ES2365205T3 - Síntesis biocatalítica del ácido shikímico. - Google Patents
Síntesis biocatalítica del ácido shikímico. Download PDFInfo
- Publication number
- ES2365205T3 ES2365205T3 ES99956926T ES99956926T ES2365205T3 ES 2365205 T3 ES2365205 T3 ES 2365205T3 ES 99956926 T ES99956926 T ES 99956926T ES 99956926 T ES99956926 T ES 99956926T ES 2365205 T3 ES2365205 T3 ES 2365205T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- coli
- acid
- shikimic acid
- plasmid
- gene
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
- JXOHGGNKMLTUBP-HSUXUTPPSA-N shikimic acid Chemical compound O[C@@H]1CC(C(O)=O)=C[C@@H](O)[C@H]1O JXOHGGNKMLTUBP-HSUXUTPPSA-N 0.000 title claims abstract description 109
- JXOHGGNKMLTUBP-JKUQZMGJSA-N shikimic acid Natural products O[C@@H]1CC(C(O)=O)=C[C@H](O)[C@@H]1O JXOHGGNKMLTUBP-JKUQZMGJSA-N 0.000 title claims abstract description 109
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 title description 50
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 title description 22
- 230000002210 biocatalytic effect Effects 0.000 title description 2
- AAWZDTNXLSGCEK-LNVDRNJUSA-N (3r,5r)-1,3,4,5-tetrahydroxycyclohexane-1-carboxylic acid Chemical compound O[C@@H]1CC(O)(C(O)=O)C[C@@H](O)C1O AAWZDTNXLSGCEK-LNVDRNJUSA-N 0.000 claims abstract description 54
- AAWZDTNXLSGCEK-UHFFFAOYSA-N Cordycepinsaeure Natural products OC1CC(O)(C(O)=O)CC(O)C1O AAWZDTNXLSGCEK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 54
- AAWZDTNXLSGCEK-ZHQZDSKASA-N Quinic acid Natural products O[C@H]1CC(O)(C(O)=O)C[C@H](O)C1O AAWZDTNXLSGCEK-ZHQZDSKASA-N 0.000 claims abstract description 54
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims abstract description 42
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 41
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 claims abstract description 40
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 claims abstract description 40
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 33
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims abstract description 32
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 20
- -1 amino aromatic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 14
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 claims abstract description 10
- HOVAGTYPODGVJG-UHFFFAOYSA-N methyl beta-galactoside Natural products COC1OC(CO)C(O)C(O)C1O HOVAGTYPODGVJG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 9
- 108010044467 Isoenzymes Proteins 0.000 claims abstract description 8
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims abstract description 7
- 108010080376 3-Deoxy-7-Phosphoheptulonate Synthase Proteins 0.000 claims abstract description 6
- HOVAGTYPODGVJG-WLDMJGECSA-N methyl D-glucoside Chemical group COC1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O HOVAGTYPODGVJG-WLDMJGECSA-N 0.000 claims abstract description 6
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 150000002303 glucose derivatives Chemical class 0.000 claims abstract description 5
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 claims abstract description 5
- 230000001603 reducing effect Effects 0.000 claims abstract description 3
- 108020001482 shikimate kinase Proteins 0.000 claims abstract description 3
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 claims abstract description 3
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims abstract 3
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 21
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 15
- 101150040872 aroE gene Proteins 0.000 claims description 12
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 10
- 101100163490 Alkalihalobacillus halodurans (strain ATCC BAA-125 / DSM 18197 / FERM 7344 / JCM 9153 / C-125) aroA1 gene Proteins 0.000 claims description 8
- 101150037081 aroA gene Proteins 0.000 claims description 8
- 101150090235 aroB gene Proteins 0.000 claims description 8
- 101150083869 aroK gene Proteins 0.000 claims description 8
- 102000004867 Hydro-Lyases Human genes 0.000 claims description 5
- 108090001042 Hydro-Lyases Proteins 0.000 claims description 5
- 101100435931 Methanosarcina acetivorans (strain ATCC 35395 / DSM 2834 / JCM 12185 / C2A) aroK gene Proteins 0.000 claims description 5
- 101150007004 aroL gene Proteins 0.000 claims description 5
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims description 4
- 108050008280 Shikimate dehydrogenase Proteins 0.000 claims description 3
- 108050006180 3-dehydroquinate synthase Proteins 0.000 claims description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 claims 1
- 101150002295 serA gene Proteins 0.000 claims 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 abstract description 7
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 6
- 101100435903 Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) aroG gene Proteins 0.000 abstract description 2
- 101150042732 aroC gene Proteins 0.000 abstract description 2
- 101150019536 aroF gene Proteins 0.000 abstract description 2
- 108010038550 3-dehydroquinate dehydratase Proteins 0.000 abstract 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 38
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 30
- SLWWJZMPHJJOPH-UHFFFAOYSA-N DHS Natural products OC1CC(C(O)=O)=CC(=O)C1O SLWWJZMPHJJOPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- 235000010633 broth Nutrition 0.000 description 18
- YVYKOQWMJZXRRM-PUFIMZNGSA-N 3-dehydroshikimate Chemical compound O[C@@H]1C[C@H](C(O)=O)C=C(O)[C@@H]1O YVYKOQWMJZXRRM-PUFIMZNGSA-N 0.000 description 16
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 15
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 14
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 14
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 12
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 12
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 12
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 10
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 10
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 9
- NGHMDNPXVRFFGS-IUYQGCFVSA-N D-erythrose 4-phosphate Chemical compound O=C[C@H](O)[C@H](O)COP(O)(O)=O NGHMDNPXVRFFGS-IUYQGCFVSA-N 0.000 description 8
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 8
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 8
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 8
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 7
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 7
- FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 6
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 6
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 6
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 6
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 6
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 6
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 5
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 5
- 102000014701 Transketolase Human genes 0.000 description 5
- 108010043652 Transketolase Proteins 0.000 description 5
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 5
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 5
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 5
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 5
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 description 5
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 5
- GLDQAMYCGOIJDV-UHFFFAOYSA-N 2,3-dihydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC(O)=C1O GLDQAMYCGOIJDV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- WVMWZWGZRAXUBK-SYTVJDICSA-N 3-dehydroquinic acid Chemical compound O[C@@H]1C[C@](O)(C(O)=O)CC(=O)[C@H]1O WVMWZWGZRAXUBK-SYTVJDICSA-N 0.000 description 4
- WVMWZWGZRAXUBK-UHFFFAOYSA-N 3-dehydroquinic acid Natural products OC1CC(O)(C(O)=O)CC(=O)C1O WVMWZWGZRAXUBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- PJWIPEXIFFQAQZ-PUFIMZNGSA-N 7-phospho-2-dehydro-3-deoxy-D-arabino-heptonic acid Chemical compound OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CC(=O)C(O)=O PJWIPEXIFFQAQZ-PUFIMZNGSA-N 0.000 description 4
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 4
- 101150024271 TKT gene Proteins 0.000 description 4
- 101150102858 aroD gene Proteins 0.000 description 4
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 description 4
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 4
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 4
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 4
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 4
- 229930029653 phosphoenolpyruvate Natural products 0.000 description 4
- DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-N phosphoenolpyruvic acid Chemical compound OC(=O)C(=C)OP(O)(O)=O DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229960001153 serine Drugs 0.000 description 4
- 241000894007 species Species 0.000 description 4
- 101150014795 tktA gene Proteins 0.000 description 4
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 3
- SLWWJZMPHJJOPH-PHDIDXHHSA-N 3-dehydroshikimic acid Chemical compound O[C@@H]1CC(C(O)=O)=CC(=O)[C@H]1O SLWWJZMPHJJOPH-PHDIDXHHSA-N 0.000 description 3
- 229940090248 4-hydroxybenzoic acid Drugs 0.000 description 3
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 3
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 3
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 3
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 3
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 3
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 3
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 3
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 3
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 3
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 3
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 3
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 3
- 235000011149 sulphuric acid Nutrition 0.000 description 3
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 3
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 3
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 description 3
- 229960004441 tyrosine Drugs 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229940082044 2,3-dihydroxybenzoic acid Drugs 0.000 description 2
- 101000907863 Arabidopsis thaliana Shikimate dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 108091029865 Exogenous DNA Proteins 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 101100002724 Thermus thermophilus aroH gene Proteins 0.000 description 2
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150076125 aroG gene Proteins 0.000 description 2
- 101150108612 aroQ gene Proteins 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 230000001010 compromised effect Effects 0.000 description 2
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 2
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 2
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 2
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 2
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 2
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 2
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 2
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 2
- NPFOYSMITVOQOS-UHFFFAOYSA-K iron(III) citrate Chemical compound [Fe+3].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NPFOYSMITVOQOS-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 2
- 230000027086 plasmid maintenance Effects 0.000 description 2
- MZKKJVZIFIQOPP-UHFFFAOYSA-M potassium;4-aminobenzoate Chemical compound [K+].NC1=CC=C(C([O-])=O)C=C1 MZKKJVZIFIQOPP-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 238000001953 recrystallisation Methods 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 150000003364 shikimic acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 2
- 239000011573 trace mineral Substances 0.000 description 2
- 235000013619 trace mineral Nutrition 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 2
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 2
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 2
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 2
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000219310 Beta vulgaris subsp. vulgaris Species 0.000 description 1
- 239000002028 Biomass Substances 0.000 description 1
- YASYEJJMZJALEJ-UHFFFAOYSA-N Citric acid monohydrate Chemical compound O.OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O YASYEJJMZJALEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 102100037579 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 241000720991 Illicium Species 0.000 description 1
- 239000007836 KH2PO4 Substances 0.000 description 1
- 241000588747 Klebsiella pneumoniae Species 0.000 description 1
- 229920000106 Liquid crystal polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000004977 Liquid-crystal polymers (LCPs) Substances 0.000 description 1
- 229910021380 Manganese Chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- GLFNIEUTAYBVOC-UHFFFAOYSA-L Manganese chloride Chemical compound Cl[Mn]Cl GLFNIEUTAYBVOC-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 108010038555 Phosphoglycerate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 102000001253 Protein Kinase Human genes 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 240000000111 Saccharum officinarum Species 0.000 description 1
- 235000007201 Saccharum officinarum Nutrition 0.000 description 1
- 235000021536 Sugar beet Nutrition 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 1
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 1
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 1
- OHVGNSMTLSKTGN-BTVCFUMJSA-N [C].OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O Chemical compound [C].OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O OHVGNSMTLSKTGN-BTVCFUMJSA-N 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 238000005273 aeration Methods 0.000 description 1
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 235000011114 ammonium hydroxide Nutrition 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000003466 anti-cipated effect Effects 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N arabinose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N 0.000 description 1
- 101150018055 aroH gene Proteins 0.000 description 1
- 150000001491 aromatic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000011942 biocatalyst Substances 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N boric acid Chemical compound OB(O)O KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002837 carbocyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001925 catabolic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005341 cation exchange Methods 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 229960002303 citric acid monohydrate Drugs 0.000 description 1
- ARUVKPQLZAKDPS-UHFFFAOYSA-L copper(II) sulfate Chemical compound [Cu+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] ARUVKPQLZAKDPS-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000366 copper(II) sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000018044 dehydration Effects 0.000 description 1
- 238000006297 dehydration reaction Methods 0.000 description 1
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 1
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 150000001991 dicarboxylic acids Chemical class 0.000 description 1
- ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L dipotassium hydrogen phosphate Chemical compound [K+].[K+].OP([O-])([O-])=O ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000396 dipotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019797 dipotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 229940042406 direct acting antivirals neuraminidase inhibitors Drugs 0.000 description 1
- 238000002845 discoloration Methods 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 230000004907 flux Effects 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 1
- 125000002791 glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 1
- 206010022000 influenza Diseases 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011565 manganese chloride Substances 0.000 description 1
- 235000002867 manganese chloride Nutrition 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- HOVAGTYPODGVJG-ZFYZTMLRSA-N methyl alpha-D-glucopyranoside Chemical compound CO[C@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O HOVAGTYPODGVJG-ZFYZTMLRSA-N 0.000 description 1
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019796 monopotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229920001467 poly(styrenesulfonates) Polymers 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M potassium dihydrogen phosphate Chemical compound [K+].OP(O)([O-])=O GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 108060006633 protein kinase Proteins 0.000 description 1
- 238000000425 proton nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 238000002390 rotary evaporation Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 239000002911 sialidase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- DPJRMOMPQZCRJU-UHFFFAOYSA-M thiamine hydrochloride Chemical compound Cl.[Cl-].CC1=C(CCO)SC=[N+]1CC1=CN=C(C)N=C1N DPJRMOMPQZCRJU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229960000344 thiamine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- 235000019190 thiamine hydrochloride Nutrition 0.000 description 1
- 239000011747 thiamine hydrochloride Substances 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000004102 tricarboxylic acid cycle Effects 0.000 description 1
- 125000000026 trimethylsilyl group Chemical group [H]C([H])([H])[Si]([*])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 1
- NWONKYPBYAMBJT-UHFFFAOYSA-L zinc sulfate Chemical compound [Zn+2].[O-]S([O-])(=O)=O NWONKYPBYAMBJT-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000368 zinc sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011686 zinc sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000009529 zinc sulphate Nutrition 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0006—Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
- C12N1/205—Bacterial isolates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/88—Lyases (4.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/40—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a carboxyl group including Peroxycarboxylic acids
- C12P7/42—Hydroxy-carboxylic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y402/00—Carbon-oxygen lyases (4.2)
- C12Y402/03—Carbon-oxygen lyases (4.2) acting on phosphates (4.2.3)
- C12Y402/03004—3-Dehydroquinate synthase (4.2.3.4)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
- C12R2001/185—Escherichia
- C12R2001/19—Escherichia coli
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
- Y10S435/8215—Microorganisms
- Y10S435/822—Microorganisms using bacteria or actinomycetales
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
- Y10S435/8215—Microorganisms
- Y10S435/822—Microorganisms using bacteria or actinomycetales
- Y10S435/848—Escherichia
- Y10S435/849—Escherichia coli
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
- Y10S435/8215—Microorganisms
- Y10S435/911—Microorganisms using fungi
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
- Y10S435/8215—Microorganisms
- Y10S435/911—Microorganisms using fungi
- Y10S435/94—Saccharomyces
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
Abstract
Un método de sintetizar ácido shikímico de una fuente de carbono comprendiendo convertir la fuente de carbono en ácido shikímico con un E. coli recombinante que comprende el gen aroF FBR codificando un isoenzima de 3desoxi-D-arabino-heptulosonato-7 fosfato sintasa insensible a la inhibición por retroalimentación por amino ácidos aromáticos u otras moléculas aromáticas, el gen codificando 3-deshidroquinata sintasa, el gen codificando 3deshidroquinata deshidratasa, y el gen codificando shikimato deshidrogenasa, en un medio de fermentación y controlando la proporción molar de ácido shikímico a ácido quínico reduciendo o eliminando el equilibrio de ácido shikímico a ácido quínico añadiendo de un análogo de glucosa no hidrolizable que es metil glucopiranosida al medio de fermentación, en donde el gen codificando la kinasa de shikimato en el E. coli recombinante es eliminado totalmente o en parte, o es mutado, por lo tanto, eliminando, inhibiendo o reduciendo la actividad de la quinasa de shikimato.
Description
[0001] La presente invención se refiere a la producción de ácido shikímico y más específicamente, a métodos de producir ácido shikímico de la bioconversión de una fuente de carbono.
[0002] El ácido shikímico es un sintón quiral atractivo con su altamente funcionalizado anillo carbocíclico de seis eslabones y múltiples centros asimétricos. Un intermediario metabólico de biosíntesis de amino ácido aromático, el ácido shikímico se ha convertido en un material de partida quiral esencial en la síntesis de los inhibidores de la neuraminidasa efectivo en el tratamiento de la gripe. Kim. C.U. y otros, J. Am. Chem. Soc. 119:681 (1997); Rohloff,
J.C. y otros, J. Org. Chem 63;4545 (1998). El quiral, así como los químicos aromáticos, pueden también ser sintetizados del ácido shikímico. Por ejemplo, el ácido catalizado de la deshidratación del ácido shikímico proporciona ácido p-hidroxibenzoico (Ekymann, J.F., Ver. Dtch. Chem. Ges. 24:1278 (1891)). El ácido phidroxibenzoico, que tiene una producción anual de 7 x 106 kg, es el precursor clave de los parabenos y un monómero utilizado en la síntesis de polímeros de cristal liquido. El ácido shikímico también ha sido utilizado recientemente como el punto de partida para la síntesis de un gran catálogo combinacional de moléculas. Tan, D.S. y otros, J. Am. Chem. Soc. 120:8565 (1998).
[0003] El ácido shikímico es obtenido por procesos de aislamiento multi-paso tediosos de plantas. Desafortunadamente, el aislamiento actual del ácido shikímico de la fruta de las plantas Illicium (Haslem, E., Shikimic Acid: Metabolism and Metabolites, Wiley & Sons, New York, pp. 40-42 (1993)) imposibilita su uso en síntesis a nivel de kilogramo.
[0004] Por lo tanto, sería deseable proporcionar un método para producir grandes cantidades de ácido shikímico. También sería deseable si tal método fuese rentable, utilizando materiales de partida baratos. Sería además deseable que el método emplease compuestos no tóxicos y que fuese medioambientalmente benigno.
[0005] La WO 96/34961 describe métodos para mejorar el flujo de carbono en un sistema de una célula huésped para mejorar la producción biosintética de compuestos de la misma, siendo las células huésped seleccionadas en base a ser fenotípicamente Pts-/glucosa+. Tales células huésped son capaces de transportar glucosa sin consumir fosfoenolpiruvato, resultando en la conservación del fosfoenolpiruvato que puede ser redirigido al sistema para mejorar la producción de los compuestos deseados a lo largo del sistema. Se ha demostrado que los mutantes Pts/glucosa+ son ventajosos para la producción mejorada de amino ácidos aromáticos.
[0006] La WO 94/14955 revela una eficiencia de producción mejorada de compuestos aromáticos por el sistema común de una célula huésped. Es realizada aumentando la expresión de las especies de enzimas que actúan en intermediarios de sustrato en pasos de reacción limitadores de la velocidad identificados en el sistema. Los transformantes de células procariotas son descritos comprendiendo secuencias de ADN exógeno codificando las especies de enzimas, 3-deshidroquinata sintasa, shikimato kinasa, 5-enolpiruvato-shikimato-3-fosfato sintasa y corismato sintasa. Estos transformantes pueden ser además transformados con secuencias de ADN exógeno codificando las especies de enzimas transcetolasa y DAHP sintasa. En una realización, una o más de las secuencias de ADN que codifican las especies de enzimas son incorporadas en el genoma del transformante.
[0007] La US-A-5798236 revela métodos para la síntesis de compuestos orgánicos quinoides de una fuente de energía renovable, como la glucosa. El método comprende mejorar la cantidad de equivalentes de glucosa introducidos en el sistema, bloqueando el sistema común para acumular deshidroquinata y convirtiendo la deshidroquinata en ácido quínico.
[0008] La publicación de Kikuchi y otros.: Mutational analysis of the feedback sites of phenylalanine-sensitive 3deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase of Escherichia coli.” Appl. Environ. Microbiol. Vol. 63, nº 2, Febrero 1997, páginas 791-762, XP002927102 revela que en la Escherichia coli, el aroF, aroG, y aroH codifican isoenzimas 3-desoxi-D-arabino-heptulosonato-7-fosfato sintasa que son inhibidos por retroalimentación por la tirosina, fenilalanina, y triptófano, respectivamente. La mutagénesis química in vitro de los genes aroG clonados es usada para identificar residuos y regiones de polipéptidos esenciales para la inhibición por retroalimentación de la fenilalanina.
[0009] La publicación de Whipp et al.: “A reassessment of the relations between aroK- and aroL-encoded shikimate kinase enzymes of Escherichia coli”, Journal of Bacteriology, vol. 177, nº 6, Marzo 1995, páginas 1627-1629, XP002927103 revela que en el transcurso de la secuenciación de los genes aroK, se encontraron un número de errores en la secuencia publicada. LA secuencia corregida altera la longitud de la región codificante del aroK de tal forma que las proteínas aroK y aroL son ahora de una longitud comparable y la homología entre ellas aumenta la longitud total de los dos enzimas.
[0010] Se proporciona un esquema de síntesis de bioingeniería para la producción de ácido shikímico de una fuente de carbono. Los métodos de bioconversión de la presente invención comprenden la conversión por catalizado de microbios de una fuente de carbono a ácido shikímico. Como se muestra en el esquema de síntesis de la Figura 1, el paso de conversión por catalizado de microbios de la presente invención requiere cuatro enzimas que pueden ser proporcionados por un microbio recombinante. El microbio recombínate es la Escherichia coli diseñada para causar la reducción de la 3-deshidroshikimato a ácido shikímico y para inhibir cualquier conversión adicional de ácido shikímico a lo largo del sistema biosintético de amino ácido aromático.
[0011] El método de síntesis biocatalítica para el ácido shikímico proporcionado en la presente, se cree que es medioambientalmente benigno, económicamente atractivo, y utiliza abundantes fuentes renovables como material de partida.
[0012] Se harán evidentes objetos, ventajas, y características adicionales de la presente invención de la siguiente descripción y las reivindicaciones añadidas, tomadas en conjunción con los dibujos acompañantes.
[0013] Las ventajas varias de la presente invención se harán evidentes para alguien experto en la materia leyendo la especificación siguiente y las reivindicaciones adjuntas haciendo referencia a los siguientes dibujos en los que:
La Figura 1 es una ilustración esquemática del esquema de síntesis de bioingeniería de la presente invención para producir ácido shikímico; y
La Figura 2 es un gráfico que muestra el equilibrio de los ácidos shikímico y quínico catalizado por SP1.1/pKD12.112.
[0014] Se proporciona en la presente un esquema de síntesis de bioingeniería para la producción de ácido shikímico de una fuente de carbono. También se proporcionan los métodos para producir ácido shikímico de una fuente de carbono en base al esquema de síntesis.
[0015] Se proporciona un método en donde la fuente de carbono es convertida en ácido shikímico por un microbio recombinante. La manipulación del sistema biosintético del amino ácido aromático común del microbio resulta en una producción significativa de ácido shikímico cuando el microbio recombinante es cultivado en presencia de una fuente de carbono. La fuente de carbono es convertida en 3-desoxi-D-arabino-heptulosanato-7-fosfato (DAHP) que es posteriormente convertido por 3-deshidroquinata sintasa en 3-deshidroquinata (DHQ) que es después deshidratada en 3-deshidroshikimato (DHS) por 3-deshidroquinata deshidratasa (c, Figura 1). El 3-deshidroshikimato es convertido en ácido shikímico por deshidrogenasa de shikimato (d, Figura 1). El metabolismo del ácido shikímico puede ser impedido bloqueando o impidiendo la actividad quinasa del shikimato (e, f, Figura 1), permitiendo por tanto la acumulación de cantidades significativas de ácido shikímico. En una realización preferida, el microbio será incapaz de reabsorber el ácido shikímico del medio debido a una mutación en la captación de shikimato (shiA). Por lo tanto, una vez formado, el ácido shikímico no puede ser convertido en ácido quínico o cualquier otra molécula en el sistema.
[0016] Los métodos de bioconversión de la presente invención son llevados a cabo bajo condiciones de tiempo, temperatura, pH, tipo de nutriente y concentración, condiciones de aireación, y concentraciones de glucosa controladas, para proporcionar la máxima conversión de la fuente de carbono en ácido shikímico. Como se describe en detalle en los Ejemplos Específicos, en una realización preferida, se usa un fermentador alimentado por lotes para convertir la fuente de carbono en ácido shikímico, seguido por el aislamiento del ácido shikímico del caldo de fermentación por cromatografía de intercambio iónico. El proceso del fermentador por lotes y los métodos de cromatografía son conocidos por aquellos expertos en la materia.
[0017] Como se usa en la presente, la frase “fuente de carbono” se entiende que incluye fuentes de carbono derivadas de biomasa incluyendo, pero no limitado a, xilosa, arabinosa, glicerol, glucosa y los intermediarios en el ciclo de Krebs (por ejemplo, ácidos dicarboxílicos), ya sea por sí solos o en combinación. En una realización preferida, la fuente de carbono es glucosa. La fuente de carbono puede ser derivada de fuentes renovables como, sin limitación, maíz, remolachas azucareras, caña de azúcar.
[0018] El microbio recombinante empleado en los métodos de la presente invención es el E. coli. En una realización preferida el E. coli comprende un casete de aroB insertado en el locus serA y la disrupción de los loci aroL y aroK (e y f, Figura 1). Este E. coli recombinante puede además comprender un inserto de genes aroFBR, aroE y serA transportando plásmido. El ácido shikímico se acumula debido a la ausencia de los isoenzimas codificados aroL- y aroK de la kinasa de shikimato mientras la segunda copia del aroB aumenta la actividad catalítica de la 3deshidroquinata sintasa. Dell, K.A. y otros, J. Am, Chem. Soc. 115:11581 (1993). Se apreciará, sin embargo, que las mutaciones de los loci aroL y aroK no son esenciales y son empleadas para proporcionar mayor producción de acido shikímico.
[0019] En una realización preferida, el E. coli recombínate comprende pkD12.112 plásmido transportando insertos aroFBR, serA y aro E. El inserto de genes aroFFBR, codifica un isoenzima mutante 3-desoxi-D-arabino-heptulosonato7-fosfato sintasa (a, Figura 1) insensible a la inhibición por retroalimentación por amino ácidos aromáticos u otras moléculas aromáticas que aumentan el flujo de carbono en el sistema biosintético de amino ácido aromático común. La deshidrogenasa de shikimato amplificada resultante de la expresión de aroE compensa la inhibición por retroalimentación del enzima por el ácido shikímico. Pittard, J. y otros, J. Bacteriol, 92:1070 (1966); Brown, K.D. y otros, Biochim. Biophys. Acta. 428:550 (1976). Debido a una mutación en el Locus serA genómico del E. coli requerido para la biosíntesis de L-serina, el crecimiento en un medio de sales mínimo y el mantenimiento plásmido sigue de la expresión del serA plásmido-localizado. El inserto serA plásmido por lo tanto permite el crecimiento microbiano en el medio de sales mínimo, distingüendo los microbios.
[0020] En otra realización, el E. coli comprende el pkD12.138 plásmido. Este plásmido se deriva de y lleva los mismos insertos de genes que el pKD12.112 así como un inserto de genes tktA codificados de transcetolasa. La transcetolasa cataliza la formación de D-eritrosa 4-fosfato, un fosfato aldosa inestable mantenido típicamente en concentraciones prácticamente nulas en la célula. La expresión elevada de transcetolasa proporciona D-eritrosa 4fosfato adicional para la condensación posterior con el fosfoenolpiruvato para formar 3-desoxi-D-arabinoheptulosonate-7-fosfato el primer intermediario comprometido de la biosíntesis de amino ácidos aromáticos.
[0021] En otra realización, los genes aroFFBR, serA, y/o aroE son insertados directamente en el genoma de la célula huésped. De esta forma no se requerirá un plásmido para la producción de ácido shikímico del tal microbio recombinante.
[0022] Ejemplos de los anteriormente descritos microbios recombinantes preferidos de la presente invención, E. coli, SP1.1/pKD12.112, SP2.1/pKD12.112, SP1.1/pKD12.138 y SP2.1/pKD12.138 son descritos en el Ejemplo Específico 1 y han sido depositados en la American Type Culture Collection (ATCC), 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20582, bajo los términos del Tratado de Budapest, y se les otorgaron los números de designación ATCC 98905, 98903, 207055 y 207054, respectivamente. El depósito se mantendrá en el depósito de la ATCC, que es un depósito público, durante un periodo de 20 años, o 5 años tras la solicitud más reciente, o durante la vida efectiva de la patente, lo que sea más largo, y será reemplazado si el depósito se agota o se vuelve no viable durante ese periodo. Las muestras del depósito estarán disponibles al público y se retirarán todas las restricciones impuestas sobre el acceso al depósito tras la concesión de una patente en esta solicitud.
[0023] La tabla siguiente expone los cuatro enzimas requeridos para la conversión de glucosa en ácido shikímico, los genes codificando el mismo y el origen de los genes en los microbios recombinantes ejemplares de la presente invención.
TABLA 1
- Enzima+
- Genes (origen)
- a) 3-desoxi-D-arabino-ácido heptulosonico 7-fosfato sintasa
- aroFFBR (plásmido
- b) 3-deshidroquinata sintasa
- aroB (copia adicional insertada en el genoma)
- c) 3-deshidroquinata deshidratasa
- aroD (genoma)
- d) 3-deshidroshikimato deshidrogenasa
- aroE (plásmido)
- + Los enzimas a)-d) corresponden a a-d de la Figura 1.
[0024] A pesar de que el E. coli es descrito específicamente en la presente como el microbio para llevar a cabo los métodos de la presente invención, se apreciará que cualquier microorganismo como los de los tipos comunes citados en la bibliografía y conocidos por aquellos expertos en la materia, pueden ser empleados, siempre que el microorganismo pueda ser alterado para efectuar la conversión deseada, por ejemplo, fuente de carbono a ácido shikímico. Por lo tanto, está previsto que muchos tipos de hongos, bacterias y levaduras funcionarán en los métodos de la presente invención. Tales microorganismos pueden ser desarrollados, por ejemplo, a través de procesos de selección, mutación y/o transformación genética con la capacidad característica y necesaria de convertir un constituyente del esquema de síntesis de la presente invención en otro. Los métodos para tal desarrollo son bien conocidos para los profesionales expertos.
[0025] Para llevar a cabo los métodos de bioconversión de la presente invención, se pone en contacto una solución conteniendo una fuente de carbono con el microbio recombínate para formar una mezcla de bioconversión que es mantenida bajo las condiciones apropiadas para promover la conversión de la fuente de carbono en el constituyente deseado, por ejemplo, ácido shikímico. En una realización preferida, la mezcla de bioconversión es mantenida a una temperatura de 30º C a 37º C y a un pH de 6,5 a 7,5. Se prefiere que la mezcla de bioconversión también contenga otras sustancias necesarias para promover la vitalidad de los microbios recombinantes como sales minerales, reguladores, cofactores, sustancias nutrientes y similares. La mezcla de bioconversión es mantenida preferiblemente bajo condiciones de glucosa limitada. En una realización preferida, la tasa de adición de glucosa es determinada por el nivel de concentración de oxígeno disuelto. Un estado estable preferido sobre el curso de fermentación es de 100 a 200 µmol de glucosa o una concentración de oxígeno disuelto del 5% al 35% de saturación de aire.
[0026] Los requisitos más generales para el mantenimiento de la vitalidad de los microorganismos son bien conocidos y los requisitos para mantener la vitalidad de los microorganismos específicos también son bien conocidos tal como se documenta en la bibliografía, o son por otra parte fácilmente determinados por aquellos expertos en la materia. El ácido shikímico puede entonces ser recuperado de la mezcla de bioconversión por métodos conocidos en la técnica (por ejemplo, cromatografía de intercambio iónico) y además purificados por recristalización.
[0027] El cultivo de los microbios recombinantes de la presente invención no sólo produce ácido shikímico, si no también produce ácido quínico en el caldo de fermentación. Si la concentración de ácido quínico es demasiado alta, es difícil purificar el ácido shikímico fuera del ácido quínico. En una realización preferida, la proporción molar del ácido shikímico al ácido quínico en el caldo fermentador es tal que el ácido shikímico puede ser purificado fuera del ácido quínico. Preferiblemente la proporción molar será mayor que alrededor de 9. Más preferiblemente, la proporción molar será mayor que alrededor de 20 y más preferiblemente, será mayor que alrededor de 40.
[0028] En una realización, las proporciones molares del ácido shikímico al ácido quínico en el caldo fermentador son controladas controlando la concentración de la fuente de carbono durante la fermentación. Aunque no se desea estar atado por la teoría, se piensa que a menores concentraciones de la fuente de carbono; el ácido shikímico en el caldo del fermentador es recuperado por las células como una fuente de carbono alternativa y convertido en ácido quínico que es después secretado de vuelta en el caldo de fermentación. Aumentar la concentración de la fuente de carbono durante la fermentación inhibe esta recuperación de ácido shikímico y desciende o elimina el ácido quínico contaminante. Como un ejemplo no limitativo, aumentar la concentración de glucosa aumentando el Kc de 0,1 a 0,8 y así aumentando la tasa de adición de una solución de glucosa al 65% (w/v) durante la fermentación de SP1.1/pKD12.112, resultó en un aumento de la proporción molar de ácido shikímico a ácido quínico de 3,0 a 12, 0. T
[0029] La proporción molar de ácido shikímico a ácido quínico es controlada por la adición de análogos de glucosa no metabolizables (no hidrolizables) al medio de fermentación. Preferiblemente, el análogo de glucosa es glucopiranósido de metilo, preferiblemente presente en una concentración de entre alrededor de 0,1 mM y alrededor de 10mM. Más preferiblemente, está presente en una concentración de 0,5 a 1,0 mM. El glucopiranósido de metilo puede ser metil-α-glucopiranósido, metil-β-glucopiranósido, o una mezcla de los mismos. Como estos análogos son no hidrolizables, pueden ser añadidos solamente al principio de la fermentación.
[0030] Para demostrar más completamente las ventajas que surgen de la presente invención, se expone el siguiente ejemplo. Se debe entender que lo siguiente es a modo de ejemplo solamente y no pretende ser una limitación del ámbito de la invención.
Creación De Plásmidos Y Cepas Huésped
[0031] Se originaron dos cepas huésped creadas de la biosíntesis de ácido shikímico de dos cepas de E. coli diferentes. El E. coli SP1.1 fue creado del RB791, una cepa que difiere del tipo salvaje W3110 por sólo una única mutación. Se creó un segundo productor de shikimato, E. coli SP2.1, de una cepa que poseía mutaciones caracterizadas y un número desconocido de mutaciones no caracterizadas. La SP2.1 fue creada del AB2848, un aislado de varias vueltas de mutagenesis química originalmente seleccionado para una mutación en el gen aroD codificante de deshidroquinata deshidratasa. La reacción de los dos organismos para la biosíntesis del ácido shikímico permitió la evaluación del efecto de varios parámetros de cultivo en diferentes antecedentes genómicos.
[0032] La creación del SP1.1 empezó con la inserción del aroB en el locus serA del RB791 por recombinación homologa. Este suceso llevó a un E. coli con expresión de deshidroquinata sintasa aumentada mientras inactivaba la expresión de fosfoglicerato deshidrogenasa, un enzima necesario para la biosíntesis serina novo. La posterior transducción mediada por P1 de aroL478::Tn10 y aroK17::CmR del E. coli AL0807 proporcionó SP1.1 en el que ambos isoenzimas de kinasa de shikimato están inactivos. La creación del SP2.1 procedió de manera similar pero requirió el paso adicional de la reintroducción de actividad de deshidroquinata deshidratasa al organismo. Tras la inserción del aroB en el locus serA de AB2848, la transducción mediado por P1 de una copia funcional del aroD en el genoma proporcionó un organismo capaz de la biosíntesis de amino ácido aromático pero no de la biosíntesis de serina. La posterior transducción mediada por P1 del aroL478::Tn 10 y del aorK17::CmR del E. coli AL0807 proporcionó SP2.1.
[0033] El pKD12.112 plásmido es un vector basado en pSU-18 (aproximadamente de 15 a 20 copias por célula) que contiene genes codificando un isoenzima insensible de retroalimentación de 3-desoxi-D-Arabino-heptulosanato-7 fosfato sintasa (aroFFBR), shikimato deshidrogenasa (aroE), fosforoglicerato deshidrogenasa (serA), y β-lactamasa (ApR). La expresión del aroFFBR, serA, y β-lactamasa procede de sus respectivos promotores nativos mientras la expresión del aroE sucede de tanto su promotor nativo (designado ParoE) como de su tac promotor hibrido fuerte (Ptac). La expresión aumentada de un isoenzima insensible de retroalimentación de 3-desoxi-D-arabinoheptulosanato-7-fosfato sintasa aumenta el porcentaje de metabolitos dirigidos en la biosíntesis de shikimato mientras la expresión de deshidrogenasa de shikamato aumentada reduce el impacto de la inhibición de este enzima por el ácido shikímico, reduciendo de este modo la formación de subproducto de deshidroshikimato. La inclusión del serA en el pKD12.112 fuerza a las cepas huéspedes SP1.1 y SP2.1 a mantener el plásmido en el medio de cultivo careciendo del suplemento de serina. Finalmente, la inclusión del gen de β-lactamasa proporciona medios adicionales de presión selectiva para el mantenimiento plásmido en el SP1.1 y el SP2.1. La resistencia la ampicilina, sin embargo, fue utilizada solo como una presión selectiva secundaria durante la preparación de los inoculantes de la fermentación. La ampicilina nunca fue añadida a los cultivos de fermentación.
[0034] El pKD12.138 plásmido fue preparado del pKD12.112 por la inserción de tktA codificante de transcetolasa. La transcetolasa cataliza la formación de D-eritrosa 4-fosfato, un fosfato aldosa inestable típicamente mantenido en concentraciones prácticamente nulas en la célula. La expresión elevada de la transcetolasa proporciona D-eritrosa 4fosfato adicional para la posterior condensación con fosfoenolpiruvato para formar 3-desoxi-D-arabinoheptulosonato-7-fosfato, el primer intermediario comprometido de la biosíntesis de amino ácido aromático. La expresión de transcetolasa aumentada aumenta tanto la tasa de formación como el título final del ácido shikímico.
Síntesis Del Acido Shikímico De la Glucosa
I. Resultados
[0035] Cultivar SP1.1/pKD12.112 durante 42 h con Kc = 0,1 resultó en la síntesis de 27,2 g/L de ácido shikímico, 12,6 g/L de ácido quínico, y 4,4 g/L de ácido 3-deshidroshikimico (DHS). La acumulación de DHS reflejó la inhibición de retroalimentación del shikimato deshidrogenasa por el ácido shikímico. Draths, K.M. y otros, J. Am. Chem Soc. 114:9725 (1992). En contraste, la biosíntesis del ácido quínico fue sorprendente dada la ausencia en el E. coli de deshidrogenasa de ácido quínico que cataliza 3-deshidroquinata y la interconversión del ácido quínico. El DHS fue fácilmente retirado calentando el caldo del fermentador para convertir el DHS en un ácido protocatéquico que fue absorbido por carbono activo durante la decoloración. Desafortunadamente, la contaminación de ácido quínico fue superior a la que podía ser purificada del ácido shikímico por cristalización.
[0036] Minimizar la concentración citosólica del ácido 3-deshidroquinico pareció ser una estrategia razonable para reducir la contaminación por ácido quínico del ácido shikímico sintetizado por el E. coli SP1.1/pKD12.112. El gen aroD codificando la 3-deshidrouinate deshidratasa fue consecuentemente localizado en el pKD12.152A plásmido junto con el aroE, el aroFFBR, y el serA. Sin embargo, la expresión amplificada acompañante de 3-deshidroquinata deshidratasa no redujo los niveles de contaminación del ácido quínico en el ácido shikímico sintetizado por el SP1.1/pK12.152A bajo las condiciones del fermentador alimentado por lotes idénticas a las empleadas para el SP1.1/pKD12.112. Aunque no se desea estar atado por la teoría, estos resultados sugieren que la formación de ácido quínico puede no resultar de la biosíntesis de novo sino del equilibrio del ácido shikímico sintetizado inicialmente.
[0037] El equilibrio de los ácidos quínico y shikímico ha sido examinado anteriormente en extractos libres de células de Klebsiella pneumoniae. Mitsuhashi, S. y otros, Bochim, Biophy. Acta 15:268 (1954). Para ser relevante para la formación del ácido quínico en el E. coli SP1.1/pKD12.112, el sistema común debe ser capaz de operar in vivo al contrario de su dirección biosintética normal. Para probar esta posibilidad, se lavaron células SP1.1/pKD12.112 recogidas del fermentador tras 24 h, se resuspendieron en un medio de sales mínimo fresco conteniendo ácido shikímico, y después se agitaron. La formación del ácido quínico (barras sólidas, Figura 2) y ácido 3-deshidroshikimico (barras rayadas, Figura 2) junto con una disminución correspondiente en la concentración de ácido shikímico (barras transparentes, Figura 2) indicó que el SP1.1/pKD12.112 puede catalizar la formación del ácido quínico del ácido shikímico sintetizado inicialmente.
[0038] El posible papel del transporte del ácido shikímico del medio de cultivo al citoplasma microbiano durante el equilibrio observado señaló a una estrategia para minimizar la contaminación de ácido quínico. El transporte del ácido shikímico (Pittard, J. y otros, J. Bacteriol. 92:1070 (1966); Brown, K.D. y otros, Biochim. Biophys. Acta 428:550 (1976)) en el E. coli puede ser un vestigio evolutivo de una capacidad anterior para catabolizar los ácidos quínico y shikímico como fuentes únicas de carbono para el crecimiento y el metabolismo. Como la utilización de fuentes de carbono no de glucosa está a menudo sujeta a represión catabólica, aumentar la disponibilidad de D-glucosa puede reprimir el transporte del ácido shikímico minimizando de este modo la formación del ácido quínico.
[0039] La tasa de adición de D-glucosa, y por lo tanto la disponibilidad de D-glucosa, en todas las series de fermentación fue controlada por un ajuste derivado integral proporcional (PIS) ajustando la ganancia (Kc). Por ejemplo, la síntesis por E.coli SP1.1/pKD12.112 de la mezcla de los ácidos shikímico y quínico (Tabla 2) empleó un ajuste PID de Kc = 0,1. Aumentar la disponibilidad de glucosa aumentando el ajuste PID a Kc = 0,8 resultó (Tabla 2) en una drástica reducción en la formación del ácido quínico en toda la fermentación. Tras 42 h de cultivo, el E. coli SP1.1/pKD12.112 sintetizó 20,2 g/L de ácido shikímico, 4,6 g/L de DHS, y sólo 1,9 g/L de ácido quínico. Bajo condiciones idénticas el SP2.1/pKD12.112 sintetizó 37 g/L de ácido shikímico, 2,1 g/L de ácido quínico y 4,2 g/L de DHS. La disminución en los títulos sintetizados de ácido shikímico es consistente con el impacto conocido de disponibilidad aumentada de D-glucosa en la concentración y el rendimiento de la L-fenilalanina sintetizadas por el
E.coli. Konstantinov, K.B. y otros, J. Ferment. Bioeng. 70:253 (1990); Konstantinov, K.B. y otros, J. Ferment. Bioeng.
71:350 (1991). Más importante, la mejora de la proporción molarshikimato:quinata de 2,4:1 (Kc = 0,1) a 11,8:1 (Kc = 0,8) permitió que el ácido quínico fuese completamente retirado durante la cristalización del ácido shikímico.
Kc = 0,1 Kc = 0,8
- SAa
- QA DHS SA QA DHS
- 12 h
- 1,1 0,0 0,3 1,0 0,0 0,2
- 18 h
- 5,3 2,5 1,2 3,1 0,0 0,6
- 24 h
- 11,4 5,7 2,2 6,4 0,8 1,2
- 30 h
- 17,1 8,3 2,7 10,9 1,3 2,2
- 36 h
- 23,1 10,8 4,2 15,7 1,8 3,5
- 42 h
- 27,2 12,6 4,4 20,2 1,9 4,6
a Concentraciones en g/L de ácido shikímico, ácido quínico (QA), y ácido 3-deshidroshikímico (DHS),
[0040] Series de fermentación adicionales resultaron en rendimientos similares de ácido shikímico y proporciones de ácido shikímico a ácido quínico. Cuando la ganancia (Kc) para el control derivado integral proporcional para la alimentación de glucosa fue establecida en 0,1, tanto el SP1.1/pKD12.112 como el SP2.1/pKD12.112 sintetizaron mezclas no esperables de ácido shikímico y ácido quínico. El SP1.1/pKD12.112 consiguió una proporción molar de ácido shikímico a ácido quínico de 3,0 mientras el SP2.1/pKD12.112 consiguió una proporción molar de 5,0 (Tabla 3). Los intentos de obtener ácido shikímico puro de los caldos de cultivo con proporciones molares en este intervalo no fueron exitosos. A pesar de que la síntesis de subproducto DHS representa una pérdida en títulos del ácido shikímico, el DHS es fácilmente separado del ácido shikímico durante la purificación. La formación de DHS no fue un obstáculo para obtener ácido shikímico puro.
TABLA 3
Resumen de los resultados de Fermentación
- Cepa
- Modificación Kc SAa QAa (g/L) DHSa (g/L) Proporción
- (g/L)
- Molar SA:QA
- SP1.1/pKD12.112
- --- 0,1 38,2 12,4 6,5 3,0
- SP1.1pKD12.112
- -- 0,1 33,2 7,8 5,4 5,0
- SP1.1/pKD12.112
- Kc aumentado 0,8 20,2b 1,9 4,6 12
- SP2.1/pKD12.112
- Kc aumentado 0,8 36,6b 2,2 4,4 18
- SP1.1/pKD12.112
- Añadido M αDG (1mM) 0,1 40,3 0 5,3 >40
- SP2.1/pKD12.112
- Añadido M aDG (0,5 0,1 39,6 4,1 4,8 11
- mM)
- SP1.1/pKD12.138
- Añadido M αDG (1mM); 0,1 51,1 4,3 8,8 13
- tktA
SP2.1/pKD12.138 Añadido M αDG (0,5 0,1 No cambia la fase
mM); tktA a 48 h de cultivo excepto como anotado diferentemente b tras 42 h de cultivo
[0041] Cuando el control de ganancia la alimentación de glucosa fue aumentada de 0,1 a 0,8, se observo una mejora significativa en la proporción molar de ácido shikímico a ácido quínico. Aumentar el Kc a 0,8 resultó en una respuesta más fuerte por la bomba de glucosa cuando el nivel de oxígeno disuelto se desvía de su punto de referencia. Valores aumentados de Kc resultaron por lo tanto en mayores concentraciones de glucosa en estado de equilibrio en el medio de cultivo. Tras 42 h de cultivo con el Kc establecido a 0,8, el SP1.1/pK12.112 sintetizó 20,2 g/L de ácido shikímico y sólo 1,9 g/L de ácido quínico para conseguir una proporción molar de 12 (Tabla 3). Una mejora comparable fue observada con el SP2.1/pKD12..112 que alcanzó una proporción molar de 18 sintetizando 36,6 g/L de ácido shikímico y 2,2 g/L de ácido quínico tras 42 h (Tabla 3). El ácido shikímico se purificó fácilmente del ácido quínico de los caldos de cultivo en los que la proporción molar excede de aproximadamente 9.
[0042] A pesar de que aumentar el Kc elimina efectivamente la formación de ácido quínico, estas series son extremadamente difíciles de controlar. Los niveles de oxigeno disuelto oscilan como un resultado directo de las oscilaciones en las tasas de alimentación de glucosa. Estas series deben ser monitorizados estrechamente tras aproximadamente 36 h de la serie para evitar adiciones mayores, innecesarias de glucosa. Como las series pueden ser rutinariamente atendidas a lo largo de 42 h pero raramente por 48 h sin una pérdida de control, las series fueron terminadas tras 42 h. Aumentar la concentración de glucosa en estado de equilibrio en el caldo de cultivo también tuvo un impacto significativo en la tasa de producción de ácido shikímico para el SP1.1/pKD12.112. En la mayor ganancia, el SP1.1/pK12.112 sintetizó 20,2 g/L de ácido shikímico tras 42 h, comparado con los 33 g/L en el mismo tiempo cuando la ganancia fue establecida en el valor más bajo. El efecto en la tasa de producción, sin embargo, no fue observado para el SP2.1/pKD12.112.
[0043] Una alternativa para aumentar el Kc para eliminar la formación de ácido quínico fue la adición de un análogo de glucosa no hidrolizable al caldo de fermentación. Se añadió Metil α-D-glucopiranosida (MαDG) al medio de fermentación al tiempo de la inoculación y la fermentación fue después llevada a cabo sin ningún ajuste adicional. La adición de 1 mM de MαDG a la fermentación de SP1.1/pKD12.112 resultó en la síntesis de 40,3 g/L de ácido shikímico (Tabla 3). El ácido quínico no fue detectado. A pesar de que se examinaron varias concentraciones, 1 mM de MαDG fue la concentración mínima que permitió la eliminación completa de la formación de ácido quínico. La adición de MαDG a cultivos de SP2.1/pKD12.112 también resultó en la eliminación del ácido quínico. Tras 48 h de cultivo en presencia de 0,5 mM de MαDG, el SP2.1/pKD12.112 (Tabla 3) sintetizó 39,6 g/L de ácido shikímico y 4,1 g/L de ácido quínico, resultando en una proporción molar de 11. Mayores concentraciones de MαDG no mostraron ninguna mejora adicional en la eliminación del ácido quínico.
[0044] Con las condiciones establecidas que eliminan adecuadamente la formación de ácido quínico sin comprometer significativamente el control, la atención se volvió a aumentar los títulos del ácido shikímico utilizando la sobreexpresión de transcetolasa. Cuando se cultivó en presencia de 1 mM de MαDG, el SP1.1/pKD12.138 sintetizó 51,1 g/L de ácido shikímico y 4,4 g/L de ácido quínico, permitiendo una proporción molar excediendo de 13 (Tabla 3). La expresión de transcetolasa resultó en un aumento del 25% en los títulos de ácido shikímico mientras mantuvo una proporción molar de ácido shikímico a ácido quínico que permite el aislamiento del ácido shikímico. La concentración del subproducto DHS también aumentó a 8,8 g/L, proporcionando un incentivo añadido para obtener una deshidrogenasa de shikimato insensible a la inhibición del ácido shikímico. Cuando el SP2.1/pKD12.138 fue cultivado bajo condiciones estándares, la fermentación nunca alcanzó el punto de cambio de fase. A 33º C el crecimiento del SP2.1/pKD12.138 fue lento y resultó en una producción significativa de acetato. Un pequeño aumento en la temperatura de cultivo aumentaría probablemente la tasa de crecimiento para evitar esta situación.
[0045] La síntesis microbiana del ácido shikímico como se describe en la presente puede reemplazar el aislamiento de su hidroaromático de las fuentes vegetales que tienen una utilidad sintética del ácido shikímico limitada. Al mismo tiempo la disponibilidad aumentada del ácido shikímico puede presagiar la utilización más amplia de este hidroaromático. El rendimiento máximo teórico de la síntesis microbiana del ácido shikímico es del 43% de la D-glucosa. Draths, K.M. y otros, J. Am. Chem. Soc. 117:2395 (1995). La comparación con los rendimientos obtenidos hasta ahora para la síntesis microbiana del ácido shikímico (14-22%) junto con la aparente falta de toxicidad de este hidroaromático con respecto a la biocatalización microbiana sugiere que los aumentos considerables en las tasas y los títulos son posibles. Tales mejoras junto con las economías de escala asociadas con grandes escalas de fermentación pueden incluso extender la utilización del ácido shikímico del sintón quiral a quiralidades desechables utilizables en la fabricación de químicos aromáticos de gran volumen.
[0046] General. Para la cuantificación 1H NMR de concentraciones de soluto, las soluciones fueron concentradas hasta la sequedad bajo presión reducida, concentradas hasta la sequedad una vez adicional de D2O, y después redisueltas en D2O conteniendo una concentración conocida de la sal de sodio de ácido 3-(trimetilsililo)propionico2,2,3,3-d4 (TSP) conseguido de Lancaster Synthesis Inc. Las concentraciones fueron determinadas por la comparación de las integrales correspondientes a cada compuesto con la integral correspondiente al TSP (δ=0,00 ppm) en el 1H NMR. Todos los espectros del 1H NMR fueron recogidos en un Espectrometro Varian VXR-300 FTNMR (300 MHz).
[0047] Medio de cultivo. Todo el medio fue preparado en agua destilada, desionizada. Las sales M9 (1 L) contenían Na2Hd-glucosa (20 g), MgSoPO4 (6 g), KH2PO4 (3 g), NaCl (0,5 g) y NH4Cl (1 g). El medio mínimo M9 (1 L) consistió de 1 L de sales M9 conteniendo D-glucosa (10 g), MgSO4 (0,12 g), hidrocloruro de thiamina (0,001 g), Lfenilalanina (0,040 g), L-tirosina (0,040 g), L-triptofano (0,040 g), ácido p-hidroxibenzoico (0,010 g), p-aminobenzoato de potasio (0,010 g), y ácido 2,3-dihidroxibenzoico (0,010 g). Se añadió ampicilina (0,05 g/L) donde se indicó. Las soluciones de sales M9, MgSO4 y la glucosa fueron autoclavados individualmente y después mezcladas. Los amino ácidos aromáticos, las vitaminas aromáticas, y la ampicilina fueron esterilizadas a través de membranas 0,22-µm.
[0048] El medio de fermentación (1 L) contenía K2HPO4 (7,5 g), citrato de hierro amoniacal (III) (0,3 g), monohidrato de ácido cítrico (2,1 g); L-fenilalanina (0,7 g), L.tirosina (0,7 g), L-triptofano (0,35 g), y H2SO4 concentrado (1,2 mL). El medio de fermentación fue ajustado a un pH de 7,0 por la adición de NH4OH concentrado antes del autoclave. Los siguientes suplementos fueron añadidos inmediatamente antes del inicio de la fermentación: D-glucosa (20 g), MgSO4 (0,24 g), ácido p-hidroxibenzoico (0,010 g), p-aminobenzoato de potasio (0,010 g), ácido 2,3-dihidroxibenzoico (0,010 g), y oligoelementos incluyendo (NH4)6(Mo7O24)5·4H2O (0,0037 g), ZnSO4·7H2O (0,0029 g), H3BO3 (0,0247 g), CuSO4·5H2O (0,0025 g), y MnCl2·4H2O (0,0158 g). La D-Glucosa y el MgSO4 fueron autoclavados separadamente mientras las vitaminas aromáticas y los oligoelementos fueron esterilizados a través de membranas 0,22-µm.
[0049] Fermentaciones. Las fermentaciones emplearon un recipiente de cultivo B. Braun M2 de capacidad de trabajo de 2,0 L. Las utilidades fueron suministradas por un MD Biostat B. Braun que fue controlado por un DCU-1. La adquisición de datos utilizó un ordenador personal Dell Optiplex Gs+ 5166M equipado con software B. Braun MFCS/Win. La temperatura, el pH, y la alimentación de glucosa fueron controlados con bucles de control PID. La temperatura fue mantenida a 33º C. El pH fue mantenido a 7,0 por la adición de HN4OH concentrado o N H2SO4. El oxígeno disuelto (D. O.) fue medido utilizando un sensor de O2 esterilizable de 12 mm Mettler-Toledo equipado con una membrana permeables de O2 de tipo A Ingold. El D.O. fue mantenido a una saturación de aire del 10%.
[0050] Los inoculantes fueron iniciados por la introducción de una única colonia en 5 mL de medio M9 conteniendo ampicilina. El cultivo fue aumentado a 37º C con agitación a 250 rpm durante 24 h y posteriormente transferido a 100 mL de medio M9 conteniendo ampicilina. Tras el aumento a 37º C, 250 rpm durante 12 h adicionales, el inoculante estaba listo para la transferencia en el recipiente de fermentación. La concentración inicial de glucosa en el medio de fermentación de de 20 g/L. Se utilizaron tres métodos preparados para mantener los niveles de D.O. a una saturación de aire del 10% durante la duración de la serie. Con el flujo de aire a un ajuste inicial de 0,06 L/L/min, la concentración de D.O. fue mantenida aumentando la velocidad del impulsor de su punto de ajuste de inicio de 50 rpm a su máximo prefijado de 940 rpm. Con el impulsor constante a 940 rpm, el controlador de flujo de masa después mantuvo los niveles de D.O. aumentando la tasa de flujo de aire de 0,06 L/L/min al máximo prefijado de 1,9 L/L/min. A una velocidad del impulsor constante y una tasa de flujo de aire constante, los niveles de D.O. fueron finalmente mantenidos a una saturación de aire del 10% para el resto de la fermentación por la alimentación de glucosa controlada por el sensor de oxígeno. Al principio de esta etapa, los niveles de D.O. cayeron por debajo de la saturación de aire del 10% debido a la glucosa inicial residual en el medio. Esto duró aproximadamente durante 1 h antes de que comenzase la alimentación de glucosa (65% w/v). Los parámetros de control PID fueron establecidos a 0,0 (apagado) para el control derivado (TD) y 999,9 s (acción mínima de control) para el control integral (Tl). El Xp fue establecido a un 950% para conseguir un Kc de 0,1 y 125% para conseguir un Kc de 0,8.
[0051] Las muestras (10 mL) del caldo de fermentación fueron tomadas en intervalos de 6 h. Las densidades de las células fueron determinadas por la disolución del cando de fermentación con agua (1:100) seguido por la medición de la absorción a 600 nm (OP600). El peso de la célula seca (g/L) fue obtenido utilizando un coeficiente de conversión de 0,43 g/L/OD600. El caldo de fermentación restante fue centrifugado durante 4 min utilizando un microcentrífugo Beckam para obtener caldo libre de células. Las concentraciones de soluto en el caldo libre de células fueron determinadas por 1H NMR.
[0052] Purificación del Acido Shikímico del Caldo de Fermentación. El caldo de fermentación (1100-1200 mL) fue centrifugado a 14000 g durante 30 min y las células fueron descartadas. El sobrenadante resultante fue reflujado durante 4 h, enfriado a temperatura ambiente, y el pH ajustado a 2,5 por la adición de H2SO4 concentrado. Tras la centrifugación a 14000 g durante 20 min, una solución amarilla clara fue colada del resto celular y ajustada a un pH de 6,9 por la adición de HN4OH concentrado. La solución fue combinada con 5 g de carbono activo Darco KB-B, y arremolinada a 50 rpm durante 1-2 h, y después filtrada a través de papel de filtrado Whatman 5. El material filtrado fue lavado con 250 mL adicionales de agua. Los filtrados combinados fueron después tratados de la misma forma con un segundo grupo de carbono activo.
[0053] Siguiendo al tratamiento de la solución con carbono, el color oscuro era menos intenso que antes del tratamiento, pero la solución no estaba decolorada. La adición de ácido acético glacial a una concentración final del 15% proporcionó una solución amarilla, clara que fue después eluída a través de una columna de AG1-x8 (forma de acetato, 5 cm x 20 cm) a 4º C. Siguiendo la elución de la columna con 400 mL de 15% de ácido acético acuoso adicionales, los eluyentes combinados fueron pasados a través de una columna de Dowex 50 (forma de H+, 5 cm x 20 cm) a 4º C que fueron después lavados con 400 mL de 15% de ácido acético acuoso. Los eluyentes de la columna de intercambio de cationes fueron combinados y concentrados a aproximadamente 150 mL hirviendo y después secando por evaporación rotatoria, dejando un sólido blanco duro (83% de recuperación a través de este paso). La recristalización de una mezcla de metanol y acetato de etilo proporciono ácido shikímico como un polvo blanco fino (61% de recuperación en base al ácido shikímico cuantificado en el caldo de fermentación bruto.
[0054] La discusión precedente revela y describe meramente realizaciones ejemplares de la presente invención. Alguien experto en la materia reconocerá fácilmente de tal discusión, y de los dibujos y reivindicaciones acompañantes, que varios cambios, modificaciones y variaciones se pueden hacer en la presente sin salirse del espíritu y ámbito de la invención como se define en las reivindicaciones siguientes.
Claims (18)
- REIVINDICACIONES
- 1.
- Un método de sintetizar ácido shikímico de una fuente de carbono comprendiendo convertir la fuente de carbono en ácido shikímico con un E. coli recombinante que comprende el gen aroFFBR codificando un isoenzima de 3desoxi-D-arabino-heptulosonato-7 fosfato sintasa insensible a la inhibición por retroalimentación por amino ácidos aromáticos u otras moléculas aromáticas, el gen codificando 3-deshidroquinata sintasa, el gen codificando 3deshidroquinata deshidratasa, y el gen codificando shikimato deshidrogenasa, en un medio de fermentación y controlando la proporción molar de ácido shikímico a ácido quínico reduciendo o eliminando el equilibrio de ácido shikímico a ácido quínico añadiendo de un análogo de glucosa no hidrolizable que es metil glucopiranosida al medio de fermentación, en donde el gen codificando la kinasa de shikimato en el E. coli recombinante es eliminado totalmente o en parte, o es mutado, por lo tanto, eliminando, inhibiendo o reduciendo la actividad de la quinasa de shikimato.
-
- 2.
- El método de la Reivindicación 1, en donde el gen codificando la deshidogenasa de shikimato es el gen aroE.
-
- 3.
- El método de la reivindicación 2, en donde el gen aroE es introducido en el E. coli en un plásmido.
-
- 4.
- El método de la reivindicación 3, en donde el plásmido es pKD12.112, obtenible del E. coli SP1/pKD12.112 identificado por el número de designación de la ATCC 98905.
-
- 5.
- El método de la Reivindicación 3, en donde el plásmido es pKD12.138, obtenible del E. coli Sp1.1/pKD12.138 identificado por el número de designación de la ATCC 207055.
-
- 6.
- El método de la Reivindicación 1, en donde el gen codificando la sintasa de 3-deshidroquinata es el gen aroB.
-
- 7.
- El método de la Reivindicación 6, en donde el gen aroB es introducido en el E. coli por inserción en el locus serA del E. coli.
-
- 8.
- El método de la Reivindicación 1, en donde el gen aroFFBR es introducido en el E. coli en un plásmido.
-
- 9.
- El método de la Reivindicación 8, en donde el plásmido es pKD12.112, obtenible del E. coli SP1.1/pKD12.112 identificado por el número de designación de la ATCC 98905.
-
- 10.
- El método de la Reivindicación 8, en donde el plásmido es pKD12.138, obtenible del E. coli Sp1.1/pKD12.138 identificado por el número de designación de la ATCC 207055.
-
- 11.
- El método de la Reivindicación 1, en donde la proporción molar de ácido shikímico a ácido quínico es mayor que
- 9.
-
- 12.
- El método de la Reivindicación 1, en donde la metil glucopiranosida es metil-α-glucopiranosida, metil-βglucopiranosida o una mezcla de las mismas.
-
- 13.
- El método de la Reivindicación 1, comprendiendo además eliminar, mutar o disminuir los niveles de expresión de los genes aroL y aroK.
-
- 14.
- El método de la Reivindicación 1, en donde el E. coli recombinante comprende: a) un casete aroB insertado en el locus serA; b) locus aroL y aroK mutados; y c) un plásmido comprendiendo insertos de genes aroE, aroFFBR y serA.
-
- 15.
- El método de la Reivindicación 14, en donde el plásmido es pKD12.112, obtenible del E. coli SP1.1/pKD12.112 identificado por el número de designación de la ATCC 98905.
-
- 16.
- El método de la Reivindicación 1, en donde el E. coli recombinante es E. coli Sp1.1/pKD12.112 identificado por el número de designación de la ATCC 98905.
-
- 17.
- El método de la Reivindicación 1, en donde la concentración de metil glucopiranosida en el medio de fermentación es de 0,5 mM a 1,0 mM.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US240440 | 1999-01-29 | ||
US09/240,440 US6613552B1 (en) | 1999-01-29 | 1999-01-29 | Biocatalytic synthesis of shikimic acid |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
ES2365205T3 true ES2365205T3 (es) | 2011-09-26 |
Family
ID=22906534
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES99956926T Expired - Lifetime ES2365205T3 (es) | 1999-01-29 | 1999-11-04 | Síntesis biocatalítica del ácido shikímico. |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US6613552B1 (es) |
EP (1) | EP1151126B1 (es) |
JP (1) | JP4669613B2 (es) |
AT (1) | ATE514786T1 (es) |
AU (1) | AU1342700A (es) |
ES (1) | ES2365205T3 (es) |
WO (1) | WO2000044923A1 (es) |
Families Citing this family (36)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6600077B1 (en) * | 1999-01-29 | 2003-07-29 | Board Of Trustees Operating Michigan State University | Biocatalytic synthesis of quinic acid and conversion to hydroquinone |
WO2002029078A2 (en) * | 1999-01-29 | 2002-04-11 | Board Of Trustees Operating Michigan State University | Biocatalytic synthesis of shikimic acid |
EP1315808A2 (de) * | 2000-07-07 | 2003-06-04 | Basf Aktiengesellschaft | Dehydroquinat dehydratase/shikimat dehydrogenase als herbizides target |
DE10107002A1 (de) | 2001-02-15 | 2002-08-29 | Consortium Elektrochem Ind | Verfahren zur fermentativen Herstellung von O-Acetyl-L-Serin |
US6794164B2 (en) * | 2002-01-07 | 2004-09-21 | Novozymes Biopharma Ab | Process for the isolation of polyhydroxy cyclic carboxylic acids |
US20060121581A1 (en) * | 2002-10-04 | 2006-06-08 | Cervin Marguerite A | Production of bacterial strains cross reference to related applications |
DE60335574D1 (de) * | 2002-10-04 | 2011-02-10 | Du Pont | Verfahren zur biologischen herstellung von 1,3-propandiol mit hoher ausbeute |
WO2005030949A1 (en) * | 2003-09-24 | 2005-04-07 | Board Of Trustees Operating Michigan State University | Methods and materials for the production of shikimic acid |
WO2007069078A2 (en) | 2005-06-07 | 2007-06-21 | Ocean Nutrition Canada Ltd. | Eukaryotic microorganisms for producing lipids and antioxidants |
US20070134282A1 (en) * | 2005-12-09 | 2007-06-14 | Stephen F. Austin State University | Methods for inhibiting fungal pathogen infestation and propogation |
US20070149805A1 (en) * | 2005-12-23 | 2007-06-28 | Stephen F. Austin State University | Method for the extraction and purification of shikimic acid |
US20070161818A1 (en) * | 2006-01-06 | 2007-07-12 | Shiyou Li | Processes for the extraction and purification of shikimic acid and the products of such processes |
US7977077B2 (en) | 2006-01-30 | 2011-07-12 | Board Of Trustees Of Michigan State University | Synthesis of intermediates of oseltamivir carboxylates |
EP2082053B1 (en) | 2006-08-01 | 2016-04-13 | DSM Nutritional Products AG | Process for producing microbial oil comprising polyunsaturated fatty acids |
US8203020B2 (en) * | 2006-08-30 | 2012-06-19 | Kim A. Anderson | Method of isolating shikimic acid from a plant |
WO2008128076A1 (en) * | 2007-04-13 | 2008-10-23 | Monsanto Technology Llc | Use of glyphosate to produce shikimic acid in microorganisms |
US8344178B2 (en) * | 2007-10-16 | 2013-01-01 | Monsanto Technology Llc | Processes for producing and recovering shikimic acid |
EP2376619A4 (en) * | 2008-12-15 | 2012-07-04 | Greenlight Biosciences Inc | METHODS FOR CONTROLLING FLOWS IN METABOLIC PATHWAYS |
CA2749877A1 (en) * | 2008-12-22 | 2010-07-01 | Greenlight Biosciences, Inc. | Compositions and methods for the production of a compound |
CA2797786C (en) | 2010-05-07 | 2020-09-22 | Greenlight Biosciences, Inc. | Methods for control of flux in metabolic pathways through enzyme relocation |
KR101988063B1 (ko) * | 2010-08-31 | 2019-09-30 | 그린라이트 바이오사이언시스, 아이엔씨. | 프로테아제 조작을 통한 대사 경로에서 유동의 제어 방법 |
KR20150010932A (ko) | 2011-09-09 | 2015-01-29 | 그린라이트 바이오사이언시스, 아이엔씨. | 카바페넴의 무세포 제조법 |
CN104220587A (zh) * | 2012-01-30 | 2014-12-17 | 麦兰特公司 | 从经基因改造的微生物生产黏康酸 |
JP6322576B2 (ja) | 2012-07-03 | 2018-05-09 | 花王株式会社 | 有用微生物および目的物質の製造方法 |
MX2015008188A (es) | 2012-12-21 | 2016-02-05 | Greenlight Biosciences Inc | Sistema libre de celulas para convertir metano en combustible, piruvato o isobutanol. |
US20150247174A1 (en) * | 2012-12-28 | 2015-09-03 | Anhui Huaheng Bioengineering Co., Ltd, | Engineering bacteria for producing dl-alanine and method for producing dl-alanine by using engineering bacteria |
US9873880B2 (en) | 2013-03-13 | 2018-01-23 | Dsm Nutritional Products Ag | Engineering microorganisms |
KR20160037194A (ko) | 2013-08-05 | 2016-04-05 | 그린라이트 바이오사이언시스, 아이엔씨. | 프로테아제 분열 위치를 갖는 엔지니어링된 프로테인 |
KR102105532B1 (ko) * | 2013-10-17 | 2020-04-29 | (주)아모레퍼시픽 | 만능 줄기세포의 유도 방법 및 상기 방법에 의해 제조된 만능줄기세포 |
JP6302073B2 (ja) | 2014-08-21 | 2018-03-28 | 公益財団法人地球環境産業技術研究機構 | コリネ型細菌形質転換体、及びそれを用いる有機化合物の製造方法 |
KR20180002636A (ko) | 2015-03-30 | 2018-01-08 | 그린라이트 바이오사이언시스, 아이엔씨. | 리보핵산의 무세포 생산 |
EP3423563B1 (en) | 2016-03-02 | 2023-05-24 | PTT Global Chemical Public Company Limited | Improved muconic acid production from genetically engineered microorganisms |
RU2018138975A (ru) | 2016-04-06 | 2020-05-12 | Гринлайт Байосайенсис, Инк. | Бесклеточная продукция рибонуклеиновой кислоты |
AR113764A1 (es) | 2017-10-11 | 2020-06-10 | Greenlight Biosciences Inc | Métodos y composiciones para la producción de nucleósido trifosfato y ácido ribonucleico |
WO2020040017A1 (ja) * | 2018-08-23 | 2020-02-27 | 住友ベークライト株式会社 | 医薬品、抗がん剤、医薬中間体および環式カルボン酸化合物またはその誘導体の製造方法 |
KR102676309B1 (ko) * | 2019-11-22 | 2024-06-19 | (주)에스티알바이오텍 | 시킴산 생산용 미생물 및 이를 이용한 시킴산 생산 방법 |
Family Cites Families (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5168056A (en) | 1991-02-08 | 1992-12-01 | Purdue Research Foundation | Enhanced production of common aromatic pathway compounds |
US5798236A (en) * | 1992-09-30 | 1998-08-25 | Genencor International, Inc. | Synthesis of quinic acid from glucose |
KR100359131B1 (ko) | 1992-12-21 | 2003-03-06 | 제넨코 인터내셔날 인코포레이티드 | 방향족아미노산합성의경로의탈차단방법 |
MX9702011A (es) | 1994-09-16 | 1998-04-30 | Texas A & M Univ Sys | Mocrioorganismos y metodos para la sobreproduccion de dahp mediante el gen pps clonado. |
EP0827542B1 (en) | 1995-05-05 | 2008-04-09 | Genencor International, Inc. | Application of glucose transport mutants for production of aromatic pathway compounds |
EP1038968A3 (en) * | 1999-03-25 | 2002-10-02 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing shikimic acid |
-
1999
- 1999-01-29 US US09/240,440 patent/US6613552B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-11-04 AT AT99956926T patent/ATE514786T1/de not_active IP Right Cessation
- 1999-11-04 WO PCT/US1999/026112 patent/WO2000044923A1/en active Application Filing
- 1999-11-04 EP EP99956926A patent/EP1151126B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-11-04 JP JP2000596163A patent/JP4669613B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1999-11-04 AU AU13427/00A patent/AU1342700A/en not_active Abandoned
- 1999-11-04 ES ES99956926T patent/ES2365205T3/es not_active Expired - Lifetime
-
2000
- 2000-09-30 US US09/676,609 patent/US6472169B1/en not_active Expired - Lifetime
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU1342700A (en) | 2000-08-18 |
WO2000044923A1 (en) | 2000-08-03 |
US6613552B1 (en) | 2003-09-02 |
JP4669613B2 (ja) | 2011-04-13 |
EP1151126A1 (en) | 2001-11-07 |
US6472169B1 (en) | 2002-10-29 |
EP1151126A4 (en) | 2002-04-10 |
JP2002535008A (ja) | 2002-10-22 |
ATE514786T1 (de) | 2011-07-15 |
EP1151126B1 (en) | 2011-06-29 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
ES2365205T3 (es) | Síntesis biocatalítica del ácido shikímico. | |
US20220162653A1 (en) | Preparation of (R)-3-Hydroxybutyric Acid or Its Salts by One-Step Fermentation | |
US7935511B2 (en) | Aerobic succinate production in bacteria | |
US8080397B2 (en) | Biocatalystic synthesis of quinic acid and conversion to hydroquinone by recombinant microbes | |
US20050255567A1 (en) | Mutant glutamine synthetase and method for producing amino acids | |
Li et al. | Fed‐batch fermentor synthesis of 3‐dehydroshikimic acid using recombinant Escherichia coli | |
KR19990077974A (ko) | L-글루타민산을생산하는박테리아및l-글루타민산을생산하는방법 | |
JP4573365B2 (ja) | 改良された性質を有する形質転換微生物 | |
KR20120002593A (ko) | 발효에 의해 많은 양의 글리콜산을 생산하는 방법 | |
KR100528527B1 (ko) | 방향족 대사/i로부터의 물질의 미생물적 제조 방법 | |
CA2234412C (en) | Method for producing optically active compound | |
CN105593361A (zh) | 用于改善的丙氨酸生产的经修饰的微生物 | |
AU5777701A (en) | Process for producing a target fermentation product | |
KR20120038030A (ko) | 아라비노스 대사경로가 도입된 자일리톨 생산균주 및 이를 이용한 자일리톨 생산방법 | |
KR102149044B1 (ko) | 2-히드록시 감마 부티로락톤 또는 2,4-디히드록시-부티레이트 의 제조 방법 | |
WO2021254927A1 (en) | Methods for producing biotin in genetically modified microorganisms | |
CN101654666B (zh) | 用于生产d-乳酸的生物催化剂 | |
WO2023168244A1 (en) | Genetically modified yeast and fermentation processes for the production of 3-hydroxypropionate | |
WO2002029078A2 (en) | Biocatalytic synthesis of shikimic acid | |
KR100793215B1 (ko) | L-리신 생산용 돌연변이 박테리아 균주 | |
EP1187930B1 (en) | A global regulator used to enhance the synthesis of aromatic substances | |
KR102602060B1 (ko) | 부산물 생성이 저감된 2,3-부탄다이올 생산용 재조합 미생물 및 이를 이용한 2,3-부탄다이올 생산방법 | |
WO2023168233A1 (en) | Genetically modified yeast and fermentation processes for the production of 3-hydroxypropionate | |
US20210292716A1 (en) | D-xylose dehydrogenase from coryneform bacteria and process for preparing d-xylonate | |
Shah et al. | Fermentative production of L-lysine: fungal fermentation and mutagenesis-II: a review |