ES2329904T3 - Mutante de tirosinasa y procedimientos de utilizacion del mismo. - Google Patents

Mutante de tirosinasa y procedimientos de utilizacion del mismo. Download PDF

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Abstract

Polipéptido que comprende un mutante de tirosinasa, en el que el mutante de tirosinasa es capaz de acumularse en el retículo endoplasmático y (a) el mutante de tirosinasa es enzimáticamente activo y carece de un dominio transmembranal, o (b) el mutante de tirosinasa carece de un dominio transmembranal de tirosinasa aunque contiene un dominio transmembranal de una proteína que no es la tirosinasa.

Description

Mutante de tirosinasa y procedimientos de utilización del mismo.
Antecedentes de la invención 1. Campo de la invención
La presente invención se refiere a mutantes de tirosinasa según las reivindicaciones 1 y 25. En particular, la presente invención describe mutantes de tirosinasa y la utilización de los mismos para la preparación de un medicamento destinado al tratamiento del melanoma.
2. Antecedentes de la invención
La incidencia del melanoma maligno está creciendo más rápidamente que cualquier otro tipo de cáncer humano en Norteamérica (Armstrong et al., Cancer Surv. 19-20:219-240, (1994)). Aunque el melanoma es un cáncer curable, el tumor primario debe extirparse en un estadio muy temprano de la progresión de la enfermedad, es decir, antes de que se haya extendido a sitios distantes. La presencia de micrometástasis puede conducir, y con frecuencia conduce, a metástasis sintomáticas eventuales. De esta manera, existe la necesidad de diseñar un procedimiento terapéutico para el tratamiento del melanoma.
De acuerdo con lo anteriormente expuesto, los inventores investigaron la ruta de plegamiento del dominio globular de la tirosinasa en presencia y en ausencia del dominio transmembranal de la tirosinasa. La tirosinasa (monofenol, 3,4-dihidroxifenilalanina: oxígeno oxidorreductasa, EC 1.14.18.1) es una glucoproteína membranal de tipo I cuya maduración en presencia del control de calidad del ER ha sido bien documentada (Petrescu et al. 2000; Halaban et al. 1997, Toyofuku et al. 2001, Branza-Nichita et al. 2000). La tirosinasa es generalmente exclusiva de las células productoras de pigmento (melanocitos) y es un antígeno de diferenciación en el melanoma. La presente invención se refiere a mutantes de tirosinasa retenidos en el ER. Estos mutantes resultan degradados por proteasomas y presentados sobre la superficie celular por moléculas del MHC de clase I.
El mutante de tirosinasa descrito por Simonova et al. (Cancer Research 60:23, 6656-6662, 2000) no resulta retenido dentro del ER sino que, por el contrario, resulta secretado. Debido a que dicho mutante es activo, puede producir radicales libres tóxicos y puede utilizarse como profármaco que se autoactiva y elimina células. Lo anterior contrasta con el mutante de la presente invención, que resulta retenido en la ruta secretoria temprana y es inactivo; es incapaz de producir melanina ni radicales libres de efectos tóxicos. El mutante de tirosinasa de la presente invención activa el sistema inmunológico y las células del sistema inmunológico que, a su vez, eliminan células de melanoma, evitando simultáneamente cualquier toxicidad que produciría un profármaco.
Halaban et al. (PNAS 97:11, 5889-5894, 2000) describen tres mutantes de tirosinasa que resultan retenidos en el ER; dicho documento no describe un mutante de tirosinasa que carece de su dominio transmembranal y que no interacciona con calnexina.
Halaban et al. (J. Investigative Dermatology 119:2, 481-488, 2002) describen mutantes de tirosinasa por deleción de glucosilación de sitio único. Dicho documento no describe un mutante por glucosilación preparado mediante la mutación de Asn en la posición 86. Además, no se dan a conocer mutantes que no presentan el dominio transmembranal y que no interaccionan con calnexina.
Dichos documentos no se refieren a la presentación de antígenos de tirosinasa para el tratamiento del melanoma.
Woelfel et al. (International J. Of Cancer 88:3, 432-438, 2000) describen la presentación independiente de transportador y de proteasoma del péptido 1-9 de la tirosinasa por parte del HLA-A2.1. El péptido 1-9 derivado de la secuencia de señal se considera un candidato para inmunoterapia específica.
La presente invención proporciona mutantes de tirosinasa que presentan la capacidad de inducir una respuesta inmunológica mejorada para el tratamiento del melanoma.
El plegamiento de las glucoproteínas solubles y unidas a membrana en las células eucarióticas se inicia durante la traslocación de la cadena polipeptídica naciente hacia el interior de la luz del ER a través del poro del traslocón (Hardesty et al. 1999). El proceso continúa después de la traducción en etapas repetidas de plegamiento y replegamiento en presencia de chaperones residentes del ER, y resulta en un producto capaz de salir del ER (Trombetta y Helenius 1998, Chen y Helenius 2000). Las proteínas mal plegadas e incorrectamente ensambladas habitualmente se retrotraslocan al citoplasma, donde son degradadas por proteasomas (Brodsky 1997).
La ruta de plegamiento de las proteínas libres de anclaje (solubles) y de las unidas a membrana puede ser sustancialmente diferente debido a sucesos relacionados con la inserción del dominio transmembranal (TM) en la bicapa lipídica. Es conocido que el traslocón ofrece un ambiente protector y restrictivo que actúa como chaperón para la cadena proteica durante la traslocación (Chen y Helenius 2000). Recientemente se ha demostrado que el TM es incapaz de integrarse directamente en la bicapa lipídica del ER (Mothes et al. 1997). Por el contrario, el dominio del TM resulta liberado al canal acuoso tras la síntesis y se inserta en la bicapa lipídica mediante difusión lateral. La eficiencia y velocidad con las que se produce el proceso de difusión depende de la hidrofobicidad del dominio TM (Heinrich et al. 2000). Por ejemplo, una cadena naciente puede resultar retenida en el traslocón durante periodos de tiempo más largos en el caso de que las regiones TM sean menos hidrofóbicas. De esta manera, el tiempo durante el que la cadena naciente permanece en el interior o en proximidad al traslocón puede depender de la composición de aminoácidos de la región TM.
Basándose en dichos resultados, los inventores plantearon la teoría de que el dominio TM podría actuar como factor controlador de sucesos relacionados con el plegamiento durante la traslocación. El plegamiento de la cadena naciente en el lumen del ER se encuentra estrechamente regulado por un control de calidad basado en el reconocimiento de los N-glicanos monoglucosilados por parte de las lectinas chaperones denominadas calnexina (CNX) y calreticulina (CRT) (Helenius y Aebi 2001, Schrag et al. 2001). Aunque algunos estudios demuestran que el control de calidad también realiza un seguimiento del ensamblaje de los dominios TM en la bicapa lipídica (Cannon y Creswell 2001), se conoce poco el papel del dominio TM en el proceso de plegamiento de las proteínas membranales.
Con el fin de investigar adicionalmente el papel de un dominio TM, los presentes inventores construyeron un mutante de tirosina humana cuyo tráfico se detuvo al nivel del ER. En otras palabras, se plegó incorrectamente el mutante de tirosinasa y se retuvo en el ER mediante un sistema de control de calidad. De esta manera, el mutante de tirosinasa se retro-traslocó a proteasomas para la degradación, y tras ella, los péptidos resultantes fueron presentados sobre la superficie celular por moléculas del MHC de clase I. De este modo, el mutante de tirosinasa de la presente invención puede utilizarse en la inmunoterapia del melanoma a modo de vacuna diseñada para incrementar la respuesta inmunológica de CTL contra las células del melanoma.
Un aspecto importante de la respuesta inmunológica, en particular en lo referido a la eficacia de la vacuna, es la manera en la que se procesan los antígenos de manera que puedan ser reconocidos por las células especializadas del sistema inmunológico. Se utilizan rutas de procesamiento y presentación de antígeno diferentes y, por lo tanto, la presentación en la superficie celular de un antígeno particular por parte de una molécula del MHC de clase II o de clase I a un linfocito T ayudante o a un linfocito T citotóxico, respectivamente, depende de la ruta de procesamiento de los antígenos.
Una ruta es una ruta citosólica que procesa los antígenos endógenos expresados en el interior de una célula. El antígeno resulta degradado por un complejo proteasa especializado en el citosol de la célula, y los péptidos antígenos resultantes son transportados hacia el interior del retículo endoplasmático. Lo anterior resulta en la unión de antígenos a moléculas del MHC de clase I. Mediante la presentación cruzada, los antígenos exógenos pueden ser procesados en el citoplasma de las células presentadoras de antígeno profesionales y unirse a moléculas del MHC de clase I.
Una ruta alternativa es una ruta del retículo endoplasmático que evita el citosol. En el retículo endoplasmático, los péptidos antígenos se unen a las moléculas del MHC de clase I, que después son transportadas a la superficie celular para la presentación a los linfocitos T citotóxicos del sistema inmunológico. Varios estudios apuntan al papel crucial de las células T citotóxicas tanto en la producción como en la erradicación del cáncer por parte del sistema inmunológico (Byrne et al., J. Immunol. 51:682, 1984; McMichael et al., N. Engl. J. Med. 309:13, (1983)).
Una tercera ruta es una ruta endocítica que se encuentra en las células presentadoras de antígeno profesionales, que procesa antígenos existentes en el exterior de la célula, resultando en la unión del antígeno a moléculas del MHC de clase II. Dichos antígenos se introducen en la célula mediante endocitosis, que transporta los antígenos al interior de endosomas y seguidamente a lisosomas. Posteriormente, el antígeno resulta degradado por proteasas, formando péptidos antigénicos que se unen a moléculas del MHC de clase II, que después se transportan a la superficie celular para la presentación a linfocitos T ayudante del sistema inmunológico.
Sumario de la invención
Se encuentra contemplado en la presente invención un polipéptido que comprende un mutante de tirosinasa, en el que el mutante de tirosinasa es capaz de acumularse en el retículo endoplasmático y:
a)
el mutante de tirosinasa es enzimáticamente inactivo y no presenta un dominio transmembranal, o
b)
el mutante de tirosinasa no presenta un dominio transmembranal de la tirosinasa pero contiene un dominio transmembranal de una proteína que no es tirosinasa, o
c)
el residuo Asn en la posición 86 se sustituye por un residuo Gln en el mutante de tirosinasa.
Breve descripción de los dibujos
Figura 1. Experimento de pulso-caza que muestra que la tirosinasa soluble está retenida en el ER y degradada en proteasomas.
Las células CHO transfectadas con ADNc de ST se pulsaron durante 20 minutos con [^{35}S] y se realizó un seguimiento de las mismas en ausencia (carriles 1 a 8) o en presencia (carriles 9 a 16) de lactacistina 20 \muM durante el periodo de tiempo indicado. Los lisados celulares se inmunoprecipitaron con anticuerpos monoclonales T311 y las muestras de inmunoprecipitado se dividieron por la mitad y se digirieron con (+) o sin (-) EndoH. Las muestras se corrieron en un gel SDS-PAGE al 10% reductor y se visualizaron mediante autorradiografía. El marcador de masa molecular se muestra en el margen derecho de la figura.
Figura 2. Experimento de pulso-caza que indica que la tirosinasa de tipo salvaje (WT) es exportada del ER.
Se pulsaron células WT transfectadas durante 20 minutos con [^{35}S] y se realizó un seguimiento de las mismas en ausencia (carriles 1 a 4) o en presencia (carriles 9 a 12) de lactacistina 20 \muM durante el periodo de tiempo indicado. Las muestras procedentes de los carriles 5 a 8 se digirieron con EndoH. Los lisados celulares se inmunoprecipitaron con antisuero T311. Las muestras se corrieron en un gel de SDS-PAGE al 10% y se visualizaron mediante autorradiografía.
Figura 3. Experimento de pulso-caza que muestra la asociación de la calnexina y la calreticulina con la tirosinasa WT y ST.
Se incubaron células CHO transfectadas con ST (carriles 1 a 10) o WT (carriles 11 a 20) en tampón de ayuno durante 1 hora antes de realizar un pulso de 20 minutos de [^{35}S]. A continuación, se realizó un seguimiento de las células durante el periodo de tiempo indicado y los lisados celulares se inmunoprecipitaron con un anticuerpo anti-calnexina (CNX) o un anticuerpo anti-calreticulina (CRT), seguido de un anticuerpo anti-tirosinasa (anticuerpo T311). Los inmunoprecipitados se corrieron en un gel SDS-PAGE al 10% no reductor y se visualizaron mediante autorradio-
grafía.
Figura 4. Experimento de pulso-caza que demuestra la ruta de plegamiento de la tirosinasa soluble y de tipo salvaje.
Se incubaron células CHO transfectadas con tirosinasa ST (carriles 1 a 6) y WT (carriles 7 a 11) en tampón de ayuno durante 1 hora antes de realizar un pulso de 20 minutos de [^{35}S]. A continuación, se realizó un seguimiento de las mismas durante el periodo de tiempo indicado, y los lisados celulares se inmunoprecipitaron con un anticuerpo anti-tirosinasa (anticuerpo T311). Los inmunoprecipitados se corrieron en un gel SDS-PAGE al 10% no reductor o reductor y se visualizaron mediante autorradiografía.
Figura 5. Secuencia de ácidos nucleicos de tirosinasa soluble (SEC ID nº 1).
Figura 6. Experimentos de pulso-caza que muestran que Tyrmut1 está retenido en el ER.
Se pulsaron células transfectadas por Tyrmut1 durante 20 minutos con [^{35}S] y se realizó un seguimiento durante 2 horas. Los lisados celulares se inmunoprecipitaron con antisuero T311. Los inmunoprecipitados se dividieron en dos y se digirieron con (+) o sin (-) EndoH. Las muestras se corrieron en un gel SDS-PAGE al 10% y se visualizaron mediante autorradiografía.
Figura 7. Experimento de transferencia western que muestra que la quimera Tyr_E2 resulta retenida en el ER.
Se transfectaron células con el constructo Tyr_E2 y los lisados celulares se dividieron en dos y se digirieron con (+) o sin (-) EndoH. Las muestras se corrieron en un gel SDS-PAGE al 10%, se transfirieron a membranas y se visualizaron con antisuero T311 mediante quimioluminiscencia ECL.
Descripción detallada de las formas de realización preferidas Introducción
La tirosinasa humana es una glucoproteína membranal de tipo I y presenta 529 aminoácidos, siete ocupados por sitios de N-glucosilación, 17 residuos de cisteína agrupados en dos dominios ricos en cisteína, dos dominios de unión de cobre y un dominio TM C-terminal (Ujvari et al. 2001). Los inventores han construido una forma truncada de tirosinasa humana que no presenta un dominio transmembranal (TM). En ausencia del dominio TM, la cadena de la luz del ER no fue capaz de plegarse en una conformación nativa. Sin embargo, se demostró que el plegamiento productivo de la cadena truncada, que rinde una proteína activa, se produce al reducirse la velocidad de traducción. La tirosina soluble enzimáticamente activa también se produjo a temperaturas reducidas y el plegamiento productivo se asoció en ambos casos a la interacción con CNX en los estadios tempranos. Estos datos sugieren un papel para el dominio TM en el plegamiento y en el mantenimiento de la cadena en el ambiente del traslocón, facilitando de esta manera su interacción con la CNX.
La tirosinasa se expresa constitutivamente en las células de melanoma, generando antígenos tumorales. La tirosinasa de tipo salvaje sigue la ruta secretoria y presenta como diana los melanosomas. Los inventores construyeron un mutante de tirosinasa humano el tráfico del cual se detiene en el retículo endoplasmático (ER). La proteína mal plegada seguidamente resulta retenida en el ER por un sistema de control de calidad y resulta retro-traslocado, degradándose en los proteasomas. Tras la degradación citoplasmática, los péptidos resultantes son presentados a linfocitos T citotóxicos (CTL) por las moléculas del MHC de clase I. En esta forma, el mutante de tirosinasa de la presente invención puede utilizarse para la preparación de un medicamento para la inmunoterapia del melanoma en forma de vacuna diseñada para incrementar la respuesta inmunológica de CTL contra las células del melanoma.
Aunque la tirosinasa se expresa en melanocitos normales, células de melanoma y células epiteliales pigmentadas retinales (RPE), una vacuna que administra un ácido nucleico codificante del mutante de tirosinasa de la presente invención todavía resulta adecuada para el tratamiento del melanoma. Por lo tanto, aunque la vacuna puede presentar como diana melanocitos tanto normales como anormales, el ser humano puede sobrevivir sin melanocitos (Marks et al., Immunologic Research 27:409-425, 2003). Por ejemplo, la vacunación puede resultar en una condición conocida como vitíligo, un trastorno de la pigmentación de la piel que no plantea un problema sanitario grave.
Un antígeno o inmunógeno del melanoma tal como se describe en la presente memoria se refiere a un mutante de tirosinasa soluble o a un fragmento del mismo que es capaz de causar la respuesta inmunológica de células T citotóxicas en un paciente, tal como un ser humano u otro mamífero. Preferentemente el mutante de tirosinasa soluble resulta retenido en el ER y no presenta un dominio transmembranal.
El término melanoma incluye, aunque sin limitación, melanomas, melanomas metastásicos, melanomas derivados de melanocitos o de células nevus relacionadas con melanocitos, melanocarcinomas, melanoepiteliomas, melanosarcomas, melanoma in situ, melanoma de extensión superficial, melanoma nodular, melanoma léntigo maligno, melanoma lentiginoso acral, melanoma invasivo o síndrome de melanoma mola familiar atípico.
Composición
Se encuentra contemplada en la presente invención una composición inmunogénica que comprende un polinucleótido codificante de un mutante de tirosinasa soluble que resulta adecuado para la inducción de una respuesta inmunológica de CTL y opcionalmente, un excipiente farmacéuticamente adecuado. Tras la administración de la composición inmunogénica en una célula diana, la tirosinasa expresada de la presente invención resulta retenida en el retículo endoplasmático, resulta degradada y después presentada sobre la superficie celular por el MHC de clase I para la presentación de antígenos. Preferentemente, el mutante de tirosinasa soluble no presenta un dominio transmembranal. Más preferentemente, el mutante de tirosinasa soluble comprende una secuencia de ácidos nucleicos indicada en SEC ID nº 1 o variantes de la misma.
También se encuentra descrito en la presente invención un mutante de tirosinasa que carece de uno o más sitios de glucosilación. Este tipo de mutantes previsiblemente queda retenido en el ER y degradado mediante degradación asociada al retículo endoplasmático (ERAD) debido a que no serán capaces de interaccionar con la calnexina (que se une a glicanos), produciendo polipéptidos incorrectamente plegados. Dichos mutantes de glucosilación pueden incluir o no un dominio transmembranal. Pueden obtenerse otros mutantes de tirosinasa adecuados mediante deleciones o inserciones en la secuencia del ADNc de la tirosinasa, con la condición de que sean capaces de inducir la ERAD.
Por ejemplo, un mutante de tirosinasa que no presente un glicano en la posición 86 (Tyrmut1) resultará retenido en el ER. En efecto, la tirosinasa depende de la interacción de la calnexina con los glicanos para el plegamiento correcto y, por lo tanto, el bloqueo de la unión de glicanos a residuos específicos puede provocar el plegamiento incorrecto y la retención en el ER.
De manera similar, el albinismo se considera una enfermedad provocada por el plegamiento incorrecto de la tirosinasa y, por lo tanto, la tirosinasa expresada por una persona que presente dicha enfermedad resultará retenida en el ER. La baja incidencia de melanoma en albinos sugiere que los mutantes de tirosinasa presentados en el contexto del complejo HLA rompen la tolerancia frente a los antígenos de tirosinasa presentados por las células del melanoma.
Otros mutantes de tirosinasa pueden anclarse mediante un dominio transmembranal de otra proteína que contiene una señal de retención en el ER. Dicho mutante quimérico de tirosinasa resulta en una proteína con un perfil de retención en el ER. Estos mutantes también pueden carecer adicionalmente de por lo menos un sitio de glucosilación.
La presente invención también describe una secuencia de ácidos nucleicos que codifica un nuevo antígeno de melanoma reconocido por las células T. El antígeno de melanoma dado a conocer en la presente memoria es una tirosinasa mutante soluble o un fragmento de la misma que preferentemente resulta retenida en el ER y que no presenta un dominio transmembranal. Preferentemente, la secuencia de ácidos nucleicos comprende la secuencia indicada en SEC ID nº 1.
También se da a conocer en la presente memoria una vacuna para el melanoma, que comprende una secuencia de ácidos nucleicos codificante del mutante de tirosinasa de la presente invención, o un fragmento del mismo, o una vacuna que comprende un mutante de tirosinasa soluble de la presente invención o un péptido inmunogénico derivado del mutante de tirosinasa, para la utilización en el tratamiento del melanoma. Además, la vacuna de la presente invención puede administrarse en un portador farmacéuticamente aceptable. Entre los portadores farmacéuticamente aceptables típicamente se incluyen portadores conocidos por el experto en la materia, incluyendo adyuvantes farmacéuticos. Generalmente, entre dichos portadores farmacéuticamente aceptables se incluyen agua, solución salina, tampones y otros compuestos indicados, por ejemplo, en el MERCK INDEX, Merck & Co., Rahway N.J. Ver también "Bioreversible Carriers in Drug Design, Theory and Application", Roche (editor), Pergamon Press, (1987). Se proporcionan diversas consideraciones en, por ejemplo, Gilman et al. (editores), "Goodman and Gilman's: The Pharmacological Bases of Therapeutics", 8ª edición, Pergamon Press; "Novel Drug Delivery Systems", 2ª edición, Norris (editor), Marcel Dekker Inc., (1989), y Remington's Pharmaceutical Sciences, las exposiciones completas de las cuales se incorporan como referencia en la presente memoria.
Las formulaciones de vacuna indicadas en la presente memoria, en primer lugar, pueden evaluarse en modelos animales o en primates no humanos antes que en seres humanos. Se utilizarían procedimientos convencionales para evaluar la respuesta inmunológica del paciente para determinar la eficacia de la vacuna.
La presente invención también contempla variantes de los polinucleótidos y polipéptidos indicados en la presente invención. En una forma de realización, las variantes del polinucleótido dado a conocer en SEC ID nº 1 se encuentran contempladas para la utilización en la presente invención. Una "variante", tal como se utiliza en la presente memoria, se entiende que se refiere a una secuencia de nucleótidos o de aminoácidos que se aparta de la secuencia de nucleótidos o aminoácidos estándar o dada de un gen o proteína particular. Las expresiones "isoforma", "isotipo" y "análogo" también se refieren a formas "variantes" de una secuencia de nucleótidos o de aminoácidos. Una secuencia de aminoácidos que se altera mediante la adición, eliminación o sustitución de uno o más aminoácidos, o una modificación de la secuencia de nucleótidos, puede considerarse una secuencia "variante". La variante puede presentar modificaciones "conservadoras", en las que un aminoácido sustituido presenta propiedades estructurales o químicas similares, por ejemplo la sustitución de leucina por isoleucina. Una variante puede presentar modificaciones "no conservadoras", por ejemplo la sustitución de una glicina por un triptófano. Entre las variaciones menores análogas también pueden incluirse deleciones o inserciones de aminoácidos, o ambas. Pueden encontrarse guías para determinar qué residuos aminoácidos pueden sustituirse, insertarse o delecionarse utilizando programas informáticos bien conocidos de la técnica, tales como software de Vector NTI Suite (InforMax, MD).
Las variantes conservadoras según la invención generalmente conservan la estructura molecular global del mutante de tirosinasa. Dadas las propiedades de los aminoácidos individuales que comprende el mutante de tirosinasa dado a conocer, resultarán evidentes algunas sustituciones racionales. Pueden realizarse sustituciones de aminoácidos, es decir "sustituciones conservadoras", por ejemplo basándose en la similitud de polaridad, carga, solubilidad, hidrofobicidad, hidrofilicidad y/o la naturaleza anfipática de los residuos implicados.
Por ejemplo: (a) entre los aminoácidos no polares (hidrofóbicos) se incluyen alanina, leucina, isoleucina, valina, prolina, fenilalanina, triptófano y metionina, (b) entre los aminoácidos neutros polares se incluyen glicina, serina, treonina, cisteína, tirosina, asparagina y glutamina, (c) entre los aminoácidos cargados positivamente (básicos) se incluyen arginina, lisina e histidina, y (d) entre los aminoácidos cargados negativamente (ácidos) se incluyen ácido aspártico y ácido glutámico. Las sustituciones típicamente pueden realizarse dentro de los grupos (a) a (d). Además, la glicina y la prolina pueden sustituirse entre sí basándose en su capacidad de romper las hélices \alpha. De manera similar, determinados aminoácidos, tales como alanina, cisteína, leucina, metionina, ácido glutámico, glutamina, histidina y lisina, se encuentran más comúnmente en las hélices \alpha, mientras que valina, isoleucina, fenilalanina, tirosina, triptófano y treonina se encuentran más comúnmente en las láminas \beta-plegadas. Los aminoácidos glicina, serina, ácido aspártico, asparagina y prolina se encuentran comúnmente en los giros. Pueden realizarse algunas sustituciones preferentes entre los grupos siguientes: (i) S y T, (ii) P y G, e (iii) A, V, L e I. Dado el código genético conocido, y las técnicas de ADN recombinantes y sintéticas, el experto en la materia puede construir fácilmente ADN codificantes de las variantes de aminoácidos conservadoras.
El término "variante" también puede referirse a un "gen aleatorizado", tales como aquellos indicados en las patentes asignadas a Maxygen. Por ejemplo, una variante de la presente invención puede incluir variantes de secuencias y polinucleótidos deseados que son modificados según los procedimientos y argumentación dada a conocer en la patente US nº 6.132.970, que se incorpora a la presente memoria como referencia en su totalidad.
De manera similar, entre las variantes de polinucleótidos y de polipéptidos dadas a conocer en la presente invención se incluyen polinucleótidos y polipéptidos que presentan una identidad de secuencia de por lo menos 65%, de por lo menos 70%, de por lo menos 75%, de por lo menos 80%, de por lo menos 85%, de por lo menos 90%, de por lo menos 95% o de por lo menos 99% con un ácido nucleico codificante de un mutante de tirosinasa soluble o un fragmento del mismo, o un polipéptido de mutante de tirosinasa soluble o fragmento del mismo, respectivamente, o hibridarse bajo condiciones de astringencia baja, moderada o alta con un ácido nucleico codificante de un mutante de tirosina soluble o fragmento del mismo. Los procedimientos de hibridación son bien conocidos por los expertos en la materia (véase, por ejemplo, Ausubel et al., Short Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York N.Y., unidades 2.8-2.11, 3.18-3.19 y 4.6-4.9, (1997)). Pueden seleccionarse las condiciones de hibridación en la que sonda y diana completamente complementarias puedan hibridarse, es decir, cada par de bases debe interaccionar con su par de bases complementario. Alternativamente, pueden seleccionarse condiciones en las que sonda y diana presenten no correspondencias de hasta aproximadamente 10%, pero que todavía sean capaces de hibridarse. Las condiciones adecuadas pueden seleccionarse, por ejemplo, mediante la modificación de las concentraciones salines en las soluciones de prehibridación, de hibridación y de lavado o mediante la modificación de las temperaturas de hibridación y de lavado. En el caso de algunos sustratos, la temperatura puede reducirse mediante la adición de formamida a las soluciones de hibridación y de hibridación. La hibridación puede llevarse a cabo a baja astringencia utilizando tampones, tales como 5xSSC con dodecilsulfato sódico (SDS) al 1% a 60ºC, lo que permite la hibridación entre secuencias de sonda y diana que contienen algunas no correspondencias, formando complejos de sonda/diana. Los lavados posteriores se llevan a cabo a astringencia más alta, con tampones tales como 0,2xSSC con SDS al 0,1% a 45% (astringencia intermedia) o a 68ºC (astringencia elevada), con el fin de mantener la hibridación de únicamente aquellos complejos de sonda/diana que contengan secuencias completamente complementarias. Pueden reducirse las señales de fondo mediante la utilización de detergentes, tales como SDS, sarcosilo o Triton X-100, o un agente de bloqueo, tal como ADN de esperma de salmón.
Las vacunas y composiciones inmunogénicas para la utilización de acuerdo con la presente invención opcionalmente pueden formularse de manera convencional utilizando uno o más portadores o excipientes fisiológicamente aceptables. De esta manera, pueden formularse para la administración mediante inhalación o insuflado (a través de la boca o de la nariz) o mediante administración oral, bucal, parenteral o rectal. En una forma de realización preferida, la composición farmacéutica se prepara para la administración parenteral.
Para la administración oral, las composiciones de la presente invención pueden adoptar la forma de, por ejemplo, tabletas o cápsulas preparadas por medios convencionales con excipientes farmacéuticamente aceptables, tales como agentes ligantes (por ejemplo almidón de maíz pregelatinizado, polivinilpirrolidona o hidroxipropilmetilcelulosa), rellenos (por ejemplo lactosa, celulosa microcristalina o hidrogenofosfato de calcio), lubricantes (por ejemplo estearato de magnesio, talco o sílice), desintegrantes (por ejemplo almidón de patata o glicolato de almidón sódico) o agentes humectantes (por ejemplo laurilsulfato sódico). Las tabletas pueden recubrirse mediante procedimientos bien conocidos de la técnica. Las preparaciones líquidas para la administración oral pueden adoptar la forma de, por ejemplo, soluciones, jarabes o suspensiones, o pueden presentarse en forma de producto seco para la constitución con agua u otro vehículo adecuado antes de la utilización. Dichas preparaciones líquidas pueden prepararse por medios convencionales con aditivos farmacéuticamente aceptables, tales como agentes de suspensión (por ejemplo jarabe de sorbitol, derivados de celulosa o grasas comestibles hidrogenadas), agentes emulsionantes (por ejemplo lecitina o acacia), vehículos no acuosos (por ejemplo aceite de almendra, ésteres aceitosos, alcohol etílico o aceites vegetales fraccionados) y conservantes (por ejemplo metil o propil-p-hidroxibenzoatos o ácido sórbico). Las preparaciones también pueden contener sales tamponadoras, agentes saborizantes, colorantes o edulcorantes, según resulte apropiado.
Las preparaciones para la administración oral pueden formularse convenientemente para proporcionar la liberación controlada del compuesto activo. Para la administración bucal la composición puede presentar la forma de tabletas o pastillas formuladas de manera convencional.
Para la administración mediante inhalación, los mutantes de tirosinasa según la presente invención se administran convenientemente en la forma de una presentación de pulverización de aerosol a partir de paquetes presurizados o un nebulizador, con la utilización de un propelente adecuado, por ejemplo diclorodifluorometano, triclorofluorometano, diclorotetrafluoroetano, dióxido de carbono u otro gas adecuado. En el caso de un aerosol presurizado, la unidad de dosificación puede determinarse proporcionando una válvula para administrar una cantidad medida. Las cápsulas y cartuchos de, por ejemplo, gelatina para la utilización en un inhalador o insuflador pueden formularse conteniendo una mezcla de polvos del compuesto y una base de polvos adecuada, tal como lactosa o almidón.
Tal como se ha indicado anteriormente, los mutantes de tirosinasa solubles de la presente invención preferentemente se formulan para la administración parenteral mediante inyección, por ejemplo mediante inyección de bolo o la infusión continua. Las formulaciones para la inyección pueden presentarse en forma de dosificación unitaria, por ejemplo en ampollas o en recipientes multidosis, con un conservante añadido. Las composiciones pueden presentar formas tales como suspensiones, soluciones o emulsiones en vehículos aceitosos o acuosos, y pueden contener agentes de formulación, tales como agentes de suspensión, estabilizadores y/o dispersantes. Alternativamente, el ingrediente activo puede encontrarse en forma de polvos para la reconstitución con un vehículo adecuado, por ejemplo agua estéril libre de pirógenos, antes de la utilización.
Los compuestos también pueden formularse en composiciones rectales, tales como supositorios o enemas de retención, por ejemplo que contengan bases para supositorio convencionales, tales como manteca de cacao u otro glicéridos.
Además de las formulaciones anteriormente indicadas, los mutantes de tirosinasa de la presente invención también pueden formularse en forma de preparación de depósito. Este tipo de formulaciones de acción prolongada pueden administrarse mediante implantación (por ejemplo subcutáneamente o intramuscularmente) o mediante inyección intramuscular. De esta manera, por ejemplo, los compuestos pueden formularse con materiales poliméricos o hidrofóbicos (por ejemplo en forma de una emulsión en un aceite aceptable) o resinas de intercambio iónico, o en forma de derivados poco solubles, por ejemplo en forma de sal poco soluble.
La composición, si se desea, puede presentarse en un paquete o dispositivo dispensador que puede contener una o más formas de dosificación unitaria que contengan el ingrediente activo. El paquete puede comprender, por ejemplo, lámina metálica o plástica, tal como un paquete blíster. El paquete o dispositivo dispensador puede acompañarse de instrucciones para la administración.
También se describe en la presente invención un constructo de ADN que comprende una secuencia de nucleótidos de una proteína mutante soluble de tirosinasa de la presente invención. En una forma de realización preferida, la secuencia de nucleótidos de la tirosinasa es la secuencia de ácidos nucleicos proporcionada en SEC ID nº 1 o una variante de la misma.
La producción de proteínas recombinantes es bien conocida en la técnica y se describe de manera general brevemente a continuación.
Se construyen vectores de expresión útiles para la utilización en bacterias mediante la inserción de una secuencia de ADN estructural codificante de una proteína deseada conjuntamente con señales adecuadas de inicio y terminación de traducción en fase de lectura operable con un promotor funcional. El vector comprende uno o más marcadores fenotípicos seleccionables y un origen de replicación para garantizar el mantenimiento del vector y, si se desea, para proporcionar la amplificación dentro del huésped. Entre los huéspedes procarióticos adecuados para la transformación se incluyen E. coli, Bacillus subtilis, Salmonella typhimurium y diversas especies en los géneros Pseudomonas, Streptomyces y Staphylococcus, aunque pueden utilizarse a elección otros. En una forma de realización preferida, el huésped procariótico es E. coli.
Los vectores bacterianos pueden basarse, por ejemplo, en bacteriófagos, plásmidos o cósmidos. Dichos vectores pueden comprender un marcador seleccionable y un origen de replicación bacteriano derivado de plásmidos disponibles comercialmente que típicamente contienen elementos del vector de clonación bien conocido pBR322 (ATCC nº 37017). Entre dichos vectores comerciales se incluyen, por ejemplo, GEM 1 (Promega Biotec, Madison, WI, USA), pBs, phagescript, PsiX174, pBluescript SK, pBs KS, pNH8a, pNH16a, pNH18a, pNH46a (Stratagene), pTrc99A, pKK223-3, pKK233-3, pKK232-8, pDR540 y pRIT5 (Pharmacia). Un vector preferido según la invención es pTriex (Novagen).
Dichas secciones "esqueléticas" se combinan con un promotor apropiado y la secuencia estructural que debe expresarse. Entre los promotores bacterianos se incluyen lac, T3, T7, lambda P_{R} o P_{L}, trp y ara. T7 es el promotor bacteriano preferente.
Tras la transformación de una cepa huésped adecuada y el crecimiento de la cepa huésped hasta una densidad celular apropiada, el promotor seleccionada se desreprime/induce por medios apropiados (por ejemplo un cambio de temperatura o la inducción química) y las células se cultivan durante un periodo adicional. Las células típicamente se recolectan mediante centrifugación, se rompen por medios físicos o químicos y el extracto crudo resultante se retiene para la purificación adicional.
También pueden utilizarse diversos sistemas de cultivo de células de mamífero para expresar la proteína recombinante. Entre los ejemplos de sistemas de expresión de mamífero se incluyen células L de ratón seleccionadas, tales como células timidina quinasa-negativas (TK) y células adenina fosforibosiltransferasa-negativas (APRT). Entre otros ejemplos, se incluyen las líneas COS-7 de los fibroblastos renales de mono, descritos por Gluzman, Cell 23:175, (1981), y otras líneas celulares capaces de expresar un vector compatible, por ejemplo las líneas celulares C127, 3T3, CHO, HeLa y BHK. Los vectores de expresión de mamífero comprenden un origen de replicación, un promotor y un intensificador adecuados, y también cualquier sitio de unión ribosómica necesario, un sitio de poliadenilación, sitios donadores y aceptores de procesamiento, secuencias de terminación de transcripción y secuencias 5' flanqueantes no transcritas. Las secuencias de ADN derivadas del genoma del virus SV40, por ejemplo los sitios de origen, de promotor temprano, de intensificador, de procesamiento y de poliadenilación de SV40, pueden utilizarse para proporcionar los elementos genéticos no transcritos requeridos.
Entre los promotores de mamífero se incluyen CMV inmediato temprano, timidina quinasa de HSV, SV40 temprano y tardío, LTR de retrovirus y metalotioneína I de ratón. Entre los vectores de mamífero ejemplares se incluyen pWLneo, pSV2cat, pOG44, pXT1, pSG (Stratagene), pSVK3, pBPV, pMSG y pSVL (Pharmacia). En una forma de realización preferida, el vector de expresión de mamífero es pTriex.
En las células huésped de mamífero, puede utilizarse varios sistemas de expresión de base vírica. En los casos en los que se utilice un adenovirus como vector de expresión, la secuencia codificante de interés puede ligarse a un complejo de control de transcripción/traducción de adenovirus, por ejemplo el promotor tardío y la secuencia líder tripartita. Este gen quimérico seguidamente puede insertarse en el genoma de adenovirus mediante recombinación in vitro o in vivo. La inserción en una región no esencial del genoma vírico (por ejemplo la región E1 o E3) resultará en un virus recombinante que es viable y capaz de expresar una proteína diana en huéspedes infectados (ver, por ejemplo, Logan et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:3655-3659, 1984).
Las secuencias de ácidos nucleicos de la presente invención también resultan adecuadas para la utilización como sondas para detectar la expresión de la tirosinasa en tejido normal y enfermo. Por lo tanto, otro aspecto de la presente invención se refiere a un bioensayo para detectar ARNm codificante de tirosinasa en una muestra biológica, que comprende poner en contacto la muestra con la secuencia de ácidos nucleicos bajo condiciones que permitan la hibridación entre el ácido nucleico y el ARNm de la muestra, y después detectar los complejos.
La detección de complejos en el bioensayo también puede llevarse a cabo mediante una diversidad de técnicas. La detección de complejos mediante amplificación de señales puede conseguir mediante varias técnicas de marcaje convencionales, incluyendo marcajes radioactivos y enzimas (Sambrook et al., en: "Molecular Cloning, A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Press, Plainview, N.Y., 1989; Ausubel et al., en: "Current Protocols in Molecular Biology", John Wiley and Sons, New York N.Y., 1987). Los kits de marcaje radioactivo también se encuentran disponibles comercialmente. La secuencia de ácidos nucleicos del mutante de tirosina utilizada como sonda en el bioensayo puede ser ARN o ADN. Los procedimientos preferidos de marcaje de las secuencias de ADN son con ^{32}P utilizando enzima Klenow o polinucleótido quinasa. Los procedimientos preferidos de marcaje de ARN o secuencias de ribosoma son con ^{32}P o ^{35}S utilizando ARN polimerasas. Además, existen técnicas no radioactivas conocidas para la amplificación de señales, incluyendo procedimientos para unir grupos químicos a anillos de piridimina y de purina (Dale R.N.K. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 70:2238-2242, 1973; Heck R.F., S. Am. Chem. Soc. 90:5518-5523, 1968), procedimientos que permiten la detección mediante quimioluminiscencia (Barton S.K. et al., J. Am. Chem. Soc. 114:8736-8740, 1992) y procedimientos que utilizan sondas de ácidos nucleicos biotinilados (Johnson T.K. et al., Anal. Biochem. 133:125-131, 1983; Erickson P.F. et al., J. of Immunology Methods 51:241-249, 1982; Matthaei F.S. et al., Anal. Biochem. 157:123-128, 1986) y procedimientos que permiten la detección mediante fluorescencia utilizando productos disponibles comercialmente. Los kits de marcaje no radioactivo también se encuentran disponibles comercialmente.
Entre los ejemplos de muestras biológicas que pueden utilizarse en dicho bioensayo se incluyen, aunque sin limitación, cultivos primarios de mamífero, líneas celulares de mamífero continuas, tales como líneas celulares de melanocitos, órganos de mamífero, tales como piel o retina, tejidos, especímenes de biopsia, neoplasmas, especímenes patológicos y especímenes de necropsia.
En otra forma de realización, los polinucleótidos, polipéptidos y variantes de los mismos de la presente invención pueden utilizarse para preparar anticuerpos monoclonales contra el antígeno de tirosinasa soluble. Estos anticuerpos pueden utilizarse, por ejemplo, en la detección de la tirosinasa mediante inmunohistotinción. Por lo tanto, los anticuerpos de la presente invención pueden utilizarse como un reactivo diagnóstico.
Los anticuerpos monoclonales (MAb) son una población homogénea de anticuerpos contra un antígeno particular y el anticuerpo comprende únicamente un tipo de sitio de unión a antígeno y se une únicamente a un epítopo sobre un determinante antigénico. Los anticuerpos monoclonales de roedor contra antígenos específicos pueden obtenerse mediante procedimientos conocidos por los expertos en la materia. Ver, por ejemplo, Kohler y Milstein, Nature 256:495, (1975), y Coligan et al. (editores), Current Protocols in Immunology, vol., páginas 1:2.5.1-2.6.7 (John Wiley & Sons, 1991).
Asimismo, la presente invención da a conocer la utilización de un ADNc de tirosinasa modificado para la preparación de un medicamento para el tratamiento del melanoma. La tirosinasa modificada indicada en la presente memoria es un mutante de tirosinasa soluble que resulta retenido en el ER de una célula presentadora de antígeno (APC) transfectada/transducida. A continuación, se procesa esta proteína y los péptidos antigénicos derivados de la misma forman un complejo con moléculas de HLA sobre las APC. Seguidamente, estos complejos resultan reconocidos por las células T citotóxicas, que reconocen una célula anormal para la lisis.
En una forma de realización preferida, el ADN de la tirosinasa soluble se administra a células presentadoras de antígeno profesionales (por ejemplo células dendríticas) que expresarán la tirosinasa soluble y presentarán los péptidos antigénicos de la tirosinasa en el contexto del complejo HLA. Lo expresado anteriormente incrementará el cebado de los clones de CTL específicos, rompiendo la tolerancia contra los antígenos de la tirosinasa que son presentados por las células de melanoma.
Tal como se ha comentado anteriormente, se describe en la presente memoria una vacuna para el tratamiento del melanoma. La vacunación puede llevarse a cabo mediante procedimientos convencionales. Por ejemplo, el inmunógeno puede utilizarse en un diluyente adecuado, tal como solución salina o agua, o en adyuvante completo o incompleto. Además, el inmunógeno puede unirse o no a un portador para convertir la proteína en inmunogénica. Entre los ejemplos de este tipo de moléculas de portador se incluyen, aunque sin limitación, la albúmina de suero bovino (BSA), la hemocianina de lapa americana (KLH), el toxoide tetánico, y similares. El inmunógeno también puede acoplarse con lipoproteínas o administrarse en forma liposómica o con adyuvantes. El inmunógeno también puede administrarse mediante cualquier vía apropiada para la producción de anticuerpos, tal como la intravenosa, la intraperitoneal, la intramuscular, la subcutánea y similares. El inmunógeno puede administrarse una vez o a intervalos periódicos hasta producir un título significativo de células inmunológicas anti-tirosinasa o de anticuerpo anti-tirosinasa. La presencia de células inmunológicas anti-tirosinasa puede evaluarse midiendo la frecuencia de CTL precursoras (linfocitos T citotóxicos) contra un antígeno de tirosinasa antes y después de la inmunización mediante un ensayo de análisis de precursores de CTL (Coulie P. et al., International Journal Of Cancer 50:289-297, (1992)).
La administración de la vacuna o inmunógeno de la presente invención puede presentar un fin terapéutico. El inmunógeno se proporciona al aparecer la enfermedad o poco después, o al aparecer cualquier síntoma de la enfermedad. La administración terapéutica del inmunógeno sirve para atenuar la enfermedad.
A título de ejemplo, puede utilizarse una vacuna preparada utilizando proteína tirosinasa soluble recombinante o vectores de expresión de péptidos. Para proporcionar una vacuna a un individuo, se inserta una secuencia genética que codifica la totalidad o parte de la secuencia de ácidos nucleicos mutante de tirosinasa soluble en un vector de expresión, tal como se ha indicado anteriormente, y se introduce en un mamífero que debe inmunizarse. Entre los ejemplos de vectores que pueden utilizarse en las vacunas anteriormente indicadas se incluyen, aunque sin limitación, vectores retrovíricos defectivos, vectores adenovíricos, vectores de virus Vaccinia, vectores de virus de la viruela aviar u otros vectores víricos (Mulligan R.C., Science 260:926-932, (1993)). Los vectores víricos que transportan la totalidad o parte de la secuencia de ácidos nucleicos de mutante de tirosinasa soluble pueden introducirse en un mamífero antes de haberse observado evidencia de melanoma o para mediar en la regresión de la enfermedad en un mamífero que presenta melanoma. Entre los ejemplos de procedimientos de administración del vector vírico en los mamíferos se incluyen, aunque sin limitación, la exposición de las células al virus ex vivo, o la inyección del retrovirus o de una línea celular productora del virus en el tejido afectado o la administración intravenosa del virus. Alternativamente, el vector vírico que transporta la totalidad o parte de la secuencia de ácidos nucleicos de la tirosinasa soluble puede administrarse localmente mediante inyección directa en una lesión de melanoma o mediante la aplicación típica en un portador farmacéuticamente aceptable. Preferentemente, los ácidos nucleicos de tirosinasa soluble para la utilización en la presente invención se proporcionan en SEC ID nº 1, y variantes de la misma. La cantidad de vector vírico que transporta la totalidad o parte de la secuencia de ácidos nucleicos del mutante de tirosinasa que debe administrarse se basa en el título de partículas víricas. A título de ejemplo, un intervalo del inmunógeno que debe administrarse es de entre 10^{5} y 10^{13} partículas víricas por mamífero, preferentemente un ser humano.
Tras la inmunización, la eficacia de la vacuna puede evaluarse mediante la producción de anticuerpos o células inmunológicas que reconocen el antígeno, según se evalúa mediante la actividad lítica específica, la producción de citoquinas específicas o la regresión del tumor. Un experto en la materia conocerá los procedimientos convencionales para evaluar las variables anteriormente indicadas. Si el mamífero que debe inmunizarse ya presenta melanoma, la vacuna puede administrarse conjuntamente con otros tratamientos terapéuticos. Entre los ejemplos de otros regímenes terapéuticos se incluyen la inmunoterapia de células T adoptivas y la coadministración de citoquinas o de otros fármacos terapéuticos para el melanoma.
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Procedimiento de preparación
En la presente memoria se describe un procedimiento para preparar un mutante de tirosinasa soluble, que comprende construir una forma truncada de una tirosinasa humana. En una forma de realización preferida, el mutante de tirosinasa presenta una afinidad reducida para la calnexina. También resulta preferente que el mutante de tirosinasa no presente un dominio transmembranal y/o falte por lo menos un sitio de glucosilación. También se prefiere que el mutante de tirosinasa se encuentre codificado por el polinucleótido de secuencia SEC ID nº 1 o por una variante de la misma.
La invención se describe adicionalmente haciendo referencia a los siguientes ejemplos, que se proporcionan únicamente a título ilustrativo.
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Ejemplos
Ejemplo 1
Materiales y procedimientos
Se cultivaron células CHO (European Collection of Animal Cell Cultures, Porton Down, Reino Unido (UK)) y células K42 (cortésmente proporcionadas por el Dr. T. Elliott, Universidad de Southampton y por el Dr. M. Michalak, Universidad de Alberta) en medio RPMI 1640 (Life Technologies, Inc., Paisley, Escocia) que contenía suero de feto bovino al 10% (FCS, Sigma, Poole, Dorset, UK), 50 unidades/ml de penicilina y 50 mg/ml de estreptomicina (Life Technologies, Inc.) y se mantuvieron a 37ºC con 5% de CO_{2}. Los anticuerpos monoclonales de ratón anti-tirosinasa (anticuerpos T311) se obtuvieron de NeoMarkers (Fremont, USA). Los anticuerpos policlonales de conejo anti-calnexina fueron un obsequio del Dr. J. Bergeron (McGill University). Los anticuerpos de conejo anti-calreticulina (anticuerpos C-17 de la calregulina) se adquirieron de Santa Cruz Biotechnology. NB-DNJ fue un obsequio de Searle/Monsanto (St. Louis, MO). La metionina/cisteína marcada radioactivamente con [^{35}S] se obtuvo de I.C.N. Flow (Thame, Oxfordshire, UK). El CHAPS (3-[3-cloramidopropil]-dimetilamonio-1-propanosulfato) se obtuvo de Pierce Chemicals Co. La lactacistina se obtuvo de Calbiochem. Los demás compuestos químicos se obtuvieron de Sigma Chemicals Co. (St. Louis, MO).
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Ejemplo 2
Construcción de un mutante de tirosinasa
El ADNc de longitud completa codificante de tirosinasa humana en un vector de clonación pcTyr fue un obsequio del Dr. V.J. Hearing (NCI, National Institute of Health, Bethesda, MD). Se amplificó el ADNc de tirosinasa WT y el ADNc del dominio luminal WT (456 aminoácidos) (ST) mediante PCR utilizando pcTyr como molde y los cebadores siguientes:
\quad
Cebador directo: 5'-GCTATACCATGGCCCTCCTGGCTGTTTTG-3'
\quad
Cebador inverso WT: 5'-GGCGCGCCTCGAGTAAATGGCTCTGATA-3'
\quad
Cebador inverso ST: 5'-GTATTCTCGAGCCGACTCGCTTGTTC-3'
Los productos de la PCR se digirieron con NcoI y XhoI y se clonaron en el mismo marco de lectura con una etiqueta de 6 His en pTriex1 (Novagen) para la expresión en un mamífero. Las secuencias se confirmaron mediante secuenciación automática del ADN.
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Transfección de células CHO y marcaje metabólico
Se cultivaron células CHO en etapa de crecimiento logarítmico en placas de 6 pocillos para la transfección y se utilizaron para expresar transitoriamente el ADNc de la tirosinasa utilizando Lipofectamina Plus (Invitrogen). Las células se recolectaron 24 horas después de la transfección y se rasparon y se peletizaron. Para el marcaje metabólico, las células CHO transfectadas (10^{7} células/ml) se sometieron a ayuno en un medio libre de cisteína/metionina durante 1 hora, se marcaron con un pulso de 100 a 150 \muCi [^{35}S] durante 20 minutos y se realizó un seguimiento en los tiempos especificados. Inmediatamente después del seguimiento, se recolectaron las células en PBS frío y se incubaron en N-etilmaleimida (NEM) 20 mM durante 30 minutos para alquilar los grupos sulfhidrilo libres. A continuación, las células se lisaron con tampón de lisis CHAPS (tampón HEPES 50 mM, pH 7,5, que contenía CHAPS al 2%, NaCl 200 mM y cóctel inhibidor de proteasa al 0,5% (Sigma) que contenía leupeptina, aprotinina, EDTA sódico, bestatina, AEBSF y E-64).
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Inmunoprecipitación y SDS-PAGE
Se centrifugaron unos lisados celulares marcados con [^{35}S] y los sobrenadantes se incubaron con anticuerpos T311 (1:50) o con anticuerpos anti-calnexina (1:100) durante la noche a 4ºC. A continuación, se añadieron 20 \mul de proteína A-sefarosa y los lisados celulares se incubaron durante 1 hora a 4ºC. La suspensión se lavó 3 veces con CHAPS al 0,5% en tampón HEPES. Se eluyó la tirosinasa mediante ebullición de la suspensión durante 5 minutos en tampón de muestras SDS con (condiciones reductoras) o sin 2-mercaptoetanol al 5% (condiciones no reductoras). Para los estudios de coinmunoprecipitación, los lisados se inmunoprecipitaron con anticuerpos anti-calnexina (1:100) y la suspensión lavada se eluyó con SDS al 1%, se diluyó diez veces con tampón de lisis y se reprecipitó con T311. Las proteínas unidas se eluyeron en condiciones nativas o reductoras y se resolvieron en un gel de SDS-PAGE al 10%. Seguidamente los geles se visualizaron mediante autorradiografía.
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Ensayo de oxidasa DOPA
Un ensayo de DOPA oxidasa mide la segunda actividad catalítica de la tirosinasa, es decir, la conversión de L-DOPA a DOPAcromo por parte de la DOPA quinina. El ensayo se llevó a cabo en gel utilizando L-DOPA como sustrato (Negroiu et al. 2000). Los lisados crudos o el medio de cultivo celular de células transfectadas recolectadas 24 horas después de la transfección se corrieron en condiciones nativas mediante SDS-PAGE y se incubaron en L-DOPA 2,5 mg/ml para visualizar la actividad de tirosinasa.
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Inmunotransferencia
Las proteínas procedentes de las células CHO lisadas con diferentes ADNc se separaron electroforéticamente en geles de acrilamida al 10% tal como ha sido descrito (Branza-Nichita et al. 1999) y se transfirieron a una membrana immobilon (Amersham International, Amersham, UK).
Para aislar la tirosinasa secretada, el medio de cultivo se incubó con níquel-ácido nitrilotriacético-perlas Superflow (Ni-NTA) (Qiagen, Chatsworth, CA) durante la noche a 4ºC. Las perlas se peletizaron, se lavaron tres veces con imidazol 20 mM y se eluyeron con tampón para muestras SDS reductor. Las muestras resultantes se separaron mediante SDS-PAGE, tal como anteriormente. A continuación, los filtros se incubaron con dilución 1:250 de anticuerpos anti-tirosinasa (T311) en 5% de leche, Tween al 0,1% durante 2 horas a 37ºC. La inmunoreactividad se detectó mediante transferencia western quimioluminiscente potenciada (ECL, Amersham Corp.) siguiendo el protocolo del
fabricante.
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Ejemplo 3
El mutante de tirosinasas soluble no presente actividad enzimática, se acumula en el ER y resulta degradado en los proteasomas
Se realizó un seguimiento in vivo de la maduración de un mutante de tirosinasa soluble mediante análisis de pulso-caza, y se inmunoprecipitó con anticuerpos monoclonales anti-tirosinasa (T311). Las muestras se dividieron en dos, y la mitad de cada muestra se digirió con un enzima de restricción EndoH y se corrió en paralelo a un control no digerido en un gel SDS-PAGE reductor (figura 1). Debido a que EndoH únicamente digiere los N-glicanos ricos en manosa e híbridos, se utilizó la sensibilidad de EndoH para realizar un seguimiento de la maduración de los glicanos de estructuras ricas en manosa a estructuras complejas. La digestión con EndoH redujo el pool a un polipéptido que corría a 55 kD. Durante 5 horas de seguimiento, el precursor presentó la misma movilidad electroforética y siguió siendo totalmente sensible a EndoH, indicando que los N-glicanos del mismo no estaban siendo procesados para formar estructuras complejas en el Golgi (figura 1, carriles 1, 3, 5 y 7). Se observó una tendencia hacia una reducción gradual de la cantidad de proteína inmunoprecipitada tras 1 hora de síntesis (figura 1).
\newpage
Para determinar si lo anterior concordaba con la retención de cadenas en el ER y la posterior degradación, los presentes inventores llevaron a cabo el mismo experimento en presencia de inhibidores de proteasoma. Se observó un incremento de la cantidad de material inmunoprecipitado en presencia de lactacistina respecto a la muestra no tratada (figura 1) durante el periodo de seguimiento completo. El patrón de digestión de EndoH de las muestras tratadas con lactacistina fue similar al de las no tratadas (figura 1, carriles 9, 11, 13 y 15), sugiriendo que ST resultaba retenido en el ER y finalmente reconocido para la degradación en proteasomas.
Para comparar la maduración de ST con la proteína de tipo salvaje, los presentes inventores expresaron tirosinasa membranal (WT) clonada en el mismo vector bajo condiciones idénticas (figura 2). Tal como muestran los experimentos de digestión con EndoH, WT se sintetiza en forma de una proteína de 75 kD que adquiere glicanos de tipo complejo en aproximadamente 1 hora de seguimiento. La proporción reducida de glicanos complejos frente a ricos en manosa refleja una sobreexpresión de las tirosinasas en este sistema y ello ha sido informado anteriormente (Berson et al. 2000). Tal como se ha demostrado anteriormente (Halaban et al. 1997, Toyofuku et al. 2001), el tratamiento con lactacistina resulta en una acumulación de proteína no degradada en las primeras 3 horas del seguimiento, sugiriendo que, por lo menos en las etapas iniciales de la maduración, la tirosinasa membranal resulta degradada en proteasomas.
La falta de procesamiento para formar glicanos complejos mostrada por la forma soluble, en contraste con la tirosinasa WT, sugiere una maduración incompleta de la glucoproteína. Lo expresado anteriormente podría relacionarse con su incapacidad para adquirir una conformación nativa. Para investigar esta cuestión, los presentes inventores determinaron la actividad enzimática del mutante ST mediante un ensayo de DOPA-oxidasa. El mutante de ST se encuentra completamente inactivo en el lisado celular o en el medio de cultivo. Lo anterior contrasta con la tirosinasa WT, que es capaz de convertir el sustrato DOPA en DOPAcromo. De esta manera, la cadena ST se desarrolla en una conformación no nativa sin actividad biológica.
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Ejemplo 4
La tirosinasa soluble y la tirosinasa de tipo salvaje muestran diferentes patrones de interacción con chaperones y diferentes rutas de plegamiento
Para examinar el papel de la calnexina y de la calreticulina en el plegamiento de ST, los presentes inventores llevaron a cabo experimentos de inmunoprecipitación secuencial con anticuerpos anti-CNX/anti-CRT y anti-tirosinasa de lisados celulares transfectados marcados metabólicamente. Durante los 30 primeros minutos, se produjo una interacción muy débil entre ST y tanto CNX (figura 3, carriles 1 y 2) como CRT (figura 3, carriles 6 y 7). Tras 1 hora de seguimiento, la interacción resultó visible y se incrementó hasta el nivel máximo tras 3 horas tanto con CNX (figura 3, carriles 3 a 5) como CRT (figura 3, carriles 8 y 9).
Se observó un patrón diferente para la tirosinasa WT, que interaccionó con CNX desde las etapas más tempranas de plegamiento y mostró una reducción significativa tras 1 hora de seguimiento (figura 3, carriles 11 a 13). Resultó evidente una interacción débil de CRT con la cadena naciente de WT al final del periodo del pulso (figura 3, carril 6).
Para caracterizar las rutas de plegamiento de las tirosinasas WT y mutantes, los presentes inventores llevaron a cabo experimentos de inmunoprecipitación en células CHO transfectadas sometidas a pulso-caza y se analizaron las muestras en un gel SDS-PAGE no reductor. Estas condiciones permitieron seguir la formación de los enlaces disulfuro, que es simultánea a la conformación más compacta que resulta y por lo tanto se observa una movilidad acelerada de las cadenas en el gel (Branza-Nichita et al. 1999, Hebert et al. 1995).
La proteína ST se pliega pasando por, como mínimo, tres intermediarios de oxidación en una ruta de plegamiento no productiva, tal como demuestra el progresivo incremento del desplazamiento de movilidad de 0 a 5 horas de seguimiento (figura 4, carriles 1 a 6). El primer intermediario apareció tras el pulso (0 minutos), en contraste con la muestra reducida, mientras que el último intermediario se observó tras 3 horas de seguimiento, correlacionándose con un proceso acelerado de degradación de la tirosinasa truncada.
Mediante el análisis del plegamiento de la proteína WT, los presentes inventores pudieron discriminar entre dos intermediarios de oxidación. El primer no se encuentra completamente oxidado, tal como muestra su velocidad de migración similar a la de la muestra reducida (figura 4, carriles 7 y 12). Durante un periodo de 30 minutos la cadena se oxidó formando el segundo intermediario (figura 4, carril 8) que no se oxidó adicionalmente. La aparición del segundo intermediario se correlaciona con la aparición de estructuras complejas de glicano y una reducción drástica de la interacción de CNX tras 1 hora, indicando que la cadena había adquirido una conformación competente para la exportación y había alcanzado el compartimiento de Golgi. Debido a que las muestras de ST reducido (figura 1, carriles 2, 4, 6 y 8) y WT de pulso-caza (figura 2, carriles 1 a 4) mostraban movilidades uniformes durante el periodo de seguimiento, los desplazamientos en los geles no reductores se deben únicamente a diferentes intermediarios oxidados. Bajo condiciones no reductoras, se pudieron observar agregados y dímeros disulfuro en las etapas tempranas de plegamiento tanto para ST como para WT (figura 4). Estas formas se encontraban ausentes en los últimos puntos del seguimiento y bajo condiciones reductoras, indicando la formación de una mezcla de intermediarios disulfuro durante el plegamiento. Los datos muestran que el plegamiento de ST hasta producir una conformación no nativa tarda seis veces más que para WT y que los intermediarios oxidados tardíos se forman previamente a la degradación.
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Ejemplo 5
Resulta necesario el dominio TM para el plegamiento productivo de la cadena
Para investigar cómo influye en el plegamiento la presencia de un dominio transmembranal, los presentes inventores utilizaron como modelo una glucoproteína de tipo I-tirosinasa y compararon la ruta de plegamiento de la misma con la de un constructo en el que se había delecionado su dominio TM. La tirosinasa es un enzima melanogénico que regula la síntesis de pigmento en los mamíferos (Petrescu et al. 1997). Los presentes inventores han documentado anteriormente su plegamiento dependiente de la glucosilación (Branza-Nichita et al. 1999, 2000).
A partir del resultado de un SDS-PAGE no reductor de células CHO transfectadas marcadas metabólicamente, los presentes inventores demostraron que el constructo soluble madura en una conformación no nativa que resulta retenida en el ER y que finalmente se degrada en proteasomas. Lo anterior se correlaciona con la ausencia de actividad enzimática en células transfectadas con ST, en contrate con las células transfectadas con WT. Resulta interesante que la forma soluble adopta un número incrementado de intermediarios oxidados en comparación con la forma
WT.
La ruta de plegamiento de las dos formas de tirosinasa también difiere en su patrón de asociación con CNX y CRT. La cadena anclada a membrana resulta asistida por CNX partiendo de las etapas tempranas hasta el completado del proceso de plegamiento. Los presentes inventores han informado anteriormente de un plegamiento dependiente de calnexina similar para la tirosinasa membranal de ratón, produciéndose dos intermediarios oxidantes (Branza-Nichita et al. 1999, Branza-Nichita et al. 2000). En contraste, la afinidad de la tirosinasa truncada para CNX y CRT inicialmente es muy reducida y se incrementa hacia el final del proceso, previamente a la degradación. Por lo menos dos de un total de tres intermediarios de plegamiento de ST aparece en ausencia de la interacción CNX/CRT (posiblemente con la asistencia de otros factores de plegamiento del ER). Dichos intermediarios son incapaces de alcanzar el plegamiento nativo, implicando que han adquirido puentes disulfuro aberrantes. Se demostró que dos tioreductasas interaccionaban con las cadenas nacientes durante la formación de puentes disulfuro en el RE-PDI y Erp57 (Farmery et al. 2000, Mezghrani et al. 2001). Erp57 interacciona con la cadena en el caso de que ésta se encuentre asociada con CNX (Frickel et al. 2002). Resulta posible que la tiorreductasa también catalice la formación de los enlaces S-S en la tirosinasa membranal. A la inversa, los intermediarios oxidados de la forma soluble se producen inicialmente en ausencia de CNX y de Erp57 y la cadena no puede rescatarse a una conformación nativa a partir de sus interacciones tardías con chaperones, aunque se demuestra que tanto calnexina como calreticulina se asocien con ella en esta etapa. Existe un equilibrio frágil entre el plegamiento y la degradación en esta etapa, discriminando el ciclo de control de calidad entre las cadenas correcta e incorrectamente plegadas. Los polipéptidos incorrectamente plegados son nuevamente glucosilados por GT y dirigidos por CNX/CRT al ciclo (Sousa y Parodi 1995). Se ha demostrado la asociación de muchas proteínas solubles o unidas a membrana, con CNX o CRT antes de ser dirigidas a la etapa de degradación (Ellgaard y Helenius 2001).
Dichos datos indican que la nueva glucosilación de la ST incorrectamente plegada se incrementa en las etapas tardías del plegamiento y, por lo tanto, existe una asociación incrementada tanto con CNX como con CRT, coincidiendo con el colapso de la cadena a configuraciones con disulfuros aberrantes que se produce inmediatamente antes de la degradación. De hecho, no se oxida el pool entero de tirosinasa para formar el último intermediario; por el contrario, algunas de las cadenas se envían a ser degradadas en etapas más tempranas. El plegamiento aberrante y la degradación de la cadena truncada se produce prácticamente de manera simultánea en los dos últimos puntos de seguimiento. Lo anterior sugiere que las cadenas incorrectamente plegadas en el ciclo de la calnexina se envían directamente a la maquinaria de retro-traslocación. Conjuntamente estos datos demuestran que el dominio TM resulta crucial para el plegamiento productivo de la tirosinasa.
El dominio TM aparentemente desempeña un papel clave en dicho proceso, al incrementar el tiempo transcurrido en la región traslocón mediante sucesos asociados a inserciones y al impedir que la proteína se aleje por difusión rápida. Resulta importante indicar que en todos los casos las rutas de plegamiento productivo normalmente incluirían menos intermediarios que las rutas no productivas, con independencia de la duración del proceso. Básicamente, en el caso de que se formen disulfuros no nativos en las etapas tempranas, la cadena adopta más conformaciones que en la ruta nativa, resultando en varios intermediarios oxidados que finalmente se dirigirán a la etapa de degradación. Por lo tanto, un incremento del número de intermediarios durante el plegamiento podría ser una indicación de una ruta que conduce a un plegamiento no nativo. En este caso, la interacción con la calnexina podría describirse más exactamente como una etapa temprana de degradación y no como una etapa tardía de plegamiento.
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Ejemplo 6
Mutantes de glucosilación de la tirosinasa unidad a membrana
Se construyó en la posición 86 un mutante de tirosinasa humana sin la secuencia de consenso Asn-Arg-Thr. Lo anterior se consiguió mutando Asn86 a Gln, modificando de esta manera la secuencia a Gln-Arg-Thr. La retención en el ER del mutante Tyrmut1 se muestra en la figura 6 a partir de su patrón de digestión con EndoH.
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Ejemplo 7
Tirosinasa unida a membrana mediante anclaje a través de un dominio transmembranal que contiene señales de retención en el ER
Se construyó una proteína tirosinasa quimérica (TyrE2) utilizando el dominio transmembranal de la proteína de cubierta del virus de la hepatitis C (HCV E2) y un ectodominio de tirosinasa. Tal como se observa en la figura 7, la digestión con EndoH del lisado celular que expresa la quimera TyrE2 resultó en una proteína con un perfil de retención en el ER.

Claims (24)

1. Polipéptido que comprende un mutante de tirosinasa, en el que el mutante de tirosinasa es capaz de acumularse en el retículo endoplasmático y
(a)
el mutante de tirosinasa es enzimáticamente activo y carece de un dominio transmembranal, o
(b)
el mutante de tirosinasa carece de un dominio transmembranal de tirosinasa aunque contiene un dominio transmembranal de una proteína que no es la tirosinasa.
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2. Polipéptido según la reivindicación 1, en el que el mutante de tirosinasa presenta una afinidad reducida para la calnexina.
3. Polipéptido según la reivindicación 2, en el que el mutante de tirosinasa no presenta ningún dominio transmembranal.
4. Polipéptido según la reivindicación 2, en el que el mutante de tirosinasa está codificado por el polinucleótido de secuencia SEC ID nº 1 o una variante del mismo.
5. Polipéptido según la reivindicación 1, en el que el mutante de tirosinasa es una tirosinasa quimérica.
6. Polipéptido según la reivindicación 5, en el que la tirosinasa quimérica se encuentra unida a membrana mediante un dominio transmembranal de otra proteína, y en el que el dominio transmembranal contiene señales de retención en el ER.
7. Polipéptido según la reivindicación 6, en el que la tirosina quimérica está retenida en el ER a través de señales de retención en el dominio transmembranal de la proteína 2 de la cubierta del virus de la hepatitis C.
8. Composición inmunogénica que comprende un mutante de tirosinasa que es capaz de acumularse en el retículo endoplasmático y en el que:
(a)
el mutante de tirosinasa es enzimáticamente inactivo y carece de un dominio transmembranal, o
(b)
el mutante de tirosinasa carece de un dominio transmembranal de tirosinasa aunque contiene un dominio transmembranal procedente de una proteína que no es la tirosinasa.
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9. Composición inmunogénica según la reivindicación 8, en la que el mutante de tirosinasa está codificado por el polinucleótido de secuencia SEC ID nº 1 o una variante del mismo.
10. Polinucleótido codificante de un mutante de tirosinasa, en el que dicho mutante de tirosinasa es capaz de acumularse en el retículo endoplasmático, y en el que:
(a)
el mutante de tirosinasa es enzimáticamente inactivo y carece de un dominio transmembranal, o
(b)
el mutante de tirosinasa carece de un dominio transmembranal aunque contiene un dominio transmembranal procedente de una proteína que no es la tirosinasa.
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11. Polinucleótido según la reivindicación 10, en el que el mutante de tirosinasa carece de un dominio transmembranal.
12. Polinucleótido según la reivindicación 11, en el que el mutante de tirosinasa está codificado por la secuencia identificada en SEC ID nº 1 o por una variante de la misma.
13. Vacuna que comprende un polinucleótido según la reivindicación 10 y un portador farmacéuticamente aceptable.
14. Vacuna según la reivindicación 13, en la que el polinucleótido comprende la secuencia identificada en SEC ID nº 1 o una variante de la misma.
15. Célula huésped que comprende un polinucleótido según la reivindicación 10.
16. Célula huésped según la reivindicación 15, en la que el polinucleótido comprende la secuencia indicada en SEC ID nº 1, o una variante de la misma.
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17. Utilización de un polinucleótido codificante de un mutante de tirosinasa para la preparación de un medicamento destinado al tratamiento de un melanoma, y en la que:
(a)
el mutante de tirosinasa es enzimáticamente inactivo y carece de un dominio transmembranal, o
(b)
el mutante de tirosinasa carece de un dominio transmembranal de tirosinasa aunque contiene un dominio transmembranal procedente de una proteína que no es la tirosinasa.
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18. Utilización según la reivindicación 17, en la que dicho medicamento se administra en células presentadoras de antígeno.
19. Utilización según la reivindicación 17, en la que dicho medicamento induce una respuesta inmunológico de linfocitos citotóxicos.
20. Utilización según la reivindicación 17, en la que el mutante de tirosinasa se acumula en el retículo endoplasmático de una célula.
21. Utilización según la reivindicación 20, en la que el mutante de tirosinasa carece de un dominio transmembranal.
22. Procedimiento para la preparación de un mutante de tirosinasa, que comprende construir una forma truncada de una tirosinasa humana, en el que la tirosinasa no presenta ningún dominio transmembranal y es capaz de acumularse en el retículo endoplasmático, y en el que:
(a)
el mutante de tirosinasa es enzimáticamente inactivo y carece de un dominio transmembranal, o
(b)
el mutante de tirosinasa carece de un dominio transmembranal de tirosinasa aunque contiene un dominio transmembranal procedente de una proteína que no es la tirosinasa.
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23. Polipéptido que comprende un mutante de tirosinasa humano, en el que dicho mutante de tirosinasa es capaz de acumularse en el retículo endoplasmático, y en el que dicho mutante de tirosinasa humano también carece de la secuencia de consenso Asn-Arg-Thr debido a la mutación de Asn en la posición 86.
24. Polipéptido según la reivindicación 23, en el que el residuo Asn en la posición 86 se modifica por un residuo Gln.
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