EA007810B1 - Иммуногенные миметики мультимерных белков с нерегулярными вставками т-клеточных эпитопов - Google Patents
Иммуногенные миметики мультимерных белков с нерегулярными вставками т-клеточных эпитопов Download PDFInfo
- Publication number
- EA007810B1 EA007810B1 EA200400688A EA200400688A EA007810B1 EA 007810 B1 EA007810 B1 EA 007810B1 EA 200400688 A EA200400688 A EA 200400688A EA 200400688 A EA200400688 A EA 200400688A EA 007810 B1 EA007810 B1 EA 007810B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- analogue
- amino acid
- acid sequence
- human
- immunogenic
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 255
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract description 234
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 title claims abstract description 97
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 154
- 239000000178 monomer Substances 0.000 claims abstract description 107
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 62
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 34
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract description 17
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 118
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 84
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 83
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 79
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 77
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 76
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 claims description 76
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 70
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 63
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 54
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 claims description 40
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 claims description 40
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 39
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 37
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 37
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 claims description 37
- 229960000814 tetanus toxoid Drugs 0.000 claims description 33
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 30
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 30
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 29
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 claims description 24
- 239000013638 trimer Substances 0.000 claims description 23
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 19
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 17
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 17
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 17
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 17
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 16
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 claims description 11
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 claims description 11
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 11
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims description 11
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 10
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 10
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 9
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 9
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 8
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 7
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 claims description 7
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims description 7
- 230000003993 interaction Effects 0.000 claims description 7
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims description 7
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 claims description 7
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 6
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 5
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 claims description 5
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 claims description 5
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 claims description 5
- 241000282412 Homo Species 0.000 claims description 4
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 claims description 4
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims description 4
- 239000011575 calcium Substances 0.000 claims description 4
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 claims description 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 claims description 4
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 claims description 4
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 229920001202 Inulin Polymers 0.000 claims description 3
- 241001529936 Murinae Species 0.000 claims description 3
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 claims description 3
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 229960003983 diphtheria toxoid Drugs 0.000 claims description 3
- 229940029339 inulin Drugs 0.000 claims description 3
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 claims description 3
- 239000002502 liposome Substances 0.000 claims description 3
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 claims description 3
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 claims description 3
- 229920002101 Chitin Polymers 0.000 claims description 2
- 229920001661 Chitosan Polymers 0.000 claims description 2
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 claims description 2
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 claims description 2
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 claims description 2
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 claims description 2
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 claims description 2
- 238000007917 intracranial administration Methods 0.000 claims description 2
- 239000000693 micelle Substances 0.000 claims description 2
- 231100000683 possible toxicity Toxicity 0.000 claims description 2
- 230000001376 precipitating effect Effects 0.000 claims description 2
- 239000003053 toxin Substances 0.000 claims description 2
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 claims description 2
- 238000001890 transfection Methods 0.000 claims description 2
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 claims description 2
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 claims 1
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 claims 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 claims 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 claims 1
- 239000013598 vector Substances 0.000 abstract description 49
- 238000011282 treatment Methods 0.000 abstract description 17
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 abstract description 4
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 abstract description 4
- 102000000743 Interleukin-5 Human genes 0.000 abstract description 3
- 108010002616 Interleukin-5 Proteins 0.000 abstract description 3
- 229940100602 interleukin-5 Drugs 0.000 abstract description 3
- 102000009270 Tumour necrosis factor alpha Human genes 0.000 abstract 1
- 108050000101 Tumour necrosis factor alpha Proteins 0.000 abstract 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 223
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 82
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 57
- 239000003471 mutagenic agent Substances 0.000 description 37
- 231100000707 mutagenic chemical Toxicity 0.000 description 37
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 37
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 30
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 30
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 29
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 26
- 239000000047 product Substances 0.000 description 25
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 24
- 239000003518 caustics Substances 0.000 description 22
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 21
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 20
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 20
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 20
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 16
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 16
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 15
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 15
- 241000272525 Anas platyrhynchos Species 0.000 description 14
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 14
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 14
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 14
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 14
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 13
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 13
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 13
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 13
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 13
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 13
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 13
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Natural products NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 12
- 238000013461 design Methods 0.000 description 11
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 11
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 11
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 11
- 241000894007 species Species 0.000 description 11
- 108010008488 Glycylglycine Proteins 0.000 description 10
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 10
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 10
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 9
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 9
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 9
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 9
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 9
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 9
- 239000000463 material Substances 0.000 description 9
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 8
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 8
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 8
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 8
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 8
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 8
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 8
- 239000002957 persistent organic pollutant Substances 0.000 description 8
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 8
- 230000008859 change Effects 0.000 description 7
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 7
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 7
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 7
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 7
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 7
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 7
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 6
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 6
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 6
- 239000003708 ampul Substances 0.000 description 6
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 6
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 6
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 6
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 6
- -1 for example Chemical class 0.000 description 6
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 description 6
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 6
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 6
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 6
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 6
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 6
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 6
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 6
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 6
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 6
- 108700001237 Nucleic Acid-Based Vaccines Proteins 0.000 description 5
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 5
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 5
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 5
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 5
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 5
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 5
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 5
- 230000006870 function Effects 0.000 description 5
- 229910052588 hydroxylapatite Inorganic materials 0.000 description 5
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 5
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 5
- 229940023146 nucleic acid vaccine Drugs 0.000 description 5
- XYJRXVWERLGGKC-UHFFFAOYSA-D pentacalcium;hydroxide;triphosphate Chemical compound [OH-].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O XYJRXVWERLGGKC-UHFFFAOYSA-D 0.000 description 5
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 5
- 230000004044 response Effects 0.000 description 5
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 5
- 208000011231 Crohn disease Diseases 0.000 description 4
- 238000011238 DNA vaccination Methods 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 4
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 4
- 108010008165 Etanercept Proteins 0.000 description 4
- 108010006519 Molecular Chaperones Proteins 0.000 description 4
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 4
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 4
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 4
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 4
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 4
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 4
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 4
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 4
- 229940073621 enbrel Drugs 0.000 description 4
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 4
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 4
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 4
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 4
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 description 4
- 230000002584 immunomodulator Effects 0.000 description 4
- 229940121354 immunomodulator Drugs 0.000 description 4
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 235000017709 saponins Nutrition 0.000 description 4
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 4
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 4
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 4
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 4
- 229960004854 viral vaccine Drugs 0.000 description 4
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 3
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 3
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 3
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 3
- 102000018713 Histocompatibility Antigens Class II Human genes 0.000 description 3
- 108010027412 Histocompatibility Antigens Class II Proteins 0.000 description 3
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 3
- 102000005431 Molecular Chaperones Human genes 0.000 description 3
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 3
- REDMNGDGDYFZRE-WKWISIMFSA-N O-(N-acetyl-alpha-D-galactosaminyl)-L-serine Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1OC[C@H](N)C(O)=O REDMNGDGDYFZRE-WKWISIMFSA-N 0.000 description 3
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000002441 X-ray diffraction Methods 0.000 description 3
- 230000000240 adjuvant effect Effects 0.000 description 3
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 3
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 3
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 3
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 3
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 3
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 3
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 3
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 3
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 3
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 3
- 239000005457 ice water Substances 0.000 description 3
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 3
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 3
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 3
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 3
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 3
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 3
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 3
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 3
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 3
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 3
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 3
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 3
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- 239000000829 suppository Substances 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 2
- 108010042708 Acetylmuramyl-Alanyl-Isoglutamine Proteins 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010006895 Cachexia Diseases 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 108010041986 DNA Vaccines Proteins 0.000 description 2
- 229940021995 DNA vaccine Drugs 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010004889 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000002812 Heat-Shock Proteins Human genes 0.000 description 2
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 2
- 101100480715 Mus musculus Mapt gene Proteins 0.000 description 2
- 201000004681 Psoriasis Diseases 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 108020005091 Replication Origin Proteins 0.000 description 2
- 241000555745 Sciuridae Species 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 2
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 2
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K aluminium phosphate Chemical compound O1[Al]2OP1(=O)O2 ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 2
- 238000010170 biological method Methods 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 2
- 238000002983 circular dichroism Methods 0.000 description 2
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 2
- 238000011284 combination treatment Methods 0.000 description 2
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- 150000001945 cysteines Chemical class 0.000 description 2
- 230000001066 destructive effect Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 2
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 2
- 102000006602 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 2
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 229920000140 heteropolymer Polymers 0.000 description 2
- 229920001519 homopolymer Polymers 0.000 description 2
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 2
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 2
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 2
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 2
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 2
- 238000011031 large-scale manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 239000004816 latex Substances 0.000 description 2
- 229920000126 latex Polymers 0.000 description 2
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 2
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 2
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 2
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 102000035118 modified proteins Human genes 0.000 description 2
- 108091005573 modified proteins Proteins 0.000 description 2
- BSOQXXWZTUDTEL-ZUYCGGNHSA-N muramyl dipeptide Chemical compound OC(=O)CC[C@H](C(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](C)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H](O)[C@@H]1NC(C)=O BSOQXXWZTUDTEL-ZUYCGGNHSA-N 0.000 description 2
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 2
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 2
- 210000001322 periplasm Anatomy 0.000 description 2
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 2
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 229940116176 remicade Drugs 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 238000004088 simulation Methods 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 2
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 2
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 125000003831 tetrazolyl group Chemical group 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N trimethylamine Chemical compound CN(C)C GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940124856 vaccine component Drugs 0.000 description 2
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 2
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N (6E,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-hexamethyltetracosa-2,6,10,14,18,22-hexaene Chemical compound CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 1-prop-2-ynoxypropan-2-ol Chemical compound CC(O)COCC#C GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MIJDSYMOBYNHOT-UHFFFAOYSA-N 2-(ethylamino)ethanol Chemical compound CCNCCO MIJDSYMOBYNHOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 3-phospho-D-glyceric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 206010001497 Agitation Diseases 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 1
- 101710187573 Alcohol dehydrogenase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101710133776 Alcohol dehydrogenase class-3 Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 244000144725 Amygdalus communis Species 0.000 description 1
- 235000011437 Amygdalus communis Nutrition 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 102100029968 Calreticulin Human genes 0.000 description 1
- 108090000549 Calreticulin Proteins 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 241000282994 Cervidae Species 0.000 description 1
- 102000019034 Chemokines Human genes 0.000 description 1
- 108010012236 Chemokines Proteins 0.000 description 1
- 102000009016 Cholera Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010049048 Cholera Toxin Proteins 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- 241001429719 Daubentonia madagascariensis Species 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000633756 Echis pyramidum leakeyi Snaclec 4 Proteins 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- 102000030595 Glucokinase Human genes 0.000 description 1
- 108010021582 Glucokinase Proteins 0.000 description 1
- 102100031132 Glucose-6-phosphate isomerase Human genes 0.000 description 1
- 108010070600 Glucose-6-phosphate isomerase Proteins 0.000 description 1
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 1
- 102000005548 Hexokinase Human genes 0.000 description 1
- 108700040460 Hexokinases Proteins 0.000 description 1
- 101100480712 Homo sapiens MAPT gene Proteins 0.000 description 1
- 101000585555 Homo sapiens PCNA-associated factor Proteins 0.000 description 1
- 101000693970 Homo sapiens Scavenger receptor class A member 3 Proteins 0.000 description 1
- 241000701109 Human adenovirus 2 Species 0.000 description 1
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 208000022559 Inflammatory bowel disease Diseases 0.000 description 1
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 1
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 1
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 1
- 102000000589 Interleukin-1 Human genes 0.000 description 1
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 1
- 102000013462 Interleukin-12 Human genes 0.000 description 1
- 108010065805 Interleukin-12 Proteins 0.000 description 1
- 102000003816 Interleukin-13 Human genes 0.000 description 1
- 108090000176 Interleukin-13 Proteins 0.000 description 1
- 102000003812 Interleukin-15 Human genes 0.000 description 1
- 108090000172 Interleukin-15 Proteins 0.000 description 1
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 1
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 1
- 102000004388 Interleukin-4 Human genes 0.000 description 1
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 1
- 102000004889 Interleukin-6 Human genes 0.000 description 1
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- 208000003456 Juvenile Arthritis Diseases 0.000 description 1
- LEVWYRKDKASIDU-IMJSIDKUSA-N L-cystine Chemical compound [O-]C(=O)[C@@H]([NH3+])CSSC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LEVWYRKDKASIDU-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 241000234435 Lilium Species 0.000 description 1
- WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N Lithium Chemical compound [Li] WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000019693 Lung disease Diseases 0.000 description 1
- 102100026894 Lymphotoxin-beta Human genes 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 229920000057 Mannan Polymers 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 102000005741 Metalloproteases Human genes 0.000 description 1
- 108010006035 Metalloproteases Proteins 0.000 description 1
- 108010085220 Multiprotein Complexes Proteins 0.000 description 1
- 102000007474 Multiprotein Complexes Human genes 0.000 description 1
- 101100460719 Mus musculus Noto gene Proteins 0.000 description 1
- 201000003793 Myelodysplastic syndrome Diseases 0.000 description 1
- 206010028851 Necrosis Diseases 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 101100084627 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) pcb-4 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 208000001132 Osteoporosis Diseases 0.000 description 1
- 108010087702 Penicillinase Proteins 0.000 description 1
- 102000057297 Pepsin A Human genes 0.000 description 1
- 108090000284 Pepsin A Proteins 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 108010069341 Phosphofructokinases Proteins 0.000 description 1
- 102000001105 Phosphofructokinases Human genes 0.000 description 1
- 102000012288 Phosphopyruvate Hydratase Human genes 0.000 description 1
- 108010022181 Phosphopyruvate Hydratase Proteins 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241001505332 Polyomavirus sp. Species 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 201000001263 Psoriatic Arthritis Diseases 0.000 description 1
- 208000036824 Psoriatic arthropathy Diseases 0.000 description 1
- 108010011939 Pyruvate Decarboxylase Proteins 0.000 description 1
- 102000013009 Pyruvate Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108020005115 Pyruvate Kinase Proteins 0.000 description 1
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 1
- 102220469221 S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase TYW1B_E18A_mutation Human genes 0.000 description 1
- 208000006045 Spondylarthropathies Diseases 0.000 description 1
- 208000028911 Temporomandibular Joint disease Diseases 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N Tetramethylsqualene Natural products CC(=C)C(C)CCC(=C)C(C)CCC(C)=CCCC=C(C)CCC(C)C(=C)CCC(C)C(C)=C BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 description 1
- 102000005924 Triose-Phosphate Isomerase Human genes 0.000 description 1
- 108700015934 Triose-phosphate isomerases Proteins 0.000 description 1
- 206010067584 Type 1 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 206010046851 Uveitis Diseases 0.000 description 1
- 206010046865 Vaccinia virus infection Diseases 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010047115 Vasculitis Diseases 0.000 description 1
- 101100187345 Xenopus laevis noto gene Proteins 0.000 description 1
- 108010084455 Zeocin Proteins 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- 230000010933 acylation Effects 0.000 description 1
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 1
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000007815 allergy Effects 0.000 description 1
- 235000020224 almond Nutrition 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 1
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 1
- 230000006229 amino acid addition Effects 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 238000005349 anion exchange Methods 0.000 description 1
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 208000006673 asthma Diseases 0.000 description 1
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 229960001212 bacterial vaccine Drugs 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000005341 cation exchange Methods 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 238000013375 chromatographic separation Methods 0.000 description 1
- 238000011210 chromatographic step Methods 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 208000023819 chronic asthma Diseases 0.000 description 1
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 1
- 208000037976 chronic inflammation Diseases 0.000 description 1
- 208000037893 chronic inflammatory disorder Diseases 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 229940028617 conventional vaccine Drugs 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- 229960003067 cystine Drugs 0.000 description 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003405 delayed action preparation Substances 0.000 description 1
- 238000009795 derivation Methods 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 201000001981 dermatomyositis Diseases 0.000 description 1
- 230000001687 destabilization Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 238000001784 detoxification Methods 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- PSLWZOIUBRXAQW-UHFFFAOYSA-M dimethyl(dioctadecyl)azanium;bromide Chemical compound [Br-].CCCCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)CCCCCCCCCCCCCCCCCC PSLWZOIUBRXAQW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N dodecahydrosqualene Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002222 downregulating effect Effects 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 230000009881 electrostatic interaction Effects 0.000 description 1
- 230000002124 endocrine Effects 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 239000003344 environmental pollutant Substances 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 1
- 210000000222 eosinocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000032050 esterification Effects 0.000 description 1
- 238000005886 esterification reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 125000004030 farnesyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000035558 fertility Effects 0.000 description 1
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 1
- 238000007710 freezing Methods 0.000 description 1
- 230000008014 freezing Effects 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 229940044627 gamma-interferon Drugs 0.000 description 1
- 230000007614 genetic variation Effects 0.000 description 1
- 125000002686 geranylgeranyl group Chemical group [H]C([*])([H])/C([H])=C(C([H])([H])[H])/C([H])([H])C([H])([H])/C([H])=C(C([H])([H])[H])/C([H])([H])C([H])([H])/C([H])=C(C([H])([H])[H])/C([H])([H])C([H])([H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 1
- 230000034659 glycolysis Effects 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 102000057063 human MAPT Human genes 0.000 description 1
- 102000048412 human PCLAF Human genes 0.000 description 1
- 102000047147 human SCARA3 Human genes 0.000 description 1
- 230000028996 humoral immune response Effects 0.000 description 1
- 230000004727 humoral immunity Effects 0.000 description 1
- 235000011167 hydrochloric acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000004679 hydroxides Chemical class 0.000 description 1
- 230000007124 immune defense Effects 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000036737 immune function Effects 0.000 description 1
- 230000006054 immunological memory Effects 0.000 description 1
- 239000003022 immunostimulating agent Substances 0.000 description 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 1
- 238000009655 industrial fermentation Methods 0.000 description 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 1
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 1
- 229940117681 interleukin-12 Drugs 0.000 description 1
- 229940028885 interleukin-4 Drugs 0.000 description 1
- 229940100601 interleukin-6 Drugs 0.000 description 1
- 230000009878 intermolecular interaction Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000008863 intramolecular interaction Effects 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 208000002551 irritable bowel syndrome Diseases 0.000 description 1
- JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N isopropylamine Chemical compound CC(C)N JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000155 isotopic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 229910052745 lead Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000021633 leukocyte mediated immunity Effects 0.000 description 1
- 125000003473 lipid group Chemical group 0.000 description 1
- 229920006008 lipopolysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 230000006144 lipoylation Effects 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 239000006193 liquid solution Substances 0.000 description 1
- 239000006194 liquid suspension Substances 0.000 description 1
- 229910052744 lithium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 230000005980 lung dysfunction Effects 0.000 description 1
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 1
- 230000000527 lymphocytic effect Effects 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 description 1
- 150000002669 lysines Chemical class 0.000 description 1
- 230000002132 lysosomal effect Effects 0.000 description 1
- ZLNQQNXFFQJAID-UHFFFAOYSA-L magnesium carbonate Chemical compound [Mg+2].[O-]C([O-])=O ZLNQQNXFFQJAID-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000001095 magnesium carbonate Substances 0.000 description 1
- 229910000021 magnesium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 238000009115 maintenance therapy Methods 0.000 description 1
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 230000000873 masking effect Effects 0.000 description 1
- 229940127554 medical product Drugs 0.000 description 1
- QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N mercury Chemical compound [Hg] QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052753 mercury Inorganic materials 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000003020 moisturizing effect Effects 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229940035032 monophosphoryl lipid a Drugs 0.000 description 1
- 239000012452 mother liquor Substances 0.000 description 1
- 125000001421 myristyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- VMGAPWLDMVPYIA-HIDZBRGKSA-N n'-amino-n-iminomethanimidamide Chemical compound N\N=C\N=N VMGAPWLDMVPYIA-HIDZBRGKSA-N 0.000 description 1
- 230000017074 necrotic cell death Effects 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- MGFYIUFZLHCRTH-UHFFFAOYSA-N nitrilotriacetic acid Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CC(O)=O MGFYIUFZLHCRTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000414 obstructive effect Effects 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 1
- 239000006174 pH buffer Substances 0.000 description 1
- 125000001312 palmitoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000003076 paracrine Effects 0.000 description 1
- 238000005192 partition Methods 0.000 description 1
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 229950009506 penicillinase Drugs 0.000 description 1
- 229940111202 pepsin Drugs 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 229940023041 peptide vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000000737 periodic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001539 phagocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N phleomycin D1 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC[C@@H](N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCCCNC(N)=N)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N 0.000 description 1
- 235000011007 phosphoric acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000003016 phosphoric acids Chemical class 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 239000006187 pill Substances 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 231100000719 pollutant Toxicity 0.000 description 1
- 229920001515 polyalkylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 208000005987 polymyositis Diseases 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 230000008092 positive effect Effects 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N procaine Chemical compound CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1 MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004919 procaine Drugs 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 1
- 230000004845 protein aggregation Effects 0.000 description 1
- 239000003531 protein hydrolysate Substances 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 229940023143 protein vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000007420 reactivation Effects 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- BOLDJAUMGUJJKM-LSDHHAIUSA-N renifolin D Natural products CC(=C)[C@@H]1Cc2c(O)c(O)ccc2[C@H]1CC(=O)c3ccc(O)cc3O BOLDJAUMGUJJKM-LSDHHAIUSA-N 0.000 description 1
- 230000033458 reproduction Effects 0.000 description 1
- 208000023504 respiratory system disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- CVHZOJJKTDOEJC-UHFFFAOYSA-N saccharin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)NS(=O)(=O)C2=C1 CVHZOJJKTDOEJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 239000002195 soluble material Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 229940031439 squalene Drugs 0.000 description 1
- TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N squalene Natural products CC(=CCCC(=CCCC(=CCCC=C(/C)CCC=C(/C)CC=C(C)C)C)C)C TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 230000003335 steric effect Effects 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 208000003265 stomatitis Diseases 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 229920001059 synthetic polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- TXEYQDLBPFQVAA-UHFFFAOYSA-N tetrafluoromethane Chemical compound FC(F)(F)F TXEYQDLBPFQVAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 210000004367 thymic lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000013417 toxicology model Methods 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- 108091005703 transmembrane proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000035160 transmembrane proteins Human genes 0.000 description 1
- 238000011277 treatment modality Methods 0.000 description 1
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 1
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 150000003648 triterpenes Chemical class 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 230000003827 upregulation Effects 0.000 description 1
- 208000007089 vaccinia Diseases 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 125000002987 valine group Chemical group [H]N([H])C([H])(C(*)=O)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000002699 waste material Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/525—Tumour necrosis factor [TNF]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/54—Interleukins [IL]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/54—Interleukins [IL]
- C07K14/5409—IL-5
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/24—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
- C07K16/244—Interleukins [IL]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicinal Preparation (AREA)
Abstract
Настоящее изобретение относится к новым иммуногенным вариантам мультимерных белков, таким как иммуногенные варианты интерлейкина 5 (IL5) и фактора некроза опухолей альфа (TNF, TNF-альфа). Данные варианты помимо того, что они иммуногенны у аутологичного хозяина, также обладают большим сходством с природной 3D-структурой белков, от которых они происходят. Некоторые варианты являются мономерными имитациями мультимеров, где пептидные линкеры (инертные или содержащие Т-хелперный эпитоп) обеспечивают пространственную организацию мономерных единиц, которая способствует правильному фолдингу. Подмножество вариантов представляет собой мономерные варианты TNF-альфа, которые проявляют высокую способность объединяться в мультимер с высокой степенью структурного сходства с нативным белком. Также описаны способы лечения и продукции данных вариантов, а также фрагменты ДНК, векторы и клетки хозяина.
Description
Область изобретения
Настоящее изобретение относится к области терапевтической иммунотерапии и, в частности, к области активной иммунотерапии, направленной на отрицательную регуляцию аутологических («собственных») белков и других слабо иммуногенных антигенов. Изобретение, таким образом, относится к новым и улучшенным иммуногенным вариантам мультимерных белков, а также к необходимым инструментам для получения таких вариантов. Изобретение, кроме того, относится к способам иммунотерапии, а также к композициям, которые могут использоваться с такими способами.
Предпосылки изобретения
Применение активной иммунотерапии («вакцинации») в качестве средства лечения или ослабления заболевания в течение последних 2 десятилетий вызвало растущий интерес.
Примечательно, что применение активной иммунотерапии в качестве средства нарушения толерантности к аутологичным белкам, которые каким-то образом относятся к патологическому (и другим нежелательным) физиологическому состоянию, известно с конца семидесятых годов, когда сообщалось о первых экспериментах по вакцинам против фертильности.
Вакцины против аутологических антигенов традиционно получают путем «иммуногенизации» относящихся к проблеме собственных белков, например, путем химического связывания («конъюгации») с большим чужеродным и иммуногенным белком-носителем (ср. патент США 4161519) или получением конструкций слияния аутологичного белка и чужеродного белка-носителя (ср. \¥О 86/07 383). В таких конструкциях несущая часть иммуногенной молекулы ответственна за предоставление эпитопов для Тхелперных лимфоцитов («Тн-эпитопов»), что делает возможным нарушение аутотолерантности.
Позднейшие исследования показали, что хотя такие стратегии действительно могут обеспечить нарушение толерантности против аутологичных белков, возникает некоторое количество проблем. Наиболее важным является тот факт, что при иммунном ответе, который индуцируется с течением времени, будут доминировать антитела, направленные против несущей части иммуногена, поскольку реакционная способность против аутологичного белка часто снижен, эффект, который особенно выражен, когда носитель ранее служил в качестве иммуногена: данный феномен известен как подавление носителем (ср., например, Кайуарегита1 е1 а1. 1995., Еиг. 1. 1ттипо1. 25, 3375-3380). Однако при использовании терапевтической вакцинации обычно необходимо повторно иммунизировать несколько раз в год и поддерживать данное лечение в течение нескольких лет, и это также приводит к ситуации, где иммунный ответ против несущей части будет все больше и больше доминировать над вкладом иммунного ответа против аутологичной молекулы.
Дальнейшие проблемы, имеющие место при использовании технологии гаптен-носитель для нарушения аутотолерантности, представляют собой отрицательные стерические эффекты, оказываемые носителем на часть, относящуюся к аутологичному белку, в таких конструкциях: доля доступных Вклеточных эпитопов, которая напоминает конформационные профили, наблюдаемые в нативном аутологичном белке, часто снижена вследствие простого экранирования или маскировки эпитопов или вследствие конформационных изменений, индуцированных в собственной части иммуногена. Наконец, очень часто бывает трудно охарактеризовать молекулу гаптен-носитель достаточно подробно.
В XV О 95/05849 предоставлено усовершенствование указанных выше стратегий гаптен-носитель. Продемонстрировано, что собственные белки, куда встроен, по меньшей мере, один чужеродный Тнэпитоп, способны нарушить толерантность в отношении аутологичного белка. Внимание было сфокусировано на сохранении третичной структуры аутологичного белка, чтобы убедиться, что максимальное количество аутологичных В-клеточных эпитопов будет сохранено в иммуногене, несмотря на введение чужеродного Тн-элемента. Данная стратегия в общем показала себя как исключительно успешная в том, что индуцированные антитела составляли широкий спектр, а также характеризовались высоким сродством, и в том, что иммунный ответ имел раннее начало и более высокий титр по сравнению с тем, что наблюдался при иммунизации традиционной несущей конструкцией.
В \УО 00/20027 предоставлено развитие указанного выше принципа.
Обнаружено, что введение единичных Тн-эпитопов в кодирующую последовательность собственных белков может индуцировать цитотоксические Т-лимфоциты (СТЬ), которые специфично взаимодействуют с клетками, экспрессирующими собственный белок. Технология по \¥О 00/20027 также предоставляет комбинированное лечение, где индуцируются антитела и СТЬ: в данных осуществлениях еще требуется, чтобы иммуногены сохраняли существенную часть В-клеточных эпитопов.
В \УО 95/05849 и XVО 98/46642 описана вакцинная технология, которая подходит для отрицательной регуляции активности ΤΝΕα: (фактор некроза опухоли α), цитокина, вовлеченного в патологию некоторых заболеваний, таких как диабет I типа, ревматоидный артрит и воспалительные заболевания кишечника. В обоих описаниях раскрыто сохранение третичной структуры мономерного ΊΝΕα при встрече данной молекулы с иммунной системой.
VО 00/65058 относится к отрицательной регуляции интерлейкина 5 (1Ь5), молекулы, участвующей в активации действия эозинофильных гранулоцитов, значимой в патогенезе некоторого количества заболеваний дыхательных путей, таких как хроническая астма. Описано, что отрицательная регуляция может
- 1 007810 осуществляться посредством технологии вакцинации полипептидами, живых вакцин и технологии вакцинации нуклеиновыми кислотами, и, кроме того, описано, что сохранение В-клеточных эпитопов значимо при индукции иммунного ответа против 1Ь5.
Даже несмотря на то, что описанные выше технологии предоставляли весьма многообещающие результаты, имеются некоторые факторы, которые могут вступить в действие при достижении жизнеспособности вакцинного подхода для преодолении заболевания. Одним из данных факторов является уровень экспрессии иммуногенного белка.
Например, для того, чтобы вакцина с нуклеиновой кислотой была функциональной, клетки, трансфицированные ίη νινο конструкцией, кодирующей «иммуногенизированный» аутологичный белок, должны быть способны к экспрессии иммуногена в достаточных количествах для индукции подходящего иммунного ответа. Также основанные на полипептидах вакцины требуют, чтобы иммуногенный белок мог продуцироваться в удовлетворительных количествах по способу промышленной ферментации. Однако часто наблюдается, что даже небольшие изменения аминокислотной последовательности известного белка могут оказывать драматическое действие на количество белка, которое может быть получено.
Далее, стабильность генетически модифицированных белковых последовательностей может также быть меньшей, чем оптимальная (как в плане срока хранения, так и в плане стабильности ίη νινο).
Наконец, когда собственный белок, который требуется подвергнуть отрицательной регуляции, представляет собой гетерополимер или гомополимер, не обязательно происходит так, что вариант мономерной единицы данного белка способен индуцировать антитела, которые достаточно специфичны в отношении нативной конформации полимерного белка.
Цель изобретения
Целью изобретения является предоставление улучшенных иммуногенных аналогов полимерных аутологичных белков, а также предоставление улучшенных способов индукции гуморального иммунитета против таких полимерных аутологичных белков. Дальнейшей целью является предоставление иммуногенных аналогов собственных белков, которые обладают улучшенной стабильностью и проявляют улучшенные характеристики при экспрессии в гетерологичных клетках хозяина. Наконец, целью изобретения также является предоставление способов и мер, которые могут использоваться при получении или использовании улучшенных иммуногенов.
Сущность изобретения
При продукции крупномасштабных количеств рекомбинантного белка в бактериальных клетках хозяина часто требуется, чтобы продукт экспрессии стал доступным в виде телец включения внутри бактерий. Причин этого несколько: например, выходы экспрессии обычно заметно выше, если белок экспрессирован в виде нерастворимых телец включения, и очистка белка также облегчена, поскольку требуемый продукт экспрессии легко и удобно отделяется от растворимого белка из бактериальной ферментации.
При экспрессии рекомбинантного белка в качестве нерастворимых телец включения, часто бывает необходимым подвергать продукт экспрессии различным способам рефолдинга белка для получения его в биологически активной форме, но это обычно приемлемо даже несмотря на то, что такая стадия приводит к некоторой потере общего рекомбинантного белка, который никогда не свертывается в правильную биологически активную форму.
Однако при продукции рекомбинантных иммуногенных вариантов неиммуногенных собственных белков необходимо вводить Тн-эпитопы и таким образом первичная структура белкового продукта становится измененной по сравнению с нативным собственным белком. Авторами настоящего изобретения выяснено, что даже слабейшие из изменений делают традиционный подход экспрессии в тельцах включения с последующим рефолдингом непрактичным: после рефолдинга выходы белка, который сохранил удовлетворительную долю В-клеточных эпитопов по сравнению с нативным собственным белком, часто очень малы, и данная проблема возрастает со сложностью рассматриваемого белка.
В настоящее время обнаружено, что конструирование и воздействие на экспрессию белковых конструкций, которые продуцируются в бактериях в виде растворимого белка, является лучшим способом получения иммуногенных вариантов собственных белков: даже несмотря на то, что последующие стадии очистки становятся более сложными, поскольку нужно удалить другие растворимые белки, конечный очищенный и верно свернутый продукт получают со значительно более высоким выходом по сравнению с традиционным подходом, указанным выше. И, что очень важно, очищенные белки, полученные экспрессией такого типа, проявляют невиданную до сих пор способность сохранять В-клеточные эпитопы нативного собственного белка, из которого они происходят.
Коротко, по настоящему изобретению экспрессия растворимых вариантов белков является превосходным критерием отбора при начальном отборе иммуногенных вариантов собственного белка, которые подходят для целей вакцинации.
Для достижения цели экспрессии растворимого белка таких иммуногенизированных собственных белков (и других белков, в первичную структуру которых были введены изменения) могут варьироваться несколько параметров: мультимерные белки, которые трудно объединить, могут продуцироваться путем стабилизации их структуры на мономерном уровне и также путем получения мономерных имитаций
- 2 007810 мультимера, и также простые мономерные белки могут стабилизироваться по указанным здесь инструкциям.
Другим важным фактором являются условия ферментации: открытия в лаборатории авторов настоящего изобретения, например, показали, что ферментация бактерий при температурах более низких, чем обычно используемые для получения высокоуровневой экспрессии, заметно способствуют продукции растворимых форм белковых вариантов.
Авторами настоящего изобретения обнаружено, что получение «мономеризованных» форм 1Ь5 и ΤΝΡα может предоставлять иммуногенные молекулы, обладающие высокой стабильностью, отличной иммуногенностью и требуемыми характеристиками продукции. В частности, выход белка является неожиданно высоким при экспрессии рекомбинантных полипептидов, составленных двумя мономерами ЫЬ5, объединенными пептидным линкером, и включающих чужеродные Т-хелперные эпитопы. Полагают, что данное открытие может применяться в общем по отношению к мультимерным белкам, четвертичная структура которых позволяет сшить их мономерные версии.
Полагают, что настоящая технология особенно подходит для получения иммуногенов для нарушения аутотолерантности в отношении аутологичных белков, поскольку введение пептидного линкера может элегантно комбинироваться с предоставлением чужеродных Т-хелперных эпитопов при сохранении в то же время 30-структуры мультимерного белка (например, сохранение обоих элементов из третичной и четвертичной структуры такого белка путем наложения исходной четвертичной структуры на новую третичную структуру в мономерном белке).
Следовательно, в одном широком аспекте изобретение относится к иммуногенному аналогу полимерного белка, где указанный полимерный белок состоит (в природе) по крайней мере из 2 мономерных единиц, которые не объединены посредством пептидной связи, где указанный аналог
a) содержит существенные фрагменты по меньшей мере 2 мономерных единиц указанного полимерного белка, где указанные существенные фрагменты объединены посредством пептидных связей через пептидный линкер,
b) содержит по меньшей мере одну аминокислотную последовательность, связывающую МНС класс II, которая гетерологична в отношении полимерного белка, и
c) может продуцироваться в виде единственного продукта экспрессии из клетки, несущей экспрессирующий вектор, кодирующий данный аналог.
Авторами настоящего изобретения также обнаружено, что некоторое количество конкретных манипуляций в аминокислотной последовательности мономерного ΤΝΡα приводит к предоставлению мономерных молекул, которые иммуногенны и способны достигать функциональной четвертичной структуры, и это означает, что данные молекулы обладают такой высокой степенью сохранения третичной структуры, что они могут спонтанно образовывать функциональные, связывающие рецептор димеры и триммеры, и также что данные мономеры продуцируются в бактериях как растворимые белки.
Некоторые из данных манипуляций, которые проведены с белком ΤΝΡα, как полагают, могут в общем использоваться для белков, из которых требуется стабилизированная третичная структура по сравнению с нативным белком.
Конкретный аспект изобретения относится к некоторому числу вариаций в структуре мономера ΤΝΡα, которые по существу не деструктивны, так что они позволяют происходить правильному фолдингу мономеров ΤΝΡα, при введении в то же время по крайней мере одной аминокислотной последовательности, связывающей МНС класса II. Например, было обнаружено, что вставка чужеродного Тнэпитопа может быть сделана в одной конкретной петлевой структуре в нативном ΤΝΡα без отрицательного влияния на характеристики экспрессии белка или на способность мономера образовывать функциональный димер или тример ΤΝΡα.
Следовательно, значимая часть изобретения относится к иммуногенному аналогу человеческого ΤΝΡα, где аналог включает в себя по меньшей мере одну чужеродную аминокислотную последовательность, связывающую МНС класса II, и, кроме того, обладает такими характеристиками, что является мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, куда в гибкую петлю 3 встроена или замещена по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность, и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, куда введен по меньшей мере один дисульфидный мостик, который стабилизирует ЗО-структуру мономера ΤΝΡα, и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, где подвержена делеции любая из аминокислот 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 и 9 на Ν-конце, и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность встроена или замещена в петлю 1 в положении интрона, и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность введена как часть области искусственного стебля на Ν-конце человеческого ΤΝΡα,
- 3 007810 и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность введена так, что она стабилизирует мономерную структуру путем увеличения гидрофобности поверхности взаимодействия тримера, и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность, фланкированная остатками глицина, встроена или замещена в аминокислотную последовательность ΤΝΡα, и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность встроена или замещена в Б-Е-петлю, и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность встроена или замещена между двумя идентичными подпоследовательностями человеческого ΤΝΡα, и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, где по меньшей мере один солевой мостик в человеческом ΤΝΡα усилен или замещен дисульфидным мостиком, и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, где растворимость и/или стабильность в плане протеолиза усилена путем введения мутаций, которые имитируют кристаллическую структуру мышиного ΤΝΡα, и/или мономером человеческого ΤΝΡα или мономеризованным аналогом ΤΝΡα по настоящему изобретению, где потенциальная токсичность снижена или отменена путем введения по меньшей мере одной точечной мутации.
В общем, было обнаружено, что все наиболее подходящие иммуногенные аналоги по изобретению представляют собой те, что являются растворимыми белками уже на стадии, на которой их продуцируют и выделяют в растворимой форме из их рекомбинантных клеток хозяина.
По изобретению далее предоставляются фрагменты нуклеиновой кислоты (такие как фрагменты ДНК), кодирующие такие иммуногенные аналоги и также векторы, содержащие такие фрагменты ДНК.
Изобретение также относится к трансформированным клеткам, подходящим для получения данных аналогов.
Изобретение, кроме того, предоставляет иммуногенные композиции, охватывающие аналоги или векторы по изобретению.
Также изобретение относится к способам лечения, где мультимерные белки подлежат отрицательной регуляции, и к лечению конкретных заболеваний, относящихся к конкретным мультимерным белкам.
Описание чертежа
На чертеже представлен экспрессирующий вектор клеток насекомых ρ2ΖΘΡ2Τ
Последовательность вектора установлена в 8ΕΟ ГБ ΝΟ: 60. Вектор содержит участок множественного клонирования (МС8) ниже промотора ОрШ2 и выше поли А-хвоста ОрШ2 (ОрШ2рА).
Маркерный ген устойчивости к зеацину АеоР) находится под контролем второго промотора ОрШ2.
Подробное описание изобретения
Определения
Далее некоторое количество терминов, используемых в настоящей спецификации и формуле изобретения определяются и подробно объясняются для выяснения пределов изобретения.
Термины «Т-лимфоцит» и «Т-клетка» используются взаимозаменяемо для лимфоцитов тимусного происхождения, которые ответственны за различные клеточно-опосредованные иммунные ответы, а также за хелперную активность при гуморальном иммунном ответе. Сходным образом, термины «Влимфоцит» и «В-клетка» используют взаимозаменяемо для продуцирующих антитело лимфоцитов.
«Полимерный белок» определяется здесь как белок, который содержит по меньшей мере две полипептидные цепи, которые не объединены конец в конец пептидной связью (термин «мультимерный белок» используется с ним взаимозаменяемо). Следовательно, полимерные белки могут являться полимерами, состоящими из нескольких полипептидов, которые собраны вместе в полимерную форму посредством дисульфидных связей и/или нековалентного связывания. Также данный термин охватывает процессированные предбелки и пробелки, которые после процессинга охватывают по меньшей мере два свободных С-конца и по меньшей мере 2 свободных Ν-конца. Наконец, данный термин охватывает временно существующие комплексы по меньшей мере между двумя полипептидами, которые могут образовать нестабильный, но при этом биологически активный молекулярный объект, который характеризуется отличающейся 3-мерной структурной.
«Иммуногенный аналог» (или «иммуногенизированный» аналог или вариант) подразумевается здесь для обозначения единичного полипептида, который охватывает существенные части информации последовательности, находящейся в полном полимерном белке. То есть, данный белковый аналог охватывает одну полипептидную цепь, в то время полимерный белок охватывает по меньшей мере 2 полипептидные цепи. Следует заметить, что аналог может представлять вариацию мономерной субъединичной структуры полимеров, но в таком случае иммуногенный аналог способен образовывать полимерные белковые комплексы, которые напоминают нативный полимер.
- 4 007810 «Мономеризованный» аналог или вариант полимерного белка в настоящем контексте представляет собой единичный полипептид, который содержит в ковалентно связанной форме через пептидную связь по меньшей мере 2 полипептидные цепи, находящиеся в полимерном белке в природе, где данные 2 полипептидные цепи не связаны пептидной связью.
«Существенный фрагмент» или мономерная единица мультимерного белка, как подразумевается, означает часть мономерного полипептида, которая составляет по меньшей мере часть мономерного полипептида, достаточную для образования домена, который свертывается, по существу, в ту же 3Όконформацию, что может иметь место в мультимерном белке.
«Полипептид 1Ь5», как подразумевается здесь, означает полипептиды, характеризующиеся аминокислотной последовательностью белков 1Ь5, происходящих от людей и других млекопитающих. Также в пределы данного термина входят негликозилированные формы 1Ь5, которые получены в прокариотической системе, как и формы, характеризующиеся варьирующими профилями гликозилирования, например, вследствие применения дрожжей и других не относящихся к млекопитающим эукариотических систем экспрессии. Следует, однако, заметить, что при использовании термина «полипептид 1Ь5» подразумевается, что указанный полипептид обычно не является иммуногенным, когда он представляется подлежащему обработке животному. Иными словами, полипептид 1Ь5 представляет собой собственный белок или ксеноаналог такого собственного белка, который обычно не дает начало иммунному ответу против 1Ь5 у указанного животного.
«Полипептид ΤΝΕα». как подразумевается здесь, означает полипептиды, характеризующиеся аминокислотной последовательностью белков ΤΝΤα, происходящих от людей и других млекопитающих. Также в пределы данного термина входят негликозилированные формы ΤΝΤα, которые получены в прокариотической системе, как и формы, характеризующиеся варьирующими профилями гликозилирования, например, вследствие применения дрожжей и других не относящихся к млекопитающим эукариотических систем экспрессии. Следует, однако, заметить, что при использовании термина «полипептид ΤΝΤα» подразумевается, что указанный полипептид обычно не является иммуногенным, когда он представляется подлежащему обработке животному. Иными словами, полипептид ΤΝΤα представляет собой собственный белок или ксеноаналог такого собственного белка, который обычно не дает начало иммунному ответу против ΤΝΤα у указанного животного.
«Аналог 1Ь5» представляет собой полипептид 1Ь5, который был подвергнут изменениям в его первичной структуре и/или ассоциирован с элементами из других видов молекул. Такое изменение может, например, быть в виде слияния полипептида 1Ь5 с подходящим партнером слияния (например, изменение в первичной структуре, задействующее исключительно С- и/или Ν-концевые добавления аминокислотных остатков), и/или оно может быть в виде вставок, и/или делеций, и/или замен в аминокислотной последовательности полипептида 1Ь5. Также данный термин охватывает дериватизированные молекулы 1Ь5, ср. с обсуждением модификаций 1Ь5, приведенным ниже.
«Аналог ΤΝΤα» представляет собой полипептид ΤΝΤα, который был подвергнут изменениям в его первичной структуре и/или ассоциирован с элементами из других видов молекул. Такое изменение может, например, быть в виде слияния полипептида ΤΝΤα с подходящим партнером слияния (например, изменение в первичной структуре, задействующее исключительно С- и/или Ν-концевые добавления аминокислотных остатков), и/или оно может быть в виде вставок, и/или делеций, и/или замен в аминокислотной последовательности полипептида ΤΝΤα. Также данный термин охватывает дериватизированные молекулы ΤΝΤα, ср. с обсуждением модификаций ΤΝΤα, приведенным ниже.
Следует понимать, что аналоги 1Ь5 и ΤΝΤα также охватывают мономерные варианты, которые содержат существенные части полных мультимерных белков 1Ь5 и ΤΝΤα.
При использовании здесь аббревиатур «1Ь5» и «ΤΝΤα» они предназначены для ссылок на аминокислотные последовательности зрелых 1Ь5 и ΤΝΤα, 1Ь5 и ΤΝΤα дикого типа (также обозначены здесь как «1Ь5т» и «IЬ5Щ», а также «ΤΝΕαιη» и «ΤΝΡανί»), соответственно. Зрелый 1Ь5 человека обозначен как ЫЬ5, ЫЬ5т или ЫЬ5^1, а мышиный зрелый 1Ь5 обозначен т1Ь5, т1Ь5т или т1Ь5^1, и сходный порядок используется для ΤΝΤα. В случаях, где ДНК-конструкция содержит информацию, кодирующую лидерную последовательность или другой материал, это обычно ясно из контекста.
Термин «полипептид» в настоящем контексте, как подразумевается, означает короткие пептиды от 2 до 10 аминокислотных остатков, олигопептиды от 11 до 100 аминокислотных остатков, или полипептиды длиной более 100 аминокислотных остатков. Более того, данный термин также, как подразумевается, охватывает белки, т.е. функциональные биомолекулы, включающие в себя по меньшей мере один полипептид; когда они включают в себя по меньшей мере два полипептида, они могут образовывать комплексы, быть ковалентно связанными, или могут не быть ковалентно связанными.
Полипептид(-ы) в белке могут быть гликозилированными и/или липоилированными, и/или могут содержать простетические группы.
Термин «подпоследовательность» означает любой последовательный участок по меньшей мере из 3 аминокислот, или, когда это существенно, по меньшей мере из 3 нуклеотидов, происходящих непосред
- 5 007810 ственно из встречающихся в природе аминокислотных последовательностей или последовательностей нуклеиновой кислоты 1Ь5, соответственно.
Термин «животное» в настоящем контексте, как подразумевается, означает вид животного (преимущественно, млекопитающего), такой как Ното 8ар1еи8, Сате йотезйсив, и т.д., и не просто одно конкретное животное. Однако данный термин также означает популяцию животных такого вида, поскольку важно, чтобы субъекты, иммунизированные по способу изобретения все несли примерно один и тот же 1Ь5, что позволяет иммунизировать данных животных одним(-и) и тем(-и) же иммуногеном (-ами). Если, например, генетические варианты 1Ь5 или ΤΝΡα существуют в разных популяциях людей, может оказаться необходимым применять различные иммуногены в данных различных популяциях, чтобы смочь преодолеть аутотолерантность в отношении 1Ь5 и ΤΝΕα, соответственно, в каждой популяции. Специалисту ясно, что животное в настоящем контексте представляет собой живое существо, которое имеет иммунную систему. Предпочтительно, что животное является позвоночным, таким как млекопитающее.
Под термином «отрицательная регуляция» здесь понимают снижение биологической активности мультимерного белка (например, путем препятствия взаимодействию между мультимерным белком и биологически значимыми партнерами связывания с данной молекулой). Отрицательная регуляция может достигаться посредством различных механизмов; среди них наиболее простым является простое препятствие для активного участка мультимерного белка за счет связывания антитела. Однако в объем данного изобретения также входит то, что связывание антитела приводит к удалению мультимерного белка клетками захвата (такими как макрофаги или другие фагоцитарные клетки).
Выражение «эффективное представление ... иммунной системе», как подразумевается, означает, что иммунная система животного подвергается иммуногенной стимуляции контролируемым образом.
Как будет указано ниже в описании, такая стимуляция иммунной системы может осуществляться несколькими путями, наиболее значимым из которых являются вакцинация полипептидом, содержащим «фармакцины» (т.е., вакцину, которую вводят для лечения или подавления текущего заболевания) или вакцинация «фармакциной» на основе нуклеиновой кислоты. Важным результатом, которого нужно достигнуть, является контроль иммунокомпетентных клеток антигеном иммунологически эффективным образом, в то время как конкретный способ достижения данного результата менее важен для идеи изобретения, лежащей в основе настоящего изобретения.
Термин «иммунологически эффективное количество» характеризуется значением, обычно принятым в данной области, т.е. это количество иммуногена, способное индуцировать иммунный ответ, который значительно затронет патологические агенты, обладающие иммунологическими характеристиками данного иммуногена.
При использовании выражения, что 1Ь5, ΤΝΕα или другой собственный белок был «модифицирован», здесь подразумевается химическая модификация полипептида, который составляет остов собственного белка. Такая модификация может, например, представлять собой дериватизацию (например, алкилирование, ацилирование, эстерификацию и т.д.) конкретных аминокислотных остатков в аминокислотной последовательности, но как понятно из следующего ниже описания, предпочтительные модификации охватывают изменения первичной структуры аминокислотной последовательности (или добавления к ней).
При обсуждении «аутотолерантности в отношении аутологичного белка» понимают, что поскольку относящийся к проблеме мультимерный белок представляет собой собственный белок в подлежащей вакцинации популяции, нормальные субъекты в популяции не развивают иммунного ответа против него; нельзя, однако, исключать, что некоторые редкие субъекты в популяции животных могут продуцировать антитела против нативного мультимера, например, как часть аутоиммунного нарушения. Во всяком случае, вид животного в норме является аутотолерантным только в отношении своего собственного мультимера, но нельзя исключать того, что аналоги, происходящие из других видов животных или из популяции, имеющей отличный фенотип, также будут вызывать толерантность у указанного животного.
«Чужеродный Т-клеточный эпитоп» (или: «чужеродный Т-лимфоцитарный эпитоп») представляет собой пептид, который способен связываться с молекулой МНС и который стимулирует Т-клетки у видов животных, поэтому вводят альтернативный термин. Предпочтительные Т-клеточные эпитопы по изобретению являются «общими» эпитопами (или «универсальными» или «широкого интервала действия»), т.е. эпитопами, которые связываются с существенной долей конкретного класса молекул МНС у вида или популяции животных. Известно лишь очень ограниченное число таких «общих» Т-клеточных эпитопов, и они подробно обсуждаются ниже. Следует заметить, что чтобы иммуногены, которые используют по настоящему изобретению, были эффективными как можно в большей доле популяции животных, может быть необходимым 1) встроить несколько чужеродных Т-клеточных эпитопов в тот же самый аналог или 2) получить несколько аналогов, где каждый аналог имеет встроенный особый общий эпитоп. Также следует отметить, что концепция чужеродных Т-клеточных эпитопов также охватывает применение скрытых Т-клеточных эпитопов, т. е. эпитопов, которые происходят из собственного белка и которые проявляют иммуногенные свойства только когда существуют в выделенной форме, не являясь частью указанного собственного белка.
- 6 007810 «Чужеродный Т-хелперный лимфоцитарный эпитоп» (чужеродный Тн-эпитоп) представляет собой Т-клеточный эпитоп, который связывается с молекулой МНС класса II, и может представляться на поверхности антигенпредставляющей клетки (АРС), связанной с молекулой МНС класса II.
Связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность, которая гетрологична мультимерному белку», таким образом, представляет собой связывающий МНС класса II пептид, который не существует в указанном мультимерном белке. Такой пептид, если он также действительно чужероден в отношении вида животного, несущего мультимерный белок, представляет собой чужеродный Тн-эпитоп.
«Функциональная часть» (био)молекулы в настоящем контексте, как подразумевается, означает часть молекулы, ответственную по меньшей мере за один из биохимических или физиологических эффектов, проявляемых данной молекулой. В данной области хорошо известно, что многие ферменты и другие эффекторные молекулы содержат активный участок, ответственный за эффекты, проявляемые указанной молекулой. Другие части данной молекулы могут служить для цели увеличения стабильности или растворимости и поэтому могут оставаться вне внимания, если данные цели не относятся к контексту конкретного осуществления настоящего изобретения. Однако по настоящему изобретению предпочтительно задействовать как можно большую часть полимерной молекулы, поскольку при использовании описанных здесь мономеров фактически демонстрировалась повышенная стабильность.
Термин «адъювант» характеризуется своим обычным значением в области вакцинной технологии, т.е. это вещество или композиция материалов, которая 1) сама по себе не способна вызвать специфический иммунный ответ против иммуногена вакцины, но который 2) тем не менее способен усиливать иммунный ответ против иммуногена. Или, иными словами, вакцинация одним адъювантом не обеспечивает иммунный ответ против иммуногена, вакцинация иммуногеном может дать или не дать начало иммунному ответу против иммуногена, но комбинация вакцинации иммуногеном и адъювантом индуцирует иммунный ответ против иммуногена, который является более сильным, чем ответ, индуцированный одним иммуногеном.
«Нацеливание молекулы» в настоящем контексте, как подразумевается, обозначает ситуацию, в которой молекула после введения животному преимущественно обнаруживается в конкретной(-ых) ткани(-ях) или предпочтительно ассоциирована с конкретными клетками или клеточными типами. Данный эффект может осуществляться некоторым количеством путей, включая составление молекулы в композицию, облегчающую нацеливание или введение в молекулу групп, которые способствуют нацеливанию. Данные варианты будут обсуждаться подробно ниже.
«Стимуляция иммунной системы» означает, что вещество или композиция материалов проявляет общий, неспецифический иммуностимулирующий эффект. Некоторое количество адъювантов и предполагаемых адъювантов (таких как некоторые цитокины) наделены способностью стимулировать иммунную систему. Результатом применения иммуностимулирующих средств является повышенная «боевая готовность» иммунной системы, и это означает, что одновременная или последовательная иммунизация иммуногеном индуцирует существенно более эффективный иммунный ответ по сравнению с отдельным использованием данного иммуногена.
Характеристика иммуногенных аналогов по изобретению
Полимерные белки, являющиеся мишенями описанных здесь стратегий, могут представлять собой как гомополимеры, так и гетерополимеры. Как будет ясно из примеров, наиболее важной чертой первого аспекта изобретения является то, что интересующий полимерный белок может «мономеризироваться» без введения существенных изменений в трехмерную структуру мультимерного белка. Следовательно, конкретная функция мультимерного белка не важна для сущности настоящего изобретения - только структурные характеристики белка влияют на решение, является ли он подходящим кандидатом для применения настоящего подхода по первому аспекту изобретения. Например, если Ν-конец одного из мономеров в мультимерном белке характеризуется пространственной близостью к С-концу другого мономера в мультимере, связывание данных двух конкретных мономеров через пептидную связь может осуществляться без введения существенных изменений относительно структуры нативного мультимерного белка. Если, с другой стороны, концы далеко разнесены, для воплощения настоящего изобретения требуется, чтобы большая часть по меньшей мере одного из мономеров не имела отношения в плане иммуногенных целей изобретения или чтобы связывание между мономерными субъединицами могло выполняться длинным линкерным пептидом без оказания отрицательного воздействия на иммуногенные характеристики белка.
Во втором аспекте изобретения «иммуногенизацию» мономерной единицы собственного белка проводят таким образом, что полученный в результате вариант мономера еще способен образовывать часть полимерного белка, который обладает четвертичной структурой нативного полимерного собственного белка.
Предпочтительно, если иммуногенный аналог по изобретению экспонирует в существенных фрагментах существенную долю В-клеточных эпитопов, находящихся в соответствующих мономерах, которые являются частью полимерного белка. Существенная доля В-клеточных эпитопов, как подразумевается здесь, означает долю В-клеточных эпитопов, которые антигенно характеризуют мультимерный белок по сравнению с другими белками. Предпочтительно, чтобы существенные фрагменты экспонировали
- 7 007810 по существу все В-клеточные эпитопы, находящиеся в соответствующих мономерах, когда данные фрагменты являются частью полимерного белка; конечно, может быть необходимо введение малых изменений в последовательность мономера. Например, аминокислотная последовательность, происходящая из мономерной единицы может модифицироваться посредством вставки, замены, делеции или добавления так, чтобы снизить токсичность аналога по сравнению с мультимерным белком и/или ввести связывающую МНС класса II последовательность аминокислоты, если нежелательно, чтоб данная последовательность располагалась в линкере.
Особенно предпочтительное осуществление относится к иммуногенному аналогу по изобретению, где каждая из существенных долей содержит по существу полную аминокислотную последовательность каждой мономерной единицы, или в качестве непрерывной последовательности, или в виде последовательности, содержащей вставки. То есть, только несущественные части последовательности мономерных единиц теряются из аналога, например, в случаях, когда последовательность не вносит вклад в третичную структуру мономерной единицы или в четвертичную структуру мультимерного белка. Однако данное осуществление позволяет провести замену или вставку в мономер, покуда сохраняется ЗО-структура мультимерного белка. Следовательно, особенно предпочтительно, если иммуногенный аналог является таким, что в нем представлены аминокислотные последовательности всех мономерных единиц полимерных белков, и особенно предпочтительным является, если аналог охватывает полные аминокислотные последовательности (всех) мономеров, составляющих полимерный белок, будь то неизмененные последовательности или последовательности, содержащие вставки.
Таким образом, как оказывается, предпочтительным является, чтобы 3-мерная структура полного полимерного белка, по существу, сохранялась в аналоге.
Демонстрация сохранения существенной доли В-клеточных эпитопов или даже 3-мерной структуры мультимерного белка, которая подвергается описанной здесь модификации, может достигаться различными путями. Одним из них является простое получение поликлональной антисыворотки, направленной против мультимера (например, антисыворотки, полученной от кролика) и последующее применение данной антисыворотки в качестве тестового реагента (например, в конкурентном ЕЬ1§Л) против продуцированных модифицированных белков. Модифицированные версии (аналоги), которые взаимодействуют с антисывороткой в той же степени, как это делает мультимер, следует считать имеющими ту же 3Όструктуру, что и мультимер, в то время как аналоги, проявляющие ограниченную (но, тем не менее, значимую и специфичную) реакционноспособность с такой сывороткой, как полагают, сохраняют существенную долю изначальных В-клеточных эпитопов.
Альтернативно, может осуществляться отбор моноклональных антител, способных реагировать с различными эпитопами на мультимере, и они могут использоваться в качестве панели для тестирования. Данный подход имеет преимущество в том, что он предоставляет 1) картирование эпитопов мультимера и 2) картирование эпитопов, которые остаются на полученных аналогах.
Конечно, третьим подходом является разрешение 3-мерной структуры мультимера (ср. выше) и ее сравнение с разрешенной трехмерной структурой полученных аналогов. Трехмерная структура может быть разрешена с помощью исследований дифракции рентгеновского излучения и ЯМР-спектроскопии. Дальнейшая информация, касающаяся третичной структуры, может до некоторой степени быть получена из исследований кругового дихроизма, которые имеют то преимущество, что полипептид требуется лишь в чистом виде (в то время как дифракция рентгеновского излучения требует предоставления кристаллизованного полипептида, а ЯМР требует предоставления изотопных вариантов полипептида) для получения полезной информации о третичной структуре данной молекулы. Однако для получения решающих данных окончательно необходимы дифракция рентгеновского излучения и ЯМР, поскольку круговой дихроизм может предоставить только непрямые доказательства правильной 3-мерной структуры посредством информации об элементах вторичной структуры.
Иммуногенный аналог по изобретению может содержать пептидный линкер, который вводит или участвует в образовании в аналоге по меньшей мере одной связывающей МНС класса II аминокислотной последовательности, которая гетерологична в отношении мультимерного белка. Это, в частности, может использоваться в тех случаях, когда не требуется изменение аминокислотной последовательности, соответствующей мономерным единицам мультимерного белка. Альтернативно, пептидный линкер может быть лишенным связывающей МНС класса II аминокислотной последовательности и не участвовать в ее образовании в животных вида, из которого происходит мультимерный белок; это обычно может делаться в случаях, когда необходимо использовать очень короткий линкер или где предпочтительным является, например, сделать потенциально токсичный аналог нетоксичным путем введения связывающего МНС класса II элемента в активный участок. Оба данные осуществления могут комбинироваться с введением точечных мутаций, которые детоксицируют молекулу, если это необходимо.
Предпочтительно, чтобы связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность связывала большую часть молекул МНС класса II из видов животных, откуда происходит мультимерный белок, т.е. связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность была универсальной или общей.
- 8 007810
Также, конечно, важно, чтобы данная последовательность служила своей цели как Т-клеточный эпитоп в видах, для которых иммуноген предназначен в качестве составляющего компонента вакцин. Существует некоторое количество встречающихся в природе «общих» Т-клеточных эпитопов, которые активны в большой доле субъектов вида животных или популяции животных, и их предпочтительно вводят в состав вакцины, снижая таким образом необходимость в очень большом количестве различных аналогов той же вакцины. Следовательно по меньшей мере одну связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность предпочтительно выбирают из природных Т-клеточных эпитопов и искусственных связывающих МНС класса II аминокислотных последовательностей. Особенно предпочтительными последовательностями являются природные Т-клеточные эпитопы, выбранные из эпитопов столбнячного анатоксина, таких как Р2 (8ЕО Ю N0: 3) или Р30 (8Е0 Ю N0 : 5), эпитопа дифтерийного анатоксина, эпитопа гемагглютинина вируса гриппа и эпитопа С8 Р. £а1с1рагит.
В течение лет идентифицировано некоторое количество других общих Т-клеточных эпитопов. Особенно пептиды, способные связывать большую часть молекул НЬЛ-ОК, кодируемых различными аллелями НЬЛ-ΌΚ, идентифицировали, и они представляют собой все возможные Т-клеточные эпитопы, подлежащие введению в аналоги, используемые по настоящему изобретению. Ср. также эпитопы, обсуждаемые в следующих ссылках, которые все включены сюда в качестве ссылки: \У0 98/23635 (Егахсг ГН. с1 а1., переуступлено ТНе Ишуегайу о£ ОнеепЧапб); 8ои!йтеооб 8 с1. а1, 1998, 1. Iттиηο1. 160: 3363-3373 81шдад11а Е. е! а1., 1988, №11игс 336: 778-780; С1исх К.М. е! а1., 1993, 1. Ехр. Меб 178: 27-47 ; Наттег 1. е! а1., 1993, Се11 74: 197-203; апб Еа1к К. е! а1., 1994, [ттиподепебсх 39: 230-242. Последняя ссылка также относится к лигандам НЕА-ΌΟ и -ЭР. Все эпитопы, перечисленные в данных 5 ссылках, рассматриваются природные эпитопы-кандидаты, подлежащие применению по настоящему изобретению, как и эпитопы, которые характеризуются общими мотивами с указанными эпитопами.
Альтернативно, эпитоп может представлять собой любой искусственный Т-клеточный эпитоп, который способен связывать большую часть молекул МНС класса II. В данном контексте пептиды-пан-ИК.эпитопы («РАИКЕ») , описанные в \У0 95/07707 и в соответствующей статье А1ехапбег 1 е! а1., 1994, Ептиийу 1: 751-761 (оба описания включены сюда в качестве ссылки), представляют собой интересные кандидаты в эпитопы, подлежащие применению по настоящему изобретению. Следует заметить, что наиболее эффективные пептиды РАИКЕ, описанные в данных работах, несут Ό-аминокислоты на С- и Νконцах для улучшения стабильности при введении. Однако настоящее изобретение первично относится к введению относящихся к проблеме эпитопов в качестве части аналога, который затем должен быть расщеплен ферментативно внутри лизосомального компартмента АРС для обеспечения последующей презентации в контексте молекулы МНС-П, и поэтому нецелесообразно включать Ό-аминокислоты в состав эпитопов, используемых по настоящему изобретению.
Одним из особо предпочтительных пептидов РАОКЕ является тот, что характеризуется аминокислотной последовательностью АКЕУАА^ТЬКААА (8Е0 ΣΌ N0: 7) или ее иммунологически активной подпоследовательностью. Этот и другие эпитопы, обладающие сходным отсутствием рестрикции МНС, являются предпочтительными Т-клеточными эпитопами, которые должны быть представлены в аналогах, применяемых в способе по изобретению. Такие сверхобщие эпитопы обеспечивают наиболее простые осуществления изобретения, где лишь один модифицированный ГЕ5 представляется иммунной системе вакцинированного животного.
Предпочтительные осуществления изобретения охватывают модификацию путем введения по меньшей мере одного чужеродного иммунодоминантного Тн-эпитопа.
Понятно, что проблема иммунодоминантности Тн-эпитопа зависит от интересующего вида животного. Используемый здесь термин «иммунодоминантность» просто относится к эпитопам, которые вызывают значимый иммунный ответ у вакцинированного субъекта, но хорошо известным фактом является то, что Тн-эпитоп, иммунодоминантный у одного субъекта, не обязательно является иммунодоминантным у другого субъекта того же вида, даже хотя он может связывать молекулы МНС-П у последнего субъекта.
Как указано выше, введение чужеродного Т-клеточного эпитопа может осуществляться путем введения вставки, добавления, делеции или замены по меньшей мере одной аминокислоты. Конечно, обычной ситуацией является введение более одного изменения аминокислотной последовательности (например, вставка целого Т-клеточного эпитопа или замена на него), но важная цель для достижения состоит в том, чтобы аналог после процессинга антигенпредставляющей клеткой (АРС), вызывал представление такого Т-клеточного эпитопа в связи с молекулой МНС класса II на поверхности АРС. Так, если аминокислотная последовательность мономерной единицы в подходящей позиции содержит некоторое количество аминокислотных остатков, которые также могут находиться в чужеродном Тн-эпитопе, то введение чужеродного Тн-эпитопа может осуществляться путем предоставления оставшихся аминокислот чужеродного эпитопа посредством вставки, добавления, делеции или замены аминокислот. Иными словами, не является необходимым введение полного Тн-эпитопа путем вставки или замены.
По настоящему изобретению аналог также может образовывать часть более крупной молекулы, с которой он связан по меньшей мере одним функциональным радикалом, наличие которого не имеет отрицательного воздействия в значительной степени на доступность аналога для антитела. По природе та
- 9 007810 кие радикалы (которые могут быть слиты с аналогом) могут предназначаться для нацеливания модифицированной молекулы на антигенпредставляющую клетку (АРС) или В-лимфоцит, для стимуляции иммунной системы и для оптимизации представления иммунной системе данного аналога.
Радикалы нацеливания обычно выбирают из группы, состоящей, по существу, из специфичного связывающего партнера для специфичного поверхностного антигена В-лимфоцита или для специфичного поверхностного антигена АРС, такого как гаптен или углевод, для которых имеется рецептор на Влимфоците или АРС. Иммуностимулирующие радикалы могут быть выбраны из группы, состоящей из цитокина, гормона и белка теплового шока.
Радикал, оптимизирующий представление, может быть выбран из группы, состоящей из группы липида, такого как пальмитоильная группа, миристильная группа, фарнезильная группа, геранилгеранильная группа, СР1-якоря и Ν-ацилдиглицеридной группы.
Подходящий цитокин представляет собой интерферон у (ΙΡΝ-γ), Р113И, интерлейкин 1 (1Ь-1), интерлейкин 2 (1Ь-2), интерлейкин 4 (1Б-4), интерлейкин 6 (1Ь-6), интерлейкин 12 (1Ь-12), интерлейкин 13 (1Ь13), интерлейкин 15 (1Ь-15) и гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (СМС8Р) или эффективную часть любого из них.
Предпочтительный белок теплового шока представляет собой Н8Р70, Н8Р90, Н8С70, СКР94 и кальретикулин (СК.Т), или эффективную часть любого из них.
Предпочтительно, чтобы количество вставок, делеций, замен или добавлений аминокислот составляло по меньшей мере, 2, например 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21 и 25 вставок, замен, добавлений или делеций.
Более того, предпочтительно, чтобы количество аминокислот вставок, замен, добавлений или делеций не превышало 150, например, максимум 100, максимум 90, максимум 80 и максимум 70. Особенно предпочтительно, чтобы количество аминокислот замен, вставок, делеций или добавлений не превышало 60, и, в частности, чтобы данное количество не превышало 50 или даже 40. Наиболее предпочтительное количество составляет не более 30. Относительно аминокислот добавлений следует заметить, что при том, что полученная в результате конструкция находится в виде полипептида слияния, их количество часто заметно превышает 150.
Предпочтительные осуществления изобретения охватывают модификации путем введения по крайней мере одного чужеродного иммунодоминантного Тн-эпитопа (= «чужеродной связывающей МНС класса II аминокислотной последовательности»). Следует понимать, что вопрос иммунодоминантности Тн-эпитопа зависит от интересующего вида животного. Используемый здесь термин «иммунодоминантность» просто относится к эпитопам, которые у вакцинированного субъекта вызывают значимый иммунный ответ, но хорошо известным фактом является то, что Тн-эпитоп, иммунодоминантный у одного субъекта, не обязательно является иммунодоминантным у другого субъекта того же вида, даже хотя он может связывать молекулы МНС-ΙΙ у последнего субъекта.
Другим значимым моментом является явление рестрикции Тн-эпитопов по МНС. В общем встречающиеся в природе Тн-эпитопы рестрицированы по МНС, т.е. конкретный пептид, составляющий Тнэпитоп эффективно связывается лишь с подмножеством молекул МНС класса II. Это, в свою очередь, обладает тем эффектом, что в большинстве случаев применение одного конкретного Тн-эпитопа приводит к получению вакцинного компонента, эффективного только у части популяции, и в зависимости от размера данной части может быть необходимым вводить больше Тн-эпитопов в одну и ту же молекулу, или, альтернативно получать многокомпонентную вакцину, где компоненты представляют собой варианты, которые отличаются друг от друга по природе вводимых Тн-эпитопов.
Если рестрикция используемых Т-клеток по МНС вообще неизвестна (например, в ситуации, в которой вакцинируемое животное характеризуется малоизученным набором МНС), часть популяции животных, покрываемая конкретной вакцинной композицией, может определяться посредством следующей формулы:
п ίоори1Моп 1 1 О Ρί) (II) ί«1 где Ρι представляет собой частоту в популяции особей, отвечающих на ί-тый чужеродный Т-клеточный эпитоп, представленный в вакцинной композиции, и η представляет собой общее число чужеродных Тклеточных эпитопов в вакцинной композиции. Так, вакцинная композиция, содержащая 3 чужеродных Т-клеточных эпитопа, характеризующихся частотами ответа в популяции, составляющими 0,8, 0,7, и 0,6, соответственно, будет давать 1-0,2x0,3x0,4=0,976 т.е., 97,6% популяции по статистике будут развивать опосредованный МНС-П ответ на данную вакцину.
Указанная выше формула не применима в ситуациях, где для используемых пептидов известен более или менее точный профиль рестрикции по МНС. Если, например, конкретный пептид связывает только с человеческими молекулами МНС-П, кодируемыми аллелями НЬА-ОК ΌΚ.1, ΌΚ.3, ΌΚ.5 и ΌΚ.7, то применение данного пептида вместе с другим пептидом, который связывает остальные молекулы МНСII, кодируемые аллелями НЬА-ОК, будет обеспечиваться 100%-ное перекрывание интересующей популяции. Сходным образом, если второй пептид связывается только с ΌΚ.3 и ΌΚ.5, добавление данного пеп
- 10 007810 тида не увеличит покрытия вовсе. Если основывать расчет ответа популяции исключительно на рестрикции МНС Т-клеточных эпитопов в вакцине, часть популяции, покрываемая конкретной вакцинной композицией, может определяться посредством следующей формулы:
з /ρορηίαύοη ~<Р^2 (III) >1 где ф] представляет собой сумму частот в популяции аллельных гаплотипов, кодирующих молекулы МНС, которые связывают любой из Т-клеточных эпитопов в вакцине и которые относятся к |-тому из 3 известных локусов НЬЛ (ΌΡ, ΌΚ и ЭО) ; практически, вначале определяют, какие молекулы МНС распознают каждый Т-клеточный эпитоп в вакцине, а после этого данные молекулы МНС перечисляют по типу (ΌΡ, ΌΚ и ОЦ); затем индивидуальные частоты различных перечисленных аллельных гаплотипов суммируют для каждого типа с получением фь ф2 и ф3.
Может произойти так, что значение р; в формуле II превышает соответствующее теоретическое значение щ:
з (IV) >1 где сумма частот в популяции аллельных гаплотипов, кодирующих молекулы МНС, которые связываются с ί-тым Т-клеточным эпитопом вакцины и которые принадлежат к утому из 3 известных локусов НЬЛ (ΌΡ, ΌΚ и ОЦ). Это означает, что 1-щ из популяции представляет собой частоту отвечающих субъектов ГгевНиа1_1 = (Ρί - щ)/(1-щ). Поэтому формула III может быть адаптирована так, что получится формула V:
/рориШ^ = 1 - П (1 ~ <Р}У + ~ П 0 - )} ( V) где число 1-£Ге8Ииа1 ί установлено на ноле, если оно отрицательное. Следует заметить, что формула V требует, чтобы все эпитопы были картированы по гаплотипу против идентичных наборов гаплотипов.
Поэтому при выборе Т-клеточных эпитопов для введения в аналог по изобретению важно получить всю доступную информацию о данных эпитопах: 1) частота субъектов в популяции, отвечающих на каждый эпитоп, 2) данные рестрикции по МНС, и 3) частота имеющих отношение к проблеме гаплотипов.
Следует заметить, что предпочтительные аналоги по изобретению содержат модификации, результатом которых является полипептид, включающий в себя участки, обладающие идентичностью по последовательности, равной по меньшей мере 70% по отношению к мономерным единицам мультимерного белка или его подпоследовательностям, составляющим в длину по меньшей мере 10 аминокислот. Предпочтительны более высокие значения идентичности, например по меньшей мере 75% или даже по меньшей мере 80% или 85%. Идентичность по последовательности для белков и нуклеиновых кислот может быть рассчитана как (Ν^ - Ντ) · 100/ΝΓε£, где Ντ представляет собой общее число неидентичных остатков в двух последовательностях при выравнивании и где Ν^ представляет собой число остатков в одной из последовательностей. Следовательно, последовательность ДНК АОТСАОТС будет обладать идентичностью по последовательности, равной 75%, в отношении последовательности ААТСААТС Щац=2 и Н-еГ=8).
Наконец, для окончательного доказательства того, что аналог по изобретению все-таки является эффективным в качестве иммуногена, могут проводиться различные тесты для предоставления необходимого подтверждения, см. также подробности, указанные в приведенных здесь примерах. В данном контексте также делается ссылка на обсуждение или идентификацию подходящих для применения аналогов ГЕ5 в МО 00/65058: данное описание может использоваться для верификации применимости аналога (происходящего из ГЕ5 или иного) относительно технологии по настоящему изобретению.
Предпочтительными мультимерами, которые могут использоваться по технологии настоящего изобретения, являются ГЕ5 и ΤΝΕα.
Основанные на ГЕ5 конструкции
Для ЫБ5 было обнаружено, что конструкции, имитирующие структуру природного димера ЫЬ5 и в то же время содержащие чужеродные Тн-элементы, предоставляют превосходные результаты по сравнению с конструкциями, основанными на мономерной структуре, например, по сравнению с конструкциями, описанными МО 00/65058, особенно когда доходит до уровней экспрессии и реакционной способности антисывороток, полученных против данных конструкций.
Предпочтительные конструкции, основанные на ГЕ5, представляют собой те, где аналог выбран из группы, состоящей из
- двух полноразмерных мономеров ГЕ5, соединенных пептидным линкером, который содержит по меньшей мере одну связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность, и
- двух полноразмерных мономеров ГЕ5, соединенных инертным пептидным линкером, из которых по меньшей мере один мономер ГЕ5 содержит гетерологичную связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность.
- 11 007810
Такой аналог может обладать линейной структурой 1Ь-Ьт-1Ь или 1Ьт-Ь1-1Ьп, или 1Ь-Ь1-1Ьт или 1Ь-Ь11Ьт или 1Ьт-Ьт-1Ьп, где «ГО» представляет собой полную аминокислотную последовательность мономерного зрелого 1Ь5, «ГОт» и «ГОп», которые могут быть идентичными или неидентичными, обозначают по существу полную аминокислотную последовательность мономерного зрелого 1Ь5, включающую в себя гетерологичную связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность, Ьт представляет собой пептидный линкер, содержащий по меньшей мере одну связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность в аналоге или вносящий в нее вклад, и «Ь1» представляет собой инертный пептидный линкер, который не содержит по меньшей мере одну связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность в аналоге и не вносит в нее вклад. Особенно предпочтительно, чтобы Ьт, ГОт и Т,, содержали эпитопы Р2 и/или Р30 столбнячного анатоксина или содержали ΡΑΌΒΕ, и Ь1 представлял собой диглициновый линкер. Однако Ь1 может представлять собой любой неиммуногенный линкерный пептид, который не образует связывающих МНС класса II последовательностей.
Наиболее предпочтительными осуществлениями являются аналоги ЫЬ5, содержащие зрелую аминокислотную последовательность, указанную в любом из 8Еф ГО N0: 9, 11, 13 и 15.
Предпосылки, связанные с ΤΝΡα
Фактор некроза опухолей (ΤΝΡ, ΤΝΤα, кахектин, ΤΝΡ8Ρ2) представляет собой мощный паракринный и эндокринный медиатор воспалительных и иммунных функций. ΤΝΤα цитотоксичен для многих клеток, особенно в комбинации с гамма-интерфероном. ΤΝΤα впервые был идентифицирован в 1975 г. и, как было продемонстрировано, инициировал некроз и регрессию опухолей. Противораковый эффект позднее исследовали подробно, но обработка им в качестве лечения злокачественных опухолей не имела успеха, хотя до сих пор проводятся испытания по лечению злокачественных опухолей с использованием ΤΝΤα. ΤΝΤα позже был открыт как причина кахексии, и было обнаружено, что ΤΝΤ проявляет свою функцию через опосредованный рецептором процесс. Идентифицировали два различных рецептора ΤΝΤα (ΤΝΡΒ55 и ΤΝΡΒ75), которые опосредуют цитотоксический и воспалительный эффекты ΤΝΡα. ΤΝΤα индуцирует и закрепляет воспалительные процессы во время хронических воспалительных заболеваний, таких как ревматоидный артрит (ВЛ) и, как предполагается, играет критическую роль при аллергиях и псориазе. Блокирование сигнала ΤΝΡα растворимыми рецепторами, рецепторспецифичными ингибиторами, отрицательной регуляцией продукции ΤΝΤα или моноклональными антителами против ΤΝΤα представляет собой привлекательные формы лечения с целью противодействия биологическим эффектам положительной регуляции и передачи сигнала ΤΝΤα.
Из результатов, полученных при лечении растворимыми рецепторами ΤΝΤα и моноклональными антителами против ΤΝΤα, очевидно, что лечение, направленное против ΤΝΤα, имеет успех при некоторых заболеваниях, таких как ВА и болезнь Крона. Антилечение, направленное против ΤΝΡα, считается безопасным и эффективным.
К настоящему времени для клинического применения одобрены два антагониста ΤΝΤα, ремикад ЦпШхтаЬ, Ссп1оеог/1о11п5оп & Ιοίιπδοπ) и энбрел (Е1апетсер1, Iттиηеx).
Ремикад представляет собой химерное мышиное-человеческое моноклональное антитело !дС1, направленное против растворимого и ассоциированного с клетками ΤΝΤα. Ремикад блокирует связывание ΤΝΡ с его эндогенным рецептором ΤΝΡα клеточной поверхности. Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (ΡΌΑ) одобрило ремикад в октябре 1998 г. для применения при умеренной до тяжелой или характеризующейся свищами болезни Крона, устойчивой к общепринятым способам лечения. Данное показание было расширено до того, что стало включать в себя дополнительное применение с метотрексатом при ревматоидном артрите, устойчивом к лечению одним метотрексатом, и с июля 2002 г. поддерживающую терапию при болезни Крона.
Энбрел представляет собой рекомбинантный белок, состоящий из внеклеточной части человеческого рецептора ΤΝΡα, слитого с Ρс-частью человеческого ЦСР Энбрел ингибирует активность ΤΝΡα, служа в качестве капкана для рецептора ΤΝΡα. ΡΌΑ одобрило энбрел для применения при ревматоидном артрите в ноябре 1998 г. Более 350000 пациентов обрабатывали данными антагонистами ΤΝΡα. Обзор клинической эффективности и информацию по безопасности данных средств получают непрерывно, и инфекции и другие связанные с иммунитетом неблагоприятные явления остаются основным вопросом для антагонистов ΤΝΡα, последняя оценка безопасности опыта, полученного после маркетинга, осуществленная ΡΌΑ и Комитетом по патентованным медицинским продуктам (СРМР), подтверждает, что способы лечения, направленные против ΤΝΡα, имеют предпочтительный и благоприятный с точки зрения риска баланс, несмотря на то, что требуются маркировочные изменения, включая изменения при серьезных инфекциях.
По сравнению с установленными способами лечения, направленными против ΤΝΡα, предложенная здесь иммунотерапия против ΤΝΡα имеет преимущества, заключающиеся в вакцинациях микрограммовыми количествами и менее частых инъекциях для поддержания высокого титра против ΤΝΡα ш νΐνο по сравнению с обширными инфузиями моноклональных антител. Позитивными следствиями являются меньший риск развития побочных эффектов и менее дорогостоящая терапия. Также полагают, что при
- 12 007810 родный ответ поликлональных антител будет действовать в качестве более эффективного отрицательного регулятора ΤΝΕα. чем другие способы лечения, направленные против ΤΝΕα..
ΤΝΕα. транслируется в виде белка-предшественника длиной 233 аминокислот и секретируется в виде тримерного трансмембранного белка типа II. который расщепляется специфичными металлопротеазами до тримерного растворимого белка. где каждая идентичная мономерная субъединица состоит из 157 аминокислот (ее аминокислотная последовательность указана в 8Еф ΙΌ N0: 17). ΤΝΕα человека не гликозилирован. в то время как ΤΝΕα мыши содержит один участок Ν-гликозилирования. Мономер ΤΝΕα характеризуется молекулярной массой 17 кДа, в то время как тример имеет теоретическую МУ. равную 52 кДа, хотя перекрестно связанный тример обладает подвижностью. соответствующей 43 кДа, в 8Ό8РАСЕ. ΤΝΕα содержит два цистеина. которые стабилизируют структуру. образуя внутримолекулярный дисульфидный мостик. Как Ν-. так и С-конец ΤΝΕα значимы для его активности.
С-конец особо чувствителен. поскольку делеция трех. двух и даже одной аминокислоты решающим образом снижает растворимость и биологическую активность. Значимой аминокислотой является Ьеи157, который образует стабилизирующий солевой мостик между двумя мономерами тримера. С другой стороны, делеция первых восьми аминокислот повышает активность в 1,5-5 раза. тогда как делеция первых девяти аминокислот сохраняет активность полноразмерного белка. ΤΝΕα является хорошо изученным белком. и идентифицированы многие внутри- и межмолекулярные взаимодействия. которые ведут к образованию тримера и связыванию рецептора.
Следовательно. в природе ΤΝΕα человека (8Еф ГО Ν0: 17) существует как димер и тример. но данная молекула в обоих случаях хорошо подходит в качестве мишени-кандидата по настоящему изобретению.
Основанные на ΤΝΕα конструкции
Предпочтительный аналог ΤΝΕα выбран из группы. состоящей из
1) двух или трех полноразмерных мономеров ΤΝΕα, объединенных конец в конец пептидным линкером. где по меньшей мере один пептидный линкер содержит по меньшей мере одну связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность. и 2) двух или трех полноразмерных мономеров ΤΝΕα. соединенных конец в конец инертным пептидным линкером. где по меньшей мере один из мономеров содержит по меньшей мере одну чужеродную связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность или по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность слита с Ν- или С-концевым мономером. необязательно посредством инертного линкера.
Особый интерес вызывают иммуногенные молекулы ΤΝΕα с высокой стабильностью. поскольку ранее авторами изобретения было обнаружено. что мономерные конструкции на основе ΤΝΕα имеют тенденцию к относительной нестабильности. ср.. например. с дискуссией. приведенной ниже.
Таким образом. данный тип конструкции имеет очень много аналогичного с описанными выше конструкциями на основе ГО5.
Продуцировали ген. кодирующий 3 субъединицы ΤΝΕα, связанные вместе эпитопами и/или инертными пептидными линкерами способом. параллельным тому. который обсуждался в связи с ГО5. Цель состояла в генерирования вариантов молекул ΤΝΕα с конформацией. максимально близкой к таковой для природного триммера ΤΝΕα. Варианты конструировали для эффективного образования нейтрализующих антител против ΤΝΕα дикого типа.
Наиболее подходящие варианты ΤΝΕα представляют собой растворимые и стабильные белки в отсутствие детергентов и других видов добавок. которые могут разрушить конформацию белка.
Путем экспрессии трех мономеров. связанных вместе в виде единственной полипептидной цепи с использованием линкеров и Тн-эпитопов, планируется получить варианты ΤΝΕα, более стабильные. нежели существующие ранее иммуногенные варианты ΤΝΕα. Это позволит сохранить структуру ΤΝΕα за счет введения необходимых Тн-эпитопов вне стабилизирующих водородных связей. солевых мостиков или дисульфидных мостиков.
Из рентгеновской кристаллической структуры ΤΝΕα видно. что первые 5 остатков Ν-конца слишком гибки. чтобы позволить определение структуры. С-конец. однако. локализован вблизи середины поверхности взаимодействия мономера и менее гибок. Расстояние между С-альфа-атомами Агд-6 и Ьеи-157 составляет 10 А. что соответствует расстоянию 3-4 аминокислотных остатков. Поэтому представляется возможным связать мономерные субъединицы вместе. но поскольку С-концы локализованы в чувствительном участке. возможно. будет предпочтительным использовать для данной связи гибкие линкеры. например. глициновые линкеры.
К настоящему времени были сконструированы пять вариантов с использованием подхода «мономеризованного триммера».
Контрольный ΤΝΕΤ0 (тример ΤΝΕα номер 0. 8Еф ГО Ν0: 22) состоит из трех мономеров. непосредственно связанных вместе 2 отдельными глициновыми линкерами (С1у С1у С1у). ΤΝΕΤ0 сконструирован так. что он так же стабилен. как тримерный белок дикого типа. Конечно. вместо указанных выше глици
- 13 007810 новых линкеров могут использоваться другие инертные гибкие линкеры, известные в области белковой химии, при этом важной характеристикой является то, что гибкий линкер не окажет неблагоприятного воздействия на способность мономеризованного белка сворачиваться в ЗИ-структуру, сходную с 3Όструктурой физиологически активного \\1ΤΝΕα.
Конструкция ΤΝΕΤ0 экспрессируется в виде растворимого белка в Е. со11, и был использован для получения типовой конструкции ΤΝΕ-Τ4 (8ЕО ΙΌ N0: 57), являющейся вариантом, куда введен связывающий МНС класса II пептид ΡΛΌΚΕ (8Е0 ΙΌ N0: 7). В данной конструкции отношение между мономерными единицами и чужеродными эпитопами составляет 1 эпитоп на 3 мономера, вместо 1 эпитопа на мономер, как в случае ранее предложенных вариантов, которые имели отношение к иммуногенизированным мономерным белкам; тот же случай для 8Е0 ΙΌ N0: 55). Данный факт потенциально оказывает положительное влияние на стабильность тримера. Результатом данного подхода является вариант ΤΝΡ02 (8Е0 ΙΌ N0: 28, ср. ниже), который представляет собой мономер ΤΝΕα с эпитопом ΡΆΌΒΕ в той же позиции, что в ΤΗΡ Т4.
Параллельно, эпитопы столбнячного анатоксина Р2 и Р30 (8Е0 ΙΌ N0: 3 и 5, соответственно) использовали в вариантах ΤΗΕΤ1 и ΤΗΕΤ2 (8Е0 ΙΌ N0: 49 и 51, соответственно), содержащих один эпитоп в каждой линкерной области, и также в ΤΗΕΤ3 (8Е0 ΙΌ N0: 59), который содержит один С-концевой эпитоп и один во второй линкерной области. Белки большей частью сворачиваются от Η-конца к Сконцу. Идея, лежащая в основе ΤΗΡ Τ3 состоит в том, что первые два Η-концевых домена, сворачиваясь будут функционировать в качестве внутренних шаперонов для третьего домена (мономера) , в состав которого будут входит эпитопы.
Обнаружено, что, в дополнение к описанной подробно выше технологии, где полимерные белки «мономеризованы», ΤΗΡα (и возможно, многие другие мультимерные белки) позволяет осуществлять продукцию мономеров, которые 1) содержат по меньшей мере одну стабилизирующую мутацию и/или 2) содержат по крайней мере одну не происходящую из ΤΗΡα связывающую МНС класса ΙΙ аминокислотную последовательность, где данные мономерные варианты ΤΗΡα способны верно сворачиваться в третичную структуру, которая впоследствии позволит образоваться димерным или тримерным белкам ΤΗΡα, обладающим верной четвертичной структурой (что подтверждается тем, что они имеют активность по связыванию рецептора). Следовательно, в данных конструкциях возможно получать варианты мономерного ΤΗΡα, которые не обязательно необходимо продуцировать в виде мономеризованных тримеров, поскольку изменения, введенные в последовательности мономеров, вносят столь ограниченное нарушение третичной структуры мономера, что может образовываться ди- или тример. В соответствии с идеями, лежащими в основе настоящего изобретения далее было обнаружено, что все такие варианты могут экспрессироваться в виде растворимых белков в бактериальных клетках.
Следовательно, возможно получить иммуногенные варианты ΤΗΡα по следующим стратегиям, которые могут комбинироваться и которые могут далее комбинироваться с уже обсуждавшимся «подходом мономеризации» по изобретению (если данные конкретные модификации все являются по природе не деструктивными).
Стратегия гибкой петли
Авторами настоящего изобретения было обнаружено, что вставка эпитопа РАЭВЕ (8Е0 ΙΌ N0: 7) в петлю 3 в положении С1у108-А1а109 представляет собой многообещающий подход для получения вариантов ΤΗΡα со структурой, сильно напоминающей нативную молекулу ΤΗΡα.
Из кристаллической структуры ΤΗΡα сделан вывод, что Тн-эпитоп, встроенный непосредственно в данной позиции, не имеет каких-либо соседних аминокислотных остатков в непосредственной близости для взаимодействия с ним. Исследования с ΤNΕ34 (8Е0 ΙΌ N0: 18), первой содержащей РЛЭИЕ конструкцией, полученной по данному подходу, показали, что примерно 5% экспрессированного белка ΤNΕ34 в Е. со11 было растворимым, а 95% ΤNΕ34 экспрессировалось в виде телец включения, когда бактериальные клетки хозяина выращивали при 37°С, но после адаптации процесса ферментации до температуры ферментации, равной 25°С, выходы растворимого белка из ферментации были близки к 100%. Следовательно, оптимизация условий роста увеличила выход растворимого белка.
Было получено некоторое количество других конструкций (1^35-1^39, 8Е0 ΙΌ N0 23, 24, 25, 26 и 27), где все они зависели исключительно от введения 8Е0 ΙΌ N0: 7 в гибкую петлю 3.
Мутации, увеличивающие стабильность
Введение Тн-эпитопов в гибкую петлю 3 может потенциально дестабилизировать структуру варианта ΤΗΡα. Однако данной потенциальной дестабилизации можно противодействовать путем стабилизации структуры путем введения цистеинов, которые образуют дисульфидный мостик. Цистиновая пара в двух различных позициях пока не была введена в варианты 1^34^ и ΤNΕ34-Β (8Е0 ΙΌ N0: 29 и 30). Также гибкий Η-конец (первые 8 аминокислот), который, как известно, снижает силу взаимодействия с рецептором, одновременно подвергают делеции, в результате чего получают вариант ΤNΕ34-С (8Е0 ΙΌ N0: 31). Дисульфидный мостик вводят в мономер для стабилизации участка вставки эпитопа вместе с имеющимся в природе дисульфидным мостиком (Сук-67 Сук-101). Данная стратегия также стабилизирует и мономер ΤΗΡα как таковой, и мономеризованный ди- или тример.
- 14 007810
Другие конструкции
Некоторые другие стратегии использовали для конструирования вариантов растворимых продуктов экспрессии. ΤΝΡΧ1.1-2 (8ЕР ГО N0: 32 и 33) основаны на вставках 81% ГО N0:7 в первую петлю ΤΝΡα, где участок вставки локализовался в позиции интрона. В ΤΝΡΧ2.1 (8ЕР ГО N0: 34) создана искусственная область «стебля», содержащая вставку 81% ГО N0: 7.
Путем мутаций ΤΗΡα выявлено, что замены объемных гидрофобных аминокислот, находящихся на поверхности взаимодействия тримера, стабилизируют структуру тримера. ΤNΡX3.1 и ΤNΡX3.2 (8ЕР ГО N0: 35 и 36) являются попытками стабилизировать существующий вариант ΤNΡ34.
В ΤNΡX4.1 (8ЕР ГО N0: 37) использованы диглициновые линкеры для снижения структурного препятствия, воздействующего от пептида РАОКЕ на всю структуру ΤΚΡ34. В ΤNΡX5.1 (8ЕР ГО N0: 38) задействована в качестве точки вставки петлевая структура, находящаяся в молекуле представителя семейства ΊΝΓ В1у8. ΤΚΡΧ6.1-2, 1^7.1-2 и ΤNΡX8.1 (8ЕР ГО N0: 39,40, 41, 42 и 43) являются дальнейшими вариантами. ΤNΡX9.1 и ΤNΡX9.2 (ЗЕР ГО N0: 44 и 45) представляют собой варианты ΤΚΡ34, в которых задействованы идентичные перекрывающиеся последовательности 'Τ^α из 4-6 аминокислот перед и после эпитопа. Наконец, два варианта (ЗЕР ГО N0: 46 и 47) содержат собой двойные варианты Р2/Р30 в том же месте, что пептид РЛОКЕ в ΤNΡ34.
Кроме того, по кристаллической структуре ΤΧΡα сделано наблюдение, что внутри мономера 'Τ^α присутствует один стабилизирующий солевой мостик между остатками Ьуз-98 и О1и-116. Солевой мостик по определению представляет собой электростатическое взаимодействие между атомами кислорода боковых цепей Азр или О1и и положительно заряженными атомами азота боковых цепей в Агд, Ьуз или Н18 с межатомным расстоянием менее 7,0 А. Путем мутаций, заключающихся в сайт-специфической замене Ьуз-98 на Агд или Н1з в данной позиции, в сочетании с заменами О1и 116 на Азр, может достигаться усиление стабильности данного солевого мостика и, таким образом, стабильности молекулы тримера. Также возможно заменить данные солевые мостики дисульфидными мостиками в описанной выше манере.
Было сделано наблюдение, что мышиный Τ^α заметно стабильнее, чем человеческий Τ^α в плане растворимости и протеолиза. Улучшение вариантов 'Τ^α охватывает получение сайтспецифических мутантов, так что имитируется кристаллическая структура мышиного Τ^α для получения более стабильного в плане протеолиза продукта Τ^α.
Из рентгеновских структур человеческого и мышиного Τ^α видно, что центр тримера (в середине трех мономеров ΤΝαΐ держится за счет гидрофобных сил, в то время как вершина и дно тримера связаны за счет встречающихся в природе солевых мостиков. Поэтому стабильность тримера ΓΚΡα может быть усилена путем скрининга данных солевых мостиков на предмет более прочных связей.
Наконец, предварительные результаты, полученные с вариантами 'Τ^α по настоящему изобретению, неожиданно продемонстрировали, что данные варианты являются физиологически активными, по меньшей мере, в смысле их связывания с УМР-рецепторами. Однако, поскольку Τ^α является токсичным белком, требуется получить безопасные варианты, которые не вызовут каких-либо побочных эффектов у субъектов, иммунизированных вакциной по изобретению. Поэтому также важным осуществлением изобретения является введение в конструкции детоксицирующих мутаций, если они после тестиро вания на подходящих моделях токсичности продемонстрируют потенциальную опасность для вакцинированных субъектов.
В данной области известно некоторое количество точечных мутаций, призванных детоксицировать ΤNΡα или, по меньшей мере, в большой степени снизить его токсичность. Данные точечные мутации, если это необходимо, вводят в варианты по настоящему изобретению. Особенно предпочтительными мутациями являются замены, соответствующие в зрелом Τ^α заменам Руг-87 на 8ег, Азр-143 на Азп, и А1а-145 на Агд. Далее, все эффективные мутации, указанные Рое1зсйег, Н., ЗШеЬег, О., Ваппег, О., Маскау, Р. апб Ьезз1аиег, Ш. 1993 ГВС 268 (35) 26350-7, также представляют собой интересные осуществления в рамках осуществлений детоксикации по настоящему изобретению.
В заключение, по настоящему изобретению получали следующие конкретные варианты ΤNΡα:
Конструкция Первая Первая
ΤΝΕ а.к до а.к эпитопа после
Аминокислоты, Мутиции подвергнутые делеции за
Общая длина эпитопа счет вставки
ΤΝΓ34 | 108 | 109 | - | 170 |
ΤΝΓ35 | 106 | 107 | - | 170 |
ΤΝΓ36 | 107 | 108 | - | 170 |
ΤΝΕ37 | 108 | 110 | А | 169 |
ΤΝΕ38 | 108 | 112 | АЕА | 167 |
- 15 007810
ΤΝΕ39 | 106 | 112 | ЕСАЕА | 165 | |
ΤΝΕ02 | 170 | — | СЗС+добавленный с С-конца ΡΑϋΚΕ | 173 | |
ΤΝΕ34-Α | 108 | 109 | - | 067С, А111С | 170 |
ΤΝΕ34-Β | 108 | 109 | - | А96С, 1118С | 170 |
ΤΝΓ34-Ο | 108 | 109 | Удалены Νконцевые аминокислты УКЗЗЗКТР | 162 | |
ΤΝΕΧ1,1 | 17 | 19 | А | 169 | |
ΤΝΓΧ1,2 | 17 | 96 | ΑΝΡΩΆ | 165 | |
ΤΝΕΧ2,1 | 0 | 2 | V | Добавленный с N -конца ΡΑϋΚΕ | 170 |
ΤΝΕΧ3,1 | 108 | 109 | - | Д157Е | 170 |
ΤΝΓΧ3,2 | 108 | 109 | - | У49Г | 170 |
ΤΝΓΧ4,1 | 108 | 109 | — | Два глицина до и после ΡΑϋΚΕ | 174 |
ΤΝΕΧ5,1
ΤΝΕΧ6, 1
ΤΝΕΧ6,2
ΤΝΓΧ7,1
ΤΝΓΧ7,2
ΤΝΓΧ8,1
ГПХТТПХ? Α -I 11ΝΓΛ2, 1
132
135
126 α η ιυο
146
146
140
А А ιυο
ΑΫ3
3ΑΕΙΝΚΡ0ΥΣ0ΓΑ ΙΝΚΡΟΥΣΟΕΑ ЕКСОЗСРЗТНУЬЬ ТНУЬЬТНТ13К1А ЕКС6КЬЗАЕ1ЫКР
ΤΝΓΧ9, 2
108
105 ттт____ шесть аминокислот, предшествующих ΡΆΩΚΕ, после эпитопа дуплицированы Четыре аминокислоты, предшествующие ΡΑϋΚΕ, после эпитопа дуплицированы
167
157
160
157
157
157
Ί Π Г ± / Ό
174
ΤΝΓ34-Ρ2- | 108 | 109 | - | Р2 и РЗО | 194 |
РЗО | |||||
ΤΝΓ34-Ρ30- | 108 | 109 | - | РЗО и Р2 | 194 |
Р2 |
Используемые числа от Ν-концевого V в 81% ΙΌ NО: 17 (то есть, от аминокислоты № 2 в 81% ГО NО: 17). Перед Ν-концевым валином в некоторых последовательностях находится метионин, использованный для старта трансляции.
Наиболее предпочтительными белковыми конструкциями по изобретению являются те, что представлены любой из 81% ΙΌ №: 18, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 49, 51, 53, 55, 57 и 59, а также любая аминокислотная последовательность, происходящая от них, которая содержит только консервативные аминокислотные замены или детоксицирующие аминокислотные.
В любом случае значимым осуществлением является то, что все данные варианты ΤΝΡα, обсуждаемые выше, могут экспрессироваться в виде растворимых белков в бактериальных клетках, таких как Е. со11.
Предпочтительным вектором является рЕТ28Ь+, где целью является экспрессия в Е. со11, ρ2Ζορ2Ρ (8ЕР ГО NО: 60) является вектором, используемым для экспрессии в клетках насекомых, и рНР1 (или его коммерчески доступный «близнец» рСГ) представляет собой вектор для экспрессии в клетках млекопи тающих.
Основные способы лечения, предоставляемые по изобретению
Изобретение относится к способам, посредством которых становится возможной отрицательная регуляция конкретного полимерного белка очень предпочтительным образом.
В общем предоставляется способ отрицательной регуляции полимерного белка у аутологичного хозяина, причем данный способ охватывает осуществление представления иммунной системе животного иммуногенно эффективного количества по меньшей мере одного иммуногенного аналога по изобретению. Предпочтительно, чтобы аутологичный хозяин представлял собой млекопитающее, наиболее предпочтительно, человеческое существо.
- 16 007810
Данный способ может быть воплощен на практике несколькими путями, среди которых одним из способов выбора является введение белковой вакцины, но также большой интерес вызывает стратегия вакцинации нуклеиновой кислотой или стратегия вакцинации живой вакциной.
Вакцинация белком/полипептидом и композиция белка/полипептида
При осуществлении представления аналогов иммунной системе животного посредством их введения животному композиция полипептида следует принципам, в общем признанным в данной области.
Получение вакцин, которые в качестве активных ингредиентов содержат пептидные последовательности, в общем, хорошо известно в данной области, примеры чего указаны в патентах США 4608251; 4601903; 4599231; 4599230; 4596792; и 4578770; все они включены сюда в качестве ссылки. Обычно такие вакцины получают в виде препаратов для инъекций или в виде жидких растворов или суспензий; также могут быть получены твердые формы, подходящие для растворения или суспендирования в жидкости перед инъекцией. Препарат также может быть эмульгирован. Активный иммуногенный ингредиент часто смешан с наполнителями, которые являются фармацевтически приемлемыми и совместимыми с активным ингредиентом. Подходящими наполнителями, например, являются вода, солевой раствор, декстроза, глицерин, этанол или тому подобное, и их комбинации. Кроме того, если требуется, вакцина может содержать малые количества вспомогательных веществ, таких как увлажняющие или эмульгирующие средства, буферные средства для поддержания рН или адъюванты, которые усиливают эффективность вакцин; ср. подробное обсуждение адъювантов, приведенное ниже.
Вакцины обычно вводят парентерально, например, путем инъекции, или подкожно, внутрикожно, интрадермально, субдермально или внутримышечно. Дополнительные композиции, которые подходят для других способов введения, включают в себя суппозитории и, в некоторых случаях, пероральные, буккальные, подъязычные, интраперитонеальные, интравагинальные, анальные, эпидуральные, спинальные и внутричерепные препараты.
Традиционные для суппозиториев связующие вещества и носители могут включать в себя, например, полиалкаленгликоли или триглицериды; такие суппозитории могут быть образованы из смесей, содержащих активный ингредиент в интервале от 0,5 до 10%, предпочтительно 1-2%. Пероральные композиции включают в себя такие обычно используемые наполнители такие как, например, фармацевтические марки маннита, лактозы, крахмала, стеарата магния, сахарина натрия, целлюлозы, карбоната магния и тому подобного. Данные композиции принимают форму растворов, суспензий, таблеток, пилюль, капсул, препаратов замедленного высвобождения или порошков, и содержат 10-95% активного ингредиента, предпочтительно 25-70%. Для перорального применения интересным партнером в композиции (и также возможным партнером для конъюгации) является холерный токсин.
Полипептиды могут быть составлены в вакцину в нейтральной форме или в форме солей. Фармацевтически приемлемые соли включают в себя кислотно-аддитивные соли (образованные со свободными аминогруппами пептида) и те, которые образованы неорганическими кислотами, такими как, например, соляная или фосфорная кислоты, или такими органическими кислотами, как уксусная, щавелевая, винная, миндальная, и тому подобные.
Соли, образованные со свободными карбоксильными группами, могут также происходить из неорганических оснований, таких как, например, гидроксиды натрия, калия, аммония, кальция или железа, или таких органических оснований, как изопропиламин, триметиламин, 2-этиламиноэтанол, гистидин, прокаин и тому подобное.
Вакцины вводят способом, совместимым с дозированным препаратом, и в таком количестве, которое будет терапевтически эффективным и иммуногенным. Количество, подлежащее введению, зависит от подлежащего лечению субъекта, включая, например, способность иммунной системы субъекта развивать иммунный ответ, и требуемую степень защиты. Подходящие интервалы дозировки составляют порядка нескольких сотен микрограмм активного ингредиента на вакцинацию, с предпочтительным интервалом примерно от 0,1 до 2000 мкг (хотя рассматриваются даже большие количества в интервале 1-10 мг) , например, в интервале примерно от 0,5 до 1000 мкг, предпочтительно в интервале от 1 до 500 мкг, и особенно в интервале примерно от 10 до 100 мкг.
Подходящие режимы начального введения и поддерживающих введений также варьируют, но типично характеризуются начальным введением с последующими инокуляциями или другими введениями.
Способ применения может сильно варьировать. Могут использоваться любые общепринятые способы введения вакцины. Они включают в себя пероральное введение твердой физиологически приемлемой основы или физиологически приемлемой дисперсии, парентерально, путем инъекции и тому подобное. Дозировка вакцины зависит от пути введения и варьирует в зависимости от возраста вакцинируемого субъекта и композиции антигена.
Некоторые аналоги вакцины достаточно иммуногены в вакцине, но для некоторых других иммунный ответ усиливают, если вакцина, кроме того, содержит вещество-адъювант.
Известны различные способы достижения эффекта адъюванта в вакцине. Основные принципы и способы подробно описаны в ΤΙιο ΤΗβοτγ апб Ргасйса1 АррЕсайоп о£ АйщуапЩ, 1995, Эипсап Е. 8. 81е\\аП-ΤιιΙΙ (еб. ), 1оНп ^11еу & 8оп§ ЬМ, !8ΒΝ 0-471-95170-6, и также в Уасстек: Νο\ν Сепегайоп Iтти
- 17 007810 по1ощса1 ЛфиуаШз, 1995, Сгедойаб1к С. е1 а1. (ебк.), Р1епит Ргекк, Νο\ν Уогк, Ι8ΒΝ 0-306-45283-9, причем данные источники включены сюда в качестве ссылки.
Особенно предпочтительным является применение адъюванта, который может демонстрировать облегчение нарушения аутотолерантности в отношении аутоантигенов; фактически, это существенно в случаях, где в качестве активного ингредиента аутовакцины применяется немодифицированный 1Ь5.
Неограничивающие примеры подходящих адъювантов выбраны из группы, состоящей из направленного на иммунную систему адъюванта; направленного на иммунную систему адъюванта, такого как токсин, цитокин и производное микобактерий; масляного препарата; полимера; мицеллообразующего адъюванта; сапонина; иммуностимулирующего комплексного матрикс (матрикс 18СОМ); частицы; ΌΌΆ; алюминиевых адъювантов; адъювантов, основанных на ДНК; γ-инулина; и инкапсулирующего адъюванта.
В общем следует отметить, что приведенные выше описания, которые относятся к соединениям и средствам, используемым в качестве первого, второго и третьего радикала аналогов, также относятся с внесением необходимых изменений к их применению в адъюванте вакцины по изобретению.
Применение адъювантов охватывает применение средств, таких как гидроксид или фосфат алюминия (квасцы), обычно используемые в виде 0,05-0,1-процентного раствора в солевом буфере, примеси синтетических полимеров или Сахаров (например, СагЬоро1™) , используемые в виде 0,25-процентного раствора; возможна агрегация белка в вакцине путем обработки нагреванием при температурах, изменяющихся от 70 до 101°С в течение периодов от 30 с до 2 мин, соответственно, и также агрегация посредством перекрестно связывающих агентов. Также может использоваться агрегация путем реактивации обработанными пепсином антителами (ТаЬ-фрагментами) к альбумину, смешивание с бактериальными клетками, такими как С. Рагуит, или эндотоксинами или липополисахаридными компонентами грамотрицательных бактерий, эмульсия в физиологически приемлемых масляных носителях, таких как маннидмоноолеат (Агасе1 А) или эмульсия с 20-процентным раствором перфторуглерода (Е1иоко1-ОА), используемого в качестве блокового замещенного. Также предпочтительным является примешивание масел, таких как сквален и ΙΤΑ.
По изобретению интересующим кандидатом на роль адъюванта является ΌΌΑ (диметилдиоктадециламмония бромид), а также ДНК и γ-инулин, но также интересны полный и неполный адъюванты Фрейнда, а также сапонины Ош11а)а. такие как 0ш1А и 0821. также как и Κ1ΒΙ. Дальнейшие возможные варианты представляют собой монофосфориллипид А (МРЬ) , указанные выше С3 и С3б, и мурамилдипептид (МОР).
Также известно, что липосомные препараты обладают адъювантным эффектом, и поэтому липосомные адъюванты являются предпочтительными по изобретению.
Также предпочтительным выбором по изобретению являются адъюванты типа иммуностимулирующего комплексного матрикса (матрикс 18СОМ), особенно потому что было показано, что адъюванты данного типа способны положительно регулировать экспрессию МНС класса II в АРС.
Матрикс 18СОМ® состоит из (необязательно разделенных) сапонинов (тритерпеноидов) из Ош11а)а каропапа, холестерина и фосфолипида. При смешивании с иммуногенным белком полученный в результате препарат частиц представляет собой препарат, известный под названием частица 18СОМ, где сапонин составляет 60-70% мас./мас., холестерин и фосфолипид составляют 10-15% мас./мас., и белок составляет 10-15% мас./мас.
Подробности, касающиеся композиции и применения иммуностимулирующих комплексов могут, например, быть найдены в указанных выше учебниках, имеющих отношение к адъювантам, но также в Могеш В. е1 а1., 1995, С11п. 1ттипо1йег. 3: 461-475, а также в Вагг 1.С. апб Мйсйе11 С.Р., 1996, 1ттипо1. апб Се11 Вю1. 74: 8-25 (оба источника включены сюда в качестве ссылки) предоставлена полезная информация по получению полных иммуностимулирующих комплексов.
Другой очень интересной (и, таким образом, предпочтительной) возможностью достижения адъювантного эффекта является применение способа, описанного Соккейп е1 а1., 1992 (что включено сюда в качестве ссылки). В кратком изложении, презентация имеющего отношение к проблеме антигена, такого как антиген по настоящему изобретению, может усиливаться за счет конъюгации антигена с антителами (или антигенсвязывающими фрагментами антител) против Ρсγ-рецепторов на моноцитах/макрофагах. В частности, было продемонстрировано, что конъюгаты между антигеном и антителом против ΒογΡΙ усиливают иммуногенность для целей вакцинации.
Другие возможности используют применения направленных и иммуномодулирующих веществ (т. е., цитокинов), указанных в формуле изобретения как радикалы для белковых конструкций. В данной связи также возможно применение синтетических индукторов цитокинов, таких как ро1у 1:С.
Подходящие производные микобактерий выбраны из группы, состоящей из мурамилдипептида, полного адъюванта Фрейнда, Κ1ΒΙ и сложного диэфира трегалозы, такого как ТОМ и ТОЕ.
Подходящие направленные на иммунную систему адъюванты выбраны из группы, состоящей из лиганда СО40 и антител против СО40 или их специфично связывающих фрагментов (ср. обсуждение, приведенное выше), маннозы, ЕаЬ-фрагмента и СТЬА-4.
- 18 007810
Подходящие полимерные адъюванты выбраны из группы, состоящей из такого углевода, как декстран, ΡΕΟ, крахмал, маннан и манноза; пластикового полимера, такого как; и латекса, такого как латексные частицы.
Еще одним интересующим способом модулирования иммунного ответа является введение иммуногена (необязательно вместе с адъювантами и фармацевтически приемлемыми носителями и несущими средствами) в «виртуальном лимфоузле» (УБЫ) (патентованном медицинском устройстве, разработанном IттиηоΤйе^ару, Шс., 360 Бехтд1оп Ауепие, №\ν Уогк, ΝΥ 10017-6501). УБИ (тонкое трубковидное устройство) имитирует структуру и функцию лимфоузла. Вставка ΑΕΝ под кожу приводит к образованию участка стерильного воспаления с повышением количества цитокинов и хемокинов. Т- и В-клетки, а также АРС быстро отвечают на сигналы опасности, мигрируют в участок воспаления и накапливаются в пористом матриксе УБК Показано, что необходимая доза антигена, требуемая для развития иммунного ответа на антиген, при использовании ΑΕΝ снижена, и что иммунная защита, вызванная вакцинацией с использованием УБ» превосходила общепринятую иммунизацию с использованием в качестве адъюванта РТЫ. Данная технология впервые кратко описана в Се1Ьег С. е! а1., 1998, ЕНсйайоп о£ КоЬик! Се11и1аг апй Нитога1 [ттипе Кекропкек Ю Зта11 АтоиШк о£ [ттиподеш Икшд а Νο\ό1 Мейюа1 Беуюе Бекщпа!ей 1йе У1йиа1 Бутрй Мойе, ш: Егот 111е БаЬога!огу !о 111е СНшс, Воок о£ АЬк1гас1к. Ос!оЬег 12111-15111 1998, Зеаксаре Рекой, Ар!ок, СаШогша .
Ожидается, что вакцина будет вводиться по меньшей мере один раз в год, например по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6 и 12 раз в год. Более конкретно, ожидается введение нуждающемуся в этом субъекту 1-12 раз в год, например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 раз в год. Ранее было показано, что иммунологическая память, индуцированная использованием предпочтительных аутовакцин по изобретению, не перманентна, и поэтому иммунная система нуждается в периодической стимуляции аналогами.
Вследствие генетической изменчивости различные субъекты могут реагировать на один и тот же полипептид иммунными ответами разной силы. Поэтому вакцины по изобретению могут содержать несколько различных полипептидов для усиления иммунного ответа, ср. выше также обсуждение, касающееся выбора введений чужеродных Т-клеточных эпитопов. Вакцины могут включать в себя два или более полипептида, где все полипептиды являются теми, что определены.
Вакцина может в результате содержать 3-20 различных аналогов, например, 3-10 аналогов. Однако обычно число аналогов составляет минимум, например, 1 или 2 аналога.
Вакцинация нуклеиновыми кислотами
В качестве очень важной альтернативы классическому введению основанной на пептидах вакцине технология вакцинации нуклеиновой кислотой (также известная как «иммунизация нуклеиновой кислотой», «генетическая иммунизация» и «генная иммунизация») предоставляет некоторое количество привлекательных характеристик.
Во-первых, в отличие от традиционного вакцинного подхода, вакцинация нуклеиновой кислотой не требует ресурса потребления крупномасштабной продукции иммуногенного агента (например, в виде ферментации микроорганизмов, продуцирующих белки, в промышленных масштабах). Более того, не требуется организовывать очистку и схемы рефолдинга иммуногена. И наконец, поскольку вакцинация нуклеиновой кислотой относится к биохимическому аппарату вакцинируемого субъекта, для продукции экспрессированного продукта введенной нуклеиновой кислоты, ожидается, что будет происходить оптимальный посттрансляционный процессинг продукта экспрессии; это особенно важно в случае аутовакцинации, поскольку, как указывалось выше, значимая часть исходных В-клеточных эпитопов полимера в модифицированной молекуле должна сохраняться, и поскольку В-клеточные эпитопы в принципе могут составляться из частей любой (био)молекулы (например, углевода, липида, белка и т.д.). Поэтому нативные профили гликозилирования и липоилирования иммуногена могут быть очень важны для иммуногенности в целом, и ожидается, что это гарантируется хозяином, продуцирующим иммуноген.
Следует заметить, что увеличенный уровень экспрессии, наблюдаемый с описанными здесь аналогами, очень значим для эффективности вакцинации ДНК, поскольку уровень экспрессии ш у1уо является одним из определяющих факторов для иммуногенной эффективности ДНК-вакцины. Следовательно, предпочтительное осуществление изобретения относится к эффективному представлению аналога по изобретению иммунной системе путем введения нуклеиновой(-ых) кислоты(-т), кодирующих аналог, в клетки животных и к достижению таким образом экспрессии ш у1уо клетками введенной (-ых) нуклеиновой (-ых) кислоты (-т).
В данном осуществлении введенная нуклеиновая кислота предпочтительно представляет собой ДНК, которая может находиться в виде голой ДНК, ДНК, объединенной в композицию с заряженными или незаряженными липидами, ДНК, введенной в липосомы, ДНК, встроенной в вирусный вектор, ДНК, объединенной в композицию с облегчающим трансфекцию белком или полипептидом, ДНК, объединенной в композицию с направленным белком или полипептидом, ДНК, объединенной в композицию с преципитирующими кальций средствами, ДНК, связанной с молекулой инертного носителя, ДНК, инкапсулированной в полимер, например, в РБСА (ср. технологию микроинкапсулирования, описанную в АО 98/31398) или в хитин или хитозан, и ДНК, объединенной в композицию с адъювантом. В данном контексте отмечено, что практически все соображения, касающиеся применения адъювантов в традицион
- 19 007810 ном вакцинном препарате, относятся и к препарату ДНК-вакцин. Следовательно, все приведенные здесь описания, которые относятся к применению адъювантов в контексте основанных на полипептиде вакцин, относятся с необходимыми изменениями к применению технологии вакцинации нуклеиновой кислотой.
Пути введения и схемы введения основанных на полипептиде вакцин, подробно описанные выше, также могут применяться для вакцин на основе нуклеиновой кислоты по изобретению, и все приведенные выше обсуждения, касающиеся путей введения и схем введения для полипептидов, прилагаются с соответствующими изменениями к нуклеиновым кислотам. К этому стоит добавить, что вакцины на основе нуклеиновой кислоты могут подходящим образом вводиться внутривенно и внутриартериально. Более того, в данной области хорошо известно, что вакцины на основе нуклеиновых кислот могут вводиться путем применения так называемой генной пушки, и, следовательно, также этот и эквивалентные ему пути введения рассматриваются как часть настоящего изобретения. Наконец, также применение νΈΝ при введении нуклеиновых кислот, как было описано, дает хорошие результаты, и поэтому данный конкретный способ введения является особо предпочтительным.
Далее, нуклеиновая (-ые) кислота(-ы), используемые в качестве средства для иммунизации по настоящему изобретению могут содержать области, кодирующие радикалы, определенные в формуле изобретения, например, имеющие вид описанных выше иммуномодулирующих веществ, таких как цитокины, обсуждаемые в качестве подходящих адъювантов. Предпочтительный вариант данного осуществления охватывает наличие области, кодирующей аналог, и области, кодирующей иммуномодулятор, в различных рамках считывания или, по меньшей мере, под контролем различных промоторов. Таким образом избегают того, что аналог или эпитоп будет продуцировать в виде партнера слияния с иммуномодулятором. Альтернативно, могут использоваться два различных нуклеотидных фрагмента, но это менее предпочтительно из-за преимущества гарантированной совместной экспрессии при наличии обоих кодирующих областей, включенных в состав одной и той же молекулы.
Соответственно, изобретение также относится к композиции для индукции продукции антител против ГБ5, причем композиция содержит фрагмент нуклеиновой кислоты или вектор по изобретению (ср. ниже обсуждение нуклеиновых кислот и векторов) и фармацевтически и иммунологически приемлемое несущее средство, и/или носитель, и/или адъювант, как обсуждается выше.
В обычных обстоятельствах нуклеиновую кислоту вводят в виде вектора, где экспрессия происходит под контролем вирусного промотора. Для более подробного обсуждения векторов и фрагментов ДНК по изобретению, ср. обсуждение ниже. Также доступны подробные описания, относящиеся к композиции и применению вакцин на основе нуклеиновой кислоты, ср. ОоппсИу 1.1. е! а1., 1997, Лили. Неу. ^тииок 15: 617-648 апб ИоииеНу 1.1. е! а1., 1997, ЫГе 8с1еисе8 60: 163-172. Обе эти ссылки включен сюда в качестве ссылки.
Живые вакцины
Третьей альтернативой осуществления представления аналогов по изобретению иммунной системе является применение технологии живых вакцин. При живой вакцинации представление иммунной системе осуществляется путем введения животному непатогенного микроорганизма, который трансформируют фрагментом нуклеиновой кислоты, кодирующим аналог по изобретению или вектором, содержащим такой фрагмент нуклеиновой кислоты.
Непатогенный микроорганизм может быть любым подходящим аттенуированным бактериальным штаммом (аттенуированным посредством пересева или посредством удаления патогенных продуктов экспрессии посредством технологии рекомбинантной ДНК), например, ВС6 МусоЬас1егшт όονίδ. непатогенным 81гер1ососси5 §рр., Е. со11, 8а1тоие11а §рр., У1Ьгю сЬо1ега, 8Ыде11а, и т.д. Обзоры, имеющие дело с получением введенных в практику живых вакцин могут, например, обнаруживаться в 8а1юи Р., 1995, Неу. Рга!. 45: 1492-1496 и ЭДа1кег Ρ.Ό., 1992, Уассте 10: 977-990, причем оба источника включены сюда в качестве ссылки. Для подробностей по фрагментам нуклеиновой кислоты и векторов, применяемых в таких живых вакцинах, ср. обсуждение ниже.
В качестве альтернативы бактериальным живым вакцинам обсуждаемые ниже фрагменты нуклеиновой кислоты по изобретению могут быть включены в состав невирулентного вирусного вакцинного вектора, такого как штамм коровьей оспы или любого другого подходящего поксвируса.
Обычно непатогенный микроорганизм или вирус вводят животному только один раз, но в некоторых случаях может быть необходимо вводить микроорганизм более одного раза в течение жизни для поддержания протективного иммунитета. Рассматривается даже, что схемы иммунизации, такие как те, что подробно описаны выше для иммунизации полипептидами, могут использоваться и при использовании живых или вирусных вакцин.
Альтернативно, вакцинация живыми или вирусными вакцинами сочетается с предшествующей или последующей вакцинацией полипептидами и/или вакцинацией нуклеиновыми кислотами. Например, возможно осуществить первичную иммунизацию живой или вирусной вакциной с последующими загрузочными иммунизациями с использованием подхода полипептидов или нуклеиновой кислоты.
Микроорганизм или вирус может трансформироваться нуклеиновой(-ыми) кислотой(-ами), содержащими области, кодирующие указанные выше радикалы, например, имеющие вид описанных выше иммуномодулирующих веществ, таких как цитокины, обсуждаемые как подходящие адъюванты. Пред
- 20 007810 почтительный вариант данного осуществления охватывает наличие области, кодирующей аналог, и области, кодирующей иммуномодулятор, в различных рамках считывания или, по меньшей мере, под контролем различных промоторов. Таким образом избегают того, что аналог или эпитоп будет продуцировать в виде партнера слияния с иммуномодулятором. Альтернативно, в качестве средств трансформации могут использоваться два различных нуклеотидных фрагмента.
Конечно, наличие адъювантных радикалов в одной и той же открытой рамке считывания может предоставить в качестве продукта экспрессии аналог по изобретению, и такое осуществление является особо предпочтительным по настоящему изобретению.
Комбинированное лечение
Одним из особенно предпочтительных способов осуществления изобретения охватывает применение вакцинации нуклеиновой кислотой в качестве первой (первичной) иммунизации, с последующими вторыми (стимулирующими) иммунизациями основанной на полипептиде вакциной или живыми вакцинами, как описано выше.
Применение способа по изобретению при лечении заболевания
Точный выбор режима лечения зависит от выбора мультимерного белка, на который оно направлено. Например, при использовании в качестве мишени ГБ5 к проблеме имеют отношение все состояния, обсуждаемые в \УО 00/65058, а когда мишенью является ΤΝΕα, все имеющие к проблеме заболевания/состояния охватывают ревматоидный артрит, ювенильный хронический артрит, спондилартропатии, полимиозит, дерматомиозит, васкулит, псориаз (бляшки) и псориатический артрит, МЬ. болезнь Крона, хроническое обструктивное легочное нарушение, синдром миелодисплазии, увеит при ревматоидном артрите, острую дисфункцию легких, астму, гранулематоз Венегера, болезнь раздраженной толстой кишки, темпоромандибулярное нарушение (болезненное смыкание челюстей), стоматит-остеопороз и кахексию при злокачественных опухолях, а также другие воспалительные заболевания и другие состояния, рассматриваемые в данной области как связанные с неблагоприятными эффектами ΤΝΕα. Поэтому возможно лечение или ослабление симптомов любых из данных заболеваний путем использования способа отрицательной регуляции активности мультимерного белка по изобретению.
Композиции по изобретению
Изобретение также относится к композициям, которые могут использоваться при воплощении способа по изобретению. Следовательно, изобретение также относится к иммуногенной композиции, содержащей иммуногенно эффективное количество определенного выше аналога, причем указанная композиция далее содержит фармацевтически и иммунологически приемлемый растворитель, и/или несущее средство, и/или носитель, и/или наполнитель, и, необязательно, адъювант. Иными словами, данная часть изобретения относится к препаратам аналогов, по существу описанных здесь и выше. Выбор адъювантов, носителей и несущих средств осуществляется в соответствии с обсуждаемым выше, когда это относится к препарату аналогов для вакцинации пептидами.
Аналоги получают по способам, хорошо известным в данной области. Более длинные полипептиды обычно получают посредством рекомбинантной генной технологии, включающей в себя введение последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей аналог, в подходящий вектор, трансформацию данным вектором подходящего хозяина, экспрессию последовательности нуклеиновой кислоты (путем культивирования клетки хозяина в подходящих условиях), получение продукта экспрессии из клеток хозяина или их культуральной надосадочной жидкости и последующую очистку и необязательную дальнейшую модификацию, например, рефолдинг или дериватизацию. Подробности, касающиеся необходимых инструментов, находятся ниже под заголовком «Фрагменты нуклеиновой кислоты и векторы по изобретению», но также и в примерах.
Более короткие пептиды предпочтительно получают хорошо известными способами жидко- и твердофазного пептидного синтеза.
Однако последние успехи в данной технологии дали возможность для продукции полноразмерных полипептидов и белков данными средствами, и поэтому также в объеме настоящего изобретения находится получение длинных конструкций синтетическими средствами.
Фрагменты нуклеиновой кислоты и векторы по изобретению
Из указанного выше описания следует понимать, что модифицированные полипептиды могут быть получены посредством рекомбинантной генной технологии, но также посредством химического синтеза или полусинтетически; два последних условия особенно применимы, когда модификация состоит в связывании с белковыми носителями (такими как КЬН, дифтерийный анатоксин, столбнячный анатоксин и В8Л) и небелковыми молекулами, такими как углеводные полимеры, или охватывает это, и, конечно, также когда модификация охватывает добавление боковых цепей или боковых групп к происходящей из полимера пептидной цепи. Данные осуществления, как понятно из сказанного выше, не являются предпочтительными.
Для целей рекомбинантной генной технологии и, конечно, также для целей иммунизации нуклеиновой кислотой важными химическими продуктами являются фрагменты нуклеиновой кислоты, кодирующие аналоги (а также комплементарные им последовательности). Следовательно, важная часть изо
- 21 007810 бретения относится к фрагментам нуклеиновой кислоты, которая кодирует описанный здесь аналог, т. е. происходящий из полимера искусственный полимерный полипептид, как описано здесь выше. Фрагменты нуклеиновой кислоты по изобретению представляют собой ДНК- или РНК-фрагменты.
Наиболее предпочтительный ДНК-фрагмент по изобретению охватывает последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из БЕО Ш N0: 8, 10, 12, 14, 17, 48, 50, 52, 54, 56 и 58, или последовательность нуклеиновой кислоты, комплементарную любой из них.
Фрагменты нуклеиновой кислоты по изобретению обычно встраивают в подходящие векторы с образованием клонирующих или экспрессирующих векторов, несущих фрагменты нуклеиновой кислоты по изобретению; такие новые векторы также являются частью изобретения. Подробности, касающиеся конструирования данных векторов по изобретению, обсуждаются ниже в контексте трансформированных клеток и микроорганизмов. Векторы могут в зависимости от цели и типа применения находиться в виде плазмид, фагов, космид, минихромосом, или вируса, но также и голая ДНК, которая экспрессируется лишь транзиторно в конкретных клетках, является значимым вектором (и может использоваться для вакцинации ДНК). Предпочтительные клонирующие и зкспрессирующие векторы по изобретению способны к автономной репликации, что обеспечивает, таким образом, высокую копийность для целей высокоуровневой экспрессии или высокоуровневой репликации для последующего клонирования.
Общий вариант вектора по изобретению содержит следующие черты в 5' З'-направлении и функциональной связи: промотор для направления экспрессии фрагмента нуклеиновой кислоты по изобретению, необязательно последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую лидерный пептид, обеспечивающий секрецию (во внеклеточную фазу или, где возможно, в периплазму) или встраивание полипептидного фрагмента в мембрану, фрагмент нуклеиновой кислоты по изобретению, и необязательно последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующей терминатор. При работе с экспрессирующими векторами в штаммах или клеточных линиях-продуцентах для целей генетической стабильности трансформированной клетки предпочтительно, чтобы вектор при введении в клетку хозяина интегрировался в геном клетки хозяина. При работе с векторами, подлежащими использованию для экспрессии у животных ίη νίνο (т.е., использования вектора при вакцинации ДНК), наоборот, из соображений безопасности предпочтительно, чтобы вектор не был способен интегрироваться в геном клетки хозяина; обычно используют голую ДНК или неинтегрирующиеся вирусные векторы, выбор которых хорошо известен специалисту в данной области.
Векторы по изобретению используют для трансформации клеток хозяина для продукции модифицированного полипептида 1Ь5 по изобретению. Такие трансформированные клетки, которые также являются частью изобретения, могут быть культивируемыми клетками или клеточными линиями, используемыми для размножения фрагментов нуклеиновой кислоты и векторов по изобретению или используемыми для рекомбинантной продукции модифицированных полипептидов 1Ь5 по изобретению. Альтернативно, трансформированные клетки могут представлять собой штаммы, подходящие для живых вакцин, где фрагмент нуклеиновой кислоты (единственная или множественные копии) встроены так, что осуществляется секреция или интеграция модифицированного 1Ь5 в бактериальную мембрану или клеточную стенку.
Предпочтительные трансформированные клетки по изобретению представляют собой такие микроорганизмы как бактерии (такие как виды ЕксЕепсЫа [например, Е. со11], ВасШик [например, ВасШик киЬίίΐίδ], Ба1топе11а, или МусоЬас1епит [предпочтительно, непатогенные, например, М. ЬотЬ ВС6] ), дрожжи (такие как БассРаготусек сеге\ак1ае) и простейшие. Альтернативно, трансформированные клетки происходят из многоклеточного организма, такого как гриб, являются клетками насекомых, растительными клетками или клетками млекопитающих. Наиболее предпочтительными являются клетки, происходящие из человеческого существа, ср. ниже обсуждение клеточных линий и векторов. Последние результаты показали, что многообещающим является применение коммерчески доступной клеточной линии ЭгокорР11а те1аподак1ег (клеточная линия и векторная система БсРпе1йег 2 (Б2), доступные от 1птЦгодеп) для рекомбинантной продукции аналогов 1Ь5 по изобретению, и поэтому данная экспрессирующая система является особенно предпочтительной, и поэтому данный тип системы в общем является предпочтительным осуществлением изобретения.
Для целей клонирования и/или оптимизированной экспрессии предпочтительно, чтобы трансформированная клетка могла реплицировать фрагмент нуклеиновой кислоты по изобретению.
Клетки, экспрессирующие данный нуклеиновый фрагмент, являются предпочтительными используемыми осуществлениями изобретения; они могут использоваться для мелко- и крупномасштабного получения аналога или, в случае непатогенных бактерий, в качестве вакцинного составляющего живой вакцины.
При продукции аналогов по изобретению посредством трансформированных клеток удобно, хотя и не существенно, чтобы продукт экспрессии экспортировался в культуральную среду или находился на поверхности трансформированной клетки, поскольку оба данных условия облегчают последующую очистку данного продукта экспрессии.
После идентификации эффективной клетки-продуцента предпочтительно на ее основе получить стабильную клеточную линию, которая будет нести вектор по изобретению и которая будет экспресси
- 22 007810 ровать фрагмент нуклеиновой кислоты, кодирующий модифицированный 1Ь5. Предпочтительно данная стабильная клеточная секретирует или несет аналог 1Ь5 по изобретению, облегчая таким образом его очистку.
В общем в связи с конкретными хозяевами используют плазмидные векторы, содержащие репликон и последовательности контроля, которые происходят из видов, совместимых с клеткой хозяина. Обычно вектор содержит участок репликации, а также маркерные последовательности, которые способны обеспечивать фенотипическую селекцию трансформированных клеток. Например, Е. сой обычно трансформируют с использованием рВК.322, плазмиды, происходящей из видов Е. сой (см., например, Βοϊίνατ е! а1., 1977). Плазмида рВК.322 содержит гены устойчивости к ампициллину и тетрациклину, и так обеспечивает простое средство идентификации трансформированных клеток. Плазмида рВВ или другая микробная плазмида или фаг также должна содержать промоторы, которые могут использоваться прокариотическим микроорганизмом для экспрессии, или должна быть модифицирована так, чтобы она содержала данные промоторы.
Те промоторы, что наиболее часто используются в прокариотических конструкциях рекомбинантной ДНК включают в себя промоторные системы β-лактамазы (пенициллиназы) и лактозы (СНапд е! а1., 1978; Пакта е! а1., 1977; Ооеббе1 е! а1., 1979) и триптофановую (!тр) промоторную систему (Ооеббе1 е! а1., 1979; ЕР-А-0 036 776). Хотя эти системы наиболее часто используют, открыты и использованы другие микробные промоторы, и опубликованы подробности, относящиеся к их нуклеотидным последовательностям, что позволяет специалисту функционально лигировать их с плазмидными векторами (З|еЬ\\'епНк! е! а1., 1980). Некоторые гены прокариот могут эффективно экспрессироваться в Е. сой с их собственных промоторных последовательностей, отменяя необходимость добавления другого промотора искусственными средствами.
В дополнение к прокариотам также могут использоваться эукариотические микробы, такие как дрожжевые культуры, и здесь промоторы должны быть способны направлять экспрессию. Среди эукариотических микроорганизмов чаще всего используют ЗассНаготусек се^еν^к^ае, или обыкновенные пекарские дрожжи, хотя обычно доступно некоторое количество других штаммов. Для экспрессии в ЗассНаготусек обычно используют, например, плазмиду УКр7 (ЗйпсйсотЬ е! а1., 1979; Кшдктап е! а1., 1979; ’ГБсЬетрег е! а1., 1980).
Данная плазмида уже содержит ген !гр1, который обеспечивает селективный маркер для мутантного штамма дрожжей, не способного расти на триптофане, например, АТСС №. 44076 или РЕР4-1 Оопек, 1977). Тогда наличие повреждения !гр1, как характеристика генома дрожжевого хозяина, обеспечивает эффективные условия выявления трансформации по росту в отсутствие триптофана.
Подходящие промоторные последовательности в дрожжевых векторах включают в себя промоторы для 3-фосфоглицераткиназы (Нйхтап е! а1., 1980) или других ферментов гликолиза (Некк е! а1., 1968; Но11аиб е! а1., 1978), таких как енолаза, глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа, гексокиназа, пируватдекарбоксилаза, фосфофруктокиназа, глюкозо-6-фосфатизомераза, 3-фосфоглицератмутаза, пируваткиназа, триозофосфатизомераза, фосфоглюкозоизомераза и глюкокиназа. При конструировании подходящих экспрессирующих плазмид последовательности терминации, ассоциированные с данными генами, также лигируют в экспрессирующий вектор в 3'-направлении от последовательности, которую требуется экспрессировать, для обеспечения полиаденилирования мРНК и терминации.
Другие промоторы, которые имеют дополнительное преимущество транскрипции, контролируемой условиями роста, включают в себя промоторную область алкогольдегидрогеназы 2, изоцитохрома С, кислой фосфатазы, ферментов деградации, ассоциированных с метаболизмом азота, и указанной выше глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы, и ферментов, ответственных за утилизацию мальтозы и галактозы. Подходящими являются любые плазмидные векторы, содержащие совместимые с дрожжами промоторы, точку начала репликации и последовательности терминации.
В дополнение к микроорганизмам в качестве хозяев также могут применяться культуры клеток, происходящих из многоклеточных организмов. В принципе любые такие клеточные культуры могут работать, происходят ли они из позвоночных или из беспозвоночных. Однако наиболее интересными являются клетки позвоночных, и размножение клеток позвоночных в культуре (культура ткани) в последние годы стало рутинной процедурой (Пккие Си1!иге, 1973). Примерами таких подходящих клеток линий хозяина являются клетки УЕКО и НеЬа, линии клеток яичников китайского хомячка (СНО) и клетки А138, ВНК, СОЗ-7 293, Зробор!ета Ггнд|регба (ЗЕ) (коммерчески доступные в виде полных экспрессирующих систем, среди прочих, от Рто!ет Заеисек, 1000 Векеатсй Ратк^ау, Мейбеп, СТ 06450, США, и от 1пуЦгодеп) линии клеток МОСК. По настоящему изобретению особенно предпочтительной клеточной линией является клеточная линия насекомых З2, доступная от 1№Йтодеи, РО Вох 2312,9704 СН Отошидеп, Нидерланды.
Экспрессирующие векторы для таких клеток обычно включают в себя (если необходимо) точку начала репликации, промотор, локализованный перед подлежащим экспрессии геном вместе с какими-либо необходимыми участками связывания рибосомы, участками сплайсинга РНК, участком полиаденилирования и последовательностями терминации транскрипции.
Для применения в клетках млекопитающих функции контроля экспрессирующих векторов часто предоставляются вирусным материалом. Например, обычно используемые промоторы происходят из
- 23 007810 полиомавируса, аденовируса 2. и чаще всего. из обезьяньего вируса 40 (8У40) или цитомегаловируса (СМУ). Ранний и поздний промоторы вируса 8У40 особенно применимы. поскольку оба получены просто из вируса в качестве фрагмента. который также содержит точку начала репликации вируса 8У40 (Είегк е! а1.. 1978). Также могут использоваться меньшие или большие фрагменты 8У40 при обеспечении того. что будет включена последовательность длиной примерно 250 н.п., простирающаяся от участка НшбШ до участка ВдИ. локализованного в точке начала репликации вируса. Кроме того. также возможно. и часто желательно использовать промотор или последовательности контроля. в норме ассоциированные с требуемой генной последовательностью при обеспечении того. что такие последовательности контроля совместимы с системами клетки хозяина.
Точка начала репликации может предоставляться конструированием вектора. чтобы он содержал экзогенную точку начала репликации. такую как происходящая из 8У40 или другого вируса (например. полиомавирус, аденовирус. У8У. ВРУ). или может предоставляться механизмом хромосомной репликации клетки хозяина. Если вектор интегрирован в хромосому клетки хозяина. последнего часто бывает достаточно.
Пример 1. Создание новых 4 конструкций мономера ГЕ5 с двумя эпитопами (Р2+Р30)
ГЕ5 является антипараллельным гомодимером. в котором С концы и Ν концы мономеров расположены в молекуле вплотную друг к другу. Это дает возможность связать два мономера в одну молекулу. весьма подобную четвертичной структуре димера дикого типа.
Авторами изобретения предложен подход. который использует либо эпитопы р2/Р30 в качестве линкера. либо вставку диглицинового линкера как описано ранее у Ь1 е! а1. 1997, ΡΝΑ8 И8А 94 (13): 6694-9.
Использованную во всей исследовательской работе молекулу ДНК. кодирующую природный ЫЬ5. приобретали в К & Ό ууЧепъ (ВВС16). Данная ДНК последовательность не включала в себя лидирующую последовательность ЫЕ5; поэтому добавляли синтетическую последовательность ДНК. кодирующую природный лидирующий пептид. Последовательности. кодирующие эпитопы Т-клеток Р2 и Р30 получали из столбнячного анатоксина. Данные последовательности встраивали в природную последовательность гена. предоставляя. таким образом. иммуногенные варианты ГЕ5. Вставки выполняют. сохраняя рамку считывания в гене ГЕ5.
Стратегия клонирования для получения вариантов основана на удлинении праймера или фрагментов ДНК с перекрыванием последовательности. Сперва два набора праймеров с комплементарными 5' концами. составляющими вставку. удлиняют в двух отдельных реакциях РСК. используя молекулу ДНК Кб те! в качестве матрицы и праймер фланкирующего вектора. После этого данные двойные нитевидные фрагменты. которые также. соответственно. имеют дополнительные 5'-концы, отжигают и удлиняют для того. чтобы включить полную вставку во вторую РСК. В заключение. фрагмент амплифицируют при помощи фланкирующих праймеров. Данные вставки затем расщепляют соответствующими эндонуклеазами. как и вектор. и вектор и вставки лигируют совместно. Данная процедура является модификацией процедуры «соединения посредством перекрывающего продления». описанной Нойои е! а1. 1989 и приведенной в Сштеи! ргоФсок ίη то1еси1аг Ью1оду (рр. 8.5. 7-9) 'ΊηΙΐΌάιιοΙίοη о£ а ροίηΐ ιηιιίαΐίοη Ьу 5ес.|иепЦа1 РСК ЧерУ Аи§аЬе1 е! а1.
Стандартные молекулярно-биологические способы и такие манипуляции с ДНК. как расщепление ферментами рестрикции. электрофорез в агарозном геле. выращивание и хранение клеток Е. со11 проводили с использованием стандартных молекулярно-биологических способов. описанных в лабораторном руководстве 8атЬгоок, ί.. Ег115сЬ. ЕЕ. & Машайк, Τ. 1989 и с использованием стандартных протоколов М & Е.
Пример 2. ЫЬ5.34 и ЫЬ5.35
Для того. чтобы получить эпитопы Т-клеток внутри молекулы. Р2 и Р30 встраивают началом к концу в качестве линкера между двумя мономерами ГЕ5. получая. таким образом. две конструкции ЫЕ5-Р30Р2-ЫЬ5 (ЫЬ5.34, зрелый пептид в 8Еф ГО Ν0: 5 и 6) и ЫЕ5-Р2-Р30-ЫЬ5 (ЫЬ5.35, зрелый пептид в 8Еф ГО Ν0: 7 и 8): обе конструкции ДНК кодируют лидирующую последовательность природного ГО5. приводя в результате к зрелому продукту экспрессии из 266 аминокислот. Продукты трансляции. получающиеся в результате данных конструирований. как подразумевают. сворачиваются в «мономерный димер ^5. то есть мономерную молекулу. которая имеет третичную структуру. которая очень сильно похожа на полную трехмерную структуру димерного ГО5.
Пример 3. ЫЕ5.36 & МЬ5.37
На основе предыдущих успешных поколений биологически активной мономерной «имитации димера ГО5» посредством вставки диглицинового линкера по ί. Ь1 е! а1. были сконструированы похожие. но иммуногенные конструкции с дополнительными эпитопами Т-клеток. Таким образом. вариант ЫЕ5.36 имеет структуру зрелого пептида в 8Еф ГО Ν0: 9 и 10 и вариант ЫЕ5.37 имеет структуру зрелого пептида в 8ЕО ГО Ν0: 11 и 12. Обе данные конструкции кодируются лидирующей последовательностью природного ГО5. за которой следуют первые 4 аминокислоты в Κά. за которыми. в свою очередь. следует первый встроенный эпитоп; другой эпитоп расположен на С-конце.
- 24 007810
Существует 2 основные причины, по которым Ν-концевой эпитоп не располагается на Ν-конце полной последовательности ГБ5 в этих двух конструкциях вместо того, чтобы стремиться сохранить последовательность ЫЬ5. Используя лидирующий пептид природного ЫЬ5 совместно с Ν-концом ЫЬ5, авторы изобретения гарантируют, что лидирующий пептид будет отщепляться правильно. И, поскольку Ν-конец в ГБ5 составляет подвижную область, он не важен для сохранения трехмерной структуры, полученной в результате конструкции.
Продукты трансляции, полученные в результате данных конструирований, по-видимому, сворачиваются в «мономерный димер ГО5», как описано в примере 2.
Пример 4. Уровни экспрессии
Описанные выше аналоги ГБ5 человека встраивали в множественные вектора, используемые для конструкций, вакцинации ДНК и рекомбинантной экспрессии в клетках насекомых, млекопитающих или Е. со11 с использованием стандартных способов для данной области.
Главным образом, используя стандартные экспрессионные системы и протоколы для клеток СО8 (преходящая экспрессия) и для клеток 82, было обнаружено, что уровни экспрессии были даже лучше, чем уровни экспрессии, полученные для конструкций, кодирующих белок ГБ5 дикого типа, и уровни экспрессии также превышали уровни экспрессии, полученные при экспрессии вариантов ЫЬ5, описанных в АО 00/65058.
Пример 5. Индукция перекрестно взаимодействующих антител против ГБ5
Описываемые в данный момент аналоги ГБ5 человека использовали в стандартных протоколах иммунизации мышей. Вкратце, мышей иммунизировали описанными выше вариантами из примеров 2 и 3. Мышиные антитела против ЫЬ5 выделяли посредством иммуноаффинной хроматографии и их активность против ЫЬ5 сравнивали с активностью мышиных антител, полученных против ЫЬ5 дикого типа. Результаты указывают на то, что антитела имели более высокий титр и также более высокую аффинность, чем антитела против аналогов, описанных в АО 00/65058.
Предварительные результаты также показали, что имитации мультимера по настоящему изобретению сохраняли, по крайней мере, некоторую специфическую активность ГБ5.
Пример 6. Получение вариантов ΤΝΕα
Синтетическая последовательность ДНК «8ΜΤΝΕΑΤ3» (8ЕО ГО NО: 16), кодирующая полипептид мономера ΤΝΕα человека дикого типа (8ЕО ГО NО: 17), получали в качестве продукта лигирования в Еп1с1ес1юп СтЬН. Последовательность ДНК человеческого ΙιΤΝΕα оптимизировали для экспрессии в Е. со11 согласно Со4оп Икаде Эа1аЬаке посредством удаления всех кодонов с частотой менее чем 10% для Е. со11. Далее последовательность конструировали так, чтобы включить участок рестрикции для последующих стадий клонирования.
Продукт лигирования 8ΜΤΝΕΑΤ3 вводили в вектор ТОРО В1ип1 рСВ 4, и были трансформированы клетки ΌΗ10Β Е. со11. ДНК плазмиды от 10 получившихся в результате клонов 8ΜΤNΕАΤ3ΤОΡО очищали, и выбирали пять клонов, содержащих необходимый фрагмент (при анализе путем расщепления ферментами рестрикции (ВЕ)).
Фрагменты ДНК КсоЕЕсоШ из пяти потенциально правильных клонов 8ΜΤNΕАΤ3ΤОΡО выделяли и переносили в вектор рЕТ28Ь (+) и определяли их последовательность. Вставки, делеции или замены определяли в четырех клонах, поскольку один клон, по-видимому, являлся правильным. Правильную конструкцию 8ΜΤΝΕΑΤ3ρΕΤ28 впоследствии использовали в качестве матрицы для получения всех единичных вариантов ΤΝΕα.
Пример 7. Конструкция ΤΝΕ34
Аминокислотную последовательность эпитопа РаиЭВ (8Е() ΙΌ ХОк: 7 и 20) вручную «обратно транслировали» в последовательность ДНК (8ЕО ГО NО: 19), оптимизированную для экспрессии в Е. со11, см. ниже, и встраивали в петлю 3 ΤΝΕα посредством 8ОЕ-РСВ.
Полученную в результате конструкцию (последовательность ДНК, кодирующую 8ЕО ГО NО: 18) помещали в вектор рЕТ28Ь+ для того, чтобы получить ΤNΕ34-ρΕΤ28Ь+.
Пример 8. Мономеризованная конструкция тримера
Мономеризованная конструкция тримера основана на 3 областях, кодирующих ΤΝΕα, разделенных или триглициновым линкером и/или областью, кодирующей эпитоп.
Ген ΤΝΕ-α синтезировали как три отдельные части. Три фрагмента собирали посредством 8ОЕРСВ, и собранный ген (8ЕО ГО ЫО: 21) клонировали в рСВ2.1-ТОРО. После подтверждения последовательности выделяли правильный клон. Ген 1ΤΝΕΤ_0 депе (8ЕО ГО ИО: 21, кодирующая ΤΝΕα01γ61γ61γ-ΤΝΕα-61γ61γ01γ-ΤΝΕα, 8ЕО ГО МО : 22, то есть 3 копии 8ЕО ГО МО : 17, разделенные двумя триглициновыми линкерами) затем переносили в рЕТ28Ь+ для того, чтобы получить ЬΤNΕΤ_0-ρΕΤ28Ь+. Выделяли правильный клон, последовательность подтверждали и трансформировали в линии Е. со11 ΒΕ21-8ΤΆΒ, ВЬ21-О0ЕО и НМ8174.
ΗΤNΕΤ_0-ρΕΤ28Ь+ использовали в качестве матрицы для того, чтобы получить следующие четыре мономеризованных варианта тримера: 1ΤΝΕΤ_1, 1ιΤΝΕΤ_2. 1ΤΝΕΤ_3 и 1ιΤΝΕΤ_4 (8ЕО ГО МО: 49, 51, 57 и
- 25 007810
59) посредством 80Е-РСК. Дальнейший вариант (8Еф ГО N0: 53) может быть получен подобным образом.
ΕΤΝΡΤ_1, 1ιΤΝΡΤ_2 и 1ιΤΝΡΤ_3 являются вариантами, включающими в себя эпитопы столбнячного анатоксина Р2 и Р30 (8Еф ГО N0: 3 и 5, соответственно), которые необходимо собирать посредством двух циклов 80Е-РСК. НТ№Т_4 представляет собой вариант со вставкой ΡΑΌΚΕ (8Еф ГО N0 : 7) и может быть собрана посредством одного цикла 8ОЕ РСК. Дальнейший вариант (8Еф ГО N0: 55) может быть получен подобным образом.
ЕТ№Т_4 конструировали посредством описанных выше способов, и в 10 клетках ТОР были обнаружены правильные клоны 11Т№Т_4-рЕТ28Ь+, и конструкцию переносили в клетки ВЬ21-8ТАК и НМ8174.
Для того, чтобы получить МКРТД ЬТ№Т_2 и ЬТ№Т_3 эпитопы встраивали посредством 80ЕРСК в очень маленький фрагмент тримера, который встраивали в ЬТ№Т_0-рЕТ28Ь+ посредством разрезания КЕ и лигирования.
Пример 9. Стабилизация мутантов Т№34
Для дальнейшей стабилизации описанного выше варианта Т№34-рЕТ28Ь+, были сконструированы варианты содержащие включение дополнительного дисульфидного моста, а также мутантную делецию. Были сконструированы 3 различных варианта:
Т№34-А-рЕТ28Ь+, содержащий замены О67С и А111 С, ΤNΡ34-В-рЕТ28Ь+. содержащий А96С и П18С и Т№34-С-рЕТ28Ь+, который содержит делению, в большинстве случаев, 8 ^концевых аминокислот; последовательности аминокислот продуктов экспрессии указаны в 8Еф ГО N0: 20, 30, и 31.
Все 3 конструкции были сделаны при помощи 80Е-РСК и клонированы в ВЕ21-8ТАК, ВЕ21-С0ЕЭ и НМ8174, что сопровождалось подтверждением последовательности.
Пример 10. Варианты гибких петель
Для того, чтобы обнаружить вариант, который мог бы проявлять улучшенные характеристики по сравнению с вариантом Т№34-рЕТ28Ь+, были сделаны конструкции, где вставку РАОКЕ (8Еф ГО N0: 7) перемещали в гибкую петлю 3 молекулы Т№-«.
Все из них: Т№35-рЕТ28Ь+, Т№36-рЕТ28Ь+, Т№37-рЕТ28Ь+, ΤNΡ38-ρЕΤ28Ь+. Т№39-рЕТ28Ь+ и вариант с РАОКЕ, расположенной на С конце молекулы; Т№С2-рЕТ28Ь+ были сделаны при помощи способа 80Е-РСК и были клонированы в ВЬ21-8ТАК, ВЕ21-С0ЕЭ и НМ8174, что сопровождалось подтверждением последовательности. Последовательности аминокислот продуктов экспрессии указанны в 8Е6) ГО N0: 23, 24, 24,26, 27 и 28.
Также для того, чтобы оценить возможность использования клеток насекомых в качестве экспрессионной системы, ТЖ\УТ, Т№34, Т№35, Т№36, Т№37, Т№38, Т№39 и Т№С2 переносили в вектор ρ2Ζορ2ί (ср. фиг. 1) и экспрессировали в клетки насекомых 82.
Пример 11. Другие конструкции
Было приготовлено большое количество дальнейших вариантов Τ№α, все названы Т+Х, ср. выше. ДНК, кодирующую данные варианты, получили при помощи 80Е-РСК и клонировали непосредственно в рЕТ28Ь+.
Правильные клоны Т>.Х трансформировали в ВЬ21-8ТАК и НМ8174 и последовательность впоследствии подтверждали.
Пример 12. Периплазматическая экспрессия
Лидирующую последовательность ЬТВ добавляли в Т№34-рЕТ28Ь+ непосредственно выше 8Еф ГО N0:16 для достижения экспрессии в периплазматическом пространстве.
Пример 13. Экспрессия у млекопитающих
Для того, чтобы проверить экспрессию в клетках млекопитающих, 8Еф ГО N0:16 и ДНК, кодирующую Т№34 переносили в вектор рНР 1, который является вариантом коммерчески доступного вектора ρί.Ί (Рготеда СогрогаНоп). рНР1 включает в себя ген устойчивости к канамицину в качестве маркера вместо гена АтрК в рСТ
Пример 14. Совместная экспрессия СгоЕЬ и СгоЕ8
Экспрессия комплекса шаперонов в Е. со16 СгоЕЬ/Е8, как раннее было описано, увеличивает экспрессию растворимых мутантов ΊΉΡα (1еопд, е! а1 1997, Вю1есйпо1оду 1еиег5, уоС 19, по., 6 р. 579582). Для того, чтобы проверить может ли совместная экспрессия СгоЕЬ/Е8 улучшить экспрессию вариантов Т№г, как описано здесь, использовали плазмиду, содержащую оперон СгоЕЬ/Е8 из Е. сой под контролем его природного промотора. Данную плазмиду совместно трансформировали в НМ8174 вместе с ДНК, кодирующей либо \у1ТЖа, либо Т№34, либо Т№37. Двойные трансформанты отбирали, помещая их на плашки, содержащие как канамицин, так и карбициллин, которые являются двумя подходящими маркерами селекции. Затем двойные трансформанты идентифицировали посредством анализа КЕ, для того, чтобы проверить наличие обеих плазмид в одном и том же самом клоне.
В предварительном эксперименте, клетки выращивали при температуре 37°С до 00600=0,6-1, после чего следовал тепловой шок в течение 30 мин при температуре 42°С. Контрольную фракцию клеток
- 26 007810 не подвергали тепловому шоку, и все клетки разбавляли 5 раз в среде ЙБ, содержащей 1 мМ ΓΡΤΟ, и выращивали при температуре 25°С.
Клетки собирали и оба супернатанта и лизаты анализировали на предмет экспрессии ΤΝΡα. Для того, чтобы оценить экспрессию СгоЕБ/Е8 проводили окрашивание кумасси.
В данном эксперименте никакого улучшения при добавлении шаперонов не наблюдали. Это произошло, главным образом, из-за того, что авторы изобретения получили почти 100% растворимого материала в данном эксперименте, даже в отсутствие шаперонов. Впрочем, авторы изобретения проверят улучшение для других вариантов по изобретению, если они окажутся менее растворимыми вариантами.
Пример 15. Экспрессия Е. сой
Экспрессию растворимых вариантов ΤΝΡα в трех различных штаммах Е. сой проверяли в лабораторных ферментерах, а также в колбах для встряхивания. Использованным оборудованием для ферментации являлась Ыоге йегтеШог 8у81еш с рабочим объемом 1 л. Тремя проверяемыми штаммами Е. сой являлись: НМ8174, БЕ21 8ΤΑΚ и ББ21 СОЙЭ. Среда, использованная для ферментации, представляла собой определенную минимальную среду с глюкозой в качестве единственного источника углерода.
Одна из основных задач заключалась в определении оптимальных параметров процесса ферментации (особенно температуры и концентрации ΣΡΤΟ) с тем, чтобы оптимизировать экспрессию растворимых вариантов ΤΝΡα.
Параметры процесса:
Параметр Устанавливаемое Диапазон Рабочий предел значение
рН | 7,0 | 6,5-7,5 | <6,4-7,6 |
Начальная | 37°С | 36-38°С | <36->38°С |
температура Температура | 25°С | 24-26°С | <24->26°С |
индукции Давление ϋθ2 | 30% | 0-100% | >90% в течение более 4 часов |
мешалка | 1000 об./мин. | 1000-1500 | - |
Было обнаружено, что одной подходящей схемой являлась следующая схема: концентрация ΓΡΤΟ равнятся 0,5 мМ и температура при индукции снижается до 25°С. Общее время ферментации находится в пределах от 14 до 18 ч, включая сюда размножение, индукцию и продукцию белка. Общее время ферментации зависит от роста культуры. Начальная ΘΌ600 в ферментере находится обычно в пределах между 0,1-0,3 (2-6 в предварительной культуре), как рассчитано из ΘΌ в культуре инокуляции. Индукцию культуры проводили при ΘΌ600=20±1-2 или с девяти до одиннадцати часов после инокуляции. Продукция белка затем происходит в течение от трех до пяти часов.
Альтернативно: экспрессию вариантов ΤΝΡ-α проводят, воспользовавшись низкотемпературной культурой для того, чтобы избежать внутриклеточной преципитации белков вариантов с тельцами включения. Рост культуры до необходимой ΘΌ осуществляют при той же температуре, что и для действительной индукции для того, чтобы избежать «шока» для клеток при изменении температуры от оптимальной температуры для роста (37°С) до более низкой температуры индукции (25°С). Используя данный метод, полагают, что единственным воздействием, применяемым к клеткам, является действительная индукция посредством ΣΡΤΟ; во всяком случае, этот способ недавно обеспечил значительно улучшенный выход растворимого продукта экспрессии. Создавая небольшие культуры в течение ночи и приготавливая более 1 л среды ЙБ заблаговременно за день, образование материала в больших культурах ББ можно провести приблизительно за 9 ч, в то время как период действительной индукции проходит за ночь (через 16-20 ч). Следовательно, предпочтительный способ можно описать как нижеследующий: экспрессию варианта ΤΝΡα проводят в 2x2 л колбах для встряхивания с перегородками, содержащих 1 л среды ББ, каждая с единственной модификацией вышеуказанного способа, заключающейся в том, что клетки (ББ21 8ΤΑΚ) выращивают при температуре 25°С до ΟΌ436 0,7, после чего клетки индуцируют 1 мМ ФБС и позволяют продуцировать белок в течение 20 ч (все еще при температуре 25°С).
Пример 16. Селекционные анализы
Прямой ЕБКА рецептора совместно с поликлональным ЕЙ18А и цитотоксический анализ с клетками ΚΌ-4 и ^ей1 использовали в качестве анализов первой очереди для скрининга и последующей очистки. Антитела, полученные против вариантов ΤΝΡα, использовали для ингибирования связывания νΐΤΝΡα как с рецептором, так и при цитотоксическом анализе, для того, чтобы охарактеризовать качество антитела.
Пример 17. Процедуры очистки
В данном примере подробно описана рекомбинантная продукция и последующая очистка одного из вариантов ΤΝΡα (ΤΝΕ37). Однако процедура очистки является предпочтительной согласно настоящему
- 27 007810 изобретению и будет также применима (с небольшими поправками, соответствующими каждому варианту) для других вариантов ΤΝΡα по настоящему изобретению.
Колонию ΤΝΡ37 штамма ВЬ21 8ΤΑΚ Е. сой из плашки с ЬВ и канамицином (60 мг канамицина/л среды ЬВ, содержащей 1,5% агар) ресуспендируют в 5 мл среды ЬВ (60 мг канамицина/л ЬВ) и выращивают в течение ночи (16 ч) при температуре 37°С, встряхивая с 220 об./мин на шейкере №\ν Вгаигютюк.
2x2 мл данной культуры переносят к 2x1 л ЬВ (60 мг канамицина/л) в колбы для встряхивания с перегородками объемом 2 л и на шейкере №\ν Вгаипотюк при 220 об./мин позволяли клеткам расти до 0Ό436=0,6-0,8. Данную стадию выполняли при типовых температурах 37 и 25°С, но температуру можно оптимизировать для каждой культуры.
мл 1М ΓΡΤΟ добавляют в каждую колбу и позволяют клеткам расти в течение 16-20 ч. Перед индукцией температура корректировалась до 25°С, если она уже не являлась температурой ферментации.
Клетки собирают в пробирки для центрифуги (500 мл) посредством центрифугирования при 5000 об./мин. в течение 15 мин, используя насадку 8ЙА-3000 в центрифуге 8огуа11.
Клетки переносят в одну предварительно взвешенную пробирку для центрифуги объемом 500 мл, используя 0,9% №С1, и собирают клетки посредством центрифугирования как и ранее.
Супернатант убирают, и пробирку взвешивают для того, чтобы определить клеточный вес (должно быть 7-11 г).
Добавляют 200 мл 50 мМ №2ΗΡ04, рН=7,0 (если клетки ресуспендируют, их следует использовать сразу же, в ином случае возможно замораживание).
Разрушение клеток, центрифугирование и фильтрация
Механическое разрушение клеток обеспечивает несколько преимуществ над ферментативным разрушением с точки зрения эффективности, надежности и возможности выбора любого буфера, необходимого для последующих стадий очистки. АРУ-1000 содержат холодным во время работы, добавляя ледяную воду в ячейку для образца до использования и пропуская ледяную воду через устройство между двумя пассажами образца. Центрифугирование и фильтрация служат для удаления любых частиц или агрегатов из раствора перед хроматографическим разделением белков. Разрушение клеток и НАхроматографию следует проводить в тот же день, так как это может минимизировать вероятную протеазную активность как следствие отделения их на хроматографической стадии. Процедура разрушения, центрифугирования и фильтрации осуществляется следующим образом:
Тщательно ресуспендированный клеточный материал переносят в устройство для разрушения клеток (АРУ-1000). Суспензию клеток тщательно пропускают 2х через устройство для разрушения клеток (охлаждая на льду после каждого пассажа и пропуская ледяную воду через АРУ-1000 между пассажами), используя 700 бар обратного фильтрационного давления (раствор должен быть чистым на этом этапе).
Разрушенные клетки переносят в пробирки для цетрифугирования объемом 500 мл, и клетки крутят в течение 45 мин при 10000 об./мин на центрифуге 8о1ха11, используя насадку 8ЙА-3000.
Экстракт (приблизительно 225 мл) пропускают через фильтр 0,22 мкм.
Гидроксиапатитная (НА) хроматография
Гидроксиапатитный гель В|о-Се1 ΗΤΡ (ВЮ-КАЛ; № по каталогу 130-0420) является кристаллической формой фосфата кальция, доказавшей себя в качестве уникального средства в разделении таких белков, как моноклональные антитела и других белков, иначе не способных разделиться посредством других способов. Тем не менее, по опыту авторов изобретения реологические свойства материала, до некоторой степени, являются критичными в том смысле, что поток более чем 2 мл/мин увеличивает давление до неприемлемо высокого уровня. Также материал несколько раз разрушался, если совершались попытки восстановления гидроксидом натрия, как рекомендовано производителем.
Буферы и колонка
Маточный раствор для буфера А+В: 1М Ν2ΗΡ04χ2Η20, рН=7,0 (рН доводится до 7 при помощи НС1). Буферы А+В приготавливают разбавлением маточного раствора.
Буфер А: 50 мМ №2ΗΡ04χ2Η20, ρΗ=7,0
Буфер В: 0,3М №2ΗΡ04χ2Η20, ρΗ=7,0
Колонка, заполненная приблизительно до 50-60 мл гидроксиапатитным гелем В|о-Се1 ΗΤΡ (ВЮΚΛΌ; № по каталогу 130-0420) с использованием суспензии в буфере А, и колонка ХК 26/40 (Атегкйат Вю8с1епсе8).
Программа хроматографии
Очистить систему 20 мл при потоке 30 мл/мин.
Уравновешивание: 4 СУ буфера А при потоке 2 мл/мин
Загрузить образец через насос (входной канал Ρ в ВюСаб) (приблизительно 225+5-10 мл, если необходимо заполнение трубок образцом) при потоке 2 мл/мин.
Промыть колонку 1,5 СУ буфера А при потоке 2 мл/мин.
Элюирование: Элюировать белок с градиентом 4 СУ от 0 до 100% буфера В при потоке 2 мл/мин.
Очистить колонку 2 СУ буфера В при потоке 2 мл/мин.
Повторное уравновешивание 4 СУ буфера А при потоке 2 мл/мин.
- 28 007810
Выбрать фракции, объединить и диализировать при температуре 4°С против 15х объем 20 мМ ΤπδНС1, 0,075М №С1, рН 8,0.
Выбор фракций, содержащих ΤΝΡ37, после НА-хроматографии
НА-хроматографический профиль фракции элюирования в основном состоит из «проходящей» фракции и одного элюированного пика, который можно разделить на несколько пиков. Фракцию, содержащую ΤΝΡ37, необходимо выбирать на основе окрашенного кумасси геля полного пика, так как пик, содержащий ΤΝΡ37, прямо не опознается. Тем не менее, как результат последующих стадий очистки, выбор фракций на данном этапе является менее критичным, и возможно удаление загрязняющих веществ позднее по процедуре. Таким образом, менее консервативный выбор фракций обеспечивает максимальный выход варианта.
Первоначально «проходящую» фракцию проверяли при помощи «дот-блота» на наличие какоголибо ΤΝΡ37. Это дало положительный результат, который теоретически следует указывать, что значительная часть варианта не связалась с колонкой. Тем не менее, если подвергнуть «проходящую» фракцию очень эффективной катионобменной хроматографии на 8Р-сефарозе (ср. со следующей стадией), и фракции анализировать при помощи окрашенных кумасси гелей, то они не содержат какого-либо определяемого варианта ΤΝΡ37, указывая на некоторую ложноположительную реакцию в «дот-блоте» или на фракцию варианта, которая связывается совершенно по-другому с 8Р-сефарозой.
Катионобменная хроматография на 8Р-сефарозе
8Р-сефароза является основной катионобменной стадией, выбранной как следствие довольно высокого расчитанного рI 9,4 варианта по сравнению с рI 7,8 для \\1ΤΝΡα. Данное увеличение рI является следствием 2 лизинов, введенных посредсвом эпитопа РЛЭКЕ. Данная хроматография является очень эффективной и быстрой для варианта ΤΝΡ37, и , как ожидают, является пригодной для большого количества других вариантов петель ΤΝΡα.
Наносимый образец должен иметь меньшую проводимость, чем 8 мС/см и рН должно быть по крайней мере 7,7 до возобновления хроматографии на 8Р-сефарозе, поскольку варьирование этого, по опыту авторов изобретения, время от времени делало свойства связывания белка различными.
Буферы и колонка
Маточный раствор для буфера А+В: 1М Τπδ-ΗΟ. рН=8,0.
Буфер А: 20 мМ ΤτΕ-ΗΟ, 0,075М №С1, рН=8,0.
Буфер В: 20 мМ Τήδ-Ηα, 1М №С1, рН=8,0.
Колонка, заполненная приблизительно 60 мл РР 8Р-сефарозой (Лтегайат Вюкшеисек; № по каталогу: 17-0729-01)) с использованием суспензии в буфере А и колонка ХК 26/40 (Лтегайат Вю8с1еисе8) .
Программа хроматографии
Очистить систему 20 мл при потоке 30 мл/мин. Уравновешивание: 4 СУ буфера А при потоке 4 мл/мин. Загрузить образец через насос (входной канал Р в ВюСаб) (образец + 10 мл, если необходимо заполнение трубок образцом) при потоке 4 мл/мин.
Промыть колонку 1,5 СУ буфера А при потоке 4 мл/мин. Элюирование: Элюировать белок с градиентом 4 СУ от 0 до 100% буфера В при потоке 4 мл/мин.
Очистить колонку 2 СУ буфера В при потоке 4 мл/мин. Повторное уравновешивание 4 СУ буфера А при потоке 4 мл/мин.
Выбрать фракции, объединить и диализировать при температуре 4°С против 15х объем 20 мМ ΤπδНС1, 0,075М №С1, рН 8,0.
Выбор фракций, содержащих ΤΝΡ37, после хроматографии на 8Р-сефарозе
Профиль в основном состоит из «проходящей» фракции и нескольких пиков, содержащих белки. Однако два пика содержат варианты с некоторыми загрязняющими веществами. На данном этапе важно не включать слишком много фракций с правой стороны пика два, поскольку он по опыту авторов изобретения включает в себя слишком много загрязняющих веществ, которые не удаляются легко в последующих хроматографических стадиях.
Анионобменная хроматография на О-сефарозе
Анионобменная хроматография на О-сефарозе является основной анионобменной стадией, выбранной для удаления основных загрязняющих белков, которые с высокой воспроизводимостью сопровождают очистку ΤΝΡ37, включая НА-хроматографию и хроматографию на 8Р-сефарозе. Сам вариант ΤΝΡ37 не связывается с колонкой, но основные неизвестные загрязняющие вещества связываются. Тем не менее, возможно выбрать фракции консервативным образом уже на стадии 8Р-сефарозы, избегая таким способом загрязнения. Тем не менее, это ухудшает выход варианта ΤΝΡ37 по сравнению с тем, когда по процедуре используется О-сефароза, и так как другие минорные загрязнения также удаляются на данной стадии, предпочтительно включать его в общую процедуру. В заключение, стадия О-сефарозы важна для очистки варианта 37 и дает даже лучший конечный продукт с высоким выходом.
Буферы и колонка
Маточный раствор для буферов А+В: 1М 'Ггк-НС!. рН=8,0.
Буфер А: 20 мМ ^-НС! 0,075М №С1, рН=8,0.
- 29 007810
Буфер В: 20 мМ 1лз-НС1, 1М №С1, рН=8,0.
Колонка, заполненная приблизительно 50-60 мл ЕЕ Р-сефарозой (Атегзйат Вюзыепсез; № по каталогу: 17-0510-01) с использованием суспензии в буфере А и колонка ХК 26/40 (Атегзйат В1озс1епсез).
Программа хроматографии
Очистить систему 20 мл при потоке 30 мл/мин.
Уравновешивание: 4 СУ буфера А при потоке 4 мл/мин.
Загрузить образец через насос (входной канал Е в ВюСаб) (образец + 10 мл, если необходимо заполнение трубок образцом) при потоке 2 мл/мин.
Промыть колонку 3 СУ буфера А при потоке 4 мл/мин.
Элюирование: Элюировать оставшийся белок 2 СУ 100% буфера В при потоке 4 мл/мин.
Повторное уравновешивание 4 СУ буфера А при потоке 4 мл/мин.
Выбрать фракции, объединить и нанести непрседственно на колонку с 8Р-сефарозой.
Профиль элюции в основном состоит из «проходящей» фракции и нескольких пиков, содержащих белок. Иногда «проходящую» фракцию можно разделить на несколько разрешенных пиков без примесей, все из которых содержат вариант Τ^ΑΊ и, следовательно, все объединяются. Данная гетерогенность 1^^37, вероятно, разрешится, когда разрешится проблема очевидной протеолитической деградации.
Пример 18. Исследования иммунизации
Материалы:
соль (0,9% №1С1 в стерильной воде, Егезепшз КаЫ №где А8, №г\\'ау);
полный адъювант Фрейнда (81дта, Е-5881,39Н8926); неполный адъювант Фрейнда (81дта, Е-5506,60К8937); алгидрогель 2% [10 мг А1/мл] (ВгепШад ВюзесЮг, Ва1с11 96 (3176)); адъюфос [5 мг А1/мл] (ВгепШад ВюзесЮг, Ва1с11 2 (8937));
человеческий ΤNЕ дикого типа Ппуйгодеп номер по каталогу: 10062-024).
КУМ-Ш4: предоставлен А. Меадег (А. Меадег, 1. 1ттипо1. Мебюбз 1991,144 : 141-143).
Клон 13 АЕН1 164: предоставлен Т. Езребк (Τ. Езребк апб 1. №ззеп-Муег, 1. 1ттипо1. Мебюбз 1986,95 : 99-105).
Соль тетразолия (МЕЗ, Се11111ег 96 Ациеоиз опе зо1и!юп; Рготеда, 63581).
Вращающаяся платформа (Ко1ат1х, Не!о, Эептагк)
Вортекс (0ЬЕ Э1СН шзйитеп1такегз Ар8, Эептагк)
Выбор композиции/адъюванта
Очищенные белковые варианты ΤΉΡα (в 20 мМ Ег1з-НС1, 0,075М №С1, рН 8,0) разбавляют до 0,5 мг/мл солью (0,9% №С1), группируют (375 мкг/ампулу) и хранят при температуре -20°С до использования при иммунизации.
Для каждого варианта !’№, иммунизации проводят с двумя адъювантами: 1) полный адъювант Фрейнда (СЕА, для первичной иммунизации) и неполный адъювант Фрейнда (ГЕА, для стимулирующей иммунизации) и 2) алгидрогель или адъюфос (в данной области адъюванты гидроксида алюминия и фосфата алюминия, соответственно): их используют как для первичной, так и для стимулирующей инъекций.
Перед первичной иммунизацией принимается решение о выборе либо алгидрогеля, либо адъюфоса в качестве адъюванта для варианта !’№. Для дальнейшего использования в эксперименте иммунизации выбирают адъювант с наилучшей способностью адсорбировать вариант 1^. Две аликвоты варианта ЮТа смешивают с равным количеством алгидрогеля и адъюфоса в двух ампулах. Содержимое ампулы аккуратно перемешивают при комнатной температуре в течение 30 мин на вращающейся платформе. Затем ампулы центрфугируют при 13000 д в течение 15 мин и супернатант проверяют на наличие растворимого варианта ΉΡ на градиентном (4-12%) δΌδ-геле. Аликвоту адъювант/вариант, содержащую по крайней мере три варианта (то есть, где больше вариантов связалось с алюминиевыми частицами) затем выбирали как наилучший адъювант.
Приготовление эмульгата антиген/адъювант:
Эмульгаты СЕА/ГЕА приготавливают посредством следующей процедуры:
Ампулы с вариантом Τ^α [0,5 мг/мл] размораживают, переносят в стерильную ампулу объемом 10 мл и смешивают с равным объемом СЕА или ГЕА. Содержимое ампулы затем перемешивают далее на вортексе при 3300 об./мин в течение 30 мин при температуре 20°С.
Эмульгаты алгидрогель/адъюфос приготавливают посредством следующей процедуры: алгидрогель/адъюфос разбавляют солью до 1,4 мг А1/мл.
Ампулы с вариантом Τ^α [0,5 мг/мл] размораживают, переносят в стерильную ампулу объемом 10 мл и смешивают с равным объемом алгидрогеля [1,4 мг А1/мл] или адъюфоса [1,4 мг А1/мл]. Ампулу затем мешают далее на вращающейся платформе в течение 30 мин при температуре 20°С.
Выбор модели животных
Самок мышей Ва1Ь/Са в возрасте шесть-восемь недель иммунизировали с повторениями вариантами ЮТи. Образцы крови собирают в разные интервалы, и выделенные сыворотки исследуют на титры
- 30 007810 антител против \\1ΤΝΕα. Мышей заказывают в Тасошс Еагтк, Шс. Лсс.|шге5 М & В А/8, Эептагк. До начала эксперимента мышей содержат в помещении для животных РБагтеха в течение одной недели.
Схема иммунизации и дозировка
Группы 10 + 10 мышей иммунизируют каждым вариантом ΤΝΕα с СЕА/ГЕА и алгидрогелем/адъюфосом, соответственно. 20 + 20 мышей используют для иммунизации ΤΝΕα дикого типа.
При первой иммунизации 50 мкг белка с адъювантом вводят подкожно. Все мыши получают дополнительную стимулирующую иммунизацию подкожно 25 мкг белка с адъювантом через 2, 6 и 10 недель после первой иммунизации.
Образцы крови собирали непосредственно перед первой иммунизацией и через 1 неделю после каждой стимулирующей иммунизации.
Используемые анализы
Биологический анализ цитотоксичности с использованием клеток клона 13 ХУЕШ 164 или клеток КУМ-Ш4: данный анализ используют для того, чтобы определить токсичность вариантов ΤΝΕα по изобретению. Клетки культивируют в течение 48 ч в присутствии титруемых количеств вариантов ΤΝΕα, и гибель клеток определяли посредством добавления соли тетразолия (ΜΤ8), которая биодеградирует в живых клетках с образованием окрашенного продукта формазана. Цитотоксичность вариантов ΤΝΕα сравнивают с цитотоксичностью человеческого ΤΝΕα дикого типа.
Биологический анализ ингибирования цитотоксичности с использованием клеток клона 13 ХУЕШ 164 или клеток КУМ-Ш4: данный анализ используют для того, чтобы исследовать способность антисывороток, полученных у иммунизированных ΤΝΕα мышей, нейтрализовать цитотоксический эффект ΤΝΕα дикого типа. Клетки культивируют в течение 48 ч с титруемыми количествами антисывороток и постоянной концентрацией человеческого ΤΝΕα дикого типа, которая достаточна для индукции клеточной гибели у 50% клеток в отсутствие антисывороток. Клеточную гибель определяли посредством ΜΤ8, как описано выше. Нейтрализующую способность сывороток иммунизированных вариантом ΤΝΕα мышей сравнивают с сыворотками, полученными от мышей, иммунизированных человеческим ΤΝΕα дикого типа ΤΝΕα.
Исследования ίπ νίΙΐΌ
Биологический анализ цитотоксичности с использованием клеток клона 13 ХУЕШ 164 или клеток КУМ-Ш4: биологический анализ ингибирования цитотоксичности с использованием клеток клона 13 ХУЕШ 164 или клеток КУМ-Ш4.
Критерии выбора наилучших иммуногенных конструкций
Варианты ΤΝΕα должны проявлять минимальную цитотоксичность. Иммунизация мышей вариантами ΤΝΕα должна приводить к образованию антисывороток с лучшей или такой же способностью нейтрализовать цитотоксичность, опосредованную человеческим ΤΝΕα дикого типа, в клетках ХУЕШ или КУМ-Ш4, как сыворотки, полученные от мышей, иммунизированных человеческим ΤΝΕα дикого типа
- 31 007810
Список последовательностей <110> РЬагтеха А/3 <120> НОВЫЕ ИММУНОГЕННЫЕ МИМЕТИКИ МУЛЬТИМЕРНЫХ БЕЛКОВ <130> Ρ1013ϋΚ00 <160> 60 , <170> РаЬепЫп νβΓ3Ϊοη 3.1 <210> 1 <211>115 <212> Белок <213> Ьото зархепз <400>1
11е 1 | Рго ТЬг | С1и | 11е 5 | Рго ТЬг | Зег | А1а Ьеи Уа1 10 | Ьуз | С1и ТЬг Ьеи 15 | А1а | ||||||
Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | Нхз | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | 11е | А1а | Азп | С1и | ТЬг | Ьеи | Агд |
О А | О с | □ А | |||||||||||||
V | V | ||||||||||||||
11е | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | Нхз | Ьуз | Аз η | Η13 | С1п | Ьеи | Суз | ТЬг | С1и | С1и | Не |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
РЬе | С1п | С1у | 11е | С1у | ТЬг | Ьеи | С1и | Зег | С1п | ТЬг | Уа1 | С1п | С1у | С1у | ТЬг |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Уа1 | С1и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз | Аз η | Ьеи | Зег | Ьеи | 11е | Ьуз | Ьуз | Туг | 11е | Азр |
65 | 70 | 75 | 8 θ’ | ||||||||||||
61у | С1П | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | С1и | С1и | Агд | Агд | Агд | Уа1 | Азп | С1п | РЬе |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | 61п | С1и | РЬе | Ьеи | С1у | Уа1 | МеЕ | Азп | ТЬг | С1и | Тгр | Не |
100 | 105 | 110 |
Не С1и Зег
115 <210> 2 <211>45 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Эпитоп Р2 столбнячного анатоксина
- 32 007810 <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(45) <223>
<400>2 сад Рас аЪс ааа дек аас Ьсс ааа ЬЬс акс ддс акс асе даа сЬд45
О1п Туг Не Ьуз А1а Азп Зег Ьуз РЬе 11е С1у 11е ТЬг С1и Ьеи 15 1015 <210>3 <211>15 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Эпитоп Р2 столбнячного анатоксина <400> 3
С1п Туг 11е Ьуз А1а Азп Зег Ьуз РЬе 11е С1у 11е ТЬг С1и Ьеи
1 | 5 | 10 |
<210> | 4 | |
<211> | 63 | |
<212> | днк | |
<213> | Искусственная последовательность | |
<220> | ||
<223> | Эпитоп РЗО столбнячного | анатоксина |
<220> | ||
<221> | СОЗ | |
<222> | (1)··(63) | |
<223> | ||
<400> | 4 |
ЪЪс аас РЬе Азп 1 | аас Азп | Ьёс асе дЬР | Ьсс ЬЬс Рдд сЬд сде дЬЪ | сса ааа д+Ь Ьсс | 48 | ||||||||||
РЬе | ТЬг 5 | Уа1 | Зег РЬе Тгр | Ьеи 10 | Агд Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 Зег 15 | |||||||
дсЬ | Рсс | сас | сЬд | даа | 63 | ||||||||||
А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | С1и | |||||||||||
20 |
<210> 5 <211> 21 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Эпитоп РЗО столбнячного анатоксина <400> 5
- 33 007810
РЬе Азп Азп РЬе ТЬг Уа1 Зег РИе Тгр Ьеи Агд Уа1 Рго Ьуз Уа1 Зег | ||||
1 | 5 | 10 | 15 | |
А1а Зег ΗΪ3 | Ьеи 20 | С1и | ||
<210> 6 <211> 39 <212> ДНК |
<213> Искусственная последовательность <220>
<223> | Связывающий | все | типы ΏΒ | пептид | (ΡΑϋΗΕ) | |||||
<220> | ||||||||||
<221> | СОЗ | |||||||||
<222> | (1). | . (39) | ||||||||
<223> | ||||||||||
<400> | 6 | |||||||||
дсс аад | ί+с | дкд дсс | дек | кдд | асе | скд | аад | дсс дса | дек | 39 |
А1а Ьуз | РЬе | Уа1 А1а | А1а | Тгр | ТИг | Ьеи | Ьуз | А1а А1а | А1а | |
1 | 5 | 10 |
<210> 7 <211> 13 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Связывающий все типы ΌΚ пептид <400>7
А1а Ьуз РЬе Уа1 А1а А1а Тгр ТНг Ьеи Ьуз А1а А1а А1а 1510 <210> 8 <211>858 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 2 мономера человеческого 1Ь5, соединенные эпитопами РЗО и Р2 <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(855) <223>
<220>
<221> зрелый пептид <222> (58)..() <223>
- 34 007810 <220>
<221> сигнальный пептид <222> (1)..(57) <223>
<400> ι | В | |||||||||||||||
акд МеЬ | адд Агд | акд Мек | си Ьеи | сЬд Ьеи -15 | сак ΗΪ3 | Нд Ьеи | адЕ Зег | Нд сЬд Ьеи Ьеи -10 | дек А1а | сП Ьеи | дда 61 у | дек А1а | дсс А1а -5 | Ьас Туг | 48 | |
дЕд | как | дсс | акс | ссс | аса | даа | аП | ссс | аса | адЬ | дса | Нд | дкд | ааа | дад | 96 |
▼ 1 _ | 61и | |||||||||||||||
УЙХ | ±уг | л±а | ххё | гГО | 1Ϊ1Ι | 1зли | не | ГХ'О | гиг | оег | л±а | ьеи | νβχ | ьуз | ||
-1 | 1 | 5 | 10 | |||||||||||||
асе | ЬЬд | дса | скд | си | ЬсЕ | асЬ | саЪ | еда | аск | скд | сьд | ака | дсс | ааЪ | дад | 144 |
ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | 11е | А1а | Азп | 61и | |
15 | 20 | 25 | ||||||||||||||
аск | скд | адд | аЬЬ | ссЕ | дН | ссЕ | дЬа | саЬ | ааа | аак | сас | саа | скд | Еде | асЬ | 192 |
ТЬг | Ьеи | Агд | 11е | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | ΗΪ3 | Ьуз | Азп | ΗΪ3 | 61п | Ьеи | Суз | ТЬг | |
30 | 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
даа | даа | аЬс | ΐζΐζΐζ | сад | дда | ака | ддс | аса | Ид | дад | адЬ | саа | асЬ | дЬд | саа | 240 |
С1и | 61и | 11е | РЬе | С1п | 61у | 11е | 61у | ТЬг | Ьеи | 61и | Зег | 61п | ТЬг | Уа1 | 61п | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ддд | ддь | аск | дкд | даа | ада | ска | Нс | ааа | аас | Ид | Ьсс | На | ака | аад | ааа | 288 |
С1у | 61у | ТЬг | Уа1 | 61и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | Не | Ьуз | Ьуз | |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||||
Еас | аЬЪ | дас | ддс | саа | ааа | ааа | аад | ЬдЬ | дда | даа | даа | ада | едд | ада | дка | 336 |
Туг | Не | Азр | 61у | С1п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз | 61у | 61и | 61и | Агд | Агд | Агд | Уа1 | |
80 | 85 | 90 | ||||||||||||||
аас | саа | ЬЕс | ска | дас | Ьас | сЬд | саа | дад | НЕ | сП | ддь | дка | акд | аас | асе | 384 |
Азп | С1п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | 61п | 61и | РЬе | Ьеи | 61у | Уа1 | Мек | Азп | ТЬг | |
95 | 100 | 105 | ||||||||||||||
дад | Сдд | аЬа | ака | даа | адЬ | Нс | аас | аас | Нс | асе | дЬд | аде | Нс | кдд | скд | 432 |
С1и | Тгр | 11е | 11е | 61ц | Зег | РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | |
110 | 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
сдс | д+д | ссС | аад | д^д | аде | дсс | аде | сас | скд | дад | сад | кас | акс | аад | дсс | 480 |
Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | 61и | 61п | Туг | 11е | Ьуз | А1а | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
аас | Ьсс | аад | ЕЕс | акс | ддс | акс | асе | дад | сЬд | акс | ССС | аса | даа | аН | ССС | 528 |
Азп | Зег | Ьуз | РЬе | 11е | 61у | 11е | ТЬг | 01 и | Ьеи | Не | Рго | ТЬг | 61и | 11е | Рго | |
145 | 150 | 155 | ||||||||||||||
аса | адЬ | дса | Нд | дкд | ааа | дад | асе | Нд | дса | Нд | сП | ЬсЬ | аск | саЬ | еда | 576 |
ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Агд | |
160 | 165 | 170 | ||||||||||||||
асЪ | сЬд | сЪд | ака | дсс | ааЬ | дад | асЬ | скд | адд | аП | сск | дН | сск | дка | сак | 624 |
ТЬг | Ьеи | Ьеи | Не | А1а | Азп | 61и | ТЬг | Ьеи | Агд | 11е | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | ΗΪ3 | |
175 | 180 | 185 |
672
ааа ааЬ | сас саа | сЬд Ьдс | асЬ ТЬг | даа С1и | даа С1и | аЬс 11е | РЬе 200 | сад дда | а£а 11е | ддс С1у | аса ТЬг 205 | ||||
Ьуз 190 | Азп | ΗΪ3 | 61п | Ьеи | Суз 195 | С1п | С1у | ||||||||
сЬд | дад | а дБ | саа | асЪ | дЪд | саа | ддд | ддБ | асЬ | дЬд | даа | ада | сЬа | ЬЕс | ааа |
720
Ьеи С1и Зег С1п ТЬг Уа1 61п С1у С1у ТЬг Уа1 С1и Агд Ьеи РЬе Ьуз 210 215 220 аас ЬЕд Ъсс ЬЬа аЬа аад ааа Бас аЬЬ дас ддс саа ааа ааа аад ЬдЕ Азп Ьеи Зег Ьеи Не Ьуз Ьуз Туг 11е Азр 61у С1п Ьуз Ьуз Ьуз Суз 225 230235
768
дда даа С1у С1и | даа С1и 240 | ада Агд | сдд ада дка | аас саа ЬЕс сЬа дас Бас сЬд саа дад | 816 | |||||||||||
Агд | Агд | Уа1 | Азп С1п РЬе Ьеи Азр Туг Ьеи | 61п | С1и | |||||||||||
245 | 250 | |||||||||||||||
сЬЬ | ддЬ | дЪа | аЬд | аас | асе | дад | Ьдд | аЬа | аЬа | даа | адЕ | Ьда | 858 | |||
РЬе | Ьеи | С1у | Уа1 | МеЬ | Азп | ТЬг | С1и | Тгр | 11е | 11е | С1и | Зег |
255 260 265 <210>9 <211>285 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 2 мономера человеческого 1Ь5, соединенные эпитопами РЗО и Р2 <400> 9
МеЪ | Агд МеЬ | Ьеи | Ьеи ΗΪ3 -15 | Ьеи | Зег Ьеи Ьеи А1а Ьеи С1у А1а А1а | Туг | |||||||||
-10 | -5 | ||||||||||||||
Уа1 | Туг | А1а | 11е | Рго | ТЬг | С1и | Не | Рго | ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и |
-1 | 1 | 5 | 10 | ||||||||||||
ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | Не | А1а | Азп | 61и |
15 | 20 | 25 | |||||||||||||
ТЬг | Ьеи | Агд | 11е | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | ΗΪ3 | Ьуз | Азп | ΗΪ3 | С1п | Ьеи | Суз | ТЬг |
30 | 35 | 40 | 45 | ||||||||||||
С1и | С1и | 11е | РЬе | С1п | С1у | 11е | 61у | ТЬг | Ьеи | 61и | Зег | С1п | ТЬг | Уа1 | С1п |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
С1у С1у | ТЬг | Уа1 | С1и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | Не | Ьуз | Ьуз | |
65 | 70 | 75 | |||||||||||||
Туг | 11е | Азр | С1у | С1п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | С1и | С1и | Агд | Агд | Агд | Уа1 |
80 | 85 | 90 |
Азп | С1п 95 | РЬе Ьеи | Азр Туг | Ьеи С1п 100 | С1и РЬе Ьеи С1у 105 | Уа1 МеЬ | Азп ТЬг | ||||||||
С1и | Тгр | Не | 11е | <31и | Зег | РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи |
110 | 115 | 120 | 125 | ||||||||||||
Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | С1и | 61п | Туг | 11е | Ьуз | А1а |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Азп | Зег | Ьуз | РЬе | 11е | С1у | 11е | ТЬг | С1и | Ьеи | 11е | Рго | ТЬг | С1и | Не | Рго |
145 | 150 | 155 | |||||||||||||
ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Агд |
160 | 165 | 170 | |||||||||||||
ТЬг | Ьеи | Ьеи | 11е | А1а | Азп | С1и | ТЬг | Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | ΗΪ3 |
175 | 180 | 185 | |||||||||||||
Ьуз | Азп | ΗΪ3 | С1п | Ьеи | Суз | ТЬг | С1и | С1и | Не | РЬе | С1п | (31у | 11е | С1у | ТЬг |
190 | 195 | 200 | 205 | ||||||||||||
Ьеи | 61и | Зег | С1п | ТЬг | Уа1 | С1п | С1у | С1у | ТЬг | Уа1 | С1и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | 11е | Ьуз | Ьуз | Туг | Не | Азр | (31 у | С31п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз |
225 | 230 | 235 | |||||||||||||
С1у | 61и | С1и | Агд | Агд | Агд | Уа1 | Азп | 61п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | С1п | С1и |
240 | 245 | 250 | |||||||||||||
РЬе | Ьеи | 61у | Уа1 | МеЬ | Азп | ТЬг | 61и | Тгр | 11е | 11е | С1и | Зег |
255 260 265 <210>
<211>
<212>
<213>
858
ДНК последовательность <220>
<223> 2 мономера человеческого 1Ь5, соединенные эпитопами РЗО и Р2 <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(855) <223>
<220>
<221> зрелый пептид
- 37 007810 <222> (58)..() <223>
<220>
<221> сигнальный пептид <222> (1)..(57) <223>
<400> 10
акд адд | акд екк Мек Ьеи | скд сак ккд адк | ккд скд дек Ьеи Ьеи А1а -10 | екк дда дек Ьеи С1у А1а | дсс кас | 48 | ||||||||||
Мек | Агд | Ьеи -15 | ΗΪ3 | Ьеи | Зег | А1а -5 | Туг | |||||||||
дЪд | как | дсс | акс | ссс | аса | даа | акк | ссс | аса | адк | дса | ккд | дкд | ааа | дад | 96 |
Уа1 | Туг | А1а | Не | Рго | ТЬг | С1и | Не | Рго | ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | |
-1 | 1 | 5 | 10 | |||||||||||||
асе | ккд | дса | скд | екк | кек | аск | сак | еда | аск | скд | скд | ака | дсс | аак | дад | 14 4 |
ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | Не | А1а | Азп | С1и | |
15 | 20 | 25 | ||||||||||||||
аск | скд | адд | акк | сск | дкк | сск | дка | сак | ааа | аак | сас | саа | скд | кде | аск | 192 |
ТЬг | Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | ΗΪ3 | Ьуз | Азп | Илз | 61п | Ьеи | Суз | ТЬг | |
30 | 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
даа | даа | акс | ккк | сад | дда | ака | ддс | аса | скд | дад | адк | саа | аск | дкд | саа | 240 |
С1и | 61и | Не | РЬе | 61п | С1у | Не | 61у | ТЬг | Ьеи | С1и | Зег | С1п | ТЬг | Уа1 | С1п | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ддд | дд€ | аск | дЬд | даа | ада | ска | ккс | ааа | аас | ккд | ксс | кка | ака | аад | ааа | 288 |
С1у | 61у | ТЬг | Уа1 | С1и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | Не | Ьуз | Ьуз | |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||||
+- ζ-ч | а + 1- | 4-гг4- | «о а | /-4/4/4 | апа | /4¼ а | 336 | |||||||||
υαν | αυ ν | дас | ддс | ииа | ааа | аа^ | '-а ·- | дда | у | |||||||
Туг | Не | Азр | С1у | 61п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | С1и | С1и | Агд | Агд | Агд | Уа1 | |
80 | 85 | 90 | ||||||||||||||
аас | саа | ккс | ска | дас | кас | скд | саа | дад | ккк | екк | ддк | дка | акд | аас | асе | 384 |
Азп | С1п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | С1п | С1и | РЬе | Ьеи | С1у | Уа1 | Мек | Азп | ТЬг | |
95 | 100 | 105 | ||||||||||||||
дад | кдд | ака | ака | даа | адк | сад | кас | акс | аад | дсс | аас | ксс | аад | ккс | акс | 432 |
С1и | Тгр | Не | 11е | С1и | Зег | 61п | Туг | Не | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | Не | |
110 | 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
ддс | акс | асе | дад | скд | ккс | аас | аас | ккс | асе | дкд | аде | ккс | кдд | скд | сдс | 480 |
С1у | Не | ТЬг | С1и | Ьеи | РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
д€д | сск | аад | дИд | аде | дсс | аде | сас | скд | дад | акс | ссс | аса | даа | акк | ссс | 528 |
Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | С1и | Не | Рго | ТЬг | С1и | Не | Рго | |
145 | 150 | 155 | ||||||||||||||
аса | адк | дса | ЬИд | д€д | ааа | дад | асе | ккд | дса | скд | екк | кек | аск | сак | еда | 576 |
ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Агд |
160 165 170
- 38 007810
асН ТЬг | сНд сНд аНа | дсс ааП | дад 61и 180 | асН сНд адд аНН | ссН дНН Рго Уа1 185 | ссН Рго | дПа саН Уа1 ΗΪ3 | ||||||||
Ьеи 175 | Ьеи | Не | А1а | Азп | ТЬг | Ьеи Агд | 11е | ||||||||
ааа | ааП | сас | саа | сНд | Идс | асН | даа | даа | аНс | НИН | сад | дда | аНа | ддс | аса |
Ьуз | Азп | ΗΪ3 | 61п | Ьеи | Суз | ТЬг | 61и | 61и | 11е | РЬе | 61п | 61у | 11е | 61 у | ТЬг |
190 | 195 | 200 | 205 | ||||||||||||
сНд | дад | адН | саа | асН | дНд | саа | ддд | ддН | асН | дНд | даа | ада | сНа | ННс | ааа |
Ьеи | 61и | Зег | 61п | ТЬг | Уа1 | 61п | 61у | 61у | ТЬг | Уа1 | 61и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
аас | ННд | Нсс | НПа | аНа | аад | ааа | Нас | аНН | дас | ддс | саа | ааа | ааа | аад | НдН |
Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | 11е | Ьуз | Ьуз | Туг | Не | Азр | 61 у | 61п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз |
225 | 230 | 235 | |||||||||||||
дда | даа | даа | ада | сдд | ада | дПа | аас | саа | ННс | сНа | дас | Нас | сНд | саа | дад |
61у | 61и | 61и | Агд | Агд | Агд | Уа1 | Азп | 61п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | 61п | 61и |
240 | 245 | 250 | |||||||||||||
НЕН | сП И | ддН | дПа | аНд | аас | асе | дад | Ндд | аНа | аНа | даа | адН | Ида | ||
РЬе | Ьеи | 61у | Уа1 | МеН | Азп | ТЬг | 61и | Тгр | 11е | 11е | 61и | Зег | |||
255 | 260 | 265 |
<210> 11 <211>285 <212> Белок.
<213> Искусственная последовательность <220>
<223> 2 мономера человеческого 1Ь5, соединенные эпитопами РЗО и Р2 <400>11
МеН Агд | МеН Ьеи Ьеи -15 | ΗΪ3 Ьеи | Зег | Ьеи Ьеи А1а Ьеи 61у А1а А1а | Туг | ||||||||||
-10 | -5 | ||||||||||||||
Уа1 | Туг | А1а | 11е | Рго | ТЬг | 61и | 11е | Рго | ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | 61и |
-1 | 1 | 5 | 10 | ||||||||||||
ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | Η13 | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | 11е | А1а | Азп | 61и |
15 | 20 | 25 | |||||||||||||
ТЬг | Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | ΗΪ3 | Ьуз | Азп | ΗΪ3 | 61п | Ьеи | Суз | ТЬг |
30 | 35 | 40 | 45 | ||||||||||||
61и | 61и | Не | РЬе | 61п | 61у | 11е | 61у | ТЬг | Ьеи | 61и | Зег | 61п | ТЬг | Уа1 | 61п |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
61у | 61у | ТЬг | Уа1 | 61и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | 11е | Ьуз | Ьуз |
65 | 70 | 75 |
Туг | 11е Азр С1у 80 | С1п Ьуз Ьуз Ьуз 85 | Суз С1у | С1и | С1и Агд Агд 90 | Агд Уа1 | |||||||||
Азп | С1п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | С1п | С1и | РЬе | Ьеи | С1у | Уа1 | МеЕ | Азп | ТЬг |
95 | 100 | 105 | |||||||||||||
С1и | Тгр | Не | Не | С1и | Зег | С1п | Туг | Не | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | Не |
110 | 115 | 120 | 125 | ||||||||||||
61у | Не | ТЬг | С1и | Ьеи | РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | С1и | Не | Рго | ТЬг | б1и | 11е | Рго |
145 | 150 | 155 | |||||||||||||
ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | Нхз | Агд |
160 | 165 | 170 | |||||||||||||
ТЬг | Ьеи | Ьеи | Не | А1а | Азп | О1и | ТЬг | Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | ΗΪ3 |
175 | 180 | 185 | |||||||||||||
Ьуз | Азп | ΗΪ3 | б1п | Ьеи | Суз | ТЬг | С1и | 61и | Не | РЬе | С1п | С1у | Не | 61у | ТЬг |
190 | 195 | 200 | 205 |
Ьеи 01и Зег С1п | ТЬг Уа1 С1п 01у С1у ТЬг Уа1 С1и Агд Ьеи РЬе | Ьуз | |||||||||||||
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | Не | Ьуз | Ьуз | Туг | Не | Азр | 01 у | С1п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз |
225 | 230 | 235 | |||||||||||||
С1у | С1и | С1и | Агд | Агд | Агд | Уа1 | Азп | С1п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | С1п | 61и |
240 | 245 | 250 |
РЬе Ьеи О1у Уа1 МеЪ Азп ТЬг С1и Тгр Не 11е С1и Зег 255 260 265 <210> 12 <211> 864 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 2 мономера человеческого 1Ь5, соединенные диглициновым линкером и содержащие расположенные на конце эпитопы РЗО и Р2 <220>
<221> СОЗ
- 40 007810 <222> (1)..(861) <223>
<220>
<221> разные признаки <222> (70)..(132) <223> Эпитоп РЗО столбнячного анатоксина <220>
<221> разные признаки <222> (817)..(861) <223> Эпитоп РЗО столбнячного анатоксина <220>
<221> зрелый пептид <222> (58)..() <223>
<220>
<221> сигнальный пептид <222> (1)..(57) <223>
<400> 12
аРд адд | ард сРР Меб Ьеи | сРд саР РРд адр | РРд срд дсР | сРР Ьеи | дда дсР 61у А1а | дсс А1а -5 | Рас Туг | 48 | ||||||||
Мер | Агд | Ьеи -15 | ΗΪ3 | Ьеи Зег | Ьеи | Ьеи -10 | А1а | |||||||||
дрд | РаР | дсс | аРс | ссс | аса | даа | РРс | аас | аас | РРс | асе | дрд | аде | РРс | Рдд | 96 |
Уа1 | Туг | А1а | Не | Рго | ТЬг | 61и | РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | |
-1 | 1 | 5 | 10 | |||||||||||||
сРд | сдс | дрд | ссР | аад | дрд | аде | дсс | аде | сас | срд | дад | аРР | ссс | аса | адр | 144 |
Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | С1и | Не | Рго | ТЬг | Зег | |
15 | 20 | 25 | ||||||||||||||
дса | РРд | дрд | ааа | дад | асе | РРд | дса | срд | сРР | РсР | асР | саР | еда | асР | сРд | 192 |
А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Агд | ТЬг | Ьеи | |
30 | 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
сбд | аба | дсс | ааР | дад | асР | срд | адд | аРР | сер | дРР | ссР | дРа | саР | ааа | ааР | 240 |
Ьеи | Не | А1а | Азп | С1и | ТЬг | Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | ΗΪ3 | Ьуз | Азп | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
сас | саа | срд | Рдс | асР | даа | даа | аРс | РРР | сад | дда | аРа | ддс | аса | сРд | дад | 288 |
Нхз | С1п | Ьеи | Суз | ТЬг | С1и | С1и | Не | РЬе | С1п | С1у | Не | С1у | ТЬг | Ьеи | С1и | |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||||
адр | саа | асР | дрд | саа | ддд | ддр | асР | дрд | даа | ада | сРа | РРс | ааа | аас | РРд | 336 |
Зег | С1п | ТЬг | Уа1 | С1п | С1у | С1у | ТЬг | Уа1 | С1и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи | |
80 | 85 | 90 | ||||||||||||||
Рсс | РРа | ара | аад | ааа | Рас | аРР | дас | ддс | саа | ааа | ааа | аад | РдР | дда | даа | 384 |
Зег | Ьеи | Не | Ьуз | Ьуз | Туг | Не | Азр | С1у | С1п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | С1и |
100 105
- 41 007810
даа С1и 110 | ада сдд Агд Агд | ада дба | аас саа ббс сба дас бас сбд саа | дад ббб С1и РЬе | ебб Ьеи 125 | 432 | ||||||||||
Агд | Уа1 | Азп С1п 115 | РЬе Ьеи | Азр | Туг Ьеи 120 | С1п | ||||||||||
ддВ | дба | абд | аас | асе | дад | бдд | аба | аба | даа | адб | ддс | ддб | абс | ссс | аса | 480 |
С1у | Уа1 | Меб | Азп | ТЬг | 61и | Тгр | 11е | 11е | 61и | Зег | С1у | С1у | 11е | Рго | ТЬг | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
даа | абб | ссс | аса | адб | дса | ббд | дбд | ааа | дад | асе | ббд | дса | сбд | ебб | бсб | 528 |
С1и | 11е | Рго | ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | |
145 | 150 | 155 | ||||||||||||||
асб | саб | еда | асб | сбд | сбд | аба | дсс | ааб | дад | асб | сбд | адд | абб | ссб | дбб | 576 |
ТЬг | ΗΪ3 | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | 11е | А1а | Азп | С1и | ТЬг | Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 | |
160 | 165 | 170 | ||||||||||||||
ссб | дба | саб | ааа | ааб | сас | саа | сбд | бде | асб | даа | даа | абс | ббб | сад | дда | 624 |
Рго | Уа1 | ΗΪ3 | Ьуз | Азп | ΗΪ3 | С1п | Ьеи | Суз | ТЬг | С1и | С1и | 11е | РЬе | 61п | 61у | |
175 | 180 | 185 | ||||||||||||||
аба | ддс | аса | сбд | дад | адб | саа | асб | дбд | саа | ддд | ддб | асб | дбд | даа | ада | 672 |
Не | 61у | ТЬг | Ьеи | б1и | Зег | С1п | ТЬг | Уа1 | С1п | С1у | С1у | ТЬг | Уа1 | 61и | Агд | |
190 | 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
сба | ббс | ааа | аас | ббд | бсс | бба | аба | аад | ааа | бас | абб | дас | ддс | саа | ааа | 720 |
Веи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | 11е | Ьуз | Ьуз | Туг | 11е | Азр | С1у | С1п | Ьуз | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
ааа | аад | бдб | дда | даа | даа | ада | сдд | ада | дба | аас | саа | ббс | сба | дас | бас | 768 |
Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | 61и | С1и | Агд | Агд | Агд | Уа1 | Азп | С1п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг. | |
225 | 230 | 235 | ||||||||||||||
сбд | саа | дад | ббб | ебб | ддб | дба | абд | аас | асе | дад | бдд | аба | аба | даа | адб | 816 |
Ьеи | С1п | С1и | РЬе | Ьеи | С1у | Уа1 | Меб | Азп | ТЬг | С1и | Тгр | 11е | Не | 61и | Зег | |
240 | 245 | 250 | ||||||||||||||
сад | бас | абс | аад | дсс | аас | бсс | аад | ббс | абс | ддс | абс | асе | дад | сбд | бда | 864 |
С1п | Туг | 11е | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | 11е | 61у | 11е | ТЬг | С1и | Ьеи |
255 260 265 <210> 13 <211> 287 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 2 мономера человеческого 1Ь5, соединенные диглициновым линкером и содержащие расположенные на конце эпитопы РЗО и Р2 <400> 13
Меб | Агд | Меб | Ьеи | Ьеи -15 | ΗΪ3 | Ьеи | Зег | Ьеи | Ьеи -10 | А1а | Ьеи | С1у А1а | А1а -5 | Туг |
Уа1 | Туг | А1а -1 | 11е 1 | Рго | ТЬг | 61и | РЬе 5 | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 Зег 10 | РЬе | Тгр |
- 42 007810
Ьеи Агд Уа1 | Рго Ьуз Уа1 | Зег А1а 20 | Зег | Нхз | Ьеи С1и 11е 25 | Рго ТЬг | Зег | ||||||||
15 | |||||||||||||||
А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Агд | ТЬг | Ьеи |
30 | 35 | 40 | 45 | ||||||||||||
Ьеи | 11е | А1а | Азп | С1и | ТЬг | Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | Нхз | Ьуз | Азп |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Нхз | С1п | Ьеи | Суз | ТЬг | С1и | С1и | 11е | РЬе | С1п | С1у | 11е | С1у | ТЬг | Ьеи | С1и |
65 | 70 | 75 | |||||||||||||
5ег | 61п | ТЬг | Уа1 | 61п | С1у | <31 у | ТЬг | Уа1 | С1и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи |
80 | 85 | 90 | |||||||||||||
5ег | Ьеи | 11е | Ьуз | Ьуз | Туг | 11е | Азр | С1у | С1п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | С1и |
95 | 100 | 105 | |||||||||||||
С1и | Агд | Агд | Агд | Уа1 | Азп | 61п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | С1п | С1и | РЬе | Ьеи |
110 | 115 | 120 | 125 | ||||||||||||
01 у | Уа1 | Мек | Азп | ТЬг | С1и | Тгр | Не | 11е | С1и | Зег | С1у | С1у | Не | Рго | ТЬг |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
С1и | 11е | Рго | ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег |
145 | 150 | 155 | |||||||||||||
ТЬг | ΗΪ3 | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | 11е | А1а | Азп | С1и | ТЬг | Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 |
160 | 165 | 170 | |||||||||||||
Рго | Уа1 | ΗΪ3 | Ьуз | Азп | Нхз | С1п | Ьеи | Суз | ТЬг | С1и | С1и | Не | РЬе | С1п | С1у |
175 | 180 | 185 | |||||||||||||
Не | 61у | ТЬг | Ьеи | С1и | Зег | С1п | ТЬг | Уа1 | С1п | 61у | С1у | ТЬг | Уа1 | (31и | Агд |
190 | 195 | 200 | 205 | ||||||||||||
Ьеи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | 11е | Ьуз | Ьуз | Туг | Не | Азр | С1у | С1п | Ьуз |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | С1и | С1и | Агд | Агд | Агд | Уа1 | Азп | С1п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг |
225 | 230 | 235 | |||||||||||||
Ьеи | С1п | С1и | РЬе | Ьеи | 61у | Уа1 | Мек | Азп | ТЬг | С1и | Тгр | 11е | Не | С1и | Зег |
240 245 250
- 43 007810
С1п Туг 11е Ьуз А1а Азп Зег Ьуз РЬе 11е С1у 11е ТЬг С1и Ьеи 255 260265 <210>14 <211>864 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 2 мономера человеческого 1Ь5, соединенные диглициновым линкером и содержащие расположенные на конце эпитопы РЗО и Р2 <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(861) <223>
<220>
<221> разные признаки <222> (70)..(114) <223> Эпитоп Р2 столбнячного анатоксина <220>
<221> разные признаки <222> (817)..(861) <223> Эпитоп Р2 столбнячного анатоксина <220>
<221> сигнальный пептид <222> (1)..(57) <223>
<220>
<221> зрелый пептид <222> (58)..() <223>
<400> 14
аЪд адд аРд сЬР | сЬд саЬ | ЬЬд ад+ Ьеи Зег | Р±д сРд | дсЬ А1а | с+Ь дда | дсЬ А1а | дсс Рас | 48 | ||||||||
МеЪ Агд МеЪ | Ьеи | Ьеи -15 | Нхз | Ьеи | Ьеи -10 | Ьеи | С1у | А1а -5 | Туг | |||||||
дЬд | РаЬ | дсс | аЬс | ссс | аса | даа | сад | Рас | а+с | аад | дсс | аас | Ьсс | аад | Р+с | 96 |
Уа1 | Туг | А1а | 11е | Рго | ТЬг | С1и | С1п | Туг | 11е | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | |
-1 | 1 | 5 | 10 | |||||||||||||
аЪс | ддс | аРс | асе | дад | с+д | аРР | ссс | аса | адР | дса | РРд | дрд | ааа | дад | асе | 144 |
Не | С1у | 11е | ТЬг | С1и | Ьеи | 11е | Рго | ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг | |
15 | 20 | 25 | ||||||||||||||
ЪРд | дса | сРд | сЬР | ЪсЬ | асР | саЬ | еда | асЬ | скд | ерд | а+а | дсс | ааЪ | дад | асР | 192 |
Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | Η13 | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | Не | А1а | Азп | С1и | ТЬг | |
30 | 35 | 40 | 45 |
- 44 007810
сБд адд а+ | ссБ Рго | дББ Уа1 50 | ссБ Рго | дБа Уа1 | саБ ааа ааБ Н1з Ьуз Азп 55 | сас саа сБд Ηί3 С1п Ьеи | Бдс Суз | асБ даа ТЬг С1и 60 | 240 | |||||||
Ьеи | Агд 11е | |||||||||||||||
даа | аБс | БББ | сад | дда | аБа | ддс | аса | сБд | дад | адБ | саа | асБ | дБд | саа | ддд | 288 |
С1и | Не | РЬе | 61п | С1у | Не | С1у | ТЬг | Ьеи | С1и | Зег | С1п | ТЬг | Уа1 | С1п | С1у | |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||||
ддБ | асБ | дБд | даа | ада | сБа | ББс | ааа | аас | ББд | Бсс | ББа | аБа | аад | ааа | Бас | 336 |
С1у | ТЬг | Уа1 | С1и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | Не | Ьуз | Ьуз | Туг | |
80 | 85 | 90 | ||||||||||||||
аББ | дас | ддс | саа | ааа | ааа | аад | БдБ | дда | даа | даа | ада | едд | ада | дБа | аас | 384 |
Не | Азр | С1у | С1п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | С1и | С1и | Агд | Агд | Агд | νβΐ | Азп | |
95 | 100 | 105 | ||||||||||||||
саа | ББс | сБа | дас | Бас | сБд | саа | дад | БББ | сББ | ддк | дБа | аБд | аас | асе | дад | 432 |
С1п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | С1п | 61и | РЬе | Ьеи | С1у | Уа1 | МеБ | Азп | ТЬг | С1и | |
110 | 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ъдд | аБа | аБа | даа | адБ | ддс | ддБ | аБс | ссс | аса | даа | аББ | ссс | аса | адБ | дса | 480 |
Тгр | Не | Не | С1и | Зег | С1у | С1у | Не | Рго | ТЬг | С1и | Не | Рго | ТЬг | Зег | А1а | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
«д | дБд | ааа | дад | асе | ББд | дса | сБд | сББ | БсБ | асБ | саБ | еда | асБ | сБд | сБд | 528 |
Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг | Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | |
145 | 150 | 155 | ||||||||||||||
аБа | дсс | ааБ | дад | асБ | сБд | адд | аББ | ссБ | дББ | ссБ | дБа | саБ | ааа | ааБ | сас | 576 |
Не | А1а | Азп | С1и | ТЬг | Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 | Рго | νβΐ | ΗΪ3 | Ьуз | Азп | ΗΪ3 | |
160 | 165 | 170 | ||||||||||||||
саа | сБд | Бдс | асБ | даа | даа | аБс | БББ | сад | дда | аБа | ддс | аса | сБд | дад | адБ | 624 |
61п | Ьеи | Суз | ТЬг | С1и | С1и | Не | РЬе | С1п | С1у | Не | С1у | ТЬг | Ьеи | С1и | Зег | |
175 | 180 | 185 | ||||||||||||||
саа | асБ | дБд | саа | ддд | ддБ | асБ | дБд | даа | ада | сБа | ББс | ааа | аас | ББд | Бсс | 672 |
61п | ТЬг | Уа1 | С1п | С1у | С1у | ТЬг | Уа1 | С1и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи | Зег | |
190 | 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
ББа | аБа | аад | ааа | Бас | аББ | дас | ддс | саа | ааа | ааа | аад | БдБ | дда | даа | даа | 720 |
Ьеи | Не | Ьуз | Ьуз | Туг | Не | Азр | 61у | 61п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | С1и | С1и | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
ада | едд | ада | дБа | аас | саа | ББс | сБа | дас | Бас | сБд | саа | дад | БББ | сББ | ддБ | 768 |
Агд | Агд | Агд | Уа1 | Азп | С1п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | С1п | С1и | РЬе | Ьеи | С1у | |
225 | 230 | 235 | ||||||||||||||
дБ а | аБд | аас | асе | дад | Бдд | аБа | аБа | даа | адБ | ББс | аас | аас | ББс | асе | дБд | 816 |
Уа1 | МеБ | Азп | ТЬг | С1и | Тгр | Не | Не | С1и | Зег | РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | |
240 | 245 | 250 | ||||||||||||||
аде | ББс | Бдд | сБд | сдс | дБд | ссБ | аад | дБд | аде | дсс | аде | сас | сБд | дад | Бда | 864 |
Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | С1и |
255 260 265 <210> 15 <211> 287
- 45 007810 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 2 мономера человеческого 1Ь5, соединенные диглициновым линкером и содержащие расположенные на конце эпитопы РЗО и Р2 <400> 15
МеЬ | Агд | МеЬ Ьеи | Ьеи -15 | ΗΪ3 | Ьеи | Зег Ьеи | Ьеи -10 | А1а Ьеи С1у | А1а | А1а -5 | Туг | ||||
Уа1 | Туг | А1а | Не | Рго | ТЬг | 61и | С1п | Туг | Не | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе |
-1 | 1 | 5 | 10 | ||||||||||||
Не | С1у | Не | ТЬг | С1и | Ьеи | Не | Рго | ТЬг | Зег | А1а | Ьеи | Уа1 | Ьуз | С1и | ТЬг |
15 | 20 | 25 | |||||||||||||
Ьеи | А1а | Ьеи | Ьеи | 5ег | ТЬг | Нхз | Агд | ТЬг | Ьеи | Ьеи | Не | А1а | Азп | С1и | ТЬг |
30 | 35 | 40 | 45 | ||||||||||||
Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | Нхз | Ьуз | Азп | ΗΪ3 | С1п | Ьеи | Суз | ТЬг | С1и |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
С1и | Не | РЬе | С1п | С1у | Не | С1у | ТЬг | Ьеи | С1и | Зег | С1п | ТЬг | Уа1 | С1п | С1у |
65 | 70 | 75 | |||||||||||||
С1у | ТЬг | Уа1 | С1и | Агд | Ьеи | РЬе | Ьуз | Азп | Ьеи | Зег | Ьеи | Не | Ьуз | Ьуз | Туг |
80 | 85 | 90 | |||||||||||||
Не | Азр | 01 у | С1п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | 61и | С1и | Агд | Агд | Агд | Уа1 | Азп |
95 | 100 | 105 | |||||||||||||
С1п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | С1п | С1и | РЬе | Ьеи | С1у | Уа1 | МеЬ | Азп | ТЬг | С1и |
110 | 115 | 120 | 125 | ||||||||||||
Тгр | Не | Не | С1и | Зег | С1у | С1у | 11в | Рго | ТЬг | С1и | Не | Рго | ТЬг | Зег | А1а |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Т Ω11 | Т «ГЛ | ГИ ,, | Фкг· | Т ЛЧ | П 1 -» | Т Л.« | Т ЛЧ | Сл*. | ти | л | гр К*. | Т Л1Ч | Г | ||
ии; и | и У | члх и | X их | XI с ы | пхи | иии | Л XXX | XXX 0 | пх у | х их | XIС XX | ||||
145 | 150 | 155 | |||||||||||||
Не | А1а | Азп | С1и | ТЬг | Ьеи | Агд | Не | Рго | Уа1 | Рго | Уа1 | НЬз | Ьуз | Азп | Нхз |
160 | 165 | 170 | |||||||||||||
С1п | Ьеи | Суз | ТЬг | С1и | С1и | Не | РЬе | С1п | С1у | Не | С1у | ТЬг | Ьеи | С1и | Зег |
175 180 185
- 46 007810
61п ТЬг 190 | Уа1 61п С1у | 01 у ТЬг 195 | Уа1 | С1и Агд | Ьеи 200 | РЬе Ьуз | Аз η | Ьеи | Зег 205 | ||||||
Ьеи | Не | Ьуз | Ьуз | Туг | 11е | Азр | С1у | С1п | Ьуз | Ьуз | Ьуз | Суз | С1у | С1и | 61и |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Агд | Агд | Агд | Уа1 | Аз η | С1п | РЬе | Ьеи | Азр | Туг | Ьеи | С1п | С1и | РЬе | Ьеи | С1у |
225 | 230 | 235 | |||||||||||||
Уа1 | МеЕ | Аз η | ТЬг | С1и | Тгр | 11е | 11е | С1и | Зег | РЬе | Аз η | Аз η | РЬе | ТЬг | Уа1 |
240 | 245 | 250 | |||||||||||||
Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | С1и | |
255 | 260 | 265 |
<210> 16 <211> 477 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Человеческий ΤΝΕ дикого типа (КОДОНЫоптимизированы) <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(477) <223>
<220>
<221> разные признаки <222> (4)..(474) <223> Зрелая последовательность ΤΝΓ
<400> аЕд дЕд | 16 сдс Еса аде Есд сдс | асд сед ТЬг Рго | адЕ дас ааа | сса дЕа Рго Уа1 | дсЕ А1а 15 | саЕ ΗΪ3 | 48 | |||||||||
МеЕ 1 | Уа1 | Агд | Зег | Зег Зег 5 | Агд | Зег 10 | Азр Ьуз | |||||||||
дЕЕ | дбд | дсс | аас | ссЕ | сад | дед | даа | ддс | сад | сЕс | саа | Едд | ЕЕа | ааЕ | сдЕ | 96 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Аз η | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
сдс | дед | аас | дсс | сЕд | сЕд | дед | аас | ддс | дЕд | даа | сЕд | сдЕ | даЕ | аас | сад | 144 |
Агд | А1а | Аз η | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Аз η | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
сЕд | д£д | дЕс | ссс | аде | дад | ддд | сЕд | ЕаЕ | сЕд | аЕс | ЕаЕ | Еса | сад | дЕд | ЕЕд | 192 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | |
50 | 55 | 60 |
- 47 007810
ίίί: аад ддк | сад ддк С1п С1у | кдк Суз 70 | ссд аде асс сас дкк скд скд асд сак асс | 240 | ||||||||||||
РЬе 65 | Ьуз | С1у | Рго Зег ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 75 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг 80 | ||||||
акк | кек | едк | акк | дек | дка | кек | как | саа | аск | ааа | дке | аак | кка | екк | кед | 288 |
Не | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | ΘΙη | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
дед | акс | ааа | Ссс | ссд | Еде | саа | едк | дад | асс | сск | даа | дда | дед | даа | дсс | 336 |
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | ΘΙη | Агд | 61и | ТЬг | Рго | б1и | С1у | А1а | 61и | А1а | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
ааа | сск | Едд | кас | даа | ссд | акс | как | скд | ддд | ддс | дкк | ккк | сад | скс | даа | 384 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | ΘΙη | Ьеи | С1и | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
ааа | ддк | дак | едд | скд | аде | дсс | даа | акк | аак | сдс | ссд | дас | кас | екк | дак | 432 |
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
ккс | дса | дад | ксс | ддк | сад | дке | кас | ккс | ддс | акк | акс | дса | ккд | каа | 477 | |
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | ΘΙη | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | |||
145 | 150 | 155 |
<210> 17 <211> 158 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Человеческий ΤΝΓ дикого типа (кодоныоптимизированы) <400> 17
Мек Уа1 1 | Агд Зег Зег 5 | Зег | Агд ТЬг Рго Зег 10 | Азр Ьуз | Рго Уа1 | А1а 15 | ΗΪ3 | ||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | ΘΙη |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | С1у | ΘΙη | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | ΘΙη | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
85 | 90 | 95 |
А1а | Не Ьуз | Зег 100 | Рго Суз С1п | Агд С1и ТЬг Рго С1и С1у А1а 61и | А1а | ||||||||||
105 | 110 | ||||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | ||
145 | 150 | 155 |
<210> | 18 |
<211> | 170 |
<212> | Белок |
<213> | Искусственная последовательность |
<220> | |
<223> | ΗΤΝΓ с встроеннным ΡΑΌΚ.Ε |
<220> | |
<221> | Мутаген |
<222> | (109)..(121) |
<223> | Связывающий все типы БК пептид (ΡΑΌΚΕ) |
<220> | |
<221> | разные признаки |
<222> | (1)..(108) |
<223> Аминокислоты ΗΤΝΕ1-108 <220>
<221> разные признаки <222> (122)..(170) <223> Аминокислоты ΠΤΝΓ109-157 <400> 18
Уа1 Агд Зег Зег Зег | Агд ТЬг | Рго Зег Азр 10 | Ьуз | Рго | Уа1 А1а | ΗΪ3 Уа1 15 | |||||||||
1 | 5 | ||||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 |
- 49 007810
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | НЬз | ТЬг | Не |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | 61и | С1у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | А1а | 61и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | 61у | Азр | Агд |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | Не | Не | А1а | Ьеи |
165 170
<210> | 19 | ||||
<211> | 39 | ||||
<212> | ДНК | ||||
<213> | Искусственная последовательность | ||||
<220> | |||||
<223> | Связывающий | все | типы БК пептид (РАБКЕ) | ||
<220> | |||||
<221> | СБЗ | ||||
<222> | (1)..(39) | ||||
<223> | |||||
<400> | 19 | ||||
дед аад | ЬЬс дЬЬ дса | дсЬ | Ьдд асе сЬд аад дсс дсЪ | дса | 39 |
А1а Ьуз | РЬе Уа1 А1а | А1а | Тгр ТЬг Ьеи Ьуз А1а А1а | А1а |
10 <210> 20 <211> 13 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Связывающий все типы БК пептид (РАВКЕ) <400> 20
- 50 007810
А1а Ьуз РЬе Уа1 А1а А1а Тгр ТЬг Ьеи Ьуз А1а А1а А1а 15 10 <210> 21 <211> 1437 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220> , <223> Мономерная имитация тримерного ΤΝΡ человека <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(1437) <223>
<220>
<221> Мутация <222> (475)..(483) <223> Последовательность, кодирующая триглициновый линкер <220>
<221> Мутация <222> (955)..(963) <223> Последовательность, кодирующая триглициновый линкер <400> 21
аЬд д+д сдс | аде аде аде сдс асе ссс аде дас аад | ссс дрд дсс Рго Уа1 А1а 15 | сас Нхз | 48 | ||||||||||||
МеЬ 1 | Уа1 | Агд | Зег | Зег 5 | Зег | Агд ТЬг | Рго | Зег 10 | Азр Ьуз | |||||||
дрд | дрд | дсс | аас | ссс | сад | дсс | дад | ддс | саа | сРд | сад | Ьдд | с+д | аас | сдс | 96 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
сдс | дсс | аас | дсс | сЪд | сЪд | дса | аас | ддс | д+д | дад | сЬд | сдс | дас | аас | сад | 144 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
с£д | дед | д+д | ссс | аде | дад | ддс | с+д | Рас | сЪд | а1:с | Рас | аде | сад | д^д | сЬд | 192 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ЬЬс | аад | ддс | сад | ддс | Ьдс | ссс | аде | асе | сас | дЬд | сЬд | сЪд | асе | сас | асе | 240 |
РЬе | Ьуз | 61у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
аЬс | аде | сдс | а+с | дсс | д^д | аде | Рас | сад | асе | аад | дрд | аас | сЪд | сЬд | аде | 288 |
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
дсс | аРс | аад | аде | ссс | Ьдс | сад | сдс | дад | асе | ссс | дад | ддс | дсс | дад | дсс | 336 |
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а |
100 105 110
- 51 007810
аад Ьуз | ссс кдд | Бас дад | ссс Рго | акс кас скс ддс ддс дкд ккс сад скд дад | 384 | |||||||||||
Рго | Тгр 115 | Туг | 61и | Не | Туг 120 | Ьеи | 61у | С1у | Уа1 | РЬе 125 | 61п | Ьеи | 61и | |||
аад | ддс | дас | еде | скд | аде | дсс | дад | акс | аас | еде | ссс | дас | кас | скд | дас | 432 |
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
ккс | дсс | дад | аде | ддс | сад | дкд | кас | ккс | ддс | акс | акс | дсс | скд | ддк | ддс | 480 |
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | Не | Не | А1а | Ьеи | 61у | 61у | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
дда | дБ с | сдд | Есе | кос | ксс | сдд | аса | сса | ксс | дас | ааа | сса | дке | дек | сак | 528 |
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ8 | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
дке | дке | дек | аак | сса | саа | дек | даа | ддк | саа | екк | саа | кдд | екк | аак | сдд | 576 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 01и | С1у | С1п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
сдд | дек | аак | дек | екк | екк | дек | аак | ддк | дке | даа | екк | сдд | дас | аак | саа | 624 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
екк | дке | дБ с | сса | кос | даа | ддк | екк | как | екк | акк | как | ксс | саа | дке | екк | 672 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 01и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
ккк | ааа | ддБ | саа | ддк | кдк | сса | ксс | аса | сак | дке | екк | екк | аса | сак | аса | 720 |
РЬе | Ьуз | 61у | 61п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Н1з | ТЬг | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
акк | ксс | сдд | акк | дек | дке | ксс | как | саа | аса | ааа | дке | аак | екк | екк | ксс | 768 |
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
дек | акк | ааа | Бес | сса | кдк | саа | сдд | даа | аса | сса | даа | ддк | дек | даа | дек | 816 |
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | 61и | С1у | А1а | 61и | А1а | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
ааа | сск | Ъдд | как | даа | сса | акк | как | екк | ддк | ддк | дке | ккк | саа | екк | даа | 864 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | Не | Туг | Ьеи | 61у | 61 у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
ааа | ддк | дас | сдд | екк | ксс | дек | даа | акк | аак | сдд | сса | дак | как | екк | дас | 912 |
Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
ккк | дек | даа | кос | ддк | саа | дке | как | ккк | ддк | акк | акк | дек | скд | ддс | ддк | 960 |
— Г11« | А1а | ОГй | Зег | 61у | Сэ1п | ”а1 | Туг | ТМ__ гпе | 61у | Не | Не | А1а | Ьеи | 61у | 61у | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
ддд | дкк | с дБ | кек | кек | кек | едк | асд | сед | кек | да к | аад | сед | дкк | дед | сас | 1008 |
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Н13 | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
дкБ | дкк | дед | аас | сед | сад | дед | дад | ддд | саа | ккд | сад | кдд | ккд | аак | едк | 1056 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
340 | 345 | 350 |
- 52 007810
сдр дед аас | дед А1а | РРд Ьеи | РРд дед ааР ддд | дрр Уа1 | даа РРд сдр даР | аас Азп | саа С1п | 1104 | ||||||||
Агд А1а | Азп 355 | Ьеи А1а | Азп 360 | 61у | С1и | Ьеи | Агд 365 | Азр | ||||||||
РРд | дрр | дрр | ссд | РсР | дад | ддд | РРд | Рас | РРд | аРа | РаР | РсР | сад | дрр | РРд | 1152 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
РРс | ааа | ддд | саа | ддд | Рдс | ссд | РсР | асд | саР | дрр | РРд | РРд | асд | сас | асд | 1200 |
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||||
аРа | РсР | сдр | аРа | дед | дрр | РсР | Рас | сад | асд | аад | дрр | ааР | РРд | РРд | РсР | 1248 |
11е | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
дед | аРа | ааа | РсР | ссд | РдР | саа | сдр | даа | асд | ссд | даа | ддд | дед | дад | дед | 1296 |
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
аад | ссд | Рдд | РаР | даа | ссд | аРа | Рас | РРд | ддд | ддд | дрр | РРР | сад | РРд | даа | 1344 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
ааа | ддд | даР | сдр | РРд | РсР | дед | дад | аРа | аас | сдр | ссд | дас | РаР | РРд | даР | 1392 |
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
РРс | дед | даа | РсР | ддд | саа | дрр | Рас | РРР | ддд | аРа | аРа | дед | сРд | Раа | 1437 | |
РЬе | А1а | С1и | Зег | 61у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | Ьеи |
465 470 475 <210> 22 <211> 478 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Мономерная имитация тримерного ΤΝΓ человека <400> 22
Мер | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Нхз |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи |
55 60
- 53 007810
РЬе Ьуз 65 | С1у С1п С1у Суз Рго Зег ТЬг ΗΪ3 Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг 80 | |||||||||
70 | 75 | ||||||||||||||
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
85 | 90 | 95 ! | |||||||||||||
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | С1у |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Η13 |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | 01 у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Не | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | 61и | А1а |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
290 295 300
- 54 007810
РЬе А1а С1и Зег С1у 61п Уа1 | Туг РЬе С1у | Не 315 | 11е А1а | Ьеи | 61у | С1у 320 | |||||||||
305 | 310 | ||||||||||||||
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | 61у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | 61у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | 61у | А1а | С1и | А1а |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи |
465 * 470 475 <210> 23 <211> 170 <212> Белок <213> Искусственная последовательность
<220> <223> | ΗΤΝΕ с встроеннным РАББЕ |
<220> <221> <222> <223> | Мутаген (107)..(119) Связывающий все типы ББ пептид (РАББЕ) |
- 55 007810 <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(106) <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ1-106 <220>
<221> разные признаки <222> (120)..(170) <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ107-157 <400> 23
Уа1 1 | Агд | Зег | Зег | Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 15 | Уа1 | ||||||
5 | 10 | ||||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | 01 и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | 'Уа! | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Н13 | ТЬг | Не |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | С1и | 61у | А1а | С1и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | 61у | νβΐ | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | ||||||
165 | 170 |
- 56 007810 <210> 24 <211> 170 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫЕ с встроенным ΡΑΌΚΕ <220>
<221> Мутаген <222> (108)..(120) <223>
<220>
<221> разные признаки <222> (1)..(107) <223> Аминокислоты ΗΤΝΕ1-107 <220>
<221> разные признаки <222> (121)..(170) <223> Аминокислоты ΗΤΝΕ108-157 <400> 24
Уа1 Агд 1 | Зег Зег | Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз | Рго | Уа1 А1а | Нхз 15 | Уа1 | |||||||||
5 | 10 | ||||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | 61у | 61п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг | Не |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | С1у | А1а | С1и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг |
115 | 120 | 125 |
- 57 007810
61и Рго 11е Туг Ьеи С1у 61у Уа1
130 135
РЬе 61п Ьеи 61и Ьуз 61у Азр Агд
140
Ьеи Зег А1а 61и 11е Азп Агд Рго Азр Туг Ьеи Азр РЬе А1а 145 150 155
61и Зег
160
61у
165
170
<210> <211> <212> <213> | 25 169 Белок Искусственная последовательность |
<220> <223> | ЬТЫГ с встроенными 12 аминокислотами ΡΑΏΡ.Ε |
<220> <221> <222> <223> | Мутаген (109)..(121) |
<220> <221> <222> <223> | разные признаки (1)··(109) Аминокислоты ЬТЫЕ1-109 |
<220>
<221> разные признаки <222> (122)..(169) <223> Аминокислоты ЬТЫЕ110-157 <400> 25
Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | Уа1 |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61 у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | С1п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Ηί3 | ТЬг | Не |
65 | 70 | 75 | 80 |
- 58 007810
Бег Агд 11е А1а Уа1 | Бег | Туг 61п | ТЬг | Ьуз Уа1 Азп Ьеи Ьеи Бег | А1а | ||||||||||
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Не | Ьуз | Бег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 |
100 | 105 | НО | |||||||||||||
А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | 61и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Рго | Не | Туг | Ьеи | 61 у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61и | Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Бег | А1а | 61и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | 61и | Бег | 61у |
145 | 150 | 155 | 160 |
61η Уа1 Туг РЬе С1у 11е 11е А1а Ьеи
165 <210> 26 <211> 167 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ΜΝΕ с заменой на РАББЕ <220>
<221> Мутаген <222> (109)..(121) <223> Связывающий все типы ББ пептид(РАББЕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(109) <223> Аминокислоты ΜΝΓ1-109 <220>
<221> разные признаки <222> (121)..(167) <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ111-157 <400>26
Уа1 Агд Бег Бег Бег Агд ТЬг Рго Бег Азр Ьуз Рго Уа1 А1а Нхз Уа1 15 1015
Уа1 А1а Азп Рго 61п А1а 61и 61у 61п Ьеи С1п Тгр Ьеи Азп Агд Агд
2530
- 59 007810
А1а Азп А1а | Ьеи | Ьеи А1а Азп | С1у Уа1 С1и Ьеи Агд Азр | Азп | С1п | Ьеи | |||||||||
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | б1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Туг | Ьеи | С1у | 61у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
61и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи |
165 <210> 27 <211> 165 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫЕ с заменой на ΡΑΌΚΕ <220>
<221> Мутаген хЭООх ΗΛΊ) \ XV · / · · \ А Л. } <223> Связывающий все типы ΌΚ пептид (РАБКЕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(106) <223> Аминокислоты ΙίΤΝΓΙ-106 <220>
<221> разные признаки
- 60 007810 <222> (119)..(165) <223> Аминокислоты ЬТЫЕ111-157 <400> 27
Уа1 1 | Агд Зег | Зег | Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз | Рго Уа1 А1а | Нйз Уа1 15 | ||||||||||
5 | 10 | ||||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | 61и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Низ | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | Не | Не | А1а | Ьеи |
165 <210> 28 <211> 173 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫЕ с С-концевым линкером и РАБНЕ <220>
- 61 007810 <221> разные признаки <222> (1)..(157) <223> ЬТЫГ <220>
<221> Мутаген <222> (158)..(160) <223> Триглициновый пептид-линкер <220>
<221> Мутаген <222> (161)..(173) <223> Связывающий все типы БК пептид (РАБКЕ) <400> 28
Уа1 Агд 1 | Зег Зег | Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз Рго Уа1 А1а Нхз | Уа1 | ||||||||||||
5 | 10 | 15 | |||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | ΘΙη | Ьеи | ΘΙη | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 01и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | 61и | А1а | Ьуз |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
А1а | 61и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | С1у | С1у | С1у |
145 | 150 | 155 | 160 |
- 62 007810
А1а Ьуз РЬе Уа1 А1а А1а Тгр ТЬг Ьеи Ьуз А1а А1а А1а
165170 <210>29 <211>170 <212> Белок <21.3> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫЕ с встроенным ΡΑΏΚΕ и дополнительным дисульфидным мостиком <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(108) <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ1-108 <220>
<221> Мутаген <222> (124)..(124) <223> Мутация А1а на Суз <220>
<221> Дисульфидный мостик <222> (67)..(124) <223>
<220>
<221> Мутаген <222> (67)..(67) <223> Мутация Ьеи на Суз <221> Мутаген <222> (109)..(121) <223> Связывающий все типы ΌΒ. пептид (ΡΑΌΚΕ) <220>
<221> разные признаки <222> (122)..(170) <223> Аминокислоты ΜΝΓ109-157 <400> 29
Уа1 1 | Агд | Зег | Зег | Зег 5 | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр 10 | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 15 | Уа1 |
Уа1 | А1а | Азп | Рго 20 | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п 25 | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп 30 | Агд | Агд |
А1а | Азп | А1а 35 | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у 40 | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр 45 | Азп | С1п | Ьеи |
- 63 007810
Уа1 Уа1 | Рго | Зег С1и С1у Ьеи Туг Ьеи 11е Туг Зег С1п Уа1 | Ьеи РЬе | ||||||||||||
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Суз | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ5 | ТЬг | 11е |
65. | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | А1а | С1и | Суз | Ьуз | Рго | Тгр | Туг |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
О1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | 61и | Зег |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи |
165 170 <210> 30 <211> 170 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ΗΤΝΕ : встроенным РАБКЕ и дополнительным дисульфидным мостиком <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(108) <223> Остатки 1-108 ЬТЫЕ с одной мутацией <220>
<221> разные признаки <222> (122)..(170) <223> Остатки 109-157ΗΤΝΓ с одной мутацией <220>
<221> Мутаген <222> (96)..(96) <223> Мутация А1а на Суз
- 64 007810 <220>
<221> Мутаген <222> (131)..(131) <223> Мутация Не на Суз <220>
<221> Дисульфидный мостик <222> (96)..(131) <223>
<220>
<221> Мутаген <222> (109)..(121) <223> Связывающий все типы ϋΚ. пептид (ΡΑΌΡΕ) <400> 30
Уа1 Агд 1 | Зег Зег | Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз Рго Уа1 А1а Нхз | Уа1 | ||||||||||||
5 | 10 | 15 | |||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг | Не |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | Суз |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | А1а | 61и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
С1и | Рго | Суз | Туг | Ьеи | 61у | 01у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | б1у | Азр | Агд |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | Зег | А1а | 61и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег |
145 | 150 | 155 | 160 |
- 65 007810
165
170
<210> <211> <212> <213> | 31 162 Белок Искусственная последовательность |
<220> <223> | Усеченный ηΤΝΓ с встроенным РАББЕ |
<220> <221> <222> <223> | Мутаген (101)..(113) Связывающий все типы ББ пептид (РАББЕ) |
<220> <221> <222> | разные признаки (1) ·. (ЮО) |
<223> Аминокислоты ΜΝΕ9-108 <220>
<221> разные признаки <222> (114)..(160) <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ109-155 <220>
<221> разные признаки <222> (114)..(162)
>4. Лл | |||||||
<400> | 31 | ||||||
Зег 1 | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 5 | А1а | Нхз | Уа1 |
С1п | Ьеи | 51п | Тгр 20 | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
Уа1 | С1и | Ьеи 35 | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи 40 |
Ьеи | Не 50 | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи 55 | РЬе |
Нхз 65 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз 70 | ТЬг | 11е |
Уа1 | А1а 10 | Азп | Рго | 61п | А1а | С1и 15 | 61у |
А1а 25 | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а 30 | Азп | С1у |
Уа1 | Уа1 | Рго | Зёг | С1и 45 | С1у | Ьеи | Туг |
Ьуз | С1у | С1п | С1у 60 | Суз | Рго | Зег | ТЬг |
Зег | Агд | 11е 75 | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п 80 |
- 66 007810
ТЬг Ьуз Уа1 Азп Ьеи | Ьеи | Зег А1а | 11е | Ьуз 90 | Зег Рго Суз | С1п Агд С1и 95 | |||||||||
85 | |||||||||||||||
ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | А1а | С1и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
РЬе | 61п | Ьеи | С1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С51п | Уа1 | 1 Туг | РЬе | 61у | Не | Не |
145 | 150 | 155 | 160 |
А1а Ьеи <210> 32 <211> 169 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ΜΝΓ с встроенным РАЕВЕ <220>
<221> Мутаген <222> (18)..(30) <223> Связывающий все типы БВ пептид <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(18) <223> Аминокислоты ЬТЫГ1-18 <220>
<221> разные признаки <222> (31)..(169) <223> Аминокислоты ΜΝΕ19-157 <400> 32
Уа1 Агд Зег Зег Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз Рго Уа1 А1а ΗΪ3 Уа1
1 | 5 | 10 | 15 |
Уа1 А1а Ьуз | РЬе Уа1 А1а А1а Тгр ТЬг | Ьеи Ьуз А1а А1а А1а | Азп Рго |
20 25 | 30 |
- 67 007810
С1п А1а С1и | С1у | С1п Ьеи С1п | Тгр Ьеи Азп Агд Агд А1а Азп А1а | Ьеи | |||||||||||
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг | Не | Зег | Агд | Не | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Уа1 | Зег | Туг | <31п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | (31у | Азр | Агд | Ьеи |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег | 61у |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | Не | Не | А1а | Ьеи |
165 <210> 33 <211> 165 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<22 3> ЬТЫЕ с заменой на ΡΑϋΡΕ <220>
<221> Мутаген <222> (18)..(30) <223> Связывающий все типы ΌΚ пептид (ΡΑΌΚΕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(18) <223> Аминокислоты Ϊ1ΤΝΓ1-18 <220>
<221> разные признаки
- 68 007810 <222> (30)..(165) <223> Аминокислоты ЬТЫЕ22-157 <400> 33
Уа1 1 | Агд | Зег | Зег | Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз | Рго | Уа1 | А1а ΗΪ3 Уа1 15 | ||||||||
5 | 10 | ||||||||||||||
Уа1 | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | С1и | Б1у |
он | о к | ОЛ | |||||||||||||
С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе | Ьуз | С1у | С1п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг |
65 | 70 | 1 к | ап | ||||||||||||
ι | V V | ||||||||||||||
ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | 11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
ТЬг | Рго | 31и | С1у | А1а | С1и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | Не | Туг | Ьеи |
5 ч е | 1 п Л | ι е | |||||||||||||
х^и | |||||||||||||||
С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег | С1 у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе |
145 | 150 | 155 | 160 |
61у 11е 11е А1а Ьеи
165 <210> 34 <211> 170 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫЕ с добавленной областью стебля и встроенным РАБКЕ <220>
- 69 007810 <221> Мутаген <222> (2)..(14) <223> Связывающий все типы БК пептид (РАБКЕ) <220>
<221> разные признаки <222> (15)..(170) <223> Аминокислоты ΗΤΝΕ2-157
<400> | 34 | ||||||||||||||
МеН | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | Агд | Зег |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | Уа1 | Уа1 | А1а | Азп |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд | А1а | Азп | А1а |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Зег | 61и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе | Ьуз | С1у | С1п |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не | Зег | Агд | Не |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | Не | Ьуз | Зег |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и | Ьуз | 61у | Азр | Агд |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | С1П | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи |
165 170 <210> 35 <211> 170
- 70 007810 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ΗΤΝΕ с встроенным РАБКЕ и одной стабилизирующей мутацией <220>
<221> Мутаген <222> (109)..(121) <223> Связывающий все типы БК пептид (РАБКЕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(108) <223> Аминокислоты ЬТЫЕ1-108 <220>
<221> разные признаки <222> (122)..(170)
<223> | Аминокислоты ΗΤΝΕ 109- | 157 | С ОДНОЙ | мутацией | ||||||||||
<220> | ||||||||||||||
<221> | Мутаген | |||||||||||||
<222> | (170! | )..(170) | ||||||||||||
<223> ] | Мутация | Ьеи | на : | РЬе | ||||||||||
<400> | 35 | |||||||||||||
Уа1 Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | Уа1 |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||
Уа1 А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | 01 и | С1у | С1п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||
А1а Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||
Уа1 νβΐ | Рго | Зег | С1и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||
Ьуз С1у | С1п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||
Зег Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||
11е Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | С1и | 61 у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 |
100 105 110
- 71 007810
А1а | А1а | Тгр ТЬг Ьеи Ьуз А1а А1а А1а А1а С1и А1а Ьуз Рго Тгр | Туг | ||||||||||||
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | РЬе |
165 170
<210> <211> <212> <213> | 36 170 Белок Искусственная последовательность |
<220> <223> | ΗΤΝΕ с встроенным РАББЕ и единственной мутацией |
<220> <221> <222> <223> | Мутаген (109)..(121) Связывающий все типы БК. пептид (РАБКЕ) |
<220> <221> <222> <223> | разные признаки (1)..(108) Аминокислоты ΗΤΝΕ 1-108 с единственной мутацией |
<220>
<221> разные признаки <222> (122)..(170) <223> Аминокислоты ΕΤΝΓ 109-157 <220>
<221> Мутаген <222> (49)..(49) <223> Мутация Уа1 на РЬе <400> 36
Уа1 Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Нхз | Уа1 |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||
Уа1 А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | Θΐη | Ьеи С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
25 30
- 72 007810
А1а Азп А1а | Ьеи Ьеи | А1а Азп | 61у Уа1 61и Ьеи Агд Азр Азп 61п | Ьеи | |||||||||||
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
РЬе | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | 61 у | 61п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ5 | ТЬг | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | А1а | 61и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | 61у | 61 у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61и | Ьуз | 61у | Азр | Агд |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | 61и | Зег |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | 11е | 11е | А1а | Ьеи |
165 170 <210> 37 <211> 174 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫГ с встроенным глициноподобным ΡΑϋΡ,Ε <220>
<221> Мутаген <222> (111)..(123) <223^ орязыр·эюпгим зсб типы ОН пзптид (ΡΑΌΙχΕ) <220>
<221> Мутаген <222> (109)..(110) <223> Диглициновый линкер <220>
<221> Мутаген <222> (124)..(125)
- 73 007810 <223> Диглициновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(108) <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ1-108 <220>
<221> разные признаки <222> (126)..(174) <223> Аминокислоты ΗΤΝΕ109-157
<400> | 37 | ||||||||||||||
Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | Уа1 |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | б1п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | С1у | С1у | А1а | Ьуз |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | С1у | 61у | А1а | С1и | А1а |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | б1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | 61у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | Ьеи |
165 170
- 74 007810 <210> 38 <211> 167 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ΗΤΝΕ с заменой на РАБКЕ <220>
<221> Мутаген <222> (84)..(96) <223> Связывающий все типы БК пептид (РАБКЕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(84) <223> Аминокислоты ΜΝΕ1-84 <220>
<221> разные признаки <222> (97)..(167) <223> Аминокислоты ΜΝΕ87-157 <400> 38
Уа1 Агд Зег Зег Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз Рго Уа1 А1а ΗΪ3 Уа1 | |||||||||||||||
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | 11е | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п |
100 | 105 | 110 |
- 75 007810
Агд | С1и ТЬг 115 | Рго | С1и С1у А1а 61и А1а Ьуз Рго Тгр Туг 61и Рго | Не | |||||||||||
120 | 125 | ||||||||||||||
Туг | Ьеи | 61у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | 61и | Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
61и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | 61и | Зег | 61 у | 61п | Уа1 |
145 | 150 | 155 | 160 |
Туг РЬе 61у 11е Не А1а Ьеи
165 <210> 39 <211> 157 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫЕ с заменой на РАВКЕ <220>
<221> Мутаген <222> (133)..(147) <223> Связывающий все типы ЕН пептид (РАВКЕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(132) <223> Аминокислоты ЬТЫЕ1-132 <220>
<221> разные признаки <222> (148)..(157) <223> Аминокислоты ΗΤΝΕ148-157 <400> 39
Уа1 Агд Зег Зег Зег | Агд ТЬг | Рго Зег Азр Ьуз Рго Уа1 А1а Нхз | Уа1 | ||||||||||||
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61 у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 |
- 76 007810
Ьуз 65 | 61у | С1п | С1у Суз | Рго 70 | Зег | ТЬг | ΗΪ3 Уа1 | Ьеи 75 | Ьеи ТЬг | НЬз | ТЬг | Не 80 | |||
Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а | Ьуз |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и | Ьуз |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
С1у Азр | Агд | Ьеи | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
А1а | С1и | Зег | 61у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | 01 у | Не | Не | А1а | Ьеи | |||
145 | 150 | 155 |
<210> 40 <211> 160 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫГ с заменой на ΡΑϋΚΕ <220>
<221> Мутаген <222> (136)..(148) <223> Связывающий все типы ΌΡ пептид (ΡΑΌΕΕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(135) <223> Аминокислоты ΗΤΝΕ1-135 <220>
<221> разные признаки <222> (149)..(160) <223> Аминокислоты 11ΤΝΕ14 6-157 <400>40
Уа1 Агд Зег Зег Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз Рго Уа1 А1а ΗΪ8 Уа1 15 1015
Уа1 А1а Азп Рго С1п А1а С1и С1у С1п Ьеи С1п Тгр Ьеи Азп Агд Агд 20 2530
- 77 007810
А1а Азп А1а Ьеи Ьеи А1а Азп С1у Уа1 61и Ьеи Агд Азр Азп 61п Ьеи | |||||||||||||||
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | 61у | 61п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
5ег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | 61и | А1а | Ьуз |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | Не | Туг | Ьеи | 61у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61и | Ьуз |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
61 у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | А1а | А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | Не | Не | А1а | Ьеи |
145 150 155 160 <210> 41 <211> 157 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫГ с заменой на РАОК.Е <220>
<221> Мутаген <222> (64)..(76) <223> Связывающий все типы ΌΚ пептид (ΡΑΌΚΕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(63) <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ1-63 <220>
<221> разные признаки <222> (77)..(157) <223> Аминокислоты ΜΝΕ77-157
- 78 007810 <400> 41
Уа1 Агд 1 | Зег Зег | Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр | Ьуз | Рго Уа1 А1а | Η13 15 | Уа1 | |||||||||
5 | 10 | ||||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61 у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | А1а |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | ТЫ | ΗΪ3 | ТЬг | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | 61и | А1а | Ьуз |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | 61 у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61 и | Ьуз |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | |||
145 | 150 | 155 |
<210> 42 <211> 157 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫЕ с заменой на РАББЕ <220>
<221> Мутаген <222> (72)..(84) <223>
<220>
<221> разные признаки <222> (1)..(71)
- 79 007810 <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ1-71 <220>
<221> разные признаки <222> (85)..(157) <223> Аминокислоты ΗΤΝΕ85-157 <400> 42
Уа1 Агд Зег Зег 1 | Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз | Рго Уа1 А1а | ΗΪ3 Уа1 15 | ||||||||||||
5 | 10 | ||||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | 61и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Ьуз | А1а | А1а | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а | Ьуз |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и | Ьуз |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
А1а | С1и | Зег С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | Ьеи |
145 150 155 <210> 43 <211> 157 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫЕ с заменой на РАБНЕ
- 80 007810 <220>
<221> Мутаген <222> (127)..(139) <223> Связывающий все типы БВ. пептид (РАБВЕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(126) <223> Аминокислоты ЬТЫГ1-126 <220>
<221> разные признаки <222> (140)..(157) <223> Аминокислоты ΗΤΝΕ140-157 <400> 43
Уа1 Агд 1 | Зег Зег | Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а ΗΪ3 Уа1 15 | |||||||||
5 | 10 | ||||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | 61у | 61п | 61 у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | 61и | А1а | Ьуз |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | 61у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | А1а | Ьуз |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | 11е | Не | А1а | Ьеи | |||
145 | 150 | 155 |
- 81 007810 <210> 44 <211> 176 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫЕ с встроенным пептидом и дупликацией 6 аминокислот <220>
<221> Мутаген <222> (109)..(121) <223> Связывающий все типы ББ пептид (РАББЕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(108) <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ1-108 <220>
<221> разные признаки <222> (122)..(176) <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ103-157 <400> 44
Уа1 Агд 1 | Зег Зег Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз | Рго Уа1 | А1а | Нхз 15 | Уа1 | ||||||||||
5 | 10 | ||||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | 61и | 61у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | 61п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг | 11е |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | С1и | 61у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а |
115 | 120 | 125 |
61и | А1а Ьуз Рго Тгр Туг С1и Рго 11е Туг Ьеи С1у С1у Уа1 | РЬе 61п | |||||||||||||
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | С1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | Ьеи |
165 | 170 | 175 |
<210> 45 <211> 174 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ЬТЫЕ с встроенным пептидом и дупликацией 4 аминокислот <220>
<221> Мутаген <222> (109)..(121) <223> Связывающий все типы ΌΚ. пептид (ΡΑΌΗΕ) <220>
<221> разные признаки <222> (1)..(108) <223> Аминокислоты ЬТЫЕ1-108 <220>
<221> разные признаки <222> (122)..(174) <223> Аминокислоты ΗΤΝΕ105-157 <400> 45
Уа1 Агд Зег Зег Зег | Агд ТЬг | Рго Зег Азр 10 | Ьуз | Рго | Уа1 А1а | ΗΪ3 15 | Уа1 | ||||||||
1 | 5 | ||||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
50 | 55 | 60 |
- 83 007810
Ьуз | 61у | б1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
А1а | А1а | Тгр | ТЫ | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | ТЬг | Рго | 61и | С1у | А1а | С1и | А1а |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | 61 у | 11е | 11е | А1а | Ьеи |
165 170 <210> 46 <211> 194 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ΗΤΝΓ с встроенными эпитопами Р2 и РЗО столбнячного анатоксина <220>
<221> Мутаген <222> (110)..(124) <223> Эпитоп Р2 столбнячного анатоксина (ЗЕО 1Б N0: 2) <220>
<221> Мутаген <222> (125)..(145) <223> Эпитоп РЗО столбнячного анатоксина (ЗЕО Ю N0: 3) <220>
<221> разные признаки <222> (2)..(109) <223> Аминокислоты ΗΤΝΓ1-108 <220>
<221> разные признаки <222> (146)..(194) <223> Аминокислоты ΜΝΕΊ09-157
- 84 007810 <400> 46
МеЕ 1 | Уа1 | Агд Зег Зег Зег 5 | Агд ТЬг | Рго Зег Азр 10 | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а Н18 15 | |||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
11е | 5ег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | С1п | Туг | 11е |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | Не | С1у | Не | ТЬг | С1и | Ьеи | РЬе | Азп | Азп | РЬе |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
С1и | А1а | 61и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | 61и | Зег | С1у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не' |
180 | 185 | 190 |
А1а Ьеи <210> 47 <211> 194 <212> Белок <213> Искусственная последовательность
- 85 007810 <223> ΠΤΝΓ с встроенными эпитопами Р2 и РЗО столбнячного анатоксина <220>
<221> Мутаген <222> (110) <223> Эпитоп РЗО столбнячного анатоксина <220>
<221> Мутаген <222> (131)·.(145) <223> Эпитоп Р2 столбнячного анатоксина <220>
<221> разные признаки <222> (2)..(109) <223> Аминокислоты ЬТЫЕ1-108 <220>
<221> разные признаки <222> (146)..(194) <223> Аминокислоты ЬТЫЕ 109-157 <400> 47
МеН 1 | Уа1 Агд | Зег | Зег Зег Агд 5 | ТЬг Рго Зег Азр Ьуз 10 | Рго | Уа1 | А1а ΗΪ3 15 | ||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | С1у | С1п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | 61у | С1п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | РЬе | Азп | Азп |
100 | 105 | 110 |
- 86 007810
РЬе ТЬг Уа1 Зег РЬе 115 | Тгр Ьеи Агд 120 | Уа1 | Рго Ьуз Уа1 Зег А1а Зег ΗΪ3 125 | ||||||||||||
Ьеи | 61и | С1п | Туг | 11е | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | 11е | С1у | 11е | ТЬг | С1и |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Ьеи | А1а | 61и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | 61у | 61у | Уа1 |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
РЬе | 61п | Ьеи | 61и | Ьуз | 61у Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго | |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | 61и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е |
180 | 185 | 190 |
А1а Ьеи <210> 48 <211> 1545 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 3 последовательности ЬТЫГ, соединенные глициновыми линкерами и эпитопами Р2 и РЗО столбнячного анатоксина <220>
<221> разные признаки <222> (475)..(483) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (4)..(474) <223> ЬТЫГ <220>
<221> разные признаки <222> (1072)..(1542) <223> ΗΤΝΓ <220>
<221> разные признаки <222> (529)..(999) <223> ЬТЫЕ <220>
<221> разные признаки
- 87 007810 <222> (1000)..(1008) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (1009)..(1071) <223> Эпитоп РЗО столбнячного анатоксина <220>
<221> СБЗ <222> (1)..(1545) <223>
<220>
<221> разные признаки <222> (484)..(528) <223> Эпитоп Р2 столбнячного анатоксина <400> 48
аБд дЬд сдс аде | аде аде Зег Зег 5 | сдс асе ссс аде дас аад ссс дБд дсс сас | 48 | |||||||||||||
МеБ 1 | Уа1 Агд | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег 10 | Азр Ьуз | Рго | Уа1 А1а 15 | ΗΪ3 | ||||||
дЬд | дЬд | дсс | аас | ссс | сад | дсс | дад | ддс | саа | сБд | сад | Ьдд | сБд | аас | сдс | 96 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | 61у | С1п | Ьеи | ΘΙη | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
сдс | дсс | аас | дсс | сБд | сБд | дса | аас | ддс | дЬд | дад | сБд | сдс | дас | аас | сад | 144 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
Сид | дЬд | дид | ссс | аде | дад | ддс | Сид | Бас | сЕд | аы. | иаи | аде | СЗу | дид | Сид | Л П6 X 7 4. |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | ΘΙη | Уа1 | Ьеи | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ББс | аад | ддс | сад | ддс | Бдс | ссс | аде | асе | сас | дЬд | сБд | сБд | асе | сас | асе | 240 |
РЬе | Ьуз | С1у | ΘΙη | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Н1з | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Н1з | ТЬг | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
аБс | аде | сдс | аБс | дсс | дЬд | аде | Бас | сад | асе | аад | дЬд | аас | сБд | сБд | аде | 288 |
11е | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | ΘΙη | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
дсс | аБс | аад | аде | ссс | Бдс | сад | сдс | дад | асе | ссс | дад | ддс | дсс | дад | дсс | 336 |
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
аад | ссс | Ьдд | Бас | дад | ссс | аБс | Бас | сБс | ддс | ддс | дЪд | ББс | сад | сБд | дад | 384 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | ΘΙη | Ьеи | С1и | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
аад | ддс | дас | сдс | сБд | аде | дсс | дад | аБс | аас | сдс | ссс | дас | Бас | сБд | дас | 432 |
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
130 | 135 | 140 |
- 88 007810
иис дсс дад аде ддс сад д£д РЬе А1а С1и Зег 61у 61п Уа1 | иас иис ддс Туг РЬе С1у | аис 11е 155 | аис Не | дсс сид дди А1а Ьеи С1у | ддс С1у 160 | 480 | ||||||||||
145 | 150 | |||||||||||||||
дда | сад | иас | аис | ааа | дси | аас | исс | ааа | иис | аис | ддс | аис | асе | даа | сид | 528 |
61у | С1п | Туг | 11е | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | 11е | 61у | Не | ТЬг | С1и | Ьеи | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
дис | едд | исс | исс | исс | едд | аса | сса | исс | дас | ааа | сса | дис | дси | саи | дис | 576 |
Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Нхз | Уа1 | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
дис | дси | ааи | сса | саа | дси | даа | дди | саа | сии | саа | идд | сии | ааи | едд | едд | 624 |
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
дси | ааи | дси | сии | сии | дси | ааи | дди | дис | даа | сии | едд | дас | ааи | саа | сии | 672 |
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
ди с | ди с | сса | исс | даа | дди | сии | иаи | сии | аии | иаи | исс | саа | дис | сии | иии | 720 |
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
ааа | дди | саа | дди | иди | сса | исс | аса | саи | дис | сии | сии | аса | саи | аса | аии | 768 |
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
исс | едд | аии | дси | дис | исс | иаи | саа | аса | ааа | дис | ааи | сии | сии | исс | дси | 816 |
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
аии | ааа | исс | сса | иди | саа | едд | даа | аса | сса | даа | дди | дси | даа | дси | ааа | 864 |
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | 61и | А1а | Ьуз | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
сси | идд | иаи | даа | сса | аии | иаи | сии | ддк | дди | дЬс | иии | саа | сии | даа | ааа | 912 |
Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и | Ьуз | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
ддЬ | дас | едд | сии | исс | дси | даа | аии | ааи | едд | сса | дай | иаи | сии | дас | иии | 960 |
(31 у Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | ||
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
дси | даа | исс | дди | саа | дис | иаи | иии | дди | аии | аии | дси | сид | ддс | дди | ддд | 1008 |
А1а | С1и | Зег | 61у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | 11е | Не | А1а | Ьеи | С1у | 61у | 61у | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
иис | аас | аас | иис | асе | дии | исс | иис | идд | сид | сдс | дии | сса | ааа | дии | исс | 1056 |
РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
дсЬ | Ьсс | сас | сид | даа | дии | сдЬ | иси | иск | иск | едк | асд | ссд | Ьск | дак | аад | 1104 |
А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | С1и | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
ссд | дии | дед | сас | дии | дии | дед | аас | ссд | сад | дед | дад | ддд | саа | иид | сад | 1152 |
Рго | Уа1 | А1а | Н1з | Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | С1и | 61у | С1п | Ьеи | С1п |
370 375 380
- 89 007810
Бдд ББд Тгр Ьеи 385 | ааБ Азп | сдБ Агд | сдБ дед аас дед | ББд ББд дед ааБ | ддд д^Б С1у Уа1 | даа ББд С1и Ьеи 400 | 1200 | |||||||||
Агд | А1а 390 | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а 395 | Азп | |||||||||
сдБ | даБ | аас | саа | ББд | дББ | дББ | ссд | БсБ | дад | ддд | ББд | Бас | ББд | аБа | БаБ | 1248 |
Агд | Азр | Азп | Б1п | Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
БсБ | сад | дББ | ББд | ББс | ааа | ддд | саа | ддд | Бдс | ссд | БсБ | асд | саБ | дББ | ББд | 1296 |
Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе | Ьуз | 61у | С1п | (31 у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
ББд | асд | сас | асд | аБа | БсБ | сдБ | аБа | дед | дББ | БсБ | Бас | сад | асд | аад | дББ | 1344 |
Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
ааБ | ББд | ББд | БсБ | дед | аБа | ааа | БсБ | ссд | БдБ | саа | сдБ | даа | асд | ссд | даа | 1392 |
Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
ддд | дед | дад | дед | аад | ссд | Бдд | БаБ | даа | ссд | аБа | Бас | ББд | ддд | ддд | дББ | 1440 |
С1у | А1а | С1и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | |
465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
БББ | сад | ББд | даа | ааа | ддд | даБ | сдБ | ББд | БсБ | дед | дад | аБа | аас | сдБ | ссд | 1488 |
РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | |
485 | 490 | 4 95 | ||||||||||||||
дас | БаБ | ББд | даБ | ББс | дед | даа | БсБ | ддд | саа | дББ | Бас | БББ | ддд | аБа | аБа | 1536 |
Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не |
500 505 510 дед сБд Баа1545
А1а Ьеи <210>49 <211>514 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 3 последовательности ЬТЫЕ, соединенные глициновыми линкерами и эпитопами Р2 и РЗО столбнячного анатоксина <400> 49
МеБ | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Н1з |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п |
35 | 40 | 45 |
- 90 007810
Ьеи Уа1 | Уа1 | Рго Зег С1и | С1у 55 | Ьеи Туг | Ьеи | Не | Туг 60 | Зег | С1п | ν3ι | Ьеи | ||||
50 | |||||||||||||||
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Н1з | ТЬг |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Не | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | С1у |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | С1п | Туг | Не | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | Не | С1у | Не | ТЬг | С1и | Ьеи |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Нхз | Уа1 |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Н13 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Н1з | ТЬг | Не |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
260 | 265 | 270 |
- 91 007810
11е Ьуз Зег Рго 275 | Суз С1п Агд С1и ТЬг Рго С1и 280 | 61у | А1а 285 | 61и А1а Ьуз | |||||||||||
Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | Не | Туг | Ьеи | 61у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61и | Ьуз |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | Не | Не | А1а | Ьеи | 61у | 61у | 61у |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | 61и | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Рго | Уа1 | А1а | Н1з | Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | 61п | Ьеи | 61п |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | 61и | Ьеи |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе | Ьуз | 61у | 61п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
61у | А1а | 61и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | Не | Туг | Ьеи | 61у | 61у | Уа1 |
4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
РЬе | 61п | Ьеи | 61и | Ьуз | 61у Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | Не | Азп | Агд | Рго | |
485 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | Не | Не |
500 505 510
- 92 007810
А1а Ьеи <210> 50 <211> 1545 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 3 мономера ΜΝΕ, соединенные триглициновыми линкерами и эпитопами Р2 и РЗО столбнячного анатоксина <220>
<221> СЦЗ <222> (1)..(1545) <223>
<220>
<221> разные признаки <222> (1072)..(1542) <223> ΗΤΝΕ <220>
<221> разные признаки <222> (547)..(1017) <223> ЬТЫГ <220>
<221> разные признаки <222> (475)..(483) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (484)..(546) <223> Эпитоп РЗО столбнячного анатоксина <220>
<221> разные признаки <222> (1018)..(1026) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (1027)..(1071) <223> Эпитоп Р2 столбнячного анатоксина <220>
<221> разные признаки <222> (4)..(474) <223> ЬТЫГ
- 93 007810 <400> 50
акд дед Мек Уа1 1 | сдс аде | аде аде сдс асе ссс аде дас аад ссс дед дсс сас | 48 | |||||||||||||
Агд | Зег | Зег Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз | Рго | Уа1 | А1а 15 | ΗΪ3 | ||||||||||
5 | 10 | |||||||||||||||
дкд | дед | дсс | аас | ссс | сад | дсс | дад | ддс | саа | сед | сад | едд | сед | аас | сдс | 96 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | ΘΙη | А1а | С1и | С1у | ΘΙη | Ьеи | ΘΙη | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
сдс | дсс | аас | дсс | сед | сед | дса | аас | ддс | дед | дад | сед | сдс | дас | аас | сад | 144 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | б1у | Уа1 | б1и | Ьеи | Агч | Азр | Азп | С1п | |
35 | 40 | 45’ | ||||||||||||||
сед | дед | дед | ССС | аде | дад | ддс | сед | еас | сед | аес | еас | аде | сад | дед | сед | 192 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | ΘΙη | Уа1 | Ьеи | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
еес | аад | ддс | сад | ддс | еде | ссс | аде | асе | сас | дед | сед | сед | асе | сас | асе | 240 |
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | НЬз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
аес | аде | сдс | аес | дсс | дед | аде | еас | сад | асе | аад | дед | аас | сед | сед | аде | 288 |
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | ΘΙη | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
дсс | аес | аад | аде | ссс | еде | сад | сдс | дад | асе | ссс | дад | ддс | дсс | дад | дсс | 336 |
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | ΘΙη | Агд | С1и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | С1и | А1а | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
аад | ССС | едд | еас | дад | ссс | аес | еас | се с | ддс | ддс | дед | еес | сад | сед | дад | 384 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | б1у | С1у | Уа1 | РЬе | ΘΙη | Ьеи | С1и | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
аад | ддс | дас | сдс | сед | аде | дсс | дад | аес | аас | сдс | ссс | дас | еас | сед | дас | 432 |
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
еес | дсс | дад | аде | ддс | сад | дед | еас | еес | ддс | аес | аес | дсс | сед | дде | ддс | 480 |
РЬе | А1а | 61и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | С1у | С1у | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
дда | еес | аас | аас | еес | асе | дее | есс | еес | едд | сед | сдс | дее | сса | ааа | дее | 528 |
С1у | РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
есс | дсе | есс | сас | сед | даа | дес | едд | есс | есс | есс | едд | аса | сса | есс | дас | 576 |
Зег | А1а | Зег | ΗΪ3 | Ьеи | С1и | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
ааа | сса | дес | дсе | сае | дес | дес | дсе | аае | сса | саа | дсе | даа | дде | саа | сее | 624 |
Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | ΘΙη | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
саа | едд | сее | аае | едд | едд | дсе | аае | дсе | сее | сее | дсе | аае | дде | дес | даа | 672 |
ΘΙη | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | С1и |
210 215 220
екк сдд дас аак | саа екк 61п Ьеи 230 | дке дке Уа1 Уа1 | сса Рго | ксс Зег | даа 61 и 235 | ддк С1у | екк Ьеи | как Туг | екк Ьеи | акк Не 240 | 720 | |||||
Ьеи 225 | Агд Азр | Азп | ||||||||||||||
как | ксс | саа | дке | екк | ккк | ааа | ддк | саа | ддк | кдк | сса | ксс | аса | сак | дке | 768 |
Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе | Ьуз | 61у | 61п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Ηί3 | Уа1 | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
екк | екк | аса | сак | аса | акк | ксс | сдд | акк | дек | дке | ксс | как | саа | аса | ааа | 816 |
Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
дке | аак | екк | екк | ксс | дек | акк | ааа | ксс | сса | кдк | саа | сдд | даа | аса | сса | 864 |
Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
даа | ддк | дек | даа | дек | ааа | сек | кдд | как | даа | сса | акк | как | екк | ддк | ддк | 912 |
61и | 61у | А1а | 61и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | 61у | 61у | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
дке | ккк | саа | екк | даа | ааа | ддк | дас | сдд | екк | ксс | дек | даа | акк | аак | сдд | 960 |
Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | 61и | Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | Не | Азп | Агд | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
сса | дак | как | екк | дас | ккк | дек | даа | ксс | ддк | саа | дке | как | ккк | ддк | акк | 1008 |
Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег | 61у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
акк | дек | скд | ддс | ддк | ддд | сад | кас | акс | ааа | дек | аас | ксс | ааа | ккс | акс | 1056 |
11е | А1а | Ьеи | 61у | С1у | 61у | 61п | Туг | Не | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | 11е | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
ддс | акс | асе | даа | скд | дкк | едк | кек | кек | кек | едк | асд | сед | кек | дак | аад | 1104 |
61у | Не | ТЬг | С1и | Ьеи | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
сед | дкк | дед | сас | дкк | дкк | дед | аас | сед | сад | дед | дад | ддд | саа | ккд | сад | 1152 |
Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | 61у | С1п | Ьеи | 61п | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
кдд | ккд | аак | едк | едк | дед | аас | дед | ккд | ккд | дед | аак | ддд | дкк | даа | ккд | 1200 |
Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | 61и | Ьеи | |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||||
едк | дак | аас | саа | ккд | дкк | дкк | сед | кек | дад | ддд | ккд | кас | ккд | ака | как | 1248 |
Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
кек | сад | дкк | ккд | ккс | ааа | ддд | саа | ддд | кде | сед | кек | асд | сак | дкк | ккд | 1296 |
Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
ккд | асд | сас | асд | ака | кек | едк | ака | дед | дкк | кек | кас | сад | асд | аад | дкк | 1344 |
Ьеи | ТЬг | Ηί3 | ТЬг | Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
аак | ккд | ккд | кек | дед | ака | ааа | кек | сед | кдк | саа | едк | даа | асд | сед | даа | 1392 |
Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и |
450 455 460
ддд дед дад дед аад | ссд бдд баб даа ссд аба бас ббд ддд ддд дбб | 1440 | ||||||||||||||
С1у А1а С1и 465 | А1а | Ьуз | Рго 470 | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не Туг Ьеи С1у С1у Уа1 | ||||||||
475 | 480 | |||||||||||||||
ббб | сад | ббд | даа | ааа | ддд | даб | едб | ббд | бсб | дед | дад | аба | аас | едб | ссд | 1488 |
РЬе | С1п | Ьеи | С1и | Ьуз | С1у Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | ||
485 | 4 90 | 495 | ||||||||||||||
дас | баб | ббд | даб | ббс | дед | даа | бсб | ддд | саа | дбб | бас | ббб | ддд | аба | аба | 1536 |
Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | ΘΙη | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | |
500 | 505 | 510 |
дед ебд баа1545
А1а Ьеи <210>51 <211>514 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 3 мономера ΜΝΕ1, соединенные триглициновыми линкерами и эпитопами Р2 и РЗО столбнячного анатоксина <400> 51
Меб Уа1 1 | Агд Зег Зег Зег Агд ТЬг Рго Зег Азр Ьуз | Рго | Уа1 | А1а 15 | Нхз | ||||||||||
5 | 10 | ||||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | ΘΙη | А1а | б1и | 61у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | ΘΙη |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | ΘΙη | Уа1 | Ьеи |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Ηίβ | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нбз | ТЬг |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | ΘΙη | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | 61и | А1а |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | 61и |
115 | 120 | 125 |
Ьуз С1у Азр 130 | Агд Ьеи | Зег А1а 135 | С1и 11е Азп | Агд Рго 140 | Азр Туг | Ьеи Азр | |||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | С1у |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Зег | А1а | Зег | Н1з | Ьеи | С1и | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | 61у | С1п | Ьеи |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
ΘΙη | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | ΘΙη | ТЬг | Ьуз |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
С1и | С1у | А1а | С1и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | О1и | Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Не | А1а | Ьеи | 61у | С1у | С1у | С1п | Туг | Не | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | Не |
340 | 345 | 350 |
- 97 007810
С1у 11е ТЬг 61и | Ьеи | Уа1 | Агд | Зег Зег Зег Агд ТЬг Рго | Зег | Азр | Ьуз | ||||||||
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Рго | Уа1 | А1а | Нхз | Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | 61п | Ьеи | 61п |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | 61и | Ьеи |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе | Ьуз | 61у | 61п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | 11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
61у | А1а | 61и | А1а | Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | 61у | 61у | Уа1 |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
РЬе | 61п | Ьеи | 61и | Ьуз | 61 у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго |
485 | 4 90 | 495 | |||||||||||||
Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | 11е | 11е |
500 505 510
А1а Ьеи <210>52 <211>1554 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность' <220>
<223> 3 мономера ΗΤΝΕ,соединенные триглициновыми линкерами и с введенными эпитопами Р2 и РЗО <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(1554) <223>
<220>
- 98 007810 <221> разные признаки <222> (4)..(474) <223> ΗΤΝΓ <220>
<221> разные признаки <222> (475)..(483) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (484)..(954) <223> ЬТЫЕ <220>
<221> разные признаки <222> (955)..(963) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (964)..(1008) <223> Эпитоп Р2 столбнячного анатоксина <220>
<221> разные признаки <222> (1009)..(1479) <223> ЬТЫЕ <220>
<221> разные признаки <222> (1480)..(1488) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (1489)..(1551) <223> Эпитоп РЗО столбнячного анатоксина
<400> 52 абд дбд сдс Меб Уа1 Агд 1 | аде Зег | аде Зег 5 | аде Зег | сдс Агд | асе ТЬг | ссс Рго | аде Зег 10 | дас Азр | аад Ьуз | ссс Рго | дбд Уа1 | дсс А1а 15 | сас Н1з | 48 | ||
дбд | дбд | дсс | аас | ссс | сад | дсс | дад | ддс | саа | сбд | сад | бдд | сбд | аас | сдс | 96 |
Уа1 | 57а1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | С1у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
сдс | дсс | аас | дсс | сбд | сбд | дса | аас | ддс | дбд | дад | сбд | сдс | дас | аас | сад | 144 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | |
35 | 40 | 45 |
- 99 007810
скд дкд дкд ссс | аде Зег | дад ддс | скд кас скд акс кас аде сад дкд скд | 192 | ||||||||||||
Ьеи Уа1 | Уа1 | Рго | С1и | С1у 55 | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг Зег 60 | 31п | Уа1 | Ьеи | ||||
50 | ||||||||||||||||
ккс | аад | ддс | сад | ддс | кде | ссс | аде | асе | сас | дкд | скд | скд | асе | сас | асе | 240 |
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЫ | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | НЬз | ТЬг | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
а€с | аде | сдс | акс | дсс | дЪд | аде | кас | сад | асе | аад | дкд | аас | скд | скд | аде | 288 |
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
дсс | акс | аад | аде | ссс | кде | сад | сдс | дад | асе | ссс | дад | ддс | дсс | дад | дсс | 336 |
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 31и | С1у | А1а | 61и | А1а | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
аад | ссс | Ьдд | Ьас | дад | ссс | акс | кас | скс | ддс | ддс | дкд | кЛс | сад | скд | дад | 384 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
аад | ддс | да с | сдс | скд | аде | дсс | дад | акс | аас | сдс | ссс | дас | кас | скд | дас | 432 |
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
ккс | дсс | дад | аде | ддс | сад | дЬд | Ьас | (+с | ддс | акс | акс | дсс | скд | ддк | ддс | 480 |
РЬе | А1а | С1и | Зег | 61у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | 61у | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
дда | дЪс | сдд | ксс | ксс | ксс | сдд | аса | сса | ксс | дас | ааа | сса | дке | дек | сак | 528 |
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Нхз | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
дке | дке | дек | аак | сса | саа | дек | даа | ддЪ | саа | екк | саа | кдд | екк | аак | сдд | 576 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
сдд | дек | аак | дек | с!1 | екк | дек | ааЬ | ддк | дке | даа | екк | сдд | дас | аак | саа | 624 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | 31и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
скЬ | дке | дке | сса | ксс | даа | ддЬ | сЬк | как | екк | акк | как | ксс | саа | дке | сЪк | 672 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
ккк | ааа | ддк | саа | ддк | ЬдЬ | сса | ксс | аса | сак | дке | екк | екк | аса | сак | аса | 720 |
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
аСС | Ссс | сдд | а€к | дсЬ | дЪс | ксс | как | саа | аса | ааа | дке | аак. | екк | екк | Ьсс | 768 |
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
дс± | акк | ааа | ксс | сса | Ьдк | саа | сдд | даа | аса | сса | даа | ддк | дек | даа | дек | 816 |
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | 31у | А1а | 61и | А1а |
260 265 270
- 100 007810
ааа ссН Ндд | НаН даа сса аНН | НаН еНН ддН ддН дНе ИНН | саа С1п | еНН даа Ьеи 51и | 864 | |||||||||||
Ьуз Рго | Тгр 275 | Туг 61и | Рго 11е | Туг Ьеи 280 | С1у С1у Уа1 | РЬе 285 | ||||||||||
ааа | ддН | дас | едд | еНН | Нее | дсН | даа | аНН | ааН | едд | сса | даН | НаН | еНН | дас | 912 |
Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
НИН | дсН | даа | Нее | ддН | саа | дНе | НаН | ННН | ддН | аНН | аНН | дсН | сНд | ддс | ддН | 960 |
РЬе | А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | Не | Не | А1а | Ьеи | 61у | 61у | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
ддд | сад | Нас | аНс | ааа | дсН | аас | Нее | ааа | ННс | аНс | ддс | аНс | асе | даа | сНд | 1008 |
61у | 61п | Туг | Не | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | Не | С1у | Не | ТЬг | 61и | Ьеи | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
дин | едП | И сП | НсН | НсН | едН | асд | сед | НсН | даН | аад | сед | дНН | дед | сас | дНН | 1056 |
Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Н1з | Уа1 | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
дни | дед | аас | сед | сад | дед | дад | ддд | саа | ННд | сад | Ндд | ННд | ааН | едН | едН | 1104 |
Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
дед | аас | дед | ННд | ННд | дед | ааН | ддд | дНН | даа | ННд | едН | даН | аас | саа | ННд | 1152 |
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 01п | Ьеи | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
дНН | дНН | сед | НсН | дад | ддд | ННд | Нас | ННд | аНа | НаН | НсН | сад | дНН | ННд | ННс | 1200 |
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе | |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||||
ааа | ддд | саа | ддд | Иде | сед | НсН | асд | саН | дНН | ННд | ННд | асд | сас | асд | аНа | 1248 |
Ьуз | 61у | С1п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Н1з | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг | Не | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
НсН | едП | аНа | дед | дНН | НсН | Нас | сад | асд | аад | дНН | ааН | ННд | ННд | НсН | дед | 1296 |
Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
аНа | ааа | И сП | сед | НдН | саа | едН | даа | асд | сед | даа | ддд | дед | дад | дед | аад | 1344 |
Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | 61у | А1а | 61и | А1а | Ьуз | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
ссд | Ндд | НаН | даа | сед | аНа | Нас | ННд | ддд | ддд | дНН | ннн | сад | ННд | даа | ааа | 1392 |
Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | Пе | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и | Ьуз | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
ддд | даН | едН | ННд | НсН | дед | дад | аНа | аас | едН | сед | дас | НаН | ННд | даН | ННс | 1440 |
61у Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | ||
465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
дед | даа | НсН | ддд | саа | дНН | Нас | ннн | ддд | аНа | аНа | дед | сНд | ддН | ддс | дда | 1488 |
А1а | С1и | Зег | 61у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | 61у | 61у | |
485 | 490 | 495 | ||||||||||||||
ННс | аас | аас | пне | асе | дНН | Нее | ННс | Ндд | сНд | еде | дНН | сса | ааа | дНН | Нее | 1536 |
РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег |
500 505 510
- 101 007810 дсЕ Есс сас сЕд даа Еаа1554
А1а Зег ΗΪ8 Ьеи 61и
515 <210>53 <211>517 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 3 мономера ΜΝΕ,соединенные триглициновыми линкерами и
с введенными эпитопами Р2 и РЗО | |||||||||||||||
<400> | 53 | ||||||||||||||
МеЕ | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61 у | С1п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | 61 у | А1а | С1и | А1а |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
РЬе | А1а | 61и | Зег | 61у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | 61у | 61у |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | НЬз |
165 170 175
- 102 007810
Уа1 Уа1 А1а Азп Рго С1п А1а С1и 61у С1п Ьеи С1п Тгр Ьеи Азп Агд | |||||||||||||||
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | С1у |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
61у | С1п | Туг | 11е | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | Не | 61у | 11е | ТЬг | С1и | Ьеи |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | Уа1 |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
385 390 395 400
- 103 007810
Ьуз | С1у С1п | 61у | Суз 405 | Рго | Зег ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 Ьеи Ьеи 410 | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг 415 | 11е | ||||
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | 61и | А1а | Ьуз |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | 61у | 61 у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61и | Ьуз |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | 61у | 61у | 61у |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
РЬе | Азп | Азп | РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег |
500 | 505 | 510 |
А1а Зег ΗΪ3 Ьеи С1и
515 <210> 54 <211> 1485 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 3 ΗΤΝΕ, соединенные триглициновыми линкерами, и с добавленным с С-конца РАОКЕ <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(1485) <223>
<220>
<221> разные признаки η Н ! А X ! Л Ч А X \Ч ) . . I Ч / Ч ) <223> ΗΤΝΓ <220>
<221> разные признаки <222> (484)..(954) <223> ΗΤΝΕ <220>
<221> разные признаки
- 104 007810 <222> (955)..(963) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (964)..(1034) <223> ЬТЫЕ <220>
<221> разные признаки <222> (1035)..(1043) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (1044)..(1482) <223> Связывающий все типы ΏΚ пептид (ΡΑΌΚΕ) <220>
<221> разные признаки <222> (475)..(483) <223> Трициклиновый линкер <400> 54
аБд дБд сдс аде аде аде сдс асе ссс аде дас аад ссс дБд | дсс А1а 15 | сас ΗΪ3 | 48 | |||||||||||||
МеБ Уа1 1 | Агд Зег | Зег 5 | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег 10 | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | |||||
ГГ^ГГ | Лг+- ΖΎ | зап | '’СС | гагг | гтг'г*· | ггагт | ГТ ГТ Г» | саа | П+ТТ | Г’ЯГГ | 1-гггг | Г^· ГТ | ззс | ГГТГ· | 96 | |
дсс | — * ·3 | 5 | '•'и — | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | С1п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
сдс | дсс | аас | дсс | сБд | сБд | дса | аас | ддс | дБд | дад | сБд | сдс | дас | аас | сад | 144 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
сБд | дБд | дБд | ссс | аде | дад | ддс | сБд | Бас | сБд | аБс | Бас | аде | сад | дБд | сБд | 192 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | 61 у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ББс | аад | ддс | сад | ддс | Бдс | ссс | аде | асе | сас | дБд | сБд | сБд | асе | сас | асе | 240 |
РЬе | Ьуз | 61у | 61п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Η13 | ТЬг | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
аБс | аде | сдс | аБс | дсс | дБд | аде | Бас | сад | асе | аад | дБд | аас | сБд | сБд | аде | 288 |
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
дсс | аБс | аад | аде | ссс | Бдс | сад | сдс | дад | асе | ссс | дад | ддс | дсс | дад | дсс | 336 |
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | 61и | А1а | |
100 | 105 | 110 |
- 105 007810
аад ссс бдд бас дад ссс | абс бас сбс ддс ддс дбд ббс сад сбд дад | 384 | ||||||||||||||
Ьуз Рго | Тгр Туг 115 | 61и | Рго | 11е | Туг Ьеи 120 | 61у | 61у Уа1 РЬе 125 | 61п Ьеи | 61и | |||||||
аад | ддс | дас | сдс | сбд | аде | дсс | дад | абс | аас | сдс | ссс | дас | бас | сбд | дас | 432 |
Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
ббс | дсс | дад | аде | ддс | сад | дбд | бас | ббс | ддс | абс | абс | дсс | сбд | ддб | ддс | 480 |
РЬе | А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | 61у | 61у | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
дда | дбс | сдд | бсс | бсс | бсс | сдд | аса | сса | бсс | дас | ааа | сса | дбс | дсб | саб | 528 |
61у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
дбс | дбс | дсб | ааб | сса | саа | дсб | даа | ддб | саа | ебб | саа | бдд | ебб | ааб | сдд | 576 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
сдд | дсб | ааб | дсб | ебб | ебб | дсб | ааб | ддб | дбс | даа | ебб | сдд | дас | ааб | саа | 624 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
ебб | дбс | дбс | сса | бсс | даа | ддб | ебб | баб | ебб | абб | баб | бсс | саа | дбс | ебб | 672 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
ббб | ааа | ддб | саа | ддб | бдб | сса | бсс | аса | саб | дбс | ебб | ебб | аса | саб | аса | 720 |
РЬе | Ьуз | 61у | 61п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
абб | бсс | сдд | абб | дсб | дбс | бсс | баб | саа | аса | ааа | дбс | ааб | ебб | ебб | бсс | 768 |
Не | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
дсб | абб | ааа | бсс | сса | бдб | саа | сдд | даа | аса | сса | даа | ддб | дсб | даа | дсб | 816 |
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | 61и | А1а | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
ааа | ссб | бдд | баб | даа | сса | абб | баб | ебб | ддб | ддб | дбс | ббб | саа | ебб | даа | 864 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | 61у | 61 у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61и | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
ааа | ддб | дас | сдд | ебб | бсс | дсб | даа | абб | ааб | сдд | сса | даб | баб | ебб | дас | 912 |
Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
ббб | дсб | даа | бсс | ддб | саа | дбс | баб | ббб | ддб | абб | абб | дсб | сбд | ддс | ддб | 960 |
РЬе | А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61 у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | 61у | 61у | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
ддд | дбб | едб | бсб | бсб | бсб | едб | асд | ссд | бсб | даб | аад | ссд | дбб | дед | сас | 1008 |
61у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
дбб | дбб | дед | аас | ссд | сад | дед | дад | ддд | саа | ббд | сад | бдд | ббд | ааб | едб | 1056 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61 у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
340 345 350
- 106 007810
едк дед аас дед ккд | ккд дед | аак ддд дкк | даа 61и | ккд едк Ьеи Агд 365 | дак Азр | аас Азп | саа С1п | 1104 | ||||||||
Агд | А1а | Азп А1а 355 | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп 360 | 61у Уа1 | |||||||||
ккд | дкк | дкк | ссд | кек | дад | ддд | ккд | кас | ккд | ака | как | кек | сад | дкк | ккд | 1152 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | ΘΙη | Уа1 | Ьеи | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
ккс | ааа | ддд | саа | ддд | кде | ссд | кек | асд | сак | дкк | ккд | ккд | асд | сас | асд | 1200 |
РЬе | Ьуз | 61у | ΘΙη | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг | |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||||
ака | кек | едк | ака | дед | дкк | кек | кас | сад | асд | аад | дкк | аак | ккд | ккд | кек | 1248 |
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | ΘΙη | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
дед | ака | ааа | кек | ссд | кдк | саа | едк | даа | асд | ссд | даа | ддд | дед | дад | дед | 1296 |
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
аад | ссд | кдд | как | даа | ссд | ака | кас | ккд | ддд | ддд | дкк | ккк | сад | ккд | даа | 1344 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | 61у | Уа1 | РЬе | ΘΙη | Ьеи | С1и | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
ааа | ддд | дак | едк | ккд | кек | дед | дад | ака | аас | едк | ссд | дас | как | ккд | дак | 1392 |
Ьуз | С1у Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | ||
450 | 455 | 4 60 | ||||||||||||||
ккс | дед | даа | кек | ддд | саа | дкк | кас | ккк | ддд | ака | ака | дед | скд | дда | ддд | 1440 |
РЬе | А1а | 61и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | С1у | 61у | |
465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
ддк | дсс | аад | ккс | дкд | дсс | дек | кдд | асс | скд | аад | дсс | дса | дек | каа | 1485 | |
С1у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а |
485 490 <210> 55 <211> 494 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 3 ЬТЫЕ, соединенные триглициновыми линкерами, и с добавленным с С-конца РАББЕ <400> 55
Мек Уа1 Агд 1 | Зег | Зег 5 | Зег Агд ТЬг Рго Зег 10 | Азр Ьуз | Рго | Уа1 | А1а 15 | Нхз | |||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | ΘΙη | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п |
35 | 40 | 45 |
- 107 007810
Ьеи Уа1 Уа1 50 | Рго | Зег С1и С1у 55 | Ьеи Туг Ьеи | Не | Туг 60 | Зег С1п | Уа1 Ьеи | ||||||||
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | <31п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а |
100 | 105 | но | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | С1у |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | 61и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | νβΐ | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1П | Уа1 | Ьеи |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | (31и | А1а |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и |
275 280 285
- 108 007810
Ьуз | 61у 290 | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а С1и Не Азп Агд Рго Азр Туг | Ьеи | Азр | |||||||
295 | 300 | ||||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | б1у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | С1у |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Нхз |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | ΘΙη | Ьеи | ΘΙη | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | ΘΙη |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | б1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | ΘΙη | Уа1 | Ьеи |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | 01 у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | 61и | С1у | А1а | С1и | А1а |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | 61у |
465 | 470 | 475’ | 480 | ||||||||||||
С1у | А1а | Ьуз | РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а |
485 490 <210> 56 <211> 1476 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность
- 109 007810 <220>
<223> 3 ЬТЫГ, соединенные триглициновыми линкерами, и с добавленным с С-конца РАВКЕ <220>
<221> СБЗ <222> (1)..(1476) <223>
<220>
<221> разные признаки <222> (475)..(483) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (483)..(954) <223> ΗΤΝΕ <220>
<221> разные признаки <222> (484)..(954) <223> ЬТЫЕ <220>
<221> разные признаки <222> (955)..(963) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки <222> (964)..(1434) <223> ΗΤΝΓ <220>
<221> разные признаки <222> (1435)..(1473) <223> Связывающий все типы БК пептид(РАВРЕ) <220>
<221> разные признаки ζΟΟ'Κ ГЯ\ ΙΛΊΛΧ \ · -я !
<223> ЬТЫЕ <400> 56
аЬд МеЪ 1 | дрд сдс аде аде аде | сдс Агд | асе ссс аде дас аад ссс дЬд | дсс сас А1а Ηίβ 15 | 48 | |||||||||||
Уа1 Агд Зег | Зег Зег 5 | ТЬг | Рго | Зег 10 | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | ||||||||
дрд | дрд | дсс | аас | ссс | сад | дсс | дад | ддс | саа | с+д | сад | Ьдд | с£д | аас | сдс | 96 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | 61п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
20 | 25 | 30 |
- 110 007810
сдс Агд | дсс аас дсс скд скд дса аас ддс дкд дад скд сдс дас аас сад | 144 | ||||||||||||||
А1а Азп А1а 35 | Ьеи | Ьеи А1а Азп 40 | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи Агд Азр Азп 51п 45 | ||||||||||
скд | дкд | дкд | ссс | аде | дад | ддс | скд | кас | скд | акс | кас | аде | сад | дкд | скд | 192 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | ΘΙη | Уа1 | Ьеи | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ккс | аад | ддс | сад | ддс | кде | ссс | аде | асе | сас | дкд | скд | скд | асе | сас | асе | 240 |
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ8 | ТЬг | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
акс | аде | сдс | акс | дсс | дкд | аде | кас | сад | асе | аад | дкд | аас | скд | скд | аде | 288 |
11е | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | ΘΙη | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
дсс | акс | аад | аде | ссс | кде | сад | сдс | дад | асе | ссс | дад | ддс | дсс | дад | дсс | 336 |
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | ΘΙη | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | 61и | А1а | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
аад | ссс | кдд | кас | дад | ссс | акс | кас | скс | ддс | ддс | д£д | ккс | сад | скд | дад | 384 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | б1у | Уа1 | РЬе | ΘΙη | Ьеи | С1и | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
аад | ддс | дас | сдс | скд | аде | дсс | дад | акс | аас | сдс | ссс | дас | кас | скд | дас | 432 |
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
ккс | дсс | дад | аде | ддс | сад | дкд | кас | ккс | ддс | акс | акс | дсс | скд | ддк | ддс | 480 |
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | С1у | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
дда | дкс | сдд | ксс | ксс | ксс | сдд | аса | сса | ксс | дас | ааа | сса | дкс | дек | сак | 528 |
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
дкс | дкс | дек | аак | сса | саа | дек | даа | ддк | саа | екк | саа | кдд | екк | аак | сдд | 576 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | ΘΙη | А1а | 61и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
сдд | дек | аак | дек | екк | екк | дек | аак | ддк | дкс | даа | екк | сдд | дас | аак | саа | 624 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
екк | дкс | дкс | сса | ксс | даа | ддк | екк | как | екк | акк | как | ксс | саа | дкс | екк | 672 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | ΘΙη | Уа1 | Ьеи | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
ккк | ааа | ддк | саа | ддк | кдк | сса | ксс | аса | сак | дкс | екк | екк | аса | сак | аса | 720 |
РЬе | Ьуз | С1у | ΘΙη | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
акк | ксс | сдд | акк | дек | дкс | ксс | как | саа | аса | ааа | дкс | аак | екк | екк | ксс | 768 |
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
245 250 255
- 111 007810
дсе а+ ааа есс | сса еде Рго Суз | саа едд даа аса сса С1п Агд С1и ТЬг Рго 265 | даа дде дсе С1и 61у А1а 270 | даа дсе С1и А1а | 816 | |||||||||||
А1а | 11е | Ьуз Зег 260 | ||||||||||||||
ааа | ссе | едд | еае | даа | сса | аее | еае | сее | дде | дде | дес | еее | саа | сее | даа | 864 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | 61у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
ааа | дде | дас | едд | сее | есс | дсе | даа | аее | аае | едд | сса | дае | еае | сее | дас | 912 |
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
еее | дсе | даа | есс | дде | саа | дес | еае | еее | дде | аее | аее | дсе | сед | ддс | дде | 960 |
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | 61 у | Не | Не | А1а | Ьеи | С1у | С1у | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
ддд | дее | еде | есе | есе | есе | еде | асд | ссд | есе | дае | аад | ссд | дее | дед | сас | 1008 |
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
дее | дее | дед | аас | ссд | сад | дед | дад | ддд | саа | еед | сад | едд | еед | аае | еде | 1056 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | 61и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
еде | дед | аас | дед | еед | еед | дед | аае | ддд | дее | даа | еед | еде | дае | аас | саа | 1104 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
еед | дее | дее | ссд | есе | дад | ддд | еед | еас | еед | аеа | еае | есе | сад | дее | еед | 1152 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | ΘΙη | Уа1 | Ьеи | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
еес | ааа | ддд | саа | ддд | еде | ссд | есе | асд | сае | дее | еед | еед | асд | сас | асд | 1200 |
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||||
аеа | есе | еде | аеа | дед | дее | есе | еас | сад | асд | аад | дее | аае | еед | еед | есе | 1248 |
11е | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
дед | аеа | ааа | есе | ссд | еде | саа | еде | даа | асд | ссд | даа | ддд | дед | дад | дед | 1296 |
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
аад | ссд | едд | еае | даа | ссд | аеа | еас | еед | ддд | ддд | дее | еее | сад | еед | даа | 1344 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
ааа | ддд | дае | еде | еед | есе | дед | дад | аеа | аас | еде | ссд | дас | еае | еед | дае | 1392 |
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
еес | дед | даа | есе | ддд | саа | дее | еас | еее | ддд | аеа | аеа | дед | сед | дсс | аад | 1440 |
РЬе | А1а | 61и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | А1а | Ьуз | |
4 65 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
еес | дед | дсс | дсе | едд | асе | сед | аад | дсс | дса | дсе | еаа | 1476 | ||||
РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а |
485 490
112 007810 <210> 57 <211> 491 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 3 ЬТЫГ, соединенные триглициновыми линкерами, и с
добавленным с С-конца РАББЕ | |||||||||||||||
<400> | 57 | ||||||||||||||
МеЕ | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | 61 и | 61 у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61 у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | 61у | 61п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | 61и | А1а |
100 | 105 | но | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | 61 у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | Не | А1а | Ьеи | 61у | 61у |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | С1и | 61у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
180 185 190
- 113 007810
Агд А1а Азп | А1а Ьеи Ьеи А1а Азп 200 | С1у Уа1 | С1и | Ьеи Агд Азр 205 | Азп | С1п | |||||||||
195 | |||||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
11е | Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
А1а | 11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | С1и | 01у | А1а | С1и | А1а |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 01 и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | 01 и |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Ьуз | О1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | 61у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | С1у | С1у |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Нхз |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | С1п | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
340 | 345 | 350 |
Агд А1а Азп | А1а | Ьеи Ьеи А1а Азп С1у Уа1 С1и Ьеи Агд Азр Азп | С1п | ||||||||||||
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 01и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 01п | Уа1 | Ьеи |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | О1у | С1п | О1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | НЬз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
11е | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 01п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
405 | 410 | 415 |
- 114 007810
А1а 11е Ьуз Зег Рго Суз 61п Агд 61и ТЬг Рго С1и С1у А1а С1и А1а | |||||||||||||||
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | ΘΙη | Ьеи | С1и |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | ΘΙη | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | 11е | 11е | А1а | Ьеи | А1а | Ьуз |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
РЬе | Уа1 | А1а | А1а | Тгр | ТЬг | Ьеи | Ьуз | А1а | А1а | А1а | |||||
485 | 490 |
<210> 58 <211> 1545 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> 3 ЬТЫЕ, соединенные глициновыми линкерами, и с введенными Р2 и РЗО <220>
<221> СЬЗ <222> (1)..(1545) <223>
<220>
<221> разные признаки <222> (4)..(474) <223> ΗΤΝΡ
<220> <221> <222> <223> | разные признаки (475)..(483) Трициклиновый линкер | |
<220> | ||
<221> | разные | признаки |
<222> | (484).. | (954) |
<223> | ЬТЫЕ |
<220>
<221> разные признаки <222> (955)..(963) <223> Трициклиновый линкер <220>
<221> разные признаки
- 115 007810 <222> (964)..(1008) <223> Эпитоп Р2 столбнячного анатоксина <220>
<221> разные признаки <222> (1009)..(1479) <223> ЬТЫГ <220>
<221> разные признаки <222> (1480)..(1542) <223> Эпитоп РЗО столбнячного анатоксина <400> 58
акд дкд сдс аде аде аде Мек Уа1 Агд Зег Зег Зег | сдс Агд | асе ссс | аде дас | аад Ьуз | ссс дкд дсс Рго Уа1 А1а 15 | сас Ηϊβ | 48 | |||||||||
ТЬг | Рго | Зег 10 | Азр | |||||||||||||
1 | 5 | |||||||||||||||
дкд | дкд | дсс | аас | ссс | сад | дсс | дад | ддс | саа | скд | сад | кдд | скд | аас | сдс | 96 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
сдс | дсс | аас | дсс | скд | скд | дса | аас | ддс | дкд | дад | скд | сдс | дас | аас | сад | 144 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
скд | дкд | дкд | ссс | аде | дад | ддс | скд | кас | скд | акс | кас | аде | сад | дкд | скд | 192 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ккс | аад | ддс | са^ | ддс | Еде | ссс | ЗуС | асе | сас | у иу | Си у | асе | сас | асе | 240 | |
РЬе | Ьуз | 61у | С1п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
акс | аде | сдс | акс | дсс | дкд | аде | кас | сад | асе | аад | дкд | аас | скд | скд | аде | 288 |
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
дес | акс | аад | аде | ссс | кде | сад | сдс | дад | асе | ссс | дад | ддс | дсс | дад | дсс | 336 |
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61 у | А1а | 61и | А1а | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
аад | ссс | Ъдд | кас | дад | ссс | акс | кас | скс | ддс | ддс | дкд | ккс | сад | скд | дад | 384 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | Не | Туг | Ьеи | 61у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61и | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
аад | ддс | да с | сдс | скд | аде | дсс | дад | акс | аас | сдс | ссс | дас | кас | скд | дас | 432 |
Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
ккс | дсс | дад | аде | ддс | сад | дкд | кас | ккс | ддс | акс | акс | дсс | скд | ддк | ддс | 480 |
РЬе | А1а | 61 и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61 у | Не | Не | А1а | Ьеи | 61 у | 61у |
145 150 155 160
- 116 007810
дда дкс 61у Уа1 | сдд Агд | Ьсс Ьсс Ьсс сдд аса | сса Рго | Ьсс Зег 170 | дас Азр | ааа Ьуз | сса Рго | дЬс Уа1 | дсь А1а 175 | саЬ Ηί3 | 528 | |||||
Зег | Зег Зег Агд 165 | ТЬг | ||||||||||||||
дЬс | дЬс | дек | аак | сса | саа | дек | даа | ддЬ | саа | си | саа | Едд | си | ааЪ | сдд | 576 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | С1и | 61у | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
сдд | дек | ааЬ | дек | си | си | дсЬ | аак | ддЬ | дке | даа | сП | сдд | дас | аак | саа | 624 |
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | е!у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
си | дке | дЪс | сса | Ьсс | даа | ддк | си | Ьак | сП | аи | как | Ьсс | саа | дке | сП | 672 |
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
т | ааа | ддк | саа | ддь | ЬдЬ | сса | Ьсс | аса | сак | дке | си | си | аса | саЪ | аса | 720 |
РЬе | Ьуз | 61у | <31п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
аи | Ьсс | сдд | аи | дсЬ | дЬс | Ьсс | как | саа | аса | ааа | дЪс | аак | си | си | Ьсс | 768 |
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | С1п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
дек | аН | ааа | ксс | сса | ЬдЬ | саа | сдд | даа | аса | сса | даа | ддк | дсЬ | даа | дек | 816 |
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | С1и | А1а | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
ааа | ссЬ | ьдд | как | даа | сса | аи | как | си | ддк | ддк | дке | НЕ | саа | си | даа | 864 |
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | 61и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
ааа | ддЬ | дас | сдд | си | Ьсс | дек | даа | аи | ааЬ | сдд | сса | дак | как | си | дас | 912 |
Ьуз | 61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
ЬН | дсЬ | даа | Ьсс | ддь | саа | дке | как | НЬ | ддк | аи | а. И | дек | скд | ддс | ддЬ | 960 |
РЬе | А1а | 61и | Зег | 61у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | 61у | С1у | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
ддд | сад | Ьас | акс | ааа | дек | аас | Ьсс | ааа | Нс | акс | ддс | аЬс | асе | даа | сЬд | 1008 |
С1у | 61п | Туг | Не | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | Не | С1у | Не | ТЬг | 61и | Ьеи | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
дП | едк | ЪсЬ | ЬсЬ | ЬсЬ | сдЬ | асд | ссд | ЬсЬ | даЪ | аад | ссд | дН | дед | сас | дН | 1056 |
Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | Уа1 | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
дН | дед | аас | ссд | сад | дед | дад | ддд | саа | Нд | сад | Ьдд | Нд | ааЬ | сдЬ | едк | 1104 |
Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | С1п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
дед | аас | дед | Нд | Нд | дед | ааЬ | ддд | дН | даа | Нд | сдЬ | дак | аас | саа | Нд | 1152 |
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п | Ьеи | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
дН | дН | сед | ЬсЬ | дад | ддд | Нд | Ьас | Нд | аЬа | как | Еск | сад | дН | Нд | Нс | 1200 |
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
385 390 395 400
- 117 007810
ааа Ьуз | ддд саа | ддд кде ссд | кек Зег | асд сак ТЬг Нхз | дН Уа1 410 | Нд Ьеи | ккд асд | сас ΗΪ3 | асд ака | 1248 | ||||||
61у | б1п | С1у | Суз 405 | Рго | Ьеи | ТЬг | ТЬг 415 | Не | ||||||||
кек | едк | ака | дед | д+Е | кек | кас | сад | асд | аад | дН | аак | ккд | ккд | кек | дед | 1296 |
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
ака | ааа | кек | ссд | кдЬ | саа | едк | даа | асд | ссд | даа | ддд | дед | дад | дед | аад | 1344 |
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а | Ьуз | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
ссд | кдд | как | даа | ссд | ака | кас | «д | ддд | ддд | дН | сад | ккд | даа | ааа | 1392 | |
Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | 61у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | С1и | Ьуз | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
ддд | дак | едк | ί+д | кек | дед | дад | ака | аас | едк | ссд | дас | как | ккд | дак | ккс | 1440 |
С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе | |
465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
дед | даа | кек | ддд | саа | дЫ: | кас | ккк | ддд | ака | ака | дед | скд | ккс | аас | аас | 1488 |
А1а | 61и | Зег | <31у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | РЬе | Азп | Азп | |
485 | 490 | 495 | ||||||||||||||
ккс | асе | 9« | ксс | ккс | Ъдд | скд | сдс | дИ | сса | ааа | дН | ксс | дек | ксс | сас | 1536 |
РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | А1а | Зег | Ηί3 |
500 505 510 скд даа каа1545
Ьеи С1и <210>59 <211>514 <212> Белок.
<213> Искусственная последовательность <220>
<223> 3 ЬТЫЕ, соединенные глициновыми линкерами, и с введенными
Р2 и РЗО <400> 59
Мек 1 | Уа1 | Агд | Зег | Зег 5 | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег 10 | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а 15 | ΗΪ3 |
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп 20 | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у 25 | С1п | Ьеи | С1п | Тгр | Ьеи 30 | Азп | Агд |
Агд | А1а | Азп 35 | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп 40 | С1у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд 45 | Азр | Азп | С1п |
Ьеи | Уа1 50 | Уа1 | Рго | Зег | С1и | С1у 55 | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг 60 | Зег | (31п | Уа1 | Ьеи |
- 118 007810
РЬе Ьуз 61у ΘΙη С1у Суз | Рго Зег ТЬг Нхз | Уа1 Ьеи Ьеи 75 | ТЬг | Нхз | ТЬг 80 | ||||||||||
65 | 70 | ||||||||||||||
Не | 5ег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | ΘΙη | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | С1и | С1у | А1а | С1и | А1а |
100 | 105 | но | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | б1у | С1у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61и |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ьуз | 01 у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
РЬе | А1а | С1и | Зег | С1у | С1п | Уа1 | Туг | РЬе | С1у | Не | Не | А1а | Ьеи | 61у | С1у |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
С1у | Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | Нхз |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | А1а | Азп | Рго | ΘΙη | А1а | С1и | С1у | С1п | Ьеи | ΘΙη | Тгр | Ьеи | Азп | Агд |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Агд | А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61у | Уа1 | С1и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | С1п |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Ьеи | Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | Не | Туг | Зег | С1п | Уа1 | Ьеи |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
РЬе | Ьуз | С1у | С1п | С1у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | Нхз | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | Нхз | ТЬг |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Не | Зег | Агд | Не | А1а | Уа1 | Зег | Туг | ΘΙη | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
А1а | Не | Ьуз | Зег | Рго | Суз | С1п | Агд | С1и | ТЬг | Рго | б1и | С1у | А1а | С1и | А1а |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Ьуз | Рго | Тгр | Туг | С1и | Рго | Не | Туг | Ьеи | С1у | С1у | Уа1 | РЬе | С1п | Ьеи | С1и |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Ьуз | С1у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | С1и | Не | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр |
290 295 300
- 119 007810
РЬе 305 | А1а | 61и Зег | 61 у | 61п Уа1 Туг 310 | РЬе | 61у | 11е 11е 315 | А1а | Ьеи | 61 у | 61у 320 | ||||
61у | 61п | Туг | 11е | Ьуз | А1а | Азп | Зег | Ьуз | РЬе | 11е | 61у | 11е | ТЬг | 61и | Ьеи |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Уа1 | Агд | Зег | Зег | Зег | Агд | ТЬг | Рго | Зег | Азр | Ьуз | Рго | Уа1 | А1а | ΗΪ3 | Уа1 |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Уа1 | А1а | Азп | Рго | 61п | А1а | 61и | 61у | 61п | Ьеи | 61п | Тгр | Ьеи | Азп | Агд | Агд |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
А1а | Азп | А1а | Ьеи | Ьеи | А1а | Азп | 61 у | Уа1 | 61и | Ьеи | Агд | Азр | Азп | 61п | Ьеи |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Уа1 | Уа1 | Рго | Зег | 61и | 61у | Ьеи | Туг | Ьеи | 11е | Туг | Зег | 61п | Уа1 | Ьеи | РЬе |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Ьуз | 61у | 61п | 61у | Суз | Рго | Зег | ТЬг | ΗΪ3 | Уа1 | Ьеи | Ьеи | ТЬг | ΗΪ3 | ТЬг | 11е |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Зег | Агд | 11е | А1а | Уа1 | Зег | Туг | 61п | ТЬг | Ьуз | Уа1 | Азп | Ьеи | Ьеи | Зег | А1а |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
11е | Ьуз | Зег | Рго | Суз | 61п | Агд | 61и | ТЬг | Рго | 61и | 61у | А1а | 61и | А1а | Ьуз |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Рго | Тгр | Туг | 61 и | Рго | 11е | Туг | Ьеи | 61у | 61у | Уа1 | РЬе | 61п | Ьеи | 61 и | Ьуз |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
61у | Азр | Агд | Ьеи | Зег | А1а | 61и | 11е | Азп | Агд | Рго | Азр | Туг | Ьеи | Азр | РЬе |
4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
А1а | 61и | Зег | 61у | 61п | Уа1 | Туг | РЬе | 61у | Не | 11е | А1а | Ьеи | РЬе | Азп | Азп |
485 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
РЬе | ТЬг | Уа1 | Зег | РЬе | Тгр | Ьеи | Агд | Уа1 | Рго | Ьуз | Уа1 | Зег | А1а | Зег | ΗΪ3 |
500 505 510
Ьеи 61и <210> 60
- 120 007810 <211> 2773 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Экспрессирующий вектор ρ2Ζορ2Ε для клеток насекомых <220>
<221> разные признаки <222> (561)..(566) <223> Участок ΗϊηάΙΙΙ <220>
<221> разные признаки <222> (573)..(578) <223> Участок Αν3ΐ <220>
<221> разные признаки <222> (586)..(591) <223> Участок ЕсоК!
<220>
<221> разные признаки <222> (593)..(598) <223> Участок ВатН!
<220>
<221> разные признаки <222> (625)..(630) <223> Участок С1а1 <220>
<221> разные признаки <222> (629)..(634) <223> Участок С1а1 <220>
<221> разные признаки <222> (1156)..(1161) <223> Участок АраЫ <220>
<221> разные признаки <222> (2128)..(2133) <223> Участок РзЕ!
<220>
<221> разные признаки <222> (2204)..(2209) <223> Участок Ысо!
- 121 007810 <220>
<221> разные признаки <222> (2284)..(2289) <223> Участок ΑνβΙ <220>
<221> разные признаки <222> (2294)..(2299) <223> Участок Αν3ΐ, Зта1 и Хта1 <220>
<221> разные признаки <222> (2551)..(2556) <223> Участок АраЫ <400> 60
ддаксакдак | дакааасаак | дкакддкдск | аакдкЪдсбк | саасаасаак | кскдккдаас | 60 |
кдкд-Ькккса | кдкккдссаа | саадсасскк | какасЪсддк | ддссксссса | ссассааскк | 120 |
ккккдсаскд | саааааааса | сдсккккдса | сдсдддссса | касакадкас | аааскскасд | 180 |
ккксдкадас | каккккасаЬ | ааакадкска | сассдккдка | касдскссаа | акасаскасс | 240 |
асасаккдаа | сскккккдса | дкдсаааааа | дкасдкдксд | дсадксасдк | аддссддсск | 300 |
каксдддксд | сдксскдкса | сдкасдаакс | асаккаксдд | ассддасдад | кдккдкскка | 360 |
ксдбдасадд | асдссадсЪЪ | сскдкдкбдс | Ъаассдсадс | сддасдсаас | кссккаксдд | 420 |
аасаддасдс | дсскссакак | садссдсдсд | ккаксЪсакд | сдсдкдассд | дасасдаддс | 480 |
дсссдксссд | сккаксдсдс | скакааакас | адсссдсаас | дакскддкаа | асасадккда | 540 |
асадсакскд | кксдааккка | аадсккддка | сссксдадск | садскдаакк | скддаксскс | 600 |
кадассддкс | акакдсддсс | дсддаЬсдак | сдакакскда | скааакскка | дкккдкаккд | 660 |
Ъсакдкккка | акасаакакд | ккакдкккаа | акакдЪккМ: | аакааакккк | акаааакаак | 720 |
ЫгсаасЕЕЕЪ | аЕЬдЪаасаа | саХХдкссаб | ИГасасаскс | скЕЕсаадсд | сдЪдддас£с | 780 |
дакдсгсасг | саааддсддг | аагасддгса | гссасадаак | саддддакаа | сдсаддааад | 840 |
аасакдЪдад | сааааддсса | дсааааддсс | аддаассдка | ааааддссдс | дккдскддсд | 900 |
кккккссака | ддскссдссс | ссскдасдад | саксасаааа | аксдасдскс | аадксададд | 960 |
кддсдааасс | сдасаддасб | акааадакас | саддсдкккс | сссскддаад | сксссксдкд | 1020 |
сдсксксскд | ккссдассск | дссдсккасс | ддакасскдк | ссдсскккск | ссскксддда | 1080 |
адсдкддсдс | кЪРсксааЪд | сксасдскдк | аддбакскса | дкксддкдка | ддксдкксдс | 1140 |
- 122 007810
БссаадсБдд | дсБдБдБдса | сдаасссссс дББсадсссд | ассдсБдсдс | сББаБссддБ | 1200 | |
аасБаБсдБс | ББдадБссаа | сссддБаада | сасдасББаБ | сдссасБддс | адсадссасБ | 1260 |
ддБаасадда | ББадсададс | даддБаБдБа | ддсддБдсБа | сададББсББ | даадБддБдд | 1320 |
ссБаасБасд | дсБасасБад | ааддасадБа | БББддБаБсБ | дсдсБсБдсБ | даадссадББ | 1380 |
ассББсддаа | ааададББдд | БадсБсББда | Бссддсааас | ааассассдс | БддБадсддБ | 1440 |
ддБББББББд | БББдсаадса | дсадаББасд | сдсадааааа | ааддаБсБса | адаадаБссБ | 1500 |
ББдаБсББББ | сБасддддБс | БдасдсБсад | Бддаасдааа | асБсасдББа | адддаББББд | 1560 |
дБсаБдаБда | БааасааБдБ | аБддБдсБаа | БдББдсББса | асаасааББс | БдББдаасБд | 1620 |
БдББББсаБд | БББдссааса | адсассБББа | БасБсддБдд | ссБссссасс | ассаасББББ | 1680 |
ББдсасБдса | аааааасасд | сББББдсасд | сдддсссаБа | саБадБасаа | асБсБасдББ | 1740 |
БсдБадасБа | ББББасаБаа | аБадБсБаса | ссдББдБаБа | сдсБссаааБ | асасБассас | 1800 |
асаББдаасс | БББББдсадБ | дсаааааадБ | асдБдБсддс | адБсасдБад | дссддссББа | 1860 |
БсдддБсдсд | БссБдБсасд | БасдааБсас | аББаБсддас | сддасдадБд | ББдБсББаБс | 1920 |
дБдасаддас | дссадсББсс | БдБдББдсБа | ассдсадссд | дасдсаасБс | сББаБсддаа | 1980 |
саддасдсдс | сБссаБаБса | дссдсдсдББ | аБсБсаБдсд | сдБдассдда | сасдаддсдс | 2040 |
ссдБсссдсБ | БаБсдсдссБ | аБаааБасад | сссдсаасда | БсБддБааас | асадББдаас | 2100 |
адсаБсБдББ | сдааББааББ | сддаБсБсБд | садсасдБдБ | БдасааББаа | БсаБсддсаБ | 2160 |
адБаБаБсдд | саБадБаБаа | БасдасБсас | БаБаддаддд | ссассаБддс | саадББдасс | 2220 |
адБдссдББс | сддБдсБсас | сдсдсдсдас | дБсдссддад | сддБсдадББ | сБддассдас | 2280 |
сддсБсдддБ | БсБсссддда | сББсдБддад | дасдасББсд | ссддБдБддБ | ссдддасдас | 2340 |
дБдасссБдБ | БсаБсадсдс | ддБссаддас | саддБддБдс | сддасаасас | ссБддссБдд | 2400 |
дБдБдддБдс | дсддссБдда | сдадсБдБас | дссдадБддБ | сддаддБсдБ | дБссасдаас | 2460 |
ББссдддасд | ссБссдддсс | ддссаБдасс | дадаБсддсд | адсадссдБд | ддддсдддад | 2520 |
ББсдсссБдс | дсдасссддс | сддсаасБдс | дБдсасББсд | Бддссдадда | дсаддасБда | 2580 |
ссдасдссда | ссаасассдс | сддБссдасд | дсддсссасд | ддБсссаддд | дддБсдассБ | 2640 |
сдааасББдБ | ББаББдсадс | ББаБааБддБ | БасаааБааа | дсааБадсаБ | сасаааБББс | 2700 |
асаааБааад | саБББББББс | асБдсаББсБ | адББдБддББ | БдБссааасБ | саБсааБдБа | 2760 |
БсББаБсаБд | БсБ | 2773 |
ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
Claims (40)
- ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ1. Иммуногенный аналог ΤΝΕα человека, где указанный аналогa) содержит существенные фрагменты по меньшей мере 2 мономерные единицы указанного ΤΝΕα человека, где указанные существенные фрагменты соединены пептидными связями через пептидный линкер, указанная мономерная единица ΤΝΕα человека имеет аминокислотную последовательность, представленную остатками 2-158 в 8ЕС) Ш N0: 17,b) содержит по меньшей мере одну связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность, которая гетерологична в отношении ΤΝΕα человека, иc) может продуцироваться в виде единственного продукта экспрессии клеткой, несущей экспрессирующий вектор, кодирующий данный аналог.
- 2. Иммуногенный аналог по п.1, где каждый из существенных фрагментов экспонирует существенную часть В-клеточных эпитопов, находящихся на соответствующих мономерах, когда они являются частью ΤΝΕα человека.- 123 007810
- 3. Иммуногенный аналог по п.2, где каждый из существенных фрагментов экспонирует, по существу, все В-клеточные эпитопы, находящиеся на соответствующих мономерах, когда они являются частью ΤΝΤα человека.
- 4. Иммуногенный аналог по п.2 или 3, где аминокислотная последовательность, происходящая из мономерной единицы, модифицирована посредством вставки, замены, делеции или добавления аминокислот, так что снижается токсичность аналога по сравнению с ΤΝΤα человека и/или так что вводится связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность.
- 5. Иммуногенный аналог по любому из пп.1-4, где каждая из существенных частей содержит, по существу, полную аминокислотную последовательность каждой мономерной единицы в виде непрерывной последовательности или в виде последовательности, содержащей вставки.
- 6. Иммуногенный аналог по любому из предшествующих пунктов, где аминокислотные последовательности всех мономерных единиц ΤΝΤα человека представлены в данном аналоге.
- 7. Иммуногенный аналог по п.6, который содержит полные аминокислотные последовательности мономеров, составляющих ΤΝΤα человека, в виде неизмененных последовательностей или в виде последовательности, содержащей вставки.
- 8. Иммуногенный аналог по любому из предшествующих пунктов, где пептидный линкер содержит по меньшей мере одну связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность, которая гетерологична в отношении ΤΝΤα человека, или участвует в ее образовании в аналоге.
- 9. Иммуногенный аналог по любому из пп.1-7, где пептидный линкер не содержит связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность и не участвует в ее образовании у людей.
- 10. Иммуногенный аналог по любому из предшествующих пунктов, где связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность связывает большую часть молекул МНС класса II людей.
- 11. Иммуногенный аналог по любому из предшествующих пунктов, где по меньшей мере одна связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность выбрана из природного Т-клеточного эпитопа и искусственной связывающей МНС-П последовательности.
- 12. Иммуногенный аналог по п.10, где природный Т-клеточный эпитоп выбран из эпитопа столбнячного анатоксина, такого как Р2 или Р30, эпитопа дифтерийного анатоксина, эпитопа гемагглютинина вируса гриппа и эпитопа СЗ Р. Га1арагит.
- 13. Иммуногенный аналог по любому из предшествующих пунктов, где трехмерная структура полного ΤΝΤα человека, по существу, сохранена.
- 14. Иммуногенный аналог по любому из предшествующих пунктов, где аналог выбран из группы, состоящей из двух или трех полных мономеров ΤΝΤα, соединенных конец в конец пептидным линкером, где по меньшей мере один пептидный линкер содержит по меньшей мере одну связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность, двух или трех полных мономеров ΤΝΤα, соединенных конец в конец инертным пептидным линкером, где по меньшей мере один из мономеров содержит по меньшей мере одну чужеродную связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность, или где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность слита с Ν- или С-концевым мономером, необязательно, через инертный линкер.
- 15. Иммуногенный аналог ΤΝΤα человека, где данный аналог содержит по меньшей мере одну чужеродную связывающую МНС класса II аминокислотную последовательность, и далее характеризуется тем, что представляет собой мономер ΤΝΤα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность встроена или замещена в гибкую петлю 3, и/или мономер ΤΝΤα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, куда введен по меньшей мере один дисульфидный мостик, который стабилизирует ЛЭ-структуру мономера ΤΝΤα, и/или мономер ΤΝΤα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где любая из аминокислот 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 и 9 на Ν-конце подвержена делеции, и/или мономер ΤΝΤα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где встроена или замещена по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность в петлю 1 в положении интрона, и/или мономер ΤΝΤα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность введена как часть области искусственного стебля на Ν-конце ΤΝΤα человека, и/или мономер ΤΝΤα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность введена так, что она стабилизирует мономерную структуру путем увеличения гидрофобности поверхности взаимодействия тримера, и/или- 124 007810 мономер ΤΝΕα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность, фланкированная остатками глицина, встроена или замещена в аминокислотную последовательность ΤΝΕα, и/или мономер ΤΝΕα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность встроена или замещена в Ό-Ε-петлю, и/или мономер ΤΝΕα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где по меньшей мере одна чужеродная связывающая МНС класса II аминокислотная последовательность встроена или замещена между двумя идентичными подпоследовательностями ΤΝΕα человека, и/или мономер ΤΝΕα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где по меньшей мере один солевой мостик в ΤΝΕα человека усилен или замещен дисульфидным мостиком, и/или мономер ΤΝΕα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где растворимость и/или стабильность в плане протеолиза усилена путем введения мутаций, которые имитируют кристаллическую структуру мышиного ΤΝΕα, и/или мономер ΤΝΕα человека или аналог по любому из предшествующих пунктов, где потенциальная токсичность снижена или отменена путем введения по меньшей мере одной точечной мутации, где указанный мономер ΤΝΕα человека имеет аминокислотную последовательность, представленную остатками 2-158 в 8Еф ГО N0: 17.
- 16. Иммуногенный аналог по п.14 или 15, где аминокислотная последовательность аналога выбран из группы, состоящей из 8ЕЕ) ГО N0: 18, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 49, 51, 53, 55, 57 и 59, и любую аминокислотную последовательность на их основе, которая содержит только консервативные аминокислотные замены.
- 17. Иммуногенный аналог по любому из предшествующих пунктов, который может экспрессироваться в виде растворимого белка из бактериальных клеток.
- 18. Фрагмент нуклеиновой кислоты, который кодирует иммуногенный аналог по любому из предшествующих пунктов, или комплементарный ему фрагмент нуклеиновой кислоты.
- 19. Фрагмент нуклеиновой кислоты по п.18, который представляет собой фрагмент ДНК.
- 20. Фрагмент нуклеиновой кислоты по п.18, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из 8Еф ГО N0: 16, 48, 50, 52, 54, 56 и 58, или комплементарную ей последовательность нуклеиновой кислоты.
- 21. Способ отрицательной регуляции ΤΝΕα человека у человека, причем данный способ охватывает осуществление представления иммунной системе иммунологически эффективного количества по меньшей мере одного иммуногенного аналога по любому из пп.1-17.
- 22. Способ по п.21, где представление осуществляется путем введения иммуногенного аналога по любому из пп.1-17 аутологичному хозяину, необязательно, в смеси с адъювантом.
- 23. Способ по п.22, где адъювант выбран из группы, состоящей из иммуннонаправленного адъюванта; иммуномодулирующего адъюванта, такого как токсин, цитокин и производное микобактерии; масляного препарата; полимера; мицеллообразующего адъюванта; сапонина; иммуностимулирующего комплексного матрикса (матрикс ШСОМ); частицы; ΌΌΆ; алюминиевых адъювантов; ДНК-адъювантов; γ-инулина и инкапсулирующего адъюванта.
- 24. Способ по любому из пп.21-23, где иммуногенно эффективное количество аналога вводят животному путем, выбранным из парентерального пути, такого как внутрикожный, подкожный и внутримышечный путь; перитонеального; перорального; щечного; подъязычного; эпидурального; спинального; анального и внутричерепного пути.
- 25. Способ по п.24, где эффективное количество составляет от 0,5 до 2000 мкг.
- 26. Способ по п.24 или 25, который охватывает по меньшей мере одно введение в год, например по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 6 и по меньшей мере 12 введений в год.
- 27. Способ по п.21, где представление аналога иммунной системе осуществляется путем введения нуклеиновой(-ых) кислоты(-т), кодирующей(-их) аналог, в клетки животных и путем достижения таким образом экспрессии ίη νίνο клетками введенной(-ых) нуклеиновой(-ых) кислоты(-т).
- 28. Способ по п.27, где введенная(-ые) нуклеиновая(-ые) кислота(-ы) выбрана(-ы) из голой ДНК, ДНК, объединенной в композицию с заряженными или незаряженными липидами, ДНК, введенной в липосомы, ДНК, встроенной в вирусный вектор, ДНК, объединенной в композицию с облегчающим трансфекцию белком или полипептидом, ДНК, объединенной в композицию с направленным белком или полипептидом, ДНК, объединенной в композицию с преципитирующими кальций средствами, ДНК, связанной с молекулой инертного носителя, ДНК, инкапсулированной в хитин или хитозан, и ДНК, объединенной в композицию с адъювантом, таким как адъюванты по п.23.
- 29. Способ по п.35 или 36, где нуклеиновые кислоты вводят внутриартериально, внутривенно или путями по п.24.- 125 007810
- 30. Способ по любому из пп.27-29, который охватывает по меньшей мере одно введение нуклеиновых кислот в год, например по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 6 и по меньшей мере 12 введений в год.
- 31. Способ по п.21, где представление иммунной системе осуществляется путем введения непатогенного микроорганизма или вируса, который переносит фрагмент нуклеиновой кислоты, экспрессирующий и кодирующий аналог.
- 32. Способ по п.31, где вирус представляет собой непатогенный поксвирус, такой как вирус коровьей оспы.
- 33. Способ по п.31, где микроорганизм представляет собой бактерию.
- 34. Способ по любому из пп.31-33, где непатогенный микроорганизм или вирус вводят животному однократно.
- 35. Композиция для индукции продукции антител против мультимерного белка, причем данная композиция содержит иммуногенный аналог по любому из пп.1-17 и фармацевтически и иммунологически приемлемый носитель, и/или несущее средство, и/или адъювант.
- 36. Композиция для индукции продукции антител против мультимерного белка, причем данная композиция содержит фрагмент нуклеиновой кислоты по п.19 и фармацевтически и иммунологически приемлемый носитель, и/или несущее средство, и/или адъювант.
- 37. Композиция по п.35 или 36, где аналог составлен в композицию, как определено в любом из пп.22 или 23.
- 38. Способ получения аналога по любому из пп.1-17, причем данный способ охватывает культивирование клетки хозяина, трансформированной фрагментом нуклеиновой кислоты по п.19, в условиях, которые способствуют экспрессии фрагмента нуклеиновой кислоты по п.19 и последующего получения аналога из культуры в виде белкового продукта экспрессии.
- 39. Способ по п.38, где клетка хозяина представляет собой клетку бактериального хозяина.
- 40. Способ по п.39, где аналог представляет собой растворимый продукт экспрессии.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US33157501P | 2001-11-16 | 2001-11-16 | |
DKPA200101702 | 2001-11-16 | ||
PCT/DK2002/000764 WO2003042244A2 (en) | 2001-11-16 | 2002-11-15 | Immunogenic mimetics of multimer proteins with promiscuous t cell epitope inserts |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA200400688A1 EA200400688A1 (ru) | 2005-06-30 |
EA007810B1 true EA007810B1 (ru) | 2007-02-27 |
Family
ID=26069094
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA200400688A EA007810B1 (ru) | 2001-11-16 | 2002-11-15 | Иммуногенные миметики мультимерных белков с нерегулярными вставками т-клеточных эпитопов |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20040258660A1 (ru) |
EP (1) | EP1448598A2 (ru) |
JP (1) | JP2005518194A (ru) |
KR (1) | KR20050044857A (ru) |
CN (1) | CN1615316A (ru) |
CA (1) | CA2467052A1 (ru) |
EA (1) | EA007810B1 (ru) |
HU (1) | HUP0402155A2 (ru) |
IL (1) | IL161708A0 (ru) |
NZ (1) | NZ533587A (ru) |
PL (1) | PL370082A1 (ru) |
WO (1) | WO2003042244A2 (ru) |
Families Citing this family (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2003075951A2 (en) * | 2002-03-11 | 2003-09-18 | Pharmexa A/S | Novel application of vaccination against tnf-alpha |
CA2505870A1 (en) * | 2002-12-11 | 2004-06-24 | Soren Mouritsen | Targeting single epitopes |
WO2004099244A2 (en) | 2003-05-09 | 2004-11-18 | Pharmexa A/S | Immunogenic human tnf alpha analogues with reduced cytotoxicity and methods of their preparation |
DE102004014983A1 (de) * | 2004-03-26 | 2005-10-20 | Univ Stuttgart | Rekombinante Polypeptide der Mitglieder der TNF Ligandenfamilie und deren Verwendung |
CA2696699A1 (en) | 2007-08-20 | 2009-02-26 | Protalix Ltd. | Saccharide-containing protein conjugates and uses thereof |
EP2310509B1 (en) * | 2008-07-21 | 2015-01-21 | Apogenix GmbH | Tnfsf single chain molecules |
RU2016137258A (ru) * | 2009-04-01 | 2018-12-13 | Юниверсити Оф Майами | Композиции вакцин и способы их применения |
US9194011B2 (en) | 2009-11-17 | 2015-11-24 | Protalix Ltd. | Stabilized alpha-galactosidase and uses thereof |
EP3272861B1 (en) | 2011-01-20 | 2019-12-18 | Protalix Ltd. | Alpha-galactosidase compositions |
EP2542674B1 (en) * | 2010-03-02 | 2014-01-15 | Protalix Ltd. | Glucocerebrosidase multimers and uses thereof |
AU2014215639B2 (en) * | 2013-01-25 | 2017-03-23 | Thymon, Llc | Compositions for selective reduction of circulating bioactive soluble TNF and methods for treating TNF-mediated disease |
CA2958578A1 (en) * | 2014-08-21 | 2016-02-25 | The General Hospital Corporation | Tumor necrosis factor superfamily and tnf-like ligand muteins and methods of preparing and using the same |
US11572390B2 (en) | 2017-03-27 | 2023-02-07 | The University Of Queensland | Chimeric insect-specific flaviviruses |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1995005849A1 (en) * | 1993-08-26 | 1995-03-02 | Mouritsen & Elsner A/S | Inducing antibody response against self-proteins with the aid of foreign t-cell epitopes |
EP0659438A1 (en) * | 1993-12-23 | 1995-06-28 | Boehringer Mannheim Gmbh | Conjugates consisting of peptidic T cell antigens and cell binding groups, and their use for therapy |
WO1999042597A1 (en) * | 1998-02-19 | 1999-08-26 | President And Fellows Of Harvard College | Monovalent, multivalent, and multimeric mhc binding domain fusion proteins and conjugates, and uses therefor |
WO2000065058A1 (en) * | 1999-04-23 | 2000-11-02 | Pharmexa A/S | Method for down-regulating il5 activity |
WO2001070245A1 (en) * | 2000-03-22 | 2001-09-27 | Corixa Corporation | Immune mediators and related methods |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA1054937A (en) * | 1975-01-28 | 1979-05-22 | Gursaran P. Talwar | Antipregnancy vaccine |
SE524775C2 (sv) * | 1999-01-07 | 2004-09-28 | Creative Media Design At Integ | Lagringskort |
US6614751B1 (en) * | 1999-03-18 | 2003-09-02 | Hisashi Katao | Disk cartridge, optical disk drive, optical library and optical storage system |
JP2000285514A (ja) * | 1999-03-31 | 2000-10-13 | Orient Sokki Computer Kk | 非真円形光ディスク |
DE10013287A1 (de) * | 2000-03-17 | 2001-09-20 | Fuji Magnetics Gmbh | Optical-Business-Card |
-
2002
- 2002-11-15 WO PCT/DK2002/000764 patent/WO2003042244A2/en active IP Right Grant
- 2002-11-15 NZ NZ533587A patent/NZ533587A/en unknown
- 2002-11-15 EP EP02779246A patent/EP1448598A2/en not_active Withdrawn
- 2002-11-15 CA CA002467052A patent/CA2467052A1/en not_active Abandoned
- 2002-11-15 IL IL16170802A patent/IL161708A0/xx unknown
- 2002-11-15 KR KR1020047007537A patent/KR20050044857A/ko not_active Application Discontinuation
- 2002-11-15 JP JP2003544079A patent/JP2005518194A/ja active Pending
- 2002-11-15 EA EA200400688A patent/EA007810B1/ru unknown
- 2002-11-15 CN CNA028271971A patent/CN1615316A/zh active Pending
- 2002-11-15 HU HU0402155A patent/HUP0402155A2/hu unknown
- 2002-11-15 PL PL02370082A patent/PL370082A1/xx unknown
-
2004
- 2004-05-14 US US10/846,911 patent/US20040258660A1/en not_active Abandoned
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1995005849A1 (en) * | 1993-08-26 | 1995-03-02 | Mouritsen & Elsner A/S | Inducing antibody response against self-proteins with the aid of foreign t-cell epitopes |
EP0659438A1 (en) * | 1993-12-23 | 1995-06-28 | Boehringer Mannheim Gmbh | Conjugates consisting of peptidic T cell antigens and cell binding groups, and their use for therapy |
WO1999042597A1 (en) * | 1998-02-19 | 1999-08-26 | President And Fellows Of Harvard College | Monovalent, multivalent, and multimeric mhc binding domain fusion proteins and conjugates, and uses therefor |
WO2000065058A1 (en) * | 1999-04-23 | 2000-11-02 | Pharmexa A/S | Method for down-regulating il5 activity |
WO2001070245A1 (en) * | 2000-03-22 | 2001-09-27 | Corixa Corporation | Immune mediators and related methods |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
CHANG H-C ET AL.: "A GENERAL METHOD FOR FACILITATING HETERODIMERIC PAIRING BETWEEN TWO PROTEINS: APPLICATION TO EXPRESSION OFALPHA AND BETA T-CELL RECEPTOR EXTRACELLULAR SEGMENTS," PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF USA, NATIONAL ACADEMY OF SCIENCE. WASHINGTON, US, vol. 91, November 1994 (1994-11), pages 11408-11412, XP002936749, ISSN: 0027-8424, page 11408 -page 11409, page 11412 * |
JUN LI ET AL.: "Mutants of single chain interleukin 5 show asymmetric recruitment of receptor alpha and beta s subunits", THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, vol. 271, no. 49, 6 December 1996 (1996-12-06), pages 31729-31734, XP002902899, the whole document * |
JUN LI ET AL.: "Single chain human interleukin 5 and its asymmetric mutagenesis for mapping receptor binding sites", THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, vol. 271, no. 4, 26 January 1996 (1996-01-26), pages 1817-1820, XP002902898, the whole document * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
HUP0402155A2 (hu) | 2005-01-28 |
NZ533587A (en) | 2005-11-25 |
CA2467052A1 (en) | 2003-05-22 |
WO2003042244A2 (en) | 2003-05-22 |
CN1615316A (zh) | 2005-05-11 |
EA200400688A1 (ru) | 2005-06-30 |
EP1448598A2 (en) | 2004-08-25 |
PL370082A1 (en) | 2005-05-16 |
IL161708A0 (en) | 2004-09-27 |
US20040258660A1 (en) | 2004-12-23 |
KR20050044857A (ko) | 2005-05-13 |
JP2005518194A (ja) | 2005-06-23 |
WO2003042244A3 (en) | 2003-11-13 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EP0975668B1 (en) | MODIFIED TNFalpha MOLECULES, DNA ENCODING SUCH MODIFIED TNFalpha MOLECULES AND VACCINES COMPRISING SUCH MODIFIED TNFalpha MOLECULES AND DNA | |
AU754971B2 (en) | Method for down-regulating osteoprotegerin ligand activity | |
US7070784B1 (en) | Method for down-regulating GDF-8 activity using immunogenic GDF-8 analogues | |
US20070184023A1 (en) | Method for down-regulation of vegf | |
AU2006312847A1 (en) | Therapeutic vaccines targeting HMGB1 | |
JP2015511602A (ja) | リステリアワクチン処理後のサプレッサー細胞機能抑制 | |
EA007810B1 (ru) | Иммуногенные миметики мультимерных белков с нерегулярными вставками т-клеточных эпитопов | |
US20040037840A1 (en) | Novel therapeutic vaccine formulations | |
US20050063952A1 (en) | Immunogenic CEA | |
WO2002034287A2 (en) | Therapeutic vaccine formulations containing chitosan | |
AU2006228872A1 (en) | Immunogenic EGFR peptides comprising foreign Tcell stimulating epitope | |
ZA200509031B (en) | Immunogenic human TNF alpha analogues with reduced cytotoxicity and methods of their preparation | |
ZA200403686B (en) | Immunogenic mimetics of multimer proteins with promiscuous T cell epitope inserts | |
US20060222624A1 (en) | Detoxified TNF and method of preparing | |
EA008827B1 (ru) | Очистка вариантов her-2 | |
WO2009003889A2 (en) | Immunogenic analogues of rankl | |
CN113318225B (zh) | 肿瘤免疫增强剂及其制法和应用 | |
JP2023546485A (ja) | Pd-l1の細胞外ドメインを含むキメラ抗原 | |
WO2008040759A1 (en) | Method for down-regulation of cripto | |
AU2002342596A1 (en) | Immunogenic mimetics of multimer proteins with promiscuous T cell epitope inserts | |
EP1541587A2 (en) | Method for down-regulating osteoprotegerin ligand activity | |
MXPA99009394A (es) | Moleculas de tnfa modificadas, adn que modifica tales moleculas de tnfa modificadas y vacunas que comprenden tales moleculas tnfa modificadas y adn |