EP3989990A1 - Bacterie de la famille des christensenellacees et composition en contenant pour la prevention et/ou le traitement d'une perte de masse musculaire pathologique ou d'une maladie caracterisee par une perte de masse musculaire pathologique - Google Patents

Bacterie de la famille des christensenellacees et composition en contenant pour la prevention et/ou le traitement d'une perte de masse musculaire pathologique ou d'une maladie caracterisee par une perte de masse musculaire pathologique

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EP3989990A1
EP3989990A1 EP20739277.0A EP20739277A EP3989990A1 EP 3989990 A1 EP3989990 A1 EP 3989990A1 EP 20739277 A EP20739277 A EP 20739277A EP 3989990 A1 EP3989990 A1 EP 3989990A1
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EP
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bacterium
loss
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composition
bacteria
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German (de)
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Georges Rawadi
Sandrine CLAUS
Laure RINALDI
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Ysopia Biosciences SA
Original Assignee
Ysopia Biosciences SA
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    • A61K2035/11—Medicinal preparations comprising living procariotic cells
    • A61K2035/115—Probiotics

Definitions

  • the invention relates to the preservation of muscle mass.
  • the invention relates to bacteria specific to the intestinal microbiota and to compositions containing them for the prevention and / or treatment of pathological muscle loss or of a disease characterized by pathological muscle loss.
  • pathological muscle mass is well known to those skilled in the art and refers to muscle atrophy, a decrease in muscle volume (Gordon et al. Therapeutic approaches for muscle wasting disorders. Pharmacol Ther. 2007 Mar; 113 (3): 461-87).
  • This muscle loss generally involves the skeletal striated muscles, which are muscles under voluntary control.
  • Several pathologies are characterized by a loss of muscle mass, in particular muscular atrophy, pre-sarcopenia, sarcopenia, rhabdomyolysis, cachexia.
  • Amyotrophy is a decrease in the volume of the skeletal and cardiac striated muscles, that is to say that the number of fibers making up these muscles (long cells) decreases.
  • Sarcopenia is a syndrome characterized by a decrease in muscles due to age and which can lead to deterioration in muscle strength and physical performance.
  • Rhabdomyolysis is a disease in which skeletal muscle cells quickly break down and release their contents into the bloodstream. Some of these breakdown products of damaged muscle cells are harmful to the kidneys and can lead to kidney failure in particular. The disease is characterized by several symptoms such as muscle pain, vomiting and confusion, and in some cases it can be life-threatening. Some animals can be affected, especially horses. Cachexia is a profound weakening of the organism which is characterized by weight loss, fatigue and muscular atrophy in particular, linked to very significant undernutrition.
  • Muscle atrophy can be caused in particular by the synthesis of norleucine in the body.
  • Other markers of muscle wasting are known as albumin, pre-albumin, C reactive protein, and myoglobin.
  • Norleucine is a non-proteinogenic amino acid which, when present, takes the place of another amino acid, methionine, during protein synthesis. This replacement of methionine by norleucine is toxic to the cells and in particular it prevents the renewal of muscle cells, decreases the growth of muscle fibers and reduces muscle development (Bogosian et al. Biosynthesis and Incorporation Into Protein of Norleucine by Escherichia Coli , J Biol Chem 1989 Jan 5; 264 (l): 531-9. Norleucine particularly affects organs where protein replacement is important such as muscles. Thus, muscles are subject to toxicity from low dose norleucine. For example, Jeffery Escobar et al. 2010 demonstrated that administration of leucine in piglets has a positive effect on skeletal muscle protein synthesis and that norleucine has no positive effect on protein synthesis in muscle It also shows that the chemical structure of leucine gives it these properties.
  • Norleucine can be synthesized by bacteria as side products of the branched-chain amino acid synthesis pathway from pyruvate and alpha-ketobutyrate.
  • the toxicity of norleucine is very little studied and no treatment for pathological muscle loss or a disease characterized by pathological muscle loss is based on a reduction in the toxicity of norleucine despite the involvement of this amino acid in ubiquitous metabolic pathways.
  • Albumin is a soluble protein which is assayed to check the amount of protein in the blood. A low concentration of albumin is a marker of undernutrition which is accompanied by significant loss of muscle.
  • the C reactive protein is a protein which shows the inflammatory state of the patient which is observed during muscle loss due to cachexia in particular.
  • a high concentration of C reactive protein is a marker of cachexia which is accompanied by significant loss of muscle.
  • Myoglobin is a protein capable of transporting oxygen to the muscles, therefore essential for the work and development of muscles.
  • a high concentration of plasma myoglobin is a marker of muscle damage or rhabdomyolysis in multiple trauma, infectious diseases, muscular dystrophy, myopathy.
  • pathological muscle loss or diseases characterized by pathological muscle loss are not effective. Indeed, these consist essentially of physical exercises during sessions repeated several times a week, an optimal protein intake to stimulate protein synthesis, the installation of an infusion containing a saline solution, an alkalization of the urine, a dialysis , surgery on the injured region which does not allow a satisfactory result to be obtained.
  • treatments are often heavy, such as the treatment of rhabdomyolysis which consists of heavy intravenous infusions, and which may require dialysis or hemofiltration in more severe cases.
  • the bacteria of the Christensenellaceae family when they are administered to humans or animals, are capable of acting on the markers of the loss of pathological muscle mass to prevent or treat this disease or diseases characterized by loss of muscle mass such as muscular atrophy, sarcopenia, pre-sarcopenia, rhabdomyolysis, cachexia.
  • the subject of the invention is a bacterium of the Christensenellaceae family, for its use in the prevention and / or treatment of muscle atrophy in humans or animals, in particular.
  • a bacterium when it is administered to a human being or an animal exhibiting a pathological loss of muscle mass or a disease characterized by a loss of muscle mass, is capable of acting on the molecules produced in excess during this.
  • pathological condition such as in particular norleucine, and also optionally against albumin and / or pre-albumin and / or protein C and / or myoglobin allowing an increase in protein synthesis and production of muscle cells to recover the lost muscle mass.
  • the bacteria for their use according to the invention are administered in compositions.
  • a subject of the invention is also the compositions comprising at least one bacterium of the Christensenellaceae family, for its use in the prevention and / or treatment of a pathological loss of muscle mass or of a disease characterized by a loss. muscle mass in humans or animals.
  • loss of pathological muscle mass or “loss of muscle mass” or “pathological muscle loss” within the meaning of the invention is meant an abnormal, pathological decrease in muscle mass due to a decrease in protein synthesis, in particular of skeletal muscle mass.
  • the term “disease characterized by a loss of pathological muscle mass” or “disease characterized by a loss of muscle mass” means a disease of which one of the symptoms is a loss of muscle mass. It could be especially muscular atrophy, sarcopenia, pre-sarcopenia, rhabdomyolysis or cachexia.
  • the term “marker” of a disease means a molecule or a substance, the dosage of which makes it possible to follow the course of said disease.
  • the subject of the invention is the use for preventing and / or treating a pathological loss of muscle mass or a disease characterized by a loss of muscle mass, in humans or animals, of at least one bacterium of the family of Christensenellaceae.
  • the invention therefore relates to a bacterium of the Christensenellaceae family for its use in the prevention and / or treatment in humans or animals of a pathological loss of muscle mass or of a disease characterized by a loss of muscle mass.
  • muscle mass in particular chosen from amyotrophy, sarcopenia, pre-sarcopenia, rhabdomyolysis and cachexia, in particular in people or animals with pathological loss of muscle mass or a disease characterized by pathological loss of muscle mass with a synthesis of at least norleucine and / or of at least one marker chosen from: albumin and / or pre-albumin and / or C reactive protein and / or myoglobin.
  • bacteria of the Christensenellaceae family when administered to a human being or an animal exhibiting loss of muscle mass or a disease characterized by loss of muscle mass, are capable of acting on molecules produced in excess during this pathological state, in particular on the production of norleucine and / or at least one marker chosen from: albumin and / or pre-albumin and / or C reactive protein and / or myoglobin.
  • a pathological loss of muscle mass in particular in diseases characterized by a loss of muscle mass which exhibit a synthesis of norleucine, and / or a synthesis of at least one marker chosen from: albumin and / or pre-albumin and / or C-reactive protein and / or myoglobin, their decrease is a sign of increased protein synthesis and increased production of muscle cells.
  • the bacteria useful according to the invention are administered to humans or animals in an amount effective for an action on at least one of these markers of a loss of pathological muscle mass, that is to say for decrease the production of at least one of these markers in the body.
  • the bacteria or bacteria are administered at a dose of 10 9 to 10 12 colony forming units (CFU) per day, regardless of the weight of the person or of the animal.
  • CFU colony forming units
  • it is a single dose, that is to say administered all at once or a dose before each meal, ie three times a day.
  • the bacteria useful according to the invention are bacteria of the Christensenellaceae family, preferably of the genus Christensenella. It may in particular be Christensenella massiliensis, Christensenella timonensis and / or Christensenella minuta. According to a particularly suitable variant, it is Christensenella minuta.
  • the bacteria which are useful according to the invention are preferably administered to humans or animals in a composition.
  • a subject of the invention is also a composition comprising at least one bacterium of the Christensenellaceae family for its use in the prevention and / or treatment of a pathological loss of muscle mass or of a disease characterized by a loss of muscle mass.
  • muscle mass in humans or animals, in particular in people or animals exhibiting a synthesis of norleucine and / or at least one marker chosen from: albumin and / or pre-albumin and / or protein C and / or myoglobin.
  • the bacteria are present in an effective amount in the composition allowing an effect on the loss of muscle mass from which the persons or animals treated are affected.
  • the composition useful according to the invention comprises 10 6 to 10 12 colony-forming units (CFU) of bacteria of the Christensenellaceae family per daily dose of composition to be administered.
  • CFU colony-forming units
  • this corresponds to a daily dose of bacteria to be administered, whatever the weight of the person or the animal.
  • this daily dose is administered all at once.
  • composition useful according to the invention can be in liquid form. It may in particular comprise bacteria of the Christensenellaceae family and a culture medium for said bacteria which makes it possible to conserve them, such as, for example, preferably Columbia anaerobic agar medium enriched with sheep blood, or an equivalent medium not containing a product derived from animal origin.
  • compositions When the compositions are in liquid form, they are preferably frozen, maintained at -20 ° C. in an airtight sachet.
  • the composition useful according to the invention can be provided in solid form.
  • the bacteria can be present in lyophilized form, and the compositions can also comprise excipients such as, for example, microcrystalline cellulose, lactose, sucrose, fructose, levulose, starches, stachyose, raffinose, l 'amylum, calcium lactate, magnesium sulfate, sodium citrate, calcium stearate, polyvinylpyrrolidone, maltodextrin, galactooligosaccharides, fructooligosaccharides, pectins, beta-glucans, lactoglobulins, isomaltooligosaccharides, polydextroses, sorbitol and / or glycerol.
  • excipients such as, for example, microcrystalline cellulose, lactose, sucrose, fructose, levulose, starches, stachyose, raffinose, l
  • compositions useful according to the invention can be in particular in the form of powder, microencapsulated powder, gelatin capsule, capsule, tablet, lozenge, granules, emulsion, suspension or suppository. According to a particularly suitable embodiment, they can be in a gastro-resistant form, such as a coated tablet containing microencapsulated bacteria.
  • compositions When the compositions are in solid form, they are preferably packaged in capsules or in a coating hermetic to light and to oxygen maintained at an ambient temperature of between 15 ° C and 40 ° C and a humidity of between 3% and 70%.
  • the bacteria can be used alive or inactivated, for example by heat, exposure to an appropriate pH, gamma rays or high pressure.
  • At least one part consists of bacteria that are alive, in particular at least 50% (by number), even more preferably at least 90% (by number).
  • the bacteria present in the composition useful according to the invention are at least 50% of living bacteria (by number), preferably for at least 90% of living bacteria (by number), even more preferably all alive.
  • the bacteria useful according to the invention can be administered orally, topically, respiratory (inhalation) or rectally.
  • compositions useful according to the invention in addition to the bacteria useful according to the invention can comprise other compounds, such as:
  • At least one bacterium producing lactic acid which makes it possible to create an anaerobic environment favorable to Christensenellaceae, such as at least one bacterium chosen from bacteria of the genus Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., Streptococcus spp. and / or at least one other organism promoting the anaerobic conditions necessary for the survival of Christensenellaceae such as at least one yeast chosen from Saccharomyces spp. or microorganisms of the Methanobacteriaceae family and / or
  • At least one bacterium associated with the ecosystem of Christensenellaceae because they facilitate their survival in the intestine such as at least one bacterium chosen from bacteria of the phylum Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria, Tenericutes, and Verrucomicrobia, and / or
  • At least one bacterium chosen from bacteria of the order Clostridales, Verrucomicrobiales, Aeromonadales, Alteromonadales, ML615J-28, RF32, YS2, of the Clostridiaceae family, Lachnospiraceae, Erysipelotrichaceae, Ruminococcaceae, Bacteroidaceae , Enterococcaceae, Rikenéllaceae, Dehalobacteriaceae, Veillonellaceae and / or
  • Faecalibacterium chosen from bacteria of the genus Faecalibacterium, Akkermansia, Eubacterium, Turicibacter and Oscillospira such as for example Faecalibacterium prausnitzii, Akkermansia muciniphila, Eubacterium halii, Turicibacter sanguinis, Oscillospiraguilliermondii, and / or
  • At least one prebiotic such as for example at least one prebiotic chosen from galactooligosaccharides, fructooligosaccharides, inulins, arabinoxylans, beta-glucans, lactoglobulins and / or beta-caseins, and / or
  • At least one polyphenol such as for example at least one polyphenol chosen from quercetin, kaempferol, resveratrol, flavones (such as luteolin), flavan-3-ols (such as catechins), flavanones (such as narinenin) ), isoflavones, anthocyanidins, proanthocyanidins, and / or
  • a pathological loss of muscle mass and / or of a disease associated with a loss of muscle mass such as, for example, autophagy inhibitors, in particular in the case of cachexia, nusinersen, flunarizine, riluzole, in particular in the case of muscular atrophy, vitamin D, sevelamer, polystyrene sulfonate, calcium, calcimetics (in particular cinacalcet), darbopoietin , erythropoietin, furosemide, hydrochlorothiazide especially in the case of rhabdomyolysis
  • autophagy inhibitors in particular in the case of cachexia, nusinersen, flunarizine, riluzole, in particular in the case of muscular atrophy, vitamin D, sevelamer, polystyrene sulfonate, calcium, calcimetics (in particular cinacalcet), darbopoietin , erythropoiet
  • the Christensenella minuta bacteria can be cultured according to the operating protocol described below.
  • the Christensenella massiliensis bacteria can be cultured according to the operating protocol described below.
  • the meat filtrate is prepared as follows.
  • Bacteria should be grown in anaerobic condition at 37 ° C.
  • the Christensenella timonensis bacteria can be cultured according to the same operating protocol as that described in Example 2 for Christensenella massiliensis.
  • Example 4 Useful composition according to the invention in liquid form
  • composition useful according to the invention in liquid form is a composition comprising Christensenella minuta 10 9 CFU / mL in the anaerobic RCM culture medium described above, modified to contain no product of animal origin and enriched in 5% glycerol. .
  • Example 4 The composition of Example 4 is obtained from an RCB (“research cell bank”) prepared on the basis of Christensenella minuta 10 10 CFU / mL then stored frozen at -20 ° C in an airtight bag. with oxygen.
  • RCB search cell bank
  • the frozen composition must be warmed to room temperature until it returns to liquid form before use.
  • Example 5 Composition useful according to the invention in solid form
  • composition useful according to the invention in lyophilized form can be obtained by lyophilization of the composition of Example 4 in the frozen state.
  • Norleucine is a non-proteinogenic amino acid which replaces methionine during protein synthesis. This replacement is toxic: it has been shown to cause a decrease in the stability of cytochrome P450 (Cirino, PC, Tang, Y., Takahashi, K., Tirrell, DA & Arnold, FH Global incorporation of norleucine in place of methionine in cytochrome P450 BM-3 heme domain increases peroxygenase activity. Biotechnol. Bioeng. (2003). doi: 10.1002 / bit.10718) and a lack of stimulation of muscle synthesis in pigs (Escobar, J. et al. Leucine and alpha-ketoisocaproic acid, but not norleucine, stimulate skeletal muscle protein synthesis in neonatal pigs. J. Nutr. 140, 1418-24 (2010)).
  • This non-proteinogenic amino acid can be synthesized by different bacterial pathways including the branched chain amino acid synthesis pathway from pyruvate and alpha-ketobutyrate where norleucine is a by-product.
  • the operating protocol of the study is described below.
  • the basic nutrient medium was prepared from 2g / L of soybean tryptone broth, 2g / L of yeast extract, 0.1g / L of NaCl, 0.04g / L of K2 HP04, 0.01g / L of MgS0 3 .7 H 2 0, 0.01g / L of CaCl 2 .6H 2 0, 2g / L NaHCOs, 0.5g / L of L-cystine HCl, 2m L / L of tween 80, 10pL / L of vitamin Kl, 0.05g / L of heme, 0.05g / L of bile salts, 4ml / L of resazarin (pH7)
  • the 20mL biofermenters contained 18mL of basic nutrient medium autoclaved (121 ° C for 15 minutes) and poured aseptically into sterile biofermenters. This system was left to stand overnight with oxygen-free nitrogen bubbling through the medium at a rate of 2 mL / min.
  • the pH was maintained between 6.7 and 6.9 using HCl or NaOH (0.5M).
  • the temperature of each biofermenter was controlled at 37 ° C and the contents of the vessel homogenized with a magnetic mixer
  • predigested proteins (0.35g) was added to the containers before inoculation with 2mL of fecal inocula at T0.
  • the predigested proteins were obtained according to the gastrointestinal digestion protocol adapted from that of Vorsantvoort et al (2005).
  • the mixture was mixed and filtered through a 5-kDa cutoff filter to remove macromolecules.
  • the metabolites were detected by capillary electrophoresis and time-of-flight mass spectrometry (CE-TOFMS) analyzes.
  • Relative peak area (peak area of a metabolite) / (peak area of internal standard x amount of sample).
  • the library was then sequenced using 2 x 150 bp paired-end sequencing on an Illumina HiSeq platform.
  • bacteria of the Christensenellaceae family are capable of acting by reducing the production of markers of a pathological loss of muscle mass or of a disease characterized by a loss of pathological muscle mass, in particular of norleucine. They can therefore be used to prevent and / or treat pathological loss of muscle mass or diseases characterized by loss of muscle mass.

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Abstract

L'invention concerne des bactéries de la famille des Christensenellacées et des compositions l'incluant pour leur utilisation dans la prévention et/ou le traitement d'une perte de masse musculaire pathologique et/ou d'au moins une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire chez l'être humain ou l'animal.

Description

BACTERIE DE LA FAMILLE DES CHRISTENSENELLACEES ET COMPOSITION EN CONTENANT
POUR LA PREVENTION ET/OU LE TRAITEMENT D'UNE PERTE DE MASSE MUSCULAIRE PATHOLOGIQUE OU D'UNE MALADIE CARACTERISEE PAR UNE PERTE DE MASSE
MUSCULAIRE PATHOLOGIQUE
DOMAINE TECHNIQUE
L'invention concerne la préservation de la masse musculaire. En particulier l'invention se rapporte à des bactéries spécifiques du microbiote intestinal et des compositions en contenant pour la prévention et/ou le traitement d'une perte musculaire pathologique ou d'une maladie caractérisée par une perte musculaire pathologique.
ART ANTERIEUR
La perte de masse musculaire pathologique est bien connue de l'homme du métier et désigne une atrophie musculaire, une diminution du volume du muscle (Gordon et al. Therapeutic approaches for muscle wasting disorders. Pharmacol Ther. 2007 Mar;113(3):461-87). Cette perte musculaire concerne généralement les muscles striés squelettiques, qui sont les muscles sous contrôle volontaire. Plusieurs pathologies sont caractérisées par une perte de la masse musculaire, en particulier l'amyotrophie, la pré-sarcopénie, la sarcopénie, la rhabdomyolyse, la cachexie.
L'amyotrophie est une diminution du volume des muscles striés squelettiques et cardiaques, c'est-à-dire que le nombre de fibres composant ces muscles (longues cellules) diminue. La sarcopénie est un syndrome qui se caractérise par une diminution des muscles due à l'âge et qui peut conduire à une détérioration de la force musculaire et des performances physiques.
La rhabdomyolyse est une maladie dans laquelle des cellules des muscles squelettiques se dégradent rapidement et libèrent leur contenu dans la circulation sanguine. Certains de ces produits de dégradation des cellules musculaires endommagées sont nocifs pour les reins et peuvent conduire notamment à une insuffisance rénale. La maladie est caractérisée par plusieurs symptômes comme des douleurs musculaires, des vomissements et de la confusion et le pronostic vital peut être engagé dans certains cas. Certains animaux peuvent être touchés et en particulier les chevaux. La cachexie est un affaiblissement profond de l'organisme qui se caractérise par une perte de poids, de la fatigue et une atrophie musculaire notamment, lié à une dénutrition très importante.
L'atrophie musculaire peut être provoquée notamment par la synthèse de norleucine dans l'organisme. D'autres marqueurs de la fonte musculaire sont connus comme l'albumine, la pré-albumine, la protéine C réactive et la myoglobine.
La norleucine est un acide aminé non protéinogène qui, lorsqu'il est présent, prend la place d'un autre acide aminé, la méthionine, durant la synthèse protéique. Ce remplacement de la méthionine par la norleucine est toxique pour les cellules et en particulier il empêche le renouvellement des cellules musculaires, diminue la croissance des fibres musculaires et réduit le développement musculaire (Bogosian et al. Biosynthesis and Incorporation Into Protein of Norleucine by Escherichia Coli, J Biol Chem 1989 Jan 5;264(l):531-9. La norleucine affecte particulièrement les organes où le remplacement de protéines est important tels que les muscles. Ainsi, les muscles subissent la toxicité de la norleucine à faible dose. A titre d'exemple, Jeffery Escobar et al. 2010 a démontré que l'administration de leucine chez des porcelets a un effet positif sur la synthèse des protéines du muscle squelettique et que la norleucine n'a pas d'effet positif sur la synthèse protéique dans le muscle. Il montre également que la structure chimique de la leucine lui confère ces propriétés.
La norleucine peut être synthétisée par les bactéries dans la voie des produits secondaires de la voie de synthèse des acides aminés branchés à partir du pyruvate et alpha-ketobutyrate. Actuellement, la toxicité de la norleucine est très peu étudiée et aucun traitement de la perte de masse musculaire pathologique ou d'une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire pathologique ne repose sur une réduction de la toxicité de la norleucine malgré l'implication de cet acide aminé dans des voies métaboliques ubiquitaires. L'albumine est une protéine soluble qui est dosée pour vérifier la quantité de protéines dans le sang. Une concentration faible d'albumine est un marqueur de dénutrition qui est accompagné d'une perte importante de muscles.
La protéine C réactive est une protéine qui montre l'état inflammatoire du patient qui est observé lors de perte musculaire due à une cachexie notamment. Une concentration élevée de protéine C réactive est un marqueur de cachexie qui est accompagné d'une perte importante de muscles.
La myoglobine est une protéine capable de transporter l'oxygène vers les muscles, donc indispensable au travail et au développement des muscles. Une concentration élevée de myoglobine plasmatique est un marqueur d'atteinte musculaire ou rhabdomyolyse lors de polytraumatismes, maladies infectieuses, dystrophie musculaire, myopathie.
En outre, les traitements existants de la perte de masse musculaire pathologique ou des maladies caractérisées par une perte de masse musculaire pathologique ne sont pas efficaces. En effet, ceux-ci consistent essentiellement en des exercices physiques lors de séances répétées plusieurs fois par semaine, un apport protéique optimal pour stimuler la synthèse de protéines, la pose d'une perfusion contenant une solution saline, une alcalinisation des urines, une dialyse, une chirurgie de la région lésée ce qui ne permet pas d'obtenir un résultat satisfaisant. En outre, les traitements sont souvent lourds comme pour le traitement de la rhabdomyolyse qui consiste en des perfusions intraveineuses abondantes, et qui peut nécessiter une dialyse ou une hémofiltration dans les cas plus graves.
Un article a porté sur l'étude du microbiote intestinal chez des patients atteints de sarcopénie primaire et notamment les effets d'une activité physique sur le microbiote. Il a également été discuté des effets de l'administration de probiotiques tels que FOS et inuline pour améliorer les symptômes de faiblesse musculaire et de la sarcopénie et ce même s'il n'y a pas de preuve d'un microbiote intestinal distinct chez les patients souffrant de sarcopénie (Andrea Ticinesi et al. Aging gut microbiota at the cross-road between nutrition, physical frailty, and sarcopenia: Is there a gut-muscle axis?. 2017). Toutefois, l'étude ne montre pas d'intérêt particulier pour certaines souches, ni d'utilisation de bactéries selon l'invention. Ainsi, il existe un besoin important pour un traitement efficace de la perte de masse musculaire pathologique et des maladies caractérisées par une perte de masse musculaire pathologique, qui soit capable d'agir sur les différents marqueurs à l'origine de la maladie et en particulier sur la synthèse de la norleucine, qui soit facile à administrer, et qui ne présente pas d'effets secondaires.
EXPOSE DE L'INVENTION
C'est l'objectif de la présente invention, qui, pour y répondre, vise l'utilisation de bactéries particulières du microbiote intestinal humain, à savoir des bactéries de la famille des Christensenellacées.
Des bactéries de la famille des Christensenellacées, notamment du genre Christensenella, ont déjà été étudiées et décrites. C'est le cas en particulier de Christensenella minuta, Christensenella massiliensis et Christensenella timonensis. Christensenella minuta en particulier a été décrite pour la première fois en 2012. En 2014, une étude a montré qu'il s'agissait du taxon le plus héritable dans une cohorte de jumeaux britanniques et que leur présence est associée à un indice de masse corporel faible. Cette corrélation entre Christensenella minuta et l'indice de masse corporel faible a ensuite été observée dans une dizaine d'études parues depuis 2014 dans des populations géographiquement diverses. Enfin, la demande de brevet WO/2018/162738 décrit l'utilisation des bactéries de la famille des Christensenellacées dans le traitement de l'obésité et du surpoids
De façon surprenante, selon l'invention, les bactéries de la famille des Christensenellacées, lorsqu'elles sont administrées à l'homme ou à l'animal, sont capables d'agir sur les marqueurs de la perte de masse musculaire pathologique pour prévenir ou traiter cette maladie ou les maladies caractérisées par une perte de masse musculaire telles que l'amyotrophie, la sarcopénie, la pré-sarcopénie, la rhabdomyolyse, la cachexie.
C'est pourquoi, l'invention a pour objet une bactérie de la famille des Christensenellacées, pour son utilisation dans la prévention et/ou le traitement de l'atrophie musculaire chez l'être humain ou l'animal, en particulier. Avantageusement, une telle bactérie, lorsqu'elle est administrée à un être humain ou un animal présentant une perte de masse musculaire pathologique ou une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire, est capable d'agir sur les molécules produites en excès lors de cet état pathologique comme en particulier la norleucine, et également éventuellement contre l'albumine et/ou la pré-albumine et/ou la protéine C et/ou la myoglobine permettant une augmentation de la synthèse protéique et de la production de cellules musculaires pour retrouver la masse musculaire perdue.
En outre, il s'agit d'une bactérie naturellement présente dans le microbiote intestinal et dont l'administration ne provoque pas d'effets secondaires. Préférentiellement les bactéries pour leur utilisation selon l'invention sont administrées au sein de compositions. Aussi, l'invention a également pour objet les compositions comprenant au moins une bactérie de la famille des Christensenellacées, pour son utilisation dans la prévention et/ou le traitement d'une perte de masse musculaire pathologique ou d'une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire chez l'être humain ou l'animal. D'autres caractéristiques et avantages ressortiront de la description en détails de l'invention qui va suivre.
DESCRIPTION DETAILLEE DE L'INVENTION
Définitions Par « perte de masse musculaire pathologique» ou « perte de masse musculaire » ou « perte musculaire pathologique » au sens de l'invention on entend une diminution anormale, pathologique, de la masse musculaire due à une diminution de la synthèse protéique, notamment de la masse musculaire squelettique.
Par « maladie caractérisée par une perte de masse musculaire pathologique » ou « maladie caractérisée par une perte de masse musculaire » au sens de l'invention on entend une maladie dont l'un des symptômes est une perte de la masse musculaire. Il peut s'agir notamment de l'amyotrophie, la sarcopénie, la pré-sarcopénie, de la rhabdomyolyse ou de la cachexie.
Par « marqueur » d'une maladie au sens de l'invention on entend une molécule ou une substance dont le dosage permet de suivre l'évolution de ladite maladie.
Bactéries selon l'invention
L'invention a pour objet l'utilisation pour prévenir et/ou traiter une perte de masse musculaire pathologique ou une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire, chez l'être humain ou l'animal, d'au moins une bactérie de la famille des Christensenellacées. L'invention vise donc une bactérie de la famille des Christensenellacées pour son utilisation dans la prévention et/ou le traitement chez l'être humain ou l'animal d'une perte de masse musculaire pathologique ou d'une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire notamment choisie parmi l'amyotrophie, la sarcopénie, la pré-sarcopénie, la rhabdomyolyse et la cachexie, en particulier chez des personnes ou des animaux présentant une perte de masse musculaire pathologique ou une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire pathologique avec une synthèse d'au moins la norleucine et/ou d'au moins un marqueur choisi parmi : l'albumine et/ou la pré-albumine et/ou la protéine C réactive et/ou la myoglobine.
Selon l'invention, les bactéries de la famille des Christensenellacées, lorsqu'elles sont administrées à un être humain ou un animal présentant une perte de la masse musculaire ou une maladie caractérisée par une perte de la masse musculaire, sont capables d'agir sur les molécules produites en excès lors de cet état pathologique, en particulier sur la production de la norleucine et/ou d'au moins un marqueur choisi parmi : l'albumine et/ou la pré albumine et/ou la protéine C réactive et/ou la myoglobine. Dans le cas d'une perte de masse musculaire pathologique en particulier dans les maladies caractérisées par une perte de masse musculaire qui présentent une synthèse de norleucine, et/ou une synthèse d'au moins un marqueur choisi parmi : l'albumine et/ou la pré-albumine et/ou la protéine C réactive et/ou la myoglobine, leur diminution est le signe d'une augmentation de la synthèse protéique et de l'augmentation de la production de cellules musculaires.
Lorsque la perte de masse musculaire pathologique ou la maladie caractérisée par une perte de masse musculaire pathologique présente une hyperproduction de la norleucine, sa diminution est le signe de la réduction des voies de synthèse des produits secondaires des acides aminés branchés, c'est-à-dire que cette production est moins stimulée. Dès lors, la production de norleucine excessive en cause de sa toxicité est ralentie et le système retourne progressivement à la norme. Le mécanisme physiologique de synthèse des muscles se normalise et le développement musculaire augmente.
Les bactéries utiles selon l'invention sont administrées à des êtres humains ou des animaux dans une quantité efficace pour une action sur au moins l'un de ces marqueurs de d'une perte de masse musculaire pathologique, c'est-à-dire pour diminuer la production d'au moins un de ces marqueurs dans l'organisme.
Selon un mode de réalisation adapté, la ou les bactéries sont administrées à raison d'une dose de 109 à 1012 unités formant des colonies (CFU) par jour, quel que soit le poids de la personne ou de l'animal. Préférentiellement il s'agit d'une dose unique, c'est-à-dire administrée en une seule fois ou une dose avant chaque repas soit trois fois par jour.
Les bactéries utiles selon l'invention sont des bactéries de la famille des Christensenellacées, préférentiellement du genre Christensenella. Il peut s'agir en particulier de Christensenella massiliensis, Christensenella timonensis et/ou Christensenella minuta. Selon une variante particulièrement adaptée, il s'agit de Christensenella minuta.
Ces bactéries peuvent être isolées à partir de selles humaines par exemple selon les protocoles publiés par Morotomi et al. 2012 (Morotomi, M., Nagai, F. & Watanabe, Y. Description of Christensenella minuta gen. nov., sp. nov., isolated from human faeces, which forms a distinct branch in the order Clostridiales, and proposai of Christensenellaceae fam. nov. INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY 62, 144-149 (2012)) et NDongo et al. 2016 (Ndongo, S., Dubourg, G., Khelaifia, S., Fournier, P. E. & Raoult, D. Christensenella timonensis, a new bacterial species isolated from the human gut. New Microbes and New Infections 13, 32-33 (2016)). Ces documents décrivent également les méthodes de culture des bactéries utiles selon l'invention. Compositions
Les bactéries utiles selon l'invention, sont préférentiellement administrées à l'être humain ou l'animal dans une composition.
Ainsi, l'invention a également pour objet une composition comprenant au moins une bactérie de la famille des Christensenellacées pour son utilisation dans la prévention et/ou le traitement d'une perte de masse musculaire pathologique ou d'une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire, chez l'être humain ou l'animal, notamment chez des personnes ou des animaux présentant une synthèse de norleucine et/ou d'au moins un marqueur choisi parmi : l'albumine et/ou la pré-albumine et/ou la protéine C et/ou la myoglobine.
Les bactéries sont présentes en une quantité efficace dans la composition permettant un effet sur la perte de masse musculaire dont sont atteints les personnes ou les animaux traités. Préférentiellement, la composition utile selon l'invention comprend 106 à 1012 unités formant des colonies (CFU) de bactéries de la famille des Christensenellacées par dose quotidienne à administrer de composition. Préférentiellement cela correspond à une dose quotidienne de bactéries à administrer, quel que soit le poids de la personne ou de l'animal. De façon préférée, cette dose quotidienne est administrée en une seule fois.
La composition utile selon l'invention peut être sous forme liquide. Elle peut notamment comprendre des bactéries de la famille des Christensenellacées et un milieu de culture desdites bactéries qui permet de les conserver, comme par exemple préférentiellement le milieu Columbia agar anaérobique enrichi en sang de mouton, ou un milieu équivalent ne contenant pas de produit dérivé d'origine animale.
Lorsque les compositions sont sous forme liquide, elles sont préférentiellement congelées, maintenues à -20°C dans un sachet hermétique.
Selon une variante, la composition utile selon l'invention peut se présenter sous forme solide. Dans ce cas les bactéries peuvent être présentes sous forme lyophilisée, et les compositions peuvent comprendre également des excipients tels que par exemple la cellulose microcrystalline, le lactose, le saccharose, le fructose, le lévulose, les amidons, le stachyose, le raffinose, l'amylum, le lactate de calcium, le sulfate de magnésium, le citrate de sodium, le calcium stéarate, la polyvinylpyrrolidone, la maltodextrine, les galactooligosaccharides, les fructooligosaccharides, les pectines, les béta-glucans, les lactoglobulines, les isomaltooligosaccharides, les polydextroses, le sorbitol et/ou le glycérol.
Les compositions utiles selon l'invention peuvent se présenter en particulier sous forme de poudre, de poudre microencapsulée, de gélule, de capsule, de comprimé, de pastille, de granulés, d'émulsion, de suspension ou de suppositoire. Selon un mode de réalisation particulièrement adapté, elles peuvent se présenter sous une forme gastro-résistante, telles qu'un comprimé enrobé contenant des bactéries microencapsulées.
Lorsque les compositions sont sous forme solide, elles sont préférentiellement conditionnées dans des capsules ou dans un enrobage hermétique à la lumière et à l'oxygène maintenu à une température ambiante comprise entre 15°C et 40°C et un taux d'humidité compris entre 3% et 70%.
Les bactéries peuvent être utilisées vivantes ou inactivées par exemple par la chaleur, l'exposition à un pH approprié, aux rayons gamma ou à la mise sous haute pression.
Elles peuvent être toutes vivantes ou toutes inactivées.
Préférentiellement, au moins une partie est constituée par des bactéries sont vivantes, en particulier au moins 50% (en nombre), encore plus préférentiellement au moins 90% (en nombre).
Ainsi, selon un mode de réalisation adapté, les bactéries présentes dans la composition utile selon l'invention sont pour au moins 50% des bactéries vivantes (en nombre), préférentiellement pour au moins 90% des bactéries vivantes (en nombre), encore plus préférentiellement toutes vivantes.
Les bactéries utiles selon l'invention, et en particulier les compositions l'incluant, peuvent être administrées par voie orale, topique, respiratoire (inhalation) ou rectale.
Les compositions utiles selon l'invention, en plus des bactéries utiles selon l'invention peuvent comprendre d'autres composés, tels que :
- au moins un probiotique, et/ou
- au moins une bactérie produisant de l'acide lactique qui permet de créer un environnement anaérobique favorable aux Christensenellacées telle qu'au moins une bactérie choisie parmi les bactéries du genre Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., Streptococcus spp. et/ou au moins un autre organisme favorisant les conditions anaérobiques nécessaires à la survie des Christensenellacées telle qu'au moins une levure choisie parmi des Saccharomyces spp. ou des microorganismes de la famille des Methanobacteriaceae et/ou
- au moins une bactérie associée à l'écosystème des Christensenellacées car elles facilitent leur survie dans l'intestin telle qu'au moins une bactérie choisie parmi les bactéries du phylum Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria, Tenericutes, et Verrucomicrobia, et/ou
- au moins une bactérie choisie parmi les bactéries de l'ordre des Clostridales, des Verrucomicrobiales, des Aeromonadales, des Alteromonadales, ML615J-28, RF32, YS2, de la famille des Clostridiacées, des Lachnospiracées, des Erysipelotrichacées, des Ruminococcacées, des Bacteroidacées, des Enterococcacées, des Rikenéllacées, des Dehalobactériacées, des Veillonellacées et/ou
- au moins une bactérie choisie parmi les bactéries du genre Faecalibacterium, Akkermansia, Eubacterium, Turicibacter et Oscillospira telle que par exemple Faecalibacterium prausnitzii, Akkermansia muciniphila, Eubacterium halii, Turicibacter sanguinis, Oscillospiraguilliermondii, et/ou
- au moins un prébiotique tel que par exemple au moins un prébiotique choisi parmi les galactooligosaccharides, les fructooligosaccharides, les inulines, les arabinoxylans, les béta- glucanes, les lactoglobulines et/ou les béta-caséines, et/ou
- au moins un polyphénol tel que par exemple au moins un polyphénol choisi parmi la quercetin, le kaempferol, le resvératrol, les flavones (comme la lutéoline), les flavan-3-ols (comme les catéchines), les flavanones (comme la narinénine), les isoflavones, les anthocyanidines, les proanthocyanidines, et/ou
- au moins un minéral et/ou au moins une vitamine et/ou au moins un agent nutritionnel, et/ou
- au moins un principe actif pharmaceutique présentant un effet dans la prévention et/ou le traitement d'une perte de masse musculaire pathologique et/ou d'une maladie associée à une perte de masse musculaire tel que par exemple des inhibiteurs d'autophagie, notamment dans le cas de la cachexie, le nusinersen, la flunarizine, le riluzole, notamment dans le cas de l'amyotrophie, la vitamine D, le sévélamer, le sulfonate de polystyrène, le calcium, les calcimétiques (notamment cinacalcet), la darbopoïétine, l'érythropoïétine, la furosémide, l'hydrochlorothiazide notamment dans le cas d'une rhabdomyolyse L'invention est à présent illustrée par des exemples de bactéries utiles selon l'invention, de procédés de cultures de ces bactéries, des exemples de compositions les contenant et des résultats d'essais démontrant l'efficacité des bactéries de la famille des Christensenellacées sur une perte de masse musculaire pathologique et les maladies associées à une perte de masse musculaire pathologique.
EXEMPLES
Exemple 1 : Christensenella minuta
Les bactéries Christensenella minuta peuvent-être cultivées selon le protocole opératoire décrit en suivant.
1/ Dissoudre un milieu RCM ("Reinforced Clostridial Medium" milieu clostridiale renforcé) déshydraté dans de l'eau distillée
2/ Ajouter 0,5 mL/L de solution de résazurine-Na (0,1% p/v)
B/Porter à ébullition et refroidir à température ambiante tout en injectant un mélange gazeux à 80% de N2 et à 20% de C02
4/Etaler le milieu sous la même atmosphère gazeuse dans des tubes de type Hungate anoxiques ou dans des flacons de sérum puis autoclaver
5/Avant utilisation, ajoutez 1,0 g de carbonate de sodium par litre à partir d'une solution mère anoxique stérile préparée avec un mélange gazeux à 80% de N2 et à 20% de C02
6/ Vérifier le pH du milieu après autoclavage et ajuster le pH entre 7,3 et 7,5, en utilisant une solution mère anoxique stérile de bicarbonate de sodium (5% p / v) préparée dans une atmosphère gazeuse à 80% de N2 et à 20% de C02.
Exemple 2 : Christensenella massiliensis
Les bactéries Christensenella massiliensis peuvent-être cultivées selon le protocole opératoire décrit en suivant.
1/Préparer un milieu carboxyméthylcellulose (N2 / C02) en suivant les instructions suivantes fournies par DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zell- kulturen), présentées dans le Tableau 1. [Tableau 1]
2/Dissoudre les différents constituants listés dans le tableau ci-dessus, sauf la cystéine, les carbohydrates et le carbonate.
B/Faire bouillir le milieu pendant 1 min, puis le laisser refroidir à la température ambiante sous une atmosphère gazeuse à 80% de ISh et à 20% de CO2.
4/ Ajouter 0,5 g/L de L-cystéine-HCI x H2O et le verser sous la même atmosphère gazeuse dans des tubes de type Hungate (pour les souches exigeant des particules de viande, introduire celles-ci en premier dans le tube, utiliser 1 partie de particules de viande pour 4 ou 5 parties de liquide).
5/ Autoclavage à 121°C pendant 20 min.
6/ Après autoclavage, ajouter le glucose, le cellobiose, le maltose et l'amidon provenant de solutions mères anoxiques stériles préparées à 100% de gaz N2 et de carbonate à partir d'une solution mère anoxique stérile préparée sous des mélanges gazeux à 80% de N2 et 20% de C0 .
7/ Ajuster le pH du milieu à 7, si nécessaire.
La composition du filtrat de viande est présentée dans le Tableau 2. [Tableau 2]
Le filtrat de viande est préparé comme suit.
a/Utiliser du bœuf maigre ou de la viande de cheval.
b/Enlever la graisse et le tissu conjonctif avant de hacher.
c/ Mélanger la viande, l'eau et NaOH, puis faire bouillir pendant 15 min sous agitation.
d/ Laisser refroidir à la température ambiante, retirer la graisse de la surface et filtrer, en retenant les particules de viande et le filtrat.
e/Ajouter au filtrat de l'eau jusqu'à un volume final de 1000,0 ml.
Les bactéries doivent être cultivées en condition anaérobie à 37°C.
Exemple 3 : Christensenella timonensis
Les bactéries Christensenella timonensis peuvent-être cultivées selon le même protocole opératoire que celui décrit à l'exemple 2 pour Christensenella massiliensis.
Exemple 4 : Composition utile selon l'invention sous forme liquide
Un exemple de composition utile selon l'invention sous forme liquide est une composition comprenant Christensenella minuta 109 CFU/mL dans le milieu de culture RCM anaérobie décrit ci-dessus modifié pour ne contenir aucun produit d'origine animale et enrichi en glycérol 5%.
La composition de l'exemple 4 est obtenue à partir d'une RCB («research cell bank » banque de cellules de recherche) préparée à base de Christensenella minuta 1010 CFU/ mL puis conservée congelée à -20°C dans un sachet hermétique à l'oxygène.
La composition congelée doit être réchauffée à température ambiante jusqu'à retrouver une forme liquide avant utilisation.
Exemple 5 : Composition utile selon l'invention sous forme solide
Un exemple de composition utile selon l'invention sous forme lyophilisée peut être obtenu par lyophilisation de la composition de l'exemple 4 à l'état congelé.
Essai in vitro démontrant l'effet de l'invention sur la synthèse de norleucine L'objectif de cette étude est de démontrer l'effet de bactéries de la famille des Christensenellacées sur la norleucine in vitro. L'étude a été réalisée sur la norleucine, responsable de la toxicité à l'origine de la fonte musculaire.
La norleucine est un acide aminé non protéinogène qui remplace la méthionine au cours de la synthèse des protéines. Ce remplacement est toxique : il a été démontré qu'il entraîne une diminution de la stabilité du cytochrome P450 (Cirino, P. C., Tang, Y., Takahashi, K., Tirrell, D. A. & Arnold, F. H. Global incorporation of norleucine in place of méthionine in cytochrome P450 BM-3 heme domain increases peroxygenase activity. Biotechnol. Bioeng. (2003). doi:10.1002/bit.10718) et un manque de stimulation de la synthèse musculaire chez le porc (Escobar, J. et al. Leucine and alpha-ketoisocaproic acid, but not norleucine, stimulate skeletal muscle protein synthesis in néonatal pigs. J. Nutr. 140, 1418-24 (2010)).
Cet acide aminé non protéinogène peut être synthétisé par différentes voies bactériennes dont la voie de synthèse des acides aminés à chaîne ramifiée à partir de pyruvate et d'alpha- cétobutyrate où la norleucine est un sous-produit. Le protocole opératoire de l'étude est décrit en suivant.
1/ Protocole de fermentation à partir de fèces d'origine humaine contenant du Christensenella spp :
- Les donneurs ne devaient pas avoir pris d'antibiotiques durant les six mois précédents l'expérience et n'avoir aucun historique de désordres gastro-intestinaux. Les donneurs étaient âgés entre 18 et 60 ans.
- La collecte des échantillons frais de leur fèces est obtenue dans des contenants stériles en plastique, conservés dans des flacons anaérobies contenant un sachet de 2,51 d'AnaeroGenTM d'OxoidTM (02 <0.1%; CO2: 7-15%). Ces échantillons ont été apportés au laboratoire dans les deux heures après leur production. - Les échantillons de fèces ont été dilués au 1/5 (poids/volumes) dans une solution saline tamponnée au phosphate (IM) (PBS), pH 7,4. La suspension a été homogénéisée dans un stomacher pendant 120 secondes. - Milieu nutritif de base: le milieu nutritif de base a été préparé à partir de 2g/L de bouillon de tryptone de soja, 2g/L d'extrait de levure, 0,lg/L de NaCI, 0,04g/L de K2 HP04, 0,01g/L de MgS03.7 H20, 0,01g/L de CaCI2.6H20, 2g/L NaHCOs, 0,5g/L de L-cystine HCl, 2m L/L de tween 80, 10pL/L de vitamine Kl, 0,05g/L d'hème, 0,05g/L de sels biliaires, 4ml/L de résazarin (pH7)
- Fermentation en biofermenteur : Les biofermenteurs de 20mL de contenance contenaient 18mL de milieu nutritif de base autoclavé (121°C pendant 15 minutes) et versé aseptiquement dans les biofermenteurs stériles. Ce système a été laissé au repos toute la nuit avec un bullage d'azote sans oxygène à travers le milieu à un taux de 2mL/min. Le pH était maintenu entre 6,7 et 6,9 en utilisant du HCl ou NaOH (0,5M). La température de chaque biofermenteur était contrôlée à 37°C et le contenu du récipient homogénéisé avec un mélangeur magnétique
- un mélange de protéines prédigérées (0,35g) a été ajouté dans les récipients avant l'inoculation avec 2mL d'inocula fécal à T0. Les protéines prédigérées ont été obtenues selon le protocole de digestion gastro-intestinale adapté de celui de Ver- santvoort et al (2005).
- les échantillons ont été collectés avant la fermentation (T0) et après 48 heures de fermentation (T48), et congelés à -80°C jusqu'aux analyses.
2/ Quantification de la norleucine
- 50 pL d'échantillons collectés et conservés à -80°C ont été mélangés avec 20 pL d'eau Milli- Q contenant des standards internes.
- Le mélange a été mélangé et filtré à travers un filtre de seuil 5-kDa pour retirer les macromolécules.
- Les métabolites ont été détectés par analyses en électrophorèse capillaire et spectrométrie de masse à temps de vol (CE-TOFMS). La limite de détection des pics a été déterminée sur la base du ratio signal/bruit, S/N=3.
Aire relative du pic = (aire du pic d'un métabolite)/(aire du pic du standard interne x quantité d'échantillon).
3/ Quantification de Christensenella spp. - L'ADN contenu dans les échantillons a été extrait en utilisant le kit NucleoSpin®96 Soil de Macherey-Nagel selon les instructions du fabricant.
- L'ADN extrait total a ensuite été fragmenté aléatoirement en fragments de 350 bp puis utilisé pour construire une librairie en utilisant le kit NEBNext Ultra II par New England Biolabs selon les instructions du fabricant.
- La librairie a ensuite été séquencée en utilisant du séquençage paired-end de 2 x 150 bp sur une plateforme Illumina HiSeq.
- L'abondance des bactéries a été mesurée en créant un catalogue d'espèces métagénomiques (MGS) à partir d'un catalogue de référence contenant 22M de gènes. Ces MGS ont ensuite été associées à un niveau taxonomique adapté. Dans le cas des Christensenella, celles-ci ont été détectées au niveau du genre et sont donc référencées dans cette expérience par Christensenella spp.
La quantité relative de norleucine et l'abondance relative de Christensenella spp ont été analysées et corrélées, obtenant une régression linéaire de R=-0,45 (n=18). Les résultats sont présentés dans le Tableau 3.
[Tableau B]
On constate une corrélation négative entre les bactéries de la famille des Christensenellacées et la norleucine, ce qui démontre un effet protecteur des bactéries de la famille des Christensenellacées notamment contre la toxicité de la norleucine dans les réactions enzymatiques catalysées par le cytochrome P450 et l'inhibition de la synthèse musculaire. Ainsi les bactéries de la famille des Christensenellacées sont capables d'agir en diminuant la production de marqueurs d'une perte de masse musculaire pathologique ou d'une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire pathologique, notamment de norleucine. Elles peuvent donc être utilisées pour prévenir et/ou traiter une perte de masse musculaire pathologique ou les maladies caractérisées par une perte de masse musculaire.

Claims

REVENDICATIONS
[Revendication 1] [Bactérie de la famille des Christensenellacées pour son utilisation dans la prévention et/ou le traitement d'une perte de masse musculaire pathologique et/ou d'au moins une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire chez l'être humain ou l'animal.
[Revendication 2] Bactérie de la famille des Christensenellacées pour son utilisation selon la revendication 1, chez des patients ou des animaux présentant une diminution de la masse musculaire corrélée à une synthèse de norleucine.
[Revendication B] Bactérie de la famille des Christensenellacées pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications dans le traitement et/ou la prévention d'au moins une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire choisie parmi l'amyotrophie, la sarcopénie, la pré-sarcopénie, la rhabdomyolyse et la cachexie.
[Revendication 4] Bactérie de la famille des Christensenellacées pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce que ladite bactérie est une bactérie du genre Christensenella.
[Revendication 5] Bactérie de la famille des Christensenellacées pour son utilisation selon l'une des précédentes revendications, caractérisée en ce que ladite bactérie est choisie parmi Christensenella massiliensis, Christensenella timonensis et Christensenella minuta.
[Revendication 6] Composition comprenant au moins une bactérie de la famille des Christensenellacées, pour son utilisation dans la prévention et/ou le traitement d'une perte de masse musculaire pathologique et/ou d'au moins une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire chez l'être humain ou l'animal.
[Revendication 7] Composition pour son utilisation selon la précédente revendication, dans la prévention et/ou le traitement d'au moins une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire choisie parmi l'amyotrophie, la sarcopénie, la pré-sarcopénie, la rhabdomyolyse et la cachexie.
[Revendication 8] Composition pour son utilisation selon la revendication 6 ou 7, caractérisée en ce qu'elle se présente sous forme liquide.
[Revendication 9] Composition pour son utilisation selon la revendication 6 ou 7, caractérisée en ce qu'elle se présente sous forme solide.
[Revendication 10] Composition pour son utilisation selon la revendication 9, caractérisée en ce que les bactéries sont présentes sous forme lyophilisée.
[Revendication 11] Composition pour son utilisation selon l'une des revendications 6 à 10, caractérisée en ce que les bactéries présentes sont pour au moins 50% des bactéries vivantes (en nombre).
[Revendication 12] Composition pour son utilisation selon l'une des revendications 6 à 11, caractérisée en ce que les bactéries présentes sont pour au moins 90% des bactéries vivantes (en nombre).
[Revendication 13] Composition pour son utilisation selon l'une des revendications 6 à 12, par voie orale, rectale ou inhalée.
[Revendication 14] Composition pour son utilisation selon l'une des revendications 6 à 13, caractérisée en ce qu'elle se présente sous forme de poudre, de poudre microencapsulée, de gélule, de capsule, de comprimé, de pastille, de granulés, d'émulsion, de suspension ou de suppositoire.
[Revendication 15] Composition pour son utilisation selon l'une des revendications 6 à 14, caractérisée en ce qu'elle se présente sous une forme gastro-résistante.
[Revendication 16] Composition pour son utilisation selon l'une des revendications 6 à 15, caractérisée en ce qu'elle comprend au moins un probiotique et/ou au moins un prébiotique. [Revendication 17] Composition pour son utilisation selon l'une des revendications 6 à 16, caractérisée en ce qu'elle comprend également :
- au moins une bactérie produisant de l'acide lactique et/ou au moins un autre organisme favorisant les conditions anaérobiques nécessaires à la survie des Christensenellacées, et/ou
- au moins une bactérie associée à l'écosystème des Christensenellacées, et/ou
- au moins une bactérie choisie parmi les bactéries du genre Faecali-bacterium, Akkermonsio, Eubacterium, Turicibacter et Oscillospira, et/ou
- au moins un polyphénol, et/ou
- au moins un minéral et/ou au moins une vitamine et/ou au moins un agent nutritionnel, et/ou - au moins un principe actif pharmaceutique présentant un effet de prévention ou de traitement d'une perte de masse musculaire pathologique et/ou d'une maladie caractérisée par une perte de masse musculaire.
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