ES2304393T3 - Utilizacion de la proteina grf-1 para el cribado de moleculas. - Google Patents

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Abstract

Utilización de una proteína que presenta una identidad de al menos 85% con una proteína Factor 1 de Liberación de Nucleótido de Guanina (GRF1) o de células que expresen dicha proteína, en un método de detección de compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de patologías o trastornos del sistema nervioso central que impliquen una muerte neuronal o estén asociados a la obesidad.

Description

Utilización de la proteína GRF1 para el cribado de moléculas.
La presente invención trata del dominio de la biología y de la señalización celular en las neuronas. Más precisamente, la presente invención se refiere a nuevas utilizaciones de toda o parte de la proteína GRF1 (Factor 1 de Liberación de Nucleótido de Guanina) para el cribado de moléculas que presentan una actividad de protección contra la muerte neuronal y el tratamiento de la obesidad. La proteína GRF1, que se representa esquemáticamente en la Figura 1A, ha sido descubierta originalmente por el hombre por su capacidad para modular el estado de activación de la proteína p21Ras. Las secuencias de proteínas GRF1 humanas, de ratón y de rata son respectivamente las secuencias SEC ID Nº 1, SEC ID Nº 2 y SEC ID Nº 3. La solicitud de patente internacional WO 93/21314 y la patente de EE.UU. 5.656.595 describen la identificación, el aislamiento así como la caracterización de la forma humana de esta proteína.
La patente internacional WO0040718 describe mutantes en las posiciones 1.184 y 1.124 de la proteína GNRF de ratones. Según esta solicitud estas proteínas o los ácidos nucleicos que las codifican podrían ser utilizados con fines terapéuticos, en particular en el tratamiento de tumores.
GRF1 posee diversos dominios funcionales denominados dominios PH, IQ, DH y CDC25 cuyo significado e implicación se precisan a continuación.
La localización de los dominios funcionales de GRF1 en las secuencias proteicas humanas, de ratones y de rata, se indica en la tabla a continuación.
GRF1 consta de un dominio DH (homología Db1) que presenta una fuerte homología de secuencia con una región del proto-oncogén Dbl. Dbl es un factor de intercambio de proteínas G pequeñas de la familia Rho/Rac/Cdc42Hs implicadas en la regulación de diversas señales celulares que controlan o la motilidad del citoesqueleto o la activación de las cinasas denominadas de "estrés" (1).
En la proteína Dbl, la actividad de intercambio de GDP/GTP en las proteínas de la familia Rho la lleva el dominio DH. Éste se encuentra en otros factores de intercambio de proteínas G de pequeño peso molecular entre ellas las proteínas GRFs y las proteínas SOSs. Se han publicado resultados que sugieren que el dominio DH de GRF1 es funcional en Rac (activación de Rac en forma GTP) y conduce a la activación de la JNK1 en células en cultivo que sobreexpresan la subunidad beta/gamma de las proteínas G heterotriméricas (2). Por otro lado, se ha sugerido igualmente el papel funcional del dominio DH de GRF1 en los procesos neuronales por los resultados de las experiencias de mutagénesis dirigida que muestran que la activación de la proteína GRF1 por el calcio requiere un dominio DH íntegro
(3, 4).
El calcio juega un papel importante en la regulación de las actividades neuronales: secreción de neuromediadores, crecimiento de las neuronas, muerte/supervivencia celular, adaptación y estimulación de la transmisión sináptica, activación transcripcional de ciertos genes. Estudios realizados en cultivos primarios de neuronas de córtex de ratas recién nacidas han demostrado que la activación de Ras por GRF1 aumenta en presencia de calcio. Esta activación está regulada por la fijación de la calmodulina en el dominio IQ de GRF1 (3-5).
La actividad de intercambio de GRF1 para las proteínas Ras (Ha, Ki y N-Ras) es llevada en cuanto a ella se refiere por la región homóloga a CDC25 de Saccharomyces cerevisiae, situada en la extremidad carboxi-terminal de la molécula (6).
GRF1 posee dos dominios PH (Homología Pleckstrin) que son dominios de interacción entre proteínas y que están implicados probablemente en el enlace en las subunidades beta-gamma de proteínas G hetero-triméricas (7-9).
Hoy se conocen con más detalle las funciones de la proteína GRF1, descubierta inicialmente por su actividad de intercambio en el proto-oncogén Ras. Contrariamente a las proteínas SOS1, SOS2 y GRF2, otros tres factores de intercambio de Ras que se expresan de manera ubicua, se admite ahora que la expresión del gen grf1 está limitada al sistema nervioso central en seres humanos, ratones y ratas (6, 10, 11).
En el cerebro, se ha estudiado extensamente la regionalización de esta expresión. En ratas, es importante en el hipocampo, el neocórtex, algunos núcleos profundos y células en grano del lóbulo anterior del cerebelo (12). En ratones, se ha descrito igualmente que es abundante en la amígdala (13) y el hipotálamo (14).
Entre los diferentes tipos celulares presentes en el sistema nervioso central, la expresión del gen grf1 parece limitar a las neuronas (15). Este gen experimenta en el tiempo, un control transcripcional estricto puesto que no se expresa durante la vida embrionaria y no comienza a transcribirse hasta el momento del nacimiento para alcanzar un nivel máximo en torno al día quince (14, 15).
La expresión de grf1 está controlada por un mecanismo transcripcional particular denominado huella parental que se traduce en ratones por una expresión del gen a partir del alelo de origen paterno mientras que el alelo materno es silencioso (14, 16). Es interesante señalar que algunos genes (proto-oncogenes) normalmente sometidos a huella parenteral están implicados en la proliferación celular y la aparición de tumores cuando se produce un malogro del mecanismo de la huella y que se transcriben los dos alelos.
Entonces la vía de activación de Ras por los factores de intercambio SOS está bien documentada, parece ser que se sabe muy poco de cosas sobre las vías de señalización que utilizan GRF1 y sobre su función biológica in vivo.
Parece que contrariamente a los otros factores de intercambio de Ras de la familia SOS, GRF1 no traduce las señales que resultan de la fijación de ligandos en los receptores, en actividad de la tirosina cinasa, sino más bien las resultantes de receptores en siete dominios transmembrana acoplados a las proteínas G hetero-triméricas (17-19).
Finalmente se observará que algunas de las funciones biológicas de GRF1 se han podido abordar in vivo gracias al estudio del fenotipo de ratones portadores de una mutación inactivante del gen grf1 - ratón knock-out o KO, obtenido por la técnica de recombinación homóloga - que no expresa más GRF1 (13, 14). Estos animales son poco competentes, vistos deficientes en los ensayos de aprendizaje y de memorización que aplican los estímulos "aversivos". Según los autores de este trabajo, la totalidad de la región del cerebro denominada amígdala será alterada en ratones mutantes y será responsable del fenotipo observado (13). Sin embargo no se da ninguna indicación por lo que se refiere a una posible utilización de estos ratones para el cribado de moléculas que presentan una actividad terapéutica.
Las lesiones físicas del cerebro tales como la isquemia cerebral o el trauma cerebral (lesiones agudas o accidentales) y las enfermedades neurodegenerativas tales como la enfermedad de Alzheimer y la enfermedad de Parkinson, continúan siendo una de las principales causas de mortalidad y de morbilidad en los países desarrollados.
Se ha demostrado que la apoptosis constituye uno de los mecanismos que conduce a estas lesiones.
Se ha evaluado con éxito un número considerable de moléculas que actúan en diversos procesos fisiopatológicos causados por lesiones en el sistema nervioso central, en investigación experimental en diferentes modelos y especies. Aunque algunas de ellas han sido o son utilizadas en ensayos clínicos para estos trastornos, ninguna de las moléculas ensayadas ha demostrado eficacia real durante los estudios en fase III o durante su introducción en el mercado.
La única medicación utilizada actualmente para el tratamiento de la isquemia cerebral consiste en la inyección de trombolíticos sólo a pacientes que no presenten riesgos hemorrágicos.
La solicitante ha demostrado por el estudio de ratones que portan una mutación inactivante del gen grf1 que la ausencia de expresión de la proteína GRF1 confiere una protección contra la lesión física del cerebro durante una isquemia cerebral.
Por otro lado, en algunas décadas, la obesidad ha llegado a ser un problema principal de salud pública en los países industrializados donde afecta ahora al 20 a 30% de la población. Estas cifras deberían aún crecer de manera alarmante en los años venideros. Debido a sus orígenes multifactoriales que llevan sus fuentes a niveles más o menos importantes entre los factores medioambientales de una parte (comportamientos alimenticios, acceso al alimento, gasto energético,...) y múltiples orígenes genéticos por otra parte, la obesidad constituye un verdadero desafío para la medicina.
La fisiopatología de las enfermedades asociadas al peso es compleja y heterogénea. La obesidad con frecuencia está asociada a un riesgo incrementado de fallecimiento, a enfermedades cardiovasculares, a una diabetes no dependiente de la insulina y a una resistencia a la insulina. Los trastornos psicológicos y comportamentales como la ansiedad y la depresión vienen a añadirse incluso al cuadro clínico de la enfermedad. Por otro lado y fenotípicamente en el lado opuesto, la pérdida excesiva de peso en los contextos medioambientales (desnutrición) o patológicos (anorexia mental por ejemplo) particulares, está asociada con una morbilidad y una mortalidad importantes. Por estas diferentes razones, la identificación de un gen que desempeñe un papel en el aumento del peso, presenta un interés considerable que interesa en el tratamiento de la obesidad o el de la pérdida de peso excesiva.
La solicitante ha demostrado, por el estudio en ratones portadores de una mutación inactivante del gen grf1 que la expresión de la proteína GRF1 es indispensable en la regulación de la expresión de la leptina. La leptina es una citocina asociada con la sensación de saciedad que juega un papel principal en el control del aumento de peso (20).
En el contexto científico tal como se acaba de resumir, aún existe la necesidad de una mejor comprensión de los diferentes mecanismos en juego que puedan conducir especialmente a los trastornos que implican una apoptosis neuronal o estén asociados al metabolismo de la leptina.
Existe además una necesidad de medicamentos eficaces en el tratamiento de trastornos del sistema nervioso central y en el tratamiento de la obesidad.
La solicitante está vinculada a la búsqueda de compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de trastornos que afectan especialmente al sistema nervioso central y a la obesidad.
Ha demostrado con ayuda de ratones portadores de una mutación inactivante del gen grf1 como modelo de estudio, que GRF1 interviene en estos trastornos.
La presente invención se refiere pues a la utilización de una proteína que presenta una identidad de al menos 85% con una GRF1 o de células que expresan una proteína que presenta una identidad de al menos 85% con una GRF1, en los procesos de detección de compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de patologías o de trastornos del sistema nervioso central que impliquen una muerte neuronal, tal como la apoptosis.
Está relacionada además con compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de patologías o trastornos del sistema nervioso central que impliquen una muerte neuronal o estén asociados con la obesidad.
La proteína GRF1 es preferentemente de origen humano. Puede ser sin embargo de otro origen y en particular ser la proteína GRF1 de ratones o de un mamífero muy distinto. También puede ser toda proteína que presente una identidad de al menos 85% y preferentemente 90% con una proteína GRF1 y en particular con la proteína GRF1 humana que presente la secuencia SEC ID Nº 1 o con una proteína GRF1 de origen animal tal como las que presenten las secuencias SEC ID Nº 2 o SEC ID Nº 3. Se interpreta por parte de la proteína GRF1 una secuencia de aminoácidos que comprende una parte funcional de la proteína GRF1 y en particular las secuencias que corresponden a todo o parte de uno de los dominios PHs, DH o CDC25 de las proteínas GRF 1.
Una de las ventajas de los procedimientos de cribado objeto de la presente invención reside en particular en la posición de GRF1 anterior de JNKs (Figura 1B) lo que presenta como ventaja poder regular de manera específica las vías de activación de los JNKs que pasarán por GRF1.
Otra ventaja reside en poner de manifiesto la ausencia de toxicidad de estos compuestos, siendo viables los ratones inactivados por grf1 y de buena salud.
El procedimiento de cribado según la presente invención que utiliza todo o parte de la proteína GRF1 puede comprender las etapas de valoración de:
-
la fosforilación de la proteína GRF1 o de
-
la actividad de intercambio de la proteína GRF1 en, o las proteínas de la familia Ras (Ha, K, N-Ras) o las proteínas Rac y Cdc42; de manera directa o indirecta o de
-
la interacción entre la proteína GRF1 y o las subunidades beta-gamma de las proteínas G heterotriméricas o las proteínas G pequeñas de la familia Ras o Rac y Cdc42.
-
la transformación celular por GRF 1.
Así según un primer modo de aplicación ventajosa, la presente invención se refiere a un procedimiento de cribado o de detección de compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de patologías del sistema nervioso central que implique una muerte neuronal comprendiendo las etapas que consisten en:
(i)
poner en cultivo células que expresen la proteína GRF1 en presencia de un compuesto fosforilado marcado y un compuesto que se vaya a ensayar,
(ii)
lisar dichas células y
(iii)
medir la cantidad de proteína GRF 1 marcada.
El lisado celular obtenido en la etapa (ii) se puede incubar en los pozos de placas de microtitulación recubierto previamente con un anticuerpo anti-GRF1.
La fosforilación de GRF1 se puede medir también con ayuda de un anticuerpo específico de un aminoácido fosforilado.
Así según otro modo de aplicación ventajosa, la presente invención se refiere a un procedimiento de cribado o de detección de compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de patologías del sistema nervioso central que impliquen una muerte neuronal, comprendiendo las etapas que consisten en:
(i)
poner en cultivo células que expresen la proteína GRF1 en presencia de un compuesto que se vaya a ensayar,
(ii)
lisar dichas células
(iii)
medir la cantidad de GRF1 fosforilada.
La medición de la cantidad de GRF1 fosforilada se efectúa preferentemente con ayuda de un anticuerpo específico de un aminoácido fosforilado.
Se pueden poner dichas células en cultivo en un medio que contenga ortofosfato marcado con P32 o con P33.
La fosforilación de la proteína GRF1 se puede realizar en dichas células neuronales por adición de carbacol en el medio de cultivo o bien en líneas celulares carentes de suero durante una noche, después puestas de nuevo en incubación en presencia de suero o incluso en líneas celulares cotransinfectadas por los ADNc codificantes para las subunidades beta-gamma de las proteínas G triméricas \beta1\gamma2 o \beta1\gamma5, después carentes de suero durante una noche, después puestas de nuevo en incubación en presencia de suero.
Según otro modo de realización de la invención el cribado comprende la medición de la actividad de intercambio de GRF1 en ciertas proteínas de la familia de las proteínas G pequeñas (Ras, Rac, Cdc42). Así según otro modo de ventajosa, la presente invención se refiere a un procedimiento de cribado o de detección de compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de patologías del sistema nervioso central que impliquen una muerte neuronal, comprendiendo las etapas que consisten en:
(i)
poner todo o parte de la proteína GRF1, en presencia de una proteína de la familia de las proteínas G pequeñas cargada en GDP o en GTP marcado y un compuesto que se vaya a ensayar,
(ii)
añadir respectivamente GTP o GDP no marcado
(iii)
medir la cantidad de proteína G marcada.
Una de dichas proteínas de la familia de las proteínas G pequeñas puede ser especialmente Ras (53, 54, 55), Rac (56, 57, 58) o Cdc42 (59).
La medición de la actividad de intercambio de la proteína GRF1 en las proteínas de la familia Ras o las proteínas Rac y CDC42 se puede realizar in vitro en un medio acelular por incubación en pozos de placas de microtitulación de una mezcla de reacción que comprenda a dichas proteínas G pequeñas en estado recombinante cargadas en GDP tritiado, GTP frío y todo o parte de la proteína GRF1 en estado recombinante. Se extrae una fracción alícuota de dicha mezcla de reacción y se filtra por una membrana y en que se mide la radioactividad que está retenida o incluso se hace pasar el contenido de cada uno de dichos pozos por una columna PD 10 y en que se mide la radioactividad del eluyente.
Dichas proteínas G pequeñas en estado recombinante se pueden elegir del grupo constituido por las proteínas Ras, Cdc42 o Rac salvajes o en forma de proteínas de fusión y expresadas en E. coli o en células de mamíferos, o en una forma etiquetada (tagged en inglés) en un baculovirus, expresadas en células de insectos y purificadas. La cantidad de los nucleótidos intercambiados también se puede poner de manifiesto por retención.
Ventajosamente se añaden proteínas de fusión GST-Raf (dominio RBD) o GST-PAK (dominio CRIB) y una mezcla de IgG anti-GST y proteína A PVT SPA (Análisis de Centelleo por Proximidad) acoplada a microesferas (Amersham) y en que se mide de la fluorescencia de dichas placas de microtitulación después de centrifugación. Las formas asociadas al GDP no permiten la interacción. Las secuencias de PAK y Raf han sido publicadas (véanse respectivamente las referencias 60 a 64 y 65 a 69).
Se incuba la proteína recombinante Ras (o Rac) con GDP frío. Se forma Ras-GDP (o Rac-GDP). Después se añade GTP tritiado y GRF1. Tiene lugar la reacción de intercambio. Se forma Ras-GTP tritiado. Al cabo de 60 minutos se añade una proteína de fusión GST-Raf (o GST-PAK si se trabaja con Rac). La proteína de fusión interreacciona con Ras-GTP cuya cantidad en el medio depende de la actividad de intercambio de GRF1. Se añaden las microesferas que están acopladas a un anticuerpo anti-GST. El complejo GST-Raf/Ras-GTP tritiado se fija en las esferas. Esta tiene la capacidad de centellear cuando están cerca de una fuente radioactiva. Permiten entonces cuantificar la proporción de Ras-GTP y la actividad de intercambio de GRF1 en el medio.
También se puede aplicar el procedimiento de cribado en un sistema celular.
Así se puede realizar poniendo en contacto los compuestos que se tienen que cribar y una levadura transformada por grf1 y cuyos genes CDC25 y/o CDC24 han sido inactivados o mutados. Ventajosamente, la membrana de una de dichas levaduras se permeabiliza previamente y/o al menos uno de los genes implicados en los mecanismos de destoxificación ha sido inactivado.
Se puede realizar también simplemente en una levadura S. cerevisiae transformada por grf1. Se mide entonces el cese de los trastornos metabólicos creados por la expresión de grf1.
El procedimiento de cribado también puede ser un sistema denominado de doble híbrido de interacción proteína-proteína que consta de una primera proteína híbrida constituida por una proteína de fusión entre Ras, CDC42Hs o Rac y un dominio de interacción con el ADN y una segunda proteína híbrida constituida por una proteína de fusión entre todo o parte de GRF1 y un dominio transactivador. También puede ser un sistema denominado "doble híbrido más uno" que consiste en expresar en el núcleo de una misma levadura S. cerevisiae o todo o parte de GRF1, PAK1 (dominio CRIB) fusionada con un dominio transactivador y o Rac o CDC42Hs fusionadas con un dominio de interacción con el ADN, o todo o parte de GRF1, c-Raf1 (RBD) fusionada con un dominio transactivador y Ras fusionada con un dominio de interacción con el ADN.
Finalmente, el cribado puede ser un cribado celular que comprenda las etapas que consisten en:
(i)
transinfectar células de mamíferos inmortalizadas por un vector que exprese un transgen gsf1 (todo o parte) y que confiera a dichas células el fenotipo transformado y una resistencia a un agente de selección.
(ii)
seleccionar dichas células transinfectadas y que expresen el transgen y clonarlas en un soporte de crecimiento en agar, la transformación por GRF1 que permite a las células crecer sin adherirse.
(iii)
añadir dichos compuestos que se vayan a ensayar a una suspensión de dichas células y
(iv)
detectar dichos compuestos inhibidores de GRF1 por disminución del número de clones obtenidos en el medio de crecimiento.
Como ya se ha mencionado, el objeto de la presente solicitud es la búsqueda de compuestos destinados a la fabricación de medicamentos para la prevención y/o el tratamiento de diversas patologías del sistema nervioso central (A) y de la obesidad (B). Debido al papel central de GRF1, también se pueden utilizar los procedimientos objeto de la presente solicitud para cribar moléculas que presenten una actividad en contra de ciertas enfermedades cardiovasculares (B), procesos angiogénicos patológicos (C), así como con respecto a otros blancos biológicos (D).
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A- Sistema nervioso central 1- Enfermedades neurodegenerativas agudas
La presente invención permite el cribado de compuestos que antagonizan el efecto de la actividad de GRF 1 y que confieren una protección contra la muerte neuronal inducida por isquemia cerebral, traumatismo craneal o cerebral y traumatismo espinal o medular.
2- Muerte neuronal y apoptosis
Los procedimientos objeto de la presente invención se pueden utilizar para cribar moléculas para el tratamiento o la prevención de la neurodegeneración que implica la apoptosis neuronal, la enfermedad de Parkinson, la enfermedad de Alzheimer, la demencia senil, corea de Huntington, esclerosis lateral amiotrófica, epilepsias, esclerosis en placas, trastornos cerebrales y espinocerebrales, trastornos cognitivos, traumatismo craneal, traumatismo medular, traumatismos del oído interno, traumatismos de la retina, glaucomas, tumores malignos del sistema nervioso.
3- Otros
Los procedimientos objeto de la presente invención se pueden utilizar para cribar moléculas para el tratamiento o la prevención de psicosis incluida esquizofrenia, trastornos de ansiedad, depresión, ataques de pánico, neuropatías periféricas, migraña, temblores, trastorno compulsivo-obsesivo, trastornos tímicos, discinesias tardías, trastornos bipolares, trastornos del movimiento inducido por medicamentos, distonías, choques endotoxémicos, choques hemorrágicos, hipotensión, insomnio, enfermedades inmunológicas, vómitos, trastornos del apetito (bulimia, anorexia), obesidad, trastornos de la memoria, en la retirada gradual de la medicación en tratamientos crónicos y abuso del alcohol o de medicamentos (opioides, barbitúricos, cannabis, cocaína, anfetamina, fenciclidina, halucinógenos, benzodiazepinas por ejemplo), como analgésicos o potenciadores de la actividad analgésica de medicamentos narcóticos y no narcóticos.
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B- Obesidad/enfermedades cardiovasculares
La presente invención permite la búsqueda de compuestos que antagonicen la actividad de GRF1 y que jueguen un papel protector contra el aumento de peso, principalmente en individuos adultos.
GRF1 intervendría en la regulación antes de la síntesis de leptina y esto de forma directa o indirecta. La leptina es una hormona conocida por inhibir la liberación de Neuropéptido-Y (NPY), molécula que estimula el apetito y es producida por las neuronas del núcleo arqueado del hipotálamo (20, 21). Controla igualmente la síntesis de un péptido anorexígeno: CART (Transcripción Regulada de Cocaína y Anfetamina) en el núcleo arqueado (22). Las actividades antagonistas de estos dos neuropéptidos tienen como consecuencia equilibrar los efectos de la señal de la leptina en la toma de alimentos. La leptina estimula igualmente el circuito anorexígeno alfa-MSH/Receptor de Melanocortina 4 (23-25).
GRF1 es susceptible de participar en las vías de señalización que utilizan estos neuromediadores (que se asocian a los receptores en siete dominios transmembrana). Su ausencia en nuestros ratones mutantes podría traducirse por una señal de tipo "saciedad y/o aumento del gasto energético" con, como consecuencia, una reducción de la masa adiposa y una hipoleptinemia.
C- Angiogénesis
El endotelio vascular se presenta como una nueva criba de la leptina. Resultados recientes demuestran que la leptina estimula la proliferación de las células endoteliales y la angiogénesis in vivo (26, 27).
La angiogénesis juega un papel importante en la embriogénesis, la cicatrización, el ciclo menstrual pero también en situaciones patológicas como la vascularización de tumores, artritis reumatoide, soriasis, sarcoma de Kaposi, retinopatías diabéticas y aterosclerosis.
Los presentes autores han demostrado que los ratones adultos knock-out por el gen grf1 tienen un índice de leptina bastante más bajo que el de los animales de control. Es posible que los animales mutantes presenten una cierta forma de protección contra la aparición de procesos angiogénicos patológicos y por consiguiente contra el crecimiento y la diseminación de tumores y contra todas las patologías precitadas.
Los antagonistas de GRF1 que conducirían a una disminución de la leptinemia podrían tener un papel protector contra estas enfermedades. También se puede considerar un papel contraceptivo.
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D- Otras cribas biológicas
La leptina está implicada en el desencadenamiento de la pubertad y el control de la reproducción (28-32).
La leptina juega igualmente un papel en la regulación de la respuesta inmunitaria regulada por los linfocitos T (33).
Los moduladores de la actividad de GRF1 podrían tener un efecto en la función inmunitaria y los mecanismos de la reproducción. Esta última hipótesis parece verificarse por otra parte, puesto que las observaciones de los presentes autores indican una pubertad retardada y una menopausia precoz en los ratones grf1 KO. Este fenómeno puede ser debido en parte a la disminución del índice de leptina o a la desregulación de la síntesis de hormonas sexuales controladas por el eje hipotálamo-hipofisario.
Las propiedades inhibidoras de la leptina con respecto a la síntesis ósea se han puesto de manifiesto recientemente. Reacciona inhibiendo la actividad de los osteoblastos, una población de células responsables de la formación del hueso (34). Modificar la leptinemia reaccionando en GRF1 podría permitir tratar las enfermedades asociadas con una disminución de la densidad ósea como por ejemplo la osteoporosis o a la inversa células asociadas a una calcificación importante como por ejemplo la osteopetrosis.
Los trabajos realizados en ratones knock-out por el gen NPY han demostrado que estos animales manifestaron un gusto pronunciado por el alcohol y eran más resistentes a sus efectos sedantes e hinópticos que los ratones salvajes (35). La leptina juega un papel negativo en la liberación de NPY (20, 21). Los moduladores de la actividad de GRF1 se podrían utilizar en el tratamiento del comportamiento alcohólico y en el tratamiento de trastornos del
sueño.
Otros objetos, características y ventajas complementarias se van a describir a continuación con referencia a los ejemplos de realización que siguen, dados a título puramente ilustrativo y no limitante y en referencia a los dibujos adjuntos en los que:
- la Figura 1A es una representación esquemática de la proteína GRF1,
- la Figura 1B es un esquema que reagrupa las principales vías de señalización que implican la función de la proteína GRF1,
- las Figuras 2A y 2B son histogramas que representan exámenes neurológicos,
- las Figuras 3A a 3B son histogramas que ilustran la extensión de lesiones cerebrales respectivamente globales y de córtex,
- la figura 3C ilustra lesiones de diferentes zonas de la región cortical,
- la figura 3D ilustra el volumen de las lesiones de la región cortical comprendido entre 3, 22 y 1,76.
- las Figuras 4A y 4B ilustran respectivamente el peso y la leptinemia de ratones mutantes grf1 KO (señalados -/-) y salvajes (señalados +/+) y
- las Figuras 5A y 5B ilustran respectivamente el peso y la leptinemia de ratones mutantes KO grf1 y salvajes después de un ayuno de 48 h.
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Ejemplos
Ejemplo 1
Utilización de ratones portadores de una mutación inactivante del gen grf1 (ratón denominado "knock-out grf1" o "KO grf1") como modelo de estudio de la protección contra la muerte neuronal inducida por isquemia cerebral
Los ratones KO grf1 ofrecen la posibilidad de buscar el impacto de las vías dependientes de la proteína GRF1 en la isquemia cerebral. Los ratones KO y de tipo salvaje son sometidos a una isquemia cerebral focal permanente. Los parámetros medidos para determinar la incidencia de GRF1 en el dominio isquémico resultan (i) de un examen de la función neurológica y (ii) de una cuantificación histológica de las lesiones cerebrales.
1.1: Modelo de isquemia cerebral focal permanente
Se utilizan ratones macho de 22-37 g procedentes de los fondos genéticos C57B1/6 y 129SV anestesiados con halotano al 1,4% en una mezcla de óxido nitroso-oxígeno (70: 30). Se realiza una incisión entre el ojo y la oreja derecha. Se reclina el músculo temporal. Se realiza una craniotomía al nivel del hueso temporal, que permite acceder a la arteria cerebral media. Esta se cauteriza por electrocoagulación. Se provoca entonces una isquemia cerebral focal permanente por oclusión de la arteria cerebral media derecha (MCA.O, (36)). Durante la cirugía, tanto la temperatura del músculo temporal como la temperatura corporal se mantienen en normotermia. La incisión se sutura a continuación y se devuelven los animales a sus jaulas en una habitación calentada a 24-26ºC.
Se dividen los ratones en grupos como sigue:
Ratones deficientes para la expresión de GRF1 (ratones KO): mutantes C57B1/6 (n = 10), mutantes 129SV (n = 21).
Los ratones de tipo salvaje utilizados como muestras son controles C57B1/6 (n = 10) y controles 129 SV (n = 20).
1.2: Examen neurológico
Para el examen neurológico se procede como sigue:
Antes de isquemia, después 1 h y 24 h después de isquemia, se realiza un examen neurológico, inicialmente descrito en ratas (37) y ligeramente modificado por los presentes autores. Durante el examen se señalan diferentes unidades: 0 (normal), 1 (flexión de la pata anterior), 2 (movimiento circular), 3 (flexión de la pata anterior y torsión del tórax), 4 (pérdida de reflejos de recuperación).
Como se puede constatar en las Figuras 2A y 2B, todos los ratones revelan un déficit neurológico significativo, por comparación con su propia evaluación de preisquemia neuronal, 1 h y 24 h post-MCA.O. En los ratones C57B1/6, no se observa ninguna diferencia entre los ratones de tipo salvaje y los ratones KO en el conjunto de puntos examinados en el transcurso del tiempo. Al contrario, comparado con los ratones de tipo salvaje, los ratones 129SV-KO presentan un déficit netamente menos pronunciado 1 h (p<0,01) y 24 h (p<0,05) post-isquemia.
1.3: Lesión cerebral
Se procede como sigue: Después de la notación de su "neurovaloración", se sacrifican los ratones y se extraen los cerebros rápidamente y se congelan en isopentano líquido a - 30ºC. Las secciones coronales de 40 \mum de espesor se acoplan a diferentes niveles estereotáxicos con un criostato y se colorean a continuación con violeta de cresilo al 0,5%. Se miden las zonas de lesión con un analizador de imagen (Leica Q500) a diferentes niveles coronales. Se calcula a continuación el volumen de las lesiones cerebrales por integración de las superficies.
En los ratones C57B1/6, no se observa una diferencia significativa entre los ratones de tipo salvaje y los ratones KO (resultados no ilustrados).
Como se puede constatar en las Figuras 3A a 3B, en los ratones 129SV, no se observa una reducción significativa global o cortical de la lesión cerebral.
Sin embargo, se observan reducciones significativas de las zonas de lesión en ciertos niveles estereotáxicos (fig 3C), correspondiendo este resultado a una reducción del 23% (p<0,05) de la lesión en esta región específica (fig 3D).
Los resultados descritos en el Ejemplo 1 anterior muestran que la ausencia del gen grf1 tiene como consecuencia una mejor recuperación funcional en los ratones isquémicos KO-129SV.
La reducción de las lesiones en los niveles coronales específicos podría corresponder a las estructuras implicadas en las funciones motrices y sensori-motrices examinadas (especialmente el neocórtex y el cerebelo), en las que el gen grf1 podría estar fuertemente expresado (12). Por el contrario, no se observa efecto en los ratones de fondo genético C57B1/6.
La inactivación del gen grf1 podría interrumpir una de las vías de señalización que conduce a la apoptosis. Dicho de otro modo, los resultados señalados anteriormente sugieren que la proteína GRF1 participa en la señalización que conduce a la apoptosis neuronal interviniendo en la vía de activación de las cinasas del estrés por activación de una o varias de las proteínas G pequeñas de la familia de las proteínas Rho, Rac y Cdc42. Se ha descrito por otra parte la actividad de GRF1 en la proteína Rac (2).
En resumen, la proteína GRF1 podría activar en parte una vía apoptótica responsable de la vulnerabilidad a la isquemia. Estos resultados sugieren además que la proteína GRF1 misma podría representar un blanco en particular para trastornos neurodegenerativos agudos.
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Ejemplo 2
Utilización de ratones portadores de una mutación inactivante del gen grf1 (ratón denominado "knock-out grf1" o "grf1 KO") como modelo de estudio de la protección contra la obesidad 2.1: Obesidad
Los ratones salvajes de edades 10-12 meses, alimentados desde el destete con una alimentación destinada a la cría, rica en proteínas (22%) y en materias grasas (7%) (ref: D03, Código: R0310. Proveedor: UAR, Francia), presentan una masa adiposa importante entre la piel y la túnica muscular abdominal, así como en la cavidad abdominal, principalmente alrededor de los pliegues uterinos en las hembras y en el peritoneo. La presencia de grasa alrededor del corazón se encuentra igualmente en los individuos más gordos que se pueden calificar como obesos y cuyo peso sobrepasa 35 gramos en las hembras y 40 gramos en los machos.
En las mismas condiciones de cría y de nutrición, los ratones portadores de la mutación inactivante para el gen grf1 de un año de edad y más no presentan ninguna de las características que describa la obesidad. La mayoría de ellos no tiene tejido adiposo entre la piel y la pared abdominal. En las hembras, el depósito de grasa alrededor de los pliegues uterinos es muy débil y comparable en cantidad al de los animales salvajes de 6-8 semanas. Los ratones grf1 KO adultos se caracterizan aún por la ausencia de grasa en el peritoneo y alrededor del corazón.
Se observa que la inactivación del gen grf1 en ratones adultos, se traduce en una protección contra el aumento de peso y la acumulación de tejido adiposo.
2.2: Leptinemia
Para correlacionar las observaciones hechas en los ratones grf1 KO y salvajes con las características conocidas del fenotipo obeso, hemos administrado la dosis de leptina plasmática de ratones salvajes y mutantes.
La leptina es una citocina que tiene por efecto disminuir la ingesta de alimento y aumentar el gasto energético. Existe una relación de proporcionalidad entre por una parte, el número de adipocitos - que segregan leptina - y el tamaño de las vesículas lipídicas que contienen y por otra parte, la concentración plasmática de esta hormona (20).
Los presentes autores han determinado el peso y la leptinemia de ratones macho y hembra salvajes o mutantes (KO) por el gen grf1, de un año de edad. El grupo de animales estudiados está constituido por diversas hermandades. Cada hermandad está compuesta por animales salvajes y mutantes.
Las muestras sanguíneas han sido extraídas durante la eutanasia de los animales por decapitación.
La dosificación de la leptina plasmática se ha realizado utilizando un radioinmunoensayo (RIA) fabricado por la compañía Linco, en forma de estuche (ref: ML-82K) que es comercializado en Francia por la compañía Clinisciences.
Como se puede observar en las Figuras 4A y 4B en los ratones mutantes (señalados -/-), la proporción plasmática en leptina es muy baja comparado con la de los ratones salvajes de muestras de la misma edad (señalados +/+). Si nos remitimos a la bibliografía, la leptinemia de los ratones grf1 knock-out de más de 12 meses de edad y comparada con la de ratones muy jóvenes de 6-8 semanas (5 a 10 ng/ml). El examen comparativo del perfil de estos animales abunda en este sentido.
Si se pone en ayunas a los animales durante 48 h (Figuras 5A y 5B), sigue una disminución del peso corporal acompañado en los animales de control, por una disminución importante de la concentración plasmática en leptina, mientras que en los animales KO la disminución de la leptinemia es muy pequeña. Este último resultado sugiere que en los animales KO, la proporción en leptina ya está en un umbral mínimo que no se puede modular más que débilmente en respuesta a un ayuno prolongado.
Las primeras mediciones del consumo de alimentos en ratones mutantes indican que la toma de alimento se reduce con respecto a los controles. Sin embargo si se reduce la cantidad de alimento absorbido al peso de los animales no hay diferencia significativa entre los KO y los salvajes.
Se tiene que observar que si el fenotipo de los ratones mutantes tiene por origen un aumento del gasto energético, esto último no aparece debido a una hiperactividad de los ratones grf1 KO.
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Ejemplo 3
Utilización de la proteína GRF1 para la realización de cribas de compuestos por medición de la fosforilación en serinas/treoninas o en tirosinas de la proteína GRF1
Esta experiencia se realiza en células en cultivo.
La inducción de la fosforilación de GRF1 se induce en estas células en cultivo de diferentes maneras.
Se utilizan tres protocolos:
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1) Marcado radioactivo e inmunoprecipitación de la proteína GRF1
Se hacen estos diferentes tratamientos en presencia y en ausencia de moléculas para cribar, en medio de cultivo que contiene el ortofosfato marcado con P32 o con P33 (200 \muCi a 1 mCi/caja de Petri de 10 mm). La lisis de células se hace en frío en un tampón HNTG (Hepes 20 mM pH 7,5; NaCl 150 mM; Tritón al 0,1%; Glicerol al 10%, en presencia de inhibidores de proteasas y de fosfatasas: Na3VO4 1 mM, Aprotinina 2,2 \mug/ml, Leupeptina 1 \mug/ml, Antipaína 1 \mug/ml, Benzamidina 10 \mug/ml, 1 \mug/ml de inhibidor de tripsina de soja, Quimostatina 1 \mug/ml, Pepstatina-A 1 \mug/ml) o RIPA (Tris 50 mM, pH 8,0; NaCl 150 mM; NP-40 al 1%, Desoxicolato de Na al 0,5%; SDS al 0,1%; Na3VO4 1 mM; fluoruro de fenilmetilsulfonilo (PMSF) 100 \muM, Aprotinina 25 \mug/ml, Leupeptina 25 \mug/ml). La proteína GRF1 se inmunoprecipita a continuación con ayuda de anticuerpos anti-GRF1 o anti-tag (10), (epítopo reconocido por un anticuerpo monoclonal y que permite la detección o inmunoprecipitación de la proteína etiquetada (tagged en inglés) como FLAG, myc o hemaglutinina (HA)) y se separa el inmunoprecipitado en un gel SDS-poliacrilamida al 4-20%. La cuantificación de la radioactividad de la banda que corresponde a la proteína GRF1 (140 kDa) se realiza con ayuda de un detector de radiación de tipo PhosphoreImager. La eficacia de una molécula se calcula por el porcentaje de inhibición de la fosforilación de la proteína GRF1 considerando el valor encontrado para las células no estimuladas como el valor 0% y el valor encontrado para las células estimuladas en ausencia de la molécula cribada como el valor 100%.
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2) Marcado radioactivo y retención de la proteína GPF1 en placas CYTOSTAR
Una primera alternativa a este método consiste en incubar el lisado celular obtenido anteriormente en pozos de placas CYTOSTAR (comercializadas por la compañía Amersham) recubierto previamente con un anticuerpo anti-GRF1 o anti-tag con el fin de retener la proteína GRF1. Después de aclarados, se obtiene la cuantificación de la señal radioactiva con ayuda de un contador de centelleo.
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3) Cuantificación por E.L.I.S.A
Una segunda alternativa a este método consiste en tratar las células como anteriormente pero en ausencia de ortofosfato marcado. Los lisados celulares se utilizan entonces según el método de dosificación E.L.I.S.A. Para esta dosificación, los pozos de las placas se recubren con un anticuerpo anti-GRF1 o anti-tag y la fosforilación de GRF1 es revelada y cuantificada por un segundo anticuerpo marcado (radioelemento, fluorescencia, enzima, etc) o no, que puede ser o un anti-fosfotirosina o un anti-fosfoserina/fosfotreonina. En el caso en que no esté marcado el segundo anticuerpo, el revelado y la cuantificación se hacen con ayuda de un tercer anticuerpo anti-especie dirigido contra el segundo y marcado. Después de aclarado, la cuantificación de la señal se hace con ayuda de un contador de radioactividad, de un espectrofotómetro de fluorescencia o por la medición de una actividad enzimática, que de lugar a una lectura de densidad óptica por espectrofotometría (lectores de placas).
Las células en cultivo, pueden ser:
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cultivos primarios de células neuronales, mantenidas 10 días en cultivo para permitir la expresión de la proteína GRF1 endógena
\sqbullet
líneas celulares en cultivo de todo origen tisular transinfectadas con un vector que permita la expresión de la proteína GRF1 (murina o humana), total y eventualmente etiquetada (tagged en inglés). Se puede utilizar todo vector plasmídico o viral que permita la expresión de cADNs heterólogos en células de mamíferos.
La fosforilación de la proteína GRF1 en las células en cultivo se obtiene en las células neuronales, por adición de 100 \muM de Carbacol (5 a 30 minutos) en el medio de cultivo de las neuronas.
\newpage
Para las células no neuronales transinfectadas por el cADN codificante para GRF1, se estudia la fosforilación de la proteína de interés en las siguientes condiciones:
\sqbullet
o las células transinfectadas carecen de suero durante la noche, después se vuelven a incubar en presencia de suero fetal bovino al 10%,
\sqbullet
o las células se cotransinfectan por el cADNs codificante para las subunidades beta-gamma de las proteínas G triméricas \beta1\gamma2 o \beta1\gamma5. Los vectores de expresión son los plásmidos que permiten la expresión en las células eucariotas bajo el control de activadores del tipo CMV o SV40 (ejemplos pSV2 o bien pCDNA3 (INVITROGEN)). Los cADNs codificantes para las proteínas de interés se insertan después de la multiplicación de los fragmentos por PCR, verificación de la secuencia y subclonación de los fragmentos en los múltiples sitios de clonación presentes en los vectores. Las células están desprovistas de suero durante la noche, después se vuelven a incubar en presencia de suero.
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Ejemplo 4
Utilización de la proteína GRF1 para la realización de cribas de compuestos por medición de la actividad de intercambio en la proteína Ras o las proteínas Rac o Cdc42 en presencia de GRF1
Estas actividades se pueden medir en sistemas acelulares (utilización de proteínas recombinantes) o en sistemas celulares.
1) Medición en sistemas acelulares
Las proteínas Ras, Rac o Cdc42 recombinantes en la concentración final 0,5 \muM, se incuban en presencia de 3H-GDP (0,5 \muM final, NEN 111 \mumoles, 9 Ci/mmoles) en el tampón de intercambio (tris-HCl 50 mM, pH 7,5; MgCl2 1 mM, ditiotreitol 10 mM, AEDT 1 mM, 1 mg/ml de suero de albúmina bovino) durante 30 minutos a 30ºC, después conservadas en hielo. Se añade a continuación MgCl2 para tener una concentración final de 10 mM para bloquear la reacción de intercambio después se extraen 50 \mul de cada incubación (Ras/Rac/Cdc42 ligado al GDP tritiado) que se distribuyen en uno de los 96 pozos de una microplaca.
La reacción de intercambio se inicia con la adición a los pozos de 10 \mul de GTP frío 10 mM (0,1 mM final), de la proteína GRF1 recombinante (todo o partes) y de las moléculas que se vayan a ensayar.
Después de una incubación de 60 minutos a 30ºC, se extrae una alíquota de 40 \mul y se filtra en una membrana de nitrocelulosa de 0,45 \mum (placa de 96 pozos de fondos recubiertos de una membrana de filtración que puede retener las proteínas, Sartorius SM 11306). El recuento de la radioactividad (GDP tritiado ligado a la proteína G pequeña) se efectúa en un contador por centelleo, en presencia de líquido que centellea. En este caso, se recuenta la radioactividad en la membrana de filtración de nailon.
Una alternativa a la reacción de filtración consiste en hacer pasar, después de incubación, el contenido de cada pozo en una columna PD10 equilibrada previamente con el tampón de elución (Tris-HCl 50 mM, pH 7,5; MgCl2 5 mM, PMSF 1 mM, DTT 5 mM y AEDT 1 mM). En este caso, se mide la radioactividad del eluyente de la columna (se hacen pasar 4 ml de tampón de elución por la columna + 10 ml de líquido de centelleo ReadyGel Beckman).
En los dos casos, la actividad de intercambio se mide por la diferencia de cantidad de radioactividad en presencia de proteína GRF1 comparado con la obtenida en un ensayo sin proteína GRF1. La eficacia de una molécula se calcula por la inhibición de esta actividad de intercambio.
Las proteínas Ras, Rac o Cdc42 recombinantes pueden ser las proteínas Ras, Cdc42 o Rac salvajes de diferentes orígenes (humano, murinas,..) expresadas:
bien en forma de proteínas de fusión (GST, sistema pGEX-1\lambdaT o -2T, Producto Pharmacia) en E. coli (según el protocolo descrito por el fabricante y después de la transformación de los plásmidos en las bacterias BL21. La expresión de las proteínas se induce durante 4 horas con IPTG (isopropil-1-tio-beta-D-galactósido) 0,5 mM, a 30ºC) o en células de mamíferos (pBCGST, (38)) en las células CHO transinfectadas por los plásmidos. La expresión se obtiene a 37ºC en una estufa de CO2 al 5%, durante la noche. Las proteínas se purifican en columna de afinidad de glutatión según los protocolos proporcionados por Pharmacia (Biotech (GST-Gene Fusion system). Estas proteínas de fusión pueden ser o no divididas por digestión en trombina con el fin de suprimir su dominio GST.
bien en una forma etiquetada (tagged en inglés) (pBlueBacHis2, Produit Invitrogen) en baculovirus, expresada en células de insectos (Sf9, Sf21, High Five,...) después de la infección de las células por un baculovirus recombinante obtenido según los procedimientos recomendados por el vendedor. La expresión se hace a 27ºC, en dos a cuatro días y se purifican las proteínas a continuación en columna de níquel.
Las proteínas GRF1 recombinantes pueden ser la totalidad o fracciones de proteínas GRF1 de diferentes orígenes (humano, murina,..) que contengan los dominios de intercambio bien CDC25, bien DH, bien los dos, expresadas en baculovirus o en E. coli y purificadas en columna de afinidad.
Una variante de la técnica anterior consiste en utilizar la capacidad bien de Ras-GTP para unirse a Raf-1 por el dominio "dominio de Unión a Ras" de Raf (RBD), bien de Racl-GTP o Cdc42-GTP para unirse a PAK1 por el dominio CRIB de esta última (39). El sistema SPA ("Análisis de Centelleo por Proximidad"), descrito en la patente de EE.UU. 4 568 649, la patente europea EP 154 734 y la patente japonesa JP 84/52452, permite poner de manifiesto y cuantificar el enlace entre dos proteínas en una criba a flujo alto.
Las proteínas Ras, CDC42 o Rac recombinantes - en esta experiencia, las G pequeñas serán divididas de su dominio GST o bien expresadas con otra etiqueta (tag en inglés) por ejemplo, cola de His,...- en la concentración final 0,5 \muM, se incuban en presencia de GDP frío en el tampón de intercambio (Tris-HCl 50 mM, pH 7,5; MgCl2 1 mM, ditiotreitol 10 mM, AEDT 1 mM, 1 mg/ml de suero de albúmina bovina) durante 30 minutos, a 30ºC, se conservan después en hielo. Las siguientes etapas consisten en añadir MgCl2 hasta una concentración final de 10 mM para bloquear la reacción de intercambio, después se extraen 50 \mul de cada incubación y se distribuyen en uno de los 96 pozos de una microplaca.
La reacción de intercambio se inicia con la adición a los pozos de 10 \mul de GTP tritiado (NEN 111 \mumoles, 9 Ci/mmoles), de la proteína GRF1 recombinante y de las moléculas que se vayan a ensayar.
Después de una incubación de 60 minutos a 30ºC, añadir 80 \mul de proteínas GST-Raf (dominio RBD) o GST-PAK (dominio CRIB) en la concentración de 0,0013 mg/ml en un tampón Tris-HCl 50 mM, pH 7,5; ditiotreitol 2 mM y 40 \mul de una mezcla de inmunoglobulina anti-GST (0,12 mg/ml) y de proteína A PVT SPA acoplada a microesferas (Amersham; 12,6 mg/ml) en un tampón Tris-HCl 50 mM, pH 7,5; ditiotreitol 2 mM, MgCl2 2 mM. Las placas se precintan a continuación, se agitan 1 h a 22ºC, después se centrifugan a 760 g durante 2 minutos y se cuentan en un contador de centelleo.
La eficacia de la molécula se calcula por el porcentaje de inhibición de la actividad de intercambio y es igual a: 100 x (1 - (valor en presencia de GRF1 y de la molécula - muestra en ausencia de GRF1 y de la molécula)/(valor en presencia de GRF1 y en ausencia de la molécula - muestra en ausencia de GRF1 y de la molécula)).
2) Medición en sistemas celulares (levadura)
Son posibles diferentes posibilidades. Utilizan bien los sistemas de enriquecimiento de la levadura (Saccharomyces cerevisiae), bien sistemas de competición que produzcan un trastorno fisiológico, bien el sistema doble-híbrido. Todas las técnicas y los métodos que utilizan la levadura se describen extensamente en la bibliografía (40-45).
Es posible la utilización de uno u otro de estos sistemas por la existencia en la levadura de parejas de proteína G de peso molecular/factor de intercambio pequeño, homólogos a los descritos en las células de mamíferos. En cuanto a las proteínas G, las proteínas RAS de levadura son homólogas a las proteínas Ras de mamíferos (éstas últimas complementan en la levadura las mutaciones inactivantes de las proteínas RAS) y la proteína CDC42 S.c. es homóloga a las proteínas Rac de mamíferos. En cuanto a los factores de intercambio, CDC25 y SDC25 son homólogas a GRF1 y sus partes catalíticas son activas en las proteínas Ras de mamíferos (46, 47). GRF1, por su dominio homólogo a CDC25, es capaz de complementar toda mutación inactivante de CDC25 o bien de un doble mutante CDC25/SDC25 (los mutantes o KO SDC25 no teniendo fenotipo). También se conoce para CDC42 S.c. un factor de intercambio denominado CDC24 que se puede complementar por el dominio DH de Vav (48). Se puede extrapolar una actividad de intercambio de todo o parte (incluyendo el dominio DH) de GRF1 en CDC42 en una levadura mutante para CDC24, teniendo estas mutaciones inactivantes un fenotipo letal. Esta actividad de GRF1 (todo o parte) imitará total o parcialmente (según su afinidad) el efecto de CDC24.
2.1 Enriquecimiento en la levadura
En este sistema, GRF1 (todo o partes) es capaz de imitar la función de los factores de intercambio de la levadura (CDC25, CDC24) cuando estos son inactivados por una mutación que conduce a un fenotipo del tipo interrupción del crecimiento. Esta enriquecimiento tiene por efecto permitir la supervivencia de la levadura restaurando el crecimiento. Una molécula que inhiba la función de GRF 1 (proteína entera, dominio CDC25, dominio DH) en las proteínas RAS o CDC42, en un contexto CDC25 o CDC24 inactivados (mutaciones termosensibles) conduce a la pérdida del fenómeno de enriquecimiento y a la muerte de la célula a temperatura permisiva. La especificidad del modo de acción de la molécula en el sistema RAS/dominio CDC25 o CDC42/dominio DH se verificará por la medición de la acción de la molécula en una levadura salvaje (información sobre la actividad antifúngica).
El cribado se hará para las moléculas pequeñas en una levadura permeabilizada por técnicas conocidas por el experto en la materia, que consiste en extraer la concentración intracelular de las moléculas jugando con la permeabilidad de la membrana y la expresión de genes implicados en los procesos de destoxificación (por ejemplo utilizando mutantes del gen Erg6 y/o de los genes de la familia PDR) Estas técnicas, denominadas de permeabilización, se describen en las solicitudes de patente siguientes: patente francesa FR 9411509 y patente internacional WO 96/1082.
Cepas de levaduras utilizadas
Se utiliza una cepa del género S. cerevisiae, CDC25 TS o CDC24 TS (mutaciones termosensibles). No puede crecer más que en condiciones de temperatura permisiva. Se cultiva en el medio de cultivo siguiente:
Medio YNB mínimo:- Base Nitrogenada de Levadura (sin aminoácidos) (6,7 g/l) (Difco)
-
Glucosa (20 g/l) (Merck)
Se puede volver sólido este medio por adición de 20 g/l de agar (Difco).
Para permitir el crecimiento de levaduras auxótrofas en este medio, es necesario añadir los aminoácidos o las bases nitrogenadas, de las que dependen a 50 mg/ml. Se añaden 100 \mug/ml de ampicilina al medio para evitar contaminaciones bacterianas.
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Construcción y multiplicación de plásmidos
La cepa TG1 de Escherichia coli, genotipo supE, hsd\Delta5, thi, \Delta(lac-proAB), F'[tra D36 pro A+B+ lacIq lacZ\DeltaM15], se emplea para la construcción de plásmidos y para la multiplicación y el aislamiento de plásmidos. Se cultiva en el medio siguiente:
Medio LB: - NaCl (5 g/l) (Sigma)
-
Bactotriptona (10 g/l) (Difco)
-
Extracto de Levadura (5 g/l) (Difco)
Se puede volver sólido este medio por adición de 20 g/l de agar (Difco).
Se utiliza ampicilina, a 100 \mug/ml, para seleccionar las bacterias que hayan recibido los plásmidos que portan como marcador el gen de resistencia a este antibiótico.
Las preparaciones en pequeñas cantidades y en grandes cantidades de ADN plasmídico se efectúan según los protocolos recomendados por el fabricante Quiagen de los estuches de purificación de ADN:
-
estuche Quiaprep Spin Miniprep, ref: 27106
-
estuche Quiaprep Plasmid Maxiprep, ref: 12163.
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Transformación de la levadura por un plásmido
Se hacen competentes las levaduras por un tratamiento al LiAC/PEG según el método descrito por Gietz et al, (49) y transformadas por 1 \mug de plásmido que permita la expresión constitutiva o inducible de todo o parte de GRF1 en la levadura. Después de las etapas de transformación, se vuelven a poner las levaduras en cultivo en condiciones no permisivas Los clones seleccionados serán los que habrán sido enriquecidos por GRF1.
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Cribado de moléculas
Se extiende un clon seleccionado enriquecido por GRF1 en cajas que contienen el medio de selección en el que se aplican gotas de compuestos químicos. Se ponen las cajas en condiciones permisivas. Los productos que dan un halo de inhibición del crecimiento de la levadura, son retenidos y ensayados en una levadura salvaje de control para eliminar las moléculas con actividad antifúngica que den el mismo tipo de inhibición del crecimiento.
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2.2 Competición con los GEFs de levadura (dos variantes) a- Activaciones constitutivas/efecto dominante positivo
En este sistema, la expresión de GRF1 todo o parte, en la levadura se acompaña de una perturbación del crecimiento debido a la estimulación constitutiva del intercambio en las proteínas RAS o CDC42. Una molécula activa en el sistema conducirá a una normalización más o menos perfecta del trastorno fisiológico (fenotipo) engendrado por la expresión de GRF 1.
Cepas utilizadas
Se utiliza una cepa de levadura salvaje del género S. cerevisiae. Se cultiva en el medio YNB mínimo como se describe en 2.1. La construcción y la multiplicación de plásmidos se efectúa como se describe en 2.1.
En el ejemplo descrito a continuación, la expresión de GRF1 conduce a la superactivación de RAS de levadura. Dichas levaduras ya no serán entonces capaces de fabricar reservas de glicógenos cuando alcancen la fase de crecimiento preestacionario. Se identificarán por la ausencia de coloración marrón después de exposición a vapores de iodo.
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Cribado de moléculas
El cribado se hará en una levadura permeabilizada según las técnicas descritas anteriormente.
Se aplican gotas de compuestos químicos directamente en la superficie de cajas de cultivo previamente sembradas con una levadura que exprese GRF1, todo o parte. Se ponen a cultivar las cajas, después se exponen a vapores de iodo en un recinto cerrado que contiene cristales de iodo. Los productos que permiten el crecimiento de la levadura y que restauran la aparición de la coloración marrón, se retendrán como positivos.
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b- Inhibiciones constitutivas/efecto dominante negativo
Se puede igualmente considerar que la expresión de GRF1, todo o parte, se incluye en la levadura como un dominante negativo, inhibe la actividad de las proteínas de la levadura CDC25 o CDC24 y provoca un trastorno fisiológico del tipo interrupción del crecimiento, que será parado total o parcialmente por las moléculas activas en el sistema.
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Cepas utilizadas
Se utiliza una cepa salvaje del género S. cerevisiae. Se cultiva en el medio YNB mínimo como se describe en 2.1. La construcción y la multiplicación de plásmidos se efectúa como se describe en 2.1.
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Transformación de la levadura por un plásmido
Se hace competente la levadura salvaje por un tratamiento al LiAC/PEG según el método descrito por Gietz et al, (49) y es transformada por 1 \mug de plásmido que permita la expresión inducible de todo o parte de GRF1 en la levadura (ejemplo: la expresión del gen grf1 se pone bajo el control del activador del gen Gal 4 que es inducible en presencia de galactosa como única fuente de carbono en el medio de cultivo).
En el ejemplo descrito a continuación y en las condiciones de inducción, la expresión de GRF1 conduce a la perturbación de la señalización celular que utiliza las proteínas RAS en la levadura y se traduce por un fenotipo de tipo interrupción del crecimiento.
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Cribado de moléculas
El cribado se hará en una levadura permeabilizada según las técnicas descritas anteriormente.
Se aplican gotas de compuestos químicos directamente a la superficie de cajas de cultivo sembradas con una levadura transformada por el plásmido de expresión inducible de GRF1, pero previamente cultivada en ausencia de agente inductor. Se ponen las cajas a incubar en condiciones que permitan la expresión de GRF1. Los productos que permiten el crecimiento de la levadura serán retenidos como positivos.
Se puede considerar realizar estos sistemas de competición en las levaduras mutantes (mutantes termosensibles) por RAS (RAS mut TS) enriquecidas con un Ras de mamífero o CDC42 mut TS enriquecidas por Rac de mamífero.
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2.3 - Sistemas doble-híbrido y doble-híbrido inverso/interacción proteína-proteína
1a aplicación:
La utilización de este sistema permite realizar una criba en las moléculas que pueden inhibir la interacción física entre Ras o Rac/CDC42Hs y GRF1 (50, 2).
La técnica descansa en la realización de una primera proteína de fusión entre Ras, CDC42Hs o Rac y un dominio de interacción con el ADN y una segunda proteína de fusión entre GRF1 (todo o los dominios de tipo CDC25 o DH) y un dominio transactivador. La interacción entre las dos proteínas híbridas conduce a la activación de un gen informador (HIS3, LEU2, URA3, CYH2, CAN1, LacZ, GFP, etc.). Se utiliza el sistema en la levadura apropiada (ej: mutante ura3 si el gen transportador es URA3).
Ejemplo de un sistema doble-híbrido inverso para la criba de moléculas (51): La cepa de levadura CL9 se utiliza como herramienta de cribado de moléculas que interfieren en el sistema doble-híbrido. Permite poner de manifiesto la interacción proteína-proteína. Se puede hacer permeable por introducción de mutaciones en la familia de los genes PDR y del gen ERG6 implicado en los procesos de destoxificación.
Se cultiva en el medio YNB mínimo.
La cepa TG1 de Escherichia coli, genotipo supE, hsd\Delta5, thi, \Delta(lac-proAB), F'[tra D36 pro A+B+ lacIq lacZ\DeltaM15], se emplea para la construcción de plásmidos y para la multiplicación y el aislamiento de plásmidos.
Los plásmidos aplicados son los siguientes:
El vector pGAD10, proporcionado por Clontech® permite la expresión en la levadura de una proteína de fusión entre GRF1, todo o partes y el dominio transactivador de GAL4 (proteína GRF1-TA).
El vector pGBT9, proporcionado por Clontech® permite la expresión en la levadura de una proteína de fusión entre Ras, Rac o Cdc42 y el dominio de interacción con el ADN de GAL4 (proteínas Ras-BD o Rac-BD o Cdc42-BD). Comentario: de manera ventajosa, el dominio carboxi-terminal de farnesilación de Ras o de geranil-geranilación de las proteínas Rac y Cdc42, se eliminan de la construcción. Lo que permite obtener proteínas que no se enganchen a las membranas lipídicas y que entren eficazmente en el núcleo de las células.
Transformación de la levadura por un plásmido
La levadura CL9 se hace competente por un tratamiento al LiAC/PEG según el método descrito por Gietz et al, (49). Se transforma a continuación por 1 \mug de cada plásmido permitiendo la expresión de las proteínas de fusión que componen el sistema doble-híbrido. La expresión de éstas conduce a una sensibilidad de la cepa a la cicloheximida.
Un producto que interfiere con la interacción entre las proteínas de fusión del sistema doble-híbrido permitirá el crecimiento de la levadura en este tipo de medio. Para hacer un cribado, se extiende la levadura en la superficie de un medio selectivo que contenga 10 \mug/ml de cicloheximida. Se aplican gotas de compuestos químicos directamente en la superficie de la caja. Los productos seleccionados son los que dan una aureola de crecimiento alrededor del depósito.
El cribado se hará en una levadura permeabilizada según las técnicas descritas anteriormente.
El cribado se hará en una levadura permeabilizada según las técnicas descritas anteriormente.
En otro sistema la inhibición de la intercalación proteína-proteína por moléculas activas se puede revelar por la disminución de la expresión de un gen transportador. Pudiendo ésta ponerse de manifiesto, según el caso, por un ensayo colorimétrico, fluorimétrico o enzimático (ejemplo: \beta-galactosidasa). La inhibición del crecimiento se puede medir por la utilización de un medio selectivo (ej: medio al fluorato para la utilización del gen transportador URA3 o medio a la canavanina para CAN1).
La medición de la actividad \beta-galactosidasa se realiza de la siguiente forma:
La cepa L40 del género S. cerevisiae (Mata, his3D200, trp1-901, leu2-3,112, ade2, LYS2:: (lexAop)4-HIS3, URA3:: (lexAop)8-LacZ, GAL4, GAL80) se utiliza como herramienta de cribado. Esta cepa permite poner de manifiesto la interacción proteína-proteína cuando una de las parejas proteínicas se fusiona a la proteína LexA (70). Se ha cultivado en el medio de cultivo YNB mínimo.
Se ha empleado la cepa TG1 de Escherichia coli, genotipo supE, hsdD5, thi, D(lac-proAB), F'[tra D36 pro A+B+ lacIq lacZDM15], para la construcción de plásmidos y para la multiplicación y el aislamiento de plásmidos (como se describe en 2.1)
Los plásmidos aplicados son los siguientes:
El vector pGAD10, proporcionado por Clontech® permite la expresión en la levadura de proteínas de fusión entre GRF1, todo o partes y el dominio transactivador de GAL4.
El vector pLex9 (pBTM116) permite la expresión en la levadura de proteínas de fusión entre Ras, Rac o Cdc42 y el dominio de interacción con el ADN de la proteína LexA.
La levadura se hace competente por un tratamiento con LiAC/PEG según el método descrito por Gietz et al, (49). Se transforma a continuación por 1 \mug de cada plásmido permitiendo la expresión de las proteínas de fusión que componen el sistema doble-híbrido. La expresión de éstas conduce a la expresión de la \beta-galactosidasa.
Se deposita una hoja de nitrocelulosa en la caja de Petri que contenga el tapiz de levaduras y las gotas de compuestos químicos que se tienen que cribar. Esta hoja se sumerge a continuación en nitrógeno líquido durante 30 segundos para hacer estallar las levaduras y liberar así la actividad \beta-galactosidasa. Después de descongelación, se deposita la hoja de nitrocelulosa, colonias hacia arriba, en otra caja de Petri que contenga un papel Whatman previamente embebido en 1,5 ml de disolución de PBS (Na2HPO4 60 mM, NaH2PO4 40 mM, KCl 10 mM, MgSO4 1 mM, pH 7) conteniendo 15 \mul de X-Gal (5-bromo-4-cloro-3-indoil-\beta-D-galactósido) a 40 mg/ml en N,N-dimetilformamida. A continuación se pone la caja en una estufa a 37ºC. Se dice que el ensayo es positivo cuando las colonias viran al azul en la membrana al cabo de 6 horas.
Señalar que en el caso de interacciones débiles o muy fugaces entre proteínas, es posible considerar introducir mutaciones en éstas para hacer más fuerte la interacción (52).
Segunda aplicación:
Esta aplicación utiliza las propiedades de interacción de PAK1 (dominio CRIB) con Rac y Cdc42 cuando estas proteínas G pequeñas están en forma asociada a GTP y de c-Raf1 (dominio RBD) con Ras-GTP. Se puede entonces considerar una variante del sistema doble híbrido denominada doble-híbrido más uno que consistirá en expresar en el núcleo una misma levadura bien:
GRF1 (todo o parte), PAK1 (dominio CRIB) fusionado con un dominio transactivador de GAL4 y o Rac o Cdc42 Hs fusionadas con un dominio de interacción con el ADN de GAL4 o
GRF1 (todo o parte), c-Raf1 (RBD) fusionada con un dominio transactivador de GAL4 y Ras fusionada con un dominio de interacción con el ADN de GAL4.
El dominio carboxi-terminal de farnesilación de Ras o de geranil-geranilación de las proteínas Rac y Cdc42, se puede eliminar de la construcción, lo que permite obtener proteínas que no se enganchen a las membranas lipídicas y que entren eficazmente en el núcleo de las células.
La activación de G pequeñas por GRF1 inducirá su carga en GTP y su interacción pues con su efector (PAK1 o Raf-1) y permitirá pues la expresión del gen transportador como se describe a continuación.
La inhibición de la actividad de intercambio de la proteína GRF1 por pequeñas moléculas se traducirá pues en la inhibición de la expresión del gen transportador. (véase anteriormente).
La cepa de levadura CL9 se utiliza como herramienta de cribado de moléculas que interfieren en el sistema doble-híbrido. Permite poner de manifiesto las interacciones proteína-proteína. Se puede hacer permeable por introducción de mutaciones en la familia de los genes PDR y del gen ERG6 implicados en los procesos de destoxificación.
Se ha cultivado en el medio YNB mínimo.
La cepa TG1 de Escherichia coli, genotipo supE, hsd\Delta5, thi, \Delta(lac-proAB), F'[tra D36 pro A+B+ lacIq lacZ\DeltaM15], se emplea para la construcción de plásmidos y para multiplicación y el aislamiento de plásmidos. Se cultiva en el medio LB.
Los plásmidos aplicados son los siguientes:
El vector pGAD10, proporcionado por Clontech® permite la expresión en la levadura de una proteína de fusión entre PAK1 (dominio CRIB) o c-Raf1 (dominio RBD) y el dominio transactivador de GAL4 (proteína PAK1-TA o c-Raf1-TA).
El vector pGBT9, proporcionado por Clontech® permite la expresión en la levadura de una proteína de fusión entre Ras, Rac o Cdc42 y el dominio de interacción con el ADN de GAL4 (proteínas Ras-BD o Rac-BD o Cdc42-BD).
Un vector que permite la expresión en la levadura de GRF1 (todo o partes).
Transformación de la levadura por un plásmido
La levadura CL9 se hace competente por un tratamiento al LiAC/PEG según el método descrito por Gietz et al, (49). Se transforma a continuación por 1 \mug de cada plásmido permitiendo la expresión de las proteínas de fusión y GFR1 que componen el sistema doble-híbrido más uno. La expresión de éstas conduce a una sensibilidad de la cepa a la cicloheximida.
Un producto interferente con la activación por GRF1 de las proteínas de fusión Ras-BD, Rac-BD o Cdc42-BD del sistema permitirá el crecimiento de la levadura en este tipo de medio. Para hacer un cribado, se extiende la levadura en la superficie de un medio selectivo que contenga 10 \mug/ml de cicloheximida. Se aplican gotas de compuestos químicos directamente en la superficie de la caja. Los productos seleccionados son los que dan una aureola de crecimiento alrededor del depósito.
El cribado se hace en una levadura permeabilizada según las técnicas descritas anteriormente.
La especificidad de los productos para la activación por GRF1 de las proteínas Ras-BD o Rac-BD o Cdc42-BD se validará por uno de los otros ensayos dados en el ejemplo.
Se pueden aplicar otras técnicas de revelado de un sistema doble-híbrido más uno.
Inhibiendo la interacción proteína-proteína, las moléculas activas se pueden revelar por la disminución de la expresión de un gen transportador. Pudiendo ésta, según el caso, ponerse de manifiesto por un ensayo colorimétrico, fluorimétrico o enzimático. La inhibición del crecimiento se puede medir por utilización de un medio selectivo (ej: medio al fluorato para la utilización del gen transportador URA3 o medio a la canavanina para CAN1).
Se observa que en el caso de interacciones débiles o muy fugaces entre proteínas, es posible considerar introducir mutaciones en éstas para hacer más fuerte la interacción.
Para aplicar estos últimos ejemplos el experto en la materia se puede referir a las patentes de EE.UU. US 5.283.173, US 5.468.614, US 5.525.490, US 5.580.736 y US 5.885.779.
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Ejemplo 5
Utilización de la proteína GRF1 para la realización de cribas de compuestos por medición de la interacción entre GRF1 y las subunidades beta-gamma de proteínas G hetero-triméricas
Existe una interacción física entre el dominio PH de GRF1 y las subunidades beta-gamma de proteínas G hetero-triméricas (7-9). El sistema doble-híbrido en la levadura (tal como se describe en el ejemplo 4) parece ser la herramienta adaptada para la realización de una criba que permita poner de manifiesto moléculas capaces de perturbar esta interacción. Se podría utilizar bien la proteína GRF 1 entera, bien los dominios PH, bien la cadena de dominios PH-DH-PH tal como se encuentra de manera natural en la proteína GRF1.
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Ejemplo 6
Utilización de GRF1 en un ensayo de cribado celular para inhibidores de GRF1 aplicado a células transinfectadas
Según la bibliografía, la sobreexpresión de partes catalíticas de GRF1 confiere a la célula transinfectada el fenotipo transformado (46, 47).
El ensayo de cribado para inhibidores de GRF1 utiliza los clones estables de células transinfectadas por grf1, para las que los presentes autores han podido demostrar una sobreexpresión del transgen por el método western.
La sobreexpresión de GRF1 confiere a las células la capacidad para clonar en agar que se verifica según el protocolo siguiente:
Se cuentan las células y se vuelven a suspender en medio completo sin rojo de fenol y a una concentración de 2,5. 105 células por ml.
En los pozos de placas de 96 pozos, se vierte sucesivamente:
75 \mul de "Bottom layer" (capa de base) que contiene 50% de medio de cultivo 2X sin rojo de fenol y 50% de agarosa ((1,2%, "low melting point" (un punto de fusión bajo) como por ejemplo SIGMA (A-6560) tipo VII preparado en agua y esterilizado en autoclave)),
75 \mul de "capa superior" preparada a partir de la mezcla siguiente:
-
\vtcortauna 25 ml de medio 1,67X sin rojo de fenol (500 ml de medio 2X sin rojo de fenol, 100 ml de suero fetal bovino, 2X glutamina y 2X penicilina/estreptomicina), 100 ml de agua estéril), 10 ml de suspensión celular, 15 ml de agarosa (1,2%, "bajo punto de fusión" como por ejemplo SIGMA (A-6560) tipo VII preparado en agua y esterilizado en autoclave).
Una vez solidificado el agar, se diluyen las moléculas que se van a ensayar en medio 1X en las concentraciones que convienen y se añaden 75 \mul en las capas de agar en los pozos.
Se cuentan las células después de dos semanas por una coloración a la calceína: La Calceína AM (Molecular Probes C-1430, DMSO 4 mM) se diluye a 10 \muM en HBSS y se conserva a -20ºC. Se añaden 25 \mul de calceína AM a cada pozo y se dejan las células en incubadora (37ºC) durante al menos una hora. Se lee la placa en un aparato C0.
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Un inhibidor de GRF1 se revelará por la disminución del número de clones en agar. También se puede utilizar toda célula de mamífero inmortalizada y transinfectada por un vector de expresión eucariota (plásmido) que permita la expresión de todo o parte (dominio de tipo CDC25 o dominio DH) de grf1, humano o murina. Este vector de expresión confiere al mismo tiempo el fenotipo resistente a un agente de selección como higromicina, neomicina, zeocina u otros y permite de esta manera seleccionar después de clonar (por FACS o por dilución límite) las células transinfectadas y que expresan el transgen.
TABLA Localización de los dominios funcionales de las proteínas GRF 1 de mamíferos
1
Referencias bibliográficas
1- Hall, A., Rho GTPases and the actin citoskeleton. Science, 279, 509-14 (1.998).
2- Kiyono, M., et al., G protein \beta\gamma subunit-dependent Rac-guanine nucleotide exchange activity of Ras-GRF1/
CDC25Mm. Proc. Natl. Sci. USA, 96, 4.826-4.831 (1.999).
3- Farnsworth, C.L., et al., Calcium activation of Ras mediated by neuronal exchange factor Ras-GRF. Nature, 376, 524-527 (1.995).
4- Freshney, NW., et al., Activation of the exchange factor Ras-GRF by calcium requires an intact Dbl homology domain. FEBS Lett, 407, 111-5 (1.997).
5- Buchsbaum, R., et al., The N-terminal pleckstrin, coiled-coil, and IQ domains of the exchange factor Ras-GRF act cooperatively to facilitate activation by calcium. Mol Cell Biol, 16, 4.888-96 (1.996).
6- Schweighoffer, F., et al., Identification of a human guanine nucleotide-releasing factor (H-GRF55) specific for Ras proteins. Oncogene, 8, 1.477-1.485 (1.993).
7- Sawai, T., et al., Interaction between Pleckstrin homology domains and G protein betagamma-subunits: analyses of kinetic parameters by a biosensor-based method. Biol Pharm Bull, 22, 229-33 (1.999).
8- Shaw, G., The pleckstrin homology domain: an intriguing multifunctional protein module. Bioessays, 18, 35-46 (1.996).
9- Touhara, K., et al., Binding of G protein beta gamma-subunits to pleckstrin homology domains. J Biol Chem, 269, 10.217-20 (1.994).
10- Martegani, E., et al., Cloning by functional complementation of a mouse cDNA encoding a homologue of CDC25, a Saccharomyces cerevisiae RAS activator. EMBO J, 11, 2.151-2.157 (1.992).
11- Shou, C., et al., Molecular cloning of cDNAs encoding a guanine-nucleotide-releasing factor for Ras p21. Nature, 358, 351-354 (1.992).
12- Wei, W., et al., Localization of the cellular expression pattern of CDC25NEF and ras in the juvenile rat brain. Molecular brain research, 19, 339-344 (1.993).
13- Brambilla, R., et al., A role for the Ras signalling pathway in synaptic transmission and long-term memory. Nature, 390, 281-286 (1.997).
14- Itier, JM., et al., Imprinted gene in postnatal role. Nature, 393, 125-126 (1.998).
15- Zippel, R, et al., Ras-GRF, the activator of Ras, is expressed preferentially in mature neurons of the central nervous system. Molecular brain research, 48, 140-144 (1.997).
16- Plass, C., et al., Identification of GRF1 on mouse chromosome 9 as an imprinted gene by RLGS-M. Nature genetics, 14, 106-109 (1.996).
17- Shou, C., et al., Differential response of the Ras exchange factor, Ras-GRF to tyrosine kinase and G protein mediated signals. Oncogene, 10, 1.887-1.893 (1.995).
18- Mattingly, RR. and Macara, IG., Phosphorylation-dependent activation of the Ras-GRF/CDC25Mm exchange factor by muscarinic receptors and G-protein \beta\gamma subunits. Nature, 382, 268-272 (1.996).
19- Zippel, R., et al., The brain specific Ras exchange factor CDC25Mm: modulation of its activity through Gi-protein- mediated signals. Oncogene, 12, 2.697-2.703 (1.996).
20- Friedman, JM., Halaas, JL., Leptin and the regulation of body weight in mammals. Nature, 395, 763-70 (1.998).
21- Schwartz, MW., et al., Identification of targets of leptin action in rat hypothalamus. J Clin Invest, 98, 1.101-6 (1.996).
22- Kristensen, P., et al., Hypothalamic CART is a new anorectic peptide regulated by leptin. Nature, 393, 72-6 (1.998).
23- Krude, H., et al., Severe early-onset obesity, adrenal insufficiency and red hair pigmentation caused by POMC mutations in humans. Nat Genet, 19, 155-7 (1.998).
24- Yeo, GS., et al., A frameshift mutation in MC4R associated with dominantly inherited human obesity. Nat Genet, 20, 111-2 (1.998).
25- Vaisse, C., et al., A frameshift mutation in human MC4R is associated with a dominant form of obesity. Nat Genet, 20, 113-4 (1.998).
26- Sierra-Honigmann, MR., et al., Biological action of leptin as an angiogenic factor. Science, 281, 1.683-6 (1.998).
27- Bouloumie, A., et al., Leptin, the product of Ob gene, promotes angiogenesis. Circ Res, 83, 1.059-66 (1.998).
28- Chehab, FF., et al., Correction of the sterility defect in homozygous obese female mice by treatment with the human recombinant leptin. Nat Genet, 12, 318-20 (1.996).
29- Barash, IA., et al., Leptin is a metabolic signal to the reproductive system. Endocrinology, 137, 3144-7 (1.996).
30- Chehab, FF., et al., Early onset of reproductive function in normal female mice treated with leptin. Science, 275, 88-90 (1.997).
31- Strobel, A., et al., A leptin missense mutation associated with hypogonadism and morbid obesity. Nat Genet, 18, 213-5 (1.998).
32- Clement, K., et al., A mutation in the human leptin receptor gene causes obesity and pituitary dysfunction. Nature, 392, 398-401 (1.998).
33- Lord, GM., et al., Leptin modulates the T-cell immune response and reverses starvation-induced immunosuppression. Nature, 394, 897-901 (1.998).
34- Duci P. et al., Leptin inhibits bone formation through a hypothalamic relay: a central control of bone mass. Cell, 100, 197-207, 2.000.
35- Thiele, TE., et al., Ethanol consumption and resistance are inversely related to neuropeptide Y levels. Nature, 396, 366-9 (1.998).
36- Tamura, A., et al., Focal cerebral ischemia in the rat:1. Description of technique and early neuropathological consequences following middle cerebral artery occlusion. J Cereb Blood Flow Metab, 1, 53-60 (1.981).
37- Bederson, JA., et al., Rat middle cerebral artery occlusion: evaluation of the model and development of a neurologic examination. Stroke, 17, 472-476 (1.986).
38- Chatton, B., et al., Eukaryotic GST fusion vector for the study of protein-protein associations in vivo: application to interaction of ATFa with Jun and Fos. Biotechniques, 18, 142-5 (1.995).
39- Lowe N et al., Delineation of the Cdc42/Rac-binding Domain of p21-Activated Kinase. Biochemistry, 37, 7.885-7.891, (1.998).
40- Methods Enzymol., Guide to yeast genetics and molecular biology, 194, 1-863 (1.991).
41- Biotechnology, Yeast genetics engineering, 13, 1-354 (1.989).
42- Methods in molecular biology, Yeast protocols, 53, 1-433 (1.996).
43- Molecular Genetics of Yeast: A Practical Approach. Edited by John R. Johnston, 1-300 (1.994).
44- The Yeast Two-Hybrid System. Paul L. Bartel and Stanley Fields, 1-356 (1.997).
45- Methods in Yeast Genetics: A Laboratory Course Manual (1.997).
46- Chevallier-Multon MC et al. Saccharomyces cerevisiae CDC25 (1.028-1.589) is a guanine nucleotide releasing factor for mammalian Ras proteins and is oncogenic in NIH3T3 cells. J. Biol. chem. 268, págs. 11.113-11.119, 1.993.
47- Barlat I et al., The Saccharomyces cerevisiae gene product SDC25 C-domain functions as an oncoprotein in NIH3T3 cells. Oncogene, 8, 215-218, 1.993.
48- Han, J., et al., Lck regulates Vav activation of members of the Rho family of GTPases. Mol Cell Biol, 17, págs. 1.346-1.353, 1.997.
49- Gietz, R.D., R. H. Schiestl, A. R. Willems, and R. A. Woods. Studies on the transformation of intact yeast cells by LiAC/SS-DNA/PEG procedure. Yeast, 11: 355-360. 1.995.
50- Mosteller, RD., et al., Analysis of interaction between Ras and CDC25 guanine nucleotide exchange factor using yeast GAL4 two-hybrid system. Methods Enzymol. 255, 135-48 (1.995).
51- Leanna, C.A., Hannink M. The reverse two-hybrid system: a genetic scheme for selection against specific protein/protein interactions. Nucleic. Acids. Research. 96, 3.341-3.347. 1.996.
52- Kamada, S., et al., A cloning method for caspase substrates that uses the yeast two-hybrid system: cloning of the antiapoptotic gene gelsolin. Proc Natl Acad Sci U S A, 95, 8.532-7 (1.998).
53- Capon, D. J., Chen, E. Y., Levinson, A. D., Seeburg, P. H. and Goeddel, D. V. Complete nucleotide sequences of the T24 human bladder carcinoma oncogene and its normal homologue, Nature 302 (5.903), 33-37 (1.983).
54- McGrath, J. P., Capon, D. J., Smith, D. H., Chen, E. Y., Seeburg, P. H., Goeddel, D. V. and Levinson, A. D. Structure and organization of the human Ki-ras proto-oncogene and a related processed pseudogene. Nature 304 (5.926), 501-506 (1.983).
55- Taparowsky, E., Shimizu, K., Goldfarb, M. and Wigler, M. Structure and activation of the human N-ras gene. Cell 34 (2), 581-586 (1.983).
56- Didsbury, J., Weber, R. F., Bokoch, G. M., Evans, T. and Snyderman, R. rac, a novel ras-related family of proteins that are botulinum toxin substrates, J. Biol. Chem. 264 (28), 16.378-16.382 (1.989).
57- Polakis, P. G., Weber, R. F., Nevins, B., Didsbury, J. R., Evans, T. And Snyderman, R., Identification of the ral and racl gene products, low molecular mass GTP-binding proteins from human platelets. J. Biol. Chem. 264 (28), 16.383-16.389 (1.989).
58- Drivas, G. T., Shih, A., Coutavas, E., Rush, M. G. and D'Eustachio, P. Characterization of four novel ras-like genes expressed in a human teratocarcinoma cell line. Mol. Cell. Biol. 10 (4), 1.793-1.798 (1.990).
59- Shinjo, K., Koland, J. G., Hart, M. J., Narasimhan, V., Johnson, D. I., Evans, T. and Cerione, R. A. Molecular cloning of the gene for the human placental GTP-binding protein Gp (G25K): identification of this GTP-binding protein as the human homolog of the yeast cell-division-cycle protein CDC42. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87 (24), 9.853-9.857 (1.990).
60- Brown, J. L., Stowers, L., Baer, M., Trejo, J., Coughlin, S. and Chant, J. Human Ste20 homologue hPAK1 links GTPases to the JNK MAP kinase pathway. Curr. Biol. 6 (5), 598-605 (1.996).
61- Bekri S, Adelaide J, Merscher S, Grosgeorge J, Caroli-Bosc F, Perucca-Lostanlen D, Kelley PM, Pebusque MJ, Theillet C, Birnbaum D and Gaudray P. Detailed map of a region commonly amplified at 11q13-->q14 in human breast carcinoma Cytogenet. Cell Genet. 79 (1-2), 125-131 (1.997).
62- Sanders, L. C., Matsumura, F., Bokoch, G. M. and de Lanerolle, P. Inhibition of myosin light chain kinase by p21-activated kinase. Science 283 (5.410), 2.083-2.085 (1.999).
63- Sells, M.A., Boyd, J.T. and Chernoff, J. p21-activated kinase 1 (Pak1) regulates cell motility in mammalian fibroblasts. J. Cell Biol. 145 (4), 837-849 (1.999).
64- Bagrodia, S. and Cerione, R. A. Pak to the future. Trends Cell Biol. 9 (9), 350-355 (1.999).
65- Bonner, T. I., Oppermann, H., Seeburg, P., Kerby, S. B., Gunnell, M. A., Young, A. C. and Rapp, U. R. The complete coding sequence of the human raf oncogene and the corresponding structure of the c-raf-1 gene Nucleic Acids Res. 14 (2), 1.009-1.015 (1.986).
66- Nassar, N., Horn, G., Herrmann, C., Scherer, A., McCormick, F. And Wittinghofer, A. The 2.2 A crystal structure of the Ras-binding domain of the serine/treonine kinase c-Raf1 in complex with RaplA and a GTP analogue Nature 375 (6.532), 554-560 (1.995).
67- Nassar, N., Horn, G., Herrmann, C., Block, C., Janknecht, R. And Wittinghofer, A. Ras/Rap effector specificity determined by charge reversal Nat. Struct. Biol. 3 (8), 723-729 (1.996).
68- Emerson, S. D., Madison, V. S., Palermo, R. E., Waugh, D. S., Scheffler, J. E., Tsao, K. L., Kiefer, S. E., Liu, S. P. and Fry, D. C. Solution structure of the Ras-binding domain of c-Raf-1 and identification of its Ras interaction surface Biochemistry 34 (21), 6.911-6.918 (1.995).
69- Mott, H. R., Carpenter, J. W., Zhong, S., Ghosh, S., Bell, R. M. and Campbell, S. L. The solution structure of the Raf-1 cysteine-rich domain: a novel ras and phospholipid binding site Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (16), 8.312-8.317 (1.996).
70- Vojtek, A. B., S. M. Hollenberg, and J. A. Cooper.. Mammalian Ras interacts directly with the serine/threonine kinase Raf. Cell, 74: 205-214. (1.993).
<110> AVENTIS PHARMA SA
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<120> Utilización de la proteína GRF1
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<130> GRF1
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<140>
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<141>
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<160> 3
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<170> PatentIn Ver. 2.1
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<210> 1
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<211> 1275
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 1
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3
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7
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<210> 2
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<211> 1262
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<212> PRT
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<213> Mus musculus
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<400> 2
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8
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<210> 3
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<211> 1244
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<212> PRT
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<213> Rattus norvegicus
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<400> 3
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Claims (14)

1. Utilización de una proteína que presenta una identidad de al menos 85% con una proteína Factor 1 de Liberación de Nucleótido de Guanina (GRF1) o de células que expresen dicha proteína, en un método de detección de compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de patologías o trastornos del sistema nervioso central que impliquen una muerte neuronal o estén asociados a la obesidad.
2. Utilización según la reivindicación 1, caracterizada porque dicho método de detección consta de una etapa de medición de la fosforilación de la proteína GRF1.
3. Utilización según la reivindicación 1, caracterizada porque dicho método comprende una etapa de medición de la actividad de intercambio de la proteína GRF1 en las proteínas de la familia de las proteínas G pequeñas, especialmente Ras, Rac y Cdc42.
4. Utilización según la reivindicación 1, caracterizada porque dicho método comprende una etapa de medición de la interacción entre la proteína GRF1 y las subunidades beta-gamma de las proteínas G heterotriméricas.
5. Utilización según la reivindicación 1, caracterizada porque dicho método de detección consta de una etapa para poner en contacto los compuestos que se van a cribar con las levaduras transformadas por grf1.
6. Utilización según la reivindicación 5, caracterizada porque dicho método de detección consta de una etapa para poner en contacto los compuestos que se tienen que cribar con las levaduras transformadas por grf1 y cuyos genes CDC25 y/o CDC24 han sido inactivados o mutados.
7. Utilización según la reivindicación 1, caracterizada porque dicho método de detección consta de una etapa para poner en contacto los compuestos que se tienen que cribar con las levaduras que expresan una primera proteína híbrida constituida por una proteína de fusión entre Ras, CDC42Hs o Rac y un dominio de interacción con el ADN y una segunda proteína híbrida constituida por una proteína de fusión entre todo o parte de GRF 1 y un dominio transactivador.
8. Utilización según la reivindicación 1, caracterizada porque dicho método de detección consta de una etapa para poner en contacto los compuestos que se tienen que cribar con las levaduras que expresan una proteína que presenta una identidad de al menos 85% con una proteína GRF1, PAK1 fusionada con un dominio transactivador y Rac o CDC42Hs fusionada con un dominio de interacción con el ADN.
9. Utilización según la reivindicación 1, caracterizada porque dicho método de detección consta de una etapa para poner en contacto los compuestos que se tienen que cribar con las levaduras que expresan una proteína que presenta una identidad de al menos 85% con una proteína GRF1, Raf1 fusionada con un dominio transactivador y Ras fusionada con un dominio de interacción con el ADN.
10. Utilización según una cualquiera de las reivindicaciones precedentes caracterizada porque la patología es isquemia cerebral, enfermedad de Parkinson o enfermedad de Alzheimer.
11. Procedimiento de cribado o de detección de compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de pato-
logías del sistema nervioso central que impliquen una muerte neuronal, que comprende las etapas que consisten en:
(i)
poner en cultivo células constituidas por células que expresan la proteína GRF1 en presencia de un substrato de fosforilo marcado con un compuesto que se va a ensayar,
(ii)
lisar dichas células y
(iii)
medir la cantidad de proteína GRF 1 marcada.
12. Procedimiento de cribado o de detección de compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de patologías del sistema nervioso central que impliquen una muerte neuronal, que comprende las etapas previas que consisten en:
(i)
poner en cultivo células constituidas por células que expresan la proteína GRF1 en presencia de un compuesto que se va a ensayar,
(ii)
lisar dichas células y
(iii)
medir la cantidad de GRF1 fosforilada con ayuda de un anticuerpo específico de un aminoácido fosforilado.
13. Procedimiento de cribado o de detección de compuestos destinados a la prevención y/o al tratamiento de patologías del sistema nervioso central que impliquen una muerte neuronal, que comprende las etapas que consisten en:
(i)
poner en presencia de la proteína GRF 1, todo o parte de una proteína de la familia de las proteínas G pequeñas, cargada en GDP o en GTP marcado y un compuesto que se vaya a ensayar,
(ii)
añadir respectivamente GTP o GDP no marcado y
(iii)
medir la cantidad de proteína G marcada.
14. Procedimiento de detección por cribado celular e in vitro de compuestos destinados a la prevención y/ o al tratamiento de patologías del sistema nervioso central que impliquen una muerte neuronal, que comprende las etapas que consisten en:
(i)
transinfectar células de mamíferos inmortalizadas por un vector que expresa un transgen grf1 y que confiere a dichas células una resistencia a un agente de selección
(ii)
seleccionar y clonar dichas células transinfectadas y que expresan el transgen y clonarlas en un soporte de crecimiento en agar,
(iii)
añadir dichos compuestos que se van a ensayar a una suspensión de dichas células y
(iv)
detectar dichos compuestos inhibidores de GRF1 por disminución del número de clones.
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Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20050208595A1 (en) * 2004-03-19 2005-09-22 Brown Arthur M High throughput assay systems and methods for identifying agents that alter expression of cellular proteins
WO2012016963A1 (en) 2010-08-02 2012-02-09 Fondazione Centro San Raffaele Del Monte Tabor Peptides for the treatment of brain diseases
US10528897B2 (en) * 2011-04-28 2020-01-07 Intuit Inc. Graph databases for storing multidimensional models of software offerings
CN108614119A (zh) * 2018-04-23 2018-10-02 南京医科大学第二附属医院 一种尿液exosome的蛋白标记物的检测方法

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5426029A (en) * 1986-03-31 1995-06-20 T Cell Diagnostics, Inc. Therapeutic and diagnostic methods using leukocyte surface antigens
FR2690162B1 (fr) * 1992-04-21 1995-08-04 Rhone Poulenc Rorer Sa Peptides ayant une activite de facteur d'echange du gdp, sequences d'acides nucleiques codant pour ces peptides, preparation et utilisation.
US5518911A (en) * 1995-01-06 1996-05-21 Onyx Pharmaceuticals, Inc. Human PAK65
DE69729145T2 (de) * 1996-05-24 2005-06-09 Aventis Pharma Deutschland Gmbh Reagenz und Verfahren zur Inhibierung der N-RAS Expression
US5700821A (en) * 1996-07-30 1997-12-23 University Of Pittsburgh Phosphatase inhibitors and methods of use thereof
US6238881B1 (en) * 1996-11-06 2001-05-29 Onyx Pharmaceuticals, Inc. Nucleic acids and polypeptides related to a guanine exchange factor of Rho GTPase
US6340575B1 (en) * 1997-06-17 2002-01-22 Onyx Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating abnormal cell growth related to unwanted guanine nucleotide exchange factor activity
GB9722320D0 (en) * 1997-10-22 1997-12-17 Janssen Pharmaceutica Nv Human cell cycle checkpoint proteins
IT1306190B1 (it) * 1999-01-04 2001-05-30 Dipartimento Di Biotecnologie Mutanti di proteine e plasmidi idonei per la loro sintesi.
CA2259830A1 (en) * 1999-01-20 2000-07-20 Hsc Research And Development Limited Partnership Ras activator nucleic acid molecules, proteins and methods of use
US6589773B1 (en) * 2000-02-17 2003-07-08 Morphochem, Inc. Methods and compositions for a modified yeast strain with increased permeability and uses thereof

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