ES2273868T3 - Metodos de ensayo de canal ionico. - Google Patents

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Abstract

Un método de caracterización de la actividad biológica de un compuesto candidato que comprende: exponer una o más células a dicho compuesto; exponer repetidamente dichas una o más células a una pluralidad de impulsos de campo eléctrico bifásico en el que dichos impulsos tienen una amplitud máxima inferior a aproximadamente 90 V/cm, en el que dichos impulsos se aplican a una tasa de al menos aproximadamente 1 por segundo, y en el que la duración total de cada impulso es de al menos aproximadamente 1 milisegundo, de manera que realice un cambio controlado en el potencial transmembrana de dichas una o más células; y monitorizar, sin utilizar un patch clamp, los cambios en el potencial transmembrana de dichas una o más células

Description

Métodos de ensayo de canal iónico.
Referencia cruzada a las solicitudes relacionadas
Esta solicitud reivindica prioridad para las solicitudes provisionales de los EE.UU. con números de serie 60/
217.671, titulada INSTRUMENTATION AND METHODS FOR ELECTRICAL STIMULATION, presentada el 10 de julio de 2000, por Maher et al.; 60/217.666, titulada INSTRUMENTATION AND METHODS FOR ELECTRICAL STIMULATION, presentada el 10 de julio de 2000 por Mendlein; 60/217.221, titulada INSTRUMENTATION AND METHODS FOR ELECTRICAL STIMULATION, presentada el 10 de julio de 2000, por Maher et al.; 60/217.219, titulada INSTRUMENTATION AND METHODS FOR ELECTRICAL STIMULATION, presentada el 10 de julio de 2000, por Maher et al.; y las solicitudes de los EE.UU. con números de serie 09/804.457, titulada ION CHANNEL ASSAY METHODS, presentada el 12 de marzo de 2001, por Maher et al.; 09/804.480, titulada ION CHANNEL ASSAY METHODS, y presentada el 12 de marzo de 2001, por Maher et al.; 09/804.580, titulada HIGH THROUGHPUT METHOD AND SYSTEM FOR SCREENING CANDIDATE COMPOUNDS FOR ACTIVITY AGAINST TARGET ION CHANNELS, presentada el 12 de marzo de 2001, por Maher et al.; y 09/804.458, titulada MULTI-WELL PLATE AND ELECTRODE ASSEMBLIES FOR ION CHANNEL ASSAYS, presentada el 12 de marzo de 2001.
Antecedentes de la invención Campo de la invención
La presente invención se refiere generalmente a los instrumentos y métodos para manipular potenciales de membrana de células vivas mediante estimulación eléctrica.
Descripción de la técnica relacionada
Se conoce desde hace mucho tiempo que el interior de las células animales y vegetales es eléctricamente negativo con respecto al exterior. La magnitud de esta diferencia de potencial es generalmente de entre 5 y 90 mV, desarrollándose la mayor parte del potencial a través de la membrana celular. El potencial transmembrana de una célula dada se establece mediante el equilibrio de las actividades de los transportadores de iones que crean y mantienen el gradiente electroquímico, y las actividades de los canales iónicos, la difusión pasiva y otros factores, que permiten que los iones fluyan a través de la membrana plasmática.
Los canales iónicos participan en, y regulan, procesos celulares tan diversos como la generación y sincronización de los potenciales de acción, la producción de energía, la transmisión sináptica, la secreción de hormonas y la contracción de músculos, etc. Muchos fármacos ejercen sus efectos específicos mediante la modulación de los canales iónicos. Ejemplos incluyen compuestos antiepilépticos como fenitoína y lamotrigina, que bloquean los canales de sodio dependientes de voltaje en el cerebro, fármacos antihipertensores como nifedipina y diltiazem, que bloquean los canales de calcio dependientes de voltaje en las células del músculo liso, y estimuladores de la liberación de insulina como glibenclamida y tolbutamida, que bloquean los canales de potasio regulados por ATP en el páncreas.
Encontrar nuevos fármacos que tengan efectos moduladores específicos sobre los canales iónicos requiere métodos para medir y manipular el potencial de membrana de las células con los canales iónicos presentes en la membrana. En la actualidad existen varios métodos que pueden utilizarse para medir los potenciales transmembrana de las células y para medir las actividades de canales iónicos específicos. Probablemente, el enfoque mejor conocido es el patch clamp ("pinzamiento zonal"), desarrollado originalmente por Neher, Sakmann y Steinback. (The Extracellular Patch Clamp, A Method For Resolving Currents Through Individual Open Channels In Biological Membranes, Pfluegers Arch. 375; 219-278, 1978). Otros métodos incluyen registros ópticos de colorantes sensibles al voltaje (Cohen et al., Annual Reviews of Neuroscience 1: 171-82, 1978) y registros extracelulares de acontecimientos rápidos utilizando metales (Thomas et al., Exp. Cell Res. 74: 61-66, 1972) o electrodos de transistores de efecto campo (FET) (Fromherz et al., Science 252: 1290-1293, 1991).
La técnica de patch clamp permite la medición del flujo de iones a través de las proteínas del canal iónico y el análisis del efecto de los fármacos sobre la función de los canales iónicos. En resumen, en la técnica de patch clamp convencional, se calienta y se tira de una fina pipeta de vidrio hasta que se rompe, formando una abertura muy fina (< 1 \mum de diámetro) en la punta. La pipeta se llena con una solución salina que se aproxima a la composición iónica intracelular de la célula. Se inserta un electrodo de metal en el extremo largo de la pipeta y se conecta a componentes electrónicos asociados. La punta de la pipeta de la técnica de patch clamp se presiona contra la superficie de la membrana celular. La punta de la pipeta se sella herméticamente a la célula y aísla algunas proteínas del canal iónico en un diminuto parche de la membrana. La actividad de estos canales puede medirse eléctricamente (registro de canal único) o, alternativamente, el parche puede romperse permitiendo mediciones de la actividad combinada del canal de la totalidad de la membrana celular (registro de célula completa).
Tanto durante el registro de canal único como durante el registro de la célula completa, puede resolverse adicionalmente la actividad de los subtipos de canal individuales imponiendo una fijación de voltaje ("voltage clamp") a través de la membrana. Mediante el uso de un bucle de realimentación ("feedback loop"), la fijación de voltaje impone una diferencia de potencial especificada por el usuario a través de la membrana, permitiendo la medición de las dependencias del voltaje, de los iones y del tiempo de varias corrientes de canales iónicos. Estos métodos permiten la resolución de subtipos diferenciados de canales iónicos.
Una limitación principal de la técnica de patch clamp como método general en la selección farmacológica es su bajo rendimiento. Normalmente, un único operario, altamente cualificado, puede probar menos de diez compuestos por día utilizando la técnica de patch clamp. Además, la técnica no es fácilmente abordable para la automatización y produce resultados complejos que requieren un amplio análisis por parte de electrofisiólogos expertos. En comparación, el uso de sistemas de detección óptica proporciona un rendimiento significativamente mayor para las aplicaciones de selección (en la actualidad, hasta 100.000 compuestos por día), mientras que al mismo tiempo proporciona análisis sumamente sensibles de potencial transmembrana. Los métodos para la detección óptica del potencial de membrana normalmente se basan en translocación, redistribución, cambios de orientación, o desplazamientos en los espectros de colorantes fluorescentes, luminescentes, o de absorción en respuesta al potencial de la membrana celular (véase generalmente González, et al., Drug Discovery Today 4: 431-439, 1999).
Un método óptico preferido de análisis se ha descrito anteriormente (González y Tsien, Chemistry and Biology 4: 269-277, 1997; González y Tsien, Biophysical Journal 69: 1272-1280, 1995; y patente de los EE.UU. número 5.661.035 concedida el 26 de agosto de 1997). Este enfoque comprende normalmente dos reactivos que experimentan transferencia de energía para proporcionar una lectura fluorescente radiométrica que depende del potencial de membrana. La lectura radiométrica proporciona importantes ventajas para la selección de fármacos, incluyendo la mejora en la sensibilidad, la fiabilidad y la reducción de muchos tipos de artefactos experimentales.
En comparación con el uso de una técnica de patch clamp, los métodos ópticos de análisis no proporcionan intrínsecamente la capacidad de regular, o fijar, el potencial transmembrana de una célula. Los métodos de fijación ("clampling") son sumamente deseables porque proporcionan métodos significativamente mejorados y más flexibles de medición de los canales iónicos. Por tanto, existe una necesidad de métodos fiables y específicos para regular los potenciales de membrana de células vivas que sean compatibles con los métodos ópticos de análisis y sean fácilmente abordables para análisis de alto rendimiento.
El documento WO 96/41166 A2 y el artículo de J. González et al. (1999) "Cell-based assays and instrumentation for screening ion-channel targets" en DDT 4 (9), págs. 431-439, describen un método para identificar un compuesto que modula la actividad de un canal iónico, que comprende, entre otras, las etapas siguientes: exponer una o más células al compuesto; exponer repetidamente la una o más células a uno o más campos eléctricos, de manera que realice un cambio controlado en el potencial transmembrana de la una o más células; y monitorizar, sin utilizar una técnica de patch clamp, los cambios en el potencial transmembrana de la una o más células. Este método puede utilizarse para caracterizar la actividad biológica de uno o más de los compuestos identificados.
El objeto de la presente invención es mejorar el rendimiento que puede lograrse con tales métodos. Un objeto adicional de la presente invención es proporcionar un método para someter a ensayo la actividad bioquímica de un compuesto contra un canal iónico objetivo, un método para someter a ensayo la actividad del canal iónico en al menos una célula, y un método para someter a ensayo la actividad del canal iónico en un canal iónico objetivo seleccionado.
Estos objetos se logran con los métodos según la reivindicación 1, 14, 19 y 25, respectivamente. Se utilizan campos eléctricos bifásicos pulsados que tienen una amplitud máxima inferior a aproximadamente 90 V/cm, se aplican a una tasa de al menos aproximadamente 1 por segundo, y que tienen una duración total de al menos aproximadamente 1 milisegundo. Las realizaciones ventajosas de la invención constituyen el contenido de las reivindicaciones dependientes.
Breve descripción de los dibujos
La figura 1 muestra una realización de una matriz de electrodos de inmersión.
La figura 2 muestra varias realizaciones de placas de múltiples pocillos que comprenden electrodos de superficie.
La figura 3 muestra un diagrama de bloques de una realización del sistema de estimulación eléctrica.
La figura 4 muestra los efectos simulados de campos eléctricos externos repetitivos sobre una célula que expresa un canal de sodio dependiente de voltaje. El panel superior indica el campo eléctrico aplicado, el panel medio indica la corriente de sodio simulada hacia la célula, y el panel inferior indica el potencial transmembrana promedio simulado.
La figura 5 muestra una representación esquemática de una onda cuadrada.
La figura 6 muestra ejemplos de diversos núcleos de onda.
La figura 7 muestra perfiles de campo eléctrico calculados para diversos montajes de electrodos en pocillos redondos de 6,2 mm de diámetro. El círculo discontinuo es un intervalo de visualización de 3 mm de diámetro. En las zonas blancas, la intensidad del campo eléctrico es inferior al 10% de la intensidad del campo eléctrico promedio en el intervalo de visualización. En las zonas grises, la intensidad del campo eléctrico está dentro del 10% de la intensidad del campo eléctrico promedio en el intervalo de visualización. En las zonas negras, la intensidad del campo eléctrico es superior al 10% de la intensidad del campo eléctrico promedio en el intervalo de visualización.
La figura 8 muestra perfiles de campo eléctrico calculados para diversos montajes de electrodos en pocillos redondos y cuadrados 6,2 mm a través. El círculo discontinuo es un intervalo de visualización de 3 mm de diámetro. En las zonas blancas, la intensidad del campo eléctrico es inferior al 1% de la intensidad del campo eléctrico promedio en el intervalo de visualización. En las zonas grises, la intensidad del campo eléctrico, está dentro del 1% de la intensidad del campo eléctrico promedio en el intervalo de visualización. En las zonas negras, la intensidad del campo eléctrico es superior al 1% de la intensidad del campo eléctrico promedio en el intervalo de visualización.
La figura 9 muestra diversos diseños de electrodo y aislante para mejorar la uniformidad del campo eléctrico en los pocillos redondos.
La figura 10 muestra el efecto de los protocolos de estimulación eléctrica en amplitudes de impulso variables durante el transcurso de tiempo de la estimulación eléctrica en células CHO de tipo natural.
La figura 11 muestra la relación entre la respuesta celular máxima y la amplitud de impulso aplicada durante la estimulación eléctrica para células CHO de tipo natural. Los datos proceden de la figura 10 tomados tras aproximadamente 5 segundos.
La figura 12 muestra la curva de respuesta a la dosis para el efecto de TTX en células CHO de tipo natural. Los parámetros de la estimulación fueron 33 V/cm, 50 Hz durante 3 segundos con un núcleo de onda cuadrada bifásica (5 ms por fase). La línea continua es una función de Hill ajustada para los datos con CE_{50} = 9 nM y un coeficiente de Hill de 1,47.
La figura 13 muestra la relación entre la duración del impulso y la frecuencia y la respuesta celular de células CHO de tipo natural durante la estimulación eléctrica. La intensidad del campo eléctrico fue siempre de 25 V/cm. El estímulo fue una ráfaga de tres segundos de impulsos bifásicos de duración y frecuencia variables. Las líneas continuas son ajustes para la forma R = 1 + \frac{Af}{f + f_{0}}.
La figura 14 muestra perfiles de tiempo para células CHO que expresan el canal de sodio NaV2, células eléctricamente estimuladas a diversas intensidades de campo. Las células se estimularon en una placa de 96 pocillos, con una serie de impulsos de 5 mg/voltaje de fase, de 20 Hz y 3 segundos de duración. La estimulación se produjo durante la parte sombreada del gráfico. En este experimento, las células se tiñeron con CC2-DMPE 20 \muM y DiSBAC_{6}(3) 63 nM. Esta combinación de colorantes tiene una constante de tiempo de 2 ms y rastrea con precisión el potencial transmembrana. Los tiempos de aumento y disminución de la respuesta se ajustaron para las funciones de disminución exponencial y se encontró que eran de \tau_{aumento} = 200 ms y \tau_{disminución} = 850 ms.
La figura 15 muestra la relación entre la intensidad del campo eléctrico y la respuesta celular medida tras 4 segundos (cuadrados) y 10 segundos (círculos) de estimulación eléctrica. La línea es un ajuste de Boltzman para los datos.
La figura 16 muestra el efecto de la duración del impulso y la frecuencia de estimulación sobre la respuesta celular de las Células CHO que expresan el canal de sodio NaV2.
La figura 17 muestra el parámetro T_{0} de tiempo de acodamiento a partir del ajuste de los datos en la figura 16 representado frente a la duración del estímulo.
La figura 18 muestra la respuesta temporal de células HEK-293 que expresan el canal de sodio NaV3 durante la estimulación eléctrica.
La figura 19 muestra curvas dosis - respuesta para tetrotodoxina (figura 19A) y tetracaína (figura 19B) para células HEK-293 que expresan el canal de sodio NaV3. Las condiciones de estimulación eléctrica fueron: E = 33 V/cm, 10 ms/fase de estimulación bifásica, ráfaga de 15 Hz durante 1,5 segundos.
La figura 20 muestra una curva de respuesta a la dosis para tetracaína para células HEK-293 que expresan el canal iónico NaV4. Para este experimento, los parámetros de estimulación eléctrica fueron E = 33 V/cm, 10 ms/fase de estimulación bifásica, ráfaga de 15 Hz durante 1,5 segundos.
La figura 21 muestra una vista de placa completa de la estimulación eléctrica de células HEK-293 de tipo natural. Cada panel individual representa el indicio de tiempo de la razón de fluorescencia normalizada de un único pocillo en la placa de 96 pocillos. Cada pocillo en una columna vertical se estimuló simultáneamente con la misma intensidad de campo. La intensidad de campo aumenta de izquierda a derecha. Las filas 6-8 contenían TEA 10 mM para bloquear los canales de potasio dependientes de voltaje.
\newpage
La figura 22 muestra la respuesta celular como una función del campo de estímulo para las células HEK de tipo natural. Las barras de error son desviaciones estándar. Símbolos abiertos: sin añadir bloqueantes. Símbolos rellenos: con TEA 10 mM añadido para bloquear los canales de potasio.
La figura 23 muestra los indicios de respuesta al tiempo para concentraciones seleccionadas de los bloqueantes del canal de sodio, tetrodotoxina (TTX) (figura 23A) y tetracaína (figura 23B) en células CHO que expresan el canal de sodio NaV2.
La figura 24 muestra las curvas dosis - respuesta para la inhibición por parte de TTX y tetracaína del canal de sodio NaV2.
La figura 25 muestra un experimento de adiciones conocidas "aleatorias" de TTX. Cada pequeño recuadro en esta matriz de 11 x 8 contiene el indicio de tiempo de diez segundos de un pocillo en la posición correspondiente de placa de 96 pocillos. La columna duodécima fue un pocillo control sin células utilizado para la resta de fondo y no se muestra. Los pocillos (1,1), (2,2), (3,3), etc., contenían una concentración bloqueante de TTX.
La figura 26 muestra un análisis de los datos de las adiciones conocidas "aleatorias" de TTX mostrados en la figura 25. Los puntos de datos son la respuesta radiométrica en el intervalo de tiempo desde 1,8-2,4 segundos tras el comienzo de la ráfaga de estímulos (es decir, en el pico de la respuesta). Los puntos de círculos rellenos fueron adiciones conocidas con TTX 1 \muM; los círculos abiertos no tenían bloqueante añadido.
La figura 27 muestra una vista de placa completa de células de músculo cardiaco HL5 estimuladas eléctricamente. Cada panel individual representa el indicio de tiempo de la razón de fluorescencia normalizada de un único pocillo en la placa de 96 pocillos. Cada pocillo en una columna vertical se estimuló simultáneamente con la misma intensidad de campo. La intensidad de campo aumenta de izquierda a derecha. Las filas 5 y 6 contenían TTX 10 \muM para bloquear parcialmente los canales de sodio dependientes de voltaje. Las filas 7 y 8 contenían TEA 10 mM para bloquear parcialmente los canales de potasio dependientes de voltaje.
La figura 28 muestra la respuesta de células HL5 como una función de la intensidad del campo eléctrico aplicado. Los puntos negros son el promedio de la respuesta de cuatro pocillos sin compuestos añadidos. La línea continua es un ajuste de Boltzman para los datos con E_{50} = 22 V/cm. Los puntos constituyen el intervalo de selección: la diferencia entre la respuesta y la respuesta no estimulada normalizada para la desviación estándar de la respuesta (véase el apéndice A3).
Figura 29. Respuesta típica al voltaje para células CHO que expresan un canal de potasio y el canal de sodio NaV3 tras tres ciclos de estimulación separados utilizando electrodos de superficie.
La figura 30 muestra la respuesta radiométrica promedio de una población de células que se hace crecer en una placa de múltiples pocillos de 96 pocillos estimulada con estímulos monofásicos de intensidades de campo variables a través de electrodos de superficie. Los puntos en esta curva constituyen la respuesta pico promedio de 4 estimulaciones en el mismo cultivo.
La figura 31 muestra la respuesta celular como una función del campo de estímulo para las células RBL de tipo natural. Las barras de error son desviaciones estándar. Símbolos abiertos: sin añadir bloqueantes. Símbolos rellenos: con TEA 400 \muM añadido para bloquear los canales IRK1.
Descripción detallada de la realización preferida
Generalmente, la nomenclatura utilizada en el presente documento y muchos de los procedimientos de fluorescencia, informática, detección, química y laboratorio descritos a continuación son bien conocidos y se emplean comúnmente en la técnica. Las técnicas convencionales se utilizan normalmente para síntesis química, fluorescencia, óptica, biología molecular, software informático e integración. Generalmente, las reacciones químicas, ensayos celulares y reacciones enzimáticas se realizan según las especificaciones del fabricante cuando sea apropiado. Estas técnicas y procedimientos generalmente se realizan según métodos convencionales en la técnica y diversa bibliografía general, incluyendo la enumerada a continuación.
Lakowicz, J.R. Topics in Fluorescence Spectroscopy, (3 volúmenes) Nueva York: Plenum Press (1991), y Lakowicz, J. R. Emerging applications of fluorescence spectroscopy to cellular imaging: lifetime imaging, metal-ligand probes, multi-photon excitation and light quenching. Scanning Microsc Supl. Vol. 10 (1996) páginas 213-24, para las técnicas de fluorescencia.
Sambrook et al. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª ed. (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., para los métodos de biología molecular.
Cells: A Laboratory Manual, 1ª edición (1998) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., para los métodos de biología celular.
\newpage
Optics Guide 5 Melles Griot® Irvine CA, Optical Waveguide Theory, Snyder & Love publicado por Chapman & Hall para métodos ópticos generales.
Hille, B. Ionic Channels of Excitable Membranes, Segunda Edición (1992) Sinauer Associates, Inc., Sunderland, Mass. para métodos electrofisiológicos generales y propiedades de los canales iónicos.
Horowitz y Hill, The Art of Electronics, Segunda Edición (1989) Cambridge University Press, Cambridge, R.U. para circuitos electrónicos.
Las siguientes definiciones se explican para ilustrar y definir el significado y el alcance de los diversos términos utilizados para describir la invención en el presente documento.
El término activación se refiere a la transición desde un estado de reposo (no conductor) de un canal iónico hasta el estado activado (conductor).
El término umbral de activación se refiere al menor potencial, por encima del cual se produce la apertura medible de un canal.
El término ánodo se refiere a un electrodo cuando se excita a un potencial positivo con respecto a tierra mediante una fuente externa.
El término zona de estimulación celular significa la zona definida por dos electrodos que experimenta estimulación eléctrica significativa (normalmente 5 V/cm o superior) en la que se localizan las células de interés. Normalmente, la zona de estimulación celular es mayor que, o igual a, la zona de observación. Para las mediciones basadas en 96 pocillos convencionales, la zona de estimulación celular normalmente es de aproximadamente 16 mm^{2}.
El término zona de observación significa la parte del sistema sobre el que se toma una medición. La zona de observación normalmente está en un área de al menos 0,5 mm^{2} para mediciones basadas en placas de múltiples pocillos.
El término proteína bioluminiscente se refiere a una proteína que puede producir la emisión de luz a través de la catálisis de una reacción química. El término incluye proteínas que catalizan reacciones bioluminiscentes o quimioluminiscentes, tales como las que producen la oxidación de luciferinas. El término proteína bioluminiscente incluye, no sólo proteínas bioluminiscentes que se producen en la naturaleza, sino también mutantes que muestran propiedades físicas o espectrales alteradas.
El término bifásico se refiere a un impulso con dos partes, cada una con una polaridad opuesta.
El término función de Boltzman se refiere a la función de respuesta sigmoidal (es decir, similar a un escalón)
\vskip1.000000\baselineskip
y(x) = y_{0} + \frac{A}{1 + exp \left( \frac{x - x_{50}}{\Delta x}\right)}
En la que:
y es la variable independiente
y_{0} es un parámetro ajustable igual al límite de la función cuando x \rightarrow \infty
A es un parámetro ajustable igual al tamaño del escalón
x_{50} es un parámetro ajustable relacionado con el punto medio del escalón
\Deltax es un parámetro ajustable que describe la anchura del escalón.
El término cátodo se refiere a un electrodo cuando se excita a un potencial negativo con respecto a tierra mediante una fuente externa.
El término despolarizar significa hacer que el potencial transmembrana de una célula se haga más próximo a cero. En el caso de las células que normalmente están en potenciales de reposo negativos, este término significa que el potencial transmembrana cambia en una dirección positiva.
El término concentración efectiva (50%) o CE_{50} se refiere a la concentración a la que un compuesto farmacológico tiene la mitad de la efectividad, en comparación con la efectividad máxima a altas concentraciones del compuesto.
\newpage
El término eléctricamente excitable se refiere a una célula o tejido que responde a un estímulo eléctrico superior al umbral mediante la generación de un potencial de acción. Las células eléctricamente excitables contienen al menos un canal iónico dependiente de voltaje tipo que genera una corriente hacia el interior y al menos un canal iónico tipo que genera una corriente hacia el exterior.
El término estimulación eléctrica significa iniciar un cambio de voltaje en las células utilizando un impulso de corriente extracelular.
El término electrodo significa una superficie de contacto conductora controlable entre un instrumento y un sistema de prueba.
El término electropermeabilización se refiere a la electroporación leve, en la que los poros hidratados creados a través de la membrana sólo son lo suficientemente grandes como para que pasen moléculas de agua e iones de átomo individual pequeños.
El término electroporación se refiere a un fenómeno en el que la aplicación de un gran potencial eléctrico a través de la membrana de una célula da como resultado la ruptura dieléctrica de la membrana, y la creación de trayectorias hidratadas a través de la membrana.
El término componente fluorescente se refiere a un componente que puede absorber luz y después volver a emitir al menos cierta fracción de esa energía como luz a lo largo del tiempo. El término incluye compuestos, moléculas, proteínas naturalmente fluorescentes y complejos macromoleculares diferenciados o mezclas de compuestos o moléculas fluorescentes y no fluorescentes. El término componente fluorescente también incluye componentes que muestran una disminución de la fluorescencia de larga duración, tales como los iones lantánido y los complejos de lantánido con sensibilizadores de ligandos orgánicos, que absorben luz y después vuelven a emitir la energía durante milisegundos.
El término FRET se refiere a la transferencia de energía por resonancia de fluorescencia. Para los fines de esta invención, FRET incluye procesos de transferencia de energía que se producen entre dos componentes fluorescentes, un componente fluorescente y un componente no fluorescente, un componente luminiscente y un componente fluorescente y un componente luminiscente con un componente no fluorescente.
El término deficiencia genética tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a la alteración seleccionada como objetivo de un gen in vivo con pérdida completa de la función que se ha logrado mediante cualquier tecnología transgénica familiar para los expertos en la técnica. En una realización, animales transgénicos que tienen deficiencias genéticas son aquellos en los que el gen objetivo se ha convertido en no funcional mediante una inserción seleccionada como objetivo en el gen para convertirse en no funcional mediante recombinación homóloga.
El término función de Hill se refiere a la función de respuesta sigmoidal (es decir, similar a un escalón)
y(x) = y_{0} + \frac{A}{x''_{0} + x''}
en la que:
y es la variable independiente
y_{0} es un parámetro ajustable igual al límite de la función cuando x \rightarrow \infty
A es un parámetro ajustable igual al tamaño del escalón
x_{0} es un parámetro ajustable relacionado con el punto medio del escalón
n es un parámetro ajustable que describe la pendiente del escalón.
El término coeficiente de Hill se refiere al parámetro n en la función de Hill.
El término éxito se refiere a un compuesto de prueba que muestra las propiedades deseadas en un ensayo.
El término homólogo se refiere a dos secuencias o partes de las mismas, que son idénticas en más del o en igual al 75% cuando se alinean óptimamente utilizando el programa ALIGN. La homología o identidad de secuencia se refiere a lo siguiente. Dos secuencias de aminoácidos son homólogas si hay una identidad parcial o completa entre sus secuencias. Por ejemplo, un 85% de homología significa que el 85% de los aminoácidos son idénticos cuando las dos secuencias se alinean para determinar el emparejamiento máximo. Se permiten huecos (en cualquiera de las dos secuencias que se están emparejando) en la maximización del emparejamiento; se prefieren longitudes de los huecos de 5, siendo más preferido 2 o menos. Alternativa y preferiblemente, dos secuencias de proteínas (o secuencias de polipéptidos derivadas de ellas de al menos 30 aminoácidos de longitud) son homólogas, tal como se utiliza este término en el presente documento, si tienen una puntuación de alineación de más de 5 (en unidades de desviación estándar) utilizando el programa ALIGN con la matriz de fecha de mutación y una penalización de hueco de 6 o superior. Véase Dayhoff, M.O., en Atlas of Protein Sequence and Structure, 1972, volumen 5, National Biomedical Research Foundation, págs. 101-110, y Suplemento 2 a este volumen, págs. 1-10.
El término hiperpolarizar significa hacer que el potencial transmembrana de una célula se aleje adicionalmente de cero. En el caso de células que normalmente tienen potenciales de reposo negativos, este término significa que los cambios del potencial transmembrana van en una dirección negativa.
El término inactivación significa que un canal iónico se mueve hacia el estado inactivado.
El término inactivado se refiere a un canal iónico dependiente de voltaje en un estado conformacional no conductor particular. Las transiciones hacia y desde el estado inactivado generalmente son lentas con respecto a las transiciones entre otros estados conformacionales. El estado inactivado normalmente es el estado preferido a potenciales transmembrana elevados. A potenciales transmembrana bajos, el estado inactivado es inestable y se relaja hacia el estado de reposo.
El término núcleo significa una función matemática pensada para entrelazarse con una o más de otras funciones que varían con el tiempo. En teoría, el núcleo puede ser cualquier función que tienda a cero cuando la variable independiente tiende a \pm \infty. En la práctica, el núcleo puede ser cualquier forma de onda que puede programarse en un generador de función de onda arbitraria, o que puede generarse mediante un convertidor de digital en analógico (D/A) controlado por ordenador.
El término componente luminiscente se refiere a un componente que puede absorber energía, tal como energía eléctrica (por ejemplo, electro-luminiscencia), química (por ejemplo, quimioluminiscencia) o acústica, y después emitir al menos cierta fracción de esa energía como luz a lo largo del tiempo. El término componente incluye compuestos, moléculas, proteínas bioluminiscentes y complejos macromoleculares diferenciados o mezclas de compuestos o moléculas luminiscentes y no luminiscentes que actúan para producir la emisión de luz.
El modulador del potencial transmembrana se refiere a componentes que pueden alterar el potencial transmembrana de reposo o estimulado de un compartimento celular o subcelular. El término incluye compuestos, canales iónicos, receptores, proteínas de formación de poros diferenciados, o cualquier combinación de estos componentes.
El término constante de tiempo de membrana o \tau_{M} significa el producto de la resistencia (R_{M}) y la capacitancia (C_{M}) de la membrana.
El término monofásico se refiere a un impulso cuya polaridad no cambia a la polaridad opuesta.
El término proteína naturalmente fluorescente se refiere a una proteína que puede formar un cromóforo intrínseco, altamente fluorescente, o bien a través de la ciclación y la oxidación de los aminoácidos internos dentro de la proteína o mediante la adición enzimática de un cofactor fluorescente. El término incluye proteínas fluorescentes de tipo natural y mutantes obtenidos mediante ingeniería genética que muestran propiedades físicas o espectrales alteradas. El término no incluye proteínas que muestran fluorescencia débil en virtud de únicamente la contribución de la fluorescencia de grupos de tirosina, triptófano, histidina y fenilalanina no modificados dentro de la proteína.
El término que se produce en la naturaleza se refiere a un componente producido por las células en ausencia de modificaciones genéticas artificiales u otras de estas células.
El término placa de múltiples pocillos se refiere a una matriz bidimensional de pocillos direccionables situados sobre una superficie sustancialmente plana. Las placas de múltiples pocillos pueden comprender cualquier número de pocillos direccionables diferenciados y comprenden pocillos direccionables de cualquier anchura o profundidad. Ejemplos comunes de placas de múltiples pocillos incluyen las placas de 96 pocillos, las placas de 384 pocillos y las Nanoplates™ de 3456 pocillos.
El término operablemente unido se refiere a una yuxtaposición en la que los componentes así descritos están en una relación que les permite funcionar en su manera deseada. Una secuencia control operablemente unida a una secuencia codificante se une de tal manera que la expresión de la secuencia codificante se logra en condiciones compatibles con las secuencias control.
El término célula polarizada significa una célula con una diferencia de potencial eléctrico a través de su membrana celular.
El término rectificación significa que la conductancia es no lineal, con una dirección preferida.
El término liberación de la inactivación se refiere a la conversión de un canal cerrado inactivado, en un canal cerrado en reposo que ahora puede abrirse.
El término repetitivo significa repetir al menos dos veces.
El término repolarizar significa hacer que el potencial transmembrana de una célula se aproxime a su potencial en reposo.
El término en reposo o estado de reposo se refiere a un canal iónico dependiente de voltaje que está cerrado, pero libre de inactivación.
El término potencial en reposo para una célula significa el potencial transmembrana en equilibrio de una célula cuando no se somete a influencias externas.
El término potencial de inversión para un ion particular se refiere al potencial transmembrana para el que los flujos hacia el interior y hacia el exterior de ese ion son iguales.
El término sustancialmente paralelo significa que la distancia entre las superficies de dos objetos que dan la una hacia la otra varía en menos del 10%, preferiblemente en menos del 5%, cuando se mide en cada punto sobre la superficie relevante de cada objeto.
El término que puede seleccionarse como objetivo se refiere a un componente que puede situarse en una ubicación específica en determinadas condiciones. Por ejemplo, una proteína que puede existir en dos o más ubicaciones que puede translocarse a un sitio definido en determinada(s) condición(es) puede seleccionarse como objetivo para ese sitio. Ejemplos comunes incluyen la translocación de la proteína cinasa C a la membrana plasmática con la activación celular y la unión de proteínas que contienen el dominio SH2 a residuos de tirosina fosforilada. El término incluye componentes que están asociados continuadamente con un sitio o ubicación específico, en la mayor parte de las condiciones.
El término potencial de electroporación de umbral se refiere a la intensidad de campo aplicada externamente por encima de la cual se produce la electroporación de una célula viva.
El término compuesto de prueba se refiere a un compuesto químico que va a probarse mediante uno o más méto
do(s) de selección de la invención como un posible modulador. Un compuesto de prueba puede ser cualquier compuesto químico, tal como un compuesto químico inorgánico, un compuesto químico orgánico, una proteína, un péptido, un hidrato de carbono, un lípido, o una combinación de los mismos. Normalmente, se utilizan varias concentraciones predeterminadas de compuestos de prueba para la selección, tales como 0,01 micromolar, 1 micromolar y 10 micromolar. Los controles del compuesto de prueba pueden incluir la medición de una señal en ausencia del compuesto de prueba o la comparación con un compuesto que se sabe que modula el objetivo.
El término transformada se refiere a una célula en la que (o en una antecesora de la cual) se ha introducido, mediante técnicas de ácido nucleico recombinante, una molécula de ácido nucleico heterólogo.
El término transgénico se utiliza para describir un organismo que incluye material genético exógeno dentro de todas sus células. El término incluye cualquier organismo cuyo genoma se ha alterado mediante la manipulación in vitro del embrión temprano o el óvulo fertilizado o mediante cualquier tecnología transgénica para inducir una deficiencia genética específica.
El término transgén se refiere a cualquier trozo de ADN que se inserta mediante artificio en una célula, y que llega a formar parte del genoma del organismo (es decir, o bien integrado establemente o como un elemento extracromosómico estable) que se desarrolla a partir de esa célula. Un transgén de este tipo puede incluir un gen que es parcial o completamente heterólogo (es decir, extraño) para el organismo transgénico, o puede representar un gen homólogo a un gen endógeno del organismo. Dentro de esta definición se incluye un transgén creado al proporcionar una secuencia de ARN que se transcribe en ADN y después se incorpora en el genoma. Los transgenes de la invención incluyen secuencias de ADN que codifican para la proteína fluorescente o bioluminiscente que puede expresarse en un animal transgénico no humano.
El término lógica transistor-transistor o TTL se refiere a un sistema lógico electrónico en el que un voltaje de aproximadamente +5 V es VERDADERO y un voltaje de aproximadamente 0 V es FALSO.
Un campo eléctrico uniforme significa que el campo eléctrico varía en no más del 15% de la intensidad media dentro de la zona de observación en cualquier momento.
El término sensor de voltaje incluye sensores de voltaje basados en FRET, colorantes para el potencial transmembrana electrocrómicos, colorantes para el potencial transmembrana de redistribución, electrodos extracelulares, transistores de efecto campo, iones radiactivos, colorantes fluorescentes o luminiscentes sensibles a iones, y proteínas fluorescentes o luminiscentes sensibles a iones, que pueden proporcionar una indicación del potencial transmembrana.
Los siguientes términos se utilizan para describir las relaciones de secuencia entre dos o más polinucleótidos: secuencia de referencia, intervalo de comparación, identidad de secuencia, porcentaje idéntico a una secuencia e identidad sustancial. Una secuencia de referencia es una secuencia definida utilizada como base para una secuencia de comparación; una secuencia de referencia puede ser un subconjunto de una secuencia mayor, por ejemplo, como un segmento de una secuencia genómica o ADNc de longitud completa, o puede comprender una secuencia genómica o ADNc completo. Generalmente, una secuencia de referencia es de al menos 20 nucleótidos de longitud, frecuentemente de al menos 25 nucleótidos de longitud, y a menudo de al menos 50 nucleótidos de longitud. Dado que los polinucleótidos pueden cada uno (1) comprender una secuencia (es decir, una parte de la secuencia completa de polinucleótidos) que es similar entre los dos polinucleótidos, y (2) pueden comprender adicionalmente una secuencia que es divergente entre los dos polinucleótidos, las comparaciones de secuencias entre dos (o más) polinucleótidos normalmente se llevan a cabo comparando las secuencias de los dos polinucleótidos sobre un intervalo de comparación para identificar y comparar regiones locales de similitud de secuencia. Un intervalo de comparación, tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a un segmento conceptual de al menos 20 posiciones de nucleótidos contiguos en el que una secuencia de polinucleótido puede compararse con una secuencia de referencia de al menos 20 nucleótidos continuos y en el que la parte de la secuencia de polinucleótidos en el intervalo de comparación puede comprender adiciones o deleciones (es decir, huecos) del 20 por ciento o menos, en comparación con la secuencia de referencia (que no comprende adiciones ni deleciones) para la alineación óptima de las dos secuencias. La alineación óptima de las secuencias para alinear un intervalo de comparación puede llevarse a cabo mediante el algoritmo de homología local de Smith y Waterman (1981) Adv. Appl. Math. 2: 482, mediante el algoritmo de alineación por homología de Needleman y Wunsch (1970) J. Mol. Biol. 48: 443, mediante la búsqueda por el método de similitud de Pearson y Lipman (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. (EE.UU.) 85: 2444, mediante las implementaciones por ordenador de estos algoritmos (GAP, BESTFIT, FASTA, y TFASTA en el paquete de software de Wisconsin Genetics Release 7.0, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, WI), o mediante inspección, y se selecciona la mejor alineación (es decir, la que da como resultado el mayor porcentaje de homología sobre el intervalo de comparación) generada por los diversos métodos. El término identidad de secuencia significa que dos secuencias de polinucleótidos son idénticas (es decir, partiendo de la base de nucleótido por nucleótido) sobre el intervalo de comparación. El término porcentaje idéntico a una secuencia se calcula comparando dos secuencias óptimamente alineadas sobre el intervalo de comparación, determinando el número de posiciones en las que se produce la base idéntica de ácido nucleico (por ejemplo, A, T, C, G, U, o I) en ambas secuencias para dar el número de posiciones apareadas, dividiendo el número de posiciones apareadas entre el número total de posiciones en el intervalo de comparación (es decir, el tamaño del intervalo) y multiplicando el resultado por 100 para dar el porcentaje de identidad de secuencia. El término identidad sustancial tal como se utiliza en el presente documento indica una característica de una secuencia de polinucleótido, en la que el polinucleótido comprende una secuencia que tiene al menos el 30 por ciento de identidad de secuencia, preferiblemente al menos del 50 al 60 por ciento de identidad de secuencia, más normalmente al menos el 60 por ciento de identidad de secuencia en comparación con una secuencia de referencia sobre un intervalo de comparación de al menos 20 posiciones de nucleótidos, frecuentemente sobre un intervalo de al menos 25-50 nucleótidos, en la que el porcentaje de identidad de secuencia se calcula comparando la secuencia de referencia con la secuencia del polinucleótido que puede incluir deleciones o adiciones que totalizan el 20 por ciento o menos de la secuencia de referencia sobre el intervalo de comparación.
Dado que se aplica a polipéptidos, el término identidad sustancial significa que dos secuencias peptídicas, cuando se alinean óptimamente, tal como mediante los programas GAP o BESTFIT utilizando pesos de hueco por defecto, comparten al menos el 30 por ciento de identidad de secuencia, preferiblemente al menos el 40 por ciento de identidad de secuencia, más preferiblemente al menos el 50 por ciento de identidad de secuencia, y lo más preferiblemente al menos el 60 por ciento de identidad de secuencia. Preferiblemente, las posiciones de residuos que no son idénticas difieren en sustituciones de aminoácidos conservativas. Las sustituciones de aminoácidos conservativas se refieren a la intercambiabilidad de residuos que tienen cadenas laterales similares. Por ejemplo, un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales alifáticas es glicina, alanina, valina, leucina e isoleucina; un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales alifáticas - hidroxilo es serina y treonina; un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales que contienen amida es asparagina y glutamina; un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales aromáticas es fenilalanina, tirosina y triptófano; un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales básicas es lisina, arginina e histidina; y un grupo de aminoácidos que tiene cadenas laterales que contienen azufre es cisteína y metionina. Grupos preferidos de sustitución de aminoácidos conservativa son: valina-leucina-isoleucina, fenilalanina-tirosina, lisina-arginina, alanina-valina, ácido glutámico-aspártico, y asparagina-glutamina.
Dado que no puede englobarse toda la lista de términos técnicos y científicos, se interpretará que cualquier término no definido tiene el mismo significado que el que comprende comúnmente un experto en la técnica a la que pertenece esta invención. Además, las formas singulares un, una, y el, la, incluyen los referentes plurales, a menos que el contexto indique claramente otra cosa. Por ejemplo, la referencia a una enzima de restricción o una enzima de alta fidelidad puede incluir mezclas de tales enzimas y cualquier otra enzima que se ajuste a los criterios establecidos, o la referencia al método incluye referencia a uno o más métodos para obtener secuencias de ADNc que conocerán los expertos en la técnica o que llegarán a conocer con la lectura de esta memoria descriptiva.
I. Introducción
La presente invención reconoce por primera vez que los potenciales transmembrana de células vivas intactas que comprenden al menos un canal iónico regulado por voltaje, pueden modularse con precisión mediante la aplicación de impulsos de estimulación eléctrica repetitivos al fluido que baña las células. La presente invención incluye instrumentos y métodos que proporcionan modulación exacta y fidedigna de los potenciales transmembrana de células vivas intactas sin perturbar significativamente su integridad celular nativa.
Como introducción no limitativa a la amplitud de la invención, la invención incluye varios aspectos generales y útiles, incluyendo:
1)
Instrumentos que incluyen electrodos, y matrices de electrodos para generar de manera fidedigna campos eléctricos uniformes en cultivos de células vivas en disolución acuosa.
2)
Placas de múltiples pocillos que comprenden electrodos de superficie para alto rendimiento y estimulación miniaturizada y análisis de las actividades celulares y de los canales iónicos.
3)
Sistemas para análisis de alto rendimiento de las actividades celulares y de los canales iónicos y para su uso en el descubrimiento, análisis, selección y obtención del perfil del fármaco.
4)
Métodos para modular el potencial transmembrana de una célula viva mediante el uso de estimulación eléctrica repetitiva.
5)
Métodos para seleccionar los efectos de los compuestos de prueba sobre las actividades de voltaje reguladas y los canales iónicos regulados sin voltaje, los transportadores y las corrientes de fuga. Incluyendo determinar la actividad farmacológica dependiente del estado de los compuestos contra el canal iónico y las proteínas transportadoras.
6)
Métodos para obtener el perfil y seleccionar células o clones basándose en su respuesta a la estimulación eléctrica.
7)
Métodos para la determinación cuantitativa de parámetros celulares y de canal iónico de una manera en alto rendimiento, y para la cuantificación de los efectos farmacológicos de los compuestos sobre esos parámetros.
8)
Métodos para la introducción de compuestos exógenos en los espacios intracelulares de las células.
9)
Métodos para modular el potencial transmembrana de los orgánulos intracelulares y para seleccionar compuestos de prueba contra los canales iónicos en estos orgánulos.
10)
Métodos para caracterizar el efecto fisiológico del potencial transmembrana sobre la función y la regulación de las respuestas fisiológicas y bioquímicas, incluyendo la expresión génica, la función enzimática, la actividad proteica y la unión de ligandos.
11)
Métodos para programar o formar redes neuronales adaptativas o bio-ordenadores para respuestas funcionales o lógicas específicas.
12)
Métodos para proporcionar interfaces neuronales eficaces para dispositivos protésicos implantados en un animal, incluyendo un ser humano.
Estos aspectos de la invención y otros descritos en el presente documento, pueden lograrse mediante el uso de los métodos y los instrumentos descritos en el presente documento. Para obtener una apreciación total del alcance de la invención, se reconocerá además que pueden combinarse varios aspectos de la invención para obtener las realizaciones deseables de la invención. Tales combinaciones dan como resultado las realizaciones particularmente útiles y sólidas de la invención.
II. Electrodos y matrices de electrodos
En una realización, la presente invención incluye electrodos y matrices de electrodos, para crear campos eléctricos a través de la zona de observación. Normalmente, esto se logra mediante el uso de un par de electrodos eléctricamente conductores. Una importante característica de diseño es que los pares de electrodos crean campos eléctricos bien definidos. Diseños de electrodos preferidos incluyen configuraciones de electrodo que maximizan la homogeneidad del campo eléctrico experimentada por las células en observación.
Generar campos eléctricos uniformes sobre la zona de observación es importante para la estimulación eléctrica por varios motivos. En primer lugar, dado que la respuesta celular es sensible a la magnitud del campo eléctrico local, los campos eléctricos no uniformes normalmente producen respuestas no uniformes en diferentes zonas, lo que conduce a un aumento de la dispersión en los resultados. En segundo lugar, el umbral para la electropermeabilización normalmente sólo es un factor de 2-5 mayor que los potenciales transmembrana requeridos para la estimulación eléctrica de la membrana (véase Teissie y Rols, 1993, Biophys. J. 65: 409-413). Por tanto, si el campo eléctrico es demasiado no uniforme, puede que no sea posible estimular todas las células en la zona de observación sin electropermeabilizar también algunas de ellas.
La uniformidad del campo sobre una zona fijada puede describirse de dos formas: (1) la desviación estándar de la magnitud del campo dividida por la magnitud del campo promedio en la zona, y (2) la diferencia entre las magnitudes de campo mayor e inferior, normalizada para la magnitud de campo promedio en la zona.
a) Diseño de electrodos
La forma más simple de generar un campo eléctrico uniforme en un medio conductor es utilizar dos electrodos planos idénticos con superficies que están alineadas de manera sustancialmente paralela entre sí. Generalmente, cuanto más próximos están los electrodos entre sí con respecto a su anchura en la dirección transversal, mayor será la uniformidad del campo. Sin embargo, los típicos pocillos redondos de la placa de múltiples pocillos limitan la anchura de los electrodos que pueden insertarse en los pocillos y también introducen otros efectos que reducen la uniformidad del campo.
La redondez de los pocillos supone un reto a la hora de crear un campo uniforme señalando en una dirección con dos electrodos que la anchura de la solución salina conductora entre los electrodos está cambiando constantemente. Adicionalmente, la alta tensión superficial del agua genera variaciones en la altura de la solución salina a través del pocillo cuando se insertan electrodos más profundos. La superficie curvada, o menisco, puede alterar el campo eléctrico en la totalidad del volumen del pocillo. La profundidad de 100 \muL de solución salina en una placa de 96 pocillos normalmente es de aproximadamente 3,0 mm de profundidad en el centro y de aproximadamente 2,9 mm de profundidad en los bordes del pocillo. Cuando se insertan dos electrodos de placas paralelas de acero inoxidable, la solución salina se acerca entre los electrodos y las paredes del pocillo, produciendo variaciones de profundidad sobre la zona de observación, lo que sugiere que las trayectorias de corriente en la totalidad del volumen de la solución salina se curvan alrededor del centro, generando una no uniformidad del campo eléctrico.
En un aspecto, la presente invención incluye diseños de electrodo mejorados y sistemas para la estimulación eléctrica que dirigen estos puntos para crear campos eléctricos sustancialmente uniformes sobre la zona de obser-
vación.
En una realización, (figura 9A) el par de electrodos comprende dos electrodos sustancialmente paralelos que comprenden un aislante eléctrico que se une al par de electrodos para limitar el flujo de corriente a una región definida creando así un campo eléctrico altamente uniforme.
En otra realización, (figura 9B) el par de electrodos comprende adicionalmente electrodos satélite para crear un campo eléctrico más uniforme.
En otra realización, (figura 9D) el par de electrodos se subdivide en varias piezas separadas mediante finos divisores aislantes. En este caso, el potencial aplicado a cada electrodo, expresado como una fracción del potencial aplicado a la pieza más central, puede sintonizarse individualmente para maximizar la uniformidad de campo en la zona de observación.
En otro aspecto, la presente invención incluye diseños de electrodo mejorados (figura 9C) que muestran uniformidad de campo mejorada sobre la zona de observación mediante la eliminación o reducción del efecto de menisco.
En otro aspecto, pueden fabricarse múltiples sensores de potencial eléctrico en la superficie o las paredes de los pacillos en una placa de múltiples pocillos, o unirse en matrices al montaje de electrodo de inmersión. Estos sensores pueden monitorizarse para ajustar manual o automáticamente los electrodos individuales, de manera que se maximice la uniformidad del campo. Esta disposición será útil para permitir una estimulación de la matriz de electrodos para compensar las variaciones e imperfecciones en la forma del pocillo, el volumen de solución salina, las variaciones en el proceso de fabricación para los electrodos, el daño al montaje de electrodos, etc.
b) Colocación de los electrodos dentro de los pocillos
Para los electrodos de inmersión, la situación ideal (en lo que se refiere a la creación de un campo eléctrico uniforme) sería tener los fondos de los electrodos tocando el fondo del pocillo. De esta forma, no habrá campos marginales o no uniformidad de campo asociados con trayectorias de corriente verticales. Sin embargo, para una estructura desmontable, no es deseable requerir que los electrodos hagan contacto con la superficie. Pequeñas desviaciones en la geometría de la placa pueden hacer que algunos electrodos se presionen hacia la superficie, produciendo daño a la placa, las células, o los electrodos. Adicionalmente, en algunos pocillos, los electrodos pueden no extenderse en toda la trayectoria hasta la superficie. Por estos motivos, puede ser deseable diseñar un hueco pequeño entre el fondo del electrodo y el fondo del pocillo.
En consecuencia, en un aspecto, la presente invención incluye placas de múltiples pocillos en los que la zona de observación en el medio del pocillo está elevada con respecto a una zona alrededor de la circunferencia del pocillo, en la que se colocarían los electrodos.
Los campos marginales producirán la no uniformidad sobre una distancia entre electrodos aproximadamente igual al hueco entre el fondo del electrodo y el fondo del pocillo. Por tanto, este hueco debe mantenerse tan pequeño como sea práctico, preferiblemente en el intervalo de 0,1 a 0,5 mm y la zona de observación normalmente no debe incluir ninguna parte del pocillo dentro de esta distancia desde los electrodos.
c) Fabricación de los electrodos
Puede utilizarse cualquier material eléctricamente conductor como un electrodo. Los materiales de electrodo preferidos tienen muchas de las siguientes propiedades, (1) no se corroen en solución salina, (2) no producen ni liberan iones tóxicos, (3) son flexibles y resistentes, (4) son relativamente baratos de fabricar, (5) son no porosos, y (6) se limpian fácilmente. Los materiales preferidos incluyen metales nobles (incluyendo, oro, platino y paladio), metales refractarios (incluyendo titanio, tungsteno, molibdeno e iridio), aleaciones resistentes a la corrosión (incluyendo acero inoxidable) y carbono u otros conductores orgánicos (incluyendo grafito y polipirrol). Para muchas realizaciones, el acero inoxidable proporciona un material de electrodo preferido. Este material es barato, fácil de trabajar y muy inerte en solución salina. El acero inoxidable se oxida lentamente para producir óxido de hierro cuando pasa corriente en la solución salina, pero esto no parece afectar al rendimiento del sistema. El óxido de hierro tiene una solubilidad muy baja en agua y no parecen liberarse niveles tóxicos de hierro. Adicionalmente, cualquier depósito de óxido de hierro puede eliminarse fácilmente sumergiendo los electrodos en ácido nítrico al 10% en agua durante dos horas, y después enjuagando completamente con agua destilada.
Pueden utilizarse electrodos sólidos de cobre y plata para algunas aplicaciones, pero se prefieren menos para su uso habitual porque se corroen rápidamente en solución salina. Los electrodos de cobre chapados en oro son relativamente inertes, pero parecen perder parte de su chapado en oro durante la estimulación eléctrica prolongada.
Los productos de la electrolisis pueden contenerse o eliminarse recubriendo las superficies de los electrodos con recubrimientos protectores, tales como gelatina, poliacrilamida, o geles de agarosa. Otro material de electrodo potencialmente útil es una semicelda electroquímica, tal como un electrodo de plata/cloruro de plata.
d) Matrices de electrodos
Los electrodos de inmersión normalmente consisten en uno o más pares de electrodos que se disponen en una matriz que puede moverse de manera retráctil hacia dentro y hacia fuera de, uno o más pocillos de una placa de múltiples pocillos. Los electrodos de inmersión pueden orientarse en matrices que se adaptan al formato y la densidad de la placa, pero pueden estar en matrices de cualquier configuración u orientación. Por ejemplo, para una placa de 96 pocillos convencional, son posibles varias configuraciones de electrodo, incluyendo las disposiciones de matriz de electrodos para excitar selectivamente una o más columnas, o filas, simultáneamente.
Un ejemplo de una realización de una matriz de electrodos de este tipo se muestra en la figura 1. En este ejemplo, se da formato a una matriz de 12 por 8 de pares de electrodos, de manera que ajuste en una placa de múltiples pocillos de 96 pocillos convencional. En este caso, los electrodos (10) son aproximadamente de 4 mm de ancho, de 1 cm de largo y de 0,2 mm de espesor, y se extienden desde un peine conductor (50) que está conectado a través de un conmutador a un lado de la fase exterior de un generador de función de alta potencia. Los electrodos se montan paralelos entre sí, con una separación de 4 mm, con un espaciador (20) de nylon no conductor en el centro. En este caso, el conmutador (330) permite que una columna de la placa de 96 pocillos se estimule selectivamente de una vez; sin embargo cualquier combinación temporal o espacial de protocolos de estimulación es potencialmente posible, dada la configuración apropiada de conmutación, cableado y generador de función de potencia.
La totalidad de la matriz de electrodos se mantiene en el registro correcto mediante un elemento rígido no conductor (30) que mantiene cada par de electrodos separado correctamente para adaptarse con exactitud a una distribución de placa de 96 pocillos convencional. El elemento no conductor (30) hace que los electrodos se muevan hacia arriba o hacia abajo mientras se mantiene con precisión su registro con la placa de múltiples pocillos.
Para proporcionar el registro correcto de la matriz de electrodos con una placa de múltiples pocillos, el montaje de electrodos puede comprender opcionalmente un borde externo o saliente (40) que puede adaptarse a una placa de 96 pocillos convencional, y permite el registro exacto de la placa. En algunas realizaciones, el borde (40) puede incluir además una muesca o indentación de registro (80) para proporcionar el registro no ambiguo de la placa.
En una realización preferida (también mostrada en la figura 1A) la matriz de electrodos comprende además medios para insertar de manera retráctil la matriz de electrodos en los pocillos de la placa de múltiples pocillos. En una realización de esta configuración, la matriz de electrodos comprende además un elemento de soporte móvil superior (90) al que se unen los electrodos (10). El elemento de soporte móvil (90) puede moverse hacia arriba o hacia abajo con respecto a al elemento no conductor (30) deslizándose sobre cuatro pasadores de alineación (70). Existe un muelle no mostrado en estas figuras que permite que la capa de soporte móvil (90) vuelva automáticamente a la posición superior cuando ya no se aplica la fuerza hacia abajo. Un espaciador (60) proporciona la capacidad de bloquear la capa de soporte móvil (90) y los electrodos (10) en la orientación completamente inferior. Este dispositivo permite que se utilice la estimulación eléctrica en modos de selección manuales y/o robóticos.
III. Placas de múltiples pocillos para estimulación eléctrica
Las placas de múltiples pocillos de la presente invención están diseñadas principalmente para proporcionar la estimulación eléctrica eficaz de las células, mientras que al mismo tiempo permiten el análisis óptico de los cambios del potencial transmembrana. Para llevar a cabo esto, los electrodos de superficie conductores pueden orientarse en o sobre las paredes, las partes inferiores o las tapas de la placa de múltiples pocillos.
En general, tales placas de múltiples pocillos pueden tener una huella de cualquier forma o tamaño, tal como cuadrada, rectangular, circular, alargada, triangular, de riñón, u otra forma geométrica o no geométrica. La huella puede tener una forma que sea sustancialmente similar a la huella de las placas de múltiples pocillos existentes, tales como la placa de microtítulo de 96 pocillos convencional, cuya huella es de aproximadamente 85,5 mm de anchura por 127,75 mm de longitud, u otros tamaños que representen un patrón industrial actual o futuro (véase T. Astle, Standards in Robotics and Instrumentation, J. of Biomolecular Screening, Vol. 1 páginas 163-168, 1996). Las placas de múltiples pocillos de la presente invención que tienen esta huella pueden ser compatibles con la robótica e instrumentos, tales como lectores y translocadores de placa de múltiples pocillos, tal como se conocen en la técnica.
Normalmente, los pocillos se dispondrán en matrices lineales bidimensionales sobre la placa de múltiples pocillos. Sin embargo, los pocillos pueden proporcionarse en cualquier tipo de matriz, tal como en matrices geométricas o no geométricas. La placa de múltiples pocillos puede comprender cualquier número de pocillos. También pueden adaptarse fácilmente números mayores de pocillos o una densidad de pocillos aumentada utilizando los métodos de la invención reivindicada. Números de pocillos comúnmente utilizados incluyen 6, 12, 96, 384, 1536, 3456 y 9600.
Los volúmenes de pocillos normalmente pueden variar dependiendo de la profundidad y el área en corte transversal del pocillo. Preferiblemente, el volumen del pocillo es de entre aproximadamente 0,1 microlitros y 500 microlitros.
Los pocillos pueden realizarse de cualquier forma en corte transversal (en una vista en planta) incluyendo, cuadrada, redonda, hexagonal, otras formas geométricas o no geométricas y combinaciones (intra-pocillo e inter-pocillo) de las mismas. Se prefieren los pocillos cuadrados o redondos, con fondos planos.
Las paredes pueden estar achaflanadas (por ejemplo, que tienen un ángulo de diseño). Preferiblemente, el ángulo es de entre aproximadamente 1 y 10 grados, más preferiblemente de entre aproximadamente 2 y 8 grados, y lo más preferible de entre aproximadamente 3 y 5 grados.
Los pocillos pueden colocarse en una configuración de manera que la distancia de centro del pocillo a centro del pocillo pueda ser de entre aproximadamente 0,5 milímetros y aproximadamente 100 milímetros. Los pocillos pueden colocarse en cualquier configuración, tal como una matriz lineal-lineal, o en patrones geométricos, tales como patrones hexagonales. La distancia de pocillo a pocillo puede ser de aproximadamente 9 mm para una placa de 96 pocillos. Se prefieren distancias de centro de pocillo a centro de pocillo menores para los volúmenes más pequeños.
Los pocillos pueden tener una profundidad de entre aproximadamente 0,5 y 100 milímetros. Preferiblemente, la profundidad del pocillo es entre aproximadamente 1 milímetro y 100 milímetros, más preferiblemente de entre aproximadamente 2 milímetros y 50 milímetros, y lo más preferiblemente de entre aproximadamente 3 milímetros y 20 milímetros.
Los pocillos pueden tener un diámetro (cuando los pocillos son circulares) o una distancia diagonal máxima (cuando los pocillos no son circulares) de entre aproximadamente 0,2 y 100 milímetros. Preferiblemente, el diámetro del pocillo es de entre aproximadamente 0,5 y 100 milímetros, más preferiblemente de entre aproximadamente 1 y 50 milímetros, y lo más preferiblemente, de entre aproximadamente 2 y 20 milímetros.
La placa de múltiples pocillos, estará compuesta generalmente de material eléctricamente no conductor y puede comprender un material ópticamente opaco que puede interferir con la transmisión de radiación, tal como la luz, a través de la pared de un pocillo o del fondo de un pocillo. Tales materiales ópticamente opacos pueden reducir el ruido de fondo asociado con los métodos de detección óptica. Los materiales ópticamente opacos pueden ser cualquiera de los conocidos en la técnica o que se desarrollen posteriormente, tales como colorantes, pigmentos o negro de carbón. El material ópticamente opaco puede evitar que la radiación pase de un pocillo a otro, para evitar la interferencia cruzada entre pocillos, de manera que se aumente la sensibilidad y la exactitud del ensayo. El material ópticamente opaco también puede ser reflectante, tal como los conocidos en la técnica, tal como capas metálicas delgadas, revestimientos reflectantes, o pulido reflectante. Los materiales ópticamente opacos pueden revestirse sobre cualquier superficie de la placa de múltiples pocillos, o puede ser una parte integrada de la placa o el fondo cuando se fabrican. El material ópticamente opaco puede evitar la transmitancia de entre aproximadamente el 100% a aproximadamente el 50% de la luz incidente, preferiblemente de entre aproximadamente el 80% y superior al 95%, más preferiblemente superior al 99%.
Dado que la mayor parte de las mediciones normalmente no requerirán que la luz pase a través de la pared del pocillo, los materiales tales como polímeros pueden incluir pigmentos para oscurecer bien las paredes o absorber la luz. Tal aplicación de pigmentos ayudará a reducir la fluorescencia de fondo. Los pigmentos pueden introducirse mediante cualquier medio conocido en la técnica, tal como revestir o mezclar durante la fabricación del material o la placa de múltiples pocillos. La selección de pigmentos puede basarse en una mezcla de pigmentos para humedecer todo el fondo inherente al polímero, o un único pigmento o conjunto de pigmentos seleccionados para filtrar o absorber la luz a longitudes de onda deseadas. Los pigmentos pueden incluir negro de carbón.
Los electrodos de superficie pueden incluirse o, en cualquier caso, unirse a la pared en una variedad de formatos y disposiciones, por ejemplo como varias bandas de electrodos verticales y estrechas. Mediante la sintonización apropiada de los potenciales relativos de cada banda, pueden generarse campos eléctricos en la zona de observación. Además, utilizando un inserto circular, o mediante la inclusión de electrodos de banda vertical alrededor del pocillo, pueden generarse campos eléctricos uniformes en cualquier dirección a través del pocillo. También sería posible crear un campo uniforme en una dirección, seguido por un campo uniforme en otra dirección. Esto podría ser útil para tipos celulares cuyas características eléctricas son anisotrópicas, tales como células neuronales o musculares, o para tipos celulares con razones de aspecto grandes.
Cada pocillo también comprende un fondo que tiene una alta parte de transmitancia y que tiene menos fluorescencia que un fondo de poliestireno de al menos aproximadamente el 90 por ciento de dicho espesor del fondo. Esta propiedad puede determinarse comparando la fluorescencia de un material de fondo de control apropiado con la fluorescencia de un material de prueba. Estos procedimientos pueden llevarse a cabo utilizando métodos bien conocidos. Preferiblemente, el fondo es una placa o película, ya que estos términos son conocidos en la técnica. El espesor del fondo puede variar dependiendo de las propiedades globales requeridas del fondo de la placa que pueden dictarse por una aplicación particular. Tales propiedades incluyen la cantidad de fluorescencia intrínseca, rigidez, resistencia a la rotura y necesidades de fabricación en relación con el material utilizado en la placa. Las capas de fondo de los pocillos normalmente tienen un espesor de entre aproximadamente 10 micrometros y aproximadamente 1000 micrometros. Preferiblemente, el fondo del pocillo tiene un espesor de entre aproximadamente 10 micrometros y 450 micrometros, más preferiblemente de entre aproximadamente 15 micrometros y 300 micrometros, y lo más preferiblemente de entre aproximadamente 20 micrometros y 100 micrometros.
El fondo de un pocillo puede tener una parte de alta transmitancia, lo que normalmente significa que o bien todo o una parte del fondo de un pocillo puede transmitir luz. El fondo puede tener una parte ópticamente opaca y una parte de alta transmitancia de cualquier forma, tal como circular, cuadrada, rectangular, forma de riñón, poligonal, u otra forma geométrica o no geométrica o combinaciones de las mismas.
Preferiblemente, el fondo de la placa de múltiples pocillos puede ser sustancialmente plana, por ejemplo, que tiene una textura de superficie de entre aproximadamente 0,001 mm y 2 mm, preferiblemente de entre aproximadamente 0,01 mm y 0,1 mm (véase, Surface Roughness, Waviness y Lay, Am. Soc. of Mech. Eng. Nº ANSI ASME B46.1-2985 (1986)). Si el fondo no es sustancialmente plano, entonces la calidad óptica del fondo y los pocillos puede disminuir debido a las propiedades ópticas y físicas alteradas de uno o ambos.
Para realizaciones de electrodo de superficie, el fondo comprenderá preferiblemente bandas de material eléctricamente conductor o revestimientos que solapan el borde de los pocillos de la placa de múltiples pocillos y están en contacto eléctrico con el contenido de los pocillos. Las bandas eléctricamente conductoras normalmente terminarán en conectores eléctricos para permitir la fácil unión a la fase de salida de un generador de función de alta potencia, tal como se describió anteriormente. Las bandas eléctricamente conductoras deben tener una resistencia suficientemente baja de manera que puedan llevar las corrientes de estimulación sin pérdida excesiva en el voltaje en su longitud. La resistencia del extremo del conector al extremo del pocillo más alejado debe ser inferior a 10 \Omega, y más preferiblemente inferior a 1 \Omega, y todavía más preferiblemente inferior a 0,1 \Omega. El área en corte transversal de las bandas eléctricamente conductoras debe ser lo suficientemente grande como para conseguir el requisito de resistencia. Para los conductores eléctricos comúnmente empleados, esta área en corte transversal debe ser de al menos 10^{-4} mm^{2}, y más preferible de al menos 10^{-3} mm^{2}.
En la práctica, podría utilizarse cualquier material conductor siempre que esté cubierto con un material conductor que sea inerte en solución salina. Tales materiales incluyen los metales nobles (incluyendo oro, platino y paladio) y los metales refractarios (incluyendo cromo, molibdeno, iridio, tungsteno, tantalo y titanio) así como aleaciones de los mismos. Los materiales preferidos para el material conductor para electrodos de superficie incluyen combinaciones de cromo, cobre, oro y óxido de indio - estaño que pueden incluirse o electrodepositarse fácilmente en o sobre la capa de fondo transparente. Los productos de electrolisis pueden contenerse o eliminarse mediante el revestimiento de las superficies de los electrodos con revestimientos protectores, tales como geles de agarosa, poliacrilamida o gelatina.
Otro material de electrodo potencialmente útil es una semicélula electroquímica, tal como un electrodo de plata/cloruro de plata.
Pueden introducirse modificaciones de superficie o revestimientos de material eléctricamente conductor en el fondo utilizando cualquier método adecuado conocido en la técnica, incluyendo deposición en vacío, electrodeposición, impresión, pulverización, energía radiante, técnicas de ionización o inmersión. También pueden introducirse modificaciones de superficie mediante la derivatización apropiada de un polímero u otro material, tal como vidrio o cuarzo, antes, durante o después de que se fabrique la placa de múltiples pocillos e incluyendo un polímero derivatizado apropiado u otro material en la capa de fondo. El polímero derivatizado u otro material puede hacerse reaccionar entonces con un resto químico que se utiliza en una aplicación de la placa. Antes de la reacción con un resto químico, tal polímero u otro material puede proporcionar sitios de unión covalente o no covalente en el polímero u otro material. Tales sitios en o sobre la superficie del polímero u otro material pueden utilizarse para unir capas conductoras a las placas. Ejemplos de polímeros derivatizados u otros materiales incluyen los descritos por la patente de los EE.UU. 5.583.211 (Coassin et al.) y otros conocidos en la técnica o que se desarrollen posteriormente.
Materiales y fabricación
Los materiales para la fabricación de la placa de múltiples pocillos normalmente serán poliméricos, puesto que estos materiales conducen a sí mismos a técnicas de fabricación en masa. Sin embargo, pueden utilizarse otros materiales para obtener el fondo de la placa de múltiples pocillos, tal como vidrio o cuarzo. El fondo puede estar hecho del mismo o diferente material y el fondo puede comprenden poliestireno u otro material. Preferiblemente, los polímeros se seleccionan para que tengan fluorescencia baja y/o transmitancia alta. Los materiales poliméricos pueden facilitar particularmente la fabricación de placas mediante métodos de moldeo conocidos en la técnica y desarrollados en el futuro, tales como moldeo por inyección o inserto.
La placa de múltiples pocillos de la presente invención puede obtenerse de una o más piezas. Por ejemplo, la placa y el fondo pueden obtenerse como una pieza diferenciada. Alternativamente, la placa puede ser una pieza diferenciada, y el fondo puede ser una segunda pieza diferenciada, que se combinan para formar una placa de múltiples pocillos. En este caso, la placa y el fondo pueden unirse entre sí mediante medios de sellado, tales como adhesivos, soldadura sónica, soldadura térmica, fusión, moldeo por inyección de inserto u otros medios conocidos en la técnica o que se desarrollen posteriormente. La placa y el fondo pueden obtenerse del mismo o de diferentes materiales. Por ejemplo, la placa puede obtenerse de un polímero, y el fondo obtenerse de poliestireno, cicloolefina, Aclar, vidrio o
cuarzo.
Son viables los diseños de electrodo de superficie miniaturizados en los formatos de placa convencionales (96, 384, 1536) así como en 3456 y densidades de placa superiores. El rendimiento de tales sistemas es extremadamente alto de manera potencial. Por ejemplo, suponiendo que 3456 pocillos por placa seleccionados a 30 placas por hora corresponde a un rendimiento global de aproximadamente 800.000 pocillos por día de ocho oras, que es aproximadamente 8 veces más rápido de lo que está disponible en la actualidad, suponiendo tiempos de lectura de placa iguales.
Un ejemplo de una realización de placa de múltiples pocillos con electrodos de superficie se muestra en la figura 2A. En este ejemplo, pares de bandas conductoras (200) están unidas en paralelo a una capa de fondo ópticamente transparente (210) tal como vidrio o plástico, tal como COC (véase la patente de los EE.UU. número 5.910.287, concedida el 8 de junio 1999) en un formato de placa de 96 pocillos. En este ejemplo, las bandas de material conductor (200) son aproximadamente de 2 mm de ancho, 10 \mum de espesor y están separadas en una distancia de aproximadamente 4 mm para permitir el análisis óptico de las células ubicadas en los pocillos (220), entre los electrodos a través de la capa de fondo ópticamente transparente (210). En otras realizaciones las bandas de material conductor pueden comprender cables de acero inoxidable (desde aproximadamente 0,001 hasta aproximadamente 0,010 de diámetro). La capa de fondo ópticamente transparente (210) se une a una matriz de placa de múltiples pocillos de 96 pocillos (230) y sustituye al fondo de placa normal. Las bandas de material eléctricamente conductor (200) solapan el borde de los pocillos (220) de la placa de múltiples pocillos de 96 pocillos y están en contacto eléctrico con el contenido de los pocillos. Las bandas eléctricamente conductoras (200) terminan en contacto eléctrico (240) para permitir la fácil unión a la fase de salida de un generador de función de alta potencia, tal como se describió anteriormente. En este ejemplo, hay dos contactos de electrodo por columna de ocho pocillos en el primer pocillo de la columna. Esto permite el uso de distribuciones convencionales de placa de 96 pocillos, para un manejo más simple durante el cultivo celular. No se introducen células ni solución salina en estos pocillos. Este diseño permite la estimulación simultánea de siete pocillos en una única columna. Durante el ensayo, el operario o un robot unirán temporalmente cables a los contactos, por ejemplo, con electrodos de prueba de pasador.
Otra realización de una placa de múltiples pocillos con electrodos de superficie se muestra en la figura 2B. En esta realización, la capa de fondo transparente (210) se extiende más allá del borde de la placa de múltiples pocillos (230). En esta configuración, todos los pocillos siguen estando disponibles para su uso con células y compuestos. Además, se simplifica la unión de cableado externo a los contactos (240). Pueden utilizarse contactos de pasador, conectores de borde de placa de circuito, o zócalos de fuerza de inserción cero para efectuar el contacto con los electrodos. La capa de fondo extendida (210) puede hacer que las placas sean menos convenientes para manipularse durante el uso habitual. Esto puede remediarse llevando trazas de electrodo (200) al lado inverso de la capa de fondo (210) durante el proceso de fabricación. Esto puede llevarse a cabo mediante varios métodos. Por ejemplo, utilizando el procesamiento bilateral de las placas para crear zonas de contacto, pueden obtenerse agujeros pasantes y someterse a electrodeposición, o pueden envolverse trazas de conducción alrededor del borde de la capa de fondo. Como otro ejemplo, la capa de fondo puede obtenerse de un material aislante flexible. Entonces tras obtener la estructura tal como se muestra en la figura 2B, la parte de la capa de fondo que sobresale del borde de la placa puede doblarse y unirse al lado inferior de la placa.
Otra realización de una placa de múltiples pocillos con electrodos de superficie se muestra en la figura 2C. En esta realización, los electrodos (200) están unidos a los adaptadores de contacto (240) con estrechos cables (205). Esto permite el uso de distribuciones convencionales de placa de 96 pocillos, para un manejo más simple durante el cultivo celular. En esta realización, todos los electrodos de una polaridad se acortan a la vez. La selección de una única columna se lleva a cabo mediante el suministro de impulso de corriente a sólo un electrodo de la otra polaridad. En esta realización, no se colocan células, ni solución salina, ni compuestos en la columna final en la que están los adaptadores de contacto. Durante el ensayo, el operario o un robot unirán temporalmente los cables a los contactos, por ejemplo con electrodos de prueba de pasador.
Otra realización de una placa de múltiples pocillos con electrodos de superficie se muestra en la figura 2D. En esta realización, los electrodos (200) se alinean paralelos a la dimensión más larga de la placa de 96 pocillos. Este diseño es esencialmente similar al diseño mostrado en la figura 2A, con la excepción de once pocillos en una fila que se estimularán simultáneamente.
Materiales preferidos para el material conductor para los electrodos de superficie incluyen combinaciones de cromo, cobre, oro y óxido de indio - estaño que pueden incluirse, unirse o electrodepositarse fácilmente en o sobre la capa de fondo transparente. En la práctica, podría utilizarse cualquier material conductor siempre que esté cubierto con un material conductor que sea inerte en solución salina. Tales materiales inertes incluyen los metales nobles (incluyendo oro, platino, y paladio), los metales refractarios (incluyendo cromo, molibdeno, iridio, tungsteno, tantalo y titanio), aleaciones resistentes a la corrosión (incluyendo acero inoxidable), y carbono u otros conductores orgánicos (incluyendo grafito y polipirrol) así como combinaciones o aleaciones de estos materiales.
IV. Sistemas para la estimulación eléctrica y la medición espectroscópica
La presente invención incluye sistemas para la estimulación eléctrica y la medición espectroscópica automatizadas, que comprende: al menos un montaje de electrodo, un medio para la estimulación eléctrica, un detector óptico, y medios de control por ordenador para coordinar la generación de los estímulos eléctricos, la recogida de datos y el movimiento de placas de múltiples pocillos. El sistema puede comprender además medios para la adición de fluido. En un aspecto, estos sistemas están diseñados para modular, caracterizar y someter a ensayo la actividad de los canales iónicos, transportadores, corrientes de fuga presentes en o sobre las superficies de células vivas, y para la selección rápida de los efectos de los compuestos de prueba sobre los efectos de las actividades celulares o de canal. La presente invención también se refiere a entidades químicas e información (por ejemplo, moduladores o actividades químicas o biológicas de los productos químicos) generada o descubierta por el funcionamiento de las estaciones de trabajo de la presente invención.
La figura 3 muestra un diagrama de bloques de los principales componentes eléctricos y ópticos para una realización de un sistema para la estimulación eléctrica y la medición espectroscópica automatizadas. En este ejemplo se utilizó una matriz de electrodos de inmersión de placa de múltiples pocillos de 96 pocillos (figura 1) para la estimulación eléctrica. Además de la matriz de electrodos del estimulador, el sistema tiene varios componentes eléctricos, ópticos y mecánicos adicionales, tal como se describe en detalle en la solicitud de patente de los EE.UU. de titularidad común número 09/118,728, presentada el 24 de julio de 1998.
En esta realización, se utiliza una tarjeta de entrada/salida digital PC-DIO 24 de National Instruments (Austin, TX) dentro del ordenador (300) para establecer el canal apropiado en un conmutador de 1 a 12 (330) (ER-16 de National Instruments). El ordenador que controla el lector de placa fluorescente (300) también emite una señal TTL para desencadenar los generadores de funciones (310) cuando el estímulo está programado para comenzar. Las señales de estímulo se generan mediante dos generadores de forma de onda arbitraria (310). Los generadores de funciones son Tektronix (Beaverton, OR) número de modelo AFG310. El primero desencadena una serie de impulsos TTL al segundo que está programado con la forma de onda de estímulo individual. Pueden generarse trenes de formas de onda más complejos mediante la conexión de generadores de formas de onda múltiples en serie y/o en paralelo. Estos generadores de formas de ondas se desencadenarían mediante el impulso de TTL generado por ordenador o entre sí. Alternativamente, podría utilizarse un convertidor de A/D o una tarjeta de sonido dentro del ordenador para generar un tren de estímulos. En este caso, podría utilizarse un software comercialmente disponible o a la medida para programar el tren de formas de onda, o para cambiar la forma de onda durante el tren.
El tren de estímulos se envía a través de un amplificador de alta potencia (320), a través del conmutador (330), y hacia el cabezal del estimulador (370). En este caso, el amplificador se construyó utilizando el chip APEX PA93 (Apex Microtechnology Corp, Tucson, AZ) siguiendo un circuito proporcionado por el fabricante. Los amplificadores preferidos para la presente solicitud normalmente cumplirían, o rebasarían las siguientes especificaciones: \pm 100 V de CC (corriente continua) en, 100 G\Omega de impedancia de entrada, 20X de ganancia de voltaje, \pm 90 V de salida, \pm 3 A de salida, 10 \Omega de impedancia de salida.
La mayor parte de la corriente pasa a través de la solución salina entre los electrodos, normalmente en una única columna de ocho pocillos de la placa de microtítulo (350) a la vez. La luz de excitación a 400 \pm 7,5 nm ilumina las células teñidas desde abajo, y la luz fluorescente emitida se mide en dos longitudes de onda mediante el módulo de detector (340) azul a 460 +/- 20 nm y naranja a 580 +/- 30 nm; (véase González et al., Drug Discovery Today 4: 431-439, 1999). Una vez que se ha estimulado una columna de células, el ordenador (300) desencadena el motor (360) para que mueva la placa de múltiples pocillos (350) hasta una nueva posición lista para la siguiente
estimulación.
Para una placa de múltiples pocillos de 96 pocillos típica, los electrodos tienen 4 mm de ancho con una separación (g) de 4 mm. La estimulación se lleva a cabo normalmente en un volumen de 100 \muL de solución salina fisiológica en el pocillo. Con este volumen de solución salina, la profundidad es de un promedio de aproximadamente 3,0 mm (esta profundidad varía en hasta el 20% a través del pocillo debido al efecto de menisco). Los electrodos descansan a aproximadamente 0,5 mm del fondo de los pocillos. El campo eléctrico (E) aplicado a través de las células se calcula como el voltaje a través de los electrodos (V_{0}) dividido por la separación del electrodo (g), E = V_{0}/g. Esto es una sobreestimación del campo real debido a la influencia de las reacciones electroquímicas en cada electrodo que consumen aproximadamente 1,5 V. En los intervalos de voltaje típicos utilizados para la estimulación (de 10 a 60 V/cm), esta sobreestimación es del orden de aproximadamente el 10%. Puede realizarse la medición y calibración exactas del campo mediante el mapeo del potencial eléctrico en el pocillo cuando se hace pasar la
corriente.
La presente invención también incluye estaciones de trabajo automatizadas que se controlan de manera programable para minimizar los tiempos de procesamiento en cada estación de trabajo que pueden integrarse para minimizar el tiempo de procesamiento de las muestras líquidas para el análisis y la estimulación eléctrica.
Normalmente, un sistema de la presente invención incluiría uno o más de lo siguiente: A) un módulo de almacenamiento y recuperación que comprende ubicaciones de almacenamiento para almacenar una pluralidad de productos químicos en disolución en pocillos químicos direccionables, un recuperador de pocillos químico y que tiene selección programable y recuperación de los pocillos químicos direccionables y que tiene una capacidad de almacenamiento para al menos 100.000 pocillos direccionables, B) un módulo de distribución de la muestra que comprende un manejador de líquidos para aspirar o dispensar disoluciones a partir de pocillos químicos direccionables seleccionados, teniendo el módulo de distribución químico la selección programable de, y la aspiración a partir de, los pocillos químicos direccionables seleccionados y la dispensación programable en los pocillos de muestra direccionables seleccionados (incluyendo la dispensación en matrices de pocillos direccionables con diferentes densidades de pocillos direccionables por centímetro cuadrado), C) un transportador de muestras para transportar los pocillos químicos direccionables seleccionados hasta el módulo de distribución de la muestra y que tiene opcionalmente el control programable de transporte de los pocillos químicos direccionables seleccionados (incluyendo encaminamiento adaptativo y procesamiento en paralelo), D) un sistema para el lavado, la tinción y la incubación temporizada automatizados de las células en las placas de múltiples pocillos, E) un sistema para transportar automáticamente placas de células y placas de compuestos de prueba entre las diversas estaciones de trabajo, F) un sistema para la estimulación eléctrica y la medición espectroscópica automatizadas, y un módulo de integración y procesamiento de datos, G) un sistema de control maestro que coordina las actividades de cualquiera de los subsistemas anteriores.
El módulo de almacenamiento y recuperación, el módulo de distribución de la muestra, y el sistema para la estimulación eléctrica y la medición espectroscópica automatizadas están integrados y controlados de manera programable por el módulo de integración y procesamiento de datos. El módulo de almacenamiento y recuperación, el módulo de distribución de la muestra, el transportador de muestras, el sistema para la estimulación eléctrica y la medición espectroscópica automatizadas y el módulo de integración y procesamiento de datos están unidos operablemente para facilitar el rápido procesamiento de los pocillos de muestra direccionables. Normalmente, los dispositivos de la invención pueden procesar al menos 100.000 pocillos direccionables en 24 horas. Este tipo de sistema se describe en la patente de los EE.UU. número 5.985.214, concedida el 16/11/99.
Sistemas microfluídicos
La presente invención también incluye el uso de electrodos que se han incorporado en chips microfluídicos y que proporcionan estimulación eléctrica y análisis altamente miniaturizados. Tales sistemas incluyen los descritos, por ejemplo, en la patente de los EE.UU. número, 5.800.690 concedida el 1 de septiembre de 1998 a Chow et al., la solicitud de patente europea EP 0 810 438 A2 presentada el 5 de mayo de 1997, por Pelc et al. y la solicitud PCT WO 98/00231 presentada el 24 de junio 1997 por Parce et al. Estos sistemas normalmente utilizan movimiento de fluido electrogénico para manipular pequeños volúmenes de fluido dentro de los microcapilares presentes en los chips de vidrio o silicio. Estos sistemas de análisis basados en chips microfluídicos pueden proporcionar análisis miniaturizados masivamente paralelos. Tales sistemas son sistemas preferidos de mediciones espectroscópicas en algunos casos que requieren un análisis miniaturizado.
Por ejemplo, el separador de células activado por fluorescencia microfabricado descrito por Fu et al. (Nature Biotechnology 17: 1109-11, 1999) podría modificarse fácilmente para tener un par de electrodos colocados en o cerca de la región de interrogación óptica. Utilizando los métodos descritos en el presente documento, las células individuales podrían estimularse eléctricamente y separarse individualmente basándose en su respuesta a la estimulación. Este método simplificaría enormemente el proceso de obtener clones estables que contengan la expresión deseada de canales. En otro aspecto, la selección de compuestos de prueba en células individuales podría realizarse con un dispositivo microfluídico equipado con uno o más orificios de inyección de fluido adicionales y uno o más dispositivos estimuladores eléctricos insertados construidos y hechos funcionar basándose en los métodos descritos en el presente
documento.
V. Métodos de estimulación eléctrica a) Introducción
Sin pretender adherirse a ningún mecanismo de acción, los presentes inventores facilitan la siguiente descripción para el efecto de la estimulación eléctrica sobre los potenciales transmembrana celulares.
Los canales iónicos dependientes de voltaje típicos tienen una variedad de estados conductores y no conductores que están regulados por el potencial transmembrana de la célula relativo local. Mediante la aplicación apropiada de campos eléctricos externos a las células, pueden excitarse partes de la membrana celular a cualquier potencial transmembrana deseado, permitiendo así la regulación de los estados de conducción de los canales iónicos dependientes de voltaje presentes dentro de la célula. Si el campo eléctrico aplicado se varía apropiadamente, es posible tomar como muestra varios estados de conductancia de la mayor parte de los canales iónicos, haciéndolos así cíclicos a través de los estados de reposo, activado e inactivado.
Dependiendo del canal iónico en cuestión, la activación del canal iónico puede conducir a la liberación, o la captación, de iones en la célula que puede dar como resultado cambios en el potencial transmembrana global en la célula. Mediante la aplicación de un tren repetitivo de estímulos eléctricos, separados en un intervalo de tiempo inferior a la constante de tiempo de membrana, los cambios de voltaje de membrana sostenidos y grandes pueden crearse a través de una acumulación o pérdida de iones por etapas. Este proceso permite la medición directa de muchos canales iónicos y proporciona un método fácil por el que puede controlarse externamente el potencial transmembrana de la célula. Por tanto, este enfoque proporciona métodos mejorados del descubrimiento de fármacos que son compatibles con la selección de alto rendimiento.
b) Visión general de un protocolo de estimulación típico
La influencia simulada de un protocolo de estimulación eléctrica bifásica típica en una línea celular que expresa un canal de sodio activado por voltaje se ilustra, de forma simplificada, más adelante. La siguiente descripción supone que la línea celular no tiene expresión significativa de otros canales iónicos, y que el potencial transmembrana en reposo de la célula es superior al umbral para la inactivación del canal de sodio en cuestión. En la figura 4, el panel superior muestra el transcurso de tiempo del campo eléctrico aplicado (E), el panel medio muestra las corrientes de sodio estimuladas hacia dentro (I_{Na}) en respuesta al campo eléctrico aplicado, y el panel inferior muestra el potencial transmembrana promedio idealizado de la célula (V_{m}). En este ejemplo, los registros se refieren a los cambios en estos parámetros que normalmente se esperaría que experimentase una célula individual colocada en el centro del campo eléctrico aplicado durante un tren de ondas de estimulación eléctrica.
En referencia al primer impulso, el establecimiento del primer campo eléctrico produce una disminución de potencial a través de la célula que es máximo, con respecto al potencial transmembrana en reposo de la célula, en los bordes de la célula más próximos a los electrodos (véase Hibino et al., Biophysical Journal 64: 1789-1800, 1993; Gross et al. 1986, Biophys. J. 50: 339-348). La magnitud del cambio en el potencial transmembrana \DeltaV_{m} inducido por el campo eléctrico en un punto dado de la membrana en una célula esférica idealizada puede describirse mediante la fórmula (Ehrenberg et al., Biophys. J. 51: 833-837, 1987):
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En la ecuación 1, f es un factor dependiente de la conductividad de la membrana, g es un factor geométrico de orden 1, r es la mitad del diámetro de la célula paralelo al campo eléctrico, E es la magnitud local del campo eléctrico, y \theta es el ángulo entre la dirección local del campo y una línea trazada desde el centro de la célula hasta el punto de la superficie que se está considerando. Para la mayor parte de las células de mamífero intactas, en las que la conductividad de la membrana es muy baja en comparación con la conductividad de la disolución que baña las células, el factor f \approx 1. En la práctica, las células son rara vez esféricas cuando están unidas a un sustrato y puede determinarse empíricamente un cálculo exacto de la magnitud real de los cambios en el potencial transmembrana inducidos por el campo eléctrico.
Como resultado del campo eléctrico aplicado, la membrana en el lado más próximo al ánodo se excita negativamente, mientras que la membrana en el lado más próximo al cátodo se excita positivamente. En las células en las que un borde se excita de manera suficientemente negativa como para disminuir localmente el potencial transmembrana por debajo del potencial umbral para la liberación de la inactivación para el canal iónico en cuestión, el campo eléctrico aplicado hace que los canales de sodio ubicados en este borde entren en el estado de reposo. En el otro lado de la célula, el potencial transmembrana se excita positivamente con respecto al potencial en reposo. Dado que se supone que el potencial transmembrana en reposo de la célula es superior al umbral para su inactivación, los canales de sodio en este lado de la célula permanecen inactivados y no pasa corriente. Si el potencial transmembrana en reposo fuera en cambio inferior al umbral de inactivación, los canales en este lado de la célula se activarían y pasaría corriente.
Cuando se invierte el campo aplicado, el perfil de cambios del potencial transmembrana también se invierte. Los cambios en el potencial transmembrana inducidos por el campo eléctrico en los parches de membrana en los bordes de extremo de las células cambian de polaridad. Los canales en el lado que se excitan negativamente durante la primera fase de la estimulación se excitan ahora positivamente. Si los parámetros de estimulación se escogen apropiadamente, estos canales se excitan ahora por encima del potencial de activación y comienzan a permitir que el ión sodio fluya hacia el interior. Esto se muestra en la figura 4, como el primer pico más pequeño de flujo de sodio hacia el interior de la célula. Los canales de sodio se inactivan rápidamente tras un tiempo característico. Mientras, en el otro lado de la célula, el potencial transmembrana se excita negativamente, de manera que los canales de sodio se liberan de la inactivación y se cambian al estado de reposo.
Cuando finaliza la fase del segundo estímulo, todas las partes de la membrana vuelven rápidamente a un nuevo potencial transmembrana promedio. Si el potencial transmembrana promedio es ahora superior al potencial de activación de los canales de sodio, los canales en el lado de la célula que se excita negativamente durante la segunda fase de estimulación, se activan y comienzan a permitir que el ion sodio fluya hacia el interior. Esto se muestra en la figura 4, como el segundo pico más grande de flujo de sodio hacia el interior de la célula. Los canales de sodio se inactivan rápidamente tras un tiempo característico. En este caso, el flujo de sodio hacia el interior normalmente es mayor desde el segundo lado que desde el primer lado, puesto que la fuerza de conducción para la entrada de sodio es mayor cuando esta parte de la membrana se excita más positivamente mediante un campo eléctrico.
Cada impulso del flujo hacia el interior del canal de sodio eleva el potencial transmembrana promedio de la célula (figura 4, panel inferior). Esta elevación en el potencial transmembrana puede detectarse mediante cualquiera de los métodos descritos en el presente documento, pero se mide convenientemente mediante los cambios en la razón de emisión de fluorescencia de un colorante sensible a voltaje basado en FRET. Debido a las corrientes de fuga presentes en todas las células, este cambio en el potencial transmembrana promedio disminuye exponencialmente hasta el potencial transmembrana en reposo original. La dependencia del tiempo de esta respuesta, la constante de tiempo de membrana (\tau_{m}), depende de la capacitancia de la membrana y la resistencia de la membrana, y es sumamente variable de un tipo de célula a otro. Por ejemplo, las constantes de tiempo pueden variar desde 100 \mus hasta más de un segundo, dependiendo del tipo de célula. Normalmente, la constante de tiempo de membrana es de aproximadamente 100 ms para la mayor parte de las líneas celulares obtenidas por ingeniería genética.
Para proporcionar una acumulación neta de flujo hacia el interior de sodio, el impulso de estímulo se repite antes de que el potencial transmembrana tenga tiempo para disminuir hasta el potencial transmembrana en reposo. Durante las rondas posteriores de estimulación eléctrica, la carga positiva se acumula continuamente en la célula, elevando el potencial transmembrana promedio de una forma aproximadamente por etapas con cada repetición de estimulación eléctrica. Tras cada impulso de estimulación eléctrica, la magnitud de los flujos hacia en interior del ion sodio se hacen continuamente más pequeñas a medida que el potencial transmembrana promedio se aproxima al potencial de inversión del ion sodio. Finalmente, se estable un potencial transmembrana de equilibrio en el que la fuga de corriente fuera de la célula equivale al flujo hacia el interior de la corriente debido a la estimulación eléctrica.
c) Parámetros ajustables para las formas de onda del estímulo
La presente invención incluye el uso de cualquier núcleo de forma de onda con un procedimiento de repetición que puede activar selectivamente canales iónicos en células vivas. El núcleo es la estructura repetible que constituye la base del tren de estímulos. En la figura 4, el núcleo es un impulso cuadrado bifásico, pero en principio, podría ser cualquier función de onda de tiempo limitado. La duración de tiempo del núcleo fija la tasa máxima a la que puede repetirse. El procedimiento de repetición dicta cómo y cuando el núcleo está presente en la muestra. En la figura 4, la tasa de repetición es fija y continua para un total de diez ciclos. Sin embargo, no es necesario que la tasa de repetición sea fija.
Adicionalmente, el núcleo puede cambiarse durante el tren de estímulos, de manera que cada vez que el procedimiento de repetición requiere un impulso de estímulos, podría utilizarse una función de onda diferente. Además, podría utilizarse un mecanismo de realimentación para alterar el núcleo y/o el procedimiento de repetición basándose en la respuesta del sistema medido.
El uso de generadores de formas de ondas arbitrarias para crear los trenes y núcleos del estímulo permite una variación prácticamente ilimitada en la forma de onda con el fin de sintonizar el estímulo eléctrico apropiado para un tipo de célula particular o canal iónico específico. El tren de impulsos puede modularse fácilmente mediante la variación de diversos componentes controlables por separado.
1. La forma de los impulsos individuales
El núcleo de forma de onda que se repite durante el tren de estímulos puede cambiarse sin prácticamente permutaciones interminables utilizando un generador de formas de ondas digitales arbitrarias, tal como Tektronix AFG 310. La figura 5 muestra una representación esquemática de una forma de onda cuadrada bifásica para ilustrar algunas de las variables que pueden modularse. En la figura 5, el tren de impulsos consiste en un campo de partida E_{1} (400), que dura un tiempo t_{1}, un rápido aumento en el potencial (410), que dura un tiempo t_{2}, hasta que alcanza un primer campo de estimulación E_{2} (420) que dura un tiempo t_{3}, una rápida disminución en el potencial (430) que tarda un tiempo t_{4}, hasta que alcanza un segundo campo de estimulación (440), E_{3} que dura un tiempo t_{5}, un rápido aumento en el potencial (460) que tarda un tiempo t_{6}, hasta que alcanza el campo de terminación (470), E_{4} que dura un tiempo t_{7} hasta que el ciclo se repite. La magnitud y la polaridad de los campos eléctricos E_{1} a E_{4} se pueden controlar por separado y pueden variarse tanto estadística como dinámicamente tal como se describe más adelante. Los tiempos para los que se aplican los potenciales eléctricos a las células, tiempos t_{1}, t_{3}, t_{5}, y t_{7} también se pueden controlar por separado y pueden variarse estadística y dinámicamente entre 0 y 10 s durante un tren de ondas, tal como se describe más adelante. Finalmente los cambios en el potencial que se producen durante los tiempos t_{2}, t_{4} y t_{6}, pueden producirse durante periodos de tiempo variables entre 0 y 100 ms y serán lineales o no lineales para crear formas de onda de formas variables.
Algunos ejemplos de estos tipos de variación en la forma de onda se muestran en la figura 6. (a) Forma de onda bifásica, tal como se muestra en la figura 5, repetida a una tasa f. (b) Una forma de onda bifásica modificada. Se ha añadido un corto intervalo entre las fases de estimulación del tren de ondas. Esto permite que la corriente fluya a través de los canales liberados de la inactivación durante el primer impulso. (c) Forma de onda monofásica. Sólo los canales en el lado de la célula que da hacia el ánodo se liberarán de la inactivación. (d) Una forma de onda en rampa. Los canales que dan hacia el ánodo se liberarán de la inactivación mediante la onda cuadrada. Los canales se activarán y pasarán la corriente durante la rampa. La rampa permite que los canales se abran y que pasen corriente a potenciales locales más negativos, de manera que aun cuando la célula está cerca del potencial de inversión para los iones sodio, todavía pueden fluir grandes corrientes. El punto a lo largo de la rampa a la que se abrirán los canales, varía. (e) Una forma de onda bifásica triangular o en dientes de sierra. La forma de rampa puede permitir que se produzcan transiciones dependientes del voltaje entre los estados de manera más uniforme cuando cambia el potencial de membrana global. También son posibles formas de onda monofásicas triangulares. (f) Una forma de onda sinusoidal. Este tipo de forma de onda puede reducir el ruido eléctrico durante la estimulación de alta frecuencia. (g) Una corta ráfaga de formas de onda sinusoidales. (h) Ráfagas de formas de onda sinusoidales, cada una con frecuencia fundamental diferente. Este tipo de estimulación puede demostrar ser útil para estudiar los efectos de plasticidad. La(s) primera(s) ráfaga(s) se utilizan para entrenar al sistema o para comenzar un proceso, mientras que la(s) ráfaga(s) posterior(s) se utilizan para someter a ensayo al sistema.
Las variaciones en la forma de la forma de onda pueden ser útiles para mantener condiciones fijas de estímulo durante el tren de impulsos. Por ejemplo, las fluctuaciones de potencial transmembrana experimentadas por una célula altamente polarizada variarán a medida que cambie su potencial transmembrana promedio desde aproximadamente -90 mV al comienzo del ciclo de estimulación hasta aproximadamente +60 mV tras varios ciclos de estimulación repetitivos. Como consecuencia, el campo eléctrico aplicado requerido para liberar eficazmente un canal iónico de la inactivación varía a medida que varía el potencial promedio de la célula durante el transcurso de varios ciclos de estimulación. Tener en cuenta este efecto puede ser útil, en determinadas circunstancias, para cambiar el balance relativo entre las fases de estimulación positiva (E_{2}) y negativa (E_{3}) a medida que progresa el tren de ondas.
Algunas líneas celulares, por ejemplo HEK-293, tienen un potencial transmembrana en reposo promedio inferior al umbral de activación de algunos canales de sodio activados por voltaje. En estas células, a medida que el potencial transmembrana se eleva durante la estimulación como resultado del flujo hacia el interior del ion sodio, los canales de sodio pueden abrirse independientemente de la estimulación eléctrica aplicada. Esto puede mejorarse mediante el uso de un impulso de corriente en pendiente (es decir, mediante el aumento de t_{2} y t_{4}). Entonces, los canales pueden pasar corriente durante un tiempo definido justo por encima del voltaje de activación, independientemente del potencial transmembrana promedio de la célula.
2. La amplitud global del impulso individual (E_{2} y E_{3})
La magnitud y la polaridad de la amplitud del impulso controlan las fluctuaciones relativas del potencial transmembrana experimentadas por la célula durante un impulso de estímulo. Las amplitudes de impulso pueden modificarse para que el tren completo, o para que los impulsos individuales se acomoden a los diferentes canales y tipos celulares, tal como se trata en más detalle a continuación. En general, las magnitudes de E_{2} y E_{3} se seleccionan para garantizar que el canal iónico de interés se activa eficazmente, y se libera de la inactivación durante cada ciclo de estimulación, mientras que al mismo tiempo no es de magnitud suficiente de manera que produzca la electroporación irreversible de las células. Las amplitudes de impulso preferidas para E_{2} y E_{3} están normalmente en el intervalo de 5 a 60 V/cm para la mayor parte de los canales iónicos cuando se expresan en células de mamífero no excitables con tamaños promedio de desde 10 hasta 25 \mum, y pueden variar en cuanto a positivo y negativo con respecto a tierra. Al igual que anteriormente, la amplitud del estímulo puede cambiarse durante el tren de impulsos para mantener condiciones de estímulo estables cuando cambia el potencial transmembrana promedio. Las amplitudes de impulso preferidas dependen inversamente del tamaño de célula promedio. Por tanto, la técnica también puede utilizarse en células que son más pequeñas o más grandes de 10 a 25 \mum, modificando la amplitud del impulso.
3. La duración de los impulsos individuales (t_{3} y t_{5})
Muchos canales requieren modificaciones en el potencial transmembrana durante periodos de tiempo prolongados para liberarlos de la inactivación, antes de abrirlos. Por ejemplo, muchos canales de sodio dependientes de voltaje generalmente necesitan experimentar un potencial transmembrana inferior a -90 mV durante varios milisegundos antes de que se liberen de la inactivación. El uso eficaz del protocolo de estimulación eléctrica requiere por tanto normalmente que la duración de los impulsos t_{3} y t_{5} sea suficiente para permitir la liberación de la inactivación completa o casi completa, para el canal iónico de interés. En algunos casos, puede ser deseable sintonizar la magnitud de t_{3} y t_{5} para permitir la liberación selectiva de la inactivación de una clase, pero no de otra clase de canal iónico en una célula que expresa varios tipos de canales iónicos. En otros casos, puede ser deseable hacer que t_{3} y t_{5} sean muy pequeños para lograr bajos niveles de liberación de la inactivación para los canales. Normalmente, la duración de impulso preferida se ajusta al tiempo característico para las transiciones entre los estados dependientes del voltaje deseados para el canal iónico de interés, y estos están normalmente en el intervalo de aproximadamente 0,1 a 100 ms para la mayor parte de los canales iónicos.
Para evitar la electrólisis excesiva del agua y la consiguiente generación de burbujas de gas, la duración de los impulsos t_{3} y t_{5} debe mantenerse lo más corta posible, mientras que todavía se logre la estimulación eléctrica deseada. La electrólisis del agua en una superficie de contacto metal/agua normalmente se produce cuando la magnitud de la diferencia de voltaje entre el metal y el agua supera aproximadamente 0,8 V. En algunos casos, los parámetros del estímulo requeridos para producir la estimulación celular también producen la electrólisis del agua. Normalmente es aceptable cierta generación de gas en los electrodos, siempre que la carga por área unitaria de la superficie de contacto electrodo/agua suministrada durante cualquier fase de polaridad individual de un único impulso sea inferior a aproximadamente 100 \muC/mm^{2}. Superar este límite normalmente produce el desprendimiento de gases y la formación de burbujas, lo que afecta significativamente a la uniformidad del campo. La presencia de burbujas en la superficie del electrodo ocluye esta parte del electrodo y puede producir alteraciones en la uniformidad del campo eléctrico. La generación de grandes cantidades de gas también puede producir lesión oxidativa a las células y a los colorantes en el pocillo.
En una placa de 96 pocillos con 100 \muL de solución salina fisiológica con una resistividad de 70 \Omega-cm, la resistencia de la solución salina entre dos electrodos de placas paralelas con una separación de 4 mm entre ellos insertado en el pocillo hasta dentro de 0,5 mm del fondo del pocillo, es de aproximadamente 230 \Omega. Cada electrodo tiene una zona de contacto con la solución salina de aproximadamente 24 mm^{2}. Por tanto, cualquier fase de polaridad única del protocolo del estímulo no debe suministrar más de aproximadamente 2,4 mC de carga. Una diferencia de voltaje de aproximadamente 10 V aplicada entre la placas genera un campo eléctrico de aproximadamente 25 V/cm en la solución salina. Este voltaje extraerá aproximadamente 43 mA de corriente. Por tanto, para esta configuración de electrodos, un impulso de polaridad única de onda cuadrada no debe superar aproximadamente 55 milisegundos de duración con el fin de limitar la carga a menos de 2,4 mC.
4. La separación entre estímulos sucesivos (t_{1} y t_{7})
El cambio del valor de t_{1} y t_{7} globalmente para el tren, o el ajuste para cada impulso individual durante el tren, es útil para optimizar el protocolo de estimulación para canales iónicos específicos. Adicionalmente, el enfoque también es útil para determinar ciertas propiedades celulares y de los canales, incluyendo el tiempo de canal abierto y el transcurso de tiempo de la activación e inactivación del canal.
Por ejemplo, para los ensayos que suponen canales de sodio regulados por voltaje, la inserción de un retraso en el tiempo (t_{1} + t_{7}) entre impulsos igual a, o inferior, que el tiempo de apertura promedio del canal de sodio, permite una medición cuantitativa de la cinética de inactivación del canal. La cinética de inactivación está directamente relacionada con el tiempo de canal abierto promedio. Por tanto, los ensayos utilizando cortos intervalos entre impulsos permiten la detección de compuestos cuyo efecto principal es sobre la cinética de inactivación, un mecanismo que en caso contrario, es inaccesible utilizando técnicas de alto rendimiento.
En la mayor parte de los casos, el retraso en el tiempo entre los estímulos sucesivos sería inferior que la constante de tiempo de membrana con el fin de obtener aumentos sostenidos en el potencial transmembrana. Normalmente, las frecuencias de estimulación (f) óptimas están dentro del intervalo \tau_{M}^{-1} \leq f \leq \tau_{b}^{-1}, en la que \tau_{M} es la constante de tiempo para la disminución en los cambios del potencial transmembrana, y \tau_{b} es el tiempo de apertura promedio del canal. Algunos canales no se inactivan, y para estas células, la frecuencia de estimulación puede determinarse empíricamente. Adicionalmente, la frecuencia de estimulación f no puede superar la inversa de la duración del tiempo del núcleo de estímulo.
Adicionalmente, para ciertos tipos de células, puede demostrarse que es deseable estimular a una tasa más lenta. Por ejemplo, las tasas de estimulación más lentas pueden preferirse para las células con altas densidades de canal, o para ensayos en los que se requiere una sensibilidad farmacológica superior. Alternativamente, para estos casos, podría utilizarse un estímulo monopolar. Esto sólo liberaría de la inactivación los canales de sodio en un lado de la célula, aunque podría doblarse la frecuencia máxima de estimulación.
5. La duración del tren de impulsos, o el número de impulsos en el tren
Las propiedades celulares y de los canales pueden someterse a ensayo tanto en modo dinámico (es decir, tiempos de aumento y disminución, alteraciones en la forma de la respuesta, etc.) y estático. Ambos modos requieren duraciones de los trenes de estímulo lo suficientemente largos como para explorar todos los acontecimientos de interés, aunque no más largos de lo necesario para completar el ensayo. Los tiempos de estimulación típicos comprenden impulsos de 10 ms, a impulsos de 25 V/cm repetidos a una frecuencia de 20 Hz durante 3 segundos. El ajuste de estos parámetros permite que se reduzcan los tiempos de ensayo, o explorar procesos con escalas de tiempo rápidas y lentas.
6. Trenes de impulsos múltiples
En algunos casos es útil repetir los trenes de impulsos, o realizar una medición en las mismas células con dos trenes de impulsos diferentes. Un ejemplo sería caracterizar completamente las propiedades de un canal midiendo la respuesta como una función de la duración y la frecuencia del estímulo, utilizando una única placa de células sometida a múltiples trenes de estímulos. Otro ejemplo sería examinar la plasticidad de la respuesta (es decir, los cambios en la respuesta dependientes de la actividad). Uno o más trenes de estímulos condicionarían la respuesta, mientras que los conjuntos de trenes de mediciones antes y después del acondicionamiento determinarían los cambios debido a la actividad.
Realimentación de los parámetros del estímulo basándose en las mediciones dinámicas de la respuesta
La presente invención también puede utilizarse para crear un dispositivo de fijación de voltaje, mediante el uso de un bucle de realimentación dinámico para mantener el potencial transmembrana promedio en el valor prefijado. Mediante la medición del potencial transmembrana utilizando una salida fluorescente rápida tal como se describe a continuación, cambiando después los parámetros del estímulo para compensar cualquier cambio en el potencial transmembrana, es posible controlar dinámicamente el potencial transmembrana de las células. La corriente necesaria para mantener ese potencial se determinaría entonces mediante el control por ordenador de los parámetros del
estímulo.
El uso de estimulación de alta frecuencia para evitar la electrólisis
Durante los parámetros de estimulación típicos, una corriente pico de aproximadamente 50 mA pasa a través de la disolución entre los electrodos. Durante este tiempo, se producen varias reacciones electroquímicas que normalmente generan especies tóxicas para las células. Los experimentos preliminares han demostrado que la mayor parte de las células de mamífero normalmente responden durante aproximadamente dos minutos de estimulación eléctrica utilizando electrodos de acero inoxidable. Sin embargo, la estimulación prolongada durante periodos de tiempo más largo parece conducir a una pérdida en la salud y la viabilidad de la célula. A frecuencias de impulso suficientemente altas, de manera que la superficie de contacto metal - solución salina no alcance el potencial para la electrólisis del agua (aproximadamente \pm 1 V para el acero inoxidable en solución salina), la corriente puede hacerse pasar capacitativamente y no se generarán productos tóxicos. En el estimulador eléctrico mostrado en la figura 1, en el que cada electrodo tiene un área de aproximadamente 24 mm^{2} en contacto con la solución salina, la capacitancia por electrodo es de aproximadamente 1-10 \muF (Robinson, 1968, Proc. IEEE 56: 1065-1071). A 50 mA, esta capacitancia carga a 1 V en aproximadamente 20-200 \mus. Esto es en el límite inferior de los tiempos de duración de impulso
útiles.
Alternativamente, es posible realizar la estimulación eléctrica sin generar productos electrolíticos. Se dispone de varios tratamientos que pueden aumentar la capacitancia de la superficie de contacto metal - solución salina en los factores de 2-100. Estos incluyen rugosificación de la superficie, electrodeposición con negro de platino o negro de oro, y deposición y activación de iridio/óxido de iridio, titanio/nitruro de titanio, o películas de polipirrol. Utilizando los parámetros de estimulación, que evitan la electroquímica irreversible, estos tratamientos de superficie no degradan cuando pasa la corriente.
VI. Expresión de los canales iónicos a) Selección del tipo celular
La presente invención puede utilizarse con cualquier tipo de célula, incluyendo células animales, células vegetales, células de insecto, células bacterianas, levaduras y células de mamífero. Para la selección de agentes terapéuticos en humanos se prefieren las líneas celulares de mamíferos, incluyendo tales líneas celulares líneas celulares de cultivo tisular que pueden hacerse crecer de forma relativamente fácil y pueden transfectarse fácilmente con alta eficacia. Muchas líneas celulares tisulares están comercialmente disponibles a través de la American type culture collection (Colección Americana de Cultivos Tipo) (ATCC), véase (http: //www.atcc.org), así como la European collection of cell cultures (Colección Europea de Cultivos Celulares) (ECACC) (http: //www.camr.org.uk).
Adicionalmente, en algunos casos también pueden preferirse líneas celulares primarias, o cortes de tejido, para la selección cuando se requiere expresar o medir la respuesta del canal iónico de interés en su contexto fisiológico nativo. Este enfoque puede ser útil o bien como una selección primaria o bien como una secundaria para seleccionar según la especificidad, la selectividad o la toxicidad de los agentes terapéuticos candidatos, y se trata en detalle en la sección X.
Para los ensayos realizados en las líneas celulares en cultivo, los principales criterios de selección son el potencial transmembrana en reposo de la línea celular, y la presencia de canales iónicos expresados endógenamente. La selección de líneas celulares apropiadas para canales iónicos específicos de interés depende de las propiedades dependientes del voltaje y de la selectividad de iones del canal iónico de interés. Estas consideraciones se revisan en detalle para varios los canales iónicos en la sección VIII, Protocolos de estimulación.
En algunos casos es deseable utilizar una línea celular que no tenga (o tenga muy poca) expresión endógena detectable de otros canales iónicos. Las células de este tipo incluyen las células CHO-K1, CHL y LTK(-). Estas células tienen intrínsecamente un potencial en reposo en el intervalo de +10 a -30 mV, que es superior a los umbrales de activación e inactivación de la mayor parte de los canales dependientes de voltaje. El uso de estas líneas celulares tiene la ventaja de que el canal iónico de interés es el principal modulador del potencial transmembrana dentro de las células de manera que los datos del ensayo de selección generalmente se interpretan de forma fácil e inequívoca.
En algunos casos, el uso de una línea celular sin otros canales iónicos puede no resultar práctico para crear un ensayo realizable. Por ejemplo, puede ser necesario mantener un ion regulado por voltaje a un potencial transmembrana altamente polarizado. En este caso, es necesario controlar el potencial transmembrana mediante la expresión de un segundo canal iónico. Por ejemplo, someter a ensayo un canal de sodio de tipo IIa de cerebro de rata en el estado de reposo requiere que el potencial transmembrana se mantenga por debajo del potencial de activación umbral del canal de sodio, en este caso a aproximadamente -60 mV. Para lograr esto es necesario, o bien coexpresar un canal iónico, tal como un rectificador entrante de potasio, que puede mantener el potencial transmembrana en reposo de la célula hasta aproximadamente -90 mV, o identificar una línea celular que exprese endógenamente canales iónicos similares. Los tipos celulares de este tipo incluyen las células RBL y las células HEK-293.
En otros casos puede ser necesario utilizar la expresión de un segundo canal iónico, junto con la estimulación eléctrica para excitar la membrana celular a un potencial transmembrana específico, para permitir que se someta a ensayo el primer canal iónico de interés. Ejemplos de esta situación se producen cuando se someten a ensayo canales iónicos no regulados por voltaje tales como los canales iónicos regulados por ligando. La coexpresión de un canal de sodio regulado por voltaje, por ejemplo, junto con la estimulación eléctrica, puede utilizarse para fijar el potencial transmembrana a potenciales transmembrana de entre aproximadamente +10 a +60 mV. En comparación, la coexpresión de canales de potasio regulados por voltaje junto con la estimulación eléctrica puede fijar el potencial transmembrana a potenciales transmembrana de entre aproximadamente -90 a -30 mV. Estos enfoques permiten por tanto la manipulación eficaz del potencial transmembrana durante un intervalo relativamente amplio permitiendo así el análisis de prácticamente cualquier canal iónico.
Normalmente, cuando se utiliza este enfoque de coexpresión es necesario volver a seleccionar cualquier resultado obtenido con la línea celular que coexpresa ambos canales iónicos, con la línea celular que expresa sólo el canal iónico utilizado para fijar el potencial transmembrana. Esto permite que los fármacos que afectan a este segundo canal iónico se diferencien de los que realmente influyen en el canal iónico de interés. Alternativamente, pueden utilizarse toxinas selectivas tales como TTX para inhibir selectivamente una clase de canal iónico.
b) Transfección de los canales iónicos
Los ácidos nucleicos utilizados para transfectar células con secuencias que codifican para la expresión del canal iónico de interés normalmente están en la forma de un vector de expresión incluyendo secuencias de control de la expresión asociados operativamente a una secuencia de nucleótidos que codifica para la expresión del canal. Tal como se utiliza, el término secuencia de nucleótidos que codifica para la expresión de un canal se refiere a una secuencia que, con la transcripción y la traducción del ARNm, produce el canal. Esta puede incluir secuencias que contienen, por ejemplo, intrones. Tal como se utiliza en el presente documento, el término secuencias de control de la expresión se refiere a secuencias de ácido nucleico que regulan la expresión de una secuencia de ácido nucleico a la que están operativamente unidas. Las secuencias de control de la expresión están unidas operativamente a una secuencia de ácido nucleico cuando las secuencias de control de la expresión controlan y regulan la transcripción y, según sea apropiado, la traducción de la secuencia de ácido nucleico. Por tanto, las secuencias de control de la expresión pueden incluir promotores, potenciadores ("enhancers"), terminadores de la transcripción, un codón de inicio (es decir, ATG) delante de un gen que codifica para una proteína, señales de corte y empalme para intrones, el mantenimiento del marco de lectura correcto para ese gen para permitir la traducción apropiada del ARNm y codones de terminación
apropiados.
Pueden utilizarse métodos que son bien conocidos por los expertos en la técnica para construir vectores de expresión que contienen la secuencia que codifica para el canal iónico, acoplada operativamente a dominios de localización y selección como objetivo apropiados y a señales de control de la transcripción/traducción apropiados. Por ejemplo, haciendo referencia a los números de registro de la secuencia, o a las referencias en las tablas 1 a 3, un experto habitual en la técnica puede identificar la secuencia del canal iónico de interés. Estos métodos incluyen técnicas sintéticas, técnicas de ADN recombinante in vitro, y recombinación in vivo/recombinación genética. (Véanse, por ejemplo, las técnicas descritas en Maniatis, et al., Molecular Cloning A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y., 1989). Se dispone de muchos vectores de expresión comercialmente disponibles de una variedad de fuente, incluyendo Clontech (Palo Alto, CA), Stratagene (San Diego, CA) e Invitrogen (San Diego, CA), así como muchas otras fuentes comerciales.
Una versión contemplada del método es utilizar secuencias de nucleótidos para el control inducible para producir un aumento repentino en la expresión del canal iónico de interés por ejemplo, induciendo la expresión del canal. Sistemas inducibles ejemplo incluyen el sistema inducible de tetraciclina descrito por primera vez por Bujard y sus colegas (Gossen y Bujard (1992) Proc. Natl. Acad. Sci USA 89 5547-5551, Gossen et al. (1995) Science 268 1766-1769) y descrito en la patente de los EE.UU. número 5.464.758.
La transformación de una célula huésped con ADN recombinante puede llevarse a cabo mediante técnicas convencionales como se conoce bien por los expertos en la técnica. Cuando el huésped es una célula procariota, tal como E. coli, pueden prepararse células competentes que pueden captar ADN a partir de células recogidas tras la fase de crecimiento exponencial y tratadas posteriormente mediante el método del CaCl_{2} mediante procedimientos bien conocidos en la técnica. Alternativamente, pueden utilizarse MgCl_{2} o RbCl. La transformación también puede llevarse a cabo tras la formación de un protoplasto de la célula huésped o mediante electroporación.
Cuando el huésped es una célula eucariota, pueden utilizarse métodos de transfección de ADN tales como coprecipitados con fosfato de calcio, procedimientos mecánicos convencionales tales como microinyección, electroporación, inserción de un plásmido recubierto en liposomas, o vectores víricos. Las células eucariotas también pueden cotransfectarse con secuencias de ADN que codifican para el canal iónico, y una segunda molécula de ADN extraña que codifica para un fenotipo seleccionable, tal como un gen de timidina cinasa de herpes simple. Otro método es utilizar un vector vírico eucariota, tal como el virus de simio 40 (SV40) o el virus del papiloma bovino, para infectar o transformar de forma transitoria células eucariotas y expresar el canal iónico. (Eukaryotic Viral Vectors, Cold Spring Harbor Laboratory, Gluzman ed., 1982). Preferiblemente, se utiliza un huésped eucariota como la célula huésped tal como se describe en el presente documento.
La selección de clones estables se realizará normalmente partiendo de la base de la expresión satisfactoria del canal iónico de interés a un nivel suficiente como para permitir la detección fácil. En muchos casos, este análisis requerirá la caracterización funcional de los clones individuales para identificar los que muestran características electrofisiológicas apropiadas coherentes con la expresión del clon de interés. Este análisis puede complementarse mediante el uso de patch clamping, o mediante la medición de potenciales transmembrana utilizando colorantes sensibles al potencial transmembrana, tal como se describe más adelante. Una ventaja para el uso de este último método es que es compatible con la separación de células activadas por fluorescencia y proporciona el análisis rápido de muchos miles de clones individuales por segundo. En algunos casos en los que el canal de sodio está eléctricamente silencioso en la célula en reposo, también puede lograrse fácilmente la confirmación de la expresión mediante inmunoquímica utilizando anticuerpos que surgen frente al canal iónico natural, o un epítopo definido introducido en el canal iónico mediante técnicas moleculares, tal como se describió anteriormente.
En los casos en los que las células se transfectan con un primer canal iónico de interés, y un segundo canal iónico para fijar el potencial transmembrana, es importante la optimización de la expresión relativa de ambos canales iónicos. Normalmente, la expresión relativa óptima de los dos canales iónicos se determina empíricamente seleccionando clones que proporcionan en máximo intervalo dinámico y la mínima variación estadística en su respuesta.
VII. Medición de potenciales transmembrana
Los cambios en el potencial transmembrana y la medición de la conductancia de los canales iónicos específicos mediante el uso de la presente invención pueden detectarse mediante el uso de cualquiera de los medios conocidos para medir el potencial transmembrana o el movimiento de iones. Estos métodos incluyen, por ejemplo, patch clamping (Hamill et al, Pfluegers Arch. 391: 85-100, 1981), sensores de voltaje basados en FRET, colorantes para el potencial transmembrana electrocrómicos (Cohen et al., Annual Reviews of Neuroscience 1: 171-82, 1978), colorantes para el potencial transmembrana de redistribución (Freedman y Laris, Spectroscopic membrane probes Ch 16, 1988), electrodos extracelulares (Thomas et al., Exp. Cell Res. 74: 61-66, 1972), transistores de efecto campo (Fromherz et al., Science 252: 1290-1293, 1991), ensayos de flujo radiactivo, colorantes fluorescentes o luminiscentes sensibles a iones, proteínas fluorescentes o luminiscentes sensibles a iones, la expresión de proteínas endógenas o el uso de moléculas o genes indicadores.
Los métodos preferidos de análisis para la selección de alto rendimiento normalmente implican el uso de lecturas ópticas del potencial transmembrana, o la conductancia del canal iónico. Tales métodos incluyen el uso de colorantes o moléculas sensibles a iones o al potencial transmembrana, que normalmente muestran un cambio en sus características fluorescentes o luminiscentes como resultado de cambios en el potencial transmembrana o en la conductancia del canal iónico.
Un método óptico preferido de análisis para su uso con la presente invención se ha descrito en la patente de los EE.UU. número 5.661.035 concedida el 26 de agosto de 1997). Este enfoque normalmente comprende dos reactivos que experimentan transferencia de energía para proporcionar una lectura fluorescente radiométrica que depende del potencial transmembrana. Normalmente, el enfoque utiliza un colorante lipófilo sensible al voltaje y un fluoróforo insensible al voltaje asociado con una membrana celular. (Véase Gonzalez et al. Drug Discovery Today 4: 431-439, 1999).
En una realización, se cargan en la membrana plasmática de las células dos moléculas de colorante, un fosfolípido unido a cumarina (CC2-DMPE) y un colorante de oxonol, tal como bis-(ácido 1,2-dibutilbarbitúrico)trimetina oxonol [DiSBAC_{4}(3)]. CC2- DMPE divide en la parte exterior de la membrana plasmática en la que actúa como un donador de FRET fijado al aceptor de oxonol móvil sensible al voltaje. Las células con potenciales relativamente negativos en su interior empujarán al oxonol cargado negativamente hacia la parte exterior de la membrana plasmática, dando como resultado una FRET eficaz (es decir, la extinción del donador de cumarina y la excitación del aceptor de oxonol). La despolarización da como resultado la rápida translocación del oxonol a la superficie interior de la membrana plasmática disminuyendo la FRET. Dado que la FRET sólo puede producirse en distancias inferiores a 100 \ring{A}, la excitación de la cumarina da como resultado la monitorización específica de los movimientos del oxonol dentro de la membrana plasmática.
Los tiempos de respuesta para estos ensayos se alteran fácilmente aumentando o disminuyendo la hidrofobicidad del oxonol. Por ejemplo, el dibutil oxonol DiSBAC_{4}(3) más hidrófobo tiene una constante de tiempo de aproximadamente 10 ms, significativamente más rápida que el dietil oxonol DiSBAC_{2}(3) menos hidrófobo.
La carga de los colorantes normalmente se logra a temperatura ambiente antes del comienzo de las mediciones del potencial transmembrana. Normalmente, las células se cargan secuencialmente con el lípido de cumarina seguido por el oxonol. Las concentraciones de carga típicas para los lípidos de cumarina oscilan desde aproximadamente 4 hasta 15 \muM (concentración final) y las disoluciones de tinción normalmente se preparan en solución salina equilibrada de Hanks con HEMES 10 mM, glucosa 2 g/l y aproximadamente Pluronic-127 al 0,02% a un pH de aproximadamente 7,2 a 7,4. La carga normalmente es aceptable tras aproximadamente 30 minutos de incubación, tras lo cual puede eliminarse el colorante en exceso si se desea. Los colorantes de oxonol normalmente se cargan a una concentración de entre 2 y 10 \muM durante 25 minutos a temperatura ambiente, el DiSBAC_{4}(3) más hidrófobo normalmente se carga en presencia de Pluronic-127 2-3 \muM. Las concentraciones de carga óptimas varían entre los tipos celulares y pueden determinarse empíricamente mediante experimentación de rutina. Normalmente tales experimentos de optimización se llevan a cabo valorando sistemáticamente las concentraciones del primer reactivo, y después para cada concentración probada, valorando la concentración del segundo reactivo. De esta forma es posible obtener tanto las concentraciones de carga óptimas para cada reactivo, como la razón relativa óptima para lograr una razón señal - ruido máxima.
En algunos casos puede preferirse añadir, o cargar uno o más de los reactivos de FRET con una o más sustancias que absorben luz con el fin de reducir la emisión de luz no deseada, tal como se describe, por ejemplo, en la solicitud de patente de los EE.UU. de titularidad común número 09/118.497, presentada el 17 de julio de 1998; la solicitud de patente de los EE.UU. número 09/120.516, presentada el 21 de julio de 1998, y la solicitud de patente de los EE.UU. número 09/122.477 presentada el 23 de julio de 1998.
Los sensores de voltaje basados en FRET también pueden derivarse del uso de otros fluoróforos seleccionados como objetivo de la membrana junto con un donador o aceptor hidrófobo móvil. Otras de tales composiciones de describen, por ejemplo, en la solicitud de patente de los EE.UU. número 09/459.956, presentada el 13 de diciembre de 1999.
Los instrumentos adecuados para medir los cambios en el potencial transmembrana a través de métodos ópticos incluyen microscopios, lectores de placas de múltiples pocillos y otros instrumentos que pueden realizar una detección de fluorescencia radiométrica rápida y sensible. Un instrumento preferido de este tipo se describe en la solicitud de patente de los EE.UU. 09/118.728 presentada el 17 de julio de 1998. Este instrumento (el Voltaje/Ion Probe Reader (Lector de voltaje/sonda de ionización) o VIPR™) es un manejador de líquidos integrado y un lector de fluorescencia cinética para placas de múltiples pocillos de 96 pocillos y superiores. El lector VIPR™ integra un manejador de líquidos de ocho canales, una fase de colocación de los múltiples pocillos y un sistema de detección e iluminación de fibra óptica. El sistema está diseñado para medir la fluorescencia de una columna de ocho pocillos simultáneamente antes, durante y tras la introducción de una muestra líquida obtenida de otra placa de microtítulo o cubeta. El lector VIPR™ se excita y detecta señales de emisión desde el fondo de una placa de múltiples pocillos empleando ocho haces ópticos trifurcados (un haz para cada pocillo). Una rama de la fibra trifurcada se utiliza como una fuente de excitación, utilizándose las otras dos ramas de la fibra trifurcada para detectar la emisión de fluorescencia. Una lente esférica en el extremo de la fibra aumenta la eficacia de la excitación y la recogida de luz. Las fibras de emisión bifurcadas permiten que el lector detecte dos señales de emisión simultáneamente y son compatibles con las señales rápidas generadas por los colorantes sensibles al voltaje basados en FRET. Los tubos fotomultiplicadores detectan entonces fluorescencia de emisión, permitiendo la detección de la razón de emisión sub-segunda.
VIII. Protocolos de estimulación
En un aspecto, la presente invención incluye métodos para modular los potenciales transmembrana de células vivas mediante estimulación eléctrica, y el uso de estos métodos para someter a ensayo la actividad de prácticamente cualquier canal iónico o sistema transportador.
a) Medición de conductancias de canal específicas 1. Ensayo de los canales de sodio
Se ha identificado una variedad de diferentes isoformas de canales de sodio dependientes de voltaje de mamíferos y se resumen más adelante en la tabla 1. Estos canales pueden clasificarse en tres grupos principales (para revisión, véase Oroin, Annals N.Y. Academy of Sciences 868: 38-50, 1999).
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Los canales de sodio dependientes de voltaje en la tabla 1 varían ampliamente en su dependencia del voltaje y sus cinéticas de activación e inactivación. Los canales de sodio regulados por voltaje tienen muchas conformaciones diferentes, que pueden clasificarse en tres estados. (1) El estado de reposo, en el que el canal está cerrado y no puede fluir ninguna corriente. Este es el estado típico cuando un canal de sodio se expresa en una célula con un potencial transmembrana en reposo inferior a aproximadamente -60 mV. El canal puede llevarse rápidamente al estado abierto mediante despolarización, normalmente hasta un potencial transmembrana superior a aproximadamente -50 mV. (2) El estado activado, en el que el canal se abre y los iones pasan a su través. Dado que la concentración intracelular de sodio es baja en una célula en reposo normal, mientras que la concentración extracelular es alta, los iones sodio fluyen hacia el interior de la célula y hacen que el potencial transmembrana sea más positivo. El estado abierto tiene una corta duración, generalmente del orden de un milisegundo, tras el cual pasa al estado inactivado. (3) El estado inactivado, en el que un canal se ha cerrado y los iones no pueden pasar a través del canal. El canal no puede abrirse directamente una vez en el estado inactivado. Primero irán al estado de reposo, que se produce si el potencial transmembrana se mantiene muy negativo (generalmente inferior a -80 mV) durante varios milisegundos. Las constantes de tiempo y los potenciales umbral para las transiciones entre estos tres estados varían enormemente entre los subtipos de
canal.
Durante estos experimentos, se comparará la respuesta para las células con canales activos, y para las células en las que los canales están bloqueados farmacológicamente. Si no se dispone de un agente farmacológicamente adecuado, el estado bloqueado puede emularse con una línea celular no transfectada. Los parámetros óptimos del estímulo darán el menor coeficiente de variación de la diferencia en las señales de las dos poblaciones celulares.
i) Ensayos para los canales de sodio dependientes de voltaje en un estado inactivado
Las células preferidas incluyen aquellas con potenciales transmembrana en reposo superiores al umbral de activación para el canal iónico de interés, y en las que no se expresan otros canales iónicos. Las células que cumplen estos criterios incluyen las células CHL y LTK(-). Tras escoger un canal iónico objetivo, las células se transfectan y se seleccionan los clones, tal como se describe en la sección III. Alternativamente, podría utilizarse una línea celular que expresa endógenamente el canal de interés, y bajos niveles de otros canales. Por ejemplo, la línea celular CHO-K1 expresa un canal de sodio regulado por voltaje, y niveles muy bajos de otros canales iónicos. Las células se siembran en placas de microtítulo de múltiples pocillos, se cultivan y se tiñen con colorantes sensibles al voltaje tal como se describe en la sección IV antes de iniciar la estimulación eléctrica. Los experimentos iniciales normalmente se llevan a cabo en una placa de múltiples pocillos de 96 pocillos, con igual número de células en cada pocillo. Generalmente, las columnas de ocho pocillos se estimulan simultáneamente en idénticas condiciones para proporcionar datos estadísticamente significativos sobre la variación en la respuesta celular.
Un protocolo de estimulación eléctrica óptimo debe hiperpolarizar parte de la membrana plasmática de la mayoría de las células lo suficiente como para liberar los canales de sodio de la inactivación, antes de proporcionar una despolarización de activación, sin someter a electroporación o eliminar las células. Normalmente, esto requiere que se creen dentro de la célula potenciales transmembrana continuos de aproximadamente -60 a -80 mV durante periodos que oscilan desde aproximadamente 0,5 hasta aproximadamente 20 ms.
Un protocolo de estimulación preferido que logra este efecto es bifásico, de manera que los canales iónicos presentes en ambos bordes de extremo de las células se liberan de la inactivación cuando la forma de onda bifásica invierte la polaridad. Normalmente, se comenzaría con condiciones iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica de 5 ms por fase y una amplitud de 25 V/cm. El núcleo se repetiría a una tasa regular de aproximadamente 20 Hz durante una duración de tren total de aproximadamente tres segundos. Entonces se optimizaría la amplitud (hasta un máximo de aproximadamente 60 V/cm), la duración (en el intervalo de 0,1 a 50 ms), y después la frecuencia del impulso (en el intervalo de 0 a 1 kHz). Si fuera necesario, también podrían explorarse cambios en la forma del impulso para determinar si daban como resultado una estimulación eléctrica más eficaz. Los parámetros óptimos del estímulo darán la estimulación celular máxima (en comparación con células con el canal bloqueado o no presente) con el menor coeficiente de variación de la señal entre los diferentes pocillos de prueba, a la menor intensidad del campo eléctrico, y al menor ciclo de trabajo para el paso de la corriente a través de los electrodos. Una vez elegido un conjunto particular de parámetros, debe realizarse una valoración de las concentraciones de tinción para el(los) colorante(s) sensor(es) de voltaje tal como se describió anteriormente, para optimizar adicionalmente el tamaño de la señal y el coeficiente de variación de las respuestas. Estos procedimientos (concentraciones de colorante, intensidad del campo eléctrico, y duración y frecuencia del estímulo) pueden repetirse para optimizar la señal adicionalmente.
ii) Ensayos para canales de sodio normalmente en el estado de reposo
Las células preferidas incluyen aquellas con potenciales transmembrana en reposo inferiores al umbral de activación para el canal iónico de interés, y en las que la expresión de otros canales iónicos se limita en buena parte a algunos tipos de canales iónicos caracterizados. Las células de este tipo incluyen las células HEK-293 y RBL, así como las células F11 y HL5. Tras escoger un canal iónico objetivo, las células se transfectan con el canal iónico de interés y se seleccionan los clones tal como se describió anteriormente. Alternativamente, como en el caso de las células F11 y HL5, pueden utilizarse canales de sodio endógenos. Tras la selección y la caracterización, los clones celulares se siembran en placas de microtítulo de múltiples pocillos y se tiñen con colorantes sensibles al voltaje tal como se describió anteriormente. Al igual que anteriormente, los experimentos iniciales normalmente se llevan a cabo en una placa de múltiples pocillos de 96 pocillos, con un número igual de células en cada pocillo. Generalmente, las columnas de ocho pocillos se estimulan simultáneamente en idénticas condiciones para proporcionar datos estadísticamente significativos sobre la variación en la respuesta celular.
Son posibles varios enfoques de ensayo dependiendo del nivel de expresión del canal de sodio de interés en la célula. Para niveles altos de expresión del canal de sodio dependiente de voltaje, la corriente de sodio puede ser lo suficientemente grande como para crear un gran cambio en el potencial transmembrana tras una única secuencia de activación/inactivación del canal. En estos casos, pequeñas perturbaciones positivas en el potencial transmembrana creado mediante la estimulación eléctrica pueden ser suficientes para activar suficientes canales de sodio de manera que la posterior entrada del ion sodio despolarice la totalidad de la célula, activando así todos los canales de sodio. El campo de estímulo normalmente debe aplicarse durante un tiempo lo suficientemente largo como para activar los canales, pero no tan largo como para interferir con el posterior flujo de iones. Una vez que el potencial transmembrana de la célula se ha repolarizado, puede repetirse el procedimiento de estimulación. Los posteriores acontecimientos de estimulación pueden ser idénticos al primero, o variarse para examinar las propiedades de los canales dependientes del tiempo.
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Normalmente se comenzaría con condiciones iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica de 500 \mus por fase y una amplitud de 10 V/cm. Entonces se optimizaría la amplitud (entre 5 y 60 V/cm) y la duración del impulso (entre 0,1 y 1 ms). Si fuera necesario, también podrían explorarse cambios en la forma del impulso para determinar si daban como resultado una estimulación eléctrica más eficaz. Los parámetros óptimos del estímulo darán la estimulación celular máxima con el menor coeficiente de variación de la señal entre los diferentes pocillos de prueba, a la menor intensidad del campo eléctrico, y al menor ciclo de trabajo para el paso de la corriente a través de los electrodos. Una vez elegido un conjunto particular de parámetros, debe realizarse una valoración de las concentraciones de tinción para el(los) colorante(s) sensor(es) de voltaje tal como se describió anteriormente, para optimizar adicionalmente el tamaño de la señal y el coeficiente de variación de las respuestas. Estos procedimientos (concentraciones de colorante, intensidad del campo eléctrico, y duración y frecuencia del estímulo) pueden repetirse para optimizar la señal adicionalmente.
A menudo será necesario utilizar células cuya expresión de canales de sodio es demasiado baja como para dar tamaños de señal aceptables a partir de un único estímulo. También puede ser deseable mantener una gran señal durante un periodo de tiempo prolongado. En estos casos, puede administrarse a las células trenes de impulsos tal como se describió para los canales mantenidos por encima del potencial de activación. Con impulsos de estimulo bifásicos, los canales de sodio pueden activarse independientemente del potencial transmembrana de partida. Manteniendo el intervalo entre impulsos más corto que la constante de tiempo de membrana, cada estímulo conducirá corriente hacia el interior de la célula hasta que se establezca un equilibrio entre las corrientes hacia el interior y hacia el exterior. Esta desviación del voltaje se mantendrá siempre que continúe el tren de estímulos.
Los protocolos de estimulación en este caso son esencialmente los mismos que los descritos para las células cuyo potencial en reposo es superior al umbral de inactivación. En general, se llevan a cabo una serie de experimentos iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica repetido a una tasa regular durante una duración de tren fijada. La duración de impulso varía desde aproximadamente 1 \mus hasta aproximadamente 1 s, y más preferiblemente desde aproximadamente 100 \mus hasta aproximadamente 20 ms. La amplitud del impulso varía desde 0 V/cm hasta aproximadamente 60 V/cm, y más preferiblemente desde 10 V/cm hasta 50 V/cm. La frecuencia de estimulación varía entre 0 Hz (es decir, un único impulso) y 100 kHz, y más preferiblemente desde 0 Hz hasta aproximadamente 1 kHz. El tren de impulsos varía entre 0 s (es decir, un único impulso) y aproximadamente 100 s, y más preferiblemente entre 0 s y 10 s. Los parámetros óptimos del estímulo darán los cambios máximos en el potencial transmembrana (en comparación con células con el canal bloqueado o no presente) y el menor coeficiente de variación de la señal entre los pocillos de prueba, a la menor intensidad del campo eléctrico. Una vez elegido un conjunto particular de parámetros, normalmente se realiza una valoración de las concentraciones de tinción para el(los) colorante(s) sensor(es) de voltaje tal como se describió anteriormente para optimizar adicionalmente el tamaño de la señal y el coeficiente de variación de las respuestas. Estos procedimientos (concentraciones de colorante, intensidad del campo eléctrico, y duración y frecuencia del estímulo) pueden repetirse para optimizar la señal adicionalmente.
b) Canales de potasio
Los canales de potasio dependientes de voltaje repolarizan las células nerviosas y musculares tras la despolarización del potencial de acción. También pueden desempeñar papeles reguladores importantes en los sistemas neurológico, muscular, secretor y excretor. La mayor parte de las células mantienen activamente una alta concentración de potasio intracelular, de manera que el potencial transmembrana de inversión para el potasio es de aproximadamente -90 mV. El potasio normalmente fluye fuera de la célula, de manera que abrir más canales selectivos de potasio tiende a hacer que el potencial transmembrana sea más negativo, a diferencia de la apertura del canal de sodio que normalmente hace que el potencial transmembrana sea más positivo.
En la tabla 2 a continuación se presenta un resumen de los numerosos subtipos de potasio.
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Los canales de potasio muestran una enorme diversidad en lo que se refiere a las constantes de tiempo de activación e inactivación y a las dependencias del voltaje. En general, los canales de potasio dependientes de voltaje muestran una dependencia del voltaje similar a la de los canales de sodio, estando cerrados a potenciales muy negativos y abriéndose por encima de un cierto umbral. Los canales de potasio pueden tener múltiples estados de reposo, múltiples estados inactivados, y normalmente un único estado activado. A diferencia de los canales de sodio dependientes de voltaje, se permiten las transiciones entre la mayoría de los estados. Estas transiciones son activación (movimiento desde un estado de reposo hasta uno abierto), desactivación (movimiento desde un estado abierto hasta un estado de reposo), inactivación (movimiento desde un estado de reposo o abierto hasta un estado inactivado), liberación de la inactivación (movimiento desde un estado inactivado hasta un estado de reposo), y oscilación (movimiento desde un estado inactivado hasta el estado abierto). Hay una gran diversidad en los umbrales de las transiciones y en las dependencias del voltaje de las tasas de transición. Las constantes de tiempo de activación oscilan desde 0,1 hasta 1000 ms con potenciales de activación umbral desde -80 hasta +20 mV. Las constantes de tiempo de inactivación oscilan desde 0,1 hasta el infinito (es decir, sin inactivación) con potenciales umbral desde -60 hasta 0 mV. Las constantes de tiempo para la liberación de la inactivación oscilan desde 0,5 ms hasta 100 ms con potenciales umbral desde -70 hasta 0 mV.
Los protocolos de estímulo necesarios para obtener señales medibles dependientes de canal son algo dependientes de las propiedades específicas del canal en cuestión. Debido a la diversidad en los parámetros en los canales de potasio dependientes de voltaje, la optimización de un protocolo de estimulación eléctrica puede llevar varias repeticiones.
Durante estos experimentos, se comparará la respuesta para las células con canales activos, y para las células en las que los canales están bloqueados farmacológicamente. Si no se dispone de un agente farmacológicamente adecuado, el estado bloqueado puede estimularse con una línea celular no transfectada. Los parámetros óptimos del estímulo darán el menor coeficiente de variación de la diferencia en las señales de las dos poblaciones celulares.
Ensayos utilizando la estimulación directa del canal de potasio Canales de potasio regulados por voltaje
Dado que los canales de potasio generan corrientes hacia el exterior, la activación de los canales produce cambios negativos en el potencial transmembrana. En condiciones fisiológicas, el potencial de inversión para el potasio es de aproximadamente -90 mV. Dado que las células que expresan sólo un canal de potasio dependiente de voltaje generalmente tienen potenciales en reposo próximos al umbral de activación, la estimulación directa debe funcionar para aquellos canales de potasio dependientes de voltaje que tienen un umbral de activación superior a aproximadamente -50 mV. Aunque pueden detectarse de manera fiable pequeñas desviaciones negativas en el potencial transmembrana (cambio inferior a 40 mV) utilizando colorantes sensibles al voltaje de FRET, a menudo es preferible realizar selecciones de alto rendimiento con señales mayores.
Los tipos celulares preferidos incluyen aquellas células que expresan un nivel mínimo de otros canales iónicos, tales como CHO-K1, CHL y LTK(-). La transfección y la selección de clones que expresan canales iónicos de interés generalmente se llevarán a cabo tal como se describió anteriormente para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo. Alternativamente, podría utilizarse una línea celular que expresa endógenamente el canal de interés. El marcaje y la medición de las células con colorantes para el potencial transmembrana generalmente se llevarán a cabo tal como se describió para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo.
El protocolo de estimulación despolarizará ventajosamente parte de la membrana plasmática de longitud suficiente como para activar los canales de potasio dependientes de voltaje. A diferencia del caso para los canales de sodio dependientes de voltaje, los canales de potasio dependientes de voltaje normalmente pasarán corriente durante la fase de despolarización del impulso de estímulo. En el lado de la célula en el que el potencial transmembrana se lleva en una dirección negativa, los canales de potasio se liberan de la inactivación (si el canal en cuestión experimenta inactivación dependiente de voltaje). En el lado de la célula en el que el potencial transmembrana se lleva en una dirección positiva, los canales de potasio se activan y pasan la corriente hacia el exterior. Por tanto, la duración del impulso de estímulo no debe superar mucho el tiempo de inactivación. La corriente de potasio tiende a llevar al potencial transmembrana promedio en dirección negativa desde el potencial en reposo. Tras el impulso de estímulo, el potencial transmembrana se relajará exponencialmente hasta el potencial en reposo. Mediante la repetición del estímulo tras un tiempo más corto que la constante de tiempo de membrana, la membrana celular promedio puede hacerse más negativa. Utilizando un tren de estímulos, puede obtenerse una señal grande y continua.
Un protocolo de estimulación preferido que logra este efecto es bifásico, de manera que los canales iónicos presentes en ambos bordes de extremo de las células pueden participar en la mejora del movimiento del ion potasio. Normalmente se comenzaría con condiciones iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica de 5 ms por fase y una amplitud de 25 V/cm. El núcleo se repetiría a una tasa regular de aproximadamente 20 Hz durante una duración de tren total de aproximadamente tres segundos. Entonces se optimizaría la amplitud, la duración y después la frecuencia del impulso. Si fuera necesario, también podrían explorarse cambios en la forma del impulso para determinar si daban como resultado una estimulación eléctrica más eficaz. Los parámetros óptimos del estímulo darán el cambio máximo promedio en el potencial transmembrana (en comparación con células con el canal bloqueado o no presente) con el menor coeficiente de variación de la señal entre los diferentes pocillos de prueba, a la menor intensidad del campo eléctrico, y al menor ciclo de trabajo para el paso de la corriente a través de los electrodos. Una vez elegido un conjunto particular de parámetros, debe realizarse una valoración de las concentraciones de tinción para el(los) colorante(s) sensor(es) de voltaje tal como se describió anteriormente, para optimizar adicionalmente el tamaño de la señal y el coeficiente de variación de las respuestas. Estos procedimientos (concentraciones de colorante, intensidad del campo eléctrico, y duración y frecuencia del estímulo) pueden repetirse para optimizar la señal adicionalmente.
2) Canales de potasio rectificadores hacia el interior
Contrariamente a su nombre, la función del canal rectificador entrante es no permitir que entre potasio en la célula. El flujo hacia el interior de potasio sólo puede producirse (1) cuando el potencial transmembrana cae por debajo de los potenciales de equilibrio del potasio, o (2) si aumenta la concentración extracelular de potasio. Normalmente no se produce ninguna de estas situaciones, porque (1) en condiciones fisiológicas normales, dado que el potasio es el ion con el potencial de inversión más negativo, ninguna corriente iónica puede hacer que el potencial sea más negativo que el potencial de inversión del potasio, y (2) excepto en condiciones patológicas, la concentración extracelular de potasio está rigurosamente controlada. Sin embargo, utilizando la estimulación eléctrica, partes de la membrana celular pueden llevarse a niveles por debajo de V_{K}, potenciando la entrada del ion potasio en la célula. Esto producirá un cambio en el potencial transmembrana positivo neto y puede detectarse como una señal positiva. Para desarrollar y optimizar un ensayo para bloqueantes del rectificador entrante, podría seguirse, por tanto, el procedimiento siguiente.
Los tipos celulares preferidos incluyen aquellas células que expresan un nivel mínimo de otros canales iónicos, tales como CHO-K1, CHL, y LTK(-). La transfección y la selección de clones que expresan canales iónicos de interés generalmente se llevarán a cabo tal como se describió anteriormente para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo. Alternativamente, podría utilizarse una línea celular que expresa endógenamente el canal de interés. El marcaje y la medición de las células con colorantes para el potencial transmembrana generalmente se llevarán a cabo tal como se describió para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo.
Un protocolo de estimulación preferido utiliza un núcleo bifásico, de manera que participen los canales iónicos presentes en ambos bordes de extremo de las células. Normalmente se comenzaría con condiciones iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica de 5 ms por fase y una amplitud de 25 V/cm. El núcleo se repetiría a una tasa regular de aproximadamente 20 Hz durante una duración de tren total de aproximadamente tres segundos. Entonces se optimizaría la amplitud, la duración y después la frecuencia del impulso. Si fuera necesario, también podrían explorarse cambios en la forma del impulso para determinar si daban como resultado una estimulación eléctrica más eficaz. Los parámetros óptimos del estímulo darán la estimulación celular máxima (en comparación con células con el canal bloqueado o no presente) con el menor coeficiente de variación de la señal entre los diferentes pocillos de prueba, a la menor intensidad del campo eléctrico, y al menor ciclo de trabajo para el paso de la corriente a través de los electrodos. Una vez elegido un conjunto particular de parámetros, debe realizarse una valoración de las concentraciones de tinción para el(los) colorante(s) sensor(es) de voltaje tal como se describió anteriormente, para optimizar adicionalmente el tamaño de la señal y el coeficiente de variación de las respuestas. Estos procedimientos (concentraciones de colorante, intensidad del campo eléctrico, y duración y frecuencia del estímulo) pueden repetirse para optimizar la señal adicionalmente.
iii) Ensayos utilizando un contracanal de sodio dependiente de voltaje
Este método supone el uso de una línea celular que expresa el canal de potasio dependiente de voltaje de interés y que también expresa un canal de sodio dependiente de voltaje. En este método el enfoque es utilizar protocolos de estimulación eléctrica diseñados para activar específicamente el canal de sodio dependiente de voltaje. En este caso, la estimulación eléctrica hace que los iones sodio entren en la célula, produciendo un cambio de voltaje positivo. La presencia del canal de potasio de interés tenderá a suprimir la respuesta positiva del canal de sodio permitiendo que los iones potasio salgan de la célula. El ensayo se aprovecha de la ausencia de corriente hacia el exterior cuando un compuesto químico de prueba bloquea el canal de potasio, restableciendo así la gran respuesta al voltaje positivo inducida normalmente por la activación de los canales de sodio. La optimización del equilibrio de las corrientes es importante en este método para garantizar que el ensayo es sensible al bloqueo del canal de potasio. Si la corriente de sodio es demasiado pequeña con respecto a la corriente de potasio, la curva dosis - respuesta para el bloqueante del canal de potasio cambiará hacia las concentraciones superiores. Por ejemplo, en el caso extremo en el que la corriente de potasio sea 100 veces superior que la corriente de sodio, el 99% de los canales de potasio tendrían que estar bloqueados con el fin de conseguir una respuesta del 50% de los canales de sodio.
Dado que este método supone excitar un canal de sodio dependiente de voltaje con impulsos repetitivos, el desarrollo del protocolo es esencialmente el mismo al descrito anteriormente para los canales de sodio activados por voltaje en un estado inactivado. Normalmente se comenzaría con condiciones iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica de 5 ms por fase y una amplitud de 25 V/cm. El núcleo se repetiría a una tasa regular de aproximadamente 20 Hz durante una duración de tren total de aproximadamente tres segundos. Entonces se optimizaría la amplitud, la duración y después la frecuencia del impulso. Si fuera necesario, también podrían explorarse cambios en la forma del impulso para determinar si daban como resultado una estimulación eléctrica más eficaz. Los parámetros óptimos del estímulo darán la estimulación celular máxima (en comparación con células con el canal bloqueado o no presente) con el menor coeficiente de variación de la señal entre los diferentes pocillos de prueba, a la menor intensidad del campo eléctrico, y al menor ciclo de trabajo para el paso de la corriente a través de los electrodos. Una vez elegido un conjunto particular de parámetros, debe realizarse una valoración de las concentraciones de tinción para el(los) colorante(s) sensor(es) de voltaje tal como se describió anteriormente, para optimizar adicionalmente el tamaño de la señal y el coeficiente de variación de las respuestas. Estos procedimientos (concentraciones de colorante, intensidad del campo eléctrico, y duración y frecuencia del estímulo) pueden repetirse para optimizar la señal adicionalmente.
En este formato de ensayo, idealmente no habrá respuesta (o habrá una muy pequeña) a la estimulación en ausencia de bloqueo del canal, debido a que la corriente de potasio contrarrestará la corriente de sodio. Por tanto, para optimizar las condiciones del estímulo, será necesario comparar las respuestas con y sin la actividad del canal de potasio. Idealmente, esto se llevará a cabo utilizando un bloqueante selectivo del canal de potasio. En aquellos casos en los que tal bloqueante todavía se desconozca, será posible utilizar la línea celular que contiene sólo el contracanal de sodio.
Dado que este formato de ensayo implica dos canales iónicos, los moduladores de cualquiera de los canales afectarán a la respuesta al voltaje. En este caso, un éxito (un bloqueante del canal de potasio) restablecerá la respuesta al voltaje. El formato de selección hace caso omiso automáticamente de los compuestos que sólo bloquean el canal de sodio. Sin embargo, la estimulación de las células en presencia de compuestos que bloquean ambos canales también dará como resultado la no desviación del voltaje, lo que sugiere que el compuesto es inactivo. Dado que los compuestos de este tipo pueden ser de interés, también se dispone de un método para desenmascararlos. Mediante la realización de la selección de compuesto idéntica utilizando la línea celular original, que contiene el canal de sodio pero no el canal de potasio, pueden encontrarse bloqueantes del canal de sodio. Los compuestos que se encuentra que bloquean el canal de sodio pueden someterse a prueba entonces separadamente para encontrar si tienen actividad frente al canal de potasio.
c) Ensayo de los canales de calcio
Los canales de calcio se encuentran generalmente en muchas células en las que, entre otras funciones, desempeñan importantes papeles en la transducción de la señal. En las células excitables, el calcio intracelular suministra una corriente hacia el interior mantenida durante largas respuestas de despolarización y sirve como el enlace entre la despolarización y otros mecanismos intracelulares de transducción de la señal. Al igual que los canales de sodio regulados por voltaje, los canales de calcio regulados por voltaje tienen múltiples estados de reposo, activado e inactivado.
Se han identificado múltiples tipos de canales de calcio en células de mamífero procedentes de diversos tejidos, incluyendo músculo esquelético, músculo cardiaco, pulmón, músculo liso y cerebro, [véase, por ejemplo, Bean, B. P. (1989) Ann. Rev. Physiol. 51: 367-384 y Hess, P. (1990) Ann. Rev. Neurosci. 56: 337]. Los diferentes tipos de canales de calcio se han clasificado ampliamente en cuatro clases, los tipos L, T, N y P, distinguiéndose por las cinéticas de corriente, la sensibilidad del potencial basal y la sensibilidad a agonistas y antagonistas del canal de calcio. Se han propuesto cuatro subtipos de canales de calcio neuronales dependientes de voltaje (Swandulla, D. et al., Trends in Neuroscience 14: 46, 1991).
Se han determinado el ADNc y las secuencias de aminoácidos correspondientes de las subunidades \alpha1, \alpha2, \beta y \gamma del canal de calcio del músculo esquelético del conejo [véase, Tanabe et al. (1987) Nature 328: 313-318; Ruth et al. (1989) Science 245: 1115-1118; y patente de los EE.UU. número 5.386.025]. Además, también se han determinado el ADNc y las secuencias de aminoácidos correspondientes de las subunidades \alpha1 de los canales de calcio del músculo cardiaco [Mikami, A. et al. (1989) Nature 340: 230-233] y el pulmón [Biel, M. (1990) FEBS Letters 269: 409-412] del conejo. Además, se han aislado clones de ADNc que codifican para un canal de calcio de cerebro de conejo (designado como el canal BI) [Mori, Y. et al. (1991) Nature 350: 398-402].
Se han aislado clones de ADNc parciales que codifica para partes de varios subtipos diferentes, denominados las clases A, B, C y D de cerebro de rata, de la subunidad \alpha1 del canal de calcio a partir de bibliotecas de ADNc de cerebro de rata [Snutch, T. et al. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87: 3391-3395]. Más recientemente, se han aislado clones de ADNc de longitud completa de la clase A [Starr, T. et al. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 5621-5625] y la clase C [Snutch, T. et al. (1991) Neuron 7: 45-57] de cerebro de rata. Aunque la secuencia de aminoácidos codificada por el ADN de clase C de cerebro de rata es aproximadamente idéntica en un 95% a la codificada por el ADN que codifica para la subunidad \alpha1 del canal de calcio del músculo cardiaco del conejo, la secuencia de aminoácidos codificada por el ADN de clase A del cerebro de rata sólo comparte un 33% de identidad de secuencia con la secuencia de aminoácidos codificada por el ADN que codifica para la subunidad \alpha1 del músculo cardiaco o esquelético del conejo. También se ha obtenido un clon de ADNc que codifica para otra subunidad \alpha1 del canal de calcio del cerebro de rata [Hui, A. et al. (1991) Neuron 7: 35-44]. La secuencia de aminoácidos codificada por este clon es aproximadamente homóloga en un 70% a las proteínas codificadas por el ADN del canal de calcio del músculo cardiaco y esquelético del conejo. También se ha aislado un clon de ADNc estrechamente relacionado con el ADNc que codifica para la subunidad \alpha1 de la clase C del cerebro de rata y secuencias de clones de ADNc parciales estrechamente relacionadas con otros clones de ADNc parciales aparentemente diferentes de las subunidades \alpha1 del canal de calcio [véase, Snutch, T. et al. (1991) Neuron 7: 45-57; Perez-Reyes, E. et al. (1990) J. Biol. Chem. 265: 20430; y Hui, A. et al. (1991) Neuron 7: 35-44].
Para los canales de calcio conocidos que se han caracterizado, las constantes de tiempo de activación oscilan desde 0,1 hasta 10 ms con potenciales umbral desde -80 hasta -20 mV. Las constantes de tiempo de inactivación oscilan desde 0,1 hasta \infty (es decir, no inactivación) con potenciales umbral desde -60 hasta -20 mV. Las constantes de tiempo para la liberación de la inactivación oscilan desde 0,5 ms hasta 100 ms con potenciales umbral desde -70 hasta -40 mV.
La elección de la línea celular y la inducción de las corrientes de calcio dependientes de voltaje se llevan a cabo utilizando las directrices y enfoques generales tratados anteriormente para los canales de sodio.
Los tipos celulares preferidos incluyen aquellas células que expresan un nivel mínimo de otros canales iónicos, tales como CHO-K1, CHL y LTK(-). La transfección y la selección de clones que expresan canales iónicos de interés generalmente se llevarán a cabo tal como se describió anteriormente para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo. Alternativamente, podría utilizarse una línea celular que expresa endógenamente el canal de interés. El marcaje y la medición de las células con colorantes para el potencial transmembrana generalmente se llevarán a cabo tal como se describió para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo. Alternativamente, las células pueden cargarse con colorantes fluorescentes sensibles al calcio tales como Calcium Green, fluo3-AM, o indo-1.
En las células con bajas corrientes de fondo, pueden generarse fuertes corrientes de calcio hacia el interior haciendo que partes de la membrana sean lo suficientemente negativas como para liberar los canales de la inactivación. Entonces, mediante la inversión o la liberación del campo eléctrico externo, los canales se exponen a potenciales que activan los canales y permiten que la corriente de calcio fluya hacia el interior de la célula. El potencial de inversión para el calcio en la mayoría de las células generalmente es de +60 a +100 mV, por lo que son posibles grandes cambios en el voltaje debidos al flujo hacia el interior del calcio. Se pueden utilizar, o bien colorantes sensibles al voltaje unidos a la membrana o colorantes de calcio intracelulares para monitorizar la actividad de las células. Debido a la similitud en las propiedades de los canales de calcio y de sodio, se aplicarán los mismos procedimientos de optimización del ensayo generales explicados anteriormente para los canales de sodio.
Normalmente se comenzaría con condiciones iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica de 5 ms por fase y una amplitud de 25 V/cm. El núcleo se repetiría a una tasa regular de aproximadamente 20 Hz durante una duración de tren total de aproximadamente tres segundos. Entonces se optimizaría la amplitud, la duración y después la frecuencia del impulso. Si fuera necesario, también podrían explorarse cambios en la forma del impulso para determinar si daban como resultado una estimulación eléctrica más eficaz. Los parámetros óptimos del estímulo darán la estimulación celular máxima (en comparación con células con el canal bloqueado o no presente) con el menor coeficiente de variación de la señal entre los diferentes pocillos de prueba, a la menor intensidad del campo eléctrico, y al menor ciclo de trabajo para el paso de la corriente a través de los electrodos. Una vez elegido un conjunto particular de parámetros, debe realizarse una valoración de las concentraciones de tinción para el(los) colorante(s) sensor(es) de voltaje tal como se describió anteriormente, para optimizar adicionalmente el tamaño de la señal y el coeficiente de variación de las respuestas. Estos procedimientos (concentraciones de colorante, intensidad del campo eléctrico, y duración y frecuencia del estímulo) pueden repetirse para optimizar la señal adicionalmente.
Durante estos experimentos, se comparará la respuesta para las células con canales activos, y para las células en las que los canales están bloqueados farmacológicamente. Si no se dispone de un agente farmacológicamente adecuado, el estado bloqueado puede emularse con una línea celular no transfectada. Los parámetros óptimos del estímulo darán el menor coeficiente de variación de la diferencia en las señales de las dos poblaciones celulares.
d) Ensayo de los canales de cloruro dependientes de voltaje
Los canales de cloruro se encuentran en las membranas plasmáticas de prácticamente todas las células del organismo. Los canales de cloruro median una variedad de funciones celulares, incluyendo la regulación de los potenciales transmembrana y la absorción y la secreción de iones a través de las membranas epiteliales. Cuando están presentes en las membranas intracelulares del aparato de Golgi y las vesículas endocíticas, los canales de cloruro también regulan el pH del orgánulo. Para una revisión, véase Greger, R (1988) Annu. Rev. Physiol. 50: 111-122.
Las tres clases distintas de canales de cloruro se basan aparentemente en su tipo de regulación y en la conformación estructural, tabla 3. La primera clase incluye las superfamilias del receptor de GABA y glicina, la segunda clase incluye el CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrana Conductance Regulator, regulador de la conductancia transmembrana de la fibrosis cística) y la tercera clase incluye los canales de cloruro regulados por voltaje.
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A diferencia de los iones como el sodio y especialmente el calcio, el gradiente electroquímico del cloruro a través de la membrana plasmática generalmente no se aleja del equilibrio. Por tanto, al potencial en reposo de las células, la apertura de los canales de cloruro no conducirá a grandes fluctuaciones del voltaje de la membrana plasmática ni a cambios drásticos en la concentración de cloruro intracelular. Dado que la estimulación eléctrica normalmente genera cambios de voltaje simétricos a través de la membrana celular, no puede generarse un flujo de cloruro neto, a menos que la conductividad del canal sea no lineal. Para una conductancia de fuga lineal, un campo eléctrico uniforme conducirá cloruro hacia el interior de la célula en un lado y hacia fuera de la célula en el otro lado.
La estimulación eléctrica directa de los canales de cloruro que tienen curvas de conductancia no lineares (rectificadores) o regulación activada por voltaje, puede generar flujos de iones netos que, a su vez, producirán cambios detectables en el potencial transmembrana. Dependiendo de la dependencia del voltaje de la conductancia y la regulación, el cambio en el potencial transmembrana puede ser positivo o negativo. Para los canales de cloruro típicos (que se activan a potenciales elevados y se cierran a los potenciales más negativos) y para los rectificadores hacia el exterior, el cloruro fluirá hacia el interior de la célula y hará que el potencial transmembrana sea negativo. Para los rectificadores hacia el interior, el cloruro se conducirá hacia fuera de la célula y el potencial transmembrana se hará positivo.
Debido a la pequeña diferencia entre el potencial de inversión del cloruro y el potencial transmembrana en reposo, la estimulación directa de un canal de cloruro regulado por voltaje puede dar como resultado cambios insuficientes en el potencial transmembrana. Entonces, pueden desarrollarse ensayos para estos canales iónicos utilizando la coexpresión y la estimulación eléctrica de un contracanal de sodio o potasio, con el fin de producir una corriente hacia el interior o hacia el exterior. La presencia o ausencia de la corriente de cloruro puede determinarse entonces mediante la ausencia o presencia de un cambio en el potencial transmembrana cuando el contracanal se estimula eléctricamente.
Los tipos celulares preferidos incluyen aquellas células que expresan un nivel mínimo de otros canales iónicos, tales como CHO-K1, CHL, y LTK(-). La transfección y la selección de clones que expresan canales iónicos de interés generalmente se llevarán a cabo tal como se describió anteriormente para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo. Alternativamente, podría utilizarse una línea celular que expresa endógenamente el canal de interés (o el contracanal). El marcaje y la medición de las células con colorantes para el potencial transmembrana generalmente se llevarán a cabo tal como se describió para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo.
Normalmente se comenzaría con condiciones iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica de 5 ms por fase y una amplitud de 25 V/cm. El núcleo se repetiría a una tasa regular de aproximadamente 20 Hz durante una duración de tren total de aproximadamente tres segundos. Entonces se optimizaría la amplitud, la duración y después la frecuencia del impulso. Si fuera necesario, también podrían explorarse cambios en la forma del impulso para determinar si daban como resultado una estimulación eléctrica más eficaz. Los parámetros óptimos del estímulo darán la estimulación celular máxima (en comparación con células con el canal bloqueado o no presente) con el menor coeficiente de variación de la señal entre los diferentes pocillos de prueba, a la menor intensidad de campo eléctrico, y al menor ciclo de trabajo para el paso de la corriente a través de los electrodos. Una vez elegido un conjunto particular de parámetros, debe realizarse una valoración de las concentraciones de tinción para el(los) colorante(s) sensor(es) de voltaje tal como se describió anteriormente, para optimizar adicionalmente el tamaño de la señal y el coeficiente de variación de las respuestas. Estos procedimientos (concentraciones de colorante, intensidad del campo eléctrico, y duración y frecuencia del estímulo) pueden repetirse para optimizar la señal adicionalmente.
Durante estos experimentos, se comparará la respuesta para las células con canales activos, y para las células en las que los canales están bloqueados farmacológicamente. Si no se dispone de un agente farmacológicamente adecuado, el estado bloqueado puede emularse con una línea celular no transfectada. Los parámetros óptimos del estímulo darán el menor coeficiente de variación de la diferencia en las señales de las dos poblaciones celulares.
e) Ensayo de canales dependientes de ligando
La familia de canales iónicos dependientes de ligando es grande y diversa. Los canales iónicos dependientes de ligando se abren en respuesta a la unión de moléculas específicas. Normalmente median la transmisión sináptica rápida entre neuronas, y desde las neuronas hasta las células musculares. También median la transmisión sináptica lenta y controlan una variedad de mecanismos reguladores. Los canales iónicos regulados por ligando generalmente sólo son selectivos de carga; es decir, permiten el flujo de un intervalo de aniones o cationes, pero tienen poca especificidad. Tienen una enorme variación en sus cinéticas de activación, desactivación, y desensibilización, pudiendo variar todas ellas desde constantes de tiempo de submilisegundos hasta de segundos.
Cuando el ligando se une al receptor del canal, el canal experimenta uno o más cambios conformacionales para activar el canal. Si el ligando se extrae de la solución salina que baña, los ligando unidos se disocian y el canal se cierra. Si el ligando permanece en la solución salina que baña, algunos canales se desensibilizan y retienen el ligando pero moviéndose hacia un estado conformacional diferente en el que el canal está cerrado. Las distribuciones de equilibrio entre los estados activado, desactivado y desensibilizado varían enormemente entre canales.
En los formatos de ensayo actuales, el potencial transmembrana de las células se monitoriza durante una adición de ligando. El aumento repentino en la conductancia cuando el canal se abre lleva el potencial transmembrana hacia un nuevo potencial de inversión. Desgraciadamente, para muchos canales regulados por ligando el nuevo potencial de inversión normalmente está dentro de 15 mV de potencial en reposo. Este pequeño cambio es suficiente para su uso en la señalización dentro de las células, pero dificulta los ensayos farmacológicos.
En un ensayo de estimulación eléctrica para los canales iónicos regulados por ligando, un enfoque es coexpresar un contracanal de sodio regulado por voltaje con el canal iónico regulado por ligando de interés. Este enfoque permite modular el potencial transmembrana mediante estimulación eléctrica. Si se añaden los compuestos de prueba a las células durante o antes de la estimulación eléctrica, el método permite un análisis de si el canal regulado por ligando está abierto o cerrado. Si los canales regulados por ligando están abiertos, la alta conductancia en reposo de la célula suprimirá la respuesta de voltaje a la estimulación eléctrica. Sin embargo, si los canales regulados por ligando están bloqueados, las células tendrán una gran respuesta a la estimulación eléctrica. La gran cantidad de flexibilidad en los parámetros de estimulación eléctrica debe permitir someter a ensayo un gran intervalo de conductancias en reposo. Esto es importante en el caso de los canales regulados por ligando, porque la conductancia en reposo en presencia del ligando es muy sensible a la desensibilización en equilibrio. Al considerar la desensibilización y las variaciones en la expresión del canal, se pueden obtener resistencias en reposo de la membrana que oscilan en cualquier parte desde 10 M\Omega hasta 10 G\Omega. Con canales de sodio de tipo IIa de cerebro de rata como el contracanal, se puede cubrir la totalidad de este intervalo. También debe ser posible seleccionar tanto agonistas como antagonistas. Al escoger los parámetros de estimulación de manera que la respuesta sea de la mitad, los agonistas reducirán la respuesta mientras que los antagonistas la aumentarán. Los mejores intervalos de selección pueden obtenerse mediante la estimulación a frecuencias superiores (ensayo de agonista) o inferiores (ensayo de antagonista). Debe observarse que se detectarán todos los moduladores de la conductancia del canal, tiempo de apertura, desensibilización, y desactivación.
Los tipos celulares preferidos incluyen aquellas células que expresan un nivel mínimo de otros canales iónicos, tales como CHO-K1, CHL, y LTK (-). La transfección y la selección de clones que expresan canales iónicos de interés generalmente se llevarán a cabo tal como se describió anteriormente para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo. Alternativamente, podría utilizarse una línea celular que expresa endógenamente el canal de interés (o el contracanal). El marcaje y la medición de las células con colorantes para el potencial transmembrana generalmente se llevarán a cabo tal como se describió para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo.
Normalmente se comenzaría con condiciones iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica de 5 ms por fase y una amplitud de 25 V/cm. El núcleo se repetiría a una tasa regular de aproximadamente 20 Hz durante una duración de tren total de aproximadamente tres segundos. Entonces se optimizaría la amplitud, la duración y después la frecuencia del impulso. Si fuera necesario, también podrían explorarse cambios en la forma del impulso para determinar si daban como resultado una estimulación eléctrica más eficaz. Los parámetros óptimos del estímulo darán la estimulación celular máxima (en comparación con las células con el canal regulado por ligando bloqueado, o no presente) con el menor coeficiente de variación de la señal entre los diferentes pocillos de prueba, a la menor intensidad del campo eléctrico, y al menor ciclo de trabajo para el paso de la corriente a través de los electrodos. Una vez elegido un conjunto particular de parámetros, debe realizarse una valoración de las concentraciones de tinción para el(los) colorante(s) sensor(es) de voltaje tal como se describió anteriormente, para optimizar adicionalmente el tamaño de la señal y el coeficiente de variación de las respuestas. Estos procedimientos (concentraciones de colorante, intensidad del campo eléctrico, y duración y frecuencia del estímulo) pueden repetirse para optimizar la señal adicionalmente.
Durante estos experimentos, se comparará la respuesta para las células con canales activos, y para las células en las que los canales están bloqueados farmacológicamente. Si no se dispone de un agente farmacológicamente adecuado, el estado bloqueado puede emularse con una línea celular no transfectada. Los parámetros óptimos del estímulo darán el menor coeficiente de variación de la diferencia en las señales de las dos poblaciones celulares.
f) Ensayo de canales pasivos
Muchos canales tienen cambios de conductancia activada por voltaje lentos o ausencia de los mismos. Ejemplos principales son algunos de los canales implicados en la fibrosis cística, particularmente el regulador transmembrana de la fibrosis cística (CFTR, un canal de cloruro), el canal de sodio epitelial (ENaC) y los miembros de la familia de canales de potasio 4 TM (Wang et al. Ann. N. Y. Acad. Sci. 868: 286-303, 1999). Una pequeña molécula que actúa como un agonista para cualquiera de estos canales podría ser un candidato para un fármaco que alivie la fibrosis cística. En la actualidad, no hay ningún método de selección de alto rendimiento realizable conveniente para los canales de este tipo.
El formato de ensayo propuesto para las dianas del canal iónico de este tipo incluye una célula que expresa el canal de fuga de interés en una célula que también expresa un canal de sodio dependiente de voltaje. El canal de interés se clona en una célula con un canal de sodio dependiente de voltaje. La presencia de la corriente pasiva suprimirá la respuesta positiva del canal de sodio cuando se estimulan las células. El bloqueo del canal pasivo restaurará la gran respuesta positiva al voltaje. La optimización del equilibrio de las corrientes será importante en este método. La célula CHO de tipo natural puede ser útil para este fin, aunque sería preferible una célula con corrientes de sodio mayores (tanto endógenas como obtenidas por ingeniería genética). Si la corriente de sodio es demasiado pequeña con relación a la corriente de potasio, la curva dosis-respuesta para el bloqueante del canal pasivo cambiará hacia concentraciones superiores. Por ejemplo, en el caso extremo en el que la corriente pasiva sea 100 veces mayor que la corriente de sodio, el 99% de los canales pasivos tendría que estar bloqueado con el fin conseguir una respuesta del 50% con respecto a la de los canales de sodio.
Los tipos celulares preferidos incluyen aquellas células que expresan un nivel mínimo de otros canales iónicos, tales como CHO-K1, CHL, y LTK (-). La transfección y la selección de clones que expresan canales iónicos de interés generalmente se llevarán a cabo tal como se describió anteriormente para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo. Alternativamente, podría utilizarse una línea celular que expresa endógenamente el canal de interés (o el contracanal). El marcaje y la medición de las células con colorantes para el potencial transmembrana general-
mente se llevarán a cabo tal como se describió para los canales iónicos de sodio normalmente en el estado de reposo.
Un protocolo de estimulación preferido utiliza un núcleo bifásico. En general, se llevan a cabo una serie de experimentos iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica repetido a una tasa regular durante una duración de tren fijada. La duración de impulso varía desde aproximadamente 1 \mus hasta aproximadamente 1 s, y más preferiblemente desde aproximadamente 100 \mus hasta aproximadamente 20 ms. La amplitud del impulso varía desde 0 V/cm hasta aproximadamente 60 V/cm, y más preferiblemente desde 10 V/cm hasta 50 V/cm. La frecuencia de estimulación varía entre 0 Hz (es decir, un único impulso) y 100 kHz, y más preferiblemente desde 0 Hz hasta aproximadamente 1 kHz. El tren de impulsos varía entre 0 s (es decir, un único impulso) y aproximadamente 100 s, y más preferiblemente entre 0 s y 10 s.
Normalmente se comenzaría con condiciones iniciales utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica de 5 ms por fase y una amplitud de 25 V/cm. El núcleo se repetiría a una tasa regular de aproximadamente 20 Hz durante una duración de tren total de aproximadamente tres segundos. Entonces se optimizaría la amplitud, la duración y después la frecuencia del impulso. Si fuera necesario, también podrían explorarse cambios en la forma del impulso para determinar si daban como resultado una estimulación eléctrica más eficaz. Los parámetros óptimos del estímulo darán la estimulación celular máxima (en comparación con las células con el canal dependiente de ligando bloqueado, o no presente) con el menor coeficiente de variación de la señal entre los diferentes pocillos de prueba, a la menor intensidad del campo eléctrico, y al menor ciclo de trabajo para el paso de la corriente a través de los electrodos. Una vez elegido un conjunto particular de parámetros, debe realizarse una valoración de las concentraciones de tinción para el(los) colorante(s) sensor(es) de voltaje tal como se describió anteriormente, para optimizar adicionalmente el tamaño de la señal y el coeficiente de variación de las respuestas. Estos procedimientos (concentraciones de colorante, intensidad del campo eléctrico, y duración y frecuencia del estímulo) pueden repetirse para optimizar la señal adicionalmente.
Debe ser posible seleccionar tanto agonistas como antagonistas. Al escoger los parámetros de estimulación de manera que la respuesta sea la mitad de la máxima, los agonistas reducirán la respuesta mientras que los antagonistas la aumentarán. Pueden obtenerse mejores intervalos de selección mediante la estimulación a frecuencias superiores (ensayo de agonista) o inferiores (ensayo de antagonista).
Durante estos experimentos, se comparará la respuesta para las células con canales activos, y para las células en las que los canales están bloqueados farmacológicamente. Si no se dispone de un agente farmacológicamente adecuado, el estado bloqueado puede emularse con una línea celular no transfectada. Los parámetros óptimos del estímulo darán el menor coeficiente de variación de la diferencia en las señales de las dos poblaciones celulares.
La presente invención también incluye métodos para la determinación cuantitativa de los parámetros celulares y del canal iónico, y para la cuantificación de los efectos farmacológicos de los compuestos de prueba en estos parámetros utilizando estimulación eléctrica.
b) Mediciones cuantitativas de las resistencias de la membrana
Una vez que finaliza el estímulo eléctrico, el potencial transmembrana de la célula se relaja hasta un nuevo potencial en reposo. En el caso de los ensayos de canal dependiente de voltaje, los canales generalmente se cerrarán o inactivarán, y el potencial de equilibrio en reposo final será el mismo que antes del estímulo. En la mayor parte de los casos, la carga acumulada sobre la capacitancia de la membrana se disipará exponencialmente a través de la resistencia de la membrana. La constante de tiempo de membrana es simplemente el producto de la capacitancia de la membrana y la resistencia de la membrana, \tau_{m} = R_{m}C_{m}. Puede determinarse fácilmente midiendo la capacitancia de la membrana y la constante de tiempo de membrana.
La capacitancia promedio de la membrana para las células utilizadas comúnmente en estos ensayos es independiente del canal exógeno y puede medirse fácilmente mediante métodos de patch clamp. La constante de tiempo de membrana puede medirse fácilmente midiendo la tasa de disminución del potencial transmembrana y ajustando este dato a una función de disminución exponencial. Por tanto, dividiendo la constante de tiempo de membrana entre la capacitancia promedio de la membrana para el tipo de célula dado, se puede determinar cuantitativamente la resistencia de la membrana en reposo o fuga.
Puede realizarse un análisis similar para medir cuantitativamente la resistencia de la membrana mientras se abre un canal dependiente de voltaje. Durante la estimulación eléctrica, el potencial transmembrana también se relajará aproximadamente exponencialmente hacia un nuevo potencial de equilibrio. Por tanto, la constante de tiempo de membrana del cambio de voltaje al comienzo del estímulo constituye una medida de la resistencia de la membrana promediada en el tiempo. Utilizando factores de escala apropiados para explicar la fracción de tiempo que el canal está realmente abierto, se puede realizar una estimación cuantitativa de la resistencia de la membrana con el canal abierto.
c) Medición de la liberación de la constante de tiempo de inactivación
La apertura de un canal iónico de inactivación requiere mantener el potencial transmembrana por debajo de un umbral durante un tiempo del orden de varios milisegundos. Esta liberación de la inactivación tiene importantes implicaciones fisiológicas. Por ejemplo, la liberación de la inactivación fuerza un periodo de resistencia que evita la nueva propagación de los potenciales de acción, y limita las tasas de activación máximas de las neuronas. La manipulación farmacológica de esta propiedad puede ser terapéuticamente relevante.
Utilizando una estimulación eléctrica repetitiva, se puede estimar la liberación promedio del tiempo de inactivación. Esto puede realizarse utilizando impulsos de campo eléctrico de anchura variable. Cuando la anchura del impulso cae por debajo de la liberación del tiempo de inactivación, se activarán menos canales y disminuirá el aumento en el potencial transmembrana en respuesta a la estimulación.
d) Medición del tiempo de canal abierto
El tiempo de canal abierto \tau_{abierto} es una función de las propiedades de inactivación del canal. Se pueden detectar la manipulación farmacológica de este parámetro en un modo de rendimiento de medio a alto mediante la estimulación a frecuencia muy alta. Por ejemplo, se considera un ensayo para un canal de sodio dependiente de voltaje utilizando el método de múltiples estímulos. Con un núcleo de estímulo monofásico fijo de onda cuadrada repetido a una tasa constante, la respuesta al voltaje aumenta cuando aumenta la tasa de repetición del estímulo. Esto se debe a que el canal de sodio pasa relativamente más tiempo abierto a una frecuencia superior. Sin embargo, si el intervalo entre impulsos se hace más corto que el tiempo de canal abierto, los canales de sodio activados se harán negativos y, por tanto, estarán desactivados, mediante el impulso de estímulo posterior. La frecuencia de la ráfaga de estimulación a la que se aplana la respuesta está relacionada con el tiempo de canal abierto.
e) Estimulación eléctrica como un dispositivo extracelular de fijación de corriente
En el registro de célula completa, la fijación de corriente es un modo en el que las corrientes de control pueden llevarse hacia el interior de la célula mientras se registra el potencial transmembrana. Aunque el registro mediante la técnica de patch-clamp es extremadamente preciso, es una técnica de rendimiento muy bajo. En un máximo absoluto en condiciones perfectas, un científico altamente cualificado podría determinar los parámetros celulares a una tasa de aproximadamente diez células por hora. A menudo, el nivel de detalle obtenido con la técnica de patch-clamp no es necesario para la selección de fármacos, pero en la actualidad no existe ningún método para cambiar el detalle por la velocidad. Una alta velocidad es absolutamente crucial para detectar grandes bibliotecas de
compuesto.
La técnica de estimulación por campo eléctrico tratada en el presente documento permite un nuevo tipo de electrofisiología de fijación de corriente que se denomina fijación de corriente extracelular. Pueden utilizarse canales dependientes de voltaje para llevar corrientes de control hacia el interior de cultivos celulares, lo que permite la determinación de varias propiedades celulares y de canal. La fijación de corriente extracelular tiene un rendimiento muy alto, de manera que será posible obtener un alto contenido de información de los efectos farmacológicos de las bibliotecas de compuestos frente a dianas específicas del canal iónico. La farmacología y la fisiología de un canal pueden estudiarse directamente, o el canal puede utilizarse como un generador de corriente para el estudio de la propia membrana celular o de un segundo canal iónico.
Aunque la precisión final de los parámetros microscópicos que se pueden obtener con la fijación de corriente extracelular no puede aproximarse a la del método de patch-clamp, ahora se puede cambiar el contenido de información por el rendimiento. Es decir, el grado de precisión en el que puede establecerse arbitrariamente la obtención de mediciones. Con un único conjunto de parámetros de estímulo, pueden seleccionarse grandes bibliotecas para posibles compuestos de interés. Puede llevarse a cabo una selección secundaria de rendimiento medio utilizando una valoración de las concentraciones de los compuestos en los éxitos para determinar la potencia y la especificidad. Finalmente, se puede determinar propiedades terapéuticamente relevantes tales como la dependencia del uso y el mecanismo de acción variando los parámetros del estímulo en presencia de los compuestos. En cada fase, las mediciones se promedian automáticamente para muchas células, reduciendo enormemente las incertidumbres asociadas con la variabilidad de una célula a otra.
Al menos hay dos ventajas adicionales de la fijación de corriente extracelular en comparación con el análisis de patch-clamp. En primer lugar, la integridad de la membrana celular no se altera durante la estimulación por campo eléctrico. El fluido intracelular se sustituye completamente con una disolución pipeteada durante el registro de patch clamp de célula completa. Muchas proteínas dentro de la célula, incluyendo los canales iónicos, son extremadamente sensibles a los moduladores, los mensajeros intracelulares y el entorno iónico. Los componentes del citoplasma sólo se conocen de modo rudimentario, por lo que los componentes solubles en el espacio intracelular siempre están alterados. Por tanto, el estado fisiológico "normal" de la célula sólo es aproximado durante el análisis de patch clamp de célula completa, pero permanece intacto cuando se utiliza la fijación de corriente extracelular.
En segundo lugar, la mayor parte de las células experimenta alteraciones espectaculares en el comportamiento y la expresión génica cuando entra en contacto con otras células. Dado que la mayor parte de las células también forma conexiones de unión en hendidura ("gap junctional connections"), con las de las células vecinas, el análisis de patch clamp de célula completa no sólo es fidedigno cuando las células están completamente aisladas entre sí. La fijación de corriente extracelular puede utilizarse sobre las células independientemente de su grado de confluencia, por lo que las células pueden ser más relevantes desde el punto de vista fisiológico. Se puede utilizar la fijación de corriente extracelular para descubrir si hay cualquier efecto del contacto célula - célula sobre la electrofisiología del canal. Entonces, junto con el análisis de la expresión génica, se puede relacionar estos cambios con los componentes reguladores de la célula.
f) Estimulación eléctrica como un dispositivo de fijación de voltaje extracelular
En la fijación de voltaje, se controla el potencial transmembrana de la célula mientras se monitoriza el flujo de corriente. La fijación de voltaje generalmente se logra añadiendo un bucle de realimentación a un circuito de fijación de corriente. En el caso del método de célula completa, esto puede lograrse fácilmente con el uso de dos pipetas unidas simultáneamente a la misma célula. Una pipeta pasa una corriente de control, mientras que la otra detecta el voltaje. Un circuito de realimentación compara el voltaje medido con el voltaje de control, y ajusta la corriente de control en consecuencia. Generalmente, dado que la resistencia de la membrana celular es grande en comparación con la resistencia de acceso de la pipeta, la misma pipeta puede utilizarse para controlar la corriente y medir el voltaje. En comparación con la fijación de corriente, la fijación de voltaje generalmente es un método más potente para el análisis electrofisiológico. Los canales iónicos son extremadamente sensibles al potencial transmembrana, de manera que el análisis de los datos es mucho más sencillo cuando trata con mediciones de corriente a un voltaje
fijado.
La fijación de corriente extracelular puede convertirse en un método de fijación de voltaje añadiendo un bucle de realimentación entre la medición del voltaje (la fluorescencia del colorante sensor) y el generador de corriente (los parámetros del estímulo). En este caso, se requiere un colorante del potencial transmembrana con suficiente velocidad. La combinación de colorantes CC2-DMPE/DiSBAC_{6} (3) tiene una constante de tiempo de submilisegundos y debe ser suficientemente rápida para captura todos, salvo los acontecimientos celulares más rápidos. Basándose en la diferencia de las mediciones del voltaje de control y el potencial transmembrana, un ordenador alterará los parámetros del estímulo. Los parámetros del estímulo están relacionados con la corriente dirigida hacia el interior de la célula, por lo que se puede determinar el transcurso de tiempo de la corriente como una función del voltaje de control. Este método debe demostrar ser útil en la determinación del mecanismo de acción de los agentes farmacológicos en las dianas de los canales iónicos.
g) Ensayos para los compartimentos intracelulares
Los métodos de estimulación descritos en el presente documento también pueden utilizarse para modular los potenciales transmembrana de los orgánulos intracelulares que tienen membranas fosfolipídicas, incluyendo la mitocondria y el núcleo. Esto puede llevarse a cabo aumentando en primer lugar la conductancia de la membrana plasmática o bien mediante electropermeabilización o bien mediante la adición de ionóforos tales como valinomicina o gramicidina A. Entonces, el espacio intracelular ya no está aislado del campo eléctrico aplicado. Esto permite que se aplique un campo eléctrico a la solución salina para generar cambios en el potencial transmembrana a través de las membranas de los orgánulos intracelulares. Entonces, mediante la tinción de las células con colorantes que son sensibles a la concentración de iones o al potencial transmembrana, y que se seleccionan como diana sólo para la membrana del orgánulo específico de interés, los métodos presentados en el presente documento pueden utilizarse para modular y someter a ensayo los canales iónicos de estos orgánulos. La selección como diana puede lograrse, por ejemplo mediante el uso de una proteína naturalmente fluorescente que contiene señales de localización subcelular adecuadas, tal como se conoce en la técnica.
IX. Introducción de moléculas exógenas
La ruptura dieléctrica de las membranas celulares de los mamíferos se produce si el potencial eléctrico a través de la membrana supera aproximadamente 200 mV (Teissie y Rols, 1993, Biophys. J. 65: 409-413). Cuando la membrana se rompe, se forman poros a través de la membrana, que conectan los espacios intracelular y extracelular. El número y el tamaño de los poros aumenta con el aumento de los potenciales transmembrana (Kinoshita y Tsong, 1977, Nature 268: 438-441). El aumento de la intensidad del campo eléctrico superior a aproximadamente 60 V/cm en líneas celulares de mamífero típicas puede electropermeabilizar las células. A campos relativamente bajos, se crean poros pequeños en la membrana celular que aparentemente son los suficientemente grandes como para dejar entrar iones pequeños, pero no lo suficientemente grandes como para dejar entrar moléculas tan grandes como el ADN (Tsong, 1991, Biophys. J. 60: 297-306). Estos poros despolarizan totalmente la célula, haciendo que el potencial transmembrana se aproxime a cero. Mediante la electropermeabilización de las células y la monitorización del cambio en el potencial transmembrana con un colorante sensible al voltaje, la presente invención puede utilizarse para determinar el potencial transmembrana en reposo de una célula. Esto será útil para determinar las interacciones farmacológicas con las células o los canales iónicos, o bien como selección primaria o bien secundaria. Por ejemplo, en una selección de compuestos frente a un canal de sodio dependiente de voltaje, puede llevarse a cabo un protocolo de múltiples estímulos para determinar la actividad del canal. Entonces, siguiendo con un protocolo de permeabilización, se podría determinar si la membrana celular tenía o no un potencial en reposo normal en presencia del compuesto.
Adicionalmente, utilizando una línea celular altamente polarizada tal como las células RBL, podrían calibrarse fácilmente los colorantes sensibles al voltaje mediante electropermeabilización. El potencial transmembrana de partida en determinadas condiciones (por ejemplo, varias concentraciones de potasio extracelular), y el potencial transmembrana final tras la electropermeabilización es cero.
Adicionalmente, el tamaño de los poros creados por la electropermeabilización aumenta como una función del campo eléctrico aplicado. Por debajo de 50 V/cm, no se crean poros. Entre aproximadamente 60 V/cm y 100 V/cm, se crean poros lo suficientemente grandes como para dejar entrar iones monovalentes. Por encima de aproximadamente 600 V/cm, se crean poros lo suficientemente grandes como para dejar entrar ADN (Tsong, 1991, Biophys. J. 60: 297-306). Por tanto, esta invención puede utilizarse para crear poros de tamaño definido en las membranas celulares, de una manera de alto rendimiento. Esto podría ser útil para muchas aplicaciones, incluyendo la administración al espacio intracelular de iones que no atraviesan los canales, compuestos de prueba que no atraviesan los canales u otros moduladores, ADN o ARN para el fin de la transfección transitoria o estable, y colorantes fluorescentes y otros indicadores.
X. Descubrimiento y selección de fármacos a) Selección de fármacos
La presente invención proporciona la detección fidedigna de compuestos de prueba que modulan la función del canal iónico que es significativamente más versátil y sólida que los sistemas de ensayo anteriores. Y lo que es más importante, la presente invención proporciona la capacidad de modular el potencial transmembrana en células intactas sin la necesidad de agentes farmacológicos, o la destrucción de la membrana, y la pérdida del contenido intracelular, como ocurre en el caso de la técnica de patching clamping. Al proporcionar la capacidad de modular externamente el potencial transmembrana de células vivas, la presente invención permite que se someta a ensayo una amplia variedad de canales iónicos.
Además, esta capacidad para modular con precisión el estado dependiente del voltaje de un canal iónico, tiene importantes ventajas para el descubrimiento de fármacos donde se proporciona la oportunidad de seleccionar compuestos que interaccionan preferentemente con un estado, (es decir, bloqueantes dependientes del uso). Por ejemplo, se sabe que varios fármacos conocidos terapéuticamente útiles (incluyendo antiarrítmicos, anticonvulsivantes y anestésicos locales) funcionan como bloqueantes dependientes del uso de los canales de sodio y/o calcio dependientes de voltaje. En cada caso, el bloqueo total del canal seleccionado como objetivo normalmente daría como resultado la muerte. Ciertas condiciones, tales como el dolor crónico, la arritmia y las convulsiones se producen cuando las células se vuelven hiperactivas. Estas condiciones pueden aliviarse o eliminarse bloqueando los canales si comienzan a abrirse con demasiada frecuencia. Los compuestos que pueden bloquear el canal, pero que se unen preferentemente al(a los) estado(s) activado(s) o inactivados(s), en lugar de al(a los) estado(s) de reposo, pueden reducir la excitabilidad del músculo y las neuronas. Estos fármacos son eficaces porque no afectan al canal en circunstancias normales, sino que sólo lo bloquean cuando es necesario para evitar la hiper-excitabilidad. Sin embargo, los métodos de análisis existentes que son compatibles con la selección de alto rendimiento no proporcionan la capacidad para controlar de manera rutinaria el estado de activación del canal iónico en tiempo
real.
En particular, la presente invención proporciona un método para seleccionar el efecto de un compuesto de prueba sobre un canal iónico en un estado funcional definido dentro de una célula. El método supone modular el potencial transmembrana de la célula mediante el uso de estimulación eléctrica repetitiva para efectuar ciclos del canal iónico de interés a través de su ciclo de activación y para fijar el potencial transmembrana hasta un nivel deseado adecuado para un estado de activación específico o una transición entre estados. A continuación, durante o después de este proceso, se añade un compuesto de prueba a la célula, y se mide el potencial transmembrana.
Normalmente, los resultados obtenidos en presencia del compuesto de prueba se compararán con una muestra control incubada en ausencia del compuesto de prueba. Las mediciones control normalmente se llevan a cabo con una muestra que contiene todos los componentes y en las mismas condiciones de estimulación que para la muestra de prueba, excepto por el supuesto fármaco. Pueden realizarse estudios control adicionales con el canal iónico en otro estado dependiente de voltaje para identificar específicamente los compuestos de prueba específicos del estado. La detección de un cambio en el potencial transmembrana en presencia del agente de prueba con respecto al control indica que el agente de prueba es activo y es específico sobre el canal iónico en ese estado, o durante la transición desde un estado hasta el otro.
Los potenciales transmembrana también pueden determinarse en presencia o ausencia de un agente farmacológico de actividad conocida (es decir, un agente patrón) o actividad posible (es decir, un agente de prueba). Una diferencia en los potenciales transmembrana tal como se detecta mediante los métodos descritos en el presente documento permite que se compare la actividad del agente de prueba con el del agente patrón. Se reconocerá que los expertos en la técnica conocen muchas combinaciones y permutaciones de protocolos de selección de fármacos y pueden adaptarse fácilmente para su uso con las presentes invenciones descritas en el presente documento para identificar compuestos, que afectan a los canales iónicos y o a los potenciales transmembrana. Esta invención contempla el uso de las presentes invenciones en combinación con todos estos métodos.
En otro aspecto, la presente invención incluye el uso de un segundo canal iónico junto con los métodos de estimulación eléctrica descritos en el presente documento para fijar el potencial transmembrana en reposo o estimulado en un valor predefinido proporcionando así la capacidad de someter a ensayo un primer canal iónico de interés. En una realización, el segundo canal iónico es un canal de sodio o calcio regulado por voltaje que permite la generación de potenciales transmembrana positivos continuos. En otra realización el segundo canal iónico es un canal de potasio regulado por voltaje, que permite la generación de potenciales transmembrana negativos. El uso de estos segundos canales iónicos permite que se utilice el método de estimulación eléctrica para fijar el potencial transmembrana hasta prácticamente cualquier nivel predefinido.
Dado que este formato de ensayo implica dos canales iónicos, los moduladores de cualquiera de los canales afectarán a la respuesta al voltaje. En este caso, pueden llevarse a cabo estudios control adicionales con la línea celular parental que expresa sólo el segundo canal iónico utilizado para fijar el potencial transmembrana. Entonces pueden volverse a probar separadamente los compuestos que bloquean el primer canal iónico para averiguar si tienen actividad frente al segundo canal iónico.
Normalmente, los compuestos de prueba seleccionados estarán presentes en bibliotecas de compuestos relacionados o diversos. La biblioteca puede tener miembros individuales que se prueban individualmente o en combinación, o la biblioteca puede tener una combinación de miembros individuales. Tales bibliotecas pueden tener al menos dos miembros, preferiblemente superior a aproximadamente 100 miembros o superior a aproximadamente 1.000 miembros, más preferiblemente superior a aproximadamente 10.000 miembros, y lo más preferiblemente superior a aproximadamente 100.000 ó 1.000.000 miembros.
b) Selectividad y toxicología de los moduladores candidatos
Una vez identificados, los moduladores candidatos pueden evaluarse para determinar la selectividad y los efectos toxicológicos utilizando métodos conocidos (véase, Lu, Basic Toxicology, Fundamentals, Target Organs, and Risk Assessment, Hemisphere Publishing Corp., Washington (1985); patente de los EE.UU. número: 5.196.313 concedida a Culbreth (el 23 de marzo de 1993) y patente de los EE.UU. número 5.567.952 concedida a Benet (el 12 de octubre de 1996).
Por ejemplo, pueden utilizarse líneas celulares primarias o cortes de tejido para detectar el efecto del modulador candidato sobre la respuesta del canal iónico de interés en su contexto fisiológico nativo. Por ejemplo, para seleccionar fármacos que muestran efectos específicos y/o selectivos sobre células cardiacas, puede ser preferible utilizar miocitos u otras líneas celulares modelo de cultivo celular in vitro. En este caso, podría completarse una selección primaria en una línea celular derivada de miocitos para identificar los compuestos que acortan, prolongan o bloquean los potenciales de acción inducidos eléctricamente.
La selección secundaría se diseñaría entonces para identificar los compuestos que muestran efectos potencialmente adversos sobre el organismo. Por ejemplo, esto puede llevarse a cabo seleccionando los efectos del fármaco candidato sobre tejidos eléctricamente excitables tales como los tejidos cardiacos o neuronales, o cultivos de células inmortalizadas derivados de estos cultivos. Estos tejidos desempeñan papeles críticos dentro de un organismo y podría predecirse que cualquier efecto no deseado del fármaco candidato sobre la capacidad de estos tejidos para estimularse eléctricamente crearía posibles efectos secundarios graves al administrarse. Como consecuencia, los compuestos activos que también afectan a la capacidad de estos tejidos para funcionar, podrían dejar de considerarse como candidatos de fármacos en un estadio temprano, o podría realizarse química farmacéutica para reducir los efectos secun-
darios.
El análisis toxicológico adicional de los moduladores candidatos puede establecerse mediante la determinación de la toxicidad in vitro hacia una línea celular, tal como una línea celular de mamífero (preferiblemente de ser humano). Los moduladores candidatos pueden tratarse con, por ejemplo, extractos de tejido, tales como preparaciones de hígado, tales como preparaciones microsómicas, para determinar el aumento o la disminución de las propiedades toxicológicas del compuesto químico tras metabolizarse por un organismo completo, o mediante su capacidad para degradarse mediante los sistemas de citocromo P450, tal como se describió en la solicitud de patente de los EE.UU. de titularidad común número 09/301.525, presentada el 28 de abril de 1999, la solicitud de patente de los EE.UU. número 09/301.395 presentada el 28 de abril de 1999 y la solicitud de los EE.UU. número 09/458.927 presentada el 10 de diciembre de 1999. Los resultados de estos tipos de estudio a menudo predicen las propiedades toxicológicas de los compuestos químicos en animales, tales como los mamíferos, incluyendo los seres humanos.
La actividad toxicológica puede medirse utilizando genes indicadores que se activan durante la actividad toxicológica o mediante la lisis celular (véase el documento WO 98/13353, publicado el 02/04/98). Los genes indicadores preferidos producen un producto de traducción fluorescente o luminescente (tal como, por ejemplo, una proteína fluorescente verde (véase, por ejemplo, la patente de los EE.UU. número 5.625.048 concedida a Tsien et al., el 29/049/98; la patente de los EE.UU. número 5.777.079 concedida a Tsien et al., el 07/07/98; el documento WO 96/23810 concedido Tsien, publicado el 08/08/96; el documento WO 97/28261, publicado el 07/08/97; el documento PCT/US97/12410, presentado el 16/07/97; el documento PCT/US97/14595, presentado el 15/08/97)) o un producto de la traducción que puede producir un producto fluorescente o luminiscente (tal como, por ejemplo, beta-lactamasa (véase, por ejemplo, la patente de los EE.UU. número 5.741.657 concedida a Tsien, el 21/04/98, y el documento WO 96/30540, publicado el 03/10/96)), tal como un producto de la degradación enzimática. En la presente invención, la lisis celular puede detectarse como una reducción en la señal de fluorescencia a partir de al menos un agente productor de fotones dentro de una célula en presencia de al menos un agente reductor de fotones. Tales determinaciones toxicológicas pueden llevarse a cabo utilizando células procariotas o eucariotas, utilizando opcionalmente perfiles toxicológicos, tal como se describe en el documento CT/US94/00583, presentado el 21/1/94 (documento WO 94/17208), la patente alemana número 69406772.5-08, concedida el 25/11/97; documento EPC 0680517, concedido el 12/11/94; patente de los EE.UU. número 5.589.337, concedida el 31/12/96; documento EPO 651825, concedido el 14/01/98; y la patente de los EE.UU. número 5.585.232, concedida el 17/12/96).
Alternativamente, o además de estos estudios in vitro, las propiedades toxicológicas y de biodisponibilidad de un modulador candidato en un modelo animal, tal como ratones, ratas, conejos o monos, pueden determinarse utilizando métodos establecidos (véase, Lu, citado anteriormente (1985); y Creasey, Drug Disposition in Humans, The Basis of Clinical Pharmacology, Oxford University Press, Oxford (1979), Osweiler, Toxicology, Williams y Wilkins, Baltimore, MD (1995), Yang, Toxicology of Chemical Mixtures; Case Studies, Mechanisms, y Novel Approaches, Academic Press, Inc., San Diego, CA (1994), Burrell et al., Toxicology of the Immune System; A Human Approach, Van Nostrand Reinhld, Co. (1997), Niesink et al., Toxicology; Principles and Applications, CRC Press, Boca Ratón, FL (1996)). Dependiendo de la toxicidad, del órgano, tejido o locus diana y del presunto mecanismo del modulador candidato, el experto en la técnica no se cargaría de trabajo para determinar las dosis apropiadas, los valores de DL_{50}, las vías de administración, y los regímenes que resultarán apropiados para determinar las propiedades toxicológicas del modulador candidato. Además de los modelos animales, pueden realizarse ensayos clínicos con seres humanos siguiendo los procedimientos establecidos, tales como los explicados por la Food and Drug Administration de los EE.UU. (USFDA) o equivalentes de otros gobiernos. Estos estudios de toxicidad proporcionan la base para determinar la utilización terapéutica de un modulador candidato in vivo.
c) Eficacia de los moduladores candidatos
La eficacia de un modulador candidato puede estimarse utilizando varios métodos reconocidos en la técnica, tales como los métodos in vitro, los modelos animales o los ensayos clínicos con seres humanos (véase, Creasey, citado anteriormente (1979)). Existen modelos in vitro reconocidos para diversas enfermedades o estados. Por ejemplo, la capacidad de un compuesto químico para prolongar la vida de células infectadas por el VIH in vitro se reconoce como un modelo aceptable para identificar compuestos químicos que se espera que sean eficaces para tratar la infección por VIH o SIDA (véase, Daluge et al., Antimicro. Agents Chemother. 41: 1082-1093 (1995)). Además, se ha establecido la capacidad de ciclosporina A (CsA) para evitar la proliferación de las células T in vitro como un modelo aceptable para identificar compuestos químicos que se espera que sean eficaces como inmunosupresores (véase, Suthanthiran et al., citado anteriormente, (1996)). Para casi cualquier clase de agente terapéutico, enfermedad o estado, se dispone de un modelo in vitro o animal aceptable. Tales modelos existen, por ejemplo, para los trastornos gastrointestinales, cánceres, cardiología, neurobiología e inmunología. Además, estos métodos in vitro pueden utilizar extractos de tejido, tales como preparaciones de hígado, tales como preparaciones microsómicas, para proporcionar una indicación fidedigna de los efectos del metabolismo sobre el modulador candidato. De manera similar, pueden utilizarse modelos animales para establecer la eficacia de los compuestos químicos para tratar varias enfermedades o estados. Por ejemplo, la rodilla del conejo es un modelo aceptado para probar la eficacia de compuestos químicos en el tratamiento de la artritis (véase, Shaw y Lacy, J. Bone Joint Surg. (Br) 55: 197-205 (1973)). La hidrocortisona, que está aprobada para su uso en seres humanos para tratar la artritis, es eficaz en este modelo, lo que confirma la validez de este modelo (véase, McDonough, Phys. Then 62: 835-839 (1982)). Cuando se escoge un modelo apropiado para determinar la eficacia de un modulador candidato, el experto en la técnica puede guiarse por el estado de la técnica para escoger un modelo, dosis, y vía de administración, régimen y criterio de valoración apropiados y como tal, no constituiría una carga excesiva de trabajo.
Además de los modelos animales, puede utilizarse ensayos clínicos con seres humanos para determinar la eficacia de un modulador candidato en seres humanos. La USFDA, o agencias gubernamentales equivalentes, han establecido procedimientos para tales estudios (véase, www.fda.gov).
d) Selectividad de los moduladores candidatos
Los métodos in vitro e in vivo descritos anteriormente también establecen la selectividad de un modulador candidato. La presente invención proporciona un método rápido para determinar la especificidad del modulador candidato. Por ejemplo, pueden utilizarse líneas celulares que contienen miembros de la familia de canales iónicos relacionados para obtener rápidamente un perfil de la selectividad de un compuesto químico de prueba con respecto a su capacidad para inhibir canales iónicos relacionados, y a su capacidad relativa para modular diferentes estados dependientes de voltaje de los canales iónicos. Un sistema de este tipo proporciona por primera vez la capacidad para obtener rápidamente el perfil de grandes números de compuestos químicos de prueba con el fin de evaluar sistemáticamente en un formato de alto rendimiento, simple y miniaturizado la selectividad de canal iónico de un modulador
candidato.
e) Un compuesto químico, modulador o agente terapéutico identificado y composiciones
La invención incluye composiciones, tales como compuestos químicos y agentes terapéuticos novedosos identificados mediante al menos un método de la presente invención como que tienen actividad mediante el funcionamiento de los métodos, sistemas o componentes descritos en el presente documento. Los compuestos químicos novedosos, tal como se utiliza en el presente documento, no incluyen compuestos químicos ya conocidos públicamente en la técnica en el momento de la fecha de presentación de esta solicitud. Normalmente, un compuesto químico se identificaría como que tiene actividad a partir del uso de la invención y después se revelaría su estructura a partir de una base de datos patentada de estructuras químicas o se determinaría utilizando técnicas analíticas, tales como la espectroscopia de masas.
Una realización de la invención es un compuesto químico con una actividad útil, que comprende un compuesto químico identificado mediante el método descrito anteriormente. Tales composiciones incluyen pequeñas moléculas orgánicas, ácidos nucleicos, péptidos y otras moléculas fácilmente sintetizadas mediante las técnicas disponibles en la técnica y desarrolladas en el futuro. Por ejemplo, los siguientes compuestos de combinación son adecuados para la selección: peptoides (publicación PCT número WO 91/19735, 26 de diciembre de 1991), péptidos codificados (publicación PCT número WO 93/20242, 14 de octubre de 1993), bio-oligómeros aleatorios (publicación PCT WO 92/00091, 9 de enero de 1992), benzodiacepinas (patente de los EE.UU. número 5.288.514), diversómeros tales como hidantoínas, benzodiacepinas y dipéptidos (Hobbs DeWitt, S. et al., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 90: 6909-6913 (1993)), polipéptidos análogos de vinilo (Hagihara et al., J. Amer. Chem. Soc. 114: 6568 (1992)), peptidomiméticos no peptídicos con una estructura principal de Beta-D-Glucosa (Hirschmann, R. et al., J. Amer. Chem. Soc. 114: 9217-9218 (1992)), síntesis orgánica análoga de pequeñas bibliotecas de compuestos (Chen, C. et al., J. Amer. Chem. Soc. 116: 2661 (1994)), oligocarbamatos (Cho, C. Y. et al., Science 261: 1303 (1993)), y/o peptidilfosfonatos (Campbell, D.A. et al., J. Org. Chem. 59: 658 (1994)). Véase, generalmente, Gordon, E. M. et al., J. Med Chem. 37: 1385 (1994).
La presente invención también engloba las composiciones identificadas en una composición farmacéutica que comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable preparado para el almacenamiento y la posterior administración, que tienen una cantidad farmacéuticamente eficaz de los productos descritos anteriormente en un vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable. Vehículos o diluyentes aceptables para el uso terapéutico son bien conocidos en la técnica farmacéutica, y se describen, por ejemplo, en Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co. (A. R. Gennaro edit. 1985). En la composición farmacéutica pueden proporcionarse agentes conservantes, estabilizantes colorantes e incluso aromatizantes. Por ejemplo, pueden añadirse como conservantes el benzoato de sodio, el ácido ascórbico y los ésteres del ácido p-hidroxibenzoico. Además, pueden utilizarse agentes antioxidantes y de suspensión.
Las composiciones de la presente invención pueden formularse y utilizarse como comprimidos, cápsulas o elixires para la administración oral; supositorios para la administración rectal; disoluciones, suspensiones estériles para la administración inyectable; y similares. Los compuestos inyectables pueden prepararse en las formas convencionales, o bien como disoluciones o suspensiones líquidas, formas sólidas adecuadas para la disolución o suspensión en líquido antes de la inyección, o como emulsiones. Los excipientes adecuados son, por ejemplo, agua, solución salina, dextrosa, manitol, lactosa, lecitina, albúmina, glutamato de sodio, clorhidrato de cisteína, y similares. Además, si se desea, las composiciones farmacéuticas inyectables pueden contener cantidades menores de sustancias auxiliares no tóxicas, tales como agentes humectantes, agentes tamponantes del pH, y similares. Si se desea, pueden utilizarse preparaciones que mejoran la absorción (por ejemplo, liposomas).
La cantidad farmacéuticamente eficaz de la composición requerida como una dosis dependerá de la vía de administración, el tipo de animal que se está tratando y las características físicas del animal específico en consideración. La dosis puede adaptarse para lograr un efecto deseado, pero dependerá de factores tales como el peso, la dieta, la medicación simultánea y otros factores que reconocerán los expertos en las técnicas médicas. En la puesta en práctica de los métodos de la invención, los productos o composiciones pueden utilizarse solos o unos en combinación con otros, o en combinación con otros agentes terapéuticos o diagnósticos. Estos productos pueden utilizarse in vivo, normalmente en un mamífero, preferiblemente en un ser humano, o in vitro. Cuando se emplean in vivo, los productos o composiciones pueden administrarse al mamífero en una variedad de formas, incluyendo por vía parenteral, intravenosa, subcutánea, intramuscular, colónica, rectal, nasal o intraperitoneal, empleando una variedad de formas farmacéuticas. Tales métodos también pueden aplicarse para probar la actividad química in vivo.
Tal como será fácilmente evidente para un experto en la técnica, la dosis in vivo útil que va a administrarse y el modo particular de administración variarán dependiendo de la edad, el peso y la especie de mamífero tratada, de los compuestos particulares empleados, y del uso específico para el que se emplean estos compuestos. La determinación de los niveles de dosificación eficaces, es decir, los niveles de dosificación necesarios para lograr el resultado deseado, puede llevarse a cabo por un experto en la técnica mediante el uso de métodos farmacológicos de rutina. Normalmente, las aplicaciones clínicas de los productos en seres humanos comienzan a niveles de dosificación inferiores, aumentando el nivel de dosificación hasta que se logra el efecto deseado. Alternativamente, pueden utilizarse estudios in vitro aceptables para establecer las dosis y vías de administración útiles de las composiciones identificadas por los presentes métodos utilizando los métodos farmacológicos establecidos.
En estudios con animales no humanos, las aplicaciones de los posibles productos comienzan a niveles de dosificación superiores, disminuyéndose la dosis hasta que ya no se logre el efecto deseado o hasta que desaparezcan los efectos secundarios adversos. La dosis para los productos de la presente invención pueden oscilar ampliamente dependiendo de los efectos y de la aplicación terapéutica deseados. Normalmente, las dosis pueden estar entre aproximadamente 10 \mug/kg y 100 mg/kg de peso corporal, y preferiblemente entre aproximadamente 100 \mug/kg y 10 mg/kg de peso corporal. La administración es preferiblemente oral de manera diaria.
La formulación, la vía de administración y la dosis exactas pueden escogerse por el médico individual en vista del estado del paciente. (Véase por ejemplo, Fingl et al., en The Pharmacological Basis of Therapeutics, 1975). Debe observarse que el médico que atienda debería saber cómo y cuando terminar, interrumpir o ajustar la administración debido a toxicidad o disfunciones orgánicas. A la inversa, el médico que atienda también debería saber ajustar el tratamiento hasta niveles superiores si la respuesta clínica no fuera la adecuada (descartando la toxicidad). La magnitud de una dosis administrada en el tratamiento del trastorno de interés variará con la gravedad del estado que va a tratarse y con la vía de administración. La gravedad del estado puede evaluarse, por ejemplo, en parte, mediante métodos de evaluación pronósticos convencionales. Además, la dosis y puede que la frecuencia de dosificación, también variarán según la edad, el peso corporal y la respuesta del paciente individual. Puede utilizarse un programa comparable al tratado anteriormente en medicina veterinaria.
Dependiendo del estado específico que se esté tratando, tales agentes pueden formularse y administrarse sistémica o localmente. Las técnicas para la formulación y la administración pueden encontrarse en Remington's Pharmaceutical Sciences, 18ª Ed., Mack Publishing Co., Easton, PA (1990). Las vías adecuadas pueden incluir la administración oral, rectal, transdérmica, vaginal, transmucosa o intestinal; la administración parenteral, incluyendo las inyecciones intramusculares, subcutáneas e intramedulares, así como las inyecciones intratecales, intraventriculares directas, intravenosas, intraperitoneales, intranasales o intraoculares.
Para la inyección, los agentes de la invención pueden formularse en disoluciones acuosas, preferiblemente en tampones fisiológicamente compatibles, tales como la solución de Hanks, solución de Ringer o tampón salino fisiológico. Para tal administración transmucosa, se utilizan en la formulación agentes penetrantes apropiados para que permeen a través de la barrera. Tales agentes penetrantes son generalmente conocidos en la técnica. El uso de vehículos farmacéuticamente aceptables para formular los compuestos en el presente documento descritos para la puesta en práctica de la invención en dosis adecuadas para la administración sistémica está dentro del alcance de la invención. Con la elección apropiada del vehículo la práctica de fabricación adecuada, las composiciones de la presente invención, en particular, aquellas formuladas como disoluciones, pueden administrarse por vía parenteral, tal como mediante inyección intravenosa. Los compuestos pueden formularse fácilmente utilizando vehículos farmacéuticamente aceptables bien conocidos en la técnica en dosis adecuadas para la administración oral. Tales vehículos permiten que los compuestos de la invención se formulen como comprimidos, píldoras, cápsulas, líquidos, geles, jarabes, suspensiones acuosas, suspensiones y similares, para la ingestión oral por un paciente que se está tratando.
Los agentes destinados a administrarse por vía intracelular pueden administrarse utilizando técnicas bien conocidas por los expertos habituales en la técnica. Por ejemplo, tales agentes pueden encapsularse en liposomas, y después administrarse tal como se describió anteriormente. Todas las moléculas presentes en una disolución acuosa en el momento de la formación del liposoma se incorporan en el interior acuoso. Los contenidos de los liposomas se protegen del micro-entorno externo y, dado que los liposomas se funden con las membranas celulares, se administran eficazmente hacia el interior del citoplasma de la célula. Adicionalmente, debido a su hidrofobicidad, pueden administrarse directamente de manera intracelular pequeñas moléculas orgánicas.
Las composiciones farmacéuticas adecuadas para su uso en la presente invención incluyen composiciones en las que los principios activos están contenidos en una cantidad eficaz para lograr su fin deseado. La determinación de las cantidades eficaces está completamente dentro de la capacidad de los expertos en la técnica, especialmente a la luz de la descripción detallada facilitada en el presente documento. Además de los principios activos, estas composiciones farmacéuticas pueden contener vehículos farmacéuticamente adecuados que comprenden excipientes y agentes auxiliares que facilitan el tratamiento de los principios activos en las preparaciones que pueden utilizarse farmacéuticamente. Las preparaciones formuladas para la administración oral pueden estar en la forma de comprimidos, comprimidos recubiertos de azúcar, cápsulas o disoluciones. Las composiciones farmacéuticas de la presente invención pueden fabricarse de una manera que se conoce por sí misma, por ejemplo, mediante procedimientos convencionales de mezclado, disolución, granulación, fabricación de comprimidos recubiertos de azúcar, levitación, emulsión, encapsulación, atrapamiento o liofilización.
Las formulaciones farmacéuticas para la administración parenteral incluyen disoluciones acuosas de los principios activos en una forma soluble en agua. Adicionalmente, pueden prepararse suspensiones de los principios activos como suspensiones de inyección oleosas apropiadas. Los disolventes o vehículo lipófilos adecuados incluyen ácidos grasos tales como aceite de sésamo, o ésteres de ácidos grasos sintéticos, tales como oleato de etilo o triglicéridos, o liposomas. Las suspensiones de inyección acuosas pueden contener sustancias que aumentan la viscosidad de la suspensión, tales como carboximetilcelulosa de sodio, sorbitol, o dextrano. Opcionalmente, la suspensión también puede contener estabilizadores adecuados o agentes que aumentan la solubilidad de los compuestos para permitir la preparación de disoluciones altamente concentradas.
Las preparaciones farmacéuticas para el uso oral pueden obtenerse mediante la combinación de los principios activos con un excipiente sólido, opcionalmente moliendo una mezcla resultante, y tratando la mezcla de gránulos, tras añadir agentes auxiliares adecuados, si se desea, para obtener comprimidos o núcleos de comprimidos recubiertos de azúcar. Los excipientes adecuados son, en particular, cargas tales como azúcares, incluyendo lactosa, sacarosa, manitol o sorbitol; preparaciones de celulosa tales como, por ejemplo, almidón de maíz, almidón de trigo, almidón de arroz, almidón de patata, gelatina, goma tragacanto, metilcelulosa, hidroxipropilmetilcelulosa, carboximetilcelulosa de sodio y/o polivinilpirrolidona (PVP). Si se desea, pueden añadirse agentes disgregantes, tales como polivinilpirrolidona reticulada, agar, o ácido algínico o una sal de los mismos tal como el alginato de sodio. Los núcleos de los comprimidos recubiertos de azúcar están provistos de recubrimientos adecuados. Para este fin, pueden utilizarse disoluciones concentradas de azúcar, que opcionalmente pueden contener goma arábiga, talco, polivinilpirrolidona, gel de Carbopol, polietilenglicol y/o dióxido de titanio, disoluciones de laca y disolventes orgánicos adecuados o mezclas de disolventes. Pueden añadirse colorantes o pigmentos a los recubrimientos de los comprimidos o comprimidos recubiertos de azúcar para su identificación o para caracterizar diferentes combinaciones de dosis del principio activo. Para este fin, pueden utilizarse disoluciones concentradas de azúcar, que opcionalmente pueden contener goma arábiga, talco, polivinilpirrolidona, gel de Carbopol, polietilenglicol y/o dióxido de titanio, disoluciones de laca y disolventes orgánicos adecuados o mezclas de disolventes. Los colorantes o pigmentos pueden añadirse a los recubrimientos de los comprimidos o comprimidos recubiertos de azúcar para su identificación para caracterizar diferentes combinaciones de dosis del principio activo. Tales formulaciones pueden obtenerse utilizando métodos conocidos en la técnica (véase, por ejemplo, las patentes de los EE.UU. números 5.733.888 (composiciones inyectables); 5.726.181 (compuestos escasamente solubles en agua); 5.707.641 (proteínas o péptidos terapéuticamente activos); 5.667.809 (agentes lipófilos); 5.576.012 (agentes poliméricos de solubilización); 5.707.615 (formulaciones antivirales); 5.683.676 (medicamentos particulados); 5.654.286 (formulaciones tópicas); 5.688.529 (suspensiones orales); 5.445.829 (formulaciones de liberación sostenida); 5.653.987 (formulaciones líquidas); 5.641.515 (formulaciones de liberación controlada) y 5.601.845 (formulaciones de microesferas.
Ejemplos
La invención puede entenderse mejor con referencia a los ejemplos adjuntos, que sólo se destinan a fines de ilustración y no debe interpretarse como en ningún sentido limitantes del alcance de la invención, tal como se define en las reivindicaciones adjuntas al presente documento.
Ejemplo 1 Análisis de la uniformidad del campo eléctrico de electrodos de placas paralelas en pocillos redondos convencionales
Para analizar el efecto de diseños de pocillos y electrodos diversos, se produjeron una serie de simulaciones numéricas bidimensionales de los campos eléctricos utilizando el paquete de análisis de software Quickfield™ 4.1, (versión para estudiantes, Tera Analysis, bttp://www.tera-analysis.com). Este paquete de software crea mapas de intensidad de campo eléctrico de tipo de malla de grano grueso resolviendo la ecuación de Poisson con un método de análisis por elementos finitos en dos dimensiones. Para los fines de este análisis, se ignoraron los efectos marginales debido a la separación entre la parte inferior del electrodo y el fondo del pocillo, y también se supusieron que deben ser insignificantes los descensos del voltaje de los electrodos a la solución salina. La resolución espacial del modelado es de aproximadamente 0,5 mm.
La figura 7A muestra los resultados de la simulación utilizando electrodos de placas paralelas (710) de 4 mm de ancho con una separación de 4 mm con una diferencia de potencial eléctrico convencional de 2 V situado en una placa de 96 pocillos circulares convencional. En esta figura, el circulo exterior (700) es el borde del pocillo, las dos líneas verticales (710) son los electrodos, y el círculo discontinuo en el centro (720) es la zona de observación. La zona gris (740) es la zona en la que el campo eléctrico permanece dentro del \pm 10% del campo medio en la zona de observación. En la zona blanca (730), el campo es inferior al 10% de la media, y en la zona negra (750), el campo es más del 10% mayor que el campo medio. Dentro de la zona de observación, la desviación estándar de la intensidad de campo es del 2% de la media, y la diferencia entre los campos máximo y mínimo es del 10% de la media. Por tanto, esta geometría satisface las necesidades establecidas para la uniformidad del campo para su uso en la presente invención.
Ejemplo 2 Análisis de la uniformidad del campo eléctrico de electrodos de aguja en pocillos redondos convencionales
Para determinar la uniformidad del campo prevista para dos electrodos de aguja redondos de 1,0 mm de diámetro colocados en un pocillo de 6,2 mm de diámetro convencional, separados por una distancia de 4,0 mm, se completaron las simulaciones con las mismas condiciones y suposiciones tal como se describió en el ejemplo 1.
En la figura 7B, el circulo continuo exterior (705) es el borde del pocillo, los dos círculos más pequeños (715) son los electrodos, y el círculo discontinuo en el centro es la zona de observación. La zona gris (745) es la zona en la que el campo eléctrico permanece dentro del \pm 10% del campo medio en la zona de observación. En la zona blanca (735), el campo es inferior al 10% de la media, y en la zona negra (755), el campo es más del 10% mayor que el campo medio. Dentro de la zona de observación (725), la desviación estándar de la intensidad de campo es del 15% de la media, y la diferencia entre los campos máximo y mínimo es del 87% de la media. Por tanto, esta geometría no crea campos eléctricos uniformes y como consecuencia no es adecuado para su uso con la presente invención.
Ejemplo 3 Análisis de la uniformidad del campo eléctrico electrodos de placas paralelas en pocillos cuadrados
La figura 8A muestra un simulación del perfil de campo para dos electrodos de placas paralelas de 6 mm de ancho con una separación de 4 mm en un pocillo cuadrado de 6,2 mm. En esta figura, el cuadrado exterior (800) es el borde del pocillo. Las dos líneas verticales (810) son los electrodos. El círculo discontinuo en el centro (820) es la zona de observación. Es de observación particular que la escala del campo eléctrico para la figura 8 se ha amplificado mucho comparado con la figura 7 para proporcionar contraste para las variaciones en la intensidad de campo eléctrico. La zona gris (840) es la zona en la que el campo eléctrico permanece dentro del \pm 1% del campo medio en la zona de observación. En la zona blanca (830), el campo es inferior al 1% de la media. En esta simulación, no es el campo más del 1% mayor que el campo medio en ningún punto. Dentro de la zona de observación, la desviación estándar de la intensidad de campo es del 0,02% de la media, y la diferencia entre los campos máximo y mínimo es del 0,12% de la media. Por tanto, esta geometría mejora mucho la uniformidad del campo.
Los resultados de la simulación indican que la fuente primaria de la no uniformidad del campo en el sistema de placas paralelas mostrado en la figura 7A deriva de las paredes redondas del pocillo. En un pocillo convencional con una sección transversal circular, la densidad de corriente se extenderá y después se contraerá a medida que pasa desde un electrodo hasta el otro, y esta expansión genera no uniformidad. Esto puede corregirse utilizando placas de múltiples pocillos con pocillos cuadrados.
Ejemplo 4 Análisis del efecto de la adición de elementos aislantes para desenmascarar las zonas redondas de los pocillos
La figura 8B muestra una simulación del perfil de campo para dos electrodos de placas paralelas de 4 mm de ancho con una separación de 4 mm en un pocillo redondo de 6,2 mm de diámetro utilizando las condiciones y los procedimientos de análisis habituales tal como se describieron en el ejemplo 1. Los aislantes se unen a los electrodos para desenmascarar las zonas redondas del pocillo entre los electrodos, tal como se muestra en la figura 9A. En la figura 8B, el circulo exterior (802) es el borde del pocillo. Las dos líneas verticales (812) son los electrodos. El círculo discontinuo en el centro (822) es la zona de observación. Las zonas sombreadas (862) son aislantes unidos a los electrodos. La zona gris (842) es la zona en la que el campo eléctrico permanece dentro del \pm 1% del campo medio en la zona de observación. En la zona blanca (832), el campo es inferior al 1% de la media. En esta simulación, el campo no es más del 1% mayor que el campo medio en ningún punto. Dentro de la zona de observación, la desviación estándar de la intensidad de campo es del 0,2% de la media, y la diferencia entre los campos máximo y mínimo es del 1,0% de la media. Por tanto, esta geometría mejora mucho la uniformidad del campo con respecto al caso en el que no se usa aislante, pero no tanto como en el caso de los pocillos cuadrados.
Los resultados demuestran que la uniformidad del campo en placas de pocillos redondos convencionales puede aumentarse mucho rellenando la zona externa de la zona definida por los electrodos con un material aislante. En la práctica, podrían usarse plásticos inertes tales como el nylon, tetrafluoroetileno, policarbonato, o cualquier otro polímero no poroso, o vidrio, como material aislante, siempre que sean relativamente estables en disoluciones acuosas, se fabriquen fácilmente y preferiblemente no sean fluorescentes. Normalmente, el aislante debería unirse al electrodo y no debería ocultar ninguna parte de la zona definida por los electrodos.
Ejemplo 5 Análisis del efecto de electrodos satélite sobre la uniformidad del campo
Para probar si es posible compensar la pérdida de corriente en el borde curvo del pocillo por medio del uso de electrodos satélite, se llevaron a cabo simulaciones en una variedad de geometrías de electrodos. La figura 9B muestra una realización posible de este concepto, y la figura 8C muestra el perfil del campo eléctrico cuando se analiza esta geometría utilizando Quickfield™ tal como se describió en el ejemplo 1. En este ejemplo, se colocaron dos pares extra de electrodos de placas paralelas de 0,7 mm de ancho con una separación de 2 mm. Estos electrodos están fuera de la zona de observación, y se mantienen a la mitad de los potenciales de sus electrodos originales.
En la figura 8C, el círculo continuo exterior (804) es el borde del pocillo. Las dos líneas verticales continuas largas (814) son los electrodos originales, y las cuatro líneas verticales continuas más cortas (816) son los electrodos satélite. El círculo discontinuo en el centro (824) es la zona de observación. La zona gris (844) es la zona en la que el campo eléctrico permanece dentro del \pm 1% del campo medio en la zona de observación. En la zona blanca (834), el campo es inferior al 1% de la media, y en la zona negra (854), el campo es más del 1% mayor que el campo medio. Dentro de la zona de observación, la desviación estándar de la intensidad de campo es del 0,2% de la media, y la diferencia entre los campos máximo y mínimo es del 1,2% de la media. Por tanto, esta geometría mejora mucho la uniformidad del campo con respecto al caso en el que no se usa aislante, pero no tanto como en el caso de pocillos cuadrados.
Este ejemplo demostró el uso de cuatro electrodos satélite en una configuración específica. Añadiendo más electrodos satélite fuera de la zona de observación, y asignando adecuadamente sus potenciales como una función de los potenciales aplicados a los electrodos originales, en principio puede mejorarse la uniformidad del campo eléctrico hasta una precisión arbitraria.
Por ejemplo en una configuración de pocillo redondo, la uniformidad del campo en la zona central de observación puede mejorarse subdividiendo los electrodos de placas paralelas en varias piezas separadas por divisores aislantes finos, tal como se describe en la figura 9D. El potencial aplicado a cada electrodo (expresado como una fracción del potencial aplicado a la pieza más centrada) puede ajustarse individualmente para maximizar la uniformidad del campo en la zona de observación.
Este concepto puede expandirse para permitir el uso de electrodos de inmersión no paralelos, que tienen varias bandas conductoras verticales, cada una de las que se controlan independientemente.
Ejemplo 6 Análisis del efecto del menisco sobre la uniformidad del campo eléctrico
El menisco creado por los electrodos de inmersión cuando se insertan en un pocillo genera variaciones de la profundidad de la solución salina de aproximadamente el 10% a través de la zona de observación. Esto a su vez genera variaciones en el campo eléctrico de aproximadamente el 10% a través de la zona de observación. Estas variaciones existen incluso si se predice que el diseño del electrodo va a crear una uniformidad de campo perfecta. Por tanto, eliminar el efecto de menisco mejorará la uniformidad del campo real. Un método posible para realizar esto es añadir una barrera aislante entre los electrodos. La figura 9C representa una realización de este tipo, en la que se usa la barrera aislante para crear una superficie superior plana para el líquido en el pocillo. La parte inferior de esta barrera, cuando se insertan los electrodos en el pocillo, podría diseñarse para asentarse aproximadamente a 2,5 mm por encima del fondo de pocillo. Por tanto, la barrera podría sumergirse parcialmente en la solución salina y su superficie de la parte inferior podría definir la parte superior de la cámara conductora para que sea plana y perpendicular a las superficies de los electro-
dos. De esta manera, el campo eléctrico no se perturbaría por irregularidades en las superficies del volumen conductor.
Ejemplo 7 Fabricación de estimulador eléctrico de electrodo de inmersión
En una realización del simulador eléctrico, el dispositivo se compone de una estructura de autocolocación que coloca los electrodos de inmersión en la serie de pocillos en un formato de placa de múltiples pocillos de 96 pocillos (figura 1). La figura 1 describe la posición insertada de la matriz de electrodos. En este ejemplo, el dispositivo de estimulación eléctrica puede ensamblarse a partir de tres partes funcionales. La primera parte es la estructura de posicionamiento (40) que sitúa el dispositivo con respecto a los pocillos de la placa. Esta estructura está compuesta por metal y es de ajuste sin holgura a la placa de múltiples pocillos. Esta estructura sirve como base de colocación para la segunda parte funcional del sistema, el mecanismo de retractor.
El sistema de retractor consiste en pernos de tope (70) y resortes de retorno (no visibles). Los resortes se envuelven alrededor de los pernos de tope, y presionan contra la estructura de posicionamiento (40) y la parte inferior de la cobertura aislante (90). Los resortes de retorno mantiene el montaje de electrodo en la posición retraída hasta que los electrodos descienden hacia los pocillos de la placa. El mecanismo de retractor sitúa la tercera parte funcional del sistema, la matriz de electrodos.
La tercera parte funcional del sistema es la matriz de electrodos. La matriz de electrodos está compuesta por ocho pares de peines de electrodos idénticos (10). Los peines de electrodos están compuestos por acero inoxidable y se cortan con láser de precisión para impedir la distorsión. Cada peine tiene ocho lengüetas de anchura suficiente para abarcar casi el diámetro de los pocillos de la placa de múltiples pocillos. El esqueleto del peine forma la conexión eléctrica a las lengüetas (50). Dos de estos peines forman los pares de electrodos que se insertan en una columna de ocho pocillos. Los peines se mantienen en su sitio unos con respecto a otros mediante una placa perforada de precisión aislante (30) que sitúa los electrodos con respecto a la estructura de posicionamiento. Los espaciadores aislantes (20) mantienen la separación de los electrodos e indexan los peines con respecto a la placa perforada por medio de una superficie de contacto articulada. Un segundo conjunto de espaciadores (25) garantiza el posicionamiento preciso de los electrodos (10) con respecto a la placa (30). Los ejes de alineación (15) se insertan a través de agujeros de alineación en los espaciadores (20) y los peines de electrodos (10) para una estabilidad adicional. Los peines y los espaciadores se mantienen en su sitio contra la placa perforada mediante una cubierta aislante (90).
El dispositivo puede utilizarse manualmente colocando el dispositivo sobre la placa de múltiples pocillos y presionando hacia abajo sobre el montaje de electrodo para hacer descender los electrodos hacia los pocillos. Cuando se extienden completamente los electrodos, se inserta un par de barras de bloqueo (60) para mantener los electrodos extendidos dentro de los pocillos. Alternativamente, la matriz de electrodos puede insertarse y retraerse automáticamente de los pocillos por medio de sistemas de control robóticos o mecánicos convencionales conocidos en la técnica.
La figura 3 muestra un diagrama de bloques de los componentes ópticos y eléctricos principales. Se crearon estímulos eléctricos por medio de un amplificador de alta potencia (320), accionado por un par de generadores de función digitales (380 y 310). En una realización, el conmutador (330) era un ER-16 de National Instruments (Austin TX) controlado por una tarjeta de entrada/salida digital PC-DIO 24 de National Instruments integrada en el ordenador controlador de lector VIPR™ (300). El conmutador (330) dejó que los pocillos definidos dentro de una placa de 96 pocillos se estimulen eléctricamente con cualquier protocolo de tiempo dado. En este caso, se estimuló una única columna de ocho pocillos simultáneamente. El amplificador (320) se construyó utilizando el chip APEX PA93 (Apex Microtechnology Corp, Tucson, AZ) siguiendo un circuito proporcionado por el fabricante. El amplificador tenía las especificaciones siguientes: \pm 100 V de CC dentro, 100 G\Omega de impedancia de entrada, 20 X ganancia de voltaje, \pm 90 V fuera, \pm 3 A fuera, 10 \Omega de impedancia de salida. Los generadores de función fueron Tektronix (Beaverton, OR) modelo AFG310. El primer generador de función (380) se activó por el software de lector VIPR™ cuando se requirió que comenzase el tren de impulsos del estímulo, y se produjo un tren de impulsos TTL para activar el segundo generador de función (310). El segundo generador de función se programó con el núcleo de forma de onda del estímulo.
Ejemplo 8 Dependencia con el voltaje de la estimulación eléctrica
Las células de ovario de hámster chino de tipo natural (células CHO) expresan de manera endógena un canal de sodio dependiente de voltaje y pueden utilizarse convenientemente para validar y optimizar parámetros de estimulación eléctrica. Además de este canal de sodio, estas células parecen tener conexiones de unión en hendidura entre las células adyacentes y una corriente de salida dependiente de voltaje muy pequeña (\sim20 pA).
El canal de sodio dependiente de voltaje en estas células (denominada más adelante en el presente documento como NaV1) tiene características electrofisiológicas similares a los canales de sodio de tipo IIa de cerebro de rata. Los análisis de las características de corriente/voltaje de este canal por medio de la electrofisiología convencional revela que normalmente las células CHO de tipo natural tienen una corriente pico promedio de 100 pA por célula a -20 mV. Esto corresponde a un resistividad de membrana (R_{Na}) de aproximadamente 800 M\Omega. Suponiendo una conductancia del canal único de 10 pS, esto sugiere que sólo hay \sim125 canales de sodio por célula. Las células CHO que estamos manejando normalmente muestran un potencial transmembrana en reposo (R_{m}) de aproximadamente -35 mV, una resistencia de membrana en reposo > 10 G\Omega, y una capacitancia de membrana celular (C_{m}) de 15 pF.
Para probar la dependencia con el voltaje de la estimulación eléctrica, se sembraron las células CHO de tipo natural en placas de microtitulación de 96 pocillos y se incubaron en medio de crecimiento durante 24-48 horas. Entonces se enjuagar con disolución de baño 1 y se tiñeron durante 30 minutos cada vez con CC2-DMPE 10 \muM (cumarina), entonces DiSBAC_{2}(3) 3 \muM (etil-oxonol tal como se describe en el apéndice A1). Se colocó un montaje de estimulador con 96 pares de electrodos de acero inoxidable (4 mm de ancho, 4 mm de separación) en la parte superior de la placa de ensayo, tal como se describió en el ejemplo 7. Se hicieron descender los electrodos hacia la solución salina que cubría a las células y se mantuvo a 0,5 mm del fondo del pocillo. Se realizaron mediciones de fluorescencia radiométricas durante la estimulación eléctrica utilizando un lector VIPR™ tal como se describió anteriormente, y se analizaron los datos según los procedimientos en el apéndice A2. En un momento cualquiera, se sometió a ensayo sólo una columna de ocho pocillos; los pocillos restantes no recibieron luz de excitación ni estimulación eléctrica. Después que se sometiera a ensayo cada placa, se enjuagaron cuidadosamente los electrodos con agua destilada y se secaron con aire comprimido, para evitar la contaminación cruzada entre las placas.
Para determinar los cambios de potencial transmembrana que se producen en las células como resultado de la estimulación eléctrica, se analizaron las placas de múltiples pocillos que contenían las células en un lector VIPR™. Se excitaron con luz a 400 \pm 7,5 nm las células en una zona de observación de 3 mm de diámetro situada en un punto medio entre los electrodos. La luz se generó mediante una lámpara de arco de xenón de 300 W, y pasó a través de un par de filtros de paso de banda de interferencia dieléctrica para seleccionar la longitud de onda de excitación correcta. La luz se dirigió hacia y desde las células por medio de un cable de fibra óptica trifurcado, con un cable para la luz de excitación y dos para la emisión de fluorescencia. Se registraron mediciones simultáneas de señales en el azul (460 \pm 20 nm) y en el naranja (580 \pm 30 nm) de cada pocillo a 50 Hz, se digitalizaron y almacenaron en un ordenador. Los ensayos iniciales fueron de 15 segundos de duración, y consistieron en una estimulación de 6 segundos de estimulación de onda cuadrada bifásica (5 ms/fase) repetitiva (tasa de repetición de 90 Hz) que comenzaba a los 2 segundos a las amplitudes eléctricas mostradas. Durante dos segundos antes y siete segundos después de la ráfaga de estimulación, no pasó corriente a través de los electrodos. La figura 10 muestra las respuestas radiométricas a diversas intensidades de campo hasta 32 V/cm. En este caso, el tiempo de aumento aparente de la respuesta registrada se limita mediante el tiempo de respuesta del DiSBAC_{2}(3) que tiene una constante de tiempo de respuesta de aproximadamente 1 segundo. Por debajo de amplitudes de impulso de 10 V/cm, no se detecta respuesta. Por encima de 20 V/cm, la respuesta es robusta y sólo aumenta ligeramente a medida que aumenta adicionalmente el voltaje hasta 32 V/cm. Tal como se muestra en la figura 11, a voltajes superiores, la respuesta pico (medida tras aproximadamente 5 segundos) sólo muestra adicionalmente aumentos pequeños de la respuesta. Los datos en la figura 11 pueden ajustarse a una función de Boltzman, que tenía un punto medio a 18,0 V/cm con una anchura de 2,0 V/cm. La brusquedad del comienzo y la planeidad de la respuesta en campos altos sugieren sólidamente un fenómeno de umbral. El campo eléctrico en el que la respuesta es la mitad del máximo (18 V/cm) corresponde a aproximadamente desviaciones de \pm 30 mV en el potencial transmembrana en los bordes extremos de las células, utilizando fórmulas publicadas previamente (ecuación 1, véase también Tsong, 1991, Biophys. J. 60:297-306; y suponiendo un diámetro promedio de las células de 30 \mum). Por tanto esto es coherente cuantitativamente con el mecanismo de estimulación descrito anteriormente para canales de sodio regulados por voltaje normalmente en el estado inactivado.
Los campos eléctricos de alta intensidad pueden dar como resultado la electroporación de las membranas celulares, dando como resultado cambios no específicos relativamente grandes en el potencial transmembrana (Tsong, 1991, Biophys. J. 60:297-306). Para establecer si esto es o no también un factor principal en las repuestas de las células a intensidades de campo eléctrico inferiores utilizadas en el presente documento, se llevaron a cabo experimentos con la toxina específica del canal de sodio, tetrodotoxina (TTX). Si pueden bloquearse los efectos de estimulación eléctrica por la toxina, esto podría sugerir que el efecto de estimulación eléctrica está mediado principalmente por la activación de los canales de sodio. Los resultados de este experimento se muestran en la figura 12. Los datos se obtuvieron con una intensidad del campo eléctrico de 33 V/cm y demostraron que TTX podía bloquear completamente el efecto de estimulación eléctrica con características farmacológicas típicas coherentes con el bloqueo de los canales de sodio. La CE_{50} procedente del ajuste a este dato es de 9 nM, similar al valor notificado para TTX en células de tipo IIa de cerebro de rata (8 nM, West et al., 1992, Neuron 8: 59-70). El hecho de que esta señal se bloquee por TTX con farmacología normal es una fuerte evidencia de que la señal generada por medio de la estimulación eléctrica es casi totalmente debida a NaV1.
Ejemplo 9 Variación de la respuesta celular a cambios en la frecuencia y anchura de impulsos del estímulo
Para examinar el comportamiento de la respuesta celular a medida que se variaron la frecuencia y anchura de impulso del estímulo, se llevaron a cabo experimentos utilizando células CHO de tipo natural tal como se describieron en el ejemplo 8 anterior a una intensidad de campo constante de 25 V/cm, mientras que se variaba la frecuencia y la duración del impulso.
Los resultados se exponen en la figura 13. Cada punto de datos representa el promedio de ocho pocillos estimulados al mismo tiempo a partir de experimentos derivados de cinco placas separadas de células CHO de tipo natural. Los resultados muestran generalmente que a medida que aumenta la frecuencia de estimulación, aumenta la magnitud de la repuesta. Se podría predecir que este efecto finalmente debe saturarse a medida que el potencial de transmembrana se conduce al potencial de inversión de sodio (V_{Na}). En este caso esto no se produce porque la densidad del canal de sodio es demasiado baja.
El aumento de la duración del impulso da como resultado grados de estimulación eléctrica relativamente superiores a frecuencias de estimulación inferiores de hasta aproximadamente 10 ms, más allá del cual los aumentos adicionales son menos pronunciados. Las duraciones del impulso muy pequeñas (inferiores a 1 ms) también limitan la respuesta, aparentemente porque los canales no se liberan eficazmente de la inactivación. Para inducir eficazmente respuestas celulares grandes, los mejores parámetros de estimulación están normalmente en el intervalo en el que la duración del impulso es superior o igual a la constante de tiempo para la recuperación de la inactivación, y suficientemente corta de manera que la frecuencia de estimulación es superior que la constante de tiempo de membrana. Adicionalmente, la frecuencia de estimulación óptica es normalmente inferior a la inversa del tiempo promedio de apertura del canal.
Estos experimentos demuestran que la estimulación eléctrica puede utilizarse con éxito incluso en células que expresan incluso niveles relativamente bajos de canales dependientes de voltaje, y pueden completarse con éxito en condiciones que no conducen a una electroporación o muerte celular significativa. Estos experimentos también demuestran métodos mediante los que pueden optimizarse la frecuencia de repetición y la duración de impulso del estímulo para producir respuestas de un tamaño deseado.
Ejemplo 10 Análisis de células CHO que expresan un canal de sodio exógeno
Se transfectaron de manera estable las células de ovario de hámster chino con un plásmido que codifica para un canal de sodio dependiente de voltaje (denominado a continuación en el presente documento como NaV2) tal como se describió en la sección VI. Se utilizó el análisis de patch clamp de célula completa para confirmar las propiedades electrofisiológicas y farmacológicas de este canal antes del análisis por medio de estimulación eléctrica.
Se midió que la corriente de sodio transitoria pico a -20 mV era de 600 \pm 300 pA (N=5), con una capacitancia de membrana celular promedio de 15 \pm 5 pF. La resistencia de la membrana celular en reposo era demasiado grande para medirse con precisión (R_{L} > 10 G\Omega). El potencial transmembrana en reposo era de -31 \pm 3 mV.
Para determinar el campo eléctrico umbral para la estimulación, se pusieron en placas de 96 pocillos células que expresan de manera estable el canal de sodio y se tiñeron según el protocolo en el apéndice A1. El protocolo de estimulación eléctrica implicó una ráfaga de 3 segundos, de 20 Hz, de estímulos bifásicos (5 ms/fase) con intensidad de campo variable utilizando el estimulador eléctrico descrito en el ejemplo 7.
La figura 14 muestra perfiles de tiempo representativos a varias intensidades de campo (cada curva es el promedio de ocho pocillos). A intensidades de campo bajas, no hay repuesta celular detectable, lo que sugiere que el potencial transmembrana promedio cambia menos de aproximadamente 1 mV. Entre 35 y 90 V/cm, la respuesta está estereotipada, con una amplitud y forma fijas. Por encima de 90 V/cm, la respuesta pico permanece relativamente constante, pero el tiempo de desactivación de la respuesta tras haberse retirado el estímulo se vuelve considerablemente prolongado.
Coherente con los experimentos mostrados en el ejemplo 8, la respuesta inducida por la intensidad del campo eléctrico de hasta 85 V/cm pudo inhibirse por TTX mientras que la respuesta obtenida de las células estimuladas por encima de 90 V/cm no pudo (datos no mostrados). Por tanto, se concluye que la respuesta rápida es debida al mecanismo de apertura del canal de sodio explicado anteriormente, mientras que la respuesta lenta se produce principalmente por electropermeabilización de la membrana por el campo eléctrico.
Este efecto se observa más fácilmente comparando el comportamiento de la respuesta rápida (4 segundos tras la estimulación) y la respuesta lenta (diez segundos tras la estimulación) con una intensidad de campo creciente. Este dato se muestra en la figura 15. Ajustando la respuesta rápida a una función de Boltzman, el punto medio de la respuesta temprana estaba a E_{50} = 26 V/cm, con una anchura de \DeltaE = 3,5 V/cm. La respuesta era independiente de la intensidad de campo entre 40 y 80 V/cm, con un ligero aumento cuando la electropermeabilización se fija superior a
90 V/cm.
La respuesta más lenta debida a la permeabilización fue detectable en primer lugar a 90 V/cm, y es ella misma de uso potencial en algunas aplicaciones. Por ejemplo, la permeabilización puede utilizarse para volver a poner el potencial transmembrana a cero, o si la permeabilización es selectiva para un ion específico, para volver a poner el potencial transmembrana en el valor de equilibrio para ese ion. Esto puede ser útil, por ejemplo, en un ensayo para un canal que coloque el potencial transmembrana. Ejemplos incluyen canales de fuga de potasio y cloruro, rectificadores entrantes de potasio, y canales de potasio regulados por voltaje activados por voltaje bajo.
Estos resultados son coherentes con los estudios publicados en los que la electropermeabilización comienza con un potencial transmembrana umbral de aproximadamente \pm 200 mV, independientemente del tipo de célula (Teissie y Rols, 1993, Biophys. J. 65:409-413). Basándose en las fórmulas notificadas en ese artículo y ampliamente aceptadas en la bibliografía, las células CHO con un diámetro promedio de 30 \mum experimentarán cambios de potencial transmembrana de \pm 200 mV si se exponen a un campo eléctrico extracelular de 90 V/cm.
Ejemplo 11 Determinación de la liberación eficaz del tiempo de inactivación y la conductancia eficaz de sodio en el canal abierto
Para hacer estimaciones cuantitativas de la liberación eficaz del tiempo de inactivación y la conductancia del canal abierto, pero sin restringirse a ningún mecanismo de acción específico, se desarrolló la siguiente teoría para la verificación experimental.
Tras la apertura, los canales de sodio se inactivan con una constante de tiempo dependiente de voltaje del orden de 1 milisegundo. Debido a que la corriente que pasa por los canales de sodio abiertos depende mucho del tiempo y del voltaje, no es posible generar fácilmente una expresión analítica para el cambio del voltaje tras una única estimulación. Sin embargo, haciendo algunas aproximaciones de simplificación, se pueden modelar respuestas idealizadas promedio para crear una teoría que pueda probarse. Para los fines del presente documento, se supone que con la apertura, los canales de sodio se comportan como una conductancia lineal superior a V_{t} = -40 mV con un potencial de inversión a E_{Na} = +60 mV. La conductancia g_{Na} se determina como la corriente máxima obtenida a -20 mV en un experimento patch clamp de célula completa. La dependencia con el tiempo de la conductancia del canal de sodio se simplifica suponiendo que, cuando el canal se activa, tiene una conductancia fija g_{Na} 1/ R_{Na} para un tiempo fijo t_{Na} = 1,0 ms, tras lo que se inactiva el canal.
Utilizando un núcleo de estímulo de onda cuadrada bifásica (cada fase tiene un tiempo t1 y se repite a una frecuencia f = 1/T), la corriente total que entra en la célula durante T es:
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Aquí, \tau_{Na} es el tiempo que los canales de sodio están abiertos. R_{Na} = 1/g_{Na} es la resistencia de la membrana cuando los canales de sodio están abiertos. R_{L} es la resistencia de la membrana normal (fuga). V_{L} es el potencial de inversión de fuga (es decir, el potencial de membrana en reposo). V_{Na} es el potencial de inversión de sodio. \tau_{r} es la constante de tiempo para la recuperación de la inactivación; realmente esto es una función del voltaje de hiperpolarización conseguido durante el impulso, pero se supone en el presente documento que es constante.
En realidad, los canales de sodio de partes diferentes de la célula experimentan cambios de potencial de membrana diferentes, y los parámetros \tau_{Na}, \tau_{r}, y R_{Na} tienen una fuerte dependencia con el potencial de membrana. El modelo completo debería tener en cuenta la morfología celular, una distribución aleatoria de orientaciones celulares, y la dependencia con el potencial y el tiempo de estos parámetros. Entonces debería ser posible, convolucionar estas dependencias para producir valores eficaces para estos parámetros. Estos procedimientos son demasiado complicados para la presente discusión. En su lugar, se reconocerá que los valores que se extraen de los ajustes a estas ecuaciones representan promedios complicados de las propiedades del canal subyacente.
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La resolución de la ecuación (2) para el cambio del potencial transmembrana durante la estimulación (V-V_{L}) da:
8
Si la estimulación se lleva a cabo durante un tiempo suficientemente largo de manera que se alcance un nuevo potencial transmembrana, la ecuación del estado estacionario es:
9
Para determinar la liberación eficaz del tiempo de inactivación y la conductancia del canal abierto, se llevaron a cabo experimentos tal como se describieron en el ejemplo 8, utilizando un núcleo de onda cuadrada bifásica en una amplitud constante de 43 V/cm en frecuencias variables y con duraciones de impulso de 20 ms, 10 ms, 5 ms, 2 ms y 0,3 ms. Los resultados, mostrados en la figura 16, exponen la respuesta como una función de frecuencia de estimulación para varias duraciones de impulso. En este caso tal como se predijo, la respuesta se satura a altas frecuencias a medida que el potencial transmembrana se aproxima aparentemente al potencial de inversión de sodio. Para determinar la libración eficaz del tiempo de inactivación y el tiempo de apertura del canal, se ajustó la respuesta R a la ecuación de Hill modificada de a continuación.
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La ecuación (5) puede derivarse de la ecuación (4) reconociendo que la respuesta radiométrica R = 1 para ningún cambio de potencial transmembrana, y es lineal en el cambio de potencial transmembrana con una constante A de proporcionalidad no calibrada.
En la ecuación (5), A y f_{0} son parámetros ajustables. El ajuste se realizó utilizando un análisis de mínimos cuadrados no lineales utilizando el software Origin 6.0 (Microcal, Northampton MA).
Los parámetros T_{0} = 1/f_{0} de la ecuación (5) anterior se extrajeron de estos ajustes y se representaron frente a la duración del impulso y se muestran en la figura 17. La línea en esta figura es un ajuste para una desactivación exponencial, y a partir de este ajuste, se extrae la liberación de la constante de tiempo de inactivación (\tau_{r}) \tau_{r} = 5,7 ms y R_{L}_{\tau}_{Na}/R_{Na} = 0,314.
Suponiendo que \tau_{Na}=1 ms y R_{L}=45 G\Omega, entonces R_{Na}=140 M\Omega. Esto a su vez significa que la conductancia de sodio pico debería ser de 100 mV/140 M\Omega = 700 pA. Esto concuerda de manera excelente con el valor medido en el patch clamp de célula completa.
Ejemplo 12 Análisis de un canal de sodio exógeno en una línea celular con otros canales iónicos endógenos
Normalmente, las células HEK-293 de tipo natural expresan una variedad de corrientes de cloruro y potasio endógenas (Zhu et al., 1998, J. Neurosci. Meth. 81:73-83), de manera que la resistencia de membrana en reposo para estas células es de 5-10 G\Omega. Como consecuencia, la constante de tiempo de membrana para estas células es correspondientemente menor, por tanto para la estimulación óptima de las células, se predeciría que el protocolo de estimulación eléctrica debe repetirse a frecuencias relativamente superiores comparadas con las células sin canales de potasio endógenos con el fin de generar señales comparables.
Para probar que un canal de sodio regulado por voltaje podría estimularse eléctricamente de manera eficaz utilizando la presente invención en este fondo celular, se transfectaron de manera estable células HEK-293 con un canal de sodio dependiente de voltaje denominado a continuación en el presente documento como NaV3. Las células se transfectaron y se seleccionaron tal como se describió en la sección VI y se marcaron con colorantes FRET tal como se describió en el ejemplo 8. Las células se pusieron en placas y se cargaron con CC2-DMPE 15 \muM y DiSBAC_{6} (3) 2 \muM y entonces se sometieron a un tren de estímulos bifásicos de 25 V/cm, repetidos a una frecuencia de 90 Hz y con una duración de impulso de 5 ms/fase. El tren de impulsos de estimulación se produjo durante una duración total de 3 segundos y la tasa de digitalización para la recogida de datos era de 50 Hz.
La respuesta como una función del tiempo (la figura 18) muestra una fase inicial rápida (tiempo de ascenso < 20 ms) que disminuye con una constante de tiempo de aproximadamente 40 ms hasta una meseta estable. También está presente un cambio de potencial de rebote pequeño entre el pico transitorio y la meseta. Este comportamiento se interpreta como debido a la activación de canales de potasio dependientes de voltaje endógenos (K_{V}) que se produce tras el primer impulso de estímulo. Podría esperarse que la activación de estos canales de potasio endógenos ocasione una reducción del potencial transmembrana a medida que el potasio abandona la célula coherente con los datos experimentales. A medida que la estimulación eléctrica continúa, el potencial transmembrana alcanza un nuevo equilibrio que se establece por el equilibrio del flujo de sodio hacia el interior de la célula y el flujo de potasio hacia el exterior de la célula. Al final de la estimulación, la constante de tiempo de desactivación de la respuesta es de aproximadamente 143 ms, correspondiente a una resistencia de fuga de aproximadamente 9 G\Omega.
Para determinar si esta menor respuesta global podría utilizarse de manera fiable para el descubrimiento de fármacos, se realizaron para determinar si los efectos de TTX o tetracaína podrían caracterizarse de manera precisa. Los resultados mostrados en la figura 19 demuestran que los perfiles de inhibición farmacológica de estos fármacos utilizando la presente invención son coherentes con el comportamiento conocido del canal de sodio NAV3 con estos agentes. La curva dosis-respuesta para TTX pudo ajustarse con una función de Hill con una CE_{50} = 25 nM y un coeficiente de Hill de 1,1. La curva dosis-respuesta para tetracaína pudo ajustarse a una curva con una CE_{50} = 11 \muM y un coeficiente de Hill de 0,97. Estos resultados sugieren que la respuesta se produce por la actividad del canal de sodio y que la información farmacológica sobre compuestos conocidos y desconocidos puede obtenerse utilizando este método.
Ejemplo 13 Análisis de células HEK-293 que expresan el canal de sodio NaV4
Para determinar si el presente método puede aplicarse generalmente a una amplia variedad de diferentes canales de sodio, se transfectaron de manera estable células HEK-293 con otro canal de sodio dependiente de voltaje, denominado a continuación en el presente documento como NaV4. Estas células se transfectaron, se seleccionaron y se cargaron con colorantes FRET tal como se describió en la sección VI y el ejemplo 8. Los resultados de una curva dosis-respuesta para tetracaína en este canal se muestran en la figura 20. Aquí, los puntos de datos son promedios y desviaciones estándar de ocho pocillos y la línea continua es un ajuste a una función de Hill con una CE_{50} = 35 \muM estimada y un coeficiente de Hill de 1,35. Estos resultados son coherentes con la farmacología conocida de este canal iónico y demuestra de nuevo que la respuesta celular está producida principalmente por la actividad del canal de
sodio.
Ejemplo 14 Análisis de células HEK-293 que expresan una mezcla de canales de potasio y cloruro activados por voltaje
Se realizó una demostración de la estimulación directa de canales de potasio y cloruro dependientes de voltaje utilizando células HEK-293 de tipo natural, que expresan de manera endógena una mezcla de varios canales de potasio y cloruro activados por voltaje (Zhu, Zhang et al. 1998). Se hicieron crecer las células de tipo natural en placas de microtítulo de 96 pocillos y se sometieron a ensayo en confluencia tras la tinción con los colorantes de FRET según el protocolo en el apéndice A1. Los parámetros de los estímulos iniciales incluyeron una estimulación eléctrica durante 3 segundos de duración a 20 Hz con un núcleo de estímulo de onda cuadrada bifásica con una duración de impulso de aproximadamente 5 ms/fase. Se realizaron estímulos en intensidades de campo eléctrico variables para determinar la intensidad de campo umbral para una respuesta celular medible, y en presencia o ausencia de bloqueantes del canal de potasio.
La figura 21 muestra la respuesta de voltaje celular obtenida durante este experimento. En esta figura, cada panel contiene el perfil de tiempo de 10 segundos de la respuesta para un único pocillo. Los paneles se disponen para hacer coincidir sus posiciones relativas en la placa. El eje vertical en cada panel es la razón de fluorescencia normalizada, restada del fondo, de la combinación de colorante de FRET sensible al voltaje CC2-DMPE/DiSBAC2(3), los cambios en esta cantidad son aproximadamente proporcionales a los cambios en el potencial de membrana. Cada columna tenía condiciones de estimulación idénticas, aumentando la intensidad del campo eléctrico de izquierda a derecha a través de la placa. La columna decimosegunda de la placa de 96 pocillos (no mostrada) no contenía células y se utilizó para restar el fondo. Las filas 6-8 contenían TEA 10 mM para bloquear los canales de potasio dependientes de voltaje. A las intensidades de campo más bajas probadas, no había respuesta detectable. En campos eléctricos intermedios, puede observarse una respuesta de voltaje negativa que decae rápidamente cuando se elimina el estímulo. En los campos superiores se provoca una gran respuesta positiva. Este comportamiento se fija en por encima de 50 V/cm, de manera similar al umbral de electropermeabilización observado en células CHO que expresan NaV1, (ejemplo 8).
La figura 22 muestra la respuesta promediada entre 4,5 y 5,0 segundos de estimulación como una función de la intensidad del campo eléctrico. Se excluyeron las respuestas positivas grandes superiores a 60 V/cm para mostrar las respuestas negativas dependientes de canal. El coeficiente de variación de la respuesta generalmente es extremadamente pequeño, dando intervalos de selección extremadamente grandes (véase el apéndice A3). Para los datos de desbloqueo para 20-40 V/cm, la diferencia entre los pocillos estimulados y no estimulados es de aproximadamente 20 desviaciones estándar.
Se añadió tetraetilamonio (TEA), un bloqueante del canal de potasio bien conocido (Hille, 1992, Ionic Channels of Excitable Membranes), a las filas 6, 7, y 8 en una concentración completamente bloqueante de 10 mM. Este tratamiento bloquea parcialmente la respuesta. Este resultado es compatible con la existencia de los dos canales de potasio (bloqueado por TEA) y cloruro (no afectado por TEA) en estas células que responden a la estimulación eléctrica. Puede aislarse el efecto de los canales de potasio bloqueando los canales de cloruro con ácido 4,4'-diisotiocianoestilbeno-2,2'-disulfónico (DIDS) o ácido 4-acetamido-4-isotiocianoestilbeno-2,2'-disulfónico (SITS; véase Hille, 1992, Ionic Channels of Excitable Membranes). Entonces, puede utilizarse la misma línea celular para seleccionar dos clases de canales.
Ejemplo 15 Identificación de bloqueantes dependientes de estado
Cualquier sistema de selección propuesto podrá reproducir preferiblemente la farmacología de los compuestos conocidos tal como se determinaron mediante métodos aceptados. Para verificar que este era el caso de la presente invención, se analizó una serie de compuestos de prueba de actividad definida utilizando una línea celular CHO que expresa el canal NaV2. Para llevar a cabo esto, se cultivaron las células en placas de 96 pocillos y se tiñeron con colorantes sensibles al voltaje tal como se describe en el apéndice A1. Los compuestos de prueba se añadieron a las células con el tampón que portaba oxonol. A menos que se observe lo contrario, los compuestos se sometieron a prueba tal como en 8 réplicas, con diluciones 1/3 en once columnas de la placa de ensayo.
La figura 23 muestra los perfiles de tiempos para las concentraciones seleccionadas de los bloqueantes del canal de sodio, tetrodotoxina (TTX) y tetracaína.
Tetrodotoxina es un antagonista del canal de sodio no específico de estado, reversible y potente. Por comparación, tetracaína es un bloqueante del canal de sodio dependiente del uso que muestran afinidades diferentes para los diferentes estados del canal de sodio.
Los resultados muestran que la presente invención proporciona resultados altamente reproducibles con variabilidad relativamente pequeña o bien entre muestras o bien entre placas. En la figura 23 puede observarse el efecto de TTX como una pérdida progresiva de la repuesta, sin cambios significativos en la forma de la respuesta. Por comparación con tetracaína, las respuestas no sólo disminuyen, sino que cambia la forma a medida que la concentración varía. Los CV de estos experimentos fueron del 10% (TTX) y del 9% (tetracaína), comparados con los CV normales utilizando los mismo colorantes de voltaje, pero las adiciones de líquido tradicionales fueron del 16% (TTX) y del 18% (tetracaína).
De manera importante, los resultados muestran también que la presente invención puede identificar el bloqueo dependiente del estado del canal de sodio por tetracaína. El bloqueo dependiente del uso de tetracaína es más evidente en las curvas dosis-respuesta mostradas en la figura 24. Para TTX, el bloqueo del canal es independiente del intervalo de tiempo utilizado para calcular la respuesta. Para tetracaína, sin embargo, el bloqueo es de un orden de magnitud superior en 3 segundos que en 1 segundo. Con las mismas condiciones de estimulación, otros bloqueantes dependientes de uso (lidocaína y bupivacaína) mostraron una cantidad más pequeña de desplazamiento en las curvas dosis-respuesta. Los valores de CE_{50} obtenidos mediante el protocolo de estimulación eléctrica para lidocaína fueron similares a los valores de alta frecuencia notificados en la bibliografía (véase la tabla 4); esto sugiere que lidocaína y bupivacaína tienen dependencia del uso lo suficientemente rápida para saturarse completamente en los estímulos de 20 Hz utilizados en el presente documento. Esto, a su vez, sugiere que pueden explorarse las propiedades dependientes de uso de anestésicos locales variando la frecuencia de estimulación.
La tabla 4 enumera las concentraciones bloqueantes de varios antagonistas del canal de sodio. Los valores de la bibliografía notificados se han medido todos utilizando la técnica de patch clamp de célula completa, y por tanto se basan en mediciones directas de la corriente del canal de sodio.
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Referencias
a Ragsdale et al., 1996, Proceedings of the National Academy of Sciences, U.S.A. 93: 9270-9275
b Wanner et al., 1999, Biochemistry 38: 11137-11146.
c West et al., 1992, Neuron 8: 59-70.
d Ragsdale et al., 1991, Molecular Pharmacology 40: 756-65.
En la tabla 4, las entradas de la tabla son valores de CE_{50} (en micromolar) para los ajustes a las curvas dosis-respuesta de cada ensayo. Cada experimento se realizó dos veces, con cuatro pocillos por concentración del fármaco por experimento. En cada experimento, se utilizaron once concentraciones, abarcando cinco ordenes de magnitud en concentración. Los valores notificados son los promedios de las CE_{50} calculadas de cada experimento. En los que casos de bloqueantes dependientes de uso, se indican los valores notificados más bajos.
WIN-17317 y TTX son bloqueantes tónicos potentes de una serie de canales de sodio. Estos compuestos pueden detectarse utilizando el formato de estimulación eléctrica, que da potencias de bloqueo próximas a los valores de la bibliografía.
Los primeros cuatro fármacos (lidocaína, bupivacaína, tetracaína, y fenitoína) son bloqueantes dependientes de uso. Es decir, tienen afinidades diferentes para los diversos estados del canal. Son de relevancia terapéutica grande ya que a concentraciones apropiadas pueden bloquear roturas repetitivas perjudiciales de las neuronas y células musculares no afectando la actividad normal a baja frecuencia. En todos los casos, la concentración de bloqueo medida, medida con la estimulación eléctrica, se aproxima al valor notificado en la bibliografía. El formato de ensayo de estimulación eléctrica es el único método de alto rendimiento fidedigno para detectar todos los moduladores de los canales de sodio, incluyendo agonistas, antagonistas, y bloqueantes dependientes de uso.
Ejemplo 16 Aplicabilidad para la selección de alto rendimiento
Para los fines de selección de alto rendimiento, las repuestas deben ser suficientemente fiables para hablar con confianza de la diferencia entre compuestos activos e inactivos. Esto puede cuantificarse examinando la distribución de las respuestas obtenidas con condiciones de estimulación idénticas, comparando canales nativos con canales bloqueados completamente. Debido a la incertidumbre y ruido experimental en el sistema, habrá alguna dispersión en las respuestas. Sería idóneo poder cuantificar estadísticamente esta dispersión, y usarla como predicción de probabilidades de respuestas mal identificadas como falsos positivos o falsos negativos.
Para hacer esto, se cargó una placa de células que expresan el canal de sodio dependiente de voltaje NaV2 con los colorantes de FRET. Se realizó "aleatoriamente" una adición conocida en un pocillo por columna de TTX 1 \muM, aproximadamente 200 veces la concentración de la mitad del bloqueo. Las células se sometieron a ensayo con un estímulo bifásico de 5 ms/fase, con ráfagas de 25 V/cm durante 3 segundos, a 20 Hz. Los resultados se muestran en la figura 25. Los pocillos con adiciones conocidas de TTX pueden distinguirse fácilmente mediante observación como los pocillos con respuesta pequeña o no detectable.
La respuesta radiométrica dos segundos tras el comienzo del estímulo se muestran en el figura 26. Pueden distinguirse fácilmente las dos poblaciones (bloqueada y desbloqueada). La repuesta bloqueada promedio era de 1,011 \pm 0,004, mientras que la respuesta desbloqueada promedio era de 2,67 \pm 0,21. El coeficiente de variación de la respuesta desbloqueada es del 13%. El intervalo de selección (es decir, la diferencia entre las poblaciones normalizadas para las desviaciones estándar, véase el apéndice A3) es de 7,8 (\sigma_{1} + \sigma_{2}), en el que \sigma_{1} = 0,21 es la desviación estándar de la respuesta desbloqueada y \sigma_{2} = 0,004 es la desviación estándar de la respuesta bloqueada. Si se toma el punto de corte para distinguir los bloqueantes de los no bloqueantes a medio camino entre las poblaciones (en 1,042), entonces la tasa de falsos positivos y falsos negativos estadísticos (suponiendo una distribución normal) es 1-prob(7,75) = 10^{14}. Esto sugiere que durante una selección de una biblioteca de compuestos grande (10^{8} compuestos), la probabilidad de encontrar un único falso positivo o falso negativo durante la selección completa es sólo una en un millón. Para comparación, si la diferencia entre las poblaciones fuera sólo de 3 y se colocara el punto de corte de manera óptima, la tasa falso positivo/negativo sería del 0,3%, un factor de 10^{11} superior. Para una selección real, en la que se quiere incluir como compuestos de éxito los que no producen un bloqueo completo, existe un equilibrio entre la actividad farmacológica débil de detección y la tasa de falsos positivos. Si, por ejemplo, se desea una tasa de falso positivo del 0,1%, entonces en esta selección puede ponerse el punto de corte de la selección en desviaciones estándar de 3,3 inferiores a la media de la respuesta desbloqueada, o en 1,97. En este caso, la tasa de falsos negativos es efectivamente cero, y los compuestos que bloquean sólo el 50% de la respuesta se identificarán como éxitos.
Matemáticamente, hay dos razones por las que las poblaciones bloqueadas y desbloqueadas se solapan tan poco. En primer lugar, el coeficiente de variación de la respuesta desbloqueada es relativamente pequeño. Es decir, cada respuesta es casi idéntica a cada una de las otros respuestas. En segundo lugar, y quizás más importante, no hay respuesta absolutamente detectable de los pocillos bloqueados. La dispersión de los pocillos bloqueados consecuentemente es extremadamente pequeña, de manera que el límite para distinguir las poblaciones puede colocarse muy bajo.
En los ensayos realizados utilizando protocolos de adición de líquidos para la estimulación, generalmente los artefactos de la adición dan una respuesta algo pequeña con una dispersión asociada. La dispersión de la respuesta bloqueada reduce el intervalo de selección, aumenta la probabilidad de falsos positivos y falsos negativos, y limita la capacidad de la persona que selecciona para identificar bloqueantes parciales.
Ejemplo 17 Selección en líneas celulares complejas
Se demostró la viabilidad de la estimulación eléctrica de células que expresan múltiples canales utilizando cultivos de la línea celular HL5. Estas células se generaron inmortalizando células de músculo cardíaco (Claycomb et al., 1998, PNAS 95: 2979-84). Contienen varios canales de potasio, calcio y sodio activados por voltaje, así como una corriente de potasio rectificadora entrante y corrientes de fuga de cloruro y potasio. Se hicieron crecer las células en placas de microtítulo de 96 pocillos y se sometieron a ensayo en confluencia. Se tiñeron según el protocolo en el apéndice A1. Se realizaron las mediciones de fluorescencia radiométrica durante la estimulación eléctrica utilizando VIPR™ tal como se describió anteriormente, y se analizaron los datos según los procedimientos en el apéndice A2. Se eligieron arbitrariamente los parámetros del estímulo para que fueran: ráfaga largas de 3 segundos de duración a 10 Hz con un núcleo de estímulos de onda cuadrada bifásica con una duración de impulso de 5 ms/fase. Se realizaron los estímulos en campos eléctricos variables para determinar el campo umbral. Dos filas de pocillos contenían TTX 10 \muM para bloquear parcialmente el canal de sodio cardíaco, y dos filas contenían TEA 10 mM para bloquear los canales de potasio dependientes de voltaje. La figura 27 muestra las respuestas normalizadas de cada pocillo. Generalmente, a medida que aumenta la intensidad del campo eléctrico, aumenta la respuesta celular. Las tres últimas columnas muestran señales de electropermeabilización a medida que el voltaje continúa aumentando. En las columnas 6, 7, y 8, la razón realmente se recupera por debajo de la razón de partida, lo que sugiere una hiperpolarización posterior (un fenómeno producido por el cierre lento de los canales de potasio dependientes de voltaje).
La tasa de la respuesta celular es extremadamente rápida, y puede limitarse aparentemente por la capacidad del etil oxonol de redistribuirse rápidamente dentro de la membrana. La respuesta rápida es compatible con una alta conductancia en reposo de la célula debido a las corrientes de fuga y la expresión de los canales rectificadores entrantes de potasio. TTX bloquea parcialmente la respuesta positiva, lo que indica que ésta se debe, al menos parcialmente, a la corriente de sodio dependiente de voltaje.
La figura 28 muestra la respuesta de las células no tratadas (filas 1-4) como una función del campo eléctrico aplicado. La respuesta aumenta sigmoidalmente con el campo eléctrico. Por encima de 50 V/cm, hay una señal sostenida que no resulta afectada por TTX. Tal como se trató previamente, este comportamiento es compatible con la electropermeabilización de la membrana celular en alta intensidad del campo eléctrico. También se muestra en la figura 28 el intervalo de selección (véase el apéndice A3) como una función del campo de estímulo.
Estos resultados demuestran que las células HL5 pueden someterse a ensayo eficazmente utilizando la técnica de estimulación eléctrica. Los compuestos que se conocen para modificar diferentes canales iónicos producen cambios detectables en la respuesta. Debido a que estos canales iónicos son idénticos a los expresados por el corazón, un ensayo de este tipo puede ser útil como una selección secundaria, para eliminar o marcar para la modificación los compuestos que pueden interferir con la función cardiaca normal. Esto podría ser útil también como una selección primaria, para descubrir compuestos que pueden tener efectos deseables sobre uno cualquiera (o una combinación) de los canales iónicos del corazón.
Ejemplo 18 Estimulación eléctrica de cultivos celulares utilizando electrodos de superficie
Se prepararon electrodos montados de superficie en cubreobjetos de vidrio recubiertos con cromo (como una capa de adhesión) y oro (como una capa conductora). Se construyeron por encargo los cubreobjetos metalizados por Thin Film Devices, Inc. (Anaheim CA). Los cubreobjetos eran vidrio Corning 7059 de una pulgada cuadrada, de 0,17 mm de espesor. La metalización se realizó por deposición por pulverización a vacío. La capa de cromo era de aproximadamente 1000 \ring{A} de espesor y servía como una capa de adhesión. La capa de oro era de aproximadamente 5000 \ring{A} de espesor, y servía como una capa conductora. La resistividad del metal depositado era inferior a 0,1 \Omega/cuadrada. Se grabó un hueco de 4 mm a través del metal enmascarando a mano la superficie metálica con un polímero químicamente resistente (S1400-27, Shipley Co., Marlborough MA), grabando entonces a través de las capas metálicas durante cinco minutos en Gold Etchant TFA, seguido de cinco minutos en Chromium Etchant TFD (Transene Co., Danvers MA). Los cubreobjetos se unieron a las partes inferiores de las placas de 96 pocillos con elastómero de silicona (Sylgard 184 (Coming) y se curaron durante 90 minutos a 70°C). Tras la esterilización con irradiación UV a 365 nm durante 30 minutos y el recubrimiento con la molécula de adhesión celular de poli-D-lisina (peso molecular de 300.000, 1 mg/ml en solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco durante 30 minutos, enjuagada después tres veces con agua destilada), pudieron hacerse crecer con éxito las células vivas y se cultivaron en los electrodos de superficie.
Para validar las células CHO de estimulador de electrodos de superficie en una densidad inicial de aproximadamente 1000 células/mm^{2} se sembraron en placa en los pocillos de la placa de 96 pocillos y se permitió que se unieran durante aproximadamente 16 horas. Estas células se transfectaron para expresar un canal de potasio, que establece el potencial transmembrana a aproximadamente -80 mV, y el canal de sodio NaV3. Tras alcanzar la confluencia, se cargaron las células con la combinación colorante de FRET sensible al voltaje de CC2-DMPE y DiSBAC_{2} (3) tal como se describe en el apéndice A1. Los electrodos de superficie metálicos se conectaron a la salida de un generador de impulsos, que en este caso era un electroporador de disminución exponencial (Gene Pulser II, Bio-Rad Corp., Hercules CA). Se realizó la obtención de imágenes por fluorescencia radiométrica en un microscopio Zeiss Axiovert TV, equipado con una fuente de luz de lámpara de arco de xenón de 75 W. Se filtró la luz de excitación utilizando un filtro de interferencia dieléctrica de 405 \pm 10 nm y un espejo dicroico de 445 DXCR. La luz de emisión se dividió con un segundo espejo dicroico 525XR, y se midió con un par de tubos fotomultiplicadores (TFM) de Hamamatsu HC124. Un TFM tenía un filtro de interferencia dieléctrica de 475 \pm 40 nm en frente de él para monitorizar la señal de fluorescencia azul. El segundo TFM tenía un filtro de interferencia dieléctrica de 580 \pm 35 nm en frente de él para monitorizar la señal de fluorescencia naranja. Los filtros ópticos y los espejos dicroicos se adquirieron de Chroma Technology Corp., Battleboro VT. La obtención de imágenes por fluorescencia radiométrica se realizó en campos que contenían aproximadamente 100 células. Se realizó la corrección de la fluorescencia de fondo midiendo las señales naranja y azul en un campo sin células, restando después éstas de las señales obtenidas de las células. Entonces se calculó la señal radiométrica, proporcional a los cambios de potencial transmembrana, tal como se describe en el apéndice A2.
El protocolo de estimulación utilizó impulsos de campo eléctrico monofásico únicos de amplitud variable. Los impulsos eran formas de onda de disminución exponencial con una constante de tiempo de disminución de 4,3 ms. La amplitud al comienzo del impulso se varió desde cero hasta 56 V/cm.
Una respuesta de voltaje normal de células CHO que expresan un canal de potasio y el canal de sodio NaV3 tras tres respuestas de estimulación de 45 V/cm separadas se muestran en la figura 29 para el mismo campo de células, lo que muestran repetibilidad de la respuesta. La rapidez de la respuesta en este caso está limitada principalmente por el tiempo de respuesta del colorante hidrófobo móvil, que para el etil oxonol utilizado es de aproximadamente 0,5 segundos.
La respuesta radiométrica promedio de una población de células que crecieron en una placa de múltiples pocillos de 96 pocillos estimulada con estímulos monofásicos de intensidades de campo variables se muestra en la figura 30. Los puntos en esta curva son la respuesta máxima promedio de 4 estimulaciones en el mismo cultivo. Como es de esperar a partir de una curva de repuesta del tipo acción-potencial, no hay respuesta detectable por debajo de aproximadamente 18 V/cm. La región umbral es relativamente estrecha. Entre aproximadamente 20 y 40 V/cm, la respuesta aumenta con el aumento de la intensidad de campo. Por encima de 40 V/cm, la respuesta formó una meseta.
Ejemplo 19 Análisis de células RBL de tipo natural que expresan IRK1
Las células de leucemia basófila de rata (RBL) expresan endógenamente el canal rectificador entrante de potasio IRK1 (Wischmeyer et al, Pflugers Arch. 429:809-819, 1995). Este canal conduce de manera selectiva iones potasio, con una característica de conductancia altamente no lineal. La conductancia es casi lineal por debajo del potencial de inversión de potasio V_{K}, y desciende rápidamente hasta cerca de cero comenzando en aproximadamente 10 mV positivo de V_{K}. Las células que expresan cantidades grandes de canales rectificadores entrantes tienden a tener potenciales transmembrana en reposo dentro de algunos milivoltios de V_{k}.
En el lado de la célula en el que el potencial transmembrana se hace positivo por un campo eléctrico externo aplicado a las células que expresan IRK1 y algunos otros canales iónicos, los canales IRK1 se cerraran rápidamente y cesará la conducción. En el lado de la célula en el que el potencial transmembrana se hace negativo, los canales IRK1 se abrirán y pasarán la corriente de potasio. Si este lado de la célula se hace suficientemente negativo, de manera que el potencial transmembrana local sea más negativo que V_{K}, existirá una corriente de potasio hacia dentro neta. Esta corriente producirá un cambio en el potencial transmembrana global positivo. Dado que el canal IRK1 no se inactiva, esta corriente debe mantenerse durante tanto tiempo como se aplique el campo externo.
Se sembraron células RBL adherentes en placas de 96 pocillos y se cargaron con colorantes de FRET tal como se describe en el apéndice A1. Tres filas de pocillos contenían cloruro de bario 400 \muM para bloquear el canal IRK1. Se analizaron las placas utilizando un lector VIPR™ mientras que se estimularon eléctricamente con un tren de estímulos bifásico repetido a una frecuencia de 50 Hz y con una duración de impulso de 5 ms/fase. El tren de impulso de estimulación se produjo durante una duración total de 5 segundos y la tasa de digitalización para la recogida de datos fue de 50 Hz. Se fijó el campo eléctrico aplicado para cada columna de ocho pocillos, y se varió desde 7,2 hasta 72 V/cm. Los datos se analizaron según los procedimientos en el apéndice A2. Se calculó la razón normalizada tras tres segundos de estimulación, promediada para las dos poblaciones de pocillos (con y sin bloqueo de bario) y se representó como una función del campo aplicado en la figura 31. Las barras de error son desviaciones estándar de las respuestas. Los cuadrados en blanco son las respuestas sin el bloqueo de bario; los círculos rellenos son las respuestas con el bloqueo de bario. Los datos de los pocillos con el bloqueo de bario indican que no hay cambio de voltaje detectable durante la estimulación hasta que el campo alcanza 80 V/cm, punto en el que puede producirse alguna electropermeabilización. Los pocillos no bloqueados muestran respuesta casi lineal por encima de un umbral de aproximadamente 20 V/cm. Este ejemplo muestra claramente que la presente invención puede utilizarse para modular el potencial transmembrana en las direcciones o bien positiva o bien negativa, dependiendo de los parámetros del estímulo y de las propiedades de los canales iónicos expresados por la célula.
La presente invención aumenta la aplicabilidad de la estimulación eléctrica para incluir células no excitables, proporcionando instrumentos y métodos que permiten el control gradual eficaz del potencial de membrana sin dar como resultado electroporación significativa. La presente invención consigue este resultado por medio del uso de impulsos repetitivos, altamente uniformes de estimulación eléctrica aplicada al medio que rodea las células. Normalmente los campos eléctricos aplicados no alteran directamente al potencial transmembrana promedio de la célula, sino que en su lugar crean cambios de potencial transmembrana positivos y negativos simétricos en los lados de la células que dan hacia el cátodo y el ánodo, respectivamente.
El enfoque se aprovecha de la selectividad iónica y de las características de conductancia y regulación no lineal de los canales iónicos dependientes de voltaje. El enfoque también se aprovecha del hecho de que las células intactas típicas tienen constantes de tiempo largas para la disminución de los cambios en el potencial transmembrana. Incluso en aquellos casos en los que la carga inyectada a la célula mediante un impulso de estímulos único es demasiado pequeña como para detectarse de manera fiable, los impulsos de estímulos múltiples aplicados apropiadamente pueden desarrollar grandes fluctuaciones del potencial transmembrana neto. Variando el número, la duración, y la forma y amplitud de los impulsos, es posible fijar de manera artificial, o cambiar el potencial transmembrana de las células vivas en un modo que es similar al de la técnica de patch clamp. Otros canales, corrientes de fuga o transportadores que no se consideran clásicamente dependientes de voltaje, también pueden someterse a ensayo mediante la inducción de cambios en el potencial transmembrana utilizando un segundo canal dependiente de voltaje y detectando el flujo de corriente o los cambios de potencial transmembrana como resultado de la activación de transportador o canal diana.
El presente método es sólido, compatible con las metodologías de detección óptica y fácilmente modificable para un intervalo amplio de aplicaciones de potencial incluyendo la selección del alto rendimiento para su uso en el descubrimiento de fármacos. En muchos formatos de ensayo, la estimulación eléctrica directa evita la necesidad de la adición de líquido, haciendo el ensayo más simple. Las manipulaciones complejas del potencial transmembrana pueden realizarse fácilmente utilizando variaciones en el protocolo de estimulación. Por tanto, prácticamente cualquier canal sensible al voltaje puede inducir la apertura a pesar del estado de inactivación o la dependencia de voltaje. Para el descubrimiento de fármacos de alto rendimiento esto relaja las necesidades de tipos de células especializadas y permite que los ensayos se realicen rápidamente con líneas celulares fácilmente disponibles.
Apéndices A1. Protocolo de tinción de colorantes sensibles al voltaje de FRET
Reactivos:
Tampón de ensayo nº 1:
NaCl 140 mM
KCl 4,5 mM
CaCl_{2} 2 mM
MgCl_{2} 1 mM
HEPES 10 mM
Glucosa 10 mM pH 7,40, 330 mOs/kg
Disolución madre de Pluronic (1000X):
Pluronic 127 100 mg/mL en DMSO seco
Disolución madre de oxonol (3333X):
DiSBAC_{2}(3) 10 mM en DMSO seco
Disolución madre de cumarina (1000X):
CC2-DMPE 10 mM en DMSO seco
Disolución madre de ESS-CY4 (400X):
ESS-CY4 200 mM en agua.
Carga y protocolo del ensayo
1. Preparación del tampón de carga CC2-DMPE. Normalmente para una placa de 96 pocillos, se preparará 10 ml de disolución de tinción por placa.
i)
Mezclar volúmenes iguales (10 \mul) de disolución madre de cumarina y disolución madre de Pluronic en un tubo.
ii)
Añadir 10 ml de tampón de ensayo nº 1 al tubo mientras se agita con vórtex suavemente.
Concentración de carga: CC2-DMPE 10 \muM y Pluronic 0,1 \mug/ml.
2. Preparar el tampón de carga de oxonol
i)
Mezclar volúmenes iguales (3,3 \mul) de disolución madre de oxonol y de disolución madre de Pluronic en un tubo.
ii)
Añadir 10 ml de tampón de ensayo nº 1 al tubo mientras se agita con vórtex suavemente.
iii)
Añadir 25 \mul de ESS-CY4 mientras se agita con vórtex.
Concentración de carga: DiSBAC_{2}(3) 3 \muM, Pluronic 0,2 \mug/ml, y ESS-CY4 0,5 mM.
iv)
Si es necesario, combinar los compuestos de ensayo con el tampón de carga en este momento.
3. Enjuagar las células dos veces con el tampón de ensayo nº 1, eliminando cada vez todo el líquido de los pocillos.
4. Añadir 100 \mul de tampón de carga de CC2-DMPE a cada pocillo. Incubar durante 30 minutos a temperatura ambiente, evitando la luz brillante.
5. Enjuagar las células dos veces con el tampón de ensayo nº 1, eliminando cada vez todo el líquido de los pocillos.
6. Añadir 100 \mul de tampón de carga de oxonol a cada pocillo.
7. Incubar durante 30 minutos a temperatura ambiente, evitando la luz brillante. Utilizar inmediatamente.
\vskip1.000000\baselineskip
A2. Análisis de los datos del lector VIPR™
Se analizaron y se notificaron los datos como razones normalizadas de las intensidades medidas en los canales a 460 nm y 580 nm. Se realizó el proceso de cálculo de estas razones tal como sigue. En todas las placas, la columna 12 contenía tampón de ensayo nº 1 con las mismas concentraciones de DiSBAC2(3) y de ESS-CY4 que las utilizadas en las placas de célula, sin embargo no se incluyeron células en la columna 12. Se promediaron los valores de intensidad a cada longitud de onda en los intervalos inicial (antes del estímulo) y final (durante el estímulo). Estos valores promedio se restaron de los valores de intensidad promediados durante los mismos periodos de tiempo en todos los pocillos sometidos a ensayo. Las razones obtenidas de las muestras en los intervalos inicial (Ri) y final (Rf) se definen como:
(A2.1)Ri = \frac{\text{(intensidad a 460 nm, inicial - fondo a 460nm, inicial)}}{\text{(intensidad a 580nm, inicial - fondo a 580 nm, inicial)}}
(A2.2)Rf = \frac{\text{(intensidad a 460 nm, final - fondo a 460nm, final)}}{\text{(intensidad a 580nm, final - fondo a 580 nm, final)}}
Se normalizaron los datos finales para la razón de partida de cada pocillo y se notificaron como Rf/Ri.
\vskip1.000000\baselineskip
A3. Intervalo de selección
El intervalo de selección W de una respuesta se define tal como sigue. Se necesitan datos de múltiples pocillos en condiciones de estímulos idénticas. Los pocillos control pueden o bien bloquearse farmacológicamente o bien estimularse con célula no transfectada con el campo eléctrico total. Alternativamente, se pueden usar células transfectadas sin estímulos aplicados.
Se miden las repuestas de los pocillos control y experimental. Se calculan los promedios y las desviaciones estándar de las respuestas en los pocillos experimentales (R \pm \DeltaR) y control (C \pm \DeltaC). Se define el intervalo de selección como la diferencia entre las señales experimental y control normalizadas para la suma de las desviaciones estándar.
14
Una regla general para un intervalo de selección aceptable es W>3. Esto permite seleccionar una línea de punto corte a medio camino entre las repuestas control y experimental, lo que garantiza una tasa de falso negativo/positivo inferior al 1%. Suponiendo una distribución normal, la tasa de falso positivo/negativo como una función del intervalo de selección W es:
15
TABLA A3.1. La tasa de falso positivo/negativo P(W) como una función del intervalo de selección W tal como se define en la ecuación A3.1. Este cálculo supone que el punto de corte para la identificación de un éxito se sitúa un número igual de desviaciones estándar de las respuestas control negativa y positiva
16

Claims (27)

1. Un método de caracterización de la actividad biológica de un compuesto candidato que comprende:
exponer una o más células a dicho compuesto;
exponer repetidamente dichas una o más células a una pluralidad de impulsos de campo eléctrico bifásico en el que dichos impulsos tienen una amplitud máxima inferior a aproximadamente 90 V/cm, en el que dichos impulsos se aplican a una tasa de al menos aproximadamente 1 por segundo, y en el que la duración total de cada impulso es de al menos aproximadamente 1 milisegundo, de manera que realice un cambio controlado en el potencial transmembrana de dichas una o más células; y
monitorizar, sin utilizar un patch clamp, los cambios en el potencial transmembrana de dichas una o más células.
2. Método según la reivindicación 1, en el que dicha monitorización comprende detectar la emisión de fluorescencia de una zona de observación que contiene dichas una o más células.
3. Método según la reivindicación 1 ó 2, que comprende adicionalmente limitar la variación espacial en la intensidad del campo eléctrico de manera que se minimize la electroporación irreversible de las células.
4. Método según la reivindicación 1, en el que dichos impulsos de campo eléctrico hacen que un canal iónico de interés efectúe ciclos entre diferentes estados dependientes de voltaje, en particular, hacen que un canal iónico de interés se abra o se libere de la inactivación.
5. Método según la reivindicación 1, en el que dichas una o más células comprenden un sensor de voltaje seleccionado del grupo que consiste en un sensor de voltaje basado en FRET, un colorante de potencial de transmembrana electrocrómico, un colorante de redistribución de potencial transmembrana, una molécula fluorescente o luminiscente sensible a los iones y un ion radiactivo.
6. Método según la reivindicación 1, en el que dichas una o más células comprenden un canal iónico regulado por voltaje, en particular en el que dicho canal iónico regulado por voltaje se selecciona del grupo que consiste en un canal de potasio, un canal de calcio, un canal de cloruro y un canal de sodio.
7. Método según la reivindicación 1, en el que dichos impulsos de campo eléctrico muestran variación espacial limitada en intensidad en la zona de observación inferior a aproximadamente el 25% con respecto a una intensidad media en esa zona.
8. Método según la reivindicación 7, en el que dichos impulsos de campo eléctrico varían sobre una zona de observación en no más de aproximadamente el 15%, preferiblemente en no más de aproximadamente el 5% con respecto al campo eléctrico medio en cualquier momento.
9. Método según la reivindicación 1, en el que dichos impulsos de campo eléctrico comprenden la estimulación con cualquiera de una forma de onda cuadrada, una forma de onda sinusoidal o una forma de onda de diente de sierra.
10. Método según la reivindicación 1, en el que dicho uno o más campos eléctricos tienen una amplitud dentro del intervalo de aproximadamente 10 V/cm a aproximadamente 90 V/cm, preferiblemente dentro del intervalo de aproximadamente 20 V/cm a aproximadamente 80 V/cm.
11. Método según la reivindicación 1, en el que dichos impulsos de campo eléctrico se repiten a una frecuencia de estimulación que es mayor o igual que la inversa de la constante de tiempo transmembrana de dichas una o más células, preferiblemente a una frecuencia de estimulación dentro del intervalo de 1 Hz a 1 kHz.
12. Método según la reivindicación 1, en el que dichos impulsos de campo eléctrico tienen una duración de impulso dentro del intervalo de aproximadamente 1 milisegundo a aproximadamente 20 milisegundos.
13. Método según la reivindicación 1, en el que dicho potencial transmembrana se desarrolla a través de la membrana plasmática de dichas una o más células.
14. Método para someter a ensayo la actividad bioquímica de un compuesto contra un canal iónico objetivo que comprende:
seleccionar una línea celular que tiene un potencial transmembrana normal en reposo correspondiente a un estado dependiente del voltaje seleccionado de dicho canal iónico objetivo;
expresar dicho canal iónico objetivo en una población de células de dicha línea celular seleccionada;
exponer dicha población de células a dicho compuesto;
exponer repetidamente dicha población de células a una pluralidad de impulsos de campo eléctrico bifásico en el que dichos impulsos tienen una amplitud máxima inferior a aproximadamente 90 V/cm, en el que dichos impulsos se aplican a una tasa de al menos aproximadamente 1 por segundo, y en el que la duración total de cada impulso es de al menos aproximadamente 1 milisegundo, de manera que realice un cambio controlado en el potencial transmembrana de dichas una o más células; y
monitorizar los cambios en el potencial transmembrana de dichas una o más células.
15. Método según la reivindicación 14, en el que dicho canal iónico objetivo se expresa exógenamente en dicha línea celular.
16. Método según la reivindicación 14, en el que dicha línea celular se transfecta con ácido nucleico que codifica para dicho canal iónico objetivo, en particular en el que dicha línea celular expresa niveles insignificantes de otros canales iónicos y preferiblemente en el que dicha línea celular se selecciona del grupo que consiste en CHL, LTK(-) y CHO-K1.
17. Método según la reivindicación 14, en el que dicho canal iónico objetivo es un canal de sodio, y en el que dicha población de células se selecciona del grupo que consiste en células CHL, células LTK(-), y células CHO-K1 o del grupo que consiste en células HEK-293, células RBL, células F11 y células HLS.
18. Método según la reivindicación 14, en el que dicho canal iónico objetivo es un canal de potasio o de calcio, y en el que dicha población de células se selecciona del grupo que consiste en células CHL, células LTK(-), y células CHO-K1.
19. Un método para someter a ensayo la actividad del canal iónico que comprende:
exponer al menos una célula a una pluralidad de impulsos de campo eléctrico bifásico en el que dichos impulsos tienen una amplitud máxima inferior a aproximadamente 90 V/cm, en el que dichos impulsos se aplican a una tasa de al menos aproximadamente 1 por segundo, y en el que la duración total de cada impulso es de al menos aproximadamente 1 milisegundo, de manera que crea un cambio controlado en el potencial transmembrana y de manera que activa un canal iónico de interés; y
detectar la actividad del canal iónico mediante la detección de uno o más cambios en el potencial transmembrana sin utilizar una técnica de patch clamp.
20. Método según la reivindicación 19, en el que dicha al menos una célula comprende un detector de voltaje seleccionado del grupo que consiste en un detector de voltaje basado en FRET, un colorante de potencial de transmembrana electrocrómico, un colorante de redistribución de potencial transmembrana, una molécula fluorescente o luminiscente sensible a los iones y un ion radiactivo.
21. Método según la reivindicación 20 en el que dicho detector de voltaje comprende un detector de voltaje basado en FRET.
22. Método según la reivindicación 19, en el que dicho canal iónico de interés es un canal iónico regulado por voltaje.
23. Método según la reivindicación 19, en el que dicha pluralidad de impulsos de campo eléctrico hace que dicho canal iónico de interés efectúe ciclos entre diferentes estados dependientes de voltaje.
24. Método según la reivindicación 19, en el que dicha al menos una célula es una célula eucariota, una célula no excitable, una célula procariota, una célula de cultivo tisular, una línea celular primaria y/o parte de un organismo vivo intacto.
25. Método para someter a ensayo la actividad del canal iónico que comprende:
expresar un canal iónico objetivo seleccionado en al menos una célula;
expresar un canal iónico contador seleccionado en dicha al menos una célula;
exponer dicha al menos una célula a una pluralidad de impulsos de campo eléctrico bifásico en el que dichos impulsos tienen una amplitud máxima inferior a aproximadamente 90 V/cm, en el que dichos impulsos se aplican a una tasa de al menos aproximadamente 1 por segundo, y en el que la duración total de cada impulso es de al menos aproximadamente 1 milisegundo, de manera que crea un cambio controlado en el potencial transmembrana y de manera que activa dicho canal iónico contador; y
monitorizar el potencial transmembrana de dicha al menos una célula
\newpage
26. Método según la reivindicación 25, en el que se detecta un cambio en el potencial transmembrana cuando se bloquea dicho canal iónico de interés, en particular en el que dicho canal iónico de interés comprende un canal iónico asociado a un ligando y preferiblemente en el que dicho canal contador comprende un canal de sodio.
27. Método según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que dicha amplitud máxima es de aproximadamente 20 a 40 V/cm y/o en el que dicha duración de impulso es de aproximadamente 2 a 10 milisegundos por fase y/o en el que dichos impulsos se aplican a una tasa de aproximadamente 20 a 100 impulsos por segundo.
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