EA012573B1 - РНКi МОДУЛЯЦИЯ RSV И ЕЁ ТЕРАПЕВТИЧЕСКОЕ ПРИМЕНЕНИЕ - Google Patents

Abstract

Настоящее изобретение основано на демонстрации in vivo, что RSV можно ингибировать интраназальным введением РНКi-агентов, а также парентеральным введением таких агентов. Кроме того, показано, что эффективное уменьшение вируса может быть достигнуто более чем с одним вирусом, подвергаемым конкурентному лечению. На основании этих данных в настоящем изобретении предлагаются общие и специфические композиции и способы, которые являются эффективными для снижения уровней мРНК RSV, уровней белка RSV и титров вируса у пациента, например млекопитающего, такого как человек. Эти данные применимы и к другим респираторным вирусам.

Description

По заявке на данное изобретение испрашивается преимущество приоритета по предварительной заявке США № 60/642364, поданной 7 января 2005 г., которая включена здесь в качестве ссылки в полном объеме.

Область техники

Изобретение относится к области лечения респираторных синцитиальных вирусов (Β8ν) и к композициям и способам модуляции репликации вируса, более конкретно - к отрицательной регуляции гена (генов) респираторного синцитиального вируса олигонуклеотидами посредством РНК интерференции, вводимыми местно в легкие и носовой ход ингаляционно/интраназально или системно путем инъекции/внутривенно.

Предпосылки

Вследствие выполняемой природной функции дыхательные пути подвергаются воздействию множества патогенов, находящихся в воздухе, которые вызывают различные респираторные заболевания. Вирусная инфекция дыхательных путей является наиболее распространенной причиной госпитализации детей раннего возраста в развитых странах мира приблизительно с 91000 ежегодных госпитализаций в США стоимостью $300 млн. Респираторно-синцитиальный вирус человека (К.8У) и вирус парагриппа (Ρίν) являются двумя основными факторами респираторных заболеваний; вместе они инфицируют верхние и нижние дыхательные пути, приводя к крупу, пневмонии и бронхиолиту (Ореизйает, Ρ.Ι.Μ. Векр1г. Век. 3 (8ирр1 1), 315-320 (2002), ЕакЮи, А.Ц е! а1., Οΐίη. ΜίετοΜοΙ. Веу. 17, 390-412 (2004)). Только Β8ν инфицирует до 65% всех детей первого года жизни и фактически всех детей первых 2 лет. Β8ν является важной причиной заболеваемости и смертности также и у пожилых людей. Иммунитет после Β8ν инфекции не является ни полным, ни длительным, и, следовательно, повторные инфекции имеют место во всех возрастных группах. У детей, переболевших Β8ν бронхиолитом, более вероятно развитие хрипов и астмы в более позднем возрасте. Поиск эффективного лечения и вакцины против Β8ν продолжался в течение почти четырех десятилетий и имел небольшой успех (Орепкйает, Ρ.Ι.Μ. Векр1г. Век. 3 (8ирр1 1), 815-820 (2002), Маддоп, К. е! а1., Βеν. Меб. νίτοί. 14, 149-168 (2004)). В настоящее время не одобрено ни одной вакцины против Β8ν. Штаммы обоих вирусов также существуют у животных, не относящихся к человеку, таких как крупный рогатый скот, козы, свиньи и овцы, что приводит к убыткам в сельском хозяйстве, молочной и мясной промышленности (Еак!оп, А.1., е! а1., Οΐίη. ΜίετοΜοΙ. Βеν. 17, 390-412 (2004)).

Оба Β8ν содержат несегментированные РНК геномы с минус-цепью и принадлежат семейству парамиксовирусов. Целый ряд особенностей этих вирусов вносит свой вклад в трудность профилактики и лечения. Вирусные геномы мутируют с высокой скоростью вследствие отсутствия механизма корректировки считывания РНК геномов, представляя значительную трудность в создании надежной вакцины или противовирусного лекарственного средства (8и11епбег, XV.Μ. Οΐίη. Μίετοϋίοΐ. Βον. 13, 1-15 (2000)). От перспективных ингибиторов слитого белка (Е) Β8ν частично отказались, поскольку у вируса развились устойчивые мутации, которые были картированы в Е гене (ΒαζίηΕον. ν., е!. а1., Αηΐίνίτ. Век. 55, 189-200 (2002), Μοήοη, С.1. е! а1. νίτο1οβν 311, 275-288 (2003)). Оба вируса связаны с клеточными белками, что прибавляет трудностей к получению бесклеточного вирусного материала для вакцинации (Вигке, Е., е! а1., νίτο1ο^ 252, 137-148 (1998), Вигке, Е., е! а1., 1. У1го1. 74, 669-675 (2000), Сир1а, 8., е! а1., 1. У1то1. 72, 2655-2662 (1998)). Наконец, иммунология обоих, и особенно иммунология Β8ν, является чрезвычайно сложной (РееЫек, Β.8., 1г., е! а1., Уиа1. ТютитЕ 16, 25-34 (2003), Нау век, Ε.Μ., е! а1., 1. νίτο1. 11, 98319844 (2003)). Применение Β8ν белков в качестве вакцин приводит к «иммунопотенцированию» или к усиленному вакциной заболеванию (ΡοΗε^ Е.Р. е! а1. 1. Ехр. Μο6. 196, 859-865 (2002)). В целом проблема недооценивается вследствие недавнего закрытия множества биофармацевтических программ против Β8ν.

Геном Β8ν содержит одиночную обратную цепь РНК длиной 15222 нуклеотидов, продуцирующую одиннадцать основных белков (Еа1кеу, Α.Β., а об Χν<ι1κ1ι Е.Е., 2000, СНп1сл1 Μ^с^οЬ^ο1οд^са1 Βеν^еетк, 13:371-84.) Два из этих белков, гликопротеины Е (слитый) и С (связывающий), являются основными белками поверхности и наиболее важными для индукции защитного иммунитета. 8Н (малый гидрофобный) белок, Μ (матриксный) белок и М2 (22 кДа) белок связаны с оболочкой вируса, но не вызывают защитный иммунный ответ. Обнаружено, что белки N (основной белок, связанный с нуклеокапсидом), Ρ (фосфопротеин) и Ь (основной белок полимеразы) связаны с РНК вириона. Два неструктурных белка N81 и N82, по-видимому, принимают участие во взаимодействии хозяина и вируса, но отсутствуют в инфицирующих вирионах.

Штаммы Β8ν человека были разделены на две основные группы: А и В. Было показано, что гликопротеин С является наиболее дивергентным среди белков Β8ν. Считается, что изменчивость гликопротеина С Β8ν между двумя группами Β8ν и в пределах этих групп играет важную роль в способности Β8ν вызывать ежегодные вспышки эпидемии. Гликопротеин С содержит 289-299 аминокислот (в зависимости от штамма Β8ν) и имеет внутриклеточную, трансмембранную и высоко гликозилированную стеблеобразную структуру 90 кДа, а также гепаринсвязывающие домены. Этот гликопротеин существует в секретируемой и мембраносвязанной формах.

- 1 012573

В настоящее время не существует эффективных способов лечения Р8У инфекции (Маддоп К. аий Вапк 8., 2004, Вс\тс\\ъ ίη Мейюа1 У1го1оду. 14:149-68). Инфицирование нижних отделов дыхательных путей К.8У в большинстве случаев излечивается самостоятельно. Отсутствуют четкие руководства или критерии по лечению или госпитализации и выписке детей младшего и старшего возраста с этим заболеванием. Гипоксию. которая может иметь место в связи с К.8У инфекцией. можно лечить кислородом через носовой катетер. Механическая вентиляция у детей с дыхательной недостаточностью. шоком или рецидивирующим апноэ может снижать смертность. Некоторые лечащие врачи назначают стероиды. Однако некоторые исследования показали. что лечение стероидами не влияет на течение болезни детей младшего и старшего возраста. госпитализированных с бронхиолитом. Следовательно. кортикостероиды отдельно или в комбинации с бронхолитиками могут быть бесполезными при лечении бронхиолита у здоровых в других отношениях пациентов. не получающих механическую вентиляцию. Стероиды также использовались у детей младшего и старшего возраста с первичными сердечно-легочными заболеваниями. такими как бронхолегочная дисфазия и астма.

Рибавирин. аналог гуанозина. обладающий противовирусной активностью. использовали для лечения детей младшего и старшего возраста с Р8У бронхиолитом с середины 1980-х гг.. но многие исследования. оценивающие его применение. показали противоречивые результаты. В большинстве центров применение рибавирина в настоящее время ограничено пациентами с иммунодефицитом и тяжелобольными.

Тяжесть Р8У бронхиолита была связана с низкими сывороточными концентрациями ретинола. но исследования у госпитализированных детей с Р8У бронхиолитом показали. что добавление витамина А не обеспечивает положительного эффекта. Терапевтические исследования 1500 мг/кг внутривенно введенного Р8У иммуноглобулина или 100 мг/кг ингаляционно введенного иммуноглобулина при Р8У инфекции нижних отделов дыхательных путей также не показали значительных благоприятных эффектов.

В развитых странах лечение Р8У инфекции нижних отделов дыхательных путей в основном ограничено симптоматической терапией. Противовирусное лечение обычно ограничено опасными для жизни ситуациями вследствие высокой стоимости и отсутствием единого мнения в отношении эффективности. В развивающихся странах главным лечением является кислород (при его доступности) и единственным способом снижения смертности является профилактика.

РНК интерференция или «РНК1» представляет собой термин. первоначально предложенный Р1ге и сотрудниками для описания научных наблюдений. что двухспиральная РНК (й&РНК) может блокировать генную экспрессию при введении червям (Р1ге е! а1.. Иа1иге 391:806-811. 1998). Короткая йкРНК направляет геноспецифичный посттранскрипционный сайленсинг у многих организмов. в том числе у позвоночных. и представляет новый инструмент для изучения функции гена. РНК1 была предложена в качестве способа разработки нового класса терапевтических средств. Однако до настоящего времени это главным образом оставалось предположением без демонстрации доказательств возможности терапевтического использования РНК1.

Таким образом. существует необходимость в безопасных и эффективных вакцинах против Р8У. особенно для детей младшего и старшего возраста. Также существует необходимость в лекарственных средствах и способах лечения Р8У инфекции во всех возрастных группах и у индивидуумов с иммунодефицитом. Также существует необходимость в научных методах для характеристики защитной иммунной реакции на Р8У для изучения патогенеза этого заболевания и для облегчения скрининга лекарственных средств и вакцин. Настоящее изобретение преодолевает недостатки. ранее существующие в уровне техники. обеспечивая способы и композиции. эффективные для модуляции или профилактики Р8У инфекции. В частности. настоящее изобретение вносит вклад в уровень техники. предлагая 1РНК-агенты. которые. как было показано. снижают уровни Р8У ίη νίίτο и ίη νίνο. а также являются эффективными в отношении двух основных подтипов Р8У и демонстрируют терапевтическую активность молекул этого класса.

Краткое изложение изобретения

Настоящее изобретение основано на ίη νίίτο и ίη νίνο демонстрации того. что Р8У можно ингибировать путем интраназального введения 1РНК-агентов. а также парентеральным введением таких агентов. и идентификации эффективных 1РНК-агентов из Р. N и Ь гена Р8У. которые могут снижать уровни РНК. как с подтипом А. так и с подтипом В Р8У. Исходя из полученных результатов. настоящее изобретение относится к особым композициям и способам. применимым для снижения уровней мРНК Р8У. уровней белков Р8У и титров вируса Р8У у пациента. например млекопитающего. такого как человек.

Настоящее изобретение в особенности относится к 1РНК-агентам. главным образом состоящим или содержащим по меньшей мере 15 или более смежных нуклеотидов одного из генов Р8У. особенно генов Р. N и Ь Р8У. и более конкретно. к агентам. содержащим 15 или более смежных нуклеотидов одной из последовательностей. представленных в табл. 1(а-с). 1РНК-агент предпочтительно состоит из менее 30 нуклеотидов на цепь. например 21-23 нуклеотидов. таких как указано в табл. 1(а-с). Двухцепочечный 1РНК-агент может иметь тупые концы или более предпочтительно иметь выступы из 1-4 нуклеотидов с одного или обоих З'-концов этого агента.

- 2 012573

Кроме того, 1РНК-агент может либо содержать только природные рибонуклеотидные субъединицы, либо может быть синтезирован таким образом, что содержит одну или несколько модификаций сахара или основания одной или нескольких рибонуклеотидных субъединиц, включенных в этот агент. 1РНК-агент дополнительно может быть модифицирован таким образом, чтобы он присоединялся к лиганду, который выбран для улучшения стабильности, распределения или включения в клетку этого агента, например к холестерину. 1РНК-агенты дополнительно могут находиться в изолированной форме или могут представлять собой часть фармацевтической композиции, используемой для описанных здесь способов, в частности в качестве фармацевтической композиции, изготовленной для доставки в легкие или носовой ход или изготовленной для парентерального введения. Фармацевтические композиции могут содержать один или несколько 1РНК-агентов и в некоторых вариантах осуществления будут содержать два или несколько 1РНК-агентов, каждый из которых направлен на различные сегменты гена Р8У или на два различных гена Р8У.

Настоящее изобретение дополнительно относится к способам снижения уровней вирусной мРНК К.8У в клетке. Такие способы включают в себя стадию введения пациенту одного из 1РНК-агентов по настоящему изобретению, как здесь дополнительно описано ниже. В способах по настоящему изобретению используются клеточные механизмы, вовлеченные в РНК интерференцию для селективного разрушения вирусной мРНК в клетке и в них включена стадия контактирования клетки с одним из противовирусных 1РНК-агентов по настоящему изобретению. Такие способы можно выполнять непосредственно на клетке или их можно осуществлять у пациента-млекопитающего путем введения пациенту одного из 1РНК-агентов/фармацевтических композиций по настоящему изобретению. Снижение вирусной мРНК в клетках в результате приводит к уменьшению количества продуцируемого вирусного белка и в организме приводит к уменьшению титра реплицирующегося вируса (как показано в примерах).

Способы и композиции по изобретению, например способы и композиции 1РНК-агента, могут быть использованы в любой дозе и/или в составе описанных здесь, а также любым путем введения, описанным здесь. Особенно важным является показанное здесь интраназальное введение 1РНК-агента и его способность ингибировать репликацию вируса в респираторных тканях.

Подробное изложение одного или нескольких вариантов осуществления этого изобретения приведено на прилагаемых чертежах и в приведенном ниже описании. Другие признаки, объекты и преимущества этого изобретения будут очевидны из описания, чертежей и формулы изобретения. Данное изобретение включает в себя все процитированные ссылки, патенты и патентные заявки в качестве ссылок в полном объеме для любых целей.

Краткое описание чертежей

Фиг. 1. Ιη νίΐτο ингибирование Р8У с использованием 1РНК-агентов. 1РНК-агенты, представленные в табл. 1 (а-с), были протестированы на анти-КБУ активность в исследовании бляшкообразования, описанном в примерах. Каждая колонка (столбец) представляет 1РНК-агент, приведенный в табл. 1 (а-с), например колонка 1 представляет собой первый агент в табл. 1а и т.д. Были идентифицированы активные 1РНК-агенты.

Фиг. 2. Дозозависимое ингибирование Р8У ίη νίΐτο с использованием 1РНК-агентов. Были протестированы примеры активных агентов из табл. 1 на анти-КБУ активность в исследовании бляшкообразования, в четырех концентрациях, как описано в примерах. С тестируемыми активными 1РНК-агентами был обнаружен дозозависимый ответ.

Фиг. 3. Ιη νίΐτο ингибирование подтипа В Р8У с использованием 1РНК-агентов. 1РНК-агенты, представленные на фиг. 2, были протестированы на анти-КБУ активность в отношении подтипа В в исследовании бляшкообразования, описанного в примерах. Тестируемые 1РНК-агенты ингибировали подтип В.

Фиг. 4. Ιη νίνο ингибирование Р8У с использованием 1РНК-агентов. Агенты, описанные на этой фигуре. были протестированы на анти-КБУ активность в модели на мышах, как описано в примерах. 1РНКагенты эффективно снижали титры вируса ίη νίνο.

Фиг. 5. Ιη νίνο ингибирование К8У с использованием ЛЬ-ОР-1730. ЛЬ-ОР-1730 тестировали в отношении активности в зависимости от дозы с использованием способов, приведенных в примерах. У этих агентов был показан дозозависимый ответ.

Фиг. 6. Ιη νίνο ингибирование Р8У с использованием 1РНК-агентов. 1РНК-агенты, описанные на этой фигуре, тестировали на анти-КБУ активность ίη νίνο, как описано в примерах.

Фиг. 7. Ιη νίνο ингибирование Р8У с использованием 1РНК-агентов. 1РНК-агенты, описанные на этой фигуре, были протестированы на анти-КБУ активность ίη νίνο, как описано в примерах.

Фиг. 8А. Ιη νίνο ингибирование Р8У с использованием 1РНК-агентов при местном введении.

Фиг. 8В. Ιη νίνο ингибирование Р8У с использованием 1РНК-агентов при доставке с помощью аэрозоля. 1РНК-агенты, описанные на этой фигуре, были протестированы на анти-КБУ активность ίη νίνο, как описано в этом примере.

Фиг. 9. Ιη νίνο защита от Р8У инфекции с использованием 1РНК-агентов. 1РНК-агенты, описанные на этой фигуре, были протестированы до заражения Р8У для исследования защитного действия.

- 3 012573

Подробное описание

Для удобства изложения термин «нуклеотид» или «рибонуклеотид» здесь иногда используется в отношении одной или нескольких субъединиц РНК-агента. Будет понятно, что термин «рибонуклеотид» или «нуклеотид» здесь может, в случае модифицированной РНК или заменителя нуклеотида, также относиться к модифицированному нуклеотиду или заменяющей части, дополнительно описанным ниже, в одном или нескольких положениях.

Используемый здесь «РНК-агент» представляет собой немодифицированную РНК, модифицированную РНК, или нуклеозид-заменитель, каждая из которых описана здесь или хорошо известна в области РНК синтеза. Хотя описаны многочисленные модифицированные РНК и нуклеозиды-заменители, предпочтительные примеры включают в себя те, которые более резистентны к разрушению нуклеазами, чем немодифицированные РНК.

Предпочтительные примеры включают в себя те, которые имеют 2'-модификацию сахара, модификацию выступов одиночной цепи, предпочтительно 3' выступа одиночной цепи, или, в частности, в случае одноцепочечной 5'-модификацию, которая включает в себя одну или более фосфатных групп или один или несколько аналогов фосфатной группы.

Используемый здесь термин «1РНК-агент» (сокращенно от «интерферирующий РНК-агент») представляет собой РНК-агент, который может отрицательно регулировать экспрессию целевого гена, например КБУ. Не привязываясь к теории, 1РНК-агент может действовать посредством одного или ряда механизмов, включая посттрансляционное расщепление целевой мРНК, иногда называемых в этой области РНК1, или посредством претранскрипционных или претрансляционных механизмов. 1РНК-агент может представлять собой двухспиральный άδ 1РНК-агент.

Используемый здесь «άδ 1РНК-агент» (сокращенно от «двухспиральный 1РНК-агент») представляет собой 1РНК-агент, который включает в себя более одной и предпочтительно две спирали, в которых гибридизация внутри цепи может образовывать участок дуплексной структуры. «Спираль» здесь относится к непрерывной последовательности нуклеотидов (в том числе неприродных или модифицированных нуклеотидов). Две или несколько цепей могут быть отдельными молекулами, или каждая образовывать часть, или они могут быть ковалентно связаны, например, линкером, например полиэтиленгликолем, с образованием одной молекулы. По меньшей мере одна цепь может включать в себя участок, достаточно комплементарный целевой РНК. Такую цепь называют «антисмысловой спиралью». Вторую цепь, заключенную в б5РНК-агент, которая содержит участок комплементарности в отношении антисмысловой цепи, называют «смысловой спиралью».

Однако άδ 1РНК-агент также может быть образован из одной молекулы РНК, которая является, по меньшей мере частично, самокомплементарной, образуя, например, шпилечную или длинную узкую выступающую структуру, включающую дуплексный участок. В этом случае термин «спираль» относится к одному из участков молекулы РНК, который комплементарен другому участку той же молекулы РНК.

Хотя в клетках млекопитающих длинные άδ 1РНК-агенты могут вызывать интерфероновый ответ, который зачастую является повреждающим, короткие άδ 1РНК-агенты не запускают интерфероновый ответ, по меньшей мере не в такой степени, которая причиняет вред клетке и/или организму хозяина. 1РНК-агенты по настоящему изобретению включают в себя молекулы, которые являются достаточно короткими, чтобы не запускать повреждающий интерфероновый ответ в клетках млекопитающих. Таким образом, введение композиции 1РНК-агента (например, составленной, как описано здесь) в клетки млекопитающего может быть использовано для подавления экспрессии гена КБУ, избегая повреждающего интерферонового ответа. Молекулы, которые являются достаточно короткими, что они не запускают повреждающий интерфероновый ответ, здесь называются δ^РНК-агентами или δ^РНК. Используемые здесь <«1РНК-агент» или <«1РНК» относятся к 1РНК-агенту, например άδ 1РНК-агенту, который является достаточно коротким, что не вызывает повреждающий интерфероновый ответ в клетках человека, например имеет двухспиральный участок менее 30 пар нуклеотидов.

Рассмотренные здесь выделенные 1РНК-агенты, в том числе άδ 1РНК-агенты и δ^РНК-агенты, могут опосредовать подавление гена, например, путем разрушения РНК. Для удобства такая РНК также называется здесь подавляемой РНК. Такой ген также называется геном-мишенью. Предпочтительно подавляемая РНК представляет собой продукт гена КБУ, в частности продукт гена Р, N или Ь.

Используемая здесь фраза «опосредует РНК1» относится к способности агента подавлять специфично последовательности, ген-мишень. «Подавление гена-мишени» означает процесс, посредством которого клетка, не контактируя с этим агентом, содержит и/или секретирует определенный продукт генамишени, контактируя с этим агентом, будет содержать и/или секретировать по меньшей мере на 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80 или 90% меньше такого генного продукта по сравнению с подобной клеткой, которая не контактировала с этим агентом. Такой продукт гена-мишени, например, может быть матричной РНК (мРНК), белком или регуляторным элементом.

В противовирусных применениях настоящего изобретения подавление гена-мишени будет приводить к снижению «титра вируса» в клетке или у пациента. Используемое здесь «снижение титра вируса» относится к уменьшению числа жизнеспособных вирусов, продуцируемых клеткой или обнаруженных в организме, в котором подавляли вирусный ген-мишень. Уменьшение клеточного количества продуциро- 4 012573 ванного вируса предпочтительно будет приводить к уменьшению измеряемого количества вируса, продуцируемого в тканях пациента, подвергающегося лечению, и уменьшению тяжести симптомов вирусной инфекции. 1РНК-агенты по настоящему изобретению также называются «противовирусными (РНКагентами».

Используемый здесь «ген К.8У» относится к любому гену, идентифицированному в геноме вируса В8У (см. Еакеу, Л.К, аиб \Уа1ь11 Е.Е., 2000, Сйшса1 М|сгоЬю1ощса1 Ису1С\\ъ. 13:371-84). Эти гены хорошо известны в этой области и включают в себя Ν, Р и Ь гены, которые показаны здесь в качестве примеров.

Используемый здесь термин «комплементарность» применяется для обозначения достаточной степени комплементарности для осуществления стабильного и специфического связывания между соединением по изобретению и целевой молекулой РНК, например молекулой мРНК вируса В8У. Для специфического связывания необходима достаточная степень комплементарности во избежание неспецифического связывания олигомерного соединения с нецелевыми последовательностями в условиях, при которых специфическое связывание является желаемым, т.е. в физиологических условиях в случае ίη νίνο исследований или терапевтического воздействия или в случае ίη νίίτο исследований, в условиях, при которых проводят эти исследования. Нецелевые последовательности обычно отличаются по меньшей мере на 4 нуклеотида.

Использованный здесь 1РНК-агент является «достаточно комплементарным» РНК-мишени, например мРНК-мишени (например, мРНК-мишени В8У), если 1РНК-агент уменьшает продукцию белка, кодируемого в клетке РНК-мишенью. 1РНК-агент также может быть «полностью комплементарным» целевой РНК, например эта целевая РНК и 1РНК-агент гибридизируются предпочтительно с образованием гибрида, сформированного исключительно из пар оснований Уотсона-Крика в области полной комплементарности. «Достаточно комплементарный» 1РНК-агент может включать в себя внутренний участок (например, по меньшей мере 10 нуклеотидов), который полностью комплементарен вирусной РНКмишени. Кроме того, в некоторых вариантах осуществления 1РНК-агент специфически распознает различие в один нуклеотид. В этом случае этот 1РНК-агент только опосредует РНК1, если полная комплементарность обнаружена в области (например, в пределах 7 нуклеотидов) с отличием в один нуклеотид. Предпочтительные 1РНК-агенты будут основаны на смысловых и антисмысловых последовательностях, представленных в примерах, или состоять или содержать их.

Используемый здесь термин «по существу, идентичная» при использовании в отношении первой нуклеотидной последовательности по сравнению со второй нуклеотидной последовательностью означает, что первая нуклеотидная последовательность идентична второй нуклеотидной последовательности, за исключением не более одной, двух или трех нуклеотидных замен (например, аденозин замещен урацилом).

Используемый здесь термин «пациент» относится к млекопитающему, которому проводят лечение нарушения, опосредованного вирусной экспрессией, например В8У инфекции, или у которого проводят профилактическое лечение для предупреждения вирусной инфекции. Пациентом может быть любое млекопитающее, такое как примат, корова, лошадь, мышь, крыса, собака, свинья, коза. В предпочтительном варианте осуществления пациентом является человек.

Используемое здесь лечение В8У инфекции относится к улучшению любых биологических или патологических показателей, 1) которые опосредованы частично наличием вируса в организме пациента и 2) на исход которых может влиять снижение уровня присутствующих продуктов гена вируса.

Создание и выбор 1РНК-агентов.

Настоящее изобретение основано на демонстрации подавления гена-мишени респираторного вируса ίη νίνο после местного введения в легкие и носовые ходы 1РНК-агента либо посредством интраназального введения/ингаляции, либо системно/парентерально посредством инъекции и в результате - лечения вирусной инфекции. Настоящее изобретение дополнительно распространяется на применение 1РНКагентов в отношении нескольких респираторных вирусов и лечение обеих вирусных инфекций совместным введением двух и более 1РНК-агентов.

На основе этих результатов это изобретение особенно относится к 1РНК-агенту, который может быть использован при лечении вирусной инфекции, в частности респираторных вирусов и в частности К5У инфекции, в изолированной форме и в виде описанной ниже фармацевтической композиции. Такие агенты будут включать в себя смысловую цепь, имеющую по меньшей мере 15 или более смежных нуклеотидов, комплементарных вирусному гену, и антисмысловую цепь, имеющую по меньшей мере 15 или более смежных нуклеотидов, комплементарных последовательности смысловой цепи. Особенно эффективными являются 1РНК-агенты, по существу, состоящие из нуклеотидной последовательности из генов Р N и Ь В8У, приведенной в табл. 1(а-с), или содержащие ее.

1РНК-агенты по настоящему изобретению основаны и содержат по меньшей мере 15 или более смежных нуклеотидов из одного из 1РНК-агентов, активность которых показана в табл. 1(а-с). В таких агентах этот агент может состоять, по существу, из полной последовательности, приведенной в этой таблице, или содержать ее, или может содержать 15 или более смежных остатков, приведенных в табл. 1(ас) наряду с дополнительными нуклеотидами смежных участков гена-мишени.

- 5 012573

1РНК-агент можно рационально создать на основе информации о последовательности и желаемых характеристиках и информации, представленной в табл. 1(а-с). Например, 1РНК-агент можно создать в соответствии с последовательностью агентов, представленных в таблицах, а также принимая во внимание полную кодирующую последовательность гена-мишени.

В соответствии с этим настоящее изобретение относится к 1РНК-агентам, содержащим смысловую цепь и антисмысловую цепь, каждая содержит последовательность по меньшей мере 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21 или 23 нуклеотидов, которая, по существу, идентична, как определено выше, части гена респираторного вируса, в частности Р, N или Ь генам белка В8У. Характерные 1РНК-агенты включают в себя агенты, содержащие 15 или более смежных нуклеотидов одного из агентов, представленных в табл. 1(а-с).

Антисмысловая цепь 1РНК-агента должна быть равна длины или быть по меньшей мере 15, 16 17, 18, 19, 25, 29, 40 или 50 нуклеотидов в длину. Ее длина должна быть равна или меньше 50, 40 или 30 нуклеотидов. Предпочтительные диапазоны составляют длину 15-30, 17-25, 19-23 и 19-21 нуклеотидов. Характерные 1РНК-агенты включают в себя цепь, содержащую 15 или более нуклеотидов одной из антисмысловых цепей одного из агентов, представленных в табл. 1(а-с).

Смысловая цепь 1РНК-агента должна быть равна или быть по меньшей мере 15, 16 17, 18, 19, 25, 29, 40 или 50 нуклеотидов в длину. Ее длина должна быть равна или должна быть меньше 50, 40 или 30 нуклеотидов. Предпочтительными диапазонами длины являются 15-30, 17-25, 19-23 и 19-21 нуклеотидов. Характерные 1РНК-агенты включают в себя цепи, содержащие 15 или более нуклеотидов из одной из смысловых цепей одного из агентов, представленных в табл. 1(а-с).

Двухспиральный участок 1РНК-агента должен быть равен или быть по меньшей мере длиной 15, 16 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 29, 40 или 50 пар нуклеотидов. Его длина должна быть равна или быть менее 50, 40 или 30 пар нуклеотидов. Предпочтительные диапазоны длины составляют 15-30, 17-25, 19до 23 и 19-21 пар нуклеотидов.

Длина каждой цепи агентов, представленных в табл. 1(а-с), составляет 21 нуклеотид. 1РНК-агенты содержат двухспиральный участок из 19 нуклеотидов с 2-нуклеотидным выступом на каждом 3'-конце агента. Эти агенты могут быть модифицированы, как описано здесь, для получения эквивалентных агентов, содержащих по меньшей мере часть этих последовательностей (15 или более смежных нуклеотидов) и/или модификаций в отношении нуклеотидных оснований и связей.

В основном 1РНК-агенты настоящего изобретения включают в себя участок достаточной комплементарности к гену вируса, например Р, N или Ь белку Р8У. нуклеотидная длина которых достаточна, для того чтобы этот 1РНК-агент или его фрагмент мог опосредовать отрицательную регуляцию специфического вирусного гена. Антисмысловые цепи 1РНК-агентов по настоящему изобретению предпочтительно полностью комплементарны последовательностям мРНК гена вируса, как здесь для Р, Ь или N белка Βδν. Однако идеальная комплементарность между 1РНК-агентом и мишенью не является обязательной, но соответствие должно быть достаточным для обеспечения возможности 1РНК-агента или продукта его расщепления осуществлять прямой специфический сайленсинг последовательности, например, посредством РНК1 расщепления мРНК Κ5ν.

Следовательно, 1РНК-агенты по настоящему изобретению включают в себя смысловую цепь и антисмысловую цепь, каждая содержит последовательность по меньшей мере 16, 17 или 18 нуклеотидов, которые, по существу, идентичны, как определено ниже, одной из последовательностей гена вируса, в частности Р, N или Ь белка Βδν, такой как агент, представленный в табл. 1(а-с), за исключением того, что не более 1, 2 или 3 нуклеотидов в цепи соответственно замещено другими нуклеотидами (например, аденозин заменен урацилом), по существу сохраняя способность ингибировать экспрессию К8У в культивируемых клетках человека, как определено ниже. Эти агенты, следовательно, будут содержать по меньшей мере 15 или более нуклеотидов, идентичных одной из последовательностей гена вируса, в частности генам белков Р, Ь или N Βδν, но введено 1, 2 или 3 основания спаренных вопреки принципу комплементарности в отношении либо последовательности-мишени мРНК вируса, либо между смысловой и антисмысловой цепями. Некомплементарные спаривания с последовательностью-мишенью мРНК вируса, особенно в антисмысловой цепи являются наиболее допустимыми в концевых областях и при их наличии предпочтительно находятся в концевой области или областях, например, в пределах 6, 5, 4 или 3 нуклеотидов 5'- и/или 3'-конца, наиболее предпочтительно в пределах 6, 5, 4 или 3 нуклеотидов 5'-конца смысловой цепи или 3'-конца антисмысловой цепи. Смысловая цепь должна быть только достаточно комплементарной антисмысловой цепи для сохранения двухспирального характера молекулы по всей длине.

Предпочтительно, чтобы смысловая и антисмысловая цепи были выбраны так, чтобы 1РНК-агент включал в себя одну цепь или неспаренный участок на одном или обоих концах этой молекулы, например приведенные в качестве примера в табл. 1(а-с). Следовательно, 1РНК-агент содержит смысловую и антисмысловую цепи, предпочтительно спаренные таким образом, что содержат выступ, например один, или два 5', или 3' выступа, но предпочтительно 3' выступ из 2-3 нуклеотидов. Большинство вариантов осуществления будут иметь 3' выступ. Предпочтительные 51 РНК-агенты будут иметь одноцепочечные выступы, предпочтительно 3' выступы от 1 до 4 или предпочтительно 2 или 3 нуклеотида в длину, на

- 6 012573 одном или обоих концах 1РНК-агента. Выступы могут быть результатом того, что одна цепь длиннее другой, или результатом того, что две цепи одинаковой длины были смещены. 5'-концы предпочтительно фосфорилированы.

Предпочтительная длина дуплексного участка составляет от 15 до 30, наиболее предпочтительно 18, 19, 20, 21, 22 и 23 нуклеотида в длину, например, в ряду ДРНК-агентов, рассмотренных выше. Также включены варианты осуществления, в которых две цепи ДРНК-агента связаны, например ковалентно связаны. Шпилька или другие одноцепочечные структуры, представляющие желаемую двухцепочечную область и предпочтительно 3' выступ, также входят в это изобретение.

Оценка 1РНК-агентов-кандидатов.

Можно оценить способность 1РНК-агента-кандидата к отрицательной регуляции экспрессии генамишени. Например, 1РНК-агент-кандидат может быть предоставлен и приведен во взаимодействие с клеткой, например клеткой человека, которая была инфицирована или будет инфицирована интересующим вирусом, например вирусом, содержащим ген-мишень. Альтернативно, клетка может быть трансфектирована конструкцией, экспрессирующей вирусный ген-мишень, таким образом избегая необходимости вирусного инфицирования модели. Уровень экспрессии гена-мишени до и после контакта с 1РНКагентом-кандидатом можно сравнить, например, по РНК, уровню белка или титру вируса. Если определено, что количество РНК, белка или вируса, экспрессированного из гена-мишени, меньше после контакта с 1РНК-агентом, то можно сделать вывод, что этот 1РНК-агент отрицательно регулирует экспрессию гена-мишени. Уровень вирусной РНК-мишени или вирусного белка в клетке или титра вируса в клетке или ткани можно определить любым желаемым способом. Например, уровень РНК-мишени можно определить Нозерн-блоттингом, обратно-транскрипционной полимеразно-цепной реакцией (ОТ-РЦР), ЬДНК анализом или анализом защиты от РНКазы. Уровень белка можно определить, например, Вестернблот анализом или с помощью иммунофлуоресценции. Титр вируса можно определить в анализе бляшкообразования.

Тестирование стабильности, модификация и повторное тестирование 1РНК-агентов.

1РНК-агент-кандидат можно оценить в отношении стабильности, например его подверженность расщеплению эндонуклеазой или экзонуклеазой, например, когда 1РНК-агент вводят в организм пациента. Могут быть использованы способы для идентификации сайтов, подверженных модификации, в частности расщеплению, например расщеплению под действием компонента, находящегося в организме пациента.

После идентификации сайтов, подверженных расщеплению, может быть сконструирован и/или синтезирован новый 1РНК-агент, в котором возможный сайт расщепления делают устойчивым к расщеплению, например, путем введения 2'-модификации на участке расщепления, например, 2'-О-метильной группы. Этот новый 1РНК-агент может быть повторно тестирован на стабильность и этот процесс можно повторять, пока не будет обнаружено, что РНК1 проявляет желаемую стабильность.

Тестирование ίη νίνο.

1РНК-агент, идентифицированный как способный ингибировать экспрессию вирусного гена, может быть протестирован на функциональную активность ίη νίνο в модели на животных (например, у млекопитающего, например у мыши, крысы или примата), как показано в примерах. Например, 1РНК-агент можно вводить животному и 1РНК-агент можно оценить в отношении его биораспределения, стабильности и его способности ингибировать экспрессию гена вируса, например, К.8У или снижать титр вируса.

1РНК-агент можно вводить непосредственно в целевую ткань, например, путем инъекции или 1РНКагент можно вводить в животную модель таким же образом, которым вводили бы человеку. Как показано здесь, этот агент предпочтительно можно вводить путем ингаляции в виде средства для лечения вирусной инфекции.

1РНК-агент также можно оценить в отношении его внутриклеточного распределения. Такая оценка может включать в себя определение, попал ли 1РНК-агент в клетку. Такая оценка также может включать в себя определение стабильности (например, полужизни) 1РНК-агента. Оценку 1РНК-агента ίη νίνο можно облегчить, используя 1РНК-агент, конъюгированный с детектируемой меткой (например, флуоресцентной меткой, такой флуоресцин; радиоактивной меткой, такой как ³⁵§, ³²Р, ³³Р или ³Н; частицами золота или антигенными частицами для иммуногистохимии) или другим подходящим способом определения.

1РНК-агент можно оценить в отношении его способности отрицательно регулировать экспрессию вирусного гена. Уровни экспрессии вирусного гена ίη νίνο можно определить, например, гибридизацией ίη 8Йц или путем выделения РНК из ткани до и после воздействия 1РНК-агента. В тех случаях, когда животным необходимо пожертвовать для получения ткани, контрольное животное, не подвергавшееся воздействию, будет служить для сравнения. Вирусную мРНК-мишень можно выявлять любым желаемым способом, в том числе, но не только, ОТ-РЦР, Нозерн-блоттингом, методом разветвленной ДНК или анализом защиты от РНКазы. Альтернативно или дополнительно, экспрессию вирусного гена можно контролировать путем проведения Вестерн-блоттинга на тканевых экстрактах, обработанных 1РНК-агентом, или с помощью ЕЬ18Л. Титр вируса можно определить, используя анализ количества бляшкообразующих единиц.

- 7 012573

Химия РНК1.

Здесь описаны выделенные 1РНК-агенты, например бк РНК-агенты, которые опосредуют РНК1 для ингибирования экспрессии вирусного гена, например Р белка В8У.

Рассмотренные здесь РНК-агенты включают в себя другие немодифицированные РНК, а также РНК, которые были модифицированы, например, для улучшения эффективности, и полимеры заменителей нуклеозидов. Немодифицированная РНК относится к молекуле, в которой компоненты нуклеиновой кислоты, а именно сахара, основания и фосфатные части, такие же или по существу такие же, как встречаются в природе, предпочтительно, которые естественным образом встречаются в организме человека. В этой области упоминались редкие или необычные, но встречающиеся в природе РНК в виде модифицированных РНК, см., например, ЫтЬасй с1 а1. (1994), Νιιοίοίο Лс1бк Век. 22: 2183-2196. Такие редкие или необычные РНК, часто называемые модифицированными РНК (по-видимому, вследствие того, что они являются результатом посттранскрипционной модификации), при использовании здесь входят в понятие немодифицированной РНК. Используемая здесь модифицированная РНК относится к молекуле, в которой один или несколько компонентов нуклеиновой кислоты, а именно сахара, основания и фосфатные части, отличаются от таковых, встречающихся в природе, предпочтительно, отличные от тех, которые встречаются в организме человека. Хотя их называют модифицированными «РНК», они, разумеется, вследствие модификации будут включать в себя молекулы, которые не являются РНК. Заменители нуклеозидов представляют собой молекулы, в которых рибофосфатный скелет заменен нерибофосфатной конструкцией, что позволяет основаниям находиться в правильном пространственном расположении, так чтобы гибридизация была, по существу, сходной с гибридизацией, наблюдаемой с рибофосфатным скелетом, например незаряженные вещества, имитирующие рибофосфатный скелет. Здесь рассмотрены примеры всего приведенного выше.

Описанные здесь модификации могут быть внесены в любую двухспиральную РНК и описанную здесь РНК-подобную молекулу, например 1РНК-агент. Может быть, желательно модифицировать одну или обе, антисмысловую и смысловую, цепи 1РНК-агента. Поскольку нуклеиновые кислоты представляют собой полимеры субъединиц или мономеров, многие модификации, описанные ниже, встречаются в положении, которое повторяется в нуклеиновой кислоте, например модификация основания, или фосфатной части, или несвязывающего О фосфатной части. В некоторых случаях модификация будет встречаться в нуклеиновой кислоте во всех положениях, подвергаемых воздействию, но во многих, и в действительности в большинстве, случаях этого не произойдет. Для примера модификация может встречаться только в 3'- или 5'-концевом положении, может только встречаться в терминальной области, например в положении на концевом нуклеотиде или в последних 2, 3, 4, 5 или 10 нуклеотидах цепи. Модификация может встречаться в двухспиральном участке, односпиральном участке или в обоих. Например, фосфоротиоатная модификация в положении не связывающего О может встречаться только на одном или обоих концах, может встречаться только в терминальных областях, например в положении на концевом нуклеотиде или в последних 2, 3, 4, 5 или 10 нуклеотидах цепи, или может встречаться в двухспиральной и односпиральной областях, особенно на концах. Подобным образом, модификация может встречаться в смысловой цепи, антисмысловой цепи или в обеих. В некоторых случаях смысловая и антисмысловая цепи будут иметь одинаковые модификации или модификации того же класса, а в других случаях смысловая и антисмысловая цепи будут иметь различные модификации, например в некоторых случаях это может быть желательно для модификации только одной цепи, например смысловой цепи.

Две основные задачи для введения модификаций в 1РНК-агенты представляют собой стабилизацию в отношении расщепления в биологическом окружении и улучшение фармакологических свойств, например фармакодинамических свойств, которые дополнительно рассмотрены ниже. Другие подходящие модификации сахара, основания или скелета 1РНК-агента описаны в совместной заявке РСТ/И82004/01193, поданной 16 января 2004 г. 1РНК-агент может включать в себя неприродное основание, например основания, описанные в совместной заявке РСТ/И82004/011822, поданной 16 апреля 2004 г. 1РНК-агент может включать в себя неприродный сахар, например неуглеводную циклическую молекулу-носитель. Характерные особенности неприродных сахаров для использования в 1РНК-агентах описаны в совместной заявке РСТ/И82004/11829, поданной 16 апреля 2003 г.

1РНК-агент может содержать межнуклеотидную связь (например, хиральную фосфоротиоатную связь), пригодную для повышения устойчивости к действию нуклеазы. Дополнительно или альтернативно, 1РНК-агент может включать в себя рибозоподобное соединение для повышенной устойчивости к нуклеазе. Характерные межнуклеотидные связи и рибозоподобные вещества для повышенной устойчивости к нуклеазе описаны в совместной заявке РСТ/И82004/07070, поданной 8 марта 2004 г.

1РНК-агент может включать в себя мономерные субъединицы, конъюгированные с лигандом, и мономеры для синтеза олигонуклеотидов. Характерные мономеры описаны в совместной заявке США № 10/916185, поданной 10 августа 2004 г.

1РНК-агент может иметь ΖΧΥ-структуру, например, описанную в совместной заявке РСТ/И82004/07070, поданной 8 марта 2004 г.

1РНК-агент может образовывать комплекс с амифипатической частью. Характерные амифипатические части для использования с 1РНК-агентами описаны в совместной заявке РСТ/И82004/07070, подан- 8 012573 ной 8 марта 2004 г.

В другом варианте осуществления 1РНК-агент может быть составлен в комплексное вещество для доставки, особенностью которого является модульный комплекс. Этот комплекс может включать в себя носитель, связанный с одним или более (предпочтительно двумя или более, более предпочтительно всеми тремя): (а) конденсирующим агентом (например, веществом, способным притягивать, например связывать, нуклеиновую кислоту, например, посредством ионных или электростатических взаимодействий); (Ь) агентом слияния (например, вещества, способного сливаться и/или транспортироваться через клеточную мембрану) и (с) наводящей группой, например агентом, наводящим на клетку или ткань лектином, гликопротеином, липидом или белком, например антителом, которое связывается с заданным типом клетки. 1РНК-агенты, составленные в комплексное вещество для доставки, описаны в совместной заявке РСТ/и82004/07070, поданной 8 марта 2004 г.

1РНК-агент может иметь неканонические спаривания, например, между смысловой и антисмысловой последовательностями дуплекса РНК1. Характерные особенности неканонических 1РНК-агентов описаны в совместной заявке РСТ/И82004/07070, поданной 8 марта 2004 г.

Повышенная устойчивость к нуклеазе.

1РНК-агент, например 1РНК-агент, который нацелен на К.8У. может иметь повышенную устойчивость к нуклеазам.

Для повышенной устойчивости к нуклеазе и/или аффиности связывания с мишенью 1РНК-агент, например смысловая и/или антисмысловая цепь 1РНК-агента, может содержать, например, 2'-модифицированные рибозные звенья и/или фосфоротиоатные связи. Например, 2' гидроксильная группа (ОН) может быть модифицирована или заменена рядом различных «окси» или «дезокси» заместителей.

Примеры модификаций «окси»-2' гидроксильной группы включают в себя алкокси или арилокси (ОК, например, К=Н, алкил, циклоалкил, арил, аралкил, гетероарил или сахар); полиэтиленгликоли (ПЭГ), О(СН₂СН₂О)_ПСН₂СН₂ОК; «замкнутые» нуклеиновые кислоты (ΕΝΑ), в которых 2' гидроксил соединен, например, метиленовым мостиком, с 4' углеродом той же рибозы; О-амин и аминоалкокси, О(СН₂)_п-амин (например, амин=NН₂; алкиламино, диалкиламино, гетероциклиламино, ариламино, диариламино, гетероариламино или дигетероариламино, этилендиамин, полиамино). Заслуживает внимания то, что олигонуклеотиды, содержащие только метоксиэтильную группу (МОЕ), (ОСН₂СН₂ОСН₃, производные ПЭГ), демонстрируют устойчивость к нуклеазе, сравнимую с таковой у олигонуклеотидов, модифицированных робустфосфоротиоатной модификацией.

«Дезокси» модификации включают в себя водород (т.е. дезоксирибозные сахара, которые являются особенно релевантными выступающим частям частично РНК); галоген (например, фтор); амино (например, ΝΠ₂, алкиламино, диалкиламино, гетероциклил, ариламино, диариламино, гетероариламино, дигетероариламино или аминокислота); NΠ(СН₂СН₂NΠ)_ηСН₂СН₂- амин (амин =NΠ₂, алкиламино, диалкиламино, гетероциклиламино, ариламино, диариламино, гетероариламино или дигетероариламино), -NΠС(О)Κ (К=алкил, циклоалкил, арил, аралкил, гетероарил или сахар), циано; меркапто; алкил-тиоалкил; тиоалкокси и алкил, циклоалкил, арил, алкенил и алкинил, которые необязательно могут быть заменены, например, функциональной аминогруппой.

Предпочтительными заместителями являются 2'-метоксиэтил, 2'-ОСН3, 2'-О-аллил, 2'-С-аллил и 2'-фтор.

Одним путем повышения резистентности является идентификация сайтов расщепления и модификация таких сайтов для ингибирования расщепления, как описано в совместной заявке США № 60/559,917, поданной 4 мая 2004 г. Например, динуклеотиды 5'-ИА3', 5'-иО-3', 5'-СА-3', 5'-ии-3' или 5'-СС-3' могут служить в качестве сайтов расщепления. Следовательно, повышенная устойчивость к нуклеазе может быть достигнута путем модифицирования 5' нуклеотида, получая в результате, например, по меньшей мере один 5'-уридин-аденин-3' (5'-ИА-3') динуклеотид, где уридин представляет собой 2'-модифицированный нуклеотид; по меньшей мере один 5'-уридин-гуанин-3' (5'-ИО-3') динуклеотид, где 5'-уридин представляет собой 2'-модифицированный нуклеотид; по меньшей мере один 5'-цитидинаденин-3' (5'-СА-3') динуклеотид, где 5'-цитидин представляет собой 2'-модифицированный нуклеотид; по меньшей мере один 5'-уридин-уридин-3' (5'-ии-3') динуклеотид, где 5'-уридин представляет собой 2'-модифицированный нуклеотид; или по меньшей мере один 5'-цитидин-цитидин-3' (5'-СС-3') динуклеотид, где 5'-цитидин представляет собой 2'-модифицированный нуклеотид. 1РНК-агент может включать в себя по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4 или по меньшей мере 5 таких динуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления все пиримидины 1РНК-агента несут 2'-модификацию, и, следовательно, 1РНК-агент обладает повышенной устойчивостью к эндонуклеазам.

Для максимального увеличения резистентности к нуклеазе 2' модификации можно использовать в комбинации с одним или несколькими модификациями фосфатного линкера (например, фосфоротиоат). Так называемыми «химерными» олигонуклеотидами являются нуклеотиды, содержащие две или более различных модификаций.

Включение сахаров в фуранозной форме в олигонуклеотидный скелет также может снижать эндонуклеолитическое расщепление. 1РНК-агент дополнительно может быть модифицирован включением 3'

- 9 012573 катионной группы или инвертированием нуклеозида на З'-конце 3'-3' связью. В другом варианте З'-конец может быть блокирован аминоалкильной группой, например 3' С5-аминоалкил бТ. Другие 3' конъюгаты могут ингибировать 3'-5' экзонуклеолитическое расщепление. Не привязываясь к теории, 3' конъюгат, такой как напроксен или ибупрофен, может ингибировать экзонуклеолитическое расщепление путем стерического блокирования экзонуклеазы от связывания с 3'-концом олигонуклеотида. Даже небольшие алкильные цепи, арильные группы или гетероциклические конъюгаты или модифицированные сахара (Ό-рибоза, дезоксирибоза, глюкоза и т.д.) могут блокировать 3'-5'-экзонуклеазы.

Подобным образом, 5' конъюгаты могут ингибировать 5'-3' экзонуклеолитическое расщепление. Не привязываясь к теории, 5' конъюгат, такой как напроксен или ибупрофен, может ингибировать экзонуклеолитическое расщепление путем стерического блокирования экзонуклеазы от связывания с 5'-концом олигонуклеотида. Даже небольшие алкильные цепи, арильные группы или гетероциклические конъюгаты или модифицированные сахара (Ό-рибоза, дезоксирибоза, глюкоза и т.д.) могут блокировать 3'-5'-экзонуклеазы.

1РНК-агент может иметь повышенную устойчивость к нуклеазам в тех случаях, когда двухспиральный 1РНК-агент включает в себя односпиральный нуклеотидный выступ по меньшей мере на одном конце. В предпочтительных вариантах осуществления нуклеотидный выступ включает в себя от 1 до 4, предпочтительно от 2 до 3 непарных нуклеотидов. В предпочтительном варианте осуществления непарный нуклеотид односпирального выступа, который непосредственно прилегает к концевой паре нуклеотидов, содержит пуриновое основание, а концевая пара нуклеотидов представляет собой пару С-С или по меньшей мере две из последних четырех комплементарных пар нуклеотидов представляют собой пары С-С. В дополнительных вариантах осуществления нуклеотидный выступ может иметь 1 или 2 непарных нуклеотида, и в приводимом в качестве примера варианте осуществления нуклеотидный выступ представляет собой 5'-СС-3'. В предпочтительных вариантах осуществления нуклеотидный выступ находится на 3'-конце антисмысловой цепи. В одном варианте осуществления 1РНК-агент включает в себя 5'-ССС-3' мотив на 3'-конце антисмысловой цепи так, что образуется 2-нуклеотидный выступ 5'-СС-3'.

Таким образом, 1РНК-агент может включать в себя модификации таким образом, чтобы ингибировать разрушение, например, нуклеазами, например эндонуклеазами или экзонуклеазами, находящимися в организме пациента. Эти мономеры здесь называются ΝΚΜ, или мономерами, стимулирующими устойчивость к нуклеазе, соответствующие модификации - ΝΚΜ-модификациями. Во многих случаях эти модификации будут модулировать также и другие свойства 1РНК-агента, например способность взаимодействовать с белком, например транспортным белком, например сывороточным альбумином или членом К1БС, или способность первой и второй последовательностей образовывать дуплекс с другой последовательностью, например молекулой-мишенью.

В 1РНК-агент или последовательность 1РНК-агента можно вводить одну или несколько ΝΚΜмодификаций. ΝΚΜ-модификацию можно использовать больше одного раза в последовательности или в 1РНК-агенте.

ΝΚΜ-модификации включают в себя некоторые модификации, которые могут располагаться только на концах, и другие, которые могут следовать в любом положении. Некоторые ΝΚΜ-модификации, которые могут ингибировать гибридизацию, предпочтительно используют только в концевых областях и более предпочтительно не в сайте расщепления или в области расщепления последовательности, которая нацелено воздействует на последовательность или ген, особенно на антисмысловую цепь. Их можно использовать всюду в смысловой цепи при условии сохранения достаточной гибридизации между двумя цепями бк 1РНК-агента. В некоторых вариантах осуществления желательно поместить ΝΚΜ в сайт расщепления или в область расщепления смысловой цепи, поскольку это может свести к минимуму нецелевое подавление.

В большинстве случаев ΝΚΜ-модификации будут распределяться по-разному в зависимости от того, содержатся ли они на смысловой или антисмысловой цепи. На антисмысловой цепи модификации, которые препятствуют или ингибируют эндонуклеазное расщепление, не следует вставлять в область, которая подвергается ШБС-опосредованному расщеплению, например сайт расщепления или область расщепления (как описано у Е1ЬакЫг с1 а1., 2001, Сепек апб Όον. 15: 188, здесь включено в качестве ссылки). Расщепление мишени происходит примерно в середине 20 и 21 нуклеотида антисмысловой цепи или примерно 10 или 11 нуклеотидов выше первого нуклеотида на целевой мРНК, которая комплементарна антисмысловой цепи. Используемый здесь сайт расщепления относится к нуклеотидам либо на стороне сайта расщепления на целевой мРНК, либо на цепи 1РНК-агента, которая гибридизируется с ним. Область расщепления означает нуклеотиды в пределах 1, 2 или 3 нуклеотидов сайта расщепления, в том и другом направлении.

Такие модификации могут быть введены в концевые области, например в концевое положение или в пределах 2, 3, 4 или 5 положения этого конца, последовательности, которая нацелено воздействует, или последовательности, которая нацелено не воздействует на последовательность пациента.

Привязанные лиганды.

На свойства 1РНК-агента, в том числе его фармакологические свойства, можно воздействовать или их можно задавать, например, путем введения лигандов, например привязанных лигандов.

- 10 012573

К 1РНК-агенту можно привязать большое разнообразие веществ, например лигандов, например, к носителю субъединицы мономера, конъюгированного с лигандом. Ниже описаны примеры применительно к мономерной субъединице, конъюгированной с лигандом, но она является только предпочтительной, вещества могут быть соединены с 1РНК-агентом в других местах.

Предпочтительными лигандами являются лиганды, которые соединены, предпочтительно ковалентно либо напрямую, либо опосредованно через промежуточную связь, с носителем. В предпочтительных вариантах осуществления лиганд присоединен к носителю через промежуточную связь. Лиганд, или привязанный лиганд, может присутствовать на мономере, конъюгированном с лигандом, когда мономер, конъюгированный с лигандом, встроен в растущую цепь. В некоторых вариантах осуществления лиганд может быть встроен в «предшественник» субъединицы мономера, конъюгированной с лигандом, после того как «предшественник» субъединицы мономера, конъюгированной с лигандом, был встроен в растущую цепь. Например, мономер, имеющий, например, аминоконцевую связь, например ТАР-(СН₂)пПН2, может быть встроен в растущую смысловую или антисмысловую цепь. В последующем процессе, т.е. после встраивания предшественника субъединицы мономера в цепь, лиганд, имеющий электрофильную группу, например пентафторфениловый сложный эфир или альдегидную группу, впоследствии может быть присоединен к предшественнику мономера, конъюгированного с лигандом, путем присоединения электрофильной группы лиганда к концевой нуклеофильной группе связи предшественника субъединицы мономера, конъюгированной с лигандом.

В предпочтительных вариантах осуществления лиганд изменяет распределение, нацеленное воздействие или время жизни 1РНК-агента, в который он встроен. В предпочтительных вариантах осуществления лиганд обеспечивает повышенную аффиность к выбранной мишени, например молекуле, клетке или клеточному типу, компартменту, например компартменту клетки или организма, ткани, органу или участку тела, например, по сравнению с разновидностями, не имеющими такого лиганда.

Предпочтительные лиганды могут улучшать транспорт, гибридизацию и специфические свойства, а также могут улучшать резистентность к нуклеазам полученного в результате природного или модифицированного олигонуклеотида или полимерной молекулы, содержащей только комбинацию описанных здесь мономеров и/или природных или модифицированных рибонуклеотидов.

Вообще, лиганды могут включать в себя терапевтические модификаторы, например, для усиления захвата; диагностические соединения или репортерные группы, например, для мониторинга распределения; поперечно-сшивающие агенты; части, придающие устойчивость к нуклеазе; и природные или неприродные нуклеиновые основания. Общие примеры включают в себя липофильные молекулы, липиды, лектины, стероиды (например, уваол, гецигенин, диосгенин), терпены (например, тритерпены, например сарсасапогенин, фриеделин, эпифриеделанольное производное литохолевой кислоты), витамины, углеводы (например, декстран, пуллулан, хитин, хитозан, инулин, циклодекстрин или гиалуроновая кислота), белки, вещества, связывающие белки, нацеливающие молекулы интегрина, поликатионы, пептиды, полиамины и пептидомиметики.

Лиганд может быть природной, или рекомбинантной, или синтетической молекулой, такой как синтетический полимер, например синтетическая полиаминокислота. Примеры полиаминокислот включают в себя полиаминокислоту полилизин (РЬЬ), поли-Ь-аспарагиновую кислоту, поли-Ь-глутаминовую кислоту, сополимер стирена и малеинового ангидрида, сополимер поли-(Ь-лактид-когликолид), сополимер дивинилового эфира и малеинового ангидрида, сополимер Ы-(2-гидроксипропил)метакриламид (НМРА), полиэтиленгликоль (ПЭГ), поливиниловый спирт (РУА), полиуретан, поли(2-этилакриловая кислота), полимеры Ν-изопропилакриламида или полифосфазин. Примеры полиаминов включают в себя полиэтиленимин, полилизин (РЬЬ), спермин, спермидин, полиамин, псевдопептид-полиамин, пептидоподобный полиамин, дендримерный полиамин, аргинин, амидин, протамин, катионные части, например катионный липид, катионный порфирин, четвертичная соль полиамина или альфа-спиральный пептид.

Также лиганды могут включать в себя наводящие группы, например агенты, наводящие на клетку или ткань, например тиротропин, меланотропин, белок А сурфактанта, муцин, гликозилированная полиаминокислота, трансферрин, бисфосфонат, полиглутамат, полиаспартат или ΚΟΌ пептид или ΚΟΌподобный пептид.

Лигандами могут быть белки, например гликопротеины, липопротеины, например липопротеины низкой плотности (ЛПНП), или альбумины, например сывороточный альбумин человека (САЧ), или пептиды, например молекулы, обладающие специфической аффиностью к колиганду, или антитела, например антитело, которое связывается с заданным типом клеток, например злокачественными клетками или остеоцитами. Лиганды также могут включать в себя гормоны и рецепторы гормонов. Они также могут включать в себя непептидные виды, такие как кофакторы, мультивалентная лактоза, мультивалентная галактоза, Ν-ацетилгалактозамин, Ν-ацетилглюкозамин, мультивалентная маноза или мультивалентная фукоза. Лигандом может быть, например, липополисахарид, активатор р38 МАР киназы или активатор ΝΓ-κΒ.

Лигандом может быть вещество, например лекарственное средство, которое может усиливать поступление 1РНК-агента в клетку, например, путем разрушения клеточного цитоскелета, например путем разрушения клеточных микротрубочек, микрофиламентов и/или промежуточных филаментов. Этим ле

- 11 012573 карственным средством может быть, например, таксон, винкристин, винбластин, цитохалазин, нокодазол, джасплакинолид, латрункулин А, фаллоидин, свинхолид А, инданоцин или миосервин.

В одном аспекте лиганд представляет собой липид или молекулу на основе липида. Такой липид или молекула на основе липида предпочтительно связывается с сывороточным белком, например сывороточным альбумином человека (САЧ). Другие молекулы, которые могут связываться с САЧ, также могут быть использованы в качестве лигандов. Например, может быть использован непроксин или аспирин. Липидный лиганд или лиганд на основе липида может (а) повышать устойчивость к разрушению конъюгата, (Ь) улучшать наведение или увеличивать транспорт в клетку-мишень или клеточную мембрану и/или (с) может быть использован для регуляции связывания с сывороточным белком, например САЧ.

Лиганд на основе липида может быть использован для модуляции, например регуляции связывания конъюгата с тканью-мишенью. Например, липид или лиганд на основе липида, который связывается с САЧ прочнее, с меньшей вероятностью будет направляться в почки и, следовательно, с меньшей вероятностью будет выводиться из организма. Липидный лиганд или лиганд на основе липида, который связывается с САЧ менее прочно, может быть использован для направления этого конъюгата в почки.

В предпочтительном варианте осуществления лиганд на основе липида связывается с САЧ. Предпочтительно он связывается с САЧ с достаточной аффиностью, так что этот конъюгат предпочтительно будет распределяться в непочечную ткань. Однако предпочтительно, чтобы аффиность не была такой высокой, что связывание САЧ-лиганд было необратимым.

В другом аспекте лиганд представляет собой вещество, например витамин или питательное вещество, которое поглощается клеткой-мишенью, например пролиферирующей клеткой. Они особенно применимы при лечении заболеваний, характеризующихся нежелательной клеточной пролиферацией, например злокачественного или незлокачественного типа, например злокачественных клеток. Примеры витаминов включают в себя витамин А, Е и К. Другие витамины, которые можно привести в качестве примера, включают в себя витамины группы В, например фолиевую кислоту, В12, рибофлавин, биотин, пиридоксаль, или другие витамины или питательные вещества, поглощаемые злокачественными клетками.

В другом аспекте лиганд представляет собой вещество, проникающее в клетку, предпочтительно спиральное вещество, проникающее в клетку. Предпочтительно это вещество является амфипатическим. Характерным примером является пептид, такой как (а! или ап1еппареЕ1а. Если этот агент представляет собой белок, он может быть модифицирован, включая пептидилподобные, инвертомеры, непептидные или псевдопептидные связи и использование Ό-аминокислот. Спиральный агент предпочтительно представляет собой альфа-спиральный агент, который предпочтительно имеет липофильную и липофобную фазу.

Модификации 5'-фосфата.

В предпочтительных вариантах осуществления тРНК-агенты являются 5'-фосфорилированными или включают в себя фосфорильный аналог в начале 5'-конца. Модификации 5'-фосфата антисмысловой цепи включают в себя модификации, которые совместимы с опосредованным К18С подавлением гена. Подходящие модификации включают в себя 5'-монофосфат ((НО)₂(О)Р-О-5'); 5'-дифосфат ((НО)₂(О)Р-ОР(НО)(О)-О-5'); 5'-трифосфат ((НО)₂(О)Р-О-(нО)(О)Р-О-Р(НО)(О)-О-5'); 5'-гуанозиновый кэп (7метилированный или неметилированный) (7т-С-О-5'-(НО)(О)Р-О-(НО)(О)Р-О-Р(НО)(О)-О-5'); 5'-аденозиновый кэп (Аррр) и любую модифицированную или немодифицированную нуклеотидную кэпструктуру. Другие подходящие модификации 5'-фосфата будут известны специалисту.

Смысловую цепь можно модифицировать для инактивации смысловой цепи и предотвращения образования активных К18С, тем самым потенциально уменьшая нецелевые эффекты. Это можно осуществить путем модификации, которая предотвращает 5'-фосфорилирование смысловой цепи, например путем модификации 5'-О-метилрибонуклеотидом (см. Ыукапеп е! а1. (2001) АТР гес.|шгетеп18 апЕ кта11 ш!егГеттд ΚΝΑ к1тис1иге ΐη (Не ΚΝΑ 1п1етГетепсе ра!йтеау. Се11 107, 309-321.) Также могут быть использованы другие модификации, которые предотвращают фосфорилирование, например простое замещение 5'-ОН на Н, а не О-Ме. Альтернативно, крупную объемную группу можно добавить к 5'-фосфату, преобразовывая его в фосфодиэфирную связь.

Доставка 1РНК-агентов в ткани и клетки.

Композиции.

Описанные здесь 1РНК-агенты могут быть составлены для введения пациенту, предпочтительно для местного введения в легкие и носовой ход (респираторные ткани) путем ингаляции или интраназального введения, или парентерально, например путем инъекции.

Для упрощения изложения составы, композиции и способы в этом разделе рассматриваются в основном в отношении немодифицированных тРНК-агентов. Однако должно быть понятно, что эти составы, композиции и способы могут использоваться на практике с другими 1РНК-агентами, например модифицированными 1РНК-агентами, и такое использование входит в объем этого изобретения.

Составленная композиция тРНК-агента может принимать целый ряд форм. В некоторых примерах композиция является, по меньшей мере частично, кристаллической, однородно кристаллической и/или безводной (например, менее 80, 50, 30, 20 или 10% воды). В другом примере 1РНК-агент находится в водной фазе, например в растворе, который содержит воду, эта форма является предпочтительной для

- 12 012573 введения ингаляционным путем.

Композиции в водной фазе или кристаллические композиции могут быть включены в состав носителя, например липосомы (особенно для водной фазы) или частицы (например, микрочастицы, подходящей для кристаллической композиции). В основном композицию 1РНК-агента составляют таким образом, чтобы она была совместима с предусмотренным способом введения.

Препарат 1РНК-агента может быть изготовлен в комбинации с другим агентом, например другим терапевтическим средством или средством для стабилизации 1РНК-агента, например белком, который образует комплекс с 1РНК-агентом с образованием 1РНВ. Другие агенты включают в себя хелатообразующие вещества, например ΕΌΤΆ (например, для удаления двухвалентных катионов, таких как Мд²⁺), соли, ингибиторы РНКазы (например, ингибитор РНКазы широкой специфичности, такой как РНКзин) и т.п.

В одном варианте осуществления препарат 1РНК-агента включает в себя другой 1РНК-агент, например второй 1РНК-агент, который может опосредовать РНК1 в отношении второго гена. Другие препараты могут включать в себя по меньшей мере три, пять, десять, двадцать, пятьдесят или сотню или больше различных видов РНК1. В некоторых вариантах осуществления эти агенты направлены на один и тот же вирус, но имеют различные последовательности-мишени. В другом варианте осуществления каждый 1РНК-агент направлен на различные вирусы. Как показано в примере, более одного вируса можно ингибировать путем совместного введения двух 1РНК-агентов одновременно или в близкие интервалы времени, каждый из которых направлен на один из вирусов, подвергаемых лечению.

Способы лечения и пути доставки.

Композиция, которая включает в себя 1РНК-агент по настоящему изобретению, например 1РНК-агент, направленный на ЯЗУ, может быть введена пациенту различными путями. Характерные примеры путей введения включают в себя ингаляцию, внутривенный путь, назальную или пероральную доставку лекарственного средства. Предпочтительным способом введения 1РНК-агентов по настоящему изобретению является прямое введение в легкие и носовой ход или системное введение путем парентерального введения.

1РНК-агент можно включать в состав фармацевтических композиций, подходящих для введения. Например, композиции могут включать один или несколько 1РНК-агентов и фармацевтически приемлемый носитель. Используемое здесь выражение «фармацевтически приемлемый носитель» означает включение любого или всех растворителей, дисперсионной среды, покрытий, антибактериальных и противогрибковых средств, изотонических веществ и веществ, задерживающих абсорбцию, и подобного, совместимых с фармацевтическим введением. Применение таких сред и агентов для фармацевтически активных веществ хорошо известно в этой области. Поскольку не любая обычная среда или агент совместимы с активным соединением, в этих композициях предусмотрено их применение. Дополнительные активные соединения также могут быть включены в состав этих композиций.

Фармацевтические композиции по настоящему изобретению можно вводить различными путями в зависимости от того, какое лечение является желательным, местное или системное, и в зависимости от области, в которой проводят лечение. Введение может быть местным (в том числе интраназальным или интрапульмональным), пероральным или парентеральным. Предпочтительный путь введения включает в себя внутривенное вливание, подкожную, внутрибрюшинную или внутримышечную инъекцию.

В основном доставку 1РНК-агентов по настоящему изобретению осуществляют для достижения места инфекции в организме пациента. Предпочтительным способом достижения этого является либо местное введение в легкие или носовой ход, например в респираторные ткани путем ингаляции, распыления или интраназального введения, либо путем системного введения, например парентеральным введением.

Составы для ингаляции или парентерального введения хорошо известны в уровне техники. Такие составы могут включать в себя стерильные водные растворы, которые также могут содержать буферы, разбавители и другие подходящие добавки, примером является РВЗ или 5% раствор декстрозы в воде. Для внутривенного использования общую концентрацию раствора следует регулировать для обеспечения изотоничности препарата.

Описанные здесь активные соединения предпочтительно вводят в легкие или носовой ход пациента любым подходящим способом. Активные соединения можно вводить путем введения аэрозольной суспензии респираторных частиц, содержащих активное соединение или активные соединения, которые вдыхает пациент. Активное соединение можно распылять в различных формах, таких как, но не только, средства для ингаляции в виде сухого порошка, ингаляторы с дозирующим устройством или суспензии жидкость/жидкость. Вдыхаемые частицы могут быть жидкими или твердыми. Частицы могут необязательно содержать другие терапевтические ингредиенты, такие как амилорид, бензамил или фенамил, с выбранным соединением, включенным в количество, эффективное для подавления реабсорбции воды из слизистого секрета дыхательных путей, как описано в патенте США № 4501729.

Конкретная фармацевтическая композиция необязательно может быть объединена с носителем для облегчения дисперсии или переноса. Подходящий носитель, такой как сахар (т.е. декстроза, лактоза, сахароза, трегалоза, маннитол), может быть смешан с активным соединением или соединениями в любом

- 13 012573 подходящем соотношении (например, в соотношении 1:1 по массе).

Частицы, содержащие активное соединение для практического использования настоящего изобретения, должны включать в себя частицы пригодного для вдыхания размера, т. е. частицы достаточно мелкого размера для прохождения через рот или нос и гортань при ингаляции и в бронхи и альвеолы легких. В основном частицы размером примерно от 1 до 10 мкм (более предпочтительно размером примерно менее 5 мкм) являются пригодными для вдыхания. Частицы неприродного для вдыхания размера, которые включены в аэрозоль, имеют тенденцию откладываться в горле и проглатываются, и количество невдыхаемых частиц в аэрозоле предпочтительно уменьшают до минимума. Для назального введения размер частиц в интервале 10-500 мкм является предпочтительным для обеспечения задержки в носовой полости.

Жидкие фармацевтические композиции активного соединения для получения аэрозоля могут быть получены путем объединения активного соединения с подходящим носителем, таким как стерильная апирогенная вода. Гипертонические солевые растворы, используемые для осуществления настоящего изобретения, предпочтительно представляют собой стерильные апирогенные растворы, содержащие от 1 до 15 мас.% физиологически приемлемой соли и более предпочтительно от 3 до 7 мас.% физиологически приемлемой соли.

Аэрозоли жидких частиц, содержащие активное соединение, могут быть получены любым подходящим способом, как, например, струйным распылителем под давлением или ультразвуковым распылителем. См., например, патент США № 4501729. Распылители представляют собой коммерчески доступные устройства, которые превращают растворы или суспензиции активного ингредиента в терапевтическую аэрозольную пыль либо посредством ускоренного выхода сжатого газа, обычно воздуха или кислорода, через узкое выходное отверстие Вентури, либо посредством ультразвукового встряхивания.

Подходящие композиции для использования в распылителях состоят из активного ингредиента в жидком носителе, активный ингредиент содержит вплоть до 40% мас./мас. состава, но предпочтительно менее 20% мас./мас. Носителем обычно является вода (и наиболее предпочтительно стерильная апирогенная вода) или разбавленный водный спиртовой раствор, предпочтительно сделанный изотоническим, но может быть гипертоническим с жидкостями организма путем добавления, например, хлорида натрия. Необязательные добавки включают в себя консерванты, если состав не изготовляют стерильным, например метилгидроксибензоат, антиоксиданты, ароматизаторы, эфирные масла, буферные агенты и поверхностно-активные вещества.

Аэрозоли твердых частиц, содержащие активное соединение, могут быть получены подобным образом с любым аэрозольным генератором терапевтических твердых частиц. Аэрозольные генераторы для введения твердых лекарственных частиц пациенту вырабатывают пригодные для вдыхания частицы и создают объем аэрозоля, содержащий заранее определенную отмеренную дозу терапевтического средства в количестве, подходящем для введения человеку. Одним иллюстративным типом аэрозольного генератора твердых частиц является инсуффлятор. Подходящие составы для введения путем вдувания включают в себя мелкоизмельченные порошки, которые можно доставлять с помощью инсуффлятора или доставлять в носовую полость путем вдыхания через нос. В инсуффляторе порошок (например, его отмеренная доза, эффективная для проведения описанных здесь лечебных мероприятий) содержится в капсулах или картриджах, обычно сделанных из желатина или пластика, которые либо прокалываются, либо открываются ίη к1!и, и порошок доставляется выбрасываемым воздухом через это устройство при вдыхании или с помощью ручного насоса. Порошок, используемый в инсуффляторе, состоит либо из только из активного ингредиента, либо из порошкообразной смеси, содержащей активный ингредиент, подходящий порошкообразный разбавитель, такой как лактоза, и необязательное поверхностно-активное вещество. Активный ингредиент обычно содержит от 0,1 до 100 мас./мас. состава.

Второй тип иллюстративного генератора аэрозолей включает в себя ингалятор с дозирующим устройством. Ингаляторы с дозирующим устройством представляют собой находящиеся под давлением аэрозольные дозаторы, обычно содержащие суспензию или раствор активного ингредиента в сжиженном пропелленте. При использовании эти устройства рассеивают состав через клапан, приспособленный для доставки отмеренного объема, обычно от 10 до 200 мкл, для получения распыляемого раствора мелких частиц, содержащего активный ингредиент. Подходящие пропелленты включают в себя некоторые хлорфторуглеродные соединения, например дихлордифторметан, трихлорфторметан, дихлортетрафторэтан и их смеси. Композиция дополнительно может содержать один или несколько сорастворителей, например этанол, поверхностно-активные вещества, такие как олеиновая кислота или триолеат сорбитана, антиоксидант и подходящие ароматизаторы.

Введение может осуществлять пациент или другой человек, например осуществляющий уход за больным. Лицом, осуществляющим уход за больным, может быть любой человек, связанный с обеспечением ухода за человеком, например, в больнице, хосписе, кабинете врача, амбулаторной клинике; сотрудник здравоохранения, например врач, медсестра, или другой практикующий врач; супруг(а) или опекун, например родители. Лечение может обеспечиваться отмеренными дозами или дозатором, доставляющим отмеренную дозу.

- 14 012573

Термин «терапевтически эффективное количество» представляет собой количество. присутствующее в композиции. которое необходимо для обеспечения желаемого количества лекарственного средства пациенту. которому проводят лечение. для получения ожидаемой физиологической реакции. В одном варианте осуществления терапевтически эффективные количества двух или нескольких 1РНК-агентов. каждый направлен на различные респираторные вирусы. например К.8У. вводят пациенту одновременно.

Термин «физиологически эффективное количество» представляет собой количество. доставляемое пациенту для получения желаемого профилактического или лечебного эффекта.

Термин «фармацевтически приемлемый носитель» означает. что носитель может проникать в легкие. не оказывая существенных неблагоприятных токсикологических эффектов на легкие.

Термин «совместное введение» относится к введению пациенту двух или нескольких агентов. в частности. двух или нескольких 1РНК-агентов. Эти агенты могут содержаться отдельной фармацевтической композицией и могут быть введены в одно и то же время или эти агенты могут содержаться в отдельных композициях и могут быть ведены пациенту последовательно. Поскольку два агента можно определить у пациента в одно и то же время. говорят. что эти два агента введены совместно.

Типы фармацевтических эксципиентов. которые используются в качестве носителя. включают в себя стабилизаторы. такие как сывороточный альбумин человека (САЧ); наполнители. такие как углеводы. аминокислоты и полипептиды; регуляторы рН или буферы; соли. такие как хлорид натрия; и подобные. Эти носители могут находиться в кристаллической или аморфной форме или могут представлять собой смесь двух форм.

Наполнители. которые являются особенно значимыми. включают в себя совместимые углеводы. полипептиды. аминокислоты или их комбинации. Подходящие углеводы включают в себя моносахариды. такие как галактоза. Ό-манноза. сорбоза и т.п.; дисахариды. такие как лактоза. трегалоза и т.п.; циклодекстрины. такие как 2-гидроксипропил-бета-циклодекстрин; и полисахариды. такие как раффиноза. мальтодекстрины. декстраны и т.п.; алдитолы. такие как маннитол. ксилитол и т.п. Предпочтительная группа углеводов включает в себя лактозу. трегалозу. раффинозу. мальтодекстрины и маннитол. Подходящие полипептиды включают в себя аспартам. Аминокислоты включают в себя аланин и глицин. глицин является предпочтительным.

Подходящие регуляторы рН или буферы включают в себя органические соли. полученные из органических кислот и оснований. такие как цитрат натрия. аскорбат натрия и т.п.; предпочтительным является цитрат натрия.

Дозы.

1РНК-агент можно вводить в однократной дозе примерно менее 75 мг/кг массы тела или примерно менее 70. 60. 50. 40. 30. 20. 10. 5. 2. 1. 0.5. 0.1. 0.05. 0.01. 0.005. 0.001 или 0.0005 мг/кг массы тела и менее 200 нмоль 1РНК-агента (например. примерно 4.4x1016 копий) на 1 кг массы тела или менее 1500. 750. 300. 150. 75. 15. 7.5. 1.5. 0.75. 0.15. 0.075. 0.015. 0.0075. 0.0015. 0.00075. 0.00015 нмоль 1РНК-агента на 1 кг массы тела. Единичную дозу. например. можно вводить ингаляционной дозой или распылением или путем инъекции. В одном примере используется доза в интервале 0.02-25 мг/кг.

Доставка 1РНК-агента непосредственно в легкие или носовой ход может быть в дозе порядка примерно от 1 примерно до 150 мг/носовой ход.

Доза может представлять собой количество. эффективное для лечения или профилактики заболевания или нарушения.

В одном варианте осуществления единичную дозу вводят один раз в сутки. При другом использовании единичную дозу вводят дважды в первый день. а затем ежедневно. Альтернативно. однократное введение дозы может быть меньше одного раза в сутки. например. менее чем каждые 2. 4. 8 или 30 дней. В другом варианте осуществления единичную дозу не вводят с определенной частотой (например. нерегулярная частота). Например. единичную дозу можно вводить лишь один раз. Поскольку опосредуемое 1РНК-агентом подавление гена может сохраняться в течение нескольких дней после введения композиции 1РНК-агента. во многих случаях возможно вводить композицию с частотой менее одного раза в день или для некоторых случаев только один раз в течение всего периода лечения.

В одном варианте осуществления пациенту вводят начальную дозу и одну или несколько поддерживающих доз 1РНК-агента. например двухспирального 1РНК-агента. или 81РНК-агента (например. предшественника. например более крупного 1РНК-агента. который может быть процессирован в ыРНКагент. или ДНК. которая кодирует 1РНК-агент. например двухспиральный 1РНК-агент или 81РНК-агент или его предшественник). Поддерживающая доза или дозы обычно ниже начальной дозы. например на половину меньше начальной дозы. Поддерживающий режим может включать в себя лечение пациента дозой или дозами в интервале от 0.01 до 75 мг/кг массы тела в сутки. например 70. 60. 50. 40. 30. 20. 10. 5. 2. 1. 0.5. 0.1. 0.05. 0.01. 0.005. 0.001 или 0.0005 мг/кг массы тела в сутки. Поддерживающие дозы предпочтительно вводят не более одного раза каждые 5-14 дней. Кроме того. период лечения может продолжаться в течение периода времени. который будет варьировать в зависимости от природы конкретного заболевания. его тяжести и общего состояния пациента. В предпочтительных вариантах осуществления дозы можно вводить не более одного раза в сутки. например не более одного раза в 24. 36. 48 ч или более. например не более одного раза каждые 5 или 8 дней. После лечения следят за изменениями состоя

- 15 012573 ния пациента и снятием симптомов болезненного состояния. Дозу соединения можно либо увеличивать, в случае отсутствия заметной реакции у пациента на текущие уровни доз, либо дозу можно уменьшать, если заметно снятие симптомов болезненного состояния, если болезненное состояние было снято, или если наблюдаются нежелательные побочные эффекты.

В одном варианте осуществления фармацевтическая композиция 1РНК-агента включает в себя множество видов 1РНК-агентов. Разновидности 1РНК-агентов могут иметь последовательности, которые не перекрываются и не являются смежными относительно природных последовательностей-мишеней, например последовательности-мишени гена К.8У. В другом варианте осуществления множество видов 1РНК-агента является специфичным в отношении различных природных генов-мишеней. Например, 1РНК-агент, который нацелен на ген Р белка В8У, может присутствовать в той же фармацевтической композиции, что и 1РНК-агент, который нацелен на другой ген, например ген N белка. В другом варианте осуществления 1РНК-агенты являются специфичными для разных вирусов, например К.8У.

Концентрация композиции 1РНК-агента представляет собой количество, достаточное эффективное для лечения или профилактики заболевания или для регуляции физиологического состояния у людей. Концентрация или количество вводимого 1РНК-агента будет зависеть от параметров, определяемых для этого агента, и способа введения, например назально или пульмонально. Например, для назальных композиций требуются гораздо меньшие концентрации некоторых ингредиентов во избежание раздражения или ожога носовых ходов. Иногда необходимо разбавлять пероральную композицию вплоть до 10-100 раз для получения подходящей композиции для назального введения.

Определенные факторы могут влиять на дозу, необходимую для эффективного лечения пациента, в том числе, но не только, тяжесть заболевания или нарушения, получаемое ранее лечение, общее состояние здоровья и/или возраст пациента и наличие других заболеваний. Также будет понятно, что эффективная доза 1РНК-агента, такого как 51РНК-агент, используемого для лечения, может увеличиваться или снижаться на протяжении курса конкретного лечения. Изменения в дозе могут быть обусловлены или стать очевидными из результатов диагностических анализов. Например, за пациентом наблюдают после введения композиции 1РНК-агента. На основании информации наблюдения может быть введено дополнительное количество композиции 1РНК-агента.

Изобретение дополнительно иллюстрируется следующими примерами, которые не являются ограничивающими.

Примеры

Создание противовирусных 51РНК против мРНК К.8У.

51РНК против Р, N и Ь мРНК К.8У синтезировали химически с использованием известных способов. Перечислены последовательности 51РНК и некоторое ингибирование перекрестной активности между подтипами и значения 1С₅₀ (табл. 1(а-с)).

Исследование ίη νίίΓΟ и вирусная инфекция.

Клетки Уего Е6 культивировали до 80% слияния в ΌΜΕΜ, содержащей 10% ЕВ8, инактивированную нагреванием. Для введения 51РНК добавляли 4 мкл ТгапЩ-ТКО к 50 мкл бессывороточной ΌΜΕΜ и инкубировали при комнатной температуре в течение 10 мин. Затем добавляли указанную концентрацию 51РНК к реактиву среда/ТКО, соответственно, и инкубировали при комнатной температуре в течение 10 мин. Добавляли смесь РНК к 200 мкл ΌΜΕΜ, содержащей 10% ЕВ8, а затем к клеточному монослою. Клетки инкубировали при 37°С, 5% СО₂ в течение 6 ч. Смесь РНК удаляли осторожным промыванием 1х сбалансированным солевым раствором Хенкса (НВ88), в лунки добавляли 300 бляшкообразующих единиц (р£и) В8У/Л2 (ΜΟΙ=30) на лунку и подвергали адсорбции в течение 1 ч при 37°С, 5% СО₂. Вирус удаляли и клетки промывали 1х НВ88. Клетки покрывали 1% метилцеллюлозой в ΌΜΕΜ, содержащей 10% ЕВ8 среды, и инкубировали в течение 6 дней при 37°С, 5% СО₂. Клетки подвергали иммуноокрашиванию на наличие бляшек с использованием моноклонального антитела 131-2А к Е белку.

Доставка 51 РНК и вирусная инфекция ίη νίνο.

Беспатогенных самок мышей ВЛЬВ/с в возрасте 4 недель покупали у Наг1ап. Во время заражения и интраназального капельного введения (ί.η.) мыши находились под наркозом. Мышей иммунизировали интраназальным капельным введением указанного количества 51РНК либо несвязанной, либо в комплексе с 5 мкл Тгапкй ТКО. 150 мкл 8упад15 (моноклональное антитело клон 143-6С, к Е белку К.8У) и контроль мышиный изотип (1дО1) вводили внутрибрюшинно (ί.ρ.) за 4 ч до заражения К.8У (10⁶ РЕИ К.8У/Л2). Использовали 10 мышей на группу. Массу животных проверяли на 0, 2, 4 и 6 день после заражения. Легкие забирали на 6 день после заражения и исследовали на К.8У с помощью анализа иммунологического окрашивания бляшек.

Анализ иммунологического окрашивания бляшек.

24-луночные планшеты с клетками Уего Е6 культивировали до 90% слияния в ΌΜΕΜ, содержащей 10% ЕВ8, инактивированную нагреванием. Легкие мышей гомогенизировали ручным гомогенизатором в 1 мл стерильного РВ8 Дульбекко (Ό-РВЗ) и разводили в 10 раз бессывороточной ΌΜΕΜ. Разведения лизата легочной ткани, содержащей вирус, помещали в 24-луночные планшеты в трех повторах и подвергали адсорбции в течение 1 ч при 37°С 5% СО₂. Лунки покрывали 1% метилцеллюлозой в ΌΜΕΜ,

- 16 012573 содержащей 10% РВ8. Затем планшеты инкубировали в течение 6 дней при 37°С, 5% СО₂. Через 6 дней покровную среду удаляли и клетки фиксировали в ацетон:метаноле (60:40) в течение 15 мин. Клетки блокировали 5% сухим молоком в РВ8 (Мйк/РВ8) в течение 1 ч при 37°С. К лункам добавляли антитело к Р белку КБУ (131-2А) в разведении 1:500 и инкубировали в течение 2 ч при 37°С. Клетки дважды промывали в РВ8/0,5% Тетееп 20. В лунки добавляли комплекс козьих антимышиных 1§С со щелочной фосфатазой в разведении 1:500 и инкубировали в течение 1 ч при 37°С. Клетки дважды промывали в РВ8/0,5% Т\уееп 20. Реакцию развивали с использованием набора Уес1ог'5 А1ка11пе Рко8рка!а8е 8иЬ8!га!с кН II (Уес!ог В1аск) и контрастно окрашивали гематоксилином. Бляшки визуализировали и подсчитывали с помощью инвертированного микроскопа О1ушри8.

Анализ обработки.

Мышей заражали КБУ (10⁶ РРИ КБУ/А2) интраназальным капельным введением в 0 день и обрабатывали 50 мкг указанной 81РНК, вводимой интраназально капельно, в указанные моменты времени (день 1-4 после вирусного заражения). Использовали 3-5 мышей на группу и измеряли титры вируса в лизатах легких на 5 день после заражения вирусом, как описано ранее.

Ιη уйго ингибирование КБУ с использованием 1РНК-агентов.

1РНК-агены, представленные в табл. 1(а-с) были протестированы на анти-КБУ активность в анализе бляшкообразования, как описано выше (фиг. 1). Каждая колонка (столбец) представляет 1РНК-агент, (табл. 1(а-с)), например колонка 1 представляет собой первый агент табл. 1а, вторая колонка представляет собой второй агент и т.д. Активные 1РНК-агенты идентифицировали по % оставшегося вируса. Были установлены некоторые агенты, которые демонстрировали до 90% ингибирования. Результаты суммированы в табл. 1(а-с).

Определяли ίη уйго ингибирование КБУ в зависимости от дозы, используя 1РНК-агенты. Примеры активных агентов из табл. 1 тестировали на анти-КБУ активность в анализе бляшкообразования, как описано выше в четырех концентрациях. Дозозависимый ответ был обнаружен с тестируемыми активными 1РНК-агентами (фиг. 2) и суммирован в табл. 1(а-с).

Ιη уйго ингибирование подтипа В КБУ с использованием 1РНК-агентов тестировали, как описано выше. 1РНК-агенты, представленные на фиг. 2, тестировали на анти-КБУ активность против подтипа В (фиг. 3). Подтип В КБУ ингибировали 1РНК-агентами, протестированными в различной степени, и суммировали в табл. 1 (а-с).

Ιη у|уо ингибирование КБУ с использованием 1РНК-агентов.

Ιη νί\Ό ингибирование КБУ с использованием АБ1729 и АБ1730 тестировали, как описано выше. Агенты, описанные на фиг. 4, тестировали на анти-КБУ активность на мышиной модели. 1РНК-агенты эффективно снижали титры вируса ίη νί\Ό и были более эффективными, чем контрольное антитело (МаЬ 143-6с, мышиное 1дС1 АЬ, которое утверждено для лечения КБУ).

АБ1730 тестировали на дозозависимую активность с использованием способов, приведенных выше. Эти агенты показали дозозависимый ответ (фиг. 5).

1РНК-агенты, показывающие активность ίη уйго, тестировали на анти-КБУ активность ίη у1уо, как изложено выше. Некоторые агенты показали снижение титров вируса >41одз при профилактическом введении (фиг. 6).

1РНК-агенты, показывающие ίη уйго и/или ίη у1уо активность, были протестированы на анти-КБУ активность ίη у1уо, как изложено в протоколе обработки, приведенном выше. Некоторые агенты показали снижение титров вируса 2-31одз (фиг. 7) при введении на 1-2 день после вирусного заражения.

Секвенирование изолятов по длине последовательности-мишени.

Способ.

Выращивание изолятов и выделение РНК.

Клинические изоляты от пациентов, инфицированных КБУ, получали от Баггу Апйегхоп в СО С в Атланте, штат Джорджия (4 штамма), и 1о11п ОеУтсепхо из Университета штата Теннеси, г. Мемфис (15 штаммов). При их выращивании в НЕр-2, эпителиальных клетках человека (АТСС, Са! # ССБ-23), было отмечено, что 4 изолята из Джорджии росли медленнее, чем 15 штаммов из Теннеси; следовательно, их обрабатывали и анализировали по отдельности. Этот процесс кратко описывается следующим образом.

Уего Е6, эпителиальные клетки почек обезьяны (АТСС, Са! # СВБ-1586) выращивали до 95% слияния и инфицировали первичными изолятами в разведении 1/10. Вирус абсорбировался в течение 1 ч при 37°С, затем клетки дополняли Ό-МЕМ и инкубировали при 37°С. Каждый день клетки проверяли на наличие цитопатического эффекта (СРЕ) с помощью светового микроскопа. При 90% СРЕ клетки собирали соскабливанием и осаждали центрифугированием при 3000 об/мин в течение 10 мин. Препараты РНК готовили по стандартным методикам в соответствии с инструкцией производителя.

Амплификация N гена КБУ.

Вирусные РНК собирали после заражения и использовали в качестве матриц в ПЦР с использованием праймеров, которые гибридизируются выше и ниже сайта-мишени АБ-ЭР-2017 для амплификации фрагмента ~450 пар нуклеотидов. Вся РНК денатурировалась при 65°С в течение 5 мин в присутствии прямого и обратного праймеров к N гену КБУ, содержащихся на льду, а затем проводили обратную

- 17 012573 транскрипцию с использованием 8ирег5епр1 ΙΙΙ (ΙηνίΙΐΌβοη) в течение 60 мин при 55°С и в течение 15 мин при 70°С. Продукты ПЦР анализировали гель-электрофорезом на 1% агарозном геле и анализировали по стандартным протоколам.

Результаты.

Секвенирование первых 15 изолятов подтвердило, что сайт-мишень для ЛЬ-ОР-2017 был полностью консервативным у всех штаммов. Важно, что эта консервативность сохранялась у всех различных популяций, которые включали изоляты и подтипа А, и подтипа В К8У. Интересно то, что при анализе 4 изолятов, растущих медленнее, было обнаружено, что у одного из 4 (БАР6824) была мутация единичного основания в сайте узнавания ЛЬ-ОР-2017. Эта мутация изменила кодирующую последовательность в положении 13 N гена К8У N в этом изоляте с А на С.

Выводы.

Из изолятов от 19 пациентов была определена последовательность N гена К8У в сайте-мишени для АЬ-ОР-2017. В 18 из 19 случаев (95%) элемент узнавания для ЛЬ-ЭР-2017 является 100% консервативным. У одного из изолятов было изменение единичного основания, изменяющее нуклеотид в положении 13 с А на С в пределах N гена К8У. Это изменение создает единичное С:Б неоднозначное соответствие между антисмысловой цепью ЛЬ-ЭР-2017 и последовательностью-мишенью. Исходя из соображения потенциала гибридизации такого С: и неоднозначного соответствия, предполагается, что ЛЬ-ЭР-2017 будет эффективным в подавлении N гена К8У в этом изоляте.

Данные сайленсинга по изолятам.

Способы.

Клетки Уего Е6 культивировали до 80% слияния в ΌΜΕΜ, содержащей инактивированную нагреванием 10% ЕВ8. Для введения 81РНК 4 мкл ТганЩ-ТКО добавляли к 50 мкл бессывороточной ΌΜΕΜ и инкубировали при комнатной температуре в течение 10 мин. Затем указанную концентрацию ЦРНК добавляли к реактиву среда/ТКО, соответственно, и инкубировали при комнатной температуре в течение 10 мин. Смесь РНК добавляли к 200 мкл ΌΜΕΜ, содержащей 10% ЕВ8, а затем к клеточному монослою. Клетки инкубировали при 37°С, 5% СО₂ в течение 6 ч. Смесь РНК удаляли осторожным промыванием 1х сбалансированного солевого раствора Хенкса (НВ88), в лунки добавляли 300 бляшкообразующих единиц (р!и) В8У/А2 (ΜΟΙ=30) и подвергали адсорбции в течение 1 ч при 37°С, 5% СО₂. Вирус удаляли и клетки промывали 1х НВ88. Клетки покрывали 1% метилцеллюлозой в ΌΜΕΜ, содержащей 10% ЕВ8 среду и инкубировали в течение 6 дней при 37°С, 5% СО₂. Клетки подвергали иммуноокрашиванию на наличие бляшек, используя моноклональное антитело 131-2 А к Е белку.

Результаты.

Сайленсинг наблюдался у всех изолятов (табл. 2)

Вывод.

Все протестированные клинические изоляты специфически ингибировались под действием ЦРНК 2017 более чем на 85%. Не было изолятов, существенно ингибированных под действием ЦРНК 2153, некомплементарно спаренной в качестве контроля.

Сайленсинг в исследовании на основе плазмид.

Способ.

24-луночный планшет засевали клетками НеЬа 86 и выращивали до 80% слияния. Для каждой лунки смешивали 1 мкг плазмиды К8У Х-У5 с ЦРНК (в указанных условиях) в 50 мкл ΟРТI-ΜΕΜ и добавляли в смесь ΕίροίοοΙαιηίικ 2000 Ц^йгодеШ-Орйтет, приготовленную в соответствии с инструкциями производителя, и оставляли стоять 20 мин при комнатной температуре для образования комплекса. Комплекс добавляли к клеткам и инкубировали при 37°С в течение ночи. Удаляли среду, промывали клетки РВ8 и лизировали с использованием 50 мкл лизирующего буфера (буфер К1РЛ (50 мМ ТгЦ-НС1 рН 8,0, 150 мМ №С1, 1 мМ ΕΌΤΑ, 0,5% дезоксихолата №, 1% №-40, 0,05% 8Ό8) в течение 1-2 мин. Инкубирование количественно определяли измерением уровня белка К8У в клеточных лизатах, определяемого с помощью Вестерн-блоттинга с анти-У5 антителом.

Результаты.

Было показано, что транзиторная плазмидная экспрессия является эффективным анализом для 1РНК-агентов (табл. 3).

Выводы.

81РНК 2017 специфически и дозозависимым образом ингибирует продукцию N белка К8У N при транзиторной котрансфекции плазмидой, экспрессирующей N ген К8У. Ингибирование не наблюдалось с некомплементрано спаренной ЦРНК 2153 в качестве контроля.

Подавление К8У путем аэрозольной доставки ЦРНК.

Способ.

мг/мл раствора АЬ-ОР-1729 или АЬ-ОР-1730 доставляли путем распыления, используя аэрозольное устройство, в общей сложности в течение 60 с. Вирус получали из легких, как описано выше, и анализировали с помощью ΕΌΙ8Α, а не анализа бляшкообразования. В ΕΌΙ8Α определяли концентрацию N белка К8У в клетках, инфицированных вирусом, полученных из лизатов легких мышей.

- 18 012573

ЕБ18А.

Лизат легких разводили 1:1 карбонат-бикарбонатным буфером (ΝαΗΟΘ₃ рН 9,6) до рабочей концентрации 6-10 мкг/100 мкл, добавляли в каждую тестируемую лунку и инкубировали при 37°С в течение 1 ч или в течение ночи при 4°С. Лунки промывали 3х РВ8/0,5% Т\уееи 20, затем блокировали 5% сухим молоком/РВ8 в течение 1 ч при 37°С или в течение ночи при 4°С. В лунки добавляли первичное антитело (Р белок положительный контроль=клон 131-2А; О белок положительный контроль=130-2О; отрицательный контроль=нормальные 1дО1 (ВБ РРагштдеп, СаР # 553454, тестируемая сыворотка или супернатант гибридомы) 1:1000 и инкубировали при 37°С в течение 1 ч или в течение ночи при 4°С. Лунки промывали 3х РВ8/0,5% Т\уееп 20. Вторичное антитело (целая молекула козьего антимышиного 1дО (Н+Б), конъюгированная с щелочной фосфатазой), разведенное 1:1000, добавляли в лунки (100 мкл/лунку) и инкубировали при 37°С в течение 1 ч или в течение ночи при 4°С. Промывали 3х РВ8/0,5% Т\уееп 20, затем добавляли Νρρ (ΒίμιικιΕίδΓ) субстрат 81§ша АМпсР N2770 в соответствии с инструкциями производителей. Добавляли 200 мкл субстрата на лунку и инкубировали в течение 10-15 мин. Поглощение измеряют при ΘΌ 405/495.

Вывод.

Доставка специфической δί Р11К К8У снижает уровни N белка К8У в легких мышей по сравнению с контрольной некомплементарно спаренной δί Р11К (фиг. 8А, В).

Ингибирование ΐπ νίνο на 3 день - профилактика.

Способ.

Ιη νίνο профилактику тестировали с использованием ΐπ νίνο способа, описанного выше, за исключением того, что δί Р11К доставляют в различные моменты времени до заражения К8У от 3 дней до заражения до 4 ч до заражения.

Результаты.

δί Р11К, введенная интраназально вплоть до 3 дней до вирусного заражения, демонстрирует значительное подавление ΐπ νίνο (фиг. 9).

Последовательности δί Р11К

Таблица 1а

Б ген К8У

Факти- ческое начало	Стартовая точка УШеЪеас!	Смысловая	5ЕО Ш Шз	Антисмысловая	8ЕО I» Щ:	АЬ-ОР#	% ингибирования КЗЗ/ А2 (5нМ)	% ингибирования Я5УА2 500 пМ	% ингибирования К5УА2 50 пМ	% ингибирования Н5УА2 5 пМ	% ингибирования К8УВ (5нМ)
3	(	осауссса иилиил α υσσ датат	1	исслшА а ил а иосс лиссатат	1	ΑΕΌΡ-2024	92
4	2	бАисссАиилииддиобАлатат	3	ииссАиилАилАисосАисатат	4	ЛЮР-Жб	82
49	47	лсиилиииААААОсиоииА(1Т<гг	5	илАСАСсииииАААиААсиатат	6	АЪФР-Шб
50	АВ	συυΑυυυΑΑΛΑοσυπυυΑυΰΤΰτ	7	АилАСАсеишиААдиААсатат	§	АЬ-ОР-2117
53	51	лииидАААССисииАисисотйт	9	САОлилАСлссииииАААиатат	10	АЬ-ЦР-2118
55	53	циАллАСсисиилисисшатат	11	ААблСАиААСлссиииилАатат	12	ЛЬ-ОР-2119
156	154	АЛсиссАсилсилсАССАидтет	. 12	АиосисиАсиАоиосАсииатат	14	АЕ-ЦР-2027	86
<57	155	ЛСиССАСиАСОЛО АССА иА4Т<ГГ	15	илиссисиАС-иАсиссАсиатат	16	ΑΕΌΡ-2028	90
158	156	оисСАсилсиАСлослидштат	12	АидиссисиАсиАоибСАсатат	18	ЛЬ-ОР-2029	89
159	157	исслсиАсиАОАСслилисо гит	19	САилиосисиАоиАбисолатат	22	АЕОГ 2030	86
341	339	ОААОАССиАиАСЛАЛиААСйТОТ	11	сиилииисиАиАбсисиисатат	22	ЛЗ.ОГ-212В
344	342	слссиАидоАААилАоиоАотат	22	исАСШАииисиАиАбсисатат	24	АЬ-РР-2121
347	345	силиАОАлдиААсиадисиитат	25	АСАисАсиилииисиАилоатат	26	ЛЬОР-2031	15
554	552	исллАЛСААСЛсисииСАдетйт	27	иисААбАбибииоииииоАатат	28	ΑΕΌΡ-2122
1004	1002	илоАСССАиииАиилисисйТйт	29	ОАСлиАлилААисссисиАатат	30	АЬ-ЦР-2123
1408	1406	диААААСасииисиААдил<1Т<1Т	31	иАииилбАААСссииииАиатат	32	АЪОР-2124
1867	1865	сисдсиаидссиАОАлиоиетат	32	АСАиисиАСсилслсиоАбатсп·	34	АЬ-ЦР-2032	90
1868	1866	иСАСисидсаиАСлдисиштат	35	ААСлиисилссиАСАсиолатат	2«	ЛЕ-ОР-2033	84
1869	1867	САсибидсоиАСААиаииштсп·	22	АААСАиисиАССилсАсибатаг	38	ЛЪ-ОГ-2034	86
1870	1868	дсиаилсоиАСллисииисатат	29	СААлслиисидссиАСАСиатат	30	АЬ-»Р-2Ш
1871	1869	сиоилосиАСААипиииссатаг	а	осла аса иисилсси АСлсатат	42	АЬ-ОР-2113
1978	1976	лсААСАиАиссисАисилсатат	42	сиАблиСАССАидисииоиатат	44	АЬ-ОР-2035	89
2104	2102	ЛССААЛииСАЛиСАЛССАШТйТ	43	лиссииодииОААиииосиатат	46	ΑΕ-ϋΡ-2036	87

- 19 012573

	2103 2288 2382 2384 2385 2483 2485 2505 2506	ислАлиислАисААОСлишпт олшААСАллсиосАииАштат иАлиАисисисАллсосААбтот АидисисисАЛАСССАЛАиитйт илисисисААлсбСААлиштдт слиссисАлссАСАииАииогсп· иссиСАлбСАСлииАиииаотот илсслииААлилсссииААат<гг АбСАииАллилсссииАЛАатат	47 49 51 53 55 52 59 & 63	ААиосииоАбиСААиииосатат АилАиссАсиииаиисАисетат иисссицибАОлбАилиидатат АииисссииибАОлбАиАиатат ААииисссииибАОАбАиАатат АлиАлисибсииСАбслиоатат СААдиААисибсииалосАатат иилАббсиАбиилАбссиАатат ииилАббсиАииилАиосиатат	42 52 52 54 56 52 22 62 64	АЬОР-2037 Лб-ОР-2038 Аб-ОР-2125 ΑΖ-ΌΡ-Ζ126 Аб-ЭР-2127 Аб-ОР-2039 Α6-Ι3Ρ-2040 АЬ-бР-2041 Аб-ОР-2114	91 11 87 88 96	76	73	69	94
2509	2507	сслииллАилсссиилАлиатат	£	АиииАлоосиАиииААиссатат	66	Аб-бР-2042	96	98	97	97	90
2510	2508	слииАллиАОСсииААлшмпгг	22	ААбииААббсилиииААибатат	62	АЬ-ЦР-2043	97	86	79	75	94
2765	2763	иАииАббслобббАлилииагат	«2	аа илиблААсибСАбААбАвтат	22	АЬОР-2044	97	79	72	67	84
2767	2765	иилиссАсиииллиАиииАатат	21	бААЛбАббАААСибСАбАЛаТбТ	72	АЮР-2045	15
3283	3281	АЛААоиосАСААСАиилилатат	22	иАиААббиисиосАсииббатат	74	Аб-ПР-2128
.3284	3282	АЛАоисслсААСАиилилсатат	25	ббАбААбОббаибСАСибиатат	22	Α6ΌΡ-2046	94	94	91	91	93
3338	3336	АилилслАСсиАСАИАиссатсгг	22	обАблиббАбОббСбАбАбатат	78	Лб-ВР-2047	87
3339	3337	илилоАлссилслиАиссилат	22	АСОАблбСбАОбиисУАиАатат	22	Аб-ПР-2048	84
3365	3363	иАлбАсиисииилисААлоатат	81	СбббСЛбАААСААСбСббАаТаТ	82	Аб-бР-2129
4021	4019	лсАСисАоилсилолссАиатат	83	лисе бСб леи АСбб АСбоиатат	84	Α6ΌΡ-2049	24
4022	4020	САсислсилсиАОАССАисатат	25	САбОббСбАСбАСббАСбоатат	22	АЮР-2050	15
4023	4021	лоислсиАбилоАССАиаиатат	»2	АСАббОбСбАСблсббАсиатат	22	Аб-бР-2051	87
4024	4022	оислсиАсилслссАисисатат	22	САСлббСбСбАСбАСбСАСатат	22	Аб-ОР-2052	96	84	76	69	87
4025	4023	сслсилоилбАсслисибАатат	21	бСАСАбОббСбАСбАСбблатат	22	Аб-ОР-2053	92	84	79	76	74
40.37	4035	САбОббАлибсссбОслбсатат	93	САбССАОООААббСАСАббатаГ	24	Аб-ЦР-2054	97	79	78	69	96
4038	4036	АисиоллиисссиосАислатат	95	ббАбослоббААббСлСАбатат	22	Аб-ЦР-2055	88
4039	4037	исисллиисссиослисААбтит	22	ибОАббслобСААббСАСАатат	22	Аб-ПР-2056	16
4040	4038	сисААиисссиссАисААиотат	99	АибСАббСАСОбААббСАСОТаТ	ш	Аб-бР-2115
4043	4041	лАиисссисслисллилссатат	101	осилиббАбослсббААббатат	122	Аб-ОР-2057	94	91	86	79	69
4051	4049	осАисллиАССАОсиилилатат	103	блбллбсибббАбиолббсатат	125	Лб-РР-2058	86
4052	4050	слисллилсслссиилиАсатат	105	сбАИААбсисобАбббАббагат	106	Лб-бР-2059	91
4057	4055	АилссАОсиилилбАлСАлатат	107	иисиисбА иллссиссилбатат	128	ЛЫ1Р-2060	92
4058	4056	илссАбсиилиАбААСАлсатат	102	обиоббСбАиАлосббббАатат	112	Аб-ОР-2061	88
4059	4057	АсслссииАилслАСААСлатат	111	бббббибСбАбААбСббббатат	112	АЫЗР-2062	95	79	78	72	94
4060	4058	сслбсиилилсллсААСААатот	ИЗ	бббииббисбАбл Абсбббатат	114	Аб-СР-2063	90
4061	4059	слосиилиАОЛАСААСАллатат	115	биисибОббСбАбЛАбсббатат	112	Аб ОР-2064	94	86	76	67	83
4067	4065	лилолАСллСАААииАислатат	112	ббАбЛАббибибоиосбАбатаг	112	Аб-ПР-2065	91
4112	4110	илиилАСАбАЛААоилиобагат	112	ссАбАсииибсисибААбАатат	122	Аб-ЦР-2130
4251	4249	иб до Аилслибис; АОСАллат а г	121	биислисАААбСбАбСбСАвтат	122	Аб-бР-2066	86
4252	4250	бАСАилслииоолбОАААсатат	1а	СбббСАбСАААбббАбСбСатат	124	Лб-бР-2067	92
4254	4252	олилслииибАиолААссиаз а г	125	АбОббисАбслААбОбАбсатат	125	Аб-бР-2068	93
4255	4253	лиАСАиииолослААСсисатат	122	слаоииисАисАААиоблиатат	122	Аб-РР-2069	89
4256	4254	иАслииисАибААлссоссатаг	ш	СбАОббббслбСАААбоиАатат	132	Α6ΌΡ-2074
4313	4311	АлбОблилсААЛААСлбСАатат	131	ббсиоббибиббАбОАсииатат	132	Α6ΌΡ-2131
4314	4Л2	лоислилслАааАсласлиа ι ат	133	АбОСбСбибиббиАбСАСбатат	124	Α6ΌΡ-ΖΙ32
4316	4314	бОАбЛСААЛАЛСАбСАбАбаТйТ	135	АбАббСбсиииббОбАбСАатат	132	Аб-ПР-2133
4473	4471	иииААбиАсиллиииАбсиатат	122	АбСбАДАббАббАСибААЛаТаТ	132	Аб-ЦР-2075
4474	4472	иилАб(1АсилАиииАбсибатат	139	САОСбАААббАОбАСббААатаТ	142	Λ6ΌΡ-2076
4475	4473	илАбиАсиллиииАбсиобатггг	141	ссласбАЛАббАббАСбблатат	1«	Аб-ОТ-2077
4476	4474	ААоиАсиААииилосиосАатат	143	бССАбсилААббАбилсибатат	144	Аб-бР-2078
4477	4475	лбиАсилАиинАйСийОАСиТат	145	ббссАсгблААбблоиАСбатат	146	Аб-ОР-2079
4478	4476	оиАсилАиииАОсиббАСА<пг<п·	147	ббисСАбсилААббАббАСатат	142	Аб-бР-2080
4480	4478	АСОААииилбсиооАСАииатат	149	ААббиссАбСбАААииАбштат	152	Α6ΌΡ-2081
44$Ι	4481	Алииилбсиоо дсАбиослатат	151	иссААцсиссАОСблААбиатат	152	Аб-бР-2082
4484	4482	лиииАбсиббАСлииббАОИтат	153	АбсслАббисСАССблААбатат	154	Лб-ЦР-2083
4486	4484	иилбсисблсАниббАиисатит	125	ОААиссААббиссАбсиААатат	156	Аб-ОР-2084
4519	4537	ииииоААААлоАииаооолатат	Ш	бссссААисиибиисААААатат	152	Аб-ОР-2134
4540	4538	ииисллАААОАииобСбАоата г	152	сиссссААбсибббисАЛАатат	160	Аб-ОР-2135
4542	4540	иблААААСАииоосоАбАбатат	1«	сисбсссСААбсииии ислатат	122	АЪОР-2136
4543	4541	олААААОлиисбооАбАббатат	163	ссисбссссАлбСббииисатат	125	Аб-ОР-2137
4671	4669	илибллСАсиислбАисииатат	1«5	ААбАбсибААСбСбиСАбАатат	166	Аб-бР-2085
4672	4670	АиоллслсиислоАисиисатат	122	бААОАбсиоАлсбОббСАбатат	168	Λ6ΌΡ-2086
4867	4865	иссссииообоибииААСлатат	ш	бСббААСАЛСССААОСОСАаТОТ	122	А1.-ОГ-2087
4868	4866	ссссииосоииоиолАСАиатат	.171	АбСббААСЛАСССЛАОСбСбТаТ	122	Аб-ОР-2088
5544	5542	ЦАиАбСАиислиАОбосАлазат	ш	ббСАССбАббААббСбАбАатаТ	174	Аб ПР-2089
5545	5543	АиАосАиислиАбоиОААОа гат	125	СббСАССбАббААбОСбАбаТаТ	126	Аб-ПР-2090
5546	5544	илосАиисАилсбибААбоа гат	122	ссибСАССбдибАЛбОсилата г	178	Аб-ПР-2091
5550	5548	АиисАилобиолАббАбслатат	179	бОСбССббСАССбАббААбатаТ	122	Α6ΌΡ-2092

- 20 012573

5642

564)

5651

5640

5641

5638

5639

5640

5643

5644

5645

5647

5648

5649

5650

5642

5643

5645

5646

5647

5648

5752

5754

5755

5756

5919

5920 5934 60! 6

6019

6020

6252

6253

6254 ииусАлисАУслиАсииилдтат исслАцсАислиАоиииАаггат ссллиолисАУАОуиУАСсатат <,ААислисАЦАсиииАСси<гг(1т Алис.лислиАйциилссилятат АислисАилсиииАСсилиатдт САУСАилииирлссилииодтдт АисАЦАоиииАссилииалдтдт услилсииУАСсиАУУСАОстот сдилс ииилссилиислсидтат АилоииилссилиисАсииитдт слиио~сосиилииилслил<я'дт иисоисуиАиццАСАЦАиАдтит исс;исииАиииАСАиАЦАА<пат ссиси илииилсАУАУААлдтд г лилисАиосислАСАиолиетдт НАислиссисААУАЦОдиАдтат ислиАицоАииисАААиилитат илсиилсуссииАСАлиАодтдт ииАсиссииАСААилосиСбГбт иАсиссицАСААЦАСсиссдтит АиАШкиАилссиссАСУибТбт ЦАиисцлилосисоАсоилдтдт АуисилилосиссАСоиллотдт

Ш 1а ш ш

191 ш 195

192

199 адГ

2Й5 207 И»

2Ц 213

212

217

219 цг

222

222

222 илААсиАисАисАииссААдтат оиАААсиАУСАисАциссАетдт соиАААсиА»оАисАииосдт<гг АСсиАААСиАиолисАииоитдт цАбсилААсиАУСлисАтитат АУлссилААСУАУСАУСАУатат СААУАССУАЛАСиАОСАОСЛдТ ислАЦАСоиАААСУАУСАиатат СиСААУАООУАААСУАУСАДТДТ АсисААУАСсилАлсиАУсатат ААСУСААУлосилААСУАУатат УАУсидАлиААСАссААисатат УЛиАиСУАААУААСАССААаТДТ УУАиАУаиАААУААСАССлДТДТ ууиАЦАиоиАААУААСАСсатдт дисАисиисАССАисАУАиатат УАиСАУСУУОАОСАУСАиАЦГдТ УААУУУилЛАУСААУАУСАДТДТ сиАуисУААССАсиААОУАа'пл· УАСсиАииуиААсцАСиллсТот ССАССУАииСУААССАСУАДТДТ АСоиссАСсиАУАСААЦАУбтат УАСсиссАдсиАЦАОААСлдтат ииАССУССАССУАУАСлАШТбт а* а?

АЬ-РР-2093

АЬ-РР-2094

АЕ-РР-2095

ЛЬРР-2096 АЬРР-2097 ЛЕ-РР-2098

АЬ-РР-2138

АЕРР-2139

АЕ-РР-2140

АЬ-РР-2099

АЕ-РР2100

АЕ-РР-2101

АЕ-РР-2102 АЕ-РР-2103 АЕ-ОР-2141

АЬ-ОР-2142

А1-РР2104 АЕ-РР-2105

АЪ-РР-2106

АЪ РР-210?

АЕ-ОР-21С8

ЛЬРР-2109

А1-РГ-2110

АЬ-РР-2111

Таблица 1Ь

Р ген Κ8Υ

Факти-	5ЕО 10	ЗЕ9 ГО	% ингиби-	% ингибирования	% ингибирования	% ингибирования	% ингибирования
ческое	Стартовая		ΝΟ-.		N0:		рования	К5УА2	К5УА2	К51/А2	₽5УВ
начало	точка	Смысловая		Антисмысловая		АГ-ОР #	(5 нМ)	500 пМ	50 пМ	5пМ	(5 нМ)
55	53	ААдииссиАбАдисАдиАдотсЛ·	229	ииАииеАиисиАБеААиии<ггбт	230	А1-РР-2000	3
56	54	ААииссиАСААУСААиАААбтат	231	иуиАииСАиисуАесАдиидтат	232	АЬ-ОР-2001	4
58	56	ииссиАСААисААиАААСбйтцт	233	ссиииАиисАиисиАС<ЗАА<яат	224	АЕ-РР-2002	7
59	57	иссиАСАдисдАиАДАбосбТот	235	сссиииАииеАиисиАОвАсПсл·	236	АУ-РР-2003	98	93	92	84	97
61	59	СиАСААиСААиААА6С6СА<1ТаТ	237	уссссиииАиуоАиисиАоотбт	238	А1-ОР-2004	3
322	320	АСАУиибАиААСААивААбДТбТ	239	сииСАиУсиУАисАААиоибтат	240	АС-ОР-2005	7
323	321	САиУиеДУААСААУСААСАОТОТ	241	усиусАиивииАисАААиошдт	2«	АЬ-РР-2006	5
324	322	АиииоАиААСААиеААбААатат	243	иисиусАиибииАисАААидтчт	244	ΑΙ.-ΡΡ-2007	4
325	323	ииисАиААСААивААвААОцгот	245	сиисиисАиисииАисАААдтат	246	А1.-ОР-2008	7
426	424	ААбиСАААиАСУАбСААиСдТдТ		САииссиАОУАииисАсииатот	245	АЬ-РР-2009	2
427	425	АоисАААУАсиАаедАиасспчп·	249	бСАиуссиАеиАииисАсибТбТ	250	АС-РР-2010	7
428	«26	иибАААУАСиЛССАлуСа.ИТОТ	251	АБСАииссиАеиАииисАСдтот	252	АЬРР-2011	4
429	427	исАААиАсиАббААиссииатйТ	253	ААБСАииссиАСУАииисАатат	254	АГ РР 2012	96	77	68	66	92
430	428	бАААУАсиАСОААибсиисйТдт	255	вААасАииссиАсиАииисатсп·	256	АГ-РР-2013	98	85	76	75	89
431	429	АААиАсиАсаААУесуисАщат	257	исААесАУиссиАБУАииуатдт	258	А1-РР-2014	98	85	81	68	66
550	548	СААССАииддисАССДАиссПУт	2§9	САиисзБисАииААиосиисцтат	260	А1-РР-2015	7
551	549	ААССАииАДиСАССААУСАйТОТ	2§1	иСАиивсисАииААиосииатот	262	АЬ-РР-2016	98	88	82	75	94
		ССАУААиАиААСАССААСАДТздГ	263	исиуБсибииАУАииАисватздт	264	АГ-ОР-1729	90
		сбАиидиАииАСАсеАивАс1Т5<л·	265	исАиссиоиААУАиААУСбатсдг	266	АГ-РР-1730

Таблица 1с

Ν ген Κ8Υ

_ . ОД иигмЯм.	% ингибирования К5УА2 50 пМ	% ингибирования К5УА2 5лМ	% ингибирования κενβ (5нМ)
Фактическое начало	Смысловая	8ЕО Ю НО:	Антисмысловая	263 Ш	АГ- ОР #	%ингиби-
рованмя (5 нМ)	К8УА2 500 пМ
3	сссисииАбслААсисААБ<яс1т	267	сиисАсииизсидАСАСССбтсп·	268	АГ-ОР-2017	98	86	84	80	93
5	сиси идее аа АсисААвиибтат	269	ААСииСАсиииссидАвАбатдт	270	АЕ-ОР-2018	2
52	сиэисАиссАССАААидсАбТегг	271	υουΑυυυοουοβΑυοΑΟΑβάΤάτ	272	АЬ-РР-2019	5
$3	исисдиссдсслдАидсАСотат	273	сусиАиииссисбАиздСАОтат	274	АЕ-ОР-2020	2
191	иАдиАбсиАиеиУАиАиссбТдт	275	осАиАУААСАиАссиАиидсггдт	276	АЕ-ОР-2021	3
379	АиибАСДиА6ААУСиАСААс1Тс1Т	277	иисиАСАиисиАисисддиатат	278	АЕ-ОР-2022	98	78	77	75	94
897	АиисилссдидиАиисААСутсп·	279	сиисААиАиАуссиАбААиатат	280	АГ-ОР-2023	1
898	иисидссАиАиАииоААСАбтцт	281	исиисААиАидиссиАОААатсп·	262	АГ-ОР-2024	7
899	исуАССАидиАиисААСАА<1Тс1Т	283	уисиисААУАСАиссиАса^тат	284	АЕ-ОР-2025	96	89	84	77	96

- 21 012573

Таблица 2

Таблица 3

1	А1ЮР2017	10 нМ	Белок % 0	Активность % 100
2		10 нМ	0	100
3		100 пМ	0	100
4		10 пМ	11,. 7 8	88,22
5		1 пМ	70,63	29,37
6		100 фМ	72,7	27,3
7	Контроль	РВ5	100	0
8	2153	10 нМ	94,54	4,5

ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ

Claims (4)

1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ

   1. Способ снижения уровней белка респираторного синцитиального вируса (КЯУ), мРНК К8У или титра К8У в легких или респираторных клетках пациента, включающий стадию интраназального введения или непосредственного введения в легкие пациента 81РНК-агента, где 81РНК-агент содержит смысловую цепь, состоящую из последовательности 8ЕО ГО N0:267, и антисмысловую цепь, состоящую из последовательности 8ЕР ГО N0:268.
2. 2. Способ по п.1, где указанный агент 81РНК-агент вводят пациенту путем ингаляции или распыления.
3. 3. Способ по п.1, где указанный 81РНК-агент снижает титр вируса у указанного пациента.
4. 4. Способ по п.1, где у пациента диагностировано наличие вирусной инфекции, вызванной К8У.