ES2227906T3 - Promotores de plantas constitutivos. - Google Patents

Promotores de plantas constitutivos.

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Abstract

Un promotor quimérico de plantas, en el que dicho promotor comprende un promotor mínimo y elementos activadores de la transcripción de un juego de promotores en el que un elemento activador de la transcripción de dicho juego de promotores proviene de un promotor que es específicamente activo en partes verdes de la planta y un elemento activador de la transcripción de dicho juego de promotores proviene de un promotor que es específicamente activo en partes subterráneas de la planta.

Description

Promotores de plantas constitutivos.
Campo de la invención
La invención se refiere a nuevos promotores de plantas, más específicamente a aquellos promotores que se pueden producir juntando partes de promotores que tienen una especificidad complementaria.
Antecedentes de la técnica
La ingeniería genética de plantas ha sido posible en virtud de dos descubrimientos: primero de todo la posibilidad de transformación de la célula de la planta con material genético heterólogo (que se realiza de la forma más eficaz mediante la bacteria Agrobacterium tumefaciens o cepas relacionadas) y en segundo lugar por la existencia de promotores de plantas que son capaces de dirigir la expresión de dicho material genético heterólogo.
Un promotor típico de plantas consiste en elementos específicos. Una porción básica está formada por el elemento promotor mínimo, que permite la iniciación de la transcripción, acompañado a menudo por una secuencia, denominada también caja TATA, que sirve como lugar de unión de los factores de iniciación de la transcripción. En la mayor parte de los promotores, la presencia de esta caja TATA es importante para una adecuada iniciación de la transcripción. Está localizada típicamente de 35 a 25 pares de bases (pb) aguas arriba con respecto al sitio de iniciación de la transcripción. Otra parte del promotor consiste en elementos que son capaces de interaccionar con proteínas de unión al DNA. Son conocidos los elementos de unión a cajas G que están basados en un motivo hexanucleotídico CACGTG. Se ha demostrado que estos elementos son capaces de interaccionar con proteínas bZIP de unión al DNA que se unen como dímeros (Johnson y McKnight, Ann. Rev. Biochem., 58, 799-839, 1989). Se han descrito otros motivos relacionados con cajas G, tales como los motivos Iwt y PA (WO 94/12015).
Se ha demostrado que estos motivos están implicados en la expresión en plantas desde promotores específicos de tejido. Por ejemplo, la presencia de tetrámeros Iwt confiere expresión específica del estado embrionario, mientras que los tetrámeros PA confieren un alto nivel de expresión en las raíces, bajo nivel de expresión en las hojas y nada de expresión en las semillas.
De forma parecida, están descritos sitios de unión similares al de GT-1 (agrupados en base a una secuencia de moderado consenso GGT^{A}/_{T}A). Tal sitio de unión se encuentra aguas arriba lejos de la región del promotor de la plastocianina de Arabidopsis y parece estar implicado en la activación de la transcripción durante los períodos de luz (Fisscher, U. et al., Plant Mol. Biol. 26, 873-886, 1994).
Otro fenómeno relacionado con las secuencias que se encuentra a menudo en promotores de plantas es la presencia de secuencias que permiten la formación de Z-DNA. El Z-DNA es DNA plegado en una hélice a izquierdas que está causado por repeticiones de dinucleótidos GC o AC. Se cree que el plegamiento en la forma Z influye sobre la disponibilidad del DNA para que se le aproximen moléculas de RNA polimerasa, inhibiendo así la tasa de transcrip-
ción.
Una de las invenciones más tempranas e importantes en el campo de la expresión de proteínas de plantas es el uso de promotores de virus (de plantas) y derivados de Agrobacterium que proporcionan una expresión potente y constitutiva de genes heterólogos en plantas transgénicas. Se han utilizado varios de estos promotores de forma intensiva en la investigación sobre la genética de plantas y son todavía los promotores de elección para estudios de expresión rápidos, sencillos y de bajo riesgo. Los más famosos son los promotores 35S y 19S del virus del mosaico de la coliflor (CaMV), al que se le encontró utilización práctica en 1984 (EP-0.131.623), los promotores que se pueden encontrar en el
T-DNA de Agrobacterium, como los promotores de la nopalina sintasa (nos), manopina sintasa (mas) y octopina sintasa (ocs) (EP-0.122.791, EP-0.126.546, EP-0.145.338). Un promotor derivado de plantas con características similares es el promotor de la ubiquitina (EP-0.342.926).
Con el tiempo, se han hecho varios intentos para incrementar el nivel de expresión de estos promotores. Ejemplos de esto son el promotor 35S doblemente intensificado (US-5.164.316) y, más recientemente, el superpromotor, que incorpora partes de los promotores de Agrobacterium (EP-729.514).
Sin embargo, en muchos casos estos promotores no cumplen los criterios de un promotor ideal. Todos los promotores descritos anteriormente muestran un claro patrón de expresión específica de órgano o del estadio de desarrollo, y frecuentemente el patrón de expresión hallado con estos promotores no es ideal para algunas aplicaciones. Especialmente para las aplicaciones biotecnológicas como la ingeniería de resistencia a hongos e insectos, que requieren la expresión tanto en la ubicación correcta así como en la fase correcta del desarrollo de plantas, hay una necesidad de nuevos promotores constitutivos que sean capaces de dar un alto nivel de expresión del transgén exactamente en el momento y lugar correctos.
Sumario de la invención
La invención proporciona nuevos promotores de plantas, caracterizados porque comprenden 1) un promotor mínimo y 2) elementos activadores de la transcripción de un juego de promotores, elementos que dirigen un patrón y un nivel de transcripción complementarios en una planta.
Más específicamente, este promotor de plantas es un promotor constitutivo en el que cada uno de los elementos activadores de la transcripción no exhibe una especificidad de tejido absoluta, pero media en la activación transcripcional en la mayoría de las partes de la planta a un nivel \geq1% del nivel alcanzado en la parte de la planta en la que la transcripción es más activa. Un ejemplo de tales pares de promotores es un juego de promotores en el que uno es más activo en las partes verdes de la planta, mientras que el otro promotor es más activo en las partes subterráneas de la planta. Más específicamente, el nuevo promotor es una combinación del promotor de la ferredoxina y el de RolD. Preferiblemente en esta construcción el elemento promotor mínimo deriva del promotor de la ferredoxina y el promotor de la ferredoxina deriva de Arabidopsis thaliana. El promotor de rolD deriva de Agrobacterium rhizogenes.
También es parte de la invención un promotor de plantas que es una combinación del promotor de la plastocianina y de la S-adenosil-metionina-1, en donde preferiblemente el elemento promotor mínimo deriva del promotor de la S-adenosil-metionina-1 y tanto el promotor de la plastocianina como el de la S-adenosil-metionina-1 derivan de Arabidopsis thaliana.
Además son parte de la invención construcciones génicas quiméricas para la expresión de genes en plantas que comprenden los promotores anteriormente descritos.
Descripción de las figuras
Figura 1: Representación esquemática de pMOG410 y pMOG1059
Figura 2: Distribución de la expresión de GUS en líneas de patata transformadas con las construcciones pMOG1059 y pMOG410. La tinción de GUS se juzgó visualmente y se establecieron clases de expresión, relativas a la expresión más elevada de GUS medida en el laboratorio de los autores (fijada en 4). Un valor de cero indica ausencia de expresión visible.
Figura 3: Representación gráfica de la expresión media de la enzima GUS en transformantes primarios de tomate, colza y patata. La expresión de GUS se determinó visualmente y se comparó con una planta de tabaco transgénica con 35S-GUS que mostraba un alto nivel de expresión a la que se le asignó un valor de 4. La desviación típica de los valores medidos se indica sobre cada una de las barras.
Figura 4: Representación gráfica de la distribución de plantas de patata con diversos niveles de expresión de GUS que contienen construcciones SAM-1-GUS, Pc-35S-GUS y PcSAM1-GUS. Se valoró la expresión en mesófilo de hojas, sistema vascular de hojas, tallo y raíz.
Descripción detallada de la invención
Para el propósito de esta memoria descriptiva son válidas las siguientes definiciones:
Un promotor consiste en un sitio de unión a la RNA polimerasa sobre el DNA, que forma un sitio funcional de comienzo de iniciación de la transcripción. Un promotor consiste habitualmente en al menos una caja TATA y posiblemente otras secuencias rodeando el sitio de iniciación de la transcripción (iniciador) y que pueden utilizarse o aisladas (promotor mínimo) o unidas a sitios de unión de elementos activadores de la transcripción, silenciadores o intensificadores que pueden intensificar o reducir las tasas de iniciación de la transcripción, y que pueden funcionar en relación con el estadio de desarrollo, o con estímulos externos o internos.
El sitio de iniciación es la posición que rodea al primer nucleótido que es parte de la secuencia transcrita, lo que se define también como la posición +1. Todas las demás secuencias del gen y sus regiones de control se numeran con respecto a este sitio. Las secuencias situadas aguas abajo (es decir las secuencias adicionales codificantes de la proteína en la dirección 3') se denominan positivas, mientras que las secuencias situadas aguas arriba (la mayor parte de las regiones de control en la dirección 5') se denominan negativas.
Un promotor mínimo es un promotor que consiste sólo en todos los elementos basales necesarios para la iniciación de la transcripción, tales como una caja TATA y/o un iniciador.
Una secuencia intensificadora es un elemento de DNA que, cuando está presente en la proximidad de un promotor, es capaz de incrementar la tasa de iniciación de la transcripción.
Un promotor es constitutivo cuando es capaz de expresar el gen que controla en todos o casi todos los tejidos de la planta durante todos o casi todos los estadios del desarrollo de la planta.
La expresión específica es la expresión de productos de genes que se limita a uno o a unos pocos tejidos de la planta (limitación espacial) y/o a uno o a unos pocos estadios del desarrollo de la planta (limitación temporal). Se sabe que apenas existe una especificidad verdadera: los promotores parecen activarse preferiblemente en algunos tejidos, mientras que en otros tejidos puede no haber ninguna o haber solamente poca actividad. Este fenómeno se conoce como expresión de goteo. Sin embargo, con expresión específica en esta invención se alude a la expresión preferible en uno o unos pocos tejidos de la planta.
El patrón de expresión de un promotor (con o sin secuencia intensificadora) es el patrón de los niveles de expresión que muestra en qué lugar de la planta y en qué estadio del desarrollo se inicia la transcripción mediante ese promotor.
Se dice que los patrones de expresión de un juego de promotores son complementarios cuando el patrón de expresión de un promotor muestra poco solapamiento con el patrón de expresión del otro promotor.
El nivel de expresión de un promotor se puede determinar midiendo la concentración en el "estadio estacionario" de un mRNA indicador patrón transcrito. Esta medida es indirecta, puesto que la concentración del mRNA indicador es dependiente no sólo de su velocidad de síntesis, sino también de la velocidad con la que se degrada el mRNA. Por ello el nivel del estado estacionario es el producto de las velocidades de síntesis y de degradación. Se puede considerar, sin embargo, que la velocidad de degradación se produce con un valor fijo cuando las secuencias transcritas son idénticas, y así este valor puede servir como una medida de las velocidades de síntesis. Cuando se comparan los promotores de esta manera son técnicas disponibles para los expertos en la técnica el análisis por hibridación con utilización de RNasa S1, las transferencias tipo Northern y la PCR en tiempo real (RT-PCR) competitiva. Esta lista de técnicas no representa en modo alguno todas las técnicas disponibles, sino que más bien describe procedimientos utilizados habitualmente para analizar la actividad transcripcional y los niveles de expresión de mRNA.
Una de las dificultades técnicas que se encuentran en tal análisis es que los resultados cuantitativamente mejores sólo se pueden obtener fusionando partes activadoras de la transcripción con la molécula del RNA indicador, de tal manera que sólo se transcriban las secuencias del indicador. Esto requiere la determinación exacta del inicio de la síntesis del RNA, y unir en ese punto las secuencias del mRNA indicador.
Esto es importante por un número de razones. Primero, el análisis de los puntos de inicio de la transcripción en prácticamente todos los promotores ha revelado que habitualmente no hay una única base en la que comience la transcripción, sino más bien un juego de sitios de iniciación más o menos agrupados, cada uno de los cuales corresponde a algunos puntos de inicio del mRNA. Puesto que esta distribución varía de promotor a promotor, las secuencias del mRNA indicador de cada una de las poblaciones diferirían unas de otras. Puesto que cada especie de mRNA es más o menos proclive a la degradación, no se pueden esperar una única velocidad de degradación para diferentes mRNA indicadores. En segundo lugar, se ha demostrado en diversas secuencias promotoras eucarióticas que la secuencia que rodea el sitio de iniciación ("iniciador") juega un papel importante en la determinación del nivel de expresión del RNA dirigida por ese promotor específico. Esto incluye también parte de las secuencias transcritas. La fusión directa del promotor con las secuencias del indicador conduciría por ello a niveles de transcripción mucho más subóptimos.
Dejar estas secuencias transcritas permite determinar las velocidades de transcripción pero, potencialmente, altera la estabilidad del mRNA indicador e influye sobre las velocidades de iniciación de la traducción de un posible marco abierto de lectura.
El papel de este análisis, sin embargo, es la determinación del nivel relativo de expresión constitutiva de una proteína heteróloga, puesto que es la aplicación más frecuente utilizada en biotecnología. Por ello, el parámetro más importante es la capacidad de las secuencias analizadas para dirigir un alto nivel de expresión de una proteína indicadora heteróloga.
Esto implicaría acoplar las secuencias codificantes de una proteína indicadora a la parte activadora de la transcripción, el promotor y la secuencia no traducida de 5' del gen en el que se están analizando sus propiedades. De esta manera, un complejo juego de efectos (que combinan velocidades de transcripción, estabilidad del mRNA (y con ello las velocidades de degradación del mRNA) y las velocidades de iniciación de la traducción) se reduce hasta un valor que es un valor muy útil para determinar la utilidad de los elementos génicos analizados para aplicaciones biotecnológicas.
No hay ninguna palabra o frase actuales para describir este valor. En el transcurso de esta solicitud se utilizan junto con el término "valor de la expresión" los términos "nivel de expresión" y "actividad transcripcional". Los autores son conscientes de que esto puede causar alguna confusión. En todos los casos se indica con estos y otros términos relacionados el valor recién mencionado. Un procedimiento utilizado habitualmente para analizar patrones y niveles de expresión es entonces a través de la determinación del nivel en el "estado estacionario" de la acumulación de proteína en una célula. Candidatos utilizados habitualmente como gen indicador, conocidos por los expertos en la técnica, son la \beta-glucuronidasa (GUS), cloramfenicol acetiltransferasa (CAT) y proteínas con propiedades fluorescentes, tales como la proteína fluorescente verde (GFP) de Aequora victoria. En principio, sin embargo, son adecuadas para este propósito muchas más proteínas, siempre y cuando la proteína no interfiera con funciones esenciales de la planta. Para la cuantificación y la determinación de la ubicación son adecuadas numerosas herramientas. Se pueden crear fácilmente o están disponibles sistemas de detección que están basados en, por ejemplo, la detección y cuantificación inmunoquímicas, enzimáticas, fluorescentes. Los niveles de proteína se pueden determinar en extractos de tejidos de la planta o en tejidos intactos utilizando análisis in situ de la expresión de la proteína.
Generalmente, los niveles de expresión del gen indicador variarán entre las líneas individuales transformadas con una construcción quimérica promotor-indicador. También se observa frecuentemente el fenómeno de que tales transformantes no expresen ningún producto detectable (RNA o proteína). La variabilidad en la expresión se adscribe habitualmente a "efectos posicionales" aunque los mecanismos moleculares que subyacen bajo esta inactividad habitualmente no están claros.
La expresión expresión media se utiliza aquí como el nivel medio de expresión encontrado en todas las líneas que expresan cantidades detectables de gen indicador, dejando así fuera del análisis plantas que no expresan nada detectable de mRNA o proteína del indicador.
El nivel de expresión en la raíz indica el nivel de expresión hallado en extractos proteicos de raíces completas de la planta. De manera parecida, los "niveles de expresión en las hojas" o "en el tallo" se determinan utilizando extractos completos de hojas y tallos. Se sabe, sin embargo, que dentro de cada una de las partes de la planta recién descritas, pueden existir células con funciones variables, en las que puede variar la actividad del promotor.
En el caso de los promotores descritos en esta solicitud, los niveles de expresión se miden en las partes grandes de la planta. Sin embargo, análisis más detallados pueden contribuir a la construcción de un promotor que es incluso "más constitutivo", teniendo en cuenta que dentro de una parte de una planta se tienen en cuenta más tipos celulares.
Como patrón para juzgar los niveles de expresión, el promotor 35S del virus del mosaico de la coliflor es un patrón conveniente y ampliamente extendido. El nivel medio de expresión de este promotor se puede clasificar como medio alto.
La invención muestra que es posible combinar elementos de un promotor que son responsables de una expresión específica con elementos de otro promotor que son responsables de un patrón de expresión complementario para formar un promotor que - como resultado - muestra expresión en los tejidos y estadios del desarrollo que forman parte del patrón de expresión de ambos promotores. Si la complementación da como resultado actividad en (casi) todas las células de la planta, tal complementación dará lugar a un promotor constitutivo. Parece ser necesario, sin embargo, que ambos promotores tengan un valor bajo de la expresión en los tejidos y estadios del desarrollo que son específicos del otro promotor. Se ha establecido que, para que sean adecuados, la actividad transcripcional en las partes de la planta donde la expresión es baja debería ser preferiblemente \geq1% del nivel de transcripción que se alcanza en las partes de la planta donde la actividad transcripcional es alta.
Esto limita la disponibilidad de promotores y elementos de promotores a partir de los cuales construir un nuevo promotor constitutivo. Un par adecuado de promotores que cumple los criterios anteriormente mencionados es:
- el promotor de la ferredoxina en combinación con el promotor rolD
- el promotor de la S-adenosil-metionina en combinación con el promotor de la plastocianina
También se pueden aplicar otros pares de promotores que son complementarios y que muestran al menos alguna expresión en los tejidos y estadios del desarrollo que son específicos del otro promotor.
Caracterización de las partes promotoras y/o intensificadoras necesarias
Aunque los elementos reguladores de la transcripción, especialmente en eucariotas, pueden estar presentes a grandes distancias del promotor/sitio de iniciación de la transcripción, y ubicados tanto aguas abajo como aguas arriba con respecto al sitio de iniciación, muchos genes de plantas tienen la mayor parte de sus elementos reguladores en la zona situada directamente aguas arriba con respecto al promotor. Para identificar los principales elementos activadores de la transcripción de los promotores es un procedimiento habitual unir partes de las zonas no transcritas que se encuentran aguas arriba (y aguas abajo) con respecto al promotor a un gen indicador, para analizar la capacidad de cada uno de los elementos truncados de DNA para dirigir la expresión de ese indicador. Para la caracterización de más secuencias promotoras-proximales implicadas en la regulación de la transcripción, lo más común es acoplar al promotor fragmentos de las secuencias intensificadoras, que pueden derivar del gen en el cual se estudia la regulación de la transcripción. Alternativamente, se puede utilizar un promotor heterólogo tal como las secuencias del promotor 35S de -46 a +4, con respecto al inicio de la transcripción, que está acoplado de forma funcional a un gen indicador como los descritos anteriormente.
De esta manera es posible caracterizar los elementos activadores de la transcripción de la mayoría de los genes, un proceso que es bien conocido para los expertos en la técnica.
Se ha analizado de esa manera un gran número de elementos reguladores de la transcripción de genes, y a través de las publicaciones científicas están disponibles directamente para los expertos en la técnica datos relevantes de este análisis.
Los elementos activadores de la transcripción que como media pueden dirigir la expresión a aproximadamente el nivel medio del promotor 35S (al menos 50% de este nivel) en al menos algunas de las partes de la planta, y que son capaces también de dirigir al menos 0,5% (del nivel del 35S) de la transcripción en otras partes de la planta se seleccionan entonces para su uso adicional.
El elemento promotor mínimo deriva típicamente de uno de los promotores del par de promotores, aunque no necesariamente. Se puede considerar que tal elemento mínimo derive de un tercer promotor o incluso se prepare sintéticamente.
Basándose en los resultados del análisis anteriormente descritos, se seleccionan partes activadoras de la transcripción con actividades complementarias. Es decir, por ejemplo, un promotor con expresión por toda la planta, fragmentos de DNA activadores de la transcripción que dirijan un alto nivel de expresión en la raíz y con niveles de expresión más bajos en las hojas y el tallo, se combinan con elementos que dirigen la expresión principalmente en la hoja y el tallo, pero a menor nivel en la raíz. Otras combinaciones de partes complementarias activadoras de la transcripción son obvias.
Preferentemente, el nivel de expresión en las partes donde la expresión es más baja no cae hasta por debajo del 1% del nivel obtenido en la parte más alta. Se prefiere más la situación donde la relación entre la expresión más baja y la expresión más elevada entre partes de la planta es mayor que 5%.
La forma más fácil de poder realizar este acoplamiento es mediante técnicas conocidas de ingeniería genética. El gen que ha de expresar mediante el nuevo promotor constitutivo se puede clonar detrás del promotor. Es aconsejable construir en un único sitio de clonación NcoI en la zona de enlazamiento de la secuencia no transcrita de 5' unida al promotor para permitir la unión precisa del marco abierto de lectura (ORF) y el extremo 3' del promotor en el que se puede insertar el gen de interés.
El par ferredoxina-rolD
Una de las combinaciones preferidas de la presente invención en un promotor constitutivo de plantas que comprende elementos tanto del promotor de la ferredoxina como del promotor de rolD. Preferiblemente el promotor de la ferredoxina se obtiene de Arabidopsis thaliana, donde dirige la expresión del gen de la ferredoxina A, un gen que está implicado en la fotosíntesis. Se ha informado sobre la expresión de este gen y la capacidad de respuesta de su promotor a la luz (Vorst, O. et al., Plant Mol. Biol. 14, 491-499, 1990; Vorst, O. et al., The Plant J. 3(6), 793-803, 1993; Dickey, L.F. et al., The Plant Cell 6, 1171-1176, 1994). Dado que el gen de la ferredoxina está implicado en la fotosíntesis, el promotor es más activo en el tejido verde. Se demostró que los niveles de mRNA eran elevados en órganos que contenían cloroplastos tales como tallo, hojas y brácteas, pero también en los tejidos jóvenes en crecimiento, tales como flores completas y plántulas. De forma interesante, hay una expresión menor, pero significativa en las zonas de la planta sostenidas por el suelo. La secuencia del promotor contiene una región que contiene tanto una caja G como una caja I. También se halla en la posición -182 una secuencia de DNA que induce el plegamiento en forma Z.
Se ha informado de que el promotor de rolD tiene una fuerte expresión en las raíces y se puede obtener de Agrobacterium rhizogenes. Aunque el organismo de origen es una bacteria, el promotor es muy adecuado para la expresión en plantas porque la bacteria es un fitopatógeno que causa en las plantas la enfermedad de la raíz pilosa. Con tal propósito se transfiere DNA a la planta entre el cual el gen rolD es responsable del alargamiento de la raíz. Para poder ser expresado en plantas este gen necesitó un promotor fuerte funcional en plantas, el promotor de rolD. Los estudios con GUS han demostrado que la expresión bajo el control del promotor de rolD da lugar principalmente a especificidad con respecto a la raíz (Leach, F. y Aoyagi, K., Plant Sci. 79, 69-76, 1991). También, se observó algo de expresión en las hojas.
Se puede obtener una combinación del promotor de la ferredoxina y de rolD de dos maneras, dependiendo de qué promotor se tomen el elemento promotor mínimo y las secuencias no traducidas de 5'. En los ejemplos de los autores se ha utilizado el elemento promotor mínimo del promotor de la ferredoxina, pero obtenerlo como derivado del promotor de rolD es igualmente perfectamente posible.
El par S-adenosil-metionina sintetasa y plastocianina
Se puede obtener otro promotor favorable a partir de una combinación del promotor de la S-adenosil-metionina sintetasa (SAM) y partes específicas del promotor de la plastocianina. Preferiblemente, ambos promotores se obtienen de Arabidopsis thaliana.
El promotor SAM regula la expresión de la S-adenosil-metionina sintetasa, que es una enzima activa en la síntesis de poliaminas y etileno. Los estudios del promotor mostraron una fuerte expresión en tejidos vasculares, en el tejido de callos, esclerénquima y alguna actividad en el córtex radicular (Peleman, J. et al., The Plant Cell 1, 81-93, 1989) que se explicó que se debía a la implicación de la enzima en la lignificación.
El promotor de la plastocianina, como el promotor de la ferredoxina, es también un promotor que es activo en la ruta fotosintética. Los niveles de mRNA son altos en las estructuras verdes, que contienen cloroplastos, tales como hojas, hojas caulinares, tallo y plántula completa. El promotor también es muy activo en flores. Es detectable poca expresión en silicua, semilla y raíz (Vorst, O. et al., The Plant J. 4(6), 933-945, 1993). Combinando estas especificidades es posible crear un promotor quimérico que dirige una buena expresión tanto en las zonas fotosintéticas de la hoja y el tallo, como en las zonas no implicadas en la fotosíntesis, tales como las células que forman y rodean el sistema vascular en hojas y tallos.
Otros pares de promotores
Los ejemplos dados anteriormente de pares de promotores muestran en ambos casos la presencia de un promotor que es activo durante la fotosíntesis. Se considera que otros promotores que son reguladores de la expresión de un gen necesario para la actividad fotosintética puedan ser adecuados para una combinación o con el promotor de rolD o con otros promotores preferentemente radiculares.
En la construcción de un promotor que dirija la expresión por toda la planta: si uno de los componentes es un promotor que es más o menos específico para las partes verdes, esto automáticamente quiere decir que el otro promotor del par debería expresarse predominantemente (pero no exclusivamente) en las raíces y otros órganos no fotosintetizadores.
En la construcción de un promotor que dirija la expresión en todas las partes de hojas y tallos, la combinación se puede hacer utilizando un promotor que es más o menos específico para las partes verdes y un promotor que dirige la expresión principalmente en el sistema vascular.
Sin embargo, la invención no se limita a la combinación de un promotor preferencialmente radicular y un promotor preferencialmente de las partes verdes, y una combinación de promotores preferencialmente de las partes verdes y preferencialmente del sistema vascular. Se pueden utilizar todas las combinaciones de promotores siempre y cuando los patrones de expresión de los promotores individuales sean complementarios.
También es posible que los elementos de los que está compuesto por ejemplo un nuevo promotor constitutivo deriven de un juego de más de dos promotores. También debería existir entonces la complementariedad anteriormente discutida.
Parte experimental Ejemplo 1 Clonación del promotor quimérico Fd-rolD
Se aisló por digestión con HincII y NcoI un fragmento de 512 pb del promotor de la ferredoxina de Arabidopsis thaliana (O. Vorst et al., 1990, PMB 14, 491-499) que abarcaba de la posición -512 a la +4 (relativas al codón de iniciación ATG del marco abierto de lectura de la ferredoxina). Este fragmento contiene la mayor parte de las secuencias reguladoras de la transcripción del promotor de la ferredoxina, las secuencias promotoras y la secuencia líder del transcrito de la ferredoxina. Se introdujo un sitio XbaI, por razones de clonación, en las posiciones -5 a -10 relativas al ATG (O. Vorst et al., 1990, PMB 14, 491-499). Esto cambia la secuencia original del clon en este punto de ACAAAA a TCTAGA (SEQ ID NO: 1).
Parte de las secuencias situadas aguas arriba del rolD de Agrobacterium rhizogenes (SEQ ID NO: 2) (Leach et al., 1991, Plant Sci. 79, 69-76) se fusionaron con las secuencias del promotor de la ferredoxina anteriormente descritas. Se clonó un fragmento HindIII-RsaI, que comprendía los nucleótidos -385 a -86 relativos al codón de iniciación, junto al fragmento de la ferredoxina, uniendo los sitios RsaI de éste con el sitio HincII de aquél. Este elemento quimérico, que contenía el promotor y algunas de las secuencias activadoras del gen de la ferredoxina, y secuencias activadoras situadas aguas arriba del gen rolD, se utilizó en estudios posteriores de acuerdo con sus propiedades estimuladoras de la transcripción (SEQ ID NO: 3).
Ejemplo 2 Fusiones de GUS
El promotor/activador quimérico Fd-rolD se acopló al gen GUS, modificado por ingeniería genética para contener un gen con un intrón (Jefferson et al., (1987) EMBO J 6: 3901-3907). Se utilizó el sitio de restricción NcoI del codón de iniciación ATG para unir el promotor al marco abierto de lectura (ORF) del gen GUS, acoplado al fragmento de 265 pb que contenía las secuencias de 3' sin traducir y de terminación de la transcripción del Inhibidor de la Proteinasa II (Thornburg et al., 1987, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 744-748; An et al., Plant Cell 1, 115-122).
El casete completo de expresión, que contenía el promotor, el gen GUS y las secuencias de 3' del PI-II, se extrajo para clonarlo utilizando BamHI y EcoRI y se introdujo en el vector binario pMOG800 (depositado en el Centraal Bureau voor Schimmelcultures, Baarn, Países Bajos, como CBS 414.93, el 12 de agosto de 1993) digerido con las mismas enzimas. La construcción preparada a continuación (pMOG1059) se utilizó en experimentos de transformación con diversas plantas. Como control se utilizó una construcción del promotor 35S del CaMV - GUS. Ésta es la construcción pMOG410. Una representación esquemática de ambas construcciones se encuentra en la figura 1.
Ejemplo 3 Niveles y patrones de expresión de la actividad del promotor durante estadios tempranos de la transformación de plantas
Primero, se prepararon transformantes de Arabidopsis thaliana con ambas construcciones y se siguió en el tiempo la expresión de GUS durante el procedimiento de transformación.
Los niveles de expresión de GUS se determinaron visualmente, en una escala de 0 a 5, donde 0 es la expresión no detectable y 5 es el nivel más alto de GUS que han observado los autores en hojas de una planta transgénica, de una rara planta del tabaco, transgénica respecto a la construcción 35S-GUS (línea 96306). En todos los experimentos se incluyeron como referencia interna muestras de hojas de esta planta.
En la tabla 1 se indica la expresión relativa de GUS en explantes de Arabidopsis thaliana, en diversos momentos después del cocultivo con Agrobacterium tumefaciens (DDC: días después del cocultivo)
TABLA 1 Actividad relativa de GUS en explantes de raíz de Arabidopsis
Construcción: pMOG1059 pMOG410
Tiempo de ensayo
DDC 0 2 3
DDC 2 3 3
DDC 5 3 3
DDC 7 4 3
DDC 9 4 3
DDC 12 4 3
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Como se puede ver a partir de esta comparación, la expresión de GUS dirigida por el promotor quimérico comienza ligeramente más tarde después del cocultivo pero, a partir del día 7 en adelante, excede el nivel de expresión obtenido con el promotor 35S de referencia.
Se obtuvieron datos muy similares cuando se valoró la expresión de GUS en explantes de Brassica napus. En el día 5 después del cocultivo el promotor 35S es ligeramente más elevado, pero la situación se revierte en el día 20 después del cocultivo. También se obtuvieron datos similares para el tomate. Aquí incluso en el estadio más temprano del análisis la expresión de los transgénicos con pMOG1059 excedió la de los transgénicos con pMOG410.
Ejemplo 4 Niveles y patrones de expresión en plantas crecidas in vitro
Cuando las plantas se dejan crecer más, las diferencias entre estos promotores se vuelven incluso más claras. Se analizó la expresión de GUS en muestras de hojas de plantas regeneradas por completo. Se obtuvieron las medias de 11-48 plantas, dependiendo de la construcción.
En el caso de Arabidopsis thaliana que se hizo crecer solamente in vitro, no se observó gran diferencia entre la expresión de GUS en las plantas transgénicas con pMOG1059 y con pMOG410.
TABLA 2 Actividad media relativa de GUS en muestras de hojas de todos los cultivos analizados
Construcción: pMOG1059 pMOG410
Cultivo:
Patata 4,0 2,1
Brassica napus 3,7 2,8
Arabidopsis 4,0 4,1
Tomate 2,2 2,1
Lo que está claro a partir de los datos presentados en la figura 2 es que un número significativo de líneas transgénicas con 35S-GUS (aproximadamente un 50% se encontró repetidamente en los experimentos de los autores) no expresan GUS a un nivel que sea visible. Así no sólo las expresiones máxima y media son más altas en las plantas transgénicas con Fd-rolD-GUS, también la frecuencia con la que las plantas transgénicas expresan GUS se intensifica con fuerza. En aproximadamente 50 plantas transgénicas de patata que portaban la construcción Fd-rolD-GUS, los autores no encontraron ninguna que se expresara débilmente, lo que sugiere una alta expresión repetitiva en al menos 98% de las líneas obtenidas.
Ejemplo 5 Comparación de la eficacia del promotor en diversos cultivos
Las construcciones pMOG410 (35S-GUS) y pMOG1059 (Fd-rolD-GUS) se introdujeron también en colza y tomate para una comparación adicional de la eficacia del promotor. También se incluyen aquí los datos correspondientes a patata.
Como se muestra en la Figura 3A, en el tomate el nivel global de expresión del promotor Fd-rolD es más elevado tanto en el último estadio del crecimiento in vitro como en las hojas de las plantas de 4 y 7 semanas de edad. Esto sigue siendo cierto en los tallos de 7 semanas, sin embargo, en el caso de las raíces, se observa una expresión media más débil con el promotor Fd-rolD que en el caso del promotor 35S.
También se obtuvieron resultados similares en colza y patata, con la notable excepción de que en las raíces de patata el nivel de expresión mediante el promotor Fd-rolD excede el del promotor 35S. Como se muestra en las figuras 3B y 3C la expresión media del promotor Fd-rolD es más elevada y también la variación en la expresión es significativamente más baja. En conclusión se puede decir que se ha creado un promotor que resiste la comparación con el promotor 35S fácilmente en tres cultivos importantes.
Ejemplo 6 Expresión del transgén nptII
Para comprobar también las posibilidades de uso del promotor Fd-rolD para otros propósitos, se ligó el promotor al gen nptII, la expresión de cuyo correspondiente producto del gen confiere resistencia en plantas al antibiótico kanamicina. Este elemento se situó entre los extremos izquierdo y derecho del T-DNA, permitiendo la transferencia a plantas mediada por Agrobacterium tumefaciens. Como control, se utilizaron construcciones similares en las que la expresión del gen nptII estaba bajo el control del promotor nos.
La resistencia a la kanamicina se manifiesta en las plantas transgénicas de patata por el desarrollo de callos transgénicos y se dispara durante un procedimiento normalizado de transformación, en el que se utiliza kanamicina en el medio del cultivo.
Como media, para las construcciones con el casete de selección nos-nptII, la frecuencia de transformación en patata es 45%, para las construcciones con el casete de selección Fd-rolD-nptII la frecuencia es como media 61%. Aunque los autores no saben en este momento lo relevante que es para esta construcción el incremento en la frecuencia de transformación, ello indica que el promotor Fd-rolD es al menos tan adecuado para dirigir un gen heterólogo tal como nptII, como los promotores constitutivos utilizados habitualmente tales como nos.
Ejemplo 7 Comparación de la evaluación visual con los valores cuantitativos
Del análisis de la expresión de GUS basado en 1) análisis histoquímico y evaluación de un control interno y 2) de un análisis cuantitativo de la actividad enzimática de GUS, los autores han aprendido que ambos dan lugar a una figura cuantitativa reproducible. Un análisis minucioso de ambas evaluaciones en hojas y raíces de tomate y colza, lleva a la conclusión de que la escala de 3, que es la más comparable a la del 35S, equivale a aproximadamente 2000 pmol de MU/minuto.mg obtenidos en el análisis cuantitativo. En la escala de 1 y 2, las medias son 1000 y 1500, respectivamente, que marcan el valor del 50% del 35S. Aproximadamente 1% de la expresión de ese nivel equivale a 100 pmol MU/minuto.mg, que está frecuentemente por debajo del nivel de detección de la detección histoquímica, aunque es detectable algunas veces como una tinción azul muy tenue debida a la expresión de GUS. Por ello se puede utilizar la tinción histoquímica como marcador de la eficacia del promotor, midiendo el nivel de tinción azul, y usando estos datos para seleccionar elementos del promotor con utilidad.
Ejemplo 8 Construcción del promotor SAM1 y fusión con GUS
Para la construcción del promotor SAM1 se aisló DNA genómico (SEQ ID NO: 4) de hojas de Arabidopsis thaliana Landsberg erecta utilizando un procedimiento de extracción con CTAB. Los cebadores se diseñaron basándose en la secuencia publicada del gen SAM1 de Arabidopsis thaliana K85 (Peleman et al., (1989) Gene 84, 359-369). En una PCR (30 ciclos de 45 segundos a 95ºC, 45 segundos a 50ºC y 1' a 72ºC; el mismo programa se utilizó en todas las otras PCR descritas en esta parte) se amplificó el elemento del promotor utilizando los cebadores FR-Psam-143 5' AGA TTT GTA TTG CAG CGA TTT CAT TTT AG 3' (SEQ ID NO: 5) y FR-Psam-216 5' ATC TGG TCA CAG AGC TTG TC 3' (SEQ ID NO: 6) dando lugar a un fragmento de aproximadamente 550 pb. El fragmento de DNA se aisló de un gel de agarosa y se clonó en el vector pGEM-T (Promega Corp., Madison WI, EE.UU.). Este clon se utilizó como molde para introducir el sitio NcoI junto al inicio de la traducción mediante PCR utilizando los cebadores FR-Psam-144 5' GTC TCC ATG GTG CTA CAA AGA ATA G 3' (SEQ ID NO: 7) y FR-Psam-143. El fragmento resultante de 500 pb se clonó en el vector pGEM-T. Los sitios EcoRI y HindIII localizados en la región del promotor se eliminaron mediante PCR en dos etapas utilizando este clon como molde. En esta PCR se introdujo un sitio BamHI aguas arriba con respecto al promotor SAM1 y se introdujo un sitio HindIII en el sitio 3' del promotor. En la primera etapa de PCR se generaron tres fragmentos del promotor. El primer fragmento (1) contendrá el sitio BamHI de 5' y el sitio EcoRI mutado utilizando los cebadores FR-Psam-248 5' CGG GAT CCT GCA GCG ATT TCA TTT TAG 3' (SEQ ID NO: 8) y FR-Psam-249 5' ACA TGA ACG AAT GCA AAA TCT C 3' (SEQ ID NO: 9). El fragmento intermedio (2) se obtiene con los cebadores FR-Psam-250 5' AGA TTT TGC ATT CGT TCA TGT G 3' (SEQ ID NO: 10) y FR-Psam-251 5' TGT AAG CAT TTC TTA GAT TCT C 3' (SEQ ID NO: 11). Este fragmento tiene un solapamiento parcial con el fragmento 1 y 3 y tiene sitios mutados EcoRI y HindIII. El tercer fragmento de PCR (3) contendrá el sitio interno HindIII mutado e introduce un sitio HindIII en el extremo 3' del promotor que contiene el sitio NcoI en el inicio de la traducción y se genera utilizando los cebadores FR-Psam-252 5' AAG AAA TGC TTA CAG GAT ATG G 3' (SEQ ID NO: 12) y FR-Psam-253 5' GAC AAG CTT GAT CCC ATG GTG CTA CAA AGA ATA G 3' (SEQ ID NO: 13). En una segunda PCR se mezclaron en un tubo los 3 fragmentos 1, 2 y 3 y se amplificaron con los cebadores FR-Psam-248 y FR-Psam-253. Debido al solapamiento entre los fragmentos 1 y 2, y 2 y 3, esta PCR da lugar al promotor mutado completo. Después de la digestión con BamHI y HindIII el promotor SAM1 resultante se clonó en un vector pBSK+. El promotor SAM1 se clonó luego en un vector que contenía el casete indicador GUSintrón-TPI-II intercambiando la región situada aguas arriba utilizando los sitios de restricción BamHI y NcoI. Esto se hizo mediante la digestión del clon con SAM1 con BamHI y NcoI y el aislamiento del fragmento de promotor de un gel de agarosa. El vector con GUS se digirió con las mismas enzimas y luego se aisló el vector de un gel de agarosa, descartando así el promotor que contenía aguas arriba las secuencias originales.
El casete indicador del promotor SAM1-GUSintrón-TPI-II se extrajo luego del vector cortándolo mediante digestión con BamHI y EcoRI, después de lo cual se aisló el casete indicador de un gel de agarosa y se clonó en el vector binario pMOG800 digerido con BamHI y EcoRI. El vector binario resultante pMOG1402 se introdujo en la cepa EHA105 de Agrobacterium tumefaciens para transformar con él patatas.
Ejemplo 9 Construcción del promotor quimérico Pc-SAM1 y fusión con el gen GUS
Se obtuvo por PCR la secuencia intensificadora de la plastocianina (Pc) de Arabidopsis thaliana Col-0. Por ello se desarrollaron el cebador FR-Pc-146 (5' agt ggt acc atc ata ata ctc atc ctc ctt ca 3') (SEQ ID NO: 14) y el cebador FR-Pc-247 (5' cga agc ttt aca aat cta att tca tca cta aat cgg a 3') (SEQ ID NO: 15) introduciendo un sitio de restricción KpnI aguas arriba con respecto a la secuencia intensificadora y un sitio de restricción HindIII aguas abajo con respecto a la secuencia intensificadora de la plastocianina. Se llevó a cabo la PCR utilizando DNA-polimerasa Pfu clonada (Stratagene) durante 30 ciclos de 1' a 95ºC, 1' a 50ºC, 4' a 72ºC y 1 ciclo de 1' a 95ºC, 1' a 50ºC, 10' a 72ºC. El fragmento de PCR resultante se ligó a un vector de clonación de alto número de copias utilizando KpnI y HindIII, dando como resultado la construcción pPM15.1.
Este clon se utilizó como molde para una PCR (30 ciclos de 1' a 95ºC, 1' a 50ºC y 2' a 72ºC) utilizando los cebadores FR-Pc-145 5' GCT GCA ATA CAA ATC TAA TTT CAT CAC TAA ATC GG 3' (SEQ ID NO: 16) y FR-Pc-146 5' AGT GGT ACC ATC ATA ATA CTC ATC CTC CTT C 3' (SEQ ID NO: 14). La PCR genera un fragmento de aproximadamente 850 pb que incluye la secuencia intensificadora de la Pc (SEQ ID NO: 17), que contiene un sitio Kpn I aguas arriba y solapa con el lado 5' del promotor SAM1 (véase el Ejemplo 8). El fragmento de PCR se mezcló entonces con un fragmento de PCR del promotor SAM1 generado con los cebadores FR-Psam-143 y FR-Psam-144 utilizando el clon pBKS+ que contenía el promotor SAM1 ajustado descrito en el ejemplo 8. En una PCR en esta mezcla se generó el promotor quimérico PcSAM utilizando los cebadores FR-Psam-144 y FR-Pc-146. El fragmento de promotor resultante de aproximadamente 1,3 kb (SEQ ID NO: 18) se aisló de un gel de agarosa después de la digestión con KpnI y NcoI y luego se clonó en un vector de clonación de alto número de copias (pUC28) digerido con las mismas enzimas. Entonces se extrajo de este vector el fragmento de promotor cortándolo mediante la digestión con BamHI y NcoI y se clonó delante del gen GUSintrón como se describió anteriormente en el Ejemplo 8. Después se clonó el casete indicador completo Pc-SAM-GUS-TPI-II en pMOG800 como se describió para el casete indicador SAM1-GUS-TPI-II en el Ejemplo 8. El vector binario resultante pMOG14000 se introdujo en la cepa EHA105 de Agrobacterium tumefaciens para transformar con él patatas.
\newpage
Ejemplo 10 Construcción de la secuencia intensificadora de la Pc-promotor 35S y fusión con el gen GUS
Se obtuvo por PCR la secuencia intensificadora de la plastocianina (Pc) de Arabidopsis thaliana Col-0 (véase anteriormente).
Este clon se utilizó como molde para una PCR (30 ciclos de 1' a 95ºC, 1' a 50ºC y 2' a 72ºC; todas las demás reacciones de PCR descritas en esta parte se llevaron a cabo con el mismo programa) utilizando los cebadores FR-Pc-291 5' GTC TTG TAC AAA TCT AAT TTC ATC ACT AAA TCG G 3' (SEQ ID NO: 19) Y FR-Pc-146 5' AGT GGT ACC ATC ATA ATA CTC ATC CTC CTT C 3' (SEQ ID NO: 14). La PCR genera un fragmento de aproximadamente 850 pb que incluye la secuencia intensificadora de la Pc, que contiene un sitio KpnI aguas arriba y solapa con el lado 5' del promotor 35S mínimo. El promotor 35S mínimo se obtuvo en una PCR utilizando pMOG971 como molde (que contiene el promotor 35S y una UTR de 5' en omega) y los cebadores FR-35S-292 5' TTA GAT TTG TAC AAG ACC CTT CCT CTA TAT AAG G 3' (SEQ ID NO: 20) Y 1s19 (SEQ ID NO: 21). El fragmento resultante tiene un solapamiento con la secuencia intensificadora de la Pc y contiene un sitio NcoI interno en el inicio de la traducción. Se mezclaron entonces los dos fragmentos de PCR y se llevó a cabo una reacción de PCR utilizando los cebadores FR-Pc-146 y 1s19. El fragmento resultante se digirió entonces con KpnI y NcoI, se aisló de un gel de agarosa y se clonó en pUC28 digerido con las mismas enzimas. A continuación, se digirió el clon resultante con BamHI y NcoI, y se aisló el fragmento de promotor (SEQ ID NO: 22) de un gel de agarosa y se clonó aguas arriba respecto al gen GUS como se describió en el Ejemplo 7. Entonces se introdujo el casete indicador completo en el vector binario pMOG800 como se describió en el Ejemplo 7. El vector binario resultante pMOG1401 se introdujo en la cepa EHA105 de Agrobacterium tumefaciens para transformar con él patatas.
Ejemplo 11 Niveles y patrones de expresión en plantas crecidas in vitro
Se hicieron crecer plantas transformadas, y se analizó la expresión de GUS en muestras de hojas de plantas completamente regeneradas. En la figura 4 se indica el análisis de la expresión en mesófilo de hojas, sistema vascular de hojas, tallos y raíces. Se observó un nivel muy bajo de tinción de GUS en la parte del mesófilo de hojas de plantas transgénicas con SAM1 aunque la valoración indica un nivel de expresión de GUS de 0.
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(Formulario pasa a página siguiente)
1
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Zeneca MOGEN
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: Einsteinweg 97
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Leiden
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Países Bajos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (CP): 2333 CB
\vskip0.500000\baselineskip
(G)
TELÉFONO: (31) 71-5258282
\vskip0.500000\baselineskip
(H)
TELEFAX: (31) 71-5221471
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Nuevos promotores constitutivos de plantas
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 22
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
FORMA LEGIBLE PARA EL ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: PC compatible con IBM
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: Salida del PatentIn 1.0, Versión 91.25 (EPO)
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS PREVIOS DE LA SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: EP 97203912.7
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: 12-DIC-1997
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 520 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 1:
2
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 300 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
3
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 840 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
4
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 477 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Arabidopsis thaliana
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
5
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGATTTGTAT TGCAGCGATT TCATTTTAG
\hfill
29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ATCTGGTCAC AGAGCTTGTC
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTCTCCATGG TGCTACAAAG AATAG
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CGGGATCCTG CAGCGATTTC ATTTTAG
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACATGAACGA ATGCAAAATC TC
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGATTTTGCA TTCGTTCATG TG
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TYPE: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TGTAAGCATT TCTTAGATTC TC
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AAGAAATGCT TACAGGATAT GG
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 34 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GACAAGCTTG ATCCCATGGT GCTACAAAGA ATAG
\hfill
34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 31 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGTGGTACCA TCATAATACT CATCCTCCTT C
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 37 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CGAAGCTTTA CAAATCTAAT TTCATCACTA AATCGGA
\hfill
37
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 35 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GCTGCAATAC AAATCTAATT TCATCACTAA ATCGG
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 876 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Arabidopsis thaliana
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
6
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1357 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 18:
7
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 34 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTCTTGTACA AATCTAATTT CATCACTAAA TCGG
\hfill
34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 34 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TTAGATTTGT ACAAGACCCT TCCTCTATAT AAGG
\hfill
34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TTCCCAGTCA CGACGTTGT
\hfill
19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEQ ID NO: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1006 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 22:
8

Claims (15)

1. Un promotor quimérico de plantas, en el que dicho promotor comprende un promotor mínimo y elementos activadores de la transcripción de un juego de promotores en el que un elemento activador de la transcripción de dicho juego de promotores proviene de un promotor que es específicamente activo en partes verdes de la planta y un elemento activador de la transcripción de dicho juego de promotores proviene de un promotor que es específicamente activo en partes subterráneas de la planta.
2. Un promotor quimérico de acuerdo con la reivindicación 1, que es constitutivo y una combinación del promotor de la ferrodoxina y el promotor de RolD.
3. Un promotor quimérico de plantas de la reivindicación 2, en el que el elemento promotor mínimo deriva del promotor de la ferredoxina.
4. Un promotor quimérico de plantas de acuerdo con la reivindicación 2 ó 3, en el que el promotor de la ferredoxina deriva de Arabidopsis thaliana.
5. Un promotor quimérico de plantas de acuerdo con la reivindicación 4, que comprende las secuencias de SEQ ID NO:1 y SEQ ID NO:2.
6. Un promotor quimérico de acuerdo con la reivindicación 5, que comprende la secuencia de SEQ ID NO: 3.
7. Un promotor quimérico constitutivo de plantas, que es una combinación del promotor de la plastocianina y de la S-adenosil-metionina-1
8. Un promotor quimérico de plantas de acuerdo con la reivindicación 7, en el que el elemento promotor mínimo deriva del promotor de la S-adenosil-metionina-1.
9. Un promotor quimérico de plantas de acuerdo con la reivindicación 7 u 8, en el que el promotor de la plastocianina deriva de Arabidopsis thaliana.
10. Un promotor quimérico de plantas de acuerdo con la reivindicación 7, 8 ó 9, en el que el promotor de la
S-adenosil-metionina-1 deriva de Arabidopsis thaliana.
11. Un promotor quimérico de plantas de acuerdo con la reivindicación 10, que comprende las secuencias de SEQ ID NO: 4 y SEQ ID NO:17.
12. Un promotor quimérico de plantas de acuerdo con la reivindicación 11, que comprende la secuencia de SEQ ID NO: 21.
13. Una construcción génica quimérica para la expresión de genes en plantas que comprende el promotor quimérico de plantas de cualquiera de las reivindicaciones 1-12.
14. Una planta que comprende un promotor quimérico de plantas de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12 o una construcción de acuerdo con la reivindicación 13.
15. Una planta de acuerdo con la reivindicación 14, que se selecciona del grupo que consiste en tomate; Brassica napus y patata.
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