsa-miR-890

-0,21 0,63 2,63 1,99 4,04E-02 -2,84 7,2

hsa-miR-376b

0,60 0,24 3,45 1,39 8,98E-03 -2,85 7,2

hsa-miR-182

2,98 1,64 5,90 0,30 3,06E-02 -2,92 7,6

hsa-miR-1301

0,53 0,77 3,45 0,62 2,99E-03 -2,93 7,6

hsa-miR-299-5p

2,29 0,48 5,22 0,48 5,11E-04 -2,93 7,6

hsa-miR-377*

0,00 1,03 2,94 0,16 4,97E-03 -2,95 7,7

hsa-miR-183*

1,36 1,22 4,36 0,40 1,04E-02 -3,00 8,0

hsa-miR-10a*

0,79 0,52 3,82 0,57 7,18E-04 -3,04 8,2

miARN

FVPTC MTC FVPTC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-337-5p

2,04 0,52 5,33 0,33 2,22E-04 -3,29 9,8

hsa-miR-154*

1,53 0,45 4,83 0,62 4,22E-04 -3,30 9,8

hsa-miR-493*

1,99 0,43 5,39 0,45 1,61E-04 -3,40 10,6

hsa-miR-335

5,53 0,63 9,06 1,56 8,42E-03 -3,53 11,5

hsa-miR-183

6,84 1,37 10,49 0,69 8,77E-03 -3,65 12,6

hsa-miR-376a*

0,94 0,15 4,63 0,44 1,72E-05 -3,69 12,9

hsa-miR-654-3p

2,50 0,40 6,30 0,51 9,98E-05 -3,80 13,9

hsa-miR-411

0,96 0,91 4,80 0,24 9,12E-04 -3,84 14,3

hsa-miR-329

0,28 0,26 4,13 0,15 3,20E-06 -3,85 14,4

hsa-miR-431

1,04 0,82 5,00 1,06 2,51E-03 -3,96 15,6

hsa-miR-889

-0,20 0,76 3,79 0,54 6,11E-04 -3,99 15,9

hsa-miR-10a

7,60 0,79 11,69 0,52 5,80E-04 -4,09 17,0

hsa-miR-136

2,50 0,44 6,61 0,51 8,87E-05 -4,11 17,2

hsa-miR-485-5p

-0,09 1,02 4,03 0,40 1,25E-03 -4,12 17,4

hsa-miR-485-3p

0,13 0,91 4,27 0,37 7,61E-04 -4,14 17,7

hsa-miR-377

3,32 0,35 7,51 0,55 5,86E-05 -4,19 18,3

hsa-miR-9

0,41 0,75 4,69 1,56 4,56E-03 -4,27 19,3

hsa-miR-9*

1,01 0,85 5,31 1,78 7,67E-03 -4,30 19,6

hsa-miR-154

2,54 0,38 6,86 0,17 9,35E-06 -4,32 19,9

hsa-miR-543

0,93 0,40 5,30 0,05 8,61E-06 -4,37 20,6

hsa-miR-376c

4,84 0,47 9,21 0,81 2,71E-04 -4,37 20,7

hsa-miR-369-5p

0,89 0,48 5,27 0,72 1,96E-04 -4,38 20,8

hsa-miR-409-3p

2,81 0,60 7,21 0,31 8,88E-05 -4,41 21,2

hsa-miR-376a

4,10 0,40 8,51 0,67 1,07E-04 -4,41 21,2

hsa-miR-379

1,74 0,86 6,20 0,14 3,28E-04 -4,46 22,0

hsa-miR-495

2,45 0,45 6,93 0,28 2,42E-05 -4,48 22,3

hsa-miR-409-5p

0,42 0,59 4,92 0,15 5,62E-05 -4,50 22,6

hsa-miR-137

0,50 1,37 5,03 3,11 4,53E-02 -4,52 23,0

hsa-miR-381

2,81 0,74 7,34 0,33 1,97E-04 -4,53 23,1

hsa-miR-758

0,44 0,95 5,04 0,13 4,53E-04 -4,60 24,2

hsa-miR-127-3p

4,25 0,75 8,88 0,37 1,98E-04 -4,64 24,9

hsa-miR-382

1,76 0,44 6,53 0,24 1,39E-05 -4,77 27,3

hsa-miR-136*

1,39 0,40 6,41 0,51 2,62E-05 -5,02 32,3

miARN

FVPTC MTC FVPTC frente a MTC Múltiplo de cambio

MED

DE MED DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-592

2,41 0,91 7,50 1,19 1,32E-03 -5,09 34,0

hsa-miR-487a

-0,33 0,87 4,79 0,32 2,17E-04 -5,12 34,7

hsa-miR-539

1,31 0,24 6,53 0,34 2,25E-06 -5,22 37,3

hsa-miR-433

-1,20 0,60 4,13 0,61 8,50E-05 -5,33 40,2

hsa-miR-432

2,04 0,63 7,61 0,36 3,92E-05 -5,57 47,4

hsa-miR-487b

4,12 0,35 9,75 0,19 2,07E-06 -5,63 49,5

hsa-miR-410

1,65 0,58 8,20 0,14 7,92E-06 -6,54 93,2

hsa-miR-153

1,52 0,89 8,11 1,07 2,90E-04 -6,59 96,3

hsa-miR-129-5p

-0,79 1,02 5,85 5,05 4,58E-02 -6,64 99,7

hsa-miR-7

7,22 2,56 13,88 0,95 8,45E-03 -6,66 101,1

hsa-miR-323-3p

-0,32 0,52 6,93 0,13 2,72E-06 -7,24 151,3

hsa-miR-375

6,25 1,32 13,86 0,40 2,20E-04 -7,61 195,5

hsa-miR-124

-0,10 0,41 7,86 3,11 3,39E-03 -7,96 248,9

EJEMPLO 29

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE EXPRESIÓN DISTINGUE NÓDULOS HIPERPLÁSICOS (NOD) Y NEOPLASIAS DERIVADAS DE CÉLULAS FOLICULARES (FA, FTC, PTC, Y FVPTC)

5 Los inventores trataron de determinar si los miARN podrían distinguir entre nódulos hiperplásicos benignos (NOD) y nódulos de tiroides enfermos (FA, FTC, PTC y FVPTC), lo que tiene una utilidad clínica importante para la evaluación preoperativa y la gestión de pacientes con nódulos de tiroides. Se compararon los perfiles de expresión de miARN de nódulos hiperplásicos (NOD) y aquellos de las neoplasias derivadas de células foliculares más comunes (FA, FTC, PTC y FVPTC). Un total de 201 miARN humanos se expresaron significativamente de manera

10 diferencial entre nódulos hiperplásicos y especímenes de neoplasia derivada de células foliculares (p<0,05). De estos, ciento cuarenta y cuatro miARN estaban expresados a niveles al menos 2 veces mayores (dif. Log2 (NOD frente a FA, FTC, PTC y FVPTC) ≥ 1) y veintidós miARN se expresaron a niveles que eran al menos 2 veces menores en los especímenes de NOD en comparación con los especímenes de neoplasias derivadas de células foliculares (tabla 31). Entre los miARN expresados a niveles medios mayores en NOD, hsa-miR-206 estaba

15 sobreexpresado en 27 veces, trece miARN (hsa-miR-92b*, -1202, -1300, -663, -149*, -631, -936, -187*, -1182, -198, -765, -648 y -934) estaban sobreexpresados de 10 a 20 veces, cuarenta y cinco miARN estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces y ochenta y cinco miARN estaban sobreexpresados de 2 a 5 veces. Entre los miARN expresados a niveles medios menores en NOD, cinco (hsa-miR-1274a, -1274b, -221, -720 y -1260) estaban subexpresados en al menos 5 veces y diecisiete miARN estaban subexpresados de 2 a 5 veces (tabla 31).

20 Tabla 31. MicroARN expresados de manera diferencial significativamente entre NOD y neoplasias derivadas de células foliculares (FA, FTC, PTC y FVPTC). Med, media de expresión entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

NOD FA, FTC, PTC, FVPTC NOD frente a FA, FTC, PTC, FVPTC Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-206

4,98 3,14 0,18 1,69 2,20E-04 4,80 27,9

hsa-miR-92b*

2,62 0,57 -1,40 0,96 8,67E-08 4,01 16,1

hsa-miR-1202

13,40 0,83 9,44 1,31 1,08E-05 3,96 15,5

hsa-miR-1300

7,45 0,80 3,58 1,01 4,73E-07 3,87 14,6

miARN

NOD FA, FTC, PTC, FVPTC NOD frente a FA, FTC, PTC, FVPTC Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-663

8,28 0,78 4,52 1,21 7,45E-06 3,76 13,6

hsa-miR-149*

4,33 0,61 0,67 1,15 4,59E-06 3,66 12,6

hsa-miR-631

3,62 0,57 0,05 1,41 7,36E-05 3,57 11,9

hsa-miR-936

4,20 0,65 0,69 1,08 3,83E-06 3,51 11,4

hsa-miR-187*

4,38 0,72 0,88 1,05 3,20E-06 3,50 11,3

hsa-miR-1182

4,41 0,79 0,92 1,03 2,57E-06 3,50 11,3

hsa-miR-198

4,55 0,67 1,07 1,11 6,22E-06 3,48 11,2

hsa-miR-765

6,28 0,71 2,80 1,14 8,81E-06 3,48 11,1

hsa-miR-648

3,78 0,49 0,33 1,13 7,27E-06 3,46 11,0

hsa-miR-934

1,75 0,72 -1,58 1,03 4,80E-06 3,33 10,0

hsa-miR-4835p

8,12 0,81 4,92 1,14 2,94E-05 3,20 9,2

hsa-miR-623

4,60 0,57 1,47 0,97 4,31E-06 3,13 8,8

hsa-miR-493

2,58 0,75 -0,54 0,97 5,48E-06 3,12 8,7

hsa-miR-659

5,18 0,64 2,08 1,16 4,64E-05 3,09 8,5

hsa-miR-572

7,55 1,04 4,46 0,77 8,07E-07 3,09 8,5

hsa-miR-150*

7,14 0,71 4,05 0,88 1,88E-06 3,09 8,5

hsa-miR-133b

9,04 3,01 5,96 1,65 7,67E-03 3,08 8,5

hsa-miR-1909*

2,29 0,80 -0,76 1,29 1,90E-04 3,06 8,3

hsa-miR-551b*

2,37 0,66 -0,67 0,92 3,52E-06 3,04 8,2

hsa-miR-1183

5,87 0,71 2,85 1,01 1,39E-05 3,02 8,1

hsa-miR-12075p

11,48 1,07 8,50 0,96 1,73E-05 2,98 7,9

hsa-miR-1321

3,39 0,78 0,41 0,67 1,02E-07 2,98 7,9

hsa-miR-12255p

11,44 0,97 8,48 0,86 4,37E-06 2,96 7,8

hsa-miR-1268

9,84 1,32 6,89 0,74 2,66E-06 2,95 7,7

hsa-miR-1915*

1,92 0,55 -1,03 0,87 2,26E-06 2,95 7,7

hsa-miR-638

10,60 1,02 7,67 0,74 1,06E-06 2,93 7,6

hsa-miR-6715p

6,89 0,59 4,06 0,94 1,17E-05 2,83 7,1

hsa-miR-134

7,65 0,95 4,88 0,96 3,13E-05 2,77 6,8

hsa-miR-1203

2,10 0,51 -0,67 0,89 6,68E-06 2,77 6,8

hsa-miR-566

2,81 0,94 0,06 0,98 4,67E-05 2,75 6,7

miARN

NOD FA, FTC, PTC, FVPTC NOD frente a FA, FTC, PTC, FVPTC Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-34c3p

1,38 0,29 -1,33 0,54 4,18E-09 2,71 6,5

hsa-miR-1

8,39 3,41 5,69 1,44 1,49E-02 2,70 6,5

hsa-miR-12245p

7,25 0,67 4,57 1,00 5,06E-05 2,67 6,4

hsa-miR-939

8,56 0,44 5,89 0,71 4,33E-07 2,67 6,4

hsa-miR-3715p

5,79 0,48 3,17 0,82 4,67E-06 2,62 6,2

hsa-miR-1471

5,18 0,39 2,57 1,07 1,12E-04 2,61 6,1

hsa-miR-601

5,25 0,55 2,63 0,83 6,37E-06 2,61 6,1

hsa-miR-622

4,88 0,38 2,30 0,83 5,76E-06 2,59 6,0

hsa-miR-526b

3,19 0,55 0,61 0,83 7,32E-06 2,58 6,0

hsa-miR-940

8,55 0,72 6,00 0,67 8,12E-07 2,56 5,9

hsa-miR-370

3,45 0,51 0,93 1,17 4,32E-04 2,53 5,8

hsa-miR-1228*

1,57 0,73 -0,96 0,97 8,07E-05 2,52 5,7

hsa-miR-133a

5,79 2,96 3,29 1,14 7,48E-03 2,50 5,7

hsa-miR-202

6,71 0,59 4,21 0,72 1,98E-06 2,50 5,7

hsa-miR-877

4,11 0,66 1,62 1,03 1,61E-04 2,49 5,6

hsa-miR-610

4,11 0,59 1,62 0,78 6,33E-06 2,49 5,6

hsa-miR-1915

9,71 0,51 7,22 0,64 4,26E-07 2,48 5,6

hsa-miR-1885p

7,10 0,65 4,64 0,72 3,12E-06 2,46 5,5

hsa-miR-1469

3,04 0,43 0,58 1,16 5,06E-04 2,46 5,5

hsa-miR-516b

2,43 0,32 0,00 0,74 2,69E-06 2,43 5,4

hsa-miR-498

3,42 0,51 0,99 0,73 3,43E-06 2,43 5,4

hsa-miR-616

1,35 0,54 -1,06 0,80 1,11E-05 2,42 5,3

hsa-miR-617

2,91 0,37 0,50 0,73 2,92E-06 2,41 5,3

hsa-miR-1291

2,65 0,69 0,28 1,03 2,95E-04 2,36 5,1

hsa-miR-1246

9,28 1,15 6,93 1,14 1,22E-03 2,35 5,1

hsa-miR-921

1,34 0,52 -0,96 0,77 1,34E-05 2,29 4,9

hsa-miR-199b5p

8,91 0,21 6,62 1,57 9,61E-03 2,29 4,9

hsa-miR-422a

3,29 0,36 1,02 1,06 4,15E-04 2,27 4,8

hsa-miR-424*

4,99 0,68 2,72 0,93 1,68E-04 2,27 4,8

hsa-miR-518c*

1,90 0,53 -0,37 0,63 1,31E-06 2,27 4,8

miARN

NOD FA, FTC, PTC, FVPTC NOD frente a FA, FTC, PTC, FVPTC Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-4905p

3,04 0,32 0,79 0,69 2,87E-06 2,25 4,7

hsa-miR-583

2,24 0,75 0,01 0,98 3,40E-04 2,24 4,7

hsa-miR-1180

3,19 0,43 0,97 1,05 5,30E-04 2,22 4,7

hsa-miR-1276

1,67 0,65 -0,54 1,02 5,04E-04 2,21 4,6

hsa-miR-575

9,81 0,66 7,61 0,67 6,71E-06 2,20 4,6

hsa-miR-1295p

2,13 0,81 -0,06 1,14 1,58E-03 2,19 4,6

hsa-miR-662

3,23 0,23 1,04 0,52 6,49E-08 2,19 4,6

hsa-miR-373*

2,82 0,97 0,66 1,06 1,18E-03 2,16 4,5

hsa-miR-298

1,59 0,37 -0,55 0,91 1,64E-04 2,14 4,4

hsa-miR-1275p

0,95 0,36 -1,19 0,62 1,58E-06 2,14 4,4

hsa-miR-630

6,48 0,60 4,38 1,20 2,91E-03 2,10 4,3

hsa-miR-1308

9,69 0,89 7,61 1,11 2,07E-03 2,08 4,2

hsa-miR-302c*

1,28 0,71 -0,79 0,58 3,09E-06 2,07 4,2

hsa-miR-1250

1,57 0,53 -0,49 0,76 4,29E-05 2,07 4,2

hsa-miR-518a5p

1,71 0,67 -0,35 0,70 2,40E-05 2,07 4,2

hsa-miR-614

1,71 0,68 -0,27 0,64 1,54E-05 1,98 3,9

hsa-miR-6545p

3,71 0,37 1,73 0,77 7,02E-05 1,98 3,9

hsa-miR-605

3,37 1,05 1,41 1,05 2,70E-03 1,96 3,9

hsa-miR-1208

3,34 0,27 1,43 0,85 2,63E-04 1,91 3,8

hsa-miR-877*

4,38 0,42 2,48 0,47 2,31E-07 1,90 3,7

hsa-miR-1303

1,37 0,56 -0,52 0,89 5,85E-04 1,89 3,7

hsa-miR-1226*

5,37 0,48 3,50 0,47 4,23E-07 1,87 3,7

hsa-miR-7693p

2,99 0,65 1,15 0,56 8,24E-06 1,84 3,6

hsa-miR-1299

4,04 0,46 2,23 0,99 1,85E-03 1,82 3,5

hsa-miR-640

1,16 0,46 -0,65 1,02 2,56E-03 1,81 3,5

hsa-miR-5255p

1,81 0,50 0,01 0,51 1,99E-06 1,80 3,5

hsa-miR-557

5,88 0,79 4,08 0,61 4,50E-05 1,79 3,5

hsa-miR-1249

5,58 0,76 3,80 0,61 4,46E-05 1,79 3,4

hsa-miR-873

2,95 0,83 1,19 1,42 2,74E-02 1,76 3,4

miARN

NOD FA, FTC, PTC, FVPTC NOD frente a FA, FTC, PTC, FVPTC Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-513a5p

5,17 0,43 3,43 0,55 6,89E-06 1,74 3,3

hsa-miR-4863p

1,82 1,02 0,08 1,13 9,91E-03 1,74 3,3

hsa-miR-138

6,26 0,71 4,52 1,08 6,15E-03 1,74 3,3

hsa-miR-639

0,66 0,47 -1,08 0,66 7,15E-05 1,74 3,3

hsa-miR-381

3,79 1,14 2,07 1,11 1,07E-02 1,72 3,3

hsa-miR-125b1*

2,79 1,31 1,08 1,20 1,86E-02 1,71 3,3

hsa-miR-4865p

8,26 0,71 6,56 1,31 2,17E-02 1,70 3,2

hsa-miR-518e*

1,68 0,29 0,00 0,84 7,90E-04 1,69 3,2

hsa-miR-584

4,03 0,50 2,35 0,94 2,51E-03 1,68 3,2

hsa-miR-33b*

3,92 0,53 2,27 0,42 9,85E-07 1,65 3,1

hsa-miR-1306

2,62 0,34 0,99 0,61 4,71E-05 1,64 3,1

hsa-miR-122

1,86 1,30 0,26 0,59 7,55E-04 1,59 3,0

hsa-miR-1307

3,02 0,38 1,44 0,67 2,05E-04 1,58 3,0

hsa-miR-550

3,35 0,32 1,79 0,51 8,72E-06 1,56 3,0

hsa-miR-1285

3,03 0,59 1,48 0,65 2,53E-04 1,55 2,9

hsa-miR-125a3p

6,98 0,40 5,43 0,59 5,87E-05 1,55 2,9

hsa-miR-516a5p

3,28 0,99 1,73 0,79 2,51E-03 1,55 2,9

hsa-miR-214

9,06 0,45 7,52 0,91 3,71E-03 1,54 2,9

hsa-miR-4995p

4,99 1,73 3,45 0,78 9,19E-03 1,54 2,9

hsa-miR-124

1,20 1,01 -0,34 0,66 8,30E-04 1,54 2,9

hsa-miR-5013p

4,28 0,24 2,76 0,52 1,21E-05 1,53 2,9

hsa-miR-378

5,80 1,51 4,29 0,52 1,40E-03 1,51 2,8

hsa-miR-602

3,53 0,52 2,03 0,70 6,15E-04 1,50 2,8

hsa-miR-135a*

5,26 0,83 3,78 0,79 3,03E-03 1,47 2,8

hsa-miR-664*

6,07 0,84 4,60 0,73 1,78E-03 1,47 2,8

hsa-miR-760

3,96 0,39 2,49 0,85 3,25E-03 1,47 2,8

hsa-miR-5745p

7,17 0,65 5,71 0,58 1,87E-04 1,46 2,8

hsa-miR-193b*

4,35 0,60 2,90 0,62 3,51E-04 1,45 2,7

miARN

NOD FA, FTC, PTC, FVPTC NOD frente a FA, FTC, PTC, FVPTC Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-5123p

4,75 0,05 3,32 1,22 3,16E-02 1,43 2,7

hsa-miR-184

2,49 0,44 1,05 1,03 1,39E-02 1,43 2,7

hsa-miR-1244

1,73 0,83 0,32 0,66 1,22E-03 1,41 2,7

hsa-miR-194*

1,17 0,64 -0,21 0,67 1,18E-03 1,38 2,6

hsa-miR-1275

7,77 0,53 6,39 0,83 4,85E-03 1,37 2,6

hsa-miR-28-3p

1,74 0,21 0,41 0,66 8,18E-04 1,33 2,5

hsa-miR-432

2,91 0,59 1,58 0,62 8,38E-04 1,33 2,5

hsa-miR-2965p

4,16 0,70 2,86 0,38 2,91E-05 1,30 2,5

hsa-miR-658

0,84 0,57 -0,45 0,59 6,85E-04 1,29 2,5

hsa-miR-1395p

6,53 0,30 5,27 0,84 8,04E-03 1,27 2,4

hsa-miR-23a*

4,15 0,52 2,88 0,66 1,85E-03 1,26 2,4

hsa-miR-1270

2,13 0,49 0,92 0,67 2,79E-03 1,21 2,3

hsa-miR-210

6,06 0,22 4,87 1,07 4,08E-02 1,19 2,3

hsa-miR-612

0,15 0,90 -0,98 0,52 2,36E-03 1,13 2,2

hsa-miR-199a3p

11,25 0,25 10,14 0,89 2,27E-02 1,12 2,2

hsa-miR-708

2,26 0,40 1,16 0,87 2,30E-02 1,10 2,1

hsa-miR-378*

3,57 1,66 2,49 0,48 1,82E-02 1,08 2,1

hsa-miR-10b*

2,98 0,58 1,97 0,42 5,30E-04 1,01 2,0

hsa-miR-320a

8,81 0,27 7,80 0,42 1,76E-04 1,00 2,0

hsa-miR-1323

2,32 0,36 1,31 0,53 1,69E-03 1,00 2,0

hsa-miR-199a5p

9,58 0,56 8,58 0,89 4,61E-02 0,99 2,0

hsa-miR-152

7,41 0,49 6,44 0,89 4,95E-02 0,97 2,0

hsa-miR-99b*

2,60 0,27 1,64 0,53 2,28E-03 0,96 2,0

hsa-miR-15a*

0,59 0,33 1,57 0,48 8,95E-04 -0,98 2,0

hsa-miR-15a

10,12 0,45 11,14 0,61 4,92E-03 -1,02 2,0

hsa-miR-141*

2,35 0,61 3,42 0,65 6,32E-03 -1,07 2,1

hsa-miR-181a*

2,91 0,38 4,02 0,79 1,30E-02 -1,11 2,2

hsa-miR-200c*

0,71 0,51 1,88 0,58 1,19E-03 -1,17 2,2

hsa-miR-146a

6,62 0,21 7,85 0,98 2,23E-02 -1,23 2,3

hsa-miR-34a

10,54 0,23 11,79 0,50 8,70E-05 -1,24 2,4

miARN

NOD FA, FTC, PTC, FVPTC NOD frente a FA, FTC, PTC, FVPTC Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-21

12,93 0,34 14,39 0,95 7,19E-03 -1,46 2,7

hsa-miR-155

5,51 0,19 7,01 1,22 2,54E-02 -1,50 2,8

hsa-miR-503

3,37 0,73 4,88 1,00 9,46E-03 -1,51 2,9

hsa-miR-21*

4,08 0,15 5,72 0,85 1,08E-03 -1,64 3,1

hsa-miR-182

1,45 0,76 3,09 1,41 3,61E-02 -1,64 3,1

hsa-miR-96

6,74 0,37 8,38 1,11 8,80E-03 -1,65 3,1

hsa-miR-29b1*

3,01 0,32 4,73 0,49 1,48E-06 -1,72 3,3

hsa-miR-222

6,24 0,80 8,30 1,65 2,57E-02 -2,06 4,2

hsa-miR-1423p

6,85 1,06 8,92 1,49 1,60E-02 -2,07 4,2

hsa-miR-221*

4,79 0,21 7,04 1,66 1,47E-02 -2,25 4,8

hsa-miR-1260

6,15 0,87 8,47 0,65 4,63E-06 -2,31 5,0

hsa-miR-720

9,90 0,79 12,52 0,59 1,58E-07 -2,63 6,2

hsa-miR-221

6,58 0,33 9,22 1,65 5,23E-03 -2,63 6,2

hsa-miR-1274b

8,18 0,94 10,86 0,67 1,05E-06 -2,68 6,4

hsa-miR-1274a

4,39 1,03 7,27 0,70 8,19E-07 -2,87 7,3

EJEMPLO 30

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE LESIONES BENIGNAS Y PRE-MALIGNAS (NOD Y FA) DE CARCINOMAS DIFERENCIADOS DERIVADOS DE CÉLULAS FOLICULARES (FTC, PTC, FVPTC)

5 Los inventores también trataron de determinar si los niveles de expresión de miARN podrían distinguir afecciones de tiroides benignas y pre-malignas de cánceres malignos de tiroides. Los perfiles de expresión de miARN de muestras de nódulos hiperplásicos benignos (NOD) y adenoma folicular premaligno (FA) se compararon con aquellas de cánceres malignos de tiroides, en particular, cánceres de tiroides diferenciados (FTC, PTC y FVPTC). Un total de 111 miARN humanos estaban expresados significativamente de manera diferencial entre las muestras de NOD+FA y

10 especímenes de carcinoma derivado de células foliculares (FTC, PTC, FVPTC) (p<0,05). De estos, treinta y nueve miARN se expresaron a niveles al menos 2 veces mayores (dif. Log2 (NOD+FA frente a CÁNCER) ≥ 1) y veintiún miARN se expresaron a niveles al menos 2 veces menores en las muestras de NOD+FA frente a los especímenes de CÁNCER (tabla 32). Entre los miARN expresados a niveles medios mayores en las muestras de NOD+FA, hsamiR-1308 estaba sobreexpresado en 5 veces y treinta y ocho miARN estaban sobreexpresados de 2 a 5 veces.

15 Entre los miARN expresados a niveles medios menores en las muestras de NOD+FA, hsa-let-7i* estaba subexpresado en al menos 10 veces, tres miARN (hsa-miR-1244 y -1246 y hsa-let-7i) estaban subexpresados de 5 a 10 veces y diecisiete miARN estaban subexpresados de 2 a 5 veces (tabla 32).

20 desviación estándar.

Tabla 32. MicroARN expresados de manera diferencial significativamente entre NOD+FA y carcinomas diferenciados derivados de células foliculares (CÁNCER). Med, media de expresión entre muestras en un grupo; DE,

miARN

NOD+FA CÁNCER NOD+FA FRENTE A CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1308

8,77 1,60 7,45 1,23 1,71E-03 2,34 5,1

hsa-miR-136

2,16 0,62 2,26 0,94 4,90E-03 2,03 4,1

miARN

NOD+FA CÁNCER NOD+FA FRENTE A CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-135a

7,67 1,01 8,21 1,15 1,22E-03 1,88 3,7

hsa-miR-10a*

0,94 1,22 0,58 0,76 8,61E-03 1,81 3,5

hsa-miR-12075p

9,71 1,88 8,57 1,72 3,45E-02 1,77 3,4

hsa-miR-1323

1,92 0,49 1,21 1,62 2,62E-02 1,73 3,3

hsa-miR-1306

1,64 1,10 1,03 1,01 7,46E-03 1,65 3,1

hsa-miR-138-2*

1,92 0,58 1,77 0,83 9,06E-03 1,60 3,0

hsa-miR-136*

1,14 1,09 1,27 0,95 2,00E-02 1,56 2,9

hsa-miR-1290

4,31 1,31 4,23 0,81 8,30E-03 1,55 2,9

hsa-miR-127-5p

-0,41 1,43 -1,08 0,99 1,64E-02 1,50 2,8

hsa-miR-130a

10,48 0,92 10,65 0,80 8,23E-03 1,48 2,8

hsa-miR-1

6,78 2,75 5,76 1,05 4,93E-02 1,47 2,8

hsa-miR-137

-0,18 0,63 0,52 1,13 4,82E-02 1,41 2,7

hsa-let-7a

14,23 0,38 14,35 0,82 1,69E-02 1,31 2,5

hsa-miR-130b

6,42 0,86 6,42 0,72 6,38E-03 1,30 2,5

hsa-miR-10b*

2,24 0,85 2,09 0,87 2,76E-02 1,29 2,4

hsa-miR-1285

2,16 1,13 1,48 0,94 1,58E-02 1,26 2,4

hsa-miR-129-5p

1,17 1,38 -0,23 0,85 3,88E-02 1,24 2,4

hsa-let-7b

13,36 0,57 13,16 0,98 1,48E-02 1,22 2,3

hsa-let-7b*

1,52 0,87 1,31 0,77 8,98E-04 1,18 2,3

hsa-miR-1291

1,41 1,45 0,23 1,07 2,68E-02 1,17 2,3

hsa-miR-126

12,20 0,49 11,57 0,87 2,69E-02 1,17 2,3

hsa-miR-127-3p

3,52 1,07 3,66 0,62 1,07E-02 1,12 2,2

hsa-miR-1238

3,54 0,55 3,65 0,61 5,72E-03 1,11 2,2

hsa-miR-128

6,40 0,63 6,26 0,77 1,13E-02 1,09 2,1

hsa-miR-1270

1,49 0,78 0,90 0,61 2,83E-02 1,07 2,1

hsa-miR-1296

-0,02 1,27 -0,53 0,61 1,94E-03 1,07 2,1

hsa-miR-1299

2,88 1,46 2,33 1,04 4,88E-02 1,06 2,1

hsa-miR-1305

6,75 0,60 7,33 0,83 4,77E-02 1,05 2,1

hsa-miR-132*

2,56 0,50 2,98 0,62 1,75E-02 1,05 2,1

hsa-miR-10b

8,17 0,45 7,96 0,48 2,49E-02 1,04 2,1

hsa-miR-129-3p

3,00 1,37 2,66 0,66 5,94E-03 1,04 2,1

hsa-let-7f

13,69 0,55 13,91 0,68 4,81E-04 1,03 2,0

hsa-miR-133a

4,30 2,34 3,36 0,78 5,71E-03 1,01 2,0

miARN

NOD+FA CÁNCER NOD+FA FRENTE A CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-132

5,58 0,64 5,88 0,46 1,18E-02 1,01 2,0

hsa-miR-1303

0,60 1,30 -0,70 0,70 3,96E-02 1,00 2,0

hsa-miR-125b-2*

4,68 0,85 4,73 0,47 4,34E-02 0,99 2,0

hsa-miR-1280

6,86 1,16 6,34 0,62 2,79E-02 0,98 2,0

hsa-miR-101

8,21 0,87 8,52 0,42 2,79E-05 -1,06 2,1

hsa-let-7g*

0,00 1,12 -0,98 0,99 9,69E-03 -1,06 2,1

hsa-miR-1237

2,63 0,55 2,53 0,45 4,99E-04 -1,09 2,1

hsa-miR-1260

7,30 1,30 8,55 1,28 3,90E-02 -1,13 2,2

hsa-miR-100*

1,23 0,73 0,96 1,11 2,35E-02 -1,18 2,3

hsa-miR-1288

4,99 0,45 5,42 1,31 3,45E-02 -1,18 2,3

hsa-miR-1275

6,88 1,09 6,48 0,99 4,21E-03 -1,28 2,4

hsa-miR-133b

7,22 2,64 6,03 0,50 6,41E-03 -1,31 2,5

hsa-miR-126*

5,95 0,84 5,36 1,13 5,54E-03 -1,40 2,6

hsa-miR-12253p

3,39 0,49 3,29 0,77 3,00E-04 -1,43 2,7

hsa-miR-12255p

9,70 1,80 8,54 0,71 4,18E-05 -1,49 2,8

hsa-let-7d*

1,51 0,88 0,95 1,35 1,41E-02 -1,55 2,9

hsa-let-7d

11,39 0,44 11,50 1,24 5,78E-03 -1,80 3,5

hsa-miR-1227

0,71 1,17 0,12 1,53 1,13E-02 -1,81 3,5

hsa-miR-1226*

4,22 1,18 3,57 1,53 1,49E-02 -1,82 3,5

hsa-miR-1228

4,73 0,87 4,53 1,58 3,67E-03 -2,00 4,0

hsa-miR-129*

2,02 0,45 1,86 2,41 3,50E-02 -2,13 4,4

hsa-let-7i

13,18 0,41 13,75 2,24 8,36E-03 -2,33 5,0

hsa-miR-1246

7,84 1,76 7,01 1,89 5,61E-03 -2,97 7,8

hsa-miR-1244

0,78 1,17 0,42 2,05 6,90E-03 -3,08 8,5

hsa-let-7i*

2,50 0,92 3,07 3,20 5,38E-03 -3,58 12,0

EJEMPLO 31

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE NÓDULOS HIPERPLÁSICOS (NOD) DE CARCINOMAS DIFERENCIADOS DERIVADOS DE CÉLULAS FOLICULARES (FTC, PTC, FVPTC)

5 Un total de 291 miARN humanos estaban expresados significativamente de manera diferencial entre nódulos hiperplásicos (NOD) y especímenes de carcinoma derivado de células foliculares (FTC, PTC, FVPTC) (p<0,05). De estos, ciento ochenta miARN se expresaron a niveles al menos 2 veces mayores (dif. Log2 (NOD frente a CÁNCER) ≥ 1) y treinta miARN estaban expresados a niveles al menos 2 veces menores en los especímenes de NOD (tabla 33). Entre los miARN expresados a niveles medios mayores en NOD, hsa-miR-206 estaba sobreexpresado en 20 10 veces, trece miARN (hsa-miR-92b*, -631, -1202, -1300, -149*, -633, -936, -765, -648, -187*, -934, -1182 y -198) estaban sobreexpresados de 10 a 20 veces, cuarenta y cinco miARN estaban sobreexpresados de 5 a 10 veces y

ciento veintiún miARN estaban sobreexpresados de 2 a 5 veces en las muestras de NOD. Entre los miARN expresados a niveles medios menores en NOD, hsa-miR-146b-5p estaba sobreexpresado en al menos 15 veces, nueve miARN (hsa-miR-1274a, -221, -1274b, -720, -146b-3p, -221*, -222, -142-3p y -1260) estaban subexpresados de 5 a 10 veces y veinte miARN estaban subexpresados de 2 a 5 veces (tabla 33).

Tabla 33. MicroARN expresados de manera diferencial significativamente entre nódulos hiperplásicos (NOD) y carcinomas diferenciados derivados de células foliculares (CÁNCER). Med, media de expresión entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

NOD CÁNCER NOD frente a CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

EST Med EST prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-206

4,98 3,14 0,45 1,81 1,72E-03 4,52 23,0

hsa-miR-92b*

2,62 0,57 -1,49 0,94 3,82E-07 4,11 17,3

hsa-miR-631

3,62 0,57 -0,24 1,23 1,81E-05 3,86 14,6

hsa-miR-1202

13,40 0,83 9,60 1,47 1,63E-04 3,80 13,9

hsa-miR-1300

7,45 0,80 3,67 0,99 3,17E-06 3,79 13,8

hsa-miR-149*

4,33 0,61 0,73 1,05 7,50E-06 3,60 12,1

hsa-miR-663

8,28 0,78 4,68 1,24 5,67E-05 3,60 12,1

hsa-miR-936

4,20 0,65 0,74 1,13 2,87E-05 3,45 11,0

hsa-miR-765

6,28 0,71 2,87 1,20 6,43E-05 3,41 10,6

hsa-miR-648

3,78 0,49 0,40 1,11 2,50E-05 3,38 10,4

hsa-miR-187*

4,38 0,72 1,01 0,95 7,35E-06 3,37 10,3

hsa-miR-934

1,75 0,72 -1,61 0,95 7,00E-06 3,36 10,3

hsa-miR-1182

4,41 0,79 1,06 1,08 2,99E-05 3,35 10,2

hsa-miR-198

4,55 0,67 1,21 1,23 9,58E-05 3,34 10,1

hsa-miR-7

10,64 1,81 7,39 2,27 1,89E-02 3,25 9,5

hsa-miR-1909*

2,29 0,80 -0,94 0,76 1,51E-06 3,23 9,4

hsa-miR-623

4,60 0,57 1,37 1,01 1,68E-05 3,23 9,4

hsa-miR-493

2,58 0,75 -0,59 0,99 2,39E-05 3,16 9,0

hsa-miR-572

7,55 1,04 4,39 0,81 7,65E-06 3,16 8,9

hsa-miR-483-5p

8,12 0,81 5,02 1,24 2,69E-04 3,10 8,6

hsa-miR-659

5,18 0,64 2,13 1,26 2,90E-04 3,05 8,3

hsa-miR-133b

9,04 3,01 6,03 1,83 2,24E-02 3,02 8,1

hsa-miR-638

10,60 1,02 7,60 0,80 1,18E-05 3,00 8,0

hsa-miR-1268

9,84 1,32 6,85 0,83 4,08E-05 2,99 8,0

hsa-miR-551b*

2,37 0,66 -0,59 0,85 8,60E-06 2,97 7,8

hsa-miR-150*

7,14 0,71 4,19 0,94 2,89E-05 2,95 7,7

hsa-miR-1183

5,87 0,71 2,93 0,93 2,68E-05 2,94 7,7

hsa-miR-1915*

1,92 0,55 -1,02 0,87 9,74E-06 2,94 7,7

miARN

NOD CÁNCER NOD frente a CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

EST Med EST prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-1207-5p

11,48 1,07 8,57 1,04 1,63E-04 2,91 7,5

hsa-miR-1225-5p

11,44 0,97 8,54 0,95 6,63E-05 2,90 7,5

hsa-miR-1321

3,39 0,78 0,51 0,70 2,41E-06 2,87 7,3

hsa-miR-1203

2,10 0,51 -0,69 0,84 1,25E-05 2,79 6,9

hsa-miR-671-5p

6,89 0,59 4,13 1,06 1,49E-04 2,76 6,8

hsa-miR-566

2,81 0,94 0,05 0,85 3,87E-05 2,76 6,8

hsa-miR-134

7,65 0,95 4,94 1,01 2,06E-04 2,70 6,5

hsa-miR-1224-5p

7,25 0,67 4,54 0,85 2,73E-05 2,70 6,5

hsa-miR-1

8,39 3,41 5,76 1,51 3,46E-02 2,63 6,2

hsa-miR-371-5p

5,79 0,48 3,16 0,87 3,03E-05 2,63 6,2

hsa-miR-34c-3p

1,38 0,29 -1,24 0,47 1,37E-08 2,62 6,2

hsa-miR-526b

3,19 0,55 0,57 0,94 7,58E-05 2,62 6,1

hsa-miR-939

8,56 0,44 5,97 0,75 7,64E-06 2,59 6,0

hsa-miR-138-1*

0,99 0,50 -1,57 0,74 8,42E-06 2,57 5,9

hsa-miR-622

4,88 0,38 2,33 0,83 2,42E-05 2,55 5,9

hsa-miR-1228*

1,57 0,73 -0,96 0,91 1,17E-04 2,53 5,8

hsa-miR-1471

5,18 0,39 2,69 1,02 2,40E-04 2,49 5,6

hsa-miR-601

5,25 0,55 2,78 0,88 8,16E-05 2,47 5,5

hsa-miR-133a

5,79 2,96 3,36 1,29 2,46E-02 2,44 5,4

hsa-miR-940

8,55 0,72 6,12 0,62 4,69E-06 2,43 5,4

hsa-miR-498

3,42 0,51 0,99 0,61 1,95E-06 2,42 5,4

hsa-miR-202

6,71 0,59 4,29 0,73 1,74E-05 2,42 5,4

hsa-miR-1291

2,65 0,69 0,23 1,07 6,31E-04 2,42 5,3

hsa-miR-1915

9,71 0,51 7,30 0,67 6,30E-06 2,41 5,3

hsa-miR-617

2,91 0,37 0,53 0,70 7,79E-06 2,38 5,2

hsa-miR-1469

3,04 0,43 0,66 1,06 5,44E-04 2,38 5,2

hsa-miR-877

4,11 0,66 1,75 1,02 5,07E-04 2,37 5,2

hsa-miR-610

4,11 0,59 1,74 0,80 5,52E-05 2,36 5,1

hsa-miR-129-5p

2,13 0,81 -0,23 1,09 1,04E-03 2,36 5,1

hsa-miR-188-5p

7,10 0,65 4,76 0,80 6,57E-05 2,35 5,1

hsa-miR-616

1,35 0,54 -0,96 0,76 3,59E-05 2,31 5,0

hsa-miR-583

2,24 0,75 -0,06 1,07 1,04E-03 2,31 4,9

hsa-miR-490-3p

1,40 0,41 -0,90 0,73 2,16E-05 2,30 4,9

miARN

NOD CÁNCER NOD frente a CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

EST Med EST prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-490-5p

3,04 0,32 0,74 0,62 2,64E-06 2,30 4,9

hsa-miR-422a

3,29 0,36 1,01 1,05 7,08E-04 2,28 4,9

hsa-miR-1255b

1,70 0,49 -0,58 0,65 7,47E-06 2,28 4,8

hsa-miR-516b

2,43 0,32 0,15 0,70 1,23E-05 2,28 4,8

hsa-miR-1246

9,28 1,15 7,01 1,15 3,05E-03 2,27 4,8

hsa-miR-518c*

1,90 0,53 -0,36 0,62 6,04E-06 2,25 4,8

hsa-miR-1276

1,67 0,65 -0,58 0,85 1,66E-04 2,25 4,8

hsa-miR-1180

3,19 0,43 0,95 0,88 1,78E-04 2,25 4,7

hsa-miR-204

7,87 0,45 5,63 1,72 2,22E-02 2,24 4,7

hsa-miR-1308

9,69 0,89 7,45 0,82 2,38E-04 2,23 4,7

hsa-miR-370

3,45 0,51 1,23 0,86 1,79E-04 2,23 4,7

hsa-miR-921

1,34 0,52 -0,88 0,78 6,77E-05 2,22 4,7

hsa-miR-662

3,23 0,23 1,03 0,46 9,15E-08 2,21 4,6

hsa-miR-424*

4,99 0,68 2,79 0,89 3,49E-04 2,20 4,6

hsa-miR-873

2,95 0,83 0,76 1,15 2,81E-03 2,19 4,6

hsa-miR-302c*

1,28 0,71 -0,86 0,61 1,94E-05 2,15 4,4

hsa-miR-373*

2,82 0,97 0,69 0,89 7,27E-04 2,13 4,4

hsa-miR-518a-5p

1,71 0,67 -0,42 0,77 1,24E-04 2,13 4,4

hsa-miR-510

1,32 0,19 -0,79 0,93 4,02E-04 2,12 4,3

hsa-miR-575

9,81 0,66 7,73 0,66 4,17E-05 2,08 4,2

hsa-miR-1303

1,37 0,56 -0,70 0,57 7,72E-06 2,07 4,2

hsa-miR-296-3p

0,00 0,65 -2,06 0,51 4,33E-06 2,07 4,2

hsa-miR-605

3,37 1,05 1,33 1,04 3,26E-03 2,04 4,1

hsa-miR-1266

1,41 0,16 -0,62 0,86 2,91E-04 2,03 4,1

hsa-miR-127-5p

0,95 0,36 -1,08 0,53 2,51E-06 2,03 4,1

hsa-miR-298

1,59 0,37 -0,43 0,85 3,14E-04 2,02 4,1

hsa-miR-640

1,16 0,46 -0,84 0,72 8,16E-05 2,01 4,0

hsa-miR-614

1,71 0,68 -0,28 0,58 2,48E-05 1,99 4,0

hsa-miR-1250

1,57 0,53 -0,42 0,58 1,49E-05 1,99 4,0

hsa-miR-630

6,48 0,60 4,52 1,29 1,02E-02 1,96 3,9

hsa-miR-654-5p

3,71 0,37 1,76 0,58 1,05E-05 1,94 3,8

hsa-miR-877*

4,38 0,42 2,47 0,46 1,44E-06 1,92 3,8

hsa-miR-138

6,26 0,71 4,34 0,98 2,39E-03 1,91 3,8

miARN

NOD CÁNCER NOD frente a CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

EST Med EST prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-769-3p

2,99 0,65 1,10 0,56 2,87E-05 1,89 3,7

hsa-miR-557

5,88 0,79 3,99 0,66 1,74E-04 1,89 3,7

hsa-miR-199b-5p

8,91 0,21 7,03 1,36 1,60E-02 1,88 3,7

hsa-miR-525-5p

1,81 0,50 -0,04 0,47 4,07E-06 1,86 3,6

hsa-miR-1226*

5,37 0,48 3,57 0,47 4,41E-06 1,80 3,5

hsa-miR-124

1,20 1,01 -0,57 0,59 3,40E-04 1,77 3,4

hsa-miR-1249

5,58 0,76 3,85 0,64 2,89E-04 1,73 3,3

hsa-miR-1299

4,04 0,46 2,33 0,89 2,16E-03 1,72 3,3

hsa-miR-541

0,61 0,40 -1,10 0,61 7,79E-05 1,71 3,3

hsa-miR-486-5p

8,26 0,71 6,55 1,16 1,42E-02 1,71 3,3

hsa-miR-1208

3,34 0,27 1,64 0,80 8,44E-04 1,70 3,2

hsa-miR-671-3p

0,34 0,59 -1,35 0,69 3,88E-04 1,70 3,2

hsa-miR-584

4,03 0,50 2,34 1,08 8,74E-03 1,69 3,2

hsa-miR-33b*

3,92 0,53 2,24 0,40 3,59E-06 1,68 3,2

hsa-miR-639

0,66 0,47 -1,00 0,67 3,30E-04 1,65 3,1

hsa-miR-1254

1,14 0,36 -0,48 0,71 4,63E-04 1,63 3,1

hsa-miR-513a-5p

5,17 0,43 3,57 0,53 4,65E-05 1,61 3,0

hsa-miR-501-3p

4,28 0,24 2,68 0,42 2,29E-06 1,60 3,0

hsa-miR-1306

2,62 0,34 1,03 0,58 8,73E-05 1,59 3,0

hsa-miR-122

1,86 1,30 0,29 0,67 4,08E-03 1,57 3,0

hsa-miR-675b

0,16 0,91 -1,40 0,47 1,99E-04 1,57 3,0

hsa-miR-486-3p

1,82 1,02 0,26 0,91 9,11E-03 1,56 3,0

hsa-miR-1307

3,02 0,38 1,46 0,53 5,61E-05 1,56 3,0

hsa-miR-1285

3,03 0,59 1,48 0,55 1,61E-04 1,55 2,9

hsa-miR-381

3,79 1,14 2,24 1,10 2,59E-02 1,55 2,9

hsa-miR-125b-1*

2,79 1,31 1,27 1,02 2,43E-02 1,53 2,9

hsa-miR-139-5p

6,53 0,30 5,03 0,77 1,68E-03 1,51 2,8

hsa-miR-516a-5p

3,28 0,99 1,77 0,89 9,99E-03 1,51 2,8

hsa-miR-664*

6,07 0,84 4,57 0,67 1,70E-03 1,50 2,8

hsa-miR-220c

0,55 0,18 -0,94 0,53 5,27E-05 1,49 2,8

hsa-miR-518e*

1,68 0,29 0,19 0,67 6,11E-04 1,49 2,8

hsa-miR-602

3,53 0,52 2,05 0,77 2,59E-03 1,48 2,8

hsa-miR-550

3,35 0,32 1,87 0,47 2,57E-05 1,48 2,8

miARN

NOD CÁNCER NOD frente a CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

EST Med EST prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-194*

1,17 0,64 -0,30 0,46 8,51E-05 1,47 2,8

hsa-miR-499-5p

4,99 1,73 3,53 0,78 2,26E-02 1,47 2,8

hsa-miR-125a-3p

6,98 0,40 5,52 0,52 9,98E-05 1,46 2,7

hsa-miR-378

5,80 1,51 4,35 0,40 3,42E-03 1,45 2,7

hsa-miR-193b*

4,35 0,60 2,92 0,41 4,05E-05 1,43 2,7

hsa-miR-512-3p

4,75 0,05 3,35 1,10 2,41E-02 1,40 2,6

hsa-miR-135b*

0,11 0,63 -1,28 0,64 1,36E-03 1,40 2,6

hsa-miR-885-3p

0,33 0,38 -1,05 0,65 1,01E-03 1,38 2,6

hsa-miR-28-3p

1,74 0,21 0,37 0,70 1,44E-03 1,38 2,6

hsa-miR-214

9,06 0,45 7,69 0,92 1,19E-02 1,38 2,6

hsa-miR-886-5p

-0,11 0,91 -1,48 0,59 2,23E-03 1,37 2,6

hsa-miR-520a-5p

0,68 0,37 -0,68 0,56 3,30E-04 1,37 2,6

hsa-miR-611

-0,08 0,42 -1,43 0,57 4,58E-04 1,36 2,6

hsa-miR-574-5p

7,17 0,65 5,82 0,52 4,89E-04 1,35 2,6

hsa-miR-331-5p

0,48 0,50 -0,87 0,72 3,18E-03 1,35 2,6

hsa-miR-760

3,96 0,39 2,61 0,87 9,16E-03 1,34 2,5

hsa-miR-1304

0,10 0,85 -1,23 0,57 1,78E-03 1,33 2,5

hsa-miR-658

0,84 0,57 -0,48 0,52 4,12E-04 1,33 2,5

hsa-miR-135a*

5,26 0,83 3,95 0,83 1,32E-02 1,31 2,5

hsa-miR-708

2,26 0,40 0,96 0,78 5,73E-03 1,31 2,5

hsa-miR-1244

1,73 0,83 0,42 0,61 2,85E-03 1,30 2,5

hsa-miR-451

14,59 0,58 13,29 1,10 3,99E-02 1,30 2,5

hsa-miR-1275

7,77 0,53 6,48 0,84 1,06E-02 1,29 2,4

hsa-miR-296-5p

4,16 0,70 2,88 0,40 2,25E-04 1,27 2,4

hsa-miR-219-2-3p

-0,14 0,75 -1,40 0,35 1,56E-04 1,26 2,4

hsa-miR-432

2,91 0,59 1,66 0,63 2,59E-03 1,25 2,4

hsa-miR-1270

2,13 0,49 0,90 0,73 6,53E-03 1,23 2,3

hsa-miR-938

-0,36 0,55 -1,59 0,49 4,82E-04 1,23 2,3

hsa-miR-184

2,49 0,44 1,26 1,10 4,77E-02 1,23 2,3

hsa-miR-1322

0,07 0,89 -1,15 0,46 1,45E-03 1,22 2,3

hsa-miR-195*

1,70 0,31 0,49 0,84 1,39E-02 1,21 2,3

hsa-miR-595

1,47 0,36 0,27 0,61 1,87E-03 1,20 2,3

hsa-miR-612

0,15 0,90 -1,04 0,45 1,85E-03 1,19 2,3

miARN

NOD CÁNCER NOD frente a CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

EST Med EST prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-145

10,36 0,25 9,21 0,68 4,88E-03 1,14 2,2

hsa-miR-920

-0,31 0,71 -1,45 0,75 1,57E-02 1,14 2,2

hsa-miR-604

1,03 0,47 -0,09 0,71 9,28E-03 1,13 2,2

hsa-miR-665

4,11 0,23 3,00 0,86 2,37E-02 1,11 2,2

hsa-miR-300

-0,08 0,53 -1,19 0,65 6,59E-03 1,11 2,2

hsa-miR-1323

2,32 0,36 1,21 0,56 1,99E-03 1,10 2,1

hsa-miR-378*

3,57 1,66 2,47 0,45 3,28E-02 1,10 2,1

hsa-miR-193a-5p

5,79 0,54 4,70 0,64 7,04E-03 1,09 2,1

hsa-miR-152

7,41 0,49 6,32 0,84 2,72E-02 1,09 2,1

hsa-miR-1470

0,88 0,44 -0,21 0,75 1,51E-02 1,09 2,1

hsa-miR-363

6,07 0,52 5,01 0,94 4,73E-02 1,07 2,1

hsa-miR-18a*

0,03 0,53 -1,02 0,54 3,38E-03 1,06 2,1

hsa-miR-23a*

4,15 0,52 3,10 0,42 7,25E-04 1,05 2,1

hsa-miR-508-5p

-0,04 0,96 -1,09 0,40 4,24E-03 1,05 2,1

hsa-miR-1247

-0,30 0,85 -1,34 0,79 3,59E-02 1,04 2,1

hsa-miR-596

-0,35 0,80 -1,37 0,83 4,33E-02 1,02 2,0

hsa-miR-887

3,67 0,29 2,67 0,51 1,91E-03 1,00 2,0

hsa-miR-99b*

2,60 0,27 1,61 0,50 1,72E-03 0,99 2,0

hsa-miR-513a-3p

0,56 0,52 -0,43 0,64 1,19E-02 0,99 2,0

hsa-miR-567

0,38 0,82 -0,60 0,49 7,32E-03 0,98 2,0

hsa-miR-222*

-0,97 0,32 0,06 0,65 7,78E-03 -1,03 2,0

hsa-miR-34a*

3,35 0,11 4,39 0,34 2,71E-05 -1,03 2,0

hsa-miR-15a*

0,59 0,33 1,65 0,43 3,58E-04 -1,06 2,1

hsa-miR-200c*

0,71 0,51 1,83 0,44 4,76E-04 -1,12 2,2

hsa-miR-181a*

2,91 0,38 4,04 0,59 2,55E-03 -1,13 2,2

hsa-miR-141*

2,35 0,61 3,56 0,51 9,62E-04 -1,22 2,3

hsa-miR-15a

10,12 0,45 11,38 0,42 8,40E-05 -1,26 2,4

hsa-miR-34a

10,54 0,23 11,89 0,46 4,37E-05 -1,35 2,6

hsa-miR-542-3p

4,58 0,36 6,01 1,31 4,97E-02 -1,43 2,7

hsa-miR-146a

6,62 0,21 8,05 0,99 1,21E-02 -1,43 2,7

hsa-miR-181a-2*

3,55 0,49 5,02 1,17 2,85E-02 -1,47 2,8

hsa-miR-424

8,49 0,39 9,98 1,13 2,10E-02 -1,49 2,8

hsa-miR-450a

3,72 0,63 5,23 1,28 3,88E-02 -1,51 2,9

miARN

NOD CÁNCER NOD frente a CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

EST Med EST prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-96

6,74 0,37 8,33 1,20 2,12E-02 -1,59 3,0

hsa-miR-155

5,51 0,19 7,21 1,11 8,65E-03 -1,70 3,2

hsa-miR-503

3,37 0,73 5,12 0,99 4,93E-03 -1,75 3,4

hsa-miR-21

12,93 0,34 14,69 0,77 4,84E-04 -1,76 3,4

hsa-miR-29b-1*

3,01 0,32 4,86 0,45 1,05E-06 -1,85 3,6

hsa-miR-142-5p

3,80 0,94 5,68 1,35 1,99E-02 -1,88 3,7

hsa-miR-21*

4,08 0,15 6,02 0,71 7,31E-05 -1,93 3,8

hsa-miR-1260

6,15 0,87 8,55 0,65 1,60E-05 -2,40 5,3

hsa-miR-142-3p

6,85 1,06 9,26 1,24 2,86E-03 -2,42 5,3

hsa-miR-222

6,24 0,80 8,72 1,58 8,77E-03 -2,48 5,6

hsa-miR-221*

4,79 0,21 7,36 1,53 4,70E-03 -2,57 5,9

hsa-miR-146b-3p

-1,31 0,37 1,33 2,24 3,56E-02 -2,63 6,2

hsa-miR-720

9,90 0,79 12,58 0,50 3,13E-07 -2,68 6,4

hsa-miR-1274b

8,18 0,94 11,00 0,60 1,61E-06 -2,82 7,0

hsa-miR-221

6,58 0,33 9,47 1,53 2,08E-03 -2,89 7,4

hsa-miR-1274a

4,39 1,03 7,38 0,67 2,84E-06 -2,99 7,9

hsa-miR-146b-5p

7,29 0,77 11,33 3,20 2,62E-02 -4,03 16,4

EJEMPLO 32

LA ELABORACIÓN DE PERFILES DE miARN DISTINGUE ADENOMA FOLICULAR (FA) DE CARCINOMAS DIFERENCIADOS DERIVADOS DE CÉLULAS FOLICULARES (FTC, PTC, FVPTC)

5 Un total de 94 miARN humanos estaban expresados significativamente de manera diferencial entre adenomas foliculares y especímenes de carcinoma derivado de células foliculares (FTC, PTC, FVPTC) (p<0,05). De estos, diecinueve miARN estaban expresados a niveles de 2 a 5 veces mayores (dif. Log2 (FA frente a CÁNCER) ≥ 1) en las muestras de FA. Además, trece miARN estaban expresados a niveles al menos 2 veces mayores en las muestras de FA (tabla 34). Entre estos, cinco miARN (hsa-miR-31, -31*, -200a, -200b y -429) estaban 10 subexpresados de 8 a 20 veces y ocho miARN estaban subexpresados de 2 a 5 veces en las muestras de FA (tabla 34).

Tabla 34. MicroARN expresados de manera diferencial significativamente entre adenomas foliculares y carcinomas diferenciados derivados de células foliculares (CÁNCER). Med, media de expresión entre muestras en un grupo; DE, desviación estándar.

miARN

CÁNCER FA FA frente a CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-885-5p

0,15 0,95 2,39 2,44 8,50E-03 2,24 4,7

hsa-miR-873

0,76 1,15 2,39 1,52 2,22E-02 1,63 3,1

hsa-miR-668

-1,29 0,62 0,18 1,71 1,11E-02 1,47 2,8

hsa-miR-554

-1,86 0,30 -0,48 1,09 3,07E-04 1,38 2,6

miARN

CÁNCER FA FA frente a CÁNCER Múltiplo de cambio

Med

DE Med DE prueba de t Dif. Log2

hsa-miR-10a

6,76 0,85 8,12 1,89 4,06E-02 1,36 2,6

hsa-miR-1227

0,12 0,66 1,40 1,09 5,85E-03 1,28 2,4

hsa-miR-220a

-1,15 0,69 0,11 1,16 9,35E-03 1,26 2,4

hsa-miR-1910

-1,68 0,48 -0,46 2,07 4,53E-02 1,23 2,3

hsa-let-7g*

-0,98 0,49 0,23 1,47 1,22E-02 1,21 2,3

hsa-miR-671-3p

-1,35 0,69 -0,25 1,10 1,72E-02 1,11 2,2

hsa-miR-1247

-1,34 0,79 -0,29 0,97 2,80E-02 1,05 2,1

hsa-miR-637

-1,17 0,39 -0,13 1,32 1,37E-02 1,04 2,1

hsa-miR-1204

-1,05 0,49 -0,02 1,48 2,94E-02 1,03 2,0

hsa-miR-1468

-1,84 0,59 -0,81 1,29 2,64E-02 1,03 2,0

hsa-miR-371-3p

-0,16 0,67 0,85 1,16 2,79E-02 1,02 2,0

hsa-miR-411*

-1,36 0,40 -0,35 1,61 3,71E-02 1,01 2,0

hsa-miR-483-3p

0,57 0,65 1,57 0,99 2,03E-02 0,99 2,0

hsa-miR-517a

-0,40 0,54 0,59 1,11 1,63E-02 0,99 2,0

hsa-miR-595

0,27 0,61 1,24 1,14 2,73E-02 0,96 2,0

hsa-miR-1255b

-0,58 0,65 -1,55 1,06 2,52E-02 -0,98 2,0

hsa-miR-556-5p

0,05 0,34 -0,94 0,91 2,30E-03 -0,99 2,0

hsa-miR-21*

6,02 0,71 4,88 0,62 5,84E-03 -1,14 2,2

hsa-miR-21

14,69 0,77 13,53 0,95 1,47E-02 -1,16 2,2

hsa-miR-449a

3,24 0,86 1,92 0,60 6,16E-03 -1,32 2,5

hsa-miR-424

9,98 1,13 8,66 1,27 4,37E-02 -1,32 2,5

hsa-miR-200a*

3,81 1,75 1,73 1,73 3,45E-02 -2,09 4,2

hsa-miR-200b*

4,18 1,76 2,08 2,15 4,39E-02 -2,11 4,3

hsa-miR-429

7,50 2,05 4,35 3,00 1,82E-02 -3,14 8,8

hsa-miR-200b

10,12 2,06 6,77 3,16 1,45E-02 -3,35 10,2

hsa-miR-200a

8,67 1,95 5,20 3,08 9,08E-03 -3,47 11,1

hsa-miR-31*

6,98 1,89 3,33 3,40 7,99E-03 -3,66 12,6

hsa-miR-31

8,45 2,05 4,50 3,49 6,91E-03 -3,95 15,5

EJEMPLO 33

ANÁLISIS qRT-PCR DE miARN expresados de manera diferencial

Se llevaron a cabo reacciones qRT-PCR para 33 de los principales miARN más comúnmente expresados de manera diferencial entre subgrupos de tejidos de tiroides normales y enfermos. Las reacciones qRT-PCR se llevaron a cabo usando ensayos de microARN TaqMan® (Applied Biosystems; Foster City, CA, EE.UU) según las instrucciones del fabricante. Las reacciones incluyeron 5 ng de ARN total por reacción y se incubaron en el sistema para PCR en

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Claims (1)

1. imagen1

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