ES2280306T3 - Proteasa novedosa. - Google Patents
Proteasa novedosa. Download PDFInfo
- Publication number
- ES2280306T3 ES2280306T3 ES01271857T ES01271857T ES2280306T3 ES 2280306 T3 ES2280306 T3 ES 2280306T3 ES 01271857 T ES01271857 T ES 01271857T ES 01271857 T ES01271857 T ES 01271857T ES 2280306 T3 ES2280306 T3 ES 2280306T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- baselineskip
- polypeptide
- amino acids
- sequence
- amino acid
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
- C12Q1/37—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase involving peptidase or proteinase
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P13/00—Drugs for disorders of the urinary system
- A61P13/12—Drugs for disorders of the urinary system of the kidneys
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/40—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against enzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/573—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for enzymes or isoenzymes
Abstract
Un polipéptido que muestra una actividad proteasa y que comprende (1) la secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, (2) una secuencia de aminoácidos en la que se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10 aminoácidos en la secuencia de aminoácidos de los aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, o (3) una secuencia de aminoácidos en la que se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10 aminoácidos en la secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 1224º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2.
Description
Proteasa novedosa.
La presente invención se refiere a una proteasa
novedosa.
ADAMTS (Una desintegrina y metaloproteasa con
motivo de trombospondina) es un grupo de moléculas que contienen un
dominio tipo desintegrina, un dominio tipo metaloproteasa y una
secuencia repetida de trombospondina tipo I (denominada en lo
sucesivo en el presente documento secuencia repetida
TSP-1). Hasta ahora se han notificado nueve
moléculas ADAMTS humanas.
Entre las moléculas ADAMTS humanas, se ha
observado que ADAMTS4 (agrecanasa-1) y ADAMTS11
(agrecanasa-2) muestran una actividad de digestión
selectiva entre el residuo de ácido glutámico 373º y el residuo de
alanina 374º (entre Glu^{373}-Ala^{374}) de un
agrecano de sustrato extracelular, y además, se sugirió una
posibilidad de que sean enzimas esenciales que degradan el agrecano
de sustrato extracelular en cartílago de artritis u osteoartritis
(Tortorella M.D. et al., Science, 284,
1664-1666, 1999; y Abbaszade I. et al., J.
Biol. Chem., 274, 23443-23450, 1999). Además se ha
mostrado que ADAMTS2 (procolágeno I N-proteinasa)
está implicada en la conversión de procolágeno tipo I para dar un
tipo maduro del mismo como una enzima que escinde y elimina la parte
N-terminal del procolágeno tipo I, y desempeña un
papel importante en la formación de fibras de colágeno, y que una
aberración en el gen del mismo está relacionada con el síndrome de
Ehlers-Danlos tipo VIIC (Colige A. et al.,
Am. J. Hum. Genet., 65, 308-317, 1999).
Concretamente se ha mostrado que las moléculas
ADAMTS están implicadas en el metabolismo tal como la degradación y
la maduración de una matriz extracelular (por ejemplo, agrecano,
colágeno o similar).
El fallo renal crónico es una enfermedad
caracterizada por fibrosis mesangial y glomerulosclerosis. Se
considera que un cambio cualitativo y/o aumento cuantitativo de
componentes de matriz extracelular son los principales mecanismos de
un desarrollo y una progresión del mismo. En un experimento usando
un modelo de fallo renal, se mostró que una introducción de gen de
decorina (una proteína que suprime específicamente la actividad del
factor de crecimiento transformante \beta
(TGF-\beta) (Isaka Y. et al., Nature Med.,
2, 418-423, 1996) y una administración de
anti-TGF-\beta (Ziyadeh F.N. et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 97,
8015-8020; Sharma K. et al., Diabetes, 45,
522-530, 1996; y Border W.A. et al., Nature,
346, 371-374, 1990) fueron eficaces. A partir de
estos resultados se considera que una supresión o inhibición de las
acciones fisiológicas de TGF-\beta conduce a un
tratamiento de fallo renal crónico.
Sin embargo, en las actuales circunstancias en
las que no se conoce un agente eficaz para tratar la fallo renal
crónico, se desea un agente para inhibir el
TGB-\beta pero no ha estado fácilmente disponible
hasta ahora.
TGF-\beta es un factor de
crecimiento y diferenciación que muestra varias acciones
fisiológicas. Por tanto, es peligroso inhibir todas las acciones
fisiológicas del TGF-\beta en un tratamiento de
fallo renal crónico en el que se prevé una administración a largo
plazo, a la vista de los efectos secundarios. Es preferible suprimir
o inhibir solo una parte implicada con un cambio cualitativo y un
aumento cuantitativo de componentes de matriz extracelular entre las
acciones fisiológicas de TGF-\beta.
El objeto de la presente invención es
proporcionar una proteasa novedosa que sea inducida por
TGF-\beta, que esté implicada en el metabolismo de
la matriz extracelular, y que sea útil como una herramienta de
selección para detectar un agente para tratar el fallo renal
crónico, y un polinucleótido novedoso que codifica para la
proteasa.
Con el objetivo de solucionar los problemas
anteriormente mencionados, los presentes inventores han realizado
estudios intensivos y como resultado encontraron un polinucleótido
que codifica para una proteasa novedosa que consiste en una
secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 1224º
en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2 y que consiste en
1224 residuos de aminoácidos de ADNc de riñón fetal humano. Además,
los presentes inventores encontraron que un fragmento parcial que
consiste en 750 residuos de aminoácidos en el lado del extremo
N-terminal de la proteasa novedosa tiene una
actividad proteasa eficaz. Además, se encontró que (1) la proteasa
se clasifica dentro de las proteasas ADAMTS, y por tanto debe
considerarse como una proteasa implicada en el metabolismo de matriz
extracelular, (2) la proteasa se expresa actualmente en el riñón
humano, (3) una expresión de la misma se induce por
TGF-\beta en una célula cultivada primaria de
riñón, y (4) una cantidad del gen expresado de la misma aumenta en
un animal con modelo de fallo renal. A partir de estos hallazgos,
los presentes inventores revelaron que la proteasa de la presente
invención es un polipéptido causante de fallo renal, y eso mediante
selección usando el polipéptido de la presente invención, puede
seleccionarse una sustancia que inhibe la actividad proteasa de la
misma, una sustancia que suprime o inhibe sólo una parte implicada
con un cambio cualitativo y un aumento cuantitativo de componentes
de matriz extracelular entre las acciones fisiológicas de
TGF-\beta y que es útil como un agente para tratar
el fallo renal crónico, puede seleccionarse, y se completa la
presente invención.
Por consiguiente, la presente invención se
refiere a:
[1] un polipéptido que muestra una actividad
proteasa y que comprende (1) una secuencia de aminoácidos que
consiste en los aminoácidos 1º a 750º en una secuencia de
aminoácidos de SEQ ID No: 2, (2) una secuencia de aminoácidos en la
que se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10 aminoácidos en
una secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a
750º en una secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, o (3) una
secuencia de aminoácidos en la que se eliminan, sustituyen y/o
insertan de 1 a 10 aminoácidos en una secuencia de aminoácidos que
consiste en los aminoácidos 1º a 1224º en una secuencia de
aminoácidos de SEQ ID No: 2;
[2] un polipéptido que comprende una secuencia
de aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en una
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, y que muestra actividad
proteasa;
[3] un polipéptido que muestra actividad
proteasa y que consiste en (1) un secuencia de aminoácidos en la que
se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10 aminoácidos en una
secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º
en una secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, o (2) una secuencia
de aminoácidos en la que se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a
10 aminoácidos en una secuencia de aminoácidos que consiste en los
aminoácidos 1º a 1224º en una secuencia de aminoácidos de SEQ ID No:
2;
[6] un polipéptido que consiste en (1) los
aminoácidos 1º a 750º en una secuencia de aminoácidos de SEQ ID No.
2, o (2) los aminoácidos 1º a 1224º en una secuencia de aminoácidos
de SEQ ID No: 2;
[7] un polinucleótido que codifica para el
polipéptido de los puntos [1] a [6];
[8] un vector de expresión que comprende el
polinucleótido del punto [7];
[9] una célula transfectada con el vector de
expresión del punto [8];
[10] un anticuerpo o fragmento del mismo, que se
une al polipéptido de los puntos [1] a [6];
[11] un procedimiento para producir el
polipéptido de los puntos [1] a [6], que comprende las etapas
de:
cultivar la célula del punto [9], y
recuperar el polipéptido de los puntos [1] a
[6];
[12] un método para detectar si un compuesto que
debe someterse a prueba inhibe o no la actividad proteasa del
polipéptido de los puntos [1] a [6], que comprende las etapas
de:
poner en contacto (1) el polipéptido, (2)
\alpha_{2}-macroglobulina, y (3) el compuesto
que debe someterse a prueba, y
analizar si el polipéptido y la
\alpha_{2}-macroglobulina forman o no un
complejo que no se disocia por SDS y/o un agente reductor;
[13] un método para seleccionar una sustancia
que inhiba la actividad proteasa del polipéptido de los puntos [1] a
[6], que comprende las etapas de:
detectar mediante el método del punto [12],
y
seleccionar una sustancia que inhiba la
actividad proteasa;
[14] un método para seleccionar una sustancia
para tratar el fallo crónico mediante el método del punto [13].
El término "actividad proteasa" tal como se
usa en el presente documento significa una propiedad en que puede
formarse un complejo, que no se disocia por dodecilsulfato de sodio
(SDS) y/o un agente reductor, con
\alpha_{2}-macroglobulina, una proteína
inhibidora de proteasa presente en un suero.
La presente invención se explicará con detalle a
continuación en el presente documento.
El polipéptido de la presente invención
incluye
(1) un polipéptido que comprende una secuencia
de aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2;
\newpage
(2) un polipéptido que comprende una secuencia
de aminoácidos en la que se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a
10 aminoácidos en total en una o varias posiciones en la secuencia
de aminoácidos de los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de
aminoácidos de SEQ ID No: 2, y que muestran la actividad proteasa
(denominada en lo sucesivo en el presente documento variación
funcionalmente equivalente); y
(3) un polipéptido que comprende la secuencia de
aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2 o la secuencia de
aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 1224º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, y que muestra la actividad
proteasa (denominado en lo sucesivo en el presente documento
polipéptido homólogo).
El "polipéptido que comprende la secuencia de
aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2" como el polipéptido de
la presente invención no está limitado, siempre que sea un
polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos que consiste
en los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos de SEQ
ID No: 2, y que muestra la actividad proteasa. Incluye, por
ejemplo,
(1a) un polipéptido que consiste en los
aminoácidos 1º a 750º en una secuencia de aminoácidos de SEQ ID No:
2;
(1b) un polipéptido de fusión que tiene una
secuencia de aminoácidos en la que se añade una secuencia marcadora
apropiada o similar al extremo N-terminal y/o al
extremo C-terminal de la secuencia de aminoácidos
que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de
aminoácidos de SEQ ID No: 2, y que muestra la actividad
proteasa;
(1c) un polipéptido que tiene una secuencia de
aminoácidos en la que se añade una secuencia de aminoácidos que
consiste en los aminoácidos 751º a 1224º en la secuencia de
aminoácidos de SEQ ID No: 2 o una secuencia de aminoácidos en la que
se eliminan de 1 a 473 aminoácidos del extremo
C-terminal de la misma, al extremo
C-terminal de la secuencia de aminoácidos que
consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos
de SEQ ID No: 2 (es decir, el aminoácido del extremo
C-terminal es cualquiera de los aminoácidos 751º a
1224º; denominada en lo sucesivo en el presente documento "la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2 o una secuencia con
eliminación en el extremo C-terminal de la
misma");
(1d) un polipéptido de fusión que tiene una
secuencia de aminoácidos en la que se añade una secuencia marcadora
apropiada o similar al extremo N-terminal y/o
extremo C-terminal de la secuencia de aminoácidos de
SEQ ID No: 2 o la secuencia con eliminación en el extremo
C-terminal de la misma, y que muestra actividad
proteasa; y similares.
Un método para confirmar si un polipéptido que
debe someterse a prueba (denominado en lo sucesivo en el presente
documento polipéptido prueba) "muestra o no la actividad
proteasa" tal como se usa en el presente documento (denominado en
lo sucesivo en ocasiones en el presente documento "método para
confirmar la actividad proteasa") no está particularmente
limitado, siempre y cuando pueda confirmarse si el polipéptido de
prueba muestra o no "una propiedad en la que puede formarse un
complejo, que no se disocia por SDS y/o un agente reductor, con
\alpha_{2}-macroglobulina, una proteína
inhibidora de proteasa presente en un suero". Puede confirmarse,
por ejemplo, poniendo el polipéptido de prueba en contacto con
\alpha_{2}-macroglobulina, una proteína
inhibidora de proteasa presente en un suero, y analizando después si
se forma o no un complejo que no se disocia por SDS y/o un agente
reductor [tal como 2-mercaptoetanol
(2-ME)], más particularmente por un método descrito
en el ejemplo 4.
Se sabe que la
\alpha_{2}-macroglobulina es una proteína
inhibidora de proteasa presente en un suero y que puede formar un
complejo con varias proteasas. Se sabe que la formación del complejo
depende de la actividad proteasa, y que el complejo formado se forma
mediante un enlace amida de proteasa y
\alpha_{2}-macroglobulina, y por tanto no se
disocia por SDS o un agente reductor tal como 2-ME
(Feinman R.D. et al., Ann. New York Acad. Sci., 737,
254-266, 1994; y Kuno K. et al., J. Biol.
Chem., 274, 18821-18826, 1999).
El polipéptido anterior (1a), es decir, "el
polipéptido que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2" es una proteasa
novedosa que consiste en 750 residuos de aminoácidos y muestra la
actividad proteasa. El polipéptido (1a) corresponde a un polipéptido
parcial "del polipéptido que consiste en los aminoácidos 1º a
1224º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2".
Como secuencia marcadora en el polipéptido de la
presente invención, puede usarse, por ejemplo, una secuencia para
realizar fácilmente una confirmación de la expresión de polipéptido,
confirmación de la localización intracelular del mismo, purificación
del mismo, o similares. Como secuencia, pueden mencionarse, por
ejemplo, el marcador FLAG, el marcador
hexa-histidina, el marcador hemaglutinina, el
epítopo myc, o similares.
La variación funcionalmente equivalente de la
presente invención no está particularmente limitada, siempre y
cuando sea un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos
en la que se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10,
preferiblemente de 1 a 7, más preferiblemente de 1 a 5 (por ejemplo,
de uno a varios aminoácidos) en una o varias posiciones en la
secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º
en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, y que muestra la
actividad proteasa. Además, un origen de la variación funcionalmente
equivalente no se limita a los seres humanos.
La variación funcionalmente equivalente de la
presente invención incluye, por ejemplo, variaciones humanas del
polipéptido que consisten en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2 y variaciones
funcionalmente equivalentes derivadas de organismos distintos a los
seres humanos (tales como ratón, rata, hámster o perro), y se
preparan polipéptidos adicionales usando polinucleótidos obtenidos
mediante modificación artificial de polinucleótidos que codifican
para estos polipéptidos nativos (es decir, variaciones humanas o
variaciones funcionalmente equivalentes derivadas de organismos
distintos al ser humano) o polinucleótidos que codifican para el
polipéptido que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2 mediante técnicas de
ingeniería genética. El término "variación" tal como se usa en
el presente documento, significa diferencias individuales entre los
mismos polipéptidos en la misma especie o diferencias entre
polipéptidos homólogos en varias especies.
Pueden obtenerse variaciones humanas del
polipéptido que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2 o variaciones
funcionalmente equivalentes derivadas de organismos distintos al ser
humano por los expertos en la técnica según la información de una
secuencia de bases (por ejemplo, la secuencia de bases de SEQ ID No:
1) de un polinucleótido que codifica para el polipéptido que
consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos
de SEQ ID No: 2. Con respecto a esto, generalmente pueden realizarse
técnicas de ingeniería genética según métodos conocidos (por
ejemplo, Sambrook, J. et al., "Molecular
Cloning-A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor
Laboratory, NY, 1989).
Por ejemplo, se diseñan una sonda apropiada o
unos cebadores apropiados según la información de una secuencia de
bases de un polinucleótido que codifica para el polipéptido que
consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos
de SEQ ID No: 2. Se lleva a cabo un método de reacción en cadena de
la polimerasa (PCR) (Saiki, R. K. et al., Science, 239,
487-491, 1988) o un método de hibridación usando una
muestra (por ejemplo ARN total o una fracción de ARNm, una
biblioteca ADNc, o una biblioteca fago) preparada a partir de un
organismo (por ejemplo un mamífero tal como un ser humano, ratón,
rata, hámster o perro) de interés y los cebadores o la sonda para
obtener un polinucleótido que codifica para el polipéptido. Puede
obtenerse un polipéptido deseado expresando el polinucleótido
resultante en un sistema de expresión apropiado y confirmando que el
polipéptido expresado muestra la actividad proteasa mediante, por
ejemplo, el método descrito en el ejemplo 4.
Además, puede obtenerse el polipéptido
modificado artificialmente por técnicas de ingeniería genética
mediante, por ejemplo, el siguiente procedimiento. Puede obtenerse
un gen que codifica para el polipéptido mediante un método
convencional, por ejemplo, mutagénesis dirigida al sitio (Mark, D.F.
et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 81,
5662-5666, 1984). Puede obtenerse un polipéptido
deseado expresando el polinucleótido resultante en un sistema de
expresión apropiado y confirmando que el polipéptido expresado
muestra la actividad proteasa mediante, por ejemplo, el método
descrito en el ejemplo 4.
La variación funcionalmente equivalente de la
presente invención incluye, por ejemplo,
(2a) un polipéptido que tiene una secuencia de
aminoácidos en la que se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10
aminoácidos en total en una o varias posiciones en la secuencia de
aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, y que muestra la actividad
proteasa;
(2b) un polipéptido de fusión que tiene una
secuencia de aminoácidos en la que se eliminan, sustituyen y/o
insertan de 1 a 10 aminoácidos en total en una o varias posiciones
en la secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a
750º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2 y se añade una
secuencia marcadora apropiada, o similar, al extremo
N-terminal y/o extremo C-terminal de
la misma, y que muestra actividad proteasa;
(2c) un polipéptido que tiene una secuencia de
aminoácidos en la que se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10
aminoácidos en total en una o varias posiciones en la secuencia de
aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, y al extremo
C-terminal de la misma se añade una secuencia de
aminoácidos que consiste en los aminoácidos 751º a 1224º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2 o una secuencia de
aminoácidos en la que se eliminan de 1 a 473 aminoácidos del extremo
C-terminal de la misma, y que muestra actividad
proteasa; y
(2d) un polipéptido que tiene una secuencia de
aminoácidos en la que se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10
aminoácidos en total en una o varias posiciones en la secuencia de
aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, y al extremo
C-terminal de la misma se añade una secuencia de
aminoácidos que consiste en los aminoácidos 751º a 1224º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, o una secuencia de
aminoácidos en la que se eliminan de 1 a 473 aminoácidos del extremo
C-terminal de la misma, y además se añade una
secuencia marcadora apropiada o similar al extremo
N-terminal y/o extremo C-terminal de
la misma, y que muestra actividad proteasa.
Tal como anteriormente, se explica el
polipéptido de la presente invención, pero se prefiere como
polipéptido de la presente invención "el polipéptido que consiste
en los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos de SEQ
ID No: 2", "el polipéptido que consiste en los aminoácidos 1º a
1224º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2", "un
polipéptido que consiste en una secuencia de aminoácidos en la que
se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10 (preferiblemente de 1
a 7, más preferiblemente de 1 a 5) en total en una o varias
posiciones en la secuencia de aminoácidos que consiste en los
aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No:
2, y que muestra actividad proteasa" o "un polipéptido que
consiste en la secuencia de aminoácidos en la que se eliminan,
sustituyen y/o añaden de 1 a 10 (preferiblemente de 1 a 7, más
preferiblemente de 1 a 5) en total en una o varias posiciones en la
secuencia de aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º
en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, y que muestra la
actividad proteasa", y más preferiblemente "el polipéptido que
consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos
de SEQ ID No: 2" o "el polipéptido que consiste en los
aminoácidos 1º a 1224º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No:
2".
El polinucleótido de la presente invención no
está particularmente limitado, siempre y cuando codifique para el
polipéptido de la presente invención. Como polinucleótido de la
presente invención, pueden mencionarse, por ejemplo, un
polinucleótido que comprende una secuencia de bases que consiste en
las bases 1ª a 2250ª en la secuencia de bases de SEQ ID No: 1. Lo
más preferible es un polinucleótido que consiste en las bases 1ª a
2250ª en la secuencia de bases de SEQ ID No: 1. Con respecto a esto,
el término "polinucleótido" tal como se usa en el presente
documento incluye tanto ADN como ARN.
Un método para producir el polinucleótido de la
presente invención no está particularmente limitado, pero pueden
mencionarse por ejemplo, (1) un método que utiliza PCR, (2) un
método que utiliza técnicas de ingeniería genética convencionales
(es decir, un método para seleccionar un transformante que comprende
un ADNc deseado a partir de cepas transformadas con una biblioteca
de ADNc), o (3) un método de síntesis química. Estos métodos se
explicarán en este orden a continuación en el presente
documento.
En el método que utiliza PCR del punto (1), el
polinucleótido de la presente invención puede producirse, por
ejemplo, mediante el siguiente procedimiento.
Se extrae ARNm de tejidos o células humanos que
pueden producir el polipéptido de la presente invención. Se
sintetizan un par de cebadores, entre los se localiza el ARNm de
longitud total correspondiente al polipéptido de la presente
invención o una región parcial del ARNm, basándose en la secuencia
de bases de un polinucleótido que codifica para el polinucleótido de
la presente invención. Puede obtenerse ADNc de longitud total que
codifica para el polipéptido de la presente invención o una parte
del ADNc realizando una reacción en cadena de la polimerasa por
transcriptasa inversa (RT-PCR) usando el ARNm
extraído como molde.
Más preferiblemente, se extrae ARN total que
contiene ARNm que codifica para el polipéptido de la presente
invención mediante un método conocido a partir de células o tejidos
que pueden producir el polipéptido de la presente invención. Como
método de extracción, pueden mencionarse, por ejemplo, un método de
tiocianato de guanidina-fenol caliente, un método de
tiocianato de guanidina-clorhidrato de guanidina o
un método de tiocianato de guanidina-cloruro de
cesio. Se usa preferiblemente el método de tiocianato de
guanidina-cloruro de cesio. Pueden identificarse las
células o tejido que pueden producir el polipéptido de la presente
invención, por ejemplo, mediante un método de inmunotransferencia
tipo northern usando un polinucleótido o una parte del mismo que
codifica para el polipéptido de la presente invención o un método de
inmunotransferencia tipo western usando un anticuerpo específico
para el polipéptido de la presente invención.
Después se purifica el ARNm extraído. La
purificación del ARNm puede realizarse según un método convencional.
Por ejemplo puede purificarse el ARNm mediante adsorción y elución
usando una columna oligo(dT)-celulosa. El
ARNm puede fraccionarse adicionalmente mediante, por ejemplo, una
centrifugación en gradiente de densidad de sacarosa, si es
necesario. Alternativamente, puede usarse ARNm extraído y purificado
disponible comercialmente sin llevar a cabo la extracción de
ARNm.
A continuación, se sintetiza el ADNc de primera
cadena llevando a cabo una reacción con transcriptasa inversa del
ARNm purificado en presencia de un cebador al azar, un cebador
oligodT, y/o un cebador adaptado. Esta síntesis puede llevarse a
cabo según un método convencional. El ADNc de primera cadena
resultante se somete a PCR usando dos cebadores entre los que se
localizan una longitud total o una región parcial del polinucleótido
de interés, amplificando de esta manera el ADNc de interés. Se
fracciona el ADN resultante mediante, por ejemplo, electroforesis en
gel de agarosa. Puede obtenerse el fragmento de ADN de interés
llevando a cabo una digestión del ADN con enzimas de restricción y
la ligación posterior, si es necesario.
En el método que utiliza técnicas de ingeniería
genética convencionales del punto (2), puede producirse el
polinucleótido de la presente invención, por ejemplo, mediante el
siguiente procedimiento.
En primer lugar, se sintetiza ADNc de cadena
sencilla usando transcriptasa inversa de ARNm preparado mediante el
método PCR anteriormente mencionado como molde, y después se
sintetiza ADNc de doble cadena a partir del ADNc de cadena sencilla.
Como este método, pueden mencionarse, por ejemplo, un método de
nucleasa S1 (Efstratiadis, A. et al., Cell, 7,
279-288, 1976), un método Land (Land, H. et
al., Nucleic Acids Res., 9, 2251-2266, 1981), un
método O. Joon Yoo (Yoo, O. J. et al., Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 79, 1049-1053, 1983), y un método
Okayama-Berg (Okayama, H. y Berg, P., Mol. Cell.
Biol., 2, 161-170, 1982).
Después se prepara un plásmido recombinante que
comprende el ADNc de doble cadena y se introduce en una cepa de
Escherichia coli, tal como DH 5\alpha, HB101, o JM109,
transformando así la cepa. Se selecciona un transformante usando una
resistencia a fármaco frente a, por ejemplo, tetraciclina,
ampicilina, o canamicina como marcador. Cuando la célula huésped es
E. coli, puede realizarse la transformación de la célula
huésped, por ejemplo, mediante el método de Hanahan (Hanahan, D.J.,
Mol. Biol., 166, 557-580, 1983); concretamente un
método en el que el ADN recombinante se añade a células competentes
preparadas en presencia de CaCl_{2}, MgCl_{2} o RbCl. Además,
como un vector distinto a un plásmido, puede usarse un vector fago
tal como un sistema lambda.
Como un método para seleccionar un transformante
que contiene el ADNc de interés a partir de los transformantes
resultantes, pueden usarse varios métodos, tales como (i) un método
para seleccionar un transformante usando una sonda de
oligonucleótido sintético, (ii) un método para seleccionar un
transformante usando una sonda producida por PCR, (iii) un método
para seleccionar un transformante usando un anticuerpo frente al
polipéptido de la presente invención, o (iv) un método para
seleccionar un transformante usando un sistema de traducción por
hibridación selectiva.
En el método del punto (i) para seleccionar un
transformante usando una sonda oligonucleótido sintético, el
transformante que contiene el ADNc de interés puede seleccionarse,
por ejemplo, mediante el siguiente procedimiento.
Se sintetiza un oligonucleótido que corresponde
al total o a una parte del polipéptido de la presente invención (en
este caso, puede ser o bien una secuencia de nucleótido teniendo en
cuenta el uso del codón o bien una pluralidad de secuencias de
nucleótidos como una combinación de posibles secuencias de
nucleótidos, y en el último caso, puede reducirse su número
incluyendo inosina) y, usando este oligonucleótido como sonda
(marcado con ^{32}P O ^{33}P), se hibrida con filtro de
nitrocelulosa o filtro de poliamida sobre los que se desnaturalizan
los ADN de los transformantes y se fijan, para detectar y
seleccionar las cepas positivas resultantes.
En el método del punto (ii) para seleccionar un
transformante usando una sonda producida por PCR, puede
seleccionarse el transformante que contiene el ADNc de interés, por
ejemplo, mediante el siguiente procedimiento.
Se sintetizan oligonucleótidos de un cebador
sentido y un cebador antisentido correspondientes a una parte del
polipéptido de la presente invención, y se amplifica un fragmento de
ADN que codifica para todo o parte del polipéptido de interés
realizando una PCR usando estos cebadores juntos. Como ADN molde
usado en este método, puede usarse el ADNc sintetizado mediante
reacción de transcripción inversa a partir de ARNm de células que
pueden producir el polipéptido de la presente invención, o ADN
genómico. El fragmento de ADN resultante está marcado con ^{32}P O
^{33}P, y un transformante que contiene el ADNc de interés se
selecciona realizando una hibridación de colonias o una hibridación
de placa de lisis usando este fragmento como sonda.
En el método del punto (iii) para seleccionar un
transformante usando un anticuerpo frente al polipéptido de la
presente invención, el transformante que contiene el ADNc de interés
puede seleccionarse, por ejemplo, mediante el siguiente
procedimiento.
En primer lugar, se integra el ADNc en un vector
de expresión, y se producen polipéptidos en un sobrenadante de
cultivo, dentro de las células, o en la superficie celular de los
transformantes. Se selecciona un transformante que contiene el ADNc
de interés detectando una cepa que produce el polipéptido deseado
usando un anticuerpo frente al polipéptido de la presente invención
y un segundo anticuerpo frente al primer anticuerpo.
En el método del punto (iv) para seleccionar un
transformante usando un sistema de traducción por hibridación
selectiva, el transformante que contiene el ADNc de interés puede
seleccionarse, por ejemplo, mediante el siguiente procedimiento.
En primer lugar, se somete el ADNc obtenido de
cada transformante a inmunotransferencia sobre, por ejemplo, filtro
de nitrocelulosa y se hibrida con ARNm preparado a partir de células
que pueden producir el polipéptido de la presente invención, y
entonces se disocia y recupera el ARNm unido al ADNc. El ARNm
recuperado se traduce para dar un polipéptido en un sistema de
traducción de polipéptido apropiado, por ejemplo, inyección en
ovocitos de Xenopus o un sistema libre de células tal como un lisado
de reticulocito de conejo o germen de trigo. Se selecciona un
transformante que contiene el ADNc de interés detectándolo con el
uso de un anticuerpo frente a polipéptido de la presente
invención.
Puede realizarse un método para recoger el
polinucleótido de la presente invención a partir del transformante
resultante de interés según un método conocido (por ejemplo,
Sambrook, J. et al., "Molecular Cloning-A
Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory, NY, 1989). Por
ejemplo puede realizarse separando una fracción correspondiente al
ADN del plásmido de las células y cortando la región de ADNc del ADN
del plásmido.
En el método de síntesis química del punto (3),
puede producirse el polinucleótido de la presente invención, por
ejemplo, uniendo fragmentos de ADN producidos mediante un método de
síntesis química. Puede sintetizarse cada ADN usando un sintetizador
de ADN [por ejemplo, Oligo 1000M DNA Synthesizer (Beckman) o 394
DNA/RNA Synthesizer (Applied Biosystems)].
Además el polinucleótido de la presente
invención puede producirse mediante síntesis química de ácido
nucleico según un método convencional tal como un método de triéster
de fosfito (Hunkapiller, M. et al., Nature, 10,
105-111, 1984), basado en la información sobre el
polipéptido de la presente invención. Con respecto a esto, se
conocen codones para cada aminoácido y opcionalmente pueden
seleccionarse y determinarse mediante el método convencional, por
ejemplo, teniendo en cuenta el uso de codón de cada huésped que debe
usarse (Crantham, R. et al., Nucleic Acids Res., 9,
r43-r74, 1981). Además puede realizarse una
modificación parcial de los codones de estas secuencias de bases
según un método convencional, tal como mutagénesis dirigida al sitio
que usa un cebador comprendido por un oligonucleótido sintético que
codifica para una modificación deseada (Mark, D.F. et al.,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 5662-5666,
1984).
La determinación de secuencias de ADN obtenidas
mediante, por ejemplo, los métodos mencionados anteriormente puede
realizarse mediante, por ejemplo, un método de modificación química
Maxam-Gilbert (Maxam, A.M. y Gilbert, W., "Methods
in Enzymology", 65, 499-559, 1980) o un método de
terminación en cadena de didesoxinucleótido (Messing, J. y Vieira,
J., Gene, 19, 269-276, 1982).
Se reintegra un polinucleótido aislado de la
presente invención en un ADN de vector apropiado y puede
transfectarse una célula huésped eucariota o procariota mediante el
vector de expresión resultante. Además, puede expresarse el
polinucleótido en una célula huésped deseada, introduciendo un
promotor apropiado y una secuencia relacionada con la expresión del
gen en el vector.
El vector de expresión de la presente invención
no está particularmente limitado, siempre y cuando comprenda el
polinucleótido de la presente invención. Como el vector de
expresión, pueden mencionarse, por ejemplo, un vector de expresión
obtenido introduciendo el polinucleótido de la presente invención en
un vector de expresión conocido seleccionado apropiadamente según
una célula huésped que debe usarse.
La célula de la presente invención no está
particularmente limitada, siempre y cuando se transfecte con el
vector de expresión de la presente invención y comprenda el
polinucleótido de la presente invención. La célula de la presente
invención puede ser, por ejemplo, una célula en la que el
polinucleótido se integra en un cromosoma de una célula huésped, o
una célula que contiene el polinucleótido como un vector de
expresión que comprende un polinucleótido. Además, la célula de la
presente invención puede ser una célula que expresa el polipéptido
de la presente invención o una célula que no expresa el polipéptido
de la presente invención. La célula de la presente invención puede
obtenerse me-
diante, por ejemplo, la transfección de una célula huésped deseada con el vector de expresión de la presente invención.
diante, por ejemplo, la transfección de una célula huésped deseada con el vector de expresión de la presente invención.
En células huésped eucariotas se incluyen, por
ejemplo, células de animales vertebrados, insectos y levaduras. Como
célula de animal vertebrado puede mencionarse, por ejemplo, una
célula COS de simio (Gluzman, Y., Cell, 23, 175-182,
1981), una cepa carente de dihididrofolato reductasa de una célula
de ovario de hámster chino (CHO)(Urlaub, G. y Chasin, L. A., Proc.
Natl. Acad. Sci. USA, 77, 4216-4220, 1980), una
célula HEK293 derivada de riñón fetal humano, o una célula
293-EBNA (Invitrogen) obtenida introduciendo un gen
de EBNA-1 del virus Epstein Barr en una célula
HEK293.
Como un vector de expresión de una célula de
animal vertebrado, generalmente puede usarse un vector que contiene
un promotor ubicado en sentido 5' del gen que debe expresarse, un
sitio de corte y empalme de ARN, un sitio de poliadenilación, una
secuencia de terminación de transcripción y similares. El vector
puede contener adicionalmente un origen de replicación, si es
necesario. Como vector de expresión, puede mencionarse, por ejemplo,
pSV2dhfr que contiene un promotor temprano SV40 (Subramani, S. et
al., Mol. Cell. Biol., 1, 854-864, 1981),
pEF-BOS que contiene un promotor de factor de
elongación humano (Mizushima, S. y Nagata, S., Nucleic Acids Res.,
18, 5322, 1990), o pCEP4 que contiene un promotor de citomegalovirus
(Invitrogen).
Cuando se usa la célula 293-EBNA
como la célula huésped, por ejemplo, puede usarse como vector de
expresión pCEP4 (Invitrogen) que contiene un origen de replicación
del virus Epstein Barr y que puede realizar una replicación autónoma
en la célula 293-EBNA.
Cuando se usa la célula COS como célula huésped,
puede usarse como vector de expresión un vector que tiene un origen
de replicación SV40, puede realizar una replicación autónoma en la
célula COS, y tiene un promotor de transcripción, una señal de
terminación de transcripción y un sitio de corte y empalme de ARN.
Como el vector, pueden mencionarse, por ejemplo, pME18S (Maruyama,
K. y Takebe, Y., Med. Immunol., 20, 27-32, 1990),
pEF-BOS (Mizushima, S. y Nagata, S., Nucleic Acids
Res., 18, 5322, 1990), o pCDM8 (Seed, B., Nature, 329,
840-842, 1987).
Puede incorporarse el vector de expresión a las
células COS mediante, por ejemplo, un método
DEAE-dextrano (Luthman, H. y Magnusson, G., Nucleic
Acids Res., 11, 1295-1308, 1983), un método de
coprecipitación de fosfato de calcio-ADN (Graham, F.
L. y van der Ed, A. J., Virology, 52, 456-457,
1973), un método que utiliza un reactivo de transfección disponible
comercialmente (por ejemplo, FuGENE™6 Transfection Reagent;
Boeringer Mannheim), o un método de electroporación (Neumann, E.
et al., EMBO J., 1, 841-845, 1982).
Cuando se usa la célula CHO como célula huésped,
puede obtenerse una célula transfectada que puede producir de manera
estable el polipéptido de la presente invención realizando
cotransfección de un vector de expresión que comprende el
polinucleótido que codifica para el polipéptido de la presente
invención, junto con un vector que puede expresar un gen neo que
funciona como un marcador de resistencia G418, tal como pRSVneo
(Sambrook, J. et al., "Molecular Cloning-A
Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory, NY, 1989) o
pSV2-neo (Southern, P. J. y Berg, P., J. Mol. Appl.
Genet., 1, 327-341, 1982), y seleccionar una colonia
resistente G418.
Puede cultivarse la célula de la presente
invención según el método convencional [por ejemplo, "Shin
Seikagaku Jikken Koza 18, Saibou Baiyou Gijyutsu (Japanese
Biochemical Society)", Tokyo Kagaku Dojin, 1990], y se produce el
polipéptido de la presente invención fuera de las células. Como
medio que debe usarse en el cultivo, puede seleccionarse
apropiadamente un medio comúnmente usado en una célula huésped
deseada. En el caso de la célula COS puede usarse, por ejemplo, un
medio tal como un medio RPMI-1640 o un medio
esencial mínimo de Eagle modificado por Dulbeco (DMEM),
suplementándolo con un componente de suero tal como suero bovino
fetal (FBS) si es necesario. En el caso de la célula
293-EBNA, puede usarse un medio tal como un medio
esencial mínimo de Eagle modificado por Dulbeco (DMEM) con un
componente de suero tal como suero bovino fetal (FBS) y G418.
El polipéptido de la presente invención
producido fuera de la célula de la presente invención mediante
cultivo de las células puede separarse y purificarse de las mismas
mediante varias técnicas de separación conocidas [por ejemplo,
Okada, M. y Miyazaki K., "Kaitei, Tanpakushitsu Jikken Noto,
Jyo-Ge (Revision, Notebook for Protein
Experiments)", Yodo-sha 1999] haciendo uso de las
propiedades físicas, propiedades químicas y similares del
polipéptido. Más particularmente, puede purificarse el polipéptido
de la presente invención tratando un líquido de cultivo que contiene
el polipéptido de la presente invención con un tratamiento
comúnmente empleado, por ejemplo, un tratamiento con un precipitante
de proteína, ultrafiltración, varias técnicas de cromatografía de
líquidos, tal como cromatografía de tamiz molecular (filtración en
gel), cromatografía de adsorción, cromatografía de intercambio
iónico, cromatografía de afinidad o cromatografía de líquidos de
alta resolución (HPLC), o diálisis, o una combinación de las
mismas.
Cuando se expresa el polipéptido de la presente
invención como una proteína de fusión con una secuencia marcadora en
marco, puede realizarse fácilmente la identificación de la expresión
del polipéptido de la presente invención, purificación del mismo, o
similar. Como secuencia marcadora pueden mencionarse, por ejemplo,
una etiqueta TAG, una etiqueta hexa-histidina, una
etiqueta hemaglutinina o un epítope myc. Además, puede eliminarse la
secuencia marcadora por la proteasa insertando una secuencia de
aminoácidos específica reconocida por una proteasa tal como
enterocinasa, factor Xa o trombina entre la secuencia marcadora y el
polipéptido de la presente invención.
Es posible detectar si un compuesto que debe
someterse a prueba inhibe o no la actividad proteasa del polipéptido
de la presente invención, usando el polipéptido de la presente
invención. Además, usando este método de detección de la presente
invención, es posible seleccionar una sustancia que inhibe la
actividad proteasa del polipéptido de la presente invención. Se
considera que MDTS9 (metaloproteasa y desintegrina con repeticiones
de trombospondina tipo-1 9), el polipéptido de la
presente invención, es una proteasa ADAMTS a partir de su secuencia,
y por tanto que es una proteasa que está implicada en el metabolismo
de la matriz extracelular. MDTS9 es una proteína expresada en el
riñón, tal como se muestra en los ejemplos 5 y 8, y la proteasa
ADAMTS inducida por TGF-\beta tal como se muestra
en el ejemplo 6. Por tanto una sustancia que inhiba la actividad
proteasa del polipéptido de la presente invención es útil como un
agente para tratar el fallo renal crónico en la que se prevé una
administración a largo plazo, porque es sumamente posible que la
sustancia suprima o inhiba sólo una parte que está implicada en un
cambio cualitativo y un aumento cuantitativo de los componentes de
matriz extracelular, entre las acciones fisiológicas de
TGF-\beta. Además, puede usarse por sí mismo el
polipéptido de la presente invención como una herramienta para
seleccionar una sustancia que inhibe la actividad proteasa del
polipéptido de la presente invención o una sustancia para tratar el
fallo renal crónico.
Los compuestos que deben someterse a prueba que
pueden aplicarse al método de detección o método de selección de la
presente invención no están particularmente limitados, pero pueden
mencionarse, por ejemplo, diversos compuestos conocidos (incluyendo
péptidos) registrados en archivos químicos, compuestos obtenidos
mediante técnicas de química combinatoria (Terrett, N.K., et
al., Tetrahedron, 51, 8135-8137, 1995) o
técnicas de síntesis convencionales o péptidos aleatorios preparados
empleando un método de presentación de fago (Felici, F. et
al., J. Mol. Biol., 222, 301-310, 1991) o
similares. Estos compuestos conocidos incluyen compuestos
(incluyendo péptidos) que se sabe que muestran una actividad
inhibidora de proteasa pero que se desconoce que inhiban la
actividad proteasa del polipéptido de la presente invención. Además,
pueden usarse los sobrenadantes de cultivos de microorganismos,
componentes naturales derivados de plantas u organismos marinos o
extractos de tejidos animales como compuestos prueba para
seleccionar. Además, pueden usarse compuestos (incluyendo péptidos)
obtenidos modificando química o biológicamente compuestos
(incluyendo péptidos) seleccionados mediante el método de selección
de la presente invención.
El método de detección de la presente invención
comprende las etapas de:
poner en contacto (1) el polipéptido de la
presente invención, (2)
\alpha_{2}-macroglobulina y (3) un compuesto que
debe someterse a prueba, y
analizar si el polipéptido de la presente
invención y la \alpha_{2}-macroglobulina forman
o no un complejo que no se disocia por SDS y/o un agente reductor
(tal como 2-ME).
Puede llevarse a cabo el método de detección de
la presente invención mediante un método similar al mencionado
anteriormente para confirmar la actividad proteasa, excepto que el
polipéptido de la presente invención, la
\alpha_{2}-macroglobulina y el compuesto prueba
se ponen en contacto los unos con los otros en lugar de poner en
contacto el polipéptido prueba con
\alpha_{2}-macroglobulina. Concretamente, en el
método de detección de la presente invención, se detecta si el
compuesto prueba inhibe o no la actividad proteasa del polipéptido
de la presente invención poniendo en contacto el polipéptido de la
presente invención, la
\alpha_{2}-macroglobulina, y el polipéptido
prueba, y después analizando si el polipéptido de la presente
invención y la \alpha_{2}-macroglobulina forman
o no un complejo que no se disocia por SDS y/o un agente reductor
(tal como 2-ME) en presencia del compuesto prueba.
Cuando el polipéptido de la presente invención y la
\alpha_{2}-macroglobulina no forman un complejo
que no se disocia por SDS y/o un agente reductor (tal como
2-ME) en presencia del compuesto prueba, o disminuye
el grado de formación, es posible confirmar que el compuesto prueba
inhibe la actividad proteasa del polipéptido de la presente
invención.
En el método de selección de la presente
invención, se selecciona una sustancia que inhibe la actividad
proteasa del polipéptido de la presente invención o una sustancia
para tratar el fallo renal crónico, basándose en los resultados
obtenidos detectando si el compuesto prueba inhibe o no la actividad
proteasa del polipéptido de la presente invención usando el método
de detección de la presente invención. Más particularmente, por
ejemplo, cuando se ponen en contacto el polipéptido de la presente
invención, la \alpha_{2}-macroglobulina y el
compuesto prueba los unos con los otros, puede seleccionarse una
sustancia que inhibe la actividad proteasa del polipéptido de la
presente invención para tratar el fallo renal crónico basándose en
la presencia o grado de formación del complejo del polipéptido de la
presente invención y la
\alpha_{2}-macroglobulina en presencia de
compuesto prueba. Cuando el polipéptido de la presente invención y
la \alpha_{2}-macroglobulina no forman un
complejo que no se disocia por SDS y/o un agente reductor (tal como
2-ME) en presencia del compuesto prueba, o disminuye
el grado de formación, es posible confirmar que el compuesto prueba
es una sustancia que inhibe la actividad proteasa del polipéptido de
la presente invención o una sustancia para tratar el fallo renal
crónico.
Puede obtenerse un anticuerpo, tal como un
anticuerpo policlonal o un anticuerpo monoclonal, que reacciona con
el polipéptido de la presente invención, administrando directamente
el polipéptido de la presente invención o un fragmento del mismo a
varios animales. Alternativamente, puede obtenerse mediante un
método de vacuna de ADN (Raz, E. et al., Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, 91, 9519-9523, 1994; o Donnelly, J.J.
et al., J. Infect. Dis., 173, 314-320, 1996),
usando un plásmido en el que se inserta un polinucleótido que
codifica para el polinucleótido de la presente invención.
El anticuerpo policlonal puede producirse a
partir de un suero u ovarios de una animal tal como un conejo, una
rata, una cabra o una gallina, en el que se inmuniza el animal y se
sensibiliza mediante el polipéptido de la presente invención o un
fragmento del mismo emulsionado en un adyuvante apropiado (por
ejemplo, adyuvante completo de Freund) mediante administración
intravenosa, subcutánea o intraperitoneal. Puede separarse y
purificarse el anticuerpo policlonal del suero u óvulos resultantes
según los métodos convencionales para el aislamiento y purificación
de polipéptidos. Ejemplos de los métodos de separación y
purificación incluyen, por ejemplo, separación centrífuga, diálisis,
desalar con sulfato de amonio o una técnica cromatográfica que
utiliza celulosa-DEAE, hidroxipatita, agarosa de
proteína A y similares.
El anticuerpo monoclonal puede producirse
fácilmente por los expertos en la técnica según, por ejemplo, un
método de fusión celular de Kohler y Milstein (Kohler, G. y
Milstein, C., Nature, 256, 495-497, 1975).
Se inmuniza un ratón por vía intraperitoneal,
subcutánea o intravenosa varias veces con un intervalo de una pocas
semanas mediante una inoculación repetida de emulsiones en las que
el polipéptido de la presente invención o un fragmento del mismo se
emulsiona en un adyuvante adecuado tal como un adyuvante completo de
Freund. Se extraen células de bazo tras la inmunización final, y
después se fusionan con células de mieloma para preparar
hibridomas.
Como célula de mieloma para obtener un
hibridoma, puede usarse una célula de mieloma que tiene un marcador
tal como una carencia de hipoxantina-guanina
fosforibosiltransferasa o timidina cinasa (por ejemplo, línea
celular de mieloma de ratón P3X63Ag8.U1). Puede usarse
polietilenglicol como agente de fusión. Como medio de preparación de
hibridomas, puede usarse, por ejemplo, un medio comúnmente usado tal
como un medio esencial mínimo de Eagle, un medio esencial mínimo
modificado de Dubelco, o un medio RPMI-1640
añadiendo apropiadamente del 10 al 30% de suero bovino fetal. Pueden
seleccionarse las cepas fusionadas mediante un método de selección
HAT. Se selecciona un sobrenadante de cultivo de los hibridomas
mediante un método bien conocido tal como un método ELISA o un
método inmunohistológico, para seleccionar clones de hibridoma que
segregan el anticuerpo de interés. Se garantiza la monoclonalidad
del hibridoma seleccionado mediante la repetición de la subclonación
por un método de dilución limitante. Se producen anticuerpos, en una
cantidad que puede purificarse, mediante cultivo de los hibridomas
resultantes en un medio durante de 2 a 4 días, o en la cavidad
peritoneal de una cepa BALB/c de ratón tratada previamente con
pristano durante de 10 a 20 días.
Los anticuerpos monoclonales resultantes en el
sobrenadante del cultivo o los ascitis pueden separarse y
purificarse por métodos de purificación y aislamiento de polipéptido
convencionales. Ejemplos de los métodos de purificación y separación
incluyen, por ejemplo, separación centrífuga, diálisis, desalar con
sulfato de amonio o una técnica cromatográfica usando
celulosa-DEAE, hidroxipatita, agarosa de proteína A
y similares.
Además, pueden producirse los anticuerpos
monoclonales o los fragmentos de anticuerpos que contienen una parte
del mismo insertando el total o una parte del gen que codifica para
el anticuerpo monoclonal en un vector de expresión e introduciendo
el vector de expresión resultante en la célula huésped adecuada (tal
como E. coli, células animales o levaduras).
Pueden obtenerse fragmentos de anticuerpo que
comprenden una parte activa del anticuerpo tal como
F(ab')_{2}, Fab, Fab' o Fv mediante un método convencional,
por ejemplo, mediante digestión de los anticuerpos separados y
purificados (incluyendo anticuerpos policlonales y anticuerpos
monoclonales) con una proteasa tal como pepsina o papaina, y
separando y purificando los fragmentos resultantes mediante métodos
de purificación y aislamiento de polipéptido habituales.
Además, puede obtenerse un anticuerpo que
reacciona con el polipéptido de la presente invención en forma de Fv
o Fab de cadena sencilla según un método de Clackson et al.,
o un método de Zebedee et al., (Clackson, T. et al.,
Nature, 352, 624-628, 1991; o Zebedee S. et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 3175-3179,
1992). Además, puede obtenerse un anticuerpo humanizado inmunizando
un ratón transgénico en el que los genes de anticuerpo de ratón se
sustituyen con genes de anticuerpo humanos (Lonberg, N. et
al., Nature, 368, 856-859, 1994).
La presente invención se ilustrará ahora
adicionalmente por, pero no se limita de ninguna manera a, los
siguientes ejemplos. Se realizaron los procedimientos según los
métodos conocidos (Sambrook, J. et al., "Molecular Cloning
- A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory, NY, 1989),
a no ser que se especifique otra cosa.
Se construye un vector de expresión pCEP4d en el
que se ha eliminado la unidad de expresión EBNA1 del virus
Epstein-Barr digiriendo el plásmido pCEP4 (fabricado
por Invitrogen) con enzimas de restricción ClaI y NsiI, obteniendo
extremos romos y después auto ligándose. Se digirió el vector de
expresión resultante pCEP4d con enzimas de restricción NheI y BamHI,
y se extrajo el fragmento de ADN resultante de aproximadamente 7,7
kpb del gel de agarosa, al que se insertó el oligonucleótido de
doble cadena preparado por apareamiento del oligonucleótido que
consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No: 3 y el
oligonucleótido que consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No:
4 para construir el vector de expresión pCEP4d-FLAG.
Se analizó la secuencia de bases del vector de expresión resultante
para confirmar que la secuencia deseada estaba incluida en el
mismo.
Se realizó una PCR, usando como molde el vector
de expresión pCEP4d-FLAG, el oligonucleótido que
consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No: 5 y el
oligonucleótido que consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No:
6 como cebadores y ADN polimerasa PyroBest (PyroBest^{TM};
fabricado por Takara-shuzo). En la PCR, se realizó
una reacción de desnaturalización térmica primero a 94ºC durante 2
minutos. Después, se repitió 15 veces una reacción en ciclo
compuesta por tratamientos a 94ºC durante 30 segundos, a 55ºC
durante 30 segundos y a 72ºC durante 30 segundos. A continuación, se
realizó una reacción de extensión a 72ºC durante 7 minutos. Se
digirió un fragmento de ADN resultante de aproximadamente 0,4 kpb
con una enzima de restricción, SpeI, y se insertó en un vector de
expresión pCEP4d-FLAG (de aproximadamente 7,7 kpb)
que se había digerido con XbaI para obtener un vector de expresión
pCEPdE2-FLAG. En el vector de expresión resultante
pCEPdE2-FLAG se ordenaron la secuencia de
reconocimiento XbaI, la secuencia de reconocimiento NheI, la
secuencia de reconocimiento NotI, la secuencia de reconocimiento
BamHI y la etiqueta FLAG desde el promotor hacia el sentido 3' del
mismo.
Se realizó una PCR, usando una combinación de
oligonucleótido que consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No:
7 (que tiene una secuencia de reconocimiento SpeI y una secuencia
Kozak añadida al extremo 5'-terminal) y el
oligonucleótido consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No: 8
(que tiene una secuencia de reconocimiento NotI añadida al extremo
5'-terminal) como cebadores, una biblioteca de ADNc
de riñón fetal humano (ADNc Marathon-Ready^{TM};
fabricado por Clontech) como una molde, y ADN polimerasa (TaKaRa LA
Taq^{TM}; fabricado por Takara-shuzo) como ADN
polimerasa. En la PCR, se realizó en primer lugar una reacción de
desnaturalización térmica a 94ºC durante 2 minutos. Entonces se
repitió 40 veces un ciclo compuesto por tratamientos a 98ºC durante
10 segundos, y 68ºC durante 2 minutos y 30 segundos. A continuación,
se realizó una reacción de extensión a 68ºC durante 7 minutos. Se
subclonaron en un plásmido PCR2.1 (fabricado por Invitrogen) un
producto de PCR resultante, un fragmento de ADN con aproximadamente
2,2 kpb (que tiene la secuencia de reconocimiento de SpeI y la
secuencia Kozak añadida al extremo 5'-terminal y la
secuencia de reconocimiento NotI añadida al extremo
3'-terminal) para obtener un clon pMDTS9Cys1.
Se digirió el plásmido resultante pMDTS9Cys1 con
enzimas de restricción, SpeI y NotI, y se insertó un fragmento de
ADN resultante de aproximadamente 2,2 kpb en el sitio XbaI y NotI
del plásmido pCEPdE2-FLAG construido el ejemplo 1
para construir un plásmido
pCEPdE2-MDTS9Cys1-FLAG.
Se realizó una PCR, usando una combinación del
oligonucleótido que consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No:
9 (que tiene una secuencia de reconocimiento de SpeI y una secuencia
Kozak añadida al extremo 5'-terminal) y el
oligonucleótido que consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No:
10 como cebadores, una biblioteca de ADNc de riñón fetal humano
(ADNc Marathon-Ready^{TM}; fabricado por Clontech)
como molde y ADN polimerasa (TaKaRa LA Taq^{TM}; fabricada por
Takara-shuzo) como ADN polimerasa. En la PCR, se
realizó en primer lugar una reacción de desnaturalización térmica a
94ºC durante 2 minutos. Después se repitió 45 veces un ciclo
compuesto por tratamientos a 98ºC durante 10 segundos, y 68ºC
durante 30 segundos. A continuación, se realizó una reacción de
extensión a 68ºC durante 7 minutos. Se subclonaron en un plásmido
PCR2.1 (fabricado por Invitrogen) un producto de PCR resultante, un
fragmento de ADN con aproximadamente 0,2 kpb (que tiene la secuencia
de reconocimiento de SpeI y la secuencia Kozak añadida al extremo
5'-terminal y la secuencia de reconocimiento de NotI
añadida al extremo 3'-terminal) para obtener un clon
pMDTS9(5S2-12).
Se insertaron un fragmento A de ADN de
SpeI-NcoI de aproximadamente 0,2 kpb obtenido por
digestión del plásmido resultante
pMDTS9(5S2-12) con enzimas de restricción
SpeI y NcoI, y un fragmento B de ADN de NcoI-NotI de
aproximadamente 2,0 kpb obtenido por digestión del plásmido
resultante anterior pMDTS9Cys1 con enzimas de restricción NcoI y
NotI, en el sitio de XbaI y NotI del pCEPdE2-FLAG
construido en el ejemplo 1 para construir un plásmido
pCEPdE2-MDTS9Cys2-FLAG. De manera
similar, se insertaron el fragmento A de ADN y el fragmento B de ADN
en el sitio de SpeI y NotI de un plásmido pZErO-2
(fabricado por Invitrogen) para construir un plásmido
pZErO-MDTS9Cys2.
Se realizó una PCR, usando una combinación del
oligonucleótido que consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No:
11 y el oligonucleótido que consiste en la secuencia de bases de SEQ
ID No: 12 como cebadores, una biblioteca de ADNc de riñón fetal
humano (ADNc Marathon-Ready^{TM}; fabricado por
Clontech) como una molde, y ADN polimerasa (TaKaRa LA Taq^{TM};
fabricado por Takara-shuzo) como ADN polimerasa. En
la PCR, se realizó en primer lugar una reacción de desnaturalización
térmica a 94ºC durante 2 minutos. Después, se repitió 40 veces un
ciclo compuesto por tratamientos a 98ºC durante 10 segundos y 68ºC
durante 2 minutos y 30 segundos. A continuación, se realizó una
reacción de extensión a 68ºC durante 7 minutos. Se subclonaron en un
plásmido PCR2.1 (fabricado por Invitrogen) un producto de PCR
resultante, un fragmento de ADN con aproximadamente 2,1 kpb para
obtener un clon pMDTS9-3H.
Se ligó un fragmento de ADN de aproximadamente
2,1 kpb, generado mediante digestión del plásmido resultante
pMDTS9-3H con enzimas de restricción SphI y NotI, en
un fragmento de ADN de aproximadamente 9,3 kpb generado mediante
digestión del plásmido resultante anterior
pCEPdE2-MDTS9Cys2-FLAG con enzimas
de restricción SphI y NotI para construir un plásmido
pCEPdE2-MDTS9Full-FLAG.
El plásmido resultante
pCEPdE2-MDTS9Full-FLAG contiene un
gen que consiste en las bases 1ª a 3672ª en la secuencia de bases
SEQ ID No: 1, es decir, la secuencia de bases del gen de proteasa
novedosa MDTS9. Puede expresarse un polipéptido que tiene la
secuencia de aminoácidos 1º a 1224º en la secuencia de aminoácidos
de SEQ ID No: 2 y la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 21
añadida al extremo C-terminal de la misma a partir
de una célula animal como un huésped.
Además, el plásmido resultante anterior
pCEPdE2-MDTS9Cys2-FLAG contiene un
gen que consiste en las bases 1ª a 2250ª en la secuencia de bases de
SEQ ID No: 1, es decir, la secuencia de bases del gen de la proteasa
novedosa MDTS9. Puede expresarse un polipéptido que tiene la
secuencia de aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos de
SEQ ID No: 2 y la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 21 añadida
al extremo C-terminal de la misma a partir de una
célula animal como un huésped. Con respecto a esto, se considera que
el polipéptido que consiste en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID
No: 2 es una proteasa ADAMTS.
Se usó un reactivo de transfección disponible
comercialmente (FuGENE^{TM}6 Transfection Reagent; fabricado por
Boehringer Mannheim) según un protocolo relacionado con el mismo,
para introducir el plásmido
pCEPdE2-MDTS9Cys2-FLAG o el plásmido
pCEPdE2-MDTS9Full-FLAG preparado en
el ejemplo 2, o el plásmido pCEPdE2-FLAG preparado
en el ejemplo 1 como control, en una célula
HEK293-EBNA (fabricada por Invitrogen) cultivada en
un medio que contiene suero [DMEM (GIBCO-BRL), suero
bovino fetal al 10%, penicilina 100 \mug/ml, estreptomicina 100
\mug/ml, y G418 250 \mug/ml (fabricado por Nakarai Tesque
Inc.)].
Tras la introducción del plásmido, se cultivaron
células durante 48 horas (denominado en lo sucesivo en el presente
documento cultivo con suero). Alternativamente, tras la introducción
del plásmido, se cultivaron las células durante 16 horas, se lavaron
con PBS dos veces, y se cultivaron en un medio sin suero [DMEM
(GIBCO-BRL), penicilina 100 \mug/ml,
estreptomicina 100 \mug/ml, y G418 250 \mug/ml (fabricado por
Nakarai Tesque Inc.)] durante 32 horas (denominado en lo sucesivo en
el presente documento cultivo sin suero).
Se centrifugó cada líquido de cultivo obtenido
en el cultivo con suero o cultivo sin suero a 3000 rpm durante 10
minutos usando una centrífuga (tipo 8800; fabricada por Kubota
Corporation) para obtener un sobrenadante de cultivo. Se trató cada
célula restante tras la eliminación del medio de cultivo con una
disolución de extracción [HEPES 20 mmol/l (pH 7,4), Tritón
X-100 al 1%, glicerol al 1% y albúmina de suero
bovino (BSA) al 0,1%] durante 15 minutos, y se retiró de una placa
de cultivo pipeteando. Se centrifugó la suspensión celular
resultante a 3000 rpm durante 10 minutos usando una centrífuga (tipo
8800; fabricada por Kubota Corporation) para separar una fracción
unida de membrana celular (sobrenadante) de una fracción celular
(sedimento).
Se confirmó la expresión de las proteínas
deseadas en las fracciones resultantes (es decir, sobrenadante de
cultivo, fracción unida de membrana celular, y fracción celular)
mediante inmunotransferencia tipo Western usando un anticuerpo
(anticuerpo M2 monoclonal de ratón anti-FLAG;
fabricado por Sigma) frente a la etiqueta FLAG añadida al extremo
C-terminal. Más particularmente, se sometió cada
fracción a electroforesis en un gel SDS/acrilamida al 10%-20%
(fabricado por Daiichi Pure Chemicals) en condiciones reductoras
usando 2-ME, y se transfirió a una membrana
difluoruro de polivinilideno (PVDF) mediante un aparato de
inmunotransferencia. Se añadió a la membrana PVDF resultante, un
agente bloqueante (Block-ace, fabricado por
Dainippon Pharmaceutical) para realizar un bloqueo. Después, se hizo
reaccionar los productos sobre la membrana sucesivamente con el
anticuerpo M2 monoclonal de ratón anti-FLAG y un
anticuerpo policlonal de conejo anti-IgG de ratón
marcado con peroxidasa del rábano (fabricado por Zymed o TAGO).
Alternativamente, tras el bloqueo, se hizo reaccionar
satisfactoriamente los productos sobre la membrana con un anticuerpo
M2 biotinilado (fabricado por Sigma) y una estreptoavidina marcada
con peroxidasa del rábano (fabricada por Amersham Pharmacia
Biotech). Tras la reacción, se confirmó una expresión de la proteína
deseada mediante un sistema de detección mediante
inmunotransferencia tipo Western disponible comercialmente (ECL
Western Blotting Detecting System; fabricado por Amersham Pharmacia
Biotech).
Un peso molecular aparente en la electroforesis
en gel de SDS/poliacrilamida (SDS-PAGE) de la
proteína detectada (es decir, proteína MDTS9 truncada) en cada
fracción obtenida mediante el cultivo sin suero de la célula en la
que se introdujo el plásmido
pCEPdE2-MDTS9Cys2-FLAG fue de
aproximadamente 55 a 65 kDa en el sobrenadante de cultivo, de
aproximadamente 55 a 65 kDa en la fracción unida de membrana
celular, y de aproximadamente 80 a 95 kDa en la fracción
celular.
Además, la proteína detectada (es decir,
proteína MDTS9 de longitud total) en cada fracción obtenida mediante
cultivo sin suero de la célula en la que se introdujo el plásmido
pCEPdE2-MDTS9Full-FLAG, se detectó
principalmente en la fracción unida de membrana celular y la
fracción celular. Un peso molecular aparente en
SDS-PAGE de la misma fue de aproximadamente 130 a
140 kDa en todas las fracciones.
Se usó un kit de mutagénesis dirigida al sitio
QuickChange^{TM} (fabricado por Stratagene), según un protocolo
relacionado con el mismo, para construir un plásmido
pZErO-MDTS9Cys2E/Q que contiene un gen MDTS9Cys2E/Q
en el que se sustituye Glu (ácido glutámico) en
His-Glu-Ser-Gly-His
(SEQ ID No: 22) con Gln (glutamina). Se considera que Glu es un
centro activo. En esta construcción, se usó el plásmido
pZErO-MDTS9Cys2 preparado en el ejemplo 2 como
molde, y se usaron el oligonucleótido que consiste en la secuencia
de bases de SEQ ID No: 3 y el oligonucleótido que consiste en la
secuencia de bases SEQ ID No: 14 como conjunto de cebadores.
Se insertó un fragmento de ADN de
aproximadamente 2,3 kpb generado mediante digestión del plásmido
resultante pZErO-MDTS9Cys2E/Q con enzimas de
restricción SpeI y NotI, dentro del sitio XbaI y NotI del plásmido
pCEPdE2-FLAG construido en el ejemplo 1 para obtener
el plásmido
pCEPdE2-MDTS9Cys2E/Q-FLAG.
Se sometió a electroforesis
(SDS-PAGE) en condiciones reductoras usando
2-ME cada sobrenadante de cultivo (cultivo con
suero) de cada célula transfectada con el plásmido
pCEPdE2-MDTS9Cys2-FLAG preparado en
el ejemplo 2 o el plásmido
pCEPdE2-MDTS9Cys2E/Q-FLAG preparado
en el ejemplo 4(1), o el plásmido
pCEPdE2-FLAG preparado en el ejemplo 1 como control,
y se transfirió a una membrana de PVDF, tal como se describe en el
ejemplo 3. A la membrana de PVDF resultante, se añadió un agente
bloqueante (Block-Ace fabricado por Dainippon
Pharmaceutical) para realizar un bloqueo. Entonces, se hicieron
reaccionar sucesivamente los productos sobre la membrana con el
anticuerpo de cabra
anti-\alpha_{2}-macroglobulina
(fabricado por CEDARLANE) y un anticuerpo policlonal de conejo
anti-IgG de cabra marcado con peroxidasa del rábano
(fabricado por Zymed Laboratories). Tras la reacción, se confirmó
una expresión de la proteína deseada mediante un sistema de
detección mediante inmunotransferencia de tipo western
comercialmente disponible (ECL Western Blotting Detecting System;
fabricado por Amersham Pharmacia Biotech).
En el sobrenadante de cultivo (cultivo con
suero) de la célula transfectada con el plásmido
pCEPdE2-MDTS9Cys2-FLAG, se detectó
una banda de aproximadamente 250 kDa. La banda no se detectó en cada
sobrenadante de cultivo (cultivo con suero) de la célula
transfectada con plásmido
pCEPdE2-MDTS9Cys2E/Q-FLAG o el
plásmido pCEPdE2-FLAG. Este resultado muestra que la
proteína MDTS9 truncada (MDTS9Cys2) formó un complejo con
\alpha_{2}-macroglobulina, y por tanto se
confirmó que la proteína MDTS9 truncada (MDTS9Cys2) tenía una
actividad proteasa.
Se analizó una distribución tisular de la
expresión del gen de MDTS9 según los siguientes procedimientos,
usando un panel de ADNc comercialmente disponible [Human MTC Panel I
("Panel I de MTC humano") (nº de catálogo
K1420-1), Human MTC Panel II ("Panel II de MTC
humano") (nº de catálogo K1421-1), Human Fetal
MTC Panel ("panel de MTC fetal humano") (nº de catálogo
K1425-1), y Human Tumor MTC Panel ("panel de MTC
de tumor humano") (nº de catálogo K1422-1) en
Multiple Tissue cDNA (MTC^{TM}) Panel (panel de ADNc de múltiples
tejidos) fabricado por Clontech].
Más particularmente, se llevó a cabo una PCR
usando una combinación del oligonucleótido que consiste en la
secuencia de bases SEQ ID No: 15 y el oligonucleótido que consiste
en la secuencia de bases de SEQ ID No: 16 como cebadores, el panel
de ADNc como molde, y ADN polimerasa (TaKaRa KA Taq^{TM};
fabricada por Takara-shuzo). En la PCR, se realizó
en primer lugar la reacción de desnaturalización térmica a 94ºC
durante 2 minutos. Entonces, se repitió 44 veces un ciclo compuesto
por tratamientos a 98ºC durante 10 segundos y 68ºC durante 1 minuto
y 30 segundos. Se sometió a electroforesis cada líquido de reacción
sobre gel de agarosa para detectar un fragmento de ADN de
aproximadamente 1,1 kpb derivado de ARNm del gen de MDTS9. Como
resultado, se reveló que se expresaba ARNm del gen de MDTS9 en un
riñón.
Se sembraron células epiteliales de túbulo
proximal humano normal (5 x 10^{5} células; fabricadas por
Clonetics) en una placa de 6 pocillos (fabricada por ASAHI
TECHNOGLASS CORPORATION), y se cultivaron durante 1 día usando un
kit Renal Epithelial Cell Medium ("medio de células epiteliales
renales") (fabricado por Clonetics). Se cambió el medio por medio
de células epiteliales renales libre de suero, y se continuó
adicionalmente el cultivo durante 1 día. Se cambió el medio por
medio de células epiteliales renales libres de suero que contenía 10
ng/ml (concentración final) de TGF-\beta1
(fabricado por Sigma), y se cultivaron las células durante 24 horas.
Con respecto a esto, se cambió el medio de un grupo control por
medio de células epiteliales renales libre de suero sin
TGF-\beta1, y se cultivaron las células durante 24
horas.
Se preparó un ARN total de cada grupo tratado
usando un reactivo de purificación de ARN total disponible
comercialmente (ISOGEN; fabricado por Nippon Gene). Se hizo
reaccionar el ARN total resultante con ADNasa (fabricada por Nippon
Gene) a 37ºC durante 90 minutos. Se convirtió el ARN total tratado
con ADNasa (0,5 \mug) en ADNc mediante el sistema de primera
cadena Superscipt (para RT-PCR; fabricado por
GIBCO-BRL).
Se llevó a cabo un análisis de un cambio de la
expresión en la célula epitelial del tubo proximal humano normal
usando el ADNc preparado en el ejemplo 6(1) como molde y un
detector de secuencias (Prism 7700 Sequence Detector; fabricado por
Applied Biosystems). Se usó una combinación del oligonucleótido que
consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No: 17 y el
oligonucleótido que consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No:
18 como conjunto de cebadores. Se llevó a cabo una PCR, usando un
reactivo de PCR disponible comercialmente (reactivo de núcleo SYBR
Green PCR; fabricado por Applied Biosystems), llevando a cabo una
reacción de desnaturalización inicial a 95ºC durante 10 minutos, y
repitiendo 40 veces una reacción en ciclo compuesta por tratamientos
a 94ºC durante 15 segundos, 60ºC durante 30 segundos y 72ºC durante
60 segundos.
Con respecto a esto, para calcular, como patrón
interno, una cantidad de \beta-actina humana
expresada, se llevó a cabo una PCR, usando el ADNc anterior como
molde y una combinación del oligonucleótido que consiste en la
secuencia de bases de SEQ ID No: 19 y el oligonucleótido que
consiste en la SEQ ID No: 20 como conjunto de cebadores en las
mismas condiciones. Además, para obtener una curva patrón para
calcular una cantidad de ARNm expresado, se llevó a cabo una PCR,
usando el ADNc [preparado en el ejemplo 6(1)] a partir de
células epiteliales de túbulo proximal humano sin la estimulación
mediante TGF-\beta1 como molde y el conjunto de
cebadores anterior (es decir, una combinación del oligonucleótido
que consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No: 17 y el
oligonucleótido que consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No:
18, o una combinación del oligonucleótido que consiste en la
secuencia de bases de SEQ ID No: 19 y el oligonucleótido que
consiste en la SEQ ID No: 20) en las mismas condiciones. Se mostró
una cantidad del ARNm de MDTS9 expresado en cada condición como una
razón con respecto a una cantidad de ARNm del gen de
\beta-actina expresado en cada condición para
obtener una cantidad del ARNm del gen de MDTS9 con respecto a una
cierta cantidad del ARN total. Como resultado, se reveló que TGF-
\beta1 inducía la expresión génica de ARNm del gen de MDTS9 en
aproximadamente 8 veces.
Se preparó ADNc a partir de un riñón de un
modelo de nefrectomía 5/6 de rata [Kenjuro Kimura, "jin to toseki
(kidney and dialysis)", 1991 (sup.), 431-439].
Tras 1, 2, 3, 4, 6, 8, y 10 semanas desde la nefrectomía 5/6, se
anatomizaron cinco ratas con nefrectomía 5/6 y cinco ratas con
operación fingida para extirpar los riñones. Se congelaron
inmediatamente los riñones y se mantuvieron a -80ºC. Se trituraron
los riñones derivados de cada grupo usando un triturador celular
(CRYO-PRESS CP-100; fabricado por
Microtec Nition) mientras estaban congelados con nitrógeno líquido,
y luego se preparó un ARN total usando un reactivo de purificación
de ARN total (ISOGEN; fabricado por Nippon Gene). Se hizo reaccionar
el ARN total extraído con ADNasa (fabricad por Nippon Gene) a 37ºC
durante 90 minutos. Se convirtió el ARN total tratado con ADNasa
(0,25 \mug) en ADNc mediante un sistema de primera cadena
Superscript (para RT-PCR; fabricado por
GIBCO-BRL).
Se llevó a cabo un análisis de un cambio de la
expresión en un modelo de fallo renal de rata usando el ADNc
preparado en el ejemplo 7(1) como molde y un detector de
secuencias (Prism 7700 Sequence Detector; fabricado por Applied
Biosystems). Se usaron el oligonucleótido que consiste en la
secuencia de bases de SEQ ID No: 23 y el oligonucleótido que
consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No: 24 como conjunto de
cebadores. Se llevó a cabo una PCR, usando un reactivo de PCR
disponible comercialmente (reactivo de núcleo SYBR Green PCR;
fabricado por Applied Biosystems), llevando a cabo una reacción de
desnaturalización inicial a 95ºC durante 10 minutos, y repitiendo 45
veces una reacción en ciclo compuesta por tratamientos a 94ºC
durante 15 segundos, 60ºC durante 30 segundos y 72ºC durante 60
segundos.
Para calcular, como patrón interno, una cantidad
de gliceraldehído-3-fosfato
deshidrogenasa (G3PDH) humana expresada, se llevó a cabo una PCR,
usando el ADNc anterior como molde y el oligonucleótido que consiste
en la secuencia de bases de SEQ ID No: 25 y el oligonucleótido que
consiste en la secuencia de bases de SEQ ID No: 26 como conjunto de
cebadores en las mismas condiciones. Además, para obtener una curva
patrón para calcular una cantidad de ARNm expresado, se llevó a cabo
una PCR, usando el ADN genómico de rata (fabricado por Clontech) y
el conjunto de cebadores anterior en las mismas condiciones. Se
mostró una cantidad del ARNm de gen de MDTS9 expresado en cada
condición como una razón con respecto a una cantidad de ARNm del gen
de G3PDH expresado en cada condición para comparar una cantidad del
ARNm del gen de MDTS9 de rata con respecto a una cierta cantidad del
ARN total en cada grupo. Como resultado, se encontró que el ARN, del
gen de MDTS9 de rata se expresaba en la rata con nefrectomía 5/6
aproximadamente 5 veces comparado con la rata con operación fingida
tras 1 semana desde la operación, y que se expresaba aproximadamente
2 veces tras 3 semanas (una cantidad de proteínas en la orina
remarcablemente aumentada), 6 semanas (el peso del riñón comenzó a
aumentar comparado con el peso del riñón normal), y 8 semanas (se
agravaron los síntomas) desde la operación.
A partir de este ejemplo se reveló que se induce
una expresión del gen de MDTS9 en el modelo de fallo renal.
Se preparó una proteína de fusión
(GST-MDTS9A) de un péptido que consiste en los
aminoácidos 280º a 410º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No:
2 y glutatión S-transferasa (GST), usando un
plásmido pGEX-6P-1 (fabricado por
Amersham Pharmacia Biotech) como un vector de expresión y E.
coli, en una fracción de cuerpo de inclusión, según un manual de
laboratorio [Masato Okada y Maoru Miyazakim, "Kaitei,
Tanpakushitsu Jikken Noto, Jyo (revision, notebook for protein
experiments)", Yodo-sha, págs.
162-179]. Se llevó a cabo una electroforesis en gel
de SDS-poliacrilamida (PAGE) preparativa usando la
fracción de cuerpo de inclusión, y luego se extrajo la proteína
GST-MDTS9 deseada del gel mediante un método de
difusión [Masato Okada y Kaoru Miyakazi, "Kaitei, Tanpakushitsu
Jikken Noto, Ge (revision, notebook for protein experiments)",
Yodo-sha, págs.48-51].
Se inmunizó un conejo (blanco japonés) mediante
la proteína GST-MDTS9A resultante 5 veces en total
con un intervalo de 10 a 14 días para obtener antisuero. Se purificó
una fracción de IgG del antisuero mediante cromatografía de afinidad
usando una columna de Sepharose FF de proteína G (fabricada por
Amersham Pharmacia Biotech). Entonces, se purificó un anticuerpo
anti-MDTS9 humano a partir de la fracción de IgG
mediante cromatografía de afinidad usando una columna (columna
MBP-MDTS9A) en la que se inmovilizaron una proteína
de fusión (MBP-MDTS9A) de un péptido que consiste en
los aminoácidos 280º a 410º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID
No: 2 y proteína de unión a la manosa (MBP). La purificación por
afinidad mediante la columna de Sepharose FF de proteína G,
inmovilización de MBP-MDTS9A a una columna de
Sepharose FF activada con CNBr (fabricada por Amersham Pharmacia
Biotech), y la purificación por afinidad mediante columna de
MBP-MDTS9A se llevaron a cabo según protocolos
relacionados con las mismas. Además, se llevó a cabo una preparación
de MBP-MDTS9A en E. coli y purificación de la
misma usando pMALc2E (fabricado por New England Biolabs) como vector
de expresión según unas instrucciones "pMAL protein fusion and
purification system" publicadas por la misma.
Se hizo reaccionar el anticuerpo
anti-MDTS9 humano preparado en el ejemplo
8(1) con una sección de tejido que se había fijado mediante
formalina e incrustado en parafina sobre un portaobjetos. Entonces,
se tiñó la sección de tejido usando un kit de tinción disponible
comercialmente (kit VECTORSTAIN ABC-AP, nº de
catálogo AK-5000; fabricado por VECTOR LABORATORIES)
según un protocolo relacionado con el mismo. En este procedimiento,
se usaron un anticuerpo anti-conejo marcado con
biotina (nº de catálogo BA-1000; fabricado por
Vector) como segundo anticuerpo y un kit I de sustrato de fosfatasa
alcalina (nº de catálogo SK-5100; fabricado por
Vector) como sustrato de revelado de color. Como resultado, se
observó tinción en células epiteliales (particularmente podocitos)
de riñones de una persona sana y un paciente que padece nefropatía
diabética (fase temprana o fase tardía).
Resulta claro a partir de este ejemplo que la
proteína MDTS9 se expresa en el riñón humano.
El polipéptido de la presente invención es una
proteasa novedosa, que se expresa en un riñón, inducida por
TGF-\beta e implicada con un metabolismo en una
matriz extracelular. Por tanto, una sustancia que inhibe la
actividad proteasa del polipéptido de la presente invención es útil
como agente para tratar el fallo renal crónico en la que se prevé
una administración a largo plazo, dado que es sumamente posible que
la sustancia suprima o inhiba únicamente una parte que está
implicada con un cambio cualitativo y un aumento cuantitativo de
componentes de matriz extracelular, entre las acciones fisiológicas
de TGF-\beta. Esto es, según el polipéptido de la
presente invención, un sistema de selección conveniente para
detectar un agente para tratar el fallo renal crónico. Además, el
polinucleótido, el vector de expresión, la célula y el anticuerpo de
la presente invención son útiles para producir el polipéptido de la
presente invención.
Las características de la "secuencia
artificial" se describen en el identificador numérico <223>
en la lista de secuencias. Más particularmente, cada una de las
secuencias de bases de SEQ ID Nos: 3 y 4 es una secuencia ligadora
sintetizada artificialmente. Cada una de las secuencias de bases de
SEQ ID Nos: 5-9 y 12-14 son una
secuencia de cebador sintetizada artificialmente. La secuencia de
bases de SEQ ID No: 21 es una secuencia de aminoácidos obtenida
mediante expresión de ADN que contiene una secuencia de nucleótido
de reconocimiento de enzima de restricción NotI y una secuencia de
nucleótido que codifica para una secuencia de aminoácidos de
etiqueta FLAG.
<110> Yamanouchi Pharmaceutical Co.,
Ltd.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Proteasa novedosa
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> YO132PCT-664
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> JP 2000-393372
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
25-12-2000
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3675
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(3675)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1224
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia ligadora sintetizada artificialmente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctagcgcggc cgcaggatcc gactacaagg acgacgatga caaatgataa
\hfill50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia ligadora sintetizada artificialmente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgatcttatca tttgtcatcg tcgtccttgt agtcggatcc tgcggccgcg
\hfill50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia de cebador sintetizada artificialmente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggactagtct agaagctggg taccagctgc tagc
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia de cebador sintetizada artificialmente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggactagtgt cgaccggtca tggctgcgc
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia de cebador sintetizada artificialmente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggactagtgc catgggaccc gcagcggcag cgcctggg
\hfill38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia de cebador sintetizada artificialmente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggcggccgc acccctgtga atcgtgcagg ctgagttatt
\hfill40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia de cebador sintetizada artificialmente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggactagtac catgaagccc cgcgcgcgcg gatggcgggg c
\hfill41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccctgtggtc aacctcgtag gcagagacca
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggcagttcgg agagaaagcc aagctct
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia de cebador sintetizada artificialmente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggcggccgc caagttggac ttagagcaag tcttgcagca
\hfill40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia de cebador sintetizada artificialmente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptggccttcac cattgcccat cagtctggac acaactttgg c
\hfill41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia de cebador sintetizada artificialmente
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgccaaagttg tgtccagact gatgggcaat ggtgaaggcc a
\hfill41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcaccttaagt agcttctgcc agtggcagtc t
\hfill31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipacaaacatta cggctatcct ccgagcatgg ag
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttctaagcac cgctcaagct atc
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggccttcat caccatattt ca
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccatgccatc ctgcgtctg
\hfill19
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaggggccgga ctcgtcatac
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial:
una secuencia de aminoácidos obtenida mediante expresión de un ADN
que contiene una secuencia de nucleótido de reconocimiento de enzima
de restricción NotI y una secuencia de nucleótido que codifica para
una secuencia de aminoácidos de etiqueta FLAG
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Ala Ala Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp
Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Glu Ser Gly His}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rattus sp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipagcctagctc ccgatccaa
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rattus sp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccaccaccag agtctccaca t
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rattus sp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaagcaggcgg ccgag
\hfill15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rattus sp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatcaaaggtg gaagaatggg a
\hfill21
Claims (12)
1. Un polipéptido que muestra una actividad
proteasa y que comprende (1) la secuencia de aminoácidos que
consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos
de SEQ ID No: 2, (2) una secuencia de aminoácidos en la que se
eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10 aminoácidos en la
secuencia de aminoácidos de los aminoácidos que consiste en los
aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No:
2, o (3) una secuencia de aminoácidos en la que se eliminan,
sustituyen y/o insertan de 1 a 10 aminoácidos en la secuencia de
aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 1224º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2.
2. El polipéptido de la reivindicación 1, que
comprende la secuencia de aminoácidos que consiste en los
aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácido de SEQ ID No:
2.
3. Polipéptido según la reivindicación 1, que
consiste en (1) una secuencia de aminoácidos en la que se eliminan,
sustituyen y/o insertan de 1 a 10 aminoácidos en la secuencia de
aminoácidos que consiste en los aminoácidos 1º a 750º en la
secuencia de aminoácidos de SEQ ID No: 2, o (2) una secuencia de
aminoácidos en la que se eliminan, sustituyen y/o insertan de 1 a 10
aminoácidos en la secuencia de aminoácidos que consiste en los
aminoácidos 1º a 1224º en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID No:
2.
4. El polipéptido de la reivindicación 1, que
consiste en (1) aminoácidos 1º a 750º en la secuencia de aminoácidos
de SEQ ID No: 2, o (2) aminoácidos 1º a 1224º en la secuencia de
aminoácidos de SEQ ID No: 2.
5. Un polinucleótido que codifica el
polipéptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4.
6. Un vector de expresión que comprende el
polinucleótido según la reivindicación 5.
7. Una célula transfectada con el vector de
expresión según la reivindicación 6.
8. Un anticuerpo o fragmento del mismo, que se
une al polipéptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a
4.
9. Un procedimiento para producir el
polipéptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, que
comprende las etapas de:
cultivar la célula según la reivindicación 7,
y
recuperar el polipéptido según una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 4.
10. Un método para detectar si un compuesto que
debe someterse a prueba inhibe o no la actividad proteasa del
polipéptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, que
comprende las etapas de:
poner en contacto (1) dicho polipéptido, (2)
\alpha_{2}-macroglobulina, y (3) dicho compuesto
que debe someterse a prueba, y analizar si dicho polipéptido y
\alpha_{2}-macroglobulina forman o no un
complejo que no se disocia por SDS y/o un agente reductor.
11. El método según la reivindicación 10, que
comprende además la etapa de:
seleccionar una sustancia que inhiba la
actividad proteasa.
12. El método para seleccionar una sustancia
para tratar el fallo renal crónico mediante el método según la
reivindicación 11.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2000-393372 | 2000-12-25 | ||
JP2000393372 | 2000-12-25 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
ES2280306T3 true ES2280306T3 (es) | 2007-09-16 |
Family
ID=18859188
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES01271857T Expired - Lifetime ES2280306T3 (es) | 2000-12-25 | 2001-12-21 | Proteasa novedosa. |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20030129658A1 (es) |
EP (1) | EP1347048B1 (es) |
JP (1) | JPWO2002051998A1 (es) |
AT (1) | ATE353961T1 (es) |
DE (1) | DE60126659T2 (es) |
ES (1) | ES2280306T3 (es) |
WO (1) | WO2002051998A1 (es) |
Families Citing this family (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6448388B1 (en) * | 2000-08-16 | 2002-09-10 | Lexicon Genetics Incorporated | Human proteases and polynucleotides encoding the same |
JP2003180384A (ja) * | 2001-09-24 | 2003-07-02 | Daiichi Fine Chemical Co Ltd | Adamts−15,−16,−17,−18及び−19 |
EP1508619A4 (en) * | 2002-06-20 | 2005-11-02 | Astellas Pharma Inc | NEW PROMOTER |
US9487823B2 (en) | 2002-12-20 | 2016-11-08 | Qiagen Gmbh | Nucleic acid amplification |
EP1863908B1 (de) * | 2005-04-01 | 2010-11-17 | Qiagen GmbH | Reverse transkription und amplifikation von rna bei simultaner degradierung von dna |
CN101283106A (zh) * | 2005-07-27 | 2008-10-08 | 肿瘤疗法科学股份有限公司 | 小细胞肺癌的诊断方法 |
EP1762627A1 (de) | 2005-09-09 | 2007-03-14 | Qiagen GmbH | Verfahren zur Aktivierung einer Nukleinsäure für eine Polymerase-Reaktion |
EP2171450B1 (en) * | 2007-06-22 | 2012-03-21 | GENERA ISTRAZIVANJA d.o.o. | Adamts4 as a blood biomarker and therapeutic target for chronic renal failure |
US20190049459A1 (en) * | 2015-09-14 | 2019-02-14 | Tokyo Institute Of Technology | Method for identifying bioactive protein, and bioactive protein obtained by said method |
US10713888B2 (en) | 2018-03-01 | 2020-07-14 | Ags Llc | Gaming system having boot locked validation of program installs, data installs and program launches |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2001083782A2 (en) * | 2000-05-04 | 2001-11-08 | Sugen, Inc. | Novel proteases |
JPWO2002031163A1 (ja) * | 2000-10-11 | 2004-02-19 | 財団法人かずさディー・エヌ・エー研究所 | 新規なadamtsファミリーポリペプチドおよびそれをコードする遺伝子 |
AU2002239753A1 (en) * | 2000-10-18 | 2002-05-21 | Incyte Genomics, Inc. | Proteases |
JP2003180384A (ja) * | 2001-09-24 | 2003-07-02 | Daiichi Fine Chemical Co Ltd | Adamts−15,−16,−17,−18及び−19 |
WO2003040393A2 (en) * | 2001-11-06 | 2003-05-15 | Decode Genetics Ehf. | Nucleic acids encoding proteases |
-
2001
- 2001-12-21 EP EP01271857A patent/EP1347048B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2001-12-21 DE DE60126659T patent/DE60126659T2/de not_active Expired - Lifetime
- 2001-12-21 AT AT01271857T patent/ATE353961T1/de active
- 2001-12-21 ES ES01271857T patent/ES2280306T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2001-12-21 JP JP2002553479A patent/JPWO2002051998A1/ja active Pending
- 2001-12-21 WO PCT/JP2001/011251 patent/WO2002051998A1/ja active IP Right Grant
- 2001-12-21 US US10/296,616 patent/US20030129658A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20030129658A1 (en) | 2003-07-10 |
JPWO2002051998A1 (ja) | 2004-04-30 |
WO2002051998A1 (fr) | 2002-07-04 |
ATE353961T1 (de) | 2007-03-15 |
EP1347048B1 (en) | 2007-02-14 |
EP1347048A4 (en) | 2004-07-21 |
DE60126659D1 (de) | 2007-03-29 |
EP1347048A1 (en) | 2003-09-24 |
DE60126659T2 (de) | 2007-10-31 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
ES2625316T3 (es) | Neuquinasa, una proteína corriente abajo de neuregulina | |
US20090136970A1 (en) | Nogo receptor homologues and their use | |
ES2300074T3 (es) | Nuevas proteinas de receptores copulados a proteina g. | |
US20080118951A1 (en) | Nogo receptor homologues and their use | |
ES2280306T3 (es) | Proteasa novedosa. | |
US20080254028A1 (en) | Caspase-8 binding protein, its preparation and use | |
EP1290160B1 (en) | Human pellino polypeptides | |
ES2338210T3 (es) | Metaloproteasa novedosa que tiene actividad agrecanasa. | |
ES2288909T3 (es) | Nueva agrecanasa. | |
ES2292168T3 (es) | Adn que codifica el receptor de bradiquinina b1. | |
WO2004009617A1 (ja) | Notch由来新規ポリペプチドおよびそれを用いたバイオマーカー並びに試薬 | |
JP2005229804A (ja) | 新規なメラニンコンセントレーティングホルモン受容体 | |
US7211406B2 (en) | Potassium channel | |
ES2323946T3 (es) | Adnc que codifica la subunidad alfa2 delta4 del canal de calcio humano. | |
EP1347049A1 (en) | Novel potassium channel | |
EP1164142A1 (en) | Novel proteins and uses thereof | |
JPWO2003002603A1 (ja) | 新規のニューロペプチドy様ペプチド | |
AU2002324325A1 (en) | A caspase- 8 binding protein, its preparation and use | |
JP2003038188A (ja) | 血管新生阻害活性を有する新規ポリペプチド | |
JP2002171982A (ja) | 新規なk+チャネル蛋白質 |