ES2222465T3 - Calpaina activa expresada por baculovirus. - Google Patents
Calpaina activa expresada por baculovirus.Info
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION ESTA DIRIGIDA A CALPAINA ENZIMATICAMENTE ACTIVO DE MAMIFERO PRODUCIDO EN CELULAS DE INSECTO MEDIANTE ELEMENTOS RECOMBINANTES. SE DESCRIBEN VECTORES RECOMBINANTES Y BACULOVIRUS QUE CONTIENEN CADN QUE CODIFICA LA SUBUNIDAD DE 80 KDA, LA SUBUNIDAD DE 30 KDA, Y AMBAS SUBUNIDADES. TAMBIEN SE DESCRIBEN METODOS PARA PRODUCIR CALPAIN RECOMBINANTE ENZIMATICAMENTE ACTIVO DE MAMIFERO.
Description
Calpaína activa expresada por baculovirus.
La presente invención se refiere a la calpaína
humana recombinante enzimáticamente activa y su procedimiento de
preparación usando tecnología recombinante en un sistema de
baculovirus-célula de insecto.
La calpaína es una proteasa neutra activada por
calcio, también conocida como CANP; EC 3.4.22.17. Es una cisteína
proteasa intracelular que se expresa de manera ubicua en los tejidos
de los mamíferos (Aoki y col., FEBS Letters 205:
313-317, 1986). Se ha implicado a la calpaína en
muchas enfermedades degenerativas que incluyen, aunque no se limitan
a, neurodegeneración (enfermedad de Alzheimer, enfermedad de
Huntington y enfermedad de Parkinson), amiotrofia, accidente
cerebrovascular, lesión de las neuronas motoras, lesión aguda del
sistema nervioso central (SNC), distrofia muscular, reabsorción
ósea, agregación plaquetaria e inflamación.
La calpaína de los mamíferos, incluyendo la
calpaína humana, es multimérica. Está formada por dos subunidades
diferentes, que son una subunidad de 30 kDa y una subunidad de 80
kDa, y, por lo tanto, es un heterodímero. Hay dos formas de
calpaína, calpaína I (\mu-calpaína, \muCANP) y
calpaína II (m-calpaína, mCANP), que se diferencian
por su sensibilidad a la concentración de calcio necesaria para la
activación. La calpaína I sólo precisa concentraciones micromolares
bajas de calcio para su activación, mientras que la calpaína II
precisa concentraciones micromolares altas o milimolares (Aoki y
col., supra., y DeLuca y col., Biochim. Biophys. Acta 1216:
81-83, 1993). La misma subunidad de 30 kDa es común
a las dos formas. Las dos calpaínas humanas difieren en las
secuencias del ADN que codifica su subunidad de 80 kDa, y comparten
una homología de 62%. Hay datos de que la subunidad de 80 kDa es
inactiva, pero se autolisa a una forma activa de 76 kDa en presencia
de calcio (Zimmerman y col., Biochem. Biophys. Acta 1078:
192-198, 1991).
R. Siman, en Neurotoxicity of Excitatory Amino
Acids, A. Guidotti, ed., Raven Press, Ltd., Nueva York (1990),
describió la función de la calpaína I en la neurotoxicidad inducida
por aminoácidos excitadores (AAE), que finalmente lleva a la muerte
célula neuronal. Siman anticipó la propuesta de que la activación de
la calpaína I es un episodio temprano en el proceso
neurodegenerativo y no sólo simplemente una respuesta secundaria a
la muerte neuronal. Siman además describió que en ese momento sólo
se disponía de un bloqueante altamente selectivo de la calpaína, la
calpastatina. Sin embargo, las células no captan fácilmente
calpastatina, porque es una proteína globulosa de gran tamaño,
aproximadamente 280 kDa. Siman también describió que los inhibidores
de proteasas de una especificidad más amplia, incluyendo la
leupeptina, eran ineficaces para reducir la degradación proteica
inducida por AAE in vivo. La leupeptina fue ineficaz
probablemente porque no pudo entrar en las células.
Iwamoto y col., Brain Research, 561:
177-180 (1991), describieron que la activación de la
calpaína puede ser un factor importante en la proteólisis anormal
que subyace a la acumulación de placas y de marañas en el tejido
cerebral de personas que sufren demencia de tipo Alzheimer.
Saito y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
90: 2628-2632 (1993) describieron que la pérdida
sináptica y la muerte celular neuronal se corresponden en gran
medida con el grado de deterioro cognitivo en la enfermedad de
Alzheimer. También describieron que la calpaína I estaba
significativamente activada en el cerebro humano postmortem de
pacientes con enfermedad de Alzheimer, y que el grado de activación
se correspondía con las regiones el cerebro que mostraban la mayor
cantidad de degeneración. Se indicó que las influencias de la
activación de la calpaína pueden contribuir a la patología
neurofibrilar y al procesamiento anormal de las proteínas
precursoras del amiloide antes de producir pérdida de las sinapsis o
muerte celular en las poblaciones neuronales más vulnerables. Debido
a la asociación entre la calpaína y las enfermedades degenerativas
nerviosas, la modulación farmacológica de las calpaínas por los
inhibidores merece consideración como posible estrategia terapéutica
en esas enfermedades, por ejemplo, en la enfermedad de
Alzheimer.
Rami y col., Brain Research, 609:
67-70 (1993). describieron que tanto el inhibidor I
de la calpaína como la leupeptina protegían a las neuronas frente a
la lesión isquémica y tóxica que se debe a la isquemia que se induce
cuando se pinzan las dos arterias carótidas y se reduce la tensión
arterial de las ratas.
Lee y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
88: 7233-7237 (1991), aportan datos de que la
proteólisis activada por calcio es un acontecimiento importante en
el proceso de muerte celular post-isquémica y
describieron que la inhibición de la proteólisis activada por calcio
mediante el inhibidor proteolítico leupeptina protegía frente a la
degeneración de las neuronas vulnerables del hipocampo después de la
isquemia. Se seleccionó la leupeptina porque era el único inhibidor
de las proteasas que se había mostrado previamente que bloqueaba una
respuesta de calpaína desencadenada por un traumatismo in
vivo (Seubert y col., Brain Res., 459:
226-232, 1988). Sin embargo, los autores advirtieron
que la utilidad terapéutica de la modulación de la proteólisis
activada por calcio dependerá probablemente del desarrollo de
inhibidores de las proteasas más permeables, potentes y
específicos.
Como es evidente de lo anterior, los inhibidores
específicos de la calpaína pueden suponer un medio para tratar las
enfermedades neurodegenerativas en las que está implicada la
calpaína. La calpastatina ofrece una utilidad escasa debido a su
impermeabilidad celular. Los inhibidores de las proteasas de
especificidad más amplia pueden no actuar in vivo y/o pueden
tener efectos adversos indeseables. Así, se deben identificar otros
inhibidores de la calpaína, y una fuente fácil, conveniente y segura
de calpaína favorecerá la investigación en búsqueda de esos
inhibidores.
La calpaína humana recombinante enzimáticamente
activa para hacer estudios en busca de inhibidores ofrece las
ventajas de 1) ser una fuente considerablemente más conveniente y
fácilmente disponible de grandes cantidades del enzima, 2) ser más
fácil de purificar y 3) estar libre de los problemas de seguridad
que se deben abordar cuando la fuente es un tejido humano,
especialmente células sanguíneas humanas, es decir, virus
potencialmente peligrosos. La calpaína humana natural se aísla
actualmente a partir de eritrocitos humanos y se puede purificar
hasta lo que los autores caracterizan como homogeneidad aparente
(Hatanaka y col., Biomed. Res., 4: 381-388,
1983). Sin embargo, aparte de los problemas evidentes con la fuente,
el procedimiento de purificación puede ser bastante tedioso, debido
a las bajas concentraciones de calpaína en relación con la cantidad
de material inicial. Además, la calpaína natural se aísla en
presencia de un inhibidor endógeno (calpastatina) que se debe
separar durante la purificación. Una buena fuente de grandes
cantidades de calpaína enzimáticamente activa potenciaría mucho la
investigación en búsqueda de inhibidores de la calpaína mediante 1)
el incremento de la disponibilidad de calpaína para su uso en
ensayos reproducibles de inhibidores de la calpaína y 2) la
facilitación de la cristalización del enzima, lo que permite el
diseño de inhibidores racionales. Un sistema recombinante para la
producción facilita aún más la producción de mutantes dirigidos para
ayudar a los estudios estructurales. Por lo tanto, es necesario un
sistema recombinante para producir calpaína activa.
El problema de la producción de la calpaína
enzimáticamente activa por medios recombinante es el de expresar dos
productos génicos diferentes (la subunidad de 80 kDa y la subunidad
de 30 kDa), conseguir un procesamiento y plegado adecuados de los
productos individuales, y obtener la combinación adecuada de los dos
productos para producir moléculas enzimáticamente activas. Como se
ha afirmado en el análisis previo, se ha implicado a la calpaína
activada en la muerte de células neuronales. Entonces,
lamentablemente cabría esperar que cualquier calpaína
enzimáticamente activa que se produzca en un sistema recombinante
sea deletérea o letal para ese sistema de expresión. Cabría esperar
que cualquier efecto deletéreo sobre el sistema de expresión
aumentara a medida que se expresara más producto activado. De manera
notable, muchas células de mamíferos producen un inhibidor endógeno
de la calpaína, que puede ejercer un control importante sobre la
actividad de una proteasa que de otra manera sería letal.
Aoki y col., supra, describieron la
secuencia de aminoácidos completa de la subunidad de 80 kDa de la
calpaína humana I (\muCANP), que dedujeron a partir de la
secuencia de un clon de ADNc de la calpaína humana. El clon de ADNc
de la calpaína humana se aisló de la biblioteca de ADNc de músculo
esquelético humano usando como sonda un ADNc para la subunidad mayor
de la \muCANP de conejo. No se describe la expresión del ADNc.
Imajoh y col., Biochemistry, 27:
8122-8128 (1988), describieron el aislamiento de un
clon de ADNc para la subunidad mayor de la calpaína humana II
procedente de una biblioteca de músculo esquelético humano usando
sondas con CANP de pollo y mCANP de conejo. Se describió que la
proteína deducida tenía esencialmente las mismas características
estructurales que las que se habían descrito para la \muCANP y
para la CANP del pollo. Las similitudes de la secuencia de
aminoácidos de la mCANP humana con la \muCANP humana y la CANP del
pollo se describieron como 62% y 66%, respectivamente. No se
describe ni se indica la expresión del ADNc.
Ohno y col., Nucleic Acids Research, 14:
5559 (1986), describieron la secuencia de un ADNc que codifica la
subunidad menor (30 kDa) de la proteasa humana activada por calcio
aislada a partir de una biblioteca de ADNc de bazo humano. Las
comparaciones con la secuencia de aminoácidos descrita de las
secuencias del conejo y del cerdo mostraron diferencias de sólo
3%.
DeLuca y col., supra., describieron la
clonación molecular y la expresión bacteriana del ADNc de la
subunidad de 80 kDa de la calpaína II de la rata (mCANP). El ADNc
codifica una proteína que se ha mostrado que tiene una identidad de
secuencia de 93% con la calpaína humana II, y una identidad de 61%
con la calpaína humana I. La expresión del ADNc se realizó en
bacterias E. coli en un vector de expresión fagémido. Puesto
que el producto expresado era insoluble e inactivo después de la
sonicación celular, no se pudo utilizar para hacer el cribado de los
inhibidores de la calpaína.
V. Luckow, Current Opinion in
Biotechnology, 4: 546-572 (1993), y Kidd y col.,
Applied Biochem. and Biotech., 42: 137-159
(1993), han revisado recientemente los sistemas de baculovirus para
la expresión de productos génicos humanos y el uso de baculovirus
como vectores de expresión, respectivamente. Luckow analizó la
producción de diferentes tipos de proteínas, incluyendo enzimas. Sin
embargo, sólo se menciona la producción de un enzima proteolítico, a
saber, la metaloproteasa estromelisina. Al contrario que calpaína,
este enzima no es multimérico.
Kidd y col. analizaron el uso de proteínas
producidas por baculovirus para el análisis estructural con rayos X
y para el ensamblado de subunidades para formar moléculas
funcionales con múltiples subunidades. Diversos ejemplos mostraron
el ensamblado adecuado de las subunidades para producir moléculas
funcionales. Aunque el autor afirmó de manera general que la
expresión de los baculovirus da lugar a la integridad estructural de
las moléculas plegadas y a la función biológica completa en
prácticamente todos los casos, no se describió el ensamblado de las
subunidades de enzimas diméricos o multiméricos en un enzima
funcional. Además, en otros casos que implicaban moléculas con
múltiples subunidades, por ejemplo, Na,K,ATPasa, a veces el
ensamblado de las subunidades no fue eficiente. (Véase DeTomaso y
col., infra.).
Otros autores han descrito la expresión de
enzimas en el sistema de baculovirus. Vernet y col., J. Biol.
Chem., 27: 16661-16666 (1990), describieron la
secreción de un precursor de papaína a partir de células de
insectos. La papaína es una cisteína proteasa. El gen de la
prepropapaína se clonó en el vector de transferencia IpDC125 detrás
del promotor poliédrico. El constructo recombinante se incorporó
mediante recombinación homóloga en el interior del genoma del virus
de la poliedrosis Autographa californica. Se recuperó un
precursor enzimáticamente inactivo de papaína a partir de células
Sf9 de Spodoptera frugiperda infectadas con el baculovirus
recombinante. No se produjo un procesado adecuado del precursor de
papaína para producir un enzima activo en las células
infectadas.
Fertig y col., Cytotechnology, 11:
67-75 (1993) describieron la producción de
procalicreína, que es un precursor de calicreína, una serina
proteasa. Se produjo la procalicreína en células de insectos de
Spodoptera frugiperda (Sf9) y Mamestra brassicae
(IZD-Mb503) infectadas con un virus recombinante de
la poliedrosis nuclear Autographa californica (AcNPV), cepa
E2. Para obtener un enzima activo, la procalicreína que se obtuvo se
activó in vitro usando tripsina.
Button y col., Gene, 133:
75-81 (1993) describieron la producción de la
metaloproteinasa GP63 de Leishmania major en un sistema de
expresión de baculovirus-célula de insecto. El
enzima se secretó a partir de células de Spodoptera
frugiperda (Sf9) infectadas con un virus recombinante de la
poliedrosis nuclear Autographa californica (AcNPV) como una
proteasa latente que se activó posteriormente hasta la actividad
proteinasa completa por medio de un tratamiento con HgCl_{2}.
Hirowatari y col., Arch. Virol., 133:
349-356 (1993), describieron la expresión de un
polipéptido que se cree que exhibe dos actividades proteinasa
víricas necesarias para el procesado de la proteína precursora
vírica del virus de la hepatitis C (VHC). El polipéptido se expresó
en la línea celular de insecto Sf21 infectada con un baculovirus
recombinante. Se utilizó el vector de transferencia de baculovirus
pVL941. Las actividades proteinasa se infirieron a partir de la
presencia de una proteína procesada de 70 kDa.
Aunque, que sepan los inventores, todavía no se
ha descrito la producción de proteasas multiméricas enzimáticamente
activa en el sistema de baculovirus, el sistema de baculovirus se ha
usado para expresar enzimas multiméricos funcionales distintos a las
proteasas. DeTomaso y col., J. Biol. Chem., 268(2):
1470-1478 (1993), describen la expresión de Na-
K-ATPasa funcional de rata usando el sistema de
expresión de baculovirus. Se eligió un sistema de expresión que usa
células de insecto porque algunas células de insecto tienen
concentraciones escasas o nulas de Na, K-ATPasa. Se
eligió un sistema de baculovirus porque las células infectadas con
baculovirus producen cantidades elevadas de proteína extraña. Se
utilizaron células Sf9 derivadas de Spodoptera frugiperda. El
baculovirus fue Autographa californica. Sin embargo, puesto
que la actividad del enzima de las células de insecto fue sólo de
20%-25% de la actividad de la médula externa del riñón de perro, los
autores concluyeron que una porción del enzima que se expresaba era
inactiva.
Wen-Ji y col.,J. Biol.
Chem., 268(13): 9675-9680 (1993),
describen la expresión de la proteína funcional de mamíferos
farnesiltransferasa en un sistema de baculovirus usando células Sf9.
La actividad expresa específica de la proteína expresada fue 510
nM/mg/h, que se afirma que es esencialmente idéntica a la que se ha
descrito para el enzima del cerebro de rata. Sin embargo, se observó
que las cantidades de proteína que se obtenían a partir del tejido
natural no habían permitido previamente el ensayo directo de la
concentración de proteína, de modo que ésta fue la primera vez que
se determinó la actividad específica de la proteína usando un ensayo
estándar de proteínas.
No hay descripción o indicación de la expresión
de una proteasa enzimáticamente activa, multimérica y potencialmente
mortal como calpaína en ningún sistema de expresión. Se espero que
la expresión de la calpaína I, en particular, sería difícil y
precisaría la presencia de un inhibidor, puesto que la calpaína I se
activa a concentraciones extremadamente bajas de Ca^{2+}, que se
podrían conseguir durante el ciclo de infección. Sorprendentemente,
los presentes inventores encontraron de manera inesperada que se
puede expresar calpaína enzimáticamente activa en el sistema de
baculovirus, y en ausencia de un inhibidor.
La presente invención se dirige a la producción
de calpaína de mamíferos enzimáticamente activa por medios
recombinantes. Se describe específicamente la producción de calpaína
I humana recombinante enzimáticamente activa en un sistema de
baculovirus-célula de insecto. La calpaína que se
produce de esa manera se puede usar de forma beneficiosa en ensayos
para hacer el cribado de posibles inhibidores de la calpaína,
adelantando así la técnica al permitir una selección rápida y
eficiente de los inhibidores de la calpaína que se pueden usar para
tratar las enfermedades en las que se ha implicado a la calpaína, y
para ofrecer suficiente calpaína como para que se pueda cristalizar
para el diseño racional de inhibidores de la calpaína. La calpaína
que se produce de esta manera también se puede usar en otras
aplicaciones, incluyendo como producto para ablandar la carne y como
disolvente de los coágulos sanguíneos.
En un aspecto, la presente invención se dirige a
la calpaína de mamíferos enzimáticamente activa producida por
tecnología recombinante.
En otro aspecto, la presente invención se refiere
a vectores plasmídicos que comprenden ADNc que codifica calpaína de
mamíferos para la producción de calpaína de mamíferos recombinante
enzimáticamente activa.
En otro aspecto adicional, la presente invención
se refiere a baculovirus recombinantes que comprenden ADNc que
codifica calpaína de mamíferos para la producción de calpaína de
mamíferos recombinante enzimáticamente activa.
En otro aspecto adicional, la presente invención
se refiere a un procedimiento para producir calpaína de mamíferos
enzimáticamente activa por medios recombinantes usando un sistema de
baculovirus-célula de insecto.
La Figura 1 representa la estrategia de clonación
para la subunidad de calpaína de 30 kDa.
La Figura 2 representa la estrategia de clonación
para la subunidad de calpaína I de 80 kDa.
La Figura 3 representa la estrategia de clonación
para el doble constructo.
La Figura 4 representa la expresión de las
subunidades en células Sf21 determinada mediante
inmunotransferencia.
Las Figuras 5 a-d representa la
medición de la actividad de la proteasa dependiente de calcio.
Las Figuras 6 a-b representan el
procesado dependiente de calcio de la subunidad de 80 kDa inactiva a
la forma activa de 76 kDa.
La Figura 7 representa la mejora de la expresión
en un medio sin suero.
La Figura 8 representa la medición de la
actividad proteasa dependiente de calcio de la subunidad de 80 kDa
expresada sola.
La Figura 9 representa los perfiles de activación
por calcio de la calpaína I humana recombinante y natural.
La presente invención se dirige a la producción
de calpaína I de mamíferos, específicamente calpaína I
enzimáticamente activa, por medios recombinantes. "Calpaína",
como se usa en la presente memoria descriptiva, se refiere al
heterodímero formado por las dos subunidades. Estas subunidades son
la subunidad menor, que tiene un peso molecular de aproximadamente
30 kDa, y la subunidad mayor, que tiene un peso molecular de
aproximadamente 80 kDa, dependiendo de su estado de activación. La
referencia a la unidad de 80 kDa incluye al menos las formas de 77
kDa y 76 kDa que se obtienen por la autólisis de la subunidad de 80
kDa. Como será evidente para los expertos en la materia, las
subunidades de las diferentes especies de mamíferos, incluso las
subunidades de diferentes tejidos de la misma especie de mamíferos
(Hatanaka, supra), pueden variar en peso molecular. Se
incluyen estas variaciones.
"Enzimáticamente activa", como se usa en la
presente memoria descriptiva, se refiere a la capacidad de
hidrolizar de manera medible al menos un sustrato conocido de
calpaína, incluyendo la propia calpaína, es decir, como consecuencia
de la autólisis. La actividad enzimática se puede medir por
cualquier medio aceptable para los expertos en la materia para hacer
esas determinaciones incluyendo, aunque no se limita a, medios
fluorescentes y colorimétricos. Se incluye la porción de cada
subunidad que es suficiente para mantener la actividad enzimática
como se ha descrito más arriba. El procedimiento según la presente
invención facilita la determinación sencilla de las regiones de la
secuencia codificante (ADNc) necesarias para la actividad enzima
tica y los cambios de actividad que pueden deberse a la mutación
intencional de la secuencia codificante. La frase "enzimáticamente
activa después de su expresión", como se usa en la presente
memoria descriptiva, se refiere a la calpaína, o a una subunidad de
la misma, que tiene una actividad enzimática medible después de su
expresión sin que sea necesaria ninguna manipulación diferente a la
presencia de calcio.
"Expresión", como se usa en la presente
memoria descriptiva, incluye, pero no se limita a, la traducción
in vitro del ADNc contenido en los vectores y en los virus
según la invención en células de insecto y de otro tipo. Puesto que
habitualmente hay algo de Ca^{2+} durante la expresión,
particularmente en el caso de un medio que contiene suero, la
calpaína que se producen esa manera es enzimáticamente activa en el
momento de su expresión.
El término "recombinante", como se usa en la
presente memoria descriptiva, incluye, pero no se limita a, una
molécula, microorganismo, plásmido, fago u otro vector, que contiene
una nueva combinación de secuencias de ADN. El término
"microorganismo" incluye virus y bacterias. Los términos
"plásmido", "fago" y "vector" se usan según su
significado según lo conocen los expertos en la materia tal y como
se define, por ejemplo, en A Dictionary of Genetic
Engineering, Stephen G. Oliver y John M. Ward., eds., Cambridge
University Press, Cambridge, 1988.
El término "mamíferos" incluye todos los
animales de la clase filogenética "mammalia". Preferentemente,
la calpaína es calpaína humana recombinante enzimáticamente activa.
Más preferentemente, la calpaína es calpaína I humana recombinante
enzimáticamente activa.
El baculovirus Autographa californica,
virus de la poliedrosis nuclear (AcNPV), que se usa en la
descripción siguiente, es ejemplar. Sin embargo, se pueden
considerar otros baculovirus como el virus de la poliedrosis nuclear
Bombyx mori (BmNPV), el virus de la poliedrosis nuclear
Heliothis zea, el virus de la poliedrosis nuclear
Lymantria dispar, así como el baculovirus Orcytes, y
virus de las familias Poxviridae y Parvoviridae,
Choristoneura y Amsacta, en lugar del AcNPV. Véase
"Insect Cell Expression Technology", págs.
1-40, en Principles and Practice of Protein
Engineering, Jeffrey L. Cleland y Charles S. Craik (eds.), John
Wiley & Sons, 605 Third Avenue, Nueva York, NY
10158-0012.
Mientras que las células del insecto
Spodoptera frugiperda se usaron para ilustrar la presente
invención, se han establecido más de 400 líneas celulares de insecto
y se pueden usar, especialmente las de Trichoplusia ni. Véase
Cleland y Craik, supra. Los expertos en la materia pueden
determinar fácilmente una célula de insecto adecuada para la
expresión. También se contempla que se pueden utilizar otras
células, como levaduras y células de mamífero, con el vector
apropiado, y la selección de éste está dentro de la maestría en la
materia.
Los genes heterólogos que van a expresar los
baculovirus están habitualmente bajo el control de los promotores de
la poliedrina o de los promotores P10 del AcNPV, porque los genes de
la poliedrina y P10 no son esenciales para la replicación ni la
maduración del virus y se transcriben mucho. Esto en modo alguno
limita el uso de otros promotores para la práctica de esta
invención. Véase Cleland y Craik, supra.
Se describe específicamente la expresión y la
recuperación de la calpaína recombinante enzimáticamente activa.
Esto fue inesperado, particularmente para la calpaína I, que se
activa en presencia de cantidades micromolares de calcio, porque hay
Ca^{2+} en el medio de cultivo tisular en el que se cultivan las
células que se usan para su producción. Puesto que las células
infectadas generalmente se vuelven "permeables", se esperó que
el Ca^{2+} pudiera entrar en las células desde el medio
circundante en una cantidad suficiente como para activar cualquier
calpaína I producida que, a su vez, sería letal para las células y
haría que la calpaína I se dirigiera frente a sí misma mediante
autólisis.
Se ha determinado que la calpaína que se produce
por medios recombinantes es completamente activa desde el punto de
vista enzimológico y que tiene un perfil de actividad enzimática
similar al de la calpaína natural, lo que es importante para el uso
de esa calpaína obtenida por medios recombinantes en el cribado de
posibles inhibidores terapéuticos de la calpaína. La calpaína
producida por medios recombinantes mostró una sensibilidad similar a
los inhibidores conocidos de la calpaína, y una ausencia de
sensibilidad a los inhibidores de la serina o aspártico proteasa. La
cantidad de calcio necesaria para conseguir ½ V_{max} fue
esencialmente la misma para la calpaína natural y recombinante. De
manera similar, las velocidades de hidrólisis del sustrato fueron
similares, al igual que las actividades específicas (no se muestran
los datos). De nuevo, esas características son importantes para el
aprovechamiento completo de la calpaína según la invención.
Sorprendentemente, se determinó que la actividad
específica de la subunidad de 80 kDa sola era aproximadamente
20%-25% de la del heterodímero. Previamente se había determinado que
la actividad específica de la subunidad de 80 kDa disociada del
heterodímero natural era sólo el 3% de la del heterodímero. (Kikuchi
y col., Arch. Biochem. Biophys., 234:
639-645, 1984). Así, la estructura de la subunidad
de 80 kDa producida por medios recombinantes parece ser diferente a
la de la subunidad disociada de la calpaína natural, y puede
representar de manera más cercana la estructura de la subunidad
activa. Por lo tanto, la producción recombinante de las subunidades
de calpaína facilita el estudio de la estructura de las subunidades
individuales.
En la presente invención, se consiguió la
expresión de la calpaína mediante la expresión de las subunidades de
80 kDa y de 30 kDa en las mismas células de insecto mediante la
coinfección de las células con dos virus separados que comprenden un
ADNc para cada subunidad de la calpaína, o mediante la infección de
las células de insecto con un solo virus que comprende ADNc para las
dos subunidades. También se descubrió que se expresa una mayor
cantidad de la subunidad de 80 kDa cuando se coexpresa la subunidad
de 30 kDa, de modo que la subunidad de 30 kDa puede tener un efecto
estabilizador sobre la subunidad de 80 kDa.
Cuando las células se infectan con virus que
contienen las dos subunidades de calpaína, todas las células
infectadas deben expresar las dos subunidades. Independientemente de
la multiplicidad de la infección (MI) añadida, cuando las células se
infectan con virus que contienen sólo una subunidad o la otra, es
necesaria una mayor MI para conseguir la expresión de ambas
subunidades, por ejemplo, es necesaria una MI de 5 para cada virus
para que el 99% de las células contenga una o más partículas de los
dos virus y, de esta manera, exprese las dos subunidades. En una
forma de realización preferida, la expresión se lleva a cabo
mediante la coexpresión de las dos subunidades en una sola
célula.
célula.
Para construir los baculovirus de calpaína
recombinantes, se prepararon sondas para parte de las regiones
codificantes de las subunidades de 30 kDa y de 80 kDa mediante la
reacción en cadena de la polimerasa (RCP) a partir de una biblioteca
de ADNc y se usaron para hacer el cribado en una biblioteca de fagos
de ADNc humano. Se aislaron los fagos que contenían la mayor parte
de la región codificante de cada una de las subunidades y se
subclonó el ADN inserto. Cualquier región que no estaba presente en
los clones aislados se amplificó mediante RCP a partir de la
biblioteca, se verificó la secuencia y se unió a los clones
parciales para producir toda la región codificante de la calpaína.
La biblioteca de ADNc humano que se eligió fue una biblioteca de
bazo que se consiguió de Clontech (Palo Alto, CA, nº HL1134a). Se
eligió una biblioteca de bazo basándose en la abundante expresión de
calpaína I y II que se había descrito en el bazo de rata (Murachi y
col., Trends Biochem. Sci., 8: 167-179,
1983).
La Tabla 1 presenta los cebadores de
oligonucleótidos sintéticos que se usaron para la amplificación de
porciones de las subunidades de la calpaína humana de 80 kDa y de 30
kDa. Se seleccionaron los cebadores basándose en las secuencias
publicadas de ADNc para la subunidad de 80 kDa de la calpaína I
(Aoki y col., FEBS Lett., 205: 313-317, 1986)
y para la subunidad de 30 kDa (Ohno y col., Nucl. Acids
Res., 14: 5559, 1986, que se incorpora a la presente memoria
descriptiva como referencia). Además, los cebadores para la
subunidad de 80 kDa de la calpaína I se seleccionaron basándose en
la ausencia de similitud con la calpaína II humana relacionada, y
los cebadores para la subunidad de 80 kDa de la calpaína II se
eligieron basándose en la ausencia de similitud con la calpaína I
humana. Se seleccionó que los cebadores internos estuvieran
inmediatamente fuera de los puntos conocidos de la endonucleasa de
restricción, lo que permitió la posterior digestión en esos puntos
para subclonar en vectores plasmídicos los fragmentos obtenidos
mediante RCP. Todas las secuencias de la Tabla 1 se presentan en
sentido 5' a 3'. Una "S" después de la secuencia indica
sentido. Una "AS" después de la secuencia indica antisentido.
Los cebadores de la unidad de 30 kDa se indican con "30" y los
cebadores de las subunidades de 80 kDa se denominan "80I" y
"80II", respectivamente. Los números entre paréntesis debajo de
los números de identificación de las secuencias representan las
denominaciones internas de los laboratorios y éstas se usarán en los
Ejemplos siguientes.
Todas las reacciones en cadena de la polimerasa
se realizaron en un ciclador térmico (Perkin-Elmer,
Norwalk, CT) usando 2,5 unidades de ADN polimerasa Taq (Promega,
Madison, WI), 3 unidades de ADN polimerasa UlTma
(Perkin-Elmer, Norwalk, CT) o 2 unidades de ADN
polimerasa Tli (Promega, Madison, WI) en presencia del tampón
suministrado, 0,2 mM de dNTP (polimerasas ADN Taq y Tli) o 40 \muM
de dNTP (ADN polimerasa UlTma), con la adición de MgCl_{2}
0,75-2 mM y 0,25 \muM de cada cebador. Después de
una incubación desnaturalizadora inicial durante 5 min a 94ºC, se
llevaron a cabo 30-35 ciclos de amplificación como
se indica más adelante, seguidos de una extensión final a 72ºC
durante 7 minutos. La plantilla fue 1-10 \mul de
biblioteca de fagos lambda, o fago parcialmente purificado, añadido
a un mínimo de 30 \mul de agua destilada. Se liberó el ADN para la
amplificación mediante tres congelaciones posteriores en nieve
carbónica de etanol seguidas por descongelación a 37ºC.
La Figura 1 representa la estrategia para la
clonación de la subunidad de 30 kDa de la calpaína humana. Se usaron
los cebadores DL-13 5' > GGTGGAACGGCCATGCGCATC
> 3' y SM-36 5' >
CGGGATCCTTAGGAATACA
TAGTCAGCTGCAGCC > 3' para amplificar los pares de bases nº 163-805 del ADNc humano de 30 kDa procedente de la biblioteca \lambdagt10 de bazo humano HL1134a (Clontech Laboratories, Inc., Palo Alto, CA) para su uso como sonda. La numeración de los pares de bases (pb) de la secuencia se inicia tras considerar que el codón de iniciación "ATG" son los pares de bases nº 1-3. Las condiciones para la RCP fueron las que se indican más arriba, usando 30 ciclos de amplificación de 1 minuto a 94ºC, 1 minuto a 55ºC y 1 minuto a 72ºC. Se aisló el fragmento de 643 pb a partir de agarosa de baja temperatura de fusión después de la electroforesis (SeaPlaque-GTG, FMC Bioproducts, Rockland, ME) y se purificó mediante extracción con fenol-cloroformo. Posteriormente se marcó el fragmento con [32]P-dCTP (Amersham, Arlington Heights, IL) mediante marcado con cebado aleatorio usando ADN polimerasa Klenow según el procedimiento suministrado (Promega Corp., Madison, WI) y se usó para hacer el cribado en la biblioteca como se señala a continuación.
TAGTCAGCTGCAGCC > 3' para amplificar los pares de bases nº 163-805 del ADNc humano de 30 kDa procedente de la biblioteca \lambdagt10 de bazo humano HL1134a (Clontech Laboratories, Inc., Palo Alto, CA) para su uso como sonda. La numeración de los pares de bases (pb) de la secuencia se inicia tras considerar que el codón de iniciación "ATG" son los pares de bases nº 1-3. Las condiciones para la RCP fueron las que se indican más arriba, usando 30 ciclos de amplificación de 1 minuto a 94ºC, 1 minuto a 55ºC y 1 minuto a 72ºC. Se aisló el fragmento de 643 pb a partir de agarosa de baja temperatura de fusión después de la electroforesis (SeaPlaque-GTG, FMC Bioproducts, Rockland, ME) y se purificó mediante extracción con fenol-cloroformo. Posteriormente se marcó el fragmento con [32]P-dCTP (Amersham, Arlington Heights, IL) mediante marcado con cebado aleatorio usando ADN polimerasa Klenow según el procedimiento suministrado (Promega Corp., Madison, WI) y se usó para hacer el cribado en la biblioteca como se señala a continuación.
Para el cribado se colocó la biblioteca en placas
C600hfl suministradas por Clontech. Se colocaron
aproximadamente 350.000 unidades formadoras de placas en 14 placas
de Petri de 150 mm de diámetro. Se prepararon duplicados de
nitrocelulosa a partir de estas placas según los procedimientos que
describieron Sambrook y col., Molecular Cloning: A Laboratory
Manual, (segunda edición), pág. 1-1626, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY. Las reacciones de
hibridación con la sonda marcada y desnaturalizada se realizaron
durante la noche a 68ºC en 6 x SSC, fosfato sódico 50 mM, a pH 6,8,
poli A 10 a 10 mg/ml (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO), heparina
0,2 mg/ml (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO) y DSS al 0,5%, seguido
por dos lavados con 3 x SSC y DDS al 0,1% durante 30 minutos a 55ºC.
Las placas marcadas se detectaron mediante autorradiografía.
Se encontró que dos fagos tenían insertos que
contenían una porción del ADNc de la subunidad de 30 kDa. Todo el
extremo 5' del ADNc, que terminaba con el punto EcoRI interno
en el pb nº 488, estaba presente en el fago lambda que se denominó
14.2.4. El fago lambda denominado 4.1.1 contenía la mayor parte de
la región que codificaba la proteína. Posteriormente se usó el fago
4.1.1. purificado en la placa para amplificar mediante RCP el
extremo 3' del ADNc. Se usaron los cebadores SM 37 5' >
CACCCTGATCTGAAGAC > 3' y SM-36 5' >
CGGGATCCTTAG
GAATACATAGTCAGCTGCAGCC > 3'. El cebador Sm-36 añade un punto de restricción BamHI inmediatamente 3' al codón de terminación y transforma el codón de terminación en "TAA". Se realizó la amplificación con ADN polimerasa UlTma (Perkin-Elmer, Norwalk, CT) usando el tampón suministrado con la adición de dNTP 40 \muM y la adición de MgCl_{2} 0,75 mM (para 10 \mul de plantilla de fago; concentración final de Mg^{2+} 1,55 mM). Los ciclos de amplificación fueron como se señala a continuación: una etapa de desnaturalización de 2 minutos a 97ºC antes de la adición de la polimerasa, seguida de 30 ciclos de amplificación de 1 minuto a 95ºC, 45 segundos a 55ºC y 1 minuto a 72ºC. El fragmento que se obtuvo se digirió posteriormente con EcoRI y BamHI, se aisló a partir de agarosa de baja temperatura de fusión como se señala más arriba, y se subclonó en pFEM-4Z digerido con EcoRI y BamHI (Promega Corp., Madison, WI).
GAATACATAGTCAGCTGCAGCC > 3'. El cebador Sm-36 añade un punto de restricción BamHI inmediatamente 3' al codón de terminación y transforma el codón de terminación en "TAA". Se realizó la amplificación con ADN polimerasa UlTma (Perkin-Elmer, Norwalk, CT) usando el tampón suministrado con la adición de dNTP 40 \muM y la adición de MgCl_{2} 0,75 mM (para 10 \mul de plantilla de fago; concentración final de Mg^{2+} 1,55 mM). Los ciclos de amplificación fueron como se señala a continuación: una etapa de desnaturalización de 2 minutos a 97ºC antes de la adición de la polimerasa, seguida de 30 ciclos de amplificación de 1 minuto a 95ºC, 45 segundos a 55ºC y 1 minuto a 72ºC. El fragmento que se obtuvo se digirió posteriormente con EcoRI y BamHI, se aisló a partir de agarosa de baja temperatura de fusión como se señala más arriba, y se subclonó en pFEM-4Z digerido con EcoRI y BamHI (Promega Corp., Madison, WI).
La porción 5' del gen se obtuvo en dos etapas.
Primero, el ADN aislado a partir del fago lambda 14.2.4 purificado
en placa se digirió con HindIII, que escinde el ADN lambda en
la región 5' al inserto, y con BglII, que escinde el ADN
lambda en la región 3' al inserto. El fragmento resultante de 2,5 kb
se subclonó en pGEM-4Z digerido con BamHI e
HindlII. Posteriormente se usó un par de oligonucleótidos
sintéticos para modificar la región 5' al codón de iniciación
añadiendo un punto BamHI para facilitar la clonación en los
vectores de transferencia e insertando la secuencia de la región no
traducida 5' del gen de la poliedrina inmediatamente antes del codón
de iniciación en un intento de conseguir la traducción óptima del
baculovirus. El plásmido que contiene el inserto lambda se digirió
con XmaI, que escinde el punto de clonación múltiple del
vector pGEM-42 5' al punto BamHI, y con
HpaI, que escinde en el par de bases nº 13 en el ADNc de 30
kDa, que es 3' al punto BamHI, a fin de eliminar las
secuencias del ADNc de calpaína 5' al punto HpaI. El plásmido
digerido se aisló a partir de agarosa de baja temperatura de fusión
como se indica más arriba. Se unieron entre sí dos oligonucleótidos,
SM-65 5' > CCGGGATCCTATAAATATGTTCCTGGTT > 3' y
SM-66 5' > AACCAGGAACATATTTATAGGATC > 3',
como se muestra en la Figura 1, mediante coincubación en
Tris-HCl 10 mM, pH 7,0, NaCl 50 mM a las siguientes
temperaturas durante 10 minutos cada una: 90ºC, 65ºC, 42ºC, 37ºC y
temperatura ambiente. Los oligonucleótidos unidos se ligaron
posteriormente al plásmido digerido y linealizado y se hizo cribado
en las colonias resultantes para buscar la presencia del punto
BamHI que se añade con estos oligonucleótidos (Figura
1).
Posteriormente se ensambló el ADNc de toda la
región codificante a partir de los dos plásmidos que se describen
más arriba. El plásmido que contiene la porción 5' del ADNc se
dirigió con EcoRI. Hay un punto de EcoRI en la región
de clonación múltiple del vector 5' al punto XmaI y también
un punto en el pb nº 488 en el ADNc de 30 kDa. Este fragmento
EcoRI de aproximadamente 500 pb que contiene todas las
adiciones al extremo 5' del ADNc de 30 kDa se aisló posteriormente a
partir de agarosa de baja temperatura de fusión, como se señala más
arriba, y se ligó al plásmido digerido con EcoRI que contiene
la porción 3' del ADNc. Se obtuvo un plásmido con el fragmento
EcoRI en la orientación correcta. El secuenciado de los
didesoxinucleótidos del ADN (Sanger y col., Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, 74: 5463-5467, 1977) de toda la región
codificante de 30 kDa verificó que el ADNc modificado codificaba la
secuencia correcta de aminoácidos de la proteína calpaína humana
(Ohno y col., Nucl. Acid Res., 14; 5559, 1986).
Posteriormente se digirió este plásmido con
BamHI y el fragmento de 820 pb que contiene todo el ADNc de
la calpaína de 30 kDa humana con sus modificaciones para la
expresión del baculovirus: 1) adición de CCTATAAAT inmediatamente 5'
al cordón de iniciación para mejorar potencialmente la
transcripción, y 2) modificación del codón de terminación al AAT
preferido por baculovirus (Luckow y col., Virology, 170:
31-39, 1989); se subclonó para la expresión de
subunidades aisladas en el vector de transferencia pVL941 digerido
con BamHI que contiene el promotor de la poliedrina. El
plásmido resultante se denominó
pVL941-hCANP30-6. Para la expresión
de dos subunidades, se subclonó el fragmento de 820 pb en el vector
pAcUW51 digerido con BamHI o BglII (PharMingen, San
Diego, CA; denominados Bam-CANP30 y
p51-Bgl-CANP30, respectivamente),
un vector de transferencia que contenía los promotores p10 y de la
poliedrina (véase la Figura 3). Se ha diseñado el vector
pAcUAW-51 para expresar simultáneamente dos
proteínas del mismo virus, insertando las dos en el locus de la
poliedrina del baculovirus. Este vector contiene dos promotores,
poliedrina y P10, que son promotores potentes que comienzan la
transcripción en una fase muy tardía de la infección (es decir,
después de 18-24 horas). Los promotores son
insertados en el vector en una orientación opuesta para minimizar la
deleción de los ADNc por recombinación homóloga debido a la
duplicación del material genético (Weyer y col., J. Gen.
Virol., 70: 203-208, 1991). Se verificó mediante
análisis con enzimas de restricción que los plásmidos resultantes
tienen sólo un inserto en la orientación correcta para su expresión
(no se muestran los datos).
La Figura 2 representa la estrategia para clonar
la subunidad de 80 kDa de la calpaína humana I. Se prepararon los
cebadores SM-40 5' > GTACACTTGAAGCGTGACTTC >
3' y SM-41 5' > CAGGCAGCAAACGAAATTGTC > 3' y
se usaron para amplificar los pares de bases nº
1372-2037 del ADNc de 80 kDa humano de la biblioteca
\lambdagt10 de bazo humano HL1134a (Clontech Laboratories, Inc.,
Palo Alto, CA) para su uso como sonda. Las condiciones para la RCP
fueron las que se indican más arriba para la polimerasa Taq, en la
que la solución se hace 2 mM con respecto a MgSO_{4} y con la
adición de 5 \mul de la biblioteca lambda, usando 30 ciclos de
amplificación de 1 minuto a 94ºC, 1 minuto a 60ºC y 2 minutos a
72ºC. El fragmento amplificado con la RCP se aisló de los cebadores
siguiendo las instrucciones que se suministran con el kit Wizard PCR
prep (Promega, Madison, WI). Este fragmento se digirió con
XmaI y SalI. El fragmento resultante de 538 pb se
aisló a partir de un gel de agarosa Seakem-GTG
1%/NuSieve 2% (FMC BioProducts, Rockland, ME) usando el protocolo
suministrado para el kit GenoClean II (B101, La Jolla, CA) y
posteriormente se ligó al vector pGEM-4Z digerido
con XmaI y con SalI (Promega, Madison, WI).
El ADN del clon parcial de ADNc de la subunidad
de 80 kDa que se ha producido más arriba se digirió con EcoRI
y con HindIII para liberar el inserto, seguido de aislamiento
del fragmento usando el kit GeneClean II después de la
electroforesis en un gel de agarosa Seakem-GTG
1%/NuSieve 2%. Posteriormente se marcó con
[32]P-dCTP y se usó para hacer cribado de la
biblioteca de bazo humano como se ha descrito más arriba. Se
colocaron aproximadamente 500.000 unidades formadoras de placas en
10 placas de Petri de 150 mm de diámetro. Se prepararon duplicados
de nitrocelulosa y se hibridaron con la sonda marcada y
desnaturalizada durante una noche a 68ºC en la misma mezcla de
hibridación, como se ha descrito más arriba para el cribado de 30
kDa, seguido por dos lavados con 2x SSC y DSS al 0,1% durante 15
minutos cada uno a temperatura ambiente y dos lavados con 1 x SSC y
DSS al 0,1% durante una hora cada uno a 68ºC, con detección de las
placas marcadas mediante autorradiografía.
Se encontró que un fago (lambda
cal80-8A) tenía un inserto que contenía el 67% del
extremo 3' de la región codificante del ADNc para la subunidad de 80
kDa. Se aisló el ADN a partir de un medio de cultivo líquido de fago
purificado en placa siguiendo los procedimientos que se describen en
Sambrok y col., supra, se digirió con XbaI y
SalI, y el fragmento único de 1238 pb del ADNc de 80 kDa se
aisló a partir de un gel de agarosa con SeaKem-GTG
al 1% usando el protocolo que se suministra para el kit GeneClean II
(B101, La Jolla, CA). Este fragmento se ligó al vector pBluescript®
SK+ digerido con XbaI y SalI (Stratagene, La Jolla,
CA) y se verificó la identidad del inserto mediante secuenciado de
los didesoxinucleótidos del ADN (Sanger y col., supra) de las
porciones del inserto.
Las otras secciones de la región codificante del
ADNc se generaron mediante amplificación con RCP de la biblioteca de
bazo humano (extremo 5') o del fago lambda cal80-8a
purificado en placa (extremo 3'). Se hizo la amplificación del
extremo 3' para eliminar las secuencias 3' no traducidas y para
modificar el codón de terminación al codón preferido por el
baculovirus TAA. Para lo primero, se usaron los cebadores
SM-53 5' >
CGCGGATCCTATAAATATGTCG
GAGGAGATCATCACGCCG > 3' y SM-49 5' > ATTTGCGGATGGTCCGGCTCTTGA > 3' para amplificar los pares de bases nº 1-1096 del ADNc de 80 kDa a partir de 10 ml de la biblioteca de bazo humano HL1134a. El cebador SM-53 añade un punto BamHI para facilitar la posterior clonación e inserta la secuencia inmediatamente antes del codón de iniciación en un intento de conseguir la traducción óptima del baculovirus. Para esto último se usaron los cebadores SM-40 5' > GTACACTTGAAGCGTGACTTC > 3' y SM-47 5' > CGGGATCCTTATGCAAACATGGT
CAGCTGCAACC > 3' para amplificar los pares de bases nº 1372-2143 del ADNc de 80 kDa a partir de 1 \mul del fago lambda cal80-8a. Las amplificaciones se realizaron con polimerasa UlTma (Perkin-Elmer, Norwalk, CT) usando el tampón que se suministra con la adición de dNTP 40 \muM y de MgCl_{2} 1,5 mM. Los ciclos de amplificación fueron como se señala a continuación: etapa de desnaturalización de 5 minutos a 95ºC antes de la adición de la polimerasa, seguida de 30 ciclos de amplificación de 1 minuto a 94ºC, 1 minuto a 60ºC y 2 minutos a 72ºC.
GAGGAGATCATCACGCCG > 3' y SM-49 5' > ATTTGCGGATGGTCCGGCTCTTGA > 3' para amplificar los pares de bases nº 1-1096 del ADNc de 80 kDa a partir de 10 ml de la biblioteca de bazo humano HL1134a. El cebador SM-53 añade un punto BamHI para facilitar la posterior clonación e inserta la secuencia inmediatamente antes del codón de iniciación en un intento de conseguir la traducción óptima del baculovirus. Para esto último se usaron los cebadores SM-40 5' > GTACACTTGAAGCGTGACTTC > 3' y SM-47 5' > CGGGATCCTTATGCAAACATGGT
CAGCTGCAACC > 3' para amplificar los pares de bases nº 1372-2143 del ADNc de 80 kDa a partir de 1 \mul del fago lambda cal80-8a. Las amplificaciones se realizaron con polimerasa UlTma (Perkin-Elmer, Norwalk, CT) usando el tampón que se suministra con la adición de dNTP 40 \muM y de MgCl_{2} 1,5 mM. Los ciclos de amplificación fueron como se señala a continuación: etapa de desnaturalización de 5 minutos a 95ºC antes de la adición de la polimerasa, seguida de 30 ciclos de amplificación de 1 minuto a 94ºC, 1 minuto a 60ºC y 2 minutos a 72ºC.
El fragmento de 1096 pb con el extremo 5' se
aisló usando el kit GeneClean II después de la electroforesis en un
gel de agarosa Seakem-GTG 1%/NuSieve 2%.
Posteriormente se digirió este fragmento con BamHI y
XbaI, se volvió a purificar después de la digestión usando el
kit GeneClean II y se subclonó en un vector pBluescript® SK+
digerido con BamHI y XbaI (Stratagene, La Jolla, CA).
El fragmento del extremo 3' amplificado mediante RPC se aisló de los
cebadores siguiendo las instrucciones que se suministran con el kit
Wizard PCR prep (Promega, Madison, WI). Este fragmento se digirió
posteriormente con SalI y BamHI, el fragmento
resultante de 137 pb se aisló a partir de un gel de agarosa
Seakem-GTG 1%/NuSieve 2% (FMC Bioproducts, Rockland,
ME) usando el protocolo que se suministra para el kit Mermaid (B101,
La Jolla, CA) y posteriormente se ligó al vector pBluescript® SK+
digerido con SalI y BamHI (Stratagene, La Jolla, CA).
El secuenciado de los didesoxinucleótidos del ADN (Sanger y col.,
supra) de estos dos insertos verificó que codificaban las
secuencias correctas de aminoácidos (Aoki y col., FEBS Lett.,
205: 313-317, 1986) para esa porción de la proteína
y se usó para eliminar los clones con mutaciones producidas por la
amplificación mediante la reacción en cadena de la polimerasa.
El fragmento BamHI y HbaI con el
extremo 5' modificado de la región codificante, el fragmento
XbaI y SalI con la porción media de la región
codificante, y el fragmento SaiI y BamHI del extremo
3' de la región codificante se digirieron de sus vectores con los
enzimas adecuados y los fragmentos se aislaron a partir de un gel de
agarosa Seakem-GTG 1%/NuSieve 2% (FMC Bioproducts,
Rockland, ME) usando el protocolo que se suministra para el kit
GeneClean II (B101, La Jolla, CA). Posteriormente se mezclaron estos
fragmentos en cantidades equimolares con el vector pVL941 (Luckow y
Summers, Virology, 170: 31-39, 1989) que se
había digerido con BamHI y que se había tratado con fosfatasa
alcalina de camarón (U.S. Biochemical Corp., Cleveland, OH)
siguiendo el protocolo del fabricante, y se ligaron entre sí. Un
clon (denominación del plásmido
pVL941-hCANPI80-4) que contenía el
fragmento BamHI del tamaño correcto y en la orientación
adecuada, según lo determinó el análisis con enzimas de restricción,
se usó para la producción del baculovirus recombinante que expresa
sólo la subunidad de 80 kDa (véase más adelante).
El plásmido
pVL941-hCANPI80-4 también se digirió
con BamHI y el fragmento de 2153 pb que contenía todo el ADNc
de la calpaína I de 80 kDa humana se subclonó en el vector
p51-Bg1-CANP30 digerido con
BamHI o en el vector
p51-Bam-CANP30 digerido con
BglI para la producción de vectores únicos que contienen ADNc
para las dos subunidades, es decir, constructos dobles (véase la
Figura 3). Se verificó que los plásmidos resultantes (denominados
p51-hCANPI-1 y
p51-hCANPI-2, respectivamente)
tenían sólo un nuevo inserto en la orientación correcta para la
expresión mediante análisis con enzimas de restricción.
Lo que se ha descrito más arriba representa el
procedimiento que se usó para clonar los ADNc para la calpaína
humana I. Los expertos en la materia conocen otros diversos
procedimientos comparables que podrían permitir obtener secuencias
de ADNc de estos genes adecuadas para la expresión recombinante.
También se podrían usar procedimientos similares para obtener el
ADNc para la calpaína II para su expresión recombinante.
Se usó la misma estrategia para generar una sonda
para el cribado de la biblioteca para obtener el ADNc de 80 kDa de
la calpaína II. Imajoh y col., supra, describieron el ADNc de
la región que codifica la subunidad de 80 kDa de la calpaína II. Se
usaron los cebadores SM69 5' > CATTGATGATGGAGTCAGGAG > 3' y
SM-70 5' > CTGAGAAACAGAGCCAAGAGA > 3' para
amplificar los pb nº 1587-2075 a partir de la misma
biblioteca de bazo humano. Las condiciones para la RCP se describen
más arriba usando 2 unidades de ADN polimerasa Tli (Promega,
Madison, WI) con la adición de MgCl_{2} y 10 \mul de la
biblioteca lambda usando 30 ciclos de amplificación de 1 minuto a
94ºC, 1 minuto a 55ºC y 1 minuto a 72ºC. El fragmento de 489 pb se
aisló a partir de un gel de agarosa Seakem-GTG
1%/NuSieve 2% (FMC BioProducts, Rockland, ME) usando el protocolo
que se suministra para el kit GenoClean II (B101, La Jolla, CA), se
digirió con PstI y BamHI, y se usó el procedimiento
que se acaba de describir para aislar el fragmento de 377 pb
PstI y BamHI después de la electroforesis en gel de
agarosa. El fragmento purificado se ligó al vector
pGEM-4Z digerido con PstI y BamHI
(Promega, Madison, WI).
El Dr. B.G. Corsaro, del Boyce Thompson Institute
for Plant Research, Cornell University, Ithaca, NY, suministró las
células de Spodoptera frugiperda (Sf21; Vaughn y col., In
Vitro, 13: 213-217, 1977). Estas células se
cultivaron en suspensión a 27ºC en un medio de Grace suplementado
(JRH Biosciences, Lenexa, KS) con la adición de suero bovino fetal
definido al 10% (Hyclone Laboratories, Inc., Logan, UT). Se
obtuvieron cultivos en monocapa para algunos estudios de expresión
de ensayos en placa sembrando las células cultivadas en suspensión
en matraces de cultivo tisular a las densidades indicadas para las
aplicaciones.
Los baculovirus recombinantes se produjeron
cotransfectando células Sf21 en un cultivo monocapa (aproximadamente
2 x 10^{6} células en un matraz de 25 cm^{3}) con 0,5 mg de ADN
AcNPV linealizado (Baculogold®, PharMingen, San Diego, CA) y 2 mg de
uno de los cuatro vectores que se han descrito más arriba (se
enumeran más adelante en la Tabla 2) usando liposomas Insectin®,
siguiendo el protocolo suministrado por InVitrogen (San Diego, CA).
El sobrenadante del cultivo resultante que contenía principalmente
baculovirus recombinantes se recogió 2-5 días
después y se usó para preparar láminas de placas del virus
extracelular.
| Vector | Subunidad de calpaína | Promotor |
| pVL941-hCANP30-6 | 30 kDa | Poliédrico |
| pVL941-hCANPI80-4 | 80 kDa | Poliédrico |
| p51-hCANPI-1 | 30 kDa | Poliédrico |
| 80 kDa | p10 | |
| p51-hCANPI-2 | 30 kDa | p10 |
| 80 kDa | Poliédrico |
Las células Sf21 se cultivaron en platos de
cultivo de 60 mm (2 x 10^{6} células/plato) y se infectaron
durante una hora con 1 ml de diluciones seriadas 10 veces del
sobrenadante del cultivo de cotransfección (10^{-2} a 10^{-5}) y
posteriormente se cubrieron con 4 ml de una mezcla 1: 1 de medio de
Grace suplementado 2x (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) y agarosa Seakem
al 2% (FMC Bioproducts, Rockland, ME). Se identificaron placas
recombinantes putativas 5-7 días después mediante
inspección visual para placas negativas para cuerpos de oclusión
usando un microscopio de disección y un microscopio de inversión de
fase después de la tinción durante 7 min con rojo neutro al 0,05% en
STF de Dulbecco. Se verificó que las placas eran recombinantes
mediante la hibridación de las secuencias de la calpaína humana I de
30 kDa o de 80 kDa marcadas con [32] P con gotas de lisados de
células infectadas (Summers y Smith, A manual of Methods for
Baculovirus Vectors and Insect Cell Culture Procedures, Texas
Agricultural Experiment Station Bulletin 1555: 1-57,
1987). Posteriormente se expandió el virus recombinante en los dos
primeros pasos en cultivos de Sf21 en monocapa, con pasos
posteriores de los virus (mínimo de tres a máximo de 5) usando
cultivos de Sf21 en suspensión. Todas las expansiones de los virus
se realizaron infectando células Sf21 a una multiplicidad de
infección (MI) de menos de 0,5 y recogiendo el medio que contenía
las partículas víricas extracelulares 3-4 días
después de la infección.
Se aislaron siete virus recombinantes purificados
en placa (virus recombinantes denominados
AcNPV-hCANP30-1 a -7,
respectivamente) a partir de la transfección de las células con
pVL-hCANP30-6.
AcNPV-hCANP30-5 se depositó el 2 de
junio de 1994, con la American Type Culture Colection, 12301
Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852-1776 (de
aquí en adelante "ATCC") y tiene la denominación de la ATCC
ATCC VR 2459. Se aislaron seis virus recombinantes purificados en
placa (virus recombinantes denominados
AcNPV-hCANPI80-1 a -6,
respectivamente) a partir de la transfección de células con
pVL-hCANPI80-4, y todos ellos
contenían sólo el ADN para la unidad de 80 kDa.
AcNPV-hCANPI80-5 se depositó el 2 de
junio de 1994, con la ATCC y tiene la denominación de la ATCC ATCC
VR 2457. Se aislaron 12 virus recombinantes purificados en placa
independientes (denominados
AcNPV-hCANPI-1-2,
1-5, 1-7 y 1-8, y
AcNPV-hCANPI-2-1 a
2-8, respectivamente) mediante la cotransfección de
células con p51-hCANPI-1 y
p51-hCANPI-2. De los virus
recombinantes que se aislaron, sólo cinco contenían el ADN de las 2
subunidades de 30 kDa y 80 kDa. Estos 5 virus recombinantes fueron
AcNPV-hCANPI-1-5,
AcNPV-hCANPI-1-7,
AcNPV-hCANPI-1-8,
AcNPV-hCANPI-2-3 y
AcNPV-hCANPI-2-5.
AcNPV-hCANPI-2-5 se
depositó el 2 de junio de 1994, con la ATCC y tiene la denominación
de la ATCC ATCC VR 2458. Los 18 virus recombinantes seleccionados
que se obtuvieron se examinaron posteriormente en busca de su
capacidad de expresar la proteína calpaína como se describe más
adelante. Todos los depósitos se hicieron bajo las condiciones del
Tratado de Budapest para el Reconocimiento Internacional del
Depósito de Microorganismos con el Objetivo de Procedimientos de
Patentes. Todos los depósitos fueron estudiados por la ATCC y se
determinó que eran viables en el momento del depósito.
Se sembraron células Sf21 en 24 placas de
pocillos a 1,5 x 10^{5} células/cm^{2} en medio de Grace
suplementado con suero bovino fetal al 10%. Después de la unión de
las células, se añadieron los virus (véase más adelante para las
denominaciones específicas de los virus) a una MI de entre 1 y 5.
Las células se recuperaron en algún momento después de las 24
horas. Con el presente sistema de expresión, se consiguió el
rendimiento óptimo con la recuperación entre 36-48
horas después de la infección. Para la recuperación, se usó un
tampón de lisis de Tris-HCl 50 mM, EDTA 10 mM,
fluoruro de fenilmetilsulfonilo (FFMS) 0,1 mM, leupeptina 1
\mug/ml y NP-40 al 0,1%, a pH 7,4, seguido de
centrifugación de los homogenados en tubo de Eppendorf a 14.000 x g
durante 10 min a 4ºC y recuperación de la calpaína y de otras
proteínas celulares. Las proteínas se desnaturalizaron añadiendo
DSS al 0,2% y calentando las muestras durante 5 min a 95º.
Posteriormente se almacenan las muestras a -70ºC antes del
análisis.
La calpaína que se expresó y se recuperó se
examinó mediante análisis con inmunotransferencia como se señala a
continuación. Se separaron de 10 a 20 \mug de la proteína total
mediante DSS-PAGE (Laemmli, 1970) usando genes de
acrilamida al 10% o al 12,5% y se transfirieron a nitrocelulosa de
0,45 mm (Bio-Rad, Melville, NY) por el
procedimiento de Towbin y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
76: 4350-4354 (1979). Se detectó específicamente la
proteína calpaína usando una dilución de 1: 1000 de suero policlonal
anti-calpaína que detecta ambas subunidades (Siman y
col., J. Neurosci. 10: 2400-2411, 1990). El
antisuero se diluyó en Tris-HCl 20 mM a pH 7,4 con
NaCl 150 mM y leche en polvo descremada Cranation al 5% (tampón de
bloqueo). Se eliminó la unión inespecífica al anticuerpo lavando con
Tris-HCl 20 mM a pH 7,4 con NaCl 150 mM y
Tween-20 al 0,05%. Posteriormente se añadió IgG de
cabra anti-conejo conjugada con fosfatasa alcalina
(Bio-Rad, Melville, NY), diluida al 1: 2000 en un
tampón de bloqueo. El anticuerpo secundario se detectó usando el kit
de sustrato conjugado de fosfatasa alcalina
(Bio-Rad, Melville, NY). Los resultados de los virus
recombinantes AcNPV-hCANP30-5,
AcNPV-hCANPI80-5 y
AcNPV-hCANPI-2-5 se
muestran en la Figura 4.
La expresión de la subunidad individual adecuada
de calpaína resultante de las células infectadas con los virus
AcNPV-hCANP30-5 y
AcNPV-hCANPI80-5 solos se representa
en las calles 2-3 y 4-5,
respectivamente. Cuando las células se coinfectaron con dos virus,
uno que contenía el constructo de ADN para la subunidad de calpaína
de 30 kDa (AcNPV-hCANP30-5) y el
otro que contenía el constructo de ADN para la subunidad de calpaína
de 80 kDa (AcNPV-hCANPI80-5), se
expresaron las 2 subunidades adecuadas de calpaína. Estos se
representa en las calles 6-8. De manera similar,
cuando las células se infectaron con
AcNPV-hCANPI-2-5,
que contenía el constructo de ADN para las 2 subunidades de 30 kDa y
de 80 kDa de calpaína, se expresaron las 2 subunidades (calles
9-10). La capacidad de un suero
anti-calpaína de detectar la proteína recombinante
verificó que se había producido la auténtica proteína calpaína. La
calle 1 representa la infección con el virus de tipo natural. No se
detectó expresión de calpaína.
Sorprendentemente, la cantidad acumulada de la
subunidad de 80 kDa ("catalítica") estaba aumentada de manera
inesperada (según lo determinó la inspección visual) mediante la
coexpresión con la subunidad de 30 kDa ("reguladora"), ya sea
por la coinfección de las células con
AcNPV-hCANP30-5 y
AcNPV-hCANPI80-5 (calles
6-8) o por la expresión del doble constructo
AcNPV-hCANPI-2-5
(calles 9-10), en comparación con la expresión en
ausencia de la subunidad de 30 kDa (calles 4-5).
Las investigaciones previas sobre la función de la subunidad de 30
kDa no habrían permitido predecir este efecto estabilizador sobre
la otra subunidad.
El análisis de todos los virus recombinantes
AcNPV-hCANP30 y AcNPV-hCANP80 de la
misma manera que se describe arriba mostró niveles comparables de
expresión de sus subunidades respectivas (no se muestran los datos).
Mientras que los cinco aislados de virus
AcNPV-hCANPI que contenían las 2 subunidades de
calpaína expresaron la subunidad de calpaína de 80 kDa intacta, 4 de
los virus aislados ( es decir,
AcNPV-hCANPI-1-5,
AcNPV-hCANPI-1-7,
AcNPV-hCANPI-1-8 y
AcNPV-hCANPI-2-3) no
expresaban también cantidades detectables de la subunidad de 30 kDa
de la calpaína (no se muestran los datos). La ausencia de la
subunidad de 30 kDa fue evidente además por la reducción del nivel
de expresión de la subunidad de 80 kDa, que fue comparable a la que
se veía con los virus AcNPV-hCANPI80, en
contraposición al aumento del nivel que se observa con la
coinfección con los virus AcNPV-hCANP30 y
AcNPV-hCANPI80 y con la infección con
AcNPV-hCANPI-2-5.
Que sólo cinco de los 12 virus de doble subunidad contuvieran
secuencias de ADN para las 2 subunidades después de la recombinación
y la selección de virus recombinantes y que, de esos cinco, sólo se
encontrará que 1 coexpresa las 2 subunidades proteicas, indica la
existencia de una presión de selección contra la expresión por la
célula del insecto de la proteasa calpaína completa de dos
subunidades. Esto podría ser la consecuencia de la letalidad de la
calpaína.
Las bandas adicionales que se ven alrededor de
las bandas de la subunidad de 80 kDa en la Figura 4 son la
consecuencia de la actividad autolítica del enzima. Las 2 bandas
visibles en las calles 6-8 representan las formas de
80 kDa y la resultante autolítica de 76 kDa, respectivamente.
También se observan 2 bandas en las imágenes de las calles 9 y 10,
pero no se puede ver en la figura. En las calles 4 y 5 se ven
realmente tres bandas. Además de las formas de 80 kDa y de la
resultante autolítica de 76 kDa, se forma un intermediario estable
de 77 kDa a bajas concentraciones del enzima, y se había descrito
previamente que se forma por la autólisis de la subunidad mayor en
un heterodímero de calpaína I incubado con calcio en condiciones
diluidas. (Inomata y col., J. Biol. Chem., 263:
19783-19787, 1988). Sin embargo, como es evidente a
partir de la Figura 4, la mayor parte de la poliédrico recombinante
está en la forma de 80 kDa, que es la deseable en el caso de la
calpaína considerando la posible letalidad para el sistema. Puesto
que la calpaína se autolisa a la forma activa en presencia de
calcio, no es preciso ningún tratamiento separado para la activación
aparte de la adición de calcio.
Se sembraron de nuevo las células Sf21 en 24
placas a 1,5 x 10^{5} células/centímetro cúbico y se infectaron
con virus natural, se coinfectaron con
AcNPV-hCANP30 y AcNPV-hCANPI80 o se
infectaron con
AcNPV-hCANPI-2-5 (MI
= 5,7). Las proteínas intracelulares se recogieron 40 horas después
de la infección con 100 \mug/pocillo del siguiente tampón de
lisis: Tris-HCl 50 mM a pH 7,5, NaCl 50 mM, EDTA 1
mM, EGTA 1 mM, \beta-mercaptoetanol 5 mM y
Triton-100 al 0,1% seguido por una centrifugación
durante 10 min a 14.000 x g a 4º para sedimentar los núcleos y
algunas membranas. Se midió la actividad enzimática in vitro
de 20 \mul de cada extracto (12,5-20 \mug de
proteína total) usando el sustrato peptídico sintético
succinil-leucina-tirosina-aminometil
cumarina
(Succ-Leu-Tyr-AMC) a
una concentración de 1 mM con y sin la adición de CaCl_{2} 5 mM,
siguiendo el procedimiento de Sasaki y col., J. Biol. Chem.,
259: 12489-12494 (1984). La actividad que se obtuvo
se comparó con la actividad enzimática de 2 \mug de calpaína I
humanas natural parcialmente purificada que se produjo según el
procedimiento de Siman y col., supra.
La actividad en presencia de calcio también se
midió con la adición del inhibidor I de calpaína 12,5 \muM
siguiendo el procedimiento que describieron Sasaki y col.,
supra. Los resultados se representan en las Figuras 5
a-d. En las Figuras 5 a-d, los
círculos abiertos representan la actividad sin la presencia de
calcio. Los rombos sólidos representan la actividad con la presencia
de calcio. Los cuadrados con una cruz en su interior representan la
actividad con calcio y con el inhibidor de la calpaína I presente.
Los datos de las Figuras 5a-d muestran 1) un aumento
dependiente de calcio de la hidrólisis el sustrato por la calpaína
natural que es inhibido por el inhibidor de la calpaína I (5a), 2)
ausencia de hidrólisis del sustrato dependiente del calcio endógeno
en células infectadas con el virus natural (5b), y 3) en las células
coinfectadas con AcNPV-hCANP30 y
AcNPV-hCANPI80 (5c) o infectadas con
AcNPV-hCANPI-2-5
solo (5d) hay un aumento dependiente de calcio de la hidrólisis del
sustrato que también es inhibido por el inhibidor I de calpaína, al
igual que lo que se ve con el enzima natural. De acuerdo con estos
resultados, la calpaína que se produce de manera recombinante tiene
el mismo perfil de actividad enzimática que la calpaína natural. De
nuevo esto es importante para la utilización efectiva de la calpaína
enzimáticamente activa recombinante para hacer el cribado de un
posible tratamiento inhibidor de la calpaína.
Se demostró la actividad enzimática autolítica de
la calpaína recombinante mostrando que la calpaína recombinante
autoprocesaba correctamente la subunidad de 80 kDa a la forma
"activada" de 76 kDa. La forma de 76 kDa se produce en
presencia de calcio mediante escisión autolítica y es indicativa de
que es un enzima activo. Los lisados de células infectadas con el
virus natural AcNPV, coinfectadas con
AcNPV-hCANP30-5 y
AcNPV-hCANPI80-5 o infectadas con
AcNPV-hCANPI-2-5 que
se prepararon en el Ejemplo 5 se incubaron con o sin la adición de
CaCl_{2} 6,7 mM durante 5 min a temperatura ambiente,
interrumpiendo la reacción añadiendo EDTA 6,7 mM e hirviendo las
muestras en tampón de carga
DSS-PAGE-gel antes del
almacenamiento a -70ºC. Los resultados del PAGE de las preparaciones
se representan en las Figuras 6a y b. En las Figuras 6a y b, la
presencia y ausencia de calcio se indica por un "+" o "-",
respectivamente. La Figura 6a representa una inmunotransferencia
anti-calpaína I con y sin incubación in vitro
con calcio. La preparación antisuero Ac nº 4 que se usó frente a la
calpaína natural purificada. Detecta principalmente la subunidad de
80 kDa, aunque también se une al producto de escisión autolítica de
76 kDa. Las calles 1 y 2 contienen la subunidad de 80 kDa de la
calpaína natural parcialmente purificada (purificada a partir de
eritrocitos humanos como se ha descrito previamente, véase Kitahara
y col., supra. La calle 3 contiene la fracción proteica de
las células infectadas con el virus natural. Las calles 4 y 5
representan la fracción proteica de las células cotransfectadas con
AcNPV-hCANP30-5 y
AcNPV-hCANPI80-5. Las calles
6-7 representan la fracción proteica de las células
transfectadas con
AcNPV-hCANPI-2-5. En
ausencia de calcio añadido, las calles 4 y 6 tienen dos bandas
inmunorreactivas. La calle 1 (la calpaína I natural humana
purificada a partir de eritrocitos humanos) tiene sólo una banda.
Las bandas superiores de las calles 4 y 6 migran conjuntamente con
la subunidad de 80 kDa de la calpaína I natural de eritrocitos
humanos parcialmente purificada y las bandas inferiores migran
conjuntamente con la calpaína I natural humana de 76 kDa que se ha
incubado con calcio (calle 2). Las bandas inferiores, presentes
incluso en ausencia de calcio, parecen ser calpaína activada de
manera endógena, probablemente debido al flujo intracelulares de
calcio desde el medio, puesto que algunas células se hacen
permeables durante la infección. Se detecta una sola banda en todas
las muestras incubadas con calcio (calles 2, 5 y 7), y miga de
manera conjunta con la calpaína I natural humana de 76 kDa (calle 2)
que también se ha incubado con calcio.
Los datos de la Figura 6b muestran que la
proteína que migra como una banda de 76 kDa es el auténtico
fragmento autocatalítico de 76 kDa adecuadamente escindido. La
Figura 6b contiene los resultados de un análisis de
inmunotransferencia de las mismas muestras que en 6a excepto que el
anticuerpo AB#34 usado se generó frente a los primeros cinco
aminoácidos del extremo N-terminal del fragmento de
76 kDa (anti-LGRHEC) (Saido y col., J.
Biochem., 111: 81-96, 1992). Este anticuerpo
reconoce específicamente sólo el enzima humano natural adecuadamente
escindido (es decir, 76 kDa; calle 2) y no la calpaína de 80 kDa
intacta (calle 1). Este antisuero detecta tanto las cantidades
pequeñas de la subunidad mayor de calpaína I recombinante escindida
endógenamente como la banda abundante única de 76 kDa después de la
adición de calcio. Los resultados anteriores demuestran que toda la
cantidad de la proteína recombinante de la subunidad de 80 kDa es
capaz de activarse autocatalíticamente mediante la adición de calcio
y que la subunidad activada está escindida de manera adecuada.
El cultivo de células de insecto en frascos
agitados se utiliza rutinariamente para la expresión con baculovirus
de proteínas recombinantes debido a la mayor facilidad de manejo de
grandes números de células en comparación con los cultivos monocapa.
Se hizo una comparación entre la producción de calpaína en las
células Sa21 cultivadas en medio de Grace suplementado con un 10% de
suero bovino fetal definido frente a células Sf21 adaptadas a un
medio sin suero mediante diluciones de dos veces para crecer en el
medio ExCell-401 (JRH Biosciences, Lenexa, KS). Las
células Sf21 en fase logarítmica cultivadas en cada uno de los
medios se centrifugaron a 150 x g durante 10 min para sedimentar las
células y se volvieron a suspender a 10^{7} células por ml en su
medio de crecimiento que contenía el virus
AcNPV-hCANPI-2-5 a
una MI = 2. Las células más el virus se incubaron a temperatura
ambiente durante una hora y de manera ocasional se volvieron a
suspender las células a mano y con suavidad . Se añadió toda la
mezcla al medio adecuado en frascos agitados de 250 ml (Techne,
Inc., Princeton, NJ) para conseguir un volumen final de 100 ml a una
densidad celular de 1,5 x 10^{6} células por ml. Se incubaron
infecciones duplicadas para cada medio a 27ºC con agitación, a una
velocidad de 80 rpm para los cultivos que contenían suero y de 100
rpm para los cultivos sin suero. Se recogieron muestras de los
cultivos a las 24 y a las 48 horas.
Se recogieron las muestras para permitir la
medición de la actividad enzimática como se describe en el Ejemplo
5, después de la sedimentación de las células mediante
centrifugación a 150 x g durante 10 min, con una nueva suspensión en
suero salino tamponado con fosfato de Dulbecco (Mediatech, Inc.,
Herndon, VA), y posteriormente una nueva centrifugación a 150 x g
durante 10 min. Se midieron las concentraciones totales de
proteínas usando el ensayo de proteínas de Bio-Rad
(Bio-Rad Laboratories, Inc., Melville, NY) siguiendo
el protocolo suministrado, con albúmina sérica bovina como estándar
proteico de referencia. Las células adaptadas a un medio sin suero
tuvieron una concentración y una actividad inesperadamente bajas de
la proteína calpaína recombinante a las 24 horas, pero unas
concentraciones inesperadamente mayores que los cultivos con suero a
las 48 horas (Figura 7). Lo que es más importante, hubo
proporcionalmente menos proteína activada de 76kDa a las 48 horas en
los cultivos sin suero que en los cultivos que contenían suero (no
se muestran los datos). La mayor cantidad de calpaína activada a las
48 horas en los cultivos que contenían suero hizo que fue imposible
purificar calpaína inactivada intacta en ese momento (no se muestran
los datos); según esto, el uso de un medio sin suero para la
expresión permitió obtener un aumento de 3-4 veces
de la concentración inicial de la calpaína recombinante para la
purificación, en comparación con la concentración a las 24 horas en
cultivos que contenían suero.
Para determinar la actividad relativa de la
subunidad de 80 kDa producida por medios recombinantes, se examinó
la actividad enzimática de la subunidad en extractos no fraccionados
de células Sf21 infectadas con
AcNPV-hCANPI80-5. Se sedimentaron
1,5 x 10^{3} células Sf21 mediante centrifugación a 150 x g, se
eliminó el medio de cultivo, se volvieron a suspender con 3 x
10^{2} pfu de virus
AcNPV-hCANPI80-5 en 10 ml de medio
de Grace suplementado con suero bovino fetal y se incubaron durante
una hora a 27ºC. Después de la incubación, las células más el medio
más los virus se añadieron a 90 ml del mismo medio y se incubaron a
27ºC en un frasco agitado de 250 ml durante 24 horas. Las células se
recogieron como el Ejemplo 5 y el extracto se examinó para medir su
actividad enzimática, también como se describe en el Ejemplo 5. En
la Figura 8 se representan los resultados de 33 \mug de extracto
no fraccionado. En la Figura 8 los cuadrados abiertos representan la
actividad sin la presencia de calcio. Los rombos abiertos
representan la actividad con la presencia de calcio. Los círculos
abiertos representan la actividad cuando hay calcio e inhibidor I de
la calpaína. Posteriormente se introdujo la misma cantidad de
actividad enzimática para la subunidad de 80 kDa recombinante y para
la calpaína recombinante en DSS-PAGE y se determinó
cualitativamente la cantidad de cada una de ellas mediante análisis
de inmunotransferencia, como se describe en el Ejemplo 4, más
arriba. Como se determina a partir de estos datos, es necesaria
aproximadamente 4-5 veces más proteína de 80 kDa
aislada para dar una actividad equivalente a la de la proteína
heterodimérica. Así, se determinó experimentalmente que la actividad
específica de la calpaína I recombinante de 80 kDa era
aproximadamente 20%-25% de la de la calpaína I heterodimérica. Esto
es aproximadamente siete veces mayor que la de la subunidad de 80
kDa disociada de la calpaína I natural (Kikuchi y col.,
supra). Se mostró que la actividad se inhibe completamente
con el inhibidor I de la calpaína 12,5 \muM, al igual que la del
enzima heterodimérico (Figura 8).
Como se describe a continuación, se purificó la
calpaína recombinante en cuatro etapas, incluyendo tres etapas
cromatográficas, hasta una pureza de 94%, según lo determinó el
análisis con HPLC de fase inversa. Las condiciones de cultivo
celular fueron las que se describen en el Ejemplo 7. Las células se
lisaron en una solución que contenía HEPES 10 mM, EDTA 2 mM, EGTA 2
mM, \beta-mercaptoetanol 5 mM, pepstatina 5 mM,
PMSF 0,1 mM y aprotinina 10 mg/ml, a pH 7,5, y se homogeneizaros
usando un homogeneizador Dounce de 40 ml (Wheaton, Milville, NJ).
Posteriormente se centrifugó el material a 2100 x g durante 30 min
para sedimentar los núcleos, seguido de una centrifugación a 38.700
x g para sedimentar las membranas. El sobrenadante se precipitó con
sulfato de amonio y las proteínas que precipitaron entre un 30% a
45% de sulfato de amonio se volvieron a suspender en una solución
tampón que contenía HEPES 10 mM, EDTA 2 mM, EGTA 2 mM, NaCl 10 mM y
\beta-mercaptoetanol 5 mM, a pH 7,5, se dializó
durante una noche frente al mismo tampón, y posteriormente se separó
con las siguientes resinas usando técnicas estándar:
Q-Sepharose Fast Flow, seguida de Phenyl Sepharose
CL-4B (ambas de Pharmacia, Piscataway, NJ),
posteriormente Mimetic Red 2 (American International Chemical,
Natick, MA). Después de esa técnica se aislaron 5-6
mg de proteína altamente purificada a partir de 1 l de células. Se
consiguió una purificación de 15,5 veces en tres (3) separaciones
cromatográficas para obtener una proteína con un alto grado de
pureza. La purificación de la calpaína a partir de eritrocitos
humanos precisó una purificación de más de 22.000 veces con cuatro
(4) etapas cromatográficas (Hatanaka y col., supra). Esto
representa un avance importante de esta expresión recombinante, en
que es capaz de purificar fácilmente mayores cantidades de calpaína
de lo que se puede hacer fácilmente a partir de fuentes naturales.
Para cada análisis se determinó la actividad enzimática
monitorizando la velocidad de la hidrólisis del sustrato fluorógeno
sintético
Succ-Leu-Tyr-metoxil-\beta-naftilamina
(Succ-Leu-Tyr-MNA)
en presencia de Ca^{2+}, de manera similar al procedimiento que
utilizaron Sasaki y col., supra, para medir la hidrólisis de
Succ-Leu-Tyr-AMC.
Los experimentos se realizaron en 96 placas de pocillos (Dynatech,
nº cat. 011-010-7905, 14340
Sullyfield Circle, Chantilly, Virginia 22021) y la fluorescencia se
detectó usando un fluorímetro lector de placas de 96 pocillos
(excitación = 340 nM, emisión = 430 nM; Titertek Fluoroskan II,
Finlandia).
Se comparó la sensibilidad de la calpaína I
natural y de la calpaína I enzimáticamente activa recombinante
frente a varios inhibidores conocidos de la calpaína I. Para evaluar
la sensibilidad a los inhibidores, se prepararon caldos
(concentrados 40 veces) de cada inhibidor que se iba a estudiar en
DMSO anhidro al 100%, y se colocaron alícuotas de 5 \mul de las
preparaciones de cada inhibidor en cada uno de tres pocillos de una
placa de 96 pocillos. Se hicieron diluciones de cada una de las
preparaciones del enzima en tampón de ensayo (es decir, Tris HCl 50
mM, NaCl 50 mM, EDTA 1 mM, EGTA 1 mM y
\beta-mercaptoetanol 5 mM, a pH 7,5, incluyendo
Succ-Leu-Tyr-MNA 0,2
mM) y 175 \mul de cada una de las alícuotas de las diluciones en
los mismos pocillos que contenían los caldos de los inhibidores
independientes, así como pocillos de control positivos que contenían
5 \mul de DSMO, pero sin inhibidor. Para iniciar la reacción se
añadieron 20 \mul de CaCl_{2} en tampón de ensayo a todos los
pocillos de la placa, excepto a tres, que se utilizaron como
controles basales de la señal de fondo. Se monitorizó la hidrólisis
del sustrato cada 5 min hasta un total de 30 min. La hidrólisis del
sustrato en ausencia de inhibidor fue lineal hasta los 15 min. La
velocidad de la hidrólisis se determinó como el cambio de unidades
de florescencia en el período de tiempo de 10 min entre los 5 y los
15 min. A cada una de las concentraciones de inhibidor que se
estudiaron, la inhibición porcentual se determinó como la reducción
porcentual de la velocidad de la hidrólisis del sustrato en
presencia de inhibidor frente a la velocidad en su ausencia. En la
Tabla 3, a continuación, se representa la concentración inhibidora
al 50% (CI_{50}) para tres inhibidores conocidos estructuralmente
diferentes de calpaína
(Z-Leu-Phe-CONHEt,
Z-Leu-Leu-Phe-CH_{2}S(+)Me_{2}Br(-)
y Z-Leu-Nle-H).
Obsérvese que la CI_{50} que se obtuvo para cada inhibidor de la
calpaína frente a la poliédrico recombinante se aproximó a la que se
encontró para el enzima natural. El orden de rango de potencia de
los inhibidores fue el mismo. Los inhibidores prototípicos de las
proteasas de serina (PMSF) y de ácido aspártico (pepstatina A)
también se incluyeron en esta determinación. Tanto el enzima
recombinante como el natural mostraron una inhibición no
significativa de su actividad por esta clase de inhibidores
específicos, como lo manifiesta el orden de magnitud
5-6 veces mayor de las diferencias de los valores de
CI_{50} que se obtienen con respecto a los inhibidores conocidos
de la calpaína.
Para determinar la concentración de calcio
necesaria para la actividad enzimática, se realizaron pruebas
esencialmente como lo describen Kitahara y col., J. Biochem.,
95: 1759-1766 (1984). Primero se dializaron las
preparaciones del enzima durante una noche frente a clorhidrato de
imidazol 110 mM/tampón EGTA 1 mM a pH 7,3 que contenía
\beta-mercaptoetanol 5 mM. Se prepararon tampones
de Ca^{2+}/EGTA concentrados 10 veces añadiendo cantidades
variables de CaCl^{2+} al tampón de imidazol/EGTA. Se pusieron 20
\mul de cada tampón en tres pocillos de una placa de 96 pocillos.
Se hicieron diluciones del enzima dializado en el tampón de
imidazol/EGTA que contenía
Succ-Leu-Tyr-MNA 1
mM y se añadieron 180 \mul de cada preparación a los pocillos que
contenían los distintos tampones de Ca/EGTA. Se midió la hidrólisis
del sustrato cada 5 min durante 30 min. Se determinó la ½ V_{max}
como la velocidad de la hidrólisis del sustrato que era el 50% de la
velocidad máxima que se conseguía en presencia de las cantidades
variables de calcio. Los resultados se muestran en la Figura 9. La ½
V_{max} que se presenta se aproxima a la [Ca^{2+}] basándose en
la K_{d} del EGTA para el calcio en este tampón a la fuerza
iónica, pH y temperatura particulares (K_{d} = 5,5 x 10^{-6}
M). La concentración de calcio necesaria para conseguir la ½
V_{max} fue esencialmente la misma para la calpaína natural y para
la calpaína recombinante de esta invención, es decir, 15 \muM y
14 \muM, respectivamente. Los perfiles de activación de
[Ca^{2+}] para los enzimas natural y recombinante fueron
prácticamente idénticos. En la Figura 9, los cuadrados abiertos con
círculos abiertos interiores representan la calpaína humana I
recombinante (rhCANPI). Los cuadrados oscuros con círculos abiertos
interiores representan la calpaína humana I natural (nhCANPI).
La calpaína enzimáticamente activa recombinante
se purifica, por ejemplo, como se ha descrito en el Ejemplo 9, más
arriba. Entonces se puede utilizar la calpaína purificada en un
ensayo para hacer el cribado de los posibles inhibidores de la
calpaína. Las condiciones de ensayo puede ser similares a las que se
describen en los Ejemplos 9 y 10, más arriba. Por Ejemplo, se puede
usar
Succ-Leu-Tyr-MNA
como sustrato. El inhibidor de calpaína I se puede usar como control
para ensayar la inhibición de la calpaína. Sin embargo, se pueden
utilizar otros sustratos e inhibidores conocidos. (véase Sasaki,
supra). Las muestras sin inhibidor de la calpaína I se pueden
usar como controles de la actividad enzimática. Se ensaya cada uno
de los compuestos que se va a estudiar como inhibidor de la
calpaína, por Ejemplo, mediante el procedimiento que se ha descrito
en el Ejemplo 10, en el que se ensayaron inhibidores conocidos. Sin
embargo, se pueden utilizar otros procedimientos.
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Meyer, Sheryl L.
\hskip3.9cmScott, Richard W.
\hskip3.9cmSiman, Robert
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Calpaína recombinante enzimáticamente activa expresada en un sistema de baculovirus.
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 12
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Woodcock, Washburn, Kurtz, Mackiewicz y Norris
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: One Liberty Place, 46th floor
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Filadelfia
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- CÓDIGO POSTAL: 19103
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE LECTURA INFORMÁTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: Compatible IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: PatentIn Release 1.0, versión 1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA PRESENTE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: EE.UU. N/D
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Trujillo, Doreen Y.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 35.719
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: CEPH-0013
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: (215) 568-3100
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: (215) 568-3439
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: Sí
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGGATCCTT AGGAATACAT AGTCAGCTGC AGCC
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCACCCTGATC TGAAGAC
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTACACTTGA AGCGTGACTT C
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: Sí
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAGGCAGCAA ACGAAATTGT C
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: Sí
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGGATCCTT ATGCAAACAT GGTCAGCTGC AACC
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: Sí
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATTTGCGGAT GGTCCGGCTC TTGA
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 40 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGCGGATCCT ATAAATATGT CGGAGGAGAT CATCACGCCG
\hfill40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGGGATCCT ATAAATATGT TCCTGGTT
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: Sí
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACCAGGAAC ATATTTATAG GATC
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTGGAACGG CCATGCGCAT C
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID.: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATTGATGAT GGAGTCAGGA G
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. Nº ID.: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: Sí
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. Nº ID. 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTGAGAAACA GAGCCAAGAG A
\hfill21
Claims (14)
1. Un baculovirus recombinante que comprende ADNc
que codifica calpaína I de mamíferos.
2. El baculovirus recombinante de la
reivindicación 1, en el que dicho baculovirus es un vector de
transferencia.
3. Un procedimiento para preparar calpaína de
mamíferos recombinante que comprende:
- (a)
- infectar células de insecto con un baculovirus recombinante que comprende ADNc que codifica calpaína I de mamíferos, y
- (b)
- recuperar calpaína enzimáticamente activa a partir de dichas células.
4. El procedimiento de la reivindicación 3 en el
que dicho baculovirus es el virus de la poliedrosis nuclear
Autographa californica.
5. El procedimiento de la reivindicación 3 en el
que dichas células de insecto son células de Spodoptera
frugiperda.
6. El procedimiento de las reivindicaciones 3 a 5
en el que dicha calpaína es calpaína humana.
7. Un procedimiento para preparar calpaína de
mamíferos recombinante que comprende:
- (a)
- preparar al menos un baculovirus que comprende ADNc que codifica una subunidad de calpaína de aproximadamente 80 kDa y ADNc que codifica una subunidad de calpaína de aproximadamente 30 kDa, siendo dicha calpaína la calpaína I,
- (b)
- infectar células de insecto con dicho baculovirus recombinante,
- (c)
- recoger dichas células después de al menos aproximadamente 24 horas de incubación, y
- (d)
- recuperar la calpaína enzimáticamente activa a partir de dichas células recogidas.
8. El procedimiento de la reivindicación 7 en el
que dicho baculovirus es el virus de la poliedrosis nuclear
Autographa californica.
9. El procedimiento de la reivindicación 7 en el
que dichas células de insecto son células de Spodoptera
frugiperda.
10. Un procedimiento para preparar calpaína
recombinante de mamíferos que comprende:
- (a)
- preparar un primer baculovirus que comprende ADNc que codifica una subunidad de calpaína de aproximadamente 80 kDa y un segundo baculovirus que comprende ADNc que codifica una subunidad de calpaína de aproximadamente 30 kDa, y dicha calpaína es la calpaína I,
- (b)
- infectar células de insecto con dichos primero y segundo baculovirus,
- (c)
- recoger dichas células después de al menos aproximadamente 24 horas de incubación, y
- (d)
- recuperar la calpaína enzimáticamente activa a partir de dichas células recogidas.
11. El procedimiento de la reivindicación 7 o de
la reivindicación 10 en el que se usa un medio sin suero.
12. El procedimiento de las reivindicaciones 7 a
11 en el que dicha calpaína es calpaína humana.
13. El baculovirus de la reivindicación 1, en el
que dicha calpaína es calpaína humana.
14. El baculovirus de la reivindicación 1, en el
que dicho baculovirus comprende ADNc que codifica una subunidad de
calpaína de 80 kDa y ADNc que codifica una subunidad de calpaína de
30 kDa.
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