ES2258798T3 - Nuevas proteinas de union a hipoproteinas de baja densidad y su uso para el diagnostico y el tratamiento de la arterosclerosis. - Google Patents
Nuevas proteinas de union a hipoproteinas de baja densidad y su uso para el diagnostico y el tratamiento de la arterosclerosis.Info
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Abstract
Se describen polinucleótidos aislados que codifican polipéptidos capaces de unirse a LDL (lipoproteínas de baja densidad) en estado nativo y metiladas, los polipéptidos aislados, llamados LBPs (proteínas de unión a LDL) y fragmentos con actividad biológica y análogos. También se describen procedimientos para determinar si un animal sufre riesgo de arterioesclerosis, procedimientos para la evaluación de un agente para su utilización en el tratamiento de la arterioesclerosis, procedimientos para el tratamiento de la arterioesclerosis y procedimientos para el tratamiento de células que tengan una anormalidad en su estructura o en el metabolismo de LBP. También se proporciona la composición de los fármacos y de las vacunas.
Description
Nuevas proteínas de unión a hipoproteínas de
baja densidad y su uso para el diagnóstico y el tratamiento de la
arterosclerosis.
Esta invención se refiere a nuevos polipéptidos
(LBPs) que se unen a lipoproteínas de baja densidad (LDL), a
polinucleótidos que codifican estos polipéptidos, y a agentes
terapéuticos para la arteriosclerosis.
La arteriosclerosis es la causa principal de
ataques cardíacos y apoplejías. Se ha descrito que aproximadamente
el 50% de todas las muertes en los Estados Unidos, Europa y Japón
son debidas a la arterosclerosis. La arterosclerosis se caracteriza
por las lesiones arteroescleróticas en la pared arterial. Los
ésteres de colesterilo (CE) están presentes en estas lesiones
arteroscleróticas. Se ha observado que la lipoproteína de baja
densidad (LDL) es el principal soporte de los CE en plasma y ha
estado implicada como el agente por el que los CE entran en las
lesiones arteroscleróticas.
Grupos dispersos de macrófagos llenos de
lípidos, llamados células espuma, son los primeros signos visibles
de arterosclerosis y se han descrito como lesiones de tipo 1. Se ha
descrito que estos macrófagos contienen CE derivado de la LDL. Los
macrófagos reconocen la LDL oxidada, pero no la LDL originaria, y se
convierten en células espuma mediante fagocitosis de la LDL oxidada,
pero no de la LDL originaria. Grupos mayores, más organizados de
células espuma, franjas de grasa, representan las lesiones de tipo
II. Estas lesiones se desarrollan además en lesiones complejas
llamadas placas, que pueden dar lugar a impedir el flujo de sangre
en la arteria.
Se cree de forma generalizada que la acumulación
de LDL en la arteria depende de la presencia de células endoteliales
funcionalmente modificadas en la pared arterial. Se ha descrito en
modelos animales de arterosclerosis que la LDL, tanto la LDL
originaria como la LDL metilada, se acumulan de forma focalizada e
irreversible sólo en los bordes de las islas endoteliales
regenerantes en las lesiones aórticas, en donde está presente la
funcionalidad de las células endoteliales modificadas, pero no en
los centros de estas islas en donde la regeneración endotelial es
completa. De forma similar, la LDL se acumula en las lesiones
arterioscleróticas humanas. El mecanismo por el que la LDL se
acumula de forma focalizada e irreversible en las lesiones
arteriales no ha sido comprendido hasta este momento.
La base de datos WPI Sección Ch, (Semana 198542
Derwent Publications Limited, London), GB; Clase A96, AN
1985-008837 XP002169497) y la patente JP 59 206046
(ASAHI CHEM IND CO LTD), del 21 de Noviembre de 1984 se refieren a
los polianiones ácidos de peso molecular de al menos 600 (incluyendo
Poli-L-Glu y
Poli-Asp) como adsorbentes para eliminar la LDL del
suero en pacientes con arterosclerosis.
A. M. Lees y col. (Journal of Lipid Research,
vol. 32, no. 1, 1991, páginas 1-8) hacen referencia
a las imágenes en cámara Gamma in vivo de la LDL marcada para
estudiar el reconocimiento del receptor del secuestro celular en la
arterosclerosis.
La patente EP 0391629 (Universidad de Alabama
del Sur) hace referencia al uso de péptidos polianiónicos para el
tratamiento de la deposición mineral patológica, incluyendo la
arterosclerosis.
Es un objeto de la invención el proporcionar
polipéptidos que se unen a la LDL. Los métodos descritos en la
presente invención pueden ser útiles para determinar si un animal
tiene riesgo de arterosclerosis.
También es un objeto de la invención el
proporcionar un método para evaluar un agente para uso en el
tratamiento de la arterosclerosis.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para el tratamiento de la arterosclerosis. Los
genes de la LBP (proteína unida a la lipoproteína de baja densidad)
y/o polipéptidos, o fragmentos, análogos y variantes del mismo, tal
como se han descrito en el presente documento pueden ser útiles para
ayudar en el tratamiento, el diagnosis y/o la identificación de
agentes terapéuticos para la arteriosclerosis.
En un aspecto, la invención pone de relieve un
polinucleótido aislado que comprende un polinucleótido que codifica
el polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos tal como se
ha establecido en la SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 3, SEC
ID NO: 4, SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC ID NO: 7, SEC ID NO: 8 o
SEC ID NO: 9; o un polinucleótido capaz de hibridarse y que es
idéntico en al menos un 95% a cualquiera de los anteriores
polinucleótidos y en donde el polipéptido codificado es capaz de
unirse a la LDL; o un fragmento biológicamente activo de cualquiera
de los anteriores polinucleótidos en donde el polipéptido codificado
es capaz de unirse a la LDL.
En ciertas realizaciones, el polinucleótido
comprende la secuencia de ácido nucleico tal como se ha establecido
en la SEC ID NO: 10, SEC ID NO: 11, SEC ID NO: 12, SEC ID NO: 13,
SEC ID NO: 14, SEC ID NO: 15, SEC ID NO: 16, SEC ID NO: 17 o SEC ID
NO: 18.
Otro aspecto de la invención es un polilpéptido
aislado que comprende un polipéptido que presenta la secuencia de
aminoácidos tal como se ha establecido en la SEC ID NO: 1, SEC ID
NO: 2, SEC ID NO: 3, SEC ID NO: 4, SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC
ID NO: 7, SEC ID NO: 8 o SEC ID NO: 9; o un polipéptido que es
idéntico en al menos un 95% a cualquiera de los anteriores
polipéptidos y en donde el polipéptido es capaz de unirse a la LDL;
o un fragmento biológicamente activo de cualquiera de los anteriores
polipéptidos en donde el fragmento es capaz de unirse a la LDL.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para la determinación de si un animal tiene riesgo
de arterosclerosis. Se proporciona un animal. Se evalúa en el animal
un aspecto del metabolismo o de la estructura de la LBP. Una
anormalidad en el aspecto del metabolismo o de la estructura de la
LBP es diagnosticada como de tener riesgo de arterosclerosis.
Otro aspecto de la invención es un método para
la evaluación de un agente para uso en el tratamiento de la
arterosclerosis. Se proporciona un sistema de células de prueba o un
sistema libre de células. Se proporciona un agente. Se administra el
agente en el sistema de células de prueba o en el sistema libre de
células en una cantidad terapéuticamente efectiva. Se evalúa el
efecto del agente en un aspecto del metabolismo o de la estructura
de la LBP. Un cambio en el aspecto del metabolismo o de la
estructura de la LBP es indicativo de la utilidad del agente en el
tratamiento de la arterosclerosis.
Otro aspecto de la invención es un método para
la evaluación de un agente para la capacidad de alterar la unión del
polipétido LBP a una molécula de unión, por ej., la LDL originaria,
la LDL modificada, por ej., la LDL metilada o la LDL oxidada, o un
componente estructural de la matriz extracelular. Se proporciona un
agente. Se proporciona un polipéptido de LBP. Se proporciona una
molécula de unión. Se combinan el agente, el polipéptido de la LBP y
la molécula de unión. Se detecta la formación de un complejo que
comprende el polipéptido de la LBP y la molécula de unión. Una
alteración en la formación del complejo en presencia del agente
comparada con la producida en ausencia del agente es indicativa de
la alteración del agente por unión del polipéptido de la LBP a la
molécula de unión.
Otro aspecto de la invención es un método para
la evaluación de la capacidad de unión de un agente al ácido
nucleico que codifica una secuencia reguladora de la LBP. Se
proporciona un agente. Se proporciona un ácido nucleico que codifica
una secuencia reguladora de la LBP. El agente se pone en contacto
con el ácido nucleico. Se evalúa la capacidad del agente para unirse
al ácido nucleico.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para el tratamiento de la arterosclerosis en un
animal. Se proporciona un animal que precise del tratamiento para la
arterosclerosis. Se proporciona un agente capaz de alterar un
aspecto de la estructura o del metabolismo de la LBP. El agente es
administrado al animal en una cantidad terapéuticamente efectiva de
modo que se produzca el tratamiento de la arterosclerosis. El agente
puede ser un polipéptido de la LBP, por ej., LBP-1,
LBP-2 o LBP-3, o un fragmento o un
análogo biológicamente activo del mismo. El agente puede ser un
polipéptido de una longitud de no más de aproximadamente 100, 50,
30, 20, 10, 5, 4, 3 ó 2 residuos de aminoácidos. El agente puede ser
un polipéptido que tenga una secuencia de aminoácidos que incluya al
menos aproximadamente un 20%, 40%, 60%, 80%, 90%, 95% o 98% de
residuos de aminoácidos.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para tratar un animal con riesgo de
arterosclerosis. Se proporciona un animal con riesgo de
arterosclerosis. Se proporciona un agente capaz de alterar un
aspecto de la estructura o del metabolismo de la LBP. El agente es
administrado al animal en una cantidad terapéuticamente efectiva de
modo que se produzca el tratamiento en el animal.
Otro aspecto de la invención es un método para
el tratamiento de una célula que tenga una anormalidad en la
estructura o el metabolismo de la LBP. Se proporciona una célula que
tenga una anormalidad en la estructura o el metabolismo de la LBP.
Se proporciona un agente capaz de alterar un aspecto de la
estructura o del metabolismo de la LBP. El agente es administrado en
cantidades tales como para que se produzca el tratamiento de las
células.
Otro aspecto de la invención es una composición
farmacéutica para el tratamiento de la arterosclerosis en un animal
que comprende una cantidad terapéuticamente efectiva de un agente,
siendo capaz el agente de alterar un aspecto del metabolismo o la
estructura de la LBP en el animal de modo que de lugar al
tratamiento de la arterosclerosis, y a un soporte farmacéuticamente
aceptable.
Otro aspecto de la invención es una composición
de tipo vacuna para el tratamiento de la arterosclerosis en un
animal que comprende una cantidad terapéuticamente efectiva de un
agente, siendo capaz, el agente, de alterar un aspecto del
metabolismo o la estructura de la LBP en el animal de modo que
produzca el tratamiento de la arterosclerosis y a un soporte
farmacéuticamente aceptable.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para el diagnóstico de las lesiones
arteroescleróticas en un animal. Se proporciona un animal. Se
proporciona un agente marcado capaz de unirse a la LBP, por ej.,
LBP-1, LBP-2 o
LBP-3, presentes en las lesiones arteroscleróticas.
El agente marcado es administrado al animal bajo condiciones que
permitan que el agente marcado interaccione con la LBP de modo que
se produzca LBP marcada. La localización o la cuantificación de la
LBP marcada es determinada por toma de imágenes para diagnosticar
la presencia de lesiones arteroscleróticas en el animal.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para inmunizar un animal contra una LBP, por ej.,
LBP-1, LBP-2 o LBP-3
o un fragmento o análogo de la misma. Se proporciona un animal que
tenga la LDL. Se administra la LBP al fragmento o el análogo del
mismo de modo que estimule la producción de anticuerpo por el animal
a la LBP al fragmento o análogo de la misma de modo que se altere la
unión de la LBP a la LDL, por ej., disminuyendo o aumentando.
Otro aspecto de la invención es un método de
preparar un fragmento o análogo del polipéptido de la LBP, teniendo
el fragmento o análogo la capacidad de unirse a la LDL originaria y
a la LDL modificada, por ej., la LDL metilada, la LDL oxidada, la
LDL acetilada, o la LDL tratada con ciclohexandiona. Se proporciona
un polipéptido de LBP. La secuencia del polipéptido de la LBP está
alterada. Se analiza la capacidad del polipéptido de la LBP según la
capacidad para unirse a la LDL modificada y a la LDL originaria.
Todavía otro aspecto de la invención es un
método para el aislamiento de un cDNA que codifica una LBP. Se
proporciona una biblioteca de cDNA. Se selecciona la biblioteca de
cDNA para el cDNA que codifica un polipéptido que se une a la LDL
originaria y a la LDL modificada, por ej., la LDL metilada o la LDL
oxidada. Se aísla el cDNA que codifica el polipéptido, el cDNA que
codifica una LBP.
Las anteriores y otras características, objetos
y ventajas de la presente invención serán mejor comprendidas
mediante la lectura de la siguiente especificación conjuntamente con
los dibujos.
La Fig. 1 representa la secuencia de aminoácidos
de la LBP-1 del conejo (SEC ID NO: 1). Las
diferencias de aminoácidos entre la LBP-1 de conejo
y humana se representan en letra negrilla.
La Fig. 2 representa la secuencia de aminoácidos
de la LBP-2 del conejo (SEC ID NO: 2). Las
diferencias de aminoácidos entre la LBP-2 de conejo
y humana se representan en letra negrilla.
La Fig. 3 representa la secuencia de aminoácidos
de los aminoácidos 86 a 317 de la LBP-2 del conejo
(SEC ID NO: 3).
La Fig. 4 representa la secuencia de aminoácidos
de los aminoácidos 66 a 317 de la LBP-2 del conejo
(SEC ID NO: 4).
La Fig. 5 representa la secuencia de aminoácidos
de la LBP-3 del conejo (SEC ID NO: 5). Las
diferencias de aminoácidos entre la LBP-3 de conejo
y humana se representan en letra negrilla.
La Fig. 6 representa la secuencia de aminoácidos
de la LBP-1 humana (SEC ID NO: 6). Las diferencias
de aminoácidos entre la LBP-1 de conejo y humana se
representan en letra negrilla.
La Fig. 7 representa la secuencia de aminoácidos
de la LBP-2 humana (SEC ID NO: 7). Las diferencias
de aminoácidos entre la LBP-2 de conejo y humana se
representan en letra negrilla.
La Fig. 8 representa la secuencia de aminoácidos
de la LBP-3 humana (SEC ID NO: 8). Las diferencias
de aminoácidos entre la LBP-3 de conejo y humana se
representan en letra negrilla.
La Fig. 9 representa la secuencia de aminoácidos
de los aminoácidos 14 a 33 de la LBP-1 humana o de
conejo, llamada BHF-1 (SEC ID NO: 9).
La Fig. 10 representa la secuencia de cDNA que
codifica la LBP-1 del conejo (SEC ID NO: 10) y la
correspondiente secuencia de aminoácidos. Las diferencias de
aminoácidos entre la LBP-1 de conejo y humana se
representan en letra negrilla.
La Fig. 11 representa la secuencia de cDNA que
codifica la LBP-2 del conejo (SEC ID NO: 11) y la
correspondiente secuencia de aminoácidos. Las diferencias de
aminoácidos entre la LBP-2 de conejo y humana se
representan en letra negrilla.
La Fig. 12 representa la secuencia 256 a 1617 de
cDNA de la LBP-2 del conejo (SEC ID NO: 12) y la
correspondiente secuencia de aminoácidos.
La Fig. 13 representa la secuencia 196 a 1617 de
cDNA de la LBP-2 del conejo (SEC ID NO: 13) y la
correspondiente secuencia de aminoácidos.
La Fig. 14 representa la secuencia de cDNA que
codifica la LBP-3 del conejo (SEC ID NO: 14) y la
correspondiente secuencia de aminoácidos. Las diferencias de
aminoácidos entre la LBP-3 de conejo y humana se
representan en letra negrilla.
\newpage
La Fig. 15 representa la secuencia de cDNA que
codifica la LBP-1 humano (SEC ID NO: 15) y la
correspondiente secuencia de aminoácidos. Las diferencias de
aminoácidos entre la LBP-1 de conejo y humana se
representan en letra negrilla.
La Fig. 16 representa la secuencia de cDNA que
codifica la LBP-2 humana (SEC ID NO: 16) y la
correspondiente secuencia de aminoácidos. Las diferencias de
aminoácidos entre la LBP-2 de conejo y humana se
representan en letra negrilla.
La Fig. 17 representa la secuencia de cDNA que
codifica la LBP-3 humana (SEC ID NO: 17) y la
correspondiente secuencia de aminoácidos. Las diferencias de
aminoácidos entre la LBP-3 de conejo y humana se
representan en letra negrilla.
La Fig. 18 representa la secuencia de cDNA que
codifica la BHF-1 (SEC ID NO: 18).
La Fig. 19 corresponde a la secuencia de
aminoácidos de la LBP-1 del conejo (secuencia
superior) en alineación con la secuencia de aminoácidos de la
LBP-1 humana (secuencia inferior).
La Fig. 20 corresponde a la secuencia de
aminoácidos de la LBP-2 del conejo (secuencia
superior) en alineación con la secuencia de aminoácidos de la
LBP-2 humana (secuencia inferior).
La Fig. 21 corresponde a la secuencia de
aminoácidos de la LBP-3 del conejo (secuencia
superior) en alineación con la secuencia de aminoácidos de la
LBP-3 humana (secuencia inferior).
De acuerdo con aspectos de la presente
invención, se proporcionan nuevos polipéptidos humanos y de conejo
completos, LBP-1, LBP-2 y
LBP-3, y análogos y fragmentos biológicamente
activos de los mismos, y se proporcionan polinucleótidos aislados
que codifican dichos polipéptidos. LBP es una abreviatura para una
proteína de unión a la lipoproteína de baja densidad (LDL). Los
términos polinucleótido, nucleótido y oligonucleótido se utilizan en
la presente invención de forma intercambiable, y los términos
polipéptidos, proteínas y péptidos se utilizan en la presente
invención de forma intercambiable.
Esta invención proporciona un polinucleótido
aislado que comprende un polinucleótido que codifica el polipéptido
que tiene la secuencia de aminoácidos de la LBP-1 de
conejo tal como se ha establecido en la Fig. 1 (SEC ID NO: 1); la
LBP-2 de conejo tal como se ha establecido en la
Fig. 2 (SEC ID NO: 2); 86 a 317 de la LBP-2 de
conejo tal como se ha establecido en la Fig. 3 (SEC ID NO: 3); 66 a
317 de la LBP-2 de conejo tal como se ha
establecido en la Fig. 4 (SEC ID NO: 4); la LBP-3 de
conejo tal como se ha establecido en la Fig. 5 (SEC ID NO: 5); la
LBP-1 humana tal como se ha establecido en la Fig. 6
(SEC ID NO: 6); la LBP-2 humana tal como se ha
establecido en la Fig. 7 (SEC ID NO: 7); la LBP-3
humana tal como se ha establecido en la Fig. 8 (SEC ID NO: 8); 14 a
33 de la LBP-1 humana o de conejo, llamada
BHF-1, tal como se ha establecido en la Fig. 9 (SEC
ID NO: 9); un polinucleótido capaz de hibridar a y que es al menos
idéntico en aproximadamente un 80%, más preferiblemente al menos
idéntico en aproximadamente un 90%, todavía más preferiblemente
idéntico en aproximadamente un 95%, y más preferiblemente idéntico
en aproximadamente un 98% a cualquiera de los anteriores
polinucleótidos, y en el que el polipéptido codificado es capaz de
unirse a la LDL; o un fragmento biológicamente activo de cualquiera
de los anteriores polinucleótidos en donde el polipéptido codificado
es capaz de unirse a la LDL.
Esta invención también incluye un polinucleótido
aislado que comprende un polinucleótido que codifica el polipéptido
que tienen de 8-22 residuos de aminoácidos (SEC ID
NO: 19), 8-33 (SEC ID NO: 20), 23-33
(SEC ID NO: 21) o 208-217 (SEC ID NO: 22) de la
LBP-2 humana tal como se ha establecido en la Fig. 7
(SEC ID NO: 7); residuos de aminoácidos 14-43 (SEC
ID NO: 23) o 38-43 (SEC ID NO: 24) de la
LBP-1 de conejo o humana tal como se ha establecido
en la Fig. 1 (SEC ID NO: 1) y en la Fig. 6 (SEC ID NO: 6); residuos
de aminoácidos 105-120 (SEC ID NO: 25),
105-132 (SEC ID NO: 26), 121-132
(SEC ID NO: 27) o 211-220 (SEC ID NO: 28) de la
LBP-2 de conejo tal como se ha establecido en la
Fig. 2 (SEC ID NO: 2); residuos de aminoácidos
96-110 (SEC ID NO: 29) de la LBP-3
de conejo tal como se ha establecido en la Fig. 5 (SEC ID NO: 5);
residuos de aminoácidos 53-59 (SEC ID NO: 41) de la
LBP-3 humana tal como se ha establecido en la Fig. 8
(SEC ID NO: 8); un polinucleótido capaz de hibridar a y que es al
menos idéntico en aproximadamente un 80%, más preferiblemente al
menos idéntico en aproximadamente un 90%, todavía más
preferiblemente idéntico en aproximadamente un 95%, y más
preferiblemente idéntico en aproximadamente un 98% a cualquiera de
los anteriores polinucleótidos, y en el que el polipéptido
codificado es capaz de unirse a la LDL; o un fragmento
biológicamente activo de cualquiera de los anteriores
polinucleótidos en donde el polipéptido codificado es capaz de
unirse a la LDL.
Por un polinucleótido que codifica un
polipéptido se entiende un polinucleótido que incluye solo la
secuencia de codificación para el polipéptido, así como un
polinucleótido que incluye secuencias de codificación y de
no-codificación adicionales. De este modo, por ej.,
los polinucleótidos que codifican para los polipéptidos completos
de las Figs. 1-9 (SEC ID NOS: 1-9)
pueden incluir sólo la secuencia de codificación para el polipéptido
completo; la secuencia de codificación para el polipéptido completo
y la secuencia de codificación adicional tal como un líder o una
secuencia secretora o una secuencia de proteína; la secuencia de
codificación para el polipéptido completo (y opcionalmente la
secuencia de codificación adicional) y la secuencia de
no-codificación, tales como intrones o secuencias
de no-codificación 5' y/o 3' de la secuencia de
codificación para el polipéptido completo. El polipéptido de la
invención también pretende incluir polinucleótidos en los que la
secuencia de codificación para el polipéptido completo está
fusionada en el mismo bloque de lectura a una secuencia de
polinucleótido que ayuda en expresión y/o secreción de un
polipéptido a partir de una célula huésped, por ej., una secuencia
líder. Los polinucleótidos también pretenden incluir polinucleótidos
en los que la secuencia de codificación está fusionada en bloque a
una secuencia de marcador que permite, por ej., la purificación del
polipéptido.
Los polinucleótidos de la presente invención
pueden estar en forma de RNA, DNA o PNA, por ej., cRNA, cDNA, DNA
genómico, o DNA, RNA o PNA sintéticos. El DNA puede ser de doble
hebra o de hebra única, y si es de hebra única puede ser hebra de
codificación o hebra de no-codificación
(antisentido).
En las realizaciones preferidas, el
polinucleótido comprende el ácido nucleico de la
LBP-1 de conejo tal como se ha establecido en la
Fig. 10 (SEC ID NO: 10); LBP-2 de conejo tal como se
ha establecido en la Fig. 11 (SEC ID NO: 11); nucleótido 256 a 1617
de la LBP-2 de conejo tal como se ha establecido en
la Fig. 12 (SEC ID NO: 12); nucleótidos 196 a 1617 de la
LBP-2 de conejo tal como se ha establecido en la
Fig. 13 (SEC ID NO: 13); la LBP-3 de conejo tal
como se ha establecido en la Fig. 14 (SEC ID NO: 14); la
LBP-1 humana tal como se ha establecido en la Fig.
15 (SEC ID NO: 15); la LBP-2 humana tal como se ha
establecido en la Fig. 16 (SEC ID NO: 16); la LBP-3
humana tal como se ha establecido en la Fig. 17 (SEC ID NO: 17); o
los nucleótidos 97 a 156 de la LBP-1 de conejo o
los nucleótidos 157 a 216 de la LBP-1 humana,
(BHF-1), tal como se ha establecido en la Fig. 18
(SEC ID
NO: 18).
NO: 18).
En otras realizaciones preferidas, el
polinucleótido comprende el ácido nucleico tal como se ha
establecido en la SEC ID NO: 30, SEC ID NO: 31, SEC ID NO: 32, SEC
ID NO: 33, SEC ID NO: 34, SEC ID NO: 35, SEC ID NO: 36, SEC ID NO:
37, SEC ID NO: 38, SEC ID NO: 39, SEC ID NO: 40 o SEC ID NO: 42.
La secuencia de codificación que codifica el
polipéptido completo puede ser idéntica a las secuencias de
codificación que se muestran en las Figs. 10-18
(SEC ID NO: 10-18) o SEC ID NO:
30-40 o 42, o puede ser una secuencia de
codificación diferente de la secuencia de codificación, como
resultado de la redundancia o la degeneración del código genético,
que codifica los mismos polipétidos completos que el DNA de las
Figs. 10-18 (SEC ID NO: 10-18) y la
SEC ID NO: 30-40 y 42.
Esta invención también incluye vectores
recombinantes que comprenden los polinucleótidos descritos
anteriormente. El vector puede ser, por ej., un plásmido, una
partícula viral o un fago. En ciertas realizaciones, el vector
recombinante es un vector de expresión. Los vectores también pueden
incluir varios genes marcadores que son útiles in identificar las
células que contienen dichos vectores.
Esta invención también incluye una célula que
comprende dicho vector recombinante. Los vectores recombinantes
descritos en la presente invención pueden ser introducidos en una
célula huésped, por ej., por transformación, transfección o
infección.
Esta invención también incluye un método para la
producción de una LBP que comprende el cultivo de dicha célula bajo
condiciones que permitan la expresión de la LBP.
Esta invención también incluye un polipéptido
aislado que comprende un polipéptido que tiene la secuencia de
aminoácidos tal como se ha establecido en la Fig. 1 (SEC ID NO: 1);
Fig. 2 (SEC ID NO: 2); Fig. 3 (SEC ID NO: 3); Fig. 4 (SEC ID NO:
4); Fig. 5 (SEC ID NO: 5); Fig. 6 (SEC ID NO: 6); Fig. 7 (SEC ID
NO: 7); Fig. 8 (SEC ID NO: 8) o Fig. 9 (SEC ID NO: 9); o un
polipéptido que sea al menos idéntico en aproximadamente un 80%,
más preferiblemente al menos idéntico en aproximadamente un 90%,
todavía más preferiblemente idéntico en aproximadamente un 95%, y
más preferiblemente idéntico en aproximadamente un 98% a cualquiera
de los anteriores polipéptidos, y en donde dicho polipéptido sea
capaz de unirse a la LDL; o un fragmento biológicamente activo de
cualquiera de los anteriores polipéptidos en donde el fragmento sea
capaz de unirse a la LDL. Las diferencias en los aminoácidos entre
los genes de la LBP-1, LBP-2 y
LBP-3 de conejo y humana están representados en las
figuras en negrilla. Las diferencias en las secuencias de
aminoácidos entre la LBP-1, la LBP-2
y la LBP-3 de conejo y humana también se muestran
de forma específica en las Figs. 19, 20 y 21, respectivamente.
Esta invención también incluye un polipéptido
aislado que comprende un polipéptido que tiene los residuos de
aminoácidos 8-22 (SEC ID NO: 19);
8-33 (SEC ID NO: 20), 23-33 (SEC ID
NO: 21) o 208-217 (SEC ID NO: 22) tal como se ha
establecido en la Fig. 7 (SEC ID NO: 7); residuos de aminoácidos
14-43 (SEC ID NO: 23) o 38-43 (SEC
ID NO: 24) tal como se ha establecido en la Fig. 1 (SEC ID NO: 1) y
en la Fig. 6 (SEC ID NO: 6); residuos de aminoácidos
105-120 (SEC ID NO: 25), 105-132
(SEC ID NO: 26), 121-132 (SEC ID NO: 27) o
211-220 (SEC ID NO: 28) tal como se ha establecido
en la Fig. 2 (SEC ID NO: 2); residuos de aminoácidos
96-110 (SEC ID NO: 29) tal como se ha establecido
en la Fig. 5 (SEC ID NO: 5); y residuos de aminoácidos
53-59 (SEC ID NO: 41) tal como se ha establecido en
la Fig. 8 (SEC ID NO: 8); o un polipéptido que sea al menos idéntico
en aproximadamente un 80%, más preferiblemente al menos idéntico en
aproximadamente un 90%, todavía más preferiblemente idéntico en
aproximadamente un 95%, y más preferiblemente idéntico en
aproximadamente un 98% a cualquiera de los anteriores polipéptidos,
y en donde dicho polipéptido sea capaz de unirse a la LDL; o un
fragmento biológicamente activo de cualquiera de los anteriores
polipéptidos en donde el fragmento sea capaz de unirse a la LDL.
Los polipéptidos de la invención pretenden
incluir, por ej., un producto purificado de forma natural, un
producto sintetizado químicamente, y un producto derivado de
tecnología recombinante.
Los polipéptidos pueden ser utilizados, por ej.,
para unirse a la LDL, con lo que inhiben la formación de placas
arteroscleróticas. Los polipéptidos también pueden ser utilizados,
por ej., en terapia génica, por expresión de dichos polipéptidos in
vivo. Los polipéptidos también pueden ser utilizados en
composiciones de fármacos o de vacunas. Los polipéptidos también
pueden ser utilizados como inmunogenes para producir anticuerpos de
los mismos, que a su vez, pueden ser utilizados como antagonistas de
los polipéptidos de la LBP.
Sin estar ligado a ninguna teoría, se cree que
las LBPs proporcionan el mecanismo por el que se favorece la
arterosclerosis a través de la oxidación de la LDL. Se cree que las
LBP's son requeridas para que la unión de la LDL irreversible,
focal, se produzca en la pared arterial, y que dicha unión sea un
suceso temprano crítico en la arterosclerosis ya que permite el
tiempo necesario para que la LDL cambie de su estado innato a un
estado completamente oxidado. Cuando la LDL está oxidada, pero no en
su estado innato, es una proteína extraña, los macrófagos la
ingieren, haciendo primero las células espuma de las lesiones de
tipo I, y formado subsecuentemente las líneas de grasa de las
lesiones de tipo II.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para la determinación de si un animal tiene
riesgo de arterosclerosis. Se proporciona un animal. Se evalúa en el
animal un aspecto del metabolismo o de la estructura de la LBP. Una
anormalidad en el aspecto del metabolismo o de la estructura de la
LBP es diagnosticada como riesgo de arterosclerosis. Por
arterosclerosis se quiere significar una enfermedad o estado que
comprende varios estadios que se mezclan de forma imperceptible
entre sí, incluyendo la unión irreversible de la LDL, la oxidación
de la LDL, el reclutamiento de macrófagos, el bloqueo de la muerte
de la arteria y del tejido (infarto).
Por animal se quiere significar tanto seres
humanos como animales no-humanos. Animales no
humanos incluyen, por ej., mamíferos, pájaros, reptiles, anfibios,
peces, insectos y protozoos. Preferiblemente, el animal
no-humano es un mamífero, por ej., un conejo, un
roedor, por ej., un ratón, rata o cobaya, un primate, por ej., un
mono, o un cerdo. Un animal también incluye animales transgénicos
no-humanos. El término animal transgénico pretende
incluir un animal que haya ganado nueva información genética a
partir de la introducción del DNA extraño, es decir, DNA
parcialmente o enteramente heterólogo, en el DNA de sus células; o
introducción de una lesión, por ej., una mutación inducida in
vitro, por ej., una supresión u otro reordenamiento cromosómico
en el DNA de sus células; o introducción del DNA homólogo en el DNA
de sus células de modo que altere el genoma de la célula en el que
el DNA está insertado, por ej., está insertado en una posición que
difiere de la del gen natural o su inserción resulta en una
eliminación o sustitución del gen huésped homólogo o da lugar a una
expresión y/o metabolismo del gen alterado y/o regulable. El animal
puede incluir un transgen en todas sus células incluyendo células
de la línea germen, o en sólo una de algunas de sus células. Los
animales transgénicos pueden servir como un modelo para estudiar la
arterosclerosis o para evaluar los agentes para tratar la
arterosclerosis.
La determinación de estar en riesgo de
arterosclerosis puede hacerse en un animal prenatal.
Por LBP se quiere significar una proteína de
unión a una lipoproteína de baja densidad (LDL) que sea capaz de
unirse a la LDL y mutilar a la LDL. Por LDL metilada se quiere
significar que entre aproximadamente un 50% y aproximadamente un
90% de los residuos de lisina de la LDL tienen un grupo metilo unido
químicamente. La LDL metilada no está reconocida por los receptores
de superficie de células previamente descritos. Ver, por
ej., Weisgraber y col., J. Biol. Chem. 253:
9053-9062 (1978). En ciertas realizaciones, la LBP
también es capaz de unirse a la LDL oxidada. En ciertas
realizaciones preferidas, la unión de la LDL a una LBP es
irreversible. En ciertas realizaciones preferidas, la LBP no
transporta la LDL a ningún compartimiento intracelular. Ejemplos de
LBPs son la LBP-1, la LBP-2 y la
LBP-3 descritas en la presente invención.
Por metabolismo de la LBP se quiere significar
cualquier aspecto de la producción, liberación, expresión, función,
acción, interacción o regulación de la LBP. El metabolismo de la LBP
incluye modificaciones, por ej., modificaciones covalentes o
no-covalentes, del polipéptido de la LBP. El
metabolismo de la LBP incluye modificaciones, por ej.,
modificaciones covalentes o no-covalentes, que la
LBP induce en otras sustancias. El metabolismo de la LBP también
incluye cambios en la distribución del polipéptido de la LBP, y
cambios que la LBP induce en la distribución de otras
sustancias.
Puede evaluarse cualquier aspecto del
metabolismo de la LBP. Los métodos utilizados son técnicas estándar
conocidas por los expertos en la materia y pueden ser encontrados en
referencias estándar, por ej., Ausubel y col., ed., Current
Protocols in Mol. Biology, New Cork: John Wiley & Sons, 1990; M.
Kriegler, ed., Gene Transfer and Expression, Stockton Press, New
York, NY, 1989; sistema de expresión del gen pDisplay (Invitrogen,
Carlsbad, CA). Ejemplos preferidos del metabolismo de la LBP que
pueden ser evaluados incluyen la actividad de unión del polipéptido
de la LBP a una molécula de unión, por ej., la LDL; la actividad de
transactivación del polipéptido de la LBP en un gen objetivo; el
nivel de la proteína de la LBP; el nivel de la LBP mRNA; el nivel
de modificaciones de la LBP, por ej., fosforilación, glicosilación o
acilación; o el efecto de la expresión de la LBP en la unión de
células de mamíferos transfectadas de la LDL.
Por molécula de unión se quiere significar
cualquier molécula a la que pueda unirse la LBP, por ej., un ácido
nucleico, por ej., una región reguladora del DNA, una proteína, por
ej., la LDL, un metabolito, un péptido mimético, un péptido
no-mimético, un anticuerpo, o cualquier otro tipo de
ligando. En ciertas realizaciones preferidas, el aspecto del
metabolismo de la LBP que se evalúa es la capacidad de la LBP a
unirse a la LDL originaria y/o a la LDL metilada, y/o a la LDL
oxidada. La unión a la LDL, puede ser mostrada, por ej., por
ensayos de anticuerpos frente a la LDL, cromatografía de afinidad,
coelectroforesis de afinidad (ACE), o ensayos ELISA. Ver
Ejemplos. En otras realizaciones, lo que se evalúa es la capacidad
de la LBP a unirse a un componente estructural de la matriz
extracelular arterial. Ejemplos de dichos componentes incluyen
proteoglicanos, por ej., proteoglicanos de sulfato de condroitin y
proteoglicanos de sulfato de heparina; elastina; colágeno;
fibronectina; vitronectina; integrinas; y moléculas de la matriz
extracelular. La unión a componentes estructurales de la matriz
extracelular arterial puede mostrarse por métodos estándar conocidos
por los expertos en el estado de la técnica, por ej., ensayos
ELISA. A continuación se añaden los anticuerpos primarios a la LBP,
seguido por un anticuerpo secundario conjugado por enzima al
anticuerpo primario, que produce un color estable en presencia de
un sustrato apropiado, y se mide el color desarrollado en las placas
en un lector de placas microvalorador.
Puede determinarse la transactivación de un gen
objetivo por la LBP, por ej., en un ensayo de transfección
transitorio en el que el promotor del gen objetivo está unido a un
gen reportero, por ej., la
\beta-galacto-sidasa o
luciferasa, y co-transfectado con un vector de
expresión de la LBP. Dichas evaluaciones pueden ser realizadas
in vitro. Pueden medirse los niveles de proteína de la LBP,
mRNA o de fosforilación, por ej., en una muestra, por ej., una
muestra de tejido, por ej., una pared arterial, por métodos estándar
conocidos por los expertos en la materia.
En ciertas realizaciones, se evalúa un aspecto
de la estructura de la LBP, por ej., la estructura del gen de la
LBP o la estructura de la proteína de la LBP. Por ejemplo, pueden
evaluarse las estructuras primaria, secundaria o terciaria. Por
ejemplo, se determina la secuencia de DNA del gen y/o se determina
la secuencia del aminoácido de la proteína. Pueden utilizarse los
métodos de clonación y de secuenciación estándar ya que son
conocidos por los expertos en la materia. En ciertas realizaciones,
se determina la actividad de unión de un ácido nucleico antisentido
con el mRNA de la LBP celular y/o el DNA genómico utilizando métodos
estándar conocidos por los expertos en la materia para detectar la
presencia o ausencia de las secuencias de mRNA o de DNA objetivo al
que el ácido nucleico antisentido se uniría normalmente de forma
específica.
El riesgo de arterosclerosis que es determinado
puede ser un riesgo reducido o un riesgo incrementado en comparación
con un animal normal. Por ejemplo, una anormalidad que daría un
riesgo reducido sería un polipéptido de la LBP inactivo. Una
anormalidad que daría un riesgo incrementado sería, por ej., un
polipéptido de la LBP que tenga una mayor actividad, por ej., la
actividad de unión a la LDL, que el polipéptido de la LBP
original.
La invención también incluye un método para la
evaluación de un agente para uso en el tratamiento de la
arterosclerosis. Se proporciona un sistema de ensayo de células o
un sistema libre de células. Se proporciona un agente. Se
administra el agente en el sistema de células de prueba o en el
sistema libre de células en una cantidad terapéuticamente efectiva.
Se evalúa el efecto del agente en un aspecto del metabolismo o de la
estructura de la LBP. Un cambio en el aspecto del metabolismo o la
estructura de la LBP es indicativo de la utilidad del agente en el
tratamiento de la arterosclerosis.
Por célula se pretende significar una célula o
grupo de células, o una célula que es parte de un animal. La célula
puede ser una célula humana o no humana. Célula también pretende
incluir una célula transgénica. La célula puede ser obtenida, por
ej., a partir de un cultivo o a partir de un animal. En el término
animales se pretenden incluir, por ej., animales naturales y
animales transgénicos no-humanos. En ciertas
realizaciones, la célula transgénica o el animal transgénico
no-humano tiene un transgen de la LBP, o un
fragmento o análogo del mismo. En ciertas realizaciones, la célula
transgénica o el animal transgénico no-humano tiene
una eliminación para el gen de la LBP.
El sistema del ensayo de células o libre de
células puede tener un modelo de metabolismo de la LBP de tipo
natural o un modelo de tipo no natural. Un modelo de metabolismo de
la LBP de tipo no natural puede dar lugar, por ejemplo a una menor
expresión, a una sobre expresión, a no expresión, o a un cambio
temporal, del sitio o de la distribución. Dicho modelo de tipo no
natural puede dar lugar, por ej., entre una y más mutaciones en el
gen, en un gen de la molécula de unión, un gen regulador, o en
cualquier otro gen que afecte de manera directa o indirecta al
metabolismo de la LBP. Por mutación se pretende incluir, por ej., la
estructura en bruto o en fino, en un ácido nucleico. Ejemplos de la
misma incluyen alteraciones de pares de bases únicas, por ej.,
mutaciones con sentido o sin-sentido, cambios del
marco de lectura, supresiones, inserciones y
trans-localizaciones. Las mutaciones pueden ser
dominantes o recesivas. Las mutaciones pueden ser homocigóticas o
heterozigóticas. Preferiblemente, se evalúa un aspecto del
metabolismo de la LBP-1, LBP-2 o
LBP-3.
Por agente se pretende incluir, por ej.,
cualquier sustancia, por ej., un fármaco
anti-arterosclerosis. El agente de esta invención
puede cambiar preferiblemente un aspecto del metabolismo de la LBP.
Dicho cambio puede ser el resultado de cualquier variedad de
eventos, incluyendo, por ej., la prevención o la reducción de la
interacción entre la LBP y una molécula de unión, por ej., la LDL o
un componente estructural de la matriz extracelular; inactivando la
LBP y/o la molécula de unión, por ej., por rotura u otra
modificación; alterando la afinidad de la LBP y la molécula de
unión para cada otra, diluyendo la LBP y/o la molécula de unión;
previniendo la expresión de la LBP y/o la molécula de unión;
reduciendo la síntesis de la LBP y/o la molécula de unión;
sintetizando una LBP anormal y/o una molécula de unión; sintetizando
una LBP empalmada de forma alternativa y/o una molécula de unión;
previniendo o reduciendo el plegamiento conformacional adecuado de
la LBP y/o la molécula de unión; modulando las propiedades de unión
de la LBP y/o la molécula de unión; interfiriendo con señales que
se requieren para activar o desactivar la LBP y/o la molécula de
unión; activar o desactivar la LBP y/o la molécula de unión de modo
que se prevenga la unión; o interfiriendo con otros receptores,
ligandos u otras moléculas que se requieren para la síntesis o el
funcionamiento normal de la LBP y/o la molécula de unión. Por
ejemplo, el agente puede bloquear el sitio de unión de la LDL para
LBPs expresadas focalmente en la matriz extracelular de la pared
arterial, o puede bloquear el sitio de unión de una LBP para la LDL,
o puede ser bifuncional, es decir, puede bloquear ambos sitios de
unión.
Ejemplos de agentes incluyen polipéptido de la
LBP, por ej., la LBP-1, LBP-2 o
LBP-3, o un fragmento o análogo biológicamente
activo del mismo; un ácido nucleico que codifica el polipéptido de
la LBP o un fragmento o análogo biológicamente activo del mismo; un
ácido nucleico que codifica una secuencia reguladora de la LBP o un
fragmento o análogo del mismo biológicamente activo; una molécula de
unión para el polipéptido de la LBP; una molécula de unión para el
ácido nucleico de la LBP, el ácido nucleico de la LBP siendo, por
ej., un ácido nucleico que comprende una región reguladora para la
LBP; un ácido nucleico que comprende una región estructural para la
LBP; un fragmento biológicamente activo de la LBP; un ácido nucleico
antisentido; un mimético de la LBP, una molécula de unión, un
anticuerpo para la LBP o una molécula de unión; un metabolito, o un
carbohidrato inhibitorio o una glicoproteína. En ciertas
realizaciones, el agente es un antagonista, un agonista o un super
agonista.
El conocimiento de la existencia de la secuencia
de las LBP's permite una búsqueda de ligandos naturales o
artificiales para regular los niveles de la LDL en el tratamiento de
la arterosclerosis. En ciertas realizaciones, el agente es un
ligando natural para la LBP. En ciertas realizaciones, el agente es
un ligando artificial para la LBP.
Por análogo se pretende significar un compuesto
que difiere de la LBP que se encuentra de forma natural en la
secuencia de amino ácidos o en modos que no implican secuencia, o
ambos. Análogos de la invención muestran de forma general al menos
aproximadamente un 80% de homología, preferiblemente al menos
aproximadamente un 90% de homología, más preferiblemente todavía al
menos aproximadamente un 95% de homología, y más preferiblemente al
menos aproximadamente un 98% de homología, con la secuencia
sustancialmente entera de una secuencia de la LBP que se encuentra
de forma natural, preferiblemente con un segmento de aproximadamente
100 residuos de aminoácidos, más preferiblemente con un segmento de
aproximadamente 50 residuos de aminoácidos, más preferiblemente
todavía con un segmento de aproximadamente 30 residuos de
aminoácidos, más preferiblemente todavía con un segmento de
aproximadamente 20 residuos de aminoácidos, más preferiblemente
todavía con un segmento de aproximadamente 10 residuos de
aminoácidos, más preferiblemente todavía con un segmento de
aproximadamente 5 residuos de aminoácidos, más preferiblemente
todavía con un segmento de aproximadamente 4 residuos de
aminoácidos, más preferiblemente todavía con un segmento de
aproximadamente 3 residuos de aminoácidos, y más preferiblemente con
un segmento de aproximadamente 2 residuos de aminoácidos. Las
modificaciones de no secuencia incluyen derivatizaciones químicas
in vitro de la LBP. Las modificaciones de no secuencia
incluyen, por ej., cambios en la fosforilación, acetilación,
metilación, carboxilación o glicosilación. Los métodos para hacer
dichas modificaciones son conocidos por los expertos en la materia.
Por ejemplo, la fosforilación puede modificarse por exposición de la
LBP a las enzimas que alteran la fosforilación, por ej., las
quinasas o las fosfatasas.
Los análogos preferidos incluyen la LBP o
fragmentos biológicamente activos de los mismos cuyas secuencias
difieren de la secuencia de tipo irregular en una o más
sustituciones de aminoácidos conservativos o por una o más
sustituciones de aminoácidos no conservativas, eliminaciones, o
inserciones que no suprimen la actividad biológica de la LBP. Las
sustituciones conservativas incluyen de forma típica la sustitución
de un aminoácido por otro con características similares, por ej.,
sustituciones en los grupos siguientes: valina, glicina; glicina,
alanina; valina, isoleucina, leucina; ácido aspártico, ácido
glutámico; asparagina, glutamina; serina, treonina; lisina,
arginina; y fenilalanina, tirosina. Otros ejemplos de sustituciones
conservativas se muestran en la Tabla 1.
Para el aminoácido | Código | Sustituido por cualquiera de |
Alanina | A | D-Ala, Gly, beta-Ala, L-Cys, D-Cys |
Arginina | R | D-Arg, Lys, D-Lys, homo-Arg, D-homo-Arg, Met, Ile, D-Met, D-Ile, Orn, D-Orn, |
L-NMMA, L-NAME | ||
Asparagina | N | D-Asn, Asp, D-Asp, Glu, D-Glu, Gln, D-Gln |
Ácido Aspártico | D | D-Asp, D-Asn, Asn, Glu, D-Glu, Gln, D-Gln |
Cisteína | C | D-Cys, S-Me-Cys, Met, D-Met, Thr, D-Thr |
Glutamina | Q | D-Gln, Asn, D-Asn, Glu, D-Glu, Asp, D-Asp |
Ácido Glutámico | E | D-Glu, D-Asp, Asp, Asn, D-Asn, Gln, D-Gln |
Para el aminoácido | Código | Sustituido por cualquiera de |
Glicina | G | Ala, D-Ala, Pro, D-Pro, \beta-Ala, Acp |
Histidina | H | D-His |
Isoleucina | I | D-Ile, Val, D-Val, Leu, D-Leu, Met, D-Met |
Leucina | L | D-Leu, Val, D-Val, Leu, D-Leu, Met, D-Met |
Lisina | K | D-Lys, Arg, D-Arg, homo-Arg, D-homo-Arg, Met, D-Met, Ile, D-Ile, Orn, D-Orn |
Metionina | M | D-Met, S-Me-Cys, Ile, D-Ile, Leu, D-Leu, Val, D-Val |
Fenilalanina | F | D-Phe, Tyr, D-Thr, L-Dopa, His, D-His, Trp, D-Trp, Trans-3,4, o 5-fenilprolina, |
cis-3,4, o 5-fenilprolina | ||
Prolina | P | D-Pro, ácido L-I-tiazolidin-4-carboxílico, ácido D- o L-I-oxazolidin-4-carboxílico |
Serina | S | D-Ser, Thr, D-Thr, allo-Thr, Met, D-Met, Met(O), D-Met(O), L-Cys, D-Cys |
Treonina | T | D-Thr, Ser, D-Ser, allo-Thr, Met, D-Met, Met(O), D-Met(O), Val, D-Val |
Triptófano | W | D-Trp, Phe, D-Phe, Tyr, D-Tyr |
Tirosina | Y | D-Tyr, Phe, D-Phe, L-Dopa, His, D-His |
Valina | V | D-Val, Leu, Ile, D-Ile, Met, D-Met |
\vskip1.000000\baselineskip
Pueden prepararse variantes de la secuencia de
aminoácidos de una proteína por cualquiera de una variedad de
métodos conocidos por los expertos en la materia. Por ejemplo, puede
utilizarse la mutagénesis al azar de DNA que codifica una proteína o
un dominio o una región particular de una proteína, por ej., la
mutagénesis de la PCR (utilizando, por ej., la fidelidad de la
polimerasa Taq para introducir mutaciones al azar en un
fragmento clonado de DNA; Leung y col., BioTechnique 1:
11-15 (1989)), o mutagénesis de saturación (por, por
eje., tratamiento químico o irradiación del DNA de hebra única in
vitro, y síntesis de una hebra de DNA complementaria; Mayers y
col., Science 229: 242 (1985)). La mutagénesis al azar también puede
conseguirse por, por ej., generación de oligonucleótidos degenerada
(utilizando, por ej., un sintetizador automático de DNA para
sintetizar químicamente secuencias degeneradas; Narang, Tetrahedron
39: 3 (1983); Itakura y col., Recombinant DNA, Proc. 3rd Cleveland
Sympos. Macromolecules, ed. A. G. Walton, Ámsterdam: Elsevier, págs.
273-289 (1981)). La mutagénesis dirigida o no al
azar puede utilizarse para proporcionar secuencias o mutaciones
específicas en regiones específicas. Estas técnicas pueden ser
utilizadas para crear variantes que incluyen, por ej.,
eliminaciones, inserciones, o sustituciones, de residuos de la
secuencia de aminoácidos conocida de una proteína. Los sitios para
la mutación pueden ser modificados de forma individual o en series,
por ej., por (i) sustituyendo primero los aminoácidos conservados y
a continuación selecciones más radicales dependiendo de los
resultados conseguidos, (ii) eliminación del residuo objetivo,
(iii) inserción de residuos de la misma clase o de una clase
diferente adyacente al sitio localizado, o (iv) combinaciones de
los anteriores. Por ejemplo, pueden prepararse análogos por
modificaciones de la secuencia de DNA in vitro de las
secuencias de las Figs. 10-18 (SEC ID NOS:
10-18). Por ejemplo, puede utilizarse la
mutagénesis in vitro para convertir cualquiera de estas
secuencias de DNA en una secuencia que codifique un análogo en el
que uno o más residuos de aminoácidos hayan sufrido una sustitución,
por ej., una sustitución conservativa tal como se ha descrito en la
Tabla 1.
Los métodos para identificar las mutaciones
deseables incluyen, por ej., la mutagénesis de selección de alanina
(Cunningham y Wells, Science 244: 1081-1085 (1989)),
la mutagénesis mediada por oligonucleótidos (Adelman y col., DNA 2:
183 (1983)); la mutagénesis de casete (Wells y col., Gene 34: 315
(1985)), la mutagénesis combinatoria, y las bibliotecas de
exposición de fagos (Ladner y col., Solicitud de patente
internacional PCT No. WO 88/06630). Los análogos de la LBP pueden
ser ensayados, por ej., para su capacidad para unirse a la LDL y/o a
un componente de la matriz extracelular, tal como se ha descrito en
la presente invención.
Otros análogos dentro de la invención incluyen,
por ej., aquellos con modificaciones que incrementan la estabilidad
del péptido. Dichos análogos pueden contener, por ej., uno o más
uniones de no-péptidos (que sustituyen los enlaces
de péptidos) en la secuencia de péptidos. También se encuentran
incluidos, por ej., análogos que incluyen residuos diferentes de los
L-aminoácidos que se encuentran de forma natural,
por ej., D-aminoácidos o aminoácidos sintéticos que
no se encuentran de forma natural, por ej., \beta o \gamma
aminoácidos; y análogos cíclicos.
Análogos también pretende incluir péptidos en
los que las modificaciones estructurales han sido introducidas en el
esqueleto del péptido para hacer que el péptido sea no hidrolizable.
Dichos péptidos son particularmente útiles para la administración
oral, ya que no son digeridos. Las modificaciones del esqueleto del
péptido incluyen, por ej., modificaciones del nitrógeno de la amida,
el carbono \alpha, el carbonilo amida, o el enlace amida, y
modificaciones que implican extensiones, eliminaciones o
reticulaciones del esqueleto. Por ejemplo, el esqueleto puede ser
modificado por sustitución de un sulfóxido por el carbonilo, por
inversión del enlace peptídico, o por sustitución de un metileno por
el grupo carbonilo. Dichas modificaciones pueden ser realizadas por
procedimientos estándar conocidos por los expertos en la materia.
Ver, por ej., A. F. Spatola, "Peptide Backbone
Modifications: A Structure-Activity Analysis of
Peptides Containing Amide Bond Surrogates, Conformational
Constrains, and Related Backbone Replacements", en Chemistry and
Biochemistry of Amino Acids, Peptides and Proteins, Vol. 7, págs.
267-357, B. Weinstein (ed), Marcel Dekker, Inc., New
York (1983).
Un análogo también pretende incluir polipéptidos
en los que uno o más de los residuos de aminoácidos incluyen un
grupo sustituyente, o polipéptidos que están fusionados con otro
compuesto, por ej., un compuesto para incrementar la vida media del
polipéptido, por ej., polietilen glicol.
Por fragmento se pretende significar alguna
porción de un polipéptido de la LBP que se produzca de forma
natural. Preferiblemente, el fragmento es de al menos 100 residuos
de aminoácidos, más preferiblemente de al menos aproximadamente 50
residuos de aminoácidos, más preferiblemente todavía de al menos
aproximadamente 30 residuos de aminoácidos, más preferiblemente
todavía de al menos aproximadamente 20 residuos de aminoácidos, más
preferiblemente todavía de al menos aproximadamente 5 residuos de
aminoácidos, más preferiblemente todavía de al menos aproximadamente
4 residuos de aminoácidos, más preferiblemente todavía de al menos
aproximadamente 3 residuos de aminoácidos, y más preferiblemente de
al menos aproximadamente 2 residuos de aminoácidos de longitud. Los
fragmentos incluyen, por ej., formas secretadas truncadas,
fragmentos proteolíticos, fragmentos empalmados, otros fragmentos, y
construcciones quiméricas entre al menos una parte del gen
relevante, por ej., LBP-1, LBP-2 o
LBP-3, y otra molécula. Los fragmentos de la LBP
pueden ser generados por métodos conocidos por los expertos en la
materia. En ciertas realizaciones, el fragmento es biológicamente
activo. La capacidad de un fragmento candidato para exhibir una
actividad biológica de la LBP puede ser valorada por métodos
conocidos por los expertos en la materia. Por ejemplo, los
fragmentos de la LBP pueden ser ensayados para determinar su
capacidad para unirse a la LDL y/o a un componente estructural de la
matriz extracelular, tal como se describe en la presente invención.
También se incluyen fragmentos de la LBP que contienen residuos que
no son requeridos para la actividad biológica del fragmento o que
resultan de un empalme del mRNA alternativo o de sucesos de
procesamiento de la proteína alternativos.
Pueden producirse fragmentos de una proteína por
cualquiera de una variedad de métodos conocidos por los expertos en
la materia, por ej., de forma recombinante, por digestión
proteolítica, o por síntesis química. Los fragmentos internos o
terminales de un polipéptido pueden ser generados por eliminación de
uno o más nucleótidos de un extremo (para un fragmento terminal) o
de ambos extremos (para un fragmento interno) de un ácido nucleico
que codifica el polipéptido. La expresión del DNA mutagenizado
produce fragmentos de polipéptido. La digestión con endonucleasas
"de extremo recortado" puede generar de este modo DNAs que
codifican una selección de fragmentos. También pueden ser generados
los DNAs que codifican los fragmentos de una proteína, por ej., por
corte al azar, digestión de restricción o una combinación de los
métodos anteriormente discutidos. Por ejemplo, los fragmentos de la
LBP pueden ser obtenidos por expresión de LBP DNA que ha sido
manipulado in vitro para codificar el fragmento deseado, por
ej., por digestión por restricción de cualquiera de las secuencias
de DNA de las Figs. 10-18 (SEC ID NOS:
10-18).
10-18).
Los fragmentos también pueden ser sintetizados
químicamente utilizando técnicas conocidas en el estado de la
técnica, por ej., la química convencional de Merrifield en fase
sólida del f-Moc o del t-Boc. Por
ejemplo, los péptidos de la presente invención pueden ser divididos
de forma arbitraria en fragmentos de longitud deseada sin ningún
solapamiento de fragmentos, o dividido en fragmentos de solapamiento
de longitud deseada.
Una LBP, o un fragmento o análogo biológicamente
activo del mismo, o una molécula de unión o un fragmento o análogo
biológicamente activo del mismo, pueden, por ej., competir con su
molécula cognado para el sitio de unión en la molécula
complementaria, y por consiguiente reducir o eliminar la unión entre
la LBP y la molécula de unión celular. Pueden obtenerse la LBP o la
molécula de unión, por ej., a partir de la purificación o la
secreción de la LBP o de la molécula de unión que se obtienen de
forma natural, a partir de la LBP o de la molécula de unión que se
obtienen de forma recombinante, o a partir de la LBP o de la
molécula de unión sintetizadas.
Por consiguiente, los métodos para generar
análogos y fragmentos y ensayos de los mismos para determinar su
actividad son conocidos por los expertos en la materia.
Un agente también puede ser un ácido nucleico
utilizado como una molécula antisentido. Terapia antisentido
pretende incluir, por ej., la administración o la generación in
situ de oligonucleótidos o sus derivados que se hibridan de
forma específica, por ej., unión, bajo condiciones celulares, con el
mRNA celular y/o el DNA genómico que codifica un polipéptido de la
LBP, o un mutante del mismo, de modo que se inhiba la expresión de
la proteína codificada, por ej., por inhibición de la transcripción
y/o traducción. La unión puede ser por complementariedad del par de
bases convencionales, o, por ejemplo, en el caso de la unión al
doble DNA, a través de interacciones específicas en el hueco
principal de la doble hélice.
En ciertas realizaciones, la construcción
antisentido se une a una secuencia que de origen natural de un gen
de la LBP que, por ej., está implicada en la expresión del gen.
Estas secuencias incluyen, por ej., promotor, codones de inicio,
codones de terminación, y sitios de unión de la polimerasa del
RNA.
En otras realizaciones, la construcción
antisentido une una secuencia de nucleótido que no está presente en
el gen de tipo irregular. Por ejemplo, la construcción antisentido
puede unirse a una región de un gen de la LBP que contiene una
inserción de una secuencia exógena, no irregular. De forma
alternativa, la construcción antisentido puede unirse a una región
de un gen de la LBP que ha sufrido una eliminación con lo que tiene
dos regiones del gen juntas, lo cual no es la posición normal de
estar juntas y que, estando juntas, crean una secuencia de tipo no
irregular. De forma alternativa, la construcción antisentido puede
unirse a una región de un gen de la LBP que ha sufrido una
eliminación, con lo que trae dos regiones del gen juntas las cuales
normalmente no se encuentran posicionadas juntas, creando una
secuencia de tipo no irregular.
Una construcción antisentido de la presente
invención puede ser liberada, por ej., como un plásmido de expresión
que, cuando se transcribe en la célula, produce RNA que es
complementario a al menos una única porción del mRNA celular que
codifica un polipéptido de la LBP. Una alternativa es que la
construcción antisentido sea un oligonucleótido que sea generado
ex vivo y que, cuando se introduce en la célula causa
inhibición de la expresión por hibridación con el mRNA (duplicado)
y/o las secuencias genómicas (triplicadas) de un gen de la LBP.
Dichos oligonucleótidos son preferiblemente oligonucleótidos
modificados que son resistentes a las nucleasas endógenas, por ej.,
las exonucleasas y/o endonucleasas, y son por consiguiente estables
in vivo. Ejemplos de moléculas del tipo ácido nucleico para
uso como oligonicleótidos antisentido son los análogos de DNA y de
ácidos nucleicos de péptidos (PNA) fosforamidato, fosfotioato,
fosforoditioatos y metilfosfonato. (Ver también Patentes US
5.176.996; 5.264.564; y 5.256.775).
De forma adicional, se ha hecho una revisión de
las aproximaciones generales para construir oligonucleótidos útiles
en la terapia antisentido (Ver, por ej., Van der Krol y col.,
Biotechniques 6: 958-976 (1988); Stein y col.,
Cancer Res. 48: 2659-2668 (1988).
Por mimético se pretende significar una molécula
que se parezca en forma y/o distribución de carga a la LBP o a una
molécula de unión. El mimético puede ser un péptido o un no péptido.
Los miméticos pueden actuar como agentes terapéuticos debido a que
pueden, por ej., inhibir de forma competitiva la unión de la LBP a
una molécula de unión. Por utilización, por ej., de la mutagénesis
de selección, por ej., la mutagénesis de selección de alanina, la
mutagénesis de selección de grupo de unión o la mutagénesis de
saturación, para trazar un mapa de los residuos de aminoácidos de
un polipéptido de la LBP particular implicada en la unión de una
molécula de unión, péptido miméticos, por ej., derivados de
diazepina o de isoquinolina, pueden ser generados de modo que
mimeticen aquellos residuos en la unión a una molécula de unión, y
que por consiguiente puedan inhibir la unión de la LBP a una
molécula de unión y por consiguiente interfieran con la función de
la LBP. Los análogos peptídicos de dichos residuos pueden ser
generados utilizando, por ej., benzodiazepina (ver, por ej.,
Freidinger y col., en Peptides; Chemistry and Biology, G. R.
Marshall ed., ESCOM Publisher: Leiden, Netherlands (1988); azepina
(ver, por ej., Huffman y col., en Peptides: Chemistry and
Biology, G. R. Mashall ed., ESCOM Publisher: Leiden, Netherlands
(1988)); anillos gamma-lactámicos sustituidos (ver,
por ej., Garvey y col., en Peptides, Chemistry and Biology, G. R.
Mashall ed., ESCOM Publisher: Leiden, Netherlands (1988));
pseudopéptidos de ceto-metileno (ver, por
ej., Ewenson y col., J. Med. Chem. 29: 295 (1986); Ewenson y
col., en Peptides: Structure and Function, (Proceedings of the 9th
American Peptide Symposium) Pierce Chemical Co. Rockland, IL
(1985)); núcleos de dipéptidos \beta-invertidos
(ver, por ej., Nagai y col., Tetrahedron Lett. 26: 647
(1985); Sato y col., J. Chem. Soc. Perkin Trans. 1: 1231 (1986)); o
\beta-aminoalcoholes (ver por ej., Gordon y
col., Biochem. Biophys. Res. Commun. 126: 419 (1985); Dann y col.,
Biochem. Biophys. Res. Commun. 134: 71 (1986)).
Anticuerpos pretenden incluir anticuerpos frente
a cualquier mitad que directamente o indirectamente afecten al
metabolismo de la LBP. Los anticuerpos pueden ser dirigidos contra,
por ej., la LBP o una molécula de unión, o una subunidad o un
fragmento del mismo. Por ejemplo, los anticuerpos incluyen
anticuerpos anti-LBP-1,
LBP-2 o LBP-3; y anticuerpos de
moléculas anti-unión. Fragmentos anticuerpo
pretenden incluir, por ej., fragmentos Fab, fragmentos Fab',
fragmentos F(ab')_{2}, fragmentos F(v), cadenas
pesadas, monómeros, dímeros de cadenas pesadas, trímeros de cadenas
pesadas, monómeros de cadenas ligeras, dímeros de cadenas ligeras,
trímeros de cadenas ligeras, dímeros que consisten en una cadena
pesada y una cadena ligera, y péptidos que mimetizan la actividad
de los anticuerpos de las moléculas anti-LBP o
anti-unión. Por ejemplo, los fragmentos Fab_{2}'
del anticuerpo inhibitorio pueden ser generados a través, por ej.,
de rotura enzimática. Tanto los anticuerpos monoclonales como
policlonales pueden ser utilizados en esta invención.
Preferiblemente, son utilizados los anticuerpos monoclonales. Los
anticuerpos naturales, los anticuerpos recombinantes o los
anticuerpos quiméricos, por ej., los anticuerpos humanizados, están
incluidos en esta invención. Preferiblemente, los anticuerpos
humanizados son utilizados cuando el sujeto es un humano. Más
preferiblemente, los anticuerpos tienen una región constante
derivada de un anticuerpo humano y una región variable derivada de
un anticuerpo monoclonal de ratón inhibitorio. La producción de los
anticuerpos policlonales a LBP está descrita en el Ejemplo 6. Los
anticuerpos monoclonales y humanizados son generados por métodos
estándar conocidos por los expertos en la materia. Los anticuerpos
monoclonales pueden ser producidos, por ej., por cualquier técnica
que proporcione anticuerpos producidos por cultivos de líneas
celulares continuas. Ejemplos de las mismas incluyen la técnica del
hibridoma (Kohler y Milstein, Nature 256: 495-497
(1975), la técnica del trioma, la técnica de hibridoma de células
\beta humanas (Kozbor y col., Immunology Today 4: 72 (1983)), y la
técnica del hibridoma-EBV para producir anticuerpos
monoclonales humanos (Cole y col., en Monoclonal Antibodies and
Cancer Therapy, A. R. Liss, Inc., págs 77-96
(1985)). Preferiblemente, los anticuerpos humanizados son
incrementados a través de técnicas de producción y recogida
convencionales (I. Berkower, Curr. Opin. Biotechnol. 7:
622-628 (1996); Ramharayan y Skaletsky, Am.
Biotechnol. Lab. 13: 26-28 (1995)). En ciertas
realizaciones preferidas, los anticuerpos son incrementados frente
a la LBP, preferiblemente el sitio de unión de la LDL, y se producen
los fragmentos Fab. Estos anticuerpos, o fragmentos derivados de
los mismos, pueden ser utilizados, por ej., para bloquear los
sitios de unión de la LDL en las moléculas de la LBP.
Los agentes también incluyen inhibidores de una
molécula que sea requerida para la síntesis, la modificación
post-traduccional, o el funcionamiento de la LBP y/o
la molécula de unión, o activadores de una molécula que inhibe la
síntesis o el funcionamiento de la LBP y/o la molécula de unión. Los
agentes incluyen, por ej., citoquinas, quimoquinas, factores del
crecimiento, hormonas, componentes de señalización, quinasas,
fosfatasas, proteínas homeobox, factores de transcripción, factores
de edición, factores de traducción, y factores de
post-traducción o enzimas. Agentes también pretenden
incluir radiación ionizante, radiación no ionizante, ultrasonidos y
agentes tóxicos que pueden, por ej., inactivar al menos parcialmente
o destruir la LBP y/o la molécula de unión.
Un agente también pretende incluir un agente que
no sea enteramente específico de la LBP. Por ejemplo, un agente
puede alterar otros genes o proteínas relacionadas con la formación
de la placa arterial. Dicha especificidad del solapamiento puede
proporcionar una ventaja terapéutica adicional.
La invención también incluye el agente así
identificado como útil en el tratamiento de la arterosclerosis.
La invención también incluye un método para la
evaluación de un agente respecto a su capacidad para alterar la
unión del polipéptido de la LBP a una molécula de unión. Se
proporciona un agente. Se proporciona un polipéptido de la LBP. Se
proporciona una molécula de unión. El agente, el polipéptido de la
LBP y la molécula de unión están combinados. Se detecta la
formación de un complejo que comprende el polipéptido de la LBP y la
molécula de unión. Una alteración en la formación del complejo en
presencia del agente en comparación con la producida en ausencia
del agente es indicativa del agente que altera la unión del
polipéptido de la LBP a la molécula de unión.
En realizaciones preferidas, el polipéptido de
la LBP es LBP-1, LBP-2 o
LBP-3. Ejemplos de una molécula de unión incluyen
LDL originaria, LDL modificada, por ej., LDL metilada o LDL oxidada,
y componentes estructurales de la matriz extracelular.
La alteración de la unión incluye, por ej., la
inhibición o la promoción de la unión. Puede ser valorada la
eficacia del agente, por ej., por generación de curvas de respuesta
a la dosis a partir de los datos obtenidos utilizando varias
concentraciones del agente. Los métodos para determinar la formación
de un complejo son estándar y son conocidos por los expertos en la
materia, por ej., ensayos de coelectroforesis de afinidad (ACE) o
ensayos ELISA tal como se han descrito en la presente invención.
La invención también incluye el agente así
identificado como capaz de alterar la unión del polipéptido de la
LBP a una molécula de unión.
La invención también incluye un método para la
evaluación de un agente respecto a su capacidad para unirse a un
polipéptido de la LBP. Se proporciona un agente. Se proporciona un
polipéptido de la LBP. El agente es puesto en contacto con el
polipéptido de la LBP. Se evalúa la capacidad del agente para unirse
al polipéptido de la LBP. Preferiblemente, el polipéptido de la LBP
es LBP-1, LBP-2 o
LBP-3. La unión puede ser determinada, por ej.,
midiendo la formación de un complejo por métodos estándar conocidos
por los expertos en la materia, por ej., ensayos de electroforesis
de afinidad (ACE), ensayos ELISA tal como se ha descrito
anteriormente.
La invención también incluye un método para la
evaluación de un agente respecto a su capacidad para unirse al
ácido nucleico que codifica una secuencia reguladora de la LBP. Se
proporciona un agente. Se proporciona un ácido nucleico que
codifica una secuencia reguladora de la LBP. El agente es puesto en
contacto con el ácido nucleico. Se evalúa la capacidad del agente
para unirse al ácido nucleico. Preferiblemente, la secuencia
reguladora de la LBP es una secuencia reguladora
LBP-1, LBP-2 o
LBP-3. Puede determinarse la unión, por ej., por
medición de la formación de un complejo por métodos estándar
conocidos por los expertos en la materia, por ej., ensayos del
cambio de movilidad del DNA, análisis de la huella de la DNasa I
(Ausubel y col., ed., Current Protocols in Molecular Biology, John
Wiley & Sons, New York, NY, (1989)).
La invención también incluye el agente así
identificado como capaz de unirse a un ácido nucleico que codifica
una secuencia reguladora de la LBP.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para el tratamiento de la arterosclerosis en un
animal. Se precisa un animal de tratamiento para la arterosclerosis.
Se proporciona un agente capaz de alterar un aspecto de la
estructura o el metabolismo de la LBP. El agente es administrado al
animal en una cantidad terapéuticamente efectiva de modo que se
produzca el tratamiento de la arterosclerosis.
El agente puede ser un polipéptido de la LBP,
por ej., LBP-1, LBP-2 o
LBP-3, o un fragmento o análogo biológicamente
activo del mismo. El agente puede ser, por ej., el polipéptido tal
como se ha establecido en la SEC ID NOS: 1-9.
Preferiblemente, el agente es un polipéptido de una longitud de no
más de aproximadamente 100 residuos de aminoácidos, más
preferiblemente de no más de aproximadamente 50 residuos de
aminoácidos, más preferiblemente todavía de no más de
aproximadamente 30 residuos de aminoácidos, más preferiblemente
todavía de no más de aproximadamente 20 residuos de aminoácidos,
más preferiblemente todavía de no más de aproximadamente 10 residuos
de aminoácidos, más preferiblemente todavía de no más de
aproximadamente 5 residuos de aminoácidos, más preferiblemente
todavía de no más de aproximadamente 4 residuos de aminoácidos, más
preferiblemente todavía de no más de aproximadamente 3 residuos de
aminoácidos, y más preferiblemente de no más de aproximadamente 2
residuos de aminoácidos. Preferiblemente, el polipéptido incluye al
menos aproximadamente un 20% de residuos aminoácidos de tipo ácido,
más preferiblemente todavía al menos aproximadamente un 40% de
residuos aminoácidos de tipo ácido, más preferiblemente todavía al
menos aproximadamente un 60% de residuos aminoácidos de tipo ácido,
más preferiblemente todavía al menos aproximadamente un 80% de
residuos aminoácidos de tipo ácido, más preferiblemente todavía al
menos aproximadamente un 90% de residuos aminoácidos de tipo ácido,
más preferiblemente todavía al menos aproximadamente un 95% de
residuos aminoácidos de tipo ácido, y más preferiblemente al menos
aproximadamente un 98% de residuos aminoácidos de tipo ácido. Los
residuos aminoácidos de tipo ácido incluyen ácido aspártico y ácido
glutámico. Un ejemplo de dicho polipéptido de la LBP es la
BHF-1, que tiene un fragmento de una longitud de 20
aminoácidos de la LBP-1 humana o de conejo que
contiene residuos aminoácidos 14 hasta 33. Ver Fig. 9 (SEC ID NO:
9). El 45% de los residuos aminoácidos de la BHF-1
son de tipo ácido. La invención también incluye fragmentos y
análogos biológicamente activos de la BHF-1.
Otras regiones de tipo ácido preferidas de las
LBPs son los residuos aminoácidos 8 a 22 (SEC ID NO: 19), 8 a 33
(SEC ID NO: 20), 23 a 33 (SEC ID NO: 21), y 208 a 217 (SEC ID NO:
22) de la LBP-2 humana tal como se representa en la
Fig. 7 (SEC ID NO: 7); residuos de aminoácidos 14 a 43 (SEC ID NO:
23) y 38 a 43 (SEC ID NO: 24) de la LBP-1 de conejo
o humano tal como se ha representado en la Fig. 1 (SEC ID NO: 1) y
Fig. 6 (SEC ID NO: 6); residuos de aminoácidos 105 a 120 (SEC ID
NO: 25), 105 a 132 (SEC ID NO: 26), 121 a 132 (SEC ID NO: 27), y
211 a 220 (SEC ID NO: 28) de la LBP-2 de conejo tal
como se ha representado en la Fig 2 (SEC ID NO: 2); residuos de
aminoácidos 96 a 110 (SEC ID NO: 29) de la LBP-3 de
conejo tal como se ha representado en la Fig. 5 (SEC ID NO: 5); y
residuos de aminoácidos 53 a 59 (SEC ID NO: 41) de la
LBP-3 humana tal como se ha representado en la Fig.
8 (SEC ID NO: 8). La invención también pretende incluir fragmentos y
análogos biológicamente activos de cualquiera de estos
polipéptidos.
Otros ejemplos de agentes incluyen homopolímeros
y heteropolímeros de cualquier aminoácido o análogo de aminoácido.
En ciertas realizaciones preferidas, el agente es un homopolímero de
un aminoácido de tipo ácido o análogo del mismo. En ciertas
realizaciones, el agente es un heteropolímero de uno o más
aminoácidos de tipo ácido y uno o más otros aminoácidos o análogos
del mismo. Por ejemplo, los agentes incluyen poly(glu),
poly(asp), poly(glu asp), poly(glu N),
poly(asp N) y poly(glu asp N). Por N se pretende
significar cualquier aminoácido, o análogo del mismo, diferente de
glu o asp. Por poly(glu asp) se pretende significar cualquier
permutación de glu y asp para un péptido de longitud dada. Un
péptido preferido es poly(glu) de una longitud de no más de
aproximadamente 10 aminoácidos, preferiblemente de una longitud de
aproximadamente 7 aminoácidos.
El agente puede ser un ácido nucleico de la LBP
o un fragmento o análogo biológicamente activo del mismo, por ej.,
un ácido nucleico que codifique el polipéptido de la
LBP-1, LBP-2 o
LBP-3, o un fragmento o análogo biológicamente
activo del mismo. El agente puede ser, por ej., un ácido nucleico
que comprende una secuencia de nucleótidos tal como se ha
establecido en la SEC ID NOS: 10-18. En otras
realizaciones, el agente es una molécula antisentido, por ej., una
que pueda unirse a una secuencia de gen de la LBP.
Tratamiento pretende incluir, por ej., la
prevención, el tratamiento, la reducción de los síntomas de, o la
curación de la arterosclerosis. La administración del agente puede
conseguirse por cualquier método que permita que el agente alcance
las células objetivo. Estos métodos incluyen, por ej., inyección,
deposición, implantación, supositorios, ingestión oral, inhalación,
administración tópica, o cualquier otro método de administración
por el que se obtenga el acceso a las células objetivo. Las
inyecciones pueden ser, por ej., intravenosas, intradérmicas,
subcutáneas, intramusculares o intraperitoneales. La implantación
incluye insertar sistemas de liberación de fármacos implantables,
por ej., microesferas, hidrogeles, reservorios poliméricos, matrices
de colesterol, sistemas poliméricos, por ej, erosión de la matriz
y/o sistemas de difusión y sistemas no poliméricos, por ej.,
pellets comprimidos, fusionados o parcialmente fusionados. Los
supositorios incluyen supositorios de glicerina. Las dosis de
ingestión oral pueden ser recubiertas entéricamente. La inhalación
incluye la administración del agente con un aerosol en un
inhalador, tanto sólo como unido a un soporte que pueda ser
absorbido.
La administración del agente puede ser solo o en
combinación con otros agentes terapéuticos. El agente puede ser
combinado con un soporte adecuado, incorporado en un liposoma, o
incorporado en un sistema de liberación de polímero.
La administración puede ser diseñada de modo que
de lugar a exposiciones secuenciales al agente durante un cierto
periodo de tiempo, por ej., horas, días, semanas, meses o años. Esto
puede conseguirse por la administración repetida del agente por uno
de los métodos descritos anteriormente, o de forma alternativa, por
un sistema de liberación controlada en el que el agente se
administra al animal durante un periodo prolongado sin
administraciones repetidas. Por sistema de liberación controlada se
quiere significar que la liberación total del agente no se produce
de forma inmediata con la administración, sino que más bien se
libere durante algún tiempo. La liberación puede producirse de
golpe o puede tener lugar de forma gradual y continua. La
administración de dicho sistema puede ser, por ej., por formas de
dosis orales de larga acción, inyección de bolus, parches
transdérmicos o implantes subcutáneos.
Ejemplos de los sistemas en que puede tener
lugar la liberación incluyen, por ej., sistemas en los que el
agente está atrapado en liposomas que están encapsulados en una
matriz polimérica, siendo los liposomas sensibles a un estímulo
específico, por ej., la temperatura, el pH, la luz, el campo
magnético, o a una enzima de degradación, y sistemas en los que el
agente es encapsulado por una microcápsula recubierta iónicamente
con una núcleo de la microcápsula degradado por la enzima. Ejemplos
de sistemas en los que la liberación del agente es gradual y
continua incluyen, por ej., sistemas erosionales en los que el
agente es contenido en una forma dentro de una matriz, y sistemas
difusionales en los que el agente es permeabilizado a una velocidad
controlada, por ej., a través de un polímero. Dichos sistemas de
liberación pueden ser, por ej., en la forma de pellets o de
cápsulas.
El agente puede ser suspendido en un líquido,
por ej., en forma disuelta o en forma coloidal. El líquido puede
ser un disolvente, un disolvente parcial o un no disolvente. En
muchos casos pueden utilizarse agua o un líquido orgánico.
El agente puede ser administrado antes o después
de que aparezcan los síntomas de arterosclerosis. El agente puede
ser administrado a pacientes con historias familiares de
arterosclerosis, o que tengan fenotipos que puedan indicar una
predisposición a la arterosclerosis, o a los que se haya
diagnosticado como que poseen un genotipo que predispone al
paciente a la arterosclerosis, o que tengan otros factores de
riesgo, por ej., hipercolesterolemia, hipertensión o fumadores.
El agente puede ser administrado al animal en
una cantidad terapéuticamente efectiva. Por cantidad
terapéuticamente efectiva se quiere significar la cantidad que sea
capaz de prevenir o revertir, al menos parcialmente, la
arterosclerosis. Puede determinarse una cantidad terapéuticamente
efectiva sobre una base individual y estará basada, al menos en
parte, en consideraciones de la especie de animal, el tamaño del
animal, la edad del animal, el agente utilizado, el tipo de sistema
de liberación utilizado, el tiempo de administración con relación
al inicio de los síntomas de la arterosclerosis, y si se utiliza un
régimen de liberación de dosis único, múltiple o controlado. Puede
determinarse una cantidad terapéuticamente efectiva por uno de los
normalmente expertos en la materia empleando dichos factores y
utilizando sólo experimentos de rutina.
Preferiblemente, la concentración del agente
está en una dosis de aproximadamente 0,1 hasta aproximadamente 1000
mg/kg de peso corporal/día, más preferiblemente entre
aproximadamente 0,1 y aproximadamente 500 mg/kg/día, más
preferiblemente todavía entre aproximadamente 0,1 y aproximadamente
100 mg/kg/día, y más preferiblemente entre aproximadamente 0,1 y
aproximadamente 5 mg/kg/día. La concentración específica depende
parcialmente del agente particular utilizado, ya que unos son más
efectivos que otros. La concentración de la dosis del agente que es
realmente administrado depende al menos en parte de la concentración
final que se desee en el sitio de acción, del método de
administración, la eficacia del agente en particular, la longevidad
del agente en particular, y el tiempo de administración en relación
con el inicio de los síntomas de la arterosclerosis.
Preferiblemente, la forma de dosis es tal que sustancialmente no
afecta de forma negativa al animal. La dosis puede ser determinada
por cualquiera de los expertos en la materia que utilizan dichos
factores y utilizando sólo experimentación de rutina.
En ciertas realizaciones, pueden utilizarse
varias construcciones de genes como parte de un protocolo de terapia
génica para liberar ácidos nucleicos que codifican un agente, por
ej., tanto una forma agonística como antagonística de un
polipéptido de la LBP. Por ejemplo, pueden utilizarse vectores de
expresión para la transfección in vivo y la expresión de un
polipéptido de la LBP en tipos particulares de células de modo que
reconstituyan la función de, o alternativamente, anulen la función
de, el polipéptido de la LBP en una célula en la que se exprese la
LBP de tipo no irregular. Las construcciones de expresión del
polipéptido de la LBP, y los mutantes de las mismas, pueden ser
administradas en cualquier soporte biológicamente efectivo, por ej.,
cualquier formulación o composición capaz de liberar de forma
efectiva el gen de la LBP a las células in vivo. Las
aproximaciones incluyen, por ej., la inserción del gen sujeto en
vectores virales incluyendo, por ej., retrovirus recombinantes,
adenovirus, virus adeno-asociados, y
virus-1 de herpes simplex, o bacterias recombinantes
o plásmidos eucarióticos. Los vectores virales infectan o translucen
células directamente; el DNA del plásmido puede ser liberado con la
ayuda de, por ejemplo, liposomas catiónicos (lipofectin® (Life
Technologies, Inc., Gaithersburg, MD) o derivatizados (por ej.,
anticuerpos conjugados), conjugados de polilisina, gramicidina S,
cubiertas virales artificiales u otros de dichos soportes
intracelulares, así como la inyección directa de la construcción del
gen o la precipitación de Ca_{3}(PO_{4})_{2}
llevada a cabo in vivo. Los métodos anteriormente descritos
son conocidos por los expertos en la materia y pueden ser llevados a
cabo sin experimentación indebida. Ya que la transducción de las
células objetivo apropiadas representan la primera etapa crítica en
la terapia génica, la selección del particular sistema de
liberación del gen dependerá de factores tales como el fenotipo del
objetivo pretendido y la ruta de administración, por ej., de forma
local o sistémica. La administración puede ser dirigida a uno o más
tipos de células, y a una o más células dentro de un tipo de
células, de modo que sea terapéuticamente efectiva, por métodos que
son conocidos por los expertos en la materia. El agente puede ser
administrado a las células de la pared arterial. La administración
puede ser llevada a cabo a través de las células embriónicas o del
animal prenatal. Se reconocerá que el gen particular construido que
proporciona una baja expresión de la LBP transduccional in
vivo es también útil para la transducción de células in
vitro, tal como para uso en los ensayos de diagnóstico
descritos en la presente invención.
La terapia de la arterosclerosis puede ser
llevada a cabo con análogos nucleótidos antisentido de los genes
que codifican para las LBPs. Preferiblemente, los nucleótidos
antisentido tienen "esqueletos" no hidrolizables, por ej.,
fosforotioatos, fosforoditioatos o metilfosfonatos. La secuencia de
base nucleósida es complementaria a la secuencia de una parte del
gen que codifica para, por ej., la LBP-1, 2 ó 3.
Dicha secuencia puede ser, por ej., ATTGGC si la secuencia del gen
para la LBP es TAACCG. Una realización de dicha terapia sería por
incorporación de un análogo antisentido de una parte de uno de los
genes de la LBP en un medio de liberación lenta, por ej., alcohol
polivinílico, que es administrado, por ej., por inyección
subcutánea, de modo que se libere el análogo nucleótido antisentido
durante un periodo de semanas o meses. En otra realización, el
análogo antisentido es incorporado en una matriz polimérica, por
ej., alcohol polivinílico, de modo que el gel pueda ser aplicado de
forma local a una pared de la arteria dañada para inhibir la
síntesis de la LBP y prevenir la acumulación de la LDL, por ej.,
después de la angioplastia o la aterectomía.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para el tratamiento de un animal con riesgo de
arterosclerosis. Se proporciona un animal con riesgo de
arterosclerosis. Se proporciona un agente capaz de alterar un
aspecto de la estructura o del metabolismo de la LBP. El agente es
administrado al animal en una cantidad terapéuticamente efectiva de
modo que se produzca el tratamiento del animal. El riesgo de
arterosclerosis puede ser resultado de, por ej., una historia
familiar de arterosclerosis, un genotipo que predisponga a la
arterosclerosis, o síntomas fenotípicos que predispongan a la
arterosclerosis, por ej., tener hipercolesterolemia, hipertensión o
fumar.
También se incluye un método para tratar una
célula que tenga una anormalidad en la estructura o el metabolismo
de la LBP. Se proporciona una célula que tenga una anormalidad en la
estructura o el metabolismo de la LBP. Se proporciona un agente
capaz de alterar un aspecto de la estructura o del metabolismo de la
LBP. El agente es administrado a la célula en una cantidad
terapéuticamente efectiva de modo que se produzca el tratamiento de
la célula.
En ciertas realizaciones, se obtiene la célula
de un cultivo de células o de un cultivo de tejidos o de
fibroblastos de embriones no humanos. La célula puede ser, por ej.,
parte de un animal, por ej., un animal natural o un animal
transgénico no humano. Preferiblemente, la LBP es la
LBP-1, la LBP-2 o la
LBP-3.
La invención también incluye una composición
farmacéutica para el tratamiento de la arterosclerosis en un animal
que comprende una cantidad terapéuticamente efectiva de un agente,
siendo el agente capaz de alterar un aspecto del metabolismo o la
estructura de la LBP en el animal de modo que resulte en el
tratamiento de la arterosclerosis, y un soporte farmacéuticamente
aceptable. Los soportes farmacéuticamente aceptables incluyen, por
ej., solución salina, liposomas y emulsiones de lípidos.
En ciertas realizaciones preferidas, el agente
de la composición farmacéutica es un polipéptido de la LBP, por ej.,
la LBP-1, LBP-2 o
LBP-3, o un fragmento o análogo biológicamente
activo del mismo. El agente puede ser, por ej., el polipéptido tal
como se ha establecido en la SEC ID NOS: 1-9.
Preferiblemente, el agente es un polipéptido de una longitud de no
más de aproximadamente 100 residuos de aminoácidos, más
preferiblemente de no más de aproximadamente 50 residuos de
aminoácidos, más preferiblemente todavía de no más de
aproximadamente 30 residuos de aminoácidos, más preferiblemente
todavía de no más de aproximadamente 20 residuos de aminoácidos, más
preferiblemente todavía de no más de aproximadamente 10 residuos de
aminoácidos, más preferiblemente todavía de no más de
aproximadamente 5 residuos de aminoácidos, más preferiblemente
todavía de no más de aproximadamente 4 residuos de aminoácidos, más
preferiblemente todavía de no más de aproximadamente 3 residuos de
aminoácidos, y más preferiblemente de no más de aproximadamente 2
residuos de aminoácidos. Preferiblemente, el polipéptido incluye al
menos aproximadamente un 20% de residuos aminoácidos de tipo ácido,
más preferiblemente todavía al menos aproximadamente un 40% de
residuos aminoácidos de tipo ácido, más preferiblemente todavía al
menos aproximadamente un 60% de residuos aminoácidos de tipo ácido,
más preferiblemente todavía al menos aproximadamente un 80% de
residuos aminoácidos de tipo ácido, más preferiblemente todavía al
menos aproximadamente un 90% de residuos aminoácidos de tipo ácido,
más preferiblemente todavía al menos aproximadamente un 95% de
residuos aminoácidos de tipo ácido, y más preferiblemente al menos
aproximadamente un 98% de residuos aminoácidos de tipo ácido.
En ciertas realizaciones preferidas, el agente
es un ácido nucleico de la LBP, por ej., un ácido nucleico que
codifica el polipéptido de la LBP-1,
LBP-2 o LBP-3, o un fragmento o
análogo del mismo biológicamente activo. El agente puede ser, por
ej., un ácido nucleico que comprende una secuencia de nucleótidos
tal como se ha establecido en las SEC ID NOS:
10-18.
La invención también incluye una composición de
vacuna para el tratamiento de la arterosclerosis en un animal que
comprende una cantidad terapéuticamente efectiva de un agente,
siendo capaz el agente de alterar un aspecto del metabolismo o la
estructura de la LBP en el animal de modo que de lugar al
tratamiento de la arterosclerosis, y un soporte farmacéuticamente
aceptable.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para el diagnóstico de las lesiones
arteroscleróticas en un animal. Se proporciona un animal. Se
proporciona un agente marcado capaz de unirse a la LBP presente en
las lesiones arteroscleróticas. El agente marcado es administrado al
animal bajo condiciones que permitan que el agente marcado
interaccione con la LBP de modo que de lugar a la LBp marcada. La
localización o la cuantificación de la LBP marcada es determinada
por la toma de imágenes así como para diagnosticar la presencia de
las lesiones arteroscleróticas en el animal.
Preferiblemente, la LBP es
LBP-1, LBP-2 o
LBP-3. La toma de imágenes puede llevarse a cabo por
métodos estándar conocidos por los expertos en la materia,
incluyendo, por ej., imágenes de resonancia magnética, imágenes de
cámara gamma, imágenes topográficas computerizadas de emisión de
fotón único (SPECT) o tomografía de emisión de positrón (PET).
Preferiblemente, para el diagnóstico y la toma
de imágenes arteroscleróticas se utilizan los agentes que se unen
fuertemente a las LBPs en las lesiones arteroscleróticas. El agente
es radiomarcado con, por ej., Tc^{99m} u otro isótopo adecuado
para la toma de imágenes clínica por cámara gamma, SPECT, escaneado
PET u otro tipo de tecnología similar. Debido a que las LBPs se
producen en lesiones muy tempranas, dicha toma de imágenes es más
sensible que la angiografía o los ultrasonidos para la localización
de lesiones muy iniciales que todavía no afectan al lumen arterial
para causar una protuberancia visible o un flujo alterado. Además de
localizar tanto las lesiones tempranas como las más desarrolladas,
los agentes de toma de imágenes que se unen a las LBPs pueden ser
utilizados para seguir el progreso de la arterosclerosis, como un
medio de evaluar la efectividad tanto de los tratamientos
dietéticos como farmacológicos.
De este modo, una realización de diagnóstico de
la invención es la adaptación de, por ej., un péptido complementario
a una de las LBP's, por marcaje radioactivo del mismo y
utilizándolo como un agente inyectable para la toma de imágenes
para la detección de arterosclerosis oculta. El péptido es
seleccionado entre aquellos de los que se conoce que se unen a las
LBPs, por ej., RRRRRR o KKLKLXX, o cualquier otro péptido
policatiónico que se une a los dominios altamente electronegativos
de las LBPs. Para la detección extracorporal con una cámara de
centelleo gamma (Anger), los ligandos de unión a tecnecio, por ej.,
CGC, GGCGC, o GGCGCF, pueden ser incorporados en los péptidos en el
N terminal o en el C terminal para el marcaje con Tc 99m. Para la
toma de imágenes externas por imágenes de resonancia magnética
(MRI), por ej., el quelador que se une al gadolinio, el ácido
dietilen triamina-penta-acético
(DTPA), es unido de forma covalente al N o al C teminal de los
péptidos. En todavía otras realizaciones, los péptidos que se unen
a la LBP son unidos de forma covalente, por ej., a las partículas
de ión óxido magnético por métodos estándar conocidos por los
expertos en la materia, por ej., por conjugación de los péptidos
con gránulos de resina de poliestireno activado que contienen un
animal contra una LBP, por ejemplo.
Los métodos descritos en la presente invención
pueden ser útiles para inmunizar un animal contra una LBP, por ej.,
la LBP-1, LBP-2 o la
LBP-3, o un fragmento o un análogo de la misma. Se
proporciona un animal que tenga LDL. Se proporciona una LBP o un
fragmento o un análogo de la misma. La LBP o el fragmento o el
análogo de la misma son administrados al animal de modo que
estimulen la producción de anticuerpos por el animal a la LBP o al
fragmento o análogo de la misma de modo que la unión de la LBP a la
LDL sea alterada, por ej., disminuida o incrementada.
La invención también incluye un método de
preparar un fragmento o análogo del polipéptido de la LBP, el
fragmento o análogo que tenga la capacidad de unirse a la LDL
modificada y a la LDL originaria. Se proporciona un polipéptido de
la LBP. La secuencia del polipétido de la LBP es alterada. El
polipéptido de la LBP alterado es ensayado para determinar la
capacidad de unirse a la LDL modificada, por ej., a la LDL metilada,
a la LDL oxidada, a la LDL acetilada, a la LDL tratada con
ciclohexanediona (CHD-LDL), y a la LDL
originaria.
Los fragmentos o análogos pueden ser generados y
ensayados para determinar su capacidad para unirse a estas LDL's
modificadas y a la LDL originaria, por métodos conocidos por los
expertos en la materia, por ej., tal como se describe en la
presente invención. Preferiblemente, son ensayados para determinar
su capacidad para unirse a la LDL metilada y a la LDL originaria.
La actividad de unión del fragmento o análogo puede ser mayor o
menor que la actividad de unión de la LBP originaria.
Preferiblemente, es mayor. En realizaciones preferidas, la LBP es
la LBP-1, LBP-2 o la
LBP-3.
La invención también incluye un método para el
aislamiento de un cDNA que codifica una LBP. Se proporciona una
biblioteca de cDNA. La biblioteca de cDNA es seleccionada para un
cDNA que codifique un polipéptido que se una a la LDL originaria y
a la LDL modificada, por ej., la LDL metilada o la LDL oxidada. Se
aísla el cDNA que codifica este polipéptido, el cDNA que codifica
una LBP.
Los siguientes ejemplos no limitativos ilustran
además la presente invención.
Este ejemplo ilustra la construcción de una
biblioteca de cDNA de conejo utilizando mRNA de aorta abdominal de
conejo cicatrizada de forma deendotelializada con globo. La aorta de
conejo deendotelializada con un catéter de globo ha demostrado ser
un modelo válido para la arterosclerosis (Minick y col., Am. J.
Pathol. 95: 131-158 (1979).
Se obtuvo el mRNA cuatro semanas después de la
introducción del globo para maximizar la unión de la LDL focal en la
aorta de conejo con el globo. Se llevó a cabo la síntesis del cDNA
de la primera hebra en una mezcla de reacción de 50 \mul
conteniendo 4 \mug de mRNA; 2 \mug de prímero oligo d(T);
mezcla de metilación dNTP (10 mM de cada); 10 mM de DTT; 800
unidades de exponente II RT (Life Technologies, Gaithersburg, MD);
tampón de síntesis de cDNA de 1 X primera hebra (50 mM de
Tris-HCl, pH 8,3; 75 mM de KCl; 5 mM de MgCl_{2}),
que se incubaron durante 1 h a 37ºC. A continuación se ajustó la
mezcla de reacción a 250 \mul mediante la adición de un tampón de
1 X segunda hebra (30 mM de Tris-HCl, pH 7,5; 105 mM
de KCl; 5,2 mM de MgCl_{2}); 0,1 mM de DTT; mezcla de metilación
dNTP (10 mM cada una); 50 unidades de polimerasa I del DNA de la
E. coli, 3 unidades de RNasa H; 15 unidades de ligasa de DNA
de la E. coli (todas las enzimas se obtuvieron de Life
Technologies), que se incubaron durante 2,5 horas adicionales a
15ºC. Los cDNAs de doble hebra resultantes (dscDNA) se trataron a
continuación con 1,5 unidades de polimerasa de DNA T4 (Novagen Inc.,
Madison, WI) durante 20 min a 11ºC para preparar dscDNA de extremos
romos. A continuación éstos se concentraron por precipitación en
etanol y se unieron los conectores EcoRI/Hind III a los extremos
mediante la ligasa de DNA T4 (Novagen Inc.). Se trataron los cDNAs
ligados con el enlazador con las enzimas de restricción para
producir las secuencias de reconocimiento EcoRI y HindIII en sus
extremos 5' y 3', respectivamente. Después de la eliminación del
conector de DNA por cromatografía de exclusión de gel, se insertaron
los dscDNAs en los brazos del fago \lambdaEXlox (Novagen Inc.) de
un modo unidireccional mediante la ligasa DNA T4 y se empaquetaron
en partículas de fago de acuerdo con el protocolo del fabricante
(Novagen Inc.). Se estableció una biblioteca de fagos de cDNAs
conteniendo 2 x 10^{6} clones independientes a partir de 4 \mug
de mRNA.
Este ejemplo ilustra un método de selección
funcional de una biblioteca de cDNA de conejo de modo que se
identifiquen los cDNAs que codifican las LBPs que se unen tanto a la
LDL originaria como a la metil LDL. La metil LDL no es reconocida
por los receptores de la superficie de las células previamente
descritas. Ver, por ej., Weisgraber y col., J. Biol. Chem.
253: 9053-9062 (1978).
Se infectó un cultivo recién preparado de la
noche anterior de células de E. coli ER1647 (Novagen Inc.)
con el fago de cDNA obtenido a partir del Ejemplo 1, y se colocó en
placas a una densidad de 2 x 10^{4} unidades de formación de
placas (pfu) en placas de 150 mm de diámetro conteniendo agar 2 X
YT. Se prepararon e incubaron a 37ºC un total de 50 placas,
equivalente a 1 x 10^{6} fagos, hasta que las placas alcanzaron 1
mm de diámetro (5-6 horas). Se cubrió la superficie
de cada placa con una capa de membrana de nitrocelulosa seca, que
había sido previamente saturada con una solución de IPTG 10 mM,
para inducir la producción de proteína recombinante, así como para
inmovilizar las proteínas en las membranas. Las placas se incubaron
a 37ºC durante un periodo adicional de 3-4 horas, y
a continuación durante toda la noche a 4ºC.
El siguiente día, se levantaron las membranas de
cada placa y se procedió del modo siguiente. Varios enjuagues
breves en una solución de TBST (10 mM de Tris-HCl,
pH 8,0; 150 mM de NaCl, 0,05% de Tween 20), dos enjuagues de 10 min
con guanidina 6 M-HCl en HBB (20 mM de HEPES, pH
7,5; 5 mM de MgCl_{2}, 1 mM de DTT, y 5 mM de KCl); dos enjuagues
de 5 min en guanidina 3 M-HCl en HBB; un breve
enjuague final en TBSEN (TBS, 1 mM de EDTA, 0,02% de
NaN_{3}).
A continuación se bloquearon las membranas
durante 30 min a temperatura ambiente en una solución de TBSEN con
un 5% de leches en polvo no grasa, seguido por 10 min en TBSEN con
un 1% de leche en polvo no grasa. Después del bloqueo, se incubaron
las membranas con LDL humana originaria (obtenida tal como se ha
descrito en el Ejemplo 11 o LDL humana metilada (meLDL) (ver
Weisgraber y col., J. Biol. Chem. 253: 9053-9062
(1978)), a una concentración de 4 \mug/ml, en una solución
conteniendo 1 X TBSEN, un 1% de leche en polvo no grasa, 1 mM de
PMSF, una solución del inhibidor 0,5 X proteasa (1 mM de ácido
\varepsilon-aminocaproico/1 mM de benzamidina).
La incubación fue durante 4 horas a temperatura ambiente en una
placa de Petri de vidrio con una suave agitación en una mesa de
agitación, seguido por toda la noche a 4ºC sin agitación.
Se detectó la unión específica de la meLDL y la
LDL originaria en las membranas de nitrocelulosa por anticuerpos
contra la LDL humana. Se absorbieron anticuerpos policlonales de la
LDL anti-humana de cordero (Boehringer Mannheim,
Indianápolis, IN) con extractos de células E de capas de E.
coli para eliminar el origen. Para la adsorción, se hicieron
crecer células E de capas de E. coli hasta una fase log,
giradas y suspendidas de nuevo en PBS conteniendo 1 mM de PMSF, 2
mM de ácido \varepsilon-aminocaproico, y 1 mM de
benzamidina. A continuación la suspensión de células se sometió a 8
ciclos de congelación-descongelación por medio de la
inmersión en nitrógeno líquido y bajo corriente de agua del grifo
fría, respectivamente. Se incubó la solución de anticuerpos de anti
LDL/extracto de células con agitación suave durante 1 hora a 4ºC. (1
ml de solución del anticuerpo/3 mg del extracto de células crudo).
Después de la incubación, se centrifugó la mezcla (10.000 x g; 10
min; 4ºC) y se guardó el sobrenadante a 4ºC en presencia de
NaN_{3} 0,02% hasta su uso. Se procesaron las membranas para
inmunoselección del modo siguiente: (i) tres lavados de 5 min a
temperatura ambiente en TBSEN conteniendo gelatina al 1%; (ii) 30
min de incubación en PBS, pH 7,4 con gelatina al 1%; (iii) dos horas
de incubación a temperatura ambiente con agitación suave en PBS
recién preparado/solución de gelatina conteniendo anticuerpos de la
LDL anti-humanos de cordero absorbidos (Boehringer
Manheim, Indianápolis, IN) (dilución 1:1000); (iv) tres lavados
breves en TBS, pH 7,4; (v) incubación a temperatura ambiente durante
una hora con agitación suave en PBS/solución de gelatina
conteniendo anticuerpos conjugados con fosfatasa alcalina de
anticordero de burro (Sigma, St. Louis, MO) (dilución 1:10.000);
(vi) tres breves lavados con TBS, pH 7,4; y (vii) desarrollo de
acuerdo a las instrucciones del fabricante, utilizando un kit de
desarrollo de sustrato fosfatasa alcalina (Novagen Inc.). Las
placas de fago que produjeron LBPs aparecieron como "donuts"
coloreados de azul en las membranas.
Se purificó el fago del Ejemplo 1 conteniendo
los cDNAs de la LBP por placa y se convirtió en subclones de
plásmido siguiendo un protocolo llamado "Autosubcloning by
Cre-mediated Plasmad Escisión" proporcionado por
Novagen Inc. Se obtuvieron las secuencias de DNA por el método de
terminación de cadena de dideoxinucleótido (Sanger y col., Proc.
Natl. Acad. Sci., USA 74: 5463-5467 (1977), y se
analizaron por un secuenciador automatizado de Applied Biosystems.
Se determinó el marco de lectura (ORF) de cada cDNA a partir de
secuencias de consenso obtenidas tanto de hebras con sentido como
de hebras antisentido de los cDNAs. La secuenciación confirmó que
se habían aislado tres genes previamente desconocidos. Ya que los
genes se seleccionaron por selección funcional para la unión de la
LDL, las proteínas que codificaron por estos genes fueron
calificadas como proteínas de unión de la LDL (LBPs),
específicamente, LBP-1, LBP-2 y
LBP-3. Las secuencias de cDNA para
LBP-1, LBP-2 y
LBP-3 de conejo y las correspondientes proteínas se
han establecido en la SEC ID NOS: 10-14.
En base a sus respectivas secuencias de
codificación de cDNA, se determinaron los tamaños de las proteínas
recombinantes que fueron 16,2 kDa para la LBP-1, 40
kDa para la LBP-2, y 62,7 kDa para la
LBP-3.
Este ejemplo ilustra el tamaño y la distribución
de tejido de los mRNAs de la LBP. Se aisló el RNA total de
diferentes tejidos de conejo: adrenales, aorta torácica, aorta
abdominal, aorta abdominal hinchada y reendotelializada, corazón,
riñón células de músculo liso, pulmón e hígado, por el reactivo
Trizol (Life Technologies) y se concentró por precipitación con
etanol. Se llevó a cabo la electroforesis de gel de RNA en agarosa
al 1,2% conteniendo tampón 1 X MOPS (0,2 M de MOPS, pH 7,0; acetato
sódico 50 mM; EDTA 5 mM, pH 8,0) y formaldehído 0,37 M. Se cargaron
los geles con 20 \mug de RNA total a partir de cada tejido
examinado y se sometieron a electroforesis a 100 voltios durante 2
horas en tampón de 1 X MOPS. Se hicieron las manchas de los RNAs en
membranas de nitrocelulosa soportada (Schleicher & Schuell,
Keene, NH) y se inmovilizaron por calentamiento a 80ºC durante 2
horas. Se llevó a cabo la hibridación a las sondas de cDNA o cRNA de
LBP-1, LBP-2 y LBP-3
por procedimientos estándar conocidos por los expertos en la materia
(ver, por ej., Ausubel y col., Current Protocols in Molecular
Biology; John Wiley & Sons (1989)); se detectaron las señales
por autoradiografía.
Los resultados fueron los siguientes: los
tamaños de los mRNAs fueron de aproximadamente 1,3 kb para la
LBP-1, de aproximadamente 2,3-2,5 kb
para la LBP-2, y de aproximadamente 4,7 kb para la
LBP-3. Se encontró mRNA de LBP-1,
LBP-2 y LBP-3 en todos los tejidos
ensayados, pero la mayor cantidad fue en la aorta abdominal
hinchada.
Este ejemplo ilustra el aislamiento de los cDNAs
de la LBP de humano. Se aislaron los clones de cDNA de la LBP a
partir de tres bibliotecas de cDNA. Se obtuvo una biblioteca de cDNA
de cerebro de feto humano de Stratagene, LaJolla, CA, se obtuvo una
biblioteca de cDNA de hígado humano y de aorta humana de Clontech,
Palo Alto, CA, y se seleccionaron con una sonda de cDNA
radiomarcada derivada de LBP-1,
LBP-2 o LBP-3 de conejo, de acuerdo
con el método descrito en Law y col., Gene Expresión 4:
77-84 (1994). Se identificaron varios clones
fuertemente hibridantes y se purificaron por placa. Se confirmó que
los clones eran las LBP-1, LBP-2 y
LBP-3 humanas por secuenciación de DNA utilizando
el método de terminación de cadena de dideoxinucleótido y el
análisis por un secuenciador automatizado de Applied Biosystems.
Las secuencias de cDNA y las correspondientes proteínas para la
LBP-1, LBP-2 y LBP-3
se han establecido en la SEC ID NOS: 15, 16 y 17 respectivamente. En
las Figs. 19, 20 y 21 se muestra una comparación entre las
correspondientes secuencias de proteína de LBP-1,
LBP-2 y LBP-3 para conejo y
humano.
Se aisló el cDNA de LBP a partir de los
plásmidos originales pEXlox obtenidos tal como se ha descrito en los
Ejemplos 1 y 2, y se subclonaron en el vector
pProEX-HT (Life Technologies) para la expresión de
la proteína recombinante. La inducción de la proteína recombinante
por adición de IPTG a los cultivos DH10B de E. coli
transformada dieron lugar a la expresión de proteína recombinante
conteniendo la marca de la 6-histidina
(N-terminal). A continuación se purificó esta
proteína marcada para determinar las proteínas de la célula totales
por unión a Ni-NTA (nitrilo de níquel-ácido
triacético) tal como se ha descrito en el protocolo proporcionado
por el fabricante (Qiagen, Inc., Santa Clara, CA). La preparación
obtenida después de la etapa de cromatografía fue aproximadamente un
90% pura; se llevó a cabo la SDS-PAGE preparativa
como etapa de purificación final.
Cuando se requirió por el procedimiento de
caracterización, se llevó a cabo la iodinación de las LBPs
utilizando gotas de yodo (Pierce, Rockford, IL). Las gotas de yodo
se incubaron con 500 \muCi de una solución de Na^{125}I (17
Ci/mg) (New England Nuclear, Boston, MA) en un tubo de microfuga
cerrado con tapón durante 5 min a temperatura ambiente. Se añadió la
solución de proteína a las gotas de yodo-Na^{125}I
del tubo de microfuga y se incubaron durante 15 min a temperatura
ambiente. Al final de esta incubación, se separaron alícuotas para
la determinación del contaje del soluble total y del TCA
precipitable. A continuación se precipitó la proteína radiomarcada
con acetona fría (2,5 vol; -20ºC; 2,5 hr). Después de esta
incubación, se recogió la proteína precipitada por centrifugación
(14.000 g; 1 hr; temperatura ambiente) y se suspendió de nuevo en
una muestra de tampón (urea 6 M/50 mM de Tris, pH 8,0/2 mM de EDTA).
Se valoró la integridad de la preparación de la proteína por
SDS-PAGE.
Se confirmaron las identidades de las LBPs
recombinantes utilizando protocolos de secuenciación de proteína
estándar conocidos por los expertos en la materia (A Practical Guide
for Protein and Peptide Purification for Microsequencing,
Matsudaira, ed., Academic Press, Inc., 2ª edición (1993)). Se llevó
a cabo el análisis utilizando un Secuenciador de Proteína de Applied
Biosystems modelo 477A con un analizador de aminoácidos en línea
Modelo 120 PHT.
Este ejemplo ilustra la producción de
anticuerpos policlonales de la LBP-1,
LBP-2 y LBP-3. Se inyectó una mezcla
de proteína de la LBP recombinante purificada (0,5 ml; 200 \mug) y
RIBI adyuvante (RIBI ImmunoChem Research, Inc., Hamilton, MT) de
forma subcutánea en cobayas machos (Dunkin Hartley; Hazelton
Research Products, Inc., Denver, PA) a 3-5 sitios a
lo largo de las regiones torácica dorsal y abdominal del cobaya. Se
tomaron muestras de sangre por punción en vena en los días 1
(sangría pre-inmune), 28, 49 y 70. Se administraron
inyecciones suplementarias en los días 21 (100 \mug; SC), 42 (50
\mug; SC), y 63 (25 \mug; SC). Se evaluó el resultado de la
valoración del antisuero del cobaya por dilución en serie "dot
blotting". Al mismo tiempo se evaluó el antisuero preinmune.
Después de un tercer suplemento de proteína de LBP, la valoración
frente a la proteína recombinante alcanzó un nivel máximo con una
respuesta colorimétrica detectable en un ensayo de manchas de
puntos de 156 pg.
Se demostró la especificidad del anticuerpo
policlonal por la LBP-1, LBP-2 o la
LBP-3 recombinante utilizando el análisis de
manchas Western (Towbin y col., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 76: 4350
(1979)). Se visualizó el complejo
proteína-anticuerpo de forma inmunoquímica con IgG
de cobaya-anti cabra conjugado con fosfatasa
alcalina, seguido por tinción con azul de nitro tetrazolio (BioRad
Laboratorios, Hercules, CA). Se bloqueó la unión no específica
utilizando leche en polvo no grasa al 3% en solución salina
tamponada con Tris (100 mM de Tris; 0,9% de NaCl, pH 7,4).
Este ejemplo ilustra la presencia de las LBPs en
o sobre placas que cubren las células endoteliales en o sobre
células de músculo liso adyacente, y en la matriz extracelular.
Además, se demostró la co-localización de la LDL y
las LBPs. Se obtuvieron estos resultados por examen de las lesiones
de las arterias de conejo hinchadas y las placas arteroscleróticas
humanas por métodos inmunohistoquímicos.
Se obtuvo aorta deendotelializada hinchada de
conejos que habían recibido una inyección de bolus de LDL humana (3
mg; i.v.) 24 horas antes de la toma de tejidos. Se obtuvieron las
aortas humanas conteniendo placas arteroscleróticas de especimenes
de autopsias de rutina. Se fijaron los tejidos en un 10% de
formalina tamponada (\leq 24 horas) y se encajaron en parafina
utilizando una máquina de encaje de tejido automatizada. Se cortaron
secciones de tejido (5-7 \mu) y se montaron en
portaobjetos de vidrio para su incubación durante 1 hora a 60ºC. Se
desparafinizaron las secciones. Después de un lavado final con
H_{2}O desionizada, se eliminó la actividad de la peroxidasa por
incubación de las secciones con tampón de 1% de
H_{2}O_{2}/H_{2}O durante 5 min a temperatura ambiente. Se
enjuagaron las secciones con solución salina tamponada con fosfato
(PBS) durante 5 min a temperatura ambiente y se bloqueó la unión no
específica con suero de cabra normal al 5% o suero de conejo normal
al 5% dependiendo de la fuente de anticuerpo secundario (Sigma, St.
Louis, MO) (1 hora; temperatura ambiente). A continuación se
incubaron las secciones con una dilución 1:50 (en suero de cabra
normal al 5%/PBS) de un anticuerpo policlonal de cobaya frente la
forma de conejo de la LBP-1, LBP-2 o
LBP-3 recombinante. Los controles incluyeron suero
preinmune así como antisuero específico para la
LBP-1, LBP-2 o LBP-3
en los que el anticuerpo primario fue completamente adsorbido y
eliminado por incubación con LBP-1,
LBP-2 o LBP-3 recombinante seguido
por centrifugación antes de la incubación con las secciones de
tejido. Se utilizó un anticuerpo policlonal de conejo purificado
por afinidad contra a apolipoproteína B humana (Polysciences Inc.;
Warrington, PA) a una dilución de 1:100 (en suero de conejo normal
al 5%/PBS). Se incubaron las secciones durante 2 horas a
temperatura ambiente en una cámara humidificada. Al final de la
incubación, se enjuagaron las secciones con PBS y se incubaron con
una dilución 1:200 (en suero de cabra normal al 5%/PBS) del
conjugado IgG biotinilado de cobaya-anti cabra
(Vector Laboratories, Burlingame, CA) o a una dilución 1:250 (en
suero de conejo normal al 5%/PBS) de conjugado IgG biotinilado de
cabra-anti conejo (Vector Laboratories, Burlingame,
CA) durante 1 hora a temperatura ambiente en una cámara
humidificadora. A continuación se enjuagaron las secciones con PBS
y se amplificó la señal antígeno-anticuerpo
utilizando el conjugado avidina/biotina HRP (kit Vectastain ABC;
Vector Laboratories, Burlingame, CA). Se desarrollaron secciones
utilizando sustrato DAB (4-6 min; temperatura
ambiente) y se contratiñó con hematoxilina.
En la arteria de conejo hinchada, la
inmunohistoquímica con los anticuerpos
anti-LBP-1, LBP-2 y
LBP-3 mostró que las LBP-1,
LBP-2 y LBP-3 estaban localizadas en
o sobre células endoteliales funcionalmente modificadas en los
bordes de las islas endoteliales regenerantes, la misma situación en
que se ha demostrado la unión de la LDL irreversible (Chang y col.,
Arteriosclerosis and Thrombosis, 12: 1088-1098
(1992)). También se encontraron LBP-1,
LBP-2 y LBP-3 en o sobre las células
de músculo liso íntimo por debajo de las células endoteliales
funcionalmente modificadas, y a una menor extensión, en la matriz
extracelular. No se detectó ninguna LBP-1,
LBP-2 o LBP-3 en las áreas aún
desendotelializadas, en donde la unión de la LDL había demostrado
ser reversible (Chang y col., Arteriosclerosis and Thrombosis 12:
1088-1098 (1992)). La inmunohistoquímica de la aorta
de conejo hinchada con anticuerpos de apoliproteína B
anti-humana mostró la presencia de la LDL en las
mismas localizaciones que se encontraron para la
LBP-1, LBP-2 y
LBP-3.
En las placas arteroscleróticas humanas tomadas
en autopsias de rutina, la inmunohistoquímica con los anticuerpos
de anti-LBP-1,
anti-LBP-2 y
anti-LBP-3 mostraron que también se
encontraba LBP-1, LBP-2 y
LBP-3 en o sobre las placas que cubrían las células
y en o sobre las células del músculo liso adyacente. En el tejido
humano, hubo una mayor evidencia de LBP-1,
LBP-2 y LBP-3 en la matriz
extracelular.
Los resultados obtenidos con las secciones de
parafina fueron idénticos a los de las secciones congeladas.
Este ejemplo ilustra que la unión se produce
entre la LBP-1, LBP-2 o
LBP-3 y la LDL, y que esta unión es específica, tal
como se ilustra por el hecho de que la unión no se produce entre la
LBP-1, LBP-2 o LBP-3
y la HDL (lipoproteína de alta densidad).
Se llevó a cabo el análisis de afinidad y de
especificidad de la unión de la LDL a la LBP-1,
LBP-2 o LBP-3 de conejo
recombinante utilizando el principio de la electroforesis de
afinidad (Lee y Lander, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:
2768-2772 (1991)). Se preparó agarosa fundida (1%,
65ºC) en MOPS de sodio 50 mM, pH 7,0; 125 mM de acetato sódico,
0,5% de CHAPS. Se colocó un peine de teflón consistente en nueve
barras paralelas (45 x 4 x 4 mm/3 mm de espaciado entre las barras)
en una película GelBond (FMC Bioproducts, Rockland, ME) unido a una
bandeja de reparto de plexiglás con el eje largo de las barras
paralelo al eje largo de la bandeja de reparto. Se colocó una tira
de teflón (66 x 1 x 1 mm) en el borde con el eje largo paralelo al
eje corto de la bandeja de reparto, a una distancia de 4 mm del eje
del peine de teflón. A continuación se introdujo la agarosa fundida
(> 65ºC) para conseguir una altura de aproximadamente 4 mm. La
separación del peine y de la tira dio lugar a un gel conteniendo
nueve pocillos rectangulares de 45 x 4 x 4 mm adyacentes a una
ranura de 66 x 1 mm. Se prepararon muestras de LDL o de HDL en un
tampón de gel (50 mM de MOPS de sodio, pH 7,0, 125 mM de acetato
sódico) a una concentración doble de la deseada. A continuación se
mezclaron las muestras con un volumen igual de agarosa fundida (en
50 mM de MOPS de sodio, pH 7,0; 125 mM de acetato sódico; 50ºC), se
pipetearon en los pocillos rectangulares apropiados y se dejaron
melificar. Se ensayó la afinidad y la especificidad de la unión de
la LBP-1 y LBP-3 utilizando varias
concentraciones de LDL (540 a 14 nM) y de HDL
(2840-177 nM). Se cargó la ranura una cantidad
constante (0,003 nM-0,016 nM) de
LBP-1, LBP-2 o LBP-3
marcadas con I^{125} (suspendida en 50 mM de MOPS de sodio, pH
7,0; 125 mM de acetato sódico; 0,5% de azul de bromofenol; 6%
(peso/volumen) de sacarosa). Se sometieron los geles a
electroforesis a 70 v/2 horas/20ºC. Al final del recorrido los geles
se secaron al aire y se visualizaron los perfiles de retardo por
exposición a películas de rayos X a los geles durante toda la noche
a -70ºC, con pantallas intensificantes).
La LDL retardó la migración de la
LBP-1, LBP-2 y la
LBP-3 a través del gel de un modo dependiente de la
concentración, y de un modo saturable, indicando que la unión de la
LBP-1, LBP-2 y LBP-3
a la LDL fue altamente específica. Esta conclusión está soportada
por el hecho de que la HDL no retardó la LBP-1,
LBP-2 o al LBP-3. Una curva de unión
generada a partir del ensayo de coelectroforesis de afinidad indicó
que la LBP-1 se une a la LDL con una K_{d} de 25,6
nM, que la LBP-2 (clon 26 de conejo) se une a la LDL
con una K_{d} de 100 nM, y que la LBP-3
(fragmento de 80 kDa) se une a la LDL con una K_{d} de 333 nM.
Además para ensayar la afinidad y la
especificidad de la unión de la LBP-1, la
LBP-2 y la LBP-3 a la LDL, se ensayó
la capacidad de la LBP-1, LBP-2 o
LBP-3 "fría" (es decir,
no-radiomarcada) a inhibir de forma competitiva la
unión de la LBP-1, la LBP-2 y la
LBP-3 radiomarcadas a la LDL, respectivamente. Se
llevaron a cabo estudios de competición utilizando concentraciones
fijas a de LDL fría y LBP-1 radiomarcada y
cantidades incrementadas de LBP-1 recombinante fría
(6-31 \muM). Se prepararon las muestras de ensayo
de ACE y el gel tal como se ha descrito en el presente documento. La
LBP-1 fría inhibió la unión de la
LBP-1 radiomarcada a la LDL de un modo dependiente
de la concentración, la LBP-2 fría inhibió la unión
de la LBP-2 radiomarcada a la LDL de un modo
dependiente de la concentración, y la LBP-3 fría
inhibió la unión de la LBP-3 radiomarcada a la LDL
de un modo dependiente de la concentración.
La LBP-2 de conejo y humana
contiene una larga extensión de aminoácidos de tipo ácido en la
terminal amino (residuos aminoácidos 105 a 132 de la
LBP-2 de conejo y residuos aminoácidos 8 a 33 de la
LBP-2 humana). Se ensayó la posibilidad de que este
segmento de la LBP-2 fuera el dominio de unión de la
LDL por subclonación de dos clones LBP-2 de conejo
que difieren entre sí por la presencia o ausencia de esta región
ácida (clon 26 y clon 45, respectivamente) en los vectores de
expresión, por métodos estándar conocidos por los expertos en la
materia. A continuación se llevaron a cabo los ensayos de ACE con el
fin de valorar la afinidad y la especificidad de la unión de estos
dos clones a la LDL. La LDL retardó el clon 26 derivado de la
migración de la LBP-2 radiomarcada a través del gel
de un modo dependiente de la concentración, y saturable, mientras
que no se retardó la migración de la LBP-2
radiomarcada derivada del clon 45.
Se llevaron a cabo los estudios de competición
utilizando concentraciones fijadas de LDL fría y clon 26 derivado de
la LBP-2 radiomarcada y concentraciones
incrementadas de LBP-2 recombinante frío/clon 26 y
LBP-2/clon 45. El clon 26 frío derivado de la
LBP-2 inhibió la unión del clon 26 derivado de la
unión de la LBP-2 radiomarcada a la LDL de un modo
dependiente de la concentración. Por el contrario, el clon 25
derivado de la LBP-2 no afectó la unión del clon 26
derivado de la LBP-2 radiomarcada a la LDL. Estos
resultados indican que la larga extensión de aminoácidos de tipo
ácido contiene un dominio de unión de la LBP-2 a la
LDL.
Este ejemplo ilustra que la unión entre la
LBP-1 o la LBP-2 y la LDL es
inhibida por el ácido poliglutámico o la BHF-1. Se
ensayó la capacidad de un tercer componente de inhibir la unión
entre dos proteínas que previamente mostraron interacción mediante
una modificación de los ensayos de ACE descritos en el Ejemplo 8. Se
añadió un tercer compuesto a la parte superior de los pocillos junto
con la proteína radiomarcada. Si el tercer compuesto inhibía la
unión, la proteína radiomarcada correría a través del gel. Si el
tercer compuesto no inhibía la unión, la migración de la proteína
radiomarcada sería retardada por la proteína molde en el gel.
Se mostró la inhibición de la unión de la
LBP-1/LDL o LBP-2/LDL por el ácido
poliglutámico (peso molecular promedio de aproximadamente 7500,
correspondiente a aproximadamente 7 monómeros) por reparto de una
cantidad constantes de LDL (148 nM) en todas los carriles
rectangulares. Se cargó una cantidad constante (1 \mul) de
LBP-1 o de LBP-2 marcada con
I^{125} (0,003 nM-0,016 nM) en los pocillos en la
parte superior del gel, junto con concentraciones incrementadas de
ácido poliglutámico (obtenido de Sigma) (0-0,4 nM).
Se sometió el gel a electroforesis a 70 voltios durante 2 horas, se
secó y se colocó en una película de rayos X, con pantallas
intensificantes, durante toda la noche a -70ºC antes de que se
desarrollara la película para determinar el perfil de retardo de la
LBP-1 y la LBP-2. A medida que se
incrementaron las concentraciones de ácido poliglutámico, disminuía
el retardo de la migración de la LBP-1 y la
LBP-2 por la LDL de un modo dependiente de la
concentración, que mostró que el ácido poliglutámico inhibió la
unión entre la LBP-1, la LBP-2 y la
LDL.
Se mostró la inhibición de la unión de la
LBP-1/LDL por la BHF-1 por reparto
de una cantidad constante de LDL (148 nM) en todos los carriles
rectangulares. Se cargó una cantidad constante de
LBP-1 marcada con I^{125} (0,003
nM-0,016 nM) en los pocillos en la parte superior
del gel, junto con concentraciones incrementadas de
BHF-1 (0-10 nM), obtenida tal como
se ha descrito en el Ejemplo 15. Se sometió el gel a electroforesis
a 70 voltios durante 2 horas, se secó y se colocó en una película de
rayos X, con pantallas intensificantes, durante toda la noche a
-70ºC. A continuación se desarrolló la película para determinar el
perfil de retardo de la LBP-1 marcada con I^{125}.
A medida que se incrementó la concentración de
BHF-1, disminuyó el retardo de la
LBP-1 por la LDL de un modo dependiente de la
concentración, lo cual demostró que la BHF-1 inhibió
la unión entre la LBP-1 y la LDL.
Este ejemplo ilustra un método para la
identificación de fragmentos, análogos o miméticos de LBPs que se
unen a la LDL, y que de este modo pueden ser utilizados como
inhibidores de la unión de la LDL a la LBP en las paredes
arteriales, por ocupación de los sitios de unión en moléculas de
LDL, con lo que estos sitios se hacen inasequibles para la unión de
la LBP en la pared arterial.
Se generaron fragmentos de la LBPs por rotura
química o se sintetizaron a partir de secuencias conocidas de
aminoácidos. Las muestras de estos fragmentos se añadieron (frío) de
forma individual a la LBP radiomarcada tal como se ha descrito en
el Ejemplo 8, para valorar la potencia inhibitoria de los diferentes
fragmentos. Mediante la aplicación iterativa de este procedimiento
en porciones progresivamente menores de fragmentos identificados
como inhibitorios, se identificó el fragmento o fragmentos de
polipéptido activo más pequeños. De un modo similar, se ensayaron
los análogos de las LBPs para identificar análogos que puedan actuar
como inhibidores por unión a la LDL. Y, de forma similar, se
ensayaron los miméticos de la LBP (moléculas que se parecen en la
conformación y/en las distribuciones de carga de los sitios de unión
de la LDL en las moléculas de LBP) en un modo similar para
identificar moléculas que muestren afinidades para los sitios de
unión de la LDL en la LBP.
Las afinidades de los inhibidores así
identificados son al menos tan fuertes como la afinidad de la propia
LDL para los sitios de unión de la LDL en la LBP. Los inhibidores
se unen al menos de forma competitiva, y algunos también de forma
irreversible e preferencial, a los sitios de unión de la LDL, con lo
que se hace que dichos sitios sean inaccesibles para la unión de la
LDL humoral.
Este ejemplo ilustra el uso de un ensayo de
placa ELISA para la cuantificación de la capacidad de un compuesto
del ensayo para inhibir la unión de la LDL a una LBP específica.
El ensayo se llevó a cabo del modo siguiente: se
diluyó la LDL en 50 mM de Na_{2}HCO_{3}, pH 9,6/0,02% de
NaN_{3} y se añadió a los pocillos de una placa de 96 pocillos
(Placas de poliestireno EIA de Immuno Ware 96-Well
Reacti-Bind; Pierce (Rockford, IL)) para conseguir
una concentración final comprendida entre 0,1 y 1 \mug/pocillo. Se
incubaron las placas durante 6 horas a temperatura ambiente. Al
final del periodo de incubación, se lavaron los pocillos 3 veces con
solución salina tamponada con Tris, pH 7,4 (TBS), y se bloquearon
durante toda la noche con 200 \mul de albúmina de suero de bovino
al 1% (BSA) en TBS/0,02% de NaN_{3} (Sigma; St. Louis MO) a
temperatura ambiente. A continuación se incubaron los pocillos con
200 \mul de la proteína LBP (5-10 \mug/pocillo)
en TBS a concentraciones variables del compuesto de ensayo. Se
incubaron las placas durante 1 hora a temperatura ambiente. A
continuación se lavaron los pocillos tres veces con TBS y se
bloquearon durante 2 horas con 200 \mul de 1% BSA en TBS/0,02% de
NaN_{3}, a temperatura ambiente. Al final del periodo de
incubación, se lavaron los pocillos 3 veces con TBS y se añadieron a
los pocillos una dilución de 1:1000 (en TBS/0,05% de Tween 20) del
apropiado anticuerpo policlonal de la proteína
anti-LBP de cobaya, y se incubaron durante 1 hora a
temperatura ambiente. A continuación se lavaron los pocillos 3 veces
con TBS/0,05% de Tween 20; se añadió a cada pocillo una dilución
1:30.000 de conjugado de fosfatasa alcalina IgG de
anti-cobaya de cabra. Se incubaron las placas
durante 1 hora a temperatura ambiente. Los pocillos se lavaron 3
veces con TBS/0,05% de Tween 20 y se llevó a cabo una reacción
colorimétrica por adición a los pocillos de 200 ml de sustrato de
fosfato de p-nitrofenilo (Sigma; St. Louis MO). Se
dejó que la reacción procediera durante 30 min a temperatura
ambiente y se finalizó con 50 \mul de NaOH 3N. Se determinó la
absorbancia a 405 nm utilizando un lector de placas ELISA. Se
valoró la efectividad del compuesto de ensayo en bloquear la unión
de la LDL a la proteína recombinante por comparación de los valores
de absorbancia de los grupos tratados con el grupo
control.
control.
De forma alternativa, las LBPs, mejor que la
LDL, se unieron a la placa. Se determinó la unión de la proteína de
la LBP recombinante a la LDL y el efecto de variar la concentración
del inhibidor en la unión LBP-LDL mediante el uso de
anticuerpos contra la LDL. Esta interacción fue visualizada a través
del uso de un conjugado de un anticuerpo secundario a una enzima
reportera (por ej., la fosfatasa alcalina).
Se utilizaron ensayos de placas ELISA para
seleccionar agentes que pueden afectar la unión de las proteínas de
la LBP a la LDL. Por ejemplo, se sintetizaron los péptidos derivados
de las secuencias de proteína LBP-1 y
LBP-3 humana (BHF-1 y
BHF-2, respectivamente) y se ha demostrado que
reducen la unión de la LDL a la LBP-1 y
LBP-2 recombinante en este formato. Estos resultados
estuvieron de acuerdo con los obtenidos con los ensayos de
ACE.
ACE.
Este ejemplo ilustra la administración a
pacientes de anticuerpos humanizados contra la
LBP-1, LBP-2 o LBP-3
para bloquear los sitios de unión de la LDL en las moléculas de la
LBP arterial. Los anticuerpos monoclonales de ratón son humanizados
por técnicas de DNA recombinante y producidas por procedimientos
estándar conocidos por los expertos en la materia (I. Berkower,
Curr. Opin. Biotechnol. 7: 622-628 (1996);
Ramharayan y Skaletsky, Am. Biotechnol. Lab. 13:
26-28 (1995)) contra las LBPs y/o los sitios de
unión de la LDL en las LBPs. También se producen los fragmentos Fab,
tal como se ha descrito en J. W. Goding, Monoclonal Antibodies:
Principles and Practice, Academic Press, New York, NY (1986). Estos
anticuerpos son administrados de forma parenteral en cantidad
suficiente como para bloquear los sitios de unión de la LDL en las
moléculas de LBP, es decir, 1-10 mg/kg diariamente.
Esto evita la captación arterial irreversible de LDL que se requiere
para facilitar la oxidación de la LDL.
Este ejemplo ilustra la preparación de LDL. La
LDL se preparó a partir del plasma de donantes normolipémicos
(Chang y col., Arterioscler. Thromb. 12: 1088-1098
(1992)). Se colocaron 100 ml de sangre completa en tubos
conteniendo 100 mM de EDTA disódico. Se separó el plasma de los
glóbulos rojos por centrifugación de baja velocidad (2.000 g; 30
min; 4ºC). Se ajustó la densidad del plasma a 1,025 gm/ml con una
solución de KBr y se centrifugó durante 18-20
horas, 100.000 x g, 12ºC. se separaron las lipoproteínas de muy baja
densidad (VLDL) de la parte superior de los tubos de centrífuga con
una pipeta Pasteur. Se aumentó la densidad de la parte inferior
hasta 1,050 gm/ml con una solución de KBr y se centrifugó durante
22-24 horas, 100.000 x g, 12ºC. Se eliminó la LDL
de las partes superiores de los tubos de centrífuga con la punta de
una pipeta Pasteur. Se determinó la pureza de la preparación de la
LDL por una doble inmunodifusión de Ouchterlony contra anticuerpos
para la LDL humana, la HDL humana, las inmunoglobulinas humanas, y
la albúmina humana. Se separó el KBr de la solución de LDL por
diálisis (1L, x 2, \approx 16 horas) contra solución salina del
0,9%, pH 9,0, conteniendo 1mM de EDTA y 10 \muM de hidroxitolueno
butilado (BHT), este último para prevenir la oxidación de la LDL.
Después de la diálisis, se midió la proteína de la LDL por el método
de Lowry (Lowry y col., J. Biol. Chem. 193: 265-275
(1951)), y se almacenó la LDL a 4ºC hasta su uso. Se mantuvieron las
preparaciones de LDL durante no más de 4-6
semanas.
Este ejemplo ilustra la preparación de la HDL.
Se preparó la HDL a partir del plasma de donantes normolipémicos. Se
colocaron 100 ml de sangre completa en tubos conteniendo 100 mM de
EDTA disódico y se recogió el plasma por centrifugación (2000 g; 30
min; 4ºC). A continuación se precipitó la apolipoproteína B
conteniendo lipoproteínas presentes en el plasma por la adición
secuencial de heparina sódica (5.000 unidades/ml) y MnCl_{2} (1M)
para conseguir una concentración final de 200 unidades/ml y 0,46 M
respectivamente (Warnick y Albers, J. Lipid Res. 19:
65-76 (1978)). A continuación se centrifugaron las
muestras (2000 g; 1 hora; 4ºC). Se recogió el sobrenadante y se
ajustó la densidad a 1,21 g/ml mediante la adición lenta de KBr
sólido. Se separó la HDL por ultracentrifugación (100.000 g; > 46
horas; 12ºC). Se valoró la pureza de la preparación de HDL por medio
del ensayo de inmunodifusión doble de Ouchterlony utilizando
anticuerpos contra la LDL humana, la LDL humana, inmunoglobulinas
humanas, y albúmina humana. Se dializaron las muestras de HDL contra
solución salina pH 9,0/1 mM de EDTA/10 \muM de BHT (4L; 24
horas/4ºC) y se determinó la proteína total por el ensayo de
proteína de Lowry (Lowry y col.; J. Biol. Chem. 193:
265-275 (1951)). Se guardó la HDL a 4ºC hasta su
uso. Se mantuvieron las preparaciones de HDL durante no más de 2
semanas.
Este ejemplo ilustra la síntesis de la
BHF-1, un fragmento de la LBP-1 de
conejo o humana que contiene los residuos de aminoácidos 14 a 33. Se
sintetizó la BHF-1 utilizando un sintetizador de
péptidos de Applied Biosystems Modelo 430A con ciclos de química de
T-Boc NMP estándar. La secuencia de la
BHF-1 es la siguiente:
val-asp-val-asp-glu-tyr-asp-glu-asn-lys-phe-val-asp-glu-glu-asp-gly-gly-asp-gly
(SEC ID NO: 9)
Después de la síntesis, se rompió el péptido con
ácido fluorhídrico/anisol (10/1 v/v) durante 30 min a 10ºC y a
continuación se incubó durante 30 min a 0ºC. A continuación se
precipitó la BHF-1 y se lavó tres veces con éter
dietílico frío. Se monitorizó el acoplamiento de aminoácidos con el
ensayo de ninhidrina (> 99%).
Se purificó el péptido BHF-1
hasta homogeneidad por cromatografía líquida de alta resolución en
una columna Vydac C_{4} de fase reversa (2,24 X 25 cm) utilizando
una separación de gradiente lineal (2-98% B en 60
min) con un flujo de 9 ml/min. El tampón A consistió en ácido
trifluoroacético (TFA) al 0,1%/agua Milli Q y Tampón B preparado con
0,085% de TFA/80% de acetonitrilo. El gradiente se realizó a
temperatura ambiente y la absorbancia se monitorizó a 210 y 277
nm.
La espectrometría de masas por bombardeo atómico
rápido dio un pico del ión molecular protonado (M + H)^{+}
a m/z = 2290,2, en concordancia con el valor calculado. Los valores
experimentales del análisis de aminoácidos para la abundancia
relativa de cada aminoácido en el péptido estuvieron de acuerdo con
los valores teóricos. Se guardó el péptido liofilizado a -20ºC.
Este ejemplo ilustra la selección in
vitro de agentes que inhiben la unión entre la LDL y LBPs.
Se selecciona un polipéptido candidato para ser
un agente, por ej., LBP-1, LBP-2,
LBP-3, BHF-1 o cualquier otro
polipéptido. Se determinó el fragmento más corto del polipéptido que
inhibe la unión de la LDL a las LBPs in vitro. Se
sintetizaron los péptidos por técnicas estándar descritas en la
presente invención. Se llevaron a cabo los ensayos de inhibición
utilizando técnicas ELISA estándar para selección, y ensayos de
coelectroforesis de afinidad (ACE) para confirmar los resultados
del ELISA, tal como se describe en la presente invención. Se
construyen péptidos cortos, por ej., a partir de dímeros hasta
20-meros por medio de secuencias del polipéptido
candidato cuyas características químicas los hacen probables sitios
de unión de la LDL, por ej., regiones ácidas. Se valoró la
capacidad de longitudes más cortas de los péptidos para inhibir la
unión de la LDL in vitro a las células de mamíferos en
cultivos. Por ejemplo, se ensayó el efecto del péptido en la
inhibición de la unión a la LDL en células de mamífero
transfectadas para expresar un gen de la LBP. Se ensayó cada uno de
los péptidos así identificado como un inhibidor con cada uno de las
LBP-1, LBP-2 y
LBP-3, para determinar si un inhibidor único
funciona contra las tres LBPs.
Una vez determinada la secuencia activa mínima,
se modificó el esqueleto del péptido para inhibir la proteolisis,
tal como se ha discutido en la presente invención. Por ejemplo, se
consiguió la modificación por sustitución de un sulfóxido del
carbonilo, por reversión del enlace péptídico, por sustitución de un
metileno por el grupo carbonilo, o por otra metodología estándar
similar. Ver A. F. Spatola, "Peptide Backbone
Modifications: A Structure-Activity Analysis of
Peptides Containing Amide Bond Surrogates, Conformational
Constrains, and Related Backbone Replacements", en Chemistry and
Biochemistry of Amino Acids, Peptides and Proteins, Vol. 7, págs.
267-357, B. Weinstein (ed), Marcelo Dekker, Inc.,
New York (1983). Se ensayó la capacidad de estos análogos para
inhibir la unión de la LDL a las LBPs in vitro mediante
ensayos ELISA y ACE de un modo similar al descrito anteriormente
para los péptidos naturales.
Este ejemplo ilustra la selección de agentes
in vitro de base celular, de agentes que han mostrado, por
ensayos in vitro tales como el ensayo ACE y ELISA, que son
potenciales inhibidores de la unión entre la LDL y las LBPs.
Se utilizan células de mamíferos, tales como las
células 293, que son utilizadas comúnmente para la expresión de las
construcciones de genes recombinantes, para desarrollar líneas
celulares que expresen las LBPs en la superficie de la célula. Esto
se lleva a cabo por subclonación de los marcos de lectura abiertos
de la LBP (ORFs) en un vector del plásmido de expresión de mamífero,
pDisplay (Invitrogen, Carlsbad, CA), que es designado para expresar
el gen de interés en la superficie de la célula. El uso de células
de mamífero para producir las LBPs permite su expresión en una
conformación originaria, funcionalmente activa. Por consiguiente,
las líneas celulares de mamífero transfectadas de forma estable,
con expresión de superficie de LBPs de forma individual, o en
combinación, son particularmente adecuadas para ensayar y
seleccionar inhibidores que bloquean la unión de la LDL en el
cultivo celular, así como para evaluar la citotoxicidad de estos
compuestos.
De forma específica, las ORFs de la LBP son
amplificadas por PCR (Perkin Elmer, Foster City, CA) a partir de
moldes de cDNA utilizando polimerasa Taq (Perkin Elmer) y prímeros
apropiados. Se purifican los ORPs de la LBP por electroforesis en
gel de agarosa y se extraen de tiras de gel con el kit de
purificación de DNA Bio-Rad
(Bio-Rad, Hercules, CA). A continuación se cortan
los DNAs purificados con las enzimas de restricción Bgl II y Sal I
(New England Biolabs, Beverly, MA) para generar terminaciones
cohesivas, y se purifican de nuevo por electroforesis en gel de
agarosa y extracción del DNA tal como se ha descrito anteriormente.
A continuación se subclonaron los ORFs de la LBP en los sitios Bgl
II/Sal I en el vector de expresión del mamífero, por ligamiento
pDisplay (Invitrogen). Se establecieron los plásmidos recombinantes
por transformación en cepas de E. coli TOP10 (Invitrogen) o
DH5\alpha (Life Technologies, Grand Island, NY). Se aisló el DNA
de plásmido de la LBP/pDisplay recombinante a partir de cultivos de
E. coli con el kit Bio-Rad Plasmad Miniprep,
se cortó con Bgl II/Sal I, y se analizó por electroforesis sobre
gel de agarosa. Los ORFs de la LBP se transformaron de forma
exitosa en clones tal como se verificó por secuenciación de dideoxi
DNA automatizada. Para transfectar las células 293 de riñón, se
mezclaron 1-2 \mug de DNA con 6 \mul del
reactivo lipofectamina (Life Technologies) y se incubó con las
células tal como se ha descrito en el protocolo de Life
Technologies. Se confirmó la expresión de la LBP en células
transfectadas por análisis de manchas Western de extractos celulares
obtenidos 48 horas después de la transfección. Para seleccionar
células 293 transfectadas de forma estable, se añadió el antibiótico
G418 (Life Technologies) al medio de crecimiento a una
concentración de 800 \mug/ml. Se ensayaron las colonias
resistentes a G418 para la expresión de la LBP recombinante por
manchas Western, y se expandieron las LBPs que expresan los clones
recombinantes, se ensayaron para la unión a la LDL y se utilizaron
para compuestos de ensayos por su capacidad para inhibir la unión
de la LDL.
Este ejemplo ilustra la selección in vivo
de agentes que han demostrado en ensayos in vitro que son
inhibidores prometedores candidatos de la unión entre la LDL y las
LBPs.
Se ensaya en primer lugar la actividad
inhibitoria in vivo en el modelo de daño arterial en aorta de
conejo deendotelializada con un catéter globo (Roberts y col., J.
Lipid Res. 24: 1160-1167 (1983); Chang y col.,
Arterioscler. Thomb. 12: 1088-1098 (1992)). Este
modelo ha demostrado ser un excelente análogo para las lesiones
arteroscleróticas humanas. Se ensayó cada inhibidor candidato en
cinco a diez conejos hinchados, mientras que un número igual de
conejos recibió un péptido control, o placebo. Cuatro semanas
después de la deendotelialización aórtica, cuando la
reendotelialización (cicatrización) es parcialmente completa, se
empezó la administración parenteral diaria (intravenosa o
subcutánea) o intragástrica de los péptidos y de los análogos a una
concentración inicial de 10 mg/kg de peso corporal, la cual varió
por encima o por debajo de 100 mg/kg dependiendo de los resultados.
Después de 30 min, se administró la LDL marcada con I^{125} (o
Tc^{99m}) inyectada de forma intravenosa como un bolus, para
ensayar la capacidad del inhibidor candidato en estudios a corto
término para inhibir el secuestro de la LDL en lesiones arteriales
cicatrizantes. En los casos en que se utilizó la
LDL-I^{125}, los animales se sacrificaron entre
8-24 horas más tarde, se extirparon las aortas, se
lavaron y se expusieron a autoradiografía cuantitativa de aortas
extirpadas, tal como se ha descrito previamente (Roberts y col., J.
Lipid Res. 24: 1160-1167 (1983); Chang y col.,
Arterioscler. Thromb. 12: 1088-1098 (1992)). Cuando
se utilizó la LDL-Tc^{99m} el análisis es por
toma de imágenes por cámara gamma externa del animal vivo
anestesiado a las 2-24 horas, tal como se ha
descrito previamente (Lees y Lees, Síndromes of Atherosclerosis, en
Fuster, ed., Futura Publishing Co., Armonk, NY, págs.
385-401 (1996)), seguido por sacrificio, escisión y
toma de imágenes de la aorta escindida. Inmediatamente antes del
final del ensayo, los animales se someten a ensayos de toxicidad
estándar, incluyendo CBC, enzimas del hígado, y análisis de
orina.
Los compuestos que son más efectivos y menos
tóxicos son ensayados a continuación en estudios a corto plazo en
conejos alimentados con una dieta de colesterol al 2% (Schwenke y
Carew, Arteriosclerosis 9: 895-907 (1989)). Se
ensayó cada inhibidor candidato en cinco a diez conejos, mientras
que un número igual de conejos recibió un péptido control, o
placebo. Los animales recibieron una o más dosis por día del
inhibidor candidato, o del placebo, durante hasta dos semanas. La
frecuencia de dosis diaria se determinó por la vía de
administración. En los casos en que el fármaco activo o el placebo
se administraron de forma parenteral, éstos se dieron
1-3 veces al día y se continuó con la dieta de
colesterol al 2%. En los casos en los que el fármaco o el placebo se
administraron de forma oral, éstos se mezclaron con la dieta de
colesterol al 2%. Schwenke y Carew (Arteriosclerosis 9:
895-907 (1989)) han mostrado que la concentración de
la LDL en las áreas propensas a lesiones de la aorta de conejo se
incrementa hasta 22 veces por encima de lo normal en conejos
alimentados con una dieta de colesterol al 2% durante 16 días, y que
el contenido de LDL incrementado precede la evidencia histológica de
arterosclerosis temprana. Por consiguiente, se ensayó el análisis
del efecto de los inhibidores candidatos dos semanas después del
inicio de la alimentación de colesterol por inyección de
LDL-I^{125}, permitiendo que éstos circularan
durante 8-24 horas, y a continuación realizando una
autoradiografía cuantitativa en las aortas extirpadas tanto de los
animales de ensayo como de los animales control. En el caso en que
fuera apropiado, también se llevó a cabo la cuantificación del
contenido de colesterol aórtico (Schwenke y Carew, Arteriosclerosis
9: 895-907 (1989); Schwenke y Carew,
Arteriosclerosis 9: 908-918 (1989).
Los procedimientos anteriores identificaron la
mayoría de los inhibidores candidatos prometedores, así como la
mejor vía y frecuencia para su administración. Los inhibidores así
identificados son ensayados a continuación en estudios a largo
término de alimentación con colesterol. Estos tests se realizan de
la misma manera que los estudios a corto término de alimentación con
colesterol, excepto para la efectividad del inhibidor que es
ensayada por inyección de la LDL-I^{125} a
intervalos mayores después de la iniciación de la alimentación con
colesterol, y las áreas propensas a lesiones de la aorta que son
examinadas histológicamente para determinar la evidencia de
arterosclerosis. Los tiempos de ensayo son de dos, cuatro y seis
meses. Las arterias principales son extremadamente e
histológicamente examinadas para determinar la evidencia y la
extensión de la arterosclerosis. En los casos en que sea necesario,
se ensayaron otros modelos aceptados de animales, tales como los
primates susceptibles de arterosclerosis (Williams y col.,
Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 15: 827-836 (1995)
y/o los conejos Watanabe se ensayaron con alimentación con
colesterol a corto y largo término.
Este ejemplo ilustra el efecto que la inducción
de inmunidad contra la proteína LBP tiene en la acumulación de la
LDL radiomarcada en el modelo de arterosclerosis de aorta de conejo
deendotelializada hinchada.
Se indujo inmunidad en conejos machos New
Zealand White (Hazelton Research Products, Denver, PA) del modo
siguiente: Se inyectó de forma subcutánea una mezcla de
LBP-2 recombinante humana purificada o de péptido
BHF-1 (1 ml; 1 mg) y RIBI adyuvante (RIBI
InmunoChem Research, Inc., Hamilton, MT) en 2-5
sitios a lo largo de las regiones torácica dorsal y abdominal de
los conejos. Se recogió la sangre por punción en vena en los días 1
(sangría preinmune), 35, 63 y 91. Se administraron inyecciones
repetidas en los días 28 (500 \mug; SC), 56 (250 \mug; SC), y
84 (125 \mug; SC).
Se evaluó la valoración de los conejos por una
serie de diluciones utilizando un formato de placas ELISA. Se
evaluó el suero preinmune al mismo tiempo. Después de una tercera
repetición de proteína LBP o de péptido, la valoración alcanzó un
nivel máximo con una respuesta colorimétrica detectable en una placa
ELISA a 156 pg. La valoración es definida como la dilución máxima
del anticuerpo que genera una lectura de absorbancia de 0,5 por
encima del control en 30 min. Se demostró la especificidad de los
anticuerpos policlonales utilizando el análisis de manchas western
tal como se ha descrito en el Ejemplo 6.
En el día 93, se deendotelializó la aorta
abdominal de los conejos inmunizados y control utilizando un catéter
de embolectomía Fogarty del número 4 (Chang y col.,
Arteriosclerosis and Thrombosis 12: 1088-1098
(1992)). Cuatro semanas después del hinchamiento, los conejos
recibieron una inyección de bolus de LDL marcada con I^{125} (1
ml; i.v.). Se tomaron muestras de sangre a intervalos de 1 hora
durante 8 horas, y 24 horas después de la inyección. Se
centrifugaron las muestras de sangre durante 30 min a 2000 rpm
(40ºC) y se determinó la actividad total presente en el suero
utilizando un contador gamma. Se determinaron los valores del TCA
precipitable por adición de TCA al suero hasta una concentración
final del 10% seguida por incubación durante 10 min a 4ºC. A
continuación se centrifugaron las muestras de suero (2000 rpm; 30
min; 40ºC) y se determinó la actividad total presente en el
sobrenadante. Se calcularon los valores del TCA precipitable por
sustracción de los valores del total soluble menos los valores
presentes en el sobrenadante después de la precipitación del TCA. Se
recogieron las muestras de sangre para la determinación de las
valoraciones de anticuerpos antes de la inyección de la LDL
radiomarcada.
Después de 24 horas, se inyectó a los conejos de
forma intravenosa colorante azul de Evan al 5% y se dejó circular
durante 15 min. Las áreas de la aorta en las que está ausente la
cubierta endotelial se tiñeron de azul mientras que las áreas
cubiertas por endotelio permanecieron sin teñir. Al final del
periodo de incubación, los conejos fueron eutanizados y se
diseccionaron la aorta abdominal y torácica, se enjuagaron, y se
fijaron durante toda la noche en TCA al 10% a temperatura ambiente.
Se enjuagaron las aortas de forma exhaustiva con solución salina
fisiológica, se pesaron, se contabilizaron, se secaron y se
colocaron en una película de rayos X con el fin de visualizar el
modelo de acumulación de LDL radiomarcada en la aorta abdominal de
conejo deendotelializada.
La inmunización de conejos contra la
LBP-2 o el péptido BHF-1 humano
recombinante alteró el modelo de la acumulación de la LDL
radiomarcada en la aorta abdominal deendotelializada hinchada.
Cuando se corrigió la dosis, y el porcentaje de
reendotelialización, los conejos inmunizados hinchados tuvieron una
menor acumulación de LDL radiomarcada en comparación con los
conejos hinchados no inmunes. Estos resultados indican que la
inmunización activa contra la LBP proporciona un medio efectivo por
el que puede modificarse la acumulación de LDL en la pared arterial
dañada.
Se llevaron a cabo estudios en humanos de
acuerdo con los protocolos estándar de la FDA para ensayar la
seguridad de nuevos fármacos (Fase I), la eficacia (Fase II), y la
eficacia comparada con otros tratamientos (Fase III). Los sujetos
que participaron en los estudios después de dar su consentimiento
informado, tenían edades comprendidas entre los 18 y los 70 años.
Se excluyeron de los estudios las mujeres que estaban embarazadas, o
que era posible que estuvieran embarazadas, o los sujetos con
enfermedades diferentes de la arterosclerosis primaria, tales como
cáncer, enfermedades del hígado, o diabetes. Los sujetos
seleccionados para el estudio en los ensayos de Fase II y Fase III
tenían enfermedad de arterosclerosis previamente documentada por
técnicas estándar, tales como ultrasonidos y/o angiografía, o se
conocía que tenían riesgo de arterosclerosis en virtud de tener al
menos un primer grado relativo con arterosclerosis documentada. Los
sujetos en sí mismos tenían lípidos en plasma normales o anormales.
El ensayo inicial incluyó 20-50 sujetos con el
fármaco activo y 20-50 sujetos, seleccionados por
edad, sexo, y situación de arterosclerosis, con placebo. El número
de sujetos es predeterminado por el número necesario para tener
significación estadística. Los puntos finales de la eficacia
inhibitoria incluyen medidas de ultrasonidos del espesor de la
arteria carótida en sujetos con riesgo alto, así como en sujetos
con enfermedad de carótida o coronaria conocida; sucesos
arteroscleróticos; muertes arteroscleróticas; y todas las causas de
muerte en todos los sujetos. Se llevó a cabo el análisis no invasivo
(espesor de la arteria carótida por ultrasonidos) por Stadler (Med.
And Biol. 22: 25-34 (1996)) a intervalos de 6- a
12-meses durante 3 años. Se tabularon los sucesos y
muertes arteroscleróticas, así como todas las causas de muerte a
los 3 años.
La dosis oral de fármaco para los ensayos de
Fase I de la FDA osciló entre 0,01 y 10 gm/día, y se determinó por
los resultados de los estudios en animales, extrapolados en una base
por kg. En base a los datos obtenidos de los estudios en fase I, se
estrechó el intervalo de dosis y la frecuencia en los ensayos en
fase II y III. En los casos en que se determinó que la
administración parenteral de fármaco por estudios en animales como
el único método efectivo, se ensayó la administración parenteral por
inyección en sujetos humanos, así como por las vías transdérmicas y
de insuflación nasal. El ensayo para los fármacos parenterales
siguió el mismo modelo que el seguido para la administración
oral.
De este modo se estableció el régimen de
tratamiento y de dosificación óptimo para humanos.
Este ejemplo ilustra un método de tratamiento de
un individuo que tiene arterosclerosis con un fragmento de la LBP,
por ej., BHF-1, de modo que disminuyan los niveles
de LDL unida de forma arterial en el individuo. Se obtuvo el
BHF-1 tal como se ha descrito en la presente
invención. Se administró el BHF-1 al mamífero de
forma intravenosa como un bolus o como una inyección a una
concentración de 0,5-10 mg/kg de peso corporal.
Dichas administraciones se repitieron indefinidamente con el fin de
prevenir el desarrollo o la progresión de la arterosclerosis
sintomática, tal como se hace actualmente con los fármacos que
disminuyen el colesterol. Se examinaron sujetos estables dos veces
al año para evaluar la extensión de cualquier enfermedad
arterosclerótica por examen físico y estudios no invasivos, tales
como espesor de la arteria carótida, ultrasonidos, y/o imágenes de
cámara gamma de las arterias mayores, para determinar si están
presentes lesiones arteroscleróticas, y, en el caso en que
estuvieran previamente presente, determinar si han progresado o
disminuido. Dicho régimen da lugar al tratamiento de la
arterosclerosis.
Los expertos en la materia serán capaces de
encontrar muchos equivalentes de las realizaciones específicas de la
invención descrita en el presente documento sin necesidad de
utilizar más experimentación de rutina. Se pretende que todos estos
otros equivalentes estén incluidos por las siguientes
reivindicaciones.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Ann M. Lees
\hskip3.88cmRobert S. Lees
\hskip3.88cmSimon W. Law
\hskip3.88cmAnibal A. Arjona
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: NUEVAS PROTEÍNAS DE UNIÓN A LIPOPROTEÍNAS DE BAJA DENSIDAD Y SU USO EN DIAGNÓSTICO Y TRATAMIENTO DE LA ARTEROESCLEROSIS
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 42
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Banner & Witcoff, Ltd.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: One Financial Center
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Boston
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Estado. MA
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- País: USA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- ZIP: 02111
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO MEDIO: Floppy disk
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: compatible con PC de IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release #1.0, Versión # 1.30 y WordPerfect 6.1
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA PRESENTE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: No disponible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 26 de Noviembre de 1997
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN: No disponible
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- INFORMACIÓN DEL AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Helen Greer
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 36.816
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/SUMARIO: 3983/59819
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 617-345-9100
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 617-345-9111
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 151 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 317 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 232 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 252 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 557 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 151 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 217 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 530 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Asp Val Asp Glu Tyr Asp Glu Asn Lys Phe
Val Asp Glu Glu Asp}
\sac{Gly Gly Asp Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1404 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1617 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1362 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1422 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4722 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1928 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1207 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4697 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 60 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Glu Glu Glu Asp Asp Asp Glu Asp Glu Asp
Glu Glu Asp Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Glu Glu Glu Asp Asp Asp Glu Asp Glu Asp
Glu Glu Asp Asp Val}
\sac{Ser Glu Gly Ser Glu Val Pro Glu Ser
Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 11 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Ser Glu Gly Ser Glu Val Pro Glu Ser
Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Asp Asp Asp Pro Asp Gly Phe Leu
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Asp Val Asp Glu Tyr Asp Glu Asn Lys Phe
Val Asp Glu Glu Asp}
\sac{Gly Gly Asp Gly Gln Ala Gly Pro Asp Glu
Gly Glu Val Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Glu Gly Glu Val Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 16 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Asp Asp Glu
Asp Asp Asp Asp Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Asp Asp Glu
Asp Asp Asp Asp Asp}
\sac{Val Val Ser Glu Gly Ser Glu Val Pro Glu
Ser Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 12 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Val Ser Glu Gly Ser Glu Val Pro Glu Ser
Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.500000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Pro Pro Gly Lys Pro Ala Leu Pro Glu
Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Asp Gly Val Gln Gly Glu Pro Pro Glu Pro
Glu Asp Ala Glu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 45 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 30:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 31:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 78 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 31:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 32:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 32:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 33:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 33:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 34:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 90 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 34:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 35:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 35:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 36:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 48 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 36:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 37:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 84 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 37:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 38:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 38:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 39:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 39:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 40:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 45 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 40:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 41:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 7 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 41:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Asp Val Ser Glu Glu Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 42:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 42:
Claims (97)
1. Un polinucleótido aislado que comprende una
secuencia de nucleótidos que codifica para un polipéptido que
comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada dentro del grupo
constituido por:
una secuencia de aminoácidos que se une a una
lipoproteína de baja densidad (LDL) y que es al menos idéntica en un
80% a la secuencia de SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 5, SEC
ID NO: 6, SEC ID NO: 7, o SEC ID NO: 8;
una secuencia de aminoácidos que se une a una
LDL y que comprende la secuencia de SEC ID NO: 9, SEC ID NO: 19, SEC
ID NO: 20, SEC ID NO: 21, SEC ID NO: 23, o SEC ID NO: 29;
una secuencia de aminoácidos que se une a une
LDL y que es idéntica a un fragmento de al menos 20 residuos de
aminoácidos de SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 5, SEC ID NO:
6, SEC ID NO: 7, o SEC ID NO: 8; y
una secuencia de aminoácidos que se une a una
LDL, en la que la secuencia de nucleótidos se hibrida de forma
específica a SEC ID NO: 10, SEC ID NO: 11, SEC ID NO: 14, SEC ID NO:
15, SEC ID NO: 16, o SEC ID NO: 17.
2. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un
90% a la secuencia de SEC ID NO: 1 o SEC ID NO: 6.
3. El Polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un
95% a la secuencia de SEC ID NO: 1 o SEC ID NO: 6.
4. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un
90% a la secuencia de SEC ID NO: 2 o SEC ID NO: 7.
5. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un
95% a la secuencia de SEC ID NO: 2 o SEC ID NO: 7.
6. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un
90% a la secuencia de SEC ID NO: 5 o SEC ID NO: 8.
7. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un
95% a la secuencia de SEC ID NO: 5 o SEC ID NO: 8.
8. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 1.
9. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 6.
10. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que el polipéptido consiste en la secuencia de SEC ID NO:
1.
11. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que el polipéptido consiste en la secuencia de SEC ID NO:
6.
12. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 2.
13. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 7.
14. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 5.
15. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 8.
16. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que el polipéptido consiste en la secuencia de SEC ID NO:
5.
17. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 9, SEC ID NO: 19, SEC ID NO: 20, SEC ID NO: 21, SEC ID NO:
23, o SEC ID NO: 29.
18. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos es idéntica a un fragmento de
al menos 30 residuos de aminoácidos de SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2,
SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC ID NO: 7, o SEC ID NO: 8.
19. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de aminoácidos es idéntica a un fragmento de
al menos 100 residuos de aminoácidos de SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2,
SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC ID NO: 7, o SEC ID NO: 8.
20. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de nucleótidos es al menos idéntica en un 80%
a la secuencia de nucleótidos de SEC ID NO: 10, SEC ID NO: 11, SEC
ID NO: 14, SEC ID NO: 15, SEC ID NO: 16, o SEC ID NO: 17.
21. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de nucleótidos es al menos idéntica en un 95%
a la secuencia de nucleótidos de SEC ID NO: 10, SEC ID NO: 11, SEC
ID NO: 14, SEC ID NO: 15, SEC ID NO: 16, o SEC ID NO: 17.
22. El polinucleótido según la reivindicación 1,
en el que la secuencia de nucleótidos comprende SEC ID NO: 10, SEC
ID NO: 11, SEC ID NO: 14, SEC ID NO: 15, SEC ID NO: 16, o SEC ID NO:
17.
23. Un vector recombinante que comprende el
polinucleótido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 22.
24. Una célula que comprende el vector
recombinante según la reivindicación 23.
25. Un método de producción de un polipéptido,
que comprende el cultivo de una célula según la reivindicación 24 en
condiciones que permitan una expresión del polipéptido.
26. Un polipéptido aislado que comprende una
secuencia de aminoácidos seleccionada dentro del grupo constituido
por:
una secuencia de aminoácidos que se une a una
LDL y que es al menos idéntica en un 80% a la secuencia de SEC ID
NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC ID NO: 7, o SEC
ID NO: 8;
una secuencia de aminoácidos que se une a una
LDL y comprende la secuencia de SEC ID NO: 9, SEC ID NO: 19, SEC ID
NO: 20, SEC ID NO: 21, SEC ID NO: 23, o SEC ID NO: 29; y
una secuencia de aminoácidos que se une a una
LDL y que es idéntica a un fragmento de al menos 20 residuos de
aminoácidos de SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 5, SEC ID NO:
6, SEC ID NO: 7, o SEC ID NO: 8.
27. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un 90%
a la secuencia de SEC ID NO: 1 o SEC ID NO: 6.
28. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un 95%
a la secuencia de SEC ID NO: 1 o SEC ID NO: 6.
29. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un 90%
a la secuencia de SEC ID NO: 2 o SEC ID NO: 7.
30. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un 95%
a la secuencia de SEC ID NO: 2 o SEC ID NO: 7.
31. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un 90%
a la secuencia de SEC ID NO: 5 o SEC ID NO: 8.
32. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos es al menos idéntica en un 95%
a la secuencia de SEC ID NO: 5 o SEC ID NO: 8.
33. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 1.
34. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 6.
35. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que el polipéptido consiste en la secuencia de SEC ID NO:
1.
36. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que el polipéptido consiste en la secuencia de SEC ID NO:
6.
37. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 2.
38. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 7.
39. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 5.
40. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 8.
41.El polipéptido según la reivindicación 26, en
el que el polipéptido consiste en la secuencia de SEC ID NO: 5.
42. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos comprende la secuencia de SEC
ID NO: 9, SEC ID NO: 19, SEC ID NO: 20, SEC ID NO: 21, SEC ID NO:
23, o SEC ID NO: 29.
43. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos es idéntica a un fragmento de
al menos 30 residuos de aminoácidos de SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2,
SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC ID NO: 7, o SEC ID NO: 8.
44. El polipéptido según la reivindicación 26,
en el que la secuencia de aminoácidos es idéntica a un fragmento de
al menos 100 residuos de aminoácidos de SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2,
SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC ID NO: 7, o SEC ID NO: 8.
45. Un anticuerpo o fragmento del mismo que se
une de forma específica a un polipéptido consistente en la secuencia
de SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC ID
NO: 7, o SEC ID NO: 8.
46. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 45, que comprende un fragmento de un anticuerpo
seleccionado dentro del grupo constituido por un fragmento Fab, un
fragmento Fab' y un fragmento F(ab')_{2}.
47. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 45, que comprende un fragmento de anticuerpo
seleccionado dentro del grupo constituido por un fragmento
F(v), un monómero de cadena pesada, un dímero de cadena
pesada, un trímero de cadena pesada, un monómero de cadena ligera,
un dímero de cadena ligera, un trímero de cadena ligera y un dímero
consistente en una cadena pesada y en una cadena ligera.
48. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 45, que comprende un anticuerpo que es un anticuerpo
monoclonal.
49. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 45, en el que el anticuerpo o el fragmento del mismo
es un anticuerpo humanizado o un fragmento del mismo.
50. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 45, en el que el anticuerpo o el fragmento del mismo
es un anticuerpo quimérico o un fragmento del mismo.
51. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 50, en el que el anticuerpo quimérico o el fragmento
del mismo contiene una región constante derivada de un anticuerpo
humano y una región variable derivada de un anticuerpo de ratón.
52. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 45, en el que el anticuerpo o el fragmento del mismo
es un anticuerpo humano o un anticuerpo o un fragmento del
mismo.
53. El anticuerpo o fragmento del mismo según
cualquiera de las reivindicaciones 45 a 52, en el que el anticuerpo
o el fragmento del mismo bloquea la unión de la LDL al
polipéptido.
54. El anticuerpo o fragmento del mismo según
cualquiera de las reivindicaciones 45 a 53, en el que el anticuerpo
o el fragmento del mismo comprende un marcador.
55. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 54, en el que el marcador es un marcador
radioactivo.
56. El anticuerpo o fragmento del mismo según
cualquiera de las reivindicaciones 45 a 53, en el que el anticuerpo
o el fragmento del mismo comprende un ligando que se une al
tecnecio.
57. El anticuerpo o fragmento del mismo según
cualquiera de las reivindicaciones 45 a 53, en el que el anticuerpo
o el fragmento del mismo comprende un quelador que se une al
gadolinio.
58. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 57, en el que el quelador que se une al gadolinio es
el ácido dietilen triamino penta-acético (DTPA).
59. Una preparación de un anticuerpo policlonal
que se une de forma específica a un polipéptido constituido por las
secuencias de SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 5, SEC ID NO:
6, SEC ID NO: 7, o SEC ID NO: 8.
\newpage
60. La preparación según la reivindicación 59,
en la que los anticuerpos bloquean una unión de la LDL al
polipéptido.
61. Una composición farmacéutica que comprende
el anticuerpo o el fragmento del mismo según cualquiera de las
reivindicaciones 45 a 58 y un vehículo farmacéuticamente
aceptable.
62. Una línea celular que produce el anticuerpo
según la reivindicación 61.
63. La línea celular según la reivindicación 62,
en la que la línea celular es un hibridoma.
64. Un método para identificar un agente
candidato que modula el metabolismo o la estructura de la
LBP-1, LBP-2, o
LBP-3, cuyo procedimiento comprende:
la puesta en contacto in vitro de un
agente candidato y de un polipéptido LBP-1,
LBP-2, o LBP-3; y
la evaluación del efecto del agente candidato
sobre el metabolismo o la estructura de LBP-1,
LBP-2, o LBP-3.
65. El método según la reivindicación 64, en el
que el procedimiento comprende:
la puesta en contacto in vitro de un
polipéptido LBP-1, LBP-2, o
LBP-3, de una molécula que se une a
LBP-1, LBP-2, o
LBP-3 y de un agente candidato; y
la medición de la formación de un complejo que
contiene el polipéptido LBP-1,
LBP-2, o LBP-3, y la molécula que se
une a LBP-1, LBP-2, o
LBP-3, en la que una reducción en la formación del
complejo en presencia del agente candidato en comparación con la que
se produce en ausencia del agente candidato indica que el agente
candidato inhibe la unión de LBP-1,
LBP-2, o LBP-3 a la molécula que se
une a LBP-1, LBP-2, o
LBP-3.
66. El método según la reivindicación 64, en el
que el procedimiento comprende:
la medición de la unión del agente candidato al
polipéptido LBP-1, LBP-2, o
LBP-3, para identificar de este modo un agente
candidato que se une a un polipéptido LBP-1,
LBP-2, o LBP-3.
67. El método según cualquiera de las
reivindicaciones 64 a 66, en el que el polipéptido
LBP-1, LBP-2, o
LBP-3 comprende una secuencia de aminoácidos
seleccionada dentro del grupo constituido por:
una secuencia de aminoácidos que se une a una
LDL y que es al menos idéntica en un 80% a la secuencia de SEC ID
NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC ID NO: 7, o SEC
ID NO: 8;
una secuencia de aminoácidos que se une a una
LDL y que comprende la secuencia de SEC ID NO: 9, SEC ID NO: 19, SEC
ID NO: 20, SEC ID NO: 21, SEC ID NO: 23, o SEC ID NO: 29; y
una secuencia de aminoácidos que se une a una
LDL y es idéntica a un fragmento de al menos 20 residuos de
aminoácidos de SEC ID NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 5, SEC ID NO:
6, SEC ID NO: 7, o SEC ID NO: 8.
68. El método según la reivindicación 67, en el
que el polipéptido LBP-1, LBP-2, o
LBP-3 comprende una secuencia de aminoácidos que se
une a una LDL y es al menos idéntica en un 80% a la secuencia de SEC
ID NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC ID NO: 7, o
SEC ID NO: 8.
69. El método según la reivindicación 68, en el
que el polipéptido LBP-1, LBP-2, o
LBP-3 comprende la secuencia de aminoácidos de SEC
ID NO: 1, SEC ID NO: 2, SEC ID NO: 5, SEC ID NO: 6, SEC ID NO: 7, o
SEC ID NO: 8.
70. El método según cualquiera de las
reivindicaciones 64 a 69, en el que el agente candidato es un
fragmento, un análogo o un mimético de LBP-1,
LBP-2, o LBP-3.
71. El método según cualquiera de las
reivindicaciones 64 a 69, en el que el agente candidato es un ácido
nucleico, un anticuerpo, un metabolito, un glúcido, una
glicoproteína, un péptido, o una molécula mimética no peptídico.
72. El método según la reivindicación 65, en el
que la molécula que se une a LBP-1,
LBP-2, o LBP-3 es una LDL.
73. El método según la reivindicación 72, en el
que la LDL es una LDL originaria.
74. El método según la reivindicación 72, en el
que la LDL es una LDL modificada.
75. El método según la reivindicación 74, en el
que la LDL modificada es una LDL metilada o oxidada.
76. El método según la reivindicación 65, en el
que la molécula que se une a LBP-1,
LBP-2, o LBP-3 es un compuesto de la
matriz extracelular arterial.
77. El método según la reivindicación 76, en el
que el componente de la matriz extracelular arterial es un
proteoglicano.
78. El método según la reivindicación 64, en el
que el procedimiento comprende la evaluación del efecto del agente
candidato sobre la estructura primaria, secundaria o terciaria de
LBP-1, LBP-2, o
LBP-3.
79. El método según la reivindicación 64, en el
que el procedimiento comprende la evaluación del efecto del agente
candidato sobre el repliegue conformacional de
LBP-1, LBP-2, o
LBP-3.
80. El método según la reivindicación 64, en el
que el procedimiento comprende la evaluación del efecto del agente
candidato sobre la expresión de LBP-1,
LBP-2, o LBP-3.
81. El método según la reivindicación 64, en el
que el procedimiento comprende la evaluación del efecto del agente
candidato sobre la liberación de LBP-1,
LBP-2, o LBP-3.
82. El método según la reivindicación 64, en el
que el procedimiento comprende la evaluación del efecto del agente
candidato sobre la distribución de LBP-1,
LBP-2, o LBP-3.
83. El polipéptido según cualquiera de las
reivindicaciones 26 a 44, para un uso en un tratamiento de la
arterosclerosis en un sujeto.
84. El polipéptido según cualquiera de las
reivindicaciones 26 a 44, para un uso en un diagnóstico de la
arteriosclerosis en un sujeto.
85. El polipéptido según cualquiera de las
reivindicaciones 26 a 44, para un uso para inmunizar un sujeto
contra un polipéptido LBP-1, LBP-2,
o LBP-3.
86. Uso del polipéptido según cualquiera de las
reivindicaciones 26 a 44 para la fabricación de un medicamento para
el tratamiento de la arterosclerosis.
87. Uso del polipéptido según cualquiera de las
reivindicaciones 26 a 44 para la fabricación de un medicamento para
el diagnóstico de la arterosclerosis.
88. Uso del polipéptido según cualquiera de las
reivindicaciones 26 a 44 para la fabricación de un medicamento para
una utilización para inmunizar un sujeto contra un polipéptido
LBP-1, LBP-2, o
LBP-3.
89. El anticuerpo o fragmento del mismo o
preparación de un anticuerpo policlonal según cualquiera de las
reivindicaciones 45 a 60 para un uso en el tratamiento de la
arterosclerosis en un sujeto.
90. El anticuerpo o fragmento del mismo o
preparación de un anticuerpo policlonal según cualquiera de las
reivindicaciones 45 a 60 para un uso en el diagnóstico de la
arterosclerosis en un sujeto.
91. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 90, en el que el diagnóstico comprende:
la determinación de la localización o de la
cuantificación de la LBP-1, LBP-2, o
LBP-3 marcada interactuando con el anticuerpo o el
fragmento del mismo administrado por toma de imágenes de modo para
detectar la presencia de una lesión de arterosclerosis en el
sujeto.
92. El anticuerpo o fragmento del mismo según la
reivindicación 91, en el que la imagen está seleccionada dentro del
grupo constituido por la imagen obtenida por resonancia magnética,
la imagen obtenida por cámara gamma, la imagen obtenida por
tomografía de emisión monofotónica por ordenador, y la tomografía
por emisión de positrones.
93. Uso del anticuerpo o del fragmento del mismo
o de la preparación del anticuerpo policlonal según cualquiera de
las reivindicaciones 45 a 60 para la fabricación de un medicamento
para el tratamiento de la arterosclerosis.
94. Uso del anticuerpo o del fragmento del mismo
o de la preparación del anticuerpo policlonal según cualquiera de
las reivindicaciones 45 a 60 para la fabricación de un medicamento
para el diagnóstico de la arterosclerosis.
95. Una molécula antisentido que se hibrida en
las condiciones celulares al ácido nucleico de SEC ID NO: 10, SEC ID
NO: 11, SEC ID NO: 14, SEC ID NO: 15, SEC ID NO: 16, o SEC ID NO: 17
de un modo que inhibe la expresión del polipéptido
LBP-1, LBP-2, o
LBP-3 codificado por el ácido nucleico.
96. La molécula antisentido según la
reivindicación 95 para un uso en el tratamiento de la
arterosclerosis en un sujeto.
97. Uso de la molécula antisentido según la
reivindicación 95 para la fabricación de un medicamento para el
tratamiento de la arterosclerosis.
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