ES2286539T3 - Metodos para el diagnostico y el tratamiento de metastasis y una composicion util para ese fin. - Google Patents

Metodos para el diagnostico y el tratamiento de metastasis y una composicion util para ese fin. Download PDF

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Abstract

Un método para determinar de la presencia de glucoproteína pequeña de adhesión celular (SMAGP) en un paciente, que comprende: (i) la detección en una muestra biológica de un paciente, sospechosa de contener células tumorales o parte de ellas, de una cantidad de ácido nucleico que codifica SMAGP o una cantidad de polipéptido SMAGP; y (ii) la comparación de la cantidad de dicho ácido nucleico o polipéptido con una valor estándar predeterminado que indicará la línea de decisión referente a la expresión o presencia de SMAGP relacionada con la metástasis en dichas células y, de esta forma, permitirá determinar la expresión o presencia relacionadas con la metástasis de SMAGP en dicho paciente.

Description

Métodos para el diagnóstico y el tratamiento de metástasis y una composición útil para ese fin.
La invención está relacionada con el diagnóstico de metástasis, composiciones para ese fin y métodos terapéuticos para el tratamiento de las metástasis.
El cáncer es la segunda causa mayor de muerte en Europa y los Estados Unidos, después de las cardiopatías. El cáncer conlleva un crecimiento celular descontrolado que desemboca en la invasión local de tejido normal, o bien en la diseminación sistémica del crecimiento anómalo. Un tipo concreto de cáncer o un estadio concreto de la evolución del cáncer pueden implicar los dos elementos.
La división o el crecimiento de las células de los diversos tejidos que se encuentran en el organismo normalmente sucede de un modo ordenado y controlado. Esto es posible gracias a un delicado mecanismo de control del crecimiento que implica, entre otras cosas, el contacto, las vías de señalización y otros tipos de comunicación entre células vecinas. En un tejido funcional las células intercambian de forma habitual señales de crecimiento estimuladoras o inhibidoras. Las células no se dividen normalmente en ausencia de señales estimuladoras, e interrumpen su división cuando dominan las señales inhibidoras. Sin embargo, esta señalización o comunicación se vuelve defectuosa o está totalmente dañada en las células cancerosas. Por esta razón, las células continúan dividiéndose; invaden estructuras adyacentes, salen de la masa tumoral original y establecen un nuevo crecimiento en otras partes del organismo. Esta última progresión de la enfermedad cancerosa es lo que se denomina metástasis.
El término cáncer generalmente se refiere a tumores malignos y no a tumores benignos. Las células de tumores benignos son similares a las células normales que las rodean. Estos tipos de tumores casi siempre se encuentran encapsulados en una cápsula fibrosa y no poseen la capacidad de metastatizarse a otras partes del organismo. Estos tumores afectan a órganos locales pero no los destruyen; normalmente mantienen su pequeño tamaño sin producir síntomas durante muchos años. Solamente es necesario aplicar un tratamiento cuando los tumores adquieren un tamaño lo suficientemente grande como para interferir con otros órganos. Por el contrario, los tumores malignos crecen más rápidamente que los benignos; infiltran y destruyen tejidos locales. Algunos tumores malignos pueden diseminarse por el organismo a través de los sistemas circulatorio y linfático. Este crecimiento incontrolado e impredecible es la causa de que los cánceres malignos sean peligrosos y, en muchos casos, mortales. Estos tumores no son morfológicamente característicos del tejido original y no se encuentran encapsulados. Los tumores malignos con frecuencia recurren tras la extracción quirúrgica.
En consecuencia, los tratamientos habitualmente están dirigidos a cánceres o tumores malignos y en ellos es extremadamente importante descubrir marcadores sensibles de signos tempranos de formación de cáncer e identificar agentes potentes supresores del crecimiento asociados a estos signos.
El proceso metastásico es una cascada de pasos secuenciales de los cuales todos ellos deben completarse con éxito. El primer paso consiste en la separación de células cancerosas del tumor primario, seguido de la degradación e invasión de la matriz extracelular (MEC) y de los tejidos adyacentes. Una vez las células tumorales han conseguido penetrar en el sistema linfático o en el vascular y sobrevivir, pueden verse retenidas en un lugar secundario debido a limitaciones físicas (p. ej. el tamaño del capilar) donde su capacidad de crecimiento estará dictada por interacciones moleculares entre las células y el entorno del el órgano (p. ej. activación de quimiocinas). Finalmente, para formar metástasis macroscópicas es necesaria la generación de una nueva red de vascularización (Chambers, A.F., et al., Nat. Rev. Cancer 2 (2002) 563-572; Welch, D.R., Clin. Exp. Metastasis 15 (1997) 272-306).
De acuerdo con el gran número de procesos moleculares y celulares diferentes implicados en las metástasis, las células metastásicas con frecuencia muestran una gran variedad de alteraciones génicas que contribuyen a su potencial metastásico. Entre ellos se incluye la activación de oncogenes, el reclutamiento de metaloproteasas y factores de motilidad, así como cambios en la expresión o la funcionalidad de múltiples moléculas de adhesión (Hunter, K.W., et al., Cancer Res. 61 (2001) 8866-8872; Skubitz, A.P., Cancer Treat. Res. 107 (2002) 305-329). Asimismo, se han descrito ocho genes conocidos como supresores de metástasis (Steeg, P.S., Nat. Rev. Cancer 3 (2003) 55-63). A pesar del conocimiento cada vez mayor adquirido en este campo, todavía quedan por determinar gran cantidad de sucesos genéticos y bioquímicos clave implicados en el proceso metastásico.
La patente WO 02/08288 describe polipéptidos secretados y transmembrana y ácidos nucleicos que los codifican.
TARBE NESRINE et al: "Identification of rat pancreatic carcinoma genes associated with lymphogenous metástasis" ANTICANCER RESEARCH, vol. 22, núm. 4, julio 2002 (2002-07), páginas 2015-2028, ISSN: 0250-7005 identificaron 210 genes que estaban bajo regulación positiva y 247 genes que estaban bajo regulación negativa en una línea celular metastásica.
Resumen de la invención
Se encontró de forma sorprendente que los ácidos nucleicos que codifican el polipéptido SMAGP (siglas en inglés de glucoproteína pequeña de adhesión celular) están sobrexpresados en células tumorales y especialmente en células tumorales metastásicas, mientras que la expresión es considerablemente menor en células normales. Por lo tanto, SMAGP es una nueva diana de gran valor para el diagnóstico y el tratamiento del cáncer, preferiblemente el cáncer de colon, pulmón, páncreas o mama, así como las metástasis, en especial la metástasis hepática. Además, SMAGP posee una localización diferente en los estadios iniciales y tardíos del desarrollo tumoral y por lo tanto supone una herramienta valiosa para diferenciar los estadios tumorales.
Las reivindicaciones anexas definen la invención. Se proporciona un método para la determinación de la existencia de SMAGP en un paciente, que comprende:
(i) la obtención de una muestra biológica de un paciente sospechosa de contener células tumorales o una parte de las mismas;
(ii) la detección en la muestra de una cantidad de ácido nucleico que codifica SMAGP o una cantidad de polipéptido SMAGP; y
(iii) la comparación de la cantidad de dicho ácido nucleico o polipéptido con un valor estándar predeterminado que indicará la línea de decisión referente a la expresión o la presencia de SMAGP relacionada con el cáncer en dichas células y, de esta forma, permitirá determinar la expresión o la presencia de SMAGP relacionada con el cáncer en dicho paciente.
Se proporciona un método para determinar la presencia o ausencia de cáncer en un paciente, que comprende el método antes descrito.
Se proporciona un procedimiento para la determinación del contenido o no de células tumorales en una muestra de tejido o de líquido de un paciente o si proviene de células tumorales. En él se emplea esta muestra y una segunda muestra proveniente de células no tumorales del mismo individuo o de otro diferente de la misma especie, y se siguen los siguientes pasos:
(a) la incubación de cada muestra respectiva en condiciones de hibridación rigurosas con una sonda de ácido nucleico seleccionada del grupo formado por:
(i)
una secuencia de ácidos nucleicos con ID. de SEC. núm.: 1, o un fragmento de la misma;
(ii)
una secuencia de ácidos nucleicos que sea complementaria a cualquier secuencia de ácidos nucleicos de (i);
(iii)
una secuencia de ácidos nucleicos que hibride en condiciones rigurosas con la secuencia de (i); y
(iv)
una secuencia de ácidos nucleicos que hibride en condiciones rigurosas con la secuencia de (ii); y
(b) la determinación de la cantidad aproximada de hibridación de cada muestra respectiva con dicha sonda, y
(c) la comparación de la cantidad aproximada de hibridación de la muestra de análisis con una cantidad aproximada de hibridación de dicha segunda muestra para identificar si la muestra a analizar contiene una cantidad del ácido nucleico específico o de la muestra específica de ácidos nucleicos mayor que la que contiene dicha segunda
muestra.
Se proporciona un método para la detección de un tumor, que comprende:
a) la incubación de una muestra de un paciente sospechoso de padecer cáncer seleccionada del grupo formado por líquidos corporales, células, un extracto celular o sobrenadantes de cultivos celulares de dichas células, conteniendo dicha muestra ácidos nucleicos con una sonda de ácido nucleico seleccionada del grupo formado por:
(i)
el ácido nucleico mostrado con el ID. de SEC. núm.: 1 o un ácido nucleico que sea complementario a dicha secuencia, y
(ii)
ácidos nucleicos que hibridan con uno de los ácidos nucleicos de (i); y
b) la detección de la hibridación, preferiblemente mediante otra pareja de unión al ácido nucleico de la muestra o de la sonda de ácido nucleico o bien mediante radiografía por rayos X
c) la comparación de la cantidad de dicha hibridación de ácido nucleico con un valor estándar predeterminado que indicará la línea de decisión referente a la expresión de SMAGP relacionada con el cáncer en dicha muestra y, de esta forma, permitirá determinar si dicho paciente padece cáncer.
El cáncer mencionado es preferiblemente de colon, pulmón, páncreas o mama.
Preferiblemente, la detección se lleva a cabo empleando un agente de unión al ácido nucleico de SMAGP o al polipéptido. De un modo más preferible el agente de unión es una sonda que se hibrida en condiciones rigurosas con el ácido nucleico de SMAGP o bien un anticuerpo, preferiblemente un anticuerpo monoclonal de unión al polipéptido SMAGP, y en especial al dominio extracelular.
Todos estos métodos también pueden realizarse empleando anticuerpos, mediante los que se detecta el polipéptido SMAGP por interacción entre el anticuerpo y el polipéptido.
Se proporciona un método para realizar un control de la progresión del cáncer, en especial del estado canceroso metastásico en el paciente. En un método de este tipo, la cantidad de ácido nucleico de SMAGP o de polipéptido en una muestra biológica (p. ej., líquidos corporales como sangre, lisados celulares o una muestra de RNA sometida a transcripción inversa) de un paciente que padece cáncer se determina en al menos dos momentos diferentes y se compara. Es posible deducir información sobre la progresión de dicho cáncer a partir del cambio de dicha cantidad. En especial, la formación de metástasis da como resultado una mayor aparición de SMAGP, p. ej. en forma de expresión de mRNA.
Se proporcionan equipos de diagnóstico que contienen una o varias sondas oligonucleotídicas o cebadores para la hibridación con el ácido nucleico de SMAGP, o bien anticuerpo, en un ensayo diagnóstico con una muestra obtenida de un paciente que padece cáncer o del que se sospecha que lo padece.
La invención comprende también la utilización de anticuerpos frente al polipéptido SMAGP en una cantidad terapéuticamente efectiva en el tratamiento del cáncer metastásico. De forma preferible, el anticuerpo se administra de forma local en el tumor pancreático.
Para la fabricación de una composición destinada a inhibir la proliferación o la capacidad invasiva de las células tumorales se proporciona el empleo de un anticuerpo que se une al polipéptido SMAGP. Se proporciona también la utilización de un anticuerpo, de modo que la composición se administra a cultivos celulares in vitro.
Se proporciona la utilización de un anticuerpo, de modo que la composición es una composición farmacéutica y de modo que esta se administra a un mamífero que padece un tumor, en especial un tumor metastásico.
El anticuerpo frente al polipéptido SMAGP se administra al paciente en una cantidad terapéuticamente efectiva para el tratamiento de enfermedades cancerosas o la prevención o inhibición de metástasis causadas por enfermedades cancerosas.
Descripción detallada de la invención
El gen SMAGP muestra una clara asociación con el potencial metastásico de las líneas celulares tumorales humanas y con las células tumorales, especialmente del cáncer de colon, mama y páncreas. La proteína codificada es una glucoproteína transmembrana pequeña altamente conservada a lo largo de la evolución. Los análisis inmunohistoquímicos con anticuerpos específicos frente a SMAGP indicaron que esta proteína se encuentra situada en la membrana plasmática de las zonas laterales de las estructuras epiteliales normales. Durante la progresión tumoral, el nivel de expresión de SMAGP y su localización pueden conservarse, o bien alterarse asociados a una desorganización de la estructura epitelial. Se prevé que SMAGP desempeña un papel en la adhesión célula-célula mediante su interacción a través de su cola carboxiterminal con la proteína 4.1 y las proteínas MAGUK para controlar la organización del citoesqueleto y las vías de señalización.
Tal como se emplea en este documento, el término "SMAGP" significa un ácido nucleico que codifica un polipéptido de ID. de SEC. núm.: 2, preferiblemente la secuencia de DNA y la secuencia de mRNA relacionada de ID. de SEC. núm.:1, así como el polipéptido que codifican de ID. de SEC. núm.: 2. Dado que SMAGP es un receptor proteico transmembrana, este polipéptido posee un interés diagnóstico excepcional y se prefiere como epítopo para anticuerpos de unión al dominio extracelular del polipéptido SMAGP. En consecuencia, es preferible que la muestra de ácidos nucleicos y las sondas se centren hacia esta región y especialmente a las partes de la misma que presentan una homología baja con otros genes o polipéptidos.
SMAGP es una proteína transmembrana compuesta por 97 aminoácidos con una secuencia de anclaje de tipo III. El polipéptido SMAGP contiene un dominio extracelular de 34 aminoácidos (aa 1-34), un dominio transmembrana (aa 35-55) y un dominio intracelular (aa 56-97) (véase la fig. 7).
La frase "ácido nucleico o polipéptido" como se emplea a lo largo de esta solicitud hace referencia a un ácido nucleico o polipéptido que presenta una actividad SMAGP que se encuentra sustancialmente libre de material celular o medio de cultivo cuando es producida mediante técnicas de DNA recombinante, o sustancialmente libre de precursores químicos u otras sustancias químicas cuando es sintetizada por métodos químicos. Un ácido nucleico de este tipo debe estar preferiblemente libre de las secuencias que flanquean de forma natural al ácido nucleico (es decir, secuencias situadas en los extremos 5' y 3' del ácido nucleico) en el organismo del cual se obtiene el ácido nucleico.
La expresión "sondas de ácidos nucleicos y cebadores para SMAGP", tal como aquí se emplea, significa fragmentos de ácido nucleico que sirven para detectar ácidos nucleicos de SMAGP mediante métodos de hibridación. Los expertos en la materia conocen en detalle las técnicas de hibridación y sus condiciones. Estas condiciones de hibridación son, por ejemplo, unas condiciones moderadamente rigurosas que incluyen el lavado con una solución de 5 x SSC, SDS 0,5%, EDTA 1,0 mmol/l, pH 8,0, seguido de hibridación a 50-60ºC 5 x SSC durante toda la noche, lavado a temperatura ambiente durante 40 minutos con 2 x SSC que contenga SDS 0,1% y posteriormente lavado con 0,1 x SSC, SDS 0,1% a 50ºC durante 40 min con un cambio de la solución para renovarla. También es posible utilizar temperaturas más elevadas para la hibridación (p. ej., 65-70ºC) como son condiciones de hibridación altamente rigurosas. Las sondas de ácidos nucleicos y los cebadores normalmente consisten en un segmento de ácido nucleico de SMAGP de al menos unas 50 posiciones contiguas, más preferiblemente de 200 a 300 nucleótidos. La optimización de las sondas y los cebadores se puede realizar según la tecnología de vanguardia. Estas sondas y estos cebadores pueden diseñarse empleando por ejemplo las aplicaciones informáticas disponibles en (http://www-genome.wi.mit.edu/genome-software/lwww-genome.wi.mit.edu/genome-sohware/other/primer3.html).
Para conseguir una selectividad elevada es preferible utilizar unas condiciones relativamente bajas en sal o de temperatura elevada, por ejemplo una concentración salina de aproximadamente entre 0,02 mol/l y 0,15 mol/l y temperaturas aproximadas de 50ºC a 70ºC.
Los polipéptidos SMAGP se pueden identificar en pruebas diagnósticas empleando sondas y cebadores específicos. Normalmente estos métodos incluyen la amplificación de la secuencia diana de la muestra mediante métodos de amplificación como el método de la PCR. La detección cuantitativa se puede llevar a cabo mediante técnicas de PCR, preferiblemente la RT-PCR cuantitativa empleando, p. ej., el LightCycler® de Roche Diagnostics GmbH, Alemania.
En una realización preferida de la invención, el ácido nucleico codificante de la muestra se amplifica antes de la prueba, por ejemplo mediante la conocida técnica de la PCR. En el ámbito del diagnóstico mediante ácidos nucleicos habitualmente se emplea una sonda de ácidos nucleicos modificada (marcada). Esta sonda se pone en contacto con un DNA, RNA o RT-DNA desnaturalizados de la muestra que se encuentra unido a un transportador y, en este proceso, la temperatura, fuerza iónica, pH y otras condiciones amortiguadoras son seleccionadas (en función de la longitud y la composición de la sonda de ácidos nucleicos y de la temperatura de fusión resultante del híbrido esperado) de modo que el DNA o RNA marcado pueda unirse a DNA o RNA homólogo (en cuanto a la hibridación véase también Wahl, G.M., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76 (1979) 3683-3687). Las membranas adecuadas son membranas o materiales transportadores que contienen nitrocelulosa (p. ej., Schleicher y Schull, BA 85, Amersham Hybond, C.), nitrocelulosa en polvo unida o reforzada o bien membranas de nailon modificadas con grupos funcionales diversos (p. ej., grupos nitro) (p. ej., Schleicher and Schüll, Nytran; NEN, Gene Screen; Amersham Hybond M.; Pall Biodyne).
Con el fin de determinar si una muestra contiene células tumorales, se debe determinar la cantidad aproximada de hibridación que se produce entre el ácido nucleico y el ácido nucleico o ácidos nucleicos diana. No es necesario que la determinación de la cantidad aproximada de hibridación se realice de forma cuantitativa, a pesar de que en la presente invención se recoge una determinación de tipo cuantitativo. Normalmente la cantidad aproximada de hibridación se determina de forma cualitativa, por ejemplo mediante una inspección visual al detectar la hibridación. Por ejemplo, si se emplea un gel para separar un ácido nucleico marcado que hibrida con un ácido nucleico diana de la muestra, se puede realizar una inspección visual de la banda obtenida. Cuando se lleva a cabo la hibridación de un aislado de ácido nucleico que carece de células tumorales de un individuo de la misma especie, se sigue el mismo protocolo. Se puede comparar la cantidad aproximada de hibridación de la muestra de análisis con la cantidad aproximada de hibridación de la muestra carente de células tumorales para identificar si la muestra a analizar contiene una cantidad del ácido nucleico o ácidos nucleicos diana mayor que la que contiene la muestra que carece de células tumorales.
En otro método de acuerdo con la invención no se emplea ninguna segunda muestra. Para detectar si la expresión del gen de SMAGP está bajo regulación positiva, se compara la cantidad de mRNA de SMAGP con la cantidad de mRNA de un gen estándar [el gen de control interno (véase p. ej., Shaper, N.L., et al., J. Mammary Gland Biol. Neoplasia 3 (1998) 315-324; Wu, Y.Y., y Rees, J.L., Acta Derm. Venereol. 80 (2000) 2-3)] de la célula, preferiblemente mediante RT-PCR.
Tal como se muestra según la presente invención, el ácido nucleico de SMAGP se expresa en una cantidad más elevada en una muestra tumoral que en una muestra carente de células tumorales. Una muestra de análisis que contenga células tumorales poseerá una cantidad del ácido nucleico de SMAGP mayor que la de una muestra que carece de células tumorales. Para identificar que una muestra de prueba contiene ácido nucleico de SMAGP bajo regulación positiva (es decir, que la muestra contiene células tumorales o más concretamente células tumorales de carcinoma mamario) es preferible que la muestra posea de un modo apreciable una cantidad aproximada de ácido nucleico de SMAGP mayor que la de una muestra carente de células tumorales. Por ejemplo, una muestra que presenta un gen de SMAGP bajo regulación positiva puede contener una cantidad de gen de SMAGP aproximadamente de 5 a 60 veces mayor que una muestra carente de células tumorales.
Los métodos de hibridación de una sonda con una ácido nucleico les resultarán familiares a los expertos en la materia y están descritos, por ejemplo, en las patentes WO 89/06698, EP-A 0 200 362, US 2 915 082, EP-A 0 063 879, EP-A 0 173 251 y EP-A 0 128 018.
A continuación, el DNA o RNA hibridado se detecta incubando el transportador con un anticuerpo o un fragmento de anticuerpo tras un lavado y saturación exhaustivos para evitar uniones inespecíficas. El anticuerpo o fragmento de anticuerpo se dirige frente a la sustancia incorporada durante la hibridación con la sonda de ácidos nucleicos. A su vez, el anticuerpo se encuentra marcado. Sin embargo, también cabe la posibilidad de emplear un DNA marcado directamente. Tras la incubación con los anticuerpos, se lava de nuevo para detectar exclusivamente los conjugados de anticuerpos unidos de forma específica. Seguidamente, la determinación se lleva a cabo siguiendo métodos conocidos empleando el marcador unido al anticuerpo o al fragmento de anticuerpo.
La detección de la expresión se puede realizar, por ejemplo, del siguiente modo:
- hibridación in situ con células fijadas, con frotis de tejido fijados,
- hibridación de colonias (células) e hibridación de halos de lisis (fagos y virus),
- hibridación Southern (detección de DNA),
- hibridación Northern (detección de RNA),
- análisis de suero (p. ej., análisis de los tipos celulares séricos mediante análisis slot-blot),
- tras amplificación (p. ej. técnica PCR).
Los ácidos nucleicos de acuerdo con la invención son por tanto marcadores de gran valor para el diagnóstico y la caracterización de tumores.
Según la invención, se pueden emplear inhibidores para la expresión de SMAGP (p. ej., anticuerpos o nucleótidos antisentido) para inhibir la progresión del tumor in vivo.
Se proporcionan métodos para identificar y aislar antagonistas de SMAGP o inhibidores de la expresión de SMAGP (p. ej., anticuerpos y nucleótidos antisentido). Estos antagonistas o inhibidores se pueden emplear para inhibir la progresión del tumor y causar una apoptosis masiva de células tumorales in vivo.
Se proporcionan métodos para identificar y aislar antagonistas de SMAGP que sean útiles en el tratamiento del cáncer. Estos métodos incluyen métodos para modular la expresión de los polipéptidos de acuerdo con la invención, métodos para identificar antagonistas de SMAGP que puedan unirse de forma selectiva a las proteínas según la invención y métodos para identificar antagonistas de SMAGP que permitan modular la actividad de dichos polipéptidos. Los métodos incluyen además métodos de modulación, preferiblemente de inhibición, de la transcripción del gen de SMAGP a mRNA. Estos métodos pueden realizarse in vitro o in vivo y pueden utilizar y establecer líneas celulares o modelos de animales transgénicos de la invención.
Un antagonista de SMAGP se define como una sustancia o compuesto que disminuye o inhibe la actividad biológica de SMAGP, un polipéptido, o inhibe la transcripción o traducción del gen de SMAGP. En general, los procedimientos de cribado de antagonistas de SMAGP implican la puesta en contacto de sustancias candidatas con células huésped en las que la invasión se ve modulada por la expresión de SMAGP en condiciones favorables para medir la actividad de SMAGP.
La actividad de SMAGP se puede medir de varios modos. Habitualmente, la activación se hace evidente mediante un cambio en la fisiología de la célula, como una mayor movilidad e invasión in vitro, por un cambio en el estado de diferenciación, o por un cambio en el metabolismo celular que conduce a un aumento de la proliferación.
Los polipéptidos SMAGP pueden producirse utilizando métodos recombinantes o bien mediante síntesis. El polipéptido SMAGP no glucosilado se obtiene de la producción recombinante en procariotas. Con la ayuda de las secuencias de ácido nucleico proporcionadas por la invención es posible buscar el gen SMAGP o sus variantes en genomas de cualquier tipo de célula que se desee (p. ej., aparte de células humanas, también en células de otros mamíferos), para identificarlos y aislar el gen deseado que codifica las proteínas SMAGP. Estos procesos y las condiciones adecuadas de hibridación son muy conocidas por los expertos en la materia y están descritos, por ejemplo, en Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, EE. UU. y Hames, B.D., Higgins, S.G., Nucleic Acid Hybridisation - A Practical Approach (1985) IRL Press, Oxford, Inglaterra. En este caso, para los experimentos se emplean de forma habitual los protocolos estándar descritos en estas publicaciones.
Con la ayuda de estos ácidos nucleicos que codifican un polipéptido SMAGP, es posible obtener el polipéptido según la invención de un modo reproducible y en grandes cantidades. Para la expresión en organismos procariotas y eucariotas, como células huésped procariotas y eucariotas, el ácido nucleico se integra en vectores de expresión adecuados, siguiendo los métodos conocidos por los expertos en la materia. Un vector de expresión de este tipo contiene de forma preferible un promotor regulable/inducible. A continuación se introducen estos vectores recombinantes en células huésped adecuadas para su expresión, como son p. ej. E. coli como célula huésped procariota o Saccharomyces cerevisiae, la línea celular de Teratocarcinoma PA-1, sc 9117 (Büttner, R., et al., Mol. Cell. Biol. 11 (1991) 3573-3583), células de insecto o células CHO o COS como células huésped eucariotas, y las células huésped transformadas o transducidas se cultivan en condiciones que permitan la expresión del gen heterólogo. El aislamiento de la proteína puede llevarse a cabo siguiendo métodos conocidos a partir de la célula huésped o del sobrenadante del cultivo de la célula huésped. Estos métodos aparecen descritos, por ejemplo, en Ausubel I., Frederick M., Current Protocols in Mol. Biol. (1992), John Wiley and Sons, New York. También puede ser necesaria la reactivación in vitro de la proteína si no se encuentra en forma soluble en el cultivo celular.
El polipéptido SMAGP o fragmentos de este se pueden purificar tras la producción recombinante mediante cromatografía de afinidad empleando técnicas conocidas de purificación de proteínas como son la inmunoprecipitación, la filtración en gel, la cromatografía de intercambio iónico, el cromatoenfoque, el isoelectroenfoque, la precipitación selectiva, la electroforesis o similares, y pueden utilizarse para generar anticuerpos frente a SMAGP.
Se proporcionan los vectores de expresión recombinantes adecuados para la expresión de SMAGP, células huésped recombinantes transfectadas con estos vectores de expresión y un procedimiento para la producción recombinante de una proteína que está codificada por el gen de SMAGP.
La producción de anticuerpos frente a SMAGP puede realizarse siguiendo los métodos conocidos de la tecnología de vanguardia. Por ejemplo, se pueden producir anticuerpos monoclonales o policlonales utilizando un polipéptido que constituya el polipéptido completo o un fragmento del mismo. Los polipéptidos adecuados derivados de SMAGP incluyen, por ejemplo, los aminoácidos 83-97.
Puede realizarse un cribado de los anticuerpos obtenidos respecto a su capacidad de unirse a SMAGP empleando técnicas estándar como los ensayos inmunoenzimáticos sobre fase sólida. Podemos encontrar la descripción de métodos para la identificación de epítopos antigénicos y para la producción de anticuerpos en, por ejemplo, Mole, "Epitope Mapping", en: Methods in Molecular Biology, Vol. 10, Manson (ed.), pp. 105-116, The Humana Press, Inc., 1992; Price, "Production and Characterization of Synthetic Peptide-Derived Antibodies", en: Monoclonal Antibodies: Production, Engineering, and Clinical Application, Ritter and Ladyman (eds.), pp. 60-84, Cambridge University Press, 1995; Morris (ed.), Epitope Mapping Protocols 25, Humane Press, Inc., 1996; y Coligan et al. (eds.), Current Protocols in Immunology, pp. 9.3.1-9.3.5 y pp. 9.4.1-9.4.11, John Wiley & Sons, 1997.
Los anticuerpos que pueden ser de utilidad de acuerdo con la invención, en especial con fines terapéuticos, pueden identificarse reduciendo el potencial invasivo y de proliferación de las células tumorales. Con esta finalidad, se tratan células tumorales o una línea de células tumorales, preferiblemente la línea celular SUIT-2 007, con un anticuerpo frente a SMAGP y se mide el potencial invasivo y de proliferación con el reactivo de proliferación celular Cell Proliferation Reagent WST-1 (un reactivo de sal de tetrazolio, Roche Diagnostics GmbH, Alemania) y el ensayo de invasión Matrigel (BDS Biosciences, www.bdbiosciences.com).
Los anticuerpos frente a SMAGP se pueden obtener a partir de cualquier especie animal o bien pueden ser anticuerpos quiméricos o humanizados. Los anticuerpos de elección son en especial los anticuerpos humanos. La obtención de anticuerpos monoclonales humanos se realiza, por ejemplo, a partir de ratones transgénicos que se han generado mediante ingeniería genética para producir anticuerpos humanos específicos como respuesta a una provocación antigénica. En esta técnica se introducen elementos del locus de las cadenas ligera y pesada humanas en cepas de ratón procedentes de líneas de células madre embrionarias que contienen interrupciones dirigidas de los loci endógenos de las cadenas ligera y pesada. Los ratones transgénicos pueden sintetizar anticuerpos humanos específicos para antígenos humanos, y los ratones pueden utilizarse para producir hibridomas que secreten anticuerpos humanos. En Green, L.L., et al., Nat. Genet. 7 (1994) 13-21; Lonberg, N., et al., Nature 368 (1994) 856-859; y Taylor, L.D., et al., Int. Immun. 6 (1994) 579-591, por ejemplo, se describen métodos para obtener anticuerpos humanos a partir de ratones transgénicos.
Los anticuerpos monoclonales se pueden aislar y purificar de cultivos de hibridomas mediante una diversidad de técnicas completamente establecidas. Estas técnicas de aislamiento incluyen la cromatografía de afinidad con Proteína-A Sefarosa, la cromatografía por exclusión de tamaño y la cromatografía de intercambio iónico (véase, por ejemplo, Coligan en las páginas 2.7.1-2.7.12 y las páginas 2.9.1-2.9.3; Baines et al., "Purification of Immunoglobulin G (IgG)", en: Methods in Molecular Biology, Vol. 10, pp. 79-104, The Humana Press, Inc., 1992).
Los anticuerpos se pueden emplear en inmunoensayos de acuerdo con la invención. La detección se puede llevar a acabo mediante la puesta en contacto de una muestra biológica con un anticuerpo y, a continuación, la muestra biológica con una molécula marcada detectable que se une al anticuerpo. El anticuerpo se puede conjugar con avidina/estreptavidina (o biotina) y la molécula que lleva un marcador detectable puede contener biotina (o avidina/estreptavidina). Los expertos en la materia conocen bien las numerosas variaciones que existen de esta técnica básica. Como alternativa, un anticuerpo se puede conjugar con un marcador detectable para formar un inmunoconjugado. Entre los marcadores detectables adecuados se encuentran los siguientes: un radioisótopo, un marcador fluorescente, un marcador quimioluminiscente, un marcador enzimático, un marcador bioluminiscente u oro coloidal. Los métodos para realizar y detectar estos inmunoconjugados marcados de forma detectable son muy conocidos por los expertos en la materia y más adelante se describen con más detalle.
Preferiblemente, los anticuerpos según la invención pueden emplearse para el tratamiento de un paciente que padezca de un tumor, en especial un tumor metastásico. La ventaja que supone este tipo de tratamiento respecto a una composición farmacéutica que contenga un anticuerpo frente a SMAGP es demostrable en un modelo in vivo de tumor pancreático. Alves, F., et al., Pancreas 23 (2001) 227-235 describen un modelo de este tipo. Este modelo in vivo comprende un modelo de trasplante ortotópico de adenocarcinoma ductal en ratones con inmunodeficiencia combinada grave (SCID). Morikawa, K., et al., Cancer Res. 48 (1988) 6863-6871 describen un modelo adecuado de adenocarcinoma de colon humano KM12. El trasplante ortotópico de las líneas celulares metastásicas KM12SM y KM12L4A en ratones SCID da lugar a la formación de tumores y metástasis. Un modelo de tumor pulmonar humano basado en la inyección s.c. de la línea celular NIH-H460 está descrito por Corti, C., et al., J. Cancer Res. Clin. Oncol. 122 (1996) 154-160. La línea celular NIH-H460 se obtuvo de una carcinoma pulmonar de células grandes y da lugar a metástasis en los pulmones tras la inyección s.c. en ratones atímicos. Un modelo adecuado de cáncer de mama está basado en tumores implantados de forma ortotópica (en el ratón nude) procedentes de la línea celular de cáncer de mama line MDA-MB-435 que conduce a la formación de tumores y metástasis (John, C.M., et al., Clin. Cancer Res. 9 (2003) 2374-2383).
En general, la dosis administrada de anticuerpos frente a SMAGP variará en función de factores como la edad, el peso, la estatura, el sexo, el estado general de salud y los antecedentes médicos del sujeto. A modo de ejemplo, las composiciones de anticuerpos frente a SMAGP se pueden administrar a dosis bajas de proteínas, como de 20 a 100 miligramos de proteína por dosis, de una vez o de forma repetida. Por otro lado, los anticuerpos también se pueden administrar en dosis de 30 a 90 miligramos de proteína por dosis, de 40 a 80 miligramos de proteína por dosis o de 50 a 70 miligramos de proteína por dosis.
Las vías de administración elegidas de componentes de anticuerpos a un sujeto son la intravenosa, la intramuscular o por perfusión mediante catéter local, preferiblemente de forma directa en el órgano pancreático o en su proximidad. La administración puede ser por infusión continua o mediante bolos individuales o múltiples.
Una composición farmacéutica que contiene un anticuerpo frente a SMAGP puede formularse siguiendo los métodos conocidos para la preparación de composiciones de utilidad farmacéutica, según los cuales se combinan las proteínas terapéuticas en una mezcla con un transportador farmacéuticamente aceptable. Una composición se considera un "transportador farmacéuticamente aceptable" si un paciente puede tolerar su administración. La solución salina estéril tamponada con fosfato constituye un ejemplo de transportador farmacéuticamente aceptable. Otros transportadores adecuados son muy conocidos en el ámbito. Véase, por ejemplo, Gennaro (ed.), Remington's Pharmaceutical Sciences, 19 edición, Mack Publishing Company, 1995.
Como forma de tratamiento se administran anticuerpos frente a SMAGP y un transportador farmacéuticamente aceptable a un paciente en una cantidad de efectividad terapéutica. Se dice que se administra una combinación del anticuerpo y un transportador farmacéuticamente aceptable "en una cantidad de efectividad terapéutica" si la cantidad administrada tiene importancia fisiológica.
Una composición farmacéutica que contenga anticuerpos frente a SMAGP se debe facilitar preferiblemente en forma líquida inyectable o para infusión.
Se presentan los siguientes ejemplos, referencias, listado de secuencias, tablas y figuras para ayudar a la comprensión de la presente invención cuyo auténtico ámbito de aplicación se expone en las reivindicaciones anexas.
Descripción de las Figuras
Fig. 1 Análisis de transferencia Northern de la expresión de mRNA de SMAGP en sistemas de líneas celulares de adenocarcinoma isogénico de rata o humano con diferente potencial metastásico. Se cargaron geles de agarosa formaldehído con 10 \mug de RNA total por carril. Se valoró que la carga igual de RNA total fuese igual mediante tinción con bromuro de etidio de los RNA ribosómicos de 28S y 18S. El potencial no metastásico (-), metastásico bajo (\pm) o metastásico elevado se indica para cada línea celular. (A) líneas celulares isogénicas de adenocarcinoma pancreático de rata: BSp73-AS y BSp73-ASML. (B) líneas celulares isogénicas de adenocarcinoma prostático de rata: G, AT-1, AT-3, AT-6, MAT-Lu y MAT-LyLu. (C) líneas celulares isogénicas de adenocarcinoma mamario de rata: MTPa, MTC, MTLn2 y MTLn3. (D) líneas celulares isogénicas de adenocarcinoma pancreático humano: S2-028 y S2-007. (E) líneas celulares isogénicas de adenocarcinoma de colon humano: KM12C, KM12SM y KM12L4. (F) líneas celulares isogénicas de adenocarcinoma de colon humano: HCT116 y HCT116-C15.5. En todos los sistemas, los mayores niveles de expresión de mRNA de SMAGP estaban asociados a células neoplásicas con potencial
metastásico.
Fig. 2 Caracterización inmunológica de SMAGP. Análisis por transferencia Western de SMAGP con extractos de proteínas de células MTLn3 (carriles c-f) y HCT116-c15.5 (carriles g-k), antes y después de las reacciones de desglucosilación enzimática con N-glucosidasa F (PNGasa F), sialidasa y O-glucosidasa. Se utilizaron las glucoproteínas transferrina N-glucosilada, alfa 1 glucoproteína ácida y ribonucleasa B como controles positivos para el tratamiento con N-glucosidasa F (carriles a-b). SMAGP se modifica de forma postranscripcional mediante la adición de ácido siálico y O-glucosilación.
Fig. 3 Análisis por transferencia Northern de la expresión de mRNA de SMAGP en tejidos humanos normales. Cada carril se cargó con 20 \mug de RNA total. Se utilizó como control de carga la hibridación de la membrana con una sonda de RNA de 18S. Se observó expresión baja y alta de SMAGP en prácticamente todos los tejidos
estudiados.
Fig. 4 Análisis inmunohistoquímico de la expresión de SMAGP en tejidos humanos normales y neoplásicos. A-D: tejidos normales de mama, endometrio, colon e hígado (conducto biliar). SMAGP se encuentra localizado principalmente en la membrana plasmática de las zonas laterales de las células epiteliales. E-H: muestras de tumor de un paciente con cáncer de colon. E y G: tumores primarios, F y H: metástasis hepáticas. C: tejido de colon normal del mismo paciente. Los tumores bien diferenciados (E y F) muestran una fuerte expresión de SMAGP y la localización de las proteínas en la membrana plasmática se conserva bastante. Por el contrario, los tumores indiferenciados estaban asociados con una localización citoplasmática de la proteína (G y H) y una menor expresión de SMAGP (H). Aumentos: A-D, X200; E-H, X100.
Fig. 5 Detección de la expresión del mRNA de hSMAGP en tejidos pancreáticos humanos.
Fig. 6 Expresión del mRNA de hSMAGP en tejidos de colon humano medida mediante RT-PCR cuantitativa a tiempo real. Los resultados se expresan en forma de niveles de expresión normalizados del mRNA de hSMAGP. Las muestras normales, los tumores primarios y las muestras de metástasis se indican en barras blancas, ralladas y punteadas, respectivamente. Las muestras procedentes del mismo paciente están emparejadas. N, colon normal; Ta, tumor de colon en estadio A de Duke; Tb, tumor de colon en estadio B de Duke; Tc, tumor de colon en estadio C de Duke; Td, tumor de colon en estadio D de Duke; M, metástasis hepática; NL, hígado normal.
Fig. 7 Organización de los dominios de SMAGP.
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Ejemplo 1 Cultivo celular
La disponibilidad de líneas celulares tumorales isogénicas con diferencias marcadas en su comportamiento metastásico ofrece un modelo adecuado para estudiar el proceso metastásico. Con este fin se empleó el sistema celular tumoral de rata BSp73 que contenía dos variantes estables obtenidas mediante trasplante en serie de un tumor pancreático espontáneo de rata: la variante no metastásica BSp73-AS y la variante metastásica BSp73-ASML (Matzku, S., et al., Invasion Metastasis 3 (1983) 109-123). Existen estudios previos que han demostrado que este constituye un modelo adecuado para la identificación de genes asociados a metástasis. Se generaron anticuerpos monoclonales frente a proteínas de membrana de la línea celular metastásica BSp73-ASML con objeto de identificar moléculas de superficie asociadas con el fenotipo metastásico y se identificaron cuatro proteínas (CD44v, D6.1A, C4.4A y EGP314) que solo están presentes sobre la superficie de la variante metastásica. Su implicación en el proceso de metástasis se demostró utilizando transfectantes estables de varias células tumorales no metastasizantes. La expresión génica era suficiente para conceder un potencial metastásico o promover pasos diferentes de la cascada metastásica (Claas, C., et al., J. Cell. Biol. 141 (1998) 267-280; Gunthert, U., et al., Cell 65 (1991) 13-24; Rosel, M., et al., Oncogene 17 (1998) 1989-2002; y Wurfel, J., et al., Oncogene 18 (1999) 2323-2334). Asimismo, la expresión desregulada de CD44v se ha correlacionado con un mal pronóstico en muchos tipos de cáncer en humanos.
Las líneas celulares de adenocarcinoma pancreático de rata BSp73-AS y BSp73-ASML están descritas por Matzku, S., et al., Invasion Metastasis 3 (1983) 109-123. Las líneas celulares de adenocarcinoma prostático de rata G, AT-1, AT-3, AT-6, MAT-Lu y MATLyLu (Isaacs, J.T., et al., Prostate 9 (1986) 261-281) se adquirieron de la Colección Europea de Cultivos Celulares (ECACC, Salisbury, UK). Las líneas celulares de adenocarcinoma de colon humano KM12C, KM12SM y KM12L4 están descritas por Morikawa, K., et al., Cancer Res. 48 (1988) 6863-6871. La línea celular de adenocarcinoma de colon humano HCT116 está descrita por a Brattain, M.G., et al., Cancer Res. 41 (1981) 1751-1756. HCT116-cl5.5 se aisló in vivo de metástasis pulmonar derivada de HCT116 y se identificó como altamente metastásica. Las líneas celulares antes mencionadas se cultivaron sin antibióticos en RPMI 1640 complementado con suero fetal bovino al 10% y L-glutamina 2 mM. Las líneas celulares de adenocarcinoma mamario de rata MTPa, MTC, MTLn2 y MTLn3, descritas por Neri, A., et al., J. Natl. Cancer Inst. 68 (1982), se cultivaron en MEM-\alpha complementado con suero fetal bovino al 10%. Las líneas celulares de adenocarcinoma pancreático humano S2-028 y S2-007, descritas por Taniguchi, S., et al., Clin. Exp. Metastasis 10 (1992) 259-266, se cultivaron en D-MEM complementado con suero fetal bovino al 10% y L-glutamina 2 mM. Todas las líneas celulares estaban libres de contaminación por micoplasmas.
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Ejemplo 2 Transferencia Northern
Se aisló el RNA total de pellets de células congeladas con el equipo RNeasy midi (Qiagen, Hilden, Alemania). Se separaron por tamaño 10 \mug de RNA total en un gel desnaturalizante de agarosa formaldehído al 1% y se transfirieron (NorthernMax^{TM} blotting kits, Ambion) a una membrana de nailon (BrightStar-Plus^{TM}, Ambion, Austin, EE. UU.). Tras el entrecruzamiento mediante radiación UV (UV Stratalinker 2400, Stratagene, La Jolla, USA), se hibridaron las transferencias con cDNA marcado con [a-^{32}P]dATP (Tarbé, N., et al., Anticancer Res. 22 (2002) 2015-2027). La carga igual de RNA total sobre gel de agarosa-formaldehído se verificó mediante tinción con bromuro de etidio del RNA ribosómico. La expresión de mRNA de SMAGP en tejidos normales humanos se determinó utilizando sistemas comerciales de transferencia de RNA total humano (Northern Territory^{TM}, Invitrogen, Huntsville, EE. UU.). Cada carril se cargó con 20 \mug de RNA total y la carga igual se comprobó mediante cuantificación de RNA de 18S. Las transferencias se procesaron del modo antes mencionado. Las sondas de cDNA para el mRNA humano y de rata de SMAGP se obtuvieron con RT-PCR empleando los siguientes pares de cebadores:
\newpage
B1 (TTGTGGTATCGAGCCTCCA) (ID. de SEC. núm.: 3)/
B2 (GGCTCCAACACTGAGACACTG) (ID. de SEC. núm.: 4) y
H105 (ACAAAGGCAGCTACGTCACC) (ID. de SEC. núm.: 5)/
106 (CTTTCTCCATGTCCCTGGTC) (ID. de SEC. núm.: 6),
respectivamente.
Las sondas resultantes corresponden a una región de 290 pb y 295 pb del 3'UTR del mRNA de SMAGP de rata y humano, respectivamente.
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Ejemplo 3 RACE-PCR
Se obtuvo la secuencia completa del cDNA de rSMAGP con RACE-PCR empleando un equipo de amplificación de cDNA SMART^{TM} RACE (Clontech, Palo Alto, EE. UU.). Se sometió 1 \mug de RNA total de la línea celular BSp73-ASML a transcripción inversa según las instrucciones del fabricante. Las regiones 5' y 3' no traducidas se amplificaron mediante PCR con cebadores Clontech Universal y los cebadores específicos de la secuencia de rSMAGP B140 (5'-GAT GAA GTA CTC TTC CTT CTC TTT GC- 3') (ID. de SEC. núm.: 7) y B139 (5'-AAG GGG AGC CCA GCG CCA TCC TCC AG-3') (ID. de SEC. núm.: 8), respectivamente. Los productos de PCR se clonaron en el vector pCR® 4-TOPO y se secuenciación con el analizador ABI Prism® 310 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, Foster City, EE. UU.).
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Ejemplo 4 Anticuerpos y transferencia Western
Eurogentech S.A. (Herstal, Bélgica) fue la encargada de generar anticuerpos policlonales de conejo frente a SMAGP. El péptido sintético ESDLAKGSEKEEYFI, que corresponde a los residuos 83 a 97 de hSMAGP (ID. de SEC. núm.: 2), se acopló a KLH (hemocianina de lapa californiana) y se inyectó en conejos. Los sueros inmunorreactivos frente al péptido sintético se purificaron por afinidad. Es posible generar anticuerpos monoclonales de conejo siguiendo las indicaciones de Spieker-Polet, H., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92 (1995) 9348-9352.
Para la realización de la transferencia Western, se extrajeron proteínas con tampón RIPA (Tris-Cl 50 mM pH 7,5, NaCl 150 mM, NP-40 1%, desoxicolato sódico 0,5%, SDS 0,1%) que contiene una mezcla inhibidora de proteasas (Inhibidores de proteasas totalmente libres de EDTA, Complete EDTA free protease Inhibitors, Roche Diagnostics, Mannheim, Alemania). Se llevó a cabo una electroforesis en gel de poliacrilamida en condiciones reductoras empleando gel NuPAGE® Bis-Tris al 12% (Invitrogen, Carlsbad, EE. UU.) y tampón NuPAGE® MES SDS (Invitrogen). Los geles se sometieron a transferencia semiseca sobre una membrana de nitrocelulosa y se bloquearon en tampón TBS (Tris-Cl 100 mM pH7,5, NaCl 150 mM) más leche en polvo desnatada al 5% (Merck, Darmstadt, Alemania). Tras la incubación con anticuerpo de conejo frente a SMAGP diluido a 1:5000 como anticuerpo primario, las membranas se lavaron en tampón TBS con Tween20 al 0,1%, se incubaron con anticuerpo anticonejo conjugado con peroxidasa de rábano picante (Roche Diagnostics) como anticuerpo secundario y se realizó un nuevo lavado. La detección de anticuerpos se llevó a cabo utilizando quimioluminiscencia mejorada (sustrato para transferencias Western Lumi-lightPLUS, Roche Diagnostics GmbH, Alemania).
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Ejemplo 5 Ensayo de desglucosilación
Se llevaron a cabo experimentos de desglucosilación enzimática con 100 \mug o menos de lisado celular total desnaturalizado a 100ºC durante 5 min en tampón de reacción (fosfato sódico 0,05 mM, pH 7) y tampón de desnaturalización (SDS 2%, beta-mercaptoetanol 1 M). Seguidamente se añadió Triton X-100 a la solución a una concentración final del 10%. Las enzimas N-glucosidasa F (PNGasa F), Sialidasa y O-glucosidasa (Sigma, Steinheim, Alemania) se añadieron a una concentración final de 100 U/ml, 100 mU/ml y 25 mU/ml, respectivamente, en un volumen total de 50 \mul. Las muestras se incubaron durante 3 h a 37ºC. Se utilizaron las glucoproteínas humanas transferrina, alfa 1 glucoproteína ácida y ribonucleasa B como controles positivos de la actividad de la PNGasa F, analizada mediante SDS-PAGE en condiciones reductoras, y visualizada mediante tinción con coomassie blue. Tras las reacciones de desglucosilación, se analizó SMAGP mediante transferencia Western con anticuerpos de conejo frente a SMAGP.
Ejemplo 6 Inmunohistoquímica
Los tejidos se fijaron en formalina tamponada con fosfato (4%). El análisis inmunohistoquímico se realizó en secciones de tejido incluidas en parafina empleando un sistema peroxidasa-antiperoxidasa (DAKO, Carpinteria, CA) para el proceso de revelado descrito previamente (Régnier, C.H., et al., J. Biol. Chem. 270 (1995) 25715-25721). Se empleó el anticuerpo frente a SMAGP a una dilución de 1:1000.
Ejemplo 7 La expresión del mRNA de SMAGP está correlacionada con el potencial metastásico de líneas celulares cancerosas de humanos y ratas
Se analizó la expresión del mRNA de SMAGP en una serie de líneas celulares tumorales isogénicas con diferente potencial metastásico. La expresión se evaluó en primer lugar en sistemas de líneas celulares de tumor mamario, prostático y pancreático de rata (Fig. 1 A-C). El mRNA de rSMAGP, o bien no era detectable, o bien solamente lo era en niveles bajos en las líneas celulares no metastásicas BSp73-AS, G y MTPa. Por el contrario, se halló una fuerte expresión en todas las líneas celulares metastásicas (BSp73-ASML, AT-1, AT-3, AT-6, MAT-Lu, MAT-LyLu, MTLn2 y MTLn3), excepto en la línea celular MTC de bajo potencial metastásico. En la Fig. 1 D-F se muestra la expresión del mRNA de hSMAGP en sistemas de células tumorales isogénicas humanas, uno de páncreas y dos de colon. Se observó una sobreexpresión de mRNA de hSMAGP en las células con gran potencial metastásico (S2-007, KM12SM, KM12L4 y HCT116-Cl5.5) en comparación con las células de potencial metastásico bajo o nulo (S2-028, KM12C y HCT116). Por esta razón, la expresión del SMAGP en sistemas de líneas celulares de rata y humanas está correlacionada con su potencial metastásico.
Ejemplo 8 Modificaciones postraduccionales de la proteína SMAGP
Para seguir caracterizando la proteína SMAGP se generaron anticuerpos policlonales frente a un péptido sintético que corresponde a los 15 últimos residuos de la región carboxiterminal de hSMAGP, que tienen un grado de conservación entre la SMAGP de rata y de humano del 80%. Con la finalidad de demostrar la traducción de la proteína SMAGP predicha, se llevó a cabo un análisis por transferencia Western de extractos de proteínas de células tumorales de rata (MTLn3) y humanas (HCT116-cl5.5) en condiciones reductoras. Para ambos tipos se observó una banda que correspondía a SMAGP de 23 y 25 kDa, respectivamente (Figura 2, carriles c y g). Este hecho indicó que el tamaño de las proteínas expresadas se aumentó en dos veces respecto del peso molecular predicho. Dado que la secuencia primaria de SAMGP contenía varios sitios de glucosilación putativos, se llevó a cabo un análisis similar por transferencia Western de extractos de proteínas tras la desglucosilación con N-glucosidasa F (PNGasa F), sialidasa y O-glucosidasa para determinar si SMAGP se modifica postraduccionalmente. El tratamiento con PNGasa F (Figura 2, carriles d y h) no tuvo ningún efecto sobre el peso molecular aparente (PM), lo que indicó que SMAGP no sufre N-glucosilación.
El tratamiento con sialidasa (Figura 1, carriles e e i) condujo a un ligero cambio de bandas que sugiere que SMAGP está modificada por los ácidos siálicos. El tratamiento adicional con O-glucosidasa (Figura 2, carriles f y j) provocó un cambio pronunciado del PM aparente, lo cual es coherente con la presencia de sitios de O-glucosilación. Finalmente, el tratamiento individual con O-glucosidasa (Figura 2, carril k) no tuvo ningún efecto sobre el PM de SMAGP, confirmando la presencia de ácidos siálicos anexionados a oligosacáridos unidos por enlaces tipo O, hecho del que se sabe que inhibe la acción de la O-glucosidasa (Fukuda, M., et al., J. Biol. Chem. 262 (1987) 11952-11957). Se utilizaron las glucoproteínas transferrina N-glucosilada, alfa 1 glucoproteína ácida y ribonucleasa B como controles positivos para el tratamiento con PNGasa F (Figura 2, carriles a y b).
Ejemplo 9 Expresión de SMAGP y localización subcelular en tejidos normales humanos
La distribución de SMAGP en un panel de tejidos humanos normales se evaluó mediante análisis por transferencia Northern (Fig. 3). La expresión de mRNA de SMAGP es relativamente ubicua y el nivel de expresión más elevado se detectó en placenta. También se detectó una gran expresión en tejido adiposo, de esófago y de colon.
Por lo tanto, los experimentos inmunohistoquímicos que emplean el anticuerpo frente a SMAGP en tejidos normales de colon, mama, pulmón y conducto biliar mostraron que la proteína SMAGP se encuentra altamente expresada en todos los órganos (figura 4, A-D). La expresión de SMAGP se encuentra restringida a las estructuras epiteliales polarizadas caracterizadas por la adhesión célula-célula que confiere la morfología celular cuboide. En las células, la proteína se encuentra localizada principalmente en las membranas plasmáticas. Además, no se observa SMAGP a lo largo de toda la membrana plasmática, sino solamente en los dominios de membrana laterales situados en las uniones epiteliales célula a célula. Las zonas basal y apical de la membrana carecían de SMAGP. También se observó un pequeño grado de tinción en el citoplasma celular.
Ejemplo 10 Expresión de SMAGP y localización subcelular en tumores primarios de colon y metástasis
Se examinó SMAGP en tumores primarios y metástasis procedentes de pacientes con cáncer de colon. En la Fig. 4 se presenta un ejemplo de tinción inmunohistológica obtenida en pacientes procedentes del mismo paciente (C, colon normal; E y G, tumores primarios; F y H, metástasis hepáticas). En los tumores primarios la expresión de SMAGP puede mantenerse bastante elevada (E) o mostrarse disminuida (G).
Asimismo, en algunos casos la localización subcelular se conserva de forma parcial (E) mientras en otros no se recluta más hacia la membrana plasmática y pasa a ser más o menos citoplasmática (G). En las metástasis hepáticas se obtuvieron resultados similares (F y H). Así, en un paciente dado se pueden observar diversos fenotipos de SMAGP en tumores primarios y metástasis, y pueden incluso coexistir dentro de los mismos tumores en función de las áreas (F). Es interesante destacar que en todos los tumores primarios y metástasis estudiados, un nivel elevado de expresión de proteína SMAGP y su localización en la membrana celular estaban asociados con una estructura epitelial conservada (E y F comparados con G y H). Se realizaron observaciones similares en tumores primarios y metástasis procedentes de pacientes con cáncer de mama y pulmón.
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Ejemplo 11 Detección de la expresión del mRNA de hSMAGP en tejidos pancreáticos humanos
Se evaluó la expresión del mRNA de SMAGP mediante RT-PCR cuantitativa (tecnología Taqman) en 10 carcinomas de páncreas humano (Fig. 5, barras azules) y en 5 tejidos normales de páncreas humanos (Fig. 5, barras blancas). La expresión de hSMAGP también se mide en la línea celular de tumor pancreático humano Capan I. En 5 muestras de carcinoma se observa una sobreexpresión en comparación con el mayor valor de expresión de hSMAGP alcanzado en tejidos pancreáticos normales, y en paréntesis sobre las barras correspondientes se indica la proporción de los cambios.
Protocolo para el análisis Taqman
Para llevar a cabo la PCR se utilizaron reactivos de ficoeritrina (PE):
4 \mul de tampón SybrGreen, 4,8 \mul de MgCl_{2}, 3,2 \mul de dNTD, 0,2 \mul de UNG, 0,2 \mul de Amplitaq Gold, 4 \mul de Primermix, 1 \mul de cDNA y 22,6 \mul de H_{2}O.
Se aplicaron las siguientes condiciones de PCR:
Fases iniciales: 2 min 50ºC, 10 min 95ºC, 40 ciclos: 15 s 95ºC, 1 min 60ºC.
Se realizaron dos PCR (determinación doble) para examinar la expresión del gen respectivo de cada cDNA. A la vez se realizó una PCR de xs13 empleando el mismo cDNA. El programa detector de secuencias ABI indica un valor de ciclo umbral (CT) para cada PCR. Se calculó la media de los valores CT de cada cDNA (es decir, el valor medio de la doble determinación; para xs13 solamente existe un valor por cada cDNA). A continuación se resta el valor de xs13 a cada cDNA respectivo a partir de los valores promedio antes mencionados. Se calcula un valor medio solo con las diferencias obtenidas de los cDNA sanos. Las diferencias de los cDNA de pancreatitis crónica, carcinoma pancreático y páncreas sano se dividen por este valor medio. Posteriormente, estos cocientes se expresan como potencia en base 2 (porque durante la PCR los productos se duplican en cada reacción). Los números recíprocos de estos valores representan la expresión de los respectivos cDNA comparada con el cDNA sano.
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Ejemplo 12 Detección de la expresión del mRNA de hSMAGP en tejidos de colon humano
La importancia clinicopatológica de la expresión de hSMAGP respecto a la diseminación tumoral se examinó por primera vez en muestras de tejidos humanos de pacientes con cáncer de colon. La expresión de mRNA se evaluó mediante RT-PCR cuantitativa (tecnología Light-Cycler) en nueve muestras de colon normal, nueve muestras de tumor primario de colon (con estadio de Duke conocido) y nueve muestras de metástasis hepáticas (Fig. 6). Las muestras normales y de tumores primarios procedían del mismo paciente, mientras que las de metástasis hepáticas no. Se observó una sobreexpresión elevada en todos los tumores emparejados, independientemente del estadio de Duke, comparada con el colon normal. Asimismo, los niveles de mRNA de SMAGP en metástasis eran mayores que los valores alcanzados en 6 de las 9 muestras de tumor primario (75% de los casos). Se emplearon cuatro muestras de tejido hepático normal como control de la expresión de hSMAGP en el hígado, lo que confirmó que el elevado nivel de expresión de hSMAGP en metástasis no proviene del entorno del órgano. Estos resultados demuestran la existencia de sobreexpresión del mRNA del hSMAGP en tumores de colon humano en comparación con la mucosa normal del colon, y muestran en un 75% de los casos una mayor expresión en metástasis hepáticas que en tumores primarios.
El RNA total extraído con el equipo RNeasy (Qiagen) se sometió a tratamiento con desoxirribonucleasa I (Qiagen) antes de realizar la síntesis de la primera cadena de cDNA con oligo-dT y transcriptasa inversa AMV (Roche Diagnostics). A continuación se realizó una reacción en cadena de la polimerasa con una mezcla única de enzimas que contiene DNA polimerasa Taq y DNA polimerasa Tgo (Roche Diagnostics).
Para la RT-PCR cuantitativa se empleó RNA total de muestras de tejido de colon congeladas. Después del tratamiento con desoxirribonucleasa I se sometió el RNA total (1 \mug) a transcripción inversa empleando hexámeros aleatorios y transcriptasa inversa AMV (Roche Diagnostics). Se diseñaron dos cebadores específicos para el gen basándose en la secuencia de hSMAGP [H103: 5'-AGA AGA TGG AGC CAG CAC AG-3' (ID. de SEC. núm.: 9) y H104: 5'-ATC TGG ACG ATG GCA CTG G-3' (ID. de SEC. núm.: 10)]. Estos cebadores están situados en dos exones diferentes para evitar la contaminación por DNA genómico. El control a tiempo real de las reacciones de PCR se llevó a cabo mediante el sistema LightCycler y el equipo DNA Master SYBR® Green I (Roche Diagnostics). Tras la optimización, las mezclas de reacción de PCR contenían MgCl_{2} 4 mM, 0,4 \muM de cada cebador, 2 \mul de solución de cDNA y 2 \mul de SYBR Green I en un volumen final de 20 \mul. Cada experimento se realizó por duplicado. Las curvas de calibración, tanto para el gen diana hSMAGP como para el RNA de 18S como referencia endógena, se generaron con diluciones seriadas (1:10, 1:50 y 1:80) de cDNA de la línea celular de adenocarcinoma de colon humano KM12SM. Para cada muestra, la cantidad relativa de gen diana y de los RNA de referencia endógenos se determinó a partir de la curva de calibración. El nivel de expresión de mRNA de hSMAGP en las muestras se normalizó dividiendo la cantidad de mRNA de hSMAGP por la cantidad de RNA de 18S para cada muestra.
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Ejemplo 13 El impacto de la expresión de SMAGP sobre la formación de metástasis en la rata
Se transfectaron células BSp73AS, la variante de un adenocarcinoma pancreático de rata con un potencial metastásico bajo, con SMAGP o solamente el vector (transfectantes simulados). Se seleccionaron dos clones transfectados simulados y cuatro clones que diferían ligeramente en la intensidad de la expresión de SMAGP. Estos clones, así como las células BSP73ASML y BSp73AS no transfectadas, se inyectaron por vía intraperitoneal o a través de la almohadilla plantar a ratas BDX (cepa de origen) para comprobar si se producía un incremento potencial de la capacidad metastásica en las células BSp73AS transfectadas. Dado que el comportamiento de crecimiento de los dos clones transfectados simulados y de los cuatro clones transfectados con SMAGP no difería de forma significativa, los datos procedentes de estos dos clones simulados y cuatro clones transfectados con SMAGP se combinaron (Tabla 1).
Tras la aplicación intraperitoneal, las células BSp73AS y BSp73AS simuladas crecieron en grandes nódulos exclusivamente en la cavidad peritoneal, con un tiempo de supervivencia medio de las ratas trasplantadas con estas células de 20 días. Las ratas trasplantadas con células BSp73ASML presentaban un tiempo de supervivencia de 40 días. El tumor se desarrolló en forma miliar en la cavidad peritoneal y todas las ratas sucumbieron con formación de metástasis miliar en los pulmones. De 12 ratas que recibieron células BSp73AS transfectadas con SMAGP, 6 desarrollaron nódulos grandes en la cavidad peritoneal (similar a lo sucedido en las ratas a las que se había inyectado células BSp73AS), pero 6 mostraron un desarrollo de tumores miliares en la cavidad peritoneal. Cuatro ratas presentaron metástasis hepática y hubo 2 que desarrollaron, respectivamente, metástasis en riñón y ovario. Dos ratas presentaron una abundante infiltración tumoral del diafragma. Ninguna de las ratas mostró metástasis pulmonar. Estos resultados demuestran un aumento del potencial metastásico (Tabla 1A).
Para confirmar los resultados, se inyectaron las células tumorales en la almohadilla plantar, donde se puede seguir más fácilmente la progresión metastásica. En los casos en los que no se extirparon los tumores tras la aplicación en la almohadilla plantar todas las ratas desarrollaron metástasis en el ganglio linfático poplíteo de drenaje, pero solamente las ratas que recibieron BSp73ASML (5/5) y las que recibieron células BSp73AS transfectadas con SMAGP (4/5) desarrollaron metástasis en nódulos linfáticos distantes del lugar de implantación (paraaórtico, inguinal y axilar). Asimismo, solamente aquellas ratas que recibieron BSp73ASML (5/5) y células BSp73AS transfectadas con SMAGP (4/5) desarrollaron metástasis pulmonar. Las células BSp73ASML desarrollaron metástasis miliares, mientras que las célula BSp73AS transfectadas con SMAGP desarrollaron nódulos grandes. Estos resultados confirman de forma inequívoca la mayor capacidad metastásica de las células tumorales que expresan SMAGP (Tabla 1B).
Con el fin de estimar el tiempo necesario para el establecimiento metastásico, se inyectaron células tumorales en la almohadilla plantar de las ratas y 28 días después se extirpó el tumor junto con el ganglio linfático de drenaje. Los datos presentados en la tabla 1C hacen referencia solamente a aquellos animales que no desarrollaron una recurrencia local debido a la eliminación incompleta del ganglio linfático de drenaje (2 ratas con BSp73AS, 4 ratas con células BSp73AS transfectadas simuladas y 1 rata con células BSp73AS transfectadas con SMAGP). De las ratas sometidas a extirpación curativa sobrevivieron las siguientes: 0/5 ratas con BSp73ASML, 3/3 ratas con BSp73A, 6/6 ratas con BSp73AS transfectadas simuladas y 9/14 ratas con BSp73AS transfectadas con SMAGP. Por lo tanto, la colonización metastásica en las células BSp73AS transfectadas con SMAGP progresa de forma muchísimo más lenta que en las células BSp73ASML, pero de forma diferente que en las células BSp73AS no transfectadas o transfectadas simuladas; en el 36% de las ratas las células BSp73AS transfectadas con SMAGP habían migrado más allá del ganglio linfático de drenaje a los 28 días de la aplicación de las células tumorales.
TABLA 1 Desarrollo metastásico de células BSp73AS transfectadas con SMAGP
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A. Desarrollo tras la aplicación intraperitoneal
1
B. Desarrollo tras la aplicación en la almohadilla plantar
3
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C. Desarrollo tras la aplicación en la almohadilla plantar y extirpación
4
5
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Ejemplo 14 Ensayo de metástasis in vivo
Se obtuvieron ratas BDX de Jackson Laboratories, Sulzfeld, Alemania. Para los experimentos se utilizaron ratas hembra de 8 a 12 semanas de edad. Recibieron una inyección única de 5x10^{5} células tumorales, bien por vía intraperitoneal (i.p.), bien por vía subcutánea en la almohadilla plantar trasera. Allí donde se indica, tras la aplicación de la inyección en la almohadilla plantar los tumores se extirparon por amputación de la pata posterior. En resumen, las ratas se anestesiaron con Rompun/Ketanest. La piel se eliminó mediante incisión circular con un escalpelo a unos 0,5 cm por debajo la articulación. Después de suturar la arteria y eliminar el ganglio linfático de drenaje se cortaron los tendones y se eliminó la pata trasera por exarticulación. La herida se cubrió con piel y se cosió. El desarrollo del tumor se controló dos veces a la semana, bien por palpación del abdomen tras la aplicación i.p., bien midiendo el diámetro tumoral y el diámetro del ganglio de drenaje tras la aplicación en la almohadilla plantar. Cuando la masa tumoral palpable alcanzó un diámetro medio de 2,5 cm o cuando las ratas presentaban caquexia o anemia (que se puede estimar por el color de los ojos y las orejas) o disnea, se las anestesió y sacrificó. Se realizó la autopsia de las ratas y de todos los órganos se analizó la presencia de metástasis.
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<210> 1
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<211> 291
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
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<220>
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<221> CDS
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<222> (1)..(291)
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<400> 1
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6
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7
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ttgtggtatc cagcctcca
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19
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aaggggagcc cagcgccatc ctccag
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26
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<213> Artificial
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<223> cebador H103
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<400> 9
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agaagatgga gccagcacag
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<213> Artificial
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<220>
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<223> cebador H104
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atctggacga tggcactgg
\hfill
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Claims (7)

1. Un método para determinar de la presencia de glucoproteína pequeña de adhesión celular (SMAGP) en un paciente, que comprende:
(i) la detección en una muestra biológica de un paciente, sospechosa de contener células tumorales o parte de ellas, de una cantidad de ácido nucleico que codifica SMAGP o una cantidad de polipéptido SMAGP; y
(ii) la comparación de la cantidad de dicho ácido nucleico o polipéptido con una valor estándar predeterminado que indicará la línea de decisión referente a la expresión o presencia de SMAGP relacionada con la metástasis en dichas células y, de esta forma, permitirá determinar la expresión o presencia relacionadas con la metástasis de SMAGP en dicho paciente.
2. Un procedimiento para la determinación del contenido o no de células tumorales con potencial metastásico en una muestra de tejido o de líquido de un paciente o de si proviene de células tumorales metastásicas. En él se emplea esta muestra y una segunda muestra proveniente de células no tumorales del mismo individuo o de otro diferente de la misma especie, y se siguen los siguientes pasos:
(a) la incubación de cada muestra respectiva en condiciones de hibridación rigurosas con una sonda de ácido nucleico seleccionada del grupo formado por:
(i)
una secuencia de ácido nucleico con ID. de SEC. núm.: 1, o un fragmento de la misma;
(ii)
una secuencia de ácidos nucleicos que sea complementaria a cualquier secuencia de ácidos nucleicos de (i);
(iii)
una secuencia de ácidos nucleicos que hibride en condiciones rigurosas con la secuencia de (i); y (iv) una secuencia de ácidos nucleicos que hibride en condiciones rigurosas con la secuencia de (ii); y
(b) la determinación de la cantidad aproximada de hibridación de cada muestra respectiva con dicha sonda, y
(c) la comparación de la cantidad aproximada de hibridación de la muestra de análisis con una cantidad aproximada de hibridación de dicha segunda muestra para identificar si la muestra a analizar contiene una cantidad del ácido nucleico específico o de la muestra específica de ácidos nucleicos mayor que la que contiene dicha segunda muestra.
3. Método para la detección de metástasis, que comprende:
(a) la incubación de una muestra de un paciente sospechoso de padecer metástasis seleccionada del grupo formado por líquidos corporales, células, un extracto celular o sobrenadantes de cultivos celulares de dichas células, conteniendo dicha muestra ácidos nucleicos con una sonda de ácido nucleico seleccionada del grupo formado por:
(i)
el ácido nucleico mostrado en el ID. de SEC. núm.: 1 o un ácido nucleico que sea complementario a dicha secuencia, y
(ii)
ácidos nucleicos que hibriden con uno de los ácidos nucleicos de (i) y
b) la detección de la hibridación, preferiblemente mediante otra pareja de unión al ácido nucleico de la muestra o de la sonda de ácido nucleico o bien mediante radiografía por rayos X
c) la comparación de la cantidad de dicha hibridación de ácido nucleico con un valor estándar predeterminado que indicará la línea de decisión referente a la expresión de SMAGP relacionada con la metástasis en dicha muestra y, de esta forma, permitirá determinar si dicho paciente padece metástasis.
4. El empleo de un anticuerpo que se une al polipéptido SMAGP de ID. de SEC. núm.: 2 para la fabricación de una composición destinada a la inhibición de la metástasis en células tumorales.
5. Una utilización de acuerdo con la reivindicación 4, en la que la composición se administra a cultivos celulares in vitro.
6. La utilización de acuerdo con la reivindicación 4, en la que la composición es una composición farmacéutica y en la que esta se debe administrar a un mamífero que padezca un tumor.
7. Una composición farmacéutica que contiene un anticuerpo frente a SMAGP con la secuencia polipeptídica de ID. de SEC. núm.: 2 junto con un transportador farmacéuticamente aceptable.
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