ES2287130T3 - Polipeptidos para inhibir la proliferacion de celulas b y t inducida por april. - Google Patents

Polipeptidos para inhibir la proliferacion de celulas b y t inducida por april. Download PDF

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Abstract

Uso de un asociado de unión específica de APRIL seleccionado de: i) SEC ID Nº 16; o ii) SEC ID Nº 13; para la fabricación de un medicamento para tratar enfermedades o trastornos relacionados con el sistema inmune e inflamatorios, autoinmunes y otros relacionados con el sistema inmune, enfermedades linfoproliferativas y otros cánceres, o para la prevención del rechazo de transplante, mediante la inhibición de la actividad APRIL, la inhibición de la actividad TACI, la inhibición de la actividad TACI y BCMA, o la inhibición de la proliferación o activación de células B o T en un mamífero.

Description

Polipéptidos para inhibir la proliferación de células B y T inducida por APRIL.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a proteínas que están implicadas en inflamación e inmunomodulación, supervivencia o activación o en trastornos linfoproliferativos u otros cánceres. La invención se refiere además a proteínas relacionadas con la superfamilia del factor de necrosis tumoral (TNF)/factor de crecimiento nervioso (NGF) y a ácidos nucleicos relacionados, a vectores de expresión, a células huésped y a ensayos de unión. La memoria descriptiva describe también composiciones y métodos para el tratamiento de enfermedades o trastornos relacionados con el sistema inmune e inflamatorios, autoinmunes y otros relacionados con el sistema inmune tales como artritis reumatoide (AR), enfermedad de Crohn (EC), lupus y enfermedad de injerto contra huésped (EICH), así como para el tratamiento de enfermedades linfoproliferativas y otros cánceres.
Antecedentes de la invención
Después de años de estudio de la necrosis de tumores, se clonaron finalmente los factores de necrosis tumoral (TNF) \alpha y \beta en 1984. Los años posteriores fueron testigos de la emergencia de una superfamilia de citocinas TNF, incluyendo ligando fas (FasL), ligando CD27 (CD27L), ligando CD30 (CD30L), ligando CD40 (CD40L), ligando inductor de la apoptosis relacionada con TNF (TRAIL, también designado AGP-1), proteína de unión a osteoprotegerina (OPG-BP o ligando OPG), ligando 4-1BB, LIGHT, APRIL y TALL-1, Smith et al. (1994), Cell, 76: 959-962; Lacey et al. (1998), Cell, 93: 165-176; Chichepotiche et al., (1997), J. Biol. Chem., 272: 32401-32410; Mauri et al. (1998), Immunity, 8: 21-30; Hahne et al. (1998), J. Exp. Med., 188: 1185-1190; Shu et al., (1999), J. Leukocyte Biology, 65: 680-683. Esta familia está unificada por su estructura, particularmente en la terminación C. Además, la mayoría de los miembros conocidos hasta la fecha se expresan en compartimentos inmunes, aunque algunos miembros se expresan también en otros tejidos y órganos. Smith et al. (1994) Cell, 76: 959-962. Todos los miembros ligandos, con la excepción de LT-\alpha, son proteínas transmembrana de tipo II caracterizadas por una región de 150 aminoácidos conservada dentro del dominio extracelular C-terminal. Aunque limitado a sólo un 20-25% de identidad, el dominio de 150 aminoácidos conservado se pliega en un sándwich de lámina \beta plegada característico y trimeriza. Esta región conservada puede liberarse proteolíticamente, generando así una forma funcional soluble. Banner et al. (1993), Cell, 73: 431-445.
Muchos miembros dentro de esta familia de ligandos se expresan en tejidos enriquecidos en linfoides y desempeñan papeles importantes en el desarrollo y la modulación del sistema inmune. Smith et al. (1994). Por ejemplo, el TNF\alpha se sintetiza principalmente por macrófagos y es un mediador importante de respuestas inflamatorias y defensas inmunes. Tracey & Cerami (1994), Annu. Rev. Med., 45: 491-503. El Fas-L, expresado predominantemente en células T activadas, modula la apoptosis mediada por TCR de timocitos. Nagata, S. & Suda, T. (1995) Immunology Today, 16: 39-43; Castrim et al., (1996), Immunity, 5: 617-627. El CD40L, también expresado por células T activadas, proporciona una señal esencial para la supervivencia, proliferación y cambio de isotipo de inmunoglobulina de células B. Noelle (1996), Immunity, 4: 415-419.
Se han identificado los receptores semejantes para la mayoría de los miembros de la familia del ligando TNF. Estos receptores comparten repeticiones ricas en cisteína múltiples características dentro de sus dominios extracelulares, y no poseen motivos catalíticos dentro de las regiones citoplásmicas. Smith et al., (1994). Los receptores señalizan mediante interacciones directas con proteínas de dominio de muerte (por ejemplo, TRADD, FADD y RIP) o con proteínas TRAF (por ejemplo, TRAF2, TRAF3, TRAF5 y TRAF6), desencadenando rutas de señalización divergentes y superpuestas, por ejemplo, apoptosis, activación de NF-\kappaB o activación de JNK. Wallach et al (1999), Annual Review of Immunology 17: 331-367. Estos eventos de señalización conducen a la muerte, proliferación, activación o diferenciación celular. El perfil de expresión de cada miembro receptor varía. Por ejemplo, el TNFR1 se expresa en un amplio espectro de tejidos y células, mientras que el receptor de superficie celular de OPGL está limitado principalmente a los osteoclastos. Hsu et al. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 96: 3540-3545. Se cree que dichas proteínas desempeñan un papel en procesos inflamatorios e inmunes, sugiriendo su utilidad en el tratamiento de trastornos autoinmunes e inflamatorios.
Una serie de grupos de investigación han identificado recientemente ligandos de la familia de TNF con la misma secuencia o sustancialmente similar, pero no han identificado el receptor asociado. El ligando se ha nombrado de diversas maneras: neutrocina-\alpha (documento WO 98/18.921, publicado el 7 de mayo de 1998), 63954 (documento WO 98/27.114, publicado el 25 de junio de 1998), TL5 (documento EP 869.180, publicado el 7 de octubre de 1998), NTN-2 (documentos WO 98/55.620 y WO 98/55.621, publicados el 10 de diciembre de 1998), TNRL1-alfa (documento WO 99/11.791, publicado el 11 de marzo de 1999), ligando kay (documento WO99/12.964, publicado el 18 de marzo de 1999) y AGP-3 (sol. prov. de EE.UU nº 60/119.906, presentada el 12 de febrero de 1999 y nº 60/166.271, presentada el 18 de noviembre de 1999, respectivamente). De aquí en adelante en la presente memoria, esta secuencia proteica se designa como "AGP-3".
Un artículo reciente ha identificado dos proteínas conocidas anteriormente como receptores de AGP-3. Gross et al. (2000), Nature, 404: 995-999. El primer receptor se identificó anteriormente como un receptor de superficie de linfocito llamado activador transmembrana e interactor con CAML (TACI). Véanse el documento WO 98/39.361, publicado el 11 de septiembre de 1998, y von Bulow & Bram (1997), Science, 278: 138-140, cada uno de los cuales está incorporado a la presente memoria como referencia en su totalidad. Según estas referencias, el TACI se une a un ligando de ciclofilina intracelular designado CAML, que modula la ruta de señalización de calcio en linfocitos.
El segundo receptor identificado para AGP-3 es la denominada proteína de maduración de células B (BCMA). El gen de BCMA humana se descubrió mediante el análisis molecular de una translocación t(4:16) que caracteriza un linfoma de células T humanas. Laabi et al. (1993), EMBO J., 11: 3897-3904. Se reseñó que el ARNm de BCMA se encontraba principalmente en tejidos linfoides. El ADNc de BCMA humana codifica una proteína de 184 aminoácidos (185 residuos para el ratón), la bibliografía no reseña similitudes obvias con ninguna proteína ni motivo conocido, y su función permaneció desconocida. Se reseñó que la proteína residía en el aparato de Golgi (Gras et al., (1995), Intl. Immunol., 7: 1093-1106). Recientes especulaciones sugirieron que la BCMA puede ser un miembro distante de la superfamilia de TNFR. Madry et al. (1998), Intl. Immunol., 10: 1693-1702.
Un ligando denominado APRIL o G70 es un ligando de la familia de TNF que sigue sin un receptor reseñado en la bibliografía. Según la bibliografía, el APRIL está asociado a cáncer de próstata, cáncer de mama, enfermedad de Alzheimer, trastornos inmunes, trastornos inflamatorios y anormalidades gestacionales. Véanse los documentos WO 99/00518 (26 de junio de 1997), WO 99/11.791 (5 de septiembre de 1997), WO 99/12.965 (12 de septiembre de 1997), EP 911.633 (8 de octubre de 1997), EP 919.620 (26 de noviembre de 1997), WO 99/28.462 (3 de diciembre de 1997), WO 99/33.980 (30 de diciembre de 1997), WO 99/35170 (5 de enero de 1998) y Hahne et al. (1998), J. Exp. Med., 188: 1185-1190. Un artículo reciente describía isoformas de APRIL y sugería que el APRIL causa la muerte celular. Kelly et al. (2000), Cancer Res., 60: 1021-1027. La técnica se beneficiaría de la identificación de un receptor de APRIL y de una aclaración de su actividad.
Sumario de la invención
Se ha encontrado ahora que el sG70 (APRIL) se une a receptores de superficie celular en células de linfoma T y B, dando como resultado la estimulación de la proliferación de células B y T primarias humanas y de ratón tanto in vitro como in vivo. Se ha encontrado ahora que la BCMA y el TACI son receptores de superficie celular de APRIL. Se ha encontrado también que el APRIL compite con la unión de AGP-3 a TACI y BCMA. Además, se muestra aquí que la sBCMA inhibe la unión de APRIL y AGP-3 a sus receptores. La sBCMA mejora las respuestas inmunes humorales dependientes de células T e independientes de células T in vivo. Además, se ha encontrado que el sTACI inhibe la unión de APRIL y AGP-3 a sus receptores y mejora las respuestas inmunes humorales dependientes de células T e independientes de células T in vivo. Además, se ha encontrado ahora que la sBCMA reduce el crecimiento tumoral de células de linfoma y carcinoma de colon in vivo. Se ha encontrado ahora también que la sBCMA aumenta la supervivencia y reduce la incidencia de proteinuria y el desarrollo de anticuerpos anti-ADNbc en un modelo animal de lupus. Se ha encontrado también que la BCMA exhibe similitud con el TACI en un solo dominio rico en cisteínas localizado N-terminal a un dominio transmembrana potencial. Se ha encontrado también que el APRIL estimula el crecimiento de células B y la producción de inmunoglobulina in vitro e in vivo. Además, el tratamiento con un anticuerpo anti-APRIL de bloqueo mejora la generación de inmunoglobulina específica de antígeno, sugiriendo que el APRIL endógeno es necesario para la inmunidad humoral in vivo. Esta invención se refiere a nuevos métodos de uso y a composiciones de material que explota estos descubrimientos. Los descubrimientos proporcionan una estrategia para el desarrollo de terapias para el tratamiento de enfermedades autoinmunes y cáncer, y para la prevención del rechazo de transplante.
Estos descubrimientos muestran que la actividad, estados patológicos y parámetros de enfermedad asociados a APRIL y AGP-3 pueden estar afectados por la modulación de BCMA. Igualmente, los estados patológicos y parámetros de enfermedad asociados a TACI pueden estar afectados por la modulación de APRIL. Además, dichos estados patológicos y parámetros de enfermedad pueden estar afectados por la modulación de cualquiera de TACI, BCMA, APRIL y AGP-3 conjuntamente. Este descubrimiento sugiere además moléculas y métodos de tratamiento mediante los que más de uno de TACI, BCMA, APRIL y AGP-3 pueden modularse por una sola molécula.
Descripción de las figuras
La Figura 1 muestra la secuencia de APRIL humano (SEC ID Nº 1 y 2)
Los codones de inicio y terminación están subrayados.
Las Figuras 2A y 2B muestran las secuencias de ADN y aminoácidos de APRIL/G70 de ratón (SEC ID Nº 3 y 4, respectivamente). Los codones de inicio y terminación están subrayados. Se proporciona también la secuencia de aminoácidos de APRIL de ratón soluble marcado con FLAG (SEC ID Nº 19).
La Figura 3 muestra un alineamiento de APRIL humano (SEC ID Nº 22) y de ratón (SEC ID Nº 23). La línea media de cada fila muestra la secuencia consenso (SEC ID Nº 24).
La Figura 4 muestra que G70/APRIL es un potente estimulante de linfoma de células B y T. La Figura 4A muestra la estimulación dependiente de la dosis de la proliferación de células Jurkat (células T leucémicas humanas), Raji (linfoma de Burkitt humano) y K562 (células de leucemia mielogenosa crónica humana). Se determinó la proliferación de células incubando 3 x 10^{4} células/pocillo en 100 \mul de medio con la concentración indicada de sG70/APRIL recombinante y solución salina tamponada con fosfato (PBS, sin ligando) como control. Después de 48 horas, se midió el número de células viables mediante un ensayo de proliferación Celltiter 96 AQ (Promega, Madison, WI). En la Figura 4B, las células U937 (células leucémicas similares a monocitos), NIH/3T3 (estirpe celular de embrión de ratón) y 293 (estirpe celular primaria humana transformada de riñón embrionario) no respondieron a la estimulación con sG70/APRIL.
Las Figuras 5A y 5B muestran un análisis FACS de la unión a receptor de G70/APRIL. Se evaluó la expresión del receptor de G70/APRIL en la estirpe celular indicada utilizando anticuerpo monoclonal anti-Flag seguido de anticuerpo de cabra conjugado a FITC contra IgG de ratón. Se utilizó un anticuerpo monoclonal anti-CD16/CD32 de ratón (bloqueo Fc) para bloquear la unión no específica a células.
La Figura 6 muestra el efecto de sG70/APRIL sobre la proliferación de células B, células T y granulocitos de sangre periférica. Se purificaron células T (CD4+ y CD8+), células B y granulocitos periféricos humanos a partir de tres donantes diferentes utilizando anticuerpos del cóctel RosetteSep (Stem Cell Tech., Vancouver). Se cultivaron células purificadas en pocillos de plástico tratados con cultivo de tejido (Becton-Dickinson, Lincoln Park, NJ) durante 6 días en medio RPMI-1640 suplementado con 10% de suero de ternero fetal, L-glutamina 2 mM y 2-ME (50 \muM) a las presentes concentraciones diferentes de sG70/APRIL. Para el ensayo de proliferación de células B, se recubrieron pocillos de plástico con anticuerpo monoclonal de ratón purificado anti-IgM humana (3 \mug/ml, Pharmingen, San Diego, CA). El control positivo para la estimulación de células T es IL-2.
La Figura 7 muestra el efecto de G70/APRIL sobre la proliferación de células T y B de múrido in vitro. Se purificaron células T y B de bazos de ratones C57B1 mediante selección con columnas de enriquecimiento de células T y células B de múrido. Se cultivaron 1 x 10^{5} células por pocillo en ausencia o presencia de diversos G70/APRIL durante 48 horas, se sometieron a pulsos durante las últimas 18 horas con 0,5 \muCi de ^{3}H-timidina y se recogieron para contar la radiactividad incorporada.
La Figura 8 muestra el efecto de G70/APRIL sobre la proliferación de células T de múrido coestimulada mediante anticuerpo anti-CD28. Se purificaron células T de bazos de ratones C57B1 mediante selección con una columna de enriquecimiento en células T de múrido. Se trataron 1 x 10^{5} células T por pocillo con G70/APRIL en ausencia o presencia de una concentración subliminal de anticuerpo anti-CD28 (0,9 \mug/ml) durante 48 horas, se sometieron a pulsos durante las últimas 18 horas con 0,5 \muCi de ^{3}H-timidina y se recogieron para contar la radiactividad incorporada.
La Figura 9 muestra el efecto de G70/APRIL sobre la proliferación de células T de múrido coestimulada mediante anticuerpo anti-CD3. Se purificaron células T de bazos de ratones C5B71 mediante selección con una columna de enriquecimiento en células T de múrido. Se trataron 1 x 10^{5} células T por pocillo con G70/APRIL en ausencia o presencia de una concentración subliminal de anticuerpo anti-CD3 (0,9 \mug/ml) durante 48 horas, se sometieron a pulsos durante las últimas 18 horas con 0,5 \muCi de ^{3}H-timidina y se recogieron para contar la radiactividad incorporada. La Tabla 1 muestra el análisis FACS de bazo (Tabla 1A) y nódulos linfáticos mesentéricos (Tabla 1B) después de la administración sistémica in vivo de miembros de la familia de TNF. Se han ensayado in vivo varios miembros de la familia de TNF, teniendo cada grupo 5 ratones (BDF-1, de 8 semanas de edad, dosis: 1 mg/kg/día en 0,2 ml durante 5 días). Se han aislado bazo, timo y nódulos linfáticos mesentéricos de tres ratones de cada grupo para análisis FACS utilizando un panel de anticuerpos marcados de superficie celular de células T y células B. Se han resumido los resultados del análisis FACS en las siguientes tablas.
Las Figuras 10A y 10B muestran la secuencia de BCMA humana (SEC ID Nº 5). El dominio extracelular de BCMA (SEC ID Nº 6) se extiende desde el aa 1 al aa 51 y se identifica por flechas. La región consenso rica en cisteína (SEC ID Nº 7, descrita detalladamente a continuación en la presente memoria) se muestra en negrita. La región transmembrana (SEC ID Nº 8) está subrayada. huBCMA-Fc (SEC ID Nº 9). mBCMA-Fc (SEC ID Nº 10).
La Figura 11 muestra un alineamiento de la secuencia de aminoácidos de BCMA humana y la secuencia de aminoácidos de BCMA de múrido (SEC ID Nº 11). La secuencia humana se muestra en la línea superior, la de múrido en la línea inferior de cada fila. La secuencia consenso humana-de múrido (SEC ID Nº 12) aparece en la línea media de cada fila. Un "+" en la secuencia consenso indica una sustitución conservativa. La porción rica en cisteína de la secuencia consenso (SEC ID Nº 13) aparece en negrita.
Las Figuras 12A y 12B muestran la secuencia de hTACI (SEC ID Nº 14). El dominio extracelular de TACI (SEC ID Nº 15) se extiende del aa 1 al aa 166. La región consenso rica en cisteína (SEC ID Nº 16) se muestra en negrita, y la región transmembrana (SEC ID Nº 17) está subrayada. hTACI-Fc (SEC ID Nº 18).
La Figura 13 muestra un alineamiento de regiones extracelulares ricas en cisteína de TACI humano y BCMA humana. La región consenso rica en cisteína de BCMA (SEC ID Nº 20) aparece en la línea superior, la región consenso rica en cisteína de TACI (SEC ID Nº 21) aparece en la línea inferior de cada fila. Los residuos de aminoácidos conservados se indican por una barra vertical (I). Los residuos de aminoácidos
\hbox{relacionados se indican con  dos
puntos (:).}
Las Figuras 14A, 14B y 14C muestran la unión de G70/APRIL de ratón soluble a células 293 que expresan el gen de BCMA. Se incubaron células 293 humanas transfectadas con los vectores pmBCMA y pcDNA3 con G70/APRIL-Flag, seguido de tinción con anticuerpo anti-Flag conjugado con FITC para análisis FACS. A. Las células 293 se transfectaron con vector pcDNA3 solo. B. Las células 293 se transfectaron con vector pmBCMA antisentido. C. Las células 293 se transfectaron con vector pmBCMA con sentido.
La Tabla 2 muestra el análisis BIACore de la cinética de unión estequiométrica de APRIL y AGP-3 a BCMA y TACI. El APRIL-Flag se une específicamente a BCMA de múrido y humana con afinidades de 0,25 nM y 0,29 nM, respectivamente, y a TACI humano con una afinidad de 1,48 nM. También una versión más larga de APRIL marcado con Flag (aa 50-240) se une a BCMA y TACI con una alta afinidad similar a la de AGP-3-Fc (Tabla 2). En experimentos separados, se determinó que ni APRIL ni AGP-3 se unen a OPG y también que TNF\alpha, OPGL, LIGHT, TWEAK y TRAIL no se unen a BCMA ni a TACI. Por tanto, APRIL y AGP-3 se unen específicamente tanto a BCMA como a TACI con alta afinidad.
La Figura 15 muestra la unión de G70/APRIL a células 293 que expresan el gen de hTACI. Se incubaron células 293 humanas transfectadas con los vectores phTACI y pcDNA3 con G70/APRIL-Flag, seguido de tinción con anticuerpo anti-Flag conjugado con FITC para análisis FACS. En la Figura 15A, se transfectaron células 293 con el vector phTACI. En la Figura 15B, se transfectaron células 293 con el vector pcDNA3 solo.
La Figura 16 muestra que G70/APRIL bloquea completamente la unión de AGP-3 a su receptor. Se tiñeron células A20 de linfoma B de ratón con AGP-Fc o con 10 x exceso de G70/APRIL, ligando CD40, ligando TRAIL y Tweak. Después de lavar 3 veces, se incubaron las células con anticuerpo secundario de cabra anti-IgG-Fc humana conjugado con FITC. En la Figura 16A, 10 x G70/APRIL bloqueaba completamente la unión de AGP-3 a células A20. En las Figuras 16B, C y D, 10 x ligando CD40, Tweak y TRAIL no tienen ese efecto sobre la unión de
AGP-3.
La Figura 17 muestra que la unión de receptor de TACI soluble (sTACI) compite con la unión de G70/APRIL a células A20. Se incubaron las células A20 con G70/APRIL o al mismo tiempo con 10 x receptor de TACI soluble, TRAIL R2 y TRAIL R3, seguido de tinción con anticuerpo anti-Flag conjugado con FITC para análisis FACS. En la Figura 17A, el receptor de TACI soluble competía parcialmente en la unión con la unión de G70/APRIL a células A20. En las Figuras 17B y 17C, los receptores TRAIL R2 y TRAIL R3 solubles no interferían con la unión de
G70/APRIL.
La Figura 18 muestra que la proteína de fusión receptor de BCMA humana soluble-Fc (shBCMA-Fc) y la proteína de fusión receptor de TACI humano soluble-Fc (shTACI-Fc) bloquean completamente la unión de la proteína de fusión receptor de AGP-3 humana soluble-Fc (shAGP-3-Fc) a células A20. Se incubaron las células A20 con shAGP-3-Fc o al mismo tiempo con 10 x shBCMA-Fc o shTACI-Fc, seguido de tinción con anticuerpo anti-Flag conjugado con FITC para análisis FACS.
La Figura 19A muestra que la shBCMA-Fc bloquea completamente la unión de shAGP-3-Fc a células A20. Se incubaron las células A20 con shAGP-3-Fc con o sin 10 x hBCMA soluble-Fc, seguido de tinción con anticuerpo anti-Flag conjugado con FITC para análisis FACS. La Figura 19B muestra que la shBCMA-Fc bloquea la unión de APRIL de múrido soluble (smAPRIL) a células A20. Se incubaron las células A20 con smAPRIL con o sin 10 x shBCMA-Fc seguido de tinción con anticuerpo anti-Flag conjugado con FITC para análisis FACS.
La Figura 20 muestra los niveles séricos de IgG e IgM anti-KLH e IgM anti-Pneumovax en ratones tratados con proteínas de fusión TACI-Fc o BCMA-Fc o Fc no fusionado como control. Los valores de p designan la comparación con el grupo tratado con Fc. n= 7. Véanse los Materiales y Métodos a continuación en la presente memoria.
La Figura 21 muestra la secuencia de APRIL-Fc humana
La Figura 22 muestra el efecto de APRIL-Fc humana y AGP-3/BlyS/Tall-1 humana soluble sobre la proliferación de células B primarias de múrido. Se cultivaron células B de bazo de múrido purificadas en presencia de diversas cantidades de APRIL-Fc humana y AGP-3 no marcada más anti-IgM 2 \mug/ml. Los datos muestran la incorporación de ^{3}H-timidina como cpm, y representan la media de pocillos por triplicado.
La Figura 23 muestra que la hBCMA-Fc y la hTACI-Fc inhiben la proliferación de células B de ratón mediada por mAPRIL-Flag. Se cultivaron células B de bazo de múrido purificadas con las cantidades indicadas de BCMA-Fc y TACI-Fc solubles en presencia de mAPRIL-Flag 10 ng/ml y un anti-IgM 2 \mug/ml durante 72 h. La incorporación de ^{3}H-timidina se indica como cpm. Los datos mostrados representan la media de pocillos por triplicado.
La Figura 24 muestra que la administración de hBCMA-Fc (15 mg/kg intraperitoneal (i.p., los días 0, 3 y 6)) reduce los niveles de células B en sangre periférica de ratón medidos el día 7. Se trataron ratones normales (n= 7) con BCMA-Fc humana y Fc no fusionado como control los días 0, 3 y 6 (15 mg/kg). Se midieron los niveles de células B de sangre periférica el día 7.
La Figura 25 muestra que la administración de hBCMA-Fc (15 mg/kg i.p. los días 0, 3 y 6) reduce los niveles de células B de bazo de ratón medidos el día 7.
La Figura 26 muestra que la producción de IgA mediada por mAPRIL-Flag y hAGP-3 está inhibida por hBCMA-Fc y hTACI-Fc in vitro. Se cultivaron células B de bazo de múrido purificadas con LPS (100 ng/ml), AGP-3 (10 ng/ml), APRIL-Flag (10 ng/ml) o con BCMA-Fc (100 ng/ml) y TACI-Fc (100 ng/ml) durante 12 días. Se recogieron los sobrenadantes de cultivo el día 7 y el día 12 para detectar el nivel de IgA.
La Figura 27 muestra que la producción de IgG mediada por mAPRIL-Flag y hAGP-3 se inhibe por hBCMA-Fc y hTACI-Fc in vitro.
La Figura 28 muestra los niveles totales reducidos de IgE e IgA en ratones normales tratados con mBCMA-Fc y hTACI-Fc truncada (5 mg/kg, i.p., los días 0, 3 y 6). Se trataron ratones normales (n= 7) con BCMA-Fc humana, TACI-Fc truncada y Fc no fusionado como control los días 0, 3 y 6 (5 mg/kg). Se midieron los niveles de inmunoglobulina en suero el día 7.
La Figura 29 muestra que el tratamiento con hBCMA-Fc o hTACI-Fc truncada reduce los niveles de IgM específica anti-Pneumovacs en ratones normales. Se trataron ratones normales (n= 7) con BCMA-Fc humana, TACI-Fc truncada y Fc no fusionado como control a dosis diarias de 0,5 mg/kg a 15 mg/kg durante 7 días. En la preinmunización, no fueron detectables anti-KLH y anti-Pneumovax. Se midieron los anticuerpos el día 7 y el día 14.
La Figura 30 muestra que el anticuerpo monoclonal específico anti-mAPRIL nº c19 inhibe la proliferación de células B de ratón mediada por mAPRIL-Flag. Se cultivaron células B de bazo de múrido purificadas en presencia de mAPRIL-Flag 10 ng/ml con anti-IgM 2 \mug/ml. Se añadieron anticuerpo monoclonal anti-APRIL-Flag c-19 e IgG control de rata al cultivo al mismo tiempo. Los datos muestran la incorporación de ^{3}H-timidina como cpm, y representan la media de pocillos por triplicado.
La Figura 31 muestra que el tratamiento con el anticuerpo monoclonal específico anti-mAPRIL nº c19 inhibe la generación de anticuerpos específicos anti-Pneumovacs in vivo.
La Figura 32 muestra que el tratamiento con hBCMA-Fc aumenta la supervivencia en el modelo de ratón NZB/
NZWF1 de LES.
La Figura 33 muestra que el tratamiento con hBCMA-Fc reduce la incidencia de proteinuria en el modelo de ratón NZB/NZWF1 de LES.
La Figura 34 muestra que el tratamiento con hBCMA-Fc reduce los niveles de anticuerpo específico anti-ADNbc en el modelo de ratón NZB/NZWF1 de LES.
La Figura 35 muestra que el tratamiento con hBCMA-Fc reduce el porcentaje de células B en sangre periférica en el modelo de ratón NZB/NZWF1 de LES.
La Figura 36 muestra que el APRIL se une a una serie de estirpes celulares tumorales. Se determinó la unión de APRIL a estirpes celulares tumorales humanas mediante la incubación de células con APRIL-Fc o APRIL-Flag 1 \mug/ml, seguido de tinción con anticuerpo secundario marcado con FITC y análisis FACS.
La Figura 37 muestra que el APRIL estimula el crecimiento de células U266-B1 y que éste puede inhibirse por BCMA-Fc o TACI-Fc. Se cultivaron células U266 en presencia de APRIL-Fc humana 10 ng/ml o con BCMA-Fc soluble, TACI-Fc truncada 50 ng/ml durante 48 h. Se indica la incorporación de ^{3}H-timidina como cpm. Los datos mostrados representan la media de pocillos por triplicado.
La Figura 38 muestra que APRIL estimula el crecimiento de células A20 de linfoma B de ratón y que éste puede inhibirse por BCMA-Fc o TACI-Fc. Se cultivaron linfomas de células B de ratón A20 en presencia de APRIL-Flag de ratón, AGP-3-Flag humana 50 ng/ml o con BCMA-Fc soluble 100 ng/ml durante 48 h. Se indica la incorporación de ^{3}H-timidina como cpm. Los datos mostrados representan la media de pocillos por triplicado.
La Figura 39 muestra que el tratamiento con BCMA-Fc reduce el crecimiento de células B tumorales de linfoma A20 en ratones Balb/C. Se implantaron células A20 (0,2 millones), i.d., el día 0. Se administraron tratamientos con PBS, CHO-Fc, mBCMA-Fc, hBCMA-Fc, mTACI-Fc, hTACI-Fc (10 mg/kg, i.p.) los días 0, 7, 10, 13, 16, 19, 22. Se hicieron medidas del tumor dos veces por semana. Se sacrificaron los ratones los días 27-31, se congelaron inmediatamente los tumores para el aislamiento de ARN, se recogió la sangre y se congelaron las muestras de
suero.
La Figura 40 muestra que el tratamiento con hBCMA-Fc reduce el crecimiento en volumen del tumor de estirpe celular HT29 de carcinoma de colon humano en ratones. Se inyectaron por vía subcutánea 2 x 10^{6} células más Matrigel al 50% a ratones desnudos atímicos. Rx: BCMA-Fc humana a 2, 5 y 15 mg/kg Q2D, empezando el día 0 (n= 10/grupo). Control 1: CHO-Fc a 15 mg/kg Q2D. Control 2: 0,2 ml de PBS Q2D IP. Volumen tumoral: 3 veces por semana, desde el día 7. Peso tumoral al final del estudio. Peso corporal 2 veces por semana.
La Figura 41 muestra que el tratamiento con mBCMA-Fc reduce el crecimiento en volumen del tumor de estirpe celular HT29 de carcinoma de colon humano en ratones. Se inyectaron por vía subcutánea 2 x 10^{6} células más Matrigel al 50% a ratones desnudos atímicos. Rx: BCMA-Fc de ratón a 2, 5 y 15 mg/kg Q2D, empezando el día 0 (n= 10/grupo). Control 1: CHO-Fc a 15 mg/kg Q2D. Control 2: 0,2 ml de PBS Q2D IP. Volumen tumoral: 3 veces por semana desde el día 7. Peso tumoral al final del estudio. Peso corporal 2 veces por semana.
Descripción detallada de la invención Definición de términos
Los términos utilizados a lo largo de esta memoria descriptiva se definen a continuación, a menos que se limiten de otro modo en casos específicos.
El término "comprende" significa que un compuesto puede incluir aminoácidos adicionales en cualquiera o ambas de las terminaciones N o C de la secuencia dada. Por supuesto, estos aminoácidos adicionales no deberían interferir significativamente con la actividad del compuesto.
"Actividad AGP-3" designa la modulación del crecimiento, supervivencia o activación celular como resultado de la unión de AGP-3 humana natural a TACI o BCMA, particularmente en células B. A la inversa, la "actividad antagonista de AGP-3" designa la actividad opuesta a la actividad AGP-3 como resultaría, por ejemplo, por la inhibición de la unión de AGP-3 a TACI o BCMA. Dicha actividad puede determinarse, por ejemplo, mediante ensayos tales como los descritos en "Actividad biológica de AGP-3" en los Materiales y Métodos del documento PCT/US00/03653. Aparecen ensayos adicionales mediante los que puede identificarse la actividad AGP-3 en las referencias WO 98/18.921 (7 de mayo de 1998), WO 98/27.114 (25 de junio de 1998), EP 869.180 (7 de octubre de 1998), WO 98/55.620 y WO 98/55.621 (10 de diciembre de 1998), WO 99/11.791 (11 de marzo de 1999), WO 99/12.964 (18 de marzo de 1999) y Gross et al. (2000), Nature, 404: 995-999. Cualquiera de los ensayos descritos en las mismas puede modificarse según sea necesario mediante métodos conocidos por personas expertas en la técnica.
"Actividad APRIL" designa la modulación del crecimiento, supervivencia o activación celular como resultado de la unión de APRIL humana natural a TACI o BCMA, particularmente en células T. A la inversa, la "actividad antagonista de APRIL" designa la actividad opuesta a la actividad APRIL como resultaría, por ejemplo, por la inhibición de la unión de APRIL a TACI o BCMA. Dicha actividad puede determinarse, por ejemplo, mediante ensayos tales como se describen en los Materiales y Métodos a continuación en la presente memoria. Aparecen ensayos adicionales mediante los que puede identificarse la actividad APRIL en las referencias WO 99/00518 (26 de junio de 1997), WO 99/11.791 (5 de septiembre de 1997), WO 99/12.965 (12 de septiembre de 1997), EP 911.633 (8 de octubre de 1997), EP 919.620 (26 de noviembre de 1997), WO 99/28.462 (3 de diciembre de 1997), WO 99/33.980 (30 de diciembre de 1997), WO 99/35.170 (5 de enero de 1998) y Hahne et al., (1998), J. Exp. Med., 188: 1185-1190. Cualquiera de los ensayos descritos en las mismas y en la presente memoria puede modificarse según sea necesario mediante métodos conocidos por personas expertas en la técnica.
"Actividad BCMA" designa la modulación del crecimiento, supervivencia o activación celular como resultado de la unión de APRIL humana natural o AGP-3 humana natural a BCMA. A la inversa, la "actividad antagonista de BCMA" designa la actividad opuesta a la actividad BCMA como resultaría, por ejemplo, por la inhibición de la unión de AGP-3 o APRIL a BCMA. Dicha actividad puede determinarse, por ejemplo, mediante ensayos tales como se describen en los Materiales y Métodos a continuación en la presente memoria. Aparecen ensayos adicionales mediante los que puede identificarse la actividad BCMA en las referencias WO 99/00518 (26 de junio de 1997), WO 99/11.791 (5 de septiembre de 1997), WO 99/12.965 (12 de septiembre de 1997), EP 911.633 (8 de octubre de 1997), EP 919.620 (26 de noviembre de 1997), WO 99/28.462 (3 de diciembre de 1997), WO 99/33.980 (30 de diciembre de 1997), WO 99/35.170 (5 de enero de 1998), Hahne et al. (1998), J. Exp. Med. 188: 1185-1190, WO 98/18.921 (7 de mayo de 1998), WO 98/27.114 (25 de junio de 1998), EP 869.180 (7 de octubre de 1998), WO 98/55.620 y WO 98/55.621 (10 de diciembre de 1998), WO 99/11.791 (11 de marzo de 1999), WO 99/12.964 (18 de marzo de 1999) y Gross et al. (2000), Nature, 404: 995-999. Cualquiera de los ensayos descritos en las mismas y en la presente memoria puede modificarse según sea necesario mediante métodos conocidos por personas expertas en la
técnica.
"Actividad TACI" designa la modulación del crecimiento, supervivencia o activación celular como resultado de la unión de AGP-3 humana natural o APRIL humano natural a TACI. A la inversa, la "actividad antagonista de TACI" designa la actividad opuesta a la actividad TACI como resultaría, por ejemplo, por la inhibición de la unión de AGP-3 o APRIL a TACI. Dicha actividad puede determinarse, por ejemplo, mediante ensayos tales como se describen en los Materiales y Métodos de los documentos PCT/US00/03653, WO 98/18921 (7 de mayo de 1998), WO 98/27.114 (25 de junio de 1998), EP 869.180 (7 de octubre de 1998), WO 98/55.620 y WO 98/55.621 (10 de diciembre de 1998), WO 99/11.791 (11 de marzo de 1999), WO 99/12.964 (18 de marzo de 1999), WO 98/39.361 (11 de septiembre de 1998), von Bulow & Bram (1997), Science, 278: 138-140 y Gross et al. (2000), Nature, 404: 995-999. Cualquiera de los ensayos descritos en los mismos puede modificarse según sea necesario mediante métodos conocidos por personas expertas en la técnica.
La expresión "asociado de unión específica" designa cualquier molécula que se una preferiblemente a una proteína de interés, independientemente de la actividad antagonista o agonista de la molécula hacia la proteína de interés. Los asociados de unión específica ejemplares incluyen anticuerpos, receptores solubilizados, péptidos, péptidos modificados como se describen a continuación en la presente memoria, y similares.
El término "vehículo" designa una molécula que evita la degradación y/o aumenta la semivida, reduce la toxicidad, reduce la inmunogenicidad o aumenta la actividad biológica de una proteína terapéutica. Los vehículos ejemplares incluyen un dominio Fc (que se prefiere) así como un polímero lineal (por ejemplo, polietilenglicol (PEG), polilisina, dextrano, etc.), un polímero de cadena ramificada (véanse, por ejemplo, las patentes de EE.UU. nº 4.289.872 de Denkenwalter et al., expedida el 15 de septiembre de 1981; nº 5.229.490 de Tam, expedida el 20 de julio de 1993; WO 93/21.259 de Frechet et al., publicada el 28 de octubre de 1993), un lípido, un grupo colesterol (tal como un esteroide), un carbohidrato u oligosacárido, o cualquiera proteína, polipéptido o péptido natural o sintético que se une a un receptor nativo. Los vehículos se describen detalladamente a continuación en la presente
memoria.
La expresión "Fc nativo" designa la molécula o secuencia que comprende la secuencia de un fragmento sin unión a antígeno resultante de la digestión del anticuerpo completo, tanto en forma monomérica como multimérica. La fuente de inmunoglobulina original del Fc nativo es preferiblemente de origen humano, y puede ser cualquiera de las inmunoglobulinas, aunque se prefieren IgG1 e IgG2. Los Fc nativos están constituidos por polipéptidos monoméricos que pueden ligarse en formas diméricas o multiméricas mediante asociación covalente (concretamente, enlaces disulfuro) y no covalente. El número de enlaces disulfuro intermoleculares entre subunidades monoméricas de moléculas de Fc nativas oscila de 1 a 4, dependiendo de la clase (por ejemplo, IgG, IgA, IgE) o subclase (por ejemplo, IgG1, IgG2, IgG3, IgA1, IgGA2). Es un ejemplo de un Fc nativo el dímero con enlace disulfuro resultante de la digestión con papaína de una IgG (véase Ellison et al., (1982), Nucleic Acids Res., 10: 4071-4079). La expresión "Fc nativo" como se utiliza en la presente memoria es genérica de las formas monomérica, dimérica y
multimérica.
La expresión "variante de Fc" designa una molécula o secuencia que está modificada a partir de un Fc nativo, pero que comprende todavía un sitio de unión para el receptor de recuperación, FcRn. Las solicitudes internacionales WO 97/34.631 (publicada el 25 de septiembre de 1997) y WO 96/32.478 describen variantes ejemplares de Fc, así como la interacción con el receptor de recuperación. Por tanto, la expresión "variante de Fc" comprende una molécula o secuencia que está humanizada a partir de un Fc nativo no humano. Además, un Fc nativo comprende sitios que pueden eliminarse porque proporcionan rasgos estructurales o actividad biológica que no son necesarios para las moléculas de fusión de la presente invención. Por tanto, la expresión "variante de Fc" comprende una molécula o secuencia que carece de uno o más sitios o residuos de Fc nativo que afectan o están implicados en (1) la formación de enlace disulfuro, (2) la incompatibilidad con una célula huésped seleccionada, (3) la heterogeneridad N-terminal tras la expresión en una célula huésped seleccionada, (4) la glicosilación, (5) la interacción con el complemento, (6) la unión a un receptor de Fc distinto de un receptor de recuperación, o (7) la citotoxicidad celular dependiente de anticuerpo (ADCC). Se describen variantes de Fc con mayor detalle en el documento WO 99/24.782, publicado el 4 de mayo de 2000.
La expresión "dominio de Fc" comprende moléculas y secuencias de Fc nativo y variante de Fc como se definen anteriormente. Como con las variantes de Fc y Fc nativos, la expresión "dominio de Fc" incluye moléculas en forma monomérica o multimérica, tanto digeridas a partir del anticuerpo completo como producidas por otros
medios.
El término "multímero", como se aplica a dominios o moléculas de Fc que comprenden dominios Fc, designa moléculas que tienen dos o más cadenas polipeptídicas asociadas covalentemente, no covalentemente o tanto por interacciones covalentes como no covalentes. Las moléculas de IgG forman típicamente dímeros, IgM pentámeros, IgD dímeros e IgA monómeros, dímeros, trímeros o tetrámeros. Los multímeros pueden formarse explotando la secuencia y la actividad resultante de la fuente de IgG nativa del Fc o derivatizando (como se define a continuación) dicho Fc nativo.
El término "dímero", como se aplica a dominios de Fc o moléculas que comprenden dominios de Fc, designa moléculas que tienen dos cadenas polipeptídicas asociadas covalentemente o no covalentemente.
Los términos "derivatizar" y "derivado" o "derivatizado" comprenden procesos y los compuestos resultantes respectivamente en los que (1) el compuesto tiene una porción cíclica, por ejemplo, reticulación entre residuos cisteinilo dentro del compuesto, (2) el compuesto está reticulado o tiene un sitio de reticulación, por ejemplo, el compuesto tiene un residuo cisteinilo y forma por tanto dímeros reticulados en cultivo o in vivo, (3) uno o más enlaces peptidilo están reemplazados por un enlace no peptidilo, (4) la terminación N está reemplazada por -NRR^{1}, NRC(O)R^{1}, -NRC(O)OR^{1}, -NRS(O)_{2}R^{1}, -NHC(O)NHR, un grupo succinimida o benciloxicarbonil-NH- sustituido o no sustituido, en los que R y R^{1} y los sustituyentes de anillo son como se definen a continuación en la presente memoria, (5) la terminación C está reemplazada por -C(O)R^{2} o -NR^{3}R^{4}, en los que R^{2}, R^{3} y R^{4} son como se definen a continuación en la presente memoria y (6) los compuestos en los que los residuos de aminoácido individuales están modificados mediante tratamiento con agentes capaces de reaccionar con cadenas laterales seleccionadas o residuos terminales. Los derivados se describen detalladamente a continuación en la presente memoria.
El término "péptido" designa moléculas de 2 a 40 aminoácidos, prefiriéndose moléculas de 3 a 20 aminoácidos y siendo las más preferidas aquellas de 6 a 15 aminoácidos. Pueden generarse aleatoriamente péptidos ejemplares mediante cualquiera de los métodos citados anteriormente, portados en una biblioteca peptídica (por ejemplo, una biblioteca de presentación en fago) o derivarse mediante digestión de proteínas.
El término "aleatorizado", como se utiliza para designar secuencias peptídicas, designa secuencias completamente aleatorias (por ejemplo, seleccionadas mediante métodos de presentación en fago) y secuencias en las que uno o más residuos de una molécula de origen natural se reemplazan por un residuo aminoacídico que no aparece en esa posición en la molécula de origen natural. Los métodos ejemplares para identificar secuencias peptídicas incluyen presentación en fago, presentación en E. coli, presentación en ribosoma, examen basado en levadura, examen de ARN-péptido, examen químico, diseño racional, análisis estructural de proteína y similares. Los péptidos aleatorizados y métodos para generarlos aparecen en el documento WO 00/24.782, publicado el 4 de mayo de
2000.
La expresión "farmacológicamente activo" significa que se determina que una sustancia así descrita tiene una actividad que afecta a un parámetro médico (por ejemplo, proliferación de células T) o estado patológico (por ejemplo, cáncer, trastornos autoinmunes). Por tanto, los compuestos farmacológicamente activos comprenden compuestos agonistas o miméticos y antagonistas como se definen a continuación.
Los términos "mimético" y "agonista" designan una molécula que tiene una actividad biológica comparable con una proteína (por ejemplo, APRIL, AGP-3) que interacciona con una proteína de interés. Estos términos incluyen además moléculas que imitan indirectamente la actividad de una proteína de interés, tal como potenciando los efectos del ligando natural de la proteína de interés.
Los términos "antagonista" o "inhibidor" designan una molécula que bloquea o que interfiere de algún modo la actividad biológica de la proteína de interés asociada, o que tiene una actividad biológica comparable a un antagonista o inhibidor conocido de la proteína de interés asociada.
Adicionalmente, se comprenden también en la presente memoria sales fisiológicamente aceptables de los compuestos de esta invención. Por "sales fisiológicamente aceptables", se pretende cualquiera sal que sea conocida por ser, o que se descubra después que es, farmacéuticamente aceptable. Son algunos ejemplos específicos: acetato, trifluoroacetato, halohidratos tales como clorhidrato y bromhidrato, sulfato, citrato, tartrato, glicolato y oxalato.
Métodos de tratamiento
La presente descripción se refiere a un método de inhibición de la proliferación de células T en un mamífero, que comprende administrar un agente terapéutico que comprende:
a.
un asociado de unión específica a TACI, en el que el asociado de unión específica tiene actividad antagonista de TACI;
b.
un asociado de unión específica a BCMA, en el que el asociado de unión específica tiene actividad antagonista de BCMA;
c.
tanto a como b; o
d.
un asociado de unión específica a TACI y BCMA, en el que el asociado de unión específica tiene actividad antagonista de TACI, actividad antagonista de BCMA o ambas.
La presente descripción se refiere a un método de inhibición de la actividad APRIL en un mamífero, que comprende administrar un agente terapéutico que comprende de a a d anteriores.
La descripción se refiere también a un método de inhibición de la actividad TACI, la actividad BCMA o ambas en un mamífero, que comprende administrar un asociado de unión específica a APRIL. Este método puede comprender además administrar un asociado de unión específica a AGP-3.
Algunas indicaciones se benefician de un aumento en la respuesta inmune. En consecuencia, la descripción se refiere además a un método de aumento de la proliferación de células T en un mamífero, que comprende administrar un agente terapéutico que comprende:
a.
un asociado de unión específica a TACI, en el que el asociado de unión específica tiene actividad agonista de TACI;
b.
un asociado de unión específica a BCMA, en el que el asociado de unión específica tiene actividad agonista de BCMA;
c.
tanto a como b; o
d.
un asociado de unión específica a TACI y BCMA, en el que el asociado de unión específica tiene actividad agonista de TACI, actividad agonista de BCMA o ambas.
La descripción se refiere también a un método para aumentar la actividad APRIL en un mamífero, que comprende administrar un agente terapéutico que comprende de a a d anteriores.
Los inventores contemplan llevar a cabo los métodos de tratamiento anteriores con cualquiera de varios tipos diferentes de moléculas, incluyendo moléculas pequeñas, anticuerpos y péptidos modificados por ingeniería genética y moléculas de fusión descritas a continuación en la presente memoria. Estas moléculas pueden utilizarse también en ensayos para identificar células y tejidos que expresan AGP-3, TACI, APRIL o BCMA. La invención se refiere además a ácidos nucleicos, vectores y células huésped útiles en la preparación de dichas moléculas.
La descripción se refiere además a métodos de identificación de compuestos que son útiles en los métodos de uso anteriormente citados. Dichos compuestos incluyen ácidos nucleicos, péptidos, proteínas, carbohidratos, lípidos o moléculas orgánicas de bajo peso molecular, y pueden actuar como agonistas o antagonistas de la actividad de proteína BCMA, TACI, AGP-3 o APRIL.
Se cree que AGP-3, APRIL, BCMA y TACI desempeñan un papel en la regulación de la función inmune. En consecuencia, estas moléculas, sus formas solubles y los agonistas y antagonistas de las mismas pueden ser útiles para el diagnóstico y/o el tratamiento de enfermedades de inflamación y función inmune. Las indicaciones para antagonistas incluyen, pero sin limitación, las siguientes:
\bullet
infecciones tales como infecciones bacterianas, fúngicas, protozoarias y víricas, especialmente VIH-1 o VIH-2;
\bullet
diarrea;
\bullet
psoriasis;
\bullet
inflamación;
\bullet
alergias;
\bullet
dermatitis atópica;
\bullet
enfermedades alérgicas respiratorias tales como asma, rinitis alérgica, enfermedad pulmonar por hipersensibilidad, neumonitis por hipersensibilidad, neumonía eosinofílica (por ejemplo, síndrome de Loeffler, neumonía eosinofílica crónica, enfermedad pulmonar intersticial (EPI) tal como fibrosis pulmonar idiopática o EPI asociada a artritis reumatoide, lupus eritematoso sistémico, espondilitis anquilosante, esclerosis sistémica, síndrome de Sjogren, polimiositis o dermatomiositis);
\bullet
anafilaxia sistémica o respuestas de hipersensibilidad;
\bullet
alergia a medicamentos;
\bullet
alergia a picaduras de insecto;
\bullet
enfermedad inflamatoria intestinal tal como enfermedad de Crohn y colitis ulcerosa;
\bullet
espondiloartropatía;
\bullet
escleroderma;
\bullet
psoriasis;
\bullet
dermatosis inflamatoria tal como dermatitis, eccema, dermatitis atópica, dermatitis alérgica por contacto, urticaria, vasculitis (por ejemplo, vasculitis necrosante, cutánea y por hipersensibilidad), miositis eosinofílica y fascitis eosinofílica;
\bullet
enfermedades autoinmunes tales como artritis reumatoide, artritis psoriásica, esclerosis múltiple, lupus sistémico eritematoso, miastenia grave, diabetes de inicio juvenil, glomerulonefritis, tiroiditis autoinmune y enfermedad de Behcet;
\bullet
rechazo de injerto, incluyendo rechazo de aloinjerto o enfermedad de injerto contra huésped;
\bullet
cánceres con infiltración leucocitaria de la piel o los órganos;
\bullet
lesión por reperfusión;
\bullet
aterosclerosis;
\bullet
ciertas malignidades hematológicas;
\bullet
shock, incluyendo shock séptico y shock endotóxico.
\newpage
Los agonistas pueden utilizarse para tratar:
\bullet
inmunosupresión, por ejemplo, en pacientes de SIDA o individuos que experimentan terapia de radiación, quimioterapia, terapia para enfermedad autoinmune u otra terapia de medicamentos, e inmunosupresión debida a deficiencia congénita en la función de receptor u otras causas; y
\bullet
enfermedades infecciosas tales como enfermedades parasitarias, incluyendo infecciones por helmintos tales como nematodos (gusanos redondos).
Composiciones de material
Cualquier serie de moléculas puede servir como asociados de unión específica dentro de la presente invención. Son de particular interés anticuerpos, péptidos y moléculas de fusión péptido-Fc.
Anticuerpos
La descripción proporciona también un anticuerpo o dominio de unión a antígeno del mismo, o un fragmento, variante o derivado del mismo, que se une a un epítopo en cualquiera de las moléculas diana (APRIL, AGP-3, TACI o BCMA) y que tiene una actividad agonista o antagonista parcial o completa. Preferiblemente, la molécula diana es de mamífero, más preferiblemente humana, y puede estar en formas solubles o asociada a superficie celular, o fragmentos, derivados y variantes de las mismas.
Son conocidos en la técnica una serie de métodos para la generación de anticuerpos. Todos dichos métodos son útiles para generar moléculas útiles según la presente descripción. Convencionalmente, puede prepararse un anticuerpo inmunizando un animal con la molécula diana (por ejemplo, BCMA o TACI de múrido o humano) o con un fragmento inmunogénico, derivado o variante de la misma. Además, puede inmunizarse un animal con células transfectadas con un vector que contiene una molécula de ácido nucleico que codifica la molécula diana, de tal modo que la molécula diana se expresa y se asocia a la superficie de las células transfectadas. Como alternativa, pueden obtenerse asociados de unión específica que son anticuerpos mediante examen de una biblioteca que comprende secuencias de anticuerpo o de dominio de unión a antígeno para la unión a la molécula diana. Dicha biblioteca se prepara convenientemente en bacteriófago como fusiones de proteína o péptido con una proteína de cubierta de bacteriófago que se expresan sobre la superficie de partículas de fago ensambladas, y las secuencias de ADN codificante están contenidas dentro de las partículas de fago (denominado "biblioteca de presentación en fago"). En un ejemplo, una biblioteca de presentación en fago contiene secuencias de ADN que codifican anticuerpos humanos tales como las cadenas ligera y pesada variables. Las secuencias que se unen a la molécula diana pueden evolucionar además mediante múltiples rondas de mutagénesis y examen.
Los asociados de unión específica que son anticuerpos o dominios de unión a antígeno pueden ser glicoproteínas tetraméricas similares a anticuerpos nativos, o pueden ser anticuerpos monocatenarios, por ejemplo, fragmentos Fv, Fab, Fab' o F(ab)', anticuerpos biespecíficos, heteroanticuerpos u otros fragmentos, variantes o derivados de los mismos que son capaces de unirse a la molécula diana y neutralizar parcial o completamente la actividad de la molécula diana. Los anticuerpos o dominios de unión a antígeno pueden producirse en estirpes celulares de hibridoma (células productoras de anticuerpo tales como células de bazo fusionadas con células de mieloma de ratón, por ejemplo), o pueden producirse en estirpes celulares heterólogas transfectadas con moléculas de ácido nucleico que codifican dicho anticuerpo o dominio de unión a antígeno.
Los anticuerpos de la descripción incluyen anticuerpos monoespecíficos policlonales, policlonales, monoclonales, recombinantes, quiméricos, humanizados, totalmente humanos, monocatenarios y/o biespecíficos. Los fragmentos de anticuerpo incluyen aquellas porciones de un anticuerpo que se unen a un epítopo en una molécula diana. Los ejemplos de dichos fragmentos incluyen fragmentos Fab, F(ab'), F(ab)', Fv y sFv. Los anticuerpos pueden generarse mediante escisión enzimática de anticuerpos completos o mediante técnicas de ADN recombinante tales como la expresión de plásmidos recombinantes que contienen secuencias de ácido nucleico que codifican regiones variables de anticuerpo.
Los anticuerpos policlonales son poblaciones heterogéneas de moléculas de anticuerpo derivadas de los sueros de animales inmunizados con un antígeno. Un antígeno es una molécula o una porción de una molécula capaz de unirse a un anticuerpo, que es adicionalmente capaz de inducir a un animal a producir un anticuerpo capaz de unirse a un epítopo de ese antígeno. Un antígeno puede tener uno o más epítopos. La reacción específica designada anteriormente pretende indicar que el antígeno reaccionará, de manera altamente selectiva, con su correspondiente anticuerpo y no con la multitud de otros anticuerpos que pueden evocarse por otros antígenos.
Los anticuerpos policlonales dirigidos hacia una molécula diana se crean generalmente en animales (por ejemplo, conejos o ratones) mediante múltiples inyecciones subcutáneas o intraperitoneales de la molécula diana y un coadyuvante. Según la invención, puede ser útil conjugar la molécula diana, o una variante, fragmento o derivado de la misma, con una proteína vehículo que sea inmunogénica en la especie que se va a inmunizar, tal como hemocianina de lapa bocallave, suero, albúmina, tiroglobulina bovina o inhibidor de tripsina de soja. Además, se utilizan agentes agregantes tales como alúmina para potenciar la respuesta inmune. Después de la inmunización, se extrae sangre a los animales y se ensaya en el suero la valoración de anticuerpo anti-diana.
Los anticuerpos monoclonales (mAb) contienen una población sustancialmente homogénea de anticuerpos específicos de antígenos, conteniendo dicha población sitios de unión a epítopo sustancialmente similares. Dichos anticuerpos pueden ser de cualquier clase inmunogénica, incluyendo IgG, IgM, IgE, IgA, IgD y cualquier subclase de los mismos. Puede cultivarse un hibridoma productor de un anticuerpo monoclonal de la presente invención in vitro, in situ o in vivo. La producción de altas valoraciones in vivo o in situ es un método de producción
preferido.
Los anticuerpos monoclonales dirigidos hacia la molécula diana se producen utilizando cualquier método que proporcione la producción de moléculas de anticuerpo mediante estirpes celulares continuas en cultivo. Los ejemplos de métodos adecuados para preparar anticuerpos monoclonales incluyen los métodos de hibridoma de Kohler et al., Nature, 256, 495-497 (1975) y el método de hibridoma de células B humanas, Kozbor, J. Immunol., 133, 3001 (1984); Brodeur et al., "Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications", pág. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., Nueva York, 1987); y Harlow y Lane, "Antibodies: A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory
(1988).
Los asociados de unión específica preferidos incluyen anticuerpos monoclonales que inhibirán parcial o completamente la unión de la molécula diana humana a su ligando o receptor semejante o un anticuerpo que tenga sustancialmente las mismas características de unión específica, así como fragmentos y regiones de los mismos. Los métodos preferidos para determinar la especificidad y afinidad de anticuerpo monoclonal mediante inhibición competitiva pueden encontrarse en Harlow et al., "Antibodies: A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1988), Colligan et al., ed., "Current Protocols in Immunology", Greene Publishing Assoc. y Wiley Interscience, N.Y., (1992, 1993), y Muller, Meth. Enzymol., 92: 589-601 (1983).
Se proporcionan también en la descripción estirpes celulares de hibridoma que producen anticuerpos monoclonales reactivos con polipéptidos diana.
Los anticuerpos quiméricos son moléculas en las que diferentes porciones derivan de diferentes especies animales, tales como aquellas que tienen una región variable derivada de un anticuerpo monoclonal de múrido y una región constante de inmunoglobulina humana. Los anticuerpos quiméricos se utilizan principalmente para reducir la inmunogenicidad en la administración y para aumentar los rendimientos en la producción, por ejemplo, cuando los anticuerpos monoclonales de múrido tienen mayores rendimientos a partir de hibridomas pero mayor inmunogenicidad en seres humanos, de modo que se utilizan anticuerpos monoclonales quiméricos humanos/de múrido.
Los anticuerpos quiméricos y los métodos para su producción son conocidos en la técnica. Cabilly et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 3273-3277 (1984), Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851-6855 (1984); Boulianne et al., Nature, 312: 643-646 (1984), Neuberger et al., Nature, 314: 268-270 (1985); Liu et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84: 3439-3443 (1987); y Harlow y Lane, "Antibodies: A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory (1988).
Puede utilizarse un anticuerpo monoclonal quimérico de la descripción como agente terapéutico. En dicho anticuerpo quimérico, una porción de la cadena pesada y/o ligera es idéntica a u homóloga de la correspondiente secuencia en anticuerpos derivados de una especie particular o que pertenecen a una clase o subclase de anticuerpo particular, mientras que el resto de la(s) cadena(s) es idéntico a u homólogo de la correspondiente secuencia en anticuerpos derivados de otra especie o que pertenecen a otra clase o subclase de anticuerpo, así como fragmentos de dichos anticuerpos, a condición de que exhiban la actividad biológica deseada (véase la patente de EE.UU. nº 4.816.567, Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 6851-6855 (1985).
Como se utiliza en la presente memoria, la expresión "anticuerpo quimérico" incluye inmunoglobulinas monovalentes, divalentes o polivalentes. Un anticuerpo quimérico monovalente es un dímero (HL) formado por una cadena H quimérica asociada mediante puentes disulfuro con una cadena L quimérica. Un anticuerpo quimérico divalente es un tetrámero (H_{2}L_{2}) formado por dos dímeros HL asociados mediante al menos un puente disulfuro. Puede producirse también un anticuerpo quimérico polivalente, por ejemplo, empleando una región C_{H} que agregue (por ejemplo, a partir de una cadena H o cadena \mu de IgM).
Los anticuerpos, fragmentos y regiones de múrido y quiméricos de la presente descripción pueden comprender cadenas de inmunoglobulina individuales pesadas (H) y/o ligeras (L). Una cadena H quimérica comprende una región de unión a antígeno derivada de la cadena H de un anticuerpo no humano específico de la molécula diana, que está ligado al menos a una porción de una región C de cadena H humana (C_{H}) tal como CH_{1} o CH_{2}.
Una cadena L quimérica según la presente descripción comprende una región de unión a antígeno derivada de la cadena L de un anticuerpo no humano específico de la molécula diana, ligado al menos a una porción de una región C de cadena L humana (C_{L}).
Los asociados de unión específica tales como anticuerpos, fragmentos o derivados, que tienen cadenas H y cadenas L quiméricas de la misma o diferente especificidad de unión a la región variable, pueden prepararse también mediante la asociación apropiada de las cadenas polipeptídicas individuales, según etapas de métodos conocidos, por ejemplo, según Ausubel et al., ed. "Current Protocols in Molecular Biology", Wiley Interscience, N.Y. (1993), y Harlow et al., "Antibodies: A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1988). Con este enfoque, se cultivan separadamente huéspedes que expresan cadenas H quiméricas (o sus derivados) a partir de huéspedes que expresan cadenas L quiméricas (o sus derivados), y las cadenas de inmunoglobulina se recuperan separadamente y después se asocian. Como alternativa, los huéspedes pueden cocultivarse y las cadenas se permiten asociar espontáneamente en el medio de cultivo, seguido de la recuperación de la inmunoglobulina ensamblada, fragmento o derivado.
Como ejemplo, la región de unión a antígeno del asociado de unión específica (tal como un anticuerpo quimérico) de la presente invención deriva preferiblemente de un anticuerpo no humano específico del análogo humano de la molécula diana. Las fuentes preferidas del ADN que codifica dicho anticuerpo no humano incluyen estirpes celulares que producen anticuerpos tales como estirpes celulares híbridas conocidas habitualmente como
hibridomas.
La descripción proporciona también fragmentos, variantes y derivados, y fusiones de anticuerpos anti-diana, en los que los términos "fragmentos", "variantes", "derivados" y "fusiones" se definen en la presente memoria. La invención comprende fragmentos, variantes, derivados y fusiones de anticuerpos anti-diana que son funcionalmente similares al anticuerpo no modificado, es decir, retienen al menos una de las actividades del anticuerpo no modificado. Además de las modificaciones expuestas anteriormente, se incluye también la adición de secuencias genéticas que codifican proteínas citotóxicas tales como toxinas de plantas y bacterianas. Los fragmentos, variantes, derivados y fusiones de los anticuerpos pueden producirse mediante cualquiera de los huéspedes de esta inven-
ción.
Los fragmentos adecuados incluyen, por ejemplo, Fab, Fab', F(ab')_{2}, Fv y scFv. Estos fragmentos carecen del fragmento Fc de un anticuerpo intacto, se eliminan más rápidamente de la circulación y pueden tener menos unión no específica a tejido que un anticuerpo intacto. Véase Wahl et al., J. Nucl. Med., 24: 316-325 (1983). Estos fragmentos se producen a partir de anticuerpos intactos utilizando métodos bien conocidos en la técnica, por ejemplo, mediante escisión proteolítica con enzimas tales como papaína (para producir fragmentos Fab) o pepsina (para producir fragmentos F(ab')_{2}). La identificación de estas regiones de unión a antígeno y/o epítopos reconocidos por anticuerpos monoclonales de la presente invención proporciona la información necesaria para generar anticuerpos monoclonales adicionales con características de unión y utilidad terapéutica o diagnóstica similares que se asemejan a las realizaciones de esta invención.
Se proporcionan también variantes de asociados de unión específica. En una realización, las variantes de anticuerpos y dominios de unión a antígeno comprenden cambios en las secuencias de aminoácidos de cadena ligera y/o pesada que aparecen naturalmente o se introducen mediante modificación genética in vitro de secuencias nativas utilizando técnicas de ADN recombinante. Las variantes de origen natural incluyen variantes "somáticas" que se generan in vivo en las correspondientes secuencias nucleotídicas de estirpe germinal durante la generación de una respuesta de anticuerpo ante un antígeno extraño.
Las variantes de anticuerpos y dominios de unión a antígeno se preparan también mediante técnicas de mutagénesis conocidas en la técnica. En un ejemplo, pueden introducirse aleatoriamente cambios de aminoácidos a lo largo de la región de codificación de un anticuerpo, y en las variantes resultantes puede examinarse una actividad deseada tal como la afinidad de unión por la molécula diana. Como alternativa, pueden introducirse cambios de aminoácidos en regiones seleccionadas de un anticuerpo tales como en las CDR de cadena ligera y/o pesada y regiones marco conservadas, y en los anticuerpos resultantes puede examinarse la unión a la molécula diana o alguna otra actividad. Los cambios de aminoácidos comprenden una o más sustituciones de aminoácidos en una CDR, en el intervalo de una sola diferencia de aminoácido a la introducción de todas las posibles permutaciones de aminoácidos dentro de una CDR dada tal como CDR3. En otro método, puede evaluarse la contribución de cada residuo en una CDR a la unión a diana mediante la sustitución de al menos un residuo dentro de la CDR por alanina (Lewis et al. (1995), Mol. Immunol., 32: 1065-1072). Los residuos que no son óptimos para unión a la molécula diana pueden cambiarse después para determinar una secuencia más óptima. Se comprenden también variantes generadas mediante la inserción de aminoácidos para aumentar el tamaño de una CDR tal como CDR3. Por ejemplo, la mayoría de las secuencias CDR3 de cadena ligera son de nueve aminoácidos de longitud. Las secuencias de CDR3 de cadena ligera en un anticuerpo que son más cortas de nueve aminoácidos pueden optimizarse para unión a la molécula diana mediante la inserción de los aminoácidos apropiados para aumentar la longitud de la
CDR.
En una realización, las variantes de anticuerpo o dominio de unión a antígeno comprenden uno o más cambios de aminoácidos en una o más de las CDR1, CDR2 o CDR3 de cadena pesada o ligera, y opcionalmente una o más de las regiones marco conservadas de cadena pesada o ligera FR1, FR2 o FR3. Los cambios de aminoácidos comprenden sustituciones, deleciones y/o inserciones de residuos de aminoácidos.
Las variantes pueden prepararse también mediante "redistribución de cadena" de cadenas pesadas o ligeras. Marks et al. (1992), Biotechnology, 10: 779-783. Típicamente, se combina una cadena ligera (o pesada) sencilla con una biblioteca que tiene un repertorio de cadenas pesadas (o ligeras), y se examina en la población resultante la actividad deseada tal como unión a la molécula diana. Esta técnica permite examinar una muestra mayor de cadenas pesadas (o ligeras) diferentes en combinación con una sola cadena ligera (o pesada) que la posible con bibliotecas que comprenden repertorios de cadenas tanto pesadas como ligeras.
Los asociados de unión específica de la invención pueden ser biespecíficos. Los asociados de unión específica biespecíficos de esta invención pueden tener varias configuraciones. Por ejemplo, los anticuerpos biespecíficos se parecen a anticuerpos sencillos (o fragmentos de anticuerpo), pero tienen dos sitios de unión a antígeno diferentes (regiones variables). Los anticuerpos biespecíficos pueden producirse mediante técnicas químicas (véase, por ejemplo, Kranz et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 78: 5807 (1981)) mediante técnicas de "polidoma" (véase la pat. de EE.UU. nº 4.474.893 de Reading) o mediante técnicas de ADN recombinante. Por ejemplo, un anticuerpo biespecífico según esta invención puede unirse a APRIL y AGP-3. Como otro ejemplo, un anticuerpo biespecífico puede unirse a TACI y BCMA.
Los asociados de unión específica de la descripción pueden ser también heteroanticuerpos. Los heteroanticuerpos son dos o más anticuerpos, o fragmentos de unión a anticuerpo (Fab), ligados entre sí, teniendo cada anticuerpo o fragmento una especificidad diferente.
La descripción se refiere también a anticuerpos "humanizados". Los métodos para humanizar anticuerpos no humanos son bien conocidos en la técnica. Generalmente, un anticuerpo humanizado tiene uno o más residuos de aminoácidos introducidos en un anticuerpo humano a partir de una fuente que es no humana. En general, los residuos no humanos estarán presentes en CDR. La humanización puede realizarse siguiendo métodos conocidos en la técnica (Jones et al., Nature, 321, 522-525 (1986); Riechmann et al., Nature, 332, 323-327 (1988); Verhoeyen et al., Science, 239, 1534-1536 (1988)), sustituyendo regiones determinantes de la complementariedad (CDR) de roedores por las correspondientes regiones de un anticuerpo humano.
Los asociados de unión específica de la descripción incluyen anticuerpos quiméricos, injertados en CDR y humanizados que pueden producirse mediante métodos recombinantes conocidos en la técnica. Los ácidos nucleicos que codifican los anticuerpos se introdujeron en células huésped y se expresaron utilizando materiales y procedimientos descritos en la presente memoria y conocidos en la técnica. En una realización preferida, los anticuerpos se producen en células huésped de mamíferos tales como células CHO. Pueden producirse anticuerpos completamente humanos mediante la expresión de ADN recombinante transfectado en células huésped o mediante la expresión en células de hibridoma como se describe anteriormente.
Están comprendidas en la práctica de esta invención las técnicas para crear versiones de ADN recombinante de las regiones de unión a antígeno de moléculas de anticuerpo que evitan la generación de anticuerpos monoclonales. Para hacer esto, se extraen moléculas de ARN mensajero específicas de anticuerpo de células del sistema inmune tomadas de un animal inmunizado, y se transcriben a ADN complementario (ADNc). El ADNc se clona después en un sistema de expresión bacteriano. Un ejemplo de dicha técnica adecuada para la práctica de esta invención utiliza un sistema de vector de bacteriófago lambda que tiene una secuencia líder que causa que la proteína Fab expresada migre al espacio periplásmico (entre la membrana de pared bacteriana y la pared celular) o se secrete. Pueden generarse y examinarse rápidamente grandes números de fragmentos Fab funcionales para aquellos que se unen al antígeno. Dichos asociados de unión específica a molécula diana (fragmentos Fab con especificidad por la molécula diana) están comprendidos específicamente dentro del término "anticuerpo" como se define, discute y reivindica en la presente
memoria.
Están también dentro del alcance de la descripción técnicas desarrolladas para la producción de anticuerpos quiméricos mediante ayuste de los genes de una molécula de anticuerpo de ratón de especificidad de antígeno apropiada junto con genes de una molécula de anticuerpo humana de actividad biológica apropiada, tal como la capacidad de activar el complemento humano y mediar la ADCC. (Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 81: 6851 (1984), Neuberger et al., Nature, 312: 604 (1984)). Es un ejemplo el reemplazo de una región Fc por la de un isotipo diferente. Los asociados de unión específica tales como los anticuerpos producidos mediante esta técnica están dentro del alcance de la descripción.
En una realización preferida de la descripción, los anticuerpos son anticuerpos completamente humanos. Están así comprendidos por la descripción anticuerpos que se unen a molécula diana y que están codificados por secuencias de ácidos nucleicos que son variantes somáticas de origen natural de secuencias de ácido nucleico de inmunoglobulina de estirpe germinal humana y fragmentos, variantes sintéticas, derivados y fusiones de las mismas. Dichos anticuerpos pueden producirse mediante cualquier método conocido en la técnica. Los métodos ejemplares incluyen la inmunización con un antígeno diana (cualquier polipéptido diana capaz de desencadenar una respuesta inmune, y opcionalmente conjugado con un vehículo) de animales transgénicos (por ejemplo, ratones) que son capaces de producir un repertorio de anticuerpos humanos en ausencia de producción de inmunoglobulina endógena. Véanse, por ejemplo, Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 90, 2551-2555 (1993); Jakobovits et al., Nature, 362, 255-258 (1993); Bruggermann et al., Year in Immunol., 7, 33 (1993).
Como alternativa, pueden generarse anticuerpos humanos mediante el examen in vitro de bibliotecas de anticuerpo de presentación en fago. Véanse Hoogenboom et al., J. Mol. Biol., 227, 381 (1991); Marks et al., J. Mol. Biol., 222, 581 (1991). Se han descrito diversas bibliotecas de presentación en fago que contienen anticuerpo, y pueden prepararse fácilmente por un experto en la técnica. Las bibliotecas pueden contener una diversidad de secuencias de anticuerpo humano tales como fragmentos Fab, Fv y scFv humanos, que pueden examinarse frente a una diana apropiada. Como se describe detalladamente a continuación, las bibliotecas de presentación en fago pueden comprender péptidos o proteínas distintos de los anticuerpos que pueden examinarse para identificar asociados de unión específica de la molécula diana.
Un anticuerpo anti-idiotípico (anti-Id) es un anticuerpo que reconoce determinantes únicos asociados generalmente al sitio de unión a antígeno de un anticuerpo. Puede prepararse un anticuerpo Id inmunizando un animal de la misma especie y tipo genético (por ejemplo, cepa de ratón) como fuente del anticuerpo monoclonal con el anticuerpo monoclonal con el que se está preparando un anti-Id. El animal inmunizado reconocerá y responderá a los determinantes idiotípicos del anticuerpo inmunizante produciendo un anticuerpo ante estos determinantes idiotípicos (el anticuerpo anti-Id). Véase, por ejemplo, la pat. de EE.UU. nº 4.699.880. El anticuerpo anti-Id puede utilizarse también como "inmunógeno" para inducir una respuesta inmune en aún otro animal, produciendo el denominado anticuerpo anti-anti-Id. El anti-anti-Id puede ser epitópicamente idéntico al anticuerpo monoclonal original que indujo el anti-Id. Por tanto, utilizando anticuerpos de los determinantes idiotípicos de un mAb, es posible identificar otros clones que expresan anticuerpos de idéntica especificidad.
Péptidos y moléculas de fusión peptídicas
La solicitud de patente WO 00/24.782, publicada el 4 de mayo de 2000, mencionada anteriormente en la presente memoria, describe con detalle diversas técnicas de generación de péptido. Esta solicitud de patente describe además diversos derivados y moléculas de fusión.
Particularmente, un péptido utilizado como asociado de unión específica puede estar comprendido en una molécula de fórmula
(X^{1})_{a} - F^{1} - (X^{2})_{b}
en la que
F^{1} es un vehículo;
X^{1} y X^{2} se seleccionan cada uno independientemente de -(L^{1})_{c}-P^{1}, -(L^{1})_{c}-P^{1}-(L^{2})_{d}-P^{2}, -(L^{1})_{c}-P^{1}-(L^{2})_{d}-P^{2}-(L^{3})_{c}-P^{3} y -(L^{1})_{c}-P^{1}-(L^{2})_{d}-P^{2}-(L^{3})_{c}-P^{3}-(L^{4})_{f}-P^{4},
P^{1}, P^{2}, P^{3} y P^{4} son independientemente cada uno secuencias peptídicas en las que al menos una es un asociado de unión específica;
L^{1}, L^{2}, L^{3} y L^{4} son cada uno independientemente engarces; y
a, b, c, d, e y f son cada uno independientemente 0 ó 1, a condición de que al menos uno de a y b sea 1.
Preferiblemente, dicha molécula comprende una estructura de fórmulas
X^{1} - F^{1}
o
F^{1} - X^{2}.
Una molécula más preferida comprende una estructura de fórmula
F^{1} - (L^{1})_{c} - P^{1} - (L^{2})_{d} - P^{2}
en la que P^{1} y/o P^{2} es un asociado de unión específica de TACI o BCMA.
Dichas moléculas facilitan la modulación tanto de TACI como de BCMA, por ejemplo, uno de P^{1} y P^{2} es un asociado de unión específica de TACI y el otro es un asociado de unión específica de BCMA. A la inversa, en un inhibidor de ligando, uno de P^{1} y P^{2} es un asociado de unión específica de APRIL y el otro es un asociado de unión específica de AGP-3.
Para todas estas moléculas, el vehículo preferido es un dominio Fc. Entre los dominios Fc, se prefieren Fc de IgG, particularmente de IgG1.
Los dominios Fc, engarces y procesos de preparación de las moléculas anteriores se describen en el documento WO 00/24.782, publicado el 4 de mayo de 2000.
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Fragmentos de receptor soluble
Otra clase de asociados de unión específica son los fragmentos de receptor soluble. Son de particular interés los fragmentos identificados en las figuras:
a.
la región extracelular de TACI (SEC ID Nº 15)
b.
la región extracelular de BCMA (SEC ID Nº 6)
c.
la región consenso de TACI (SEC ID Nº 16)
d.
la región consenso de BCMA (SEC ID Nº 7)
e.
la secuencia consenso extracelular TACI/BCMA (SEC ID Nº 13).
Estas moléculas tienen la ventaja no reconocida hasta el momento de unirse tanto a APRIL como a AGP-3. Como los péptidos anteriormente citados, estos asociados de unión específica pueden estar también ligados covalentemente a un vehículo, preferiblemente un dominio Fc.
Muteínas
Pueden resultar secuencias peptídicas útiles adicionales a partir de modificaciones conservativas y/o no conservativas de las secuencias de aminoácidos de los anticuerpos, péptidos, péptidos de fusión con Fc y fragmentos de receptor anteriormente citados.
Las modificaciones conservativas producirán moléculas que tienen características funcionales y químicas similares a las de la molécula a partir de la que se preparan dichas modificaciones. En contraposición, pueden realizarse modificaciones sustanciales de las características funcionales y/o químicas de las moléculas seleccionando sustituciones en la secuencia de aminoácidos que difieren significativamente en su efecto sobre el mantenimiento de (a) la estructura de la cadena principal molecular en la zona de sustitución, por ejemplo, en conformación de lámina o hélice, (b) la carga o hidrofobicidad de la molécula en el sitio diana, o (c) el tamaño de la molécula.
Por ejemplo, una "sustitución de aminoácido conservativa" puede implicar una sustitución de un residuo de aminoácido nativo por un residuo no nativo de tal modo que haya poco o ningún efecto sobre la polaridad o la carga del residuo de aminoácido en esa posición. Además, cualquier residuo nativo en el polipéptido puede sustituirse también por alanina, como se ha descrito anteriormente para la "mutagénesis de análisis con alanina" (véanse, por ejemplo, MacLennan et al., 1998, Acta Physiol. Scand. Suppl., 643: 55-67; Sasaki et al., 1998, Adv. Biophys., 35: 1-24, que discute la mutagénesis de análisis con alanina).
Las sustituciones de aminoácido deseadas (tanto conservativas como no conservativas) pueden determinarse por los expertos en la técnica en el momento en que se desean dichas sustituciones. Por ejemplo, las sustituciones de aminoácidos pueden utilizarse para identificar residuos importantes de la secuencia molecular, o para aumentar o reducir la afinidad de las moléculas descritas en la presente memoria. Se exponen sustituciones de aminoácido ejemplares en la Tabla 3.
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TABLA 3 Sustituciones de aminoácido
1
2
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En ciertas realizaciones, las sustituciones de aminoácido conservativas comprenden también residuos de aminoácido de origen no natural que se incorporan típicamente mediante síntesis peptídica química en lugar de síntesis en sistemas biológicos.
Como se observa en la sección anterior "Definición de términos", los residuos de origen natural pueden dividirse en clases basadas en propiedades de la cadena lateral comunes que pueden ser útiles para modificaciones de secuencia. Por ejemplo, las sustituciones no conservativas pueden implicar el intercambio de un miembro de una de estas clases por un miembro de otra clase. Dichos residuos sustituidos pueden introducirse en regiones de la molécula que son homólogas de ortólogos no humanos, o en las regiones no homólogas de la molécula. Además, pueden hacerse también modificaciones utilizando P o G con fines de influir en la orientación de cadena.
Al hacer dichas modificaciones, puede considerarse el índice hidropático de los aminoácidos. Se ha asignado a cada aminoácido un índice hidropático basándose en sus características de hidrofobicidad y carga, estos son: isoleucina (+4,5), valina (+4,2), leucina (+3,8), fenilalanina (+2,8), cisteína/cistina (+2,5), metionina (+1,9), alanina (+1,8), glicina (-0,4), treonina (-0,7), serina (-0,8), triptófano (-0,9), tirosina (-1,3), prolina (-1,6), histidina (-3,2), glutamato (-3,5), glutamina (-3,5), aspartato (-3,5), asparagina (-3,5), lisina (-3,9) y arginina (-4,5).
La importancia del índice hidropático de aminoácidos para conferir función biológica interactiva a una proteína es entendida en la técnica. Kyte et al., J. Mol. Biol., 157: 105-131 (1982). Es conocido que ciertos aminoácidos pueden sustituirse por otros aminoácidos que tienen un índice o puntuación hidropático similar y seguir reteniendo una actividad biológica similar. Al hacer cambios basados en el índice hidropático, se prefiere la sustitución de aminoácidos cuyos índices hidropáticos están a \pm 2, aquellos que están a \pm 1 son particularmente preferidos y aquellos a \pm 0,5 son aún más particularmente preferidos.
Se entiende también en la técnica que la sustitución de aminoácidos similares puede hacerse eficazmente basándose en la hidrofilicidad. La mayor hidrofilicidad media local de una proteína, regida por la hidrofilicidad de sus aminoácidos adyacentes, se correlaciona con su inmunogenicidad y antigenicidad, concretamente, con una propiedad biológica de la proteína.
Se han asignado los siguientes valores de hidrofilicidad a los residuos de aminoácidos: arginina (+3,0), lisina (+3,0), aspartato (+3,0 \pm1), glutamato (+3,0 \pm1), serina (+0,3), asparagina (+0,2), glutamina (+0,2), glicina (0), treonina (-0,4), prolina (-0,5 \pm1), alanina (-0,5), histidina (-0,5), cisteína (-1,0), metionina (-1,3), valina (-1,5), leucina (-1,8), isoleucina (-1,8), tirosina (-2,3), fenilalanina (-2,5), triptófano (-3,4). Al hacer cambios basados en valores de hidrofilicidad similares, se prefiere la sustitución de aminoácidos cuyos valores de hidrofilicidad están a \pm 2, se prefieren particularmente aquellos que están a \pm 1, y se prefieren aún más particularmente aquellos a \pm 0,5. Pueden identificarse también epítopos de secuencias de aminoácidos primarias basándose en la hidrofilicidad. Estas regiones se designan también como "regiones núcleo epitópicas".
Un experto en la técnica será capaz de determinar las variables adecuadas del polipéptido como se expone en las secuencias anteriores utilizando técnicas bien conocidas. Para identificar las zonas adecuadas de la molécula que pueden cambiarse sin destruir la actividad, un experto en la técnica puede dirigirse a zonas que se cree que no son importantes para la actividad. Por ejemplo, cuando son conocidos polipéptidos similares con actividades similares de la misma especie o de otras especies, un experto en la técnica puede comparar la secuencia de aminoácidos de una molécula con moléculas similares. Con dicha comparación, pueden identificarse los residuos y porciones de las moléculas que están conservados entre polipéptidos similares. Se apreciará que sería menos probable que los cambios en las zonas de una molécula que no están conservados respecto a dichas moléculas similares afectaran adversamente a la actividad biológica y/o la estructura de la molécula. Un experto en la técnica sabría también que, incluso en regiones relativamente conservadas, se pueden sustituir con aminoácidos químicamente similares los residuos de origen natural reteniendo la actividad (sustituciones conservativas de residuos de aminoácidos). Por lo tanto, incluso zonas que pueden ser importantes para la actividad biológica o la estructura, pueden estar sujetas a sustituciones conservativas de aminoácidos sin destruir la actividad biológica o sin afectar adversamente la estructura de la molécula.
Adicionalmente, un experto en la técnica puede revisar los estudios de estructura-función identificando los residuos en moléculas similares que son importantes para la actividad o la estructura. A la vista de dicha comparación, puede predecirse la importancia de los residuos de aminoácido en una molécula que corresponden con los residuos de aminoácido que son importantes para la actividad o la estructura en moléculas similares. Un experto en la técnica puede optar por sustituciones de aminoácidos químicamente similares para dichos residuos de aminoácidos importantes predichos de las moléculas.
Un experto en la técnica puede analizar también la estructura tridimensional y la secuencia de aminoácidos con respecto a esa estructura en polimoléculas similares. A la vista de esa información, un experto en la técnica puede predecir el alineamiento de los residuos de aminoácidos de una molécula con respecto a su estructura tridimensional. Un experto en la técnica puede elegir no hacer cambios radicales en los residuos de aminoácido que se predice que están en la superficie de la proteína, ya que dichos residuos pueden estar implicados en interacciones importantes con otras moléculas. Además, un experto en la técnica puede generar variantes de ensayo que contienen una sola sustitución de aminoácido en cada residuo de aminoácido deseado. Las variantes pueden examinarse después utilizando ensayos de actividad conocidos por los expertos en la técnica. Dichos datos podrían utilizarse para reunir información sobre variantes adecuadas. Por ejemplo, si se descubriera que un cambio en un residuo de aminoácido particular daba como resultado una actividad destruida, indeseablemente reducida o inadecuada, se evitarían las variantes con dicho cambio. En otras palabras, basándose en la información reunida a partir de dichos experimentos rutinarios, un experto en la técnica puede determinar fácilmente los aminoácidos en que deberían evitarse sustituciones adicionales solas o en combinación con otras mutaciones.
Se han dedicado una serie de publicaciones científicas a la predicción de la estructura secundaria. Véanse Moult J., Curr. Op. in Biotech., 7(4): 422-427 (1996); Chou et al., Biochemistry, 13(2): 222-245 (1974); Chou et al., Biochemistry, 113(2): 211-222 (1974); Chou et al., Adv. Enzymol. Relat. Areas Mol. Biol., 47: 45-148 (1978); Chou et al., Ann. Rev. Biochem., 47: 251-276 y Chou et al., Biophys. J., 26: 367-384 (1979). Además, están actualmente disponibles programas informáticos para ayudar a predecir la estructura secundaria. Un método de predicción de la estructura secundaria está basado en la modelización por homología. Por ejemplo, dos polipéptidos o proteínas que tienen una identidad de secuencia de más de un 30%, o una similitud superior a un 40%, a menudo tienen topologías estructurales similares. El reciente crecimiento de la base de datos estructurales de proteínas (PDB) ha proporcionado una predecibilidad potenciada de la estructura secundaria, incluyendo el número potencial de plegamientos en la estructura de un polipéptido o proteína. Véase Holm et al., Nucl. Acid. Res., 27(1): 244-247 (1999). Se ha sugerido (Brenner et al., Curr. Op. Struct. Biol., 7(3): 369-376 (1997)) que hay un número limitado de plegamientos en un polipéptido o proteína dado y que, una vez se ha resuelto un número crítico de estructuras, la predicción estructural ganará drásticamente exactitud.
Los métodos adicionales de predicción de la estructura secundaria incluyen "enhebrado", (Jones, D., Curr. Opin. Struct. Biol., 7(3): 377-387 (1997); Sippl. et al., Structure, 4(1): 15-19 (1996)), "análisis de perfil" (Bowie et al., Science, 253: 164-170 (1991); Gribskov et al., Meth. Enzym., 183: 146-159 (1990); Gribskov et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 84(13): 4355-4358 (1987)) y "conexión evolutiva" (véase Home, anteriormente, y Brenner, anteriormente).
Producción de asociados de unión específica
Cuando el asociado de unión específica para preparar es un asociado de unión específica proteico tal como un anticuerpo o un dominio de unión de antígeno o molécula de fusión péptido-Fc, están disponibles diversos métodos biológicos o químicos para producir dicho asociado.
Los métodos biológicos son preferibles para producir suficientes cantidades de un asociado de unión específica para uso terapéutico. Las técnicas de ADN recombinante son particularmente útiles para la producción de anticuerpos y dominios de unión a antígeno de la invención. Se describen a continuación vectores de expresión, células huésped y métodos para la recuperación del producto expresado ejemplares.
Se inserta una molécula de ácido nucleico que codifica un anticuerpo o dominio de unión a antígeno en un vector de expresión apropiado utilizando técnicas de ligamiento estándar. Se selecciona típicamente el vector para ser funcional en la célula huésped particular empleada (concretamente, el vector es compatible con la maquinaria de la célula huésped de tal modo que pueda ocurrir la amplificación del gen y/o la expresión del gen). Puede amplificarse/expresarse una molécula de ácido nucleico que codifica un anticuerpo en células huésped procarióticas, de levadura, de insecto (sistemas de baculovirus) y/o eucarióticas. La selección de la célula huésped dependerá en parte de si el anticuerpo ha de modificarse post-traduccionalmente (por ejemplo, glicosilarse y/o fosforilarse). En ese caso, son preferibles células huésped de levadura, insecto o mamífero. Para una revisión de los vectores de expresión, véase Meth. Enz., v. 185, (D.V. Goeddel, ed.), Academic Press Inc. San Diego, CA (1990).
Típicamente, los vectores de expresión utilizados en cualquier célula huésped contendrán uno o más de los siguientes componentes: un promotor, una o más secuencias potenciadoras, un origen de replicación, una secuencia de terminación transcripcional, una secuencia de intrón completa que contiene un sitio donante y un sitio aceptor de ayuste, una secuencia líder para secreción, un sitio de unión a ribosoma, una secuencia de poliadenilación, una región de poliengarce para insertar el ácido nucleico que codifica el polipéptido que se va a expresar, y un elemento marcador detectable. Cada una de estas secuencias se discute con más detalle a continuación.
Los componentes del vector pueden ser homólogos (concretamente, de la misma especie y/o cepa que la célula huésped), heterólogos (concretamente, de una especie distinta de la especie o cepa de la célula huésped), híbridos (concretamente, una combinación de diferentes secuencias de más de una fuente), sintéticos o secuencias nativas que funcionan normalmente regulando la expresión de inmunoglobulina. Como tal, una fuente de componentes vector puede ser cualquier organismo procariótico o eucariótico, cualquier organismo vertebrado o invertebrado, o cualquier planta, a condición de que los componentes sean funcionales en, y puedan activarse por, la maquinaria de la célula huésped.
Se selecciona un origen de replicación basándose en el tipo de célula huésped utilizado para expresión. Por ejemplo, el origen de replicación del plásmido pBR322 (nº de producto 303-3s, New England Biolabs, Beverly, MA) es adecuado para la mayoría de las bacterias gram-negativas, mientras que diversos orígenes de SV40, polioma, adenovirus, virus de estomatitis vesicular (VSV) o papilomavirus (tales como HPV o BPV) son útiles para clonar vectores en células de mamífero. Generalmente, el componente origen de replicación no es necesario para vectores de expresión de mamífero (por ejemplo, el origen SV40 se utiliza a menudo sólo porque contiene el promotor temprano).
Una secuencia de terminación de la transcripción está localizada típicamente 3' del extremo de las regiones que codifican un polipéptido, y sirve para terminar la transcripción. Habitualmente, es una secuencia de terminación de la transcripción en células procarióticas un fragmento rico en G-C seguido por una secuencia de poli-T. Aunque la secuencia se clona fácilmente a partir de una biblioteca o incluso se adquiere comercialmente como parte de un vector, puede sintetizarse también fácilmente utilizando métodos para la síntesis de ácido nucleico tales como los descritos anteriormente.
El elemento gen marcador detectable codifica una proteína necesaria para la supervivencia y el crecimiento de una célula huésped crecida en un medio de cultivo selectivo. Los genes marcadores de selección típicos codifican proteínas que (a) confieren resistencia a antibióticos u otras toxinas, por ejemplo, ampicilina, tetraciclina o kanamicina para células huésped procarióticas, (b) complementan deficiencias auxotróficas de la célula, o (c) suministran nutrientes críticos no disponibles en medios complejos. Los marcadores detectables preferidos son el gen de resistencia a kanamicina, el gen de resistencia a ampicilina y el gen de resistencia a tetraciclina. Puede utilizarse también un gen de resistencia a neomicina para selección en células huésped procarióticas y eucarióticas.
Pueden utilizarse otros genes selectivos para amplificar el gen que se expresará. La amplificación es el proceso en el que los genes que tienen mayor demanda para la producción de una proteína crítica para el crecimiento se repiten en serie dentro de los cromosomas de generaciones sucesivas de células recombinantes. Los ejemplos de marcadores detectables adecuados para células de mamífero incluyen dihidrofolato reductasa (DHFR) y timidina quinasa. Los transformantes de células de mamífero se disponen bajo presión selectiva en la que sólo los transformantes están adaptados únicamente para sobrevivir en virtud del marcador presente en el vector. La presión selectiva se impone cultivando las células transformadas en condiciones en las que la concentración de asociado selectivo en el medio se cambia sucesivamente, conduciendo así a la amplificación tanto del gen selectivo como del ADN que codifica un anticuerpo. Como resultado, se sintetizan cantidades aumentadas de un anticuerpo a partir del ADN amplificado.
Habitualmente es necesario un sitio de unión a ribosoma para la iniciación de la traducción de ARNm, y se caracteriza por una secuencia de Shine-Dalgarno (procariotas) o secuencia de Kozak (eucariotas). El elemento se localiza típicamente 3' del promotor y 5' de la secuencia de codificación del polipéptido que se va a expresar. La secuencia de Shine-Dalgarno varía, pero es típicamente una polipurina (concretamente, que tiene un alto contenido de A-G). Se han identificado muchas secuencias de Shine-Dalgarno, cada una de las cuales puede sintetizarse fácilmente utilizando métodos expuestos anteriormente y utilizarse en un vector procariótico.
Se utiliza una secuencia líder, o señal, para dirigir la secreción de un polipéptido. Puede colocarse una secuencia señal dentro o directamente en el extremo 5' de una región codificante de polipéptido. Se han identificado muchas secuencias señal y pueden seleccionarse basándose en la célula huésped utilizada para expresión. En la presente descripción, una secuencia señal puede ser homóloga (de origen natural) o heteróloga de una secuencia de ácido nucleico que codifica un anticuerpo o dominio de unión a antígeno. Una secuencia señal heteróloga seleccionada debería ser aquella que es reconocida y procesada, concretamente se escinde, por una peptidasa señal por la célula huésped. Para células huésped procarióticas que no reconocen ni procesan una secuencia señal de inmunoglobulina nativa, la secuencia señal se sustituye por una secuencia señal procariótica seleccionada, por ejemplo, del grupo de líderes de fosfatasa alcalina, penicilinasa o enterotoxina II termoestable. Para la secreción de levadura, puede sustituirse una secuencia señal de inmunoglobulina nativa por líderes de invertasa de levadura, factor alfa o fosfatasa ácida. En la expresión de células de mamífero, la secuencia señal nativa es satisfactoria, aunque pueden ser adecuadas otras secuencias señal de mamífero.
En la mayoría de los casos, la secreción de un anticuerpo o dominio de unión a antígeno a partir de una célula huésped dará como resultado la eliminación del péptido señal del anticuerpo. Por tanto, el anticuerpo maduro carecerá de cualquier secuencia líder o señal.
En algunos casos, tales como cuando se desea glicosilación en un sistema de expresión de célula huésped eucariótica, pueden manipularse las diversas presecuencias para mejorar la glicosilación o el rendimiento. Por ejemplo, puede alterarse el sitio de escisión de peptidasa de un péptido señal particular, o añadirse prosecuencias que pueden afectar también a la glicosilación. El producto proteico final puede tener en la posición -1 (respecto al primer aminoácido de la proteína madura) uno o más aminoácidos adicionales inherentes a la expresión, que pueden no haberse eliminado completamente. Por ejemplo, el producto proteico final puede tener uno o dos aminoácidos encontrados en el sitio de escisión de peptidasa, unidos a la terminación N. Como alternativa, el uso de algunos sitios de escisión enzimática puede dar como resultado una forma ligeramente truncada del polipéptido deseado, si la enzima corta en dicha zona dentro del polipéptido maduro.
Los vectores de expresión de la presente invención contendrán típicamente un promotor que se reconoce por el organismo huésped y está ligado operativamente a una molécula de ácido nucleico que codifica un anticuerpo o dominio de unión a antígeno. Puede utilizarse un promotor nativo o heterólogo, dependiendo de la célula huésped utilizada para expresión y del rendimiento de la proteína deseada.
Los promotores adecuados para uso con huéspedes procarióticos incluyen los sistemas promotores de beta-lactamasa y lactosa, fosfatasa alcalina, un sistema promotor de triptófano (trp) y promotores híbridos tales como el promotor tac. Son también adecuados otros promotores bacterianos conocidos. Sus secuencias se han publicado, posibilitando así que un experto en la técnica los ligue a la(s) secuencia(s) de ADN deseado, utilizando engarces o adaptadores según sea necesario para suministrar cualquier sitio de restricción necesario.
Los promotores adecuados para uso con huéspedes de levadura son también bien conocidos en la técnica. Los potenciadores de levadura se utilizan ventajosamente con promotores de levadura. Los promotores adecuados para uso con células huésped de mamíferos son bien conocidos e incluyen aquellos obtenidos a partir de los genomas de virus tales como virus de polioma, virus de viruela aviar, adenovirus (tal como adenovirus 2), papilomavirus bovino, virus de sarcoma aviar, citomegalovirus, un retrovirus, virus de la hepatitis B y, lo más preferiblemente, virus de simio 40 (SV40). Otros promotores de mamífero adecuados incluyen promotores de mamífero heterólogos, por ejemplo, promotores de shock térmico y el promotor de actina.
Los promotores adicionales que pueden utilizarse para expresar los asociados de unión específica de la invención incluyen, pero sin limitación: la región promotora temprana de SV40 (Benoist y Chambon (1981), Nature, 290: 304-310); el promotor de CMV; el promotor contenido en la repetición terminal larga 3' de virus del sarcoma de Rous (Yamamoto et al., (1980), Cell, 22: 787-797); el promotor de timidina quinasa de herpes (Wagner et al. (1981), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 78, 1444-1445); las secuencias reguladoras del gen de metalotioneína (Brinster et al., (1982), Nature, 296: 39-42); vectores de expresión procariótica tales como el promotor de beta-lactamasa (Villa-Kamaroff et al. (1978), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75: 3727-3731) o el promotor tac (DeBoer et al. (1983), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 80: 21-25). Son también de interés las siguientes regiones de control transcripcional animal, que exhiben especificidad de tejido y que se han utilizado en animales transgénicos: la región de control del gen de elastasa I que es activa en células acinares pancreáticas (Swift et al., (1984), Cell, 38: 639-646; Ornitz et al. (1986), Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 50: 399-409; MacDonald (1987), Hepatology, 7: 425-515); la región de control del gen de insulina que es activa en células beta pancreáticas (Hanahan (1985), Nature, 315: 115-122); la región de control del gen de inmunoglobulina que es activa en células linfoides (Grosschedl et al., (1984), Cell, 38: 647-658; Adames et al. (1985), Nature, 318: 533-538; Alexander et al. (1987), Mol. Cell. Biol., 7: 1436-1444); la región de control del virus de tumor mamario de ratón que es activa en células testiculares, de mama, linfoides y mastocitos (Leder et al., (1986), Cell, 45: 485-495); la región de control del gen de albúmina que es activa en el hígado (Pinkert et al., (1987), Genes and Devel., 1: 268-276); la región de control del gen de alfafetoproteína que es activa en el hígado (Krumlauf et al. (1987), Mol. Cell. Biol. 5: 1639-1648; Hammer et al., (1987), Science, 235: 53-58); la región de control del gen de alfa-1-antitripsina que es activa en el hígado (Kelsey et al. (1987), Genes and Devel., 1: 161-171; la región de control del gen de beta-globina que es activa en células mieloides (Mogram et al. (1985), Nature, 315: 338-340; Kollias et al., (1986), Cell, 46: 89-94); la región de control del gen de la proteína básica mielina que es activa en células oligodendrocíticas en el cerebro (Readhead et al., (1987), Cell, 48: 703-712); la región de control del gen de cadena ligera 2 de miosina que es activa en músculo esquelético (Sani (1985), Nature, 314: 283-286); y la región de control del gen de hormona de liberación gonadotrópica que es activa en el hipotálamo (Mason et al., (1986), Science, 234: 1372-1378).
Puede insertarse una secuencia potenciadora en el vector para aumentar la transcripción en células huésped eucarióticas. Son conocidas diversas secuencias potenciadoras disponibles en genes de mamífero (por ejemplo, globina, elastasa, albúmina, alfa-fetoproteína e insulina). Sin embargo, típicamente se utilizará un potenciador de un virus. El potenciador SV40, el potenciador promotor temprano de citomegalovirus, el potenciador de polioma y los potenciadores de adenovirus son elementos potenciadores ejemplares para la activación de promotores eucarióticos. Aunque un potenciador puede ayustarse en el vector en una posición 5' o 3' de la región de codificación del polipéptido, se localiza típicamente en un sitio 5' del promotor.
Los vectores preferidos para practicar esta invención son aquellos que son compatibles con células huésped de bacterias, insectos y mamíferos. Dichos vectores incluyen, entre otros, pCRII, pCR3 y pcDNA3.1 (Invitrogen Company, San Diego, CA), pBSII (Stratagene Company, La Jolla, CA), pET15 (Novagen, Madison, WI), pGEX (Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ), pEGFP-N2 (Clontech, Palo Alto, CA), pETL (BlueBacII, Invitrogen), pDSR-alfa (publicación PCT nº WO 90/14.363) y pFastBacDual (Gibco/BRL, Grand Island, NY).
Los vectores posibles adicionales incluyen, pero sin limitación, cósmidos, plásmidos o virus modificados, pero el sistema de vector debe ser compatible con la célula huésped seleccionada. Dichos vectores incluyen, pero sin limitación, plásmidos tales como derivados del plásmido Bluescript® (un fagémido basado en ColE1 de alto número de copias, Stratagene Cloning Systems Inc., La Jolla, CA), plásmidos de clonación por PCR diseñados para clonar productos de PCR amplificados por Taq (por ejemplo, TOPO^{TM} TA Cloning® Kit, derivados del plásmido PCR2.1®, Invitrogen, Carlsbad, CA) y vectores de mamífero, levadura o víricos tales como un sistema de expresión de baculovirus (derivados del plásmido pBacPAK, Clontech, Palo Alto, CA). Las moléculas recombinantes pueden introducirse en células huésped mediante transformación, transfección, infección, electroporación u otras técnicas
conocidas.
Las células huésped de la invención pueden ser células huésped procarióticas (tales como E. coli) o células huésped eucarióticas (tales como una célula de levadura, una célula de insecto o una célula de vertebrado). Las células huésped procarióticas tales como E. coli producen proteína no glicosilada, por ejemplo, shBCMA no glicosilada y shTCAI no glicosilada, que puede poseer ventajas frente a las moléculas eucarióticas glicosiladas. La célula huésped, cuando se cultiva en condiciones apropiadas, expresa un anticuerpo o dominio de unión a antígeno de la invención que puede recogerse posteriormente del medio de cultivo (si la célula huésped lo secreta en el medio) o directamente de la célula huésped que lo produce (si no se secreta). La selección de una célula huésped apropiada dependerá de diversos factores tales como los niveles de expresión deseados, las modificaciones polipeptídicas que son deseables o necesarias para la actividad tales como glicosilación o fosforilación, y la facilidad de plegamiento en una molécula biológicamente activa.
Son conocidas una serie de células huésped en la técnica, y muchas están disponibles en la American Type Culture Collection (ATCC), Manassas, VA. Los ejemplos incluyen células de mamíferos tales como células CHO DHFR de ovario de hámster chino (CHO) (nº de ATCC CCL61) (Urlaub et al. (1980), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 97, 4217-4220), células 293 o 293T de riñón embriónico humano (HEK) (nº de ATCC CRL1573) o células 3T3 (nº de ATCC CCL92). Son conocidos en la técnica la selección de las células huésped de mamífero y los métodos para la transformación, cultivo, amplificación, examen y producción y purificación de producto adecuados. Son otras estirpes celulares de mamífero adecuadas las estirpes celulares COS-1 de mono (nº de ATCC CRL1650) y COS-7 (nº de ATCC CRL1651) y la estirpe celular CV-1 (nº de ATCC CCL70). Las células huésped de mamífero ejemplares adicionales incluyen estirpes celulares de primate y estirpes celulares de roedor, incluyendo estirpes celulares transformadas. Son también adecuadas células diploides normales, cepas celulares derivadas del cultivo in vitro de tejido primario, así como explantes primarios. Las células candidatas pueden ser genotípicamente deficientes en el gen de selección, o pueden contener un gen de selección de acción dominante. Otras estirpes celulares de mamífero adecuadas incluyen, pero sin limitación, células N2A de neuroblastoma de ratón, células HeLa, L-929 de ratón, estirpes 3T3 derivadas de ratones Swiss, Balb-c o NIH, estirpes celulares de hámster BHK o HaK, que están disponibles en la American Type Culture Collection, Manassas, VA). Cada una de estas estirpes celulares es conocida por y está disponible para los expertos en la técnica de la expresión de proteína.
Son similarmente útiles como células huésped adecuadas para la presente invención las células bacterianas. Por ejemplo, las diversas cepas de E. coli (por ejemplo, HB101, nº de ATCC 33694), DH5\alpha, DH10 y MC1061 (nº de ATCC 53338)) son bien conocidas como células huésped en el campo de la biotecnología. Pueden emplearse también diversas cepas de Pseudomonas spp., B. subtilis, otros Bacillus spp., Streptomyces spp. y similares en este método.
Muchas cepas de células de levadura conocidas por los expertos en la técnica están también disponibles como células huésped para la expresión de los polipéptidos de la presente invención. Las células de levadura preferidas incluyen, por ejemplo, Saccharomyces cerevisiae.
Adicionalmente, cuando se desee, pueden utilizarse sistemas de células de insecto en los métodos de la presente invención. Dichos sistemas se describen, por ejemplo, en Kitts et al. (1993), Biotechniques, 14: 810-817, Lucklow (1993), Curr. Opin. Biotechnol., 4: 564-572 y Lucklow et al., (1993), J. Virol. 67: 4566-4579. Las células de insecto preferidas son Sf-9 e Hi5 (Invitrogen, Carlsbad, CA).
La transformación o transfección de una molécula de ácido nucleico que codifica un asociado de unión específica en una célula huésped seleccionada puede conseguirse mediante métodos bien conocidos, incluyendo métodos tales como cloruro de calcio, electroporación, microinyección, lipofección o el método de extracción con DEAE-dextrano. El método seleccionado estará en parte en función del tipo de célula huésped que se va a utilizar. Estos métodos y otros métodos adecuados son bien conocidos por el experto en la técnica y se exponen, por ejemplo, en Sambrook et al., anteriormente.
Pueden utilizarse también animales transgénicos para expresar asociados de unión específica glicosilados tales como anticuerpos y dominios de unión a antígeno. Por ejemplo, puede utilizarse un animal productor de leche transgénico (una vaca o cabra, por ejemplo) y obtener asociados de unión glicosilados en la leche animal. Como alternativa, pueden utilizarse plantas para producir asociados de unión específica glicosilados.
Las células huésped que comprenden (por transformación o transfección) un vector de expresión que codifica un asociado de unión específica de la molécula diana pueden cultivarse utilizando medios estándar bien conocidos por el experto en la técnica. Los medios contendrán habitualmente todos los nutrientes necesarios para el crecimiento y la supervivencia de las células. Son medios adecuados para cultivar células E. coli, por ejemplo, caldo Luria (LB) y/o caldo Terrific (TB). Los medios adecuados para cultivar células eucarióticas son RPMI 1640, MEM, DMEM, todos los cuales pueden suplementarse con suero y/o factores de crecimiento según sea necesario para la estirpe celular particular que se está cultivando. Un medio adecuado para cultivos de insecto es el medio Grace suplementado con Yeastolate, hidrolizado de lactoalbúmina y/o suero de ternero fetal, según sea necesario.
Típicamente, se añade como suplemento a los medios un antibiótico u otro compuesto útil para el crecimiento selectivo de células transfectadas o transformadas. El compuesto que se va a utilizar estará dictado por el elemento marcador detectable presente en el plásmido con el que se transformó la célula huésped. Por ejemplo, cuando el elemento marcador detectable es la resistencia a kanamicina, el compuesto añadido al medio de cultivo será kanamicina. Otros compuestos para crecimiento selectivo incluyen ampicilina, tetraciclina y neomicina.
La cantidad de un anticuerpo o dominio de unión a antígeno producida por una célula huésped puede evaluarse utilizando métodos estándar conocidos en la técnica. Dichos métodos incluyen, sin limitación, análisis de transferencia Western, electroforesis en gel de SDS-poliacrilamida, electroforesis en gel no desnaturalizante, separación por HPLC, inmunoprecipitación y/o ensayos de actividad.
La purificación de un asociado de unión específica que se ha secretado en los medios celulares puede conseguirse utilizando una variedad de técnicas, incluyendo cromatografía de afinidad, inmunoafinidad o intercambio iónico, cromatografía de tamiz molecular, electroforesis en gel preparativa o enfoque isoeléctrico, cromatoenfoque y cromatografía líquida de alta presión. Por ejemplo, los anticuerpos que comprenden una región Fc pueden purificarse convenientemente mediante cromatografía de afinidad con proteína A, que se une selectivamente a la región Fc. Las formas modificadas de un anticuerpo o dominio de unión a antígeno pueden prepararse con marcajes de afinidad tales como hexahistidina u otro péptido pequeño tal como FLAG (Eastman Kodak Co., New Haven, CT) o myc (Invitrogen) en su terminación carboxilo o amino y purificarse mediante una columna de afinidad de una etapa. Por ejemplo, la polihistidina se une con mayor afinidad y especificidad al níquel, por tanto puede utilizarse una columna de afinidad de níquel (tal como las columnas de níquel Qiagen®) para la purificación de asociados de unión específica marcados con polihistidina. Véase, por ejemplo, Ausubel et al., ed. (1993), "Current Protocols in Molecular Biology", sección 10.11.8, John Wiley & Sons, Nueva York. En algunos casos, puede ser necesaria más de una etapa de
purificación.
Los asociados de unión específica de la invención que se expresan en células huésped procarióticas pueden estar presentes en forma soluble en el espacio periplásmico o en el citoplasma, o en forma insoluble como parte de los cuerpos de inclusión intracelulares. Los asociados de unión específica pueden extraerse de la célula huésped utilizando cualquier técnica estándar conocida por el experto en la técnica. Por ejemplo, las células huésped pueden lisarse para liberar los contenidos del periplasma/citoplasma mediante prensa French, homogeneización y/o sonicación, seguido de centrifugación.
Las formas solubles de un anticuerpo o dominio de unión a antígeno presente en el citoplasma o liberado desde el espacio periplásmico pueden purificarse además utilizando métodos conocidos en la técnica, por ejemplo, se liberan fragmentos Fab desde el espacio periplásmico bacteriano mediante técnicas de shock osmótico.
Si un anticuerpo o dominio de unión a antígeno ha formado cuerpos de inclusión, a menudo pueden unirse a las membranas celulares interior y/o exterior, y por tanto se encontrarán principalmente en el material de sedimento después de la centrifugación. El material de sedimento puede tratarse después a pH extremo o con un asociado caotrópico tal como un detergente, guanidina, derivados de guanidina, urea o derivados de urea en presencia de un asociado reductor tal como ditiotreitol a pH alcalino o triscarboxietilfosfina a pH ácido para liberar, disgregar y solubilizar los cuerpos de inclusión. El asociado de unión específica soluble puede analizarse después utilizando electroforesis en gel, inmunoprecipitación o similares. Si se desea aislar un anticuerpo o dominio de unión a antígeno solubilizado, el aislamiento puede realizase utilizando métodos estándar tales como los expuestos anteriormente y en Marston et al. (1990), Meth. Enz., 182: 264-275.
En algunos casos, un anticuerpo o dominio de unión a antígeno puede no ser biológicamente activo tras el aislamiento. Pueden utilizarse diversos métodos para "replegar" o convertir el polipéptido a su estructura terciaria y generar enlaces disulfuro para restaurar la actividad biológica. Dichos métodos incluyen exponer el polipéptido solubilizado a un pH habitualmente superior a 7 y en presencia de una concentración particular de un caotrópico. La selección del caotrópico es muy similar a las elecciones utilizadas para la solubilización de cuerpos de inclusión, pero habitualmente el caotrópico se utiliza a una concentración menor y no es necesariamente igual que los caotrópicos utilizados para la solubilización. En la mayoría de los casos, la solución de replegamiento/oxidación contendrá también un asociado reductor o el asociado reductor más su forma oxidada a una relación específica para generar un potencial rédox particular que permita que ocurra una redistribución de disulfuros en la formación del (de los) puente(s) de cisteína de la proteína. Algunas de las parejas rédox utilizadas habitualmente incluyen cisteína/cistamina, glutation (GSH)/ditiobis-GSH, cloruro cúprico, ditiotreitol (DTT)/ditiano-DTT y 2-mercaptoetanol (bME)/ditio-(bME). En muchos casos, puede utilizarse un codisolvente o puede ser necesario para aumentar la eficacia del replegamiento, y los reasociados más comunes utilizados con este fin incluyen glicerol, polietilenglicol de diversos pesos moleculares, arginina y
similares.
Los asociados de unión específica de la invención pueden prepararse también mediante métodos de síntesis química (tales como síntesis peptídica en fase sólida) utilizando técnicas conocidas en la técnica tales como las expuestas por Merrifield et al. (1963), J. Am. Chem. Soc., 85: 2149; Houghten et al. (1985), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82: 5132; y Stewart y Young (1984), Solid Phase Peptide Synthesis, Pierce Chemical Co., Rockford, IL. Dichos polipéptidos pueden sintetizarse con o sin una metionina en la terminación amino. Los anticuerpos y los dominios de unión a antígeno sintetizados químicamente pueden oxidarse utilizando métodos expuestos en estas referencias para formar puentes disulfuro. Los anticuerpos así preparados retendrán al menos una actividad biológica asociada a un anticuerpo o dominio de unión a antígeno nativo o producido recombinantemente.
La invención se describirá detalladamente ahora mediante ejemplos experimentales específicos. Estos ejemplos se pretende que sean ilustrativos en lugar de limitantes.
Ejemplos de trabajo Materiales y métodos Aislamiento de ADNc de BCMA y TACI
Se aislaron ADNc de BCMA de ratón y humana mediante PCR utilizando el cebador con sentido de BCMA de ratón.
\dotable{\tabskip\tabcolsep\hfil#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{
 5'-CACAATACCTGTGGCCCTCTTAAGAC-3'\cr
 (SEC ID Nº
25)\cr}
\vskip1.000000\baselineskip
y el cebador sin sentido
\dotable{\tabskip\tabcolsep\hfil#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{
 5'-TGGTAAACGGTCATCCTAACGACATC-3'\cr
 (SEC ID Nº
26)\cr}
\vskip1.000000\baselineskip
el cebador con sentido de BCMA humana
\dotable{\tabskip\tabcolsep\hfil#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{
 5'-TTACTTGTCCTTCCAGGCTGTTCT-3'\cr  
(SEC ID Nº
27)\cr}
\vskip1.000000\baselineskip
y el cebador sin sentido
\dotable{\tabskip\tabcolsep\hfil#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{
 5'-CATAGAAACCAAGGAAGTTTCTACC-3'\cr 
(SEC ID Nº
28)\cr}
\vskip1.000000\baselineskip
Para el aislamiento de ADNc de TACI, se utilizaron el cebador con sentido
\dotable{\tabskip\tabcolsep\hfil#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{
 5'-AGCATCCTGAGTAATGAGTGGCCTGG-3'\cr
 (SEC ID Nº
29)\cr}
\vskip1.000000\baselineskip
y el cebador sin sentido
\dotable{\tabskip\tabcolsep\hfil#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{

5'-GTGATGACGACCTACAGCTGCACTGGG-3'\cr
 (SEC ID Nº
30)\cr}
Se transcribieron inversamente ARN poli(A)+ de la estirpe celular de linfoma B de ratón A20 y de nódulo linfático humano, y se sintetizó ADNc utilizando el kit de amplificación de ADNc Smart RACE (Clontech, Palo Alto, California). Se clonaron el ADNc completo de los genes de BCMA de ratón y humano, así como del gen de TACI humano, en el vector pcDNA3 para expresión en células de mamífero (Invitrogen, Carlsbad, California).
Proteínas recombinantes
Se generó proteína APRIL-Flag de múrido soluble fusionando la secuencia Flag en fase con la terminación N de los aminoácidos 101-239 de APRIL. Se expresó la proteína mAPRIL-Flag soluble en E. coli y se purificó por afinidad la proteína replegada mediante columna de anticuerpo M2 anti-Flag. Se generó la proteína AGP-3 marcada con Fc fusionando el péptido señal OPG seguido de IgG-\gamma1-Fc humana en fase con la terminación N de los aminoácidos 128-285 de AGP-3. Se expresó la proteína en baculovirus y se purificó con columna de proteína A-Sepharose. Se codificó APRIL humana marcada con Fc mediante un constructo similar (véase la Figura 21), se expresó en células CHO y se purificó con columna de proteína A-Sepharose.
Se expresaron en E. coli proteína TACI soluble (aminoácidos 1-165) y proteína BCMA (aminoácidos 4-55) seguido de IgG-\gamma1 humana en fase. Se solubilizaron los cuerpos de inclusión formados. Se purificó la proteína replegada mediante cromatografía de intercambio catiónico.
Purificación de BCMA-Fc humana
La purificación de BCMA-Fc humana producida en E. coli recombinante se inició solubilizando 53,3 g de una preparación de cuerpos de inclusión lavada en una solución que tiene una composición final de cloruro de guanidinio 6 M, Tris(HCl) 50 mM, ditiotreitol 8,0 mM. El volumen final de la solución fue de aproximadamente 200 ml. Se ajustó la solución a pH 9,0 a 23ºC y se dejó agitar a temperatura ambiente durante 1 hora.
Se añadió después la solución de polipéptido solubilizado a 3,8 l de urea 4 M fría, L-arginina 160 mM, glicerol al 20% (en volumen), cisteína 4 mM, cistamina 1 mM, Tris 50 mM. Se ajustó el pH a 8,9 a 12ºC y se dejó agitar la muestra a 4-8ºC durante aproximadamente 60 horas.
Se clarificó después la mezcla de replegamiento mediante filtración a través de un cartucho Cuno 10SP de 836 cm^{2}. Se concentró después el filtrado aproximadamente cinco veces y se diafiltró con cinco volúmenes de retenido de fosfato de sodio 10 mM/cloruro de sodio 40 mM, pH 9, utilizando un módulo TFF de celulosa regenerada Pall Filtron de 929 cm^{2} con un corte de peso molecular nominal de 50 kDa. Se realizó el procesamiento a 4-8ºC.
Se eliminó el retenido de la unidad, se calentó a 20ºC y se ajustó a pH 5,0 utilizando ácido acético 1 M. Se eliminaron los sólidos precipitados después mediante centrifugación en una centrífuga Beckman J6-B operando a 20ºC aproximadamente a 2.500 x g durante aproximadamente 15 minutos. Se tomaron alícuotas del sobrenadante y se almacenaron congeladas a -30ºC.
Se descongelaron las alícuotas de sobrenadante y se procesaron en una columna de 5,0 cm de diámetro x 27,5 cm de altura de SP-Sepharose Fast Flow. Todas las fases de la cromatografía se realizaron a 8ºC. Se equilibró la columna utilizando fosfato de sodio 25 mM, pH 6,5. Se acondicionó el producto para carga ajustando el pH a 6,5. Después de la carga, se lavó la columna con tampón de equilibrado y se eluyó después el producto con un gradiente lineal de cloruro de sodio 17 mM a 60 mM en un fondo de fosfato de sodio 25 mM a pH 6,5 durante 20 volúmenes de columna. Se seleccionaron las fracciones para procesamiento adicional basándose en su apariencia en un gel de poliacrilamida SDS teñido con azul de Coomasie.
Se procesaron además las fracciones de SP-Sepharose Fast Flow combinadas con una columna de 5,0 cm de diámetro x 27,5 cm de altura de Butyl Toyopearl 650M operada a 21ºC. Se acondicionó el producto antes de cargar añadiendo fosfato de potasio sólido, proporcionando una concentración final de aproximadamente 0,6 M. Se equilibró la columna utilizando fosfato de potasio 0,6 M, pH 7,0. Después de cargar, se lavó la columna con 0,5 volúmenes de lecho de tampón de equilibrado y se eluyó después el producto utilizando un gradiente lineal de fosfato de potasio 0,5 M a 0,3 M durante 15 volúmenes de columna. Se combinaron las fracciones del pico de elución de UV predominante para procesamiento adicional.
Se concentraron las fracciones combinadas de la cromatografía Butyl Toyopearl veinte veces y se diafiltraron frente a seis volúmenes de retenido de solución salina tamponada con fosfato utilizando un módulo Millipore XL TFF, operado a 4-8ºC. Se tomaron alícuotas de la combinación de retenido final y se almacenaron a -30ºC.
Estudio in vivo
Se adquirieron ratones B6 (6-8 semanas de edad) en Charles River Laboratories y se inyectaron i.p. APRIL-Flag de múrido y otras proteínas TNF a 1 mg/kg/día durante 5 días. El día 7, se recogieron células de bazos y nódulos linfáticos mesentéricos de ratón y se analizó la activación y diferenciación de células B y T mediante FACS utilizando tinción de anticuerpos monoclonales específicos.
Estirpes celulares y ensayos de proliferación
Se adquirieron células epiteliales de riñón humano 293, células de linfoma de Burkitt Raji, células de linfoblastoma T humanas Jurkat y de estirpe celular de linfoma B de ratón A20 en la American Type Culture Collection (Rockville, Maryland). Se mantuvieron las células Raji, Jurkat y A20 en medio completo RPMI-1640 (Life Technologies) suplementado con 10% de suero bovino fetal (HyClone, Logan, Utah) y HEPES 25 mM. Se cultivaron células 293 en medio Dulbecco modificado por Eagle (Life Technologies) con 10% de suero bovino fetal. Se determinó la proliferación celular mediante incubación de 5 x 10^{4} células/pocillo en 100 \mul de medio con la concentración indicada de proteína APRIL-Flag utilizando el ensayo de proliferación Celltiter 96AQ (Promega Corp., Madison, WI) siguiendo las instrucciones del fabricante. Como alternativa, se sometieron a pulsos las células durante 18 h con ^{3}H-timidina (0,5 \muCi/pocillo). Después de recoger las células, se monitorizó la incorporación de ^{3}H-timidina mediante recuento de centelleo líquido.
Transfección y análisis citométrico de flujo
Para las células 293 que expresan receptor de BCMA y TACI, se sembraron 2 x 10^{6} células 293 en una placa de 6 pocillos, se transfectaron las células con Lipofectamine 2000 según el procedimiento del fabricante (Life Technologies), 48 h después de la transfección se recogieron las células y se incubaron a 4ºC con ligando APRIL-Flag o ligando Blys-(AGP-3)-Fc 1 \mug/ml durante 60 min. Después de lavar 3 veces con PBS (que contiene 2% de FBS), se tiñeron las células con anticuerpo secundario conjugado con FITC durante 30 min, después se lavaron 3 veces con PBS y se analizó la fluorescencia mediante un analizador FACS (Becton Dickinson, Mountain View, California).
Determinación de las afinidades de unión de APRIL y TALL-1 por BCMA y TACI
Se realizó un análisis de interacción biomolecular (BIA) utilizando un BIACORE 2000 (Biacore AB, Uppsala, Suecia). Se inmovilizaron los receptores, BCMA-Fc y TACI-Fc (2 \mug/ml en acetato de sodio 10 mM, pH 4,5) sobre el chip sensor CM5 utilizando el procedimiento de acoplamiento amina estándar BIACORE. Se consiguió un nivel de inmovilización de aproximadamente 120 UR. Se diluyeron los analitos, APRIL-FLAG y AGP-3-Fc a entre 100 nM-0,01 nM en tampón de proceso (HEPES 10 mM, NaCl 0,5 M, EDTA 3 mM, Tween 20 al 0,005%, CM-dextrano 2 mg/ml, pH 6,8). Se inyectaron los analitos sobre un receptor de superficie inmovilizado durante 2 minutos a 50 \mul/min y se permitieron disociar durante 10 minutos. Se eliminó la proteína unida mediante una inyección de 1 minuto de HCl 50 mM. Se determinaron las afinidades de unión utilizando un modelo Langmuir 1:1 (BIA Evaluation software, versión 3.1.2, BIACORE).
Ensayo de coestimulación de células T
Se purificaron células T de los bazos de ratones C57 BI/6 mediante selección negativa con una columna de enriquecimiento en células T de múrido (R&D Systems). Se cultivaron células T (1 x 10^{5} por pocillo) en ausencia o presencia de diversa proteína APRIL-Flag durante 48 h. Como alternativa, se prerrecubrieron placas de 96 pocillos con cantidades subliminales de anticuerpo anti-CD3, se trataron las células T con proteína APRIL-Flag durante 72 h, se sometieron a pulsos durante las últimas 18 h con 1 \muCi de ^{3}H-timidina y se recogieron para contar la incorporación de radiactividad.
Proliferación de células B y secreción de Ig
Se seleccionaron negativamente células B de ratón a partir de bazos con columna de recuperación de células B de ratón (Cedarlane, Hornby, Ontario, Canadá). Se sembraron 1 x 10^{6}/ml en placas de cultivo de tejido de fondo plano de 96 pocillos en medio RPMI-1640 (5% de FBS, 2 ME 5 x 10^{-5} M, IgM de cabra anti-ratón purificada por afinidad 2,5 \mug/ml, Pharmingen, San Diego). Se trataron después las células B con proteína APRIL-Flag más diferentes concentraciones de proteína BCMA-Fc soluble durante 72 h y el cultivo recibió 1 \muCi de ^{3}H-timidina durante las últimas 18 h. Se cuantificó la proliferación de células B midiendo la incorporación de radiactividad.
Para el análisis de la secreción de Ig de células B, se cultivaron células B purificadas a 5 x 10^{5}/ml en placas de cultivo de tejido de fondo plano de 96 pocillos en presencia de APRIL-Flag durante 6 días. Se recogió el sobrenadante de cultivo y se determinaron los niveles de IgG, IgM e IgA mediante una técnica ELISA de sándwich específica de isotipo. Se determinó la concentración de Ig en las muestras de ensayo comparando los valores de ensayo por triplicado con patrón de control de isotipo.
Inducción y detección de anticuerpos anti-hemocianina de lapa bocallave (KLH) y anti-Pneumovax
Se inmunizaron ratones (Balb/c hembra de 9-11 semanas y 19-21 g, Charles River Laboratories, Wilmington, MA) el día 0 con 100 \mug de KLH (Pierce, Rockford, IL) en CFA s.c. o con 115 \mug de Pneumovax (Merck, West Point, PA) i.p. Empezando el día 0, los ratones recibieron 7 inyecciones i.p. diarias de 5 mg/kg de proteínas de fusión TACI-Fc o BCMA-Fc o Fc no fusionado, y después se les extrajo sangre el día 7. Se midieron las IgG e IgM anti-KLH y anti-Pneumovax en suero mediante ELISA. Brevemente, para la medida de los anticuerpos anti-KLH, se recubrieron las placas con KLH en PBS, se bloquearon y se añadieron diluciones de patrón y muestras de ensayo. Se revelaron las IgG o IgM anti-KLH capturadas utilizando anticuerpos biotinilados anti-IgG o anti-IgM y HRP conjugado con neutravidina. Para la medida de IgM anti-Pneumovax, se recubrieron las placas con Pneumovax utilizando poli-L-lisina, se bloquearon y se añadieron diluciones de patrón y muestras de ensayo. Se reveló la IgM anti-Pneumovax capturada utilizando un anticuerpo biotinilado anti-IgM y HRP conjugado con neutravidina. Los resultados se compararon con el test t de Student.
En un segundo experimento, se trataron ratones normales (n= 7) con BCMA-Fc humana, TACI-Fc truncada y Fc no fusionado como control a dosis diarias de 0,5 mg/kg a 15 mg/kg durante 7 días. En la preinmunización, los anti-KLH y anti-Pneumovax fueron indetectables. Se midieron los anticuerpos el día 7 y el día 14.
Efecto de hBCMA-Fc sobre células B de sangre periférica de ratón in vivo
Se trataron ratones normales (15 mg/kg i.p. los días 0, 3 y 6, n= 7) con BCMA-Fc y Fc no fusionado como control los días 0, 3 y 6 (15 mg/kg). Se midió el nivel de células B en sangre periférica y bazo el día 7.
Efectos de mAPRIL-Flag, hAGP-3, hBCMA-Fc y hTACI-Fc sobre la producción de inmunoglobina in vitro
Se cultivaron células B de bazo de múrido purificadas con LPS (100 ng/ml), AGP-3 (10 ng/ml), APRIL-Flag (10 ng/ml) o con BCMA-Fc (100 ng/ml) y TACI-Fc (100 ng/ml) durante 12 días. Se recogieron los sobrenadantes de cultivo el día 7 y el día 12 para detectar los niveles de IgA e IgG.
Efecto de mBCMA-Fc y hTACI-Fc truncada sobre los niveles de inmunoglobulina in vitro
Se trataron ratones normales con mBCMA-Fc, hTACI-Fc truncada o control Fc (5 mg/kg i.p. los días 0, 3 y 6, n= 7). Se midieron los niveles de inmunoglobulina en suero el día 7.
Generación y análisis de anticuerpo monoclonal específico anti-mAPRIL
Se utilizó mAPRIL-Flag como antígeno para la generación de anticuerpos monoclonales de rata específicos anti-mAPRIL siguiendo procedimientos estándar. Se identificaron 40 clones que reconocieron APRIL-Flag en un ELISA. Se determinó el efecto de los clones sobre la proliferación de células B de ratón mediada por mAPRIL-Flag. Se cultivaron células B de bazo de múrido purificadas en presencia de mAPRIL-Flag 10 ng/ml más anti-IgM 2 \mug/ml. Se añadieron anticuerpo monoclonal anti-APRIL-Flag e IgG control de rata al cultivo al mismo tiempo. Los datos muestran la incorporación de ^{3}H-timidina como cpm, y representan la media de pocillos por triplicado. Se utilizó el anticuerpo monoclonal específico anti-mAPRIL nº c19 a 5 mg/kg i.p. los días 0, 3 y 6 para determinar el efecto del bloqueo de APRIL endógeno sobre IgM anti-Pneumovacs in vivo.
Modelo de lupus en NZBxNZWF1
Se trataron ratones NZBxNZWF1 de 5 meses 3 veces/semana (lun, miér, vier) durante un periodo de 5 meses con la cantidad indicada de proteína. Una dosis de 100 \mug se traduce a 4 mg/kg. Se extrajo sangre a los ratones el día de tratamiento para analizar posteriormente los anticuerpos específicos de ADN, las proteínas histona, etc. También el día 0, se extrajo orina y se analizaron los niveles de proteínas. Se excluyeron los animales que tenían ya altos niveles de proteína en la orina, un signo de lupus. Se inyectó i.p. el tratamiento. Se extrajeron orina y sangre cada 30 días y se analizaron hasta el día 150.
Unión de APRIL y estimulación de células tumorales
Se determinó la unión de APRIL a estirpes celulares tumorales humanas incubando las células con APRIL-Fc o APRIL-Flag 1 \mug/ml, seguido de tinción con anticuerpo secundario marcado con FITC y análisis FACS.
Efecto de APRIL y BCMA-Fc o TACI-Fc sobre el crecimiento de células U266-B1
Se cultivaron células U266 en presencia de APRIL-Fc humana 10 ng/ml o con BCMA-Fc soluble, TACI-Fc truncada 50 ng/ml durante 48 h. La incorporación de ^{3}H-timidina se indica como cpm. Los datos mostrados representan la media de pocillos por triplicado. Se cultivaron células A20 de linfoma B de ratón en presencia de APRIL-Flag de ratón, AGP-3-Flag humana 50 ng/ml o con BCMA-Fc soluble 100 ng/ml durante 48 h. La incorporación de ^{3}H-timidina se indica como cpm. Los datos mostrados representan la media de pocillos por triplicado.
Crecimiento de células tumorales de linfoma B A20 en ratones Balb/c
Se implantaron células A20 (0,2 millones) i.d. el día 0. Se administraron tratamientos con PBS, CHO-Fc, mBCMA-Fc, hBCMA-Fc, mTACI-Fc, hTACI-Fc (10 mg/kg, i.p.) los días 0, 7, 10, 13, 16, 19, 22. Se hicieron medidas de tumor dos veces por semana. Se sacrificaron los ratones los días 27-31, se congelaron inmediatamente los tumores para el aislamiento de ARN, se recogió sangre y se congelaron las muestras de suero.
Crecimiento tumoral de estirpe celular HT29 de carcinoma de colon humano
Se inyectaron por vía subcutánea 2 x 10^{6} células HT29 más Matrigel al 50% en ratones desnudos atímicos. Rx: BCMA-Fc humana o de ratón a 2, 5 y 15 mg/kg Q2D, empezando el día 0 (n= 10/grupo). Control 1: CHO-Fc a 15 mg/kg Q2D. Control 2: 0,2 ml de PBS Q2D IP. Volumen de tumor: 3 veces por semana, desde el día 7. Peso de tumor al final del estudio. Peso corporal 2 veces por semana.
Resultados Función in vitro de G70/APRIL
Se aisló G70 humana y de ratón, también llamada APRIL, y se caracterizó (Figuras 1, 2 y 3). Se produjo G70 de ratón soluble marcada con FLAG (smG70) purificada y replegada en E. coli (Figura 2). La G70 soluble (smG70) estimula específicamente la proliferación celular de linfoma de células B y T de manera dependiente de la dosis (Figura 4). Además, la G70 soluble:
1)
se une específicamente a receptores de superficie celular expresados en células de linfoma B y T humanas (Figura 5);
2)
estimula específicamente la proliferación de células B y T de sangre periférica humana purificadas (Figura 6);
3)
estimula la proliferación de células B y T de bazo de múrido purificadas de manera dependiente de la dosis (Figura 7);
4)
actúa sinérgicamente con el anticuerpo anti-CD28 para estimular la proliferación de células T de múrido purificadas (Figura 8);
5)
tiene una fuerte actividad coestimulante sobre células T de múrido purificadas (Figura 9) en presencia de una concentración subóptima de activador de receptor de células T: anticuerpo anti-CD3.
Función in vivo de G70/APRIL
Se realizó una serie de experimentos para dilucidar la actividad biológica de G70/APRIL soluble en ratones normales in vivo. Cada grupo consistía en 5 ratones (BDF-1, 8 semanas de edad, dosificados a 1 mg/kg/día, 0,2 ml durante 5 días). Se utilizaron bazo, timo y nódulos linfáticos mesentéricos de tres ratones de cada grupo para análisis FACS utilizando un panel de anticuerpos marcadores de superficie de células T y células B, y se analizaron todos los ratones mediante necropsia estándar y análisis patológicos.
Bazo (Tabla 1A): La G70 soluble de múrido causó una reducción media de aproximadamente un 60% del porcentaje de células T CD3+. Además, hubo un aumento medio de 5 veces de la activación de células T auxiliares y un aumento medio de 22 veces de la activación de células T citotóxicas medido por la expresión del receptor IL-2. Además, el porcentaje de células B inmaduras aumentó aproximadamente 2 veces, mientras que el porcentaje de células B maduras aumentó 3 a 4 veces. El porcentaje total de linfocitos (T+B) no cambió comparado con el control.
Nódulos linfáticos mesentéricos (Tabla 1B): Los ratones tratados con G70 soluble tenían una reducción media de un 25% del porcentaje de células T. Hubo un aumento medio de 3 veces del porcentaje de células T auxiliares activadas y un aumento de 36 veces de las células T citotóxicas activadas medido por la expresión del receptor CD25/IL-2. Además, el porcentaje de células B inmaduras aumentó una media de 2 veces, mientras que las células B maduras lo hacían una media de 4 veces.
En resumen, las observaciones preliminares indican que el G70/APRIL estimula tanto células T como B en el bazo y los nódulos linfáticos mesentéricos. El análisis patológico reveló que los ratones tratados con G70 soluble tienen bazos ligeramente agrandados de morfología normal.
El G70/APRIL es un ligando de BCMA y TACI
El G70/APRIL está relacionado con el miembro AGP-3/BlyS de la familia de ligandos de TNF. Se ha mostrado recientemente que el miembro TACI de la familia de receptores TNFR (Fig. 12) es un receptor de AGP-3 ([solicitud de patente nº serie A-570A]). Además, el TACI tiene coincidencia con el miembro huérfano BCMA de la familia de receptores TNFR (Figura 10) en un dominio rico en cisteína extracelular conservado (Figura 13). Estas observaciones conjuntas llevaron a investigar si el G70/APRIL es un ligando de BCMA y TACI y a ensayar si, además de TACI, AGP-3/BlyS es también un ligando de BCMA.
El G70 de ratón soluble se une específicamente a células 293 que expresan BCMA exógena (Figura 14). El G70 se une también a células 293 que expresan TACI (Figura 15). Además, el G70 soluble bloquea específicamente la unión de AGP-3/BlyS a receptores de superficie celular localizados en células de linfoma B de ratón (Figura 16). Esto sugiere que G70 y AGP4 se unen ambos a BCMA y TACI.
La smBCMA-Fc y la shTACI-Fc evitan la unión de ligando G70 y AGP-3 a receptores de superficie celular
Se produjeron BCMA soluble (smBCMA-Fc, Fig. 10) y TACI soluble (shTACI-Fc) en E. coli, se purificaron hasta homogeneidad y se replegaron.
El receptor de TACI soluble evita específicamente la unión de G70 a células B de ratón (Figura 17). Además, la shBCMA-Fc y la shTACI-Fc evitan ambas la unión de AGP-3 a células B (Figura 18 y Figura 19A). La hBCMA-Fc soluble mejora también la unión de G70 a células A20 (Figura 19B).
En resumen: 1) tanto G70 como AGP-3 se unen a los miembros huérfanos TACI y BCMA de la familia de receptor TNFR; 2) BCMA y TACI solubles inhiben ambas eficazmente la unión de G70 y AGP-3 a células B; 3) G70 y AGP-3 compiten por la unión a receptores de superficie celular.
Efectos del tratamiento con TACI-Fc y BCMA-Fc sobre la producción de anticuerpos anti-KLH y anti-Pneumovax
El tratamiento con TACI-Fc o BCMA-Fc inhibía significativamente la producción de anticuerpos anti-KLH y anti-Pneumovax. Los niveles séricos de ambas IgG e IgM anti-KLH fueron aproximadamente 25% y 19% menores, repectivamente, en ratones tratados con TACI-Fc que en controles (Figura 20). Las IgG e IgM anti-KLH en suero fueron aproximadamente 52% y 66% menores, respectivamente, en ratones tratados con BCMA-Fc que en controles (Figura 20). Los niveles en suero de IgM anti-Pneumovax fueron también menores en ratones tratados con TACI-Fc y BCMA-Fc que en controles (24% y 42%, respectivamente, Figura 20). Segundo experimento: el tratamiento con hBCMA-Fc o hTACI-Fc truncada reduce los niveles de IgM específica anti-Pneumovacs en ratones normales (Figura 29). Se trataron ratones normales (n= 7) con BCMA-Fc humana, TACI-Fc truncada y Fc no fusionado como control a dosis diarias de 0,5 mg/kg a 15 mg/kg durante 7 días. En la preinmunización, anti-KLH y anti-Pneumovax fueron indetectables. Se midieron los anticuerpos el día 7 y el día 14.
Efectos de la hBCMA-Fc sobre la progresión de lupus en ratones NZBxNZWF1
El tratamiento de ratones NZB/NZWF1 con BCMA-Fc humana aumentó la supervivencia, redujo la proteinuria, redujo el nivel de anticuerpos específicos anti-ADNbc y redujo el porcentaje de células B en sangre periférica. Protocolo para LES: Se trataron ratones NZBxNZWF1 de 5 meses 3 veces/semana (lun, miér, vier) durante un periodo de 5 meses con la cantidad indicada de proteína. 100 \mug de dosis se traduce a 4 mg/kg. Se extrajo sangre a los ratones el día de tratamiento para analizar después los anticuerpos específicos de ADN, proteínas histona, etc. También el día 0, se extrajo orina y se analizaron los niveles de proteína. Se excluyeron los animales que tienen ya altos niveles de proteína en la orina, un signo de lupus. Se inyectó el tratamiento i.p. Se extrajeron orina y sangre cada 30 días y se analizaron hasta el día 150.
Efectos de la hBCMA-Fc sobre el crecimiento de células de linfoma A20 in vivo
El tratamiento con BCMA-Fc reduce el crecimiento de células tumorales de linfoma B A20 en ratones Balb/C. Se implantaron células A20 (0,2 millones), i.d., el día 0. Se administraron los tratamientos con PBS, CHO-Fc, mBCMA-Fc, hBCMA-Fc, mTACI-Fc, hTACI-Fc (10 mg/kg, i.p.) los días 0, 7, 10, 13, 16, 19, 22. Se hicieron las medidas de tumor dos veces por semana. Se sacrificaron los ratones los días 27-31, se congelaron inmediatamente los tumores para aislamiento de ARN, se recogió sangre y se congelaron las muestras de suero.
Efectos de la hBCMA-Fc sobre el crecimiento de células HT29 de carcinoma de colon humano in vivo
El tratamiento con hBCMA-Fc reduce el crecimiento en volumen del tumor de estirpe celular HT29 de carcinoma de colon humano en ratones. Se inyectaron 2 x 10^{6} células más Matrigel al 50% por vía subcutánea en ratones desnudos atímicos. Rx: BCMA-Fc humana a 2, 5 y 15 mg/kg Q2D, empezando el día 0 (n= 10/grupo). Control 1: CHO-Fc a 15 mg/kg Q2D. Control 2: 0,2 ml de PBS Q2D IP. Volumen tumoral: 3 veces por semana desde el día 7. Peso tumoral al final del estudio. Peso corporal: 2 veces por semana.
Efecto de la Fc-APRIL sobre células B
La APRIL-Fc humana y la AGP-3/BlyS/Tall-1 humana soluble estimulan la incorporación de ^{3}H-timidina a células B primarias de múrido. Se cultivaron células B de bazo de múrido purificadas en presencia de diversas cantidades de APRIL-Fc humana y AGP-3 no marcada más anti-IgM 2 \mug/ml. Los datos muestran la incorporación de ^{3}H-timidina como cpm, y representan medias de pocillos por triplicado.
Efecto de la hBCMA-Fc sobre la proliferación de células B mediada por APRIL
Las hBCMA y hTACI-Fc inhiben la proliferación de células B de ratón mediada por mAPRIL-Flag (Figura 23). Se cultivaron células B de bazo de múrido purificadas con las cantidades indicadas de BCMA-Fc y TACI-Fc solubles en presencia de mAPRIL-Flag 10 ng/ml y anti-IgM 2 \mug/ml durante 72 h. La incorporación de ^{3}H-timidina se indica como cpm. Los datos mostrados representan medias de pocillos por triplicado.
Efecto de la hBCMA-Fc sobre los niveles de células B de sangre periférica
La shBCMA-Fc (15 mg/kg i.p. los días 0, 3 y 6) reduce los niveles de células B en sangre periférica de ratón medidos el día 7 (Figuras 24 y 25). Se trataron ratones normales (n= 7) con BCMA-Fc humana y Fc no fusionado como control los días 0, 3 y 6 (15 mg/kg). Se midieron los niveles de células B en sangre periférica y bazo (B220) el día 7.
La producción de IgA mediada por mAPRIL-Flag y hAGP-3 se inhibe por hBCMA-Fc y hTACI-Fc in vitro (Figura 26). Se cultivaron células B de bazo de múrido purificadas con LPS (100 ng/ml), AGP-3 (10 ng/ml), APRIL-Flag (10 ng/ml) o con BCMA-Fc (100 ng/ml) y TACI-Fc (100 ng/ml) durante 12 días. Se recogieron los sobrenadantes de cultivo el día 7 y el día 12 para detectar el nivel de IgA. La producción de IgG mediada por mAPRIL-Flag y hAGP-3 está inhibida por hBCMA-Fc y hTACI-Fc in vitro (Figura 27).
Efecto de la BCMA-Fc sobre la inmunoglobulina total in vivo
Se reducen los niveles de IgE e IgA totales en ratones normales tratados con mBCMA-Fc y hTACI-Fc truncada (5 mg/kg, i.p., días 0, 3 y 6). Se trataron ratones normales (n= 7) con BCMA-Fc humana, TACI-Fc truncada y Fc no fusionado como control los días 0, 3 y 6 (5 mg/kg). Se midieron los niveles de inmunoglobulina en suero el día 7.
Efecto de anticuerpo monoclonal específico anti-mAPRIL
El anticuerpo monoclonal específico anti-mAPRIL nº c19 inhibe la proliferación de células B de ratón mediada por mAPRIL-Flag (Figura 30). Se cultivaron células B de bazo de múrido purificadas en presencia de mAPRIL-Flag 10 ng/ml más anti-IgM 2 \mug/ml. Se añadieron el anticuerpo monoclonal anti-APRIL-Flag c-19 e IgG control de rata al cultivo al mismo tiempo. Los datos muestran la incorporación de ^{3}H-timidina como cpm, y representan la media de pocillos por triplicado. El tratamiento con anticuerpo monoclonal específico anti-mAPRIL nº c19 inhibe la generación de anticuerpos específicos anti-Pneumovacs in vivo (Figura 31).
Unión de APRIL y efecto sobre células tumorales
El APRIL se une a una serie de estirpes de células tumorales (Fig. 36). La unión de APRIL a estirpes celulares tumorales humanas se determinó incubando células con APRIL-Fc o APRIL-Flag 1 \mug/ml, seguido de tinción con anticuerpo secundario marcado con FITC y análisis FACS. El APRIL estimula el crecimiento de células U266-B1 y éste puede inhibirse por BCMA-Fc o TACI-Fc (Figura 37). Se cultivaron células U266 en presencia de APRIL-Fc humana 10 ng/ml o con BCMA-Fc soluble, TACI-Fc truncada 50 ng/ml durante 48 h. La incorporación de ^{3}H-timidina se indica como cpm. Los datos mostrados representan la media de pocillos por triplicado.
<110> AMGEN INC.
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<120> MÉTODOS Y COMPOSICIONES DE MATERIA CONCERNIENTES A APRIL/G70, BCMA, BLYS/AGP-3, Y TACI
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<130> A-686B
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<140> PCT/US 01/15504
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<141> 14-05-2001
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<150> US 60/204,039
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<151> 12-05-2000
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<150> US 60/214,591
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<151> 27-06-2000
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<160> 31
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<170> PatentIn version 3.1
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<210> 1
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<211> 1465
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
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<400> 1
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3
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<210> 2
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<211> 233
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 2
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4
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<210> 3
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<211> 1486
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<212> DNA
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<213> Mus musculus
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<400> 3
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5
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<210> 4
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<211> 240
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<212> PRT
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<213> Mus musculus
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<400> 4
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6
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<210> 5
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<211> 181
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 5
7
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<210> 6
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<211> 51
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 6
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8
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<210> 7
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<211> 34
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 7
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100
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<210> 8
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<211> 21
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 8
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101
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<210> 9
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<211> 283
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 9
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9
10
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<210> 10
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<211> 281
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<212> PRT
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<213> Mus musculus
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<400> 10
11
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<210> 11
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<211> 185
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<212> PRT
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<213> Murine
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<400> 11
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12
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<210> 12
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<211> 117
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<212> PRT
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<213> Consenso humana-de múrido
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<400> 12
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13
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<210> 13
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<211> 81
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<212> PRT
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<213> Consenso
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<400> 13
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14
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<210> 14
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<211> 293
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 14
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15
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<210> 15
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<211> 166
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 15
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17
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<210> 16
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<211> 67
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 16
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18
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<210> 17
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<211> 20
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 17
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102
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<210> 18
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<211> 397
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 18
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19
20
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<210> 19
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<211> 149
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<212> PRT
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<213> Mus musculus
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<400> 19
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21
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<210> 20
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<211> 59
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 20
22
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<210> 21
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<211> 58
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 21
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23
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<210> 22
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<211> 233
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (79)..(79)
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<223> Xaa es cualquier aminoácido
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<400> 22
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24
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<210> 23
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<211> 232
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<212> PRT
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<213> Mus musculus
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<400> 23
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25
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<210> 24
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<211> 190
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<212> PRT
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<213> Consenso
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<400> 24
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26
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<210> 25
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<211> 26
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<212> ADN
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<213> Mus musculus
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<400> 25
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cacaatacct gtggccctct taagag
\hfill
26
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<210> 26
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<211> 26
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<212> ADN
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<213> Antisentido
\newpage
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<400> 26
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tggtaaacgg tcatcctaac gacatc
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26
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<210> 27
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<211> 24
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 27
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ttacttgtcc ttccaggctg ttct
\hfill
24
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<210> 28
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<211> 25
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<212> ADN
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<213> Antisentido
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<400> 28
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\hskip-.1em\dddseqskip
catagaaacc aaggaagttt ctacc
\hfill
25
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<210> 29
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<211> 26
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 29
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\hskip-.1em\dddseqskip
agcatcctga gtaatgagtg gcctgg
\hfill
26
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<210> 30
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<211> 27
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<212> ADN
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<213> Antisentido
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<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtgatgacga cctacagctg cactggg
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 394
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
27
28

Claims (27)

1. Uso de un asociado de unión específica de APRIL seleccionado de:
i)
SEC ID Nº 16; o
ii)
SEC ID Nº 13;
para la fabricación de un medicamento para tratar enfermedades o trastornos relacionados con el sistema inmune e inflamatorios, autoinmunes y otros relacionados con el sistema inmune, enfermedades linfoproliferativas y otros cánceres, o para la prevención del rechazo de transplante, mediante la inhibición de la actividad APRIL, la inhibición de la actividad TACI, la inhibición de la actividad TACI y BCMA, o la inhibición de la proliferación o activación de células B o T en un mamífero.
2. Un uso según la reivindicación 1, en el que el asociado de unión específica está comprendido en una molécula de fórmula:
(X^{1})_{a} - F^{1}-(X^{2})_{b}
en la que
F^{1} es un vehículo;
X^{1} y X^{2} se seleccionan cada uno independientemente de -(L^{1})_{c}-P^{1}, -(L^{1})_{c}-P^{1}-(L^{2})_{d}-P^{2}, -(L^{1})_{c}-P^{1}-(L^{2})_{d}-P^{2}-(L^{3})_{c}-P^{3} o -(L^{1})_{c}-P^{1}-(L^{2})_{d}-P^{2}-(L^{3})_{c}-P^{3}-(L^{4})_{f}-P^{4};
P^{1}, P^{2}, P^{3} y P^{4} son independientemente cada uno secuencias peptídicas en las que al menos una es un asociado de unión específica;
L^{1}, L^{2}, L^{3} y L^{4} son cada uno independientemente engarces, y
a, b, c, d, e y f son cada uno independientemente 0 ó 1, a condición de que al menos uno de a y b sea 1.
3. Un uso según la reivindicación 2, en el que la molécula comprende una estructura de fórmulas:
X^{1} - F^{1}
o
F^{1} - X^{2}.
4. Un uso según la reivindicación 2, en el que la molécula comprende una estructura de fórmula:
F^{1} - (L^{1})_{c} - P^{1}.
5. Un uso según la reivindicación 2, en el que la molécula comprende una estructura de fórmula:
F^{1} - (L^{1})_{c}-P^{1} - (L^{2})_{d} - P^{2}.
6. Un uso según una cualquiera de las reivindicaciones 2 a 5, en el que el vehículo es un dominio Fc.
7. Un uso según la reivindicación 1, en el que el asociado de unión específica está unido covalentemente a un vehículo.
8. Un uso según la reivindicación 7, en el que el vehículo es un dominio Fc.
9. Uso de una secuencia de aminoácidos seleccionada de:
a)
SEC ID Nº 16; o
b)
SEC ID Nº 13;
\newpage
para la fabricación de un medicamento para tratar un trastorno linfoproliferativo de células B o un trastorno linfoproliferativo de células T.
10. Un uso según la reivindicación 9, en el que la secuencia de aminoácidos está unida covalentemente a un vehículo.
11. Un uso según la reivindicación 10, en el que el vehículo es un dominio Fc.
12. Un uso según la reivindicación 1, en el que el medicamento es para tratar infecciones, incluyendo infecciones bacterianas, fúngicas, protozoarias y víricas, incluyendo VIH-1 o VIH-2; diarrea, psoriasis; inflamación; alergias; enfermedades alérgicas respiratorias incluyendo asma, rinitis alérgica, enfermedad pulmonar por hipersensibilidad, pneumonitis por hipersensibilidad, neumonía eosinofílica (por ejemplo, síndrome de Loeffler, neumonía eosinofílica crónica, enfermedad pulmonar intersticial (EPI), incluyendo fibrosis pulmonar idiopática o EPI asociada a artritis reumatoide, lupus eritematoso sistémico, espondilisis anquilosante, esclerosis sistémica, síndrome de Sjogren, polimiositis o dermatomiositis; anafilaxia sistémica o hipersensibilidad a respuestas; alergia a medicamentos; alergia a picadura de insectos; enfermedad inflamatoria intestinal, incluyendo enfermedad de Crohn y colitis ulcerosa; espondiloartropatía; escleroderma; dermatosis inflamatoria, incluyendo dermatitis, eccema, dermatitis atópica, dermatitis alérgica por contacto, urticaria, vasculitis, incluyendo vasculitis necrosante, cutánea y por hipersensibilidad, miositis eosinofílica y fascitis eosinofílica; enfermedades autoinmunes, incluyendo artritis reumatoide, artritis psoriásica, esclerosis múltiple, lupus eritematoso sistémico, miastenia grave, diabetes de inicio juvenil, glomerulonefritis, tiroiditis autoinmune y enfermedad de Behcet; rechazo de injerto, incluyendo rechazo de aloinjerto o enfermedad de injerto contra huésped; cánceres con infiltración leucocitaria de la piel o los órganos; lesión por reperfusión; aterosclerosis; malignidades hematológicas; o shock, incluyendo shock séptico y shock endotóxico.
13. Una secuencia de aminoácidos seleccionada de:
a)
SEC ID Nº 16; o
b)
SEC ID Nº 13;
para uso en un método de tratamiento de enfermedades o trastornos relacionados con el sistema inmune e inflamatorios, autoinmunes u otros relacionados con el sistema inmune, enfermedades linfoproliferativas y otros cánceres, para uso en la prevención del rechazo de transplantes, para uso en el tratamiento de un trastorno linfoproliferativo de células B o para uso en el tratamiento de un trastorno linfoproliferativo de células T, mediante la inhibición de la proliferación o activación de células B o T en un mamífero.
14. Una secuencia de aminoácidos seleccionada de:
a)
SEC ID Nº 16; o
b)
SEC ID Nº 13.
15. Una composición de material de fórmula
(X^{1})_{a} - F^{1}-(X^{2})_{b}
en la que
F^{1} es un vehículo;
X^{1} y X^{2} se seleccionan cada uno independientemente de -(L^{1})_{c}-P^{1}, -(L^{1})_{c}-P^{1}-(L^{2})_{d}-P^{2}, -(L^{1})_{c}-P^{1}-(L^{2})_{d}-P^{2}-(L^{3})_{c}-P^{3} y -(L^{1})_{c}-P^{1}-(L^{2})_{d}-P^{2}-(L^{3})_{c}-P^{3}-(L^{4})_{f}-P^{4};
P^{1}, P^{2}, P^{3} y P^{4} son independientemente cada uno secuencias peptídicas en las que al menos una es un asociado de unión específica seleccionado de:
i)
SEC ID Nº 16; o
ii)
SEC ID Nº 13;
L^{1}, L^{2}, L^{3} y L^{4} son cada uno independientemente engarces; y
a, b, c, d, e y f son cada uno independientemente 0 ó 1, a condición de que al menos uno de a y b sea 1.
\newpage
16. La composición de material de la reivindicación 15, en la que la molécula comprende una estructura de fórmula:
X^{1} - F^{1}
o
F^{1} - X^{2}.
17. La composición de material de la reivindicación 15, en la que la molécula comprende una estructura de fórmula:
F^{1} - (L^{1})_{c} - P^{1}.
18. La composición de material de la reivindicación 15, en la que la molécula comprende una estructura de fórmula:
F^{1} - (L^{1})_{c} - P_{1} - (L^{2})_{d} - P^{2}.
19. La composición de material según una cualquiera de las reivindicaciones 15 a 18, en la que el vehículo es un dominio Fc.
20. Un ácido nucleico aislado que codifica la composición de material de una cualquiera de las reivindicaciones 14 a 18.
21. El ácido nucleico de la reivindicación 20, que incluye uno o más codones preferidos para la expresión de Escherichia coli.
22. Un vector de expresión que comprende el ácido nucleico de la reivindicación 20 ó 21.
23. Una célula huésped transformada con el vector de expresión de la reivindicación 22.
24. La célula huésped de la reivindicación 23, en la que la célula es una célula procariótica.
25. La célula huésped de la reivindicación 24, en la que la célula es Escherichia coli.
26. Uso in vitro de los polipéptidos de SEC ID Nº 16 ó 13 para inhibir APRIL.
27. Uso in vitro de los polipéptidos de SEC ID Nº 16 ó 13 para inhibir la proliferación de células B o T.
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